POLIPEPTÍDEO MUTANTE DE INTERLEUCINA-18 E COMPOSIÇÃO FARMACÊUTICA
CAMPO DA INVENÇÃO
[001] A presente invenção refere-se a mutantes de IL-18 tendo atividade biológica maior com relação à proteína do tipo selvagem.
ANTECEDENTES DA INVENÇÃO
[002] Em 1989, uma atividade de soro induzida por endotoxina que induzia interferon-γ (IFN-γ) obtido de células de baço de camundongo foi descrita (Nakamura e outros, 1989). Esta atividade do soro funcionou não como um indutor direto de IFN-γ mas pelo contrário como um co-estimulante junto com IL-2, IFN-/, TNF ou mitógenos. Uma tentativa de purificar a atividade do soro de camundongo pós-endotoxina revelou uma proteína de 50-55 kDa aparentemente homogênea (Nakamura e outros, 1993). Uma vez que outras citocinas podem agir como co-estimulantes para produção de IFN-γ, a falha em neutralizar anticorpos para IL-1, IL-4, IL-5, IL-6 ou TNF para neutralizar a atividade do soro sugeriu que ela era um fator diferente. Em 1995, os mesmos cientistas demonstraram que o co-estimulante induzido por endotoxina para produção de IFN-γ estava presente em extratos de fígados de camundongos pré-condicionados com P. acnes (Okamura e outros, 1995). Neste modelo, a população de macrófago hepática (células Kupffer) expandiu e nesses camundongos, uma baixa dose de lipopolissacarídeo bacteriano (LPS), que em camundongos não pré-condicionados não é letal, se torna letal. O fator, chamado fator de indução de IFN-γ (IGIF) e mais tarde chamado Interleucina-18 (IL-18), foi purificado para homogeneidade a partir de 1.200 gramas de fígados de camundongo tratado com P. acnes. Oligonucleotídeos de degeneração derivados de seqüências de aminoácido de IL-18 purificada foram usados para clonar um cDNA de IL-18 de murino (Okamura e outros, 1995). RNAs mensageiros para IL-18 e Interleucina-12 (IL-12) são imediatamente detectados em macrófagos ativados. IL-18 não induz IFN-γ por si só, mas funciona principalmente como um co-estimulante com mitógenos ou IL-12. A seqüência de cDNA humano para IL-18 foi descrita em 1996 (Figura 1A SEQ ID NO:1).
[003] A Interleucina IL-18 compartilha características estruturais com a família de proteínas IL-1 (Nakamura e outros, 1993; Okamura e outros, 1995; Ushio e outros, 1996; Bazan e outros, 1996). Diferente da maior parte das citocinas, que exibem uma estrutura de feixe de quatro hélices, IL-18 e IL-1 β têm uma estrutura em folha pregueada β (Tsutsui e outros, 1996). Similarmente à IL-1 β, IL-18 é sintetizada como um precursor biologicamente inativo (pró IL-18), não tendo um peptídeo de sinal (Ushio e outros, 1996). Os precursores de IL-1 β e IL-18 são clivados por caspase 1 (enzima de conversão de IL-1 β ou ICE), que cliva os precursores após um resíduo de ácido aspártico na posição P1. As citocinas maduras resultantes são imediatamente liberadas da célula (Ghayur e outros, 1997 e Gu e outros, 1997).
[004] IL-18 é um co-estimulante para produção de citocina (IFN-γ, IL-2 e fator de estimulação de colônia de granulócito-macrófago) pelas células do tipo I (Th1) auxiliares de T (Kohnoet e outros, 1997) e também um co-estimulante para citotoxidez mediada por ligante FAS de clones de célula assassina natural de murino (Tsutsui e outros, 1996).
[005] Linfócitos de Th1 estão envolvidos nas respostas imune contra tumores (Seki e outros, 2000). As respostas de Th1 incluem a secreção das citocinas IL-2, IL-12, IL-18 e IFN-γ, bem como a geração de linfócitos T citotóxicos específicos reconhecendo antígenos de tumor específicos. A resposta de Th1 é também uma arma vital de defesa do hospedeiro contra muitos microorganismos. No entanto, a resposta de Th1 pode também estar associada a efeitos não-desejáveis tal como o desenvolvimento de várias doenças autoimunes, inflamação e rejeição de transplante de órgão.
[006] Tentativas de expressar a forma madura de IL-18 em E. coli usando um vetor codificando a proteína madura não proveu uma citocina completamente ativa. Um sistema de expressão eficiente para a geração da IL-18 humana completamente biologicamente ativa foi desenvolvido para usos terapêuticos, por exemplo, em males, ou qualquer condição onde a indução de IFN-γ for desejada (WO 00/61768). Nesse sistema, o sítio de clivagem de caspase-1 de precursor de IL-18 foi mudado para um sítio de fator Xa (ICE-Xa), e um vetor codificando o precursor de IL-18 ICE/Xa foi usado para transformação de E. coli. Seguindo a expressão deste precursor de IL-18 em E. coli, a IL-18 madura foi gerada pela clivagem de um fator Xa in vitro. Esta IL-18 madura gerada pela clivagem do fator Xa era completamente ativa.
[007] Proteínas de ligação de citocina (receptores de citocina solúveis) são geralmente os domínios de ligação de ligante extracelular dos seus respectivos receptores de citocina de superfície celular. Elas são produzidas ou através de união alternativa ou através de clivagem proteolítica do receptor de superfície celular. Esses receptores solúveis foram descritos no passado, por exemplo, os receptores solúveis de IL-6 e IFN-γ (Novick e outros, 1989), TNF (Engelmann e outros, 1989; Engelmann e outros, 1990), IL-1 e IL-4 (Maliszewski e outros, 1990), IFN-α/β (Novick e outros, 1994; Novick e outros, 1992). Uma proteína de ligação de citocina, chamada osteoprotegerina (OPG, também conhecida como fator de inibição de osteoclasto-OCIF), um membro da família TNFR/Fas, parece ser o primeiro exemplo de um receptor solúvel que existe apenas como uma proteína secretada (Anderson e outros, 1997; Simonet e outros, 1997; Yasuda e outros, 1998).
[008] Uma proteína de ligação de IL-18 (IL-18BP) foi purificada com afinidade, em uma coluna de IL-18, a partir de urina (Novick e outros, 1999). A IL-18BP abole a indução pela IL-18 de IFN-γ e de IL-8, ativação de NF-kB in vitro e indução de IFN- in vivo. IL-18BP é uma proteína de circulação solúvel que é constitutivamente expressa no baço, e pertence à superfamília da imunoglobulina. A isoforma de IL-18BP mais abundante, a isoforma variante unida a, exibe uma alta afinidade para IL-18 com uma taxa de início rápida e uma taxa de término lenta, e uma constante de dissociação (Kd) de aproximadamente 400 pM (Kim e outros, 1999).
[009] Os resíduos envolvidos na interação de IL-18 com IL-18BP foram descritos através do uso de modelagem por computador (Kim e outros, 1999) e baseados na interação de IL-1 com o tipo I de IL1R (Vigers e outros, 1997). No modelo para ligação de IL-18 à IL-18BP, o resíduo Glu na posição 42 e o resíduo Lys na posição 89 de IL-18 foram propostos se ligarem a Lys-130 e Glu-114 em IL-18P, respectivamente (Kim e outros).
[0010] IL-18 está constitutivamente presente em muitas células (Puren e outros) e circula em humanos saudáveis (Urushihara e outros, 2000). A alta afinidade de IL-1BP para IL-18 bem como a alta concentração de IL-18BP encontrada na circulação (excesso molar de 20 vezes sobre a IL-18) representa uma situação única na biologia da citocina. Desse modo, a maior parte, se não todas, das moléculas de IL-18 na circulação é ligada à IL-18BP. A IL-18BP em circulação que compete com os receptores de superfície celular quanto à IL-18 pode agir como um antiinflamatório natural e uma molécula imunossupressiva.
[0011] Agentes virais codificam IL-18B como proteínas, por exemplo, proteínas virais MC53 e MC54 de M. contagiosum compartilham uma homologia significante com IL-18BP de mamífero (Novick e outros, 1999). Proteínas MC53 e MC54 de M. contagiosum possuem a habilidade de ligar e neutralizar IL-18 humana de uma maneira similar àquela de IL-18B (Xiang e Moss, 1999). A proteína p13 de poxvirus ectromelia, que é homóloga à IL-18BP, liga IL-18 humana e inibe sua atividade in vitro. Camundongos infectados com um vírus mutante de deleção de p13 exibem níveis menores de infectividade (Borne e outros, 2000). Desse modo, o grau de infectividade parece se relacionar com a presença de IL-18BP.
[0012] Os altos níveis de circulação de IL-18BP podem representar uma defesa natural contra uma resposta de Th1 fora de controle à infecção e desenvolvimento de doenças auto-imunes. No entanto, a IL-18 contribui para a resposta de Th1 que é importante na defesa do hospedeiro contra tumores. Desse modo, a IL-18BP pode causar falha do hospedeiro em desenvolver células T citotóxicas direcionadas contra células de tumor. Na verdade, há evidência de que a IL-18 promove defesa do hospedeiro contra tumores em camundongos. Por exemplo, em camundongos singenêicos, células de carcinoma de mama de murino expressando IL-12 de murino ou IL-18 de murino eram menos tumorigênicas e formaram tumores mais lentamente do que as células de não-expressão de controle (Coughlin e outros, 1998). Estudos de neutralização de anticorpo revelaram que os efeitos antitumor necessitaram de IFN-γ. Em um outro estudo, administração sistêmica de IL-18 a animais experimentais em combinação com melanoma B16 expressando B7-1 (CD80) resultou em supressão drástica de formação de melanoma, crescimento de tumor e uma melhora significante na sobrevivência (Cho e outros, 2000).
[0013] Citocinas são usadas como adjuvante para aumentar a eficácia da imunoterapia em câncer. Por exemplo, a IL-2 é administrada para carcinoma ou melanoma de célula renal (Gollob e outros, 2000). Muitas vezes, uma conseqüência importante do tratamento com citocinas são perfis de toxidez sistêmica grave. Uso de citocinas, expressas pelo próprio tumor do paciente ou células dendríticas, é uma solução lógica para o problema. Ainda, se IL-18 tiver que ser usada localmente, como adjuvante na imunoterapia de tumor, a habilidade dos níveis constitutivos de IL-18BP para neutralizar IL-18 no ambiente local seria ainda exercida e conseqüentemente sua eficácia seria diminuída bastante.
[0014] O uso de transplantes alogeneicos não-mieloablativos, os chamados minitransplantes, para tratar leucemia e tumores sólidos é muito útil na indução de reações de leucemia-versus-enxerto e de tumor-versus-enxerto (Slavin S., 2000; Slavin e outros, 2000). Dois estudos que usaram ou células tronco periféricas alogeneicas (Childs e outros, 2000) ou células dendríticas (Kugler e outros, 2000) para tratar pacientes com carcinoma de célula renal metastático encontraram um sucesso notável. Embora esses estudos precisem ser estendidos e confirmados, o conceito de que uma reação tumor-versus-enxerto que está acontecendo pode ser explorado para imunoterapia em câncer está ganhando aceitação (Slavin, 2000). Uma vez que a IL-18 parece estar envolvida nessas abordagens terapêuticas bem-sucedidas, um aperfeiçoamento adicional pode ser conseguido se o efeito de neutralização da IL-18BP puder ser abolido.
[0015] Mutantes de IL-18 (IFN-γ, fator de indução) são descritos na EP0845530. Os mutantes de IL-18 descritos são moléculas onde 1, 2, 3 ou todos os 4 resíduos de cisteína na IL-18 (Figura 1B) foram substituídos por resíduos serina ou alanina. Esses mutantes contidos em uma seqüência de consenso intacta (Figura 1B). Todos os mutantes isolados exibiram maior estabilidade do que a IL-18 do tipo selvagem. O grau de estabilidade dos mutantes é diretamente proporcional ao número de resíduos Cys substituídos na molécula. A EP0845530 é silenciosa quanto à habilidade da IL-18BP em neutralizar esses mutantes.
[0016] A geração e uso terapêutico de mutantes de IL-18 completamente ativos incapazes de se ligar ou se ligam com baixa afinidade à IL-18BP, é desse modo altamente vantajosa.
SUMÁRIO DA INVENÇÃO
[0017] A presente invenção refere-se a um polipeptídeo mutante de IL-18 compreendendo mutações em um ou mais resíduos de aminoácido que estão envolvidos em sua interação com a proteína de ligação IL-18. Mais especificamente, as mutações são substituições, de preferência adições ou deleções, não-conservativas. Os resíduos mutados no dito polipeptídeo podem ser selecionados de Glu-42, lle-85, Met-87, Lys-89, Met-96, Asp-130, Lys-132, Pro-143, Met-149 e Leu-189, de preferência, Glu-42 e Lys-89.
[0018] Em uma modalidade, o Glu-42 ou Lys-89 ou ambos Glu-42 e Lys-89 são substituídos com um aminoácido não-polar, de preferência alanina.
[0019] Em adição, a invenção provê um DNA codificando o dito polipeptídeo, de preferência codificando um polipeptídeo da SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:7 ou SEQ ID NO:8.
[0020] Em uma modalidade, o DNA codificando a SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:7 ou SEQ ID NO:8 é fundido a um peptídeo de sinal, de preferência aquele de hGH. No entanto, a invenção também provê um vetor compreendendo o dito DNA capaz de expressar o polipeptídeo codificado pelo dito DNA em uma célula hospedeira adequada, por exemplo, uma célula hospedeira procariótica ou eucariótica.
[0021] Em adição, a presente invenção provê composições farmacêuticas compreendendo o dito polipeptídeo para o tratamento de doenças que são prevenidas ou aliviadas pelas respostas de Th1, de preferência para o tratamento de doença viral ou câncer.
BREVE DESCRICÃO DAS FIGURAS
[0022] A Figura 1A mostra a seqüência de nucleotídeo codificando o precursor de IL-18 WT e a localização dos iniciadores usados para construir as proteínas IL-18 mutadas diferentes. A seta grande indica onde a seqüência de codificação da proteína IL-18 começa.
[0023] A Figura 1B mostra a seqüência de aminoácido da IL-18 madura. A seqüência consenso dentre diferentes espécies de IL-18 está dentro das caixas brancas. As cistidinas estão sublinhadas. As caixas escuras mostram os resíduos mutados em IL-18 de acordo com esta invenção.
[0024] A Figura 2 mostra a representação esquemática dos mutantes de IL-18 de acordo com a invenção. A His-6 indica a localização das seis histidinas fundidas no terminal N da pró-peça do precursor de IL-18. A seta indica o sítio de clivagem de ICE conforme substituído pelo sítio de clivagem do fator Xa (x). WT indica a IL-18 madura do tipo selvagem. E42A indica Glu-42 para mutação Ala, K89A indica Lys-89 para mutação Ala e E42A/K89A indica mutação dupla. Com base no precursor /x/WT, três mutantes de IL-18 (E42A, K89A e E42A+K89A) foram gerados pelas duas etapas de PCR.
[0025] A Figura 3A mostra a indução de IFN- em células NKO pela IL-18 WT e proteína mutante em concentrações mostradas sob o eixo x na Figura 3B na presença de IL-12 (0,5 ng/ml).
[0026] A Figura 3B mostra a indução de IFN- em células PBMCs pela IL-18 WT e proteína mutante em concentrações mostradas sob o eixo x e na presença de IL-12 (1,0 ng/ml).
[0027] A Figura 4A mostra o efeito de IL-18BP em indução de IFN-por IL-18 WT humana e proteína mutante em células NKO. Mutante e IL-18 WT (30 ng/ml) foram pré-incubadas com IL-18BP nas concentrações indicadas sob o eixo x (da Figura 3B) por 1 hora em temperatura ambiente e adicionadas a células NKO estimuladas com IL-12 (0,5 mg/ml).
[0028] A Figura 4B mostra o efeito de IL-18BP em indução de IFN-por IL 18 WT humana e proteína mutante em células PBMCs. Mutante e IL-18 WT (30 ng/ml) foram pré-incubadas com IL-18BP nas concentrações indicadas sob o eixo x por 1 hora em temperatura ambiente e adicionadas a células PBMCs estimuladas com IL-12 (1,0 mg/ml).
[0029] A Figura 5 mostra a indução de IL-8 por IL-18 WT e proteína mutante. PBMCs foram incubadas com IL-18 WT ou mutante (30 ng/ml). Polimixina Β (1 g/ml) foi misturada com IL-18 por 30 minutos antes de ser adicionada às PBMCs. Após 24 horas os sobrenadantes foram removidos e avaliados quanto à concentração de IL-18 por ECL (exemplo 9). Um de três experimentos é mostrado.
DESCRICÃO DETALHADA DA INVENÇÃO
[0030] A presente invenção refere-se a um mutante de IL-18 ou seu fragmento ativo, ou uma muteína, ou qualquer outra proteína ou seu derivado de peptídeo (IL-18M), que é menos suscetível à neutralização pela IL18BP conforme comparado com o tipo selvagem (IL-18 WT). Mais especificamente, um ou mais aminoácidos da IL-18 WT, de preferência não mais de 30, com mais preferência até 10 aminoácidos, podem ser substituídos com outros aminoácidos, ou eliminados, ou um ou mais aminoácidos podem ser adicionados, de preferência não mais de 30, com mais preferência até 10 aminoácidos a fim de gerar um mutante de IL-18 ativo que é menos suscetível à neutralização por IL-18BP. Aminoácidos podem ser substituídos por aminoácidos diferentes, as substituições de preferência sendo substituintes não-conservativas. Mais especificamente, as ditas mutações poderiam ser objetivo para resíduos previstos estar envolvidos na ligação à IL-18BP tal como Glu-42, lle-85, Met-87, Lys-89, Met-96, Asp-130, Lys-132, Pro-143, Met-149 e Leu-189, com mais preferência Glu-42 e/ou Lys-89 (Kim e outros, 1999).
[0031] IL-18M pode ser produzida em eucariotas ou sistemas de expressão eucariótica, intracelularmente, periplásmica ou podem ser secretadas no meio. A IL-18M pode ser recuperada na forma solúvel ou insolúvel (corpos de inclusão).
[0032] Um vetor compreendendo o cDNA de IL-18M precursora pode ser usado para expressão de IL-18M precursora de montagem correta em sistemas procarióticos. Subseqüentemente, a proteína completamente ativa madura pode ser gerada após clivagem por ICE in vitro. Uma seqüência codificando o sítio de clivagem específico para uma protease, de preferência fator Xa, pode substituir a seqüência ICE no precursor de IL-18M.
[0033] Um vetor de expressão codificando um peptídeo de sinal eficaz, de preferência o peptídeo de sinal de hormônio do crescimento humano, fundido ao cDNA da IL-18M madura pode ser usado para expressão e secreção eucariótica.
[0034] O cDNA de IL-18 de origem usado para a construção do mutante pode ser selecionado de espécies de camundongo ou humana.
[0035] A IL-18M pode ser marcada com epítopo, de preferência com histidina, para purificação conveniente. A IL-18M recombinante pode ser purificada através de métodos convencionais ou de afinidade. A quantidade de IL-18M produzida pode ser monitorada por um ELISA específico.
[0036] A IL-18M pode ser usada em uma formulação farmacêutica para o tratamento de doenças que são prevenidas ou reduzidas por respostas Th1, mais especificamente através de tratamento de IL-18, por exemplo, infecções por microorganismo e câncer. A vantagem de usar o mutante ao invés da versão do tipo selvagem da proteína reside em sua resistência à neutralização de IL-18BP.
[0037] Mais especificamente, IL-18M pode ser administrada sistemicamente ou localmente como um adjuvante para antígenos de tumor em imunoterapia de tumor.
[0038] Células de tumor derivadas de um paciente podem ser isoladas e geneticamente modificadas para secretar IL-18M e reenxertadas no mesmo paciente para vacinação local (Coughlin e outros, 1998). Fusão das células de tumor modificadas expressando IL-18M a células dendríticas alogeneicas (células apresentando antígeno) pode ser realizada para aumentar mais a antigeneicidade do tumor e conseqüentemente, a resposta antitumor.
[0039] A IL-18M pode ser administrada como um adjuvante em vacinação de DNA (Tuting e outros, 1989). De maneira similar àquela descrita para o uso de citocinas IL-12 e IFN-. Nesse caso, vacinação de antígeno de tumor transdérmica pode ser realizada usando uma pistola de gene. Isso pode resultar em transfecção de células dendríticas residentes na pele com DNA codificando ambos antígeno de tumor e IL-18M. Alternativamente, as células dendríticas podem ser construídas ex vivo seguido por uma transferência de adoção.
[0040] A IL-18M pode ser usada como um adjuvante em terapia de tumor versus enxerto. Células tronco alogeneicas podem ser usadas para transplantes de pacientes com câncer. Para aumentar a rejeição de tumor versus enxerto induzida por transplante das células alogeneicas, IL-18M pode ser administrada sistemicamente ou localmente, de preferência através de expressão de IL-18M em células dendríticas singeneicas geneticamente modificadas ou em células de tumor tomadas do paciente.
[0041] Deve ser entendido que embora a invenção tenha sido descrita em conjunto com as suas modalidades específicas preferidas, a descrição acima bem como os exemplos que seguem são pretendidos ilustrar e não limitar o escopo da invenção. Outros aspectos, vantagens e modificações dentro do escopo da invenção ficarão aparentes àqueles versados na técnica à qual a invenção pertence.
EXEMPLOS
Exemplo 1
Construção de vetores para expressão de proteína de fusão marcador Histidina pró IL-18 WT para clivagem pelo Fator Xa
[0042] A fim de gerar a montagem correta de IL-18 em E. coli, o sítio de clivagem de ICE no precursor de IL-18 foi substituído por um sítio de clivagem Xa. Subseqüentemente, clivagem in vitro do precursor de IL-18 por Xa gera então a proteína ativa (WO 00/61768).
[0043] A seqüência de cDNA codificando o precursor de IL-18 humana (pró IL-18, número de acesso no banco de gene D49950, Figura 1) usada para geração do plasmídeo de expressão foi isolada conforme descrito (Ghayur e outros, 1997).
[0044] A substituição do sítio de clivagem de ICE com um sítio de clivagem de Xa foi conseguida usando 2 reações PCR (vide os iniciadores usados na Figura 1). Reação PCR 1: A pró-peça de cDNA de IL-18 foi gerada usando o iniciador de sentido (Pr 1) contendo o sítio EcoRI localizado a montante do ORF, 5’-ATATGAATTCATGGCTGCTGAACCAGTAG, (SEQ ID NO:11) e um iniciador reverso (Pr 2) designado para o sítio de ICE (33-LESD-36) onde 6 nucleotídeos foram mudados para codificar o sítio do fator Xa (33-IEGR-36), 5’-AAAGTAACGTCCTTCGATGTTTTC (SEQ ID NO: 12). O fragmento de DNA amplificado codificando a IL-18 madura foi gerado usando o iniciador de sentido (Pr 3) que é complementar a Pr 2,
[0045] 5’-GAAAACATCGAAGGACGTTACTTT, (SEQ ID NO: 13) e iniciador reverso (Pr 4) contendo o sítio BamHI a jusante da seqüência de codificação de IL 18 5’- AΤATGG ATCCTAGTCTTCGTTTTGAACAGTG (SEQ ID NO: 14). A pró-peça de 108 pb e DNAs de IL-18 de 474 pb maduros foram analisados em eletroforese em 1% de agarose e eluídos por um sistema de extração de gel (GIBCO/BRL).
[0046] Reação PCR 2: Os dois fragmentos de DNA obtidos na reação PCR 1 foram misturados em uma razão 1:1 e usados juntos com os iniciadores Pr1 e Pr4 para gerar um cDNA de IL-18 humano completo onde o sítio ICE é substituído pelo sítio do fator Xa (ICE/Xa).
[0047] O cDNA pró IL-18 (ICE/Xa) era ligado ao plasmídeo BlueScript (Stratagene) pelos sítios de restrição EcoRI e BamHI (GIBCO/BRL). Este plasmídeo serviu para confirmação da seqüência. A seqüência de aminoácido prevista codificada é mostrada na SEQ ID NO:2. Para expressão de E. coli, a inserção de DNA de IL-18 foi religada no vetor pROEX HTa (GIBCO/BRL) com o uso de sítios EcoRI e Xbal (originando em BlueScript). Neste vetor, a proteína resultante é N-terminal fundida a uma lacuna de histidina.
Exemplo 2
Construção dos mutantes de E42A, K89A e E42A/K89A
[0048] As mutações em IL-18 foram criadas em resíduos previstos como sendo importantes para a ligação à IL-18BP inibidora (Kim e outros, 2000). Três mutantes: E42A, K89A e F-42A/K89A foram gerados. As mutações foram conseguidas através de duas reações PCR, conforme descrito no Exemplo 1, usando os iniciadores e moldes descritos abaixo (os iniciadores são mostrados na Figura 2).
Mutante de E42A
[0049] Reação PCR 1- Os pares de iniciadores usados para preparação da E42A mutante foram:
[0050] par A - Pr 1 (Exemplo 1) e o iniciador reverso (Pr 5) 5’-TAA TTT AGA TGC AAG CTT GCC (SEQ ID NO:15) codificando alanina ao invés de ácido glutâmico (E 42),
[0051] e par Β - o iniciador de sentido (Pr 6) 5’-GGC AAG CTT GCA TCT AAA TTA (SEQ ID NO: 16) codificando Alanina ao invés do ácido Glutâmico (GAA a GCA) e o iniciador reverso Pr 4 (Exemplo 1), usando pró IL-18 (ICE/Xa) como um molde na reação de PCR.
[0052] Reação de PCR 2: Os dois fragmentos de DNA obtidos nas reações de PCR 1 foram usados como moldes para a segunda reação de PCR usando os iniciadores Pr 1 e Pr 4.
Mutante de K89A
[0053] Reação PCR 1: O par de iniciadores usado para preparação do K89A mutante foi o par A Pr 1 (Exemplo 1) e o iniciador reverso (Pr 7) 5’-CTG GCT ATC TGC ATA CAT ACT (SEQ ID NO: 17) codificando alanina ao invés de lisina (K 89), e par Β o iniciador de sentido (Pr 8) 5’-AGT ATG TAT GCA GAT AGC CAG (SEQ ID NO: 18) codificando alanina ao invés de lisina (AAA a GCA) com o iniciador reverso Pr 4 (Exemplo 1) usando pró IL-18 (ICE/Xa) como o molde para a primeira reação de PCR.
[0054] Reação PCR 2: Os dois fragmentos de DNA obtidos na reação PCR 1 foram usados como moldes para a segunda reação PCR usando os iniciadores Pr 1 e Pr 4.
Mutante de E42A/K89A
[0055] Para a mutação dupla de E42A/K89A, o iniciador usado foi o mesmo que o para a preparação da mutação F-42A e cDNA de K89A mutante foi usado como o molde na reação.
[0056] Cada um dos três genes mutados de IL-18 foi ligado ao vetor BlueScript para confirmação de seqüência. A seqüência de aminoácido prevista para os mutantes do precursor IL-18E 42A, K89A e E42A/K89A é mostrada nas SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4 e SEQ ID NO:5, respectivamente. Para expressão de E. coli, cada uma das três inserções de DNA de IL-18 foi religada no vetor pPROEX HTa (GIBCO/BRL) com o uso de sítios EcoRI e Xbal. A proteína resultante é N-terminal fundida à histidina (Figura 1).
Exemplo 3
Expressão e purificação de proteína
[0057] Os precursores de mutante de IL-18 foram expressos em E. coli, afinidade purificada em virtude da lacuna de histidina e as respectivas moléculas maduras foram geradas através de clivagem proteolítica com fator Xa.
[0058] Cada um dos quatro plasmídeos pPROEX HTu/IL-18 (WT e os três mutantes) foi introduzido nas células de E. coli competentes da cepa DHQ (GIBCO/BRL) e expresso conforme descrito (11). Uma cultura de um dia para o outro de 25 ml serviu como inócuo para uma cultura de LB de 450 ml contendo 100 μg/ml de ampicilina e cresceu até atingir uma densidade de célula de 0,6-1 ΟD600. A expressão da proteína foi induzida através de tratamento com isopropiltiogalactosídeo (IPTG 0,3 mM) e a incubação continuou a 37°C com agitação por 3 horas. As células bacterianas cultivadas foram colhidas através de centrifugação (5.000 x g por 15 min a 4°C) e o pélete foi suspenso em 30 ml de tampão Talon (50 mM de NaH2PO4/20 mM de Tris-HCI/100 mM de NaCl, pH 8). As células foram lisadas através de sonificação (explosões de 2 x 30 s) em gelo. A proteína solúvel foi obtida através de centrifugação (4.000 xg por 30 min a 4°C) e aplicada a uma coluna mini-Talon de 3 ml (CLONTECH). A coluna Talon foi então lavada com 30 volumes de leito de tampão Talon e eluída com 6 ml de 100 mM de imidazol em tampão Talon. O eluente foi dializado contra tampão de fator Xa (20 mM de Tris-HCI/150 mM de NaCI/2 mM de CsCI2) a 4°C por 20 h. O 0,2 ml de His N-terminal purificado com afinidade de Talon x 6 de fusão de pró-IL18 foram incubados com 4 μg de enzima do fator Xa (New England Biolabs) por 4 h em temperatura ambiente na presença de 2 mM de fluoreto de fenilmetilsulfonila (GIBCO/BRL). A quantidade de IL-18 produzida foi monitorada por um ELISA específico (R&D Systems). A seqüência de aminoácido prevista para os mutantes de IL-18 WT, E42A, K89A e E42A/K89A maduros é mostrada nas seqüências SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:8, respectivamente.
Exemplo 4
Caracterização de proteínas mutantes de IL-18 E42A, K89A, E42A e K89A através de Western blot
[0059] Os mutantes de IL-18 purificados foram submetidos à análise Western blot com um anticorpo policlonal e um anticorpo monoclonal específico para a IL-18 madura.
[0060] Quantidades iguais de precursor purificado com afinidade com Talon e proteína madura (após clivagem pelo fator Xa), as formas de WT e IL-18 mutante, foram analisadas através de SDS/PAGE (10% de acrilamida) sob condições de redução. As proteínas foram transferidas para membranas de nitrocelulose e então incubadas com os anticorpos primários (anticorpo policlonal de IL-18 anti-humano de coelho ou clone de anticorpo monoclonal 8-31-4 (lgG2a) que foram criados contra a forma madura recombinante de IL-18 humana (Puren e outros, 1999) que também reconhece o precursor IL-18). Após 24 horas de incubação, o segundo anticorpo correspondente, peroxidase IgG anticamundongo de cabra ou anticoelho de burro (Jackson Immuno Research), foi adicionado e desenvolvido através de ECL (New England Nuclear Life Science Products).
[0061] O tingimento de prolL-18 pela IL-18 anti-humana de coelho policlonal foi de igual intensidade para a WT e cada um dos três mutantes. Similarmente, os sinais obtidos com as formas maduras de WT e IL-18 e cada um dos três mutantes usando o anti-soro policlonal eram de igual intensidade. O peso molecular aparente indicou que as formas de IL-18 diferentes eram de tamanho correto. Em contraste, quando o anticorpo monoclonal é usado, os dois mutantes K89A e E42A/K89A parecem tingir mais intensamente do que o mutante WT e o E42A, sugerindo que a afinidade do anticorpo monoclonal é maior para esses mutantes. Esses resultados sugerem que os mutantes K89A e E42A/K89A possam ter uma conformação diferente resultando em maior afinidade.
Exemplo 5
Caracterização da atividade biológica de proteínas mutantes de IL-18 E42A/K89A, E42A e K89A
[0062] As formas maduras purificadas de IL-18/ICE/Xa foram analisadas quanto à co-indução de IFN-γ em células assassinas naturais humanas (NKO descrito no Exemplo 8), em PBMCs (descrito no Exemplo 7) e quanto à indução de IL-8 em PBMCs.
[0063] A IL-18 não induz IFN-γ nessas células a menos que IL-12 (ou IL-15) seja usada como um co-estimulador. Baixas concentrações de IL-12 (1-2 ng/ml 12 (PreproTech Rocky Hill, NJ)) induziram uma pequena quantidade de IFN-γ, no entanto, tratamento com IL-12 junto com IL-18 aumenta muito a produção de IFN-γ. O IFN-γ produzido foi monitorado na célula conforme descrito no Exemplo 9. A indução de IFN-γ em células NKO por IL-18/ICE/Xs WT e IL-12 foi verificada ser comparável com aquela induzida por IL-18 humana madura recombinante resultante de processamento ICE de prolL-18 (Gu e outros, 1997) e IL-12. Os resultados indicam que a IL-18 foi corretamente montada em E. coli e corretamente processada pelo fator Xa.
[0064] Para testar a atividade da IL-18 mutada, a indução de produção de IFN-γ através de estímulo com a mutante ou IL-18 WT junto com IL-12 foi avaliada em células NKO (análises estatísticas são descritas no Exemplo 10). Conforme mostrado na Figura 3, IL-18 WT era ativa como um indutor de IFN-γ, começando em 7,5 ng/ml e aumentando progressivamente até 60 ng/ml (a maior concentração testada). Cada uma das três formas IL-18 mutadas exibiu atividade biológica mais do que aquela de WT nessas células. Por exemplo, a mutação de E42A simples era duas vezes tão ativa quanto a forma WT em cada uma das concentrações testadas. A mutação de K89A simples era quatro vezes mais ativa do que a WT em uma concentração de 7,5 ng/ml. A mutação dupla de E2A/K89A resultou na IL-18 mais ativa. Conforme mostrado na Figura 3, a IL-18 mutada_E42A induziu 600 pg/ml de IFN-γ, a atividade máxima observada pelo pré-tratamento com 60 ng/ml de IL-18 WT, em uma concentração de 30 ng/ml, o mutante K89A em uma concentração de 15 ng/ml e o mutante duplo em uma concentração de 7,5 ng/ml. Os mutantes E42A, K89A e o mutante duplo eram então 2, 4 e 8 vezes mais potentes do que a WT, respectivamente.
[0065] Resultados similares foram observados quando a produção de IFN-γ foi testada em PBMCs humanas recém-isoladas (Exemplo 7). Nessas células, a co-estimulação de IL-12 e IL-18 resultou em produção de IFN-γ, enquanto que nenhuma das duas citocinas sozinhas podia induzir IFN-γ. O mutante de E42A/K89A duplo era o mais ativo (Figura 3B).
[0066] Os resultados indicam que a substituição dos dois aminoácidos carregados Glu 42 e/ou Lys 89 pelos resíduos Ala coerentemente causa um aumento na atividade biológica de IL-18.
[0067] IL-18 é sabida induzir IL-8 em células CD14+ em preparações de PBMC (descrito no Exemplo 7). Embora a IL-18 induza a produção de IL-8 nessas células sem a necessidade de co-estimulação de IL-12, a indução de IL-8 requer concentrações maiores de IL-18 do que a indução de IFN-γ. A indução de IL-8 pela IL-18 WT e a estimulação dos mutantes de PBMCs foram então testadas. A IL-8 produzida foi monitorada no meio celular através do ensaio específico descrito no Exemplo 9. A Figura 4 mostra que embora as duas mutações únicas fossem comparáveis com a WT na indução de II-8, a IL-18 mutada dupla induziu significantemente mais IL-8 (3,5 vezes) do que a versão do tipo selvagem.
[0068] Esses resultados indicam que o mutante duplo, E42A/K89A, exibe a maior atividade biológica.
Exemplo 6
Neutralização de mutantes de IL-18 pela IL-18BP
[0069] As mutações foram criadas em resíduos previstos como sendo importantes para ligação de IL-18 através da IL-18BP inibidora. A habilidade da IL-18BP em neutralizar a atividade biológica da IL-18, por exemplo, produção de IFN-γ (Exemplo 8), foi desse modo especificamente avaliada.
[0070] Concentrações diferentes de IL-18BP (isoforma "a" de célula CHO produziu IL-18BP humana marcada em his-6 recombinante (fornecida pela Interpharm Laboratories, Ness Ziona, Israel Kim e outros, 2000)) foram pré-incubadas com IL-18 WT ou suas formas mutadas (concentração final de 30 ng/ml) e então adicionadas às culturas celulares.
[0071] Conforme mostra na Figura 4A, a concentração de 50% de inibição de IL-18BP para co-indução de IFN-γ pela IL-18 WT a partir das células NKO era de aproximadamente 15 ng/ml (supondo que nenhuma inibição aconteça em 3,7 ng/ml de IL-18BP e este valor representa 100% de atividade). A mutação simples de E42A resultou em uma concentração de inibição de dose similar pela IL-18BP.
[0072] No entanto, quando o mutante de K89A foi incubado com IL-18BP, sua habilidade em agir como co-indutor de INF-γ em células NKO foi neutralizada em um grau menor (Figura 5A). Apenas em uma concentração de 120 ng/ml uma redução estatisticamente significante na atividade podia ser observada. Em contraste, IL-18BP falhou em neutralizar o mutante de IL-18 duplo E42A/K89A.
[0073] Conforme mostrado na Figura 4B, IL-18 é mais sensível à neutralização pela IL-18BP quando testada em PBMCs ao invés de células NKO. A quantidade de IL-18BP necessária para neutralizar IL-18 WT era 3,7 ng/ml, a menor concentração testada. A mutação simples E42A se comportou similarmente à IL-18 WT, conforme estabelecido pela observação de que baixas concentrações de IL-18BP neutralizaram sua atividade biológica em PBMCs. Em contraste, a mutação simples de K89Afoi neutralizada em 120 ng/ml. Similar aos resultados referentes à neutralização de mutantes de IL-18 pela IL-18BP em células NKO, a mutação dupla de E42A/K89A foi apenas ligeiramente afetada pela IL-18BP em PBMCs.
[0074] Esses resultados mostram que o mutante E89A e o mutante duplo E42A/K89A são menos afetados pelo inibidor natural IL-18BP.
Exemplo 7
Isolamento e cultura de células mononucleares de sangue periférico (PBMCs) e indução de IFN-γ
[0075] Leucócitos residuais de plaquetoferese de plaqueta de doadores humanos saudáveis foram enxaguados do tubo de sangue e submetidos à centrifugação sobre Histopaque. PBMCs foram aspiradas da interface, lavadas três vezes em solução salina sem pirogênio (Baxter Health Care, Mundelein, IL) e ressuspensas a 5 x 106 células por ml em meio RPMI 1640 suplementado com FBS a 10% (GIBCO/BRL, Grand Island, NY). As células foram cultivadas em placas de 96 cavidades de fundo piano (Becton Dickinson) com meio RPMI 1640 apenas (controle), concentrações variantes de IL-18 humano recombinante e IL-18 WT (ICF/Xa) ou os três mutantes, na presença de 1 ng/ml de IL-12. Em alguns experimentos, preparações de IL-18 foram primeiro misturadas com polimixina Β (1 μg/ml comprado da Sigma) antes de serem adicionadas às células. As células foram incubadas por 16-20 horas a 37°C em ar umidificado com CO2 a 5%, e os sobrenadantes da cultura foram então coletados para medição de IFN-γ.
Exemplo 8
Indução de IFN-γ em Linhagem Celular NKO
[0076] A linhagem celular NK92 parenteral original foi obtida da Hans Klingerman (Gong e outros, 1994). A linhagem celular NKO humana usada nos presentes estudos era um subclone desta linhagem celular. Células NKO foram mantidas em meio RPMI 1640 suplementado contendo FBS a 10% e 50 pg/ml de IL-2 (R&D Systems) e 200 pg/ml de IL-15 (PreproTech). Para ensaios, as células NKO foram suspensas a 0,5 x 106 células por ml em meio RPMI 1640 e estimuladas em volumes de 0,2 ml em placas de 96 cavidades com 0,5 ng/ml de IL-12 (PreproTech Rocky Hill, NJ) e concentrações diferentes de IL-18 WT humana recombinante, IL-18 (ICE/Xa) ou mutantes de IL-18 E42A, K89A e E42A/X89A. Após 16-20 horas a 37°C em ar umidificado com CO2 a 5%, o sobrenadante da cultura foi coletado para medição de IFN-γ.
Exemplo 9
Análise de Citocinas
[0077] O método de eletroquimioluminescência de fase líquida (ECL) foi usado para medir IFN-γ (13) e IL-8 (12) em meio de cultura celular. A quantidade de ECL foi determinada com o uso de um analisador Origen (Igen, Gaithersburg, MD). O limite de detecção de IFN-γ e IL-8 era 62 pg/ml e 40 pg/ml, respectivamente.
Exemplo 10
Análise Estatística
[0078] Os dados são expressos como a média ±SEM. Médias de grupo foram comparadas através de ANOVA, com o uso da diferença significantemente mínima de Fisher. Significância estatística foi aceita dentro de 95% de limites de confiança. Análises ANOVA e de correlação foram realizadas com os pacotes estatísticos STATVIEW 512 + (Brain Power, Calabases, CA).
Exemplo 11
Produção dos mutantes de IL-18 madura em células CHO
[0079] Para expressão e secreção de mutantes de IL-18 madura em células CHO, a seqüência de DNA codificando a proteína madura do tipo selvagem e o mutante de IL-18BP é ligada à seqüência da seqüência de DNA do peptídeo de sinal do hormônio de crescimento humano (hGH) através de duas reações PCR similarmente às reações descritas no Exemplo 1. O molde para a primeira reação PCR para a amplificação de cada mutante de IL-18 é o constructo correspondente do Exemplo 2 com iniciador de sentido (Pr 9) contendo seqüências de sobreposição de IL-18 e peptídeo de sinal de hGH e iniciadores reversos (Pr 10) codificando pelo menos 12 nucleotídeos da IL-18, um códon de parada e um sítio para uma enzima de restrição. Para a amplificação do peptídeo de sinal de hormônio do crescimento o plasmídeo pXGH é usado como o molde com um iniciador de sentido (Pr 11) contendo um sítio para uma enzima de restrição, para os primeiros 12 nucleotídeos do peptídeo de sinal de hGH e para o iniciador reverso (Pr 12), contendo seqüências de sobreposição com o peptídeo de sinal de hGH e proteína madura IL-18. Os moldes para a segunda PCR realizada para a amplificação do fragmento codificando o peptídeo de sinal do hGH fundido à seqüência madura da IL-18 são fragmentos amplificados purificados da primeira reação de PCR e os iniciadores Pr 10 e Pr 11 contendo os sítios de restrição. O fragmento de fusão é purificado, digerido com as enzimas de restrição apropriadas e clonado para um vetor de expressão de mamífero.
[0080] Os plasmídeos são usados para transfecção de células CHO (DHFR-) junto com um plasmídeo contendo o gene DHFR de camundongo como um marcador genético. As células resistentes são isoladas em um meio seletivo e avaliadas quanto à produção de IL-18 através de um ensaio ELISA.
[0081] As células estavelmente transfectadas são submetidas a vários ciclos de amplificação de gene aumentando as concentrações de MTX. No final do processo de amplificação de gene, clones são isolados através de diluição limitante. Após subclonagem o clone que mostra produtividade específica alta e maior estabilidade de produção é selecionado para produção.
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[0082] As referências citadas acima e no relatório são aqui incorporadas a título de referência em sua totalidade.