Pluto mi rende facile organizzare i miei dati ed eseguire analisi bioinformatiche, senza dover programmare. Pluto mi permette anche di creare buone figure rappresentative da solo. Mi piace che tutti i miei dati possano essere salvati nello stesso posto e mi dà la flessibilità di creare più grafici e interpretazioni mentre analizzo. Mi piace anche che abbiano una funzione di chat reattiva che risponde rapidamente alle mie domande. Recensione raccolta e ospitata su G2.com.

Sarebbe utile eseguire più tipi di analisi statistiche su Plutone. Recensione raccolta e ospitata su G2.com.

Il nostro team ha poca conoscenza su come analizzare i dati del trascrittoma utilizzando linguaggi di programmazione complessi (R, Python). Pluto rende facile per ognuno di noi esaminare i propri dati e creare grafici a barre, grafici a vulcano, ecc. Torno spesso per creare nuove figure/analisi comparative sui miei set di dati più tardi quando ho bisogno di un nuovo grafico. Recensione raccolta e ospitata su G2.com.

Mi piacerebbe vedere ancora più tipi di analisi tra cui scegliere in Pluto. Recensione raccolta e ospitata su G2.com.

Pluto è utile per la condivisione e la visualizzazione dei dati, in particolare per i saggi biologici 'semplici' che faccio. Posso integrare più saggi in un unico posto facile, e aggiungere sia immagini che testo. È basato su cloud, quindi posso lavorare sui miei dati da qualsiasi luogo, anche dal mio telefono (cosa che ho già fatto!). Recensione raccolta e ospitata su G2.com.

La barriera all'usabilità è piuttosto alta, non sono riuscito a coinvolgere tanti colleghi quanto avrei voluto.

I grafici non sono pronti per la pubblicazione: quando i valori sono inferiori a 1, non vengono visualizzati i decimali. Le legende non sono modificabili per chiarezza e non possono includere unità.

Nel formato dei Dati di Esempio, Pluto non può estrarre valori numerici se è incluso del testo. Questo rende impossibile aggiungere 'target' come concentrazioni (ad esempio 5uM).

Nessuna modellazione Bliss o curve di adattamento per IC50. Recensione raccolta e ospitata su G2.com.

Sono un ricercatore esperto in bioinformatica che ha provato personalmente numerose piattaforme di analisi e visualizzazione attraverso diversi tipi di -omica. Un grande vantaggio di questa piattaforma è che è completamente end-to-end. Non ho incontrato un'altra piattaforma che possa elaborare grandi file di sequenziamento, eseguire il controllo di qualità e generare analisi interpretabili e di qualità per la pubblicazione.

Ho condiviso dati attraverso questa piattaforma (cosa piuttosto semplice) con ricercatori con esperienza limitata in bioinformatica. Nonostante questa limitazione, la piattaforma è così intuitiva che sono facilmente in grado di comprendere l'analisi fino a quel punto e sono rapidamente in grado di generare nuove analisi. Recensione raccolta e ospitata su G2.com.

I ricercatori vogliono sempre più funzionalità e analisi, quindi mi piacerebbe vedere una crescita continua. Ho utilizzato questa piattaforma per oltre un anno e sono rimasto impressionato dalla crescita e dallo sviluppo continui. Nuovi esperimenti e analisi vengono aggiunti frequentemente, mantenendo questa piattaforma aggiornata con ciò che è necessario per l'analisi bioinformatica, ma sarà necessario un ulteriore sviluppo.

Viene eseguito un controllo di qualità estensivo. Tuttavia, poiché viene generata così tanta informazione, può essere difficile sapere rapidamente se ci sono problemi con i dati. Le notifiche di QC potrebbero essere un'area di miglioramento. Recensione raccolta e ospitata su G2.com.

La parte più utile di Pluto è la sezione dei metodi che accompagna ogni figura. È stato così facile scrivere il manoscritto quando ogni figura ha esattamente ciò che è stato fatto per realizzarla. Recensione raccolta e ospitata su G2.com.

Non c'era davvero nulla che non mi piacesse, l'unica cosa che mi piacerebbe vedere è più opzioni per visualizzare i dati. Recensione raccolta e ospitata su G2.com.

Pluto rende facile l'esecuzione delle parti più banali dell'analisi NGS con pochissimo tempo di intervento da parte dell'utente. Come bioinformatico, non mi piace eseguire le parti di base delle analisi informatiche (come il QC e la generazione di matrici di conteggio), e Pluto mi permette di trascorrere un paio di minuti caricando i dati in modo da potermi concentrare sulle parti più complesse delle analisi a valle e sullo sviluppo del software. Forniscono metriche di QC molto dettagliate e complete, in modo che se ho bisogno di modificare o rieseguire la pipeline, posso farlo facilmente facendo una copia dell'esperimento, cambiando un paio di parametri e rieseguendo in base ai problemi di QC che vedo. Posso seriamente fare questo in meno di 5 minuti del mio tempo. Penso anche che la capacità di importare studi GEO da fastq attraverso l'analisi sia molto potente e mi fa risparmiare molto tempo cercando di scaricare fastq e affrontare problemi di larghezza di banda internet da SRA e rianalizzarli per essere concordanti con le pipeline e i parametri che voglio usare; la piattaforma rende l'esecuzione di analisi riproducibili molto più snella. Recensione raccolta e ospitata su G2.com.

Mi piacerebbe vedere più tutorial/documentazione/video su come interpretare le diverse parti del report multiqc e esempi di quando dovrei preoccuparmi del QC. Inoltre, sarebbe fantastico avere più tipi di esperimenti -- un qualche tipo di pipeline semplificata per il variant calling (particolarmente per studi sul cancro) o un'analisi scRNA-seq sarebbe utile. Recensione raccolta e ospitata su G2.com.

È una piattaforma amichevole per gli scienziati di laboratorio umido che riduce i passaggi verso l'analisi effettiva! E il personale di Pluto è disponibile e molto reattivo per risolvere i problemi ogni volta che necessario. Recensione raccolta e ospitata su G2.com.

Sarebbero apprezzati più webinar considerando i diversi aspetti che puoi esplorare sulla piattaforma. E se potesse riflettere la tecnologia delle cellule singole, che sta diventando uno standard, sarebbe fantastico. Recensione raccolta e ospitata su G2.com.

Pluto consente la collaborazione tra i team. È molto utile avere tutti i dati relativi a un determinato campione visualizzati in un unico posto. È un'ottima aggiunta al software ELN dove l'attenzione è rivolta ai protocolli e alla registrazione piuttosto che alla visualizzazione e alla collaborazione. Recensione raccolta e ospitata su G2.com.

Quando si aggiungono nuovi dati a Pluto per ripetizioni tecniche di esperimenti, è necessario caricare un file completamente nuovo e i grafici devono essere rifatti, il che richiede un po' di tempo in più.

Inoltre, i decimali non vengono visualizzati nei grafici sull'asse y. Recensione raccolta e ospitata su G2.com.

Un negozio unico per tutte le mie esigenze di sequenziamento dell'RNA senza la necessità di essere un bioinformatico. Recensione raccolta e ospitata su G2.com.

Niente di particolare. Forse all'inizio alcune cose avevano dei bug, ma il loro team è stato fantastico nel risolverli, quindi non è più un problema... Recensione raccolta e ospitata su G2.com.

Adoro quanto sia facile creare un grafico dai dati di RNAseq in massa. Recensione raccolta e ospitata su G2.com.

Vorrei che ci fosse un pulsante di eliminazione per i progetti creati per errore nell'interfaccia utente. Recensione raccolta e ospitata su G2.com.