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TW202305146A - 利用微小核醣核酸檢測合併乾癬性關節炎及僵直性脊椎炎之血清陰性關節炎風險與發炎性腸炎引起的相關性背痛風險的方法及其應用 - Google Patents

利用微小核醣核酸檢測合併乾癬性關節炎及僵直性脊椎炎之血清陰性關節炎風險與發炎性腸炎引起的相關性背痛風險的方法及其應用 Download PDF

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TW202305146A
TW202305146A TW110126858A TW110126858A TW202305146A TW 202305146 A TW202305146 A TW 202305146A TW 110126858 A TW110126858 A TW 110126858A TW 110126858 A TW110126858 A TW 110126858A TW 202305146 A TW202305146 A TW 202305146A
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Taiwan
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mirna
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ankylosing spondylitis
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seronegative
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TW110126858A
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English (en)
Inventor
蘇昱日
Original Assignee
長庚醫療財團法人高雄長庚紀念醫院
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Abstract

本發明係一種利用微小核醣核酸(miRNA)檢測合併乾癬性關節炎及僵直性脊椎炎之血清陰性關節炎風險與發炎性腸炎引起的相關性背痛風險的方法及其應用,該方法包含以下步驟:體外測試一種或多種本文所揭露之miRNA的在一測試樣本中表現量,以及所述測試樣本中的至少一miRNA與合併乾癬性關節炎及僵直性脊椎炎之血清陰性關節炎或發炎性腸炎引起的相關性背痛的樣本中的對應miRNA的表現量進行比較,其中當所述測試樣本中的至少一miRNA的表達水平高於沒有合併乾癬性關節炎及僵直性脊椎炎之血清陰性關節炎或沒有發炎性腸炎引起的相關性背痛的樣本中對應的miRNA時,則表示該個體患有合併乾癬性關節炎及僵直性脊椎炎之血清陰性關節炎或發炎性腸炎引起的相關性背痛的風險。

Description

利用微小核醣核酸檢測合併乾癬性關節炎及僵直性脊椎炎之血清陰性關節炎風險與發炎性腸炎引起的相關性背痛風險的方法及其應用
本發明係關於一種利用微小核醣核酸檢測血清陰性關節炎風險的方法及其應用,特別係關於一種利用血漿中微小核醣核酸檢測合併乾癬性關節炎及僵直性脊椎炎之血清陰性關節炎風險與發炎性腸炎引起的相關性背痛風險的方法及其應用。
血清陰性關節炎是一種全身性疾病,包含可能涉及皮膚、關節、指甲、腎臟、血管系統和心臟,並且可能發展成相關癌症。常見特徵包括沒有類風濕因子(RF)以及與HLA-B27的強遺傳關聯。
與正常對照組相比,血清陰性關節炎血清包含乾癬性關節炎、反應性關節炎及僵直性脊椎炎,而同時具有乾癬性關節炎及僵直性脊椎炎合併體質之患者,其關節之惡化尤為嚴重。
最近的一項研究報導指出,皮膚科診所的乾癬病患者中,乾癬性關節炎(psoriatic arthritis, PSA)的患病率約為17%。乾癬性關節炎為慢性發炎性疾病,涉及與乾癬相關之進行性關節病(progressive arthropathy)。大約30%具有乾癬的患者估計具有乾癬性關節炎。通常,在PSA發病之前約10年為皮膚之表現(manifestations)。Haroon et al. (Annals of the rheumatic diseases 2015;74(6):1045-50)報導了超過6個月的乾癬性關節炎診斷延遲造成PSA的患者之不良放射線影像學結果及不良的功能性結果。早期診斷與及時介入為避免永久性關節變形及破壞的關鍵。目前,PSA的診斷主要基於臨床表現型。至今並沒有早期偵測PSA之標準且可靠的評估方法,導致許多具有乾癬的患者未確診乾癬性關節炎造成不佳治療結果(Veale DJ et al., Lancet 2018;391(10136):2273-84)。
僵直性脊椎炎(ankylosing spondylitis, AS),是一個脊椎關節的慢性發炎性疾病,好發於20至40歲之年輕男性,但女性也可能得到此疾病;典型的僵直性脊椎炎症狀為:慢性下背痛、晨間脊椎僵硬及運動範圍受限。於休息時更明顯,尤以早晨剛起床時間為最為嚴重(通常大於一小時),嚴重時病人甚至會在半夜因痠痛及僵硬感而醒過來,這種背痛及晨僵現象在活動過後症狀會減輕。診斷僵直性脊椎炎主要是經由詳細的病史詢問、根據臨床症狀、理學檢查及X光攝影(必需看到有雙側腸薦骨關節炎),必要時抽血檢查患者血液之HLA-B27抗原,一起綜合判斷而診斷僵直性脊椎炎,故其診斷尤為困難。
即使在超音波檢查的幫助下,血清陰性關節炎的早期檢測和診斷仍然對風濕病學家構成挑戰。馬德里超聲血清陰性關節炎指數(MASEI)對血清陰性關節炎的診斷敏感性僅有30%。即使病人有明顯的症狀,要確定診斷為血清陰性關節炎,要延遲至少兩年以上的時間。2020年Mayo Clinic的研究也顯示,這樣延遲診斷的現象自2000 年到2017 年都沒有太大的進步。
微小核醣核酸(miRNA)是進化的保守且非編碼RNA分子,其通常長度為21至25個核苷酸,且藉由結合至mRNA的3端未轉譯區(3’-untranslated regions, 3’-UTRs)來作用,而可抑制蛋白質轉譯或促進mRNA降解(參見 Griffiths-Jones S (2004). The microRNA Registry. Nucleic acids research 32: D109-111)。
然而,現今的miRNA生物標誌的研究較少應用於臨床診斷。因此,利用miRNA發展出早期檢測和確認血清陰性關節炎,尤其是同時具有乾癬性關節炎及僵直性脊椎炎之檢測方法的需求仍未被滿足,而本發明滿足該需求和其他需求。
有鑑於上述問題,本發明之目的在於提供一種以致病機理為導向的新方法,以區分合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎患者;目前已發現藉由血漿中微小核醣核酸檢測網絡進行表觀遺傳調控,是控制免疫系統生理和病理狀況的關鍵因素,某些血漿中微小核醣核酸檢測的差異表達可能決定罹患血清陰性關節炎和無血清陰性關節炎之間的臨床結果不同;由此可知,特定的血漿中微小核醣核酸可能被用做血清學標誌物,以改善目前可用於有合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎患者早期診斷的有限臨床檢測。
為找出可用以檢測合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎的血漿中微小核醣核酸,進行了基於定量聚合酶連鎖反應(Quantitative Polymerase chain reaction, qPCR)的研究;qPCR技術係利用專一的引子探針(primer probe)會在PCR過程中產生螢光,再利用螢光偵測系統來偵測每個循環(cycle)所釋放出的螢光量,進而推算出每個循環中所產生的產物產量,達到即時定量的目的。
使用qPCR技術,針對乾癬性關節炎和乾癬病患者之間的149種血漿中微小核醣核酸檢測特性結果進行前瞻性的比較,找出10種具有不同差異表達的血漿中微小核醣核酸檢測;將上述10種具有不同差異表達的血漿中微小核醣核酸檢測,與來自健康個體樣本的血漿中微小核醣核酸檢測作為對照組進行比較,根據具有差異表達的血漿中微小核醣核酸檢測描述的基因本體論,對乾癬性關節炎疾病患者定義了幾種關鍵發炎途徑。
接著,尋找了僵直性脊椎炎及發炎性腸炎的患者,抽取其體液對其血漿中微小核醣核酸進行qPCR,驗證具有差異表達的5種血漿中微小核醣核酸檢測後,確認了3種不同的血漿中微小核醣核酸檢測可以代表乾癬性關節炎和僵直性脊椎炎的合併體質,其分別為miRNA-140-5p、miRNA-192-5p以及miRNA-146a-5p等3種血漿中微小核醣核酸,如下表1所示。
表1
miRNA名稱 序列編號
miRNA-140-5p SEQ ID NO:1
miRNA-192-5p SEQ ID NO:2
miRNA-146a-5p SEQ ID NO:3
當測試樣本中的上述3種miRNA之至少一者的表達水平高於無合併乾癬性關節炎及僵直性脊椎炎之血清陰性關節炎的樣本中對應的miRNA時,則表示所述個體患有合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎或具有罹患合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎的風險。
當測試樣本中的上述3種miRNA的表達水平高於無合併乾癬性關節炎及僵直性脊椎炎之血清陰性關節炎的樣本中對應的3種miRNA時,則表示所述個體患有合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎或具有罹患合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎的風險。
綜上所述,藉由特定的微小核醣核酸檢測結果之差異表達,可用於檢測合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎,抑或用於預測罹患合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎的風險,且檢測微小核醣核酸相當方便,可快速篩選出相同發炎途徑之患者,尤其是乾癬性關節炎及僵直性脊椎炎合併體質之患者,進行早期之風險診斷,可避免關節炎之惡化並防止錯過治療之黃金時機。
本發明的實施例藉由以下範例進行描述,其不以任何方式解釋為對其範圍施加限制。反之,應清楚理解的是,在不脫離本發明的精神的情況下,對於所屬領域技術中具有通常知識者而言,在閱讀本說明書之後,可以想到其他各種實施例、修改及其等效物。除非另外說明,在下列範例所述的研究中,遵循常規程序。下文描述的部分程序用於說明性目的。
在申請專利範圍中用語「或」的使用意為「及/或」。
當本說明書及申請專利範圍使用字詞「包含」、「具有」、或「含有」為涵蓋或開放式的且不排除額外的、未列舉的元件或方法步驟。
本文所使用的「患者」或「受試者」指的是經診斷具有乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎或疑似具有發展乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎之風險的哺乳類受試者。例示性的受試者可為人類、人猿、狗、豬、牛、貓、馬、羊、綿羊、齧齒類及其他可發展乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎的哺乳類。
如本文中可替換使用的「微小RNA(microRNA)」、「微小RNA(miR)」或「微小RNA(miRNA)」指的是來自miR基因之未經加工的(如:前驅物)、或經加工的(如:成熟的)的RNA轉錄本(transcript)。微小RNA為在真核生物中負調控基因表現並構成新穎類基因調節子(regulators)的內源非編碼單股RNA(Chua, et al. (2009) Curr. Opin. Mol. Ther. 11:189-199)。個別的miRNAs在不同生物體中被鑑別與定序,並給予其名稱。本文提供miRNAs的名稱及其序列。
本文的所有數目應被理解為藉由「大約」修飾,係意於涵蓋特定值的±10%的變異,當例如這些變異適合為miRNA量的表現。
「較高」的miRNA表現為相對的用語,且可藉由在測試樣本中與已知為無乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎受試者之參考池(referenced pool)比較miRNA 表現量決定。
本文所使用的用語「樣本」指的是包含miRNA的樣本。樣本可利用來偵測感興趣miRNA的存在及/或表現量。儘管被預測為含有與正常對照組相較為不同表現的miRNA生物液體與器官最適合。在一些實施例中,例如像是血液或其成分的樣本相對容易取得。樣本的非限制例包含體液(例如,周邊血液)、細胞(例如,血球細胞)及組織(例如,活檢標本或關節液)較佳地,樣本可選自由生物檢體、血液、血漿、血清、淋巴液、骨髓、唾液及其組合所組成之群組。
miRNA的表現量的測量指的是量化存在樣本中miRNA的數量。特定或任何miRNA的表現量的測量可使用任何本發明技術領域中具有通常知識者所習知或如藉由即時聚合酶連鎖反應(real-time PCR)、北方墨點法(Northern blot)分析之本文所述的方法達成。miRNA的表現量的測量包含測量成熟形式的miRNA或與miRNA的表現相關之前驅物形式的表現。
在一特定的實施例中,至少一種miRNA的表現量係使用北方墨點法分析量化。例如,可藉由在核酸萃取緩衝液的存在下均質化(homogenization),然後離心,以從細胞中純化出總細胞RNA。沉澱核酸,且DNA藉由以DNA分解酶(DNase)處理及沉澱來移除。然後,RNA分子根據標準技術藉由在瓊脂糖凝膠(agarose gels)上的膠體電泳(gel electrophoresis)分離並轉移至硝化纖維素濾紙。之後,RNA藉由加熱固定化(immobilized)於濾紙上。特定RNA的偵測及量化使用適合的經標定DNA或RNA探針互補至所討論的RNA而完成。參見,例如Molecular Cloning: A Laboratory Manual, J. Sambrook et al., eds., 2nd edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989, Chapter 7,其揭露的全文與此併入作為參考。
在一些實施例中,微陣列(microarray)的使用為可行的。微陣列是核酸、蛋白質、小分子、細胞或可對複合生物樣本平行分析的其他物質的微觀、序化陣列。所述技術提供許多具有已知序列資訊的寡核苷酸(oligonucleotides)或多核苷酸(polynucleotides)作為探針,以找尋並與樣本中的互補股(complementary strands)雜交(hybridize),因此藉由選擇性結合捕獲互補股。探針包含對目標miRNA序列的至少一部分互補或實質上互補的寡核苷酸或多核苷酸序列。「互補(complementary)」指的是在兩個核酸股的區域之間序列互補的廣義概念。已知的是,若殘基為胸腺嘧碇(thymine)或脲嘧啶(uracil),則第一核酸區域的腺嘌呤殘基(adenine residue)可與反向平行於第一區域的第二核酸區域的殘基形成特定的氫鍵(「鹼基對(base pairing)」)。相似地,已知的是,若殘基為鳥嘌呤(guanine),則第一核酸區域的胞嘧啶殘基(cytosine residue)可與反向平行於第一股的第二核酸股的殘基鹼基配對。當如果兩個區域以反向平行形式(fashion)排列,第一區域的至少一核苷酸殘基可與第二區域的殘基鹼基配對時,核酸的第一區域互補於相同或不同核酸的第二區域。較佳地,第一區域包含第一部份且第二區域包含第二部分,因此當第一部份及第二部分以反向平行形式排列,第一部分的核苷酸殘基的至少大約50%及較佳為至少大約75%、至少大約90%或至少大約95%可與第二部分中的核苷酸殘基鹼基配對。更佳地,所有第一部份的核苷酸殘基可與第二部分中的核苷酸殘基鹼基配對。
例如,miRNAs的微陣列分析可根據任何所屬技術領域習知方法完成。在一個實施例中,RNA從樣本的細胞進行萃取,使用變性聚丙烯醯胺凝膠電泳(polyacrylamide gel electrophoresis)從所有RNA中尺寸選擇(size-selected)小的RNA(18~26個核苷酸)。寡核苷酸連接子附著於小的RNA的5’及3’端,且產生的接合產物作為用於10個放大(amplification)循環的RT-PCR反應之模板。有義股(sense strand)PCR引子具有附著其之5’端的螢光團,因而螢光標記PCR產物的有義股。所述PCR產物變性,接著雜交至微陣列。PCR產物指的是作為與陣列上相應的miRNA捕獲探針序列互補的目標核酸,其將經由鹼基配對雜交至固定有捕獲探針的點。之後,當所述的點使用微陣列雷射掃瞄器激發時將發出螢光。然後,各點的螢光強度是使用數個陽性及陰性對照組及陣列數據標準化方法來評估特定miRNA的複製數量,其將產生特定miRNA的表現量之評估。關於本文所揭露的miRNA,探針可以與目標miRNA或多核苷酸序列100%互補。然而,由於探針可以特異性結合目標多核苷酸並從樣本捕獲目標多核苷酸,因而所述探針不需必須沿著目標多核苷酸的全長完全互補至目標多核苷酸。在一些實施例中,探針為與SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2或SEQ ID NO:3至少90%、至少95%或100%相同的多核苷酸互補。
在一些實施例中,定量反轉錄聚合酶鏈鎖反應(quantitative RT-PCR)的使用為可行的。定量反轉錄聚合酶鏈鎖反應(qRT-PCR)為用來快速測定聚合酶鏈鎖反應的產物量之聚合酶鏈鎖的修改。qRT-PCR的目的通常為用於測定如miRNA的基因序列是否存在於樣本中,以及若其存在時,則在所述樣本中的複製量為何。可測定包含miRNA的核酸分子之表現的PCR之任何方法落在本揭露的範圍中。在所屬技術領域中已知的qRT-PCR方法的數種變化包含但不限制於經由瓊酯醣膠體電泳分析(agarose gel electrophoresis)、SYBR Green的使用(雙股DNA染劑)以及螢光報導探針(fluorescent reporter probe)的使用。
在一個實施例中,本發明提供用於在受試者中檢測合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎或預測罹患合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎的風險之方法,其包含:(a)自疑似患有合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎之個體取得測試樣本,體外測定所述測試樣本中的至少一miRNA的表達水平,所述至少一miRNA係選自由miRNA-140-5p、miRNA-192-5p及其所組成的群組;以及(b)若所述測試樣本中的所述至少一miRNA的表達水平相對於無合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎測試樣本中對應的miRNA的表達水平較高時,則識別所述個體患有合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎或具有罹患合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎的風險。
在另一實施例中,本發明提供用於在受試者中檢測合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎或預測罹患合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎的風險之方法,其方法同上所述,但體外測定的至少一miRNA係選自由miRNA-140-5p、miRNA-192-5p、miRNA-146a-5p及其所組成的群組。
在又一實施例中,本發明提供用於在受試者中檢測合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎或預測罹患合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎的風險之方法,其中所述合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎係為非放射影像確認之中軸性脊椎關節炎(non-radiography axial spondyarthropathy, nr-axSpA)。
實例1
研究招募了30位受試者作為確認組,其中包含20位具有合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎(SPA_DSA)之受試者,以及10位不具合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎(SPA_DSN)之健康受試者作為對照組;進行文獻回顧並選定感興趣的各種RNA靶標以在所述確認組中進行測試。其中,對每位受試者檢測選定的miRNA靶標,以確定可以區分SPA_DSA受試者和SPA_DSN受試者的任何特定靶標miRNA。
臨床評估
30位受試者在招募時收集補體水平和抗雙股DNA水平,且接著定期收集。此外,為了進一步分析,亦收集了各種臨床生物標誌、例如人口數據、生化數據、白血球含量、和紅血球沉降速率等數據。參照第1圖,第1圖係為具有合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎受試者以及不具具有合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎受試者之各種生理數據分析示意圖;第1圖中SPA_DSA受試組(20位)和SPA_DSN受試組(10位)的各種臨床生物標誌比較,係使用SPSS第22版藉由曼惠特尼U檢定(Mann-Whitney U test)完成,其所得P值設定為閾值低於0.05時,被視為具有顯著差異。
樣本收集
利用2,500rpm(150×g)離心20分鐘以將全血分離成血漿和血球細胞(即白細胞和紅血球)。藉由4.5%葡聚醣(dextran)沉降以1:5的比例將白血球與紅血球分離,以將白血球自紅血球細胞(RBC)分離。接著,使用Ficoll-Paque(Amersham Pharmacia Biotech)的密度梯度離心以2:1的比例在1500rpm離心30分鐘,以將白血球分離成多形核細胞(olymorphonuclear cell, PMN)和單核細胞(MNC)。進一步地,使用Direct-zol TMRNA MiniPrep套組(ZYMO RESEARCH)處理收集的單核細胞,以萃取總RNA,接著進行次世代定序法(Next-generation sequencing, NGS)及/或qPCR分析。
確認選定的微小RNA水平
即時qPCR驗證微小RNA表達豐度(abundances)
使用TaqMan TM微小RNA逆轉錄套組(Applied Biosystems)來製備cDNA。每個反應需要來自外周血球單核細胞(PBMC)的總RNA 20ng。按照製造商的說明,使用Veriti 96孔熱循環儀(Applied Biosystems)進行逆轉錄反應。接著,使用逆轉錄產物進行qPCR反應,並使用7500即時PCR系統(Applied Biosystems)和不含UNG的TaqMan Universal PCR Master Mix II(Applied Biosystems)進行定量RT-PCR。即時PCR循環條件為95℃10分鐘,接著以95℃15秒進行40個循環,最後為60℃1分鐘。使用ΔCt (cycle threshold)值確定微小RNA表達豐度。
統計分析
本研究中的所有數據以平均±標準誤差(SD)或中位數(四分位數範圍)表示。必要時,使用卡方檢驗(Chi-square test)或費雪精確性檢定(Fisher's exact test)比較分類變量。使用Student’s t-test比較兩組之間的連續變量。若 p≤0.05,則變量被認為具有統計學意義。所有統計分析計算利用SAS套裝軟體,9.1版本(2002, SAS Statistical Institute, North Carolina)進行。
以NGS剖析miRNA
將收集自6位SPA_DSA個體和6位SPA_DSN個體(性別及年齡匹配)的MNC的RNA樣本平均地合併3位SPA_DSA與3位SPA_DSN,以產生兩個SPA_DSA與SPA_DSN合併的RNA基因庫;其後,尋找20位SPA_DSA個體和10位SPA_DSN個體進行驗證(參考第1圖)。我們按照TruSeq®小RNA(Illumina)樣本製備方案製備了合併的基因庫,並使用Illumina MiSeq平台進行定序。如Kuo HC, Hsieh KS, Ming-Huey Guo M, Weng KP, Ger LP, Chan WC, Li SC. Next-generation sequencing identifies micro-RNA-based biomarker panel for Kawasaki disease. J Allergy Clin Immunol. 2016; 138: 1227-30. doi: 10.1016/j.jaci.2016.04.050所述,使用miRSeq分析分析生成的原始數據,評估整體定序質量並確定微小RNA表達譜。我們將SPA_DSA組與SPA_DSN對照組之間的商數(quotient)維持在0.8至1.2,其確定了3個標靶miRNA,亦即miRNA-140-5p、miRNA-192-5p、miRNA-146a-5p,此三者miRNA皆在SPA_DSA組與SPA_DSN對照組之間有顯著差異(參照第1圖,皆為p ≤ 0.05)
實例2
接收者操作特徵曲線分析
接收者操作特徵曲線(receiver operating characteristic curve, ROC curve),其係以圖像的方式呈現二分類系統(binary classifier system)在特定的分類或閾值(discrimination threshold)下的表現。圖形的縱軸(y-axis)為真陽性率(true positive rate; TPR),又稱為靈敏度(sensitivity);橫軸(x-axis)為偽陽性率(false-posiitive rate; FPR),以1-特異度(1-specificity)表示,而靈敏度為將結果正確判斷為陽性的機率,特異度係將結果正確判斷為負向或陰性的機率。當指定一個分界點(cut-point)來區分檢驗的陽性與陰性時,這個分界點會影響到診斷工具的靈敏度(sensitivity)及特異度(specificity)。在醫學上,靈敏度表示有病者被判為陽性的機率,而特異度表示無病者被判為陰性的機率。
由實例1中可得知,miRNA-140-5p、miRNA-192-5p、miRNA-146a-5p等三者miRNA在SPA_DSA組與SPA_DSN對照組之間有顯著差異,因此對此三者miRNA進行ROC曲線分析。參照第2圖,第2圖係為miRNA-140-5p、miRNA-192-5p以及miR-146a-5p之ROC曲線示意圖,由第2圖中可看出,曲面下面積(area under curve, AUC)可分別達到0.85、0.69及0.74,AUC值越大,代表其檢測之準確度越高。
此外,miRNA-140-5p、miRNA-192-5p、miRNA-146a-5p之靈敏度依序為93.8%、87.5%、62.5%,而異度則皆為70%;雖然miRNA-140-5p、miRNA-192-5p兩者miRNA即可達到85%以上的靈敏度及70%之特異度,亦即可識別該個體患有合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎或具有罹患合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎的風險;同時檢測三者miRNA來識別該個體患有合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎或具有罹患合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎的風險的positive predictive value為86%,negative predictive value為50-70%。
實例3
非放射影像確認之中軸性脊椎關節炎分析
非放射影像確認之中軸性脊椎關節炎(non-radiography axial spondyarthropathy, nr-axSpA),其係為一種炎症性關節炎,可引起脊椎炎症和其他症狀,在X光影像上沒有看到明顯的損傷,因此被稱為非放射影像確認之中軸性脊椎關節炎;但因為無法由X光影像中判別,可藉由以下病徵進行判斷是否可能為中軸性脊椎關節炎:發炎性背痛、後腳跟痛、指關節炎、發炎性腸炎所引起的發炎性背痛、牛皮癬等。
針對在發炎性腸炎(inflammatory bowel disease, IBD)所引起的發炎性背痛患者進行檢測,藉由單因子多樣本中位數差異檢定(Kruskal-Wallis test)是否miRNA-140-5p、miRNA-192-5p、miRNA-146a-5p等三者miRNA也出現於發炎性腸炎所引起的發炎性背痛患者上;Kruskal-Wallis test係當資料中包含多組樣本(三組以上樣本),且想了解多組樣本間母體中位數是否有差異時,則可使用此方法。
參照第3圖至第5圖,其依序為miRNA-140-5p、miRNA-192-5p以及miRNA-146a-5p之單因子多樣本中位數差異檢定示意圖,由第3圖至第5圖中可看出,在發炎性腸炎(IBD)所引起的相關性背痛患者中,與乾癬性關節炎(PSA)以及僵直性脊椎炎(AS)一樣地可測出上述三者miRNA。由此可見,miRNA-140-5p、miRNA-192-5p以及miRNA-146a-5p等三者miRNA的確具有檢測合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎,或預測罹患合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎的風險的潛力。
上述實施例僅例示性說明本發明之原理及功效,而非用於限制本發明。任何熟習此項技術之人士均可在不違背本發明之精神及範疇下,對上述實施例進行修飾與改變。因此,本發明之權利保護範圍,應如本發明申請專利範圍所列。
以下搭配圖式,對於本發明進行進一步說明:
第1圖係為具有關節炎性脊椎關節炎疾病譜受試者以及不具關節炎性脊椎關節炎疾病譜受試者之各種生理數據分析示意圖; 第2圖係為miRNA-140-5p、miRNA-192-5p以及miR-146a-5p之ROC曲線示意圖; 第3圖係為miRNA-140-5p之單因子多樣本中位數差異檢定示意圖; 第4圖係為miRNA-192-5p之單因子多樣本中位數差異檢定示意圖; 第5圖係為miR-146a-5p之單因子多樣本中位數差異檢定示意圖。
Figure 12_A0101_SEQ_0001
Figure 12_A0101_SEQ_0002

Claims (10)

  1. 一種用於檢測合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎或預測罹患合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎的風險之方法,其包含以下步驟: (a)自疑似患有合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎之一個體取得一測試樣本,體外測定該測試樣本中的至少一miRNA的表達水平,該至少一miRNA係選自由miRNA-140-5p、miRNA-192-5p及所組成的群組;以及 (b)若該測試樣本中的該至少一miRNA的表達水平相對於一無合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎測試樣本中對應的miRNA的表達水平較高時,則識別該個體患有合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎或具有罹患合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎的風險。
  2. 如請求項1所述之方法,其中該步驟(a)進一步包含體外測定miRNA-146a-5p的表達水平。
  3. 如請求項1所述之方法,其中該合併乾癬性關節炎和僵直性之脊椎炎之血清陰性關節炎係為非放射影像確認之中軸性脊椎關節炎。
  4. 如請求項1所述之方法,其中該至少一miRNA的表達水平係藉由即時PCR進行測定。
  5. 如請求項1所述之方法,其中該測試樣本係選自由生物檢體、血液、血漿、血清、淋巴液、骨髓、唾液及其組合所組成之群組。
  6. 一種用於檢測發炎性腸炎引起的相關性背痛或預測罹患發炎性腸炎引起的相關性背痛的風險之方法,其包含以下步驟: (a)自疑似患有發炎性腸炎引起的相關性背痛之一個體取得一測試樣本,體外測定該測試樣本中的至少一miRNA的表達水平,該至少一miRNA係選自由miRNA-140-5p、miRNA-192-5p及其所組成的群組;以及 (b)若該測試樣本中的該至少一miRNA的表達水平相對於一無測試樣本中對應的miRNA的表達水平較高時,則識別該個體患有發炎性腸炎引起的相關性背痛或具有發炎性腸炎引起的相關性背痛的風險。
  7. 如請求項6所述之方法,其中該步驟(a)進一步包含體外測定miRNA-146a-5p的表達水平。
  8. 如請求項6所述之方法,其中該發炎性腸炎引起的相關性背痛係為非放射影像確認之中軸性脊椎關節炎。
  9. 如請求項6所述之方法,其中該至少一miRNA的表達水平係藉由即時PCR進行測定。
  10. 如請求項6所述之方法,其中該測試樣本係選自由生物檢體、血液、血漿、血清、淋巴液、骨髓、唾液及其組合所組成之群組。
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