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TW202545956A - 吡啶並嘧啶類衍生物的晶型、製備方法及其應用 - Google Patents

吡啶並嘧啶類衍生物的晶型、製備方法及其應用

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Publication number
TW202545956A
TW202545956A TW114100952A TW114100952A TW202545956A TW 202545956 A TW202545956 A TW 202545956A TW 114100952 A TW114100952 A TW 114100952A TW 114100952 A TW114100952 A TW 114100952A TW 202545956 A TW202545956 A TW 202545956A
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TW
Taiwan
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crystal form
compound
angles
radiation
ray powder
Prior art date
Application number
TW114100952A
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English (en)
Inventor
付志飛
羅妙榮
張楊
Original Assignee
大陸商南京明德新藥研發有限公司
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Publication date
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Publication of TW202545956A publication Critical patent/TW202545956A/zh

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Abstract

提供了一種吡啶並嘧啶類衍生物的晶型、製備方法、其藥物組合物及其應用,具體公開了式(I)化合物的晶型、製備方法、其藥物組合物和應用。

Description

吡啶並嘧啶類衍生物的晶型、製備方法及其應用
本公開提供了一種吡啶並嘧啶類衍生物的晶型、製備方法及其應用,具體公開了式(I)化合物的晶型、製備方法和應用。
RAS家族中的NRAS,HRAS和KRAS突變引起的癌症占所有人類癌症的近四分之一,使其成為與癌症相關的最常見基因突變之一。幾乎覆蓋了所有的癌症類型,每年在全球造成100萬人死亡。其中,KRAS是最常見的致癌基因(所有RAS突變的85%),存在於90%的胰腺癌中,30-40%的結腸癌中,15-20%的肺癌中(大多為非小細胞肺癌)。根據存在的特定突變,G12C、G12D 和 G12R 是病友們最常見的 KRAS 突變。除此之外,還有G12A、G12S、G12V等。
KRAS蛋白屬於小GTP酶,具有GTP水解活性,參與多種細胞生存和生長相關的訊號傳導。KRAS在結合 GTP(鳥苷三磷酸)時處於活化狀態,可以啟動一系列的下游通路,而結合的GTP被水解成 GDP(鳥苷二磷酸)後,KRAS處於非活化狀態。正常情況下,KRAS活化後,會在自身水解酶作用下馬上失活。而致癌突變的KRAS,都表現出GTP酶活性的受損,使其更傾向於停留在GTP結合的狀態,導致KRAS蛋白持續活化,進而不斷啟動下游通路如RAF/MEK/ERK及PI3K/Akt通路,使得細胞不斷增殖、分化、形成腫瘤並促進腫瘤的發展。KRAS G12D突變占所有KRAS突變腫瘤的20%-50%,但一直以來沒有KRAS G12D藥物上市,研究可抑制KRAS G12D的小分子口服抑制劑對治療惡性腫瘤具有極高的價值。
本公開提供了式(I)化合物的A晶型,其特徵在於,其Cu Kα輻射的X射線粉末繞射圖譜在下列2θ角處具有特徵繞射峰:8.09°±0.2°、21.34°±0.2°、24.74°±0.2°、25.26°±0.2°,
本公開的一些方案中,上述A晶型的Cu Kα輻射的X射線粉末繞射圖譜在下列2θ角處具有特徵繞射峰:8.09°±0.2°、19.18°±0.2°、19.49°±0.2°、21.34°±0.2°、24.74°±0.2°、25.26°±0.2°。
本公開的一些方案中,上述A晶型的Cu Kα輻射的X射線粉末繞射圖譜在下列2θ角處具有特徵繞射峰:8.09°±0.15°、19.18°±0.15°、19.49°±0.15°、21.34°±0.15°、24.74°±0.15°、25.26°±0.15°。
本公開的一些方案中,上述A晶型的Cu Kα輻射的X射線粉末繞射圖譜在下列2θ角處具有特徵繞射峰:8.09°±0.2°、9.46°±0.2°、13.95°±0.2°、19.18°±0.2°、19.49°±0.2°、21.34°±0.2°、24.74°±0.2°、25.26°±0.2°。
本公開的一些方案中,上述A晶型的Cu Kα輻射的X射線粉末繞射圖譜在下列2θ角處具有特徵繞射峰:8.09°±0.15°、9.46°±0.15°、13.95°±0.15°、19.18°±0.15°、19.49°±0.15°、21.34°±0.15°、24.74°±0.15°、25.26°±0.15°。
本公開的一些方案中,上述A晶型的Cu Kα輻射的X射線粉末繞射圖譜在下列2θ角處具有特徵繞射峰:8.09°±0.2°、9.46°±0.2°、13.95°±0.2°、15.28°±0.2°、17.12°±0.2°、19.18°±0.2°、19.49°±0.2°、21.34°±0.2°、24.74°±0.2°、25.26°±0.2°。
本公開的一些方案中,上述A晶型的Cu Kα輻射的X射線粉末繞射圖譜在下列2θ角處具有特徵繞射峰:8.09°±0.15°、9.46°±0.15°、13.95°±0.15°、15.28°±0.15°、17.12°±0.15°、19.18°±0.15°、19.49°±0.15°、21.34°±0.15°、24.74°±0.15°、25.26°±0.15°。
本公開的一些方案中,上述A晶型的Cu Kα輻射的X射線粉末繞射圖譜在下列2θ角處具有特徵繞射峰:8.09°±0.2°、9.46°±0.2°、13.95°±0.2°、15.28°±0.2°、17.12°±0.2°、19.18°±0.2°、19.49°±0.2°、20.82°±0.2°、21.34°±0.2°、24.74°±0.2°、25.26°±0.2°、28.32°±0.2°。
本公開的一些方案中,上述A晶型的Cu Kα輻射的X射線粉末繞射圖譜在下列2θ角處具有特徵繞射峰:8.09°±0.15°、9.46°±0.15°、13.95°±0.15°、15.28°±0.15°、17.12°±0.15°、19.18°±0.15°、19.49°±0.15°、20.82°±0.15°、21.34°±0.15°、24.74°±0.15°、25.26°±0.15°、28.32°±0.15°。
本公開的一些方案中,上述A晶型的Cu Kα輻射的X射線粉末繞射圖譜在下列2θ角處具有特徵繞射峰:8.09°±0.2°、9.46°±0.2°、12.10°±0.2°、13.95°±0.2°、15.28°±0.2°、16.39°±0.2°、17.12°±0.2°、19.18°±0.2°、19.49°±0.2°、20.82°±0.2°、21.34°±0.2°、22.22°±0.2°、24.74°±0.2°、25.26°±0.2°、27.99°±0.2°、28.32°±0.2°。
本公開的一些方案中,上述A晶型的Cu Kα輻射的X射線粉末繞射圖譜在下列2θ角處具有特徵繞射峰:8.09°±0.15°、9.46°±0.15°、12.10°±0.15°、13.95°±0.15°、15.28°±0.15°、16.39°±0.15°、17.12°±0.15°、19.18°±0.15°、19.49°±0.15°、20.82°±0.15°、21.34°±0.15°、22.22°±0.15°、24.74°±0.15°、25.26°±0.15°、27.99°±0.15°、28.32°±0.15°。
本公開的一些方案中,上述A晶型的Cu Kα輻射的X射線粉末繞射圖譜在下列2θ角處具有特徵繞射峰:8.09°±0.2°、9.46°±0.2°、12.10°±0.2°、12.78°±0.2°、13.06°±0.2°、13.95°±0.2°、15.28°±0.2°、16.39°±0.2°、17.12°±0.2°、18.56°±0.2°、18.86°±0.2°、19.18°±0.2°、19.49°±0.2°、19.84°±0.2°、20.82°±0.2°、21.34°±0.2°、22.22±0.2°、22.96°±0.2°、23.58°±0.2°、24.11°±0.2°、24.74°±0.2°、25.26°±0.2°、27.99°±0.2°、28.32°±0.2°、29.00°±0.2°、30.21°±0.2°。
本公開的一些方案中,上述A晶型的Cu Kα輻射的X射線粉末繞射圖譜在下列2θ角處具有特徵繞射峰:7.29°±0.2°、8.09°±0.2°、9.46°±0.2°、9.75°±0.2°、11.06°±0.2°、12.10°±0.2°、12.78°±0.2°、13.06°±0.2°、13.95°±0.2°、14.87°±0.2°、15.28°±0.2°、16.39°±0.2°、17.12°±0.2°、17.54°±0.2°、18.56°±0.2°、18.86°±0.2°、19.18°±0.2°、19.49°±0.2°、19.84°±0.2°、20.82°±0.2°、21.34°±0.2°、22.22°±0.2°、22.96°±0.2°、23.58°±0.2°、24.11°±0.2°、24.74°±0.2°、25.26°±0.2°、25.73°±0.2°、26.11°±0.2°、26.50°±0.2°、26.64°±0.2°、27.54°±0.2°、27.99°±0.2°、28.32°±0.2°、28.78°±0.2°、29.00°±0.2°、30.21°±0.2°、30.50°±0.2°、31.03°±0.2°、31.99°±0.2°、33.33°±0.2°、33.69°±0.2°、34.01°±0.2°、34.39°±0.2°、34.81°±0.2°、35.48°±0.2°、35.82°±0.2°、36.37°±0.2°、36.63°±0.2°、37.34°±0.2°、37.78°±0.2°、38.39°±0.2°、38.71°±0.2°、39.14°±0.2°、39.57°±0.2°。
本公開的一些方案中,上述A晶型的Cu Kα輻射的X射線粉末繞射圖譜在下列2θ角處具有特徵繞射峰:8.09°±0.2°、21.34°±0.2°、24.74°±0.2°、25.26°±0.2°、和/或7.29°±0.2°、和/或9.46°±0.2°、和/或9.75°±0.2°、和/或11.06°±0.2°、和/或12.10°±0.2°、和/或12.78°±0.2°、和/或13.06°±0.2°、和/或13.95°±0.2°、和/或14.87°±0.2°、和/或15.28°±0.2°、和/或16.39°±0.2°、和/或17.12°±0.2°、和/或17.54°±0.2°、和/或18.56°±0.2°、和/或18.86°±0.2°、和/或19.18°±0.2°、和/或19.49°±0.2°、和/或19.84°±0.2°、和/或20.82°±0.2°、和/或22.22°±0.2°、和/或22.96°±0.2°、和/或23.58°±0.2°、和/或24.11°±0.2°、和/或25.73°±0.2°、和/或26.11°±0.2°、和/或26.50°±0.2°、和/或26.64°±0.2°、和/或27.54°±0.2°、和/或27.99°±0.2°、和/或28.32°±0.2°、和/或28.78°±0.2°、和/或29.00°±0.2°、和/或30.21°±0.2°、和/或30.50°±0.2°、和/或31.03°±0.2°、和/或31.99°±0.2°、和/或33.33°±0.2°、和/或33.69°±0.2°、和/或34.01°±0.2°、和/或34.39°±0.2°、和/或34.81°±0.2°、和/或35.48°±0.2°、和/或35.82°±0.2°、和/或36.37°±0.2°、和/或36.63°±0.2°、和/或37.34°±0.2°、和/或37.78°±0.2°、和/或38.39°±0.2°、和/或38.71°±0.2°、和/或39.14°±0.2°、和/或39.57°±0.2°。
本公開的一些方案中,上述A晶型的Cu Kα輻射的X射線粉末繞射圖譜在下列2θ角處具有特徵繞射峰:8.09°、9.46°、12.10°、13.95°、15.28°、16.39°、17.12°、19.18°、19.49°、20.82°、21.34°、22.22°、24.74°、25.26°、27.99°、28.32°。
本公開的一些方案中,上述A晶型的Cu Kα輻射的X射線粉末繞射圖譜在下列2θ角處具有特徵繞射峰:7.29°、8.09°、9.46°、9.75°、11.06°、12.10°、12.78°、13.06°、13.95°、14.87°、15.28°、16.39°、17.12°、17.54°、18.56°、18.86°、19.18°、19.49°、19.84°、20.82°、21.34°、22.22°、22.96°、23.58°、24.11°、24.74°、25.26°、25.73°、26.11°、26.50°、26.64°、27.54°、27.99°、28.32°、28.78°、29.00°、30.21°、30.50°、31.03°、31.99°、33.33°、33.69°、34.01°、34.39°、34.81°、35.48°、35.82°、36.37°、36.63°、37.34°、37.78°、38.39°、38.71°、39.14°、39.57°。
本公開的一些方案中,上述A晶型的XRPD圖譜基本上如圖1所示。
本公開的一些方案中,上述A晶型的XRPD圖譜繞射峰資料如表1所示。
表1 式(I)化合物A晶型的XRPD繞射峰資料
編號 2θ [°] 面間距(Å) 強度[計數] 相對強度[%] 編號 2θ [°] 面間距(Å) 強度[計數] 相對強度[%]
1 7.29 12.11821 262.024 0.30 29 26.11 3.41072 933.224 3.40
2 8.09 10.91653 19287 100.00 30 26.50 3.36058 826.949 2.90
3 9.46 9.33914 3011.45 14.60 31 26.64 3.34334 969.316 3.70
4 9.75 9.06181 472.462 1.40 32 27.54 3.23624 380.465 0.70
5 11.06 7.99650 220.323 0.30 33 27.99 3.18551 1499.56 6.60
6 12.10 7.31169 1016.45 4.40 34 28.32 3.14869 2189.91 10.20
7 12.78 6.92315 760.608 2.90 35 28.78 3.09907 358.899 0.70
8 13.06 6.77489 894.541 3.60 36 29.00 3.07650 593.98 2.00
9 13.95 6.34547 3646.54 17.90 37 30.21 2.95575 977.517 4.10
10 14.87 5.95218 366.389 0.60 38 30.50 2.92882 311.454 0.70
11 15.28 5.79459 2923 14.10 39 31.03 2.87981 210.398 0.20
12 16.39 5.40461 1437.27 6.30 40 31.99 2.79562 399.362 1.30
13 17.12 5.17557 2892.56 13.90 41 33.33 2.68574 387.489 1.20
14 17.54 5.05292 497.062 1.40 42 33.69 2.65827 341.337 0.90
15 18.56 4.77577 607.256 1.90 43 34.01 2.63402 312.113 0.80
16 18.86 4.70220 997.962 3.90 44 34.39 2.60577 456.957 1.60
17 19.18 4.62418 4043.84 19.80 45 34.81 2.57528 314.538 0.90
18 19.49 4.55020 4238.54 20.80 46 35.48 2.52837 197.476 0.30
19 19.84 4.47183 983.585 3.60 47 35.82 2.50489 207.026 0.30
20 20.82 4.26218 1561.38 6.60 48 36.37 2.46850 284.261 0.70
21 21.34 4.15971 4776.22 23.50 49 36.63 2.45130 222.015 0.40
22 22.22 3.99818 1371.87 5.70 50 37.34 2.40628 199.047 0.40
23 22.96 3.87110 511.603 1.30 51 37.78 2.37912 279.458 0.80
24 23.58 3.76980 516.021 1.30 52 38.39 2.34280 191.966 0.30
25 24.11 3.68818 723.857 2.30 53 38.71 2.32405 163.344 0.20
26 24.74 3.59587 4338.5 21.20 54 39.14 2.29985 163.223 0.10
27 25.26 3.52270 4462.29 21.80 55 39.57 2.27591 174.978 0.20
28 25.73 3.45952 585.892 1.50  
本公開的一些方案中,上述A晶型的差示掃描量熱曲線(DSC)在199.55±3.00℃處有放熱峰的起始值。
本公開的一些方案中,上述A晶型的差示掃描量熱曲線(DSC)在204.65±3.00℃處有放熱峰的峰值。
本公開的一些方案中,上述A晶型的DSC圖譜基本上如圖2所示。
本公開的一些方案中,上述A晶型的熱重分析(TGA)曲線在220.00±3.00℃時失重達4.502%。
本公開的一些方案中,上述A晶型的TGA圖譜基本上如圖3所示。
本公開還提供了一種藥物組合物,其包含上述式(I)化合物的A晶型。
在一些方案中,所述藥物組合物還包含藥學上可接受的輔料。
在一些方案中,所述藥物組合物包含治療有效量的上述式(I)化合物的A晶型以及藥學上可接受的輔料。
本公開還提供了治療KRAS G12D突變的實體瘤的方法,其包括向有需要的個體(例如哺乳動物,優選人類)給予治療有效量的上述式(I)化合物的A晶型或其藥物組合物。
本公開還提供了用於治療KRAS G12D突變的實體瘤的上述式(I)化合物的A晶型或其藥物組合物。
本公開還提供了上述式(I)化合物的A晶型或其藥物組合物在治療KRAS G12D突變的實體瘤中的應用。
本公開還提供了上述式(I)化合物的A晶型在製備用於治療KRAS G12D突變的實體瘤藥物中的應用。
本公開的一些方案中,上述KRAS G12D突變的實體瘤選自結腸癌和胰腺癌。
技術效果
本公開化合物的晶型具有良好的穩定性,引濕性良好,對KRAS G12D突變的腫瘤細胞具有良好的細胞增殖抑制活性,有效抑制p-ERK,有良好的PK性質,並且有顯著的抑瘤作用。
定義和說明
除非另有說明,本文所用的下列術語和短語旨在含有下列含義。一個特定的短語或術語在沒有特別定義的情況下不應該被認為是不確定的或不清楚的,而應該按照普通的含義去理解。當本文出現商品名時,旨在指代其對應的商品或其活性成分。
本公開的中間體化合物可以透過本領域技術人員所熟知的多種合成方法來製備,包括下面列舉的具體實施方式、其與其他化學合成方法的結合所形成的實施方式以及本領域技術上人員所熟知的等同替換方式,優選的實施方式包括但不限於本公開的實施例。
本公開具體實施方式的化學反應是在合適的溶劑中完成的,所述的溶劑須適合於本公開的化學變化及其所需的試劑和物料。為了獲得本公開的化合物,有時需要本領域技術人員在已有實施方式的基礎上對合成步驟或者反應流程進行修改或選擇。
除非另有說明,在粉末X-射線繞射光譜中,峰的位置或峰的相對強度可能會因為測定儀器、測定方法/條件等因素而產生差異。對任何特定的晶型,峰的位置可能存在誤差,2θ值的測定誤差可以為±0.2°、±0.15°和±0.1°。因此,在確定每種晶型時,應該將此誤差考慮在內,在誤差內也屬於本案的範圍。
除非另有說明,用楔形實線鍵()和楔形虛線鍵()表示一個立體中心的絕對構型,用直形實線鍵()和直形虛線鍵()表示立體中心的相對構型。例如,使用直形實線鍵()和直形虛線鍵()表示立體中心的相對構型,代表的混合物;代表的混合物。
下面會透過實施例具體描述本公開,這些實施例並不意味著對本公開的任何限制。
本公開的化合物可以透過本領域技術人員所熟知的常規方法來確認結構,如果本公開涉及化合物的絕對構型,則該絕對構型可以透過本領域常規技術手段予以確證。例如單晶X射線繞射法(SXRD),把培養出的單晶用Bruker D8 venture繞射儀收集繞射強度資料,光源為CuKα輻射,掃描方式:φ/ω 掃描,收集相關資料後,進一步採用直接法(Shelxs97)解析晶體結構,便可以確證絕對構型。
本公開中,術語「治療有效量」意指(i) 治療特定疾病、病況或障礙,或(ii) 減輕、改善或消除特定疾病、病況或障礙的一種或多種症狀的藥物或藥劑的用量。構成「治療有效量」的本公開式(I)化合物的A晶型或其藥物組合物的量取決於該藥物或藥劑、疾病狀態及其嚴重性、給藥方式以及待被治療的個體的年齡而改變,但可例行性地由本領域技術人員根據其自身的知識及本公開內容而確定。
術語「治療」意為將藥物或製劑進行給藥以改善或消除疾病或與所述疾病相關的一個或多個症狀,且包括:(i)抑制疾病或疾病狀態,即遏制其發展;(ii)緩解疾病或疾病狀態,即使該疾病或疾病狀態消退。
在本公開中,術語「個體」包括人和動物,例如,哺乳動物(如靈長類動物,牛,馬,豬,狗,貓,小鼠,大鼠,兔,山羊,綿羊以及禽類等)。
術語「藥學上可接受的輔料」是指對有機體無明顯刺激作用,而且不會損害活性物質的生物活性及性能的那些輔料。常規的藥用輔料包括填充劑、吸收劑、潤濕劑、粘合劑、崩解劑、潤滑劑、載體、稀釋劑、等滲調節劑、酸鹼度調節劑等。合適的輔料是本領域技術人員熟知的,例如碳水化合物、蠟、水溶性和/ 或水可膨脹的聚合物、親水性或疏水性材料、明膠、油、溶劑、水等。
給予本公開的式(I)化合物的A晶型或其藥物組合物的典型途徑包括但不限於口服、直腸、局部、吸入、腸胃外、舌下、陰道內、鼻內、眼內、腹膜內、肌內、皮下、靜脈內給藥。
本公開的藥物組合物可以採用本領域眾所周知的方法製造,如常規的混合法、溶解法、制粒法、乳化法、冷凍乾燥法等。
在一些實施方案中,藥物組合物可以是口服形式。對於口服給藥,可以透過將活性物質與本領域熟知的藥學上可接受的輔料混合,來配製該藥物組合物。這些輔料能使本公開的式(I)化合物的A晶型或其藥物組合物被配製成片劑、丸劑、錠劑、糖衣劑、膠囊劑、液體、凝膠劑、漿劑、懸浮劑等,用於對患者的口服給藥。
可以透過常規的混合、填充或壓片方法來製備固體口服組合物。例如,可透過下述方法獲得:將所述的活性化合物與固體輔料混合,任選地碾磨所得的混合物,如果需要則加入其它合適的輔料,然後將該混合物加工成顆粒,得到了片劑或糖衣劑的核心。
本公開的藥物組合物中含有的式(I)化合物的A晶型的治療有效量選自0.001mg/kg體重到1000mg/kg體重,例如0.01mg/kg體重到500mg/kg體重,以單獨或分開劑量的形式。
本領域技術人員認識到對於同一化合物的給定結晶形式的XRPD峰位置和/或強度的測量資料將在誤差範圍內變化。本公開中的2θ值涵蓋了適當的誤差範圍,通常該誤差範圍是由「±」表示。例如,本公開中用具體角度值±0.20º表示的2θ值即代表其中的具體角度值具有±0.20º的誤差浮動範圍,即8.09°±0.2°表示2θ在7.89°至8.29°範圍內。取決於樣品製備技術、應用於儀器的校準技術、人類操作偏差等,本領域技術人員認識到對於XRPD繞射角的適當的誤差範圍可為±0.20º、±0.15º、±0.10º、±0.05º或更小,且峰強度允許一定的可變性。當用於描述XRPD圖時,術語「基本上相同」或「基本上如……所示」是指包括至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或至少99%的繞射角在±0.2º 2θ的標準差範圍內的繞射峰的圖。
由於本領域技術人員認識到對於同一化合物的給定結晶形式的DSC譜圖的測量資料將在誤差容限內變化。峰的起始值和單峰峰值(以攝氏度表示)允許適當的誤差範圍。通常,誤差範圍是由「±」表示。對於同種化合物的同種晶型,在連續的分析中,熱轉變溫度和熔點誤差典型地在±3.00℃之內。例如,「204.65±3.00℃」的峰值表示在207.65℃至201.65℃範圍內。取決於樣品製備技術、應用於儀器的校準技術、人類操作偏差等,本領域技術人員認識到對於單峰峰值的適當的誤差範圍可為±3.0℃、±2.0℃或更小。
術語「任選」或「任選地」是指隨後描述的事件或情況可能發生或可能不發生,該描述包括發生所述事件或情況和不發生所述事件或情況。
本公開採用下述縮略詞:ACN代表乙腈;DMSO代表二甲基亞碸;MTBE代表甲基叔丁基醚;N2:氮氣;RH:相對濕度;mL:毫升;L:升;min:分鐘;℃:攝氏度;µm:微米;mm:毫米;μL:微升;mol/L:莫耳每升;mg:毫克;s:秒;nm:納米;MPa:兆帕;lux:勒克斯;µw/cm2:微瓦每平方釐米;h:小時;Kg:千克;nM:納莫耳;1M代表1 moL/L;rpm:轉速;XRPD代表X射線粉末繞射;DSC代表差示掃描量熱分析;TGA代表熱重分析;1H NMR代表核磁共振氫譜。
本公開化合物依據本領域常規命名原則或者使用ChemDraw®軟體命名,市售化合物採用供應商目錄名稱,本公開所使用的所有溶劑是市售可得的。
儀器及分析方法
本公開X-射線粉末繞射(X-ray powder diffractometer, XRPD)方法儀器型號:布魯克D2 PHASER X射線粉末繞射儀測試方法:大約10 ~ 20 mg樣品用於XRPD檢測。詳細的XRPD 參數如下:射線源:Cu, kα, (λ=1.54184Ǻ).光管電壓:30 kV,光管電流:10 mA發散狹縫:1 mm探測器狹縫:0.075 mm防散射狹縫:3 mm掃描範圍:3-40 deg步徑:0.02 deg步長:0.3 秒
本公開單晶X射線繞射檢測分析儀器型號:Bruker D8 VENTURE低溫設備型號: Oxford Cryostream 800測試參數:Cu轉靶: λ=1.54184 Å, 功率:2.5kW,樣品到探測器距離: d = 45 mm電壓: 50 kV電流: 50mA繞射實驗溫度 T = 173 K
本公開差熱分析(Differential Scanning Calorimeter, DSC)方法儀器型號:Discovery 2500差示掃描量熱儀測試方法:精密稱取樣(2~ 3 mg)置於DSC鋁坩鍋內,密封,放置於感測器樣品端(S);同法製備空白參比坩堝,並放至感測器參比端(R)。在50mL/min N2條件下,以10°C/min的升溫速率,加熱樣品從30°C(室溫)到400°C。
本公開熱重分析(Thermal Gravimetric Analyzer, TGA)方法儀器型號:Discovery 5500熱重分析儀測試方法:取空坩堝置於感測器上,清零;使用內置天平稱取5.581mg 樣品置於坩堝中,測試。在25mL/min N2條件下,以10°C/min的升溫速率,加熱樣品從30°C到400°C。
本公開動態蒸汽吸附分析(Dynamic Vapor Sorption, DVS)方法儀器型號:SMS DVS Advantage動態蒸汽吸附儀測試條件:取樣品(10 ~ 30 mg)置於DVS樣品盤內進行測試。詳細的DVS 參數如下:溫度:25°C平衡:dm/dt=0.005%/min(最短:10 min,最長:180 min)氣體:N2RH(%)測試梯級:10%(90%-0%-90%);5%(95%-90%,90%-95%)RH(%)測試梯級範圍:0% - 95% - 0%引濕性評價分類如下:表2. 引濕性評價分類
吸濕性分類 ΔW%
潮解 吸收足量水分形成液體
極具吸濕性 ΔW% ≥ 15%
有吸濕性 15% > ΔW% ≥ 2%
略有吸濕性 2% > ΔW% ≥ 0.2%
無或幾乎無吸濕性 ΔW% < 0.2%
注:ΔW%表示受試品在25 ± 1°C和80 ± 2% RH下的吸濕增重。
下面透過實施例對本公開內容進行詳細描述,但並不意味著對本公開任何不利限制。本文已經詳細地描述了本公開內容,其中也公開了其具體實施例方式,對本領域的技術人員而言,在不脫離本公開精神和範圍的情況下針對本公開具體實施方式進行各種變化和改進將是顯而易見的。
實施例1:式(I)化合物的合成
步驟1:中間體2-2的製備
將中間體2-1 (50 g, 418.09 mmol),溶於二氯甲烷 (500 mL) 中,加入三乙胺 (84.61 g, 836.17 mmol,) ,接著加入二碳酸二叔丁酯 (100.37 g, 459.90 mmol),在25℃下反應16小時。反應液加入100 mL水,分液,有機相用無水硫酸鈉乾燥,過濾,濃縮。粗品經矽膠柱層析(石油醚/乙酸乙酯=100/1 - 50/1)分離得中間體2-2。MS: m/z = 206.1 [M+Na]+
步驟2:中間體2-3的製備
將中間體2-2溶於無水(25 g, 136.43 mmol)四氫呋喃中 (350 mL) 中,加入3,7-二丙基-3,7-二氮雜二環[3.3.1]壬烷 (37.31 g, 177.36 mmol),冷卻至-65℃,再緩慢滴加仲丁基鋰 (1.3 M, 157.42 mL),反應1小時後,滴加入氯甲酸甲酯 (15.73 g, 166.44 mmol),在-65℃下反應2小時。反應液滴加飽和氯化銨(20 mL)萃滅,乙酸乙酯(300 mL*2)萃取,合併有機相,用飽和食鹽水(150 mL)洗,無水硫酸鈉乾燥,過濾,濃縮。粗品經矽膠柱層析(PE/EA=50/1 - 25/1)分離得中間體2-3。MS: m/z = 186.0 [M-tBu+H]+
步驟3:中間體2-4的製備
將中間體2-3 (12 g, 49.73 mmol),溶於四氫呋喃 (120 mL)中,再加入3-氯-2-氯甲基丙烯 (24.87 g, 198.94 mmol),冷卻至-40℃,緩慢滴加雙三甲基矽基胺基鋰 (1 M, 99.47 mL),逐漸升溫至20℃下反應2小時。反應液滴加飽和氯化銨(20 mL)淬滅,乙酸乙酯(150 mL*2)萃取,合併有機相,用飽和食鹽水(80 mL)洗,無水硫酸鈉乾燥,過濾,濃縮。粗品經矽膠柱層析(石油醚/乙酸乙酯=20/1 - 10/1)分離得相對構型混合物中間體2-4。TLC薄層層析(石油醚:丙酮=5:1)展開兩次,2-4的Rf值為0.5,其異構體的Rf值為0.55。2-4在LCMS(色譜柱:Agilent Poroshell 120 EC-C18 2.7μm 3.0*30mm,流動相:A: 水(0.037%甲酸)-B: 乙腈(0.0187%甲酸);梯度: B: 5%-95%)上的保留時間為0.776min,其異構體的保留時間為0.801min。MS: m/z = 274.0 [M-tBu+H]+
步驟4:中間體2-5的製備
將中間體2-4 (3.6 g, 10.92 mmol),溶於氯化氫/乙酸乙酯 (4 M, 27.29 mL)中,20℃下反應2小時。反應液減壓濃縮得粗品中間體2-5的鹽酸鹽。MS: m/z = 230.1 [M+H]+
步驟5:中間體2-6的製備
將中間體2-5的鹽酸鹽 (2.9 g),溶於甲醇(100 mL) 中,再加入碳酸鉀 (4.52 g, 32.69 mmol) ,20℃下反應2小時。反應液加二氯甲烷(80 mL),過濾,濃縮。粗品經矽膠柱層析(石油醚/乙酸乙酯=10/1 - 5/1)分離得中間體2-6。MS: m/z = 194.1 [M+H]+
步驟6:中間體2-7的製備
將中間體2-6 (1.6 g, 8.28 mmol),溶於無水四氫呋喃 (20 mL)中,再加入四氫鋰鋁 (628.51 mg, 16.56 mmol),0℃下反應2小時。反應液滴加乙酸乙酯(10 mL)稀釋,滴加水(0.63 mL),無水硫酸鈉乾燥,過濾,濃縮得粗品中間體2-7。MS: m/z = 166.1 [M+H]+
步驟7:中間體1-2的製備
將中間體1-1(25 g, 99.03 mmol) 溶於二氯甲烷(200 mL)中,冷卻至-30℃,隨後依次加入N,N-二異丙基乙胺(38.40 g, 297.08 mmol)和1-1B(21.02 g, 99.03 mmol),-30℃下反應2小時。直接減壓濃縮得粗品中間體1-2。MS: m/z = 428.1 [M+1]+
步驟8:中間體1-3A的製備
將中間體1-2 (23 g)和中間體2-7 (9.76 g)溶於無水甲苯 (300 mL)中,在0℃下緩慢加入叔丁醇鈉 (13.93 g, 145.00 mmol) ,0℃下反應0.5小時,再在20℃下反應0.5小時。反應液加乙酸乙酯200 mL稀釋,飽和食鹽水洗(100 mL),無水硫酸鈉乾燥,過濾,濾液減壓濃縮得粗產物1-3。粗產物1-3經製備SFC(色譜柱: DAICEL CHIRALCEL OD(250mm*50mm,10 μm); 流動相:[A(超臨界二氧化碳), B(含有0.1%氨水的乙醇)]; B: 40%)純化得單一異構體1-3A及其異構體。1-3A在分析SFC(色譜柱: Cellulose 2 100 mm*4.6mm, 3 μm)流動相:[ A(超臨界二氧化碳), B(甲醇 (0.05% 二乙胺))]; B: 40%)條件下的保留時間為4.964 min,ee值為95.7%,1H NMR (400MHz, CD3OD) δ 8.76 (s, 1H), 4.98 - 4.87 (m, 2H), 4.51 – 4.48 (m, 3H), 4.34 - 4.29 (m, 1H), 4.27 (br s, 2H), 4.23 - 4.18 (m, 1H), 3.61 – 3.58 (m, 3H), 3.12 (d, J=9.5 Hz, 1H), 2.78 (br d, J=16.8 Hz, 1H), 2.71 (dd, J=4.0, 9.6 Hz, 1H), 2.45 (br d, J=16.8 Hz, 1H), 1.83 – 1.72 (m, 2H), 1.75 - 1.62 (m, 3H), 1.55 – 1.51 (m, 1H), 1.42 (s, 9H), 0.60 (q, J=4.2 Hz, 1H), 0.47 -0.42 (m, 1H)。MS: m/z = 557.2 [M+1]+。其異構體在同樣條件下的保留時間為8.382 min,ee值為96.5%。
步驟9:中間體1-4的合成
將中間體1-3A (11.3 g, 20.29 mmol)加入水(60 mL) 和無水二氧六環(240 mL)中,再加入甲磺酸[正丁基二(1-金剛烷基)膦](2-氨基-1,1'-聯苯-2-基)鈀(II) (1.48 g, 2.03 mmol) 和中間體1-4A (15.38 g, 24.34mmol),碳酸銫 (13.22 g, 40.57 mmol) ,87℃下反應2小時。反應液加乙酸乙酯(200 mL)稀釋,飽和食鹽水(40mLx2)洗,無水硫酸鈉乾燥,過濾,濾液減壓濃縮得粗品。粗品經柱層析(流動相:二氯甲烷:甲醇=50:1~20:1)分離得中間體1-4。MS (ESI) m/z: 862.4 [M+H2O-Ph2CO+1]+
步驟10:中間體1-5的合成
將中間體1-4(8.4 g, 8.18 mmol)加入到乙酸乙酯 (30 mL) 和水 (10 mL) ,再加入鹽酸/乙酸乙酯(4 M, 62.37 mL),20℃下反應2小時。反應液加水(30mL),有機相用水(30 mLx2)洗,合併水相,用飽和碳酸氫鈉調pH至7-8,用乙酸乙酯(80 mLx3)萃取,合併有機相,無水硫酸鈉乾燥,過濾,濾液減壓濃縮得粗品1-5。MS (ESI) m/z: 762.3 [M+1]+
步驟11:式(I)化合物的合成
將中間體1-5(6.2 g) 加入乙腈 (70 mL)中,再加入四甲基氟化銨 (2.29g, 13.83 mmol) ,60℃下反應1小時。反應液加100 mL乙酸乙酯稀釋,30 mL飽和碳酸氫鈉洗,無水硫酸鈉乾燥,過濾,濾液減壓濃縮得粗品。粗品經柱層析(流動相:二氯甲烷(10%氨氣的甲醇溶液):甲醇=20:1~10:1)純化得式(I)化合物。MS (ESI) m/z: 606.3 [M+1]+1H NMR (400 MHz, CD3OD) δ = 9.01 (s, 1H), 7.76 (dd, J = 5.6, 9.2 Hz, 1H), 7.28 - 7.19 (m, 2H), 7.15 (d, J= 2.3 Hz, 1H), 5.08 (br s, 1H), 5.01 (br s, 1H), 4.70 - 4.54 (m, 3H), 4.43 (dd, J = 7.3, 10.0 Hz, 1H), 4.32 (dd, J = 6.3,10.3 Hz, 1H), 3.78 - 3.65 (m, 5H), 3.39 - 3.34 (m, 1H), 3.23 (d, J = 9.5 Hz, 1H), 2.93 (br d, J = 17.3 Hz, 1H), 2.82(dd, J = 4.0, 9.3 Hz, 1H), 2.56 (br d, J = 17.1 Hz, 1H), 1.91 - 1.76 (m, 5H), 1.64 (td, J = 3.6, 6.9 Hz, 1H), 0.72 (q, J =4.0 Hz, 1H), 0.61 - 0.53 (m, 1H)。
實施例2-1:式(I)化合物A晶型的製備
將式(I)化合物(37 g)加入250 mL甲基叔丁基醚中,45℃下懸浮攪拌4小時,再在20℃下攪拌16小時。過濾,濾餅用30 mL甲基叔丁基醚淋洗,濾餅減壓乾燥得固體為式(Ⅰ)化合物A晶型,其XRPD譜圖如圖1所示。其DSC圖譜如圖2所示,其TGA圖譜如圖3所示。
實施例2-2:式(I)化合物A晶型的製備
將式(I)化合物(34 g)加入60 mL乙醇,45℃加熱溶解,緩慢加入40 mL甲基叔丁基醚,加入晶型A的晶種誘導,45℃攪拌2小時,再緩慢加入200 mL甲基叔丁基醚,先45℃攪拌1小時,再降至20℃攪拌16小時。過濾,濾餅用20 mL正庚烷淋洗,烘乾濾餅得到式(Ⅰ)化合物A晶型。其XRPD圖譜與圖1基本一致,其DSC圖譜基本與圖2一致,其TGA圖譜基本與圖3一致。
實施例2-3:式(I)化合物晶型的製備
取10mg式(I)化合物加入2mL乙醇,攪拌,樣品不溶,再滴入0.5ml甲醇後攪拌至樣品全部溶解,得到黃色清液,將樣品溶液置於4 mL半密封樣品瓶中,在室溫下緩慢揮發。一周後得到無色塊狀晶體。
實施例3:式(I)化合物A晶型吸濕性研究
實驗材料:SMS DVS Intrinsic 動態蒸汽吸附儀
實驗方法:取式(I)化合物A晶型10~30 mg置於DVS樣品盤內進行測試。
實驗結果:式(I)化合物A晶型的DVS譜圖如圖4所示,當濕度升至80%時,△W=1.606%。
實驗結論:式(I)化合物A晶型在25°C和80 % RH下的吸濕增重為1.606%,樣品略有吸濕性。
實施例4:式(I)化合物的單晶X射線繞射檢測分析
取實施例2-3所得無色塊狀晶體,用單晶X射線繞射儀收集繞射強度資料。該化合物的基本結構資訊為:分子式C35H33F2N7O,單斜晶系,空間群P21。晶胞參數a =7.9101(4) Å, b =17.6683(9) Å, c = 10.7175(6) Å,α=γ =90°,β =95.763(3)°, 體積 V=1490.29(14) Å3。絕對構型參數Flack值為0.16(17)。單晶資料可以確定式(I)化合物的絕對構型。式(I)化合物單晶的立體結構橢球圖見附圖5。式(I)化合物的晶體結構資料和參數見表3、4、5、6、7和8。
表3 式(I)化合物單晶的晶體資料
Formula C35H33F2N7O
Crystal size 0.140 x 0.120 x 0.100 mm3
Crystal system Monoclinic
Space group P2(1)
Unit cell dimensions a/Å 7.9101(4)
b/Å 17.6683(9)
c/Å 10.7175(6)
Volume(Å3 1490.29(14)
Temperature                       173(2) K
Wavelength            1.54178 A
Z, Calculated density 2,  1.350 mg/m3
Absorption coefficient 0.762 mm-1
F(000) 636
Theta range for data collection 4.146 to 66.582 deg.
Limiting indices -9<=h<=9, -21<=k<=20, -12<=l<=12
Completeness to theta = 66.582 99.9 %
Absorption correction Semi-empirical from equivalents
Max. and min. transmission 0.7531 and 0.6467
Goodness-of-fit on F^2 1.015
Final R indices [I>2sigma(I)] R1 = 0.0519, wR2 = 0.1187
R indices (all data) R1 = 0.0810, wR2 = 0.1363
Absolute structure parameter 0.16(17)
Largest diff. peak and hole 0.201 and -0.196 e.A-3
表4 式(I)化合物晶體的原子座標(× 104)和等價各向同性移位參數(Å2× 103
原子 x y z U(eq)
N(1) 3414(6) 8409(3) 6883(5) 38(1)
C(1) 6789(6) 6545(3) 6907(5) 28(1)
F(2) 3437(4) 6250(2) 3953(3) 37(1)
N(2) 4223(5) 5200(2) 6848(4) 30(1)
C(2) 8028(7) 5959(3) 6834(5) 32(1)
N(3) 2286(6) 1587(3) 6674(5) 40(1)
C(3) 9615(7) 6064(3) 7454(6) 38(1)
N(4) 1769(6) 3110(2) 5623(4) 31(1)
C(4) 10091(7) 6729(3) 8111(6) 38(1)
N(5) 498(5) 3771(2) 3919(4) 29(1)
C(5) 8991(7) 7307(3) 8105(5) 37(1)
N(6) 1415(5) 5014(2) 3330(4) 30(1)
C(6) 7311(6) 7244(3) 7505(5) 30(1)
N(7) -4067(6) 4526(2) 980(4) 33(1)
C(7) 6172(7) 7860(3) 7489(5) 34(1)
C(8) 4526(7) 7806(3) 6943(5) 30(1)
C(9) 3999(7) 7094(3) 6430(5) 30(1)
C(10) 5048(6) 6486(3) 6406(5) 27(1)
C(11) 7749(7) 5291(3) 6062(6) 35(1)
C(12) 7553(8) 4757(4) 5396(7) 50(2)
F(1) 10777(4) 5508(2) 7436(4) 54(1)
O(1) -742(5) 4356(2) 2228(3) 33(1)
C(13) 4256(6) 5754(3) 5961(5) 27(1)
C(14) 3417(6) 5679(3) 4804(5) 28(1)
C(15) 2447(6) 5025(3) 4440(5) 26(1)
C(16) 2568(6) 4429(3) 5312(5) 27(1)
C(17) 3416(7) 4566(3) 6516(5) 31(1)
C(18) 1603(6) 3755(3) 4927(5) 27(1)
C(19) 460(7) 4407(3) 3217(5) 29(1)
C(20) 3463(6) 2809(3) 6088(5) 32(1)
C(21) 3295(8) 2242(3) 7136(6) 38(1)
C(22) 2231(8) 2557(4) 8138(6) 47(2)
C(23) 390(8) 2325(4) 7658(6) 48(2)
C(24) 584(8) 1934(3) 6413(6) 41(1)
C(25) 499(7) 2505(3) 5331(5) 34(1)
C(26) -1121(7) 5042(3) 1503(5) 32(1)
C(27) -2538(7) 4855(3) 476(5) 33(1)
C(28) -2074(8) 4279(4) -475(6) 43(2)
C(29) -2175(9) 3453(4) -130(6) 49(2)
C(30) -3668(8) 3827(4) -845(6) 47(2)
C(31) -5018(8) 4140(3) -105(6) 42(2)
C(32) -5003(8) 5184(3) 1409(6) 40(1)
C(33) -4761(7) 5812(3) 479(6) 40(1)
C(34) -3201(8) 5607(3) -152(6) 42(2)
C(35) -5758(9) 6401(4) 238(7) 56(2)
表5 式(I)化合物晶體的鍵長(Length/Å)
鍵長[Å] 鍵長[Å]
N(1)-C(8) 1.380(7) C(8)-C(9) 1.419(7)
C(1)-C(10) 1.431(7) C(9)-C(10) 1.359(7)
C(1)-C(6) 1.433(7) C(10)-C(13) 1.495(7)
C(1)-C(2) 1.434(7) C(11)-C(12) 1.184(9)
F(2)-C(14) 1.361(6) O(1)-C(19) 1.354(6)
N(2)-C(17) 1.320(7) O(1)-C(26) 1.455(6)
N(2)-C(13) 1.366(7) C(13)-C(14) 1.353(7)
C(2)-C(3) 1.373(8) C(14)-C(15) 1.419(7)
C(2)-C(11) 1.445(8) C(15)-C(16) 1.404(7)
N(3)-C(21) 1.463(8) C(16)-C(17) 1.414(7)
N(3)-C(24) 1.480(8) C(16)-C(18) 1.453(7)
C(3)-F(1) 1.346(7) C(20)-C(21) 1.520(8)
C(3)-C(4) 1.402(9) C(21)-C(22) 1.534(9)
N(4)-C(18) 1.361(7) C(22)-C(23) 1.550(9)
N(4)-C(25) 1.478(7) C(23)-C(24) 1.524(9)
N(4)-C(20) 1.481(7) C(24)-C(25) 1.533(8)
C(4)-C(5) 1.341(8) C(26)-C(27) 1.526(7)
N(5)-C(18) 1.320(6) C(27)-C(28) 1.511(8)
N(5)-C(19) 1.351(7) C(27)-C(34) 1.556(8)
C(5)-C(6) 1.421(7) C(28)-C(29) 1.510(9)
N(6)-C(19) 1.311(7) C(28)-C(30) 1.511(9)
N(6)-C(15) 1.373(6) C(29)-C(30) 1.496(8)
C(6)-C(7) 1.411(8) C(30)-C(31) 1.498(10)
N(7)-C(32) 1.476(7) C(32)-C(33) 1.516(9)
N(7)-C(31) 1.486(7) C(33)-C(35) 1.316(8)
N(7)-C(27) 1.491(7) C(33)-C(34) 1.509(9)
C(7)-C(8) 1.376(8)
表6 式(I)化合物單晶的鍵角(Angle/˚)
鍵角[deg] 鍵角[deg]
C(10)-C(1)-C(6) 117.0(5) C(16)-C(15)-C(14) 115.3(4)
C(10)-C(1)-C(2) 124.4(5) C(15)-C(16)-C(17) 118.3(5)
C(6)-C(1)-C(2) 118.6(4) C(15)-C(16)-C(18) 115.3(4)
C(17)-N(2)-C(13) 117.6(5) C(17)-C(16)-C(18) 125.9(5)
C(3)-C(2)-C(1) 118.2(5) N(2)-C(17)-C(16) 124.2(5)
C(3)-C(2)-C(11) 117.8(5) N(5)-C(18)-N(4) 119.1(5)
C(1)-C(2)-C(11) 123.7(5) N(5)-C(18)-C(16) 120.0(5)
C(21)-N(3)-C(24) 101.1(4) N(4)-C(18)-C(16) 120.8(4)
F(1)-C(3)-C(2) 119.2(5) N(6)-C(19)-N(5) 130.4(5)
F(1)-C(3)-C(4) 118.0(5) N(6)-C(19)-O(1) 118.7(5)
C(2)-C(3)-C(4) 122.9(5) N(5)-C(19)-O(1) 110.8(4)
C(18)-N(4)-C(25) 117.6(4) N(4)-C(20)-C(21) 109.9(4)
C(18)-N(4)-C(20) 121.2(4) N(3)-C(21)-C(20) 110.9(5)
C(25)-N(4)-C(20) 112.6(4) N(3)-C(21)-C(22) 101.8(5)
C(5)-C(4)-C(3) 119.7(5) C(20)-C(21)-C(22) 111.9(5)
C(18)-N(5)-C(19) 116.8(4) C(21)-C(22)-C(23) 103.6(5)
C(4)-C(5)-C(6) 121.3(5) C(24)-C(23)-C(22) 103.7(5)
C(19)-N(6)-C(15) 112.3(4) N(3)-C(24)-C(23) 101.1(5)
C(7)-C(6)-C(5) 120.8(5) N(3)-C(24)-C(25) 112.6(5)
C(7)-C(6)-C(1) 120.2(4) C(23)-C(24)-C(25) 111.3(5)
C(5)-C(6)-C(1) 118.9(5) N(4)-C(25)-C(24) 109.8(4)
C(32)-N(7)-C(31) 112.0(4) O(1)-C(26)-C(27) 107.6(4)
C(32)-N(7)-C(27) 104.9(4) N(7)-C(27)-C(28) 104.0(5)
C(31)-N(7)-C(27) 105.1(5) N(7)-C(27)-C(26) 112.7(4)
C(8)-C(7)-C(6) 121.8(5) C(28)-C(27)-C(26) 114.9(5)
C(7)-C(8)-N(1) 122.5(5) N(7)-C(27)-C(34) 103.8(5)
C(7)-C(8)-C(9) 117.1(5) C(28)-C(27)-C(34) 112.2(5)
N(1)-C(8)-C(9) 120.4(5) C(26)-C(27)-C(34) 108.6(5)
C(10)-C(9)-C(8) 123.5(5) C(29)-C(28)-C(27) 117.7(5)
C(9)-C(10)-C(1) 120.1(5) C(29)-C(28)-C(30) 59.4(4)
C(9)-C(10)-C(13) 116.9(4) C(27)-C(28)-C(30) 106.3(5)
C(1)-C(10)-C(13) 122.7(4) C(30)-C(29)-C(28) 60.4(4)
C(12)-C(11)-C(2) 177.5(7) C(29)-C(30)-C(31) 117.4(6)
C(19)-O(1)-C(26) 117.0(4) C(29)-C(30)-C(28) 60.3(4)
C(14)-C(13)-N(2) 121.7(5) C(31)-C(30)-C(28) 106.7(5)
C(14)-C(13)-C(10) 121.9(5) N(7)-C(31)-C(30) 104.6(5)
N(2)-C(13)-C(10) 115.8(4) N(7)-C(32)-C(33) 105.7(5)
C(13)-C(14)-F(2) 120.2(4) C(35)-C(33)-C(34) 127.1(7)
C(13)-C(14)-C(15) 122.2(5) C(35)-C(33)-C(32) 126.5(7)
F(2)-C(14)-C(15) 117.5(4) C(34)-C(33)-C(32) 106.3(5)
N(6)-C(15)-C(16) 124.1(4) C(33)-C(34)-C(27) 105.5(5)
N(6)-C(15)-C(14) 120.5(4)
表7 式(I)化合物單晶的扭轉角度(Angle/˚)
A-B-C-D Angle/˚ A-B-C-D Angle/˚
C(10)-C(1)-C(2)-C(3) -174.1(5) C(15)-C(16)-C(18)-N(4) 172.4(5)
C(6)-C(1)-C(2)-C(3) 6.7(8) C(17)-C(16)-C(18)-N(4) -16.0(8)
C(10)-C(1)-C(2)-C(11) 11.1(9) C(15)-N(6)-C(19)-N(5) -9.7(8)
C(6)-C(1)-C(2)-C(11) -168.1(5) C(15)-N(6)-C(19)-O(1) 173.5(5)
C(1)-C(2)-C(3)-F(1) 177.5(5) C(18)-N(5)-C(19)-N(6) 4.0(9)
C(11)-C(2)-C(3)-F(1) -7.4(8) C(18)-N(5)-C(19)-O(1) -178.9(4)
C(1)-C(2)-C(3)-C(4) -2.6(9) C(26)-O(1)-C(19)-N(6) -12.2(7)
C(11)-C(2)-C(3)-C(4) 172.5(5) C(26)-O(1)-C(19)-N(5) 170.4(4)
F(1)-C(3)-C(4)-C(5) 177.2(5) C(18)-N(4)-C(20)-C(21) 163.0(5)
C(2)-C(3)-C(4)-C(5) -2.7(9) C(25)-N(4)-C(20)-C(21) -49.9(6)
C(3)-C(4)-C(5)-C(6) 3.6(9) C(24)-N(3)-C(21)-C(20) -68.6(6)
C(4)-C(5)-C(6)-C(7) -179.0(6) C(24)-N(3)-C(21)-C(22) 50.6(5)
C(4)-C(5)-C(6)-C(1) 0.6(8) N(4)-C(20)-C(21)-N(3) 63.2(6)
C(10)-C(1)-C(6)-C(7) -5.4(8) N(4)-C(20)-C(21)-C(22) -49.7(6)
C(2)-C(1)-C(6)-C(7) 173.8(5) N(3)-C(21)-C(22)-C(23) -29.1(6)
C(10)-C(1)-C(6)-C(5) 175.0(5) C(20)-C(21)-C(22)-C(23) 89.4(6)
C(2)-C(1)-C(6)-C(5) -5.8(8) C(21)-C(22)-C(23)-C(24) -2.3(6)
C(5)-C(6)-C(7)-C(8) -178.2(5) C(21)-N(3)-C(24)-C(23) -52.0(5)
C(1)-C(6)-C(7)-C(8) 2.1(8) C(21)-N(3)-C(24)-C(25) 66.7(6)
C(6)-C(7)-C(8)-N(1) -177.9(5) C(22)-C(23)-C(24)-N(3) 32.4(6)
C(6)-C(7)-C(8)-C(9) 2.0(8) C(22)-C(23)-C(24)-C(25) -87.4(6)
C(7)-C(8)-C(9)-C(10) -3.0(9) C(18)-N(4)-C(25)-C(24) -164.3(5)
N(1)-C(8)-C(9)-C(10) 176.9(5) C(20)-N(4)-C(25)-C(24) 47.3(6)
C(8)-C(9)-C(10)-C(1) -0.4(8) N(3)-C(24)-C(25)-N(4) -58.2(7)
C(8)-C(9)-C(10)-C(13) 173.5(5) C(23)-C(24)-C(25)-N(4) 54.4(6)
C(6)-C(1)-C(10)-C(9) 4.5(8) C(19)-O(1)-C(26)-C(27) -178.2(4)
C(2)-C(1)-C(10)-C(9) -174.6(5) C(32)-N(7)-C(27)-C(28) -153.8(4)
C(6)-C(1)-C(10)-C(13) -169.1(5) C(31)-N(7)-C(27)-C(28) -35.6(5)
C(2)-C(1)-C(10)-C(13) 11.8(8) C(32)-N(7)-C(27)-C(26) 81.0(5)
C(17)-N(2)-C(13)-C(14) 3.6(8) C(31)-N(7)-C(27)-C(26) -160.7(4)
C(17)-N(2)-C(13)-C(10) 174.8(5) C(32)-N(7)-C(27)-C(34) -36.2(5)
C(9)-C(10)-C(13)-C(14) 59.1(7) C(31)-N(7)-C(27)-C(34) 82.0(5)
C(1)-C(10)-C(13)-C(14) -127.1(6) O(1)-C(26)-C(27)-N(7) 55.0(6)
C(9)-C(10)-C(13)-N(2) -112.1(5) O(1)-C(26)-C(27)-C(28) -63.9(6)
C(1)-C(10)-C(13)-N(2) 61.7(7) O(1)-C(26)-C(27)-C(34) 169.4(5)
N(2)-C(13)-C(14)-F(2) 178.2(5) N(7)-C(27)-C(28)-C(29) -41.6(7)
C(10)-C(13)-C(14)-F(2) 7.5(8) C(26)-C(27)-C(28)-C(29) 82.1(7)
N(2)-C(13)-C(14)-C(15) 0.3(8) C(34)-C(27)-C(28)-C(29) -153.1(5)
C(10)-C(13)-C(14)-C(15) -170.3(5) N(7)-C(27)-C(28)-C(30) 21.9(6)
C(19)-N(6)-C(15)-C(16) 4.7(7) C(26)-C(27)-C(28)-C(30) 145.6(5)
C(19)-N(6)-C(15)-C(14) -172.1(5) C(34)-C(27)-C(28)-C(30) -89.7(6)
C(13)-C(14)-C(15)-N(6) 170.4(5) C(27)-C(28)-C(29)-C(30) 93.3(6)
F(2)-C(14)-C(15)-N(6) -7.6(7) C(28)-C(29)-C(30)-C(31) -94.3(6)
C(13)-C(14)-C(15)-C(16) -6.6(7) C(27)-C(28)-C(30)-C(29) -112.9(6)
F(2)-C(14)-C(15)-C(16) 175.4(4) C(29)-C(28)-C(30)-C(31) 112.5(6)
N(6)-C(15)-C(16)-C(17) -168.0(5) C(27)-C(28)-C(30)-C(31) -0.5(7)
C(14)-C(15)-C(16)-C(17) 8.9(7) C(32)-N(7)-C(31)-C(30) 148.8(5)
N(6)-C(15)-C(16)-C(18) 4.3(7) C(27)-N(7)-C(31)-C(30) 35.5(6)
C(14)-C(15)-C(16)-C(18) -178.8(5) C(29)-C(30)-C(31)-N(7) 43.3(7)
C(13)-N(2)-C(17)-C(16) -0.8(8) C(28)-C(30)-C(31)-N(7) -21.3(6)
C(15)-C(16)-C(17)-N(2) -5.7(8) C(31)-N(7)-C(32)-C(33) -77.5(6)
C(18)-C(16)-C(17)-N(2) -177.1(5) C(27)-N(7)-C(32)-C(33) 35.9(5)
C(19)-N(5)-C(18)-N(4) -175.9(5) N(7)-C(32)-C(33)-C(35) 156.6(6)
C(19)-N(5)-C(18)-C(16) 6.8(7) N(7)-C(32)-C(33)-C(34) -20.9(6)
C(25)-N(4)-C(18)-N(5) -10.0(7) C(35)-C(33)-C(34)-C(27) -179.0(6)
C(20)-N(4)-C(18)-N(5) 135.5(5) C(32)-C(33)-C(34)-C(27) -1.5(6)
C(25)-N(4)-C(18)-C(16) 167.3(5) N(7)-C(27)-C(34)-C(33) 23.0(6)
C(20)-N(4)-C(18)-C(16) -47.1(7) C(28)-C(27)-C(34)-C(33) 134.7(5)
C(15)-C(16)-C(18)-N(5) -10.3(7) C(26)-C(27)-C(34)-C(33) -97.2(5)
C(17)-C(16)-C(18)-N(5) 161.3(5)
表8 式(I)化合物單晶的氫原子座標(× 104)和各向同性移位參數(Å2×103
x y z U(當量)
H(1A) 3749 8850 7201 45
H(1B) 2370 8354 6526 45
H(1) 2530(100) 1420(40) 5950(70) 60
H(4) 11187 6770 8557 45
H(5) 9342 7767 8510 45
H(7) 6553 8325 7865 41
H(9) 2852 7039 6085 36
H(12) 7397 4328 4862 60
H(17) 3403 4177 7126 37
H(20A) 4213 3230 6404 38
H(20B) 3983 2560 5393 38
H(21) 4440 2079 7522 46
H(22A) 2341 3115 8202 56
H(22B) 2580 2330 8968 56
H(23A) -89 1975 8253 57
H(23B) -355 2775 7535 57
H(24) -303 1533 6242 49
H(25A) 729 2244 4548 41
H(25B) -653 2728 5203 41
H(26A) -97 5217 1127 38
H(26B) -1491 5448 2050 38
H(28) -1338 4435 -1136 51
H(29A) -1513 3088 -586 59
H(29B) -2264 3326 761 59
H(30) -3966 3694 -1747 56
H(31A) -5750 4503 -614 51
H(31B) -5737 3729 181 51
H(32A) -4541 5336 2265 49
H(32B) -6224 5063 1416 49
H(34A) -2331 6009 -21 50
H(34B) -3494 5535 -1064 50
H(35A) -5523 6752 -393 68
H(35B) -6713 6476 696 68
實施例5:式(I)化合物A晶型的固體穩定性試驗
依據《原料藥與製劑穩定性試驗指導原則》 (中國藥典2020版四部通則9001),為評估式(I)化合物A晶型的固體穩定性。將A晶型分別在高溫(60 °C,敞口)、高濕(25℃/92.5%相對濕度,敞口)、光照(敞口,在5000±500 lux(可見光)與90µw/cm2(紫外)條件下照射10天,所接受總照度不低於1.2×106Lux∙hr,近紫外能量不低於200w∙hr/m2,遮光對照組樣品同時放置並用錫箔紙包裹)。每份樣品放置1.5 g,放樣結束後對所有穩定性樣品進行了XRPD測試,結果如表9所示。
表9 式(I)化合物A晶型的固體穩定性試驗結果
試驗條件 取點條件 晶型
- 0天 A晶型
高溫(60 °C,敞口) 30天 A晶型
高濕 (25°C,相對濕度92.5%,敞口) 30天 A晶型
遮光對照組 與可見光+紫外同時放置,並用錫箔紙包裹 A晶型
可見光+紫外(ICH條件,敞口) 可見光總照度不低於1.2×106Lux∙hr 紫外光總照度不低於200w∙hr/m2 A晶型
結論:式(I)化合物A晶型在所有穩定性(高溫,高濕,光照)條件下晶型均未發生明顯變化,具有較好的化學穩定性。
生物測試資料
實驗例1:式(I)化合物A晶型對GP2D細胞株增殖抑制作用
一、實驗材料
表10. 細胞及培養基配製
細胞名稱 細胞類型 細胞來源 貨號 培養基 培養條件
GP2D 人結腸癌細胞 ECACC 95090714 DMEM,含胎牛血清10%,青黴素/鏈黴素1% 37℃, 5% CO2
表11. 主要試劑
試劑 品牌 品牌貨號 批號 存儲條件 保質期
CellTiter-Glo ® 3D Cell Viability assay Promega G9683 0000575083 -20℃ 2026.02
0.25%胰酶 Gibco 25200-072 2537168 -20℃ 2025.02
DMSO Sigma D2650-100ML RNBL1802 室溫 NA
青黴素/鏈黴素 HyClone SV30010 J220018 4℃ 2024.08
胎牛血清FBS ExCell Bio FSP500 12B244 -20℃ 2027.08
DMEM Gibco 11965-092 2509030 4℃ 2023.12
二、實驗方法
實驗用細胞培養液:在DMEM細胞培養基中添加終濃度為10%的胎牛血清,1%的青黴素/鏈黴素溶液,4℃保存備用。
用胰酶消化已達到80%細胞融合的GP2D細胞,離心重懸計數,用培養基製成細胞懸液,96孔板中每孔加入180 µL/孔細胞懸液(1000細胞/孔),置於含5% CO2的細胞培養箱中37℃培養過夜。
受試化合物用DMSO溶液稀釋至200 µM,再用完全培養基將其稀釋至10 µM,並以10 µM為起始濃度5×遞減稀釋9個濃度。細胞培養過夜後將稀釋好的混合液分別轉移至相應的細胞板中,化合物終濃度為1 µM為起始濃度,5×遞減稀釋9個濃度,混勻,置於含5% CO2的細胞培養箱中37℃培養5天。
化合物孵育到上述時間後取96孔細胞培養板,棄去50 µL上清後加入80 µL 3D-CellTiter Glo,室溫震盪孵育30分鐘。在Envision上進行讀板,使用*US LUM-US LUM 96 (cps)程式讀板。
測得的各組訊號值均減去無細胞對照孔訊號值進行標化。資料根據如下公式計算化合物處理後的細胞活率:% 抑制率=(1-(RFU化合物- AVER(RFU陰性對照)/ (AVER(RFU陽性對照)- AVER(RFU陰性對照))) ×100%。陽性對照:0.5% DMSO處理的細胞;陰性對照:無細胞僅有完全培養基,利用Prism8.3.0作圖計算化合物的IC50值, IC50值的計算公式為log(inhibitor) vs. response (three parameters):Y=Bottom + (Top-Bottom)/(1+10^((X-LogIC50)))。
三、實驗結果
化合物對細胞增殖抑制的IC50如下表。
表 12 化合物對GP2D細胞增殖的抑制作用
化合物 GP2D IC50 (nM)
式(I)化合物A晶型 1.25
實驗結論:式(I)化合物A晶型對KRAS G12D突變的GP2D細胞有顯著的增殖抑制作用。
實驗例2:式(I)化合物對PANC04.03細胞株增殖抑制作用
一、實驗目的:
本實驗旨在驗證本公開化合物對KRAS G12D突變的PANC04.03人胰腺癌細胞的增殖抑制效果。
二、實驗材料:
細胞株PANC04.03、RPMI-1640培養基購自GIBCO,FBS購自Hyclone,human insulin購自Yeasen。96-孔板購自Ultra Low Cluster,CellTiter-Glo® 3D Cell Viability Assay(3D細胞活率化學發光檢測試劑)試劑購自Promega,2104 EnVision讀板器購自PerkinElmer。
三、實驗方法:
將PANC04.03細胞按RPMI-1640+15% FBS+5ug/ml human insulin培養條件在37℃,5% CO2的培養箱中進行培養。定期傳代,取處於對數生長期的細胞用於鋪板。將PANC04.03細胞種於96孔U底細胞培養板中,135 μL細胞懸液每孔,其中包含2000個PANC04.03細胞。將培養板在37℃,5% CO2,及100% 相對濕度的培養箱中培養過夜。將待測化合物用排槍進5倍稀釋至第8個濃度,即從200 μM稀釋至2.56 nM,設置雙複孔實驗。向中間板中加入78 μL培養基,再按照對應位置,轉移2 μL每孔的梯度稀釋化合物至中間板,混勻後轉移20μL每孔到細胞板中。轉移到細胞板中的化合物濃度範圍是1 μM至0.0128 nM。細胞板置於二氧化碳培養箱中培養7天。加入化合物的細胞板結束孵育後,向細胞板中加入每孔100 μL的細胞活率化學發光檢測試劑,室溫孵育10分鐘使發光訊號穩定。採用多標記分析儀讀數。
四、資料分析:
利用方程式(Sample-Min)/(Max-Min)*100%將原始資料換算成抑制率,IC50的值即可透過四參數進行曲線擬合得出(GraphPad Prism中「log(inhibitor) vs. response -- Variable slope」模式得出)。
五、實驗結果:
結果見表13。
表13 化合物對PANC04.03細胞抗增殖的IC50
化合物 PANC04.03 IC50 (nM)
式(I)化合物 34.17
實驗結論:式(I)化合物對KRAS G12D突變的PANC04.03細胞具有顯著的抗增殖活性。
實驗例3. 體內藥代動力學實驗
一、實驗目的:
本實驗旨在考察本公開化合物在CD-1小鼠口服及靜脈注射下的藥代動力學特徵。
二、實驗方法:
受試化合物與10%二甲基亞碸+90%(10%羥丙基-β-環糊精(HP-β-CD)水溶液)混合,渦旋並超聲,分別製備得到0.6、3.0和10.0mg/mL澄清溶液。選取7至10周齡的雄性CD-1小鼠,靜脈注射(i.v.)給予候選化合物溶液,劑量為3 mg/kg(給藥濃度0.6 mg/mL)。口服(p.o.)給予候選化合物溶液,劑量為30 mg/kg(給藥濃度3.0 mg/mL)或100 mg/kg(給藥濃度10.0 mg/mL)。收集一定時間的全血,製備得到血漿,以LC-MS/MS方法分析藥物濃度,並用Phoenix WinNonlin 軟體(美國Pharsight公司)計算藥代參數。
三、實驗結果:
結果見表14。
表14 式(I)化合物在CD-1小鼠體內的PK性質
式(I)化合物
i.v. 3 mpk T1/2 (h) 9.30
Vd (L/kg) 41.1
Cl (mL/kg/min) 50.8
AUC0-last (nM.h) 1556
AUC0-∞(nM.h) 1660
p.o. 30 mpk T1/2 (h) 5.41
Tmax(h) 0.583
Cmax (nmol/L) 439
AUC0-last (nM.h) 1154
AUC0-∞(nM.h) 1183
p.o. 100 mpk T1/2 (h) 4.24
Tmax(h) 1.25
Cmax (nmol/L) 3114
AUC0-last (nM.h) 13149
AUC0-∞(nM.h) 13306
F (%) 24.0
實驗結論:式(I)化合物在小鼠體內具有較好的藥代動力學特徵。
本公開要求於2024年01月10日向中國國家智慧財產權局提交的CN202410040440.3號中國發明專利申請和於2025年01月06日向中國國家智慧財產權局提交的第CN202510018660.0號中國發明專利申請的權益和優先權,在此將它們的全部內容以援引的方式整體併入本文中。
圖1:式(I)化合物A晶型的Cu-Kα輻射的XRPD譜圖。
圖2:式(I)化合物A晶型的DSC譜圖。
圖3:式(I)化合物A晶型的TGA譜圖。
圖4:式(I)化合物A晶型的DVS譜圖。
圖5:式(I)化合物單晶的立體結構橢球圖。

Claims (15)

  1. 一種式(I)化合物的A晶型,其特徵在於,其Cu Kα輻射的X射線粉末繞射圖譜在下列2θ角處具有特徵繞射峰:8.09°±0.2°、21.34°±0.2°、24.74°±0.2°、25.26°±0.2°,
  2. 根據請求項1所述的A晶型,其Cu Kα輻射的X射線粉末繞射圖譜在下列2θ角處具有特徵繞射峰:8.09°±0.2°、19.18°±0.2°、19.49°±0.2°、21.34°±0.2°、24.74°±0.2°、25.26°±0.2°。
  3. 根據請求項2所述的A晶型,其Cu Kα輻射的X射線粉末繞射圖譜在下列2θ角處具有特徵繞射峰:8.09°±0.2°、9.46°±0.2°、13.95°±0.2°、19.18°±0.2°、19.49°±0.2°、21.34°±0.2°、24.74°±0.2°、25.26°±0.2°。
  4. 根據請求項3所述的A晶型,其Cu Kα輻射的X射線粉末繞射圖譜在下列2θ角處具有特徵繞射峰:8.09°±0.2°、9.46°±0.2°、13.95°±0.2°、15.28°±0.2°、17.12°±0.2°、19.18°±0.2°、19.49°±0.2°、21.34°±0.2°、24.74°±0.2°、25.26°±0.2°。
  5. 根據請求項4所述的A晶型,其Cu Kα輻射的X射線粉末繞射圖譜在下列2θ角處具有特徵繞射峰:8.09°±0.2°、9.46°±0.2°、13.95°±0.2°、15.28°±0.2°、17.12°±0.2°、19.18°±0.2°、19.49°±0.2°、20.82°±0.2°、21.34°±0.2°、24.74°±0.2°、25.26°±0.2°、28.32°±0.2°。
  6. 根據請求項5所述的A晶型,其Cu Kα輻射的X射線粉末繞射圖譜在下列2θ角處具有特徵繞射峰:8.09°±0.2°、9.46°±0.2°、12.10°±0.2°、13.95°±0.2°、15.28°±0.2°、16.39°±0.2°、17.12°±0.2°、19.18°±0.2°、19.49°±0.2°、20.82°±0.2°、21.34°±0.2°、22.22°±0.2°、24.74°±0.2°、25.26°±0.2°、27.99°±0.2°、28.32°±0.2°。
  7. 根據請求項6所述的A晶型,其Cu Kα輻射的X射線粉末繞射圖譜在下列2θ角處具有特徵繞射峰:8.09°±0.2°、9.46°±0.2°、12.10°±0.2°、12.78°±0.2°、13.06°±0.2°、13.95°±0.2°、15.28°±0.2°、16.39°±0.2°、17.12°±0.2°、18.56°±0.2°、18.86°±0.2°、19.18°±0.2°、19.49°±0.2°、19.84°±0.2°、20.82°±0.2°、21.34°±0.2°、22.22±0.2°、22.96°±0.2°、23.58°±0.2°、24.11°±0.2°、24.74°±0.2°、25.26°±0.2°、27.99°±0.2°、28.32°±0.2°、29.00°±0.2°、30.21°±0.2°。
  8. 根據請求項7所述的A晶型,其Cu Kα輻射的X射線粉末繞射圖譜在下列2θ角處具有特徵繞射峰:7.29°±0.2°、8.09°±0.2°、9.46°±0.2°、9.75°±0.2°、11.06°±0.2°、12.10°±0.2°、12.78°±0.2°、13.06°±0.2°、13.95°±0.2°、14.87°±0.2°、15.28°±0.2°、16.39°±0.2°、17.12°±0.2°、17.54°±0.2°、18.56°±0.2°、18.86°±0.2°、19.18°±0.2°、19.49°±0.2°、19.84°±0.2°、20.82°±0.2°、21.34°±0.2°、22.22°±0.2°、22.96°±0.2°、23.58°±0.2°、24.11°±0.2°、24.74°±0.2°、25.26°±0.2°、25.73°±0.2°、26.11°±0.2°、26.50°±0.2°、26.64°±0.2°、27.54°±0.2°、27.99°±0.2°、28.32°±0.2°、28.78°±0.2°、29.00°±0.2°、30.21°±0.2°、30.50°±0.2°、31.03°±0.2°、31.99°±0.2°、33.33°±0.2°、33.69°±0.2°、34.01°±0.2°、34.39°±0.2°、34.81°±0.2°、35.48°±0.2°、35.82°±0.2°、36.37°±0.2°、36.63°±0.2°、37.34°±0.2°、37.78°±0.2°、38.39°±0.2°、38.71°±0.2°、39.14°±0.2°、39.57°±0.2°。
  9. 根據請求項8所述的A晶型,其XRPD譜圖基本上如圖1所示。
  10. 根據請求項1-9任意一項所述的A晶型,其差示掃描量熱(DSC)曲線在199.55±3.00℃處有放熱峰的起始值。
  11. 根據請求項1-9任意一項所述的A晶型,其DSC譜圖基本上如圖2所示。
  12. 根據請求項1-9任意一項所述的A晶型,其熱重分析(TGA)曲線在220.00±3.00℃時失重達4.502%。
  13. 根據請求項12所述的A晶型,其TGA譜圖基本上如圖3所示。
  14. 一種藥物組合物,其包含請求項1-13任意一項所述的式(I)化合物的A晶型;任選地,所述藥物組合物還包含藥學上可接受的輔料。
  15. 根據請求項1-13任意一項所述的式(I)化合物的A晶型或請求項14所述的藥物組合物在製備用於治療KRAS G12D突變的實體瘤藥物中的應用;優選地,其中所述KRAS G12D突變的實體瘤選自結腸癌和胰腺癌。
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