MX2011001741A - Polipeptidos y polinucleotidos aislados utiles para mejorar la eficacia en el uso de nitrogeno tolerancia al estres abiotico, rendimiento y biomasa en plantas. - Google Patents
Polipeptidos y polinucleotidos aislados utiles para mejorar la eficacia en el uso de nitrogeno tolerancia al estres abiotico, rendimiento y biomasa en plantas.Info
- Publication number
- MX2011001741A MX2011001741A MX2011001741A MX2011001741A MX2011001741A MX 2011001741 A MX2011001741 A MX 2011001741A MX 2011001741 A MX2011001741 A MX 2011001741A MX 2011001741 A MX2011001741 A MX 2011001741A MX 2011001741 A MX2011001741 A MX 2011001741A
- Authority
- MX
- Mexico
- Prior art keywords
- plant
- blastp
- gbl64
- acid sequence
- rice
- Prior art date
Links
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 title claims abstract description 414
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 title claims abstract description 207
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 title claims abstract description 203
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 title claims abstract description 203
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 title claims abstract description 203
- 239000002028 Biomass Substances 0.000 title claims abstract description 103
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 title claims abstract description 80
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 title claims abstract description 80
- 230000036579 abiotic stress Effects 0.000 title claims abstract description 79
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 title claims abstract description 79
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 title claims abstract description 60
- 230000012010 growth Effects 0.000 claims abstract description 158
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 118
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 claims abstract description 77
- 239000003337 fertilizer Substances 0.000 claims abstract description 75
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims abstract description 58
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 44
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 23
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 23
- 235000018343 nutrient deficiency Nutrition 0.000 claims description 17
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 claims description 15
- 238000013518 transcription Methods 0.000 claims description 10
- 230000035897 transcription Effects 0.000 claims description 10
- 229910001385 heavy metal Inorganic materials 0.000 claims description 6
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 claims description 3
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 claims description 3
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 7
- 230000027772 skotomorphogenesis Effects 0.000 claims 1
- 238000009281 ultraviolet germicidal irradiation Methods 0.000 claims 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 616
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 279
- 240000007594 Oryza sativa Species 0.000 description 190
- 235000007164 Oryza sativa Nutrition 0.000 description 190
- 235000009566 rice Nutrition 0.000 description 188
- 235000007688 Lycopersicon esculentum Nutrition 0.000 description 172
- 240000003768 Solanum lycopersicum Species 0.000 description 172
- 229920000742 Cotton Polymers 0.000 description 123
- 241000219146 Gossypium Species 0.000 description 120
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 109
- 240000008042 Zea mays Species 0.000 description 101
- 235000002017 Zea mays subsp mays Nutrition 0.000 description 100
- 239000003921 oil Substances 0.000 description 91
- 235000019198 oils Nutrition 0.000 description 90
- 241000219194 Arabidopsis Species 0.000 description 84
- 244000062793 Sorghum vulgare Species 0.000 description 80
- 235000011684 Sorghum saccharatum Nutrition 0.000 description 77
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 76
- 235000016383 Zea mays subsp huehuetenangensis Nutrition 0.000 description 68
- 235000009973 maize Nutrition 0.000 description 68
- 244000068988 Glycine max Species 0.000 description 65
- 235000010469 Glycine max Nutrition 0.000 description 64
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 63
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 51
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 45
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 45
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 44
- 101000630833 Homo sapiens Synaptonemal complex central element protein 1 Proteins 0.000 description 40
- 102100026392 Synaptonemal complex central element protein 1 Human genes 0.000 description 40
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 40
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 38
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 38
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 35
- 101000894428 Homo sapiens Transcriptional repressor CTCFL Proteins 0.000 description 34
- 102100021393 Transcriptional repressor CTCFL Human genes 0.000 description 34
- 235000005824 Zea mays ssp. parviglumis Nutrition 0.000 description 32
- 235000005822 corn Nutrition 0.000 description 32
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 31
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 31
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 31
- 241000219000 Populus Species 0.000 description 30
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 30
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 29
- 240000005979 Hordeum vulgare Species 0.000 description 28
- 235000007340 Hordeum vulgare Nutrition 0.000 description 28
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 27
- CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L Magnesium sulfate Chemical compound [Mg+2].[O-][S+2]([O-])([O-])[O-] CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 27
- 235000013339 cereals Nutrition 0.000 description 27
- 238000011161 development Methods 0.000 description 27
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 27
- 239000000047 product Substances 0.000 description 26
- 241000209140 Triticum Species 0.000 description 24
- 235000021307 Triticum Nutrition 0.000 description 24
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 24
- 241000208125 Nicotiana Species 0.000 description 22
- 235000002637 Nicotiana tabacum Nutrition 0.000 description 22
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 21
- 101100521334 Mus musculus Prom1 gene Proteins 0.000 description 20
- 108700005078 Synthetic Genes Proteins 0.000 description 20
- 230000035882 stress Effects 0.000 description 20
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 19
- 241000220225 Malus Species 0.000 description 17
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 17
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 17
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 17
- 235000004977 Brassica sinapistrum Nutrition 0.000 description 16
- 240000006365 Vitis vinifera Species 0.000 description 16
- 235000014787 Vitis vinifera Nutrition 0.000 description 16
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 16
- 238000003306 harvesting Methods 0.000 description 16
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 16
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 16
- 102100023189 Armadillo repeat-containing protein 3 Human genes 0.000 description 15
- 235000003222 Helianthus annuus Nutrition 0.000 description 15
- 101000684962 Homo sapiens Armadillo repeat-containing protein 3 Proteins 0.000 description 15
- 241000219823 Medicago Species 0.000 description 15
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 15
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 15
- FGIUAXJPYTZDNR-UHFFFAOYSA-N potassium nitrate Chemical compound [K+].[O-][N+]([O-])=O FGIUAXJPYTZDNR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 15
- 239000002689 soil Substances 0.000 description 15
- 235000006008 Brassica napus var napus Nutrition 0.000 description 14
- 240000000385 Brassica napus var. napus Species 0.000 description 14
- 241000208818 Helianthus Species 0.000 description 14
- 241000208822 Lactuca Species 0.000 description 14
- 235000003228 Lactuca sativa Nutrition 0.000 description 14
- 241001520808 Panicum virgatum Species 0.000 description 14
- 241001506137 Rapa Species 0.000 description 14
- 108091027544 Subgenomic mRNA Proteins 0.000 description 14
- 235000009754 Vitis X bourquina Nutrition 0.000 description 14
- 235000012333 Vitis X labruscana Nutrition 0.000 description 14
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 description 14
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 14
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 14
- 229910052943 magnesium sulfate Inorganic materials 0.000 description 14
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 14
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 14
- 235000014698 Brassica juncea var multisecta Nutrition 0.000 description 13
- 235000006618 Brassica rapa subsp oleifera Nutrition 0.000 description 13
- 240000000111 Saccharum officinarum Species 0.000 description 13
- 235000007201 Saccharum officinarum Nutrition 0.000 description 13
- 235000019341 magnesium sulphate Nutrition 0.000 description 13
- 229910000402 monopotassium phosphate Inorganic materials 0.000 description 13
- 244000299461 Theobroma cacao Species 0.000 description 12
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 12
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 12
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 12
- 230000008635 plant growth Effects 0.000 description 12
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 12
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 12
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 12
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 11
- 235000009470 Theobroma cacao Nutrition 0.000 description 11
- 230000008520 organization Effects 0.000 description 11
- 230000008569 process Effects 0.000 description 11
- 229920002477 rna polymer Polymers 0.000 description 11
- JLIDBLDQVAYHNE-YKALOCIXSA-N (+)-Abscisic acid Chemical compound OC(=O)/C=C(/C)\C=C\[C@@]1(O)C(C)=CC(=O)CC1(C)C JLIDBLDQVAYHNE-YKALOCIXSA-N 0.000 description 10
- 241000589158 Agrobacterium Species 0.000 description 10
- 241000207199 Citrus Species 0.000 description 10
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 10
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 10
- 102100023153 Sodium- and chloride-dependent creatine transporter 1 Human genes 0.000 description 10
- 101710162246 Sodium- and chloride-dependent creatine transporter 1 Proteins 0.000 description 10
- 210000003763 chloroplast Anatomy 0.000 description 10
- 235000020971 citrus fruits Nutrition 0.000 description 10
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 10
- 238000007821 culture assay Methods 0.000 description 10
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 10
- 230000035784 germination Effects 0.000 description 10
- 238000002493 microarray Methods 0.000 description 10
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 10
- -1 yield Substances 0.000 description 10
- 244000105624 Arachis hypogaea Species 0.000 description 9
- 241000209134 Arundinaria Species 0.000 description 9
- 101000824971 Homo sapiens Sperm surface protein Sp17 Proteins 0.000 description 9
- 240000003183 Manihot esculenta Species 0.000 description 9
- 101150084044 P gene Proteins 0.000 description 9
- 235000004443 Ricinus communis Nutrition 0.000 description 9
- 102100022441 Sperm surface protein Sp17 Human genes 0.000 description 9
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 9
- 238000005520 cutting process Methods 0.000 description 9
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 9
- 230000008723 osmotic stress Effects 0.000 description 9
- 238000011056 performance test Methods 0.000 description 9
- 230000033458 reproduction Effects 0.000 description 9
- 241000894007 species Species 0.000 description 9
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 8
- 101710132601 Capsid protein Proteins 0.000 description 8
- 241001070941 Castanea Species 0.000 description 8
- 235000014036 Castanea Nutrition 0.000 description 8
- 101710094648 Coat protein Proteins 0.000 description 8
- 101710125418 Major capsid protein Proteins 0.000 description 8
- 101710141454 Nucleoprotein Proteins 0.000 description 8
- 101710083689 Probable capsid protein Proteins 0.000 description 8
- 241000220259 Raphanus Species 0.000 description 8
- 235000006140 Raphanus sativus var sativus Nutrition 0.000 description 8
- 235000002595 Solanum tuberosum Nutrition 0.000 description 8
- 244000061456 Solanum tuberosum Species 0.000 description 8
- 241001250564 Thellungiella Species 0.000 description 8
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 8
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 8
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 8
- 235000020232 peanut Nutrition 0.000 description 8
- 229910052939 potassium sulfate Inorganic materials 0.000 description 8
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 8
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 8
- 230000017260 vegetative to reproductive phase transition of meristem Effects 0.000 description 8
- 102100031910 A-kinase anchor protein 3 Human genes 0.000 description 7
- 241000132570 Centaurea Species 0.000 description 7
- 101000774732 Homo sapiens A-kinase anchor protein 3 Proteins 0.000 description 7
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 7
- 235000010582 Pisum sativum Nutrition 0.000 description 7
- 238000004422 calculation algorithm Methods 0.000 description 7
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 7
- 230000004720 fertilization Effects 0.000 description 7
- 230000008642 heat stress Effects 0.000 description 7
- 235000021317 phosphate Nutrition 0.000 description 7
- 244000144730 Amygdalus persica Species 0.000 description 6
- 235000017060 Arachis glabrata Nutrition 0.000 description 6
- 235000010777 Arachis hypogaea Nutrition 0.000 description 6
- 235000018262 Arachis monticola Nutrition 0.000 description 6
- 235000003826 Artemisia Nutrition 0.000 description 6
- 235000003261 Artemisia vulgaris Nutrition 0.000 description 6
- 102100025933 Cancer-associated gene 1 protein Human genes 0.000 description 6
- 235000002566 Capsicum Nutrition 0.000 description 6
- 235000009467 Carica papaya Nutrition 0.000 description 6
- 240000006432 Carica papaya Species 0.000 description 6
- 241000723343 Cichorium Species 0.000 description 6
- 108700010070 Codon Usage Proteins 0.000 description 6
- 102100031938 Eppin Human genes 0.000 description 6
- 102100021181 Golgi phosphoprotein 3 Human genes 0.000 description 6
- 101000933825 Homo sapiens Cancer-associated gene 1 protein Proteins 0.000 description 6
- 101000920711 Homo sapiens Eppin Proteins 0.000 description 6
- 101001055250 Homo sapiens Interactor of HORMAD1 protein 1 Proteins 0.000 description 6
- 101001036406 Homo sapiens Melanoma-associated antigen C1 Proteins 0.000 description 6
- 101000674717 Homo sapiens Transcription initiation factor TFIID subunit 7-like Proteins 0.000 description 6
- 102100026213 Interactor of HORMAD1 protein 1 Human genes 0.000 description 6
- 235000010627 Phaseolus vulgaris Nutrition 0.000 description 6
- 244000046052 Phaseolus vulgaris Species 0.000 description 6
- 241000219843 Pisum Species 0.000 description 6
- ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N Potassium Chemical compound [K] ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 235000006040 Prunus persica var persica Nutrition 0.000 description 6
- 108700008625 Reporter Genes Proteins 0.000 description 6
- 102100021172 Transcription initiation factor TFIID subunit 7-like Human genes 0.000 description 6
- 101000602831 Urodacus yaschenkoi Antimicrobial peptide UyCT3 Proteins 0.000 description 6
- 244000030166 artemisia Species 0.000 description 6
- 235000009052 artemisia Nutrition 0.000 description 6
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 6
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 6
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 6
- 238000010252 digital analysis Methods 0.000 description 6
- 235000013399 edible fruits Nutrition 0.000 description 6
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 6
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 6
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 6
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 6
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 6
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 6
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 6
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 6
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 6
- 239000011591 potassium Substances 0.000 description 6
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 6
- 240000002791 Brassica napus Species 0.000 description 5
- 244000025254 Cannabis sativa Species 0.000 description 5
- 241000219112 Cucumis Species 0.000 description 5
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 5
- 101000633613 Homo sapiens Probable threonine protease PRSS50 Proteins 0.000 description 5
- 206010020649 Hyperkeratosis Diseases 0.000 description 5
- 235000021506 Ipomoea Nutrition 0.000 description 5
- 241000207783 Ipomoea Species 0.000 description 5
- 235000016735 Manihot esculenta subsp esculenta Nutrition 0.000 description 5
- 239000006002 Pepper Substances 0.000 description 5
- 240000007377 Petunia x hybrida Species 0.000 description 5
- 235000016761 Piper aduncum Nutrition 0.000 description 5
- 240000003889 Piper guineense Species 0.000 description 5
- 235000017804 Piper guineense Nutrition 0.000 description 5
- 235000008184 Piper nigrum Nutrition 0.000 description 5
- 102100029523 Probable threonine protease PRSS50 Human genes 0.000 description 5
- 241000219492 Quercus Species 0.000 description 5
- 108700019146 Transgenes Proteins 0.000 description 5
- 241000906460 Triphysaria Species 0.000 description 5
- 241000219977 Vigna Species 0.000 description 5
- 235000010726 Vigna sinensis Nutrition 0.000 description 5
- 230000035508 accumulation Effects 0.000 description 5
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 5
- FCRACOPGPMPSHN-UHFFFAOYSA-N desoxyabscisic acid Natural products OC(=O)C=C(C)C=CC1C(C)=CC(=O)CC1(C)C FCRACOPGPMPSHN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 238000001035 drying Methods 0.000 description 5
- 239000004744 fabric Substances 0.000 description 5
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 5
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 5
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 5
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 5
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 5
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 5
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 5
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 5
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 5
- 230000029553 photosynthesis Effects 0.000 description 5
- 238000010672 photosynthesis Methods 0.000 description 5
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 5
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 5
- 238000007619 statistical method Methods 0.000 description 5
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 5
- 230000001052 transient effect Effects 0.000 description 5
- 235000015112 vegetable and seed oil Nutrition 0.000 description 5
- 230000035899 viability Effects 0.000 description 5
- 235000009434 Actinidia chinensis Nutrition 0.000 description 4
- 244000298697 Actinidia deliciosa Species 0.000 description 4
- 235000009436 Actinidia deliciosa Nutrition 0.000 description 4
- 235000003840 Amygdalus nana Nutrition 0.000 description 4
- 241000207875 Antirrhinum Species 0.000 description 4
- 241000219195 Arabidopsis thaliana Species 0.000 description 4
- 229930192334 Auxin Natural products 0.000 description 4
- 240000007154 Coffea arabica Species 0.000 description 4
- 235000015510 Cucumis melo subsp melo Nutrition 0.000 description 4
- 244000019459 Cynara cardunculus Species 0.000 description 4
- 235000019106 Cynara scolymus Nutrition 0.000 description 4
- 241000220223 Fragaria Species 0.000 description 4
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 description 4
- 108020004684 Internal Ribosome Entry Sites Proteins 0.000 description 4
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical compound [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 241000219739 Lens Species 0.000 description 4
- 241000511731 Leymus Species 0.000 description 4
- 102100039447 Melanoma-associated antigen C1 Human genes 0.000 description 4
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 4
- 235000011432 Prunus Nutrition 0.000 description 4
- 241000220299 Prunus Species 0.000 description 4
- 240000000528 Ricinus communis Species 0.000 description 4
- 235000010185 Tamarix canariensis Nutrition 0.000 description 4
- 235000014265 Tamarix gallica Nutrition 0.000 description 4
- 240000001869 Tamarix ramosissima Species 0.000 description 4
- 235000010154 Tamarix ramosissima Nutrition 0.000 description 4
- 241000723873 Tobacco mosaic virus Species 0.000 description 4
- 235000006886 Zingiber officinale Nutrition 0.000 description 4
- 244000273928 Zingiber officinale Species 0.000 description 4
- FJJCIZWZNKZHII-UHFFFAOYSA-N [4,6-bis(cyanoamino)-1,3,5-triazin-2-yl]cyanamide Chemical compound N#CNC1=NC(NC#N)=NC(NC#N)=N1 FJJCIZWZNKZHII-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 4
- 238000003915 air pollution Methods 0.000 description 4
- 235000016520 artichoke thistle Nutrition 0.000 description 4
- 239000002363 auxin Substances 0.000 description 4
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 4
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 4
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 4
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 4
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 4
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 4
- 150000001875 compounds Chemical group 0.000 description 4
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 4
- 230000008641 drought stress Effects 0.000 description 4
- 238000011049 filling Methods 0.000 description 4
- 238000007710 freezing Methods 0.000 description 4
- 230000008014 freezing Effects 0.000 description 4
- 235000008397 ginger Nutrition 0.000 description 4
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 4
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 4
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 4
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 4
- 239000000463 material Substances 0.000 description 4
- 230000035800 maturation Effects 0.000 description 4
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 4
- 230000000877 morphologic effect Effects 0.000 description 4
- 108010058731 nopaline synthase Proteins 0.000 description 4
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 4
- 239000002357 osmotic agent Substances 0.000 description 4
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 4
- 235000014774 prunus Nutrition 0.000 description 4
- 230000005855 radiation Effects 0.000 description 4
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 4
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 4
- 244000291564 Allium cepa Species 0.000 description 3
- 235000002732 Allium cepa var. cepa Nutrition 0.000 description 3
- 240000007124 Brassica oleracea Species 0.000 description 3
- 235000003899 Brassica oleracea var acephala Nutrition 0.000 description 3
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000723377 Coffea Species 0.000 description 3
- 241000208947 Cynara Species 0.000 description 3
- 235000003198 Cynara Nutrition 0.000 description 3
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 3
- 235000016623 Fragaria vesca Nutrition 0.000 description 3
- 235000011363 Fragaria x ananassa Nutrition 0.000 description 3
- 235000015847 Hesperis matronalis Nutrition 0.000 description 3
- 240000004533 Hesperis matronalis Species 0.000 description 3
- 240000008790 Musa x paradisiaca Species 0.000 description 3
- 235000006508 Nelumbo nucifera Nutrition 0.000 description 3
- 235000006510 Nelumbo pentapetala Nutrition 0.000 description 3
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 3
- 244000025272 Persea americana Species 0.000 description 3
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 3
- 235000009827 Prunus armeniaca Nutrition 0.000 description 3
- 244000018633 Prunus armeniaca Species 0.000 description 3
- 241001464837 Viridiplantae Species 0.000 description 3
- 230000004075 alteration Effects 0.000 description 3
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 3
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 3
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 3
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 3
- 230000008859 change Effects 0.000 description 3
- 230000008645 cold stress Effects 0.000 description 3
- 230000000875 corresponding effect Effects 0.000 description 3
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 3
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 3
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 3
- 241001493065 dsRNA viruses Species 0.000 description 3
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 3
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 3
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 3
- SEOVTRFCIGRIMH-UHFFFAOYSA-N indole-3-acetic acid Chemical compound C1=CC=C2C(CC(=O)O)=CNC2=C1 SEOVTRFCIGRIMH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 3
- 235000021374 legumes Nutrition 0.000 description 3
- 235000021073 macronutrients Nutrition 0.000 description 3
- 231100000783 metal toxicity Toxicity 0.000 description 3
- 239000006870 ms-medium Substances 0.000 description 3
- VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N n-Hexane Chemical compound CCCCCC VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- CJWXCNXHAIFFMH-AVZHFPDBSA-N n-[(2s,3r,4s,5s,6r)-2-[(2r,3r,4s,5r)-2-acetamido-4,5,6-trihydroxy-1-oxohexan-3-yl]oxy-3,5-dihydroxy-6-methyloxan-4-yl]acetamide Chemical compound C[C@H]1O[C@@H](O[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)CO)[C@@H](NC(C)=O)C=O)[C@H](O)[C@@H](NC(C)=O)[C@@H]1O CJWXCNXHAIFFMH-AVZHFPDBSA-N 0.000 description 3
- 108091027963 non-coding RNA Proteins 0.000 description 3
- 102000042567 non-coding RNA Human genes 0.000 description 3
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 3
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 3
- 230000001766 physiological effect Effects 0.000 description 3
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 3
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 3
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 3
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 3
- 230000021749 root development Effects 0.000 description 3
- 230000035939 shock Effects 0.000 description 3
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 3
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 3
- 239000008158 vegetable oil Substances 0.000 description 3
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 3
- SUBDBMMJDZJVOS-UHFFFAOYSA-N 5-methoxy-2-{[(4-methoxy-3,5-dimethylpyridin-2-yl)methyl]sulfinyl}-1H-benzimidazole Chemical compound N=1C2=CC(OC)=CC=C2NC=1S(=O)CC1=NC=C(C)C(OC)=C1C SUBDBMMJDZJVOS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 244000144725 Amygdalus communis Species 0.000 description 2
- 235000011437 Amygdalus communis Nutrition 0.000 description 2
- 244000099147 Ananas comosus Species 0.000 description 2
- 235000007119 Ananas comosus Nutrition 0.000 description 2
- 241001184073 Basilicum Species 0.000 description 2
- 235000011299 Brassica oleracea var botrytis Nutrition 0.000 description 2
- 235000011301 Brassica oleracea var capitata Nutrition 0.000 description 2
- 235000001169 Brassica oleracea var oleracea Nutrition 0.000 description 2
- 240000003259 Brassica oleracea var. botrytis Species 0.000 description 2
- BHPQYMZQTOCNFJ-UHFFFAOYSA-N Calcium cation Chemical compound [Ca+2] BHPQYMZQTOCNFJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000208328 Catharanthus Species 0.000 description 2
- 244000067602 Chamaesyce hirta Species 0.000 description 2
- 244000037364 Cinnamomum aromaticum Species 0.000 description 2
- 235000014489 Cinnamomum aromaticum Nutrition 0.000 description 2
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 2
- 241000218916 Cycas Species 0.000 description 2
- 235000017788 Cydonia oblonga Nutrition 0.000 description 2
- 244000236931 Cydonia oblonga Species 0.000 description 2
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 2
- 102000012410 DNA Ligases Human genes 0.000 description 2
- 108010061982 DNA Ligases Proteins 0.000 description 2
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102100031780 Endonuclease Human genes 0.000 description 2
- 241001518935 Eragrostis Species 0.000 description 2
- 241001517310 Eria Species 0.000 description 2
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000758791 Juglandaceae Species 0.000 description 2
- 108010025815 Kanamycin Kinase Proteins 0.000 description 2
- 235000014647 Lens culinaris subsp culinaris Nutrition 0.000 description 2
- 240000007472 Leucaena leucocephala Species 0.000 description 2
- 235000010643 Leucaena leucocephala Nutrition 0.000 description 2
- 235000004431 Linum usitatissimum Nutrition 0.000 description 2
- 240000006240 Linum usitatissimum Species 0.000 description 2
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 description 2
- 235000017587 Medicago sativa ssp. sativa Nutrition 0.000 description 2
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 2
- 235000018290 Musa x paradisiaca Nutrition 0.000 description 2
- 238000004497 NIR spectroscopy Methods 0.000 description 2
- 238000005481 NMR spectroscopy Methods 0.000 description 2
- 229910002651 NO3 Inorganic materials 0.000 description 2
- 240000002853 Nelumbo nucifera Species 0.000 description 2
- NHNBFGGVMKEFGY-UHFFFAOYSA-N Nitrate Chemical compound [O-][N+]([O-])=O NHNBFGGVMKEFGY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000000636 Northern blotting Methods 0.000 description 2
- 241000209485 Nuphar Species 0.000 description 2
- 241000282320 Panthera leo Species 0.000 description 2
- 235000008673 Persea americana Nutrition 0.000 description 2
- OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N Phosphorus Chemical compound [P] OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 240000004713 Pisum sativum Species 0.000 description 2
- 241001523344 Pseudoroegneria Species 0.000 description 2
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 2
- 101000702488 Rattus norvegicus High affinity cationic amino acid transporter 1 Proteins 0.000 description 2
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 2
- 235000007230 Sorghum bicolor Nutrition 0.000 description 2
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 description 2
- 238000000692 Student's t-test Methods 0.000 description 2
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 2
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 2
- 240000001949 Taraxacum officinale Species 0.000 description 2
- 235000005187 Taraxacum officinale ssp. officinale Nutrition 0.000 description 2
- 101710159648 Uncharacterized protein Proteins 0.000 description 2
- 101710100170 Unknown protein Proteins 0.000 description 2
- 241000863480 Vinca Species 0.000 description 2
- 108020005202 Viral DNA Proteins 0.000 description 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 2
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 2
- 235000020224 almond Nutrition 0.000 description 2
- 230000001174 ascending effect Effects 0.000 description 2
- 239000007640 basal medium Substances 0.000 description 2
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 2
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 2
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 2
- 229930002875 chlorophyll Natural products 0.000 description 2
- 235000019804 chlorophyll Nutrition 0.000 description 2
- ATNHDLDRLWWWCB-AENOIHSZSA-M chlorophyll a Chemical compound C1([C@@H](C(=O)OC)C(=O)C2=C3C)=C2N2C3=CC(C(CC)=C3C)=[N+]4C3=CC3=C(C=C)C(C)=C5N3[Mg-2]42[N+]2=C1[C@@H](CCC(=O)OC\C=C(/C)CCC[C@H](C)CCC[C@H](C)CCCC(C)C)[C@H](C)C2=C5 ATNHDLDRLWWWCB-AENOIHSZSA-M 0.000 description 2
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 2
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 2
- 239000002131 composite material Substances 0.000 description 2
- 230000006835 compression Effects 0.000 description 2
- 238000007906 compression Methods 0.000 description 2
- 239000000470 constituent Substances 0.000 description 2
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 2
- 230000002596 correlated effect Effects 0.000 description 2
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 2
- 230000006735 deficit Effects 0.000 description 2
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 2
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 2
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 2
- 235000021186 dishes Nutrition 0.000 description 2
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 2
- 230000024346 drought recovery Effects 0.000 description 2
- 210000002257 embryonic structure Anatomy 0.000 description 2
- 230000002349 favourable effect Effects 0.000 description 2
- 230000005714 functional activity Effects 0.000 description 2
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 2
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 2
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 2
- 239000000122 growth hormone Substances 0.000 description 2
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 2
- 230000036541 health Effects 0.000 description 2
- 238000010191 image analysis Methods 0.000 description 2
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 2
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 2
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 2
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 2
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 2
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 2
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 2
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 2
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 2
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 2
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 2
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 2
- 230000000442 meristematic effect Effects 0.000 description 2
- 230000002503 metabolic effect Effects 0.000 description 2
- 239000002679 microRNA Substances 0.000 description 2
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 2
- 230000017074 necrotic cell death Effects 0.000 description 2
- 230000000065 osmolyte Effects 0.000 description 2
- 230000003204 osmotic effect Effects 0.000 description 2
- 230000036542 oxidative stress Effects 0.000 description 2
- 239000003415 peat Substances 0.000 description 2
- 229910052698 phosphorus Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000011574 phosphorus Substances 0.000 description 2
- 230000027665 photoperiodism Effects 0.000 description 2
- 230000000243 photosynthetic effect Effects 0.000 description 2
- 230000008121 plant development Effects 0.000 description 2
- 239000003375 plant hormone Substances 0.000 description 2
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 2
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 2
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 2
- 108020001580 protein domains Proteins 0.000 description 2
- 210000001938 protoplast Anatomy 0.000 description 2
- 238000003127 radioimmunoassay Methods 0.000 description 2
- 239000002994 raw material Substances 0.000 description 2
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 2
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 2
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 2
- 230000008929 regeneration Effects 0.000 description 2
- 238000011069 regeneration method Methods 0.000 description 2
- 230000001850 reproductive effect Effects 0.000 description 2
- 238000007894 restriction fragment length polymorphism technique Methods 0.000 description 2
- 230000002786 root growth Effects 0.000 description 2
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 2
- 238000002791 soaking Methods 0.000 description 2
- 210000001082 somatic cell Anatomy 0.000 description 2
- 238000009331 sowing Methods 0.000 description 2
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 description 2
- 239000008107 starch Substances 0.000 description 2
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 2
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 2
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 2
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 2
- 235000020234 walnut Nutrition 0.000 description 2
- ZDSRFXVZVHSYMA-CMOCDZPBSA-N (2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-amino-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]amino]-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]amino]-4-carboxybutanoyl]amino]pentanedioic acid Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 ZDSRFXVZVHSYMA-CMOCDZPBSA-N 0.000 description 1
- BAAVRTJSLCSMNM-CMOCDZPBSA-N (2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-amino-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]amino]-4-carboxybutanoyl]amino]-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]amino]pentanedioic acid Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 BAAVRTJSLCSMNM-CMOCDZPBSA-N 0.000 description 1
- GYHXNGRPRPFNOF-UHFFFAOYSA-N 2-amino-5-[[1-(carboxymethylamino)-1-oxo-3-sulfanylbutan-2-yl]amino]-5-oxopentanoic acid Chemical compound OC(=O)CNC(=O)C(C(S)C)NC(=O)CCC(N)C(O)=O GYHXNGRPRPFNOF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101150090724 3 gene Proteins 0.000 description 1
- HZWWPUTXBJEENE-UHFFFAOYSA-N 5-amino-2-[[1-[5-amino-2-[[1-[2-amino-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]-5-oxopentanoyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]-5-oxopentanoic acid Chemical compound C1CCC(C(=O)NC(CCC(N)=O)C(=O)N2C(CCC2)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(O)=O)N1C(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 HZWWPUTXBJEENE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WFPZSXYXPSUOPY-ROYWQJLOSA-N ADP alpha-D-glucoside Chemical compound C([C@H]1O[C@H]([C@@H]([C@@H]1O)O)N1C=2N=CN=C(C=2N=C1)N)OP(O)(=O)OP(O)(=O)O[C@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O WFPZSXYXPSUOPY-ROYWQJLOSA-N 0.000 description 1
- WFPZSXYXPSUOPY-UHFFFAOYSA-N ADP-mannose Natural products C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1C(C(C1O)O)OC1COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC1OC(CO)C(O)C(O)C1O WFPZSXYXPSUOPY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 240000004507 Abelmoschus esculentus Species 0.000 description 1
- 241000208140 Acer Species 0.000 description 1
- RZVAJINKPMORJF-UHFFFAOYSA-N Acetaminophen Chemical compound CC(=O)NC1=CC=C(O)C=C1 RZVAJINKPMORJF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241001133760 Acoelorraphe Species 0.000 description 1
- 108090000104 Actin-related protein 3 Proteins 0.000 description 1
- 241000219068 Actinidia Species 0.000 description 1
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 description 1
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 description 1
- 241000157282 Aesculus Species 0.000 description 1
- 241000592335 Agathis australis Species 0.000 description 1
- VWEWCZSUWOEEFM-WDSKDSINSA-N Ala-Gly-Ala-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O VWEWCZSUWOEEFM-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- 102100036475 Alanine aminotransferase 1 Human genes 0.000 description 1
- 108010082126 Alanine transaminase Proteins 0.000 description 1
- 241000524150 Albizia amara Species 0.000 description 1
- 102100027211 Albumin Human genes 0.000 description 1
- 108010088751 Albumins Proteins 0.000 description 1
- 102000002572 Alpha-Globulins Human genes 0.000 description 1
- 108010068307 Alpha-Globulins Proteins 0.000 description 1
- 241000962146 Alsophila tricolor Species 0.000 description 1
- 235000009328 Amaranthus caudatus Nutrition 0.000 description 1
- 240000001592 Amaranthus caudatus Species 0.000 description 1
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O Ammonium Chemical compound [NH4+] QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 1
- 241000744007 Andropogon Species 0.000 description 1
- 108020005544 Antisense RNA Proteins 0.000 description 1
- 240000007087 Apium graveolens Species 0.000 description 1
- 235000015849 Apium graveolens Dulce Group Nutrition 0.000 description 1
- 235000010591 Appio Nutrition 0.000 description 1
- 241000218156 Aquilegia Species 0.000 description 1
- 101000651036 Arabidopsis thaliana Galactolipid galactosyltransferase SFR2, chloroplastic Proteins 0.000 description 1
- 101000577662 Arabidopsis thaliana Proline-rich protein 4 Proteins 0.000 description 1
- 101100194010 Arabidopsis thaliana RD29A gene Proteins 0.000 description 1
- 101100480489 Arabidopsis thaliana TAAC gene Proteins 0.000 description 1
- 235000003911 Arachis Nutrition 0.000 description 1
- 244000080767 Areca catechu Species 0.000 description 1
- 235000006226 Areca catechu Nutrition 0.000 description 1
- 241000233788 Arecaceae Species 0.000 description 1
- 244000003416 Asparagus officinalis Species 0.000 description 1
- 235000005340 Asparagus officinalis Nutrition 0.000 description 1
- 241000243239 Astelia fragrans Species 0.000 description 1
- 241001061305 Astragalus cicer Species 0.000 description 1
- 235000007319 Avena orientalis Nutrition 0.000 description 1
- 244000075850 Avena orientalis Species 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 241000012950 Baikiaea plurijuga Species 0.000 description 1
- 241000710076 Bean common mosaic virus Species 0.000 description 1
- 235000012284 Bertholletia excelsa Nutrition 0.000 description 1
- 244000205479 Bertholletia excelsa Species 0.000 description 1
- 241000219310 Beta vulgaris subsp. vulgaris Species 0.000 description 1
- 235000003932 Betula Nutrition 0.000 description 1
- 241000219429 Betula Species 0.000 description 1
- 241001457926 Brachys Species 0.000 description 1
- 235000011331 Brassica Nutrition 0.000 description 1
- 241000219198 Brassica Species 0.000 description 1
- 235000011293 Brassica napus Nutrition 0.000 description 1
- 235000004221 Brassica oleracea var gemmifera Nutrition 0.000 description 1
- 235000017647 Brassica oleracea var italica Nutrition 0.000 description 1
- 235000012905 Brassica oleracea var viridis Nutrition 0.000 description 1
- 244000308368 Brassica oleracea var. gemmifera Species 0.000 description 1
- WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N Bromine atom Chemical compound [Br] WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 244000277360 Bruguiera gymnorhiza Species 0.000 description 1
- 241000195940 Bryophyta Species 0.000 description 1
- 241001424028 Burkea africana Species 0.000 description 1
- 241000726739 Butea Species 0.000 description 1
- 235000008635 Cadaba farinosa Nutrition 0.000 description 1
- 241000628166 Cadaba farinosa Species 0.000 description 1
- 101100297347 Caenorhabditis elegans pgl-3 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100411570 Caenorhabditis elegans rab-28 gene Proteins 0.000 description 1
- 241001343295 Calliandra Species 0.000 description 1
- 244000052707 Camellia sinensis Species 0.000 description 1
- 244000292211 Canna coccinea Species 0.000 description 1
- 235000005273 Canna coccinea Nutrition 0.000 description 1
- 240000008574 Capsicum frutescens Species 0.000 description 1
- 108090000565 Capsid Proteins Proteins 0.000 description 1
- 235000003255 Carthamus tinctorius Nutrition 0.000 description 1
- 244000020518 Carthamus tinctorius Species 0.000 description 1
- 108010049994 Chloroplast Proteins Proteins 0.000 description 1
- 235000021511 Cinnamomum cassia Nutrition 0.000 description 1
- 235000007460 Coffea arabica Nutrition 0.000 description 1
- 241000350000 Colophospermum mopane Species 0.000 description 1
- 241000218631 Coniferophyta Species 0.000 description 1
- 235000009091 Cordyline terminalis Nutrition 0.000 description 1
- 244000289527 Cordyline terminalis Species 0.000 description 1
- 241001507946 Cotoneaster Species 0.000 description 1
- 235000014493 Crataegus Nutrition 0.000 description 1
- 241001092040 Crataegus Species 0.000 description 1
- 240000005109 Cryptomeria japonica Species 0.000 description 1
- 241000195493 Cryptophyta Species 0.000 description 1
- 235000010071 Cucumis prophetarum Nutrition 0.000 description 1
- 235000009854 Cucurbita moschata Nutrition 0.000 description 1
- 240000001980 Cucurbita pepo Species 0.000 description 1
- 235000009852 Cucurbita pepo Nutrition 0.000 description 1
- 241000723198 Cupressus Species 0.000 description 1
- 241000132493 Cyathea dealbata Species 0.000 description 1
- 102000001493 Cyclophilins Human genes 0.000 description 1
- 108010068682 Cyclophilins Proteins 0.000 description 1
- 230000004544 DNA amplification Effects 0.000 description 1
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 1
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 1
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 1
- 241000746417 Dalbergia monetaria Species 0.000 description 1
- 235000002767 Daucus carota Nutrition 0.000 description 1
- 244000000626 Daucus carota Species 0.000 description 1
- 241000035389 Davallia divaricata Species 0.000 description 1
- 241000522190 Desmodium Species 0.000 description 1
- 241000196119 Dicksonia Species 0.000 description 1
- 241000219761 Dioclea Species 0.000 description 1
- 241000219764 Dolichos Species 0.000 description 1
- 241000249436 Dorycnium rectum Species 0.000 description 1
- 101100408379 Drosophila melanogaster piwi gene Proteins 0.000 description 1
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 1
- 241000628129 Echinochloa pyramidalis Species 0.000 description 1
- 241000380130 Ehrharta erecta Species 0.000 description 1
- 235000001950 Elaeis guineensis Nutrition 0.000 description 1
- 240000003133 Elaeis guineensis Species 0.000 description 1
- 235000007349 Eleusine coracana Nutrition 0.000 description 1
- 244000078127 Eleusine coracana Species 0.000 description 1
- 108010042407 Endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 244000004281 Eucalyptus maculata Species 0.000 description 1
- 241001175061 Euclea schimperi Species 0.000 description 1
- 108091029865 Exogenous DNA Proteins 0.000 description 1
- 244000233576 Feijoa sellowiana Species 0.000 description 1
- 235000012068 Feijoa sellowiana Nutrition 0.000 description 1
- 241000234642 Festuca Species 0.000 description 1
- 241001022083 Flemingia Species 0.000 description 1
- 241000169596 Freycinetia Species 0.000 description 1
- 101150104463 GOS2 gene Proteins 0.000 description 1
- 102100040004 Gamma-glutamylcyclotransferase Human genes 0.000 description 1
- 229930182566 Gentamicin Natural products 0.000 description 1
- CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N Gentamicin Chemical compound O1[C@H](C(C)NC)CC[C@@H](N)[C@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](NC)[C@@](C)(O)CO2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N 0.000 description 1
- 244000105059 Geranium thunbergii Species 0.000 description 1
- 235000005491 Geranium thunbergii Nutrition 0.000 description 1
- 108010061711 Gliadin Proteins 0.000 description 1
- 241000411998 Gliricidia Species 0.000 description 1
- 108010044091 Globulins Proteins 0.000 description 1
- 102000006395 Globulins Human genes 0.000 description 1
- 108010068370 Glutens Proteins 0.000 description 1
- 235000009438 Gossypium Nutrition 0.000 description 1
- 244000299507 Gossypium hirsutum Species 0.000 description 1
- 235000009432 Gossypium hirsutum Nutrition 0.000 description 1
- 108010073032 Grain Proteins Proteins 0.000 description 1
- 241001648387 Grevillea Species 0.000 description 1
- 108010051696 Growth Hormone Proteins 0.000 description 1
- 206010053759 Growth retardation Diseases 0.000 description 1
- 241000013479 Guibourtia coleosperma Species 0.000 description 1
- 102000002812 Heat-Shock Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010004889 Heat-Shock Proteins Proteins 0.000 description 1
- 241000214032 Hedysarum Species 0.000 description 1
- 244000020551 Helianthus annuus Species 0.000 description 1
- 241001582739 Heteropogon <robber fly> Species 0.000 description 1
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 1
- 102100033558 Histone H1.8 Human genes 0.000 description 1
- 102100033636 Histone H3.2 Human genes 0.000 description 1
- 108010033040 Histones Proteins 0.000 description 1
- 102000009331 Homeodomain Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010048671 Homeodomain Proteins Proteins 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 101000886680 Homo sapiens Gamma-glutamylcyclotransferase Proteins 0.000 description 1
- 101100123312 Homo sapiens H1-8 gene Proteins 0.000 description 1
- 244000284937 Hyparrhenia rufa Species 0.000 description 1
- 241000782597 Hypericum erectum Species 0.000 description 1
- 235000000177 Indigofera tinctoria Nutrition 0.000 description 1
- 108091092195 Intron Proteins 0.000 description 1
- 108010044467 Isoenzymes Proteins 0.000 description 1
- 241001092400 Leptarrhena pyrolifolia Species 0.000 description 1
- 241000209510 Liliopsida Species 0.000 description 1
- 241000218300 Liriodendron Species 0.000 description 1
- 241000219743 Lotus Species 0.000 description 1
- 241001329168 Loudetia simplex Species 0.000 description 1
- 241000219745 Lupinus Species 0.000 description 1
- 239000006142 Luria-Bertani Agar Substances 0.000 description 1
- 241000219822 Macrotyloma axillare Species 0.000 description 1
- 241000218922 Magnoliophyta Species 0.000 description 1
- 235000004456 Manihot esculenta Nutrition 0.000 description 1
- 240000006236 Martynia annua Species 0.000 description 1
- 235000009071 Mesembryanthemum crystallinum Nutrition 0.000 description 1
- 241000218666 Metasequoia Species 0.000 description 1
- 108700011259 MicroRNAs Proteins 0.000 description 1
- 108091092878 Microsatellite Proteins 0.000 description 1
- 241000362816 Miscanthus sinensis var. purpurascens Species 0.000 description 1
- 102000005431 Molecular Chaperones Human genes 0.000 description 1
- 108010006519 Molecular Chaperones Proteins 0.000 description 1
- 235000003805 Musa ABB Group Nutrition 0.000 description 1
- NWBJYWHLCVSVIJ-UHFFFAOYSA-N N-benzyladenine Chemical compound N=1C=NC=2NC=NC=2C=1NCC1=CC=CC=C1 NWBJYWHLCVSVIJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 240000002778 Neonotonia wightii Species 0.000 description 1
- IOVCWXUNBOPUCH-UHFFFAOYSA-M Nitrite anion Chemical compound [O-]N=O IOVCWXUNBOPUCH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 101710163270 Nuclease Proteins 0.000 description 1
- 240000007817 Olea europaea Species 0.000 description 1
- 101710089395 Oleosin Proteins 0.000 description 1
- 102000015636 Oligopeptides Human genes 0.000 description 1
- 108010038807 Oligopeptides Proteins 0.000 description 1
- 241000219830 Onobrychis Species 0.000 description 1
- 241001446528 Ornithopus Species 0.000 description 1
- 241000209094 Oryza Species 0.000 description 1
- 108700025855 Oryza sativa oleosin Proteins 0.000 description 1
- 101100454022 Oryza sativa subsp. japonica OSH1 gene Proteins 0.000 description 1
- 235000019482 Palm oil Nutrition 0.000 description 1
- 241001618237 Peltophorum africanum Species 0.000 description 1
- 241000209046 Pennisetum Species 0.000 description 1
- 235000011236 Persea americana var americana Nutrition 0.000 description 1
- 241000219833 Phaseolus Species 0.000 description 1
- 235000015867 Phoenix canariensis Nutrition 0.000 description 1
- 244000297511 Phoenix canariensis Species 0.000 description 1
- 240000008340 Phormium cookianum Species 0.000 description 1
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 1
- 241001092035 Photinia Species 0.000 description 1
- 240000000020 Picea glauca Species 0.000 description 1
- 235000008127 Picea glauca Nutrition 0.000 description 1
- 108020005089 Plant RNA Proteins 0.000 description 1
- 235000015266 Plantago major Nutrition 0.000 description 1
- 235000018794 Podocarpus totara Nutrition 0.000 description 1
- 240000003145 Podocarpus totara Species 0.000 description 1
- 241000133788 Pogonarthria Species 0.000 description 1
- 239000004353 Polyethylene glycol 8000 Substances 0.000 description 1
- 208000037062 Polyps Diseases 0.000 description 1
- 241000218976 Populus trichocarpa Species 0.000 description 1
- 240000000037 Prosopis spicigera Species 0.000 description 1
- 235000006629 Prosopis spicigera Nutrition 0.000 description 1
- 102100029812 Protein S100-A12 Human genes 0.000 description 1
- 101710110949 Protein S100-A12 Proteins 0.000 description 1
- 235000008572 Pseudotsuga menziesii Nutrition 0.000 description 1
- 240000001416 Pseudotsuga menziesii Species 0.000 description 1
- 241001112090 Pseudovirus Species 0.000 description 1
- 241000350492 Pterolobium stellatum Species 0.000 description 1
- 235000014443 Pyrus communis Nutrition 0.000 description 1
- 240000001987 Pyrus communis Species 0.000 description 1
- 108091034057 RNA (poly(A)) Proteins 0.000 description 1
- 238000002123 RNA extraction Methods 0.000 description 1
- 235000011129 Rhopalostylis sapida Nutrition 0.000 description 1
- 240000007586 Rhopalostylis sapida Species 0.000 description 1
- 235000011483 Ribes Nutrition 0.000 description 1
- 241000220483 Ribes Species 0.000 description 1
- 244000171263 Ribes grossularia Species 0.000 description 1
- 235000002357 Ribes grossularia Nutrition 0.000 description 1
- 241001493421 Robinia <trematode> Species 0.000 description 1
- 235000011449 Rosa Nutrition 0.000 description 1
- 241001092459 Rubus Species 0.000 description 1
- 241000282849 Ruminantia Species 0.000 description 1
- 101100242307 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) SWH1 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000124033 Salix Species 0.000 description 1
- 241001116461 Sciadopitys Species 0.000 description 1
- 241001639806 Searsia natalensis Species 0.000 description 1
- 235000007238 Secale cereale Nutrition 0.000 description 1
- 244000082988 Secale cereale Species 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- 241001138418 Sequoia sempervirens Species 0.000 description 1
- 241000422846 Sequoiadendron giganteum Species 0.000 description 1
- 235000003434 Sesamum indicum Nutrition 0.000 description 1
- 244000040738 Sesamum orientale Species 0.000 description 1
- 239000005708 Sodium hypochlorite Substances 0.000 description 1
- 101100020617 Solanum lycopersicum LAT52 gene Proteins 0.000 description 1
- 235000002597 Solanum melongena Nutrition 0.000 description 1
- 244000061458 Solanum melongena Species 0.000 description 1
- 102100038803 Somatotropin Human genes 0.000 description 1
- 241000219315 Spinacia Species 0.000 description 1
- 241000847989 Sporobolus fimbriatus Species 0.000 description 1
- 235000021536 Sugar beet Nutrition 0.000 description 1
- 241000505911 Tadehagi Species 0.000 description 1
- 241001138405 Taxodium distichum Species 0.000 description 1
- 235000006468 Thea sinensis Nutrition 0.000 description 1
- 244000152045 Themeda triandra Species 0.000 description 1
- 235000005764 Theobroma cacao ssp. cacao Nutrition 0.000 description 1
- 235000005767 Theobroma cacao ssp. sphaerocarpum Nutrition 0.000 description 1
- 102000004357 Transferases Human genes 0.000 description 1
- 108090000992 Transferases Proteins 0.000 description 1
- 241000219793 Trifolium Species 0.000 description 1
- 244000098338 Triticum aestivum Species 0.000 description 1
- 229920004890 Triton X-100 Polymers 0.000 description 1
- 239000013504 Triton X-100 Substances 0.000 description 1
- 240000003021 Tsuga heterophylla Species 0.000 description 1
- 235000008554 Tsuga heterophylla Nutrition 0.000 description 1
- 108090000848 Ubiquitin Proteins 0.000 description 1
- 102000044159 Ubiquitin Human genes 0.000 description 1
- 108091023045 Untranslated Region Proteins 0.000 description 1
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000012429 Vaccinium sp Nutrition 0.000 description 1
- 241000700647 Variola virus Species 0.000 description 1
- 241000219873 Vicia Species 0.000 description 1
- 108700005077 Viral Genes Proteins 0.000 description 1
- 108020000999 Viral RNA Proteins 0.000 description 1
- 208000036142 Viral infection Diseases 0.000 description 1
- 240000001198 Zantedeschia aethiopica Species 0.000 description 1
- 241000209149 Zea Species 0.000 description 1
- 235000007244 Zea mays Nutrition 0.000 description 1
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 1
- 239000002250 absorbent Substances 0.000 description 1
- 230000002745 absorbent Effects 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 230000001154 acute effect Effects 0.000 description 1
- 230000006978 adaptation Effects 0.000 description 1
- 230000002411 adverse Effects 0.000 description 1
- 238000012271 agricultural production Methods 0.000 description 1
- 229910052782 aluminium Inorganic materials 0.000 description 1
- XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N aluminium Chemical compound [Al] XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000012735 amaranth Nutrition 0.000 description 1
- 239000004178 amaranth Substances 0.000 description 1
- 108010025592 aminoadipoyl-cysteinyl-allylglycine Proteins 0.000 description 1
- DVARTQFDIMZBAA-UHFFFAOYSA-O ammonium nitrate Chemical compound [NH4+].[O-][N+]([O-])=O DVARTQFDIMZBAA-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 210000003484 anatomy Anatomy 0.000 description 1
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 238000009360 aquaculture Methods 0.000 description 1
- 244000144974 aquaculture Species 0.000 description 1
- 210000004507 artificial chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 230000002238 attenuated effect Effects 0.000 description 1
- 238000002869 basic local alignment search tool Methods 0.000 description 1
- 235000013361 beverage Nutrition 0.000 description 1
- 230000003851 biochemical process Effects 0.000 description 1
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 1
- 229920000704 biodegradable plastic Polymers 0.000 description 1
- 239000003225 biodiesel Substances 0.000 description 1
- 239000002551 biofuel Substances 0.000 description 1
- 230000001486 biosynthesis of amino acids Effects 0.000 description 1
- 238000013452 biotechnological production Methods 0.000 description 1
- 235000008429 bread Nutrition 0.000 description 1
- GDTBXPJZTBHREO-UHFFFAOYSA-N bromine Substances BrBr GDTBXPJZTBHREO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052794 bromium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 1
- 235000001046 cacaotero Nutrition 0.000 description 1
- 235000019577 caloric intake Nutrition 0.000 description 1
- 239000001390 capsicum minimum Substances 0.000 description 1
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 1
- FPPNZSSZRUTDAP-UWFZAAFLSA-N carbenicillin Chemical compound N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)C(C(O)=O)C1=CC=CC=C1 FPPNZSSZRUTDAP-UWFZAAFLSA-N 0.000 description 1
- 229960003669 carbenicillin Drugs 0.000 description 1
- 230000023852 carbohydrate metabolic process Effects 0.000 description 1
- 235000021256 carbohydrate metabolism Nutrition 0.000 description 1
- 230000006860 carbon metabolism Effects 0.000 description 1
- 230000030833 cell death Effects 0.000 description 1
- 230000024245 cell differentiation Effects 0.000 description 1
- 230000032823 cell division Effects 0.000 description 1
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 1
- 230000036978 cell physiology Effects 0.000 description 1
- 210000003850 cellular structure Anatomy 0.000 description 1
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 description 1
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 description 1
- 238000007385 chemical modification Methods 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 238000004891 communication Methods 0.000 description 1
- 239000003184 complementary RNA Substances 0.000 description 1
- 238000010205 computational analysis Methods 0.000 description 1
- 238000004590 computer program Methods 0.000 description 1
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 1
- 239000000356 contaminant Substances 0.000 description 1
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 239000008162 cooking oil Substances 0.000 description 1
- 210000000877 corpus callosum Anatomy 0.000 description 1
- 238000010219 correlation analysis Methods 0.000 description 1
- 239000002537 cosmetic Substances 0.000 description 1
- 244000038559 crop plants Species 0.000 description 1
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 1
- 239000004062 cytokinin Substances 0.000 description 1
- UQHKFADEQIVWID-UHFFFAOYSA-N cytokinin Natural products C1=NC=2C(NCC=C(CO)C)=NC=NC=2N1C1CC(O)C(CO)O1 UQHKFADEQIVWID-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000004292 cytoskeleton Anatomy 0.000 description 1
- 244000195896 dadap Species 0.000 description 1
- 230000007123 defense Effects 0.000 description 1
- 230000003111 delayed effect Effects 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 239000003651 drinking water Substances 0.000 description 1
- 235000020188 drinking water Nutrition 0.000 description 1
- 239000008157 edible vegetable oil Substances 0.000 description 1
- 230000005684 electric field Effects 0.000 description 1
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 1
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 1
- ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N ethidium bromide Chemical compound [Br-].C12=CC(N)=CC=C2C2=CC=C(N)C=C2[N+](CC)=C1C1=CC=CC=C1 ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960005542 ethidium bromide Drugs 0.000 description 1
- 238000012851 eutrophication Methods 0.000 description 1
- 238000010195 expression analysis Methods 0.000 description 1
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 1
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 1
- 235000014089 extruded snacks Nutrition 0.000 description 1
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 1
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 1
- 244000037666 field crops Species 0.000 description 1
- 239000004459 forage Substances 0.000 description 1
- 239000000446 fuel Substances 0.000 description 1
- ZZUFCTLCJUWOSV-UHFFFAOYSA-N furosemide Chemical compound C1=C(Cl)C(S(=O)(=O)N)=CC(C(O)=O)=C1NCC1=CC=CO1 ZZUFCTLCJUWOSV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 1
- 210000000232 gallbladder Anatomy 0.000 description 1
- 108010007981 gamma-glutamyl-thiothreonyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 238000012215 gene cloning Methods 0.000 description 1
- 108091008053 gene clusters Proteins 0.000 description 1
- 230000004545 gene duplication Effects 0.000 description 1
- 229960002518 gentamicin Drugs 0.000 description 1
- 239000003365 glass fiber Substances 0.000 description 1
- 101150091511 glb-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 235000002532 grape seed extract Nutrition 0.000 description 1
- 238000000227 grinding Methods 0.000 description 1
- 239000003673 groundwater Substances 0.000 description 1
- 231100000001 growth retardation Toxicity 0.000 description 1
- 101150054900 gus gene Proteins 0.000 description 1
- 230000002650 habitual effect Effects 0.000 description 1
- 210000002768 hair cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000035876 healing Effects 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 238000002744 homologous recombination Methods 0.000 description 1
- 230000006801 homologous recombination Effects 0.000 description 1
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 description 1
- 208000006278 hypochromic anemia Diseases 0.000 description 1
- 238000007654 immersion Methods 0.000 description 1
- 210000001822 immobilized cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 1
- 238000003365 immunocytochemistry Methods 0.000 description 1
- 238000010166 immunofluorescence Methods 0.000 description 1
- 238000003364 immunohistochemistry Methods 0.000 description 1
- 239000003547 immunosorbent Substances 0.000 description 1
- 238000007901 in situ hybridization Methods 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 229940097275 indigo Drugs 0.000 description 1
- COHYTHOBJLSHDF-UHFFFAOYSA-N indigo powder Natural products N1C2=CC=CC=C2C(=O)C1=C1C(=O)C2=CC=CC=C2N1 COHYTHOBJLSHDF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000036512 infertility Effects 0.000 description 1
- 230000008595 infiltration Effects 0.000 description 1
- 238000001764 infiltration Methods 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 229910052500 inorganic mineral Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 1
- 230000002262 irrigation Effects 0.000 description 1
- 238000003973 irrigation Methods 0.000 description 1
- 239000003621 irrigation water Substances 0.000 description 1
- 238000005304 joining Methods 0.000 description 1
- 230000002015 leaf growth Effects 0.000 description 1
- 230000014634 leaf senescence Effects 0.000 description 1
- 229920005610 lignin Polymers 0.000 description 1
- 239000000314 lubricant Substances 0.000 description 1
- 230000003050 macronutrient Effects 0.000 description 1
- 210000001161 mammalian embryo Anatomy 0.000 description 1
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 1
- 230000037353 metabolic pathway Effects 0.000 description 1
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 description 1
- 208000005135 methemoglobinemia Diseases 0.000 description 1
- 230000002906 microbiologic effect Effects 0.000 description 1
- 238000000520 microinjection Methods 0.000 description 1
- 239000011859 microparticle Substances 0.000 description 1
- 235000019713 millet Nutrition 0.000 description 1
- 235000010755 mineral Nutrition 0.000 description 1
- 239000011707 mineral Substances 0.000 description 1
- 238000005065 mining Methods 0.000 description 1
- 235000020772 multivitamin supplement Nutrition 0.000 description 1
- 150000002823 nitrates Chemical class 0.000 description 1
- 239000000618 nitrogen fertilizer Substances 0.000 description 1
- QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N nitrogen group Chemical group [N] QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 238000007899 nucleic acid hybridization Methods 0.000 description 1
- 230000031787 nutrient reservoir activity Effects 0.000 description 1
- 235000021231 nutrient uptake Nutrition 0.000 description 1
- 235000016709 nutrition Nutrition 0.000 description 1
- 238000002515 oligonucleotide synthesis Methods 0.000 description 1
- 210000003463 organelle Anatomy 0.000 description 1
- 239000011368 organic material Substances 0.000 description 1
- 125000001477 organic nitrogen group Chemical group 0.000 description 1
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 description 1
- 239000002540 palm oil Substances 0.000 description 1
- 244000045947 parasite Species 0.000 description 1
- 230000003071 parasitic effect Effects 0.000 description 1
- 238000005192 partition Methods 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 1
- 229910001562 pearlite Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 1
- 230000000505 pernicious effect Effects 0.000 description 1
- 239000003208 petroleum Substances 0.000 description 1
- 239000000825 pharmaceutical preparation Substances 0.000 description 1
- 229940127557 pharmaceutical product Drugs 0.000 description 1
- 230000000144 pharmacologic effect Effects 0.000 description 1
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- 150000003013 phosphoric acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 1
- 230000019935 photoinhibition Effects 0.000 description 1
- 230000000704 physical effect Effects 0.000 description 1
- 230000004962 physiological condition Effects 0.000 description 1
- 230000035479 physiological effects, processes and functions Effects 0.000 description 1
- 239000001739 pinus spp. Substances 0.000 description 1
- 230000037039 plant physiology Effects 0.000 description 1
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 235000019446 polyethylene glycol 8000 Nutrition 0.000 description 1
- 229940085678 polyethylene glycol 8000 Drugs 0.000 description 1
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 1
- 230000008092 positive effect Effects 0.000 description 1
- 235000010333 potassium nitrate Nutrition 0.000 description 1
- 239000004323 potassium nitrate Substances 0.000 description 1
- USHAGKDGDHPEEY-UHFFFAOYSA-L potassium persulfate Chemical compound [K+].[K+].[O-]S(=O)(=O)OOS([O-])(=O)=O USHAGKDGDHPEEY-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- OTYBMLCTZGSZBG-UHFFFAOYSA-L potassium sulfate Chemical compound [K+].[K+].[O-]S([O-])(=O)=O OTYBMLCTZGSZBG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 235000012015 potatoes Nutrition 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 101150059999 pro gene Proteins 0.000 description 1
- 108060006613 prolamin Proteins 0.000 description 1
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 1
- 238000012514 protein characterization Methods 0.000 description 1
- 238000001742 protein purification Methods 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 1
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 1
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 1
- 230000001172 regenerating effect Effects 0.000 description 1
- 238000004153 renaturation Methods 0.000 description 1
- 230000003362 replicative effect Effects 0.000 description 1
- 230000004044 response Effects 0.000 description 1
- 210000000614 rib Anatomy 0.000 description 1
- 230000005070 ripening Effects 0.000 description 1
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 description 1
- 238000005070 sampling Methods 0.000 description 1
- 238000010845 search algorithm Methods 0.000 description 1
- 238000010187 selection method Methods 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- HBMJWWWQQXIZIP-UHFFFAOYSA-N silicon carbide Chemical compound [Si+]#[C-] HBMJWWWQQXIZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910010271 silicon carbide Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 235000011888 snacks Nutrition 0.000 description 1
- SUKJFIGYRHOWBL-UHFFFAOYSA-N sodium hypochlorite Chemical compound [Na+].Cl[O-] SUKJFIGYRHOWBL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910001415 sodium ion Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000000638 solvent extraction Methods 0.000 description 1
- 238000004611 spectroscopical analysis Methods 0.000 description 1
- 235000011496 sports drink Nutrition 0.000 description 1
- 235000020354 squash Nutrition 0.000 description 1
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 1
- 238000013517 stratification Methods 0.000 description 1
- 239000010902 straw Substances 0.000 description 1
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 1
- 239000013589 supplement Substances 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- 238000004114 suspension culture Methods 0.000 description 1
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 1
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 description 1
- 238000006257 total synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 1
- 238000000844 transformation Methods 0.000 description 1
- 238000011426 transformation method Methods 0.000 description 1
- 230000001960 triggered effect Effects 0.000 description 1
- 230000005740 tumor formation Effects 0.000 description 1
- WFKWXMTUELFFGS-UHFFFAOYSA-N tungsten Chemical compound [W] WFKWXMTUELFFGS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052721 tungsten Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010937 tungsten Substances 0.000 description 1
- 108010032276 tyrosyl-glutamyl-tyrosyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010068794 tyrosyl-tyrosyl-glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 description 1
- 235000013311 vegetables Nutrition 0.000 description 1
- 230000009385 viral infection Effects 0.000 description 1
- 238000012800 visualization Methods 0.000 description 1
- 235000009492 vitamin B5 Nutrition 0.000 description 1
- 239000011675 vitamin B5 Substances 0.000 description 1
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 1
- 239000002023 wood Substances 0.000 description 1
- 238000004383 yellowing Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/415—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from plants
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/415—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from plants
- C07K14/42—Lectins, e.g. concanavalin, phytohaemagglutinin
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
- C12N15/8262—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield involving plant development
- C12N15/8269—Photosynthesis
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
- C12N15/8271—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
- C12N15/8271—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
- C12N15/8273—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for drought, cold, salt resistance
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
- Y02A40/00—Adaptation technologies in agriculture, forestry, livestock or agroalimentary production
- Y02A40/10—Adaptation technologies in agriculture, forestry, livestock or agroalimentary production in agriculture
- Y02A40/146—Genetically Modified [GMO] plants, e.g. transgenic plants
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Physiology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Botany (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Agricultural Chemicals And Associated Chemicals (AREA)
- Fertilizers (AREA)
- Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
- Oil, Petroleum & Natural Gas (AREA)
- Nutrition Science (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
Se proveen métodos para aumentar la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite y/o tolerancia al estrés abióticio de una planta expresando dentro de la planta, un polinucleótido exógeno que comprende una secuencia de ácido nucleico que tiene una identidad de, al menos, el 80% con respecto al NR ID DE SEC: 2506, 2512, 2442, 2496, 2446, 1, 2, 4, 7, 8, 11, 12, 13, 16-19, 21-60, 63-128, 130-137, 270-287, 289-293, 295-306, 308-362, 364-666, 671, 673-1333, 2414-2441, 2443-2445, 2447-2455, 2458-2495, 2497-2505, 2507-2511, 2513-2521 o 2522; y para aumentar la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante y/o contenido de aceite de una planta expresando dentro de la planta un polinucleótido exógeno que comprende una secuencia de ácido nucleico que tiene una identidad de, al menos, el 80% con respecto al NR ID SEC: 3, 5, 6, 9, 10, 14, 15, 288, 294, 2398-2412 o 2413. Además se proveen polinucleótidos y polipéptidos aislados que pueden utilizarse para aumentar la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite y/o tolerancia al estrés abiótico de un planta de una planta.
Description
POLIPÉPTIDOS Y POLINUCLEÓTIDOS AISLADOS ÚTILES PARA MEJORAR LA
EFICACIA EN EL USO DE NITROGENO, TOLERANCIA AL ESTRES ABIOTICO,
RENDIMIENTO Y BIOMASA EN PLANTAS CAMPO Y ANTECEDENTES DE LA INVENCIÓN
La presente invención, en algunas de sus realizaciones, se refiere a polipéptidos y polinucleótidos aislados, constructos de ácido nucleico que los comprenden, plantas transgénicas que los expresan y métodos para utilizarlos para mejorar la eficacia en el uso de nitrógeno, rendimiento, biomasa, vigor, tasa de crecimiento, contenido de aceite, eficacia en el uso del fertilizante, eficacia en el uso de agua y tolerancia al estrés abiótico de una planta.
Un enfoque común para promover el desarrollo de una planta ha sido y continua siendo el uso de nutrientes naturales asi como también, sintéticos (fertilizantes). De esta forma, los fertilizantes son el combustible detrás de la "revolución verde", y son directamente responsables del aumento excepcional de los rendimientos de cosechas durante los últimos 40 años, y son considerados como los gastos principales más elevados en agricultura. De los tres macronutrientes provistos como fertilizantes principales [Nitrógeno (N) , Fosfato (P) y Potasio (K) ] , el nitrógeno es el único que usualmente necesita ser repuesto ca-da año, especialmente para cereales, que comprenden más de la mitad de las áreas cultivadas en el mundo entero. Por ejemplo, los fertilizantes nitrogenados como el nitrato de
amonio, nitrato de potasio o urea, típicamente suman el 40% de los costos asociados con los cultivos como por ejemplo, de maíz y trigo.
El nitrógeno es un macronutriente esencial para la planta, responsable de la biosíntesis de aminoácidos y ácidos nucleicos, grupos prostéticos, hormonas vegetales y defensas químicas de la planta, entre otros. Además, el nitrógeno a menudo es un elemento limitante de la tasa de crecimiento de una planta y todos los cultivos en campo tienen una dependencia fundamental con el nitrógeno inorgánico. Así, el nitrógeno se transloca a la raíz, donde se almacena en hojas y tallo durante el rápido paso de desarrollo de la planta y hasta la floración. En maíz por ejemplo, las plantas acumulan el volumen de nitrógeno orgánico durante el período de germinación del grano hasta la floración. Una vez ocurrida la fertilización de la planta, los granos comienzan a formarse y se genera el depósito principal de nitrógeno en la planta. El nitrógeno almacenado luego se puede redistribuir desde las hojas y tallo que sirvieron como compartimientos de almacenamiento hasta la formación del grano.
Como el fertilizante se agota rápidamente en la mayoría de tipos de cultivo, se debe proveer a los cultivos en desarrollo, dos o tres veces durante la estación de crecimiento. Además la baja eficacia en el uso de nitrógeno (EUN) en los principales cultivos (por ejemplo, entre un rango de sólo 30-70 %) afecta
negativamente los gastos de inicio del agricultor debido al exceso de fertilizante aplicado. Además, el abuso y uso ineficiente de fertilizantes son los factores principales responsables de los problemas ambientales como eutrofización de aguas subterráneas, lagos, ríos y mares, la polución con nitrato del agua potable que puede provocar metahemoglobinemia, contaminación con fosfato, contaminación atmosférica y consecuencias similares. Sin embargo, a pesar del impacto negativo de los fertilizantes en el medio ambiente, y las limitaciones en el uso del fertilizante legisladas en varios países, se espera que el uso de fertilizantes aumente para poder sostener la producción de alimento y fibras para el rápido crecimiento de la población debido a recursos limitados de tierra. Por ejemplo, se ha estimado que para el año 2050, se utilizarán, en el mundo anualmente, más de 150 millones de toneladas de fertilizante nitrogenado.
La eficacia aumentada en el uso de nitrógeno por parte de las plantas, permite que los cultivos se realicen con una cantidad inicial menor de fertilizante o alternativamente, sean cultivados en suelos de menor calidad y podrían, por lo tanto, tener un impacto económico significativo tanto en sistemas agrícolas desarrollados como sistemas en desarrollo.
La mejora genética de la eficacia en el uso del fertilizante (EUF) en plantas puede generarse tanto mediante cultivos tradicionales o mediante ingeniería genética.
Los intentos para generar plantas con EUF aumentado, han sido descriptos en la Solicitud de Patente Estadounidense N° 20020046419 de Choo, y colab. ; Solicitud de Patente Estadounidense N° 2005010879 de Edgerton y colab.; Solicitud de Patente Estadounidense N° 20060179511 de Chomet y colab.; Good, A, y colab. 2007 (Engineering nitrogen use efficiency with alanine aminotransferase . Canadian Journal of Botany 85: 252-262); y Good AG y colab. 2004 (Trends Plant Sci . 9:597-605).
Yanagisawa y colab. (Proc. Nati. Acad. Sci. U.S. A. 2004 101:7833-8) describe las plantas transgénicas Dofl que exhiben un desarrollo mejorado bajo condiciones de baja cantidad de nitrógeno .
La Patente Estadounidense N° 6,084,153 de Good y colab., describe el uso de un promotor responsable del estrés para el control de la expresión de la alanina amina transferasa (AlaAT) y plantas de cañóla transgénicas con una tolerancia mejorada a la sequía y deficiencia de nitrógeno comparadas con las plantas de control .
La escasez global de provisión de agua, la desertificación, las condiciones de estrés abiótico (ABS, por sus siglas en inglés) (por ejemplo, sequía, salinidad, agente osmótico, inundación, temperaturas subóptimas como por ejemplo, frío y calor, contaminación química tóxica, deficiencia de nutrientes y condiciones similares) junto con la presencia limitada de nitrógeno y fuentes de fertilizantes, producen un
daño sustancial a las plantas agrícolas como por ejemplo, alteraciones principales en el metabolismo de la planta, muerte celular y disminución en el crecimiento de la planta y productividad de la cosecha.
La sequía es un fenómeno gradual que incluye períodos de clima anormalmente seco que persiste lo suficiente como para producir serios desequilibrios hidrológicos como por ejemplo, daño del cultivo, escasa provisión de agua y susceptibilidad aumentada a diversas enfermedades.
La salinidad afecta una de cada cinco hectáreas de tierra irrigada. Ninguno de los cinco cultivos principales, es decir, trigo, maíz, arroz, papa y soja, puede tolerar excesiva cantidad de sal. Los efectos perniciosos de la sal en las plantas resultan tanto del déficit de agua que produce estrés osmótico (similar al estrés por sequía) como del efecto de iones de sodio en exceso sobre los procesos bioquímicos críticos. Tanto con el congelamiento como la sequía, la elevada cantidad de sal provoca déficit de agua; y la presencia de una cantidad elevada de sal dificulta a las raíces la extracción de agua en su propio medio ambiente. De esta forma, la salinización de suelos utilizados para la producción agrícola es un problema significativo y en aumento en regiones que se basan fuertemente en la agricultura, y empeora con la utilización excesiva, fertilización excesiva y escasez de agua, típicamente provocada por el cambio climático y las demandas de
una población en aumento.
Las temperaturas extremas como por ejemplo, temperaturas subóptimas o de elevada temperatura, afectan el crecimiento y desarrollo de la planta durante todo el ciclo de vida vegetal. De esta manera, las bajas temperaturas reducen la tasa de germinación y las elevadas temperaturas resultan en una necrosis de hoja. Además, las plantas maduras expuestas a calor excesivo pueden experimentar un choque térmico por calor que surge en varios órganos como por ejemplo, las hojas y particularmente los frutos, cuando la transpiración es insuficiente para superar el estrés por calor. El calor también daña las estructuras celulares, incluyendo organelos y citoesqueleto e impide la función de la membrana. El choque térmico por calor puede producir una disminución en la síntesis total de la proteína acompañada por la expresión de proteínas de choque térmico, por ejemplo, los chaperones que están involucrados en las renaturalización de proteínas desnaturalizadas por el calor. El daño producido en el polen por la elevada temperatura siempre ocurre junto con el estrés por sequía y, raras veces ocurre bajo buenas condiciones de agua. El estrés combinado puede alterar el metabolismo de la planta de formas nuevas. Las condiciones de enfriamiento excesivo, por ejemplo, temperaturas bajas pero superiores al congelamiento afectan los cultivos de origen tropical, por ejemplo, soja, arroz, maíz y algodón. Los daños típicos por
enfriamiento incluyen, marchitamiento, necrosis, clorosis o pérdida de iones de las membranas celulares. Las condiciones de luz excesiva que ocurren bajo condiciones atmosféricas claras subsiguientes a las noches frías del verano/otoño tardíos, pueden producir la fotoinhibición de la fotosíntesis (interrupción de la fotosíntesis). Además, el enfriamiento puede producir pérdidas del producto y una calidad de producto inferior debido a la maduración retardada del maíz.
Las deficiencias de nutrientes provocan adaptaciones de la arquitectura de raíz, especialmente notable es, por ejemplo, la proliferación de raíces dentro de las áreas ricas en nutrientes para aumentar la captación de nutrientes. Las deficiencias de nutrientes producen además la activación de las vías metabólicas de la planta que maximizan los procesos de absorción, asimilación y distribución por ejemplo, mediante la activación de cambios en la arquitectura. La manipulación genética de la expresión de genes disparados, puede hacer gue la planta exhiba cambios en la arquitectura y un metabolismo mejorado también en otras condiciones.
Además, se sabe ampliamente que las plantas usualmente responden a la deficiencia de agua creando un sistema radicular más profundo que permita el acceso a la humedad ubicada en las capas de suelo más profundas. Provocando este efecto se permite a las plantas acceder a nutrientes y agua ubicadas en suelos más profundos, particularmente, aquellos que se disuelven
rápidamente en agua como los nitratos.
El rendimiento se ve afectado por varios factores como por ejemplo, la cantidad y el tamaño de los órganos de la planta, la arquitectura de la planta (por ejemplo, la cantidad de ramas) , la longitud determinada de los granos, la cantidad de granos rellenos, el vigor (por ejemplo, de las plántulas) , la tasa de crecimiento, desarrollo de raiz, utilización de agua, nutrientes (por ejemplo, nitrógeno) y fertilizantes, y tolerancia al estrés.
Los cultivos como por ejemplo, maíz, arroz, trigo, cañóla y soja suman más de la mitad de la ingesta calórica humana total, tanto mediante el consumo directo de las semillas mismas como por el consumo de productos comestibles generados con semillas procesadas o forraje. Las semillas también son una fuente de azúcares, proteínas y aceites y metabolitos usados en procesos industriales. La capacidad para aumentar el rendimiento de la planta, tanto mediante el aumento de la tasa de acumulación de materia seca, la modificación de la composición de celulosa o lignina, el aumento de la resistencia del tallo, el agrandamierito del tamaño del meristema, el cambio en el patrón de ramificación de la planta, la capacidad de las hojas de mantenerse erguidas, el aumento en la eficacia de fertilización, la tasa de acumulación de materia seca en semilla aumentada, la modificación del desarrollo de semilla, el aumentado relleno en semilla o mediante el aumento del
contenido de aceite, almidón o proteina en las semillas, podrían tener muchas aplicaciones en usos agrícolas y no agrícolas como por ejemplo, en la producción biotecnológica de productos farmacéuticos, anticuerpos o vacunas.
La publicación de Patente WO N° 2009/013750 describe genes, constructos y métodos para aumentar la tolerancia al estrés abiótico, biomasa y/o rendimiento en plantas generadas para dicho fin.
La publicación de Patente WO N° 2008/122980 describe genes, constructos y métodos para aumentar el contenido de aceite, tasa de crecimiento y biomasa de las plantas.
La publicación de Patente WO N° 2008/075364 describe polinucleótidos involucrados en el desarrollo de la fibra de la planta y métodos para utilizarlos.
La publicación de Patente WO N° 2007/049275 describe polipéptidos , polinucleótidos aislados, polinucleótidos que los codifican, plantas transgénicas que ios expresan y métodos para utilizarlos para aumentar la eficacia en el uso del fertilizante, la tolerancia de la planta al estrés abiótico y su biomasa.
La publicación de Patente WO N° 2004/104162 describe métodos para aumentar la tolerancia al estrés abiótico y/o biomasa en plantas y plantas generadas para tal fin.
La publicación de Patente WO N° 2005/121364 describe polinucleótidos y polipéptidos involucrados en el desarrollo de
la fibra vegetal y métodos para utilizarlos para mejorar la calidad de la fibra, rendimiento y/o biomasa de una planta que produce fibra.
La publicación de Patente O N° 2007/020638 describe métodos para aumentar la tolerancia al estrés abiótico y/o biomasa y plantas y plantas generadas para tal fin.
COMPENDIO DE LA INVENCIÓN
De acuerdo con un aspecto de algunas realizaciones de la presente invención, se provee un método para aumentar la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite y/o tolerancia al estrés abiótico de una planta, que comprende expresar dentro de la planta, un polinucleótido exógeno que comprende una secuencia de ácido nucleico que tiene una identidad de, al menos, el 80% con respecto al NR ID DE SEC: 2506, 2512, 2442, 2496, 2446, 1, 2, 4, 7, 8, 11, 12, 13, 16-19, 21-60, 63-128, 130-137, 270-287, 289-293, 295-306, 308-362, 364-666, 671, 673-1333, 2414-2441, 2443-2445, 2447-2455, 2458-2495, 2497-2505, 2507-2511, 2513-2521 o 2522, aumentando asi la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite y/o tolerancia al estrés abiótico de la planta.
De acuerdo con un aspecto de algunas realizaciones de la presente invención, se provee un método para aumentar la
eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite y/o tolerancia al estrés abiótico de una planta, que comprende expresar dentro de la planta, un polinucleótido exógeno que comprende la secuencia de ácido nucleico seleccionada del grupo formado por los NRs ID DE SEC: 2506, 2512, 2442, 2496, 2446, 1, 2, 4, 7, 8, 11, 12, 13, 16-19, 21-60, 63-128, 130-137, 270-287, 289-293, 295-306, 308-362, 364-666, 671, 673-1333, 2414-2441, 2443-2445, 2447-2455, 2458-2495, 2497-2505, 2507-2511, 2513-2522, 3, 5, 6, 9, 10, 14, 15, 20, 61, 62, 129, 288, 294, 307, 363, 667, 668, 669, 670, 672, 2398-2413, 2456 y 2457, aumentando asi. la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite y/o tolerancia al estrés abiótico de la planta.
De acuerdo con un aspecto de algunas realizaciones de la presente invención, se provee un método para aumentar la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite y/o tolerancia al estrés abiótico de una planta, que comprende expresar dentro de ella, un polinucleótido exógeno que comprende una secuencia de ácido nucleico que codifica un polipéptido que tiene una identidad de, al menos, el 80%· con respecto al NR ID DE SEC: 2557, 2560, 184, 238, 188, 154-156, 158-161, 163-183, 185-187, 189-197,
200-237, 239-264, 266-269, 1351, 1365-1425, 1429-1457, 1459, 1461-1730, 1735, 1739-2397, 2533-2541, 2544-2556, 2558, 2559, 2561-2562 o 2563, aumentando asi la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite y/o tolerancia al estrés abiótico de la planta.
De acuerdo con un aspecto de algunas realizaciones de la presente invención, se provee un método para aumentar la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite y/o tolerancia al estrés abiótico de una planta, que comprende expresar dentro de ella, un polinucleótido exógeno que comprende una secuencia de ácido nucleico que codifica un polipéptido seleccionado del grupo que consiste en los NRs ID DE SEC : 2557, 2560, 184, 238, 188, 154-156, 158-161, 163-183, 185-187, 189-197, 200-237, 239-264, 266-269, 1351, 1365-1425, 1429-1457, 1459, 1461-1730, 1735, 1739-2397, 2533-2541, 2544-2556, 2558, 2559, 2561-2563, 138-143, 146, 148, 150-152, 157, 162, 198, 265, 1334-1350, 1352-1364, 1426-1428, 1458, 1460, 1732-1734, 1737-1738, 2523-2532, 2542 y 2543, aumentando asi la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite y/o tolerancia al estrés abiótico de la planta.
De acuerdo con un aspecto de algunas realizaciones de la
presente invención, se provee un método para aumentar la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante y/o contenido de aceite de una planta, que comprende expresar dentro de ella, un polinucleótido exógeno que comprende una secuencia de ácido nucleico que tiene una identidad de, al menos, el 80% con respecto al NR ID DE SEC: 3, 5, 6, 9, 10, 14, 15, 288, 294, 2398-2412 o 2413, aumentando asi la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, y/o contenido de aceite de la planta.
De acuerdo con un aspecto de algunas realizaciones de la presente invención, se provee un método para aumentar la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante y/o contenido de aceite de una planta, que comprende expresar dentro de ella, un polinucleótido exógeno que comprende la secuencia de ácido nucleico seleccionada del grupo formado por el NRs ID DE SEC: 3, 5, 6, 9, 10, 14, 15, 288, 294, 2398-2413, aumentando asi la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante y/o contenido de aceite de la planta.
De acuerdo con un aspecto de algunas realizaciones de la presente invención, se provee un método para aumentar la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante y/o contenido de aceite de una planta, que comprende expresar dentro de ella, un polinucleótido exógeno que comprende una secuencia de ácido nucleico que codifica un
polipéptido que tiene una identidad de, al menos, el 80% con respecto al NR ID DE SEC: 138-153, 1334-1350, 1352-1364, 1458, 1460, 2523-2531 o 2532, aumentando asi la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante y/o contenido de aceite de la planta.
De acuerdo con un aspecto de algunas realizaciones de la presente invención, se provee un método para aumentar la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante y/o contenido de aceite de una planta, que comprende expresar dentro de ella, un polinucleótido exógeno que comprende una secuencia de ácido nucleico que codifica un polipéptido seleccionado del grupo que consiste en los NRs ID DE SEC: 138-153, 1334-1350, 1352-1364, 1458, 1460, 2523-2532, aumentando asi la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante y/o contenido de aceite de la planta.
De acuerdo con un aspecto de algunas realizaciones de la presente invención se provee un polinucleótido aislado que comprende una secuencia de ácido nucleico que tiene una identidad de, al menos, el 80% con respecto al NR ID DE SEC: 2506, 2512, 2442, 2496, 2446, 1, 2, 4, 7, 8, 11, 12, 13, 16-19, 21-60, 63-128, 130-137, 270-287, 289-293, 295-306, 308-362, 364-666, 671, 673-1333, 2414-2441, 2443-2445, 2447-2455, 2458-2495, 2497-2505, 2507-2511, 2513-2521 o 2522, donde la secuencia de ácido nucleico es capaz de aumentar la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante,
rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite y/o estrés abiótico de una planta.
De acuerdo con un aspecto de algunas realizaciones de la presente invención, se provee un polinucleótido aislado que comprende la secuencia de ácido nucleico seleccionada del grupo que consiste en los NRs ID DE SEC: 2506, 2512, 2442, 2496, 2446, 1, 2, 4, 7, 8, 11, 12, 13, 16-19, 21-60, 63-128, 130-137, 270-287, 289-293, 295-306, 308-362, 364-666, 671, 673-1333, 2414-2441, 2443-2445, 2447-2455, 2458-2495, 2497-2505, 2507-2511, 2513-2522, 3, 5, 6, 9, 10, 14, 15, 20, 61, 62, 129, 288, 294, 307, 363, 667, 668, 669, 670, 672, 2398-2413, 2456 y 2457.
De acuerdo con un aspecto de algunas realizaciones de la presente invención, se provee un polinucleótido aislado que comprende una secuencia de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende una secuencia aminoácida que tiene una homología de, al menos, el 80 % con respecto a la secuencia de aminoácido determinada por el NR ID DE SEC: 2557, 2560, 184, 238, 188, 154-156, 158-161, 163-183, 185-187, 189-197, 200-237, 239-264, 266-269, 1351, 1365-1425, 1429-1457, 1459, 1461-1730, 1735, 1739-2397, 2533-2541, 2544-2556, 2558, 2559, 2561-2562 o 2563, donde la secuencia de aminoácido es capaz de aumentar la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite y/o tolerancia al estrés abiótico de una planta.
De acuerdo con un aspecto de algunas realizaciones de la presente invención, se provee un polinucleótido aislado que comprende una secuencia de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido seleccionada del grupo que consiste en los NRs ID DE SEC: 2557, 2560, 184, 238, 188, 154-156, 158-161, 163-183, 185-187, 189-197, 200-237, 239-264, 266-269, 1351, 1365-1425, 1429-1457, 1459, 1461-1730, 1735, 1739-2397, 2533-2541, 2544-2556, 2558, 2559, 2561-2563, 138-143, 146, 148, 150-152, 157, 162, 198, 265, 1334-1350, 1352-1364, 1426-1428, 1458, 1460, 1732-1734, 1737-1738, 2523-2532, 2542 y 2543.
De acuerdo con un aspecto de algunas realizaciones de la presente invención, se provee un constructo de ácido nucleico que comprende al polinucleótido aislado de la invención, y un promotor para dirigir la transcripción de la secuencia de ácido nucleico en una célula hospedante.
De acuerdo con un aspecto de algunas realizaciones de la presente invención, se provee un polipéptido aislado que comprende una secuencia de aminoácido que tiene una homología de, al menos, el 80 % con respecto al NR ID DE SEC: 2557, 2560, 184, 238, 188, 154-156, 158-161, 163-183, 185-187, 189-197, 200-237, 239-264, 266-269, 1351, 1365-1425, 1429-1457, 1459, 1461-1730, 1735, 1739-2397, 2533-2541, 2544-2556, 2558, 2559, 2561-2562 o 2563, donde la secuencia de aminoácido es capaz de aumentar la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso
del fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite y/o tolerancia al estrés abiótico de una planta.
De acuerdo con un aspecto de algunas realizaciones de la presente invención, se provee un polipéptido aislado que comprende la secuencia de aminoácido seleccionada del grupo que consiste en los NRs ID DE SEC: 2557, 2560, 184, 238, 188, 154-156, 158-161, 163-183, 185-187, 189-197, 200-237, 239-264, 266-269, 1351, 1365-1425, 1429-1457, 1459, 1461-1730, 1735, 1739-2397, 2533-2541, 2544-2556, 2558, 2559, 2561-2563, 138-143, 146, 148, 150-152, 157, 162, 198, 265, 1334-1350, 1352-1364, 1426-1428, 1458, 1460, 1732-1734, 1737-1738, 2523-2532, 2542 y 2543.
De acuerdo con un aspecto de algunas realizaciones de la presente invención, se provee una célula vegetal que expresa de manera exógena al polinucleótido de la invención, o el constructo de ácido nucleico de la invención.
De acuerdo con un aspecto de algunas realizaciones de la presente invención, se provee una célula de una planta que expresa de manera exógena al polipéptido de la invención.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, la secuencias de ácido nucleico es como se determina en el NR ID DE SEC: 2506, 2512, 2442, 2496, 2446, 1, 2, 4, 7, 8, 11, 12, 13, 16-19, 21-60, 63-128, 130-137, 270-287, 289-293, 295-306, 308-362, 364-666, 671, 673-1333, 2414-2441, 2443-2445, 2447-
2455, 2458-2495, 2497-2505, 2507-2511, 2513-2521 o 2522.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, el polinucleótido consiste en la secuencia de ácido nucleico seleccionada del grupo formado por los NRs ID DE SEC: 2506, 2512, 2442, 2496, 2446, 1, 2, 4, 7, 8, 11, 12, 13, 16-19, 21-60, 63-128, 130-137, 270-287, 289-293, 295-306, 308-362, 364-666, 671, 673-1333, 2414-2441, 2443-2445, 2447-2455, 2458-2495, 2497-2505, 2507-2511, 2513-2522.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, la secuencia de ácido nucleico codifica una secuencia de aminoácido que tiene una homología de, al menos, el 80 % con respecto al NR ID DE SEC: 2557, 2560, 184, 238, 188, 154-156, 158-161, 163-183, 185-187, 189-197, 200-237, 239-264, 266-269, 1351, 1365-1425, 1429-1457, 1459, 1461-1730, 1735, 1739-2397, 2533-2541, 2544-2556, 2558, 2559, 2561-2562 o 2563.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, la secuencia de ácido nucleico codifica la secuencia de aminoácido seleccionada del grupo que consiste en los NRs ID DE SEC: 2557, 2560, 184, 238, 188, 154-156, 158-161, 163-183, 185-187, 189-197, 200-237, 239-264, 266-269, 1351, 1365-1425, 1429-1457, 1459, 1461-1730, 1735, 1739-2397, 2533-2541, 2544-2556, 2558, 2559, 2561-2563.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, la secuencia de ácido nucleico es como se determina en el NR ID DE SEC: 3, 5, 6, 9, 10, 14, 15, 288, 294, 2398-2412 o 2413.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, el polinucleótido consiste en la secuencia de ácido nucleico seleccionada del grupo que consiste en los NRs ID DE SEC: 3, 5, 6, 9, 10, 14, 15, 288, 294, 2398-2413.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, la secuencia de ácido nucleico codifica una secuencia de aminoácido que tiene una homología de, al menos, el 80 % con respecto al NR ID DE SEC: 138-153, 1334-1350, 1352-1364, 1458, 1460, 2523-2531 o 2532.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, la secuencia de ácido nucleico codifica la secuencia de aminoácido seleccionada del grupo que consiste en los NRs ID DE SEC: 138-153, 1334-1350, 1352-1364, 1458, 1460, 2523-2532.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, la célula vegetal forma parte de una planta.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, el método además comprende desarrollar la planta que expresa al polinucleótido exógeno bajo estrés abiótico.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, el estrés abiótico se selecciona del grupo formado por salinidad, sequía, privación de agua, inundación, etiolización, baja temperatura, alta temperatura, toxicidad por metales pesados, anaerobiosis , deficiencia de nutrientes, exceso de nutrientes, contaminación atmosférica y Radiación UV.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, el
rendimiento comprende: rendimiento de semilla o rendimiento de aceite .
A menos que se defina de otro modo, todos los términos técnicos y/o científicos usados aquí, tienen el mismo significado comúnmente comprendido por el experto en el arte al que pertenece la invención. Sin embargo, pueden utilizarse métodos y materiales similares o equivalentes a los descriptos aquí en la práctica o ensayo de las realizaciones de la invención, métodos ejemplares y/o materiales descriptos más abajo. En caso de conflicto, primará la especificación de la patente, incluyendo las definiciones. Además, los materiales, métodos y ejemplos son sólo ilustrativos y no son necesariamente limitantes.
BREVE DESCRIPCIÓN DE LOS DIBUJOS
Aquí se describen algunas realizaciones de la invención, a manera de ejemplo solamente, haciendo referencia a los dibujos que la acompañan. Con respecto ahora a los dibujos en detalle, se destaca que los dibujos particulares se muestran a manera de ejemplo y con la finalidad de ilustrar la descripción de las realizaciones de la invención. A este respecto, la descripción considerada junto con los dibujos, muestra claramente ál experto en el arte cómo pueden llevarse a la práctica las realizaciones de la invención.
En los dibujos:
La FIG. 1 es una ilustración esquemática del plásmido
binario pGI usado para expresar las secuencias de polinucleótido aislado de algunas realizaciones de la invención. RB - T-DNA borde derecho; LB - T-DNA borde izquierdo; . enzima de restricción H- HindIII; enzima de restricción X - Xbal; enzima de restricción B - BamHI; enzima de restricción S - Salí; enzima de restricción Sm - Smal; enzima de restricción R-I - EcoRI; Se - SacI/SstI/Ecll36II ; (números) - Longitud en pares base; NOS pro = promotor de nopalina sintasa; NPT-II = gen de neomicina fosfotransferasa; NOS ter = terminador de nopalina sintasa; señal Poli-A (señal de poliadenilación) ; GUSintrón - el gen reportero GUS (secuencia de codificación e intrón) . Las secuencias de polinucleótido de la invención fueron clonadas dentro del vector reemplazando el gen reportero GUSintrón.
LA FIG. 2 es una ilustración esquemática del plásmido pGI modificado usado para expresar las secuencias de polinucleótido aislado de la invención. RB - T-DNA borde derecho; LB - T-DNA borde izquierdo; Sitio de clonación múltiple MCS -; RE -cualquier enzima de restricción; (números) - Longitud en pares base; NOS pro = promotor de nopalina sintasa; NPT-II = gen de neomicina fosfotransferasa; NOS ter = terminador de nopalina sintasa; señal Poli-A (señal de poliadenilación) ; GUSintrón -el gen reportero GUS (secuencia de codificación e intrón) . Las secuencias de polinucleótido de la invención fueron clonadas dentro del vector reemplazando el gen reportero GUSintrón.
Las FIGs. 3A-B son imágenes que ilustran la visualización del desarrollo de raíz de plantas desarrolladas en placas de agar transparentes. Los diferentes transgenes fueron desarrollados en placas de agar durante 10 días y las placas fueron fotografiadas cada 3-4 días partiendo del día 1. Figura 3A - Una imagen de una fotografía de plantas tomada luego de 10 días en placas de agar. Figura 3B - Una imagen de análisis de raíz donde la longitud de la raíz medida está representada por una flecha.
DESCRIPCIÓN DE LAS REALIZACIONES ESPECÍFICAS DE LA INVENCIÓN
La presente invención, en algunas de sus realizaciones, se refiere a polinucleótidos y polipéptidos aislados, vectores de expresión que los comprenden y plantas transgénicas que los expresan y, más particularmente, pero no exclusivamente, a métodos para aumentar la eficacia en el uso de nitrógeno, rendimiento, biomasa, vigor, tasa de crecimiento, contenido de aceite y tolerancia al estrés abiótico de una planta utilizando los mismos.
Antes de explicar al menos una realización de la invención en detalle, debe comprenderse que la invención no está necesariamente limitada a su explicación de los detalles incluidos en la siguiente descripción o ejemplificados por los Ejemplos. La invención es capaz de tener otras realizaciones o de ser practicada o llevada a cabo de diversas formas.
Aunque se reduce la presente invención a la práctica, los
inventores presentes han identificado polipéptidos y polinucleótidos nuevos que pueden usarse para aumentar la eficacia en el uso de nitróqeno, eficacia en el uso del fertilizante, eficacia en el uso de agua, rendimiento, tasa de crecimiento, biomasa, contenido de aceite, vigor y/o tolerancia al estrés abiótico de una planta.
De esta manera, como se muestra en la sección Ejemplos que sigue, los inventores presentes han utilizado las herramientas bioinformáticas para generar los perfiles de expresión digitales de agrupamientos génicos cuyo nivel de expresión está asociado con varias condiciones y estrés como por ejemplo, deficiencia de nutrientes, frío, salinidad, sequía, estrés por calor, etiolización, anegamiento y estrés oxidativo (Tablas 1-19; Ejemplo 1 de la sección Ejemplos que sigue), y en base a los perfiles de expresión, han identificado genes que se espera mejoren la eficacia en el uso de nitrógeno, biomasa, tasa de crecimiento, rendimiento, vigor, contenido de aceite y/o tolerancia al estrés abiótico de una planta (Tabla 20; polinucleótidos NRs ID DE SEC: 1-137; polipéptidos NRs ID DE SEC: 138-269; Ejemplo 1 .de la Sección Ejemplos que sigue) . También se identificaron polipéptidos y polinucleótidos homólogos que tienen la misma función (Tabla 21, polinucleótido NRs ID DE SEC: 270-1333; polipéptido NRs ID DE SEC: 1334-2397; Ejemplo 2 de la Sección Ejemplos que sigue) . Para ensayar el efecto que tienen los genes aislados sobre la característica de
interés, se clonaron los polinucleótidos en vectores binarios (Tabla 23, polinucleótido NRs ID DE SEC: 2398-2522; Ejemplo 3 de la Sección Ejemplos que sigue) y se identificaron las proteínas predichas (Tabla 23, Ejemplo 3) . Se descubrió que las plantas transgénicas que sobreexpresan a los polinucleótidos identificados exhiben una eficacia en el uso de nitrógeno, rendimiento, biomasa, áreas fotosintéticas y tasa de crecimiento mejoradas (Tablas 24-52, Ejemplos 5, 6 y 7 de la Sección Ejemplos que sigue) , así como también, una mejorada tolerancia al estrés abiótico (por ejemplo, bajo estrés salino; Tablas 53-55, Ejemplo 8 de la Sección Ejemplos que sigue) . En general, estos resultados sugieren el uso de los polinucleótidos y polipéptidos nuevos de la invención y sus secuencias homologas para aumentar la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, rendimiento (incluyendo el rendimiento de aceite, rendimiento de semilla y contenido de aceite) , tasa de crecimiento, biomasa, vigor y/o tolerancia al estrés abiótico de una planta.
De esta manera, de acuerdo con un aspecto de algunas realizaciones de la invención, se provee un método para aumentar la eficacia en el uso del fertilizante, eficacia en el uso de nitrógeno, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite y/o tolerancia al . estrés abiótico de una planta, que comprende expresar dentro de la planta un polinucleótido exógeno que comprende una secuencia de ácido
nucleico que tiene una identidad de, al menos, el 80% con respecto al NR ID DE SEC: 2506, 2512, 2442, 2496, 2446, 1, 2, 4, 7, 8, 11, 12, 13, 16-19, 21-60, 63-128, 130-137, 270-287, 289-293, 295-306, 308-362, 364-666, 671, 673-1333, 2414-2441, 2443-2445, 2447-2455, 2458-2495, 2497-2505, 2507-2511, 2513-2521 o 2522, aumentando asi la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite, eficacia en el uso de agua y/o tolerancia al estrés abiótico de la planta.
Como se utiliza aquí, la frase "eficacia en el uso del fertilizante" se refiere a el (los) proceso (s) metabólico ( s ) que producen una mejora en el rendimiento, biomasa, vigor, y tasa de crecimiento de una planta por unidad de fertilizante aplicado. El proceso metabólico puede ser captación, diseminación, absorción, acumulación, reubicación (dentro de la planta) y utilización de uno o más de los minerales y porciones orgánicas absorbidas por la planta, como por ejemplo, nitrógeno, fosfatos y/o potasio.
Como se utiliza aqui, la frase "condiciones limitadas de fertilizante" se refiere a condiciones de crecimiento que incluyen un nivel (por ejemplo, concentración) de un fertilizante aplicado que esté por debajo del nivel necesario para el metabolismo, crecimiento, reproducción y/o viabilidad normal de la planta.
Como se utiliza aqui, la frase "eficacia en el uso de
nitrógeno (EUN)" se refiere a el (los) proceso (s) metabólico ( s ) que producen una mejora en el rendimiento, biomasa, vigor, y tasa de crecimiento de la planta por unidad de nitrógeno aplicada. El (los) proceso (s) metabólico ( s ) pueden ser la captación, diseminación, absorción, acumulación, reubicación (dentro de la planta) y utilización del nitrógeno absorbido por la planta.
Como se utiliza aquí, la frase "condiciones limitadas de nitrógeno" se refiere a condiciones de crecimiento que incluyen un nivel (por ejemplo, concentración) de nitrógeno (por ejemplo, amonio o nitrato) aplicado que es inferior al nivel necesario para el metabolismo, crecimiento, reproducción y/o viabilidad normal de una planta.
EUN y EUF mejorados de la planta se traduce en campo, tanto en la cosecha de cantidades similares de producto utilizando menos fertilizantes como en la obtención de rendimientos aumentados ganados por la utilización de los mismos niveles de fertilizantes. Asi, la EUN o EUF mejoradas tienen un efecto directo sobre el rendimiento de la planta en campo. De esta manera, los polinucleótidos y polipéptidos de algunas realizaciones de la invención afectan positivamente el rendimiento de la planta, rendimiento de semilla, y biomasa de la planta. Además, el beneficio de la EUN mejorada de la planta ciertamente mejorará la calidad de la cosecha y los constituyentes bioquímicos de la semilla como por ejemplo, el
rendimiento de la proteina y rendimiento de aceite.
Como se utiliza aquí, la frase "rendimiento de la planta" se refiere a la cantidad (determinada mediante peso y tamaño) o cantidad (número) de tejidos producidos por planta o por estación de crecimiento. Por lo tanto, el rendimiento podría afectar el beneficio económico que se puede obtener de la planta en cierta área de crecimiento y/o tiempo de crecimiento.
Cabe notarse que el rendimiento de una planta puede ser afectado por varios parámetros que incluyen, pero no se limitan a, biomasa de la planta, vigor de la planta; tasa de crecimiento; rendimiento de semilla; cantidad de semilla o grano; calidad de semilla o grano; rendimiento de aceite; contenido de aceite, almidón y/o proteína en órganos cosechados (por ejemplo, semillas o partes vegetativas de la planta) ; cantidad de flores (floretes) por panoja (expresadas como una relación de cantidad de semillas rellenas con respecto a la cantidad de panojas primarias); índice de cosecha; cantidad de plantas desarrolladas por área; cantidad y tamaño de órganos cosechados por planta y por área; cantidad de plantas por área de crecimiento (densidad) ; cantidad de órganos cosechados en campo; área total de hoja; asimilación de carbono y partición de carbono (la distribución/ubicación de carbono dentro de la planta) ; resistencia a la sombra; cantidad de órganos cosechables (por ejemplo, semillas) , semillas por vaina, peso por semilla y arquitectura modificada [por ejemplo, aumento en
el diámetro del tallo, espesor o mejora de propiedades físicas (por ejemplo, elasticidad)].
Como se utiliza aquí, la frase "biomasa de la planta" se refiere a la cantidad (medida en gramos de tejido secado al aire) de un tejido producido por la planta en una estación de crecimiento, que podría también determinar o afectar el rendimiento de la planta o rendimiento por área de crecimiento. Un aumento en la biomasa de la planta puede ser en la planta entera o en partes de la misma, por ejemplo, partes debajo del suelo ( cosechables ) , biomasa vegetativa, raíces y semillas.
Como se utiliza aquí, la frase "tasa de crecimiento" se refiere al aumento en el tamaño de un órgano o masa de la planta por tiempo (puede medirse en cm2 por día, día o como coeficiente de regresión en el trascurso del tiempo) .
Como se utiliza aquí, la frase "vigor de la planta" se refiere a la cantidad (medida en peso) de tejido producido por la planta en un tiempo dado. Por lo tanto, el aumento en el vigor podría determinar o afectar el rendimiento de la planta o rendimiento por tiempo de crecimiento o área de crecimiento. Además, se logra un vigor temprano (semilla y/o plántula) con un soporte mejorado en campo.
Como se utiliza aquí, la frase "rendimiento de semilla" se refiere a la cantidad o peso de las semillas por planta, semillas por vaina o área de crecimiento o a la altura de una sola semilla o al aceite extraído por semilla. Por lo tanto, el
rendimiento de semilla puede ser afectado por las dimensiones de la semilla (por ejemplo, longitud, ancho, perímetro, área y/o volumen), cantidad de semillas (presentes) y tasa de relleno de semillas y contenido de aceite en semilla. Por lo tanto, el aumento del rendimiento de semilla por planta podría afectar el beneficio económico que se puede obtener de la planta en una cierta área de crecimiento y/o tiempo de crecimiento; y el aumento del rendimiento de semilla por área de crecimiento podría lograrse aumentando el rendimiento de semilla por planta y/o aumentando la cantidad de plantas desarrolladas en la misma área dada.
El término "semilla" (también referido como "grano" o "germen") como se usa aquí, se refiere a una planta embriónica pequeña envuelta en una cubierta llamada recubrimiento de semilla (usualmente con parte de alimento almacenado) , el producto del óvulo maduro de plantas gimnosperma y angiosperma que ocurre después de la fertilización y cierto crecimiento dentro de la planta madre.
La frase "contenido de aceite" como se usa aquí, se refiere a la cantidad de lípidos en un órgano vegetal dado, ya sea de las semillas (contenido de aceite en semilla) o la porción vegetativa de la planta (contenido de aceite vegetativo) y típicamente expresado como porcentaje de peso seco (10% de humedad de las semillas) o peso en húmedo (para la porción vegetativa) .
Cabe destacar que el contenido de aceite está afectado por la producción intrínseca de aceite de un tejido (por ejemplo, semilla, porción vegetativa) , así como también, la masa o tamaño de tejido producido por el aceite por planta o por período de crecimiento.
En una realización, se puede lograr el aumento del contenido de aceite de la planta mediante un aumento del tamaño/masa de el/los tejido/s de una planta que comprende aceite por período de crecimiento. De esta forma, el contenido de aceite aumentado de una planta puede lograrse aumentando el rendimiento, tasa de crecimiento, biomasa y vigor de la planta.
Cabe destacarse que el rendimiento de la planta puede determinarse bajo estrés (por ejemplo, estrés abiótico, condiciones limitadas de nitrógeno) o en condiciones sin estrés (normal) .
Como se usa aquí, la frase "condiciones sin estrés" se refiere a las condiciones de crecimiento (por ejemplo, agua, temperatura, ciclos luz-oscuridad, humedad, concentración de sal, concentración de fertilizante en, suelo, provisión de nutrientes como por ejemplo, nitrógeno, fósforo y/o potasio), que permiten el metabolismo, crecimiento, reproducción y/o viabilidad normal de una planta en cualquier etapa de su ciclo de vida (desde la semilla hasta la planta madura y de vuelta hasta la semilla) . Cabe destacar que, mientras las condiciones sin estrés pueden incluir algunas variaciones leves de las
condiciones óptimas (que pueden variar de un tipo/especie de planta a otra) , dichas variaciones no provocan que la planta deje de desarrollarse sin la capacidad de reanudar el crecimiento .
La frase "estrés abiótico" como se usa aquí se refiere a cualquier efecto adverso sobre el metabolismo, crecimiento, reproducción y/o viabilidad de una planta. De esta forma, se puede inducir estrés abiótico mediante condiciones de crecimiento ambiental s bóptimas como por ejemplo, salinidad, privación de agua, inundación, congelamiento, baja y alta temperatura, toxicidad por metales pesados, anaerobiosis , deficiencia de nutrientes, contaminación atmosférica y radiación UV. Las implicancias del estrés abiótico se describen en la sección ANTECEDENTES. ,
La frase "tolerancia al estrés abiótico" como se usa aquí se refiere a la capacidad que tiene una planta para soportar el estrés abiótico sin sufrir alteración sustancial en el metabolismo, crecimiento, productividad y/o viabilidad.
Como se utiliza aquí, la frase "eficacia en el uso de agua (EUA)" se refiere al nivel de material orgánica producida por unidad de agua consumida por la planta, es decir, el peso seco de una planta en relación al uso de agua por parte de dicha planta, por ejemplo, la biomasa producida por la transpiración por unidad.
Como se utiliza aquí el término "aumentar" se refiere a un
aumento de, al menos, alrededor del 2 %, al menos, alrededor del 3 %, al menos, alrededor del 4 %, al menos, alrededor del 5. %, al menos, alrededor del 10 %, al menos, alrededor del 15 %, al menos, alrededor del 20 %, al menos, alrededor del 30 %, al menos, alrededor del 40 %, al menos, alrededor del 50 %, al menos, alrededor del 60 %, al menos, alrededor del 70 %, al menos, alrededor del 80 , en la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite, eficacia en el uso de agua y/o tolerancia al estrés abiótico de una planta comparado con la planta nativa [es decir, una planta no modificada con las biomoléculas (polinucleótido o polipéptidos ) de la invención, por ejemplo, una planta no transformada de la misma especie que es desarrollada en las mismas condiciones de crecimiento) .
Como se utiliza aquí, la frase "polinucleótido exógeno" se refiere a una secuencia de ácido nucleico heterólogo que puede no expresarse naturalmente dentro de la planta o cuya sobreexpresion se desea en la planta. El polinucleótido exógeno puede introducirse dentro de la planta de manera estable o transitoria, de manera de producir una molécula de ácido ribonucleico (ARN) y/o una molécula de polipéptido. Debe notarse que el polinucleótido exógeno puede comprender una secuencia de ácido nucleico que es idéntica o parcialmente homologa a la secuencia de ácido nucleico endógena de la
planta .
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención el polinucleótido exógeno comprende una secuencia de ácido nucleico que es al menos, alrededor del 80 al menos , alrededor del 81 "3 , al menos , alrededor del 82 ¾ , al menos, alrededor del 83 al menos , alrededor del 84 al menos , alrededor del 85 al menos , alrededor del 86 al menos , alrededor del 87 al menos, alrededor del 88 al menos , alrededor del 89 "6 , al menos , alrededor del 90 al menos, alrededor del 91 al menos, alrededor del 92 al menos, alrededor del 93 ¾ , al menos, alrededor del 93 al menos , alrededor del 94 al menos, alrededor del 95 al menos, alrededor del 96 al menos, alrededor del 97 al menos, alrededor del 98 al menos, alrededor del 99 , por ejemplo, 100 % idéntica a la secuencia de ácido nucleico seleccionada del grupo formado por los NR ID DE SEC: 2506, 2512, 2442, 2496, 2446, 1, 2, 4, 7, 8, ll, 12, 13, 16-19, 21-60, 63-128, 130-137, 270-287, 289-293, 295-306, 308-362, 364-666, 671, 673-1333, 2414-2441, 2443-2445, 2447-2455, 2458-2495, 2497-2505, 2507-2511, 2513-2522.
La identidad (por ejemplo, homología porcentual) puede determinarse usando cualquier software para comparación de homología, incluyendo por ejemplo, el software BlastN del National Center of Biotechnology Information (NCBI) por ejemplo, utilizando los parámetros por defecto.
acuerdo con algunas realizaciones de la invención el polinucleótido exógeno es al menos, alrededor del 80 al menos, alrededor del 81 ¾ , al menos , alrededor del 82 al menos, alrededor del 83 al menos , alrededor del 84 al menos , alrededor del 85 al menos , alrededor del 86 al menos, alrededor del 87 al menos , alrededor del 88 %, al menos , alrededor del 89 o , al menos , alrededor del 90 "6 , al menos, alrededor del 91 ¾ , al menos, alrededor del 92 al menos, alrededor del 93 al menos , alrededor del 93 al menos, alrededor del 94 al menos , alrededor del 95 al menos, alrededor del 96 al menos , alrededor del 97 al menos, alrededor del 98 al menos, alrededor del 99 por ejemplo, 100 % idéntico al polinucleótido seleccionado del grupo formado por los NRs ID DE SEC: 2506, 2512, 2442, 2496, 2446, 1, 2, 4, 7, 8, 11, 12, 13, 16-19, 21-60, 63-128, 130-137, 270-287, 289-293, 295-306, 308-362, 364-666, 671, 673-1333, 2414-2441, 2443-2445, 2447-2455, 2458-2495, 2497-2505, 2507-2511, 2513-2522.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención el polinucleótido exógeno es como se determina en NR ID DE SEC: 2506, 2512, 2442, 2496, 2446, 1, 2, 4, 7, 8, 11, 12, 13, 16-19, 21-60, 63-128, 130-137, 270-287, 289-293, 295-306, 308-362, 364-666, 671, 673-1333, 2414-2441, 2443-2445, 2447-2455, 2458-2495, 2497-2505, 2507-2511, 2513-2521 o 2522.
Como se utiliza aquí, el término "polinucleótido" se
refiere a una secuencia de ácido nucleico de hebra simple o doble que está aislada y provista en la forma de una secuencia de ARN, una secuencia de polinucleótido complementaria (cADN) , una secuencia de polinucleótido genómica y/o secuencias de polinucleótido compuestas (por ejemplo, una combinación de las anteriores) .
El término "aislado" se refiere a estar, al menos parcialmente, separado del entorno natural por ejemplo, de una célula vegetal.
Como se utiliza aquí la frase la frase "secuencia complementaria de polinucleótido" se refiere a una secuencia que resulta de la transcripción inversa del ARN mensajero usando una transcriptasa inversa o cualquier otra ADN polimerasa dependiente de ARN. Dicha secuencia puede subsiguientemente amplificarse in vivo o in vitro usando una ADN polimerasa dependiente de ADN.
Como se utiliza aquí, la frase "secuencia genómica de polinucleótido" se refiere a una secuencia derivada (aislada) de un cromosoma y, por lo tanto, representa una porción contigua de un cromosoma.
Como se utiliza aquí, la frase "secuencia compuesta de polinucleótido " se refiere a una secuencia que es al menos parcialmente complementaria y, al menos, parcialmente genómica. Una secuencia compuesta puede incluir algunas secuencias exónicas requeridas para codificar al polipéptido de la
invención, asi como también a algunas secuencias intrónicas que se interponen entre ellas. Las secuencias intrónicas pueden ser de cualquier fuente, incluyendo de otros genes y, típicamente, incluirán secuencias de señal de empalme conservadas. Dichas secuencias intrónicas pueden, además, incluir elementos regulatorios de la expresión cis-actuante.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, el polinucleótido exógeno de la invención codifica un polipéptidó que tiene una secuencia aminoácida al menos, alrededor del 80 %, al menos, alrededor del 81 %, al menos, alrededor del 82 %, al menos, alrededor del 83 %, al menos, alrededor del 84 %, al menos, alrededor del 85 O
O al menos, alrededor del 86 O.
O al menos , alrededor del 87 0,
O al menos , alrededor del 88 0.
O / al menos, alrededor del 89 *o t al menos , alrededor del 90 g.
? r al menos, alrededor del 91 0,
? al menos , alrededor del 92 o.
? al menos , alrededor del 93 > al menos, alrededor del 94 o,
O al menos, alrededor del 95 o, al menos , alrededor del 96 o, al menos , alrededor del 97 %, al menos , alrededor del 98 o.
O / al menos, alrededor del 99 % , o más , es decir, 100 % homóloga a la secuencia aminoácida seleccionada del grupo formado por los NRs ID DE SEC: 2557, 2560, 184, 238, 188, 154-156, 158-161, 163-183, 185-187, 189-197, 200-237, 239-264, 266-269, 1351, 1365-1425, 1429-1457, 1459, 1461-1730, 1735, 1739-2397, 2533-2541, 2544-2556, 2558, 2559, 2561-2563.
La homología (por ejemplo, homología porcentual) puede
determinarse usando cualquier software para comparación de homología incluyendo por ejemplo, los softwares BlastP o TBLASTN de National Center of Biotechnology Information (NCBI, por sus siglas en inglés) por ejemplo, usando los parámetros por defecto cuando se comienza con una secuencia de polipéptido; o el algoritmo tBLASTX (disponible por el NCBI) por ejemplo, usando los parámetros por defecto; dicho algoritmo compara los productos de traducción conceptual de seis marcos de una secuencia pregunta (query) de nucleótido (ambas hebras) contra una bases de datos de secuencia de proteína.
Las secuencias homologas incluyen tanto a las secuencias ortólogas como parólogas. El término "parálogo" se refiere a duplicaciones génicas dentro del genoma de una especie que conduce a genes parálogos. El término "ortólogo" se refiere a genes homólogos en diferentes organismos debido a una relación ancestral .
Una opción para identificar ortólogos en una especie de planta monocotiledónea es realizar una búsqueda blast recíproca. Esto puede realizarse mediante una primer búsqueda blast (búsqueda de parecidos en una base de datos) que incluye comparar la secuencia de interés con cualquier base de datos de secuencia, como por ejemplo, la base de datos pública disponible por NCBI que puede encontrarse en: Hypertext Transfer Protocol : //World Wide Web (punto) nebí (punto) nlm (punto) nih (punto) gov. Si se buscaran ortólogos en arroz, la
secuencia de interés seria sometida a una búsqueda blast contra por ejemplo, los 28.469 clones cADN de longitud completa de Oryza sativa Nipponbare disponible en NCBI. Los resultados de la búsqueda blast pueden filtrarse. Las secuencias de longitud completa tanto de los resultados filtrados como no filtrados, se vuelven a someter a otra búsqueda blast (segundo blast) contra las secuencias del organismo del que deriva la secuencia de interés. Luego se comparan los resultados de la primera y segunda búsqueda blast. Se identifica un ortólogo cuando la secuencia resultante con puntaje más alto (mejor acierto (hit) ) en la primera búsqueda blast, identifica en el segundo blast a la secuencia pregunta (query) (secuencia de interés original) como el mejor acierto (hit). Usando la misma lógica, se encuentra un parálogo (homólogo de un gen en el mismo organismo). En el caso de grandes familias de secuencias, se puede utilizar el programa ClustalW [Hypertext Transfer Protocol : //World Wide Web (punto) ebi (punto) ac (punto) uk/Tools/clustalw2/index (punto) html] , seguido por un árbol vecino que se ensambla (Hypertext Transfer Protocol : //en (punto) wikipedia (punto) org/wiki/Neighbor-joining) que ayuda a visualizar el agrupamiento .
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, el polinucleótido exógeno codifica un polipéptido que consiste en la secuencia aminoácida determinada por el NR ID DE SEC: 2557, 2560, 184, 238, 188, 154-156, 158-161, 163-183, 185-187, 189-
197, 200-237, 239-264, 266-269, 1351, 1365-1425, 1429-1457, 1459, 1461-1730, 1735, 1739-2397, 2533-2541, 2544-2556, 2558, 2559, 2561-2562 o 2563.
De acuerdo con un aspecto de algunas realizaciones de la invención se provee un método para aumentar la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite y/o tolerancia al estrés abiótico de una planta. El método se realiza expresando dentro de la planta un polinucleótido exógeno que comprende la secuencia de ácido nucleico seleccionado del grupo que consiste en los NRs ID DE SEC: 2506, 2512, 2442, 2496, 2446, 1, 2, 4, 7, 8, 11, 12, 13, 16-19, 21-60, 63-128, 130-137, 270-287, 289-293, 295-306, 308-362, 364-666, 671, 673-1333, 2414-2441, 2443-2445, 2447-2455, 2458-2495, 2497-2505, 2507-2511, 2513-2522, 3, 5, 6, 9, 10, 14, 15, 20, 61, 62, 129, 288, 294, 307, 363, 667, 668, 669, 670, 672, 2398-2413, 2456 y 2457, aumentando asi la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite y/o tolerancia al estrés abiótico de la planta.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención el polinucleótido exógeno está determinado por el NR ID DE SEC: 2506, 2512, 2442, 2496, 2446, 1, 2, 4, 7, 8, 11, 12, 13, 16-19, 21-60, 63-128, 130-137, 270-287, 289-293, 295-306, 308-362, 364-666, 671, 673-1333, 2414-2441, 2443-2445, 2447-2455, 2458-
2495, 2497-2505, 2507-2511, 2513-2522, 3, 5, 6, 9, 10, 14, 15, 20, 61, 62, 129, 288, 294, 307, 363, 667, 668, 669, 670, 672, 2398-2413, 2456 o 2457.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, el polinucleótido exógeno de la invención codifica un polipéptido que tiene una secuencia de aminoácido seleccionada del grupo que consiste en los NRs ID DE SEC: 2557, 2560, 184, 238, 188, 154-156, 158-161, 163-183, 185-187, 189-197, 200-237, 239-264, 266-269, 1351, 1365-1425, 1429-1457, 1459, 1461-1730, 1735, 1739-2397, . 2533-2541, 2544-2556, 2558, 2559, 2561-2563, 138-143, 146, 148, 150-152, 157, 162, 198, 265, 1334-1350, 1352-1364, 1426-1428, 1458, 1460, 1732-1734, 1737-1738, 2523-2532, 2542 y 2543, aumentando asi la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite y/o tolerancia al estrés abiótico de la planta.
De acuerdo con un aspecto de algunas realizaciones de la invención se provee un método para aumentar la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante y/o contenido de aceite de una planta. El método se realiza expresando dentro de la planta un polinucleótido exógeno que comprende una secuencia de ácido nucleico que tiene una identidad de, al menos, el 80% con respecto al NR ID DE SEC: 3, 5, 6, 9, 10, 14, 15, 288, 294, 2398-2412 o 2413, aumentando asi la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del
fertilizante, y/o contenido de aceite de la planta.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención el polinucleótido exógeno comprende una secuencia de ácido nucleico que tiene una identidad de, al menos, alrededor del 80 %, al menos, alrededor del 81 %, al menos, alrededor del 82 %, al menos, alrededor del 83 %, al menos, alrededor del 84 %, al menos, alrededor del 85 %, al menos, alrededor del 86 %, al menos, alrededor del 87 %, al menos, alrededor del 88 %, al menos, alrededor del 89 %, al menos, alrededor del 90 %, al menos, alrededor del 91 %, al menos, alrededor del 92 %, al menos, alrededor del 93 %, al menos, alrededor del 94 %, al menos, alrededor del 95 %, al menos, alrededor del 96 %, al menos, alrededor del 97 %, al menos, alrededor del 98 %, al menos, alrededor del 99 %, por ejemplo, 100 % de identidad con respecto a la secuencia de ácido nucleico seleccionada del grupo que consiste en los NRs ID DE SEC: 3, 5, 6, 9, 10, 14, 15, 288, 294, 2398-2413.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención el polinucleótido exógeno tiene una identidad de, al menos, alrededor del 80 %, al menos, alrededor del 81 %, al menos, alrededor del 82 % al menos, alrededor del 83 % al menos, alrededor del 84 % al menos, alrededor del 85 % al menos, alrededor del 86 % al menos, alrededor del 87 % al menos, alrededor del 88 % al menos, alrededor del 89 % al menos, alrededor del 90 % al menos, alrededor del 91 % al menos,
alrededor del 92 %, al menos, alrededor del 93 %, al menos, alrededor del 94 %, al menos, alrededor del 95 %, al menos, alrededor del 96 %, al menos, alrededor del 97 %, al menos, alrededor del 98 %, al menos, alrededor del 99 %, por ejemplo, 100 % con respecto al polinucleótido seleccionado del grupo que consiste en los NRs ID DE SEC: 3, 5, 6, 9, 10, 14, 15, 288, 294, 2398-2413.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención el polinucleótido exógeno está determinado por el NR ID DE SEC: 3, 5, 6, 9, 10, 14, 15, 288, 294, 2398-2412 o 2413.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, el polinucleótido exógeno de la invención codifica un polipéptido que tiene una secuencia de aminoácido con una homología de, al menos, alrededor del 80 al menos , alrededor del 81 al menos, alrededor del 82 al menos , alrededor del 83 al menos, alrededor del 84 al menos , alrededor del 85 al menos, alrededor del 86 al menos, alrededor del 87 al menos, alrededor del 88 al menos , alrededor del 89 al menos, alrededor del 90 al menos, alrededor del 91 al menos, alrededor del 92 al menos , alrededor del 93 al menos, alrededor del 94 al menos , alrededor del 95 al menos, alrededor del 96 al menos , alrededor del 97 "5 , al menos, alrededor del 98 al menos , alrededor del 99 por ej emplo , 100 % con respecto a la secuencia de aminoácido seleccionada del grupo que consiste en los NRs ID DE SEC: 138-
153, 1334-1350, 1352-1364, 1458, 1460, 2523-2532.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, el polinucleótido exógeno codifica un polipéptido que consiste en la secuencia aminoácida determinada por el NR ID DE SEC: 138-153, 1334-1350, 1352-1364, 1458, 1460, 2523-2531 o 2532.
Las secuencias de ácido nucleico que codifican a los polipéptidos de la presente invención, pueden optimizarse mediante la expresión. Los ejemplos no limitantes de secuencias de aminoácido optimizadas se proveen en los NRs ID DE SEC: 2415, 2420, 2428, 2430, 2431, 2436, 2437, 2441, 2444, 2445, 2446, 2451, 2456, 2468, 2471, 2478, 2481, 2484, 2520 y 2522 (Tabla 23) . Los ejemplos de dichas modificaciones de secuencia incluyen, pero no están limitadas a, un contenido G/C alterado para acercarse más al típicamente hallado en las especies vegetales de interés, y la remoción de codones atípicamente hallada en las especies vegetales, referida aquí, como optimización de codones.
La frase "optimización de codón" se refiere a la selección de nucleótidos de ADN adecuados para usar dentro de un gen o fragmento estructural que incluye la utilización del codón dentro de la planta de interés. Por lo tanto, un gen optimizado o secuencia de ácido nucleico se refiere a un gen en el que la secuencia de nucleótido del gen nativo o natural ha sido modificada para utilizar codones estadísticamente preferidos o favorables dentro de la planta. Típicamente, la secuencia de
nucleótido se examina a nivel ADN y se optimiza la región codificante para la expresión en la especie vegetal determinada usando cualquier procedimiento adecuado, por ejemplo, el descripto en Sardana y colab. (1996, Plant Cell Reports 15:677-681) . En este método, la desviación estándar de la utilización del codón, una medida del sesgo de uso del codón, puede calcularse hallando primero la desviación proporcional al cuadrado de la utilización de cada codón del gen natural con respecto a la de los genes altamente expresados en la planta, seguido por el cálculo de la desviación al cuadrado promedio. La fórmula utilizada es: 1 SDCU = n = 1 N [ ( Xn - Yn ) / Yn ] 2 / N, donde Xn se refiere a la frecuencia de utilización del codón n en genes altamente expresados en la planta, Yn a la frecuencia de utilización del codón n en el gen de interés y N se refiere a la cantidad total de codones en el gen de interés. Se compiló una tabla de utilización de codones de genes altamente expresados de plantas dicotiledóneas usando los datos de Murray y colab. (1989, Nuc Acids Res. 17:477-498) .
Un método para optimizar la secuencia de ácido nucleico de acuerdo con la utilización preferida del codón para un tipo de célula vegetal particular, está basado en el uso directo, sin realizar ningún cálculo estadístico extra, de las tablas de optimización de codones como por ejemplo, las provistas en línea en la Base de Datos de Utilización de Codones de NIAS ((National Institute of Agrobiological Sciences) banco de DNA
de Japón (http://www.kazusa.or.jp/codon/). La Base de Datos de Utilización de Codones contiene tablas para la utilización de codones para una cantidad de especies diferentes, cada tabla de utilización de codones ha sido estadísticamente determinada en base a los datos presentes en Genbank.
Se puede optimizar el codón de una secuencia de nucleótido natural que codifica una proteina de interés para esa especie vegetal particular, utilizando las tablas anteriores para determinar los codones más preferidos o favoritos para cada aminoácido en una especie particular (por ejemplo, arroz) . Esto se realiza reemplazando codones que pueden tener una baja incidencia estadística en el genoma de una especie particular por codones correspondientes, relacionados con un aminoácido, que son estadísticamente más favorables. Sin embargo, se puede seleccionar uno o más codones menos favoritos para eliminar los sitios de restricción existentes para crear nuevos empalmes potencialmente útiles (extremos 5' y 3' para agregar péptido de señal o cassettes de terminación, sitios internos que podrían utilizarse para cortar y unir segmentos para producir una secuencia correcta de longitud completa) , o para eliminar secuencias de nucleótido que pueden afectar negativamente la estabilidad o expresión de mARN.
La secuencia de nucleótido codificante natural puede ya, antes de cualquier modificación, contener una cantidad de codones que corresponden a un codón estadísticamente favorecido
en una especie vegetal particular. Por lo tanto, la optimización de codones de la secuencia de nucleótido natural, puede comprender la determinación de qué codones, dentro de la secuencia de nucleótido natural, no están estadísticamente favorecidos con respecto a una planta particular, y modificar estos codones de acuerdo con la tabla de utilización de codones de la planta particular para producir un derivado optimizado del codón. Una secuencia de nucleótido modificada puede estar completa o parcialmente optimizada para la utilización de un codón vegetal con la condición de que la proteína codificada por la secuencia de nucleótido se produzca a un nivel superior que la proteína codificada por el gen natural o nativo correspondiente. La construcción de genes sintéticos alterando la utilización del codón se describe en por ejemplo, la Solicitud de Patente PCT 93/07278.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, el polinucleótido exógeno es un ARN no codificante.
Como se utiliza aquí, la frase ^ARN no codificante" se refiere a una molécula de ARN que no codifica una secuencia de aminoácido (un polipéptido) . Ejemplos de dichas moléculas de ARN no codificante incluyen, pero no están limitadas a, ARN antisentido, un pre-miARN (precursor de un microARN) , o un precursor de ARN, ARN de interacción con Piwi (piARN) .
De acuerdo con una realización específica, el polinucleótido no codificante comprende una secuencia de ácido
nucleico del NR ID DE SEC: 64 o 2459 (EUN512).
De esta forma, la invención incluye las secuencias de aminoácidos aislados descriptas aqui anteriormente; fragmentos de las mismas, secuencias hibridables con las mismas, secuencias homologas, secuencias que codifican polipéptidos similares usando diferentes codones, secuencias alteradas caracterizadas por mutaciones como por ejemplo, eliminación, inserción o sustitución de uno o más nucleótidos, tanto naturales como inducidos por el hombre, de manera aleatoria o dirigida .
La invención provee un polinucleótido aislado que comprende una secuencia de ácido nucleico al menos, alrededor del 80 %, al menos, alrededor del 81 %, al menos, alrededor del
82 % , al menos, alrededor del 8 3 %, al menos, alrededor del 84
%, al menos, alrededor del 85 % , al menos, alrededor del 86 Q.
o al menos, alrededor del 8 7 %, al menos , alrededor del 88 Q.
o al menos, alrededor del 89 Q.
0 , al menos, alrededor del 90 Q.
o al menos , alrededor del 91 o
o , al menos , alrededor del 92 Q.
0 al menos, alrededor del 93 o
o , al menos , alrededor del 93 Q.
° / al menos , alrededor del 94 o
o , al menos , alrededor del 95 0.
o / al menos, alrededor del 96 Q.
"6 , al menos , alrededor del 97 o
o al menos, alrededor del 98 Q. al menos, alrededor del 99 g. por ejemplo, 100 % idéntica al polinucleótido seleccionado del grupo formado por los NRs ID DE SEC: 2506, 2512, 2442, 2496, 2446, 1, 2, 4, 7, 8, 11, 12, 13, 16-19, 21-60, 63-128, 130-137,
270-287, 289-293, 295-306, 308-362, 364-666, 671, 673-1333, 2414-2441, 2443-2445, 2447-2455, 2458-2495, 2497-2505, 2507- 2511, 2513-2522.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención la secuencia de ácido nucleico es capaz de aumentar la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite, tolerancia al estrés abiótico y/o eficacia en el uso de agua de una planta.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención el polinucleótido aislado comprende la secuencia de ácido nucleico seleccionada del grupo que consiste en los NRs ID DE SEC: 2506,
2512, 2442, 2496, 2446, 1, 2, 4, 7, 8, 11, 12, 13, 16-19, 21-60, 63-128, 130-137, 270-287, 289-293, 295-306, 308-362, 364-666, 671, 673-1333, 2414-2441, 2443-2445, . 2447-2455, 2458-2495, 2497-2505, 2507-2511, 2513-2522, 3, 5, 6, 9, 10, 14, 15, 20, 61, 62, 129, 288, 294, 307, 363, 667, 668, 669, 670, 672, 2398-2413, 2456 y 2457.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención el polinucleótido aislado es como lo determina el NR ID DE SEC: 2506, 2512, 2442, 2496, 2446, 1, 2, 4, 7, 8, 11, 12, 13, 16-19, 21-60, 63-128, 130-137, 270-287, 289-293, 295-306, 308-362, 364-666, 671, 673-1333, 2414-2441, 2443-2445, 2447-2455, 2458-2495, 2497-2505, 2507-2511, 2513-2522, 3, 5, 6, 9, 10, 14, 15, 20, 61, 62, 129, 288, 294, 307, 363, 667, 668, 669, 670, 672,
2398-2413, 2456 o 2457.
La invención provee un polinucleótido aislado que comprende una secuencia de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende una secuencia aminoácida al menos , alrededor del 80 0. al menos , alrededor del 81 al menos, alrededor del 82 al menos , alrededor del 83 al menos , alrededor del 84 al menos , alrededor del 85 al menos , alrededor del 86 al menos, alrededor del 87 al menos, alrededor del 88 al menos, alrededor del 89 al menos, alrededor del 90 al menos, alrededor del 91 al menos, alrededor del 92 al menos , alrededor del 93 al menos , alrededor del 93 al menos , alrededor del 94 o , al menos, alrededor del 95 al menos , alrededor del 96 o , al menos, alrededor del 97 al menos , alrededor del 98 al menos, alrededor del 99 a.
o , o más , es decir, 100 "6 omóloga a la secuencia aminoácida seleccionada del grupo formado por los NRs ID DE SEC: 2557, 2560, 184, 238, 188, 154-156, 158-161, 163-183, 185-187, 189-197, 200-237, 239-264, 266-269, 1351, 1365-1425, 1429-1457, 1459, 1461-1730, 1735, 1739-2397, 2533-2541, 2544-2556, 2558, 2559, 2561-2563.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención la secuencia aminoácida es capaz de aumentar la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite, tolerancia al estrés abiótico y/o eficacia en el uso de agua de
una planta.
La invención provee un polinucleótido aislado que comprende una secuencia de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido seleccionado del grupo que consiste en los NRs ID DE SEC: 2557, 2560, 184, 238, 188, 154-156, 158-161, 163-183, 185-187, 189-197, 200-237, 239-264, 266-269, 1351, 1365-1425, 1429-1457, 1459, 1461-1730, 1735, 1739-2397, 2533-2541, 2544-2556, 2558, 2559, 2561-2563, 138-143, 146, 148, 150-152, 157, 162, 198, 265, 1334-1350, 1352-1364, 1426-1428, 1458, 1460, 1732-1734, 1737-1738, 2523-2532, 2542 y 2543.
La invención provee un polipéptido aislado que comprende una secuencia aminoácida al menos, alrededor del 80 al menos, alrededor del 81 , al menos , alrededor del 82 al menos, alrededor del 83 , al menos , alrededor del 84 al menos , alrededor del 85 , al menos , alrededor del 86 al menos, alrededor del 87 , al menos, alrededor del 88 al menos, alrededor del 89 % , al menos , alrededor del 90 al menos, alrededor del 91 , al menos , alrededor del 92 al menos, alrededor del 93 , al menos , alrededor del 93 al menos, alrededor del 94 , al menos, alrededor del 95 al menos, alrededor del 96 , al menos, alrededor del 97 al menos, alrededor del 98 %, al menos, alrededor del 99 %, o más, es decir, 100 % homologa a una secuencia aminoácida seleccionada del grupo formado por los NRs ID DE SEC: 2557,
2560, 184, 238, 188, 154-156, 158-161, 163-183, 185-187, 189-197, 200-237, 239-264, 266-269, 1351, 1365-1425, 1429-1457, 1459, 1461-1730, 1735, 1739-2397, 2533-2541, 2544-2556, 2558, 2559, 2561-2563.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, el polipéptido comprende una secuencia de aminoácido seleccionada del grupo que consiste en los NRs ID DE SEC: 2557, 2560, 184, 238, 188, 154-156, 158-161, 163-183, 185-187, 189-197, 200-237, 239-264, 266-269, 1351, 1365-1425, 1429-1457, 1459, 1461-1730, 1735, 1739-2397, 2533-2541, 2544-2556, 2558, 2559, 2561-2563, 138-143, 146, 148, 150-152, 157, 162, 198, 265, 1334-1350, 1352-1364, 1426-1428, 1458, 1460, 1732-1734, 1737-1738, 2523-2532, 2542 y 2543.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, el polipéptido es como lo determina el NR ID DE SEC: 2557, 2560, 184, 238, 188, 154-156, 158-161, 163-183, 185-187, 189-197, 200-237, 239-264, 266-269, 1351, 1365-1425, 1429-1457, 1459, 1461-1730, 1735, 1739-2397, 2533-2541, 2544-2556, 2558, 2559, 2561-2563, 138-143, 146, 148, 150-152, 157, 162, 198, 265, 1334-1350, 1352-1364, 1426-1428, 1458, 1460, 1732-1734, 1737-1738, 2523-2532, 2542 o 2543.
La invención también incluye fragmentos de los polipeptidos descriptos anteriormente y polipéptidos que tienen mutaciones, como por ejemplo, eliminaciones, inserciones o sustituciones de uno o más aminoácidos, tanto naturales como
inducidos por el hombre, de manera aleatoria o dirigida.
El término "planta" como se usa aquí, incluye plantas completas, antecesoras y progenie de plantas y partes de plantas incluyendo semillas, brotes, tallos, raices (incluyendo tubérculos) y células, tejidos y órganos vegetales. La planta puede tener cualquier forma incluyendo cultivos en suspensión, embriones, regiones meristemáticas , tejido calloso, hojas, gametofitos, esporófitos, polen y microesporas . Las plantas que son particularmente útiles para los métodos de la invención incluyen a todas las plantas que pertenecen a la superfamilia Viridiplantae, en particular, plantas monocotiledóneas y dicotiledóneas que incluyen forraje o legumbres forrajeras, plantas ornamentales, cultivo de comestibles, árboles o arbustos seleccionados de la lista que comprende: Acacia spp., Acer spp., Actinidia spp., Aesculus spp., Agathis australis, Albizia amara, Alsophila tricolor, Andropogon spp., Arachis spp, Areca catechu, Astelia fragrans, Astragalus cicer, Baikiaea plurijuga, Betula spp., Brassica spp., Bruguiera gymnorrhiza, Burkea africana, Butea frondosa, Cadaba farinosa, Calliandra spp, Camellia sinensis, Canna indica, Capsicum spp., Cassia spp., Centroema pubescens, Chacoomeles spp., Cinnamomum cassia, Coffea arábica, Colophospermum mopane, Coronillia varia, Cotoneaster serótina, Crataegus spp., Cucumis spp., Cupressus spp., Cyathea dealbata, Cydonia oblonga, Cryptomeria japónica, Cymbopogon spp., Cynthea dealbata, Cydonia oblonga,
Dalbergia monetaria, Davallia divaricata, Desmodium spp., Dicksonia squarosa, Dibeteropogon amplectens, Dioclea spp, Dolichos spp., Dorycnium rectum, Echinochloa pyramidalis, Ehraffia spp., Eleusine coracana, Eragrestis spp., Erythrina spp., Eucalypfus spp., Euclea schimperi, Eulalia vi/losa, Pagopyrum spp., Feijoa sellowlana, Fragaria spp., Flemingia spp, Freycinetia banksli, Geranium thunbergii, GinAgo biloba, Glycine javanica, Gliricidia spp, Gossypium hirsutum, Grevillea spp., Guibourtia coleosperma, Hedysarum spp., Hemaffhia altissima, Heteropogon contoffus, Hordeum vulgare, Hyparrhenia rufa, Hypericum erectum, Hypeffhelia dissolute, Indigo incamata, Iris spp., Leptarrhena pyrolifolia, Lespediza spp., Lettuca spp. , Leucaena leucocephala, Loudetia simplex, Lotonus bainesli, Lotus spp., Macrotyloma axillare, Malus spp., Manihot esculenta, Medicago saliva, Metasequoia glyptostroboides, Musa sapientum, Nicotianum spp., Onobrychis spp., Ornithopus spp., Oryza spp., Peltophorum africanum, Pennisetum spp., Persea gratissima, Petunia spp., Phaseolus spp., Phoenix canariensis, Phormium cookianum, Photinia spp., Picea glauca, Pinus spp., Pisum sativam, Vainaocarpus totara, Pogonarthria fleckii, Pogonaffhria squarrosa, Populus spp., Prosopis cineraria, Pseudotsuga menziesii, Pterolobium stellatum, Pyrus communis, Quercus spp., Rhaphiolepsis umbellata, Rhopalostylis sápida, Rhus natalensis, Ribes grossularia, Ribes spp., Robinia pseudoacacia, Rosa spp., Rubus spp., Salix spp., Schyzachyriuna
sanguineum, Sciadopitys vefficillata, Sequoia sempervirens, Sequoiadendron giganteum, Sorghum bicolor, Spinacia spp., Sporobolus fimbriatus , Stiburus alopecuroides, Stylosanthos hurailis, Tadehagi spp, Taxodium distichum, Themeda triandra, Trifolium spp . , Triticum spp., Tsuga heterophylla, Vaccinium sp . , Vicia spp., Vitis vinifera, atsonia pyramidata, Zantedeschia aethiopica, Zea raays, amaranto, alcaucil, espárrago, brócoli, repollito de Bruselas, repollo, cañóla, zanahoria, coliflor, apio, berza, lino, col rizada, lentejas, colza oleaginosa, quingombó, cebolla, papa, arroz, poroto de soja, popote, remolacha azucarera, caña de azúcar, girasol, tomate, calabaza, maíz, trigo, cebada, centeno, avena, maní, arveja, lenteja y alfalfa, algodón, semilla de colza, cañóla, pimienta, girasol, tabaco, berenjena, eucaliptos, un árbol, una planta ornamental, césped perenne y cultivo forrajero. Alternativamente, pueden usarse para los métodos de la presente invención, algas y otras plantas no Viridiplantae.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, la planta utilizada por el método de la invención es una planta de cultivo como por ejemplo, arroz, maíz, trigo, cebada, maní, papa, sésamo, olivo, aceite de palma, banana, poroto de soja, girasol, cañóla, caña de azúcar, alfalfa, mijo, leguminosas (judía, arveja), lino, lupino, semilla de colza, tabaco, álamo y algodón.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, se
provee una célula vegetal que expresa de manera exógena al polinucleótido de algunas realizaciones de la invención, al constructo de ácido nucleico de algunas realizaciones de la invención y/o al polipéptido de algunas realizaciones de la invención .
La expresión del polinucleótido exógeno de la invención dentro de la planta se puede realizar transformando una o más células vegetales con el polinucleótido exógeno, seguido por la generación de una planta madura a partir de células transformadas y el cultivo de la planta madura en condiciones adecuadas para expresar al polinucleótido exógeno dentro de la planta madura.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, la transformación se realiza introduciendo en la célula vegetal, un constructo de ácido nucleico que incluye al polinucleótido exógeno de algunas realizaciones de la invención y, al menos, un promotor capaz de dirigir la transcripción del polinucleótido exógeno en la célula hospedante (una célula vegetal) . En adelante, se proveen más detalles de los métodos de transformación adecuados.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, se provee un constructo de ácido nucleico que comprende al polinucleótido aislado de la invención, y un promotor para dirigir la transcripción de la secuencia de ácido nucleico en una célula hospedante.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, el polinucleótido aislado está operativamente ligado a la secuencia promotora.
Una secuencia de ácido nucleico codificante está "operativamente ligada" a una secuencia regulatoria (por ejemplo, un promotor), si la secuencia regulatoria es capaz de ejercer un efecto regulatorio sobre la secuencia de codificación ligada a ella.
Como se utiliza aquí, el término "promotor" se refiere a una región de ADN que está ubicada corriente arriba del sitio de iniciación transcripcional de un gen al que se liga la ARN polimerasa para iniciar la transcripción del ARN. El promotor controla dónde (por ejemplo, qué porción de una planta) y/o cuándo (por ejemplo, en qué estado o condición en la vida de un organismo) se expresa el gen.
Cualquier secuencia promotora adecuada puede utilizarse mediante el constructo de ácido nucleico de la presente invención. Preferentemente, el promotor es un promotor constitutivo, un promotor especifico de tejido, o un promotor inducible por estrés abiótico.
Los promotores constitutivos adecuados incluyen, por ejemplo, al promotor CaMV 35S (NR ID DE SEC: 3063; Odell y colab., Nature 313:810-812, 1985); promotor de Arabidopsis At6669 (NR ID DE SEC: 3064; véase la Publicación PCT N° WO04081173A2) ; de maiz Ubi 1 (Christensen y colab., Plant Sol.
Biol. 18:675-689, 1992); actina de · arroz (McElroy y colab., Plant Cell 2:163-171, 1990); pEMU (Last y colab., Theor. Appl. Genet. 81:581-588, 1991); CaMV 19S (Nilsson y colab., Physiol. Plant 100:456-462, 1997); GOS2 (de Pater y colab., Plant J Nov; 2(6):837-44, 1992); ubiquitina (Christensen y colab., Plant Mol. Biol. 18: 675-689, 1992); ciclofilina de arroz (Bucholz y colab., Plant Mol Biol. 25 (5) : 837-43, 1994); histona H3 en maíz (Lepetit y colab., Mol. Gen. Genet. 231: 276-285, 1992); Actina 2 (An y colab., Plant J. 10(1); 107-121, 1996) y Super MAS sintético (Ni y colab., The Plant Journal 7: 661-76, 1995). Otros promotores constitutivos incluyen aquellos de las Patentes Estadounidenses Nros 5.659.026. 5.608.149; 5.608.144; 5.604.121; 5.569.597: 5.466.785; 5.399.680; 5.268.463; y 5.608.142.
Los promotores específicos de tejido adecuados incluyen, pero no están limitados a, promotores específicos de hoja [como los descriptos, por ejemplo, por Yamamoto y colab., Plant. J. 12:255-265, 1997; Kwon y colab., Plant Physiol. 105:357-67, 1994; Yamammoto y colab., Plant Cell Physiol. 35:773-778, 1994; Gotor y colab., Plant J. 3:509-18, 1993; Orozco y colab., Plant Mol. Biol. 23:1129-1138, 1993; y Matsuoka y colab., Proc. Nati. Acad. Sci. USA 90:9586-9590, 1993], preferidos de semilla [por ejemplo, genes específicos de semilla (Simón, y colab., Plant Mol. Biol. 5. 191, 1985; Scofield, y colab., J. Biol. Chem. 262: 12202, 1987; Baszczynski, y colab., Plant Mol. Biol. 14:
633, 1990), albúmina de nuez de brasil (Pearson y colab., Plant Mol. Biol. 18: 235- 245, 1992), legumina (Ellis, y colab. Plant Mol. Biol. 10: 203-214, 1988), Glutelina (arroz) (Takaiwa, y colab., Mol. Gen. Genet . 208: 15-22, 1986; Takaiwa, y colab., FEBS Letts. 221: 43-47, 1987), Zeina (Matzke y colab. Plant Mol Biol, 143: 323-32 1990), napA (Stalberg, y colab., Planta 199: 515-519, 1996), trigo SPA (Albanietal, Plant Cell, 9: 171- 184,
1997) , oleosina en girasol (Cummins, y colab., Plant Mol. Biol. 19: 873- 876, 1992)], promotores específicos de endosperma [por ejemplo, trigo LM y HMW, glutenina-1 (Mol Gen Genet 216:81-90, 1989; NAR 17:461-2), gliadinas a, b y g de trigo (EMBO3:1409-15, 1984), promotor ltrl en cebada, hordeína Bl, C, D en cebada (Theor Appl Gen 98:1253-62, 1999; Plant J 4:343-55, 1993; Mol Gen Genet 250:750- 60, 1996), DOF en cebada (Mena y colab., The Plant Journal, 116(1) : 53- 62, 1998), Biz2 (EP99106056.7 ) , promotor sintético (Vicente-Carbaj osa y colab., Plant J. 13: 629-640, 1998), prolamina de arroz NRP33, globulina Glb-1 de arroz (Wu y colab., Plant Cell Physiology 39(8) 885- 889,
1998) , alfa-globulina REB/OHP-1 de arroz (Nakase y colab. Plant Mol. Biol. 33: 513-S22, 1997), ADP-glucosa PP de arroz (Trans
Res 6:157-68, 1997), familia génica en la región ESR del maíz (Plant J 12:235-46, 1997), gamma- kafirina de sorgo (PMB 32:1029-35, 1996)] promotores específicos del embrión [por ejemplo, OSH1 de arroz (Sato y colab., Proc. Nati. Acad. Sci. USA, 93: 8117-8122), KNOX ( Postma-Haarsma y colab., Plant Mol.
Biol. 39:257-71, 1999), oleosina de arroz (Wu y colab., J. Biochem., 123:386, 1998)], y promotores específicos de la flor [por ejemplo, AtPRP4, sintasa (chsA) (Van der Meer, y colab., Plant Mol. Biol. 15, 95-109, 1990), LAT52 (Twell y colab., Mol. Gen Genet . 217:240-245; 1989), apétala- 3] .
Los promotores inducibles por estrés abiótico incluyen, pero no están limitados a, promotores inducibles por salinidad como por ejemplo, RD29A ( Yamaguchi-Shinozalei y colab., Mol. Gen. Genet. 236:331-340, 1993); promotores inducibles por sequía como el promotor génico rabl7 del maíz (Pía y colab., Plant Mol. Biol. 21:259-266, 1993), promotor génico rab28 del maíz (Busk y colab., Plant J. 11:1285-1295, 1997) y promotor génico Ivr2 del maíz (Pelleschi y colab., Plant Mol. Biol. 39:373-380, 1999); promotores inducibles por calor como por ejemplo, el promotor tomate hsp80 del tomate (Patente estadounidense N° 5.187.267) .
El constructo de ácido nucleico de algunas realizaciones de la invención puede incluir un marcador seleccionable apropiado y/o un origen de replicación apropiado. De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, el constructo de ácido nucleico utilizado es un vector transformador ("shuttle") que puede tanto propagarse en E. coli (donde el constructo comprende un marcador seleccionable adecuado y un origen de replicación) como ser compatible con la propagación en células. El constructo de acuerdo con la presente invención puede ser,
por ejemplo, un plásmido, bácmido, fagémido, cósmido, fago, un virus o cromosoma artificial.
El constructo de ácido nucleico de algunas realizaciones de la invención, puede utilizarse de manera estable o transitoria para transformar células vegetales. En la transformación estable, el polinucleótido exógeno se integra dentro del genoma de la planta y, como tal, representa una característica estable y heredada. En la transformación transitoria, el polinucleótido exógeno es expresado por la célula transformada pero no se integra dentro del genoma y, como tal, representa una característica transitoria.
Existen varios métodos para introducir genes extraños en plantas monocotiledóneas y dicotiledóneas (Potrykus, I. Annu. Rev. Plant. Physiol., Plant. Mol. Biol. (1991) 42:205-225; Shimamoto y colab., Nature (1989) 338:274-276) .
Los métodos principales para producir la integración estable de ADN exógeno en ADN genómico vegetal incluyen dos métodos principales:
(i) Transferencia génica mediada por Agrobacterium: Klee y colab. (1987) Annu. Rev. Plant Physiol. 38:467-486; Klee and Rogers en Cell Culture and Somatic Cell Genetics of Plants, Vol. 6, Molecular Biology of Plant Nuclear Genes, Editores: Schell, J., and Vasil, L. K., Academic Publishers, San Diego, Calif. (1989) p. 2-25; Gatenby, en Plant Biotechnology, eds . Kung, S. and Arntzen, C. J. , Butterworth Publishers, Boston,
Mass. (1989) páginas 93-112.
(ii) Captación directa de ADN: Paszkowski y colab., en Cell Culture and Somatic Cell Genetics of Plants., Vol. 6, Molecular Biology of Plant Nuclear Genes eds . Schell, J. , y Vasil, L. K., Academic Publishers, San Diego, Calif. (1989) páginas 52-68; incluyendo los métodos para la captación directa de ADN en protoplastos , Toriyama, K. y colab. (1988) Bio/Technology 6:1072-1074. La captación de ADN inducida mediante choque eléctrico de células vegetales: Zhang y colab. Plant Cell Rep. (1988) 7:379-384. Fromm y colab. Nature (1986) 319:791-793. Inyección de ADN en células o tejidos vegetales mediante bombardeo de partículas, Klein y colab. Bio/Technology (1988) 6:559-563; McCabe y colab. Bio/Technology (1988) 6:923-926; Sanford, Physiol. Plant. (1990) 79:206-209; mediante el uso de sistemas de micropipetas : Neuhaus y colab., Theor. Appl. Genet. (1987) 75:30-36; Neuhaus and Spangenberg, Physiol. Plant. (1990) 79:213-217; transformación de fibras de vidrio y filamentos de carburo de silicio de cultivos celulares, embriones o tejido calloso, Patente Estadounidense N° 5.464.765 o mediante la incubación directa de ADN con polen germinante, De et y colab. en Experimental Manipulation of Ovule Tissue, eds. Chapman, G. P. and Mantell, S. H. and Daniels, W. Longman, London, (1985) páginas 197-209; y Ohta, Proc. Nati. Acad. Sci. USA (1986) 83:715-719.
El sistema mediado por Agrobacterium incluye el uso de
vectores de plásmido que contienen segmentos de ADN definidos que se integran en el ADN genómico de la planta. Los métodos de inoculación del tejido vegetal varían dependiendo de la especie vegetal y del sistema de distribución de Agrobacterium. Un método ampliamente usado, es el procedimiento con discos de hojas, que puede realizarse con cualquier explante de tejido que provea una buena fuente para la iniciación de la diferenciación de la planta completa. Véase, por ejemplo, Horsch y colab. en Plant Molecular Biology Manual A5, Kluwer Academic Publishers, Dordrecht (1988) páginas 1-9. Un método suplementario utiliza el sistema de distribución de Agrobacterium combinado con infiltración por vacío. El sistema de Agrobacterium es especialmente útil para la creación de plantas dicotiledóneas transgénicas .
Existen varios métodos de transferencia directa de ADN en las células vegetales. En la electroporación, se exponen brevemente los protoplastos a un fuerte campo eléctrico. En la microinyección, se inyecta mecánicamente el ADN directamente dentro de las células usando micropipetas . En el bombardeo de micropartículas, se adsorbe el ADN en microproyectiles como por ejemplo, cristales de sulfato de magnesio o partículas de tungsteno y se aceleran físicamente los microproyectiles dentro de las células o tejidos de la planta.
Luego de la transformación estable, ocurre la propagación de la planta. El método más común de propagación es por
semilla. Sin embargo, la desventaja de la regeneración por propagación de semilla, es la falta de uniformidad en el cultivo debido a la heterocigosidad, ya que las semillas son producidas por las plantas de acuerdo con variantes genéticas gobernadas por las reglas mendelianas. Básicamente, cada semilla es genéticamente diferente y cada una se desarrollará con sus propias características específicas. Por lo tanto, se prefiere que la regeneración se realice de manera que la planta regenerada tenga características idénticas a las de la planta transgénica parental. Por lo tanto, el método preferido para regenerar una planta transformada es por micropropagación que provee una réproducción rápida, consistente de las plantas transformadas .
La micropropagación es un proceso para desarrollar plantas de segunda generación a partir de una muestra de tejido simple extirpada de una planta o cultivo parental seleccionado. Este proceso permite la reproducción en masa de las plantas que tienen el tejido preferido y expresan una proteína de fusión. Las plantas nuevas generadas son genéticamente idénticas a, y tienen todas las características de la planta original. La micropropagación permite la producción en masa de un material vegetal de calidad en un período corto de tiempo y ofrece una rápida multiplicación de cultivos seleccionados, conservando las características de la planta transgénica o transformada original. Las ventajas de este método de clonación de plantas
incluyen la velocidad de multiplicación de plantas y la calidad y uniformidad de las plantas producidas.
La micropropagación es un procedimiento de etapas múltiples que requiere alteración del medio de cultivo o condiciones de desarrollo entre las etapas. De esta forma, el proceso de micropropagación incluye cuatro etapas básicas: etapa uno, cultivo de tejido inicial; etapa dos, multiplicación del cultivo tisular; etapa tres, diferenciación y formación de la planta; y etapa cuatro, cultivo en invernadero y endurecimiento. Durante la etapa uno, el cultivo tisular se determina y certifica libre de contaminantes. Durante la etapa dos, el cultivo tisular inicial se multiplica hasta producir una cantidad suficiente de muestras de tejido para lograr las metas de producción. Durante la etapa tres, las muestras de tejido nuevo desarrollado se dividen y desarrollan en plántulas individuales. En la etapa cuatro, las plántulas transformadas se transfieren a un invernadero para endurecimiento donde se aumenta gradualmente la tolerancia a la luz de las plantas de manera que puedan continuar el desarrollo en el entorno natural .
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, se generan las plantas transgénicas mediante transformación transitoria de células de hoja, células meristemáticas o de la planta completa.
La transformación transitoria puede realizarse mediante
cualquiera de los métodos de transferencia directa de ADN descriptos anteriormente o mediante la infección viral usando virus de plantas modificadas.
Los virus que han demostrado ser útiles en la transformación de plantas huésped incluyen CaMV, virus mosaico del tabaco (TMV) , virus mosaico del bromo (BMV) y Virus mosaico común del poroto BV o BVMV) . La transformación de plantas usando virus de plantas se describe en la Patente Estadounidense N° 4.855.237 (virus mosaico dorado del poroto BGV) , EP-A 67,553 (TMV), la Solicitud de Patente Japonesa Publicada N° 63-14693 (TMV), EPA 194,809 (BV), EPA 278,667 (BV) ; y Gluzman, Y. y colab., Communications in Molecular Biology: Viral Vectors, Frío Spring Harbor Laboratory, New York, páginas 172-189 (1988). Las partículas de pseudovirus para utilizar en la . expresión del ADN extraño en muchos huéspedes, incluyendo plantas, se describe en la WO 87/06261.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, el virus usado para las transformaciones transitorias es avirulento y, de esta forma, es incapaz de provocar síntomas severos como por ejemplo, velocidad de crecimiento reducida, virus del mosaico, anillo clorótico, hoja enrollada, amarilleo, veteado, formación de viruela, formación de tumores y picaduras. Un virus avirulento adecuado puede ser un virus avirulento natural o un virus artificialmente atenuado. La atenuación del virus puede realizarse usando métodos conocidos
en el arte que incluyen, pero no están limitados a, técnicas de calentamiento subletal, tratamiento químico o mutagénesis dirigida al sitio tal como describen por ejemplo, Kurihara y Watanabe (Molecular Plant Pathology 4:259-269, 2003), Gal-on y colab. (1992), Atreya y colab. (1992) y Huet y colab. (1994).
Las cepas de virus adecuadas pueden obtenerse de fuentes-disponibles como por ejemplo, American Type culture Collection (Colección Americana de Cultivos Tipo) (ATCC, por sus siglas en inglés) o mediante el aislamiento de plantas infectadas. El aislamiento de virus de tejidos de plantas infectadas puede realizarse mediante técnicas bien conocidas en el arte como por ejemplo, las descriptas por Foster and Tatlor, Eds. "Plant Virology Protocols: From Virus Isolation to Transgenic Resistance (Methods in Molecular Biology (Humana Pr) , Vol 81)", Humana Press, 1998. En síntesis, se cree que los tejidos de una planta infectada contienen una elevada concentración de un virus adecuado, preferentemente, se muelen hojas jóvenes y pétalos de flores en una solución reguladora (por ejemplo, solución reguladora de fosfato) para producir una savia infectada con el virus que puede usarse para inoculaciones subsiguientes .
La construcción de virus ARN de plantas para la introducción y expresión de secuencias de polinucleótido exógeno no viral en plantas, se demuestra en las referencias anteriores así como también en Dawson, W. O. y colab., Virology
(1989) 172:285-292; Takamatsu y colab. EMBO J. (1987) 6:307-311; French y colab. Science (1986) 231:1294-1297; y Takamatsu y colab. FEBS Letters (1990) 269:73-76 y la Patente Estadounidense N° 5.316.931.
Cuando el virus es un virus ADN, pueden realizarse modificaciones adecuadas al virus mismo. Alternativamente, primero se puede clonar el virus en un plásmido bacteriano para facilitar la construcción del vector viral deseado con el ADN extraño. El virus luego se puede extraer del plásmido. Si el virus es un virus ADN, se puede anexar un origen bacteriano de replicación al ADN viral que luego es replicado por la bacteria. La transcripción y traducción de este ADN producirá la proteina de recubrimiento que encapsidará al ADN viral. Si el virus es un virus ARN, generalmente el virus se clona como cADN y se inserta en un plásmido. Luego se usa el plásmido para preparar todas las construcciones. El virus ARN luego se produce mediante la transcripción de la secuencia viral del plásmido, seguido por la traducción de los genes virales para producir la/s proteina/s de recubrimiento que encapsidan al ARN viral .
En una realización, se provee un polinucleótido viral vegetal donde la secuencia codificante de proteina de recubrimiento natural ha sido eliminada de un polinucleótido viral, y se ha insertado una secuencia de codificante de proteina de recubrimiento viral vegetal natural y un promotor
no natural, preferentemente, un promotor subgenómico de la secuencia codificante de proteina de recubrimiento no natural, capaz de expresión en la planta hospedante, de empaquetamiento del polinucleótido viral de planta recombinante y de asegurar una infección sistémica del huésped mediante el polinucleótido viral de planta recombinante. Alternativamente, el gen de proteina de recubrimiento puede desactivarse mediante la inserción dentro de él, de una secuencia de polinucleótido no natural, de manera que se produzca una proteina. El polinucleótido viral de planta recombinante puede contener uno o más promotores subgenómicos no naturales adicionales. Cada promotor subgenómico no natural es capaz de transcribir o expresar genes adyacentes o secuencias de polinucleótido en la planta hospedante e incapaz de recombinación entre si y con los promotores subgenómicos naturales. Las secuencias de polinucleótido no naturales (extrañas) pueden insertarse adyacentes al promotor subgenómico viral vegetal natural o a los promotores subgenómicos virales vegetales no naturales si se incluye más de una secuencia de polinucleótido. Las secuencias de polinucleótido no naturales se transcriben o expresan en la planta hospedante bajo el control del promotor subgenómico para producir los productos deseados.
En una segunda realización, se provee un polinucleótido viral de planta recombinante como en la primera realización excepto en que, se coloca la secuencia de codificación de
proteina de recubrimiento natural adyacente a uno de los promotores subgenómicos de proteina de recubrimiento no natural en lugar de una secuencia de codificación de proteina de recubrimiento no natural.
En una tercera realización, se provee un polinucleótido viral de planta recombinante donde el gen de proteina de recubrimiento natural está adyacente a su promotor subgenómico y se han insertado uno o más promotores subgenómicos no naturales dentro del polinucleótido viral. Los promotores subgenómicos no naturales insertados son capaces de transcribir o expresar genes adyacentes en una planta hospedante y son capaces de recombinación entre si y con los promotores subgenómicos naturales. Las secuencias de polinucleótido no naturales pueden insertarse adyacentes a los promotores virales vegetales subgenómicos naturales de manera que se transcriban o expresen las secuencias en la planta hospedante, bajo el control de los promotores subgenómicos, para producir el producto deseado.
En una cuarta realización, se provee un polinucleótido viral de planta recombinante como en la tercera realización, excepto en que la secuencia de codificación de proteina de recubrimiento natural es reemplazada por una secuencia de codificación de proteina de recubrimiento no natural.
Los vectores virales son encapsidados por las proteínas de recubrimiento codificadas por el polinucleótido viral de planta
recombinante para producir un virus de planta recombinante . El polinucleótido viral de planta recombinante o virus de planta recombinante se utiliza para infectar plantas hospedantes adecuadas. El polinucleótido viral de planta recombinante es capaz de replicarse en el hospedante, dispersarse sistémicamente en el hospedante y de transcripción o expresión de gen/es extraño/s (polinucleótido exógeno) en el hospedante para producir la proteina deseada.
Las técnicas para la inoculación de virus en las plantas pueden hallarse en Foster and Taylor, editores, "Plant Virology Protocols: From Virus Isolation to Transgenic Resistance ( ethods in Molecular Biology (Humana Pr) , Vol 81)", Humana Press, 1998; Maramorosh and Koprowski, Editores, "Methods in Virology" 7 volúmenes, Academic Press, New York 1967-1984; Hill, S.A. "Methods in Plant Virology", Blackwell, Oxford, 1984; Walkey, D.G.A. "Applied Plant Virology", Wiley, New York, 1985; y Kado and Agrawa, editores, "Principies and Techniques in Plant Virology", Van Nostrand-Reinhold, New York.
Además de lo anterior, el polinucleótido de la presente invención también puede introducirse dentro de un genoma de cloroplasto permitiendo asi, la expresión del cloroplasto.
Se conoce una técnica para introducir secuencias de polinucleótido exógenas en el genoma de los cloroplastos . Esta técnica incluye los siguientes procedimientos. Primero, se tratan químicamente las células de las plantas de manera tal de
reducir la cantidad de cloroplastos por célula a alrededor de uno. Luego, se introduce el polinucleotido exógeno dentro de las células, preferentemente mediante bombardeo de partículas, con la finalidad de introducir al menos un polinucleotido exógeno dentro de los cloroplastos. Se seleccionan los polinucleótidos exógenos para que sean capaces de integrarse dentro del genoma del cloroplasto mediante recombinación homologa, que se realiza rápidamente mediante las enzimas inherentes al cloroplasto. En este punto, el polinucleotido exógeno comprende, además de un gen de interés, al menos un polinucleotido derivado del genoma del cloroplasto. Además, el polinucleotido exógeno comprende un marcador seleccionable que, mediante los procedimientos de selección secuencial, sirve para permitir al experto determinar que todas o sustancialmente todas las copias del genoma del cloroplasto, luego de dicha selección se incluirá el polinucleotido exógeno. Se pueden hallar más detalles con respecto a esta técnica en la Patente Estadounidense N° 4.945.050 y 5.693.507, que se incorpora aquí como referencia. De esta forma, se puede producir un polipéptido mediante el sistema de expresión de proteína del cloroplasto e integrarse dentro de la membrana interna del cloroplasto .
Como los procesos que aumentan en el contenido de aceite, rendimiento, tasa de crecimiento, biomasa, vigor y/o tolerancia al estrés abiótico de una planta pueden involucrar múltiples
genes que actúan aditivamente o en sinergia (véase, por ejemplo, Quesda y colab., Plant Physiol. 130:951-063, 2002), la invención también incluye la expresión de una pluralidad de polinucleotidos exógenos en una sola planta hospedante para lograr asi, un aumento superior en el contenido de aceite, rendimiento, tasa de crecimiento, biomasa, vigor y/o tolerancia al estrés abiótico.
La expresión de una pluralidad de polinucleotidos exógenos en una sola planta hospedante puede realizarse mediante la cointroducción de múltiples constructos de ácido nucleico, cada uno incluye un polinucleótido exógeno diferente, dentro de una sola célula de planta. La célula transformada luego puede regenerarse en una planta madura usando los métodos descriptos anteriormente .
Alternativamente, la expresión de una pluralidad de polinucleotidos exógenos en una sola planta hospedante, puede realizarse mediante la co-introducción dentro de una sola célula de planta, de un constructo de ácido nucleico solo que incluye una pluralidad de diferentes polinucleotidos exógenos. Dicho constructo puede diseñarse con una secuencia promotora sola que puede transcribir un ARN mensajero policistrónico que incluye a todas las diferentes secuencias de polinucleótido exógenas. Para permitir la co-traducción de los diferentes polipéptidos codificados mediante el ARN mensajero policistrónico, las secuencias de polinucleótido pueden
interconectarse mediante una secuencia del sitio interno de entrada al ribosoma (IRES, por sus siglas en inglés), que facilita la traducción de secuencias de polinucleótido posicionadas corriente abajo de la secuencia IRES. En este caso, una molécula ARN policistrónica transcripta que codifica diferentes polipéptidos descriptos anteriormente, se traducirá de ambas, la secuencia del extremo 5' con CAP (Casquete ) y las dos secuencias IRES internas de la molécula ARN policistrónica para producir asi, en la célula, todos los polipéptidos diferentes. Alternativamente, el constructo puede incluir varias secuencias promotoras, cada una ligada a una secuencia de polinucleótido exógeno diferente.
La célula de la planta transformada con el constructo que incluye una pluralidad de diferentes polinucleótidos exógenos, puede regenerarse en una planta 'madura, usando los métodos anteriormente descriptos.
Alternativamente, la expresión de una pluralidad de polinucleótidos exógenos en una sola planta hospedante puede realizarse mediante la introducción de diferentes constructos de ácido nucleico, incluyendo diferentes polinucleótidos exógenos dentro de una pluralidad de plantas. Las plantas transformadas regeneradas luego pueden someterse a fertilización cruzada y seleccionarse la progenie para obtener características de tolerancia al estrés abiótico, crecimiento, biomasa, rendimiento, vigor y/o eficacia en el uso de nitrógeno
superiores, usando las técnicas convencionales para reproducción de plantas.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, el método además comprende desarrollar la planta que expresa al polinucleótido exógeno bajo estrés abiótico.
Ejemplos no limitantes, de condiciones de estrés abiótico incluyen, estrés por salinidad, sequía, privación de agua, exceso de agua (por ejemplo, inundación, anegamiento) , etiolización, baja temperatura, alta temperatura, toxicidad por metales pesados, anaerobiosis, deficiencia de nutrientes, exceso de nutrientes, contaminación atmosférica y Radiación UV.
De esta forma, la invención incluye plantas que expresan de manera exógena a el (los) polinucleótido ( s ) , constructos de ácido nucleico y/o polipéptidos (s) de la invención. Una vez expresados dentro de la célula vegetal o la planta completa, el nivel de polipéptido codificado por el polinucleótido exógeno puede ser determinado mediante métodos bien conocidos en el arte como por ejemplo, ensayos de actividad, Western Blots usando anticuerpos capaces de ligarse específicamente al polipéptido, Ensayo Inmunosorbente ligado a enzima (ELISA) , radio-immuno-ensayos (RIA) , immunohistoquímica, immunocitoquímica, inmunofluorescencia y métodos similares.
Los métodos para determinar el nivel de una molécula ARN de interés en la planta son bien conocidos en el arte e incluyen, por ejemplo, el análisis Northern blot, análisis de
reacción de cadena de polimerasa por transcripción inversa (RT-PCR) (incluyendo RT-PCR cuantitativo, semi-cuantitativo o en tiempo real) e hibridación ARN-in situ.
Además, el homólogo endógeno del polinucleótido exógeno o polipéptido de la invención, o un fragmento del homólogo endógeno (por ejemplo, intrones o regiones no traducidas) en la planta, puede utilizarse como marcador para la selección asistida (MAS, por sus siglas en inglés) , donde se utiliza un marcador para la selección indirecta de un determinante o determinantes genéticos de una característica de interés (por ejemplo, biomasa, tasa de crecimiento, contenido de aceite, rendimiento, tolerancia al estrés abiótico) . Estos genes (secuencia de ADN o ARN) pueden contener o estar ligados a sitios polimórficos o marcadores genéticos en el genoma como por ejemplo, polimorfismo de longitud de fragmento de restricción (RFLP, por sus siglas en inglés), polimorfismo de microsatélites y nucleótido simple (SNP, por sus siglas en inglés), huellas digitales de ADN ( "fingerprinting" ) (DFP, por sus siglas en inglés), polimorfismo de longitud de fragmento amplificado (AFLP, por sus siglas en inglés), polimorfismo de nivel de expresión, polimorfismo de polipéptido codificado y cualquier otro polimorfismo en la secuencia ADN o ARN.
Ejemplos de selecciones asistidas por marcador incluyen, pero no están limitadas a, la selección de una característica morfológica (por ejemplo, un gen que afecta la forma,
coloración, esterilidad o resistencia masculina como por ejemplo, la presencia o ausencia de A N, coloración de hoja y vaina, altura, color del grano, aroma del arroz) ; selección de una característica bioquímica (por ejemplo, un gen que codifica una proteína que puede extraerse y observarse; por ejemplo, isozimas y proteínas de almacenamiento) ; selección de una característica biológica (por ejemplo, las razas de patógenos o biotipos de insectos basados en la interacción hospedante patógeno u hospedante parásito puede usarse como marcador ya que la constitución genética de un organismoo puede afectar su susceptibilidad a patógenos y parásitos).
Los polinucleótidos y polipéptidos descriptos aquí pueden usarse en un amplio rango de plantas económicas, de manera segura y rentable.
Las líneas de plantas que expresan de manera exógena al polinucleótido o polipéptido de la invención se clasifican para identificar aquellas que muestran el mayor aumento de la característica deseada de la planta.
A continuación se ofrece una descripción no limitante de ensayos que pueden utilizarse para determinar el efecto del transgén (polinucleótido exógeno de algunas realizaciones de la invención) o su polipéptido codificado sobre la característica de interés en una planta.
Los parámetros principales de la eficacia usada para definir el metabolismo del nitrógeno (N) de la planta, incluyen
la eficacia en la captación de nitrógeno, eficacia en la utilización de nitrógeno y eficacia en el uso de nitrógeno.
La eficacia en la captación de nitrógeno [cantidad de N en la biomasa bajo suelo (gramos de nitrógeno) / N aplicado (gramos/hectárea) ] es la cantidad total de nitrógeno incorporado por la planta y es una función de la "captación" (la capacidad de transporte que tiene la planta) , la eficacia metabólica del proceso de asimilación y la tasa de desarrollo del tamaño de la planta ya que, la masa de tallo y hojas creada durante el crecimiento constituyen los órganos reales de almacenamiento de nitrógeno. La fracción de nitrógeno asimilado hallada en una raiz que, en última instancia, es transferida al grano (rendimiento) está controlada enzimáticamente y, de esta forma, puede ser afectada por la manipulación transgénica. Este parámetro es, en efecto, igual a la Eficacia en el uso de nitrógeno (EUN) . Es más probable que la mejor partición grano-raíz mejore el rendimiento y contenido de proteínas del grano.
De manera similar, pueden realizarse los mismos cálculos de uso y eficacia de utilización para otros macronutrientes como por ejemplo, fósforo (P) y potasio (K) , que tienen una correlación directa con el rendimiento y tolerancia general de la planta.
Eficacia en el uso del fertilizante - Para analizar si las plantas transgénicas son más sensibles a los fertilizantes, se desarrollaron plantas en placas de agar o macetas con una
cantidad limitada de fertilizante, como se describe por ejemplo, en los Ejemplos 5-7 de la Sección Ejemplos que sigue y en Yanagisawa y colab., (Proc Nati Acad Sci U S A. 2004; 101:7833-8). Se analizaron las plantas en cuanto a su tamaño total, tiempo de floración, rendimiento, contenido de proteina de raiz y/o grano. Los parámetros controlados fueron el tamaño total de la planta madura, su peso en húmedo y peso en seco, el peso de las semillas recolectadas, el tamaño promedio de la semilla y la cantidad de semilas producidas por planta. Otros parámetros para ensayar son: contenido de clorofila en hojas (ya que el estado de nitrógeno en planta y el grado de verdor de hoja están altamante correlacionados) , contenido de aminoácidos y contenido total de proteina en semilla u otras partes de la planta como por ejemplo, hojas o raices, contenido de aciete, etc. De manera similar, en lugar de proveer nitrógeno en cantidades limitadas, se puede agregar fosfato o potasio en concentraciones crecientes. Otra vez, los parámetros medidos son los mismos enumerados anteriormente. De esta manera, se evalúan la eficacia en el uso de nitrógeno (EUN) , eficacia en el uso de fosfato (EUF) y eficacia en el uso de potasio (EUP) , controlando la capacidad que tienen las plantas de prosperar bajo condiciones restringidas de nutrientes.
Eficacia en el uso de nitrógeno - Para analizar- si las plantas transgénicas de Arabidopsis son más sensibles al nitrógeno, se desarrollaron palntas en 0.75-1.5 m (condiciones
deficientes de nit'rogeno) o 6-15 mM (concentración óptima de nitrógeno). Se dejaron crecer durante 20-40 dias adicionales o hasta la producción de semilla. Luego se analizaron las plantas en cuanto a su tamaño total, tiempo de floración, rendimiento, contenido de proteina en brote y/o producción de grano/semilla. Los parámetros controlados fueron el tamaño total de la planta madura, su peso en húmedo y peso en seco, el peso de las semillas recolectadas, el tamaño promedio de la semilla y la cantidad de semilas producidas por planta. Otros parámetros para ensayar son: contenido de clorofila en hojas (ya que el estado de nitrógeno en planta y el grado de verdor de hoja están altamante correlacionados), contenido de aminoácidos y contenido total de proteina en semilla u otras partes de la planta como por ejemplo, hojas o raices y contenido de aceite. Las plantas transformadas que no exhiben efectos sustanciales fisiológicos y/o morfológicos o que exhiben niveles parámetros medidos más elevados que las plantas del tipo Silvestre, son identificados como plantas eficientes en el uso de nitrógeno.
Determinación de nitrógeno - El procedimiento para la determinación de concentración de N (nitrógeno) en las partes estructurales de las plantas incluye el método de digestión de persulfato de potasio para convertir el N orgánico en N03- (Purcell and King 1996 Argón. J. 88:111-113, la reducción mediada por Cd- modifcado de N03- en N02- (Vodovotz 1996 Biotechniques 20:390-394) y la medición de nitrito mediante el
ensayo de Griess (Vodovotz 1996, arriba) . Los valores de absorbancia se midieron a 550 nm contra una curva estándar de NaN02. El procedimiento se describe en detalle en Samonte y colab. 2006 Agron. J. 98:168-176.
Ensayos de germinación - Los ensayos de germinación comparan el porcentaje de semillas de las plantas transgénicas que podría completer el proceso de germinación hasta llegar al porcentaje de semillas de las plantas de control tratadas de la misma manera. Se considera condiciones normales, por ejemplo, incubaciones a 22 °C bajo ciclos diarios de 22 horas de luz y 2 horas de oscuridad. La evaluación de la germinación y vigor de la plántula se lleva a cabo entre los días 4 y 14 después de plantadas. El medio basal es 50% medio MS (Murashige and Skoog, 1962 Plant Physiology 15, 473-497) .
La germinación se controla también en condiciones desfavorables como por ejemplo, frío (incubando a temperaturas inferiores a los 10 °C en lugar de 22 °C) o usando soluciones para inhibir semillas que contienen elevadas concentraciones de osmolitos como por ejemplo, sorbitol sorbitol (en concentraciones de 50 mM, 100 ' mM, 200 mM, 300 mM, 500 mM, y hasta 1000 mM) o aplicando concentraciones crecientes de sal (de 50 mM, 100 mM, 200 mM, 300 mM, 500 mM de NaCl) .
El efecto del transgén sobre el vigor de la planta, tasa de crecimiento, biomasa, rendimiento y/o contenido de aceite puede ser determinado usando los métodos conocidos.
Vigor de la planta - Se puede calcular el vigor de la planta mediante el aumento en los parámetros de crecimiento como por ejemplo, área de hoja, longitud de fibra, diámetro de roseta, peso fresco de la planta y parámetros similares por tiempo.
Tasa de crecimiento - Se puede medir la tasa de crecimiento usando el análisis digital de las plantas en crecimiento. Por ejemplo, se pueden capturar imágenes de plantas desarrolladas en invernadero sobre la base de una parcela cada 3 días y calcular el área de roseta mediante análisis digital. Se calcula el crecimiento del área de roseta usando la diferencia del área de roseta entre los días de muestreo dividido por la diferencia en días entre las muestras.
Se puede realizar la evaluación de la tasa de crecimiento midiendo la biomasa de la planta producida, el área de roseta, el tamaño de la hoja o longitud de raíz por tiempo (puede medirse en cm2 por día de área de hoja).
El área de crecimiento relativo puede calcularse usando la Fórmula I .
Fórmula I :
El valor del área de crecimiento relativo = (Área ? / At) * (1/ Área tQ)
At es el día de la imagen actual analizada menos el día inicial (t-tO) .
De esta manera, el valor del área de crecimiento relativo
está expresada en unidades de 1/dia y la tasa de longitud de crecimiento está expresado en unidades 1/dia.
Alternativamente, la tasa de crecimiento relative del área puede calcularse como el coeficiente de regresión a lo largo del tiempo.
Rendimiento de semilla - La evaluación del rendimiento de semilla por planta puede realizarse mediante la medición de la cantidad (peso o tamaño) o cantidad (es decir, número) de semillas secas producidas y cosechadas a partir de 8-16 plantas y dividido la cantidad de plantas.
Por ejemplo, se pueden recolectar las semillas totales de 8-16 plantas, pesarlas usando por ejemplo, una balanza analítica y se puede dividir el peso total por la cantidad de plantas. El rendimiento de semilla por área de crecimiento puede calcularse del mismo modo, teniendo en cuenta el área de crecimiento de una sola planta. Aumentar, el rendimiento de semilla por área de crecimiento podría lograrse aumentando el rendimiento de semilla por planta y/o aumentando la cantidad de plantas capaces de desarrollarse en un área dada.
Además, el rendimiento de semilla puede ser determinado mediante el peso de 1.000 semillas. Se puede determinar el peso de 1.000 semillas de la siguiente manera: se diseminan las semillas sobre una bandeja de vidrio y se toma una foto. Cada muestra se pesa y luego se utiliza el análisis digital, se calcula la cantidad de semillas en cada muestra.
Se puede calcular el peso de las 1.000 semillas usando la fórmula II:
Fórmula II:
Peso de 1.000 semillas = cantidad de semillas en muestra/peso de la muestra X 1.000
Se puede calcular el índice de Cosecha usando la Fórmula
III
Fórmula III:
índice de Cosecha = Rendimiento promedio de semilla por planta/ Peso Promedio seco
Concentración de proteina en grano - El contenido de proteínas en grano (gramos de proteina en grano m-2) se estima como el producto de la masa de N en grano (nitrógeno) [gramos de Nitrógeno en grano m-2] multiplicado por la relación de conversión N/proteina de k-5,13 (Mosse 1990, arriba). Se estima la concentración de proteina en grano como la relación entre el contenido de proteina en grano por masa unitaria del grano (gramos de proteina en grano kg-1 de grano) .
Longitud de la Fibra - Se puede medir la longitud de la fibra usando un fibrógrafo.' El sistema de fibrografia se utiliza para medir la longitud en términos de longitud "media de la mitad superior" . La longitud media de la mitad superior (UHM, por sus siglas en inglés) es la longitud promedio de la mitad más larga de la distribución de la fibra. La fibrografia mide la longitud en tramos de longitudes en un punto porcentual
dado (Hypertext Transfer Protocol : //World Wide Web (punto) cottoninc (punto) com/ClassificationofCotton/?Pg=4#Length) .
Contenido de aceite - El contenido de aceite de una planta puede determinarse mediante la extracción del aceite de la semilla o de la porción vegetativa de la planta. Brevemente, se pueden retirar los lipidos (aceite) de la planta (por ejemplo, semilla) moliendo el tejido de la planta en presencia de solventes específicos (por ejemplo, hexano o éter de petróleo) y extrayendo el aceite en un extractor continuo. Se puede llevar a cabo el análisis indirecto de contenido de aceite usando varios métodos como por ejemplo, Resonancia Magnética Nuclear (RMN) , Espectroscopia, que mide la energía de resonancia absorbida por los átomos de hidrógeno en el estado líquido de la muestra [Véase, por ejemplo, Conway TF. y Earle FR. , 1963, Journal of the American Oil Chemists ' Society; Springer Berlín / Heidelberg, ISSN: 0003-021X (Print) 1558-9331 (Online)]; Espectroscopia de infrarrojo cercana (NI, por sus siglas en inglés, que utiliza la absorción de la energía de infrarrojo cercana (1100-2500 nm) por parte de la muestra; y un método descripto en WO/2001/02388 , que está basado en extraer aceite por solvente, evaporar el solvente en una corriente de gas que forma partículas de aceite y, dirigir la luz dentro de la corriente de gas y partículas de aceite que forman una luz reflejada detectable.
El efecto del transgén o su polipéptido codificado sobre
la tolerancia al estrés abiótico puede determinarse usando los métodos conocidos.
Tolerancia al estrés abiótico - Las plantas transformadas (es decir, que expresan al transgen) y no transformadas (del tipo silvestre) se exponen a condiciones de estrés abiótico como privación de agua, temperature subóptima (baja temperatura, alta temperatura) , deficiencia de nutrientes, exceso de nutrientes, una condición de estrés salino, estrés osmótico, toxicidad por metales pesados, anaerobiosis, contaminación atmosférica y Radiación UV.
Ensayo de tolerancia a la salinidad - Las plantas transgénicas con tolerancia a concentraciones elevadas de sal, se espera exhiban una mejor germinación, vigor o crecimiento de la plántula, en elevado contenido de sal. El estrés salino puede realizarse de muchas formas, por ejemplo, irrigando las plantas con una solución hiperosmótica, mediante el cultivo hidropónico de plantas en una solución nutritiva hiperosmótica (por ejemplo, solución de Hoagland) o cultivando las plantas en un medio nutritivo hiperosmótico [por ejemplo, 50 % de un medio Murashige-Skoog (medio MS) ] . Como muchas plantas diferentes varían considerablemente en cuanto a su tolerancia a la salinidad, la concentración de sal en agua de riego, solución nutritiva o medio de crecimiento puede ajustarse de acuerdo con características específicas del cultivo o variedad específica de la planta, de manera tal de producir un efecto suave o
moderado sobre la fisiología y/o morfología de las plantas (para obtener una guía para la concentración adecuada, véase, Bernstein y Kafkafi, Raíz Growth Under Salinity Stress En: Plant Raízs, The Hidden Half 3rd ed. Waisel Y, Eshel A y Kafkafi U. (editores) Marcel Dekker Inc., New York, 2002, y la referencia citada aquí) .
Por ejemplo, se puede realizar una prueba de tolerancia a la salinidad irrigando las plantas en diferentes etapas de desarrollo con concentraciones de cloruro de sodio en aumento (por ejemplo, 50 mM, 100 mM, 200 mM, 400 mM NaCl) aplicado desde la base y desde arriba para asegurar la distribución pareja de sal. Luego de, exponer a la condición de estrés, se controlan frecuentemente las plantas hasta que aparezcan efectos fisiológicos y/o morfológicos sustanciales en plantas del tipo silvestre. De esta forma, se compara el aspecto fenotípico externo, grado de marchitamiento y éxito completo para alcanzar la maduración y lograr la progenie, entre las plantas de control y las transgénicas . Los parámetros cuantitativos de tolerancia medidos incluyen, pero no se limitan, al peso promedio húmedo y seco, peso de las semillas producidas, tamaño promedio de semilla y cantidad de semillas producidas por planta. Las plantas transformadas que no exhiben efectos fisiológicos y/o morfológicos sustanciales o que exhiben una biomasa mayor que las plantas del tipo silvestre, son identificadas como plantas tolerantes al estrés abiótico.
Ensayo de tolerancia osmótica - Los ensayos de estrés osmótico (incluyendo los ensayos de cloruro de sodio y manitol) se llevan a cabo para determinar si un fenotipo de estrés osmótico era especifico de cloruro de sodio o si era un fenotipo relacionado al estrés osmótico general. Las plantas que son tolerantes al estrés osmótico pueden tener más tolerancia a la sequía y/o congelamiento. Para los experimentos de germinación con estrés salino y osmótico, el medio se suplementa por ejemplo, con 50 mM, 100 mM, 200 mM NaCl o 100 mM, 200 mM NaCl, 400 mM de manitol, 500 mM sorbitol o 15 g (gramos) PEG [Polietilén Glicol 8000] .
Ensayo de tolerancia a la sequía / osmótico - Se realiza el ensayo de tolerancia a la sequía para identificar genes que confieren una mejor supervivencia a la planta después de una privación aguda de agua. Para analizar si las plantas transgénicas son más tolerantes a la sequía, se puede realizar un estrés osmótico producido mediante osmolito no iónico de sorbitol en el medio. Las plantas de control y transgénicas se hacen germinar y desarrollar en placas de planta-agar durante 4 días, cuando se las transfiere a placas que 500 mM de sorbitol. El tratamiento produce un retardo en el crecimiento, luego ambas plantas, las de control y transgénicas, se comparan midiendo el peso de la planta (húmedo y seco) , el rendimiento y tasas de crecimiento medidas como por ejempo, tiempo para la floración.
Inversamente, las clasificaciones de sequía en base suelo se realizan con plantas que sobreexpresan los polinucleótidos descriptos arriba. Se hacen germinar semillas de plantas control de Arabidopsis u otras plantas transgénicas que sobreexpresan al polipéptido de la invención y se las transfiere a macetas. Se obtiene el estrés por sequía después de detener la irrigación acompañada por la colocación de las macetas sobre papel absorbente para aumentar la tasa de secado del suelo. Se comparan las plantas transgénicas y de control entre sí cuando la mayoría de las plantas de control desarrollan un marchitamiento severo. Se vuelve a regar las plantas después de obtener una fracción significativa de plantas de control que muestran marchitamiento severo. Se clasifican las plantas comparando con los controles según cada uno de dos criterios: tolerancia a las condiciones de sequía y recuperación (supervivencia) después de volver a regar.
Tolerancia al estrés por frío - Para analizar el estrés por frío, se transfirieron plantas maduras (de 25 días) a cámaras a 4 °C durante 1 a 2 semanas, con luz constitutiva. Luego, se regresan las plantas al invernadero. Dos semanas más tarde, se comparan los daños producidos por el período de enfriamiento, resultantes en el retraso del crecimiento y otros fenotipos, entre las plantas de control y transgénicas midiendo el peso de la planta (húmedo y seco) y, comparando ambas tasas de crecimiento medidas como tiempo para floración, tamaño de la
planta, rendimiento y parámetros similares.
Tolerancia al estrés por calor - La tolerancia al estrés por calor se logra exponiendo las plantas a temperaturas superiores a los 34 °C durante un cierto período de tiempo. Se examina la tolerancia de la planta después de transferirlas de vuelta a 22 °C después de 5 días, para recuperación y evaluación con respecto a los controles internos (plantas no transgénicas ) o plantas no expuestas ni al estrés por calor ni frío .
Eficacia en el uso de agua - Puede determinarse como la biomasa producida por unidad de agua transpirada. Para analizar la EUA, se puede medir el contenido relativo de agua en hoja de las plantas de control y transgénicas. El peso fresco (FW, por sus siglas en inglés) se registra inmediatamente; luego se remojan las hojas durante 8 horas en agua destilada a temperatura ambiente en la oscuridad y se registra el peso turgente (TW, por sus siglas en inglés) . El peso total seco (DW, por sus siglas en inglés) se registra después de secar las hojas a 60 DC hasta obtener un peso constante. El contenido relativo de agua (R C, por sus siglas en inglés) se calcula de acuerdo con la siguiente Fórmula IV:
Fórmula IV
(FW - DW/TW - DW) X 100
Así, la presente invención tiene un elevado valor agrícola para promover el rendimiento de cultivos comercialmente
deseados (por ejemplo, biomasa de órganos vegetativos como por ejemplo, madera de álamo, órganos reproductores como cantidad dé semillas o biomasa de la semilla) en condiciones normales o limitantes de crecimiento (por ejemplo, en condiciones de deficientes de nitrógeno, estrés abiótico) .
Cualquiera de las plantas transgénicas descriptas anteriormente o sus partes, puede ser procesada para producir alimento, comida, preparación de proteina o de aceite, por ejemplo, para animales rumiantes.
Las plantas transgénicas descriptas anteriormente, que exhiben un contenido aumentado de aceite pueden usarse para producir aceite vegetal (extrayendo el aceite de la planta) .
El aceite vegetal (incluyendo al aceite de semilla y/o aceite de porción vegetativa) producido de acuerdo con el método de la invención, puede combinarse con una variedad de otros ingredientes. Los ingredientes específicos incluidos en el producto se determinan de acuerdo con el uso pretendido. Los productos ejemplares incluyen alimento para animales, material prima para modificación química, plástico biodegradable, producto comestible mezcla, aceite comestible, biocombustible, aceite de cocina, lubricante, biodiesel, tentempié, cosméticos y materia prima para procesos de fermentación. Los productos ejemplares que se pueden incorporar al aceite vegetal incluyen alimentos para animales, productos comestibles para humanos como por ejemplo, snacks extruidos, panes, como agente de
enlace para comestibles, alimentos para acuicultura, mezclas fermentables , suplementos comestibles, bebidas deportivas, barras de alimento nutricional, suplementos multivitaminicos , bebidas bajas calorías y alimentos de cereales. De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, el aceite comprende un aceite de semilla y/o aceite de una porción vegetativa.
De acuerdo con algunas realizaciones de la invención, la célula vegetal constituye una parte de una planta.
Como se utiliza aguí, el término "alrededor de" se refiere a ± 10 %.
Los términos "comprende", "comprendiendo", "incluye", "incluyendo, "teniendo" y sus conjugaciones, significan "incluyendo pero sin limitarse a".
La frase "consiste en" significa "incluye limitándose a".
La frase "consiste esencialmente en" significa que la composición, método o estructura puede incluir ingredientes adicionales, pasos y/o partes, pero sólo si los ingredientes adicionales, pasos y/o partes no alteran materialmente las características básicas y nuevas de la composición, método o estructura reivindicada.
Como se usa aquí, la forma singular "uno", "una" y "el" incluyen a los plurales a menos que el contexto indique claramente lo contrario. Por ejemplo, el término "un compuesto" o "al menos un compuesto" puede incluir una pluralidad de compuestos, incluyendo mezclas de los mismos.
En esta solicitud, se pueden presentar varias realizaciones de esta invención en formato de rango. Debe entenderse que la descripción en formato de rango es meramente por razones de conveniencia y brevedad y no deben considerarse como una limitación inflexible del alcance de la invención. De esta forma, la descripción de un rango debe considerarse como una descripción especifica de todos los subrangos posibles, asi como también, de los valores numéricos individuales incluidos dentro de dicho rango. Por ejemplo, la descripción de un rango tal como, entre ly 6, debe considerarse como descripción especifica de subrangos tales como, entre 1 y 4, entre 1 y 4, entre 1 y 5, entre 2 y 4, entre 2 y 6, entre 3 y 6, etc., asi como, también, los números individuales dentro de dicho rango, por ejemplo, 1, 2, 3, 4, 5, y 6. Esto se aplica independientemente de la amplitud del rango.
Cada vez que se indica aquí un rango, se entiende que incluye cualquier número (fraccional o entero) citado dentro del rango indicado. Las frases "comprendido en un rango/dentro de un rango entre" un primer número indicado y un segundo número indicado y "comprendido en un rango/dentro de un rango entre" un primer número indicado "hasta" un segundo número indicado, se utilizan aquí de manera indistinta y se entiende incluyen al primero y segundo número indicado y todos los números fracciónales o enteros incluidos.
Como se usa aqui, el término "método" se refiere a
maneras, medios, técnicas y procedimientos para lograr una tarea dada incluyendo pero sin limitarse a, aquellas maneras, medios, técnicas y procedimientos ya sea conocidos para o rápidamente desarrollados a partir de maneras, medios, técnicas y procedimientos conocidos por los técnicos de las artes químicas, farmacológica, biológica, bioquímica y médica.
Se apreciará que ciertas características de la invención que se describen con la finalidad de ofrecer claridad al contexto de realizaciones separadas, también pueden ser provistas combinadas en una sola realización. De manera inversa, varias características de la invención que se describen por razones de brevedad en el contexto de una sola realización, también pueden ser provistas separadamente o en cualquier subcombinación adecuada o, de manera adecuada en cualquier otra realización descripta de la invención. Ciertas características descriptas en el contexto de varias realizaciones no deben considerarse características esenciales de dichas realizaciones, a menos que la realización sea inoperante sin dichos elementos.
Varias realizaciones y aspectos de la presente invención tal como se detallan abajo y se reivindican en la sección reivindicaciones más adelante, tienen respaldo experimental en los siguientes ejemplos.
EJEMPLOS
Ahora se hará referencia a los siguientes ejemplos que,
junto con las descripciones anteriores ilustran algunas realizaciones de la invención de manera no limitante.
En general, la nomenclatura usada aquí y los procedimientos de laboratorio utilizados en la presente invención incluyen técnicas moleculares, bioquímicas, microbiológicas y técnicas de ADN recombinante . Dichas técnicas se explican minuciosamente en la literatura. Véase, por ejemplo, "Molecular Cloning: A laboratory Manual" Sambrook y colab., (1989); "Current Protocols in Molecular Biology" Volúmenes I-III Ausubel, R. M. , ed. (1994); Ausubel y colab., "Current Protocols in Molecular Biology", John Wiley and Sons, Baltimore, Maryland (1989); Perbal, "A Practical Guide to Molecular Cloning", John Wiley & Sons, New York (1988) ; Watson y colab., "Recombinant DNA", Scientific American Books, New York; Birren y colab. (eds) ' "Genorae Analysis: A Laboratory Manual Series", Vols. 1-4, Frío Spring Harbor Laboratory Press, New York (1998); metodologías como las descriptas en las Patentes Estadounidenses N° 4.666.828; 4.683.202; 4.801.531; 5.192.659 and 5.272.057; "Cell Biology: A Laboratory Handbook", Volumes I-III Cellis, J. E., ed. (1994); "Current Protocols in Immunology" Volumes I-III Coligan J. E . , ed. (1994); Stites y colab. (eds), "Basic and Clinical Immunology" (Octava Edición), Appleton & Lange, Norwalk, CT (1994); Mishell and Shiigi (eds), "Selected Methods in Cellular Immunology", W. H. Freeman and Co . , New York (1980); los inmunoensayos disponibles se
describen extensivamente en la patente y literatura científica available, véase, por ejemplo, las Patentes Estadounidenses N° 3.791.932; 3.839.153; 3.850.752; 3.850.578; 3.853.987; 3.867.517; 3.879.262; 3.901.654; 3.935.074; 3.984.533; 3.996.345; 4.034.074; 4.098.876; 4.879.219; 5.011.771 y 5.281.521; "Oligonucleotide Synthesis" Gait, H. J., ed. (1984); "Nucleic Acid Hybridization" Hames, B. D., and Higgins S. J. , eds . (1985); "Transcription and Translation" Hames, B. D., y Higgins S. J. , Eds. (1984); "Animal Cell Culture" Freshney, R. I., ed. (1986); "Immobilized Cells and Enzymes" IRL Press, (1986); "A Practical Guide to Molecular Cloning" Perbal, B., (1984) y "Methods in Enzymology" Vol. 1-317, Academic Press; "PCR Protocols: A Guide To Methods And Applications", Academic Press, San Diego, CA (1990); Marshak y colab., "Strategies for Protein Purification and Characterization - A Laboratory Course Manual" CSHL Press (1996); todas ellas se incorporan aquí como referencia como si hubieran sido expuestos aquí. Se proveen otras referencias generales en el documento. Se cree que los procedimientos mencionados aquí, son conocidos en el arte y se ofrecen para conveniencia del lector. Toda la información contenida aquí se incorpora como referencia.
EJEMPLO 1
IDENTIFICACIÓN DE GENES QUE AUMENTAN LA EFICACIA EN EL USO DE NITRÓGENO, EFICACIA EN EL USO DEL FERTILIZANTE, RENDIMIENTO, CONTENIDO DE ACEITE, BIOMASA Y/O TOLERANCIA AL ESTRÉS ABIÓTICO
Los genes que aumentan la eficacia en el uso de nitrógeno (EUN) , eficacia en el uso del fertilizante (EUF) , rendimiento, contenido de aceite, biomasa y/o tolerancia al estrés abiótico (ABST) fueron identificados usando varias herramientas para minería de datos y bioinformática .
Todos los grupos de datos de secuencias de nucleótido utilizados aquí, se originaron de bases de datos públicas. Los datos de secuencias de 76 especies de plantas diferentes fueron introducidos en una base de datos única, abarcante. También se incorporó información adicional sobre expresión génica, anotación de proteínas, enzimas y vías. Las bases de datos principales incluyen:
• Genomas
o Genoma de Arabidopsis [genoma TAIR versión 6 (Hypertext Transfer Protocol : //World Wide Web (punto) arabidopsis (punto) org/)];
o Genoma del arroz [IRGSP construcción 4.0 (Hypertext Transfer Protocol : //rgp (punto) dna (punto) affrc (punto) go (punto) jp/IRGSP/)];
o Álamo [Populus trichocarpa versión 1.1 de JGI
(versión de ensamble vl.O) (Hypertext Transfer Protocol : //World Wide Web (punto) genome (punto) jgi-psf (punto) org/)];
o Braquipodio [ensamble JGI 4x, Hypertext Transfer Protocol : //World Wide Web (punto) brachpodium (punto) org)]; o Poroto de soja [DOE-JGI SCP, versión GlymaO
(Hypertext Transfer Protocol : //World Wide Web (punto) phytozome (punto) net/) ] ;
o Uva [French-Italian Public Consortiura for Grapevine Genome Caracterización del genoma de vino de uva (Hypertext Transfer Protocol:// World Wide Web (punto) genoscope (punto) cns (punto) fr /)];
o Ricino [TIGR/J Craig Venter Institute 4x assembly [(Hypertext Transfer Protocol : //msc (punto) jcvi (punto) org/r_communis ] ;
o Sorgo [DOE-JGI SCP, versión Sbil [Hypertext Transfer
Protocol : //World Wide Web (punto) phytozome (punto) net/)];
• Las secuencias EST y mARN se extrajeron de las siguientes bases de datos:
o GenBank (Hypertext Transfer Protocol : //World Wide Web (punto) ncbi (punto) nlm (punto) nih (punto) gov/Genbank/ ) ;
o RefSeq (Hypertext Transfer Protocol : //World Wide Web (punto) ncbi (punto) nlm (punto) nih (punto) gov/RefSeq/ ) ;
o TAIR (Hypertext Transfer Protocol : //World Wide Web (dot) arabidopsis (dot) org/) .
· Proteina y bases de datos de vías
Uniprot [Hypertext Transfer Protocol : //World Wide Web (punto) uniprot (punto) org/].
• AraCyc [Hypertext Transfer Protocol : //World Wide Web (punto) arabidopsis (punto) org/biocyc/index (punto) jsp].
· ENZYME [Hypertext Transfer Protocol : //expasy (punto)
org/enzyme/] .
• Las bases de datos de microensayos se bajaron de:
• GEO (Hypertext Transfer Protocol : //World Wide Web.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)
TAIR (Hypertext Transfer Protocol : //World Wide Web.arabidopsis.org/) .
o Datos de microarreglo de fibra de algodón patentados (Publicación PCT N° WO2008 /075364 )
o Datos de microarreglo patentados en ecotipos de Arabidopsis (Publicación PCT No. WO2008/122980) .
Información QTL (mapeo de locus cuantitativos) o Gramene (Hypertext Transfer Protocol : //World Wide Web (dot) gramene (dot) org/qtl/) .
Se realizó un montaje de bases de datos para armar una base de datos amplia, rica, de notación confiable y fácil de analizar formada por las secuencias mARN genómico, ESTs ADN públicas y disponibles, datos de varias cosechas asi como también expresión génica, notación de proteínas y datos de vías QTLs, y otras informaciones relevantes.
El ensamblado de la base de datos está formado por un grupo de herramientas de refinamiento genético, estructuración y notación y análisis que permiten construir una base de datos recortada para cada proyecto de descubrimiento génico. Las herramientas de refinamiento genético y estructuración permiten detectar de manera confiable las variantes de escisión y
transcriptos antisentido, generando la comprensión de varios resultados fenotipicos potenciales de un solo gen. La comunidad científica ha confirmado y aceptado la capacidad de la plataforma "LEADS" de Compugen LTD para analizar el genoma humano [véase, por ejemplo, " idespread Antisense Transcription" , Yelin, y colab. (2003) Nature Biotechnology 21, 379-85; "Splicing of Alu Sequences" , Lev-Maor, y colab. (2003) Science 300 (5623), 1288-91; "Computational analysis of alternative splicing using EST tissue information" , Xie H y colab. Genomics 2002], y también, ha probado ser la más eficaz en genómica vegetal.
Agruparrtiento (clustering) EST y ensamblado génico - Para el agrupamiento y ensamblado génico de arabidopsis, arroz, uva, sorgo, braquipodio, y poroto de soja, se utilizó la versión "LEADS genómica". Esta herramienta permite el agrupamiento más preciso de secuencias ESTs y mRNA en el genoma y predice la estructura génica así como también, los eventoos de escisión alternativa y transcripción anti-sentido .
Notación genética - Se anotaron los genes y proteínas de la siguiente manera: se realizó una búsqueda Blast [Hypertext Transfer Protocol : //blast (punto) ncbi (punto) nlm (punto) nih (punto) gov /Blast (punto) cgi] contra todas las secuencias de plantas de UniProt [Hypertext Transfer Protocol : //World Wide Web (punto) uniprot (punto) org/]. Se analizaron los marcos de lectura abierta de cada transcripto putativo y se seleccionó el
ORF más largo con mayor cantidad de homólogos como proteina predicha del transcripto. Se analizaron las proteínas predichas mediante InterPro [Hypertext Transfer Protocol : //World Wide Web (punto) ebi (punto) ac (punto) uk/interpro/] .
Se realizó una búsqueda Blast contra proteínas de AraCyc y se utilizaron las bases de datos ENZYME para mapear los transcriptos predichos en vías AraCyc.
Se compararon proteínas predichas de diferentes especies usando el algoritmo blast [Hypertext Transfer Protocol :/ /World Wide Web (punto) ncbi (punto) nlm (punto) nih (punto) gov /Blast (punto) cgi] para validar la precisión de la secuencia de proteína predicha y la detección eficaz de ortólogos.
Perfil de expresión génica - Se utilizaron varias fuentes de datos para realizar el perfil de expresión génica que combina datos del microensayo y el perfil de expresión digital (véase abajo). De acuerdo con el perfil de expresión génica, se realizó un análisis de correlación para identificar genes que son coregulados en diferentes etapas de desarrollo y condiciones ambientales.
Se bajaron los grupos de datos de microarreglos publicados y disponibles de los sitios de TAIR y NCBI GEO, se renormalizaron e integraron a la base de datos. El perfil de expresión es uno de los datos de recursos más importante para identificar genes importantes para EUN, ABST, rendimiento, incremiento de biomasa y/o EUF. Además, cuando se descubrió que
genes homólogos de diferentes cultivos estaban asociados con el aumento de EUN, ABST, EUF, biomasa, rendimiento o contenido de aceite, los genes fueron marcados como "altamente predictivos" para mejorar la característica.
Se compiló un resumen digital de perfil de expresión para cada agrupamiento (cluster) de acuerdo con las palabras claves incluidas en los registros de secuencias que comprenden dicho agrupamiento. La expresión digital, también conocida como Northern Blot electrónico, es una herramienta que muestra el perfil de expresión virtual basado en las secuencias EST que forman el agrupamiento (cluster) génico. La herramienta puede proveer el perfil de expresión de un agrupamiento (cluster) en términos de la anatomía de la planta (por ejemplo, tejidos/órganos en el . que se expresa el gen), estado de desarrollo (las etapas de desarrollo en las que puede hallarse el gen) y perfil de tratamiento (provee las condiciones fisiológicas en las que se expresa un gen por ejemplo, sequía, frío, infección por patógenos, etc.). Dada una distribución aleatoria de ESTs en diferentes agrupamientos (clusters) , la expresión digital provee un valor de probabilidad que describe la probabilidad de que un agrupamiento (cluster) tenga un total de N ESTs que contengan X ESTs en una cierta colección de bibliotecas. Para los cálculos de probabilidad, se toma en cuenta la siguiente consideración: a) la cantidad de ESTs en el agrupamiento (cluster) , b) la cantidad de ESTs de las
bibliotecas implicadas y relacionadas, c) la cantidad total de ESTs disponibles que representan las especies. Asi, los agrupamientos (clusters) con valores de baja probabilidad, se enriquecen mucho con las ESTs del grupo de bibliotecas de interés indicando una expresión especializada.
Los resultados de los datos de expresión génica del microarreglo se proven en las Tablas 1-19, más adelante.
A continuación se resumen los criterios clave utilizados para seleccionar los genes cuya expresión puede utilizarse en una planta para aumentar la EUN, EUF, biomasa, rendimiento, contenido de aceite y ABST. El plegamiento de sobreexpresión ( "Desdoblam. " ) se calcula como la relación entre la cantidad de ESTs halladas en un gen o un grupo ortólogo para cierta categoría ("Palabra Clave") y la cantidad de ESTs esperadas de acuerdo con una distribución normal. Se estimó un valor probabilístico (valor-P) para los desdoblamientos de sobreexpresión calculados. Se seleccionaron los genes en base a los resultados presentados en las Tablas 1-19 a continuación y otros filtros informáticos combinados con la curación manual detallada más adelante.
Las EUN242, EUN244, EUN234, EÜN239, EUN240, EUN514, EUN523, EUN533, EUN538, EUN548, EUN549, EUN241, EUN235, EUN251, EUN587 y EUN582 fueron seleccionadas ya que están altamente expresadas en raíces y bajo condiciones deficientes de nutrientes (como se muestra en las Tablas 1 y 2, más
continuación)
Tabla 1
Expresión digital de EUN242, EUN244, EUN234, EUN239, EUN240, EUN514, EUN523, EUN533, EUN538, EUN548, EUN549, EUN241, EUN235, EUN251, EUN587 y EÜN582 en diferentes tejidos
Tabla 1. Expresión digital de los genes indicados en semilla en germinación, raíz, plántula y brotes. Se provee el aumento por desdoblamiento y los valores-p calculados. Los resultados se consideraron estadísticamente significativos si
el valor-p era inferior a 0,05. Las celdas en blanco indican que, el genno está expresado o los datos no están disponibles.
Tabla 2
Expresión digital de EUN242, EUN244, EUN234, EUN239, EUN240, EUN514, EUN523, EUN533, EUN538, EUN548, EUN549, EUN241, EUN235, EUN251, EUN587 y EUN582 bajo diferentes condiciones de desarrollo
Tabla 2. Expresión digital de los genes indicados en
condiciones de sequía, etiolización, estrés por calor, deficiencias de nutrientes y anegamiento. Se provee el aumento por desdoblamiento y los valores-p calculados. Los resultados son considerados estadísticamente significativos si el valor-p era inferior a 0,05. Las celdas en blanco indican que el gen no está expresado o los datos no están disponibles.
Se seleccionaron las EUN229, EUN248, EUN254, EUN542, EUN562, EUN237, EUN221, EUN585 y EUN588 debido a su elevada expresión en raíces y condiciones de estrés por sequía (como se muestra en las Tablas 3 y 4, a continuación) .
Tabla 3
Expresión digital de EUN229, EUN248, EUN254, EÜN542, EUN562, EUN237, EUN221, EUN585 y EUN588 en diferentes tejidos
Tabla 3. Expresión digital de los genes indicados en hoja,
semilla, raíz, plántula y brotes. Se provee el aumento de desdoblamiento y los valores-p calculados. Los resultados fueron considerados estadísticamente significativos si el valor-p era inferior a 0,05. Las celdas en blanco indican que el gen no está expresado o los datos no están disponibles.
Tabla 4
Expresión digital de EUN229, EUN248, EUN254, EUN542, EUN562, EUN237, EUN221 y EUN588 bajo diferentes condiciones de desarrollo
Tabla 4. Expresión digital de los genes indicados bajo condiciones de frío, sequía, etiolización y salinidad. Se provee el aumento de desdoblamiento y los valores-p calculados. Los resultados fueron considerados estadísticamente significativos si el valor-p era inferior a 0,05. Las celdas en blanco indican que el gen no está expresado o los datos no
están disponibles.
EUN252 y MAB106, EUN265, EUN553, EUN513, EUN579, EUN580, EUN256, EUN227 y EUN223 fueron seleccionados debido a su elevada expresión en condiciones de desarrollo de etiolización (como se ilustra en la Tabla 5) .
Tabla 5
Expresión digital de EUN252, MAB106, EUN265, EUN553, EUN513, EUN579, EUN580, EUN256, EUN227 y EUN223 bajo diferentes condiciones de desarrollo
Tabla 5. Expresión digital de los genes indicados bajo condiciones de sequía, etiolización, calor y metales pesados. Se provee el aumento de desdoblamiento y los valores-p calculados. Los resultados fueron considerados estadísticamente significativos si el valor-p era inferior a 0,05. Nótese la elevada expresión de la EUN252 y MAB106 bajo etiolización. Las celdas en blanco indican que el gen no está expresado o los datos no están disponibles.
Tabla 6
Expresión digital de EUN252, MAB106, EUN265, EUN553, EUN513, EUN579, EUN580, EUN256, EUN227 y EUN223 bajo diferentes condiciones de desarrollo
Tabla 6. Expresión digital de los genes indicados bajo condiciones de salinidad, estrés oxidativo y anegamiento. Se provee el aumento de desdoblamiento y los valores-p calculados. Los resultados fueron considerados estadísticamente significativos si el valor-p era inferior a 0,05. Las celdas en blanco indican que el gen no está expresado o los datos no están disponibles.
Las EUN224, EUN230, EUN255, EUN245, EUN237, EUN233, EUN231, EUN228, EUN225 y EUN249 fueron seleccionadas debido a su elevada expresión en raíces y expresada cuando se las trató con hormonas de plantas intrínsecamente relacionadas con el crecimiento y desarrollo de la planta (como se ilustra en la Tablas 7, 8 y 9) .
Tabla 7
Expresión digital de EUN224, EUN230, EUN255, EUN245, EUN237, EUN233, EUN231, EUN228, EÜN225 y EUN249 en diferentes tej idos
Tabla 7. Expresión digital de los genes indicados en hoja, callo, raíz, plántula y brote. Se provee el aumento de desdoblamiento y los valores-p calculados. Los resultados fueron considerados estadísticamente significativos si el valor-p era inferior a 0,05. Las celdas en blanco indican que el gen no está expresado o los datos no están disponibles.
Tabla 8
Expresión digital de EUN224, EUN230, EUN255, EUN245, EUN237, EUN233, EUN231, EUN228, EUN225 y EUN249 bajo diferentes
condiciones de desarrollo y tratamientos
Table 8. Expresión digital de los genes indicados bajo tratamiento con hormonas de desarrollo vegetal, sequía y etiolización. Se provee el aumento de desdoblamiento y los valores-p calculados. Los resultados fueron considerados estadísticamente significativos si el valor-p era inferior a 0,05. Las celdas en blanco indican que el gen no está expresado o los datos no están disponibles.
Tabla 9
Expresión digital de EUN224, EUN230, EUN255, EUN245, EUN237, EÜN233, EUN231, EUN228, EUN225 y EUN249 bajo diferentes tratamientos para el desarrollo
Tratamiento
Genes anegamiento respuesta al fotoperíodo salinidad
desdoblam. valor-p desdoblam. valor-p desdoblam. valor-p
EUN224
EUN230 1 ,26 4,3E-01
EUN255
EUN245 2,00 2,7E-02 0,87 6.9E-01
EUN237
EUN233
EUN231
Tabla 9. Expresión digital de los genes indicados bajo anegamiento, respuesta al fotoperíodo y salinidad. Se provee el aumento de desdoblamiento y los valores-p calculados. Los resultados fueron considerados estadísticamente significativos si el valor-p era inferior a 0,05. Las celdas en blanco indican que el gen no está expresado o los datos no están disponibles.
Las EUN268, EUN574 y EUN575 fueron seleccionadas debido a su elevada expresión en callos (un tejido con una tasa de división celular elevada) e inducidos cuando se los trató con hormonas relacionadas con el crecimiento y desarrollo de la planta (como se ilustra en la Tabla 10, a continuación) .
Tabla 10
Expresión digital de EUN268, EUN574 y EUN575 en varios tejidos y bajo diferentes condiciones y tratamientos
EUN268 EUN574 EUN575
valor-p ?,??+00 9.5E-01 9,9E-01 desdoblam.
anegamiento
valor-p
respuesta al desdoblam. 3,32
fotoperiodo valor-p 3,4E-02
desdoblam. 1 ,00
salinidad
valor-p 4.3E-01
Tabla 10. Expresión digital de los genes indicados en vario tejidos (hoja, callo, raíz, plántula y brote) y bajo varios tratamientos o condiciones (hormonas de desarrollo, vegetal, sequía, etiolización, anegamiento, respuesta al fotoperiodo y salinidad. Se provee el aumento de desdoblamiento y los valores-p calculados. Los resultados fueron considerados estadísticamente significativos si el valor-p era inferior a 0,05. Nótese la expresión de desdoblamiento significativa en callo y con tratamiento con hormonas de desarrollo vegetal.
CT75, CT7, CT76, CT71, CT74, CT11, CT20, CT81, CT22, CT82, CT3, CT40, CT1, CT6, CT27, CT2, EUN269, EUN545 y EUN544, se seleccionaron en base a su elevada expresión en fibra de algodón, cuya formación está fuertemente relacionada con la elongación celular (Tablas 11 y 12, a continuación) y, por lo tanto, se espera que tengan un efecto positivo sobre el desarrollo de raíz en condiciones normales, condiciones deficientes de nitrógeno, escasez de fertilizante y/o condiciones de deficiencia de agua así como también, para aumentar el contenido de aceite.
Tabla 11
Expresión digital de CT75, CT7, CT76, CT71, CT74, CT11,
CT81, CT22, CT82, CT3 , CT40, CTl, CT6, CT27, CT2 , EUN269, y EUN544 en diferentes tejidos
Tabla 11. Expresión digital de los genes indicados en fibras de algodón, fruto, semilla y raíz. Se provee el aumento de desdoblamiento y los valores-p calculados. Los resultados fueron considerados estadísticamente significativos si el valor-p era inferior a 0,05. Nótese la expresión de desdoblamiento significativa en fibra de algodón. Las celdas en blanco indican que el gen no está expresado o los datos no están disponibles.
Tabla 12
Expresión digital de CT75, CT7 , CT76, CT71, CT74, CT11, CT20, CT81, CT22, CT82, CT3, CT40, CTl, CT6, CT27, CT2, EUN269, EUN545 y EUN544
Tabla 12. Expresión digital de los genes indicados en plántula, tallo y hoja. Se provee el aumento de desdoblamiento y los valores-p calculados. Los resultados fueron considerados estadísticamente significativos si el valor-p era inferior a 0,05. Las celdas en blanco indican que el gen no está expresado o los datos no están disponibles.
Las plantas desarrolladas bajo condiciones de baja cantidad de nitrógeno o condiciones rigurosas de sequía padecen una senescencia severa de hoja. Se seleccionaron EUN525, EUN535, EUN565, EUN578, EUN515 y EUN591 como genes altamente inducidos en hojas y bajo condiciones de estrés por deficiencias de nutrientes por sequía (como se ilustra en la Tablas 13 y 14, a continuación). Además, EUN578 muestra una fuerte inducción en plantas afectadas por estrés por calor.
Tabla 13
Expresión digital de EUN525, EUN535, EUN565, EUN578, EUN515 y EUN591 en diferentes tejidos
Table 13. Expresió.n digital de los genes indicados en hoja, raiz, flor y callo. Se provee el aumento de desdoblamiento y los valores-p calculados. Los resultados fueron considerados estadísticamente significativos si el valor-p era inferior a 0,05. Nótese la expresión de desdoblamiento en hoja. Las celdas en blanco indican que el gen no está expresado o los datos no están disponibles.
Tabla 14
Expresión digital de EUN525, EUN535, EUN565, EUN578, EUN515 y EUN591 en diferentes condiciones
Tabla 14. Expresión digital de los genes indicados bajo deficiencia de nutrientes, sequía, salinidad y calor. Se provee el aumento de desdoblamiento y los valores-p calculados. Los resultados fueron considerados estadísticamente significativos si el valor-p era inferior a 0,05. Nótese la expresión de desdoblamiento bajo condiciones de deficiencia de nutrientes y sequía. Las celdas en blanco indican que el gen no está expresado o los datos no están disponibles.
Se seleccionaron EUN520, EUN521, EUN560, EUN563 y EUN573 como genes que mejoran el vigor de la plántula bajo condiciones de estrés por falta de nitrógeno'. Se seleccionaron EUN520, EUN521, EUN560 como genes que se expresan altamente en plántulas completas y son altamente inducidos bajo estrés por squía. Se seleccionó EUN563 como un gen altamente inducido en hojas de plántula y bajo estrés por salinidad. EUN573 es inducido en raíces de plántlas y bajo estrés por salinidad (véase las Tablas 15 y 16) .
Tabla 15
Expresión digital de EUN520, EUN521, EUN560, EUN563 y EUN573 en diferentes tejidos
Tabla 15. Expresión digital de los genes indicados en hoja, raíz, flor y plántula. Se provee el aumento de desdoblamiento y los valores-p calculados. Los resultados fueron considerados estadísticamente significativos si el valor-p era inferior a 0,05. Nótese la expresión de desdoblamiento en hoja (EUN563) , raíz (EUN573) y plántula (EUN520, EUN521, EUN560, EUN563 y EUN573) . Las celdas en blanco indican que el gen no está expresado o los datos no están disponibles.
Tabla 16
Expresión digital de EUN520, EUN521, EUN560, EUN563 y EUN573 bajo diferentes condiciones
Tabla 16. Expresión digital de los genes indicados bajo condiciones de deficiencia de nutrientes, sequía, calor y salinidad. Se provee el aumento de desdoblamiento y los valores-p calculados. Los resultados fueron considerados estadísticamente significativos si el valor-p era inferior a 0,05. Nótese la expresión de desdoblamiento bajo condiciones de sequía (EUN520, EUN521, EUN560) y salinidad (EUN563 y EUN573) .
Las celdas en blanco indican que el gen no está expresado o los datos no están disponibles.
Las plántulas y el cultivo de células constituyen tejidos de rápido crecimiento. Además, las plántulas de raíz emergente elongan muy rápidamente para alcanzar el agua . y nitrógeno disponibles en suelos más profundos. Se selecionaron EUN520, EUN211, EUN564 y EUN567 por su elevada expresión en plántulas con raíz y/o plántulas completas, mientras que EUN519 se seleccionó debido a su elevada expresión en plántulas con raíz y cultivos celulares (véase la Tabla 17).
Tabla 17
Expresión digital de EUN520, EUN211, EUN564, EUN567, y EUN519 en diferentes tejidos
Tabla 17. Expresión digital de los genes indicados en hoja, suspensión de células, raíz, plántula y brote. Se provee el aumento de desdoblamiento y los valores-p calculados. Los' resultados fueron considerados estadísticamente significativos si el valor-p era inferior a 0,05. Nótese la expresión de
desdoblamiento en raíz (EUN211, EUN564, EUN567 y EUN519) y plántula (EUN211 y EUN564). Las celdas en blanco indican que el gen no está expresado o los datos no están disponibles.
Se indujeron EUN528, EUN571, EUN531 y EUN590 mediante estrés por baja temperatura. El estrés por baja temperatura reduce la fotosíntesis de la planta y produce un efecto similar al observado en plantas que se desarrollan en condiciones de nitrógeno deficiente (véase la Tabla 18).
Tabla 18
Expresión digital de EUN528, EUN571, EUN531 y EUN590 bajo diferentes condiciones
Tabla 18. Expresión digital de los genes indicados bajo condiciones de deficiencias de nutrientes, frío, calor, salinidad y sequía. Se provee el aumento de desdoblamiento y los valores-p calculados. Los resultados fueron considerados estadísticamente significativos si el valor-p era inferior a 0,05. Nótese la expresión de desdoblamiento bajo deficiencias de nutrientes (EUN528) y baja temperatura (EUN528, 571, 531 y
590) . Las celdas en blanco indican que el gen no está expresado o los datos no están disponibles.
Se seleccionó EUN206 en base a su análisis de expresión digital. Se demostró que EUN206 está altamente expresada en raices (2,4 desdoblamiento p < 0,05) hay indicaciones de estar inducida por baja temperatura (2,2 desdoblam. p < 0,08). EUN208 y EUN210 son genes de tomate que están expresados en el fruto y durante la maduración del fruto, respectivamente. Estas etapas fueron consideradas importantes para mantener una elevada turgencia celular. EUN209 es una proteina putativa de homeodominio HB2 altamente expresada en capullos de flor. Se seleccionó como gen que pertenece a un grupo ortólogo de genes que son altamente inducidos por las hormonas de desarrollo vegetal como por ejemplo, auxinas (5 desdoblam. p < 0,002), y en tejidos que mantinen una elevada turgencia celular como por ejemplo, la pulpa del fruto (3 desdoblam. p < 0,00098) y en callo (2 desdoblam. p < 0,0003). EUN246 se seleccionó debido a su elevada expresión en el pericarpio del fruto (3,7 desdoblam. p < 0,01) y debido a que es altamente inducido por sequía (4 desdoblam., p < 0,0013). EUN516 es un interactor de kinasa putativa Pto seleccionado por su inducción bajo condiciones de sequía (3,2 desdoblam., p < 0,03) y antes de la etapa de floración (2,0 desdoblam. p < 0,02). Se eligió EUN527 debido a su expresión en diferentes deficiencias de nutrientes (3,7 desdoblam. p < 0,002) estando principalmente expresada bajo
deficiencia de fosfato (4 desdoblam. , p < 0,006) . EUN547, que es una nucleasa putativa dependiente de Ca(2+), se seleccionó como un gen inducido en flores durante la etapa pre-antesis (2,0 desdoblam. p< 0,04) . ' EUN551 es una proteína no caracterizada que se clasificó y eligió como un gen que es inducido en flores (2,6 desdoblam. p < 0,007) y está involucrado en el metabolismo de carbono de la planta (GO: 0005975 metabolismo de carbohidratos) . EUN554 fue caracterizada como proteína del tipo de enlace TBP que es inducida en brotes (1,8 desdoblam. p < 8e-09) durante la etapa de relleno de la vesícula y/o grano lechoso (3,4 desdoblam. p < le-08) . EUN583 es una proteína no caracterizada altamente expresada en flores (2,5 desdoblam. p < 0,006) e inducida significativamente mediante citoquininas (4,0 desdoblam. p < 2e-05) . EUN584 es una proteína desconocida altamente inducida en brotes y raíces (6,0 desdoblam. p < 8e-07) y sobrerepresentada bajo condiciones de deficiencia de nutrientes (6,0 desdoblam. p < le-08) y sequía (3,0 desdoblam. p<0,03) . EUN592 es una proteína desconocida inducida por deficiencia de fosfato (2,0 desdoblam. p< 0,05) y mediante las hormonas relacionadas con el estrés (6,1 desdoblam. p < 2E-05) .
Otros genes EUN y MAB se seleccionaron en base a su expresión inducida en diferentes experimentos de microarreglos. Los experimentos seleccionados de Gene Expression Omnibus (Hypertext Transfer Protocol : //World Wide Web (dot) nebí (dot)
nlm (dot) nih (dot) gov/geo/) son de estrés abiótico (sequía, salinidad) GSE6901, deficiencia de nitrógeno GSE4409, baja temperatura GSE3326, atlas sobre la actividad del arroz GSE6893, y auxina GSE3350. De TAIR (Hypertext Transfer Protocol : //World Wide Web (dot) arabidopsis (dot) org/servlets/Search?type=expr&search_action=ne _search) , se eligieron los experimentos sobre salinidad 1007966888, agente osmótico 1007966835, baja temperatura 1007966553 y aplicación de ABA 1007964750, y de Nascarrays (Hypertext Transfer Protocol : //affymetrix (dot) arabidopsis (dot) info/narrays/experimentbrowse (dot) pl)/ se eligió un experimento sobre deficiencia de Nitrógeno, NASCARRAYS-136. Además, se utilizaron datos de un microarreglo sobre fibra de algodón patentada para detectar la expresión de los genes específicamente en fibra de algodón o raíz (Publicación PCT No: WO 2008/075364) .
En base al análisis de los experimentos de microarreglo descriptos anteriormente, se seleccionó EUN222 debido a que está altamente expresada bajo deficiencia de nitrógeno, salinidad y debido a que está altamente inducida por ABA (véase, Tabla 19, más adelante) . Se seleccionaron EUN267 y EUN206 como genes que son altamente inducidos por salinidad, 'baja temperatura y ABA. La EUN212 es un gen de algodón específicamente expresado en raíces. MAB52 se seleccionó debido a que es inducido por sequía. MAB53 fue seleccionado porque
está inducido por deficiencia de nitrógeno y es un ortólogo funcional de MAB106. EUN566 y EUN568 fueron selecionados por su elevada expresión en hojas cuando ' se los compara con su expresión en raices) . EUN570 fue selecionado debido a que está altamente sobrerepresentado en las bibliotecas EST de hojas (5 desdoblam. p< 0,001) y está inducido por salinidad en el experimento del microarreglo. EUN540 está expresado en raices y está relacionado con la diferenciación de célula ciliada de raíz (GO:0048765) . EUN539, EUN543, EUN576 y EUN577 fueron seleccionados por estar altamente inducidos por deficiencia de nitrógeno. EUN577 también fue seleccionada por estar inducida por estrés por salinidad y baja temperatura. Se seleccionó EUN569 por estar inducido bajo condiciones de salinidad y agente osmótico. EUN586 se seleccionó por estar inducido cuando se trató con la hormona de crecimiento auxina. Se seleccionó EUN253 como gen altamente expresado bajo deficiencia de nitrógeno y EUN593 se seleccionó como gen altamente expresado bajo condiciones de salinidad.
Tabla 19
Análisis de expresión mediante microarreglo de EUN222,
EUN267, EUN206, EUN212, MAB52, MAB53, EUN539, EUN543, EUN576, EUN566, EÜN568, EUN569, EUN570, EUN572, EUN581, EUN540, EUN586, EUN577, EUN253 y EUN593
Tabla 19: Análisis de expresión mediante microarreglo de los genes indicados bajo condiciones de salinidad, sequía, agente osmótico, nitrógeno deficiency, baja temperatura, ABA (ácido abscísico) y en raíces, brote y auxina. Las celdas en blanco indican que altuno de los genes no está expresado.
EUN49, EUN50 y EUN102 son variantes de genes previamente descriptos que se seleccionaron originalmente para rendimiento y mejora de la EUN (Publicación PCT No. WO2007/049275) .
Se identificó en todos los 137 genes un impacto principal sobre la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, rendimiento (por ejemplo, rendimiento de semilla, rendimiento de aceite, cantidad y/o cualidad del grano) , tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite, tolerancia al estrés abiótico y/o eficacia en el uso de
agua cuando se aumenta su expresión en plantas. Los genes identificados, sus secuencias de polinucleótido y polipéptido curadas, asi como también sus secuencias actualizadas de acuerdo con la base de datos del GenBank, se resumen en la Tabla 20, a continuación.
Tabla 20
Genes que afectan la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite, tolerancia al estrés abiótico y/o eficacia en el uso de agua
Polín.
Nombre del gen Nombre del agrupamiento (cluster) Organismo Polip. NR ID DE SEC:
NR ID DE SEO
EUN228 rice|gb l 57.2| AA753730 arroz 33 170
EUN229 maize|gbl64|AW455682 maíz 34 171
EUN230 rice|gb I 57.2| AA749861 arroz 35 172
EUN231 rice|gbl 57.2| A .108994 arroz 36 173
EUN233 rice|gbl 57.2|CB640732 arroz 37 174
EU 234 poplar|gbl 57.2|BU868634 álamo 38 175
EUN235 soybean|gbl62|CA852963 soja 39 176
EUN237 rice|gbl 57.2|BI81 1377 arroz 40 177
EUN239 poplar|gbl 57.2|BU880014 álamo 41 178
EUN240 poplar|gbl 57.2|AJ407707 álamo 42 179
EUN241 tomato|gb! 64|BGl 29806 tomate 43 180
EU 242 tomato|gbl64|BG791300 tomate 44 181
EUN244 soybean|gbl62|CF808561 soja 45 182
EUN245 rice|gbl 57.2|AT003383 arroz 46 183
EUN246 grape|gbl60|CF207859 uva 47 184
EUN248 maize|gbl57|BG354535 maíz 48 185
EU 249 rice|gbl 57.2|AU029933 arroz 49 186
EUN250 rice|gbl57.2|AK.102239 arroz 50 187
EUN251 sorghum|gb 161.xeno| A1947781 sorgo 51 188
EU 252 arabidopsis|gb 165|AT1 G58030 arabidopsis 52 189
EU 253 rice|gbl57.2|AF145730 arroz 53 190
EUN254 maize|gbl64|AI600563 maíz 54 191
EUN255 rice|gbl 57.2|CB000630 arroz 55 192
EUN256 wcalor|gbl54|TG BE216912 trigo 56 193
??G?265 rice|gbl 57.2|BE039218 arroz 57 194
EU 267 arabidopsislgbl 65|AT5G60680 arabidopsis 58 195
EU 268 rice|gbl57.2|AA750934 arroz 59 196
EU 269 cotton|gbl 64|A1730085 algodón 60 197
EUN49 maize|gb l54|AW037179 maíz 61 198
EU 50 maize|gbl64|AW287760 maíz 62 199
EUN51 1 maize|gbl 57|AW360667 maíz 63 200
EUN512 arabidopsislgbl 57.2|AT5G23460 arabidopsis 64 201
EU 513 arabidopsislgbl 57.2|AT3G26100 arabidopsis 65 202
EUN5 I4 soybean|gbl 62|SOYHPR soja 66 203
EUN515 arabidopsis|gb 165|AT 1 G44920 arabidopsis 67 204
EUN515 arabidopsis|gbl 57.2|ATlG44920 P l arabidopsis 67 266
EUN516 arabidopsislgbl 57.2|AT1 G48210 arabidopsis 68 205
EUN519 wcalor|gb! 64|BE445396 trigo 69 206
EUN520 rice|gbl 57.2|B1305493 arroz 70 207
EUN521 rice|gbl 57.2|AU077950 arroz 71 208
EUN523 sorghum|gb 161.xeno| A1901439 sorgo 72 209
EUN525 sorghum|gb 161.xeno|A W052978 sorgo 73 210
EUN527 sorghum|gb 161.xeno| AW055409 sorgo 74 21 1
EUN528 sorghum|gb 161.xeno|A1372194 sorgo 75 212
EUN531 rice|gbl57.2|BI805136 arroz 76 213
EU 532 maize|gbl 64|AW054475 maíz 77 214
EUN533 soybean|gbl 66|AW350050 soja 78 215
EUN535 sorghum|gb 161.crp|BE599042 sorgo 79 216
EUN536 maize|gbl64|BQ279657 maíz 80 217
EUN537 barley|gbl 57.2|AJ234408 cebada 81 218
EUN538 sorghum|gbl61.xeno|AW923729 sorgo 82 219
EUN539 rice|gb l 57.2|AW155216 arroz 83 220
EUN540 arabidopsislgbl 57.2|AT1G 13980 arabidopsis 84 221
EUN542 arabidopsislgbl 57.2|AT3G46280 arabidopsis 85 222
EUN543 rice|gbl 57.2|AK063415 arroz 86 223
EUN544 cotton|gbl64|BQ412384 algodón 87 224
EUN545 cotton|gbl64|A1055737 algodón 88 225
EUN547 sorghum|gb 161.xeno|BI 139559 sorgo 89 226
EUN548 sorghum|gb 161.xeno|BQ279657 sorgo 90 227
Polin.
Nombre del gen Nombre del agolpamiento (cluster) Organismo Polip. NR ID DESEC:
NR ID DE SEC:
EUN549 sorghum|gb 161.xeno| AF 019147 sorgo 91 228
EUN550 canola|gbl61 |EE559843 cañóla 92 229
EUN551 barley|gbl57.3|BE420701 cebada 93 230
EUN553 barley|gbl57.3|BE421829 cebada 94 231
EUN554 sorghumlgb 161.xeno| AAO 1 1880 sorgo 95 232
EUN560 rice|gbl 57.2|BE229552 arroz 96 233
EU 562 rice|gbl57.2|BE039784 arroz 97 234
EUN563 rice|gbl57.2|AU057884 arroz 98 235
EUN564 maize|gbl64|AI619269 maíz 99 236
EUN565 arabidopsis|gb 157.2| AT5G 15080 arabidopsis 100 237
EUN566 arabidopsis|gb 165 |AT2G43700 arabidopsis 101 238
EUN567 arabidopsis|gbl65|ATl G60680 arabidopsis 102 239
EUN568 arabidopsis|gb 165|AT1 G78450 arabidopsis 103 240
EUN569 arabidopsis|gbl65|AT2G03890 arabidopsis 104 241
EUN570 arabidopsis|gb 1651 AT 1 G43910 arabidopsis 105 242
EUN571 arabidopsis|gbl57.2|ATlG47530 arabidopsis 106 243
EUN572 arabidopsis|gbl57.2|AT2G24240 arabidopsis 107 244
EUN573 arabidopsis|gbl65|AT4G15390 arabidopsis 108 245
EUN574 rice|gbl57.2|BI807603 arroz 109 246
EUN575 rice|gbl 57.2|AU068829 arroz 1 10 247
EUN576 ricelgbl 57.2| AA752451 arroz 1 1 1 248
EUN577 arabidopsis|gbl65|ATl G67800 arabidopsis 1 12 249
EUN578 wcalor|gbl64|BE401454 trigo 1 13 250
EUN579 arabidopsis|gbl 651 ATI G70850 arabidopsis 1 14 251
EUN580 arabidopsis|gbl65|AT2G35880 arabidopsis 1 15 252
EUN581 arabidopsis|gb 165|AT1 Gl 2845 arabidopsis 1 16 253
EUN582 sorghum|gb 161.xeno|T 18303 sorgo 1 17 254
EUN583 ricelgbl 57.2|AU 172665 arroz 1 18 255
EUN584 sorghumlgb 161.crp| AW923545 sorgo 1 19 256
EUN585 arab¡dopsis|gb 1651 AT 1 G71900 arabidopsis 120 257
EUN586 arabidopsis|gb 165|AT1 G72320 arabidopsis 121 258
EUN587 sorghumlgb 161.xeno| AW672541 sorgo 122 259
ELTN588 rice|gb l 57.2|AA750816 arroz 123 260
EUN590 sorghumlgb 161.xeno| AI622209 sorgo 124 261
EUN591 sorghum|gbl 61.xeno|BE 123399 sorgo 125 262
EUN592 sorghumlgb 161.xeno| A1901557 sorgo 126 263
EUN593 arabidopsis|gb 165|AT2G04066 arabidopsis 127 264
CT82 cotton|gbl64|BQ402794 TI algodón 128 153
EU 102 maize|gbl64|AI974922 TI maíz 129 265
EUN21 1 rice|gbl57.2|AU174544 TI arroz 130 162
EUN212 cotton|gbl64|CO081293 TI algodón 131 163
EUN269 cotton|gb!64|AI730085 TI algodón 132 1 7
EUN 1 wcalor|gbl 64|BE445396 TI trigo 133 206
EUN535 sorghumlgbl 6 l .xeno|BE599042 TI sorgo 134 267
EUN537 barley|gbl57.2|AJ234408 TI cebada 135 218
EUN544 cotton|gbl64|BQ412384 TI algodón 136 268
EUN584 sorghumlgbl 6 l .xeno|AW923465 TI sorgo 137 269
Tabla 20. Se proveen polinucleótidos (polin.) polipéptidos (polip.) que afectan la eficacia en el uso d nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, rendimiento tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite
tolerancia al estrés abiótico y/o eficacia en el uso de agua de una planta.
EJEMPLO 2
IDENTIFICACIÓN DE HOMÓLOGOS QUE AFECTAN LA EUN, EUF, RENDIMIENTO, TASA DE CRECIMIENTO, VIGOR, BIOMASA, CONTENIDO DE
ACEITE, ABST Y UE
Los conceptos de ortología y paralogia han sido aplicados recientemente a caracterizaciones y clasificaciones funcionales sobre la escala de comparaciones de genomas completos. Los ortólogos y parálogos constituyen dos tipos principales de homólogos. El primero evolucionó de un ancestro común mediante especialización y el último, esta relacionado mediante eventoos de duplicación. Debe comprenderse que los parálogos que surgen de eventoos de duplicación antiguos probablemente tengan función divergente mientras que es más probable que los verdaderos ortólogos retengan su función idéntica en el transcurso del tiempo de evolución.
Para investigar e identificar más a los ortólogos putativos de los genes que afectan la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, rendimiento (por ejemplo, rendimiento de semilla, rendimiento de aceite, biomasa, cantidad y/o cualidad del grano), tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite, tolerancia al estrés abiótico y/o eficacia en el uso de agua (presentados en la Tabla 20, arriba) se alinearon todas las secuencias usando el
BLAST (/Basic Local Alignment Search Tool/) . Se agruparon tentativamente las secuencias lo suficientemente similares. Estos ortólogos putativos luego se organizaron en un Filograma un diagrama (árbol) de ramificación tomado como una representación de relaciones en la evolución entre taxonomías biológicas. Estos ortólogos putativos se organizaron después en cuanto a la coincidencia con el filograma -un diagrama con ramificaciones (árbol) considerado como una representación de las relaciones evolucionarías entre los taxones biológicos. Los grupos ortólogos putativos se analizaron en cuanto a la coincidencia con el filograma y, en casos de desacuerdo, se quebraron los grupos ortólogos no coincidentes. Se analizaron los datos de expresión y se clasificaron las bibliotecas EST usando un vocabulario fijo de términos comunes como por ejemplo, etapas de desarrollo (por ejemplo, genes que muestran un perfil de expresión similar a través del desarrollo con regulación ascendente en una etapa especifica, como la etapa de llenado de semillas) y/o órganos vegetales (por ejemplo, genes que muestran un perfil de expresión similar en sus órganos con regulación ascendente en órganos específicos como por ejemplo, la raíz) . Las notaciones de todas las ESTs agrupadas en un gen fueron analizadas estadísticamente mediante la comparación de su frecuencia en el grupo (cluster) contra su abundancia en la base de datos, permitiendo la construcción de un perfil de expresión numérico y gráfico de dicho gen, que se llamó
"expresión digital". La razón de usar estos dos métodos complementarios con métodos de estudio de asociación fenotipica de QTLs y correlación de expresión de fenotipo está basada en la presunción de que los verdaderos ortólogos probablemente retienen una función idéntica durante el tiempo de evolución. Estos métodos proveen dos grupos diferentes de indicaciones sobre las similitudes de función entre los genes homólogos, similitudes a nivel de secuencia - aminoácidos idénticos en dominios de proteina y similitud en perfiles de expresión.
La búsqueda e identificación de genes homólogos incluye la clasificación de la información de secuencias disponible, por ejemplo, en bases de datos públicas, que incluyen pero no están limitadas a la Base de Datos de ADN de Japón (DDBJ) , Genbank, y European Molecular Biology Laboratory Nucleic Acid Sequence Datábase (EMBL) o sus versiones o la base de datos MIPS. Se han desarrollado una cantidad de algoritmos diferentes de búsqueda incluyendo pero sin limitarse al conjunto de programas referidos como programas BLAST. Existen cinco implementaciones de BLAST, tres diseñadas para secuencias query de nucleótido (BLASTN, BLASTX, y TBLASTX) y dos diseñadas para secuencias query de proteina (BLASTP y TBLASTN) (Coulson, Trends in Biotechnology : 76-80, 1994; Birren y colab., Genome Analysis, I: 543, 1997). Dichos métodos incluyen la alineación y comparación de secuencias. El algoritmo BLAST calcula la identidad de secuencia porcentual y realiza análisis
estadístico de similitudes entre dos secuencias. El software para realizar el análisis BLAST se encuentra disponible al público a través del National Centre for Biotechnology Information. Otros de dicho software y algoritmos son GAP, BESTFIT, FASTA y TFAS A. GAP utilizó el algoritmo de Needleman y Wunsch (J. Mol. Biol. 48: 443-453, 1970) para encontrar la alineación de dos secuencias completas que maximiza la cantidad de coincidencias (matches) y minimiza la cantidad de gaps .
Los genes homólogos pueden pertenecer a la misma familia génica. El análisis de una familia génica puede llevarse a cabo usando el análisis de similitud de secuencias. Para realizar este análisis se pueden utilizar los programas estándar para múltiples alineaciones, por ejemplo, Clustal W. Un árbol que liga vecinos de homólogos de proteínas a los genes en esta invención, puede utilizarse para proporcionar un panorama de las relaciones estructurales y ancestrales. Se puede calcular la identidad de secuencia usando un programa de alineación como describimos anteriormente. Se espera que otras plantas porten un gen funcional similar (ortólogo) o una familia de genes similares y, aquellos genes proporcionarán el mismo fenotipo preferido que los genes presentes aquí. Ventajosamente, estos miembros de familia pueden ser útiles para los métodos de algunas realizaciones de la invención. Ejemplos de otras plantas incluyen pero no están limitados a cebada (Hordeum vulgare) , Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) , maíz (Zea mays) ,
algodón (Gossypium) , colza (Brassica napus) , arroz (Oryza sativa) , caña de azúcar (Saccharum officinarum) , Sorgo (Sorghum bicolor), soja (Glycine max) , girasol (Helianthus annuus) , Tomate (Lycopersicon esculentum) y trigo (Triticum aestivum) .
Los análisis anteriormente mencionados para homología de secuencia, preferentemente, se llevan a cabo en una secuencia de longitud completa, aunque también pueden basarse en una comparación de ciertas regiones como por ejemplo, los dominios conservados. La identificación de dichos dominios, también podría estar dentro del alcance de la persona experta en el arte e involucraría, por ejemplo, un formato legible por computadora de los ácidos nucleicos de la presente invención, el uso de programas de software para alineaciones y el uso de información pública disponible sobre dominios de proteínas, motivos conservados y cajas. Esta información está disponible en la base de datos de PRODOM (Hypertext Transfer Protocol : //World Wide Web (punto) biochem (punto) ucl (punto) ac (punto) uk/bsm/dbbrowser/protocol/prodomqry (punto) html), PIR (Hypertext Transfer Protocol : //pir (punto) Georgetown (punto) edu/) o Pfam (Hypertext Transfer Protocol : //World Wide Web (punto) sanger (punto) ac (punto) uk/Software/Pfam/ ) . Los programas de análisis de secuencias diseñados para la búsqueda de motivos pueden usarse para la identificación de fragmentos, regiones y dominios conservados como se mencionó anteriormente. Los programas para computadora preferidos incluyen, pero no
están limitados a, MEME, SIGNALSCAN, y GENESCAN.
El experto en el arte puede utilizar las secuencias homologas provistas aquí, para encontrar secuencias similares en otras especies y organismos. Los homólogos de una proteina incluyen, péptidos, oligopéptidos, polipéptidos , proteínas y enzimas que tienen sustituciones, eliminaciones y/o inserciones de aminoácido relacionadas con la proteina no modificada en cuestión y que tienen actividades biológicas y funcionales similares a las de la proteína no modificada de la que derivan. Para producir dichos homólogos, se pueden reemplazar los aminoácidos de la proteína por otros aminoácidos que tengan propiedades similares (cambios conservativos, como por ejemplo, hidrofobicidad, hidrofilicidad, antigenicidad, propensión a formar o romper estructuras a-helicoidales o estructuras de 3-láminas) . Se conocen bien en el arte las tablas de sustitución conservativa (véase, por ejemplo, Creighton (1984) Proteins . W.H. Freeman and Company) . Los homólogos de ácido nucleico incluyen ácidos nucleicos que tienen sustituciones, eliminaciones y/o inserciones de nucleótido relacionadas con el ácido nucleico no modificado en cuestión y que tienen actividades biológicas y funcionales similares a las del ácido nucleico no modificado del que derivan.
La Tabla 21, abajo, ofrece una lista resumida de secuencias ortólogas y homologas de las secuencias de polinucleótido (NRs ID DE SEC: 1-137) y secuencias de
polipéptido (NRs ID DE SEC: 138-269) presentadas en la Tabla 20, que fueron identificadas usando BLAST (programas TBLASTN y BlastP) que tienen al menos, un 80% de identidad con respecto a los polipéptidos seleccionados y que se espera posean la misma función en la EUN, ABST, EUF, WUE, incrementoo de biomasa, incrementoo en la tasa de crecimiento, rendimiento, vigor y/o contenido de aceite de las plantas.
Tabla 21
Homólogos de los polinucleótidos y polipéptidos identificados que afectan la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite, tolerancia al estrés abiótico y/o eficacia en el uso de agua de una planta
Polín. Nombre del %de .
Homología
NR ID Nombre del Polip. núcleo del identi
Organismo Algo con NR ID
DE agrupamiento (cluster) SEQ ID agrupamiento dad ritmo
DE SEC:
SEC: (cluster) global
cotton|gbl64|AI72
270 cacao|gbl67|CU484898 cacao 1334 138 88.2 blastp
5990
cotton|gbl 64|AI72
271 cotton|gbl 64|AI726705 algodón 1335 138 86.9 blastp
5990
almond|gbl57.2|AY94 cotton|gbl64|AI72
272 almendra 1336 139 85.7
7462 blastp
5968
apple|gbl 57.3|C04159 cotton|gbl64|AI72
273 manzana 1337 139
32 83.5 blastp
5968
cotton|gbl64|AI72
274 bean|gbl67|CA902463 poroto 1338 139 87.9 blastp
5968
cotton|gbl64|A172
275 cacao|gbl 67|CU519200 cacao 1339 139 95.5 blastp
5968
cotton|gbl64|AI72
276 citnis|gbl66|CK936045 cítrico 1340 139 92.4 blastp
5968
277 cotton|gbl64|AI72
cotton|gbl64|AI728519 algodón 1341 139 90.7 blastp
5968
278 grape|gbl60|AF373604 cotton|gbl64|A172
uva 1342 139 86.2 blastp
5968
lotus|gbl57.2|AY77040 cotton|gbl 64|A172
279 loto 1343 139 85.7
5 blastp
5968
medicago|gbl57.2|BI31 cotton|gbl64|AI72
280 medicago 1344 139 87.4 blastp
1053 5968
papaya|gbl65|GFXEUl
281 cotton|gb!64|AI72
papaya 1345 139
41966X1 90.1 blastp
5968
Polin. Nombre del %de
Homología
NR /D Nombre del Polip. núcleo del identi Algo
Organismo con NR ID
DE agrupamiento (cluster) SEQ ID agrupamiento dad ritmo
DE SEC:
SEC: (cluster) global
poplar|gbl 70|BU88288 cotton|gbl64|A172
282 álamo 1346 139 87.6 blastp
9 5968
poplar|gbl 70|CV25650 cotton|gbl64|A172
283 álamo 1347 139 83.9 blastp
7 5968
prunus|gbl67|AJ8251 1 ciruela cotton|gbl64|AI72
284 1348 139 85.2 blastp
6 europea 5968
soybean|gbl68|BE6599 cotton|gbl64|A172
285 soja 1349 139 87.4 blastp
13 5968
soybean|gbl68|BE6599 cotton|gbl64|AI72
286 soja 1350 139 85.2 blastp
15 5968
spurge|gbl61 |DV 14372 cotton|gbl64|A172
287 euforbiácea 1351 139 84.75 tblastn
0 5968
cotton|gbl64|A172
288 cotton|gbl64|AI726482 algodón 1352 140 98.1 blastp
7334
cotton|gbl64|A172
289 cacao|gbl 67|CU473257 cacao 1353 141 87.4 blastp
6497
cotton|gbl64|BF27232 cotton|gbl64|AI72
290 algodón 1354 141 83.3 blastp
6 6497
cotton|gbl64|AI72
291 cotton|gbl64|AI729672 algodón 1355 144 83.7 blastp
5456
cotton|gbl64|CB35046 cotton|gbl64|BE05
292 algodón 1356 145 87.8 blastp
0 2317
cotton|gbl 64|DV43794 cotton|gbl64|BE05
293 algodón 1357 145
6 87.8 blastp
2317
cotton|gbl64|A172
294 cotton|gbl64|A1726435 algodón 1358 146 95.1 blastp
6479
cotton|gbl64|A172
295 cacao|gbl67|CF972823 cacao 1359 148 81.4 blastp
5508
cotton|gbl64|AI72
296 cotton|gbl64|AI725520 algodón 1360 148 81.8 blastp
5508
cotton|gbl64|BE05438 cotton|gbl 64|A172
297 algodón 1361 148 85.4 blastp
1 5508
cotton|gbl64|A172
298 cotton|gbl 64|AI726610 algodón 1362 149 86.8 blastp
5950
cotton|gbl64|AI72
299 cotton|gbl64|AI731567 algodón 1363 149 96.4 blastp
5950
cotton|gbl64|AI72
300 cotton|gbl 64|AI726627 algodón 1364 150 96.4 blastp
6599
brachyvainaium|gbl69|
301 braquipodio 1365 154 barley|gb 157.2| AL
84.7 blastp BE425417 450627
leymus|gbl 66|EG3888 barley|gb 157.2| AL
302 leymus 1366 154 86.4
30 blastp
450627
pseudoroegneria|gb 167| pseudoroegn barley|gb 157.2| AL
303 1367 154 89.4 blastp
FF340314 eria 450627
wcalor|gbl64|BE42993 barley|gbl57.2|AL
304 trigo 1368 154 89.4
1 blastp
450627
switchgrass|gb 167|DN 1 césped de
305 rice|gbl57.2|BI805
1369 156
42225 82.5
pradera blastp
919
brachy vainaium|gb 169| maize|gb l70|AI97
306 Braquipodio 1370 157 85.2 blastp
BE425715 4922
brachyvainaium|gb 169|
306 maize|gbl64|A197
braquipodio 1370 265 81 blastp BE425715 4922
maize|gbl 70|BG32061
307 maize|gbl70|A197
maíz 1371 157 92.1 blastp 5 4922
maize|gbl70|BG32061 maize|gbl64|A197
307 maíz 1371 265
5 86 blastp
4922
maize|gbl70|A197
308 maize|gbl 70|CF023721 maíz 1372 157 89.1 blastp
4922
Polin. Nombre del Yode
Homología
NR ID Nombre del Polip. núcleo del identi Algo
Organismo con NR ID
DE agrupamiento (cluster) SEQ ID agrupamiento dad ritmo
DE SEC:
SEC: (cluster) global
maize|gbl 64|AI97
308 maize|gbl 70|CF023721 maíz 1372 265 87.5 blastp
4922
ma¡ze|gbl 70|A197
309 maize|gbl 70|CF059393 maíz 1373 157 87.6 blastp
4922
maize|gbl64|AI97
309 maize|gbl70|CF059393 maíz 1373 265 86 blastp
4922
maize|gbl 70|SRR0145 maize|gbl64|AI97
310 maíz 1374 265 88.1 blastp
51 S0286097 4922
maize|gbl70|SRR0145 maize|gbl 70|AI97
310 maíz 1374 157 85.1 blastp
51 S0286097 4922
rice|gbl70|OSHG0902 maize|gbl64|A197
31 1 arroz 1375 265 83.56 tblastn
0 4922
rice|gbl70|OSH G0902 maize|gbl 70|AI97
31 1 arroz 1375 157 80.1 blastp
0 4922
rice|gbl 70|OS12G0809 maize|gbl 70|AI97
312 arroz 1376 157 86 blastp
0 4922
rice|gbl 70|OS12G0809 maize|gbl64|A197
312 arroz 1376 265 81.3 blastp
0 4922
rice|gbl70|OS12G0813 maize|gbl 70|A197
313 arroz 1377 157 86.2 blastp
0 4922
rice|gbl70|OS12G0813 maize|gbl64|AI97
313 arroz 1377 265 81.5 blastp
0 4922
sorghum|gb 161.crp|BE maize|gbl 70|AI97
314 sorgo 1378 157 95.6 blastp
35881 1 4922
sorghum|gb 161.crp|BE maize|gbl64|A197
314 sorgo 1378 265 89.8 blastp
358811 4922
sorghum|gb 161.crp|BG maize|gbl 70|AI97
315 sorgo 1379 157 89.1 blastp
052599 4922
sorghum|gb 161.crp|BG maize|gbl64|AJ97
315 sorgo 1379 265 87.5 blastp
052599 4922
sorghum|gb 161.crp|BG maize|gbl 70|A197
316 sorgo 1380 157 91 blastp
464355 4922
sorghum|gb 161.crp|BG maize|gbl 64|A197
316 sorgo 1380 265 85.6 blastp
464355 4922
sorghum|gb 161.crp|BG maize|gbl 70|AI97
317 sorgo 1381 157 89.1 blastp
488442 4922
sorghum|gb 161.crp|BG maize|gbl64|AI97
317 sorgo 1381 265 87.7 blastp
488442 4922
sorghum|gb 161.crp|SB maize|gbl70|AI97
318 sorgo 1382 157 87.6 blastp
GWP027891 4922
sorghum|gb 161.crp|SB maize|gbl64|A197
318 sorgo 1382 265 86 blastp
GWP027891 4922
wcalor|gbl64|BI47903 maize|gbl 64|AI97
319 trigo 1383 265 81.74 tblastn
1 4922
wcalor|gbl64|BI47903 maize|gbl70|A197
319 trigo 1383 157
1 80.33 tblastn
4922
b rapa|gbl 62|BG54404 arabidopsis|gbl65|
320 b rapa 1384 158 87.5 blastp
7 AT4G24960 b rapa|gbl 62|EX08764 arabidopsis|gbl65|
321 b_rapa 1385 158 82.2 blastp
9 AT4G24960 canola|gbl61 |DY02004
322 arabidopsis|gbl65|
cañóla 1386 158 86.8 blastp 2 AT4G24960 radish|gbl64|EV53886 arabidopsis|gb 165
323 rábano 1387 158 1
84.4 blastp 7 AT4G24960 radish|gbl64|EV54490 arabidopsis|gbl65|
324 rábano 1388 158 85.1
2 blastp
AT4G24960
radish|gbl64|EX74692 arabidopsis|gbl65|
325 rábano 1389 158
8 84.4 blastp
AT4G24960
Polín. Nombre del %de
Homología
NR ID Nombre del Polip. núcleo del identi Algo
Organismo con NR ID
DE agrupamiento (cluster) SEQ ID agrupamiento dad ritmo
DE SEC:
SEC: (cluster) global
radish|gbl 64|EX74824 arabidopsis|gbl65|
326 rábano 1390 158 83.9
4 blastp
AT4G24960
thellungiella|gbl67|BY arabidopsis|gbl65|
327 thellungiella 1391 158 84.3 blastp
812778 AT4G24960
apple|gbl57.3|CN8769 tomato|gbl64|BGl
328 manzana 1392 159 81.7 blastp
40 24666
apple|gbl57.3|CN9447 tomato|gbl64|BGl
329 manzana 1393 159 81.7 blastp
10 24666
apricot|gbl 57.2|CB819 tomato|gbl64|BGl
330 damasco 1394 159
340 82.3 blastp
24666
b oleracea|gbl61 |AM0 tomato|gbl64|BGl
331 b_oleracea 1395 159
57864 80.6 blastp
24666
b rapa|gbl62|EE52769
332 tomato|gbl64|BGl
b_rapa 1396 159 80.6 blastp 0 24666
333 cacao|gbl67|CU493876 tomato|gbl64|BGl
cacao 1397 159 80.3 blastp
24666
canola|gbl61 |CD83051
334 tomato|gbl64|BGl
cañóla 1398 159 80 blastp 8 24666
canola|gbl61 |CX2791 1 tomato|gbl64|BGl
335 cañóla 1399 159 80.6
0 blastp
24666
cassava|gbl64|DV4542
336 tomato|gbl64|BGl
yuca 1400 159
17 82.3 blastp
24666
catharanthus|gb 166| EG
337 tomato|gbl64|BGl
catharanthus 1401 159
557732 81.1 blastp
24666
338 citrus|gbl66|CB290240 tomato|gbl64|BGl
cítrico 1402 159 83.4 blastp
24666
coffea|gbl57.2|DV694
339 café tomato|gbl64|BGl
1403 159 83.4 blastp 449 24666
340 tomato|gbl 64|BGl
cotton|gbl64|AI727100 algodón 1404 159 83.7 blastp
24666
cynara|gbl67|GE58972
341 tomato|gbl64|BGl
alcachofa 1405 159 80
8 blastp
24666
ipomoea|gbl57.2|EE87
342 tomato|gbl64|BGl
ipomea 1406 159 81.7 blastp 5432 24666
343 tomato|gbl64|BGl
kiwi|gbl66|FG405906 kiwi 1407 159 81.6 blastp
24666
peach|gbl57.2|BU0443
344 tomato|gbl64|BGl
durazno 1408 159 84
42 blastp
24666
pepper|gbl 57.2|CA514
345 pimienta tomato|gbl64|BGl
1409 159 93.1 blastp 905 24666
periwinkle|gbl 64|EG55
346 tomato|gbl64|BGl
vinca 1410 159
7732 81.1 blastp
24666
petunia|gbl 66|CV2949
347 tomato|gbl64|BGl
petunia 141 1 159 88.7 73 tblastn
24666
poplar|gbl70|BU86749
348 álamo tomato|gbl64|BGl
1412 159 85.2 blastp 3 24666
prunus|gbl67|BU04434 ciruela
349 tomato|gbl64|BGl
1413 159
2 84
europea blastp
24666
safflor|gbl62|EL39977
350 tomato|gbl64|BGl
cártamo 1414 159
8 81.71 tblastn
24666
soybean|gbl68|AL3712
351 soja 1415 tomato|gbl64|BGl
159
64 81.1 blastp
24666
soybean|gbl68|BE6618
352 tomato|gbl64|BGl
soja 1416 159
67 80.6 blastp
24666
spurge|gbl61 |DV 12188
353 tomato|gbl64|BGl
euforbiácea 1417 159
6 80.6 blastp
24666
strawberry |gb 164| D Y6
354 tomato|gbl64|BGl
frutilla 1418 159
70203 82.4 blastp
24666
Polin. Nombre del %de
Homología
NR ID Nombre del Polip. núcleo del identi Algo
Organismo con NR ID
DE agrupamiento (cluster) SEQ ID agrupamiento dad ritmo
DE SEC:
SEC: (cluster) global
wcalor|gbl64|BE40497 rice|gbl 57.2|AA74
384 trigo 1448 172 81.7 blastp
0 9861
wcalor|gbl64|BE41829 rice|gbl 57.2|AA74
385 trigo 1449 172 82 blastp
0 9861
maize|gbl 70|BM89569 rice|gbl57.2|A 10
386 maíz 1450 173 84.5 blastp
5 8994
rice|gbl70|OS04G5574 rice|gbl57.2|AK10
387 arroz 1451 173 94.7 blastp
0 8994
sorghum|gb 161.crp|BM rice|gbl57.2|AK10
388 sorgo 1452 173 82.2 blastp
895695 8994
brachyvainaium|gbl69| rice|gbl57.2|CB64
389 braquipodio 1453 174 87.2 blastp
CA684980 0732
maize|gbl70|AW56280 rice|gbl 57.2|CB64
390 maíz 1454 174 87.1 blastp
5 0732
sorghum|gb 161.crp|CD rice|gbl57.2|CB64
391 sorgo 1455 174 87.7 blastp
219694 0732
soybean]gbl68|AL3661 rice|gbl57.2|CB64
392 soja 1456 174 80.38 tblastn
92 0732
poplar|gbl57.2|BU
393 poplar|gb 170|AI 166596 álamo 1457 175 88.2 blastp
868634
castorbean|gbl 60|AJ60 soybean|gbl62|CA
394 ricino 1458 176 81 blastp
5572 852963
chestnut|gbl70|SRR00 soybean|gbl62|CA
395 castaña 1459 176
6296S0014660 80.08 tblastn
852963
soybean|gbl62|CA
396 citrus|gbl66|C 740163 cítrico 1460 176 80.08 tblastn
852963
cowpea|gbl66|FF39455 guisante soybean|gbl62|CA
397 1461 176 90.7 blastp
1 pinto 852963
medicago|gb 157.2| AA6 soybean|gbl62|CA
398 medicago 1462 176
60751 87.9 blastp
852963
peanut|gbl67|EH04245 soybean|gbl62|CA
399 maní 1463 176 88.66 tblastn
3 852963
soybean|gbl68|BU5476 soybean|gbl62|CA
400 soja 1464 176 97.2 blastp
71 852963
barley|gbl 57.3|BE1944 rice|gbl57.2|BI81 1
401 cebada 1465 177
21 81.5 blastp
377
brachyvainaium|gbl 69|
402 rice|gbl 57.2|BI81 1
braquipodio 1466 177 82.4 blastp BE424330 377
leymus|gbl66|EG3763
403 rice|gbl57.2|BI81 1
leymus 1467 177 81.8 blastp 96 377
pseudoroegneria|gb 167| pseudoroegn
404 rice|gbl57.2|B181 1
1468 177 82.1 blastp FF349876 eria 377
sugarcanelgb 157.3|C A0 caña de
405 rice|gbl57.2|BI81 1
1469 177 81 blastp 991 15 azúcar 377
wcalor|gbl64|BE42433
406 rice|gbl57.2|BI81 1
trigo 1470 177 81.82 tblastn 0 377
wcalor|gbl64|BE51677
407 rice|gbl57.2|B181 1
trigo 1471 177 82.1 5 blastp
377
antirrhinum|gbl66|AJ5
408 tomato|gbl64|BGl
antirrhinum 1472 180
60033 82.9 blastp
29806
antirrhinum|gb 166| AJ8
409 antirrhinum 1473 180 tomato|gbl64|BGl
83.3 01252 blastp
29806
apple|gbl57.3|AU3012
410 tomato|gbl64|BGl
manzana 1474 180 86.9 87 blastp
29806
apple|gbl57.3|CN4889
41 1 tomato|gbl64|BGl
manzana 1475 180 84.7 89 blastp
29806
apple|gbl 57.3|CN8641
412 tomato|g l64|BGl
manzana 1476 180 84.7 blastp 73 29806
Polin. Nombre del %de
Homología
NR ID Nombre del Polip. núcleo del identi Algo
Organismo con NR ID
DE agrupamiento (cluster) SEQ ID agrupamiento dad ritmo
DE SEC:
SEC: (cluster) global
canola|gbl61 |CD84148 tomato|gbl64|BGl
442 cañóla 1506 180 82.4 blastp
4 29806
canola|gbl61 |CN73488 tomato|gbl64|BGl
443 cañóla 1507 180 81.5 blastp
5 29806
canola|gbl61 |DW9985 tomato|gbl64|BGl
444 cañóla 1508 180 82.1 blastp
30 29806
canola|gbl61 |DY02858 tomato|gbl64|BGl
445 cañóla 1509 180 82.5 blastp
0 29806
canola|gbl61 |EE48334 tomato|gbl64|BGl
446 cañóla 1510 180 80.2 blastp
5 29806
cassava|gbl 64|B 2597 tomato|gbl64|BGl
447 yuca 151 1 180 84.2 blastp
89 29806
cassava|gb 164|C 6459 tomato|gbl64|BGl
448 yuca 1512 180 84.7 blastp
68 29806
cassava|gb 164|DV4467 tomato|gbl 64|BGl
449 yuca 1513 180 82.4 blastp
94 29806
castorbean|gbl60|EE25 tomato|gbl64|BGl
450 ricino 1514 180 82.9 blastp
5473 29806
castorbean|gbl60|EE25 tomato|gbl64|BGl
451 ricino 1515 180 85.1 blastp
5572 29806
castorbean|gbl60|EE25 tomato|gbl64|BGl
452 ricino 1516 180 86 blastp
9993 29806
centaurea|gbl66|EH728 tomato|gbl64|BGl
453 centaurea 1517 180 84.3 blastp
993 29806
centaurea|gb 166|EH737 tomato|gbl64|BGl
454 centaurea 1518 180 83.33 tblastn
653 29806
centaurea|gb 166|EH743 tomato|gbl 64¡BGl
455 centaurea 1519 180 84.7 blastp
515 29806
ccntaurea|gb 166|EH747 tomato|gbl64|BGl
456 centaurea 1520 180 82 blastp
496 29806
chestnut|gbl 70|SRR00 tomato|gbl64|BGl
457 castaña 1521 180 84.7 blastp
6295S0000799 29806
chestnut|gbl 70|SRR00 tomato|gbl64|BGl
458 castaña 1522 180 85.7 blastp
6295S0000895 29806
cichorium|gb 166|DT21 tomato|gbl64|BGl
459 cichorium 1523 180 83.33 tblastn
2405 29806
cichorium|gb 166|DT21 tomato|gbl64|BGl
460 cichorium 1524 180 84.7 blastp
2482 29806
cichorium|gb 166|EH68 tomato|gbl64|BGl
461 cichorium 1525 180 82.88 tblastn
6887 29806
tomato|gbl64|BGl
462 citrus|gbl66|BE205677 cítrico 1526 180 88.3 blastp
29806
tomato|gbl64|BGl
463 citrus|gbl66|CB290704 cítrico 1527 180 83.3 blastp
29806
tomato|gbl64|BGl
464 citrus!gbl 66|CF830698 cítrico 1528 180 83.8 blastp
29806
coffea|gbl57.2|CF5886 tomato|gbl64|BGl
465 café 1529 180
60 82.9 blastp
29806
coffea|gbl57.2|DV665 tomato|gbl64|BGl
466 café 1530 180 80.5 blastp
256 29806
tomato|gbl64|BGl
467 cotton|gbl64|AI055143 algodón 1531 180 82.4 blastp
29806
tomato|gbl64|BGl
468 cotton|gbl64|AI726538 algodón 1532 180 82.43 tblastn
29806
cotton|gbl 64|BF26828 tomato|gbl64|BGl
469 algodón 1533 180
1 88.3 blastp
29806
cotton|gbl64|BF27080 tomato|gbl64|BGl
470 algodón 1534 180 85.1
0 blastp
29806
Polin. Nombre del %de
Homología
NR ID Nombre del Polip. núcleo del identi Algo
Organismo con NR ID
DE agrupamiento (cluster) SEQ ID agrupamiento dad ritmo
DE SEC:
SEC: (cluster) global
cotton|gbl64|BF27430 tomato|gbl64|BGl
471 algodón 1535 180 88.8 blastp
9 29806
cowpea|gbl66|FF38270 guisante tomato|gbl 64|BGl
472 1536 180 84.2 blastp
3 pinto 29806
cowpea|gbl66|FF38550 guisante tomato|gbl64|BGl
473 1537 180 87.4 blastp
0 pinto 29806
cowpea|gbl66|FF38869 guisante tomato|gbl64|BGl
474 1538 180 88 blastp
4 pinto 29806
tomato|gbl64|BGl
475 cycas|gbl66|CB090084 cycas 1539 180 80.6 blastp
29806
cynara|gbl67|GE58364 tomato|gbl64|BGl
476 alcachofa 1540 180 81.98 tblastn
1 29806
cynara|gbl67|GE58600 tomato|gbl64|BGl
477 alcachofa 1541 180 80.18 tblastn
8 29806
dandelion|gbl61 |DY82 diente de tomato|gbl64|BGl
478 1542 180 84.23 tblastn
0375 león 29806
dandelion|gbl61 |DY82 diente de tomato|gbl64|BGl
479 1543 180 85.1 blastp
2153 león 29806
fescue|gbl61 |DT68664 fleo de los tomato|gbl 64|BGl
480 1544 180 82.9 blastp
4 prados 29806
ginger|gbl64|DY35449 tomato|gbl64|BGl
481 jengibre 1545 180 82.9 blastp
0 29806
ginger|gbl64|DY35700 tomato|gbl64|BGl
482 jengibre 1546 180 81.53 tblastn
9 29806
tomato|gbl64|BGl
483 grape|gbl60|BQ797249 uva 1547 180 84.2 blastp
29806
tomato|gbl64|BGl
484 grape|gb>160|CA814878 uva 1548 180 83.4 blastp
29806
tomato|gbl64|BGl
485 grape|gbl60|CB009359 uva 1549 180 83.8 blastp
29806
ipomoea|gbl57.2|BJ55 tomato|gbl64|BGl
486 ipomea 1550 180 90.1 blastp
4498 29806
ipomoea|gb 157.2|BJ55 tomato|gbl64|BGl
487 ipomea 1551 180 89.6 blastp
5833 29806
ipomoea|gb 157.2|BJ56 tomato|gbl64|BGl
488 ipomea 1552 180 89.6 blastp
5525 29806
ipomoea|gbl57.2|DQ01 tomato|gbl64|BGl
489 ipomea 1553 180 82 blastp
6990 29806
tomato|gbl 64|BGl
490 kiwi|gbl66|FG428824 kiwi 1554 180 81.5 blastp
29806
lettuce|gbl57.2|DW046 tomato|gbl64|BGl
491 lechuga 1555 180 85.1 blastp
480 29806
lettuce|gbl57.2|DW051 tomato|gbl64|BGl
492 lechuga 1556 180 80.6 blastp
770 29806
lettuce|gbl57.2|DW054 tomato|gbl64|BGl
493 lechuga 1557 180 84.7 blastp
433 29806
lettuce|gbl57.2|DW104 tomato|gbl64|BGl
494 lechuga 1558 180 83.8 blastp
005 29806
lettuce|gbl57.2|DW148 tomato|gbl64|BGl
495 lechuga 1559 180 84.7 blastp
893 29806
liriodendron|gb 166|CK. tomato|gbl 64|BGl
496 liriodendro 1560 180 81.1 blastp
761427 29806
lovegrass|gbl67|EH189 tomato|gbl64|BGl
497 gramilla 1561 180 81.5 blastp
433 29806
tomato|gbl64|BGl
498 maize|gbl 70|AI621444 maíz 1562 180 83 blastp
29806
tomato|gbl64|BGl
499 maize|gbl70|AI901672 maíz 1563 180 81.5 blastp
29806
Polin. Nombre del %de
Homología
NR ID Nombre del Polip. núcleo del identi Algo
Organismo con NR ID
DE agrupamiento (cluster) SEQ ID agrupamiento dad ritmo
DE SEC:
SEC: (cluster) global
medicago|gbl 57.2|AL3 tomato|gbl64|BGl
500 medicago 1564 180 81.3 blastp
71369 29806
medicago|gbl57.2|AW tomato|gbl64|BGl
501 medicago 1565 180 85.3 blastp
127543 29806
medicago|gbl57.2|AW tomato|gbl 64|BGl
502 medicago 1566 180 81.5 blastp
329342 29806
melon|gbl 65|AM74303 tomato|gbl 64|BGl
503 melón 1567 180 82.9 blastp
6 29806
melon|gbl65|DV63362
504 tomato|gbl64|BGl
melón 1568 180 80.6 blastp 0 29806
nuphar|gbl66|ES73005 tomato|gbl64|BGl
505 nuphar 1569 180 81.2 blastp
4 29806
506 tomato|gbl64|BGl
oak|gbl 70|CU639508 roble 1570 180 85.7 blastp
29806
oak|gbl 70|SRR006307
507 tomato|gbl64|BGl
roble 1571 180 84.7 blastp S0008904 29806
oil_palm|gbl66|CN599 palma de tomato|gbl64|BGl
508 1572 180 82 blastp
846 aceite 29806
509 tomato|gbl 64|BGl
onion|gbl62|CF440003 cebolla 1573 180 82.43 tblastn
29806
papaya|gbl65|AM9041
510 tomato|gbl64|BGl
papaya 1574 180 84.2 blastp 22 29806
papaya|gbl65|EX24513
51 1 tomato|gbl64|BGl
papaya 1575 180
4 83.8 blastp
29806
peach|gbl 57.2|BU0407
512 tomato|gbl64|BGl
durazno 1576 180 88.7 blastp 87 29806
peach|gbl 57.2|BU0486
513 tomato|gbl 64|BGl
durazno 1577 180 81.53 tblastn 27 29806
peanut|gbl 67|EH04295
514 tomato|gbl 64|BGl
maní 1578 180 88.4 blastp 7 29806
peanut|gbl67|EH04486
515 tomato|gbl64|BGl
maní 1579 180
1 83 blastp
29806
pepper|gbl57.2|CA520
516 tomato|gbl64|BGl
pimienta 1580 180 82.4 blastp 584 29806
petunia|gbl 66|CV2968 tomato|g l64|BGl
517 petunia 1581 180
53 82.9 blastp
29806
pineapple|gbl57.2|DT3
518 ananá 1582 tomato|gbl 64|BGl
180 83.3 blastp 37519 29806
519 tomato|gbl64|BGl
poplarjgb 170| AI 166018 álamo 1583 180 86.9 blastp
29806
520 tomato|gbI 64[BGl
poplar|gbl70|BI 120322 álamo¦¦ 1584 180 82.9 blastp
29806
521 tomato|g l64|BGl
popIar|gb 170|B 1128184 álamo 1585 180 81.1 blastp
29806
poplar|gb l70|BU81835
522 tomato|gbl64|BGl
álamo 1586 180
4 87.8 blastp
29806
poplar]gbl 70|CB24041
523 tomato|gbl64|BGl
álamo 1587
1 180 81.1 blastp
29806
potato|gbl 57.2|BG5903
524 papa tomato|gbl 64|BGl
1588 180
29 80.3 blastp
29806
potato|gbl57.2|BG8869
525 papa tomato|gbl 64|BGl
1589 180 82.9 blastp 84 29806
potato|gbl 57.2|B14066
526 tomato|gbl 64|BGl
papa 1590 180 100 blastp 51 29806
prunus|gbl 67|BU04078 ciruela
527 tomato|g l 64|BGl
1591 180 88.7 blastp 7 europea 29806
prunus|gbl 67|BU04862 ciruela
528 tomato|gbl64|BGl
1592 180
7 europea 85.6 blastp
29806
Polín. Nombre del %de
Homología
NR ID Nombre del Polip. núcleo del identi Algo
Organismo con NR ID
DE agrupamiento (cluster) SEQ ID agrupamiento dad ritmo
DE SEC:
SEC: (cluster) global
strawberrylgbl 64|DY6 tomato|gbl64|BGl
558 frutilla 1622 180 83.8 blastp
67942 29806
sugarcanelgb 157.3 |C A0 caña de tomato|gbl64|BGl
559 1623 180 81.53 tblastn
66679 azúcar 29806
sugarcane|gb 157.3|CA0 caña de tomato|gbl64|BGl
560 1624 180 83 blastp
70863 azúcar 29806
sugarcane|gb 157.3|CA0 caña de tomato|gbl64|BGl
561 1625 180 82.5 blastp
73069 azúcar 29806
sugarcane|gb 157.3|CA0 caña de tomato|gbl64|BGl
562 1626 180 81.1 blastp
98212 azúcar 29806
sugarcanelgb 157.3|C A 1 caña de tomato|gbl64|BGl
563 1627 180 83 blastp
05955 azúcar 29806
sugarcanelgb 157.3|C Al caña de tomato|gbl64|BGl
564 1628 180 83 blastp
25341 azúcar 29806
sunflor|gbl62|CD8484 tomato|gbl64|BGl
565 girasol 1629 180 83.8 blastp'
38 29806
sunflor|gbl62|CD8558 tomato|gbl64|BGl
566 girasol 1630 180 84.7 blastp
29 29806
sunflor|gbl62|DY9093 tomato|gbl64|BGl
567 girasol 1631 180 84.7 blastp
91 29806
sunflor|gbl62|EL42356 tomato|gbl64|BGl
568 girasol 1632 180 83.3 blastp
9 29806
sunflor|gbl62|EL42922 tomato|gbl64|BGl
569 girasol 1633 180 85.1 blastp
0 29806
switchgrass|gb 167|DN 1 césped de tomato|gbl64|BGl
570 1634 180 82.4 blastp
43573 pradera 29806
switchgrass|gb 167|DN 1 césped de tomato|gbl64|BGl
571 1635 180 82.9 blastp
51435 pradera 29806
switchgrass|gb 167|FE6 césped de tomato|gbl64|BGl
572 1636 180 83 blastp
07763 pradera 29806
switchgrass|gbl67|FE6 césped de tomato|gbl 64|BGl
573 1637 180 84.2 blastp
24609 pradera 29806
thellungiella|gbl67|BY tomato|gbl64|BGl
574 thellungiella 1638 180 81.5 blastp
802757 29806
tobacco|gbl62|DV1579 tomato|gbl64|BGl
575 tabaco 1639 180 82.4
24 blastp
29806
tobacco|gbl62|EB4264 tomato|gbl64|BGl
576 tabaco 1640 180 96.4 tblastn
44 29806
tobacco|gbl62|EB4265
577 tomato|gbl64|BGl
tabaco 1641 180 84.7 blastp 74 29806
tobacco|gbl62|EB6779 tomato|gbl 64|BGl
578 tabaco 1642 180 94.1 blastp
16 29806
tomato|gbl64|BG 13500 tomato|gbl64|BGl
579 tomate 1643 180 84.2 blastp
3 29806
tomato|gbl64|BG62945 tomato|gbl64|BGl
580 tomate 1644 180 82.9 blastp
6 29806
triphysarialgb 164|DR17 tomato|gbl64|BGl
581 triphysaria 1645 180 82.3 blastp
2719 29806
triphysaria|gbl64|EY12
582 tomato|gbl64|BGl
triphysaria 1646 180 83.8
6667 blastp
29806
triphysaria|gbl64|EY12
583 triphysaria 1647 tomato|gbl64|BGl
180 83.8 blastp 8979 29806
walnuts|gbl66|CV1983 tomato|gbl64|BGl
584 walnuts 1648 180 85.7
06 blastp
29806
wcalor|gbl 64|BE40049 tomato|gbl64|BGl
585 trigo 1649 180 80.8 blastp
9 29806
wcalor|gbl64|BE41769 tomato|gbl64|BGl
586 trigo 1650 180 81.2
4 blastp
29806
Polín. Nombre del %de
Homología
NR ID Nombre del Polip. núcleo del identi Algo
Organismo con NR ID
DE agrupamiento (cluster) SEQ ID agrupamiento dad ritmo
DE SEC:
SEC: (cluster) global
sorghum]gb 161.crp| Al 7 maize|gbl 64|AW0
758 sorgo 1822 214 97.8 blastp
39896 54475
sugarcane|gbl 57.3|BQ4 caña de maize|gbl64|AW0
759 1823 214 97.8 blastp
79038 azúcar 54475
switchgrass|gb 167|FE6 césped de maize|gbl64|AW0
760 1824 214 95.1 blastp
22691 pradera 54475
wcalor|gbl64|BE40670 maize|gbl64|AW0
761 trigo 1825 214 86.7 blastp
3 54475
apple|gbl57.3|AU3014 soybean]gbl66|A
762 manzana 1826 215 93.1 blastp
05 W350050
arabidopsis|gb 165 soybean|gbl66|A
763 1 AT2
arabidopsis 1827 215 91 blastp G27600 W350050
b rapa|gbl62|CV54652 soybean|gbl66|A
764 b rapa 1828 215 90.6 blastp
4 W350050
b rapa|gbl62|EX01933 soybean|gbl66|A
765 b rapa 1829 215 89.9 blastp
5 W350050
barley|gbl 57.3|BE4389 soybean|gbl66|A
766 cebada 1830 215 87.5 blastp
44 W350050
basilicum|gbl57.3|DY3 soybean|gbl66|A
767 basilicum 1831 215 88 blastp
30212 W350050
soybean|gbl66|A
768 bean|gbl67|CA896847 poroto 1832 215 98.4 blastp
W350050
brachyvainaium|gb 169| soybean|gbl66|A
769 braquipodio 1833 215
BE405668 87.9 blastp
W350050
770 soybean|gbl66|A
cacao|gbl67|CA794307 cacao 1834 215 93.1 blastp
W350050
canola|gbl61 |CD81477 soybean|gb 166|A
771 cañóla 1835 215 88.7 blastp
9 W350050 ' canola|gbl61 |DY02474 soybean|gbl66|A
772 cañóla 1836 215 90.8 blastp
9 W350050
castorbeanlgb 160|EG66 soybean|gbl66|A
773 ricino 1837 215 93.1 blastp
1556 W350050
chestnut|gbl 70|SRR00 soybean|gbl66|A
774 castaña 1838 215
6295S0002595 92.9 blastp
W350050
soybean|gbl66|A
775 citrus|gbl66|CF830344 cítrico 1839 215 93.8 blastp
W350050
776 soybean|gb 166|A
cotton|gbl64|AI726326 algodón 1840 215 94 blastp
W350050
soybean|gbl66|A
777 cotton|gbl64|AI729650 algodón 1841 215 91.5 blastp
W350050
soybean|gbl66|A
778 cotton|gbl 64|AI731487 algodón 1842 215 89.5 blastp
W350050
soybean|gbl66|A
779 cotton|gbl64|AI731657 algodón 1843 215 92.2 blastp
W350050
cowpea|gbl66|FF39598 guisante soybean|gbl66|A
780 1844 215
6 pinto 94.2 blastp
W350050
iceplant|gbl64|AF1654 planta de soybean|gbl66|A
781 1845 215
22 91.3 blastp hielo W350050
lettuce|gbl57.2|DW049
782 soybean|gbl66|A
lechuga 1846 215 90.8 083 blastp
W350050
lettuce|gbl57.2|DW059 soybean|gb 166|A
783 lechuga 1847 215 83.9 blastp
917 W350050
784 soybean|gbl66|A
maize|gbl 70|AI615072 maíz 1848 215 89.9 blastp
W350050
785 soybean|gb 166|A
maize|gbl70|AI714627 maíz 1849 215 89.7 blastp
W350050
medicago|gbl57.2|AW soybean|gbl66|A
786 medicago 1850 215
329426 91.94 tblastn
W350050
Polin. Nombre del %de
Homología
NR ID Nombre del Polip. núcleo del identi Algo
Organismo con NR ID
DE agrupamiento (cluster) SEQ ID agrupamiento dad ritmo
DE SEC:
SEC: (cluster) global
apple|gbl57.3|CN9950 rice|gbl57.2|BE03
923 manzana 1987 234 90.7 blastp
13 9784
apricot|gbl 57.2|CB819 rice|gbl 57.2|BE03
924 damasco 1988 234 92.7 blastp
597 9784
apricot|gbl 57.2|CV044 rice|gbl57.2|BE03
925 damasco 1989 234 93.4 blastp
080 9784
aquüegia|gbl57.3|DR9 rice|gbl57.2|BE03
926 aquilegia 1990 234 94.7 blastp
15026 9784
arabidopsis|gbl65|AT2 rice|gbl57.2|BE03
927 arabidopsis 1991 234 90.7 blastp
G36160 9784
arabidopsis|gb 165|AT3 rice¡gbl57.2|BE03
928 arabidopsis 1992 234 91.4 blastp
G l 1510 9784
arabidopsis|gbl65|AT3 rice|gbl 57.2|BE03
929 arabidopsis 1993 234 91.4 blastp
G52580 9784
artemisia|gbl64|EY033 rice|gbl57.2|BE03
930 artemisia 1994 234 89.4 blastp
322 9784
artemisia|gbl64|EY038 rice|gbl57.2|BE03
931 artemisia 1995 234 88.1 blastp
655 9784
artemisia|gbl64|EY050 rice|gbl57.2|BE03
932 artemisia 1 96 234 89.4 blastp
701 9784
avocado|gbl64|CK753 rice|gbl 57.2|BE03
933 palta 1997 234 93.4 blastp
882 9784
bJuncea|gbl 64|EVGN rice|gbl57.2|BE03
934 bjuncea 1998 234 92.7 blastp 00033609170815 9784
bJuncea|gbl64|EVGN rice|gbl 57.2|BE03
935 bjuncea 1999 234 92.7 blastp 00191625522759 9784
bJuncea|gbl64|EVGN rice|gbl57.2|BE03
936 bjuncea 2000 234 84.8 blastp 00422623890637 9784
bJuncea|gbl64|EVGN rice|gbl57.2|BE03
937 bjuncea 2001 234 93.4 blastp 00544912222373 9784
bJuncea|gbl64|EVGN rice|gbl57.2|BE03
938 bjuncea 2002 234 92.1 blastp 0071601 1751939 9784
bJuncea|gbl64|EVGN rice|gbl57.2|BE03
939 bjuncea 2003 234 92.1 blastp 0088821 1982122 9784
bJuncea|gbl64|EVGN rice|gbl57.2|BE03
940 bjuncea 2004 234 92.7 blastp 01248609033239 9784
b oleracea|gbl61 |DY0 rice|gbl 57.2|BE03
941 b_oleracea 2005 234 93.4 blastp
26232 9784
b oleracea|gbl61 |DY0 rice|gbl57.2|BE03
942 b_oleracea 2006 234 92.7 blastp
26495 9784
b oleracea|gbl61 |DY0 rice|gbl57.2|BE03
943 b_oleracea 2007 234 93.4 blastp
26867 9784
b oleracea|gbl61 |DY0 rice|gbl57.2|BE03
944 b_oleracea 2008 234 92.7 blastp
27139 9784
b oleracea|gbl61 |DY0 rice|gbl57.2|BE03
945 b_oleracea 2009 234 92.7 blastp
28093 9784
b oleracea|gbl61|ES94 rice|gbl 57.2|BE03
946 b_oleracea 2010 234 92.7 blastp
2246 9784
b rapa|gbl62|BG54439 rice|gbl57.2|BE03
947 b_rapa 201 1 234 92.7 blastp
0 9784
b rapa|gbl62|CA99225 rice|gbl 57.2|BE03
948 b rapa 2012 234 92.7 blastp
5 9784
b rapa|gbl62|CV43376 rice|gbl 57.2|BE03
949 b_rapa 2013 234 92.7 blastp
9 9784
b rapa|gbl62|CV43378 rice|gbl57.2|BE03
950 b_rapa 2014 234 93.4 blastp
3 9784
b rapa|gbl 62|CX26569 rice|gbl57.2|BE03
951 b_rapa 2015 , 234 93.4 blastp
4 9784
Polin. Nombre del %de
Homología
NR ID Nombre del Polip. núcleo del identi Algo
Organismo con NR ID
DE agrupamiento (cluster) SEQ ID agrupamiento dad ritmo
DE SEC:
SEC: (cluster) global
sugarcane|gbl57.3|CAl caña de rice|gbl57.2|BE03
1 184 2248 234 96 blastp
23229 azúcar 9784
sugarcane|gbl57.3|CAl caña de rice|gbl57.2|BE03
1 185 2249 234 98.7 blastp
37141 azúcar 9784
sugarcane|gbl57.3|CA2 caña de rice|gbl 57.2|BE03
1 186 2250 234 92.72 tblastn
30074 azúcar 9784
sunflor|gbl62|AJ31826 rice|gbl57.2|BE03
1 187 girasol 2251 234 90.1 blastp
3 9784
sunflor|gbl 62|CD8480 rice|gbl 57.2|BE03
1 188 girasol 2252 234 91.4 blastp
93 9784
sunflor|gbl62|CD8488 rice|gbl57.2|BE03
1 189 girasol 2253 234 90.1 blastp
05 9784
sunflor|gbl62|EL43096 rice|gbl57.2|BE03
1 190 girasol 2254 234 82.8 blastp
7 9784
switchgTass|gb 167|DN 1 césped de rice|gbl 57.2|BE03
1 191 2255 234 96.7 blastp
49917 pradera 9784
switchgrass|gb 167|DN 1 césped de rice|gbl57.2|BE03
1 192 2256 234 98.7 blastp
50990 pradera 9784
switchgrass|gb 167|FE5 césped de rice|gbl57.2|BE03
1 193 2257 234 96 blastp
99497 pradera 9784
switchgrass|gb 167|FE6 césped de rice|gbl57.2|BE03
1 194 2258 234 96.7 blastp
08350 pradera 9784
switchgTass|gb 167|FE6 césped de rice|gbl57.2|BE03
1 195 2259 234 80.13 tblastn
25398 pradera 9784
switchgrass|gb 167|FE6 césped de rice|gbl 57.2|BE03
1 196 2260 234 98.7 blastp
27660 pradera 9784
switchgrass|gbl67|FE6 césped de rice|gbl 57.2|BE03
1 197 2261 234 98 blastp
34044 pradera 9784
switchgrass|gb 167|FE6 césped de rice|gbl57.2|BE03
1 198 2262 234 97.4 blastp
37032 pradera 9784
switchgrass|gb 167|FL9 césped de rice|gbl 57.2|BE03
1 199 2263 234 82.12 tblastn
48269 pradera 9784
switchgrass|gb 167|GD0 césped de rice|gbl57.2|BE03
1200 2264 234 80.13 tblastn
4391 1 pradera 9784
tamarix|gbl 66|EG9669 rice|gbl 57.2|BE03
1201 tamarix 2265 234
33 93.4 blastp
9784
tamarix|gbl 66]EG9729 rice|gbl 57.2|BE03
1202 tamarix 2266 234 82.8 blastp
00 9784
thellungiella|gbl67|BY rice|gbl57.2|BE03
1203 thellungiella 2267 234 94 blastp
818453 9784
thellungiella|gbl67|DN rice|gbl57.2|BE03
1204 thellungiella 2268 234 94 blastp
775374 9784
tobacco|gbl62|AM816 rice|gbl57.2|BE03
1205 tabaco 2269 234
373 81.5 blastp
9784
tobacco|gbl62|CN4988 rice|gbl57.2|BE03
1206 tabaco 2270 234 82.2 blastp
43 9784
tobacco|gbl62|CV0191 rice|gbl 57.2|BE03
1207 tabaco 2271 234
14 91.4 blastp
9784
tobacco|gbl 62|CV0202 rice|gbl57.2|BE03
1208 tabaco 2272 234 91.4 blastp
33 9784
tobacco|gbl62|CV0218
1209 rice|gbl57.2|BE03
tabaco 2273 234 92.7 blastp 07 9784
tobacco|gbl62|NTU662 rice|gbl57.2|BE03
1210 tabaco 2274 234
62 90.7 blastp
9784
tomato|gbl64|BG12315 rice|gbl57.2|BE03
1211 tomate 2275 234 92.1 blastp
9 9784
tomato|gbl 64|BG 12356
1212 rice|gbl 57.2|BE03
tomate 2276 234
2 92.7 blastp
9784
Tabla 21: Se proveen los polipéptidos (polipep.) y polinucleotidos (polinucl.) homólogos de los genes ' y polipéptidos identificados en la Tabla 20, que son capaces de aumentar la eficacia en el uso de nitrógeno, eficacia en el uso del fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite, tolerancia al estrés abiótico y/o eficacia en el uso de agua de una planta. Se calculó la homología como un % de identidad sobre las secuencias alineadas. Las secuencias query eran las secuencias de polipéptido de los NRs ID DE SEC: 138-269 y las secuencias objeto eran secuencias de polipéptido o de nucleótido dinámicamente traducidas en todos los seis marcos de lectura identificados en la base de datos basada en una identidad superior al 80% con respecto a las secuencias query de polipéptido .
EJEMPLO 3
CLONACIÓN GÉNICA Y GENERACIÓN DE VECTORES BINARIOS PARA LA
EXPRESIÓN EN PLANTAS
Estrategia de clonación
Los genes presentados en los Ejemplos 1 y 2 anteriores, fueron clonados en vectores binarios para la generación de plantas transgénicas . Para la clonación, primero se identificó el marco de lectura abierto de longitud completa (ORF, por sus siglas en inglés) . En los agrupamientos (Clusters) EST y en algunos casos de secuencias mARN, se analizaron las secuencias mARN para identificar el marco de lectura abierto completo comparando los resultados de varios algoritmos de traducción para proteínas conocidas de otras especies vegetales.
Para clonar los cADNs de longitud completa, se realizó la Transcripción Inversa seguida por PCR (RT-PCR) sobre el ARN total extraído de hojas, raíces, fibras u otros tejidos vegetales, que se estaban desarrollando en condiciones normales, deficientes d enturientes u otras condiciones de estrés abiótico. La extracción de ARN total, producción de cADN y amplificación por PCR se realizaron usando los protocolos estándar descriptos en varios documentos (Sambrook J. , E.F. Fritsch, and T. Maniatis. 1989. Molecular Cloning. A Laboratory Manual., Segunda edición, Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York.) y que son de rutina para el experto en el arte. Se purificaron los productos PCR usando un equipo de purificación PCR (Qiagen) y se secuenciaron los productos PCR amplificados usando el secuenciador ABI 377 (Applied Biosystem) . En los casos en que no se hallaron visibles ninguna banda o banda
débil de producto PCR sobre bromuro de etidio -teñido con 1% geles de agarosa, se utilizó 0,01-1 C3L del producto PCR como matriz AND y se realizó la amplificación PCR usando el mismo grupo de cebadores o un grupo Nuevo, diseñados internamente para el primer grupo de cebadores. En dichos casos, el grupo de cebadores que se esperaba que produzca el PCR más largo, fue llamado grupo de cebadores externos (EF y ER para Externo-Directo y Externo-Inverso, respectivamente), y el grupo de cebadores que se esperaba produzca el producto PCR más corto fue llamado grupo de cebadores Anidados (NF y NR para Anidado-Directo y Anidado-Inverso, respectivamente, como se ilustra en la Tabla 22 más adelante. La clonación de los genes de algodón CT75, CT7, CT76, CT71, CT74, CT11, CT20, CT81, CT22, CT82, CT3, CT40, CT1, CT6, CT27 y CT2 se realize usando sólo un grupo de cebadores, como se detalla en la Publicación WO Publication No: WO2005/121364.
Para facilitar la clonación de secuencias cDNAs/ genómicas, se agregó una extensión de 7-12 bp al extremo 5' de cada cebador de la mayoría de los cebadores. La extensión del cebador incluye un sitio de restricción de endonucleasa (Tabla 22). Los sitios de restricción se seleccionaron usando dos parámetros: (a). El sitio no existía en la secuencia cDNA; y (b) . Los sitios de restricción en los cebadores directos e inversos fueron diseñados de manera que el cADN digerido se inserta en la formación sentido dentro del vector binario
utilizado para transformación. La Tabla 22, a continuación, provee la designación de cebadores, sitios de endonucleasa de restrcción agregados para la subsiguiente clonación y secuencias de cada cebador usadas para la amplifación de genes de algunas de las realizaciones de la invención.
Tabla 22
Cebadores PCR usados para la clonación y clasificación de clones positivos
NR
NR ID
ID del ID
Enz. Cebadores para clonación Cebadores para clasificación DE Pías. Gen DE
SEC:
SEC:
AAAGTCGACAATT
EU 241 GGAGAGGACAG
EUN241 Salí, CTTCTTTGTTTGCT 2576 35SJ F 2864
_EF_SalI GCTTCTTGAG
TGC
EUN241 ATTCTAGATAAAT EUN241 ATTCTAGATCAC
Xbal ER Xb GCTGATATAGGAC 2577 NR Xb AATAGAAACATC 2865
al AAAGC al CTCCCTC
pGXN
EUN241 AAAGTCGACGAA
NF Sal GAAAACCCACAA 2578
I AACCAG
EUN241 ATTCTAGATCACA
NR Xb ATAGAAACATCCT 2579
al CCCTC
EUN242 TATCTAGAGAGAA
GGACAGGCTTCT
EU 242 Xbal, EF Xba GAGAGAGACTTTG 2580 p35S_F2 2866
TGAGATCCT I AAGATG
EUN242 TGAGCTCTTAAGA EUN242 TGAGCTCTTATT
SacI ER Sac GTAGACACAACTC 2581 NR Sac AGGAAGCAACTT 2867
I CTGCG I CAAGAAATG
pGXN
EUN242 TTAGTCGACTGAA
Salí, NF Sal GATGGAAGCAAA 2582
I CTCTAAC
EUN242 TGAGCTCTTATTA
SacI NR Sac GGAAGCAACTTCA 2583
I AGAAATG
EUN255 ATGATATCCCTCC
GGACAGGCTTCT
EUN255 EF Eco AACCTCTCTCCCA 2584 p35S_F2 2868
TGAGATCCT RV AC
EUN255 TAGATATCGATTG EUN255 TAGATATCTCAT ER Eco CTTCTTGTACTCT 2585 NR Ec CATTTGATCAGC 2869 RV GATCATC oRV
EcoRV TTTAGCG
Topo
EUN255 ATGATATCCAAGA
NF Eco ATTAAGGTGTAGC 2586
RV AACC
EUN255 TAGATATCTCATC
NR Ec ATTTGATCAGCTT 2587
oRV TAGCG
EUN269 TATGTCGACACAA
EU 269 GGAGAGGACAG
Salí, NF Sal GGAAATGATGGCT 2588 35SJ F 2870
GCTTCTTGAG I ATTG
pGXN
EUN269 TATCTAGACACCA EUN269 TATCTAGACACC
Xbal NR Xb CAACATGATAGCT 2589 NR Xb ACAACATGATAG 2871
al TTTG al CTTTTG
AAGGTCGACCTGG
EUN521 GGACAGGCTTCT
EU 521 Sal, GAGCTAGCTTTGG 2590 p35S_F2 2872
NF Sal TGAGATCCT
AG
ACTCTAGATCACA CGTCTAGATCAG
EUN521 EUN521
Xba CCGATTCCACACA 2591 ATCGTGTTGAGC 2873
ER Xba NR Xba
TAAC ACTTGAGC
pGXN
AAGGTCGACCTGG
EUN521
GAGCTAGCTTTGG 2592
NF Sal
AG
CGTCTAGATCAGA
EUN521
TCGTGTTGAGCAC 2593
NR Xba
TTGAGC
EUN554 TCCCGGGCTCCGT
GGAGAGGACAG
EUN554 Smal, EF Sm CTCTAGGGTTTGA 2594 35S_1F 2874 pGXN
GCTTCTTGAG
al G
NR
NR ID
ID del ID
Enz. Cebadores para clonación Cebadores para clasificación DE Pías. Gen DE
SEC:
SEC:
EUN554 TGAGCTCTCAGTG EUN554 TGAGCTCTCAGT
SacI ER Sac ATTGGAACTCTAG 2595 ER Sac GATTGGAACTCT 2875
I ATCTTG I AGATCTTG
EUN562 TATCTAGACTTGA
EUN562 Xbal, EF Xba GCTAGGGTTTTAT G
2596 35SJF GGAGAGGACA
2876 I CGC GCTTCTTGAG
EUN562 TGAGCTCTTAATG EUN562 TGAGCTCTTATG
SacI ER Sac CAGACGGTAACAT 2597 NR Sac AAGATTACAGCC 2877
I CTAGG 1 TCCTACC
pGXN
EUN562 TATCTAGAAACAA
NF Xb TGTCCGGGAGGA 2598
al AGAAGAC
EUN562 TGAGCTCTTATGA
NR Sac AGATTACAGCCTC 2599
I CTACC
AGAGTCGACGTG
EUN567 Sal, EUN567
ACATAAAATCCAT 2600 35S_1F GGAGAGGACAG 2878 _EF_Sal GCTTCTTGAG
GGCTG
EUN567 TATCTAGATCAGC ACCTCTAGATCA
Xba EUN567
_ER_Xb TTACACAAGCCCT 2601 TTAAGTGGCTTT 2879
NR Xba
a TAGCA CCAGGAAG
pGXN
GAGGTCGACAATC
EUN567
CATGGCTGAAGCT 2602
_NF Sal
TG
EUN567 ACCTCTAGATCAT
TAAGTGGCTTTCC 2603
NR Xba
AGGAAG
AGAGTCGACCGC
EUN568
EUN568 Sal, AACGGAAAACAA 2604 GGAGAGGACAG
35S_1F
EF Sal 2880
GCTTCTTGAG ATC
TATCTAGAAGATA TATCTAGATCAT
EUN568
Xba EU 568
GGCTTATCTCAAT GTTCACTGAGTA ER Xba 2605 2881
NR Xba ACGATACTAACA
GGCT
G pGXN
TAGGTCGACACAA
EUN568
ATCCGCCAATGGA NF Sal 2606
AG
TATCTAGATCATG
EUN568
NR ba TTCACTGAGTAAC 2607
GATACTAACAG
TAGGTCGACGAG
EUN573 Sal, EUN 573
AGAAATCCATGG 2608 35SJF GGAGAGGACAG
EF Sal 2882
AGACG GCTTCTTGAG
EUN573 CGAGCTCAATTTC CGAGCTCTCAGT
Sac EUN573
AGTACAGGATTTA 2609
_ER Sac ACAGGATTTAAA 2883
NR Sac
AACC CCAAGACA
pKsJ
ACCCGGGAGACG
EUN573
Sma, ATGACGATGAAG 2610
_NF Sma
GTTG
EUN573 CGAGCTCTCAGTA
Sac
NR Sac CAGGATTTAAACC 261 1
AAGACA
EUN575 EUN575
AAGATATCCCAAA AAGATATCCCAA
EUN575 NF Eco 2612 NF Eco ACACCAAACCCT 2884
RV CACCAAACCCTCG
EcoRV RV CG
EUN575 pKsJ
TAGATATCTCATC NR Ec ATATTCCTAGCTT 2613 101_R AAGTTGGGTAAC
2885 oRV GCCAGGGT
ATCAACCTC
NR
NR ID
¡D del ID
Enz. Cebadores para clonación Cebadores para clasificación DE Pías. Gen DE
SEC:
SEC:
AAAGTCGACCGAT
EUN585 GGAGAGGACAG
EUN585 Salí, TTCTGCTTCGATC 2614 35S 1 F 2886
_EF_Sall GCTTCTTGAG
TCTAC
EUN585 ATTCTAGACCTTC EU 585 ATTCTAGATTAG
Xbal ER Xb TTCGATCTTCTTG 2615 NR Xb TTTGCAGTTATC 2887
al AACC al GCAGTGG
pGXN
EUN585 AAAGTCGACGTCT
NF Sal GGGTCGAAGTTAA 2616
I ATAGG
EUN585 ATTCTAGATTAGT
NR Xb TTGCAGTTATCGC 2617
al AGTGG
AAAGTCGACGTTC
EUN587 GGAGAGGACAG
EU 587 Salí, CATTGGAGGAGA 2618 35SJ F 2888
_EFJSall GCTTCTTGAG
ATCG
EUN587 ATTCTAGATTCAA EUN587 ATTCTAGATTAT
Xbal ER Xb AAGGAAAATGGA 2619 NR Xb TTCAAACATGAA 2889
al GAGG al ATGAGTTGC
pGXN
EUN587 AAAGTCGACAAA
NF Sal GGCTTGGAAAGG 2620
I AAGG
EUN587 ATTCTAGATTATT
NR Xb TCAAACATGAAAT 2621
al GAGTTGC
EUN528 AGAGCTCAACCCT GCTATGACCATG
EU 528 Sac 2622 I 01F 2890
EF Sac AACGTTTCGATCG ATTACGCC
TGAGCTCTTCCAG TGAGCTCTGGCC
EUN528 EUN528
Salí, AAGTAGCATCTTT 2623 TTCACCCTCTAT 2891
_ER_Sac _NR_Sac
CG ATCTC
EUN528 AATGTCGACGAA pGXN NF Sal GCGTCTGAGCCAG 2624
I TCC
TGAGCTCTGGCCT
EUN528
TCACCCTCTATAT 2625
_NR_Sac
CTC
ATTGTCGACGAGT
EUN535 GCTATGACCATG
EU 535 Sal, ATGCTTTCCGATG 2626 101_F 2892
_NF_Sal ATTACGCC
GG
pGXN
EUN535 TTTCTAGACTATG EUN535 TTTCTAGACTAT
Xbal NR Xb AATGAATCCGTGA 2627 NR Xb GAATGAATCCGT 2893
al CTCTTG al GACTCTTG
ATTGTCGACCACG ATTGTCGACCAC
EUN538 EUN538
EUN538 Sal, ACCATTCTTCATT 2628 GACCATTCTTCA 2894
_EF_Sal _EF_Sal '
TTCC TTTTCC
pKSJ
EUN538 TCCCGGGTTAGAA
GCGGGACTCTAA
Sma ER Sm CTGAGTCTGAAAG 2629 NOS R 2895
TCATAAAAACC
a GATGG
AATGTCGACGTCC
EUN548 GCTATGACCATG
EUN548 Sal TAATACTATACTC 2630 101 F 2896
_NF_Sal ATTACGCC
GCAATCC
pGXN
EUN548 AATCTAGATCAAC EUN548 AATCTAGATCAA
Xba _NR_Xb CAACTAGTTTGCA 2631 _NR_Xb CCAACTAGTTTG 2897
a GCTCCT a CAGCTCCT
TAAGTCGACCAAA
EUN537 GAAACACCATCT
EUN537 Sal, CAACATGTCTGCC 2632 101_ER 2898
_NF_Sal TCGTTCTTG
TGTG
pGXN
EUN537 ATTCTAGATTAAC TAAGTCGACCAA
EUN537
Xba _NR_Xb ACATCGTTTGGTG 2633 ACAACATGTCTG 2899
_NF_Sal
a CATAGC CCTGTG
NR
NR ID
ID del ID
Enz, Cebadores para clonación Cebadores para clasificación DE Pías. Gen DE
SEC:
SEC:
AATGTCGACGTTG
EU 551 EUN551 GTCAAGCTGTGC
EUN551 Sal, ATCAGTCAGCCCA 2634 2900
_NF_Sal _seqF TGTCTTCC
CTTC
pGXN
EUN551 TATCTAGAGACAT
GAAACACCATCT
Xba _ER_Xb AATCCATCAACGG 2635 101_ER 2901
TCGTTCTTG
a TTG
AATCTAGACTCAC EUN553 AATCTAGAGACA
EUN553
EUN553 Xba. GAATCCACCGATC 2636 _NF_Xb CGGACCGAACA 2902
_EF_Xba
AG a GCTAG
EUN553 TCCCGGGACACAC
GCGGGACTCTAA
Sma _ER_Sm ATCATGGCTGTTA 2637 NOS_R 2903
TCATAAAAACC
a CAG
pGXN
EUN553 AATCTAGAGACAC
_NF_Xb GGACCGAACAGC 2638
a TAG
EUN553 TCCCGGGCGACTT
_NR_Sm CATATACAGACGG 2639
a ATG
AATCTAGAGATTA AATCTAGAGATT
EUN51 1 EUN51 1
EUN51 1 Xba. GGAGCAGGGACC 2640 AGGAGCAGGGA 2904
_EF_Xba _EF_Xba
AATC CCAATC
pGXN
TGAGCTCTTAGGT
EUN51 1 GAAACACCATCT
Sac ACATGATGACATT 2641 101_ER 2905
NR Sac TCGTTCTTG
TCAGCA
EUN512 AATCTAGACCTAT EUN512 AATCTAGACCTA
EUN512 Xba. _NF_Xb TGCTCATGATGTT 2642 _NF_Xb TTGCTCATGATG 2906
a TGA a TTTGA
pGXN
TG AGCTCTT AC A A
EUN512 GCGGGACTCTAA
Sac AGGCAGGAAATA 2643 Nos R 2907
_NR_Sac TCATAAAAACC
CAGAAG
EUN542 TATCTAGAAATTT
EUN542 GTACGTCTCCGT
EUN542 Xbal, EF Xba AGCTCGTTGATGA 2644 2908
_seqF CCGACAAC
I TGG
EUN542 TGAGCTCCTAGTG
GAAACACCATCT
SacI ER sac TCCATGTCAATGA 2645 101 ER 2909
TCGTTCTTG I TGTC
pGXN
EUN542 TATCTAGATAGCT
NF Xb CGTTGATGATGGA 2646
al GG
EUN542 TGAGCTCTTATCC
NR Sac ATGTCAATGATGT 2647
1 CCATC
EUN569 AAAGTCGACGCTA
GGAGAGGACAG
EUN569 Salí NF Sal CTGCTTCTTCTGTT 2648 35SJF 2910
GCTTCTTGAG
1 CACC
pGXN
EUN569 TGAGCTCTACTAC
EUN569 GAGATGGAGCCT
SacI NR Sac CATAGAACTGAA 2649 291 1
_seqR TGTCATGA
I GAAGAAGTC
EUN244 TTAGTCGACTAGA
EUN244 Salí, GGAGAGGACAG
NF Sal CTGATGGGAAGTG 2650 35S_1F 2912
GCTTCTTGAG I TTCC
pGXN
EUN244 TATCTAGACTACT EUN244
Xbal TATCTAGACTAC
NR Xb ACACGGATTGCCC 2651 NR Xb 2913
TACACGGATTGC
al AAAC al
CCAAAC
EUN577 AATCTAGAGTTTA
EUN577 GGAGAGGACAG
NF Xb TCTTGTTTTGGGT 2652 2914 TopoB
35SJ F GCTTCTTGAG
al TTGG
NR
NR ID
ID del ID
Enz. Cebadores para clonación Cebadores para clasificación DE Pías. Gen DE
SEC:
SEC:
EUN577 TCCCGGGGTGAAA EUN577 TCCCGGGGTGAA NR Sm GATCTCAGACCAC 2653 NR Sm AGATCTCAGACC 2915 al CTC al ACCTC
EUN253 TATCTAGACTTCT
GGAGAGGACAG
EUN253 Xbal, EF Xba TCCTCCATATCAC 2654 35S_1 F 2916
GCTTCTTGAG I ACG
EUN253 TCCCGGGTCACGT
Smal ER Sm GGCATGCATGATC 2655
al TG
pl SJ
EUN253 TATCTAGAAACAA EUN253 TCCCGGGTCATC NF Xb TGGATGGGGAGG 2656 NR Sm ACTCGCTCTCGA 2917 al AGGAC al ATTCC
EUN253 TCCCGGGTCATCA
NR Sm CTCGCTCTCGAAT 2657
al TCC
EUN583 TATCTAGACACGA
GGAGAGGACAG
EU 583 Xbal. EF Xba ATCAACCCACCAG 2658 35SJF 2918
GCTTCTTGAG I AG
EUN583 TGAGCTCTCAATG EUN583 TGAGCTCTCATC
SacI ER Sac CCGATCATCAGTG 2659 NR Sac AGAACCGGAAG 2919
I CTAAG I AAGTTGG
pGXN
EUN583 TATCTAGAAACAA
_NF_Xb TGCCTTGGGTTTA 2660
al TCATCC
EUN583 TGAGCTCTCATCA
NR Sac GAACCGGAAGAA 2661
I GTTGG
EUN235 TATCTAGAATTGA
GGAGAGGACAG
EUN235 Xbal, EF Xba GCAGAGGAGCCA 2662 35SJ F 2920
GCTTCTTGAG I TG
EUN235 TGAGCTCCTACAC EUN235 TGAGCTCTTAAG
SacI ER Sac AGGGTGCCAGATC 2663 NR Sac TGCAAGTTGTCA 2921
1 TC I ATCCTATTG
pGXN
EUN235
TATCTAGAGGAGC NF Xb 2664
CATGGCCAAAATC
al
EUN235 TGAGCTCTTAAGT
NR Sac GC AAGTTGTC A AT 2665
I CCTATTG
GGAGAGGACAG
EUN231 35SJ F 2922
GCTTCTTGAG
EUN231 CCTGAGAGGGC
GA 2923
GA R GATCATATC
EUN513 AATCTAGAGATGA
GGAGAGGACAG
EU 513 Xbal, NF Xb TGGTTTGATGCAG 2666 35SJF 2924
GCTTCTTGAG
al ATG
pKSJ
EUN513 TCCCGGGCTAACG
EUN513 CTGCTTTGACAT
Smal NR Sm TAGTTTCTTACCA 2667 2925
_seqR GGCTTAGAC
al ACCAAAC
EUN516 AATGTCGACGAG
GGACAGGCTTCT
EUN516 Salí, NF Sal AGAAGGGTGTAA 2668 p35S_F2 2926
TGAGATCCT I TGAGCTG
pGXN
EUN516 TATCTAGATCATC EUN516 TATCTAGATCAT
Xbal NR Xb AGTAGGGGTTCCT 2669 NR Xb CAGTAGGGGTTC 2927
al ATGTGG al CT ATGTGG
EUN223 AAAGTCGACCAA
GGAGAGGACAG
EUN223 Salí, NF Sal GAGGTAGCACATC 2670 35SJ F 2928 pGXN
GCTTCTTGAG I CTCTCC
NR
NR ID
ID del ID
Enz. Cebadores para clonación Cebadores para clasificación DE Pías. Gen DE
SEC:
SEC:
EU 223 ATTCTAGACCGGA EUN223 ATTCTAGACCGG
Xbal NR Xb TTGAACTAATTAA 2671 NR Xb ATTGAACTAATT 2929
al CGAC al AACGAC
EUN540 AAAGTCGACAGG
GGAGAGGACAG
EUN540 Salí, NF Sal AAGATTGTGAGCA 2672 35SJF 2930
GCTTCTTGAG I TTGAAG
pGX
EUN540 ATTCTAGACACCT EUN540
CATACCAACATG
Xbal NR Xb AATGATCTCACTT 2673 ER Nd 2931
TTCGACCAC
al GTAAGG el
TTAGTCGACAGCC
EUN544 GGAGAGGACAG
EU 544 Salí, TTGCCTTGTTTCTT 2674 35SJ F 2932
_EF_SalI GCTTCTTGAG
C
EU 544 TCCCGGGCAACTT EUN544 TCCCGGGCTTTC
Smal ER Sm ATACACTCAACCA 2675 NR Sm ATCCATGTGTGC 2933
al AAGC al AGTG
pKSJ
EUN544 TTAGTCGACCATA
NF Sal CACACACAGTGA 2676
I GAGGTAGG
EUN544 TCCCGGGCTTTCA
NR Sm TCCATGTGTGCAG 2677
al TG
EUN560 AATCTAGAAGAA
EU 560 Xbal, GGAGAGGACAG
EF Xba ACCCAGAGGAGC 2678 35S_1 F 2934
I GCTTCTTGAG AGC
EUN560 CGAGCTCAAGGG EUN560 TGAGCTCCTACT
SacI ER Sac ATTATTATTGCAG 2679 NR Sac TCTAGGCCTTGT 2935
I GTTG I TGCTGC
pGXN
EUN560 AATCTAGAGAAG
NF Xb CAGGAAGGAAGC 2680
al AGAG
EUN560 TGAGCTCCTACTT
NR Sac CTAGGCCTTGTTG 2681
I CTGC
EUN563 AATCTAGAGATAA EUN563 ATTCTAGATCAC
EU 563 Xbal, EF Xba CATCAGTAGTTCG 2682 _NF_Xb AGCAACACAATC 2936
I CAGC al ACCAC
EUN563 CGAGCTCAACACA
AAGTTGGGTAAC
SacI ER Sac CTCACACCAAAAG 2683 101_R 2937
GCCAGGGT I TCC
pGXN
EUN563 ATTCTAGATCACA
NF Xb GCAACACAATCAC 2684
al CAC
EUN563 TGAGCTCCACTGC
NR Sac TACTGAAGGCAA 2685
I ATTC
EUN565 ATTCTAGATTTTC
GGAGAGGACAG
EUN565 Xbal EF Xba CTGGATTTTGTTT 2686 35S_1F 2938
I GCTTCTTGAG TCTC
EUN565 TGAGCTCTCAATT EUN565 TGAGCTCCTACT
SacI ER Sac AAAGAGTTACCCT 2687 NR Sac TGAGCCTTCTAG 2939
I AACG I CTCTGTTC
pGXN
EUN565 ATTCTAGAGATTT
NF Xb GGGGAAAAGCTA 2688
al TGG
EUN565 TGAGCTCCTACTT
NR Sac GAGCCTTCTAGCT 2689
I CTGTTC
NR
NR ID
ID del ID
Enz. Cebadores para clonación Cebadores para clasificación DE Pías.
Gen DE
SEC:
SEC:
TACGTCGACTTCA
EUN566 GGAGAGGACAG
EU 566 CATGTCTTGÁCTA 2690 35SJF 2940
_EF_SalI GCTTCTTGAG
GTTCATATG
EUN566 TAAGTCGACACGA
EU 566 CGAAGGCATAG
ER Sal TACATTCAATACA 2691 2941
_R ACGTCTGTC
I ATCACC
Salí Topo
EU 566 TTAGTCGACCTTC
NF Sal CATCATGCTCCCA 2692
I AAG
EUN566 TAAGTCGACTCAA
NR Sal CTCAGCATCACGT 2693
I CTCAGC
AATGTCGACTCGT
EUN586 GGAGAGGACAG
EUN586 Salí, TTCTCCTCTAACG 2694 35SJF 2942
_EF_SalI GCTTCTTGAG
TCAAC
EUN586 TCCCGGGTCAGCA
EU 586 CATCGAAGCACT
Smal ER Sm GCTCTCTGTCTGT 2695 2943
_R TCTCAACTG
al TAC
pKSJ
EUN586 ATAGTCGACGTTT
NF Sal AACATAGTTGGGG 2696
I CTAGG
EUN586 CCCCGGGATAAGC
NR Sm CAGGAGATGAAA 2697
al GGAG
EUN588 AAAGTCGACGATC
GGAGAGGACAG
EU 588 Salí, NF Sal GAAAAGAGAAGA 2698 35S_1F 2944
GCTTCTTGAG I GGAGC
pGXN
EUN588 ATTCTAGACTAAT EUN588 ATTCTAGACTAA
Xbal NR Xb CTCTCTCCCTCCC 2699 NR Xb TCTCTCTCCCTC 2945
al TCC al CCTCC
GGAGAGGACAG
EUN591 35S_1F 2946
GCTTCTTGAG
EUN591 CTCTTGCAGCTC
GA 2947
GA R TTGATCTTC
EUN206 ATTCTAGAATTTA
GGAGAGGACAG
EUN206 Xbal, EF Xba CACAGACTTGTCG 2700 35SJF 2948
GCTTCTTGAG I CTCTC
EU 206 TATCTAGACTTCT EUN206 TATCTAGATCAT
Salí ER Xb GATTCAGTGACTG 2701 NR Xb CAGTGACTGTGA 2949
al TGAGC al GCCTCGT
pGN
EUN206 ATAGTCGACAACA
NF Sal ATGGACAAATTTT 2702
I GGAC
EUN206 TATCTAGATCATC
NR Xb AGTGACTGTGAGC 2703
al CTCGT
EUN208 A ATCT AG ACTG A A
GGAGAGGACAG
EUN208 Xbal, EF Xba AGAGAGAGAGGT 2704 35SJ F 2950
GCTTCTTGAG I ATGGC
EUN208 TGAGCTCTGAATT EUN208 TGAGCTCTTATT
SacI ER Sac AGTCATCTATTGG 2705 NR Sac AGTCATCTATTG 2951
I GTCC I GGTCCTGAG
pGN
EUN208 TATCTAGAAACAA
_NF Xb TGGCAGGTGAGG 2706
al CAACTC
EUN208 TGAGCTCTTATTA
NR Sac GTCATCTATTGGG 2707
I TCCTGAG
MR
NR ID
ID del ID
Enz. Cebadores para clonación Cebadores para clasificación DE ñas. Gen DE
SEC:
SEC:
AATGTCGACTTTG
EUN209 GGAGAGGACAG
EUN209 Salí, TGATGACCCTTTT 2708 35SJ F 2952
_EF_SalI GCTTCTTGAG
AAGG
EUN209 ATTCTAGAGGTAG EUN209 ATTCTAGATTAT
Xbal ER Xb TTAGCCGGTCATG 2709 NR Xb TAGCCGGTCATG 2953
al TTG al TTGTAGTC
pGN
EUN209 AATGTCGACAACA
NF Sal ATGGATTGGGAA 2710
I AAACAGC
EUN209 ATTCT AG ATT ATT
NR Xb AGCCGGTCATGTT 271 1
al GTAGTC
TGAGTCGACGTCT
EUN210 GGAGAGGACAG
EUN210 Salí TGAAATGTTTGGT 2712 35SJ F 2954
_EF_SalI GCTTCTTGAG
GGGT
TGTCTAGACTAT
EUN210 TATCTAGACTTAC EUN210
GCTATGAGGAA
Xbal ER Xb TTGCCCTTTGCTT 2713 NR Xb 2955
AAGAAACTAAG
al ATGA al
C pGN
EUN210 AATGTCGACAACA
NF Sal ATGTTTGGTGGGT 2714
I TCAATGTG
EUN210 TGTCTAGACTATG
NR Xb CTATGAGGAAAA 2715
al GAAACTAAGC
GGAGAGGACAG
EUN21 1 35SJ F 2956
GCTTCTTGAG
GCGGGACTCTAA
GeneArt NOS_R 2957
TCATAAAAACC
EUN212 ATTCT AGAATATC
GGAGAGGACAG
EUN212 Xbal EF Xba ATAATGAAAGGG 2716 35SJ F 2958
GCTTCTTGAG I ATTCG
EUN212 TGAGCTCCCATTA EUN212 TGAGCTCTTATT
Sacl ER Sac GAACCGAGACTG 2717 NEW AGAACCGAGAC 2959
I AAG NR Sacl TGAAGATACTTA
pGN
EUN212 TATCTAGAAACAA
NF Xb TGAAAGGGATTCG 2718
al CTCC
EUN212 TGAGCTCTTATTA
NR Sac GAACCGAGACTG 2719
I AAGATACTTA
EUN221 AAGATATCAATGA
EU 221 GGAGAGGACAG
EF Eco CTTTCCCCATCTA 2720 35SJ F 2960
GCTTCTTGAG RV TCC
EUN221 ACGATATCAATCG EUN221 ATGATATCCATT ER Eco ACCAACAACTAAC 2721 NR Ec ACATGTGTGTAT 2961 RV ATTAC oRV CCGACG
EcoRV pKSJ
EUN221 AAGATATCCTTCT
NF Eco AATAATCAACCGA 2722
RV CAGG
EUN221 ATGATATCCATTA
NR Ec CATGTGTGTATCC 2723
oRV GACG
ATAGTCGACGGG
EUN222 EUN222 AGTTGCATCGAT
EUN222 Salí, AAGT ATC ATT AGT 2724 2962 pGN
_EF_SalI _seq_Fl CTTGATCTTG
TCATTACC
EUN222 TATCTAGACTAGT
CTGCAAGGCGAT
Xbal ER Xb ATCCCTAACGTAA 2725 101_ER 2963
TAAGTTGG
al CAAAGACTC
NR
NR ID
ID del ID
Enz. Cebadores para clonación Cebadores para clasificación DE Pías. Gen DE
SEC:
SEC:
EUN222 AATGTCGACTTAC
NF Sal CATGGGAGACTAT 2726
I AACATG
EUN222 TATCTAGACTACT
NR Xb AACGTAACAAAG 2727
al ACTCTTCACA
EU 229 TATCTAGACTGTC
EU 229 GCAAGGTTAGCT
EUN229 Xbal EF Xba TGTTTGCCTGTCG 2728 2964
_seq_F 1 TCATGACG
I AG
EUN229 TCCCGGGATACTC
GAAACACCATCT
Smal ER Sm AAATCAAATGAA 2729 101_ER 2965
TCGTTCTTG
al AGTCCG
pGN
EUN229 CATCTAGACAACA
NF Xb ATGGCGAGGATG 2730
al ATC
EUN229 TCCCGGGTTAGAT
NR Sm AGAAGTTTATCCC 2731
al ATCAGGG
AATGTCGACAGTC EUN254 AATGTCGACCTG
EUN254
EU 254 Salí TGCACTGGAAGG 2732 NF Sal GAAGGACAGCA 2966
_EF_SalI
ACAG I TGTCG
EUN254 TATCTAGACTTGT
AAGTTGGGTAAC
Xbal ER Xb TGCCAGCATCTCT 2733 101_R 2967
GCCAGGGT
al TATG
pGN
EUN254 AATGTCGACCTGG
NF Sal AAGGACAGCATG 2734
I TCG
EUN254 TATCTAGACTATG
NR Xb ACTAGCTGATGGA 2735
al GTCCTCC
EUN267 CTTCTTCAATGGC EU 267 CTTCTTCAATGG
EUN267 2736
F 2968
GACGG F CGACGG
TAGTCATGCAAAT Topo
EUN267 GAAACACCATCT ATTTAATCTTGGA 2737 101_ER
_R 2969
TCGTTCTTG ACCC
EUN519 TTAGTCGACTTAA EU 519 TTAGTCGACTTA
EU 51 Salí, NF Sal GATGGCCAAGGTT 2738 NF Sal AGATGGCCAAG 2970
I AACG I GTTAACG
pGN
EUN519 TATCTAGACTAAT
CTGCAAGGCGAT
Xbal NR Xb GCCGTTGCTTCTA 2739 101_ER 2971
al TAAGTTGG
GTAATAG
EUN549 TATCTAGATCCTC
EUN549
EU 549 Xbal, EF Xba CAGCTGTGGAAG
TCCCTAGCTAGCA 2740 2972
_seq_F3 GCATCAAC
I AG
EUN549 TGAGCTCCTAATC
SacI ER Sac AAGTTGGGTAAC
ACCCTGGCTGTTG 2741 101_R 2973
GCCAGGGT I AC
pGN
EUN549 TATCTAGATCCCT
NF Xb AGCTAGCAAGCTC 2742
al TAG
EUN549
TGAGCTCCCTTAA NR Sac 2743
TGCCATGCTGCG I
EUN572 ATTCTAGATACAT
EU 572 Xbal, NF Xb CGTCTTCACCTAA 2744 GGAGAGGACAG
35SJF 2974 al GCTTCTTGAG
TTTTC
EUN572 pGN
CGAGCTCAACAA EUN572 CGAGCTCAACAA
SacI NR Sac GCAAACTAAACGT 2745 NR Sac GCAAACTAAAC 2975
I GAAC I GTGAAC
NR
NR ID
ID del ID
Enz. Cebadores para clonación Cebadores para clasificación DE Pías. Gen DE
SEC:
SEC:
EUN592
ATGATATCAAATC GGAGAGGACAG
EUN592 EF Eco 2746 35SJ F 2976
CGGTGGAC GCTTCTTGAG RV
EUN592 TAGATATCCAACA EUN592 TAGATATCGTTG ER Eco CTCACTAGGGAGC 2747 NR Ec AACGCTCCACAT 2977 RV ACAG oRV CATG
EcoRV pl SJ
EUN592
TAGATATCAGAAT NF Eco 2748
TCGCAGGGATGCC RV
EUN592 TAGATATCGTTGA
NR Ec ACGCTCCACATCA 2749
oRV TG
EUN248 EUN248 GCTCTAGAAGGC
GCTCTAGAAGGCG
EU 248 Xbal, NF Xb 2750 NF Xb GAGATGTGGGA 2978
AGATGTGGGAGTC
al al GTC
pGN
EUN248 TGAGCTCCTACTA
GCGGGACTCTAA
SacI NR Sac GGCCTTCTCCTTT 2751 NOS_R 2979
TCATAAAAACC I GTTG
EUN590 AATCTAGACAACT
GGAGAGGACAG
EUN590 EF Xba GCAACTGCAACTA 2752 35SJ F 2980
GCTTCTTGAG I GC
EUN590 CGAGCTCACAGCT
ER Sac AAACATCAATCCT 2753
I CTTC
SacI TopoB
EUN590 TGAGCTCTGCAAG EUN590 TGAGCTCCTCAT NF Sac CAATCACCAGTTT 2754 NR Sac TTTATTTGCTGC 2981
I G I GTG
EUN590 TGAGCTCCTCATT
NR Sac TTATTTGCTGCGT 2755
I G
GGAGAGGACAG
EUN245 35SJ F 2982
GCTTCTTGAG
EUN245 CTCGGTGTTCTT
GA 2983
GA Rl GATGGTCAC
EUN520 GGAGAGGACAG
35SJ F 2984
GCTTCTTGAG
EUN520
GA TTCTTGACCTTG
2985 GA R2 GTCAGCTTG
EUN574
Agattagtcccaaagattatt
EUN574 GGAGAGGACAG
EF Sm 2756 35SJ F 2986 al cg GCTTCTTGAG
EUN574 EUN574
gcatgtaattgtagctttcttt
ER Sm Gacattgtggggaagctact 2757 NR Sm 2987
t
al al
Smal Topo
EUN574
NF Sm Gatacaaagaattcgctttgc 2758
al
EUN574
NR Sm gcatgtaattgtagctttctttt 2759
al
EUN224 TATCTAGAGTTTG
GGAGAGGACAG
EUN224 Xbal. EF CTTGCTTACCAGG 2760 p35S_Fl 2988
GCTTCTTGAG
Xbal AG
pGXN
EUN224 TCCCGGGTTAGCA EUN224 TCCCGGGTTAGC
Smal _ER_ GCATCGATCGTAC 2761 ER Sm AGCATCGATCGT 2989
Smal ACTAG al ACACTAG
EUN225 AATGTCGACGAGT
GGAGAGGACAG
EUN225 Salí, NF TTACAAGAGACCC 2762 p35S_Fl 2990 pGXN
GCTTCTTGAG
Salí AGACG
NR
NR ID
ID del ID
Enz. Cebadores para clonación Cebadores para clasificación DE Pías.
Gen DE
SEC:
SEC:
EUN225 ACTCTAGAATTCA EU 225 ACTCTAGAATTC
Xbal NR GTCATAGATCGCC 2763 NR Xb AGTCATAGATCG 2991
Xbal TTG al CCTTG
GGAGAGGACAG
EU 230 p35S_Fl 2992
GCTTCTTGAG
EUN230 GGATCTTGATGT
GA 2993
GA Rl ACACGTTTGG
GGAGAGGACAG
EUN234 p35S_Fl 2994
GCTTCTTGAG
EUN234 CGATGTTGCACC
GA 2995
GA Rl TCTTTGG
GGAGAGGACAG
EUN239 p35S_Fl 2996
GCTTCTTGAG
EU 239 CGAAATCCTCTG
GA 2997
GA Rl GGAATGAC
GGAGAGGACAG
EU 240 p35S_Fl 2998
GCTTCTTGAG
EUN240 CCTCAGTAGAGA
GA 2999
GA Rl GAGACTCGTCG
GGAGAGGACAG
EUN246 p35S_Fl 3000
GCTTCTTGAG
EU 246 CAACACTTGCAT
GA 3001
GA Rl CACCCTAGTC
GGAGAGGACAG
EU 249 p35S_Fl 3002
GCTTCTTGAG
EU 249 CCACCTCAAGAA
GA 3003
GA Rl CAGTAACGAG
GGAGAGGACAG
EU 250 p35S_Fl 3004
GCTTCTTGAG
EUN250
GA GAAGGTAGAGT
3005 GA Rl GCAGCATGG
EUN252 TATCTAGATTGGT
GGAGAGGACAG
EUN252 Xbal, EF CACAGGGGATAG 2764 p35S_Fl 3006
GCTTCTTGAG
Xbal GC
SacI
EUN252 TGAGCTCCTAAGA
EUN252 TGAGCTCCTACT
SacI _ER_ TGCTGCTTTCTCA 2765 3007
_NR_ ATGCCAAAGAA
SacI GACTATG
CCTTCATG pGXN
EUN252 TATCTAGAGAAAT
NF TGTGTTTGTTTGA 2766
Xbal TGGG
EUN252 TGAGCTCCTACTA
_NR_ TGCCAAAGAACCT 2767
SacI TCATG
EUN265 TATCTAGAGAGAA
GGAGAGGACAG
EUN265 Xbal, NF ATGACAAGTGTCT 2768 p35S_Fl 3008
GCTTCTTGAG
Xbal GGAAG
pGXN
EUN265 TGAGCTCGGAGTG EU 265 TGAGCTCGGAGT
SacI _NR_ ATCACTACTGCTT 2769 NR Sac GATCACTACTGC 3009
SacI CTCC I TTCTCC
EUN268 AATGTCGACTGAA
GGAGAGGACAG
EUN268 Salí NF GATGGCTGACGAT 2770 p35S_Fl 3010
Salí GCTTCTTGAG
TTG
pGXN
EUN268 TATCTAGACTAGT EU 268 TATCTAGACTAG
Xbal NR CTTAGCCACCACC 2771 NR Xb TCTTAGCCACCA 301 1
Xbal AGAAC al CCAGAAC
NR
NR ID
ID del ID
Enz. Cebadores para clonación Cebadores para clasificación DE Pías. Gen DE
SEC:
SEC:
EUN514 AATCTAGAGGATT
GGAGAGGACAG
EUN514 Xbal, EF GAGACATGCACTT 2772 p35S_Fl 3012
GCTTCTTGAG
Xbal AACAG
EUN514 TGAGCTCTTTTGA EUN514 TGAGCTCCTACA
Sacl _ER_ GCACCTCTTATTT 2773 NR Sac ATACACCTCTTG 3013
Sacl AGC 1 ACATCCTTC
pGXN
EUN514 AATCTAGAACTCA
NF TCAGCAACTACAA 2774
Xbal CGTG
EUN514 TGAGCTCCTACAA
_NR_ TACACCTCTTGAC 2775
Sacl ATCCTTC
EUN515 TAAGTCGACGATA
GGAGAGGACAG
EUN515 Salí, NF CAATGAGAATGTT 2776 p35S_Fl 3014
GCTTCTTGAG
Salí AGTTCTTCG
pGXN
EUN515 TATCTAGATCATC EUN515 TATCTAGATCAT
Xbal NR ACCATCGTCTTAT 2777 NR Xb CACCATCGTCTT 3015
Xbal CAATGAAG al ATCAATGAAG
EUN523 ACCCGGGTCGTCT
GGAGAGGACAG
EUN523 Smal, EF CATCAATTCAAGA 2778 p35S_Fl 3016
GCTTCTTGAG
' Smal TCC
Topo
EUN523 TGAGCTCCCCTTC EUN523 TGAGCTCCCCTT
Sacl _ER_ AAACTAATCAATC 2779 ER Sac CAAACTAATCAA 3017
Sacl TTG I TCTTG
GGAGAGGACAG
EUN525 P35S_F1 3018
GCTTCTTGAG
pQXYN
EUN525 GTACTGAAGCTC
GA 3019
GA R GTCCTGGAC
AATCTAGAAAGA
EUN527 GGAGAGGACAG
EUN527 Xbal GCACCACCAGAG 2780 p35S_Fl 3020
EF Xbal GCTTCTTGAG
CAG
pKSJ
EUN527 EUN527 TTGATATCCTTT
TTGATATCCTTTA
EcoRV ER 2781 ER Eco ATGTCACCATTC 3021
TGTCACCATTCAT
EcoRV RV ATCTCAG
CTCAG
EUN532 AATCTAGACTGGT
GGAGAGGACAG
EUN532 Xbal, EF TTAGGAGACGAA 2782 p35S_Fl 3022
GCTTCTTGAG
Xbal AAGG
EUN532 AGAGCTCCTATCT EUN532 AGAGCTCCTACT
Sacl _ER_ CAACTCCATCGCC 2783 NR Sac ACTCAACTTCTC 3023
Sacl TCAG I TGATGATTCTC
pGXN
EUN532 AATCTAGAAGTGC
NF TCTCCGGTTTGAG 2784
Xbal G
EUN532 AGAGCTCCTACTA
_NR_ CTCAACTTCTCTG 2785
Sacl ATGATTCTC
GGAGAGGACAG
EUN533 p35S_Fl 3024
GCTTCTTGAG
pQXYN
EUN533 GGTTAGACACGA
GA 3025
GA R GCTTCTCAGAC
EUN536 ATTCTAGAGCCTT
GGAGAGGACAG
EUN536 Xbal, EF CTGATTCCCACTC 2786 p35S_Fl 3026 pGXN
GCTTCTTGAG
Xbal C
EUN536 TGAGCTCTGGAGT EUN536 CGAGCTCAAAGT
Sacl _ER_ ATCTGGTTTAGTT 2787 _NR_Sac CTCACTCCGCAC 3027
Sacl CGTC 1 TACAC
1 R
NR ID
ID del ID
Enz. Cebadores para clonación Cebadores para clasificación DE Pías. Gen DE
SEC:
SEC:
EUN536 AATCTAGACCTAC
NF TATACTTGCAACC 2788
Xbal TCTCC
EUN'536 CGAGCTCAAAGTC
_NR_ TCACTCCGCACTA 2789
SacI CAC
GGAGAGGACAG
EUN547 p35S_Fl 3028
GCTTCTTGAG
pQXYN
EUN547 GTGTGCAGCTCG
GA 3029
GA R AACTTGG
EUN550 ACCCGGGGTAAC
GGACAGGCTTCT
EU 550 _EF_ ACTATCAAGAGAC 2790 p35S_F2 3030
TGAGATCCT
Smal GATGAAG
EUN550 TCCCGGGGTTTAC EU 550 TCCCGGGAATCT _ER_ ATTGTTCTCGTTT 2791 NR Sm T ATTAACGAAA 3031 Smal CAAATC al CAGCAG
Smal pKSJ
EUN550 ACCCGGGCTATCA
_NF_ AGAGACGATGAA 2792
Smal GGTTG
EUN550 TCCCGGGAATCTT
_NR_ TATTAACGAAACA 2793
Smal GCAG
EUN564 AATCTAGACTTCA
GGAGAGGACAG
EU 564 Xbal, EF AGCAGGCAGCAC 2794 p35S_Fl 3032
GCTTCTTGAG
Xbal AC
EUN564 CGAGCTCAAAGG EUN564 TGAGCTCCTACA
SacI _ER_ GTCCATCATAATC 2795 NR Sac TGTCCCTTAGAT 3033
SacI ACAG I TGCTCTATTC
pGXN
EUN564
TATCTAGAGGAAA NF Xb 2796
CCTTGAGCCATGG
al
EUN564 TGAGCTCCTACAT
_NR_ GTCCCTTAGATTG 2797
SacI CTCTATTC
EUN576 AAAGTCGACAGG
GGAGAGGACAG
EUN576 Salí, EF AACAGCAACAAA 2798 p35S_Fl 3034
GCTTCTTGAG
Salí AGTAAGC
EUN576 TCCCGGGCTAAAC EUN576 TCCCGGGCTAAG
Smal _ER_ TGTCCCATTCTGC 2799 NR Sm TAGCATGAGTCT 3035
Smal GTG al AGAGCTTGG
pGXN
EUN576 AAAGTCGACCAA
NF Sal CAACCACACACAC 2800
1 TCACAG
EUN576 TCCCGGGCTAAGT
_NR_ AGCATGAGTCTAG 2801
Smal AGCTTGG
EUN579 AATGTCGACTCTC
GGAGAGGACAG
EUN579 Salí, NF AAAACCCTAACTG 2802 p35S_F l 3036
GCTTCTTGAG
Salí TTTCC
pGXN
EUN579 ATTCTAGACAGGA EUN579 ATTCTAGACAGG
Xbal NR TAATAGATAGTCA 2803 NR Xb ATAATAGATAGT 3037
Xbal CACGAGG al CACACGAGG
EUN581 AAAGTCGACCAA
GGAGAGGACAG
EU 581 Salí, EF AAGAATCTGTCTT 2804 p35S_Fl 3038 pGXN
GCTTCTTGAG
Salí CTTCTCTG
EUN581 ATTCTAGACTATC EUN581 ACTCTAGATTAG
Xbal ER CAAGAAGGAACA 2805 NR Xb AACCACAAAAG 3039
Xbal ATGAGG al ATTACAACATC
NR
NR ID
ID del ID
Enz. Cebadores para clonación Cebadores para clasificación DE Pías. Gen DE
SEC:
SEC:
EUN581 AAAGTCGACGGT
NF AAAATATCTTTCT 2806
Salí TGTGCAG
EUN581 ACTCTAGATTAGA
NR ACCACAAAAGATT 2807
Xbal ACAACATC
TCAGCCACCCAA
MAB52 6669F 3040
ACCATGAC
pGN
MAB52_ GAAGTCCTGAGA
GA 3041
R Seq CCGTTGATAG
MAB 106 GTTCCAGTTGAGC TACGACTCACTA
MAB106 2808 T7 1 3042
EF GAGCAG TAGGGCGA
MAB 106 TTGATATCCCAGT MAB106 AAGATATCGTGC
EcoRV
ER CTGTTTATTGCAT 2809 NR Ec TAAACTATACAT 3043 EcoRV CATC oRV CAAACGTG
AACTGCAGGATCA
MAB 106 pGN
Pstl TCCTCACATTGCG 2810
_NF_PstI
AG
MAB106
AAGATATCGTGCT
NR 281 1
AAACTATACATCA
EcoRV
AACGTG
GGAGAGGACAG
EUN251 35S_1F 3044
GCTTCTTGAG
EUN251 GAAGTACCACCA
GA 3045
GA R GTTGAAGAAGC
EUN545 TATGTCGACAGGT
EUN545 GCAACAATTGTG
EUN545 Salí, NF Sal TATGGGGAAGAA 2812 3046
_F GAGTCAACAC
I GCTAG
pGXN
EUN545 TATCTAGATCATC
Xbal AAGTTGGGTAAC
NR Xb AGTAGCCACGAA 2813 101 R 3047
GCCAGGGT
al CTTGTCTAG
TTCGTCGACTAAG
EUN570 EUN570 CTTTGAGACGTT
EUN570 Sal, CACAAATGGCGA 2814
_NF Sal 3048
SeqF AGCTGTTGAG
CTC
pKSJ
ACCCGGGTCAAG
EUN570 AAGTTGGGTAAC
Sma GAGCTGAAACACT 2815 101 3049
NR Sma GCCAGGGT
AGAGTTACT
GTAGTCGACTTCA
EUN571 GTAGTCGACTTC
EUN571
EUN571 Sal, CATGGGAAAGGA 2816 ACATGGGAAAG 3050
_NF_Sal _NF_Sal
TAAGAC GATAAGAC
pGXN
AATCTAGATCACT
EUN571 AAGTTGGGTAAC
Xba GATATAGTCCACG 2817 101_R 3051
NR Xba GCCAGGGT
TCCTAAGG
EUN578 AATCTAGAATATC
GGAGAGGACAG
EUN578 Xbal, EF Xba CTCCCATTCTCAT 2818 35S_1F 3052
GCTTCTTGAG I TCTG
EUN578 TCCCGGGCTAATG EUN578 TCCCGGGCTAAG
Smal ER Sm CAATCTCCAACTC 2819 _NR_Sm AAAAGGTAGGA 3053
al CAAG al GAAGGAAGG
pGXN
EUN578 AATCTAGAAGCG
NF Xb GAGAAGAGGAAG 2820
al GAG
EUN578 TCCCGGGCTAAGA
NR Sm AAAGGTAGGAGA 2821
al AGGAAGG
EUN580 AATCTAGACGGA
GGAGAGGACAG
EUN580 Xbal, NF Xb ATATACATTTGCT 2822 35SJF 3054 pGXN
GCTTCTTGAG
al TTGTG
NR
NR ID
ID del ID
Enz. Cebadores para clonación Cebadores para clasificación DE Pías. Gen DE
SEC:
SEC:
EUN580 TCCCGGGCTACTG EUN580 TCCCGGGCTACT
Smal NR Sm CTGAATGCTCTCT 2823 NR Sm GCTGAATGCTCT 3055
al TTGC al CTTTGC
EUN582 AATCTAGAAATCA
GGAGAGGACAG
EUN582 Xbal NF Xb TCCTTCCCCAACC 2824 35S_1F 3056
GCTTCTTGAG
al TC
pGXN
EUN582 CCCCGGGACCCAA EUN582 CCCCGGGACCCA
Smal NR Sm ACAGTCATGCTAG 2825 NR Sm AACAGTCATGCT 3057
al G al AGG
EUN584 AAAGTCGACAAG
GGAGAGGACAG
EUN584 Salí, NF Sal GTTGGAGATTGTG 2826 35S_1 F 3058
GCTTCTTGAG I AAATTG
pGXN
EUN584 CGAGCTCATACTC EUN584 CGAGCTCATACT
SacI NR Sac TACGTTCCCGTGT 2827 NR Sac CTACGTTCCCGT 3059
I GG I GTGG
GGAGAGGACAG
EUN593 35S_1F 3060
GCTTCTTGAG
EUN593 GTAGCCTGAACA
GA 3061
GA R GCAGAACC
AAGTTGGGTAACG
CT1 Smal Reverse 2828
CCAGGGT
p S
GGTGGCTCCTACA
SacI Forward 2829
AATGCCATC
AAGTTGGGTAACG
CT1 1 Smal Reverse 2830
CCAGGGT
pK.S
GGTGGCTCCTACA
SacI Forward 2831
AATGCCATC
AAGTTGGGTAACG
CT2 Xbal Reverse 2832
CCAGGGT
pKS
ATGGGGCAACATC
Forward 2833
ACTTGGG
AAGTTGGGTAACG
CT20 Smal Reverse 2834
CCAGGGT
pKS
GGTGGCTCCTACA
SacI Forward 2835
AATGCCATC
AAGTTGGGTAACG
CT22 Smal Reverse 2836
CCAGGGT
pKS
GGTGGCTCCTACA
SacI Forward 2837
AATGCCATC
AAGTTGGGTAACG
CT27 Smal Reverse 2838
CCAGGGT
pKS
EcoR GGTGGCTCCTACA
Forward 2839
V AATGCCATC
AAGTTGGGTAACG
CT3 Smal Reverse 2840
CCAGGGT
pKS
GGTGGCTCCTACA
SacI Forward 2841
AATGCCATC
AAGTTGGGTAACG
CT40 Smal Reverse 2842
CCAGGGT
pKS
GGTGGCTCCTACA
SacI Forward 2843
AATGCCATC
AAGTTGGGTAACG
CT6 Smal Reverse 2844
CCAGGGT
pKS
GGTGGCTCCTACA
SacI Forward 2845
AATGCCATC
AAGTTGGGTAACG
CT7 Smal Reverse 2846 pKS
CCAGGGT
NR
NR ID
ID del ID
Enz. Cebadores para clonación Cebadores para clasificación DE Pías. Gen DE
SEC:
SEC:
EcoR GGTGGCTCCTACA
Forward 2847
V AATGCCATC
AAGTTGGGTAACG
CT71 Xbal Reverse 2848
CCAGGGT
pK-S
GGTGGCTCCTACA
SacI Forward 2849
AATGCCATC
AAGTTGGGTAACG
CT74 Smal Reverse 2850
CCAGGGT
pKS
GGTGGCTCCTACA
SacI Forward 2851
AATGCCATC
AAGTTGGGTAACG
CT75 Smal Reverse 2852
CCAGGGT
pK.S
GGTGGCTCCTACA
EcoRV Forward 2853
AATGCCATC
AAGTTGGGTAACG
CT76 Smal Reverse 2854
CCAGGGT
pKS
GGTGGCTCCTACA
SacI Forward 2855
AATGCCATC
AAGTTGGGTAACG
CT81 Smal Reverse 2856
CCAGGGT
pKS
GGTGGCTCCTACA
SacI Forward 2857
AATGCCATC
AAGTTGGGTAACG
CT82 Smal Reverse 2858
CCAGGGT
p .S
GGTGGCTCCTACA
SacI Forward 2859
AATGCCATC
Tabla 22: Se proveen las secuencias de los cebadores usados para la clonación de los genes indicados y para la clasificación de los plásmidos binarios clonados. Los cebadores se proven desde 5'D 3'. "EF" = cebadores externo directo; "ER": cebador externo inverso; "NF" cebador anidado directo; "NR" cebador anidado inverso. A menos que se indique de otro modo, todos los genes fueron clonados a partir de las moléculas de ARN. "GA" = GeneArt, genes preparados sintéticamente; "Enz." = enzima; "Pías." = plásmido.
Cada producto PCR digerido fue insertado en un vector de copias elevadas originado en un plásmido pBlue-script KS [pBlue-script KS vector plásmido, Hypertext Transfer
Protocol : //World Wide Web (punto) stratagene (punto) com/manuals/212205 (punto) pdf] . En los casos donde se utilizó el vector de copias elevadas originado de un vector plásmido pBlue-script KS (pGN) , se insertó el producto PCR corriente arriba del terminador NOS (NR ID DE SEC: 3064) originado en el vector binario pBI 101.3 (Nr de Acceso GenBank U12640, nucleótidos 4417 a 4693) . En otros casos, se insertó el producto PCR en el vector de copias elevadas (lit para clonación ZeroBlunt® TOPO ® PCR, Invitrogene) . Algunos de los genes eran sintéticos obtenidos de un proveedor comercial (GeneArt, GmbH) , estos genes fueron recibidos dentro de vectores de copias elevadas pQXYN, pGXN obtenidos de proveedores .
Se realizó la secuenciación de los genes insertados usando el secuenciador ABI 377 (Applied Biosystems) . En algunos casos, después de confirmar las secuencias de los genes clonados, se introdujo el cADN clonado acompañado con el terminador NOS dentro de los vectores binarios pGI que contienen al promotor 35S mediante la digestión con endonucleasas de restricción adecuadas. En otros casos, el cADN clonado acompañado por el promotor 35S se introdujo dentro de los vectores binarios pGI que contienen al promotor 35S mediante la digestión con endonucleasas de restricción adecuadas. En otros casos, el cADN clonado acompañado por el promotor 35S se introdujo dentro del vector pGI. En cualquiera de los casos, el inserto fue seguido
por una sola copia del terminador NOS (NR ID DE SEC: 3064). Los productos digeridos y el vector plásmido linearizado fueron ligados usando la enzima ligasa T4 ADN (Roche, Suiza) .
Para algunos de los polinucleótidos clonados, en lugar de amplificar la secuencia a partir del cADN, se ordenaron secuencias sintéticas a un proveedor commercial (GeneArt, GmbH) . De esta forma, no se utilizaron cebadores para la amplificación de los genes sintéticos. Para optimizar las secuencias de codificación de los genes sintéticos, se utilizaron las Tablas de utilización de codones de los transcriptomas vegetales (un ejemplo de dichas Tablas puede encontrarse en la Base de datos de Utilización de Codones en Hypertext Transfer Protocol : //World Wide Web (dot) kazusa (dot) or (dot) jp/codon/). Se diseñaron las secuencias de codificación de manera que ningún cambio se introdujera en la secuencia de aminoácido codificada mientras se utilizaban los codones preferidos para la expresión en plantas dicotiledóneas, principalmente tomate y Arabidopsis; y plantas monocotiledóneas com por ejemplo, maíz. Dichas secuencias optimizadas promueven una major tasa de traducción y, por lo tanto, niveles de expresión de proteina más elevados. A las secuencias optimizadas que flanquean se agregaron únicos sitios de enzimas de restricción adicionales, para facilitar la clonación de genes dentro de los vectores binarios.
Se utilizaron los plásmidos de vectores binarios pPI y pGI
para introducir los constructos del gen dentro de las plantas. Se construyó el plásmido pPI insertando una secuencia de señal poli- (A) sintética originaria del vector plásmido básico pGL3 (Promega, Nr de Acceso U47295; bp 4658-4811) dentro del sitio de restricción HindIII del vector binario pBI101.3 (Clontech, Nr. de Acceso U12640) . En algunos casos, el plásmido binario de cadena principal usado, era pGI que es similar a pPI pero el gen GUS fue reemplazado por el gen GUS-Intrón (Vancanneyt. G, y colab., MGG 220, 245-50, 1990) . Se utilizó el plásmido pPI o pGI para clonar las secuencias de polinucleótido, inicialmente bajo el control del promotor 35S [Odell, JT, y colab. Nature 313, 810 - 812 (28 de febrero de 1985); NR ID DE SEC: 3063] o promotor de Arabidopsis thaliana At6669 (NR ID DE SEC: 3064, Publicación PCT No. WO2004/104162 ) . At6669 o la secuencia del promotor CaMV 35S (determinada en el NR ID DE SEC: 3063) fue insertada en el vector binario pPI o pGI, corriente arriba de los genes clonados utilizando las enzimas de restricción HindIII y Salí o BamHI (Roche, Suiza) . El producto PCR digerido y el vector plásmido linearizado fueron ligados usando la enzima ligasa T4 DNA (Roche, Suisa) , como describimos anteriormente.
Se transformaron 60 DL de E. coli, células competentes cepa DH5-D (alrededor de 109 células/mL) usando 1 DI de una mezcla de reacción para ligadura por electroporación, usando un electroporador MicroPulser (Biorad), cubetas de 0,2 cm (Biorad)
y un programa para electroporación EC-2 (Biorad) . Se desarrollaron las células de E. coli cells en 0,8 mL de un medio liquido LB a 37 DC durante 1 hr y 0,2 mL de la suspensión celular se colocaron en placas sobre placas de LB-agar suplementadas con el antibiótico canamicina 50 mg/L (Sigma) . Luego se incubaron las placas a 37 °C durante 16 hrs . Se desarrollaron las colonias de bacterias y se confirmó la expresión mediante amplificación PCR usando los grupos de cebadores detallados en la Tabla 22 anterior, que fueron diseñados para espaciar la secuencia insertada en el vector binario.
Se separaron los productos PCR en geles de agarosa al 1,5% y se estimaron los tamaños del producto comparando con una escalera de ADN (MBI Fermentas) .
Tabla 23
Secuencias clonadas
NR ID DESEC: NR ID DE SEC:
Nombre Método de del gen clonado del polipéptido Agrupamiento
del gen clonación o sintético codificado
2398 CTl 2523 cotton|gbl64|A1725990 TI clonado
2399 CT1 1 2524 cotton|gbl64|AJ725968 TI clonado
2400 CT2 2525 cotton|gbl64|AI727334 TI clonado
2401 CT20 2526 cotton|gbl64|AI726497 TI clonado
2402 CT22 2527 cotton|gbl64|BG440027 TI clonado
2403 CT27 2528 cotton|gbl64|AF336280 TI clonado
2404 CT3 144 cotton|gbl64|AI725456 TI clonado
2405 CT40 145 cotton|gbl 64|BE052317 TI clonado
2406 CT6 2529 cotton|gbl64|AI726479 TI clonado
2407 CT7 147 cotton|gbl64|AI727027 TI clonado
2408 CT71 148 cotton|gbl 64|AI725508 TI clonado
2409 CT74 149 cotton|gbl64|AI725950 TI clonado
2410 CT75 2530 cotton|gbl 64|AI726599 TI clonado
241 1 CT76 2531 cotton|gbl64|AI726155 TI clonado
2412 CT81 2532 cotton|gbl64|AI726693 TI clonado
2413 CT82 153 cotton|gbl64|BQ402794 TI clonado
2414 MAB 106 154 barley|gbl57.2|AL450627 TI clonado
NRIDDESEC: NRIDDESEC:
Nombre Método de del gen clonado del polipéptido Agrupamiento
del gen clonación o sintético codificado
sintetizado_optimiz
2415 MAB52 155 rice|gbl57.2|AU070543_Tl
ado arabidopsis|gb 165| AT4G24960
2416 EUN206 158 clonado
TI
2417 EU 208 2533 tomato|gbl64|BG124666 TI clonado
2418 EU 209 160 tomato|gbl64|BG 134403 TI clonado tomato|gbl 57|TOMTRALTAB
2419 EUN210 2534 clonado
TI
sintetizado_optimiz
2420 EUN211 162 rice|gb 157.2| AU 174544_T 1
ado
2421 EU 212 163 cotton|gbl64|CO081293 TI clonado
2422 EUN221 164 rice|gbl57.2|BI305241 TI clonado arabidopsislgb 165| ATl G31820
2423 EUN222 165 clonado
TI
2424 EUN223 166 ricelgbl 57.2| AW069985 TI clonado
2425 EUN224 167 rice|gbl 57.2| AW155063 TI clonado
2426 EUN225 168 rice|gbl57.2|BE039221 TI clonado
2427 EU 227 169 rice|gbl57.2|AU056888 TI clonado sintetizado_optimiz
2428 EUN228 170 rice|gbl 57.2|AA753730_T1
ado
2429 EU 229 2535 maize|gbl64|AW455682 TI clonado sintetizado_optimiz
2430 EUN230 172 rice|gbl57.2|AA749861_Tl
ado sintetizado_optimiz
2431 EUN231 173 rice|gbl 57.2|AK108994_T 1
ado
2432 EU 233 174 rice|gbl57.2|CB640732 TI clonado sintetizado_optimiz
2433 EUN234 175 poplar|gbl 57.2|BU868634_T1
ado
2434 EUN235 176 soybean|gb!62|CA852963 TI clonado
2435 EUN237 177 rice|gbl57.2|BI811377 TI clonado sintetizado optimiz
2436 EUN239 178 poplar|gbl57.2|BU880014_Tl
ado sintetizado_optimiz
2437 EUN240 179 poplar|gbl57.2|AJ407707_Tl
ado
2438 EUN241 180 tomato|gbl64|BG129806 TI clonado
2439 EU 242 2536 tomato|gbl64|BG791300 TI clonado
2440 EU 244 182 soybean|gbl62|CF808561 TI clonado sintetizado_optimiz
2441 EUN245 2537 rice|gbl57.2|AT003383_Tl
ado
2442 EUN246 184 grape|gbl60|CF207859 TI synthesized
2443 EUN248 2538 maize|gbl57|BG354535 TI clonado sintetizado_optimiz
2444 EUN249 186 rice|gbl57.2|AU029933_Tl
ado sintetizado_optimiz
2445 EUN250 187 rice|gbl57.2|AK102239_Tl
ado sorghum|gb 161.xeno| AI947781 sintetizado_optimiz
2446 EUN251 188
TI ado arabidopsislgb 165|AT1 G58030
2447 EUN252 189 clonado
TI
2448 EUN253 1 0 rice|gbl57.2|AF145730 TI clonado
2449 EUN254 2539 maize|gbl64|AI600563 TI clonado
2450 EUN255 2540 rice|gbl57.2|CB000630 TI clonado sintetizado optimiz
2451 EUN256 193 wcalor|gbl 64|BE415875_T1
ado
2452 EU 265 1 4 rice|gbl57.2|BE039218 TI clonado arabidopsislgbl 65|AT5G60680
2453 EU 267 195 clonado
TI
2454 EUN268 196 ricelgbl 57.2| AA750934 TI clonado
2455 EUN269 2541 cotton|gbl64|AI730085 TI clonado
NR ID DE SEC: NR ID DE SEC:
Nombre Método de del gen clonado del polipéptido Agrupamiento
del gen clonación o sintético codificado
sintetizado_optimiz
2456 EU 49 2542 maizelgb 154|AW037179_T 1
ado
2457 EUN50 2543 maize|gbl64|AW287760 TI clonado
2458 EUN51 1 2544 maize|gbl57|AW360667 TI clonado arabidopsislgb 157.2|AT5G23460
2459 EU 512 201
TI clonado arabidopsislgb 157.2|AT3G26100
2460 EUN513 2545 clonado
TI
2461 EUN514 2546 soybean|gbl62|SOYHPR TI clonado arabidopsislgb 165| ATI G44920
2462 EUN515 2547 clonado
TI
arabidopsislgb 157.2|AT1 G48210
2463 EUN516 205 clonado
TI
2464 EUN519 2548 wcalor|gbl64|BE445396 TI clonado
2465 EU 520 207 rice|gbl57.2|B1305493 TI synthesized
2466 EU 521 208 rice|gbl 57.2| AU077950 TI clonado sorghum|gb 161.xeno|A1901439
2467 EUN523 209 clonado
TI
sorghum|gbl 61.xeno|AW052978 sintetizado_optimiz
2468 EUN525 210
TI ado sorghum|gb 161.xeno|AW055409
2469 EUN527 21 1 clonado
TI
sorghum|gb 161.xeno| AI372194
2470 EUN528 212 clonado
TI
sintetizado optimiz
2471 EUN531 213 rice|gb 157.2|BI805136 T1
ado
2472 EUN532 214 maize|gb 164|AW054475 TI clonado
2473 EUN533 215 soybean|gbl66|AW350050 TI clonado
2474 sorghum|gbl61.crp|BE599042 T
EUN535 2549 clonado
1
2475 EUN536 217 maizelgb 164|BQ279657 TI clonado
2476 EUN537 218 barley|gbl57.2|AJ234408 TI clonado sorghum|gb 161.xeno| AW923729
2477 EUN538 219 clonado
TI
sintetizado optimiz
2478 EUN539 220 rice|gbl57.2|AW155216_Tl
ado arabidopsislgb 157.2|AT1 G 13980
2479 EUN540 2550 clonado
TI
arabidopsis|gbl57.2|AT3G46280
2480 EUN542 2551 clonado
TI
sintetizado_optimiz
2481 EU 543 223 rice|gbl57.2|A 063415_Tl
ado
2482 EUN544 2552 cotton|gbl 64|BQ412384 TI clonado
2483 EUN545 2553 cotton|gbl64|AI055737 TI clonado sorghum|gb 161.xeno|BI 139559
2484 sintetizado_optimiz
EUN547 226
TI ado sorghum|gb 161.xeno|BQ279657
2485 EUN548 227 clonado
TI
sorghum|gb 1 1. xeno| AF019147
2486 EUN549 228 clonado
TI
2487 EUN550 229 canola|gbl 61 |EE559843 TI clonado
2488 EUN551 2554 barley|gbl57.3|BE420701 TI clonado
2489 EU 553 231 barley|gbl57.3|BE421829 TI clonado sorghum|gbl61.xeno|AA01 1880
2490 EUN554 232 clonado
TI
2491 EUN560 233 rice|gbl57.2|BE229552 TI clonado
2492 EUN562 2555 rice|gbl 57.2|BE039784 TI clonado
2493 EUN563 235 rice|gbl 57.2|AU057884 TI clonado
2494 EUN564 236 maizelgb 164|AI619269 TI clonado
NR ID DE SEC: NR ID DE SEC:
Nombre Método de del gen clonado del polipéptido Agrupamiento
del gen clonación o sintético codificado
arabidopsislgb 157.2|AT5G 15080
2495 EUN565 237 clonado
TI
arabidopsis|gbl65|AT2G43700
2496 EUN566 238 clonado
TI
arabidopsislgb 165
2497 EUN567 239 1 AT 1 G60680
clonado TI
arabidopsislgb 165| ATl G78450
2498 EUN568 240 clonado
TI
arabidopsis|gbl65|AT2G03890
2499 EUN569 241 clonado
TI
arabidopsislgb 165| AT 1 G43910
2500 EUN570 242 clonado
TI
arabidopsislgb 157.2|AT1 G47530
2501 EU 571 243 clonado
TI
arabidopsis|gbl57.2|AT2G24240
2502 EU 572 244 clonado
TI
arabidopsis|gbl65|AT4G15390
2503 EUN573 245 clonado
TI
2504 EUN574 2556 rice|gbl57.2|BI807603 TI clonado
2505 EU 575 247 ricelgbl 57.2| AU068829 TI clonado
2506 EUN576 2557 rice|gbl 57.2| AA752451 TI clonado
arabidopsislgb 165
2507 EUN577 249 1 AT 1 G67800
clonado TI
2508 EUN578 250 wcalor|gbl64|BE401454 TI clonado
arabidopsis|gbl65|ATl G70850
2509 EUN579 2558 clonado
TI
arabidopsislgb 165|AT2G35880
2510 EU 580 2559 clonado
TI
arabidopsislgb 165
251 1 EU 581 253 1 AT 1 G 12845
clonado TI
2512 EU 582 2560 sorghum|gbl 6 l .xeno|Tl 8303 TI clonado
2513 EU 583 255 rice|gbl 57.2|AU 172665 TI clonado
sorghum|gb 161.crp| AW923545
2514 EUN584 2561 clonado
TI
arabidopsislgb 165 19
2515 EUN585 257 1 AT 1 G7 00
clonado TI
arabidopsis|gbl65|ATl G72320
2516 EUN586 2562 clonado
TI
sorghum|gbl 61.xeno| AW672541
2517 EUN587 259 clonado
TI
2518 EUN588 260 rice|gbl 57.2|AA750816 TI clonado
sorghum|gb 161.xeno|A1622209
2519 EUN590 2563 clonado
TI
sorghum|gbl61.xeno|BE123399 sintetizado_optimiz
2520 EUN591 262
TI ado sorghum|gb 161.xeno|AI901557
2521 EUN592 263 clonado
TI
arabidopsislgb 165|AT2G04066
2522 sintetizado_optimiz
EUN593 264
TI ado
Tabla 23. Se proveen los genes clonados o producidos sintéticamente y sus polipéptidos codificados, junto con los identificadores de secuencia, organismos a partir de los cuales
fueron clonados.
EJEMPLO 4
GENERACIÓN DE PLANTAS TRANSGÉNICAS QUE EXPRESAN A LOS POLINUCLEÓTIDOS DE ALGUNAS REALIZACIONES DE LA INVENCIÓN
Arabidopsis fue transformada de acuerdo con el procedimiento de Clough SJ, Bent AF. (1998) Floral dip: a simplified method for Agrobacterium-mediated transíormation of Arabidopsis thaliana. Plant J. 16(6): 735-43; y Desfeux C, Clough SJ, Bent AF. (2000) Los tejidos reproductores femeninos son el principal objetivo de la transformación mediada por Agrobacterium mediante el método por inmersión floral. Plant Physiol. 123(3): 895-904] con modificaciones menores. En síntesis, se sembraron Plantas T0 de Arabidopsis thaliana Columbia (ColO) en macetas de 250 mi con una mezcla para crecimiento basada en turba. Se cubrieron las macetas con una hoja de aluminio y una cúpula plástica, se mantuvieron a 4 °C durante 3-4 días, luego se destaparon y se incubaron en una cámara para crecimiento a 18-24 °C en ciclos de 16/8 horas de luz/oscuridad. Las plantas T0 estaban listas para la transformación seis días antes de la antesis. Se cultivaron colonias individuales de Agrobacterium que portan vectores binarios que alojan a los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención en un medio LB suplementado con kanamicina (50 mg/L) y gentamicina (50 mg/L) . Se incubaron los cultivos a 28 °C durante 48 horas con agitación vigorosa y se
centrifugó a 4.000 rpm durante 5 minutos. Los pellets que comprendían células de Agrobacterium fueron resuspendidos en un medio de transformación que contenia Murashige-Skoog de concentración media (2,15 g/L) (Duchefa) ; 0,044 DM de bencilamino purina (Sigma) ; 112 Dg/L de vitaminas B5 Gambourg (Sigma); 5 % de sacarosa; y 0,2 ml/L de Silwet L-77 (OSI Specialists, CT) en agua bidestilada, a un pH de 5,7.
La transformación de las plantas TO se realizó invirtiendo cada planta dentro de una suspensión de Agrobacterium de manera que el tallo de floración sea sumergido durante 3-5 segundos. Cada planta T0 inoculada se colocó inmediatamente en una bandeja plástica, luego se cubrió con una cúpula plástica transparente para mantener la humedad y se mantuvo a la oscuridad a temperatura ambiente durante 18 horas para facilitar la infección y transformación. Las plantas transformadas ( transgénicas ) luego se destaparon y se transfirieron a un invernadero para recuperación y maduración. Las plantas T0 transgénicas se desarrollaron en invernadero durante 3-5 semanas hasta la maduración de las silicuas y se cosecharon las semillas y mantuvieron a temperatura ambiente hasta la siembra.
Para generar las plantas transgénicas TI y T2 que portan los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención, se esterilizan en superficie las semillas recolectadas de las plantas transgénicas T0 remojando en etanol 70 % durante 1
minuto, seguido por el remojado en hipoclorito de sodio al 5 % y Tritón X-100 0,05 % durante 5 minutos. Las semillas esterilizadas en superficie se lavaron cuidadosamente en agua destilada estéril, luego se colocaron en placas de cultivo que contienen Murashige-Skoog de concentración media (Duchefa) ; sacarosa al 2 %; agar para ' plantas 0,8 % ; 50 mM de kanamicina; y 200 mM de carbenicilina (Duchefa) . Se incubaron las placas de cultivo a 4 °C durante 48 horas, luego se transfirieron a una cámara de crecimiento a 25 °C durante una semana adicional de incubación. Las plantas vitales TI Arabidopsis se transfirieron a placas de cultivo fresco durante otra semana de incubación. Luego de la incubación, las plantas TI se retiraron de las placas de cultivo y se plantaron a una mezcla para crecimiento colocada en macetas de 250 mi. Se dejaron desarrollar las plantas transgénicas en invernadero hasta la maduración. Las semillas cosechadas de las plantas TI fueron cultivadas y desarrolladas hasta la maduración como plantas T2 en las mismas condiciones usadas para el cultivo y desarrollo de plantas TI. Se crearon al menos 10 eventoos de transformación independientes de cada constructor para el que se recolectó un volumen de semillas T2.
Se clonaron los genes de EUN584 (NR ID DE SEC: 2514), EUN253 (NR ID DE SEC: 2448), EUN533 (NR ID DE SEC: 2473), EUN577 (NR ID DE SEC: 2507), EUN590 (NR ID DE SEC: 2519) y EUN562 (NR ID DE SEC: 2492), introducidos en Arabidopsis y se
produjeron las semillas T2.
EUN540 (NR ID DE SEC: 2479), EUN549 (NR ID DE SEC : 2486), y EUN533 (NR ID DE SEC: 2473) desarrollaron plantas saludables de color púrpura, sugiriendo vigor aumentado en las plantas transgénicas .
EUN591 (NR ID DE SEC: 2520) produjo plantas verde claro. Este fenotipo relaciona el gen con la capacidad de fotosíntesis que tiene la planta a diferentes niveles de fertilización con con nitrógeno.
EJEMPLO 5
ENSAYO 1: EFICACIA MEJORADA EN EL USO DE NITRÓGENO IN VITRO
(ENSAYO DE CULTIVO TISULAR)
Se siembran semillas esterilizadas en. superficie en un medio basal [medio de Murashige-Skoog 50 % (MS). suplementado con agar para tejidos vegetales al 0,8 % como agente solidificante] en presencia de kanamicina (usado como agente de selección) . Después de sembrar, se transfirieron las placas durante 2-3 días para estratificación a 4 °C y luego se desarrollaron a 25 °C bajo ciclos diarios de 12 horas de luz, 12 horas de oscuridad durante 7 a 10 días. En este momento, se transfieren cuidadosamente plántulas elegidas aleatoriamente a las placas que contienen un medio ½ MS (15 mM N) para el tratamiento con concentración normal de nitrógeno y 0,75 mM de nitrógeno para los tratamientos con baja concentración de nitrógeno. Cada placa contenía 5 plántulas del mismo eventoo
transgénico, y había 3-4 placas diferentes (replicados) para cada eventoo. Para cada polinucleótido de la invención, se analizaron al menos cuatro eventoos diferentes de transformación de cada constructo. Las plantas que expresan a los polinucleótidos de la invención, se compararon con la medición porcentual de las plantas de control (vector vacío o gen reportero GUS bajo el mismo promotor) utilizada en el mismo experimento .
Captura de imágenes digitales - Para capturar imágenes de los plantines sembrados en placas de agar, se utilizó un sistema de adquisición de imágenes de laboratorio que consiste en una cámara réflex digital (Canon EOS 300D) , con una lente de longitud focal 55 mm (Cannon serie EF-S) , montada en un dispositivo de reproducción (Kaiser RS) , que incluía 4 unidades de luz (bombilla de luz 4x150 Vatios) y ubicada en un cuarto oscuro .
El proceso para capturar imágenes se repitió cada 3-4 días comenzando en el día 1 hasta el día 10 (véase, por ejemplo, las imágenes de las Figuras 3 A-B) . Se utilizó un sistema de análisis de imágenes que consistía en una computadora personal de escritorio (procesador Intel P4 3.0 GHz) y un programa de dominio público - ImageJ 1.39 [Programa para procesamiento de imágenes basado en Java que fue desarrollado en U.S. National Institutes of Health y disponible gratis en internet en Hypertext Transfer Protocol : //rsbweb (punto) nih (punto) gov/] .
Las imágenes se capturaron en una resolución de 10 Mega Pixeles (3888 x 2592 pixeles) y se almacenó en un formato JPEG de baja compresión (estándar Joint Photographic Experts Group) . Luego, los datos analizados se guardaron en archivos de texto y se procesaron usando software para análisis estadístico JMP (Instituto SAS) .
Análisis de plántulas - Se calcularon los datos del análisis digital de plántulas incluyendo área de hoja, cobertura de raíz y longitud de raíz.
La tasa de crecimiento relativo para los diversos parámetros de la plántula se calculó de acuerdo con las siguientes fórmulas V, VI y VII.
Fórmula V:
índice de crecimiento relativo del área de hoja = Coeficiente de regresión del área de hoja a lo largo del transcurso del tiempo.
Fórmula VI :
Tasa de crecimiento relativo de cobertura de raíz Coeficiente de regresión de cobertura de raíz en el transcurso de tiempo.
Fórmula VII:
Tasa de crecimiento relative de longitude de raíz = Coeficiente de regresión de cobertura de raíz en el transcurso de tiempo.
Al final del experimento, se retiraron las plántulas del
medio y se pesaron para determinar el peso fresco de la planta. Luego se secaron las plántulas durante 24 horas a 60 °C y se pesaron otra vez para medir el peso seco de la planta para un posterior análisis estadístico. Se determinó la tasa de crecimiento comparando la cobertura de área de hoja, cobertura de raíz y longitud de raíz, entre cada par de fotografías secuenciales y se utilizaron los resultados para resolver el efecto del gen introducido sobre el vigor de la planta bajo estrés osmótico así como también, en condiciones óptimas. De manera similar, el efecto del gen introducido sobre la acumulación de biomasa en condiciones óptimas, se determinó comparando el peso fresco y seco de las plantas con el de las plantas de control (que contienen un vector vacío o el gen reportero GUS bajo el mismo promotor) . De cada constructo creado, se examinaron 3-5 eventoos de transformación independientes en replicados.
Análisis estadístico - Para identificar genes que confieren un vigor significativamente mejorado o arquitectura agrandada de raíz, se compararon los resultados obtenidos de las plantas transgénicas con aquellos obtenidos de las plantas de control. Para identificar los genes y constructos con mayor rendimiento, se analizaron separadamente los resultados probados de los eventoos de transformación independiente. Para evaluar el efecto de un eventoo génico con respecto a los datos de control, se analizaron mediante la prueba T de Student y se
calculó el valor p. Los resultados fueron considerados significativos si p = 0,1. Se utilizó el paquete de software estadístico JMP (Versión 5.2.1, SAS Institute Inc., Cary, NC, Estados Unidos) .
Resultados experimentales
Se halló que los genes presentados en las Tablas 24-25, más adelante, mejoran la eficacia en el uso de nitrógeno (EUN) produciendo una biomasa vegetal mayor cuando se desarrollan bajo condiciones limitadas de nitrógeno, comparados con las plantas de control.
Las Tablas 24 y 25 muestran los análisis de biomasa vegetal (peso fresco y seco de la planta y área de hoja) cuando se desarrollan en condiciones limitantes de nitrógeno [condiciones de poca cantidad de nitrógeno o nitrógeno deficiente (0,75 mM N) ] en plantas que sobreexpresan los the polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S) . Se realizó la evaluación de cada gen ensayando el rendimiento de varios eventoos. Se evaluaron algunos de los genes en más de un ensayo de cultivo tisular y el Segundo experimento confirmó un incrementoo significativo en la biomasa vegetal. El eventoo con valor-p <0,1 fue considerado como estadísticamente significativo.
Tabla 24
Plantas transgénicas que expresan de manera exógena los
polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención, exhiben una biomasa vegetal mejorada (peso fresco y seco) bajo condiciones deficientes de nitrógeno
Tabla 24: Análisis de biomasa de planta (peso fresco y seco de la planta) de plantas transgénicas que sobreexpresan polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) bajo la regulación del promotor constitutivo (35S) cuando se desarrollan bajo condiciones limitantes de nitrógeno [condiciones de baja cantidad de nitrógeno o deficientes de nitrógeno (0,75 mM N) ] comparadas con las plantas de control. "Incr." = incrementoo.
Tabla 25
Las plantas transgénicas que expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención exhiben una biomasa vegetal mejorada (área de hoja) bajo condiciones de nitrógeno deficiente
Tabla 25: Análisis de biomasa vegetal (área de hoja) de plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S) cuando se desarrollan bajo condiciones de nitrógeno limitado [condiciones de baja cantidad de nitrógeno o de nitrógeno deficiente (0.75 mM N) ] comparados con las plantas de control.
Los genes presentados en la Tabla 26, más adelante, tienen una EUN vegetal mejorada ya que produjeron una biomasa mayor de raiz cuando se los desarrolló bajo condiciones de crecimiento con nitrógeno limitado, comparados con las plantas de control. Las plantas que producen una biomasa mayor de raiz tienen mejores posibilidades de absorber una mayor cantidad de nitrógeno del suelo.
La Tabla 26 ilustra los análisis de biomasa de raiz (longitud y cobertura de raiz) cuando se desarrollan bajo condiciones de nitrógeno limitado [condiciones de baja cantidad de nitrógeno o de nitrógeno deficiente (0,75 mM N) ] en plantas que sobreexpresan los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S) . Se realizó la evalulación de cada gen realizando el
ensayo de rendimiento de varios eventos. Algunos de los genes fueron evaluados con más de un ensayo de cultivo tisular y el segundo experimento confirmó el incremento significativo en el rendimiento de raíz. Evento with valor-p <0.1 fue considerado estadísticamente significativo.
Tabla 26
Las Plantas transgénicas gue expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención exhiben un rendimiento mejorado de raíz bajo condiciones de nitrógeno deficiente
Longitud de raíces /cm/ Cobertura de raíces /cm2/
Even Even
Nombre del gen Prom. valor-p % incr. Nombre del gen Prom. valor-p % incr.
to # to #
3,82
Control EUN209 8192,13 5, 1 10 7,0E-02 24,91
EUN222 8854,1 4,997 7,0E-02 7,48 EUN209 8192,14 5,450 1 ,7E-01 33,21
Control 4,649 Control 4,091
EUN223 9613,1 4,236 5.0E-01 10,38 EUN209 8192,14 5,624 5,5E-02 73,16
EUN223 961 1 ,5 5,091 6,8E-03 32,67 Control 3,248
EUN223 9612,3 4,868 1.6E-01 26,86 EUN210 8202,2 5,208 1 ,0E-01 27,29
Control 3,837 Control 4,091
EUN225 9731 ,7 4,58 4,0E-02 20,0 EUN212 8335,2 6,338 2.8E-02 54,92
EÜN225 9731 ,8 4,30 2.0E-01 12,5 EUN212 8334,1 4,541 3,4E-01 10,99
EUN225 9732,8 4,09 4,7E-01 6,9 EUN212 8331,4 6, 188 1.3E-01 5 1 ,26
EUN225 9734,5 4,07 4,9E-01 6,5 Control 4,091
EUN225 9734,9 4,26 2.3E-01 1 1 ,5 EUN212 8332,2 8,847 2.5E-01 56,56
Control 3,82 EUN212 8331,4 6,998 2,5E-01 23,84
EUN228 10092,2 4,242 1,4E-01 13,89 Control 5,651
EUN228 10093, 1 4,106 2.5E-01 10,23 EUN221 9801, 1 5,06 1.4E-01 29,7
Control 3,725 EUN221 9802,8 5,89 1.2E-03 50,9
EUN231 10631,3 4,27 2,3E-01 1 1 ,6 EUN221 9806,1 4,39 5,4E-01 12,3
EUN231 10631 ,4 4,08 4.8E-01 6,8 Control
EUN231 10633,3 4,34 l ,6E-0l 13,5 EUN223 9613,1 5,41 1 2.9E-01 16,86
Control 3,82 EUN223 9612,3 5,162 2,9E-01 1 1 ,49
EUN233 10174,3 3,942 4.0E-01 7,65 Control 4,630
EUN233 10174,1 4,973 2,8E-02 35,83 EUN223 961 1,5 8,701 1.9E-02 67,39
EUN233 10173,5 4,903 2,0E-02 33,89 EUN223 9612,3 6,493 2.6E-01 24,90
EUN233 10172,5 4,240 1,3E-01 15,78 Control 5,198
EUN233 10173,7 4,289 1.7E-01 17,14 EUN225 9731,7 4,77 2.7E-01 22,1
Control 3,662 Control 3,90
EUN233 10174, 1 4,253 l ,5E-02 16,86 EUN228 10092,2 5,763 7,2E-02 34,52
EUN233 10173,5 4, 101 3.7?-0G 12,66 EUN228 10093,3 5,099 1 ,5E-01 19,02
EUN233 10172,5 3,91 1 ? ,??-01 7,44 EUN228 10093,1 5,468 1 ,2E-01 27,63
EUN233 10173,7 4,544 1 ,3E-01 24,84 Control 4,284
Control 3,640 EUN231 10631,3 4,31 5,9E-01 10,5
EUN234 9162,1 4,574 9,8E-02 23,62 EUN231 10631,4 4,87 2.1 E-01 24,8
Control 3,700 EUN231 10633,3 6,21 3,6E-03 59,1
EUN235 9693,4 4,908 6,4E-02 22,32 Control
EUN235 9691,1 4,310 4,9E-01 7,43 EUN233 10174,3 4,340 2,8E-01 24,27
EUN235 9694,4 4,347 4.0E-01 8,36 EUN233 10174, 1 7, 195 2,6E-04 106,04
EUN235 9694,3 5,377 3.4E-02 34,03 EUN233 10173,5 4,086 3,5E-01 17,00
Control 4,012 EUN233 10173,7 4,955 5,4E-02 41 ,90
EUN239 9192,3 5,241 4,4E-04 36,59 Control 3,492
EUN239 9192,1 4,041 5,6E-01 5,31 ELN235 9693,4 6,31 1 7,2E-03 44,37
EUN239 9191 ,2 4,081 4.2E-01 6,35 EUN235 9691,1 5,246 3.3E-02 20,00
Control 3,837 EUN235 9694,4 5,145 1,4E-01 17,69
EUN240 9172,1 4,624 l ,3E-02 20,49 EUN235 9694,3 6,927 4,8E-02 58,46
Control 3,837 Control 4,371
EUN241 9633,4 6,137 3,4E-06 52,97 EUN237 9654,4 7,760 1.1 E-01 38,68
EUN241 9632,3 4,772 2.4E-01 18,94 ELN237 9654,1 7, 127 3,0E-01 27,37
EUN241 9632,2 5, 157 3,2E-04 28,54 Control 5,596
EUN241 9632,4 5,016 2.0E-01 25,02 EUN239 9192,3 8,844 6.5E-05 70,14
Control 4,012 EUN239 9191,2 5,903 2.8E-01 13,55
EUN242 9212,1 4,373 4,9E-01 6,96 Control 5,198
EUN242 9211 ,2 4,328 5.2E-01 5,86 EUN240 9172,2 5,902 5,7E-02 27,47
EUN242 9213,4 5,474 l ,3E-03 33,89 EUN240 9174,3 5,530 1 ,2E-01 19,43
Control 4,088 Control 4,630
EUN242 9212,1 4,552 1 ,0E-01 29,06 EUN240 9172,1 7,568 l ,8E-02 45,59
Control 3,527 Control 5,198
EUN245 10641,7 4,388 9,4E-02 20,56 EUN241 9633,4 9,643 7,2E-07 120,61
EUN245 10641,8 4,657 7.4E-03 27,95 EUN241 9632,3 5,344 3,9E-01 22,26
Longitud de raices fcm/ Cobertura de raices fcm2/
Even Even
Nombre del gen Prom. valor-p % incr. Nombre del gen Prom. valor-p % incr.
to # to #
EUN245 10643,4 3,906 2, 1 E-01 7,31 EUN241 9632,2 6,559 3,6E-02 50,05
Control 3,640 EUN241 9632,4 6,451 1 ,3E-01 47,58
EUN246 9033,4 4,695 4.8E-01 7,49 Control 4,371
EUN246 9031 , 1 5,062 8,4E-02 15,90 EUN241 9632,5 5, 170 5, 1 E-01 15,54
Control 4,368 EUN241 9632,3 6, 198 8.3E-02 38,51
EUN250 9134,1 4,593 1 ,6E-01 5,15 EUN241 9632,4 5,754 1.6E-01 28,58
EUN250 9132,2 4,590 3.3E-01 5,09 Control 4,475
Control 4,088 EUN242 9212,1 5,873 4, 1 E-01 1 1 ,59
EUN251 10181,3 3,907 2,6E-01 7,34 EUN242 9213,4 8, 125 l,6E-02 54,40
EUN251 10183,2 4,763 7.9E-02 30,87 Control 5,262
Control 3,640 EUN242 9212,1 5,679 1 ,2E-01 67,87
EUN256 10063,4 5,259 1.4E-02 43,63 EUN242 9213,4 4,572 2.4E-01 35,15
EUN256 10064,1 4,734 2,3E-02 29,28 Control 3,383
EUN256 10061 ,2 4,281 1 ,3E-01 16,92 EUN245 10641,8 4,795 1 ,3 E-01 22,01
EUN256 10062,4 3,855 7.0E-01 5,28 Control 3,930
EUIN256 10063,2 5,276 5.5E-03 44, 10 EUN246 9033,8 6,003 2,5E-01 20,21
Control 3,662 EUN246 9033,4 5,693 4,7E-01 14,00
EUN512 9284,3 4,875 1.0E-01 17,48 EUN246 9034,1 6,292 1 /7E-01 25,99
EUN512 9282,3 4,442 4,4E-01 7,05 EUN246 9031,1 7,329 6,6E-03 46,77
EUN512 9284,4 6, 172 3,9E-04 48,73 Control 4,994
Control 4,150 EUN250 9134,1 5,762 4,8 E-01 9,49
EUN513 9681 ,6 5,009 1/7E-03 30,52 EUN250 9132,2 7,281 2/7E-01 38,35
EUN513 9683,2 4,506 8,6E-02 17,42 Control 5,262
Control 3,837 EUN2S1 10181,3 4,289 1 ,9E-01 22,81
EUN514 9404,1 4,333 5.3E-01 5,99 EUN251 10183,2 4,689 1.4E-01 34,27
EUN514 9404,5 4,906 4, l E-02 20,00 EUN251 10183,1 4,709 1,9E-01 34,86
ELN514 9403,2 4,451 6,9E-02 8,87 Control 3,492
ELN514 9402,5 4,644 2,1 E-01 13,59 EUN251 10183,2 6,691 3,8E-02 70,25
Control 4,088 EUN251 10181,1 4,687 4,8E-01 19,25
EUN514 9403,2 4,874 2,l E-02 38,20 Control 3,930
EUN514 9402,5 4,044 2,9E-01 14,65 EUN256 10063,4 7,393 2,9E-02 1 1 1,70
Control 3,527 EUN256 10064,1 7,214 2,6E-02 106,59
EUN515 9712,5 4,43 1 ,0E-01 15,9 EUN256 10061,2 6,139 2,2E-03 75,81
EUN515 9712,6 4,05 5.0E-01 5,8 EUN256 10062,4 6,337 7.9E-02 81 ,46
EUN515 9713,6 5,34 ? ,??-04 39,7 EUN256 10063,2 6,594 l ,7E-02 88,81
Control 3,82 Control 3,492
EUN520 9771 ,4 4,327 6,9E-02 16, 16 EUN256 10061,3 4,798 3,9E-02 22,09
EUN520 9771 ,7 4,332 1.7E-01 16,28 EUN256 10061 ,2 5,141 1.9E-02 30,82
EUN520 9771 ,2 4,303 l ,2E-01 15,52 EUN256 10061,4 5,617 9,8E-02 42,92
EUN520 9771,3 4,345 1.6E-01 16,66 EUN256 10063,2 5,303 1.5E-02 34,95
Control 3,725 Control 3,930
EUN520 9771,4 4,377 1,4E-01 19,54 EUN268 8996,5 7,789 1.6E-02 40,04
EUN520 9771,2 4,684 3, l E-02 27,93 Control 5,562
EUN520 9771 ,3 3,878 5,2E-01 5,90 EUN512 9284,3 4,930 1.1 E-01 21 ,84
Control 3,662 EUN512 9282,3 5,873 1 ,4 E-01 45,13
EUN523 9 12,5 4,031 3.9E-01 14,28 EUN512 9284,4 7,912 1.6E-03 95,53
EUN523 9414,2 5,032 l ,5E-03 42,68 Control 4,047
EUNS23 9413,4 3,766 2,8E-01 6,78 EUN513 9681,6 6,591 3,6E-02 26,79
Control 3,527 Control 5, 1 8
EUN523 9412,5 5,066 6,2E-01 7,98 EUN514 9404,5 6,570 9,0E-02 24,84
EUN523 9414,2 5,879 2.1 E-04 25,30 , Control 5,262
Control 4,692 EUN514 9403,2 5,579 I .2E-02 64,94
EUN525 9531 ,2 5,029 1.0E-03 25,34 ELN514 9402,5 4,299 3.2E-01 27,09
EUN525 9534, 1 5, 1 16 4,0E-02 27,51 Control 3,383
EUN525 9533,1 4,471 2,8E-01 1 1,43 EUN515 9712,5 4,93 26,3 1 ,9E-01
EUN525 9531 , 1 5, 184 1 ,9E-01 29,21 EUN515 9712,6 4,09 4,7 8, 1 E-01
Control 4,012 EUN515 9713,6 7,39 89,4 l ,9E-05
EUN531 10081,5 5,029 9,2E-02 35,00 Control 3,90
Longitud de raíces /cm/ Cobertura de raíces /cm2/
Even Even
Nombre del gen Prom. valor-p % incr. Nombre del gen Prom. valor-p % incr.
to # to #
Control 3,725 EUN519 9371 ,2 7,868 4.7E-01 51 ,36
EUN531 10083,3 4,502 2,7E-03 23,69 EUN519 9371 ,1 7,813 1 ,7E-01 50,30
EUN531 10081 ,4 3,894 1.4E-01 6,98 Control 5, 198
EUN531 10083,2 4,655 3,2E-02 27,89 EUN520 9771 ,4 4,820 3.0E-01 12,51
EUN531 10081 ,5 5,026 2.1 E-02 38,08 EUN520 9771 ,7 5,879 1.4E-02 37,23
Control 3,640 EUN520 9771,2 6,392 3,3E-02 49,20
EUN536 9233,3 5,416 1.2E-02 24,00 EUN520 9771,3 7,265 1.4E-02 69,57
Control 4,368 Control 4,284
EUN539 10101 ,5 4,107 4.7E-01 12,17 EUN520 9771,4 6, 158 1.8E-02 76,34
EUN539 10103,5 4,561 5,0E-02 24,57 EUN520 9771,2 6,839 1 /7E-02 95,84
EUN539 10101 ,7 4,953 2,0E-02 35,27 EUN520 9771,3 5,440 5,3E-03 55,77
Control 3,662 ELN520 9773,1 4,655 9,8E-02 33,29
EUN539 10101 ,7 4,344 8.5E-02 19,36 Control 3,492
Control 3,640 EUN521 9362,2 4,458 3, 1 E-01 31 ,79
EUN543 10051,1 4,030 3.5E-01 8,20 EUN521 9363,4 5,071 5,6E-02 49,90
EUN543 10052,3 4,347 8,l E-02 . 16,70 Control 3,383
EUN543 10053, 1 4,034 4.0E-01 8,29 EUN523 9412,5 4,834 3,0E-01 42,92
Control 3,725 EUN523 9414,2 5,371 1.7E-04 58,79
EUN563 9452,3 5,668 7,3E-02 41,27 Control 3,383
EUN563 9451,2 4,348 2.6E-01 8,38 EUN523 9413,3 6,532 5, 1 E-01 20,78
EUN5Ó3 9452,1 4,415 3.9E-01 10,04 EUN523 9414,2 8,479 4,6E-02 56,78
Control 4,012 Control 5,408
EUN566 9513, 1 4,306 4.5E-01 7,32 EUN525 9531,2 6,497 l ,7E-04 48,62
EUN566 9 12,2 4, 1 18 6.3E-01 2,63 EUN525 9534,1 6,805 6,9E-02 55,67
EUN566 9512,4 4,41 1 3.9E-01 9,95 EUN525 9531,3 4,928 6,1 E-01 12,73
EUN566 9512,1 5,392 9,6E-02 34,39 EUN525 9533,1 7,002 3,6E-02 60,17
EUN566 9514, 1 5,583 l ,8E-05 39, 15 EUN525 9531, 1 8,063 1.5E-01 84,46
Control 4,012 Control 4,371
EUN574 10363,4 4, 132 3,5E-01 13,52 EUN531 10083,3 4,905 2,4E-02 24,81
EUN574 10366,2 4,697 7.2E-02 29,04 EUN531 10081 ,4 6,308 l ,3E-02 60,52
EUN574 10366, 1 4,264 6.0E-03 17,15 EUN531 10083,2 5,480 8,6E-02 39,45
Control 3,640 EUN531 10081,5 7,516 4,3E-02 91,25
EUN581 9724,9 4,35 1.5E-01 13,8 Control 3,930
Control 3,82 EUN536 9233,3 7, 107 3,3E-02 42,30
EUN583 9673,4 5,145 8,6E-02 41,35 Control 4,994
EUN583 9673,2 4,621 l ,6E-02 26,95 EUN537 9393,3 7,508 5,7E-02 85,53
EUIN583 9671 ,2 4, 181 1 ,0E-01 14,88 Control 4,047
EUN583 9671 ,1 3,903 3.2E-01 7,24 EUN539 10101 ,5 5,026 1 ,1 E-01 43,93
Control 3,640 EUN539 10103,5 5,622 7.6E-03 60,99
EUN586 9751 ,1 4,510 4,7E-01 7,36 EUN539 10101 ,7 6,622 4.1 E-03 89,62
EUN586 9751,7 5,845 3.0E-03 39,13 Control 3,492
EUN586 9751 ,3 5,259 7,3E-02 25,20 EUN543 10051,1 5,204 9,l E-02 21 ,47
EUN586 9752,2 4,903 1 ,1 E-01 16,71 EUN543 10052,3 4,978 2,0E-01 16,20
EUN586 9752,1 6,626 1.3E-05 57,73 EUN543 10051,2 5,086 3, 6 E-01 18,73
Control 4,201 Control 4,284
EUN586 9751,1 5,290 3,0E-01 13,71 EUN544 9764,2 8,303 9,5E-02 46,92
ELN586 9751 ,6 6,090 l,6E-03 30,92 EUN544 9763,3 6,821 1 ,1 E-01 20,71
EUN586 9751 ,3 5, 181 3.1 E-01 1 1 ,38 Control 5,651
EUN586 9752,4 5,952 2,9E-03 27,96 EUN548 9095,2 7,731 2,2 E-01 46,90
EUN586 9752,1 6,660 2.1 E-04 43,17 EUN548 9095,4 7,888 1.3E-01 49,89
Control 4,652 EUN548 9091,1 6,01 1 2/7E-01 14,23
EUN593 10391,2 4,849 8,9E-03 30,18 Control 5,262
EUN593 10394, 1 4,390 2.4E-01 17,85 EUN554 91 15,2 7,603 3,2E-02 36,68
EUN593 10394,2 4,698 3,3E-02 26,13 Control 5,562
Control 3,725 EUN563 9452,3 9,266 1.7E-01 1 1 1 ,97
EUN592 9741.7 4,08 4,8E-01 6,8 EUN563 9451,2 6,068 1 ,3 E-01 38,82
ELN592 9747,4 4,00 6.2E-01 4,8 EUN563 9452,1 5, 145 1 ,2E-01 17,70
EUN592 9747,5 4,70 1.8E-02 23.0 Control 4,371
Longitud de ratees [cm] Cobertura de raices ¡cm2}
Even Even
Nombre del gen Prom. valor-p % incr. Nombre del gen Prom. valor-p % incr.
to # to #
Control 3,82 EUN566 9513, 1 5,537 2.0E-01 26fi7
EUN566 9512,2 5,086 1.3E-01 16,36
EUN566 9512,1 7,608 1 ,0E-01 74,05
EUNS66 9514, 1 7,752 2,2E-03 77,33
Control 4,371
EUN569 9381 ,2 5, 147 2,8E-02 21.78
Control 4,226
EUN570 931 1 ,4 4,965 5,6E-01 22,69
EUN570 93 14,4 5,327 8,0E-02 31 ,63
EUN570 9314,1 5,093 3.3E-01 25,85
Control 4,047
EUN574 10364,2 4,318 1.9E-01 9,88
EUN574 10366,2 7,430 5,lE-02 89,06
EUN574 10366, 1 5,260 5,6E-02 33,83
Control 3,930
EUN581 9723,6 4,16 7,4E 6,5
EUN581 9724,9 4,93 1,9E 26,3
Control 3,90
EUN583 9673,4 8,986 1.7E-02 128,64
EUN583 9673,2 6,359 5,0E-02 61 ,80
EUN583 9671,2 4,956 1 ,0E-01 26, 1 1
Control 3,930
EUN586 9751,1 5,324 5,1 E-01 14,00
EUN586 9751 ,7 8,938 2,6E-02 91 ,38
EUN586 9751,3 6,250 8,3E-02 33,83
EUN586 9752,2 5,566 3,7E-01 19, 18
EUN586 9752,1 10,320 9.6E-04 120,99
Control 4,670
EUN586 9751,1 7,261 2,8E-01 28,49
EUN586 9751,6 7,902 4,2E-02 39,83
EUN586 9751 ,7 6,250 6,0E-01 10,60
EUN586 9751,3 7,274 9,2E-02 28,71
EUN586 9752,4 8,572 6,8E-03 51 ,70
EUN586 9752,1 9,922 5,6E-02 75,58
Control 5,651
EUN587 9643,2 7,007 7,6E-02 50,03
Control 4,670
EUN592 9741 ,7 4,20 7,0E 7,7
EUN592 9747,5 5,31 7,3E 36,0
Control 3,90
EUN593 10391 ,2 5,167 2,6E-01 20,60
EUN593 10394,2 6,009 9,4E-02 40,25
Control 4,284
Tabla 26: Análisis del rendimiento de raíz (longitud y cobertura de raíz) de las plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) bajo la
regulación de un promotor constitutivo (35S) cuando se desarrollan bajo condiciones de nitrógeno limitado [condiciones de baja cantidad de nitrógeno o de nitrógeno deficiente (0,75 mM N) ] comparados con las plantas de control. "Prom." Promedio; "Incr." = incremento.
Los genes presentados en la Tablas 27 y 28, más adelante, tienen una mejorada tasa de crecimiento vegetal cuando se los desarrolló bajo condiciones de crecimiento con nitrógeno limitado, comparados con las plantas de control. Las plantas que muestran una tasa de crecimiento más rápida confirman un mejor establecimiento de la planta en suelo bajo condiciones de nitrógeno deficiente. Se observó un crecimiento más rápido cuando se midió la tasa de crecimiento del área de hoja asi como también, cuando se midió la longitud y cobertura de raíz.
Las Tabla 27 y 28 ilustran los análisis de la tasa de crecimiento de la planta del área de hoja, cobertura de raíz y longitud de raíz cuando se desarrollan bajo condiciones de nitrógeno limitado [condiciones de baja cantidad de nitrógeno o de nitrógeno deficiente (0,75 mM N) ] en plantas que sobreexpresan los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S). Se realizó la evalulación de cada gen realizando el ensayo de rendimiento de varios eventos. Algunos de los genes fueron evaluados con más de un ensayo de cultivo tisular y el segundo experimento confirmó el incremento significativo en la
tasa de crecimiento. El evento con valor-p < 0.1 fue considerado estadísticamente significativo.
Tabla 27
Las plantas transgénicas que expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención exhiben una tasa de crecimiento vegetal mejorada (tasa de crecimiento relativa del área de hoja y cobertura de raíz) bajo condiciones de nitrógeno deficiente
RGR del Area de hoja RGR de Cobertura de raices
Nombre Evento valor- % Nombre Evento valor- %
Promedio Promedio
del gen # P Incr. del gen # P Incr.
3, 1 E- 2,6E- CT11 4892,3 0,043 14,75 CT11 4894,3 1 ,07 18,78
01 01
7,0E- 4,7E- CT11 4893,2 0,054 43,87 CT11 4892,2 1 ,02 12,68
02 01
4,9E- Control 0,038 CT11 4892,1 1,17 29,43
02
3,2E- CT11 4894,3 0,071 37,85 Control 0,90
02
6,5 E- 6,6E- CT11 4892,3 0,077 47,95 CT22 5023,1 0,49 51 ,49
03 02
8.1E- CT11 4892,2 0,066 27,89 Control 0,32
02
5,1 E- Control 0,052 CT27 5033,7 0,51 59,31
01
2, I E- 4,4E- CT27 5031 ,4 0,059 56,19 CT27 5031,4 0,66 106,25
03 01
3,7E- 3,3E- CT27 5035,2 0,050 31 ,33 CT27 5035,2 0,48 50,35
02 01
1,9E- Control 0,038 CT27 5033,6 0,46 41 ,98
01
1,4E- 5,0E- CT27 5035,2 0,052 47,58 CT27 5033,4 0,81 152,27
02 02
4,5 E- Control 0,035 CT27 5033,8 0,36 12,91
02
1,9E- CT27 5033,4 0,047 28,65 Control 0,32
01
l,7E- 4,7E- CT27 5033,8 0,062 66,84 CT6 4943, 1 0,93 60,75
04 02
3,3 E- Control 0,037 CT6 4941,4 0,88 52,53
02
1 ,9E- CT6 4943,1 0,058 54,43 Control 0,58
02
1,2E- 1, 1 E- CT6 4941 ,4 0,058 52,74 CT75 4873,3 0,75 30,24
02 01
Control 0,038 Control 0,58 ·
3,8E- 5,2E- CT76 5044,6 0,059 13,49 CT76 5041 ,5 1 ,29 43,20
01 02
RGR del Area de hoja RGR de Cobertura de raíces
Nombre Evento valor- % Nombre Evento valor- %
Promedio Promedio
del gen # P Incr. del gen # P Incr.
2,9E- 5,2E- CT76 5041 ,5 0,075 44,40 CT76 5043,5 1 ,24 37,15
02 02
2,8E- 4,7E- CT76 5043,5 0,082 58,85 CT76 5041,6 1 ,01 1 1 ,99
04 01
4,2 E- CT76 5041,9 0,084 62,25 Control 0,90
03
5,5E- 3,6E- CT76 5041,6 0,086 65,56 CT76 5044,6 0,59 49,62
04 02
1,9E- Control 0,052 CT76 5043,5 0,67 71 ,45
02
2,9E- 4,1 E- CT76 5044,6 0,044 18,54 CT76 5041,6 0,46 17,98
01 01
5,8E- 8,3E- CT76 5041,5 0,050 36,83 CT76 5041,9 0,64 64,17
02 03
1,6E- CT76 5043,5 0,075 103,60 Control 0,39
07
9,2E- 6, 1 E- CT76 5041,6 0,053 43,71 EUN206 6731,2 0,88 107,33
03 03
7,7E- 2,5 E- CT76 5041 ,9 0,055 48,95 ELN206 6732,7 0,54 28,14
03 01
Control 0,037 Control 0,42
1,9E- 3,0E- CT81 4992,1 0,074 43,33 EUN206 6731,2 0,73 103,93
03 04
2,8E- 1,5E- CT81 4993,5 0,061 17,47 EUN206 6732,9 0,46 29,09
01 01
2,3E- 1,5E- CT81 4992,2 0,072 38,79 EUN206 6732,5 0,51 42,93
02 01
Control 0,052 Control 0,36
2,0E- 3,9E- EUN206 6731,2 0,035 39,25 EUN208 8354,8 0,58 18,43
02 01
6,4E- 3,7E- EUN206 6732,7 0,032 28,96 ELN208 8351 ,3 0,71 44,72
02 02
Control 0,025 Control 0,49
1,0E- 9, 1 E- EUN208 8351,3 0,046 54,30 EUN208 8355,3 0,72 100, 13
02 03
9,5E- EUN208 8355,3 0,038 28,29 Control 0,36
02
1,3E- Control 0,030 ELN209 8192,13 0,63 28,43
01
2,0E- 1, 1 E- ELN208 8355,3 0,073 55,84 ELN209 8192,14 0,65 32,34
02 01
Control 0,047 Control 0,49
3,2E- 4,0E- EUN209 8192,13 0,043 44,12 EUN209 8192,14 0,65 79,86
02 03
6,9E- ELN209 8192,14 0,047 60,54 Control 0,36
03
2,2E- Control 0,030 EUN212 8332,2 0,64 70,92
02
2,2E- 1,5E- EUN209 8192,13 0,047 38,99 EUN212 8334,1 0,61 63,17
02 01
4,8E- EUN209 8191,5 0,055 64,77 Control 0,37
04
1.2E- 1.1 E- EUN209 8192,14 0,041 22,52 EUN212 8335,2 0,75 52,25
01 02
2,4E- Control 0,033 EUN212 8331 ,4 0,76 54,17
02
2,5E- EUN209 8192,14 0,071 52,94 Control 0,49
03
RGR del Area de hoja RGR de Cobertura de raíces
Nombre Evento valor- % Nombre Evento valor- %
Promedio Promedio
del gen # P Incr. del gen # P Incr.
2,2E- 2,7E- EUN209 8191 ,3 0,057 22,44 EUN212 8332,2 1,08 58,34
01 02
1.6E- Control 0,047 EUN212 8331,4 0,87 27,37
01
1.9E- EUN212 8335,2 0,041 40, 1 1 Control 0,68
02
8.8E- 8,9E- EUN212 8331 ,4 0,046 54,77 EUN223 961 1,5 1 ,06 67,16
03 04
2,3 E- Control 0,030 EUN223 9612,3 0,77 21 ,00
01
4,8E- EUN212 8332,1 0,062 50,03 Control 0,63
03
2,0E- Control 0,041 EUN228 10092,2 0,70 41 ,76
02
5,9E- 1 ,5E- EUN224 9001,3 0,064 41 ,00 EUN228 10093,3 0,61 23,30
04 01
5,5E- Control 0,045 EUN228 10093,1 0,66 33,53
02
8.1 E- EUN230 9154,2 0,054 19,70 Control 0,49
02
1,5E- 2,2E- EUN230 9151,2 0,052 14,88 EUN233 10174,3 0,52 27,38
01 01
1,1 E- Control 0,045 EUN233 10174,1 0,86 1 1 1, 13
05
3,5 E- 4,2E- EUN230 9153,3 0,046 23,46 ELN233 10173,7 0,59 45,30
02 02
Control 0,038 Control 0,41
2,8 E- 8, 1 E- EUN233 10174,3 0,047 52,81 EUN233 10174,1 0,56 22,89
03 02
5,3E- 2,7E- EUN233 10174, 1 0,075 141,80 EUN233 10173,7 0,72 57,48
09 03
4,3E- EUN233 10173,7 0,040 28,55 Control 0,46
02
5, 1 E- Control 0,031 EUN234 162,1 0,51 39,40
02
4.5E- EUN237 9651,1 0,051 12,77 Control 0,37
01
2.5E- 2,5 E- EUN237 9654,4 0,059 31 ,14 EUN235 9693,4 0,68 44,45
02 03
2,6E- 2,0E- EUN237 9654,1 0,056 24,39 EUN235 9691,1 0,56 18,18
02 01
2,3E- Control 0,045 ELN235 9694,4 0,55 15,87
01
1,3E- 1, 1 E- EUN239 9191,1 0,063 58,77 EUN235 9694,3 0,76 60,48
02 03
Control 0,040 Control 0,47
5.3E- 7,8E- EUN239 9192,3 0,061 25,48 EUN237 9654,4 0,93 39,79
02 02
2,4E- Control 0,048 EUN237 9654,1 0,84 26,90
01
1 ,5E- EUN240 9172,2 0,067 68,99 Control 0,66
03
1 ,4E- 6,5 E- EUN240 9174,3 0,052 29,40 EUN239 9191,1 0,75 36,48
01 02
Control 0,040 Control 0,55
4.1 E- 7,2E- EUN240 9172,1 0,068 41 ,05 EUN239 9192,3 1 ,08 71,00
03 05
3,5E- Control 0,048 EUN239 9191,2 0,73 14,79
01
RGR del Area de hoja RGR de Cobertura de raices
Nombre Evento valor- % Nombre Evento valor- %
Promedio Promedio
del gen # P Incr. del gen # P Incr.
4,5 E- EUN241 9633,4 0,053 58,65 Control 0,63
04
7,6E- 5.1 E- EUN241 9632,2 0,042 26,55 EUN240 9172,2 0,73 33,21
02 02
6,8E- 1 ,4E- EUN241 9632,4 0,045 35,24 EUN240 9174,3 0,68 23,94
02 01
Control 0,033 Control 0,55
2,2E- 8,4E- EUN241 9632,3 0,056 43,54 EUN240 9172,1 0,93 46,95
02 03
Control 0,039 Control 0,63
4.2E- 5,1 E- EUN242 9212,1 0,053 49,38 EUN241 9633,4 1 ,05 121 , 17
03 09
2,2E- 3,0E- EUN242 9213,4 0,041 15,83 EUN241 9632,3 0,56 17,76
01 01
4,2E- Control 0,036 EUN241 9632,2 0,70 47,48
03
3,3E- 2,6E- EUN245 10641,7 0,064 39,30 EUN241 9632,4 0,68 42,78
02 02
Control 0,046 Control 0,47
5,0E- 8,7E- EUN246 9033,8 0,047 13,54 EUN241 9632,3 0,73 37,63
01 02
1,8E- 1,8E- EUN246 9033,4 0,053 27,65 EUN241 9632,4 0,68 28,48
01 01
1,3E- EUN246 9034,1 0,067 63,07 Control 0,53
02
5,3 E- Control 0,041 EUN242 9214,1 0,82 34,65
01
1,8E- 4,4E- EUN248 8981,5 0,059 42,38 EUN242 9213,4 0,98 61 ,42
02 04
Control 0,041 Control 0,61
2,9E- 2,3E- EUN250 9132,1 0,051 13,50 EUN242 9212,1 0,69 76,75
01 03
4,2E- 4,3 E- EUN250 9132,2 0,051 12,43 EUN242 9213,4 0,55 40,32
01 02
5,3E- EUN250 9134,1 0,055 21 ,91 Control 0,39
02
5,7E- Control 0,045 ELN245 10641 ,7 0,67 46,73
03
3,2E- 4,6E- EUN251 10181 ,3 0,052 67,47 EUN245 10641,8 0,57 24,96
05 02
1, 1 E- 4, 1 E- EUN251 10183,2 0,044 41 ,23 EUN245 10643,4 0,50 10,90
02 01
1,1 E- EUN251 10183,1 0,043 38,27 Control 0,46
02
2,4 E- Control 0,031 EUN246 9033,8 0,72 22,81
01
2,2E- 3,8E- EUN251 10183,2 0,084 83,75 EUN246 9033,4 0,69 17,06
05 01
8, 1 E- 1,5E- EUN251 10182,1 0,057 23,66 EUN246 9034, 1 0,78 32,69
02 01
7,3E- 1 ,2E- EUN251 10181 , 1 0,048 4,28 EUN246 9031,1 0,90 52,58
01 02
Control 0,046 Control 0,59
4,9E- 7,3 E- EUN256 10063,4 0,045 10,33 EUN248 8981,5 0,70 30,02
01 02
1,5E- EUN256 10064, 1 0,057 37,35 Control 0,53
02
3,3E- Control 0,041 EUN250 9134,1 0,68 12,73
01
RGR del Area de hoja RGR de Cobertura de raíces
Nombre Evento valor- % Nombre Evento valor- %
Promedio Promedio
del gen # P Incr. del gen # P Incr.
8.1 E- 3,6E- ELN256 10063,4 0,061 96,42 EUN250 9132,2 0,89 46,62
04 02
1, SE¬
EUN256 10064,1 0,063 104,87 Control 0,61
OS
1 ,0E- 8,3E- EUN256 10061,2 0,065 1 10, 14 EUN251 10183,2 0,81 77,68
07 05
2,3E- 1 ,8E- ELN256 10062,4 0,062 99,98 EUN251 10181 ,1 0,56 24,08
05 01
1 JE- EUN256 10063,2 0,054 74,87 Control 0,46
04
6,0E- Control 0,031 EUN254 8972,4 0,74 38,45
02
6,0E- EUN256 10061,2 0,071 55,03 Control 0,53
04
4, 1 E- 2,3E- EUN256 10061,4 0,068 47,93 EUN256 10063,4 0,88 1 15,25
03 04
3,9E- 1,6E- EUN256 10063,2 0,051 1 1 ,43 EUN256 10064,1 0,89 1 17, 15
01 04
5,9E- Control 0,046 EUN256 10061,2 0,74 81 ,36
04
2,6E- 4,0E- EUN511 9271 ,2 0,056 50,68 EUN256 10062,4 0,77 87,01
02 03
7,9E- Control 0,040 EUN256 10063,2 0,78 90,93
04
3,6E- EUN512 9282,3 0,072 68,22 Control 0,41
04
8,0E- 7,7E- EUN512 9284,4 0,059 38,67 EUN256 10061 ,3 0,55 20,48
03 02
1,1 E- Control 0,043 EUN256 10061,2 0,61 34,76
02
3,4E- 6,4E- EUN514 9404,1 0,047 30,81 EUN256 10061,4 0,67 46,55
02 03
3,3E- 6,6E- EUN514 9402,2 0,041 14,01 EUN256 10063,2 0,63 39,24
01 03
1,7E- EUN514 9403,2 0,042 17,39 Control 0,46
01
7,5 E- Control 0,036 EUN268 8996,5 0,95 46,67
03
3,6E- EUN516 9291 ,1 0,051 12,83 Control 0,65
01
5,2E- 1,2E- EUN516 9291 ,4 0,058 28,67 EUN512 9284,3 0,59 24,74
02 01
1,5E- Control 0,045 EUNS12 9282,3 0,72 51 ,97
02
7,6E- 7,5E- EUN519 9371 ,2 0,065 34,99 EUN512 9284,4 0,94 98,41
02 06
1 ,7E- EUN519 9371 ,1 0,059 22,69 Control 0,47
01
1,4E- Control 0,048 EUN513 9681,6 0,77 21 ,72
01
7,7E- EUN521 9362,2 0,050 41 ,00 Control 0,63
03
3, 1 E- 2,6E- EUN521 9361 ,2 0,041 15,27 EUN514 9404,1
01 0,72 17,95
01
1.4E- 2,9E- EUN521 9363,4 0,056 56,51 EUN514 9404,5 0,79 30,17
04 02
Control 0,036 Control 0,61
3,4E- 3,9E- EUN521 9362,2 0,057 16,01 ELN514 9403,2 0,67 71 ,81
01 05
RGR del Area de hoja RGR de Cobertura de raíces
Nombre Evento valor- % Nombre Evento valor- %
Promedio Promedio
del gen # P Incr. del gen # P Incr.
6,3 E- 5,8E- EUN521 9363,4 0,065 31,54 EUN514 9402,5 0,52 34,24
02 02
Control 0,049 Control 0,39
4,9E- 5,6E- ELN523 9412,5 0,048 33,67 EUN519 9371,2 0,97 52,96
02 02
9.2E- 2,5 E- EUN523 9414,2 0,043 20,21 EUN519 9371,1 0,96 51,45
02 02
Control 0,036 Control 0,63
7,6E- 2,1E- EUN523 9412,5 0,058 41,83 EUIN520 9771,4 0,59 20,79
02 01
2.2E- 9,4E- EÜN523 9414,2 0,049 19,88 EUN520 9771,7 0,72 47,07
01 03
5,2E- 4,4E- EUN523 9412,1 0,062 49,67 EUN520 9771,2 0,78 59,79
03 03
5,5E- Control 0,041 EUN520 9771,3 0,89 81,39
04
8,9E- EUN525 9531,2 0,043 27,96 Control 0,49
02
1,4E- 1,5E- EUN525 9534,1 0,042 27,19 EUN520 9771,4 0,76 85,18
01 03
3,9E- 3,7E- EUN525 9531,3 0,046 36,82 EUN520 9771,2 0,83 102,18
02 04
1,6E- 5,4E- EUN525 9533,1 0,048 42,76 EUN520 9771,3 0,66 60,90
02 03
3,5 E- 1,1E- EUN525 9531,1 0,045 36,14 EUN520 9773,1 0,57 39,32
02 01
Control 0,033 Control 0,41
5,6E- 5,4E- EUN531 10083,1 0,070 24,91 EUN521 9362,2 0,55 39,89
02 02
1,1E- 2,1E- EUN531 10082,2 0,067 20,04 EUN521 9361,3 0,46 18,65
01 01
1,2E- 1,4E- EUN531 10081,4 0,070 24,78 EUN521 9363,4 0,63 61,36
01 03
8,2E- EUN531 10081,5 0,073 30,25 Control 0,39
02
5,0E- Control 0,056 EUN523 9412,5 0,58 49,67
02
4,0E- 9,9E- EUN531 10081,4 0,051 11,96 EUN523 9414,2 0,63 61,62
01 06
1,3E- EUN531 10081,5 0,090 95,63 Control 0,39
05
2,6E- Control 0,046 EUN523 9413,3 0,80 24,87
01
1,6E- 3,8E- EUN532 9222,4 0,050 40,00 EUN523 9414,2 1,03 60,15
01 03
Control 0,036 Control 0,64
1,7E- 5,0E- EUN535 9082,2 0,040 29,19 EUN523 9412,5 1,03 44,09
01 02
2,0E- 7,8 E- EUN535 9084,2 0,037 17,89 EUN523 9414,2 1,05 47,15
01 03
4,7E- ELN535 9081,1 0,045 45,68 Control 0,71
02
9,9E- 1,1E- EUN535 9083,1 0,059 91,43 EUN525 9531,2 0,71 50,16
06 03
6,1E- 3,0E- EUN535 9084,4 0,046 49,99 EUN525 9534,1 0,76 59,45
03 03
3,9E- Control 0,031 EUN525 9531,3 0,55 15,44
01
RGR del Area de hoja RGR de Cobertura de raíces
Nombre Evento valor- % Nombre Evento valor- %
Promedio Promedio
del gen # P Incr. del gen # P Incr.
8.9E- 1, 1 E- EUN537 9391 ,2 0,067 57,56 EUN525 9533,1 0,75 57,42
04 03
3,4E- 9,0 E- EUN537 9393,3 0,078 83,37 EUN525 9531 ,1 0,88 85,07
06 04
Control 0,043 Control 0,47
7,5 E- 6,0 E- EUN539 10103,5 0,060 45,45 EUN527 9201,2 0,91 39,82
02 02
Control 0,041 Control 0,65
6,3E- 8,8E- EUN539 10101,5 0,052 68,95 EUN528 9073, 1 0,91 33,70
04 02
2,7E- EUN539 10103,5 0,052 67,92 Control 0,68
05
4.6E- 1,2E- ELN539 10101,2 0,058 85,91 EUN531 10081 ,4 0,65 33,32
06 01
1 ,3E- 6, 1 E- EUN539 10101,7 0,067 1 15,49 EUN531 10081,5 0,95 93,18
06 03
Control 0,031 Control 0,49
1 JE- 5,7E- EUN542 9333,2 0,058 27,22 EUN531 10083,3 0,56 22,09
02 02
2,5E- Control 0,045 EUN531 10081,4 0,76 67,03
04
4,9E- 7,4E- EUN543 10051,2 0,043 1 1 ,08 EUN531 10083,2 0,65 42,46
01 03
EUN543 10051,6 0,052 2.6E- 5,5 E- 32,97 EUN531 10081 ,5 0,88 94,20 02 05
Control 0,039 Control 0,46
1 ,9E- 1, 1 E- EUN548 9095,2 0,058 45,78 EUN535 9084,2 0,87 34,81
02 01
1 , 1 E- EUN548 9092,2 0,054 34,83 Control 0,65
01
2,7E- Control 0,040 EUN536 9233,3 0,85 45,06
02
2,0E- EUN548 9095,2 0,067 16,93 Control 0,59
01
6,7E- 9,3 E- EUN548 9095,4 0,082 43,33 EUN537 9393,2 0,50 28,21
03 02
7,8 E- 8,0E- EUN548 9091 ,1 0,070 21,75 EUN537 9393,3 0,49 25,71
02 02
Control 0,057 Control 0,39
8,8E- 5,4E- EUN554 91 15,2 0,067 26,2\ EUN537 9393,3 0.92 95,13
02 04
Control 0,053 Control 0,47
4,8E- 3,4E- EUN560 9424,3 0,069 39,85 EUN539 10101 ,5 0,62 50,84
02 02
6,2E- Control 0,049 EUN539 10103,5 0,66 61 ,79
03
8,5 E- 2,0E- EUN564 9242,2 0,066 54,86 EUN539 10101,7 0,80 96,01
03 04
Control 0,043 Control 0,41
2,2E- 2,7E- EUN566 9512,1 0,052 56,47 EUN544 9764,2 1 ,00 46,55
02 02
2,7E- Control 0,033 EUN544 9763,3 0,80 17,81
01
1 ,8E- EUN567 9263,3 0,053 25,10 Control 0,68
01
7,1 E- Control 0,043 EUN545 9482,4 0,61 28,80
02
2,9E- EUN568 9471 ,3 0,051 14,08' Control 0,47
01
RGR del Area de hoja RGR de Cobertura de raices
Nombre Evento valor- % Nombre Evento valor- %
Promedio Promedio
del gen # P Incr. del gen # P Incr.
5,2E- 1,2E- EUN568 9472,2 0,062 40,02 EUN548 9095,2 0,72 30,12
03 01
Control 0,045 Control 0,55
6,7E- 1 ,5E- EUN570 9314,1 0,064 32,94 EUN548 9095,2 0,96 57,39
02 02
4,3 E- Control 0,048 EUN548 9095,4 0,97 59,52
03
6,1 E- 1,1 E- EUN573 9491 ,4 0,058 30,87 EUN548 9091, 1 0,74 22,28
02 01
1.4E- EUN573 9494,3 0,055 23,73 Control 0,61
01
1,4E- Control 0,045 EUN550 9141 ,3 0,83 28,42
01
1 ,0E- EUN574 10364,2 0,062 34,44 Control 0,65
02
6,7E- 1,7E- EUN574 10362,2 0,048 5,59 EUN554 91 15,2 0,93 43,12
01 02
6,5E- EUN574 10366,2 0,079 72,54 Control 0,65
05
3,8E- Control 0,046 EUN563 9452,3 1 ,02 1 14,90
03
2,5E- 3,0E- EUN576 9791,3 0,046 17,12 ELN563 9451,2 0,65 36,75
01 02
9,0E- EUN576 9792,4 0,050 27,76 Control 0,47
02
9.8E- 2,0E- EUN576 9794,1 0,048 24,04 EUN564 9242,3 0,58 21 ,75
02 01
1,4E- 3,1 E- EUN576 9793,3 0,048 22,67 ELN564 9242,2 0,71 49,74
01 02
9,3E- Control 0,039 EUN564 9243,4 0,65 37,10
02
4,1 E- EUN582 9562,4 0,056 24,61 Control 0,47
02
1,3E- Control 0,045 ELN566 9513,1 0,58 23,35
01
3,2E- 1,7E- EUN583 9673,1 0,056 43,43 EUN566 95 12,2 0,56 17,73
02 01
5.1 E- Control 0,039 ELN566 9512,1 0,79 67,15
03
3,5 E- 2,8E- EUN583 9673,4 0,092 100,45 EUN566 9514,1 0,86 80,42
05 05
2,5E- EUN583 9673,2 0,063 38,28 Control 0,47
02
7,7E- Control 0,046 ELN567 9263,3 0,66 39,99
02
4,2E- EUN586 9751,6 0,047 12,92 Control 0,47
01
3, 1 E- 5,0E- EUN586 9751,7 0,049 19,09 EUN567 9263,3 0,97 42,53
01 02
2,6E- EUNS86 9752,4 0,057 36,93 Control 0,68
02
1.0E- 8,8E- EUN586 9752,1 0,058 39,90 EUN569 9381,2 0,60 20,49
01 02
2, 1 E- Control 0,041 EUN569 9381,5 0,59 19,31
01
Control 0,50
2,9E- EUN570 931 1,4 0,60 27,17
01
RGR del Area de hoja RGR de Cobertura de raices
Nombre Evento valor- % Nombre Evento valor- %
Promedio Promedio
del gen # P Incr. del gen # P Incr.
4,5 E- EUN570 9314,4 0,64 35,92
02
1,6E- EUN570 9314,1 0,61 29,32
01
Control 0,47
2,6E- EUN570 9314,4 0,63 26,50
01
1, 1 E- EUN570 9314,1 0,81 64,12
02
Control 0,50
1,4E- EUN571 9304,2 0,84 30, 16
01
Control 0,64
2,5 E- EUN574 10364,2 0,51 12,29
01
7,6E- EUN574 10366,2 0,91 99,71
05
6,2E- EUN574 10366,1 0,63 38,15
03
Control 0,46
7,4E- EUN583 9673,4 1 ,08 136,31
07
3.4E- EUN583 9673,2 0,76 67,32
04
3,4E- EUN583 9671,2 0,58 27,94
02
Control 0,46
4,4E- EUN586 9751,7 1 ,08 90,56
04
1,3E- EUN586 9751,3 0,73 28,69
01
1, 1 E- EUNS86 9752,1 1 ,23 1 17,25
06
Control 0,57
1,9E- EUN586 9751,1 0,86 26,09
01
5,1E- EUN586 9751,6 0,93 35,91
02
9,6E- EUN586 9751,3 0,89 30,27
02
9,5 E- EUN586 9752,4 1 ,02 49,17
03
6,5 E- EUN586 9752,1 1 ,16 69,78
03
Control 0,68
2,3E- EUN587 9643,2 0,85 50,29
02
Control 0,57
1,5E- EUN593 10394,2 0,72 46,89
02
Control 0,49
Tabla 27: Análisis de la tasa de crecimiento de la planta (tasa de crecimiento relativa de área de hoja and cobertura de
raíz) de plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S) , cuando se desarrollan bajo condiciones de nitrógeno limitado [condiciones de baja cantidad de nitrógeno o de nitrógeno deficiente (0.75 mM N) ] , comparados con las plantas de control. "Incr." = incremento; "RGR" = tasa de crecimiento relativo.
Tabla 28
Las plantas transgénicas que expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención exhiben una tasa de crecimiento vegetal mejorada (tasa de crecimiento relativa de longitud de raiz) bajo condiciones de nitrógeno deficiente
R GR de Longitud de raíces
Nombre del gen Evento # Promedio valor-p % incr.
CT1 4841 ,1 0,325 4.6E-01 14,92
CT1 4844,5 0,386 3,9E-02 36,53
CT1 4841 ,2 0,399 5.1 E-02 41 ,25
Control 0,282
CT11 4892, 1 0,612 9,8E-02 15,48
Control 0,530
CT22 5023,1 0,373 9,6E-02 32,01
Control 0,282
CT27 5033,4 0,394 5,2E-02 29,10
CT27 5033,8 0,350 2.6E-01 14,96
Control 0,305
CT6 4945,8 0,460 2,1 E-01 17,91
CT6 4943,1 0,548 2,0E-02 40,56
Control 0,390
CT75 4873,4 0,473 1.5E-01 21 ,17
CT75 4873,3 0,532 1.3E-02 36,39
Control 0,390
CT76 5044,6 0,408 1.1 E-02 33,88
CT76 5043,5 0,389 7,9E-02 27,59
CT76 5041 ,9 0,381 6,4E-02 25,1 1
Control 0,305
EUN206 6731 ,2 0,496 5,5E-03 49,81
EUN206 6732,7 0,395 1.8E-01 19,18
RGR de Longitud de raíces
Nombre del gen Evento # Promedio valor-p % incr.
Control 0,331
EUN206 6731 ,2 0,501 l ,2E-05 64,61
EUN206 6732,9 0,417 8,6E-03 37,13
Control 0,304
EUN208 8351 ,3 0,477 7.4E-02 22,59
Control 0,389
EUN208 8355,3 0,500 7,9E-04 64,40
Control 0,304
ELN209 8192,13 0,506 l,6E-02 30,23
EUN209 8192.14 0,475 9,5E-02 22,29
Control 0,389
EUN209 8191 ,2 0,421 5,l E-02 36,60
EUN209 8192,13 0,394 7.1 E-02 27,85
ELN209 8191 ,5 0,410 3,0E-02 ' 32,93
Control 0,308
ELN209 8192,14 0,452 5,l E-03 48,66
Control 0,304
EUN210 8202,2 0,462 9.4E-02 18,92
Control 0,389
EUN210 6755,3 0,421 3.2E-02 36,49
Control 0,308
EUN212 8332,2 0,455 l,7E-02 47,71
ELN212 8334,1 0,426 1,6E-01 38,40
Control 0,308
EUN212 8331 ,4 0,504 2,3E-02 29,68
Control 0,389
ELN212 8331,1 0,584 6,4E-02 24,96
EUN212 8332,2 0,597 8,7E-02 27,76
EUN212 8331 ,4 0,567 1,3E-01 21 ,20
Control 0,468
EUN223 961 1,5 0,537 4, l E-03 35,20
EUN223 9612,3 0,466 2,5E-01 17,18
Control 0,397
EUN228 10092,2 0,426 5,6E-02 29,90
EUN228 10093,3 0,422 8,2E-02 28,77
EUN228 10093, 1 0,408 ?, ? ?-01 24,40
Control 0,328
EUN233 10174,3 0,391 3,9E-01 14,35
ELN233 10174,1 0,471 4.7E-02 37,60
EUN233 10173,5 0,461 5,6E-02 34,78
ELN233 10172,5 0,412 2,3E-01 20,55
EUN233 10173,7 0,407 2,8E-01 19,07
Control 0,342
EUN233 10174, 1 0,404 l,2E-03 29,24
EUN233 10173,5 0,362 2,5E-01 15,71
ELN233 10172,5 0,362 6,0E-02 15,79
EUN233 10173,7 0,436 3.6E-03 39,35
Control 0,313
EUN234 9162,1 0,426 5,9E-02 25,45
Control 0,340
EUN235 9693,4 0,451 l,4E-02 25,62
EUN235 9694,3 0,517 4,3E-04 43,98
Control 0,359
EUN239 9191 , 1 0,435 3,5E-01 10,73
EUN239 9194,3 0,482 4,7E-02 22,75
Control 0,393
EUN239 9192,3 0,565 2,7E-04 42, 18
EUN239 9192,1 0,447 2,6E-01 ' 12,34
EUN239 9191 ,2 0,449 2,2E-01 13,06
RGR de Longitud de raíces
Nombre del gen Evento # Promedio valor-p % incr.
Control 0,397
EUN240 172,2 0,490 l,2E-02 24,73
Control 0,393
EUN240 9172,1 0,507 l ,4E-02 27,47
Control 0,397
EUN241 9633,4 0,554 8,4E-07 54,27
EUN241 9632,3 0,407 2,8E-01 13,32
EUN241 9632,2 0,466 l ,7E-03 29,87
EUN241 9632,4 0,432 1 ,5E-01 20,52
Control 0,359
EUN242 9212,1 0,429 2,2E-01 13,68
EUN242 9213,4 0,544 4.7E-05 44,09
Control 0,377
EUN242 9212, 1 0,462 ? ,? ?-03 54,42
EUN242 921 1,2 0,403 7,9E-02 34,60
EUN242 9213,4 0,347 2,6E-01 16,09
Control 0,299
EUN245 10643,1 0,351 2,1E-01 12,20
EUN245 10641 ,7 0,414 3,8E-03 32,32
EUN245 10641 ,8 0,434 2,5E-04 38,90
EUN245 10643,4 0,377 2,2E-02 20,56
Control 0,313
EUN246 9033,4 0,504 l ,2E-01 21 ,54
EUN246 9034,1 0,510 1,4E-01 22,94
EUN246 9031 ,1 0,524 5,4E-02 26,35
Control 0,414
ELN250 9134,1 0,433 l ,4E-01 14,91
ELN250 9132,2 0,482 2,4E-02 27,68
Control 0,377
EUN251 10183,1 0,460 6,6E-02 34,46
Control 0,342
EUN251 10181 ,3 0,337 3,8E-01 7,88
EUN251 10183,2 0,485 l,4E-04 55,27
EUN251 10182, 1 0,391 3,4E-02 25,13
EUN2S1 10183, 1 0,323 6,8E-01 3,24
EUN2S1 10181 ,1 0,361 2,5E-01 15,54
Control 0,313
EUN252 901 1 ,3 0,468 6.8E-03 24,03
EUN252 9012,2 0,438 1,2E-01 16,22
EUN252 9013,2 0,458 8,4E-02 21 ,40
Control 0,377
EUN254 8972,4 0,508 2,7E-03 27,22
Control 0,399
EUN256 10063,4 0,507 l ,5E-02 48,06
EUN256 10064,1 0,525 4,0E-03 53,43
EUN2S6 10061 ,2 0,431 1 ,4E-01 26,08
EUN256 10063,2 0,518 6,8E-03 51 ,45
Control 0,342
EUN256 10061,3 0,383 6,3E-02 22,55
EUN256 10061,2 0,368 6.1 E-02 17,75
EUN256 10061 ,4 0,432 3,7E-04 38,10
EUN256 10063,2 0,434 3,8E-05 38,83
Control 0,313
EUN512 9282,3 0,479 5,0E-02 22,43
EUN512 9284,4 0,525 3,4E-03 34,40
Control 0,391
ELN513 9681 ,4 0,489 1 ,7E-01 18,01
EUN513 9683,5 0,518 8,4E-02 24,96
Control 0,414
RGR de Longitud de raíces
Nombre del gen Evento # Promedio valor-p % incr.
EUN513 9681 ,6 0,475 6,5E-02 19,62
Control 0,397
EUN513 9683,5 0,515 8,4E-02 16,54
Control . 0,442
ELN514 9404,1 0,471 2,5E-02 24,98
EUN514 9402,2 0,445 9,9E-02 17,92
EUN514 9404,5 0,493 4,6E-03 30,81
EUN514 9403,2 0,443 4,8E-02 17,37
EUN514 9402,5 0,503 3,8E-03 33,24
Control 0,377
EUN514 9404,1 0,371 3,0E-02 23,82
EUN514 9403,2 0,471 4,9E-05 57,43
ELN514 9402,5 0,442 9,5E-04 47,79
Control 0,299
EUN519 9371 ,2 0,513 1 ,3E-01 29,00
EUN519 9371 ,1 0,555 l,8E-02 39,76
Control 0,397
EUN520 9771 ,4 0,486 2,5E-03 48,07
EUN520 9771 ,7 0,471 ? ,? ?-02 43,62
EUN520 9771 ,2 0,463 9,8E-03 41 ,14
EUN520 9771 ,3 0,463 2,4E-02 41 ,09
Control 0,328
EUN520 9771 ,4 0,476 3,4E-02 39,14
EUN520 9771 ,2 0,478 3,0E-02 39,79
Control 0,342
EUN521 9362,2 0,414 1.2E-02 38,49
EUN521 9361 ,3 0,383 8,8E-03 27,99
EUN521 9363,4 0,456 ? ,??-04 52,49
Control 0,299
EUN523 9412,5 0,410 2.6E-02 36,99
EUN523 9414,2 0,495 ? ,? ?-06 65,32
EUN523 9412,1 0,364 7,6E-02 21 ,51
EUN523 9413,4 0,372 3,3E-02 24,28
Control 0,299
EUN523 9412,5 0,525 1.7E-01 18,63
EUN523 9414,2 0,552 6,9E-03 24,85
Control 0,442
EUN525 9531 ,2 0,465 3,5E-03 29,55
EUN525 9534,1 0,506 5,7E-04 40,93
EUN525 9531 ,1 0,494 4.1 E-03 37,67
Control 0,359
EUN531 10082,2 0,413 1.1 E-01 25,96
EUN531 10081 ,5 0,451 5,6E-02 37,34
Control 0,328
ELN531 10083,3 0,387 8,0E-03 23,90
EUN531 10082,2 0,359 2.2E-01 14,68
EUN531 10081,4 0,366 5.7E-02 17,00
EUN531 10083,2 0,445 5,0E-04 42,20
EUN531 10081,5 0,478 2.9E-05 52,87
Control 0,313
EUN536 9233,3 0,51 1 8.2E-02 23,25
Control 0,414
EUN537 9393,2 0,409 2,5E-03 36,75
EUN537 9393,3 0,415 1.8E-03 38,64
Control 0,299
EUN537 9393,3 0,496 1.4E-02 26,83
Control 0,391
EUN539 10101,5 0,454 9,5E-02 32,65
EUN539 10103,5 0,436 1,2E-01 27,43
RGR de Longitud de raíces
Nombre del gen Evento # Promedio valor-p % incr.
EUN539 10101,7 0,527 4,4E-03 53,99
Control 0,342
EUN539 10101 ,7 0,420 2,4E-03 34,28
Control 0,313
EUN544 9764,2 0,581 9,7E-02 24,20
Control 0,468
ELN548 - 9095,2 0,495 3, l E-02 31 , 12
EUN548 9095,4 0,541 1.3E-03 43,44
EUN548 9091 ,1 0,436 8,2E-02 15,49
Control 0,377
EUN550 9141 ,3 0,469 9,2E-02 27,80
Control 0,367
EUN563 9452,3 0,513 4,5E-03 42,86
Control 0,359
EUN566 9512,1 0,448 7,9E-02 24,77
EUN566 9514,1 0,530 1.3E-05 47,65
Control 0,359
EUN570 9314,4 0,477 6,l E-02 22,12
EUN570 9314,1 0,436 3.3E-01 1 1 ,56
Control 0,391
EUN570 9314,1 0,522 5,4E-02 26,80
Control 0,41 1
EUN574 10363,4 0,384 9,0E-02 22,79
EUN574 10364,2 0,369 3,4E-02 18,18
EUN574 10362,2 0,372 4,OE-02 19,10
EUN574 10366,2 0,505 1.3E-05 61 ,62
EUN574 10366, 1 0,403 1.8E-03 28,75
Control 0,313
EUN583 9673,1 0,337 3.3E-01 7,83
EUN583 9673,4 0,51 1 4,9E-04 63,57
EUN583 9673,2 0,445 1.3E-04 42,20
EUN583 9671.2 0,373 5,7E-02 19,44
EUN583 9671 ,1 0,356 1.3E-01 13,96
Control 0,313
EUN586 9751 ,1 0,466 3.8E-01 12,01
EUN586 9751,7 0,561 1.4E-02 34,87
EUN586 9752,1 0,616 6.6E-04 48,10
Control 0,416
EUN586 9751 ,6 0,578 9,9E-02 23,61
EUN586 9751 ,3 0,544 2.5E-01 16,32
EUN586 9752,4 0,585 6,OE-02 25,16
EUN586 9752,1 0,61 1 3,8E-02 30,58
Control 0,468
EUN593 10394,2 0,446 2.9E-02 35,91
Control 0,328
Tabla 28: Análisis de la tasa de crecimiento de la planta (tasa de crecimiento relativa de longitud de raíz) de las plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los
genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) , bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S), cuando se desarrollan bajo condiciones de nitrógeno limitado [condiciones de baja cantidad de nitrógeno o de nitrógeno deficiente (0.75 mM N) ] comparados con las plantas de control. "Incr." = incremento; "RGR" = tasa de crecimiento relativo .
Los genes presentados en la Tablas 29 y 30, más adelante, tienen una EUN vegetal mejorada ya que produjeron una mayor biomasa vegetal cuando se desarrollaron en condiciones estándar de crecimiento con nitrógeno, comparados con las plantas de control, indicando la elevada capacidad de la planta para metabolizar mejor el nitrógeno presente en el medio.
Las Tablas 29 y 30 ilustran el análisis de biomasa vegetal (peso fresco y seco de la planta y área de hoja) cuando se desarrollan en condiciones estándar de nitrógeno [condiciones de crecimiento normales o regulares (15 mM N) ] en plantas que sobreexpresan los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención, bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S). Se realizó la evalulación de cada gen realizando el ensayo de rendimiento de varios eventos. Algunos, de los genes fueron evaluados con más de un ensayo de cultivo tisular y se repitieron los resultados obtenidos. El evento con valor-p < 0.1 fue considerado estadísticamente significativo.
Tabla 29
Las plantas transgénicas que expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención exhiben una biomasa vegetal mejorada (peso fresco y seco) bajo condiciones estándar de nitrógeno
Peso fresco de la planta ¡mg/ Peso seco de la planta fmg/
Nombre Evento % Nombre Evento valor- Promedio valor-p Promedio % incr. del gen # incr. del gen # P
1 ,0E- CT1 4841 ,1 224,68 5.7E-03 44,54 CT11 4894,3 10,93 57,88
01
2,3E- CT1 4844,3 220,28 1.3E-01 41 ,71 CT11 4892,2 1 1,00 58,84
02
1,6E- Control 155,44 CT11 4892,3 9,35 35,02
01
7,0E- CT11 4892,2 327,13 1.2E-02 41 ,78 CT11 4893,2 7,20 3,97
01
1,0E- CT11 4892,3 321 ,38 4,4E-02 39,29 CT11 4892,1 12,40 79,06
01
Control 230,73 Control 6,93
5,8E- CT11 4893,2 293,83 l ,8E-02 70,30 CT11 4894,2 6,70 8,06
01
5,8E- Control 172,54 CT11 4893,2 12,73 105,24
03
CT22 5023,1 249,48 1.3E-02 60,50 Control 6,20
1,9E- Control 155,44 CT27 5033,6 7,40 79,39
01
9,2E- CT27 5033,6 234,13 1 ,1E-01 148, 18 CT27 5033,8 7,50 81 ,82
02
1 ,9E- CT27 5033,8 192,50 8,4E-03 104,05 CT27 5033,5 5,55 34,55
01
CT27 5033,5 143,73" 3.1E-01 52,35 Control 4, 13
1.5E- Control 94,34 CT27 5033,7 8,23 32,66
01
2,1 E- CT27 5033,7 224,58 1 ,2E-01 30,16 CT27 5035,2 13,10 1 1 1,29
04
8,2E- CT27 5035,2 343,65 2,2E-02 99,17 CT27 5031,4 9,28 49,60
03
2,7E- CT27 5031 ,4 255,88 3.0E-03 48,30 CT27 5033,6 8,15 31 ,45
01
4,7E- Control 172,54 CT27 5033,4 7,95 28,23
02
2,5 E- CT76 5041,7 292,55 5,6E-02 26,80 CT27 5033,8 8,90 43,55
02
2, 1 E- CT76 5043,5 415,05 1.4E-03 79,89 CT27 5033,5 7,63 22,98
01
Control 230,73 Control 6,20
3,2E- CT76 5044,6 239,08 2.1E-03 153,43 CT6 4943,1 7,83 26,21
01
1 ,8E- CT76 5041 ,5 209,10 l,6E-03 121,65 CT6 4945,9 7,63 22,98
01
2,9E- CT76 5043,5 272,60 2,7E-02 188,96 CT6 4941,4 9,28 49,60
02
CT76 5041 ,6 124,75 3,9E-02 32,24 Control 6,20
1 ,2E- CT76 5041 ,9 245,20 7.1E-02 159,92 CT75 4874,4 9,35 50,81
02
Peso fresco de la planta lmg¡ Peso seco de la planta Img/
Nombre Evento % Nombre Evento valor- Promedio valor-p Promedio % incr. del gen # incr. del gen # P
Control 94,34 Control 6,20
1 ,6E- CT81 4992, 1 381 ,73 3,3E-04 65,45 CT76 5044,6 9,40 35,74
01
7,8E- CT81 4992,2 305,85 2.8E-01 32,56 CT76 5043,5 17,23 148,74
06
9.7E- Control 230,73 CT76 5041 ,6 10,03 44,89
02
EUN209 8192,14 217,23 3,8E-02 86,30 Control 6,93
5,8E- Control 1 16,60 CT76 5044,6 7,43 80,00
02
1,0E- EUN210 8202,1 279,53 1 ,1 E-01 139,73 CT76 5041,5 9,70 135,15
04
4,5E- EUN210 8201 ,3 250,90 4.8E-02 1 15,18 CT76 5041,7 5,03 21 ,82
01
1 ,3E- Control 1 16,60 CT76 5043,5 10,88 163,64
02
1 , 1 E- EUN211 8263,5 162,35 5.0E-02 31,43 CT76 5041,9 8,95 1 16,97
02
Control 123,53 Control 4, 13
4,1 E- EUN212 8332,1 253,75 1 ,0E-01 105,42 CT81 4992,1 1 1 ,20 61 ,73
02
3,6E- EUN212 8335,2 169,28 4,9E-02 37,03 CT81 4993,5 8,60 24,19
01
3,4E- Control 123,53 CT81 4992,2 8,63 24,55
01
3,8E- EUN212 8335,2 221,83 2,0E-02 90,24 CT81 4995,5 7,90 14,08
01
EUN212 8331 ,4 163,88 2JE-01 40,54 Control 6,93
7,9E- Control 1 16,60 EUN206 6732,9 13,68 43,38
03
4.3E- EUN212 8332,1 1 16,43 1 ,8E-01 29,34 EUN206 6731,2 14,13 48,19
01
1 ,8E- EUN212 8334,1 128,33 8,lE-02 42,56 EUN206 6732,5 12,98 36,04
02
3,6E- EUN212 8331 ,4 143,63 3,0E-02 59,56 EUN206 6732,2 10,98 15,07
01
Control 90,01 Control 9,54
2.7E- EUN208 8354,8 8,20 78,75
EUN221 9802,8 149,35 3,9E-03 58,7 02
3,3 E- EUN208 8355,3 5,78 25,89
EUN221 9806, 1 209,18 1.7E-08 122,3 01
Control 94,09 Control 4,59
3, 1 E- EUN222 8851 ,3 240,70 6,lE-02 106,43 EUN208 8354,8 6,15 14,42
02
EUN222 8852,4 138,15 3,1E-01 18,48 Control 5,38
1 ,9E- Control 1 16,60 EUN208 8354,8 16,45 72,48
03
2,4E- EUN224 9002,4 279,08 6,lE-02 32,66 EUN208 8354,5 15,58 63,30
03
9,6E- Control 210,36 EUN208 8355,3 12,40 30,01
02
EUN224 9002,4 159,13 2.6E-01 14,58 Control 9,54
1 ,5E- EUN224 9002,2 268,95 3,8E-03 93,66 EUN209 8192,1 7,73 68,39
01
7.1 E- EUN224 9001 ,3 181,65 3,2E-02 30,80 EUN209 8191 ,5 7, 13 55,31
02
Control 138,88 Control 4,59
6,2E- EUN225 24,4 EUN209 8191,5 10,83 162,42
9732,8 1 17,00 2.2E-01 01
Peso fresco de la planta ¡mgl Peso secó de la planta Imgl
Nombre Evento % Nombre Evento valor- Promedio valor-p Promedio % incr. del gen # incr. del gen # P
6,3E- Control 94,09 EUN209 8191,3 15,40
03
EUN227 9853, 1 197,68 9,4E-02 55,51 Control 9,54
1 ,0E- Control 127,1 1 EUN210 8202,1 10,95 138,69
02
5,5E- EUN229 8862,2 75,00 l,2E-02 26,32 ELN210 8201,3 8,98 95,64
02
EUN229 8862,5 74,03 1 ,3E-01 24,67 Control 4,59
2,4E- EUN229 8864,2 84,93 3,9E-02 43,03 ELN210 8202,1 4,28 41 ,91
02
1 , 1 E- Control 59,38 ELN210 8751,4 4,33 43,57
01
2,4E- EUN230 9154,2 171 ,38 4,4E-01 23,40 EUN210 6755,3 3,85 27,80
01
2,1 E- EUN230 9151 ,2 203,78 3,lE-02 46,73 EUN210 8201,2 3,93 30,29
01
Control 138,88 Control 3,01
10633,3 199,70 l ,6E-07 8,8E- EUN231 112,2 ELN211 8265,1 7,38 60,76
02
Control 94,09 Control 4,59
7,3 E- EUN233 10174,3 139,08 9,0E-02 44,46 EUN212 8335,2 9,53 107,63
02
EUN233 10174,1 190,05 5,5E-04 97,40 Control 4,59
7,4E- EUN233 10173,7 143,98 3.5E-03 49,55 F.UN212 8334, 1 4,20 39,42
02
5,7E- Control 96,28 EUN212 8331,4 5,08 68,46
02
EUN235 9694,2 171,15 1 ,0E-01 23,24 Control 3,01
EUN221 9802,8, 7,50 2,5E- 56,3
EUN235 9691 ,1 172,20 7,8E-02 24,00
03
EUN221 9806,1, 9,08 3,5E- 89,1
EÜN235 9693,3 194,48 5,4E-02 40,04
06
Control 138,88 Control 4,80
4,2E- EUN237 9651 ,1 293,05 3,8E-02 1 1 1,02 ELN222 8851,3 1 1 ,60 152,86
02
EUN237 9652,3 167,10 1 , 1E-01 20,32 Control 4,59
5,4E- EUN237 9654,4 195,80 1.4E-01 40,99 EUN224 9002,2 10,13 83,67
02
1 , 1E- Control 138,88 EUN224 9001,3 7,03 27,44
01
EUN237 9651 , 1 191,70 1.8E-02 26,32 Control 5,51
1 ,4E- Control 151,76 EUN227 9851,2 5,88 24,34
01
4,0E- EUN239 9192,1 245,53 3,6E-02 56,82 EUN227 9853,1 8,88 87,83
02
Control 156,56 Control 4,73
2,0E- EUN240 9172,1 212,68 7,3E-02 35,84 EUN228 10092 7,90 45,29
01
8,6E- EUN240 9174,3 255,50 2.6E-01 ELN228 10093 7,98 46,67
02
5,3E- Control 156,56 EUN228 10093 6,68 22,76
03
EUN241 9631 ,3 166,03 6,6E-02 30,61 Control 5,44
4,1 E- EUN241 9632,5 185,58 l ,4E-02 45,99 EUN229 8862,2 3,90 30,54
02
2,7E- EUN241 9632,4 219,43 8,4E-03 72,62 EUN229 8862,5 3,80 27,20
01
2,9E- Control 127,1 1 ELN229 8864,2 4,45 48,95
02
Peso fresco de la planta ¡mg¡ Peso seco de ta planta ¡mgj
Nombre Evento % Nombre Evento valor- Promedio valor-p % incr. del gen # incr. del gen # Promedio
P
EUN242 9212,1 140,78 3,9E-02 59,41 Control 2,99
1 ,0E- EUN242 9214,1 129,18 1,5E-01 46,27 EUN230 9154,2 7,38 33,79
01
5,8E- ELN242 9213,2 101 ,43 3,7E-01 14,85 EUN230 9151,2 7,48 35,60
02
EUN242 9213,4 146,30 3.0E-02 65,66 Control 5,51
EUN231 10632,2 5,53 4, 1 E- 15,1
Control 88,31
01
ELN231 10633,3 1 1,43 2,0E- 138,0
EUN244 9061,1 164,20 8,9E-04 45,23
1 1
EUN244 9061,5 143,40 4,8E-01 26,83 Control 4,80
1 ,2E- Control 1 13,06 EUN233 10174 6, 13 58,58
02
2, 1 E- EUN246 9033,6 273,05 8,9E-03 43,57 ELN233 10174 8,63 123,30
04
8,2E- EUN246 9033,4 241,48 4,8E-01 26,97 ELN233 10174 5,10 32,04
02
EUN246 9034,1 224,08 2,5E-01 17,82 Control 3,86
8,7E- EUN246 9031 ,1 232,65 3,3E-01 22,33 EUN234 9163,5 4,28 43,10
02
1 ,3E- Control 190,19 EUN234 9162,1 4,60 53,97
01
EUN246 9034,1 160,45 l,8E-02 41 ,91 Control 2,99
2,2E- Control 1 13,06 EUN235 9694,2 7,35 33,33
01
1 ,4E- EUN246 9033,4 185,78 4,3E-01 16,45 EUN235 9691,1 7,90 43,31
01
6,2E- EUN246 9033,8 205,95 1,8E-01 29,09 ELN235 9693,3 6,98 26,53
02
EUN246 9034,1 228,95 2,4E-03 43,51 Control 5,51
2,9E- Control 159,54 EUN237 9651, 1 10,20 85,03
02
6,3E- EUN248 8982,4 275,80 2,2E-02 45,01 ELN237 9652,3 6,68 21,09
02
1 , 1 E- EUN248 8981 ,5 343,28 ?,??-02 80,49 EUN237 9654,4 8,25 49,66
02
EUN248 8984,1 294,45 1.5E-01 54,82 Control 5,51
4,0E- EUN248 8981 ,2 245,25 1.1E-01 28,95 ELN237 9651,1 6,98 26,53
02
Control 190,19 Control 5,51
7,6E- EUN248 8982,4 1 18,75 1 ,6E-01 37,56 EUN239 9191,2 8,80 19,32
02
EUN248 8984,1 124,38 2,5E-02 44,08 Control 7,38
8,5 E- EUN248 8981 ,5 140,05 4.8E-02 62,24 EUN241 9631,3 6,43 35,98
02
2,8E- EUN248 8983,1 1 14,05 3.2E-01 32, 12 EUN241 9632,5 8,33 76,19
04
1 ,6E- Control 86,33 EUN241 9632,3 6,55 38,62
02
1 ,0E- EUN249 9122,5 145,73 4,6E-02 68,82 ELN241 9632,4 8,03 70,02
04
EUN249 9121 ,4 1 12,83 3,6E-01 30,71 Control 4,73
6,3 E- EUN249 9123,3 107,98 2,1E-01 25,08 ELN244 9061,1 5,65 34,52
02
6,7E- Control 86,33 EUN244 9061,5 5,88 39,88
02
EUN250 9133,2 182,70 4,3E-02 31 ,56 Control 4,20
2,9E- EUN250 9134,1 216,85 2,5E-02 56,15 EUN246 9033,6 8,98 28,90
02
Peso fresco de la planta ¡mg¡ Peso seco de la planta ¡mg¡
Nombre Evento % Nombre Evento valor- Promedio valor-p Promedio % incr. del gen # incr. del gen # P
3, 1 E- Control 138,88 EUN246 9033,4 8,28 18,85
01
EUN251 10181,3 143,00 4,0E-02 48,53 Control 6,96
7,3E- EUN251 10183,2 146,38 2,4E-02 52,04 EUN246 9034,1 5,60 33,33
02
EUN251 10183,1 128,05 3,6E-01 33,00 Control 4,20
1 ,7E- Control 96,28 EUN246 9033,4 6,28 18,40
01
5,2E- EUN254 8972,2 173,28 8,8E-02 100,72 EUN246 9033,8 8,63 62,74
04
2,5E- EUN254 8974,1 130,38 4,l E-02 51 ,03 ELN246 9034,1 8,35 57,55
04
Control 86,33 Control 5,30
2,2E- EUN256 10063,4 132,65 l ,4E-02 37,78 EUN248 8982,4 9,88 41 ,83
02
1 ,3E- EUN256 10064,1 212,63 1.5E-04 120,85 ELN248 8981,5 1 1 ,78 69, 12
01 l ,4E- EUN256 10061,2 151,98 1 ,2E-01 57,86 EUN248 8984,1 10,25 47,22
01
6,5 E- EUN256 10062,4 152,75 1 ,5E-01 58,66 EUN248 8981,2 7,55 8,44
01
EUN256 10063,2 162,50 2.1 E-01 68,79 Control 6,96
l ,2E- Control 96,28 EUN248 8984,1 7,15 43,00
01 l ,9E- EUN267 8962,1 185,23 1.6E-02 63,83 EUN248 8981,5 8,65 73,00
02
Control 1 13,06 Control 5,00
l ,3E- EUN268 8994,5 228,80 8.7E-02 64,46 EUN250 9134,3 8,48 49,67
02
EUN268 8992, 1 204,08 2,2E-01 46,69 Control 5,66
1 ,5E- EUN268 8996,5 146,34 7,6E-02 5,19 ELN250 9132,1 1 1 ,18 102,72
01
2,6E- Control 139,13 EUN250 9133,2 7,88 42,86
02
3,2E- EUN269 9101,1 95,83 l ,4E-02 79,28 EUN250 9132,2 8,55 55,10
02
4,5E- EUN269 9102,2 89,05 7,7E-05 66,60 EUN250 9134,1 8,88 61 ,00
02
EUN269 9102,3 1 17,90 6,5E-02 120,58 Control 5,51
i,8E- EUN269 9103,1 83,60 7,0E-02 56,41 ELN250 9134,1 3,53 17,99
01
7,2E- EUN269 9103,3 82,45 1 ,6E-02 54,26 EUN250 9131,2 4,38 46,44
02
Control 53,45 Control 2,99
4,9E- EUN512 9284,2 94,55 9,0E-O2 20,60 EUN251 10181 5,98 54,69
02
3,6E- EUN512 9284,3 92,98 4.2E-01 18,59 EUN251 10183 6,63 71 ,52
03
EUN512 9283,1 91 ,30 8.6E-02 16,45 Control 3,86
2, 1 E- EUN512 9282,3 92,85 5.7E-02 18,43 EUN254 8972,2 6,43 52,98
02
EUN512 9281 ,3 105,50 2.1 E-01 34,57 Control 4,20
3,3E- Control 78,40 EUN254 8972,2 9,28 85,50
02
EUN514 9404,1 158,73 3.8E-02 79,73 Control 5,00
1 ,7E- Control 88,31 EUN256 10063 6,10 57,93
03
EUN515 2,9E- EUN256 10064 9,55 147,25
9712,5 104,98 5.6E-01 1 1 ,6 07
Peso fresco de la planta /mg/ Peso seco de la planta fmg/
Nombre Evento % Nombre Evento valor- Promedio valor-p Promedio % incr. del gen # incr. del gen # P
EUN515 5,2E- EUN256 10061 6,30 63,1 1
9713,6 185,55 4,0E-06 97,2 02
1.1 E- Control 94,09 EUN256 10062 7,65 98,06
01
4,9E- EUN516 9291 ,1 230,00 8,3E-02 65,62 EUN256 10063 6,33 63,75
03
EUN516 9291 ,4 227,13 5,7E-02 63,55 Control 3,86
5,0E- Control 138,88 EUN267 8962,1 6,43 52,98
03
EUN520 9771 ,4 137,73 5,8E-02 43,05 Control 4,20
8,4E- EUN520 9771,7 160,25 3,5E-03 66,45 ELN268 8994,5 7,18 59,44
02
1,9E- EUN520 9771 ,2 158,98 1.3E-02 65,13 EUN268 8996,3 6,85 52,22
02
2,8E- EUN520 9771 ,3 148,40 6,5E-02 54,14 EUN268 8996,5 7,00 55,56
03
Control 96,28 Control 4,50
1 ,6E- EUN521 9361 ,2 167,53 7,3E-05 89,70 EUN512 9284,2 4,20 46,72
02
l ,7E- EUN521 9363,4 180,95 7,6E-03 104,90 EUN512 9284,3 3,58 24,89
01
1 ,8E- Control 88,31 EUN512 9283,1 4,35 51 ,97
02
2,6E- EUN523 9412,1 271 ,35 1 ,0E-01 42,67 EUN512 9282,3 4,18 45,85
02
1,9E- Control 190,19 EUN512 9281,3 4,93 72,05
02
EUN523 9413,3 184,25 7,3E-02 28,51 Control 2,86
2,3E- EUN523 9413,4 180,55 2,2E-01 25,93 EUN512 9284,2 6,00 53,35
03
Control 143,37 Control 3,91
6,3E- EUN527 9202,6 152,18 6, 1E-01 9,38 EUN514 9404, 1 7,90 61 ,64
02
EUIN527 9203,2 249,95 7,5E-02 79,66 Control 4,89
1,0E- EUN527 9201 ,2 273,53 4,2E-04 96,60 EUN51S
9713,6 8,38 04 74,5
Control 139,13 Control 4,80
1 ,4E- EUN527 9204,2 101,70 l ,3E-02 90,27 EUN519 9371,1 12,15 64,75
01
3,5E- EUN527 9202,6 82,40 3,4E-02 54,16 EUN519 9371,2 14,15 91 ,86
01
2.4E- EUN527 9201,1 120,30 3.6E-03 125,07 EUN519 9373,1 9,20 24,75
01
EUN527 9203,2 84,63 2,6E-03 58,33 Control 7,38
1,5E- EUN527 9204,1 68,55 1 ,2E-01 28,25 EUN520 9771,4 5,73 48,22
01
5,4E- Control 53,45 EUN520 9771,7 6,60 70,87
02
7,6E- EUN532 9222,4 210,65 3,5E-01 51 ,41 ELN520 9771 ,2 8,05 108,41
03
2,9E- EUN532 9222,1 168,45 8,4E-02 21 ,08 ELN520 9771,3 5,73 48,22
02
EUN532 9223,5 210,15 7,6E-02 51,05 Control 3,86
6,0E- Control 139,13 EUN523 9412,1 9,03 29,62
02
EUN535 9081 ,1 1 17,15 3,0E-01 21 ,68 Control 6,96
7,7E- EUN535 9083,1 235,35 7,7E-02 144,46 EUN527 9201,2 8,78 95,00
02
EUN535 9084,4 128,88 5,4E-02 33,86 1 Control 4,50
Peso fresco de la planta ¡mg¡ Peso seco de la planta ¡mgj
Nombre Evento % Nombre Evento valor- Promedio valor-p Promedio % incr. del gen # incr. del gen # P
1 ,2E- EUN535 9082,1 1 14,83 3, 1 E-01 19,27 EUN531 10083 7,05 29,66
01
7,5 E- Control 96,28 ELN531 10082 8,90 63,68
02
2,4E- EUN535 9082,2 85,55 5,9E-03 60,06 EUN531 10081 8,60 58,16
01
1.6E- EUN535 9086,2 120,63 l ,3E-02 125,68 EUN531 10082 9,43 73,33
02
EUN535 9086,3 86,67 1.2E-01 62,15 Control 5.44
4,2E- EUN535 9081 ,1 90,65 4,3E-03 69,60 ELN531 10081 8,48 32,13
02 l ,2E- EUN535 9084,4 69,83 2.2E-02 30,64 EUN531 10082 8,95 39,53
01
Control 53,45 Control 6,41
1 ,4E- EUN537 9393,3 207,43 6,7E-02 30,28 EUN532 9222,4 8,28 83,89
01
8.4E- Control 159,21 ELNS32 9222,1 6,53 45,00
02
7,5 E- EUN538 9782,1 203,68 4,0E-02 60,23 EL.NS32 9223,3 6,08 35,00
02
1 ,8E- Control 127,1 1 EUN532 9223,5 6,70 48,89
01
EUN539 10101 ,5 146,60 3,7E-03 52,27 Control 4,50
5,6E- EUN539 10103,5 126,33 7,8E-02 31 ,21 EUN53S 9083,1 10,90 182,20
02
EUN539 10101 ,2 190,80 5,0E-03 98,18 Control 3,86
9.9E- EUM539 10101,7 173,78 2,0E-04 80,50 EUN537 9391,1 6,48 65,50
02
2,9E- Control 96,28 EUN537 9393,3 5,53 41 ,21
01
EUN542 9332,1 196,48 3,3E-02 41 ,48 Control 3,91
2,8E- Control 138,88 EUN538 9782,1 8,30 75,66
05
EUN544 9763,3 169,78 8,8E-02 26,31 Control 4,73
1 ,4E- Control 134,41 EUN539 10102 6.83 76,70
03
2,0E- EUN549 9343,6 200,95 9,7E-02 32,41 EUN539 10101 9,15 136,89
02
1 ,6E- EUN549 9343,7 205,95 2,8E-01 35,71 EUN539 10102 7,80 101,94
02
Control 151 ,76 Control 3,86
7,1 E- EUN550 9144,4 128,13 5.6E-03 139,71 EÜN543 10052 5,90 24,87
02
EUN550 9141 ,3 1 16,60 5,0E-07 1 18,15 Control 4,73
1 , 1 E- EUN550 9143,1 124,23 l ,9E-02 132,41 EUN544 9764,2 8,25 53,49
01
2,7E- EUN550 9143,4 98,70 5.2E-02 84,66 ELN544 9763,3 8,25 53,49
02
Control 53,45 Control 5,38
7,6E- EUN550 9143, 1 197,68 2,6E-01 42,08 EUN548 9095,2 7,50 32,45
02
1 ,7E- EUN550 9143,4 174,85 l ,4E-01 25,68 EUN548 9095,4 8, 18 44,37
01
2,1 E- EUN550 9142,2 240,83 7,2E-05 73,10 EUN548 9091,1 7,68 35,54
01
Control 139,13 Control 5,66
2,7E- EUN553 9181 ,5 76,85 l ,9E-03 43,78 EUN548 9095,2 10,17 71 ,23
02
Peso fresco de la planta ¡mgl Peso seco de la planta [mgl
Nombre Evento % Nombre Evento valor- Promedio valor-p Promedio % incr. del gen # incr. del gen # P
8,9E- EUN553 9185,2 74,85 2.4E-01 40,04 EUN548 9092,2 8, 15 37,26
02
EUN553 9184,3 61 ,65 5,6E-01 15,34 Control 5,94
6,9E- EUN553 9182,2 72,28 1 ,3E-01 35,22 EUN549 9343,7 7,25 31 ,52
02
Control 53,45 Control 5,51
3.0E- EUN554 91 1 1 ,4 135,30 6,7E-02 153,13 EUN550 9141,3 5,80 28,89
01
8,3 E- Control 53,45 EUN550 9143,4 5,73 27,22
03
1 ,6E- EUN563 9453,2 270,58 1 ,2E-01 53,26 EUN550 9142,2 8,08 79,44
02
EUN563 9452,3 207,35 4,2E-01 17,45 Control 4,50
4,5 E- EUN563 9451 ,2 273,50 4,7E-02 54,91 EUN554 91 15,2 6,40 42,22
02
Control 176,55 Control 4,50
1.7E- EUN564 9242,3 1 13,35 4,7E-02 44,58 EUN560 9424,3 8,85 65,64
03
4,7E- EÜN564 9242,4 90,95 8,5E-02 16,01 EUN560 9422,1 6,88 28,68
02
EUN564 9244,1 94,08 l ,3E-02 19,99 Control 5,34
3,0E- Control 78,40 EUN562 9252,8 8,43 57,69
02
EUN566 9512,4 257,28 l ,4E-02 45,72 Control 5,34
6.3E- Control 176,55 EUN567 9261,3 4,10 43,23
02
EUN567 9263,2 130,00 7,3E-03 65,82 Control 2,86
1 ,8E- EUN567 9261 ,3 93,50 8.4E-02 19,26 EUN568 9471,3 7,63 38,32
02
EUN567 9261,4 1 12,75 2,2E-02 43,81 Control 5,51
1.7E- EUN567 9263,3 84,55 5,9E-01 7,84 EUN569 9381,2 4,40 53,71
02
9,0E- Control 78,40 EUN569 9381,5 4,90 71 ,18
02
2,4E- EUN568 9471,3 230,43 4.1 E-02 51,83 EUN569 9381,3 4,73 65,07
03
EUN568 9461 ,2 186,87 2,5E-01 23, 13 Control 2,86
1,4E- EUN568 9474,4 187,77 2,0E-01 23,72 EUN570 93 1 1,4 3,63 26,64
01
4,3 E- ELN568 9472,2 195,70 3.0E-01 28,95 ELN570 9313,3 4,33 51,09
02
8,5E- EUN568 9462,3 172,65 5, 1 E-01 13,76 EUN570 9314,4 4,78 66,81
03
3,0E- Control 151,76 EUN570 9314,1 4,33 51 ,09
02
4,2 E- EUN569 9384,4 90,90 2,1 E-01 15,94 EUN570 9312,3 5,23 82,53
04
EUN569 9381 ,2 124,28 7,9E-03 58,51 Control 2,86
5,6E- EUN569 9381,5 130,40 4,3E-02 66,33 EUN571 9304,2 8,98 67,98
02
2,3 E- EUN569 9381,3 99,18 1 JE-01 26,50 EUN571 9303,2 8,63 61 ,43
03
6,3 E- EUNS69 9384,2 99,08 9,4E-02 26,37 EUN571 9301,4 7,13 33,36
02
Control 78,40 Control 5,34
2,4E- EUN570 9313,3 1 10,70 1.2E-01 41 ,20 EUN571 9304,3 6,50 127,07
04
2,8E- EUN570 9314,4 1 19,08 l ,2E-02 51 ,88 EUN571 9304,2 6,05 1 1 1 ,35
02
Peso fresco de la planta ¡mgl Peso seco de la planta ¡mg/
Nombre Evento % Nombre Evento valor- Promedio valor-p Promedio % incr. del gen # incr. del gen # P
4,2E- EUN570 9314,1 109,93 8,7E-03 40,21 EUN571 9303,2 4,98 73,80
03
4, 1 E- EUN570 9312,3 149,30 8,0E-03 90,43 EUN571 9301,4 4,13 44, 10
02
3,4E- Control 78,40 EUN571 9302,3 4,03 40,61
02
EUN571 9304,2 212,53 1 , 1 E-01 48,23 Control 2,86
9,0E- EUN571 9303,2 240,93 3,8E-02 68,04 EUN572 9321,3 4,95 72,93
02
2,4E- EUN571 9302,1 177,58 4.0E-01 23,86 EUN572 9324,3 4,55 58,95
02
4,7E- EUN571 9301 ,4 209,80 1.0E-01 46,33 EUN572 9321,1 4,80 67,69
03
1 ,5E- EUN571 9302,3 199,13 2,6E-01 38,89 EUN572 9322,2 4,35 51 ,97
02
Control 143,37 Control 2,86
1.8E- EUN571 9304',3 124,43 1.2E-02 58,71 EUN573 9491,4 7,28 31 ,97
03
EUN571 9304,2 123,90 4,5E-02 58,04 Control 5,51
7,1 E- EUN571 9303,2 106,00 l ,7E-02 35,20 EUN576 9793,3 8,03 69,84
04
Control 78,40 Control 4,73
9,3 E- EUN572 9322,1 124,90 3,5E-02 59,31
EUN581 9723,6 6,28 02 30,7
2,0E- EUN572 9324,3 1 15,85 2.7E-03 47,77
EUN581 9724,9 8, 15 04 69,8
EUN572 9321 ,1 101,00 3,lE-02 28,83 Control 4,80
2,6E- EUN572 9322,2 98,05 1.1E-02 25,06 EUN582 9561,1 6,90 25,17
01
3,3 E- Control 78,40 EUN582 9562,4 7,88 42,86
02
3,0E- EUN573 9491 ,1 226,63 4,7E-02 49,33 EUN582 9561,2 8,95 62,36
02
Control 151,76 Control 5,51
6,2E- EUN583 9673,4 1 1,28 75,78
EUN581 9723,6 125,85 9,7E-02 33,8 02
4,3 E- EUN583 9673,2 7,70 20,04
EUN581 9724,5 99,23 7.8E-01 5,5 01
EUN581 9724,9 165,35 2,0E-04 75,7 Control 6,41
7,5 E- Control 94,09 EUN585 9661,1 6,95 31 , 13
02
EUN582 9564,2 189,45 1.4E-01 36,42 Control 5,30
3,2E- EUN582 9561,1 186,30 1.5E-01 34,15 EUN587 9643,2 10,20 85,03
02
1 ,8E- EUN582 9562,4 209,48 7.3E-02 50,84 EUN587 9641,3 8,23 49,21
01
EUN582 9561 ,2 244,25 9,8E-02 75,88 Control 5,51
rol 138,88 1 ,0E- Cont
EUN592 9744,5 9,80 07 104,2
2,0E- EUN583 9673,4 222,13 4,7E-02 54,28
EUN592 9747,5 8,23 04 71 ,4
Control 143,97 Control 4,80
EUN585 9661 ,5 198,18 6,9E-02 24,22
EUN585 9661 ,1 194,93 2,6E-01 22,18
Control 159,54
EUN587 9643,2 242,53 4.2E-02 53,46
EUN587 9643,1 221,50 1.9E-01 40,16
EUN587 9642,5 169,73 7,0E-01 7,40
EUN587 9642,2 192,08 4.1 E-01 21 ,54
Peso fresco de la planta ¡mgl Peso seco de la planta /mg/
Nombre Evento % Nombre Evento valor- Promedio valor-p Promedio % incr. del gen # incr. del gen # P
EUN587 9641 ,3 268,95 3,5E-04 70,18
Control 158,04
EUN592 9741 ,7 1 15,18 2.6E-01 22,4
EUN592 9744,5 197,68 2,6E-07 1 10,1
EUN592 9747,4 1 18,53 1.9E-01 26,0
EUN592 9747,5 169,38 l ,0E-04 80,0
Control 94,09
Tabla 29: Análisis de biomasa vegetal (peso fresco y seco de la planta) de plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S), cuando se desarrollan en condiciones estándar de nitrógeno [condiciones de crecimiento normales o regulares (15 mM N) ] comparados con las plantas de control. "Incr." = incremento; "RGR" = tasa de crecimiento relativo.
Tabla 30
Las plantas transgénicas gue expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención exhiben una biomasa vegetal mejorada (área de hoja) bajo condiciones estándar de nitrógeno
Tabla 30: Análisis de biomasa vegetal (área de hoja) de plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) , bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S), cuando se desarrollan en condiciones estándar de nitrógeno [condiciones de crecimiento normales o regulares (15
mM N) ] comparados con las plantas de control. "Incr." = incremento; "RGR" = tasa de crecimiento relativo.
Los genes presentados en la Tabla 31 más adelante, tienen una EUN vegetal mejorada ya que produjeron una biomasa mayor de raíz cuando se desarrollaron en condiciones estándar de crecimiento con nitrógeno, comparados con las plantas de control. Las plantas que producen una biomasa mayor de raíz tienen mejores posibilidades de absorber una mayor cantidad de nitrógeno del suelo.
La Tabla 31 muestra los análisis del rendimiento de raíz (longitud y cobertura de raíz) cuando se desarrollan en condiciones estándar de nitrógeno [condiciones de crecimiento normales o regulares (15 mM N) ] en plantas que sobreexpresan los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S) . Se realizó la evalulación de cada gen realizando el ensayo de rendimiento de varios eventos. Algunos de los genes fueron evaluados con más de un ensayo de cultivo tisular y se repitieron los resultados obtenidos. El evento con valor-p < 0.1 fue considerado estadísticamente significativo.
Tabla 31
Las plantas transgénicas que expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención exhiben un rendimiento mejorado de raíz (longitud y cobertura de raíz) bajo condiciones estándar de nitrógeno
I I I Longitud de raíces fcm/ \ Cobertura de raices /cm1/ \
Tabla 31: Análisis del rendimiento de raíz (longitud y cobertura de raíz) de las plantas transgénicas gue sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) , bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S), cuando se desarrollan en condiciones estándar de nitrógeno [condiciones de crecimiento normales o regulares (15 mM N) ] comparados con las plantas de control. "Incr." = incremento; "RGR" = tasa de crecimiento relativo.
Los genes presentados en la Tabla 32, más adelante, tienen una mejorada tasa de crecimiento vegetal cuando se desarrollan en condiciones estándar de crecimiento con nitrógeno, comparados con las plantas de control. Se observó un crecimiento más rápido cuando se midieron la tasa de crecimiento del área de hoja y longitud y cobertura de raíz.
La Tabla 32 ilustra el análisis de área de hoja, longitud y cobertura de raiz tasa de crecimiento cuando se desarrollan en condiciones estándar de nitrógeno [condiciones de crecimiento normales o regulares (15 mM N) ] en plantas que sobreexpresan los polinucleotidos de algunas realizaciones de la invención bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S) . Se realizó la evalulación de cada gen realizando el ensayo de rendimiento de varios eventos. Algunos de los genes fueron evaluados con más de un ensayo de cultivo tisular y se repitieron los resultados obtenidos. El evento con valor-p < 0.1 fue considerado estadísticamente significativo.
Tabla 32
Las plantas transgénicas que expresan exógenamente los polinucleotidos de algunas realizaciones de la invención exhiben una tasa de crecimiento mejorada bajo condiciones estándar de nitrógeno
Tabla 32: Análisis de la tasa de crecimiento de la planta (área de hoja, cobertura de raíz y longitud de raiz) de las plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) , bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S), ' cuando se desarrollan en condiciones estándar de nitrógeno [condiciones de crecimiento normales o regulares (15 mM N) ] comparados con las plantas de control. "Incr." = incremento; "RGR" = tasa de crecimiento relativo; " Prom." = promedio .
EJEMPLO 6
ENSAYO 2: EFICACIA EN EL USO DE NITRÓGENO: RENDIMIENTO Y TASA DE CRECIMIENTO DE LA PLANTA A UNA CONCENTRACIÓN DE NITRÓGENO LIMITADA Y ÓPTIMA EN CONDICIONES DE INVERNADERO
Este ensayo sigue al de producción del rendimiento de semilla, formación de biomasa y crecimiento del área de roseta
de plantas desarrolladas en invernadero, en condiciones de fertilización estándar deficientes de nitrógeno. Se sembraron las semillas en un medio de agar suplementado con un medio ½ S y un agente de selección (canamicina) . Las plántulas T2 transgénicas luego se transplantaron a bandejas 1,7 rellenadas con turba y perlita. Se irrigaron las bandejas con una solución que contenia condiciciones constantes de nitrógeno limitado, logradas irrigando las plantas con una solución que contiene 1,5 mM de nitrógeno inorgánico en la forma de KN03, suplementadas con 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 3,6 mM K2S04, 2 mM CaC12 y microelementos , logrando niveles normales de nitrógeno aplicando una solución de 6 mM de nitrógeno inorgánico también en la forma de KN03 con 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 2 mM CaC12 y microelementos. Todas las plantas se desarrollaron en invernadero hasta obtener semillas maduras. Se cosecharon las semillas separadametne con respecto al tejido bajo tierra anterior, se extrajeron y pesaron. La biomasa de la planta (tejido bajo suelo anterior) también fue recolectada y secada durante 1 semana a 30 °C.
Se validó cada constructo según la generación de T2. Las plantas transgénicas transformadas con un constructo conformadas mediante un vector vacio que porta al promotor 35S y al marcador seleccionable , fueron usadas como controles.
Se analizaron las plantas según su tamaño total, tasa de crecimiento, rendimiento de semilla, peso de 1.000 semillas,
materia seca e índice de cosecha (HI- rendimiento de semilla/materia seca) . Se compararon el rendimiento de las plantas transgénicas con las plantas de control desarrolladas en paralelo en las mismas condiciones.
Se planeó el experimento en una distribución de parcelas aleatorias anidadas. Para cada gen de la invención, se analizaron de tres a cinco eventos de transformación independientes para cada constructo.
Captura de imágenes digitales - Para capturar imágenes de las muestras de las muestras de plantas, se utilizó un sistema de adquisición de imágenes de laboratorio que consiste en una cámara réflex digital (Canon EOS 300D) , con una lente de longitud focal 55 mm (Cannon serie EF-S) , montada en un dispositivo de reproducción (Kaiser RS) , que incluía 4 unidades de luz (bombilla de luz 4x150 Vatios) y ubicada en un cuarto oscuro .
El proceso de captura de imágenes se repitió cada dos días comenzando en el día 7 hasta el día 15. Se utilizó para capturar imágenes de plantas más grandes sembradas en tubos blancos en un invernadero con ambiente controlado, la misma cámara colocada en un soporte de hierro habitual. Los tubos blancos tenían forma cuadrada, medían 36 x 26,2 cm y 7,5 de profundidad. Durante el proceso de captura, se colocaron las bandejas debajo del soporte de hierro, evitando la luz directa del sol y la proyección de sombras.
Se utilizó un sistema de análisis de imágenes que consistía en una computadora personal de escritorio (procesador Intel P4 3.0) y un programa de dominio público - ImageJ 1.37 (programa de procesamiento de imágenes basado en Java que fue desarrollado en el U.S National Institutes of Health y de distribución libre por Internet en Hypertext Transfer Protocol : //rsbweb (punto) nih (punto) gov/) . Se capturaron las imágenes en una resolución de 10 Mega Pixeles (3.888 x 2.592 pixeles) y se almacenó en un formato JPEG de baja compresión (estándar Joint Photographic Experts Group) . Luego se guardaron los datos analizados en archivos de texto y se procesaron usando el software para análisis estadístico JMP (SAS Institute) .
Análisis de crecimiento de hoja - Usando los datos del análisis digital se calcularon los datos de hojas, incluyendo cantidad de hojas, área de roseta, diámetro de roseta, área de corte de hoja, cobertura de parcela, longitud de pecíolo de hoj a .
Tasa vegetativa de crecimiento: es la tasa de crecimiento de la planta tal como se define mediante las fórmulas VIII, IX, X y XI
Fórmula VIII:
Tasa de crecimiento relativa del área de corte de hoja = Coeficiente de regresión del área de hoja con el transcurso del tiempo.
Fórmula IX:
Tasa de crecimiento relativa del área de roseta = Coeficiente de regresión del área de roseta con el transcurso del tiempo.
Fórmula X
Tasa de crecimiento relativa del diámetro de roseta = Coeficiente de regresión del diámetro de roseta con el transcurso del tiempo.
Fórmula XI
Tasa de crecimiento relativa de cobertura de parcela = Coeficiente de regresión de cobertura de parcela con el transcurso del tiempo.
Peso promedio de semillas (peso de semilla o peso de 1000 semillas) - Al final del experimento, se recolectaron todas las semillas. Se diseminaron las semillas sobre una bandeja de vidrio y se tomó una foto. Usando el análisis digital, se calculó la cantidad de semillas de cada muestra.
Peso seco de la planta y rendimiento de semilla Alrededor del día 80 desde la siembra, se cosecharon las plantas y se dejaron secar a 30 DC en una cámara de secado. Se midió la biomasa y el peso de semilla de cada parcela y se dividió por la cantidad de plantas de cada parcela.
Peso seco = peso total de la porción vegetativa anterior en suelo (excluyendo las raices) después de secar a 30 DC en una cámara de secado;
Rendimiento de semilla por planta = peso total de semilla por planta (gramos) .
Se puede calcular el índice de cosecha usando la Fórmula III (como se describió anteriormente; índice de cosecha = Promedio rendimiento de semilla por planta/ peso seco promedio) .
Análisis estadístico - Para identificar los genes que confieren una significat ivmente mejorada eficacia en el uso de nitrógeno y producción de rendimiento, se analizaron los resultados obtenidos de las plantas transgénicas comparados con los obtenidos de las plantas de control. Para identificar los genes y constructos destacados en su comportamiento, se ensayaron separadamente los eventos de transformación independientes. Los datos se analizaron mediante la prueba T de Student y se consideraron como datos significativos si el valor p era inferior a 0,1. Se utilizó el paquete de software estadístico JMP (Versión 5.2.1, SAS Institute Inc., Cary, NC, Estados Unidos) .
Resultados experimentales:
Los genes presentados en las Tablas 33, 34 y 35, más adelante, tienen una EUN vegetal mejorada cuando se desarrollan con niveles de concentración de nitrógeno limitados. Estos genes producen un mayor rendimiento de semilla, índice de cosecha, peso de semilla (expresado como peso de 1.000 semillas) y biomasa de la planta [expresado como peso seco de
la planta (DW)] cuando se los desarrolló bajo condiciones de crecimiento con nitrógeno limitado, comparados con los de control.
Las Tablas 33, 34 y 35 ilustran los análisis de rendimiento de semilla, índice de cosecha, tamaño de semilla (expresado como peso de 1.000 semillas) cuando se desarrollan bajo condiciones de nitrógeno limitado en plantas que sobreexpresan los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención, bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S) . Se realizó la evalulación de cada gen realizando el ensayo de rendimiento de varios eventos. Algunos de los genes fueron evaluados con más de un ensayo de cultivo tisular y se repitieron los resultados obtenidos. El evento con valor-p < 0,1 fue considerado estadísticamente significativo.
Tabla 33
Las plantas transgénicas que expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención exhiben un mejorado rendimiento de semilla y peso (expresado como peso de 1.000 semillas) en condiciones de crecimiento deficientes de nitrógeno
Nombre Rendimiento de semilla Nombre Evento Peso de semillas
Evento #
del gen Prom. valor-p % incr. del gen # Pro . valor-p % incr.
EUN241 9631 ,6 0,169 1,3E-01 12,60 EUN241 9632,3 0,020 2.5E-01 2,46
EUIN241 9631 ,4 0,150 9JE-01 0,40 EUN241 9631,4 0,020 6,4E-01 1 ,96
Control 0, 150 Control 0,020
EUN248 8982,3 0,144 3,6E-01 7,27 EUN248 8982,4 0,023 4,l E-03 14,08
Control 0, 135 EUN248 8982,3 0,021 4,3E-01 4,59
EUN525 9534,1 0,161 6,7E-01 7,33 EUN248 8981,1 0,021 7,2E-01 7,54
EUN525 9531 ,3 0,169 5,6E-01 12.83 EUN248 8983,1 0,021 7,3E-01 5,14
EUN525 9533,4 0, 162 7,0E-01 8,26 Control 0,020
Nombre Rendimiento de semilla Nombre Evento Peso de semillas
Evento #
del gen Prom. valor-p % incr. del gen # Prom. valor-p % incr.
EUN525 9531 ,1 0, 166 1.0E-01 10,90 EUN255 9431 ,4 0.021 ?,??-01 4,57
Control 0,150 Control 0,020
EUN536 9234,1 0,157 6.1 E-01 16,81 EUN525 9533,1 0,022 2.1 E-01 10,94
Control 0,135 EUN525 9531 ,3 0,020 7,6E-01 2,55
EUN545 9482,4 0,184 1.7E-04 22,72 Control 0,020
Control 0, 150 EUN536 9234,1 0,020 6,0E-01 3,02
EUN565 9443,4 0,204 1.8E-01 36,33 EUN536 9231,3 0,021 5.3E-01 4,99
Control 0, 150 Control 0,020
EUN566 9514,3 0,163 1 ,6E-01 9,08 EUN545 9482,4 0,020 7.1 E-01 1 ,36
EUN566 9514,1 0,172 7,0E-01 15,02 Control 0,020
Control 0,150 EUN549 9343.6 0,023 2,7E-01 14,91
EUN568 9471 ,3 0, 160 1.8E-01 6,55 EUN549 9342,3 0,021 5.1E-01 3,66
Control 0,150 Control 0,020
EUN573 9493,4 0, 172 3.8E-01 14,54 EUN560 9424,1 0,023 l ,3E-04 18,35
EUN573 9491 ,2 0,181 3,3E-04 20,87 EUN560 9424,3 0,021 8.0E-02 4,76
EUN573 9492,2 0,155 8.9E-01 3,21 EUN560 9422,1 0,020 3,1E-01 3,38
Control 0,150 Control 0,020
EUN578 9524,1 0,147 9.3E-01 -1 ,70 EUN568 9461 ,2 0,024 l,3E-05 21,77
Control 0, 150 Control 0,020
EUN580 9552,3 0,180 1.9E-01 19,99 EUN573 9491 ,2 0,023 1.1 E-01 14,40
Control 0,150 EUN573 9492,2 0,021 3,6E-02 5,14
EUN585 9661 ,1 0,150 1 ,8E-01 1 1 ,29 Control 0,020
Control 0,135 EUN578 9524,1 0,022 8,2E-04 10,87
Control 0,020
EUN580 9551 ,3 0,025 7,2E-02 24,52
EUN580 9554,4 0,023 9,7E-02 14,78
Control 0,020
EUN585 9662,4 0,021 7.5E-02 6,26
EUN585 9661, 1 0,022 5,2E-03 9,36
Control 0,020
Tabla 33 : Análisis de rendimiento de semilla and weight of plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) bajo la regulación de un promotor constitutivo ( 35S ) cuando se desarrollan bajo condiciones de nitrógeno deficiente (1.5 mM KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 3.6 mM K2S04, 2 mM CaC12 y microelementos ) comparados con las plantas de control. "Incr." = incremento; "Prom." = promedio.
Tabla 34
Las plantas transgénicas que expresan exógenamente los
polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención exhiben un mejorado índice de cosecha en condiciones de crecimiento deficientes de nitrógeno.
Tabla 34: Análisis de índice de cosecha de las plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior), bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S) , cuando se desarrollan bajo condiciones de nitrógeno deficiente (1,5 mM KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 3, 6 mM K2S04, 2 mM CaC12 y microelementos ) comparados con las plantas de control.
Tabla 35
Las plantas transgénicas que expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención exhiben un mejorado peso seco bajo condiciones de crecimiento deficientes en nitrógeno
Tabla 35: Análisis de peso seco de las plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) , bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S), cuando se
desarrollan bajo condiciones de nitrógeno deficiente (1,5 mM KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 3,6 mM K2S04, 2 mM CaC12 y microelementos ) comparados con las plantas de control.
Los genes presentados en las Tablas 36 y 37, más adelante, tienen una EUN vegetal mejorada ya gue producen un mayor rendimiento de semilla, índice de cosecha, peso de semilla (expresado como peso de 1.000 semillas) y biomasa de la planta [ (expresado como peso seco de la planta (DW) ] cuando se desarrollaron en condiciones estándar de crecimiento con nitrógeno, comparados con las plantas de control indicando la elevada capacidad de la planta para metabolizar mejor el nitrógeno presente en el medio.
Las Tablas 36 y 37 ilustran los análisis de peso seco, rendimiento de semilla, índice de cosecha, tamaño de semilla (expresado como peso de 1.000 semillas) cuando se desarrollan en condiciones estándar de nitrógeno (6 mM KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 2 mM CaC12 y microelementos) en plantas que sobreexpresan los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S) . Se realizó la evalulación de cada gen realizando el ensayo de rendimiento de varios eventos. Algunos de los genes fueron evaluados con más de un ensayo de cultivo tisular y se repitieron los resultados obtenidos. El evento con valor-p < 0,1 fue considerado estadísticamente significativo.
Tabla 36
Las plantas transgénicas que expresan exógénamente los polinucleotidos de algunas realizaciones de la invención, exhiben una biomasa vegetal mejorada (peso seco) y mejorado rendimiento de semilla bajo condiciones estándar de nitrógeno
Tabla 36: Análisis de biomasa vegetal (peso seco) y rendimiento de semilla . de las plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleotidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) , bajo la
regulación de un promotor constitutivo (35S), cuando se desarrollan en condiciones estándar de nitrógeno (6 mM KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 2 mM CaC12 y microelementos ) comparados con las plantas de control. "Incr." = incremento; "RGR" = tasa de crecimiento relativo; " Prom. " = promedio.
Tabla 37
Las plantas transgénicas que expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención exhiben un mejorado índice de cosecha y mejorado peso de semilla bajo condiciones estándar de nitrógeno
Nombre Evento índice de cosecha Nombre Even Peso de semilla del gen # Prom. Valor-p % incr. del gen to # Prom. Valor-p % incr.
EUN568 9462,3 0,023 6,l E-04 10,961
Control 0,021
EUN573 9491 ,4 0,021 7.1 E-01 1 ,229
EUN573 9492,1 0,021 1 ,8E-01 3, 164
EUN573 9493,4 0,022 1,9E-01 8,883
EUN573 9491 ,2 0,023 4,0E-01 14,335
Control 0,021
EUN582 9561 ,2 0,024 1.6E-03 15,172
Control 0,021
Tabla 37: Análisis del índice de cosecha y peso de semilla de las plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) , bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S) , cuando se desarrollan en condiciones estándar de nitrógeno (6 m KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 2 mM CaC12 y microelementos ) comparados con las plantas de control. "Incr." = incremento; "RGR" = tasa de crecimiento relativo; " Prom." = promedio.
La mejora en el área de roseta así como también, en la tasa de crecimiento avala el hecho de que las plantas pueden producir una biomasa mayor mediante una mejor explotación del nitrógeno disponible en suelo. Además, la producción de una mayor cantidad de hojas, así como también, de una mayor cobertura de parcela cuando se desarrolln en condiciones de baja cantidad de nitrógeno, indicant una mayor capacidad de fotosíntesis de la planta cuando se desarrola en diferentes
condiciones de crecimiento con nitrógeno.
Los genes presentados en las Tablas 38 y 39, más adelante, tienen una EUN vegetal mejorada producen una mayor biomasa vegetal cuando se los desarrolló bajo condiciones de crecimiento con nitrógeno limitado, comparados con las plantas de control. Además, una producción de mayor cantidad de hojas asi como también una mayor cobertura de parcela, cuando se desarrollan en condiciones de bajo nitrógeno, indican una mayor capacidad fotosintética de la planta.
Las Tablas 38 y 39 ilustran los análisis de área de roseta y cantidad de hojas (diámetro de roseta, área de roseta, cantidad de hojas, área de corte de hoja y cobertura de parcela) cuando se desarrollan bajo condiciones de nitrógeno limitado (1.5 mM KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 3,6 mM K2S04, 2 mM CaC12 y microelementos ) en plantas que sobreexpresan los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S). Se realizó la evalulación de cada gen realizando el ensayo de rendimiento de varios eventos. Algunos de los genes fueron evaluados con más de un ensayo de cultivo tisular y se repitieron los resultados obtenidos. El evento con valor-p < 0.1 fue considerado estadísticamente significativo.
Tabla 38
Las plantas transgénicas que expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención
exhiben un mejorado rendimiento en el crecimiento de la (diámetro y área de roseta y cobertura de parcela) , condiciones de nitrógeno deficiente
Nombre Evento Diámetro de roseta ¡cm¡ Área de roseta fcm2/ Cobertura de parcela /%/ del gen Prom. valor-p % incr. Prom. valor-p % incr. Prom. valor-p % incr.
Control 1,42 0,709 5,67
EUN575 9501,4 2,04 l,4E-02 43,55 1,338 8JE-08 88,73 10,70 8.7E-08 88,73
EUN575 9504,1 1,93 1,8E-01 35,73 1,259 2,5E-01 77,60 10,07 2,5E-01 77,60
EUN575 9503,1 1,84 2,2E-01 29,22 1,282 2,0E-01 80,88 10,26 2,0E-01 80,88
EUN575 9502,1 1,73 2,7E-01 21,38 1,097 2,1 E-01 54,82 8,78 2,1 E-01 54,82
Control 1,42 0,709 5,67
EUN578 9524,3 1,92 6,lE-02 34,78 1,274 4.5E-02 79,68 10,19 4.5E-02 79,68
EUN578 9524,1 2,13 1,5E-01 49,88 1,602 1,4E-01 126,00 12,12 2,2E-01 ####
EUN578 9523,3 1,97 l,9E-02 38,35 1,400 4,0E-02 97,45 11,20 4,0E-02 97,45
EUN578 9522,3 1,75 4,8E-04 22,83 1,095 6.4E-05 54,54 8,76 6,4E-05 54,54
Control 1,42 0,709 5,67
EUN580 9552,3 1,52 1,2E-01 6,68 0,783 3,5E-02 10,46 6,26 3.5E-02 10,46
EUN580 9551,3 1,71 1,7E-01 19,93 1,049 2,0E-01 48,02 8,39 2.0E-01 48,02
EUN580 9553,4 1,73 ?,??-05 21,63 1,058 5,lE-06 49,24 8,46 5.1E-06 49,24
EUNS80 9551,4 1,85 6,7E-02 30,17 1,284 6,8E-02 81,21 10,28 6.8E-02 81,21
EUN580 9554,4 1,70 2,7E-01 19,55 1,084 2,8E-01 52,96 8,67 2,8E-01 52,96
Control 1,42 0,709 5,67
EUN582 9561,1 1,73 3,0E-01 21,81 1,026 3.3E-01 44,69 7,60 2,5E-01 34,04
EUN582 9562,1 1,60 3,4E-01 12,36 0,985 2,2E-01 38,99 7,88 2.2E-01 38,99
EUN582 9562,4 1,58 4,7E-01 11,39 0,920 4,7E-01 29,79 7,00 6,1 E-01 23,36
EUN582 9563,3 1,76 2,1E-01 23,73 1,071 1,4 E-01 51,05 8,57 1,4 E-01 51,05
EUN582 9561,2 1,92 6,2E-02 34,91 1,328 9,8E-02 87,34 10,02 2,1 E-01 76,63
Control 1,42 0,709 5,67
Tabla 38: Análisis de diámetro y área de roseta y cobertura de parcela de plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S) cuando se desarrollan bajo condiciones de' nitrógeno deficiente (1,5 mM KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 3,6 mM K2S04, 2 mM CaC12 y microelementos ) comparados con las plantas de control. "Incr." = incremento; " Prom." = promedio.
Tabla 39
Las plantas transgénicas que expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención exhiben un mejorado crecimiento de roseta (cantidad de hojas y corte de hoja) bajo condiciones de nitrógeno deficiente
Nombre del Cantidad de hojas Área de corte de la hoja /cm2/
Evento #
gen Prom. valor-p % incr. Prom. valor-p % incr.
EUN241 9632,3 8,0 6.4E-01 7,34 0,174 5,3E-01 30,98
EUN241 9631,4 8,3 1.6E-01 10,69 0,156 2,8E-02 17,43
Control 7,5 0,133
EUN249 9122,2 9,8 UE-01 4,20 0,266 4.7E-02 12,23
Control 9,4 0,237
EUN525 9534,1 8,8 5,9E-02 17,88 0,199 1,6E-01 49,90
EUN525 9531,2 8,9 3.6E-05 19,80 0,181 4,lE-02 36,68
EUN525 9533,1 7,8 l,9E-02 4,82 0,175 3,3E-01 31,80
ELN525 9531,3 7,6 8.6E-01 2,31 0,149 6,4E-01 12,26
EUN525 9533,4 8,3 8,0E-02 11,53 0,176 2,0E-02 32,40
EUN525 9531,1 8,4 3.0E-05 12,37 0,161 3.4E-03 21,39
Control 7,5 0,133
EUIN536 9234,1 9,4 9/7E-01 0,19 0,266 3.0E-01 12,00
Control 9,4 0,237
EUN545 9484,2 8,7 4.6E-02 16,56 0,216 2.8E-03 62,69
EUN545 9482,4 8,0 4,7E-01 7,34 0,174 1,6E-01 31,20
EUN545 9481,3 7,8 7,2E-01 3,98 0,188 4,7E-01 41,85
EUN545 9484,4 8,3 1.6E-01 10,69 0,207 2,6E-07 56,09
Control 7,5 0,133
EUN549 9341,1 7,9 6.7E-01 5,66 0,160 8,3E-02 20,34
Control 7,5 0,133
EUN563 9454,1 8,3 1,6E-01 10,69 0,154 1JE-01 16,19
EUN563 9452,3 7,4 9,8E-0l -0,21 0,150 6,1E-01 13,28
EUN563 9453,4 8,1 1.9E-01 9,01 0,181 2,2E-01 36,86
EUN563 9452,1 0,141 4,4E-01 6,33
Control 7,5 0,133
EUN565 9444,1 7,7 8,6E-02 3,14 0,162 2,2E-01 21,85
EUN565 9442,4 7,8 1.9E-02 4,82 0,148 1,4E-01 11,60
Control 7,5 0,133
EUN566 9514,3 7,8 4.5E-01 4,94 0,188 5,6E-02 41,70
EUN566 9513,1 7,8 1,8E-01 3,98 0,162 3,2E-01 22,40
EUN566 9512,4 8,1 5,4E-01 8,18 0,170 3,9E-01 28,31
EUN566 9514,1 8,0 4,2E-01 7,82 0,180 1,9E-01 35,77
Control 7,5 0,133
EUN568 9474,4 7,9 3,1E-01 5,66 0,175 4,2E-02 31,80
EUN568 9461,2 8,6 9,9E-03 15,72 0,195 9,6E-02 47,20
EUN568 9462,4 8,1 1.3E-01 8,18 0,193 3,2E-01 45,51
EUN568 9462,3 7,8 5,7E-01 3,98 0,176 5,3E-02 32,52
EUN568 9463,4 7,6 6,1E-01 2,31 0,185 3,7E-01 39,91
EUN568 9473,3 7,9 4.6E-01 6,50 0,148 1,8E-01 11,71
Control 7,5 0,133
EUN573 9491,4 7,9 6.7E-01 5,66 0,168 2,6E-01 27,07
EUN573 9492,1 9,1 6,lE-02 22,43 0,234 3,8E-02 76,54
EUN573 9493,4 8,0 3,1E-01 7,94 0,193 9,4E-07 45,94
EUN573 9494,3 8,1 3,6E-02 9,01 0,193 l,3E-05 45,95
EUN573 9491,2 8,7 2,0E-01 16,56 0,181 2,2E-01 36,33
EUN573 9492,2 7,6 6,7E-01 1,47 0,183 5.8E-02 38,25
Control 7,5 0,133
EUN575 9501,4 8,5 1,1E-01 14,05 0,216 l,9E-02 62,82
EUN575 9504,1 8,5 2,0E-01 14,05 0,214 2,2E-01 61,54
EUN575 9503,1 8,4 3.8E-01 13,21 0,207 2.1E-01 55,92
EUN575 9502,1 8,4 2.5E-01 13,21 0,182 2.6E-01 37,35
Control 7,5 0,133
EUN578 9524,3 8,4 2,3E-01 12,37 0,208 l,5E-07 57,07
EUN578 9524,1 9,1 1,3E-01 22,19 0,242 1,6E-01 82,58
EUN578 9523,3 8,8 3,lE-06 17,40 0,223 7,2E-02 68,19
Nombre del Cantidad de hojas Área de corte de la hoja fcm2/
Evento #
gen Prom. valor-p % incr. Prom. valor-p % incr.
EUN578 9522,3 8,4 2,3E-01 12,37 0, 178 2,4E-04 34,51
Control 7,5 0, 133
EUN580 9552,3 8,1 l ,6E-03 8, 18 0, 135 6,4E-01 1 ,85
ELN580 9551 ,3 8,5 l ,3E-05 14,05 0,175 2,4E-01 31 ,72
EUN580 9553,4 7,9 1 ,8E-01 6,50 0, 185 1 ,4E-01 39,73
EUN580 9551 ,4 8,5 2,0E-0I 14,05 0,202 2,0E-05 52,26
EUN580 9554,4 7,9 9,4E-02 5,66 0,183 3,4E-0 l 38,26
Control 7,5 0, 133
EUN582 9561 ,1 8,3 2,8E-01 1 1 ,29 0,171 3,9E-01 28,94
EUN582 9562,1 8,1 1 ,9E-01 9,01 0,168 3,4E-01 26,84
EUN582 9562,4 7,7 5,3E-01 2,67 0, 164 5,0E-01 24,06
EUN582 9563,3 8,4 l ,0E-04 13,21 0,186 1 ,5E-01 40,09
EUN582 9561,2 8,7 7,5E-02 16,08 0,217 1 ,5 E-01 63,53
Control 7,5 0, 133
Tabla 39: Análisis de cantidad de hojas y corte de hoja de plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S) cuando se desarrollan bajo condiciones de nitrógeno deficiente (1,5 mM KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 3.6 mM K2S04, 2 mM CaC12 y microelementos) comparados con las plantas de control. "Incr." = incremento; " Prom." = promedio.
Los genes presentados en la Tablas 40 y 41, más adelante, tienen una mejorada tasa de crecimiento vegetal cuando se desarrollan en niveles de fertilización con nitrógeno limitado. Estos genes mejoran la tasa de crecimiento de roseta y cubren más rápido el suelo cuando se desarrollan en condiciones de crecimiento de nitrógeno limitado.
Las Tablas 40 y 41 ilustran los análisis de tasa de crecimiento del diámetro de roseta, área de roseta, área de
corte de la hoja, cantidad de hojas y cobertura de parcela cuando se desarrollan bajo condiciones de nitrógeno limitado (1,5 mM KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 3,6 mM K2S04, 2 mM CaC12 y microelementos ) en plantas que sobreexpresan los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S). Se realizó la evalulación de cada gen realizando el ensayo de rendimiento de varios eventos. Algunos de los genes fueron evaluados con más de un ensayo de cultivo tisular y se repitieron los resultados obtenidos. El evento con valor-p < 0,1 fue considerado estadísticamente significativo.
Tabla 40
Las plantas transgénicas que expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención exhiben una mejorada tasa de crecimiento (RGR del área de corte de la hoja y RGR de la cantidad de hojas) bajo condiciones de nitrógeno deficiente
RGR del Area de corte de la hoja RGR Of Cantidad de hojas
Nombre del gen Evento #
Promedio valor-p % incremento Promedio valor-p % incremento
EUN545 9484,2 0,026 1 , 1 ?-07 60,54
EUN545 9482,4 0,021 6,0E-03 28,52
EUN545 9482,2 0,018 9,81
EUN545 9481 ,3 0,022 2, 1 E-02 39,32
EUN545 9484,4 0,025 l ,3E-06 54,25
Control 0,016
EUN549 9341 ,1 0,018 1 ,6E-01 12,49
Control 0,016
EUN563 9454,1 0,018 1 ,4E-01 13,13 0,544 0,509 8,79
EUN563 9452,3 0,018 3,7E-01 9,76
EUN563 9453,4 0,021 2,7E-03 30,97 0,580 0,223 16,07
Control 0,016 0,500
EUN565 9444,1 0,020 3,2E-02 21,06
Control 0,016
EUN566 9514,3 0,022 3,5E-03 34,09 0,558 0,384 1 1 ,55
EUN566 9513,1 0,020 3,2E-02 22,23 0,551 0,432 10,19
EUN566 9512,4 0,021 l ,2E-02 31,16 0,575 0,285 14,98
EUN566 9514,1 0,021 5.5E-03 29,97 0,515 3,05
Control 0,016 0,500
EUN568 9474,4 0,022 6,2E-04 34,41
EUN568 9461 ,2 0,024 l ,2E-04 46,02 0,567 0,327 13,35
EUIN568 9462,4 0,024 5.3E-04 48,85 0,527 0,687 5,52
EUN568 9462,3 0,022 l ,2E-03 35,77
EUN568 9463,4 0,022 2.5E-03 38,12
Control 0,016 0,500
EUN573 9491 ,4 0,018 1 ,4E-01 14,16
EUN573 9492,1 0,029 7,4E-09 77, 15 0,606 0, 122 21,29
EUN573 9493,4 0,023 9.0E-05 42,33 0,539 0,549 7,79
EUN573 9494,3 0,023 1.3E-04 40,79 0,573 0,271 14,63
EUN573 9491 ,2 0,020 9,4E-03 26,53 0,565 0,383 13,00
EUN573 9492,2 0,022 4,2E-04 39, 19
Control 0,016 0,500
EUN575 9501,4 0,026 2,8E-07 59,00 0,554 0,441 10,78
EUN575 9504,3 0,016 8.9E-01 -1 ,86 0,517 0,813 3.41
EUN575 9504,1 0,025 l,3E-04 55,64 0,560 0,398 12,06
EUN575 9503, 1 0,024 l,4E-04 51,12 0,615 0, 126 23,04
EUN575 9502,1 0,021 1,5 E-02 28,36 0,513 0,852 2,58
Control 0,016 0,500
EUN578 9524,3 0,025 4.9E-06 56,63 0,575 0,268 14,98
EUN578 9524,1 0,029 3.0E-07 77,86 0,630 0,050 25,93
EUN578 9523,3 0,027 6,9E-08 65,64 0,561 0,372 12,29
EUN578 9522,3 0,021 l,6E-03 32,66 0,606 0, 1 19 21 ,29
Control 0,016 0,500
RGR del Area de corte de la hoja RGR Of Cantidad de hojas
Nombre del gen Evento #
Promedio valor-p % incremento Promedio valor-p % incremento
EUN580 9551 ,3 0,021 6,5E-03 28,15 0,538 0,545 7,62
EUN580 9554,2 0,564 0,339 12,76
EUN580 9553,4 0,023 1.5E-04 40,79 0,526 0,686 5,28
EUN580 9551 ,4 0,024 1.3E-05 47,33 0,524 0,734 4,82
EUN580 9554,4 0,022 4,0E-03 37,25
Control 0,016 0,500
EUN582 9561 ,1 0,021 l,3E-02 29,36 0,585 0,225 16,94
EUN582 9562,1 0,020 1.8E-02 26,50 0,560 0,379 1 1 ,94
EUN582 9562,4 0,020 3,7E-02 26,29 0,556 0,464 1 1 ,24
EUN582 9563,3 0,023 1 JE-04 44,35 0,615 0, 1 13 23,04
EUN582 9561 ,2 0,026 1.4E-06 61 ,66 0,605 0,124 21 ,1 1
Control 0,016 0,500
Table 40: Análisis de tasa de crecimiento (RGR de área de corte de la hoja y RGR de cantidad de hojas) de las plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) , bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S), cuando se desarrollan bajo condiciones de nitrógeno deficiente (1,5 mM KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 3, 6 mM K2S04, 2 mM CaC12 y microelementos ) comparados con las plantas de control.
Tabla 41
Las plantas transgénicas que expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención exhiben una mejorada tasa de crecimiento (RGR de área y diámetro de roseta y RGR de cobertura de parcela) bajo condiciones de nitrógeno deficiente
Nombre
%
Prom. valor-p % incr. Prom. valor-p Prom. valor-p % incr.
incr.
EUN241 9633,4 0,102 2,9E-01 13,04 0,130 6,4E-01 -3,23 0,82 2,9E-01 13,04
EUN241 9632,3 0,131 2,2E-02 44,18 0,163 5,3E-02 21,41 1,05 2,2E-02 44,18
EUN241 9631,4 0,114 2,6E-02 25,68 0,151 8,4E-02 12,12 0,91 2,6E-02 25,68
Control 0,091 0,135 0,72
ELN525 9534,1 0,160 3,4E-07 76,36 0,164 3,4E-03 21,78 1,20 2,3E-05 66,06
EUN525 9531,2 0,150 3,9E-06 65,52 0,161 7,7E-03 19,52 1,13 2,0E-04 55,87
EUN525 9533,1 0,135 3,4E-04 48,53 0,153 5,lE-02 13,37 1,08 3,4E-04 48,53
ELN525 9531,3 0,111 ?,??-01 22,62 0,135 9,8E-01 0,21 0,89 1.1E-01 22,62
EUN525 9533,4 0,130 3,6E-04 43,83 0,149 ?,??-01 11,07 1,04 3,6E-04 43,83
EUN525 9531,1 0,129 6,5E-04 42,14 0,140 5,5E-01 4,10 1,03 6,5E-04 42,14
Control 0,091 0,135 0,72
EUN545 9484,2 0,168 4,4E-08 85,85 0,184 4.2E-06 36,37 1,35 4,4E-08 85,85
EUN545 9482,4 0,127 3.1E-03 40,34 0,154 6.9E-02 14,35 1,02 3,1 E-03 40,34
EUN545 9482,2 0,098 8,66 0,135 9,6E-01 0,34 0,79 4,4E-01 8,66
EUN545 9481,3 0,130 2,3E-02 43,77 0,173 3,3E-02 28,42 1,04 2,3E-02 ¦43,77
EUN545 9484,4 0,163 2,7E-07 79,91 0,194 4,6E-07 43,83 1,30 2,7E-07 79,91
Control 0,091 0,135 0,72
EUN549 9341,1 0,118 U4E-02 30,70 0,140 6,0E-01 3,79 0,95 1.4E-02 30,70
Control 0,091 0,135 0,72
EUN563 9454,1 0,119 9,5E-03 31,19 0,148 1,5E-01 9,88 0,95 9.5E-03 31,19
EUN563 9452,3 0,104 2,4E-01 15,20 0,140 6.0E-01 4,00 0,84 2,4E-01 15,20
EUN563 9453,4 0,137 2,lE-04 51,54 0,155 3,6E-02 15,50 1,10 2,lE-04 51,54
Control 0,091 0,135 0,72
EUN565 9444,1 0,111 6,2E-02 22,99 0,157 6,4E-02 16,45 0,89 6,2E-02 22,99
Control 0,091 0,135 0,72
EUNS66 9514,3 0,143 3,0E-04 58,15 0,162 4,2E-02 20,44 1,07 6,9E-04 47,03
EUN566 9513,1 0,118 l,7E-02 30,34 0,155 4.8E-02 14,92 0,94 1JE-02 30,34
EUN566 9512,4 0,121 2,4E-02 33,06 0,156 7,6E-02 15,84 0,96 2.4E-02 33,06
EUN566 9514,1 0,134 1 , 1 E-03 48,17 0,160 ?,??-02 18,57 1,02 l,0E-02 40,14
Control 0,091 0,135 0,72
EUN568 9474,4 0,121 7,0E-03 33,08 0,160 l,2E-02 19,19 0,96 7,0E-03 33,08
EUN568 9461,2 0,157 7,6E-06 73,36 0,170 4,1 E-03 26,24 1,26 7,6E-06 73,36
EUN568 9462,4 0,139 5,3E-04 53,79. 0,172 5,8E-03 27,76 1,11 5,3E-04 53,79
EUN568 9462,3 0,131 l,4E-03 44,88 0,167 l,3E-03 23,84 1,05 l,4E-03 44,88
EUN568 9463,4 0,129 3,7E-03 42,01 0,159 2.5E-02 18,33 1,03 3JE-03 42,01
Control 0,091 0,135 0,72
EUN573 9491,4 0,123 6,0E-03 35,42 0,149 1,7E-01 10,44 0,98 6,0E-03 35,42
EUN573 9492,1 0,182 5,7E-09 100,76 0,190 l,2E-06 41,04 1,46 5JE-09 100,76
EUN573 9493,4 0,141 5,6E-05 55,36 0,166 2,1 E-03 23,03 1,06 6,8E-04 45,86
EUN573 9494,3 0,151 5,3E-06 66,87 0,171 6,6E-04 26,79 1,21 5,3E-06 66,87
EUN573 9491,2 0,139 l,3E-04 53,69 0,164 l,lE-02 21,53 1,11 l,3E-04 53,69
EUN573 ' 9492,2 0,130 1,5 E-03 43,69 0,165 4,8E-03 22,63 1,04 1,5 E-03 43,69
Control 0,091 0,135 0,72
EUN575 9501,4 0,172 9.2E-09 89,99 0,198 1,1?-07 47,36 1,38 9,2E-09 89,99
EUNS75 9504,3 0,095 7,7E-01 4,69 0,135 l,0E+00 -0,04 0,76 7,7E-01 4,69
EUN575 9504,1 0,160 4.5E-05 76,22 0,178 3,5E-03 32,48 1,28 4,5E-05 76,22
EUN575 9503,1 0,165 4,lE-06 82,22 0,168 1.2E-02 24,58 1,32 4, 1 E-06 82,22
EUN575 9502,1 0,136 9,0E-04 50,03 0,151 1.3E-01 12,57 1,09 9,0E-04 50,03
Control 0,091 0,135 0,72
EUN578 9524,3 0,165 6.9E-07 81,99 0,185 2.5E-04 37,68 1,32 6.9E-07 81,99
EUN578 9524,1 0,206 3,9E-09 127,63 0,202 1.1E-06 49,79 1,56 4,4E-07 115,41
EUN578 9523,3 0,181 4,2E-09 99,40 0,179 1.9E-05 33,16 1,45 4,2E-09 99,40
EUN578 9522,3 0,141 6,5E-05 55,95 0,167 l,6E-03 24,01 1,13 6,5E-05 55,95
Control 0,091 0,135 0,72
EUN580 9551,3 0,135 3,5E-04 48,50 0,157 2,7E-02 16,48 1,08 3,5E-04 48,50
EUN580 9554,2 0,093 8,5E-01 0,130 7.1E-01 0,74 8,5E-01
EUN580 9553,4 0,137 1.5E-04 51,17 0,169 8,0E-04 25,59 1,10 l,5E-04 51,17
EUN580 9551,4 0,165 2,lE-07 82,42 0,170 1,3 E-03 26,33 1,32 2,lE-07 82,42
EÜN580 9554,4 0,138 l,0E-03 52,73 0,152 9.4E-02 12,99 1,11 l,0E-03 52,73
RGR de Area de roseta RGR de Diámetro de roseta RGR de Cobertura de parcela
Nombre
Evento %
del gen Prom. valor-p % incr. Prom. valor-p Prom. valor-p % incr.
# incr.
Control 0,091 0, 135 0,72
EUN582 9561 ,1 0, 133 2,5E-03 47,08 0, 167 6,9E-03 24,32 0,99 7,7E-03 36,09
ELN582 9562, 1 0, 127 3,4E-03 40,44 0, 152 7,7E-02 13,15 1 ,02 3,4E-03 40,44
EUN582 9562,4 0,120 2,8E-02 32,82 0, 153 1 ,1 E-01 13,90 0,91 ? ,??-01 26,19
EUN582 9563,3 0, 141 2,l E-04 55,33 0,178 4,6E-04 32,62 1 , 13 2, 1 ?-04 55,33
EUN582 9561,2 0,172 9,3E-08 89,88 0, 186 1 , 1 ?-05 37,84 1 ,30 4,6E-06 79,08
Control 0,091 0, 135 0,72
Tabla 41: Análisis de tasa de crecimiento (RGR de área y diámetro de roseta y RGR de cobertura de parcela) de las plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S) cuando se desarrollan bajo condiciones de nitrógeno deficiente (1,5 mM KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 3, 6 mM K2S04, 2 mM CaC12 y microelementos ) comparados con las plantas de control.
Los genes presentados en la Tables 42 and 43, más adelante, tienen una EUN vegetal mejorada and produced larger plant biomasa cuando se desarrollan under standard nitrógeno fertilization conditions, comparados con las plantas de control. In addition a production of a larger number of leaves as well as a higher cobertura de parcela cuando se desarrollan at low nitrógeno conditions indícate a larger photosynthetic capacity de la planta cuando se desarrollan at high nitrógeno growth conditions. Table 42 and 43 ilustran los análisis de área de roseta and cantidad de hojas (diámetro de roseta, área de roseta, cantidad de hojas, área de corte de la hoja and
cobertura de parcela) cuando se desarrollan under standard nitrógeno fertilization conditions (6 mM KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 2 mM CaC12 y microelementos ) en plantas que sobreexpresan los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S). Se realizó la evalulación de cada gen realizando el ensayo de rendimiento de varios eventos. Algunos de los genes fueron evaluados con más de un ensayo de cultivo tisular y se repitieron los resultados obtenidos. Evento with valor-p < 0.1 fue considerado estadísticamente significativo.
Tabla 42
Las plantas transgénicas que expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención exhiben un mejorado rendimiento del crecimiento de roseta (diámetro y área de roseta y cobertura de parcela) bajo condiciones estándar de nitrógeno
Tabla 42: Análisis del rendimiento de crecimiento de roseta (diámetro y área de roseta y cobertura de parcela) de las plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos
exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior), bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S), cuando se desarrollan under standard nitrógeno (6 mM KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 2 mM CaC12 y microelementos ) comparados con las plantas de control.
Tabla 43
Las plantas transgénicas gue expresan exógenamente los polinucleotidos de algunas realizaciones de la invención exhiben un mejorado rendimiento del crecimiento de roseta (cantidad y área de hojas y área de corte de la hoja) bajo ondiciones estándar de nitrógeno
Cantidad de hojas Area de corte de la hoja fcm2/
Nombre del gen Evento #
Prom. Valor-p % incr. Prom. Valor-p % incr.
EUN230 9154,2 8,75 1 ,4E-01 4,03 0,26 7.3E-03 16,16
Control 8,41 0,23
EUN234 9163,4 8,88 4.2E-01 5,52 0,28 2,9E-02 23,30
EUN234 9162,5 8,06 5.7E-01 -4,14 0,26 9,0E-02 12,41
Control 8,41 0,23
EUN248 8983,1 8,75 1.4E-01 4,03 0,25 1.0E-02 1 1 ,97
Control 8,41 0,23
EUN249 9122,2 9,25 2.2E-02 9,98 0,27 3.5E-03 17,48
Control 8,41 0,23
ELN268 8996,3 8,81 1.4E-02 4,78 0,28 6.2E-04 21 ,22
Control 8,41 0,23
ELN525 ; 9534,1 8,88 3.4E-02 9,44 0,23 6,6E-02 20,64
ELN525 9531 ,2 9,06 9.5E-03 1 1 ,75 0,26 1.3E-01 39,24
EUN525 9533,1 8,63 5,6E-01 6,36 0,24 3,4E-01 29,39
ELN525 9531 ,3 8,69 4.8E-01 7,13 0,23 2,3E-02 23,65
EUN525 9533,4 8,88 4,8E-01 9,44 0,23 3.5E-01 24,51
Control 8,1 1 0,19
EUN536 9233,3 9,50 1.2E-02 12,95 0,27 2,8E-01 1 8,94
EUN536 9234,1 9,44 6,lE-02 12,21 0,29 7,6E-02 28,74
Control 8,41 0,23
EUN545 9484,2 9,31 1 ,5E-01 14,84 0,28 2.1 E-03 47,68
EUN545 9482,4 8,56 6,3E-01 5,59 0,22 . 6,6E-01 18,07
EUN545 9481 ,3 8,06 8JE-01 -0,58 0,27 1.2E-03 41 ,88
EUN545 9484,4 8,88 1 , 1 E-01 9,44 0,25 8,3E-02 31 ,54
Control 8, 1 1 0,19
EUN549 9343,6 8,81 7,7E-02 8,67 0,20 6.6E-01 8,33
EUN549 9341 , 1 8,44 6,7E-01 4,05 0,21 6,0E-01 14,37
EUN549 9342,3 9,06 ? , ? ?-01 1 1 ,75 0,21 1 ,3E-01 13,98
Control 8,1 1 0, 19
EUN560 9423,4 8,75 l ,3E-02 4,03 0,28 4.4E-01 21 ,95
Cantidad de hojas Area de corte de la hoja ¡cm2/
Nombre del gen Evento #
Prom. Valor-p % incr. Prom. Valor-p % incr.
Control 8,41 0,23
EUN568 9461 ,2 9,63 l ,5E-02 1 8,69 0,30 2.1 E-02 59,80
EUN568 9461,3 8,94 2,6E-01 10,21 0,23 3,2E-02 25,07
EUN568 9462,4 8,48 3,5E-01 4,60 0,21 4,6E-01 13,21
EUNS68 9463,4 8,69 7,2E-02 7,13 0,24 7,0E-02 28,16
Control 8, 1 1 0, 19
EUN573 94 1 ,4 8,63 2,3E-01 6,36 0,23 6,2E-02 22,82
EUN573 9492,1 8,81 7,7E-02 8,67 0,23 3,9E-02 20,79
EUN573 9493,4 8,86 4,2E-02 9,22 0,22 8.1 E-02 17,66
EUN573 9491 ,2 8,63 1 ,2E-01 6,36 0,25 1.2E-01 33,61
EUN573 9494,3 9,13 1 ,5E-01 12,52 0,23 9,9E-02 20,47
ELN573 9492,2 8,46 7.1E-01 4,30 0,23 5.5E-01 25,07
Control 8, 1 1 0, 19
EUN575 9501 ,4 8,38 3,6E-01 3,28 0,21 3.9E-01 14,56
ELIN57S 9504,1 9,06 9,5E-03 1 1 ,75 0,25 ?, ? ?-01 33,06
EUN575 9503,1 8,06 9,2E-01 -0,58 0,22 3,3E-01 16,13
EUN575 9502,1 8,98 3,9E-01 10,73 0,22 3.0E-01 18,72
Control 8,1 1 0,19
EUN578 9524,1 8,50 1 ,9E-01 4,82 0,26 7,3E-03 40,77
EUN578 9524,3 8,31 8,7E-01 2,50 0,25 5.4E-01 32,70
EUN578 9523,3 9,48 l ,5E-02 16,93 0,28 4,2E-03 51 ,09
EUN578 9522,3 9,06 1.1 E-01 1 1 ,75 0,24 1.9E-01 27,90
Control 8, 1 1 0, 19
EUN580 9552,3 8,56 1.4E-01 5,59 0,20 4.9E-01 7,20
ELN580 9551 ,3 8,69 7,2E-02 7,13 0,23 1.6E-02 25,62
EUN580 9554,4 8,63 4.8E-01 6,36 0,23 3,5E-01 24,90
Control 8,1 1 0, 19
EUN582 9561 ,1 9,44 2,7E-01 16,38 0,27 1,6E-01 43,32
ELN582 9561 ,2 8,94 1.8E-02 10,21 0,25 5,5E-03 33,79
Control 8, 1 1 0, 19
ELN585 9661 ,1 8,94 4,0E-03 6,26 0,33 1.8E-02 43,63
Control 8,41 0,23
ELN588 9591 ,3 9, 19 5,6E-04 9,24 0,25 2,6E-02 9,62
Control 8,41 0,23
Tabla 43: Análisis de rendimiento de crecimiento de roseta (cantidad y área de hojas y área de corte de la hoja) de las plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleó idos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) , bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S), cuando se desarrollan con cantidad estándar de nitrógeno (6 mM KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 2 mM CaC12 y microelementos ) comparados con las plantas de control.
Los genes presentados en las Tablas 44 y 45, más adelante, tienen una mejorada tasa de crecimiento vegetal cuando se desarrollan a niveles de fertilización con nitrógeno limitado. Estos genes mejoran la tasa de crecimiento de la roseta y cubrieron más rápidamente el suelo cuando se desarrollan a niveles de fertilización con nitrógeno estándar. Estos genes produjeron un crecimiento más rápido en plantas que muestran una major utilización del nitrógeno presente.
Las Tablas 44 y 45 ilustran los análisis de la tasa de crecimiento del diámetro de roseta, área de roseta, área de corte de la hoja, cantidad de hojas y cobertura de parcela cuando se desarrollan en condiciones estándar de nitrógeno (6 mM KN03, 1 m KH2P04, 1 mM MgS04, 2 mM CaC12 y microelementos ) en plantas que sobreexpresan los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S) . Se realizó la evalulación de cada gen realizando el ensayo de rendimiento de varios eventos. Algunos de los genes fueron evaluados con más de un ensayo de cultivo tisular y se repitieron los resultados obtenidos. El evento con valor-p < 0,1 fue considerado estadísticamente significativo.
Tabla 44
Plantas transgénicas que expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención exhibit improved tasa de crecimiento (RGR of área de corte de la hoja, cantidad de hojas and área de roseta) bajo condiciones
estándar de nitrógeno
Tabla 44: Análisis de tasa de crecimiento (RGR del área de corte de la hoja, cantidad de hojas y área de roseta) de las plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) , bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S), cuando se desarrollan en condiciones estándar de nitrógeno (6 mM KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 2 mM CaCl2 y microelementos ) comparadas con las plantas de control.
Tabla 45
Las plantas transgénicas que expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención exhiben una mejorada tasa de crecimiento (RGR del diámetro de roseta y cobertura de parcela) bajo condiciones estándar de nitrógeno
RGR de Diámetro de roseta RGR de Cobertura de parcela
Nombre del gen Evento #
Prom. Valor-p % incr. Prom. Valor-p % incr.
EUN568 9474,4 0,18 0,947 0,98 1,24 0,624 10,72
EUN568 9461,3 0,21 0,218 18,40 1,56 0,080 39,53
Control 0,17 1,12
EUN573 9491,4 0,19 0,582 8,00 1,50 0,121 34,11
EUN573 9493,4 0,19 0,589 7,89 1,35 0,349 20,66
EUN573 9491,2 0,21 0,222 18,90 1,64 0,042 ' 46,75
EUN573 9492,2 0,18 0,821 3,40 1,27 0,542 13,46
Control 0,17 1,12
EUN575 9504,1 0,21 0,196 19,39 1,64 0,040 47,00
EUN575 9503,1 0,19 0,644 6,72 1,29 0,472 15,58
EUN575 9502,1 0,19 0,637 7,16 1,33 0,439 19,10
Control 0,17 1,12
EUN578 9524,1 0,21 0,154 21,31 1,73 0,018 54,74
EUN578 9524,3 0,21 0,302 19,94 1,67 0,073 49,17
EUN578 9523,3 0,23 0,036 33,14 1,73 0,017 54,56
EUN578 9522,3 0,19 0,472 10,54 1,71 .0,024 52,52
Control 0,17 1,12
EUN580 9551,3 0,20 0,319 14,57 1,55 0,084 38,45
EUN580 9554,4 0,18 0,764 4,75 1,55 0,094 38,64
Control 0,17 1,12
EUN582 9561,1 0,22 0,112 24,58 1,79 0,012 60,37
EUN582 9562,1 0,19 0,548 9,10 1,38 0,300 23,28
EUN582 9562,4 0,19 0,469 10,79 1,31 0,438 16,65
EUN582 9561,2 0,20 0,325 16,03 1,72 0,031 54,06
Control 0,17 1,12
EUN585 9661,3 0,20 0,518 7,29 1,46 0,528 10,62
EUN585 9661,1 0,22 0,142 17,93 2,00 0,007 52,30
Control 0,19 1,32
EUN588 9591,3 0,21 0,413 9,34 1,54 0,317 17,29
Control 0,19 1,32
Tabla 45: Análisis de tasa de crecimiento (RGR del diámetro de roseta y cobertura de parcela) de las plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) , bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S), cuando se desarrollan en condiciones de nitrógeno estándar (6 mM KN03, 1 mM KH2P04, 1'mM MgS04, 2 mM CaC12 y microelementos) comparadas con las plantas de control.
EJEMPLO 7
ENSAYO 3: EFICACIA EN EL USO DE NITRÓGENO MEDIDA HASTA LA ETAPA
DE FLORACIÓN PREMATURA: BIOMASA VEGETAL Y TASA DE CRECIMIENTO DE LA PLANTA EN CONCENTRACIONES DE NITRÓGENO LIMITADO Y ESTÁNDAR EN CONDICIONES DE INVERNADERO
Este ensayo sigue la producción del rendimiento de semilla, la formación de biomasa y el crecimiento del área de roseta de las plantas desarrolladas en invernadero, en condiciones de crecimiento con nitrógeno limitado y no limitado. Las semillas de Arabidopsis transgénicas se sembraron en un medio de agar suplementado con un medio ½ MS y un agente de selección (canamicina) . Las plántulas T2 transgénicas luego se transplantaron a bandejas 1,7 rellenadas con turba y perlita en una relación 1:1. Se irrigaron las bandejas con una solución que contenia condiciciones constantes de nitrógeno limitado, logradas irrigando las plantas con una solución que contiene 1,5 mM de nitrógeno inorgánico en la forma de N03, suplementadas con 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 3,6 mM K2S04, 2 mM CaC12 y microelementos , logrando niveles normales de nitrógeno aplicando una solución de 6 mM de nitrógeno inorgánico también en la forma de KN03 con 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 2 mM CaC12 y microelementos. Todas las plantas se desarrollaron en invernadero hasta obtener semillas maduras. La biomasa de la planta (tejido bajo suelo anterior) se pesó inmediatamente después de cosechar la roseta (peso fresco de la planta [F ] ) . Luego, se secaron las plantas en un horno a 50 DC durante 48 horas y se pesó (peso seco de la planta [D ] ) .
Se validó cada constructo según la generación de T2. Las plantas transgénicas transformadas con un constructo conformadas mediante un vector vacio que porta al promotor 35? y al marcador seleccionadle , fueron usadas como controles.
Se analizaron las plantas según su tamaño total, tasa de crecimiento, materia fresca y seca. Se compararon el rendimiento de las plantas transgénicas con las plantas de control desarrolladas en paralelo en las mismas condiciones.
Se planeó el experimento en una distribución de parcelas aleatorias anidadas. Para cada gen de la invención, se analizaron de tres a cinco eventos de transformación independientes para cada constructo.
Captura de imágenes digitales - Para capturar imágenes de las muestras de las muestras de plantas, se utilizó un sistema de adquisición de imágenes de laboratorio que consiste en una cámara réflex digital (Canon EOS 300D) , con una lente de longitud focal 55 mm (Cannon serie EF-S) , montada en un dispositivo de reproducción (Kaiser RS) , que incluía 4 unidades de luz (bombilla de luz 4x150 Vatios) y ubicada en un cuarto oscuro.
El proceso de captura de imágenes se repitió cada dos días comenzando en el día 1 hasta el día 15. Se utilizó para capturar imágenes de plantas más grandes sembradas en tubos blancos en un invernadero con ambiente controlado, la misma cámara colocada en un soporte de hierro habitual. Durante el
proceso de captura, se colocaron las bandejas debajo del soporte de hierro, evitando la luz directa del sol y la proyección de sombras.
Se utilizó un sistema de análisis de imágenes que consistía en una computadora personal de escritorio (procesador Intel P4 3.0) y un programa de dominio público - ImageJ 1.37 (programa de procesamiento de imágenes basado en Java que fue desarrollado en el U.S National Institutes of Health y de distribución libre por Internet en Hypertext Transf.er Protocol : //rsbweb (punto) nih (punto) gov/) . Se capturaron las imágenes en una resolución de 10 Mega Pixeles (3.888 x 2.592 pixeles) y se almacenó en un formato JPEG de baja compresión (estándar Joint Photographic Experts Group) . Luego se guardaron los datos analizados en archivos de texto y se procesaron usando el software para análisis estadístico JMP (SAS Institute) .
Análisis de hoja - Usando los datos del análisis digital se calcularon los datos de hojas, incluyendo cantidad de hojas, área de roseta, diámetro de roseta, área de corte de hoja, cobertura de parcela, longitud de pecíolo de hoja.
Tasa vegetativa de crecimiento: es la tasa de crecimiento de la planta tal como se define mediante las fórmulas VIII, IX, X y XI
Fórmula VIII:
Tasa de crecimiento relativa del área de corte de hoja =
Coeficiente de regresión del área de hoja con el transcurso del tiempo .
Fórmula IX:
Tasa de crecimiento relativa del área de la hoja Coeficiente de regresión del área de hoja con el transcurso del tiempo .
Fórmula X
Tasa de crecimiento relativa del diámetro de roseta = Coeficiente de regresión del diámetro de roseta con el transcurso del tiempo.
Fórmula XI
Tasa de crecimiento relativa de cobertura de parcela = Coeficiente de regresión de cobertura de parcela con el transcurso del tiempo.
Peso fresco y seco de la planta - Alrededor del dia 40 desde la siembra, se cosecharon las plantas y se pesó directamente para la determinación del peso fresco de la planta (FW) y se dejó secar a 50 DC en una cámara de secado durante alrededor de 48 horas antes de pesar para determinar el peso seco de la planta (DW) .
Análisis estadístico - Para identificar los genes que confieren una EUN significativamente mejorada, se analizaron los resultados obtenidos de las. plantas transgénicas comparados con los obtenidos de las plantas de control. Para identificar los genes y constructos destacados en su comportamiento, se
ensayaron separadamente los resultados de los eventos de transformación independientes. Los datos se analizaron mediante la . prueba T de Student y se consideraron como datos significativos si el valor p era inferior a 0,1. Se utilizó el paquete de software estadístico JMP (Versión 5.2.1, SAS Institute Inc., Cary, NC, Estados Unidos).
Resultados experimentales:
Los genes presentados en las Tablas 46 y 47, más adelante, tienen una EUN vegetal mejorada cuando se los desarrolló bajo condiciones de crecimiento con nitrógeno limitado, comparados con las plantas de control. Estos genes produjeron plantas más grandes con mayor capacidad fotosintética cuando se desarrollan bajo condiciones de nitrógeno limitado.
Las Tablas 46 y 47 ilustran el análisis de biomasa vegetal y área fotosintética (peso fresco, peso seco, diámetro de roseta, área de roseta y cobertura de parcela) cuando se desarrollan bajo condiciones de nitrógeno limitado (1.5 mM KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 3,6 mM KC1, 2 mM CaC12 y microelementos ) en plantas que ' sobreexpresan los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S) . Se realizó la evalulación de cada gen realizando el ensayo de rendimiento de varios eventos. Algunos de los genes fueron evaluados con más de un ensayo de cultivo tisular y se repitieron los resultados obtenidos. El evento con valor-p < 0,1 fue considerado
estadísticamente significativo.
Tabla 46
Las plantas transgénicas que expresan exógenamente los polinucleotidos de algunas realizaciones de la invención exhiben una biomasa vegetal mejorada (peso seco y peso fresco) en condiciones de nitrógeno limitado
Peso seco [g Peso fresco |¡
Nombre *1
Evento # % % del gen Promedio Valor-p Promedio Valor-p
incremento incremento
Control 0,026 0,248
EUN576 9791 ,3 0,431 0,838 6,86
EUN576 9792,4 0,500 0,007 23,89
EUN576 9792,3 0,550 0, 159 36,28
Control 0,404
Tabla 46: Análisis de biomasa vegetal (peso seco y fresco) de las plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) , bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S), cuando se desarrollan bajo condiciones de nit rógeno limitado (1,5 mM KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 3,6 mM KC1, 2 mM CaC12 y microelementos) comparados con las plantas de control.
Tabla 47
Las plantas transgénicas que expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención exhiben una biomasa vegetal mejorada (diámetro y área de roseta y cobertura de parcela) en condiciones de nitrógeno limitado
Nom Diámetro de roseta |cm| Área de roseta [cm2l Cobertura de parcela [%]
Even
bre del Pro % Prom
to # % Prom %
Valor-p Valor-p
gen Valor-p
m. incr. incr. incr.
EUN22 2,04
9851 ,4 1 1 ,81
2,4E-02 48,28 1,477 7,6E-02 1 15,90 7,6E-02 1 15,90 7 0 9
EUN22 1 ,77
9854,2 5,9E-02 29,24 1,070 7,0E-03 56,44 8,564 7,0E-03 56,44 7 8
EUN22 1 ,67
9853,1 9,5E-02 22,03 0,979 ?, ? ?-01 43,09 7,833 1 ,1 E-01 43,09 7 9
EUN22 1 ,55
9851 ,1 2,8E-01 13,03 0,915 2.8E-01 33,71 7,320
7 5 2.8E-01 33,71
EUN22 1 ,88
9852,3 10,38
1.7E-01 37,33 1 ,298 1 ,8E-01 89,71 1 ,8E-01 89,71
7 9 6
1 ,37
Control 0,684 5,474
6
Nom Diámetro de roseta [cm] Área de roseta [cm2] Cobertura de parcela |%1
Even
re del Pro % Prom % Prom % to# Valor-p Valor-p Valor-p gen m. incr. incr. incr.
EUN23 10173, 1,77
1,9E-01 7,66 1,080 3.2E-01 16,76 7,559 7,1E-01 5,15 3 5 8
1,65
Control 0,925 7,189
1
EUN25 10061, 1,99 10,66
2.6E-03 20,56 1,333 2,7E-02 44,13 2,0E-02 48,34 6 1 1 4
1,65
Control 0,925 7,189
1
EUN51 1,47
9284,2 7,1E-01 7,21 0,794 7,0E-01 15,97 6,349 7,0E-01 15,97 2 5
EUN51 1,58
9283,1 1,8E-01 14,91 0,916 2,6E-02 33,86 7,328 2,6E-02 33,86 2 1
EUN51 1,39
9284,3 9,0E-01 1,41 0,719 8,2E-01 5,14 5,755 8,2E-01 5,14 2 5
EUN51 1,58
9282,3 2.6E-01 15,43 0,928 6,3E-02 35,67 7,427 6,3E-02 35,67 2 8
EUN51 1,41
9283,3 8,2E-01 2,50 0,789 3,9E-01 15,37 6,315 3,9E-01 15,37 2 0
EUN51 1,52
9281,3 3,8E-01 10,94 0,824 4,1E-01 20,42 6,236 6,5E-01 13,91 2 6
1,37
Control 0,684 5,474
6
EUN51 1,58
9403,5 5,6E-01 14,93 0,901 5,4E-01 31,69 7,209 5.4E-01 31,69 4 1
EUN51 1,60
9404,4 2,3E-01 16,92 0,930 2,0E-01 35,86 6,923 2,2E-02 26,47 4 8
EUN51 1,99 11,15
9402,2 1,8E-01 45,07 1,395 1,5E-01 103,85 1,5E-01 103,85 4 6 9
EUN51 1,86
9402,5 3,2E-01 35,21 1,160 3,2E-01 69,52 9,280 3,2E-01 69,52 4 0
EUN51 1,68
9404,5 2,2E-01 22,77 1,006 4,7E-02 47,02 8,048 4,7E-02 47,02 4 9
1,37
Control 0,684 5,474
6
EUN52 1,77
9201,1 l,4E-02 28,89 1,109 ^9,3E-02 62,12 8,875 9.3E-02 62,12 7 3
1,37
Control 0,684 5,474
6
EUN53 10081, 1,75
4,5E-01 6,49 1,043 5,1E-01 12,74 8,342 4,3E-01 16,04 1 5 8
1,65
Control 0,925 7,189
1
EUN53 1,75
9222,4 3,9E-01 27,34 1,056 4,4E-01 54,32 8,448 4.4E-01 54,32 2 2
EUN53 1,66
9222,3 4.6E-04 21,24 1,034 8,3E-05 51,08 8,270 8,3E-05 51,08 2 8
EUN53 1,62
9222,1 3,8E-01 17,95 1,016 2.8E-01 48,52
2 3 8,130 2.8E-01 48,52
EUN53 1,58
9223,3 5.5E-03 15,23 0,902 6,2E-03 31,88 7,219 6,2E-03 31,88 2 5
ELIN53 1,73
9224,4 1.4E-04 25,88 1,060 6.5E-05 54,91 7,941 2,3E-02
2 2 45,06
EUN53 1,89 10,35
9223,5 7.1E-02 38,02 1,294 3.2E-02 89,11 3,2E-02 89,11 2 9 3
1,37
Control 0,684 5,474
6
EUN53 1,69
9086,2 2,2E-01 23,27 0,938 2,2E-01 37,03 7,502 2,2E-01 37,03 5 6
Nom Diámetro de roseta |cm] Area de roseta |cm ] Cobertura de parcela [%]
Even
bre del Pro % Prom % Prom %
to # Valor-p Valor-p Valor-p gen m. incr. incr. incr.
EUN53 1 ,46
9084,2 6,4E-01 6,35 0,827 4,3E-01 20,92 6,620 4,3E-01 20,92 5 3
EUN53 1 ,52
9081 ,1 3,3E-01 10,57 0,823 3,0E-01 20,21 6,581 3,0E-01 20,21 5 1
EUN53 1 ,43
9082,1 5,6E-01 4, 10 0,742 3,8E-01 8,46 5,938 3,8E-01 8,46 5 2
1,37
Control 0,684 5,474
6
EUN53 1 ,50
9391 ,1 5,2E-01 9,24 0,807 3,8E-01 17,86 6,452 3,8E-01 17,86 7 3
EUN53 1,47
9392,2 4,9E-01 7,21 0,851 3,4E-01 24,32 6,806 3,4E-01 24,32 7 5
EUN53 1 ,53
9393,2 8,5E-03 1 1 ,34 0,955 4,l E-04 39,59 7,157 4,5E-02 30,73 7 2
EUN53 1 ,85
9393,1 l ,7E-03 34,95 1,225 7,0E-05 78,96 9,797 7,0E-05 78,96 7 6
EUN53 1 ,42
9392,3 8,3E-01 3,89 0,784 7.3E-01 14,54 6,270 7,3E-01 14,54 7 9
EUN53 1 ,73
9393,3 5,3E-02 26,42 1,092 l,5E-02 59,52 8,733 1.5E-02 59,52 7 9
1,37
Control 0,684 5,474
6
EUN57 1 ,96 10,80
9794,1 1 ,5E-01 18,86 1,350 2,3E-01 45,96 2,1 E-01 50,23 6 3 0
1 ,65
Control 0,925 7,189
1
EUN57 1,41
9791 ,3 8,6E-01 2,94 0,753 7,4E-01 10,01 6,022 7.4E-01 10,01 6 6
EUN57 1,82
9792,4 2,lE-05 32,75 1,204 2,4E-04 75,90 9,629 2,4E-04 75,90 6 6
EUN57 1,91
9792,3 5,4E-06 39,03 1,208 ?,? ?-05 76,46 9,660 1 ,1 ?-05 76,46 6 2
1,37
Control 0,684 5,474
6
Tabla 47: Análisis de biomasa vegetal (diámetro y área de roseta y cobertura de parcela) de las plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) , bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S) , cuando se desarrollan en condiciones de nitrógeno limitado (1,5 mM KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 3,6 mM KC1, 2 mM CaC12 y microelementos) comparados con las plantas de control.
Los genes presentados en la Tabla 48, más adelante, tienen una EUN vegetal mejorada cuando se los desarrolló bajo condiciones de crecimiento con nitrógeno limitado, comparados con las plantas de control. Estos genes produjeron áreas fotosintéticas más grandes como puede observarse por su mayor cantidad de hojas, área de corte de la hoja y área de peciolo.
La Tabla 48 ilustra el análisis del área fotosintética
(cantidad de hojas, área de corte de la hoja y área de peciolo) cuando se desarrollan bajo condiciones de nitrógeno limitado
(l,5.mM KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 3,6 mM KC1, 2 mM CaC12 y microelementos ) en plantas que sobreexpresan los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención, bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S)). Se realizó la evalulación de cada gen realizando el ensayo de rendimiento de varios eventos. Algunos de los genes fueron evaluados con más de un ensayo de cultivo tisular y se repitieron los resultados obtenidos. El evento con valor-p < 0,1 fue considerado estadísticamente significativo.
Tabla 48
Las plantas transgénicas que expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención exhiben un área fotosintética mejorada (cantidad de hojas, área de corte de la hoja y área de pecíolo) en condiciones de nitrógeno limitado
Longitud del peciolo de la
Cantidad de hojas Área de corte de hoja fcm2¡
Nombre Evento hoja fcm¡ del gen # Pro % % %
Valor-p Pront. Valor-p Prom. Valor-p m. incr. incr. incr.
EUN227 9851,4 8,56 l,9E-02 16,38 0,24 4,6E-02 108,44 0,38 6,5E-02 69,59
EUN227 9854,2 7,63 1,5E-01 3,64 0, 19 5,8E-03 67,63 0,32 1.2E-04 41 ,44
EUN227 9853,1 7,81 3,5E-02 6,19 0,17 2,2E-01 49,04 0,26 3,8E-02 14,04
EUN227 9851,1 7,69 2,8E-01 4,49 0,16 2,9E-01 35,75 0,24 4,7E-01 5,61
EUN227 9852,3 8,50 2.4E-01 15,53 0,21 1 ,1 E-01 82,96 0,32 4,4E-01 41 ,85
Control 7,36 0,1 1 0,22
EUN233 10173,5 7,79 6,0E-01 2,05 0,19 4,0E-01 15,50 0,26 5.8E-01 8,27
Control 7,63 0,17 0,24
EUN256 10061 ,1 8,13 2,5E-01 6,50 0,23 8,4E-02 39,00 0,31 2,0E-01 30,30
Control 7,63 0,17 0,24
EUN512 9283,1 7,63 2,5E-01 3,64 0, 16 7,0E-02 42,74 0,24 1.2E-01 8,56
EUN512 9284,3 6,88 5,0E-01 -6,55 0,13 4,9E-01 15,53 0,21 8,3E-01 -5,04
EUN512 9282,3 7,38 9,8E-01 0,24 0,16 3,9E-02 41 ,04 0,26 5.5E-01 14,40
EUN512 9283,3 7,56 6.3E-01 2,79 0,13 6, 1 E-01 12,00 0,25 6,2E-02 1 1 ,05
EUN512 9281,3 7,08 7,9E-01 -3,76 0,15 3,8E-02 31,49 0,23 9,9E-01 0,30
Control 7,36 0,1 1 0,22
ELN514 9403,5 7,31 8,7E-01 -0,61 0, 16 5,0E-01 35,23 0,28 4.7E-01 25,62
EUN514 9404,4 8,04 4,1 E-01 9,22 0, 14 1,2E-01 25,05 0,26 1.1 E-02 17,01
EUN514 9402,2 8,75 2,5E-01 18,93 0,22 1,4E-01 89,22 0,35 3,1 E-01 55,03
EUN514 9402,5 8,38 2,7E-01 13,83 0, 19 3.3E-01 63,94 0,32 3.1 E-01 42,26
EUN514 9404,5 8,56 ? ,??-01 16,38 0,16 3,9E-02 37,00 0,30 3,7E-01 31 ,67
Control 7,36 0, 1 1 0,22
EUN527 9201 ,1 8,19 2,0E-03 1 1 ,29 0, 17 1,3E-01 49,68 0,33 l,7E-03 45,43
EUN527 9201,2 6,94 6,5E-01 -5,70 0,12 5,8E-01 7,58 0,22 9.3E-01 -1 ,31
Control 7,36 0,1 1 0,22
EUN531 10082,2 8,24 7,l E-02 7,98 0,15 2.3E-01 -12,84 0,27 3.9E-01 13,71
EUN531 10081,5 8,31 4.4E-02 8,95 0, 17 9.4E-01 1 ,15 0,27 3,2E-02 15,99
Control 7,63 0, 17 0,24
EUN532 9222,4 7,56 8,4E-01 2,79 0,17 4,2E-01 51,79 0,30 4, 1E-01 32,08
EUN532 9222,3 8,31 3,5E-02 12,99 0,16 2,5E-05 41,75 0,29 1,5 E-03 30,67
EUN532 9222,1 7,94 ?, ? ?-01 7,89 0,16 2,6E-01 40,64 0,27 5,0E-01 21 ,12
EUN532 9223,3 7,31 9,4E-01 -0,61 0, 15 2,6E-01 32,70 0,28 1 ,5 E-03 26,20
EUN532 9224,4 8,27 l ,3E-03 12,38 0,16 3,4E-02 41 ,63 0,32 6,8E-02 43,77
EÜN532 9223,5 8,25 9,8E-02 12,14 0,20 l ,5E-02 72,88 0,35 1.5E-02 58,06
Control 7,36 0,1 1 0,22
EUN535 9086,2 7,75 5.7E-01 5,34 0,16 2,0E-01 37,02 0,34 2, 1 E-01 52,44
EUN535 9084,2 6,88 4.0E-01 -6,55 0,15 2,4E-01 28,20 0,23 8.7E-01 2,43
EUN535 9081 ,1 8,31 I .4E-01 12,99 0,13 4.7E-01 12,91 0,28 2.6E-03 25,65
EUN535 9082,1 7,25 6,2E-01 -1,46 0,13 2,5E-02 12,04 0,26 4,5E-01 14,26
Control 7,36 0,11 0,22
EUN537 9391 ,1 7,81 4,8E-01 6,19 0, 14 2,6E-01 23,28 0,25 5.7E-01 1 1 ,88
EUN537 9392,2 7,31 9,4E-01 -0,61 0, 14 2,9E-01 25,68 0,26 4,1E-01 14,53
EUN537 9393,2 7,56 7.2E-01 2,79 0,15 2,2E-02 33,42 0,24 5.1E-01 4,72
EUN537 9393,1 8,63 1.7E-03 17,23 0,19 4,6E-02 69,46 0,34 4.7E-04 52,73
EUN537 9392,3 7,19 8.5E-01 -2,31 0,13 7.3E-01 10,02 0,25 7.4E-01 1 1 ,68
EUN537 9393,3 8,00 4.8E-01 8,74 0, 18 2,6E-02 56,70 0,30 3.1E-04 33,39
Control 7,36 0,11 0,22
EUN576 9794,1 8, 13 5,7E-01 6,50 0,24 1.4E-01 42,20 0,30 5,0E-01 28,80
Control 7,63 0, 17 0,24
EUN576 9791 ,3 7,00 6.7E-01 -4,85 0, 13 6,3E-01 15,21 0,24 8,0E-01 7,24
EUN576 9792,4 8,75 1 , 1 E-03 18,93 0, 18 l ,4E-04 55,06 0,35 2,8E-02 56,82
EUN576 9792,3 8,06 2.1 E-01 9,59 0,20 2,9E-05 71,82 0,34 9,6E-04 52,50
Control 7,36 0,1 1 0,22
Tabla 48: Análisis del área fotosintética (cantidad de hojas, área de corte de la hoja y área de pecilo) de las plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) , bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S), cuando se desarrollan bajo condiciones de nitrógeno limitado (1,5 mM KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 3,6 mM KC1, 2 mM CaC12 y microelementos ) comparados con las plantas de control .
Los genes presentados en la Tabla 49, más adelante, tienen una mejorada tasa de crecimiento vegetal cuando se desarrollan a niveles de fertilización de nitrógeno limitado. Estos genes mejoraron la tasa de crecimiento de la roseta y cubrieron más rápidamente el suelo cuando se los desarrolló bajo condiciones de crecimiento con nitrógeno limitado, comparados con las plantas de control. Estos genes produjeron plantas de crecimiento más rápido demostrando una major utilización del nitrógeno presente.
La Tabla 49 ilustra el análisis de la tasa de crecimiento del diámetro de roseta, área de roseta, área de corte de la hoja, cantidad de hojas y cobertura de parcela, cuando se desarrollan en condiciones estándar de nitrógeno y bajo condiciones de nitrógeno limitado (1,5 mM KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 3,6 mM KC1, 2 mM CaC12 y microelementos) en plantas
que sobreexpresan los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S). Se realizó la evalulación de cada gen realizando el ensayo de rendimiento de varios eventos. Algunos de los genes fueron evaluados con más de un ensayo de cultivo tisular y se repitieron los resultados obtenidos. El evento con valor-p < 0,1 fue considerado estadísticamente significativo.
Tabla 49
Las plantas transgénicas que expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención exhiben un mejorado rendimiento del crecimiento de roseta (RGR del área y diámetro de roseta y cobertura de parcela) en condiciones de nitrógeno limitado
RGR del Diámetro de RGR del Cobertura de
RGR del Area de roseta
Nombre Evento roseta parcela del gen #
Prom. Valor-p %
% incr. Prom. Valor-p Prom. Valor-p % incr.
incr.
EUN527 9201,1 0,131 l,5E-02 56,83 0,146 3.8E-01 11,45 1,048 1.5E-02 56,83
Control 0,084 0,131 0,668
EUN532 9222,4 0,132 3,4E-02 58,62 0,1 7 4,2E-02 34,79 1,060 3,4E-02 58,62
EUN532 9222,3 0,124 2,7E-02 48,99 0,148 3,2E-01 12,66 0,995 2,7E-02 48,99
EUN532 9222,1 0,124 3,9E-02 48,48 0,153 2,5 E-01 16,37 0,992 3.9E-02 48,48
EUN532 9223,3 0,106 2.0E-01 26,75 0,135 8,3 E-01 2,62 0,847 2,0E-01 26,75
EUN532 9224,4 0,132 9,5E-03 58,37 0,159 1,0E-01 21,08 0,991 2,7E-02 48,37
EUN532 9223,5 0,162 l,4E-04 94,31 0,169 3,4E-02 28,67 1,298 1.4E-04 94,31
Control 0,084 0,131 0,668
EUN535 9086,2 0,118 6,7E-02 40,98 0,169 3,7E-02 28,72 0,942 6,7E-02 40,98
EUN535 9084,2 0,103 2,6E-01 23,65 0,138 7.0E-01 4,93 0,826 2.6E-01 23,65
EUN535 9081,1 0,101 3,1 E-01 20,62 0,137 7,2E-01 4,66 0,806 3,1 E-01 20,62
Control 0,084 0,131 0,668
EUN537 9391,1 0,101 3.0E-01 20,89 0,143 5,1 E-01 8,62 0,808 3,0E-01 20,89
EUN537 9392,2 0,107 1,9 E-01 27,77 0,142 5,0E-01 8,29 0,854 l,9E-01 27,77
EUN537 9393,2 0,120 4,4E-02 43,18 0,135 8,3 E-01 2,61 0,894 1,1E-01 33,89
EUN537 9393,1 0,156 5,lE-04 86,73 0,198 2,4E-04 50,58 1,247 5.1E-04 86,73
EUN537 9392,3 0,101 3,8E-01 20,36 0,140 6,6E-01 6,28 0,804 3.8E-01 20,36
EUN537 9393,3 0,133 ?,??-02 59,56 0,162 7,9E-02 23,54 1,066 ?,??-02 59,56
Control 0,084 0,131 0,668
EUN576 9793,4 0,163 ?,??-01 37,49 0,157 5,5 E-01 11,44 1,139 3.0E-01 23,91
EUN576 9792,4 0,139 2,6E-01 17,71 0,167 2.7E-01 18,29 1,047 4.2E-01 13,98
EUN576 9794,1 0,168 1.7E-02 41,95 0,161 4,0E-01 14,09 1,343 1.6E-02 46,20
Control 0,118 0,141 0,919
EUN576 9792,4 0,150 8.5E-04 79,96 0,162 6,5E-02 23.36 1,202 8.5E-04 79,96
EUN576 9792,3 0,149 I.2E-03 78,96 0,177 1.3E-02 34,59 1,196 l,2E-03 78,96
EUN576 9794,1 0,095 5,1 E-01 14,23 0,145 4.7E-01 10,57 0,763 5,1 E-01 14,23
EUN576 9793,3 0,104 2.4E-01 24,59 0,140 6,4 E-01 6,33 0,771 4.4E-01 15,45
Control 0,084 0,131 0,668
Tabla 49: Análisis del rendimiento del crecimiento de roseta (RGR del área y diámetro de roseta y cobertura de parcela) de las plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior), bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S) , cuando se desarrollan en condiciones limitadas de nitrógeno (1,5 mM KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 3,6 mM KC1, 2 mM CaC12 y microelementos) comparados con las plantas de control.
Los genes presentados en las Tablas 50 y 51, más adelante, tienen una EUN vegetal mejorada cuando se desarrollaron en condiciones estándar de crecimiento con nitrógeno, comparados con las plantas de control. Estos genes produjeron plantas más grandes con un área fotosintética mayor cuando se desarrollaron en condiciones estándar de crecimiento con nitrógeno, comparados con las plantas de control.
Las Tablas 50 y 51 ilustran el análisis de biomasa vegetal (peso fresco, peso seco, diámetro de roseta, área de roseta y cobertura de parcela) cuando se desarrollan en condiciones estándar de nitrógeno (6 m KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 2 mM CaC12 y microelementos ) en plantas que sobreexpresan los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S) ) . Se realizó la evalulación de cada gen realizando el ensayo de rendimiento de varios eventos. Algunos de los genes fueron evaluados con más de un ensayo de cultivo tisular y se repitieron los resultados obtenidos. El evento con valor-p < 0,1 fue considerado estadísticamente significativo.
Tabla 50
Las plantas transgénicas que expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención exhiben una biomasa vegetal mejorada (peso seco y peso fresco) en condiciones de nitrógeno limitado
Nombre del gen \ Evento # Peso seco Peso fresco
Prom. Valor-p % incremento Prom. Valor-p % incremento
EUN227 9851,4 0,170 1,8E-01 18,41 1,631 2, 1 E-01 12,64
EUN227 9854,2 0,163 1.7E-01 13,18 1,744 2,lE-02 20,41
EUN227 9853,1 0,202 2,1E-01 40,61 2,019 l,9E-02 39,40
EUN227 9852,3 0,199 2.6E-01 38,87 1,794 3.7E-01 23,86
Control 0,144 1,448
EUN233 10174,3 0,128 1,3E-01 21,58 1,206 l,0E-Ol 19,80
EUN233 10173,7 0,143 l,4E-02 36,31 1,210 3,8E-01 20,15
Control 0,105 1,007
EUN256 10063,4 0,139 4,0E-01 32,65 1,363 1,6E-01 35,31
EUN256 10061,3 0,118 5,8E-01 12,64 1,025 9.2E-01 1,80
Control 0,105 1,007
EUN512 9282,3 0,177 2.0E-01 23,20 1 ,881 2,8E-03 29,90
Control 0,144 1,448
EUNS14 9403,5 0,168 2,3E-02 17,10 1,556 5,9E-01 7,46
EUN514 9402,2 0,161 2,2E-01 11,88 1,769 3,7E-02 22,13
EUN514 9404,5 0,153 5,0E-01 6,65 1,531 3, 9 E-01 5,73
EUN514 9402,5 0,171 1,7E-01 19,28 1,488 7,3E-01 2,71
Control 0,144 1,448
EUN531 10081,5 0,115 5,2E-01 10,00 1,086 5,9E-01 7,83
Control 0,105 1,007
EUN532 9222,4 0,175 4,9E-01 21,89 1,750 3, 4 E-01 20,84
EUN532 9223,3 0,156 2,3E-01 8,83 1,556 2,8E-01 7,46
EUN532 9223,5 0,164 4,4E-01 14,05 1,669 5,3E-02 15,23
Control 0,144 1,448
EUN537 9391,1 0,178 1,3E-01 24,07 1,669 4,8E-02 15,23
EUN537 9393,1 0,168 2,4E-01 16,92 1,743 3,2E-02 20,35
Control 0,144 1,448
Tabla 50: Análisis de biomasa vegetal (peso seco y peso fresco) de las plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) , bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S) , cuando se desarrollan en condiciones estándar de nitrógeno (6 mM KN03, 1 inM KH2P04, 1 mM MgS04, 2 mM CaC12 y microelementos) comparados con las plantas de control. " Prom." = promedio.
Tabla 51
Las plantas transgénicas que expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención
exhiben una biomasa vegetal mejorada (diámetro y área de roseta y cobertura de parcela) en condiciones estándar de nitrógeno
Tabla 51: Análisis de biomasa vegetal (diámetro y área de roseta y cobertura de parcela) de las plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) , bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S) , cuando se desarrollan en condiciones estándar de nitrógeno (6 mM KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 2 mM CaC12 y microelementos ) comparados con las plantas de control. "Incr." = incremento; " Prom. " = promedio .
Los genes presentados en la Tabla 52, más adelante, tienen una EUN vegetal mejorada cuando se desarrollaron en condiciones estándar de crecimiento con nitrógeno, comparados con las plantas de control. Estos genes produjeron áreas fotosintéticas más grandes como se puede observar por su mayor cantidad de hojas, área de corte de la hoja y área de peciolo, comparados con las plantas de control.
La Tabla 52 ilustra el análisis del área fotosintética de la planta (cantidad de hojas y área de pecilo) cuando se desarrollan en condiciones estándar de nitrógeno (6 mM KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 2 mM CaC12 y microelementos) en plantas que sobreexpresan los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S)). Se realizó la evaluación de cada gen realizando el ensayo de rendimiento de varios eventos. Algunos de los genes
fueron evaluados con más de un ensayo de cultivo tisular y se repitieron los resultados obtenidos. El evento con valor-p < 0,1 fue considerado estadísticamente significativo.
Tabla 52
Las plantas transgénicas ,que expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención exhiben áreas fotosintéticas mejoradas (área de corte de la hoja y longitud del pecíolo de la hoja) en condiciones de crecimiento con nitrógeno estándar
Tabla 52: Análisis áreas fotosintéticas (área de corte la hoja y 'longitud pecíolo de la hoja) de las plantas
transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) , bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S), cuando se desarrollan en condiciones estándar de nitrógeno (6 m KN03, 1 mM KH2P04, 1 mM MgS04, 2 mM CaC12 y microelementos) comparados con las plantas de control. " Prom. " = promedio.
EJEMPLO 8
EVALUACIÓN DEL DESARROLLO DE PLANTAS TRANSGÉNICAS EN CONDICIONES DE ESTRÉS ABIÓTICO
Una de las consecuencias de la sequía es la inducción de estrés osmótico en el área que rodea las raíces; por lo tanto, en muchos estudios científicos, se utiliza PEG (por ejemplo, 1,5 % PEG8000) para simular las condiciones de estrés osmótico que simulan la elevada osmolaridad encontrada durante el estrés por sequía.
Ensayo 1: Ensayo de tolerancia al estrés abiótico en condiciones de cultivo tisular - Se evaluó el desarrollo de la planta en condiciones de salinidad (150 mM NaCl) o estrés osmótico [poli (etilén glicol) (PEG)] en un cultivo tisular.
Se siembran semillas esterilizadas en superficie en un medio basal [medio de Murashige-Skoog 50 % (MS) suplementado con agar para tejidos vegetales al 0,8 % como agente solidificante] en presencia de kanamicina (para seleccionar sólo las plantas transgénicas) . Después de sembrar, se
transfirieron las placas durante 2-3 días para estratificación a 4 °C y luego se desarrollaron a 25 °C bajo ciclos diarios de 12 horas de luz, 12 horas de oscuridad durante 7 a 10 días. En este momento, se transfieren cuidadosamente plántulas elegidas aleatoriamente a las placas que contienen 150 mM o 1,5 % PEG: 0,5 medio MS o condiciones de Crecimiento Normal (0,5 medio MS) . Cada placa contenia 5 -plántulas del mismo evento transgénico, y habla 3-4 placas diferentes (replicados) para cada evento. Para cada polinucleótido de la invención, se analizaron al menos cuatro eventos diferentes de transformación de cada constructo. Las plantas que expresan a los polinucleótidos de la invención, se compararon con la medición porcentual de las plantas de control (vector vacio o gen reportero GUS bajo el mismo promotor) utilizada en el mismo experimento.
Captura de imágenes digitales - Para capturar imágenes de los plantines sembrados en placas de agar, se utilizó un sistema de adquisición de imágenes de laboratorio que consiste en una cámara réflex digital (Canon EOS 300D) , con una lente de longitud focal 55 mm (Canon Serie EF-S), montada en un dispositivo de reproducción (Kaiser RS) , que incluía 4 unidades de luz (bombilla de luz 4x150 Vatios) y ubicada en un cuarto oscuro .
Se utilizó un sistema de análisis de imágenes que consistía en una computadora personal de escritorio (procesador
Intel P4 3.0 GHz) y un programa de dominio público - ImageJ 1.39 [Programa para procesamiento de imágenes basado en Java que fue desarrollado en U.S. National Institutes of Health y disponible gratis en internet en Hypertext Transfer Protocol : //rsbweb (punto) nih (punto) gov/]. Las imágenes se capturaron en una resolución de 10 Mega Pixeles (3888 x 2592 pixeles) y se almacenó en un formato JPEG de baja compresión (estándar Joint Photographic Experts Group) . Luego, los datos analizados se guardaron en archivos de texto y se procesaron usando software para análisis estadístico JMP (Instituto SAS).
Análisis de plántulas - Se calcularon los datos del análisis digital de plántulas incluyendo área de hoja, cobertura de raíz y longitud de raíz.
La tasa de crecimiento relativo para los diversos parámetros de la plántula se calculó de acuerdo con las fórmulas V, VI y VII, como se describió anteriormente.
Fórmula V:
Tasa de crecimiento relativa de área de hoja = Coeficiente de regresión de área de hoja con el transcurso del tiempo.
Fórmula VI:
Tasa de crecimiento relativa de cobertura de raíz= Coeficiente de regresión de cobertura de raíz con el transcurso del tiempo.
Fórmula VII:
Tasa de crecimiento relativa de longitud de raíz
Coeficiente de regresión de cobertura de raiz con el transcurso del tiempo.
Al final del experimento, se retiraron las plántulas del medio y se pesaron para determinar el peso fresco de la planta. Luego se secaron las plántulas durante 24 horas a 60 °C y se pesaron otra vez para medir el peso seco de la planta para un posterior análisis estadístico. Se determinó la tasa de crecimiento comparando la cobertura de área de hoja, cobertura de raíz y longitud de raíz, entre cada par de fotografías secuenciales y se utilizaron los resultados para resolver ' el efecto del gen introducido sobre el vigor de la planta bajo estrés osmótico así como también, en condiciones óptimas. De manera similar, el efecto del gen introducido sobre la acumulación de biomasa, bajo estrés osmótico así como también en condiciones óptimas, se determinó comparando el peso fresco y seco de las plantas con el de las plantas de control (que contienen un vector vacío o el gen reportero GUS bajo el mismo promotor) . De cada constructo creado, se examinaron 3-5 eventos de transformación independientes en replicados.
Análisis estadístico - Para identificar genes que confieren una tolerancia significativamente mejorada al estrés abiótico o arquitectura agrandada de raíz, se compararon los resultados obtenidos de las plantas transgénicas con aquellos obtenidos de las plantas de control. Para identificar los genes y constructos con mayor rendimiento, se analizaron
separadamente los resultados probados de los eventos de transformación independiente. Para evaluar el efecto de un evento génico con respecto a los datos de control, se analizaron mediante la prueba T de Student y se calculó el valor p. Los resultados fueron considerados significativos si p = 0,1. Se utilizó el paquete de software estadístico JMP (Versión 5.2.1, SAS Institute Inc., Cary, NC, Estados Unidos).
Resultados experimentales:
Los genes presentados en las Tablas 53, 54 y 55, más adelante, tienen una (tolerancia al estrés abiótico) mejorada cuando se desarrollan en niveles de elevada concentración de salinidad, comparados con las plantas de control. Los resultados demostraron que los genes tmabién mejoraron el rendimiento de la planta en condiciones de no-salinidad.
Las Tablas 53, 54 y 55 ilustran los análisis de rendimiento de la planta (área de hojas y raíces) en condiciones normales (0 mM NaCl) o de elevada salinidad (150 mM NaCl) de plantas que sobreexpresan los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S) . Se realizó la evalulación de cada gen realizando el ensayo de rendimiento de varios eventos. Algunos de los genes fueron evaluados con más de un ensayo de cultivo tisular y se repitieron los resultados obtenidos.- El evento con valor-p < 0,1 fue considerado estadísticamente significativo .
Tabla 53
Las plantas transgénicas que expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención exhiben un mejorado rendimiento de la planta (área de hojas y raices) en condiciones normales (estándar)
Tabla 53: Análisis del rendimiento de la planta (área de hojas y de raices) de las plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) , bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S) , cuando se desarrollan en condiciones estándar (0 mM NaCl) comparados con las plantas de control.
Tabla 54
Las plantas transgénicas que expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención exhiben un mejorado rendimiento de la planta (área de hojas) bajo estés salino
Area de hojas fcm2/
Nombre del gen Evento
Tratamiento Promedio Estadística % incremento
150 m NaCl CT81 4991 ,1 0,25 A 27,57
150 mM NaCl CT81 4995,1 0,21 B 3,74
Area de hojas fcm2/
Nombre del gen Evento
Tratamiento Promedio Estadística % incremento
150 m NaCl CT81 4993,1 0,20 B 2,09
150 mM NaCl Control 4543,3 0,20 B
Tabla 54: Análisis de rendimiento de la planta (área de hojas) de las plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior), bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S), cuando se desarrollan en condiciones de salinidad (150 mM NaCl) comparados con las plantas de control.
Tabla 55
Las plantas transgénicas que expresan exógenamente los polinucleótidos de algunas realizaciones de la invención exhiben un mejorado rendimiento de la planta (área de raices) en condiciones de salinidad
Table 55: Análisis de rendimiento de la planta (área de raices) of plantas transgénicas que sobreexpresan los polinucleótidos exógenos de algunas realizaciones de la invención (usando los genes clonados o sintéticos enumerados en la Tabla 23 anterior) bajo la regulación de un promotor constitutivo (35S) cuando se desarrollan en condiciones de
salinidad (150 mM NaCl) comparados con las plantas de control.
Si bien la invención ha sido descripta junto con sus realizaciones especificas, es evidente que serán obvias para el experto en el arte, muchas alternativas, modificaciones y variaciones. De esta forma, se pretende incluir todas dichas alternativas, modificaciones y variaciones que están dentro del espíritu y amplio alcance de las reivindicaciones anexas.
Todas las publicaciones, patentes y solicitudes de patentes mencionadas en esta especificación, se incorporan aquí completas como referencia en la memoria descriptiva, como si cada publicación, patente o solicitud de patente hubiera sido específica e individualmente indicada para ser incorporada aquí como referencia. Además, no debe considerarse cada cita o identificación de cualquier referencia de esta solicitud como el reconocimiento de que dicha referencia está disponible en el arte previo de la invención. Hasta el grado en que se utilizan, los títulos de sección no deben ser necesariamente considerados limitantes .
Claims (15)
1. Un método para incrementar la eficiencia de uso de nitrógeno, eficiencia de uso de fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite y/o tolerancia al estrés abiótico de una planta, caracterizado porque comprende expresar dentro de la planta un polinucleótido exógeno que comprende una secuencia de ácido nucleico que codifica un polipéptido por lo menos 80% idéntica a SEQ ID NO:2557, 2560, 184, 238, 188, 154-156, 158-161, 163-183, 185-187, 189-197, 200-237, 239-264, 266-269, 1351, 1365-1425, 1429-1457, 1459, 1461-1730, 1735, 1739-2397, 2533-2541, 2544-2556, 2558, 2559, 2561-2562 o 2563, para de esta manera incrementar la eficiencia de uso de nitrógeno, eficiencia de uso de fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite y/o tolerancia al estrés abiótico de la planta .
2. Un método para incrementar la eficiencia de uso de nitrógeno, eficiencia de uso de fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite y/o tolerancia al estrés abiótico de una planta, caracterizado porque comprende expresar dentro de la planta un polinucleótido exógeno que comprende una secuencia de ácido nucleico que codifica un polipéptido seleccionada del grupo que consiste de SEQ ID NOs:2557, 2560, 184, 238, 188, 154-156, 158-161, 163-183, 185-187, 189-197, 200-237, 239-264, 266-269, 1351, 1365- 1425, 1429-1457, 1459, 1461-1730, 1735, 1739-2397, 2533-2541, 2544-2556, 2558, 2559, 2561-2563, 138-143, 146, 148, 150-152, 157, 162, 198, 265, 1334-1350, 1352-1364, 1426-1428, 1458, 1460, 1732-1734, 1737-1738, 2523-2532, 2542 y 2543, para de esta manera incrementar la eficiencia de uso de nitrógeno, eficiencia de uso de fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite y/o tolerancia al estrés abiótico de la planta.
3. El método de conformidad con la reivindicación 1 o 2, caracterizado porque el polinucleótido exógeno comprende una secuencia de ácido nucleico por lo menos 80% idéntica a SEQ ID NO:2506, 2512, 2442, 2496, 2446, 1, 2, 4, 7, 8, 11, 12, 13, 16-19, 21-60, 63-128, 130-137, 270-287, 289-293, 295-306, 308-362, 364-666, 671, 673-1333, 2414-2441, 2443-2445, 2447-2455, 2458-2495, 2497-2505, 2507-2511, 2513-2521 o 2522.
4. El método de conformidad con la reivindicación 1 o 2, caracterizado porque el polinucleótido exógeno comprende la secuencia de ácido nucleico seleccionada del grupo que consiste de SEQ ID NOs:2506, 2512, 2442, 2496, 2446, 1, 2, 4, 7, 8, 11, 12, 13, 16-19, 21-60, 63-128, 130-137, 270-287, 289-293, 295-306, 308-362, 364-666, 671, 673-1333, 2414-2441, 2443-2445, 2447-2455, 2458-2495, 2497-2505, 2507-2511, 2513-2522, 3, 5, 6, 9, 10, 14, 15, 20, 61, 62, 129, 288, 294, 307, 363, 667, 668, 669, 670, 672, 2398-2413, 2456 y 2457.
5. Un polinucleótido aislado, caracterizado porque comprende una secuencia de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende una secuencia de aminoácidos por lo menos 80% homologa a la secuencia de aminoácidos expuesta en SEQ ID NO:2557, 2560, 184, 238, 188, 154-156, 158-161, 163-183, 185-187, 189-197, 200-237, 239-264, 266-269, 1351, 1365-1425, 1429-1457, 1459, 1461-1730, 1735, 1739-2397, 2533-2541, 2544-2556, 2558, 2559, 2561-2562 o 2563, en donde la secuencia de aminoácidos es capaz de incrementar la eficiencia de uso de nitrógeno, eficiencia de uso de fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite y/o tolerancia al estrés abiótico de una planta.
6. Un polinucleótido aislado, caracterizado porque comprende una secuencia de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste de SEQ ID NOs:2557, 2560, 184, 238, 188, 154-156, 158-161, 163-183, 185-187, 189-197, 200-237, 239-264, 266-269, 1351, 1365-1425, 1429-1457, 1459, 1461-1730, 1735, 1739-2397, 2533-2541, 2544-2556, 2558, 2559, 2561-2563, 138-143, 146, 148, 150-152, 157, 162, 198, 265, 1334-1350, 1352-1364, 1426-1428, 1458, 1460, 1732-1734, 1737-1738, 2523-2532, 2542 y 2543.
7. El polinucleótido aislado de conformidad con la reivindicación 5 o 6, caracterizado porque la secuencia de ácido nucleico es por lo menos 80% idéntica a SEQ ID NO:2506, 2512, 2442, 2496, 2446, 1, 2, 4, 7, 8, 11, 12, 13, 16-19, 21- 60, 63-128, 130-137, 270-287, 289-293, 295-306, 308-362, 364-666, 671, 673-1333, 2414-2441, 2443-2445, 2447-2455, 2458-2495, 2497-2505, 2507-2511, 2513-2521 o 2522.
8. El polinucleótido aislado de conformidad con la reivindicación 5 o 6, caracterizado porque la secuencia de ácido nucleico se selecciona del qrupo que consiste de SEQ ID NOs:2506, 2512, 2442, 2496, 2446, 1, 2, 4, 7, 8, 11, 12, 13, 16-19, 21-60, 63-128, 130-137, 270-287, 289-293, 295-306, 308-362, 364-666, 671, 673-1333, 2414-2441, 2443-2445, 2447-2455, 2458-2495, 2497-2505, 2507-2511, 2513-2522, 3, 5, 6, 9, 10, 14, 15, 20, 61, 62, 129, 288, 294, 307, 363, 667, 668, 669, 670, 672, 2398-2413, 2456 y 2457.
9. Un constructo de ácido nucleico, caracterizado porque comprende el polinucleótido aislado de la reivindicación 5, 6, 7 u 8 y un promotor para dirigir la transcripción de la secuencia de ácido nucleico en una célula hospedera.
10. Un polipéptido aislado, caracterizado porque comprende una secuencia de aminoácidos por lo menos 80% homologa a SEQ ID NO:2557, 2560, 184, 238, 188, 154-156, 158-161, 163-183, 185-187, 189-197, 200-237, 239-264, 266-269, 1351, 1365-1425, 1429-1457, 1459, 1461-1730, 1735, 1739-2397, 2533-2541, 2544-2556, 2558, 2559, 2561-2562 o 2563 en donde la secuencia de aminoácidos es capaz de incrementar la eficiencia de uso de nitrógeno, eficiencia de uso de fertilizante, rendimiento, tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite y/o tolerancia al estrés abiótico de una planta.
11. Un polipéptido aislado, caracterizado porque comprende la secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste de SEQ ID NOs:2557, 2560, 184, 238, 188, 154-156, 158-161, 163-183, 185-187, 189-197, 200-237, 239-264, 266-269, 1351, 1365-1425, 1429-1457, 1459, 1461-1730, 1735, 1739-2397, 2533-2541, 2544-2556, 2558, 2559, 2561-2563, 138-143, 146, 148, 150-152, 157, 162, 198, 265, 1334-1350, 1352-1364, 1426-1428, 1458, 1460, 1732-1734, 1737-1738, 2523-2532, 2542 y 2543.
12. Una célula de planta, caracterizada porque expresa exógenamente el polinucleótido de la reivindicación 5, 6, 7 u 8, el constructo de ácido nucleico de la reivindicación 9 o el polipéptido de la reivindicación 10 u 11.
13. La célula de planta de conformidad con la reivindicación 12, caracterizada porque la célula de planta forma parte de una planta.
14. El método de conformidad con la reivindicación 1, 2 , 3 o 4, caracterizado porque además comprende cultivar la planta que expresa el polinucleótido exógeno bajo estrés abiótico.
15. El método de conformidad con la reivindicación 1, 2, 3, 4 o 14, el polinucleótido aislado de la reivindicación 5, el constructo^ de ácido nucleico de la reivindicación 9, el polipéptido aislado de la reivindicación 10, o la célula de planta de la reivindicación 12, caracterizado porque el estrés abiótico se selecciona del grupo que consiste de salinidad, sequía, privación de agua, inundación, etiolación, baj temperatura, alta temperatura, toxicidad con metales pesados anaerobiosis, deficiencia de nutrientes, exceso de nutrientes contaminación atmosférica e irradiación UV.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US13618908P | 2008-08-18 | 2008-08-18 | |
| PCT/IB2009/053633 WO2010020941A2 (en) | 2008-08-18 | 2009-08-18 | Isolated polypeptides and polynucleotides useful for increasing nitrogen use efficiency, abiotic stress tolerance, yield and biomass in plants |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| MX2011001741A true MX2011001741A (es) | 2011-03-29 |
Family
ID=41707523
Family Applications (3)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| MX2011001741A MX2011001741A (es) | 2008-08-18 | 2009-08-18 | Polipeptidos y polinucleotidos aislados utiles para mejorar la eficacia en el uso de nitrogeno tolerancia al estres abiotico, rendimiento y biomasa en plantas. |
| MX2013009706A MX361687B (es) | 2008-08-18 | 2009-08-18 | Polipeptidos y polinucleotidos aislados utiles para mejorar la eficacia en el uso de nitrogeno, tolerancia al estrés abiotico, rendimiento y biomasa en plantas. |
| MX2018015309A MX2018015309A (es) | 2008-08-18 | 2011-02-11 | Polipeptidos y polinucleotidos aislados utiles para mejorar la eficacia en el uso de nitrogeno, tolerancia al estres abiotico, rendimiento y biomasa en plantas. |
Family Applications After (2)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| MX2013009706A MX361687B (es) | 2008-08-18 | 2009-08-18 | Polipeptidos y polinucleotidos aislados utiles para mejorar la eficacia en el uso de nitrogeno, tolerancia al estrés abiotico, rendimiento y biomasa en plantas. |
| MX2018015309A MX2018015309A (es) | 2008-08-18 | 2011-02-11 | Polipeptidos y polinucleotidos aislados utiles para mejorar la eficacia en el uso de nitrogeno, tolerancia al estres abiotico, rendimiento y biomasa en plantas. |
Country Status (10)
| Country | Link |
|---|---|
| US (7) | US9018445B2 (es) |
| EP (4) | EP3072972B1 (es) |
| AR (1) | AR073076A1 (es) |
| AU (5) | AU2009283785B2 (es) |
| BR (9) | BR122021014201B1 (es) |
| CA (2) | CA2732773C (es) |
| HU (1) | HUE048303T2 (es) |
| MX (3) | MX2011001741A (es) |
| WO (1) | WO2010020941A2 (es) |
| ZA (1) | ZA201100918B (es) |
Families Citing this family (47)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US7554007B2 (en) | 2003-05-22 | 2009-06-30 | Evogene Ltd. | Methods of increasing abiotic stress tolerance and/or biomass in plants |
| AU2005234725B2 (en) | 2003-05-22 | 2012-02-23 | Evogene Ltd. | Methods of Increasing Abiotic Stress Tolerance and/or Biomass in Plants and Plants Generated Thereby |
| CA2570195C (en) | 2004-06-14 | 2017-10-24 | Evogene Ltd. | Polynucleotides and polypeptides involved in plant fiber development and methods of using same |
| WO2007049275A2 (en) | 2005-10-24 | 2007-05-03 | Evogene Ltd. | Isolated polypeptides, polynucleotides encoding same, transgenic plants expressing same and methods of using same |
| WO2008073578A2 (en) | 2006-12-08 | 2008-06-19 | Iowa State University Research Foundation, Inc. | Plant genes involved in nitrate uptake and metabolism |
| MX2009006660A (es) | 2006-12-20 | 2009-08-20 | Evogene Ltd | Polinucleotidos y polipeptidos involucrados en el desarrollo de fibra vegetal y metodos de uso. |
| US8513488B2 (en) | 2007-04-09 | 2013-08-20 | Evogene Ltd. | Polynucleotides, polypeptides and methods for increasing oil content, growth rate and biomass of plants |
| EP2183371B1 (en) | 2007-07-24 | 2015-07-01 | Evogene Ltd. | Polynucleotides, polypeptides encoded thereby, and methods of using same for increasing abiotic stress tolerance and/or biomass and/or yield in plants expressing same |
| BRPI0819476A2 (pt) | 2007-12-27 | 2015-07-14 | Evogene Ltd | Método de melhorar a tolerância ao estresse abiótico de uma planta, método de melhorar a eficiência do uso de água, eficiência do uso de fertilizante, biomassa, vigor e/ou produção de uma planta, polinucleotídeo isolado, constructo de ácido nuclêico, polipeptídio isolado, célula de planta" |
| CA3021575C (en) | 2008-05-22 | 2022-04-12 | Evogene Ltd. | Isolated polynucleotides and polypeptides and methods of using same for increasing plant yield, biomass, growth rate, vigor, oil content, abiotic stress tolerance of plants and nitrogen use efficiency |
| BR122021014201B1 (pt) | 2008-08-18 | 2022-08-16 | Evogene Ltd. | Método para aumentar a eficiência de uso do nitrogênio, eficiência de uso de fertilizantes, produção, taxa de crescimento, vigor, biomassa, e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta, e, construção de ácido nucleico isolado |
| WO2010049897A2 (en) | 2008-10-30 | 2010-05-06 | Evogene Ltd. | Isolated polynucleotides and polypeptides and methods of using same for increasing plant yield, biomass, growth rate, vigor, oil content, abiotic stress tolerance of plants and nitrogen use efficieny |
| CA3052515A1 (en) | 2008-12-29 | 2010-07-08 | Evogene Ltd. | Polynucleotides, polypeptides encoded thereby, and methods of using same for increasing abiotic stress tolerance, biomass and/or yield in plants expressing same |
| CA2753616C (en) | 2009-03-02 | 2018-07-17 | Evogene Ltd. | Isolated polynucleotides and polypeptides, and methods of using same for increasing plant yield and/or agricultural characteristics |
| BRPI1009032B1 (pt) | 2009-06-10 | 2019-05-28 | Evogene Ltd. | Método de aumento de eficiência no uso de nitrogênio, biomassa, taxa de crescimento, e/ou tolerância a deficiência de nitrogênio de uma planta |
| MX374069B (es) | 2009-08-04 | 2020-07-30 | Evogene Ltd | Polinucleotidos y polipeptidos aislados, y metodos para utilizarlos para mejorar la tolerancia al estres abiotico, rendimiento,tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite y/o eficacia en el uso de nitrogeno de las plantas. |
| AR081095A1 (es) | 2009-12-28 | 2012-06-13 | Evogene Ltd | Polinucleotidos y polipeptidos aislados y metodos para utilizarlos para aumentar el rendimiento de la planta, biomasa, tasa de crecimiento, vigor, contenido de aceite, tolerancia al estres abiotico y eficacia en el uso de nitrogeno |
| EP2563112A4 (en) | 2010-04-28 | 2014-03-05 | Evogene Ltd | INSULATED POLYNUCLEOTIDES AND POLYPEPTIDES AND METHODS OF USING THE SAME FOR INCREASING PLANT YIELD AND / OR AGRICULTURAL CHARACTERISTICS |
| BR122019017041B1 (pt) | 2010-08-30 | 2021-11-23 | Evogene Ltd | Método de aumento de eficiência do uso de nitrogênio, área fotossintética, biomassa, taxa de crescimento, vigor, e/ou tolerância à deficiência por nitrogênio de uma planta e/ou redução do tempo de floração e/ou emergência de inflorescência de uma planta em comparação com uma planta nativa |
| BR122021002248B1 (pt) | 2010-12-22 | 2022-02-15 | Evogene Ltd | Método para aumentar a tolerância ao estresse abiótico, produção, biomassa, e/ou taxa de crescimento de uma planta |
| HUE053720T2 (hu) | 2011-01-14 | 2021-07-28 | Univ California | ROR-1 fehérje elleni terápiás antitestek és eljárások alkalmazásukra |
| CN102174527B (zh) * | 2011-01-27 | 2013-10-30 | 中国科学院遗传与发育生物学研究所 | 直立密穗基因提高氮肥利用效率的新应用 |
| MX354195B (es) | 2011-05-03 | 2018-02-16 | Evogene Ltd | Polipeptidos y polinucleotidos aislados y metodos para su uso, para aumentar el rendimiento, la biomasa, el indice de crecimiento, el vigor, el contenido de aceite, la tolerancia al estrés abiotico de las plantas y la eficiencia en el uso de nitrogeno. |
| CA3177736A1 (en) | 2011-08-23 | 2013-02-28 | Evogene Ltd. | Isolated polynucleotides and polypeptides, and methods of using same for increasing plant yield and/or agricultural characteristics |
| US10000768B2 (en) | 2011-11-21 | 2018-06-19 | Syngenta Participations Ag | Compositions and methods for increasing nematode resistance in plants |
| BR122019023058B1 (pt) | 2011-11-28 | 2021-04-06 | Evogene Ltd. | Método para aumento da eficiência no uso de nitrogênio, produção, biomassa, taxa de crescimento, vigor, teor de óleo, e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta e construto de ácido nucleico isolado |
| WO2013098819A1 (en) | 2011-12-28 | 2013-07-04 | Evogene Ltd. | Isolated polynucleotides and polypeptides, and methods of using same for increasing yield of plants |
| BR122020018472B1 (pt) | 2012-02-29 | 2022-05-03 | Evogene Ltd | Método para aumentar o rendimento, a taxa de crescimento, a biomassa, o comprimento da raiz e/ou a taxa de crescimento relativo da cobertura da raiz, e, construção de ácido nucleico isolado |
| CN104520312B (zh) * | 2012-02-29 | 2017-12-19 | 先正达参股股份有限公司 | 种子活力的调节 |
| BR122021002108B1 (pt) | 2012-05-28 | 2022-08-16 | Evogene Ltd | Método para aumentar a produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, produção de sementes, eficiência no uso de nitrogênio, e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta, e, construção de ácido nucleico isolado |
| BR122020018663B1 (pt) | 2012-08-27 | 2022-08-09 | Evogene Ltd | Método para aumentar o rendimento, taxa de crescimento, biomassa, vigor, rendimento da semente, capacidade fotossintética, eficiência do uso de nitrogênio e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta |
| WO2014102773A1 (en) | 2012-12-25 | 2014-07-03 | Evogene Ltd. | Isolated polynucleotides and polypeptides, and methods of using same for increasing nitrogen use efficiency of plants |
| US9771598B2 (en) | 2012-12-26 | 2017-09-26 | Evogene Ltd. | Isolated polynucleotides and polypeptides, construct and plants comprising same and methods of using same for increasing nitrogen use efficiency of plants |
| JP6299030B2 (ja) * | 2013-03-04 | 2018-03-28 | タキイ種苗株式会社 | Prsv抵抗性キュウリ植物、ならびにprsv抵抗性およびzymv抵抗性を示すキュウリ植物の製造方法 |
| MX359122B (es) | 2013-05-22 | 2018-09-14 | Evogene Ltd | Polinucleotidos y polipetidos aislados y metodos para utilizarlos para mejorar el rendimiento y/o caracteristicas agricolas de la planta. |
| BR112016004099A2 (pt) | 2013-08-27 | 2017-10-17 | Evogene Ltd | polinucleotídeos e polipeptídeos isolados e métodos de uso dos mesmos para aumento da produção e/ou características agrícolas da planta |
| MX384480B (es) | 2014-05-28 | 2025-03-14 | Evogene Ltd | Polinucleotidos aislados, polipeptidos y metodos para utilizarlos para aumentar la tolerancia al stress abiotico, la biomasa y el rendimiento de plantas. |
| CA3176207A1 (en) | 2014-08-27 | 2016-03-03 | Evogene Ltd. | Constructs and methods for increasing plant yield or agricultural characteristics or both |
| US11254947B2 (en) | 2015-08-17 | 2022-02-22 | Yeda Research And Development Co. Ltd. | Truncated forms of atypical CYS HIS rich thioredoxin 4 (ACHT4) capable of inhibiting ACHT4-mediated oxidation of the small subunit of ADP-glucose pyrophosphorylase (APS1) |
| CN105399804B (zh) * | 2015-12-03 | 2018-08-31 | 南京农业大学 | 与水稻粒型和叶夹角相关的蛋白及其编码基因的应用 |
| MX2018008037A (es) | 2015-12-28 | 2019-03-11 | Evogene Ltd | Rasgos de plantas conferidos mediante polinucleotidos y polipeptidos aislados. |
| CN110373424B (zh) * | 2019-07-09 | 2022-12-23 | 西藏自治区农牧科学院农业研究所 | 一种含有hvul5h49059.2基因的耐寒水稻的生产方法 |
| CN114250236B (zh) * | 2021-12-31 | 2023-07-21 | 中国农业科学院作物科学研究所 | Dek48基因在调控玉米籽粒发育中的应用 |
| CN116103330B (zh) * | 2023-02-02 | 2024-10-22 | 山西农业大学棉花研究所 | GhACY基因在提高棉花抗旱性和产量中的应用 |
| CN116286875A (zh) * | 2023-04-24 | 2023-06-23 | 浙江大学 | OsNPF5.13在水稻氮高效育种中的应用 |
| CN118956887B (zh) * | 2023-05-15 | 2025-10-17 | 湖南农业大学 | OsAAP16在调控水稻粒型和粒重中的应用 |
| CN117466677B (zh) * | 2023-11-22 | 2025-11-18 | 山东姜本源农业科技有限公司 | 一种生姜直播剂及其制备方法 |
Family Cites Families (200)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US1087905A (en) | 1913-04-26 | 1914-02-17 | George O Ballinger | Combined link and block for conveyers. |
| NL154600B (nl) | 1971-02-10 | 1977-09-15 | Organon Nv | Werkwijze voor het aantonen en bepalen van specifiek bindende eiwitten en hun corresponderende bindbare stoffen. |
| NL154598B (nl) | 1970-11-10 | 1977-09-15 | Organon Nv | Werkwijze voor het aantonen en bepalen van laagmoleculire verbindingen en van eiwitten die deze verbindingen specifiek kunnen binden, alsmede testverpakking. |
| NL154599B (nl) | 1970-12-28 | 1977-09-15 | Organon Nv | Werkwijze voor het aantonen en bepalen van specifiek bindende eiwitten en hun corresponderende bindbare stoffen, alsmede testverpakking. |
| US3901654A (en) | 1971-06-21 | 1975-08-26 | Biological Developments | Receptor assays of biologically active compounds employing biologically specific receptors |
| US3853987A (en) | 1971-09-01 | 1974-12-10 | W Dreyer | Immunological reagent and radioimmuno assay |
| US3867517A (en) | 1971-12-21 | 1975-02-18 | Abbott Lab | Direct radioimmunoassay for antigens and their antibodies |
| NL171930C (nl) | 1972-05-11 | 1983-06-01 | Akzo Nv | Werkwijze voor het aantonen en bepalen van haptenen, alsmede testverpakkingen. |
| US3850578A (en) | 1973-03-12 | 1974-11-26 | H Mcconnell | Process for assaying for biologically active molecules |
| US3935074A (en) | 1973-12-17 | 1976-01-27 | Syva Company | Antibody steric hindrance immunoassay with two antibodies |
| US3996345A (en) | 1974-08-12 | 1976-12-07 | Syva Company | Fluorescence quenching with immunological pairs in immunoassays |
| US4034074A (en) | 1974-09-19 | 1977-07-05 | The Board Of Trustees Of Leland Stanford Junior University | Universal reagent 2-site immunoradiometric assay using labelled anti (IgG) |
| US3984533A (en) | 1975-11-13 | 1976-10-05 | General Electric Company | Electrophoretic method of detecting antigen-antibody reaction |
| US4098876A (en) | 1976-10-26 | 1978-07-04 | Corning Glass Works | Reverse sandwich immunoassay |
| US4879219A (en) | 1980-09-19 | 1989-11-07 | General Hospital Corporation | Immunoassay utilizing monoclonal high affinity IgM antibodies |
| CA1192510A (en) | 1981-05-27 | 1985-08-27 | Lawrence E. Pelcher | Rna plant virus vector or portion thereof, a method of construction thereof, and a method of producing a gene derived product therefrom |
| US5504200A (en) * | 1983-04-15 | 1996-04-02 | Mycogen Plant Science, Inc. | Plant gene expression |
| JPS6054684A (ja) | 1983-09-05 | 1985-03-29 | Teijin Ltd | 新規dνa及びハイブリツドdνa |
| US5011771A (en) | 1984-04-12 | 1991-04-30 | The General Hospital Corporation | Multiepitopic immunometric assay |
| US4666828A (en) | 1984-08-15 | 1987-05-19 | The General Hospital Corporation | Test for Huntington's disease |
| US4945050A (en) | 1984-11-13 | 1990-07-31 | Cornell Research Foundation, Inc. | Method for transporting substances into living cells and tissues and apparatus therefor |
| US5420034A (en) * | 1986-07-31 | 1995-05-30 | Calgene, Inc. | Seed-specific transcriptional regulation |
| US4943674A (en) * | 1987-05-26 | 1990-07-24 | Calgene, Inc. | Fruit specific transcriptional factors |
| CA1288073C (en) | 1985-03-07 | 1991-08-27 | Paul G. Ahlquist | Rna transformation vector |
| US4683202A (en) | 1985-03-28 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying nucleic acid sequences |
| US4801531A (en) * | 1985-04-17 | 1989-01-31 | Biotechnology Research Partners, Ltd. | Apo AI/CIII genomic polymorphisms predictive of atherosclerosis |
| US5569597A (en) | 1985-05-13 | 1996-10-29 | Ciba Geigy Corp. | Methods of inserting viral DNA into plant material |
| GB8608850D0 (en) | 1986-04-11 | 1986-05-14 | Diatech Ltd | Packaging system |
| JPS6314693A (ja) | 1986-07-04 | 1988-01-21 | Sumitomo Chem Co Ltd | 植物ウイルスrnaベクタ− |
| US5268463A (en) | 1986-11-11 | 1993-12-07 | Jefferson Richard A | Plant promoter α-glucuronidase gene construct |
| US5608142A (en) | 1986-12-03 | 1997-03-04 | Agracetus, Inc. | Insecticidal cotton plants |
| ATE108828T1 (de) | 1987-02-09 | 1994-08-15 | Lubrizol Genetics Inc | Hybrides rns-virus. |
| US5316931A (en) | 1988-02-26 | 1994-05-31 | Biosource Genetics Corp. | Plant viral vectors having heterologous subgenomic promoters for systemic expression of foreign genes |
| US5693507A (en) | 1988-09-26 | 1997-12-02 | Auburn University | Genetic engineering of plant chloroplasts |
| US5495070A (en) * | 1988-10-04 | 1996-02-27 | Agracetus, Inc. | Genetically engineering cotton plants for altered fiber |
| US5597718A (en) | 1988-10-04 | 1997-01-28 | Agracetus | Genetically engineering cotton plants for altered fiber |
| US5272057A (en) | 1988-10-14 | 1993-12-21 | Georgetown University | Method of detecting a predisposition to cancer by the use of restriction fragment length polymorphism of the gene for human poly (ADP-ribose) polymerase |
| US5302523A (en) | 1989-06-21 | 1994-04-12 | Zeneca Limited | Transformation of plant cells |
| US6329570B1 (en) | 1989-07-19 | 2001-12-11 | Calgene, Llc | Cotton modification using ovary-tissue transcriptional factors |
| US5192659A (en) * | 1989-08-25 | 1993-03-09 | Genetype Ag | Intron sequence analysis method for detection of adjacent and remote locus alleles as haplotypes |
| US5859330A (en) * | 1989-12-12 | 1999-01-12 | Epitope, Inc. | Regulated expression of heterologous genes in plants and transgenic fruit with a modified ripening phenotype |
| EP0452269B1 (en) | 1990-04-12 | 2002-10-09 | Syngenta Participations AG | Tissue-preferential promoters |
| US5498830A (en) | 1990-06-18 | 1996-03-12 | Monsanto Company | Decreased oil content in plant seeds |
| US5187267A (en) * | 1990-06-19 | 1993-02-16 | Calgene, Inc. | Plant proteins, promoters, coding sequences and use |
| US5399680A (en) | 1991-05-22 | 1995-03-21 | The Salk Institute For Biological Studies | Rice chitinase promoter |
| ATE186571T1 (de) | 1991-08-27 | 1999-11-15 | Novartis Ag | Proteine mit insektiziden eigenschaften gegen homopteran insekten und ihre verwendung im pflanzenschutz |
| UA48104C2 (uk) | 1991-10-04 | 2002-08-15 | Новартіс Аг | Фрагмент днк, який містить послідовність,що кодує інсектицидний протеїн, оптимізовану для кукурудзи,фрагмент днк, який забезпечує направлену бажану для серцевини стебла експресію зв'язаного з нею структурного гена в рослині, фрагмент днк, який забезпечує специфічну для пилку експресію зв`язаного з нею структурного гена в рослині, рекомбінантна молекула днк, спосіб одержання оптимізованої для кукурудзи кодуючої послідовності інсектицидного протеїну, спосіб захисту рослин кукурудзи щонайменше від однієї комахи-шкідника |
| ZA927576B (en) | 1991-10-04 | 1993-04-16 | Univ North Carolina State | Pathogen-resistant transgenic plants. |
| US5356816A (en) | 1991-11-19 | 1994-10-18 | Board Of Trustees Operating Michigan State University | Method and compositions using polypeptides of arabidopsis thaliana |
| US5281521A (en) * | 1992-07-20 | 1994-01-25 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Modified avidin-biotin technique |
| US5296462A (en) * | 1992-11-19 | 1994-03-22 | Board Of Trustees Operating Michigan State University | Method and compositions using polypeptides of arabidopsis thaliana |
| US5521708A (en) * | 1992-11-25 | 1996-05-28 | Canon Information & Systems, Inc. | Correlated color temperature detector |
| ZA939767B (en) | 1993-01-21 | 1994-09-14 | Univ North Carolina State | Nematode-resistant transgenic plants |
| JPH08509871A (ja) | 1993-09-30 | 1996-10-22 | アグラシータス インコーポレイテッド | 異種ペルオキシダーゼを生産するトランスジェニック綿植物 |
| US5598515A (en) * | 1994-01-10 | 1997-01-28 | Gen Tech Corp. | System and method for reconstructing surface elements of solid objects in a three-dimensional scene from a plurality of two dimensional images of the scene |
| US5608144A (en) | 1994-08-12 | 1997-03-04 | Dna Plant Technology Corp. | Plant group 2 promoters and uses thereof |
| US7262055B2 (en) | 1998-08-25 | 2007-08-28 | Gendaq Limited | Regulated gene expression in plants |
| US6310194B1 (en) * | 1994-09-26 | 2001-10-30 | Carnegie Institution Of Washington | Plant fatty acid hydroxylases |
| US5961466A (en) | 1995-01-03 | 1999-10-05 | Omnicorder Technologies, Inc. | Method of detection of cancerous lesions by their effect on the spatial distribution of modulation of temperature and homogeneity of tissue |
| US5659026A (en) | 1995-03-24 | 1997-08-19 | Pioneer Hi-Bred International | ALS3 promoter |
| JPH11507233A (ja) | 1995-06-07 | 1999-06-29 | カルジーン,インコーポレーテッド | 綿繊維転写因子 |
| JPH0967270A (ja) * | 1995-08-31 | 1997-03-11 | Res Dev Corp Of Japan | 水晶体混濁の予防および治療法、並びにそのための薬 剤 |
| US6084153A (en) * | 1996-02-14 | 2000-07-04 | The Governors Of The University Of Alberta | Plants having enhanced nitrogen assimilation/metabolism |
| JPH1094392A (ja) | 1996-09-20 | 1998-04-14 | Nisshinbo Ind Inc | ワタ遺伝子 |
| AU4722797A (en) | 1996-10-24 | 1998-05-15 | Japan Tobacco Inc. | Method for controlling water content of plant |
| IL119831A (en) | 1996-12-15 | 2002-12-01 | Cognitens Ltd | A device and method for three-dimensional reconstruction of the surface geometry of an object |
| AU732481B2 (en) * | 1997-01-21 | 2001-04-26 | Monsanto Company | Strawberry promoters and genes |
| CA2301500A1 (en) * | 1997-08-27 | 1999-03-04 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Genes encoding enzymes for lignin biosynthesis and uses thereof |
| US6201541B1 (en) * | 1997-12-11 | 2001-03-13 | Cognitens, Ltd. | System and method for “Stitching” a plurality of reconstructions of three-dimensional surface features of object(s) in a scene defined relative to respective coordinate systems to relate them to a common coordinate system |
| US20090093620A1 (en) * | 2000-09-05 | 2009-04-09 | David Kovalic | Annotated Plant Genes |
| JP2002524052A (ja) * | 1998-08-04 | 2002-08-06 | クロップデザイン・エヌ・ヴェー | 環境ストレスに対する耐性に関与する遺伝子 |
| US6313375B1 (en) | 1998-08-13 | 2001-11-06 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Maize aquaporins and uses thereof |
| US6313376B1 (en) | 1998-08-14 | 2001-11-06 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Maize aquaporins and uses thereof |
| US6717034B2 (en) | 2001-03-30 | 2004-04-06 | Mendel Biotechnology, Inc. | Method for modifying plant biomass |
| US7511190B2 (en) * | 1999-11-17 | 2009-03-31 | Mendel Biotechnology, Inc. | Polynucleotides and polypeptides in plants |
| JP3178672B2 (ja) | 1998-10-14 | 2001-06-25 | 農林水産省国際農林水産業研究センター所長 | 環境ストレス耐性植物 |
| EP1033405A3 (en) | 1999-02-25 | 2001-08-01 | Ceres Incorporated | Sequence-determined DNA fragments and corresponding polypeptides encoded thereby |
| WO2000066610A1 (en) * | 1999-04-30 | 2000-11-09 | Agritope, Inc. | Apple promoters for expression of transgenes in plants |
| US20100293669A2 (en) * | 1999-05-06 | 2010-11-18 | Jingdong Liu | Nucleic Acid Molecules and Other Molecules Associated with Plants and Uses Thereof for Plant Improvement |
| US20030233670A1 (en) | 2001-12-04 | 2003-12-18 | Edgerton Michael D. | Gene sequences and uses thereof in plants |
| US20110214206A1 (en) | 1999-05-06 | 2011-09-01 | La Rosa Thomas J | Nucleic acid molecules and other molecules associated with plants |
| US20040031072A1 (en) * | 1999-05-06 | 2004-02-12 | La Rosa Thomas J. | Soy nucleic acid molecules and other molecules associated with transcription plants and uses thereof for plant improvement |
| US8877916B2 (en) * | 2000-04-26 | 2014-11-04 | Ceres, Inc. | Promoter, promoter control elements, and combinations, and uses thereof |
| US6559363B1 (en) * | 1999-07-05 | 2003-05-06 | Toyo Boseki Kabushiki Kaisha | Cotton plants with improved cotton fiber characteristics and method for producing cotton fibers from these cotton plants |
| WO2001006006A1 (fr) | 1999-07-19 | 2001-01-25 | Japan Science And Technology Corporation | Gene de resistance au stress ambiant |
| US6472588B1 (en) | 1999-09-10 | 2002-10-29 | Texas Tech University | Transgenic cotton plants with altered fiber characteristics transformed with a sucrose phosphate synthase nucleic acid |
| US6359196B1 (en) * | 1999-09-23 | 2002-03-19 | Finn Lok | Germination-specific plant promoters |
| US6403862B1 (en) * | 1999-09-24 | 2002-06-11 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Seed-preferred promoter from maize |
| MXPA02003063A (es) | 1999-09-27 | 2003-10-14 | Monsanto Technology Llc | Metodos para determinar aceites en semillas. |
| IT1313518B1 (it) * | 1999-10-22 | 2002-07-24 | Meta Instr S R L | Metodi ed apparecchiatura per la misura della distribuzionetridimensionale delle temperature all'interno dei mezzi dielettrici. |
| US6407315B1 (en) | 1999-11-02 | 2002-06-18 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Seed-preferred promoter from barley |
| US6828476B1 (en) | 1999-12-02 | 2004-12-07 | The Regents Of The University Of California | Cotton transcription factors and their uses |
| GB2358752A (en) | 2000-01-31 | 2001-08-01 | Tricorder Technology Plc | Surface or volumetric data processing method and apparatus |
| JP3807721B2 (ja) * | 2000-02-21 | 2006-08-09 | シャープ株式会社 | 画像合成装置 |
| US6689939B2 (en) * | 2000-04-07 | 2004-02-10 | Basf Plant Science Gmbh | GTP binding stress-related proteins and methods of use in plants |
| US20110131679A2 (en) * | 2000-04-19 | 2011-06-02 | Thomas La Rosa | Rice Nucleic Acid Molecules and Other Molecules Associated with Plants and Uses Thereof for Plant Improvement |
| US7834146B2 (en) | 2000-05-08 | 2010-11-16 | Monsanto Technology Llc | Recombinant polypeptides associated with plants |
| US20040181830A1 (en) | 2001-05-07 | 2004-09-16 | Kovalic David K. | Nucleic acid molecules and other molecules associated with plants and uses thereof for plant improvement |
| US6701081B1 (en) * | 2000-06-06 | 2004-03-02 | Air Controls, Inc. | Dual camera mount for stereo imaging |
| US7109033B2 (en) | 2000-08-24 | 2006-09-19 | The Scripps Research Institute | Stress-regulated genes of plants, transgenic plants containing same, and methods of use |
| TW519485B (en) * | 2000-09-20 | 2003-02-01 | Ind Tech Res Inst | Infrared 3D scanning system |
| US20020170088A1 (en) | 2000-11-03 | 2002-11-14 | The Regents Of The University Of California | Novel auxin binding proteins and uses thereof |
| JP2002164066A (ja) | 2000-11-22 | 2002-06-07 | Mitsubishi Heavy Ind Ltd | 積層型熱交換器 |
| CA2430642A1 (en) * | 2000-12-01 | 2003-02-20 | John B. Ohlrogge | Plant seed specific promoters |
| AU2036302A (en) | 2000-12-08 | 2002-06-18 | Commw Scient Ind Res Org | Modification of sucrose synthase gene expression in plant tissue and uses therefor |
| US7214786B2 (en) * | 2000-12-14 | 2007-05-08 | Kovalic David K | Nucleic acid molecules and other molecules associated with plants and uses thereof for plant improvement |
| US6801257B2 (en) | 2001-01-12 | 2004-10-05 | Cognitens Ltd. | Optical three-dimensional digital imaging and mensuration system for industrial applications |
| US7105723B2 (en) * | 2001-03-16 | 2006-09-12 | Basf Plant Science Gmbh | Sugar and lipid metabolism regulators in plants |
| JP4739569B2 (ja) * | 2001-04-09 | 2011-08-03 | パナソニック株式会社 | 運転支援装置 |
| WO2002082988A2 (en) | 2001-04-16 | 2002-10-24 | The Johns Hopkins University | Method for imaging and spectroscopy of tumors and determination of the efficacy of anti-tumor drug therapies |
| WO2002090557A2 (en) | 2001-05-03 | 2002-11-14 | Vlaams Interuniversitair Instituut Voor Biotechnologie Vzw | Freeze-tolerant eukaryotic cells |
| AU2002345250A1 (en) * | 2001-06-22 | 2003-01-08 | Syngenta Participations Ag | Plant disease resistance genes |
| US20040250310A1 (en) | 2001-08-31 | 2004-12-09 | Shukla Vipula Kiran | Nucleic acid compositions conferring insect control in plants |
| US7038111B2 (en) | 2001-09-06 | 2006-05-02 | The Arizona Board Of Regents | Method for increasing stress tolerance in plants |
| DE10150918C2 (de) | 2001-10-18 | 2003-10-09 | Inframedic Ag | Verfahren zur Auswertung von Wärmebildern einer weiblichen oder männlichen Brust |
| US20050108791A1 (en) * | 2001-12-04 | 2005-05-19 | Edgerton Michael D. | Transgenic plants with improved phenotypes |
| MXPA04009778A (es) | 2002-04-08 | 2004-12-13 | Pionner Hi Bred International | Exsercion de fibra sedosa mejorada bajo estres. |
| AU2003245878B2 (en) * | 2002-05-08 | 2008-01-24 | Basf Plant Science Gmbh | Methods for increasing oil content in plants |
| US20030221218A1 (en) | 2002-05-17 | 2003-11-27 | The Regents Of The University Of California | Bioengineering cotton fiber properties |
| JP2005185101A (ja) | 2002-05-30 | 2005-07-14 | National Institute Of Agrobiological Sciences | 植物の全長cDNAおよびその利用 |
| CA2491234A1 (en) * | 2002-07-10 | 2004-01-22 | Basf Plant Science Gmbh | Use of a gene for increasing the oil content in plants |
| AU2003298095A1 (en) | 2002-10-18 | 2004-05-04 | Cropdesign N.V. | Identification of e2f target genes and uses thereof |
| WO2004053055A2 (en) | 2002-12-04 | 2004-06-24 | Monsanto Technology Llc | Transgenic maize with enhanced phenotype |
| JP5253710B2 (ja) | 2002-12-31 | 2013-07-31 | ユニバーシティ オブ デリー | ストレス耐性を与えるイネの新規遺伝子osisap1及びストレス耐性を与える方法 |
| CN101386855A (zh) | 2003-03-12 | 2009-03-18 | 伊沃基因有限公司 | 调节基因表达的核苷酸序列和构建体及其使用方法 |
| EP1641930B1 (en) * | 2003-04-15 | 2011-06-29 | BASF Plant Science GmbH | Nucleic acid sequences encoding proteins associated with abiotic stress response and plant cells and plants with increased tolerance to environmental stress |
| DE602004013569D1 (de) | 2003-04-16 | 2008-06-19 | Basf Plant Science Gmbh | N pflanzen |
| RU2350653C2 (ru) | 2003-05-22 | 2009-03-27 | Эводжин Лтд. | Способы повышения толерантности к абиотическому стрессу и/или биомассы у растений и получаемые таким образом растения |
| AU2005234725B2 (en) | 2003-05-22 | 2012-02-23 | Evogene Ltd. | Methods of Increasing Abiotic Stress Tolerance and/or Biomass in Plants and Plants Generated Thereby |
| US7554007B2 (en) | 2003-05-22 | 2009-06-30 | Evogene Ltd. | Methods of increasing abiotic stress tolerance and/or biomass in plants |
| JP3819377B2 (ja) | 2003-06-18 | 2006-09-06 | 株式会社東芝 | 半導体集積回路の静電放電の解析方法 |
| EP1636333A4 (en) | 2003-06-19 | 2007-10-24 | Evogene Ltd | NUCLEOTIDE SEQUENCES FOR REGULATING GENE EXPRESSION IN VEGETABLE TRICHROMES, AND HYBRID GENES AND METHODS IN WHICH THEY INTERVENE |
| JP4452876B2 (ja) | 2003-08-06 | 2010-04-21 | 国立大学法人 香川大学 | LKP2部分cDNAを用いた遺伝子導入による植物体の種子収量、乾燥重量の制御 |
| US7884261B2 (en) | 2004-06-30 | 2011-02-08 | CERES,Inc. | Nucleotide sequences and corresponding polypeptides conferring modulated plant growth rate and biomass in plants |
| US7803983B2 (en) * | 2004-06-30 | 2010-09-28 | Ceres, Inc. | Nucleotide sequences and corresponding polypeptides conferring modulated plant growth rate and biomass in plants |
| US7663027B2 (en) * | 2004-12-08 | 2010-02-16 | Ceres, Inc. | Nucleotide sequences and corresponding polypeptides conferring modulated plant size and biomass in plants |
| US20060107345A1 (en) * | 2003-09-30 | 2006-05-18 | Nickolai Alexandrov | Sequence-determined DNA fragments and corresponding polypeptides encoded thereby |
| US7989676B2 (en) * | 2006-08-31 | 2011-08-02 | Ceres, Inc. | Nucleotide sequences and corresponding polypeptides conferring modulated plant characteristics |
| US20060150283A1 (en) | 2004-02-13 | 2006-07-06 | Nickolai Alexandrov | Sequence-determined DNA fragments and corresponding polypeptides encoded thereby |
| US20060048240A1 (en) * | 2004-04-01 | 2006-03-02 | Nickolai Alexandrov | Sequence-determined DNA fragments and corresponding polypeptides encoded thereby |
| US20060143729A1 (en) * | 2004-06-30 | 2006-06-29 | Ceres, Inc. | Nucleotide sequences and polypeptides encoded thereby useful for modifying plant characteristics |
| US20050096515A1 (en) * | 2003-10-23 | 2005-05-05 | Geng Z. J. | Three-dimensional surface image guided adaptive therapy system |
| WO2005084331A2 (en) | 2004-03-01 | 2005-09-15 | Syngenta Participations Ag | Sorghum gene expression profiling |
| WO2005095614A1 (en) | 2004-03-31 | 2005-10-13 | Commonwealth Scientific And Industrial Research Organistion | Genes involved in plant fibre development |
| AU2005229157B2 (en) | 2004-03-31 | 2011-07-21 | Commonwealth Scientific And Industrial Research Organisation | Genes involved in plant fibre development |
| BRPI0510082A (pt) * | 2004-04-23 | 2007-10-16 | Ceres Inc | seqüências de nucleotìdeo e polipeptìdeos codificados por elas úteis para modificar as caracterìsticas de eficiência de uso de nitrogênio em plantas |
| CA2564202A1 (en) | 2004-05-05 | 2005-11-17 | The Royal Veterinary And Agricultural University | Ammonium/ammonia transporter |
| CA2570195C (en) * | 2004-06-14 | 2017-10-24 | Evogene Ltd. | Polynucleotides and polypeptides involved in plant fiber development and methods of using same |
| WO2007049275A2 (en) | 2005-10-24 | 2007-05-03 | Evogene Ltd. | Isolated polypeptides, polynucleotides encoding same, transgenic plants expressing same and methods of using same |
| NZ552704A (en) | 2004-07-07 | 2009-02-28 | Real Imaging Ltd | 3D thermal breast cancer detector |
| US7563942B2 (en) | 2004-10-22 | 2009-07-21 | Agrinomics Llc | Generation of plants with altered oil content |
| WO2008069878A2 (en) | 2006-10-27 | 2008-06-12 | Ceres, Inc. | Modulating lignin in plants |
| US20080148432A1 (en) * | 2005-12-21 | 2008-06-19 | Mark Scott Abad | Transgenic plants with enhanced agronomic traits |
| PL1827078T3 (pl) * | 2004-12-21 | 2014-07-31 | Monsanto Technology Llc | Rośliny transgeniczne z ulepszonymi cechami agronomicznymi |
| EP1681128A1 (de) * | 2005-01-14 | 2006-07-19 | Siemens Aktiengesellschaft | Verfahren zur Herstellung eines Lochs und Vorrichtung |
| WO2006138005A2 (en) * | 2005-05-10 | 2006-12-28 | Monsanto Technology, Llc | Genes and uses for plant improvement |
| CA2609236A1 (en) | 2005-05-26 | 2006-11-30 | Monsanto Technology Llc | Elevation of oil in monocot plants |
| WO2006138012A1 (en) | 2005-06-17 | 2006-12-28 | Ceres Inc. | P450 substrates and methods related thereto |
| WO2007027866A2 (en) | 2005-08-30 | 2007-03-08 | Monsanto Technology Llc | Transgenic plants with enhanced agronomic traits |
| BRPI0706526A2 (pt) * | 2006-01-13 | 2011-03-29 | Ceres Inc | sequências de nucleotìdeos e polipeptìdeos correspondentes que conferem caracterìsticas de eficiência aperfeiçoada no uso de nitrogênio em plantas |
| EP2343377A3 (en) | 2006-03-24 | 2011-11-16 | BASF Plant Science GmbH | Proteins associated with abiotic stress response and homologs |
| CA2638978A1 (en) | 2006-03-31 | 2007-10-11 | Basf Plant Science Gmbh | Plants having enhanced yield-related traits and a method for making the same |
| MX2009006660A (es) * | 2006-12-20 | 2009-08-20 | Evogene Ltd | Polinucleotidos y polipeptidos involucrados en el desarrollo de fibra vegetal y metodos de uso. |
| US8513488B2 (en) | 2007-04-09 | 2013-08-20 | Evogene Ltd. | Polynucleotides, polypeptides and methods for increasing oil content, growth rate and biomass of plants |
| WO2008157370A2 (en) * | 2007-06-15 | 2008-12-24 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Secondary wall forming genes from maize and uses thereof |
| US20110265221A1 (en) | 2007-07-10 | 2011-10-27 | Monsanto Technology Llc | Transgenic plants with enhanced agronomic traits |
| EP2183371B1 (en) | 2007-07-24 | 2015-07-01 | Evogene Ltd. | Polynucleotides, polypeptides encoded thereby, and methods of using same for increasing abiotic stress tolerance and/or biomass and/or yield in plants expressing same |
| US8362325B2 (en) * | 2007-10-03 | 2013-01-29 | Ceres, Inc. | Nucleotide sequences and corresponding polypeptides conferring modulated plant characteristics |
| BRPI0819476A2 (pt) * | 2007-12-27 | 2015-07-14 | Evogene Ltd | Método de melhorar a tolerância ao estresse abiótico de uma planta, método de melhorar a eficiência do uso de água, eficiência do uso de fertilizante, biomassa, vigor e/ou produção de uma planta, polinucleotídeo isolado, constructo de ácido nuclêico, polipeptídio isolado, célula de planta" |
| CN101959456A (zh) | 2007-12-31 | 2011-01-26 | 真实成像有限公司 | 用于成像数据的配准的系统和方法 |
| CA2710941C (en) | 2007-12-31 | 2017-01-03 | Real Imaging Ltd. | Method apparatus and system for analyzing images |
| US10299686B2 (en) | 2008-03-28 | 2019-05-28 | Real Imaging Ltd. | Method apparatus and system for analyzing images |
| CA3021575C (en) | 2008-05-22 | 2022-04-12 | Evogene Ltd. | Isolated polynucleotides and polypeptides and methods of using same for increasing plant yield, biomass, growth rate, vigor, oil content, abiotic stress tolerance of plants and nitrogen use efficiency |
| US20110229491A1 (en) | 2008-05-29 | 2011-09-22 | Lieven De Veylder | Minichromosome maintenance complex interacting protein involved in cancer |
| BR122021014201B1 (pt) | 2008-08-18 | 2022-08-16 | Evogene Ltd. | Método para aumentar a eficiência de uso do nitrogênio, eficiência de uso de fertilizantes, produção, taxa de crescimento, vigor, biomassa, e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta, e, construção de ácido nucleico isolado |
| WO2010049897A2 (en) | 2008-10-30 | 2010-05-06 | Evogene Ltd. | Isolated polynucleotides and polypeptides and methods of using same for increasing plant yield, biomass, growth rate, vigor, oil content, abiotic stress tolerance of plants and nitrogen use efficieny |
| CA3052515A1 (en) | 2008-12-29 | 2010-07-08 | Evogene Ltd. | Polynucleotides, polypeptides encoded thereby, and methods of using same for increasing abiotic stress tolerance, biomass and/or yield in plants expressing same |
| CA2753616C (en) * | 2009-03-02 | 2018-07-17 | Evogene Ltd. | Isolated polynucleotides and polypeptides, and methods of using same for increasing plant yield and/or agricultural characteristics |
| BRPI1009032B1 (pt) | 2009-06-10 | 2019-05-28 | Evogene Ltd. | Método de aumento de eficiência no uso de nitrogênio, biomassa, taxa de crescimento, e/ou tolerância a deficiência de nitrogênio de uma planta |
| MX374069B (es) | 2009-08-04 | 2020-07-30 | Evogene Ltd | Polinucleotidos y polipeptidos aislados, y metodos para utilizarlos para mejorar la tolerancia al estres abiotico, rendimiento,tasa de crecimiento, vigor, biomasa, contenido de aceite y/o eficacia en el uso de nitrogeno de las plantas. |
| US20110080674A1 (en) * | 2009-10-02 | 2011-04-07 | Joel Durand | Magnetic azimuth adjustment for tonearm |
| AR081095A1 (es) | 2009-12-28 | 2012-06-13 | Evogene Ltd | Polinucleotidos y polipeptidos aislados y metodos para utilizarlos para aumentar el rendimiento de la planta, biomasa, tasa de crecimiento, vigor, contenido de aceite, tolerancia al estres abiotico y eficacia en el uso de nitrogeno |
| EP2563112A4 (en) | 2010-04-28 | 2014-03-05 | Evogene Ltd | INSULATED POLYNUCLEOTIDES AND POLYPEPTIDES AND METHODS OF USING THE SAME FOR INCREASING PLANT YIELD AND / OR AGRICULTURAL CHARACTERISTICS |
| BR122019017041B1 (pt) | 2010-08-30 | 2021-11-23 | Evogene Ltd | Método de aumento de eficiência do uso de nitrogênio, área fotossintética, biomassa, taxa de crescimento, vigor, e/ou tolerância à deficiência por nitrogênio de uma planta e/ou redução do tempo de floração e/ou emergência de inflorescência de uma planta em comparação com uma planta nativa |
| BR122021002248B1 (pt) | 2010-12-22 | 2022-02-15 | Evogene Ltd | Método para aumentar a tolerância ao estresse abiótico, produção, biomassa, e/ou taxa de crescimento de uma planta |
| MX354195B (es) | 2011-05-03 | 2018-02-16 | Evogene Ltd | Polipeptidos y polinucleotidos aislados y metodos para su uso, para aumentar el rendimiento, la biomasa, el indice de crecimiento, el vigor, el contenido de aceite, la tolerancia al estrés abiotico de las plantas y la eficiencia en el uso de nitrogeno. |
| CA3177736A1 (en) | 2011-08-23 | 2013-02-28 | Evogene Ltd. | Isolated polynucleotides and polypeptides, and methods of using same for increasing plant yield and/or agricultural characteristics |
| US10000768B2 (en) | 2011-11-21 | 2018-06-19 | Syngenta Participations Ag | Compositions and methods for increasing nematode resistance in plants |
| BR122019023058B1 (pt) | 2011-11-28 | 2021-04-06 | Evogene Ltd. | Método para aumento da eficiência no uso de nitrogênio, produção, biomassa, taxa de crescimento, vigor, teor de óleo, e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta e construto de ácido nucleico isolado |
| WO2013098819A1 (en) | 2011-12-28 | 2013-07-04 | Evogene Ltd. | Isolated polynucleotides and polypeptides, and methods of using same for increasing yield of plants |
| BR122020018472B1 (pt) | 2012-02-29 | 2022-05-03 | Evogene Ltd | Método para aumentar o rendimento, a taxa de crescimento, a biomassa, o comprimento da raiz e/ou a taxa de crescimento relativo da cobertura da raiz, e, construção de ácido nucleico isolado |
| BR122021002108B1 (pt) | 2012-05-28 | 2022-08-16 | Evogene Ltd | Método para aumentar a produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, produção de sementes, eficiência no uso de nitrogênio, e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta, e, construção de ácido nucleico isolado |
| BR122020018663B1 (pt) | 2012-08-27 | 2022-08-09 | Evogene Ltd | Método para aumentar o rendimento, taxa de crescimento, biomassa, vigor, rendimento da semente, capacidade fotossintética, eficiência do uso de nitrogênio e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta |
| WO2014102773A1 (en) | 2012-12-25 | 2014-07-03 | Evogene Ltd. | Isolated polynucleotides and polypeptides, and methods of using same for increasing nitrogen use efficiency of plants |
| US9771598B2 (en) | 2012-12-26 | 2017-09-26 | Evogene Ltd. | Isolated polynucleotides and polypeptides, construct and plants comprising same and methods of using same for increasing nitrogen use efficiency of plants |
| MX359122B (es) | 2013-05-22 | 2018-09-14 | Evogene Ltd | Polinucleotidos y polipetidos aislados y metodos para utilizarlos para mejorar el rendimiento y/o caracteristicas agricolas de la planta. |
| BR112016004099A2 (pt) | 2013-08-27 | 2017-10-17 | Evogene Ltd | polinucleotídeos e polipeptídeos isolados e métodos de uso dos mesmos para aumento da produção e/ou características agrícolas da planta |
| MX384480B (es) | 2014-05-28 | 2025-03-14 | Evogene Ltd | Polinucleotidos aislados, polipeptidos y metodos para utilizarlos para aumentar la tolerancia al stress abiotico, la biomasa y el rendimiento de plantas. |
| CA3176207A1 (en) | 2014-08-27 | 2016-03-03 | Evogene Ltd. | Constructs and methods for increasing plant yield or agricultural characteristics or both |
| MX2018008037A (es) | 2015-12-28 | 2019-03-11 | Evogene Ltd | Rasgos de plantas conferidos mediante polinucleotidos y polipeptidos aislados. |
-
2009
- 2009-08-18 BR BR122021014201-7A patent/BR122021014201B1/pt active IP Right Grant
- 2009-08-18 EP EP16161064.7A patent/EP3072972B1/en not_active Not-in-force
- 2009-08-18 HU HUE16161064A patent/HUE048303T2/hu unknown
- 2009-08-18 BR BR122021014170-3A patent/BR122021014170B1/pt active IP Right Grant
- 2009-08-18 EP EP09807983.3A patent/EP2326163B1/en not_active Not-in-force
- 2009-08-18 MX MX2011001741A patent/MX2011001741A/es active IP Right Grant
- 2009-08-18 BR BR122021014158-4A patent/BR122021014158B1/pt active IP Right Grant
- 2009-08-18 EP EP22165467.6A patent/EP4079146A3/en not_active Withdrawn
- 2009-08-18 EP EP19196607.6A patent/EP3616504A3/en not_active Withdrawn
- 2009-08-18 CA CA2732773A patent/CA2732773C/en active Active
- 2009-08-18 BR BR122021014159-2A patent/BR122021014159B1/pt active IP Right Grant
- 2009-08-18 AR ARP090103167A patent/AR073076A1/es active IP Right Grant
- 2009-08-18 CA CA3047798A patent/CA3047798A1/en active Pending
- 2009-08-18 US US13/059,231 patent/US9018445B2/en active Active
- 2009-08-18 BR BR122021014165-7A patent/BR122021014165B1/pt active IP Right Grant
- 2009-08-18 BR BR122021014175-4A patent/BR122021014175B1/pt active IP Right Grant
- 2009-08-18 BR BRPI0912898-0A patent/BRPI0912898B1/pt not_active IP Right Cessation
- 2009-08-18 WO PCT/IB2009/053633 patent/WO2010020941A2/en not_active Ceased
- 2009-08-18 BR BR122021014172-0A patent/BR122021014172B1/pt active IP Right Grant
- 2009-08-18 BR BR122021014193-2A patent/BR122021014193B1/pt active IP Right Grant
- 2009-08-18 AU AU2009283785A patent/AU2009283785B2/en not_active Ceased
- 2009-08-18 MX MX2013009706A patent/MX361687B/es unknown
-
2011
- 2011-02-04 ZA ZA2011/00918A patent/ZA201100918B/en unknown
- 2011-02-11 MX MX2018015309A patent/MX2018015309A/es unknown
-
2015
- 2015-03-03 US US14/636,275 patent/US9783818B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2016
- 2016-04-04 AU AU2016202091A patent/AU2016202091B2/en not_active Ceased
-
2017
- 2017-08-10 US US15/673,608 patent/US10208316B2/en active Active
- 2017-10-24 AU AU2017251729A patent/AU2017251729B2/en not_active Ceased
-
2018
- 2018-12-06 US US16/211,255 patent/US10829776B2/en active Active
-
2019
- 2019-06-27 AU AU2019204564A patent/AU2019204564B2/en not_active Ceased
-
2020
- 2020-09-21 US US17/026,376 patent/US20210024946A1/en not_active Abandoned
- 2020-09-21 US US17/026,368 patent/US11453887B2/en active Active
-
2021
- 2021-09-10 AU AU2021225152A patent/AU2021225152A1/en not_active Abandoned
-
2022
- 2022-08-23 US US17/893,245 patent/US20220403404A1/en not_active Abandoned
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| US11453887B2 (en) | Isolated polypeptides and polynucleotides useful for increasing nitrogen use efficiency, abiotic stress tolerance, yield and biomass in plants | |
| AU2016203516B2 (en) | Polynucleotides, Polypeptides Encoded Thereby, and Methods of Using Same for Increasing Abiotic Stress Tolerance, Biomass and/or Yield in Plants Expressing Same | |
| CA2736350C (en) | Isolated polynucleotides and polypeptides and methods of using same for increasing plant yield, biomass, growth rate, vigor, oil content, abiotic stress tolerance of plants and nitrogen use efficiency | |
| AU2009334312B9 (en) | Polynucleotides, polypeptides encoded thereby, and methods of using same for increasing abiotic stress tolerance, biomass and/or yield in plants expressing same | |
| AU2009309242B9 (en) | Isolated polynucleotides and polypeptides and methods of using same for increasing plant yield |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FG | Grant or registration |