[go: up one dir, main page]

TW202400134A - 用於治療疾病之化合物及方法 - Google Patents

用於治療疾病之化合物及方法 Download PDF

Info

Publication number
TW202400134A
TW202400134A TW112109554A TW112109554A TW202400134A TW 202400134 A TW202400134 A TW 202400134A TW 112109554 A TW112109554 A TW 112109554A TW 112109554 A TW112109554 A TW 112109554A TW 202400134 A TW202400134 A TW 202400134A
Authority
TW
Taiwan
Prior art keywords
compound
certain embodiments
cancer
group
hydrogen
Prior art date
Application number
TW112109554A
Other languages
English (en)
Inventor
唐娜 L 羅米洛
奧利弗 桑德斯
奎格瑞 史都華 比撒奇
丹尼斯 札勒
里柏曼 羅薩娜 卡佩勒
Original Assignee
美商羅米醫療公司
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 美商羅米醫療公司 filed Critical 美商羅米醫療公司
Publication of TW202400134A publication Critical patent/TW202400134A/zh

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • C07H19/06Pyrimidine radicals
    • C07H19/10Pyrimidine radicals with the saccharide radical esterified by phosphoric or polyphosphoric acids
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7042Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings
    • A61K31/7052Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides
    • A61K31/706Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7042Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings
    • A61K31/7052Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides
    • A61K31/706Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom
    • A61K31/7064Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom containing condensed or non-condensed pyrimidines
    • A61K31/7068Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom containing condensed or non-condensed pyrimidines having oxo groups directly attached to the pyrimidine ring, e.g. cytidine, cytidylic acid
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7042Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings
    • A61K31/7052Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides
    • A61K31/706Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom
    • A61K31/7064Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom containing condensed or non-condensed pyrimidines
    • A61K31/7068Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom containing condensed or non-condensed pyrimidines having oxo groups directly attached to the pyrimidine ring, e.g. cytidine, cytidylic acid
    • A61K31/7072Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom containing condensed or non-condensed pyrimidines having oxo groups directly attached to the pyrimidine ring, e.g. cytidine, cytidylic acid having two oxo groups directly attached to the pyrimidine ring, e.g. uridine, uridylic acid, thymidine, zidovudine
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7042Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings
    • A61K31/7052Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides
    • A61K31/706Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom
    • A61K31/7064Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom containing condensed or non-condensed pyrimidines
    • A61K31/7076Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom containing condensed or non-condensed pyrimidines containing purines, e.g. adenosine, adenylic acid
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00Drugs for disorders of the nervous system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02Immunomodulators
    • A61P37/06Immunosuppressants, e.g. drugs for graft rejection
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D487/00Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, not provided for by groups C07D451/00 - C07D477/00
    • C07D487/02Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, not provided for by groups C07D451/00 - C07D477/00 in which the condensed system contains two hetero rings
    • C07D487/04Ortho-condensed systems
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • C07H19/06Pyrimidine radicals
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • C07H19/06Pyrimidine radicals
    • C07H19/073Pyrimidine radicals with 2-deoxyribosyl as the saccharide radical
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • C07H19/12Triazine radicals
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • C07H19/16Purine radicals
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • C07H19/16Purine radicals
    • C07H19/173Purine radicals with 2-deoxyribosyl as the saccharide radical
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • C07H19/16Purine radicals
    • C07H19/20Purine radicals with the saccharide radical esterified by phosphoric or polyphosphoric acids

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Transplantation (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Neurology (AREA)
  • Neurosurgery (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Abstract

本發明提供用於使用根據式I之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,或本文所提供的相關化合物治療諸如癌症、自體免疫病症及/或神經病症之醫學病症且抑制LINE1逆轉錄酶及/或HERV-K逆轉錄酶的化合物、組合物及方法。

Description

用於治療疾病之化合物及方法
本發明提供用於使用根據式I之化合物或其醫藥學上可接受之鹽或本文提供的相關化合物治療諸如癌症、自體免疫病症及/或神經病症之醫學病症且調節LINE1逆轉錄酶及/或HERV-K逆轉錄酶的化合物、組合物及方法。
轉位元件(或轉位子)係基因體DNA序列,能夠在基因體內移動,從而改變其組織結構、增加其大小且產生重複及冗餘。(Ukadike及Mustelin, J. Clin. Med., 10:856 (2021))。此等基因體序列據信藉由數百萬年前感染人類祖先之外源逆轉錄病毒或保留在人類生殖系基因體中嵌入及複製能力的逆轉錄病毒之古老後代的感染引入人類基因體。(Ukadike及Mustelin, 2021)。
長散佈核元件1 (LINE-1)為某些生物體DNA中之I類轉位元件,約佔人類基因體的17%。LINE-1包含兩個開放閱讀框ORF1及ORF2,它們依次分別編碼具有核酸伴護蛋白活性之ORF1p及具有逆轉錄酶(RT)及核酸內切酶活性之ORF2p。(在Babushok及Kazazian, Hum. Mut. 28:527-539, (2007)中評論)。LINE-1逆轉錄轉位活性由ORF2p介導。人類基因體中之大多數LINE-1元件含有不活化突變,但一小部分LINE-1元件完整且保留了逆轉錄轉位的能力。此能力因個體而異,亦因個體內的細胞類型而異。活性LINE-1元件係認為經由插入、缺失、重排及重組來破壞基因體。(Garcia-Perez等人, Development,143:4101-4114 (2016))。LINE-1活性通常在生殖系中受到DNA甲基化、組蛋白修飾及piRNA之嚴格調控。
逆轉錄轉位子係與許多疾病之發病機制有關的轉位元件,諸如癌症、自體免疫疾病、神經病症及衰老等。(Zhang等人, Frontiers in Cell and Dev. Bio., 8:657 (Aug. 2020);Kuriyama等人, Nature: Scientific Reports, 11:23146 (2021))。LINE-1 RNA及蛋白過表現可促進細胞凋亡、DNA損傷及修復,以及細胞可塑性,從而促進腫瘤進展。此外,基因體低甲基化可誘導重複序列的表現,從而驅動以1型乾擾素過量產生為特徵之促炎反應。(Zhang,2020)。
致病干擾素的產生係I型乾擾素病之一個特徵。此等包括發生率為1:10,000至1:1,000,000之罕見遺傳病。I型乾擾素之病理誘導導致免疫系統過度活化,引起全身炎症,影響神經系統、肺及血管等器官系統。(Nesterova 等人「Congenital and Acquired Interferonopathies: Differentiated Approaches to Interferon Therapy」. Innate Immunity in Health and Disease, Saxena及Prakash編, IntechOpen, 2020)。艾卡迪-古特雷斯症候群(Aicardi-Goutieres Syndrome,AGS)為由基因突變驅動之單基因發炎性腦肌病,此等基因對於維持細胞溶質核酸寡聚體的穩態至關重要。結果,細胞質核酸積累水準的增加引起干擾素反應之增強。LINE-1逆轉錄之雙股DNA產物為DNA感測受體(諸如cGAS)之潛在觸發物,cGAS為可活化STING途徑從而產生I型乾擾素之DNA感測器。(Zhao, J. Autoimmunity, 90:105-115 (2018))。LINE-1逆轉錄酶產物被認為係AGS患者促炎性核酸之主要來源。對AGS患者投與三種核苷逆轉錄酶抑制劑之組合歷時12個月有效降低了他們的全身乾擾素反應。導致AGS之致病干擾素反應亦與SLE的發病機制有關,一些案例研究鑑定出由諸如TREX1之核酸代謝酶之亞等位基因驅動之SLE的單基因形式。
低甲基化及高表現的LINE-1已在許多自體免疫疾病患者中發現,諸如全身性紅斑狼瘡(SLE)、皮膚狼瘡、休格倫氏症候群(Sjögren’s syndrome,SS)及牛皮癬。(Zhang等人)。亦發現LINE-1在皮肌炎(DM)患者中顯著上調,干擾素α及乾擾素β水準顯著升高。(Kuriyama 等人, J. Am. Acad Dermatol., 84(4):1103-1105 (2020))。
LINE-1亦與神經病症有關,諸如共濟失調毛細血管擴張症(AT)、雷特症候群(Rett syndrome)、弗里德里希共濟失調(Friederichs's ataxia)、核上性麻痺、肌萎縮性脊髓側索硬化症、額顳葉癡呆及精神分裂症。已經在此等疾病中的每一者中識別出增加的逆轉錄轉位以及升高的1型乾擾素水準。LINE-1亦與衰老過程及額顳葉退化有關。(Zhang,2020)。
儘管文獻中報導了治療癌症之大量研究工作及科學進步,但此疾病仍然為重大的健康問題。包括前列腺癌、乳癌及肺癌在內之固態腫瘤在世界人口中仍然非常普遍。白血病及淋巴瘤亦佔新癌症診斷之很大比例。目前針對此等癌症之治療選擇並非對所有患者都有效且/或可能具有顯著的不良副作用。需要新的療法來解決癌症療法中此未滿足之需求。
已在許多腫瘤組織中發現了高LINE-1活性。LINE-1 RT使用稱為目標位點引發逆轉錄(TPRT)之程序,該程序涉及切割基因體DNA,然後進行逆轉錄且將LINE-1插入基因體。LINE-1介導之基因重排可以觸發致癌基因擴增。此外,LINE-1可以介導抑瘤基因之缺失(Zhang,2020)。經由活性LINE-1元件之RNA干擾依賴性沉默或使用RT抑制化合物抑制癌細胞中的LINE-1 RT可以減少癌細胞增殖,促進癌細胞分化且可以延緩某些動物模型中之腫瘤進展。(Sciamann等人, Frontiers in Chemistry, 4:6(2016年2月))。亦顯示LINE1可以促進腫瘤轉移。此外,腫瘤微環境中1型乾擾素之慢性產生與免疫監督之抗性有關,干擾素傳訊之治療性阻斷增加了抗癌免疫反應。
人類內源性逆轉錄病毒(HERV)佔人類基因體的近8%,據信來源於逆轉錄病毒古老整合至生殖系中。HERV之生物學定義不明確,但有越來越多的證據支持在諸如癌症、自體免疫疾病、神經退行性疾病及衰老之多種疾病中之病理作用。功能性蛋白質係由HERV編碼之基因產生,包括逆轉錄酶(RT),這可能為對歸因於異常HERV-K表現之病理學的貢獻。
HERV藉由重新連接植入前胚胎之基因調控網路在早期發育中發揮作用(Fu等人, Biomolecules, 11(6):829 (2021))。HERV表現似乎為未分化狀態、獲得表現型可塑性及乾細胞特徵之標誌(Balestrieri等人, Frontiers in Microbiology, 9:1448 (2018));與侵襲性癌症及不良患者預後相關之特徵。HERV在正常成人組織中的表現通常受到嚴格控制,但據報導異常表現於癌症(Downey等人, Int. J. Cancer, 137(6):1249-1257(2015))、發炎性疾病(Greenig, PeerJ 7:e6711 (2019))、神經疾病(Kury等人, Trends Mol. Med.,24(4):379-394(2018))、衰老(Gorbunova等人, Nature, 596(7870):43-53 (2021))及病毒性疾病(Romer, Frontiers in Neuroscience, 15:648629-648629 (2021))中。有許多關於HERV-K [HML-2(人類內源性MMTV樣)亞型衍生之mRNA及蛋白質在多種固態及液態腫瘤類型中上調之報導(Dervan等人, Front. Onc.,11:658489 (2021);Hohn等人, Front. Onc., 3:246 (2013))。疾病與內源性逆轉錄病毒之關聯以及疾病狀態期間HERV編碼蛋白之表現表明,可以在此等病狀之管理中探索抗逆轉錄病毒療法。
因此,需要新穎治療方法來提供改善的功效及/或減少的副作用以治療諸如癌症、自體免疫疾病、神經病症、衰老及與衰老相關之疾病的醫學病症。本發明解決了上述需要且提供了其他相關優點。
本文提供之化合物及組合物除其他用途外,可用於治療癌症、自體免疫病症及/或神經病症。該等化合物抑制LINE1逆轉錄酶活性及/或HERV-K逆轉錄酶活性。化合物可以調配成醫藥組合物。提供治療方法及抑制LINE1逆轉錄酶活性之方法。
本揭示案之一個態樣提供具有優異特性組合的化合物,此等特性包括對LINE1逆轉錄酶之有效抑制活性、抑制LINE1逆轉錄酶之選擇性,以及使該等化合物非常適合用作經口投與藥劑之優異物理特性。抑制LINE1逆轉錄酶之選擇性可以根據化合物抑制LINE1逆轉錄酶同時對DNA聚合酶( 例如,α、β及γ)具有實質上較低抑制活性的能力來表徵。部分由於抑制DNA聚合酶(諸如DNA聚合酶γ)會導致線粒體毒性形式之毒性,對LINE1逆轉錄酶表現出有效抑制活性同時對DNA聚合酶具有實質上較低抑制活性的化合物係一個重要發現及重大科學進步。對LINE1逆轉錄酶之有效抑制活性與對DNA聚合酶之低抑制活性相結合有助於主題化合物的高治療指數,藉此為該化合物在醫療中提供優異性能概況。本文之實驗結果證明瞭此等益處。
本揭示案之另一態樣提供具有優異特性組合的化合物,此等特性包括對LINE1逆轉錄酶之有效抑制活性、抑制LINE1逆轉錄酶之選擇性,有效抑制發炎性組織中之致病干擾素反應,以及使該等化合物非常適合用作經口投與藥劑之優異物理特性。如上所述,抑制LINE1逆轉錄酶之選擇性可以根據化合物抑制LINE1逆轉錄酶同時對DNA聚合酶( 例如,α、β及γ)具有實質上較低抑制活性的能力來表徵。部分由於抑制DNA聚合酶(諸如DNA聚合酶γ)會導致線粒體毒性形式之毒性,對LINE1逆轉錄酶表現出有效抑制活性同時對DNA聚合酶具有實質上較低抑制活性的化合物係一個重要發現及重大科學進步。有效抑制發炎性組織中之致病干擾素反應之化合物可用於治療癌症、自體免疫疾病( 例如,SLE及CLE)、神經病症、衰老及與衰老相關之疾病。對LINE1逆轉錄酶之有效抑制活性與對DNA聚合酶( 例如,α、β及γ)之低抑制活性相結合有助於主題化合物的高治療指數,藉此為該化合物在醫療中提供優異性能概況。
本揭示案之另一態樣提供具有優異特性組合的化合物,此等特性包括對HERV-K逆轉錄酶之有效抑制活性、抑制HERV-K逆轉錄酶之選擇性,以及使該等化合物非常適合用作經口投與藥劑之優異物理特性。抑制HERV-K逆轉錄酶之選擇性可以根據化合物抑制HERV-K逆轉錄酶同時對DNA聚合酶( 例如,α、β及γ)具有實質上較低抑制活性的能力來表徵。部分由於抑制DNA聚合酶(諸如DNA聚合酶γ)會導致線粒體毒性形式之毒性,對HERV-K逆轉錄酶表現出有效抑制活性同時對DNA聚合酶具有實質上較低抑制活性的化合物係一個重要的重大科學進步。作為HERV-K逆轉錄酶有效抑制劑之化合物可用於治療HERV-K逆轉錄酶相關病症。對HERV-K逆轉錄酶之有效抑制活性與對DNA聚合酶之低抑制活性相結合有助於主題化合物的高治療指數,藉此為該化合物在醫療中提供優異性能概況。
因此,本揭示案之一個態樣提供由式I表示之化合物: (I) 或其醫藥學上可接受之鹽,其中B、R 1、R 2、R 3、R 4、R 5及R 6如本文所述。本文亦提供包含式I化合物之醫藥組合物。
本揭示案之另一態樣提供化合物之集合,諸如由式II表示之化合物: (II) 或其醫藥學上可接受之鹽,其中變量如本文所述。本文亦提供包含式II化合物之醫藥組合物。
本揭示案之另一態樣提供化合物之集合,諸如由式III表示之化合物: (III) 或其醫藥學上可接受之鹽,其中變量如本文所述。本文亦提供包含式III化合物之醫藥組合物。
本揭示案之另一態樣提供化合物之集合,諸如由式IV表示之化合物: (IV) 或其醫藥學上可接受之鹽,其中變量如本文所述。本文亦提供包含式IV化合物之醫藥組合物。
本揭示案之另一態樣提供化合物之集合,諸如由式V表示之化合物: (V) 或其醫藥學上可接受之鹽,其中變量如本文所述。本文亦提供包含式V化合物之醫藥組合物。
本揭示案之另一態樣提供化合物之集合,諸如由式VI表示之化合物: (VI) 或其醫藥學上可接受之鹽,其中變量如本文所述。本文亦提供包含式VI化合物之醫藥組合物。
所揭示之化合物及組合物經設計用於藉由使用所揭示之化合物抑制LINE1逆轉錄酶及/或HERV-K逆轉錄酶來治療醫學病症。特定言之,本揭示案之一個態樣提供根據式I之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其用於治療選自由癌症、自體免疫病症及神經病症組成之群的病症之方法中。在實施方式中描述了用於該方法之額外化合物集合的其他描述,包括式II、III、IV、V及VI之化合物。在實施方式中描述了該方法的額外特徵。
本揭示案的另一態樣提供根據式I之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其用於抑制患有選自由癌症、自體免疫病症及神經病症組成之群的病症之個體中之LINE1逆轉錄酶活性之方法中。該方法包含使LINE1逆轉錄酶與有效量的式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽接觸,以抑制該LINE1逆轉錄酶之活性。在實施方式中描述了用於該方法之額外化合物的其他描述,包括式II、III、IV、V及VI之化合物。在實施方式中描述了該方法的額外特徵。
本揭示案的另一態樣提供根據式I之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其用於抑制患有選自由癌症、自體免疫病症及神經病症組成之群的病症之個體中之HERV-K逆轉錄酶活性之方法中。該方法包含使HERV-K逆轉錄酶與有效量的式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽接觸,以抑制該HERV-K逆轉錄酶之活性。在實施方式中描述了用於該方法之額外化合物集合的其他描述,包括式II、III、IV、V及VI之化合物。在實施方式中描述了該方法的額外特徵。
相關申請案之交互參照
本申請案主張於2022年11月11日提交之美國臨時專利申請序列第63/424,723號;於2022年6月22日提交之美國臨時專利申請序列第63/354,620號;及於2022年3月15日提交之美國臨時專利申請序列第63/269,375號的權益及優先權;其中每一者之內容均藉由引用的方式整體併入本文。 對電子序列表的引用
本申請案包含已經由專利中心以電子方式以XML格式提交的序列表,且藉由引用的方式整體併入本文。該XML複本創建於2023年3月9日,名為198109_seqlist.xml,且大小為11,441字節。
在某些實施例中,本揭示案提供式I之化合物: (I) 或其醫藥學上可接受之鹽,其中 B為 ; R 1為-H或 ; Alk每次出現時獨立地為C 2-C 6脂族基; R 2為-H、C 1-C 6脂族基、C 1-C 3鹵基脂族基、C 1-C 3羥基脂族基、環丙基、-CN、-N 3、-O-(C 1-C 3脂族基)、-F或-Cl; R 3為-H; R 4為-OH、-Cl、-OCH 3、-F、-N 3; R 5為-H或-F;且 R 6為-H、-F、-Cl、C 1-C 6脂族基、C 1-C 4鹵基脂族基、-O-(C 1-C 4脂族基)、環丙基或-OH。
本發明進一步提供如本文所述之式II、III、IV、V或VI之化合物。本發明進一步提供式I化合物之組合物以及使用根據式I之化合物或其醫藥學上可接受之鹽或本文提供的相關化合物(諸如式II、III、IV、V或VI之化合物)治療醫學病症(諸如癌症、自身免疫病症及/或神經病症)且抑制LINE1逆轉錄酶及/或HERV-K逆轉錄酶之方法。
本發明進一步提供如本文所述之式I-A、II-A、III-A、III-B、IV-A及IV-B之化合物。本發明進一步提供式I化合物之組合物以及使用根據式I之化合物或其醫藥學上可接受之鹽或本文提供的相關化合物(諸如式I-A、II-A、III-A、III-B、IV-A及IV-B之化合物)治療醫學病症(諸如癌症、自身免疫病症及/或神經病症)且抑制LINE1逆轉錄酶及/或HERV-K逆轉錄酶之方法。
本發明之各個態樣在以下章節中闡述;然而,在一個特定章節中描述的本發明之態樣不限於任何特定章節。此外,當變量沒有伴隨定義時,以變量的先前定義為準。 定義
本發明之化合物包括本文一般描述的化合物,且藉由本文揭示之類別、亞類及種類進一步說明。如本文所用,除非另外指示,否則以下定義應適用。除非另外指示,否則無論術語係單獨使用抑或與其他術語結合使用,此等定義均適用。因此,「脂族基」之定義適用於「脂族基」以及「-O-脂族基」的「脂族基」部分等。為了本發明之目的,化學元素係根據元素週期表,CAS版本,Handbook of Chemistry and Physics,第75版識別。此外,有機化學之一般原理係描述於「Organic Chemistry」,Thomas Sorrell, University Science Books, Sausalito: 1999及「March’s Advanced Organic Chemistry」, 第5版, 編輯:Smith, M.B.及March, J., John Wiley & Sons, New York: 2001中,其全部內容藉由引用的方式併入本文。
當用於描述可能具有多個連接點的化學基團時,連字符(-)表示該基團與其所連接的變量的連接點。同樣,使用符號「 」表示基團與結構之連接點。
單獨使用或作為較大部分之一部分使用的術語「脂族基」,諸如「鹵基脂族基」及類似基團意謂飽和或不飽和之直鏈或支鏈單價烴基。除非另外規定,否則脂族基通常具有1-6個碳原子。脂族基之實例包括甲基、乙基、乙炔基、乙烯基、丙基、丙烯基、異丙基、丁基、異丁基、三級丁基及類似基團。
術語「鹵基脂族基」包括單、多及全鹵基脂族基,其中鹵素獨立地選自F、Cl、Br及I,且脂族基如上所述。「鹵基脂族基」之實例包括-CF 3、-CH 2F、-CFClH、-CH 2CH 2F、-CH 2CH 2Cl、-CH=CHF、-CF 2CF 3、-CH 2Cl及類似基團。
單獨使用或作為較大部分之一部分使用的術語「烷基」,諸如「鹵烷基」及類似基團意謂飽和直鏈或支鏈單價烴基。除非另外規定,否則烷基通常具有1-6個碳原子。烷基之實例包括甲基、乙基、丙基、異丙基、丁基、異丁基、三級丁基及類似基團。
術語「鹵烷基」包括單、多及全鹵烷基,其中鹵素獨立地選自F、Cl、Br及I,且烷基如上所述。「鹵烷基」之實例包括-CF 3、-CH 2F、-CFClH、-CH 2CH 2F、-CH 2CH 2Cl、-CF 2CF 3、-CH 2Cl及類似基團。術語「鹵甲基」係指含有單個碳原子之鹵烷基。術語「氘鹵甲基」係指含有一個或兩個氘原子之鹵甲基。
術語「烷氧基」意謂藉由氧連接原子連接之脂族基,亦由-O-脂族基表示,其中脂族基如上所述。「烷氧基」之實例包括-OCH 3、-OCH 2CH 3、-OCH=CH 2及類似基團。
術語「羥基脂族基」意謂經一或多個-OH取代之如上所述的脂族基。「羥基脂族基」之實例包括-CH 2OH、-C(H)(OH)CH 3、-CH 2C(H)(OH)CH 2OH及類似基團。
術語「鹵素」意謂F、Cl、Br或I。
如本文所用,術語「不飽和」意謂部分具有一或多個不飽和單元。例如,「不飽和」脂族基包括烯基與炔基部分,諸如乙炔基、乙烯基、2-丙烯基、3-丙烯基、2-丙炔基及類似基團。
如本文所用,術語「醫藥學上可接受之鹽」係指在合理的醫學判斷範疇內適用於與人類及低等動物組織接觸而沒有過度毒性、刺激、過敏反應及類似作用且與合理的收益/風險比相稱之彼等鹽。醫藥學上可接受之鹽係此項技術中眾所周知的。例如,S.M. Berge 等人在J. Pharmaceutical Sciences, 1977, 66, 1-19 中詳細描述了醫藥學上可接受之鹽,該文獻係藉由引用的方式併入本文。本發明化合物之醫藥學上可接受之鹽包括衍生自合適的無機及有機酸及鹼的彼等鹽。醫藥學上可接受之無毒酸加成鹽的實例為胺基與無機酸諸如鹽酸、氫溴酸、磷酸、硫酸及過氯酸;或與有機酸諸如乙酸、草酸、馬來酸、酒石酸、檸檬酸、琥珀酸或丙二酸;或藉由使用此項技術中使用的其他方法,諸如離子交換所形成的鹽。其他醫藥學上可接受之鹽包括己二酸鹽、海藻酸鹽、抗壞血酸鹽、天冬胺酸鹽、苯磺酸鹽、苯甲酸鹽、硫酸氫鹽、硼酸鹽、丁酸鹽、樟腦酸鹽、樟腦磺酸鹽、檸檬酸鹽、環戊烷丙酸鹽、二葡糖酸鹽、十二烷基硫酸鹽、乙烷磺酸鹽、甲酸鹽、富馬酸鹽、葡庚糖酸鹽、甘油磷酸鹽、葡糖酸鹽、半硫酸鹽、庚酸鹽、己酸鹽、氫碘化物、2-羥基-乙烷磺酸鹽、乳糖酸鹽、乳酸鹽、月桂酸鹽、月桂基硫酸鹽、蘋果酸鹽、馬來酸鹽、丙二酸鹽、甲烷磺酸鹽、2-萘磺酸鹽、菸鹼酸鹽、硝酸鹽、油酸鹽、草酸鹽、棕櫚酸鹽、巴莫酸鹽(pamoate)、果膠酸鹽、過硫酸鹽、3-苯基丙酸鹽、磷酸鹽、新戊酸鹽、丙酸鹽、硬脂酸鹽、琥珀酸鹽、硫酸鹽、酒石酸鹽、硫氰酸鹽、對甲苯磺酸鹽、十一酸鹽、戊酸鹽及類似物。
衍生自適當鹼之鹽包括鹼金屬鹽、鹼土金屬鹽、銨鹽及N +(C 1–4脂族基) 4鹽。代表性的鹼金屬或鹼土金屬鹽包括鈉、鋰、鉀、鈣、鎂及類似物。適當時,其他醫藥學上可接受之鹽包括使用相對離子諸如鹵化物、氫氧化物、羧酸鹽、硫酸鹽、磷酸鹽、硝酸鹽、低級脂族磺酸鹽及芳基磺酸鹽形成的無毒銨、四級銨及胺陽離子。
除非另有說明,否則本文描述之結構亦意謂包括該結構之所有異構( 例如,鏡像異構、非鏡像異構及幾何(或構形))形式;例如,各不對稱中心之R及S組態、Z及E雙鍵異構物以及Z及E構形異構物。因此,本發明化合物之單一立體化學異構物以及鏡像異構、非鏡像異構及幾何(或構形)混合物均在本發明之範疇內。除非另有說明,否則本發明化合物之所有互變異構形式均在本發明之範疇內。此外,除非另有說明,否則本文描述的結構亦意謂包括僅在存在一或多個同位素富集原子的情況下不同之化合物。例如,具有本發明結構之化合物,包括用氘或氚置換氫,或用富含 13C或 14C之碳置換碳,都在本發明之範疇內。根據本發明,此類化合物可用作例如分析工具、生物檢定中之探針或治療劑。
除非另外指示,否則當D在某個位置具體列舉或在化學式中顯示時,此D表示氫及氘之混合物,其中氘的量為約100% ( ,氘之豐度範圍為至少90%直到100%)。在某些實施例中,D中氘之豐度為95%至100%,或97%至100%。氘( 2H)為 1H氫之一種穩定的非放射性同位素,原子量為2.014。氫以同位素 1H氫( 氕)、氘( 2H)及氚( 3H)之混合物形式天然存在。氘的天然豐度為0.015%。一般熟習此項技術者認識到,在所有具有H原子之化合物中,H原子實際上表示 1H氫、氘( 2H)及氚( 3H)之混合物,其中約0.015%為氘。
當揭示之化合物的立體化學藉由結構命名或描繪時,所命名或描繪之立體異構物相對於所有其他立體異構物為至少60重量%、70重量%、80重量%、90重量%、95重量%、99重量%、99.5重量%或99.9重量%純。相對於其他立體異構物之純重量百分比為一種立體異構物的重量與所有立體異構物的重量之比。當藉由結構命名或描繪單個鏡像異構物時,所描繪或命名之鏡像異構物為至少60%、70%、80%、90%、95%、99%、99.5%或99.9%光學純。光學純度百分比係藉由對掌性液相層析使用面積百分比來測定。
本文使用之術語「一」及「一個」意謂「一或多個」且包括複數,除非上下文不合適。
本發明之一或多種化合物可以與醫藥學上可接受之溶劑諸如水、乙醇及類似物以非溶劑化及溶劑化形式存在,且本發明意在包括溶劑化與非溶劑化形式兩者。「溶劑合物」意謂本發明之化合物與一或多種溶劑分子的物理締合。此物理締合涉及不同程度的離子鍵結及共價鍵結,包括氫鍵結。在某些情況下,溶劑合物將能夠分離,例如當一或多種溶劑分子併入結晶固體之晶格中時。「溶劑合物」涵蓋溶液相與可分離之溶劑合物兩者。合適的溶劑合物之非限制性實例包括乙醇化物、甲醇化物及類似物。「水合物」為一種溶劑合物,其中溶劑分子為H 2O。
如本文所用,術語「個體」及「患者」可互換使用且指待藉由本發明之方法治療的生物體。此類生物體較佳包括但不限於哺乳動物( 例如,鼠科動物、類人猿、馬科動物、牛科動物、豬科動物、犬科動物、貓科動物及類似物),且最佳包括人類。
術語「抑制(inhibit)」、「抑制(inhibition)」或「抑制(inhibiting)」包括生物活性或過程之基線活性的降低。
如本文所用,術語「有效量」係指將在個體中引起生物或醫學反應之化合物的量,例如,酶或蛋白質活性相對於治療前之基線水準降低或抑制。通常,化合物之「有效量」為足以實現一些有益變化或所需結果( 例如,治療、改善、抑制或預防結果)的量。有效量可以在一或多次投與、施藥或給藥中投與,且不旨在限於特定的調配或投與途徑。如本文所用,術語「治療」包括導致改善疾患、疾病、病症及類似物或改善其症狀的任何作用, 例如減輕、減少、調節、改善或消除。例如,治療癌症可能意謂延長腫瘤負荷不增加的時間段(無惡化存活期)、減輕腫瘤負荷、延長患者之總存活時間、改善與癌症相關之症狀、預防轉移、減緩轉移及類似作用。自體免疫疾病之治療包括減輕疾病症狀、延長疾病發作之間的時間、緩解疾病、預防疾病惡化及類似作用。神經疾病之治療可包括改善認知功能、降低認知喪失率、減輕症狀及類似作用。
在一些實施例中,治療係在一或多種症狀出現後投與。在一些實施例中,治療係在沒有症狀的情況下投與。例如,可以在症狀發作之前對易感個體投與治療(例如,根據症狀史及/或根據遺傳或其他易感因素)。症狀消失後亦可繼續治療,例如以預防或延緩其複發。
如本文所用,術語「醫藥組合物」係指活性劑與惰性或活性載劑、佐劑或媒劑之組合,使得該組合物尤其適用於 活體內離體診斷或治療用途。
如本文所用,術語「醫藥學上可接受之載劑、佐劑及/或媒劑」係指不破壞與其所調配之化合物之藥理活性的任何無毒載劑、佐劑及/或媒劑。用於本發明組合物之醫藥學上可接受之載劑、佐劑及/或媒劑包括但不限於離子交換劑、氧化鋁、硬脂酸鋁、卵磷脂、血清蛋白,諸如人類血清白蛋白,緩衝物質,諸如磷酸鹽、甘胺酸、山梨酸、山梨酸鉀、飽和植物脂肪酸之偏甘油酯混合物、水、鹽或電解質,諸如山梨酸鉀、磷酸氫二鈉、磷酸氫鉀、氯化鈉、鋅鹽、膠態二氧化矽、三矽酸鎂、聚乙烯吡咯啶酮、基於纖維素之物質、聚乙二醇、羧甲基纖維素鈉、聚丙烯酸酯、蠟、聚乙烯-聚氧丙烯-嵌段聚合物、乳液( 例如像油/水或水/油乳液)及各種潤濕劑。組合物亦可包括穩定劑及/或防腐劑。關於載劑、媒劑及佐劑之實例, 參見例如,Martin, Remington’s Pharmaceutical Sciences, 第15版, Mack Publ. Co., Easton, PA [1975]。
術語「組合」係指同時、分開或依次投與。在本揭示案之一個態樣中,「組合」係指同時投與。在本揭示案之另一態樣中,「組合」係指分開投與。在本揭示案之另一態樣中,「組合」係指依次投與。在單獨或依次投與的情況下,延遲投與一或多種額外治療劑以設計之間隔進行,以便不失去組合之有益效果。
在整個說明書中,當組合物係描述為具有、包括或包含特定組分,或過程及方法係描述為具有、包括或包含特定步驟時,考慮另外存在基本上由或由所述組分組成之本發明之組合物,且存在基本上由或由所述加工步驟組成之根據本發明之過程及方法。
如本文所用,術語「包含(comprising)」或「包含(comprises)」用於指代化合物、用途、組合物、方法及其各自的組分,此等組分對於方法或組合物為必需的,但可以包含未指定之的要素,無論是否必要。術語「由……組成」係指如本文所述之化合物、用途、組合物、方法及其各自的組分,不包括在該實施例之描述中未列舉的任何要素。術語「基本上由……組成」係指給定實施例所需之彼等要素。該術語允許存在不會實質性影響該實施例之基本及新穎功能特徵的要素。
一般而言,除非另外規定,否則指定百分比的組合物均按重量計。 I. 示例性化合物之描述
在第一個實施例中,本揭示案提供式I化合物: (I) 或其醫藥學上可接受之鹽,其中 B為 ; R 1為-H或 ; Alk每次出現時獨立地為C 2-C 6脂族基; R 2為-H、C 1-C 6脂族基、C 1-C 3鹵基脂族基、C 1-C 3羥烷基、環丙基、-CN、-N 3、-O-(C 1-C 3脂族基)、-F或-Cl; R 3為-H; R 4為-OH、-Cl、-OCH 3、-F、-N 3; R 5為-H或-F;且 R 6為-H、-F、-Cl、C 1-C 6脂族基、C 1-C 4鹵基脂族基、-O-(C 1-C 4脂族基)、環丙基或-OH。
在第二個實施例中,併入式I之R 1及R 4的選項中的Alk在每次出現時獨立地為乙基、丙基、異丙基、二級丁基、三級丁基或異丁基,其餘變量如上文針對於式I所述。
在第三個實施例中,式I中之R 1為-H或 ,且其餘變量如上文針對式I所述。
在第四個實施例中,式I中之R 1為-H,且其餘變量如上文針對式I或任何前述實施例所述。
在第五個實施例中,式I中之R 5為-H,且其餘變量如上文針對式I或任何前述實施例所述。
在第六個實施例中,式I中之R 2不為-H,且其餘變量如上文針對式I或任何前述實施例所述。
在第七個實施例中,式I中之R 4為-OH或 ,且其餘變量如上文針對式I或任何前述實施例所述。
在第八個實施例中,式I中之R 6為-H、-F、-CH 3、-CH 2CH 3、-OCH 3、-OCH 2CH 3、-CH=CH 2、-CH 2F或-CH 2Cl,且其餘變量如上文針對式I或任何前述實施例所述。
在第九個實施例中,式I中之R 6為-H或-F,且其餘變量如針對式I或以上實施例一至七中的任一者所述。
在第十個實施例中,式I中之R 6為-H,且其餘變量如針對式I或以上實施例一至七中的任一者所述。
在第十個實施例中,式I中之R 6為-F,且其餘變量如針對式I或以上實施例一至七中的任一者所述。
在第十二個實施例中,式I中之B為 ,且其餘變量如上文針對式I或任何前述實施例所述。
在另一實施例中,B為 。在此實施例之一個態樣中,B為 。在此實施例之另一態樣中,B為 。在此實施例之另一態樣中,B為 。在此實施例的又一態樣中,B為 。在此實施例之另一態樣中,B為 。在此實施例的一個態樣中,B為 。在第十二實施例之任何此等態樣中,式I之其餘變量如上文針對任何所揭示之實施例所述。
在第十三個實施例中,式I中之B為 ,且其餘變量如上文針對式I或任何前述實施例所述。在此實施例的一個態樣中,B為 。在此實施例之另一態樣中,B為 。在此實施例的又一態樣中,B為 。在第十三實施例之任何此等態樣中,式I之其餘變量如上文針對任何所揭示之實施例所述。
在第十四實施例中,式I之R 2為-CH 3、-CF 3、-N 3、-OCH 3、-CH 2Cl、-CH 2F、-CHF 2、-CHCl 2、-CHClF、-CH 2CH 3、-CH=CH 2、環丙基或-C≡CH,且其餘變量如上文針對式I或任何前述實施例所述。
在第十五實施例中,式I之R 2為-N 3、-CH 3、-CH 2Cl、-CH 2F、-CH=CH 2或-C≡CH,且其餘變量如上文針對式I或實施例一至十三中的任一者所述。在此實施例之一個態樣中,R 2為-N 3。在此實施例之另一態樣中,R 2為-CH=CH 2。在又一態樣中,R 2為-CH 2F。在此實施例之任何態樣中,其餘變量如上文針對式I或實施例一至十三中的任一者所述。
在第十六實施例中,式I之R 2為-CH 2Cl、-CH 2F或-C≡CH,且其餘變量如上文針對式I或實施例一至十三中的任一者所述。
在第十七實施例中,式I之R 2為-CH 2Cl或-C≡CH,且其餘變量如上文針對式I或實施例一至十三中的任一者所述。在此實施例之一個態樣中,R 2為-CH 2Cl。在此實施例之另一態樣中,R 2為-C≡CH。在此實施例之任何態樣中,其餘變量如上文針對式I或實施例一至十三中的任一者所述。
在第十八實施例中,在式I化合物中,R 4為-OH,R 5為-H,且R 6為-H,且其餘變量如上文實施例一、二、三、四、十二、十三、十四、十五、十六及十七中的任一者中所述。在此實施例之一個態樣中,式I之R 2為-CH 2Cl,且其餘變量如上文第一至第四實施例中所述。
在第十九實施例中,式I化合物選自表1: 1.
化合物編號 結構 名稱
1 (2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基-9H-嘌呤-9-基)-2-(羥甲基)-2-(丙-1-炔-1-基)四氫呋喃-3-醇
2 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
3 1-((2R,3S,4R)-3-氟基-4-羥基-5,5-雙(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
4 1-((2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
5 (2R,3R,4S,5R)-5-(6-胺基-2-氯基-9H-嘌呤-9-基)-2-乙炔基-4-氟基-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇
6 1-((2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-4-(羥胺基)嘧啶-2(1H)-酮
7 1-((2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-氟基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
8 (2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基-9H-嘌呤-9-基)-2-(氯甲基)-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇
9 1-((2R,3R,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
10 ((3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基-9H-嘌呤-9-基)-3-羥基 四氫呋喃-2,2-二基)二甲醇
11 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2(1H)-酮
12 4-胺基-1-((2R,3S,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)-3-甲基 四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
13 4-胺基-1-((2R,3S,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)-3-甲氧基 四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
14 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮
15 (2R,3S,5R)-5-(6-胺基-9H-嘌呤-9-基)-2-(氯甲基)-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇
16 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-環丙基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
17 4-胺基-1-((2R,3S,4S,5R)-5-(氯甲基)-3-乙炔基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
18 5-胺基-2-((2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-1,2,4-三嗪-3(2H)-酮
19 4-胺基-1-((2R,3S,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-3,5-二甲基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
20 4-胺基-1-((2R,3S,4S,5R)-3-乙炔基-4-羥基-5-(羥甲基)-5-甲基 四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
21 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-(三氟甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
22 4-胺基-5-氟基-1-((2R,4S,5R)-5-(氟甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
或其醫藥學上可接受之鹽。在一個態樣種,式I化合物選自表1中之化合物。
在第二十個實施例中,本揭示案提供本文表1、1-A或1-B中之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為本文表1、1-A或1-B中之化合物。在某些實施例中,化合物為本文表1或1-A中之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為本文表1或1-A中之化合物。在某些實施例中,化合物為以下表1-A中之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為以下表1-A中之化合物。在某些實施例中,化合物為以下表1-B中之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為以下表1-B中之化合物。
在某些實施例中,本揭示案提供本文表1、1-A、1-B或1-C中之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,本揭示案提供本文表1、1-A、1-B或1-C中之化合物。在某些實施例中,化合物為以下表1-C中之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為以下表1-C中之化合物。
在某些實施例中,本揭示案提供本文表1、1-A、1-B或1-C中之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中該化合物為式II、式III或式IV之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,本揭示案提供本文表1、1-A、1-B或1-C中之化合物,其中該化合物為式II、式III或式IV之化合物。在某些實施例中,本揭示案提供本文表1、1-A、1-B或1-C中之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中該化合物為式II之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,本揭示案提供本文表1、1-A、1-B或1-C中之化合物,其中該化合物為式II之化合物。在某些實施例中,本揭示案提供本文表1、1-A、1-B或1-C中之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中該化合物為式III之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,本揭示案提供本文表1、1-A、1-B或1-C中之化合物,其中該化合物為式III之化合物。在某些實施例中,本揭示案提供本文表1、1-A、1-B或1-C中之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中該化合物為式IV之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,本揭示案提供本文表1、1-A、1-B或1-C中之化合物,其中該化合物為式IV之化合物。
在某些實施例中,本揭示案提供本文表1、1-A、1-B或1-C中之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,本揭示案提供本文表1、1-A、1-B或1-C中之化合物。在某些實施例中,化合物為以下表1-C中之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為以下表1-C中之化合物。
在某些實施例中,本揭示案提供本文表1、1-A、1-B、1-C或1-D中之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中該化合物為式II、式III或式IV之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,本揭示案提供本文表1、1-A、1-B、1-C或1-D中之化合物,其中該化合物為式II、式III或式IV之化合物。在某些實施例中,本揭示案提供本文表1、1-A、1-B、1-C或1-D中之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中該化合物為式II之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,本揭示案提供本文表1、1-A、1-B、1-C或1-D中之化合物,其中該化合物為式II之化合物。在某些實施例中,本揭示案提供本文表1、1-A、1-B、1-C或1-D中之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中該化合物為式III之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,本揭示案提供本文表1、1-A、1-B、1-C或1-D中之化合物,其中該化合物為式III之化合物。在某些實施例中,本揭示案提供本文表1、1-A、1-B、1-C或1-D中之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中該化合物為式IV之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,本揭示案提供本文表1、1-A、1-B、1-C或1-D中之化合物,其中該化合物為式IV之化合物。 1-A.
化合物編號 結構 名稱
52 異丁酸(2R,3S,5R)-5-(4-胺基-2-側氧基嘧啶-1(2H)-基)-2-乙基-2-((異丁醯氧基)-甲基)四氫-呋喃-3-酯
53 異丁酸(2R,3S,5R)-5-(4-胺基-2-側氧基嘧啶-1(2H)-基)-2-((異丁醯氧基)甲基)-2-乙烯基四氫呋喃-3-酯
54 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)-4-甲氧基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
55 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-異丙基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
56       1-((2R,4S)-5-烯丙基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-4-胺基嘧啶-2(1H)-酮
57    4-胺基-1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-丙基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮 4-胺基-1-((2R,4S)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-丙基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
58 異丁酸(2R,3S,5R)-5-(4-胺基-5-氟基-2-側氧基嘧啶-1(2H)-基)-2-(氯甲基)-2-((異丁醯氧基)-甲基)四氫呋喃-3-酯
59 4-胺基-1-((2R,4R,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
60 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-丙基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
61 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-疊氮基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮
62 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-(2,2,2-三氟乙基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
63 2-胺基-9-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)-5-乙烯基四氫呋喃-2-基)-1,9-二氫-6H-嘌呤-6-酮
64 (2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基-9H-嘌呤-9-基)-2-乙基-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇
65 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-(二氟甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮
66 4-胺基-5-氟基-1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-(2,2,2-三氟乙基)-四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
67 4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)-四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮
68 2-胺基-9-((2R,3S,4R,5R)-5-乙基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-1,9-二氫-6H-嘌呤-6-酮
69 2-胺基-9-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-乙烯基四氫呋喃-2-基)-1,9-二氫-6H-嘌呤-6-酮
70 2-胺基-9-((2R,3S,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)-四氫呋喃-2-基)-1,9-二氫-6H-嘌呤-6-酮
71 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-(三氟甲基)-嘧啶-2(1H)-酮
72 4-胺基-5-氟基-1-((2R,3S,4S,5R)-5-(氟甲基)-3,4-二羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
73 4-胺基-1-((2R,3S,4S,5R)-5-(氯甲基)-3,4-二羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮
74 4-胺基-5-氟基-1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-乙烯基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
75 4-胺基-1-((2R,3S,4S,5R)-3,4-二羥基-5-(羥甲基)-5-乙烯基四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮
76 4-胺基-5-氟基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)-5-乙烯基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
77 4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-5-乙基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮
78 4-胺基-1-((2R,3S,4S,5R)-5-乙基-3,4-二羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮
79 (2R,3S,5R)-5-(4-胺基吡咯并[2,1-f][1,2,4]三嗪-7-基)-2-(氟甲基)-2-(羥甲基)-四氫呋喃-3-醇
80 (2R,3R,4S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基-9H-嘌呤-9-基)-4-氟基-2-(羥甲基)-2-乙烯基四氫呋喃-3-醇
81 (2R,3R,4S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基-9H-嘌呤-9-基)-2-乙基-4-氟基-2-(羥甲基)-四氫呋喃-3-醇
82 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-乙基-4-羥基-5-(羥甲基)-四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮
83 2-胺基-9-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(氟甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-1,9-二氫-6H-嘌呤-6-酮
84 (2R,3R,4S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基-9H-嘌呤-9-基)-4-氟基-2-(氟甲基)-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇
85 4-胺基-5-氟基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(氟甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
86 4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-5-(溴甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)-四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮
87 4-胺基-5-氟基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)-5-(丙-1,2-二烯-1-基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
88 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-(溴甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮
89 4-胺基-5-氟基-1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-(丙-1,2-二烯-1-基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
90 4-胺基-5-氟基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)-5-甲氧基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
91 4-胺基-5-氟基-1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-甲氧基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
92 (2R,3S,5R)-5-(4-胺基吡咯并[2,1-f][1,2,4]三嗪-7-基)-2-疊氮基-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇
93 2-胺基-9-((2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-1,9-二氫-6H-嘌呤-6-酮
94 2-胺基-9-((2R,3S,4S,5R)-5-(氯甲基)-3,4-二羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-1,9-二氫-6H-嘌呤-6-酮
95 4-胺基-1-((2R,3S,4S,5R)-3,4-二羥基-5-(羥甲基)-5-(三氟甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮
96 1-((2R,4S,5S)-4-疊氮基-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)-四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
97 4-胺基-5-氟基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)-5-(三氟甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
98 4-胺基-1-((2R,3S,4R,5S)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)-5-(三氟甲氧基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
99 4-胺基-1-((2R,3S,4S,5R)-5-乙基-3,4-二羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
100 4-胺基-1-((2R,4S,5S)-4-疊氮基-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
101 4-胺基-1-((2R,3S,4S,5R)-3,4-二羥基-5-(羥甲基)-5-乙烯基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
102 4-胺基-1-((2R,3S,4S,5R)-3,4-二羥基-5-(羥甲基)-5-(丙-1-炔-1-基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
103 4-胺基-1-((2R,4S,5S)-4-氯基-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
104 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-氟基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
105 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-(二氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
119 4-胺基-1-((2R,4R,5R)-5-(氯甲基)-3,3-二氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
1-B.
化合物 結構
2-TP
14-TP
25-TP
43-TP
44-TP
1-C.
化合物 結構
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
173
174
175
67-TP
1-D.
化合物編號 結構
86-TP
176
177
178
179
180
181
182
183
184
第二十二個實施例為一種醫藥組合物,其包含如以上任何實施例中所述的根據式I之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,以及載劑、賦形劑及/或媒劑。另一實施例為一種醫藥組合物,其包含如以上任何實施例中所述的化合物或其醫藥學上可接受之鹽,以及載劑、賦形劑及/或媒劑。另一實施例為一種醫藥組合物,其包含如本文任何實施例中所述的化合物或其醫藥學上可接受之鹽,以及載劑、賦形劑及/或媒劑。
任何以上實施例之一個態樣將表2之化合物自式I之化合物中排除。任何以上實施例之另一態樣將表2、2-A及2-B之化合物自式I之化合物中排除。
本發明在本文中進一步提供一種根據式I-A之化合物: (I-A) 或其醫藥學上可接受之鹽,其中: R 1A為-C(O)R 5A、氫或-P(O)(OH)-OP(O)(OH)-OP(O)(OH) 2; R 2A為(i)鹵甲基、C 1-3脂族基或環丙基,其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換,或(ii) -N 3; R 3A為-C(O)R 5A或氫; R 4A為鹵基、氫或-OH; R 5A每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基、C 1-20鹵基脂族基、-C(H)(R 6A)-N(R 7A) 2、苯基、-CH 2-苯基或氫;其中各苯基經m次出現之R 10A取代; R 6A為C 1-6烷基或氫,其中該C 1-6烷基視情況經苯基取代; R 7A每次出現時獨立地表示氫、C 1-6烷基、-C(O)CH 3、-C(O)OC(CH 3) 3、-C(O)O(CH 2)苯基或-C(O)O(CH 2)茀基; R 8A為氫、鹵基、-CH 3或-CF 3; R 9A為鹵基、-CH 3或-CF 3; R 10A每次出現時獨立地表示C 1-6烷基、C 1-6烷氧基、C 1-6鹵烷基或鹵基; B A;且 m為0、1或2; 條件為若R 4A為氫,則R 1A及R 3A中之至少一者為-C(O)R 5A;且 條件為若R 3A為氫,R 4A為鹵基或-OH,且R 1A為氫或-P(O)(OH)-OP(O)(OH)-OP(O)(OH) 2,則R 8A為鹵基、-CH 3或-CF 3
如上一般所述,R 1A為-C(O)R 5A、氫或-P(O)(OH)-OP(O)(OH)-OP(O)(OH) 2。在某些實施例中,R 1A為氫或-P(O)(OH)-OP(O)(OH)-OP(O)(OH) 2。在某些實施例中,R 1A為-C(O)R 5A或-P(O)(OH)-OP(O)(OH)-OP(O)(OH) 2。在某些實施例中,R 1A為-C(O)R 5A或氫。在某些實施例中,R 1A為-C(O)R 5A。在某些實施例中,R 1A為氫。在某些實施例中,R 1A為P(O)(OH)-OP(O)(OH)-OP(O)(OH) 2。在某些實施例中,R 1A選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中所描述之彼等。
如上一般所述,R 2A為(i)鹵甲基、C 1-3脂族基或環丙基,其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換,或(ii) -N 3。在某些實施例中,R 2A為鹵甲基。在某些實施例中,R 2A為C 1-3脂族基。在某些實施例中,R 2A為環丙基。在某些實施例中,R 2A為鹵甲基,其一或多個氫視情況經氘置換。在某些實施例中,R 2A為C 1-3脂族基,其一或多個氫視情況經氘置換。在某些實施例中,R 2A為環丙基,其一或多個氫視情況經氘置換。在某些實施例中,R 2A為-N 3。在某些實施例中,R 2A為鹵甲基、C 1-3脂族基或環丙基,其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換。
在某些實施例中,R 2A為-CH 2F、-CH 2Br或-CH 2Cl。在某些實施例中,R 2A為-CH 2F。在某些實施例中,R 2A為-CD 2F、-CD 2Br或-CD 2Cl。在某些實施例中,R 2A為-CD 2F。在某些實施例中,R 2A選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中所描述之彼等。
如上一般所述,R 3A為-C(O)R 5A或氫。在某些實施例中,R 3A為-C(O)R 5A。在某些實施例中,R 3A為氫。在某些實施例中,R 3A選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中所描述之彼等。
如上一般所述,R 4A為鹵基、氫或-OH。在某些實施例中,R 4A為鹵基。在某些實施例中,R 4A為氟基。在某些實施例中,R 4A為氫。在某些實施例中,R 4A為-OH。在某些實施例中,R 1A選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中所描述之彼等。
如上一般所述,R 5A每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基、C 1-20鹵基脂族基、-C(H)(R 6A)-N(R 7A) 2、苯基、-CH 2-苯基或氫;其中各苯基經m次出現之R 10A取代。在某些實施例中,R 5A每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基、C 1-20鹵基脂族基、-C(H)(R 6A)-N(R 7A) 2、苯基或-CH 2-苯基;其中各苯基經m次出現之R 10A取代。在某些實施例中,R 5A每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基。在某些實施例中,R 5A每次出現時獨立地表示C 1-20鹵基脂族基。在某些實施例中,R 5A每次出現時獨立地表示-C(H)(R 6A)-N(R 7A) 2。在某些實施例中,R 5A每次出現時獨立地表示苯基,其中各苯基經m次出現之R 10A取代。在某些實施例中,R 5A每次出現時獨立地表示-CH 2-苯基,其中各苯基經m次出現之R 10A取代。在某些實施例中,R 5A為氫。在某些實施例中,R 5A為C 1-20脂族基。在某些實施例中,R 5A為C 1-20鹵基脂族基。在某些實施例中,R 5A為-C(H)(R 6A)-N(R 7A) 2。在某些實施例中,R 5A為苯基,其中各苯基經m次出現之R 10A取代。在某些實施例中,R 5A為-CH 2-苯基,其中各苯基經m次出現之R 10A取代。在某些實施例中,R 5A選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中所描述之彼等。
如上一般所述,R 6A為C 1-6烷基或氫,其中該C 1-6烷基視情況經苯基取代。在某些實施例中,R 6A為C 1-6烷基,其中該C 1-6烷基視情況經苯基取代。在某些實施例中,R 6A為氫。在某些實施例中,R 6A為C 1-6烷基。在某些實施例中,R 6A選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中所描述之彼等。
如上一般所述,R 7A每次出現時獨立地表示氫、C 1-6烷基、-C(O)CH 3、-C(O)OC(CH 3) 3、-C(O)O(CH 2)苯基或-C(O)O(CH 2)茀基。在某些實施例中,R 7A每次出現時獨立地表示C 1-6烷基。在某些實施例中,R 7A為氫。在某些實施例中,R 7A為C 1-6烷基。在某些實施例中,R 7A為-C(O)CH 3。在某些實施例中,R 7A為-C(O)O(CH 2)苯基。在某些實施例中,R 7A為-C(O)O(CH 2)茀基。在某些實施例中,R 7A每次出現時獨立地表示C 1-6烷基、-C(O)CH 3、-C(O)OC(CH 3) 3、-C(O)O(CH 2)苯基或-C(O)O(CH 2)茀基。在某些實施例中,R 7A選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中所描述之彼等。
如上一般所述,R 8A為氫、鹵基、-CH 3或-CF 3。在某些實施例中,R 8A為氫、鹵基、-CH 3或-CF 3。在某些實施例中,R 8A為鹵基、-CH 3或-CF 3。在某些實施例中,R 8A為氫,-CH 3或-CF 3。在某些實施例中,R 8A為氫、鹵基或-CF 3。在某些實施例中,R 8A為氫、鹵基或-CH 3。在某些實施例中,R 8A為氫。在某些實施例中,R 8A為鹵基。在某些實施例中,R 8A為氟基。在某些實施例中,R 8A為-CH 3。在某些實施例中,R 8A為-CF 3。在某些實施例中,R 8A選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中所描述之彼等。
如上一般所述,R 9A為鹵基、-CH 3或-CF 3。在某些實施例中,R 9A為鹵基 在某些實施例中,R 9A為-CH 3。在某些實施例中,R 9A為-CF 3。在某些實施例中,R 9A為F、Br或Cl。在某些實施例中,R 9A選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中所描述之彼等。
如上一般所述,R 10A每次出現時獨立地表示C 1-6烷基、C 1-6烷氧基、C 1-6鹵烷基或鹵基。在某些實施例中,R 10A每次出現時獨立地表示C 1-6烷基。在某些實施例中,R 10A每次出現時獨立地表示C 1-6烷氧基。在某些實施例中,R 10A每次出現時獨立地表示C 1-6鹵烷基。在某些實施例中,R 10A每次出現時獨立地表示鹵基。在某些實施例中,R 10A為C 1-6烷基、C 1-6烷氧基、C 1-6鹵烷基或鹵基。在某些實施例中,R 10A選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中所描述之彼等。
如上一般所述,B A。在某些實施例中,B A。在某些實施例中,B A。在某些實施例中,B A選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中所描述之彼等。
如上一般定義,m為0、1或2。在某些實施例中,m為0。在某些實施例中,m為1。在某些實施例中,m為2。在某些實施例中,m為1或2。在某些實施例中,m為0或2。在某些實施例中,m為0或2。在某些實施例中,m選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中描述之彼等。
在某些實施例中,式II化合物具有下式或其醫藥學上可接受之鹽:
本揭示案之另一態樣提供一種由式II表示之化合物: (II) 或其醫藥學上可接受之鹽;其中: R 1及R 4獨立地表示-C(O)R 5或氫;條件為R 1及R 4中的至少一者為-C(O)R 5; R 2為鹵基、氫或-OH; R 3為鹵甲基、C 1-3脂族基或環丙基,其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換; R 5每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基、C 1-20鹵基脂族基、-C(H)(R 6)-N(R 7) 2、苯基、-CH 2-苯基或氫;其中各苯基經m次出現之R 10取代; R 6為C 1-6烷基或氫,其中該C 1-6烷基視情況經苯基取代; R 7每次出現時獨立地表示氫、C 1-6烷基、-C(O)CH 3、-C(O)OC(CH 3) 3、-C(O)O(CH 2)苯基或-C(O)O(CH 2)茀基; R 8為氫、鹵基、-CH 3或-CF 3; R 9為鹵基、-CH 3或-CF 3; R 10每次出現時獨立地表示C 1-6烷基、C 1-6烷氧基、C 1-6鹵烷基或鹵基; B 1;且 m為0、1或2。
以上式II中變量之定義涵蓋多個化學基團。本申請案考慮如下實施例,其中例如,i)變量之定義係選自上述彼等化學基團之單個化學基團,ii)變量之定義係選自上述彼等化學基團之兩個或更多個化學基團的集合,及iii)化合物由變量之組合定義,其中變量由(i)或(ii)定義。
在某些實施例中,化合物為式II之化合物。
如上一般所定義,R 1及R 4獨立地表示-C(O)R 5或氫;限制條件為R 1及R 4中之至少一者為-C(O)R 5
在一些實施例中,R 1為-C(O)R 5,且R 4為氫。在一些實施例中,R 1為氫,且R 4為C(O)R 5。在一些實施例中,R 1及R 4獨立地表示-C(O)R 5。在一些實施例中,R 1及R 4為-C(O)R 5
如上一般所定義,R 2為鹵基、氫或-OH。在某些實施例中,R 2為氟基、氫或-OH。在一些實施例中,R 2為鹵基或氫。在一些實施例中,R 2為氟基或氫。在一些實施例中,R 2為氫或-OH。在一些實施例中,R 2為鹵基或-OH。在一些實施例中,R 2為氟基或-OH。
在一些實施例中,R 2為鹵基。在某些實施例中,R 2為氟基。在一些實施例中,R 2為氫。在一些實施例中,R 2為-OH。
如上一般所定義,R 3為鹵甲基、C 1-3脂族基或環丙基,其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換。在某些實施例中,R 3為鹵甲基或C 1-3脂族基,其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換。
在某些實施例中,R 3為鹵甲基、C 1-3脂族基或環丙基,其中之每一者的一或多個氫經氘置換。在某些實施例中,R 3為鹵甲基或C 1-3脂族基,其中之每一者的一或多個氫經氘置換。
在某些實施例中,R 3為鹵甲基、C 1-3脂族基或環丙基。在一些實施例中,R 3為鹵甲基或C 1-3脂族基。在一些實施例中,R 3為鹵甲基或環丙基。在一些實施例中,R 3為C 1-3脂族基或環丙基。在一些實施例中,R 3為乙基或環丙基。
在一些實施例中,R 3為鹵甲基,其一或多個氫視情況經氘置換。在一些實施例中,R 3為鹵甲基。在一些實施例中,R 3為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br、-CH 2I、-CHF 2或-CF 3。在一些實施例中,R 3為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br、-CH 2I或-CF 3。在一些實施例中,R 3為-CH 2F、-CH 2Br、-CH 2I或-CF 3。在一些實施例中,R 3為-CH 2Cl、-CH 2Br、-CH 2I或-CF 3。在一些實施例中,R 3為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2I或-CF 3。在一些實施例中,R 3為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br或-CF 3。在一些實施例中,R 3為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br或-CH 2I。
在一些實施例中,R 3為-CH 2Br、-CH 2I或-CF 3。在一些實施例中,R 3為-CH 2Cl、-CH 2I或-CF 3。在一些實施例中,R 3為-CH 2Cl、-CH 2F或-CF 3。在一些實施例中,R 3為-CH 2Cl、-CH 2F或-CH 2Br。在一些實施例中,R 3為-CH 2F、-CH 2I或-CF 3。在一些實施例中,R 3為-CH 2F、-CH 2Br或-CF 3。在一些實施例中,R 3為-CH 2F、-CH 2Br或-CH 2I。在一些實施例中,R 3為-CH 2Cl、-CH 2Br或-CF 3。在一些實施例中,R 3為-CH 2Cl、-CH 2Br或-CH 2I。在一些實施例中,R 3為-CH 2Cl、-CH 2F或-CH 2I。在一些實施例中,R 3為-CH 2F、-CHF 2或-CF 3
在一些實施例中,R 3為-CH 2I或-CF 3。在一些實施例中,R 3為-CH 2Cl或-CH 2F。在一些實施例中,R 3為-CH 2Cl或-CF 3。在一些實施例中,R 3為-CH 2F或-CH 2I。在一些實施例中,R 3為-CH 2Cl或-CH 2Br。在一些實施例中,R 3為-CH 2Br或-CH 2I。在一些實施例中,R 3為-CH 2Br或-CF 3。在一些實施例中,R 3為-CH 2Cl或-CH 2I。在一些實施例中,R 3為-CH 2F或-CF 3。在一些實施例中,R 3為-CH 2F或-CH 2Br。在一些實施例中,R 3為-CH 2F或-CHF 2。在一些實施例中,R 3為-CHF 2或-CF 3
在一些實施例中,R 3為-CH 2Cl。在一些實施例中,R 3為-CH 2F。在一些實施例中,R 3為-CH 2Br。在一些實施例中,R 3為-CH 2I。在一些實施例中,R 3為-CHF 2。在一些實施例中,R 3為-CF 3
在一些實施例中,R 3為鹵甲基,其一或多個氫經氘置換。在一些實施例中,R 3為-CD 2Cl、-CD 2F、-CD 2Br、-CD 2I或-CDF 2。在一些實施例中,R 3為-CD 2Cl或-CD 2F。在一些實施例中,R 3為-CD 2Cl。在一些實施例中,R 3為-CD 2F。在一些實施例中,R 3為-CD 2Br。在一些實施例中,R 3為-CD 2I。在一些實施例中,R 3為-CDF 2
在一些實施例中,R 3為C 1-3脂族基,其一或多個氫視情況經氘置換。在一些實施例中,R 3為C 1-3脂族基,其一或多個氫經氘置換。在一些實施例中,R 3為C 1-3脂族基。在一些實施例中,R 3為C 2-3脂族基。在一些實施例中,R 3為C 1-2脂族基。在一些實施例中,R 3為C 1-3烷基。在一些實施例中,R 3為C 2-3烷基。在一些實施例中,R 3為C 1-2烷基。在一些實施例中,R 3為-CH 2CH 3、-C(H)=CH 2或-C(H)=C=CH 2。在一些實施例中,R 3為-CH 2CH 3。在一些實施例中,R 3為-C(H)=CH 2。在一些實施例中,R 3為-C(H)=C=CH 2
在一些實施例中,R 3為環丙基,其一或多個氫視情況經氘置換。在一些實施例中,R 3為環丙基,其一或多個氫經氘置換。在一些實施例中,R 3為環丙基。
如上一般所定義,R 5每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基、C 1-20鹵基脂族基、-C(H)(R 6)-N(R 7) 2、苯基、-CH 2-苯基或氫;其中各苯基經m次出現之R 10取代。
在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基、C 1-20鹵基脂族基、苯基或氫;其中該苯基經m次出現之R 10取代。在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基、C 1-20鹵基脂族基或氫。在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示-C(H)(R 6)-N(R 7) 2、苯基或-CH 2-苯基;其中各苯基經m次出現之R 10取代。在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示-C(H)(R 6)-N(R 7) 2或經m次出現之R 10取代之苯基。
在某些實施例中,R 5為C 1-20脂族基、C 1-20鹵基脂族基、苯基或氫;其中該苯基經m次出現之R 10取代。在某些實施例中,R 5為C 1-20脂族基、C 1-20鹵基脂族基或氫。在某些實施例中,R 5為-C(H)(R 6)-N(R 7) 2、苯基或-CH 2-苯基;其中各苯基經m次出現之R 10取代。在某些實施例中,R 5為苯基或-CH 2-苯基;其中各苯基經m次出現之R 10取代。在某些實施例中,R 5為-C(H)(R 6)-N(R 7) 2或經m次出現之R 10取代之苯基。
在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基或C 1-20鹵基脂族基。在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示C 1-8脂族基或C 1-8鹵基脂族基。在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示C 10-20脂族基或C 10-20鹵基脂族基。在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示C 1-20烷基或C 1-20鹵烷基。在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示C 1-8烷基或C 1-8鹵烷基。在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示C 10-20烷基或C 10-20鹵烷基。
在某些實施例中,R 5為C 1-20脂族基或C 1-20鹵基脂族基。在某些實施例中,R 5為C 1-8脂族基或C 1-8鹵基脂族基。在某些實施例中,R 5為C 10-20脂族基或C 10-20鹵基脂族基。在某些實施例中,R 5為C 1-20烷基或C 1-20鹵烷基。在某些實施例中,R 5為C 1-8烷基或C 1-8鹵烷基。在某些實施例中,R 5為C 10-20烷基或C 10-20鹵烷基。
在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基。在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示C 1-8脂族基。在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示C 10-20脂族基。在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示C 1-20烷基。在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示C 1-8烷基。在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示C 10-20烷基。
在某些實施例中,R 5為C 1-20脂族基。在某些實施例中,R 5為C 1-8脂族基。在某些實施例中,R 5為C 10-20脂族基。在某些實施例中,R 5為C 1-20烷基。在某些實施例中,R 5為C 1-8烷基。在某些實施例中,R 5為C 1-5烷基。在某些實施例中,R 5為C 10-20烷基。
在一些實施例中,R 5為-CH 3、-CH 2CH 3、-CH(CH 3) 2、-C(H)=CH 2、-CH 2C(H)=CH 2、-C≡CH、-(CH 2) 3CH 3、-(CH 2) 3C(H)=CH 2、-(CH 2) 6C(H)=CH 2、-(CH 2) 3C≡CH、-(CH 2) 6C≡CH或環丙基。在一些實施例中,R 5為-CH 3、-CH 2CH 3、-CH(CH 3) 2、-C(H)=CH 2、-CH 2C(H)=CH 2或-C≡CH。在一些實施例中,R 5為-CH 3、-CH 2CH 3或-CH(CH 3) 2。在一些實施例中,R 5為-C(H)=CH 2、-CH 2C(H)=CH 2或-C≡CH。在一些實施例中,R 5為-CH 3。在一些實施例中,R 5為-CH 2CH 3。在一些實施例中,R 3為-CH(CH 3) 2。在一些實施例中,R 5為-C(H)=CH 2。在一些實施例中,R 5為-CH 2C(H)=CH 2。在一些實施例中,R 5為-C≡CH。在一些實施例中,R 5為-(CH 2) 3CH 3。在一些實施例中,R 5為-(CH 2) 3C(H)=CH 2。在一些實施例中,R 5為-(CH 2) 6C(H)=CH 2。在一些實施例中,R 5為-(CH 2) 3C≡CH。在一些實施例中,R 5為-(CH 2) 6C≡CH。在一些實施例中,R 5為環丙基。
在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示C 1-20鹵基脂族基。在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示C 1-8鹵基脂族基。在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示C 10-20鹵基脂族基。在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示C 1-20鹵烷基。在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示C 1-8鹵烷基。在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示C 10-20鹵烷基。
在某些實施例中,R 5為C 1-20鹵基脂族基。在某些實施例中,R 5為C 1-8鹵基脂族基。在某些實施例中,R 5為C 10-20鹵基脂族基。在某些實施例中,R 5為C 1-20鹵烷基。在某些實施例中,R 5為C 1-8鹵烷基。在某些實施例中,R 5為C 10-20鹵烷基。
在一些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示-C(H)(R 6)-N(R 7) 2。在一些實施例中,R 5為-C(H)(R 6)-N(R 7) 2。在一些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示 。在一些實施例中,R 5。在一些實施例中,R 5。在一些實施例中,R 5。在一些實施例中,R 5。在一些實施例中,R 5
在一些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示 。在一些實施例中,R 5。在一些實施例中,R 5。在一些實施例中,R 5。在一些實施例中,R 5。在一些實施例中,R 5
在一些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示經m次出現之R 10取代之苯基。在一些實施例中,R 5為經m次出現之R 10取代之苯基。在一些實施例中,R 5為苯基。
在一些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示-CH 2-苯基,其中該苯基經m次出現之R 10取代。在一些實施例中,R 5為-CH 2-苯基,其中該苯基經m次出現之R 10取代。在一些實施例中,R 5為-CH 2-苯基。
在一些實施例中,R 5為氫。
如上一般所定義,R 6為C 1-6烷基或氫,其中該C 1-6烷基視情況經苯基取代。在某些實施例中,R 6為甲基、異丙基、苄基或氫。在某些實施例中,R 6為視情況經苯基取代之C 1-6烷基。在某些實施例中,R 6為C 1-6烷基。在某些實施例中,R 6為C 1-4烷基。在某些實施例中,R 6為C 2-6烷基。在某些實施例中,R 6為經苯基取代之C 1-6烷基。在某些實施例中,R 6為氫。
如上一般所定義,R 7每次出現時獨立地表示氫、C 1-6烷基、-C(O)CH 3、-C(O)OC(CH 3) 3、-C(O)O(CH 2)苯基或-C(O)O(CH 2)茀基。
在某些實施例中,一次出現之R 7為氫或C 1-6烷基,且另一次出現之R 7為氫,C 1-6烷基、-C(O)CH 3、-C(O)OC(CH 3) 3、-C(O)O(CH 2)苯基或-C(O)O(CH 2)茀基。在某些實施例中,一次出現之R 7為氫或C 1-6烷基,且另一次出現之R 7為-C(O)CH 3、-C(O)OC(CH 3) 3、-C(O)O(CH 2)苯基或-C(O)O(CH 2)茀基。
在某些實施例中,一次出現之R 7為氫,且另一次出現之R 7為氫,C 1-6烷基、-C(O)CH 3、-C(O)OC(CH 3) 3、-C(O)O(CH 2)苯基或-C(O)O(CH 2)茀基。在某些實施例中,一次出現之R 7為氫,且另一次出現之R 7為-C(O)CH 3、-C(O)OC(CH 3) 3、-C(O)O(CH 2)苯基或-C(O)O(CH 2)茀基。
在某些實施例中,R 7每次出現時獨立地表示氫或C 1-6烷基。在某些實施例中,R 7為氫。在某些實施例中,R 7每次出現時獨立地表示C 1-6烷基。
如上一般所定義,R 8為氫、鹵基、-CH 3或-CF 3。在某些實施例中,R 8為氫或鹵基。在某些實施例中,R 8為氫或氟基。在某些實施例中,R 8為鹵基或-CF 3。在某些實施例中,R 8為氟基或-CF 3。在某些實施例中,R 8為-CH 3或-CF 3。在某些實施例中,R 8為氫。在某些實施例中,R 8為鹵基。在某些實施例中,R 8為氟基。在某些實施例中,R 8為-CH 3。在某些實施例中,R 8為-CF 3
如上一般所定義,R 9為鹵基、-CH 3或-CF 3。在某些實施例中,R 9為鹵基或-CF 3。在某些實施例中,R 9為氟基或-CF 3。在某些實施例中,R 9為-CH 3或-CF 3。在某些實施例中,R 9為鹵基。在某些實施例中,R 9為氟基。在某些實施例中,R 9為-CH 3。在某些實施例中,R 9為-CF 3
如上一般所定義,R 10每次出現時獨立地表示C 1-6烷基、C 1-6烷氧基、C 1-6鹵烷基或鹵基。在某些實施例中,R 10每次出現時獨立地表示-CH 3、-OCH 3、-CF 3或鹵基。
在某些實施例中,R 10每次出現時獨立地表示C 1-6烷基。在某些實施例中,R 10為-CH 3。在某些實施例中,R 10每次出現時獨立地表示C 1-6烷氧基。在某些實施例中,R 10為-OCH 3。在某些實施例中,R 10每次出現時獨立地表示C 1-6鹵烷基。在某些實施例中,R 10為-CF 3。在某些實施例中,R 10每次出現時獨立地表示鹵基。
如上一般所定義,B 1。在一些實施例中,B 1。在一些實施例中,B 1
如上一般所定義,m為0、1或2。在某些實施例中,m為0。在某些實施例中,m為1。在某些實施例中,m為2。在某些實施例中,m為0或1。在某些實施例中,m為1或2。
以上描述描述了與式II化合物有關之多個實施例。該專利申請案特別考慮了實施例之所有組合。
本揭示案之另一態樣提供由式II-A表示之化合物: (II-A) 或其醫藥學上可接受之鹽;其中: R 1及R 4為-C(O)R 5; R 3為鹵甲基; R 5每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基、C 1-20鹵基脂族基、-C(H)(R 6)-N(R 7) 2、苯基或-CH 2-苯基;其中各苯基經m次出現之R 10取代; R 6為C 1-6烷基或氫,其中該C 1-6烷基視情況經苯基取代; R 7每次出現時獨立地表示氫、C 1-6烷基、-C(O)CH 3、-C(O)OC(CH 3) 3、-C(O)O(CH 2)苯基或-C(O)O(CH 2)茀基; R 8為鹵基或-CF 3; R 10每次出現時獨立地表示C 1-6烷基、C 1-6烷氧基、C 1-6鹵烷基或鹵基;且 m為0、1或2。
如上一般所述,R 1及R 4為-C(O)R 5。在某些實施例中,R 1及R 4選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中所描述之彼等。
如上一般所述,R 3為鹵甲基。在某些實施例中,R 3為-CH 2Cl或-CH 2F。在某些實施例中,R 3為-CH 2Cl。在某些實施例中,R 3選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中所描述之彼等。
如上一般所述,R 5每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基、C 1-20鹵基脂族基、-C(H)(R 6A)-N(R 7A) 2、苯基、-CH 2-苯基或氫;其中各苯基經m次出現之R 10A取代。在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基、C 1-20鹵基脂族基、-C(H)(R 6A)-N(R 7A) 2、苯基或-CH 2-苯基;其中各苯基經m次出現之R 10A取代。在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基。在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示C 1-20鹵基脂族基。在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示-C(H)(R 6A)-N(R 7A) 2。在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示苯基,其中各苯基經m次出現之R 10A取代。在某些實施例中,R 5每次出現時獨立地表示-CH 2-苯基,其中各苯基經m次出現之R 10A取代。在某些實施例中,R 5為氫。在某些實施例中,R 5為C 1-20脂族基。在某些實施例中,R 5為C 1-20鹵基脂族基。在某些實施例中,R 5為-C(H)(R 6A)-N(R 7A) 2。在某些實施例中,R 5為苯基,其中各苯基經m次出現之R 10A取代。在某些實施例中,R 5為-CH 2-苯基,其中各苯基經m次出現之R 10A取代。在某些實施例中,R 5選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中所描述之彼等。
如上一般所述,R 6為C 1-6烷基或氫,其中該C 1-6烷基視情況經苯基取代。在某些實施例中,R 6為C 1-6烷基,其中該C 1-6烷基視情況經苯基取代。在某些實施例中,R 6為氫。在某些實施例中,R 6為C 1-6烷基。在某些實施例中,R 6選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中所描述之彼等。
如上一般所述,R 7每次出現時獨立地表示氫、C 1-6烷基、-C(O)CH 3、-C(O)OC(CH 3) 3、-C(O)O(CH 2)苯基或-C(O)O(CH 2)茀基。在某些實施例中,R 7每次出現時獨立地表示C 1-6烷基。在某些實施例中,R 7為氫。在某些實施例中,R 7為C 1-6烷基。在某些實施例中,R 7為-C(O)CH 3。在某些實施例中,R 7為-C(O)O(CH 2)苯基。在某些實施例中,R 7為-C(O)O(CH 2)茀基。在某些實施例中,R 7每次出現時獨立地表示C 1-6烷基、-C(O)CH 3、-C(O)OC(CH 3) 3、-C(O)O(CH 2)苯基或-C(O)O(CH 2)茀基。在某些實施例中,R 7選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中所描述之彼等。
如上一般所述,R 8為鹵基或-CF 3。在某些實施例中,R 8為鹵基。在某些實施例中,R 8為氟基。在某些實施例中,R 8為-CF 3。在某些實施例中,R 8選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中所描述之彼等。
如上一般所述,R 10每次出現時獨立地表示C 1-6烷基、C 1-6烷氧基、C 1-6鹵烷基或鹵基。在某些實施例中,R 10每次出現時獨立地表示C 1-6烷基。在某些實施例中,R 10每次出現時獨立地表示C 1-6烷氧基。在某些實施例中,R 10每次出現時獨立地表示C 1-6鹵烷基。在某些實施例中,R 10每次出現時獨立地表示鹵基。在某些實施例中,R 10為C 1-6烷基、C 1-6烷氧基、C 1-6鹵烷基或鹵基。在某些實施例中,R 10選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中所描述之彼等。
如上一般定義,m為0、1或2。在某些實施例中,m為0。在某些實施例中,m為1。在某些實施例中,m為2。在某些實施例中,m為1或2。在某些實施例中,m為0或2。在某些實施例中,m為0或2。在某些實施例中,m選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中描述之彼等。
本揭示案之另一態樣提供一種由式III表示之化合物: (III) 或其醫藥學上可接受之鹽;其中: R 1為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br、-CH 2I、-CF 3、-CH 2CH 3、-C(H)=CH 2、-C(H)=C=CH 2或環丙基;其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換; R 2為氟基或-OH; R 3為鹵基、-CH 3或-CF 3;且 B 1
以上式III中變量之定義涵蓋多個化學基團。本申請案考慮如下實施例,其中例如,i)變量之定義係選自上述彼等化學基團之單個化學基團,ii)變量之定義係選自上述彼等化學基團之兩個或更多個化學基團的集合,及iii)化合物由變量之組合定義,其中變量由(i)或(ii)定義。
在某些實施例中,化合物為式III之化合物。
如上一般所定義,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br、-CH 2I、-CF 3、-CH 2CH 3、-C(H)=CH 2、-C(H)=C=CH 2或環丙基,其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br、-CH 2I、-CH 2CH 3、-C(H)=CH 2、-C(H)=C=CH 2或環丙基,其中之每一者的一或多個氫經氘置換。
在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br、-CH 2I、-CF 3、-CH 2CH 3、-C(H)=CH 2、-C(H)=C=CH 2或環丙基。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br、-CH 2I或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2CH 3、-C(H)=CH 2、-C(H)=C=CH 2或環丙基。
在一些實施例中,R 1為-CH 2F、-CH 2Br、-CH 2I或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2Br、-CH 2I或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2I或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br或-CH 2I。
在一些實施例中,R 1為-CH 2Br、-CH 2I或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2I或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F或-CH 2Br。在一些實施例中,R 1為-CH 2F、-CH 2I或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2F、-CH 2Br或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2F、-CH 2Br或-CH 2I。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2Br或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2Br或-CH 2I。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F或-CH 2I。
在一些實施例中,R 1為-CH 2I或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl或-CH 2F。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2F或-CH 2I。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl或-CH 2Br。在一些實施例中,R 1為-CH 2Br或-CH 2I。在一些實施例中,R 1為-CH 2Br或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl或-CH 2I。在一些實施例中,R 1為-CH 2F或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2F或-CH 2Br。
在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl。在一些實施例中,R 1為-CH 2F。在一些實施例中,R 1為-CH 2Br。在一些實施例中,R 1為-CH 2I。在一些實施例中,R 1為-CF 3
在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br、-CH 2I或-CF 3,其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br或-CH 2I,其中之每一者的一或多個氫經氘置換。在一些實施例中,R 1為-CD 2Cl、-CD 2F、-CD 2Br或-CD 2I。在一些實施例中,R 1為-CD 2Cl或-CD 2F。在一些實施例中,R 1為-CD 2Cl。在一些實施例中,R 1為-CD 2F。在一些實施例中,R 1為-CD 2Br。在一些實施例中,R 1為-CD 2I。
在一些實施例中,R 1為-CH 2CH 3、-C(H)=CH 2或-C(H)=C=CH 2。在一些實施例中,R 1為-CH 2CH 3或環丙基。在一些實施例中,R 1為-C(H)=CH 2、-C(H)=C=CH 2或環丙基。在一些實施例中,R 1為-C(H)=CH 2或-C(H)=C=CH 2。在一些實施例中,R 1為-CH 2CH 3。在一些實施例中,R 1為-C(H)=CH 2。在一些實施例中,R 1為-C(H)=C=CH 2。在一些實施例中,R 1為環丙基。
在一些實施例中,R 1為-CH 2CH 3、-C(H)=CH 2、-C(H)=C=CH 2或環丙基,其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換。在一些實施例中,R 1為-CH 2CH 3、-C(H)=CH 2、-C(H)=C=CH 2或環丙基,其中之每一者的一或多個氫經氘置換。在一些實施例中,R 1為-CH 2CH 3,其一或多個氫經氘置換。在一些實施例中,R 1為-C(H)=CH 2,其一或多個氫經氘置換。在一些實施例中,R 1為-C(H)=C=CH 2,其一或多個氫經氘置換。在一些實施例中,R 1為環丙基,其一或多個氫經氘置換。
如上一般所定義,R 2為氟基或-OH。在一些實施例中,R 2為氟基。在一些實施例中,R 2為-OH。
如上一般所定義,R 3為鹵基、-CH 3或-CF 3。在一些實施例中,R 3為氟基、氯基、-CH 3或-CF 3。在一些實施例中,R 3為氟基、-CH 3或-CF 3
在一些實施例中,R 3為-CH 3或-CF 3。在一些實施例中,R 3為鹵基或-CF 3。在一些實施例中,R 3為鹵基或-CH 3
在一些實施例中,R 3為鹵基。在一些實施例中,R 3為氟基或氯基。在一些實施例中,R 3為氟基。在一些實施例中,R 3為氯基。在一些實施例中,R 3為溴基。在一些實施例中,R 3為碘基。
在一些實施例中,R 3為-CH 3 在一些實施例中,R 3為-CF 3
如上一般所定義,B 1。在一些實施例中,B 1。在一些實施例中,B 1
以上描述描述了與式III化合物有關之多個實施例。該專利申請案特別考慮了實施例之所有組合。
本發明進一步提供由式III-A表示之化合物: (III-A) 或其醫藥學上可接受之鹽;其中: R 1為-CH 2Cl、-CH 2Br或-CH 2F;其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換;且 R 3為鹵基或-CF 3
在某些實施例中,化合物為式III-A之化合物。
如上一般所述,R 1為-CH 2Cl、-CH 2Br或-CH 2F;其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換。在某些實施例中,R 1為-CH 2Cl。在某些實施例中,R 1為-CH 2Br。在某些實施例中,R 1為-CH 2F。在某些實施例中,R 1為-CH 2Cl或-CH 2F。在某些實施例中,R 1選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中所描述之彼等。
如上一般所述,R 3為鹵基或-CF 3。在某些實施例中,R 3為鹵基。在某些實施例中,R 3為-CF 3。在某些實施例中,R 3為Cl、Br或F。在某些實施例中,R 3為F。在某些實施例中,R 3選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中所描述之彼等。
本發明進一步提供由式III-B表示之化合物: (III-B) 或其醫藥學上可接受之鹽;其中: R 1為-N 3;且 R 3為鹵基或-CF 3
在某些實施例中,化合物為式III-B之化合物。
如上一般所述,R 1為-N 3。在某些實施例中,R 1選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中所描述之彼等。
如上一般所述,R 3為鹵基或-CF 3。在某些實施例中,R 3為鹵基。在某些實施例中,R 3為-CF 3 在某些實施例中,R 3為 Cl、Br或F。在某些實施例中,R 3為F。在某些實施例中,R 3選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中所描述之彼等。
本揭示案之另一態樣提供一種由式IV表示之化合物: (IV) 或其醫藥學上可接受之鹽;其中: R 1為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br、-CH 2I、-CF 3、-CH 2CH 3、-C(H)=CH 2、-C(H)=C=CH 2或環丙基;其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換; R 2為氫、鹵基或-CF 3;且 B 1
以上式IV中變量之定義涵蓋多個化學基團。本申請案考慮如下實施例,其中例如,i)變量之定義係選自上述彼等化學基團之單個化學基團,ii)變量之定義係選自上述彼等化學基團之兩個或更多個化學基團的集合,及iii)化合物由變量之組合定義,其中變量由(i)或(ii)定義。
在某些實施例中,化合物為式IV之化合物。
如上一般所定義,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br、-CH 2I、-CF 3、-CH 2CH 3、-C(H)=CH 2、-C(H)=C=CH 2或環丙基,其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br、-CH 2I、-CH 2CH 3、-C(H)=CH 2、-C(H)=C=CH 2或環丙基,其中之每一者的一或多個氫經氘置換。
在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br、-CH 2I、-CF 3、-CH 2CH 3、-C(H)=CH 2、-C(H)=C=CH 2或環丙基。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br、-CH 2I或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2CH 3、-C(H)=CH 2、-C(H)=C=CH 2或環丙基。
在一些實施例中,R 1為-CH 2F、-CH 2Br、-CH 2I或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2Br、-CH 2I或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2I或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br或-CH 2I。
在一些實施例中,R 1為-CH 2Br、-CH 2I或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2I或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F或-CH 2Br。在一些實施例中,R 1為-CH 2F、-CH 2I或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2F、-CH 2Br或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2F、-CH 2Br或-CH 2I。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2Br或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2Br或-CH 2I。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F或-CH 2I。
在一些實施例中,R 1為-CH 2I或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl或-CH 2F。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2F或-CH 2I。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl或-CH 2Br。在一些實施例中,R 1為-CH 2Br或-CH 2I。在一些實施例中,R 1為-CH 2Br或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl或-CH 2I。在一些實施例中,R 1為-CH 2F或-CF 3。在一些實施例中,R 1為-CH 2F或-CH 2Br。
在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl。在一些實施例中,R 1為-CH 2F。在一些實施例中,R 1為-CH 2Br。在一些實施例中,R 1為-CH 2I。在一些實施例中,R 1為-CF 3
在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br、-CH 2I或-CF 3,其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換。在一些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br或-CH 2I,其中之每一者的一或多個氫經氘置換。在一些實施例中,R 1為-CD 2Cl、-CD 2F、-CD 2Br或-CD 2I。在一些實施例中,R 1為-CD 2Cl或-CD 2F。在一些實施例中,R 1為-CD 2Cl。在一些實施例中,R 1為-CD 2F。在一些實施例中,R 1為-CD 2Br。在一些實施例中,R 1為-CD 2I。
在一些實施例中,R 1為-CH 2CH 3、-C(H)=CH 2或-C(H)=C=CH 2。在一些實施例中,R 1為-CH 2CH 3或環丙基。在一些實施例中,R 1為-C(H)=CH 2、-C(H)=C=CH 2或環丙基。在一些實施例中,R 1為-C(H)=CH 2或-C(H)=C=CH 2。在一些實施例中,R 1為-CH 2CH 3。在一些實施例中,R 1為-C(H)=CH 2。在一些實施例中,R 1為-C(H)=C=CH 2。在一些實施例中,R 1為環丙基。
在一些實施例中,R 1為-CH 2CH 3、-C(H)=CH 2、-C(H)=C=CH 2或環丙基,其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換。在一些實施例中,R 1為-CH 2CH 3、-C(H)=CH 2、-C(H)=C=CH 2或環丙基,其中之每一者的一或多個氫經氘置換。在一些實施例中,R 1為-CH 2CH 3,其一或多個氫經氘置換。在一些實施例中,R 1為-C(H)=CH 2,其一或多個氫經氘置換。在一些實施例中,R 1為-C(H)=C=CH 2,其一或多個氫經氘置換。在一些實施例中,R 1為環丙基,其一或多個氫經氘置換。
如上一般所定義,R 2為氫、鹵基或-CF 3。在一些實施例中,R 2為氫或-CF 3。在一些實施例中,R 2為鹵基或-CF 3。在一些實施例中,R 2為鹵基或氫。在一些實施例中,R 2為氟基或-CF 3。在一些實施例中,R 2為氟基或氫。
在一些實施例中,R 2為鹵基。在一些實施例中,R 2為氟基或氯基。在一些實施例中,R 2為氟基。在一些實施例中,R 2為氯基。在一些實施例中,R 2為溴基。在一些實施例中,R 2為碘基。
在一些實施例中,R 2為氫。在一些實施例中,R 2為-CF 3
如上一般所定義,B 1。在一些實施例中,B 1。在一些實施例中,B 1
以上描述描述了與式IV化合物有關之多個實施例。該專利申請案特別考慮了實施例之所有組合。
本揭示案之另一態樣提供由式IV-A表示之化合物: (IV-A) 或其醫藥學上可接受之鹽;其中: R 1為(i) -CH 2Cl、-CH 2F或-CH 2Br,其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換,或(ii) -N 3;且 R 2為氫或鹵基。
在某些實施例中,化合物為式IV-A之化合物。
如上一般所述,R 1為(i) -CH 2Cl、-CH 2F或-CH 2Br,其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換,或(ii) -N 3。在某些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F或-CH 2Br,其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換。在某些實施例中,R 1為-N 3。在某些實施例中,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F或-CH 2Br。在某些實施例中,R 1為-CH 2Cl。在某些實施例中,R 1為-CH 2F。在某些實施例中,R 1為-CH 2Br。在某些實施例中,R 1選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中所描述之彼等。
如上一般所述,R 2為氫或鹵基。在某些實施例中,R 2為氫。在某些實施例中,R 2為鹵基。在某些實施例中,R 2為Cl、Br或F。在某些實施例中,R 2為F。在某些實施例中,R 2選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中所描述之彼等。
本揭示案之另一態樣提供一種由式IV-B表示之化合物: (IV-B) 或其醫藥學上可接受之鹽;其中: R 1為-CH 2Cl、-CH 2F或-CH 2Br,其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換;且 R 2為F。
在某些實施例中,化合物為式IV-B之化合物。
如上一般所述,R 1為-CH 2Cl、-CH 2F或-CH 2Br,其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換。在某些實施例中,R 1為-CH 2Cl。在某些實施例中,R 1為-CH 2F。在某些實施例中,R 1為-CH 2Br。在某些實施例中,R 1選自表1、1-A、1-B、1-C及1-D中所描述之彼等。
本揭示案之另一態樣提供一種由式V表示之化合物: (V) 或其醫藥學上可接受之鹽;其中: B 1; R 1為-H、-C(O)R 8或-P(O)(OH)-OP(O)(OH)-OP(O)(OH) 2; R 2為-H、C 1-C 6脂族基、C 1-C 3鹵基脂族基、C 1-C 3羥烷基、-CH 2NH 2、-CH 2SH、-CH 2S-(C 1-C 3脂族基)、環丙基、-CN、-C(O)NH 2、-N 3、-O-(C 1-C 3脂族基)、-O-(C 1-C 3鹵基脂族基)、-S-(C 1-C 3脂族基)、-F或-Cl;其中該C 1-C 6脂族基、C 1-C 3鹵基脂族基及環丙基中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換; R 3為-H或-OH; R 4為-OH、-Cl、-OCH 3、-F、-N 3或-OC(O)R 8; R 5為-H或-F; R 6為-H、-F、-Cl、C 1-C 6脂族基、C 1-C 4鹵基脂族基、-O-(C 1-C 4脂族基)、環丙基或-OH; R 7為氫、鹵基、-CH 3或-CF 3; R 8每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基、C 1-20鹵基脂族基、-C(H)(R 9)-N(R 10) 2、苯基、-CH 2-苯基或氫;其中各苯基經m次出現之R 11取代; R 9為C 1-6烷基或氫,其中該C 1-6烷基視情況經苯基取代; R 10每次出現時獨立地表示氫、C 1-6烷基、-C(O)CH 3、-C(O)OC(CH 3) 3、-C(O)O(CH 2)苯基或-C(O)O(CH 2)茀基; R 11每次出現時獨立地表示C 1-6烷基、C 1-6烷氧基、C 1-6鹵烷基或鹵基;且 m為0、1或2。
以上式V中變量之定義涵蓋多個化學基團。本申請案考慮如下實施例,其中例如,i)變量之定義係選自上述彼等化學基團之單個化學基團,ii)變量之定義係選自上述彼等化學基團之兩個或更多個化學基團的集合,及iii)化合物由變量之組合定義,其中變量由(i)或(ii)定義。
在某些實施例中,化合物為式V之化合物。
如上一般所定義,R 1為-H、-C(O)R 8或-P(O)(OH)-OP(O)(OH)-OP(O)(OH) 2。在某些實施例中,R 1為-H或-C(O)R 8。在某些實施例中,R 1為-H或-C(O)C(H)(CH 3) 2。在某些實施例中,R 1為-H或-P(O)(OH)-OP(O)(OH)-OP(O)(OH) 2。在某些實施例中,R 1為-C(O)R 8或-P(O)(OH)-OP(O)(OH)-OP(O)(OH) 2。在某些實施例中,R 1為-H。在某些實施例中,R 1為-C(O)R 8。在某些實施例中,R 1為-P(O)(OH)-OP(O)(OH)-OP(O)(OH) 2
如上一般所定義,R 2為-H、C 1-C 6脂族基、C 1-C 3鹵基脂族基、C 1-C 3羥烷基、-CH 2NH 2、-CH 2SH、-CH 2S-(C 1-C 3脂族基)、環丙基、-CN、-C(O)NH 2、-N 3、-O-(C 1-C 3脂族基)、-O-(C 1-C 3鹵基脂族基)、-S-(C 1-C 3脂族基)、-F或-Cl;其中該C 1-C 6脂族基、C 1-C 3鹵基脂族基及環丙基中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換。
在一些實施例中,R 2為-H、C 1-C 6脂族基、C 1-C 3鹵基脂族基、C 1-C 3羥烷基、-CH 2NH 2、-CH 2SH、-CH 2S-(C 1-C 3脂族基)、環丙基、-CN、-C(O)NH 2、-N 3、-O-(C 1-C 3脂族基)、-O-(C 1-C 3鹵基脂族基)、-S-(C 1-C 3脂族基)、-F或-Cl。
在某些實施例中,R 2為C 1-C 6脂族基、C 1-C 3鹵基脂族基、C 1-C 3羥烷基、-CH 2NH 2、-CH 2SH、-CH 2S-(C 1-C 3脂族基)、環丙基、-CN、-C(O)NH 2、-N 3、-O-(C 1-C 3脂族基)、-O-(C 1-C 3鹵基脂族基)、-S-(C 1-C 3脂族基)、-F或-Cl。
在某些實施例中,R 2為-H、C 1-C 6脂族基、C 1-C 3鹵基脂族基或環丙基。在某些實施例中,R 2為C 1-C 6脂族基、C 1-C 3鹵基脂族基或環丙基。在某些實施例中,R 2為C 1-C 6脂族基或環丙基。在某些實施例中,R 2為C 1-C 6脂族基或C 1-C 3鹵基脂族基。
在某些實施例中,R 2為C 1-C 6脂族基、C 1-C 3鹵基脂族基或環丙基,其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換。在某些實施例中,R 2為C 1-C 6脂族基或環丙基,其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換。在某些實施例中,R 2為C 1-C 6脂族基或C 1-C 3鹵基脂族基,其一或多個氫視情況經氘置換。
在某些實施例中,R 2為C 1-C 6脂族基、C 1-C 3鹵基脂族基或環丙基,其中之每一者的一或多個氫經氘置換。在某些實施例中,R 2為C 1-C 6脂族基或環丙基,其中之每一者的一或多個氫經氘置換。在某些實施例中,R 2為C 1-C 6脂族基或C 1-C 3鹵基脂族基,其中之每一者的一或多個氫經氘置換。
在某些實施例中,R 2為C 1-C 3羥烷基、-CH 2NH 2、-CH 2SH、-CH 2S-(C 1-C 3脂族基)、-CN、-C(O)NH 2、-N 3、-O-(C 1-C 3脂族基)、-O-(C 1-C 3鹵基脂族基)、-S-(C 1-C 3脂族基)、-F或-Cl。在某些實施例中,R 2為C 1-C 3羥烷基、-CH 2NH 2或-CH 2SH。在某些實施例中,R 2為-CH 2S-(C 1-C 3脂族基)、-O-(C 1-C 3脂族基)、-O-(C 1-C 3鹵基脂族基)或-S-(C 1-C 3脂族基)。在某些實施例中,R 2為-CN、-C(O)NH 2或-N 3。在某些實施例中,R 2為-F或-Cl。
在某些實施例中,R 2為C 1-C 3羥烷基、-O-(C 1-C 3脂族基)或-O-(C 1-C 3鹵基脂族基)。在某些實施例中,R 2為-CH 2NH 2、-CN、-C(O)NH 2或-N 3。在某些實施例中,R 2為-CH 2SH、-CH 2S-(C 1-C 3脂族基)或-S-(C 1-C 3脂族基)。
在某些實施例中,R 2為-H。在某些實施例中,R 2為C 1-C 6脂族基,其一或多個氫視情況經氘置換。在某些實施例中,R 2為C 1-C 6脂族基,其一或多個氫經氘置換。在某些實施例中,R 2為C 1-C 6脂族基。在某些實施例中,R 2為C 1-C 3鹵基脂族基,其一或多個氫視情況經氘置換。在某些實施例中,R 2為C 1-C 3鹵基脂族基,其一或多個氫經氘置換。在某些實施例中,R 2為C 1-C 3鹵基脂族基。在某些實施例中,R 2為C 1-C 3羥烷基。在某些實施例中,R 2為-CH 2NH 2。在某些實施例中,R 2為-CH 2SH。在某些實施例中,R 2為-CH 2S-(C 1-C 3脂族基)。在某些實施例中,R 2為環丙基,其一或多個氫視情況經氘置換。在某些實施例中,R 2為環丙基,其一或多個氫經氘置換。在某些實施例中,R 2為環丙基。在某些實施例中,R 2為-CN。在某些實施例中,R 2為-C(O)NH 2。在某些實施例中,R 2為 -N 3。在某些實施例中,R 2為-O-(C 1-C 3脂族基)。在某些實施例中,R 2為-O-(C 1-C 3鹵基脂族基)。在某些實施例中,R 2為-S-(C 1-C 3脂族基)。在某些實施例中,R 2為-F。在某些實施例中,R 2為-Cl。
在某些實施例中,R 2為-CH 3、-CF 3、-N 3、-OCH 3、-CH 2Cl、-CH 2F、-CHF 2、-CHCl 2、-CHClF、-CH 2CH 3、-CH=CH 2、環丙基或-C≡CH。在某些實施例中,R 2為-N 3、-CH 3、-CH 2Cl、-CH 2F、-CH=CH 2或-C≡CH。在某些實施例中,R 2為-CH 2Cl、-CH 2F或-C≡CH。在某些實施例中,R 2為-CH 2Cl或-C≡CH。在某些實施例中,R 2為-CH 2Cl或-CH 2F。
在某些實施例中,R 2為-CH 3、-CH 2CH 3、-CH=CH 2、環丙基或-C≡CH。在某些實施例中,R 2為-CH 2CH 3、-CH=CH 2、環丙基或-C≡CH。在某些實施例中,R 2為-CH 2CH 3、-CH=CH 2或環丙基。在某些實施例中,R 2為-CH 2CH 3、-C(H)=CH 2、-C(H)=C=CH 2或環丙基。在一些實施例中,R 2為-CH 2CH 3、-C(H)=CH 2或-C(H)=C=CH 2。在一些實施例中,R 2為-CH 2CH 3或環丙基。在一些實施例中,R 2為-C(H)=CH 2、-C(H)=C=CH 2或環丙基。在一些實施例中,R 2為-C(H)=CH 2或-C(H)=C=CH 2
在某些實施例中,R 2為-CF 3、-CH 2Cl、-CH 2F、-CHF 2、-CHCl 2或-CHClF。在某些實施例中,R 2為-CF 3、-CH 2Cl、-CH 2F或-CHF 2。在某些實施例中,R 2為-CF 3、-CH 2F或-CHF 2。在某些實施例中,R 2為-N 3或-OCH 3
在某些實施例中,R 2為-CH 3。在某些實施例中,R 2為-CF 3。在某些實施例中,R 2為-N 3。在某些實施例中,R 2為-OCH 3。在某些實施例中,R 2為-CH 2Cl。在某些實施例中,R 2為-CH 2F。在某些實施例中,R 2為-CHF 2。在某些實施例中,R 2為-CHCl 2。在某些實施例中,R 2為-CHClF。在某些實施例中,R 2為-CH 2CH 3。在某些實施例中,R 2為-CH=CH 2。在一些實施例中,R 2為-C(H)=C=CH 2。在某些實施例中,R 2為環丙基。在某些實施例中,R 2為-C≡CH。
在一些實施例中,R 2為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br、-CH 2I或-CF 3,其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換。在一些實施例中,R 2為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br或-CH 2I,其中之每一者的一或多個氫經氘置換。在一些實施例中,R 2為-CD 2Cl、-CD 2F、-CD 2Br或-CD 2I。在一些實施例中,R 2為-CD 2Cl或-CD 2F。在一些實施例中,R 2為-CD 2Cl。在一些實施例中,R 2為-CD 2F。在一些實施例中,R 2為-CD 2Br。在一些實施例中,R 2為-CD 2I。
如上一般所定義,R 3為-H或-OH。在某些實施例中,R 3為-H。在某些實施例中,R 3為-OH。
如上一般所定義,R 4為-OH、-Cl、-OCH 3、-F、-N 3或-OC(O)R 8。在某些實施例中,R 4為-OH、-OCH 3或-OC(O)R 8。在某些實施例中,R 4為-OH或-OCH 3。在某些實施例中,R 4為-OH或-OC(O)R 8。在某些實施例中,R 4為-OH或-C(O)C(H)(CH 3) 2。在某些實施例中,R 4為-OCH 3或-OC(O)R 8
在某些實施例中,R 4為-OH。在某些實施例中,R 4為-Cl。在某些實施例中,R 4為-OCH 3。在某些實施例中,R 4為-F。在某些實施例中,R 4為-N 3。在某些實施例中,R 4為-OC(O)R 8。在某些實施例中,R 4為-C(O)C(H)(CH 3) 2
如上一般所定義,R 5為-H或-F。在某些實施例中,R 5為-H。在某些實施例中,R 5為-F。
如上一般所定義,R 6為-H、-F、-Cl、C 1-C 6脂族基、C 1-C 4鹵基脂族基、-O-(C 1-C 4脂族基)、環丙基或-OH。
在某些實施例中,R 6為-F或-Cl。在某些實施例中,R 6為C 1-C 6脂族基、C 1-C 4鹵基脂族基或環丙基。在某些實施例中,R 6為C 1-C 6脂族基或C 1-C 4鹵基脂族基。在某些實施例中,R 6為C 1-C 6脂族基或環丙基。在某些實施例中,R 6為C 1-C 4鹵基脂族基或環丙基。在某些實施例中,R 6為-O-(C 1-C 4脂族基)或-OH。
在某些實施例中,R 6為-H、-F、-Cl或-OH。在某些實施例中,R 6為-H、-F或-OH。在某些實施例中,R 6為-H或-F。在某些實施例中,R 6為-H或-OH。在某些實施例中,R 6為-F或-OH。
在某些實施例中,R 6為-H、-F、-CH 3、-CH 2CH 3、-OCH 3、-OCH 2CH 3、-CH=CH 2、-CH 2F或-CH 2Cl。
在某些實施例中,R 6為-H。在某些實施例中,R 6為-F。在某些實施例中,R 6為-Cl。在某些實施例中,R 6為C 1-C 6脂族基。在某些實施例中,R 6為-CH 3。在某些實施例中,R 6為-CH 2CH 3。在某些實施例中,R 6為-CH=CH 2。在某些實施例中,R 6為C 1-C 4鹵基脂族基。在某些實施例中,R 6為-CH 2F。在某些實施例中,R 6為-CH 2Cl。在某些實施例中,R 6為-O-(C 1-C 4脂族基)。在某些實施例中,R 6為-OCH 3。在某些實施例中,R 6為-OCH 2CH 3。在某些實施例中,R 6為環丙基。在某些實施例中,R 6為-OH。
如上一般所定義,R 7為氫、鹵基、-CH 3或-CF 3。在某些實施例中,R 7為氫或鹵基。在某些實施例中,R 7為氫或氟基。在某些實施例中,R 7為鹵基或-CF 3。在某些實施例中,R 7為氟基或-CF 3。在某些實施例中,R 7為-CH 3或-CF 3。在某些實施例中,R 7為氫。在某些實施例中,R 7為鹵基。在某些實施例中,R 7為氟基。在某些實施例中,R 7為-CH 3。在某些實施例中,R 7為-CF 3
如上一般所定義,R 8每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基、C 1-20鹵基脂族基、-C(H)(R 9)-N(R 10) 2、苯基、-CH 2-苯基或氫;其中各苯基經m次出現之R 11取代。
在某些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基、C 1-20鹵基脂族基、苯基或氫;其中該苯基經m次出現之R 11取代。在某些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基、C 1-20鹵基脂族基或氫。在某些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示-C(H)(R 9)-N(R 10) 2、苯基或-CH 2-苯基;其中各苯基經m次出現之R 11取代。在某些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示苯基或-CH 2-苯基,其中各苯基經m次出現之R 11取代。
在某些實施例中,R 8為C 1-20脂族基、C 1-20鹵基脂族基、苯基或氫;其中該苯基經m次出現之R 11取代。在某些實施例中,R 8為C 1-20脂族基、C 1-20鹵基脂族基或氫。在某些實施例中,R 8為-C(H)(R 9)-N(R 10) 2或經m次出現之R 11取代之苯基。
在某些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基或C 1-20鹵基脂族基。在某些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示C 1-8脂族基或C 1-8鹵基脂族基。在某些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示C 10-20脂族基或C 10-20鹵基脂族基。在某些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示C 1-20烷基或C 1-20鹵烷基。在某些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示C 1-8烷基或C 1-8鹵烷基。在某些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示C 10-20烷基或C 10-20鹵烷基。
在某些實施例中,R 8為C 1-20脂族基或C 1-20鹵基脂族基。在某些實施例中,R 8為C 1-8脂族基或C 1-8鹵基脂族基。在某些實施例中,R 8為C 10-20脂族基或C 10-20鹵基脂族基。在某些實施例中,R 8為C 1-20烷基或C 1-20鹵烷基。在某些實施例中,R 8為C 1-8烷基或C 1-8鹵烷基。在某些實施例中,R 8為C 10-20烷基或C 10-20鹵烷基。
在某些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基。在某些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示C 1-8脂族基。在某些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示C 10-20脂族基。在某些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示C 1-20烷基。在某些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示C 1-8烷基。在某些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示C 10-20烷基。
在某些實施例中,R 8為C 1-20脂族基。在某些實施例中,R 8為C 1-8脂族基。在某些實施例中,R 8為C 10-20脂族基。在某些實施例中,R 8為C 1-20烷基。在某些實施例中,R 8為C 1-8烷基。在某些實施例中,R 8為C 10-20烷基。
在一些實施例中,R 8為-CH 3、-CH 2CH 3、-CH(CH 3) 2、-C(H)=CH 2、-CH 2C(H)=CH 2、-C≡CH、-CH 2CH 3、-C(H)=CH 2、-CH 2C(H)=CH 2、-C≡CH、-(CH 2) 3CH 3、-(CH 2) 3C(H)=CH 2、-(CH 2) 6C(H)=CH 2、-(CH 2) 3C≡CH、-(CH 2) 6C≡CH或環丙基。在一些實施例中,R 8為-CH 3、-CH 2CH 3、-CH(CH 3) 2、-C(H)=CH 2、-CH 2C(H)=CH 2或-C≡CH。在一些實施例中,R 8為-CH 3、-CH 2CH 3或-CH(CH 3) 2。在一些實施例中,R 8為-C(H)=CH 2、-CH 2C(H)=CH 2或-C≡CH。在一些實施例中,R 8為-CH 3。在一些實施例中,R 8為-CH 2CH 3。在一些實施例中,R 3為-CH(CH 3) 2。在一些實施例中,R 8為-C(H)=CH 2。在一些實施例中,R 8為-CH 2C(H)=CH 2。在一些實施例中,R 8為-C≡CH。在一些實施例中,R 8為-(CH 2) 3CH 3。在一些實施例中,R 8為-(CH 2) 3C(H)=CH 2。在一些實施例中,R 8為-(CH 2) 6C(H)=CH 2。在一些實施例中,R 8為-(CH 2) 3C≡CH。在一些實施例中,R 8為-(CH 2) 6C≡CH。在一些實施例中,R 8為環丙基。
在某些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示C 1-20鹵基脂族基。在某些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示C 1-8鹵基脂族基。在某些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示C 10-20鹵基脂族基。在某些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示C 1-20鹵烷基。在某些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示C 1-8鹵烷基。在某些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示C 10-20鹵烷基。
在某些實施例中,R 8為C 1-20鹵基脂族基。在某些實施例中,R 8為C 1-8鹵基脂族基。在某些實施例中,R 8為C 10-20鹵基脂族基。在某些實施例中,R 8為C 1-20鹵烷基。在某些實施例中,R 8為C 1-8鹵烷基。在某些實施例中,R 8為C 10-20鹵烷基。
在一些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示-C(H)(R 9)-N(R 10) 2。在一些實施例中,R 8為-C(H)(R 9)-N(R 10) 2。在一些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示 。在一些實施例中,R 8。在一些實施例中,R 8。在一些實施例中,R 8。在一些實施例中,R 8。在一些實施例中,R 8
在一些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示 。在一些實施例中,R 8。在一些實施例中,R 8。在一些實施例中,R 8。在一些實施例中,R 8。在一些實施例中,R 8
在一些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示經m次出現之R 11取代之苯基。在一些實施例中,R 8為經m次出現之R 11取代之苯基。在一些實施例中,R 8為苯基。
在一些實施例中,R 8每次出現時獨立地表示-CH 2-苯基,其中該苯基經m次出現之R 11取代。在一些實施例中,R 8為-CH 2-苯基,其中該苯基經m次出現之R 11取代。在一些實施例中,R 8為-CH 2-苯基。
在一些實施例中,R 8為氫。
如上一般所定義,R 9為C 1-6烷基或氫,其中該C 1-6烷基視情況經苯基取代。在某些實施例中,R 9為甲基、異丙基、苄基或氫。在某些實施例中,R 9為視情況經苯基取代之C 1-6烷基。在某些實施例中,R 9為C 1-6烷基。在某些實施例中,R 9為C 1-4烷基。在某些實施例中,R 9為C 2-6烷基。在某些實施例中,R 9為經苯基取代之C 1-6烷基。在某些實施例中,R 9為氫。
如上一般所定義,R 10每次出現時獨立地表示氫、C 1-6烷基、-C(O)CH 3、-C(O)OC(CH 3) 3、-C(O)O(CH 2)苯基或-C(O)O(CH 2)茀基。
在某些實施例中,一次出現之R 10為氫或C 1-6烷基,且另一次出現之R 10為氫,C 1-6烷基、-C(O)CH 3、-C(O)OC(CH 3) 3、-C(O)O(CH 2)苯基或-C(O)O(CH 2)茀基。在某些實施例中,一次出現之R 10為氫或C 1-6烷基,且另一次出現之R 10為-C(O)CH 3、-C(O)OC(CH 3) 3、-C(O)O(CH 2)苯基或-C(O)O(CH 2)茀基。
在某些實施例中,一次出現之R 10為氫,且另一次出現之R 10為氫,C 1-6烷基、-C(O)CH 3、-C(O)OC(CH 3) 3、-C(O)O(CH 2)苯基或-C(O)O(CH 2)茀基。在某些實施例中,一次出現之R 10為氫,且另一次出現之R 10為-C(O)CH 3、-C(O)OC(CH 3) 3、-C(O)O(CH 2)苯基或-C(O)O(CH 2)茀基。
在某些實施例中,R 10每次出現時獨立地表示氫或C 1-6烷基。在某些實施例中,R 10為氫。在某些實施例中,R 10每次出現時獨立地表示C 1-6烷基。
如上一般所定義,R 11每次出現時獨立地表示C 1-6烷基、C 1-6烷氧基、C 1-6鹵烷基或鹵基。在某些實施例中,R 11每次出現時獨立地表示-CH 3、-OCH 3、-CF 3或鹵基。
在某些實施例中,R 11每次出現時獨立地表示C 1-6烷基。在某些實施例中,R 11為-CH 3。在某些實施例中,R 11每次出現時獨立地表示C 1-6烷氧基。在某些實施例中,R 11為-OCH 3。在某些實施例中,R 11每次出現時獨立地表示C 1-6鹵烷基。在某些實施例中,R 11為-CF 3。在某些實施例中,R 11每次出現時獨立地表示鹵基。
如上一般所定義,B 1
在某些實施例中,B 1。在某些實施例中,B 1
在某些實施例中,B 1
在某些實施例中,B 1。在某些實施例中,B 1。在某些實施例中,B 1。在某些實施例中,B 1
在某些實施例中,B 1。在某些實施例中,B 1
在某些實施例中,B 1。在某些實施例中,B 1。在某些實施例中,B 1。在某些實施例中,B 1。在某些實施例中,B 1。在某些實施例中,B 1。在某些實施例中,B 1。在某些實施例中,B 1。在某些實施例中,B 1。在某些實施例中,B 1。在某些實施例中,B 1。在某些實施例中,B 1。在某些實施例中,B 1。在某些實施例中,B 1。在某些實施例中,B 1。在某些實施例中,B 1。在某些實施例中,B 1。在某些實施例中,B 1。在某些實施例中,B 1。在某些實施例中,B 1
如上一般所定義,m為0、1或2。在某些實施例中,m為0。在某些實施例中,m為1。在某些實施例中,m為2。在某些實施例中,m為0或1。在某些實施例中,m為1或2。
以上描述描述了與式V化合物相關之多個實施例。本專利申請案特別考慮了實施例之所有組合。
本揭示案之另一態樣提供一種由式VI表示之化合物: (VI) 或其醫藥學上可接受之鹽;其中: R 1及R 4獨立地表示-C(O)R 5或氫; R 2為鹵基、氫或-OH; R 3為鹵甲基、C 1-3脂族基或環丙基,其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換; R 5每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基、C 1-20鹵基脂族基、-C(H)(R 6)-N(R 7) 2、苯基、-CH 2-苯基或氫;其中各苯基經m次出現之R 10取代; R 6為C 1-6烷基或氫,其中該C 1-6烷基視情況經苯基取代; R 7每次出現時獨立地表示氫、C 1-6烷基、C(O)OC(CH 3) 3、C(O)O(CH 2)苯基或C(O)O(CH 2)茀基; R 8及R 9各自獨立地表示氫、鹵基、-CH 3或-CF 3; R 10每次出現時獨立地表示C 1-6烷基、C 1-6烷氧基、C 1-6鹵烷基或鹵基; B 1;且 m為0、1或2。
以上式VI中變量之定義涵蓋多個化學基團。本申請案考慮如下實施例,其中例如,i)變量之定義係選自上述彼等化學基團之單個化學基團,ii)變量之定義係選自上述彼等化學基團之兩個或更多個化學基團的集合,及iii)化合物由變量之組合定義,其中變量由(i)或(ii)定義。
在某些實施例中,化合物為式VI之化合物。
如上一般定義,R 1及R 4獨立地表示-C(O)R 5或氫。在某些實施例中,R 1及R 4為氫。
在某些實施例中,R 1為-C(O)R 5或氫。在某些實施例中,R 1為-C(O)R 5。在某些實施例中,R 1為氫。
在某些實施例中,R 4為-C(O)R 5或氫。在某些實施例中,R 4為-C(O)R 5。在某些實施例中,R 4為氫。
如上一般所定義,R 8及R 9各自獨立地表示氫、鹵基、-CH 3或-CF 3
在某些實施例中,R 8為氫、鹵基、-CH 3或-CF 3。在某些實施例中,R 8為氫或鹵基。在某些實施例中,R 8為氫或氟基。在某些實施例中,R 8為鹵基或-CF 3。在某些實施例中,R 8為氟基或-CF 3。在某些實施例中,R 8為-CH 3或-CF 3。在某些實施例中,R 8為氫。在某些實施例中,R 8為鹵基。在某些實施例中,R 8為氟基。在某些實施例中,R 8為-CH 3。在某些實施例中,R 8為-CF 3
在某些實施例中,R 9為氫、鹵基、-CH 3或-CF 3。在某些實施例中,R 9為氫或鹵基。在某些實施例中,R 9為氫或氟基。在某些實施例中,R 9為鹵基或-CF 3。在某些實施例中,R 9為氟基或-CF 3。在某些實施例中,R 9為-CH 3或-CF 3。在某些實施例中,R 9為氫。在某些實施例中,R 9為鹵基。在某些實施例中,R 9為氟基。在某些實施例中,R 9為-CH 3。在某些實施例中,R 9為-CF 3
在某些實施例中,本發明提供式VI之化合物,其中變量R 2、R 3、R 5、R 6、R 7、R 10、B 1及m中的每一者單獨地及組合地如以上式II之描述中所定義以及如本文之實施例中所描述。例如,在某些實施例中,R 2為鹵基。在另一實例中,在某些實施例中,R 2為氟基,且R 3為鹵甲基。在另一實例中,在某些實施例中,R 1及R 4為氫,R 2為氫,且R 3為-CH 2F或-CH 2Cl。
以上描述描述了與式VI化合物有關之多個實施例。該專利申請案特別考慮了實施例之所有組合。 II. 治療醫學病症及 / 或抑制逆轉錄酶之方法
考慮以上第I章節中之化合物( 例如,如上所述的式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽)或以下第III章節中之其他化合物為患有癌症、自體免疫病症及/或神經病症的個體提供治療益處。
因此,本揭示案之一個態樣提供一種治療選自由癌症、自體免疫病症及神經病症組成之群的病症之方法。該方法包含向有此需要之個體投與治療有效量的本文所述之化合物(諸如式I、II、III、IV、V或VI之化合物,或第I或III章節中所描述的其他化合物),其醫藥學上可接受之鹽,或前述任一種的醫藥組合物,以治療該病症。在某些實施例中,特定化合物係針對本文之任何實施例,在所描述之各種實施例及實施例之態樣的任何及所有組合中描述之化合物。
本揭示案之另一態樣提供一種治療選自由癌症、自體免疫病症及神經病症組成之群的病症之方法。該方法包含向有此需要之個體投與治療有效量的式I化合物、其醫藥學上可接受之鹽或前述任一種之醫藥組合物,以治療病症;其中式I化合物在所描述之各種實施例及實施例之態樣的任何及所有組合中如上文針對實施例一至二十二中任一項所描述。
本揭示案之另一態樣提供一種治療選自由癌症、自體免疫病症及神經病症組成之群的病症之方法。該方法包含向有此需要之個體投與治療有效量的本文所述之化合物,諸如式I化合物或表1、1-A、1-B、2及/或2-A中之化合物以治療病症。在某些實施例中,特定化合物係針對本文之任何實施例,在所描述之各種實施例及實施例之態樣的任何及所有組合中描述之化合物。
本揭示案的又一態樣提供一種治療病毒感染之方法。該方法包含向有此需要之個體投與治療有效量的本文所述之化合物(諸如式I、II、III、IV、V或VI之化合物,或第I或III章節中所描述的其他化合物),其醫藥學上可接受之鹽,或前述任一種的醫藥組合物,以治療病毒感染。在某些實施例中,特定化合物係針對本文之任何實施例,在所描述之各種實施例及實施例之態樣的任何及所有組合中描述之化合物。
在上述每種方法之某些實施例中,化合物為表1、1-A、1-B、1-C、I-D、2、2-A、2-B或2-C中之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在上述每種方法之某些實施例中,化合物為表1、1-A、1-B、1-C、2、2-A、2-B或2-C中之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在上述每種方法的某些實施例中,化合物為表1、1-A、1-B、1-C、I-D、2、2-A、2-B或2-C中之化合物。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、1-B、1-C、2、2-A、2-B或2-C中之化合物。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、1-C、2、2-A或2-C中之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、1-C、2、2-A或2-C中之化合物。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、1-B、2、2-A或2-B中之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、1-B、2、2-A或2-B中之化合物。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、2或2-A中之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、2或2-A中之化合物。在某些實施例中,化合物為表1-B或2-B中之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為表1-B或2-B中之化合物。在某些實施例中,化合物為表1或2中之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為表1或2中之化合物。
在某些實施例中,化合物以包含化合物及載劑、賦形劑及/或媒劑之醫藥組合物投與,如下文第V章節中進一步所描述。
在某些實施例中,該方法進一步包含投與有效量之一或多種額外治療劑,如下文第IV章節中進一步所描述。 癌症
在某些實施例中,病症為癌症。在某些實施例中,癌症為固態腫瘤或白血病。在某些實施例中,癌症為固態腫瘤 在某些實施例中,癌症為癌或黑色素瘤。在某些實施例中,癌症為癌。在某些實施例中,癌症為肉瘤。在某些實施例中,癌症為黑色素瘤。在某些實施例中,癌症為淋巴瘤。在某些實施例中,癌症為白血病。
在某些實施例中,癌症為乳癌、卵巢癌(ovarian cancer)、子宮癌、子宮頸癌、前列腺癌、睪丸癌、肺癌、白血病、頭頸癌、口腔癌、食道癌、胃癌、膽管癌、膽囊癌、膀胱癌、尿路癌、結腸癌、直腸癌、甲狀腺癌、胰臟癌、腎癌、肝癌、腦癌、皮膚癌或眼癌。
在某些實施例中,癌症為乳癌、卵巢癌(ovarian cancer)、子宮癌、子宮頸癌、前列腺癌、睪丸癌、肺癌、白血病、頭頸癌、口腔癌、食道癌、胃癌、膽管癌、膽囊癌或膀胱癌。
在某些實施例中,癌症具有(i) LINE1 RNA、LINE1 ORF1多肽及/或LINE1 ORF2多肽之表現;(ii) LINE1逆轉錄酶之活性;(iii) HERV-K RNA之表現,及/或(iv) HERV-K逆轉錄酶之活性。
在某些實施例中,癌症具有(i) LINE1 RNA、LINE1 ORF1多肽及/或LINE1 ORF2多肽之表現;及/或(ii) LINE1逆轉錄酶之活性。在某些實施例中,癌症具有LINE1 RNA、LINE1 ORF1多肽及/或LINE1 ORF2多肽之表現。在某些實施例中,癌症具有LINE1 RNA之表現。在某些實施例中,癌症具有LINE1 ORF1多肽之表現。在某些實施例中,癌症具有LINE1 ORF2多肽之表現。在某些實施例中,癌症具有LINE1逆轉錄酶之活性。
在某些實施例中,癌症具有(i) HERV-K RNA之表現,及/或(ii) HERV-K逆轉錄酶之活性。在某些實施例中,癌症具有HERV-K RNA之表現。在某些實施例中,癌症具有HERV-K逆轉錄酶之活性。
在某些實施例中,癌症具有升高之(i) LINE1 RNA、LINE1 ORF1多肽及/或LINE1 ORF2多肽之水準;(ii) LINE1逆轉錄酶之活性;(iii) HERV-K RNA之水準,及/或(iv) HERV-K逆轉錄酶之活性。
在某些實施例中,癌症具有升高之(i) LINE1 RNA、LINE1 ORF1多肽及/或LINE1 ORF2多肽之水準;及/或(ii) LINE1逆轉錄酶之活性。在某些實施例中,癌症具有升高之LINE1 RNA、LINE1 ORF1多肽及/或LINE1 ORF2多肽之水準。在某些實施例中,癌症具有升高之LINE1 RNA之水準。在某些實施例中,癌症具有升高之LINE1 ORF1多肽之水準。在某些實施例中,癌症具有升高之LINE1 ORF2多肽之水準。在某些實施例中,癌症具有升高之LINE1逆轉錄酶之活性。
在某些實施例中,癌症具有升高之(i) HERV-K RNA之水準;及/或(ii) HERV-K逆轉錄酶之活性。在某些實施例中,癌症具有升高之HERV-K RNA之水準。在某些實施例中,癌症具有升高之HERV-K逆轉錄酶之活性。
在某些實施例中,癌症為上皮癌。在某些實施例中,上皮癌為胰臟癌、結直腸癌、乳癌、前列腺癌、食道癌、頭頸癌、腎癌、卵巢癌(ovarian cancer)或肺癌。在某些實施例中,癌症為胰臟癌、結直腸癌、乳癌、前列腺癌、腎癌、卵巢癌(ovarian cancer)或肺癌。在某些實施例中,癌症為胰臟癌。在某些實施例中,癌症為胰臟腺癌。在某些實施例中,癌症為結直腸癌。在某些實施例中,癌症包含微衛星不穩定(MSI)結直腸癌或微衛星穩定(MSS)結直腸癌。在某些實施例中,癌症為乳癌。在某些實施例中,癌症為前列腺癌。在某些實施例中,癌症為食道癌。在某些實施例中,癌症為頭頸癌。在某些實施例中,癌症為腎癌。在某些實施例中,癌症為卵巢癌(ovarian cancer)。在某些實施例中,癌症為肺癌。在某些實施例中,肺癌為非小細胞肺癌或小細胞肺癌。在某些實施例中,癌症為非小細胞肺癌。在某些實施例中,癌症為小細胞肺癌。
在某些實施例中,癌症為癌前病變或早期癌症病變。在某些實施例中,癌症為導管內乳頭狀黏液性腫瘤(IPMN)、胰腺上皮內瘤變(PanIN)、導管原位癌(DCIS)或巴瑞特食道癌(Barrett’s Esophagus)。在某些實施例中,癌症為導管內乳頭狀黏液性腫瘤(IPMN)。在某些實施例中,癌症為胰腺上皮內瘤變(PanIN)。在某些實施例中,癌症為導管原位癌(DCIS)。在某些實施例中,癌症為巴瑞特食道癌。
在某些實施例中,癌症具有升高之周心測量人類衛星II (HSATII) RNA水準。在一些實施例中,癌症為微衛星不穩定(MSI)癌症。在一些實施例中,癌症為微衛星穩定(MSS)癌症。
在任何實施例之態樣中,癌症與長散佈核元件-1 (LINE-1)逆轉錄酶(RT)相關。在此等實施例的其他態樣中,癌症與高LINE-1 RT活性程度相關。
在某些實施例中,癌症選自B細胞淋巴瘤(例如,B細胞慢性淋巴球性白血病、B細胞非霍奇金淋巴瘤、皮膚B細胞淋巴瘤、瀰漫性大B細胞淋巴瘤)、基底細胞癌、膀胱癌、母細胞瘤、腦轉移、乳癌、伯基特淋巴瘤(Burkitt lymphoma)、癌(例如,腺癌(例如,胃食管交界處之腺癌))、子宮頸癌、結腸癌、結直腸癌(結腸癌及直腸癌)、子宮內膜癌、食道癌、尤文氏肉瘤(Ewing sarcoma)、濾泡性淋巴瘤、胃癌、胃食管交界處癌、胃腸道癌、神經膠質母細胞瘤(例如,多形性神經膠質母細胞瘤,例如,新診斷的或複發的)、神經膠質瘤、頭頸癌(例如,頭頸鱗狀細胞癌)、肝轉移、霍奇金氏及非霍奇金淋巴瘤(Hodgkin' s and non-Hodgkin' s lymphoma)、腎癌(例如腎細胞癌及威爾姆斯瘤(Wilms' tumor))、喉頭癌、白血病(例如慢性骨髓性白血病、毛細胞白血病)、肝癌(liver cancer) (例如肝癌(hepatic carcinoma)及肝細胞瘤)、肺癌(例如,非小細胞肺癌及小細胞肺癌)、淋巴母細胞淋巴瘤、淋巴瘤、套細胞淋巴瘤、轉移性腦腫瘤、轉移性癌症、骨髓瘤(例如,多發性骨髓瘤)、神經母細胞瘤、眼黑色素瘤、口咽癌、骨肉瘤、卵巢癌(ovarian cancer)、胰臟癌(例如,胰管腺癌)、前列腺癌(例如,激素難治性(例如,去勢抵抗)、轉移性、轉移性激素難治性(例如,去勢抵抗、雄激素非依賴性))、腎細胞癌(例如,轉移性)、唾液腺癌、肉瘤(例如,橫紋肌肉瘤)、皮膚癌(例如,黑色素瘤(例如,轉移性黑色素瘤))、軟組織肉瘤、固態腫瘤、鱗狀細胞癌、滑膜肉瘤、睪丸癌、甲狀腺癌、移行細胞癌(尿路上皮細胞癌)、葡萄膜黑色素瘤(例如轉移性)、疣狀癌、外陰癌及華氏巨球蛋白血症(Waldenstrom macroglobulinemia)。
在一些實施例中,癌症為病毒相關癌症。如本文所用,術語「病毒相關癌症」意謂已知病毒在其中起作用之任何癌症。例如,據報導愛潑斯坦-巴爾病毒(Epstein-Barr virus,EBV)與伯基特淋巴瘤及某些其他淋巴瘤之地方性變體有關。人類乳突狀瘤病毒(HPV)感染據信為導致某些類型之子宮頸癌及/或生殖器癌的原因。據報導,人類T細胞白血病病毒1 (HTLV-1)與成人T細胞白血病/淋巴瘤(ATLL)相關。據報導,人類T細胞白血病病毒2 (HTLV-2)與皮膚T細胞淋巴瘤相關。人類疱疹病毒8 (HHV-8)據信會導致AIDS患者患上卡波西氏肉瘤(Kaposi’s sarcoma)。在某些實施例中,癌症為與EBV、HPV、HTLV-1、HTLV-2或HHV-8相關之癌症。在某些實施例中,癌症為伯基特淋巴瘤、子宮頸癌、生殖器癌、成人T細胞白血病/淋巴瘤、皮膚T細胞淋巴瘤或卡波西氏肉瘤。
在一些實施例中,癌症為除病毒相關癌症以外之癌症。在某些實施例中,癌症為除與EBV、HPV、HTLV-1、HTLV-2或HHV-8相關癌症以外之癌症。在某些實施方案中,癌症為除伯基特淋巴瘤、子宮頸癌、生殖器癌、成人T細胞白血病/淋巴瘤、皮膚T細胞淋巴瘤或卡波西氏肉瘤以外之癌症。在一個實施例中,癌症為與李法美尼症候群(Li_Fraumeni syndrome)相關之腫瘤。
在一些實施例中,癌症為腎細胞癌或腎癌、間皮瘤、肝膽癌(肝臟及膽管)、骨癌、橫紋肌肉瘤、胰臟癌、皮膚癌、頭頸癌、皮膚癌或眼內黑色素瘤、卵巢癌(ovarian cancer)、結腸癌、直腸癌、臀部癌、胃癌、胃腸癌(胃癌、結腸直腸癌及十二指腸癌)、子宮癌、輸卵管癌、子宮內膜癌、子宮頸癌、陰道癌、外陰癌、霍奇金氏病、食道癌、小腸癌、內分泌系統癌、甲狀腺癌、副甲狀腺癌、腎上腺癌、腎上腺皮質癌、軟組織肉瘤、軟組織及骨滑膜肉瘤、尿道癌、陰莖癌、前列腺癌、睪丸癌、慢性或急性白血病、慢性骨髓性白血病、急性骨髓性白血病、淋巴細胞性淋巴瘤、膀胱癌、腎癌或輸尿管癌、腎細胞癌、腎盂癌、非霍奇金氏淋巴瘤、脊柱軸腫瘤、腦乾膠質瘤、垂體腺瘤、腎上腺皮質癌、膽囊癌、多發性骨髓瘤、膽管癌、纖維肉瘤、神經母細胞瘤、視網膜母細胞瘤、頭頸部鱗狀細胞癌(SCCHN);唾液腺癌;神經纖維瘤病-1相關之惡性周邊神經鞘瘤(MPNST);及髓母細胞瘤,或上述一或多種癌症的組合。
在一些實施例中,癌症為肝細胞癌(HCC)。在一些實施例中,癌症為肝母細胞瘤。在一些實施例中,癌症為結腸癌。在一些實施例中,癌症為直腸癌。在一些實施例中,癌症為卵巢癌(ovarian cancer)或卵巢癌(ovarian carcinoma)。在一些實施例中,癌症為卵巢上皮癌。在一些實施例中,癌症為輸卵管癌。在一些實施例中,癌症為乳頭狀漿液性囊腺癌。在一些實施例中,癌症為子宮乳頭狀漿液性癌(UPSC)。在一些實施例中,癌症為肝膽管癌。在一些實施例中,癌症為軟組織及骨滑膜肉瘤。在一些實施例中,癌症為橫紋肌肉瘤。在一些實施例中,癌症為骨肉瘤。在一些實施例中,癌症為未分化甲狀腺癌。在一些實施例中,癌症為腎上腺皮質癌。在一些實施例中,癌症為胰臟癌或胰腺導管癌。在一些實施例中,癌症為胰臟腺癌。在一些實施例中,癌症為神經膠質瘤。在一些實施例中,癌症為惡性周邊神經鞘瘤(MPNST)。在一些實施例中,癌症為神經纖維瘤病-1相關之MPNST。在一些實施例中,癌症為華氏巨球蛋白血症。在一些實施例中,癌症為髓母細胞瘤。
在某些實施例中,癌症為白血病(例如,急性白血病、急性淋巴球性白血病、急性骨髓性白血病、急性骨髓母細胞性白血病、急性前骨髓性白血病、急性骨髓單核球性白血病、急性單核球白血病、急性紅血球性白血病、慢性白血病、慢性骨髓性白血病、慢性淋巴球性白血病)、真性紅血球增多症、淋巴瘤(例如霍奇金氏病或非霍奇金氏病)、華氏巨球蛋白血症、多發性骨髓瘤或重鏈病。在一個實施例中,癌症為固態腫瘤,諸如肉瘤或癌(例如,纖維肉瘤、黏液肉瘤、脂肪肉瘤、軟骨肉瘤、骨原性肉瘤、脊索瘤、血管肉瘤、內皮肉瘤、淋巴血管肉瘤、淋巴管內皮肉瘤、滑膜瘤、間皮瘤、尤文氏瘤、平滑肌肉瘤、橫紋肌肉瘤、結腸癌、胰臟癌、乳癌、卵巢癌(ovarian cancer)、前列腺癌、鱗狀細胞癌、基底細胞癌、腺癌、汗腺癌、皮脂腺癌、乳頭狀癌、乳頭狀腺癌、囊腺癌、髓質癌、支氣管癌、腎細胞癌、肝細胞瘤、膽管癌、絨毛膜癌、精原細胞瘤、胚胎性癌、威爾姆斯瘤、子宮頸癌、子宮癌、睪丸癌、肺癌、小細胞肺癌、膀胱癌、上皮癌、神經膠質瘤、星形細胞瘤、多形性神經膠質母細胞瘤(GBM、亦稱為神經膠質母細胞瘤)、髓母細胞瘤、顱咽管瘤、室管膜瘤、松果體瘤、血管母細胞瘤、聽神經瘤、寡樹突神經膠細胞瘤、神經鞘瘤、神經纖維肉瘤、腦膜瘤、黑色素瘤、神經母細胞瘤及視網膜母細胞瘤)。
在一些實施例中,癌症為神經膠質瘤、星形細胞瘤、多形性神經膠質母細胞瘤(GBM、亦稱為神經膠質母細胞瘤)、髓母細胞瘤、顱咽管瘤、室管膜瘤、松果體瘤、血管母細胞瘤、聽神經瘤、寡樹突神經膠細胞瘤、神經鞘瘤、神經纖維肉瘤、腦膜瘤、黑色素瘤、神經母細胞瘤或視網膜母細胞瘤。
在一些實施例中,癌症為聽神經瘤、星形細胞瘤(例如I級–毛狀星細胞瘤、II級–低級別星形細胞瘤、III級–未分化星形細胞瘤或IV級–神經膠質母細胞瘤(GBM))、脊索瘤、CNS淋巴瘤、顱咽管瘤、腦乾膠質瘤、室管膜瘤、混合膠質瘤、視神經膠質瘤、室管膜下瘤、髓母細胞瘤、腦膜瘤、轉移性腦腫瘤、寡樹突神經膠細胞瘤、垂體瘤、原始神經外胚層(PNET)腫瘤或神經鞘瘤。在一些實施例中,癌症為在兒童中比在成人中更常見的類型,諸如腦幹膠質瘤、顱咽管瘤、室管膜瘤、幼年毛狀星細胞瘤(JPA)、髓母細胞瘤、視神經膠質瘤、松果體腫瘤、原始神經外胚層腫瘤(PNET),或橫紋肌瘤。 自體免疫疾病及病症
在某些實施例中,病症為自體免疫病症。如本文所用,術語「自體免疫病症」及「自體免疫疾病」可互換使用,且包括傳統上歸類為自體免疫病症之彼等疾病及病症,以及發炎性病症及免疫病症(不包括病毒感染)。術語「自體免疫疾病」及「自體免疫病症」意欲包括由先天性免疫反應及適應性免疫反應驅動之所有疾病及病症,此等反應會引發某種先天免疫發炎反應。申請人意欲使術語「自體免疫疾病」及「自體免疫病症」包括由先天性炎症驅動之疾病及病症的全部範疇,病毒感染除外。
在某些實施例中,本發明提供自體免疫病症的治療。當免疫系統攻擊體內之正常細胞及/或組織時,通常會發生傳統的自體免疫病症。在沒有感染的情況下,發炎性疾病通常表現為慢性炎症(以及其他症狀)。自體免疫病症亦包括當細胞免疫系統對身體之自體抗原作出反應時出現的症狀。亦可能存在與一系列原發性免疫不全病相關之自體免疫及/或炎症表現。在此等實施例之其他態樣中,自體免疫疾病或病症與高LINE-1及/或HERV-K RNA蛋白表現水準相關。
本發明之一個實施例為一種治療I型乾擾素病的方法。在此實施例的一個態樣中,I型乾擾素病為與I型乾擾素過表現相關之先天性病症。在此實施例的一個態樣中,先天性I型乾擾素病選自艾卡迪-古特雷斯症候群(AGS)、Singleton-Merten症候群、蛋白酶體相關自體炎症症候群、慢性非典型嗜中性球皮膚病伴脂失養及體溫升高(CANDLE)、嬰兒期發病之STING相關血管病變(SAVI)、日本自體發炎性症候群伴脂失養(JASL)、脊椎軟骨發育不良(SPENCD)、ISG15缺乏症、泛素特異性肽酶18缺乏症(假性TORCH症候群)、慢性非典型神經性皮炎伴脂失養、DNA II缺乏症、發-肝-腸症候群2、視網膜血管病變伴腦白質失養、家族性凍瘡狀狼瘡及X性聯網狀色素性病症(XLPDR)。在另一個實施例中,I型乾擾素病為IFN系統中之獲得性病症。
在一個實施例中,本發明提供了一種治療導致干擾素過量產生之自體免疫疾病的方法。在此實施例之一個態樣中,所表現之干擾素包括I型乾擾素。在此實施例之另一態樣中,自體免疫疾病與升高之LINE-1活性及/或表現相關。在此實施例之另一態樣中,自體免疫疾病與升高之HERV-K RNA活性及/或表現相關。
在某些實施例中,自體免疫病症選自弛緩不能、艾迪森氏病(Addison's disease)、成人史迪爾氏症(adult Still's disease)、無γ球蛋白血症、斑禿、類澱粉變性、關節黏連性脊椎炎、抗GBM/抗TBM腎炎、抗磷脂質症候群、自體免疫性血管水腫、自體免疫性自主神經障礙、自體免疫性腦炎、自體免疫性肝炎、自體免疫性內耳病(AIED)、自體免疫性心肌炎、自體免疫性卵巢炎、自體免疫性睾丸炎、自體免疫性胰腺炎、自體免疫性視網膜病變、自體免疫性蕁麻疹、軸突及神經元神經病變(AMAN)、巴洛病(Balo disease)、白塞氏病(Behcet’s disease)、良性黏膜類天皰瘡、大皰性類天皰瘡、卡斯爾曼氏病(Castleman disease,CD)、乳糜瀉、卻格司氏病(Chagas disease)、慢性發炎脫髓鞘性多發神經病變(CIDP)、慢性複發性多因素骨髓炎(CRMO)、查格-施特勞斯症候群(Churg-Strauss syndrome)或嗜酸性肉芽腫、瘢痕性類天皰瘡、寇甘症候群(Cogan’s syndrome)、冷凝集素病、複雜的局部疼痛症候群(以前稱為反射性交感神經失養症)、先天性心臟傳導阻滯、柯薩克心肌炎(coxsackle myocarditis)、CREST症候群、克隆氏病(Crohn’s disease)、皮膚紅斑狼瘡(CLE)、泡疹樣皮炎、皮肌炎、戴維氏症(Devic’s disease) (視神經脊髓炎)、盤狀狼瘡、卓斯勒氏症候群(Dressler’s syndrome)、子宮內膜異位症、嗜酸性食管炎(EoE)、嗜酸性筋膜炎、結節性紅斑、原發性混合性冷凝球蛋白血症、埃文斯症候群(Evans syndrome)、纖維肌痛、纖維化肺泡炎、巨細胞動脈炎(顳動脈炎)、巨細胞心肌炎、腎小球性腎炎、古德帕斯丘氏症候群(Goodpasture’s syndrome)、肉芽腫病伴多血管炎、移植物抗宿主病、葛瑞夫茲氏病(Graves’ disease)、格巴二氏症候群(Guillain-Barre syndrome)、橋本氏甲狀腺炎(Hashimoto’s thyroiditis)、溶血性貧血、過敏性紫癜病(Henoch-Schonlein purpura,HSP)、妊娠疱疹或妊娠天皰瘡(PG)、化膿性汗腺炎(反常性痤瘡)、發炎性腸病、IgA腎病、IgG4-相關硬化病、免疫性血小板減少性紫癜病(ITP)、包涵體肌炎(IBM)、間質性膀胱炎(IC)、幼年型關節炎、幼年型糖尿病(I型糖尿病)、幼年型肌炎(JM)、川崎病(Kawasaki disease)、蘭伯特-伊頓症候群(Lambert-Eaton syndrome)、扁平苔蘚、硬化性苔蘚、木質性結膜炎、線性IgA病(LAD)、狼瘡性腎炎、萊姆病(慢性)、梅尼埃病(Meniere’s disease)、顯微多血管炎(MPA)、混合性結締組織病(MCTD)、多灶性運動神經病、多發性硬化症、重症肌無力、髓磷脂寡樹突細胞糖蛋白抗體障礙、肌炎、發作性睡病、新生兒狼瘡、嗜中性白血球減少症、眼疤痕性類天皰瘡、視神經炎、復發性風濕病、與鏈球菌感染相關之兒童自體免疫性神經精神疾病(PANDAS)、伴腫瘤性小腦變性(PCD)、陣發性夜間血紅素尿(PNH)、睫狀體扁平部炎(周邊眼色素層炎)、帕森吉-特納症候群(Parsonage-Turner syndrome)、天皰瘡、周邊神經病變、靜脈周邊腦脊髓炎、惡性貧血(PA)、POEMS症候群、風濕性多動脈炎、多發性肌炎、心肌梗塞後症候群、心包膜切開後症候群、原發性膽汁性膽管炎、原發性硬化性膽管炎、黃體激素皮炎、進行性半面萎縮(帕-羅二氏症候群(Parry Romberg syndrome))、牛皮癬、牛皮癬性關節炎、純紅血球再生不良、壞疽性膿皮病、雷諾氏現象(Raynoud’s phenomena)、反應性關節炎、復發性多軟骨炎、不寧腿症候群(RLS)、腹膜後纖維變性、風濕熱、類風濕性關節炎(RA)、類肉瘤病、施密特症候群(自體免疫多內分泌症候群II型)、鞏膜炎、硬皮病、休格倫氏病、僵人症候群、蘇薩克氏症候群(Susac’s syndrome)、交感性眼炎、全身性紅斑狼瘡(SLE)、高安氏動脈炎(Takayasu’s arteritis)、血栓性血小板減少性紫癜病、甲狀腺眼病、托洛薩-亨特症候群(Tolosa-Hunt syndrome)、橫貫性脊髓炎、潰瘍性結腸炎、未分化結締組織病、眼色素層炎、血管炎、白斑病、原田氏病(Vogt-Koyanagi-Harada disease)及溫熱性自體免疫溶血性貧血。
在某些實施例中、自體免疫病症選自艾卡迪-古特雷斯症候群、類風濕性關節炎、牛皮癬、全身性紅斑狼瘡(SLE)、皮膚紅斑狼瘡(CLE)、移植物抗宿主病、硬皮病、I型糖尿病、皮肌炎、發炎性腸病、潰瘍性結腸炎、克隆氏病、血管炎及休格倫氏症候群。
在某些實施例中,自體免疫病症為艾卡迪-古特雷斯症候群(AGS)。在另一個實施例中,自體免疫病症為全身性紅斑狼瘡(SLE)。在另一個實施例中,自體免疫疾病為狼瘡性腎炎。在又一實施例中,自體免疫疾病為皮膚紅斑狼瘡(CLE)。在另一實施例中,自體免疫疾病為皮肌炎。
在某些實施例中,自體免疫病症為1型乾擾素病。在某些實施例中,自體免疫病症為1型糖尿病、艾卡迪-古特雷斯症候群(AGS)、全身性紅斑狼瘡(SLE)、狼瘡性腎炎、皮膚紅斑狼瘡(CLE)、家族性凍瘡性狼瘡、全身性硬化症、嬰兒期發病之STING相關血管病變(SAVI)、休格倫氏症候群或皮肌炎。在某些實施例中,免疫病症為1型乾擾素病、1型糖尿病、艾卡迪-古特雷斯症候群(AGS)、全身性紅斑狼瘡(SLE)、狼瘡性腎炎、皮膚紅斑狼瘡(CLE)、皮肌炎或休格倫氏症候群。在某些實施例中,自體免疫病症為全身性紅斑狼瘡(SLE)、狼瘡性腎炎、皮膚紅斑狼瘡(CLE)或家族性凍瘡狀狼瘡。在某些實施例中,免疫病症為全身性紅斑狼瘡(SLE)。
在某些實施例中,自體免疫病症為1型糖尿病。在某些實施例中,自體免疫病症為家族性凍瘡狀狼瘡。在某些實施例中,自體免疫病症為全身性硬化症。在某些實施例中,自體免疫病症為嬰兒期發病之STING相關血管病變(SAVI)。在某些實施例中,自體免疫病症為休格倫氏症候群。
在某些實施例中,自體免疫病症為發炎性腸道疾病、克隆氏病或潰瘍性結腸炎。在某些實施例中,自體免疫病症為發炎性腸道疾病。在某些實施例中,自體免疫病症為克隆氏病。在某些實施例中,自體免疫病症為潰瘍性結腸炎。在一個實施例中,自體免疫病症為藥物誘發之結腸炎,諸如與向癌症患者投與檢查點抑制劑相關的結腸炎。
在某些實施例中,自體免疫病症為骨關節炎、非酒精性脂肪性肝炎(NASH)、非酒精性脂肪肝病(NAFLD)、膽汁淤積性肝病、硬化性膽管炎、哮喘、支氣管炎、慢性阻塞性肺病(COPD)、肺纖維化、肺動脈高壓、心包炎、痛風或肌炎。
在某些實施例中,自體免疫病症為瑞特氏症候群(Reiter's syndrome)、剝脫性銀屑病皮炎、尋常型天皰瘡、自體免疫性眼色素層炎、肺含鐵血黃素沉著、類澱粉變性、口瘡口炎、甲狀腺炎、胃炎、腎上腺炎(艾迪森氏病)、卵巢炎、原發性膽汁性肝硬化、重症肌無力、性腺衰竭、副甲狀腺低能症、脫髮、吸收不良症候群、惡性貧血、肝炎、低腦垂腺功能症、尿崩症或乾燥症候群。 神經病症
在某些實施例中,病症為神經病症。在某些實施例中,神經病症為阿茲海默氏症(Alzheimer’s disease)、肌萎縮性脊髓側索硬化症(ALS)、多發性硬化症、帕金森氏症(Parkinson’s disease)、亨汀頓氏舞蹈症(Huntington’s disease)、周邊神經病變、年齡相關性黃斑退化、克雅氏病(Creutzfeldt-Jacob disease)、中風、朊病毒病、額顳葉癡呆、匹克氏症(Pick’s disease)、進行性核上神經麻痺症、脊髓小腦性失調症、路易體病、癡呆、多系統萎縮、癲癇、雙極性障礙、精神分裂症、焦慮症或重度抑鬱症。在某些實施例中,神經病症為阿茲海默氏症、肌萎縮性脊髓側索硬化症(ALS)、多發性硬化症、帕金森氏症、亨汀頓氏舞蹈症或癡呆。在另一個實施例中,神經病症為ALS或進行性核上神經麻痺症。
在某些實施例中,神經疾病為周邊神經病變、年齡相關性黃斑退化、克雅氏病、中風、朊病毒病、額顳葉癡呆、皮克氏病、進行性核上神經麻痺症、脊髓小腦性失調症、路易體病、癡呆、多系統萎縮、癲癇、雙極性障礙、精神分裂症、焦慮症或重度抑鬱症。
在某些實施例中,神經病症為阿茲海默氏症。在其他實施例中,神經病症為肌萎縮性脊髓側索硬化症(ALS)。在另一實施例中,神經病症為多發性硬化症。在又一實施例中,神經病症為帕金森氏症。在另一個實施例中,神經病症為亨汀頓氏舞蹈症。在另一個實施例中,神經病症為癡呆。在某些實施例中,神經病症為年齡相關性黃斑退化。在另一個實施例中,神經病症為進行性核上神經麻痺症。在某些實施例中,神經病症為中風。 病毒感染
在某些實施例中,病毒感染係由人類免疫缺乏病毒1或2 (HIV-1或HIV-2)、人類T細胞白血病病毒1或2 (HTLV-1或HTLV-2)、呼吸道融合病毒(RSV)、人類乳突狀瘤病毒(HPV)、腺病毒、B型肝炎病毒(HBV)、C型肝炎病毒(HCV)、愛潑斯坦-巴爾病毒(EBV)、水痘帶狀皰狀病毒(VZV)、巨細胞病毒(CMV)、單純疱疹病毒1或2 (HSV-1或HSV-2)、人類疱疹病毒8 (HHV-8,亦稱為卡波西氏肉瘤相關病毒)或選自黃熱病毒、登革熱病毒、日本腦炎病毒及西尼羅河病毒之黃病毒引起之感染。
在某些實施例中,病毒感染係由人類免疫缺乏病毒1或2 (HIV-1或HIV-2)引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由人類免疫缺乏病毒1 (HIV-1)引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由人類免疫缺乏病毒2 (HIV-2)引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由人類T細胞白血病病毒1或2 (HTLV-1或HTLV-2)引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由呼吸道融合病毒(RSV)引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由人類乳突狀瘤病毒(HPV)引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由腺病毒引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由B型肝炎病毒(HBV)引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由C型肝炎病毒(HCV)引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由愛潑斯坦-巴爾病毒(EBV)引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由水痘帶狀皰狀病毒(VZV)引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由巨細胞病毒(CMV)引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由單純疱疹病毒1或2 (HSV-1或HSV-2)引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由人類疱疹病毒8 (HHV-8,亦稱為卡波西氏肉瘤相關病毒)引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由選自黃熱病毒、登革熱病毒、日本腦炎病毒及西尼羅河病毒之黃病毒引起之感染。
在某些實施例中,病毒感染係由腺病毒引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由疱疹病毒引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由痘病毒引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由小病毒引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由里奧病毒引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由小核糖核酸病毒引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由鼻病毒或腸病毒引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由披衣病毒引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由正黏液病毒引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由棒狀病毒引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由逆轉錄病毒引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由肝炎病毒引起之感染。
在某些實施例中,病毒感染係由冠狀病毒引起之感染。在一些實施例中,冠狀病毒為α、β、γ或δ冠狀病毒。在某些實施例中,病毒感染係由選自229E (α冠狀病毒)、NL63 (α冠狀病毒)、OC43 (β冠狀病毒)、HKU1 (β冠狀病毒)、MERS-CoV (β冠狀病毒)、SARS-CoV (β冠狀病毒)及SARS-CoV-2 (冠狀病毒病2019,或COVID-19)之冠狀病毒引起之感染。
在某些實施例中,病毒感染係由流感病毒引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由A型或B型流感病毒引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由選自H5N1、H1N1及H3N2之流感病毒引起之感染。
在某些實施例中,病毒感染係由小兒麻痺病毒引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由1型小兒麻痺病毒引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由2型小兒麻痺病毒引起之感染。在某些實施例中,病毒感染係由3型小兒麻痺病毒引起之感染。 個體
在某些實施例中,個體具有(i) LINE1 RNA、LINE1 ORF1多肽及/或LINE1 ORF2多肽之表現;(ii) LINE1逆轉錄酶之活性;(iii) HERV-K RNA之表現,及/或(iv) HERV-K逆轉錄酶之活性。
在某些實施例中,個體具有(i) LINE1 RNA、LINE1 ORF1多肽及/或LINE1 ORF2多肽之表現;及/或(ii) LINE1逆轉錄酶之活性。在某些實施例中,個體具有(i)升高之LINE1 RNA、LINE1 ORF1多肽及/或LINE1 ORF2多肽表現;及/或(ii)升高之LINE1逆轉錄酶活性。在某些實施例中,個體具有LINE1 RNA、LINE1 ORF1多肽及/或LINE1 ORF2多肽之表現。在某些實施例中,個體具有LINE1 RNA之表現。在某些實施例中,個體具有LINE1 ORF1多肽之表現。在某些實施例中,個體具有LINE1 ORF2多肽之表現。在某些實施例中,個體具有LINE1逆轉錄酶之活性。
在某些實施例中,個體具有(i) HERV-K RNA之表現,及/或(ii) HERV-K逆轉錄酶之活性。在某些實施例中,個體具有HERV-K RNA之表現。在某些實施例中,個體具有HERV-K逆轉錄酶之活性。
在某些實施例中,個體具有升高之(i) LINE1 RNA、LINE1 ORF1多肽及/或LINE1 ORF2多肽水準;(ii) LINE1逆轉錄酶活性;(iii) HERV-K RNA水準,及/或(iv) HERV-K逆轉錄酶活性。
在某些實施例中,個體具有升高之(i) LINE1 RNA、LINE1 ORF1多肽及/或LINE1 ORF2多肽水準;(ii) LINE1逆轉錄酶活性。在某些實施例中,個體具有升高之LINE1 RNA、LINE1 ORF1多肽及/或LINE1 ORF2多肽水準。在某些實施例中,個體具有升高之LINE1 RNA水準。在某些實施例中,個體具有升高之LINE1 ORF1多肽水準。在某些實施例中,個體具有升高之LINE1 ORF2多肽水準。在某些實施例中,個體具有升高之LINE1逆轉錄酶活性。
在某些實施例中,個體具有升高之(i) HERV-K RNA水準,及/或(ii) HERV-K逆轉錄酶活性。在某些實施例中,個體具有升高之HERV-K RNA水準。在某些實施例中,個體具有升高之HERV-K逆轉錄酶活性。
在某些實施例中,個體為人類。在某些實施例中,個體為成年人。在某些實施例中,個體為兒科人。在某些實施例中,個體為伴生動物。在某些實施例中,個體為犬科動物、貓科動物或馬科動物。 化合物之用途
本揭示案之另一態樣提供一種本文所述之化合物(諸如式I化合物或第III章節中之其他化合物)用於治療醫學病症(諸如本文所述之醫學病症)的用途。
本揭示案之另一態樣提供一種本文所述之化合物(諸如式I化合物或第III章節中之其他化合物)在製造藥劑中的用途。在某些實施例中,藥劑係用於治療本文所述之病症,諸如癌症、自體免疫病症及/或神經病症。在某些實施例中,病症為衰老,或與衰老相關之疾病。 抑制個體中之 LINE1 / HERV-K 逆轉錄酶活性的方法
本發明之另一實施例提供一種抑制個體中之LINE1逆轉錄酶活性的方法,該個體患有選自由癌症、自體免疫病症及神經病症組成之群的病症。該方法包含使LINE1逆轉錄酶與有效量的式I化合物接觸,以抑制該LINE1逆轉錄酶之活性;其中式I化合物如以上實施例一至二十二中的任一項中所描述。在該方法中有用之其他化合物在第III章節中進一步描述。在某些實施例中,該方法包括投與表1及表2中之任何化合物或其醫藥學上可接受之鹽及/或包含它們的醫藥組合物。
本發明之另一個實施例提供了一種抑制個體中之LINE1逆轉錄酶活性之方法,該方法包含使LINE1逆轉錄酶與有效量的根據式I之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,或包含根據式I之化合物的組合物接觸,以抑制該LINE1逆轉錄酶之活性。
在某些實施例中,病症係由上述實施例之一定義的病症,諸如癌症、自體免疫病症及/或神經病症。在某些實施例中,病症為衰老,或與衰老相關之疾病。
在某些實施例中,該方法進一步包含抑制個體中之HERV-K逆轉錄酶活性。
本發明之另一實施例提供一種抑制個體中之LINE1逆轉錄酶活性的方法,該個體患有選自由癌症、自體免疫病症及神經病症組成之群的病症。該方法包含使LINE1逆轉錄酶與有效量的本文所述之化合物接觸,諸如式I之化合物或表1、1-A、1-B、2、2-A或2-B中之化合物,以抑制該LINE1逆轉錄酶的活性。
在某些實施例中,病症係由上述實施例之一定義的病症,諸如癌症、自體免疫病症及/或神經病症。
在某些實施例中,該方法進一步包含抑制個體中之HERV-K逆轉錄酶活性。
在某些實施例中,特定化合物係針對本文之任何實施例,在所描述之各種實施例及實施例之態樣的任何及所有組合中描述之化合物。例如,在某些實施例中,化合物為式II、III、IV、V或VI之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、1-B、1-C、2、2-A、2-B或2-C中之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、1-B、1-C、1-D、2、2-A、2-B或2-C中之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、1-B、1-C、2、2-A、2-B或2-C中之化合物。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、1-B、1-C、1-D、2、2-A、2-B或2-C中之化合物。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、1-C、2、2-A或2-C中之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、1-C、2、2-A或2-C中之化合物。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、1-B、2、2-A或2-B中之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、1-B、2、2-A或2-B中之化合物。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、2 或2-A中之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、2或2-A中之化合物。在某些實施例中,化合物為表1-B或2-B中之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為表1-B或2-B中之化合物。在某些實施例中,化合物為表1或2中之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為表1或2中之化合物。
在某些實施例中,化合物以包含化合物及載劑、賦形劑及/或媒劑之醫藥組合物投與,如下文第V章節中進一步所描述。
本發明之另一實施例提供一種抑制LINE1逆轉錄酶活性之方法。該方法包含使LINE1逆轉錄酶與有效量的本文所述之化合物接觸,諸如表1、1-A或1-B中之化合物,以抑制該LINE1逆轉錄酶的活性。在某些實施例中,特定化合物係針對本文之任何實施例,在所描述之各種實施例及實施例之態樣的任何及所有組合中描述之化合物。例如,在某些實施例中,化合物為式I、II、III、IV、V或VI之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為式II、III或IV之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。
在某些實施例中,化合物以包含化合物及載劑、賦形劑及/或媒劑之醫藥組合物投與,如下文第V章節中進一步所描述。
本發明之另一態樣提供一種抑制個體中之HERV-K逆轉錄酶活性的方法,該個體患有選自由癌症、自體免疫病症及神經病症組成之群的病症。該方法包含使HERV-K逆轉錄酶與有效量的式I化合物接觸,以抑制該HERV-K逆轉錄酶之活性,其中式I化合物如以上實施例一至二十二中任一項所描述。在該方法中有用之其他化合物在第III章節中進一步描述。在某些實施例中,該方法包括投與表1及表2中之任何化合物或其醫藥學上可接受之鹽及/或包含它們的醫藥組合物。
本揭示案之另一態樣提供一種抑制個體中之HERV-K逆轉錄酶活性之方法,該方法包含使HERV-K逆轉錄酶與有效量的根據式I之化合物或其醫藥學上可接受之鹽或包含式I化合物之組合物接觸,以抑制該HERV-K逆轉錄酶的活性。
在某些實施例中,病症係由以上第I章節中所述實施例之一定義的病症,諸如癌症、自體免疫病症及/或神經病症。在某些實施例中,病症為衰老,或與衰老相關之疾病。
在某些實施例中,該方法進一步包含抑制個體中之LINE1逆轉錄酶活性。
本發明之另一實施例提供一種抑制個體中之HERV-K逆轉錄酶活性的方法,該個體患有選自由癌症、自體免疫病症及神經病症組成之群的病症。該方法包含使HERV-K逆轉錄酶與有效量的本文所述之化合物接觸,諸如式I之化合物或表1、1-A、1-B、2或2-A中之化合物,以抑制該HERV-K逆轉錄酶的活性。
在某些實施例中,病症係由上述實施例之一定義的病症,諸如癌症、自體免疫病症及/或神經病症。
在某些實施例中,該方法進一步包含抑制個體中之LINE1逆轉錄酶活性。
在某些實施例中,特定化合物係針對本文之任何實施例,在所描述之各種實施例及實施例之態樣的任何及所有組合中描述之化合物。例如,在某些實施例中,化合物為式II、III、IV、V或VI之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、1-B、1-C、2、2-A、2-B或2-C中之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、1-B、1-C、1-D、2、2-A、2-B或2-C中之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、1-B、1-C、2、2-A、2-B或2-C中之化合物。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、1-B、1-C、1-D、2、2-A、2-B或2-C中之化合物。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、1-C、2、2-A或2-C中之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、1-C、2、2-A或2-C中之化合物。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、1-B、2、2-A或2-B中之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、1-B、2、2-A或2-B中之化合物。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、2或2-A中之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為表1、1-A、2或2-A中之化合物。在某些實施例中,化合物為表1-B或2-B中之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為表1-B或2-B中之化合物。在某些實施例中,化合物為表1或2中之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為表1或2中之化合物。
在某些實施例中,化合物以包含化合物及載劑、賦形劑及/或媒劑之醫藥組合物投與,如下文第V章節中進一步所描述。
本發明之另一實施例提供一種抑制HERV-K逆轉錄酶活性之方法。該方法包含使HERV-K逆轉錄酶與有效量的本文所述之化合物接觸,諸如表1、1-A或1-B中之化合物,以抑制該HERV-K逆轉錄酶之活性。在某些實施例中,特定化合物係針對本文之任何實施例,在所描述之各種實施例及實施例之態樣的任何及所有組合中描述之化合物。例如,在某些實施例中,化合物為式I、II、III、IV、V或VI之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,化合物為式II、III或IV之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。
本揭示案之一個態樣提供具有優異特性組合的化合物,此等特性包括對LINE1逆轉錄酶之有效抑制活性、抑制LINE1逆轉錄酶之選擇性,以及使該等化合物非常適合用作經口投與藥劑之優異物理特性。抑制LINE1逆轉錄酶之選擇性可以根據化合物抑制LINE1逆轉錄酶同時對DNA聚合酶( 例如,α、β及γ)具有實質上較低抑制活性的能力來表徵。部分由於抑制DNA聚合酶(諸如DNA聚合酶γ)會導致線粒體毒性形式之毒性,對LINE1逆轉錄酶表現出有效抑制活性同時對DNA聚合酶具有實質上較低抑制活性的化合物係一個重要發現及重大科學進步。對LINE1逆轉錄酶之有效抑制活性與對DNA聚合酶之低抑制活性相結合有助於主題化合物的高治療指數,藉此為該化合物在醫療中提供優異性能概況。本文之實驗結果證明了此等益處。
本揭示案之另一態樣提供具有優異特性組合的化合物,此等特性包括對LINE1逆轉錄酶之有效抑制活性、抑制LINE1逆轉錄酶之選擇性,有效抑制發炎性組織中之致病干擾素反應,以及使該等化合物非常適合用作經口投與藥劑之優異物理特性。如上所述,抑制LINE1逆轉錄酶之選擇性可以根據化合物抑制LINE1逆轉錄酶同時對DNA聚合酶( 例如,α、β及γ)具有實質上較低抑制活性的能力來表徵。部分由於抑制DNA聚合酶(諸如DNA聚合酶γ)會導致線粒體毒性形式之毒性,對LINE1逆轉錄酶表現出有效抑制活性同時對DNA聚合酶( 例如,α、β及γ)具有實質上較低抑制活性的化合物係一個重要發現及重大科學進步。有效抑制發炎性組織中之致病干擾素反應之化合物可用於治療癌症、自體免疫疾病(例如,SLE及CLE)、神經病症、衰老及與衰老相關之疾病。對LINE1逆轉錄酶之有效抑制活性與對DNA聚合酶( 例如,α、β及γ)之低抑制活性相結合有助於主題化合物的高治療指數,藉此為該化合物在醫療中提供優異性能概況。
本揭示案之另一態樣提供具有優異特性組合的化合物,此等特性包括對HERV-K逆轉錄酶之有效抑制活性、抑制HERV-K逆轉錄酶之選擇性,以及使該等化合物非常適合用作經口投與藥劑之優異物理特性。抑制HERV-K逆轉錄酶之選擇性可以根據化合物抑制HERV-K逆轉錄酶同時對DNA聚合酶( 例如,α、β及γ)具有實質上較低抑制活性的能力來表徵。部分由於抑制DNA聚合酶(諸如DNA聚合酶γ)會導致線粒體毒性形式之毒性,對HERV-K逆轉錄酶表現出有效抑制活性同時對DNA聚合酶具有實質上較低抑制活性的化合物係一個重要的重大科學進步。作為HERV-K逆轉錄酶有效抑制劑之化合物可用於治療HERV-K逆轉錄酶相關病症。對HERV-K逆轉錄酶之有效抑制活性與對DNA聚合酶之低抑制活性相結合有助於主題化合物的高治療指數,藉此為該化合物在醫療中提供優異性能概況。
在某些實施例中,化合物以包含化合物及載劑、賦形劑及/或媒劑之醫藥組合物投與,如下文第V章節中進一步所描述。
可以檢驗化合物抑制LINE1逆轉錄酶活性之能力,例如,如實例中所述。可以檢驗化合物抑制HERV-K逆轉錄酶活性之能力,例如,如實例中所述。 III. 額外化合物
以上第II章節中描述之方法可以根據方法中所使用之化合物進一步表徵。下文描述了用於該等方法之額外示例性化合物,以及製備該等化合物之示例性程序。
在某些實施例中,用於上述方法之化合物為可見於表2中之式I化合物: 2.
化合物編號 結構 名稱
23 (2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基-9H-嘌呤-9-基)-2-乙炔基-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇
24 異丁酸(2R,3R,4R,5R)-5-(4-胺基-2-側氧基嘧啶-1(2H)-基)-2-(氯甲基)-4-氟基-2-((異丁醯氧基)甲基)四氫呋喃-3-酯
25 (2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氯基-9H-嘌呤-9-基)-2-乙炔基-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇
26 (2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基-9H-嘌呤-9-基)-3-羥基-2-(羥甲基)四氫呋喃-2-甲腈
27 (2R,3S,5R)-5-(6-胺基-9H-嘌呤-9-基)-2-乙炔基-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇
28 1-((2R,3R,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-4-(羥胺基)嘧啶-2(1H)-酮
29 1-((2R,3R,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
30 1-((2R,4S,5R)-5-疊氮基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
31 4-胺基-1-((2R,3R,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
32 4-胺基-1-((2R,3R,4R,5R)-5-乙炔基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
33 1-((2R,3R,4R,5R)-5-乙炔基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
34 1-((2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
35 4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-5-乙炔基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
36 1-((2R,3S,4R,5R)-5-乙炔基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
37 (2R,3S,5R)-5-(4-胺基吡咯并[2,1-f][1,2,4]三嗪-7-基)-2-乙炔基-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇
38 1-((2R,4S,5R)-5-乙炔基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
39    1-((2R,3S,4R,5R)-5-乙炔基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
40 4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
41 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-乙炔基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
42 (2R,3R,4S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基-9H-嘌呤-9-基)-2-乙炔基-4-氟基-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇
43 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-乙烯基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
44 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-乙基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
45 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-(氟甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
46    2-胺基-9-((2R,4S,5R)-5-(氟甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-1,9-二氫-6H-嘌呤-6-酮
47 4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)-5-乙烯基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
48 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-甲氧基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
49    4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-疊氮基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
   50 4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-5-疊氮基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
51 4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-5-乙基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
在某些實施例中,用於上述方法之化合物為本文表2、2-A、2-B或2-C中之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,用於上述方法之化合物為本文表2、2-A、2-B或2-C中之化合物。在某些實施例中,用於上述方法之化合物為本文表2、2-A或2-B中之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,用於上述方法之化合物為本文表2、2-A或2-B中之化合物。在某些實施例中,用於上述方法之化合物為本文表2或2-A中之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,用於上述方法之化合物為本文表2或2-A中之化合物。在某些實施例中,用於上述方法之化合物為下文表2-A中之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,用於上述方法之化合物為下文表2-A中之化合物。在某些實施例中,用於上述方法之化合物為下文表2-B中之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,用於上述方法之化合物為下文表2-B中之化合物。在某些實施例中,用於上述方法之化合物為下文表2-C中之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,用於上述方法之化合物為下文表2-C中之化合物。 2-A.
化合物 結構 名稱
106 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-甲基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
107 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-乙炔基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮
108 2-胺基-9-((2R,4S,5R)-5-疊氮基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-1,9-二氫-6H-嘌呤-6-酮
109 (2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基-9H-嘌呤-9-基)-2-(羥甲基)-2-乙烯基四氫呋喃-3-醇
110 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-(二氟甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)-四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
111 4-胺基-1-((2R,4R,5R)-3,3-二氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
112 4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-5-乙炔基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)-四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮
113 4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(氟甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)-四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
114 4-胺基-1-((2R,3S,4S,5R)-5-(氯甲基)-3,4-二羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
115 2-胺基-9-((2R,4S,5R)-5-乙基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-1,9-二氫-6H-嘌呤-6-酮
116 4-胺基-1-((2R,3S,4S,5R)-5-乙炔基-3,4-二羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮
117 1-((2R,4S)-4-羥基-5,5-雙(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
118 4-胺基-1-((2R,3S,4S,5R)-3,4-二羥基-5-(羥甲基)-5-甲基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮
2-B.
化合物 結構
35-TP
40-TP
2-C.
化合物 結構
165
166
167
168
169
170
171
172
在某些實施例中,化合物為式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽排除表2中列出之所有化合物。在某些實施例中,式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽排除表2、2-A及2-B中列出之所有化合物。在某些實施例中,式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽為表1、表1-A或表1-B中列出之化合物。在某些實施例中,式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽為表1、表1-A、表1-B或表1-C中列出之化合物。在某些實施例中,式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽為表1、表1-A、表1-B、表1-C或表1-D中列出之化合物。在某些實施例中,式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽為表1中列出之化合物。在任何此等實施例中,化合物為式I化合物。 IV. 組合療法
本揭示案之另一態樣提供組合療法。在某些實施例中,上文描述之方法進一步包含投與一或多種額外治療劑來治療醫學病症( 例如,根據第II章節中描述之方法)。因此,在一些實施例中,本發明之方法進一步包含投與有效量之一或多種額外治療劑。
本文所述之使用組合療法治療疾病的方法中之每一者可根據方法中使用之額外治療劑進一步表徵。例如,在某些實施例中,額外治療劑為本文所提供之第二化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,額外治療劑為本文所提供之第二化合物。
在某些實施例中,額外治療劑為司他夫定(stavudine)、其前藥或前述任一種之醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,額外治療劑為司他夫定、斯坦匹定或前述任一種之醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,額外治療劑為司他夫定或斯坦匹定。
在某些實施例中,額外治療劑為替諾福韋(tenofovir)、其前藥或前述任一種之醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,額外治療劑為替諾福韋、替諾福韋艾拉酚胺(tenofovir alafenamide)、替諾福韋胺丁苯胺(tenofovir amibufenamide)、替諾福韋地索普西(tenofovir disoproxil)或替諾福韋依昔利得(tenofovir exalidex);或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,額外治療劑為替諾福韋、替諾福韋艾拉酚胺、替諾福韋胺丁苯胺、替諾福韋地索普西或替諾福韋依昔利得。
在某些實施例中,額外治療劑為替諾福韋,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,額外治療劑為替諾福韋。在某些實施例中,額外治療劑為替諾福韋艾拉酚胺,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,額外治療劑為替諾福韋艾拉酚胺。在某些實施例中,額外治療劑為替諾福韋胺丁苯胺,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,額外治療劑為替諾福韋胺丁苯胺。在某些實施例中,額外治療劑為替諾福韋地索普西,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,額外治療劑為替諾福韋地索普西,或其富馬酸鹽、琥珀酸鹽、馬來酸鹽、乳清酸鹽、天冬胺酸鹽或磷酸鹽。在某些實施例中,額外治療劑為替諾福韋地索普西,或其富馬酸鹽、琥珀酸鹽或馬來酸鹽。在某些實施例中,額外治療劑為替諾福韋地索普西。在某些實施例中,額外治療劑為替諾福韋依昔利得,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,額外治療劑為替諾福韋依昔利得,或其鉀鹽。在某些實施例中,額外治療劑為替諾福韋依昔利得。
在一些實施例中,本發明提供了一種治療所揭示之疾病或疾患的方法,該方法包含向有此需要之患者投與有效量的本文所揭示之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,且同時、分開或依次共投與有效量的一或多種額外治療劑,諸如本文所述之彼等。在一些實施例中,該方法包括共投與一種額外治療劑。在一些實施例中,該方法包括共投與兩種額外治療劑。在一些實施例中,所揭示之化合物與一或多種額外治療劑的組合協同作用。
一或多種其他治療劑可以與本發明之化合物或 組合物分開投與,作為多劑量方案之一部分。或者,一或多種其他治療劑可以為單一劑型的一部分,與本發明化合物混合在單一組合物中。若以多劑量方案投與,則一或多種其他治療劑及本發明之化合物或組合物可以同時、依次或在彼此間隔的一段時間內,例如在1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23或24小時內分開投與。在一些實施例中,一或多種其他治療劑及本發明之化合物或組合物作為多劑量方案間隔超過24小時投與。
組合療法中使用之活性成分的劑量及給藥方案可由主治臨床醫生確定。在某些實施例中,本文所述之化合物,諸如式I化合物,包括第III章節中之其他化合物,以及額外治療劑( 例如,下文所述之第二、第三或第四或第五抗癌劑)以此等藥劑用作治療病症的單一療法時通常使用之劑量投與。在某些實施例中,本文所述之化合物,諸如式I化合物,包括第III章節中之其他化合物,以及額外治療劑( 例如,下文所述之第二、第三或第四或第五抗癌劑)以低於此等藥劑用作治療病症的單一療法時通常使用之劑量之劑量投與。在某些實施例中,本文所述之化合物,諸如式I化合物,包括第III章節中之其他化合物,以及額外治療劑(例如,下文所述之第二、第三或第四或第五抗癌劑)存在於相同醫藥組合物中,其適合於經口投與。
在某些實施例中,本文所述之化合物,諸如式I化合物,包括第III章節中之其他化合物,以及額外治療劑( 例如,下文所述之第二、第三或第四或第五抗癌劑)可能相加或協同作用。協同組合可以允許使用較低劑量之一或多種藥劑及/或較低頻率地投與組合療法之一或多種藥劑。一或多種藥劑的較低劑量或較低頻率之投與可降低療法之毒性而不降低療法之功效。
本發明之另一態樣為一種套組,其包含治療有效量的本文所述之化合物,諸如式I化合物,包括第III章節中之其他化合物、醫藥學上可接受之載劑、佐劑或媒劑,以及視情況至少一種以下所列出之額外治療劑。 癌症
因此,本揭示案之另一態樣提供一種治療患者癌症之方法。該方法包含向有此需要之個體投與(i)治療有效量之式I化合物,包括選自表1或表2之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,及(ii)第二抗癌劑,以治療癌症。在某些實施例中,該方法包含向有此需要之個體投與(i)治療有效量之本文所述的化合物(諸如式I、II、III、IV、V或VI之化合物),或其醫藥學上可接受之鹽,及(ii)第二抗癌劑,以治療癌症。
在某些實施例中,第二抗癌劑為放射療法。
在某些實施例中,第二抗癌劑為治療性抗體。在某些實施例中,治療性抗體靶向以下之一:CD20、CD30、CD33、CD52、EpCAM、CEA、gpA33、黏蛋白、TAG-72、CAIX、PSMA、葉酸結合蛋白、神經節苷脂、Le、VEGF、VEGFR、VEGFR2、整合素αVβ3、整合素α5β1、EGFR、ERBB2、ERBB3、MET、IGF1R、EPHA3、TRAILR1、TRAILR2、RANKL、FAP、tenascin、CD19、KIR、NKG2A、CD47、CEACAM1、c-MET、VISTA、CD73、CD38、BAFF、介白素-1 β、B4GALNT1、介白素-6及介白素-6受體。在某些實施例中,治療性抗體靶向VEGFR3或TRAILR3。
在某些實施例中,第二抗癌劑為選自由以下組成之群的治療性抗體:利妥昔單抗(rituximab)、替伊莫單抗(ibritumomab tiuxetan)、托西莫單抗(tositumomab)、奧比妥珠單抗(obinutuzumab)、奧法木單抗(ofatumumab)、維布妥昔單抗(brentuximab vedotin)、吉妥珠單抗奧唑米星(gemtuzumab ozogamicin)、阿侖珠單抗(alemtuzumab)、IGN101、阿替卡單抗(adecatumumab)、拉貝妥珠單抗(labetuzumab)、huA33、派姆單抗(pemtumomab)、奧戈伏單抗(oregovomab)、米妥單抗(minetumomab)、cG250、J591、Mov18、法妥珠單抗(farletuzumab)、3F8、ch14.18、KW-2871、hu3S193、lgN311、貝伐珠單抗(bevacizumab)、IM-2C6、帕唑帕尼(pazopanib)、索拉非尼(sorafenib)、阿昔替尼(axitinib)、CDP791、樂伐替尼(lenvatinib)、雷莫蘆單抗(ramucirumab)、埃達珠單抗(etaracizumab)、伏洛昔單抗(volociximab)、西妥昔單抗(cetuximab)、帕尼單抗(panitumumab)、尼妥珠單抗(nimotuzumab)、806、阿法替尼(afatinib)、厄洛替尼(erlotinib)、吉非替尼(gefitinib)、奧希替尼(osimertinib)、凡德他尼(vandetanib)、曲妥珠單抗(trastuzumab)、帕妥珠單抗(pertuzumab)、MM-121、AMG 102、METMAB、SCH 900105、AVE1642、IMC-A12、MK-0646、R1507、CP 751871、KB004、IIIA-4、馬帕木單抗(mapatumumab)、HGS-ETR2、CS-1008、地諾單抗(denosumab)、西羅珠單抗(sibrotuzumab)、F19、81C6、MEDI551、利瑞魯單抗(lirilumab)、MEDI9447、達雷木單抗(daratumumab)、貝利尤單抗(belimumab)、卡那單抗(canakinumab)、地努圖希單抗(dinutuximab)、司妥昔單抗(siltuximab)及托珠單抗(tocilizumab)。在某些實施例中,第二抗癌劑為選自由以下組成之群的治療性抗體:利妥昔單抗、替伊莫單抗、托西莫單抗、奧比妥珠單抗、奧法木單抗、維布妥昔單抗、吉妥珠單抗奧唑米星、阿侖珠單抗、IGN101、阿替卡單抗、拉貝妥珠單抗、huA33、派姆單抗、奧戈伏單抗、米妥單抗、cG250、J591、Mov18、法妥珠單抗、3F8、ch14.18、KW-2871、hu3S193、lgN311、貝伐珠單抗、IM-2C6、CDP791、雷莫蘆單抗、埃達珠單抗、伏洛昔單抗、西妥昔單抗、帕尼單抗、尼妥珠單抗、806、曲妥珠單抗、帕妥珠單抗、MM-121、AMG 102、METMAB、SCH 900105、AVE1642、IMC-A12、MK-0646、R1507、CP 751871、KB004、IIIA-4、馬帕木單抗、HGS-ETR2、CS-1008、地諾單抗、西羅珠單抗、F19、81C6、MEDI551、利瑞魯單抗、MEDI9447、達雷木單抗、貝利尤單抗、卡那單抗、地努圖希單抗、司妥昔單抗及托珠單抗。
在某些實施例中,第二抗癌劑為細胞介素。在某些實施例中,細胞介素為IL-12、IL-15、GM-CSF或G-CSF。
在某些實施例中,第二抗癌劑為普列威(sipuleucel)-T、阿地介白素(一種人重組介白素-2產品,化學名稱為去丙胺醯基-1、絲胺酸125人類介白素-2)、達拉非尼(dabrafenib) (一種激酶抑制劑,化學名稱為 N-{3-[5-(2-胺基嘧啶-4-基)-2- 三級丁基-1,3-噻唑-4-基]-2-氟苯基}-2,6-二氟基苯磺醯胺)、維莫非尼(vemurafenib) (一種激酶抑制劑,化學名稱為丙烷-1-磺酸{3-[5-(4-氯苯基)-1 H-吡咯并[2,3- b]吡啶-3-羰基]-2,4-二氟基-苯基}-醯胺)或2-氯-去氧腺苷。在某些實施例中,第二抗癌劑為帕唑帕尼、索拉非尼、阿西替尼、樂伐替尼、阿法替尼、厄洛替尼、吉非替尼、奧希替尼或凡德他尼。
在某些實施例中,第二抗癌劑為胎盤生長因子、抗體-藥物結合物、溶瘤病毒或抗癌疫苗。在某些實施例中,第二抗癌劑為胎盤生長因子。在某些實施例中,第二抗癌劑係包含阿柏西普(ziv-aflibercept)之胎盤生長因子。在某些實施例中,第二抗癌劑為抗體-藥物結合物。在某些實施例中,第二抗癌劑係選自由維布妥昔單抗(brentoxumab vedotin)及恩美曲妥珠單抗(trastuzumab emtransine)組成之群的抗體-藥物結合物。
在某些實施例中,第二抗癌劑為溶瘤病毒。在某些實施例中,第二抗癌劑為溶瘤病毒talimogene laherparepvec。在某些實施例中,第二抗癌劑為抗癌疫苗。在某些實施例中,第二抗癌劑係選自由GM-CSF腫瘤疫苗、STING/GM-CSF腫瘤疫苗及NY-ESO-1組成之群的抗癌疫苗。在某些實施例中,第二抗癌劑係選自IL-12、IL-15、GM-CSF及G-CSF之細胞介素。
在某些實施例中,第二抗癌劑為免疫檢查點抑制劑(亦稱為免疫檢查點阻斷劑)。免疫檢查點抑制劑為一類具有阻斷免疫檢查點作用之治療劑。參見,例如,Pardoll, Nature Reviews Cancer(2012) 第12卷,第252-264頁。在某些實施例中,免疫檢查點抑制劑為抑制以下中之一或多者的藥劑:(i)細胞毒性T-淋巴細胞相關抗原4(CTLA4),(ii)程式性細胞死亡蛋白1 (PD1),(iii) PDL1,(iv) LAB3,(v) B7-H3,(vi) B7-H4,及(vii) TIM3。在某些實施例中,免疫檢查點抑制劑為伊匹單抗(ipilumumab)。在某些實施例中,免疫檢查點抑制劑為帕博利珠單抗(pembrolizumab)。在某些實施例中,免疫檢查點抑制劑為阿特珠單抗(atezolizumab)、西米普利單抗(cemiplimab)、西米普利單抗-rwlc、多塔利單抗(dostarlimab)、度伐利尤單抗(durvalumab)或納武利尤單抗(nivolumab)。
在某些實施例中,第二抗癌劑為靶向非檢查點靶標之單株抗體(例如,赫賽汀(Herceptin))。在某些實施例中,第二抗癌劑為非細胞毒性劑(例如,激酶抑制劑)。
在某些實施例中,第二抗癌劑係選自絲裂黴素(mitomycin)、核莫司汀(ribomustin)、長春新鹼(vincristine)、視網酸(tretinoin)、依託泊苷(etoposide)、克拉屈濱(cladribine)、吉西他濱(gemcitabine)、米托布羅糖醇(mitobronitol)、胺甲喋呤(methotrexate)、阿黴素(doxorubicin)、卡波醌(carboquone)、噴司他丁(pentostatin)、硝克林(nitracrine)、淨司他丁(zinostatin)、西曲瑞克(cetrorelix)、來曲唑(letrozole)、雷替曲塞(raltitrexed)、道諾黴素(daunorubicin)、法曲唑(fadrozole)、福莫司汀(fotemustine)、胸腺法新(thymalfasin)、索布佐生(sobuzoxane)、奈達鉑(nedaplatin)、胺麩精(aminoglutethimide)、安吖啶(amsacrine)、丙谷醯胺(proglumide)、醋酸羥吡咔唑(elliptinium acetate)、酮舍林(ketanserin)、去氧氟尿苷(doxifluidine)、依曲替酯(etretinate)、異視網酸、鏈脲黴素(streptozocin)、尼莫司汀(nimustine)、長春地辛(vindesine)、阿糖胞苷(cytarabine)、比卡魯胺(bicalutamide)、長春瑞濱(vinorelbine)、維司力農(vesnarinone)、氟他胺(flutamide)、屈尼醇(drogenil)、布托辛(butocin)、卡莫氟(carmofur)、雷佐生(razoxane)、施佐非蘭(sizofilan)、卡鉑、溴衛矛醇(mitolactol)、替加氟(tegafur)、異環磷醯胺、潑尼莫司汀(prednimustine)、比西巴尼(picibanil)、左旋咪唑(levamisole)、替尼泊甙(teniposide)、英丙舒凡(improsulfan)、依諾他濱(enocitabine)、麥角乙脲(lisuride)、羥甲烯龍(oxymetholone)、他莫昔芬(tamoxifen)、助孕酮、美雄烷(mepitiostane)、環硫雄醇(epitiostanol)、福美司坦(formestane)、群落刺激因子-1、群落刺激因子-2、地尼白介素(denileukin diftitox)、介白素2、促黃體素釋放因子、干擾素-α、干擾素-2α、干擾素-β及乾擾素-γ。
在某些實施例中,第二抗癌劑為紫杉醇、多西紫杉醇(docetaxel)、順鉑、表柔比星(epirubicin)、5-氟尿嘧啶或卡培他濱(capecitabine)。在某些實施例中,第二抗癌劑為伊沙匹隆(ixabepilone)或艾日布林(eribulin)。在某些實施例中,第二抗癌劑為ART558。在某些實施例中,第二抗癌劑為拉帕替尼(lapatinib)、來那替尼(neratinib)或圖卡替尼(tucatinib)。在某些實施例中,第二抗癌劑為氟維司群(fulvestrant)。在某些實施例中,第二抗癌劑為阿那曲唑(anastrozole)或伊析美斯坦(exemestane)。在某些實施例中,第二抗癌劑為MK2206。在某些實施例中,第二抗癌劑為達克替尼、莫博西替尼(mobocertinib)、奈西妥單抗(necitumumab)或阿米萬塔單抗(amivantamab)。在某些實施例中,第二抗癌劑為培美曲塞(pemetrexed)。在某些實施例中,第二抗癌劑為布加替尼(brigatinib)。在某些實施例中,第二抗癌劑為卡馬替尼(capmatinib)或特泊替尼(tepotinib)。在某些實施例中,第二抗癌劑為恩曲替尼(entrectinib)。在某些實施例中,第二抗癌劑為普拉替尼(pralsetinib)或塞爾帕替尼(selpercatinib)。在某些實施例中,第二抗癌劑為伊匹木單抗(ipilimumab)。在某些實施例中,第二抗癌劑為索托拉西布(sotorasib)。在某些實施例中,第二抗癌劑為拓撲替康(topotecan)或伊立替康(irinotecan)。在某些實施例中,第二抗癌劑為魯比卡丁(lurbinectedin)、黴法蘭(melphalan)或噻替派(thiotepa)。在某些實施例中,第二抗癌劑為曲氟尿苷(trifluridine)或替吡嘧啶(tipiracil)。在某些實施例中,第二抗癌劑為甲地孕酮(megestrol)。在某些實施例中,第二抗癌劑為舒尼替尼(sunitinib)。在某些實施例中,第二抗癌劑為蘭瑞肽(lanreotide)或鑥。在某些實施例中,第二抗癌劑為貝組替凡(belzutifan)。
在某些實施例中,第二抗癌劑為ALK抑制劑、ATR抑制劑、A2A拮抗劑、鹼基切除式修復抑制劑、Bcr-Abl酪胺酸激酶抑制劑、布魯頓氏酪胺酸激酶抑制劑(Bruton's Tyrosine Kinase Inhibitor)、CDC7抑制劑、CHK1抑制劑、週期蛋白依賴性激酶抑制劑、DNA-PK抑制劑、DNA-PK與mTOR兩者之抑制劑、DNMT1抑制劑、DNMT1抑制劑加2-氯基-去氧腺苷、HDAC抑制劑、Hedgehog傳訊途徑抑制劑、IDO抑制劑、JAK抑制劑、mTOR抑制劑、MEK抑制劑、MELK抑制劑、MTH1抑制劑、PARP抑制劑、磷酸肌醇3-激酶抑制劑、PARP1與DHODH兩者之抑制劑、蛋白酶體抑制劑、拓撲異構酶-II抑制劑、酪胺酸激酶抑制劑、VEGFR抑制劑或WEE1抑制劑。
在某些實施例中,第二抗癌劑為ALK抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含色瑞替尼(ceritinib)或克唑替尼(crizotinib)之ALK抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含勞拉替尼(lorlatinib)之ALK抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為ATR抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含AZD6738或VX-970之ATR抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含BAY1895344或M4344之ATR抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為A2A拮抗劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含甲氧胺之鹼基切除式修復抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為鹼基切除式修復抑制劑,諸如甲氧胺。在某些實施例中,第二抗癌劑為Bcr-Abl酪胺酸激酶抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含達沙替尼(dasatinib)或尼羅替尼(nilotinib)之Bcr-Abl酪胺酸激酶抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為布魯頓氏酪胺酸激酶抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含依魯替尼之布魯頓氏酪胺酸激酶。在某些實施例中,第二抗癌劑為CDC7抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含RXDX-103或AS-141之CDC7抑制劑。
在某些實施例中,第二抗癌劑為CHK1抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含MK-8776、ARRY-575或SAR-020106之CHK1抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含AZD7762之CHK1抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為週期蛋白依賴性激酶抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含帕博西尼(palbociclib)之週期蛋白依賴性激酶抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含阿貝西尼(abemaciclib)或瑞博西尼(ribociclib)之週期蛋白依賴性激酶抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為DNA-PK抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含MSC2490484A之DNA-PK抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為DNA-PK及mTOR之抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑包含CC-115。
在某些實施例中,第二抗癌劑為DNMT1抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含地西他濱、RX-3117、瓜地西他濱(guadecitabine)、NUC-8000或氮雜胞苷之DNMT1抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑包含DNMT1抑制劑及2-氯基-去氧腺苷。在某些實施例中,第二抗癌劑包含ASTX-727。
在某些實施例中,第二抗癌劑為HDAC抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含OBP-801、CHR-3996、伊諾司他(etinostate)、瑞米司他(resminostate)、普雷司他(pracinostat)、CG-200745、帕比司他(panobinostat)、羅米地辛(romidepsin)、莫西司他(mocetinostat)、貝利司他(belinostat)、AR-42、瑞考司他(ricolinostat)、KA-3000或ACY-241之HDAC抑制劑。
在某些實施例中,第二抗癌劑為Hedgehog傳訊途徑抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含索尼德吉(sonidegib)或維莫德吉(vismodegib)之Hedgehog傳訊途徑抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為IDO抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含INCB024360之IDO抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為JAK抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含魯索替尼(ruxolitinib)或託法替尼(tofacitinib)之JAK抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為mTOR抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含依維莫司(everolimus)或替西羅莫司(temsirolimus)之mTOR抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為MEK抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含考比替尼(cobimetinib)或曲美替尼(trametinib)之MEK抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為MELK抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含ARN-7016、APTO-500或OTS-167之MELK抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為MTH1抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含( S)-克唑替尼(crizotinib)、TH287或TH588之MTH1抑制劑。
在某些實施例中,第二抗癌劑為PARP抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含MP-124、奧拉帕尼(olaparib)、BGB-290、他拉唑帕尼(talazoparib)、維利帕尼(veliparib)、尼拉帕尼(niraparib)、E7449、魯卡帕尼(rucaparib)或ABT-767之PARP抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為磷酸肌醇3-激酶抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含艾代拉利司(idelalisib)之磷酸肌醇3-激酶抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含阿培利司(alpelisib)之磷酸肌醇3-激酶抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為PARP1與DHODH兩者之抑制劑( 抑制聚ADP核糖聚合酶1與二氫乳清酸去氫酶兩者的藥劑)。
在某些實施例中,第二抗癌劑為蛋白酶體抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含硼替佐米(bortezomib)或卡非佐米(carfilzomib)的蛋白酶體抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為拓樸異構酶-II抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含伏沙羅新(vosaroxin)之拓樸異構酶-II抑制劑。
在某些實施例中,第二抗癌劑為酪胺酸激酶抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含博蘇替尼(bosutinib)、卡博紮替尼(cabozantinib)、伊馬替尼(imatinib)或帕納替尼(ponatinib)之酪胺酸激酶抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為VEGFR抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含瑞戈非尼(regorafenib)之VEGFR抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為WEE1抑制劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為包含AZD1775之WEE1抑制劑。
在某些實施例中,第二抗癌劑為OX40、CD137、CD40、GITR、CD27、HVEM、TNFRSF25或ICOS之促效劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為OX40、CD137、CD40或GITR之促效劑。在某些實施例中,第二抗癌劑為CD27、HVEM、TNFRSF25或ICOS之促效劑。
在某些實施例中,第二抗癌劑為本文所提供之第二化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二抗癌劑為本文所提供之第二化合物。
在某些實施例中,第二抗癌劑為司他夫定,其前藥或前述任一種之醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二抗癌劑為司他夫定、斯坦匹定或前述任一種之醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二抗癌劑為司他夫定或斯坦匹定。
在某些實施例中,第二抗癌劑為替諾福韋,其前藥或前述任一項之醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二抗癌劑為替諾福韋、替諾福韋艾拉酚胺、替諾福韋胺丁苯胺、替諾福韋地索普西或替諾福韋依昔利得;或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二抗癌劑為替諾福韋、替諾福韋艾拉酚胺、替諾福韋胺丁苯胺、替諾福韋地索普西或替諾福韋依昔利得。
在某些實施例中,第二抗癌劑為替諾福韋,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二抗癌劑為替諾福韋。在某些實施例中,第二抗癌劑為替諾福韋艾拉酚胺,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二抗癌劑為替諾福韋艾拉酚胺。在某些實施例中,第二抗癌劑為替諾福韋胺丁苯胺,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二抗癌劑為替諾福韋胺丁苯胺。在某些實施例中,第二抗癌劑為替諾福韋地索普西,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二抗癌劑為替諾福韋地索普西,或其富馬酸鹽、琥珀酸鹽、馬來酸鹽、乳清酸鹽、天冬胺酸鹽或磷酸鹽。在某些實施例中,第二抗癌劑為替諾福韋地索普西,或其富馬酸鹽、琥珀酸鹽或馬來酸鹽。在某些實施例中,第二抗癌劑為替諾福韋地索普西。在某些實施例中,第二抗癌劑為替諾福韋依昔利得,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二抗癌劑為替諾福韋依昔利得或其鉀鹽。在某些實施例中,第二抗癌劑為替諾福韋依昔利得。
在某些實施例中,該方法進一步包含向個體投與第三抗癌劑。在某些實施例中,該方法進一步包含向個體投與第四抗癌劑。在某些實施例中,該方法進一步包含向個體投與第五抗癌劑。
在某些實施例中,第三抗癌劑為以上所述之第二抗癌劑之一。在某些實施例中,第四抗癌劑為以上所述之第二抗癌劑之一。在某些實施例中,第五抗癌劑為以上所述之第二抗癌劑之一。 自體免疫病症
本揭示案之另一態樣提供一種治療患者之自體免疫病症的方法。該方法包含向有此需要之個體投與(i)治療有效量的根據式I之化合物,包括選自表1或表2之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,及(ii)第二治療劑,以治療自體免疫病症。在某些實施例中,該方法包含向有此需要之個體投與(i)治療有效量的本文所述之化合物(諸如式I、II、III、IV、V或VI之化合物),或其醫藥學上可接受之鹽,及(ii)第二治療劑,以治療自體免疫病症。
在某些實施例中,第二治療劑為小分子或重組生物劑。在某些實施例中,第二治療劑選自乙醯胺酚(acetaminophen)、非類固醇 消炎 藥物 (NSAIDS),諸如阿司匹靈(aspirin)、伊布洛芬(ibuprofen)、萘普生(naproxen)、依託度酸(etodolac)(Lodine ®)及塞來昔布(celecoxib)、秋水仙素(colchicine)(Colcrys ®);皮質類固醇,諸如普賴鬆(prednisone)、普賴蘇穠(prednisolone)、甲基普賴蘇穠、氫皮質酮及類似物、丙磺舒(probenecid)、異嘌呤醇(allopurinol)、非布司他(febuxostat)(Uloric ®)、灑拉淨(sulfasalazine) (Azulfidine ®);抗瘧疾藥,諸如羥氯喹(Plaquenil ®)及氯奎(Aralen ®)、胺甲喋呤(methotrexate) (Rheumatrex ®);金鹽,諸如硫代葡萄糖金(Solganal ®)、硫代蘋果酸金 (Myochrysine ®)及金諾芬(auranofin)(Ridaura ®);D-青黴胺(Depen ®或Cuprimine ®)、硫唑嘌呤 (Imuran ®)、環磷醯胺(Cytoxan ®)、氯芥苯丁酸(Leukeran ®)、環孢素(Sandimmune ®、Neoral ®)、他克莫司(tacrolimus)、西羅莫司(sirolimus)、麥考酚酸酯(mycophenolate)、來氟米特(leflunomide) (Arava ®)及「抗TNF」劑,諸如依那西普(etanercept) (Enbrel ®)、英夫利西單抗(infliximab) (Remicade ®)、戈利木單抗(golimumab) (Simponi ®)、塞妥珠單抗聚乙二醇(certolizumab pegol) (Cimzia ®)及阿達木單抗(adalimumab) (Humira ®);「抗IL-1」劑,諸如阿那白滯素(anakinra) (Kineret ®)及利納西普(rilonacept) (Arcalyst ®);抗T細胞抗體,諸如即複寧(Thymoglobulin)、IV免疫球蛋白(IVIg)、卡那單抗(Ilaris ®);抗Jak抑制劑,諸如托法替尼(tofacitinib);抗體,諸如利妥昔單抗(Rituxan ®)、「抗T細胞」劑,諸如阿巴西普(abatacept) (Orencia ®);「抗IL-6」劑,諸如托珠單抗(Actemra ®)、雙氯芬酸(diclofenac)、可體松(cortisone)、玻尿酸(Synvisc ®或Hyalgan ®);單株抗體,諸如他尼組單抗(tanezumab);抗凝劑,諸如 肝素 (Calcinparine ®或Liquaemin ®)及華法林(warfarin) (Coumadin ®);止瀉藥,諸如地芬諾酯(diphenoxylate) (Lomotil ®)及洛哌丁胺(loperamide) (Imodium ®);膽酸結合劑,諸如消膽胺(cholestyramine)、阿洛司瓊(alosetron) (Lotronex ®)、魯比前列酮(lubiprostone) (Amitiza ®);緩瀉劑,諸如鎂乳、聚乙二醇(MiraLax ®)、Dulcolax ®、Correctol ®及Senokot ®;抗膽鹼劑或解痙劑,諸如雙環胺(Bentyl ®)、Singulair ®;β-2促效劑,諸如沙丁胺醇(albuterol) (Ventolin ®HFA、Proventil ®HFA)、左旋沙丁胺醇(Xopenex ®)、間羥喘息定(metaproterenol) (Alupent ®)、醋酸吡布特羅(pirbuterol acetate) (Maxair ®)、硫酸特布他林(terbutaline sulfate) (Brethaire ®)、昔美酸沙美特羅(salmeterol xinafoate) (Serevent ®)及福莫特羅(formoterol) (Foradil ®);抗膽鹼劑,諸如溴化異丙托銨(ipratropium bromide) (Atrovent ®)及噻托溴銨(tiotropium) (Spiriva ®);吸入皮質類固醇,諸如二丙酸培氯米松(beclomethasone dipropionate) (Beclovent ®、Qvar ®及Vanceril ®)、丙酮特安皮質醇(triamcinolone acetonide) (Azmacort ®)、莫美他松(mometasone) (Asthmanex ®)、布地奈德(budesonide) (Pulmocort ®)及氟尼縮松(flunisolide) (Aerobid ®)、Afviar ®、Symbicort ®、Dulera ®、色甘酸鈉(Intal ®);甲基黃嘌呤,諸如茶鹼(Theo-Dur ®、Theolair ®、Slo-bid ®、Uniphyl ®、Theo-24 ®)及胺茶鹼;IgE抗體,諸如奧馬珠單抗(omalizumab) (Xolair ®);核苷逆轉錄酶抑制劑,諸如齊多夫定(zidovudine) (Retrovir ®)、阿巴卡韋(abacavir) (Ziagen ®)、阿巴卡韋/拉米夫定(lamivudine) (Epzicom ®)、阿巴卡韋/拉米夫定/齊多夫定(Trizivir ®)、地達諾新(didanosine) (Videx ®)、恩曲他濱(emtricitabine) (Emtriva ®)、拉米夫定(Epivir ®)、拉米夫定/齊多夫定(Combivir ®)、司他夫定(Zerit ®)及紮西他濱(zalcitabine) (Hivid ®);非核苷逆轉錄酶抑制劑,諸如地拉韋定(delavirdine) (Rescriptor ®)、依法韋侖(efavirenz) (Sustiva ®)、奈韋拉平(nevairapine) (Viramune ®)及依曲韋林(etravirine) (Intelence ®);核苷酸逆轉錄酶抑制劑,諸如替諾福韋(Viread ®);蛋白酶抑制劑,諸如安普那韋(amprenavir) (Agenerase ®)、阿紮那韋(atazanavir) (Reyataz ®)、達蘆那韋(darunavir) (Prezista ®)、福沙那韋(fosamprenavir) (Lexiva ®)、印地那韋(indinavir) (Crixivan ®)、洛匹那韋(lopinavir)及利托那韋(ritonavir) (Kaletra ®)、奈非那韋(nelfinavir) (Viracept ®)、利托那韋 (Norvir ®)、沙奎那韋(saquinavir) (Fortovase ®或Invirase ®)及替拉那韋(tipranavir) (Aptivus ®);進入抑制劑,諸如恩夫韋肽(enfuvirtide) (Fuzeon ®)及馬拉維若(maraviroc) (Selzentry ®);整合酶抑制劑,諸如雷特格韋(raltegravir) (Isentress ®)、多柔比星(doxorubicin) (Hydrodaunorubicin ®)、長春新鹼(Oncovin ®)、硼替佐米(bortezomib) (Velcade ®)及地塞米松(dexamethasone) (Decadron ®)與之來那度胺(lenalidomide) (Revlimid ®)之組合;抗IL36劑,諸如BI655130、二氫乳清酸脫氫酶抑制劑,諸如IMU-838;抗OX40劑,諸如KHK-4083;微生物體劑,諸如RBX2660、SER-287;窄效激酶抑制劑,諸如TOP-1288;抗CD40劑,諸如BI-655064及FFP-104;鳥苷酸環化酶促效劑,諸如多卡那肽(dolcanatide);神經鞘胺醇激酶抑制劑,諸如奧帕加尼(opaganib);抗IL-12/IL-23劑,諸如AK-101;泛蛋白連接酶複合物抑制劑,諸如BBT-401;神經胺醇受體調節劑,諸如BMS-986166;P38MAPK/PDE4抑制劑,諸如CBS-3595;CCR9拮抗劑,諸如CCX-507;FimH拮抗劑,諸如EB-8018;HIF-PH抑制劑,諸如FG-6874;HIF-1α穩定劑,諸如GB-004;MAP3K8蛋白質抑制劑,諸如GS-4875;LAG-3抗體,諸如 GSK-2831781;RIP2激酶抑制劑,諸如GSK-2983559;Farnesoid X受體促效劑,諸如MET-409;CCK2拮抗劑,諸如PNB-001;IL-23受體拮抗劑,諸如PTG-200;Purinergic P2X7受體拮抗劑,諸如SGM-1019;PDE4抑制劑,諸如阿普斯特(Apremilast);ICAM-1抑制劑,諸如阿地碸鈉(alicaforsen sodium);抗IL23劑,諸如古塞庫單抗(guselkumab)、佈雷庫單抗(brazikumab)及米吉珠單抗(mirkizumab);抗gnIL-15劑,諸如AMG-714;TYK-2抑制劑,諸如BMS-986165;NK細胞活化劑,諸如CNDO-201;RIP-1激酶抑制劑,諸如GSK-2982772;抗NKGD2劑,諸如JNJ-4500;CXCL-10抗體,諸如JT-02;IL-22受體促效劑,諸如RG-7880;GATA-3拮抗劑,諸如SB-012;及群落刺激因子-1受體抑制劑,諸如埃克替尼(edicotinib)。
在某些實施例中,第二治療劑為己酮可可鹼(pentoxifylline)、丙戊茶鹼(propentofylline)、托巴茶鹼(torbafylline)、環孢素(cyclosporine)、胺甲喋呤(methotrexate)、他莫昔芬、毛喉素(forskolin)及其類似物、焦油衍生物、類固醇、維生素A及其衍生物、維生素D及其衍生物、細胞介素、趨化因子、幹細胞生長因子、淋巴毒素、造血因子、群落刺激因子(CSF)、紅血球生成素、血小板生成素、腫瘤壞死因子-α (TNF)、TNF-⊖、顆粒球群落刺激因子(G-CSF)、顆粒球巨噬細胞-群落刺激因子(GM-CSF)、干擾素-α、干擾素-β、干擾素-γ、干擾素-λ、指定為「S1因子」的幹細胞生長因子、人類生長激素、N-甲硫胺醯基人類生長激素、牛生長激素、副甲狀腺激素、甲狀腺素、胰島素、胰島素原、鬆弛素、鬆弛素原、促濾泡素(FSH)、促甲狀腺素(TSH)、促黃體素(LH)、肝生長因子、前列腺素、纖維母細胞生長因子、泌乳素、胎盤生乳素、OB蛋白質、苗勒氏管(mullerian)抑制物質、小鼠促性腺素相關肽、抑制素、活化素、血管內皮生長因子、整合素、NGF-β、血小板生長因子、TGF-α、TGF-β、胰島素樣生長因子-I、胰島素樣生長因子-II、巨噬細胞-CSF (M-CSF)、IL-1、IL-la、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-8、IL-9、IL-10、IL-11、IL-12、IL-13、IL-14、IL-15、IL-16、IL-17、IL-18、IL-21、IL-25、LIF、FLT-3、血管抑制素、血小板反應蛋白、內皮抑素或淋巴毒素。
在某些實施例中,第二治療劑為本文所提供之第二化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為本文所提供之第二化合物。
在某些實施例中,第二治療劑為司他夫定,其前藥或前述任一項之醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為司他夫定、斯坦匹定或前述任一項之醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為司他夫定或斯坦匹定。
在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋,其前藥或前述任一項之醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋、替諾福韋艾拉酚胺、替諾福韋胺丁苯胺、替諾福韋地索普西或替諾福韋依昔利得;或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋、替諾福韋艾拉酚胺、替諾福韋胺丁苯胺、替諾福韋地索普西或替諾福韋依昔利得。
在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋艾拉酚胺,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋艾拉酚胺。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋胺丁苯胺,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋胺丁苯胺。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋地索普西,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋地索普西,或其富馬酸鹽、琥珀酸鹽、馬來酸鹽、乳清酸鹽、天冬胺酸鹽或磷酸鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋地索普西,或其富馬酸鹽、琥珀酸鹽或馬來酸鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋地索普西。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋依昔利得,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋依昔利得或其鉀鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋依昔利得。
在某些實施例中,該方法進一步包含向該個體投與第三治療劑。在某些實施例中,該方法進一步包含向該個體投與第四治療劑。在某些實施例中,該方法進一步包含向該個體投與第五治療劑。
在某些實施例中,第三治療劑為上述第二治療劑之一。在某些實施例中,第四治療劑為上述第二治療劑之一。在某些實施例中,第五治療劑為上述第二治療劑之一。 病毒感染
本揭示案之另一態樣提供一種治療患者的病毒感染之免疫病症的方法。該方法包含向有此需要之個體投與(i)治療有效量的本文所述之化合物(諸如式I、II、III、IV、V或VI之化合物)或其醫藥學上可接受之鹽,及(i)第二治療劑,以治療為病毒感染之免疫病症。在某些實施例中,免疫病症為除流感病毒感染之外的病毒感染。
在某些實施例中,第二治療劑為抗HIV劑。在某些實施例中,第二治療劑為核苷逆轉錄酶抑制劑(NRTI)、非核苷逆轉錄酶抑制劑、蛋白酶抑制劑或融合抑制劑。在某些實施例中,第二治療劑為3TC (拉米夫定)、AZT (齊多夫定)、(-)-FTC、ddI (地達諾新)、ddC (紮西他濱)、阿巴卡韋(ABC)、替諾福韋(PMPA)、D-D4FC (Reverset)、D4T (司他夫定)、拉西韋(Racivir)、L-FddC、L-FD4C、NVP (奈韋拉平(Nevirapine))、DLV (地拉韋定)、EFV (依法韋侖)、SQVM (甲磺酸沙奎那韋)、RTV (利托那韋)、IDV (印地那韋)、SQV (沙奎那韋)、NFV (奈非那韋)、APV (安普那韋)、LPV (洛匹那韋)或融合抑制劑T20。
在某些實施例中,第二治療劑為ddC、阿巴卡韋、ddI、ddA、3TC、AZT、D4T、FTC、FddC、Fd4C、阿紮那韋、阿德福韋雙吡呋酯(Adefovir dipivoxyl)、替諾福韋二吡呋酯(Tenofovir disoproxil)、依替卡韋(Etecavir)、印地那韋、KHI-227.2-[3-[3-(S)-[[(四氫呋喃氧基)羰基]胺基]-4-苯基-2(R)-羥丁基]]-N-(1,1-二甲基乙基)十氫-3-異喹啉甲醯胺、VB-11,328、KNI-174、Val-Val-Sta、CPG53820、HOEt-N2氮雜肽等價異構物、2,5-二胺基-N,N'-雙(N-苄氧基羰基uelyl)-1,6-二苯基-3(S),4(S)-己二醇 BzOCValPhe[二CHOH(SS)] PheValBzOC、2,5,-二胺基-N,N'-雙(N-芐氧基羰基uelyl)-1,6-二苯基-3(R),4(R)-己二醇 BzOCValPhe[二CHOH(RR]PheValBzOC、[雙(SATE)ddAMP]、BILA 2186 BS、Agenerase、A-98881、A-83962、A-80987、(2-萘亞甲基羰基)Asn[去羰基Phe-羥乙基]ProO三級丁基、A-81525、XM323、替拉那韋(Tipranavir)、SDZ PRI 053、SD146、替利那韋(Telinavir)、(R)2QuinCOAsnPhe[CHOHCH2]PipCONHtBu、沙奎那韋(Saquinavir)、R-87366、DMP 460、L685,434、L685,434-OEtNMe2、L689,502、拉西那韋(Lasinavir)、Aluviran P9941帕利那韋(Palinavir)或青黴素。在某些實施例中,第二治療劑為ddC、阿巴卡韋、ddI、ddA、3TC、AZT、D4T、FTC、FddC或Fd4C。
在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋,其前藥或前述任一項之醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋、替諾福韋艾拉酚胺、替諾福韋胺丁苯胺、替諾福韋地索普西或替諾福韋依昔利得;或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋、替諾福韋艾拉酚胺、替諾福韋胺丁苯胺、替諾福韋地索普西或替諾福韋依昔利得。
在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋艾拉酚胺,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋艾拉酚胺。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋胺丁苯胺,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋胺丁苯胺。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋地索普西,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋地索普西,或其富馬酸鹽、琥珀酸鹽、馬來酸鹽、乳清酸鹽、天冬胺酸鹽或磷酸鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋地索普西,或其富馬酸鹽、琥珀酸鹽或馬來酸鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋地索普西。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋依昔利得,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋依昔利得或其鉀鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋依昔利得。
在某些實施例中,該方法進一步包含向該個體投與第三治療劑。在某些實施例中,該方法進一步包含向該個體投與第四治療劑。在某些實施例中,該方法進一步包含向該個體投與第五治療劑。
在某些實施例中,第三治療劑為上述第二治療劑之一。在某些實施例中,第四治療劑為上述第二治療劑之一。在某些實施例中,第五治療劑為上述第二治療劑之一。 神經病症
本揭示案之另一態樣提供一種治療患者之神經病症的方法。該方法包含向有此需要之個體投與(i)治療有效量的根據式I之化合物,包括選自表1或表2之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,及(ii)第二治療劑,以治療神經病症。該方法包含向有此需要之個體投與(i)治療有效量的本文所述之化合物(諸如式I、II、III、IV、V或VI之化合物)或其醫藥學上可接受之鹽,及(i)第二治療劑,以治療神經病症。
在某些實施例中,第二治療劑為多巴胺治療、膽鹼酯酶抑制劑、抗精神病藥、深層腦刺激(例如,以停止震顫及難治性運動障礙)、利魯唑(riluzole)、咖啡因A2A受體拮抗劑、普拉克索(pramipexole)或雷沙吉林(rasagilin)。
在某些實施例中,第二治療劑為本文所提供之第二化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為本文所提供之第二化合物。
在某些實施例中,第二治療劑為司他夫定,其前藥或前述任一項之醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為司他夫定、斯坦匹定或前述任一項之醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為司他夫定或斯坦匹定。
在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋,其前藥或前述任一項之醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋、替諾福韋艾拉酚胺、替諾福韋胺丁苯胺、替諾福韋地索普西或替諾福韋依昔利得;或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋、替諾福韋艾拉酚胺、替諾福韋胺丁苯胺、替諾福韋地索普西或替諾福韋依昔利得。
在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋艾拉酚胺,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋艾拉酚胺。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋胺丁苯胺,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋胺丁苯胺。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋地索普西,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋地索普西,或其富馬酸鹽、琥珀酸鹽、馬來酸鹽、乳清酸鹽、天冬胺酸鹽或磷酸鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋地索普西,或其富馬酸鹽、琥珀酸鹽或馬來酸鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋地索普西。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋依昔利得,或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋依昔利得或其鉀鹽。在某些實施例中,第二治療劑為替諾福韋依昔利得。
在某些實施例中,該方法進一步包含向該個體投與第三治療劑。在某些實施例中,該方法進一步包含向該個體投與第四治療劑。在某些實施例中,該方法進一步包含向該個體投與第五治療劑。
在某些實施例中,第三治療劑為上述第二治療劑之一。在某些實施例中,第四治療劑為上述第二治療劑之一。在某些實施例中,第五治療劑為上述第二治療劑之一。 V. 醫藥組合物及給藥注意事項
如上所述,本發明提供醫藥組合物,其包含治療有效量的與一或多種醫藥學上可接受之載劑、佐劑及/或媒劑一起調配之一或多種上述化合物。醫藥組合物可以特別調配用於以固體或液體形式投與,包括適用於以下之彼等:(1)經口投與,例如,灌注劑(水性或非水性溶液或懸浮液)、錠劑( 例如彼等以口腔、舌下及全身吸收為目標者)、藥丸、散劑、顆粒劑、施用至舌頭之糊劑;(2)腸胃外投與,例如藉由皮下、肌內、靜脈內或硬膜外注射,例如作為無菌溶液或懸浮液,或持續釋放調配物;(3)局部施用,例如作為乳膏、軟膏或控制釋放貼劑或噴霧劑施用於皮膚;(4)陰道內或直腸內,例如作為子宮托、乳膏或泡沫;(5)舌下;(6)眼部;(7)透皮;或(8)鼻腔。
在某些實施例中,本發明提供一種醫藥組合物,其包含本文所述之化合物(例如,式I化合物)及醫藥學上可接受之載劑。在某些實施例中,本發明提供一種醫藥組合物,其包含本文所述之化合物(例如,式I化合物)、額外治療劑(例如,第IV章節中描述的化合物)及醫藥學上可接受之載劑。
如本文所用之短語「治療有效量」意謂本發明化合物、包含本發明化合物之材料或組合物的量,其可以適用於任何醫療之合理收益/風險比有效地在動物之至少細胞亞族群中產生一些期望的治療效果。
本文採用之短語「醫藥學上可接受之」係指在合理的醫學判斷範疇內,適用於與人類及動物之組織接觸而沒有過度毒性、刺激、過敏反應或其他問題或併發症,與合理之收益/風險比相稱的彼等化合物、材料、組合物及/或劑型。
潤濕劑、乳化劑及潤滑劑,諸如月桂基硫酸鈉及硬脂酸鎂,以及著色劑、脫模劑、塗佈劑、甜味劑、調味劑及芳香劑、防腐劑及抗氧化劑亦可存在於組合物中。
醫藥學上可接受之抗氧化劑的實例包括:(1)水溶性抗氧化劑,諸如抗壞血酸、半胱胺酸鹽酸鹽、亞硫酸氫鈉、偏二亞硫酸鈉、亞硫酸鈉及類似物;(2)油溶性抗氧化劑,諸如抗壞血酸棕櫚酸酯、丁基羥基甲氧苯(BHA)、二丁基羥基甲苯(BHT)、卵磷脂、沒食子酸丙酯、α-生育酚及類似物;及(3)金屬螯合劑,諸如檸檬酸、乙二胺四乙酸(EDTA)、山梨糖醇、酒石酸、磷酸及類似物。
本發明之調配物包括適用於經口、鼻腔、局部(包括口腔及舌下)、直腸、陰道及/或腸胃外投與的彼等。調配物可以方便地以單位劑型存在且可以藉由藥學技術中眾所周知之任何方法製備。可與載劑材料組合以產生單一劑型之活性成分的量將根據所治療之宿主、特定投與方式而變化。可以與載劑材料組合以產生單一劑型之活性成分的量通常為產生治療效果之化合物的量。通常,在百分之一百中,此量範圍為活性成分之約0.1%至約99%,較佳約5%至約70%,最佳約10%至約30%。
製備此等調配物或組合物之方法包括將本發明之化合物與載劑及視情況的一或多種輔助成分締合的步驟。通常,藉由將本發明之化合物與液體載劑或細分的固體載劑或兩者均勻且密切地締合,然後必要的話使產品成型來製備調配物。
適用於經口投與之本發明調配物可以為膠囊、扁囊劑、丸劑、錠劑、口含錠(使用調味基質,通常為蔗糖及阿拉伯樹膠或黃芪膠)、散劑、顆粒或作為水性或非水性液體中之溶液或懸浮液形式,或作為水包油或油包水液體乳液,或作為酏劑或糖漿,或作為糖錠(使用惰性基質,諸如明膠及甘油,或蔗糖及阿拉伯樹膠)及/或作為漱口水及類似物,各自含有預定量之本發明化合物作為活性成分。本發明之化合物也可以作為藥丸、舐劑或糊劑投與。
在本發明用於經口投與之固體劑型(膠囊、錠劑、丸劑、糖衣錠、散劑、顆粒、含片及類似物)中,活性成分與一或多種醫藥學上可接受之載劑混合,諸如檸檬酸鈉或磷酸氫鈣及/或以下任何一種:(1)填充劑或增量劑,諸如澱粉、乳糖(lactose)、蔗糖、葡萄糖、甘露糖醇及/或矽酸;(2)黏合劑,例如像羧甲基纖維素、海藻酸鹽、明膠、聚乙烯吡咯啶酮、蔗糖及/或阿拉伯樹膠;(3)保濕劑,諸如甘油;(4)崩解劑,諸如瓊脂、碳酸鈣、馬鈴薯或木薯澱粉、海藻酸、某些矽酸鹽及碳酸鈉;(5)溶液阻凝劑,諸如石蠟;(6)吸收促進劑,諸如四級銨化合物及界面活性劑,諸如泊洛沙姆(poloxamer)及月桂基硫酸鈉;(7)潤濕劑,諸如鯨蠟醇、單硬脂酸甘油酯及非離子型界面活性劑;(8)吸收劑,諸如高嶺土及膨潤土;(9)潤滑劑,諸如滑石、硬脂酸鈣、硬脂酸鎂、固體聚乙二醇、十二烷基硫酸鈉、硬脂酸鋅、硬脂酸鈉、硬脂酸及其混合物;(10)著色劑;及(11)控制釋放劑,諸如交聯聚維酮或乙基纖維素。在膠囊、錠劑及丸劑的情況下,醫藥組合物亦可包含緩沖劑。類似類型之固體組合物亦可使用諸如乳糖(lactose)或乳糖(milk sugar)以及高分子量聚乙二醇及類似物之賦形劑用作軟殼及硬殼明膠膠囊中之填料。
錠劑可以藉由壓製或模製製成,視情況與一或多種輔助成分一起使用。壓製錠劑可以使用黏合劑(例如,明膠或羥丙基甲基纖維素)、潤滑劑、惰性稀釋劑、防腐劑、崩解劑(例如,羥基乙酸澱粉鈉或交聯羧甲基纖維素鈉)、表面活性劑或分散劑來製備。模製錠可以藉由在合適的機器中模製用惰性液體稀釋劑潤濕之粉末狀化合物之混合物來製備。
本發明之醫藥組合物的錠劑及其他固體劑型,諸如糖衣錠、膠囊、丸劑及顆粒,可以視情況刻痕或製備有包衣及外殼,諸如腸溶包衣及藥物調配技術中熟知的其他包衣。它們也可以經調配以提供其中活性成分之緩慢或控制釋放,例如使用不同比例以提供所需釋放概況之羥丙基甲基纖維素、其他聚合物基質、脂質體及/或微球。它們可以經調配用於快速釋放, 例如冷凍乾燥。它們可以藉由例如藉由細菌截留過濾器過濾,或藉由在使用前立即合併可溶解於無菌水或一些其他無菌可注射介質中之無菌固體組合物形式的滅菌劑來滅菌。此等組合物亦可視情況含有遮光劑且可為它們僅或較佳地視情況以延遲的方式在胃腸道之某個部分釋放活性成分的組合物。可以使用之包埋組合物的實例包括聚合物質及蠟。如果合適的話,活性成分亦可與一或多種上述賦形劑一起呈微囊化形式。
用於經口投與本發明化合物之液體劑型包括醫藥學上可接受之乳液、微乳液、溶液、懸浮液、糖漿及酏劑。除活性成分外,液體劑型可含有此項技術中常用之惰性稀釋劑,例如像水或其他溶劑、增溶劑及乳化劑,諸如乙醇、異丙醇、碳酸乙酯、乙酸乙酯、苯甲醇、苯甲酸芐酯、丙二醇、1,3-丁二醇、油(特定言之棉籽油、花生油、玉米油、胚芽油、橄欖油、蓖麻油及芝麻油)、甘油、四氫呋喃醇、聚乙二醇及失水山梨糖醇之脂肪酸酯及其混合物。
除了惰性稀釋劑外,經口組合物亦可包括佐劑,諸如潤濕劑、乳化劑及懸浮劑、甜味劑、調味劑、著色劑、芳香劑及防腐劑。
除活性化合物外,懸浮液亦可含有懸浮劑,例如乙氧基化異硬脂醇、聚氧乙烯山梨糖醇及失水山梨糖醇酯、微晶纖維素、偏氫氧化鋁、膨潤土、瓊脂及黃芪膠,以及其混合物。
用於直腸或陰道投與之本發明醫藥組合物的調配物可以栓劑形式呈現,其可以藉由將一或多種本發明化合物與一或多種合適的無刺激性賦形劑或載劑混合來製備,該等賦形劑或載劑包括例如可可脂、聚乙二醇、栓劑蠟或水楊酸酯,且其在室溫下為固體但在體溫下為液體,因此會在直腸或陰道腔中融化且釋放活性化合物。
適用於陰道投與之本發明調配物亦包括子宮托、衛生棉條、乳膏、凝膠、糊劑、泡沫或噴霧調配物,其含有諸如此項技術中已知合適之載劑。
用於本發明化合物之局部或透皮投與的劑型包括散劑、噴霧劑、軟膏、糊劑、乳膏、洗劑、凝膠、溶液、貼劑及吸入劑。活性化合物可以在無菌條件下與醫藥學上可接受之載劑以及可能需要的任何防腐劑、緩沖劑或推進劑混合。
除本發明之活性化合物外,軟膏、糊劑、乳膏及凝膠還可含有賦形劑,諸如動植物脂肪、油、蠟、石蠟、澱粉、黃芪膠、纖維素衍生物、聚乙二醇、聚矽氧、膨潤土、矽酸、滑石及氧化鋅,或其混合物。
除了本發明之化合物外,散劑及噴霧劑亦可含有賦形劑,諸如乳糖(lactose)、滑石、矽酸、氫氧化鋁、矽酸鈣及聚醯胺粉末,或此等物質的混合物。噴霧劑可另外含有常用之推進劑,諸如氯氟烴及揮發性未經取代烴,諸如丁烷及丙烷。
透皮貼劑具有將本發明之化合物控制遞送至身體的額外優點。此類劑型可以藉由將化合物溶解或分散於適當的介質中來製備。吸收增強劑亦可用於增加化合物穿過皮膚的流量。該流量之速率可以藉由提供速率控制膜或將化合物分散於聚合物基質或凝膠中來控制。
亦考慮眼用調配物、眼藥膏、散劑、溶液及類似物在本發明之範疇內。
適用於胃腸外投與的本發明之醫藥組合物包含一或多種本發明之化合物以及一或多種醫藥學上可接受之無菌等張水性或非水性溶液、分散液、懸浮液或乳液,或可在使用前重組成無菌可注射溶液或分散液之無菌粉末的組合,其中可能含有糖、醇、抗氧化劑、緩沖劑、抑菌劑、使調配物與預期接受者之血液等張的溶質或懸浮劑或增稠劑。
可用於本發明之醫藥組合物的合適水性及非水性載劑的實例包括水、乙醇、多元醇(諸如甘油、丙二醇、聚乙二醇及類似物)及其合適混合物、植物油(諸如橄欖油)及可注射有機酯(諸如油酸乙酯)。適當之流動性可以藉由例如使用諸如卵磷脂之塗佈材料、藉由在分散液的情況下保持所需粒度以及藉由使用界面活性劑來保持。
此等組合物亦可含有佐劑,諸如防腐劑、潤濕劑、乳化劑及分散劑。可以藉由包含各種抗細菌劑及抗真菌劑,例如對羥基苯甲酸酯、氯丁醇、苯酚山梨酸及類似物來確保防止微生物對主題化合物的作用。還可能希望在組合物中包含等滲劑,諸如糖、氯化鈉及類似物。此外,可藉由包括延遲吸收之藥劑,諸如單硬脂酸鋁及明膠來延長可注射藥物形式的吸收。
在某些情況下,為了延長藥物的作用,需要減緩皮下或肌內注射藥物之吸收。此可藉由使用水溶性差的結晶或無定形材料之液體懸浮液來實現。藥物的吸收速率則取決於其溶解速率,而溶解速率又可能取決於晶體大小及結晶形式。或者,腸胃外投與藥物形式之延遲吸收係藉由將藥物溶解或懸浮於油媒劑中來實現。
可注射儲存形式係藉由在可生物降解之聚合物諸如聚丙交酯-聚乙交酯中形成主題化合物的微囊基質來製備。根據藥物與聚合物之比例以及所用特定聚合物之性質,可以控製藥物釋放速率。其他生物可降解聚合物之實例包括聚(原酸酯)及聚(酸酐)。亦可藉由將藥物包埋於與身體組織相容之脂質體或微乳液中來製備儲存可注射調配物。
當本發明之化合物作為藥品投與於人類及動物時,它們可以本身或作為含有與醫藥學上可接受之載劑組合之例如0.1至99% (更佳10至30%)之活性成分的醫藥組合物給予。
本發明之製備劑可以經口、腸胃外、局部或直腸給藥。它們當然以適合每種投與途徑之形式給出。例如,它們以錠劑或膠囊形式投與,藉由注射、吸入投與,以洗眼劑、軟膏、栓劑等投與,藉由注射、輸注或吸入投與;藉由洗劑或軟膏局部投與;及藉由栓劑直腸投與。經口投與較佳。
本文所用之短語「腸胃外投與」及「在腸胃外投與」意謂除腸內及局部投與以外通常藉由注射之投與方式,且包括但不限於靜脈內、肌內、動脈內、鞘內、囊內、眶內、心內、皮內、腹膜內、經氣管、皮下、表皮下、關節內、囊下、蛛膜下、脊椎內及胸骨內注射及輸注。
本文所用之短語「全身投與」、「在全身投與」、「外周投與」及「在外周投與」意謂除直接進入中樞神經系統以外之化合物、藥物或其他材料之投與,從而進入患者的系統,因此經歷新陳代謝及其他類似過程,例如皮下投與。
此等化合物可以藉由任何合適投與途徑投與人類及其他動物以用於治療,包括經口、鼻腔投與,例如像藉由噴霧,直腸、陰道內、腸胃外、腦池內及局部投與,如藉由粉末、軟膏或滴劑,包括口腔及舌下投與。
無論選擇何種投與途徑,可以合適的水合形式使用之本發明化合物及/或本發明醫藥組合物係藉由熟習此項技術者已知的習知方法調配成醫藥學上可接受之劑型。
可以改變本發明醫藥組合物中活性成分之實際劑量水準,以獲得有效實現針對特定患者、組合物及投與方式之所需治療反應而對該患者無毒的活性成分之量。
選定的劑量水準將取決於多種因素,包括所採用之本發明特定化合物或其酯、鹽或醯胺的活性、投與途徑、投與時間、所採用之特定化合物的排泄或代謝速率、吸收速率及程度、治療持續時間、與所採用之特定化合物組合使用的其他藥物、化合物及/或材料,接受治療之患者的年齡、性別、體重、狀況、一般健康狀況及既往病史,以及醫學技術中眾所周知之類似因素。
一般熟習此項技術之醫師或獸醫可以容易地確定及開出所需醫藥組合物的有效量。例如,醫生或獸醫可以以低於達到所需治療效果所需之水準的水準開始醫藥組合物中所採用之本發明化合物的劑量,且逐漸增加劑量直至達到所需效果。
一般而言,本發明化合物之合適日劑量將為有效產生治療效果之最低劑量之化合物的量。該有效劑量通常取決於上述因素。較佳地,化合物以約0.01 mg/kg至約200 mg/kg、更佳約0.1 mg/kg至約100 mg/kg、甚至更佳約0.5 mg/kg至約50 mg/kg投與。當本文所述之化合物與另一藥劑( 例如,作為敏化劑)共投與時,有效量可能低於單獨使用該藥劑時的有效量。
需要的話,活性化合物之有效日劑量可以作為兩個、三個、四個、五個、六個或更多個分劑量投與,在一天中以適當的間隔分開投與,視情況以單位劑型投與。較佳給藥係每天投與一次。
本發明進一步提供一種單位劑型(諸如錠劑或膠囊),其包含治療本文所述之醫學病症之治療有效量的西薩夫定(censavudine)或本文所述之相關化合物。 VI. 列舉之實施例
在以下列舉之實施例中描述了本發明之額外態樣: 實施例 1.一種根據式I之化合物: (I) 或其醫藥學上可接受之鹽,其中: B為 ; R 1為-H或 ; Alk每次出現時獨立地為C 2-C 6脂族基; R 2為-H、C 1-C 6脂族基、C 1-C 3鹵基脂族基、C 1-C 3羥烷基、環丙基、-CN、-N 3、-O-(C 1-C 3脂族基)、-F或-Cl; R 3為-H; R 4為-OH、-Cl、-OCH 3、-F、-N 3; R 5為-H或-F;且 R 6為-H、-F、-Cl、C 1-C 6脂族基、C 1-C 4鹵基脂族基、-O-(C 1-C 4脂族基)、環丙基或-OH。 實施例 2.如實施例1之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中Alk每次出現時獨立地為乙基、丙基、異丙基、二級丁基、三級丁基或異丁基。 實施例 3.如實施例1或2之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中R 1為-H或 實施例 4.如前述實施例中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中R 1為-H。 實施例 5.如前述實施例中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中R 5為-H。 實施例 6.如前述實施例中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中R 2不為-H。 實施例 7.如前述實施例中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中R 4為-OH或 實施例 8.如前述實施例中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中R 6為-H、-F、-CH 3、-CH 2CH 3、-OCH 3、-OCH 2CH 3、-CH=CH 2、-CH 2F或-CH 2Cl。 實施例 9.如前述實施例中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中R 6為-H或-F。 實施例 10.如前述實施例中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中R 6為-H。 實施例 11.如實施例1至9中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中R 6為-F。 實施例 12.如前述實施例中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中B為 實施例 13.如前述實施例中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中B為 實施例 14.如前述實施例中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中R 2為-CH 3、-CF 3、-N 3、-OCH 3、-CH 2Cl、-CH 2F、-CHF 2、-CHCl 2、-CHClF、-CH 2CH 3、-CH=CH 2、環丙基或-C≡CH。 實施例 15.如實施例1至13中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中R 2為-N 3、-CH 3、-CH 2Cl、-CH 2F、-CH=CH 2或-C≡CH。 實施例 16.如實施例1至13中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中R 2為-CH 2Cl、-CH 2F或-C≡CH。 實施例 17.如實施例1至13中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中R 2為-CH 2Cl或-C≡CH。 實施例 18.如前述實施例中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中R 2為-CH 2Cl。 實施例 19.如實施例1之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中: R 4為-OH; R 5為-H;且 R 6為H。 實施例 20.如實施例19之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中R 2為-CH 2Cl。 實施例 21.如實施例1之化合物,其選自由以下組成之群:
化合物 結構
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
或其醫藥學上可接受之鹽。 實施例 22.一種本文表1、1-A或1-B中之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。 實施例 23.一種醫藥組合物,其包含根據實施例1至21中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,以及載劑、賦形劑及/或媒劑。 實施例 24.一種醫藥組合物,其包含根據實施例22之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,以及載劑、賦形劑及/或媒劑。 實施例 25.一種治療選自由癌症、自體免疫病症及神經病症組成之群的病症之方法,包含向有此需要之個體投與治療有效量的根據實施例1至21中任一項之式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽或如實施例23之醫藥組合物,以治療該病症。 實施例 26.如實施例25之方法,其中該方法進一步包含投與有效量的額外治療劑。 實施例 27.一種抑制個體中之LINE1逆轉錄酶活性之方法,該個體患有選自由癌症、自體免疫病症及神經病症組成之群的病症,該方法包含使LINE1逆轉錄酶與有效量的根據實施例1至21中任一項之式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽或如實施例23之組合物接觸,以抑制該LINE1逆轉錄酶的活性。 實施例 28.如實施例27之方法,其中該方法進一步包含抑制個體中之HERV-K逆轉錄酶活性。 實施例 29.一種抑制個體中之HERV-K逆轉錄酶活性之方法,該個體患有選自由癌症、自體免疫病症及神經病症組成之群的病症,該方法包含使HERV-K逆轉錄酶與有效量的根據實施例1至21中任一項之式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽或如實施例23之組合物接觸,以抑制該HERV-K逆轉錄酶的活性。 實施例 30.如實施例25至29中任一項之方法,其中該化合物選自由以下組成之群:
化合物 結構
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34   
35
36
37
38
39   
40
41
42
43
44
45
46   
47
48
49   
   50
51
或其醫藥學上可接受之鹽。 實施例 31.如實施例25至30中任一項之方法,其中該病症為癌症。 實施例 32.如實施例31之方法,其中該癌症為乳癌、卵巢癌(ovarian cancer)、子宮癌、子宮頸癌、前列腺癌、睪丸癌、肺癌、白血病、頭頸癌、口腔癌、食道癌、胃癌、膽管癌、膽囊癌、膀胱癌、尿路癌、結腸癌、直腸癌、甲狀腺癌、胰臟癌、腎癌、肝癌、腦癌、皮膚癌或眼癌。 實施例 33.如實施例25至30中任一項之方法,其中該病症為自體免疫病症。 實施例 34.如實施例33之方法,其中該自體免疫病症選自艾卡迪-古特雷斯症候群、類風濕性關節炎、牛皮癬、全身性紅斑狼瘡(SLE)、皮膚紅斑狼瘡(CLE)、移植物抗宿主病、硬皮病、I型糖尿病、皮肌炎、發炎性腸道疾病、潰瘍性結腸炎、克隆氏病、血管炎及休格倫氏症候群。 實施例 35.如實施例25至30中任一項之方法,其中該病症為神經病症。 實施例 36.如實施例35之方法,其中該神經病症為阿茲海默氏症、肌萎縮性脊髓側索硬化症(ALS)、多發性硬化症、帕金森氏症、亨汀頓氏舞蹈症、周邊神經病變、年齡相關性黃斑退化、克雅氏病、中風、朊病毒病、額顳葉癡呆、匹克氏症、進行性核上神經麻痺症、脊髓小腦性失調症、路易體病、癡呆、多系統萎縮、癲癇、雙極性障礙、精神分裂症、焦慮症或重度抑鬱症。 實施例 37.如實施例25至36中任一項之方法,其中該個體具有(i)升高之LINE1 RNA、LINE1 ORF1多肽及/或LINE1 ORF2多肽表現;及/或(ii)升高之LINE1逆轉錄酶活性。 實施例 38.如實施例25至37中任一項之方法,其中個體具有(i) HERV-K RNA之表現及/或(ii) HERV-K逆轉錄酶之活性。 實施例 39.如實施例25至38中任一項至方法,其中個體為人類。 實例
現在一般性地描述本發明,藉由參考以下實例將更容易理解,包括此等實例僅用於說明本發明之某些態樣及實施例之目的,而不旨在限製本發明。本文所述的起始材料可以自商業來源獲得或者可以使用熟習此項技術中已知之轉化容易地自市售可得之材料製備。 實例 1– 化合物 44 4- 胺基 -1-((2R,4S,5R)-5- 乙基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- ) 嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在室溫,氮氣氛圍下向2'-去氧尿苷(50 g,219.1)及咪唑(149.1 g,2191.0 mmol)於吡啶(500 mL)之攪拌溶液中分批添加TBSCl (99.1 g,657.3 mmol)。將混合物在80℃下攪拌15 h。LCMS顯示反應完成。將混合物冷卻至室溫且用EA稀釋,用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾出固體,將濾液合併且濃縮,得到呈淡黃色油狀物之1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(98 g,215 mmol,粗品)。產物(ES, m/z): 457 (M+H +)。
步驟2:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(90 g,197.1 mmol)於甲醇(500 mL)之攪拌溶液中分批添加PPTS (74.3 g,295.5 mmol)。將混合物在35℃下攪拌15 h。LCMS顯示反應完成。將混合物在減壓下濃縮。將殘餘物用EA稀釋,用檸檬酸及鹽水之水溶液洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾出固體,將濾液合併且在減壓下濃縮,得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(65 g,190 mmol,粗品)。產物(ES, m/z): 343 (M+H +)。
步驟3:向1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(65 g,189.7 mmol)於CH 3CN (500 mL)之攪拌溶液中添加IBX (159.4 g,569.4 mmol)。將混合物在60℃下攪拌3 h。LCMS顯示反應完成。將反應冷卻至室溫。過濾出固體且濃縮濾液,得到呈灰白色固體之(2S,3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(60 g,176 mmol,粗品)。產物(ES, m/z): 341 (M+H +)。
步驟4:在室溫,氮氣氛圍下向(2S,3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(60 g,176.2 mmol)及甲醛(26.4 g,881.1 mmol)於二噁烷(500 mL)之攪拌溶液中逐滴添加NaOH (21.1 g,528.7 mmol)於水(50 mL)中之溶液。將混合物在室溫下攪拌15 h。LCMS顯示消耗了起始材料,然後在0℃下添加NaBH 4(20 g,528.7 mmol)。將混合物在0℃下攪拌30 min,LCMS顯示反應完成。將反應用NH 4Cl水溶液淬滅,且用EA萃取。將合併之有機物用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾出固體且濃縮濾液。藉由用甲醇/二氯甲烷(7/93)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4S)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(20 g,53.7 mmol,30.47%)。產物(ES, m/z): 372 (M+H +)。
步驟5:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,4S)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(20 g,53.6 mmol)於吡啶(200 mL)之攪拌溶液中分批添加4,4'-(氯(苯基)亞甲基)雙(甲氧基苯) (18 g,53.6 mmol)。將混合物在30℃下攪拌3 h。LCMS顯示反應完成。該混合物未經進一步純化即用於下一步驟。產物(ES, m/z): 675 (M+H +)。
步驟6:向上述溶液中添加TBSCl (20 g,133.3 mmol)。將混合物在30℃下攪拌15 h。LCMS顯示反應完成。將混合物用EA稀釋,用檸檬酸及鹽水之水溶液洗滌。將有機層經無水Na 2SO 4乾燥。過濾出固體,將濾液合併且在減壓下濃縮,得到呈黃色固體之1-[(2R,4S,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(40 g,50.7 mmol,粗品)。產物(ES, m/z): 787 (M-H +) -
步驟7:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(40 g,50.6 mmol)於CH 3CN (50 mL)之攪拌溶液中逐滴添加80% CH 3COOH水溶液(200 mL)。將混合物在室溫下攪拌15 h。LCMS顯示反應完成。用碳酸氫鈉水溶液將反應之pH調節至8,且用EA萃取。將合併之有機物用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾出固體且濃縮濾液。藉由用甲醇/二氯甲烷(3/97)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(18 g,37.0 mmol,72.95%)。產物(ES, m/z): 487 (M+H +)。
步驟8:將1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(18 g,37.0 mmol)及IBX (31 g,111.1 mmol)於乙腈(200 mL)中之溶液在60℃下攪拌2 h。LCMS顯示反應完成。將反應冷卻至室溫,且過濾出固體。將濾液合併且在減壓下濃縮,得到呈白色固體之(2R,3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(17 g,35.1 mmol,粗品)。產物(ES, m/z): 485 (M+H +)。
步驟9:在78℃、氮氣氛圍下向甲基三苯基溴化鏻(37.5 g,105.2 mmol)於THF (200 mL)之攪拌溶液中逐滴添加n-BuLi (42 mL,105.2 mmol)。將混合物在0℃下攪拌30 min,然後添加含(2R,3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(17 g,35.1 mmol)之THF(20 mL)。將混合物在室溫下攪拌1.5 h。LCMS顯示反應完成。將反應用NH 4Cl溶液淬滅,且用EA萃取。將合併之有機物用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾出固體,將濾液合併且濃縮。藉由用EA/PE (1/10)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(15 g,31.1 mmol,88.60%)。產物(ES, m/z): 483 (M+H +)。
步驟10:向1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(15 g,31.1 mmol)及DMAP (7.6 g,62.1 mmol)於乙腈(200 mL)之攪拌溶液中添加TEA (9.4 g,93.2 mmol)及2,4,6-三異丙基苯磺醯氯(18.7 g,62.1 mmol)。將混合物在室溫下攪拌1 h。LCMS顯示反應完成。將反應用NH 3 .H 2O淬滅。然後用EA稀釋混合物,用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾出固體,將濾液合併且濃縮。藉由用甲醇/二氯甲烷(7/93)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(14 g,29.1 mmol,93.52%)。產物(ES, m/z): 482 (M+H +)。
步驟11:向4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(13 g,26.9 mmol,1 equiv)於甲醇(300 mL)之攪拌溶液中添加Pd/C (2.5 g,w/w=20%)。在室溫,H 2氛圍下將混合物攪拌15 h。LCMS顯示反應完成。過濾出固體,將濾液合併且在減壓下濃縮,得到呈淡黃色固體之4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(10 g,20.7 mmol,粗品)。LC-MS (ES, m/z): 484 (M+H +)。
步驟12:向4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(7 g,14.4 mmol)於MeOH (300 mL)之攪拌溶液中添加NH 4F (16.1 g,434.0 mmol)。將混合物在60℃下攪拌15 h。LCMS顯示反應完成。將反應冷卻至室溫。過濾固體,且用MeOH洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液,得到粗產物,將其藉由製備型SFC在以下條件下純化(管柱:CHIRAL ART 直鏈澱粉-SA, 7*25 cm,10 μm;流動相A:CO 2,流動相B:MeOH (0.1% 2M NH 3-MeOH);流率:250 mL/min;梯度:等度50% B;管柱溫度(℃):35;背壓(bar):100;波長:220 nm;RT1(min):3.998;樣品溶劑:MeOH-製備型;注射量:2 mL;運行次數:30),得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-5-乙基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(1.0023 g,3.9 mmol,26.89%)。LC-MS (ES, m/z): 256 (M+H +), 99.1%純度。LCMS之條件:(管柱:Shim Pack Scepter C18, 33*3.0 mm,3.0 μm;流動相A:水/6.5mM NH 4HCO 3,流動相B:ACN;流率:1.200 mL/min;梯度:在1.2 min內10% B至95% B,在1.80 min內95% B至95% B,在1.82 min內95% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):1.033)。 1H NMR (300 MHz, DMSO- d 6) δ 7.86 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 7.11 (d, J= 20.2 Hz, 2H), 6.08 (t, J= 6.6 Hz, 1H), 5.70 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 5.05 (d, J= 4.8 Hz, 1H), 4.96 (t, J= 5.2 Hz, 1H), 4.23 (dt, J= 5.8, 4.1 Hz, 1H), 3.41 (h, J= 5.9, 5.4 Hz, 2H), 2.23 – 1.98 (m, 2H), 1.54 (ddq, J= 28.8, 14.5, 7.3 Hz, 2H), 0.86 (t, J= 7.5 Hz, 3H)。 實例 2– 化合物 14 4- 胺基 -1-((2R,4S,5R)-5-( 氯甲基 )-4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- )-5- 氟基嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在0℃、氮氣氛圍下向氟尿苷(4 g,16.247 mmol)於吡啶(40 mL)之攪拌混合物中分批添加1-[氯(4-甲氧基苯基)苯基甲基]-4-甲氧基苯(6.06 g,17.872 mmol)。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌2 h且在真空下濃縮。將粗產物自石油醚/EtOAc (10:1)中再結晶,得到呈黃色固體之1-[(2R,4S,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(8 g,89.8%)。產物(ES, m/z): 549 (M+H +)。
步驟2:在0℃、氮氣氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(11 g,20.052 mmol)及咪唑(16.38 g,240.624 mmol)於DMF (200 mL)之攪拌混合物中分批添加TBSCl (12.09 g,80.208 mmol)。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌2 h,然後藉由添加飽和NaHCO 3水溶液來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機物用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,且在真空下濃縮。此得到呈黃色固體之1-[(2R,4S,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(11 g,82.76%)。產物(ES, m/z): 663 (M+H +)。
步驟3:將1-[(2R,4S,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(8 g,12.069 mmol)於AcOH (80 mL)中之混合物在室溫下攪拌隔夜。藉由添加飽和NaHCO 3水溶液來淬滅反應。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機物用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,且在真空下濃縮。此得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(4 g,91.94%)。產物(ES, m/z): 361 (M+H +)。
步驟4:向1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(5 g,13.871 mmol)於ACN (100 mL)之混合物中添加IBX (7.77 g,27.742 mmol)。將反應混合物在60℃下攪拌2 h。過濾所得混合物且用乙腈洗滌濾餅。在真空下濃縮濾液。此得到呈黃色固體之(2S,3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(4.5 g,90.51%)。產物(ES, m/z): 359 (M+H +)。
步驟5:在室溫下向(2S,3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛 (5.0 g,0.330 mmol)及NaOH水溶液(5 mL,2M)於1,4-二噁烷(50 mL)之攪拌混合物中逐滴添加甲醛(2.5 mL,37%)。將所得混合物在室溫下攪拌2 h,然後用AcOH調節至pH 7。隨後在0℃下添加EtOH (7.5 mL)及NaBH 4(2.22 g,58.586 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌30 min且藉由添加飽和NH 4Cl水溶液來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機物用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,且在真空下濃縮。此得到呈白色固體之1-[(2R,4S)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(4 g,73.44%)。產物(ES, m/z): 391 (M+H +)。
步驟6:在-30℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,4S)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(800 mg,2.049 mmol)於吡啶(8 mL)之混合物中添加Tf 2O (1213.83 mg,4.303 mmol)。將反應混合物在-30℃,氮氣氛圍下攪拌2 h,隨後藉由添加飽和NaHCO 3水溶液來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機物用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,且在真空下濃縮。藉由用石油醚/EtOAc (2:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之三氟甲烷磺酸[(3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(1.1 g,82.02%)。產物(ES, m/z): 655 (M+H +)。
步驟7:在室溫,氮氣氛圍下將三氟甲烷磺酸[(3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(800 mg,1.222 mmol)及TEA (247.34 mg,2.444 mmol)於THF (8 mL)中之混合物攪拌隔夜。然後向以上混合物中添加氯化鋰(155.42 mg,3.666 mmol)。將所得混合物在60℃下再攪拌2 h。藉由LCMS可以偵測到所需產物。所得粗混合物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。產物(ES, m/z): 391 (M+H +)。
步驟8:將來自前一步驟之溶液用H 2O (8 mL)稀釋,隨後添加NaOH (245.56 mg,6.141 mmol)。將反應混合物在室溫下攪拌隔夜,然後藉由添加飽和NH 4Cl水溶液來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機物用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,且在真空下濃縮。藉由用石油醚/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(600 mg,71.70%)。產物(ES, m/z): 409 (M+H +)。
步驟9:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(500 mg,1.223 mmol)及咪唑(166.48 mg,2.446 mmol)於DMF (10 mL)之攪拌混合物中分批添加TBSCl (276.43 mg,1.835 mmol)。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌2 h,然後藉由添加飽和NaHCO 3水溶液來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機物用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,且在真空下濃縮。此得到呈黃色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(600 mg,93.79%)。產物(ES, m/z): 523 (M+H +)。
步驟10:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(500 mg,0.956 mmol)、DMAP (350.27 mg,2.868 mmol)及TEA (290.12 mg,2.868 mmol)於ACN (20 mL)之攪拌混合物中添加2,4,6-參(丙-2-基)苯-1-磺醯氯(868.31 mg,2.868 mmol)。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌2 h。然後向以上混合物中逐滴添加NH 3.H 2O (10.00 mL)。將所得混合物在室溫下再攪拌1 h,然後在真空下濃縮。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化殘餘物:管柱,C18矽膠;流動相,含ACN之水,在15 min內0%至100%梯度;偵測器,UV 254 nm。此得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(400 mg,80.15%)。產物(ES, m/z): 522 (M+H +)。
步驟11:向4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(400 mg,0.766 mmol)於MeOH (4 mL)之混合物中添加NH 4F (851.08 mg,22.980 mmol)。將反應混合物在60℃下攪拌隔夜。過濾所得混合物且用乙醇洗滌濾餅。將合併之濾液在真空下濃縮。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物:管柱,XBridge Prep OBD C18管柱,30*150 mm,5µm;流動相,水(10 mmol/L NH 4HCO 3)及ACN (在7 min內2% ACN直到15%);偵測器,UV 254 nm。此得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(71.4 mg,31.58%)。化合物14 (ES, m/z): 294 (M+H +)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 8.02 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.77 (s, 1H), 7.53 (s, 1H), 6.22–6.18 (m, 1H), 5.45 (d, J= 4.4 Hz, 1H), 5.30 (t, J= 5.2 Hz, 1H), 4.38–4.36 (m, 1H), 3.78 (d, J= 11.6 Hz, 1H), 3.71 (d, J= 11.6 Hz, 1H), 3.66–3.56 (m, 2H), 2.24–2.17 (m, 2H)。 實例 3– 化合物 40 4- 胺基 -1-((2R,3S,4R,5R)-5-( 氯甲基 )-3- 氟基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- ) 嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(60 g,243.7 mmol)及咪唑(166 g,2437.1 mmol)於DMF (500 mL)之攪拌溶液中分批添加TBSCl (110 g,731.1 mmol)。將混合物在80℃下攪拌15 h。LCMS顯示反應完成。將混合物冷卻至室溫,用EtOAc稀釋,用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾出固體且濃縮濾液,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(110 g,231.7 mmol,粗品)。產物(ES, m/z): 475 (M+H +)。
步驟2:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(110 g,231.7 mmol,1 equiv)於MeOH (500 mL)之攪拌溶液中分批添加PPTS (175 g,695.1 mmol)。將混合物在50℃下攪拌15 h。LCMS顯示反應完成。將混合物冷卻至室溫且濃縮。將殘餘物用EA稀釋,用鹽水洗滌,且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾出固體且濃縮濾液。藉由用甲醇/二氯甲烷= 3/97溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(66 g,183.3 mmol,79.02%)。產物(ES, m/z): 361 (M+H +)。
步驟3:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(66 g,183.3 mmol)於CH 3CN (500 mL)之攪拌溶液中分批添加IBX (47 g,166.4 mmol)。將混合物在60℃下攪拌5 h。LCMS顯示反應完成。將混合物冷卻至室溫。過濾出固體且濃縮濾液,得到呈白色固體之(2S,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基] -5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-4-氟基氧雜環戊烷-2-甲醛(60 g,167.5 mmol,粗品)。產物(ES, m/z): 359 (M+H +)。
步驟4:在0℃下向(2S,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-4-氟基氧雜環戊烷-2-甲醛(60 g,167.5 mmol)及HCHO (33 g,1089.3 mmol,6.5 equiv)於二噁烷(1000 mL)之攪拌溶液中逐滴添加NaOH (20 g,502.7 mmol,3 equiv)於水(50 mL)中之溶液。將所得混合物在室溫下攪拌1h。在0℃下向以上混合物中分批添加NaBH 4(29 g,754.1 mmol)。將所得混合物再攪拌30 min。用NH 4Cl水溶液淬滅混合物。將所得混合物用EA萃取。將合併之有機層用飽和鹽水洗滌,且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用DCM/MeOH (4.9% MeOH)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(35 g,89.7 mmol,53.55%)。產物(ES, m/z): 391 (M+H +)。
步驟5:在-35℃、氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(31 g,79.4 mmol)於DCM (500 mL)之攪拌溶液中逐滴添加吡啶(31 g,396.9 mmol)及三氟甲酸酐(49 g,174.6 mmol)。將混合物在0℃下攪拌30 min,LCMS顯示反應完成。將混合物用水淬滅且用EA萃取。將合併之有機物用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾出固體且濃縮濾液。藉由用EA/PE (1/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之三氟甲烷磺酸[(3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-4-氟基-2-[(三氟甲烷-磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(30 g,45.8 mmol,57.05%)。產物(ES, m/z): 655 (M+H +)。
步驟6:在室溫,氮氣氛圍下向三氟甲烷磺酸[(3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-4-氟基-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(30 g,45.8 mmol)於THF (500 mL)之攪拌溶液中逐滴添加TEA (46 g,458.3 mmol)。將混合物在60℃下攪拌15 h。LCMS顯示消耗了起始材料,然後添加氯化鋰(19 g,458.3mmol)。將所得混合物在60℃下攪拌2 h,LCMS顯示反應完成。該混合物未經進一步純化即用於下一步驟中。產物(ES, m/z): 391 (M+H +)。
步驟7:向以上溶液中緩慢添加NaOH (5.5 g,136.6 mmol)於水(50 mL)中之溶液。將混合物在室溫下攪拌兩天。LCMS顯示消耗了大部分起始材料。過濾出固體,將濾液合併且濃縮。將殘餘物用EA稀釋,用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾出固體且濃縮濾液。藉由用甲醇/二氯甲烷(7/93)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(氯甲基)-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(11 g,26.9 mmol,59.07%)。產物(ES, m/z): 409 (M+H +)。
步驟8:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(氯甲基)-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(10 g,24.4 mmol)及咪唑(17 g,244.5 mmol)於二甲基甲醯胺(200 mL)之攪拌溶液中分批添加三級丁基二甲基氯矽烷(11 g,73.3 mmol)。將混合物在80℃下攪拌15 h。LCMS顯示反應完成。將混合物冷卻至室溫,用EA稀釋,用鹽水洗滌,且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾出固體,將濾液合併且濃縮。藉由用甲醇/二氯甲烷(7/93)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(12 g,23.0 mmol,93.79%)。產物(ES, m/z): 523 (M+H +)。
步驟9:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(12 g,22.9 mmol)及DMAP (5.6 g,45.8 mmol)於CH 3CN (200 mL)之攪拌溶液中添加TEA (7 g,68.8 mmol)及2,4,6-三異丙基苯磺醯氯(14 g,45.8 mmol)。將混合物在40℃下攪拌15 h。消耗了起始材料,然後緩慢添加NH 3.H 2O (50 mL)。將所得混合物在室溫下攪拌1h。LCMS顯示反應完成。將混合物用EA稀釋,用鹽水洗滌,且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾出固體,將濾液合併且濃縮。藉由用甲醇/二氯甲烷(7/93)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(11 g,21.1 mmol,91.84%)。產物(ES, m/z): 522 (M+H +)。
步驟10:在60℃,氮氣氛圍下將4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(8 g,15.4 mmol)及NH 4F (17 g,461 mmol)於MeOH (200 mL)中之混合物攪拌隔夜。將所得混合物冷卻至室溫且過濾出固體;用MeOH洗滌濾餅。將濾液合併且在減壓下濃縮。藉由逆相急速(NH 4HCO 3)純化粗產物,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(2.5 g,8.53 mmol,55.38%)。化合物40 (ES, m/z): 294 (M+H +), 98.6%純度。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.63 (dd, J= 7.5, 1.4 Hz, 1H), 7.24 (d, J= 24.8 Hz, 2H), 6.25 (dd, J= 17.9, 4.0 Hz, 1H), 6.15 (d, J= 5.1 Hz, 1H), 5.74 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 5.34 (t, J= 5.5 Hz, 1H), 5.09 (dt, J= 53.0, 3.3 Hz, 1H), 4.42 (ddd, J= 18.3, 5.2, 2.8 Hz, 1H), 3.97 – 3.69 (m, 2H), 3.66 – 3.50 (m, 2H)。 實例 4- 化合物 4 1-((2R,4S,5R)-5-( 氯甲基 )-4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- )-5- 甲基嘧啶 -2,4(1H,3H)- 二酮之合成
步驟1:將胸苷(5 g,20.6 mmol)及三級丁基氯基二甲基矽烷(3.4 g,22.7 mmol)於吡啶(30 mL)中之混合物在室溫下攪拌3 h。將所得混合物用水(500 mL)稀釋。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 300 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 150 mL)洗滌且經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。將殘餘物應用於具有二氯甲烷/甲醇(10/1)之矽膠管柱層析法,得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(7 g,19.6 mmol,95.13%)。LC-MS (ES, m/z): 357 [M+H] +
步驟2:在0℃下向1-[(2R,4S,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(7 g,19.6 mmol)及2,4,6-三甲基吡啶(7.1 g,58.9 mmol)於二氯甲烷(50 mL)之混合物中添加硝酸銀(6.6 g,39.2 mmol)及1-(氯基二苯基甲基)-4-甲氧基苯(6.6 g,21.6 mmol),且將混合物在室溫下攪拌隔夜。用鹽酸(0.1M)將混合物酸化至pH 6。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 200 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 100 mL)洗滌且經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟。LC-MS (ES, m/z): 629 [M+H] +
步驟3:在室溫下將1-[(2R,4S,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(12 g,19.1 mmol)及四丁基氟化銨(22.9 mL,22.9 mmol,1 M於THF中)於四氫呋喃(300 mL)中之混合物攪拌6 h。濃縮混合物且藉由用石油醚/乙酸乙酯(1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之1-[(2R,4S,5R)-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(8 g,15.5 mmol,81.47%)。LC-MS (ES, m/z): 515 [M+H] +
步驟4:在室溫,氮氣氛圍下將1-[(2R,4S,5R)-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(8 g,15.5 mmol)及戴斯-馬丁(6.5 g,15.5 mmol)於二氯甲烷(50 mL)中之混合物攪拌隔夜。藉由用石油醚/乙酸乙酯(1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之(2S,3S,5R)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(6.8 g,13.2 mmol,85.33%)。LC-MS (ES, m/z): 513 [M+H] +
步驟5:在室溫,氮氣氛圍下將(2S,3S,5R)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(6.8 g,13.2 mmol)及HCHO (3.9 g,132.8 mmol)於1,4-二噁烷(60 mL)及水(12 mL)中之混合物用苛性鈉(1.1 g,26.5 mmol)處理隔夜,隨後在室溫下分批添加NaBH 4(2.1 g,53.1 mmol)。在室溫,空氣氛圍下將所得混合物攪拌1 h。將所得混合物用水(200 mL)稀釋。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 200 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 100 mL)洗滌且經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用二氯甲烷/甲醇(10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4S)-5,5-雙(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(3.5 g,6.4 mmol,48.44%)。LC-MS (ES, m/z): 545 [M+H] +
步驟6:在-35℃下向1-[(2R,4S)-5,5-雙(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(3.5 g,6.4 mmol)及吡啶(2.5 g,32.1 mmol)於二氯甲烷(50 mL)之混合物中逐滴添加三氟甲磺酸酸酐(3.6 g,12. mmol)且在室溫,氮氣氛圍下將混合物攪拌2 h。將所得混合物用水(200 mL)稀釋。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 100 mL)洗滌且經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EA (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之三氟甲烷磺酸[(3S,5R)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(2 g,2.4 mmol,38.48%)。LC-MS (ES, m/z): 809 [M+H] +
步驟7:將三氟甲烷磺酸[(3S,5R)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(2 g,2.4 mmol)及氫化鈉(0.06 g,2.4 mmol)於N,N-二甲基甲醯胺(10 mL)中之混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌4 h,然後將氯化鋰(0.31 g,7.4 mmol)添加至該混合物中且攪拌1.5 h。藉由在0℃下添加水(1 mL)來淬滅反應。濃縮混合物且藉由用二氯甲烷/甲醇(10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之(6R,8S,9R)-9-(氯甲基)-8-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)-3-甲基-7,8,9,10-四氫-2H,6H-6,9-環氧基嘧啶并[2,1-b][1,3]噁唑嗪-2-酮(1 g,1.8 mmol,74.19%)。LC-MS (ES, m/z): 545/547 [M+H] +
步驟8:將(6R,8S,9R)-9-(氯甲基)-8-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)-3-甲基-7,8,9,10-四氫-2H,6H-6,9-環氧基嘧啶并[2,1-b][1,3]噁唑嗪-2-酮(500 mg,0.9 mmol)及氫氧化鈉(73.3 mg,1.8 mmol)於四氫呋喃(10 mL)中之混合物在室溫下攪拌隔夜。將所得混合物在真空下濃縮。藉由用二氯甲烷/甲醇(10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(190 mg,0.3 mmol,36.78%)。LC-MS (ES, m/z): 563/ 565 [M+H] +
步驟9:將1-[(2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(190 mg,0.3 mmol)於甲酸(8 mL)及H 2O (2 mL)中之混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌0.5 h。濃縮混合物且藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(80 mg) (管柱:XBridge Prep C18 OBD管柱,30*100 mm,5μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在10 min內20% B至38% B,38% B;波長:254/220 nm;RT1(min):9.98),得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(11.4 mg,11.45%)。LC-MS (ES, m/z): 291/293 [M+H] +. 98.5%純度。LCMS之條件:(管柱:Shim-pack ScepterC18, 33*3 mm,3 μm;流動相A:水/5mM NH 4HCO 3,流動相B:乙腈;流率:1.5000 mL/min;梯度:在1.79 min內5% B至30% B,在0.40 min內30% B至95% B,在0.10 min內95% B至95% B,在0.30 min內95% B至10% B;波長:254 nm;RT1(min):1.040)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 11.24 (s, 1H), 7.63 (d, J= 1.6 Hz, 1H), 6.26 (dd, J= 8.2, 5.9 Hz, 1H), 5.48 (s, 1H), 5.25 (s, 1H), 4.41 (dd, J= 6.2, 3.0 Hz, 1H), 3.84 – 3.70 (m, 2H), 3.59 (s, 2H), 2.33 (ddd, J= 13.9, 8.3, 6.1 Hz, 1H), 2.20 – 2.06 (m, 1H), 1.79 (s, 3H)。 實例 5- 化合物 67 之合成
步驟1:在0℃下向苯甲酸[(2R,3S,4R,5R)-3,5-雙(苄醯氧基)-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]甲酯(50 g,108.1 mmol)於DCM (500 mL)之溶液中逐滴添加BAST (47.8 g,216.2 mmol)。將所得混合物在50℃下攪拌2天,然後冷卻至0℃且藉由添加水來淬滅。用EtOAc萃取所得溶液。將合併之有機物用飽和NaHCO 3水溶液洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由用石油醚/EtOAc (2:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之苯甲酸[(2R,3R,4S,5R)-3,5-雙(苄醯氧基)-4-氟基氧雜環戊烷-2-基]甲酯(40 g,79.7%)。LC-MS (ES, m/z): 343 (M-OBz) +
步驟2:向苯甲酸[(2R,3R,4S,5R)-3,5-雙(苄醯氧基)-4-氟基氧雜環戊烷-2-基]甲酯(40 g,86.1 mmol)於DCM (400 mL)之溶液中逐滴添加HBr-AcOH (120 mL)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜,然後藉由添加水來淬滅。用EtOAc萃取所得溶液。將合併之有機物用飽和NaHCO 3水溶液洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由用石油醚/EtOAc (4:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈棕黃色油狀物之苯甲酸[(2R,3R,4S,5R)-3-(苄醯氧基)-5-溴基-4-氟基氧雜環戊烷-2-基]甲酯(35 g,96.0%)。LC-MS (ES, m/z): 343 (M-Br) +
步驟3:向氟尿嘧啶(16.14 g,124.0 mmol)於HMDS (160 mL)之攪拌溶液中分批添加(NH 4) 2SO 4(32.78 g,248.1 mmol)。將所得混合物在120℃下攪拌4小時,然後冷卻至室溫且在真空下濃縮。向以上殘餘物中添加苯甲酸[(2R,3R,4S,5R)-3-(苄醯氧基)-5-溴基-4-氟基氧雜環戊烷-2-基]甲酯(35 g,82.697 mmol)於氯仿(350 mL)中之溶液。將所得混合物在60℃下攪拌隔夜。將所得溶液冷卻至室溫,用鹽水洗滌,且在真空下濃縮。藉由用石油醚/EtOAc (5:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之苯甲酸[(2R,3R,4S,5R)-3-(苄醯氧基)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-基]甲酯(26 g,66.6%)。LC-MS (ES, m/z): 473 (M+H +)。
步驟4:在室溫,氮氣氛圍下向苯甲酸[(2R,3R,4S,5R)-3-(苄醯氧基)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-基]甲酯(26 g,55.0 mmol)於MeOH(300 mL)之攪拌溶液中分批添加NaOH (5.5 g,137.6 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜且在真空下濃縮。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (15:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之5-氟基-1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(11 g,75.7%)。LC-MS (ES, m/z): 265 (M+H +)。
步驟5:在0℃,氮氣氛圍下向5-氟基-1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(20 g,75.7 mmol)及咪唑(15.46 g,227.1 mmol)於DMF (200mL)之攪拌溶液中分批添加TBSCl (28.53 g,189.3 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜,然後用EtOAc (200 mL)稀釋。將所得溶液用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由用石油醚/EtOAc (8:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(28 g,75.1%)。LC-MS (ES, m/z): 493 (M+H +)。
步驟6:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(28 g,57.1 mmol)於THF (300 mL)之溶液中逐滴添加TFA (60 mL)。將所得混合物攪拌4小時,然後藉由添加水來淬滅。用EtOAc萃取所得溶液。將合併之有機物用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由用石油醚/EtOAc (5:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,呈白色固體之得到1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(15.3 g,70.9%)。LC-MS (ES, m/z): 379 (M+H +)。
步驟7:向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(15.3 g,40.4 mmol)於乙腈(160 mL)之溶液中添加IBX (22.64 g,80.9 mmol)。將混合物在60℃下攪拌3小時,然後冷卻至室溫。過濾所得混合物且用乙腈(3 x 100 mL)洗滌濾餅。在真空下濃縮濾液,得到呈白色固體之粗(2S,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(12.9 g,84.8%)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 377 (M+H +)。
步驟8:在0℃下向(2S,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(12.9 g,34.3 mmol)於1,4-二噁烷(130 mL)之溶液中逐滴添加HCHO水溶液(13 mL,37%-40%)及NaOH水溶液(40 mL,2 M,80.0 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌隔夜,然後用乙酸調節至pH 7。向以上混合物中逐滴添加EtOH (39 mL)。隨後在0℃下分批添加NaBH 4(2.6 g,68.5 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌4小時,然後冷卻至0℃且藉由添加飽和NH 4Cl水溶液來淬滅。用EtOAc萃取所得溶液。將合併之有機物用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由用石油醚/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(6.7 g,47.9%)。LC-MS (ES, m/z): 409 (M+H +)。
步驟9:在-30℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(10.0 g,24.5 mmol 7.344 mmol)於吡啶(300 mL)之攪拌溶液中逐滴添加Tf 2O (17.3 g,61.3 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌2小時,然後冷卻至0℃且藉由添加飽和NH 4Cl水溶液來淬滅。用EtOAc萃取所得溶液。將合併之有機物用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由用石油醚/EtOAc (5:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之三氟甲烷磺酸[(3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-2-[(三氟甲磺醯氧基)-甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(10.5 g,63.75%)。LC-MS (ES, m/z): 673 (M+H +)。
步驟10:在室溫,氮氣氛圍下向三氟甲烷磺酸[(3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(10.2 g,15.2 mmol)於THF (100 mL)之攪拌溶液中逐滴添加TEA (15.3 g,151.4 mmol)。將所得混合物在50℃下攪拌3小時,然後冷卻至室溫。向以上混合物中分批添加LiCl (1.9 g,45.5 mmol),且將所得混合物在50℃下攪拌隔夜。冷卻至室溫後,逐滴添加NaOH (1.2 g,30.2 mmol)於水(40 mL)中之溶液。將所得混合物在室溫下再攪拌3小時,然後用EtOAc萃取。將合併之有機物用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由用石油醚/EtOAc (2:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-((2R,3S,4R,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)-氧基)-5-(氯甲基)-3-氟基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(2.5 g,40.4%)。LC-MS (ES, m/z): 427 (M+H +)。
步驟11:在0℃下向1-((2R,3S,4R,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(氯甲基)-3-氟基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(2.5 g,6.1 mmol)及咪唑(1.2 g,17.5 mmol)於DMF (40 mL)之溶液中分批添加TBSCl (1.32 g,8.9 mmol)。將所得混合物攪拌隔夜,然後藉由添加水來淬滅。用EtOAc萃取所得溶液。將合併之有機物用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由用石油醚/EtOAc (4:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-((2R,3S,4R,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-5-(氯甲基)-3-氟基四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(1.5 g,46.9%)。LC-MS (ES, m/z): 541 (M+H +)。
步驟12:在室溫,氮氣氛圍下向1-((2R,3S,4R,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-5-(氯甲基)-3-氟基四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(1.5 g,2.9 mmol)於CH 3CN (30 mL)之攪拌溶液中分批添加DMAP (701.5 mg,5.75 mmol)及TEA (870.0 mg,8.5 mmol)。在室溫下攪拌10 min後,分批添加2,4,6-參(丙-2-基)苯-1-磺醯氯(1.7 g,5.75 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌0.5 h,隨後逐滴添加氨水(2.5 mL)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜,然後藉由添加水(20 mL)來淬滅。用EtOAc萃取所得溶液。將合併之有機物用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由用石油醚/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(810.0 mg,42.2%)。LC-MS (ES, m/z): 540 (M+H +)。
步驟13:在室溫,氮氣氛圍下向4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(800.0 mg,1.5 mmol)於MeOH (20 mL)之攪拌溶液中分批添加NH 4F (267.9 mg,7.2 mmol)。將所得混合物在60℃下攪拌隔夜,然後冷卻至室溫。藉由過濾移除沉澱之固體,且在真空下濃縮濾液。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物:管柱:XBridge Shield RP18 OBD管柱,19*250 mm,10μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:25 mL/min;梯度:在6 min內5% B至30% B;波長:254 nm;RT1(min):5.78。此得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(111.2 mg,23.8%)。LC-MS (ES, m/z): 312 (M+H +)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 7.94 (d, J= 6.8 Hz, 1H), 7.89–7.87 (m, 1H), 7.65 (brs, 1H), 6.25–6.20 (m, 1H), 6.17 (d, J= 5.2 Hz, 1H), 5.47 (t, J= 5.2 Hz, 1H), 5.23 (t, J= 4.0 Hz, 0.5H), 5.09 (t, J= 4.0 Hz, 0.5H), 4.47–4.40 (m, 1H), 3.89–3.86 (m, 1H), 3.71–3.68 (m, 1H), 3.64–3.59 (m, 2H)。 實例 6- 化合物 6 1-((2R,4S,5R)-5-( 氯甲基 )-4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- )-4-( 羥胺基 ) 嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在室溫下向1-[(2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(500 mg,0.9 mmol)於DMF (5.0 mL)之攪拌溶液中添加三級丁基二甲基氯矽烷(480 mg,3.2 mmol)及咪唑(248 mg,3.6 mmol)。將所得混合物攪拌2h。藉由LCMS可以偵測到所需產物。藉由在室溫下添加水(10 mL)來淬滅反應且用EtOAc (3 x 10 mL)萃取。將合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-[(2R,4S,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(400 mg,0.60 mmol,66%)。LC-MS (ES, m/z): 663 (M+H +)。
步驟2:向1-[(2R,4S,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(380 mg,0.6 mmol)於乙腈(5 mL)之攪拌溶液中添加DMAP (139 mg,1.1 mmol)及TEA (173 mg,1.7 mmol),將反應混合物在室溫下攪拌10 min。添加2,4,6-三異丙基苯磺醯氯(347 mg,1.1 mmol)。將混合物在室溫下攪拌30 min,然後分批添加DBU (261 mg,1.7 mmol)及鹽酸羥胺(79 mg,1.1 mmol)。將混合物在室溫下攪拌1 h。LCMS顯示反應完成。將混合物用乙酸乙酯(200 ml)稀釋,用鹽水(2 x 100 ml)洗滌且經無水硫酸鈉乾燥。過濾出固體且濃縮濾液。藉由製備型TLC (甲醇/二氯甲烷=20/1)純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-[(2R,4S,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-4-(羥胺基)嘧啶-2-酮(350 mg,0.51 mmol,90%)。LC-MS (ES, m/z): 678 (M+H +)。
步驟3:在室溫下向1-[(2R,4S,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-4-(羥胺基)嘧啶-2-酮(340 mg,0.5 mmol)於四氫呋喃(5.0 mL)之攪拌溶液中添加TBAF (1.0 mL,1.00 mmol,1M於THF中)。將所得混合物攪拌2 h。藉由LCMS可以偵測到所需產物。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-[(2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-4-(羥胺基)嘧啶-2-酮(80 mg,0.14 mmol,28%)。LC-MS (ES, m/z): 564 (M+H +)。
步驟4:在室溫下向1-[(2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-4-(羥胺基)嘧啶-2-酮(70 mg,0.1 mmol)之攪拌溶液中添加乙酸(4 mL)及H 2O (1 mL)。將所得混合物攪拌2 h。藉由LCMS可以偵測到所需產物。將所得混合物在真空下濃縮,且藉由逆相急速層析法在以下條件下純化殘餘物:管柱:XBridge Prep OBD C18管柱,30*150 mm,5 μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在8 min內4% B至25% B,波長:254/220 nm;RT1(min):6.05,得到呈灰白色固體之1-[(2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-4-(羥胺基)嘧啶-2-酮(10.3 mg,0.035 mmol,27%)。LC-MS (ES, m/z): 292 (M+H +); 98.5%純度。LCMS之條件:(管柱:Shim‐pack ScepterC18, 33*3.0 mm,3.0μm;流動相A:水+5 mM NH 4HCO 3,流動相B:ACN;流率:1.5000 mL/min;梯度:在1.1 min內5% B至30% B,在1.6 min內30% B至95% B,在1.9 min內95% B至95% B,在1.93 min內95% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):0.612)。 1H NMR (300 MHz, DMSO- d 6) δ 9.98 (s, 1H), 7.00 (d, J= 8.3 Hz, 1H), 6.24 (dd, J= 8.6, 5.8 Hz, 1H), 5.59 (d, J= 8.2 Hz, 1H), 5.44 (s, 1H), 5.17 (s, 1H), 4.37 (s, 1H), 3.75 (d, J= 1.7 Hz, 2H), 3.63 – 3.43 (m, 2H), 2.38 – 2.15 (m, 1H), 2.13 – 1.97 (m, 1H)。 實例 7– 化合物 2 4- 胺基 -1-((2R,4S,5R)-5-( 氯甲基 )-4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- ) 嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在60℃,氮氣氛圍下將2'-去氧尿苷(40 g,175.3 mmol,1.0 equiv)及三級丁基二甲基氯矽烷(106 g,701.1 mmol,4.0 equiv)於吡啶(800 mL)中之溶液攪拌隔夜。將所得混合物用水(500 mL)稀釋。用EtOAc (3 x 500 mL)萃取所得混合物。將合併之有機層用鹽水(3 x 250 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EA (2:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基-二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(73 g,160 mmol,91.1%)。LC-MS (ES, m/z): 457 (M+H +)。
步驟2:在室溫,空氣氛圍下將1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(73 g,159.8 mmol,1 equiv)及PPTS (161 g,639.3 mmol,4 equiv)於MeOH (1.4 L)中之溶液攪拌2天。將所得混合物用水(500 mL)稀釋。用EtOAc (3 x 500 mL)萃取所得混合物。將合併之有機層用鹽水(3 x 250 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EA (1:10)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基-二甲基矽烷基)氧基]-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(28.7 g,83.9 mmol,52.4%)。LC-MS (ES, m/z): 343 (M+H +)。
步驟3:在60℃,空氣氛圍下將1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(28.7 g,83.8 mmol,1 equiv)及IBX (58.7 g,209.5 mmol,2.5 equiv)於乙腈(560 mL)中之溶液攪拌2 h。在減壓下濃縮所得混合物。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之(2S,3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(27 g,79.4mmol,94.6%)。LC-MS (ES, m/z): 341 (M+H +)。
步驟4:在室溫,氮氣氛圍下將(2S,3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(27 g,79.3 mmol,1 equiv)及HCHO (23.8 g,793.1 mmol,10 equiv)於1,4-二噁烷(540 mL)中之溶液用氫氧化鈉(6.3 g,158.6 mmol,2 equiv)處理隔夜,隨後在室溫下分批添加NaBH 4(12 g,317 mmol,4 equiv)。在室溫,空氣氛圍下將所得混合物攪拌1 h。將所得混合物用水(500 mL)稀釋。用EtOAc (3 x 500 mL)萃取所得混合物。將合併之有機層用鹽水(3 x 250 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4S)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(14.8 g,39.6 mmol,50.1%)。LC-MS (ES, m/z): 373 (M+H +)。
步驟5:在-35℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,4S)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(12.5 g,33.6 mmol,1 equiv)於CH 2Cl 2(150 mL)及吡啶(21.2 g,268.5 mmol,8 equiv)之攪拌混合物中逐滴添加三氟甲酸酐(23.7 g,83.9 mmol,2.5 equiv)。將混合物在-35℃下攪拌10 min。然後返回室溫且攪拌1h。在室溫下用水淬滅反應。將所得混合物用二氯甲烷萃取。將合併之有機層用碳酸氫鈉洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EA (30% EA)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈少量黃色固體之三氟甲烷磺酸[(3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(12.8 g,20.1 mmol,59.9%)。LC-MS (ES, m/z): 637 (M+H +)。
步驟6:在室溫,氮氣氛圍下向三氟甲烷磺酸[(3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(12.8 g,20.1 mmol,1 equiv)於THF (150 mL)之攪拌溶液中逐滴添加TEA (20 g,201.1 mmol,10 equiv)。將混合物在60℃下攪拌16 h。然後添加氯化鋰(4.3 g,100.5 mmol,5 equiv),且將混合物在60℃下攪拌2 h。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 373 (M+H +)。
步驟7:在0℃,氮氣氛圍下向以上溶液中逐滴添加含氫氧化鈉(2 g,50 mmol,2.5 equiv)之水(15 mL)。將混合物在室溫下攪拌2 h。LCMS顯示反應完成。將所得混合物在真空下濃縮。將所得混合物用二氯甲烷萃取。將合併之有機層用飽和NH 4Cl水溶液洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用CH 2Cl 2/MeOH溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(3.7 g,9.4 mmol)。LC-MS (ES, m/z): 391 (M+H +)。
步驟8:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(3.7 g,9.5 mmol,1 equiv)於二甲基甲醯胺(40 mL)及咪唑(3.2 g,47.3 mmol,5 equiv)之攪拌混合物中分批添加三級丁基二甲基-氯矽烷(4.3 g,28.4 mmol,3 equiv)。將混合物在60℃下攪拌16 h。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EA (40% EA)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(3.2 g,6.3 mmol,66.9%)。LC-MS (ES, m/z): 505 (M+H +)。
步驟9:向1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(3.2 g,6.3 mmol,1 equiv)於CH 3CN (30 mL)之攪拌溶液中添加DMAP (1.5 g,12.668 mmol,2 equiv)及TEA (1.3 g,12.668 mmol,2 equiv),且將混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌10 min。在室溫,氮氣氛圍下向以上混合物中添加2,4,6-參(丙-2-基)苯-1-磺醯氯(3.84 g,12.668 mmol,2 equiv)。將混合物在室溫下攪拌16 h。然後添加NH 3.H 2O (0.44 g,12.7 mmol,2 equiv)且在室溫下攪拌1h。將所得混合物在真空下濃縮。藉由用PE/EA (50%EA)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(2.6 g,5.1 mmol,79.8%)。LC-MS (ES, m/z): 504 (M+H +)。
步驟10:在室溫,氮氣氛圍下向4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(2.6 g,5.1 mmol,1 equiv)於MeOH (50 mL)之攪拌溶液中分批添加NH 4F (4.7 g,126.4 mmol,25 equiv)。將混合物在60℃下攪拌16 h。過濾所得混合物且用EA洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (16% MeOH)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到(1.2 g)粗產物。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(1.2 g):流動相A:水(0.01 M NH 4HCO 3),流動相B:ACN;梯度:在5 min內100% A;然後在20 min內直到20% B,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(831.5 mg,3.0 mmol,59.1%)。LC-MS (ES, m/z): 276 (M+H +);99.1%純度。LCMS分析條件:管柱:HALO AQ‐C18管柱,30*3.0 mm,2μm;流動相A:含0.05% TFA之水,流動相B:乙腈/0.05%TFA;流率:1.20 mL/min;梯度:在1.3 min內0% B至95% B,在1.8 min內95% B至95% B,在1.83 min內95% B至5% B;波長:254/220 nm。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.73 (dd, J= 7.4, 1.1 Hz, 1H), 7.18 (s, 1H), 7.12 (s, 1H), 6.25 (dd, J= 7.8, 6.0 Hz, 1H), 5.73 (dd, J= 7.4, 1.6 Hz, 1H), 5.43 (d, J= 4.4 Hz, 1H), 5.19 (d, J= 4.7 Hz, 1H), 4.36 (q, J= 4.2, 3.1 Hz, 1H), 3.82 – 3.70 (m, 2H), 3.63 – 3.48 (m, 2H), 2.25 – 2.09 (m, 2H)。 實例 8- 化合物 9 1-((2R,3R,4R,5R)-5-( 氯甲基 )-3- 氟基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- )-5- 甲基嘧啶 -2,4(1H,3H)- 二酮之合成
步驟1:在0℃,空氣氛圍下向(2R,4R,5R,6S)-5-羥基-4-(羥甲基)-11-甲基-3,7-二氧雜-1,9-二氮雜三環[6.4.0.0^ {2,6}]十二碳-8,11-二烯-10-酮(10 g,41.6 mmol)及二氫哌喃(105 mL)於二甲基甲醯胺(200 ml)之攪拌溶液中分批添加對甲苯磺酸酯(7.8 g,45.7 mmol)。將所得混合物在室溫,空氣氛圍下攪拌隔夜。將所得混合物用水(500 mL)稀釋。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 500 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 250 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由過濾收集沉澱之固體且用己烷(3 x 200 mL)洗滌。此得到呈白色固體之(2R,4R,5R,6S)-11-甲基-5-(噁烷-2-基氧基)-4-[(噁烷-2-基氧基)甲基]-3,7-二氧雜-1,9-二氮雜三環[6.4.0.0^ {2,6}]十二碳-8,11-二烯-10-酮(15 g,36.7 mmol,88.22%)。LC-MS (ES, m/z): 409(M+H +)。
步驟2:在室溫,空氣氛圍下將(2R,4R,5R,6S)-11-甲基-5-(噁烷-2-基氧基)-4-[(噁烷-2-基氧基)甲基]-3,7-二氧雜-1,9-二氮雜三環[6.4.0.0^ {2,6}]十二碳-8,11-二烯-10-酮(15 g,36.7 mmol)及苛性鈉(4.4 g,110.1 mmol)於甲醇(300 ml)及水(110 ml)中之溶液攪拌隔夜。在減壓下濃縮所得混合物。藉由過濾收集沉澱之固體且用乙酸乙酯(3 x 200 mL)洗滌。此得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4S,5R)-3-羥基-4-(噁烷-2-基氧基)-5-[(噁烷-2-基氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(15.5 g,36.3 mmol,98.97%)。LC-MS (ES, m/z): 427(M+H +)。
步驟3:在-60℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4S,5R)-3-羥基-4-(噁烷-2-基氧基)-5-[(噁烷-2-基氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(15.5 g,36.3 mmol)及吡啶(37 mL)於二氯甲烷(300 ml)之攪拌溶液中逐滴添加二乙基(三氟基-λ4-硫烷基)胺(19.3 g,119.9 mmol)。在40℃,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌隔夜。將所得混合物用水(500 mL)稀釋。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 500 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 250 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 429(M+H +)。
步驟4:在室溫,空氣氛圍下將1-[(2R,3R,4R,5R)-3-氟基-4-(噁烷-2-基氧基)-5-[(噁烷-2-基氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(15.5 g,36.1 mmol)及對甲苯磺酸酯(4.6 g,27.1 mmol)於甲醇(300 ml)中之溶液攪拌2 h。將所得混合物用水(500 mL)稀釋。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 500 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 250 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用二氯甲烷/甲醇(10/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3R,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(9 g,34.5 mmol,95.60%)。LC-MS (ES, m/z): 261(M+H +)。
步驟5:在室溫,空氣氛圍下向1-[(2R,3R,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(9 g,34.5 mmol)及咪唑(14.1 g,207.5 mmol)於二甲基甲醯胺(200 ml)之攪拌溶液中分批添加三級丁基二甲基氯矽烷(10.4 g,69.1 mmol)。在80℃,空氣氛圍下將所得混合物攪拌2 h。將所得混合物用水(500 mL)稀釋。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 500 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 250 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用二氯甲烷/甲醇(10/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3R,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(5.4 g,14.4 mmol,41.69%)。LC-MS (ES, m/z): 375 (M+H +)。
步驟6:在室溫,空氣氛圍下向1-[(2R,3R,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(5.4 g,14.4 mmol)及2,4,6-三甲基吡啶(10.4 g,86.5 mmol)及精胺酸硝酸鹽(argentio nitrate)(9.8 g,57.6 mmol)於二氯甲烷(100 ml)之攪拌溶液中分批添加1-(氯基二苯基甲基)-4-甲氧基苯(8.9 g,28.8 mmol)。在室溫,空氣氛圍下將所得混合物攪拌2 h。將所得混合物用水(500 mL)稀釋。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 500 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 250 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用石油醚/乙酸乙酯(2/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3R,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(8.3 g,12.8 mmol,88.99%)。LC-MS (ES, m/z): 647(M+H +)。
步驟7:在室溫,空氣氛圍下將1-[(2R,3R,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(8.3 g,12.8 mmol)及四正丁基氟化銨(15.3 mL,15.3 mmol,1M於四氫呋喃中)於四氫呋喃(160 ml)中之溶液攪拌隔夜。在減壓下濃縮所得混合物。藉由用二氯甲烷/甲醇(10/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3R,4R,5R)-3-氟基-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(6.2 g,11.6 mmol,90.73%)。LC-MS (ES, m/z): 533(M+H +)。
步驟8:在60℃,空氣氛圍下將1-[(2R,3R,4R,5R)-3-氟基-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(6.2 g,11.6 mmol)及IBX (6.5 g,23.2 mmol)於乙腈(120 ml)中之溶液攪拌2 h。在減壓下濃縮所得混合物。藉由用二氯甲烷/甲醇(10/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之(2S,3R,4R,5R)-4-氟基-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(6 g,11.3 mmol,97.14%)。LC-MS (ES, m/z): 531(M+H +)。
步驟9:向(2S,3R,4R,5R)-4-氟基-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(6 g,11.3 mmol)及HCHO (1.0 g,33.9 mmol)於1,4-二噁烷(60 ml)中之溶液中添加含苛性鈉(1.3 g,33.9 mmol)之水(12 ml)。將混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌隔夜,隨後在室溫下分批添加NaBH 4(1.7 g,45.2 mmol)。在室溫,空氣氛圍下將所得混合物攪拌1 h。將所得混合物用水(200 mL)稀釋。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 200 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 100 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用二氯甲烷/甲醇(10/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3R,4R)-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(3.2 g,5.68 mmol,50.30%)。LC-MS (ES, m/z): 563(M+H +)。
步驟10:在室溫,空氣氛圍下向1-[(2R,3R,4R)-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(500 mg,0.8 mmol)及吡啶(351 mg,4.4 mmol)於二氯甲烷(10 ml)之攪拌溶液中逐滴添加三氟甲酸酐(752 mg,2.6 mmol)。將所得混合物在室溫,空氣氛圍下攪拌隔夜。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型TLC用二氯甲烷/甲醇(10/1)純化殘餘物,得到呈白色固體之三氟甲烷磺酸[(3R,4R,5R)-4-氟基-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(620 mg,0.67 mmol,84.38%)。LC-MS (ES, m/z): 827(M+H +)。
步驟11:在室溫,氮氣氛圍下向三氟甲烷磺酸[(3R,4R,5R)-4-氟基-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(800 mg,0.9 mmol)及氯化鋰(123 mg,2.9 mmol)於二甲基甲醯胺(16 ml)之攪拌溶液中分批添加氫化鈉(23 mg,0.9 mmol)。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌3 h。將所得混合物用水(200 mL)稀釋。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 200 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 100 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC用二氯甲烷/甲醇(10/1)純化殘餘物,得到呈白色固體之(1R,10R,11R,12R)-10-(氯甲基)-12-氟基-11-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-4-甲基-8,13-二氧雜-2,6-二氮雜三環[8.2.1.0{2,7}]十三碳-3,6-二烯-5-酮(450 mg,0.71 mmol,82.59%)。LC-MS (ES, m/z): 563(M+H +)。
步驟12:在室溫,空氣氛圍下將(1R,10R,11R,12R)-10-(氯甲基)-12-氟基-11-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-4-甲基-8,13-二氧雜-2,6-二氮雜三環[8.2.1.0^ {2,7}]十三碳-3,6-二烯-5-酮(430 mg,0.7 mmol)及苛性鈉(61 mg,1.5 mmol)於四氫呋喃(10 ml)及水(1 ml)中之溶液攪拌隔夜。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型TLC用二氯甲烷/甲醇(10/1)純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3R,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(350 mg,0.51 mmol,78.87%)。LC-MS (ES, m/z): 581(M+H +)。
步驟13:在60℃,空氣氛圍下將1-[(2R,3R,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(330 mg,0.5 mmol)及乙酸(4 mL)於水(1 ml)中之溶液攪拌隔夜。將所得混合物在真空下濃縮。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(管柱:XBridge Prep OBD C18管柱,30*150 mm,5μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在8 min內8% B至30% B,30% B;波長:254/220 nm;RT1(min):6.26),得到呈白色固體之1-[(2R,3R,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(85.9 mg,48.95%)。LC-MS (ES, m/z): 309(M+H +)。99.9%純度。LCMS之條件:(管柱:Ascentis Express C18管柱,50*3.0 mm,2.7μm;流動相A:水/0.05%TFA,流動相B:ACN/0.05%TFA;流率:1.5000 mL/min;梯度:在1.10 min內5% B至100% B,在1.75 min內100% B至100% B,在1.80 min內100% B至5% B;波長:254/220 nm;RT1(min):0.672)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 10.90 (s, 1H), 7.71 (d, J= 1.4 Hz, 1H), 6.12 (dd, J= 13.9, 5.3 Hz, 1H), 5.98 (d, J= 5.4 Hz, 1H), 5.47 (t, J= 5.1 Hz, 1H), 5.25 (dt, J = 53.0, 5.2 Hz, 1H), 4.42 (dt, J= 10.1, 4.9 Hz, 1H), 3.77 (s, 2H), 3.69 (dd, J= 11.6, 3.9 Hz, 1H), 3.61 (dd, J= 11.7, 3.7 Hz, 1H), 1.78 (d, J= 1.2 Hz, 3H)。 實例 9 :化合物 10 ((3S,5R)-5-(6- 胺基 -2- 氟基 -9H- 嘌呤 -9- )-3- 羥基四氫呋喃 -2,2- 二基 ) 二甲醇之合成
步驟1:在室溫,氮氣氛圍下向[(3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]甲醇(110 mg,0.266 mmol)及TBAF (139.10 mg,0.532 mmol)於DCM (3 mL)之攪拌溶液中。將所得混合物在室溫下再攪拌5 h。藉由LCMS可以偵測到所需產物。用EtOAc (3x30 mL)萃取水層。在真空下濃縮有機萃取物。藉由製備型HPLC在以下條件下純化殘餘物:管柱:XBridge Prep OBD C18管柱,30*150 mm,5μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在8 min內4% B至15% B,15% B;波長:254/220 nm;RT1(min):6.1,得到呈白色固體之(3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-2,2-雙(羥甲基)氧雜環戊-3-醇(11.4 mg,0.04 mmol,14.32%)。LC-MS (ES, m/z): 300 (M+H +); 97.6%純度。LCMS之條件:(管柱:Shim‐pack Scepter C18, 50*3.0 mm,3.0μm;流動相A:水/0.04% NH 3.H 2O,流動相B:乙腈;流率:1.5000 mL/min;梯度:在1.70 min內0% B至95% B,在0.60 min內100% B至100% B,在0.20 min內95% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):1.009)。 1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ 8.32 (s, 1H), 7.83 (s, 2H), 6.26 (t, J = 6.7 Hz, 1H), 5.19 (d, J = 4.8 Hz, 1H), 4.90 (t, J = 5.7 Hz, 1H), 4.47 (dt, J = 16.5, 5.3 Hz, 2H), 3.65 – 3.48 (m, 4H), 2.75 (dt, J = 13.3, 6.6 Hz, 1H), 2.36 (ddd, J = 13.1, 6.4, 3.8 Hz, 1H)。 實例 10 :化合物 11 4- 胺基 -1-((2R,4S,5R)-5-( 氯甲基 )-4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- )-5- 甲基嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在室溫下向胸苷(25 g,103 mmol)及咪唑(35 g,514 mmol)於DMF (300 mL)之攪拌溶液中分批添加TBSCl (62 g,411 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌2 h,然後用EA (500 mL)稀釋。將混合物用水(5 x 500 mL)洗滌,將有機層經無水硫酸鈉乾燥,過濾且在真空下濃縮。經由矽膠層析法(用含30% EA之PE溶析)純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(44.5 g,94.5 mmol,87.01%)。LC-MS (ES, m/z): 471(M+H +)。
步驟2:將1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(44.5 g,94.5 mmol)及PPTS (24 g,95.5 mmol)於MeOH (500 mL)中之溶液在50℃下攪拌4h。將所得混合物在真空下濃縮。將殘餘物用EA (500 mL)稀釋,用水(3 x 500 mL)及飽和NaHCO 3水溶液洗滌,直至沒有形成任何氣體為止。將有機層經無水硫酸鈉乾燥,過濾且在真空下濃縮。經由矽膠層析法(在30 min內用含0%至10% MeOH之DCM溶析)純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(22.4 g,62.8 mmol,63.15%)。LC-MS (ES, m/z): 357(M+H +)。
步驟3:向1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(22.4 g,62.8 mmol)於ACN (400 mL)之攪拌溶液中添加IBX (35 g,125 mmol)。將所得混合物在60℃下攪拌1h,然後冷卻至室溫,過濾且將濾液在真空下濃縮,得到呈白色固體之(2S,3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(22.2 g,63.2 mmol,40.81%)。LC-MS (ES, m/z): 355(M+H +)。
步驟4:將NaOH (7.6 g,190 mmol)於H 2O (100 mL)中之溶液添加至(2S,3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(22.4 g,63.2 mmol)、HCHO (19 g,633 mmol)及1,4-二噁烷 (500 mL)之混合物中。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜,然後用冰/水浴分批添加NaBH 4(4.7 g,124 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌1h。將反應用飽和NH 4Cl水溶液淬滅,然後倒入水(500 mL)中,將所得混合物用EA (3 x 500 mL)萃取,將有機層合併,用HOAc將pH值調節至5~6,用水洗滌,經無水硫酸鈉乾燥,過濾且在真空下濃縮有機層,得到呈白色固體之1-[(2R,4S)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(15.5 g,46.76%)。LC-MS (ES, m/z): 387(M+H +)。
步驟5:在-30℃下向1-[(2R,4S)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(15.5 g,40.2 mmol)於DCM (150 mL)及吡啶(19 g,240 mmol)之攪拌溶液中逐滴添加Tf 2O (34 g,121 mmol)。將所得混合物在-30℃下攪拌2h。將反應用水(100 mL)淬滅。將混合物用DCM (3 x 200 mL)萃取,將合併之有機層經無水硫酸鈉乾燥,過濾且在真空下濃縮。經由矽膠層析法(在30 min內用含0%至50% EA之PE溶析)純化殘餘物,得到呈白色固體之三氟甲烷磺酸[(3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(13.8 g,21.2 mmol,52.73%)。LC-MS (ES, m/z): 651(M+H +)。
步驟6:將三氟甲烷磺酸[(3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(3.4 g,5.2 mmol)及TEA (3.1 g,31.4 mmol)於THF (150 mL)中之溶液在60℃下攪拌10h,然後添加LiCl (2.2 g,52.4 mmol),將混合物在60℃下攪拌1h。將混合物直接用於下一步驟。LC-MS (ES, m/z): 387/389 (M+H +)。
步驟7:向前一步驟溶液中添加NaOH (630 mg,15.8 mmol)於H 2O (12.6 mL)中之溶液。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。將混合物在THF與H 2O之間分配。藉由HOAc將有機層的pH值調節至5~6。將所得混合物用EA (300 mL)稀釋,然後用水(3 x 200 mL)洗滌,將有機層經無水硫酸鈉乾燥,過濾且在真空下濃縮。經由矽膠層析法(用1:1 PE/EA溶析)純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.08 g,2.67 mmol,51.33%兩個步驟)。LC-MS (ES, m/z): 405/407(M+H +)
步驟8:向1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.0 g,2.6 mmol)及咪唑(1.7 g,26.0 mmol)於DMF (10 mL)之攪拌溶液中添加TBSCl (0.63 g,4.1 mmol)。將所得混合物在60℃下攪拌1h。將反應冷卻至室溫,倒入水(50 mL)中,用EA (3 x 50 mL)萃取,將合併之有機層經無水硫酸鈉乾燥,過濾且在真空下濃縮。經由矽膠層析法(用1/1 PE/EA溶析)純化殘餘物,得到呈灰白色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.1 g,2.1 mmol,80.76%)。LC-MS (ES, m/z): 519/521(M+H +)。
步驟9:向1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(500 mg,0.9 mmol)、DMAP (235 mg,1.9 mmol)及TEA (390 mg,3.8 mmol)於乙腈(5 mL)之溶液中添加2,4,6-參(丙-2-基)苯-1-磺醯氯(875 mg,2.9 mmol),將混合物在室溫下攪拌15h。之後,添加NH 3 . H 2O (3 mL)且在室溫下再攪拌1h。將所得混合物倒入水(50 mL)中,用乙酸乙酯(3 x 50 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用二氯甲烷/甲醇(20/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基嘧啶-2-酮(404 mg,0.78 mmol,86.82%)。LC-MS (ES, m/z): 518/520(M+H +)。
步驟10:在室溫下向4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基嘧啶-2-酮(360 mg,0.7 mmol)於甲醇(5 mL)之攪拌溶液中添加NH 4F (772 mg,20.9 mmol)。將混合物在室溫下攪拌16h。過濾所得混合物,且用水(20 mL x 3)洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液。藉由逆相層析法(管柱,C18矽膠;流動相A:水(含有8mmol/L NH 4HCO 3)及B:乙腈;梯度:在25 min內0%至35% B;偵測器,UV 254 nm)純化殘餘物,得到呈灰白色固體之4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基嘧啶-2-酮(51.8 mg,0.18 mmol,24.45%)。LC-MS (ES, m/z): 290/292(M+H +)。95.0%純度。LCMS之條件:(管柱:Kinetex EVO C18管柱,33*3.0 mm,2.6 μm;流動相A:水/5 mM NH 4HCO 3,流動相B:ACN;流率:1.5000 mL/min;梯度:在1.2 min內2% B至95% B,在1.78 min內95% B至95% B,在1.83 min內95% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):0.721)。 1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ (ppm) 7.55 (s, 1H), 7.31 (s, 1H), 6.81 (s, 1H), 6.27 (dd, J= 8.0, 6.0 Hz, 1H), 5.42 (d, J= 4.8 Hz, 1H), 5.21 (t, J= 5.3 Hz, 1H), 4.39-4.36 (m, 1H), 3.81 - 3.69 (m, 2H), 3.57 (dd, J= 5.0, 1.7 Hz, 2H), 2.22 - 2.14 (m, 2H), 1.90 (s, 3H)。 實例 11- 化合物 12 4- 胺基 -1-((2R,3S,4S,5R)-5-( 氯甲基 )-4- 羥基 -5-( 羥甲基 )-3- 甲基四氫呋喃 -2- ) 嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在0℃,N 2氛圍下向1-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-二羥基-5-(羥甲基)-3-甲基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(40 g,154.9 mmol)及咪唑(63.2 g,929.4 mmol)於二甲基甲醯胺(500 mL)之攪拌溶液中逐滴添加(氯氧基)({[(氯氧基)二異丙基矽烷基]氧基})二異丙基矽烷(64.5 g,185.8 mmol)。TLC顯示反應完成。將所得混合物用乙酸乙酯(2 x 500 mL)萃取。將合併之有機層用水(100 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用石油醚/乙酸乙酯(2/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(6aR,8R,9R,9aR)-9-羥基-2,2,4,4-四異丙基-9-甲基-四氫呋喃并[3,2-f][1,3,5,2,4]三氧雜二矽雜環壬烷-8-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(41 g,83.8 mmol,52.86%)。LC-MS (ES, m/z): 501 (M+H +)。
步驟2:將1-[(6aR,8R,9R,9aR)-9-羥基-2,2,4,4-四異丙基-9-甲基-四氫呋喃并[3,2-f] [1,3,5,2,4]三氧雜矽雜環壬烷-8-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(41 g,83.8 mmol)及草醯氯酸甲酯(15.4 g,125.8 mmol)及DMAP (20.4 g,167.7 mmol)於ACN (500 mL)中之溶液在室溫下攪拌1 h。藉由LCMS可以偵測到所需產物。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 500 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 250 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用石油醚/乙酸乙酯(2:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之草酸(6aR,8R,9R,9aR)-8-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-2,2,4,4-四異丙基-9-甲基-四氫呋喃并[3,2-f] [1,3,5,2,4]三氧雜矽雜環壬烷-9-酯甲酯(43 g,73.2 mmol,87.37%)。LC-MS (ES, m/z): 587 (M+H +)。
步驟3:在N 2氛圍下向草酸(6aR,8R,9R,9aR)-8-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-2,2,4,4-四異丙基-9-甲基-四氫呋喃并[3,2-f][1,3,5,2,4]三氧雜矽雜環壬烷-9-酯甲酯(43 g,73.2 mmol)於甲苯(400 mL)之攪拌溶液中添加AIBN (1.8 g,10.9 mmol)及n-Bu3SnH (42.6 g,146.5 mmol)。將所得混合物在100℃,N 2氛圍下攪拌2 h。LCMS顯示反應完成。在減壓下濃縮所得混合物。藉由用石油醚/乙酸乙酯(2/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(6aR,8R,9S,9aS)-2,2,4,4-四異丙基-9-甲基-四氫-6H-呋喃并[3,2-f] [1,3,5,2,4] 三氧雜矽雜環壬烷-8-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(29 g,59.8 mmol,81.64%)。LC-MS (ES, m/z): 485 (M+H +)。
步驟4:在60℃,氮氣氛圍下將1-[(6aR,8R,9S,9aS)-2,2,4,4-四異丙基-9-甲基-四氫-6H-呋喃并[3,2-f] [1,3,5,2,4] 三氧雜矽雜環壬烷-8-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(29 g,59.8 mmol)於甲醇(300 mL)中之溶液用NH 4F (11.0 g,299.1 mmol)處理隔夜。藉由LCMS可以偵測到所需產物。在減壓下濃縮所得混合物。藉由用二氯甲烷/甲醇(10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之1-[(2R,3S,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-3-甲基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(14.4 g,57.7 mmol,99.37%)。LC-MS (ES, m/z): 243 (M+H +)。
步驟5:向1-[(2R,3S,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-3-甲基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(14 g,57.7 mmol)及咪唑(15.7 g,231.1 mmol)於二甲基甲醯胺(300 mL)之攪拌溶液中添加TBSCl (26.1 g,173.3 mmol)。將所得混合物在60℃下攪拌2 h。LCMS顯示反應完成。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 300 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用石油醚/乙酸乙酯(2:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-甲基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(19 g,40.3 mmol,69.83%)。LC-MS (ES, m/z): 471 (M+H +)。
步驟6:將1-[(2R,3S,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-甲基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(19 g,40.3 mmol)及PPTS (30.4 g,121.0 mmol)於甲醇(400 mL)中之溶液在60℃下攪拌3 h。LCMS顯示反應完成。將所得混合物在真空下濃縮。藉由用石油醚/乙酸乙酯(1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(羥甲基)-3-甲基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(9.5 g,26.6 mmol,66.03%)。LC-MS (ES, m/z): 357 (M+H +)。
步驟7:將1-[(2R,3S,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(羥甲基)-3-甲基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(9.5 g,26.6 mmol)及IBX (14.9 g,53.2 mmol)於乙腈(200 mL)中之溶液在60℃下攪拌2 h。LCMS顯示反應完成。過濾所得混合物;用乙腈(100 ml)洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液。此得到呈黃色油狀物之(2S,3S,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-4-甲基氧雜環戊烷-2-甲醛(9 g,25.3 mmol,95.28%)。LC-MS (ES, m/z): 355 (M+H +)。
步驟8:在室溫下將(2S,3S,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-4-甲基氧雜環戊烷-2-甲醛(9 g,25.3 mmol)於水(20 mL)及二噁烷(200 mL)中之溶液用HCHO (4.5 g,152.3 mmol)及苛性鈉(2.2 g,55.8 mmol)處理5 h。藉由LCMS可以偵測到所需產物。向以上混合物中添加NaBH 4(3.8 g,101.5 mmol)。將所得混合物在室溫下再攪拌1 h。藉由LCMS可以偵測到所需產物。將反應在室溫下用飽和NH 4Cl (水溶液)淬滅。用乙酸乙酯(3 x 500 mL)萃取水層。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用二氯甲烷/甲醇(10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4S)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5,5-雙(羥甲基)-3-甲基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(5.5 g,14.3mmol,56.05%)。LC-MS (ES, m/z): 387 (M+H +)。
步驟9:在室溫,氮氣氛圍下將1-[(2R,3S,4S)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5,5-雙(羥甲基)-3-甲基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(3.5 g,9.0 mmol)於二氯甲烷(50 mL)中之溶液用吡啶(7.1 g,90.5 mmol)處理5 min,隨後在-35℃下逐滴添加Tf 2O (7.6 g,27.1 mmol)。藉由LCMS可以偵測到所需產物。在-20℃下用水/冰淬滅反應。用乙酸乙酯(3 x 200 mL)萃取水層。藉由用石油醚/乙酸乙酯(2:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之三氟甲烷磺酸[(3S,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-4-甲基-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(1.5 g,2.3 mmol,25.46%)。LC-MS (ES, m/z): 651 (M+H +)。
步驟10:在60℃,氮氣氛圍下將三氟甲烷磺酸[(3S,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-4-甲基-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(1.5 g,2.3 mmol)於四氫呋喃(30 mL)中之溶液用TEA (2.3 g,23.0 mmol)處理隔夜,然後在60℃下向溶液中添加LiCl (293 mg,6.9 mmol)。藉由LCMS可以偵測到所需產物。將所得混合物用水(200 mL)稀釋。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 200 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 100 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。所得混合物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 387 (M+H +)。
步驟11:在室溫,氮氣氛圍下將(1R,10R,11S,12S)-11-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-10-(氯甲基)-12-甲基-8,13-二氧雜-2,6-二氮雜三環[8.2.1.0^{2,7}]十三碳-3,6-二烯-5-酮(粗品)於1,4-二噁烷(30 mL)及H 2O (15 mL)中之溶液用NaOH (465 mg,11.6 mmol)處理2 h。藉由LCMS可以偵測到所需產物。將所得混合物用水(200 mL)稀釋。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 200 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 100 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC(石油醚/乙酸乙酯1:1)純化殘餘物,得到呈灰白色固體之1-[(2R,3S,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)-3-甲基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(470 mg,1.16 mmol,29.94%)。LC-MS (ES, m/z): 405 (M+H +)。
步驟12:在室溫,氮氣氛圍下將1-[(2R,3S,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)-3-甲基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(350 mg,0.8 mmol)於DMF (7 mL)中之溶液用咪唑(235 mg,3.4 mmol)及三級丁基(氯基)二甲基矽烷(260 mg,1.7 mmol)處理隔夜。藉由LCMS可以偵測到所需產物。將所得混合物用水(100 mL)稀釋。用乙酸乙酯(3 x 50 mL)萃取水層。在減壓下濃縮合併之有機層。藉由製備型TLC(石油醚/乙酸乙酯1:1)純化殘餘物,得到呈灰白色固體之1-[(2R,3S,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-3-甲基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(380 mg,0.6 mmol,84.68%)。LC-MS (ES, m/z): 519 (M+H +)。
步驟13:在室溫,氮氣氛圍下將1-[(2R,3S,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-3-甲基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(360 mg,0.6 mmol)於乙腈(5 mL)中之溶液用DMAP (169 mg,1.3 mmol)及TEA (140 mg,1.3 mmol)處理10 min,然後在室溫下向溶液中添加2,4,6-參(丙-2-基)苯-1-磺醯氯(419 mg,1.3 mmol)歷時5 h。最後,在室溫下向溶液中添加NH 3 .H 2O (1 mL)歷時15 min。藉由LCMS可以偵測到所需產物。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型TLC(石油醚/乙酸乙酯1:1)純化殘餘物,得到呈灰白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-3-甲基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(280 mg,0.54 mmol,77.93%)。LC-MS (ES, m/z): 518 (M+H +)。
步驟14:將4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-3-甲基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(80 mg,0.2 mmol)及HF (0.8 mL,8.9 mmol,70%於吡啶中)於四氫呋喃(3 mL)中之溶液在室溫下攪拌2 h。藉由LCMS可以偵測到所需產物。過濾所得混合物;用甲醇(3 x 5 mL)洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(40 mg) (管柱:XBridge Prep OBD C18管柱,30*150 mm,5μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3+0.1%NH 3.H 2O),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在8min內2% B至19% B,19% B;波長:254/220 nm;RT1(min):7.07),得到呈灰白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)-3-甲基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(26.4 mg,58.19%)。
LC-MS (ES, m/z): 290 (M+H +); 98.5%純度。LCMS之條件:(管柱:HALO C18, 30*3.0 mm,2.0μm;流動相A:水/0.05%TFA,流動相B:乙腈/0.05%TFA;流率:1.2000 mL/min;梯度:在1.3 min內5% B至100% B,在0.5 min內100% B至100% B,在0.03 min內100% B至5% B;波長:254/220 nm;RT1(min):0.647)。 1H NMR (300 MHz, DMSO- d 6) δ 7.96 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 7.09 (d, J= 21.6 Hz, 2H), 6.20 (d, J= 8.0 Hz, 1H), 5.68 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 5.54 (d, J= 5.0 Hz, 1H), 5.31 (t, J= 5.1 Hz, 1H), 4.01 (dd, J= 9.8, 5.0 Hz, 1H), 3.88 (d, J= 12.1 Hz, 1H), 3.75 (dd, J= 11.7, 5.2 Hz, 1H), 3.61 (d, J= 12.1 Hz, 1H), 3.51 (dd, J= 11.7, 5.1 Hz, 1H), 2.81 – 2.52 (m, 1H), 0.74 (d, J= 7.0 Hz, 3H)。 實例 12- 化合物 13 4- 胺基 -1-((2R,3S,4S,5R)-5-( 氯甲基 )-4- 羥基 -5-( 羥甲基 )-3- 甲氧基四氫呋喃 -2- ) 嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4S,5R)-3,4-二羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.5 g,6.1 mmol)於吡啶(15 mL)之攪拌混合物中分批添加氯基([[氯基雙(丙-2-基)矽烷基]氧基])雙(丙-2-基)矽烷(2.3 g,7.4 mmol)。將混合物在室溫下攪拌2小時。在減壓下濃縮所得混合物。藉由用石油醚/乙酸乙酯(3:2)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之1-[(6aR,8R,9S,9aS)-9-羥基-2,2,4,4-四異丙基-四氫-6H-呋喃并[3,2-f] [1,3,5,2,4] 三氧雜矽雜環壬烷-8-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(5.93 g,12.2 mmol,94.16%)。LC-MS (ES, m/z): 487(M+H +)。
步驟2:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(6aR,8R,9S,9aS)-9-羥基-2,2,4,4-四異丙基-四氫-6H-呋喃并[3,2-f] [1,3,5,2,4] 三氧雜矽雜環壬烷-8-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(5.0 g,10.3 mmol)於四氫呋喃(200 mL)之攪拌溶液中分批添加氫化鈉(493 mg,20.5 mmol)及碘甲烷(8.8 g,61.6 mmol)。將混合物在室溫下攪拌15小時。藉由在0℃下添加水(50 mL)來淬滅反應。在減壓下濃縮所得混合物。將所得混合物用水稀釋且用乙酸乙酯(3x100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x200 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用石油醚/乙酸乙酯(1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-((6aR,8R,9S,9aR)-2,2,4,4-四異丙基-9-甲氧基四氫-6H-呋喃并[3,2-f][1,3,5,2,4]三氧雜二矽雜環壬烷-8-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(2.69 g,5.4 mmol,52.29%)。LC-MS (ES, m/z): 501(M+H +)。
步驟3:在室溫,氮氣氛圍下向1-((6aR,8R,9S,9aR)-2,2,4,4-四異丙基-9-甲氧基四氫-6H-呋喃并[3,2-f][1,3,5,2,4]三氧雜二矽雜環壬烷-8-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(21 g,41.9 mmol)於甲醇(250 mL)之攪拌溶液中分批添加NH 4F (7.8 g,209.7 mmol)。將混合物在60℃下攪拌15小時。在減壓下濃縮所得混合物。藉由用二氯甲烷/甲醇 (10/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-3-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(9.6 g,37.2 mmol,88.65%)。LC-MS (ES, m/z): 259(M+H +)。
步驟4:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-3-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(10.5 g,40.7 mmol)及咪唑(11.1 g,162.6 mmol)於N, N-二甲基甲醯胺(150 mL)之攪拌溶液中分批添加 三級丁基二甲基氯矽烷(18.4 g,122.0 mmol)。將混合物在80℃下攪拌15小時。將所得混合物用水稀釋且用乙酸乙酯(3x300 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x200 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用石油醚/乙酸乙酯(1/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色油狀物之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(19.2 g,39.4 mmol,97.01%)。LC-MS (ES, m/z): 487 (M+H +)。
步驟5:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(19.2 g,39.4 mmol)於甲醇(500 mL)之攪拌溶液中分批添加對甲苯磺酸吡啶(29.7 g,118.3 mmol)。將混合物在60℃下攪拌4小時。在減壓下濃縮所得混合物。藉由用石油醚/乙酸乙酯(3/7)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(羥甲基)-3-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(9.9 g,26.6 mmol,67.38%)。LC-MS (ES, m/z): 373(M+H +)。
步驟6:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(羥甲基)-3-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(4.9 g,13.2 mmol)於乙腈(100 mL)之攪拌溶液中分批添加2-二氧碘基苯甲酸(9.2 g,32.9 mmol)。將混合物在60℃下攪拌2小時。藉由過濾收集沉澱之固體且用乙腈(2x10 mL)洗滌,得到呈白色固體之(2S,3S,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-4-甲氧基氧雜環戊烷-2-甲醛(4.7 g,12.7 mmol,96.44%)。LC-MS (ES, m/z): 371(M+H +)。
步驟7:在室溫,氮氣氛圍下向(2S,3S,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-4-甲氧基氧雜環戊烷-2-甲醛(4.7 g,12.7 mmol)及甲醛(1.1 g,38.1 mmol)於二噁烷(80 mL)及水(16 mL)之攪拌溶液中分批添加NaOH (1.5 g,38 mmol)。將混合物在室溫下攪拌15小時。然後將混合物冷卻至0℃且添加硼氫化鈉(1.9 g,50.7 mmol)。將混合物在室溫下攪拌1小時。將所得混合物用水稀釋且用乙酸乙酯(3x100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x200 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用二氯甲烷/甲醇(10/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4S)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5,5-雙(羥甲基)-3-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(2.15 g,5.3 mmol,42.10%)。LC-MS (ES, m/z): 403(M+H +)。
步驟8:在-35℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4S)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5,5-雙(羥甲基)-3-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(2.8 g,7.0 mmol)及吡啶(2.8 g,35.0 mmol)於二氯甲烷(30 mL)之攪拌溶液中逐滴添加三氟甲磺酸酸酐(4.9 g,17.5 mmol)。將混合物在室溫下攪拌2小時。將所得混合物用水稀釋且用乙酸乙酯(3x200 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x100 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用石油醚/乙酸乙酯(1/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色油狀物之三氟甲烷磺酸[(3S,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-4-甲氧基-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(3.55 g,5.3 mmol,76.01%)。LC-MS (ES, m/z): 667(M+H +)。
步驟9:在室溫,氮氣氛圍下向三氟甲烷磺酸[(3S,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-4-甲氧基-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(500 mg,0.8 mmol)於四氫呋喃(10 mL)之攪拌混合物中逐滴添加三甲胺(759 mg,7.5 mmol)。將混合物在60℃下攪拌15小時。然後添加氯化鋰(127 mg,3.0 mmol)。將混合物在60℃下攪拌5小時。然後在室溫下添加氫氧化鈉(90 mg,2.3 mmol)及水(2 mL)。將混合物在室溫下攪拌15小時。將所得混合物用水稀釋且用乙酸乙酯(3x100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x200 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用二氯甲烷/甲醇(10/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之1-[(2R,3S,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)-3-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(250 mg,0.6 mmol,79.18%)。LC-MS (ES, m/z): 421(M+H +)。
步驟10:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)-3-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.0 g,2.4 mmol)及咪唑(656 mg,9.6 mmol)於N, N-二甲基甲醯胺(40 mL)之攪拌溶液中分批添加三級丁基二甲基氯矽烷(726 mg,4.8 mmol)。將混合物在60℃下攪拌18小時。將所得混合物用水稀釋且用乙酸乙酯(3x30 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x50 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用石油醚/乙酸乙酯(1/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之1-[(2R,3S,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-3-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(760 mg,1.4 mmol,58.95%)。LC-MS (ES, m/z): 535 (M+H +)。
步驟11:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-3-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(760 mg,1.4 mmol)、DMAP (342 mg,2.8 mmol)、及三甲胺(431 mg,4.3 mmol)於乙腈(20 mL)之攪拌溶液中分批添加2,4,6-參(丙-2-基)苯-1-磺醯氯(860 mg,2.8 mmol)。將混合物在室溫下攪拌15小時。然後在室溫,氮氣氛圍下添加氫氧化銨(10 mL)。將混合物攪拌1小時。將所得混合物用水稀釋且用乙酸乙酯(3x100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x200 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC用二氯甲烷/甲醇(10:1)純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-3-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(645 mg,1.2 mmol,85.03%)。LC-MS (ES, m/z): 534 (M+H +
步驟12:在室溫,氮氣氛圍下向4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-3-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(200 mg,0.4 mmol)於四氫呋喃(20 mL)之攪拌溶液中逐滴添加HF-吡啶(4 mL)。將混合物在室溫下攪拌48小時。過濾所得混合物;用甲醇(3x20 mL)洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(110 mg) (管柱:XBridge Prep OBD C18管柱,30*150 mm,5μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3+0.1%NH 3.H 2O),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在8 min內2% B至19% B,19% B;波長:254/220 nm;RT1(min):6.25),得到呈灰白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)- 5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)-3-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(61.5 mg,0.2 mmol,53.52%)。LC-MS (ES, m/z): 306 (M+H +)。99.6%純度。LCMS之條件:(管柱:XBridge BEH Shield RP18, 30*4.6 mm,2.5 μm粒子;流動相A:水/6.5mM NH 4HCO 3,流動相B:乙腈;流率:1.5000 mL/min;梯度:在1.20 min內0% B至95% B,在0.58 min內95% B至95% B,在0.05 min內95% B至10% B;波長:254 nm;RT1(min):0.765)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.55 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 7.12 (d, J= 38.0 Hz, 2H), 6.28 (d, J= 5.1 Hz, 1H), 5.79 (d, J= 5.0 Hz, 1H), 5.68 (d, J= 7.5 Hz, 1H), 5.19 (t, J= 5.4 Hz, 1H), 4.26 (t, J= 4.4 Hz, 1H), 3.92 (dd, J= 5.1, 3.9 Hz, 1H), 3.83 (d, J= 11.6 Hz, 1H), 3.69 (d, J= 11.6 Hz, 1H), 3.56 (d, J= 4.9 Hz, 2H), 3.17 (s, 3H)。 實例 13- 化合物 15 (2R,3S,5R)-5-(6- 胺基 -9H- 嘌呤 -9- )-2-( 氯甲基 )-2-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -3- 醇之合成
步驟1:在室溫,空氣氛圍下向2-去氧腺苷(25 g,99.5 mmol)及咪唑(40.6 g,597.1 mmol)於DMF (100 mL)中之混合物分批添加三級丁基二甲基氯矽烷(44.8 g,298.8 mmol)。在室溫,空氣氛圍下將所得混合物攪拌2h。將所得混合物用水(500 mL)稀釋。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 500 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 250 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EA (5:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]嘌呤-6-胺(28 g,58.3 mmol,58.65%)。LC-MS (ES, m/z): 480 [M+H +]。
步驟2:在0℃,氮氣氛圍下向9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]嘌呤-6-胺(28 g,58.3 mmol)於吡啶(100 mL)之攪拌混合物中逐滴添加2-甲基丙醯氯(8.1 g,75.8 mmol)。將混合物在0℃下攪拌30 min。在室溫下用水淬滅反應。在減壓下濃縮所得混合物。藉由用二氯甲烷/甲醇(20/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之N-{9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]嘌呤-6-基}-2-甲基丙醯胺(24.5 g,44.5 mmol,76.35%)。LC-MS (ES, m/z): 550 [M+H +]。
步驟3:在0℃,氮氣氛圍下向N-{9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]嘌呤-6-基}-2-甲基丙醯胺(24.5 g,44.5 mmol)於THF(200 mL)及H 2O (50 mL)之攪拌混合物中逐滴添加TFA (50 mL)。將混合物在0℃下攪拌40 min。將所得混合物倒入水(300 mL)中,用乙酸乙酯(300mL)萃取。將合併之有機層用飽和碳酸氫鈉洗滌,然後用鹽水洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用石油醚/乙酸乙酯(1/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之N-{9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]嘌呤-6-基}-2-甲基丙醯胺(11.6 g,26.6 mmol,59.77%)。LC-MS (ES, m/z): 436 [M+H +]。
步驟4:將N-{9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]嘌呤-6-基}-2-甲基丙醯胺(11.6 g,26.6 mmol)及IBX (14.9 g,53.2 mmol)於ACN (110 mL)中之混合物在60℃下攪拌1h。將混合物冷卻至室溫,過濾,在真空下濃縮濾液。經由矽膠層析法(用1:5 ACN/EA溶析)純化殘餘物,得到呈白色固體之N-{9-[(2R,4S,5S)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-甲醯基氧雜環戊烷-2-基]嘌呤-6-基}-2-甲基丙醯胺(9.1 g,20.9 mmol,78.81%)。LC-MS4 (ES, m/z): 434 [M+H] +
步驟5:向N-{9-[(2R,4S,5S)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-甲醯基氧雜環戊烷-2-基]嘌呤-6-基}-2-甲基丙醯胺(9.1 g,20.9 mmol)及HCHO (9.4 g,314.7 mmol)於二噁烷(90 mL)之攪拌溶液中添加NaOH (2.5 g,62.9 mmol)於水(9 mL)中之溶液。將混合物在室溫下攪拌16h。然後添加NaBH 4(1.6 g,41.9 mmol)且在0℃下攪拌30min。將反應用飽和NH 4Cl水溶液淬滅。將所得混合物用水(100 mL)稀釋,用EA (5 x 100 mL)萃取,用HOAc將合併之有機層的pH調節至5~6,用水(2 x 100 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥,過濾且在真空下濃縮。經由矽膠層析法(用含7% MeOH之DCM溶析)純化殘餘物,得到呈白色固體之N-{9-[(2R,4S)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]嘌呤-6-基}-2-甲基丙醯胺(2.68 g,6.0 mmol,27.42%)。LC-MS (ES, m/z): 396 [M+H +]。
步驟6:將[(3S,5R)-5-(6-胺基嘌呤-9-基)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]甲醇(2.4 g,6.1 mmol)及1-[氯(4-甲氧基苯基)苄基]-4-甲氧基苯(2.6 g,7.8 mmol)於吡啶(20 mL)中之混合物在室溫下攪拌隔夜。將所得混合物用乙酸乙酯(100mL)稀釋且用水(100mL)及鹽水(100mL)洗滌。在真空下濃縮有機層。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之[(2S,3S,5R)-5-(6-胺基嘌呤-9-基)-2-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]甲醇(1.9 g,2.7 mmol,44.87%)。LC-MS (ES, m/z): 698 [M+H] +
步驟7:在室溫,空氣氛圍下向[(2S,3S,5R)-5-(6-胺基嘌呤-9-基)-2-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]甲醇(1.9 g,2.7 mmol)及咪唑(556 mg,8.1 mmol)於DMF (20 mL)之混合物中分批添加三級丁基二甲基氯矽烷(613.3 mg,4 mmol)。在室溫,空氣氛圍下將所得混合物攪拌2h。將所得混合物用水(100 mL)稀釋。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 50 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。所得混合物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 812 [M+H] +
步驟8:向含9-[(2R,4S,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]嘌呤-6-胺(2 g,2.4 mmol)之吡啶(20 mL)中逐滴添加2-甲基丙醯氯(341.1 mg,3.2 mmol)且在0℃下攪拌30 min。將所得混合物在真空下濃縮。藉由用PE/EA (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之N-{9-[(2R,4S,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]嘌呤-6-基}-2-甲基丙醯胺(1.02 g,1.1 mmol,46.95%)。LC-MS (ES, m/z): 882[M+H] +
步驟9:將含N-{9-[(2R,4S,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]嘌呤-6-基}-2-甲基丙醯胺(1 g,1.1 mmol)之H 2O (2 mL)及甲酸(8 mL)的混合物在室溫下攪拌5 min,然後用MeOH淬滅。在真空下濃縮所得混合物。藉由用PE/EA (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之N-{9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]嘌呤-6-基}-2-甲基丙醯胺(600 mg,1.1 mmol,91.29%)。LC-MS (ES, m/z): 580 [M+H +]。
步驟10:在-30℃下向N-{9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]嘌呤-6-基}-2-甲基丙醯胺(590 mg,1.1 mmol)及吡啶(241.4 mg,3.1 mmol)於DCM (15)之攪拌混合物中逐滴添加Tf 2O (287.1 mg,1.1 mmol),然後將混合物攪拌5 h。在室溫下用水淬滅反應。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 50 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 50 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。將所得混合物在真空下濃縮,且未經進一步純化即用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 712 [M+H] +
步驟11:將三氟甲烷磺酸[(2S,3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-[6-(2-甲基丙醯胺基)嘌呤-9-基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(600 mg,0.8 mmol)及LiCl (107.1 mg,2.5 mmol)於DMF (5 mL)中之混合物在室溫下攪拌3 h。將所得混合物用水(20 mL)稀釋。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 50 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。所得混合物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 598/ 600 [M+H] +
步驟12:將N-{9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)氧雜環戊烷-2-基]嘌呤-6-基}-2-甲基丙醯胺(580 mg,0.9 mmol)於EtOH (10 mL)及甲胺(2M於THF中,5 mL)中之混合物在室溫下攪拌隔夜。所得混合物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 528/ 530 [M+H] +
步驟13:將9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)氧雜環戊烷-2-基]嘌呤-6-胺(300 mg,粗品)及NH 4F (631 mg,17.1 mmol)於MeOH(20 mL)中之混合物在60℃下攪拌2天。將混合物冷卻至室溫,然後在真空下濃縮。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化殘餘物:管柱,C18矽膠;流動相,含MeCN之水(0.05% FA),在30 min內0%至30%梯度;偵測器,UV 254 nm,得到呈灰白色固體之(2R,3S,5R)-5-(6-胺基嘌呤-9-基)-2-(氯甲基)-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-3-醇 (11.3 mg,0.07 mmol)。LC-MS (ES, m/z): 300/302 [M+H] +97.8%純度。LCMS之條件:(管柱:XBridge Shield RP18, 50*4.6 mm,3.5 μm;流動相A:水/5mM NH 4HCO 3,流動相B:乙腈;流率:1.5000 mL/min;梯度:在1.19 min內10% B至95% B,在0.58 min內95% B至95% B,在0.05 min內95% B至10% B;波長:254 nm;RT1(min):0.661)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.35 (s, 1H), 8.14 (s, 1H), 7.32 (s, 2H), 6.41 (dd, J= 8.3, 6.0 Hz, 1H), 5.54 – 5.35 (m, 2H), 4.59 – 4.52 (m, 1H), 3.81 (s, 2H), 3.66 – 3.59 (m, 2H), 3.05 (ddd, J= 13.7, 8.4, 5.7 Hz, 1H), 2.35 (ddd, J= 13.3, 6.1, 2.6 Hz, 1H)。 實例 14- 化合物 16 4- 胺基 -1-((2R,4S,5R)-5- 環丙基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- ) 嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.2 g,2.4 mmol,合成描繪於實例1中)及DMAP (607 mg,4.9 mmol)及TEA (1.5 ml)於二氯甲烷(20 ml)之攪拌溶液中逐滴添加苯甲醯氯(698 mg,4.9 mmol)。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌隔夜。將所得混合物用水(200 mL)稀釋。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 200 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 100 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用石油醚/乙酸乙酯(1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之3-苯甲醯基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2,4-二酮(1.2 g,2 mmol,82.26%)。LC-MS (ES, m/z): 587(M+H +)
步驟2:在室溫,氮氣氛圍下,向3-苯甲醯基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2,4-二酮(600 mg,1.0 mmol)及乙酸(乙醯基氧基)鈀((acetyloxy)palladio acetate) (23 mg,0.1 mmol)於二氯甲烷(15 ml)之攪拌混合物中逐滴添加含重氮甲烷之乙醚(80 mL)。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌隔夜。將所得混合物用水(200 mL)稀釋。將所得混合物用二氯甲烷(3 x 200 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 100 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC用石油醚/乙酸乙酯(1:1)純化殘餘物,得到呈白色固體之3-苯甲醯基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-環丙基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2,4-二酮(440 mg,0.73 mmol,71.62%)。LC-MS (ES, m/z): 601(M+H +)
步驟3:在室溫,氮氣氛圍下將3-苯甲醯基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-環丙基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2,4-二酮(200 mg,0.3 mmol)及氨水(4 mL,7 M於甲醇中)之溶液攪拌隔夜。將所得混合物在真空下濃縮。藉由製備型TLC用石油醚/乙酸乙酯(1:1)純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-環丙基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(90 mg,0.1 mmol,54.43%)。LC-MS (ES, m/z): 497(M+H +)
步驟4:在室溫,氮氣氛圍下將1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-環丙基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(90 mg,0.1 mmol)於乙腈(2 mL)中之溶液用DMAP (44 mg,0.3 mmol)及TEA (36 mg,0.3 mmol)處理30 min,隨後在室溫下分批添加2,4,6-三異丙基苯磺醯氯(109 mg,0.3 mmol)。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌隔夜。在室溫下向以上混合物中逐滴添加氫氧化銨(12 mg,0.3 mmol)。將所得混合物在室溫下再攪拌1 h。將所得混合物在真空下濃縮。藉由製備型TLC用二氯甲烷/甲醇(10:1)純化殘餘物,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-環丙基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(80 mg,0.1 mmol,89.07%)。LC-MS (ES, m/z): 496(M+H +)
步驟5:在60℃,氮氣氛圍下將4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-環丙基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(80 mg,0.1 mmol)及NH 4F (179 mg,4.8 mmol)於甲醇(5 ml)中之混合物攪拌2天。將所得混合物在真空下濃縮。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(管柱:XBridge Prep OBD C18管柱,30*150 mm,5μm;流動相A:水(10 mmol/L NH4HCO3+0.1%NH3.H2O),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在8 min內2% B至14% B,14% B;波長:254/220 nm;RT1(min):7.52),得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-5-環丙基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(17.6 mg,0.066 mmol,40.20%)。LC-MS (ES, m/z): 268(M+H +) 98.5%純度。LCMS之條件:(管柱:Shim Pack Scepter C18管柱,33*3.0 mm,3.0μm;流動相A:水/6.5mM NH4HCO3,流動相B:乙腈;流率:1.2000 mL/min;梯度:在1.20 min內10% B至95% B,在1.80 min內95% B至95% B,在1.82 min內95% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):0.512)。 1H NMR (300 MHz, DMSO- d 6) δ 8.00 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 7.05 (d, J= 15.9 Hz, 2H), 5.93 (dd, J= 6.5, 5.1 Hz, 1H), 5.66 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 5.32 – 4.93 (m, 2H), 4.58 – 4.21 (m, 1H), 3.54 – 3.41 (m, 2H), 2.25 – 2.14 (m, 1H), 2.05 (dd, J= 7.0, 5.3 Hz, 1H), 0.91 (td, J= 8.3, 4.2 Hz, 1H), 0.47 – 0.05 (m, 4H)。 實例 15- 化合物 17 4- 胺基 -1-((2R,3S,4S,5R)-5-( 氯甲基 )-3- 乙炔基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- ) 嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟 1 在0℃,氮氣氛圍下將((3aR,6S,6aR)-6-(苄氧基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5,5-二基)二甲醇(20 g,64.4 mmol)於THF(200 mL)中之溶液用NaH (2.5 g,64.4 mmol,60%)處理0.5 h,隨後在0℃下分批添加BnBr (7.6 mL,64.4 mmol)。在室溫下將所得混合物再攪拌隔夜。藉由在0℃下添加水(20 mL)來淬滅反應。藉由在0℃下添加水(20 mL)來淬滅反應。將所得混合物用EtOAc (3 x 200 mL)萃取。將合併之有機層用水(3 x 200 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。在減壓下濃縮所得混合物。藉由用PE/EA (4:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色油狀物之((3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-基)甲醇(17 g,42.4 mmol,65.87%)。LC-MS (ES, m/z): 418/420 [M+NH 4] +
步驟2:在-35℃,氮氣氛圍下向((3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-基)甲醇(17 g,42.4 mmol)於DCM (200 mL)之攪拌溶液中分批添加Tf 2O (20.3 g,72.1 mmol)及吡啶(16.7 g,212.2 mmol)。將所得混合物在-35℃下再攪拌1 h。將所得混合物用EtOAc (3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用水(3 x 100 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。在減壓下濃縮所得混合物。粗產物混合物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。此得到呈白色固體之三氟甲烷磺酸((3aR,5S,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-基)甲酯(22 g,41.3 mmol,97.32%)。LC-MS (ES, m/z): 550/552 [M+NH 4] +
步驟3:在60℃,氮氣氛圍下向三氟甲烷磺酸((3aR,5S,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-基)甲酯 (22 g,41.3 mmol)於DMF (200 mL)之攪拌溶液中分批添加LiCl (7 g,165.2 mmol)。將所得混合物在60℃下再攪拌2h。將所得混合物用水(100 mL)稀釋。將所得混合物用EtOAc (3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用水(3 x 100 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EA (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色油狀物之(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-(氯甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯(9 g,21.5 mmol,52.00%)。LC-MS (ES, m/z): 436/438 [M+NH 4] +
步驟4:在0℃,氮氣氛圍下向(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-(氯甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯(9 g,21.4 mmol)於AcOH(80 mL)之攪拌溶液中分批添加Ac 2O (29.6 g,290 mmol)及H 2SO 4(252.8 mg,2.5 mmol)。將所得混合物在室溫下再攪拌2h。用飽和NaHCO 3(水溶液)將殘餘物鹼化至pH 7。將所得混合物用EtOAc (3 x 150 mL)萃取。將合併之有機層用NaHCO 3(3 x 100 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EA (4:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色油狀物之乙酸(3R,4S,5R)-2-(乙醯基氧基)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)氧雜環戊烷-3-酯(7.3 g,15.8 mmol,73.40%)。LC-MS (ES, m/z): 480/482 [M+NH 4] +
步驟5:在0℃,N 2氛圍下向2,4-雙[(三甲基矽烷基)氧基]嘧啶(7.3 g,15.8 mmol)於DCE (243 mL)之攪拌溶液中逐滴添加乙酸(3R,4S,5R)-2-(乙醯基氧基)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)氧雜環戊烷-3-酯(10.1 g,21.3 mmol)及TMSOTf (5 mL)。在35℃,N 2氛圍下將所得混合物攪拌18 h。藉由添加NaHCO 3來淬滅反應。將所得混合物用EA (2 x 100 ml)萃取。將合併之有機層用鹽水(100 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液,得到呈黃色油狀物之乙酸(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-2-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-3-酯(7 g,13.6 mmol,89.9%)。LC-MS (ES, m/z): 515/517 [M+H] +
步驟6:向乙酸(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-2-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-3-酯(7 g,13.5 mmol)於MeOH(25 mL)之攪拌溶液中添加TEA (2.3 g,230.7 mmol)。將所得混合物在60℃下攪拌5 h。將所得混合物在真空下濃縮。藉由用DCM/MeOH (10/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-3-羥基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(5.3 g,11.2 mmol,82.6%)。LC-MS (ES, m/z): 473/475 [M+H] +
步驟7:向1-[(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-3-羥基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(5.3 g,11.2 mmol)於DCM (50 mL)之攪拌溶液中添加戴斯-馬丁(7.5 g,17.8 mmol)。將所得混合物在30℃下攪拌1h。LCMS顯示反應完成。在0℃下用Na 2S 2O 3淬滅反應。將所得混合物用EA (2 x 200 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(100 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液,得到呈黃色油狀物之1-[(2R,4R,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-3-側氧基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(2.5 g,5.3 mmol,89.67%)。LC-MS (ES, m/z): 471/473 [M+H] +
步驟8:在-78℃,N 2氛圍下向三甲基矽烷基乙炔(312.9 mg,3.19 mmol)於THF (15 mL)之攪拌溶液中逐滴添加n-BuLi (1.27 mL,3.19 mmol)。在-78℃,N 2氛圍下將所得混合物攪拌0.5 h。在-78℃下向以上混合物中逐滴添加含1-[(2R,4R,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-3-側氧基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(500 mg,1.06 mmol)之THF (5 mL)。將所得混合物在-78℃下再攪拌0.5 h。LCMS顯示反應完成。藉由在-78℃下添加NH 4Cl水溶液(5 mL)來淬滅反應。將所得混合物用EA (2 x 50 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(20 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC (DCM/MeOH = 12/1)純化殘餘物,得到呈黃色油狀物之1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-3-羥基-3-[2-(三甲基矽烷基)乙炔基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(359 mg,0.63 mmol,59.41%)。LC-MS (ES, m/z): 569/571 [M+H] +
步驟9:在0℃下向1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-3-羥基-3-[2-(三甲基矽烷基)乙炔基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(359 mg,0.63 mmol)於DCM (5 mL)之攪拌溶液中逐滴添加DMAP (154.1 mg,1.26 mmol)及草醯氯酸甲酯(115.9 mg,0.95 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌10 min。LCMS顯示反應完成。將反應用水(20 mL)淬滅。將所得混合物用DCM (2 x 20 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(20 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液,得到呈白色固體之草酸(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-2-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[2-(三甲基矽烷基)乙炔基]氧雜環戊烷-3-酯甲酯(380 mg,0.58 mmol,91.95%)。LC-MS (ES, m/z): 655/657 [M+H] +
步驟10:在N 2氛圍下向草酸(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-2-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[2-(三甲基矽烷基)乙炔基]氧雜環戊烷-3-酯甲酯(380 mg,0.58 mmol)於甲苯(6 mL)之攪拌溶液中添加AIBN (28.5 mg,0.17 mmol)及 n-Bu 3SnH (338.7 mg,1.16 mmol)。在100℃,N 2氛圍下將所得混合物攪拌1h。將所得混合物在真空下濃縮。藉由製備型TLC (DCM/MeOH)純化殘餘物,得到呈黃色油狀物之1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-3-[2-(三甲基矽烷基)乙炔基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(60 mg,0.11 mmol,14.21%)。LC-MS9 (ES, m/z): 553/555 [M+H] +
步驟11:向1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-3-[2-(三甲基矽烷基)乙炔基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(60 mg,0.11 mmol)於MeCN (2 mL)之攪拌溶液中添加TEA (32.9 mg,0.32 mmol)、DMAP (26.5 mg,0.22 mmol)及TPSCl (65.5 mg,0.22 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌18 h。向以上混合物中添加NH 3.H 2O (19 mg,0.54 mmol)。將所得混合物在室溫下再攪拌1h。LCMS顯示反應完成。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型TLC (DCM/MeOH 12/1)純化殘餘物,得到呈黃色油狀物之4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-3-[2-(三甲基矽烷基)乙炔基]氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(50 mg,0.09 mmol,83.47%)。LC-MS (ES, m/z): 552/554 [M+H] +
步驟12:在-78℃,N 2氛圍下向4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-3-[2-(三甲基矽烷基)乙炔基]氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(50 mg,0.09 mmol)於DCM (5 mL)之攪拌溶液中逐滴添加BCl 3(0.9 mL,0.9 mmol)。然後將反應混合物溫熱至室溫。LCMS顯示反應完成。將所得混合物在真空下濃縮。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化殘餘物:管柱,C18矽膠;流動相,ACN;10 mM NH 4HCO 3;在10 min內10%至50%梯度;偵測器,UV 254 nm。此得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)-3-[2-(三甲基矽烷基)乙炔基]氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(20 mg,0.05 mmol,59.40%)。LC-MS (ES, m/z): 372/374 [M+H] +
步驟13:向4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)-3-[2-(三甲基矽烷基)乙炔基]氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(15 mg,0.04 mmol)於MeOH(2 mL)之攪拌溶液中添加NH 4F (29.9 mg,0.80 mmol)。將所得混合物在60℃下攪拌36 h。LCMS顯示反應完成。將所得混合物在真空下濃縮。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(管柱:XBridge Prep OBD C18管柱,30*150 mm,5 μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3+ 0.1%NH 3.H 2O),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在8 min內15% B至28% B,28% B;波長:254/220 nm;),得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-5-(氯甲基)-3-乙炔基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(10.9 mg,0.04 mmol,89.00%)。LC-MS (ES, m/z): 300/302 [M+H] +。98.7%純度。LCMS之條件:(管柱:HALO C18, 30*3 mm,2.7 μm;流動相A:水+0.05%TFA,流動相B:乙腈;流率:1.5000 mL/min;梯度:在1.90 min內5% B至40% B,在0.20 min內40% B至100% B,在0.50 min內100% B至100% B,在0.10 min內100% B至5% B;波長:210 nm;RT1(min):0.668)。 1H NMR (300 MHz, DMSO- d 6) δ 7.76 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 7.16 (s, 1H), 7.08 (s, 1H), 6.26 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 6.05 (d, J= 5.3 Hz, 1H), 5.70 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 5.32 (t, J= 5.3 Hz, 1H), 4.49 – 4.42 (m, 1H), 3.92 (d, J= 11.9 Hz, 1H), 3.77 – 3.49 (m, 4H), 3.11 (d, J= 2.6 Hz, 1H)。 實例 16- 化合物 18 5- 胺基 -2-((2R,4S,5R)-5-( 氯甲基 )-4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- )-1,2,4- 三嗪 -3(2H)- 酮之合成
步驟1:在氮氣氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.8 g,4.8 mmol)於四氫呋喃(16 mL)之溶液中添加氟化四丁基銨於四氫呋喃(24 mL,1.0 M)中之溶液。將混合物在室溫下攪拌2 h。將所得混合物在真空下濃縮且藉由用二氯甲烷/甲醇(10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化,得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.2 g,4.3 mmol,97%)。LC-MS: (ES, m/z): 277/279 (M+H +)。
步驟2:在氮氣氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.2 g,4.3 mmol)於乙腈(50 mL)之溶液中添加三乙胺(1.0 g,10.1 mmol)、4-二甲胺基吡啶(61.8 mg,0.5 mmol)。然後添加2-甲基丙酸2-甲基丙醯酯(3.2 g,20.2 mmol)且在40℃下攪拌隔夜。藉由添加冰水來淬滅反應。將所得混合物用乙酸乙酯萃取。將合併之有機層用碳酸氫鈉及氯化鈉水溶液洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用石油醚/乙酸乙酯(1:3)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之異丁酸(2R,3S,5R)-2-(氯甲基)-5-(2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-2-((異丁醯氧基)甲基)四氫呋喃-3-酯(1.5 g,3.6 mmol,83%)。LC-MS: (ES, m/z): 417/419 (M+H +)。
步驟3:在氮氣氛圍下向氮雜尿嘧啶(1.5 g,13.0 mmol)於六甲基二矽氮烷(20 mL)之溶液中添加硫酸銨(19 mg,0.1 mmol)。將混合物在110℃下攪拌隔夜。蒸發六甲基二矽氮烷,得到粗產物。在氮氣氛圍下向粗產物於乙腈(20 mL)之溶液中添加異丁酸(2R,3S,5R)-2-(氯甲基)-5-(2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-2-((異丁醯氧基)甲基)四氫呋喃-3-酯(600 mg,1.4 mmol)及三氟甲烷磺酸三甲基矽烷酯(1.6 g,7.2 mmol)。將混合物在60℃下攪拌隔夜。藉由在0℃下添加碳酸氫鈉水溶液來淬滅反應且用乙酸乙酯萃取。將合併之有機層用氯化鈉溶液洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用二氯甲烷/甲醇(20:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色半固體之異丁酸(2R,3S)-2-(氯甲基)-5-(3,5-二側氧基-4,5-二氫-1,2,4-三嗪-2(3H)-基)-2-((異丁醯氧基)甲基)四氫呋喃-3-酯(300 mg,0.7 mmol,50%)。LC-MS: (ES, m/z): 418/420 (M+H +)。
步驟4:在氮氣氛圍下向異丁酸(2R,3S)-2-(氯甲基)-5-(3,5-二側氧基-4,5-二氫-1,2,4-三嗪-2(3H)-基)-2-((異丁醯氧基)甲基)四氫呋喃-3-酯(300 mg,0.7 mmol)、4-二甲胺基吡啶(175 mg,1.4 mmol)及三乙胺(145 mg,1.4 mmol)於乙腈(15 mL)之溶液中添加2,4,6-參(丙-2-基)苯-1-磺醯氯(435 mg,1.4 mmol)。將混合物在25℃下攪拌隔夜。然後添加濃氫氧化銨(3 mL)且在氮氣氛圍下攪拌30 min。在減壓下濃縮所得混合物。藉由用二氯甲烷/甲醇(10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之2-甲基丙酸[(2R,3S)-5-(5-胺基-3-側氧基-1,2,4-三嗪-2-基)-2-(氯甲基)-3-[(2-甲基丙醯基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(210 mg,0.5 mmol,70%)。LC-MS: (ES, m/z): 417/419 (M+H +)。
步驟5:向NH 3(g)於甲醇(7 ml,7.0 M)之溶液中添加2-甲基丙酸[(2R,3S)-5-(5-胺基-3-側氧基-1,2,4-三嗪-2-基)-2-(氯甲基)-3-[(2-甲基丙醯基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(210 mg,0.5 mmol),將混合物在30℃下攪拌隔夜。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(管柱:Xselect CSH C18 OBD管柱30*150mm 5μm,n;流動相A:水(0.1% FA),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在10 min內1% B至4% B,4% B;波長:254 nm;RT1(min):7.72),得到呈淡黃色固體之5-胺基-2-[(4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基]-1,2,4-三嗪-3(2H)-酮(65 mg,0.2 mmol,44%)。LC-MS: (ES, m/z): 277/279 (M+H +)。
步驟6:藉由製備型對掌性HPLC在以下條件下純化5-胺基-2-[(4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基]-1,2,4-三嗪-3(2H)-酮(65 mg,0.2 mmol)(管柱:CHIRALPAK IH,2*25 cm,5 μm;流動相A:Hex (0.5% 2M NH 3-MeOH),流動相B:EtOH--HPLC;流率:20 mL/min;梯度:在23 min內20% B至20% B;波長:220/254 nm;RT1(min):15.337,RT2(min):19.203),得到呈灰白色固體之5-胺基-2-[(2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-1,2,4-三嗪-3-酮(26.1 mg,0.09 mmol,18%)。LC-MS: (ES, m/z): 277/279 (M+H +)。99.0%純度。
LCMS之條件:(管柱:Shim‐pack Scepter C18管柱,30*3.0 mm,3 μm;流動相A:水+5mMNH 4HCO 3,流動相B:乙腈;流率:1.5000 mL/min;梯度:在1.40 min內0% B至95% B,在1.80 min內95% B至95% B,在1.85 min內95% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):0.711)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.13 – 7.93 (m, 2H), 7.56 (s, 1H), 6.31 (dd, J= 7.5, 6.1 Hz, 1H), 5.20 (d, J= 7.0 Hz, 1H), 4.95 (t, J= 5.7 Hz, 1H), 4.40 (q, J= 6.9 Hz, 1H), 3.83 – 3.71 (m, 2H), 3.45 (d, J= 5.6 Hz, 2H), 2.60 (dt, J= 13.5, 7.5 Hz, 1H), 2.27 (dt, J= 13.5, 6.2 Hz, 1H)。 實例 17- 化合物 19 4- 胺基 -1-((2R,3S,4S,5R)-4- 羥基 -5-( 羥甲基 )-3,5- 二甲基四氫呋喃 -2- ) 嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在室溫,氮氣氛圍下將4-胺基-1-((2R,3S,4S,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-5-(氯甲基)-3-甲基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮(10 mg,0.02 mmol)於甲苯(3 mL)中之溶液用AIBN (0.9 mg,0.006 mmol)及 n-Bu 3SnH (16.7 mg,0.06 mmol)處理。在100℃,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌4 h。藉由LCMS可以偵測到所需產物。在減壓下濃縮所得混合物。然後,藉由製備型TLC用石油醚/乙酸乙酯(1:1)純化殘餘物,得到呈黃色油狀物之4-胺基-1-((2R,3S,4S,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-3,5-二甲基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮(60 mg,0.12 mmol,91.77%)。LC-MS (ESI, m/z): 484 (M+H +)
步驟2:在室溫,氮氣氛圍下向4-胺基-1-((2R,3S,4S,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-3,5-二甲基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮(50 mg,0.1 mmol)於甲醇(2 mL)之攪拌溶液中添加NH 4F (114.8 mg,3.1 mmol)。在60℃,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌5.0天。藉由LCMS可以偵測到所需產物。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(管柱:XBridge Prep OBD C18管柱,30*150 mm,5 μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3+ 0.1%NH 3.H 2O),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在8 min內2% B至14% B,14% B;波長:254/220 nm;RT1(min):5.88(min);運行次數:0),得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-3,5-二甲基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(8.3 mg,0.03 mmol,31.43%)。LC-MS (ES, m/z): 256(M+H +) 99.9%純度。LCMS之條件:(管柱:Shim‐pack Scepter C18管柱,50*3.0 mm,2.7μm;流動相A:水/0.05%TFA,流動相B:ACN/0.05%TFA;流率:1.5000 mL/min;梯度:在1.20 min內0 B至100% B,在0.62 min內100% B至100% B,在0.18 min內0% B至0% B;波長:254/220 nm;RT1(min):0.353)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 8.04 (d, J= 7.3 Hz, 1H), 7.03 (d, J= 32.9 Hz, 2H), 6.08 (d, J= 7.9 Hz, 1H), 5.66 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 5.28 – 5.08 (m, 2H), 3.83 – 3.71 (m, 1H), 3.45 (m, 2H), 2.46 (s, 1H), 0.99 (s, 3H), 0.74 (d, J= 6.8 Hz, 3H)。 實例 18- 化合物 20 4- 胺基 -1-((2R,3S,4S,5R)-3- 乙炔基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 )-5- 甲基四氫呋喃 -2- ) 嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在室溫,氮氣氛圍下將1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-甲基-3-[2-(三甲基矽烷基)乙炔基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(100 mg,0.2 mmol)於ACN(5 mL)中之溶液用DMAP (27.1 mg,0.4 mmol)及TEA (39.2 mg,0.4 mmol)處理10 min,然後添加2,4,6-參(丙-2-基)苯-1-磺醯氯(116.6 mg,0.4 mmol),且將反應在室溫下攪拌5h。最後,添加NH 4OH (0.5 mL)之溶液,且將所得反應混合物在室溫下攪拌15 min。藉由LCMS可以偵測到所需產物。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型TLC用PE/EA (1:1)純化殘餘物,得到呈灰白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-甲基-3-[2-(三甲基矽烷基)乙炔基]氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(80 mg,0.2 mmol,0.15%)。LC-MS (ES, m/z): 518 (M+H +)
步驟2:在-78℃,氮氣氛圍下將4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-甲基-3-[2-(三甲基矽烷基)乙炔基]氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(80 mg,0.2 mmol)於DCM (5 mL)中之溶液用三氯化硼(271.6 mg,2.4 mmol)處理2h。藉由LCMS可以偵測到所需產物。藉由在-20℃下添加MeOH/TEA (2/1)來淬滅反應。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型TLC用CH 2Cl 2/MeOH (10:1)純化殘餘物,得到呈灰白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-甲基-3-[2-(三甲基矽烷基)乙炔基]氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(35 mg,0.1 mmol,69.04%)。LC-MS (ES, m/z): 338 (M+H +)
步驟3:在60℃下將4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-甲基-3-[2-(三甲基矽烷基)乙炔基]氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(35 mg,0.1 mmol)及NH 4F (7.7 mg,0.2 mmol)於甲醇(4 mL)中之溶液攪拌隔夜。藉由LCMS可以偵測到所需產物。過濾所得混合物;用MeOH (3x5 mL)洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(20 mg)(管柱:XBridge Shield RP18 OBD管柱,19*250 mm,10μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3+0.1%NH 3 .H 2O),流動相B:ACN;流率:25 mL/min;梯度:在8 min內2% B至8% B,在內8% B;波長:254/220 nm;RT1(min):6.52),得到呈灰白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-3-乙炔基-4-羥基-5-(羥甲基)-5-甲基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(12.2 mg,0.05 mmol,43.46%)。LC-MS (ES, m/z): 266 (M+H +); 98.0%純度。
LCMS之條件:(管柱:XSelect HSS T3, 30*2.1 mm,2.5μm;流動相A:水+5 mM NH 4HCO 3,流動相B:乙腈/0.05%TFA;流率:1.2000 mL/min;梯度:在1.6 min內0% B至50% B,在0.4 min內50% B至95% B,在0.4 min內95% B至95% B,在0.4 min內95% B至0% B;波長:254/220 nm;RT1(min):1.028)
1H NMR (300 MHz, DMSO- d 6) δ 7.83 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 7.06 (d, J= 26.4 Hz, 2H), 6.17 (d, J= 7.5 Hz, 1H), 5.77 – 5.53 (m, 2H), 5.13 (t, J= 5.4 Hz, 1H), 4.23 (dd, J= 8.4, 5.6 Hz, 1H), 3.56 – 3.34 (m, 3H), 2.99 (d, J= 2.5 Hz, 1H), 1.02 (s, 3H)。 實例 19- 化合物 22 4- 胺基 -5- 氟基 -1-((2R,4S,5R)-5-( 氟甲基 )-4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- ) 嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,4S)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5,5-雙(羥基-甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(20.0 g,51.2 mmol)於吡啶(200 mL)之溶液中添加1-[氯(4-甲氧基苯基)苯基甲基]-4-甲氧基苯(17.35 g,51.2 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜,然後用乙酸乙酯(200 mL)稀釋。將分離之有機層用飽和NH 4Cl水溶液洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由用石油醚/乙酸乙酯(8:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5S)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(30.5 g,84.5%)。LC-MS (ES, m/z): 693 (M+H +)。
步驟2:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,4S,5S)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(30.0 g,43.3 mmol)及咪唑(8.84 g,129.9 mmol)於DMF (300 mL)之攪拌溶液中分批添加TBSCl (7.83 g,52.0 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜,然後用乙酸乙酯(300 mL)稀釋。將分離之有機層用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由用石油醚/乙酸乙酯(7:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(29.8 g,85.8%)。LC-MS (ES, m/z): 807 (M+H +)。
步驟3:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(29.8 g,37.2 mmol)及K 2CO 3(10.27 g,74.3 mmol)於DMF (300 mL)之攪拌溶液中逐滴添加PMBCl (11.64 g,74.3 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜,然後藉由在0℃下添加飽和NaHCO 3水溶液來淬滅。用乙酸乙酯(300 mL)稀釋所得混合物。將分離之有機層用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由用石油醚/乙酸乙酯(10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3-[(4-甲氧基苯基)甲基]嘧啶-2,4-二酮(31.0 g,87.0%)。LC-MS (ES, m/z): 927 (M+H +)。
步驟4:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3-[(4-甲氧基苯基)甲基]嘧啶-2,4-二酮(30 g,32.4 mmol)於MeOH (300 mL)之攪拌溶液中添加NH 4F (6.0 g,161.8 mmol)。將所得混合物在60℃下攪拌隔夜,然後冷卻至室溫且在真空下濃縮。將殘餘物溶解於乙酸乙酯(300 mL)中。將所得溶液用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由用石油醚/乙酸乙酯(5:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5S)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3-[(4-甲氧基-苯基)甲基]嘧啶-2,4-二酮(18 g,79.6%)。LC-MS (ES, m/z): 699 (M+H +)。
步驟5:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,4S,5S)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3-[(4-甲氧基苯基)甲基]嘧啶-2,4-二酮(18 g,25.8 mmol)於DMF (200 mL)之溶液中添加NaH (60%於油中,3.08 g,77.3 mmol)。攪拌20 min後,在0℃下逐滴添加BnBr (9.69 g,56.7 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜,然後冷卻至0℃,且藉由添加飽和NaHCO 3水溶液來淬滅。用乙酸乙酯(200 mL)稀釋所得混合物。將分離之有機層用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由用石油醚/乙酸乙酯(10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5S)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3-[(4-甲氧基苯基)甲基]-嘧啶-2,4-二酮(15 g,66.2%)。LC-MS5(ES, m/z): 879 (M+H +)。
步驟6:將1-[(2R,4S,5S)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-{[雙(4-甲氧基-苯基)(苯基)甲氧基]-甲基}氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3-[(4-甲氧基苯基)甲基]嘧啶-2,4-二酮(15 g,17.1 mmol)溶解於AcOH/H 2O (4:1,150 mL)中。將反應混合物在室溫下攪拌隔夜,然後冷卻至0℃,且藉由添加飽和NaHCO 3水溶液來淬滅。將所得溶液用乙酸乙酯萃取,用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由用石油醚/乙酸乙酯(5:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3-[(4-甲氧基苯基)甲基]嘧啶-2,4-二酮(7.1 g,71.1%)。LC-MS (ES, m/z): 577 (M+H +)。
步驟7:在-78℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3-[(4-甲氧基苯基)甲基]嘧啶-2,4-二酮(7 g,12.1 mmol)於甲苯(70 mL)之攪拌溶液中逐滴添加DAST (9.78 g,60.7 mmol)。將所得混合物在60℃下攪拌隔夜,然後冷卻至0℃且藉由添加飽和NaHCO 3水溶液來淬滅。用乙酸乙酯(100 mL)稀釋所得溶液。將分離之有機層用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由用石油醚/乙酸乙酯(5:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氟甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3-[(4-甲氧基苯基)甲基]嘧啶-2,4-二酮(3.2 g,42.7%)。LC-MS (ES, m/z): 579 (M+H +)。
步驟8:向1-[(2R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氟甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3-[(4-甲氧基苯基)甲基]嘧啶-2,4-二酮(3.0 g,5.2 mmol)於MeCN/H 2O (3:1, 50 mL)之溶液中添加CAN (8.52 g,15.6 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將反應混合物攪拌隔夜。用乙酸乙酯(100 mL)稀釋所得混合物。將分離之有機層用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化殘餘物:管柱,C18矽膠;流動相,含MeCN之水(10mmol/L NH 4HCO 3),在20 min內10%至80%梯度;偵測器,UV 254 nm。此得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氟甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.1 g,42.1%)。LC-MS (ES, m/z): 459 (M+H +)。
步驟9:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氟甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.0 g,2.2 mmol)、TEA (0.66 g,6.5 mmol)及DMAP (0.53 g,4.4 mmol)於MeCN (20 mL)之攪拌溶液中分批添加TPSCl (1.32 g,4.4 mmol)。在室溫下攪拌30 min後,逐滴添加氨溶液(2 mL,10.9 mmol)。將所得混合物在室溫下再攪拌隔夜,然後用乙酸乙酯稀釋。將所得溶液用飽和NH 4Cl水溶液洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化殘餘物:管柱,C18矽膠;流動相,含MeCN之水(10 mmol/L NH 4HCO 3),在20 min內40%至100%梯度;偵測器,UV 254 nm。此得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氟甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(600 mg,60.1%)。LC-MS (ES, m/z): 458 (M+H +)。
步驟10:在室溫,氮氣氛圍下向4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氟甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(600 mg,1.3 mmol)、AgNO 3(445.6 mg,2.6 mmol)及2,4,6-三甲基吡啶(317.9 mg,2.6 mmol)於DCM (10 mL)之攪拌溶液中分批添加1-(氯基二苯基甲基)-4-甲氧基苯(405.0 mg,1.3 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜,然後用乙酸乙酯(50 mL)稀釋。將分離之有機層用飽和NH 4Cl水溶液洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由用石油醚/乙酸乙酯(1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氟甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-4-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘧啶-2-酮(500 mg,52.2%)。LC-MS (ES, m/z): 730 (M+H +)。
步驟11:向1-[(2R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氟甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-4-{[(4-甲氧基苯基)二苯甲基]胺基}嘧啶-2-酮(500 mg,0.7 mmol)及HCOONH 4(0.86 g,13.7 mmol)於丙酮(10 mL)之攪拌溶液中添加Pd/C (100 mg)。將所得混合物在60℃下攪拌隔夜,然後冷卻至室溫。藉由過濾移除固體且在真空下濃縮濾液。藉由用石油醚/乙酸乙酯(1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之5-氟基-1-[(2R,4S,5R)-5-(氟甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-4-{[(4-甲氧基苯基)二苯甲基]胺基}嘧啶-2-酮(100 mg,26.6%)。LC-MS (ES, m/z): 550 (M+H +)。
步驟12:在室溫,氮氣氛圍下將5-氟基-1-[(2R,4S,5R)-5-(氟甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-4-{[(4-甲氧基苯基)二苯甲基]胺基}嘧啶-2-酮(100 mg,0.2 mmol)於AcOH/H 2O (4:1,5 mL)中之溶液攪拌隔夜。將反應冷卻至0℃且藉由添加飽和NaHCO 3水溶液來淬滅。將所得溶液用乙酸乙酯萃取,用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由製備型HPLC在以下條件下純化殘餘物:管柱:XBridge BEH C18 OBD製備型管柱,19*250 mm,5μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:25 mL/min;梯度:在8 min內2% B至17% B;波長:254 nm;RT1(min):5.95。此得到呈白色固體之4-胺基-5-氟基-1-[(2R,4S,5R)-5-(氟甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(7.3 mg,14.4%)。LC-MS-PH-ROF-RT-0453-0 (ES, m/z): 278 (M+H +)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 8.03 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.77 (brs, 1H), 7.53 (brs, 1H), 6.24–6.19 (m, 1H), 5.38 (d, J= 4.8 Hz, 1H), 5.28 (t, J= 5.2 Hz, 1H), 4.62–4.52 (m, 1H), 4.50–4.41 (m, 1H), 4.39–4.36 (m, 1H), 3.56 (s, 2H), 2.16 (t, J= 6.0 Hz, 2H)。 實例 20- 化合物 8 (2R,3S,5R)-5-(6- 胺基 -2- 氟基 -9H- 嘌呤 -9- )-2-( 氯甲基 )-2-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -3- 醇之合成
步驟1:在室溫,氮氣氛圍下向2'-去氧基-2-氟基腺苷(9 g,33.4 mmol)及TBSCl (15.1 g,100.2 mmol)於DMF (120 mL)之攪拌溶液中添加咪唑(11.3 g,167.1 mmol)。在室溫下將所得混合物再攪拌隔夜。藉由LCMS可以偵測到所需產物。將所得混合物用EtOAc (3 x 500mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 100 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EA (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-2-氟基嘌呤-6-胺(15 g,30.1mmol,90.15%)。LC-MS (ES, m/z): 498(M+H +)
步驟2:在0℃,氮氣氛圍下將9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-2-氟基嘌呤-6-胺(13 g,26.1 mmol)於TFA (50 mL)、水(50 mL)及THF (100 mL)中之溶液攪拌1h。藉由LCMS可以偵測到所需產物。將所得混合物在真空下濃縮。藉由逆相急速層析法純化殘餘物,得到呈灰白色油狀物之[(2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]甲醇(6.3 g,16.4 mmol,62.90%)。LC-MS (ES, m/z): 384(M+H +)。
步驟3:在60℃下將[(2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]甲醇(6.3 g,16.4 mmol)及IBX (18.4 g,65.7 mmol)於ACN (70 mL)中之室溫,氮氣氛圍下的溶液攪拌1.5h。藉由LCMS可以偵測到所需產物。將所得混合物用EtOAc (2 x 300 mL)萃取。將合併之有機層用Na 2S 2O 3、NaHCO 3、NaCl (2 x 200 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化殘餘物:管柱,C18矽膠;流動相,含MeCN之水(0.1% NH 3.H 2O),在10 min內56%至63%梯度;偵測器,UV 254 nm,得到呈灰白色固體之(2S,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]氧雜環戊烷-2-甲醛(2.7 g,7.1 mmol,41.99%)。LC-MS (ES, m/z): 382(M+H +)。
步驟4:在室溫,氮氣氛圍下向(2S,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基] 氧雜環戊烷-2-甲醛(2.7 g,7.1 mmol)及HCHO (4.3 g,141.5 mmol)於1,4-二噁烷(40 mL)之攪拌溶液中添加含NaOH (0.6 g,15.5 mmol)之H 2O (4 ml)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。在0℃下向以上混合物中添加NaBH 4(1.7 g,26.8 mmol)。將所得混合物在0℃下再攪拌1h。藉由LCMS可以偵測到所需產物。將所得混合物用EtOAc (3 x 200 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 100 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之[(3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]甲醇(1.3 g,3.1 mmol,44.42%)。LC-MS (ES, m/z): 414(M+H +)。
步驟5:在室溫,氮氣氛圍下向[(3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]甲醇(1.3 g,3.1 mmol)於吡啶(20 mL)之攪拌溶液中添加1-(氯基二苯基甲基)-4-甲氧基苯(1.4 g,4.7 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。藉由LCMS可以偵測到所需產物。將所得混合物用EtOAc (3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 50 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EA (1:3)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色油狀物之[(2S,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]甲醇(750 mg,1.08 mmol,34.78%)。LC-MS (ES, m/z): 686(M+H +)。
步驟6:在室溫,氮氣氛圍下向[(2S,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]甲醇(600 mg,0.8 mmol)及咪唑(178.6 mg,2.6 mmol)於DCM (5 mL)之攪拌溶液中添加TBDPSCl (360.6 mg,1.3 mmol)。在室溫下將所得混合物再攪拌隔夜。藉由LCMS可以偵測到所需產物。將所得混合物用EtOAc (3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 50 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EA (5:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色油狀物之9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}-5-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-2-氟基嘌呤-6-胺(750 mg,0.8 mmol,92.76%)。LC-MS (ES, m/z): 924(M+H +)。
步驟7:在室溫,氮氣氛圍下向9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}-5-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-2-氟基嘌呤-6-胺(750 mg,0.8 mmol)於DCM (15 mL)之攪拌溶液中添加TFA (0.3 mL)。將所得混合物在室溫下再攪拌30 min。藉由LCMS可以偵測到所需產物。將所得混合物用EtOAc (3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 50 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EA (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之[(2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]甲醇(400 mg,0.6 mmol,75.61%)。LC-MS (ES, m/z): 652(M+H +)。
步驟8:在0℃,氮氣氛圍下向[(2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]甲醇(400 mg,0.6 mmol)及吡啶(145.6 mg,1.8 mmol)於DCM (5 mL)之攪拌溶液中添加Tf 2O (259.6 mg,0.9 mmol)。將所得混合物在0℃下再攪拌10 min。藉由LCMS可以偵測到所需產物。將所得混合物用EtOAc (3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 50 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 784(M+H +)。
步驟9:在室溫,氮氣氛圍下向三氟甲烷磺酸[(2S,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]甲酯 (440 mg,0.5 mmol)及LiCl (71.3 mg,1.6 mmol)於DMF (5 mL)之攪拌溶液中。在室溫下將所得混合物再攪拌隔夜。藉由LCMS可以偵測到所需產物。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化殘餘物:管柱,C18矽膠;流動相,含MeCN之水(0.1% NH 3 .H 2O),在10 min內52%至58%梯度;偵測器,UV 254 nm,得到呈灰白色固體之9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-氟基嘌呤-6-胺(110 mg,0.1 mmol,29.24%)。LC-MS (ES, m/z): 670(M+H +)。
步驟10:在室溫,氮氣氛圍下向9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-氟基嘌呤-6-胺(110 mg,0.1 mmol)及TBAF (128.5 mg,0.5 mmol)於DCM (3 mL)之攪拌溶液中。在室溫下將所得混合物再攪拌隔夜。藉由LCMS可以偵測到所需產物。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化殘餘物:管柱:XBridge Prep OBD C18管柱,30*150 mm,5μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在8 min內2% B至20% B,20% B;波長:254/220 nm;RT1(min):7,得到呈白色固體之(2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基-9H-嘌呤-9-基)-2-(氯甲基)-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇(22.2 mg,0.043 mmol,42.58%)。LC-MS (ES, m/z): 318(M+H +); 99.9%純度。LCMS之條件:(管柱:XBridge Shield RP18, 50*4.6 mm,3.5μm;流動相A:水/5mM NH4HCO3,流動相B:乙腈;流率:1.5000 mL/min;梯度:在1.75 min內10% B至95% B,在1.05 min內95% B至95% B,在0.01 min內95% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):1.040)。 1H NMR (300 MHz, DMSO- d 6) δ 8.32 (s, 1H), 7.84 (s, 2H), 6.30 (dd, J= 7.9, 6.1 Hz, 1H), 5.53 (d, J= 4.9 Hz, 1H), 5.13 (t, J= 5.5 Hz, 1H), 4.55 (td, J= 5.4, 3.0 Hz, 1H), 3.81 (s, 2H), 3.68 – 3.52 (m, 2H), 2.95 (ddd, J= 13.6, 8.1, 5.8 Hz, 1H), 2.37 (ddd, J= 13.4, 6.1, 3.0 Hz, 1H)。 實例 21- 化合物 55 4- 胺基 -1-[(2R,4S,5R)-4- 羥基 -5-( 羥甲基 )-5- 異丙基氧雜環戊烷 -2- ] 嘧啶 -2- 酮之合成
步驟1:在0℃,氮氣氛圍下向(2R,3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(1 g,2.2 mmol)於THF (10 mL)之溶液中添加CH 3MgBr (7 mL,59.1 mmol)。將混合物在0℃下攪拌2 h。藉由在0℃下添加NH 4Cl (10 mL)來淬滅反應。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 20mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3x20 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。此得到呈淡黃色固體之1-[(2R,4S,5S)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(1-羥乙基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(1 g,2.2 mmol,粗品)。LC-MS (ES, m/z): 501 (M+H +)。
步驟2:在氮氣氛圍下向1-[(2R,4S,5S)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(1-羥乙基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(1 g,2.1 mmol)於二氯甲烷(15 mL,692.2 mmol)之溶液中添加戴斯-馬丁(4.7 g,10.9 mmol)。將混合物在30℃下攪拌隔夜。將所得混合物濃縮,用水稀釋,且用乙酸乙酯(3 x 40mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC純化殘餘物(石油醚:乙酸乙酯=3:1),得到呈淡黃色油狀物之1-[(2R,4S,5R)-5-乙醯基-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(695 mg,1.4 mmol,63.44%)。LC-MS (ES, m/z): 499 (M+H+)。
步驟3:在0℃,氮氣氛圍下向甲基三苯基溴化鏻(2.7 g,7.5 mmol)於THF (10 mL)之溶液中添加t-BuOK (0.8 g,6.7 mmol)。將混合物在0℃下攪拌1 h。在0℃下向以上混合物中添加1-[(2R,4S,5R)-5-乙醯基-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(375 mg,0.7 mmol)於THF (5 mL)中之溶液。將混合物在室溫下攪拌隔夜。藉由在0℃下添加NH 4Cl來淬滅反應。將所得混合物用二氯甲烷萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用石油醚:乙酸乙酯(3:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色油狀物之1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(丙-1-烯-2-基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(250 mg,0.5 mmol,66.93%)。LC-MS (ES, m/z): 497 (M+H +)。
步驟4:在氮氣氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-5-乙醯基-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(250 mg,0.5 mmol)於EtOH (5 mL)之溶液中添加Pd/C (33 mg,10%碳載鈀)。將該混合物在室溫,氫氣氛圍下攪拌2 h。過濾所得混合物;用甲醇(3x10 mL)洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液。此得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(丙-1-烯-2-基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(250 mg,0.5 mmol,粗品)。LC-MS (ES, m/z): 499 (M+H +)。
步驟5:向1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-異丙基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(250 mg,0.5 mmol)於CH 3CN (5 mL)之溶液中添加DMAP (122 mg,1.0 mmol)、TEA (101 mg,1.0 mmol)及2,4,6-參(丙-2-基)苯-1-磺醯氯(303 mg,1.0 mmol)且將混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌隔夜,隨後在室溫下逐滴添加NH 3.H 2O (1 mL)。將所得混合物在室溫下再攪拌30 min。在減壓下濃縮所得混合物。藉由用石油醚/乙酸乙酯(1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-異丙基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(150 mg,0.3 mmol,60.12%)。LC-MS (ES, m/z): 498 (M+H +)。
步驟6:在室溫,氮氣氛圍下向4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-異丙基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(150 mg,0.3 mmol)於MeOH (5 mL)之攪拌溶液中分批添加NH4F (669 mg,18.0 mmol)。將所得混合物在60℃下攪拌隔夜。將所得混合物冷卻至室溫且在減壓下濃縮。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(管柱:XBridge Prep OBD C18管柱,30*150 mm,5 μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3+0.1%NH 3.H 2O),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在8 min內3% B至25% B;波長:254/220 nm;RT1(min):7.2),得到呈灰白色固體之4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-異丙基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(17.9 mg,0.06 mmol,22.06%)。LC-MS (ES, m/z): 270 (M+H +) 97.6%純度。LCMS之條件:(管柱:Shim‐pack ScepterC18管柱,4.6*100 mm,4.5 μm;流動相A:水/5 mM NH4HCO3,流動相B:ACN;流率:1.50 mL/min;梯度:在8 min內5% B至95% B,在10 min內95% B至95% B,在10.5 min內95% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):2.500)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 7.94 (dd, J = 7.4, 1.5 Hz, 1H), 7.07 (d, J = 25.0 Hz, 2H), 6.17 (dd, J = 8.4, 5.8 Hz, 1H), 5.70 (dd, J = 7.3, 1.5 Hz, 1H), 5.06 (dd, J = 5.0, 1.5 Hz, 1H), 4.91 (t, J = 5.0 Hz, 1H), 4.28 (td, J = 5.2, 2.1 Hz, 1H), 3.52 (qd, J = 11.6, 5.0 Hz, 2H), 2.27 – 1.91 (m, 3H), 0.93 (dd, J = 9.1, 7.0 Hz, 6H)。 實例 22 :化合物 62: 4- 胺基 -1-[(2R,4S,5R)-4- 羥基 -5-( 羥甲基 )-5-(2,2,2- 三氟乙基 ) 氧雜環戊烷 -2- ] 嘧啶 -2- 酮之合成
步驟1:在0℃,氮氣氛圍下向(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-甲醛(6.2 g,15.6 mmol)及氟化銫(470 mg,3.1 mmol)於甲苯(150 mL)之攪拌溶液中添加三氟甲基-三甲基矽烷(8.9 g,62.4 mmol)。將混合物在室溫下攪拌18小時。將所得混合物用水稀釋且用乙酸乙酯(3x100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x200 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液,得到呈黃色油狀物之((R)-1-((3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-基)-2,2,2-三氟基乙氧基)三甲基矽烷(8.1 g,15 mmol,粗品)。LC-MS (ES, m/z): 541(M+H +)。
步驟2:在室溫,氮氣氛圍下向((R)-1-((3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-基)-2,2,2-三氟基乙氧基)三甲基矽烷(8.5 g,15.8 mmol)於四氫呋喃(100 mL)之攪拌溶液中逐滴添加TBAF於THF (19.6 mL,1.0 M)中之溶液。將混合物在室溫下攪拌20分鐘。將所得混合物用水稀釋且用乙酸乙酯(3x100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x200 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EA(3/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色油狀物之(R)-1-((3aR,5S,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-基)-2,2,2-三氟乙烷-1-醇(7.2 g,15.4 mmol,97.19%)。LC-MS (ES, m/z): 469(M+H +)。
步驟3:在0℃,氮氣氛圍下向(R)-1-((3aR,5S,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-基)-2,2,2-三氟乙烷-1-醇(7.2 g,15.4 mmo)及DMAP (7.5 g,61.5 mmol)於DCM (100 mL)之攪拌溶液中逐滴添加硫代氯甲酸苯酯(5.3 g,30.7 mmol)。將混合物在室溫下攪拌2小時。將所得混合物用水稀釋且用乙酸乙酯(3x100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x200 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EA(4/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色油狀物之O-苯基硫代碳酸O-((R)-1-((3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-基)-2,2,2-三氟乙酯)(8.55 g,14.2 mmol,92.01%)。LC-MS (ES, m/z): 605 (M+H +)。
步驟4:在室溫,氮氣氛圍下向O-苯基硫代碳酸O-((R)-1-((3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-基)-2,2,2-三氟乙酯)(6.6 g,10.8 mmol)及三丁基錫(18.9 g,65.0 mmol)於甲苯(150 mL)之攪拌溶液中添加AIBN (3.6 g,21.7 mmol)。將混合物在80℃下攪拌2小時。將所得混合物冷卻至室溫,用水稀釋且用乙酸乙酯(3x100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x200 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (5/2)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色油狀物之(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基-5-(2,2,2-三氟乙基)四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯(4 g,8.8 mmol,81.61%)。LC-MS (ES, m/z): 453(M+H +)。
步驟5:在0℃,氮氣氛圍下向(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基-5-(2,2,2-三氟乙基)四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯 (5 g,11.1 mmol)於乙酸(80 mL)之攪拌溶液中逐滴添加乙酸酐(15.8 g,154.7 mmol)及硫酸(54 mg,0.6 mmol)。將混合物在室溫下攪拌2小時。將所得混合物用水稀釋且用乙酸乙酯(3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2 x 200 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (4/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色油狀物之二乙酸(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-(2,2,2-三氟乙基)四氫呋喃-2,3-二酯(5.2 g,10.5 mmol,94.78%)。LC-MS (ES, m/z): 497(M+H +)。
步驟6:在0℃,氮氣氛圍下向1,2,3,4-四氫嘧啶-2,4-二酮(1.8 g,15.7 mmol)於ACN(150 mL)之攪拌溶液中分批添加(E)-(N-(三甲基矽烷基)伸乙基甲亞胺酸三甲基矽烷酯) (8.5 g,41.9 mmol)。將混合物在80℃下攪拌2小時。將混合物冷卻至室溫且添加二乙酸(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-(2,2,2-三氟乙基)四氫呋喃-2,3-二酯(5.2 g,10.5 mmol)於ACN (50 mL)中之溶液。然後在室溫,氮氣氛圍下添加三氟甲磺酸三甲基矽烷酯(3.7 g,16.8 mmol)。將混合物在80℃下攪拌15小時。將所得混合物冷卻至室溫,用水稀釋且用乙酸乙酯(3x100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x200 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (2/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之乙酸(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2-(2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-5-(2,2,2-三氟乙基)四氫呋喃-3-酯(3.94 g,7.2 mmol,68.58%)。LC-MS (ES, m/z): 549(M+H +)。
步驟7:在室溫,氮氣氛圍下向NH 3(g)於MeOH(7 M,50 mL)之攪拌溶液中添加乙酸(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2-(2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-5-(2,2,2-三氟乙基)四氫呋喃-3-酯(3.9 g,7.2 mmol)。將混合物在室溫下攪拌2小時且濃縮。藉由用PE/EA(5/3)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-[(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-3-羥基-5-(2,2,2-三氟乙基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(3.6 g,7.1 mmol 98.95%)。LC-MS (ES, m/z): 507(M+H +)。
步驟8:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-3-羥基-5-(2,2,2-三氟乙基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.8 g,3.6 mmol)及DMAP (1.7 g,14.2 mmol)於DCM (30 mL)之攪拌溶液中添加硫代氯甲酸苯酯(1.2 g,7.1 mmol)。將混合物在室溫下攪拌2小時。將所得混合物用水稀釋且用乙酸乙酯(3x100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x200 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (4/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色油狀物之1-[(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-3-[(苯氧基甲烷硫基)氧基]-5-(2,2,2-三氟乙基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.44 g,2.2 mmol,63.05%)。LC-MS (ES, m/z): 643(M+H +)。
步驟9:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-3-[(苯氧基甲烷硫基)氧基]-5-(2,2,2-三氟乙基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.4 g,2.2 mmol)及三丁基錫(3.9 g,13.4 mmol)於甲苯(20 mL)之攪拌溶液中分批添加AIBN (736 mg,4.5 mmol)。將混合物在90℃下攪拌2小時。將所得混合物冷卻至室溫,用水稀釋且用乙酸乙酯(3x100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x200 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (3/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(2,2,2-三氟乙基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(880 mg,1.8 mmol,80.07%)。LC-MS (ES, m/z): 491 (M+H +)。
步驟10:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(2,2,2-三氟乙基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(880 mg,1.8 mmol)及TEA (545 mg,5.4 mmol)於ACN (20 mL)之攪拌溶液中添加2,4,6-參(丙-2-基)苯-1-磺醯氯(1.1 g,3.6 mmol)。將混合物在室溫下攪拌15小時。然後添加氫氧化銨(4 mL),且將混合物在室溫下攪拌30分鐘。將所得混合物用水稀釋且用乙酸乙酯(3x100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x200 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用DCM/MeOH (20/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(2,2,2-三氟乙基)氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(730 mg,1.5 mmol,83.12%)。LC-MS (ES, m/z): 490 (M+H +)。
步驟11:在-78℃,氮氣氛圍下向4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(2,2,2-三氟乙基)氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(340 mg,0.7 mmol)於DCM (20 mL)之攪拌溶液中逐滴添加三氯化硼(10.4 mL,10.4 mmol,1.0 M於DCM中)。將混合物在室溫下攪拌2小時。藉由在0℃下添加TEA/MeOH溶液(1/2) (50 mL)來淬滅反應,然後濃縮。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化殘餘物:管柱,C18矽膠;流動相,含ACN之水,在15 min內0%至25%梯度;偵測器,UV 254 nm。藉由製備型HPLC在以下條件下再純化粗產物(管柱:XBridge Prep OBD C18管柱,30*150 mm,5μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3+0.1%NH 3.H 2O),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在8 min內4% B至28% B;波長:254/220 nm;RT1(min):6.82),得到呈灰白色固體之4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-(2,2,2-三氟乙基)氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(93.6 mg,0.3 mmol,42.18%)。LC-MS (ES, m/z): 310 (M+H +)。96.8 %純度。LCMS之條件:(管柱:Kinetex EVO C18,30*3.0 mm,2.6 μm;流動相A:水+5mMNH 4HCO 3,流動相B:乙腈;流率:1.50 mL/min;梯度:在1.20 min內0% B至95% B,95% B保持0.58 min,在0.05 min內95% B至10% B;波長:254 nm;RT1(min):0.619)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.79 (d, J= 7.5 Hz, 1H), 7.14 (d, J= 22.2 Hz, 2H), 6.19 (t, J= 6.7 Hz, 1H), 5.72 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 5.40 (d, J= 84.0 Hz, 2H), 4.35 (t, J= 5.1 Hz, 1H), 3.65 – 3.45 (m, 2H), 2.66 (dq, J= 15.6, 12.6 Hz, 1H), 2.48 – 2.29 (m, 1H), 2.25 – 1.98 (m, 2H)。 實例 23- 化合物 112 4- 胺基 -1-((2R,3S,4R,5R)-5- 乙炔基 -3- 氟基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- )-5- 氟基嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.5 g,3.7 mmol)於ACN (20 mL)之攪拌溶液中分批添加IBX (1.23 g,4.4 mmol)。將所得混合物在60℃下攪拌2 h,然後在室溫下冷卻且藉由過濾移除固體。將濾餅用MeCN洗滌且將合併之濾液在真空下濃縮,得到粗(2R,3R,4S,5R)-3-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-2-(羥甲基)四氫呋喃-2-甲醛(約1.3 g),其未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 407 (M+H +)。
步驟2:在室溫,氮氣氛圍下向(1-重氮基-2-側氧基丙基)膦酸二甲酯(665.5 mg,3.5 mmol)於ACN (10 mL)之攪拌溶液中分批添加K 2CO 3(870.5 mg,6.3 mmol)。隨後在室溫下逐滴添加(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-甲醛(1.28 g,3.1 mmol)於MeOH (10 mL)中之溶液。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜,然後藉由添加水來淬滅。將所得溶液用EtOAc萃取,用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由用石油醚/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-((2R,3S,4R,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-乙炔基-3-氟基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(410 mg,兩個步驟27.7%)。LC-MS (ES, m/z): 403 (M+H +)。
步驟3:在0℃,氮氣氛圍下向1-((2R,3S,4R,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-乙炔基-3-氟基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(410 mg,1.0 mmol)及咪唑(208.1 mg,3.1 mmol)於DMF (10 mL)之攪拌溶液中分批添加TBSCl (230.3 mg,1.5 mmol)。將所得混合物在室溫下再攪拌3小時,然後藉由添加水來淬滅。將所得溶液用EtOAc萃取,用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由用石油醚/EtOAc (2:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-((2R,3S,4R,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-5-乙炔基-3-氟基四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(280 mg,53.2%)。LC-MS (ES, m/z): 517 (M+H +)。
步驟4:在室溫,氮氣氛圍下向1-((2R,3S,4R,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-5-乙炔基-3-氟基四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(230 mg,0.5 mmol)、TEA (146.9 mg,1.5 mmol)及DMAP (118.2 mg,1.0 mmol)於CH 3CN (5 mL)之攪拌溶液中分批添加2,4,6-參(丙-2-基)苯-1-磺醯氯(293.1 mg,1.0 mmol)。在室溫下攪拌0.5小時後,向混合物中滴加氨(0.5 mL)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜且藉由添加水來淬滅。將所得溶液用EtOAc萃取,用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由製備型TLC(石油醚/EtOAc = 1:1)純化殘餘物,得到呈白色固體之4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-5-乙炔基-3-氟基四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮(130 mg,52.1%)。LC-MS (ES, m/z): 516 (M+H +)。
步驟5:向4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-5-乙炔基-3-氟基四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮(110 mg,0.3 mmol)於MeOH (5 mL)之攪拌溶液中添加NH 4F (140.0 mg,3.8 mmol)。將所得混合物在60℃下攪拌隔夜,然後冷卻至室溫且在真空下濃縮。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物:管柱:X Bridge Shield RP18 OBD管柱,19*250 mm,10μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:25 mL/min;梯度:在2 min內3% B至3% B,在7.5 min內3% B至15% B,15% B;波長:254 nm;RT1:7.07 min。此得到呈白色固體之4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-5-乙炔基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮(57.1 mg,78.9%)。LC-MS (ES, m/z): 288 (M+H +)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.96-7.90 (m, 2H), 7.70 (brs, 1H), 6.22 (s, 1H), 6.16 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 5.61 (d, J= 6.4 Hz, 1H), 5.17-5.04 (m, 1H), 4.39-4.33 (m, 1H), 3.72-3.68 (m, 2H), 3.61-3.57 (m, 1H)。 實例 24 :化合物 76 之合成
步驟1:在氮氣氛圍下向4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙炔基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(1.0 g,1.9 mmol)於20 mL EtOH之溶液中添加林德拉(Lindlar)催化劑(400.4 mg,1.9 mmol)。將混合物用氮氣噴射,置於氫氣(氣球)氛圍下,然後在室溫下攪拌隔夜。藉由過濾移除固體且在真空下濃縮濾液。藉由用石油醚/EtOAc (2:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(800 mg,79.69%)。LC-MS (ES, m/z): 518 (M+H +)。
步驟2:向4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-嘧啶-2-酮(800 mg,1.5 mmol)於MeOH之攪拌溶液中添加NH 4F (858.4 mg,23.2 mmol)。將所得混合物在60℃下攪拌隔夜,然後冷卻至室溫且藉由過濾移除固體。用MeOH洗滌濾餅且將合併之濾液在真空下濃縮。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化殘餘物:管柱,C18矽膠;流動相,含MeCN之水(0.1% TFA),在15 min內5%至20%梯度;在254 nm下UV偵測。此得到呈黃色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-乙烯基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(300 mg,純度:90%)。藉由製備型HPLC在以下條件下進一步純化100 mg粗固體:管柱,XBridge Shield RP18 OBD管柱,19*250 mm,10μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:25 mL/min;梯度:在6.5 min內3% B至20% B,20% B;波長:254 nm。冷凍乾燥隔夜後,獲得呈白色固體之所需4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-乙烯基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(56.3 mg)。LC-MS (ES, m/z): 290 (M+H +)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 8.17 (d, J = 7.2 Hz, 1H), 7.88 (s, 1H), 7.64 (s, 1H), 6.14-6.11 (m, 1H), 6.04 (d, J = 5.2 Hz, 1H), 5.97-5.90 (m, 1H), 5.53 (t, J = 5.6 Hz, 1H), 5.41-5.32 (m, 1H), 5.26-5.23 (m, 1H), 5.03-5.00 (m, 0.5H), 4.89-4.87 (m, 0.5H), 4.48-4.42 (m, 1H), 3.55-3.51 (m, 1H), 3.39-3.36 (m, 1H)。 實例 25- 化合物 77 4- 胺基 -1-[(2R,3S,4R,5R)-5- 乙基 -3- 氟基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 氧雜環戊烷 -2- ]-5- 氟基嘧啶 -2- 酮之合成
步驟1:在氮氣氛圍下向4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-乙烯基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(200 mg,0.7 mmol)於5 mL MeOH之溶液中添加Pd/C (10%, 100 mg)。將混合物用氮氣脫氣,置於氫氣(氣球)氛圍下,然後在室溫下攪拌隔夜。藉由過濾移除固體且在真空下濃縮濾液。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物:管柱:X Bridge Shield RP18 OBD管柱,19*250 mm,10μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:25 mL/min;梯度:在6 min內5% B至30% B,30% B;波長:254 nm。冷凍乾燥隔夜後,獲得呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-乙基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(51.6 mg,25.6%)。LC-MS (ES, m/z): 292 (M+H +)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.07 (d, J= 6.8 Hz, 1H), 7.84 (s, 1H), 7.60 (s, 1H), 6.12-6.04 (m, 1H), 5.81 (d, J= 4.4 Hz, 1H), 5.25 (brs, 1H), 5.16 (s, 0.5H), 5.03 (s, 0.5H), 4.34-4.29 (m, 1H), 3.58-3.52 (m, 1H), 3.42-3.40 (m, 1H), 1.65-1.61 (m, 1H), 1.59-1.48 (m, 1H), 0.86 (t, J= 7.6 Hz, 3H)。 實例 26- 化合物 65 4- 胺基 -1-[(2R,4S,5R)-5-( 二氟甲基 )-4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 氧雜環戊烷 -2- ]-5- 氟基嘧啶 -2- 酮之合成
步驟1:在室溫,氮氣氛圍下向5-氟基胞嘧啶(2 g,16.1 mmol)於ACN(50 mL)之攪拌混合物中分批添加(E)-(N-(三甲基矽烷基)伸乙基甲亞胺酸三甲基矽烷酯) (8.8 g,43.0 mmol)。將所得混合物在80℃下攪拌2 h。然後在0℃,氮氣氛圍下向以上混合物中添加乙酸(2R,3R,4S,5R)-2-(乙醯基氧基)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(二氟甲基)氧雜環戊烷-3-酯(5 g,10.7 mmol)及TMSOTf (4.8 g,21.5 mmol)。將所得混合物在80℃下再攪拌3 h。將反應冷卻至室溫且在0℃下用飽和NH 4Cl(水溶液)淬滅。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 40mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3x40 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用二氯甲烷/甲醇(10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之乙酸(2R,3R,4S,5R)-2-(4-胺基-5-氟基-2-側氧基嘧啶-1(2H)-基)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-(二氟甲基)四氫呋喃-3-酯(2.8 g,5.2 mmol,60.94%)。LC-MS (ES, m/z): 534 (M+H +)。
步驟2:在室溫下向NH 3(g)於MeOH (20 mL,7.0 M)之溶液中添加乙酸(2R,3R,4S,5R)-2-(4-胺基-5-氟基-2-側氧基嘧啶-1(2H)-基)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-(二氟甲基)四氫呋喃-3-酯(2.8 g,5.2 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。在減壓下濃縮所得混合物。藉由用二氯甲烷/甲醇(10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(二氟甲基)-3-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(2.2 g,4.5 mmol,85.29%)。LC-MS (ES, m/z): 492 (M+H +)。
步驟3:在室溫,氮氣氛圍下向4-胺基-1-[(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(二氟甲基)-3-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(500 mg,1.0 mmol)於二氯甲烷(5 mL)之攪拌混合物中添加硫代氯甲酸苯酯(210 mg,1.2 mmol)及DMAP (497 mg,4.0 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌2 h。在減壓下濃縮所得混合物。藉由用二氯甲烷/甲醇(10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(二氟甲基)-3-[(苯氧基-甲烷硫基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(340 mg,0.5 mmol,53.25%)。LC-MS (ES, m/z): 628 (M+H +)。
步驟4:在室溫,氮氣氛圍下向4-胺基-1-[(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(二氟甲基)-3-[(苯氧基甲烷硫基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(340 mg,0.5 mmol)於甲苯(8 mL)之攪拌溶液中添加AIBN (178 mg,1.0 mmol)及三丁基錫烷(942 mg,3.2 mmol)。將所得混合物在90℃下攪拌2 h。將所得混合物冷卻至室溫且在減壓下濃縮。藉由用二氯甲烷/甲醇(10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(二氟甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(180 mg,0.4 mmol,69.88%)。LC-MS (ES, m/z): 476 (M+H +)。
步驟5:在-78℃,氮氣氛圍下向4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(二氟甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(180 mg,0.3 mmol)於DCM (5 mL)之攪拌混合物中逐滴添加三氯化硼(0.9 mL,1.0 M於DCM中)。將所得混合物在-78℃下攪拌2 h。藉由在-78℃下添加甲醇來淬滅反應。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物 (管柱:XBridge Shield RP18 OBD管柱,19*250 mm,10μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:25 mL/min;梯度:在3 min內5% B至16% B,在7 min內16% B至19% B;波長:254 nm),得到呈灰白色固體之4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-5-(二氟甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(15 mg,0.05 mmol,13.42%)。LC-MS (ES, m/z): 296 (M+H +)。98.1 %純度。HPLC之條件:(管柱:Shim‐pack ScepterC18管柱,4.6*100 mm,4.5μm;流動相A:水/5 mM NH 4HCO 3,流動相B:ACN;流率:1.50 mL/min;梯度:在8 min內5% B至95% B,在10 min內95% B至95% B,在10.5 min內95% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):2.500)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 8.22 – 7.96 (m, 1H), 7.86 (d, J = 31.0 Hz, 1H), 7.68 – 7.45 (m, 1H), 6.43 – 6.25 (m, 1H), 6.08 (t, J = 54.6 Hz, 1H), 5.80 – 5.53 (m, 1H), 5.49 – 5.37 (m, 1H), 4.77 – 4.34 (m, 1H), 3.85 – 3.44 (m, 2H), 2.22 (t, J = 6.2 Hz, 2H)。 實例 27- 化合物 63 2- 胺基 -9-[(2R,3S,4R,5R)-5- 乙烯基 -3- 氟基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 氧雜環戊烷 -2- ]-1H- 嘌呤 -6- 酮之合成
步驟1:在室溫,氮氣氛圍下向2-胺基-9-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-1H-嘌呤-6-酮(13 g,45.5 mmol)及咪唑(23 g,341.8 mmol)於吡啶(250 ml)之攪拌溶液中分批添加TBSCl (17 g,113.9 mmol)。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌隔夜。將所得混合物用水(1000 mL)稀釋。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 500 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 500 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用石油醚/乙酸乙酯(1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之2-胺基-9-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-1H-嘌呤-6-酮(23 g,44.8 mmol,98.23%)。LC-MS (ES, m/z): 514(M+H +)。
步驟2:在60℃,氮氣氛圍下將2-胺基-9-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-1H-嘌呤-6-酮(23 g,44.7 mmol)及AcOH (210 mL)於THF (105 ml)及H 2O (70 mL)中之溶液攪拌隔夜。將所得混合物用水(500 mL)稀釋。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 500 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 500 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用石油醚/乙酸乙酯(1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之2-胺基-9-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-1H-嘌呤-6-酮(17 g,42.6 mmol,95.05%)。LC-MS (ES, m/z): 400 (M+H +)。
步驟3:在室溫,氮氣氛圍下將2-胺基-9-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-1H-嘌呤-6-酮(17 g,42.5 mmol)於吡啶(300 ml)中之溶液用Ac 2O (6.5 g,63.8 mmol)處理隔夜,隨後在室溫下分批添加1-(氯基二苯基甲基)-4-甲氧基苯(39.4 g,127.6 mmol)及AgNO 3(21.6 g,127.6 mmol)。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌隔夜。將所得混合物用水(500 mL)稀釋。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 500 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 500 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用二氯甲烷/甲醇(20:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之乙酸[(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-6-側氧基-1H-嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-基]甲酯(23.8 g,33.3 mmol,78.35%)。LC-MS (ES, m/z): 714 (M+H +)。
步驟4:向NH 3(g)於MeOH (238 mL,7 M)之溶液中添加乙酸[(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-6-側氧基-1H-嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-基]甲酯(24 g,33.3 mmol)且在室溫,氮氣氛圍下攪拌隔夜。在減壓下濃縮所得混合物。藉由用二氯甲烷/甲醇(20:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之9-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(10.4 g,15.4 mmol,46.43%)。LC-MS (ES, m/z): 672 (M+H +)。
步驟5:在60℃,氮氣氛圍下將9-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(10 g,15.4 mmol)及IBX (5.6 g,20.1 mmol)於乙腈(200 ml)中之混合物攪拌2 h。將所得混合物冷卻至室溫,過濾且用乙腈(3 x 200 mL)洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 670 (M+H +)。
步驟6:向(2S,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-6-側氧基-1H-嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(10 g,15.5 mmol)於二噁烷(200 ml)及H 2O (40 mL)之溶液中添加多聚甲醛(5.5 g,62.1 mmol)及NaOH (931 mg,23.2 mmol)且在室溫,氮氣氛圍下攪拌隔夜,隨後在0℃下分批添加NaBH 4(3.5 g,93.1 mmol)。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌1 h。將所得混合物用冰水(500 mL)淬滅。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 500 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 500 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用二氯甲烷/甲醇(20:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之9-[(2R,3S,4R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(6.5 g,9.2 mmol,59.65%)。LC-MS (ES, m/z): 702 (M+H +)。
步驟7:在室溫,氮氣氛圍下將9-[(2R,3S,4R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(1.3 g,1.8 mmol)及1-[氯(4-甲氧基苯基)苯基甲基]-4-甲氧基苯(627 mg,1.8 mmol)於二氯甲烷(20 ml)及吡啶(5 mL)中之溶液攪拌2 h。將所得混合物用水(100 mL)稀釋。將所得混合物用二氯甲烷(3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 100 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用二氯甲烷/甲醇(25:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之9-[(2R,3S,4R,5S)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(1 g,0.9 mmol,53.76%)。LC-MS (ES, m/z): 1004 (M+H +)。
步驟8:在室溫,氮氣氛圍下向9-[(2R,3S,4R,5S)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(950 mg,0.9 mmol)及AgNO 3(321 mg,1.8 mmol)於吡啶(20 ml)之攪拌混合物中逐滴添加TBDPSCl (520 mg,1.8 mmol)。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌2 h。將所得混合物用水(100 mL)稀釋且用乙酸乙酯(3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 100 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用二氯甲烷/甲醇(40:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之9-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(1.1 g,0.8 mmol,93.58%)。LC-MS (ES, m/z): 1243 (M+H +)。
步驟9:在78℃,氮氣氛圍下向9-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(1.1 g,0.8 mmol)於二氯甲烷(15 ml)之攪拌溶液中逐滴添加二氯乙酸(0.5 mL)。在-10℃,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌2 h。將所得混合物用冰水(100 mL)淬滅。將所得混合物用二氯甲烷(3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 100 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用二氯甲烷/甲醇(30:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之9-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(400 mg,0.4 mmol,48.06%)。LC-MS (ES, m/z): 940 (M+H +)。
步驟10:向9-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(350 mg,0.3 mmol)於二氯甲烷(10 ml)之溶液中分批添加戴斯-馬丁(394 mg,0.9 mmol)且在室溫,氮氣氛圍下攪拌4 h。過濾所得混合物且用二氯甲烷(3 x 10 mL)洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 938 (M+H +)。
步驟11:向甲基三苯基溴化鏻(371 mg,1.0 mmol)於四氫呋喃(10 ml)之溶液中添加n-BuLi (0.1 ml,1.0 mmol,2.5 M於THF中)且在-78℃,氮氣氛圍下攪拌1 h。然後在0℃下逐滴添加(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}-4-氟基-5-(2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-6-側氧基-1H-嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(325 mg,0.3 mmol)於四氫呋喃(10 ml)中之溶液。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌隔夜。將所得混合物用冰水(100 mL)淬滅。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 100 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC(二氯甲烷/甲醇20:1)純化殘餘物,得到呈白色固體之9-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(200 mg,0.2 mmol,61.67%)。LC-MS (ES, m/z): 936 (M+H +)。
步驟12:在60℃,氮氣氛圍下將9-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(180 mg,0.1 mmol)及NH 4F (167 mg,4.5 mmol)於甲醇(5 ml)中之混合物攪拌隔夜將所得混合物冷卻至室溫,過濾且用甲醇(3 x 5 mL)洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC(二氯甲烷/甲醇10:1)純化殘餘物,得到呈白色固體之9-[(2R,3S,4R,5R)-5-乙烯基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(60 mg,0.1 mmol,53.48%)。LC-MS-PH-ROF-RT-0503-12 (ES, m/z): 584 (M+H +)。
步驟13:在室溫,氮氣氛圍下將9-[(2R,3S,4R,5R)-5-乙烯基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(55 mg,0.1 mmol)於HCOOH (0.8 mL) 及水(0.2 ml)中之溶液攪拌2 h。將所得混合物在真空下濃縮。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(管柱:XBridge Prep OBD C18管柱,30*150 mm,5μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3+0.1%NH 3.H 2O),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在8 min內3% B至16% B;波長:254/220 nm;RT1(min):6.92),得到呈白色固體之2-胺基-9-[(2R,3S,4R,5R)-5-乙烯基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-1H-嘌呤-6-酮(7.7 mg,26.01%)。LC-MS (ES, m/z): 312(M+H +)。99.1%純度。LCMS之條件:(管柱:Kinetex EVO C18 ‐100A,30*3.0 mm,2.6 μm;流動相A:水/6.5mM NH 4HCO 3,流動相B:乙腈;流率:1.2000 mL/min;梯度:在1.20 min內5% B至95% B,在1.80 min內95% B至95% B,在1.82 min內95% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):0.310)。 1H NMR (300 MHz, DMSO- d 6) δ 9.68 (s, 1H), 7.92 (s, 1H), 6.52 (s, 2H), 6.26-5.85 (m, 3H), 5.48-4.91 (m, 4H), 4.67 (d, J = 21.1 Hz, 1H), 3.53 (s, 1H), 3.44-3.37 (m, 1H)。 實例 28- 化合物 68 2- 胺基 -9-((2R,3S,4R,5R)-5- 乙基 -3- 氟基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- )-1,9- 二氫 -6H- 嘌呤 -6- 酮之合成
步驟1:向9-[(2R,3S,4R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(1 g,1.4 mmol)於乙腈(100 ml)之混合物中分批添加IBX (598 mg,2.1 mmol),且在室溫,氮氣氛圍下攪拌隔夜。過濾所得混合物;用乙腈(3 x 20 mL)洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 700 (M+H +)。
步驟2:在室溫,氮氣氛圍下向(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-2-(羥甲基)-5-(2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-6-側氧基-1H-嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(1 g,1.4 mmol)及K 2CO 3(592 mg,4.2 mmol)於甲醇(20 ml)之攪拌混合物中添加(1-重氮基-2-側氧基丙基)膦酸二甲酯(549 mg,2.8 mmol)且在室溫,氮氣氛圍下攪拌隔夜。在減壓下濃縮所得混合物。藉由用二氯甲烷/甲醇(20:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之9-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-乙炔基-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(380 mg,0.5 mmol,38.22%)。LC-MS (ES, m/z): 696 (M+H +)。
步驟3:在室溫,氫氣氛圍下將9-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-乙炔基-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(370 mg,0.5 mmol)及Pd/C (37 mg,0.3 mmol,10%於碳上)於甲醇(10 ml)中之混合物攪拌隔夜。過濾所得混合物;用甲醇(3 x 10 mL)洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液。此得到呈白色固體之9-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-乙基-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(350 mg,0.5 mmol,粗品)。LC-MS (ES, m/z): 700 (M+H +)。
步驟4:在60℃,在氮氣氛圍下將9-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-乙基-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(340 mg,0.4 mmol)及NH 4F (422 mg,11.4 mmol)於甲醇(10 ml)中之混合物攪拌隔夜。將所得混合物冷卻至室溫,過濾;用甲醇(3 x 10 mL)洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC (二氯甲烷/甲醇10:1)純化殘餘物,得到呈白色固體之9-[(2R,3S,4R,5R)-5-乙基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(140 mg,0.2 mmol,49.21%)。LC-MS (ES, m/z): 586 (M+H +)。
步驟5:在室溫,氮氣氛圍下將9-[(2R,3S,4R,5R)-5-乙基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(130 mg,0.2 mmol)於乙酸(1.6 mL)及水(0.4 ml)中之溶液攪拌隔夜。將所得混合物在真空下濃縮。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(管柱:XBridge Shield RP18 OBD管柱,19*250 mm,10μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:25 mL/min;梯度:在6 min內5% B至30% B;波長:254 nm),得到呈白色固體之 2-胺基-9-((2R,3S,4R,5R)-5-乙基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-1,9-二氫-6H-嘌呤-6-酮(30.1 mg,0.1 mmol,42.94%)。LC-MS (ES, m/z): 314(M+H +)。99.2%純度。HPLC之條件:(管柱:Xselect HSS T3,100*4.6 mm,3.5 μm;流動相A:水/0.05%TFA,流動相B:MeOH;流率:1.2000 mL/min;梯度:在8.00 min內5% B至95% B,在10.00 min內95% B至95% B,在10.50 min內90% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):3.78)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.23 (s, 1H), 7.85 (s, 1H), 6.55 (s, 2H), 6.15 (dd, J = 13.7, 4.7 Hz, 1H), 5.89 (s, 1H), 5.20 (dt, J = 53.4, 4.7 Hz, 2H), 4.54 (dd, J = 19.7, 4.4 Hz, 1H), 3.49 (q, J = 11.8 Hz, 2H), 1.60 (ddq, J = 43.7, 14.9, 7.5 Hz, 2H), 0.89 (t, J = 7.5 Hz, 3H)。 實例 29- 化合物 69 2- 胺基 -9-((2R,4S,5R)-4- 羥基 -5-( 羥甲基 )-5- 乙烯基四氫呋喃 -2- )-1,9- 二氫 -6H- 嘌呤 -6- 酮之合成
步驟1:在室溫,氮氣氛圍下向2-去氧鳥苷(20 g,74.8 mmol)及咪唑(20.4 g,299.3 mmol)於吡啶(300 mL)之攪拌溶液中分批添加TBSCl (45.1 g,299.3 mmol)。將溶液在室溫下攪拌12 h。將所得混合物在真空下濃縮,用水稀釋且用乙酸乙酯(3x300 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x300 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。此得到呈白色固體之2-胺基-9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-1H-嘌呤-6-酮(36 g,72.7 mmol,粗品)。LC-MS (ES, m/z): 496 (M+H +)。
步驟2:向1L圓底燒瓶中添加2-胺基-9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-1H-嘌呤-6-酮(30 g,48.4 mmol)於THF (200 mL)及H 2O (100 mL),在0℃下添加TFA (100 mL) 且攪拌1h。將所得混合物在真空下濃縮。將混合物用水稀釋且用乙酸乙酯(3x300 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x300 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (20:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之2-胺基-9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-1H-嘌呤-6-酮(13 g,34.1 mmol,63.3%)。LC-MS (ES, m/z): 382 (M+H +)。
步驟3:在室溫,氮氣氛圍下將2-胺基-9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-1H-嘌呤-6-酮(13 g,34.1 mmol)及Ac 2O (5.2 g,51.1 mmol)於吡啶(200 mL)中之混合物攪拌6h。在室溫下向以上混合物中添加AgNO 3(17.4 g,102.2 mmol)及1-(氯基二苯基甲基)-4-甲氧基苯(31.6 g,102.2 mmol)。將所得混合物在室溫下再攪拌6h。然後添加冰水以淬滅反應。將所得混合物在真空下濃縮。將所得混合物用乙酸乙酯(300 mL)稀釋且用鹽水(3x100 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。此得到呈黃色固體之乙酸[(2R,3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-6-側氧基-1H-嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-基]甲酯(25 g,25.1 mmol,粗品)。LC-MS (ES, m/z): 696 (M+H +)。
步驟4:向500 mL圓底燒瓶中添加含乙酸[(2R,3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-6-側氧基-1H-嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-基]甲酯(25 g,25.1 mmol)之MeOH (150 mL),然後添加NH 3(g)於MeOH (105.0 mL,7.0 M)中之溶液且在室溫下攪拌2 h。將所得混合物在真空下濃縮。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (15:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(7 g,10.7 mmol,40.4%)。LC-MS (ES, m/z): 654 (M+H +)。
步驟5:在室溫下向250 mL圓底燒瓶中添加含9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(7 g,10.7 mmol)及IBX (9 g,32.1 mmol)之CH 3CN (100 mL)。將混合物在60℃、氮氣氛圍下攪拌2 h,然後冷卻至室溫。將沉澱之固體過濾且用CH 3CN (3x50 mL)洗滌。將所得濾液在真空下濃縮。此得到呈白色固體之(2S,3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-6-側氧基-1H-嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(4.7 g,7.2 mmol,粗品)。LC-MS (ES, m/z): 652 (M+H +)。
步驟6:在室溫,氮氣氛圍下將(2S,3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-6-側氧基-1H-嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(4.7 g,7.2 mmol)及多聚甲醛(1.1 g,36.1 mmol)於二噁烷(60 mL)及H 2O (6 mL)中之溶液攪拌12 h。在0℃下向以上混合物中分批添加NaBH 4(0.8 g,21.6 mmol)且在0℃下再攪拌1 h。在0℃下將反應用飽和NH 4Cl (水溶液)來淬滅。將所得混合物用EtOAc (3x100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x100 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之9-[(2R,4S)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(1.5 g,2.12 mmol,28.6%)。LC-MS (ES, m/z): 684 (M+H +)。
步驟7:在室溫,氮氣氛圍下將9-[(2R,4S)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(700 mg,1.02 mmol)及IBX (1146.5 mg,4.1 mmol)於ACN (10 mL) 中之溶液12 h。過濾所得混合物;用ACN (3x10 mL)洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液。此得到呈白色固體之(2R,3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-(羥甲基)-5-(2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-6-側氧基-1H-嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(700 mg,0.001 mmol,粗品)。LC-MS (ES, m/z): 682 (M+H +)。
步驟8:在0℃,氮氣氛圍下將(2R,3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-(羥甲基)-5-(2-{[(4-甲氧基苯基)二苯甲基]胺基}-6-側氧基-1H-嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(700 mg,1.02 mmol)、K 2CO 3(425.6 mg)及(1-重氮基-2-側氧基丙基)膦酸二甲酯(394.4 mg,2.05 mmol)於MeOH (10 mL)中之混合物 攪拌2 h。將所得混合物在真空下濃縮。藉由製備型TLC(CH 2Cl 2/MeOH 15:1)純化殘餘物,得到呈黃色固體之9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-乙炔基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(420 mg,0.6 mmol,54.9%)。LC-MS (ES, m/z): 678 (M+H +)。
步驟9:在室溫,氫氣氛圍下將9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-乙炔基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(420 mg,0.6 mmol)及林德拉催化劑(12.8 mg,0.06 mmol)於EtOH (5 mL)中之混合物攪拌12 h。LCMS顯示反應完成。過濾出固體,然後在真空下濃縮過濾。藉由製備型TLC (CH 2Cl 2/MeOH 15:1)純化殘餘物,得到呈黃色固體之9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-乙烯基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(410 mg,0.6 mmol,87.6%)。LC-MS (ES, m/z): 680 (M+H +)。
步驟10:在60℃,氮氣氛圍下將9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-乙烯基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(400 mg,0.6 mmol)及NH 4F (653 mg,17.6 mmol)於MeOH (10 mL)中之溶液 攪拌4 h。將所得混合物冷卻至室溫且在真空下濃縮。藉由製備型TLC(CH 2Cl 2/MeOH 10:1)純化殘餘物,得到呈白色固體之9-[(2R,4S,5R)-5-乙烯基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(150 mg,0.25 mmol,40.6%)。LC-MS (ES, m/z): 566 (M+H +)。
步驟11:在室溫,氮氣氛圍下將9-[(2R,4S,5R)-5-乙烯基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(70 mg,0.1 mmol)於AcOH (2 mL)及H 2O (0.5 mL)中之混合物攪拌24h。將所得混合物在真空下濃縮。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(2#SHIMADZU (HPLC-01)):管柱,XBridge Shield RP18 OBD管柱,19*250 mm,10µm;流動相,水(10 mmol/L NH 4HCO 3)及ACN (在5.5 min內5% ACN直到20%;在254 nm下UV偵測。將含有產物之級分合併且冷凍乾燥隔夜,得到呈白色固體之2-胺基-9-[(2R,4S,5R)-5-乙烯基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-1H-嘌呤-6-酮(13 mg,0.04 mmol,35.71%)。LC-MS (ES, m/z): 294 (M+H +)。LCMS之條件:(管柱:HALO C18,30*3 mm,3 μm;流動相A:水/0.05%TFA,流動相B:ACN/0.05%TFA;流率:1.50 mL/min;梯度:在1.20 min內5% B至100% B,在1.80 min內100% B至100% B,在1.82 min內100% B至5% B,在2.00 min內5% B至5% B;波長:254 nm)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.67 (s, 1H), 7.98 (s, 1H), 6.50 (s, 2H), 6.16 – 6.08 (m, 1H), 5.97 (dd, J = 17.3, 10.9 Hz, 1H), 5.42 – 5.08 (m, 4H), 4.59 (q, J = 6.0 Hz, 1H), 3.51 (dd, J = 11.8, 5.6 Hz, 1H), 3.42 (dd, J = 11.8, 4.9 Hz, 1H), 2.46 (dt, J = 12.0, 5.7 Hz, 1H), 2.21 (dt, J = 13.3, 6.9 Hz, 1H)。 實例 30- 化合物 64 (2R,3S,5R)-5-(6- 胺基 -2- 氟基 -9H- 嘌呤 -9- )-2- 乙基 -2-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -3- 醇之合成
步驟1:在室溫,氮氣氛圍下向[(2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]甲醇(1 g,1.5 mmol)於ACN (20 mL)之攪拌溶液中分批添加IBX (1.2 g,4.5 mmol)。在60℃,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌2h。過濾所得混合物;用ACN洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液,得到呈白色固體之(2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-甲醛(940 mg,1.4 mmol,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS: (ES, m/z): 650 (M+H +)。
步驟2:在室溫,氮氣氛圍下向三級丁氧基鉀(568 mg,5.1 mmol)於四氫呋喃(5 mL)之攪拌溶液中分批添加甲基三苯基溴化鏻(2.1 g,5.7 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌1h。在室溫下向以上混合物中逐滴添加(2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-甲醛(940 mg,1.4 mmol)於四氫呋喃(5 mL)中之溶液。將混合物在室溫下攪拌15h。將所得混合物用冰水淬滅且用EA萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用石油醚/乙酸乙酯(1/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基氧雜環戊烷-2-基]-2-氟基嘌呤-6-胺(570 mg,0.88 mmol,60.83%)。LC-MS: (ES, m/z): 648 (M+H +)。
步驟3:在室溫,氮氣氛圍下向9-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基氧雜環戊烷-2-基]-2-氟基嘌呤-6-胺(520 mg,0.81 mmol)於四氫呋喃(10 mL)之攪拌溶液中逐滴添加TBAF於THF (1.2 mL,1.0 M)中之溶液。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌15h。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型TLC (二氯甲烷/甲醇=10/1)純化殘餘物,得到粗產物,且進一步藉由用二氯甲烷/甲醇(5/1)溶析之矽膠管柱層析法純化。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化殘餘物:管柱,C18矽膠;流動相,含NaHCO 3(5 M)之ACN,在15 min內10%至50%梯度;偵測器,UV 254 nm,得到呈灰白色固體之(2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基-9H-嘌呤-9-基)-2-(羥甲基)-2-乙烯基四氫呋喃-3-醇(180 mg,0.6 mmol,74.07%)。LC-MS: (ES, m/z): 296 (M+H +)。
步驟4:在室溫,氮氣氛圍下向(2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基-9H-嘌呤-9-基)-2-(羥甲基)-2-乙烯基四氫呋喃-3-醇(180 mg,0.6 mmol)於甲醇(5 mL)之攪拌溶液中添加10%碳載鈀(36 mg)。在室溫,氫氣氛圍下將所得混合物攪拌1h。過濾所得混合物;用MeOH洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物:管柱:SunFire Prep C18 OBD管柱,19×150 mm,5 ums;流動相A:水(0.1% NH 4HCO 3+0.1%NH 3 .H 2O),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在7 min內30 B至60 B;偵測器,UV 254/210 nm;收集含有產物之級分,在旋轉蒸發器上在減壓下部分蒸發,且冷凍乾燥隔夜,得到呈白色固體之(2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-2-乙基-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-3-醇(91.5 mg,0.31 mol,51.69%)。LC-MS: (負模式,ES, m/z): 296 [M-H] -。98.9%純度(M+H +)。LCMS之條件:(管柱:Kinetex EVO C18, 33*3 mm,2.6 μm;流動相A:水/5mM NH 4HCO 3,流動相B:乙腈;流率:1.5000 mL/min;梯度:在1.20 min內10% B至95% B,在1.78 min內95% B至95% B,在1.83 min內95% B至10% B;波長:254 nm;RT1(min):0.539)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.33 (s, 1H), 7.83 (s, 2H), 6.19 (dd, J= 7.5, 6.2 Hz, 1H), 5.17 (d, J= 4.9 Hz, 1H), 4.92 (t, J= 5.6 Hz, 1H), 4.45 – 4.36 (m, 1H), 3.50 (dd, J= 11.5, 5.3 Hz, 1H), 3.41 (dd, J= 11.5, 6.0 Hz, 1H), 2.81 (ddd, J= 13.4, 7.6, 5.9 Hz, 1H), 2.28 (ddd, J= 13.3, 6.2, 3.4 Hz, 1H), 1.60 (ddq, J= 29.0, 14.6, 7.3 Hz, 2H), 0.88 (t, J= 7.5 Hz, 3H)。 19F NMR (376 MHz, DMSO-d6) δ-15.15)。 實例 31- 化合物 72 4- 胺基 -5- 氟基 -1-((2R,3S,4S,5R)-5-( 氟甲基 )-3,4- 二羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- ) 嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在0℃,氮氣氛圍下,在15分鐘內向((3aR,6S,6aR)-6-(苄氧基)-2,2-二甲基-四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5,5-二基)二甲醇(40 g,128.9 mmol)於四氫呋喃(1000 mL)之攪拌溶液中分批添加NaH (5.2 g,128.9 mmol)。將混合物在0℃下攪拌15分鐘。然後,添加含溴甲苯(22 g,128.9 mmol)之四氫呋喃(100 mL)且在20℃下攪拌15分鐘。藉由在0℃下添加飽和NH 4Cl (1000 mL)來淬滅反應。將所得混合物用乙酸乙酯(3x1000 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x200 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EA (4/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色油狀物之((3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-基)甲醇(29.5 g,73.8 mmol,57.15%)。LC-MS (ES, m/z): 401 (M+H +)。
步驟2:在0℃,氮氣氛圍下,在15分鐘內向((3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-基)甲醇(5 g,12.4 mmol)於甲苯(200 mL)之攪拌溶液中分批添加DAST (4 g,25 mmol)。將混合物在60℃下攪拌5分鐘。將反應冷卻至室溫,藉由在0℃下添加飽和NaHCO 3(水溶液)(300 mL)來淬滅。將所得混合物用水稀釋且用乙酸乙酯(3x100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x200 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EA (4/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈深黃色油狀物之(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-(氟甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯(3.91 g,9.7 mmol,77.81%)。LC-MS (ES, m/z): 403 (M+H +)。
步驟3:在0℃,氮氣氛圍下,在5分鐘內向(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-(氟甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯(3.9 g,9.7 mmol)於乙酸(100 mL)之攪拌溶液中逐滴添加乙酸酐(13.9 g,136 mmol)及硫酸(0.5 mL)。將混合物在室溫下攪拌2小時。將所得混合物用水稀釋且用乙酸乙酯(3x100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x200 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (3/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色油狀物之二乙酸(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-(氟甲基)四氫呋喃-2,3-二酯(2.91 g,6.5 mmol,67.09%)。LC-MS (ES, m/z): 447 (M+H +)。
步驟4:在0℃,氮氣氛圍下向氟尿嘧啶(857 mg,6.6 mmol)於ACN(30 mL)之攪拌溶液中分批添加(E)-(N-(三甲基矽烷基)伸乙基甲亞胺酸三甲基矽烷酯) (3.6 g,17.6 mmol)。將混合物在80℃下攪拌1小時。將混合物冷卻至室溫且添加含二乙酸(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-(氟甲基)四氫呋喃-2,3-二酯(2 g,4.4 mmol)之ACN (30 mL)。然後在室溫,氮氣氛圍下添加三氟甲磺酸三甲基矽烷酯(1.6 g,7 mmol)。將混合物在80℃下攪拌2小時。將所得混合物冷卻至室溫,用水稀釋且用乙酸乙酯(3x100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x200 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (3/2)稀釋之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之乙酸(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-5-(氟甲基)四氫呋喃-3-酯(900 mg,1.7 mmol,39.69%)。LC-MS (ES, m/z): 517 (M+H +)。
步驟5:在室溫,氮氣氛圍下向NH 3(g)於MeOH (10 mL,7.0 M)之攪拌溶液中添加乙酸(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-5-(氟甲基)四氫呋喃-3-酯(895 mg,1.7 mmol)。將混合物在室溫下攪拌2小時。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型TLC(PE/EtOAc = 1/2)純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之1-[(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氟甲基)-3-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(610 mg,1.3 mmol,74.20%)。LC-MS (ES, m/z): 475 (M+H +)。
步驟6:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氟甲基)-3-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(630 mg,1.3 mmol)及三苯基膦(1.1 g,4 mmol)於二甲基甲醯胺(10 mL)之攪拌溶液中分批添加DIAD (805 mg,4 mmol)。將混合物在室溫下攪拌15小時。將所得混合物用水稀釋且用乙酸乙酯(3x100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x200 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC(EtOAc)純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之(2R,4R,5S,6S)-5-(苄氧基)-4-[(苄氧基)甲基]-11-氟基-4-(氟甲基)-3,7-二氧雜-1,9-二氮雜三環[6.4.0.0^ {2,6}]十二碳-8,11-二烯-10-酮(粗,1.49 g,3.3 mmol)。LC-MS (ES, m/z): 457 (M+H +)。
步驟7:在室溫,氮氣氛圍下向(2R,4R,5S,6S)-5-(苄氧基)-4-[(苄氧基)甲基]-11-氟基-4-(氟甲基)-3,7-二氧雜-1,9-二氮雜三環[6.4.0.0^ {2,6}]十二碳-8,11-二烯-10-酮(1.5 g,3.2 mmol)於二噁烷(20 mL)及水(4 mL)之攪拌溶液中分批添加NaOH (381 mg,9.5 mmol)。將混合物在室溫下攪拌2小時。將所得混合物用水稀釋且用乙酸乙酯(3x100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x200 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC純化殘餘物(EtOAc),得到呈淡黃色固體之1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氟甲基)-3-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(440 mg,0.9 mmol,29.19%)。LC-MS (ES, m/z): 475 (M+H +)。
步驟8:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氟甲基)-3-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(420 mg,0.9 mmol)及咪唑(181 mg,2.7 mmol)於二甲基甲醯胺(10 mL)之攪拌溶液中添加氯三甲基矽烷(144 mg,1.3 mmol)。將混合物在室溫下攪拌2小時。將所得混合物用水稀釋且用乙酸乙酯(3x100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x200 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC(PE/EtOAc = 1/1)純化殘餘物,得到呈淡黃色油狀物之1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氟甲基)-3-[(三甲基矽烷基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(370 mg,0.7 mmol,76.46%)。LC-MS (ES, m/z): 547 (M+H +)。
步驟9:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氟甲基)-3-[(三甲基矽烷基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(350 mg,0.6 mmol)及TEA (194 mg,1.9 mmol)於ACN (12 mL)之攪拌溶液中添加2,4,6-參(丙-2-基)苯-1-磺醯氯(388 mg,1.2 mmol)。將混合物在室溫下攪拌2小時。然後添加氫氧化銨(2 mL)且將混合物在室溫下攪拌1小時。將所得混合物用水稀釋且用乙酸乙酯(3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2 x 200 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC (DCM/MeOH=10/1)純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氟甲基)-3-[(三甲基矽烷基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(246 mg,0.5 mmol,70.41%)。LC-MS (ES, m/z): 546 (M+H +)。
步驟10:在室溫,氮氣氛圍下向4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氟甲基)-3-[(三甲基矽烷基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(236 mg,0.4 mmol)於甲醇(10 mL)之攪拌溶液中添加NH 4F (480 mg,13.0 mmol)。將混合物在室溫下攪拌2小時。在減壓下濃縮所得混合物。藉由用DCM/MeOH (20/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氟甲基)-3-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(195 mg,0.4 mmol,95.22%)。LC-MS (ES, m/z): 474 (M+H +)。
步驟11:在-78℃,氮氣氛圍下向4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氟甲基)-3-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(170 mg,0.4 mmol)於DCM (12 mL)之攪拌溶液中逐滴添加三氯化硼(7.2 mL,7.2 mmol,1.0 M於DCM中)。將混合物在0℃下攪拌2小時。藉由在0℃下添加TEA/MeOH (40 mL,1/2)來淬滅反應。在減壓下濃縮所得混合物。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化殘餘物:C18矽膠;流動相,含ACN之水,在15 min內0%至15%梯度;在254 nm下UV偵測。藉由製備型HPLC在以下條件下再純化粗產物(管柱:XBridge Shield RP18 OBD管柱,19*250 mm,10μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:25 mL/min;梯度:在6 min內3% B至20% B;波長:254 nm)。將含有產物之級分冷凍乾燥隔夜,得到呈灰白色固體之產物(48.7 mg,0.2 mmol,44.78%)。LC-MS (ES, m/z): 294 (M+H +)。96.8%純度。LCMS之條件:(管柱:Atlantis HILIC Silica, 100*4.6 mm,3 μm;流動相A:20mmol乙酸銨,流動相B:乙腈;流率:1.20 mL/min;梯度:在1.00 min內95% B至95% B,在6.00 min內95% B至50% B;波長:254 nm)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.75 (t, J= 9.4 Hz, 2H), 7.49 (s, 1H), 6.09 (s, 1H), 5.64 (d, J= 16.0 Hz, 2H), 5.28 (s, 1H), 4.69 – 4.33 (m, 2H), 4.09 (s, 2H), 3.58 (q, J= 11.3 Hz, 2H)。 實例 32- 化合物 73 4- 胺基 -1-((2R,3S,4S,5R)-5-( 氯甲基 )-3,4- 二羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- )-5- 氟基嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在-35℃,氮氣氛圍下將((3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-基)甲醇(1 g,2.5 mmol)及吡啶(1.0 g,12.5 mmol)於DCM (20 mL)中之溶液用Tf 2O (1.2 g,4.2 mmol)處理2 h。藉由添加飽和NH 4Cl溶液來淬滅反應。將所得混合物用DCM萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 550 (M+NH 4 +)。
步驟2:向三氟甲烷磺酸((3aR,5S,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-基)甲酯(1.5 g,2.8 mmol)於DMF (15 mL)之溶液中添加LiCl (0.5 g,11.2 mmol)。在60℃,氮氣氛圍下將混合物攪拌2 h。將混合物冷卻至室溫且用水稀釋。用EtOAc (3 x 30 mL)萃取水層。在減壓下濃縮所得混合物。藉由用PE/EA (5:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-(氯甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯(900 mg,2.1 mmol,76.2%)。LC-MS (ES, m/z): 436/438 (M+NH 4 +)。
步驟3:向(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-(氯甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯(900 mg,2 mmol)於AcOH (11.6 g)之溶液中逐滴添加Ac 2O (3 g,29 mmol)及H 2SO 4(13.7 µL, 0.2 mmol)且在室溫,氮氣氛圍下將混合物攪拌3 h。將混合物用飽和NaHCO 3(水溶液)淬滅且用EtOAc萃取。在減壓下濃縮所得混合物。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 480/482 (M+NH 4 +)。
步驟4:在80℃,氮氣氛圍下將二乙酸(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-(氯甲基)四氫呋喃-2,3-二酯(1 g,2.1 mmol)於ACN (20mL)中之溶液用(E)-(N-(三甲基矽烷基)伸乙基甲亞胺酸三甲基矽烷酯) (1.7 g,8.6 mmol)處理30 min,隨後逐滴添加氟尿嘧啶(0.4 g,3.0 mmol)及TMSOTf (0.8 g,3.5 mmol)。將混合物在80℃下再攪拌2小時。然後冷卻至室溫且用冰水淬滅。用EtOAc萃取水層。在減壓下濃縮所得混合物。藉由用PE/EtOAc (3:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之乙酸(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-(氯甲基)-2-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)四氫呋喃-3-酯(600 mg,1.1mmol,52.1%)。LC-MS (ES, m/z): 533/535 (M+H +)。
步驟5:向NH 3(g)於MeOH(10 mL,7.0 M)之溶液中添加乙酸(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-(氯甲基)-2-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)四氫呋喃-3-酯(600 mg,1.1 mmol)。在60℃,氮氣氛圍下將混合物攪拌2 h。將所得混合物冷卻至室溫且在減壓下濃縮。藉由製備型TLC(PE/EtOAc = 2:1)純化殘餘物,得到呈灰白色固體之1-[(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-3-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(400 mg,0.81mmol,72.3%)。LC-MS (ES, m/z): 491/493 (M+H +)。
步驟6:在室溫,氮氣氛圍下將1-[(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-3-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(400 mg,0.8 mmol)於DMF (5 mL)中之溶液用PPh 3(641 mg,2.4 mmol)及DIAD (494 mg,2.4 mmol)處理隔夜。將混合物用水稀釋且用EtOAc萃取。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型TLC(CH 2Cl 2/MeOH 10:1)純化殘餘物,得到呈灰白色固體之(2R,4R,5S,6S)-5-(苄氧基)-4-[(苄氧基)甲基]-4-(氯甲基)-11-氟基-3,7-二氧雜-1,9-二氮雜三環[6.4.0.0^ {2,6}]十二碳-8,11-二烯-10-酮(1.1 g,2.3 mmol,粗品) (包括PPh 3)。粗產物直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 473/475 (M+H +)。
步驟7:向(2R,4R,5S,6S)-5-(苄氧基)-4-[(苄氧基)甲基]-4-(氯甲基)-11-氟基-3,7-二氧雜-1,9-二氮雜三環[6.4.0.0^ {2,6}]十二碳-8,11-二烯-10-酮(1.1 g,2.3 mmol)於1,4-二噁烷(10 mL)及H 2O (2 mL)之溶液中添加NaOH (0.3 g,6.9 mmol)且在室溫,氮氣氛圍下將混合物攪拌隔夜。將混合物用水稀釋且用EtOAc萃取。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型TLC(PE/EtOAc = 1:1)純化殘餘物,得到呈灰白色固體之1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-3-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1 g,2.0 mmol,87.6%) (包括PPh 3)。粗產物直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 491/493 (M+H +)。
步驟8:在室溫,氮氣氛圍下將1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-3-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1 g,2 mmol)於DMF (10 mL)中之溶液用TMSCl (332 mg,3.0 mmol)及咪唑(416 mg,6 mmol)處理隔夜。將混合物用水稀釋且用EtOAc萃取。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型TLC(PE/EtOAc = 3:1)純化殘餘物,得到呈灰白色固體之1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-3-[(三甲基矽烷基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(100 mg,0.18 mmol,8.7%)。LC-MS (ES, m/z): 563/565 (M+H +)。
步驟9:在室溫,氮氣氛圍下將1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-3-[(三甲基矽烷基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(100 mg,0.2 mmol)於ACN (2 mL)中之溶液用DMAP (43.4 mg,0.4 mmol)及TEA (53.9 mg,0.5 mmol)處理10 min,然後添加2,4,6-參(丙-2-基)苯-1-磺醯氯(107.5 mg,0.4 mmol)且在室溫下攪拌5 h。最後,添加NH 3.H 2O (0.1 mL,2.5 mmol)且在室溫下攪拌15 min。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型TLC(PE/EtOAc = 1:1)純化殘餘物,得到呈灰白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-3-[(三甲基矽烷基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(90 mg,0.16mmol,90%)。LC-MS (ES, m/z): 562/564 (M+H +)。
步驟10:在-78℃,氮氣氛圍下將4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-3-[(三甲基矽烷基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(100 mg,0.2 mmol)於DCM (3 mL)中之溶液用三氯化硼(2.7 mL,2.7 mmol,1.0 M於DCM中)處理2 h。藉由在-20℃下添加MEOH/TEA (5 mL,1/1)來淬滅反應且濃縮。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(管柱:XBridge Shield RP18 OBD管柱,19*250 mm,10μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:25 mL/min;梯度:在6 min內3% B至20% B;波長:254 nm;),得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-5-(氯甲基)-3,4-二羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(31.4 mg,0.10mmol,56.9%)。LC-MS (ES, m/z): 310/312 (M+H +);99.9%純度。LCMS之條件:(管柱:Shim-pack Scepter C18, 33*3.0 mm;流動相A:水/5mM NH 4HCO 3,流動相B:乙腈;流率:1.5000 mL/min;梯度:在1.7 min內0% B至95% B,在1.1 min內95% B至95% B,在0.03 min內95% B至10% B;波長:254/220 nm)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.77 (d, J= 7.6 Hz, 2H), 7.49 (s, 1H), 6.09 (s, 1H), 5.69 (d, J= 21.1 Hz, 2H), 5.27 (s, 1H), 4.10 (d, J= 19.6 Hz, 2H), 3.81 (d, J= 11.4 Hz, 1H), 3.68 (d, J= 14.9 Hz, 3H)。 實例 33- 化合物 70 2- 胺基 -9-((2R,3S,4R,5R)-5-( 氯甲基 )-3- 氟基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 )- 四氫呋喃 -2- )-1,9- 二氫 -6H- 嘌呤 -6- 酮之合成
步驟1:在0℃,氮氣氛圍下向9-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(450 mg,0.4 mmol)及吡啶(189 mg,2.3 mmol)於二氯甲烷(10 ml)之攪拌溶液中逐滴添加Tf 2O (229 mg,0.8 mmol)。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌隔夜。將所得混合物用水(100 mL)稀釋。將所得混合物用二氯甲烷(3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 100 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 1072 (M+H +)。
步驟2:在室溫,氮氣氛圍下將三氟甲烷磺酸((2S,3R,4S,5R)-3-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-2-(((三級丁基二苯基矽烷基)氧基)甲基)-4-氟基-5-(2-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲基)胺基)-6-側氧基-1,6-二氫-9H-嘌呤-9-基)四氫呋喃-2-基)甲酯(450 mg,0.4 mmol)及LiCl (71 mg,1.6 mmol)於二甲基甲醯胺(10 ml)中之混合物攪拌隔夜。將所得混合物用水(100 mL)稀釋。將所得混合物用乙酸乙酯(3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3 x 100 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 958(M+H +)。
步驟3:在60℃,氮氣氛圍下將9-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(450 mg,0.4 mmol)及NH 4F (408 mg,11.0 mmol)於甲醇(10 ml)中之混合物攪拌隔夜。將所得混合物冷卻至室溫,過濾且用甲醇(3 x 10 mL)洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC(二氯甲烷/甲醇10:1)純化殘餘物,得到呈白色固體之9-[(2R,3S,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(130 mg,0.2 mmol,45.70%)。LC-MS (ES, m/z): 606(M+H +)。
步驟4:在室溫,氮氣氛圍下將9-[(2R,3S,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}-1H-嘌呤-6-酮(120 mg,0.1 mmol)於乙酸(1.6 mL)及水(0.4 ml)中之溶液攪拌隔夜。將所得混合物在真空下濃縮。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(管柱:XBridge Shield RP18 OBD管柱,19*250 mm,10μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:25 mL/min;梯度:在7 min內5% B至30% B;波長:254 nm),得到呈白色固體之2-胺基-9-[(2R,3S,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-1H-嘌呤-6-酮(25.9 mg,0.1 mmol,37.87%)。LC-MS (ES, m/z): 334(M+H +)。96.6%純度。HPLC之條件:(管柱:Xbridge RP18,100*4.6 mm,3.5 μm;流動相A:H 2O+0.1%TFA,流動相B:MeOH;流率:1.2000 mL/min;梯度:在8.00 min內5% B至95% B,在10.00 min內95% B至95% B,在10.50 min內90% B至10% B;波長:254/220 nm)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.09 (s, 1H), 7.82 (d, J= 2.8 Hz, 1H), 6.57 (s, 2H), 6.38 – 6.19 (m, 2H), 5.30 (dt, J= 53.1, 4.3 Hz, 2H), 4.65 (d, J= 18.8 Hz, 1H), 3.88 (d, J= 12.0 Hz, 1H), 3.76 (d, J= 11.9 Hz, 1H), 3.61 (t, J= 11.9 Hz, 2H)。 實例 34- 化合物 74 4- 胺基 -5- 氟基 -1-((2R,4S,5R)-4- 羥基 -5-( 羥甲基 )-5- 乙烯基四氫呋喃 -2- ) 嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在室溫,氮氣氛圍下向3-O-苄基-4-(羥甲基-1,2-O-亞異丙基)-α- d-赤式戊呋喃糖(18 g,58.1 mmol)於無水DCM (280 mL)之溶液中依次添加Et 3N (24.2 mL,174.1 mmol)及 三級丁基-氯基-二苯基矽烷(42.3 mL,162.4 mmol)且攪拌18 h。完成後,藉由添加飽和NaHCO 3(20 mL)來淬滅反應混合物且用DCM (2 x 30 mL)萃取。將有機層合併,用硫酸鈉乾燥且過濾。 在真空中蒸發濾液,得到粗殘餘物,藉由管柱層析法在矽膠上純化(梯度:0-40% EtOAc於己烷中),得到異構物2b (20.4 g,64.1%產率,白色固體): 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 7.63-7.54 (m, 4H), 7.49 – 7.22 (m, 11H), 5.73 (d, J= 3.7 Hz, 1H), 4.83 (dd, J= 5.2, 3.7 Hz, 1H), 4.69 (d, J= 12.2 Hz, 1H), 4.49 (d, J= 12.2 Hz, 1H), 4.34 (d, J= 5.1 Hz, 1H), 4.23 (dd, J= 6.7, 5.0 Hz, 1H), 3.83 (dd, J= 11.9, 5.0 Hz, 1H), 3.73 (d, J= 10.8 Hz, 1H), 3.63 – 3.51 (m, 2H), 1.50 (s, 3H), 1.29 (s, 3H), 0.90 (s, 9H)。
步驟2:向[(5 R,6 S,6a R)-6-苄氧基-5-[[三級丁基(二苯基)矽烷基]氧基甲基]-2,2-二甲基-6,6a-二氫-3aH-呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-基]甲醇2b (20.4 g,37.2 mmol)於無水DCM (75 mL)之溶液中添加戴斯-馬丁高碘烷(18.9 g,44.6 mmol)且將混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌6 h。反應完成後進行TLC (30% EtOAc於己烷中)。藉由添加飽和NaHCO 3溶液(200 mL)來淬滅反應。分離各層,且用DCM (3 x 100 mL)萃取水層。將有機層合併,用硫酸鈉乾燥且過濾,然後 在真空中濃縮。藉由管柱層析法在矽膠(梯度:0-100% EtOAc於己烷中)上純化粗殘餘物,得到呈白色固體之(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-(((三級丁基二苯基矽烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基-四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-甲醛(18.3 g,90%產率)。 1H NMR (400 MHz, CDCl 3) δ 9.90 (s, 1H), 7.65-7.55 (m, 4H), 7.47 – 7.28 (m, 11H), 5.87 (d, J= 3.3 Hz, 1H), 4.74 (d, J= 12.2 Hz, 1H), 4.70 – 4.58 (m, 2H), 4.54 (d, J= 4.4 Hz, 1H), 3.88 (d, J= 11.5 Hz, 1H), 3.79 (d, J= 11.5 Hz, 1H), 1.62 (s, 3H), 1.37 (s, 3H), 0.98 (s, 9H)。
步驟3:在氬氣下將甲基三苯基溴化鏻(20.2 g,56.4 mmol)懸浮於無水THF (188 mL)中且冷卻至0℃。然後,在0℃下小心地添加正丁基鋰溶液(2.5 M於己烷中,18.8 mL,47 mmol)。溶液變黃,且將混合物在此溫度下攪拌10 min,然後溫熱且在室溫下攪拌1h。然後將溶液進一步冷卻至-78℃且在此溫度下作為於無水THF (30 mL)中之溶液添加(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-(((三級丁基二苯基矽烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-甲醛(10.3 g,18.8 mmol)。在氮氣下,在-78℃下繼續攪拌30 min,然後將反應混合物溫熱至室溫且再攪拌16 h。將混合物用飽和NH 4Cl溶液(200 mL)淬滅且攪拌5 min。然後用EtOAc (3 x 100 mL)萃取混合物。將有機層合併,用硫酸鈉乾燥,過濾且 在真空下濃縮。經由管柱層析法在矽膠上(梯度:0-40% EtOAc於己烷中)純化粗殘餘物,得到呈無色膠狀物之[(5 R,6 S,6a R)-6-苄氧基-2,2-二甲基-5-乙烯基-6,6a-二氫-3aH-呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-基]甲氧基-三級丁基-二苯基-矽烷(9.12 g,89%產率)。 1H NMR (400 MHz, CDCl 3) δ 7.68-7.57 (m, 4H), 7.46 – 7.27 (m, 11H), 6.17 (dd, J= 17.6, 11.1 Hz, 1H), 5.81 (d, J= 3.8 Hz, 1H), 5.45 (dd, J= 17.6, 1.9 Hz, 1H), 5.18 (dd, J= 11.0, 1.9 Hz, 1H), 4.83 (d, J= 12.4 Hz, 1H), 4.71 – 4.59 (m, 2H), 4.45 (d, J= 4.9 Hz, 1H), 3.57 – 3.46 (m, 2H), 1.55 (s, 3H), 1.32 (s, 3H), 0.98 (s, 9H)。
步驟4:向[(5 R,6 S,6a R)-6-苄氧基-2,2-二甲基-5-乙烯基-6,6a-二氫-3aH-呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-基]甲氧基-三級丁基-二苯基-矽烷(5 g,9.2 mmol)於乙酸(84 mL)及乙酸酐(9.3 mL,98.9 mmol)之混合物的冷溶液中添加濃硫酸(80.7 µL, 1.5 mmol)且將混合物在0-10℃下攪拌直至完成。2 h後,小心地用冷飽和NaHCO 3(1.2 L)中和混合物且使pH達到6-7。然後用EtOAc (5 x 500 mL)萃取水層。將有機萃取物合併,用硫酸鈉乾燥且過濾。 在真空中濃縮濾液且經由管柱層析法在矽膠上(梯度;0-30% EtOAc於己烷中)純化粗殘餘物,得到呈無色膠狀固體之兩種變旋異構物。主要變旋異構物,二乙酸(2S,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-(((三級丁基二苯基矽烷基)氧基)甲基)-5-乙烯基四氫呋喃-2,3-二酯,(3.4 g,64%); 1H NMR (400 MHz, CDCl 3) δ 7.64 (tt, J= 5.9, 1.5 Hz, 4H), 7.44 – 7.28 (m, 11H), 6.26 (s, 1H), 5.98 (dd, J= 17.4, 11.0 Hz, 1H), 5.47 (dd, J= 17.3, 1.8 Hz, 1H), 5.34 (d, J = 4.9 Hz, 1H), 5.18 (dd, J= 11.0, 1.8 Hz, 1H), 4.71 – 4.62 (m, 2H), 4.53 (d, J= 11.6 Hz, 1H), 3.67 – 3.58 (m, 2H), 2.05 (s, 3H), 1.85 (s, 3H), 1.05 (s, 9H)。次要變旋異構物,二乙酸(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-(((三級丁基二苯基矽烷基)氧基)甲基)-5-乙烯基四氫呋喃-2,3-二酯,(392 mg,7%); 1H NMR (400 MHz, CDCl 3) δ 7.63 (ddt, J= 11.3, 6.6, 1.6 Hz, 4H), 7.49 – 7.29 (m, 11H), 6.46 (d, J= 4.6 Hz, 1H), 5.91 (dd, J= 17.4, 11.1 Hz, 1H), 5.43 – 5.32 (m, 2H), 5.17 (dd, J= 11.0, 1.7 Hz, 1H), 4.68 – 4.51 (m, 2H), 4.46 (d, J= 6.2 Hz, 1H), 3.52 (s, 2H), 2.10 (s, 3H), 2.06 (s, 3H), 1.05 (s, 9H)。
步驟5:在130℃,氮氣下將5-氟尿嘧啶(1.7 g,12.9 mmol)及(NH 4) 2SO 4(77.7 mg,0.6 mmol)於HMDS (21 mL,100 mmol)中之攪拌混合物加熱至回流歷時3h。然後將混合物冷卻至室溫,蒸發掉HMDS,且將混合物置於高真空下30 min。然後將混合物冷卻至0℃,且在氮氣下向此混合物中添加二乙酸(2S,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-(((三級丁基二苯基矽烷基)氧基)甲基)-5-乙烯基四氫呋喃-2,3-二酯(3.46 g,5.88 mmol)於無水DCE (29 mL)中之溶液。攪拌5 min後,添加氯化錫(IV) (1.4 mL,11.8 mmol),且使混合物溫熱至室溫隔夜。將混合物小心地用飽和NaHCO 3溶液(20 mL)淬滅,然後用EtOAc (4 x 100 mL)萃取。將有機層合併,用硫酸鈉乾燥,過濾且 在真空下濃縮。藉由管柱層析法在矽膠上(梯度:0-50% EtOAc於DCM中)純化粗殘餘物,得到呈白色固體之乙酸[(2 R,3 R,4 S,5 R)-4-苄氧基-5-[[三級丁基(二苯基)矽烷基]氧基甲基]-2-(5-氟基-2,4-二側氧基-嘧啶-1-基)-5-乙烯基-四氫呋喃-3-基]酯(2.7 g,69.7%產率)。 1H NMR (400 MHz, CDCl 3) δ 8.25 (d, J= 4.7 Hz, 1H), 7.87 (d, J= 5.7 Hz, 1H), 7.64 (ddd, J= 6.7, 3.3, 1.6 Hz, 4H), 7.48 – 7.29 (m, 9H), 7.23 (dd, J= 7.4, 2.0 Hz, 2H), 6.16 (dd, J= 4.4, 1.7 Hz, 1H), 5.80 (dd, J= 17.4, 10.9 Hz, 1H), 5.42 (dd, J= 17.4, 1.4 Hz, 1H), 5.33 (dd, J= 6.1, 4.3 Hz, 1H), 5.22 (dd, J= 10.9, 1.4 Hz, 1H), 4.57 (d, J= 11.2 Hz, 1H), 4.50 – 4.37 (m, 2H), 3.67 (q, J= 11.7 Hz, 2H), 2.06 (s, 3H), 1.11 (s, 9H)。
步驟6:在室溫下將乙酸[(2 R,3 R,4 S,5 R)-4-苄氧基-5-[[三級丁基(二苯基)矽烷基]氧基甲基]-2-(5-氟基-2,4-二側氧基-嘧啶-1-基)-5-乙烯基-四氫呋喃-3-基]酯(2.53 g,3.84 mmol)及甲氧鈉(1.23 mL,5.4 mmol,25% wt溶液於MeOH中)於無水甲醇(60 mL)中之溶液攪拌3.5 h。用10% w/v酒石酸水溶液(10 mL)中和反應混合物(pH=5)且用DCM (3 x 100 mL)萃取混合物。將有機萃取物合併,用硫酸鈉乾燥,過濾且 在真空中濃縮。藉由管柱層析法在矽膠上(梯度:0-50% EtOAc於DCM中)純化粗殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2 R,3 R,4 S,5 R)-4-苄氧基-5-[[ 三級丁基(二苯基)矽烷基]氧基甲基]-3-羥基-5-乙烯基-四氫呋喃-2-基]-5-氟基-嘧啶-2,4-二酮(2.05 g,86.5%產率)。 1H NMR (400 MHz, CDCl 3) δ 8.36 (d, J= 13.0 Hz, 1H), 7.85 (d, J= 5.8 Hz, 1H), 7.66 – 7.59 (m, 4H), 7.49 – 7.34 (m, 9H), 7.31-7.27 (m, 2H), 5.99 (dd, J= 4.5, 1.7 Hz, 1H), 5.81 (dd, J= 17.3, 10.9 Hz, 1H), 5.47 (dd, J= 17.3, 1.4 Hz, 1H), 5.26 (dd, J= 10.9, 1.4 Hz, 1H), 4.56 (t, J= 0.6 Hz, 2H), 4.28 (d, J= 6.1 Hz, 1H), 4.24 (dd, J= 6.1, 4.5 Hz, 1H), 3.74 – 3.63 (m, 2H), 2.77 (s, 1H), 1.10 (s, 9H)。
步驟7:向1-[(2 R,3 R,4 S,5 R)-4-苄氧基-5-[[ 三級丁基(二苯基)矽烷基]氧基甲基]-3-羥基-5-乙烯基-四氫呋喃-2-基]-5-氟基-嘧啶-2,4-二酮(2.05 g,3.32 mmol)於無水MeCN (25 mL)之溶液中添加DMAP (2.4 g,19.94 mmol)及苯基氯硫代甲酸酯(0.7 mL,4.99 mmol),且將混合物在室溫下攪拌1 h。然後快速濃縮混合物以移除溶劑,用DCM (20 mL)再次稀釋且用5%檸檬酸水溶液(5 mL)及水(5 mL)洗滌。然後將有機層用硫酸鈉乾燥,過濾且 在真空中濃縮。將所獲得之粗混合物1-[(2 R,3 R,4 S,5 R)-4-苄氧基-5-[[三級丁基(二苯基)矽烷基]氧基甲基]-3-苯氧基碳硫醯基氧基-5-乙烯基-四氫呋喃-2-基]-5-氟基-嘧啶-2,4-二酮(2.5 g,3.3 mmol)溶解於無水甲苯(30 mL)中。向此溶液中添加 n-Bu 3SnH (4.5 mL,16.6 mmol)及催化量之AIBN (109.1 mg,0.66 mmol),然後將混合物回流1 h。然後將混合物冷卻至室溫,且蒸發以移除溶劑。藉由管柱層析法在矽膠上(梯度:0-80% EtOAc於己烷中)純化粗殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2 R,4 S,5 R)-4-苄氧基-5-[[三級丁基(二苯基)矽烷基]氧基甲基]-5-乙烯基-四氫呋喃-2-基]-5-氟基-嘧啶-2,4-二酮(810.2 mg,兩個步驟41%產率)。 1H NMR (400 MHz, CDCl 3) δ 8.13 (d, J= 4.7 Hz, 1H), 8.02 (d, J= 5.8 Hz, 1H), 7.67-7.56 (m, 4H), 7.47 – 7.30 (m, 9H), 7.27 (d, J= 2.0 Hz, 2H), 6.20 (ddd, J= 7.2, 3.8, 1.7 Hz, 1H), 5.87 (dd, J= 17.3, 10.9 Hz, 1H), 5.47 (dd, J= 17.3, 1.6 Hz, 1H), 5.26 (dd, J= 10.9, 1.6 Hz, 1H), 4.60 – 4.41 (m, 3H), 3.73 (s, 2H), 2.46 (dt, J= 13.6, 7.5 Hz, 1H), 2.20 (ddd, J= 13.5, 7.1, 3.8 Hz, 1H), 1.08 (s, 9H)。
步驟8:將2,4,6-三異丙基-苯磺醯氯(1.22 g,4.02 mmol)及DMAP (491.1 mg,4.02 mmol)添加至100 mL圓底燒瓶中,隨後添加1-[(2 R,4 S,5 R)-4-苄氧基-5-[[三級丁基(二苯基)矽烷基]氧基甲基]-5-乙烯基-四氫呋喃-2-基]-5-氟基-嘧啶-2,4-二酮(805 mg,1.34 mmol)於無水MeCN (25 mL)中之溶液。然後添加Et 3N (0.57 mL,4.02 mmol)。將反應混合物在室溫下攪拌4 h,之後起始材料已經完全消耗掉。將氨溶液(28% w/v,25 mL,39.69 mmol)添加至橙色反應混合物中且將混合物在室溫下攪拌3 h。攪拌幾分鐘後,混合物變成了渾濁的淡黃色。然後蒸發混合物以自先前步驟中移除氨及MeCN。用DCM (3 x 30 mL)萃取所得殘餘物。將有機層合併,用硫酸鈉乾燥,過濾且 在真空下濃縮。藉由管柱層析法在矽膠上(梯度:0-5% MeOH於DCM中)純化粗殘餘物,得到呈灰白色固體之4-胺基-1-[(2 R,4 S,5 R)-4-苄氧基-5-[[ 三級丁基(二苯基)矽烷基]氧基甲基]-5-乙烯基-四氫呋喃-2-基]-5-氟基-嘧啶-2-酮(606.1 mg,76.4% 產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 7.88 (d, J= 6.7 Hz, 1H), 7.77 (s, 1H), 7.69 – 7.56 (m, 4H), 7.53 (s, 1H), 7.46 – 7.20 (m, 11H), 6.10 (ddd, J= 6.3, 3.6, 1.2 Hz, 1H), 5.90 (dd, J= 17.3, 10.9 Hz, 1H), 5.39 (dd, J= 17.3, 2.0 Hz, 1H), 5.23 (dd, J= 10.8, 2.0 Hz, 1H), 4.66 – 4.37 (m, 3H), 3.68 (d, J= 11.2 Hz, 1H), 3.68 (d, J= 11.2 Hz, 1H), 2.32 (ddd, J= 13.3, 7.2, 4.0 Hz, 1H), 2.23 (dt, J= 13.3, 7.6 Hz, 1H), 0.98 (s, 9H)。 19F NMR (376 MHz, DMSO-d6) δ -166.76, -166.77, -166.78。
步驟9:在室溫,氮氣下向4-胺基-1-[(2 R,4 S,5 R)-4-苄氧基-5-[[ 三級丁基(二苯基)矽烷基]氧基甲基]-5-乙烯基-四氫呋喃-2-基]-5-氟基-嘧啶-2-酮(600.mg,1 mmol)於無水THF (4 mL)之溶液中添加四丁基氟化銨溶液(1.0 M於THF中,1.5 mL,1.5 mmol)且將混合物攪拌16 h。將混合物 真空濃縮且藉由管柱層析法在矽膠上(0-20% MeOH於DCM中)純化粗殘餘物,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2 R,4 S,5 R)-4-苄氧基-5-(羥甲基)-5-乙烯基-四氫呋喃-2-基]-5-氟基-嘧啶-2-酮(326.2 mg,90.2%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 8.28 (d, J= 7.3 Hz, 1H), 7.70 (s, 1H), 7.47 (s, 1H), 7.39 – 7.21 (m, 5H), 6.02 (dt, J= 6.3, 3.1 Hz, 1H), 5.93 (dd, J= 17.3, 10.8 Hz, 1H), 5.48 (t, J= 5.0 Hz, 1H), 5.36 (dd, J= 17.4, 2.1 Hz, 1H), 5.21 (dd, J= 10.9, 2.1 Hz, 1H), 4.53 (s, 2H), 4.37 (t, J= 7.2 Hz, 1H), 3.61 (dd, J= 11.9, 5.1 Hz, 1H), 3.44 (d, J= 4.9 Hz, 1H), 2.19 (dd, J= 7.2, 5.5 Hz, 2H)。
步驟10:向4-胺基-1-[(2 R,4 S,5 R)-4-苄氧基-5-(羥基-甲基)-5-乙烯基-四氫呋喃-2-基]-5-氟基-嘧啶-2-酮(80 mg,0.22 mmol)於無水DCM (10 mL)之-78℃溶液中添加BBr 3溶液(1.0 M於DCM中,0.5 mL,0.5000 mmol)且將混合物在-78℃下攪拌6 h。在-78℃下用吡啶:甲醇(10 mL)之2:1混合物淬滅混合物且使其攪拌30分鐘。使混合物達到室溫且 在真空中蒸發以移除溶劑,同時與甲苯(3次)及DCM (3次)徹底共蒸發以移除痕量吡啶。藉由管柱層析法在矽膠上(梯度:0-30% MeOH於EtOAc中)純化粗殘餘物,得到呈白色固體之4-胺基-5-氟基-1-[(2 R,4 S,5 R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-乙烯基-四氫呋喃-2-基]嘧啶-2-酮(化合物74) (12.2 mg,20.3%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 8.31 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 7.67 (s, 1H), 7.44 (s, 1H), 5.96 (d, J= 6.0 Hz, 1H), 5.88 (dd, J= 17.3, 10.9 Hz, 1H), 5.39 (s, 1H), 5.32 (dd, J= 17.4, 2.2 Hz, 1H), 5.24 (d, J= 4.7 Hz, 1H), 5.18 (dd, J= 10.9, 2.2 Hz, 1H), 4.40 (t, J= 6.2 Hz, 1H), 3.56 (dd, J= 11.6, 4.5 Hz, 1H), 3.38 (d, J= 4.5 Hz, 1H), 2.15 – 1.98 (m, 2H)。 19F NMR (376 MHz, DMSO-d6) δ -167.85, -167.86, -167.87, -167.88; HPLC: >99%; HRMS: [2M+Na] +之計算值565.1833,實驗值565.1830。 實例 35- 化合物 75 4- 胺基 -1-((2 R,3 S,4 S,5 R)-3,4- 二羥基 -5-( 羥甲基 )-5- 乙烯基四氫呋喃 -2- )-5- 氟基嘧啶 -2(1 H)- 酮之合成
步驟1:在0℃下向3-O-苄基-4-(羥甲基-1,2-O-亞異丙基)-α- d-赤式戊呋喃糖(12.7 g,41.1 mmol)於無水DMF (60 mL)之溶液中添加氫化鈉(60%分散液於礦物油中,1.97 g,49.3 mmol)。將反應在0℃下攪拌15 min,然後溫熱至室溫。將混合物在室溫下攪拌30 min後,逐滴添加溴甲苯(5.13 mL,43.1 mmol)。將混合物在室溫下攪拌3 h。將反應用冰冷H 2O (100 mL)淬滅且用EtOAc (4 x 100 mL)萃取。將合併之有機萃取物經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且 在真空中濃縮。藉由管柱層析法在矽膠上(梯度:0-30% EtOAc於己烷中)純化粗品,得到呈淡黃色固體之((3a R,5 R,6 S,6a R)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-基)甲醇(10.2 g,62%產率)。 1H NMR (400 MHz, CDCl 3) δ 7.36 – 7.24 (m, 10H), 5.78 (d, J= 3.9 Hz, 1H), 4.78 (d, J= 11.8 Hz, 1H), 4.64 (dd, J= 5.3, 3.9 Hz, 1H), 4.56 – 4.43 (m, 3H), 4.27 (d, J= 5.3 Hz, 1H), 3.93 (d, J= 11.9 Hz, 1H), 3.83 (d, J= 11.9 Hz, 1H), 3.62 – 3.51 (m, 2H), 2.36 (s, 1H), 1.63 (s, 3H), 1.34 (d, J= 0.7 Hz, 3H)。
步驟2:向((3a R,5 R,6 S,6a R)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-基)甲醇(10.2 g,25.5 mmol)於無水DCM (40 mL)之溶液中添加戴斯-馬丁高碘烷(12.9 g,30.6 mmol)且將混合物在室溫下攪拌6 h。將反應用飽和NaHCO 3溶液(100 mL)水溶液淬滅。分離有機層且用DCM (2 x 100 mL)萃取水層。將合併之有機萃取物用鹽水(250 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且 在真空中濃縮。藉由管柱層析法在矽膠上(梯度:0-20% EtOAc於己烷中)純化粗品,得到呈無色油狀物之(3a R,5 R,6 S,6a R)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-甲醛(9.49 g,93%產率)。 1H-NMR (400 MHz, CDCl 3) δ 9.91 (s, 1H), 7.37 – 7.27 (m, 8H), 7.25 – 7.21 (m, 2H), 5.84 (d, J= 3.4 Hz, 1H), 4.71 (d, J= 12.2 Hz, 1H), 4.62 – 4.57 (m, 2H), 4.49 (q, J= 12.0 Hz, 2H), 4.37 (d, J= 4.5 Hz, 1H), 3.71 – 3.58 (m, 2H), 1.60 (s, 3H), 1.35 (d, J= 0.7 Hz, 3H)。
步驟3:在氬氣下向甲基三苯基溴化鏻(22.9 g,64.3 mmol)於無水THF (60 mL)之冷卻(0℃)混合物中添加 丁基鋰(1.6 M於己烷中,32.7 mL,52.4 mmol)。將混合物攪拌5 min後,移除冰浴,且在室溫下繼續攪拌1 h。然後將橙黃色反應混合物冷卻至-78℃,且添加(3a R,5 R,6 S,6a R)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-甲醛(9.49g,23.82mmol)於THF (15 mL)中之溶液。繼續攪拌30分鐘,然後溫熱至室溫。攪拌隔夜後,將反應混合物在0℃下用飽和NH 4Cl水溶液(50 mL)淬滅,且用EtOAc (3 x 100 mL)萃取。將合併之有機萃取物經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且 在真空中濃縮。藉由管柱層析法在矽膠上(梯度:0-10% EtOAc於己烷中)純化粗品,得到呈無色油狀物之(3a R,5 R,6 S,6a R)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基-5-乙烯基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯(7.1 g,17.9 mmol,75%產率)。 1H NMR (400 MHz, CDCl 3) δ 7.38 – 7.21 (m, 10H), 6.20 (dd, J= 17.6, 11.1 Hz, 1H), 5.76 (d, J= 3.9 Hz, 1H), 5.52 (dd, J= 17.6, 1.9 Hz, 1H), 5.25 (dd, J= 11.1, 1.8 Hz, 1H), 4.77 (d, J= 12.3 Hz, 1H), 4.62 – 4.55 (m, 2H), 4.52 (d, J= 12.1 Hz, 1H), 4.41 (d, J= 12.1 Hz, 1H), 4.25 (d, J= 5.0 Hz, 1H), 3.33 (d, J= 1.5 Hz, 2H), 1.53 (s, 3H), 1.31 – 1.27 (m, 3H)。
步驟4:向(3a R,5 R,6 S,6a R)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基-5-乙烯基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯(7.1 g,17.9 mmol)於乙酸(140 mL)之冷卻溶液中添加乙酸酐(18.2 mL,192.9 mmol)及硫酸(0.16 mL,2.9 mmol)。將反應在0-10℃ (冷水浴)下攪拌2 h。將反應用飽和NaHCO 3水溶液(200 mL)中和(pH = 7),然後用EtOAc (3 x 200 mL)萃取。將合併之有機萃取物用鹽水(350 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且 在真空中濃縮。藉由管柱層析法在矽膠上(梯度:0-10% EtOAc於己烷中)純化粗品,得到呈白色固體之二乙酸(3 R,4 S,5 R)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-乙烯基四氫呋喃-2,3-二酯(5.9 g,75%產率)。 1H NMR (400 MHz, CDCl 3) δ 7.35 – 7.26 (m, 8H), 7.26 – 7.23 (m, 2H), 6.19 (d, J= 0.5 Hz, 1H), 5.98 (dd, J= 17.4, 11.0 Hz, 1H), 5.49 (dd, J= 17.4, 1.7 Hz, 1H), 5.28 (dd, J= 4.8, 0.6 Hz, 1H), 5.24 (dd, J= 11.0, 1.7 Hz, 1H), 4.65 (d, J= 12.0 Hz, 1H), 4.51 – 4.47 (m, 3H), 4.39 (d, J= 11.9 Hz, 1H), 3.41 (d, J= 1.8 Hz, 2H), 2.05 (s, 3H), 1.86 (s, 3H)。
步驟5:在氬氣下將5-氟尿嘧啶 (3.8 g,29.6 mmol)及硫酸銨(177 mg,1.34 mmol)於六甲基二矽氮烷(47.8 mL,227.9 mmol)中之混合物加熱至回流(130℃)歷時3 h。將混合物冷卻至室溫且移除溶劑。在0℃,氬氣下向此粗品中添加二乙酸(3 R,4 S,5 R)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-乙烯基四氫呋喃-2,3-二酯(5.9 g,13.4 mmol)於無水DCE (60 mL)中之溶液,隨後添加氯化錫(IV) (3.1 mL,26.9 mmol)。將混合物溫熱至室溫且攪拌隔夜。將反應用飽和NaHCO 3水溶液(250 mL)稀釋且用EtOAc (3 x 300 mL)萃取。將合併之有機萃取物用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且 在真空中濃縮。藉由管柱層析法在矽膠上(梯度:0-40% EtOAc於己烷中)純化粗品,得到呈白色固體之乙酸(2 R,3 R,4 S,5 R)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-5-乙烯基四氫呋喃-3-酯(6.1 g,89%產率)。LCMS: m/z= 511 [M+H] +. 1H NMR (400 MHz, CDCl 3) δ 8.93 (d, J= 33.1 Hz, 1H), 8.07 (d, J= 6.4 Hz, 1H), 7.39 – 7.26 (m, 9H), 7.25 (d, J= 1.5 Hz, 1H), 6.16 (dd, J= 3.7, 1.6 Hz, 1H), 5.90 (dd, J= 17.4, 11.0 Hz, 1H), 5.46 (dd, J= 17.4, 1.3 Hz, 1H), 5.32 – 5.25 (m, 2H), 4.60 (d, J= 11.7 Hz, 1H), 4.50 (d, J= 11.4 Hz, 1H), 4.43 (d, J= 5.7 Hz, 1H), 4.40 (d, J= 5.5 Hz, 1H), 4.38 (d, J= 5.8 Hz, 1H), 3.50 (d, J= 10.6 Hz, 1H), 3.43 (d, J= 10.6 Hz, 1H), 2.06 (s, 3H)。
步驟6:在氬氣下向11g (6.1 g,11.9 mmol)於無水甲醇(60 mL)之溶液中添加甲氧鈉(25%於甲醇中,4.4 mL,19.2 mmol)且將反應混合物在室溫下攪拌2.5 h。TLC指示反應完成後,用濃酒石酸水溶液(20 mL,2 g/20 mL)中和反應(pH = 5),添加水(50 mL),且用DCM (3 x 100 mL)萃取混合物。將合併之有機萃取物經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且 在真空中濃縮。藉由管柱層析法在矽膠上(梯度:0-30% EtOAc於DCM中)純化粗品,得到呈白色固體之1-((2 R,3 R,4 S,5 R)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-3-羥基-5-乙烯基四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮 12g (5.3 g,95%產率)。LCMS: m/z= 469 [M+H] +. 1H NMR (400 MHz, CDCl 3) δ 8.88 (d, J= 4.8 Hz, 1H), 8.03 (d, J= 6.4 Hz, 1H), 7.39 – 7.30 (m, 8H), 7.29 – 7.26 (m, 2H), 6.03 – 5.99 (m, 1H), 5.92 (dd, J= 17.3, 10.9 Hz, 1H), 5.51 (dd, J= 17.3, 1.3 Hz, 1H), 5.31 (dd, J= 11.0, 1.3 Hz, 1H), 4.67 – 4.58 (m, 2H), 4.55 (d, J= 11.3 Hz, 1H), 4.47 (d, J= 11.3 Hz, 1H), 4.27 – 4.23 (m, 2H), 3.52 (d, J= 2.1 Hz, 2H)。
步驟7:在氮氣下向三苯基膦(1.1 g,4.27 mmol)於無水二乙醚(20 mL)之冷卻溶液中添加偶氮二甲酸二異丙酯(0.84 mL,4.27 mmol)且將反應在0℃下攪拌30分鐘。在0℃下向此黃色漿液懸浮液中添加1-((2 R,3 R,4 S,5 R)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-3-羥基-5-乙烯基四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1 H,3 H)-二酮(1 g,2.13 mmol)及苯甲酸(521 mg,4.27 mmol)於無水二乙醚(20 mL)中之冷卻溶液。將混合物溫熱至室溫且攪拌16 h。將反應混合物 在真空中濃縮後,添加NaOH (316 mg)於MeOH(40 mL)中之溶液,且將反應混合物在50℃下攪拌隔夜。將反應冷卻至室溫,且移除過量溶劑。添加1 NHCl溶液(50 mL),且用EtOAc (3 x 60 mL)萃取混合物。將合併之有機萃取物經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且 在真空中濃縮。藉由管柱層析法在矽膠上(梯度:0-45% EtOAc於己烷中)純化粗品,得到呈白色固體之1-((2 R,3 S,4 S,5 R)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-3-羥基-5-乙烯基四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1 H,3 H)-二酮(680 mg,68%產率)。LCMS: m/z= 469 [M+H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 11.84 (s, 1H), 7.93 (d, J= 7.1 Hz, 1H), 7.40 – 7.24 (m, 10H), 6.08 (dd, J= 6.3, 1.8 Hz, 1H), 6.04 – 5.92 (m, 2H), 5.44 (dd, J= 17.2, 1.8 Hz, 1H), 5.28 (dd, J= 10.8, 1.8 Hz, 1H), 4.72 (d, J= 12.1 Hz, 1H), 4.62 (d, J= 12.0 Hz, 1H), 4.50 (q, J= 11.7 Hz, 2H), 4.28 (q, J= 6.4 Hz, 1H), 4.20 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 3.62 (d, J= 10.7 Hz, 1H), 3.50 (d, J= 10.7 Hz, 1H)。
步驟8:在-78℃,氬氣下向1-((2 R,3 S,4 S,5 R)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-3-羥基-5-乙烯基四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1 H,3 H)-二酮(666 mg,1.42 mmol)於無水DCM (17 mL)之溶液中添加三溴化硼(1.0 M於DCM中,7.1 mL,7.11 mmol)且將混合物在相同溫度下攪拌4 h。向溶液中添加吡啶(3 mL)及甲醇(4.4 mL)之混合物且將混合物在-78℃下攪拌1 h。移除過量溶劑,將殘餘物與吡啶共蒸發兩次,然後溶解於吡啶(20 mL)中。將乙酸酐(2.0 mL,21.3 mmol)添加至淡黃色溶液中,且在室溫下攪拌18 h。蒸發反應且將殘餘物分配於EtOAc (60 mL)與H 2O (50 mL)之間。分離有機層,且用EtOAc (2 x 50 mL)萃取水層。將合併之有機萃取物經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且 在真空中濃縮。藉由管柱層析法在矽膠上(梯度:0-25% EtOAc於DCM中)純化粗品,得到呈淡黃色固體之二乙酸(2 R,3 S,4 S,5 R)-2-(乙醯氧基甲基)-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2 H)-基)-2-乙烯基四氫呋喃-3,4-二酯(262 mg,44%產率)。LCMS: m/z= 415 [M+H] +. 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 12.00 (s, 1H), 8.02 (d, J= 7.0 Hz, 1H), 6.24 (d, J= 6.0 Hz, 1H), 5.89 (dd, J= 17.3, 10.9 Hz, 1H), 5.57 (d, J= 5.9 Hz, 1H), 5.51 (dd, J= 17.3, 1.4 Hz, 1H), 5.40 (dd, J= 10.8, 1.4 Hz, 1H), 5.31 (t, J= 5.9 Hz, 1H), 4.34 (d, J= 12.0 Hz, 1H), 4.24 (d, J= 11.9 Hz, 1H), 2.09 (s, 3H), 2.05 (s, 3H), 1.98 (s, 3H)。
步驟9:在氬氣下向二乙酸(2 R,3 S,4 S,5 R)-2-(乙醯氧基甲基)-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2 H)-基)-2-乙烯基四氫呋喃-3,4-二酯(260 mg,0.63 mmol)、2,4,6-三異丙基苯磺醯氯(570 mg,1.88 mmol)及4-(二甲胺基)吡啶(230 mg,1.88 mmol)於無水乙腈(10 mL)之溶液中添加三乙胺(0.26 mL,1.88 mmol)。反應在室溫下攪拌17 h。添加氫氧化銨(,28%水溶液,15 mL)且將反應在室溫下攪拌3 h。移除過量溶劑且藉由管柱層析法在矽膠上(梯度:0-10% MeOH於DCM中)兩次純化粗品。固體與含5%MeOH之DCM共蒸發五次,然後再懸浮於含5%MeOH之DCM中,藉由真空過濾收集,用DCM洗滌,且在高真空下乾燥,得到呈乳白色固體之4-胺基-1-((2 R,3 S,4 S,5 R)-3,4-二羥基-5-(羥甲基)-5-乙烯基四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1 H)-酮(化合物75) (37 mg,20%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 8.04 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 7.66 (s, 1H), 7.44 (s, 1H), 6.04 (dd, J= 6.1, 2.2 Hz, 1H), 5.94 (dd, J= 17.4, 10.9 Hz, 1H), 5.48 (dd, J= 11.9, 5.4 Hz, 2H), 5.39 – 5.30 (m, 2H), 5.18 (dd, J= 10.9, 2.2 Hz, 1H), 4.11 (dd, J= 6.9, 5.1 Hz, 1H), 3.99 (q, J= 6.2 Hz, 1H), 3.53 (dd, J= 11.8, 5.6 Hz, 1H), 3.34 (dd, J= 11.8, 5.1 Hz, 1H)。HRMS (m/z):C 11H 14FN 3O 5(2M+Na) +之計算值597.1730;實驗值597.1732。HPLC純度 = 99%。 實例 36- 化合物 57 60 4- 胺基 -1-((2R,4S,5R)-4- 羥基 -5-( 羥甲基 )-5- 丙基四氫呋喃 -2- ) 嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在室溫下向1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(10g,43.8 mmol)於THF (100 ml)之攪拌溶液中添加咪唑(5.97g,87.64 mmol),隨後添加磷酸三苯酯(17.24g,65.73 mmol)且攪拌15 min。在0℃下向此溶液中以分批方式添加I 2(8.34g,65.73 mmol)且將反應混合物在室溫下攪拌6 h後,藉由TLC監測反應進展。完成後,濃縮反應物質,用冰水稀釋所得殘餘物且用硫酸氫鈉溶液淬滅,用乙酸乙酯萃取。將合併之有機級分用水及鹽水洗滌,然後經硫酸鈉乾燥,過濾且濃縮,得到粗產物,將其藉由用含3%甲醇之DCM溶析之combi-flash純化,得到呈白色固體之所需產物(4.2 g,28 %)。LC-MS (ES, m/z): 336.90 (M-H)。
步驟2:在室溫下向1-((2R,4S,5S)-4-羥基-5-(碘甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(6g,17.75 mmol)於THF (100 ml)之攪拌溶液中添加DBN (6.61g,53.24 mmol),且將反應混合物在60℃下攪拌6 h後,藉由TLC監測反應進展。完成後,將反應混合物濃縮,得到粗產物,將其藉由用含3%甲醇之DCM溶析之combi-flash層析法純化,得到呈灰白色固體之所需產物(2.1 g,56 %)。LC-MS (ES, m/z): 210.80 (M+H +)。
步驟3:在室溫下向1-((2R,4S)-4-羥基-5-亞甲基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(9.0g,42.818 mmol)於DMF (90 ml)之攪拌溶液中添加咪唑(8.74g,128.455 mmol)且攪拌15 min。向此溶液中添加TBSCl (12.907 g,85.637 mmol)且將反應混合物在室溫下攪拌4 h後,藉由TLC監測反應進展。完成後,將反應物質用冰水稀釋且用乙酸乙酯萃取。將合併之有機級分用水及鹽水洗滌,然後經硫酸鈉乾燥,過濾且濃縮,得到粗產物,將其藉由用含1%甲醇之DCM溶析之combi flash層析法純化,得到呈灰白色固體之所需產物(5.2 g,37 %)。LC-MS (ES, m/z): 324.90 (M+H +)。
步驟4:在0℃下向1-((2R,4S)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-亞甲基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(2.500g,7.705 mmol)於DCM (40 ml)之攪拌溶液中添加NaHCO 3(9.709 g,115.58 mmol)及丙酮(17.901 g,308.214 mmol)且攪拌15 min。在0℃下向此溶液中逐滴添加含Oxone(16.579g,53.937 mmol)之水(75 ml),且反應混合物在0℃下攪拌2 h後,藉由TLC監測反應進展。完成後,將反應物質用冷DCM稀釋且用冷硫代硫酸鈉溶液、冰水及冷鹽水洗滌,然後經硫酸鈉乾燥,過濾且濃縮,得到呈淺黃色固體之粗產物(2.7 g),其未經純化即原樣用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 340.95 (M+H +)。
步驟5:向1-((3S,5R,7S)-7-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-1,4-二氧雜螺[2.4]庚-5-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(2.5g,7.343 mmol)於DCM (40 ml)之攪拌溶液中添加烯丙基三甲基矽烷(3.356g,29.373 mmol)且攪拌15 min。在-40℃下向此溶液中以逐滴方式添加SnCl4 (7.652 g,29.373 mmol),且反應混合物在0℃下攪拌2 h後,藉由TLC監測反應進展。完成後,將反應混合物用NaHCO3溶液淬滅,用DCM萃取。將合併之有機級分用水及鹽水洗滌,然後經硫酸鈉乾燥,過濾且濃縮,得到呈淺黃色固體之粗產物,將其藉由用含1.2%甲醇之DCM溶析之combi flash層析法純化,得到呈白色固體之所需產物(0.85 g,30 %)。LC-MS (ES, m/z): 380.85 (M-H)。
步驟6:在室溫下向1-((2R,4S,5R)-5-烯丙基-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.840g,2.196 mmol)於DMF (8 mL)之攪拌溶液中添加咪唑(0.448g,6.588 mmol)且攪拌15 min。向此溶液中添加TBDMS-Cl (0.662g,4.392 mmol)且在室溫下攪拌4 h後,藉由TLC監測反應進展。完成後,將反應混合物用冰水稀釋且用乙酸乙酯萃取。將合併之有機級分用水及鹽水洗滌,然後經硫酸鈉乾燥,過濾且濃縮,得到呈泡沫型固體之粗產物,將其藉由用含30% EtOAc之己烷溶析之combi-flash層析法純化,得到呈白色固體之所需產物(0.820 g,75 %)。LC-MS (ES, m/z): 495.10 (M-H)。
步驟7:在室溫下向1-((2R,4S,5R)-5-烯丙基-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.4 g,0.805 mmol)於乙酸乙酯(20 mL)之攪拌溶液中添加10% Pd/C (40 mg,10% wt/wt)。反應混合物在室溫,氫氣氣球壓力下攪拌2h後,藉由TLC監測反應進展。完成後,將反應混合物經矽藻土過濾,濾液濃縮得到粗產物,將其藉由用含30% EtOAc之己烷溶析之Combi-flash層析法純化,得到呈白色固體之所需產物(0.310 g,73 %)。LC-MS (ES, m/z): 540.20 (M+41, MeCN加合物)。
步驟8:在室溫下向1-((2R,4S,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-5-丙基 四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.380g,0.762 mmol)於CH 3CN (7 ml)之攪拌溶液中添加Et 3N (0.308g,3.047 mmol)及DMAP (0.186g,1.524 mmol)且攪拌15 min。在0℃下向此溶液中以分批方式添加TPSCl (0.461g,1.524 mmol)且在室溫下攪拌2 h。隨後在0℃下添加1,2,4-三唑(0.263g,3.809 mmol)且在室溫下繼續攪拌2 h。藉由TLC及LCMS監測反應進展。完成後,用冰水及乙酸乙酯稀釋反應混合物。分離有機層,且用2x20 mL EtOAc洗滌水層。將合併之有機物用水及鹽水洗滌,然後經硫酸鈉乾燥,過濾且濃縮,得到粗產物,將其藉由用含30% EtOAc之己烷溶析之Combiflash層析法純化,得到呈無色膠狀液體之所需產物(0.310 g,73 %)。LC-MS (ES, m/z): 550.15 (M+H +)。
步驟9:向1-((2R,4S,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-5-丙基 四氫呋喃-2-基)-4-(1H-1,2,4-三唑-1-基)嘧啶-2(1H)-酮(0.300 g,0.545 mmol)於1,4-二噁烷(2 mL)之攪拌溶液中添加氨溶液(2 mL)且在室溫下攪拌15 min,然後加熱至30℃歷時4h。藉由TLC及LCMS監測反應進展。完成後,將反應混合物濃縮,得到呈淺黃色液體之粗產物,將其藉由用含4 % MeOH之DCM溶析之Combiflash層析法純化,得到呈無色黏稠液體之所需產物(0.190 g)。LC-MS (ES, m/z): 498.20 (M+H +)。
步驟10:在0℃下向4-胺基-1-((2R,4S,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-5-丙基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮(0.170 g,0.341 mmol)於THF (3 mL)之攪拌溶液中添加TBAF (2.05 ml,2.049 mmol)。反應混合物在0℃至室溫下攪拌4 h後,藉由TLC監測反應進展。完成後,將反應物質在真空下濃縮。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗品:管柱:X SELECT (250mmx20.0mm), 5.0µ; 流動相:A:含0.02% NH 4OH之水,B:ACN,流率:18.0 ml/min,梯度程式:時間/% B:0/5,2/10,8/20,得到29 mg化合物57,其進一步在以下條件下進行對掌性製備型純化:管柱:Chiralpak IH,250mmX21mm,5µm;流動相:含正己烷(A)及氨之IPA:MeOH,1:1(B);流率:15ml;等度:75 (A):25(B);稀釋劑:EtOH:DCM,3:1.2ml;注射量-0.5ml;運行時間-15min;儀器製造商和型號:Agilent-1260 Infinity。此得到4-胺基-1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-丙基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮(10 mg,11 %呈白色固體) (化合物60)。LC-MS (ES, m/z): [M+H] +=269.85, 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 7.84 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 7.16 - 6.99 (m, 2H), 6.10 - 6.05 (m, 1H), 5.69 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 5.04 (d, J= 4.9 Hz, 1H), 4.97 - 4.93 (m, 1H), 4.25 - 4.19 (m, 1H), 3.47 - 3.36 (m, 2H), 2.19 - 2.12 (m, 1H), 2.08 - 2.00 (m, 1H), 1.58 - 1.45 (m, 2H), 1.41 - 1.28 (m, 2H), 0.87 (t, J= 7.2 Hz, 3H)。 實例 37- 化合物 61 4- 胺基 -1-((2R,4S,5R)-5- 疊氮基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- )-5- 氟基嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:向5-氟基-1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(14g,56.87 mmol)及咪唑(7.74g,113.73 mmol)於無水THF (160 mL)之溶液中添加三苯基膦(22.37g,85.30 mmol),將反應混合物攪拌15 min,此後在0℃下分批添加碘(21.64 g,85.30mmol)。在室溫下攪拌反應混合物16h後,藉由TLC監測反應進展。過濾反應混合物,用THF (50 mL)洗滌。在減壓下濃縮濾液,得到粗化合物。將粗材料溶解於DCM (500 mL)中,用水(200 mL)洗滌且用DCM (200 mL)萃取水層。將合併之有機物用水(300 mL)、鹽水(300 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且在減壓下濃縮,得到粗化合物。藉由用含10% MeOH之DCM溶析之Combi-flash管柱層析法純化粗殘餘物,得到呈白色固體之5-氟基-1-((2R,4S,5S)-4-羥基-5-(碘甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(9g,44.46%)。(ES, m/z): 356.75 (M+H +)。
步驟2:在室溫下向5-氟基-1-((2R,4S,5S)-4-羥基-5-(碘甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(8g,22.47 mmol)於THF (80 mL)之溶液中添加DBN (11.10 mL,89.86 mmol)。反應混合物在60℃下攪拌2h後,藉由TLC監測反應進展。完成後,在減壓下濃縮反應混合物,得到粗化合物。藉由用含4% MeOH之DCM溶析之Combi-flash層析法純化粗產物,得到呈白色固體之所需產物(3.6 g,70.31%)。(ES, m/z): 226.90 (M-1)。
步驟3:將疊氮化鈉(538.47mg,8.28 mmol)添加至苄基三乙基氯化銨(1.89g,8.28 mmol)於MeCN (12 mL)之溶液中,且將混合物在室溫下攪拌2 h。在室溫下使所得懸浮液通過帶有注射器過濾器之注射器,進入 5-氟基-1-((2R,4S)-4-羥基-5-亞甲基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(630mg,2.76 mmol)於THF (10 mL)之懸浮液中。向此混合物中添加含碘(701.01 mg,2.76 mmol)之THF (5 mL)且將混合物再攪拌2 h。藉由TLC及LCMS監測反應進展。完成後,在減壓下濃縮反應混合物,得到粗化合物。藉由用含4% MeOH之DCM溶析之Combi-flash層析法純化粗殘餘物,得到呈白色固體之1-((2R,4S,5S)-5-疊氮基-4-羥基-5-(碘甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(600mg,55.04%)。(ES, m/z): 395.75 (M-H)。
步驟4:在0℃下向1-((2R,4S,5S)-5-疊氮基-4-羥基-5-(碘甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(600 mg,1.51 mmol)、DMAP (18.45 mg,0.15 mmol)及Et 3N (0.420 mL,3.0219 mmol)於THF (20 mL)之攪拌溶液中逐滴添加苯甲醯氯(0.210 mL,1.8131 mmol)。反應混合物在室溫下攪拌2h後,藉由TLC監測反應進展。完成後,在減壓下濃縮反應混合物,得到粗化合物。藉由用含4% MeOH之DCM溶析之Combi-flash層析法純化粗殘餘物,得到呈白色固體之苯甲酸(2S,3S,5R)-2-疊氮基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-2-(碘甲基)四氫呋喃-3-酯(360mg,47.61%)。(ES, m/z): 499.85 (M-H)。
步驟5:將苯甲酸(2S,3S,5R)-2-疊氮基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-2-(碘甲基)四氫呋喃-3-酯(300mg,0.60 mmol)及苯甲酸銀(1.37g,5.99 mmol)於吡啶(3 mL)中之混合物在100℃下加熱16 h。藉由TLC及LCMS監測反應進展。完成後,在減壓下濃縮反應混合物,得到粗化合物。藉由用含6% MeOH之DCM溶析之Combi-flash層析法純化粗殘餘物,得到呈白色固體之苯甲酸(2R,3S,5R)-2-疊氮基-2-((苄醯氧基)甲基)-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)四氫呋喃-3-酯(260mg,87.83%)。(ES, m/z): 493.95 (M-H)。
步驟6:在 至0℃向苯甲酸(2R,3S,5R)-2-疊氮基-2-((苄醯氧基)甲基)-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)四氫呋喃-3-酯(0.02 g,0.04 mmol)於MeCN (1.0ml)之攪拌溶液中添加 Et 3N (0.022 ml,0.160 mmol)、DMAP (0.009g,0.08 mmol)及TPSCl (0.024g,0.080 mmol),且反應混合物在室溫下攪拌4h後,向其中添加NH 4OH:1,4-二噁烷(0.01 ml) 且在室溫下攪拌15 min。藉由TLC監測反應進展。完成後,將反應混合物濃縮且在真空下乾燥。藉由用含 5 % MeoH之DCM溶析之製備型TLC純化粗材料,得到呈白色固體之苯甲酸(2R,3S,5R)-5-(4-胺基-5-氟基-2-側氧基嘧啶-1(2H)-基)-2-疊氮基-2-((苄醯氧基)甲基)四氫呋喃-3-酯(0.018g,91.0 %)。(ES, m/z): 494.8 (M+H +)。
步驟7:將苯甲酸(2R,3S,5R)-5-(4-胺基-5-氟基-2-側氧基嘧啶-1(2H)-基)-2-疊氮基-2-((苄醯氧基)甲基)四氫呋喃-3-酯,7 (0.046g; 0.093 mmol)於7N甲醇氨(2.0ml)中之溶液在室溫下攪拌16h,然後藉由TLC監測反應進展。完成後,將反應混合物濃縮且在真空下乾燥。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物:流動相:A:含0.02% NH 4OH之水;B:MeCN;管柱:X SELECT (250mmx20.0mm),5.0µ;流率:15ml/min;梯度程式:時間/% B:0/5,2/10,8/25,得到呈白色固體之4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-疊氮基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮(8.5mg,32 %)。(ES, m/z): (M+H +)=286.90; 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 7.99 (d, J = 7.2 Hz, 1H), 7.87 - 7.81 (m, 1H), 7.63 - 7.57 (m, 1H), 6.30 - 6.25 (m, 1H), 5.73 (d, J = 5.6 Hz, 1H), 5.64 (t, J = 5.7 Hz, 1H), 4.45 - 4.39 (m, 1H), 3.68 - 3.56 (m, 2H), 2.28 - 2.22 (m, 2H)。 實例 38- 化合物 66 4- 胺基 -5- 氟基 -1-((2R,4S,5R)-4- 羥基 -5-( 羥甲基 )-5-( 三氟甲基 ) 四氫呋喃 -2- ) 嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:向D-核糖(50g,333.1 mmol)於丙酮(500 mL)之攪拌懸浮液中添加C. H 2SO 4(1.8mL,33.31 mmol),且反應混合物在室溫下攪拌16h後,藉由TLC監測反應進展。完成後,將固體NaHCO 3添加至反應混合物中且攪拌1h。將獲得之固體通過矽藻土床過濾,經Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮。藉由用含80 %乙酸乙酯之己烷溶析之管柱(60-120矽膠)層析法純化粗材料,獲得呈無色油狀物之(3aR,6R,6aR)-6-(羥甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧雜環戊烯-4-醇(52g,82.0 %)。
步驟2:向(3aR,6R,6aR)-6-(羥甲基)-2,2-二甲基-四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧雜環戊烯-4-醇(62g,325.9 mmol)於DCM (500 mL)之攪拌溶液中添加咪唑(33.2g,488.8 mmol)且將其冷卻至0℃,然後逐滴添加TBDMSCl (49.1g , 325.9 mmol)於DCM (100 mL)中之溶液。反應混合物在室溫下攪拌16h後,藉由TLC監測反應進展。將反應混合物分配於DCM與碳酸氫鈉水溶液之間。將有機層分離,用鹽水洗滌,經Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮。藉由用含10-15 %乙酸乙酯之己烷溶析之Combiflash管柱層析法純化粗材料,得到呈無色油狀物之(3aR,6R,6aR)-6-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧雜環戊烯-4-醇(62g,62.4 %)。
步驟3:在0℃下向異丙基三苯基碘化鏻(2.8g,6.570 mmol)於THF(15mL)之攪拌懸浮液中逐滴添加n-BuLi (1.6 M於正己烷中) (4.1mL,6.57 mmol)且在室溫下將反應混合物攪拌1h。然後在0℃下向以上反應混合物中逐滴添加(3aR,6R,6aR)-6-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d] [1,3]二氧雜環戊烯-4-醇(1g;3.285 mmol)於THF (5mL)中之溶液。反應混合物在室溫下攪拌16h後,藉由TLC監測反應進展。將反應混合物用飽和NaHCO 3淬滅,且所得固體通過矽藻土床過濾。將濾液用二乙醚稀釋且用水及鹽水洗滌,經Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由用含10 %乙酸乙酯之己烷溶析之Combiflash管柱層析法純化粗材料,得到呈無色油狀物之所需產物(0.46g,42.3 %)且回收0.25 g (R)-2-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-1-((4R,5S)-2,2-二甲基-5-(2-甲基丙-1-烯-1-基)-1,3-二氧雜環戊烷-4-基)乙-1-醇。
步驟4:在室溫下向(R)-2-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-1-((4R,5S)-2,2-二甲基-5-(2-甲基丙-1-烯-1-基)-1,3-二氧雜環戊烷-4-基)乙-1-醇(12g,36.30 mmol)於MeCN (100mL)之攪拌溶液中添加IBX (15.2g,54.46 mmol),然後將反應混合物回流3h且藉由TLC監測反應進展。通過矽藻土床過濾反應混合物且在減壓下濃縮濾液(filtarate)。藉由用含10 %乙酸乙酯之己烷溶析之Combiflash管柱層析法純化粗材料,得到呈無色油狀物之2-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-1-((4S,5S)-2,2-二甲基-5-(2-甲基丙-1-烯-1-基)-1,3-二氧雜環戊烷-4-基)乙-1-酮(9g,75.4 %)。
步驟5:在0℃下向2-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-1-((4S,5S)-2,2-二甲基-5-(2-甲基丙-1-烯-1-基)-1,3-二氧雜環戊烷-4-基)乙-1-酮(6.3g,19.17 mmol)及TMSCF 3(3.4mL,23.01 mmol)於THF (100 mL)之攪拌溶液中添加TBAF (23mL,23.01 mmol),且反應混合物在0℃下攪拌30 min然後在室溫下攪拌2h後,藉由TLC監測反應進展。完成後,濃縮反應混合物且將所得殘餘物分配於DCM及碳酸氫鈉水溶液中。將有機層分離,用鹽水洗滌,經Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮。藉由用含30-40 % EA之己烷溶析之Combiflash管柱層析法純化粗材料,得到呈黃色油狀物之(R)-2-((4S,5S)-2,2-二甲基-5-(2-甲基丙-1-烯-1-基)-1,3-二氧雜環戊烷-4-基)-3,3,3-三氟丙烷-1,2-二醇(4g,73.4 %)。
步驟6:在0℃下向(R)-2-((4S,5S)-2,2-二甲基-5-(2-甲基丙-1-烯-1-基)-1,3-二氧雜環戊烷-4-基)-3,3,3-三氟丙烷-1,2-二醇(0.18g,0.633 mmol)於DCM (10mL)之攪拌溶液中添加Et 3N (0.097mL,0.696 mmol)、DMAP (10mg)及苯甲醯氯(0.074 mL,0.633 mmol),且反應混合物在室溫下攪拌16h後,藉由TLC監測反應進展。將反應混合物分配於DCM與碳酸氫鈉水溶液之間。將有機層分離,用鹽水洗滌,經Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮。藉由用含30-40 %乙酸乙酯之己烷溶析之Combiflash管柱層析法純化粗材料,獲得呈黃色油狀物之苯甲酸(R)-2-((4S,5S)-2,2-二甲基-5-(2-甲基丙-1-烯-1-基)-1,3-二氧雜環戊烷-4-基)-3,3,3-三氟基-2-羥丙酯(0.18g,73.2 %)。
步驟7:將苯甲酸(R)-2-((4S,5S)-2,2-二甲基-5-(2-甲基丙-1-烯-1-基)-1,3-二氧雜環戊烷-4-基)-3,3,3-三氟基-2-羥丙酯(4g,10.30 mmol)於DCM (200mL)中之攪拌溶液冷卻至-78℃且向其中鼓泡O 3氣體,直至混合物變成藍色。向以上反應混合物中鼓泡氧氣且用過量的DMS (4.0mL)淬滅臭氧化物,且反應混合物在室溫下攪拌16h後,藉由TLC監測反應進展。完成後,濃縮反應混合物且藉由用含30-40 %乙酸乙酯之己烷溶析之conbiflash管柱層析法純化粗材料,得到呈無色液體之苯甲酸((3aS,4R,6aR)-6-羥基-2,2-二甲基-4-(三氟甲基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧雜環戊烯-4-基)甲酯(3.6g,96.4 %)。(ES, m/z): 380.0 (M+18)。
步驟8:在0℃下將苯甲酸((3aS,4R,6aR)-6-羥基-2,2-二甲基-4-(三氟甲基)四氫呋喃并[3,4-d] [1,3]二氧雜環戊烯-4-基)甲酯(3.6g,9.94 mmol)溶解於TFA (18mL)及水(2mL)中,且反應混合物在室溫下攪拌16h後,藉由TLC監測反應進展。完成後,濃縮反應混合物,將所得殘餘物與甲苯共蒸餾兩次,且未經純化原樣用於下一步驟中(3.2g,99.9 %)。(ES, m/z): 320.7 (M-H)。
步驟9:在0℃下向苯甲酸((2R,3S,4R)-3,4,5-三羥基-2-(三氟甲基)四氫呋喃-2-基)甲酯(3.2 g,9.93 mmol)於DCM (100mL)之攪拌溶液中添加Et 3N (6.9mL,49.65 mmol)、DMAP (6g,49.65 mmol)及苯甲醯氯(5.8ml,49.65 mmol)。反應混合物在室溫下攪拌16h後,藉由TLC監測反應進展。完成後,將反應混合物分配於DCM與碳酸氫鈉水溶液之間。將有機層分離,用鹽水洗滌,經Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮,得到粗材料。藉由用含 30-40 % 乙酸乙酯之己烷溶析之Combiflash管柱層析法純化粗產物,獲得所需產物(4g,66.4 %)。(ES, m/z): 652 (M+18)。
步驟10:在120℃下將5-氟基尿嘧啶(1.3g,10.40 mmol)及硫酸銨(60mg)於HMDS (17.5mL,84.15 mmol)中之懸浮液加熱2h,當反應混合物變成澄清溶液時,將其濃縮且將殘餘物溶解於MeCN (40ml)中,且在室溫下將所得溶液添加至三苯甲酸(3R,4S,5R)-5-((苄醯氧基)甲基)-5-(三氟甲基)四氫呋喃-2,3,4-三酯,10 (3.0 g;4.728 mmol)於MeCN (10 mL)之溶液中。在室溫下將TMSOTf (6.1mL,33.09 mmol)添加至以上反應混合物中,且反應混合物在90℃下加熱16 h後,藉由TLC監測反應進展。完成後,用飽和NaHCO 3淬滅反應混合物且用EtOAc (3 x 15mL)萃取所得混合物。將合併之有機物用冷水洗滌一次,經Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮,得到粗材料,將其藉由用含30 %乙酸乙酯之正己烷溶析之Combiflash管柱層析法純化,得到呈白色固體之二苯甲酸((2R,3S,4R,5R)-2-((苄醯氧基)甲基)-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-2-(三氟甲基)四氫呋喃-3,4-二酯(1.4g,46.0 %),且回收1g三苯甲酸(3R,4S,5R)-5-((苄醯氧基)甲基)-5-(三氟甲基)四氫呋喃-2,3,4-三酯。(ES, m/z): 642.7 (M+H +)。
步驟11:在室溫下將二苯甲酸(2R,3S,4R,5R)-2-((苄醯氧基)甲基)-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-2-(三氟甲基)四氫呋喃-3,4-二酯(1.4g,2.18 mmol)於7N甲醇氨(20mL)中之溶液攪拌16h且藉由TLC監測反應進展。將反應混合物濃縮且在真空下乾燥。藉由用含8 % MeOH之DCM溶析之Combiflash管柱層析法純化粗材料,獲得呈無色黏稠固體之1-((2R,3R,4S,5R)-3,4-二羥基-5-(羥甲基)-5-(三氟甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.6g,83.4 %)。(ES, m/z): M+1=330.8。
步驟12:在室溫下向1-((2R,3R,4S,5R)-3,4-二羥基-5-(羥甲基)-5-(三氟甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.3g,0.91 mmol)於DMF (2.0mL)之攪拌溶液中添加碳酸二苯酯(0.2g,0.99 mmol)及NaHCO 3(0.019g,0.227 mmol)。在140℃,MW中將反應混合物攪拌1 h且藉由TLC監測反應進展。完成後,將反應混合物濃縮且在真空下乾燥,得到呈白色固體之所需產物(0.45g)。將粗材料原樣用於下一步驟中。(ES, m/z): M+1=312.8。
步驟13:在室溫下向(2R,3S,3aS,9aR)-7-氟基-3-羥基-2-(羥甲基)-2-(三氟甲基)-2,3,3a,9a-四氫-6H-呋喃并[2',3':4,5]噁唑并[3,2-a]嘧啶-6-酮(0.35g,1.12 mmol)於1,4-二噁烷(20mL)之攪拌溶液中添加LiBr (0.12g,1.46 mmol)及BF3.Et 2O (0.15ml,1.233 mmol),且反應混合物在60℃下攪拌16h後,藉由TLC監測反應進展。濃縮反應混合物,得到粗材料,將其藉由用含8 % MeOH之DCM溶析之Combiflash管柱層析法純化,獲得呈白色固體之1-((2R,3R,4R,5R)-3-溴基-4-羥基-5-(羥甲基)-5-(三氟甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.35g,79.4 %)。(ES, m/z): M+1=394.7。
步驟14:將1-((2R,3R,4R,5R)-3-溴基-4-羥基-5-(羥甲基)-5-(三氟甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.18g;0.458 mmol)於乙醇(10.0 mL)中之攪拌溶液用氬氣脫氣5 min,且向其中添加Pd (OH) 2(0.04g),隨後添加NaOAc (0.056 g; 0.687 mmol)。反應混合物在室溫,H 2氣體氛圍下攪拌2 h後,藉由TLC監測反應進展。完成後,通過矽藻土床過濾反應物質,且在減壓下濃縮濾液,得到粗產物。藉由用含8 % MeOH之DCM溶析之Combiflash管柱層析法純化粗材料,獲得呈無色黏稠材料之5-氟基-1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-(三氟甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.12g,83.4 %)。(ES, m/z): M+1=314.7。
步驟15:在室溫下向5-氟基-1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-(三氟甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.12g,0.382 mmol)於吡啶(5.0mL)之攪拌溶液中添加乙酸酐(0.1mL,1.146 mmol)。反應混合物在室溫下攪拌16h後,藉由TLC監測反應進展。完成後,在減壓下濃縮反應混合物且將所得殘餘物分配於EtOAc與碳酸氫鈉水溶液之間。將有機層分離,用鹽水洗滌,經Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮,得到粗化合物,將其藉由用含20 %乙酸乙酯之己烷溶析之Combiflash管柱層析法純化,獲得呈白色固體之乙酸((2R,3S,5R)-3-乙醯氧基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫-嘧啶-1(2H)-基)-2-(三氟甲基)四氫呋喃-2-基)甲酯(0.12 g,78.8 %)。(ES, m/z): M+1=398.8。
步驟16:在 0℃下向乙酸((2R,3S,5R)-3-乙醯氧基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-2-(三氟甲基)四氫呋喃-2-基)甲酯(0.035g,0.087 mmol)於MeCN (1.0mL)之攪拌溶液中添加Et 3N (0.048mL,0.348 mmol)、DMAP (0.021g,0.174 mmol)及TPSCl (0.053g,0.175 mmol)且將反應混合物在室溫下攪拌4h。然後將NH 4OH:1,4-二噁烷(0.2 ml)添加至RM且在室溫下攪拌15 min。藉由TLC監測反應進展。完成後,將反應混合物濃縮且在真空下乾燥。藉由用100 % EtOAc溶析之製備型TLC純化粗材料,得到呈黃色固體之乙酸((2R,3S,5R)-3-乙醯氧基-5-(4-胺基-5-氟基-2-側氧基嘧啶-1(2H)-基)-2-(三氟甲基)四氫呋喃-2-基)甲酯(0.025g; 72.3 %)。(ES, m/z): M+1=397.45。
步驟17:在室溫下將乙酸((2R,3S,5R)-3-乙醯氧基-5-(4-胺基-5-氟基-2-側氧基嘧啶-1(2H)-基)-2-(三氟甲基)四氫呋喃-2-基)甲酯(0.125g,0.314 mmol)於7N甲醇氨(2.0mL)中之溶液攪拌16h且藉由TLC及LCMS監測反應進展。完成後,將反應混合物濃縮且在真空下乾燥。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗化合物:流動相:A= 含0.02% NH 4OH之水;B= MeCN;管柱:X SELECT (250mmx20.0mm),5.0µ;流率:18ml/min;梯度程式:時間/% B:0/5,2/10,8/30,得到呈白色固體之4-胺基-5-氟基-1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-(三氟甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮(20mg,20 %)。(ES, m/z): M+1=313.95; 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 7.97 (d, J = 7.0 Hz, 1H), 7.90 - 7.82 (m, 1H), 7.65 - 7.58 (m, 1H), 6.35 - 6.29 (m, 1H), 5.80 - 5.73 (m, 1H), 5.65 - 5.57 (m, 1H), 4.73 - 4.66 (m, 1H), 3.76 - 3.64 (m, 2H), 2.39 - 2.18 (m, 2H)。 實例 39- 化合物 7 1-((2R,4S,5R)-5-( 氯甲基 )-4- 氟基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- )-5- 甲基嘧啶 -2,4(1H,3H)- 二酮之合成
步驟1:在氮氣氛圍下向胸苷(14.2 g,58.6 mmol)於DMF (150 mL)之溶液中添加咪唑(11.9 g,175.8 mmol)。然後在0℃下添加氯化三級丁基二甲基矽烷基(9.7 g,64.4 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下攪拌2 h後,藉由LCMS可以偵測到所需產物。用乙酸乙酯(3 x 100 mL)萃取所得混合物。將合併之有機層用飽和鹽溶液(3 x 100 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用二氯甲烷/甲醇(20/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色油狀物之1-[(2R,4S,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(15.5 g,43.4 mmol,74.17%)。LC-MS (ES, m/z): 357 [M+H] +
步驟2:在氮氣氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(15.5 g,43.4 mmol)於N, N-二甲基甲醯胺(200 mL)之溶液中添加PPh 3(34.2 g,130.4 mmol)。然後在水冰下添加偶氮二甲酸二異丙酯(26.3 g,130.4 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下攪拌1.5 h後,藉由LCMS可以偵測到所需產物。用乙酸乙酯(3 x 100 mL)萃取所得混合物。將合併之有機層用飽和鹽溶液(3 x 100 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用二氯甲烷/甲醇(20/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色油狀物之(1R,10R)-10-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-甲基-8,11-二氧雜-2,6-二氮雜三環[7.2.1.0^ {2,7}]十二碳-3,6-二烯-5-酮(14.5 g,42.8 mmol,98.53%)。LC-MS (ES, m/z): 339 [M+H] +
步驟3:在氮氣氛圍下向(1R,10R)-10-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-甲基-8,11-二氧雜-2,6-二氮雜三環[7.2.1.0{2,7}]十二碳-3,6-二烯-5-酮(14.5 g,42.8 mmol)於乙醇(140 mL)及水(14 mL)之溶液中添加氫氧化鈉(3.4 g,85.6 mmol)。在45℃,氮氣氛圍下攪拌2 h後,LCMS可以偵測到所需產物。在減壓下濃縮所得混合物。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化殘餘物:(管柱,矽膠;流動相,含MeCN之水,在15 min內10%至20%梯度;偵測器,UV 254 nm),得到呈白色固體之1-[(2R,4R,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(7.6 g,31.3 mmol,73.24%)。LC-MS (ES, m/z): 243 [M+H] +
步驟4:在水冰,氮氣氛圍下向1-[(2R,4R,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(6.5 g,26.8 mmol)於二甲基甲醯胺(40 mL)之溶液中添加咪唑(5.48 g,80.5 mmol)及氯化三級丁基二甲基矽烷基(4.4 g,29.5 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下攪拌隔夜後,藉由LCMS可以偵測到所需產物。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化所得混合物:(管柱,矽膠;流動相,含MeCN之水,在15 min內10%至80%梯度;偵測器,UV 254 nm),得到呈白色固體之1-[(2R,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(8.5 g,23.8 mmol,88.86%)。LC-MS (ES, m/z): 357 [M+H] +
步驟5:在氮氣氛圍下向1-[(2R,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(8.5 g,23.8 mmol)於二氯甲烷(80 mL)之溶液中添加2,4,6-三甲基吡啶(11.5 g,95.3 mmol)及硝酸銀(16.2 g,95.3 mmol)。然後在水冰下添加1-(氯基二苯基甲基)-4-甲氧基苯(36.8 g,119.2 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下攪拌隔夜後,藉由LCMS可以偵測到所需產物。將所得混合物用二氯甲烷(3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用飽和鹽溶液(3 x 100 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液,得到呈淡黃色油狀物之1-[(2R,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(14 g,22.2 mmol,93.37%)。LC-MS (ES, m/z): 629 [M+H] +
步驟6:在氮氣氛圍下向1-[(2R,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(14 g,22.2 mmol)於四氫呋喃(140 mL)之溶液中添加四丁基氟化銨(44.5mL,44.526 mmol,1 M於THF中)。在室溫,氮氣氛圍下攪拌隔夜後,可以藉由LCMS偵測到所需產物。將所得混合物濃縮且藉由用二氯甲烷/甲醇(20/1)溶析之矽膠管柱層析法純化,得到呈淡黃色固體之1-[(2R,4R,5R)-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(11 g,21.3 mmol,96.02%)。LC-MS (ES, m/z): 515 [M+H] +
步驟7:在60℃下將1-[(2R,4R,5R)-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(11 g,21.3 mmol)及IBX (23.9 g,85.5 mmol)於乙腈(acetotronile) (20 mL)中之混合物攪拌0.5 h。過濾所得混合物;用乙腈(3 x 100 mL)洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EA (1/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之(2S,3R,5R)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(10 g,19.5 mmol,91.27%)。LC-MS (ES, m/z): 513 [M+H] +
步驟8:向(2S,3R,5R)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(10 g,19.5 mmol)及HCHO (4.8 g,126.9mmoL)於二噁烷(100 mL)之混合物中添加含NaOH 1.5 g,39.1 mmol)之H 2O (20 mL),將混合物在室溫下攪拌15小時,然後添加NaBH 4(3.3 g,87.7 mmol)且在0℃下攪拌20 min。將所得混合物在真空下濃縮。用乙酸乙酯(3 x 100 mL)萃取所得混合物。將合併之有機層用飽和鹽溶液(3 x 100 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用二氯甲烷/甲醇(10/)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4R)-5,5-雙(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(5.6 g,9.5 mmol,52.71%)。LC-MS (ES, m/z):545 [M+H] +
步驟9:在-30℃下向1-[(2R,4R)-5,5-雙(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(5.2 g,9.5 mmol)及吡啶(3.7 g,47.9 mmo)於DCM (50 mL)之混合物中添加Tf 2O (5.41 g,19.1 mmol)且在室溫下攪拌1.5 h。用水(10 mL)淬滅混合物且用飽和NaHCO 3溶液洗滌。藉由用PE/EA (1/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之三氟甲烷磺酸[(3R,5R)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(4 g,4.9 mmol,51.60%)。LC-MS (ES, m/z): 809 [M+H] +
步驟10:向三氟甲烷磺酸[(3R,5R)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(3.5 g,4.3 mmol)及NaH (0.10 g,4.3 mmol)於DMF (20 mL)之溶液中添加LiCl (1.1 g,25.9 mmoL),在室溫下攪拌2 h。用乙酸乙酯(3 x 100 mL)萃取所得混合物。將合併之有機層用飽和鹽溶液(3 x 100 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EA (1/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之(1R,10R,11R)-10-(氯甲基)-11-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-4-甲基-8,13-二氧雜-2,6-二氮雜三環[8.2.1.0{2,7}]十三碳-3,6-二烯-5-酮(1.2 g,2.2 mmol,50.87%)。LC-MS (ES, m/z): 545/ 547 [M+H] +
步驟11:向(1R,10R,11R)-10-(氯甲基)-11-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-4-甲基-8,13-二氧雜-2,6-二氮雜三環[8.2.1.0{2,7}]十三碳-3,6-二烯-5-酮(1.2 g,2.2 mmol)於THF之混合物中添加含NaOH (0.18 g,4.4 mmol)之水(2 mL),將混合物在室溫下攪拌隔夜。將所得混合物在真空下濃縮。藉由用DCM/MeOH (10/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4R,5R)-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(750 mg,1.3 mmol,60.50%)。LC-MS (ES, m/z): 563/ 565 [M+H] +
步驟12:將1-[(2R,4R,5R)-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(750 mg,1.3 mmol)及CH 3COOH (8 mL)於H 2O (2mL)中之混合物在室溫下攪拌2 h。將所得混合物在真空下濃縮。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (10/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4R,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(350 mg,1.2 mmol,90.39%)。LC-MS (ES, m/z): 291/ 293 [M+H] +
步驟13:在室溫下將1-[(2R,4R,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(280 mg,0.9 mmol)及TBSCl (159.6 mg,1.1mmol,1.1)於吡啶(5 mL)中之混合物攪拌1 h。將所得混合物在真空下濃縮。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (10/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(310 mg,0.7 mmol,79.48%)。LC-MS (ES, m/z): 405/ 407 [M+H] +
步驟14:在0 ℃下向1-[(2R,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(310 mg,0.7 mmol)於DCM (5 mL)之溶液中逐滴添加DAST (3.1 mL,3.1mmol,1 M於DCM中),在室溫下攪拌10 min。藉由製備型TLC用CHCl 2/MeOH (10/1)純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-4-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(35 mg,0.075,11.24%)。LC-MS (ES, m/z): 407/ 409 [M+H] +
步驟15:在室溫,氮氣氛圍下將1-[(2R,4S,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-4-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(30 mg,0.07 mmol)及TFA (0.7 mL)於THF (2.1 mL)及H 2O (0.7 mL)中之混合物攪拌隔夜。藉由製備型TLC用CH 2Cl 2/MeOH (10/1)純化殘餘物,得到呈白色固體之1-((2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-氟基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(10.9 mg,0.035mmol,50.32%)。LC-MS (ES, m/z): 293/295 [M+H] +. 99.6%純度。LCMS之條件:(管柱:Luna Omega,50*3 mm,3 μm;流動相A:水/0.09%FA,流動相B:乙腈/0.1%FA;流率:1.5000 mL/min;梯度:在1.89 min內20% B至50% B,在0.10 min內50% B至100% B,在0.70 min內100% B至100% B,在0.05 min內100% B至5% B;波長:254 nm;RT1(min):0.842)。 1H NMR (300 MHz, DMSO-d 6) δ 7.66 (d, J = 1.6 Hz, 1H), 6.31 (dd, J = 8.4, 6.5 Hz, 1H), 5.43 - 5.25 (m, 1H), 3.82 - 3.63 (m, 4H), 2.56 – 2.55 (m, 1H), 2.49 (d, J = 6.3 Hz, 1H), 1.81 (d, J = 1.3 Hz, 3H)。 實例 40– 化合物 3 1-((2R,3S,4R)-3- 氟基 -4- 羥基 -5,5- ( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- ) 嘧啶 -2,4(1H,3H)- 二酮之合成
步驟1:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(4 g,16.3 mmol)於吡啶(25 mL)之攪拌混合物中分批添加三級丁基二甲基氯矽烷(2.7 g,17.9 mmol)。將混合物在室溫下攪拌3小時。將所得混合物用水稀釋且用乙酸乙酯萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液,得到呈灰白色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-5- {[ (三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(5.34 g,14.8 mmol,91.18%)。LC-MS: (ES, m/z): 361 (M+H +)。
步驟2:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(5.3 g,14.8 mmol)、硝酸銀(5.1 g,29.6 mmol)及2,6-二甲基吡啶(4.8 g,44.4 mmol)於二氯甲烷(20 mL)之攪拌混合物中分批添加1-(氯基二苯基甲基)-4-甲氧基苯(5 g,16.3 mmol)。將混合物在室溫下攪拌15小時。過濾所得混合物;用二氯甲烷洗滌濾餅。用鹽酸水溶液(1 M)及鹽水稀釋濾液。過濾所得混合物;用二氯甲烷洗滌濾餅。將合併之有機層用鹽水洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液,得到呈黃色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(8.84 g,13.9 mmol,94.30%)。LC-MS: (ES, m/z): 633 (M+H +)。
步驟3:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(8.84 g,14.0 mmol)於四氫呋喃(60 mL)之攪拌混合物中逐滴添加四丁基氟化銨於四氫呋喃中之溶液(16.8 mL,1.0 M)。將混合物在室溫下攪拌15小時。在減壓下濃縮所得混合物。藉由用二氯甲烷/甲醇(20/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(6.3 g,12.2 mmol,86.94%)。LC-MS: (ES, m/z): 519 (M+H +)。
步驟4:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(6.3 g,12.2 mmol)於二氯甲烷(100 mL)之攪拌混合物中添加吡啶(3.4 g,43.0 mmol)及戴斯-馬丁(6.7 g,15.8 mmol)。將混合物在室溫下攪拌15小時。藉由在室溫下添加4%硫代硫酸鈉水溶液及4%碳酸鈉水溶液淬滅反應。過濾所得混合物;用二氯甲烷洗滌濾餅。將所得混合物用水稀釋且用二氯甲烷萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用二氯甲烷/甲醇(20/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之(2S,3R,4S,5R)-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-4-氟基-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-甲醛(5.72 g,11.1 mmol,91.20%)。LC-MS: (ES, m/z): 517 (M+H +)。
步驟5:在室溫,氮氣氛圍下向(2S,3R,4S,5R)-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-4-氟基-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-甲醛(5.7 g,11.1 mmol)於二噁烷(50 mL)及水(5 mL)之攪拌混合物中添加甲醛(998 mg,33.3 mmol)及氫氧化鈉(1.3 g,33.3 mmol)。將混合物在室溫下攪拌15小時。使混合物冷卻至0℃且添加硼氫化鈉(1.7 g,44.4 mmol)。將混合物在室溫下攪拌30分鐘。在室溫下用飽和氯化銨溶液淬滅反應。將所得混合物用水稀釋且用乙酸乙酯萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用二氯甲烷/甲醇(20/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之1-[(2R,3S,4R)-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(2.35 g,4.3 mmol,38.78%)。LC-MS: (ES, m/z): 549 (M+H +)。
步驟6:在室溫下將1-[(2R,3S,4R)-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(170 mg,0.3 mmol)於水(1 mL)及乙酸(4 mL)中之溶液攪拌16小時。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型TLC用二氯甲烷/甲醇(10:1)純化殘餘物。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(管柱:XBridge Prep C18 OBD管柱,30*100 mm,5μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在2 min內2% B至2% B,在9 min內2% B至7% B,7% B;波長:254/220 nm;RT1(min):3.65)。收集含有產物之級分,在旋轉蒸發器上在減壓下部分蒸發且冷凍乾燥隔夜,得到呈灰白色固體之1-[(2R,3S,4R)-3-氟基-4-羥基-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(10.8 mg,0.04 mmol,12.40%)。LC-MS: (ES, m/z): 277 (M+H +)。98.3%純度(M+H +)。
LCMS之條件:(管柱:Ascentis Express C18,50*3.0 mm;2.7μm;流動相A:水/0.05%TFA,流動相B:ACN/0.05%TFA;流率:1.2000 mL/min;梯度:在0.80 min內2% B至100% B,在0.65 min內100% B至100% B,在0.05 min內100% B至2% B;波長:254 nm;RT1(min):0.579)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 10.51 (s, 1H), 7.89 (d, J = 8.1 Hz, 1H), 6.32 (t, J = 6.6 Hz, 1H), 5.93 (s, 1H), 5.66 (d, J = 8.1 Hz, 1H), 5.31 (dt, J = 57.0, 6.0 Hz, 2H), 4.98 (s, 1H), 4.38 (dd, J = 27.9, 5.9 Hz, 1H), 3.58 (d, J = 11.4 Hz, 1H), 3.45 (q, J = 12.0 Hz, 2H), 3.29 (d, J = 11.4 Hz, 1H)。 實例 41– 化合物 5 (2R,3R,4S,5R)-5-(6- 胺基 -2- 氯基 -9H- 嘌呤 -9- )-2- 乙炔基 -4- 氟基 -2-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -3- 醇之合成
步驟1:在0℃,氬氣下經15 min向氫化鈉(3.22 g於礦物油中60%分散液,80.6 mmol)於四氫呋喃(230 mL)之攪拌懸浮液中分批添加((3aR,6S,6aR)-6-(苄氧基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5,5-二基)二甲醇(25 g,80.6 mmol)。將所得白色懸浮液在0℃下攪拌15 min,然後經10 min添加溴甲苯(9.58 mL,80.6 mmol)於四氫呋喃(20 mL)中之溶液。將所得白色懸浮液在20℃下攪拌18 h。藉由添加氯化銨飽和溶液(250 mL)淬滅反應混合物。將所得混合物用乙酸乙酯(300 mL)稀釋且分離各層。用乙酸乙酯(300 mL)萃取水層,將合併之有機物經硫酸鎂乾燥,過濾且在減壓下濃縮,得到呈黃色油狀物之粗產物。藉由乾急速層析法在二氧化矽上純化且用庚烷-乙酸乙酯(9:1)至(4:1)至(2:1)至(1:1)溶析,然後旋轉蒸發,得到兩批混合級分。藉由正相二氧化矽層析法(Isolera, 120 g SiliaSep筒,含2-60%乙酸乙酯之庚烷,12個管柱體積)再純化混合級分,得到((3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-基)甲醇(19.2 g,59%) 黃色油狀物。 1H NMR (CDCl 3, 400 MHz): 7.36-7.22 (m, 10H), 5.78 (d, 1H), 4.77 (d, 1H), 4.64 (dd, 1H), 4.56-4.46 (m, 3H), 4.27 (d, 1H), 3.92 (dd, 1H), 3.82 (dd, 1H), 3.59 (d, 1H), 3.53 (d, 1H), 1.62 (s, 3H), 1.34 (s, 3H), 1H未觀察到。UPLC-MS (鹼性, 2-95%, 1.2 min, BEH C18): 99.7%, Rt = 0.96 min, [M+Na] +423.2。
步驟2:在60℃,氬氣下將((3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-基)甲醇(10.3 g,25.7 mmol)及2-碘氧基苯甲酸(24.0 g之45 wt.%混合物,用苯甲酸及間苯二甲酸穩定,38.6 mmol)於乙酸乙酯(100 mL)中之攪拌懸浮液加熱24 h。將所得懸浮液冷卻至室溫。通過矽藻土墊過濾懸浮液,用乙酸乙酯(3 x 100 mL)沖洗濾餅。將濾液用碳酸氫鈉(2 x 100 mL飽和水溶液)及鹽水(100 mL)洗滌,經硫酸鎂乾燥,過濾且在減壓下濃縮,得到粗產物。將材料與第二批(22.1 mmol)合併,且藉由二氧化矽層析法(Isolera,120g SiliaSep筒,含2-30%乙酸乙酯之庚烷,13個管柱體積)純化,得到含有IBX雜質之黃色油狀物。將材料溶解於乙酸乙酯(100 mL)中且用碳酸氫鈉(2 x 100 mL飽和水溶液)及鹽水(100 mL)洗滌,經硫酸鎂乾燥,過濾且在減壓下濃縮,得到呈淺黃色油狀物之(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-甲醛(12.4 g,65%)。 1H NMR (CDCl 3, 400 MHz): 9.90 (s, 1H), 7.37-7.20 (m, 10H), 5.83 (d, 1H), 4.70 (d, 1H), 4.61-4.56 (m, 2H), 4.48 (q, 2H), 4.36 (d, 1H), 3.67 (d, 1H), 3.60 (d, 1H), 1.59 (s, 3H), 1.34 (s, 3H)。UPLC-MS (鹼性, 2-95%, 1.2 min, BEH C18): 87.2%, Rt = 1.03 min。未觀察到質量離子。
步驟3(i):在0℃下向(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-甲醛(2.00 g,5.02 mmol,1 eq)於二氯甲烷(42 mL)之攪拌溶液中添加四溴化碳(3.32 g,10.0 mmol,2 eq),隨後添加三苯基膦(5.27 g,20.1 mmol,4 eq)。將反應混合物在0℃下攪拌1 h。添加三乙胺(4.5 mL,30.1 mmol,6 eq)且將混合物添加至庚烷(210 mL)中。過濾沉澱物且在減壓下蒸發溶劑。藉由通過二氧化矽塞用庚烷:乙酸乙酯(2:1, 300 mL)純化材料且在減壓下濃縮,得到呈黃色油狀物之(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-(2,2-二溴基乙烯基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯(2.41 g,87%)。 1H NMR (CDCl 3, 400 MHz): 7.37-7.22 (m, 10H), 7.11 (s, 1H), 5.75 (d, 1H), 4.71 (d, 1H), 4.61 (s, 1H), 4.57 (s, 1H), 4.52 (t, 1H), 4.42 (d, 1H), 4.20 (d, 1H), 3.82 (d, 1H), 3.40 (d, 1H), 1.58 (s, 3H), 1.29 (s, 3H)。UPLC-MS (長鹼性, 50-95%, BEH C18): 89.7%, Rt = 0.96 min。未觀察到質量離子。
步驟3(ii):在−78℃,氬氣下下向(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-(2,2-二溴基乙烯基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯 (1.80 g,3.25 mmol,1 eq)於四氫呋喃(36 mL)之攪拌溶液中緩慢添加正丁基鋰(1.6M於庚烷中) (5.07 mL,8.11 mmol,2.5 eq)且將混合物在−78℃下攪拌30 min。添加氯三乙基矽烷(0.65 mL,3.90 mmol,1.2 eq)且將混合物溫熱至室溫且攪拌15 min。將混合物用水(50 mL)稀釋且用乙酸乙酯(3 × 70 mL)萃取。將有機層合併,經硫酸鎂乾燥,過濾,在減壓下濃縮且與獲自500 mg (3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-(2,2-二溴基乙烯基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯的第二批粗產物合併,得到呈黃色油狀物之(((3aR,5R,6烷S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-基)乙炔基)三乙基矽(2.10 g,99%)。 1H NMR (CDCl 3, 400 MHz): 7.41-7.35 (m, 2H), 7.34-7.20 (m, 8H), 5.70 (d, 1H), 4.74 (d, 1H), 4.67-4.61 (m, 2H), 4.56 (d, 1H), 4.47 (d, 1H), 4.22 (d, 1H), 3.70 (d, 1H), 3.57 (d, 1H), 1.72 (s, 3H), 1.33 (s, 3H), 0.97 (t, 9H), 0.59 (q, 6H)。UPLC-MS (短鹼性, 50-95%, BEH C18): Rt = 1.24 min。
步驟4:在室溫下向(((3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-基)乙炔基)三乙基矽烷(2.10 g,4.13 mmol)於乙酸酐(5.3 mL)及乙酸(21.2 mL)之攪拌溶液中添加硫酸(26.6 µL)。將所得溶液在室溫下攪拌4 h,然後倒入乙酸乙酯(100 mL)、庚烷(100 mL)及水(200 mL)中。分離有機層,且用水(2 x 150 mL)、碳酸氫鈉(2 x 150 mL飽和水溶液)及鹽水(150 mL)洗滌有機物,經硫酸鎂乾燥,過濾且濃縮,得到粗產物(2.05 g)。存在起始材料。使粗材料經受相同條件且攪拌隔夜。將混合物倒入乙酸乙酯(100 mL)、庚烷(100 mL)及水(200 mL)中。分離有機層,且用水(2 x 150 mL)、碳酸氫鈉(2 x 150 mL飽和水溶液)及鹽水(150 mL)洗滌有機物,經硫酸鎂乾燥,過濾且濃縮,得到呈淺黃色油狀物之二乙酸(3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-((三乙基矽烷基)乙炔基)四氫呋喃-2,3-二酯(1.78 g),其未經進一步純化即用於下一步驟中。
步驟5:在室溫下向2-氯基-9H-嘌呤-6-胺(1.05 g,6.20 mmol,1.5 eq)於乙腈(15 mL)之攪拌懸浮液中依次添加1,8-二氮雜雙環[5.4.0]十一-7-烯(1.23 mL,8.26 mmol,2 eq)及三氟甲烷磺酸三甲基矽烷酯(4.5 mL,24.8 mmol,6 eq)且將混合物在60℃下攪拌20 min。經5 min向所得黃色溶液中添加二乙酸(3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-((三乙基矽烷基)乙炔基)四氫呋喃-2,3-二酯(1.78 g,4.13 mmol,1 eq)於乙腈(15 mL)中之溶液。在60℃下攪拌30 min後,將混合物倒入冰水(100 mL)中且用EtOAc (3 × 100 mL)萃取。將萃取物用鹽水洗滌,經硫酸鎂乾燥,過濾且在真空中濃縮,得到粗產物,然後將其溶解於甲醇(41 mL)中。在室溫下向溶液中添加三乙胺(10.4 mL)且將混合物在60℃下攪拌18 h。將混合物在真空中濃縮且用乙酸乙酯(100 mL)稀釋。將溶液用水(50 mL × 3)及鹽水(50 mL)洗滌,經硫酸鎂乾燥且在減壓下濃縮。藉由正相二氧化矽層析法(Isolera,40 g SiliaSep筒,含2-80%乙酸乙酯之庚烷,15個管柱體積)純化殘餘物,得到呈灰白色固體之(2R,3R,4S,5R)-2-(6-胺基-2-氯基-9H-嘌呤-9-基)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-((三乙基矽烷基)乙炔基)四氫呋喃-3-醇(996 mg,三個步驟39%)。 1H NMR (CDCl 3, 400 MHz): 8.02 (s, 1H), 7.42-7.24 (m, 10H), 6.13 (d, 1H), 5.94 (brs, 1H), 4.96 (d, 1H), 4.72-4.65 (m, 2H), 4.55 (q, 2H), 4.43 (d, 1H), 3.83 (d, 1H), 3.71 (d, 1H), 3.24 (brs, 1H), 0.98 (t, 9H), 0.61 (q, 6H)。UPLC-MS (長鹼性, 50-95%, BEH C8): 94.5%, RT = 0.97 min, [M+H] +620.3。
步驟6:在氬氣下將(2R,3R,4S,5R)-2-(6-胺基-2-氯基-嘌呤-9-基)-4-苄氧基-5-(苄氧基甲基)-5-(2-三乙基矽烷基乙炔基)四氫呋喃-3-醇(500 mg,806 μmol)及吡啶(383 mg,4.83 mmol,391 μL)於二氯甲烷(10 mL)中之溶液冷卻至-78℃且添加DAST (520 mg,3.23 mmol,426 μL)。經3小時將反應溫熱至室溫,然後在室溫下攪拌16小時。將反應冷卻至0℃且用飽和NaHCO 3(30 ml)淬滅。經由相分離器收集DCM層,且用DCM (2 × 10 ml)進一步萃取水層。將DCM層濃縮成棕色膠狀物。藉由正相層析法(Biotage Isolera,25 g Silicycle筒;溶析液含0-80%乙酸乙酯之庚烷)純化材料,得到呈白色固體之9-[(2R,3S,4R,5R)-4-苄氧基-5-(苄氧基甲基)-3-氟基-5-(2-三乙基矽烷基乙炔基)四氫呋喃-2-基]-2-氯基-嘌呤-6-胺(238 mg,383 μmol,47%產率,100%純度)。 1H NMR (400 MHz, CDCl 3): δ [ppm] = 8.26 (s, 1H), 7.44-7.31 (m, 10H), 6.63 (dd, 1H), 5.45 (dt, 1H), 4.74 (dd, 2H), 4.65-4.57 (m, 3H), 3.83 (dd, 1H), 3.73 (d, 1H), 1.02 (t, 9H), 0.66 (q, 6H), 2H未觀察到。 19F NMR (376 MHz, CDCl 3): δ [ppm] = -196.9--197.1 (m, 1F)。UPLC-MS: (BEH C18長鹼性50-95%) Rt = 2.68 min (100%), MS (ESIpos): m/z= [M+H] +622.2。
步驟7(i):在氬氣下將9-[(2R,3S,4R,5R)-4-苄氧基-5-(苄氧基甲基)-3-氟基-5-(2-三乙基矽烷基乙炔基)四氫呋喃-2-基]-2-氯基-嘌呤-6-胺(287 mg,461 μmol)於二氯甲烷(10 mL) 中之溶液冷卻至-78℃且緩慢添加三氯化硼(1 M,4.61 mL)。將反應在-78℃下攪拌3.5小時,然後在-30℃下攪拌30分鐘。將反應冷卻至-78℃且用甲醇(6 ml)及三乙胺(3 ml)之冷卻混合物淬滅,然後使其溫熱。將混合物濃縮成漿液,且藉由逆相層析法(Biotage Isolera,60 g Biotage C18筒;梯度含25-85% (乙腈+ 0.1% NH 4OH)之(水 + 0.1% NH 4OH),9CV)純化。將產物級分合併且冷凍乾燥,得到(2R,3R,4S,5R)-5-(6-胺基-2-氯基-嘌呤-9-基)-4-氟基-2-(羥甲基)-2-(2-三乙基矽烷基乙炔基)四氫呋喃-3-醇(152 mg,308 μmol,67%產率,89.7%純度)。 1H NMR (400 MHz, CDCl 3): δ [ppm] = 8.86 (s, 1H), 6.60 (dd, 1H), 5.46-5.30 (m, 1H), 4.87 (d, 1H), 4.04 (d, 1H), 3.95 (d, 1H), 1.04 (t, 9H), 0.69 (q, 6H), 4H未觀察到。 19F NMR (376 MHz, CDCl 3): δ [ppm] = -200.2. nUPLC-MS: (BEH C18短鹼性2-95%) Rt = 0.95 min (89.7%), MS (ESIpos): m/z= [M+H] +442.1。
步驟7(ii):在室溫下向(2R,3R,4S,5R)-5-(6-胺基-2-氯基-嘌呤-9-基)-4-氟基-2-(羥甲基)-2-(2-三乙基矽烷基乙炔基)四氫呋喃-3-醇(150 mg,339 μmol)於四氫呋喃(2 mL)之溶液中添加TBAF (177 mg,509 μmol,197 μL,75%純度)。將反應攪拌2小時,藉由逆相層析法(Biotage Isolera, 60 g Biotage C18筒;梯度含2-40% (乙腈+ 0.1% NH 4OH)之(水 + 0.1% NH 4OH),8CV)純化且將產物級分冷凍乾燥,得到呈白色固體之(2R,3R,4S,5R)-5-(6-胺基-2-氯基-嘌呤-9-基)-2-乙炔基-4-氟基-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇(98 mg,299 μmol,88%產率,100%純度)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ [ppm] = 8.25 (d, 1H), 7.90 (s, 2H), 6.40 (dd, 1H), 6.29 (d, 1H), 5.50 (t, 1H), 5.39 (dt, 1H), 4.65 (dt, 1H), 3.72-3.61 (m, 3H)。 19F NMR (376 MHz, DMSO-d6): δ [ppm] = -199.2 (ddd, 1F)。UPLC-MS: (CSH C18長酸性2-50%) Rt = 1.15 min (100%), MS (ESIpos): m/z= [M+H] +328.0。 實例 42– 化合物 27 (2R,3S,5R)-5-(6- 胺基 -9H- 嘌呤 -9- )-2- 乙炔基 -2-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -3- 醇之合成
步驟1:在-78℃下向9-((2R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-((三乙基矽烷基)乙炔基)四氫呋喃-2-基)-2-氟基-9H-嘌呤-6-胺(340 mg,578 μmol) (合成顯示於實例41中)於四氫呋喃(2 mL)之溶液中添加氨(15 ml),隨後分批添加鈉(66.5 mg,2.89 mmol)。將反應攪拌10分鐘,在0℃下用氯化銨(155 mg,5 eq)淬滅。將混合物在室溫下攪拌隔夜,然後在甲醇中成漿,過濾且濃縮。藉由逆相層析法(Biotage Isolera,30 g Biotage C18筒;梯度含0-20% (乙腈+ 0.1% NH 4OH)之(水 + 0.1% NH 4OH),10CV)純化殘餘物且將產物級分冷凍乾燥,得到呈白色固體之2種產物: (2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基-9H-嘌呤-9-基)-2-乙炔基-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇(30 mg,102 μmol,18%產率,85.3%純度)。UPLC-MS: (BEH C18短鹼性2-20%) Rt = 0.69 min (85.3%), MS (ESIneg): m/z= [M-H] -. 292.0。 1H NMR (400 MHz, MeOD-d3): δ 8.25 (s, 1H), 6.33 (dd, 1H), 4.71 (t, 1H), 3.86-3.73 (m, 3H), 2.76 (ddd, 1H), 2.59 (td, 1H)。
(2R,3S,5R)-5-(6-胺基-9H-嘌呤-9-基)-2-乙炔基-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇(52 mg,189 μmol,94.7%純度)。UPLC-MS: (BEH C18長鹼性2-95%) Rt = 0.94 min (94.7%), MS (ESIpos): m/z= [M+H] +276.2。 1H NMR (400 MHz, MeOD-d3): δ 8.33 (s, 1H), 8.19 (s, 1H), 6.46 (dd, 1H), 4.73 (t, 1H), 3.83 (dd, 2H), 2.83 (ddd, 1H), 2.63-2.57 (m, 1H), 1.89 (s, 1H)。 實例 43– 化合物 173 :異丁酸 (2R,3R,4S,5R)-5-(4- 胺基 -5- 氟基 -2- 側氧基嘧啶 -1(2H)- )-2-( 氯甲基 )-4- 氟基 -2-(( 異丁醯氧基 ) 甲基 ) 四氫呋喃 -3- 酯之合成
步驟1:在0℃下向1-((2R,3S,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-5-(羥甲基)-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(20g,34.19 mmol)於DCM (100mL)之攪拌溶液中添加含4M HCl之1,4-二噁烷(150mL)且在0℃下攪拌2 h至室溫。藉由TLC監測反應進展。完成後,將反應混合物濃縮且與甲苯共蒸餾。將所得殘餘物溶解於吡啶(100mL)中,隨後在室溫下添加異丁酸酐(12.4 mL,75.21 mmol)。反應混合物在室溫下攪拌16h後,濃縮反應混合物得到粗產物,將其藉由用含20% EtOAc之己烷溶析之Combiflash純化,得到呈淺黃色固體之異丁酸(2R,3R,4S,5R)-2-(氯甲基)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-2-((異丁醯氧基)甲基)四氫呋喃-3-酯(3.9 g,25.19 %)。LC-MS (ES, m/z): 451.00 (M-1)。
步驟2:在0℃下向1,2,4-三唑(4.9 g,71.55 mmol,9 Eq.)於吡啶(15 mL)之攪拌溶液中添加POCl 3(1.18 mL,15.90 mmol,2 Eq.)。然後添加Et 3N (10 mL,71.55 mmol,9 Eq.),且將混合物在0℃下攪拌30 min。在0℃下向此混合物中添加含異丁酸(2R,3R,4S,5R)-2-(氯甲基)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-2-((異丁醯氧基)甲基)四氫呋喃-3-酯(3.6 g,7.95 mmol,1 Eq.)之吡啶(15 mL)且在室溫下攪拌2 h。將反應混合物濃縮至乾且與甲苯共蒸餾。將所得殘餘物溶解於DCM (30 mL)中,用鹽水溶液洗滌,經Na 2SO 4乾燥且濃縮至乾。將所得材料溶解於THF (10 mL)中,添加含0.5M NH 3之THF (30 mL),且將混合物在0℃至室溫下攪拌15 min。藉由TLC監測反應進展。完成後,用冰水及乙酸乙酯(各50 mL)稀釋反應混合物。將有機層分離,用水及鹽水洗滌,經硫酸鈉乾燥,過濾且濃縮。藉由用含0.9% MeOH之DCM溶析之CombiFlash層析法純化粗產物。使用MTBE使所得材料再結晶,得到呈白色固體之所需產物(1.7g,47.35%)。LC-MS (ES, m/z): 449.95 (M-1)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ = 7.98 (br s, 1H), 7.79 - 7.71 (m, 2H), 6.34 (br dd, J = 3.2, 17.1 Hz, 1H), 5.66 (dd, J = 2.2, 19.4 Hz, 1H), 5.48 - 5.29 (m, 1H), 4.48 - 4.35 (m, 2H), 4.00 (d, J = 12.0 Hz, 1H), 3.85 (d, J = 11.9 Hz, 1H), 2.73 - 2.55 (m, 2H), 1.18 - 1.09 (m, 12H)。 實例 44– 化合物 53 2- 甲基丙酸 [(2R,3S,5R)-5-(4- 胺基 -2- 側氧基嘧啶 -1- )-2- 乙烯基 -3-[(2- 甲基丙醯基 ) 氧基 ] 氧雜環戊烷 -2- ] 甲酯之合成
步驟1:在室溫,氮氣氛圍下將4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(1 g,2.1 mmol)及DMTr-Cl (0.9 g,3.1 mmol)於吡啶(10 mL)中之溶液攪拌12 hr。將所得混合物在真空下濃縮。將殘餘物溶解於EtOAc中。將所得溶液用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液,此得到呈黃色固體之4-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲基]胺基}-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(2 g,1.7 mmol,86.02%)。LC-MS (ES, m/z): 784 (M+H) +
步驟2:在室溫,氮氣氛圍下將4-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲基]胺基}-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(1.9 g,1.7 mmol)及TBAF (0.5 g,2.03 mmol)於THF中之溶液攪拌2 h。在減壓下濃縮所得混合物。將殘餘物溶解於水中。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液,此 得到呈灰白色固體之4-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲基]胺基}-1-[(2R,4S,5R)-5-乙烯基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(1 g,1.8 mmol,90.2%)。LC-MS (ES, m/z): 556 (M+H) +
步驟3:在0℃下向4-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲基]胺基}-1-[(2R,4S,5R)-5-乙烯基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(1 g,1.8 mmol)、TEA (0.4 g,3.6 mmol)及DMAP (21.9 mg,0.2 mmol)於CH 3CN之攪拌溶液中逐滴添加異丁酸酐(1.1 g,7.2 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌4 h。將所得混合物在真空下濃縮。將混合物用乙酸乙酯稀釋且用鹽水洗滌,經無水硫酸鈉乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (15:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之2-甲基丙酸[(2R,3S,5R)-5-(4-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲基]胺基}-2-側氧基嘧啶-1-基)-2-乙烯基-3-[(2-甲基丙醯基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(900 mg,1.26 mmol. 66.8%)。LC-MS (ES, m/z): 696 (M+H) +
步驟4:在室溫,氮氣氛圍下將2-甲基丙酸[(2R,3S,5R)-5-(4-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲基]胺基}-2-側氧基嘧啶-1-基)-2-乙烯基-3-[(2-甲基丙醯基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(100 mg,0.14 mmol)於AcOH (4 mL)及H 2O (1 mL)中之溶液攪拌2 h。將所得混合物在真空下濃縮。在以下條件下純化粗產物:(管柱:XBridge Prep OBD C18管柱,30*150 mm,5μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3+0.1% NH 3.H 2O),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在8 min內34% B至44% B;波長:254/220 nm)。收集含有產物之級分且冷凍乾燥隔夜,得到呈白色固體之2-甲基丙酸[(2R,3S,5R)-5-(4-胺基-2-側氧基嘧啶-1-基)-2-乙烯基-3-[(2-甲基丙醯基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(45 mg,0.11 mmol,76.9%)。LC-MS (ES, m/z): 394 (M+H) +。LCMS條件:(HALO C18, 30*3.0 mm,2.7μm;流動相A:水(0.05% TFA),流動相B:乙腈(0.05% TFA);流率:1.5000 mL/min;梯度:在1.90 min內5% B至70% B,在2.05 min內70% B至100% B,在2.60 min內100% B至100% B,在2.70 min內100% B至5% B;波長:254/220 nm)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 7.67 (d, J= 6.9 Hz, 1H), 7.22 (d, J= 13.0 Hz, 2H), 6.19 (t, J= 6.4 Hz, 1H), 5.77 (q, J= 10.3, 9.6 Hz, 2H), 5.49-5.30 (d, J= 10.8 Hz, 3H), 4.17 (d, J= 3.5 Hz, 2H), 2.57 (dt, J= 14.3, 7.1 Hz, 2H), 2.39 (q, J= 6.8 Hz, 1H), 2.33-2.23 (m, 1H), 1.45-1.05 (m, 12H)。 實例 45– 化合物 58 :異丁酸 ((2R,3S,5R)-5-(4- 胺基 -5- 氟基 -2- 側氧基嘧啶 -1(2H)- )-2-( 氯甲基 )-2-(( 異丁醯氧基 ) 甲基 ) 四氫呋喃 -3- ) 之合成
步驟1:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(600 mg,1.15 mmol)於MeOH (15 mL)之攪拌溶液中分批添加NH 4F (637.1 mg,17.2 mmol)。將所得混合物在60℃下攪拌隔夜,然後冷卻至室溫且藉由過濾移除固體。用MeOH洗滌濾餅且在真空下濃縮濾液。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化殘餘物:管柱,C18矽膠;流動相,含MeCN之水(0.1% TFA),在10 min內5%至30%梯度;偵測器,UV 254 nm。此得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(300 mg,88.8%)。LC-MS (ES, m/z): 295 (M+H) +
步驟2:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(300 mg,1.0 mmol)、TEA (206.0 mg,2.0 mmol)及DMAP (248.8 mg,2.0 mmol)於MeCN之攪拌溶液中逐滴添加2-甲基丙酸2-甲基丙醯酯(402.7 mg,2.5 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌3小時,然後藉由添加水來淬滅。將所得溶液用EtOAc萃取,用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由用石油醚/EtOAc (5:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之2-甲基丙酸[(2R,3S,5R)-2-(氯甲基)-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(2-甲基丙醯基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(400 mg,90.4%)。LC-MS (ES, m/z): 435 (M+H) +
步驟3:在室溫,氮氣氛圍下向2-甲基丙酸[(2R,3S,5R)-2-(氯甲基)-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(2-甲基丙醯基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(400 mg,0.9 mmol)、TEA (279.2 mg,2.8 mmol)及DMAP (224.76 mg,1.840 mmol)於CH 3CN (10 mL)之攪拌溶液中分批添加2,4,6-參(丙-2-基)苯-1-磺醯氯(557.2 mg,1.8 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌30 min。隨後逐滴添加氨(1 mL)。將所得混合物在室溫下再攪拌4小時且藉由添加水來淬滅。將所得溶液用EtOAc萃取,用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物:管柱:XBridge Shield RP18 OBD管柱,30*150 mm,5μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在8 min內28% B至50% B,50% B;波長:220 nm;RT1(min):7.62 min。收集含有產物之級分且冷凍乾燥隔夜,得到呈白色固體之2-甲基丙酸[(2R,3S,5R)-5-(4-胺基-5-氟基-2-側氧基嘧啶-1-基)-2-(氯甲基)-3-[(2-甲基丙醯基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(102 mg,25.6%)。LC-MS (ES, m/z): 434 (M+H) +. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 7.91 (s, 1H), 7.87 (d, J = 7.2 Hz, 1H), 7.67 (brs, 1H), 6.24 (t, J = 6.8 Hz, 1H), 5.51-5.48 (m, 1H), 4.32 (dd, J = 16.0, 11.6 Hz, 2H), 3.92 – 3.89 (m, 1H), 3.81-3.79 (m, 1H), 2.69-2.58 (m, 3H), 2.40-2.36 (m, 1H), 1.18-1.12 (m, 12H)。 實例 46– 化合物 52 2- 甲基丙酸 [(2R,3S,5R)-5-(4- 胺基 -2- 側氧基嘧啶 -1- )-2- 乙基 -3-[(2- 甲基丙醯基 ) 氧基 ] 氧雜環戊烷 -2- ] 甲酯之合成
在室溫,氫氣氛圍下將2-甲基丙酸[(2R,3S,5R)-5-(4-胺基-2-側氧基嘧啶-1-基)-2-乙烯基-3-[(2-甲基丙醯基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(200 mg,0.5 mmol)及Pd/C (20 mg,10%碳載鈀)於MeOH (5 mL)中之溶液攪拌12 h。過濾所得混合物;用MeOH洗滌濾餅且在減壓下濃縮濾液。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(管柱:XBridge Prep OBD C18管柱,30*150 mm,5μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3+0.1%NH 3.H 2O),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在8 min內34% B至44% B;波長:254/220 nm)。收集含有產物之級分且冷凍乾燥隔夜,得到呈白色固體之2-甲基丙酸[(2R,3S,5R)-5-(4-胺基-2-側氧基嘧啶-1-基)-2-乙基-3-[(2-甲基丙醯基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(88.9 mg,42.81%)。LC-MS (ES, m/z): 396.2 (M+H) +。LCMS條件:(HALO C18, 30*3.0 mm,2.7μm;流動相A:水+0.05%TFA,流動相B:乙腈+0.05%TFA;流率:1.5000 mL/min;梯度:在1.90 min內20% B至70% B,在2.00 min內70% B至100% B,在2.60 min內100% B至100% B,在2.70 min內100% B至5% B;波長:254/220 nm)。 1H NMR (300 MHz, DMSO-d 6) δ 7.62 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 7.20 (d, J = 11.9 Hz, 2H), 6.12 (t, J= 6.8 Hz, 1H), 5.74 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 5.36 (dd, J= 6.5, 3.4 Hz, 1H), 4.12 (d, J= 2.8 Hz, 2H), 2.69-2.52 (m, 2H), 2.48-2.24 (m, 2H), 1.69 (p, J= 7.4 Hz, 1H), 1.55 (dq, J= 14.6, 7.2 Hz, 1H), 1.11 (td, J= 7.3, 2.7 Hz, 12H), 0.88 (t, J= 7.4 Hz, 3H)。 實例 47- 化合物 161 及化合物 92 (2R,3S,5R)-5-(4- 胺基 -5- 碘基吡咯并 [2,1-f][1,2,4] 三嗪 -7- )-2- 疊氮基 -2-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -3- & (2R,3S,5R)-5-(4- 胺基吡咯并 [2,1-f][1,2,4] 三嗪 -7- )-2- 疊氮基 -2-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -3- 醇之合成
步驟1:將 N-[7-[(2 R,4 S,5 R)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基]吡咯并[2,1- f][1,2,4]三嗪-4-基]苯甲醯胺(4.23 g,11.9 mmol)、咪唑(975 mg,14.3 mmol)及三苯基膦(3.75 g,14.3 mmol)於無水THF (50 mL)中之混合物在冰浴中冷卻且經10 min逐滴添加碘(3.63 g,14.3 mmol)於無水THF (10 mL)中之溶液。將反應混合物在0℃下攪拌10 min,然後溫熱至室溫且攪拌18 h。將反應混合物用DCM (300 mL)稀釋且用0.5 M含Na 2S 2O 3之飽和NaHCO 3水溶液(200 mL)洗滌。將水層用DCM洗滌且將合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且 在真空中濃縮。藉由管柱層析法在矽膠上(梯度:0-100% EtOAc於己烷中)純化粗油狀物,得到呈黃色固體之 N-(7-((2 R,4 S,5 S)-4-羥基-5-(碘甲基)四氫呋喃-2-基)吡咯并[2,1- f][1,2,4]三嗪-4-基)苯甲醯胺(3.84 g,69%產率)。LCMS ( m /z): 465.8 [M+H] +; 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 8.17 (d, J= 77.1 Hz, 3H), 7.63 (d, J= 7.5 Hz, 1H), 7.54 (t, J= 7.5 Hz, 2H), 7.14 (s, 1H), 6.96 (s, 1H), 5.67 (s, 1H), 5.38 (d, J= 4.0 Hz, 1H), 4.24 (s, 1H), 3.89 (td, J= 6.0, 2.1 Hz, 1H), 3.40 (dd, J= 10.3, 6.3 Hz, 1H), 3.34 (s, 1H), 2.36 (td, J= 11.8, 10.1, 5.5 Hz, 1H), 2.21 (dd, J= 12.8, 5.7 Hz, 1H)。
步驟2:向 N-(7-((2 R,4 S,5 S)-4-羥基-5-(碘甲基)四氫呋喃-2-基)吡咯并[2,1- f][1,2,4]三嗪-4-基)苯甲醯胺(3.96 g,8.53 mmol)於無水THF (25 mL)之溶液中添加2,3,4,6,7,8,9,10-八氫嘧啶并[1,2- a]吖呯(3.13 mL,22.69 mmol),且將反應在室溫下攪拌16 h,然後加熱至45℃且攪拌6 h。將反應混合物 在真空中濃縮,且藉由管柱層析法在矽膠上(梯度:0-5% MeOH於DCM中)純化粗品兩次,得到呈淡黃色固體之 N-(7-((2 R,4 S)-4-羥基-5-亞甲基四氫呋喃-2-基)吡咯并[2,1- f][1,2,4]三嗪-4-基)苯甲醯胺(1.06 g,37%產率)。LCMS ( m /z): 337 [M+H] +; 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 11.28 (s, 1H), 8.19 (d, J= 99.5 Hz, 3H), 7.64 (t, J= 7.3 Hz, 1H), 7.54 (t, J= 7.6 Hz, 2H), 7.13 (s, 1H), 6.94 (s, 1H), 5.95 (s, 1H), 5.49 (d, J= 4.7 Hz, 1H), 4.72 – 4.62 (m, 1H), 4.17 (s, 1H), 4.06 (s, 1H), 2.48 – 2.40 (m, 1H), 2.28 (ddd, J= 12.8, 6.2, 3.3 Hz, 1H)。
步驟3:向苄基三乙基氯化銨(1.04 g,4.58 mmol)於無水MeCN (20 mL)之攪拌溶液中添加疊氮化鈉(298 mg,4.58 mmol)。將混合物超音波處理20 min,然後在室溫,氬氣下攪拌16 h。過濾溶液且經由注射器添加至 N-(7-((2 R,4 S)-4-羥基-5-亞甲基四氫呋喃-2-基)吡咯并[2,1- f][1,2,4]三嗪-4-基)苯甲醯胺(700 mg,2.08 mmol)於無水THF (8 mL)之溶液中。添加嗎啉,4-甲基- (0.55 mL,4.99 mmol)且將所得溶液冷卻至0℃,然後經30 min逐滴添加碘(1.05 g,4.16 mmol)於THF (8 mL)中之溶液。在冰浴中繼續攪拌4 h,然後添加N-乙醯基半胱胺酸,直至不再觀察到氣體的析出(以破壞過量疊氮化物),隨後添加飽和Na 2S 2O 3水溶液(15 mL)直至溶液為淡黃色。 在真空中移除溶劑且將殘餘物用H 2O (80 mL)稀釋且用EtOAc (3 x 100 mL)萃取。將合併之有機萃取物經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且 在真空中濃縮。藉由管柱層析法在矽膠上(梯度:0-25% EtOAc於己烷中)純化粗品,得到呈黃色固體之 N-(7-((2 R,4 S,5 S)-5-疊氮基-4-羥基-5-(碘甲基)四氫呋喃-2-基)吡咯并[2,1- f][1,2,4]三嗪-4-基)苯甲醯胺(825 mg,78%產率)。LCMS ( m /z): 506.8 [M+H 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 11.26 (s, 1H), 8.20 (d, J= 123.8 Hz, 3H), 7.69 – 7.49 (m, 3H), 7.10 (d, J= 39.3 Hz, 2H), 6.09 (d, J= 5.1 Hz, 1H), 5.91 (s, 1H), 4.59 – 4.51 (m, 1H), 3.61 – 3.51 (m, 2H), 2.63 (dt, J= 13.6, 7.1 Hz, 1H), 2.41 (dt, J= 12.7, 6.3 Hz, 1H)。
步驟4:向圓底燒瓶中之四丁基氫氧化銨溶液(19 mL,39.19 mmol)中添加TFA (3 mL)以將pH調節至4.0。將含 N-(7-((2 R,4 S,5 S)-5-疊氮基-4-羥基-5-(碘甲基)四氫呋喃-2-基)吡咯并[2,1- f][1,2,4]三嗪-4-基)苯甲醯胺(825 mg,1.63 mmol)之無水DCM (20 mL)添加至溶液中,隨後添加3-氯基過氧苯甲酸(1.83 g,8.16 mmol),以每小時為間隔分三份添加。在劇烈攪拌另外3.5 h後,用飽和Na 2S 2O 3水溶液淬滅反應。分離有機層且用飽和NaHCO 3水溶液及鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且 在真空中濃縮。藉由管柱層析法在矽膠上(梯度:0-5% MeOH於DCM中)純化粗品,得到呈黃色固體之 N-(7-((2 R,4 S,5 R)-5-疊氮基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)吡咯并[2,1- f][1,2,4]三嗪-4-基)苯甲醯胺(114 mg,18%產率)及 N-(7-((2 R,4 S,5 R)-5-疊氮基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-碘基吡咯并[2,1- f][1,2,4]三嗪-4-基)苯甲醯胺(74 mg,9%產率)。
N-(7-((2 R,4 S,5 R)-5-疊氮基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)吡咯并[2,1- f][1,2,4]三嗪-4-基)苯甲醯胺:LCMS ( m /z): 396 [M+H] +; 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 )) δ 11.28 (s, 1H), 8.57 – 7.99 (m, 3H), 7.74 – 7.53 (m, 3H), 7.11 (d, J= 46.6 Hz, 2H), 5.89 (s, 1H), 5.68 (d, J= 5.6 Hz, 1H), 5.35 (t, J= 6.2 Hz, 1H), 4.48 (q, J= 6.2 Hz, 1H), 3.65 (dd, J= 11.9, 6.2 Hz, 1H), 3.56 (dd, J= 11.9, 6.2 Hz, 1H), 2.48 (d, J= 6.4 Hz, 1H), 2.41 (q, J= 6.5 Hz, 1H)。
N-(7-((2R,4S,5R)-5-疊氮基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-碘基吡咯并[2,1-f][1,2,4]三嗪-4-基)苯甲醯胺:LC/MS (ESI, m/z): [M+H] += 522; 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 13.22 (s, 1H), 8.51 – 7.84 (m, 3H), 7.64 – 7.49 (m, 3H), 7.13 (s, 1H), 5.71 (s, 1H), 5.63 (d, J = 5.6 Hz, 1H), 5.33 (t, J = 6.1 Hz, 1H), 4.39 (d, J = 6.3 Hz, 1H), 3.60 (dd, J = 12.0, 6.3 Hz, 1H), 3.52 (dd, J = 11.9, 6.1 Hz, 1H), 2.36 (d, J = 16.4 Hz, 2H)。
步驟5A:向N-(7-((2R,4S,5R)-5-疊氮基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-碘基吡咯并[2,1-f][1,2,4]三嗪-4-基)苯甲醯胺(67 mg,0.13 mmol)於MeOH (1.5 mL)之溶液中添加7N甲醇氨溶液(0.55 mL,3.86 mmol)且將反應在55℃下加熱隔夜。在真空中移除過量溶劑且藉由管柱層析法在矽膠上(梯度:0-5% MeOH於DCM中)純化粗品,得到呈乳白色固體之(2R,3S,5R)-5-(4-胺基-5-碘基吡咯并[2,1-f][1,2,4]三嗪-7-基)-2-疊氮基-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇(35 mg,65%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 7.90 (s, 1H), 6.99 (s, 1H), 5.72 (t, J = 7.1 Hz, 1H), 5.58 (d, J = 5.6 Hz, 1H), 5.29 (t, J = 6.2 Hz, 1H), 4.37 (q, J = 6.1 Hz, 1H), 3.57 (dd, J = 11.9, 6.3 Hz, 1H), 3.49 (dd, J = 11.8, 6.2 Hz, 1H), 2.38 – 2.24 (m, 2H); HPLC純度:98.9%; HRMS ( m/z): C 11H 12IN 7O 3(M+H) +之計算值418.0125;實驗值418.0126。
步驟5B:向N-(7-((2R,4S,5R)-5-疊氮基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)吡咯并[2,1-f][1,2,4]三嗪-4-基)苯甲醯胺(111 mg,0.28 mmol)於MeOH (2 mL)之溶液中添加7N甲醇氨溶液(1.2 mL,8.42 mmol)且將反應在55℃下加熱隔夜。在真空中移除過量溶劑且藉由管柱層析法在矽膠上(梯度:0-6% MeOH於DCM中)純化粗品,得到呈黃色固體之(2R,3S,5R)-5-(4-胺基吡咯并[2,1-f][1,2,4]三嗪-7-基)-2-疊氮基-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇(45 mg,54%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 7.85 (s, 1H), 7.70 (s, 2H), 6.84 (d, J = 4.5 Hz, 1H), 6.71 (d, J = 4.4 Hz, 1H), 5.77 – 5.72 (m, 1H), 5.56 (d, J = 5.6 Hz, 1H), 5.26 (t, J = 6.2 Hz, 1H), 4.41 (q, J = 6.1 Hz, 1H), 3.57 (dd, J = 11.9, 6.2 Hz, 1H), 3.48 (dd, J = 11.9, 6.2 Hz, 1H), 2.43 (dt, J = 13.3, 6.9 Hz, 1H), 2.28 (ddd, J = 12.8, 7.5, 5.7 Hz, 1H); HPLC純度:98%; HRMS ( m/z): C 11H 13N 7O 3(M+H) +之計算值292.1158;實驗值292.1156。 實例 48- 化合物 25 ({[(2R,3S,5R)-5-(6- 胺基 -2- 氯嘌呤 -9- )-2- 乙炔基 -3- 羥基氧雜環戊烷 -2- ] 甲氧基 ( 羥基 ) 磷醯基 } 氧基 ( 羥基 ) 磷醯基 ) 氧基膦酸 TEA 鹽之合成
步驟1:在0℃下向司他夫定(50 mg,0.21 mmol)於(MeO) 3PO (2 mL)之溶液中添加POCl 3(342 mg,2.1 mmol)。攪拌10 min後,添加2,6-二甲基吡啶(17 mg,0.22 mmol)。在室溫,N 2氛圍下將混合物攪拌2 h。然後將(Bu 4N) 3HP 2O 7(728 mg,0.82 mmol)及Bu 3N (149 mg,0.82 mmol)於DMF (3 mL)中之溶液添加至以上溶液中。將混合物在室溫下攪拌15 h。在0℃下用TEAB (1M,緩衝液)淬滅混合物。將混合物用水稀釋且用DCM (7 x 20 mL)洗滌。將水相合併且在減壓下濃縮。藉由離子交換管柱在以下條件下純化殘餘物(管柱:HiTrap DEAE Sepharose FF,5mL;流動相A:水,流動相B:水(0.5M TEAB);流率:5 mL/min;梯度:在15 min內至25% B;波長:254 nm;RT1(min):12),得到27 mg粗產物。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(管柱:Atlantis Prep T 3OBD管柱,19*250 mm 10 μm;流動相A:水(20 mM TEAB),流動相B:ACN;流率:25 mL/min;梯度:在8 min內至15% B;波長:254 nm;RT1(min):6.5)。收集級分且在真空下濃縮,將殘餘物再溶解於CH 3CN及H 2O中,然後冷凍乾燥,得到呈白色固體之四氫三磷酸((2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氯基-9H-嘌呤-9-基)-2-乙炔基-3-羥基四氫呋喃-2-基)甲酯TEA鹽(3.9 mg,7 mmol,3.2%)。LCMS (ES, m/z): 548/550 [M-H] -, 95.1%純度。LCMS之條件:(管柱:XSelect HSS T3, 100*4.6 mm,3.5 μm;流動相A:20 mM TEAA+H 2O,流動相B:ACN;流率:1.50 mL/min;梯度:在6 min內0% B至30% B,在2 min內30% B至95% B;波長:254/220 nm;RT1(min):3.665)。 1H NMR (400 MHz, D 2O) δ 8.34 (s, 1H), 6.29 (dd, J= 7.1, 4.4 Hz, 1H), 4.83 (d, J= 7.5 Hz, 1H), 4.11 (ddd, J= 59.8, 11.4, 5.0 Hz, 2H), 3.03 (q, J= 7.5 Hz, 24H), 2.63 (ddp, J= 21.4, 14.1, 7.3 Hz, 2H), 1.11 (t, J= 7.4 Hz, 36H)。 31P NMR (162 MHz, D 2O) δ -6.64 (d, J= 21.2 Hz), -12.05 (d, J= 19.7 Hz), -22.41 (t, J= 20.0 Hz)。 實例 49- 化合物 174 :異丁酸 (2R,3S,5R)-5-(5- 胺基 -3- 側氧基 -1,2,4- 三嗪 -2(3H)- )-2-( 氯甲基 )-2-(( 異丁醯氧基 ) 甲基 ) 四氫呋喃 -3- 酯之合成
步驟1:在N 2氛圍下向1-((2R,4S)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5,5-雙(羥基-甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(4.71 g,12.62 mmol)於DCM (150 mL)之溶液中添加吡啶(5 g,63.12 mmol)。然後在-35℃下向該溶液中添加Tf 2O (7.82 g,27.83 mmol)且將反應攪拌1 h。藉由在0℃下添加冰水來淬滅反應。將所得混合物用EtOAc (3 x 300 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之雙(亞甲基)雙(三氟甲烷磺酸)((3S,5R)-3-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)四氫呋喃-2,2-二基)酯(5.42 g,8.48 mmol,67.1 %)。LC-MS (ES, m/z): 637 [M+H] +
步驟2:在N 2氛圍下向雙(亞甲基)雙(三氟甲烷磺酸)((3S,5R)-3-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)四氫呋喃-2,2-二基)酯(5.42 g,8.51 mmol)於THF (100 mL)之溶液中添加TEA (13.8 g,127.22 mmol)。將混合物在60℃下攪拌2天。然後向反應中添加LiCl (7.23 g,169.61 mmol)。在60℃下攪拌1天後,將所得混合物冷卻至室溫,在減壓下濃縮。藉由用PE/EtOAc (1:2)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之(6R,8S,9R)-8-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-9-(氯甲基)-7,8,9,10-四氫-2H,6H-6,9-環氧基嘧啶并[2,1-b] [1,3] 噁唑嗪-2-酮(2.82 g,7.51 mmol,88.2 %)。LC-MS (ES, m/z): 373/375 [M+H] +
步驟3:在N 2氛圍下向(6R,8S,9R)-8-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-9-(氯甲基)-7,8,9,10-四氫-2H,6H-6,9-環氧基嘧啶并[2,1-b][1,3]噁唑嗪-2-酮(2.82 g,7.51 mmol)於1,4-二噁烷(50 mL)及水(5 mL)之溶液中添加NaOH (1.22 g,30 mmol)。將混合物在室溫下攪拌2 h。用飽和NH 4Cl溶液將混合物中和至pH約7,且將所得混合物用EtOAc (3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:3)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之1-((2R,4S,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(1.33 g,3.31 mmol,43.1 %)。LC-MS (ES, m/z): 391/393 [M+H] +
步驟4:在N 2氛圍下向1-((2R,4S,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(1.82 g,4.81 mmol)於THF (16 mL)之溶液中添加TBAF (33 mL,33 mmol,1 M於THF中)。將混合物在室溫下攪拌2 h。將所得混合物在真空下濃縮且藉由用DCM/MeOH (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-((2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(1.22 g,4.31 mmol,97.1 %)。LC-MS (ES, m/z): 277/279 [M+H] +
步驟5:在N 2氛圍下向1-((2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(1.42 g,5.11 mmol)於ACN (50 mL)之溶液中添加TEA (1 g,10.12 mmol)及DMAP (62 mg,0.53 mmol)。然後向反應中添加2-甲基丙酸2-甲基丙醯酯(3.23 g,20.21 mmol)且將反應在40℃下攪拌隔夜。藉由添加冰水來淬滅反應,且將所得混合物用EtOAc (3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用飽和NaHCO 3溶液及鹽水洗滌,且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用石油醚/EtOAc (1:3)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之異丁酸(2R,3S,5R)-2-(氯甲基)-5-(2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-2-((異丁醯氧基)甲基)四氫呋喃-3-酯(1.72 g,4.11 mmol,83.2 %)。LC-MS (ES, m/z): 417/419 [M+H] +
步驟6:在N 2氛圍下向1,2,4-三嗪-3,5(2H,4H)-二酮(1.52 g,13 mmol)於HMDS (20 mL)之溶液中添加(NH 4) 2SO 4(19 mg,0.11 mmol)。將混合物在110℃下攪拌隔夜。蒸發混合物,得到粗產物。在N 2氛圍下向粗產物於ACN (20 mL)之溶液中添加異丁酸(2R,3S,5R)-2-(氯甲基)-5-(2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-2-((異丁醯氧基)甲基)四氫呋喃-3-酯(600 mg,1.42 mmol)及TMSOTf (1.64 g,7.22 mmol)。將混合物在60℃下攪拌隔夜。將反應冷卻至室溫,藉由在0℃下添加飽和NaHCO 3溶液來淬滅且用EtOAc (3 x 50 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌,且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用DCM/MeOH (20:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色半固體之異丁酸(2R,3S)-2-(氯甲基)-5-(3,5-二側氧基-4,5-二氫-1,2,4-三嗪-2(3H)-基)-2-((異丁醯氧基)甲基)四氫呋喃-3-酯(300 mg,0.72 mmol,50.1%)。LC-MS (ES, m/z): 418/420 [M+H] +
步驟7:在N 2氛圍下向異丁酸(2R,3S)-2-(氯甲基)-5-(3,5-二側氧基-4,5-二氫-1,2,4-三嗪-2(3H)-基)-2-((異丁醯氧基)甲基)四氫呋喃-3-酯(140 mg,0.32 mmol)於ACN (5 mL)之溶液中添加1,2,4-三唑(1.51 g,21.82 mmol),隨後在0℃下逐滴添加TEA (194 mg,1.92 mmol)。然後添加POCl 3(1 g,6.72 mmol)且在室溫下攪拌24 h。藉由在0℃下添加冰水來淬滅反應。將所得混合物用EtOAc (3 x 50 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且濃縮濾液,得到呈淡黃色油狀物之異丁酸(2R,3S)-2-(氯甲基)-2-((異丁醯氧基)甲基)-5-(3-側氧基-5-(1H-1,2,4-三唑-1-基)-1,2,4-三嗪-2(3H)-基)四氫呋喃-3-酯(140 mg,0.38 mmol,89.1 %)。LC-MS (ES, m/z): 469/471 [M+H] +
步驟8:在室溫下將異丁酸(2R,3S)-2-(氯甲基)-2-((異丁醯氧基)甲基)-5-(3-側氧基-5-(1H-1,2,4-三唑-1-基)-1,2,4-三嗪-2(3H)-基)四氫呋喃-3-酯 (140 mg,0.32 mmol)於含0.5M NH 3之THF (30 mL,15 mmol)中之溶液攪拌24 h。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型TLC用DCM/MeOH (10:1)純化殘餘物,得到呈黃色固體之異丁酸(2R,3S)-5-(5-胺基-3-側氧基-1,2,4-三嗪-2(3H)-基)-2-(氯甲基)-2-((異丁醯氧基)甲基)四氫呋喃-3-酯(80 mg,0.21 mmol,64.2 %)。LC-MS (ES, m/z): 417/419 [M+H +
步驟9:藉由製備型HPLC在以下條件下分離異丁酸(2R,3S)-5-(5-胺基-3-側氧基-1,2,4-三嗪-2(3H)-基)-2-(氯甲基)-2-((異丁醯氧基)甲基)四氫呋喃-3-酯(50 mg,0.12 mmol) (管柱:XBridge Prep OBD C18管柱,30*150 mm,5 μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3+ 0.1 % NH 3.H 2O),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在8 min內40% B至50% B,波長:254/220 nm;RT1(min):6.83)。收集級分且在真空下濃縮,將殘餘物再溶解於CH 3CN及H 2O中,然後冷凍乾燥,得到呈灰白色固體之異丁酸(2R,3S,5R)-5-(5-胺基-3-側氧基-1,2,4-三嗪-2(3H)-基)-2-(氯甲基)-2-((異丁醯氧基)甲基)四氫呋喃-3-酯(3.9 mg,0.01 mmol,8%)。LC-MS (ES, m/z): 417/419 [M+H] +, 99.7%純度。LCMS之條件:(管柱:Kinetex EVO C18管柱,30*3.0 mm,2.6 μm;流動相A:水+5 mM NH 4HCO 3,流動相B:ACN;流率:1.50 mL/min;梯度:在1.20 min內10% B至95% B,在1.78 min內95% B至95% B,在1.83 min內95% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):0.988)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 8.11 – 8.06 (m, 1H), 7.96 (s, 1H), 7.53 (s, 1H), 6.52 (m, J = 7.3, 4.8 Hz, 1H), 5.52 (m, J = 6.4 Hz, 1H), 4.15 (m, J = 11.5 Hz, 2H), 3.84-3.77 (d, J = 11.7 Hz, 2H), 2.73 (m, J = 13.7, 7.0, 4.9 Hz, 1H), 2.67 – 2.53 (m, 1H), 2.56 – 2.47 (m, 1H), 2.41 (m, J = 13.5, 7.4, 5.8 Hz, 1H), 1.13-1.07 (m, J = 7.0, 1.8 Hz, 12H)。 實例 50- 化合物 21 4- 胺基 -1-((2R,4S,5R)-4- 羥基 -5-( 羥甲基 )-5-( 三氟甲基 ) 四氫呋喃 -2- ) 嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:將尿嘧啶(0.46 g; 4.160 mmol)及硫酸銨(10 mg)於HMDS (7.0 mL; 33.65 mmol)中之懸浮液加熱至120℃歷時2 h,此時反應混合物變成澄清溶液。然後將反應濃縮且將殘餘物溶解於乙腈(15.0 mL)中。然後在室溫下向此溶液中添加三苯甲酸(3R,4S,5R)-5-((苄醯氧基)甲基)-5-(三氟甲基)四氫呋喃-2,3,4-三酯(1.2g,1.891 mmol)於乙腈(5.0 mL)中之溶液,然後添加TMSOTf (1.7 mL,9.46mmol)。然後將反應混合物在90℃下加熱16 h,此時如藉由TLC及LCMS測定反應完成。然後用飽和NaHCO 3溶液萃取反應混合物且用EtOAc (15 mL x 3)萃取水層。將合併之有機物用冷水洗滌一次,經Na 2SO 4乾燥。在減壓下移除溶劑且藉由用含20 % EtOAc之正己烷溶析之MPLC (CombiFlash Siliasep 12 g管柱)純化所得殘餘物,獲得標題產物(0.5g,42.3%)。LC-MS (ES, m/z): 625.0 (M+1)。
步驟2:在室溫下將二苯甲酸(2R,3S,4R,5R)-2-((苄醯氧基)甲基)-5-(2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-2-(三氟甲基)四氫呋喃-3,4-二酯(0.75 g,1.200 mmol )於7N甲醇氨(16.0 mL)中之溶液攪拌16 h。藉由TLC及LCMS監測反應,且完成後,將反應混合物濃縮且在真空下乾燥。藉由用含8% MeOH之DCM溶析之MPLC (CombiFlash Siliasep 40 g管柱)純化所得殘餘物,獲得所需產物(0.35 g,93.4 %)。LC-MS (ES, m/z): 312.8 (M+1)。
步驟3:在室溫下向1-((2R,3R,4S,5R)-3,4-二羥基-5-(羥甲基)-5-(三氟甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.28g,0.896 mmol)於DMF (2.0 mL)之攪拌溶液中添加碳酸二苯酯(0.21g,0.986 mmol),隨後添加NaHCO3 (0.018 g,0.224 mmol)。使用微波反應器將反應混合物在140℃下加熱1 h。濃縮反應混合物,且藉由用含8% MeOH之DCM溶析之MPLC (CombiFlash Siliasep 40 g管柱)純化所得殘餘物,獲得所需產物(0.21 g;79.6 %)。LC-MS-APSL-0574-051-P1 (ES, m/z): 294.7 (M+1)。
步驟4:在室溫下向(2R,3S,3aS,9aR)-3-羥基-2-(羥甲基)-2-(三氟甲基)-2,3,3a,9a-四氫-6H-呋喃并[2',3':4,5]噁唑并[3,2-a]嘧啶-6-酮(0.21g,0.714 mmol)於1,4-二噁烷(10.0 mL)之攪拌溶液中添加LiBr (0.080 g;0.928 mmol)及BF3.Et 2O (0.096 mL;0.785 mmol)。將反應混合物在60℃下攪拌2 h,此時TLC及LCMS顯示完全反應。濃縮反應混合物,且藉由用含8% MeOH之DCM溶析之MPLC (CombiFlash Siliasep 40 g管柱)純化所得殘餘物,獲得所需產物(0.19 g;70.9%)。LC-MS (ES, m/z): 376.7 (M+1)。
步驟5:將1-((2R,3R,4R,5R)-3-溴基-4-羥基-5-(羥甲基)-5-(三氟甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.19g,0.506 mmol)於甲醇(10.0 mL)中之溶液用氬氣脫氣5 min。在室溫下向該溶液中添加10 % Pd/C (0.075 g),隨後添加NaOAc (0.062g,0.759 mmol)。在室溫,H 2氣體(1 atm)下將反應混合物攪拌2 h,且藉由TLC及LCMS監測反應進展。通過矽藻土床過濾反應混合物且在減壓下濃縮濾液,得到粗產物(0.13g,86.7 %)。LC-MS (ES, m/z): 340.8 (M+45_甲酸鹽加合物)。
步驟6:在室溫下向1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-(三氟甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.13g,0.438 mmol)於DMF (10 mL)之攪拌溶液中添加咪唑(0.29g,4.380 mmol)、TBDMSCl (0.66 g,4.380 mmol)及AgNO 3(0.14g,0.876 mmol)。將反應混合物在80℃下攪拌2 h,此時TLC及LCMS顯示反應完成。用EtOAc及碳酸氫鈉水溶液稀釋反應混合物。將有機層分離,用鹽水洗滌,經Na 2SO 4乾燥且濃縮。藉由用含10-15 % EtOAc之正己烷溶析之MPLC (CombiFlash,Siliasep 40 g管柱)純化所得殘餘物,獲得所需產物(0.15g,65.2 %)。LC-MS (ES, m/z): 524.9 (M+1)。
步驟7:在0℃下向1-((2R,4S,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-5-(三氟甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.1g,0.190 mmol)於乙腈(5.0 mL)之攪拌溶液中添加Et 3N (0.053 mL,0.381 mmol)、DMAP (0.046 g ; 0.381 mmol)及TPSCl (0.115 g;0.381 mmol)。將反應混合物在室溫下攪拌2 h,此時藉由TLC及LCMS反應完成。然後向反應中添加氨水(0.4 ml)且將反應在室溫下攪拌2 h。濃縮反應混合物,且藉由用含4 % MeOH之DCM溶析之MPLC (CombiFlash,Siliasep 40 g管柱)純化所得殘餘物,獲得所需產物(0.08g,80.3 %)。LC-MS (ES, m/z): 524.1 (M+1)。
步驟8:在室溫下向4-胺基-1-((2R,4S,5R)-4-((三級丁基-二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-5-(三氟甲基)四氫呋喃-2-基) 嘧啶-2(1H)-酮(0.135g,0.257 mmol)於甲醇(10.0 mL)之攪拌溶液中添加NH 4F (0.095g,2.58 mmol)。將反應混合物在90℃下攪拌,此時TLC及LCMS顯示完全反應。通過矽藻土床過濾反應物質且濃縮濾液。藉由製備型HPLC在以下條件下純化所得殘餘物:流動相:A= 含0.02% NH 4OH之水;B= MeCN;管柱:X SELECT (250mm x 20.0mm),5.0µ;流動:18ml/min;梯度程式:時間%B 0/5, 2/10, 8/30,得到所需產物(0.026g,21.6 %)。LC-MS-APSL-0574-062-P1 (ES, m/z): 295.9 (M+1)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 7.71 (d, J = 7.5 Hz, 1H), 7.24 (br s, 1H), 7.20 (br s, 1H), 6.37 (t, J = 6.7 Hz, 1H), 5.75 (d, J = 7.5 Hz, 2H), 5.56 - 5.43 (m, 1H), 4.69 (br t, J = 5.9 Hz, 1H), 3.74 - 3.62 (m, 2H), 2.24 (t, J = 6.5 Hz, 2H)。 實例 51- 化合物 14 :四氫三磷酸 ((2R,3S,5R)-5-(4- 胺基 -5- 氟基 -2- 側氧基嘧啶 -1(2H)- )-2-( 氯甲基 )-3- 羥基四氫呋喃 -2- ) 甲酯 TEA 鹽之合成
在0℃下向4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮(40 mg,0.21 mmol)於(MeO) 3PO (3 mL)之溶液中添加POCl 3(667 mg,4.41 mmol)。在室溫,N 2氛圍下將混合物攪拌2 h。然後將(Bu 4N) 3HP 2O 7(3.93 g,4.35 mmol)及Bu 3N (0.6 mL)於DMF (5 mL)之溶液添加至以上溶液中。將混合物在室溫下攪拌15 h。在0℃下用TEAB緩衝液(1M)淬滅混合物。將混合物用水稀釋且用DCM (7 x 40 mL)洗滌。將水相合併且在減壓下濃縮。藉由離子交換管柱在以下條件下純化殘餘物(管柱:HiTrap DEAE Sepharose FF,5mL;流動相A:水,流動相B:水(0.5M TEAB);流率:5 mL/min;梯度:在10 min內0%至50% B;波長:254/220 nm;RT 1(min):6.3),得到40 mg粗產物。藉由製備型HPLC在以下條件下再純化粗產物(管柱:XSelect CSH Prep C18 OBD管柱,19*250 mm,5 μm;流動相A:水(50 mM TEAB),流動相B:ACN;流率:25 mL/min;梯度:在7 min內2% B至25% B;波長:254/220 nm;RT 1(min):5.7)。收集級分且在真空下濃縮,將殘餘物再溶解於CH 3CN及H 2O中,然後冷凍乾燥,得到呈白色固體之四氫三磷酸((2R,3S,5R)-5-(4-胺基-5-氟基-2-側氧基嘧啶-1(2H)-基)-2-(氯甲基)-3-羥基四氫呋喃-2-基)甲酯TEA鹽(11 mg,0.01 mmol,8.3%)。LC-MS0 (ES, m/z): 532/534 [M-H] -, 96.6%純度。LCMS之條件:(管柱:EVO C18, 150 mm,4.6 mm;流動相A:20 mmol TEA,流動相B:ACN;流率:1.20 mL/min;梯度:在6 min內0% B至95% B,95% B至95% B保持7.9 min;波長:254/220 nm;RT1(min):2.358)。 1H NMR (400 MHz, D 2O) δ 7.94 (d, J= 6.1 Hz, 1H), 6.33 – 6.07 (m, 1H), 4.698 - 4.735 (m, 1H), 4.29 – 3.92 (m, 2H), 3.82 – 3.67 (m, 2H), 3.05 (q, J= 7.3 Hz, 24H), 2.38 (dd, J= 11.7, 6.1 Hz, 2H), 1.13 (t, J= 7.3 Hz, 36H)。 31P NMR (162 MHz, D 2O) δ -7.61, -11.81, -22.75。 實例 52- 化合物 54 4- 胺基 -1-[(2R,4S,5R)-5-( 氯甲基 )-5-( 羥甲基 )-4- 甲氧基氧雜環戊烷 -2- ]-3,4- 二氫嘧啶 -2- 酮之合成
步驟1:在0℃,氮氣氛圍下向2'-去氧尿苷(10 g,43.82 mmol)及咪唑(5.9 g,87.64 mmol)於DMF (100 mL)之攪拌溶液中分批添加TBSCl (6.6 g,43.82 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌16 h。將反應用EtOAc (20 mL)稀釋,將所得混合物用鹽水(3x20 mL)洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液,得到呈黃色油狀物之1-[(2R,4S,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(12.0 g,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 343 (M+H) +
步驟2:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(12.0 g,粗品)於THF (200 mL)之攪拌溶液中添加NaH (1.7 g,70.1 mmol)。將混合物在0℃下攪拌10分鐘。然後分批添加CH 3I (14.9 g,105.12 mmol)。將混合物在室溫下攪拌16小時且藉由添加冰水(100 mL)使其淬滅。將所得混合物用EtOAc (2 x 50mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3x50 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色油狀物之1-[(2R,4S,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(8.0 g,22.44 mmol,兩個步驟51.3%產率)。LC-MS (ES, m/z): 357 (M+H) +
步驟3:在室溫,氮氣氛圍下將1-[(2R,4S,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(8.0 g,22.44 mmol)及NH 4F (16.6 g,448.82 mmol)於MeOH (100 mL)中之溶液攪拌16 h。過濾所得混合物;且用MeOH (2x20 mL)洗滌濾餅。將合併之濾液在減壓下濃縮,得到呈白色固體之1-[(4S)-5-(羥甲基)-4-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(5.0 g,粗品),其未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 243 (M+H) +
步驟4:向1-[(2R,4S,5R)-5-(羥甲基)-4-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(5.0 g,粗品)於ACN (50 mL)之溶液中添加IBX (11.6 g,41.28 mmol)。在80℃,氮氣氛圍下將混合物攪拌2 h。過濾所得混合物;用ACN (2x20 mL)洗滌濾餅。將合併之濾液在減壓下濃縮,得到呈白色固體之(3S)-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-甲氧基氧雜環戊烷-2-甲醛(3.0 g,粗品),其未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 241 (M+H) +
步驟5:向(2S,3S,5R)-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-甲氧基氧雜環戊烷-2-甲醛(3.0 g,粗品)於1,4-二噁烷(60 mL)之攪拌溶液中添加NaOH水溶液(12.5 mL,2M)。隨後在室溫,氮氣氛圍下逐滴添加HCHO (5 mL,37%於水中)。將混合物在室溫下攪拌15 h,然後冷卻至0℃。在0℃下經5 min向以上混合物中分批添加NaBH 4(0.9 g,24.97 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌2 h,然後藉由在0℃下添加飽和NH 4Cl (水溶液)來淬滅。將所得混合物用EtOAc (3 x 60 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x100 mL)洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4S)-5,5-雙(羥甲基)-4-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮;甲烷(300 mg,1.10 mmol,三個步驟7.9 %產率)。LC-MS (ES, m/z): 273(M+H) +
步驟6:在-30℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,4S)-5,5-雙(羥甲基)-4-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(300 mg,1.10 mmol)於吡啶(5 mL)之攪拌溶液中逐滴添加Tf 2O (621.0 mg,2.20 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌1 h且藉由添加水(10 mL)來淬滅。將所得混合物用DCM (2 x 10mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x20 mL)洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC純化殘餘物(PE/EtOAc 1:1),得到呈黃色油狀物之三氟甲烷磺酸[(3S,5R)-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-甲氧基-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(300 mg,0.56 mmol,50.8%)。LC-MS (ES, m/z): 537(M+H) +
步驟7:向三氟甲烷磺酸[(3S,5R)-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-甲氧基-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(300 mg,0.56 mmol)於THF (3 mL)之溶液中添加Et 3N (566.0 mg,5.60 mmol)。將混合物在室溫下攪拌3 h。向以上混合物中添加LiCl (46 mg,1.12 mmol)且將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。隨後添加NaOH (82.0 mg,2.08 mmol)於水(1 mL)中之溶液。將所得混合物在室溫下再攪拌3 h且在真空下濃縮。藉由用DCM/MeOH (50:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之3-乙醯基-1-[(2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)-4-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]脲(120 mg,0.42 mmol,75.0 %)。LC-MS (ES, m/z): 291/293 (M+H) +
步驟8:在室溫,氮氣氛圍下向3-乙醯基-1-[(2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)-4-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]脲(120.0 mg,0.42 mmol,)及咪唑(56.2 mg,0.81 mmol)於DMF (5 mL)之攪拌溶液中分批添加TBSCl (123.0 mg,0.81 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌3 h且用EtOAc (10 mL)稀釋。將所得溶液用鹽水(3x10 mL)洗滌且在減壓下濃縮。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠層析法純化殘餘物,得到呈黃色油狀物之1-[(2R,4S,5R)-5-{[(三級丁基-二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-4-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(150.0 mg,0.12 mmol,89.9%)。LC-MS (ES, m/z): 405/407 (M+H) +
步驟9:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-4-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(150.0 mg,0.36 mmol)及DMAP (135.0 mg,10.8 mmol)於MeCN (3 mL)之攪拌溶液中分批添加Et 3N (111.0 mg,1.08 mmol)及TPSCl (336.0 mg,1.08 mmol)。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌2 h。在室溫下向以上混合物中逐滴添加NH 3.H 2O (129.0 mg,3.69 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌4 h且在減壓下濃縮。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-4-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]-3,4-二氫嘧啶-2-酮(80.0 mg,0.20 mmol,53.3%)。LC-MS (ES, m/z): 404/406 (M+H) +
步驟10:在室溫,氮氣氛圍下將4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-4-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]-3,4-二氫嘧啶-2-酮(80.0 mg,0.20 mmol)及NH 4F (72.0 mg,2.00 mmol)於MeOH (2 mL)中之溶液攪拌1天。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型HPLC在以下條件下純化殘餘物:管柱:XBridge Shield RP18 OBD管柱,30 x150 mm,5μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在8 min內2% B至20% B;波長:254/210 nm。將含有產物之級分合併且部分蒸發以移除溶劑,然後冷凍乾燥隔夜,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)-4-甲氧基氧雜環戊烷-2-基]-3,4-二氫嘧啶-2-酮(35.8 mg,0.12 mmol,62.4%)。LC-MS (ES, m/z): 290/292 (M+H) +, 99.2%純度。HPLC之條件:(管柱:Shim‐pack Scepter C18‐120, 33*3.0 mm,3.0 μm;流動相A:水/5mM NH 4HCO 3,流動相B:乙腈;流率:1.5000 mL/min;梯度:在1.19min內10% B至95% B,在0.6 min內95% B至95% B,在0.02 min內95% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):0.564)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 7.76 (d, J = 7.6 Hz, 1H), 7.19 (d, J = 25.6 Hz, 2H), 6.16 (t, J = 6.9 Hz, 1H), 5.74 (d, J = 7.6 Hz, 1H), 5.29 (t, J = 5.2 Hz, 1H), 4.06 (dd, J = 6.0, 3.4 Hz, 1H), 3.78 – 3.70 (m, 2H), 3.63 – 3.55 (m, 2H), 3.30 (s, 3H), 2.41 – 2.37 (m, 1H), 2.18 – 2.11 (m, 1H)。 實例 53- 化合物 56 1-((2R,4S)-5- 烯丙基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- )-4- 胺基嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在室溫下向1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(10.00g,43.82mmol)於THF(100 mL)之攪拌溶液中添加咪唑(5.96g,87.64 mmol)及TPP (17.24g,65.73 mmol)。將反應攪拌15 min,然後用在0℃下以分批方式添加的I 2(8.34g,65.73 mmol)處理。反應混合物在室溫下攪拌16 h後,TLC顯示完全反應。過濾反應混合物,且用THF (50 mL)洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液,得到粗化合物。將粗材料溶解於DCM (500 mL)中,用水(200 mL)洗滌且用DCM (200 mL)萃取水層。將合併之有機物用水(300 mL)、鹽水(300 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且在減壓下濃縮,得到粗化合物。藉由用含10% MeOH之DCM溶析之CombiFlash管柱層析法純化粗殘餘物,得到呈白色固體之所需產物(4.2g,28%)。LC-MS (ES, m/z): 336.90 (M-H)。
步驟2:在室溫下向1-((2R,4S,5S)-4-羥基-5-(碘甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(19.80g 159.76 mmol)於THF (180 mL)之攪拌溶液中添加DBN (19.80g 159.76 mmol)。將反應混合物在60℃下攪拌6 h,此時TLC及LCMS顯示完全反應。濃縮反應混合物,且藉由用含3% MeOH之DCM溶析之CombiFlash層析法純化所得殘餘物,得到呈灰白色固體之所需產物(10.0g;55.5%)。LC-MS (ES, m/z): 210.8 (M+H) +
步驟3:在室溫下向1-((2R,4S)-4-羥基-5-亞甲基-四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(9.0g,42.818 mmol)於DMF (90 mL)之攪拌溶液中添加咪唑(8.744g,128.455 mmol),隨後添加TBDMS-Cl (12.907 g,85.637 mmol)。反應混合物在室溫下4 h,此時TLC及LCMS顯示反應完成。將反應混合物用冰水稀釋且用EtOAc萃取。將合併之有機級分用水及鹽水洗滌,然後經硫酸鈉乾燥,過濾且濃縮。藉由用1% 甲醇之DCM溶析之CombiFlash管柱層析法純化殘餘物,得到5.2g,(產率:37 %)1-((2R,4S)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-亞甲基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮。LC-MS (ES, m/z): 324.90 (M+H) +
步驟4:向1-((2R,4S)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-亞甲基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(2.50g,7.70 mmol)於DCM (40 mL)之攪拌溶液中添加NaHCO 3(9.71g,115.58 mmol)及丙酮(17.90g,308.21 mmol)。將反應冷卻至0℃且攪拌15 min。向此冷溶液中逐滴添加含Oxone (16.58g,53.94 mmol)之水(75 mL)。將反應在0℃下攪拌2 hr,此時TLC及LCMS顯示完全反應。將反應用冷DCM稀釋,且用冷硫代硫酸鈉溶液、冰水及冷鹽水洗滌。將有機物經硫酸鈉乾燥,過濾且濃縮,得到呈淺黃色固體之標題化合物(2.7g)。LC-MS (ES, m/z): 340.95 (M+H)。
步驟5:向1-((3S,5R,7S)-7-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-1,4-二氧雜螺[2.4]庚-5-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(2.50 g,7.34 mmol)於DCM (40 mL)之攪拌溶液中添加烯丙基三甲基矽烷(3.36g,29.373 mmol)。將反應攪拌15 min,然後冷卻至-40℃。然後在-40℃下以逐滴方式向此冷卻溶液中添加SnCl 4(7.65 g,29.37 mmol)。將反應在0℃下攪拌2 hr,此時TLC及LCMS顯示完全反應。將反應用NaHCO 3溶液淬滅且用DCM萃取。將合併之有機物用水及鹽水洗滌,且經硫酸鈉乾燥。將溶液過濾且濃縮。藉由用含1.2% 甲醇之DCM溶析之CombiFlash層析法純化殘餘物,得到呈淺黃色固體之0.85g,( 30%)標題產物。LC-MS (ES, m/z): 380.85 (M-H)。
步驟6:在室溫下向1-((2R,4S,5R)-5-烯丙基-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.840g,2.196 mmol)於DMF (8 mL)之攪拌溶液中添加咪唑(0.448g,6.588 mmol),隨後添加TBDMS-Cl (0.662 g,4.392 mmol)。將反應在室溫下攪拌4 hr,此時TLC及LCMS顯示完全反應。將反應混合物用冰水稀釋且用EtOAc萃取。將合併之有機物用水及鹽水洗滌,然後經硫酸鈉乾燥。將溶液過濾且濃縮。藉由用含30% EtOAc之己烷溶析之CombiFlash層析法純化殘餘物,得到呈固體泡沫之0.82g,(75%)標題化合物。LC-MS (ES, m/z): 495.10 (M-H)。
步驟7:在室溫下向1-((2R,4S,5R)-5-烯丙基-4-((三級丁基-二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.300g,0.604 mmol)於MeCN (7 mL)之攪拌溶液中添加Et3N (0.244g,2.415 mmol)及DMAP (0.148g,1.208 mmol)。將反應攪拌15 min且冷卻至0℃。在0℃下將反應用以分批方式添加的TPS-Cl (0.37g,1.21 mmol)處理,且在室溫下繼續攪拌2 h。將反應冷卻至0℃,用1,2,4-三唑(0.209g,3.019 mmol)處理且在室溫下攪拌2 h,此時TLC及LCMS顯示完全反應。將反應用冰水稀釋且用EtOAc萃取。將合併之有機物用水及鹽水洗滌,然後經硫酸鈉乾燥。將溶液過濾且濃縮。藉由用含40% EtOAc之正己烷溶析之CombiFlash層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之0.26g,( 73%)標題化合物。LC-MS (ES, m/z): 570.20 (M+Na)。
步驟8:向1-((2R,4S,5R)-5-烯丙基-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)-4-(1H-1,2,4-三唑-1-基)嘧啶-2(1H)-酮(0.210 g,0.383 mmol)於1,4-二噁烷(2 mL)之攪拌溶液中添加氨溶液(2 mL)。將反應在室溫下攪拌15 min,然後加熱至30℃歷時4 h。此時TLC及LCMS顯示完全反應。濃縮反應物質,得到呈淺黃色液體之標題化合物(0.210g)。LC-MS (ES, m/z): 496.10 (M+1)。
步驟9:向1-((2R,4S,5R)-5-烯丙基-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)-4-胺基嘧啶-2(1H)-酮(0.195 g,0.393 mmol)於THF (3 mL)之攪拌溶液中添加TBAF (1M於THF中) (2.36 mL,2.36 mmol)。將反應混合物在室溫下攪拌4 h,此時TLC及HPLC顯示完全反應。濃縮反應混合物,且藉由製備型HPLC在以下條件下純化殘餘物:流動相:A=含0.02% NH 4OH之水,B= CH 3CN,管柱:X SELECT (250mm x 20.0mm),5.0µ 流動:18.0 mL/min,梯度:時間/%B:0/5,2/10,8/20。藉由製備型HPLC按照與以上相同之條件再純化以上所獲得之材料,得到呈白色固體之10 mg標題化合物。LC-MS (ES, m/z): 267.80 (M+1)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 7.86 (d, J = 7.5 Hz, 1H), 7.15 - 7.00 (m, 2H), 6.11 (t, J = 6.5 Hz, 1H), 5.86 (br d, J = 7.3 Hz, 1H), 5.69 (d, J = 7.3 Hz, 1H), 5.18 (d, J = 4.8 Hz, 1H), 5.09 - 4.98 (m, 3H), 4.27 (br d, J = 6.0 Hz, 1H), 3.40 (t, J = 5.5 Hz, 2H), 2.41 - 2.30 (m, 1H), 2.28 - 2.14 (m, 2H), 2.06 (td, J = 6.7, 13.2 Hz, 1H)。 實例 54- 化合物 59 4- 胺基 -1-[(2R,4R,5R)-5-( 氯甲基 )-4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 氧雜環戊烷 -2- ] 嘧啶 -2- 酮之合成
步驟1:在0℃,氮氣氛圍下向2'-去氧尿苷(40.0 g,175.28 mmol)及咪唑(17.9 g,262.92 mmol)於DMF (800 mL)之攪拌溶液中分批添加TBSCl (26.4g,175.28 mmol)。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌2 h。藉由在0℃下添加100 mL飽和NaHCO 3(水溶液)來淬滅反應。將所得混合物用EtOAc (3 x 500 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2 x 500 mL)洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(50.0 g,146.0 mmol,83.3%)。LC-MS (ES, m/z): 343 (M+H) +
步驟2:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(50.0 g,146.00 mmol)及PPh 3(114.9 g,437.99 mmol)於DMF (500 mL)之攪拌溶液中逐滴添加DIAD (88.6 g,438.00 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌隔夜。藉由在0℃下添加水(220mL)來淬滅反應。用EtOAc (3x200 mL)萃取所得溶液。將合併之有機層用鹽水(2x200 mL)洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用CHCl2/MeOH (30:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之(1R,10R)-10-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-8,11-二氧雜-2,6-二氮雜三環[7.2.1.0^{2,7}]十二碳-3,6-二烯-5-酮(35.0 g,107.8 mmol,73.9%)。LC-MS (ES, m/z): 325 (M+H) +
步驟3:在0℃下向(1R,10R)-10-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-8,11-二氧雜-2,6-二氮雜三環[7.2.1.0^ {2,7}]十二碳-3,6-二烯-5-酮(35.0 g,107.9 mmol)於H 2O (70 mL)及EtOH (350 mL)之攪拌溶液中逐滴添加1M NaOH水溶液(220 mL,220.0 mmol)。將所得混合物在60℃下攪拌隔夜,然後冷卻至室溫。用AcOH (水溶液)將所得混合物中和至pH 7且在減壓下濃縮。藉由用DCM/MeOH (30:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4R,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(20.0 g,87.6 mmol,81.2%)。LC-MS (ES, m/z): 229 (M+H) +
步驟4:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,4R,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(20.0 g,87.64 mmol)及咪唑(8.9 g,131.46 mmol)於DMF (400 mL)之攪拌溶液中分批添加TBSCl (13.2 g,87.64 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌2 h,然後藉由在0℃下添加飽和NaHCO 3(水溶液) (50 mL)來淬滅。將所得混合物用EtOAc (3 x 200 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2 x 200 mL)洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(25.0 g,73.0 mmol,83.3%)。LC-MS (ES, m/z): 343 (M+H) +
步驟5:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(25.0 g,73.00 mmol)及AgNO 3(24.7 g,146.00 mmol)於DCM (600 mL)之攪拌溶液中分批添加s-三甲基吡啶(88.0 g,730.00 mmol)及MMTrCl (98.7 g,292.00 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌隔夜。過濾所得混合物;用DCM (3 x 300 mL)洗滌濾餅。將合併之有機層用鹽水(2 x 300 mL)、NaHCO 3(水溶液) (100 ml)洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液,得到1-[(2R,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(35.0 g,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 615 (M+H) +
步驟6:在室溫下向1-[(2R,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(35.0 g,粗品)於THF (350 mL)之攪拌溶液中分批添加TBAF (17.8 g,68.31 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。在減壓下濃縮所得混合物。用鹽水(100 mL)稀釋殘餘物。將所得混合物用EtOAc (3 x 200 mL)萃取且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:2)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4R,5R)-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(20.0 g,40.0 mmol,兩個步驟54.8%產率)。LC-MS (ES, m/z): 499 (M-H) -
步驟7:在室溫,氮氣氛圍下向1-[(2R,4R,5R)-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(20.0 g,39.96 mmol)於ACN (40 mL)之攪拌溶液中分批添加IBX (22.4 g,79.91 mmol)。在60℃,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌2 h。使混合物冷卻至室溫。過濾所得混合物;用乙腈(3x5 mL)洗滌濾餅。將合併之濾液在真空下濃縮,得到呈白色固體之(2S,3R,5R)-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基] 氧雜環戊烷-2-甲醛(18.0 g,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 499 (M+H) +
步驟8:在室溫下向(2S,3R,5R)-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基] 氧雜環戊烷-2-甲醛(18.0 g,粗品)於1,4-二噁烷(150 mL)之攪拌溶液中逐滴添加HCHO (9 mL,37%於水中)及NaOH水溶液(40 mL,2M)。將所得混合物用氮氣脫氣三次,然後在室溫,氮氣氛圍下攪拌隔夜。在0℃下經5 min向以上混合物中分批添加NaBH 4(5.8 g,151.65 mmol)。將所得混合物在室溫下再攪拌1 h。藉由在0℃下添加飽和NH 4Cl (水溶液) (200 mL)來淬滅反應。將所得混合物用EtOAc (3 x 200 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2 x 200 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (20:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4R)-5,5-雙(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(12.6 g,23.76 mmol,兩個步驟34.0%產率)。LC-MS (ES, m/z): 529 (M-H) -
步驟9:在-30℃下向1-[(2R,4R)-5,5-雙(羥甲基)-4-[(4-甲氧基-苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(5.0 g,9.42 mmol)於吡啶(40 mL)之溶液中添加Tf 2O (8.0 g,28.27 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌2 h,且藉由在0℃下添加飽和NaHCO 3(水溶液) (200 mL)來淬滅。將所得混合物用EtOAc (2 x 200 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2 x 200 mL)洗滌,且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (20:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之[三氟甲烷磺酸(3R,5R)-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(4.0 g,5.0 mmol,53.41%)。LC-MS (ES, m/z): 795 (M+H) +
步驟10:在室溫,氮氣氛圍下向三氟甲烷磺酸[(3R,5R)-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(4.0 g,5.03 mmol)於THF (40 mL)之攪拌溶液中分批添加TEA (5.1 g,50.33 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌3 h。向以上混合物中添加LiCl (493.0 mg,11.63 mmol)且將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。向所得混合物中添加NaOH (226.0 mg,5.65 mmol)於水(3 mL)中之溶液。將所得混合物在室溫下再攪拌3 h。完成後,添加20 mL水,且用EtOAc (3 x 60 mL)萃取。將有機層用鹽水洗滌,且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠層析法純化殘餘物,得到1-[(2R,4R,5R)-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(600.0 mg,1.1 mmol,21.7%)。LC-MS (ES, m/z): 549/551 (M+H) +
步驟11:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,4R,5R)-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(600.0 mg,1.12 mmol)及咪唑(112.0 mg,1.64 mmol)於DMF (12 mL)之攪拌溶液中分批添加TBSCl (165.0 mg,1.12 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌2 h,且藉由在0℃下添加飽和NaHCO 3(水溶液)(100 mL)來淬滅。用EtOAc (2 x100 mL)萃取所得溶液。將合併之有機層用鹽水(2 x 100 mL)洗滌,且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (20:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(700.0 mg,1.1 mmol,96.57%)。LC-MS (ES, m/z): 663/665 (M+H) +
步驟12:在室溫下向1-[(2R,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(600.0 mg,0.91 mmol)及DMAP (332.0 mg,2.72 mmol)於ACN (24 mL)之攪拌溶液中分批添加TEA (275.0 mg,2.72 mmol)及TPSCl (822.0 mg,2.72 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌2 h。在室溫下向以上混合物中逐滴添加NH 3.H 2O (12 mL,0.71 mmol)。將所得混合物在室溫下再攪拌1 h。在減壓下濃縮所得混合物。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之4-胺基-1-[(2R,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-4-[(4-甲氧基苯基) 二苯基-甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(400.0 mg,0.6 mmol,66.77%)。LC-MS (ES, m/z): 662/664 (M+H) +
步驟13:在50℃,氮氣氛圍下將4-胺基-1-[(2R,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(400.0 mg,0.60 mmol)於乙酸(8 mL,80%)中之溶液攪拌1 h。使混合物冷卻至室溫且用飽和NaHCO 3(水溶液)中和至pH 7。將所得混合物用EtOAc (3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3x100 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(200.0 mg,0.51 mmol,84.92%)。LC-MS (ES, m/z): 390/392 (M+H) +
步驟14:在室溫下向4-胺基-1-[(2R,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(200.0 mg,0.51 mmol)於MeOH (2 mL)之攪拌溶液中分批添加NH 4F (200.0 mg,5.40 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。過濾所得混合物;且用MeOH (3x5 mL)洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液。藉由製備型HPLC在以下條件下純化殘餘物:管柱:XBridge Prep OBD C18管柱,30 x150 mm,5μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在8 min內2% B至16% B;波長:254/220 nm。將含有產物之級分合併且部分蒸發以移除溶劑,然後冷凍乾燥隔夜,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,4R,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(59.6 mg,0.2 mmol,42.15%)。LC-MS 276/278 (M+H) +. 99.2%純度。HPLC之條件:(管柱:Atlantis T3, 100*4.6 mm,3.5 μm;流動相A:水/0.05%TFA,流動相B:MeOH;流率:1.0000 mL/min;梯度:在8.00 min內3% B至95% B,在2.00 min內95% B至95% B,在0.50 min內90% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):3.54)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 7.89 (d, J = 7.6 Hz, 1H), 7.17 (brs, 1H), 7.10 (brs, 1H), 6.16 – 6.13 (m, 1H), 5.75 (d, J = 7.6 Hz, 1H), 5.50 – 5.49 (m, 1H), 4.81 – 4.79 (m, 1H), 4.27 – 4.25 (m, 1H), 3.78 – 3.64 (m, 4H), 2.82 – 2.75 (m, 1H), 1.88 – 1.86 (m, 1H)。 實例 55- 化合物 44 (([(2R,3S,5R)-5-(4- 胺基 -2- 側氧基嘧啶 -1- )-2- 乙基 -3- 羥基氧雜環戊烷 -2- ] 甲氧基 ( 羥基 ) 磷醯基氧基 ( 羥基 ) 磷醯基 ) 氧基膦酸;肆 ( 三乙胺 ) 之合成
在0℃,N 2氛圍下向4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-5-乙基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(40 mg,0.21 mmol)於(MeO) 3PO (4 mL)之攪拌溶液中逐滴添加POCl 3(480 mg,3.22 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌2 h。然後在0℃,N 2氛圍下逐滴添加(Bu 4N) 3HP 2O 7(2.82 g,3.21 mmol)及Bu 3N (580 mg,3.11 mmol)於DMF (4 mL)中之溶液。在室溫,N 2氛圍下將所得混合物攪拌18 h。在0℃下將混合物用TEAB緩衝液(1M)淬滅,用水稀釋且用DCM (7 x 40 mL)洗滌。將水相合併且在減壓下濃縮。藉由離子交換管柱在以下條件下純化殘餘物(管柱:HiTrap DEAE Sepharose FF, 5mL;流動相A:水,流動相B:水(0.5M TEAB);流率:5 mL/min mL/min;梯度:在15 min內60% B至80% B;波長:254 nm/220 nm;RT1(min):8.7),得到粗產物。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(管柱:YMC Triart C18 ExRs 5 μm,20*250 mm;流動相A:水(50 mM TEAB),流動相B:ACN;流率:25 mL/min;梯度:在10 min內3% B至20% B;波長:254/220 nm;RT1(min):8.8)。收集含有產物之級分且在真空下濃縮,將殘餘物再溶解於CH 3CN及H 2O中,然後冷凍乾燥,得到呈白色固體之四氫三磷酸((2R,3S,5R)-5-(4-胺基-2-側氧基嘧啶-1(2H)-基)-2-乙基-3-羥基四氫呋喃-2-基)甲酯TEA鹽(17.2 mg,0.02 mmol,11.9%)。LCMS (ES, m/z): 494 [M-H] -, 98.3%純度。LCMS之條件:(管柱:Kinetex EVO,100*4.6 mm,2.6 μm;流動相A:20 mM TEAA,流動相B:ACN;流率:1.20 mL/min;梯度:在8.00 min內0% B至95% B;波長:254/220 nm;RT1(min):3.382)。 1H NMR (400 MHz, D2O) δ 7.90 (d, J = 7.8 Hz, 1H), 6.13 (d, J = 6.9 Hz, 1H), 6.02 (d, J = 7.6 Hz, 1H), 4.56 (t, J = 6.4 Hz, 1H), 3.19 – 2.80 (m, 21H), 2.30 (p, J = 8.2, 7.8 Hz, 2H), 1.58 (ddd, J = 44.3, 14.7, 7.5 Hz, 2H), 1.15 (tt, J = 7.4, 1.6 Hz, 31H), 0.85 (t, J = 7.6 Hz, 3H)。31P NMR (162 MHz, D 2O) δ -9.91 (d, J = 20.7 Hz), -11.52 (d, J = 20.1 Hz), -23.17 (t, J = 19.8 Hz)。 實例 56- 化合物 44 :四氫三磷酸 ((2R,3S,5R)-5-(4- 胺基 -2- 側氧基嘧啶 -1(2H)- )-3- 羥基 -2- 乙烯基四氫呋喃 -2- ) 甲酯 TEA 鹽之合成
在0℃,N 2氛圍下向4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-5-乙烯基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(50 mg,0.21 mmol)於(MeO) 3PO (6 mL)之攪拌溶液中逐滴添加POCl 3(605 mg,3.92 mmol)。在室溫,N 2氛圍下將所得混合物攪拌2 h。在0℃,N 2氛圍下向以上溶液中逐滴添加含(Bu 4N) 3HP 2O 7(3.6 g,3.92 mmol)及Bu 3N (1.2 mL)之DMF (4 mL)。在室溫,N 2氛圍下將所得混合物攪拌14 h。在0℃下用TEAB緩衝液(1M)將混合物鹼化至pH 11。用DCM (7 x 40 mL)洗滌所得混合物。在真空下濃縮水溶液。藉由離子交換管柱在以下條件下純化殘餘物(管柱:HiTrap DEAE Sepharose FF,5 mL;流動相A:水,流動相B:水(0.5M TEAB);流率:5 mL/min;梯度:在15 min內2% B至50% B,波長:254/220 nm;RT1(min):6.7),得到50 mg粗產物。藉由製備型HPLC在以下條件下再純化粗產物(50 mg)(管柱:YMC-Actus Triart C18 ExRS, 20*250 mm,5 μm;流動相A:水(50 mM TEAB),流動相B:ACN;流率:25 mL/min;梯度:在10 min內2% B至20% B,波長:254/220 nm;RT1(min):6.8)。收集含有產物之級分且在真空下濃縮,將殘餘物再溶解於CH 3CN及H 2O中,然後冷凍乾燥,得到呈白色固體之四氫三磷酸((2R,3S,5R)-5-(4-胺基-2-側氧基嘧啶-1(2H)-基)-3-羥基-2-乙烯基四氫呋喃-2-基)甲酯TEA鹽(16 mg,18 μmol,8.7%)。LC-MS (ES, m/z): 492 [M-H] -, 97.1%純度。HPLC之條件:(管柱:Kinetex EVO, 100*4.6 mm,2.6 μm;流動相A:20 mM TEAA,流動相B:乙腈;流率:1.20 mL/min;梯度:在1.0 min內0% B至0% B,在7.0 min內0% B至95% B;波長:254 nm;RT1(min):3.487)。 1H NMR (300 MHz, D 2O) δ 8.03 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 6.21 (t, J= 5.5 Hz, 1H), 6.05 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 5.88 (dd, J= 17.4, 10.9 Hz, 1H), 5.43 (dd, J= 17.4, 1.4 Hz, 1H), 5.33 (dd, J= 10.9, 1.4 Hz, 1H), 4.72 (d, J= 7.8 Hz, 1H), 4.19 (dd, J= 11.5, 5.6 Hz, 1H), 3.86 (dd, J= 11.5, 3.8 Hz, 1H), 3.08 (q, J= 7.3 Hz, 24H), 2.32 – 2.21 (m, 2H), 1.16 (t, J= 7.3 Hz, 36H)。 31P NMR (121 MHz, D 2O) δ -6.40 (d, J= 21.0 Hz), -11.70 (d, J= 19.7 Hz), -22.55 (t, J= 20.5 Hz)。 實例 57- 化合物 119 4- 胺基 -1-((2R,4R,5R)-5-( 氯甲基 )-3,3- 二氟基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- ) 嘧啶 -2(1H)- 酮之合成s
步驟1:向4-胺基-1-((2R,4R,5R)-3,3-二氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮(13g,49.39mmol)於1,4-二噁烷(65 mL)及水(80 mL)之攪拌溶液中添加1N HCl (6.5 mL)且在室溫下將反應攪拌15 min。向其中添加亞硝酸異戊酯(57.86g,493.92 mmol)。將反應在70℃下攪拌16 hr,此時TLC及LSMS顯示完全反應。濃縮反應混合物,用正己烷濕磨所得殘餘物且在真空下乾燥,得到呈白色固體之所需化合物(13.1 g,粗品)。LC-MS (ES, m/z): 264.80 (M+H)。
步驟2:在0℃下向1-((2R,4R,5R)-3,3-二氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(12.8 g,48.45 mmol)於吡啶(150 mL)之攪拌溶液中添加TBDPSCl (14.649 g , 53.297 mmol)。將反應在室溫下攪拌4 hr,此時TLC及LCMS顯示完全反應。將反應混合物濃縮,用冰水(250 mL)稀釋且用EtOAc (2x250 mL)萃取。將合併之有機物用水(100 mL),然後鹽水(100 mL)洗滌,且經硫酸鈉乾燥。過濾混合物且濃縮濾液。藉由用含40% EtOAc之正己烷溶析之CombiFlash管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之所需產物(10.8 g,51%)。LC-MS (ES, m/z): 502.85 (M+H)。
步驟3:在室溫下向1-((2R,4R,5R)-5-(((三級丁基二苯基矽烷基)氧基)甲基)-3,3-二氟基-4-羥基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(10.80 g,21.489 mmol)於DCM (100 mL)之攪拌溶液中添加AgNO 3(4.02g,23.64 mmol),隨後添加2,4,6-三甲基吡啶(2.864g,23.638 mmol)。攪拌15 min後,在0℃下以分批方式添加MMTr-Cl (7.30 g , 23.638 mmol)。攪拌6 hr後,TLC及LCMS顯示完全反應。將反應混合物用冰水(250 mL)稀釋且用DCM (2x250 mL)萃取。將合併之有機物用水(100 mL)及鹽水(100 mL)洗滌,然後經硫酸鈉乾燥。然後過濾混合物且濃縮濾液。藉由用含40% EtOAc之正己烷溶析之CombiFlash管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之所需產物(12.7 g,76%)。LC-MS (ES, m/z): 772.85 (M-H)。
步驟4:向1-((2R,4R,5R)-5-(((三級丁基二苯基矽烷基)氧基)甲基)-3,3-二氟基-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(12.50g,16.13 mmol)於THF (100 mL)之攪拌溶液中添加TBAF (1M於THF中) (64.5 mL,64.52 mmol)。反應混合物在室溫下攪拌4 h後,TLC及LCMS顯示完全反應。將反應混合物用冰水(250 mL)稀釋且將所得混合物用EtOAc (2x250 mL)萃取。將合併之有機物用水(100 mL)及鹽水(100 mL)洗滌,然後經硫酸鈉乾燥。過濾混合物且濃縮。藉由用含40% EtOAc之己烷溶析之CombiFlash管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之所需產物(7.6 g,87%)。LC-MS (ES, m/z): 535.00 (M-H)。
步驟5及6:在室溫下向1-((2R,4R,5R)-3,3-二氟基-5-(羥甲基)-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(3.0g,5.59 mmol)於CH 3CN (30 mL)之攪拌溶液中添加IBX (1.879 g,6.710 mmol)。將反應在90℃下攪拌2 h,此時TLC及LCMS顯示完全反應。過濾反應混合物且將濾液濃縮至乾,得到粗醛。將該醛溶解於1,4-二噁烷(30 mL)中且用HCHO (1.82 mL,22.37 mmol),隨後2M NaOH (5.6 mL,11.18 mmol)處理。然後將反應在室溫下攪拌2 h。然後在0℃下向反應中添加NaBH 4(1.269 g,33.549 mmol)。將反應在室溫下攪拌30 min,此時TLC及LCMS顯示完全反應。將反應混合物用鹽水(100 mL)稀釋且用DCM (2x100 mL)萃取。將合併之有機物用水及鹽水洗滌且經硫酸鈉乾燥。將混合物過濾,濃縮且藉由用含70% EtOAc之正己烷溶析之CombiFlash管柱層析法純化所得殘餘物,得到呈灰白色固體之所需產物(0.95g,29%)。LC-MS (ES, m/z): 566.85 (M+H)。
步驟7:向1-((2R,4R)-3,3-二氟基-5,5-雙(羥甲基)-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.550g,0.97 mmol)於DCM (10 mL)之攪拌溶液中添加吡啶(0.768g,9.71 mmol)。將反應攪拌15 min,冷卻至-30℃且用Tf 2O (0.603g,2.136 mmol)處理。將反應在-30℃下攪拌1 hr,此時TLC及LCMS顯示完全反應。將反應物質在-30℃下用水(150 mL)淬滅,在0℃下攪拌10 min,然後用DCM (2x150 mL)萃取。將合併之有機物用水及鹽水洗滌,然後經硫酸鈉乾燥。將混合物過濾且濃縮,藉由用含25% EtOAc之正己烷溶析之CombiFlash管柱層析法純化所得殘餘物,得到呈灰白色固體之所需產物(0.95g,29%)。LC-MS (ES, m/z): 830.70 (M+H)。
步驟8及9:在0℃下向雙(亞甲基)雙(三氟甲烷磺酸)((3R,5R)-5-(2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-4,4-二氟基-3-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)四氫呋喃-2,2-二基)酯(0.60g,0.72 mmol)於DMF (5 mL)之攪拌溶液中添加NaH (0.031 g,0.795 mmol)。將反應在0℃下攪拌1 h,此時TLC及LCMS顯示完全反應。然後將反應用LiCl (0.092g,2.17 mmol)處理且在室溫下攪拌4 h。然後在0℃下以逐滴方式向反應中添加1M NaOH (1.1 mL,1.083 mmol)。將反應攪拌1 h,此時TLC及LCMS顯示完全反應。將反應混合物用水(100 mL)淬滅,攪拌10 min且用EtOAc (2x100 mL)萃取。將合併之有機級分用水(50 mL)及鹽水(50 mL)洗滌,然後經硫酸鈉乾燥。過濾混合物且在減壓下濃縮濾液。藉由用含55% EtOAc之正己烷溶析之CombiFlash管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之所需產物(0.31 g,73%)。LC-MS (ES, m/z): 583.15 (M-H)。
步驟10:在室溫下向1-((2R,4R,5R)-5-(氯甲基)-3,3-二氟基-5-(羥甲基)-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.30g,0.513 mmol)於DMF (3 mL)之攪拌溶液中添加咪唑(0.105g,1.54 mmol),隨後添加TBDMS-Cl (0.155 g,1.026 mmol)。將反應在室溫下攪拌6 h,此時TLC及LCMS顯示完全反應。將反應混合物用冰水(100 mL)稀釋且用EtOAc (2x100 mL)萃取。將合併之有機物用水及鹽水洗滌,然後經硫酸鈉乾燥。將混合物過濾,濃縮且藉由用含55% EtOAc之正己烷溶析之CombiFlash管柱層析法純化所得殘餘物,得到呈灰白色固體之所需產物(0.270 g,75%)。LC-MS (ES, m/z): 696.75 (M-1)。
步驟11A:在0℃下向1-((2R,4R,5R)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-5-(氯甲基)-3,3-二氟基-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.200g,0.286 mmol)於CH 3CN (5 mL)之攪拌溶液中添加Et 3N (0.116g,1.14 mmol)、DMAP (0.070g,0.572 mmol),隨後添加TPS-Cl (0.173g,0.572 mmol)。將反應在室溫下攪拌2 h,然後冷卻至0℃。然後向反應中添加1H-1,2,4-三唑(0.079g ,1.144 mmol)且將反應在室溫下攪拌2 h,此時TLC及LCMS顯示完全反應。將反應用冰水(100 mL)稀釋且用EtOAc (2x100 mL)萃取。將合併之有機物用水及鹽水洗滌,然後經硫酸鈉乾燥。將混合物過濾且濃縮。藉由用含55% EtOAc之正己烷溶析之CombiFlash管柱層析法純化殘餘物,得到呈膠狀液體之所需產物(0.175 g,81%)。LC-MS (ES, m/z): 749.85 (M-1)。
步驟11B:向1-((2R,4R,5R)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-5-(氯甲基)-3,3-二氟基-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)四氫呋喃-2-基)-4-(1H-1,2,4-三唑-1-基)嘧啶-2(1H)-酮(0.170g,0.226 mmol)於1,4-二噁烷(2 mL)之攪拌溶液中添加氨溶液(2 mL)且在室溫下攪拌15 min,然後加熱至30℃歷時2 h。TLC及LCMS顯示反應進展係完全的。將反應濃縮,用己烷洗滌且乾燥,得到呈灰白色固體之所需化合物(13.1 g,粗品)。LC-MS (ES, m/z): 697.80 (M+H)。
步驟12:將4-胺基-1-((2R,4R,5R)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-5-(氯甲基)-3,3-二氟基-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮(0.160 g,0.229 mmol)於80% HCOOH (1.6 mL)中之攪拌溶液在0℃至室溫下攪拌16 h,此時TLC及LCMS顯示完全反應。將反應混合物濃縮,且藉由製備型HPLC使用以下條件純化殘餘物:流動相:A=含0.01% HCOOH之水,B= MeCN;管柱:X SELECT (250mmx20.0mm),5.0 µ;流動:18.0 mL/min;梯度程式:時間/%B:0/5,2/10,8/25,得到呈白色固體之所需產物(10mg,10%)。LC-MS (ES, m/z): 311.60 (M+H)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ = 7.64 (d, J = 7.6 Hz, 1H), 7.42 - 7.36 (m, 2H), 6.64 (br d, J = 5.9 Hz, 1H), 6.29 (t, J = 8.7 Hz, 1H), 5.79 (d, J = 7.6 Hz, 1H), 5.50 - 5.44 (m, 1H), 4.50 - 4.41 (m, 1H), 3.87 - 3.82 (m, 1H), 3.76 (s, 1H), 3.74 - 3.69 (m, 1H), 3.57 (br d, J = 11.2 Hz, 1H)。 實例 58- 化合物 71 4- 胺基 -1-((2R,4S,5R)-5-( 氯甲基 )-4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- )-5-( 三氟甲基 ) 嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在N 2下向CF 3SO 2Na (20.51g,131.46mmol)於水(100 mL)之攪拌溶液中添加1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4-(1H,3H)二酮(20.0g,87.64mmol)。將反應混合物冷卻至-5℃至5℃,且經20 min之時段緩慢添加t-BuOOH (70%水溶液,34 mL,23.68 g,262.92mmol) (13-15℃放熱)。使反應混合物溫熱至20-30℃,然後加熱至70℃歷時2 h。2小時後,形成淺黃色的不均勻物質。濃縮反應混合物且藉由用含70% EtOAc之正己烷溶析的使用80g管柱之CombiFlash純化所得殘餘物,得到呈白色固體之所需產物(8 g,30.80%)。LC-MS (ES, m/z): 294.75 (M-H)。
步驟2:在室溫下向1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-(三氟甲基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(6.8 g,16.88mmol)於吡啶(50 mL)之攪拌溶液中添加TBDPSCl ( 6.8 g,17.732mmol)。將反應在室溫下攪拌16 hr,此時TLC及LCMS顯示完全反應。在高真空下蒸發反應混合物且將殘餘物分配於EtOAc與水之間。將有機層分離,經Na 2SO 4乾燥且濃縮。藉由用含40% EtOAc之正己烷溶析的使用80 g管柱之CombiFlash管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之所需產物(6.8 g,75.35%)。LC-MS (ES, m/z): 532.85 (M-H)。
步驟3:在室溫下向-((2R,4S,5R)-5-(((三級丁基二苯基矽烷基)氧基)甲基)-4-羥基四氫呋喃-2-基)-5-(三氟甲基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(1.5g,2.81 mmol)於DCM (10 mL)之攪拌溶液中添加三甲基吡啶(0.4 mL,3.09 mmol)、AgNO 3(0.52 g,3.085 mmol),然後添加氯化三苯甲基(0.86 g,3.085mmol)。將反應在室溫下攪拌16 h,此時TLC及LCMS顯示完全反應。濃縮反應混合物且將殘餘物分配於EtOAc與水之間。將有機層分離,經Na 2SO 4乾燥,濃縮且藉由用含45% EtOAc之正己烷溶析的使用40g管柱之CombiFlash純化粗材料,獲得呈灰白色固體之所需產物(2.0 g,91.79%)。LC-MS (ES, m/z): 774.95 (M-H)。
步驟4:在室溫下向1-((2R,4S,5R)-5-(((三級丁基二苯基矽烷基)氧基)甲基)-4-(三苯甲基氧基)四氫呋喃-2-基)-5-(三氟甲基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(2.0g,2.57mmol)於THF (20 mL)之攪拌溶液中添加TBAF (1M於THF中) (10.30mL,10.30 mmol)。將反應在室溫下攪拌4 h,此時TLC及LCMS顯示完全反應。蒸發反應混合物且將所得殘餘物分配於EtOAc與水之間。將有機層分離,經Na 2SO 4乾燥且濃縮。藉由用含45% EtOAc之正己烷溶析之CombiFlash管柱純化所得殘餘物,得到呈灰白色固體之所需產物(1 g,72.14%)。LC-MS (ES, m/z): 536.75 (M-H)。
步驟5:在室溫下向11-((2R,4S,5R)-5-(羥甲基)-4-(三苯甲基氧基)四氫呋喃-2-基)-5-(三氟甲基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.45g,0.835mmol)於ACN (10.0 mL)之攪拌溶液中添加IBX (0.28g,1.00 mmol)。將反應在90℃下攪拌2 h,此時TLC及LCMS顯示完全反應。過濾反應混合物且濃縮濾液,得到粗醛。將該醛溶解於1,4-二噁烷(5 mL)中且在室溫下用甲醛(0.45mL),隨後1N NaOH (1.0 mL)處理。將反應攪拌12 h,此時TLC及LCMS顯示完全反應。將反應混合物冷卻至0℃且分批添加NaBH 4(0.12g,3.34mmol)。將反應在室溫下攪拌1 h,此時TLC及LCMS顯示完全反應。濃縮反應混合物,且將所得殘餘物分配於EtOAc (50 mL)與水(100 mL)之間。將有機層分離,經Na 2SO 4乾燥,且在減壓下濃縮。將所得殘餘物用正戊烷濕磨且攪拌15分鐘。傾析戊烷層,且在真空下乾燥所獲得之固體,得到呈灰白色固體之所需產物(0.4g,84.25%)。LC-MS (ES, m/z): 566.80 (M-H)。
步驟6:在-30℃下向1-((2R,4S)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5,5-雙(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-(三氟甲基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(1.4 g,2.462mmol)於DCM (20 mL)之攪拌溶液中添加吡啶(1.9 mL,24.62 mmol),隨後添加Tf 2O (0.9 mL,5.41mmol)。將反應在相同溫度下攪拌2小時,此時TLC顯示完全反應。將反應混合物用冰冷水淬滅,然後分配於EtOAc (30 mL)與水(5 mL)之間。將有機層分離,經Na 2SO 4乾燥且濃縮,且藉由用含35% EtOAc之正己烷溶析的使用12g管柱之CombiFlash純化所得殘餘物,得到呈灰白色固體之所需產物(1.0g,48.78%)。LC-MS (ES, m/z): 830.10 (M-H)。
步驟7:在0℃下向雙(亞甲基)雙(三氟甲烷磺酸)((3S,5R)-5-(2,4-二側氧基-5-(三氟甲基)-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-3-(三苯甲基氧基)四氫呋喃-2,2-二基)酯(1 g,1.2 mmol)於DMF (10 mL)之溶液中添加NaH (0.034 g,1.4 mmol)。將反應在0℃下攪拌2 h,此時TLC顯示完全反應。然後用LiCl (0.15g,3.6 mmol)處理反應且在室溫下持續攪拌2 h。將反應混合物用冰冷水淬滅,然後分配於EtOAc與水之間。將有機層分離,經Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮,得到所需粗化合物(1.0g,粗品)。LC-MS (ES, m/z): 568.85 (M-H)。
步驟8:在室溫下向(6R,8S,9R)-9-(氯甲基)-3-(三氟甲基)-8-(三苯甲基氧基)-7,8,9,10-四氫-2H,6H-6,9-環氧基嘧啶并[2,1-b][1,3]噁唑嗪-2-酮(1 g,1.2 mmol)於THF (10 mL)之溶液中添加1N NaOH (1.4 mL,0.1.4 mmol)。將反應在室溫下攪拌1 hr,此時TLC及LCMS顯示完全反應。將反應混合物用冰冷水淬滅,然後分配於EtOAc與水之間。將有機層分離,經Na 2SO 4乾燥,在減壓下濃縮,得到所需粗化合物。藉由用含35% EtOAc之正己烷溶析的使用24g管柱之CombiFlash純化粗產物,得到呈灰白色固體之所需產物(0.38g,53.99%)。LC-MS (ES, m/z): 584.65 (M-H)。
步驟9:在0℃下向1-((2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)-4-(三苯甲基氧基)四氫呋喃-2-基)-5-(三氟甲基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(160 mg,0.272 mmol)於DMF (2 mL)之溶液中添加咪唑(55 mg,0.817 mmol)、TBSCl ( 82 mg,0.545 mmol),隨後添加硝酸銀(93 mg,0.544 mmol)。將反應在室溫下攪拌12 h,此時TLC及LCMS顯示完全反應。將反應混合物用冰冷水淬滅,然後分配於EtOAc與水之間。將有機層分離,經Na 2SO 4乾燥,濃縮且藉由用含35% EtOAc之正己烷溶析之CombiFlash管柱層析法純化所得殘餘物,得到呈灰白色固體之所需產物(100 mg,52.20%)。LC-MS (ES, m/z): 699.05 (M-H)。
步驟10:在0℃下向1-((2R,4S,5R)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-5-(氯甲基)-4-(三苯甲基氧基)四氫呋喃-2-基)-5-(三氟甲基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(80mg,0.114 mmol)於ACN (2 mL)之溶液中添加TEA (0.06 mL,0.456 mmol)、DMAP ( 69 mg,0.228 mmol),然後添加TPSCl (17 mg,0.057 mmol)。然後將反應在室溫下攪拌2 h且用NH 4OH:1,4-二噁烷(1 mL)處理。藉由TLC及LCMS監測反應進展。完成後,濃縮反應混合物且藉由用含50% EtOAc之正己烷溶析之製備型TLC純化所得殘餘物,得到呈灰白色固體之所需產物(20 mg,25.05%)。LC-MS (ES, m/z): 697.95 (M-H)。
步驟11:在0℃下向4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-5-(氯甲基)-4-(三苯甲基氧基)四氫呋喃-2-基)-5-(三氟甲基)嘧啶-2(1H)-酮(70 mg,0.009 mmol)於DCM (2 mL)之溶液中添加80%甲酸(0.7 mL)。將反應在室溫下攪拌6 h,同時藉由TLC及LCMS進行監測。完成後,濃縮反應混合物且藉由製備型HPLC在以下條件下純化所得殘餘物:流動相:A= 0.02% 0.1%HCOOH於水B= ACN;管柱:X SELECT (250mmx20.0mm),5.0µ流動:15mL/min梯度程控器:時間/%B:0/5,2/10,8/40,得到呈白色固體之所需產物(0.6mg,19 %)。LC-MS (ES, m/z): 343.90 (M+H)。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 8.59 (s, 1H), 7.96 - 7.83 (m, 1H), 7.13 - 6.99 (m, 1H), 6.14 (t, J = 6.3 Hz, 1H), 5.53 - 5.39 (m, 2H), 4.41 - 4.35 (m, 1H), 3.81 (d, J = 11.4 Hz, 1H), 3.69 (d, J = 11.4 Hz, 2H), 3.57 (d, J = 11.4 Hz, 1H), 2.44 - 2.36 (m, 1H), 2.29 - 2.20 (m, 1H)。 實例 59化合物 116 4- 胺基 -1-((2R,3S,4S,5R)-5- 乙炔基 -3,4- 二羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- )-5- 氟基嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在0℃,N 2氛圍下向[(3aR,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-(羥甲基)-2,2-二甲基-二氫-3aH-呋喃并[2,3-d] [1,3]二氧雜環戊烯-5-基]甲醇(30 g,96.61 mmol)於THF (300 mL)之溶液中添加NaH (3.86 g,96.61 mmol,60%於油中)。將反應混合物攪拌30 min。向以上溶液中添加溴甲苯(16 g,96.61 mmol),使混合物溫熱至室溫且攪拌隔夜。將反應混合物用冰水淬滅且用EtOAc (3 x 500 mL)萃取。將合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用EtOAc/石油醚(1:5)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之[(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-2,2-二甲基-二氫-3aH-呋喃并[2,3-d] [1,3]二氧雜環戊烯-5-基]甲醇(28 g,69.83 mmol,72.1%)。LC-MS (ES, m/z): 418 [M+NH 4] +
步驟2:在室溫,N 2氛圍下向[(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-2,2-二甲基-二氫-3aH-呋喃并[2,3-d] [1,3]二氧雜環戊烯-5-基]甲醇(28 g,69.83 mmol)於ACN (300 mL)之攪拌溶液中添加IBX (29 g,104.81 mmol)。將所得混合物在60℃下攪拌12 h且冷卻至室溫。過濾出反應混合物中之固體且在減壓下濃縮濾液。藉由用EtOAc/石油醚(1:3)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色油狀物之(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-2,2-二甲基-二氫-3aH-呋喃并[2,3-d] [1,3]二氧雜環戊烯-5-甲醛(20 g,50.13 mmol,71.2%)。LC-MS (ES, m/z): 416 [M+NH4] +
步驟3:在0℃下向(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-2,2-二甲基-二氫-3aH-呋喃并[2,3-d] [1,3]二氧雜環戊烯-5-甲醛(20 g,50.13 mmol)及K 2CO 3(21 g,150.39 mmol)於CH 3OH (200 mL)之攪拌溶液中添加(1-重氮基-2-側氧基丙基)膦酸二甲酯(19 g,100.26 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌1 h。過濾出反應混合物中之固體且在減壓下濃縮濾液。藉由用EtOAc/石油醚(1:4)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-乙炔基-2,2-二甲基-二氫-3aH-呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯(16 g,40.61 mmol,80.1%)。LC-MS (ES, m/z): 412 [M+NH4] +
步驟4:在-78℃,N 2氛圍下向(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-乙炔基-2,2-二甲基-二氫-3aH-呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯(16 g,40.61 mmol)於THF (160 mL)之攪拌溶液中添加正丁基鋰(41 mL,101.52 mmol,2.5 M於己烷中)。將反應在-78℃下攪拌30 min。然後在-78℃下逐滴添加含TESCl (9 g,60.91 mmol)之THF (2 mL)。將所得混合物在-78℃下再攪拌30 min。藉由在0℃下添加冰水(100 mL)來淬滅反應,然後將所得混合物用EtOAc (3 x 250 mL)萃取。將合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用EtOAc/石油醚(1:5)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色油狀物之{2-[(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-2,2-二甲基-二氫-3aH-呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-基]乙炔基}三乙基矽烷(9.5 g,18.7 mmol,46.2%)。LC-MS (ES, m/z): 526 [M+NH4] +
步驟5:在0℃下向{2-[(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-2,2-二甲基-二氫-3aH-呋喃并[2,3-d][1,3]二氧雜環戊烯-5-基]乙炔基}三乙基矽烷(4 g,7.6 mmol)於AcOH (40 mL)之攪拌溶液中添加Ac 2O (10 g,106.12 mmol)及濃H 2SO 4(1.54 g,1.53 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌2 h。藉由在0℃下添加飽和Na 2S 2O 3(100 mL,水溶液)來淬滅反應。將所得混合物用EtOAc (3 x 200 mL)萃取。將合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液,得到呈黃色油狀物之乙酸(2R,3R,4S,5R)-2-(乙醯基氧基)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-[2-(三乙基矽烷基)乙炔基]氧雜環戊烷-3-酯(4.3 g,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 570 [M+NH4] +
步驟6:在0℃下向氟尿嘧啶(1 g,1.75 mmol)於ACN (40 mL)之攪拌溶液中添加(E)-(N-(三甲基矽烷基)伸乙基甲亞胺酸三甲基矽烷酯) (6 g,31.12 mmol)。將反應在80℃下攪拌30 min,然後冷卻至0℃。添加乙酸(2R,3R,4S,5R)-2-(乙醯基氧基)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-[2-(三乙基矽烷基)乙炔基]氧雜環戊烷-3-酯(4.3 g,7.79 mmol)及TMSOTf (2 g,12.41 mmol)。將反應混合物在80℃下攪拌2 h。將所得混合物冷卻至室溫,用水稀釋且用EtOAc (3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用EtOAc/石油醚(1:7)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之乙酸(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-2-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-5-[2-(三乙基矽烷基)乙炔基]氧雜環戊烷-3-酯(3.5 g,5.62 mmol,72.1%)。(ES, m/z): 623 [M+H] +
步驟7:向NH 3(g)之溶液(35 mL,2M於MeOH中)中添加乙酸(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基] -2-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基) -5-[2-(三乙基矽烷基)乙炔基]氧雜環戊烷-3-酯(3.5 g,5.62 mmol)。將混合物在室溫下攪拌3 h。將所得混合物在真空下濃縮。藉由用EtOAc/石油醚(1:3)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-[(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-3-羥基-5-[2-(三乙基矽烷基)乙炔基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.3 g,2.24 mmol,41.1%)。LC-MS (ES, m/z): 581 [M+H] +
步驟8:在0℃,N 2氛圍下向1-[(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-3-羥基-5-[2-(三乙基矽烷基)乙炔基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.3 g,2.24 mmol)於DMF (10 mL)之攪拌溶液中添加PPh 3(1.8 g,6.72 mmol)及DIAD (1.4 g,6.72 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。將所得混合物用水稀釋且用EtOAc (3 x 80 mL)萃取。將合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用EtOAc/石油醚(3:2)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之(2R,4R,5S,6S)-5-(苄氧基)-4-[(苄氧基)甲基]-11-氟基-4-[2-(三乙基矽烷基)乙炔基]-3,7-二氧雜-1,9-二氮雜三環[6.4.0.0^ {2,6}]十二碳-8,11-二烯-10-酮(900 mg,1.61 mmol,68.1%)。LC-MS (ES, m/z): 563 [M+H] +
步驟9:在室溫下向(2R,4R,5S,6S)-5-(苄氧基)-4-[(苄氧基)甲基]-11-氟基-4-[2-(三乙基矽烷基)乙炔基]-3,7-二氧雜-1,9-二氮雜三環[6.4.0.0^ {2,6}]十二碳-8,11-二烯-10-酮(800 mg,1.42 mmol)於水(7 mL)及二噁烷(7 mL)之攪拌溶液中添加NaOH (227 mg,5.67 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌2 h。將所得混合物用EtOAc (3 x 10 mL)萃取。將合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用EtOAc/石油醚(1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-乙炔基-3-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(450 mg,0.96 mmol,67.2%)。LC-MS (ES, m/z): 467 [M+H] +
步驟10:在N 2氛圍下向1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-乙炔基-3-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(450 mg,0.96 mmol)於DMF (10 mL)之攪拌溶液中添加咪唑(197 mg,2.88 mmol)及TMSCl (157 mg,1.44 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌2 h。將所得混合物用冰水淬滅且用EtOAc (3 x 40 mL)萃取。將合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用EtOAc/石油醚(2:3)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-乙炔基-3-[(三甲基矽烷基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(450 mg,0.84 mmol,86.3%)。LC-MS (ES, m/z): 539 [M+H] +
步驟11:在室溫下向1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-乙炔基-3-[(三甲基矽烷基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(150 mg,0.28 mmol)於ACN (5 mL)之攪拌溶液中添加DMAP (68 mg,0.56 mmol)及TEA (64 mg,0.56 mmol)。將反應混合物攪拌10 min。向以上溶液中添加2,4,6-參(丙-2-基)苯-1-磺醯氯(168 mg,0.56 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌12 h。然後添加濃氫氧化銨(2 mL)且攪拌30 min。將所得混合物用水稀釋且用EtOAc (3 x 30 mL)萃取。將合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用DCM/MeOH (5:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-乙炔基-3-[(三甲基矽烷基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(100 mg,0.21 mmol,66.2%)。LC-MS (ES, m/z): 466 [M+H] +
步驟12:在-78℃,N 2氛圍下向4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-乙炔基-3-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(100 mg,0.21 mmol)於DCM (5 mL)之攪拌溶液中逐滴添加BCl3 (3 mL,3.15 mmol,1M於己烷中)。使混合物溫熱至室溫且攪拌2 h。藉由在-78℃下添加MeOH (10 mL)及TEA (5 mL)來淬滅反應且攪拌10 min。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型HPLC在以下條件下純化殘餘物(管柱:XBridge Shield RP18 OBD管柱,19*250 mm,10 μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:25 mL/min;梯度:在6 min內3% B至20% B,波長:254 nm;RT1(min):5.85)。收集級分且在真空下濃縮,將殘餘物再溶解於CH 3CN及H 2O中,然後冷凍乾燥,得到呈灰白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-5-乙炔基-3,4-二羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(24.4 mg,85 μmol,39.1%)。LC-MS (ES, m/z): 286 [M+H] +。99.1%純度。LCMS之條件:(管柱:Atlantis T3, 100*4.6 mm,3 μm;流動相A:水+5 mM TFA,流動相B:ACN;流率:1.20 mL/min;梯度:在8 min內0% B至95% B,在10 min內95% B至95% B,在10.5 min內95% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):2.24)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 7.78 (d, J = 6.5 Hz, 2H), 7.53 (s, 1H), 6.09 (d, J = 6.0 Hz, 1H), 5.74 (d, J = 5.3 Hz, 1H), 5.65 (d, J = 5.3 Hz, 1H), 5.52 (d, J = 6.5 Hz, 1H), 4.19 (d, J = 6.5 Hz, 1H), 3.99 (d, J = 6.0 Hz, 1H), 3.62 (dd, J = 13.8, 5.3 Hz, 2H), 3.54 (d, J = 2.9 Hz, 1H)。 實例 60- 化合物 78 4- 胺基 -1-((2R,3S,4S,5R)-5- 乙基 -3,4- 二羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- )-5- 氟基嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
在室溫,N 2氛圍下向4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-5-乙炔基-3,4-二羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(60 mg,0.21 mmol)於MeOH (5 mL)之攪拌溶液中添加Pd/C (6 mg,10%碳載鈀)。將所得混合物在H 2氛圍下攪拌1 h。過濾出反應混合物且在減壓下濃縮濾液。藉由製備型HPLC在以下條件下純化殘餘物(管柱:XBridge Shield RP18 OBD管柱,19*250 mm,10 μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:25 mL/min;梯度:在6 min內3% B至20% B,波長:254 nm;RT1(min):5.28)。收集級分且在真空下濃縮,將殘餘物再溶解於CH 3CN及H 2O中,然後冷凍乾燥隔夜,得到呈灰白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-5-乙基-3,4-二羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(18.6 mg,64 μmol,30.1%)。LC-MS (ES, m/z): 290 [M+H] +, 純度:95.2%。LCMS之條件:(管柱:Atlantis T3, 100*4.6 mm,3 μm;流動相A:水+ 5 mM TFA,流動相B:ACN;流率:1.20 mL/min;梯度:在8 min內0% B至95% B,在10 min內95% B至95% B,在10.5 min內95% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):3.67)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 7.95 – 7.88 (m, 1H), 7.67 (s, 1H), 7.44 (s, 1H), 5.97 (d, J = 4.9 Hz, 1H), 5.53 – 5.47 (m, 1H), 5.34 (d, J = 4.4 Hz, 1H), 5.12 (s, 1H), 4.08 (s, 1H), 3.98 (s, 1H), 3.51 (s, 2H), 1.61 (d, J = 16.0 Hz, 1H), 1.49 (d, J = 12.1 Hz, 1H), 0.86 (d, J = 7.7 Hz, 3H)。 實例 61- 化合物 79 (2R,3S,5R)-5-(4- 胺基吡咯并 [2,1-f] [1,2,4] 三嗪 -7- )-2-( 氟甲基 )-2-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -3- 醇之合成
步驟1:在室溫,N 2氛圍下向(2R,3S,5R)-5-(4-胺基吡咯并[2,1-f] [1,2,4]三嗪-7-基)-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇(2.7 g,10.81 mmol)及咪唑(2.2 g,32.31 mmol)於DMF (50 mL)之攪拌溶液中添加TBSCl (1.8 g,11.92 mmol)。將混合物在60℃下攪拌15小時。將所得混合物用水稀釋且用EtOAc (3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌,且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (2/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之(2R,3S,5R)-5-(4-胺基吡咯并[2,1-f] [1,2,4]三嗪-7-基)-2-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)四氫呋喃-3-醇(3.6 g,9.91 mmol,91.5%)。LC-MS (ES, m/z): 365 [M+H] +
步驟2:在N 2氛圍下向(2R,3S,5R)-5-(4-胺基吡咯并[2,1-f] [1,2,4]三嗪-7-基)-2-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)四氫呋喃-3-醇 (1.8 g,4.93 mmol)於DCM (50 mL)之溶液中添加2,4,6-三甲基吡啶(3.6 g,29.61 mmol)及AgNO 3(4.2 g,24.72 mmol)。然後在冰水下添加MMTrCl (7.6 g,24.71 mmol)。在室溫,N 2氛圍下攪拌隔夜後,將所得混合物用水稀釋且用EA萃取。將合併之有機層用飽和NH 4Cl溶液洗滌,然後用檸檬酸洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (4:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之7-((2R,4S,5R)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)四氫呋喃-2-基)-N-((4-甲氧基苯基)二苯基甲基)吡咯并[2,1-f] [1,2,4]三嗪-4-胺(4.2 g,4.6 mmol,93.5%)。LC-MS (ES, m/z): 909 [M+H] +
步驟3:在N 2氛圍下向7-((2R,4S,5R)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)四氫呋喃-2-基)-N-((4-甲氧基苯基)二苯基甲基)吡咯并[2,1-f] [1,2,4]三嗪-4-胺(4.2 g,4.6 mmol)於MeOH (100 mL)之溶液中添加NH 4F (5.1 g,138.6 mmol)。在60℃,N 2氛圍下攪拌隔夜後,濃縮所得混合物且藉由用PE/EA (3:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之((2R,3S,5R)-3-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)-5-(4-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲基)胺基)吡咯并[2,1-f] [1,2,4]三嗪-7-基)四氫呋喃-2-基)甲醇(3 g,3.81 mmol,81.7%)。LC-MS (ES, m/z): 795 [M+H] +
步驟4:在N 2氛圍下向((2R,3S,5R)-3-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)-5-(4-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲基)胺基)吡咯并[2,1-f] [1,2,4]三嗪-7-基)四氫呋喃-2-基)甲醇(3 g,3.81 mmol)於ACN (50 mL)之溶液中添加IBX (2.1 g,7.52 mmol)。在60℃,N 2氛圍下攪拌1 h後,過濾所得混合物且用ACN洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液,得到呈淡黃色固體之(2S,3S,5R)-3-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)-5-(4-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲基)胺基)吡咯并[2,1-f] [1,2,4]三嗪-7-基)四氫呋喃-2甲醛(2.8 g,3.52 mmol,93.6%)。LC-MS (ES, m/z): 793 [M+H] +
步驟5:在N 2氛圍下向(2S,3S,5R)-3-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)-5-(4-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲基)胺基)吡咯并[2,1-f] [1,2,4]三嗪-7-基)四氫呋喃-2甲醛(3.4 g,9.61 mmol)於1,4-二噁烷(100 mL)及H 2O (10 mL)之溶液中添加多聚甲醛(1.4 g,47.92 mmol)及NaOH (343 mg,8.6 mmol)。將反應在室溫下攪拌隔夜。然後在0℃下添加NaBH 4(487 mg,12.93 mmol)。在室溫,N 2氛圍下攪拌2 h後,將所得混合物用水稀釋且用EtOAc (3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用飽和NH 4Cl溶液洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之((3S,5R)-3-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)-5-(4-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲基)胺基)吡咯并[2,1-f] [1,2,4]三嗪-7-基)四氫呋喃-2,2-二基)二甲醇(1.96 g,2.41 mmol,52.9%)。LC-MS (ES, m/z): 825 [M+H] +
步驟6:在0℃,N2氛圍下向((3S,5R)-3-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)-5-(4-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲基)胺基)吡咯并[2,1-f] [1,2,4]三嗪-7-基)四氫呋喃-2,2-二基)二甲醇(2.3 g,2.81 mmol)及咪唑(570 mg,8.42 mmol)於DCM (50 mL)之溶液中添加TBDPSCl (919 mg,3.43 mmol)。在室溫,N2氛圍下攪拌隔夜後,在減壓下濃縮所得混合物,且藉由用PE/EA (1/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之((2S,3S,5R)-2-(((三級丁基二苯基矽烷基)氧基)甲基)-3-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)-5-(4-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲基)胺基)吡咯并[2,1-f] [1,2,4]三嗪-7-基)四氫呋喃-2-基)甲醇(1.58 g,1.52 mmol,53.3%)。LC-MS (ES, m/z): 1063 [M+H] +
步驟7:在N 2氛圍下向((2S,3S,5R)-2-(((三級丁基二苯基矽烷基)氧基)甲基)-3-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)-5-(4-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲基)胺基)吡咯并[2,1-f] [1,2,4]三嗪-7-基)四氫呋喃-2-基)甲醇(1.6 g,1.5 mmol)於DCM (30 mL)之溶液中添加2,4,6-三甲基吡啶(540 mg,4.5 mmol)及AgNO 3(505 mg,3.11 mmol)。然後在0℃下添加MMTrCl (688 mg,2.2 mmol)。在室溫,N 2氛圍下攪拌隔夜後,將所得混合物用水稀釋,用DCM萃取。將合併之有機層用飽和NH 4Cl溶液及檸檬酸洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液且藉由用PE/EtOAc (5/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之7-((2R,4S,5S)-5-(((三級丁基二苯基矽烷基)氧基)甲基)-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)-5-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)-N-((4-甲氧基苯基)二苯基甲基)吡咯并[2,1-f][1,2,4]三嗪-4-胺(1.9 g,1.41 mmol,95.7%)。LC-MS (ES, m/z): 1336 [M+H] +
步驟8:在室溫,N 2氛圍下向7-((2R,4S,5S)-5-(((三級丁基二苯基矽烷基)氧基)甲基)-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)-5-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)-N-((4-甲氧基苯基)二苯基甲基)吡咯并[2,1-f][1,2,4]三嗪-4-胺(1.9 g,1.52 mmol)於MeOH (100 mL)之溶液中添加NH 4F (1.6 g,43.83 mmol)。在60℃,N 2氛圍下攪拌隔夜後,將所得混合物冷卻至室溫且濃縮。藉由用PE/EA (1/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之((2R,3S,5R)-3-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)-2-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)-5-(4-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲基)胺基)吡咯并[2,1-f][1,2,4]三嗪-7-基)四氫呋喃-2-基)甲醇(1.47 g,1.31 mmol,91.8%)。LC-MS (ES, m/z): 1097 [M+H] +
步驟9:在0℃,N 2氛圍下將((2R,3S,5R)-3-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)-2-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)-5-(4-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲基)胺基)吡咯并[2,1-f] [1,2,4]三嗪-7-基)四氫呋喃-2-基)甲醇(440 mg,0.42 mmol)及DAST (194 mg,1.21 mmol)於甲苯(5 mL)中之溶液攪拌2小時。藉由在0℃下添加飽和NaHCO 3溶液來淬滅反應。將所得混合物用水稀釋且用EtOAc (3 x 30 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC(PE/EtOAc = 2/1)純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之7-((2R,4S,5R)-5-(氟甲基)-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)-5-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)-N-((4-甲氧基苯基)二苯基甲基)吡咯并[2,1-f][1,2,4]三嗪-4-胺(355 mg,0.32 mmol,80.5%)。LC-MS (ES, m/z): 1099 [M+H] +
步驟10:在0℃,N 2氛圍下將7-((2R,4S,5R)-5-(氟甲基)-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)-5-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)-N-((4-甲氧基苯基)二苯基甲基)吡咯并[2,1-f] [1,2,4]三嗪-4-胺(300 mg,0.27 mmol)於濃鹽酸(10 mL)中之溶液攪拌6小時。藉由在0℃下添加MeOH (20 mL)來淬滅反應。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型TLC(DCM/MeOH=10/1)純化殘餘物,得到粗產物。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(管柱:XBridge Shield RP18 OBD管柱,19*250 mm,10 μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:25 mL/min;梯度:在2 min內5% B至10% B,在7 min內10% B至20% B,波長:254 nm;RT1(min):6.82)。收集級分且在真空下濃縮,將殘餘物再溶解於CH 3CN及H2O中,然後冷凍乾燥,得到呈灰白色固體之(2R,3S,5R)-5-(4-胺基吡咯并[2,1-f] [1,2,4]三嗪-7-基)-2-(氟甲基)-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇(5.6 mg,0.02 mmol,6.9%)。LC-MS (ES, m/z): 283 [M+H] +, 95.5%純度。LC-MS之條件:(管柱:Shim-pack Scepter C18,33*3.0 mm;流動相A:水/5 mM NH 4HCO 3,流動相B:乙腈;流率:1.50 mL/min;梯度:在1.20 min內10% B至95% B,在0.60 min內95% B至95% B,在0.02 min內95% B至10% B;波長:254 nm;RT1(min):0.417)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 7.85 (s, 1H), 7.69 (s, 2H), 6.84 (d, J = 4.4 Hz, 1H), 6.64 (d, J = 4.4 Hz, 1H), 5.41 (d, J = 4.3 Hz, 1H), 5.27 (d, J = 11.6 Hz, 1H), 4.81 (t, J = 5.9 Hz, 1H), 3.93 (s, 1H), 3.88 – 3.72 (m, 2H), 3.66 – 3.46 (m, 2H), 2.38 – 2.19 (m, 1H), 1.83 (dd, J = 13.6, 3.1 Hz, 1H)。 實例 62- 化合物 80 (2R,3R,4S,5R)-5-(6- 胺基 -2- 氟基嘌呤 -9- )-2- 乙烯基 -4- 氟基 -2-( 羥甲基 ) 氧雜環戊烷 -3- 醇之合成
在0℃下向苯甲酸[(2R,3S,4R,5R)-3,5-雙(苄醯氧基)-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]甲酯(20.0 g,43.24 mmol)於DCM (200 mL)之溶液中逐滴添加BAST (19.1 g,86.49 mmol)。將所得混合物在50℃下再攪拌2天。用水稀釋所得混合物。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用飽和NaHCO 3水溶液洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (2:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之苯甲酸[(2R,3R,4S,5R)-3,5-雙(苄醯氧基)-4-氟基氧雜環戊烷-2-基]甲酯(16.0 g,34.40 mmol,79.6%)。LC-MS (ES, m/z): 465 (M+H) +
步驟2:在0℃下向苯甲酸[(2R,3R,4S,5R)-3,5-雙(苄醯氧基)-4-氟基氧雜環戊烷-2-基]甲酯(15.0 g,32.32 mmol)於DCM (15 mL)之溶液中逐滴添加含HBr之AcOH (45 mL)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜,然後藉由添加水來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用飽和NaHCO 3水溶液洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (2:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈棕黃色油狀物之苯甲酸[(2R,3R,4S,5R)-3-(苄醯氧基)-5-溴基-4-氟基氧雜環戊烷-2-基]甲酯(12.0 g,28.43 mmol,87.8%)。LC-MS (ES, m/z): 423 (M+H) +
步驟3:向2-氟基-9H-嘌呤-6-胺(5.2 g,34.09 mmol)於ACN (83 mL)及t-BuOH (84 mL)之溶液中添加t-BuOK (4.8 g,42.61 mmo)及氫化鈣(1.8 g,42.61 mmol)。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌2 h。向以上混合物中添加苯甲酸[(2R,3R,4S,5R)-3-(苄醯氧基)-5-溴基-4-氟基氧雜環戊烷-2-基]甲酯(12.0 g,28.43 mmol)於DCM (100 mL)中之溶液。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。過濾所得混合物且用EtOAc洗滌濾餅。將合併之濾液在減壓下濃縮。藉由用PE/EtOAc (1:2)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之苯甲酸[(2R,3R,4S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-3-(苄醯氧基)-4-氟基氧雜環戊烷-2-基]甲酯(2.1 g,4.23 mmol,24.9%)。LC-MS (ES, m/z): 496 (M+H) +
步驟4:在室溫下將苯甲酸[(2R,3R,4S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-3-(苄醯氧基)-4-氟基氧雜環戊烷-2-基]甲酯(2.1 g,4.23 mmol)於含NH 3(g)之MeOH (80 mL)中之溶液攪拌6 h。將混合物用濃HCl調節至pH 7。將所得混合物在真空下濃縮。藉由逆相急速在以下條件下純化粗產物:C18管柱;流動相A:水(0.1% TFA),流動相B:ACN;流率:100 mL/min;梯度:在15min內0% B至50%,在254 nm下UV偵測。此得到呈淡黃色固體之(2R,3R,4S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-4-氟基-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-3-醇 (1.0 g,3.48 mmol,82.1%)。LC-MS (ES, m/z): 287 (M+H)+。
步驟5:在0℃下向(2R,3R,4S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-4-氟基-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-3-醇(1.0 g,3.48 mmol)及咪唑(2.8 g,41.78 mmol)於DMF (10 mL)之溶液中分批添加TBSCl (2.1 g,13.92 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜且藉由添加水來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (2:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之9-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-2-氟基嘌呤-6-胺(1.6 g,3.10 mmol,89.1%)。LC-MS (ES, m/z): 516 (M+H) +
步驟6:在0℃,氮氣氛圍下向9-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-2-氟基嘌呤-6-胺(1.6 g,3.10 mmol)於DCM (16 mL)之溶液中添加2,4,6-三甲基吡啶(1.1 g,9.30 mmol)及AgNO 3(1.1 g,6.20 mmol)。隨後在0℃下分批添加1-(氯基二苯基甲基)-4-甲氧基苯(1.9 g,6.20 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。過濾所得混合物且用EtOAc洗滌濾餅。將合併之濾液在減壓下濃縮。藉由用PE/EtOAc (5:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色油狀物之9-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-2-氟基-N-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]嘌呤-6-胺(2.2 g,2.79 mmol,89.9%)。LC-MS (ES, m/z): 788 (M+H) +
步驟7:在0℃下向9-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-2-氟基-N-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]嘌呤-6-胺(2.2 g,2.79 mmol)於THF (10 mL)之溶液中逐滴添加TFA (3 mL,40.38 mmol)於H 2O (3 mL)中之溶液。將所得混合物在0℃下攪拌2 h。將混合物用飽和NaHCO 3水溶液調節至pH 7。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌,且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之[(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-基]甲醇(1.6 g,2.37 mmol,85.0%)。LC-MS (ES, m/z): 674 (M+H) +
步驟8:向[(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-基]甲醇(1.6 g,2.37 mmol)於ACN (16 mL)之溶液中分批添加IBX (1331.4 mg,4.75 mmol)。將所得混合物在60℃下攪拌4 h。過濾所得混合物;用乙腈洗滌濾餅。將合併之濾液在減壓下濃縮。此得到呈淡黃色油狀物之(2S,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(1.4 g,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 672 (M+H) +
步驟9:向(2S,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(1.4 g,粗品)於1,4-二噁烷(20 mL)之混合物中添加HCHO (1 mL,37%於水中)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌隔夜。在0℃下向以上混合物中分批添加NaBH 4(323.7 mg,8.74 mmol)。將所得混合物在室溫下再攪拌2 h,然後藉由在0℃下添加飽和NH 4Cl (水溶液)來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌,且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:2)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之[(3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]甲醇(600.0 mg,0.85 mmol,兩個步驟35.9%產率)。LC-MS (ES, m/z): 704 (M+H) +
步驟10:向[(3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]甲醇(600.0 mg,0.85 mmol)於ACN (8 mL)之溶液中添加IBX (286.8 mg,1.02 mmol)。在65℃,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌4 h。將所得混合物冷卻至室溫且過濾。用乙腈洗滌濾餅。將合併之濾液在減壓下濃縮。此得到呈淡黃色油狀物之(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-甲醛(550 mg,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 702 (M+H) +
步驟11:向(1-重氮基-2-側氧基丙基)膦酸二甲酯(165.7 mg,0.86 mmol)於ACN (5 mL)中之混合物中添加K 2CO 3(216.4 mg,1.56 mmol)。在0℃、氮氣氛圍下將所得混合物攪拌30 min。在0℃下向以上混合物中逐滴添加(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-甲醛(550 mg,粗品)於MeOH(5 mL)中之溶液。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜,然後在真空下濃縮。藉由用PE/EtOAc (1:2)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之[(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-乙炔基-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯甲基]胺基}嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-基]甲醇(220.0 mg,0.31 mmol,兩個步驟36.9%產率)。LC-MS (ES, m/z): 698 (M+H) +
步驟12:在室溫下向[(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-乙炔基-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-基]甲醇(220.0 mg,0.31 mmol)於EtOH (5 mL)之溶液中分批添加林德拉催化劑(65.7 mg,0.31 mmol)。排空燒瓶且用氮氣沖洗三次,然後用氫氣沖洗。將混合物在室溫,氫氣(氣球)氛圍下攪拌1 h。過濾所得混合物;用乙醇洗滌濾餅。將合併之濾液在減壓下濃縮。此得到呈無色油狀物之[(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-乙烯基-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-基]甲醇(200 mg,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 700 (M+H) +
步驟13:在0℃,氮氣氛圍下將[(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)-2-(丙-1-烯-2-基)氧雜環戊烷-2-基]甲醇(200 mg,粗品)於AcOH (3 mL,80%)中之溶液攪拌隔夜。用水稀釋所得混合物。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用飽和NaHCO 3水溶液洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色油狀物之[(2R,3R,4S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-乙烯基-4-氟基氧雜環戊烷-2-基]甲醇(100.0 mg,0.23 mmol,兩個步驟74.2%產率)。LC-MS (ES, m/z): 428 (M+H) +
步驟14:向[(2R,3R,4S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-2-(丙-1-烯-2-基)氧雜環戊烷-2-基]甲醇(100.0 mg,0.23 mmol)於THF (2 mL)之溶液中逐滴添加TBAF (1 mL,1N於THF中)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜,然後在真空下濃縮。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色油狀物之(2R,3R,4S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-2-乙烯基-4-氟基-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-3-醇(60 mg,粗品)。藉由製備型HPLC在以下條件下進一步純化粗產物:管柱:SunFire C18 OBD製備型管柱,19x250 mm,5μm;流動相A:水(0.1%FA),流動相B:ACN;流率:25 mL/min;梯度:在6 min內40% B至60% B;波長:254/210 nm。將含有產物之級分合併且部分蒸發以移除溶劑,然後冷凍乾燥隔夜,得到呈白色固體之(2R,3R,4S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-2-乙烯基-4-氟基-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-3-醇(16.3 mg,0.05 mmol,22.23%)。LC-MS (ES, m/z): 314 (M+H) +; 99.5%純度。HPLC之條件:(管柱:Shim‐pack Scepter C18, 33*3.0 mm,3.5 μm;流動相A:水/0.05% NH 4CO 3,流動相B:ACN;流率:1.2000 mL/min;梯度:在0.01 min內10% B至10% B,在1.69 min內10% B至40% B,在0.5 min內40% B至95% B;在0.5 min內95% B至95% B;在0.03 min內95% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):0.812)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 8.36 (d, J = 1.2 Hz, 1H), 7.91 (brs, 2H), 6.36 (t, J = 6.4 Hz, 1H), 6.11 (d, J = 5.2 Hz, 1H), 5.98 (dd, J = 17.6, 10.8 Hz, 1H), 5.49 – 5.44 (m, 1H), 5.38 (t, J = 5.6 Hz, 1H), 5.30 – 5.23 (m, 1H), 5.11 (t, J = 6.4 Hz, 1H), 4.79 – 4.71 (m, 1H), 3.61 – 3.56 (m, 1H), 3.46 – 3.41 (m, 1H)。 實例 63- 化合物 81 (2R,3R,4S,5R)-5-(6- 胺基 -2- 氟基嘌呤 -9- )-2- 乙基 -4- 氟基 -2-( 羥甲基 ) 氧雜環戊烷 -3- 醇之合成
步驟1:在氮氣氛圍下向[(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-乙炔基-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-基]甲醇(200.0 mg,0.28 mmol)於EtOH (2 mL)之溶液中添加Pd/C (20 mg,10%)。排空燒瓶且用氮氣沖洗三次,然後用氫氣沖洗。將混合物在室溫,氫氣(氣球)氛圍下攪拌2 h。過濾所得混合物;用乙醇洗滌濾餅。將合併之濾液在減壓下濃縮。此得到呈無色油狀物之[(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-乙基-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯甲基]胺基}嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-基]甲醇(190 mg,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 702 (M+H) +
步驟2:在室溫,氮氣氛圍下將[(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-乙基-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-基]甲醇(180.0 mg,0.26 mmol)於AcOH (3 mL,80%於水中)中之溶液攪拌隔夜。用水稀釋所得混合物。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用飽和NaHCO 3水溶液洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。此得到呈無色油狀物之[(2R,3R,4S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-乙基-4-氟基氧雜環戊烷-2-基]甲醇(100.0 mg,0.23 mmol,兩個步驟81.3%產率)。LC-MS (ES, m/z): 430 (M+H) +
步驟3:在0℃下向[(2R,3R,4S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-乙基-4-氟基氧雜環戊烷-2-基]甲醇(100.0 mg,0.23 mmol)於THF (2 mL)之溶液中逐滴添加TBAF (0.4 mL,1N於THF中)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜,然後在真空下濃縮。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之粗(2R,3R,4S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-2-乙基-4-氟基-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-3-醇(100 mg,粗品)。藉由製備型HPLC在以下條件下進一步純化粗產物:管柱:SunFire C18 OBD Prep管柱,19*250 mm,5μm;流動相A:水(0.1%FA),流動相B:ACN;流率:25 mL/min;梯度:在6 min內40% B至60% B;波長:254/210 nm。將含有產物之級分合併且部分蒸發以移除溶劑,然後冷凍乾燥隔夜,得到呈白色固體之(2R,3R,4S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-2-乙基-4-氟基-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-3-醇(17.3 mg,0.05 mmol,23.43%)。LC-MS (ES, m/z): 316 (M+H)。99.4%純度。HPLC之條件:(管柱:Shim‐pack Scepter C18,33*3.0 mm,3.5 μm;流動相A:水/0.05% NH 4CO 3,流動相B:ACN;流率:1.2000 mL/min;梯度:在1.19 min內5% B至95% B,在0.6 min內95% B至95% B,在0.02 min內90% B至5% B;波長:254/220 nm;RT1(min):0.517)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 8.29 (d, J = 2.0 Hz, 1H), 7.88 (brs, 2H), 6.32 – 6.28 (m, 1H), 5.88 (d, J = 5.6 Hz, 1H), 5.38 (t, J = 5.2 Hz, 0.5H), 5.25 (t, J = 5.2 Hz, 0.5H), 5.14 (t, J = 5.6 Hz, 1H), 4.64 – 4.58 (m, 1H), 3.56 – 3.53 (m, 1H), 3.50 – 3.46 (m, 1H), 1.69 – 1.56 (m, 2H), 0.90 (t, J = 7.6 Hz, 3H)。 實例 64- 化合物 83 2- 胺基 -9-((2R,3S,4R,5R)-3- 氟基 -5-( 氟甲基 )-4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- )-1,9- 二氫 -6H- 嘌呤 -6- 酮之合成
步驟1:在室溫,N 2氛圍下向9-((2R,3S,4R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-2-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲基)胺基)-1,9-二氫-6H-嘌呤-6-酮(2.51 g,3.51 mmol)、2,4,6-三甲基吡啶(1.2 g,10.53 mmol)及AgNO 3(1.2 g,7.02 mmol)於DCM (25 mL)之攪拌混合物中分批添加MMTrCl (1.2 g,3.86 mmol)。在室溫,N 2氛圍下將所得混合物攪拌2 h。將所得混合物用水稀釋且用DCM (3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌,且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。所得混合物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 974 [M+H] +
步驟2:向TBAF (10 mL,3.82 mmol,1M於THF中)於THF(25 mL)之溶液中添加9-((2R,3S,4R,5S)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-3-氟基-5-(羥甲基)-5-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)-2-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲基)胺基)-1,9-二氫-6H-嘌呤-6-酮(2.5 g,2.51 mmol)。將混合物在室溫,N 2氛圍下攪拌2 h且濃縮。藉由用EtOAc/石油醚(1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之9-((2R,3S,4R,5S)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)-5-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)-2-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲基)胺基)-1,9-二氫-6H-嘌呤-6-酮(1.6 g,1.82 mmol,72.5%)。LC-MS (ES, m/z): 860 [M+H] +
步驟3:在室溫,N 2氛圍下向9-((2R,3S,4R,5S)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)-5-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)-2-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲基)胺基)-1,9-二氫-6H-嘌呤-6-酮(1.6 g,1.82 mmol)、TEA (1.6 g,16.73 mmol)及DMAP (340 mg,2.74 mmol)於DCM (15 mL)之攪拌溶液中添加氯化4-甲基-苯甲醯(862 mg,5.52 mmol)。在室溫,N2氛圍下將所得混合物攪拌2 h。將所得混合物用水稀釋且用DCM (3 x 80 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌,且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用EtOAc/石油醚(1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之4-甲基苯甲酸(2R,3R,4S,5R)-4-氟基-2-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)-5-(2-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲基)胺基)-6-側氧基-1,6-二氫-9H-嘌呤-9-基)-2-(((4-甲基苯甲醯基)氧基)甲基)四氫呋喃-3-酯(870 mg,0.72 mmol,42.7%)。LC-MS (ES, m/z): 1096 [M+H] +
步驟4:在室溫,N 2氛圍下將4-甲基苯甲酸(2R,3R,4S,5R)-4-氟基-2-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)-5-(2-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲基)胺基)-6-側氧基-1,6-二氫-9H-嘌呤-9-基)-2-(((4-甲基苯甲醯基)氧基)甲基)四氫呋喃-3-酯(870 mg,0.72 mmol)及TFA (0.3 mL)於DCM (9 mL)中之溶液攪拌2 h。將所得混合物在真空下濃縮。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化殘餘物:C18管柱;流動相,ACN及水(10 mmol/L NH 4HCO 3),在5 min內65%至75%梯度;在254 nm下UV偵測。此得到呈白色固體之4-甲基苯甲酸(2R,3R,4S,5R)-5-(2-胺基-6-側氧基-1,6-二氫-9H-嘌呤-9-基)-4-氟基-2-(羥甲基)-2-(((4-甲基苯甲醯基)氧基)甲基)四氫呋喃-3-酯(250 mg,0.42 mmol,57.1%)。LC-MS (ES, m/z): 552 [M+H] +
步驟5:在室溫,N 2氛圍下向4-甲基苯甲酸(2R,3R,4S,5R)-5-(2-胺基-6-側氧基-1,6-二氫-9H-嘌呤-9-基)-4-氟基-2-(羥甲基)-2-(((4-甲基苯甲醯基)氧基)甲基)四氫呋喃-3-酯(100 mg,0.14 mmol)於DCM (2 mL)及吡啶(0.3 mL)之攪拌溶液中添加DAST (87 mg,0.51 mmol)。在40℃,N 2氛圍下將所得混合物攪拌隔夜。將所得混合物用水淬滅且用DCM (3 x 50 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化殘餘物:C18管柱;流動相,ACN及水(10 mmol/L NH 4HCO 3),在5 min內75%至85%梯度;在254 nm下UV偵測。此得到呈白色固體之4-甲基苯甲酸[(2R,3R,4S,5R)-5-(2-胺基-6-側氧基-1H-嘌呤-9-基)-4-氟基-2-(氟甲基)-3-(4-甲基苄醯氧基)氧雜環戊烷-2-基]甲酯(30 mg,0.05 mmol,29.9%)。LC-MS (ES, m/z): 554 [M+H] +
步驟6:向NH3 (g)於MeOH(1 mL,7 M)之溶液中添加4-甲基苯甲酸(2R,3R,4S,5R)-5-(2-胺基-6-側氧基-1,6-二氫-9H-嘌呤-9-基)-4-氟基-2-(氟甲基)-2-(((4-甲基苯甲醯基)氧基)甲基)四氫呋喃-3-酯(30 mg,0.05 mmol)。在室溫,N 2氛圍下將反應攪拌隔夜。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(管柱:XBridge Shield RP18 OBD管柱,19*250 mm,10 μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:25 mL/min;梯度:在6 min內5% B至25% B;波長:254 nm;RT1(min):5.7)。收集級分且在真空下濃縮。將殘餘物再溶解於CH 3CN及H 2O中且冷凍乾燥,得到呈白色固體之2-胺基-9-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(氟甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-1,9-二氫-6H-嘌呤-6-酮(2.4 mg,7 μmol,13.6%)。LC-MS (ES, m/z): 318 [M+H] +, 97.6%純度。HPLC之條件:(管柱:HALO C18, 100*4.6 mm;流動相A:H2O+0.1% TFA,流動相B:ACN+0.1% TFA;流率:1.20 mL/min;梯度:在8 min內0% B至95% B,在10 min內95% B至95% B,在10.5 min內95% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):2.45)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 7.81 (d, J = 2.2 Hz, 1H), 6.54 (s, 2H), 6.30 – 6.17 (m, 2H), 5.36 – 5.06 (m, 2H), 4.73 – 4.64 (m, 1H), 4.64 – 4.42 (m, 2H), 3.62 (dd, J = 11.9, 5.5 Hz, 1H), 3.53 (dd, J = 11.4, 5.3 Hz, 1H)。 實例 65- 化合物 84 (2R,3R,4S,5R)-5-(6- 胺基 -2- 氟基嘌呤 -9- )-4- 氟基 -2-( 氟甲基 )-2-( 羥甲基 ) 氧雜環戊烷 -3- ) 之合成
步驟1:在0℃,氮氣氛圍下向9-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-2-氟基-N-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]嘌呤-6-胺(2.0 g,2.54 mmol)於THF (8 mL)之攪拌溶液中逐滴添加TFA (8 mL,50%於水中)。將所得混合物在0℃下攪拌1 h,然後藉由在0℃下添加飽和NaHCO 3(水溶液)(50mL)來淬滅。用EtOAc (3 x100mL)萃取所得混合物。將合併之有機層用鹽水(3x100 mL)洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之[(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-基]甲醇(1.5 g,2.2 mmol,87.7%)。LC-MS (ES, m/z): 674 (M+H) +
步驟2:向[(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-基]甲醇(1.5 g,2.23 mmol)於ACN (30 mL)之溶液中添加IBX (11.2 g,4.45 mmol)。在65℃,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌2 h且冷卻至室溫。過濾所得混合物;用MeCN (3 x 10 mL)洗滌濾餅。將合併之濾液在減壓下濃縮。此得到呈白色固體之(2S,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(1.4 g,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 672 (M+H) +
步驟3:在室溫下向(2S,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(1.4 g,粗品)及HCHO (0.7 mL,37%於水中)於1,4-二噁烷(14 mL)之攪拌溶液中分批添加NaOH水溶液(2.8 mL,2M)。將所得混合物用氮氣脫氣三次,然後在室溫,氮氣氛圍下攪拌隔夜。在0℃下向以上混合物中分批添加NaBH 4(331.0 mg,8.75 mmol)。將所得混合物在室溫下再攪拌30 min,然後藉由在0℃下添加飽和NH 4Cl水溶液(200 mL)來淬滅。用EtOAc (2 x 200 mL)萃取所得溶液。將合併之有機層用鹽水(2x200 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之[(3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]甲醇(1.0 g,1.4 mmol,兩個步驟64.1%產率)。LC-MS (ES, m/z): 704 (M+H) +
步驟4:在0℃,氮氣氛圍下向[(3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]甲醇(1.0 g,1.42 mmol)於吡啶(20 mL)之攪拌溶液中分批添加DMTrCl (480.0 mg,1.56 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌隔夜且藉由在0℃下添加MeOH (1 mL)來淬滅。在減壓下濃縮所得混合物。藉由用PE/EtOAc (2:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之[(2S,3R,4S,5R)-2-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-基]甲醇(900.0 mg,0.9 mmol,62.9%)。LC-MS (ES, m/z): 1006 (M+H) +
步驟5:在室溫,氮氣氛圍下向[(2S,3R,4S,5R)-2-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-基]甲醇(900.0 mg,0.89 mmol)於THF (9 mL)之攪拌溶液中分批添加TBAF (470.0 mg,1.79 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌2 h且藉由添加水(100 mL)來淬滅。用EtOAc (3 x100 mL)萃取所得混合物。將合併之有機層用鹽水(2 x 100 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之(2S,3R,4S,5R)-2-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯甲基]胺基}嘌呤-9-基)-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-3-醇(700.0 mg,0.8 mmol,87.7%)。LC-MS (ES, m/z): 892 (M+H) +
步驟6:在0℃,氮氣氛圍下向含(2S,3R,4S,5R)-2-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-3-醇(700.0 mg,0.79 mmol)之THF (14 mL)添加NaH (38 mg,60%於油中,1.57 mmol)。攪拌10 min後,在0℃,氮氣氛圍下逐滴添加BnBr (268.0 mg,1.57 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌隔夜且藉由在0℃下添加飽和NH 4Cl水溶液(100 mL)來淬滅。用EtOAc (3 x 100mL)萃取所得溶液。將合併之有機層用鹽水(2 x100 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之9-[(2R,3S,4R,5S)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-2-氟基-N-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]嘌呤-6-胺(710.0 mg,0.6 mmol,83.19%)。LC-MS (ES, m/z): 1072 (M+H) +
步驟7:在-78℃,氮氣氛圍下向9-[(2R,3S,4R,5S)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-2-氟基-N-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]嘌呤-6-胺(700.0 mg,0.65 mmol)於CH 2Cl 2(10 mL)之攪拌溶液中逐滴添加Cl 2CHCOOH (0.35 mL)於CH 2Cl 2(3.5 mL)中之溶液。在0℃,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌30 min且藉由在0℃下添加飽和NaHCO 3(水溶液)(100 mL)來淬滅。用CH 2Cl 2(3 x 100 mL)萃取所得溶液。將合併之有機層用鹽水(2x100 mL)洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之[(2R,3R,4S,5R)-3-(苄氧基)-2-[(苄氧基)甲基]-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-基]甲醇(305.0 mg,0.4 mmol,59.69%)。LC-MS (ES, m/z): 770 (M+H) +
步驟8:在-78℃,氮氣氛圍下向[(2R,3R,4S,5R)-3-(苄氧基)-2-[(苄氧基)甲基]-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)氧雜環戊烷-2-基]甲醇(300.0 mg,0.39 mmol)於DCM (30 mL)之攪拌溶液中分批添加DAST (628.0 mg,3.90 mmol)。在0℃,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌隔夜,然後藉由在0℃下添加飽和NaHCO 3水溶液(50 mL)來淬滅。用EtOAc (2 x 100 mL)萃取所得溶液。將合併之有機層用鹽水(2 x 100 mL)洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:2)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之9-[(2R,3S,4R,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-3-氟基-5-(氟甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-氟基-N-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]嘌呤-6-胺(250.0 mg,0.30 mmol,83.14%)。LC-MS (ES, m/z): 772 (M+H) +
步驟9:在氮氣氛圍下向9-[(2R,3S,4R,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-3-氟基-5-(氟甲基)氧雜環戊烷-2-基]-2-氟基-N-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]嘌呤-6-胺(250.0 mg,0.32 mmol)及NH 4HCO 3(919.0 mg,14.58 mmol)於丙酮(5 mL)之攪拌溶液中添加Pd/C (345.0 mg,3.24 mmol)。將所得混合物在60℃下攪拌隔夜。將所得混合物冷卻至室溫且過濾;用MeOH (5x5 mL)洗滌濾餅。將合併之濾液在減壓下濃縮。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之(2R,3R,4S,5R)-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)-2-(氟甲基)-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-3-醇(170.0 mg,0.3 mmol,88.72%)。LC-MS (ES, m/z): 592 (M+H) +
步驟10:在室溫下將(2R,3R,4S,5R)-4-氟基-5-(2-氟基-6-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲基]胺基}嘌呤-9-基)-2-(氟甲基)-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-3-醇(170.0 mg,0.29 mmol)於AcOH (4 mL,80%)中之溶液攪拌隔夜。用飽和NaHCO 3(水溶液)將混合物中和至pH 7。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物:管柱:SunFire Prep C18 OBD管柱,19*150 mm,5μm;流動相A:水(0.1%FA),流動相B:ACN;流率:20 mL/min;梯度:在5.3 min內65% B至90% B;波長:210/254 nm;RT1(min):5.3。此得到呈白色固體之(2R,3R,4S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-4-氟基-2-(氟甲基)-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-3-醇(27.7 mg,0.1 mmol,25.67%)。LC-MS (ES, m/z): 320 (M+H +)。99.5%純度。HPLC之條件:(管柱:Luna Omega PS C18,30*2.1 mm,3.5 μm;流動相A:水/0.1%FA,流動相B:ACN/0.1%FA;流率:1.2000 mL/min;梯度:在1.2.00 min內5% B至100% B,在0.6 min內100% B至100% B,在0.2 min內100% B至5% B;波長:254/220 nm;RT1(min):0.43)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 8.25 (d, J = 1.2 Hz, 1H), 7.91 (brs, 2H), 6.41 – 6.37 (m, 1H), 6.23 (d, J = 5.2 Hz, 1H), 5.37 – 5.24 (m, 1H), 5.29 (t, J = 5.6 Hz, 1H), 4.77 – 4.69 (m, 1H), 4.63 – 4.58 (m, 1H), 4.47 (d, J = 10.0 Hz, 1H), 3.70 – 3.66 (m, 1H), 3.61 – 3.57 (m, 1H)。 實例 66- 化合物 85 4- 胺基 -5- 氟基 -1-[(2R,3S,4R,5R)-3- 氟基 -5-( 氟甲基 )-4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 氧雜環戊烷 -2- ] 嘧啶 -2- 酮之合成
步驟1:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.0 g,2.45 mmol)及TEA (740.0 mg,7.34 mmol)於DCM (10 mL)之攪拌溶液中分批添加乙醯氯(480.0 mg,6.12 mmol)。在0℃,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌2 h。用稀釋DCM所得混合物。將有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之[(3R,4S,5R)-2-[(乙醯基氧基)甲基]-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-基] mEtOAc (1.0 g,2.03 mmol,82.93%)。LC-MS (ES, m/z): 493 (M+H) +
步驟2:在氮氣氛圍下向[(3R,4S,5R)-2-[(乙醯基氧基)甲基]-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-基]mEtOAc (1.0 g,2.03 mmol)於MeOH (10 mL)之攪拌溶液中添加NH 4F (230.0 mg,6.09 mmol)。在60℃,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌隔夜。使混合物冷卻至室溫且在減壓下濃縮。藉由用PE/EtOAc (4:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之[(3R,4S,5R)-2-[(乙醯基氧基)甲基]-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-羥基氧雜環戊烷-2-基] mEtOAc) (800.0 mg,2.12 mmol)。LC-MS (ES, m/z): 379 (M+H) +
步驟3:在室溫,氮氣氛圍下向[(3R,4S,5R)-2-[(乙醯基氧基)甲基]-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-羥基氧雜環戊烷-2-基] mEtOAc (800.0 mg,2.12 mmol)及吡啶(5 mL,6.35 mmol)於DCM (8 mL)之攪拌溶液中分批添加1-(氯基二苯基甲基)-4-甲氧基苯(784.0 mg,2.54 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌隔夜且藉由添加飽和NH 4Cl (水溶液)來淬滅。將所得混合物用DCM萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌,且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (8:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之[(3R,4S,5R)-2-[(乙醯基氧基)甲基]-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基] mEtOAc (1.0 g,1.54 mmol,72.68%)。LC-MS (ES, m/z): 651 (M+H) +
步驟4:向[(3R,4S,5R)-2-[(乙醯基氧基)甲基]-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基] mEtOAc (1.0 g,1.54 mmol)於MeOH (10 mL)之攪拌溶液中逐滴添加NaOH (180.0 mg,4.61 mmol)於H 2O (5 mL)中之溶液。將所得混合物在室溫下攪拌3 h,然後在減壓下濃縮。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化殘餘物:C18管柱; 流動相A:水(0.1% NH 3.H 2O)及B:CH 3CN;梯度:在20 min內5%至100% B;在254/220 nm下UV偵測。此得到呈白色固體之5-氟基-1-[(2R,3S,4R)-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(700.0 mg,1.24 mmol,80.39%)。LC-MS (ES, m/z): 567(M+H) +
步驟5:在室溫下向5-氟基-1-[(2R,3S,4R)-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(700.0 mg,1.24 mmol)於DCM (7 mL)之攪拌溶液中逐滴添加吡啶(293.0 mg,3.71 mmol)。隨後在-30℃下逐滴添加Tf 2O (871.0 mg,3.09 mmol)。將所得混合物在0℃下再攪拌2 h,然後藉由在0℃下添加飽和NaHCO 3(水溶液)來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (5:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之三氟甲烷磺酸[(3R,4S,5R)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(710 mg,0.84 mmol,68.20%)。(ES, m/z): 831 (M+H) +
步驟6:向三氟甲烷磺酸[(3R,4S,5R)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(700.0 mg,0.84 mmol)於ACN (7 mL)之溶液中添加TBAF (331.0 mg,1.26 mmol)。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌12 h。向以上混合物中逐滴添加NaOH水溶液(1M,20 mL,20.00 mmol)。將所得混合物在室溫下再攪拌1 h且藉由在0℃下添加飽和NH 4Cl (水溶液)來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之5-氟基-1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(氟甲基)-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(405.0 mg,0.84 mmol,83.49%)。LC-MS (ES, m/z): 569 (M+H) +
步驟7:在0℃,氮氣氛圍下向5-氟基-1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(氟甲基)-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(400.0 mg,0.70 mmol)及咪唑(144.0 mg,2.11 mmol)於DMF (4 mL)之攪拌溶液中添加三級丁基二甲基氯矽烷(117.0 mg,0.77 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌隔夜且用EtOAc稀釋。將有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化殘餘物:C18管柱;流動相A:水(含有0.1% NH 3.H 2O)及B:CH 3CN;梯度:在20 min內10%至100% B;在254/220 nm下UV偵測。此得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-(氟甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(380.0 mg,0.70 mmol,79.10%)。LC-MS (ES, m/z): 683 (M+H) +
步驟8:向1-[(2R,3S,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氟甲基)-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(380.0 mg,0.70 mmol)於ACN (4 mL)之溶液中添加DMAP (172.0 mg,1.40 mmol)及TEA (213.0 mg,2.11 mmol)。隨後分批添加2,4,6-參(丙-2-基)苯-1-磺醯氯(425.0 mg,1.40 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌2 h。然後向以上混合物中逐滴添加NH 3.H 2O (2 mL)。將所得混合物在室溫下再攪拌3 h,然後在減壓下濃縮。藉由製備型TLC (PE/EtOAc = 5:1)純化殘餘物,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氟甲基)-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(200.0 mg,0.29 mmol,52.73%)。LC-MS (ES, m/z): 682 (M+H) +
步驟9:在室溫下向4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-(氟甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(200.0 mg,0.29 mmol)於MeOH (2 mL)之攪拌溶液中分批添加NH 4F (33.0 mg,0.88 mmol)。在60℃,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌隔夜。將所得混合物冷卻至室溫且在減壓下濃縮。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化殘餘物:C18管柱; 流動相A:水(0.1% NH 3.H 2O)及B:CH 3CN;梯度:在10 min內10%至100% B;在254/220 nm下UV偵測。此得到呈白色固體之4-胺基-5-氟基-1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(氟甲基)-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(100.0 mg,0.18 mmol,60.07%)。LC-MS (ES, m/z): 568 (M+H) +
步驟10:在室溫下將4-胺基-5-氟基-1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(氟甲基)-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(100.0 mg,0.18 mmol)於AcOH (1 mL)中之溶液攪拌隔夜,然後在減壓下濃縮。藉由製備型HPLC在以下條件下純化殘餘物:管柱:XBridge Shield RP18 OBD管柱,19*250 mm,10μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:25 mL/min;梯度:在6 min內5% B至18% B;波長:254 nm;RT1(min):4.87。此得到呈白色固體之4-胺基-5-氟基-1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(氟甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(34.0 mg,0.12 mmol,40.84%)。LC-MS (ES, m/z): 296 (M+H) +。95.0%純度。HPLC之條件:(管柱:Atlantis T3 3 μm 4.6*100mm;流動相A:水/0.05%TFA,流動相B:ACN/0.05% TFA;流率:1.2000 mL/min;梯度:在8.00 min內5% B至95% B,在2.00 min內5% B至95% B,在0.50 min內90% B至10% B;波長:254 nm;RT1(min):2.22)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 8.03 – 8.00 (m, 3H), 6.22 – 6.17 (m, 2H), 5.09 (d, J = 53.2 Hz, 1H), 4.67 (d, J = 10.0 Hz, 1H), 4.59 – 4.54 (m,1H), 4.46 (d, J = 4.0 Hz, 1H), 4.42 – 4.40 (m, 1H), 3.61 – 3.51 (m, 2H)。 實例 67- 化合物 95 4- 胺基 -1-((2R,3S,4S,5R)-3,4- 二羥基 -5-( 羥甲基 )-5-( 三氟甲基 ) 四氫呋喃 -2- )-5- 氟基嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在0℃下向4N HCl於1,4 二噁烷(2.0 mL)及H 2O (2.0 mL)之混合物中添加(2R,3S,3aS,9aR)-7-氟基-3-羥基-2-(羥甲基)-2-(三氟甲基)-2,3,3a,9a-四氫-6H-呋喃并[2',3':4,5]噁唑并[3,2-a]嘧啶-6-酮(0.4g,1.28 mmol)。將反應在80℃下加熱2 hr,此時TLC及LCMS顯示完全反應。濃縮反應混合物且藉由用含5% MeOH之DCM溶析之CombiFlash管柱層析法純化所得殘餘物,得到呈白色固體之所需產物 (0.28g,66.2%)。LC-MS (ES, m/z): 331.1 (M+H)。
步驟2:向1-((2R,3S,4S,5R)-3,4-二羥基-5-(羥甲基)-5-(三氟甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.28 g,0.848 mmol)於吡啶(10 mL)之攪拌溶液中添加乙酸酐(0.4 mL,4.24 mmol)。將反應攪拌16 h,此時TLC及LCMS顯示完全反應。將反應混合物濃縮且用EtOAc稀釋,用碳酸氫鈉水溶液及鹽水(10 mL)洗滌。經Na 2SO 4乾燥後,濃縮溶液,且藉由用含20 % EtOAc之正己烷溶析之CombiFlash管柱層析法純化所得殘餘物,得到呈白色固體之所需產物(0.22g,56%)。LC-MS (ES, m/z): 454.9 (M-H)。
步驟3:在0℃下向二乙酸(2R,3S,4S,5R)-2-(乙醯氧基甲基)-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-2-(三氟甲基)四氫呋喃-3,4-二酯(0.15g,0.328 mmol)於乙腈(5 mL)之攪拌溶液中添加TEA (0.18 mL,1.312 mmol)、DMAP (0.08g,0.656 mmol),然後添加TPSCl (0.19g,0.657 mmol)。反應混合物在室溫下攪拌4 h後,將NH 4OH:1,4-二噁烷(0.6 mL)添加至以上反應混合物中且在室溫下攪拌15min。藉由TLC及LCMS監測反應進展。完成後,濃縮反應混合物且藉由使用100 % EtOAc作為溶析液之製備型TLC純化所得殘餘物,得到呈白色固體之所需產物(0.12g,80%)。LC-MS (ES, m/z): 456.1 (M+H)。
步驟4:向二乙酸(2R,3S,4S,5R)-2-(乙醯氧基甲基)-5-(4-胺基-5-氟基-2-側氧基嘧啶-1(2H)-基)-2-(三氟甲基)四氫呋喃-3,4-二酯(0.08g,0.175 mmol)於MeOH (0.3 mL)之攪拌溶液中添加含7N NH 3之MeOH(2 mL)。將反應在室溫下攪拌4 h。濃縮反應混合物且藉由製備型HPLC按照以下條件純化所得殘餘物;流動相:A= 含0.02% NH 4OH之水,B= CH 3CN,管柱:waters X BRIDGE (250mmx20.0mm),5.0µ,流動:15.0 mL/min,梯度程式:時間/% B:0/5, 2/10, 8/30),得到呈白色固體之所需產物(0.025g,43%)。LC-MS (ES, m/z): 330.05 (M+H)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ = 7.78 (d, J = 7.2 Hz, 2H), 7.56 (br s, 1H), 6.22 (dd, J = 1.9, 5.7 Hz, 1H), 6.05 (d, J = 5.4 Hz, 1H), 5.85 (d, J = 5.3 Hz, 1H), 5.68 (t, J = 5.6 Hz, 1H), 4.38 (t, J = 5.3 Hz, 1H), 4.24 (q, J = 5.3 Hz, 1H), 3.79 - 3.68 (m, 2H)。 實例 68- 化合物 88 4- 胺基 -1-((2R,4S,5R)-5-( 溴甲基 )-4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- )-5- 氟基嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在室溫下向5-氟基-1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(20.0 g,81.238mmol)於吡啶(400 mL)之溶液中添加TBDPSCl ( 23.44 mL,85.299mmol)。將反應在室溫下攪拌16 h,此時TLC及LCMS顯示完全反應。完成後,蒸發反應混合物且將所得殘餘物分配於EtOAc與水之間。將有機層分離,經Na 2SO 4乾燥,濃縮且藉由用含40% EtOAc之正己烷溶析之CombiFlash管柱純化粗產物,獲得呈灰白色固體之所需產物(30 g,76.20%)。LC-MS (ES, m/z): 484.80 (M+H +)。
步驟2:在室溫下向1-((2R,4S,5R)-5-(((三級丁基二苯基矽烷基)氧基)甲基)-4-羥基四氫呋喃-2-基)-5-(三氟甲基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.5g,1.031mmol)於DCM (10 mL)之攪拌溶液中添加三甲基吡啶(0.14 mL,1.13 mmol)、AgNO 3(0.19 g,1.134mmol),隨後添加氯化三苯甲基(0.31 g,1.13mmol)。將反應在室溫下攪拌16 h,此時TLC及LCMS顯示完全反應。蒸發反應混合物且將所得殘餘物分配於EtOAc與水之間。將有機層分離,經Na 2SO 4乾燥,濃縮且藉由用含30% EtOAc之正己烷溶析之CombiFlash管柱純化粗產物,得到呈灰白色固體之所需產物(0.7g,93.40%)。LC-MS (ES, m/z): 724.80 (M-1)。
步驟3:在0℃下向1-((2R,4S,5R)-5-(((三級丁基二苯基矽烷基)氧基)甲基)-4-(三苯甲基氧基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(200 mg,0.275mmol)於THF (4 mL)之攪拌溶液中添加TBAF (1.1 mL,1.10 mmol)。將反應在室溫下攪拌4 h,此時TLC及LCMS顯示完全反應。蒸發反應混合物且將殘餘物分配於EtOAc (50 mL)與水之間。將有機層分離,經Na 2SO 4乾燥,濃縮且藉由用含55% EtOAc之正己烷溶析的使用12g管柱之CombiFlash純化粗產物,獲得呈灰白色固體之所需產物(60 mg,44.66%)。LC-MS (ES, m/z): 486.75 (M-1)。
步驟4及5:在室溫下向5-氟基-1-((2R,4S,5R)-5-(羥甲基)-4-(三苯甲基氧基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(2.7g,5.53 mmol)於ACN(50.0 mL)之溶液中添加IBX (1.85g,6.63 mmol)。將反應在85℃下攪拌2 h,冷卻至室溫且過濾。濃縮濾液,得到粗醛材料。將該醛溶解於1,4-二噁烷(50 mL)中且在室溫下用甲醛(2.7 mL)處理,隨後用2N NaOH (5.4 mL)處理。將反應在室溫下攪拌16 h。將反應冷卻至0℃且用NaBH 4(0.84g,22.11mmol)處理。然後將反應在室溫下攪拌1 h。在高真空下蒸發反應混合物,得到所需粗化合物。藉由用含5% MeOH之DCM溶析之CombiFlash純化粗產物,獲得呈灰白色固體之所需產物(1.4g,48.85%)。LC-MS (ES, m/z): 517.20 (M-1)。
步驟6:在-30℃下向1-((2R,4S)-5,5-雙(羥甲基)-4-(三苯甲基氧基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮三氟甲基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.1g,0.175 mmol)於DCM (2 mL)之攪拌溶液中添加吡啶(0.31 mL,3.85 mmol),隨後添加Tf 2O (0.15 mL,0.848mmol)。將反應在室溫下攪拌2 h。向反應混合物中添加冰冷水且用DCM萃取混合物兩次。將有機層分離,經Na 2SO 4乾燥,濃縮且藉由用含35% EtOAc之正己烷溶析之CombiFlash管柱純化粗材料,獲得呈灰白色固體之所需產物(0.16g,53.09%)。LC-MS (ES, m/z): 780.95 (M-1)。
步驟7、8及9:在室溫下向雙(亞甲基)雙(三氟甲烷磺酸)((3S,5R)-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-3-(三苯甲基氧基)四氫呋喃-2,2-二基)酯(150 mg,0.19 mmol)於THF (4 mL)之攪拌溶液中添加Et 3N (0.26 mL,1.916mmol)。將反應在50℃下攪拌3 h,冷卻至0℃且用LiBr (49 mg,0.573mmol)處理。將反應在50℃下攪拌12 h,冷卻至0℃且緩慢添加1N NaOH(0.57 mL,0.573mmol)。反應混合物在室溫下攪拌2 h後,將反應混合物分配於各自20 mL的冰冷水與DCM之間。將有機層分離,經Na 2SO 4乾燥,得到呈灰白色固體之所需產物(110 mg,粗品)。LC-MS (ES, m/z): 579.00 (M-1)。
步驟10:在0℃下向1-((2R,4S,5R)-5-(溴甲基)-5-(羥基-甲基)-4-(三苯甲基氧基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.6 g,1.03 mmol)於DMF (12 mL)之攪拌溶液中添加咪唑(0.35 g,5.15 mmol)、TBSCl (0.46 g,3.095 mmol),隨後添加硝酸銀(0.35 g,2.062 mmol)。將反應在室溫下攪拌48 h。將反應混合物用冰冷水淬滅,然後分配於EtOAc與水(各自20 mL)之間。將有機層分離,經Na 2SO 4乾燥,濃縮且藉由用含45% EtOAc之正己烷溶析之CombiFlash管柱純化粗產物,得到呈淺黃色黏稠物之產物(0.42g,58.55%)。LC-MS (ES, m/z): 695.10 (M+1)。
步驟11及12:在0℃下向1-((2R,4S,5R)-5-(溴甲基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-4-(三苯甲基氧基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(50 mg,0.071 mmol)於ACN (2 mL)之攪拌溶液中添加Et 3N (0.03 mL,0.29 mmol)及DMAP (17 mg,0.143 mmol),然後添加TPSCl (43 mg,0.143 mmol)。將反應在室溫下攪拌2 h且用三唑(19 mg,0.287 mmol)處理。又攪拌2 h後,將NH 4OH:1,4-二噁烷(0.5 mL)添加至以上反應混合物中且攪拌2小時。將反應混合物用冰冷水淬滅,然後用EtOAc (20 mL)及水(5 mL)分配。分離有機層,用EtOAc (2 x 10 mL)洗滌水層。將合併之有機物經Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮有機層,得到所需粗化合物。藉由用含100% EtOAc之正己烷溶析之製備型TLC純化粗化合物,得到呈灰白色固體之所需產物(20mg,40.54%)。LC-MS (ES, m/z): 694.20 (M+1)。
步驟13:在0℃下將4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-(溴甲基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-4-(三苯甲基氧基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮(150mg,0.215 mmol)於DCM (3 mL)於中之攪拌溶液用80%甲酸(0.4 mL)處理。反應混合物在室溫下攪拌12 h後,濃縮反應混合物且藉由製備型HPLC按照以下條件純化所得殘餘物:流動相:A:含0.02% NH 4OH之水;B:MeCN;管柱:X SELECT (250mm x 20.0mm),5.0µ;流率:15mL/min;梯度程式:時間/% B:0/5,2/10,8/30,得到呈白色固體之所需產物(9 mg,12.17 %)。LC-MS (ES, m/z): 338.0 (M+1)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ = 8.01 (d, J = 7.2 Hz, 1H), 7.81 - 7.47 (m, 2H), 6.22 - 6.17 (m, 1H), 5.45 (d, J = 4.8 Hz, 1H), 5.31 (t, J = 5.1 Hz, 1H), 4.39 - 4.35 (m, 1H), 3.70 - 3.63 (m, 2H), 3.61 - 3.56 (m, 2H), 2.28 - 2.15 (m, 2H)。 實例 69- 化合物 121 4- 胺基 -1-[(2R,3S,4R,5R)-5- 環丙基 -3- 氟基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 氧雜環戊烷 -2- ] 嘧啶 -2- 酮之合成
步驟1:在室溫,N 2氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(10 g,40.49 mmol)於DMF (100 mL)之攪拌溶液中分批添加咪唑(13.8 g,202.45 mmol)及TBSCl (18.3 g,121.47 mmol)。在80℃,N 2氛圍下將所得混合物攪拌2 h。將所得混合物冷卻至室溫,用水稀釋且用EtOAc (3 x 300 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液,得到粗產物(22 g,粗品),其未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 475 [M+H] +
步驟2:在室溫,N 2氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(22 g,46.32 mmol)於MeOH (300 mL)之攪拌溶液中分批添加PPTS (34.9 g,138.96 mmol)。在50℃,N 2氛圍下將所得混合物攪拌15 h。將所得混合物在真空下濃縮且用水稀釋。將所得混合物用EtOAc (3 x 200 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(11.8 g,粗品)。LC-MS (ES, m/z): 361 [M+H] +
步驟3:在室溫,N 2氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(11.8 g,32.69 mmol)於ACN (100 mL)之攪拌溶液中分批添加IBX (27.3 g,98.07 mmol)。在60℃,N 2氛圍下將所得混合物攪拌2 h。將所得混合物冷卻至室溫且過濾;用ACN洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液,得到呈白色固體之(2S,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-4-氟基氧雜環戊烷-2-甲醛(10.2 g,粗品)。LC-MS (ES, m/z): 359 [M+H] +
步驟4:在室溫下向(2S,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-4-氟基氧雜環戊烷-2-甲醛(10.2 g,28.41 mmol)及多聚甲醛(4.3 g,142.05 mmol)於二噁烷(100 mL)之攪拌溶液中逐滴添加含NaOH (2.3 g,56.82 mmol)之水(10 mL)。將所得混合物在室溫下攪拌15 h。在0℃下向以上混合物中分批添加NaBH 4(3.2 g,85.23 mmol)。將所得混合物在室溫下再攪拌30 min。在0℃下用飽和NH 4Cl (水溶液)淬滅反應。將所得混合物用EtOAc (3 x 200 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌,且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用DCM/MeOH (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(5.2 g,13.3 mmol,46.8%)。LC-MS (ES, m/z): 391 [M+H] +
步驟5:在0℃,N 2氛圍下向1-[(2R,3S,4R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(3 g,7.67 mmol)於吡啶(50 mL)之攪拌溶液中分批添加DMTrCl (3.9 g,11.51 mmol)。在室溫,N 2氛圍下將所得混合物攪拌3 h。所得混合物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 693 [M+H] +
步驟6:在室溫下向以上混合物中分批添加TBSCl (3.4 g,22.56 mmol)。將所得混合物在60℃下再攪拌15 h。將所得混合物冷卻至室溫且在真空下濃縮。藉由用DCM/MeOH (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(2.2 g,2.73 mmol,36.1%)。LC-MS-PH (ES, m/z): 807 [M+H] +
步驟7:在室溫下將1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(2.2 g,2.73 mmol)於AcOH (16 mL)及水(4 mL)中之溶液攪拌2 h。將所得混合物在真空下濃縮。藉由用DCM/MeOH (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.2 g,2.38 mmol,87.2%)。LC-MS (ES, m/z): 505 [M+H] +
步驟8:在室溫,N 2氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(820 mg,1.62 mmol)於ACN (15 mL)之攪拌溶液中分批添加IBX (1.3 g,4.86 mmol)。在60℃,N 2氛圍下將所得混合物攪拌2 h。將所得混合物冷卻至室溫且過濾;用ACN洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液,得到呈白色固體之(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-4-氟基氧雜環戊烷-2-甲醛(680 mg,1.35 mmol,83.3%)。LC-MS (ES, m/z): 503 [M+H] +
步驟9:在-78℃,N 2氛圍下向溴(甲基)三苯基-λ5-磷烷(3.2 g,9.06 mmol)於THF (30 mL)之攪拌混合物中逐滴添加n-BuLi (3 mL,7.55 mmol,2.5 M於THF中)。在室溫,N 2氛圍下將所得混合物攪拌1 h。在室溫下向以上混合物中逐滴添加含(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-4-氟基氧雜環戊烷-2-甲醛(760 mg,1.51 mmol)之THF (10 mL)。將所得混合物在室溫下再攪拌15 h。在0℃下用冰水淬滅反應。將所得混合物用EtOAc (3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC (DCM/MeOH 10:1)純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(600 mg,1.19 mmol,79.3%)。LC-MS (ES, m/z): 501 [M+H] +
步驟10:在室溫,N 2氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(590 mg,1.18 mmol)及DMAP (143 mg,1.18 mmol)於DCM (10 mL)之攪拌溶液中逐滴添加TEA (357 mg,3.54 mmol)及苯甲醯氯(248 mg,1.77 mmol)。在室溫,N 2氛圍下將所得混合物攪拌2 h。用DCM (3 x 50 mL)萃取所得混合物。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC (DCM/MeOH 20:1)純化殘餘物,得到呈白色固體之3-苯甲醯基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2,4-二酮(500 mg,0.83 mmol,70.2%)。LC-MS (ES, m/z): 605 [M+H] +
步驟11:在室溫,N 2氛圍下向3-苯甲醯基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2,4-二酮(500 mg,0.83 mmol)於DCM (10 mL)之攪拌溶液中添加Pd(OAc) 2(18 mg,0.08 mmol)。在0℃下向以上混合物中逐滴添加CH 2N 2乙醚溶液(100 mL)。將所得混合物在室溫下再攪拌15 h。過濾所得混合物;用DCM洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液。將所得混合物用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC (EtOAc/石油醚5:1)純化殘餘物,得到呈黃色固體之3-苯甲醯基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-環丙基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2,4-二酮(310 mg,0.5 mmol,60.6%)。LC-MS (ES, m/z): 619 [M+H] +
步驟12:向NH 3(g)於MeOH(6 mL,7M)之溶液中添加3-苯甲醯基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-環丙基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2,4-二酮(310 mg,0.5 mmol)。在室溫,N 2氛圍下將混合物攪拌2 h。將所得混合物在真空下濃縮。藉由製備型TLC (DCM/MeOH 20:1)純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-環丙基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(240 mg,0.47 mmol,93.1%)。LC-MS (ES, m/z): 515 [M+H] +
步驟13:在室溫,N 2氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-環丙基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(220 mg,0.43 mmol)於ACN (5 mL)之攪拌溶液中添加DMAP (104 mg,0.86 mmol)及TEA (86 mg,0.86 mmol)。在室溫,N 2氛圍下將所得混合物攪拌10 min。向以上混合物中分批添加TPSCl (258 mg,0.86 mmol)且在室溫下再攪拌15 h。在室溫下向以上混合物中添加濃氫氧化銨(2 mL)。將所得混合物在室溫下攪拌30 min。將所得混合物在真空下濃縮。藉由製備型TLC (DCM/MeOH 10:1)純化殘餘物,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-環丙基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(220 mg,0.43 mmol,100%)。LC-MS (ES, m/z): 514 [M+H] +
步驟14:在室溫,N 2氛圍下向4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-環丙基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(220 mg,0.43 mmol)於MeOH (6 mL)之攪拌溶液中分批添加NH 4F (475 mg,12.9 mmol)。在60℃,N 2氛圍下將所得混合物攪拌48 h。將所得混合物冷卻至室溫且過濾;用MeOH洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(管柱:SunFire Prep C18 OBD管柱,19*150 mm,5 μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3+0.1% NH 3 .H 2O),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在6 min內50% B至70% B,波長:254/210 nm;RT1(min):6.35)。收集級分且在真空下濃縮,將殘餘物再溶解於CH 3CN及H 2O中,然後冷凍乾燥,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-環丙基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(42.4 mg,0.15 mmol,34.7%)。LC-MS (ES, m/z): 286 [M+H] +, 96.3%純度。LCMS之條件:(管柱:Shim‐pack Scepter C18,33*3.0 mm,2.7 μm;流動相A:水/5 mM NH 4HCO 3,流動相B:ACN;流率:1.50 mL/min;梯度:在1.2 min內10% B至95% B,在0.60 min內95% B至95% B,在0.02 min內95% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):2.828)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 7.92 (d, J= 7.5 Hz, 1H), 7.19 (d, J= 28.5 Hz, 2H), 6.10 (dd, J= 9.0, 5.5 Hz, 1H), 5.88 (s, 1H), 5.69 (d, J= 7.5 Hz, 1H), 5.35 (d, J= 5.2 Hz, 1H), 5.11 (dt, J= 54.3, 5.6 Hz, 1H), 4.47 (dd, J= 22.0, 5.7 Hz, 1H), 3.48 (d, J= 4.1 Hz, 2H), 1.02 (tt, J= 8.5, 5.6 Hz, 1H), 0.46 – 0.38 (m, 1H), 0.37 – 0.28 (m, 1H), 0.24 (d, J= 5.2 Hz, 2H)。 實例 70- 化合物 120 4- 胺基 -1-[(2R,4S,5R)-5- 環丙基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 氧雜環戊烷 -2- ]-5- 氟基嘧啶 -2- 酮之合成
步驟1:在N 2氛圍下向氟尿苷 (20 g,81.23 mmol)於吡啶(200 mL)之溶液中添加DMTrCl (27.5 g,81.21 mmol)。將混合物在0℃下攪拌4小時。將反應濃縮且在0℃下用飽和NH 4Cl (水溶液)稀釋。將所得混合物用EtOAc (3 x 300 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌,且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。此得到呈黃色固體之1-[(2R,4S,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(43.8 g,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 549 [M+H] +
步驟2:在0℃,N 2氛圍下將1-[(2R,4S,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(43.8 g,79.81 mmol)於DMF (450 mL)中之溶液用咪唑(16.3 g,239.5 mmol)處理5分鐘,隨後在0℃下分批添加TBSCl (18 g,119.8 mmol)。將混合物在室溫下攪拌隔夜。在0℃下用冰水淬滅反應。將所得混合物用EtOAc (3 x 800 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。此得到呈黃色固體之1-[(2R,4S,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮((49 g,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS-PH (ES, m/z): 663 [M+H] +
步驟3:在室溫,N 2氛圍下將1-[(2R,4S,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(49 g,73.91 mmol)於水(100 mL)及AcOH (400 mL)中之溶液攪拌隔夜。濃縮混合物且用飽和NaHCO 3(水溶液)中和至pH 7。將所得混合物用EtOAc (3 x 500 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用(EtOAc/石油醚5:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(17.2 g,47.71 mmol,64.6%)。LC-MS (ES, m/z): 361 [M+H] +
步驟4:在室溫,N 2氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(17.2 g,47.71 mmol)於ACN (200 mL)之溶液中添加IBX (26.7 g,95.42 mmol)。將混合物在60℃下攪拌4小時。將所得混合物冷卻至室溫且過濾;用ACN洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液,得到呈黃色固體之(2S,3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(5-氟基-2-側氧基-3,4-二氫嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(16.8 g,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 359 [M+H] +
步驟5:將(2S,3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(16.8 g,44.8 mmol)於1,4-二噁烷(160 mL)中之溶液用多聚甲醛(13.1 g,436.92 mmol)及含NaOH (2.62 g,64 mmol)之水(32 mL)處理。在室溫,N 2氛圍下將反應攪拌隔夜。在0℃下經5分鐘向以上混合物中分批添加NaBH 4(3.43 g,89.31 mmol)。將所得混合物在室溫下再攪拌1小時。在0℃下將反應用飽和NH 4Cl (水溶液)來淬滅。將所得混合物用EtOAc (3 x 300 mL)萃取。將合併之有機層用水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用(EtOAc/石油醚1/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4S)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(5.52 g,14.12 mmol,31.5%)。LC-MS (ES, m/z): 391 [M+H] +
步驟6:在0℃,N 2氛圍下向1-[(2R,4S)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(5.52 g,14.12 mmol)於吡啶(50 mL)之攪拌溶液中分批添加DMTrCl (5.72 g,16.93 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。將反應濃縮且在0℃下用飽和NH 4Cl (水溶液)來淬滅。將所得混合物用EtOAc (3 x 150 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液,得到呈黃色固體之1-[(2R,4S,5S)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(10.8 g,15.64 mmol,99.7%)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS-PH (ES, m/z): 693 [M+H] +
步驟7:在0℃、N 2氛圍下向咪唑(3.22 g,46.83 mmol)及1-[(2R,4S,5S)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(10.8 g,15.64 mmol)於DMF (100 mL)之攪拌溶液中分批添加TBSCl (3.54 g,23.42 mmol)。在室溫,N 2氛圍下將所得混合物攪拌隔夜。在0℃下用冰水淬滅反應。將所得混合物用EtOAc (3 x 200 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。此得到呈黃色固體之1-[(2R,4S,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(13.2 g,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 807 [M+H] +
步驟8:在室溫,N 2氛圍下將1-[(2R,4S,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(13.2 g,16.14 mmol)於水(26 mL)及AcOH (104 mL)中之溶液攪拌隔夜。濃縮混合物且用飽和NaHCO 3(水溶液)中和至pH 7。將所得混合物用EtOAc (3 x 500 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用(EtOAc/石油醚1/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(5 g,9.91 mmol,61.5%)。LC-MS (ES, m/z): 505 [M+H] +
步驟9:在室溫,N 2氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(5 g,9.91 mmol)於ACN (50 mL)之攪拌溶液中分批添加IBX (8.33 g,29.72 mmol)。在60℃,N 2氛圍下將所得混合物攪拌3小時。將所得混合物冷卻至室溫且過濾;用ACN洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液,得到呈黃色固體之(2R,3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(5 g,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 503 [M+H] +
步驟10:在0℃,N 2氛圍下將甲基三苯基溴化鏻(3.91 g,10.92 mmol)於THF(40 mL)中之溶液用n-BuLi (4 mL,10.92 mmol,2.5 M於己烷中)處理5分鐘,隨後在0℃,N 2氛圍下逐滴添加含(2R,3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(5 g,9.92 mmol)之THF (50 mL)。在0℃,N 2氛圍下將所得混合物攪拌2小時。在0℃下用冰水淬滅反應。將所得混合物用EtOAc (3 x 200 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用(EtOAc/石油醚5/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(2 g,3.99 mmol,40.2%)。LC-MS (ES, m/z): 501 [M+H] +
步驟11:在0℃,N 2氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(2 g,3.99 mmol)於DCM (20 mL)之攪拌溶液中依次添加TEA (1.2 g,11.73 mmol)、DMAP (1.5 g,11.73 mmol)及苯甲醯氯(842 mg,5.87 mmol)。在室溫,N 2氛圍下將所得混合物攪拌隔夜。用稀釋DCM (3 x 100 mL)所得混合物。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用(EtOAc/石油醚10/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之3-苯甲醯基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2,4-二酮(700 mg,1.16 mmol,28.9%)。LC-MS (ES, m/z): 605 [M+H] +
步驟12:在室溫,N 2氛圍下向3-苯甲醯基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2,4-二酮(700 mg,1.16 mmol)於DCM (20 mL)之攪拌溶液中添加Pd(OAc) 2(26 mg,0.11 mmol)。在0℃下向以上混合物中逐滴添加CH 2N 2乙醚溶液(20 mL)。將所得混合物在室溫下再攪拌15小時。過濾所得混合物;用DCM洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液。將所得混合物用水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC (EtOAc/石油醚5/1)純化殘餘物,得到呈黃色固體之3-苯甲醯基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-環丙基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2,4-二酮(540 mg,0.87 mmol,75.4%)。(ES, m/z): 619 [M+H] +
步驟13:向NH 3(g)於MeOH(10 mL,7 M)之溶液中添加3-苯甲醯基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-環丙基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2,4-二酮(540 mg,0.87 mmol)。將混合物在室溫下攪拌2小時。將所得混合物在真空下濃縮。藉由製備型TLC (DCM/MeOH 15/1)純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-環丙基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(340 mg,0.66 mmol,77.1%)。LC-MS (ES, m/z): 515 [M+H] +
步驟14:在室溫,N 2氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-環丙基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(320 mg,0.66 mmol)、DMAP (152 mg,1.32 mmol)及TEA (189 mg,1.85 mmol)於ACN (10 mL)之攪拌混合物中分批添加TPSCl (377 mg,1.32 mmol)。將混合物在室溫下攪拌15小時。然後添加濃氫氧化銨(5 mL)且將混合物在室溫下攪拌1小時。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型TLC (DCM/MeOH 8/1)純化殘餘物,得到呈灰白色固體之4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-環丙基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(300 mg,0.58 mmol,93.9%)。LC-MS (ES, m/z): 514 [M+H] +
步驟15:在室溫,N 2氛圍下向4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-環丙基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(300 mg,0.58 mmol)於MeOH (14 mL)之攪拌混合物中分批添加NH 4F (649 mg,17.4 mmol)。將混合物在60℃下攪拌15小時。將所得混合物冷卻至室溫且在減壓下濃縮。藉由製備型TLC (DCM/MeOH = 8:1)純化殘餘物,得到粗產物。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物 (管柱:Xselect CSH C18 OBD管柱 30*150 mm 5 μm,n;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在7 min內2% B至15% B,波長:220 nm;RT1(min):7.63)。收集級分且在真空下濃縮,將殘餘物再溶解於CH 3CN及H 2O中,然後冷凍乾燥,得到呈灰白色固體之4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-5-環丙基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(14.5 mg,0.05 mmol,8.4%)。LC-MS (ES, m/z): 286 [M+H] +, 96.2%純度。LCMS之條件:(管柱:HALO C18, 100*4.6 mm,2.7 μm;流動相A:H 2O+0.1% TFA,流動相B:ACN+0.1% TFA;流率:1.20 mL/min;梯度:在8.00 min內0% B至95% B,在2.00 min內95% B至95% B,在0.50 min內95% B至10% B;波長:254 nm;RT1(min):2.85)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 8.37 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 7.56 (d, J= 93.1 Hz, 2H), 5.86 (ddd, J= 6.4, 4.2, 1.9 Hz, 1H), 5.33 (t, J= 4.8 Hz, 1H), 5.15 (d, J= 4.9 Hz, 1H), 4.41 (q, J= 6.9 Hz, 1H), 3.63 – 3.43 (m, 2H), 2.28 – 1.99 (m, 2H), 0.89 (td, J= 8.2, 4.2 Hz, 1H), 0.45 – 0.35 (m, 1H), 0.26 (q, J= 6.0, 5.5 Hz, 2H), 0.18 – 0.08 (m, 1H)。 實例 71- 化合物 94 2- 胺基 -9-[(2R,3S,4S,5R)-5-( 氯甲基 )-3,4- 二羥基 -5-( 羥甲基 ) 氧雜環戊烷 -2- ]-1H- 嘌呤 -6- 酮之合成
步驟1:在-35℃,N 2氛圍下向[(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-2,2-二甲基-二氫-3aH-呋喃并[2,3-d] [1,3]二氧雜環戊烯-5-基]甲醇(8 g,19.91 mmol)及吡啶(6.3 g,79.87 mmol)於DCM (150 mL)之攪拌溶液中添加Tf 2O (7.3 g,25.88 mmol)。將混合物在0℃下攪拌2小時。在減壓下濃縮所得混合物。將所得混合物用水稀釋且用EtOAc (3 x 300 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用EtOAc/石油醚(3/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色油狀物之三氟甲烷磺酸[(3aR,5S,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-2,2-二甲基-二氫-3aH-呋喃并[2,3-d] [1,3]二氧雜環戊烯-5-基]甲酯(10.4 g,19.51 mmol,97.8%)。LC-MS (ES, m/z): 550 [M+NH 4] +
步驟2:在室溫,N 2氛圍下向三氟甲烷磺酸[(3aR,5S,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-2,2-二甲基-二氫-3aH-呋喃并[2,3-d] [1,3]二氧雜環戊烯-5-基]甲酯(10.4 g,19.51 mmol)於DMF (100 mL)之攪拌混合物中添加LiCl (8.3 g,197.62 mmol)。將混合物在60℃下攪拌2小時。在減壓下濃縮所得混合物。將所得混合物用水稀釋且用EtOAc (3 x 300 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌,且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用EtOAc/石油醚(3/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到粗產物。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化粗產物:C18管柱;流動相,水及ACN,在20 min內5%至100%梯度;在254 nm下UV偵測。此得到呈淡黃色油狀物之(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-2,2-二甲基-二氫-3aH-呋喃并[2,3-d] [1,3]二氧雜環戊烯(5.1 g,12.21 mmol,62.4%)。LC-MS (ES, m/z): 436/438 [M+NH 4] +
步驟3:在0℃,N 2氛圍下向(3aR,5R,6S,6aR)-6-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-2,2-二甲基-二氫-3aH-呋喃并[2,3-d] [1,3]二氧雜環戊烯(5.1 g,12.21 mmol)於AcOH (60 mL)之攪拌混合物中逐滴添加Ac 2O (17.4 g,170.78 mmol)及濃H 2SO 4(1 mL)。將混合物在室溫下攪拌2小時。將所得混合物在真空下濃縮且用冰水淬滅。用飽和NaHCO 3(水溶液)將殘餘物調節至pH 8。將所得混合物用EtOAc (3 x 200 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用溶析之PE/EA (2/1)矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色油狀物之乙酸(2R,3R,4S,5R)-2-(乙醯基氧基)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)氧雜環戊烷-3-酯(4.4 g,9.51 mmol,78.1%)。LC-MS (ES, m/z): 480/482 [M+NH 4] +
步驟4:在室溫,N 2氛圍下向2-甲基-N-(6-側氧基-1,9-二氫嘌呤-2-基)丙醯胺 (1.7 g,7.71 mmol)於ACN (30 mL)之攪拌溶液中添加(E)-(N-(三甲基矽烷基)亞胺醯乙酸三甲基矽烷酯) (4.2 g,20.52 mmol)。將混合物在80℃下攪拌1小時。將混合物冷卻至室溫,然後在氮氣下逐滴添加含TMSOTf (1.8 g,8.2 mmol)及乙酸(2R,3R,4S,5R)-2-(乙醯基氧基)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)氧雜環戊烷-3-酯(2.4 g,5.21 mmol)之ACN (10 mL)。將混合物在80℃下攪拌15小時。將所得混合物冷卻至室溫,用水稀釋且用EtOAc (3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用DCM/MeOH (10/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之乙酸((2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-(氯甲基)-2-(2-異丁醯胺基-6-側氧基-1,6-二氫-9H-嘌呤-9-基)四氫呋喃-3-酯(2.9 g,4.62 mmol,89.2%)。LC-MS (ES, m/z): 624/626 [M+H] +
步驟5:在室溫下向NH 3(g)於MeOH(15 mL,2M)之溶液中添加乙酸(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-((苄氧基)甲基)-5-(氯甲基)-2-(2-異丁醯胺基-6-側氧基-1,6-二氫-9H-嘌呤-9-基)四氫呋喃-3-酯(1.2 g,1.91 mmol)且在N 2氛圍下攪拌15小時。在減壓下濃縮所得混合物。藉由用DCM/MeOH (10/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之2-胺基-9-[(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-3-羥基氧雜環戊烷-2-基]-1H-嘌呤-6-酮(860 mg,1.72 mmol,88.4%)。LC-MS (ES, m/z): 512/514 [M+H] +
步驟6:在室溫,N 2氛圍下向2-胺基-9-[(2R,3R,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-3-羥基氧雜環戊烷-2-基]-1H-嘌呤-6-酮(860 mg,1.72 mmol)於DMSO (24 mL)之攪拌混合物中添加Ac 2O (17 mL)。將混合物在室溫下攪拌2小時。藉由在0℃下添加飽和NH 4Cl (水溶液)來淬滅反應。用EtOAc (3 x 100 mL)萃取所得混合物。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC (DCM/MeOH=10/1)純化殘餘物,得到呈黃色固體之N-{9-[(2R,4R,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-3-側氧基氧雜環戊烷-2-基]-6-側氧基-1H-嘌呤-2-基}乙醯胺(490 mg,0.91 mmol,52.2 %)。LC-MS (ES, m/z): 552/554 [M+H] +
步驟7:在0℃,N 2氛圍下向N-{9-[(2R,4R,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-3-側氧基氧雜環戊烷-2-基]-6-側氧基-1H-嘌呤-2-基}乙醯胺(490 mg,0.91 mmol)於THF (25 mL)之攪拌溶液中添加NaBH 4(168 mg,4.42 mmol)。將混合物在0℃下攪拌2小時。藉由在0℃下添加飽和NH 4Cl (水溶液)來淬滅反應。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC (DCM: MeOH = 10:1)純化殘餘物,得到300 mg粗產物。藉由製備型對掌性HPLC在以下條件下純化粗產物(管柱:SunFire Prep C18 OBD管柱,19*150 mm,5 μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3+ 0.1%NH 3.H 2O),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在6.34 min內40% B至60% B,波長:254/210 nm;RT1(min):6)。收集級分且在真空下濃縮,將殘餘物再溶解於CH 3CN及H 2O中,然後冷凍乾燥,得到呈灰白色固體之2-胺基-9-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-3-羥基氧雜環戊烷-2-基]-1H-嘌呤-6-酮(45 mg,0.09 mmol,9.9%)。LC-MS (ES, m/z): 512/514 [M+H] +
步驟8:在-78℃,N 2氛圍下向2-胺基-9-[(2R,3S,4S,5R)-4-(苄氧基)-5-[(苄氧基)甲基]-5-(氯甲基)-3-羥基氧雜環戊烷-2-基]-1H-嘌呤-6-酮(60 mg,0.12 mmol)於DCM (30 mL)之攪拌溶液中添加BCl 3(1.8 mL,1.82 mmol,1M於己烷中)。將反應混合物在室溫下攪拌1小時。藉由在0℃下MeOH/TEA = 2:1之溶液來淬滅反應。將所得混合物在真空下濃縮且藉由製備型HPLC在以下條件下純化(管柱:XBridge Prep Phenyl OBD管柱,19*250 mm,5 μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3+ 0.1% NH 3.H 2O),流動相B:ACN;流率:20 mL/min;梯度:在7 min內3% B至9% B,波長:254/210 nm;RT1(min):6.35)。收集級分且在真空下濃縮,將殘餘物再溶解於CH 3CN及H 2O中且冷凍乾燥隔夜,得到呈灰白色固體之2-胺基-9-[(2R,3S,4S,5R)-5-(氯甲基)-3,4-二羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-1H-嘌呤-6-酮(23.6 mg,0.07 mmol,60.2%)。LC-MS (ES, m/z): 332/334 [M+H] +, 99.1%純度。LCMS之條件:(管柱:HALO C18, 100*4.6 mm,2.7 μm;流動相A:H 2O+0.1% TFA,流動相B:ACN+0.1% TFA;流率:1.20 mL/min;梯度:在8.00 min內0% B至95% B,在2.00 min內95% B至95% B,在0.50 min內95% B至10% B;波長:254 nm;RT1(min):2.51)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 7.92 (s, 1H), 6.44 (s, 2H), 6.03 (d, J= 5.2 Hz, 1H), 5.59 (m, 2H), 5.00 (s, 1H), 4.40 (t, J= 5.3 Hz, 1H), 4.32 (d, J= 5.2 Hz, 1H), 3.78 (s, 2H), 3.73 – 3.61 (m, 2H)。 實例 72- 化合物 86 4- 胺基 -1-[(2R,3S,4R,5R)-5-( 溴甲基 )-3- 氟基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 氧雜環戊烷 -2- ]-5- 氟基嘧啶 -2- 酮之合成
步驟1:在氮氣氛圍下向5-氟基-1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(20.0 g,75.70 mmol)於DMF (400 mL)之溶液中添加imid (12.8 g,189.26 mmol)。隨後在0℃下分批添加TBSCl (22.8 g,151.41 mmol)。將所得混合物攪拌隔夜且藉由在0℃下添加冰-水(400 mL)來淬滅。用EtOAc (3 x 100 ml)萃取所得溶液。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(15.0 g,39.63 mmol,52.36%)。LC-MS-PH (ES, m/z): 379 (M+H +)。
步驟2:在氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(15.0 g,39.63 mmol)於DCM (150 mL)之溶液中添加2,4,6-三甲基吡啶(14.4 g,118.90 mmol)。隨後在0℃下分批添加1-(氯基二苯基甲基)-4-甲氧基苯(24.4 g,79.27 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜,然後藉由在0℃下添加冰-水(150mL)來淬滅。將所得混合物用CH 2Cl 2(3x100 ml)萃取。將合併之有機層用檸檬酸水溶液洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由用PE/EtOAc (2:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(21.0 g,32.26 mmol,81.41%)。LC-MS (ES, m/z): 651 (M+H) +
步驟3:向1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(21.0 g,32.26 mmol)於THF (210 mL)之溶液中添加TBAF (16.9 g,64.53 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌3 h且藉由在0℃下添加HCl水溶液(1M,100 ml)來淬滅。用EtOAc (3x70 ml)萃取所得混合物。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之5-氟基-1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(15.0 g,27.95 mmol,86.64%)。LC-MS (ES, m/z): 537 (M+H) +
步驟4:向5-氟基-1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(15.0 g,27.95 mmol)於ACN (150 mL)之溶液中添加IBX (15.7 g,55.91 mmol)。在60℃,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌2 h。過濾所得混合物;用乙腈洗滌濾餅。在減壓下濃縮合併之濾液,得到(2S,3R,4S,5R)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-甲醛(14 g,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 535 (M+H +)。
步驟5:在0℃,氮氣氛圍下向(2S,3R,4S,5R)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-甲醛(14.0 g,粗品)於1,4-二噁烷(140 mL)之溶液中添加HCHO (28 mL,37%於水中)。隨後在0℃下逐滴添加NaOH水溶液(28 mL,2M)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌隔夜。在0℃下向以上混合物中分批添加NaBH 4(4.2 g,110.53 mmol)。將所得混合物在室溫下再攪拌1 h且藉由在0℃下添加飽和NH 4Cl水溶液來淬滅。用EtOAc (3x200 ml)萃取所得混合物。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (3:2)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之5-氟基-1-[(2R,3S,4R)-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(6.0 g,1.06 mmol,兩個步驟37.9%產率)。LC-MS (ES, m/z): 567 (M+H) +
步驟6:在室溫,氮氣氛圍下向5-氟基-1-[(2R,3S,4R)-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.5 g,2.64 mmol)於DCM (15 mL)之溶液中添加吡啶(1.6 g,21.18 mmol)。隨後在-30℃,氮氣氛圍下逐滴添加三氟甲酸酐(1.9 g,6.62 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌2 h且藉由在0℃下添加NaHCO 3水溶液來淬滅。用EtOAc (3x100 ml)萃取所得混合物。將合併之有機層用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之三氟甲烷磺酸[(3R,4S,5R)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(2.1 g,2.52 mmol,95.49%)。LC-MS (ES, m/z): 831 (M+H) +
步驟7:向三氟甲烷磺酸[(3R,4S,5R)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯 (2.1 g,2.52 mmol)於THF (21 mL)之溶液中添加TEA (2.5 g,25.28 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌2 h。向以上混合物中添加LiBr (0.65 g,7.49 mmol)且將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。向所得混合物中添加NaOH (0.2 g,4.90 mmol)於水(2 mL)中之溶液。將混合物在室溫下再攪拌2 h且藉由在0℃下添加冰水來淬滅。用EtOAc (3x200 ml)萃取所得混合物。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(溴甲基)-3-氟基-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(950.0 mg,1.50 mmol,59.7%)。LC-MS (ES, m/z): 629/631 (M+H) +
步驟8:向1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(溴甲基)-3-氟基-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(950.0 mg,1.50 mmol)於DMF (10 mL)之溶液中添加imid (256.0 mg,3.77 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌2 h。隨後在0℃下分批添加三級丁基二甲基氯矽烷(341.0 mg,2.26 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜且藉由添加水來淬滅。用EtOAc (3x100 ml)萃取所得混合物。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (2:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(溴甲基)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(955.0 mg,1.27 mmol,84.64%)。LC-MS (ES, m/z): 743/745 (M+H) +
步驟9:在0℃下向1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(溴甲基)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(950.0 mg,1.27 mmol)、TEA (387.0 mg,3.83 mmol)及DMAP (468.0 mg,3.83 mmol)於CH 3CN (10 mL)之溶液中添加2,4,6-參(丙-2-基)苯-1-磺醯氯(1.2 g,3.83 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將反應混合物攪拌3 h。向以上混合物中逐滴添加NH 3.H 2O (20 mL)。將所得混合物在室溫下再攪拌1 h且在減壓下濃縮。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(溴甲基)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(720.0 mg,0.94 mmol,75.89%)。LC-MS (ES, m/z): 742/744 (M+H +)。
步驟10:在室溫,氮氣氛圍下將4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(溴甲基)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(700.0 mg,0.94 mmol)於AcOH (7 mL,80%於水中)中之溶液攪拌隔夜。藉由在0℃下添加水/冰來淬滅反應。用EtOAc (3x100 ml)萃取所得混合物。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC (CH 2Cl 2/MeOH 8:1)純化殘餘物,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(溴甲基)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(225.0 mg,0.43 mmol,50.75%)。LC-MS (ES, m/z): 470/472 (M+H +)。
步驟11:向4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(溴甲基)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(200.0 mg,0.42 mmol)於MeOH (4 mL)之溶液中添加NH 4F (400.0 mg,10.80 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌隔夜,然後在減壓下濃縮。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物:管柱:C18;流動相A:水(10mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:100 mL/min;梯度:在15min內10% B至50%;偵測器:UV 254nm。將含有產物之級分合併且部分蒸發以移除溶劑,然後冷凍乾燥隔夜,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(溴甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(59.2 mg,0.16 mmol,39.10%)。LC-MS (ES, m/z): 356/358 (M+H +)。99.0%純度。
HPLC之條件:(管柱:Shim‐pack Scepter C18,33*3 mm,3.0 μm;流動相A:水/5mM NH 4HCO 3,流動相B:乙腈;流率:1.5000 mL/min;梯度:在1.20 min內10% B至95% B,在0.60 min內95% B至95% B,在0.02 min內95% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):0.460)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 7.93 (d, J= 6.8 Hz, 1H),7.88 (brs, 1H), 6.64 (brs, 1H), 6.25 – 6.24 (m, 1H), 6.21 – 6.17 (m, 1H), 5.47 (t, J= 5.6 Hz, 1H), 5.26 (t, J= 3.2 Hz, 0.5H), 5.11 (t, J= 3.2 Hz, 0.5H), 4.48 – 4.42 (m, 1H), 3.78 (d, J= 11.2 Hz,1H), 3.71 – 3.66 (m,1H), 3.62 – 3.57 (m, 2H)。 實例 73- 化合物 129 4- 胺基 -5- 氟基 -1-((2R,3S,4R,5R)-3- 氟基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 )-5-( 碘甲基 ) 四氫呋喃 -2- ) 嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在氮氣氛圍下向5-氟基-1-[(2R,3S,4R)-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(2.0 g,3.53 mmol)於DCM (20 mL)之溶液中添加吡啶(2.2 g,28.24 mmol)。隨後在-30℃,氮氣氛圍下逐滴添加三氟甲酸酐(2.5 g,8.82 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌2 h且藉由在0℃下添加NaHCO 3水溶液(20 ml)來淬滅。用EtOAc (3x70 ml)萃取所得混合物。將合併之有機層用鹽水洗滌,且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (3:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之三氟甲烷磺酸[(3R,4S,5R)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-2-[(三氟甲烷磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(2.0 g,2.40 mmol,68.2%)。LC-MS (ES, m/z): 831 (M+H) +
步驟2:向三氟甲烷磺酸[(3R,4S,5R)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(2.0 g,2.40 mmol)於THF (20 mL)之溶液中添加TEA (2.4 g,24.08 mmol)。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌2 h。向以上混合物中添加LiI (946.0 mg,7.07 mmol)且將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。向所得混合物中添加NaOH (182.0 mg,4.55 mmol)於水(2 mL)中之溶液。將所得混合物在室溫下再攪拌3 h且用水(20 mL)稀釋。用EtOAc (3 x 50 mL)萃取所得溶液。將有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之5-氟基-1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(羥甲基)-5-(碘甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.2 g,1.77 mmol,73.6%)。LC-MS (ES, m/z): 677 (M+H +)。 步驟3:向5-氟基-1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(羥甲基)-5-(碘甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.2 g,1.77 mmol)於DMF (12 mL)之溶液中添加imid (301.0 mg,4.43 mmol)。隨後在0℃,氮氣氛圍下分批添加TBSCl (401.0 mg,2.66 mmol)。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌2 h,然後藉由添加水來淬滅。用EtOAc (3x50 ml)萃取所得混合物。將合併之有機層用鹽水洗滌,且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (2:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-(碘甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(810.0 mg,1.01 mmol,57.03%)。LC-MS (ES, m/z): 791 (M+H) +
步驟4:在氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-(碘甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(800.0 mg,1.01 mmol)於CH 3CN (10 mL)之溶液中添加DMAP (370.0 mg,3.03 mmol)及TEA (307.1 mg,3.04 mmol)。隨後在室溫下分批添加2,4,6-參(丙-2-基)苯-1-磺醯氯(919.0 mg,3.03 mmol)。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌4 h。向以上混合物中逐滴添加NH 3.H 2O (10 mL)。將所得混合物在室溫下再攪拌1 h且在減壓下濃縮。藉由用PE/EtOAc (2:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之4-胺基-4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-3-氟基-5-(碘甲基)-4-((4-甲氧基苯基)二苯基-甲氧基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮(705.0 mg,0.88 mmol,87.61%)。LC-MS (ES, m/z): 790 (M+H) +
步驟5:在室溫,氮氣氛圍下將4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-(碘甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(700.0 mg,0.88 mmol)於AcOH(15 mL,80%於水中)中之溶液攪拌隔夜。藉由在0℃下添加冰-水來淬滅反應。用EtOAc (3x50 ml)萃取所得混合物。將合併之有機層用飽和NaHCO 3水溶液洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (50:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-4-羥基-5-(碘甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(405.0 mg,0.77 mmol,87.22%)。LC-MS-ROF (ES, m/z): 518 (M+H +)。 步驟6:向4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-4-羥基-5-(碘甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(400.0 mg,0.77 mmol)於MeOH (4 mL)之溶液中添加NH 4F (800.0 mg,21.60 mmol)。將反應混合物在60℃下攪拌隔夜。將所得混合物冷卻至室溫且在減壓下濃縮。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物:管柱:XBridge Prep OBD C18管柱,30*150 mm,5μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在7 min內5% B至15% B;波長:254/220 nm。將含有產物之級分合併且部分蒸發以移除溶劑,然後冷凍乾燥隔夜,得到呈白色固體之4-胺基-5-氟基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)-5-(碘甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮 4(51.0 mg,0.13 mmol,15.92%)。LC-MS (ES, m/z): 404 (M+H +)。97.3%純度。HPLC之條件:(管柱:Shim‐pack Scepter C18,33*3 mm,3.0 μm;流動相A:水/5mM NH 4HCO 3,流動相B:乙腈;流率:1.5000 mL/min;梯度:在1.20 min內10% B至95% B,在0.60 min內95% B至95% B,在0.02 min內95% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):0.495。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 7.92 (d, J= 6.8 Hz, 1H), 7.88 (brs, 1H), 7.64 (brs, 1H), 6.21 – 6.20 (m, 1H), 6.18 – 6.14 (m, 1H), 5.45 (t, J= 5.2 Hz, 1H), 5.29 (t, J= 4.4 Hz, 0.5H), 5.16 (t, J= 4.4 Hz, 0.5H), 4.47 – 4.40 (m, 1H), 3.73 – 3.70 (m, 1H), 3.59 – 3.52 (m, 2H), 3.34 – 3.32 (m, 1H)。 實例 74- 化合物 139 4- 胺基 -1-[(2R,3S,4R,5R)-5-( 胺基甲基 )-3- 氟基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 氧雜環戊烷 -2- ]-5- 氟基嘧啶 -2- 酮之合成
步驟1:在-30℃,氮氣氛圍下向5-氟基-1-[(2R,3S,4R)-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(3.0 g,5.30 mmol)於吡啶(30 mL)之攪拌溶液中逐滴添加三氟甲酸酐(3.7 g,13.24 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌2 h,且藉由在0℃下添加飽和NaHCO 3水溶液(300 mL)來淬滅。用EtOAc (2 x300 mL)萃取所得混合物。將合併之有機層用鹽水(2x300 mL)洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈棕色固體之三氟甲烷磺酸[(3R,4S,5R)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(3.1 g,3.73 mmol,68.2%)。LC-MS (ES, m/z): 831 (M+H +)。
步驟2:在0℃,氮氣氛圍下向三氟甲烷磺酸[(3R,4S,5R)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(3.0 g,3.61 mmol)於DMF (30 mL)之攪拌溶液中分批添加NaH (152.2 mg,60%於礦物油中,3.97 mmol)。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌2 h。向以上混合物中添加疊氮基鈉(1.2 g,17.63 mmol)且將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。隨後添加NaOH水溶液(3.5 mL,2M)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。將所得混合物用EtOAc (300 mL)稀釋。將所得溶液用鹽水(3 x 300 mL)洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(疊氮基甲基)-3-氟基-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.2 g,2.03 mmol,56.2%)。LC-MS (ES, m/z): 592 (M+H +)。
步驟3:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(疊氮基甲基)-3-氟基-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.2 g,2.03 mmol)、AgNO 3(1.0 g,6.08 mmol)及S-三甲基吡啶(740.0 mg,6.08 mmol)於DCM (24 mL)之攪拌溶液中分批添加1-(氯基二苯基甲基)-4-甲氧基苯(1.3 g,4.06 mmol)。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌隔夜且藉由在0℃下添加冰水(150 mL)來淬滅。用CH 2Cl 2(3x100 ml)萃取所得混合物。將合併之有機層用檸檬酸水溶液洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (3:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(疊氮基甲基)-3-氟基-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.3 g,1.51 mmol,74.18%)。LC-MS (ES, m/z): 864 (M+H +)。
步驟4:在室溫下向1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(疊氮基甲基)-3-氟基-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.3 g,1.51 mmol)及DMAP (552.0 mg,4.52 mmol)於CH 3CN (42 mL)之攪拌溶液中分批添加TEA (457.0 mg,4.52 mmol)及TPSCl (1.4 g,4.52 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌2 h。在室溫下向以上混合物中逐滴添加NH 3.H 2O (26.0 mL)。將所得混合物在室溫下再攪拌1 h且在減壓下濃縮。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (30:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(疊氮基甲基)-3-氟基-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(1.0 g,1.16 mmol,77.01%)。LC-MS (ES, m/z): 861(M-H -)。
步驟5:將4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(疊氮基甲基)-3-氟基-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(1.0 g,1.16 mmol)於AcOH (10 mL,80%)中之溶液在室溫下攪拌隔夜。在減壓下濃縮所得混合物。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化殘餘物:C18管柱;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3)及B:CH 3CN;梯度:在15 min內10%至60% B;在254/220 nm下UV偵測。此得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(疊氮基甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(250 mg,0.79 mmol,67.75%)。LC-MS (ES, m/z): 319 (M+H +)。
步驟6:在室溫,氮氣氛圍下向4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(疊氮基甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(250.0 mg,0.79 mmol)於H 2O (0.3 mL)及THF (3 mL)之攪拌溶液中分批添加PPh 3(1236.3 mg,4.72 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌隔夜且在減壓下濃縮。藉由製備型HPLC在以下條件下純化殘餘物:管柱:XBridge Prep Amide OBD管柱,19x150 mm,5μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:25 mL/min;梯度:在7 min內50% B至90% B;波長:254/220 nm。此得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(胺基甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(18.1 mg,0.06 mmol,7.88%)。LC-MS (ES, m/z): 293 (M+H +)。98.9%純度。 1H NMR (400 MHz, 甲醇- d 4) δ 8.05 (d, J= 6.4 Hz, 1H), 6.34 – 6.29 (m, 1H), 5.25 – 5.24 (m, 0.5H), 5.12 – 5.11 (m, 0.5H), 4.47 – 4.42 (m, 1H), 3.71 (s, 2H), 3.09 (d, J= 14.0 Hz, 1H), 3.00 (d, J= 14.0 Hz, 1H)。 實例 75- 化合物 138 (2R,3R,4S,5R)-5-(4- 胺基 -5- 氟基 -2- 側氧基嘧啶 -1- )-4- 氟基 -3- 羥基 -2-( 羥甲基 ) 氧雜環戊烷 -2- 甲醯胺之合成
步驟1:在0℃下向1-[(2R,3S,4R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(4.0 g,9.79 mmol)及吡啶(8 mL)於DCM (32 mL)之溶液中分批添加1-[氯(4-甲氧基苯基)苯基-甲基]-4-甲氧基苯(4.0 g,11.75 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜,然後藉由添加水(50 mL)來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌,且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-[(2R,3S,4R,5S)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(5.5 g,7.73 mmol,79.01%)。LC-MS (ES, m/z): 711 (M+H +)。
步驟2:向1-[(2R,3S,4R,5S)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(5.5 g,7.73 mmol)於DMF (55 mL)之溶液中添加imid (1.6 g,23.21 mmol)。隨後在0℃下逐滴添加TBSCl (1.8 g,11.60 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌3 h,然後藉由在0℃下添加飽和NaHCO 3(水溶液)來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。此得到呈淡黃色固體之粗[(2R,3S,4R,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(6.0 g,7.27 mmol,93.98%)。LC-MS (ES, m/z): 823 (M-H -)。
步驟3:在室溫,氮氣氛圍下將1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(6.0 g,7.27 mmol)於AcOH (60 mL,80%於水中)中之溶液攪拌隔夜。將反應混合物在減壓下濃縮。用水稀釋殘餘物且用飽和NaHCO 3(水溶液)調節至pH 7。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (2:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色油狀物之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(2.8 g,5.35 mmol,73.66%)。LC-MS (ES, m/z): 523 (M+H +)。
步驟4:向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(2.8 g,5.35 mmol)於ACN (28 mL)之溶液中添加IBX (3.0 g,10.71 mmol)。在80℃,氮氣氛圍下將所得溶液攪拌3 h。將所得混合物冷卻至室溫且過濾,用乙腈洗滌濾餅。將合併之濾液在減壓下濃縮。此得到呈淡黃色油狀物之粗(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(2.6 g,4.99 mmol)。(ES, m/z): 521 (M+H +)。
步驟5:向(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(2.6 g,4.99 mmol)於吡啶(26 mL)之溶液中添加鹽酸羥胺(0.7 g,9.98 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜且藉由添加水來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-[(羥基亞胺基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.7 g,3.17 mmol,63.55%)。LC-MSPH (ES, m/z): 536 (M+H +)。
步驟6:向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-[(羥基亞胺基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.0 g,1.87 mmol)於Ac 2O (15 mL)之溶液中添加AcONa (612.5 mg,7.46 mmol)。將所得混合物在120℃下攪拌4 h,然後冷卻至室溫且藉由添加水來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲腈(510.0 mg,0.96 mmol,51.74%)。LC-MS (ES, m/z): 518 (M+H +)。
步驟7:在0℃下向(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲腈(500.0 mg,0.96 mmol)於DMSO (5 mL)之溶液中添加K 2CO 3(400.4 mg,2.89 mmol)。將所得混合物在0℃下攪拌20 min。在0℃下向以上混合物中逐滴添加H 2O 2(1.5 mL,30%於水中)。將所得混合物在室溫下再攪拌4 h且藉由添加水來淬滅。用EtOAc萃取所得溶液。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醯胺(310.0 mg,0.56 mmol,57.98%)。LC-MS (ES, m/z): 536 (M+H +)。
步驟8:在0℃下向(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醯胺(300.0 mg,0.56 mmol)、DMAP (273.7 mg,2.24 mmol)及TEA (340.0 mg,3.36 mmol)於ACN (5 mL)之溶液中分批添加2,4,6-三異丙基苯磺醯氯(678.4 mg,2.24 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌4 h。隨後添加NH 3.H 2O (6 mL),然後將混合物在室溫下再攪拌2 h。將所得混合物在真空下濃縮。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之(2R,3R,4S,5R)-5-(4-胺基-5-氟基-2-側氧基嘧啶-1-基)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-氟基氧雜環戊烷-2-甲醯胺(220.0 mg,0.37 mmol,73.47%)。LC-MS (ES, m/z): 535(M+H +)。
步驟9:向(2R,3R,4S,5R)-5-(4-胺基-5-氟基-2-側氧基嘧啶-1-基)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-氟基氧雜環戊烷-2-甲醯胺(180.0 mg,0.33 mmol)於MeOH (5 mL)之溶液中添加NH 4F (409.0 mg,11.05 mmol)。將所得混合物在60℃下攪拌隔夜,然後冷卻至室溫且在減壓下濃縮。將殘餘物溶解於EtOH (20 mL)中。過濾所得混合物,用EtOH洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液。藉由製備型HPLC在以下條件下純化殘餘物:管柱:C18;流動相A:水(10mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:100 mL/min;梯度:在18min內0% B至30%,偵測器:UV 254nm。此得到呈白色固體之(2R,3R,4S,5R)-5-(4-胺基-5-氟基-2-側氧基嘧啶-1-基)-4-氟基-3-羥基-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-甲醯胺(27.9 mg,0.09 mmol,27.06%)。LC-MS (ES, m/z): 307(M+H +) 96.5%純度。HPLC之條件:(管柱:Atlantis T3 3 μm,100*4.6 mm,3.5 μm;流動相A:水/0.05%TFA,流動相B:MeOH;流率:1.2000 mL/min;梯度:在7.99 min內0% B至95% B,在2.00 min內95% B至95% B,在0.5 min內95% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):2.53)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 8.03 (d, J= 7.2, 1H), 7.85 (brs, 1H), 7.60 (brs, 1H), 7.46 (s, 1H), 7.21 (s, 1H), 6.26 – 6.20 (m, 1H), 6.04 (d, J= 4.8 Hz, 1H), 5.22 – 5.19 (m, 1H), 5.02 (t, J= 1.2 Hz, 0.5H), 4.88 (t, J= 1.2 Hz, 0.5H), 4.14 (dd, J= 12.6, 4.0 Hz, 1H), 3.91 (dd, J= 11.8, 6.8 Hz, 1H), 3.55 – 3.52 (m, 1H)。 實例 76- 化合物 135 4- 胺基 -5- 氟基 -1-[(2R,3S,4R,5R)-3- 氟基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 )-5-[( 甲硫烷基 ) 甲基 ] 氧雜環戊烷 -2- ] 嘧啶 -2- 酮之合成
步驟1:在0℃,氮氣氛圍下向5-氟基-1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(12.0 g,45.42 mmol)及imid (15.5 g,227.12 mmol)於DMF (120 mL)之攪拌溶液中分批添加TBSCl (34.2 g,227.12 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌隔夜且藉由在0℃下添加水來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(18 g,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 493 (M+H +)。
步驟2:在室溫下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(18 g,粗品)於MeOH (180 mL)之攪拌溶液中分批添加PPTS (17.9 g,71.04 mmol)。將反應混合物在60℃下攪拌3 h,然後冷卻至室溫且藉由在0℃下添加飽和NaHCO 3(水溶液)來淬滅。用EtOAc萃取所得溶液。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基-二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(11.9 g,31.44 mmol,兩個步驟69.3%產率)。LC-MS (ES, m/z): 379 (M+H +)。
步驟3:在室溫下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(11.9 g,31.44 mmol)於乙腈(120 mL)之攪拌溶液中分批添加IBX (17.6 g,62.89 mmol)。將所得混合物在65℃下攪拌3 h。將所得混合物冷卻至室溫,過濾且用乙腈洗滌濾餅。將合併之濾液在減壓下濃縮,得到呈白色固體之(2S,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(11 g,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 377 (M+H +)。
步驟4:向(2S,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(11 g,粗品)於1,4-二噁烷(110 mL)之溶液中逐滴添加HCHO (22.00 mL,37%於水中)及NaOH (2M,22.1 mL,44.13 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌隔夜。在0℃下向以上混合物中分批添加NaBH 4(4.6 g,122.73 mmol)。將所得混合物在室溫下再攪拌30 min且藉由添加飽和NH 4Cl (水溶液)來淬滅。用EtOAc萃取所得溶液。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (20:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(5.6 g,13.73 mmol,兩個步驟43.6%產率)。LC-MS (ES, m/z): 409 (M+H +)。
步驟5:在-30℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(3.0 g,7.34 mmol)及吡啶(4.7 g,58.75 mmol)於DCM (30 mL)之攪拌溶液中逐滴添加三氟甲酸酐(5.2 g,18.36 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌2 h,且藉由在0℃下添加飽和NaHCO 3(水溶液)來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (5:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之三氟甲烷磺酸[(3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(4.3 g,6.39 mmol,87.05%)。LC-MS-PH-R (ES, m/z): 673 (M+H +)。
步驟6:在氮氣氛圍下向三氟甲烷磺酸[(3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯 (4.3 g,6.39 mmol)於THF (45 mL)之攪拌溶液中添加TEA (6.5 g,63.93 mmol)。在60℃,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌2 h。將反應冷卻至0℃後,在氮氣氛圍下添加(甲基硫烷基)鈉(2.6 g,36.75 mmol)及15-冠醚-5 (1.6 g,7.35 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌隔夜且藉由添加水來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (2:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5-(羥甲基)-5-[(甲基硫烷基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(840.0 mg,1.92 mmol,30.0%)。LC-MS (ES, m/z): 439 (M+H +)。
步驟7:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5-(羥甲基)-5-[(甲基硫烷基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(823.0 mg,1.88 mmol)及imid (447.2 mg,6.57 mmol)於DMF (9 mL)之攪拌溶液中分批添加TBSCl (707.1 mg,4.69 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌3 h且藉由在室溫下添加水來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (3:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色油狀物之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-[(甲基硫烷基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(710.0 mg,1.27 mmol,67.48%)。LC-MS-PH (ES, m/z): 553 (M+H +)。
步驟8:在室溫下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-[(甲基硫烷基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(385.0 mg,0.70 mmol)、DMAP (510.5 mg,4.18 mmol)及TEA (422.8 mg,4.18 mmol)於CH 3CN (16 mL)之攪拌溶液中分批添加2,4,6-參(丙-2-基)苯-1-磺醯氯(1.3 g,4.18 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌5 h。在室溫下向以上混合物中添加NH 3·H 2O (7.7 mL)。將所得混合物在室溫下再攪拌2 h。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC (CH 2Cl 2/MeOH 10:1)純化殘餘物,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-[(甲基硫烷基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-嘧啶-2-酮(264.0 mg,0.48 mmol,68.69%)。LC-MS (ES, m/z): 552 (M+H +)。
步驟9:向4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-[(甲基硫烷基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(264.0 mg,0.48 mmol)於甲醇(3 mL)之溶液中添加NH 4F (1.1 g,28.62 mmol)。將所得溶液在60℃下攪拌43 h。將所得混合物冷卻至室溫且在減壓下濃縮。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物:管柱,XBridge Shield RP18 OBD管柱,30x150 mm,5µm;流動相,水(10 mmol/L NH 4HCO 3+0.1% NH 3·H 2O)及ACN (在7 min內11% ACN直到17%);在254/220 nm下UV偵測。將含有產物之級分合併且部分蒸發以移除溶劑,然後冷凍乾燥隔夜,得到呈白色固體之4-胺基-5-氟基-1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)-5-[(甲基硫烷基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(58.4 mg,0.18 mmol,20.91%)。LC-MS (ES, m/z): 324 (M+H +)。98.8%純度。HPLC之條件:(管柱:Shim‐pack Scepter C18,33*3.0 mm,3.0 μm;流動相A:水/ 5mM NH 4HCO 3,流動相B:乙腈;流率:1.5000 mL/min;梯度:在1.20 min內10% B至95% B,在0.60 min內95% B至95% B,在0.06 min內95% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):0.453)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.08 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.84 (brs, 1H), 7.60 (brs, 1H), 6.23 – 6.19 (m, 1H), 6.02 (d, J= 4.0 Hz, 1H), 5.42 (d, J= 5.2 Hz, 1H), 5.31 (t, J= 4.4 Hz, 0.5H), 5.17 (t, J= 4.4 Hz, 0.5H), 4.41 – 4.35 (m, 1H), 3.69 – 3.66 (m, 1H), 3.53 – 3.50 (m, 1H), 2.85 – 2.82 (m, 1H), 2.59 – 2.55 (m, 1H), 2.08 (s, 3H)。 實例 77- 化合物 163 1-[(2R,3S,4R,5R)-5-( 氯甲基 )-3- 氟基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 氧雜環戊烷 -2- ]-5- 氟基 -3H- 嘧啶 -2,4- 二酮之合成
在室溫、N 2氛圍下將1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(50 mg,0.08 mmol)於AcOH (4 mL)及水(2 mL)中之溶液攪拌隔夜。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(管柱:XBridge Shield RP18 OBD管柱,30*150 mm,5 μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3+0.1% NH 3.H 2O),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在9 min內5% B至8% B,波長:254/210 nm;RT1(min):8.75)。收集級分且在真空下濃縮,將殘餘物再溶解於CH 3CN及H 2O中,然後冷凍乾燥,得到呈灰白色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(20.3 mg,65 μmol,72.1%)。LC-MS (ES, m/z): 313/315 [M+H] +, 95.1%純度。LCMS之條件:(管柱:Atlantis T3 3 μm 4.6*100 mm;流動相A:H 2O+0.1% TFA,流動相B:ACN + 0.1% TFA;流率:1.20 mL/min;梯度:在8 min內0% B至95% B,在2 min內95% B至95% B,在0.5 min內95% B至10% B;波長:254; RT1(min):3.38)。 1H NMR (400 MHz, 甲醇- d 4 ) δ 8.04 (dd, J= 6.7, 2.1 Hz, 1H), 6.37 (ddd, J= 14.6, 4.4, 1.6 Hz, 1H), 5.24 (dt, J= 53.3, 4.0 Hz, 1H), 4.54 (dd, J= 19.5, 3.5 Hz, 1H), 3.95 – 3.70 (m, 4H)。 實例 78- 化合物 162 5- 氟基 -1-[(2R,3S,4R,5S)-3- 氟基 -4- 羥基 -5-(1- 羥乙基 )-5-( 羥甲基 ) 氧雜環戊烷 -2- ]-3H- 嘧啶 -2,4- 二酮之合成
步驟1:在室溫下向5-氟基-1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(11.0 g,41.6 mmol)及咪唑(14.2 g,208 mmol)於DMF (150 mL)之攪拌溶液中添加三級丁基二甲基氯矽烷(7.53 g,49.9 mmol)。然後將反應在室溫下攪拌4 h。將反應混合物倒入水(300 mL)中,且用EtOAc (3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (4:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-5-([(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基-3-氟基-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(11.2 g,29.6 mmol,71.08%)。LC-MS (ES, m/z): 379 [M+H] +
步驟2:在室溫下向1-[(2R,3S,4R,5R)-5-([(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基-3-氟基-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(11.2 g,29.6 mmol)及2,4,6-三甲基吡啶(7.17 g,59.2 mmol)於DCM (100 mL)之攪拌溶液中添加1-(氯基二苯基甲基)-4-甲氧基苯(18.3 g,59.2 mmol)。然後將反應在室溫下攪拌隔夜。將所得混合物倒入水(100 mL)中,且用DCM (3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液,得到1-[(2R,3S,4R,5R)-5-([(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基-3-氟基-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(15.0 g,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 651 [M+H] +
步驟3:在室溫下向1-[(2R,3S,4R,5R)-5-([(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基-3-氟基-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(15.0 g,粗品)於MeOH (150 mL)之攪拌溶液中添加NH 4F (4.27 g,115 mmol)。將所得混合物在60℃下攪拌隔夜。使反應混合物冷卻至室溫,用水(500 mL)稀釋且用EtOAc (3 x 300 mL)萃取。將合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (3:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之5-氟基-1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(11.3 g,21.1 mmol,兩個步驟71.2%產率)。LC-MS (ES, m/z): 537 [M+H] +
步驟4:在室溫下向5-氟基-1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(6.00 g,11.2 mmol)於MeCN (60.0 mL)之攪拌溶液中添加IBX (3.76 g,13.4 mmol)。將反應在75℃下攪拌1 h。使所得混合物冷卻至室溫,過濾且用MeCN洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液,得到(2S,3R,4S,5R)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-甲醛(6.00 g,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 535 [M+H] +
步驟5:在室溫下向(2S,3R,4S,5R)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-甲醛(6.00 g,粗品)及福馬林(6.00 mL,37%)於1,4-二噁烷(60.0 mL)之攪拌溶液中添加NaOH於H 2O (12.0 mL,24.0 mmol,2N)中之溶液。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。向以上混合物中添加EtOH (20.0 mL),隨後在0℃下分批添加NaBH 4(1.27 g,33.7 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌4 h,然後冷卻至0℃且藉由添加飽和NH 4Cl水溶液來淬滅。將所得溶液用EtOAc (3 x 200 mL)萃取,用鹽水(2 x 300 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且在真空下濃縮。藉由用PE/EA (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之5-氟基-1-[(2R,3S,4R)-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(2.10 g,3.71 mmol,兩個步驟33.02%產率)。LC-MS (ES, m/z): 567 [M+H] +
步驟6:在室溫下向5-氟基-1-[(2R,3S,4R)-3-氟基-5,5-雙(羥基-甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(2.10 g,3.71 mmol)於吡啶(25.0 mL)之攪拌溶液中添加TBSCl (670 mg,4.45 mmol)。將反應在室溫下攪拌4 h。藉由水(100 mL)來淬滅反應混合物且用EtOAc (3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (3:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4R,5S)-5-([(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基-3-氟基-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(480 mg,0.71 mmol,19.02%)及呈白色固體之1-((2R,3S,4R,5R)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-3-氟基-5-(羥甲基)-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(480 mg,0.71 mmol,19.02%)。LC-MS (ES, m/z): 681 [M+H] +及LC-MS (ES, m/z): 681 [M+H] +
步驟7:在室溫下向1-[(2R,3S,4R,5S)-5-([(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基-3-氟基-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(480 mg,0.71 mmol)及2,4,6-三甲基吡啶(256 mg,2.11 mmol)於DCM (5.00 mL)之攪拌溶液中添加1-(氯基二苯基甲基)-4-甲氧基苯(653 mg,2.11 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。藉由水(10 mL)來稀釋反應混合物且用DCM (3 x 10 mL)萃取。將合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液,得到1-[(2R,3S,4R,5S)-5-([(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基-3-氟基-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-([(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]甲基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(600 mg,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS-PH (ES, m/z): 953 [M+H] +
步驟8:在室溫下向1-[(2R,3S,4R,5S)-5-([(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基-3-氟基-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-([(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]甲基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(600 mg,粗品)於MeOH (10.0 mL)之攪拌溶液中添加NH 4F (233 mg,6.29 mmol)。在60℃,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌隔夜。使反應混合物冷卻至室溫,然後藉由水(30 mL)來稀釋,且用DCM (3 x 30 mL)萃取。將合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (2:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之5-氟基-1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-([(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]甲基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(450 mg,0.5 mmol,兩個步驟75.9%產率)。LC-MS-PH (ES, m/z): 839 [M+H] +
步驟9:在室溫下向5-氟基-1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-([(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]甲基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(200 mg,0.24 mmol)於MeCN (2.00 mL)之攪拌溶液中添加IBX (100 mg,0.36 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌2 h。過濾所得混合物且用MeCN洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液,得到(2R,3R,4S,5R)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-2-([(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]甲基氧雜環戊烷-2-甲醛(180 mg,粗品)。所得混合物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 837 [M+H] +
步驟10:在-78℃,氮氣氛圍下向(2R,3R,4S,5R)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-2-([(4-甲氧基苯基)二苯基-甲氧基]甲基氧雜環戊烷-2-甲醛(180 mg,0.22 mmol)於THF (3.00 mL)之攪拌溶液中逐滴添加溴(甲基)鎂於THF (0.9 mL,0.90 mmol,1M)中之溶液。在-78℃,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌1 h。藉由水(10 mL)來淬滅反應混合物且用EtOAc (3 x 10 mL)萃取。將合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液,得到5-氟基-1-[(2R,3S,4R,5S)-3-氟基-5-(1-羥乙基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-([(4-甲氧基苯基)二苯基-甲氧基]甲基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(100 mg,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 853 [M+H] +
步驟11:在室溫下向5-氟基-1-[(2R,3S,4R,5S)-3-氟基-5-(1-羥乙基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-([(4-甲氧基苯基)二苯基-甲氧基]甲基氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(100 mg,粗品)於AcOH (0.80 mL)之攪拌溶液中添加H 2O (0.20 mL)。將所得混合物在60℃下攪拌隔夜。將所得混合物在真空下濃縮。藉由逆相層析法在以下條件下純化殘餘物(管柱:X-Select Prep OBD C18管柱,30 x 150 mm,5μm;流動相A:水(0.1% FA),流動相B:ACN;流率:60 mL/min mL/min;梯度:在7 min內30% B至50% B;波長:254nm/220nm nm)。收集含有產物之級分且在真空下濃縮以移除大部分溶劑,然後冷凍乾燥,得到呈白色固體之5-氟基-1-[(2R,3S,4R,5S)-3-氟基-4-羥基-5-(1-羥乙基)-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(6.4 mg,0.02 mmol,三個步驟8.7%產率)。LC-MS (ES, m/z): 309 [M+H] +, 99.08%純度。HPLC之條件:(管柱:X‐bridge RP18 3.5 μm,100 x 4.6 mm,2.2 μm;流動相A:水/5mM NH 4HCO 3,流動相B:MeOH;流率:1.00 mL/min;梯度:在6.00 min內0% B至60% B,在2.00 min內60% B至95% B,在1.5 min內保持95%,在0.2 min內95% B至0% B;波長:254 nm;RT1(min):2.83, RT2(min):3.04)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.20 (s, 1H), 8.31 – 8.25 (m, 1H), 6.30 – 6.25 (m, 1H), 5.95 – 5.80 (m, 1H), 5.61 – 5.23 (m, 2H), 4.96 – 4.92 (m, 1H), 4.73 – 4.41 (m, 1H), 3.82 – 3.76 (m, 1H), 3.66 – 3.45 (m, 2H), 1.18 – 0.99 (m, 3H)。 實例 79- 化合物 137 4- 胺基 -1-[(2R,3S,4R,5R)-3- 氯基 -5-( 氯甲基 )-4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 氧雜環戊烷 -2- ]-5- 氟基嘧啶 -2- 酮之合成
步驟1:在0℃下向苯甲酸[(2R,3S,4R,5R)-3,5-雙(苄醯氧基)-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]甲酯(80.0 g,0.17 mol)於DCM (400 mL)之溶液中添加吡啶(41.1 g,5.19 mol)。在0℃下攪拌15 min後,在0℃下向以上混合物中添加Tf 2O (58.6 g,0.21 mol)。在0℃下再攪拌45 min後,用DCM (200 mL)稀釋所得混合物。將所得混合物用飽和NaHCO 3水溶液(3 x 400 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。用NMP (400 mL)稀釋殘餘物,然後在室溫下將LiCl (36.7 g,0.87 mol)添加至以上混合物中。在室溫下攪拌隔夜後,用水(1L)稀釋所得混合物。將所得混合物用EtOAc (3 x 1.0 L)萃取且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (5:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色油狀物之苯甲酸[(2R,3R,4S,5R)-3,5-雙(苄醯氧基)-4-氯基氧雜環戊烷-2-基]甲酯(64.0 g,0.13 mol,76.9%)。LC-MS (ES, m/z): 359/361 [M-OBz] +
步驟2:向苯甲酸[(2R,3R,4S,5R)-3,5-雙(苄醯氧基)-4-氯基氧雜環戊烷-2-基]甲酯(64.0 g,0.13 mol)於DCM (640 mL)之溶液中添加HBr於AcOH (220 mL,33%)中之溶液,在冰/水浴中冷卻。在室溫下攪拌隔夜後,將所得混合物用水(2 x 300 mL)及飽和NaHCO 3水溶液(2 x 300 mL)洗滌,且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在真空下濃縮所得混合物,得到呈黃色油狀物之苯甲酸[(2R,3R,4S,5R)-3-(苄醯氧基)-5-溴基-4-氯基氧雜環戊烷-2-基]甲酯(64.0 g,粗品)。(ES, m/z): 439/441[M-H] +
步驟3:在室溫下向氟尿嘧啶(28.4 g,0.22 mol)於HMDS (100 mL)之溶液中添加TMSCl (15.8 g,0.15 mol)。在120℃下攪拌4 h後,將所得混合物冷卻至室溫,然後在真空下濃縮。向殘餘物中添加苯甲酸[(2R,3R,4S,5R)-3-(苄醯氧基)-5-溴基-4-氯基氧雜環戊烷-2-基]甲酯(64.0 g,粗品)於CHCl 3(640 mL)中之溶液。在60℃下攪拌隔夜後,使混合物冷卻至室溫且藉由在0℃下添加MeOH (20 mL)來淬滅。在減壓下濃縮所得混合物。將殘餘物用ACN/水(1:10)及MeOH研磨純化,過濾,將收集之固體在空氣中乾燥,得到呈白色固體之苯甲酸[(2R,3R,4S,5R)-3-(苄醯氧基)-4-氯基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-基]甲酯(50.0 g,0.10 mol,兩個步驟78.8%產率)。LC-MS (ES, m/z): 489/491[M+H] +
步驟4:向苯甲酸[(2R,3R,4S,5R)-3-(苄醯氧基)-4-氯基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-基]甲酯(50.0 g,0.10 mol)於MeOH (100 mL)之混合物中添加NaOH (8.20 g,205 mmol)。在室溫下攪拌1 h後,過濾所得混合物且在減壓下濃縮濾液。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氯基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(20.0 g,0.7 mol 69.7%)。LC-MS (ES, m/z): 281/283[M+H] +
步驟5:向1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氯基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(20.0 g,0.07 mol)於DMF (200 mL)之混合物中添加咪唑(97.0 g,714 mmol)及TBSCl (16.1 g,107 mmol)。在室溫下攪拌30 min後。在0℃下用MeOH (50.0 mL)淬滅反應。將所得混合物用水(400 mL)稀釋。用EtOAc (3 x 300 mL)萃取所得混合物。將合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氯基-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(20.0 g,50.7 mmol,71.1%)。LC-MS (ES, m/z): 395/397 [M+H] +
步驟6:在室溫下將1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氯基-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(14.0 g,35.5 mmol)、1-(氯基二苯基甲基)-4-甲氧基苯(32.8 g,106 mmol)、AgNO 3(6.00 g,35.5 mmol)及2,4,6-三甲基吡啶(8.60 g,70.9 mmol)於DCM (140 mL)中之混合物攪拌4 h。過濾所得混合物且用DCM洗滌濾餅。將所得混合物用水(200 mL)稀釋且用DCM (3 x 200 mL)萃取。將合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液,得到呈淡黃色油狀物之1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氯基-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(25.0 g粗品)。LC-MS (ES, m/z): 667/669 [M+H] +
步驟7:在60℃下將1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氯基-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(25.0 g,粗品)及NH 4F (8.00 g,216 mmol)於MeOH (250 mL)中之混合物攪拌隔夜。使混合物冷卻至室溫,過濾且用MeOH洗滌濾餅。將合併之有機層在減壓下濃縮以移除大部分溶劑,然後藉由用DCM/MeOH (10/1)溶析之矽膠層析法純化,得到呈淡黃色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氯基-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基-甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(13.0 g,23.5 mmol,兩個步驟66.2%產率)。LC-MS (ES, m/z): 553/555 [M+H] +。 步驟8:在室溫下向1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氯基-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基) 二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(4.00 g,7.24 mmol)於ACN (40.0 mL)之混合物中添加IBX (2.60 g,9.28 mmol)。在75℃下攪拌2 h後,過濾所得混合物且用MeCN洗滌濾餅。在真空下濃縮濾液,得到呈黃色油狀物之(2S,3R,4S,5R)-4-氯基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-甲醛(4.00 g,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 551/553[M+H] +
步驟9:向(2S,3R,4S,5R)-4-氯基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-甲醛(4.00 g,粗品)於二噁烷(40.0 mL)之溶液中添加NaOH (0.88 g,22.0 mmol)及多聚甲醛(0.88 g,29.3 mmol)。將所得混合物用氮氣脫氣三次,然後在室溫,氮氣氛圍下攪拌隔夜。在0℃下經5 min向以上混合物中分批添加NaBH 4(1.64 g,43.3 mmol)。將所得混合物在室溫下再攪拌1 h。藉由在0℃下添加飽和NH 4Cl水溶液(20 mL)來淬滅反應。用EtOAc (3 x 20 mL)萃取所得混合物。將合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4R)-3-氯基-5,5-雙(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(2.00 g,3.43 mmol,兩個步驟47.2%產率)。LC-MS (ES, m/z): 583/585[M+H] +
步驟10:在0℃下向1-[(2R,3S,4R)-3-氯基-5,5-雙(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基) 二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(2.00 g,3.43 mmol)及吡啶(0.54 g,6.86 mmol)於DCM (20.0 mL)之溶液中添加Tf 2O (2.42 g,8.57 mmol)。在室溫下攪拌2 h後,將所得混合物用水(20 mL)稀釋。將所得混合物用DCM (3 x 40 mL)萃取。將合併之有機層經Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液,得到呈淡黃色油狀物之三氟甲烷磺酸[(3R,4S,5R)-4-氯基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-2-[(三氟甲烷-磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(2.00 g,2.36 mmol,68.8%)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 847/849[M+H] +
步驟11:在室溫下向三氟甲烷磺酸[(3R,4S,5R)-4-氯基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-2-[(三氟甲磺醯氧基)甲基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(2.00 g,2.36 mmol)於THF (20.0 mL)之混合物中逐滴添加TEA (2.39 g,23.6 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌3 h。向以上混合物中添加LiCl (0.50 g,11.8 mmol)且將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。向所得混合物中添加NaOH (0.19 g,4.72 mmol)於水(2.00 mL)中之溶液。將所得混合物在室溫下再攪拌3 h。將所得混合物用水(20 mL)稀釋,然後用EtOAc (3 x 50 mL)萃取。將有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EA (1:1)溶析之矽膠層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色油狀物之1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氯基-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.00 g,1.66 mmol,69.4%)。LC-MS (ES, m/z): 601/603[M+H] +
步驟12:將1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氯基-5-(氯甲基)-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.00 g,1.66 mmol)、AgNO 3(0.28 g,1.66 mmol)及2,4,6-三甲基吡啶(0.40 g,3.32 mmol)於DCM (20.0 mL)中之混合物在室溫下攪拌2 h。將混合物過濾且用DCM (10 mL)洗滌。在真空下濃縮濾液。藉由用PE/EA (1:1)溶析之矽膠層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色油狀物之1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氯基-5-(氯甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-{[(4-甲氧基苯基)二苯基-甲氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.00 g,1.14 mmol,67.4%)。LC-MS (ES, m/z): 873/875[M+H] +
步驟13:在室溫下向1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氯基-5-(氯甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.00 g,1.14 mmol)於MeCN (10.0 mL)之攪拌混合物中添加DMAP (0.28 g,2.28 mmol)及TEA (0.35 g,3.42 mmol)。在室溫下攪拌10 min後,添加2,4,6-參(丙-2-基)苯-1-磺醯氯(0.69 g,2.28 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌12 h,且用氨(1.00 mL,30%)逐滴處理。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜,然後藉由添加水(10 mL)來淬滅。將所得混合物用EtOAc (3 x 20 mL)萃取,用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且在真空下濃縮。藉由用PE/EA (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氯基-5-(氯甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(0.4 g,0.46 mmol,41.7%)。LC-MS (ES, m/z): 872/874 [M+H] +
步驟14:將4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氯基-5-(氯甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]-5-{[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]甲基}氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(0.40 g,0.46 mmol)於AcOH (4.00 mL)/THF (1.00 mL)中之溶液在60℃下攪拌12 h。使混合物冷卻至室溫且在真空下濃縮。藉由製備型HPLC在以下條件下純化殘餘物:管柱:XBridge Shield RP18 OBD管柱,30 x150 mm,5 μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3+ 0.1% NH 3.H 2O),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在9 min內11%至16% B,16% B;波長:254/210 nm。將含有產物之級分合併且部分蒸發以移除溶劑,然後冷凍乾燥隔夜,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氯基-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(34.9 mg,0.11 mmol,23.0%)。LC-MS (ES, m/z): 328/330 [M+H] +。99.2%純度。LCMS之條件:(管柱:HALO C18, 30 x 3.0 mm;2.0 μm;流動相A:水/0.05% TFA,流動相B:ACN/0.05% TFA;流率:1.50 mL/min;梯度:在1.2 min內5% B至95% B,在0.6 min內95% B至95% B,在0.02 min內95% B至5% B;波長:254 nm;RT1(min):0.524)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 8.11 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.87 (br s, 1H), 7.75 (br s, 1H), 6.34 – 6.29 (m, 2H), 5.59 (t, J= 5.2 Hz, 1H), 4.80 (t, J= 6.4 Hz, 1H), 4.46 – 4.45 (m, 1H), 3.97 (d, J= 12.0 Hz, 1H), 3.79 – 3.74 (m, 1H), 3.73 (d, J= 13.6 Hz, 1H), 3.58 – 3.33 (m, 1H)。 實例 80- 化合物 122 4- 胺基 -1-[(2R,3S,4R,5R)-5- 環丙基 -3- 氟基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 氧雜環戊烷 -2- ]-5- 氟基嘧啶 -2- 酮之合成
步驟1:在室溫,N 2氛圍下向1-[(2R,3S,4R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(6.0 g,14.61 mmol)於吡啶(60 mL)之溶液中分批添加DMTrCl (6.4 g,18.99 mmol)。將混合物在室溫下攪拌隔夜。所得混合物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 711 [M+H] +
步驟2:在室溫,N 2氛圍下向以上溶液中分批添加TBSCl (3.8 g,25.35 mmol)。將混合物在室溫下攪拌隔夜。將所得混合物用水稀釋且用EtOAc (3 x 250 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。粗產物(12 g)未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 825 [M+H] +
步驟3:在室溫,N 2氛圍下將1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(12.0 g,14.5 mmol)於AcOH (96 mL)及水(24 mL)中之溶液攪拌隔夜。將所得混合物在真空下濃縮。藉由用DCM/MeOH (20:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(4.5 g,8.6 mmol,59.2%)。LC-MS (ES, m/z): 523 [M+H] +
步驟4:在60℃,N 2氛圍下將1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(4.5 g,8.6 mmol)及IBX (7.2 g,25.81 mmol)於ACN (45 mL)中之混合物攪拌2 h。將所得混合物冷卻至室溫且過濾;用ACN (3 x 45 mL)洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液。粗產物(4.5 g,粗品)未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 521 [M+H] +
步驟5:在-78℃,N 2氛圍下向甲基三苯基溴化鏻(9.2 g,25.91 mmol)於THF(45 mL)之攪拌溶液中逐滴添加n-BuLi (10 mL,25.9 mmol,2.5 M於己烷中)。在-50℃,N 2氛圍下將所得混合物攪拌2 h。在-50℃,N 2氛圍下向以上混合物中添加含(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基-二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(4.5 g,8.64 mmol)之THF (15 mL)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。將所得混合物用冰水淬滅且用EtOAc (3 x 150 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用DCM/MeOH (20:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(2.6 g,5.01 mmol,58%)。LC-MS (ES, m/z): 519 [M+H] +
步驟6:在室溫,N 2氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(2.6 g,5.01 mmol)、DMAP (612 mg,5.01 mmol)及TEA (1.5 g,15.03 mmol)於DCM (25 mL)之攪拌溶液中逐滴添加苯甲醯氯(1 g,7.52 mmol)。將所得混合物攪拌隔夜。將混合物用水淬滅且用DCM (3 x 150 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用DCM/MeOH (20:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之3-苯甲醯基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2,4-二酮(2.1 g,3.21 mmol,67.3%)。LC-MS (ES, m/z): 623 [M+H] +
步驟7:在室溫,N 2氛圍下向3-苯甲醯基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2,4-二酮(720 mg,1.16 mmol)及Pd(OAc) 2(25 mg,0.11 mmol)於DCM (10 mL)之攪拌混合物中逐滴添加CH 2N 2.Et 2O溶液(60 mL)。在室溫,N 2氛圍下將所得混合物攪拌隔夜。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型TLC (DCM/MeOH 20:1)純化殘餘物,得到呈白色固體之3-苯甲醯基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-環丙基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2,4-二酮(620 mg,0.97 mmol,84.2%)。LC-MS (ES, m/z): 637 [M+H] +
步驟8:向NH 3(g)於MeOH(10 mL,7 M)之溶液中添加3-苯甲醯基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-環丙基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2,4-二酮(620 mg,0.97 mmol)。在室溫,N 2氛圍下將混合物攪拌隔夜。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型TLC (DCM/MeOH 20:1)純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-環丙基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(440 mg,0.83 mmol,84.8%)。LC-MS (ES, m/z): 533 [M+H] +
步驟9:將1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-環丙基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(440 mg,0.83 mmol)、DMAP (201 mg,1.66 mmol)及TEA (167 mg,1.66 mmol)於ACN (5 mL)中之溶液用2,4,6-TPSCl (500 mg,1.66 mmol)處理且在室溫,N 2氛圍下攪拌2 h,隨後在室溫下添加濃氫氧化銨(2 mL)。在室溫,N 2氛圍下將所得混合物攪拌30 min。將所得混合物用水稀釋且用EtOAc (3 x 50 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC (DCM/MeOH 10:1)純化殘餘物,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-環丙基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(430 mg,0.81 mmol,97.9%)。LC-MS (ES, m/z): 532 [M+H] +
步驟10:在60℃,N 2氛圍下將4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-環丙基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(430 mg,0.81 mmol)及NH 4F (703 mg,20.25 mmol)於MeOH (20 mL)中之混合物攪拌2天。將所得混合物冷卻至室溫且在減壓下濃縮。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(管柱:XBridge Shield RP18 OBD管柱,30*150 mm,5 μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3+0.1% NH 3.H 2O),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在9 min內13% B至18% B;波長:254/210 nm;RT1(min):8.55)。收集級分且在真空下濃縮,將殘餘物再溶解於CH 3CN及H 2O且冷凍乾燥,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-環丙基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(53.8 mg,0.18 mmol,21.9%)。LC-MS (ES, m/z): 304 [M+H] +, 99.9%純度。LCMS之條件:(管柱:Shim‐pack Scepter C18, 33*3.0 mm;流動相A:水/5 mM NH 4HCO 3,流動相B:乙腈;流率:1.50 mL/min;梯度:在1.70 min內10% B至40% B,在2.30 min內40% B至95% B,在2.80 min內95% B至95% B,在2.83 min內95% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):0.572)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 8.35 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 7.69 (d, J= 91.9 Hz, 2H), 6.06 (td, J= 6.0, 1.9 Hz, 1H), 5.94 (d, J= 4.9 Hz, 1H), 5.55 (t, J= 4.8 Hz, 1H), 5.18 (dt, J= 54.6, 6.3 Hz, 1H), 4.49 (dt, J= 23.1, 5.5 Hz, 1H), 3.62 – 3.44 (m, 2H), 1.06 – 0.94 (m, 1H), 0.49 – 0.17 (m, 4H)。 實例 81- 化合物 131 4- 胺基 -1-[(2R,3S,4R,5R)-5(E)-(2- 氯乙烯基 )-3- 氟基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 氧雜環戊烷 -2- ]-5- 氟基嘧啶 -2- 酮之合成
步驟1:在0℃,氮氣氛圍下向5-氟基-1-[(2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-3H-嘧啶-2,4-二酮(25.0 g,94.63 mmol)及imid (32.2 g,473.16 mmol)於DMF (250 mL)之攪拌溶液中分批添加三級丁基二甲基氯矽烷(71.3 g,473.16 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌3 h且藉由在0℃下添加水來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(36.0 g,73.17 mmol,77.2%)。LC-MS (ES, m/z): 493 (M+H) +
步驟2:在室溫下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(34.0 g,69.01 mmol)於MeOH (340 mL)之攪拌溶液中添加PPTS (34.7 g,138.01 mmol)。將所得混合物在60℃下攪拌3 h,然後冷卻至0℃溫度且藉由在0℃下添加飽和NaHCO 3(水溶液)來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (5:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(22.0 g,58.13 mmol,84.2%)。LC-MS (ES, m/z): 379 (M+H) +
步驟3:在室溫下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(22.0 g,58.13 mmol)於ACN (220 mL)之攪拌溶液中添加IBX (32.6 g,116.26 mmol)。將所得混合物在80℃下攪拌5 h。將所得混合物冷卻至室溫且過濾,用乙腈洗滌濾餅。將合併之濾液在減壓下濃縮。此得到呈白色固體之(2S,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(20.6 g,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 377 (M+H) +
步驟4:向(2S,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(20.6 g,粗品)於1,4-二噁烷(200 mL)之溶液中添加HCHO (41.0 mL,37%於水中)及NaOH (水溶液)(2M,41.0 mL,82.00 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌隔夜。在0℃下向以上混合物中分批添加NaBH 4(8.7 g,229.84 mmol)。將所得混合物在室溫下再攪拌30 min且藉由在0℃下添加飽和NH 4Cl水溶液來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (20:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-[(2R,3S,4R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(11.5 g,28.19 mmol,兩個步驟31.3%產率)。LC-MS (ES, m/z): 409 (M+H) +
步驟5:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(6.0 g,14.69 mmol)於吡啶(48 mL)及DCM (12 mL)之攪拌溶液中分批添加DMTrCl (5.5 g,16.16 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌隔夜且藉由在室溫下添加MeOH來淬滅。在減壓下濃縮所得混合物。將殘餘物用水(100 mL)稀釋且用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (3:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-[(2R,3S,4R,5S)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(8.0 g,11.27 mmol,76.6%)。LC-MS (ES, m/z): 711 (M+H) +
步驟6:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5S)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(7.5 g,10.55 mmol)及imid (2.2 g,31.65 mmol)於DMF (80 mL)之攪拌溶液中分批添加TBSCl (3.2 g,21.10 mmo)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌2 h,然後藉由在0℃下添加水來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。此得到呈黃色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(7.6 g,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 825 (M+H) +
步驟7:在室溫下將1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基]甲基}-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(7.6 g,粗品)於AcOH (150 mL,80%於水中)中之溶液攪拌隔夜。在減壓下濃縮混合物且用水稀釋殘餘物。用飽和NaHCO 3(水溶液)將溶液調節至pH 7。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (3:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(3.6 g,6.90 mmol,65.3%產率兩個步驟)。LC-MS (ES, m/z): 523 (M+H) +
步驟8:在室溫下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.5 g,2.87 mmol)於ACN (15 mL)之攪拌溶液中添加IBX (1.0 g,3.73 mmol)。將所得混合物在75℃下攪拌3 h。將所得混合物冷卻至室溫且過濾,用乙腈洗滌濾餅。將合併之濾液在減壓下濃縮。此得到呈白色固體之(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(1.5 g,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC (ES, m/z): 521 (M+H) +
步驟9:在-78℃,氮氣氛圍下向氯(氯甲基)三苯基-λ5-磷烷(2.8 g,8.07 mmol)於THF (20 mL)之攪拌溶液中逐滴添加n-BuLi (2.5M於己烷中,3.8 mL,9.41 mmol)。在-78℃、氮氣氛圍下將所得混合物攪拌50 min。隨後在-78℃,氮氣氛圍下添加(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(1.4 g,粗品)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜且藉由在0℃下添加飽和NH 4Cl (水溶液)來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (3:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(2-氯乙烯基)-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(810.0 mg,1.46 mmol,57.8%)。LC-MS (ES, m/z): 553/555 (M+H) +
步驟10:在室溫下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(2-氯乙烯基)-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(810.0 mg,1.46 mmol)及TEA (445.0 mg,4.39 mmol)於CH 3CN (32 mL)之攪拌溶液中添加DMAP (536.0 mg,4.39 mmol)及2,4,6-參(丙-2-基)苯-1-磺醯氯(2.2 g,7.32 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌2 h。在室溫下向以上混合物中逐滴添加NH 3.H 2O (16.2 mL,415.95 mmol)。將所得混合物在室溫下再攪拌1 h。用HCl水溶液(1M)將混合物中和至pH 7。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(2-氯乙烯基)-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(730.0 mg,1.32 mmol,90.28%)。LC-MS (ES, m/z): 552/554 (M+H) +
步驟11:向4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(2-氯乙烯基)-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(180.0 mg,0.33 mmol)於MeOH (2 mL)之溶液中添加NH 4F (360.0 mg,9.72 mmol)。在60℃,N 2氛圍下將所得混合物攪拌隔夜。將所得混合物冷卻至室溫且在減壓下濃縮。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物:管柱:XBridge Shield RP18 OBD管柱,30*150 mm,5μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3+ 0.1% NH 3.H 2O),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在9 min內11% B至16% B;波長:254/210 nm;RT1(min):6.68, RT2(min):8.68。將含有產物之級分合併且部分蒸發以移除溶劑,然後冷凍乾燥隔夜,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5(E)-(2-氯乙烯基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(9.5 mg,0.03 mmol,8.99%)及4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(2-氯乙烯基)-3-氟基-4-羥基-5(Z)-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(20.3 mg,0.06 mmol,19.22%)。化合物131:LC-MS (ES, m/z): 324/326 (M+H) +。99.8%純度。化合物132:LC-MS (ES, m/z): 324/326 (M+H +)。99.9%純度。LCMS之條件:(管柱:Shim-pack Scepter C18,33*3.0 mm,3.0 μm;流動相A:水/5mM NH 4HCO 3,流動相B:乙腈;流率:1.5000 mL/min;梯度:在1.20 min內10% B至95% B,在0.60 min內95% B至95% B,在0.02 min內95% B至10% B;波長:254 nm;RT1(min):0.49)。
化合物131: 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.09 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.87 (brs, 1H), 7.63 (brs, 1H), 6.53 (d, J= 13.2 Hz, 1H), 6.19 – 6.14 (m, 2H), 6.06 (d, J= 13.2 Hz, 1H), 5.56 (t, J= 5.2 Hz, 1H), 5.09 (t, J= 5.2 Hz, 0.5H), 4.96 (t, J= 5.2 Hz, 0.5H), 4.45 – 4.40 (m, 1H), 3.58 – 3.53 (m, 1H), 3.49 – 3.45 (m, 1H)。
化合物132: 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.05 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.89 (brs, 1H), 7.64 (brs, 1H), 6.52 (d, J= 8.0 Hz, 1H), 6.21 – 6.20 (m, 1H), 6.11 – 6.08 (m, 1H), 6.00 (d, J= 8.0 Hz, 1H), 5.55 – 5.53 (m, 1H), 5.08 (t, J= 5.2 Hz, 0.5H), 4.94 (t, J= 5.2 Hz, 0.5H), 4.48 – 4.41 (m, 1H), 3.77 – 3.73 (m, 1H), 3.54 – 3.50 (m, 1H)。 實例 82– 化合物 123 4- 胺基 -5- 氟基 -1-((2R,3S,4R,5R)-3- 氟基 -5-((Z)-2- 氟基乙烯基 )-4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- ) 嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:將1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-(羥甲基)-4-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(487 mg,0.72 mmol)及IBX (260 mg,0.93 mmol)於無水ACN (7.00 mL)中之混合物在75℃下攪拌1 h。將混合物冷卻至室溫,過濾,用ACN洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液。藉由用DCM/己烷(3/1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之(2R,3R,4S,5R)-2-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-甲醛(390 mg,0.58 mmol,80%)。LC-MS (ES, m/z): 677 [M-H] -
步驟2:在-70℃,氮氣氛圍下向四氟基硼酸化(氟甲基)三苯基鏻(878 mg,2.30 mmol)於無水THF (5.80 mL)之溶液中逐滴添加n-BuLi於正己烷中(0.90 mL,2.5 M)之溶液。將反應在-70℃下攪拌50 min。在-70℃下添加(2R,3R,4S,5R)-2-{[(三級丁基二甲基-矽烷基)氧基]甲基}-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)-3-[(4-甲氧基苯基) 二苯基甲氧基]氧雜環戊烷-2-甲醛(390 mg,0.58 mmol)於無水THF (2.00 mL)中之溶液,且將反應在0℃下攪拌3 h,然後在室溫下攪拌隔夜。將反應用飽和NH 4Cl水溶液(10 mL)淬滅,用EtOAc (3 x 10 mL)萃取所得混合物。將合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且在真空下濃縮。藉由製備型TLC (PE/EtOAc 2:1)純化殘餘物,得到呈無色油狀物之1-((2R,3S,4R,5R)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-3-氟基-5-((Z)-2-氟基乙烯基)-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(150 mg,0.2 mmol,37%)。LC-MS (ES, m/z): m/z693 [M-H] -
步驟3:在室溫下向1-((2R,3S,4R,5R)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-3-氟基-5-((Z)-2-氟基乙烯基)-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(130 mg,0.19 mmol)於CH 3CN (3.00 mL)之溶液中添加DMAP (45 mg,0.37 mmol)及TEA (56 mg,0.56 mmol)。將混合物用氮氣脫氣三次且在室溫下攪拌10 min。向此混合物中添加TPSCl (113 mg,0.38 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌,直至起始材料完全消耗,然後添加NH 3.H 2O (4.00 mL,30%),且在室溫下進行攪拌,直至中間體完全轉化為所需產物。將反應混合物在減壓下濃縮。將殘餘物用水(10 mL)稀釋且用EtOAc (3 x 10 mL)萃取。將有機層經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且在減壓下濃縮。藉由製備型TLC (PE/EtOAc = 1/2)純化殘餘物,得到呈灰白色固體之4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-3-氟基-5-((Z)-2-氟基乙烯基)-4-((4-甲氧基苯基) 二苯基甲氧基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮(80 mg,0.11 mmol,61%)。LC-MS (ES, m/z): m/z694 [M+H] +
步驟4:在室溫,氮氣氛圍下將4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-3-氟基-5-((Z)-2-氟基乙烯基)-4-((4-甲氧基苯基) 二苯基甲氧基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮(70 mg,0.10 mmol)於AcOH (8.0 mL,80%)中之溶液攪拌4天。將所得混合物在真空下濃縮。首先藉由逆相層析法在以下條件下純化殘餘物(管柱:C 18矽膠;流動相A:水(含有0.05% FA)及B:CH 3CN;梯度:在15 min內0%至20% B;偵測器:254/220 nm)。收集含有產物之級分且在真空下濃縮,得到約40 mg粗產物。藉由製備型HPLC在以下條件下再純化粗產物(管柱:X-Select Prep OBD C18管柱,30 x 150 mm,5 μm;流動相A:水(0.05% FA),流動相B:ACN;流率:60 mL/min mL/min;梯度:在7 min內30% B至50% B;波長:254 nm/220 nm nm)。收集含有產物之級分且在減壓下濃縮以移除一些溶劑,然後冷凍乾燥隔夜,得到呈無色油狀物之4-胺基-5-氟基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-((Z)-2-氟基乙烯基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮(13.4 mg,0.04 mmol,28%)。LC-MS (ES, m/z): 308 [M+H] +。97.4%純度。HPLC條件:(管柱:Xselect HSS T3,100 x 4.6 mm,3.5 μm;流動相A:水/0.05%TFA,流動相B:MeOH;流率:1.20 mL/min;梯度:在8.00 min內0% B至60% B,在2.00 min內60% B至95% B,在0.5 min內95% B至10% B;波長:254 nm;RT1(min):4.21)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ8.09 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.87 (br s, 1H), 7.63 (br s, 1H), 6.77 (dd, J= 84, 5.6 Hz, 1H), 6.15 – 6.08 (m, 2H), 5.58 (br s, 1H), 5.14 – 4.91 (m, 2H), 4.99 (dd, J= 48.4, 5.6 Hz, 1H), 4.44 (dd, J= 23.6, 5.2 Hz, 1H), 3.68 (d, J= 12.0 Hz, 1H), 3.58 (d, J= 12.4 Hz, 1H)。 實例 83- 化合物 164 (2R,3S,5R)-5-(6- 胺基 -2- 氟基嘌呤 -9- )-2-( 羥甲基 )-2-( -1,2- 二烯 -1- ) 氧雜環戊烷 -3- 醇之合成
步驟1:在室溫下向(2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-2-乙炔基-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-3-醇 (150.0 mg,0.51 mmol)於1,4-二噁烷(1.5 mL)之攪拌溶液中添加CuBr (36.7 mg,0.26 mmol)、POM (30.9 mg,0.34 mmol)及DIPA (129.4 mg,1.28 mmol)。將所得混合物在140℃下攪拌2 h。將反應冷卻至室溫且藉由在0℃下添加飽和NH 4Cl水溶液來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取,用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物:管柱,XBridge Prep OBD C18管柱,30*150 mm,5µm;流動相,水(10 mmol/L NH 4HCO 3)及ACN (在6.5 min內10% ACN直到14%);在254 nm下UV偵測。將含有產物之級分合併且部分蒸發以移除溶劑,然後冷凍乾燥隔夜,得到呈白色固體之(2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基嘌呤-9-基)-2-(羥甲基)-2-(丙-1,2-二烯-1-基)氧雜環戊烷-3-醇 (32.4 mg,0.11 mmol,20.59%)。LC-MS (ES, m/z): 308 (M+H) +。99.9%純度。HPLC之條件:(管柱:Shim‐pack Scepter C18, 33*3.0 mm,3.0 μm;流動相A:水/ 5mM NH 4HCO 3,流動相B:乙腈;流率:1.5000 mL/min;梯度:在1.69 min內10% B至40% B,在0.60 min內40% B至95% B,在0.50 min內95% B至95% B,在0.03 min內95% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):0.783)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.33 (s, 1H), 7.82 (brs, 2H), 6.19 (dd, J= 7.2, 4.8 Hz, 1H), 5.40 – 5.36 (m, 2H), 5.14 (t, J= 6.0 Hz, 1H), 5.02 – 4.91 (m, 2H), 4.63 (q, J= 5.2 Hz, 1H), 3.56 – 3.53 (m, 2H), 2.61 – 2.56 (m, 1H), 2.39 – 2.32 (m, 1H)。 實例 84- 化合物 90 4- 胺基 -5- 氟基 -1-((2R,3S,4R,5R)-3- 氟基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 )-5- 甲氧基四氫呋喃 -2- ) 嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在0℃下以逐滴方式向二苯甲酸(2R,3S,4R,5R)-5-((苄醯氧基)甲基)-3-氟基四氫呋喃-2,4-二酯(100 g,215.308 mmol)於DCM (1000 mL)之攪拌溶液中添加含HBr之乙酸(300 mL)。反應攪拌2 h後,TLC顯示完全反應。完成後,將反應混合物用冰水(500mL)及DCM (500 mL)稀釋,用NaHCO 3溶液使之呈鹼性且用DCM (3 x 500 mL)萃取。將合併之有機物用水(3 x 500 mL)及鹽水(2 x 500mL)洗滌,然後經硫酸鈉乾燥,過濾且濃縮,得到呈白色泡沫型黏稠固體之標題化合物(48g),其未經進一步純化即原樣用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 423.90 (M+1)。
步驟2:向5-氟尿嘧啶(50 g,384.378 mmol)於HMDS (500 mL)之攪拌溶液中添加硫酸銨(101.58 g,768.757 mmol)。將所得反應混合物在120℃下攪拌3 h,然後冷卻至室溫且在真空下濃縮。向以上殘餘物中添加苯甲酸((2R,3R,4S,5R)-3-(苄醯氧基)-5-溴基-4-氟基四氫呋喃-2-基)甲酯(89.47 g,211.408 mmol)於DCE (700 mL)中之溶液。將所得反應混合物在80℃下攪拌16 h。將反應混合物分配於鹽水溶液(500 mL)與DCM (500 mL)之間。將有機層分離,且將合併之有機物用水(2 x 500 mL)及鹽水(2 x 500 mL)洗滌,經硫酸鈉乾燥,過濾且濃縮,得到粗產物。將粗產物溶解於DCM (250 mL)中,且在攪拌的同時向其中添加正己烷(750mL)。將所獲得之固體過濾,用己烷洗滌,且在真空下乾燥,得到呈白色固體之所需產物(80g,80.11%)。LC-MS (ES, m/z): 473.2 (M+1)。
步驟3:在室溫下以分批方式向苯甲酸((2R,3R,4S,5R)-3-(苄醯氧基)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)四氫呋喃-2-基)甲酯(10 g,21.1685 mmol)於MeOH (100 mL)之攪拌溶液中添加NaOH (2.11 g,52.92 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌16 h。監測反應進展,完成後,用1N HCl中和,隨後在真空下濃縮,得到呈白色固體之粗材料(6.0 g),其原樣用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 265.10 (M+1)。
步驟4:在室溫下向5-氟基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(5g,18.93 mmol)及咪唑(2.57 g,37.853 mmol)於THF (100 mL)之攪拌溶液中添加三苯基膦(7.44 g,28.3897 mmol)且將反應混合物攪拌15 min;此後在0℃下以分批方式添加碘(7.20g,28.39 mmol)。反應混合物在室溫下攪拌16 h後,將混合物過濾且用THF (50 mL)洗滌。在減壓下濃縮濾液,得到粗化合物。將粗材料溶解於DCM (500 mL)中,用水(200 mL)洗滌且用DCM (200 mL)萃取水層。將合併之有機物用水(300 mL)、鹽水(300 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且在減壓下濃縮,得到粗化合物。藉由用含10% MeOH之DCM溶析之CombiFlash管柱層析法純化粗材料,得到呈白色固體之所需產物(2.5g,35.31%)。LC-MS (ES, m/z): 374.65 (M+H)。
步驟5:在室溫下向5-氟基-1-((2R,3S,4R,5S)-3-氟基-4-羥基-5-(碘甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(1.7 g,4.54 mmol)於THF (30 mL)之攪拌溶液中添加DBN (2.24 mL,18.18 mmol)。將所得澄清溶液在室溫下攪拌16 h。完成後,在減壓下濃縮反應混合物,得到粗化合物。藉由用含4% MeOH之DCM溶析之CombiFlash層析法純化粗產物,得到呈白色固體之所需產物(0.9 g,81.81%)。LC-MS (ES, m/z): 244.95 (M-1)。
步驟6:在0℃下向5-氟基-1-((2R,3S,4R)-3-氟基-4-羥基-5-亞甲基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(100 mg,0.4062 mmol)於MeOH (2 mL)之攪拌溶液中添加PbCO 3(217.09 mg,0.8124 mmol),隨後添加含碘(230.58 mg,0.8124 mmol)之MeOH (1 mL)。所得反應混合物在室溫下攪拌16 h後,濃縮反應混合物,且藉由用含4% MeOH之DCM溶析之CombiFlash層析法純化所得殘餘物,得到呈白色固體之所需產物(150 mg)。LC-MS (ES, m/z): 403.0 (M-1)。
步驟7:在冰冷條件下向5-氟基-1-((2R,3S,4R,5S)-3-氟基-4-羥基-5-(碘甲基)-5-甲氧基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.50 g,1.23 mmol)於吡啶(10 mL)之攪拌溶液中以逐滴方式添加乙酸酐(0.442 mL,4.33 mmol)且在室溫下攪拌4 h。濃縮反應混合物且藉由用含4% MeOH之DCM溶析之CombiFlash層析法純化所得殘餘物,得到呈白色固體之所需產物(450mg,85.70%)。LC-MS (ES, m/z): 446.25 (M+H)。
步驟8:在0℃下乙酸向(2S,3R,4S,5R)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-2-(碘甲基)-2-甲氧基四氫呋喃-3-酯(0.300 g,0.673 mmol)於DCE (10 mL)之攪拌溶液中添加三氟基乙酸銀(1.48 g,6.73 mmol)且在室溫下攪拌16 h。藉由TLC分析及LCMS監測反應進展。完成後,在減壓下濃縮反應混合物,得到呈白色固體之粗化合物(300mg)。LC-MS (ES, m/z): 336.61 (M+H) +
步驟9:在0℃下以逐滴方式向乙酸(2R,3R,4S,5R)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-2-(羥甲基)-2-甲氧基四氫呋喃-3-酯(0.20 g,0.595 mmol)於吡啶(5 mL)之攪拌溶液中添加乙酸酐(0.243 mL,2.38 mmol)且在室溫下攪拌16 h。完成後,濃縮反應混合物且藉由用含4% MeOH之DCM溶析之CombiFlash層析法純化所得殘餘物,得到呈白色固體之所需產物(200mg,88.82%)。LC-MS (ES, m/z): 376.90(M-1)。
步驟10:在0℃下向三唑(0.33g,4.76 mmol)於吡啶(3mL)之溶液中添加氧氯化磷(0.162 g,1.058 mmol)。5 min後,在0℃下以逐滴方式添加三乙胺(0.481 g,4.761 mmol),將以上溶液在相同溫度下攪拌30 min。將尿嘧啶衍生物(0.20g,0.53 mmol)溶解於無水吡啶(2mL)中且在0℃下以逐滴方式添加至以上反應混合物中。將反應在0℃下攪拌2.5 h。將反應混合物濃縮且與甲苯(2 × 20 mL)共蒸發。將粗產物用DCM (100mL)溶解且用鹽水(60mL)洗滌兩次。用DCM (30mL)萃取水層。將合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且蒸發。將所得殘餘物溶解於1,4-二噁烷(20mL)中,冷卻至0℃且添加氨水25% (20 mL)。將所得溶液在室溫下攪拌2 h且藉由TLC及LCMS監測反應進展。完成後,將溶液蒸發且與甲苯(3 × 20 mL)共蒸發。按照以下條件藉由製備型HPLC純化粗產物。流動相:A:含0.02% NH 4OH之水;B:MeCN;管柱:X SELECT (250mmx20.0mm),5.0µ;流率:15mL/min;梯度程式:時間/% B:0/5, 2/10, 8/25,得到呈白色固體之所需產物(8.5mg,32 %)。LC-MS (ES, m/z): 294.1 (M+1)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ = 8.13 - 7.78 (m, 3H), 6.25 - 6.19 (m, 1H), 5.30 - 5.10 (m, 1H), 4.42 - 4.32 (m, 1H), 3.76 - 3.70 (m, 1H), 3.50 (dd, J= 10.4, 11.3 Hz, 2H), 3.27 (s, 3H)。 實例 85- 化合物 58 1-((2R,3S,4R,5R)-5-( 氯甲基 )-3- 氟基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- )-5- 甲基嘧啶 -2,4(1H,3H)- 二酮之合成
步驟1:在0℃下以逐滴方式向二苯甲酸(2R,3S,4R,5R)-5-((苄醯氧基)甲基)-3-氟基四氫呋喃-2,4-二酯(6 g,12.92 mmol)於DCM (60 mL)之攪拌溶液中添加HBr於AcOH (18 mL)。將反應在0℃下攪拌2 h。將反應混合物用冰淬滅,然後用DCM (150 mL)萃取。將合併之有機物用水(2 X 100 mL)、飽和NaHCO 3溶液(2 X 100 mL)洗滌,經Na 2SO 4乾燥,過濾且在減壓下濃縮,得到粗化合物。LC-MS (ES, m/z): 423.90 (M+2)。
步驟2:將胸腺嘧啶(3g,23.7887 mmol)及BSA (12.79 mL,52.3352 mmol)於ACN (30 mL)中之攪拌溶液在80℃下加熱4 h,然後冷卻至室溫且在真空下濃縮。在0℃下向以上殘餘物中添加苯甲酸((2R,3R,4S,5R)-3-(苄醯氧基)-5-溴基-4-氟基四氫呋喃-2-基)甲酯(5.53g,13.08 mmol)於1,4-二噁烷(40 mL)中之溶液。將反應在80℃下攪拌16 h。完成後,將反應混合物冷卻至室溫且用水及DCM萃取。將有機層分離,經Na 2SO 4乾燥,過濾且在減壓下濃縮,得到粗化合物。將粗產物自DCM及正己烷中再結晶,得到呈白色固體之所需產物(5.6g,50.26 %)。LC-MS (ES, m/z): 469.2 (M+1)。
步驟3:在0℃,氮氣氛圍下以分批方式向苯甲酸((2R,3R,4S,5R)-3-(苄醯氧基)-4-氟基-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)四氫呋喃-2-基)甲酯(28 g,59.78 mmol)於MeOH (300 mL)之攪拌溶液中添加NaOH (5.97 g,149.432 mmol)。反應混合物在室溫下攪拌16 h後,用1N HCl中和反應混合物且在真空下濃縮,得到呈白色固體之粗材料(15.1 g),其原樣用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 261.15 (M+H)。
步驟4:在0℃下向1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(15.1 g,58.03 mmol)於吡啶(150 mL)之攪拌溶液中添加TBDPSCl (19.74 mL,75.44 mmol)。反應混合物在室溫下攪拌16 h後,在低壓下濃縮反應且用冰水(500mL)及EtOAc (500 mL)稀釋。將有機層分離,用水(3 x 500 mL)及鹽水(2 x 500mL)洗滌,經硫酸鈉乾燥,過濾且濃縮,且藉由用含30% EtOAc之己烷溶析之CombiFlash層析法純化所得殘餘物,得到呈白色固體之所需產物(19.3g,66.71%),其原樣用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 499.2 (M+H)。
步驟5:在0℃下向1-((2R,3S,4R,5R)-5-(((三級丁基二苯基矽烷基)氧基)甲基)-3-氟基-4-羥基四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(22 g,44.1208 mmol)於DCM (300 mL)之攪拌溶液中添加三甲基吡啶(6.89 mL,52.94 mmol),隨後添加AgNO 3(8.99 g,52.95 mmol)及MMTrCl (16.34 g,52.95 mmol)。反應混合物在室溫下攪拌16 h後,將反應混合物用甲醇淬滅且攪拌20 min。濃縮反應混合物且藉由用含30% EtOAc之己烷溶析之CombiFlash層析法純化所得殘餘物,得到呈白色固體之所需產物(23 g,67.64%)。LC-MS (ES, m/z): 771.40 (M+1)。
步驟6:在0℃下向1-((2R,3S,4R,5R)-5-(((三級丁基二苯基矽烷基)氧基)甲基)-3-氟基-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(24.5 g,31.7781 mmol)於THF (250 mL)之攪拌溶液中添加TBAF (79.44 mL,79.4453 mmol)。將所得反應混合物在室溫下攪拌16 h,且藉由TLC及LCMS監測反應進展。完成後,將反應物質濃縮且用冰水(500mL)及EtOAc (500 mL)稀釋。將有機層分離,用水(3 x 500 mL)及鹽水(2 x 500mL)洗滌,經硫酸鈉乾燥,過濾且濃縮。藉由用含30% EtOAc之己烷溶析之CombiFlash層析法純化粗產物,得到呈白色固體之所需產物(14g,82.74%),其原樣用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 533.15(M+1)。
步驟7:在0℃下向1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(羥甲基)-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(13 g,24.41 mmol)於DMSO (130 mL)之攪拌溶液中添加DCC (15.10 g,73.23 mmol),隨後添加TFA. Py (4.71 g,24.41 mmol)。將所得反應混合物在室溫下攪拌2 h,且在室溫下用水及EtOAc稀釋反應混合物。過濾所得到之固體,用EtOAc洗滌。用EtOAc萃取濾液,將有機層用水、鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且在減壓下濃縮,獲得粗醛(13g),其原樣用於下一步驟中。
步驟8:向(2S,3R,4S,5R)-4-氟基-3-((4-甲氧基苯基) 二苯基甲氧基)-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)四氫呋喃-2-甲醛(13 g,24.5028 mmol)於二噁烷(130 mL)之攪拌溶液中添加37% HCHO (13 mL),隨後添加2N NaOH溶液(26 mL)。反應混合物在室溫下攪拌16 h後,在0℃下添加NaBH 4(2.31 g,61.26 mmol)且在室溫下又繼續攪拌1 h。藉由TLC及LCMS監測反應進展。完成後,在0℃下用NH 4Cl溶液淬滅反應混合物且用EtOAc (500 mL)萃取所得混合物。將合併之有機物用水(3 x 500 mL)及鹽水(2 x 500mL)洗滌,然後經硫酸鈉乾燥,過濾且濃縮。藉由用含30% EtOAc之己烷溶析之CombiFlash層析法純化粗產物,得到呈白色固體之所需產物(10g,76.92%),其原樣用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 561.10(M-1)。
步驟9:在-35℃下向1-((2R,3S,4R)-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(3.5 g,6.22 mmol)於DCM (50 mL)之攪拌溶液中添加吡啶(2.5 mL,31.11 mmol),隨後添加三氟甲酸酐(3.15 mL,18.66 mmol)。將所得反應混合物在室溫下攪拌2 h。用NaHCO 3溶液淬滅反應混合物且用EtOAc (300 mL)萃取。將合併之有機物用水(3 x 200 mL)及鹽水(2 x 200mL)洗滌,然後經硫酸鈉乾燥,過濾且濃縮。藉由用含30% EtOAc之己烷溶析之CombiFlash層析法純化粗產物,得到呈白色固體之所需產物(2.0g,38.91%),其原樣用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 826.7(M+1)。
步驟10:在室溫下向雙(亞甲基)雙(三氟甲烷磺酸)((3R,4S,5R)-4-氟基-3-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)四氫呋喃-2,2-二基)酯(2g,2.42 mmol)於THF (30 mL)之攪拌溶液中添加Et 3N (3.36 mL,24.2 mmol)。反應混合物在50℃下攪拌5 h後,將反應混合物冷卻至室溫,然後添加LiCl (307.6 mg,7.26 mmol)且在室溫下繼續攪拌16 h。完成後,在減壓下濃縮反應混合物,得到呈白色固體之所需產物(1.5g),其原樣用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 563.2 (M+H)。
步驟11:在0℃下向(6R,7S,8R,9R)-9-(氯甲基)-7-氟基-8-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)-3-甲基-7,8,9,10-四氫-2H,6H-6,9-環氧基嘧啶并[2,1-b][1,3]噁唑嗪-2-酮(1.5 g,2.6642 mmol)於THF (30 mL)之攪拌溶液中添加1N NaOH溶液(6.66 mL,6.66 mmol)。將所得反應混合物在室溫下攪拌3 h,且藉由TLC及LCMS監測反應進展。在0℃下將反應混合物用NH 4Cl溶液淬滅且用EtOAc (300 mL)萃取。將合併之有機物用水(3 x 200 mL)及鹽水(2 x 200mL)洗滌,經硫酸鈉乾燥,過濾,濃縮,且藉由用含30% EtOAc之己烷溶析之CombiFlash層析法純化所得殘餘物,得到呈白色固體之所需產物(0.8g,51.94%)。LC-MS (ES, m/z): 578.95(M-1)。
步驟12:在0℃下向1-((2R,3S,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-5-(羥甲基)-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(200 mg,0.344 mmol)於DCM (4 mL)之攪拌溶液中添加80% HCOOH (2 mL)。將所得反應混合物在室溫下攪拌3 h,且濃縮反應,藉由製備型HPLC用以下條件純化殘餘物:流動相:A= 含0.1% HCOOH之水,B = CAN;管柱:Gemini NX (250mmx21.2mm),5.0µ;流動:18mL/min;梯度程式:時間/% B:0/10,2/20,8/40,得到呈白色固體之所需產物(30mg,29.12 %)。LC-MS (ES, m/z): 309.0 (M+1)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ = 11.48 - 11.38 (m, 1H), 7.60 (s, 1H), 6.26 (dd, J= 4.8, 14.2 Hz, 1H), 6.19 (d, J= 5.1 Hz, 1H), 5.46 (t, J= 5.4 Hz, 1H), 5.29 - 5.12 (m, 1H), 4.55 - 4.45 (m, 1H), 3.87 (d, J= 11.9 Hz, 1H), 3.70 (d, J= 11.7 Hz, 1H), 3.67 - 3.56 (m, 2H), 1.78 (d, J= 0.9 Hz, 3H)。 實例 86- 化合物 91 4- 胺基 -5- 氟基 -1-((2R,4S,5R)-4- 羥基 -5-( 羥甲基 )-5- 甲氧基四氫呋喃 -2- ) 嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在0℃下向5-氟基-1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)二酮(10 g,40.619 mmol)於THF (100 mL)之攪拌溶液中添加咪唑(5.6 g,101.54 mmol),隨後添加三苯基膦(16 g,60.928 mmol)及碘(7.73 g,60.928 mmol)。將反應混合物在室溫下攪拌16 h,然後將反應混合物分配於水(100 mL)與EtOAc (250 mL)之間。將有機物分離且經Na 2SO 4乾燥。過濾溶液且在減壓下移除溶劑,得到粗化合物。藉由用含20-30% EtOAc之己烷溶析之CombiFlash管柱層析法純化粗殘餘物,得到呈白色固體之所需產物 (6.3 g)。LC-MS (ES, m/z): 356.90 (M+H) +
步驟2:向5-氟基-1-((2R,4S,5S)-4-羥基-5-(碘甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(6.3 g,17.692 mmol)於THF (100 mL)之攪拌溶液中添加DBN (6.59 g,53.076 mmol)。將反應在室溫下攪拌6 h。且濃縮,得到呈棕色液體之粗產物。藉由用含3% MeOH之DCM溶析之CombiFlash管柱層析法純化粗殘餘物,得到呈棕色液體之所需產物 (3 g)。LC-MS (ES, m/z): 227.0 (M-H)。
步驟3:用氬氣吹掃5-氟基-1-((2R,4S)-4-羥基-5-亞甲基-四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(2g,8.77 mmol)於甲醇(20 mL)中之攪拌溶液。在室溫下用PbCO 3(4.68 g,13.14mmol),隨後用碘(4.5 g,13.14 mmol)處理反應。將反應在室溫下攪拌6 h。將反應混合物用冰水(50 mL)稀釋且用亞硫酸氫鈉溶液(20 mL)淬滅,且用EtOAc (3*100 mL)萃取。將合併之萃取物用水及鹽水洗滌,然後經硫酸鈉乾燥,過濾且濃縮,得到呈棕色固體之粗產物 (0.7 g)。LC-MS (ES, m/z): 384.90 (M-H)。
步驟4:向5-氟基-1-((2R,4S,5S)-4-羥基-5-(碘甲基)-5-甲氧基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.7 g,1.8129 mmol)於DCM (5 mL)之攪拌溶液中添加吡啶(0.6mL,5.44 mmol)。將反應攪拌15 min,且在0℃下向此反應中添加BzCl (0.3 mL,1.99 mmol)且在室溫下繼續攪拌2 h。藉由TLC及LCMS監測反應進展。完成後,將反應混合物用冰水(25 mL)稀釋,用DCM (2x75mL)萃取。將合併之有機級分用水及鹽水洗滌,然後經硫酸鈉乾燥,過濾且濃縮,且藉由用含70% EtOAc之正己烷溶析之CombiFlash管柱層析法純化所得殘餘物,得到呈棕色固體之所需產物 (0.3 g)。LC-MS (ES, m/z): 489.20 (M-H)。
步驟5:在室溫下向苯甲酸(2S,3S,5R)-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-2-(碘甲基)-2-甲氧基四氫呋喃-3-酯(0.65 g,1.32 mmol)於吡啶(5 mL)之攪拌溶液中添加苯甲酸銀(1.82g,7.96 mmol)。反應混合物在110℃下攪拌4 h後,將反應混合物用冰水(10 mL)稀釋,用EtOAc (2x50 mL)萃取。將合併之有機級分用水及鹽水洗滌,然後經硫酸鈉乾燥,過濾且濃縮,且藉由用含55% EtOAc之正己烷溶析之CombiFlash管柱層析法純化所得殘餘物,得到呈棕色固體之所需產物 (0.55g,85.67%)。LC-MS (ES, m/z): 483.30 (M-H)。
步驟6:在0℃下向1,2,4-三唑(0.257g,3.716 mmol)於吡啶(4 mL)之攪拌溶液中添加POCl 3(0.127g,0.826 mmol)。向此溶液中添加Et 3N (0.376g,3.72 mmol)且在相同溫度下攪拌30 min。在0℃下向此溶液中添加含苯甲酸((2R,3S,5R)-3-(苄醯氧基)-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-2-甲氧基四氫呋喃-2-基)甲酯(0.250g,0.413 mmol)之吡啶(4 mL)且在室溫下攪拌2 h。藉由TLC監測反應進展,且完成後,將反應混合物濃縮至乾且與甲苯共蒸餾。將殘餘物溶解於DCM中且用鹽水溶液洗滌,經Na 2SO 4乾燥且濃縮。在0℃下將以上粗材料溶解於NH 4OH水溶液:1,4-二噁烷(1:3) (4 mL)中且反應混合物在室溫下攪拌2 h後,濃縮反應混合物且藉由用含5% MeOH之DCM溶析之製備型TLC純化來純化所得殘餘物,得到呈白色固體之所需產物(0.150g,58.59%)。LC-MS (ES, m/z): 482.05 (M-H)。
步驟7:向苯甲酸(2R,3S,5R)-5-(4-胺基-5-氟基-2-側氧基嘧啶-1(2H)-基)-2-((苄醯氧基)甲基)-2-甲氧基四氫呋喃-3-酯(0.150g,0.3103 mmol)於MeOH (5 mL)之攪拌溶液中添加2M NaOH (0.5 mL)。將反應攪拌15 min且pH調節至約5。濃縮反應混合物。藉由對掌性製備型純化按照以下條件純化所得殘餘物;管柱:Regis (S,S) Whelk-01,250mmX21.1 mm,5µm;流動相:正己烷(A)及EtOH(B);流動:15mL;梯度:時間;溶劑(B) 0/30, 10/50;稀釋劑:EtOH: DCM,3:1,5mL;注射量-0.750mL;運行時間-15min,得到呈白色固體之所需化合物(8mg,9.41%)。LC-MS (ES, m/z): 276.10 (M+1)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ = 8.22 - 8.01 (m, 1H), 7.80 - 7.37 (m, 2H), 6.04 - 6.01 (m, 1H), 5.39 - 5.31 (m, 1H), 4.91 (br d, J= 6.7 Hz, 1H), 4.39 - 4.29 (m, 1H), 3.74 - 3.66 (m, 1H), 3.51 - 3.43 (m, 1H), 3.28 (s, 3H), 2.31 - 2.20 (m, 1H), 2.08 (ddd, J= 2.5, 8.1, 13.1 Hz, 1H)。 實例 87- 化合物 177 4- 胺基 -5- 氟基 -1-((2R,3S,4R)-3- 氟基 -4- 羥基 -5,5- ( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- ) 嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在0℃,N 2氛圍下向咪唑(7.7 g,114 mmol)及5-氟基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(10 g,37.9 mmol)於DMF (100 mL)之攪拌溶液中分批添加TBSCl (6.9 g,45.4 mmol)。將反應在室溫下攪拌4 h。將所得混合物用水稀釋且用EtOAc (3 x 200 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液,得到產物(10.6 g,粗品),其未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LCMS (ES, m/z): 379 [M+H] +
步驟2:在0℃,N 2氛圍下向1-((2R,3S,4R,5R)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-3-氟基-4-羥基四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(10.6 g,28 mmol)於DCM (100 mL)之攪拌溶液中分批添加s-三甲基吡啶(10.2 g,84 mmol)及MMTrCl (17.3 g,56.1 mmol)。將反應在室溫下攪拌隔夜。將所得混合物用水稀釋且用DCM (3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液,得到產物(15 g,粗品),其未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LCMS (ES, m/z): 651 [M+H] +
步驟3:在45℃,N 2氛圍下將NH 4F (3.4 g,92.4 mmol)及1-((2R,3S,4R,5R)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-3-氟基-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(15 g,23.1 mmol)於MeOH (150 mL)中之溶液攪拌隔夜。將所得混合物冷卻至室溫。過濾所得混合物且用EA洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液,得到產物(10.2 g,粗品),其未經進一步純化即直接用於下一步驟中。(ES, m/z): 537 [M+H] +
步驟4:在室溫,N 2氛圍下向5-氟基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(羥甲基)-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(10.2 g,19.1 mmol)於ACN (98 mL)之攪拌溶液中分批添加IBX (10.2 g,36.5 mmol)。將所得混合物在50℃下攪拌隔夜。將所得混合物冷卻至室溫。過濾所得混合物且用ACN洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液,得到產物(9.8 g,粗品),其未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LCMS (ES, m/z): 535 [M+H] +
步驟5:在0℃,N 2氛圍下向(2S,3R,4S,5R)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-3-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)四氫呋喃-2甲醛(9.8 g,18.3 mmol)於1,4-二噁烷(98 mL)之溶液中分批添加多聚甲醛(2.8 g,91.6 mmol)。然後在0℃,N 2氛圍下添加含NaOH (2.2 g,55 mmol)之H 2O (9.8 mL)。在室溫,N 2氛圍下將所得混合物攪拌隔夜。然後在0℃,N 2氛圍下添加NaBH 4(2.1 g,55 mmol)。在室溫、N 2氛圍下將所得混合物再攪拌30 min。將所得混合物在0℃下用水淬滅且用EtOAc (3 x 300 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用DCM/MeOH (15:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之5-氟基-1-((2R,3S,4R)-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(9.8 g,17.3 mmol,94.3%)。LCMS (ES, m/z): 567 [M+H] +
步驟6:在室溫、N 2氛圍下向5-氟基-1-((2R,3S,4R)-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(9.8 g,17.3 mmol)於DCM (98 mL)之攪拌溶液中添加AgNO 3(5.9 g,34.6 mmol)及s-三甲基吡啶(8.4 g,69.2 mmol)。然後在0℃,N 2氛圍下添加MMTrCl (8 g,25.9 mmol)。在40℃,N 2氛圍下將所得混合物攪拌隔夜。將所得混合物冷卻至室溫。將所得混合物用水稀釋且用DCM (3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EA (4:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之5-氟基-1-((2R,3S,4R,5S)-3-氟基-5-(羥甲基)-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)-5-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(4 g,4.81 mmol,27.6%)。LCMS (ES, m/z): 839 [M+H] +
步驟7:在室溫,N 2氛圍下向5-氟基-1-((2R,3S,4R,5S)-3-氟基-5-(羥甲基)-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)-5-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(4 g,4.81 mmol)於DMF (40 mL)之攪拌溶液中分批添加TBSCl (1.4 g,9.62 mmol)及咪唑(1.6 g,24.1 mmol)。在80℃,N 2氛圍下將所得混合物攪拌隔夜。將所得混合物冷卻至室溫。將所得混合物用水稀釋且用EtOAc (3 x 200 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EA (2:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-((2R,3S,4R,5R)-5-(((三級丁基-二甲基矽烷基)氧基)甲基)-3-氟基-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)-5-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(4.3 g,4.52 mmol,94.6%)。LCMS-PH (ES, m/z): 953 [M+H] +
步驟8:在室溫,N 2氛圍下向1-((2R,3S,4R,5R)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-3-氟基-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)-5-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(800 mg,840 μmol)於ACN (11 mL)之攪拌溶液中添加DMAP (615 mg,5.04 mmol)及TEA (509 mg,5.04 mmol)。將所得混合物攪拌10 min。然後添加TPSCl (763 mg,2.52 mmol)且在室溫,N 2氛圍下將反應攪拌15 h。然後添加濃NH 3.H 2O (2 mL)且在室溫,N 2氛圍下將反應攪拌30 min。將所得混合物用水稀釋且用EtOAc (3 x 50 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (2:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-3-氟基-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)-5-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮(530 mg,0.56 mmol,66.3%)。LCMS (ES, m/z): 952 [M+H] +
步驟9:在室溫,N 2氛圍下向4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-3-氟基-4-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)-5-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮(160 mg,168 μmol)於MeOH (2 mL)之攪拌溶液中添加NH 4F (187 mg,5.04 mmol)。將所得混合物在60℃下攪拌隔夜。將所得混合物冷卻至室溫且過濾所得混合物。用EtOAc洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液,得到粗產物。在室溫,N 2氛圍下向以上殘餘物中添加AcOH (0.8 mL)及H 2O (0.2 mL)。在40℃,N 2氛圍下將所得混合物攪拌1 h。將所得混合物冷卻至室溫。在減壓下濃縮混合物,得到粗產物。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(管柱:XBridge Prep OBD C18管柱,30*150 mm,5 μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:60 mL/min;梯度:在9 min內71% B至76% B;波長:254 nm/220 nm;RT1(min):8.9)。收集級分且在真空下濃縮,將殘餘物再溶解於CH 3CN及H 2O中,然後冷凍乾燥,得到呈灰白色固體之4-胺基-5-氟基-1-((2R,3S,4R)-3-氟基-4-羥基-5,5-雙(羥甲基)四氫呋喃-2-基) 嘧啶-2(1H)-酮(23.6 mg,81 μmol,50.3%)。LCMS (ES, m/z): 294 [M+H] +, 99.8%純度。HPLC之條件:(管柱:Atlantis HILIC二氧化矽,100*4.6 mm; 3.0 μm;流動相A:水/5 mM NH 4HCO 3,流動相B:MeOH;流率:1.20 mL/min;梯度:在5.00 min內0% B至95% B,在2.00 min內95% B至95% B,在0.30 min內95% B至0% B;波長:254 nm;RT1(min):3.367)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.11 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.93 – 7.38 (m, 2H), 6.28 (ddd, J= 7.8, 5.8, 2.0 Hz, 1H), 5.83 (s, 1H), 5.25 (dt, J= 57.0, 5.7 Hz, 2H), 4.92 (t, J= 5.5 Hz, 1H), 4.37 (dd, J= 27.5, 5.6 Hz, 1H), 3.57 (dd, J= 11.5, 5.1 Hz, 1H), 3.52 – 3.39 (m, 2H), 3.27 (dd, J= 11.7, 4.4 Hz, 1H)。 實例 88- 化合物 178 1-((2R,3S,4R,5R)-5- 疊氮基 -3- 氟基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- )-5- 甲基嘧啶 -2,4(1H,3H)- 二酮之合成
步驟1:在0℃下向二苯甲酸(2R,3S,4R,5R)-5-((苄醯氧基)甲基)-3-氟基四氫呋喃-2,4-二酯(30 g,64.59mmol)於DCM (300mL)之攪拌溶液中逐滴添加含HBr之乙酸(90 mL)。將反應混合物在室溫下攪拌2 h。藉由TLC監測反應的完成。將粗材料溶解於DCM (500 mL)中,用水(200 mL)洗滌且用DCM (200 mL)萃取水層。將合併之有機物用水(300 mL)、鹽水(300 mL)及碳酸氫鈉(300mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且在減壓下濃縮,得到呈白色泡沫/黏稠固體之粗苯甲酸((2R,3R,4S,5R)-3-(苄醯氧基)-5-溴基-4-氟基四氫呋喃-2-基)甲酯(27g),其原樣用於下一步驟中。
步驟2:在室溫下向胸腺嘧啶(15g,118.94mmol)於乙腈(150.0mL)之攪拌溶液中添加BSA (290mL,1189mmol)。將反應混合物在100℃下攪拌4 h。將澄清的反應混合物濃縮至乾,將所得殘餘物溶解於1-4二噁烷(150.0mL)中且在0℃下添加至苯甲酸((2R,3R,4S,5R)-3-(苄醯氧基)-5-溴基-4-氟基四氫呋喃-2-基)甲酯溶液(25g,59.47mmol)中。將反應混合物在80℃下攪拌16 h。藉由TLC監測反應的完成。將反應混合物分配於鹽水溶液(500 mL)與DCM (500 mL)之間。將有機層分離,且將合併之有機物用水(2 x 500 mL)及鹽水(2 x 500 mL)洗滌,經硫酸鈉乾燥,過濾且濃縮。將粗產物溶解於DCM (250mL)中,添加至己烷(750mL)中且攪拌。藉由過濾分離所形成之沉澱且用己烷洗滌。在真空下乾燥固體,得到呈灰白色固體之所需產物(25g,90.25 %)。LC-MS (ES, m/z): 469.2 (M+1)。
步驟3:在室溫,氮氣氛圍下向苯甲酸((2R,3R,4S,5R)-3-(苄醯氧基)-4-氟基-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)四氫呋喃-2-基)甲酯(29.0 g,4.27mmol)於甲醇(300mL)之攪拌溶液中分批添加0℃之氫氧化鈉(4.2g,10.68mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌2 h,用1N HCl中和且在真空下濃縮,得到呈灰白色固體之所需產物(17 g)。LC-MS (ES, m/z): 260.90 (M+H)。
步驟4:向1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(10g,38.44mmol)於DMF (100mL)之攪拌溶液中添加MeP(OPh) 3I (34g,76.89mmol)。將反應混合物在室溫下攪拌30 min且在室溫下添加2.0 mL甲醇。將反應混合物在室溫下攪拌10 min。藉由TLC監測反應的完成。完成後,在減壓下濃縮反應混合物。藉由用含4% MeOH之DCM溶析之CombiFlash層析法純化粗產物,得到呈白色固體之所需產物(3.0 g,21.09%)。LC-MS (ES, m/z): 370.95 (M+1)。
步驟5:在0℃下向1-((2R,3S,4R,5S)-3-氟基-4-羥基-5-(碘甲基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(3.0 g,8.098 mmol)於THF (30 mL)之攪拌溶液中添加DBN (3.0mL,24.24mmol)。將反應混合物在室溫下攪拌16 h。藉由TLC監測反應的完成。完成後,在減壓下濃縮反應混合物。藉由用含60% EtOAc之正己烷溶析之CombiFlash層析法純化粗產物,得到呈白色固體之所需產物(900mg,45.91%)。LC-MS (ES, m/z): 243 (M+1)。
步驟6:在0℃下向苄基三乙基氯化銨(2.5g,11.15mmol)之攪拌溶液中添加含疊氮化鈉(725mg,11.15mmol)之乙腈(10.0 mL)。將反應混合物在室溫下攪拌2 h。然後將反應在0℃下用1-((2R,3S,4R)-3-氟基-4-羥基-5-亞甲基四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(900mg,3.71 mmol)處理,隨後在0℃下用含碘(941mg,3.71mmol)之THF (5.0mL)處理。將反應混合物在室溫下攪拌2 h。藉由TLC監測反應的完成。完成後,在減壓下濃縮反應混合物。藉由用含4% MeOH之DCM溶析之CombiFlash層析法純化粗殘餘物,得到呈白色固體之所需產物(700mg,46%)。LC-MS (ES, m/z): 411.90 (M+2)。
步驟7:在0℃下向1-((2R,3S,4R,5S)-5-疊氮基-3-氟基-4-羥基-5-(碘甲基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(900mg,2.18mmol)於吡啶(10mL)之攪拌溶液中添加苯甲醯氯(0.5mL,4.37mmol)。將反應混合物在室溫下攪拌2 h。藉由TLC監測反應的完成。完成後,將反應混合物在減壓下濃縮。藉由用含4% MeOH之DCM溶析之CombiFlash層析法純化粗殘餘物,得到呈白色固體之所需產物(800mg,71.42%)。LC-MS (ES, m/z): 514.10 (M-H)。
步驟8:在室溫下向苯甲酸(2S,3R,4S,5R)-2-疊氮基-4-氟基-2-(碘甲基)-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)四氫呋喃-3-酯(800mg,1.55mmol)於吡啶(10mL)之攪拌溶液中添加苯甲酸銀(3.5g,15.53mmol)。將反應混合物在90℃下攪拌16 h。藉由TLC監測反應的完成。完成後,在減壓下濃縮反應混合物。藉由用含6% MeOH之DCM溶析之CombiFlash層析法純化粗殘餘物,得到呈白色固體之所需化合物(400mg,50%)。LC-MS (ES, m/z): 508.1 (M-H)。
步驟9:在室溫下將苯甲酸(2R,3R,4S,5R)-2-疊氮基-2-((苄醯氧基)甲基)-4-氟基-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)四氫呋喃-3-酯(100mg,0.19mmol)於含7N氨之甲醇(2.0mL)中之溶液攪拌2 h且藉由TLC及LCMS監測反應進展。完成後,將反應混合物濃縮且在真空下乾燥。藉由製備型HPLC使用以下條件純化粗產物:流動相:A:含0.02% NH 4OH之水;B:MeCN;管柱:X SELECT (250mmx20.0mm),5.0µ;流率:15mL/min;梯度程式:時間/% B:0/5, 2/10, 8/25,得到呈白色固體之所需產物(22mg,37 %)。LC-MS (ES, m/z): 301.85 (M+1)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ = 11.56 - 11.43 (m, 1H), 7.51 (s, 1H), 6.47 (br d, J= 5.0 Hz, 1H), 6.35 (dd, J= 5.9, 10.1 Hz, 1H), 5.82 (br t, J= 5.6 Hz, 1H), 5.35 - 5.15 (m, 1H), 4.56 - 4.46 (m, 1H), 3.83 - 3.73 (m, 2H), 1.79 (s, 3H)。 實例 89- 化合物 130 4- 胺基 -1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(2- 氯乙基 )-3- 氟基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 氧雜環戊烷 -2- ]-5- 氟基嘧啶 -2- 酮之合成
步驟1:向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.9 g,3.64 mmol)於ACN (38 mL)之攪拌溶液中添加IBX (1.3 g,4.73 mmol)。將所得混合物在75℃下攪拌2 h,然後冷卻至室溫。過濾所得混合物且用乙腈洗滌濾餅。將合併之濾液在減壓下濃縮。此得到呈白色固體之(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(1.8 g,粗品)。LC-MS (ES, m/z): 521 (M+H +)。
步驟2:在60℃,氮氣氛圍下將溴(甲基)三苯基-λ5-磷烷(3.7 g,10.37 mmol)及三級丁醇鉀(1.2 g,10.37 mmol)於THF (36 mL)中之溶液攪拌1 h。在室溫下向以上混合物中分批添加(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(1.8 g,粗品)。將所得混合物在室溫下再攪拌30 min,然後藉在0℃下添加飽和NH 4Cl水溶液來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由逆相急速在以下條件下純化粗產物:管柱:C18;流動相A:水(10mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:100 mL/min;梯度:在20 min內10% B至80%;在254 nm下UV偵測。此得到呈黃色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.1 g,2.12 mmol,61.34%)。LC-MS (ES, m/z): 519 (M+H +)。
步驟3:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙烯基-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.1 g,2.12 mmol)於THF (20 mL)之溶液中添加BH 3-THF (1M,6.4 mL,6.40 mmol)。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌1 h。在0℃下向以上混合物中逐滴添加H 2O (1.0 mL,61.06 mmol)。將所得混合物在0℃下再攪拌15 min。然後在0℃下向以上混合物中逐滴添加NaOH水溶液(2.1 mL,6.30 mmol,3 mol/L)。將所得混合物在0℃下再攪拌15 min。隨後在0℃下逐滴添加H 2O 2(2.1 mL,27.20 mmol,30%)。將所得混合物在室溫下再攪拌2 h,然後藉由在0℃下添加飽和NH 4Cl水溶液來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC (PE/EtOAc = 3:1)純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-(2-羥乙基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(450.0 mg,0.84 mmol,39.54%)。LC-MS (ES, m/z): 537 (M+H +)。
步驟4:在0℃,氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-3-氟基-5-(2-羥乙基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(450.0 mg,0.84 mmol)及TEA (212.0 mg,2.10 mmol)於DCM (5 mL)之攪拌溶液中逐滴添加乙烷磺醯氯(162.0 mg,1.26 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌1 h,然後在減壓下濃縮。此得到呈棕色固體之乙烷磺酸2-[(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-基]乙酯(500 mg,粗品)。LC-MS (ES, m/z): 629 (M+H +)。
步驟5:向乙烷磺酸2-[(2R,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-基]乙酯(500 mg,粗品)於THF (5 mL)之攪拌溶液中添加LiCl (337.0 mg,7.95 mmol)。將所得混合物在50℃下攪拌隔夜,然後冷卻至室溫且藉由添加水來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC (CH 2Cl 2/MeOH = 30:1)純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(2-氯乙基)-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(300.0 mg,0.54 mmol,67.96%)。LC-MS (ES, m/z): 555/557 (M+H +)。
步驟6:在氮氣氛圍下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(2-氯乙基)-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(300.0 mg,0.54 mmol)及TEA (164.0 mg,1.62 mmol)於ACN (12 mL)之攪拌溶液中添加DMAP (198.0 mg,1.62 mmol)及2,4,6-參(丙-2-基)苯-1-磺醯氯(818.0 mg,2.70 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌2 h。在室溫下向以上混合物中逐滴添加NH 3.H 2O (6.0 mL)。將所得混合物在室溫下再攪拌1 h,然後在減壓下濃縮。藉由製備型TLC (CH 2Cl 2/MeOH = 10:1)純化殘餘物,得到呈黃色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(2-氯乙基)-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(280.0 mg,0.51 mmol,93.50%)。LC-MS (ES, m/z): 554/556 (M+H +)。
步驟7:在0℃,氮氣氛圍下向4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(2-氯乙基)-3-氟基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(50 mg,0.09 mmol)於MeOH (0.5 mL)之攪拌溶液中逐滴添加HF水溶液(0.5 mL,14.62 mmol,50%)。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化所得混合物:管柱,C18矽膠;流動相A:水(0.1% TFA),流動相B:MeCN,在15 min內0% B至50%梯度;在254 nm下UV偵測。將含有產物之級分合併且部分蒸發以移除溶劑,然後冷凍乾燥隔夜,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(2-氯乙基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(4.6 mg,0.01 mmol,14.98%)。LC-MS (ES, m/z): 326/328 (M+H +)。LCMS之條件:(管柱:Shim-pack Scepter C18,30*3.0 mm,2.0 μm;流動相A:水/0.05%TFA,流動相B:ACN/0.05%TFA;流率:1.5000 mL/min;梯度:在1.70 min內5% B至40% B,在0.60 min內40% B至100% B,在0.50 min內100% B至100% B,在0.03 min內100% B至5% B;波長:254 nm;RT1(min):0.71)。 1H NMR (400 MHz, 甲醇- d 4) δ 8.24 (d, J= 6.8 Hz, 1H), 6.24 – 6.19 (m, 1H), 5.22 (t, J= 3.6 Hz, 0.5H), 5.09 (t, J= 3.6 Hz, 0.5H), 4.45 – 4.40 (m, 1H), 3.75 – 3.65 (m, 4H), 2.32 – 2.18 (m, 2H)。 實例 90- 化合物 175 4- 胺基 -1-((2R,3S,4R,5R)-5-( 氯甲基 -d2)-3- 氟基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- )-5- 氟基嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在室溫下向1-[(2R,3S,4R,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-3-氟基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(3.0 g,7.93mmol)於ACN (60 mL)之攪拌溶液中分批添加IBX (4.4 g,15.85 mmol)。在70℃,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌2 h。使混合物冷卻至室溫且過濾。用MeCN (5 x10 mL)洗滌濾餅。將合併之濾液在減壓下濃縮。此得到呈白色固體之(2S,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(2.9 g,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 377(M+H +)。
步驟2:向(2S,3R,4S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(2.9 g,7.70 mmol)及甲醛- d 2 (3 mL,37%於水中)於1,4-二噁烷(30 mL)之攪拌溶液中逐滴添加NaOH水溶液(6 mL,2M)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。在0℃下向以上混合物中分批添加EtOH (9 mL)及NaBH 4(1.22 g,32.36 mmol)。將所得混合物在室溫下再攪拌1 h,然後藉由在0℃下添加飽和NH 4Cl (水溶液)(200 mL)來淬滅。將所得混合物用EtOAc (3 x 200 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(3x200 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之1-((2R,3S,4R,5S)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-3-氟基-5-(羥甲基)-5-(羥甲基- d 2 )四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(1.5 g,3.62 mmol,兩個步驟46.1 %產率)。LC-MS (ES, m/z): 411 (M+H +)。
步驟3:在-30℃,氮氣氛圍下向1-((2R,3S,4R,5S)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-3-氟基-5-(羥甲基)-5-(羥甲基- d 2 )四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(1.5 g,3.62 mmol)於吡啶(12 mL)之攪拌溶液中逐滴添加Tf 2O (2.55 g,9.05 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌2 h且藉由在0℃下添加飽和NaHCO 3(水溶液)(200 mL)來淬滅。將所得混合物用EtOAc (2 x 200 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x200 mL)洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈棕色固體之三氟甲烷磺酸((2S,3R,4S,5R)-3-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-2-((((三氟甲基)磺醯基)氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)甲基- d 2 酯(1.7 g,2.52 mmol,86.2%)。LC-MS (ES, m/z): 675 (M+H +)。
步驟4:在室溫下向三氟甲烷磺酸((2S,3R,4S,5R)-3-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-2-((((三氟甲基)磺醯基)氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)甲基- d 2 酯(1.7 g,2.52 mmol)於THF (17 mL)之攪拌溶液中逐滴添加TEA (2.55 g,25.20 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌3 h。向以上混合物中添加LiCl (1.3 g,2.48 mmol)且將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。隨後在室溫下添加NaOH (195.0 mg,4.87 mmol)於水(2 mL)中之溶液。將所得混合物在室溫下再攪拌3 h,然後藉由添加水(20 mL)來淬滅。用EtOAc (3 x 50 mL)萃取所得溶液。將有機層用鹽水洗滌,且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (20:1)溶析之矽膠層析法純化殘餘物,得到呈棕黃色固體之1-((2R,3S,4R,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(氯甲基- d 2 )-3-氟基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(705.0 mg,1.64 mmol,67.48%)。LC-MS (ES, m/z): 429 (M+H +)。
步驟5:在0℃,氮氣氛圍下向1-((2R,3S,4R,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(氯甲基- d 2 )-3-氟基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(700.0 mg,1.64 mmol)及咪唑(159.0 mg,3.34 mmol)於DMF (10 mL)之攪拌溶液中分批添加TBSCl (991.0 mg,6.56 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌隔夜,然後藉由在0℃下添加飽和NaHCO 3水溶液(100 mL)來淬滅。將所得混合物用EtOAc (2 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2 x 50 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (2:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-((2R,3S,4R,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-5-(氯甲基- d 2 )-3-氟基四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(510.0 mg,0.92 mmol,78.9%)。LC-MS-PH(ES, m/z): 543 (M+H +)。
步驟6:在室溫下向1-((2R,3S,4R,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-5-(氯甲基- d 2)-3-氟基四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(500.0 mg,0.92 mmol)及TEA (279.0 mg,2.760 mmol)於CH 3CN (20 mL)之攪拌溶液中分批添加DMAP (337.0 mg,2.76 mmol)及TPSCl (1394.0 mg,4.60 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。在室溫下向以上混合物中逐滴添加NH 3.H 2O (10 mL)。將所得混合物在室溫下再攪拌1 h,然後藉由添加水(100 mL)來淬滅。將所得混合物用EtOAc (3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水(2x100 mL)洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-4-((三級丁基-二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-5-(氯甲基- d 2 )-3-氟基-四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮(400.0 mg,0.74 mmol,80.4%)。LC-MS (ES, m/z): 542 (M+H +)。
步驟7:在室溫下向4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-5-(氯甲基- d 2 )-3-氟基四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮(400.0 mg,0.74 mmol)於MeOH (8.00 mL)之攪拌溶液中分批添加NH 4F (800.0 mg,21.60 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜。過濾所得混合物;用EtOH (5 x 5 mL)洗滌濾餅。在減壓下濃縮合併之濾液。藉由製備型HPLC急速層析法在以下條件下純化殘餘物:管柱:XBridge Prep OBD C18管柱,30*150 mm,5μm;流動相A:水(10mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:100 mL/min;梯度:在20 min內10% B至70% B;波長:254nm/220nm。將含有產物之級分合併且部分蒸發以移除溶劑,然後冷凍乾燥隔夜,得到呈白色固體之4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-5-(氯甲基- d 2 )-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮(48.2 mg,0.15 mmol,20.21%)。LC-MS (ES, m/z): 314 (M+H +); 99.9%純度。HPLC之條件:(管柱:XBridge Shield RP C18, 100*4.6 mm,2.2 μm;流動相A:水/5mM NH 4HCO 3,流動相B:ACN;流率:1.5000 mL/min;梯度:在10.00 min內0% B至30% B,在2.00 min內30% B至95% B,在1.7 min內95% B至95% B,在0.3min內95% B至95% B;波長:254/220 nm;RT1(min):4.63)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.94 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.89 (brs, 1H), 7.64 (brs, 1H), 6.25 – 6.20 (m, 1H), 6.19 (d, J= 4.8 Hz, 1H), 5.48 – 5.43 (m, 1H), 5.23 (t, J= 4.0 Hz, 0.5H), 5.09 (t, J= 4.0 Hz, 0.5H), 4.47 – 4.40 (m, 1H), 3.65 – 3.61 (m, 2H)。 實例 91- 化合物 125 4- 胺基 -5- 氟基 -1-((2R,3S,4R,5R)-3- 氟基 -5-(2- 氟基乙基 )-4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- ) 嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟1:在室溫,N 2氛圍下向1-((2R,3S,4R,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-3-氟基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(20 g,52.9 mmol)於ACN (300 mL)之攪拌溶液中添加IBX (37 g,132.1 mmol)。將所得混合物在60℃下攪拌2 h且使其冷卻至室溫。過濾所得混合物且用ACN洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液,得到產物(12 g,粗品),其未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 377 [M+H] +
步驟2:在0℃,N 2氛圍下向(2S,3R,4S,5R)-3-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)四氫呋喃-2甲醛(12 g,31.9 mmol)及多聚甲醛(4.8 g,159 mmol)於二噁烷(150 mL)之攪拌溶液中逐滴添加含NaOH (3.8 g,95.6 mmol)之H 2O (15 mL)。將所得混合物在室溫下攪拌15 h。在0℃,N 2氛圍下向以上混合物中分批添加NaBH 4(3.6 g,95.6 mmol)。將所得混合物在室溫下再攪拌1 h。將反應在0℃下用飽和NH 4Cl溶液淬滅且用EtOAc (3 x 300 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用DCM/MeOH (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-((2R,3S,4R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(6.5 g,15.9 mmol,44.9%)。LC-MS (ES, m/z): 409 [M+H] +
步驟3:在室溫,N 2氛圍下將1-((2R,3S,4R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-3-氟基-5,5-雙(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(6.5 g,15.9 mmol)及DMTrCl (5.4 g,17.5 mmol)於吡啶(100 mL)中之溶液攪拌12 h。將所得混合物在真空下濃縮。然後將殘餘物用水稀釋且用EtOAc (3 x 100 mL)萃取。將所得混合物用鹽水洗滌。將有機層經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用DCM/MeOH (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-((2R,3S,4R,5S)-5-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-3-氟基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(9.4 g,13.3 mmol,75.1%)。LC-MS (ES, m/z): 709 [M-H] -
步驟4:在室溫,N 2氛圍下向1-((2R,3S,4R,5S)-5-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-3-氟基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(7.5 g,10.6 mmol)及咪唑(3.6 g,52.7 mmol)於DMF (60 mL)之攪拌混合物中分批添加TBSCl (3.9 g,26.4 mmol)。將混合物在60℃下攪拌16 h,然後將混合物冷卻至室溫。將所得混合物用水稀釋且用EtOAc (3 x 200 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之1-((2R,3S,4R,5R)-5-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-3-氟基四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(6.1 g,7.39 mmol,69.5%)。LC-MS (ES, m/z): 825 [M+H] +
步驟5:在室溫,N 2氛圍下將1-((2R,3S,4R,5R)-5-((雙(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-3-氟基四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(6.1 g,7.39 mmol)於水(8 mL)及AcOH (32 mL)中之溶液攪拌16 h。在減壓下濃縮所得混合物。藉由用PE/EtOAc (2:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈黃色固體之1-((2R,3S,4R,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-3-氟基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(2.2 g,4.21 mmol,57.4%)。LC-MS (ES, m/z): 523 [M+H] +
步驟6:在室溫,N 2氛圍下向1-((2R,3S,4R,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-3-氟基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(2.2 g,4.21 mmol)於ACN (20 mL)之攪拌混合物中分批添加IBX (3.5 g,12.6 mmol)。將混合物在60℃下攪拌2 h。將混合物冷卻至室溫。過濾所得混合物;用ACN洗滌濾餅。在減壓下濃縮濾液,得到產物(2.1 g,粗品),其未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 521 [M+H] +
步驟7:在0℃,N 2氛圍下向PPh 3MeBr (4.5 g,12.7 mmol)於THF (30 mL)之攪拌混合物中分批添加t-BuOK (1.4 g,12.7 mmol)。將混合物在室溫下攪拌1 h。然後在0℃下添加(2R,3R,4S,5R)-3-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-2-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)四氫呋喃-2甲醛(2.2 g,4.22 mmol)且將混合物在室溫下再攪拌15 h。將所得混合物在0℃下用水淬滅且用EtOAc (3 x 100 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (2:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之1-((2R,3S,4R,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-3-氟基-5-乙烯基四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(1.3 g,2.51 mmol,59.3%)。LC-MS (ES, m/z): 519 [M+H] +
步驟8:在室溫,N 2氛圍下向1-((2R,3S,4R,5R)-4-((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-3-氟基-5-乙烯基四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(1.3 g,2.51 mmol)於THF (10 mL)之攪拌溶液中逐滴添加TBAF (5 mL,5 mmol,1.0 M於THF中)。將所得混合物在室溫下攪拌1 h。將所得混合物用水稀釋且用EtOAc (3 x 50 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌,且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用DCM/MeOH (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之5-氟基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)-5-乙烯基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(728 mg,2.51 mmol,99.9%)。LC-MS (ES, m/z): 291 [M+H] +
步驟9:在0℃,N 2氛圍下向5-氟基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)-5-乙烯基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(800 mg,2.75 mmol)及THP (8 mL)於DMF (10 mL)之攪拌溶液中分批添加p-TsOH (512 mg,2.91 mmol)。在室溫,N 2氛圍下將所得混合物攪拌4 h。用TEA將混合物中和至pH 7。將所得混合物用水稀釋且用EtOAc (3 x 50 mL)萃取。將合併之有機層用飽和NaHCO 3溶液洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC (PE/EA = 1:1)純化殘餘物,得到呈白色固體之5-氟基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)-5-(((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)甲基)-5-乙烯基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(850 mg,1.86 mmol,67.3%)。LC-MS (ES, m/z): 457 [M-H] -
步驟10:在0℃,N 2氛圍下向5-氟基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)-5-(((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)甲基)-5-乙烯基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(200 mg,440 μmol)於THF (8 mL)之攪拌溶液中逐滴添加BH 3-THF (1.3 mL,1.32 mmol,1.0 M於THF中)。將所得混合物在室溫下攪拌2 h。在0℃下向以上混合物中逐滴添加水(2 mL)。將所得混合物在0℃下再攪拌10 min。在0℃下向以上混合物中逐滴添加NaOH溶液(1 mL,3.0 M於H 2O中)。將所得混合物在0℃下再攪拌2 min。在0℃下向以上混合物中逐滴添加H 2O 2(928 mg,8.19 mmol,30%於H 2O中)。將所得混合物在室溫下再攪拌2 h。將混合物在0℃下用飽和Na 2S 2O 3溶液淬滅且用EtOAc (3 x 50 mL)萃取。將合併之萃取物經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC (DCM/MeOH=10:1)純化殘餘物,得到呈白色固體之5-氟基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(2-羥乙基)-4-((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)-5-(((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(275 mg,578 μmol,33.1%)及5-氟基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(2-羥乙基)-5-(羥甲基)-4-((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(370 mg,944 μmol,35.5%)。LC-MS (ES, m/z): 477 [M+H] +。LC-MS (ES, m/z): 393 [M+H] +
步驟11:在0℃,N 2氛圍下向5-氟基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(2-羥乙基)-4-((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)-5-(((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(275 mg,578 μmol)於DCM (10 mL)之攪拌溶液中逐滴添加TEA (146 mg,1.45 mmol)及乙烷磺醯氯(111 mg,867 μmol)。在室溫,N 2氛圍下將所得混合物攪拌1 h。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型TLC (EA)純化殘餘物,得到呈白色固體之乙烷磺酸2-((2R,3R,4S,5R)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-3-((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)-2-(((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)乙酯(270 mg,470 μmol,96.4%)。LC-MS-P (ES, m/z): 567 [M-H] -
步驟12:在室溫,N 2氛圍下向乙烷磺酸2-((2R,3R,4S,5R)-4-氟基-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)-3-((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)-2-(((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)乙酯(270 mg,470 μmol)於THF (8 mL)之攪拌溶液中逐滴添加TBAF (1.9 mL,1.88 mmol,1.0 M於THF中)。在室溫,N 2氛圍下將所得混合物攪拌15 h。將所得混合物用水稀釋且用EtOAc (3 x 50 mL)萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由製備型TLC (DCM/MeOH = 10:1)純化殘餘物,得到呈白色固體之5-氟基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(2-氟基乙基)-4-((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)-5-(((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(260 mg,540 μmol,96.1%)。LC-MS (ES, m/z): 477 [M-H] -
步驟13:在室溫,N 2氛圍下向5-氟基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(2-氟基乙基)-4-((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)-5-(((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(260 mg,540 μmol)於ACN (8 mL)之攪拌溶液中添加TEA (109 mg,1.08 mmol)及DMAP (132 mg,1.08 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌10 min。在室溫下向以上混合物中添加TPSCl (329 mg,1.08 mmol)。將所得混合物在室溫下再攪拌15 h。在室溫下向以上混合物中逐滴添加濃NH 3.H 2O溶液(1 mL)。將所得混合物在室溫下再攪拌30 min。在減壓下濃縮所得混合物。藉由製備型TLC (DCM/MeOH =10:1)純化殘餘物,得到呈白色固體之4-胺基-5-氟基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(2-氟乙基)-4-((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)-5-(((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)甲基)四氫呋喃-2-基) 嘧啶-2(1H)-酮(240 mg,503 μmol,92.5%)。LC-MS (ES, m/z): 478 [M+H] +
步驟14:在室溫,N 2氛圍下向4-胺基-5-氟基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(2-氟乙基)-4-((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)-5-(((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮(240 mg,503 μmol)於MeOH (6 mL)之攪拌溶液中分批添加p-TsOH (207 mg,1.01 mmol)。在室溫,N 2氛圍下將所得混合物攪拌3 h。將所得混合物在真空下濃縮且藉由製備型TLC (DCM/MeOH =10:1)純化,得到粗產物。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(管柱:Xbridge Phenyl OBD管柱,19*150 mm,5m;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:20 mL/min;梯度:在20 min內8% B至25% B;RT1(min):9.89)。收集級分且在真空下濃縮,將殘餘物再溶解於CH 3CN及H 2O中,然後冷凍乾燥,得到呈白色固體之4-胺基-5-氟基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(2-氟乙基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基) 嘧啶-2(1H)-酮(8 mg,26 μmol,4.3%)。LC-MS (ES, m/z): 310 [M+H] +, 98.9%純度。HPLC之條件:(XBridge Shield RP C18, 100*4.6 mm,3.5 μm;流動相A:水/5 mM NH 4HCO 3,流動相B:乙腈;流率:1.50 mL/min;梯度:在10.00 min內0% B至30% B,在2.00 min內30% B至95% B,在1.70 min內95% B至95% B;波長:254 nm;RT1(min):4.381)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.05 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.84 (s, 1H), 7.60 (s, 1H), 6.10 (ddd, J= 13.4, 4.8, 1.9 Hz, 1H), 6.05 – 5.95 (m, 1H), 5.40 – 5.30 (m, 1H), 5.12 (dt, J= 53.4, 4.4 Hz, 1H), 4.72 – 4.46 (m, 2H), 4.43 – 4.30 (m, 1H), 3.56 (dd, J= 12.3, 5.1 Hz, 1H), 3.45 (dd, J= 11.9, 5.3 Hz, 1H), 2.18 – 1.84 (m, 2H)。 實例 92- 化合物 179 5- 氟基 -1-((2R,3S,4R,5R)-3- 氟基 -4- 羥基 -5-(2- 羥乙基 )-5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- ) 嘧啶 -2,4(1H,3H)- 二酮之合成
在室溫,N 2氛圍下向5-氟基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-5-(2-羥乙基)-5-(羥甲基)-4-((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(370 mg,944 μmol)於MeOH (10 mL)之攪拌溶液中分批添加p-TsOH (243 mg,1.42 mmol)。在室溫,N 2氛圍下將所得混合物攪拌3 h。將混合物濃縮且藉由製備型TLC (DCM/MeOH = 5:1)純化,得到粗產物。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(管柱:Xbridge Phenyl OBD管柱,19*150 mm,5 μm;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;流率:20 mL/min;梯度:在20 min內8% B至25% B;波長:254 nm;RT1(min):9.89)。收集級分且在真空下濃縮,將殘餘物再溶解於CH 3CN及H 2O中,然後冷凍乾燥,得到呈白色固體之5-氟基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(2-羥乙基)-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(20.1 mg,65 μmol,6.8%)。LC-MS (ES, m/z): 309 [M+H] +, 97.6%純度。HPLC之條件:(Atlantis T3, 100*4.6 mm,3 μm;流動相A:H 2O+0.05% TFA,流動相B:can + 0.05% TFA;流率:1.50 mL/min;梯度:在8.00 min內0% B至95% B,在2.00 min內95% B至95% B,在0.50 min內95% B至10% B;波長:254 nm;RT1(min):2.48)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 9.34 (d, J= 212.2 Hz, 1H), 8.23 (dd, J= 7.2, 2.4 Hz, 1H), 6.11 (ddd, J= 10.8, 5.2, 1.8 Hz, 1H), 5.90 (s, 1H), 5.41 (s, 1H), 5.17 (dt, J= 53.9, 5.1 Hz, 1H), 4.58 (s, 1H), 4.37 (dd, J= 23.0, 4.9 Hz, 1H), 3.65 – 3.57 (m, 1H), 3.53 (t, J= 6.8 Hz, 2H), 3.43 (d, J= 12.0 Hz, 1H), 1.82 – 1.61 (m, 2H)。 實例 93- 化合物 96 1-((2R,4S,5S)-4- 疊氮基 -5-( 氯甲基 )-5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- )-5- 甲基嘧啶 -2,4(1H,3H)- 二酮之合成
步驟1:在0℃下向1-((2R,4S,5S)-4-疊氮基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(50g,187.09 mmol)於乙醇(250mL)之攪拌溶液中添加boc酸酐(94mL,411.5mmol),隨後添加10% wt. Pd/C (5.0g)。在室溫,氫氣氛圍(60 psi)下將反應混合物在高壓釜(1L)中攪拌16 h後,通過矽藻土床過濾反應混合物,且用乙醇洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液,得到呈灰白色固體之所需產物 (35g,54.80%)。LC-MS (ES, m/z): 386.2 (M+45)。
步驟2:向((2S,3S,5R)-2-(羥甲基)-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)四氫呋喃-3-基)胺甲酸三級丁酯(20 g,58.58 mmol)於MeCN (200 mL)之溶液中添加IBX(50 g,175.7mmol)且將反應在90℃下攪拌2 h。藉由TLC監測反應進展。完成後,過濾反應混合物且濃縮濾液,得到粗醛材料,其原樣用於下一步驟中。將粗醛材料用1,4-二噁烷(200 mL)及甲醛(20 mL,585.8 mmol)稀釋,隨後在0℃下添加2N NaOH (40 mL,234.3 mmol)且在室溫下攪拌12小時。藉由TLC監測反應進展。完成後,以分批方式添加硼氫化鈉(4.5g,117.7 mmol)且攪拌1小時。藉由TLC及LCMS監測反應進展。完成後,將反應混合物用氯化銨淬滅,然後用EtOAc (250 mL)及水(100 mL)分配。分離有機層,用EtOAc (2x100mL)萃取水層且將合併之有機物經Na 2SO 4乾燥,濃縮,藉由用含65% EtOAc之正己烷溶析之CombiFlash管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之所需產物 (13g,59.75%)。LC-MS (ES, m/z): 372.10 (M+H)。
步驟3:向((3S,5R)-2,2-雙(羥甲基)-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)四氫呋喃-3-基)胺甲酸三級丁酯(13g,35.00 mmol)於DCM (150 mL)之溶液中添加吡啶(13 mL,175.0 mmol)且將反應攪拌15 min。在0℃下向以上混合物中添加BzCl (9.38 mL,87.50 mmol)且繼續在室溫下攪拌2 h。藉由TLC及LCMS監測反應進展。完成後,將反應混合物分配於水(100 mL)與DCM (250 mL)之間。將有機層分離,經Na 2SO 4乾燥,濃縮且藉由用含38% EtOAc之正己烷溶析之CombiFlash管柱層析法純化所得殘餘物,得到呈白色固體之所需產物 (18g,88.72%)。LC-MS (ES, m/z): 580.15 (M+H)。
步驟4:在0℃下向雙(亞甲基)二苯甲酸((3S,5R)-3-((三級丁氧基羰基)胺基)-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)四氫呋喃-2,2-二基)酯(18g,31.05 mmol)於DCM (50 mL)之溶液中添加含4N HCl之二噁烷(50 mL,93.16 mmol)。反應混合物在室溫下攪拌4 h後,將反應混合物在減壓下濃縮且與乙醚共蒸餾以移除過量HCl氣體。用正己烷濕磨殘餘物,得到呈淡粉色固體之粗化合物(16 g),其原樣用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 480.15 (M+H)。
步驟5:在0℃下向雙(亞甲基)二苯甲酸((3S,5R)-3-胺基-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)四氫呋喃-2,2-二基)酯(12.5 g,26.06 mmol)於甲醇(120 mL)之溶液中添加碳酸鉀(8.4 g,65.17 mmol),隨後相繼添加CuSO 4.5H 2O (620 mg,2.606 mmol)及1H-咪唑-1-磺醯基疊氮HCl (7.6 g,39.10 mmol)。反應混合物在室溫下攪拌5 h後,將反應混合物分配於水(100 mL)與DCM (250 mL)之間。將有機層分離,經Na 2SO 4乾燥,濃縮且藉由用含35% EtOAc之正己烷溶析之CombiFlash管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之所需產物 (6 g,48.98%)。LC-MS (ES, m/z):504.05 (M-H)。
步驟6:在0℃下向雙(亞甲基)二苯甲酸((3S,5R)-3-疊氮基-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)四氫呋喃-2,2-二基)酯(6 g,11.86 mmol)於甲醇(10 mL)之攪拌溶液中添加甲醇氨(15 mL,35.60 mmol)。反應混合物在室溫下攪拌16 h後,將反應混合物濃縮且藉由用含60% EtOAc之正己烷溶析之CombiFlash管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之所需產物 (2.45 g,69.41%)。LC-MS (ES, m/z): 295.90 (M-H)。
步驟7:向1-((2R,4S)-4-疊氮基-5,5-雙(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(0.5g,1.68 mmol)於DCM (5 mL)之溶液中添加吡啶(0.667 mL,8.409 mmol),且攪拌至-35℃後,以逐滴方式添加三氟甲酸酐(0.852 mL,5.045 mmol)。然後將反應在-35℃下攪拌2 hr。將反應混合物用飽和碳酸氫鈉淬滅且用EtOAc萃取,將有機層用鹽水洗滌且經Na 2SO 4乾燥,在真空下濃縮有機層且藉由用含55% EtOAc之正己烷溶析之CombiFlash管柱層析法純化殘餘物,得到呈灰白色固體之所需產物 (0.5 g,52.97%)。LC-MS (ES, m/z): 559.90 (M-H)。
步驟8:在室溫,氮氣氛圍下向雙(亞甲基)雙(三氟基甲烷磺酸)((3S,5R)-3-疊氮基-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3,4-二氫嘧啶-1(2H)-基)四氫呋喃-2,2-二基)酯(250mg,0.426 mmol)於THF (5 mL)之攪拌溶液中添加Et 3N (0.6 mL,4.260 mmol)。反應混合物在50℃下攪拌3小時後,將反應混合物冷卻至室溫且向其中分批添加LiCl (60 mg,1.28 mmol)。將反應混合物在室溫下攪拌16 h,然後藉由TLC及LCMS監測反應進展。完成後,逐滴添加1N NaOH溶液(0.5 mL,1.07 mmol)。反應混合物攪拌3 h後,將反應混合物用EtOAc萃取,用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,在真空下濃縮且藉由製備型HPLC使用此等條件純化殘餘物;流動相:A= 含0.1% HCOOH之水,B= MeCN;管柱:Waters X BRIDGE(150mmx20.0mm),5.0µ;流動:15mL/min梯度程式:時間%B:0/20, 2/30, 8/60,得到呈灰白色固體之所需產物 (6 mg,4.26% (三個步驟之總產率))。LC-MS (ES, m/z): 316.1 (M-H)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ = 11.32 (br s, 1H), 7.61 (s, 1H), 6.17 (t, J= 6.3 Hz, 1H), 5.45 (t, J= 5.2 Hz, 1H), 4.71 (t, J= 7.6 Hz, 1H), 3.84 - 3.72 (m, 2H), 3.68 - 3.55 (m, 2H), 2.59 - 2.54 (m, 1H), 2.47 - 2.40 (m, 1H), 1.83 - 1.75 (m, 3H)。 實例 94- 化合物 180 1-((2R,4S,5R)-4- 氟基 -5-( 羥甲基 )-5- 甲基四氫呋喃 -2- )-5- 甲基嘧啶 -2,4(1H,3H)- 二酮之合成
步驟1:在室溫,N 2氛圍下向1-((2R,4S,5R)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-5-(氯甲基)-4-氟基四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(47 mg,116 μmol)於甲苯(2 mL)之攪拌溶液中添加AIBN (38 mg,232 μmol)及n-Bu 3SnH (202 mg,696 μmol)。將反應混合物在100℃下攪拌3 h。將所得混合物冷卻至室溫,在減壓下濃縮且藉由製備型TLC (PE/EtOAc = 1:1)純化,得到呈白色固體之1-((2R,4S,5R)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-4-氟基-5-甲基四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(31 mg,83 μmol,72.1%)。LC-MS (ES, m/z): 373 [M+H] +
步驟2:向1-((2R,4S,5R)-5-(((三級丁基二甲基矽烷基)氧基)甲基)-4-氟基-5-甲基四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(31 mg,83 μmol)於THF (4 mL)及H 2O (1.2 mL)之攪拌溶液中添加TFA (0.8 mL)。在室溫,N 2氛圍下將反應攪拌16 h。將所得混合物在真空下濃縮且藉由製備型HPLC在以下條件下純化(管柱:X-Select Prep OBD C18管柱,30*150 mm,5 μm;流動相A:水(0.1% FA),流動相B:20 mm NaOH+10% ACN;流率:60 mL/min;梯度:在7 min內30% B至50% B;波長:254 nm/220 nm;RT1(min):6.56)。收集級分且在真空下濃縮,將殘餘物再溶解於CH 3CN及H 2O中,然後冷凍乾燥,得到呈灰白色固體之1-((2R,4S,5R)-4-氟基-5-(羥甲基)-5-甲基四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(2.7 mg,10 μmol,12.5%)。LC-MS (ES, m/z): 259 [M+H] +, 99.7%純度。LCMS之條件:(管柱:Shim‐pack Scepter C18管柱,33*3.0 mm,3.0 μm;流動相A:水/5 mM NH 4HCO 3,流動相B:乙腈;流率:1.50 mL/min;梯度:在1.20 min內10% B至95% B,在0.60 min內95% B至95% B,在0.02 min內95% B至10% B;波長:254/220 nm;RT1(min):0.517)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 11.34 (s, 1H), 7.78 – 7.74 (m, 1H), 6.20 (t, J= 7.4 Hz, 1H), 5.34 (t, J= 5.1 Hz, 1H), 5.27 – 5.03 (m, 1H), 3.48 (dd, J= 5.2, 1.8 Hz, 2H), 2.46 (s, 1H), 2.43 – 2.37 (m, 1H), 1.78 (d, J= 1.2 Hz, 3H), 1.17 (d, J= 4.4 Hz, 3H)。 實例 95- 化合物 86-TP :四氫三磷酸 ((2R,3R,4S,5R)-5-(4- 胺基 -5- 氟基 -2- 側氧基嘧啶 -1(2H)- )-2-( 溴甲基 )-4- 氟基 -3- 羥基四氫呋喃 -2- ) 甲酯;肆 ( 三乙胺 ) 之合成
在0℃,N 2氛圍下向4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-5-(溴甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮(30 mg,84 μmol)於吡啶(2 mL)之攪拌溶液中逐滴添加POCl 3(194 mg,1.27 mmol)。將混合物在0℃下攪拌20 min,然後在0℃,N 2氛圍下添加(Bu 4N) 3HP 2O 7(1.1 g,1.27 mmol)及Bu 3N (312 mg,1.68 mmol)於DMF (2 mL)中之溶液。將反應在室溫下攪拌3 h。將反應在0℃下用TEAB緩衝液(1.0 M於H 2O中)淬滅且用DCM (7 x 10 mL)洗滌。將水相合併且在減壓下濃縮,得到粗產物。藉由離子交換管柱純化在以下條件下純化粗產物(管柱:HiTrap DEAE Sepharose FF,5 mL;流動相A:水,流動相B:水(0.5 M TEAB);流率:5 mL/min;梯度:在15 min內60% B至80% B;波長:254 nm/246 nm;RT1(min):8.7),得到粗產物。藉由製備型HPLC在以下條件下純化粗產物(管柱:YMC Triart C18 ExRs 5 μm,20*250 mm;流動相A:水(50 mM TEAB),流動相B:ACN;流率:25 mL/min;梯度:在10 min內3% B至20% B;波長:254 nm/220 nm;RT1(min):8.8)。收集級分且在真空下濃縮,將殘餘物再溶解於CH 3CN及H 2O中,然後冷凍乾燥,得到呈灰白色固體之四氫三磷酸((2R,3R,4S,5R)-5-(4-胺基-5-氟基-2-側氧基嘧啶-1(2H)-基)-2-(溴甲基)-4-氟基-3-羥基四氫呋喃-2-基)甲酯TEA鹽(2.9 mg,5 μmol,6.1%)。LCMS (ES, m/z): 594/596 [M-H] -, 95.4%純度。LCMS之條件:(管柱:Xselect HSS T3,100*4.6 mm,3.5 μm;流動相A:20 mM TEAA,流動相B:乙腈;流率:1.50 mL/min;梯度:在6.00 min內0% B至30% B,在2.00 min內30% B至95% B,在2.00 min內95% B至95% B,在0.20 min內95% B至0% B;波長:254/220 nm;RT1(min):2.555)。 1H NMR (400 MHz, D 2O) δ 8.02 (d, J= 6.3 Hz, 1H), 6.38 (dd, J= 11.0, 5.3 Hz, 1H), 5.38 (dt, J= 53.1, 5.1 Hz, 1H), 4.83 (dd, J= 24.1, 4.9 Hz, 1H), 4.18 (ddd, J= 34.1, 11.2, 4.6 Hz, 2H), 3.66 (q, J= 11.8 Hz, 2H), 2.90 (q, J= 7.3 Hz, 26H), 1.11 (q, J= 7.1 Hz, 39H)。 31P NMR (162 MHz, D 2O) δ -9.21, -11.85 (d, J= 20.7 Hz), -22.81。 實例 96- 化合物 181 1-[(2R,4S,5S)-4- 疊氮基 -5-( 羥甲基 )-5- 甲基氧雜環戊烷 -2- ]-5- 甲基 -3H- 嘧啶 -2,4- 二酮之合成
步驟1:在0℃下向反式-2-甲基-2-丁烯醛(20.0 g,237.76 mmol)及TEA (36.1 g,356.65 mmol)於DCM (300 mL)之攪拌溶液中逐滴添加TMSOTf (58.1 g,261.55 mmol)。將混合物在0℃下攪拌4 h,然後在室溫下攪拌隔夜。將反應藉由在0℃下添加飽和NaHCO 3(水溶液)來淬滅。將所得混合物用飽和NH 4Cl (水溶液)及飽和NaHCO 3(水溶液)洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由在減壓下蒸餾來純化粗產物,且在68-72℃下收集餾分,得到呈淡黃色油狀物之三甲基({[(1E)-2-甲基丁-1,3-二烯-1-基]氧基})矽烷(22.5 g,144.23 mmol,60.55%)。GC-MS (ES, m/z): 156 (M)。
步驟2:在室溫下向(二乙氧基甲氧基)乙烷(20.9 g,140.76 mmol)及ZnCl 2(29.7 g,218.17 mmol)於EtOAc (220 mL)之攪拌混合物中逐滴添加三甲基({[(1E)-2-甲基丁-1,3-二烯-1-基]氧基})矽烷(22.0 g,140.76 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌隔夜,然後藉由在0℃下添加飽和NaHCO 3(水溶液)來淬滅。過濾所得混合物;用乙醚洗滌濾餅。用EtOAc萃取所得溶液。將所得混合物用飽和NaHCO 3(水溶液)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (10:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色油狀物之(2E)-5,5-二乙氧基-2-甲基戊-2-烯醛(18.0 g,96.64 mmol,68.66%)。GC-MS (ES, m/z): 186 (M)。
步驟3:在0℃,氮氣氛圍下向(2E)-5,5-二乙氧基-2-甲基戊-2-烯醛(18.0 g,96.64 mmol)於乙醚(180 mL)之攪拌溶液中逐滴添加Red-Al (90 mL,70%於甲苯中)。將所得混合物在0℃下攪拌1 h,然後藉由在0℃下添加飽和NH 4Cl (水溶液)來淬滅。將所得混合物在室溫下攪拌30 min,然後過濾;用乙醚洗滌濾餅。用EtOAc萃取所得溶液。將有機層用飽和NaHCO 3(水溶液)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (5:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色油狀物之(2E)-5,5-二乙氧基-2-甲基戊-2-烯-1-醇(10.5 g,55.85 mmol,57.71%)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 5.36 – 5.31 (m, 1H), 4.68 (td, J= 5.6, 1.2 Hz, 1H), 4.44 (t, J= 5.6 Hz, 1H), 3.79 (d, J= 5.6, 2H), 3.60 – 3.52 (m, 2H), 3.47 – 3.40 (m, 2H), 2.28 – 2.24 (m, 2H), 1.55 (s, 3H), 1.11 (t, J= 7.2 Hz, 6H)。
步驟4:將粉末狀活化4A MS (5.29 g)於DCM (200 mL)中之混合物冷卻至-20℃。在-20℃下添加(2S,3S)-2,3-二羥基丁二酸1,4-雙(丙-2-基)酯(1.244 g,5.31 mmol)、肆(丙-2-基氧基)鈦(1.5 g,5.31 mmol)及氫過氧化三級丁基(9.6 g,106.23 mmol)。在-20℃下攪拌30 min後,在-20℃下逐滴添加(2E)-5,5-二乙氧基-2-甲基戊-2-烯-1-醇(10.0 g,53.12 mmol)於DCM (50 mL)中之溶液。將所得混合物在-20℃下混合物攪拌8 h,然後藉由在-20℃下添加NaOH於飽和鹽水中之溶液(10%)來淬滅。向以上混合物中添加無水Na 2SO 4及矽藻土。攪拌15 min且再靜置1 h後,過濾所得混合物且用乙醚洗滌濾餅。將合併之濾液經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (3:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色油狀物之[(2R,3R)-3-(2,2-二乙氧基乙基)-2-甲基環氧乙烷-2-基]甲醇(6.5 g,31.86 mmol,59.91%)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 4.79 (t, J= 6.0 Hz, 1H), 4.62 – 4.60 (m, 1H), 3.64 – 3.56 (m, 2H), 3.49 – 3.44 (m, 2H), 3.40 – 3.36 (m, 1H), 3.33 – 3.28 (m, 1H), 2.89 – 2.86 (m, 1H), 1.84 – 1.79 (m, 1H), 1.71 – 1.66 (m, 1H), 1.19 (s, 3H), 1.15 – 1.10 (m, 6H)。
步驟5:在室溫,氮氣氛圍下將疊氮基三甲基矽烷(5.0 g,43.40 mmol)及異丙醇鈦(IV) (13.5 g,47.49 mmol)之混合物攪拌60 min。然後將[(2R,3R)-3-(2,2-二乙氧基乙基)-2-甲基環氧乙烷-2-基]甲醇(5.0 g,24.48 mmol)於甲苯(200 mL)中之溶液添加至以上系統中。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌隔夜,然後藉由添加飽和NaHCO 3(水溶液)來淬滅。在室溫下攪拌1 h後,過濾所得混合物且用CHCl 3洗滌濾餅。將合併之濾液在減壓下濃縮。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (50:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色油狀物之(2S,3S)-3-疊氮基-5,5-二乙氧基-2-甲基戊烷-1,2-二醇(2.1 g,8.49 mmol,34.69%)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 4.73 (t, J= 5.2 Hz, 1H), 4.64 – 4.51 (m, 2H), 3.66 – 3.56 (m, 2H), 3.51 – 3.42 (m, 3H), 3.33 – 3.27 (m, 2H), 1.98 – 1.92 (m, 1H), 1.67 – 1.58 (m, 1H), 1.19 – 1.13 (m, 6H), 1.00 (s, 3H)。
步驟6:向(2S,3S)-3-疊氮基-5,5-二乙氧基-2-甲基戊烷-1,2-二醇(2.1 g,8.49 mmol)於EtOH (60 mL)之溶液中添加含HCl之EtOH (0.2 mL,10%)。將所得混合物在室溫下攪拌30 min,,隨後在室溫下添加K 2CO 3。將所得混合物在室溫下攪拌1 h。過濾所得混合物且用EtOAc洗滌濾餅,將合併之濾液在減壓下濃縮。此得到呈淡黃色油狀物之[(2S,3S)-3-疊氮基-5-乙氧基-2-甲基氧雜環戊烷-2-基]甲醇(1.5 g,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 156 (M-45) +
步驟7:在-15℃,氮氣氛圍下向[(2S,3S)-3-疊氮基-5-乙氧基-2-甲基氧雜環戊烷-2-基]甲醇(1.5 g,粗品)於吡啶(15 mL)之攪拌溶液中添加4-甲基苯甲醯氯(1.4 g,8.20 mmol)。在室溫,氮氣氛圍下將所得混合物攪拌16 h,然後在減壓下濃縮。將殘餘物溶解於CHCl 3中。將所得混合物用水、飽和NaHCO 3水溶液及鹽水洗滌。將所得溶液經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。藉由用PE/EtOAc (40:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色油狀物之4-甲基苯甲酸[(2S,3S)-3-疊氮基-5-乙氧基-2-甲基氧雜環戊烷-2-基]甲酯(1.9 g,5.96 mmol,79.81%)。LC-MS (ES, m/z): 274 (M-45) +
步驟8:在室溫下向胸腺嘧啶(789.8 mg,6.26 mmol)於HMDS (10 mL)之攪拌溶液中添加TMSCl (680.4 mg,6.26 mmol)。將所得混合物在120℃下攪拌隔夜,然後冷卻至室溫且在減壓下濃縮。將殘餘物溶解於ACN (20 mL)中,然後添加4-甲基苯甲酸[(2S,3S)-3-疊氮基-5-乙氧基-2-甲基氧雜環戊烷-2-基]甲酯(1.0 g,3.13 mmol)及TMSOTf (1.4 g,6.26 mmol)。將所得混合物在室溫下再攪拌12 h,然後藉由在0℃下添加飽和NaHCO 3(水溶液)來淬滅。將所得混合物用CHCl 3萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在減壓下濃縮濾液。此得到呈淡黃色油狀物之4-甲基苯甲酸[(2S,3S,5R)-3-疊氮基-2-甲基-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-基]甲酯(850 mg,粗品)。LC-MS (ES, m/z): 400 (M+H +)。
步驟9:向4-甲基苯甲酸[(2S,3S,5R)-3-疊氮基-2-甲基-5-(5-甲基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-基]甲酯(850.0 mg,1.89 mmol)於MeOH之攪拌溶液中添加NaOMe.MeOH (5.5 mL,30%)。將所得混合物在室溫下攪拌3 h,然後用Dowex 50wX8調節至pH 7。過濾所得混合物;用DCM洗滌濾餅。將合併之濾液在減壓下濃縮。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (30:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到粗產物,然後藉由逆相急速層析法進一步在以下條件下純化該粗產物:管柱,C18 silica gel;流動相A:水(10 mmol/L NH 4HCO 3),流動相B:ACN;在10 min內10% B至50%梯度;在254 nm下UV偵測。將含有產物之級分合併且部分蒸發以移除溶劑,然後冷凍乾燥隔夜,得到呈白色固體之1-[(2R,4S,5S)-4-疊氮基-5-(羥甲基)-5-甲基氧雜環戊烷-2-基]-5-甲基-3H-嘧啶-2,4-二酮(7.6 mg,0.03 mmol,1.43%)。LC-MS (ES, m/z): 282 (M+H +)。99.0%純度。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 11.28 (s, 1H), 7.73 (d, J= 1.2 Hz, 1H), 6.07 – 6.04 (m, 1H), 5.34 (t, J= 5.6 Hz, 1H), 4.47 (t, J= 7.6 Hz, 1H), 3.52 – 3.40 (m, 2H), 2.47 – 2.39 (m, 2H), 1.79 (d, J= 1.2 Hz, 3H), 1.11 (s, 3H)。 實例 97– 化合物 82 4- 胺基 -1-((2R,4S,5R)-5- 乙基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 四氫呋喃 -2- )-5- 氟基嘧啶 -2(1H)- 酮之合成
步驟12:4-胺基-1-((2 R,4 S,5 R)-4-(苄氧基)-5-乙基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1 H)-酮(16b)之合成。將4-胺基-1-[(2 R,4 S,5 R)-4-苄氧基-5-(羥甲基)-5-乙烯基-四氫呋喃-2-基]-5-氟基-嘧啶-2-酮15b (以上合成於實例34中) (160 mg,0.44 mmol)溶解於無水MeOH (6 mL)中且在氬氣下添加碳載鈀(10 wt.%負載,47.1 mg,0.04 mmol)。將混合物抽空且用氫氣吹掃歷時三個循環,然後在氫氣氣球下攪拌2 h。通過矽藻土塞過濾混合物且 真空中濃縮濾液。藉由急速層析法在矽膠上(梯度含0-20% MeOH之DCM)純化粗品,得到呈白色固體之4-胺基-1-((2 R,4 S,5 R)-4-(苄氧基)-5-乙基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1 H)-酮16b (131.2 mg,82%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 8.15 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.69 (s, 1H), 7.46 (s, 1H), 7.40 – 7.17 (m, 5H), 6.00 (td, J= 6.4, 2.1 Hz, 1H), 5.21 (d, J= 5.0 Hz, 1H), 4.57 (d, J= 12.0 Hz, 1H), 4.45 (d, J= 12.0 Hz, 1H), 4.20 (dd, J= 6.3, 4.6 Hz, 1H), 3.53 (dd, J= 11.7, 4.1 Hz, 1H), 3.44 (dd, J= 11.6, 4.3 Hz, 1H), 2.39 (ddd, J= 13.5, 6.3, 4.6 Hz, 1H), 2.15 (dt, J= 13.2, 6.4 Hz, 1H), 1.66 (dq, J= 15.0, 7.5 Hz, 1H), 1.53 (dq, J= 14.6, 7.4 Hz, 1H), 0.86 (t, J= 7.5 Hz, 3H)。
步驟13:在氬氣下向冷卻至-78℃的4-胺基-1-((2 R,4 S,5 R)-4-(苄氧基)-5-乙基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1 H)-酮 16b (130 mg,0.36 mmol)於無水DCM (8 mL)之溶液中添加三溴化硼溶液(1M於DCM中,0.89 mL,0.89 mmol)且將混合物在-78℃下攪拌5 h。完成後,將混合物在-78℃下用甲醇:吡啶之溶液(2:1,8 mL)淬滅且在相同溫度下攪拌1 h。溫熱至室溫後, 在真空中濃縮混合物且藉由急速層析法在矽膠上(梯度含0-20% MeOH之EtOAc)純化粗品兩次,得到呈白色固體之4-胺基-1-((2 R,4 S,5 R)-5-乙基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1 H)-酮(14.6 mg,15%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 8.15 (d, J= 7.3 Hz, 1H), 7.66 (s, 1H), 7.43 (s, 1H), 6.00 (td, J= 6.4, 2.1 Hz, 1H), 5.10 (td, J= 5.1, 1.4 Hz, 1H), 5.05 (dd, J= 4.9, 1.4 Hz, 1H), 4.23 (q, J= 5.2 Hz, 1H), 3.49 (dd, J= 11.5, 5.0 Hz, 1H), 3.39 (dd, J= 11.5, 5.1 Hz, 1H), 2.16 (ddd, J= 13.1, 6.1, 4.3 Hz, 1H), 2.08 (dt, J= 13.2, 6.4 Hz, 1H), 1.58 (dq, J= 15.0, 7.6 Hz, 1H), 1.45 (dq, J= 14.6, 7.4 Hz, 1H), 0.84 (t, J= 7.5 Hz, 3H); 19F NMR (376 MHz, DMSO- d 6 ) δ -167.58, -167.59, -167.60, -167.61。HPLC: 99.2%; HRMS: C 11H 16FN 3O 4[M+Na] +之計算值296.1022, 實驗值296.1020。 實例 98- 化合物 182 4- 胺基 -1-[(2R,3S,4R,5R)-5-( 氯甲基 )-3- 氟基 -4- 羥基 -5-( 羥甲基 ) 氧雜環戊烷 -2- ]-5- 氟基嘧啶 -2- 酮之合成
步驟1:向2-甲基丙酸[(2R,3R,4S,5R)-2-(氯甲基)-4-氟基-5-[5-氟基-4-(2-甲基丙醯胺基)-2-側氧基嘧啶-1-基]-3-[(2-甲基丙醯基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(500 mg,0.96 mmol)於MeOH (10 mL)之溶液中添加NH 3.MeOH (7N, 3 mL)。將所得溶液在室溫,氮氣氛圍下攪拌隔夜,然後在真空下濃縮。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化殘餘物:管柱:C18;流動相A:水(0.1% NH 3HCO 3),流動相B:ACN;流率:100 mL/min;梯度:在15 min內10% B至100%,偵測器:UV 254 nm。此得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(250 mg,0.80 mmol,83.73%)。LC-MS (ES, m/z): 312 (M+H) +
步驟2:向4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(250 mg,0.80 mmol)於吡啶(4 mL)之溶液中添加TBSCl (250 mg,1.60 mmol)。在60℃,氮氣下將所得混合物攪拌隔夜。將混合物冷卻至室溫且用EtOAc (10 mL)稀釋。將溶液用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮,得到呈白色固體之4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-3-氟基-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(250 mg,0.59 mmol)。LC-MS (ES, m/z): 426 (M+H) +
步驟3:在0℃,氮氣下向4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-5-(氯甲基)-3-氟基-4-羥基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(250 mg,0.59 mmol)於ACN (10 mL)之溶液中添加DMAP (150 mg,1.17 mmol)。隨後在0℃下添加2-甲基丙酸2-甲基丙醯酯(95 mg,0.58 mmol)。在0℃、氮氣下將混合物攪拌1 h,然後藉由添加水來淬滅。將混合物用EtOAc萃取,用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮,得到呈黃色固體之2-甲基丙酸(2R,3R,4S,5R)-5-(4-胺基-5-氟基-2-側氧基嘧啶-1-基)-2-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-2-(氯甲基)-4-氟基氧雜環戊烷-3-酯(240 mg粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 496 (M+H) +
步驟4:向2-甲基丙酸(2R,3R,4S,5R)-5-(4-胺基-5-氟基-2-側氧基嘧啶-1-基)-2-{[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]甲基}-2-(氯甲基)-4-氟基氧雜環戊烷-3-酯(240 mg,粗品)於MeOH (5 mL)之溶液中添加NH 4F (270 mg,7.26 mmol)。在60℃,氮氣下將所得混合物攪拌隔夜,然後冷卻至室溫且在真空下濃縮。過濾混合物;用丙酮洗滌濾餅。將合併之濾液在真空下濃縮。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化殘餘物:管柱:C18;流動相A:水(0.1% NH 3HCO 3),流動相B:ACN;流率:100 mL/min;梯度:在15 min內10% B至100%,偵測器:UV 254 nm。此得到呈白色固體之2-甲基丙酸(2R,3R,4S,5R)-5-(4-胺基-5-氟基-2-側氧基嘧啶-1-基)-2-(氯甲基)-4-氟基-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-3-酯(85.5 mg,0.22 mmol,兩個步驟38.03%產率)。LC-MS (ES, m/z): 382 (M+H) +98.2%純度。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 8.00 (d, J = 7.2 Hz, 1H), 7.93 (brs, 1H), 7.70 (brs, 1H), 6.33 – 6.28 (m, 1H), 5.62 – 5.57 (m, 2H), 5.39 – 5.25 (m, 1H), 3.94 (d, J = 11.6 Hz, 1H), 3.76 (d, J = 12.0 Hz, 1H), 3.70 – 3.63 (m, 2H), 2.69 – 2.65 (m, 1H), 1.15 (dd, J = 7.2, 3.2 Hz, 6H)。 實例 99- 化合物 183 2- 甲基丙酸 [(2R,3R,4S,5R)-5-(4- 胺基 -5- 氟基 -2- 側氧基嘧啶 -1- )-2-( 氯甲基 )-4- 氟基 -3- 羥基氧雜環戊烷 -2- ] 甲酯之合成
步驟1:在0℃,氮氣下向4-胺基-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(5.5 g,17.68 mmol)及DMAP (4.0 g,35.36 mmol)於吡啶(50 mL)之溶液中逐滴添加異丁酸酐(17.0 g,106.11 mmol)。將混合物在80℃下攪拌隔夜,然後冷卻至室溫且在真空下濃縮。將殘餘物用EtOAc稀釋,用檸檬酸及鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。過濾後,在真空下濃縮濾液。藉由用石油醚/EtOAc (1:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈白色固體之2-甲基丙酸[(2R,3R,4S,5R)-2-(氯甲基)-4-氟基-5-[5-氟基-4-(2-甲基丙醯胺基)-2-側氧基嘧啶-1-基]-3-[(2-甲基丙醯基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(6.6 g,12.65 mmol,71.55%)。LC-MS (ES, m/z): 522 (M+H) +
步驟2:在100℃,氮氣下將2-甲基丙酸[(2R,3R,4S,5R)-2-(氯甲基)-4-氟基-5-[5-氟基-4-(2-甲基丙醯胺基)-2-側氧基嘧啶-1-基]-3-[(2-甲基丙醯基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(1.0 g,1.92 mmol)於EtOH (20 mL)中之溶液攪拌隔夜。將所得混合物冷卻至室溫且在真空下濃縮,得到呈白色固體之2-甲基丙酸[(2R,3R,4S,5R)-5-(4-胺基-5-氟基-2-側氧基嘧啶-1-基)-2-(氯甲基)-4-氟基-3-[(2-甲基丙醯基)氧基]氧雜環戊烷-2-基]甲酯(800 mg,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 452 (M+H) +
步驟3:向2-甲基丙酸[(2R,3R,4S,5R)-5-(4-胺基-5-氟基-2-側氧基嘧啶-1-基)-2-(氯甲基)-4-氟基-3-(丙醯氧基)氧雜環戊烷-2-基]甲酯(800 mg,粗品)於MeOH (20 mL)之溶液中添加NH 3.MeOH (7N, 2 mL)。在室溫,氮氣下將溶液攪拌20 min且用AcOH中和該溶液。將所得混合物在真空下濃縮。藉由逆相急速層析法在以下條件下純化殘餘物:管柱:C 18;流動相A:水(0.1% NH 3HCO 3),流動相B:ACN;流率:100 mL/min;梯度:在15 min內10% B至100%,偵測器:UV 254 nm。藉由層析法成功分離出兩種產物,呈白色固體之2-甲基丙酸(2R,3R,4S,5R)-5-(4-胺基-5-氟基-2-側氧基嘧啶-1-基)-2-(氯甲基)-4-氟基-2-(羥甲基)氧雜環戊烷-3-酯(粗品,60 mg)及呈白色固體之2-甲基丙酸[(2R,3R,4S,5R)-5-(4-胺基-5-氟基-2-側氧基嘧啶-1-基)-2-(氯甲基)-4-氟基-3-羥基氧雜環戊烷-2-基]甲酯(126.1 mg,0.33 mmol,兩個步驟17 %產率)。LC-MS (ES, m/z): 382 (M+H) +98.6%純度。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.95 (brs, 1H), 7.70 – 7.66 (m, 2H), 6.38 (d, J= 5.2 Hz, 1H), 6.28 – 6.23 (m, 1H), 5.21 – 5.06 (m, 1H), 4.45 – 4.40 (m, 2H), 4.27 (d, J= 12.0 Hz, 1H), 3.91 (d, J= 11.6 Hz, 1H), 3.81 (d, J= 11.6 Hz, 1H), 2.68 – 2.64 (m, 1H), 1.13 (dd, J= 7.2, 1.6 Hz, 6H)。 實例 100- 化合物 184 4- 胺基 -5- 氟基 -1-[(2R,4S,5R)-4- 羥基 -5-( 羥甲基 )-5-( -1,2- 二烯 -1- ) 氧雜環戊烷 -2- ] 嘧啶 -2- 酮之合成
步驟1:在室溫下向1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}-5-(羥甲基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(2.0 g,3.18 mmol)於ACN (20 mL)之攪拌溶液中分批添加IBX (1.07 g,3.82 mmol)。將所得混合物在65℃下攪拌3 h。使混合物冷卻至室溫,然後過濾;用ACN洗滌濾餅。將合併之濾液在真空下濃縮。此得到呈白色固體之(2R,3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(2.0 g,粗品)。粗產物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LC-MS (ES, m/z): 649 (M+Na +)。
步驟2:向seyferth-gilbert同系化(674.8 mg,3.51 mmol)於ACN (20 mL)之溶液中添加K 2CO 3(881.8 mg,6.39 mmol)。隨後在室溫下逐滴添加(2R,3S,5R)-3-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-2-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}-5-(5-氟基-2,4-二側氧基-3H-嘧啶-1-基)氧雜環戊烷-2-甲醛(2.0 g,粗品)於MeOH (20 mL)中之溶液。將所得混合物在室溫下攪拌2 h,然後在真空下濃縮。用水稀釋殘餘物。用EtOAc萃取所得溶液。將合併之有機層用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由用CH 2Cl 2/MeOH (40:1)溶析之矽膠管柱層析法純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙炔基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.35 g,2.17 mmol,兩個步驟68.24%產率)。LC-MS (ES, m/z): 645 (M+Na) +
步驟3:向1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}-5-乙炔基氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(1.35 g,2.17 mmol)及CuBr (311.5 mg,2.17 mmol)於二噁烷(15 mL)之攪拌混合物中添加多聚甲醛(130.2 mg,4.34 mmol)及二異丙胺(549.1 mg,5.43 mmol)。將所得混合物在140℃下攪拌隔夜,然後冷卻至室溫且藉由添加飽和NH 4Cl (水溶液)來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由製備型TLC (CH 2Cl 2/MeOH = 15:1)純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}-5-(丙-1,2-二烯-1-基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(280.0 mg,0.44 mmol,20.28%)。LC-MS (ES, m/z): 659 (M+Na +)。
步驟4:在氮氣氛圍下向1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}-5-(丙-1,2-二烯-1-基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基-3H-嘧啶-2,4-二酮(280.0 mg,0.44 mmol)及DMAP (161.1 mg,1.32 mmol)於ACN (5 mL)之攪拌溶液中添加TEA (133.3 mg,1.32 mmol)及2,4,6-參(丙-2-基)苯-1-磺醯氯(398.6 mg,1.32 mmol)。將所得混合物在室溫,氮氣氛圍下攪拌隔夜。然後在室溫下逐滴添加NH 3.H 2O (5.6 mL,25%)。將所得混合物在室溫下再攪拌2h,然後藉由在0℃下添加HCl水溶液(4M)來淬滅。將所得混合物用EtOAc萃取。將合併之有機層用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空下濃縮。藉由製備型TLC (CH 2Cl 2/MeOH = 10:1)純化殘餘物,得到呈淡黃色固體之4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}-5-(丙-1,2-二烯-1-基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(160\.0 mg,0.25 mmol,57.27%)。LC-MS (ES, m/z): 658 (M+Na +)。
步驟5:向4-胺基-1-[(2R,4S,5R)-4-[(三級丁基二甲基矽烷基)氧基]-5-{[(三級丁基二苯基矽烷基)氧基]甲基}-5-(丙-1,2-二烯-1-基)氧雜環戊烷-2-基]-5-氟基嘧啶-2-酮(160.0 mg,0.25 mmol)於MeOH (5 mL)之攪拌溶液中添加NH 4F (640.0 mg,17.30 mmol)。將所得混合物在65℃下攪拌2天,然後冷卻至室溫且在真空下濃縮。用丙酮稀釋殘餘物。過濾所得混合物;用丙酮洗滌濾餅。將合併之濾液在真空下濃縮。藉由逆相急速在以下條件下純化粗產物:管柱,XBridge Prep OBD C18管柱,30*150 mm,5µm;流動相,水(10 mmol/L NH 4HCO 3)及ACN (在9.0 min內0% ACN直到5%);在254 nm下UV偵測。將含有產物之級分合併且部分蒸發以移除溶劑,然後冷凍乾燥隔夜,得到呈白色固體之4-胺基-5-氟基-1-[(2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-(丙-1,2-二烯-1-基)氧雜環戊烷-2-基]嘧啶-2-酮(19.5 mg,0.25 mmol,27.55%)。LC-MS (ES, m/z): 567 (2M+1 +)。98.4%純度。 1H NMR (400 MHz, 甲醇- d 4) δ 8.45 (d, J= 7.0 Hz, 1H), 6.10 – 6.07 (m, 1H), 5.29 (t, J= 6.8 Hz, 1H), 4.98 – 4.89 (m, 2H), 4.52 (t, J= 8.0, 1H), 3.77 – 3.69 (m, 2H), 2.48 – 2.40 (m, 1H), 2.26 – 2.20 (m, 1H)。 實例 101– 額外化合物之合成
表1及表2中所包括之化合物係使用類似於以上實例1-3及4-7中列出之彼等的方法、報導之合成程序以及熟習有機合成技術者已知的相關策略及程序來合成。表1及表2中一些化合物之詳細合成程序亦提供於以上實例8-100中。示例性化合物之質譜資料列於表3中: 3.
化合物 名稱 MS 資料
1 (2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基-9H-嘌呤-9-基)-2-(羥甲基)-2-(丙-1-炔-1-基)四氫呋喃-3-醇 M-1: 306.12
2 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮 M+1: 276.05
3 1-((2R,3S,4R)-3-氟基-4-羥基-5,5-雙(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮 M+1: 276.95
4 1-((2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮 M-1: 289.10
5 (2R,3R,4S,5R)-5-(6-胺基-2-氯基-9H-嘌呤-9-基)-2-乙炔基-4-氟基-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇 M+1: 328.02
6 1-((2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-4-(羥胺基)嘧啶-2(1H)-酮 M+1: 292.00
7 1-((2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-氟基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮 M+1: 293.20
8 (2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基-9H-嘌呤-9-基)-2-(氯甲基)-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇 M+1: 318
9 1-((2R,3R,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮 M+23: 330.90
10 ((3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基-9H-嘌呤-9-基)-3-羥基 四氫呋喃-2,2-二基)二甲醇 M+1: 300.10
11 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2(1H)-酮 M+1: 290.10
12 4-胺基-1-((2R,3S,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)-3-甲基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮 M+1: 290.05
13 4-胺基-1-((2R,3S,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)-3-甲氧基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮 M+1: 306.00
14 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-氟基嘧啶-2(1H)-酮 M+1: 294
15 (2R,3S,5R)-5-(6-胺基-9H-嘌呤-9-基)-2-(氯甲基)-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇 M+1: 300
16 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-環丙基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮 M+1: 268.05
17 4-胺基-1-((2R,3S,4S,5R)-5-(氯甲基)-3-乙炔基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮 M+1: 300.05
18 5-胺基-2-((2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-1,2,4-三嗪-3(2H)-酮 M+1: 277.15
19 4-胺基-1-((2R,3S,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-3,5-二甲基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮 M+1: 256.1
20 4-胺基-1-((2R,3S,4S,5R)-3-乙炔基-4-羥基-5-(羥甲基)-5-甲基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮 M+1: 266.1
21 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-(三氟甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮 M+1: 295.90
22 4-胺基-5-氟基-1-((2R,4S,5R)-5-(氟甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮 M+1: 278.10
23 (2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基-9H-嘌呤-9-基)-2-乙炔基-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇 M+23: 316.05
24 異丁酸(2R,3R,4R,5R)-5-(4-胺基-2-側氧基嘧啶-1(2H)-基)-2-(氯甲基)-4-氟基-2-((異丁醯氧基)甲基)四氫呋喃-3-酯 M+1: 434.10
25 (2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氯基-9H-嘌呤-9-基)-2-乙炔基-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇 M+1: 310.05
26 (2R,3S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基-9H-嘌呤-9-基)-3-羥基-2-(羥甲基)四氫呋喃-2-甲腈 M-1: 393.18
27 (2R,3S,5R)-5-(6-胺基-9H-嘌呤-9-基)-2-乙炔基-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇 M+1: 276.15
28 1-((2R,3R,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-4-(羥胺基) 嘧啶-2(1H)-酮 M+1: 310.00
29 1-((2R,3R,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4 (1H,3H)-二酮 M-1: 293.05
30 1-((2R,4S,5R)-5-疊氮基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮 未測定
31 4-胺基-1-((2R,3R,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮 M+1: 294.15
32 4-胺基-1-((2R,3R,4R,5R)-5-乙炔基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮 M+1: 270.05
33 1-((2R,3R,4R,5R)-5-乙炔基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮 M+1: 271.20
34 1-((2R,4S,5R)-5-(氯甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮 M+1: 277
35 4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-5-乙炔基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮 M+1: 270
36 1-((2R,3S,4R,5R)-5-乙炔基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮 M+23: 292.90
37 (2R,3S,5R)-5-(4-胺基吡咯并[2,1-f][1,2,4]三嗪-7-基)-2-乙炔基-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇 M+1: 275
38 1-((2R,4S,5R)-5-乙炔基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮 M-1: 265.05
39 1-((2R,3S,4R,5R)-5-乙炔基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-5-甲基嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮 M+1: 285.20
40 4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-5-(氯甲基)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮 M+1: 293.95
41 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-乙炔基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮 M+1: 252
42 (2R,3R,4S,5R)-5-(6-胺基-2-氟基-9H-嘌呤-9-基)-2-乙炔基-4-氟基-2-(羥甲基)四氫呋喃-3-醇 M+1: 312.10
43 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-乙烯基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮 M+1: 254.05
44 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-乙基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮 M+1: 256.05
45 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-(氟甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮 M+1: 260.20
46 2-胺基-9-((2R,4S,5R)-5-(氟甲基)-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)-1,9-二氫-6H-嘌呤-6-酮 M+1: 300.20
47 4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)-5-乙烯基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮 M+1: 272.05
48 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-4-羥基-5-(羥甲基)-5-甲氧基四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮 M+1: 257.95
49 4-胺基-1-((2R,4S,5R)-5-疊氮基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮 M+: 268.30
50 4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-5-疊氮基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮 市售
51 4-胺基-1-((2R,3S,4R,5R)-5-乙基-3-氟基-4-羥基-5-(羥甲基)四氫呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮 M+1: 274.10
表4列出了以上表3中列出之所選化合物的 1H NMR特徵化資料。 4.
化合物編號 1H NMR 化學位移資料(ppm)
1 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 8.26 (s, 1H), 7.80 (br s, 2H), 6.17 (q, J= 4.1 Hz, 1H), 5.36 (d, J= 5.5 Hz, 1H), 5.17 (dd, J= 6.5, 5.8 Hz, 1H), 4.48 (q, J= 6.4 Hz, 1H), 3.58 (q, J= 5.8 Hz, 1H), 3.48 (q, J= 6.1 Hz, 1H), 2.66-2.59 (m, 1H), 2.41-2.34 (m, 1H), 1.83 (s, 3H)。
21 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 7.71 (d, J= 7.5 Hz, 1H), 7.24 (br s, 1H), 7.20 (br s, 1H), 6.37 (t, J= 6.7 Hz, 1H), 5.75 (d, J= 7.5 Hz, 2H), 5.56 - 5.43 (m, 1H), 4.69 (br t, J= 5.9 Hz, 1H), 3.74 - 3.62 (m, 2H), 2.24 (t, J= 6.5 Hz, 2H)
24 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.69 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 7.40 (s, 2H), 5.93 (dd, J= 21.8, 2.6 Hz, 1H), 5.80 – 5.70 (m, 2H), 5.59 (ddd, J= 53.5, 5.7, 2.6 Hz, 1H), 4.27 (d, J= 2.0 Hz, 2H), 3.94 – 3.80 (m, 2H), 2.63 (dp, J= 35.5, 7.1 Hz, 2H), 1.15 (d, J= 7.0 Hz, 6H), 1.09 (dd, J= 7.0, 2.5 Hz, 6H)。
25 1H NMR (300 MHz, DMSO- d 6) δ 8.34 (s, 1H), 7.83 (s, 2H), 6.28 (dd, J= 7.2, 5.1 Hz, 1H), 5.58 (s, 1H), 5.31 (s, 1H), 4.56 (t, J= 6.8 Hz, 1H), 3.66 (d, J= 11.9 Hz, 1H), 3.56 (d, J= 11.9 Hz, 1H), 3.52 (s, 1H), 2.70 (ddd, J= 13.2, 6.7, 5.0 Hz, 1H), 2.44 (dt, J= 13.5, 7.1 Hz, 1H)。
26 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.27 (s, 1H), 7.85 (br s, 2H), 6.39 (t, J= 6.6 Hz, 1H), 6.29 (d, J= 5.0 Hz, 1H), 5.67 (t, J= 6.0 Hz, 1H), 4.67 (m, 1H), 3.75 (m, 1H), 3.61 (m, 1H), 2.90 (m, 1H), 2.41 (m, 1H)。
27 1H NMR (400 MHz, MeOD- d 3 ): δ 8.33 (s, 1H), 8.19 (s, 1H), 6.46 (dd, 1H), 4.73 (t, 1H), 3.83 (dd, 2H), 2.83 (ddd, 1H), 2.63-2.57 (m, 1H), 1.89 (s, 1H), 4H未觀察到。
28 1H NMR (400 MHz, 甲醇- d 4) δ 7.19 (d, J= 8.2 Hz, 1H), 6.15 (dd, J= 14.5, 5.3 Hz, 1H), 5.64 (d, J= 8.3 Hz, 1H), 5.22 (dt, J= 53.5, 5.2 Hz, 1H), 4.53 (dd, J= 9.3, 5.1 Hz, 1H), 3.87 – 3.73 (m, 4H)。
29 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 11.45 (s, 1H), 7.87 (d, J= 8.1 Hz, 1H), 6.12 (dd, J= 14.2, 5.0 Hz, 1H), 6.00 (d, J= 5.6 Hz, 1H), 5.70 (d, J= 8.1 Hz, 1H), 5.45 (t, J= 5.2 Hz, 1H), 5.31 - 5.18 (t, J= 5.0 Hz, 1H), 4.42 (dt, J= 10.8, 5.2 Hz, 1H), 3.80 (s, 2H), 3.60 (m, 2H)。
31 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.81 (d, J= 7.5 Hz, 1H), 7.28 (d, J= 11.8 Hz, 2H), 6.13 (dd, J= 14.8, 4.7 Hz, 1H), 5.90 (d, J= 5.5 Hz, 1H), 5.76 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 5.34 (t, J= 5.3 Hz, 1H), 5.13 (dt, J= 53.4, 4.9 Hz, 1H), 4.42 (dt, J= 12.6, 5.3 Hz, 1H), 3.77 (d, J= 1.6 Hz, 2H), 3.69 (dd, J= 11.6, 5.1 Hz, 1H), 3.60 (dd, J= 11.6, 5.5 Hz, 1H)。
32 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.75 (d, J= 7.5 Hz, 1H), 7.26 (d, J= 7.6 Hz, 2H), 6.01 (dd, J= 19.8, 1.9 Hz, 1H), 5.74 (dd, J= 17.8, 7.1 Hz, 2H), 5.49 (t, J= 5.9 Hz, 1H), 4.96 (ddd, J= 53.9, 5.1, 1.9 Hz, 1H), 4.37 – 4.20 (m, 1H), 3.73 – 3.55 (m, 2H), 3.53 (s, 1H)。
33 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.73 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 7.14 (d, J= 24.0 Hz, 2H), 6.26 (dd, J= 7.9, 6.0 Hz, 1H), 5.73 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 5.42 (d, J= 4.4 Hz, 1H), 5.18 (t, J= 5.1 Hz, 1H), 4.36 (dt, J= 6.8, 3.4 Hz, 1H), 3.82 – 3.70 (m, 2H), 3.63 – 3.43 (m, 2H), 2.32 – 2.05 (m, 2H)。
34 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 11.25 (s, 1H), 7.80 (d, J= 8.1 Hz, 1H), 6.24 (dd, J= 7.9, 6.0 Hz, 1H), 5.65 (d, J= 8.1 Hz, 1H), 5.50 (s, 1H), 5.25 (s, 1H), 4.39 (d, J= 5.2 Hz, 1H), 3.81 – 3.70 (m, 2H), 3.58 (d, J= 3.5 Hz, 2H), 2.31 (ddd, J= 13.7, 8.0, 6.0 Hz, 1H), 2.20 (ddd, J= 13.4, 6.1, 3.2 Hz, 1H)。
35 1H NMR (400 MHz, 甲醇- d 4) δ 7.81 (dd, J= 7.6, 1.2 Hz, 1H), 6.36 (dd, J= 11.8, 5.3 Hz, 1H), 5.90 (d, J= 7.5 Hz, 1H), 5.26 - 5.12 (t, J= 5.0 Hz, 1H), 4.48 - 4.42 (d, J= 4.8 Hz, 1H), 3.86 (dd, J= 12.4, 1.7 Hz, 1H), 3.74 (d, J= 12.3 Hz, 1H), 3.17 (s, 1H)。
36 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 10.83 (s, 1H), 7.70 (d, J= 8.1 Hz, 1H), 6.33 (s, 1H), 6.20 (dd, J= 10.6, 5.7 Hz, 1H), 5.68 (t, J= 9.6 Hz, 2H), 5.19 (dt, J= 54.3, 5.6 Hz, 1H), 4.39 (dt, J= 24.9, 4.4 Hz, 1H), 3.73 – 3.54 (m, 3H)。
37 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.80 (s, 1H), 6.83 (d, J= 4.4 Hz, 1H), 6.68 (d, J= 4.5 Hz, 1H), 5.59 (t, J= 7.6 Hz, 1H), 4.30 (dd, J= 6.7, 5.0 Hz, 1H), 3.52 - 3.46 (d, J= 11.7 Hz, 2H), 3.29 (s, 1H), 2.35 (dt, J= 12.3, 7.4 Hz, 1H), 2.20 (ddd, J= 12.4, 7.3, 5.0 Hz, 1H)。
38 1H NMR (400 MHz, 甲醇- d 4) δ 7.75 (q, J= 1.2 Hz, 1H), 6.27 (dd, J= 7.4, 4.6 Hz, 1H), 4.52 (t, J= 7.5 Hz, 1H), 3.89 – 3.70 (m, 2H), 3.06 (s, 1H), 2.44 (dt, J= 13.6, 7.5 Hz, 1H), 2.32 (ddd, J= 13.5, 7.5, 4.6 Hz, 1H), 1.87 (d, J= 1.2 Hz, 3H)。
39 1H NMR (400 MHz, 甲醇- d 4) δ 7.64 (t, J= 1.4 Hz, 1H), 6.32 (dd, J= 10.5, 5.6 Hz, 1H), 5.18 (dt, J= 54.4, 5.5 Hz, 1H), 4.51 (dd, J= 24.6, 5.4 Hz, 1H), 3.87 (dd, J= 12.4, 1.8 Hz, 1H), 3.75 (d, J= 12.4 Hz, 1H), 1.87 (d, J= 1.2 Hz, 3H)。
41 1H NMR (300 MHz, DMSO- d 6) δ 7.77 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 7.14 (d, J= 14.3 Hz, 2H), 6.29 – 5.86 (m, 3H), 5.71 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 4.30 (t, J= 7.2 Hz, 1H), 3.64 (d, J= 12.0 Hz, 1H), 3.57 (d, J= 12.0 Hz, 1H), 3.48 (s, 1H), 2.24 (dt, J= 13.1, 7.3 Hz, 1H), 2.06 (ddd, J= 12.7, 7.2, 4.8 Hz, 1H)。
42 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.23 (d, J= 1.9 Hz, 1H), 7.98 - 7.90 (s, 2H), 6.36 (dd, J= 8.7, 5.8 Hz, 1H), 6.30 (d, J= 5.7 Hz, 1H), 5.49 (dt, J= 27.2, 6.2 Hz, 1H), 5.32 – 5.40 (t, J= 6.1 Hz, 1H), 4.65 (dt, J= 22.5, 6.0 Hz, 1H), 3.70 (d, J= 6.1 Hz, 2H), 3.63 (dd, J= 12.2, 6.9 Hz, 1H)。
43 1H NMR (300 MHz, DMSO- d 6) δ 7.99 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 7.08 (d, J= 15.3 Hz, 2H), 6.06 (dd, J= 6.7, 4.4 Hz, 1H), 5.92 (dd, J= 17.3, 10.8 Hz, 1H), 5.70 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 5.34 (dd, J= 17.4, 2.3 Hz, 1H), 5.19 (dq, J= 5.4, 2.8 Hz, 3H), 4.39 (q, J= 6.9 Hz, 1H), 3.45 (ddd, J= 47.3, 11.8, 5.4 Hz, 2H), 2.16 – 1.92 (m, 2H)。
45 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.74 (dd, J= 7.5, 2.7 Hz, 1H), 7.17 - 7.11 (s, 2H), 6.25 (td, J= 7.1, 6.4, 2.7 Hz, 1H), 5.73 (dd, J= 7.4, 2.8 Hz, 1H), 5.36 (dd, J= 4.8, 2.8 Hz, 1H), 5.18 (dt, J= 8.0, 3.8 Hz, 1H), 4.58 (qd, J= 9.8, 2.8 Hz, 1H), 4.46 (qd, J= 9.9, 2.8 Hz, 1H), 4.37 (d, J= 5.4 Hz, 1H), 3.63 (s, 1H), 3.47 (d, J= 10.4 Hz, 1H), 2.12 (dt, J= 13.1, 6.4 Hz, 2H)。
46 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 7.94 (s, 1H), 6.47 (s, 2H), 6.23 – 6.15 (m, 1H), 5.42 (d, J = 4.6 Hz, 1H), 5.12 (t, J = 5.5 Hz, 1H), 4.65-4.45 (d, J = 10.0 Hz, 3H), 3.49 (t, J = 5.7 Hz, 2H), 3.29 (s, 1H), 2.78 – 2.68 (m, 1H), 2.26 (s, 1H)。
47 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 7.92 - 7.80 (m, 2H), 7.80 - 7.66 (m, 4H), 7.49 (t, J= 7.6 Hz, 2H), 7.42 - 7.25 (m, 4H), 6.63 (t, J= 7.6 Hz, 1H), 5.82 - 5.58 (m, 2H), 4.17 – 3.83 (m, 2H), 3.30 - 3.19 (m, 1H), 2.35 - 2.16 (m, 2H)。
51 1H NMR (300 MHz, DMSO- d 6) δ 7.73 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 7.18 (d, J= 19.4 Hz, 2H), 6.09 (dd, J= 16.3, 4.3 Hz, 1H), 5.71 (d, J= 7.4 Hz, 2H), 5.16 – 4.89 (m, 2H), 4.29 (dd, J= 20.0, 3.2 Hz, 1H), 3.53 – 3.37 (m, 2H), 1.66 – 1.51 (m, 2H), 0.87 (t, J= 7.4 Hz, 3H)。
實例 102 額外化合物之合成
使用實例1-7、實例8-100、實施方式中所描述之實驗程序及策略以及熟習有機合成技術者已知的相關策略及程序製備下表5中列出之化合物。表5中一些化合物之詳細合成程序亦提供於以上實例8-100中。表5亦列出各化合物的 1H NMR特徵化資料及藉由LC/MS觀察到之質荷比。化學結構呈現於以上表1-A、1-B、2-A及2-B中。 5.
化合物編號 質譜 m/z(M+H) + 1H NMR 化學位移資料(ppm)
52 396 1H NMR (300 MHz, DMSO-d 6) δ 7.62 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 7.20 (d, J = 11.9 Hz, 2H), 6.12 (t, J= 6.8 Hz, 1H), 5.74 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 5.36 (dd, J= 6.5, 3.4 Hz, 1H), 4.12 (d, J= 2.8 Hz, 2H), 2.69 – 2.52 (m, 2H), 2.48 – 2.24 (m, 2H), 1.69 (p, J= 7.4 Hz, 1H), 1.55 (dq, J= 14.6, 7.2 Hz, 1H), 1.11 (td, J= 7.3, 2.7 Hz, 12H), 0.88 (t, J= 7.4 Hz, 3H)。
53 394 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 7.67 (d, J= 6.9 Hz, 1H), 7.22 (d, J= 13.0 Hz, 2H), 6.19 (t, J= 6.4 Hz, 1H), 5.77 (q, J= 10.3, 9.6 Hz, 2H), 5.49 – 5.30 (d, J= 10.8 Hz, 3H), 4.17 (d, J= 3.5 Hz, 2H), 2.57 (dt, J= 14.3, 7.1 Hz, 2H), 2.39 (q, J= 6.8 Hz, 1H), 2.33 – 2.23 (m, 1H), 1.45 – 1.05 (m, 12H)。
54 290 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.76 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 7.19 – 7.13 (m, 2H), 6.16 (t, J= 6.8 Hz, 1H), 5.75 – 5.73 (m, 1H), 5.28 (t, J= 5.2 Hz, 1H), 4.08 – 4.07 (m, 1H), 3.78 – 3.70 (m, 2H), 3.61 – 3.55 (m, 2H), 3.30 (s, 3H), 2.41 – 2.37 (m, 1H), 2.18 – 2.11 (m, 1H)。
56 267.80 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 7.86 (d, J= 7.5 Hz, 1H), 7.15 - 7.00 (m, 2H), 6.11 (t, J= 6.5 Hz, 1H), 5.86 (br d, J= 7.3 Hz, 1H), 5.69 (d, J= 7.3 Hz, 1H), 5.18 (d, J= 4.8 Hz, 1H), 5.09 - 4.98 (m, 3H), 4.27 (br d, J= 6.0 Hz, 1H), 3.40 (t, J= 5.5 Hz, 2H), 2.41 - 2.30 (m, 1H), 2.28 - 2.14 (m, 2H), 2.06 (td, J= 6.7, 13.2 Hz, 1H)。
57 269.90 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 7.84 (d, J= 7.5 Hz, 1H), 7.13 - 6.98 (m, 2H), 6.07 (t, J= 6.6 Hz, 1H), 5.69 (d, J= 7.3 Hz, 1H), 5.04 (d, J= 4.8 Hz, 1H), 4.95 (t, J= 5.2 Hz, 1H), 4.27 - 4.18 (m, 1H), 3.47 - 3.36 (m, 2H), 2.14 (dt, J= 3.8, 6.6 Hz, 1H), 2.04 (td, J= 6.6, 13.5 Hz, 1H), 1.56 - 1.29 (m, 4H), 0.90 - 0.85 (m, 3H)。
58 434 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.91 (s, 1H), 7.87 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.67 (brs, 1H), 6.24 (t, J= 6.4 Hz, 1H), 5.51 – 5.48 (m, 1H), 4.32 (dd, J= 16.0, 11.6 Hz, 2H), 3.92 – 3.89 (m, 1H), 3.81 – 3.79 (m, 1H), 2.69 – 2.58 (m, 3H), 2.40 – 2.36 (m, 1H), 1.18 – 1.12 (m, 12H)。
59 276 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.89 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 7.17 – 7.10 (m, 2H), 6.16 – 6.13 (m, 1H), 5.75 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 5.49 (brs, 1H), 4.82 – 4.80 (m, 1H), 4.28 – 4.26 (m, 1H), 3.75 – 3.66 (m, 4H), 2.82 – 2.75 (m, 1H), 1.88 – 1.83 (m, 1H)。
71 343.90 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 8.59 (s, 1H), 7.96 - 7.83 (m, 1H), 7.13 - 6.99 (m, 1H), 6.14 (t, J= 6.3 Hz, 1H), 5.53 - 5.39 (m, 2H), 4.41 - 4.35 (m, 1H), 3.81 (d, J= 11.4 Hz, 1H), 3.69 (d, J= 11.4 Hz, 2H), 3.57 (d, J= 11.4 Hz, 1H), 2.44 - 2.36 (m, 1H), 2.29 - 2.20 (m, 1H)
78 290 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.95 – 7.88 (m, 1H), 7.67 (s, 1H), 7.44 (s, 1H), 5.97 (d, J= 4.9 Hz, 1H), 5.53 – 5.47 (m, 1H), 5.34 (d, J= 4.4 Hz, 1H), 5.12 (s, 1H), 4.08 (s, 1H), 3.98 (s, 1H), 3.51 (s, 2H), 1.61 (d, J= 16.0 Hz, 1H), 1.49 (d, J= 12.1 Hz, 1H), 0.86 (d, J= 7.7 Hz, 3H)。
79 283 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.85 (s, 1H), 7.69 (s, 2H), 6.84 (d, J= 4.4 Hz, 1H), 6.64 (d, J= 4.4 Hz, 1H), 5.41 (d, J= 4.3 Hz, 1H), 5.27 (d, J= 11.6 Hz, 1H), 4.81 (t, J= 5.9 Hz, 1H), 3.93 (s, 1H), 3.85 – 3.70 (m, 2H), 3.64 – 3.49 (m, 2H), 2.27 (t, J= 13.0 Hz, 1H), 1.83 (dd, J= 13.6, 3.1 Hz, 1H)。
80 314 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.36 (d, J= 1.2 Hz, 1H), 7.91 (brs, 2H), 6.37 (t, J= 6.4 Hz, 1H), 6.11 (d, J= 5.2 Hz, 1H), 5.99 – 5.95 (m, 1H), 5.48 (d, J= 2.0 Hz, 1H), 5.44 (d, J= 2.0 Hz, 1H), 5.38 (t, J= 5.6 Hz, 1H), 5.30 – 5.23 (m, 1H), 5.13 – 5.10 (m, 1H), 4.79 – 4.71 (m, 1H), 3.61 – 3.56 (m, 1H), 3.46 – 3.41 (m, 1H)。
81 316 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.29 (d, J= 2.0 Hz, 1H), 7.88 (brs, 2H), 6.32 – 6.28 (m, 1H), 5.88 (d, J= 6.4 Hz, 1H), 5.38 (t, J= 5.2 Hz, 0.5H), 5.25 (t, J= 5.2 Hz, 0.5H), 5.14 (t, J= 6.4 Hz, 1H), 4.64 – 4.58 (m, 1H), 3.58 – 3.55 (m, 1H), 3.50 – 3.46 (m, 1H), 1.69 – 1.63 (m, 1H), 1.58 – 1.54 (m, 1H), 0.90 (t, J= 7.6 Hz, 3H)。
82 296.10 (M+Na) + 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.15 (d, J= 7.3 Hz, 1H), 7.66 (s, 1H), 7.43 (s, 1H), 6.00 (td, J= 6.4, 2.1 Hz, 1H), 5.10 (td, J= 5.1, 1.4 Hz, 1H), 5.05 (dd, J= 4.9, 1.4 Hz, 1H), 4.23 (q, J= 5.2 Hz, 1H), 3.49 (dd, J= 11.5, 5.0 Hz, 1H), 3.39 (dd, J= 11.5, 5.1 Hz, 1H), 2.16 (ddd, J= 13.1, 6.1, 4.3 Hz, 1H), 2.08 (dt, J= 13.2, 6.4 Hz, 1H), 1.58 (dq, J= 15.0, 7.6 Hz, 1H), 1.45 (dq, J= 14.6, 7.4 Hz, 1H), 0.84 (t, J= 7.5 Hz, 3H)。
83 318 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.81 (d, J= 2.2 Hz, 1H), 6.54 (s, 2H), 6.33 – 6.10 (m, 2H), 5.37 – 5.04 (m, 2H), 4.72 – 4.63 (m, 1H), 4.63 – 4.43 (m, 2H), 3.62 (dd, J= 11.9, 5.5 Hz, 1H), 3.53 (dd, J= 11.4, 5.3 Hz, 1H)。
84 320 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.24 (d, J= 1.2 Hz, 1H), 7.91 (brs, 2H), 6.41 – 6.37 (m, 1H), 6.23 (d, J= 5.2 Hz, 1H), 5.37 – 5.24 (m, 2H), 4.77 – 4.69 (m, 1H), 4.63 – 4.58 (m, 1H), 4.49 – 4.46 (m, 1H), 3.70 – 3.57 (m, 2H)。
85 296 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.03 (brs, 1H), 8.01 (brs, 2H), 6.25 – 6.21 (m, 2H), 5.16 (t, J= 5.2 Hz, 0.5H), 5.02 (t, J= 5.2 Hz, 0.5H), 4.68 – 4.66 (m, 1H), 4.59 – 4.52 (m, 1H), 4.47 – 4.41 (m, 2H), 3.61 – 3.51 (m, 2H)。
106 242 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.89 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 7.12 – 7.06 (m, 2H), 6.08 (t, J= 6.4 Hz, 1H), 5.70 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 5.12 – 5.06 (m, 2H), 4.18 (dd, J= 6.4, 5.2 Hz, 1H), 3.45 – 3.41 (m, 2H), 2.23 – 2.17 (m, 1H), 2.08 – 2.02 (m, 1H), 1.07 (s, 3H)。
107 270 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.07 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.79 (brs, 1H), 7.55 (brs, 1H), 6.07 – 6.06 (m, 1H), 5.56 (t, J= 6.0 Hz, 1H), 5.50 (d, J= 5.2 Hz, 1H), 4.35 – 4.30 (m, 1H), 3.71 – 3.60 (m, 2H), 3.52 (s, 1H), 2.28 – 2.21 (m, 1H), 2.16 – 2.14 (m, 1H)。
108 308.90 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 8.46 (s, 1H), 7.89 (s, 1H), 6.69 (s, 2H), 6.27 (dd, J= 4.9, 7.4 Hz, 1H), 5.95 - 5.71 (m, 1H), 5.61 - 5.42 (m, 1H), 4.63 (t, J= 6.9 Hz, 1H), 3.70 - 3.61 (m, 1H), 3.61 - 3.53 (m, 1H), 2.66 - 2.60 (m, 1H), 2.45 - 2.37 (m, 1H)
109 294 (M-H) - 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.36 (s, 1H), 7.85 (s, 2H), 6.23 (dd, J= 7.0, 4.7 Hz, 1H), 5.96 (dd, J= 17.3, 10.9 Hz, 1H), 5.39 (dd, J= 17.3, 2.3 Hz, 1H), 5.30 (d, J= 5.0 Hz, 1H), 5.22 (dd, J= 10.9, 2.2 Hz, 1H), 5.11 (dd, J= 6.3, 5.3 Hz, 1H), 4.64 (td, J= 6.7, 4.9 Hz, 1H), 3.55 – 3.38 (m, 2H), 2.59 (ddd, J= 13.1, 6.6, 4.7 Hz, 1H), 2.26 (dt, J= 13.1, 7.0 Hz, 1H)。
110 278 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.80 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 7.22-7.16 (s, 2H), 6.33 (t, J= 6.8 Hz, 1H), 6.07 (d, J= 1.7 Hz, 1H), 5.73 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 5.66 (d, J= 4.8 Hz, 1H), 5.33 (t, J= 5.3 Hz, 1H), 4.55 (q, J= 5.1 Hz, 1H), 3.73-3.58 (dd, J= 11.7, 4.9 Hz, 2H), 2.18 (t, J= 6.1 Hz, 2H)。
113 278 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.65 (d, J= 7.5 Hz, 1H), 7.24 (d, J= 25.5 Hz, 2H), 6.25 (dd, J= 16.4, 4.3 Hz, 1H), 6.11 (d, J= 4.9 Hz, 1H), 5.75 (d, J= 7.5 Hz, 1H), 5.33 (t, J= 5.7 Hz, 1H), 5.03 (d, J= 53.5 Hz, 1H), 4.74 – 4.35 (m, 3H), 3.60 (dd, J= 11.8, 5.5 Hz, 1H), 3.48 (dd, J= 11.5, 5.6 Hz, 1H)。
114 291.60 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 7.55 (d, J= 7.3 Hz, 1H), 7.15 - 6.96 (m, 2H), 6.14 (d, J= 3.8 Hz, 1H), 5.69 - 5.63 (m, 2H), 5.59 (d, J= 5.0 Hz, 1H), 5.13 (t, J= 5.3 Hz, 1H), 4.11 - 4.05 (m, 2H), 3.85 - 3.76 (m, 1H), 3.75 - 3.69 (m, 1H), 3.69 - 3.58 (m, 2H)
115 296 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 9.38 (s, 1H), 7.94 (s, 1H), 6.48 (s, 2H), 6.08 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 5.15 (d, J= 4.5 Hz, 1H), 4.93 (d, J= 5.6 Hz, 1H), 4.35 (t, J= 4.5 Hz, 1H), 3.43 (q, J= 9.1, 6.2 Hz, 2H), 2.66 (dt, J= 13.9, 6.9 Hz, 1H), 2.26 – 2.16 (m, 1H), 1.63 - 1.55 (dd, J= 14.1, 7.3 Hz, 2H), 0.86 (t, J= 7.6 Hz, 3H)。
116 286 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.78 (d, J= 6.5 Hz, 2H), 7.53 (s, 1H), 6.09 (d, J= 6.0 Hz, 1H), 5.74 (d, J= 5.3 Hz, 1H), 5.65 (d, J= 5.3 Hz, 1H), 5.52 (d, J= 6.5 Hz, 1H), 4.19 (d, J= 6.5 Hz, 1H), 3.99 (d, J= 6.0 Hz, 1H), 3.62 (dd, J= 13.8, 5.3 Hz, 2H), 3.54 (d, J= 2.9 Hz, 1H)。
2-TP 514 (M-H) - 1H NMR (300 MHz, 氧化氘) δ 7.84 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 6.32 (t, J= 6.6 Hz, 1H), 6.05 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 4.73 (d, J= 6.2 Hz, 1H), 4.21 – 4.06 (m, 2H), 3.88 – 3.70 (m, 2H), 3.11 (q, J= 7.3 Hz, 24H), 2.50 – 2.34 (m, 2H), 1.19 (t, J= 7.3 Hz, 36H)。
25-TP 548 (M-H) - 1H NMR (400 MHz, 氧化氘) δ 8.34 (s, 1H), 6.29 (dd, J= 7.1, 4.4 Hz, 1H), 4.82 (t, J= 7.4 Hz, 1H), 4.11 (ddd, J= 59.8, 11.4, 5.0 Hz, 2H), 3.03 (q, J= 7.5 Hz, 24H), 2.63 (ddp, J= 21.4, 14.1, 7.3 Hz, 2H), 1.11 (t, J= 7.4 Hz, 36H)。
35-TP 508.98 (M-H) - 未測定
40-TP 532 (M-H) - 1H NMR (400 MHz, 氧化氘) δ 7.82 (dd, J= 7.6, 1.2 Hz, 1H), 6.44 – 6.35 (m, 1H), 6.01 (dd, J= 8.1, 3.9 Hz, 1H), 5.32 (dt, J= 53.2, 4.8 Hz, 1H), 4.11 (s, 2H), 3.86 – 3.63 (m, 2H), 3.08 (qd, J= 7.3, 2.3 Hz, 24H), 1.31 – 0.84 (m, 36H)。
43-TP 492 (M-H) - 1H NMR (300 MHz, 氧化氘) δ 8.03 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 6.21 (t, J= 5.5 Hz, 1H), 6.05 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 5.88 (dd, J= 17.4, 10.9 Hz, 1H), 5.43 (dd, J= 17.4, 1.4 Hz, 1H), 5.33 (dd, J= 10.9, 1.4 Hz, 1H), 4.72 (d, J= 7.8 Hz, 1H), 4.19 (dd, J= 11.5, 5.6 Hz, 1H), 3.86 (dd, J= 11.5, 3.8 Hz, 1H), 3.08 (q, J= 7.3 Hz, 24H), 2.32 – 2.21 (m, 2H), 1.16 (t, J= 7.3 Hz, 36H)。
44-TP 494 (M-H) - 1H NMR (400 MHz, 氧化氘) δ 7.90 (d, J= 7.8 Hz, 1H), 6.13 (d, J= 6.9 Hz, 1H), 6.02 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 4.56 (t, J= 6.4 Hz, 1H), 3.97 (d, J= 4.4 Hz, 2H), 3.23 – 2.95 (m, 21H), 2.30 (p, J= 8.2, 7.8 Hz, 2H), 1.58 (ddd, J= 44.3, 14.7, 7.5 Hz, 2H), 1.23 – 1.01 (m, 32H), 0.85 (t, J= 7.6 Hz, 3H)。
實例 103 額外化合物之合成
使用實例1-100、實施方式中所描述之實驗程序及策略以及熟習有機合成技術者已知的相關策略及程序製備下表5-A中列出之化合物。表5-A亦列出各化合物的 1H NMR特徵化資料及藉由LC/MS觀察到之質荷比。化學結構呈現於以上表1-A、1-C及2-C中。 5-A.
化合物編號 質譜 m/z(M+H) + 1H NMR 化學位移資料(ppm)
86 356/358 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 7.93 (d, J= 6.8 Hz, 1H), 7.88 (s, 1H), 7.64 (s, 1H), 6.25 – 6.19 (m, 1H), 6.18 (d, J= 4.8 Hz, 1H), 5.47 (t, J= 5.2 Hz, 1H), 5.30 – 5.05 (m, 1H), 4.52 – 4.35 (m, 1H), 3.80 – 3.77 (m, 1H), 3.71 – 3.66 (m, 1H), 3.62 – 3.57 (m, 2H)。
88 338.00 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 8.01 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.79 - 7.74 (m, 1H), 7.57 - 7.49 (m, 1H), 6.23 - 6.17 (m, 1H), 5.47 - 5.44 (m, 1H), 5.33 - 5.28 (m, 1H), 4.40 - 4.34 (m, 1H), 3.70 - 3.63 (m, 2H), 3.62 - 3.55 (m, 2H), 2.26 - 2.18 (m, 2H)。
92 292.12 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.85 (s, 1H), 7.71 (s, 2H), 6.84 (d, J= 4.4 Hz, 1H), 6.71 (d, J= 4.4 Hz, 1H), 5.76 (t, J= 7.3 Hz, 1H), 5.57 (d, J= 5.7 Hz, 1H), 5.26 (t, J= 6.2 Hz, 1H), 4.41 (q, J= 6.1 Hz, 1H), 3.57 (dd, J= 11.8, 6.2 Hz, 1H), 3.48 (dd, J= 11.8, 6.3 Hz, 1H), 2.43 (dt, J= 12.6, 6.9 Hz, 1H), 2.28 (ddd, J= 12.9, 7.6, 5.8 Hz, 1H)。
94 332 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 7.92 (s, 1H), 6.44 (s, 2H), 6.03 (d, J= 5.2 Hz, 1H), 5.59 (m, 2H), 5.00 (s, 1H), 4.40 (t, J= 5.3 Hz, 1H), 4.32 (d, J= 5.2 Hz, 1H), 3.78 (s, 2H), 3.73 – 3.61 (m, 2H)。
95 330.05 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 7.82 - 7.74 (m, 2H), 7.61 - 7.50 (m, 1H), 6.25 - 6.21 (m, 1H), 6.07 - 6.04 (m, 1H), 5.87 - 5.83 (m, 1H), 5.71 - 5.66 (m, 1H), 4.41 - 4.36 (m, 1H), 4.28 - 4.21 (m, 1H), 3.81 - 3.68 (m, 2H)。
120 286 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.37 (d, J= 7.5 Hz, 1H), 7.56 (d, J= 93.2 Hz, 2H), 5.86 (ddd, J= 6.4, 4.2, 1.9 Hz, 1H), 5.33 (t, J= 4.8 Hz, 1H), 5.15 (d, J= 4.9 Hz, 1H), 4.41 (q, J= 7.0 Hz, 1H), 3.59 – 3.41 (m, 2H), 2.23 (dt, J= 13.6, 7.0 Hz, 1H), 2.06 (ddd, J= 13.0, 6.9, 4.3 Hz, 1H), 0.89 (td, J= 8.2, 4.2 Hz, 1H), 0.45 – 0.34 (m, 1H), 0.26 (q, J= 6.0, 5.5 Hz, 2H), 0.19 – 0.09 (m, 1H)。
121 286 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.92 (d, J= 7.5 Hz, 1H), 7.19 (d, J= 28.5 Hz, 2H), 6.10 (dd, J= 9.0, 5.5 Hz, 1H), 5.88 (s, 1H), 5.69 (d, J= 7.5 Hz, 1H), 5.35 (d, J= 5.2 Hz, 1H), 5.11 (dt, J= 54.3, 5.6 Hz, 1H), 4.47 (dd, J= 22.0, 5.7 Hz, 1H), 3.48 (d, J= 4.1 Hz, 2H), 1.02 (tt, J= 8.5, 5.6 Hz, 1H), 0.46 – 0.38 (m, 1H), 0.37 – 0.28 (m, 1H), 0.24 (d, J= 5.2 Hz, 2H)。
122 607 (2M+H +) 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.35 (d, J= 7.4 Hz, 1H), 7.69 (d, J= 91.9 Hz, 2H), 6.06 (td, J= 6.0, 1.9 Hz, 1H), 5.94 (d, J= 4.9 Hz, 1H), 5.55 (t, J= 4.8 Hz, 1H), 5.18 (dt, J= 54.6, 6.3 Hz, 1H), 4.49 (dt, J= 23.1, 5.5 Hz, 1H), 3.72 – 3.44 (m, 2H), 1.40 – 0.72 (m, 1H), 0.49 – 0.12 (m, 4H)。
123 308 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 8.31 (s, 0H), 8.09 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.87 (s, 1H), 7.63 (s, 1H), 6.89 – 6.66 (m, 1H), 6.15 – 6.08 (m, 2H), 5.58 (s, 1H), 5.14 – 4.91 (m, 2H), 4.45 – 4.38 (m, 1H), 3.68 (d, J= 12 Hz, 1H), 3.54 (d, J= 12.4 Hz, 1H)。
129 404 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 7.92 (d, J= 6.8 Hz, 1H), 7.88 (brs, 1H), 7.64 (brs, 1H), 6.21-6.14 (m, 2H), 5.45 (t, J= 5.2 Hz, 1H), 5.29 (t, J= 4.4 Hz, 0.5H), 5.16 (t, J = 4.4 Hz, 0.5H), 4.47-4.40 (m, 1H), 3.73-3.69 (m, 1H), 3.59-3.52 (m, 2H)。
131 324 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.09 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.87 (brs, 1H), 7.63 (brs, 1H), 6.53 (d, J= 13.2 Hz, 1H), 6.19-6.14 (m, 2H), 6.06 (d, J= 13.2 Hz, 1H), 5.56 (t, J= 5.2 Hz, 1H), 5.09 (t, J= 5.2 Hz, 0.5H), 4.96 (t, J= 5.2 Hz, 0.5H), 4.45-4.40 (m, 1H), 3.58-3.53 (m, 1H), 3.49-3.45 (m, 1H)。
132 324 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.05 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.89 (brs, 1H), 7.64 (brs, 1H), 6.52 (d, J= 8.0 Hz, 1H), 6.20 (brs, 1H), 6.11-6.08 (m, 1H), 6.00 (d, J= 8.0 Hz, 1H), 5.54 (brs, 1H), 5.08 (t, J= 5.2 Hz, 0.5H) 4.94 (t, J= 5.2 Hz, 0.5H), 4.48-4.41 (m, 1H), 3.77-3.73 (m, 1H), 3.54-3.50 (m, 1H)。
135 324 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.08 (d, J= 7.2, Hz, 1H), 7.85 (brs, 1H), 7.61 (brs, 1H), 6.23-6.19 (m, 1H), 6.01 (brs, 1H), 5.42 (brs, 1H), 5.32-5,17 (m, 1H), 4.41-4.35 (m, 1H), 3.69-3.66 (m, 1H), 3.53-3.50 (m, 1H), 2.85-2.82 (m, 1H), 2.59-2.55 (m, 1H), 2.13 (s, 3H)。
137 328 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 8.12 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.95 – 7.63 (m, 2H), 6.34 – 6.29 (m, 2H), 5.59 (t, J= 5.2 Hz, 1H), 4.80 (t, J= 6.4 Hz, 1H), 4.46 – 4.45 (m, 1H), 3.97 (d, J= 12.0 Hz, 1H), 3.79 – 3.74 (m, 1H), 3.73 (d, J= 13.6 Hz, 1H), 3.58 – 3.33 (m, 1H)。
138 307 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.04 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.86 (brs, 1H), 7.60 (brs, 1H), 7.46 (s, 1H), 7.21 (s, 1H), 6.26-6.21 (m, 1H), 6.04 (d, J= 4.8 Hz, 1H), 5.22-5.19 (m, 1H), 5.02-5.01 (m, 0.5H), 4.89 (m, 0.5H), 4.15-4.11 (m, 1H), 3.93-3.88 (m, 1H), 3.55-3.52 (m, 1H)。
139 293 1H NMR (400 MHz, 甲醇- d 4) δ 8.05 (d, J= 6.4 Hz, 1H), 6.34-6.29 (m, 1H), 5.25-5.11 (m, 1H), 4.47-4.42 (m, 1H), 3.71 (s, 2H), 3.11-2.98 (m, 2H)。
161 418.01 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 7.90 (s, 1H), 6.99 (s, 1H), 5.72 (t, J= 7.1 Hz, 1H), 5.59 (d, J= 5.5 Hz, 1H), 5.30 (t, J= 6.2 Hz, 1H), 4.37 (q, J= 6.1 Hz, 1H), 3.57 (dd, J= 11.9, 6.2 Hz, 1H), 3.48 (dd, J= 11.9, 6.2 Hz, 1H), 2.40 – 2.22 (m, 2H)。
162 309 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.20 (s, 1H), 8.31 – 8.25 (m, 1H), 6.29 – 6.26 (m, 1H), 5.95 – 5.80 (m,1H), 5.53 – 5.27 (m, 2H), 4.96 – 4.92 (m, 1H), 4.60 – 4.46 (m, 1H), 3.82 – 3.76 (m, 1H), 3.63 – 3.46 (m, 2H), 1.24 – 0.98 (m, 3H)。
163 313 1H NMR (400 MHz, 甲醇- d 4) δ 8.04 (dd, J= 6.6, 2.0 Hz, 1H), 6.37 (ddd, J= 14.6, 4.4, 1.6 Hz, 1H), 5.24 (dt, J= 53.3, 4.0 Hz, 1H), 4.54 (dd, J= 19.5, 3.5 Hz, 1H), 3.90 – 3.71 (m, 4H)。
164 308 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.33 (s, 1H), 7.82 (brs, 2H), 6.20-6.17 (m, 1H), 5.40-5.36 (m, 2H), 5.14 (t, J= 5.6 Hz, 1H), 5.02-4.91(m, 2H), 4.65-4.60 (m, 1H), 3.56-3.51 (m, 2H), 2.59-2.56 (m, 1H), 2.39-2.35 (m, 1H)。
165 304.85 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ = 7.96 (br s, 1H), 7.88 (d, J= 6.8 Hz, 1H), 7.72 (br s, 1H), 6.35-5.89 (m, 3H), 5.18 (dt, J= 5.2, 52 Hz, 1H), 4.46 (dd, J= 4.9, 24 Hz, 1H), 3.79 - 3.71 (m, 2H)。
166 289 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.02 (brs, 1H), 7.83 (d, J= 7.0 Hz, 1H), 7.75 (brs, 1H), 6.92 (d, J= 5.5 Hz, 1H), 6.35-6.26 (m,1 H), 5.96 (t, J= 6.3 Hz, 1H), 5.29-5.09 (m, 1H), 4.52-4.45 (m, 1H), 3.80 (d, J= 6.4 Hz, 2H)。
172 339 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 7.62 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 7.26 (s, 1H), 7.20 (s, 1H), 6.26 (m, 1H), 6.15 (d, J= 4.0 Hz, 1H), 5.73 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 5.32 (t, J= 4 Hz, 1H), 5.18 (t, J= 3.4 Hz, 1H), 5.05 (t, J= 3.3 Hz, 1H), 4.46 (d, J= 3.4 Hz, 1H), 3.79 (d, J= 10.8 Hz, 1H), 3.68 – 3.58 (m, 3H)。
174 415 (M-H) 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6) δ 8.11 – 8.06 (m, 1H), 7.96 (s, 1H), 7.53 (s, 1H), 6.52 (dd, J= 7.3, 4.8 Hz, 1H), 5.52 (t, J= 6.4 Hz, 1H), 4.15 (q, J= 11.5 Hz, 2H), 3.84 – 3.77 (d, J= 11.7 Hz, 2H), 2.73 (ddd, J= 13.7, 7.0, 4.9 Hz, 1H), 2.67 – 2.53 (m, 1H), 2.56 – 2.47 (m, 1H), 2.41 (ddd, J= 13.5, 7.4, 5.8 Hz, 1H), 1.13 – 1.07 (dd, J= 7.0, 1.8 Hz, 12H)。
實例 104 用於抑制 LINE1 逆轉錄酶之穩定細胞檢定
使用穩定之人工內含子順式LINE1報告基因檢定來檢驗示例性化合物抑制LINE1逆轉錄酶之能力。檢定程序及結果描述如下。 I 部分 穩定的人工內含子順式 LINE1 報告基因檢定之程序
表現雙向誘導LINE1構築體的穩定之HeLa Tet-On 3G (Takara,目錄號631183)細胞株係如Xie, Y. 等人. 「Cell division promotes efficient retrotransposition in a stable L1 reporter cell line,」 Mobile DNA(2013) 4:10中所述生成。篩選高螢光素酶表現之單細胞純系,且選擇最高表現的螢火蟲(Firefly)表現純系用於化合物測試。
將測試化合物連續稀釋於DMSO中且在96孔板中點樣。隨後,將HeLa L1人工內含子報告細胞鋪種到含有化合物之孔中(8,000個細胞/孔),且用最終濃度為500 ng/mL之多西環素(Sigma-Aldrich目錄號D9891)誘導細胞進行報告基因表現。按照製造商的說明,使用Dual-Glo螢光素酶檢定系統(Promega目錄號E2940)在鋪種後72 h量測發光。螢火蟲螢光素酶活性用於報告LINE1活性。 II 部分 - 結果
結果列於表6、6-A及6-B中。下表6、6-A、6-B中,A表示值 ≤0.050 μM;B表示值自> 0.050 µM至≤ 0.100 µM;C表示值自> 0.100 µM至≤ 0.250 µM;D表示值自> 0.250 µM至≤ 1µM;E表示值 >1 µM;且NT = 未檢驗。 6.
化合物編號 Ic 50(µm)
1 NT
2 A
3 E
4 E
5 B
6 C
7 E
8 C
9 E
10 E
11 E
12 D
13 D
14 A
15 D
16 D
17 >30
18 E
19 D
20 E
21 D
22 A
23 A
24 D
25 A
26 NT
6-A.
化合物編號 Ic 50(µm)
27 A
28 E
29 E
30 E
31 A
32 E
33 E
34 >30
35 A
36 E
37 A
38 E
39 D
40 A
41 A
42 A
43 A
44 A
45 B
46 B
47 A
48 B
49 B
50 A
51 A
52 C
53 D
54 >30
55 E
56 C
57 E
58 B
59 E
60 E
61 A
62 D
63 D
64 B
65 A
66 D
67 A
68 C
69 A
70 E
71 >30
72 D
73 A
74 A
75 C
76 A
77 A
78 B
79 >30
80 C
81 C
82 A
83 E
84 E
85 B
86 A
88 A
92 A
94 >30
95 >30
106 A
107 A
108 B
109 A
110 D
111 A
112 A
113 B
114 C
115 A
116 C
119 B
120 D
121 C
122 D
123 B
129 E
131 C
132 E
135 E
137 D
138 >30
139 >30
161 B
162 >30
163 >30
164 D
166 >30
172 A
173 D
174 >30
6-B
化合物編號 Ic 50(µm)
175 A
176 E
177 E
178 B
179 E
180 E
實例 105 用於抑制 LINE1 逆轉錄酶之生化檢定
使用均相時間解析螢光(HTRF)檢定檢驗示例性三磷酸酯類似物抑制LINE1逆轉錄酶之能力。檢定程序及結果描述如下。 I 部分 - 均相時間解析螢光 LINE1 RT 檢定之程序
LINE1逆轉錄酶均相時間解析螢光(HTRF)檢定法係使用重組帶有MBP標籤之LINE1蛋白(238-1061) (根據Dai L. 等人. BMC Biochemistry 2011; 12:18之程序產生及純化)在384孔格式中進行。將檢驗化合物連續稀釋於DMSO中,且在檢定緩衝液(50 mM Tris-HCl、50 mM KCl、10 mM MgCl 2、10 mM DTT,pH 8.1)中進一步稀釋,以達到1%的最終DMSO濃度。將連續稀釋之化合物在檢定緩衝液中與64 ng/孔的LINE1酶、5 nM預退火模板/生物素-引子對(在Generay Biotechnology合成)、10 nM螢光素-12-dCTP螢光探針(PerkinElmer)及1 µM dGTP/dATP/dTTP (ThermoFisher Scientific)混合。模板/生物素引子序列如下: 5'至3' GUAACUAGAGAUCCCUCAGACCCUUUUAGUCAGAAU (SEQ ID NO: 1) 5'至3'生物素-TTCTGACTAAAAGGGTCTGAGGGAT (SEQ ID NO: 2)。
在25℃下孵育60分鐘後,添加含偵測試劑(20 mM EDTA與鏈黴親和素-鋱穴狀化合物,Cisbio Bioassay)之PPI緩衝液(Cisbio Bioassay),且將混合物在25℃下孵育30分鐘。在孵育結束時,在Envision 2104讀板器(PerkinElmer)上讀取ex/em=337/485 nm及ex/em=337/520 nm處之螢光。將520/485 nm之螢光比率用於計算。計算抑制百分比,其中DMSO樣品為0%抑制且沒有酶為100%抑制。藉由用4參數非線性迴歸方程擬合化合物劑量抑制曲線來計算IC 50 II 部分 - 結果
在此檢定中檢驗了以下化合物:
化合物編號 三磷酸酯結構 IC 50(µM)
2-TP 0.0475
35-TP 0.0137
40-TP 0.831
14-TP 0.272
製備且檢驗了以下額外的三磷酸酯化合物:
化合物編號 三磷酸酯結構 IC 50(µM)
44-TP 0.108
43-TP 0.081
67-TP 0.43
86-TP 1.61
化合物 106 用於抑制 HERV-K 逆轉錄酶之生化檢定
使用均相時間解析螢光(HTRF)檢定來檢驗示例性三磷酸酯類似物抑制HERV-K逆轉錄酶之能力。檢定程序及結果描述如下。 I 部分 - 均相時間解析螢光 HERV-K RT 檢定之程序
HERV-K逆轉錄酶均相時間解析螢光(HTRF)檢定係使用HERV-K逆轉錄酶(2-596)-8His蛋白在384孔格式中進行。桿狀病毒係使用Bac-to-Bac技術(Invitrogen)產生。將含有HERV-K逆轉錄酶序列(NCBI GenBank編號AAC63291.1, J. Virology(1999)第73卷,第3期,第2365-2375頁)之pFastBac供體質體按照製造商的說明轉化至DH10 Bac細胞中。然後以選殖方式分離重組桿狀病毒質體(bacmid)且用脂質體轉染至SF9細胞中。HERV-K逆轉錄酶表現於SF9昆蟲細胞中,然後先後使用固定化金屬親和層析(IMAC)及粒徑排阻層析(SEC)進行純化。
將檢驗化合物連續稀釋於DMSO中,且在檢定緩衝液(50 mM Tris-HCl、50 mM KCl、10 mM MgCl 2、10 mM DTT,pH 8.1)中進一步稀釋,以達到1%的最終DMSO濃度。將連續稀釋之化合物與16 ng/孔的HERV-K酶、5 nM預退火模板/生物素-引子對(在Generay Biotechnology合成)、10 nM螢光素-12-dCTP螢光探針(PerkinElmer)及1 mM dGTP、dATP及DTTP (ThermoFisher Scientific)混合。模板/生物素-引子序列為: 5'至3' GUAACUAGAGAUCCCUCAGACCCUUUUAGUCAGAAU (SEQ ID NO: 1) 5'至3'生物素-TTCTGACTAAAAGGGTCTGAGGGAT (SEQ ID NO: 2)。
在25℃下孵育30分鐘後,添加含偵測試劑20 mM EDTA與鏈黴親和素-鋱穴狀化合物(Cisbio Bioassay)之PPI緩衝液(Cisbio Bioassay),且將混合物在25℃下孵育60分鐘。在孵育結束時,在Envision 2104讀板器(PerkinElmer)上讀取ex/em=337/485 nm及ex/em=337/520 nm處之螢光。將520/485 nm之螢光比率用於計算。計算抑制百分比,其中DMSO樣品為0%抑制且沒有酶為100%抑制。藉由用4參數非線性迴歸方程擬合化合物劑量抑制曲線來計算IC 50值。 II 部分 - 結果
在此檢定中檢驗了以下三磷酸酯類似物。結果顯示於下表中:
化合物編號 三磷酸酯結構 IC 50(µM)
2-TP 16.97
35-TP 0.013
製備且檢驗了以下額外的三磷酸酯化合物:
化合物編號 三磷酸酯結構 IC 50(µM)
40-TP >10
14-TP >10
44-TP >10
43-TP 4.01
67-TP >10
86-TP >10
實例 107–THP1 TREX1 KO 抑制檢定
在用5-氮雜-2ʹ-去氧胞苷處理之THP1 Dual TREX1 KO細胞中,檢驗了示例性化合物改變1型乾擾素反應的能力。檢定程序及結果描述如下。 I 部分 - 程序
THP1 Dual TREX1 KO細胞係購自Invivogen。將THP1-Dual™ KO-TREX1細胞培養於RPMI 1640、10%熱失活胎牛血清、25 mM HEPES、10µg/mL殺稻瘟菌素(blasticidin)及100µg/mL吉歐黴素(zeocin)中。單獨或在存在1µM 5-氮雜-2ʹ-去氧胞苷(Sigma-Aldrich,目錄號189825)之情況下,藉由檢驗化合物之劑量滴定處理THP1-Dual™ KO-TREX1細胞。處理六天後評定1型乾擾素及細胞生存力。
在DMSO中製備檢驗化合物之儲備溶液,然後在DMSO中稀釋三倍。在細胞培養基中為各稀釋液製備額外的50倍稀釋液。然後將10µL經稀釋檢驗化合物添加至96孔板中。
用1xPBS或1µM 5-氮雜-2ʹ-去氧胞苷處理THP1-Dual™ KO-TREX1細胞。將來自任一處理的190µL THP1-Dual™ KO-TREX1細胞以50,000個細胞/孔添加至含有檢驗化合物滴定之96孔板的每個孔中。在37℃、5% CO 2下將細胞於加濕孵育箱中孵育六天。以與上述相同之密度添加用1µM 5-氮雜-2ʹ-去氧胞苷處理的細胞,且在37℃、5% CO 2下於加濕孵育箱中孵育六天。第六天,將25µL細胞上清液轉移至96孔白壁板中,然後向各孔中添加50µL含有穩定劑之Quanti-Luc溶液。根據製造商的說明在讀板器上偵測發光。
藉由向各孔中添加25µL CellTiter-Glo (Promega,G9683)溶液且在室溫下置於振盪器上10分鐘來評定剩餘細胞的細胞生存力。根據製造商的說明,在讀板器上偵測發光。 II 部分 - 結果
結果顯示於下表中。在表中,A表示值 ≤0.050 μM;B表示值自> 0.050 µM至≤ 0.100 µM;C表示值自> 0.100 µM至≤ 0.250 µM;D表示值自> 0.250 µM至≤ 1µM;E表示值 >1 µM;且NT = 未檢驗。 7-A
化合物編號 Ic 50(µm)    化合物編號 ic 50(µM)
1 E    27 E
2 B    28 E
3 NT 29 E
4 E 30 NT
5 E 31 E
6 E 32 E
7 E 33 E
8 E 34 E
9 E 35 D
10 NT 36 NT
11 E 37 E
12 E 38 E
13 E 39 E
14 C 40 E
15 E 41 E
16 E 42 E
17 E 43 E
18 E 44 E
19 E 45 E
20 E 46 E
21 NT 47 E
22 B 48 NT
23 E 49 NT
24 E 50 D
25 E 51 E
26 E      
7-B
化合物編號 Ic 50(µm)
52 E
53 E
55 E
56 E
57 E
58 E
60 E
61 E
62 E
63 E
64 E
65 D
66 E
67 D
68 E
69 E
70 E
72 E
73 E
74 E
75 E
76 E
77 E
78 E
80 E
81 E
82 E
85 D
86 E
88 D
92 E
106 D
107 E
108 D
109 E
110 E
111 B
112 E
113 E
114 E
115 E
116 E
119 E
120 E
121 E
122 E
123 E
131 E
137 E
161 B
164 E
165 D
172 E
173 E
175 D
176 E
177 E
178 E
179 E
180 E
實例 108 –C57BL/6 小鼠中之 活體內地西他濱攻擊模型
在用地西他濱處理之C57BL/6小鼠中檢驗了示例性化合物改變乾擾素刺激基因(ISG)反應的能力。檢定程序及結果描述如下。 I 部分 化合物 23 之程序
將二十只9-11週齡C57BL/6小鼠在實驗室中適應至少5天。在0.5%甲基纖維素溶液中製備化合物23,用於經口(p.o.)投與。將地西他濱(Sigma-Aldrich)溶解於無菌PBS (pH 7.4)中,且在溶液製備後30分鐘內給藥。化合物及地西他濱之劑量自第0天至第4天每一天,一天投與一次。
在第0天,將小鼠分成五組,每組五隻,且給予它們第一劑地西他濱(腹膜內(i.p.),5 mg/kg)及化合物23。給藥組為:
化合物23 劑量(mg/kg) 地西他濱劑量(mg/kg)
PBS 0 0
地西他濱對照 0 5
1 0.6 5
2 2.0 5
3 6.0 5
自第0天至第4天每天投與地西他濱及化合物23。在第4天最後一劑投與後1小時對所有小鼠實施安樂死。收集脾臟、肝臟及末端結腸以及來自各動物之血漿。藉由首先使用Δ (Delta) CT方法正規化為GAPDH基因來計算干擾素刺激基因(ISG)表現之倍數變化。計算CT (關注之基因)–CT (參考基因)以生成所有樣品的Δ CT。然後藉由採用Log2(Δ CT (對照) – Δ CT (實驗)計算倍數變化。本實例中之對照為PBS對照動物組。Taqman雙鏈檢定用於確定GAPDH相對於IFIT2之水準。 II 部分 - 化合物 2 之程序
將二十只9-11週齡C57BL/6小鼠在實驗室中適應至少5天。在含20% PEG400之PBS (最終pH 4.5)中製備化合物2,用於經口投與。將地西他濱(Sigma)溶解於無菌PBS (pH 7.4)中,且在溶液製備後30分鐘內給藥。化合物2與地西他濱之劑量一天投與一次。
在第0天,將小鼠分成五組,每組五隻,且給予它們第一劑地西他濱及化合物2。給藥組為:
化合物2 劑量(mg/kg) 地西他濱劑量(mg/kg)
PBS 0 0
地西他濱對照 0 5
1 1 5
2 10 5
3 100 5
自第1天到第4天每天投與地西他濱(腹膜內,5 mg/kg)及化合物2。在第4天最後一劑投與後1小時對所有小鼠實施安樂死。採集腎臟且快速冷凍在液氮中,且收集血漿(EDTA)用於生物分析。藉由首先使用Δ CT方法正規化為GAPDH基因來計算干擾素刺激基因(ISG,具體而言IRF7及MX1)表現之倍數變化。計算CT (關注之基因)–CT (參考基因)以生成所有樣品的Δ CT。然後藉由採用Log2(Δ CT (對照) – Δ CT (實驗)計算倍數變化。本實例中之對照為PBS對照動物組。將單獨的引子用於擴增目標基因。 III 部分 - 結果
地西他濱之重複給藥在對照動物之脾臟中誘導干擾素刺激基因(ISG)反應(參見圖1A及圖1B)。給予化合物2顯示出ISG反應之變化(參見圖2A)。給予化合物2亦顯示出ISG反應之變化(參見圖2B及2C)。 IV 部分 -BALB/c 小鼠中之 活體內地西他濱攻擊模型
使三十只9-11週齡BALB/c小鼠適應實驗室至少5天。在20% PEG400 (pH 3.5)溶液中製備化合物2、40及67用於經口投與,化合物在每日給藥前不超過30分鐘製備。將地西他濱(Sigma)溶解於無菌PBS (pH 7.4)中,且在溶液製備後30分鐘內給藥。化合物及地西他濱之劑量自第0天至第4天每一天,一天投與一次。
在第0天,將小鼠分成七組,每組五隻,且給予其第一劑量之地西他濱(腹膜內,5mg/kg)及化合物。給藥組如下表(所有劑量以mg/kg表示):
地西他濱 化合物2 化合物40 化合物67
PBS 0 0 0 0
對照 5 0 0 0
1 5 0 0 0
2 5 100 0 0
3 5 0 100 0
4 5 0 0 30
5 5 0 0 100
自第1天至第4天每天投與地西他濱(腹膜內,5mg/kg)及化合物2、40或67。在第4天最後一劑投與後1小時,對所有小鼠實施安樂死。採集脾臟及腎臟且在液氮中快速冷凍,且收集血漿(EDTA)進行生物分析。使用PureLink RNA迷你套組(ThermoFisher)分離總RNA,且使用TruSeq Stranded mRNA平台(Illumina)為RNAseq製備。在Illumina HiSeq系統上收集50M Stranded讀數。資料分析如下:使用STAR RNA-seq對準儀將RNA定序讀數與hg38參考基因體對準(Dobin等人,2013)。對於各轉錄本使用Salmon (Patro等人,2015) TPM值量化各轉錄本之表現。此等轉錄水準TPM值按照基因彙集以獲得基因水準TPM值,且對此等值進行對數轉換。使用Ensembl BioMart (Kinsella等人,2011年)在來自Liu等人2019之人類基因體中之ISG相關基因列表中識別各基因之小鼠異種同源物。各樣品之ISG評分計算為此ISG基因集中所有基因之中值對數轉換TPM值。 V 部分 - 結果
地西他濱之重複給藥在對照動物之脾臟中誘導干擾素刺激基因(ISG)反應(參見圖1A及圖1B)。在C57BL/6小鼠中,給予化合物23顯示出ISG反應之變化(參見圖2A)。在C57BL/6小鼠中化合物2之給予亦顯示出ISG反應之變化(參見圖2B及2C)。
在BALB/c小鼠中,給予化合物2 (圖2D)、化合物40 (圖2E)、30 mg/kg之化合物67 (圖2F)及100 mg/kg之化合物67 (圖2G)顯示出脾臟及腎臟中ISG評分之變化。 實例 109 –B6/JGpt-Trex1em1Cd1194/Gpt 小鼠模型
在B6/JGpt-Trex1em1Cd1194/Gpt小鼠模型中檢驗示例性化合物改變乾擾素刺激基因(ISG)反應之能力。檢定程序及結果描述如下。 I 部分 化合物 2 之程序
使九隻8-10週齡B6/JGpt-Trex1em1Cd1194/Gpt小鼠適應實驗室至少5天。每天在20% PEG400 (pH 3.5)溶液中製備化合物2用於經口投與。化合物2投與5天。
化合物2 (mg/kg) 接受媒劑?
對照 C57BL/6 0
1 B6/JGpt-Trex1em1Cd1194/Gpt 0
2 B6/JGpt-Trex1em1Cd1194/Gpt 100
自第1天至第5天每天投與化合物2。在第5天最後一劑投與後1小時,對所有小鼠實施安樂死。採集心臟及皮膚且在液氮中快速冷凍,收集血漿(EDTA)進行生物分析。分離總RNA且如實例108之第IIIa部分中確定各樣品的ISG評分。 II 部分 - 化合物 67 之程序
使十五隻6-8週齡B6/JGpt-Trex1em1Cd1194/Gpt小鼠適應實驗室至少5天。每天在20% PEG400 (pH 3.5)溶液中製備化合物67用於經口投與。化合物2投與5天。
化合物67 mg/kg 接受媒劑?
對照 C57BL/6 0
1 B6/JGpt-Trex1em1Cd1194/Gpt 0
2 B6/JGpt-Trex1em1Cd1194/Gpt 100
自第1天至第5天每天投與化合物67。在第5天最後一劑投與後1小時,對所有小鼠實施安樂死。採集心臟及皮膚且在液氮中快速冷凍,收集血漿(EDTA)進行生物分析。分離總RNA且如實例108之第IIIa部分中確定各樣品的ISG評分。 III 部分 - 結果
B6/JGpt-Trex1em1Cd1194/Gpt之心臟及腎臟ISG評分相對於同窩仔對照升高(圖8A)。化合物2之重複給藥降低了心臟及皮膚中B6/JGpt-Trex1em1Cd1194/Gpt之ISG評分(圖8B)。化合物67之重複給藥降低了心臟及皮膚中B6/JGpt-Trex1em1Cd1194/Gpt之ISG評分(圖8C)。 實例 110– 地西他濱刺激之人類 PBMC 檢定 I 部分 - 程序
將EasySep緩衝液(32 mL,STEMCELL Technologies,目錄號20144)用於稀釋8 mL LRSC膚色血球層(buffy coat) (來自新鮮的Leukopak)且輕輕混合。將經過稀釋之膚色血球層(20 mL)轉移至兩個SepMate 50管中的每一個中,且在管中填充15 mL Lyphoprep (STEMCELL,目錄號07851)密度梯度。然後將SepMate管在室溫下以1200G離心10分鐘(制動器開啟)。藉由將上清液之頂層快速倒入新的50 mL錐形管中,將其收集於SepMate管中。藉由在300G下離心5分鐘,用EasySep緩衝液洗滌PBMC兩次。將細胞再懸浮於30 mL EasySep中,且以100G離心5分鐘(制動器關閉),然後移除血小板。然後將細胞再懸浮於6 mL之1x RBC溶解緩衝液(Invitrogen)中,且在37℃下孵育5分鐘。然後將25 mL EasySep緩衝液混入管中且以300G離心5分鐘。將細胞再懸浮於10 mL EasySep緩衝液中,然後使用Cellometer (AO/PI)對細胞進行計數。PBMC以3x10 6/mL再懸浮於RPMI1640 (ThermoFisher) + 10% FBS (HyClone) + p/s中。然後將PBMC (100 µL,300k PBMC)接種於96孔平底微板(Corning)中,該微板已在檢定開始前一天在4℃下預塗佈100 µL抗CD3抗體(PBS中10µg/mL,Biolegend)或PBS。
向各孔中添加以下溶液1) 100 µL細胞(每孔最終細胞數為3x10 5個細胞/孔);2) 25 µL抗CD28抗體,6x (5 µg/mL最終濃度,Biolegend);3) 25 µL地西他濱,6x (10 µM最終濃度);及4)用d300e數字分配器(Tecan)將DMSO中之化合物直接分配至各孔中。將各孔之DMSO最終濃度正規化為0.3%。將板在37℃下孵育5天,無需任何攪動。孵育後120小時收集樣品,使用U-PLEX人類IFN-β Assay Sector (5PL) (MSD,目錄號K151VIK-2)測定IFN-β及IL-2水準。
5天後,將板以100xG離心5分鐘。收集上清液(100µL)用於使用上述MSD檢定來進行乾擾素β (IFN-β)分析,且將任何殘留的上清液儲存於-80℃。檢查細胞生存力以確定細胞死亡是否對偵測到之IFN-β水準有影響。 II 部分 - 結果
在此實驗中檢驗了化合物2、23、25及40。結果顯示於圖3A及3B中。化合物40在較高濃度下顯示出一些細胞生存力損失,因此圖表中顯示之IFN-β減少會受到此細胞生存力損失的影響。圖3A表示高反應者(代表5個所檢驗供體中2個之PBMC),且圖3B表示中等反應者(代表5個所檢驗供體中2個之PBMC)。一個PBMC供體顯示,地西他濱對乾擾素反應之激發幾乎沒有影響(資料未顯示)。化合物2及40顯示出對IFN-β之抑制,儘管化合物40在較高劑量下亦顯示出細胞死亡。此等結果為使用該等化合物治療自體免疫病症提供了支持。化合物23及25活化IFN-β之產生,這顯示了免疫系統的活化。此等結果為使用該等化合物治療癌症提供了支持。 實例 111–HaCaT 細胞中 UVB 誘導之 pTBK1 的分析 I 部分 - 程序
pTBK1為調控發炎性反應之重要傳訊分子。HaCaT細胞在HaCaT培養基(DMEM,優化的1x(Addex Bio)+ 1%青黴素鏈黴素(Gibco)+ 5%熱失活胎牛血清(Gibco))中以約100 k/孔之密度鋪種於6孔板中。然後將細胞在37℃下培養隔夜。第二天,用檢驗化合物處理細胞。將各檢驗化合物稀釋且添加至培養基等分試樣中以提供所需濃度。為了添加檢驗化合物+培養基混合物,自各孔中吸出等量的培養基,然後用加有檢驗化合物之培養基補充。然後將細胞再培養72小時,在UVB暴露之前進行化合物處理。
然後自孔中吸出培養基,剩餘細胞在各孔中至少80%匯合。然後將1 mL PBS添加至各孔中,然後將板置於UVB燈下。UVB感測器位於板附近以記錄板之曝光。將細胞暴露於UVB光下,直至它們達到0.1 mJ/cm2。然後將板蓋上且轉移至無菌罩中進行處理。
將PBS吸出孔,且用3 mL新鮮培養基補充孔。然後將細胞再培養24小時,且在暴露於UVB後24小時處理樣品。為了處理樣品,吸出培養基,將板置於冰上,且用冷PBS洗滌細胞,然後吸出冷PBS。將另外1 mL之冷PBS添加至各孔中。然後將細胞在冷PBS溶液中刮擦且轉移至冰上的錐形管中。然後將細胞在4℃下以≥1000 RCF旋轉5分鐘。然後將細胞再懸浮於1 mL冷PBS中且轉移至微量離心管中。將細胞在4℃下以≥1000 RCF再旋轉5分鐘,且吸出PBS。製備細胞團塊用於溶解。
將RIPA溶解緩衝液(#BP-115,Boston BioProducts)添加至Halt蛋白酶及磷酸鹽抑制劑混合物(#78440,ThermoFisher)中,且將混合物在冰上冷卻。將約30µL之溶解緩衝液混合物添加至細胞中。將樣品短暫渦旋,然後在冰上孵育至少15分鐘。然後將細胞在4℃下以≥1000 RCF旋轉5分鐘,且將上清液轉移至乾淨的管中。使用Pierce™ Rapid Gold BCA蛋白質檢定套組#AF3225 (ThermoFisher)量測細胞溶解產物之蛋白質濃度。使用以下套組之一對選擇樣品進行ELISA分析: a.    FastScan™磷酸化TBK1/NAK (Ser172) ELISA套組#46948 (Cell Signaling Technologies) b.    FastScan™總TBK1/NAK ELISA套組 #15816 (Cell Signaling Technologies) c.    FastScan™磷酸化STING (Ser366) ELISA套組#82083 (Cell Signaling Technologies) d.    FastScan™磷酸化IRF-3 (Ser396) ELISA套組#50386 (Cell Signaling Technologies) e.    FastScan™總IRF-3 ELISA套組#29771 (Cell Signaling Technologies) f.    磷酸化NAK/TBK1 (S172) ELISA套組(ab279952) (Abcam) g.    磷酸化IRF3 (S386) ELISA套組(ab279833) (Abcam) II 部分 - 結果
圖4A顯示有或沒有UVB暴露以及有或沒有投與cGAS抑制劑G140 (InvivoGen)之情況下之基線pTBK1 Ser172檢定讀數。亦在此檢定中檢驗化合物2、14、40及44,且所得劑量反應曲線顯示於圖4B及4C中。化合物14在濃度等於或高於30µM時顯示出細胞毒性。在處理72小時後,所有檢驗之化合物均顯示出對基線與UVB誘導之磷酸化TANK結合激酶1 (pTBK1)之劑量依賴性調節。與本發明化合物接觸後pTBK1水準之降低,在UVB刺激TBK1產生及沒有UVB刺激的情況下均可見,支持在投與本發明化合物後炎症減少,因此支持治療如本文所述之自體免疫疾病。
IC 50值係根據反應曲線確定,且此等資料呈現於下表8中。在表中,「A」表示值≤ 0.50 µM;「B」表示值> 0.50 µM至≤ 2.0 µM;「C」表示值> 2.0 µM至≤ 5.0 µM;「D」表示值> 5.0 µM至≤ 10 µM;「E」表示值>10 µM。 8.
化合物編號 IC 50(µM)
2 A
14 B
67 C
40 C
85 D
72 D
12 E
13 E
15 E
16 E
19 E
21 E
51 E
61 E
88 E
44 E
實例 112 用地西他濱誘導之 IFN 產生 THP1-Dual TMTREX1 KO 異種移植物
檢驗了在顯示地西他濱依賴性IFN誘導之小鼠中產生THP1-Dual TMKO-TREX1異種移植物的能力。檢定程序及結果描述如下。 I 部分 - 使用地西他濱誘導之 IFN 產生 THP1-Dual TMTREX1 KO 異種移植物的程序
CB-17 SCID雌性小鼠皮下接種含1000萬個個THP1-Dual TMKO-TREX1細胞之200 μl PBS及Matrigel (1:1)。當腫瘤體積達到350-400 mm 3時,將小鼠隨機分組,且在每個採樣時間點以N=3分組。然後對攜帶THP1-Dual TMKO-TREX1異種移植腫瘤之小鼠以5mg/kg IP投與媒劑或地西他濱(DAC),每天一次,自第1天開始,持續4天。地西他濱調配於無菌PBS,pH 7.4中。自第2天開始每天採集腫瘤,持續4天,在PBS中以50 Hz研磨5 min,在冰上保持30分鐘,同時每5 min渦旋一次。然後離心腫瘤溶解產物,且使用Pierce TMBCA蛋白質檢定套組量測蛋白質濃度。將等量蛋白質添加至96孔黑色板中,且根據製造商的說明使用QUANTI-Luc TM偵測培養基量測螢光素酶訊號。使用EnVision® 2105 Multimode Plate Reader量測發光。 II 部分 - 結果
實驗結果描繪於圖5中。資料相對D2之干擾素訊號進行正規化。在圖5中,「D2 4h」描繪第2天之干擾素資料,其中在地西他濱給藥後4小時採集腫瘤;「D3 4h」描繪第3天之干擾素資料,其中在地西他濱給藥後4小時採集腫瘤;「D4 4h」描繪第4天之干擾素資料,其中在地西他濱給藥後4小時採集腫瘤;「D4 24h」描繪第5天之干擾素資料,其中在第4天最後一次地西他濱給藥後24小時採集腫瘤。
隨著時間的推移,給小鼠投與地西他濱會導致THP1腫瘤中之干擾素訊號增加。 實例 113 改變 THP1 TREX1 KO 異種移植物中 IFN 產生之檢定
檢驗了示例性化合物2、25及40改變小鼠THP1-Dual TMKO-TREX1異種移植物中IFN水準的能力。檢定程序如下所述。 I 部分 - 改變 THP1 TREX1 KO 異種移植物中 IFN 產生之程序
CB-17 SCID雌性小鼠皮下接種含1000萬個THP1-Dual TMKO-TREX1細胞之200 μl PBS及Matrigel (1:1),且當腫瘤體積達到350-400 mm 3時分組。然後將攜帶THP1-Dual TMKO-TREX1異種移植腫瘤之小鼠分成5組。投與三組:(1)地西他濱(DAC),5mg/kg IP,每天一次,持續4天,及(2)檢驗化合物,10、30或100 mg/kg,PO,每天一次,持續4天。一組投與地西他濱(DAC),5mg/kg IP,每天一次,持續4天,以及檢驗化合物媒劑對照。最後一組投與來自檢驗化合物之媒劑對照及來自地西他濱之媒劑對照。在無菌PBS、pH 7.4中調配地西他濱且在含20% PEG400之PBS中調配化合物2、25及40。
在第4天最後一劑投與後24小時採集腫瘤,在PBS中以50 Hz研磨5 min,且在冰上保持30 min,同時每5 min渦旋一次。然後將腫瘤離心,且使用Pierce TMBCA蛋白質檢定套組量測蛋白質濃度。將等量蛋白質添加至96孔黑色板中,且根據製造商的說明使用QUANTI-Luc TM偵測培養基量測螢光素酶訊號。使用EnVision® 2105 Multimode Plate Reader量測發光。 II 部分 - 結果
實驗結果描述於圖6中。資料相對媒劑組之干擾素訊號進行正規化。在圖6中,「D4 24h」描繪第5天之干擾素資料,其中在第4天最後一次地西他濱及檢驗化合物給藥後24小時採集腫瘤。
化合物2及40在THP1腫瘤中顯示出對DAC誘導之IFN訊號的有效抑制。 實例 114–THP1 TREX1 KO 抑制檢定 組合給藥
檢驗示例性化合物以確定兩種化合物之組合給藥對用5-氮雜-2ʹ-去氧胞苷處理之THP1 Dual TREX1 KO細胞中1型乾擾素反應的作用。檢定程序及結果描述如下。 I 部分 - 程序
THP1 Dual TREX1 KO細胞係購自InvivoGen。將THP1-Dual™ KO-TREX1細胞培養於RPMI 1640、10%熱失活胎牛血清、25 mM HEPES、10µg/mL殺稻瘟菌素及100µg/mL吉歐黴素中。在存在1µM 5-氮雜-2ʹ-去氧胞苷(Sigma-Aldrich,目錄號189825)之情況下,藉由檢驗化合物之劑量滴定處理THP1-Dual™ KO-TREX1細胞。處理五天後評定1型乾擾素及細胞生存力。
在DMSO中製備檢驗化合物斯坦匹定及化合物2之儲備溶液,然後在DMSO中稀釋三倍。該板經製備具有檢驗化合物濃度基質,y軸為斯坦匹定(最終濃度3 µM至0.0003 µM)且x軸為化合物2 (最終濃度為0.3 µM至0.00003 µM)。在細胞培養基中為各稀釋液製備額外的50倍稀釋液。然後將10µL經稀釋檢驗化合物添加至384孔板中。
用1µM 5-氮雜-2ʹ-去氧胞苷處理THP1-Dual™ KO-TREX1細胞。將THP1-Dual™ KO-TREX1細胞(50µL)以10,000個細胞/孔添加至含有檢驗化合物滴定的384孔板之各孔中。將細胞在37℃、5% CO2下於加濕孵育箱中孵育五天。第五天,將20µL細胞上清液轉移至384孔白壁板中,然後向各孔中添加50µL含有穩定劑之QUANTI-LUC溶液。根據製造商的說明在讀板器上偵測發光。使用以下分析計算干擾素之抑制百分比:(平均DMSO-樣品)/(平均DMSO-平均30µM斯坦匹定)*100。
藉由向各孔中添加30µl CellTiter-Glo (Promega,G9683)溶液且在室溫下置於振盪器上10分鐘來評定剩餘細胞的細胞生存力。根據製造商的說明,在讀板器上偵測發光。使用以下分析計算使用CellTiter-Glo對細胞生存力之抑制百分比:(平均DMSO-樣品)/(平均DMSO-平均20µM生存力對照試劑)*100。 II 部分 - 結果
根據Twarog,N. R., 等人. Scientific Reports6:25523 (DOI: 10.1038/srep25523)使用對加成相互作用劑量之雙變量反應(BRAID)進行組合分析。最佳BRAID擬合確定為k 2.00 (0.583 – 3.64),其中k > 0表示協同作用,k = 0表示加成性,且k < 0表示拮抗作用。提供用於在四種濃度之斯坦匹定下增強化合物2 (圖7A)及在四種濃度之化合物2下增強斯坦匹定(圖7B)的增強建模曲線。此外,計算EC 50偏移且呈現於下表中:
斯坦匹定(µM) 化合物2 之EC 50(µM)
0 0.040
0.001 0.0335
0.01 0.0203
0.1 0.00015
化合物2 (µM) 斯坦匹定之EC 50(µM)
0 0.115
0.0001 0.103
0.001 0.080
0.01 0.029
實例 115 改變 THP1-Dual TMKO-TREX1 小鼠異種移植物中 IFN 產生之檢定
檢驗示例性化合物67改變小鼠THP1-Dual TMKO-TREX1異種移植物中之IFN水準的能力。檢定程序如下所述。 I 部分 - 改變 THP1-Dual TMKO-TREX1 異種移植物中 IFN 產生之程序
CB-17 SCID雌性小鼠皮下接種含1000萬個THP1-Dual TMKO-TREX1細胞之200 μl PBS及Matrigel (1:1),且當腫瘤體積達到平均340 mm 3時,每個採樣時間點根據治療以N=5分組。共投與六組:(1)地西他濱(DAC),5mg/kg SC,每天一次,持續5天,及(2)檢驗化合物67,六種劑量之一(0.3mg/kg PO,1mg/kg PO,3mg/kg PO,10mg/kg PO,30mg/kg PO,100mg/kg PO),每天一次,持續5天。投與另外兩組(1)地西他濱及檢驗化合物媒劑對照SC+PO,每天一次,持續5天,及(2)地西他濱,5mg/kg SC,每天一次,持續5天。地西他濱調配於無菌PBS,pH 7.4中。檢驗化合物調配於含20% HPBCD之50 mM檸檬酸鹽緩衝液(pH 4.5)中。
在第5天最後一劑投與後4小時採集腫瘤,在PBS中以50 Hz研磨5 min,在冰上保持30 min,同時每5 min渦旋一次。然後將腫瘤離心,且使用Pierce TMBCA蛋白質檢定套組量測蛋白質濃度。將等量蛋白質添加至96孔黑色板中,且根據製造商的說明使用QUANTI-Luc TM偵測培養基量測螢光素酶訊號。使用EnVision® 2105 Multimode Plate Reader量測發光。 II 部分 - 結果
實驗結果描繪於圖9中。資料相對媒劑組之干擾素訊號進行正規化。在圖9中,在第5天最後一次地西他濱及檢驗化合物給藥後4小時,在自小鼠採集之腫瘤中量測IFN訊號。
化合物67在THP1腫瘤中顯示出對DAC誘導之IFN訊號的劑量反應抑制。 實例 116 抑制人類 DNA 聚合酶γ 之生化檢定
使用均相時間解析螢光(HTRF)檢定來檢驗示例性化合物抑制人類DNA聚合酶γ的能力。NRTI對DNA聚合酶γ之脫靶抑制可導致不希望的粒線體毒性。檢定程序及結果描述如下。 I 部分 - 均相時間解析螢光人類 DNA 聚合酶γ 檢定之程序
人類DNA聚合酶γ均相時間解析螢光(HTRF)檢定係使用重組人類DNA聚合酶γ蛋白質(Gentaur)在384孔格式中進行。將檢驗化合物在水中連續稀釋且在檢定緩衝液(28 mM Tris-HCl、14 mM NaCl、0.56 mM MgCl 2、0.011% Triton X-100、0.11 mg/ml BSA、1.1 mM DTT,pH 8.1)中進一步稀釋。將連續稀釋之化合物與聚合酶γ、10 nM預退火模板/生物素-引子對(在Geneway Biotechnology合成)、100 nM螢光素-12-dCTP螢光探針(PerkinElmer)及10 µM dGTP/dATP/dTTP (ThermoFisher Scientific)在檢定緩衝液中混合。模板/生物素引子序列如下: 5’至3’ TCCCAGACTCCCTAGAGATCAATCAAC (SEQ ID NO: 3) 5’至3’生物素-AGGGTCTGAGGGAT (SEQ ID NO: 4)
在室溫下孵育30分鐘後,添加含偵測試劑(5mM EDTA與鏈黴親和素-鋱穴狀化合物,Cisbio Bioassay)之PPI緩衝液(Cisbio Bioassay),且在室溫下將混合物孵育60分鐘。在孵育結束時,在Envision 2104讀板器(PerkinElmer)上讀取ex/em=337/485 nm及ex/em=337/520 nm處之螢光。將520/485 nm之螢光比率用於計算。計算抑制百分比,其中DMSO樣品為0%抑制且沒有酶為100%抑制。藉由用4參數非線性迴歸方程擬合化合物劑量抑制曲線來計算IC 50
使用上述程序檢驗示例性化合物。結果如下所示。在表中,「A」表示值≤ 50.0 µM;「B」表示值> 50.0 µM至≤ 100.0 µM;「C」表示值> 100.0 µM至≤ 200.0 µM;「D」表示值> 200.0 µM至≤ 300.0 µM;且「E」表示值>300 µM。 59B
化合物編號 Ic 50(µm)
2-TP A
14-TP B
35-TP D
40-TP D
43-TP D
44-TP E
67-TP D
實例 117 生化端粒酶檢定
使用PCR ELISA檢定來檢驗示例性化合物抑制人類端粒酶的能力。人類端粒酶之脫靶抑制可導致不希望之細胞毒性, 例如觸發複製性衰老及/或凋亡細胞死亡。檢定程序及結果描述如下。 I 部分 - 人類端粒酶 PCR ELISA 檢定之程序
根據製造商的說明,使用Telo TAGGG端粒酶PCR ELISA plus套組(Roche),用MCF-7細胞溶解產物中之端粒酶進行人類端粒酶檢定。將MCF-7細胞在溶解緩衝液中溶解,且將上清液用於該檢定。將檢驗化合物在水中連續稀釋,在PCR管中與0.2 µg MCF-7溶解產物混合,且在室溫下孵育15分鐘。然後添加PCR反應混合物,將管轉移至熱循環儀(Analytikjena)中,且端粒酶延伸反應進行30分鐘,隨後按照以下方案進行30個PCR循環:
步驟 時間 溫度 循環
引子延伸 30分鐘 25℃ 1
端粒酶失活 5分鐘 94℃ 1
擴增
變性 30秒 94℃ 30
退火 30秒 50℃
聚合 90秒 72℃
最終聚合 10分鐘 72℃ 1
保持 4℃ 1
將上述2.5 µL PCR擴增產物與10 µl變性試劑混合至PCR板之各孔中,且在室溫下孵育10分鐘。添加100 µl雜交緩衝液T且混勻。將每孔100 µl反應混合物轉移至預塗佈MP模組,在37℃下孵育2小時。移除雜交溶液,用洗滌緩衝液洗滌三次,添加抗DIG-HRP溶液,在室溫下孵育30分鐘。移除抗DIG-HRP溶液且用洗滌緩衝液洗滌五次。添加TMB受質且在室溫下孵育10分鐘。使用Envision (PerkinElmer)量測450 nm處之吸光度。
使用上述程序檢驗示例性化合物。結果顯示於下表9中。在表中,「A」表示值≤ 1.0 µM;「B」表示值> 1.0 µM至≤ 25.0 µM;「C」表示值> 25.0 µM至≤ 50.0 µM;「D」表示值> 50.0 µM至≤ 100.0 µM;且「E」表示值>100.0 µM。 9.
化合物編號 Ic 50(µm)
2-TP A
14-TP A
35-TP E
40-TP E
43-TP B
44-TP C
67-TP E
實例 118 使用 PC3 細胞之粒線體毒性檢定
檢驗示例性化合物對粒線體DNA編碼蛋白COX-1(環氧合酶-1)之表現的抑制。SDH-A (琥珀酸去氫酶-A)係由核DNA編碼之對照粒線體蛋白。COX-1表現之減少指示粒線體DNA合成的脫靶抑制,這會導致粒線體毒性。檢定程序及結果描述如下。 I 部分 - 程序
PC3細胞係購自ATCC且在F-12 Kaighn改質培養基(Hyclone)、10%熱失活胎牛血清(Invitrogen)、1%青黴素-鏈黴素(Invitrogen)中培養。在37℃、5% CO 2下,在加濕孵育箱中,PC3細胞在96孔板上用檢驗化合物之劑量滴定處理5天。處理板一式兩份,一份用於粒線體蛋白之細胞內ELISA且一份用於細胞毒性。
根據製造商的說明,使用MitoBiogenesis In-Cell ELISA套組(Abcam)進行細胞內ELISA以量測粒線體蛋白。自化合物處理過之細胞中吸出培養基,每孔添加100 µl 4%多聚甲醛(Solarbio),且將細胞在室溫下孵育20分鐘。細胞用PBS洗滌三次。每個細胞添加100 µl 0.5%乙酸且將細胞在室溫下孵育5分鐘。細胞用PBS洗滌一次。每孔添加100 µl滲透緩衝液且將細胞在室溫下孵育30分鐘。移除滲透緩衝液,每孔添加200 µl 2x阻斷緩衝液,且將細胞在室溫下孵育2小時。去除阻斷緩衝液後,每孔添加100 µl SDH-A或COX-1之初級抗體,且將細胞在4℃下孵育隔夜。去除初級抗體溶液且用洗滌緩衝液洗滌細胞3次。每孔添加100 µl標記AP及HRP之二級抗體,且將細胞在室溫下孵育1小時。細胞然後用洗滌緩衝液洗滌4次。對於SDH-A偵測,每孔添加100 µl AP顯色溶液,且將細胞在室溫下孵育10分鐘。然後在CLARTO star plus讀微板器(BMG Labtech)上讀取細胞在405 nm處5分鐘之動態讀數。對於COX-1偵測,去除AP顯色溶液,每孔添加100 µl HRP顯色溶液,且將細胞在室溫下孵育2分鐘。然後在CLARTO star plus讀微板器(BMG Labtech)上讀取細胞在600 nm處15分鐘之動態讀數。
對於細胞毒性檢定,移除細胞生存力板中的培養基,每孔添加50 µL Cell Titer Glo (Promega,G9683)。然後將細胞在室溫下孵育30分鐘。藉由Envision (PerkinElmer 2105)讀取發光。
使用上述程序檢驗之化合物的結果出現於下表10中。在表中,「A」表示值≤ 1.0 µM;「B」表示值> 1.0 µM至≤ 10.0 µM;「C」表示值> 10.0 µM至≤ 50.0 µM;「D」表示值> 50.0 µM至≤ 100.0 µM;且「E」表示值>100.0 µM。 10.
化合物編號 IC 50COX-1 (µM) IC 50CTG (µM) IC 50SDH-A (µM)
2 A E E
4 E E E
5 C E E
7 E E E
8 B B B
9 E E E
10 B C B
11 E E E
12 E E E
13 E E E
14 E E E
15 E E E
16 E E E
19 C D C
21 E E E
22 E E E
23 C C D
24 E E E
25 D E E
26 D E E
27 E E E
30 E E E
31 C C C
35 A A E
37 B C B
38 E E E
39 E E E
41 B C B
42 C D C
43 B E B
44 E E E
45 A B A
46 B B B
47 B B B
48 B C B
49 A A A
50 A A A
51 C E E
52 E E E
53 E E E
54 E E E
55 E E E
56 E E E
57 E E E
58 C E E
59 E E E
60 E E E
61 E E E
62 C C C
63 C C C
64 A A A
65 E E E
66 E E E
67 E E E
68 C C C
69 B B B
70 C C C
71 E E E
72 D D E
73 E E E
74 E E E
75 E E E
76 B E B
77 E E E
78 E E E
79 E E E
80 D E E
81 E E E
82 E E E
83 C C C
84 C C D
85 E E E
86 E E E
88 C E E
92 A B B
94 E E E
95 E E E
106 A A A
107 E E E
108 B B C
109 B B B
110 E E E
111 A A A
112 A E A
113 A A A
114 E E E
115 B B B
116 E E E
119 B B B
120 E E E
121 E E E
122 E E E
123 E E E
129 E E E
131 E E E
132 E E E
135 B C C
137 E E E
138 E E E
139 E E E
161 B B B
162 E E E
163 E E E
164 E E E
165 A E A
166 E E E
172 E E E
173 D E E
175 E E E
40 E E E
176 E E E
177 E E E
178 C E E
179 E E E
180 E E E
實例 119 使用 PC3 細胞之粒線體 DNA 檢定
檢驗示例性化合物對7S粒線體DNA以及管家基因18S及GAPDH之DNA水準的作用。7S粒線體DNA之減少指示粒線體DNA合成之脫靶抑制,這會導致粒線體毒性。檢定程序及結果描述如下。 I 部分 - 程序
PC3細胞係購自ATCC且在F-12 Kaighn改質培養基(Hyclone)、10%熱失活胎牛血清(Invitrogen)、1%青黴素-鏈黴素(Invitrogen)中培養。在37℃、5% CO 2下,在加濕孵育箱中,PC3細胞在6孔板上用檢驗化合物之劑量滴定處理5天。
根據製造商的說明,使用DNeasy血液及組織套組(Qiagen)採集細胞且進行粒線體DNA提取。
使用PowerUp TMSYBR TMGreen系統(Applied Biosystems)藉由多重qPCR對粒線體7S及管家基因18S及GAPDH DNA進行量化。製備由5 µl 2x PowerUp TMSYBR TMGreen Master Mix、1 µl 5 μM 7S、18S或GAPDH之引子、4 µl來自上述DNA提取之DNA模板組成的反應混合物。引子序列如下:
7S DNA之正向引子 GTGGCTTTGGAGTTGCAGTT (SEQ ID NO: 5)
7S DNA之反向引子 CAGCCACCATGAATATTGTAC (SEQ ID NO: 6)
mtDNA之正向引子 GTGGCTTTGGAGTTGCAGTT (SEQ ID NO: 7)
mtDNA之反向引子 GAAGCAGATTTGGGTACCAC (SEQ ID NO: 8)
18S之正向引子 CGGGTGACGGGGAATCAG (SEQ ID NO: 9)
18S之反向引子 CACTACCTCCCCGGGTC (SEQ ID NO: 10)
GAPDH之正向引子 AGATCCCTCCAAAATCAAGTGG (SEQ ID NO: 11)
GAPDH之反向引子 GGCAGAGATGATGACCCTTTT (SEQ ID NO: 12)
在QuantStudio TM7 Flex RealTime qPCR系統(Applied Biosystems)上進行qPCR,如下所闡述: a.    50℃持續2分鐘,然後 b.    95℃持續2分鐘,然後 c.    95℃持續15秒,然後 d.    60℃持續60秒, 然後其中步驟(c)及(d)重複60次。
藉由QuantStudio™ 7 Flex軟體(ThermoFisher Scientific)使用預設值設定計算閾值。Ct值用於使用以下公式評估相對粒線體DNA (mtDNA)水準:ΔCt = Ct (7S目標基因)- Ct (18S)或ΔCt = Ct (7S目標基因)- Ct (GAPDH)。相對mtDNA水準 = 2 -ΔCt。相對於DMSO對照之表現倍數 = 2 -ΔCt(化合物處理組)/2 -ΔCt(DMSO組)
使用上述程序檢驗之化合物的結果出現於下表11中。在表中,「A」表示值≤ 0.1 µM;「B」表示值> 0.1 µM至≤ 1.0 µM;「C」表示值> 1.0 µM至≤ 10.0 µM;「D」表示值> 10.0 µM至≤ 100.0 µM;且「E」表示值>100.0 µM。 11.
化合物編號 Ic 50(µm)
2 A
14 A
24 E
25 E
31 B
44 E
61 E
67 E
73 E
77 E
86 E
88 A
116 E
161 E
173 E
40 E
藉由引用的方式併入
本文引用之每篇專利文件及科學文章的全部揭示內容出於所有目的藉由引用之方式併入。 等效物
在不脫離本發明之精神或本質特徵的情況下,本發明可以以其他特定形式體現。因此,認為上述實施例在所有方面都為說明性的,而非限制本文描述之本發明。因此,本發明之範疇由所附申請專利範圍而非前述描述指示,且落入申請專利範圍等效性的含義及範圍內的所有變化都打算包含在其中。
圖1A及1B顯示,在 活體內地西他濱(decitabine)攻擊模型中,地西他濱之重複給藥在媒劑對照動物之脾臟中誘導干擾素刺激基因(ISG)反應,如實例108中所述。 圖2A、2B及2C描繪在 活體內地西他濱攻擊模型中重複投與化合物23 (圖2A)及化合物2 (圖2B及2C)之作用,如實例108中所述。 圖2D、2E、2F及2G係描繪在BALB/c小鼠 活體內地西他濱攻擊模型中,以30 mg/kg重複投與化合物2 (圖2D)、化合物40 (圖2E)、化合物67 (圖2F)及以100 mg/kg重複投與化合物67 (圖2G)對脾臟及腎臟ISG評分之作用的圖,如實例108所述。 圖3A及3B顯示在投與本揭示案之各種化合物後對地西他濱誘導之干擾素水準的兩種示例性PBMC供體反應,如實例110中所述。圖3A描繪一個代表性高反應者,且圖3B描繪一個代表性中度反應者。 圖4A顯示在有及沒有UVB暴露,有或沒有投與cGAS抑制劑G140 (InvivoGen)之情況下pTBK1之基線水準,如實例111中所述。 圖4B及4C顯示在單獨投與不同濃度之化合物2、14、40及44時或在UVB暴露後,pTBK1的水準以劑量依賴性方式變化,如實例111中所述。 圖5係描繪來自每天一次用5mg/kg媒劑或地西他濱(DAC)腹膜內處理四天之小鼠之THP1-Dual TMKO-TREX1異種移植物中乾擾素水準隨時間變化的圖,如實例112中所述。 圖6係描繪來自每天一次用地西他濱(DAC)及不同劑量之化合物2處理四天之小鼠之THP1-Dual TMKO-TREX1異種移植物中正規化干擾素水準的圖,如實例113中所述。該圖描繪了第5天獲得之資料,在第4天最後一次地西他濱給藥後24小時採集腫瘤。 圖7A及7B係描述化合物2在四種濃度之斯坦匹定(stampidine)下的增強作用(圖7A)及斯坦匹定在四種濃度之化合物2下的增強作用(圖7B)之增強建模曲線之圖,如實例114中所述。 圖8A、8B及8C係描繪與 活體內B6/JGpt-Trex1em1Cd1194/Gpt小鼠模型中之對照(圖8B)相比,重複投與化合物2 (圖8A)及化合物67 (圖8B)對B6/JGpt-Trex1em1Cd1194/Gpt小鼠心臟及腎臟ISG評分之作用的圖,如實例109中所述。 圖9係描繪來自每天一次用地西他濱(DAC)及不同劑量之化合物67處理四天之小鼠之THP1-Dual TMKO-TREX1異種移植物中正規化干擾素水準的圖,如實例115中所述。該圖描繪了第5天獲得之資料,在第4天最後一次地西他濱給藥後24小時採集腫瘤。
TW202400134A_112109554_SEQL.xml

Claims (106)

  1. 一種根據式I之化合物: (I) 或其醫藥學上可接受之鹽,其中: B為 ; R 1為-H或 ; Alk每次出現時獨立地為C 2-C 6脂族基; R 2為-H、C 1-C 6脂族基、C 1-C 3鹵基脂族基、C 1-C 3羥烷基、環丙基、-CN、-N 3、-O-(C 1-C 3脂族基)、-F或-Cl; R 3為-H; R 4為-OH、-Cl、-OCH 3、-F、-N 3; R 5為-H或-F;且 R 6為-H、-F、-Cl、C 1-C 6脂族基、C 1-C 4鹵基脂族基、-O-(C 1-C 4脂族基)、環丙基或-OH。
  2. 如前述請求項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中R 5為-H。
  3. 如前述請求項中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中R 4為-OH或
  4. 如前述請求項中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中R 6為-H或-F。
  5. 如前述請求項中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中B為
  6. 如前述請求項中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中R 2為-CH 2Cl、-CH 2F或-C≡CH。
  7. 如前述請求項中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中R 2為-CH 2Cl。
  8. 一種根據式I-A之化合物: (I-A) 或其醫藥學上可接受之鹽,其中: R 1A為-C(O)R 5A、氫或-P(O)(OH)-OP(O)(OH)-OP(O)(OH) 2; R 2A為(i)鹵甲基、C 1-3脂族基或環丙基,其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換,或(ii) -N 3; R 3A為-C(O)R 5A或氫; R 4A為鹵基、氫或-OH; R 5A每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基、C 1-20鹵基脂族基、-C(H)(R 6A)-N(R 7A) 2、苯基、-CH 2-苯基或氫;其中各苯基經m次出現之R 10A取代; R 6A為C 1-6烷基或氫,其中該C 1-6烷基視情況經苯基取代; R 7A每次出現時獨立地表示氫、C 1-6烷基、-C(O)CH 3、-C(O)OC(CH 3) 3、-C(O)O(CH 2)苯基或-C(O)O(CH 2)茀基; R 8A為氫、鹵基、-CH 3或-CF 3; R 9A為鹵基、-CH 3或-CF 3; R 10A每次出現時獨立地表示C 1-6烷基、C 1-6烷氧基、C 1-6鹵烷基或鹵基; B A;且 m為0、1或2; 條件為若R 4A為氫,則R 1A及R 3A中之至少一者為-C(O)R 5A;且 條件為若R 3A為氫,R 4A為鹵基或-OH,且R 1A為氫或-P(O)(OH)-OP(O)(OH)-OP(O)(OH) 2,則R 8A為鹵基、-CH 3或-CF 3
  9. 如請求項8之化合物,其中R 1A為-C(O)R 5A
  10. 如請求項8之化合物,其中R 1A為氫。
  11. 如請求項8之化合物,其中R 1A為-P(O)(OH)-OP(O)(OH)-OP(O)(OH) 2
  12. 如請求項8至11中任一項之化合物,其中R 4A為鹵基。
  13. 如請求項8至11中任一項之化合物,其中R 4A為氟基。
  14. 如請求項8至13中任一項之化合物,其中B A
  15. 如請求項8之化合物,其中該化合物具有下式或其醫藥學上可接受之鹽:
  16. 如請求項8至15中任一項之化合物,其中R 8A為鹵基。
  17. 如請求項8至15中任一項之化合物,其中R 8A為氟基。
  18. 如請求項8至17中任一項之化合物,其中R 2A為鹵甲基。
  19. 如請求項8至17中任一項之化合物,其中R 2A為鹵甲基,其中一或多個氫經氘置換。
  20. 如請求項8至17中任一項之化合物,其中R 2A為-CH 2F。
  21. 如請求項8至20中任一項之化合物,其中R 3A為-C(O)R 5A
  22. 如請求項8至20中任一項之化合物,其中R 3A為氫。
  23. 如請求項8之化合物,其中該化合物由式II表示: (II) 或其醫藥學上可接受之鹽;其中: R 1及R 4獨立地表示-C(O)R 5或氫;條件為R 1及R 4中的至少一者為-C(O)R 5; R 2為鹵基、氫或-OH; R 3為鹵甲基、C 1-3脂族基或環丙基,其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換; R 5每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基、C 1-20鹵基脂族基、-C(H)(R 6)-N(R 7) 2、苯基、-CH 2-苯基或氫;其中各苯基經m次出現之R 10取代; R 6為C 1-6烷基或氫,其中該C 1-6烷基視情況經苯基取代; R 7每次出現時獨立地表示氫、C 1-6烷基、-C(O)CH 3、-C(O)OC(CH 3) 3、-C(O)O(CH 2)苯基或-C(O)O(CH 2)茀基; R 8為氫、鹵基、-CH 3或-CF 3; R 9為鹵基、-CH 3或-CF 3; R 10每次出現時獨立地表示C 1-6烷基、C 1-6烷氧基、C 1-6鹵烷基或鹵基; B 1;且 m為0、1或2。
  24. 如請求項23之化合物,其中該化合物為式II化合物。
  25. 如請求項23或24之化合物,其中R 1為-C(O)R 5且R 4為氫。
  26. 如請求項23或24之化合物,其中R 1為氫且R 4為-C(O)R 5
  27. 如請求項23或24之化合物,其中R 1及R 4為-C(O)R 5
  28. 如請求項23至27中任一項之化合物,其中R 2為鹵基。
  29. 如請求項23至27中任一項之化合物,其中R 2為氟基。
  30. 如請求項23至27中任一項之化合物,其中R 2為氫。
  31. 如請求項23至27中任一項之化合物,其中R 2為-OH。
  32. 如請求項23至31中任一項之化合物,其中B 3為鹵甲基。
  33. 如請求項23至31中任一項之化合物,其中R 3為-CH 2Cl或-CH 2F。
  34. 如請求項23至31中任一項之化合物,其中R 3為-CH 2Cl。
  35. 如請求項23至31中任一項之化合物,其中R 3為C 1-3脂族基或環丙基。
  36. 如請求項23至35中任一項之化合物,其中R 5為-C(H)(R 6)-N(R 7) 2、苯基或-CH 2-苯基;其中各苯基經m次出現之R 10取代。
  37. 如請求項23至35中任一項之化合物,其中R 5為C 1-20脂族基、C 1-20鹵基脂族基或氫。
  38. 如請求項23至35中任一項之化合物,其中R 5為C 1-3烷基。
  39. 如請求項23至35中任一項之化合物,其中R 5為C 1-8烷基。
  40. 如請求項23至39中任一項之化合物,其中B 1
  41. 如請求項23至40中任一項之化合物,其中R 8為氫。
  42. 如請求項23至40中任一項之化合物,其中R 8為鹵基。
  43. 如請求項23至40中任一項之化合物,其中R 8為氟基。
  44. 如請求項23至40中任一項之化合物,其中R 8為-CH 3或-CF 3
  45. 如請求項23至39中任一項之化合物,其中B 1
  46. 如請求項23至39或45中任一項之化合物,其中R 9為鹵基。
  47. 如請求項23至39或45中任一項之化合物,其中R 9為-CH 3或-CF 3
  48. 如請求項8之化合物,其中該化合物由式II-A表示: (II-A) 或其醫藥學上可接受之鹽;其中: R 1及R 4為-C(O)R 5; R 3為鹵甲基; R 5每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基、C 1-20鹵基脂族基、-C(H)(R 6)-N(R 7) 2、苯基或-CH 2-苯基;其中各苯基經m次出現之R 10取代; R 6為C 1-6烷基或氫,其中該C 1-6烷基視情況經苯基取代; R 7每次出現時獨立地表示氫、C 1-6烷基、-C(O)CH 3、-C(O)OC(CH 3) 3、-C(O)O(CH 2)苯基或-C(O)O(CH 2)茀基; R 8為鹵基或-CF 3; R 10每次出現時獨立地表示C 1-6烷基、C 1-6烷氧基、C 1-6鹵烷基或鹵基;且 m為0、1或2。
  49. 如請求項48之化合物,其中R 3為-CH 2Cl或-CH 2F。
  50. 如請求項48之化合物,其中R 3為-CH 2Cl。
  51. 如請求項48至50中任一項之化合物,其中R 5為C 1-4烷基。
  52. 如請求項48至51中任一項之化合物,其中R 8為鹵基。
  53. 如請求項48至51中任一項之化合物,其中R 8為氟基。
  54. 如請求項8之化合物,其中該化合物由式III表示: (III) 或其醫藥學上可接受之鹽;其中: R 1為-CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br、-CH 2I、-CF 3、-CH 2CH 3、-C(H)=CH 2、-C(H)=C=CH 2或環丙基;其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換; R 2為氟基或-OH; R 3為鹵基、-CH 3或-CF 3;且 B 1
  55. 如請求項54之化合物,其中該化合物為式III化合物。
  56. 如請求項54或55之化合物,其中R 1為-CH 2Cl或-CH 2F。
  57. 如請求項54或55之化合物,其中R 1為-CH 2Cl。
  58. 如請求項54或55之化合物,其中R 1為-CH 2CH 3
  59. 如請求項54至58中任一項之化合物,其中R 2為氟基。
  60. 如請求項54至58中任一項之化合物,其中R 2為-OH。
  61. 如請求項54至60中任一項之化合物,其中B 1
  62. 如請求項54至60中任一項之化合物,其中B 1
  63. 如請求項54至62中任一項之化合物,其中R 3為鹵基。
  64. 如請求項54至62中任一項之化合物,其中R 3為氟基。
  65. 如請求項54至62中任一項之化合物,其中R 3為-CH 3或-CF 3
  66. 如請求項8之化合物,其中該化合物由式III-A表示: (III-A) 或其醫藥學上可接受之鹽;其中: R 1為-CH 2Cl、-CH 2Br或-CH 2F;其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換;且 R 3為鹵基或-CF 3
  67. 如請求項66之化合物,其中該化合物為式III-A化合物。
  68. 如請求項66或67之化合物,其中R 1為-CH 2Cl或-CH 2F。
  69. 如請求項8之化合物,其中該化合物由式III-B表示: (III-B) 或其醫藥學上可接受之鹽;其中: R 1為-N 3;且 R 3為鹵基或-CF 3
  70. 如請求項69之化合物,其中該化合物為式III-B化合物。
  71. 一種由式IV表示之化合物: (IV) 或其醫藥學上可接受之鹽;其中: R 1為(i) -CH 2Cl、-CH 2F、-CH 2Br、-CH 2I、-CF 3、-CH 2CH 3、-C(H)=CH 2、-C(H)=C=CH 2或環丙基;其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換,或(ii) -N 3; R 2為氫、鹵基或-CF 3;且 B 1
  72. 如請求項71之化合物,其中該化合物為式IV化合物。
  73. 如請求項71或72之化合物,其中R 1為-CH 2Cl或-CH 2F。
  74. 如請求項71或72之化合物,其中R 1為-CH 2CH 3
  75. 如請求項71至74中任一項之化合物,其中B 1
  76. 如請求項71至74中任一項之化合物,其中B 1
  77. 如請求項71至76中任一項之化合物,其中R 2為氫。
  78. 如請求項71至76中任一項之化合物,其中R 2為鹵基。
  79. 如請求項71至76中任一項之化合物,其中R 2為氟基。
  80. 如請求項71至76中任一項之化合物,其中R 2為-CF 3
  81. 如請求項71之化合物,其中該化合物由式IV-A表示: (IV-A) 或其醫藥學上可接受之鹽;其中: R 1為(i) -CH 2Cl、-CH 2F或-CH 2Br,其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換,或(ii) -N 3;且 R 2為氫或鹵基。
  82. 如請求項81之化合物,其中該化合物為式IV-A化合物。
  83. 如請求項71之化合物,其中該化合物由式IV-B表示: (IV-B) 或其醫藥學上可接受之鹽;其中: R 1為-CH 2Cl、-CH 2F或-CH 2Br,其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換;且 R 2為F。
  84. 如請求項83之化合物,其中該化合物為式IV-B化合物。
  85. 一種本文表1、1-A、1-B、1-C或1-D中之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。
  86. 一種醫藥組合物,其包含根據請求項1至86中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,及載劑、賦形劑及/或媒劑。
  87. 一種治療選自由癌症、自體免疫病症及神經病症組成之群的病症之方法,其包含向有此需要之個體投與治療有效量之式V化合物或其醫藥學上可接受之鹽以治療該病症,其中式V表示為: (V) 或其醫藥學上可接受之鹽;其中: B 1; R 1為-H、-C(O)R 8或-P(O)(OH)-OP(O)(OH)-OP(O)(OH) 2; R 2為-H、C 1-C 6脂族基、C 1-C 3鹵基脂族基、C 1-C 3羥烷基、-CH 2NH 2、-CH 2SH、-CH 2S-(C 1-C 3脂族基)、環丙基、-CN、-C(O)NH 2、-N 3、-O-(C 1-C 3脂族基)、-O-(C 1-C 3鹵基脂族基)、-S-(C 1-C 3脂族基)、-F或-Cl;其中該C 1-C 6脂族基、C 1-C 3鹵基脂族基及環丙基中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換; R 3為-H或-OH; R 4為-OH、-Cl、-OCH 3、-F、-N 3或-OC(O)R 8; R 5為-H或-F; R 6為-H、-F、-Cl、C 1-C 6脂族基、C 1-C 4鹵基脂族基、-O-(C 1-C 4脂族基)、環丙基或-OH; R 7為氫、鹵基、-CH 3或-CF 3; R 8每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基、C 1-20鹵基脂族基、-C(H)(R 9)-N(R 10) 2、苯基、-CH 2-苯基或氫;其中各苯基經m次出現之R 11取代; R 9為C 1-6烷基或氫,其中該C 1-6烷基視情況經苯基取代; R 10每次出現時獨立地表示氫、C 1-6烷基、-C(O)CH 3、-C(O)OC(CH 3) 3、-C(O)O(CH 2)苯基或-C(O)O(CH 2)茀基; R 11每次出現時獨立地表示C 1-6烷基、C 1-6烷氧基、C 1-6鹵烷基或鹵基;且 m為0、1或2。
  88. 如請求項87之方法,其中該化合物為根據式VI之化合物: (VI) 或其醫藥學上可接受之鹽;其中: R 1及R 4獨立地表示-C(O)R 5或氫; R 2為鹵基、氫或-OH; R 3為鹵甲基、C 1-3脂族基或環丙基;其中之每一者的一或多個氫視情況經氘置換; R 5每次出現時獨立地表示C 1-20脂族基、C 1-20鹵基脂族基、-C(H)(R 6)-N(R 7) 2、苯基、-CH 2-苯基或氫;其中各苯基經m次出現之R 10取代; R 6為C 1-6烷基或氫,其中該C 1-6烷基視情況經苯基取代; R 7每次出現時獨立地表示氫、C 1-6烷基、C(O)OC(CH 3) 3、C(O)O(CH 2)苯基或C(O)O(CH 2)茀基; R 8及R 9各自獨立地表示氫、鹵基、-CH 3或-CF 3; R 10每次出現時獨立地表示C 1-6烷基、C 1-6烷氧基、C 1-6鹵烷基或鹵基; B 1;且 m為0、1或2。
  89. 如請求項87之方法,其中該化合物為本文表1、1-A、1-B、1-C、1-D、2、2-A、2-B或2-C中之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。
  90. 一種治療選自由癌症、自體免疫病症及神經病症組成之群的病症之方法,其包含向有此需要之個體投與治療有效量的根據請求項1至85中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,或如請求項86之醫藥組合物以治療該病症。
  91. 如請求項87至90中任一項之方法,其中該方法進一步包含投與有效量之額外治療劑。
  92. 一種抑制個體中之LINE1逆轉錄酶活性之方法,該個體患有選自由癌症、自體免疫病症及神經病症組成之群的病症,該方法包含使LINE1逆轉錄酶與有效量之根據請求項1至85中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽或如請求項86之組合物接觸,以抑制該LINE1逆轉錄酶的活性。
  93. 一種抑制個體中之LINE1逆轉錄酶活性之方法,該方法包含使LINE1逆轉錄酶與有效量的根據請求項1至86中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽或如請求項86之組合物接觸,以抑制該LINE1逆轉錄酶的活性。
  94. 如請求項92或93之方法,其中該方法進一步包含抑制該個體中之HERV-K逆轉錄酶活性。
  95. 一種抑制個體中之HERV-K逆轉錄酶活性之方法,該個體患有選自由癌症、自體免疫病症及神經病症組成之群的病症,該方法包含使HERV-K逆轉錄酶與有效量之根據請求項1至85中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽或如請求項86之組合物接觸,以抑制該HERV-K逆轉錄酶的活性。
  96. 一種抑制個體中之HERV-K逆轉錄酶活性之方法,該方法包含使HERV-K逆轉錄酶與有效量的根據請求項1至85中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽或如請求項86之組合物接觸,以抑制該HERV-K逆轉錄酶的活性。
  97. 如請求項87至92、94、95或96中任一項之方法,其中該病症為癌症。
  98. 如請求項97之方法,其中該癌症為乳癌、卵巢癌、子宮癌、子宮頸癌、前列腺癌、睪丸癌、肺癌、白血病、頭頸癌、口腔癌、食道癌、胃癌、膽管癌、膽囊癌、膀胱癌、尿路癌、結腸癌、直腸癌、甲狀腺癌、胰臟癌、腎癌、肝癌、腦癌、皮膚癌或眼癌。
  99. 如請求項87至92、94、95或97中任一項之方法,其中該病症為自體免疫病症。
  100. 如請求項99之方法,其中該自體免疫病症選自艾卡迪-古特雷斯症候群(Aicardi-Goutieres syndrome)、類風濕性關節炎、牛皮癬、全身性紅斑狼瘡(SLE)、皮膚紅斑狼瘡(CLE)、移植物抗宿主病、硬皮病、I型糖尿病、皮肌炎、發炎性腸道疾病、潰瘍性結腸炎、克隆氏病(Crohn’s disease)、血管炎及休格倫氏症候群(Sjögren’s syndrome)。
  101. 如請求項99之方法,其中該自體免疫病症為全身性紅斑狼瘡(SLE)。
  102. 如請求項87至92、94、95或97中任一項之方法,其中該病症為神經病症。
  103. 如請求項102之方法,其中該神經病症為阿茲海默氏症(Alzheimer’s disease)、肌萎縮性脊髓側索硬化症(ALS)、多發性硬化症、帕金森氏症(Parkinson’s disease)、亨汀頓氏舞蹈症(Huntington’s disease)、周邊神經病變、年齡相關性黃斑退化、克雅氏病(Creutzfeldt-Jacob disease)、中風、朊病毒病、額顳葉癡呆、匹克氏症(Pick’s disease)、進行性核上神經麻痺症、脊髓小腦性失調症、路易體病、癡呆、多系統萎縮、癲癇、雙極性障礙、精神分裂症、焦慮症或重度抑鬱症。
  104. 如請求項87至103中任一項之方法,其中該個體具有(i)升高之LINE1 RNA、LINE1 ORF1多肽及/或LINE1 ORF2多肽表現;及/或(ii)升高之LINE1逆轉錄酶活性。
  105. 如請求項87至104中任一項之方法,其中該個體具有(i) HERV-K RNA之表現及/或(ii) HERV-K逆轉錄酶之活性。
  106. 如請求項87至105中任一項之方法,其中該個體為人類。
TW112109554A 2022-03-15 2023-03-15 用於治療疾病之化合物及方法 TW202400134A (zh)

Applications Claiming Priority (6)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US202263269375P 2022-03-15 2022-03-15
US63/269,375 2022-03-15
US202263354620P 2022-06-22 2022-06-22
US63/354,620 2022-06-22
US202263424723P 2022-11-11 2022-11-11
US63/424,723 2022-11-11

Publications (1)

Publication Number Publication Date
TW202400134A true TW202400134A (zh) 2024-01-01

Family

ID=88024390

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
TW112109554A TW202400134A (zh) 2022-03-15 2023-03-15 用於治療疾病之化合物及方法

Country Status (13)

Country Link
US (3) US20230295212A1 (zh)
EP (1) EP4493573A1 (zh)
JP (1) JP2025509635A (zh)
KR (1) KR20250004956A (zh)
CN (1) CN119546620A (zh)
AU (1) AU2023236711A1 (zh)
CA (1) CA3245459A1 (zh)
CO (1) CO2024012882A2 (zh)
IL (1) IL315480A (zh)
MX (1) MX2024011291A (zh)
PE (1) PE20250684A1 (zh)
TW (1) TW202400134A (zh)
WO (1) WO2023178133A1 (zh)

Families Citing this family (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2025059461A1 (en) * 2023-09-14 2025-03-20 Rome Therapeutics, Inc. Crystalline compounds, pharmaceutical compositions, and methods for treating disease
WO2025255246A1 (en) * 2024-06-04 2025-12-11 Rome Therapeutics, Inc. Compounds and their use in treating medical conditions
WO2025255245A1 (en) * 2024-06-04 2025-12-11 Rome Therapeutics, Inc. Compounds and their use in treating medical conditions

Family Cites Families (80)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6060592A (en) 1990-01-11 2000-05-09 Isis Pharmaceuticals, Inc. Pyrimidine nucleoside compounds and oligonucleoside compounds containing same
US5798340A (en) 1993-09-17 1998-08-25 Gilead Sciences, Inc. Nucleotide analogs
JPH09328497A (ja) 1996-04-12 1997-12-22 Yamasa Shoyu Co Ltd 4’−フルオロメチルヌクレオシド
DE60005501T2 (de) 1999-05-12 2004-06-24 Yamasa Corp., Choshi 4'-c-ethynyl-pyrimidine nukleoside
NZ561342A (en) 2000-10-18 2010-02-26 Pharmasset Inc Simultaneous quantification of nucleic acids in diseased cells
WO2002062197A2 (en) 2000-12-19 2002-08-15 Hospital For Special Surgery Markers for disease susceptibility and targets for therapy
US7105499B2 (en) 2001-01-22 2006-09-12 Merck & Co., Inc. Nucleoside derivatives as inhibitors of RNA-dependent RNA viral polymerase
GB0114286D0 (en) 2001-06-12 2001-08-01 Hoffmann La Roche Nucleoside Derivatives
WO2003078650A2 (en) 2002-03-12 2003-09-25 The Johns Hopkins University Manganese ion regulation of reverse transcriptase activity and methods of modulating same
AU2003269890A1 (en) 2002-06-21 2004-01-06 Isis Pharmaceuticals, Inc. Nucleoside derivatives as inhibitors of rna-dependent rna viral polymerase
US20050113324A1 (en) 2003-01-15 2005-05-26 Bondarev Igor E. Modulation of line-1 reverse transcriptase
PL2604620T5 (pl) 2003-05-30 2024-10-14 Gilead Pharmasset Llc Zmodyfikowane fluorowane analogi nukleozydu
EP1732569B1 (en) 2004-01-21 2009-10-14 Gilead Sciences, Inc. Use of adefovir or tenofovir for inhibiting mmtv-like viruses involved in breast cancer and primary biliary cirrhosis
CA2502109C (en) 2004-03-24 2010-02-23 Yamasa Corporation 4'-c-substituted-2-haloadenosine derivative
US20080261216A1 (en) 2006-09-08 2008-10-23 The Regents Of The University Of Michigan HERV Group II Viruses In Lymphoma And Cancer
US7964580B2 (en) 2007-03-30 2011-06-21 Pharmasset, Inc. Nucleoside phosphoramidate prodrugs
EP1980568A1 (de) 2007-04-13 2008-10-15 Eberhard Karls Universität Tübingen Ethinylierte Heterodinucleosidphosphatanaloga, Verfahren zu deren Herstellung und deren Verwendung
CN100532388C (zh) * 2007-07-16 2009-08-26 郑州大学 2’-氟-4’-取代-核苷类似物、其制备方法及应用
US20090318380A1 (en) 2007-11-20 2009-12-24 Pharmasset, Inc. 2',4'-substituted nucleosides as antiviral agents
US8173621B2 (en) 2008-06-11 2012-05-08 Gilead Pharmasset Llc Nucleoside cyclicphosphates
WO2010030858A1 (en) * 2008-09-15 2010-03-18 Enanta Pharmaceuticals, Inc. 4'-allene-substituted nucleoside derivatives
BRPI1010809A2 (pt) * 2009-05-12 2015-10-13 Southern Res Inst composto, composição farmacêutica, métodos de tratar câncer em mamífero e usos de compostos e de composição farmacêutica
US20120135950A1 (en) 2009-05-21 2012-05-31 The Regents Of The University Of Michigan Antiviral treatment of lymphoma and cancer
AR083221A1 (es) 2010-09-29 2013-02-06 Univ Nac Quilmes Proceso para producir dialquilfosfotriesteres de nucleosidos mediante transesterificacion enzimatica y desproteccion de los mismos para producir nucleosidos monofosfato
EP2625292B1 (en) 2010-10-07 2018-12-05 The General Hospital Corporation Biomarkers of cancer
CN107510040A (zh) 2010-12-31 2017-12-26 雅培制药有限公司 包含人乳低聚糖和核苷酸的营养型组合物以及其治疗和/或预防肠病毒感染的用途
EP2697241B1 (en) 2011-04-13 2019-06-12 Gilead Sciences, Inc. 1'-substituted pyrimidine n-nucleoside analogs for antiviral treatment
US20120321637A1 (en) 2011-06-20 2012-12-20 The Board Of Regents Of The University Of Texas System Combination cancer therapy with herv inhibition
GEP20166496B (en) 2011-12-22 2016-06-27 Alios Biopharma Inc Substituted nucleosides, nucleotides and analogs thereof
NZ629428A (en) * 2012-03-21 2016-10-28 Alios Biopharma Inc Substituted nucleosides, nucleotides and analogs thereof
US9441007B2 (en) 2012-03-21 2016-09-13 Alios Biopharma, Inc. Substituted nucleosides, nucleotides and analogs thereof
WO2014047117A1 (en) 2012-09-18 2014-03-27 Bristol-Myers Squibb Company Process for preparing phosphoramidate derivatives of nucleoside compounds for treatment of viral infections
EP2912050A4 (en) 2012-10-29 2016-09-28 Cocrystal Pharma Inc PYRIMIDIN NUCLEOTIDES AND THEIR MONOPHOSPHATE PRODRUGS FOR THE TREATMENT OF VIRAL INFECTIONS AND CANCER
EP2971120B1 (en) 2013-03-15 2018-06-06 Cold Spring Harbor Laboratory Transposon activation during aging and neuronal decline
WO2014209979A1 (en) 2013-06-26 2014-12-31 Alios Biopharma, Inc. Substituted nucleosides, nucleotides and analogs thereof
SI3043803T1 (sl) 2013-09-11 2022-09-30 Emory University Nukleotidne in nukleozidne sestave in njihova uporaba
CN113712989A (zh) 2013-10-11 2021-11-30 艾丽奥斯生物制药有限公司 取代的核苷、核苷酸及其类似物
PE20170203A1 (es) 2014-02-06 2017-03-16 Riboscience Llc Derivados de nucleosido sustituidos con 4'-difluorometilo como inhibidores de la replicacion de arn de la influeza
WO2015143712A1 (en) 2014-03-28 2015-10-01 Merck Sharp & Dohme Corp. 4'-substituted nucleoside reverse transcriptase inhibitors
CN106456836B (zh) 2014-04-29 2019-12-06 微仙美国有限公司 包含活性剂的聚合物
TW201625247A (zh) 2014-05-12 2016-07-16 葛蘭素史密斯克藍智慧財產權有限公司 用於治療傳染性疾病之醫藥組合物
ES2841310T3 (es) 2014-06-24 2021-07-08 Janssen Biopharma Inc Nucleósidos, nucleótidos y análogos sustituidos para su uso en el tratamiento de infecciones virales
EA201692537A1 (ru) 2014-06-24 2017-05-31 Элиос Биофарма, Инк. Замещенные нуклеозиды, нуклеотиды и их аналоги
WO2015200697A1 (en) 2014-06-25 2015-12-30 The General Hospital Corporation Targeting human satellite ii (hsatii)
WO2016014398A1 (en) 2014-07-22 2016-01-28 Alios Biopharma, Inc. Methods for treating paramyxoviruses
RU2017106742A (ru) 2014-08-05 2018-09-06 Элиос Биофарма, Инк. Комбинированная терапия для лечения парамиксовируса
TWI673283B (zh) 2014-08-21 2019-10-01 美商基利科學股份有限公司 2’-氯胺基嘧啶酮及嘧啶二酮核苷類
JP6671355B2 (ja) 2014-09-26 2020-03-25 リボサイエンス・エルエルシー 呼吸器多核体ウイルスのrna複製の阻害剤としての4’‐ビニル置換ヌクレオシド誘導体
US9908914B2 (en) 2014-10-28 2018-03-06 Alios Biopharma, Inc. Methods of preparing substituted nucleoside analogs
FR3027804A1 (fr) 2014-10-31 2016-05-06 Centre Nat Rech Scient Utilisation d'un inhibiteur de transcriptase inverse dans la prevention et le traitement des maladies degeneratives
MA41213A (fr) 2014-12-19 2017-10-24 Alios Biopharma Inc Nucléosides substitués, nucléotides et analogues de ceux-ci
US20190022116A1 (en) 2014-12-26 2019-01-24 Emory University N4-Hydroxycytidine and Derivatives and Anti-Viral Uses Related Thereto
EP4215527B1 (en) 2015-02-26 2024-10-09 University Of Kentucky Research Foundation Compositions and methods for treating retinal degradation
WO2016145142A1 (en) 2015-03-10 2016-09-15 Emory University Nucleotide and nucleoside therapeutics compositions and uses related thereto
WO2016149366A1 (en) 2015-03-16 2016-09-22 The Johns Hopkins University Methods and compositions for treating cancer
HK1252343A1 (zh) 2015-07-02 2019-05-24 春季银行制药股份有限公司 用於治疗病毒感染的组合物和方法
JP6767011B2 (ja) 2015-09-18 2020-10-14 ヤマサ醤油株式会社 抗dnaウィルス活性などの生理活性を有するヌクレオシド誘導体
EP3355924A1 (en) 2015-09-29 2018-08-08 The U.S.A. as represented by the Secretary, Department of Health and Human Services Methods of treating and preventing amyotrophic lateral sclerosis
WO2017142984A1 (en) 2016-02-16 2017-08-24 Riboscience Llc Inhibitors of zika virus
WO2017156380A1 (en) 2016-03-10 2017-09-14 Emory University N4-hydroxycytidine and derivatives and anti-viral uses related thereto
NZ749593A (en) 2016-06-20 2025-10-31 Univ Leland Stanford Junior Circular rnas and their use in immunomodulation
US20180117042A1 (en) 2016-10-27 2018-05-03 Alios Biopharma, Inc. Methods for treating respiratory syncytial virus infection
WO2018093777A1 (en) 2016-11-15 2018-05-24 The Regents Of The University Of Michigan Centromere analysis
US20210353706A1 (en) 2017-01-23 2021-11-18 Health Research, Inc. Inhibition of endogenous reverse transcriptase and targeting of cells for prophylaxis and therapy of cancer and aging
WO2018208727A1 (en) 2017-05-08 2018-11-15 Eternity Bioscience Inc. Nucleoside and nucleotide analogues as cd73 inhibitors and therapeutic uses thereof
WO2018222774A1 (en) 2017-05-30 2018-12-06 Alios Biopharma, Inc. Methods for treating pneumoviruses
CA3087192A1 (en) 2017-12-27 2019-07-04 Raymond F. Schinazi Combined modalities for nucleosides and/or nadph oxidase (nox) inhibitors as myeloid-specific antiviral agents
CA3090652A1 (en) 2018-02-06 2019-08-15 The General Hospital Corporation Repeat rna as biomarkers of tumor immune response
WO2019246376A1 (en) 2018-06-20 2019-12-26 Chernova Olga B Prevention of primary and treatment-resistant cancer by inhibitors of endogenous reverse transcriptase
WO2020142629A1 (en) 2019-01-02 2020-07-09 The General Hospital Corporation Reverse transcriptase blocking agents and methods of using the same
MX2021008751A (es) 2019-01-25 2021-11-12 Univ Brown Composiciones y metodos para tratar, prevenir o revertir la inflamacion y los trastornos asociados a la edad.
JP2023512656A (ja) 2020-01-27 2023-03-28 ギリアード サイエンシーズ, インコーポレイテッド SARS CoV-2感染を治療するための方法
CN113304166B (zh) 2020-02-27 2022-10-14 河南真实生物科技有限公司 核苷类化合物在制备治疗冠状病毒感染性疾病的药物中的用途
US20230172962A1 (en) 2020-03-20 2023-06-08 University Of Virginia Patent Foundation Nrtis, nrti metabolites, and nrti analogs for macular degeneration and viral infections
CA3192874A1 (en) 2020-09-23 2022-03-31 Eckard Weber Method for treating cancer with a reverse transcriptase inhibitor
WO2022066880A1 (en) * 2020-09-23 2022-03-31 Transposon Therapeutics, Inc. Line-1 inhibitors to treat disease
WO2022197689A1 (en) 2021-03-15 2022-09-22 Transposon Therapeutics, Inc. Line-1 inhibitors to treat cns and systemic diseases
CA3214904A1 (en) 2021-04-09 2022-10-13 Raymond Schinazi Modified nucleosides and nucleotides analogs as antiviral agents for corona and other viruses
US20240261317A1 (en) 2021-05-17 2024-08-08 Rome Therapeutics, Inc. Methods of treating medical conditions and inhibiting line1 reverse transcriptaseusing a substituted 4-fluoro-2,5-dihydrofuranyl phosphonic acid or related compound
CN114288313B (zh) 2022-02-18 2023-07-04 常晓宇 嘧啶核苷类药物在制备预防或治疗冠状病毒感染性疾病药物中的用途

Also Published As

Publication number Publication date
CA3245459A1 (en) 2023-09-21
JP2025509635A (ja) 2025-04-11
PE20250684A1 (es) 2025-03-04
MX2024011291A (es) 2025-03-07
US12187758B2 (en) 2025-01-07
IL315480A (en) 2024-11-01
WO2023178133A9 (en) 2023-10-26
EP4493573A1 (en) 2025-01-22
US20230295212A1 (en) 2023-09-21
US20250145654A1 (en) 2025-05-08
US20230374058A1 (en) 2023-11-23
CN119546620A (zh) 2025-02-28
WO2023178133A1 (en) 2023-09-21
AU2023236711A1 (en) 2024-10-03
CO2024012882A2 (es) 2024-10-10
KR20250004956A (ko) 2025-01-08

Similar Documents

Publication Publication Date Title
TWI868471B (zh) 可作為蛋白質調節劑之雜環醯胺
TWI696629B (zh) 作為sting促效劑之環狀雙核苷酸化合物
EP3312182B1 (en) Brk inhibitory compound
TW202400134A (zh) 用於治療疾病之化合物及方法
US9457039B2 (en) 2′-disubstituted nucleoside derivatives and methods of use thereof for the treatment of viral diseases
TW202315607A (zh) 抗病毒化合物
KR20200036922A (ko) 단백질 아르기닌 메틸트랜스퍼라제 5 (prmt5)의 선택적 억제제
TWI827583B (zh) 作為PI3K-γ抑制劑之胺基吡嗪二醇化合物
CN114366745A (zh) 治疗沙粒病毒科和冠状病毒科病毒感染的方法
KR20130116358A (ko) Pi3 키나아제 억제제로서 헤테로사이클릭 화합물
EA030695B1 (ru) Замещенные производные хинолизина, которые можно использовать как ингибиторы интегразы вич
CN115087659A (zh) 抗病毒化合物
AU2021224588B2 (en) Antiviral compounds
EP3694867A1 (en) Cyclic dinucleotides as anticancer agents
KR20200132916A (ko) 단백질 아르기닌 메틸트랜스퍼라제 5(prmt5)의 선택적 억제제
TW202535873A (zh) 抗病毒吡唑并吡啶酮化合物
US20240366649A1 (en) 4-ethynyl-3-hydroxy-tetrahydrofuranyl-adenine phosphoramidates and related compounds and their use in treating medical conditions
JP2025519493A (ja) Dgk阻害剤としての三環式トリアゾロ化合物
WO2024103016A1 (en) 4'-halomethyl-cytidine phosphoramidates and related compounds and their use in treating medical conditions
WO2024107859A1 (en) Cyclopentene-oxymethylene phosphonamidates and related compounds and their use in treating medical conditions
WO2024107850A1 (en) Halo-dehydro-3'-deoxyuracil phosphoramidates and related compounds and their use in treating medical conditions
WO2025240608A1 (en) Cyclo-oxymethylene phosphonamidates and related compounds and their use in treating medical conditions
TW202517253A (zh) Cdk2抑制劑及其用途
HK40042000B (zh) 苯并氧氮杂䓬恶唑烷酮化合物及其使用方法
HK40039385B (zh) 苯并氧氮杂䓬恶唑烷酮化合物及其使用方法