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MX2008014608A - Sistema y metodo para determinar la intervencion medica individualizada para un estado de enfermedad. - Google Patents

Sistema y metodo para determinar la intervencion medica individualizada para un estado de enfermedad.

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MX2008014608A
MX2008014608A MX2008014608A MX2008014608A MX2008014608A MX 2008014608 A MX2008014608 A MX 2008014608A MX 2008014608 A MX2008014608 A MX 2008014608A MX 2008014608 A MX2008014608 A MX 2008014608A MX 2008014608 A MX2008014608 A MX 2008014608A
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MX
Mexico
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gene
molecular
expression
change
analysis
Prior art date
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MX2008014608A
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Daniel D Von Hoff
Robert Penny
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Molecular Profiling Inst Inc
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Publication date
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Abstract

Un sistema y método para determinar la intervención médica individualizada para un estado de enfermedad particular, y especialmente para cánceres, que incluye el perfilado molecular de una muestra biológica del paciente, determinar si cualquiera de los descubrimientos moleculares que incluyen uno o más genes, una o más proteínas expresadas en genes, uno o más mecanismos moleculares, y/o combinaciones de tales exhiben un cambio en la expresión comparada con una referencia, e identificar una terapia de enfermedad no específica o agente capaz de interactuar con los genes, las proteínas expresadas en los genes, los mecanismos moleculares o combinaciones de tales descubrimientos moleculares que exhibieron un cambio en la expresión.

Description

SISTEMA Y MÉTODO PARA DETERMINAR LA INTERVENCIÓN MÉDICA INDIVIDUALIZADA PARA UN ESTADO DE ENFERMEDAD Campo de la Invención La presente invención generalmente se relaciona a la aplicación del perfilado molecular para proporcionar un sistema y método para determinar la intervención médica para un estado de enfermedad particular. El sistema y método se pueden conducir en cualquier etapa de la enfermedad. En particular, la presente invención se relaciona a un sistema y método para determinar la intervención médica para un paciente gravemente enfermo, por ejemplo, un paciente con cáncer que ha progresado en por lo menos dos regímenes quimioterapéuticos u hormonales, donde el método incluye el perfilado molecular de una muestra biológica del paciente, determinar si cualquiera de los descubrimientos moleculares incluyendo uno o más genes, proteínas expresadas en gen, mecanismos moleculares, y/o combinaciones de tales descubrimientos moleculares exhiben un cambio en la expresión comparada con una referencia normal, e identificar una terapia de fármaco capaz de interactuar con los genes, proteínas expresadas en gen, mecanismos moleculares, o combinaciones de tales descubrimientos moleculares que exhibieron un cambio en la expresión. Antecedentes de la Invención Los estados de enfermedad en pacientes típicamente se tratan con regímenes o terapias de tratamiento que se seleccionan basados en criterios de base clínica; esto es, una terapia o régimen de tratamiento se seleccionan para un paciente basado en la determinación de que el paciente se ha diagnosticado con una enfermedad particular (la diagnosis que se ha hecho de ensayos de diagnostico clásicos) . Aunque los mecanismos moleculares detrás de varios estados de enfermedad ha sido el sujeto de estudios por años, la aplicación específica de un perfil molecular del individuo enfermo en la determinación de regímenes y terapias de tratamiento para ese individuo ha sido específica de la enfermedad y no seguida ampliamente . Algunos regímenes de tratamiento se han determinado utilizando el perfilado molecular en combinación con la caracterización clínica de un paciente tales como observaciones hechas por un médico (tal como un código de la Clasificación Internacional de Enfermedades, por ejemplo, y las fechas de tales códigos fueron determinados), resultados de prueba de laboratorio, rayos X, resultados de biopsia, declaraciones hechas por el paciente, y cualquier otra información médica típicamente realizada por un médico para hacer una diagnosis en una enfermedad específica. Sin embargo, la utilización de una combinación de material de selección basado en el perfilado molecular y las caracterizaciones clínicas (tal como la diagnosis de un tipo particular de cáncer) para determinar un régimen o terapia de tratamiento presenta un riesgo de que un régimen de tratamiento efectivo puede ser marginado para un individuo particular puesto que algunos regímenes de tratamiento pueden trabajar bien para diferentes estados de enfermedad aunque están asociados con el tratamiento de un tipo particular de estado de enfermedad. Los pacientes con cáncer metastático son de problema particular para los médicos tratantes. La mayoría de los pacientes con cáncer metastático eventualmente agotan las opciones de tratamiento para sus tumores. Estos pacientes tienen opciones muy limitadas después de que sus tumores han progresado sobre las terapias estándares de línea frontal y segunda línea (y algunas veces tercera línea y más allá) . Aunque estos pacientes pueden participar en experimentos clínicos de Fase I y Fase II para nuevos agentes anticáncer, ellos usualmente deben cumplir con criterios de eligibilidad muy estrictos para tratarse de esta manera. Los estudios han mostrado que cuando los pacientes participan en estos tipos de experimentos, el nuevo agente anticáncer puede dar proporciones de respuesta de cualquier parte de 5% a 10% en promedio en instalaciones de la Fase I a 12% en instalaciones de la Fase II. Estos pacientes también tienen la opción de elección para recibir el mejor cuidado de soporte para tratar sus síntomas.
Recientemente ha existido una explosión de interés en desarrollar nuevos agentes anticáncer que son más dirigidos contra un receptor de superficie celular o un producto génico regulado hacia arriba o amplificado. Este procedimiento ha cumplido con algo de éxito (por ejemplo, Herceptin contra HER2/neu en células de cáncer de seno, rituximab contra CD20 en células de linfoma, bevacizamab contra VEGF, Cetuximab contra EGFR, etc.). Sin embargo, los tumores de los pacientes todavía eventualmente progresan en estas terapias. Si un número más grande de objetivos o descubrimientos moleculares tales como mecanismos moleculares, genes, proteínas expresadas en gen, y/o combinaciones de tales se midieron en el tumor de un paciente, se pueden encontrar objetivos o descubrimientos moleculares adicionales que pueden ser explotados para utilizar agentes terapéuticos específicos. La identificación de múltiples agentes que pueden tratar múltiples objetivos o mecanismos implícitos proporcionaría a un paciente con cáncer metastático con una alternativa terapéutica viable a aquellos regímenes de tratamiento que existen actualmente. Por consiguiente, hay una necesidad por un sistema y método para determinar una intervención médica individualizada para un estado de estado de enfermedad basado en el perfilado molecular que sea utilizado para genes específicos objetivo y/o proteínas expresadas en gen con fármacos o agentes específicos que sea independiente de la diagnosis de linaje de enfermedad. Breve Descripción de la Invención La presente invención se dirige a un sistema y método para determinar la intervención médica individualizada para un estado de enfermedad particular. Un método ejemplar de la presente invención para determinar la intervención médica para un estado de enfermedad incluye las etapas de realizar una prueba para un gen y/o una prueba para una proteína expresada en gen de una muestra biológica de un individuo enfermo, determinar que genes y/o proteínas expresadas en gen exhibieron cambio en la expresión comparada con una referencia, e identificar una terapia de fármaco utilizada para interactuar con el gen y/o las proteínas expresadas en gen que exhibieron un cambio de expresión que no es restringido a una sola enfermedad. En un aspecto de esta modalidad ejemplar de la invención, la etapa de identificación de una terapia de fármaco utilizada para interactuar con un gen y/o proteína expresada en gen que exhibió- un cambio en expresión puede incluir la etapa de identificar una terapia de fármaco desde una revisión automatizada de una base de datos de literatura extensiva y/o datos generados de experimentos clínicos. En otro aspecto de la modalidad ejemplar descrita en lo anterior de la presente invención, la etapa de realizar una prueba para un gen y/o una prueba para una proteina expresada en gen puede incluir la etapa de realizar un análisis inmunohistoquimico (IHC) y/o un análisis de microarreglo. Además, la etapa de realizar un análisis de microarreglo puede incluir la etapa de realizar un análisis utilizando un microarreglo de expresión, un microarreglo de hibridación genómica comparativa (CGH) , un microarreglo de polimorfismo de nucleótido individual (SNP) , una hibridación in-situ fluorescente (ISH), una hibridación in-situ (ISH), y un arreglo proteomico. Además, la etapa de realizar un análisis IHG puede incluir la etapa de realizar un análisis IHC para una proteina expresada en gen que incluye por lo menos uno de Her2/Neu, ER, PR, c-kit, EGFR, MLH1, MSH2, CD20, p53, Ciclina DI, bcl2, COX-2, receptor de Andrógeno, CD52, PDGFR, AR, CD25, y VEGF. En otro aspecto de la invención, la etapa de realizar un análisis de microarreglo en el método ejemplar descrito en lo anterior para determinar la intervención médica para un estado de enfermedad puede incluir la etapa de realizar un análisis de microarreglo para un gen que incluye por lo menos uno de BCL2 , HIF1A, AR, ESR1, PDGFRA, KIT, PDGFRB, CDW52, ZAP70, PGR, SPARC, GART, GSTP1, NFKBIA, MSH2, TXNRD1, HDAC1, PDGFC, PTE , CD33, TYMS, RXRB, ADA, TNF, ERCC3, RAF1, VEGF, TOP1, TOP2A, BRCA2, TK1, FOLR2, TOP2B, MLH1, IL2RA, DN T1, HSPCA, ERBR2 , ERBB2, SSTR1, VHL, VDR, PTGS2 , POLA, CES2, EGFR, OGFR, ASNS, NFKB2, RARA, S4A1 , DCK, DNMT3A, EREG, Epiregulin, FOLR1 , GNRH1 , GNRHR1, FSHB, FSHR, FSHPRH1, receptor de folato, HGF, HIG1, IL13RA1, LTB, 0DC1, PPARG, PPARGC1, VHL, Receptor de Linfotoxina Beta, Myc, TOP2B Topoisomerasa II, TOP02B, TXN, VEGFC, ACE2, ADH1C, ADH4 , AGT, AREG, CA2, CDK2, caveolin, y NFKB1. En todavía otro aspecto del método ejemplar descrito en lo anterior de la presente invención, la etapa de realizar una prueba para un gen y/o una prueba para un proteína expresada en gen de una muestra biológica de un individuo enfermo puede incluir la etapa de realizar un análisis inmunohistoquímico sobre un tumor y la etapa de determinar qué genes y/o proteínas expresadas en gen exhiben un cambio en la expresión comparado a una referencia que puede incluir la etapa de determinar si el 30% o más de las células de tumor fueron +2 o más grande establecido para una proteína expresada en gen particular. En todavía otro aspecto del método ejemplar descrito en lo anterior de la presente invención, la etapa de realizar una prueba para un gen y/o una prueba para una proteína expresada en gen de una muestra biológica de un individuo enfermo puede incluir la etapa de realizar un análisis de microarreglo sobre un tumor y la etapa de determinar que genes y/o proteínas expresadas en gen exhiben un cambio en la expresión comparado con una referencia puede incluir la etapa de identificar que genes son regulados hacia arriba o regulados hacia abajo al determinar si el cambio completo de la expresión para un gen particular con relación a una referencia de tejido de origen normal es significante en p < 0.001. Además, el método ejemplar descrito en lo anterior de la presente invención para determinar la intervención médica para un estado de enfermedad también puede incluir la etapa de proporcionar un reporte de perfil del paciente que identifica el cambio en la expresión para los genes y/o proteínas expresadas en gen junto con una terapia de fármaco posible para la interacción con cada uno de los genes y/o proteínas expresadas en gen que exhiben un cambio en la expresión. Otra modalidad ejemplar de la presente invención se dirige a un método para identificar una terapia de fármaco capaz de interactuar con un objetivo molecular que incluye las etapas de identificar un objetivo molecular en una pluralidad de los individuos enfermos que exhibe un cambio en la expresión cuando se compara con una referencia normal, administrar una terapia de fármaco a los individuos enfermos que exhiben el cambio en la expresión del objetivo molecular, y determinar cualquiera de los cambios en el objetivo molecular de los individuos enfermos después de la terapia de fármaco. Además, en un aspecto de esta modalidad ejemplar de un método para identificar una terapia de fármaco capaz de interactuar con el objetivo molecular, la etapa de identificar un objetivo molecular en una pluralidad de individuos enfermos que exhibe un cambio en la expresión cuando se compara con una referencia normal puede incluir la etapa de realizar una prueba para un gen y/o una prueba para una proteina expresada en gen de una muestra biológica del individuo enfermo donde la prueba comprende un análisis inmunohistoquimico (IHC) y/o un análisis de microarreglo . En todavía otra modalidad ejemplar de la presente invención, se proporciona un sistema para determinar la intervención médica individualizada para un estado de enfermedad donde el sistema incluye un servidor principal, una interfaz de usuario para accesar al servidor principal para accesar e introducir datos, un procesador para procesar los datos introducidos, una memoria acoplada al procesador para almacenar los datos procesados e instrucciones para: a) accesar a un perfil molecular tomado de una muestra biológica de un paciente, b) determinar si por lo menos uno de un gen, una proteína expresada en gen, un mecanismo molecular, y otros descubrimientos moleculares que resultan del perfil molecular exhiben cambio en la expresión comparado con una referencia normal, y c) accesar a una base de datos de terapia de fármaco para identificar una o más terapias de fármaco que interactúan con un gen, una proteína expresada en gen, un mecanismo molecular, y/u otros descubrimientos moleculares que exhibieron un cambio en la expresión, y un medio de exhibición para exhibir un gen, una proteina expresada en gen, un mecanismo molecular, y otros descubrimientos moleculares que exhiben un cambio en la expresión y las terapias de fármaco que interactúan con estos. Con respecto a la modalidad ejemplar de la presente invención dirigida al sistema para determinar la intervención médica individualizada para un estado de enfermedad, el perfil molecular tomado de la muestra biológica puede incluir el mismo análisis inmunohistoquimico (IHC) y el análisis de microarreglo descrito en lo anterior con respecto a la primera modalidad ejemplar de la presente invención. Además, los diferentes tipos de estos análisis junto con los genes analizados utilizando estos análisis pueden ser los mismos como aquellos descritos en lo anterior con respeto a la primera modalidad ejemplar de la presente invención que es dirigida a un método para determinar la intervención médica para un estado de enfermedad. Todavía otra modalidad ejemplar de la presente invención se dirige a un método para determinar la intervención médica para un estado de enfermedad que incluye las etapas de realizar por los menos una prueba molecular para por lo menos un objetivo de una muestra biológica de un individuo enfermo, determinar si el objetivo exhibe un cambio en la expresión comparado con una referencia, e identificar por lo menos un agente no específico de la enfermedad que interactúa con el objetivo que exhibe un cambio en la expresión. La etapa de identificar por lo menos un agente no especifico de la enfermedad que interactúa con el objetivo puede incluir la etapa de identificar una terapia de fármaco desde una revisión automatizada de una base de literatura extensiva y/o una revisión automatizada de los datos generados de los experimentos clínicos. Además, la modalidad ejemplar de la presente invención dirigida a un método para determinar la intervención médica para un estado de enfermedad también puede incluir la etapa de proporcionar un reporte de perfil del paciente que incluye los resultados de la prueba del paciente para varios objetivos y cualquiera de las terapias propuestas basadas sobre esos resultados. La etapa de realizar por lo menos una prueba molecular para por lo menos un objetivo de una muestra biológica de un individuo enfermo en la modalidad ejemplar de la presente invención dirigida a un método para determinar la intervención médica para un estado de enfermedad puede incluir todos los análisis descritos en lo anterior relacionados con el análisis inmunohistoquimico (IHC) y análisis de microarreglo y los genes analizados utilizando esos análisis. Breve Descripción de los Dibujos La FIG. 1 ilustra un diagrama de bloques de una modalidad ejemplar de un sistema para determinar la intervención médica individualizada para un estado de enfermedad particular que utiliza el perfilado molecular de la muestra biológica de un paciente que es no especifica de enfermedad . La FIG. 2 es un diagrama de flujo de una modalidad ejemplar de un método para determinar la intervención médica individualizada para un estado de enfermedad particular que utiliza el perfilado molecular de la muestra biológica de un paciente que es no especifica de enfermedad. Las FIGS. 3A hasta 3D ilustran un reporte del perfil del paciente ejemplar de acuerdo con la etapa 80 de la FIG. 2. La FIG. 4 es un diagrama de flujo de una modalidad ejemplar de un método para identificar una terapia/agente de fármaco capaz de interactuar con un objetivo. Las FIGS. 5-14 son diagramas de flujo y diagramas que ilustran varias partes de un sistema y método de descubrimiento de fármaco de medicina personalizado basado en información de acuerdo con la presente invención. Las FIGS. 15-25 son impresiones en pantalla de computadora asociadas con varias partes del sistema y método de descubrimiento de fármaco de medicina personalizado basado en información mostrados en las FIGS. 5-14. Descripción Detallada La descripción detallada de modalidades ejemplares en la presente hace referencia a los dibujos y fotografías acompañantes, que muestran la modalidad ejemplar a manera de ilustración y su mejor modo. Mientras que estas modalidades ejemplares son descritas en detalle suficiente para permitir a aquellos expertos en la técnica practicar la invención, se debe entender que otras modalidades pueden ser realizadas y que cambios lógicos y mecánicos pueden ser hechos sin apartarse del espíritu y alcance de la invención. Así, la descripción detallada en la presente se presenta para propósitos de ilustración solamente y no de limitación. Por ejemplo, las etapas mencionadas en cualquiera de las descripciones de método o de proceso pueden ser ejecutadas en cualquier orden y no están limitadas al orden presentado. Por otra parte, cualquiera de las funciones o etapas pueden ser fundamentadas o realizadas por una o más de terceras partes. Además, cualquier referencia a singular incluye modalidades plurales, y cualquier referencia a más de un componente puede incluir una modalidad singular. Por cuestión de brevedad, la operación en red convencional de datos, el desarrollo de la aplicación y otros aspectos funcionales de los sistemas (y componentes de los componentes de operación individuales de los sistemas) no pueden ser descritos en detalle en la presente. Además, las líneas de conexión mostradas en las diversas figuras contenidas en la presente se proponen para representar relaciones funcionales y/o acoplamientos físicos ejemplares entre los diversos elementos. Se debe observar que muchas relaciones funcionales o conexiones físicas alternativas o adicionales pueden estar presentes en un sistema práctico. Los diversos componentes del sistema discutidos en la presente pueden incluir uno o más de los siguientes: un servidor principal u otros sistemas de . computación que incluyen un procesador para procesar datos digitales; una memoria acoplada al procesador para almacenar datos digitales; un digitalizador de entrada acoplado al procesador para introducir datos digitales, un programa de aplicación almacenado en la memoria y accesible por el procesador para dirigir el procesamiento de los datos digitales por el procesador; un dispositivo de visualización acoplado al procesador y la memoria para visualizar la información derivada de los datos digitales procesados por el procesador, y una pluralidad de bases de datos. Varias bases de datos utilizadas en la presente pueden incluir: datos del paciente tal como la historia familiar, datos demográficos y ambientales, datos de muestra biológica, datos previos al tratamiento y de protocolo, datos clínicos del paciente, datos del perfilado molecular de las muestras biológicas, datos sobre los agentes de fármaco terapéuticos y/o fármacos de investigación, una librería génica, una librería de enfermedades, una librería de fármacos, datos que rastrean el paciente, datos de manejo de archivos, datos de manejo financiero, datos de facturación y/o datos similares útiles en la operación del sistema. Como aquellos expertos en la técnica apreciarán, la computadora del usuario puede incluir un sistema de operación (por ejemplo, Windows NT, 95/98/2000, OS2, UNIX, Linux, Solaris, MacOS, etc.) como asi como diversos software de soporte convencionales y dispositivos de accionamiento típicamente asociados con las computadoras. La computadora puede incluir cualquier computadora personal adecuada, computadora de red, estación de trabajo, minicomputadora , procesador central o los similares. La computadora del usuario puede estar en un ambiente domestico o médico/negocio con acceso a una red. En una modalidad ejemplar, el acceso es a través de una red o la Internet a través de un paquete de software hojeador de la red comercialmente disponible. Como se utiliza en la presente, el término "red" incluirá cualquiera de los medios de comunicaciones electrónicos que incorpora componentes tanto de hardware como de software de los mismos. La comunicación entre las partes se puede realizar a través de cualquiera de los canales de comunicación adecuados, tales como, por ejemplo, una red telefónica, un extranet, un intranet, Internet, dispositivo de punto de interacción, asistente digital personal (por ejemplo, Palm Pilot®, Blackberry®) , teléfono celular, kiosco, etc.)/ comunicaciones en linea, comunicaciones de satélite, comunicaciones fuera de linea, comunicaciones inalámbricas, comunicaciones de transpondedor, red de área local (LAN) , red de área amplia (WAN), dispositivos en red o enlazados, tablero, ratón y/o cualquier modalidad de comunicación o de entrada de datos adecuada. Por otra parte, aunque el sistema es frecuentemente descrito en la presente como que es implementado con protocoles de comunicaciones TCP/IP, el sistema también puede ser implementado utilizando IPX, Appletalk, IP-6, NetBIOS, OSI o cualquier número de protocolos existentes o futuros. Si la red es de una naturaleza de una red pública, tal como la Internet, puede ser ventajoso suponer que la red sea insegura y abierta a escuchadores furtivos. La información especifica relacionada con los protocolos, estándares y software de aplicación utilizado en conexión con la Internet es generalmente conocida para aquellos expertos en la técnica y, como tales, no necesitan ser detallados en la presente. Ver, por ejemplo, DILIP, NAIK, INTERNET STANDARDS AND PROTOCOLS (1998); JAVA 2 COMPLETE, varios autores, (Sybex 1999); DEBORAH RAY AND ERIC RAY, MASTERING HTML 4.0 (1997); y LOSHIN, TCP/IP CLEARLY EXPLAINED (1997) y DAVID GOURLEY AND BRIAN TOTTY, HTTP, THE DEFINITIVE GUIDE (2002), los contenidos de los cuales son incorporados en la presente por referencia. Los diversos componentes del sistema pueden ser independientemente, separadamente o colectivamente acoplados de manera adecuada a la red por la vía de enlaces de datos que incluye, por ejemplo, una conexión a un Proveedor de Servicio de Internet (ISP) sobre el circuito local como es típicamente utilizado en conexión con la comunicación de modem estándar, modem por cable, redes Parabólicas, ISDN, Línea de Subscritor Digital (DSL), o varios métodos de comunicación inalámbricos, ver, por ejemplo, GILBERT HELD, UNDERSTANDING DATA COMMUNICATIONS (1996), que es incorporado en la presente por referencia. Se observa que la red puede ser implementada como otros tipos de redes, tal como una red de televisión interactiva (ITV). Por otra parte, el sistema contempla el uso, venta o distribución de cualquiera de los artículos, servicios o información sobre cualquier red que tenga funcionalidad similar descrita en la presente. Como se utiliza en la presente "transmitir" puede incluir el envío de datos electrónicos de un componente del sistema a otro sobre una conexión de red. Adicionalmente, como se utiliza en la presente, "dato" puede incluir la información circundante tales como mandos, interrogantes, archivos, datos para almacenamiento, y los similares en forma ¦ digital o cualquier otra forma. El sistema contempla usos en asociación con servicios de red, computación de servicio, computación pervasiva e individualizada, soluciones de seguridad e identidad, computación autonómica, computación comercial, soluciones de movilidad e inalámbricas, fuente abierta, estadística de datos biológicos, computación de distribución y/o computación de red. Cualquiera de las bases de datos discutidas en la presente puede incluir la estructura relacional, jerárquica, gráfica u orientada al objeto y/o cualquiera de otras configuraciones de base de datos. Los productos de base de datos comunes que pueden ser utilizados para implementar las bases de datos incluye DB2 por IBM (White Plains, NY) , varios productos de base de datos disponibles de Oracle Corporation (Redwood Shores, CA) , Microsoft Access o Microsoft SQL Servidor by Microsoft Corporation (Redmond, Washington), o cualquier otro producto de base de datos adecuado. Por otra parte, las bases de datos pueden ser organizadas en cualquier manera adecuad, por ejemplo, como tablas de datos o tablas de consulta. Cada registro pueden ser un solo archivo, una serie de archivos, una serie enlazada de campo de datos o cualquier otra estructura de datos. La asociación de ciertos datos se puede realizar a través de cualquier técnica de asociación de datos deseada tal como aquella conocida o practicada en la técnica. Por ejemplo, la asociación se puede realizar ya sea manualmente o automáticamente. Las técnicas de asociación automáticas pueden incluir, por ejemplo, una búsqueda de base de datos, una fusión de base de datos, GREP, AGREP, SQL, utilizando un campo de clave en las tablas para agilizar las búsquedas, búsquedas secuenciales a través de todas las tablas y archivos, clasificación de registros en el archivo de acuerdo con un orden conocido para simplificar la consulta, y los similares. La etapa de asociación se puede realizar por una función de fusión de base de datos, por ejemplo, utilizando un "campo de clave" en bases de datos pre-seleccionadas o sectores de datos. Más particularmente, un "campo de clave" particiona la base de datos de acuerdo con la clase de objetos de alto nivel definidos por el campo de clave. Por ejemplo, ciertos tipos de datos pueden ser designados como un campo de clave en una pluralidad de tablas de datos relacionados y las tablas de datos luego se pueden enlazar sobre la base del tipo de dato en el campo de clave. Los datos correspondientes al campo de clave en cada una de las tablas de datos es de preferencia el mismos o del mismo tipo. Sin embargo, las tablas de datos que tienen datos similares, aunque no idéntico, en los campos de clave también se pueden enlazar al utilizar AGREP, por ejemplo. De acuerdo con una modalidad, cualquier técnica de almacenamiento de datos adecuada se puede utilizar para almacenar datos sin un formato estándar. Los conjuntos de datos pueden ser almacenados utilizando cualquier técnica adecuad, incluyendo, por ejemplo, el almacenamiento de archivos individuales utilizando una estructura de archive ISO/IEC 7816-4; implementación de un dominio mediante lo cual un archivo dedicado es seleccionado de modo que se exponen uno o más archivos elementales que contienen uno o más conjuntos de datos, la utilización de conjunto de datos almacenados en archivos individuales utilizando un sistema de archivamiento jerárquico; conjuntos de datos almacenados como registros en un solo archivo (incluyendo compresión, accesible SQL, marcados por la vía de uno o más claves, numéricos, alfabéticos por primer tupie, etc.); Objeto Grande Binario (BLOB); almacenados como elementos de datos no agrupados codificados utilizando los elementos de datos ISO/IEC 7816-6; almacenados como elementos de datos no agrupados codificados utilizando ISO/IEC Abstract Syntax Notation (ASN.l) como en ISO/IEC 8824 y 8825; y/u otras técnicas patentadas que pueden incluir métodos de comprensión fractal, métodos de compresión de imagen, etc. En una modalidad ejemplar, la habilidad para almacenar una amplia variedad de información en diferentes formatos es facilitada al almacenar la información como un BLOB. Asi, cualquier información binaria puede ser almacenada en un espacio de almacenamiento asociado con un conjunto de datos. El método BLOB puede almacenar conjuntos de datos como elementos de datos no agrupados formateados como un bloque de binarios por la vía de un compensador de memoria fija utilizando ya sea la asignación de almacenamiento fija, técnicas de cola circular, o mejores prácticas con respecto al manejo de memoria (por ejemplo, memoria paginada, menos recientemente utilizado, etc.)- Al utilizar los métodos BLOB, la habilidad para almacenar varios conjuntos de datos que tienen diferentes formatos facilita el almacenamiento de datos por múltiples propietarios y propietarios no relacionados de los conjuntos de datos. Por ejemplo, un primer conjunto de datos que puede ser almacenado puede ser proporcionado por una primera parte, un segundo conjunto de datos que puede ser almacenado puede ser proporcionado por una segunda parte no relacionada, y todavía un tercer conjunto de datos que puede ser almacenado, se puede proporcionar por una tercera parte no relacionada con la primera y la segunda parte. Cada uno de estos tres conjuntos de datos ejemplares puede contener diferente información que es almacenada utilizando diferentes formatos y/o técnicas de almacenamiento de datos. Además, cada conjunto de datos puede contener subconjuntos de datos que también pueden ser distintos de otros subconjuntos. Como se estableció en lo anterior, en varias modalidades, los datos pueden ser almacenados sin considerar un formato común. Sin embargo, en una modalidad ejemplar, el conjunto de datos (por ejemplo, BLOB) puede ser anotado en una manera estándar cuando se proporciona para la manipulación de los datos. La anotación puede comprender un encabezado corto, rastreador, u otro indicador apropiado relacionado con cada conjunto de datos que es configurado para transportar la información útil en el manejo de los diversos conjuntos de datos. Por ejemplo, la anotación puede ser llamada un "encabezado de condición", "encabezado", "rastreador" o "estado" en la presente, y puede comprender una indicación del estado del conjunto de datos o puede incluir un identificador correlacionado con un expedidor especifico o propietario de los datos. Los bytes subsecuentes de datos pueden ser utilizados para indicar por ejemplo, la identidad del expedidor o propietario de los datos, usuario, identificador de cuenta de transacción/membrecía o los similares. Cada una de estas anotaciones de condición además se discuten en la presente. La anotación de conjunto de datos también se puede utilizar para otros tipos de información de estado asi como otros diversos propósitos. Por ejemplo, la anotación de conjunto de datos puede incluir información de seguridad que establece los niveles de acceso. Los niveles de acceso pueden ser configurados, por ejemplo, para permitir que solo ciertos individuos, niveles de empleados, compañías u otras entidades ingresen a los ' conj untos de datos, o para permitir el acceso a conjuntos de datos específicos basados sobre la transacción, el expedidor o el propietario de los datos, usuario o los similares. Además, la información de seguridad puede restringir/permitir solamente ciertas acciones tales como acceso, modificación, y/o supresión de conjuntos de datos. En un ejemplo, la anotación de conjunto de datos indica que solamente el propietario del conjunto de datos o el usuario están permitidos para borra un conjunto de datos, varios usuarios identificados pueden ser permitidos para ingresar los conjuntos de datos para la lectura, y otros son completamente excluidos del acceso al -conjunto de datos. Sin embargo, otros parámetros de restricción de acceso también pueden ser utilizados que permiten a varias entidades ingresar al conjunto de datos con diversos niveles de permiso como sea apropiado. Los datos, incluyendo el encabezado o rastreador pueden ser recibidos por un dispositivo de interacción solamente configurado para adicionar, borrar, modificar o aumentar los datos de acuerdo con el encabezado o rastreador . Un experto en la técnica también apreciará que, por razones de seguridad, cualquiera de las bases de datos, sistemas, dispositivos, servidores u otros componentes del sistema, pueden consistir de cualquier combinación de los mismos en una sola ubicación o en múltiples ubicaciones, en donde cada base de datos o sistema incluye cualquiera de varias características de seguridad adecuadas, tales como cortacorrientes, códigos de acceso, encriptación, descriptación , compresión, descompresión, y/o los similares.
La unidad de computación del cliente de la red además puede estar equipada con un hojeador de Internet conectado a Internet o un intranet utilizando disco selector estándar, cable, DSL o cualquier protocolo de Internet conocido en la técnica. Las transacciones que se originan en un cliente de la red pueden pasar a través de un cortacorriente con el fin de prevenir el acceso no autorizado de los usuarios a otras redes. Además, cortacorrientes adicionales pueden ser desplegados entre los componentes variables del CMS para aumentar adicionalmente la seguridad. El cortacorriente (firewall) puede incluir cualquier . hardware y/o software adecuadamente configurado para proteger los componentes de CMS y/o los recursos de computación de la empresa de los usuarios a redes. Además, un cortacorriente puede ser configurado para limitar o restringir el acceso a varios sistemas y componentes detrás del cortacorriente para los clientes de la red que se conectan a través de un servidor de la red. El cortacorriente puede residir en configuraciones variables incluyendo Stateful Inspection, Proxy based y Packet Filtering entre otros. El cortacorriente puede ser integrado dentro de un servidor de la red o cualquiera de los otros componentes de CMS o además puede residir como una entidad separada. Las computadoras discutidas en la presente pueden proporcionar un sitio de la red adecuado u otra interfaz del usuario gráfico basado en el Internet que es accesible por los usuarios. En una modalidad, El Servidor de Información de Internet de Microsoft (IIS), Servidor de Transacción de 'Microsoft (MTS) , y Servidor SQL de Microsoft, se usan en conjunción con el sistema de operación de Microsoft, el software del servidor de la red NT de Microsoft, un sistema de datos del servidor SQL de Microsoft, y un Servidor Comercial de Microsoft. Adicionalmente los componentes tales como Access o Microsoft SQL Servidor, Oracle, Sybase, Informix MySQL, Interbase, etc., se pueden utilizar para proporcionar un Objeto de Datos Activo -(ADO) que cumple con el sistema de manejo de la base de datos. Cualquiera de las comunicaciones, entradas, almacenamiento, bases de datos o visualizaciones discutidas en la presente se pueden facilitar a través de un sitio en la red que tiene páginas de la red. El término "página de la red" como se utiliza en la presente no se' propone para limitar el tipo de documentos y aplicaciones que podrían ser utilizadas para interactuar con el usuario. Por ejemplo, un sitio de la red podría incluir, además de los documentos HTML estándares, varios formatos, Java applets, JavaScript, páginas servidoras activas (ASP) , escritos de interfaz de entrada común (CGI) , lenguaje de margen extensible (XML) , HTML de dinámico, hojas de estilo de cascada (CSS), aplicaciones ayudantes, enchufes y los similares. Un servidor puede incluir un servicio de la red que recibe una petición de un servidor de la red, la petición que incluye un URL (http : //yahoo . com/stockquotes /ge) y una dirección IP (123.56.789.234). El servidor de la red recupera las páginas de la red apropiadas y envia los datos o aplicaciones para las páginas de la red o a la dirección IP. Los servicios de la red son aplicaciones que son capaces de interactuar con otras aplicaciones sobre un medio de comunicación, tal como el Internet. Los servicios de la red están típicamente basados sobre estándares o protocolos tales como XML, XSLT, SOAP, WSDL y ÜDDI. Los métodos de servicios de la red son bien conocidos en la técnica, y están cubiertos en muchos de estos estándares. Ver, por ejemplo, ALEX NGHIEM, IT WEB SERVICES: ? ROADMAP FOR THE ENTERPRISE (2003), incorporada en la presente por referencia. La base de datos clínicos basado en la red para el sistema y método de la presente invención de preferencia tiene la habilidad para cargar y almacenar archivos de datos clínicos en formatos nativos y es buscable sobre cualquier parámetro clínico. La base de datos también es escalable y puede utilizar un modelo de datos EAV (metadatos) para introducir anotaciones clínicas de cualquier estudio para facilidad de integración con otros estudios. La base de datos clínicos basados en la red es flexible y puede ser XML y XSLT habilitado para ser capaz de adicionar cuestiones usuales del usuario dinámicamente. Además, la base de datos incluye la exportabilidad a CDISC ODM. Los profesionales también apreciarán que hay un número de métodos para visualizar los datos dentro de un documento basado en hojeador. Los datos se pueden representar como texto estándar o dentro de una lista fija, lista enrollable, lista descendente, campo de texto editable, campo de texto fijo, ventana emergente, y los similares. Del mismo modo hay un número of métodos disponibles para modificar los datos en una página de la red tal, por ejemplo, la entrada del texto libre utilizando un teclado, selección de artículos del menú, cuadros de verificación, cuadros de opción y los similares . El sistema y método puede ser descrito en la presente en términos de componentes de bloque funcionales, tomas de pantalla, selecciones opcionales y varias etapas de procesamiento. Se debe apreciar que tales bloques funcionales pueden ser realizados por cualquier número de componentes de hardware y/o software configurados para realizar las funciones especificadas. Por ejemplo, el sistema puede emplear varios componentes de circuito integrado, por ejemplo, elementos de memoria, elementos de procesamiento, elementos lógicos, tablas de consulta y los similares, que pueden llevar a cabo una variedad de funciones bajo el control de uno o más microprocesadores u otros dispositivos de control. De manera similar los elementos de software del sistema se pueden . implementar con cualquier lenguaje de programación o escriptación tal como C, C++ , Macromedia Cold Fusión, Microsoft Active Server Pages, Java, COBOL, assembler, PERL, Visual Basic, SQL Stored Procedures, lenguaje de margen extensible (XML) , con los diversos algoritmos que son implementados con cualquier combinación de estructuras de datos, objetos, procesos, rutinas u otros elementos de programación. Además, se debe observar que el sistema puede emplear cualquier número de técnicas convencionales para transmisión de datos, señalización, procesamiento de datos, control de la red, y los similares. Todavía adicionalmente, el sistema podría ser utilizado para detectar o prevenir puntos de seguridad con un lenguaje de escriptación del lado del cliente, tal como JavaScript, VBScript o los similares. Para una introducción básica de la criptografía y seguridad de la red, ver cualquiera de las siguientes referencias: (1) "Applied Cryptography: Protocols, Algorithms, And Source Code In C", por Bruce Schneier, publicadas por John Wiley & Sons (segunda edición, 1995); (2) "Java Cryptography" por Jonathan Knudson, publicadas por O'Reilly & Associates (1998); (3) "Cryptography & Red Security: Principies & Practice" por William Stallings, publicadas por Prentice Hall; todas las cuales son incorporadas en la presente por referencia.
Como se utiliza en la presente, el término "usuario final", "consumidor", "abonado", "cliente", "medico tratante", "hospital", o "negocio" se pueden utilizar intercambiablemente entre si, y cada uno significará cualquier persona, entidad, · máquina, hardware, software o negocio. Cada participante está equipado con un dispositivo de computación con el fin de interactuar con el sistema y facilitar el acceso de datos en linea y la entrada de datos. El abonado tiene una unidad de computación en la forma de una computadora personal, aunque otros tipos de unidades de computación pueden ser utilizadas incluyendo computadoras transportables, libros de notas, computadoras portátiles, cajas de equipo de ajuste, teléfonos celulares, teléfonos de tono de tacto, y los similares. El propietario/operador del sistema y método de la presente invención tiene una unidad de computación implementada en la . forma de una computadora-servidor, aunque otras implementaciones son contempladas por el sistema incluyendo un centro de computación mostrado como una computadora de estructura principal, una mini-computadora, un servidor de PC, una red de computadoras ubicadas en las mismas de diferentes ubicaciones geográficas, o los similares. Por otra parte, el sistema contempla el uso, venta I o distribución de cualquiera de los artículos, servicios o información sobre cualquier red que tiene funcionalidad similar descrita en la presente.
En una modalidad ejemplar, cada abonado de cliente puede ser expedido con una "cuenta" o "número de cuentas". Como se utiliza en la presente, la cuenta o número de cuenta puede incluir cualquier dispositivo, código, número, letras, símbolo, certificado digital, chip inteligente, señal digital, señal análoga, estadística de datos biológicos u otro identificador/indicios adecuadamente configurados para permitir al consumidor ingresar, interactuar con o comunicarse con el sistema (por ejemplo, uno o más de un código de autorización/acceso, número de identificación personal (PIN) , código de Internet, otro código de identificación, y/o los similares). El número de cuenta opcionalmente puede ser localizado sobre o asociado con una tarjeta de cambio, tarjeta de crédito, tarjeta de débito, tarjeta de prepago, tarjeta en relieve, tarjeta inteligente, tarjeta con cinta magnética, tarjeta de código de barras, transpondedor , tarjeta de radio frecuencia o una cuenta asociada. El sistema puede incluir o estar en interfaz con cualquiera de las tarjetas o dispositivos anteriores, o un fob que tiene un transpondedor y lector RFID en comunicación de RF con el fob. Aunque el sistema puede incluir una modalidad de fob, la invención no es de esta manera limitada. En realidad, el sistema puede incluir cualquier dispositivo que tiene un transpondedor que está configurado para comunicarse con el lector de RFID por la vía de la comunicación de RF. Dispositivos típicos pueden incluir, por ejemplo, un anillo de clave, etiqueta, tarjeta, teléfono celular, reloj de pulsera o cualquier forma de tal clase capaz de ser presentada para la interrogación. Por otra parte, el sistema, unidad o dispositivo de computación discutido en la presente puede incluir un "un dispositivo de computación pervasivo", que puede incluir un dispositivo tradicionalmente no computarizado que es incrustado con una unidad de computación. El número de cuenta puede ser distribuido y almacenado en cualquier forma de dispositivo plástico, electrónico, magnético, de radio frecuencia, inalámbrico, de audio y/o óptico capaz de transmitir o descargar datos de el mismo a un segundo dispositivo. Como será apreciado por uno de habilidad ordinaria en la técnica, el sistema puede ser incorporado como una adaptación de un sistema existente, un producto de adición, software mejorado, un sistema único, un sistema distribuido, un método, un sistema de procesamiento de datos, un dispositivo para procesar datos, y/o un producto de programa de computadora. Por consiguiente, el sistema puede tomar la forma de una modalidad completamente de software, una modalidad completamente de hardware, o una modalidad que combina los aspectos de tanto el software y el hardware. Además, el sistema puede tomar la forma de un producto de programa de computadora sobre un medio de almacenamiento leíble en computadora que tiene medios de código de programa leíbles en computadora incorporados en el medio de almacenamiento. Cualquier medio de almacenamiento leíble en computadora adecuado puede ser utilizado, incluyendo disco duros, CD-ROM, dispositivos de almacenamiento ópticos, dispositivos de almacenamiento magnético, y/o los similares. El sistema y método es descrito la presente con referencia a tomas de pantalla, diagramas de bloques e ilustraciones de diagrama de flujo de métodos, aparato (por ejemplo, sistema), y productos de programa de computadora de acuerdo con varias modalidades. Será entendido que cada bloque funcional de los diagramas de bloque y las ilustraciones de diagrama de flujo, y combinaciones de bloques funcionales en los diagrama de bloques e lustraciones de diagramas de flujo, respectivamente, se pueden implementar mediante instrucciones de programa de computadora. Con referencia ahora a las Figuras 2-25 los flujos de proceso y las tomas de pantalla representadas son meramente modalidades y no se proponen para limitar el alcance de la invención como es descrito en la presente. Por ejemplo, las etapas mencionadas en cualquiera de las descripciones del método o proceso se pueden ejecutar en cualquier orden y no están limitadas al orden presentado. Será apreciado que la siguiente descripción hace referencias apropiadas no solamente a las etapas y los elementos del interfaz del usuario representado en las Figuras 2-25, sino también a los diversos componentes del sistema como es descrito en lo anterior con referencia a la Figura 1. Estas instrucciones de programa de computadora pueden ser cargadas en una computadora de propósito general, computadora de propósito especial, u otro aparato de procesamiento de datos programable para producir una máquina, tal que las instrucciones que se ejecutan sobre la computadora u otro aparato de procesamiento de datos programable crea medios para implementar las funciones especificadas en el bloque o bloque del diagramas de flujo. Estas instrucciones de programa de computadora también pueden ser almacenadas en una menoría leíble en computadora que puede dirigirse a una computadora u otro aparato de procesamiento de datos programable para funcionar de una manera particular, tal que las instrucciones almacenadas en la memoria leíble en computadora producen un artículo de manufactura que incluye medios de instrucción que implementan la función especificada en el bloque o bloques del diagramas de flujo. Las instrucciones de programa de computadora también se pueden cargar sobre una computadora u otro aparato de procesamiento de datos programable para causar una serie de etapas de operación sean realizadas sobre la computadora u otro aparato programable para producir un proceso implementado en computadora tal que las instrucciones que se ejecutan sobre la computadora u otro aparato programable proporcionan etapas para implementar las funciones especificadas en el bloque o bloque del diagrama de flujo. Por consiguiente, los bloques funcionales de los diagrama de bloques e ilustraciones del diagrama de flujo soportan combinaciones de medios para realizar las funciones especificadas, combinaciones de etapas para realizar las funciones especificadas, y medios de instrucción de programa para realizar las funciones especificadas. También será entendido que cada bloque funcional de los diagramas de bloques e ilustraciones de diagramas de flujo, y combinaciones de bloques funcionales en los diagramas de bloques e ilustraciones de diagramas de flujo, se pueden implementar por ya sea sistema de computadora basados en hardware de propósito especial que realizan las funciones o etapas especificadas, o combinaciones adecuadas del hardware de de propósito especial e instrucciones de computadora. Además, las ilustraciones de los flujos del proceso y las descripciones de los mismos pueden hacer referencia a las ventanas del usuario, páginas de la red, sitios de la red, formas de la red, avisos, etc. Los profesionales apreciarán que las etapas ilustradas descritas en la presente pueden comprender cualquier número of configuraciones incluyendo el uso de ventanas, páginas de la red, formas de la red, ventanas emergente, avisos y los similares. Además se debe apreciar que las múltiples etapas como son ilustradas y descritas se pueden combinar en páginas de la red y/o ventanas individuales pero que se han expandido por cuestión de simplicidad. En otros casos, las etapas ilustradas y descritas como etapas de proceso individuales se pueden separar en múltiples páginas de la red y/o ventanas pero se han combinado por simplicidad. Los beneficios, otras ventajas y soluciones a los problemas se han descrito en la presente con respecto a modalidades especificas. Sin embargo, los beneficios, ventajas, soluciones a los problemas, y cualquier elemento (s) que pueden causar cualquier beneficio, ventaja, o solución para que ocurran o lleguen a ser más pronunciados no van a ser considerados como características o elementos críticos, requeridos o esenciales de cualquiera de todas las reivindicaciones de la invención. El alcance de la invención es por consiguiente para ser limitado por nada diferente de las reivindicaciones adjuntas, en las cuales la referencia a un elemento en lo singular no se propone para dar a entender "uno y solamente uno" a menos que explícitamente así sea establecido, sino más bien "uno o más". Todos los equivalentes estructurales, químicos y funcionales a los elementos de las modalidades ejemplares descritas en lo anterior que son conocidos para aquellos de habilidad ordinaria en la técnica son expresamente incorporados en la presente por referencia y se proponen para ser abarcados por las presentes reivindicaciones. Por otra parte, no es necesario para un dispositivo o método dirigirse a cada uno y todo el problema buscado a ser resuelto por la presente invención, para que sea abarcado por las presentes reivindicaciones. Además, ningún elemento, componente, o etapa del método en la presente descripción se propone para ser dedicado al público sin considerar si el elemento, componente, o etapa del método es explícitamente mencionado en las reivindicaciones. Ningún elemento de las reivindicaciones en la presente va a ser considerado bajo las condiciones de 35 U.S.C. 112, sexto párrafo, a menos que el elemento sea expresamente mencionado utilizando la frase "significa para". Como se utiliza en la presente, los términos "comprende", "que comprende", o cualquier otra variación de los mismos, se proponen para cubrir una inclusión no exclusiva, tal que un proceso, método, artículo, o aparato que comprende una lista de elementos no incluye solamente esos elementos sino puede incluir otros elementos no expresamente listado o inherentes a tal proceso, método, artículo, o aparato. Además ningún elemento descrito en la presente es requerido para la práctica de la invención a menos que sea descrito expresamente como "esencial" o "crítico" . La FIG. 1 es un diagrama de bloques de una modalidad ejemplar de un sistema 10 para determinar la intervención médica individualizada para un estado de enfermedad' particular que utiliza el perfilado molecular de la muestra biológica de un paciente. El sistema 10 incluye una interfaz del usuario 12, un servidor principal 14 que incluye un procesador 16 para procesar datos, una memoria 18 acoplada al procesador, un programa de aplicación 20 almacenado en la memoria 18 y accesible por el procesador 16 para dirigir el procesamiento de los datos por el procesador 16, una pluralidad de bases de datos internas 22 y bases de datos externas 24, y una interfaz con una red de comunicaciones alámbrica o inalámbrica 26 (tal como el Internet, por ejemplo). El sistema 10 también puede incluir un digitalizador de entrada 28 acoplado al procesador 16 para introducir datos digitales de los datos que son recibidos de la interfaz del usuario 12. La interfaz del usuario 12 incluye un dispositivo de entrada 30 y un dispositivo visualizador 32 para introducir datos en el sistema 10 y para visualizar la información derivada de los datos procesados por el procesador 16. La interfaz del usuario 12 también puede incluir una impresora 34 para imprimir la información derivada de los datos procesados por el procesador 16 tal como los reportes del paciente que pueden incluir resultados de prueba para objetivos y terapias de fármaco propuestas basadas en los resultados de prueba. Las bases de datos internas 22 pueden incluir, pero no están limitadas a, información y rastreo de la muestra/espécimen biológico del paciente, datos clínicos, datos del paciente, rastreo del paciente, manejo de archivos, protocolos de estudio, resultados de prueba del paciente del perfilado molecular, e información de facturación y rastreo. Las bases de datos externas 24 pueden incluir, pero no están limitadas a, librerías de fármaco, librerías de genes, librerías de enfermedades, y bases de datos públicas y privadas tales como UniGene, OMIM, GO, TIGR, GenBank, KEGG y Biocarta . Varios métodos se pueden utilizar de acuerdo con el sistema 10. La FIG. 2 muestra un diagrama de flujo de una modalidad ejemplar de un método 50 para determinar la intervención médica individualizada para un estado de enfermedad particular que utiliza el perfilado molecular de una muestra biológica de un paciente que no es específica de enfermedad. Con el fin de determinar una intervención médica para un estado de enfermedad particular utilizando el perfilado molecular que es independiente de la diagnosis del linaje de enfermedad (es decir, no restringido a enfermedad única) , por lo menos una prueba se realiza para por lo menos un objetivo de una muestra biológica de un paciente enfermo en la etapa 52. Un objetivo se define como cualquier descubrimiento molecular que puede ser obtenido de la prueba molecular. Por ejemplo, un objetivo puede incluir uno o más genes, una o más proteínas expresadas en gen, uno o más mecanismos moleculares, y/o combinaciones de los mismos. Las pruebas para encontrar tales objetivos puede incluir, pero no están limitadas a un análisis inmunohistoquímico (IHC), un análisis de microarreglo tal como un microarreglo de hibridación genómica comparativa (CGH) , un microarreglo de polimorfismo de nucleótido individual (SNP), una hibridación in-situ fluorescente (FISH), una hibridación in-situ (ISH), y un arreglo proteomico, y otras prueba moleculares conocidas para aquellos expertos en la técnica. Por consiguiente, uno o más de los siguientes se pueden realizar: un análisis de IHC en etapa 54, un microanálisis en etapa 56, y otras pruebas moleculares conocidas para aquellos expertos en la técnica en la etapa 58. Las muestras biológicas se obtienen de pacientes enfermos al tomar una biopsia de un tumor, al conducir la cirugía mínimamente invasiva si no está disponible tumor reciente, al obtener una muestra de la sangre del paciente, o una muestra de cualquier otro fluido biológico que incluye, pero no limitado a, extractos celulares, extractos nucleares, lisados celulares o productos biológicos o substancia de origen biológico tales como excreciones, sangre, suero, plasma, orina, esputo, lágrimas, heces, saliva, extractos de membrana, y los similares. En la etapa 60, se hace una determinación en cuanto a si uno o más de los objetivos que se probaron en la etapa 52 exhiben un cambio en la expresión comparado con una referencia normal para ese objetivo particular. En un método ejemplar de la invención, un análisis IHC se puede realizar en la etapa 54 y una determinación en cuanto a si cualquiera de los objetivos del análisis IHC exhiben un cambio en la expresión se hace en la etapa 64 al determinar si 30% o más de las células de la muestra biológica fueron +2 o más grande de manchado para el objetivo particular. Será entendido por aquellos expertos en la técnica que habrá casos donde +1 o más grande de manchado indicará un cambio en la expresión en que los resultados de manchado pueden variar dependiendo del técnico que realiza la prueba y el tipo de Objetivo que es probado. En otra modalidad ejemplar de la invención, un análisis de microarreglo se puede realizar en la etapa 56 y una determinación en cuanto a si cualquiera de los objetivos del análisis de microarreglo exhiben un cambio en la expresión se hace en la etapa 66 al identificar que objetivos son regulados hacia 5 o regulados hacia abajo al determinar si el cambio doble en la expresión para un objetivo particular con relación a un tejido normal de referencia de origen es significante en p< 0 001. Un cambio en la expresión también puede ser evidenciado por una ausencia de uno o más genes, proteínas expresadas en gen, mecanismos moleculares, u otros descubrimientos moleculares. Después de determinar que objetivos exhiben un cambio en la expresión en la etapa 60, por lo menos un agente no específico de enfermedad es identificado que interactúa con cada objetivo que tiene una expresión cambiada en la etapa 70. Un agente puede ser cualquier fármaco o compuesto que tiene un efecto terapéutico. Un agente no específico de enfermedad es un fármaco o compuesto terapéutico no previamente asociado con el tratamiento de la enfermedad diagnosticada del paciente que es capaz de interactuar con el objetivo de la muestra biológica del paciente que ha exhibido un cambio en la expresión. Algunos de los agentes no específicos de enfermedad que se han encontrado que interactúan con objetivos específicos encontrados en diferentes pacientes con cáncer se muestran en la Tabla 1 enseguida . Tabla 1 Pacientes Objetivo (s) Encontrado Tratamiento ( s ) Cáncer Pancreático HER2/neu Herceptin™ Avanzado (IHC/arreglo) Cáncer Pancreático EGFR (IHC) , HIF la Erbitux™ Avanzado Rapamicin™ Cáncer Pancreático ERCC3 (Arreglo) Irofulvene Avanzado Carcinoma Cístico Receptor de Vitamina D, Calcitriol™ Adenoide Avanzado Receptores de Andrógeno Flutamida™ Finalmente, en la etapa 80, se puede proporcionar un reporte de perfil del paciente que incluye los resultados de prueba del paciente para varios objetivos y cualquiera de las terapias propuestas basadas en esos resultados. Un reporte de perfil del paciente ejemplar 100 se muestra en las FIGS. 3A-3D. El reporte de perfil del paciente 100 mostrado en la Fig. 3A identifica los objetivos probados 102, esos objetivos probados que exhibieron cambios significantes en la expresión 104, y agentes no específicos de enfermedad propuestos para interactuar con los objetivos 106. El reporte de perfil del paciente 100 mostrado en la Fig. 3B identifica los resultados 108 del análisis inmunohistoquímico para ciertas proteínas expresadas en gen 110 y si una proteína expresada en gen es un objetivo molecular 112 al determinar si 30% o más de las células de tumor fueron +2 o más grande manchadas. El reporte 100 también identifica las pruebas inmunohistoquímicas que no fueron realizadas 114. El reporte de perfil del paciente 100 mostrado en la Fig. 3C identifica los genes analizados 116 con un análisis de microarreglo y si los genes fueron sub-expresados o sobre-expresados 118 comparados con una referencia. Finalmente, el reporte de perfil del paciente 100 mostrado en la Fig. 3D identifica la historia clínica 120 del paciente y las muestras que fueron enviadas 122 del paciente. La FIG. 4 muestra un diagrama de flujo de una modalidad ejemplar de un método 200 para identificar una terapia de fármaco/agente capaz de interactuar con un objetivo. En la etapa 202, se identifica un objetivo molecular que exhibe un cambio en la expresión en un número de individuos enfermos. Enseguida, en la etapa 204, una terapia de fármaco/agente se administra a los individuos enfermos. Después de la administración de la terapia de fármaco/agente, cualquiera de los cambios en el objetivo molecular identificado en la etapa 202 se identifica en la etapa 206 con el fin de determinar si la terapia de fármaco/agente administrada en la etapa 204 interactúa con los objetivos moleculares identificados en la etapa 202. Si se determina que la terapia de fármaco/agente administrada en la etapa 204 interactúa con un objetivo molecular identificado en la etapa 202, la terapia de fármaco/agente se puede aprobar para el tratamiento de pacientes que exhiben un cambio en la expresión del objetivo molecular identificado en lugar de aprobar la terapia de fármaco/agente para una enfermedad particular. Las FIGS . 5-14 son diagramas de flujo y diagramas que ilustran varias partes de un sistema y método de descubrimiento de fármaco de medicina personalizado basado en la información de acuerdo con la presente invención. La FIG. 5 es un diagrama que muestra un sistema de soporte de decisión clínico ejemplar del sistema y método de descubrimiento de fármaco de medicina personalizado basado en la información de la presente invención. Los datos obtenidos a través de la investigación clínica y el cuidado clínico tales como datos de experimentos clínicos, datos de formación de imagen biomédicos/moleculares , genómica/proteomica/librería química/literatura/curación de experto, rastreo de bioespécimen/LIMS , historia familiar/registros ambientales, y datos clínicos se recolectan y almacenan como bases de datos y conjuntos de datos dentro de un almacén de datos. La FIG. 6 es un diagrama que muestra el flujo de información a través del sistema de soporte de decisión clínico del sistema y método de descubrimiento de fármaco de medicina personalizado basado en la información de la presente invención utilizando los servicios de la red. Un usuario interactúa con el sistema al introducir datos en el sistema por la vía de la entrada/carga basada en forma de los conjunto de datos, al formular preguntas y al ejecutar los trabajos de análisis de datos, y al adquirir y evaluar representaciones de datos de salida. El almacén de datos en el sistema basado en la red es donde los datos son extraído, transformados y cargados de varios sistemas de bases de datos. El almacén de datos también es donde ocurren los formatos comunes, mapeo y transformación. El sistema baso en la red también incluye conjuntos de datos que son creados basados en las vistas de datos de interés. Un diagrama de flujo de un sistema de soporte de decisión clínica ejemplar del sistema y método de descubrimiento de fármaco de medicina personalizado basado en información de la presente invención se muestra en la FIG. 7. El sistema de manejo de información clínica incluye en sistema de manejo de información de laboratorio y la información médica contenida en los almacenes de datos y bases de datos que libreras de información médica, tales como librerías de fármaco, librerías de genes, y librerías de enfermedades, además de la extracción de textos de la literatura. Tanto los sistemas de manejo de información relacionados con pacientes particulares como las bases de datos de información médica y los almacenes de datos vienen conjuntamente en un centro de unión de datos donde se puede obtener la información de diagnóstico y opciones terapéuticas. Un sistema de manejo financiero también puede ser incorporado en sistema de soporte de decisión clínica del sistema and método de descubrimiento de fármaco de medicina personalizado basado en información de la presente invención. La FIG. 8 es un diagrama que muestra un sistema de rastreo y manejo de bioespécimen ejemplar que puede ser utilizado como parte del sistema and método de descubrimiento de fármaco de medicina personalizado basado en información de la presente invención. La FIG. 8 muestra dos centros médicos principales que envían muestras a un banco de tejido/sangre. Las muestras pueden ir a través del análisis de laboratorio antes del envío. La investigación también se puede conducir sobre las muestras por la vía del análisis de microarreglo , determinación de genotipo y proteomico. Esta información puede ser redistribuida al banco de tejido/sangre. La FIG. 9 representa un diagrama de flujo de un sistema de rastreo y manejo de bioespécimen ejemplar que puede ser utilizado con el sistema and método de descubrimiento de fármaco de medicina personalizado basado en información de la presente invención. El centro médico principal obtiene muestras de los pacientes y luego envía las muestras del paciente a un laboratorio de perfilado molecular que también puede realizar el aislamiento y análisis de RNA y DNA. Un diagrama que muestra un método para mantener un vocabulario estandarizado clínico para el uso con el sistema y método de descubrimiento de fármaco de medicina personalizado basado en información de la presente invención se muestra en la FIG . 10. La FIG. 10 ilustra como las observaciones del médico y la información del paciente asociada con el paciente de un médico pueden ser accesibles a otro médico para permitir al otro médico utilizar los. datos para hacer decisiones de diagnóstico y terapéuticas para sus pacientes . La FIG. 11 muestra un arreglo esquemático de una base de datos de expresión de gen de microarreglo ejemplar que se puede utilizar como parte del sistema y método de descubrimiento de fármaco de medicina personalizado basado en información de la presente invención. La base de datos de la expresión de gen de microarreglo incluye tanto bases de datos externas como bases de datos internas que puede ser accesadas por la vía del sistema basado en la red. Las bases de datos externas pueden incluir, pero no están limitadas a, UniGene, GO, TIGR, GenBank, KEGG . Las bases de datos internas pueden incluir, pero no están limitadas a, rastreo de tejido, LIMS, datos clínicos, y rastreo del paciente. La FIG. 12 muestra un diagrama de un almacén de datos de la base de datos de expresión de gen de microarreglo ejemplar que puede ser utilizado como parte del sistema y método de descubrimiento de fármaco de medicina personalizado basado en información de la presente invención. Los datos de laboratorio, los datos clínicos, y datos del paciente todos pueden ser alojados en el almacén de datos de la base de datos de expresión de gen de microarreglo y los datos a su vez pueden ser accesados mediante personal público/privado y utilizados por herramientas de análisis de datos. Otra representación esquemática que muestra el flujo de información a través de un sistema y método de descubrimiento de fármaco de medicina personalizado basado en información de la presente invención se muestra en la FIG. 13. Similar a la FIG. 7, la representación esquemática incluye el manejo de información clínica, manejo de información médica y de literatura, y manejo financiero del sistema y método de descubrimiento de fármaco de medicina personalizado basado en información de la presente invención. La FIG. 14 es una representación esquemática que muestra una red ejemplar del sistema y método de descubrimiento de fármaco de medicina personalizado basado en información de la presente invención. Los pacientes, profesionales médicos, centros médicos principales y laboratorios todos comparten el intercambio en una variedad de información con el fin de proporcionar a un paciente con una terapia o agente propuesto basado en varios objetivos identificados. Las FIGS. 15-25 son impresiones de pantalla en computadora asociadas con varias partes del sistema y método de descubrimiento de fármaco de medicina personalizado basado en información mostrado en las FIGS. 5-14. Las FIGS. 15 y 16 muestran pantallas de computadora donde la información del médico e información de la compañía aseguradora es introducida en beneficio de un cliente. Las FIGS. 17-19 muestran pantallas de computadora en las cuales la información puede ser introducida para ordenar el análisis y las pruebas sobre muestras de pacientes.
La FIG. 20 es una pantalla de computadora que muestra los resultados del análisis de microarreglo de genes específicos probados con muestras de pacientes. Esta información y la pantalla de computadora, es similar a la información detallada en el reporte de perfil del paciente mostrada en la FIG. 3C. La FIG. 22 es una pantalla de computadora que muestra los resultados de la prueba inmunohistoquímica para un paciente particular para varios genes. Esta información es similar a la información contenida en el reporte de perfil del paciente mostrada en la FIG. 3B. La FIG. 21 es una pantalla de computadora que muestra opciones de selección para encontrar pacientes particulares, ordenar las pruebas y/o resultados, expedir reportes del paciente y rastrear los casos actuales/pacientes. La FIG. 23 es una pantalla de computadora que resume algunas de las etapas para crear un reporte de perfil del paciente como se muestra en las FIGS. 3A hasta 3D. La FIG. 24 muestra una pantalla de computadora para ordenar una prueba inmunohistoquímica sobre una muestra de paciente y la FIG. 25 muestra una pantalla de computadora para introducir información que considera un sitio de tumor primario para el análisis de microarreglo. Será entendido por aquellos expertos en la técnica que cualquier número y variedad de pantallas de computadora pueden ser utilizadas para introducir la información necesaria para utilizar el sistema y método de descubrimiento de fármaco de medicina personalizado basado en información de la presente invención y para obtener información que resulta de la utilización del sistema y método de descubrimiento de fármaco de medicina personalizado basado en información de la presente invención. También será entendido que la descripción anterior es de modalidades ejemplares preferidas de la invención y que la invención no está limitada a las formas especificas mostradas o descritas en la presente. Varias modificaciones se pueden hacer en el diseño, arreglo, y tipo de elementos divulgados en la presente, asi como en las etapas para utilizar la invención sin apartarse del alcance de la invención como es expresado en las reivindicaciones adjuntas.

Claims (31)

  1. REIVINDICACIONES 1. Un método para determinar la intervención médica personalizada para un individuo enfermo, caracterizado porque comprende las etapas de: realizar por lo menos una de una prueba para un gen y una prueba para una proteina expresada en gen de una muestra biológica de un individuo enfermo que tiene una enfermedad diagnosticada; determinar que genes y/o proteínas expresadas en gen exhiben un cambio en la expresión comparado con una referencia; e identificar una terapia de fármaco personalizada utilizada para interactuar con por lo menos uno de los genes y/o proteínas expresadas en gen que exhibieron un cambio en la expresión que no se ha asociado previamente con el tratamiento de la enfermedad diagnosticada .
  2. 2. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la etapa de identificar una terapia de fármaco utilizada para interactuar con por lo menos uno de los genes y/o proteínas expresadas en gen que exhibieron un cambio en la expresión comprende la etapa de identificar una terapia de fármaco de por lo menos una de una revisión automatizada de una base de datos de literatura extensiva y datos generados de experimentos clínicos.
  3. 3. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la etapa de realizar por lo menos una de una prueba para un gen y una prueba para una proteina expresada en gen comprende la etapa de realizar por lo menos uno de un análisis inmunohistoquímico (IHC) y un análisis de microarreglo.
  4. 4. El método de conformidad con la reivindicación 3, caracterizado porque la etapa de realizar un análisis de microarreglo comprende la etapa de realizar un análisis utilizando por lo menos uno de un microarreglo de expresión, un microarreglo de hibridación genómica comparativa (CGH) , un microarreglo de polimorfismo de nucleótido individual (SNP) , una hibridación in-situ fluorescente (FISH), una hibridación in-situ (ISH), y un arreglo proteomico.
  5. 5. El método de conformidad con la reivindicación .3, caracterizado porque la etapa de realizar un análisis IHC comprende la etapa de realizar un análisis IHC para una proteina expresada en gen que incluye por lo menos una de Her2/Neu, ER, PR, c-kit, EGFR, MLH1 , MSH2, CD20, p53, Ciclina DI, bcl2, COX-2, receptor de Andrógeno, CD52, PDGFR, AR, CD25, y VEGF.
  6. 6. El método de conformidad con la reivindicación 3, caracterizado porque la etapa de realizar un análisis de microarreglo comprende la etapa de realizar un análisis de microarreglo para un gen que incluye por lo menos uno de BCL2, HI FIA, AR, ESR1, PDGFRA, KIT, PDGFRB, CDW52, ZAP70, PGR, SPARC, GART, GSTP1, NFKBIA, MSH2 , TXNRD1 , HDAC1, PDGFC, PTEN, CD33, TYMS , RXRB , ADA, TNF, ERCC3, RAF1, VEGF, TOPl, TOP2A, BRCA2-, TKl , FOLR2, TOP2B, MLH1, IL2RA, DNMT1, HSPCA, ERBR2, ERBB2, SSTR1, VHL, VDR, PTGS2, POLA, CES2, EGFR, OGFR, ASNS, NFKB2, RARA, MS4A1, DCK, DNMT3A, EREG, Epiregulin, FOLR1, GNRH1 , GNRHR1 , FSHB, FSHR, FSHPRH1, receptor de folato, HGF, HIG1, IL13RA1, LTB, ODC1, PPARG, PPARGC1, VHL, Receptor de Linfotoxina Beta, Myc, TOP2B Topoisomerasa II, TOP02B, TXN, VEGFC, ACE2, ADH1C, ADH4, AGT, AREG, CA2 , CDK2, caveolin y NFKB1.
  7. 7. El método de conformidad con la reivindicación 3, caracterizado porque la etapa de realizar por lo menos una de una prueba para un gen y una prueba para una proteina expresada en gen de una muestra biológica de un individuo enfermo comprende la etapa de realizar una análisis inmunohistoquimico sobre un tumor y la etapa de determinar que genes y/o proteínas expresadas en gen exhiben un cambio en la expresión comparado con una referencia que comprende la etapa de determinar si 30% o más de las células de tumor fueron +2 o más grande manchado para una proteína expresada en gen particular.
  8. 8. El método de conformidad con la reivindicación 3, caracterizado porque la etapa de realizar por lo menos una de una prueba para un gen y una prueba para una proteína expresada en gen de una muestra biológica de un individuo enfermo comprende la etapa de realizar una análisis de microarreglo sobre un tumor y la etapa de determinar que genes y/o proteínas expresadas en gen exhiben un cambio en la expresión comparado con una referencia que comprende la etapa de identificar que genes son regulados hacia arriba o regulados hacia abajo al determinar si el cambio doble de la expresión para un gen particular con relación a un tejido normal de referencia de origen es significante en p < 0.001.
  9. 9. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque además comprende la etapa de proporcionar un reporte de perfil del paciente que identifica el cambio en la expresión para los genes y/o proteínas expresadas en gen junto con una terapia de fármaco posible para la interacción con cada uno de los genes y/o proteínas expresadas en gen que exhiben un cambio en la expresión.
  10. 10. Un método para identificar una terapia de fármaco capaz de interactuar con un objetivo molecular, caracterizado porque comprende las etapas de: identificar un mismo objetivo molecular en una pluralidad de individuos enfermos que tienen diferentes enfermedades que exhibe un cambio en la expresión cuando se compara con una referencia normal; administrar una terapia de fármaco a los individuos enfermos que exhiben el cambio en la expresión del objetivo molecular; y determinar cualquiera de los cambios en el objetivo molecular de los individuos enfermos después de la terapia de fármaco .
  11. 11. El método de conformidad con la reivindicación 10, caracterizado porque la etapa de identificar un objetivo molecular en una pluralidad de individuos enfermos que exhibe un cambio en la expresión cuando se compara con una referencia normal comprende la etapa de realizar por lo menos una de una prueba para un gen y una prueba para una proteina expresada en gen de una muestra biológica del individuo enfermo en donde la prueba comprende por lo menos uno de un análisis inmunohistoquímico (IHC) y un análisis de microarreglo .
  12. 12. Un sistema para determinar la intervención médica individualizada para un estado de enfermedad, caracterizado porque comprende: un servidor principal, una interfaz del usuario para accesar al servidor principal para accesar e introducir datos; un procesador para procesar los datos introducidos ; una memoria acoplada "al procesador para almacenar los datos procesados e instrucciones para: i) accesar a un perfil molecular tomado de una muestra biológica de un paciente enfermo con una enfermedad diagnosticada ; ii) determinar si por lo menos uno o más de un gen, una proteina expresada en gen, un mecanismo molecular, y otros descubrimientos moleculares que resultan del perfil molecular exhiben un cambio en la expresión comparado con una referencia normal; y iii) accesar a una base de datos de terapia de fármaco para identificar uno o más terapias de fármaco que interactúan con por lo menos un gen, proteina expresada en gen, mecanismo molecular, y otro descubrimiento molecular que inhibió un cambio en la expresión donde la una o más terapias de fármaco no se han asociado previamente con el tratamiento de la enfermedad diagnosticada; y un medio de visualización para visualizar por lo menos un gen, proteina expresada en gen, mecanismo molecular, y otro descubrimiento molecular que exhibe un cambio en la expresión y las terapias de fármaco que interactúan con estos que no se han asociado previamente con el tratamiento de la enfermedad diagnosticada.
  13. 13. El sistema de conformidad con la reivindicación 12, caracterizado porque el perfil molecular comprende por lo menos uno de un análisis inmunohistoquimico (IHC) y un análisis de microarreglo .
  14. 14. El sistema de conformidad con la reivindicación 13, caracterizado porque el análisis de microarreglo comprende por lo menos uno de un microarreglo de expresión, un microarreglo de hibridación genómica comparativa (CGH) , un microarreglo de polimorfismo de nucleótido individual (SNP) , una hibridación in-situ fluorescente (ISH), una hibridación in-situ (ISH), y un arreglo proteomico.
  15. 15. El sistema de conformidad con la reivindicación 13, caracterizado porque el análisis IHC comprende un análisis IHC para una proteina expresada en gen que incluye por lo menos una de Her2/Neu, ER, PR, c-kit, EGFR, MLH1, MSH2, CD20, p53, Ciclina DI, bcl2, COX-2, receptor de Andrógeno, CD52, PDGFR, AR, CD25, y VEGF .
  16. 16. El sistema de conformidad con la reivindicación 13, caracterizado porque el análisis de microarreglo comprende un análisis de microarreglo para un gen que incluye por lo menos uno de BCL2, HIF1A, AR, ESR1, PDGFRA, KIT, PDGFRB, CD 52, ZAP70, PGR, SPARC, GART, GSTP1, NFKBIA, MSH2, TXNRD1 , HDAC1 ,. PDGFC, PTEN, CD33, TYMS, RXRB, ADA, TNF, ERCC3, RAF1, VEGF, TOP1, TOP2A, BRCA2 , TK1, FOLR2, TOP2B, MLH1, IL2RA, DNMT1, HSPCA, ERBR2, ERBB2, SSTR1, VHL, VDR, PTGS2 , POLA, CES2 , EGFR, OGFR, ASNS, NFKB2, RARA, MS4A1, DCK, DNMT3A, EREG, Epiregulin, FOLR1, GNRH1, GNRHR1, FSHB, FSHR, FSHPRH1, receptor de folato, HGF, HIG1, IL13RA1, LTB, ODC1, PPARG, PPARGC1, VHL, Receptor de Linfotoxina Beta, Myc, TOP2B Topoisomerasa II, TOP02B, TXN, VEGFC, ACE2, ADH1C, ADH4 , AGT, AREG, CA2, CDK2, caveolin, y NFKB1.
  17. 17. El sistema de conformidad con la reivindicación 13, caracterizado porque el perfil molecular comprende un análisis inmunohistoquimico sobre un tumor e instrucciones para determinar si por lo menos uno o más gen, proteina expresada en gene, mecanismo molecular y otro descubrimiento molecular que resulta del perfil molecular exhibe un cambio en la expresión comparado con una referencia incluye instrucciones para determinar si el 30% o más de las células de tumor fueron +2 o más grande de manchado para una proteina expresada en gen particular.
  18. 18. El sistema de conformidad con la reivindicación 13, caracterizado porque el perfil molecular comprende un análisis de microarreglo sobre un tumor e instrucciones para determinar si por lo menos uno más de gen, proteina expresada en gen, mecanismo molecular, y otro descubrimiento molecular que resulta del perfil molecular exhibe un cambio en la expresión comparado con una referencia normal, incluye instrucciones para identificar que genes son regulados hacia arriba y regulados hacia abajo al determinar si el cambio doble en la expresión para un gen particular con relación a un tejido normal de referencia de origen fue significante en p<0 001.
  19. 19. El sistema de conformidad con la reivindicación 12, caracterizado porque el medio de visualización incluye un reporte de perfil del paciente impreso.
  20. 20. El sistema de conformidad con la reivindicación 12, caracterizado porque las instrucciones para accesar a una base de datos de terapia de fármaco para identificar una o más terapias de fármaco que interactúan con por lo menos un gen, proteina expresada en gen, mecanismo molecular, y otro descubrimiento molecular que exhibió un cambio en la expresión que no fueron previamente asociados con el tratamiento de la enfermedad diagnosticada comprende instrucciones para conducir una revisión automatizada de una base de datos de literatura extensiva que incluye literatura que correlaciona las interacciones de la terapia de fármaco con genes y/o proteínas expresadas en gen.
  21. 21. Un método para determinar la intervención médica personalizada para un individuo enfermo, caracterizado porque comprende las etapas de: realizar por lo menos una prueba molecular para por lo menos un objetivo de una muestra biológica de un individuo enfermo que tiene una enfermedad diagnosticada; determinar si el por lo menos un objetivo exhibe un cambio en la expresión comparado con una referencia; e identificar por lo menos un agente específico que interactúa con el por lo menos un objetivo que exhibe un cambio en la expresión y que no se ha asociado previamente con el tratamiento de la enfermedad diagnosticada.
  22. 22. El método de conformidad con la reivindicación 21, caracterizado porque la etapa de identificación de por lo menos un agente no especifico de enfermedad que interactúa con el por lo menos un objetivo comprende la etapa de identificar una terapia de fármaco de por lo menos una revisión automatizada de una base de datos de literatura extensiva y datos generados de experimentos clínicos.
  23. 23. El método de conformidad con la reivindicación 21, caracterizado porque la etapa de realizar por lo menos una prueba molecular para por lo menos un objetivo comprende la etapa de realizar por lo menos uno de un . análisis inmunohistoquímico (IHC) y un análisis de microarreglo.
  24. 24. El método de conformidad con la reivindicación 23, caracterizado porque la etapa de realizar un análisis de microarreglo comprende la etapa de realizar un análisis utilizando por lo menos uno de un microarreglo de expresión, un microarreglo de hibridación genómica comparativa (CGH) , un microarreglo de polimorfismo de nucleótido individual (SNP) , una hibridación in-situ fluorescente (FISH), e hibridación ¦in-situ (ISH), y un arreglo proteómico.
  25. 25. El método de conformidad con la reivindicación 23, caracterizado porque la etapa de realizar por lo menos uno de un análisis IHC comprende la etapa de realizar un análisis IHC para una proteína expresada en gen que incluye por lo menos una de Her2/Neu, ER, PR, c-kit, EGFR, LH1, MSH2, CD20, p53, Ciclina DI, bcl2, COX-2, receptor de Andrógeno, CD52, PDGFR, AR, CD25, y VEGF.
  26. 26. El método de conformidad con la reivindicación 23, caracterizado porque la etapa de realizar por lo menos uno de un análisis de microarreglo comprende la etapa de realizar un análisis de microarreglo para un gen que incluye 5 por lo menos uno de BCL2, HI FIA, AR, ESRl, PDGFRA, KIT, PDGFRB, CDW52, ZAP70, PGR, SPARC, GART, GSTPl, NFKBIA, SH2, TXNRD1, HDAC1 , PDGFC, PTE , CD33, TYMS, RXRB , ADA, TNF, ERCC3, RAF1, VEGF, TOP1, T0P2A, BRCA2 , TK1, F0LR2 , T0P2B, MLH1, IL2RA, DNMT1 , HSPCA, ERBR2, ERBB2, SSTR1, VHL, VDR, 10 PTGS2, POLA, CES2, EGFR, OGFR, ASNS, NFKB2, RARA, MS4A1, DC , DNMT3A, EREG, Epiregulin, FOLR1, GNRH1, GNRHR1, FSHB, FSHR, FSHPRH1, receptor de folato, HGF, HIG1, IL13RA1, LTB, ODC1, PPARG, PPARGC1, VHL, Receptor de Linfotoxina Beta, Myc, TOP2B Topoisomerasa II, TOP02B, TXN, VEGFC, ACE2, ADH1C, ADH4, AGT, 15 AREG, CA2, CDK2, caveolin y NFKB1.
  27. 27. El método de conformidad con la reivindicación 23, caracterizado porque la etapa de realizar por lo menos una prueba molecular para por lo menos un objetivo de una muestra biológica de un individuo enfermo . comprende la etapa 20 de realizar un análisis inmunohistoquimico sobre un tumor y la etapa de determinar si el por lo menos un objetivo exhibe un cambio en la expresión comparado con una referencia comprende la etapa de determinar si 30% o más de las células de tumor fueron +2 o más grande de manchado para una proteina 25 expresada en gen particular.
  28. 28. El método de conformidad con la reivindicación 23, caracterizado porque la etapa de realizar por lo menos una prueba molecular para por lo menos un objetivo de una muestra de un individuo enfermo comprende la etapa de realizar un análisis de microarreglo sobre un tumor y la etapa de determinar si por lo menos un objetivo exhibe un cambio en la expresión comparado con una referencia comprende la etapa de identificar que genes son regulados hacia arriba o regulados hacia abajo al determinar si el cambio doble en la expresión para un gen particular con relación a un tejido normal de referencia de origen es significante en p<0 001.
  29. 29. El método de conformidad con la reivindicación 21, caracterizado porque además comprende la etapa de proporcionar un reporte de perfil del paciente que incluye los resultados de prueba del paciente para varios objetivos y cualquiera de las terapias propuestas basado en esos resultados .
  30. 30. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la etapa de identificar una terapia de fármaco personalizada comprende la etapa de identificar una pluralidad de compuestos terapéuticos que cada uno interactúa con un gen diferente y/o proteina expresada en gen que exhibió un cambio en la expresión en donde los compuestos terapéuticos no se han asociado previamente con el tratamiento de la enfermedad diagnosticada del individuo.
  31. 31. El método de conformidad con la reivindicación 21, caracterizado porque la etapa de identificar por lo menos un agente especifico comprende la etapa de identificar una pluralidad de agentes que cada uno interactúa con un diferente objetivo en donde los agentes específicos no se han asociado previamente con el tratamiento de la enfermedad diagnosticada del individuo.
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