AR127300A1 - Métodos para mejorar la fertilidad de la flor y el rendimiento de semillas - Google Patents

Abstract

Esta invención se refiere a composiciones y métodos para modificar ácidos nucleicos que codifican polipéptidos de histona demetilasa que regulan la fertilidad de la flor, el número de semillas, y/o el peso de la semilla en plantas. Reivindicación 52: Un método para producir o mejorar / reproducir una planta con edición del genoma libe de transgenes (p. ej., con edición de bases), que comprende: (a) cruzar la planta de cualquiera de las reivindicaciones 1 - 27, 34, 35, o 48 - 50 con una planta libre de transgenes, a fin de introducir la mutación o modificación en la planta que está libre de transgenes; y (b) seleccionar una planta de progenie que comprende la mutación o modificación, pero que está libre de transgenes, a fin de producir una planta con edición del genoma libre de transgenes. Reivindicación 53: Un método para crear una mutación en un gen de histona demetilasa endógeno en una planta, que comprende: (a) dirigir un sistema de edición génica a una porción del gen de histona demetilasa endógeno, donde la porción: (i) comprende una secuencia de nucleótidos que tiene por lo menos 80% de identidad de secuencia con cualquiera de SEQ ID Nº 75, 76, 78, 79, 81, 82, 84 u 85 y/o codifica una secuencia de aminoácidos que tiene por lo menos 80% de identidad con cualquiera de SEQ ID Nº 87, 88, 90, o 91, opcionalmente comprende una secuencia de nucleótidos que tiene por lo menos 80% de identidad de secuencia con cualquiera de SEQ ID Nº 75, 78, 81, u 84 y/o codifica una secuencia de aminoácidos que tiene por lo menos 80% de identidad con SEQ ID Nº 87 o SEQ ID Nº 90, y/o (ii) comprende una secuencia de nucleótidos que tiene por lo menos 80% de identidad de secuencia con cualquiera de SEQ ID Nº 77, 80, 83, u 86 y/o codifica y/o codifica una secuencia de aminoácidos que tiene por lo menos 80% de identidad con cualquiera de SEQ ID Nº 89 o 92; y (b) seleccionar una planta que comprende una modificación ubicada en la porción del gen de histona demetilasa endógeno que tiene por lo menos 80% de identidad de secuencia con cualquiera de las secuencias de nucleótidos de SEQ ID Nº 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, u 86. Reivindicación 55: Un método para generar variación en un polipéptido de histona demetilasa en una célula vegetal, que comprende: introducir un sistema de edición en una célula vegetal, donde el sistema de edición se dirige a una región de un gen de histona demetilasa en una célula vegetal; y poner en contacto la región del gen de histona demetilasa con el sistema de edición, a fin de introducir una mutación en el gen de histona demetilasa y generar variación en el polipéptido de histona demetilasa en la célula vegetal. Reivindicación 63: Un método para editar un sitio específico en el genoma de una célula vegetal, donde el método comprende: escindir, de una manera específica de sitio, un sitio objetivo dentro de un gen de histona demetilasa endógeno en la célula vegetal, donde el gen de histona demetilasa endógeno: (a) comprende una secuencia que tiene por lo menos 80% de identidad de secuencia con cualquiera de las secuencias de nucleótidos de SEQ ID Nº 69, 70, 72 o 73; y/o (b) codifica un polipéptido que comprende una secuencia que tiene por lo menos 80% de identidad de secuencia con la secuencia de aminoácidos de SEQ ID Nº 71 o SEQ ID Nº 74, de modo de generar así una edición en el gen de histona demetilasa endógeno de la célula vegetal. Reivindicación 105: Un complejo que comprende una proteína efectora CRISPR-Cas que comprende un dominio de escisión y un ácido nucleico guía, donde el ácido nucleico guía se une a un sitio objetivo en un gen de histona demetilasa que comprende una secuencia que tiene por lo menos 80% de identidad de secuencia con cualquiera de las secuencias de nucleótidos de SEQ ID Nº 69, 70, 72 o 73; o codifica un polipéptido que comprende una secuencia que tiene por lo menos 80% de identidad de secuencia con la secuencia de aminoácidos de SEQ ID Nº 71 o SEQ ID Nº 74, donde el dominio de escisión escinde una hebra objetivo en el gen de histona demetilasa. Reivindicación 109: Un ácido nucleico que codifica una histona demetilasa que tiene un sitio de unión a ADN mutado, donde el sitio de unión a ADN mutado comprende una mutación que interrumpe la unión de ADN y/o reduce la actividad de desmetilación de la histona de la histona demetilasa.