[go: up one dir, main page]

NL8401780A - Werkwijze voor het inbouwen van vreemd dna in het genoom van planten. - Google Patents

Werkwijze voor het inbouwen van vreemd dna in het genoom van planten. Download PDF

Info

Publication number
NL8401780A
NL8401780A NL8401780A NL8401780A NL8401780A NL 8401780 A NL8401780 A NL 8401780A NL 8401780 A NL8401780 A NL 8401780A NL 8401780 A NL8401780 A NL 8401780A NL 8401780 A NL8401780 A NL 8401780A
Authority
NL
Netherlands
Prior art keywords
region
plasmid
lba
agrobacterium
pral
Prior art date
Application number
NL8401780A
Other languages
English (en)
Original Assignee
Rijksuniversiteit Leiden En Pr
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Rijksuniversiteit Leiden En Pr filed Critical Rijksuniversiteit Leiden En Pr
Priority to NL8401780A priority Critical patent/NL8401780A/nl
Priority to DE8585200871T priority patent/DE3577724D1/de
Priority to AT85200871T priority patent/ATE52803T1/de
Priority to EP85200871A priority patent/EP0176112B1/en
Priority to JP60118982A priority patent/JPH0740941B2/ja
Publication of NL8401780A publication Critical patent/NL8401780A/nl
Priority to US07/449,282 priority patent/US5149645A/en

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8201Methods for introducing genetic material into plant cells, e.g. DNA, RNA, stable or transient incorporation, tissue culture methods adapted for transformation
    • C12N15/8202Methods for introducing genetic material into plant cells, e.g. DNA, RNA, stable or transient incorporation, tissue culture methods adapted for transformation by biological means, e.g. cell mediated or natural vector
    • C12N15/8205Agrobacterium mediated transformation

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)

Description

* , ·* - Werkwijze voor het inhouwen van vreemd DNA in het genoom van planten -
Het T-gebied van het Ti(tumor inducerend)- en Ri(root cf wortel inducerend)-plasmide van Agrobacterium wordt van nature overgedragen naar cellen van hogere planten, alwaar dit DNA in het genoom wordt ingebouwd en tot experssie komt. Overdracht 5 van het T-gebied of enig artificieel T-gebied treedt ook op als dit gebied in de bacterie aanwezig is op een apart· plasmide, naast een plasmide dat de essentiële virulentie genen op een Vir-gebied bevat (Het zgn. binaire vector systeem, Ned. octrooiaanvrage nr. 8300698, en tevens als onderdeel genoemd in een Ned.
10 octrooiaanvrage voor genetische manipulatie van monocotylen onder nr. 8401048). De thans beschreven verrassende, nieuwe vinding berust op een uitbreiding van het binaire vector systeem, waarbij een intact T-gebied of artificieel T-gebied als onderdeel van een transposon (Tn 1882) wordt ingebouwd in het chromosoom van 15 Agrobacterium en een Vir-gebied in de bacterie aanwezig is op een helper plasmide. Het T-gebied, ingebouwd in het bacterië-le chromosoom blijkt aldus in een binair systeem efficient naar de plantecel te worden overgedragen, alwaar het in het plante-genoom wordt geïntegreerd en tot expressie komt. Deze uitvinding 20 legt tevens vast dat het binaire systeem ook bruikbaar zal zijn indien het Vir-gebied in het bacteriële chromosoom is ingebouwd en het T-gebied aanwezig is op een plasmide of indien zowel het Vir-gebied als het T-gebied zijn ingebouwd in het bacteriële chromosoom van Agrobacterium. Met deze nieuwe vinding kunnen 8401780 -Ff - 2 - nieuwe procedures worden ontwikkeld voor de genetische manipulatie van dicotyle en monocotyle plantecellen. Nieuwe mogelijkheden voor de incorporatie van vreemd DNA in het genoom van dicotyle zowel als monocotyle plantecellen; Een binair vector systeem 5 te gebruiken in Agrobacterium waarbij- één van de componenten of beide componenten niet meer als los replicon in de bacterie aanwezig is of zijn.
De uitvinding handelt over verbeteringen in Agrobacteri-um/geicSiët voor genetische manipulatie van hogere plantecellen . 10 Een groot plasmide (Ti-plasmide), van nature aanwezig in tumorverwekkende stammen van Agrobacterium tumefaciens is verantwoordelijk voor tumorinductie op dicotyle planten (Van Larebeke et al., Nature (London) 252, 169-170 (1974); Zaenen et al., J. Mol. Biol. 86, 109-127 (1974)). Een specifiek deel van 15 het Ti-plasmide, het T-gebied genaamd, wordt door de bacterie naar de plantecel overgedragen en wordt geïntegreerd in het kern DNA (Chilton et al., Cell 11, 263-271 (1977)). Het geïntegreerde DNA komt tot expressié (Willmitzer et al., Mol. Gen Genet. 182, 255-262 (1981) en deze expressie vormt de moleculaire basis van 20 de planteziekte Crown Gall. Resulterende tumorcellen kunnen , in tegenstelling tot normale plantecellen, gekweekt worden op synthetische media zonder de toevoeging van de plantehormonen auxine en cytokinine UBraun, Proc. Natl. Acad. Sci 44, 344-349 (1958)). De tumorcellen bevatten tevens specifieke verbindingen, 25 opines genoemd, die afwezig zijn in normale cellen en waarvoor de genetische informatie gecodeerd ligt op het overgedragen T-DNA (Bomhoff et al., Mol. Gen. Genet. 145, 177-181 (1976).; Schröder et al., FEBS Lettt. 129, 166-168 (1981)1.
Behalve het T-gebied, dat in de plantecel wordt terug-30 gevonden, bevat het Ti-plasmide een tweede gebied dat essentieel is voor de virulente eigenschappen van de bacterie (Ooms et al., J. Bacteriol. 144, 82-91 (1980); Garfinkel et al., J. Bacteriol. 144, 732-743 (1980)). Dit gebied is nooit in tumorcellen aangetroffen en genetische analyses hebben aangetoond dat mutaties 8401780 - 3 - f ï in dit gebied (leidend tot sterk verzwakte virulente of complete avirulentie) intrans complementeerbaar zijn door wild type genen, aanwezig op cloons of R prime plasmides (Hille et al., Plasmid 7, 107-118 (1982); Klee et al., J. Bacteriol. 150, 327-331 (1982)}.
5 Zeven genetische loei zijn bepaald in dit Vir(virulentie)gebied, genaamd Vir A, B, C, D, E, F en D (Klee et al., J. Bacteriol.
150, 327-331 (19821; Hille et al., Plasmid 7, 107-118 (1982);
Hooykaas et al., in press (1984)).
Het Vir-gebied en het T-gebied kunnen fysisch van elkaar 10 gescheiden worden op twee compatibele plasmides zonder enig negatief effect op het vermogen van agrobacteria het T-gebied of artificieel T-gebied in de plantecel in te bouwen (Hoekema et al.,
Nature (London), 303, 179-180 (1983)) . Een op deze vinding gebaseerd binair vector systeem is bruikbaar voor de genetische 15 manipulatie van plantecellen. (beschreven in Nederlandse octrooiaanvrage nr. 8300698 en de európese aanvrage nr. 842002396, en in de Nederlandse octrooiaanvrage nr. 8401048).
De hier gepresenteerde resultaten tonen aan dat de aanwezigheid van de componenten van het binaire systeem op plasmides 20 geen essentiële voorwaarde is. De componenten (T- of Vir-gebied) kunnen apart of beide in het chromosoom van Agrobacterium geïntegreerd worden zonder enig negatief effect op de overdracht van het T-gebied of artificieel T-gebied naar de plantecel gevolgd door integratie in het plantegenoom. De uitvinding werpt niet 25 alleen een nieuw licht op het moleculair mechanisme dat de bacterie in staat stelt DNA over te dragen naar plantecellen. Zij betekent tevens een duidelijke verruiming van de mogelijkheden die het binaire systeem biedt voor genetische manipulatie van hogere 30 planten.
Met het doel de T-regio van het Ti plasmide op verschillende plaatsen in het genoom van Agrobacterium te inserteren werd in vito het transposon Tn 1882 geconstrueerd waarop het “ Jr 8401780 - 4 - f ï hele T-gebied aanwezig is. Drie restrictieenzym-fragmenten die samen het hele T-gebied omvatten nl: EcoRI fragment 19a, BamHI fragment 17a, en Kpnl fragment 9 werden apart gesubcloneerd en in een driestapselonerlhg gebruikt om het intacte T-gebied, zo-5 als hierna volgend wordt beschreven, te reconstrueren in trans-poson Tn3 (Δ5-65). Dit gebruikte transposon (Kostriken et al.,
Proc. Natl. Acad. Sci 78, 4041-4045 (1982)) is een afgeleide van Tn3 waarin een EeoRI-site is geïntroduceerd op een plaats die niet essentieel is voor transpositie van het transposon of zijn 10 ampicilline resistentie. Dit transposon werd vervolgens geinserteerd in het E coli vector plasmide pTR262 (Roberts et al., Gene 12, 123-127 (1980)) dat zelf geen EcoRI site bevat. In de unieke EcoRI site van het resulterende plasmide pRAL 3103 werd het EcoRI fragment 19a van pTiB6 gedoneerd.. In de volgende stap werd BamHi I5 fragment 17a , dat gedeeltelijk met EcoRI fragment 19a overlapt , in de natuurlijke BamHi-site geplaatst (positie 13.774 volgens Barker et al., Plant.Mol.Biol.2, 335-350 (1983)). Hiervoor werd eerst het Tn3 afgeleide transposon met daarin EcoRi fragment 19a (Tn 1880) overgezet op pRAL 3102, een plasmide waaruit d.m.v.
20 in vitro deletie de BamHi site was verwijderd.. Plasmide pRAL 3102 werd hiertoe getransformeerd naar een E.coli stam waar pAL 1155 (R 772:: Tn 1880) aanwezig was. De resulterende stam werd als donor gebruikt in een kruising naar een lege E coli stam. Selectie voor mobilisatie van pRAL 3102 door pAL 1155 leverde 2 type transconjuganten. De transconjuganten waarbij Tn 1880 naar pRAL 3102 was gesprongen werden gezuiverd door plasmide DNA te isoleren en dit DNA opnieuw te gebruiken voor transformatie van een lege E.coli stam,selecterend voor de markers van pRAL 3102 en Tn 1880. Aldus werd pRAL 3955 verkregen, waarop hét 30 transposon Tn 1880 is gelegen. In de unieke BamHi site van Tn 1880 op het plasmide pRAL 3955 werd BamHIfragment 17a in de juiste oriëntatie gedoneerd, (zie fig. 1) .Het hieruit resulterende plasmide pRAL 3956 bevat nu de T-gebied genen 3, 6a, 6b en het 84 0 1 7 B 0 ï \ - 5 - rechter deel van gen 4 als een ononderbroken stuk DNA aanwezig op een transposeerbaar element. In de unieke Kpnl site van pRAL 3956 werd vervolgens als laatste het Kpnl fragment 9 gedoneerd in de juiste oriëntatie op de natuurlijke positie (positie 9834).
5 Het aldus verkregen plasmide pRAL 3957 bevat het transposon Tn 1882 dat het intacte T-gebied van het Ti B6 plasmide omvat.
Om na te gaan of Th 1882 inderdaad een functioneel T-gebied bevatte, werden Agrobacterium stammen geconstrueerd die zowel het virulentie plasmide pAL 4404 , als een hiermee compati-10 bel plasmide waarop Tn 1882 gelegen was, bevatten. Hiertoe werd Tn 1882 geinserteerd in plasmide R772. Plasmide R772 werd ingekruist in een E.coli stam die pRAL 3957 bevatte. Doorkruisen naar een lege stam met selectie voor overdracht van de Ap van Tn 1882 geeft 2 soorten transconjuganten. Dit valt te verklaren uit het 15 gegeven dat plasmide R772 met lage frequentie pRAL 3957 gemobiliseerd kan hebben, waarbij ook de andere markers van pRAL in de transconjuganten aanwezig zijn, of Tn 1882 kan door transpositie op R772 zijn terechtgekomen. Aanwezigheid van het transposon op R772 in één van de 2 soorten transconjuganten werd vastgesteld 20 door gelelectroforese van plasmide DNA behandeld met restrictie enzymen. Het R772 plasmide met daarop Tn 1882 werd pAl 1157 genoemd. Het plasmide pAL 1157 werd vervolgens via conjugatie binnengebracht in LBA 4404 (pAL 4404). De tumorigene eigenschappen van LBA 4404 (pAL 4404, pAL 1157) bleken dezelfde als die van de wild 25 type. A.tumefaciens stam LBA 1010 voor alle geteste gastheerplan-ten. Dit resultaat liet zien dat transposon Tn 1882 een normaal functionerend T-gebied bevatte.
Voor de insertie van Tn 1882 in het chromosoom van A. tumefaciens zijn verschillende benaderingen gebruikt. Een eerste 20 benadering omvatte de constructie in E.coli van het plasmide pRAL 3958. Dit plasmide is afgeleid van pRK 2013, een conjugatief plasmide dat niet in A.tumefaciens kan repliceren. Dit betekent 9401780 ? * ' - 6 - dat in. principe pRAL 3958 (pRK 2013:: Tn 1882) gebruikt kan worden als "suicide plasmide" in A.tumefaciens, waarbij Tn 1882 kan achterblijven door transpositie naar het genoom van de Agrobacterium stam, terwijl pRAL 3958 zelf verloren gaat. Met dit doel werd 5 een E.coli stam met pRAL 3958 als donor gebruikt in een kruising met A.tumefaciens stam LBA 288, die geen Ti plasmide bevat.
R
Hoewel de resistentie marker van Tn 1882 (Ap ) goed tot expressie
R
komt in LBA 288 werd geen overdracht van de Ap marker, gevonden. Conjugatieve overdracht van pRAL 3958 binnen Ξ.coli trad op met een frequentie van 30% per recipient. Het voor Agrobacterium gevonden negatieve resultaat geeft aan dat Tn 1882 niet of nauwelijks "springt" in het genoom van A.tumefaciens.We hebben dit probleem omzeild door eerst een genomisch stuk DNA van A.tumefaciens aan te brengen op een "suicide" donor plasmide voor 15 Tn 1882. De strategie omvatte /3 stappen:(zie figuur 2) i) A.tumefaciens genomisch DNA, geïsoleerd uit LBA 288, werd gedoneerd in de E.coli vector pACYC 184. ii) in één van de cloons, namelijk pRAL 3305, werd Tn 1882 geïntroduceerd d.m.v. transpositie in E.coli, iii) het hietbij ontstane plasmide pRAL 20 3959 kan ook niet repliceren in A.tumefaciens en is dus in
Agrobacterium als "suicide" donor te gebruiken voor Tn 1882.
Daartoe werd pRAL 3959 gemobiliseerd naar LBA 288.
De Ap van de Tn 1882 kan nu niet alleen in Agrobacterium achterblijven door eventuele transpositie, maar tevens kan het hele plasmide in het genoom terecht komen door homologe recombina- tle over het gedoneerde A.tumefaciens genomisch DNA fragment.
-7
De mobilisatie naar LBA verliep met een frequentie van 10 per recipient, terwijl (ter controle) mobilisatie van dit plas- -4 mide binnen E.coli optrad met een frequentie van 10 per recipient. Uit deze resultaten blijkt dat pRAL 3959 inderdaad niet kan repliceren in A.tumefaciens. Eén van de Agrobacterium transconjugenten, LBA 1160, werd in detail geanalyseerd teneinde vast te stellen of Tn 1882 inderdaal in het chromosoom van 8401780 - 7 - Λ 'f i
Agrobacterium is ingebouwd.
Het uit Agrobacterium stam ISA 288 gedoneerde stuk genomisch DNA (pRAL 3305} kon namelijk afkomstig zijn geweest van zowel het chromosoom als van het cryptisch plasmide pAt C58 5 dat aanwezig is in LBA 288. Het is daardoor ook mogelijk dat een eventuele recombinatie van pRAL 3959 in LBA 1160 kon zijn opgetreden met zowel het chromosoom als met pAtC58. Stam LBA 1160 werd genetisch gekarakteriseerd ( i en ii) en het DNA van de stam werd geanalyseerd m.b.v. Southern blot hybridisatie (iii) 10 om onderscheid te kunnen maken tussen beide mogelijkheden i} Door random transposon mutagenese werd het cryptisch plasmide pAtC58 van eei selecteerbare marker voorzien. Hiertoe werd het "suicide" plasmide pJB4ji als Tn 5 donor gebruikt voor LBA 288, zoals werd beschreven voor mutagenese van Rhizobium 15 leguminosarum (Berlinger et al., Nature (London), 276, 633-634 (1978}). Via conjugatie experimenten werd aangetoond dat in een aantal gevallen Tn 5 in LBA 288 aanwezig was op een zelfover- draagbaar plasmide. Dit plasmide bleek pAtC58 (overdrachtfrequen--7 tie 10 per recipient). Deze nieuw gevonden eigenschap van 20 pAtC58 om zichzelf te kunnen overdragen werd benut om te bepalen of Tn 1882 in LBA 1160 aanwezig was op pAtC58 of niet. Hiertoe werden ter onderlinge vergelijking LBA 1160 en LBA 1201 (pAtC58::
Tn 5) beide als donor stammen gebruikt in kruisingen met LBA 285. Na selectie op transconjuganten bleek pAtC58::Tn 5 , zoals -7 25 verwacht, overgedragen to worden met een frequentie van 10 per
R
recipient. Geen overdracht van de Ap van Tn 1882 uit LBA 1160 kon echter worden aangetoond. Dit gegeven vormde een sterke aanwijzing voor de veronderstelling dat Tn 1882 in de donor stam LBA 1160 niet aanwezig was op het cryptisch plasmide pAtC58.
33 ii) Plasmiden die niet stabiel in één bacteriecel ge handhaafd kunnen worden zonder dat selectieve druk wordt uitgeoefend, behoren tot eenzelfde incompatibiliteitsklasse (inc.) A fortiori zijn dus plasmides incompatibel met zichzelf. Wanneer 8401780 ί ·
- 8 -R
een Τη 5 gemarkeerd pAtC58 (Km ) geïntroduceerd wordt i,n een A.
£ tumefaciens stam met een Tn 1831 gemarkeerd pAtC58 (Sp ) en er wordt geselecteerd op het binnenkomend plasmide (Km ) dan levert dat
R
verlies op van de Sp marker door imcompatibiliteit, dus verdrijving 5 van het reeds aanwezige plasmide, in het grootste deel van de transconjuganten. LBA 1160 werd derhalve nu gebruikt als recipient in een kruising met LBA 1201 (pAtC58:: Tn5) als donor.
R
Er werd geselecteerd (Km ] op het binnenkomend plasmide pAtC58::Tn5 en in de transconjuganten werd gecontroleerd of de Ap , afkomstig 10 van Tn 1882, verloren was gegaan door incompatibiliteit. Het
R R
bleek nu dat alle Km transconjuganten hun Ap hadden behouden, hetgeen wederom een sterke aanwijzing was dat Tn 1882 niet op pAtC58 gelegen is in LBA 1160.
iii) Definitief bewijs voor de plaats van Tn 1882 in 15 LBA 1160 werd verkregen via Southern blot hybridisatie experimenten waarmee ruwe plasmide preparaten van LBA 288, LBA 1201 en LBA 116o werden geanalyseerd. De ruwe plamside preparaten (geisoleerd vgl. . Casse et al., J. Gen. Microbiol. 113, 229-242 (1979)1 werden in hun componenten gescheiden op agarose gels. De componenten die als 20 banden in de gel aanwezig zijn werden direkt uit de gels overgebracht op nitrocellulose fieters (zgn. blot-procedure) en daarna gehy-bridiseerd met een aantal specifieke radioactief gelabelde DNA probes . Een controle Tn 5-probe hybridiseerde met de zgn. super-coil DNA band van pAtC58:: Tn5, en met de lineaire DNA band, 25 waarin naast afgebroken chromosomaal DNA ook afgebroken pAtC58::
Tn5 DNA aanwezig is, van de blot. Wanneer Tn3 , het uitgangsmateriaal voor Rn 1882 als radioactieve probe werd gebruikt werd géén hybridisatie met pAtC58, dat aanwezig is in LBA 1160, gevonden.
Uit de bovenstaande gegevens hebben wij dan ook kunnen concluderen 30 dat Tn 1882 en daarmee het gehele T-gebied van pTi B6 aanwezig
is in het chromosoom van LBA 1160. Southern blot hybridisaties, die uitgevoerd werden met blots waarop aanwezig was het totaal DNA
8401780 - 9 - /ζ ** f % van LBA 1160, gefragmenteerd met een aantal restrictieenzymen, en waarbij pRAL 3305 en pOTY 8 als gelabelde probes werden gebruikt bevestigden de correcte interne organisatie van het T-gebied van de Tn 1882 insertie in LBA 1160. (structuur als getekend in 5 fig. 3).
De stabiliteit van de insertie van pRAL 3959, waarop Tn 1882 is gelegen, in het chromosoom van DBA 1160 werd nagegaan door de bacteriën gedurende ca. 100 generaties te groeien zonder selectie-druk en te controleren of de resistentiemarkers van pRAL 3959 10 (TcE en ApE) behouden bleven. Geen verlies van markers werd gedetecteerd.
LBA 1160 bevat dus het T-gebied stabiel ingebouwd in het chromosoom. Door nu de oncoteniciteit van de door ons verkregen geheel nieuwe constructie te testen werden de eveneens noodzakelijke virulentiefuncties (Vir-gebied) geïntroduceerd, via R-prime plasmiden (pAL 18118 en pAL 1819] in de stam LBA 1160. Plasmide pAL 1818 bevat de vir genen A,B,C,D,E, en O en pAL 1819 bevat de vir genen A t/m F en O. Na conjugatie van LBA 1160 met stammen die de R-primes bevatten en selectie van transconjuganten ontstonden 20 LBA 1161 Cdit is LBA 1160 (pAL 1818Q en LBA 1162 tdit is LBA 1160 (pAL 1819)1 . Deze stammen en de ouderstammen LBA 1160 zowel als LBA 1818 (pAL 1818) en LBA 1819 (pAL 1819) werden getest op hun tumor-inducerend vermogen op een aantal verschillende soorten planten.
Zowel LBA 1160 als LBA 1818 en 1819 bevatten slechts één van de 25 componenten van het binair systeem en gaven dan ook geen aanleiding' tot tumoren. Echter de LBA 1160 stammen met een virulentie plasmide (de genoemde R-primes) gaven verrassenderwijs aanleiding tot tumorvorming op alle geteste planten. Gedrag en grootte van de tumoren waren geheel overeenkomstig met die van tumoren geïnduceerd ^ door wild type Agrobacterium stammen. Het T-gebied van het Ti plasmide kan dus vanuit het chromosoom van Agrobacterium m.b-v.
Vir-gebied normaal geïntroduceerd worden in het genoom van de hogere plantecel.
8401780 r · - 10 -
De hier beschreven waarnemingen zijn van groot belang voor het leren begrijpen van het mechanisme waarmee Agrobacterium zijn T-gebied overdraagt naar de plantecel. De verrassende vinding dat het T-gebied ook wanneer het aanwezig is in het chromosoom ^ van Agrobacterium normaal wordt overgedragen maakt het zeer onwaarschijnlijk dat, wat vroeger wel werd aangenomen, het gehele Ti plasmide in de plantecel wordt gebracht tijdens de infectie en daar t.b.v. integratie van T-DNA wordt „geprocessed". Mede op grond van deze resultaten postuleren we dan ook dat herkenning en 1 n u excisie van het T-DNA door virulentie genen binnen de bacterie plaatsvindt als een van de vroege stappen in het tumorinductie-proces. De zgn. bordersequenties, die het T-gebied flaneren, zouden hierbij als herkenningssignalen kunnen optreden.
Naast dit fundamenteel wetenschappelijk belang opent 15 deze nieuwe vinding nieuwe wegen voor de genetische manipulatie van hogere plantecellen. De nieuwheid van deze vinding en zijn gebruiksmogelijkheden kan het best worden toegelicht aan de hand van figuur 4. Een T-gebied en het Vir-gebied, die gescheiden op 2 aparte plasmiden, aanwezig zijn, zijn nog steeds in staat om een 20 T-gebied of een artificieel T-gebied (en daarin geinserteerd vreemd DNA) over te dragen naar de plantecel, alwaar het in het genoom wordt geïntegreerd en tot expressie komt. Met behulp van dit zgn.
binaire vector systeem kunnen zowel dicotyle alsmonocotyle plantecellen voorzien worden van nieuw genetisch materiaal (fig.
25 4a). Stammen met alleen het Vir-gebied of alleen een T-gebied op een plasmide (fig. 4b) of in het chromosoom (fig. 4c) geven geen aanleiding tot transformatie van plantecellen. Met de nieuwe vinding is aangetoond dat een T-gebied, geinserteerd in het chromosoom, nog normaal wordt overgedragen naar plantecellen in” 30 een binair systeem waarbij een Vir-gebied op een apart plasmide aanwezig is (fig. 4d) . Door deze verrassende vinding wordt tevens vastgelegd dat indiai Agrobacteria eem T-gebied of een Vir-gebied of beide componenten, niet op extrachromosomale replicons 84 0 1 7 3 0 ¥ £ - 11 - (plasmiden) hebben, zitten, maar geinserteerd in het chromosoom, (situaties als geschetst in fig. 4D,E en Έ) zij toch op efficiënte wijze een T-gebied of artificieel T-gebied in het plantegenoom inbouwen, zodat de claims als neergelegd in de Europese octrooi-
C
aanvragen 842002396 en 8401048 ook van toepassing zijn op deze nieuwe situaties- Dergelijke Agrobacteria kunnen gebruikt worden voor de genetische manipulatie van dicotyle zowel als monocotyle plantecellen (Ned. octrooiaanvrage 8401048)- 8401780 - 12 - TABEL 1
Gebruikte plasmides en bacteriestammen
PLASMIDES RESISTENTIE SPECIFICATIES BRON
MARKERS
pOTY 8 Ap Hirsch pRAL 3101 CmKm pACYC 184 afgeleide bevattend unieke
Kpnl-site deze pu blicatie pRAL 3102 Cm pACYC 184 zender BamHI site " " pRAL 3103 ApTd pTR 262: :Tn 3 (&5-6S) " " pRAL 3305 Tc pACYC 184 met 1600 bp chromosomaal
EcoRi DNA fragment " " pRAL 3910 ApEm pBR325, gedoneerd pTiB6 EcoRI fragment 19a " "
pRAL 3911 Ap pBR313 waarin gedoneerd pTiB6 BamHI
fragment 17a " " pRAL 3921 Cm pRAL 3101, waarin gedoneerd pTiB6 Kpnl fragment 9 " " pRAL 3945 'ApTc pTR262:: Tn 1880 " " pRAL 3955 ApCm pRAL 3102:: Tn 1880 " "
pRAL 3956 ApCm pRAL3955 waarin gedoneerd pTiB6 BamHI
fragment 17a " " pRAL 3957 ApCm pRAL3956 waarin gedoneerd pTiB6 Kpnl fragment 9 " " pRAL 3958 ApKm pRK20l3:: Tn 1882 " " pRAL 3959 ApTc pRAL 3305:: Tn 1882 " " pAL 1155 ApKm R772:: Tn 1880 " " pAL 1157 ApKm R772:: TN 1882 " " R772 Km Hedges pRK 2013 Km Figurski 8401780 - 13 - E.coli stammen relevante Specificatie Bron markers KMBL 1164 Pro Thi vd Putte _ £ HP 3435 Bio Rif Pannekoek 5 A. tumefaciens stammen LBA 285 Spc LBA 288 Rif LBA 1010 RifR pTiB6
10 R
LBA 1160 Rif ApTc. LBA 288; Tn 1882 in het hier be schreven chromosoom.
LBA 1161 RifR ApTc LBA 1160 (pAL 1818)
R
LBA 1162 Rif ApTc LBA 1160 (pAL 1819) LBA 1201 Km pAtC58 :: " " 15 R Tll5‘ LBA 1223 KmSpc LBA 285 (pAtC58:: " "
Tn5) .
LBA 1224 Rif ApKmTc LBA 1160 (pAtC58:: " "
Tn5) .
LBA 1818 pAL 1818 20 LBA 1819 pAL 1819 LBA 4404 RifR pAL 4404 LBA 4434 RifR ApKm LBA 4404 (pAL 1050) LBA 4440 RifR ApKm LBA 4404 (pAL 1157) 8401780

Claims (5)

1. Werkwijze voor het inhouwen van vreemd DNA in het genoom van planten door planten of daarvan genomen explantaten of planteprotoplasten te infecteren of planteprotoplasten te incuberen met Agrobacterium, 5 met het kenmerk, dat Agrobacteriën worden gebruikt, die in hun erfelijk materiaal één of meer T-gebieden en een Vir-gebied afkomstig uit het Ti-plasmide van Agrobacterium bevatten en/of één of meer T-gebieden bestaande uit een kunstmatig T-gebied dat is opgebouwd uit elk gewenst DNA geflankeerd door bolder 10 sequenties, zoals aanwezig in het wild type T-gebied van Agrobacterium of daaraan functioneel analoog zijnde sequenties.
2. Werkwijze volgens conclusie 1, met het kenmerk, dat Agrobacteriën worden gebruikt, waarbij één 15 of meer T-gebieden of een Vir-gebied of beide in het bacteriële chromosoom is (zijn) ingebouwd.
3. Agrobacteriën met in hun DNA's zowel een of meer T-gebieden als een Vir-gebied, daardoor gekenmerkt, 20 dat het T-gebied of het Vir-gebied of beide in het bacteriële chromosoom zijn ingebouwd.
4. Werkwijze ter verkrijging van Agrobacteriën volgens conclusie 3, met een T-gebied in het bacteriële 25 chromosoom met het kenmerk, dat men in Escherichia coli bacteriën met een T-gebied in een "vector DNA-molekuul, dat de eigenschap heeft stabiel te integreren in Agrobacterium chromosoom, vreemd DNA inbouwt in het T-DNA waarna meri het aldus gemodificeerde vector DNA-molekuul uit de E. coli bacteriën verwijdert en doet 30 integreren in het Agrobacterium chromosoom. 8401780 Λ V* — /$“- - 2 -
5. Werkwijze volgens conclusie 4, dat het vector DNA-molekuul een plasmide is, dat als zodanig niet kan voortbestaan in Agrobacteriën (een zgn suicide plasmide is) maar wel geïntegreerd in het genoom daarvan en dat na de 5 modificatie met behulp van een van een R-plasmide afgeleid plasmide wordt gemobiliseerd van E. coli-naar Agrobacteriën. « 3401780
NL8401780A 1984-06-04 1984-06-04 Werkwijze voor het inbouwen van vreemd dna in het genoom van planten. NL8401780A (nl)

Priority Applications (6)

Application Number Priority Date Filing Date Title
NL8401780A NL8401780A (nl) 1984-06-04 1984-06-04 Werkwijze voor het inbouwen van vreemd dna in het genoom van planten.
DE8585200871T DE3577724D1 (de) 1984-06-04 1985-06-03 Verfahren zum einbringen einer fremden dns in pflanzengenome.
AT85200871T ATE52803T1 (de) 1984-06-04 1985-06-03 Verfahren zum einbringen einer fremden dns in pflanzengenome.
EP85200871A EP0176112B1 (en) 1984-06-04 1985-06-03 Process for introducing foreign dna into genome of plants
JP60118982A JPH0740941B2 (ja) 1984-06-04 1985-06-03 植物ゲノムへの外来性dnaの導入方法
US07/449,282 US5149645A (en) 1984-06-04 1989-12-05 Process for introducing foreign DNA into the genome of plants

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
NL8401780 1984-06-04
NL8401780A NL8401780A (nl) 1984-06-04 1984-06-04 Werkwijze voor het inbouwen van vreemd dna in het genoom van planten.

Publications (1)

Publication Number Publication Date
NL8401780A true NL8401780A (nl) 1986-01-02

Family

ID=19844039

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
NL8401780A NL8401780A (nl) 1984-06-04 1984-06-04 Werkwijze voor het inbouwen van vreemd dna in het genoom van planten.

Country Status (5)

Country Link
EP (1) EP0176112B1 (nl)
JP (1) JPH0740941B2 (nl)
AT (1) ATE52803T1 (nl)
DE (1) DE3577724D1 (nl)
NL (1) NL8401780A (nl)

Families Citing this family (56)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6664109B2 (en) 1985-01-17 2003-12-16 Calgene Llc Transformation system with Ti or Ri plasmid
NL8502948A (nl) * 1985-10-29 1987-05-18 Rijksuniversiteit Leiden En Pr Werkwijze voor het inbouwen van "vreemd dna" in het genoom van dicotyle planten.
US5543576A (en) * 1990-03-23 1996-08-06 Mogen International Production of enzymes in seeds and their use
US7033627B2 (en) 1990-03-23 2006-04-25 Syngenta Mogen B.V. Production of enzymes in seeds and their use
US5593963A (en) * 1990-09-21 1997-01-14 Mogen International Expression of phytase in plants
DK0604662T3 (da) * 1992-07-07 2008-10-20 Japan Tobacco Inc Fremgangsmåde til transformering af monocotyledon
US7060876B2 (en) 1992-07-07 2006-06-13 Japan Tobacco Inc. Method for transforming monocotyledons
US6350934B1 (en) 1994-09-02 2002-02-26 Ribozyme Pharmaceuticals, Inc. Nucleic acid encoding delta-9 desaturase
US6586661B1 (en) 1997-06-12 2003-07-01 North Carolina State University Regulation of quinolate phosphoribosyl transferase expression by transformation with a tobacco quinolate phosphoribosyl transferase nucleic acid
US6183959B1 (en) 1997-07-03 2001-02-06 Ribozyme Pharmaceuticals, Inc. Method for target site selection and discovery
CA2427825A1 (en) 2000-11-07 2002-05-16 North Carolina State University Putrescine-n-methyltransferase promoter
US10266836B2 (en) 2001-11-13 2019-04-23 U.S. Smokeless Tobacco Company Llc Tobacco nicotine demethylase genomic clone and uses thereof
US8592663B2 (en) 2001-11-13 2013-11-26 U.S. Smokeless Tobacco Company Llc Tobacco nicotine demethylase genomic clone and uses thereof
US7700851B2 (en) 2001-11-13 2010-04-20 U.S. Smokeless Tobacco Company Tobacco nicotine demethylase genomic clone and uses thereof
US7700834B2 (en) 2001-11-13 2010-04-20 U.S. Smokless Tobacco Company Nicotiana nucleic acid molecules and uses thereof
US7812227B2 (en) 2001-11-13 2010-10-12 U.S. Smokeless Tobacco Company Cloning of cytochrome p450 genes from nicotiana
CN1684974A (zh) 2002-06-28 2005-10-19 美国陶氏益农公司 可获自类芽孢杆菌种的杀虫活性蛋白质及多核苷酸
AP2005003286A0 (en) 2002-10-16 2005-06-30 Us Smokeless Tobacco Co Cloning of cytochrome p450 genes from nicotiana
US8637731B2 (en) 2003-10-16 2014-01-28 U.S. Smokeless Tobacco Company Nicotiana nucleic acid molecules and uses thereof
ZA200602938B (en) 2003-10-16 2008-06-25 Us Smokeless Tobacco Company Cloning of cytochrome p450 genes from Nicotiana
US8586837B2 (en) 2004-04-29 2013-11-19 U.S. Smokeless Tobacco Company Llc Nicotiana nucleic acid molecules and uses thereof
PL2295549T3 (pl) 2004-04-29 2015-10-30 U S Smokeless Tobacco Company Llc Cząsteczki kwasu nukleinowego Nicotiana i ich zastosowanie
PT1740039E (pt) 2004-04-30 2012-08-27 Dow Agrosciences Llc Novos genes de resistência a herbicida
WO2006091194A1 (en) 2005-02-23 2006-08-31 North Carolina State University Alteration of tobacco alkaloid content through modification of specific cytochrome p450 genes
CN103361316B (zh) 2005-10-28 2017-05-17 美国陶氏益农公司 新除草剂抗性基因
US8319011B2 (en) 2006-12-15 2012-11-27 U.S. Smokeless Tobacco Company Llc Tobacco plants having reduced nicotine demethylase activity
US11332753B2 (en) 2006-12-15 2022-05-17 U.S. Smokeless Tobacco Company Llc Tobacco plants having reduced nicotine demethylase activity
CA2686835C (en) 2007-05-09 2020-04-21 Dow Agrosciences Llc Novel herbicide resistance genes
CN101730712B (zh) 2007-06-08 2015-04-08 墨西哥国立大学 使用不需要钙黏着蛋白受体的毒素遏制昆虫对苏云金芽孢杆菌cry毒素的抗性
WO2009064771A2 (en) 2007-11-12 2009-05-22 North Carolina State University Alteration of tobacco alkaloid content through modification of specific cytochrome p450 genes
CA2755639C (en) 2009-03-19 2018-09-25 Martek Biosciences Corporation Polyunsaturated fatty acid synthase nucleic acid molecules and polypeptides, compositions, and methods of making and uses thereof
CA2758885C (en) 2009-04-17 2018-09-11 Dow Agrosciences Llc Dig-3 insecticidal cry toxins
AU2011205282B2 (en) 2010-01-15 2014-10-02 North Carolina State University Compositions and methods for minimizing nornicotine synthesis in tobacco
MX2012012371A (es) 2010-04-23 2014-02-27 Dow Agrosciences Llc Combinaciones que incluyen proteinas cry3aa y cry6aa para prevenir el desarrollo de resistencia en gusanos de la raiz de maiz (diabrotica spp.).
US9234208B1 (en) 2010-05-10 2016-01-12 Dow Agrosciences Llc DIG-13 insecticidal cry toxins
RU2611188C2 (ru) 2010-07-29 2017-02-21 ДАУ АГРОСАЙЕНСИЗ ЭлЭлСи Штаммы agrobacterium, модифицированные для увеличения частоты трансформации растений
WO2012030714A2 (en) 2010-08-30 2012-03-08 Agrigenetics, Inc. Activation tagging platform for maize, and resultant tagged population and plants
JP2014515596A (ja) 2011-02-28 2014-07-03 ノース カロライナ ステイト ユニヴァーシティ タバコ近交系植物ncbex1f、ncbex1ms、及びncex90
JP2014511184A (ja) 2011-02-28 2014-05-15 アルトリア クライアント サービシーズ インコーポレイテッド タバコ近交系植物albex1f及びalbex1ms
UY34014A (es) 2011-04-15 2012-11-30 Dow Agrosciences Llc Genes sintéticos para expresar proteínas en células de maíz, construcciones, plantas transgénicas, métodos para controlar pestes y composiciones
BR112014026203A2 (pt) 2012-04-23 2017-07-18 Bayer Cropscience Nv engenharia do genoma direcionado nas plantas
CA2884256C (en) 2012-08-17 2021-08-03 Dow Agrosciences Llc Use of a maize untranslated region for transgene expression in plants
AR092482A1 (es) 2012-09-07 2015-04-22 Dow Agrosciences Llc Enriquecimiento de la clasificacion de las celulas activadas por fluorescencia (facs) para generar plantas
EP2943059A1 (en) 2013-01-11 2015-11-18 North Carolina State University Tobacco inbred plants k326 src, cms k326 src, k346 src, cms k346 src, nc1562-1 src, nctg-61 src, cms nctg-61 src and hybrid nc196 src
EP2964016A1 (en) 2013-03-05 2016-01-13 North Carolina State University Tobacco inbred and hybrid plants and uses thereof
CN106659232A (zh) 2014-03-03 2017-05-10 北卡罗莱纳州立大学 烟草近交和杂种植物以及由其制得的烟草产品
US9596823B2 (en) 2014-03-03 2017-03-21 North Carolina State University Tobacco inbred and hybrid plants and tobacco products made thereof
WO2015134438A1 (en) 2014-03-03 2015-09-11 North Carolina State University Tobacco inbred and hybrid plants and tobacco products made thereof
AR099800A1 (es) 2014-03-21 2016-08-17 Agrigenetics Inc Cry1d para controlar el gusano de la mazorca del maíz
KR20170099907A (ko) 2014-12-30 2017-09-01 다우 아그로사이언시즈 엘엘씨 곤충 해충의 방제에 유용한 변형된 Cry1Ca 독소
JP2018529652A (ja) 2015-08-17 2018-10-11 ダウ アグロサイエンシィズ エルエルシー 操作されたcry6a殺虫性タンパク質
CN109196105B (zh) 2016-03-24 2022-08-05 莱顿大学 转染植物和减少随机整合事件的方法
US20190225974A1 (en) 2016-09-23 2019-07-25 BASF Agricultural Solutions Seed US LLC Targeted genome optimization in plants
EP3502259A1 (en) 2017-12-19 2019-06-26 Universiteit Leiden A combinational strategy for reducing random integration events when transfecting plants
EP3898988A1 (en) 2018-12-20 2021-10-27 Benson Hill, Inc. Pre-conditioning treatments to improve plant transformation
WO2021260632A1 (en) 2020-06-24 2021-12-30 Benson Hill, Inc. Plant cell treatments to improve plant transformation

Also Published As

Publication number Publication date
JPS6152294A (ja) 1986-03-14
DE3577724D1 (de) 1990-06-21
ATE52803T1 (de) 1990-06-15
JPH0740941B2 (ja) 1995-05-10
EP0176112B1 (en) 1990-05-16
EP0176112A1 (en) 1986-04-02

Similar Documents

Publication Publication Date Title
NL8401780A (nl) Werkwijze voor het inbouwen van vreemd dna in het genoom van planten.
US5149645A (en) Process for introducing foreign DNA into the genome of plants
OoNo et al. SHORT PAPER The TL-DNA gene of Ri plasmids responsible for dwarfness of tobacco plants
DK173104B1 (da) Vektorkombination, acceptor-Ti-plasmid, intermediær kloningsvektor, fremgangsmåde til fremstilling af et hybridt Ti-plasmid
Briddon et al. The coat protein of beet curly top virus is essential for infectivity
US5668298A (en) Selectable marker for development of vectors and transformation systems in plants
Shaw et al. A general method for the transfer of cloned genes to plant cells
JP2523468B2 (ja) 双子葉植物の染色体への外来性遺伝子の導入方法
Hoekema et al. Delivery of T‐DNA from the Agrobacterium tumefaciens chromosome into plant cells
Phelep et al. Transformation and regeneration of a nitrogen-fixing tree, Allocasuarina verticillata Lam.
EP0870043A1 (en) Enhancer-increased gene expression in plants
Thomas et al. Genetic transformation of Medicago truncatula using Agrobacterium with genetically modified Ri and disarmed Ti plasmids
JPS6070080A (ja) 双子葉植物の染色体への外来性dνaの組込方法
Haymes et al. Agrobacterium-mediated transformation ofAlpine'Fragaria vesca, and transmission of transgenes to R1 progeny
CA1340766C (en) Selectable marker for development of vectors and transformation systems in plants
WO1986003776A1 (en) Process for preparing genetically stably transformed monocotyledonous plant cells
Hansen et al. Phenotypic effects of overexpression of Agrobacterium rhizogenes T‐DNA ORF13 in transgenic tobacco plants are mediated by diffusible factor (s)
Jen et al. Activity of T-DNA borders in plant cell transformation by mini-T plasmids
EP0224287A1 (en) A process for the incorporation of foreign DNA into the genome of dicotyledonous plants
Kishimoto et al. Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation of Elatior Begonia (Begonia× hiemalis Fotsch)
EP1781082A2 (en) Biological gene transfer system for eukaryotic cells
Kodama et al. Transgenic roots produced by introducing Ri-rol genes into cucumber cotyledons by particle bombardment
Schaart et al. Some methodological aspects of apple transformation by Agrobacterium
Tanaka et al. Agrobacterium rhizogenes-mediated transformation and regeneration of Vinca minor L.
US20050289667A1 (en) Biological gene transfer system for eukaryotic cells

Legal Events

Date Code Title Description
A1B A search report has been drawn up
BV The patent application has lapsed