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TW201623331A - 抗黑色素瘤細胞黏著分子(mcam)抗體類及使用彼等之相關方法 - Google Patents

抗黑色素瘤細胞黏著分子(mcam)抗體類及使用彼等之相關方法 Download PDF

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TW201623331A
TW201623331A TW104107585A TW104107585A TW201623331A TW 201623331 A TW201623331 A TW 201623331A TW 104107585 A TW104107585 A TW 104107585A TW 104107585 A TW104107585 A TW 104107585A TW 201623331 A TW201623331 A TW 201623331A
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amino acid
chain variable
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TW104107585A
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躍 劉
派翠克 蓋瑞戴爾
安德烈斯 藍格
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普羅帝納生物科學公司
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Abstract

本發明提供抑制人黑色素瘤細胞黏著分子(MCAM)結合層黏連蛋白(laminin)α-4鏈之能力的抗MCAM抗體類。本發明亦提供醫藥組成物和醫藥調製劑、產生該等抗體之方法及彼等於製造用於治療神經炎性疾病、自體免疫疾病或癌症之藥物的用途。

Description

抗黑色素瘤細胞黏著分子(MCAM)抗體類及使用彼等之相關方法 相關申請案之交叉參考
本申請案主張2014年3月12日提交申請之美國臨時申請案第61/952,116號、2014年3月13日提交申請之美國臨時申請案第61/952,833號、2014年7月11日提交申請之美國臨時申請案第62/023,724號及2014年10月24日提交申請之美國臨時申請案第62/068,419號的優先權,上述各申請案之全部內容併入本文以用於所有目的。
序列表、表格或電腦程式列表之參考資料
創建於2015年3月4日之“ANTI-MCAM ANTIBODIES AND ASSOCIATED METHODS OF USE”的檔案458911SEQLIST.txt中所寫之序列表為154千字節。包含在此檔案中之信息以引用方式併入本文。
稱為TH17細胞(T輔助細胞17)之CD4+T細胞的子集涉及許多自體免疫性疾病之發病機理,尤其是那些涉及T細胞之CNS浸潤的神經發炎病況,諸如多發性硬化和該動物模型,實驗性自體免疫性腦脊髓炎(EAE)。據報導,TH17細胞分泌許多優等的細胞因子,包括IL-17和IL-22。據報導,TH17細胞經歷特定招募及組織浸潤。據報導,MCAM表現在TH17細胞上且作為配體結合至層黏連蛋白α-4。
本發明提供包含成熟重鏈可變區及成熟輕鏈可變區之抗體,該成熟重鏈可變區包含SEQ ID NO:161之3個Kabat CDR,唯其中位置32(Kabat編號)可為N、S或Q且位置33(Kabat編號)可為G或A,其中位置1(Kabat編號)被E佔用且該成熟輕鏈可變區包含SEQ ID NO:123之3個Kabat CDR。於一些抗體中,該成熟重鏈可變區與SEQ ID NO:161具有至少90%之同一性,該成熟輕鏈可變區與SEQ ID NO:123具有至少90%之同一性。一些該等抗體為人化抗體。於一些該等抗體中,該成熟重鏈可變區與SEQ ID NO:161具有至少95%、96%、97%、98%或99%之同一性,而該成熟輕鏈可變區與SEQ ID NO:123具有至少98%或99%之同一性。於一些該等抗體中,該成熟重鏈可變區與SEQ ID NO:161具有至少95%、96%、97%、98%或99%之同一性,而該成熟輕鏈可 變區與SEQ ID NO:123具有至少95%、96%、97%、98%或99%之同一性。於一些該等抗體中,該成熟重鏈可變區具有SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:160或SEQ ID NO:161之胺基酸序列且其中該成熟輕鏈可變區與SEQ ID NO:123具有至少95%之同一性。於一些該等抗體中,該成熟重鏈可變區與SEQ ID NO:161具有至少95%之同一性且該成熟輕鏈可變區具有SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:122或SEQ ID NO:123之胺基酸序列。於一些該等抗體中,該成熟重鏈可變區具有SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:160或SEQ ID NO:161之胺基酸序列且該成熟輕鏈可變區具有SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:122或SEQ ID NO:123之胺基酸序列。於一些該等抗體中,該成熟重鏈可變區具有SEQ ID NO:161之胺基酸序列且該成熟輕鏈可變區具有SEQ ID NO:123之胺基酸序列。於一些該等抗體中,該重鏈恆定區具有SEQ ID NO:171或172之胺基酸序列及/或該輕鏈恆定區具有SEQ ID NO:168之胺基酸序列。
本發明進一步提供在包括胺基酸殘基141之抗原決定部位結合至人MCAM(SEQ ID NO:11)的抗MCAM抗體。於一些抗體中,該抗原決定部位包含胺基酸殘基145。於一些抗體中,該抗原決定部位包含至少5個人MCAM的連續胺基酸殘基,包括胺基酸殘基141。於一些該等抗體中,該抗體並非選自由下列所組成之群組中的 抗體:(a)選殖株15,其具有對應於SEQ ID NO:18之成熟重鏈可變區及對應於SEQ ID NO:13之成熟輕鏈可變區;(b)選殖株17,其具有對應於SEQ ID NO:7之成熟重鏈可變區及對應於SEQ ID NO:2之成熟輕鏈可變區;(c)1174.1.3,其具有對應於SEQ ID NO:35之成熟重鏈可變區及對應於SEQ ID NO:30之成熟輕鏈可變區;(d)1414.1.2,其具有對應於SEQ ID NO:45之成熟重鏈可變區及對應於SEQ ID NO:40之成熟輕鏈可變區;(e)1415.1.1,其具有對應於SEQ ID NO:55之成熟重鏈可變區及對應於SEQ ID NO:50之成熟輕鏈可變區;(f)1749.1.3,其具有對應於SEQ ID NO:65之成熟重鏈可變區及對應於SEQ ID NO:60之成熟輕鏈可變區;(g)2120.4.19,其具有對應於SEQ ID NO:77之成熟重鏈可變區及對應於SEQ ID NO:70之成熟輕鏈可變區;(h)2107.4.10,其具有對應於SEQ ID NO:89之成熟重鏈可變區及對應於SEQ ID NO:84之成熟輕鏈可變區;及 (i)包含實質上來自單株抗體1174.1.3、1414.1.2、1415.1.1、1749.1.3、2120.4.19及2107.4.10之CDR的抗體。於一些該等抗體中,該抗體為單株抗體。於一些該等抗體中,該抗體為嵌合抗體、人化抗體、經表面修飾之抗體或人抗體。
於一些該等抗體中,該抗體並非選自由下列所組成之群組的抗體:(a)選殖株15,其具有對應於SEQ ID NO:18之成熟重鏈可變區及對應於SEQ ID NO:13之成熟輕鏈可變區;(b)選殖株17,其具有對應於SEQ ID NO:7之成熟重鏈可變區及對應於SEQ ID NO:2之成熟輕鏈可變區;(c)1174.1.3,其具有對應於SEQ ID NO:35之成熟重鏈可變區及對應於SEQ ID NO:30之成熟輕鏈可變區;(d)1414.1.2,其具有對應於SEQ ID NO:45之成熟重鏈可變區及對應於SEQ ID NO:40之成熟輕鏈可變區;(e)1415.1.1,其具有對應於SEQ ID NO:55之成熟重鏈可變區及對應於SEQ ID NO:50之成熟輕鏈可變區;(f)1749.1.3,其具有對應於SEQ ID NO:65之成熟重鏈可變區及對應於SEQ ID NO:60之成熟輕鏈可變區; (g)2120.4.19,其具有對應於SEQ ID NO:77之成熟重鏈可變區及對應於SEQ ID NO:70、71成72之成熟輕鏈可變區;(h)2107.4.10,其具有對應於SEQ ID NO:89之成熟重鏈可變區及對應於SEQ ID NO:82或84之成熟輕鏈可變區;及(i)包含實質上來自單株抗體1174.1.3、1414.1.2、1415.1.1、1749.1.3、2120.4.19及2107.4.10之CDR的抗體。於一些該等抗體中,該抗體為單株抗體。於一些該等抗體中,該抗體為嵌合抗體、人化抗體、經表面修飾之抗體或人抗體。
本發明進一步提供包含上述任一抗體之醫藥組成物。
本發明進一步提供醫藥調製劑,其包含(a)如本文所描述之任何抗體,其存在濃度係介於約1mg/mL至約100mg/mL;(b)一種緩衝液,諸如組胺酸緩衝液,其存在濃度係介於約10mM至約30mM;(c)糖及/或多元醇,諸如蔗糖或海藻糖,其存在濃度係介於約200mM至約260mM;和(d)表面活性劑,諸如聚山梨醇酯20,其存在濃度係介於約0.005重量%至約0.05重量%;其中該調製劑之特徵為pH值介於約5.5至約7。
示例性醫藥調製劑包含(a)本文所描述之任何抗體,其中該抗體之存在濃度為約40mg/mL;(b)組胺酸緩衝液,其存在濃度為約20mM;(c)蔗糖,其存在濃度為 約220mM;(d)聚山梨醇酯20,其存在濃度為約0.02%;和(e)約6.0之pH值。
另一種示例性醫藥調製劑包含(a)本文所描述之任何抗體,其中該抗體之存在濃度為約40mg/mL;(b)組胺酸緩衝液,其存在濃度為約20mM;(c)海藻糖,其存在濃度為約220mM;(d)聚山梨醇酯20,其存在濃度為約0.02%;和(e)約6.5之pH值。
本發明所提供之一些調製劑進一步包含增容劑(bulking agent),其為無菌的及/或在冷凍和解凍時是穩定的。於一些調製劑中,當在38℃至42℃下儲存至少30天後及/或在38℃至42℃下儲存至少3個月後,至少65%之抗體在疏水性交互作用色層分析上係以單峰形式顯示。於一些調製劑中,當在38℃至42℃下儲存至少30天後及/或在38℃至42℃下儲存至少3個月後,在高性能尺寸排阻色層分析上,聚集蛋白質不超過5重量%。
本發明所提供之抗體調製劑可為凍乾調製劑之形式。例如,代表性凍乾調製劑可包含:(a)本文所描述之任何抗體;(b)組胺酸緩衝液;(c)蔗糖或海藻糖;及(d)聚山梨醇酯20。凍乾調製劑可包含約10mg至約40mg之抗體及濃度介於約0.005重量%至約0.05重量%之聚山梨醇酯20。重構成後,該凍乾調製劑可包含約10mM至約30mM之組胺酸緩衝液及約200mM至約260mM之蔗糖或海藻糖。重構成後,該凍乾調製劑產生pH值在約6至約7,諸如pH 6.0或6.5之水溶液。
一種示例性凍乾調製劑當被重構成後可包含:(a)本文所描述之任何抗體,其存在濃度為約40mg/mL;(b)組胺酸緩衝液,其存在濃度為約20mM;(c)蔗糖,其存在濃度為約220mM;(d)聚山梨醇酯20,其存在濃度為約0.2g/L;及(e)約6.0之pH值。該等凍乾調製劑可包含約200mg之抗體、約15.5mg之組胺酸,約376mg之蔗糖及約1mg之聚山梨醇酯20。
另一示例性凍乾調製劑當被重構成後可包含:(a)本文所描述之任何抗體,其存在濃度為約40mg/mL;(b)組胺酸緩衝液,其存在濃度為約20mM;(c)海藻糖二水合物,其存在濃度為約220mM;及(d)聚山梨醇酯20,其存在濃度為約0.2g/L;及(e)約6.5之pH值。該等凍乾調製劑可包含約200mg之抗體、約15.5mg之組胺酸,約416mg之海藻糖二水合物及約1mg之聚山梨醇酯20。
本發明進一步提供任何上述抗體於製造用於治療炎性病症之藥物的用途,該炎性病症之特徵為表現MCAM之細胞浸潤入體內發炎部位。該等炎性病症可為其特徵為表現MCAM之細胞浸潤入CNS的中樞神經系統(CNS)炎性病症。
本發明進一步提供任何上述抗體於製造用於治療下列疾病之藥物的用途:多發性硬化症(multiple sclerosis)、帕金森氏病(Parkinson’s disease)、過敏性接觸性皮膚炎(allergic contact dermatitis)、牛皮癬 (psoriasis)、牛皮癬性關節炎、類風濕性關節炎(rheumatoid arthritis)、結節病(sarcoidosis)、炎性腸病、克隆氏病(Crohn’s disease)或癌症(例如實體腫瘤或血液腫瘤),諸如黑色素瘤(melanoma)。
本發明進一步提供治療其特徵為表現MCAM之細胞浸潤入發炎部位之炎性病症的方法,該方法包含投予有此需要之哺乳動物個體有效量之任一上述抗體。於一些方法中,該疾病為多發性硬化症、帕金森氏病、過敏性接觸性皮炎、牛皮癬、牛皮癬性關節炎、類風濕性關節炎、結節病、炎性腸病、克隆氏病或癌症(例如實體腫瘤或血液腫瘤),諸如黑色素瘤。於一些方法中,該表現MCAM之細胞為TH 17細胞。於一些方法中,該哺乳動物個體為人。於一些方法中,該抗體抑制MCAM結合至包含層黏連蛋白α-4鏈之蛋白質。於一些方法中,該哺乳動物個體為人。於一些方法中,該表現MCAM之細胞為TH 17細胞。
本發明進一步提供包含可供結合抗MCAM單株抗體之抗原決定部位的經分離之肽,其中該肽包含5至50個人MCAM(SEQ ID NO:11)的連續胺基酸殘基,其中包括胺基酸殘基141。於這些肽之某些肽中,該肽係與載體多肽連接。於這些肽之某些肽中,該肽係與佐劑結合。
本發明進一步提供用於產生抑制人MCAM結合至層黏連蛋白α-4鏈之抗體的方法,其包含:(a)以如上述之肽將個體免疫化; (b)從該個體分離出B細胞,其中該B細胞分泌抗體;(c)篩選該抗體以鑑別能抑制人MCAM結合至層黏連蛋白α-4鏈之抗體。於該方法之某些方法中,該方法進一步包含:(d)將B細胞與培養中之永生化細胞融合以形成製造單株抗體之雜交瘤細胞;(e)培養該雜交瘤細胞;及,(f)從培養物分離出單株抗體。
第1圖描繪關鍵選殖株之鑑別。繪製之2120.4.19結合平均值係作為其表面表現平均值(灰色菱形)函數。應用<30%之單株抗體反應性及>50%小鼠血清結合之閾值來鑑別抗體結合為陰性,但表面表現為陽性之選殖株(黑色菱形)。
第2A至C圖。第2A圖為以帶狀柵欄圖表示之人MCAM的同源模型。第2B圖描繪人BCAM、人MCAM及老鼠MCAM序列之部分比對,指明在人MCAM之位置141(I141)及位置145(P145)的所欲殘基。第2C圖為描繪人MCAM之I141和P145殘基之定位和暴露的帶狀柵欄圖。
第3A和3B圖。第3A圖顯示下列抗體之可變重鏈的序列比對:大鼠2120.4.19抗MCAM抗體 (2120.4.19.6_VH_topo_pro;SEQ ID NO:114);2120 VH1人化抗MCAM抗體(h212OVH1;SEQ ID NO:115);2120 VH2人化抗MCAM抗體(h2120VH2;SEQ ID NO:116);2120 VH3人化抗MCAM抗體(h2120VH3;SEQ ID NO:117);2120 VH4人化抗MCAM抗體(h2120VH4;SEQ ID NO:118);2120 VH5人化抗MCAM抗體(h2120VH5;SEQ ID NO:119);及作為框構供體之重鏈人可變AF062133 IGHV2-26 *01序列(AF062133_VH;SEQ ID NO:108)。使用Kabat編號並將從大鼠2120.4.19.6抗體移植至可變重鏈可變AF062133 IGHV2-26 *01框構之高度可變區(HVR)框起來。該S30T、I37V、L48I和K71R突變與(i)CDR-H1中加框之N/D殘基的突變,例如N32S(VH3);N32Q(VH4);或G33A(VH5)結合,提供N脫醯胺突變體。人化抗體序列中之粗體的胺基酸殘基與大鼠抗體序列中之對應殘基不同。可能影響CDR接觸或CDR結構之標準和界面胺基酸殘基的位置以星號指明。由於N-二脫胺位點或N-糖基化位點的存在而聚焦之突變的殘基係以括弧之框顯示。
第3B圖顯示下列抗體之可變輕鏈之序列比對:大鼠2120.4.19.6抗MCAM抗體(2120.4.19.6_VL_topo_pro;SEQ ID NO:120);2120 VL1人化抗MCAM抗體(h2120VL1 SEQ ID NO:121);2120 VL2化抗MCAM抗體(h2120VL2 SEQ ID NO:122);2120 VL3人化抗MCAM抗體(h2120VL3 SEQ ID NO:123);及作為框構供體之輕鏈 人可變X84343 IGKV2-26 * 01序列(X84343_VL SEQ ID NO:124)。使用Kabat編號並將從大鼠2120.4.19.6抗體移植至可變輕鏈可變X84343 IGKV2-26 * 01框構之高度可變區(HVR)框起來。人化抗體序列中之粗體的胺基酸殘基與大鼠抗體序列中之對應殘基不同。可能影響CDR接觸或CDR結構之標準和界面胺基酸殘基的位置以星號指明。
第4A圖顯示下列抗體之可變重鏈之序列比對:大鼠2120.4.19.6抗MCAM抗體(2120.4.19.6_VH_topo_pro;SEQ ID NO:114);2120 VH1.Q1E人化抗MCAM抗體(h2120VH1.Q1E;SEQ ID NO:157);2120 VH2.Q1E人化抗MCAM抗體(h2120VH2.Q1E;SEQ ID NO:158);2120 VH3.Q1E人化抗MCAM抗體(h2120VH3.Q1E;SEQ ID NO:159);2120 VH4.Q1E人化抗MCAM抗體(h2120VH4.Q1E;SEQ ID NO:160);2120 VH5.Q1E人化抗MCAM抗體(h2120VH5.Q1E;SEQ ID NO:161);及作為框構供體之重鏈人可變AF062133 IGHV2-26 * 01序列(AF062133_VH;SEQ ID NO:108)。使用Kabat編號且將從大鼠2120.4.19.6抗體移植至可變重鏈可變AF062133 IGHV2-26 * 01框構之高度可變區(HVR)框起來。位置Q1E取代係以方盒框出輪廓。
第4B圖顯示下列抗體之可變輕鏈之序列比對:大鼠2120.4.19.6抗MCAM抗體2120.4.19.6_VL_topo_pro;SEQ ID NO:120);2120 VL1人化抗MCAM抗體(h2120VL1;SEQ ID NO:121);2120 VL2人化抗MCAM 抗體(h2120VL2;SEQ ID NO:122);2120 VL3人化抗MCAM抗體(h2120VL3;SEQ ID NO:123);及作為框構供體之輕鏈人可變X84343 IGKV2-26 * 01序列(X84343_VL SEQ ID NO:124)。使用Kabat編號且將從大鼠2120.4.19.6抗體移植至可變輕鏈可變X84343 IGKV2-26 * 01框構之高度可變區(HVR)框起來。
序列之簡單說明
SEQ ID NO:1為編碼抗體選殖株17之成熟輕鏈可變區的核酸序列。
SEQ ID NO:2為抗體選殖株17之成熟輕鏈可變區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:3為抗體選殖株17之CDRL1的胺基酸序列。
SEQ ID NO:4為抗體選殖株17之CDRL2的胺基酸序列。
SEQ ID NO:5為抗體選殖株17之CDRL3的胺基酸序列。
SEQ ID NO:6為編碼抗體選殖株17之成熟重鏈可變區的核酸序列。
SEQ ID NO:7為抗體選殖株17之成熟重鏈可變區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:8為抗體選殖株17之CDRH1的 胺基酸序列。
SEQ ID NO:9為抗體選殖株17之CDRH2的胺基酸序列。
SEQ ID NO:10為抗體選殖株17之CDRH3的胺基酸序列。
SEQ ID NO:11為人MCAM保藏編號CAA48332之胺基酸序列。
SEQ ID NO:12為編碼抗體選殖株15之成熟輕鏈可變區的核酸序列。
SEQ ID NO:13為抗體選殖株15之成熟輕鏈可變區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:14為抗體選殖株15之CDRL1的胺基酸序列。
SEQ ID NO:15為抗體選殖株15之CDRL2的胺基酸序列。
SEQ ID NO:16為抗體選殖株15之CDRL3的胺基酸序列。
SEQ ID NO:17為編碼抗體選殖株15之成熟重鏈可變區的核酸序列。
SEQ ID NO:18為抗體選殖株15之成熟重鏈可變區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:19為抗體選殖株15之CDRH1的胺基酸序列。
SEQ ID NO:20為抗體選殖株15之CDRH2 的胺基酸序列。
SEQ ID NO:21為抗體選殖株15之CDRH3的胺基酸序列。
SEQ ID NO:22為人MCAM結構域1(殘基19至129)之胺基酸序列。
SEQ ID NO:23為人MCAM結構域2(殘基139至242)之胺基酸序列。
SEQ ID NO:24為人MCAM結構域3(殘基244至321)之胺基酸序列。
SEQ ID NO:25為人MCAM結構域4(殘基355至424)之胺基酸序列。
SEQ ID NO:26為人MCAM結構域5(殘基430至510)之胺基酸序列。
SEQ ID NO:27為人層黏連蛋白411之α 4鏈同種型的胺基酸序列(保藏編號NP001098676)。
SEQ ID NO:28為人層黏連蛋白411之α 4鏈同種型的胺基酸序列(保藏編號CAA48332)。
SEQ ID NO:29為編碼抗體1174.1.3之成熟輕鏈可變區的核酸序列。
SEQ ID NO:30為抗體1174.1.3之成熟輕鏈可變區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:31為抗體1174.1.3之CDRL1的胺基酸序列。
SEQ ID NO:32為抗體1174.1.3之CDRL2的 胺基酸序列。
SEQ ID NO:33為抗體1174.1.3之CDRL3的胺基酸序列。
SEQ ID NO:34為編碼抗體1174.1.3之成熟重鏈可變區的核酸序列。
SEQ ID NO:35為抗體1174.1.3之成熟重鏈可變區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:36為抗體1174.1.3之CDRH1的胺基酸序列。
SEQ ID NO:37為抗體1174.1.3之CDRH2的胺基酸序列。
SEQ ID NO:38為抗體1174.1.3之CDRH3的胺基酸序列。
SEQ ID NO:39為編碼抗體1414.1.2之成熟輕鏈可變區的核酸序列。
SEQ ID NO:40為抗體1414.1.2之成熟輕鏈可變區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:41為抗體1414.1.2之CDRL1的胺基酸序列。
SEQ ID NO:42為抗體1414.1.2之CDRL2的胺基酸序列。
SEQ ID NO:43為抗體1414.1.2之CDRL3的胺基酸序列。
SEQ ID NO:44為編碼抗體1414.1.2之成熟 重鏈可變區的核酸序列。
SEQ ID NO:45為抗體1414.1.2之成熟重鏈可變區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:46為抗體1414.1.2之CDRH1的胺基酸序列。
SEQ ID NO:47為抗體1414.1.2之CDRH2的胺基酸序列。
SEQ ID NO:48為抗體1414.1.2之CDRH3的胺基酸序列。
SEQ ID NO:49為編碼抗體1415.1.1之成熟輕鏈可變區的核酸序列。
SEQ ID NO:50為抗體1415.1.1之成熟輕鏈可變區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:51為抗體1415.1.1之CDRL1的胺基酸序列。
SEQ ID NO:52為抗體1415.1.1之CDRL2的胺基酸序列。
SEQ ID NO:53為抗體1415.1.1之CDRL3的胺基酸序列。
SEQ ID NO:54為編碼抗體1415.1.1之成熟重鏈可變區的核酸序列。
SEQ ID NO:55為抗體1415.1.1之成熟重鏈可變區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:56為抗體1415.1.1之CDRH1的 胺基酸序列。
SEQ ID NO:57為抗體1415.1.1之CDRH2的胺基酸序列。
SEQ ID NO:58為抗體1415.1.1之CDRH3的胺基酸序列。
SEQ ID NO:59為編碼抗體1749.1.3之成熟輕鏈可變區的核酸序列。
SEQ ID NO:60為抗體1749.1.3之成熟輕鏈可變區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:61為抗體1749.1.3之CDRL1的胺基酸序列。
SEQ ID NO:62為抗體1749.1.3之CDRL2的胺基酸序列。
SEQ ID NO:63為抗體1749.1.3之CDRL3的胺基酸序列。
SEQ ID NO:64為編碼抗體1749.1.3之成熟重鏈可變區的核酸序列。
SEQ ID NO:65為抗體1749.1.3之成熟重鏈可變區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:66為抗體1749.1.3之CDRH1的胺基酸序列。
SEQ ID NO:67為抗體1749.1.3之CDRH2的胺基酸序列。
SEQ ID NO:68為抗體1749.1.3之CDRH3的 胺基酸序列。
SEQ ID NO:69為編碼抗體2120.4.19之成熟輕鏈可變區的核酸序列。
SEQ ID NO:70為SEQ ID NO:69中所列之抗體2120.4.19的成熟輕鏈可變區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:71為抗體2120.4.19之成熟輕鏈可變區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:72為抗體2120.4.19之成熟輕鏈可變區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:73為抗體2120.4.19之CDRL1的胺基酸序列。
SEQ ID NO:74為抗體2120.4.19之CDRL2的胺基酸序列。
SEQ ID NO:75為抗體2120.4.19之CDRL3的胺基酸序列。
SEQ ID NO:76為編碼抗體2120.4.19之成熟重鏈可變區的核酸序列。
SEQ ID NO:77為抗體2120.4.19之成熟重鏈可變區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:78為抗體2120.4.19之CDRH1的胺基酸序列。
SEQ ID NO:79為抗體2120.4.19之CDRH2的胺基酸序列。
SEQ ID NO:80為抗體2120.4.19之CDRH3 的胺基酸序列。
SEQ ID NO:81為編碼抗體2107.4.10之成熟輕鏈可變區的核酸序列。
SEQ ID NO:82為SEQ ID NO:81中所列之抗體2107.4.10的成熟輕鏈可變區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:83為編碼抗體2107.4.10之成熟輕鏈可變區的核酸序列。
SEQ ID NO:84為SEQ ID NO:83中所列之抗體2107.4.10的成熟輕鏈可變區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:85為抗體2107.4.10之CDRL1的胺基酸序列。
SEQ ID NO:86為抗體2107.4.10之CDRL2的胺基酸序列。
SEQ ID NO:87為抗體2107.4.10之CDRL3的胺基酸序列。
SEQ ID NO:88為編碼抗體2107.4.10之成熟重鏈可變區的核酸序列。
SEQ ID NO:89為抗體2107.4.10之成熟重鏈可變區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:90為抗體2107.4.10之CDRH1的胺基酸序列。
SEQ ID NO:91為抗體2107.4.10之CDRH2的胺基酸序列。
SEQ ID NO:92為抗體2107.4.10之CDRH3 的胺基酸序列。
SEQ ID NO:93為抗體1749.1.3之成熟重鏈可變區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:94為人化抗體1749第1版之成熟重鏈可變區(VH1)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:95為人化抗體1749第2版之成熟重鏈可變區(VH2)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:96為重鏈可變框構供體U96282_VH之胺基酸序列。
SEQ ID NO:97為抗體1749.1.3之成熟輕鏈可變區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:98為人化抗體1749第1版之成熟輕鏈可變區(VL1)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:99為人化抗體1749第2版之成熟輕鏈可變區(VL2)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:100為輕鏈可變框構供體X02990_VL之胺基酸序列。
SEQ ID NO:101為抗體2107.4.10.18之成熟重鏈可變區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:102為人化抗體2107第1版之成熟重鏈可變區(VH1)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:103為人化抗體2107第2版之成熟重鏈可變區(VH2)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:104為人化抗體2107第3版之成 熟重鏈可變區(VH3)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:105為人化抗體2107第4A版之成熟重鏈可變區(VH4A)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:106為人化抗體2107第5A版之成熟重鏈可變區(VH5A)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:107為人化抗體2107第6版之成熟重鏈可變區(VH6)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:108為重鏈可變框構供體AF062133_VH之胺基酸序列。
SEQ ID NO:109為抗體2107.4.10.18之成熟輕鏈可變區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:110為人化抗體2107第1版之成熟輕鏈可變區(VL1)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:111為人化抗體2107第2版之成熟輕鏈可變區(VL2)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:112為人化抗體2107第3版之成熟輕鏈可變區(VL3)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:113為輕鏈可變框構供體U86803之胺基酸序列。
SEQ ID NO:114為抗體2120.4.19.6之成熟重鏈可變區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:115為人化抗體2120第1版之成熟重鏈可變區(VH1)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:116為人化抗體2120第2版之成 熟重鏈可變區(VH2)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:117為人化抗體2120第3版之成熟重鏈可變區(VH3)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:118為人化抗體2120第4版之成熟重鏈可變區(VH4)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:119為人化抗體2120第5版之成熟重鏈可變區(VH5)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:120為抗體2120.4.19.6之成熟輕鏈可變區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:121為人化抗體2120第1版之成熟輕鏈可變區(VL1)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:122為人化抗體2120第2版之成熟輕鏈可變區(VL2)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:123為人化抗體2120第3版之成熟輕鏈可變區(VL3)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:124為輕鏈可變框構供體X84343_VL之胺基酸序列。
SEQ ID NO:125為人化重鏈框構區之胺基酸序列。
SEQ ID NO:126為人化重鏈框構區之胺基酸序列。
SEQ ID NO:127為人化重鏈框構區之胺基酸序列。
SEQ ID NO:128為人化重鏈/輕鏈框構區之胺 基酸序列。
SEQ ID NO:129為人化輕鏈框構區之胺基酸序列。
SEQ ID NO:130為人化輕鏈框構區之胺基酸序列。
SEQ ID NO:131為人化輕鏈框構區之胺基酸序列。
SEQ ID NO:132為人化輕鏈框構區之胺基酸序列。
SEQ ID NO:133為人化重鏈框構區之胺基酸序列。
SEQ ID NO:134為人化重鏈框構區之胺基酸序列。
SEQ ID NO:135為人化重鏈框構區之胺基酸序列。
SEQ ID NO:136為人化重鏈框構區之胺基酸序列。
SEQ ID NO:137為人化重鏈框構區之胺基酸序列。
SEQ ID NO:138為人化重鏈框構區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:139為人化抗體2120第3版之CDRH1(VH3)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:140為人化抗體2120第4版之 CDRH1(VH4)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:141為人化抗體2120第5版之CDRH1(VH5)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:142為人化輕鏈框構區之胺基酸序列。
SEQ ID NO:143為人化輕鏈框構區之胺基酸序列。
SEQ ID NO:144為人化輕鏈框構區之胺基酸序列。
SEQ ID NO:145為人化輕鏈框構區之胺基酸序列。
SEQ ID NO:146為人化輕鏈框構區之胺基酸序列。
SEQ ID NO:147為人化輕鏈框構區之胺基酸序列。
SEQ ID NO:148為人化輕鏈框構區之胺基酸序列。
SEQ ID NO:149為人化輕鏈框構區之胺基酸序列。
SEQ ID NO:150為人化輕鏈框構區之胺基酸序列。
SEQ ID NO:151為人化抗體2107第1版之CDRH1(VH1)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:152為人化抗體2107第4版之 CDRH1(VH4)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:153為人化抗體2120第1至5版之CDRH3(VH1-VH5)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:154為人化輕鏈框構區之胺基酸序列。
SEQ ID NO:155為人化重鏈框構區之胺基酸序列。
SEQ ID NO:156為抗體2120.4.19.Q1E之成熟重鏈可變區的胺基酸序列,其中位置1(Kabat編號)被E佔用。
SEQ ID NO:157為人化抗體2120第1版Q1E之成熟重鏈可變區(VH1.Q1E)的胺基酸序列,其中位置1(Kabat編號)被E佔用。
SEQ ID NO:158為人化抗體2120第2版Q1E之成熟重鏈可變區(VH2.Q1E)的胺基酸序列,其中位置1(Kabat編號)被E佔用。
SEQ ID NO:159為人化抗體2120第3版Q1E之成熟重鏈可變區(VH3.Q1E)的胺基酸序列,其中位置1(Kabat編號)被E佔用。
SEQ ID NO:160為人化抗體2120第4版Q1E之成熟重鏈可變區(VH4.Q1E)的胺基酸序列,其中位置1(Kabat編號)被E佔用。
SEQ ID NO:161為人化抗體2120第5版Q1E之成熟重鏈可變區(VH5.Q1E)的胺基酸序列,其中位 置1(Kabat編號)被E佔用。
SEQ ID NO:162為編碼可融合至成熟重鏈或成熟輕鏈可變區之示例性信號肽的核酸序列。
SEQ ID NO:163為由SEQ ID NO:162之核酸序列編碼的示例性信號肽之胺基酸序列。
SEQ ID NO:164為編碼可融合至成熟重鏈或成熟輕鏈可變區之示例性信號肽的核酸序列。
SEQ ID NO:165為由SEQ ID NO:164之核酸序列編碼的示例性信號肽之胺基酸序列。
SEQ ID NO:166為編碼可融合至成熟重鏈或成熟輕鏈可變區之示例性信號肽的核酸序列。
SEQ ID NO:167為由SEQ ID NO:166之核酸序列編碼的示例性信號肽之胺基酸序列。
SEQ ID NO:168為人化2120輕鏈恆定區之胺基酸序列,其N-端具有精胺酸。
SEQ ID NO:169為人化2120輕鏈恆定區之胺基酸序列,其N-端不具有精胺酸。
SEQ ID NO:170為人化2120重鏈恆定區之胺基酸序列。
SEQ ID NO:171為BIP版重鏈Glm3同種異型(allotype)恆定區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:172為BIP版重鏈Glm3同種異型恆定區的胺基酸序列。
SEQ ID NO:173為人化抗體2120第3版之成 熟輕鏈區(VL3+輕鏈恆定區)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:174為人化抗體2120第5版之成熟重鏈區(VH5+BIP版重鏈Glm3同種異型恆定區)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:175為人化抗體2120第5版之成熟重鏈區(VH5+BIP版重鏈Glm3同種異型恆定區)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:176為人化抗體2120第5 Q1E版之成熟重鏈區(VH5.Q1E+BIP版重鏈Glm3同種異型恆定區)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:177為人化抗體2120第5 Q1E版之成熟重鏈區(VH5.Q1E+BIP版重鏈Glm3同種異型恆定區)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:178為人化抗體2107第4B版之成熟重鏈可變區(VH4B)的胺基酸序列。
SEQ ID NO:179為人化抗體2107第5B版之成熟重鏈可變區(VH5B)的胺基酸序列。
定義
單株抗體通常係以經分離之形式提供。此意指抗體通常為具有至少50% w/w純蛋白質及其他從抗體製造或純化產生之大分子,但不排除該單株抗體與過量醫藥上可接受之載體或其他旨在便於其使用之載劑組合的可能性。有時單株抗體為至少60%、70%、80%、90%、95% 或99% w/w純蛋白質及其他從抗體製造或純化產生之大分子。
單株抗體特異結合至其標靶抗原意指以至少106、107、108、109或1010M-1之親和力結合。特異性結合在幅度上可檢測地高於對至少一種不相關標靶所發生之非特異性結合且可與非特異性結合區分。特異性結合可為特定官能基之間形成鍵的結果或為特定空間擬合(例如鎖和鑰匙型)之結果,而非特異性結合通常為凡得瓦爾力(van der Waals)之結果。然而,特異性結合並不一定意味著單株抗體結合一種且只有一種標靶。
該基本抗體結構單位為次單位之四聚體。各四聚體包括兩對完全相同之多肽鏈對,各對具有一個“輕”鏈(約25kDa)及一個“重”鏈(約50至70kDa)。各鏈之胺基端部分包括主要負責識別抗原之具有約100至110或更多個胺基酸的可變區。此可變區最初表現時係鏈接至可裂解之信號肽。無信號肽之可變區有時稱為成熟可變區。因此,例如,輕鏈成熟可變區意指無輕鏈信號肽之輕鏈可變區。各鏈之羧基端部分界定主要負責效應子功能之恆定區。
輕鏈被分類為κ或λ。重鏈被分類為γ、μ、α、δ或ε並分別定義該抗體之同種型為IgG、IgM、IgA、IgD和IgE。在輕鏈和重鏈之內,該可變區和恆定區係藉由具有約12或更多個胺基酸之“J”區連接在一起,該重鏈亦包括具有約10或更多個胺基酸之“D” 區。(大致上參考Fundamental Immunology(Paul,W.,ed.,2nd ed.Raven Press,N.Y.,1989,Ch.7,其全部內容以引用方式併入本文)。
各輕/重鏈對之成熟可變區形成抗體結合位點。因此,完整抗體具有二個結合位點。除了在雙功能或雙特異性抗體中以外,該二個結合位點是相同的。各輕/重鏈均顯現出具有相對保守之框構區(FR)的相同整體結構,該框構區係藉由三個高可變區連接(亦稱為互補決定區或CDR)。該來自各對之兩條鏈的CDR係藉由框構區對齊,從而使能結合至特定之抗原決定部位。從N端至C端,輕鏈和重鏈均包含結構域FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3及FR4。各結構域之胺基酸分配係根據Kabat,Sequences of Proteins of Immunological Interest(National Institutes of Health,Bethesda,MD,1987 and 1991),或Chothia & Lesk,J.Mol.Biol.196:901-917(1987);Chothia et al.,Nature 342:878-883(1989)。Kabat亦提供廣泛使用之編號慣例(Kabat編號),其中不同重鏈之間或不同輕鏈之間的對應殘基被賦予相同的號碼(例如在成熟重鏈可變區中由Kabat編號之H83意指位置83;同樣的,在成熟輕鏈可變區中由Kabat編號之L36意指位置36)。除非另外明確聲明,全文中係使用Kabat編號來指稱抗體可變區中之位置。
術語“抗體”包括完整抗體及其抗原結合片段。通常,片段與衍生彼等之完整抗體競爭特異結合至標 靶,包括單獨之重鏈、輕鏈Fab、Fab’、F(ab’)2、F(ab)c、雙功能抗體、Dab、奈米抗體及Fv。片段可藉由重組DNA技術或藉由酶催化或化學分離完整免疫球蛋白來製造。
術語“抗體”亦包括雙特異性抗體、及/或嵌合抗體、及/或人化抗體。雙特異性或雙官能抗體為具有兩對不同重/輕鏈對和二個不同結合位點之人工雜交抗體(見,例如Songsivilai and Lachmann,Clin.Exp.Immunol.,79:315-321(1990);Kostelny et al.,J.Immunol.148:1547-53(1992))。於一些雙特異性抗體中,該兩種不同重/輕鏈對可包括特異於不同抗原決定部位之人化重鏈/輕鏈對和重鏈/輕鏈對。
於一些雙特異性抗體中,一種重鏈輕鏈對為如下文中進一步揭示之人化抗體且該重輕鏈對係來自結合至表現在血腦屏障上之受體(諸如胰島素受體、胰島素樣生長因子(IGF)受體、瘦素受體或脂蛋白受體或轉鐵蛋白受體)的抗體(Friden et al.,PNAS 88:4771-4775,1991;Friden et al.,Science 259:373-377,1993)。這類雙特異性抗體可藉由受體介導之胞移作用(transcytosis)轉移跨越血腦屏障。藉由遺傳工程處理該雙特異性抗體以降低其對血腦屏障受體之親和性可將腦部攝取雙特異性抗體之作用進一步增進。降低對受體之親和力導致更廣泛地分佈在大腦中(見,例如Atwal.et al.Sci.Trans.Med.3,84ra43,2011;Yu et al.Sci.Trans.Med.3,84ra44,2011)。
示例性雙特異性抗體亦可為(1)雙可變結構域抗體(DVD-Ig),其中各輕鏈和重鏈含有二個透過短肽鍵串聯之可變結構域(Wu et al.,Generation and Characterization of a Dual Variable Domain Immunoglobulin(DVD-IgTM)Molecule,在:Antibody Engineering,Springer Berlin Heidelberg(2010)中);(2)Tandab,其為導致四價雙特異性抗體之二個單鏈雙功能抗體的融合體且具有二個用於各標靶抗原之結合位點;(3)flexibody,其為導致多價分子之scFv與二價抗體的組合物;(4)基於蛋白激酶A(Protein Kinase A)中之“二聚體化和對接結構域”之所謂的“對接及鎖定(dock and lock)”分子,當將其應用在Fab時可產生三價雙特異性結合蛋白,此三價雙特異性結合蛋白係由二個連接不同Fab片段之完全相同的Fab片段所組成;(5)所謂之Scorpion分子,其包含,例如二個融合至人Fc區之二端的scFv。用於製備雙特異性抗體之平台的實例包括,但不限於BiTE(Micromet)、DART(MacroGenics)、Fcab及Mab2(F-star)、Fc-遺傳工程處理之IgGl(Xencor)或DuoBody(基於Fab臂交換,Genmab)。
術語“抗原決定部位”係指在抗原上,抗體結合之位點。抗原決定部位可從連續胺基酸形成或藉由一或多種蛋白質之三級折疊從並列之非連續胺基酸形成。從連續胺基酸形成之抗原決定部位在暴露於變性溶劑時通常被保留,而藉由三級折疊形成之抗原決定部位在以變性溶劑處理時通常會喪失。抗原決定部位通常在獨特之空間構 形中包括至少3個,更通常為至少5個或8至10個胺基酸。測定抗原決定部位之空間構形的方法包括,例如x-射線晶體學及2-維核磁共振。參見,例如Epitope Mapping Protocols,在Methods in Molecular Biology,Vol.66,Glenn E.Morris,Ed.(1996)中。
“拮抗劑”抗體或其他結合劑為抑制其所結合之抗原的生物活性者。該等抗體可大致或完全抑制該抗原之生物活性。
與MCAM相關之術語“生物活性”及“生物學上活性”係指其特異結合其配體(層黏連蛋白α 4鏈,例如層黏連蛋白411之α 4鏈)及/或促進表現之MCAM細胞,例如TH 17細胞浸潤入CNS之能力。
“抑制”意指作用劑降低至少一種標靶,例如MCAM之生物活性。該等抑制劑可抑制至少一種標靶至少約25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少95%或至少100%之活性。
“個體”包括接受預防性或治療性治療之人或其他哺乳動物個體。
為了將胺基酸取代分類為保守或非保守性,將胺基酸依下述分組:第I組(疏水性側鏈):met、ala、val、leu、ile;第II組(中性親水側鏈):cys、ser、thr;第III組(酸性側鏈):asp、glu;第IV組(鹼性側鏈): asn、gln、his、lys、arg;第V組(影響鏈之定向的殘基):gly、pro;和第VI組(芳香族側鏈):trp、tyr、phe。保守取代涉及同一類別中之胺基酸之間的取代。非保守取代構成這些類別的成員之一與另一類別之成員交換。
序列同一性百分比係藉由Kabat編號慣例將抗體序列進行最大限度比對來測定。比對後,若將個體抗體區(例如重鏈或輕鏈之整個成熟可變區)與參考抗體之相同區域相比較,該個體與參考抗體區之間的序列同一性百分比為個體和參考抗體區中被相同胺基酸佔據之位置的數目除以該二個區域之比對位置的總數(間隙不計算在內),再乘以100以轉化為百分比。
“包含”一或多種列舉之元素的組成物或方法可包括未明確列舉之其他元素。例如,包含抗體之組成物可含有單獨之抗體或與其他成分組合。
指定之數值範圍包括所有在該範圍內或界定該範圍之整數,及由該範圍內之整數界定的所有子範圍。
除非從上下文中另外清楚地看出,術語“約”包含在陳述之數值的測量誤差的標準邊距(SEM)內之數值。
統計上有意義意指p≦0.05。
詳細說明 I. 一般
WO /2012/170071和PCT/US2013/058773中揭示具有抑制MCAM結合至層黏連蛋白411之層黏連蛋白α 4鏈之有用性質的抗體。除其他事項外,本申請案(a)提供2120.4.19抗體之新人化形式,(b)繪製此抗體所結合之抗原決定部位的位置,(c)提供結合至相同抗原決定部位之抗體,及(d)提供所揭示之抗體的新調製劑。
術語“2120.4.19”、“m2120”、“老鼠2120”抗體係指源自囓齒類之具有對應於SEQ ID NO:114的成熟可變重鏈及對應於SEQ ID NO:120之成熟可變輕鏈的單株抗體選殖株。“人化2120”或“hu2120”係指2120.4.19選殖株之人化變異體。
II. 標靶分子
天然人野生型MCAM(黑色素瘤細胞黏附分子,亦稱為CD146和MUC18)為具有646個胺基酸之蛋白質,其具有下列胺基酸序列: (SEQ ID NO:11).
(GenBank資料庫登錄編號AAA20922.1(CAA48332))。MCAM為一種細胞表面糖蛋白,其屬於涉及細胞黏附及血管組織中細胞間連接處之內皮單層結合的免疫球蛋白超家族。其亦促進許多癌症,諸如實體腫瘤,包括黑色素瘤及前列腺癌之腫瘤進展。已知其以同型/嗜同方式進行交互作用且亦可結合至其他配體。人MCAM包括五個免疫球蛋白結構域(1:胺基酸殘基19至129;2:胺基酸殘基139至242;3:胺基酸殘基244至321;4:胺基酸殘基335至424;及5:胺基酸殘基430至510),如SEQ ID NO:22至26中所示。
除非上下文另外清楚表示,MCAM或其片段之引用包括如上文指出之天然人野生型胺基酸序列,及彼等之人等位基因變異體。
層黏連蛋白α 4係指在層黏連蛋白分子中發現的多肽鏈之一,該層黏連蛋白分子表現在(基底膜之)基底層中,此為大多數細胞和器官之蛋白質網絡基礎。已知層黏連蛋白透過質膜分子結合至細胞膜並有助於細胞附著。層黏連蛋白α 4鏈通常與層黏連蛋白β-鏈和層黏連蛋白γ-鏈形成複合物。層黏連蛋白α 4鏈可在許多層黏連蛋白分子中找到,包括層黏連蛋白411(層黏連蛋白8或α 4 β 1 γ 1);層黏連蛋白421(層黏連蛋白9或α 4 β 2 γ 1)及層黏連蛋白423(層黏連蛋白14或α 4 β 2 γ 3)。人層黏連蛋白α 4鏈有兩種主要之同種型:GenBank登錄編號NP001098676和NP001098677(分別為SEQ ID NO:27和28)。“層黏 連蛋白411”係指由三個多肽次單位或鏈所組成的三聚體多肽複合物:α 4-鏈、β 1鏈及γ 1-鏈。
針對MCAM之拮抗劑包括抗體、受體之融合蛋白或IgG恆定區其他生物結合分子及小分子之配體。抗體可為單株或多株抗體。抗體可為非人抗體,諸如小鼠或大鼠、非人靈長類動物或可為人。抗體可為嵌合型、經表面修飾的、人化的、靈長類動物化之抗體,等。
MCAM拮抗劑係指完全或部分地抑制MCAM下列能力之拮抗劑(i)特異結合其配體:層黏連蛋白α 4鏈,例如,層黏連蛋白411之α 4鏈;及/或(ii)促進表現之MCAM細胞(例如TH17細胞)浸潤入或移行入個體組織。MCAM拮抗劑包括結合至MCAM或其配體層黏連蛋白α 4之抗體或其他拮抗劑。
III. 抗體 A. 抗體2120.4.19及其嵌合、經表面修飾和人化形式
人化抗體為經遺傳工程處理之抗體,其中該來自非人“供體”抗體(即,2120.4.19)之CDR被移植入人“受體”抗體序列(見,例如Queen,US 5,530,101及5,585,089;Winter,US 5,225,539、Carter,US 6,407,213、Adair,US 5,859,205、6,881,557、Foote,US 6,881,557)。該受體抗體序列可為,例如成熟的人抗體序列、該等序列之複合物、人抗體序列之共有序列(consensus sequence)或種系(germline)區序列。人受體抗 體序列可選擇性地自許多已知之人抗體序列中選出以在人受體序列可變區框構與供體抗體鏈之對應的可變區框構之間提供高度的序列同一性(例如65至85%之同一性)。因此,人化抗體為其有些或全部CDR係完全或實質上來自供體抗體且其可變區框構序列及恆定區(若存在時)係完全或實質上來自人抗體序列的抗體。類似地,人化重鏈具有至少一個、二個,且通常是全部三個完全或實質上來自供體抗體重鏈之CDR及實質上來自人重鏈可變區框構和恆定區序列之重鏈可變區框構序列和重鏈恆定區(若存在時)。類似地,人化輕鏈具有至少一個、二個,通常是全部三個完全或實質上來自供體抗體輕鏈之CDR及實質上來自人輕鏈可變區框構和恆定區序列之輕鏈可變區框構序列和輕鏈恆定區(若存在時)。除了奈米抗體(nanobody)及dAb外,人化抗體包含人化重鏈和人化輕鏈。當在各別CDR之間的對應殘基(如Kabat所定義者)具有至少85%、90%、95%或100%之同一性時,人化抗體中之CDR實質上係來自非人抗體之對應CDR,唯其中CDRH1可具有最多二個取代且CHDRH2可在位置H60至65具有取代。當Kabat所定義之對應殘基具有至少85%、90%、95%或100%之同一性時,抗體鏈之可變區框構序列或抗體鏈之恆定區實質上係分別來自人可變區框構序列或人恆定區。
雖然人化抗體通常納入所有六個來自小鼠抗體之CDR(較佳為如Kabat所定義者),其亦可使用較全部數量更少(例如至少3、4或5個CDR)之小鼠抗體CDR來 製造(例如Pascalis et al.,J.Immunol.169:3076,2002;Vajdos et al.,Journal of Molecular Biology,320:415-428,2002;Iwahashi et al.,Mol.Immunol.36:1079-1091,1999;Tamura et al,Journal of Immunology,164:1432-1441,2000)。
於一些抗體中僅需要部分之CDR,即,結合所需之CDR殘基的子集(稱為SDR)來保留人化抗體中之結合。不接觸抗原且不在SDR中之CDR殘基可根據之前的研究(例如CDR H2中之殘基H60至H65通常不需要),藉由分子建模及/或憑經驗,或依Gonzales et al.,Mol.Immunol.41:863,2004中之描述從位在Chothia高度可變環(Chothia,J.Mol.Biol.196:901,1987)外之Kabat CDR區鑑定出。於該等人化抗體中,在其中不存有一或多個供體CDR殘基或其中整個供體CDR被省略的位置處,佔據該位置之胺基酸可為佔據受體抗體序列中之對應位置(藉由Kabat編號)的胺基酸。CDR中所包含之該等以供體胺基酸取代受體胺基酸的數目反映了平衡競爭考慮。該等取代在減少人化抗體中之小鼠胺基酸數目且因此降低可能之致免疫性上可能是有利的。然而,取代亦可能引起親和力之變化且最好避免親和力顯著降低。亦可憑經驗選擇CDR中用於替代之位置和欲取代之胺基酸。
針對MCAM之2120.4.19大鼠抗體揭示於PCT/US2013/058773中且在本文中係由SEQ ID NO:69-80定義。2120.4.19抗體之嵌合、經表面修飾及人化形式 亦揭示於‘773申請案中。所揭示之人化形式在本文中係定義為SEQ ID NO:115-119、121-123、139-141和153。所揭示之形式,包括由這些SEQ ID NO所代表之任何人化重鏈和人化輕鏈之置換,可用於本發明之一些態樣中,諸如醫藥組成物和調製劑。
本申請案提供2120.4.19抗體之另外的人化形式,其中在重鏈可變區(即Q1E)之位置1(Kabat編號)處的麩胺醯胺被取代成麩胺酸。在重鏈可變區中之Q1E取代為不被預期對抗體之結合特性產生重大影響的保守取代,但其可提高抗體之穩定性。
除非從上下文另外顯明,下列描述包括PCT/US2013/058773中所揭示之人化抗體及本文所揭示之Q1E變異體。
本發明提供抗體,這些抗體包含含有下列者之重鏈可變區:SEQ ID NO:78之Kabat CDR1:GFSLTSNGVS;SEQ ID NO:79之Kabat CDR2:AISSGGTTYYNSAFKS;SEQ ID NO:80之Kabat CDR3:RYGYGWYFDF。一些抗體包含含有下列者之輕鏈可變區:SEQ ID NO:73之Kabat CDR1:KASQNIYNSLA;SEQ ID NO:74之Kabat CDR2:NANSLQT;及SEQ ID NO:75之Kabat CDR3:QQFYSGYT。一些該等抗體在SEQ ID NO:78之Kabat CDR1中包含N32S取代或N32Q取代,而一些抗體在SEQ ID NO:78之Kabat CDR1中包含G33A取代。這些取代已被發現可提供改善之特性,包 括增加抗體之親和力和效力。
本發明亦提供其中該成熟重鏈可變區與SEQ ID NO:161具有至少90%、95%、96%、97%、98%或99%之同一性且該成熟輕鏈可變區與SEQ ID NO:123具有至少90%、95%、96%、97%、98%或99%之序列同一性的抗MCAM抗體。一些該等抗體包括與供體2120.4.19抗體之CDR區完全或實質上相同的三個重鏈和三個輕鏈CDR。若非完全相同,較佳地,CDR具有如本文中(諸如在前面的段落中)所定義之類型和位置處之取代。該CDR區可藉由任何習知定義(例如Chothia)來定義,但較佳為藉由Kabat定義。
上述之任一抗體可為人化抗體。一些人化抗體包含含有SEQ ID NO:161之三個Kabat CDR(其與SEQ ID NO:156之CDR相同)的成熟重鏈可變區(唯其中位置32(Kabat編號)可為N、S或Q且位置33(Kabat編號)可為G或A)且包含含有SEQ ID NO:123之三個Kabat CDR(其與SEQ ID NO:120之CDR相同)的成熟輕鏈可變區,較佳地,其中該成熟重鏈可變區與SEQ ID NO:161具有至少90%之同一性,且較佳地,其中該成熟輕鏈可變區與SEQ ID NO:123具有至少90%之同一性。任何該等抗體在藉由Kabat編號之位置H1處可具有Q或E(即,Q1E取代)。
本文所提供之在成熟重鏈可變區具有Q1E取代的抗體包括那些包含具有下列胺基酸序列之成熟重鏈可 變區的抗體:SEQ ID NO:156(即,2120.4.19.Q1E)、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:160或SEQ ID NO:161。一些該等抗體包含具有定名為SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:122或SEQ ID NO:123之胺基酸序列的成熟輕鏈可變區。該成熟重鏈及輕鏈可變區可以任何可能的排列組合。示例性組合為包含具有SEQ ID NO:161之胺基酸序列的成熟重鏈可變區及包含具有定名為SEQ ID NO:123之胺基酸序列的成熟輕鏈可變區之抗體。無Q1E取代之這些抗體形式(諸如已描述於PCT/US2013/058773中者)亦可用於本發明之一些態樣中,諸如醫藥組成物和調製劑。
本發明進一步提供其中該重鏈成熟可變區與SEQ ID NO:156(即,2120.4.19.Q1E)、SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:160或SEQ ID NO:161中之任一者的胺基酸序列具有至少90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%之序列同一性且該輕鏈與SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:122或SEQ ID NO:123中之任一者具有至少90%、95%、96%、97%、98%或99%之序列同一性的抗體。較佳地,該等抗體為人化抗體。任何該等抗體在藉由Kabat編號之位置H1處可具有Q或E(即,Q1E取代)。
所揭示之SEQ ID NO的變異體通常與成熟重鏈和輕鏈可變區序列具有少數(例如,在輕鏈或重鏈成熟 可變區框構或此兩者中通常不超過1、2、3、5或10個)之替代、缺失或插入的差異。較佳地,任何改變為保守取代。
B. 恆定區之選擇
嵌合抗體、經表面修飾之抗體或人化抗體之重鏈和輕鏈可變區可連接到至少一部分之人恆定區上。恆定區之選擇部分取決於是否期望有抗體依賴性細胞介導之細胞毒性、抗體依賴性細胞吞噬作用及/或補體依賴性細胞毒性。例如,人同種型IgG1和IgG3具有補體依賴性細胞毒性,而人同種型IgG2和IgG4則不。人IgG1和IgG3亦誘導較人IgG2和IgG4所誘導者更強之由細胞介導的效應子功能。輕鏈恆定區可為λ或κ。
在一定比例或所有分子中,輕及/或重鏈之胺基或羧基端處(諸如重鏈之C-端賴胺酸)可能遺失或衍生一或數個胺基酸。取代可在恆定區中製造以減少或增加效應子功能,諸如補體介導之細胞毒性或ADCC(參見,例如Winter等人,美國專利案第5,624,821號;Tso等人,美國專利案第5,834,597號;及Lazar等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 103:4005,2006)或延長在人體中之半衰期(見,例如Hinton et al.,J.Biol.Chem.279:6213,2004)。示例性取代包括用於增加抗體之半衰期之在位置250處的Gln及/或在位置428處之Leu(本段落中恆定區係使用EU編號)。在234、235、236及/或237之任一或所有位置處 的取代可降低對Fc γ受體,尤其是Fc γ RI受體之親和力(見,例如US 6,624,821)。在人IgG1之位置234、235及237處之丙胺酸取代可用於降低效應子功能。一些抗體在人IgG1之位置234、235及237處具有用於降低效應子功能之丙胺酸取代。可選擇地,人IgG2中之位置234、236及/或237處被丙胺酸取代且位置235處被麩胺醯胺取代(參見,例如美國5,624,821)。於一些抗體中,使用在人IgG1之位置241、264、265、270、296、297、322、329和331(藉由EU編號)的一或多個位置處之突變。於一些抗體中,使用在人IgG1之位置318、320和322(藉由EU編號)的一或多個位置處之突變。於一些抗體中,位置234及/或235被丙胺酸取代及/或位置329被甘胺酸取代。於一些抗體中,位置234和235被丙胺酸取代,諸如在SEQ ID NO:172中。於一些抗體中,該同種型為人IgG2或IgG4。示例性之人輕鏈κ恆定區具有SEQ ID NO:168之胺基酸序列。SEQ ID NO:168之N端精胺酸可被省略,在此種情況中,輕鏈κ恆定區具有SEQ ID NO:169之胺基酸序列。示例性人IgG1重鏈恆定區具有SEQ ID NO:170之胺基酸序列(具有或不具有C-端賴胺酸)。抗體之表現形式可為含有兩條輕鏈和二條重鏈之四聚體、為單獨之重鏈、輕鏈、為Fab、Fab’、F(ab’)2和Fv,或為其中重鏈和輕鏈成熟可變區係透過間隔子連接之單鏈抗體。
人類恆定區顯示出不同個體之間的同種異型變化和同族同種異型(isoallotypic)變化,亦即,在不同個 體中該恆定區在一或多個多態型位置處可有不同。同族同種異型與同種異型之不同處在於識別同族同種異型之血清結合一或多個其他同種型之非多態性區。因此,例如另一重鏈恆定區為IgG1 Glm3同種異型之重鏈恆定區且具有SEQ ID NO:171之胺基酸序列。另一個重鏈恆定區具有SEQ ID NO:171之胺基酸序列,唯其中缺乏C-端賴胺酸。另一重鏈恆定區具有SEQ ID NO:172之胺基酸序列。再另一重鏈恆定區具有SEQ ID NO:172之胺基酸序列,唯其中缺乏C-端賴胺酸。
本發明進一步提供編碼上述任一恆定區之核酸。可選擇地,該等核酸進一步編碼信號肽且可與連接恆定區之信號肽一起表現。
C. 重組抗體之表現
抗體可藉由重組表現製造。編碼該抗體之核酸可經密碼子優化以在所需之細胞類型中表現(例如CHO或Sp2/0)。重組核酸構建體通常包括可操作地連接抗體鏈之編碼序列的表現控制序列,包括天然相關或異源啟動子區。該表現控制序列可為能夠轉化或轉染真核宿主細胞之載體中的真核啟動子系統。一旦該載體被納入合適之宿主中,將該宿主保持在適合高度表現該核苷酸序列之條件下,並收集和純化該交叉反應抗體。編碼該抗體鏈之載體亦可含有可選擇之基因(諸如二氫葉酸還原酶)以允許編碼該抗體鏈之核酸的複本數擴增。
大腸桿菌為特別有用之用於表現抗體,尤其是抗體片段的原核宿主。微生物,諸如酵母亦可用來表現。釀酒酵母為酵母宿主之一種實例,其帶有具有表現控制序列、複製起點、終止序列及所需之類似物的合適載體。典型之啟動子包括3-磷酸甘油酸酯激酶及其他糖解酶。誘導型酵母啟動子包括來自醇脫氫酶、異細胞色素C及負責麥芽糖和半乳糖利用之酶等的啟動子。
哺乳動物細胞可用於表現編碼免疫球蛋白或其片段之核苷酸節段。參見Winnacker,From Genes to Clones(VCH出版社,紐約,1987)。本技藝中已研發出許多能夠分泌完整異源蛋白之合適宿主細胞株,包括CHO細胞株、各種COS細胞株、HeLa細胞、HEK293細胞、L細胞及非抗體製造骨髓瘤,包括Sp2/0和NSO。使用非人細胞可能是有利地。用於這些細胞之表現載體可包括表現控制序列,諸如複製起點、啟動子、增強子(Queen et al.,Immunol.Rev.89:49(1986))及必要之加工信息位點,諸如核糖體結合位點、RNA剪接位點、聚腺苷酸化位點及轉錄終止子序列。合適之表現控制序列為源自內源基因、巨細胞病毒、SV40、腺病毒、牛乳頭瘤病毒,等之啟動子。參見Co et al.,J.Immunol.148:1149(1992)。
將編碼抗體重鏈和輕鏈之載體導入細胞培養物中後,可將細胞匯集體在無血清培養基中篩選生長產製率及產物品質。然後將頂尖產製細胞匯集體進行以FACS為基礎之單細胞選殖以產生單一選殖株細胞系。每天每細 胞高於50pg或100pg之比生產力(其相當於產物效價高於7.5g/L培養)可有優勢。亦可測試由單一細胞選殖株製造之抗體的濁度、過濾性質、PAGE、IEF、UV掃描、HP-SEC、碳水化合物-寡醣映射、質譜法及結合分析,諸如ELISA或Biacore試驗。然後,可將選定之選殖株存入多個小瓶中並冷凍保存以供後續使用。
一旦表現出,抗體可根據本技藝之標準程序純化,包括蛋白A捕捉、管柱色層分析法(例如疏水性交互作用或離子交換)、用於病毒滅活之低pH值,等(大致上參見Scopes,Protein Purification(Springer-Verlag,NY,1982))。
用於商業產製抗體的方法包括密碼子優化、選擇啟動子、轉錄元件及終止子、無血清單細胞選殖、細胞積存、使用選擇標記擴增複本數、CHO終止子、無血清單細胞選殖、提高蛋白質效價(參見,例如US 5,786,464、US 5,888,809、US 6,063,598、US 6,114,148、US 7,569,339、WO 2004/050884、WO 2005/019442、WO 2008/012142、WO 2008/012142、WO 2008/107388和WO 02009/027471)。
D. 核酸
本發明進一步提供編碼上述任一重鏈和輕鏈之核酸。通常,該核酸亦編碼融合至成熟重鏈和輕鏈之信號肽(例如,可由SEQ ID NO:162、164和166編碼之具 有SEQ ID NO:163、165和167之胺基酸序列的信號肽)。核酸上之編碼序列可與調節序列以可操作之方式連接以確保該編碼序列,諸如啟動子、增強子、核糖體結合位點、轉錄終止信號,等之表現。編碼重鏈和輕鏈之核酸可以分離出之形式發生或可被選殖入一或多個載體中。核酸可藉由,例如固態合成或重疊寡核苷酸之PCR來合成。編碼重鏈和輕鏈之核酸可結合為一連續核酸,例如在表現載體內,或可分開,例如各自選殖入其本身之表現載體中。
E. 用於與抗體結合之MCAM抗原決定部位的表徵及結合彼等之抗體的產製 1. 用於與抗體結合之MCAM抗原決定部位
本發明提供與人MCAM蛋白內之特定抗原決定部位結合的單株抗體,其中一些係與命名為2120.4.19(mM2120)之抗體結合相同或重疊的抗原決定部位。
在MCAM(SEQ ID NO:11)之殘基39、62、133、141、159、212、220、221、223、227、238、241及/或392處之突變擾亂m2120的特異性結合(例如,依實例中之描述,與陽性對照野生型MCAM相比較,<30%結合突變體MCAM)。在殘基145、167、175、206、207、216和225之突變被鑑定為對m2120之特定結合具有最大效果(降低)。因為相當少之殘基影響結合且殘基之分隔較典型之線性抗原決定部位(例如,3至20個連續胺基酸)更 寬,這些結果指出m2120可與構象抗原決定部位結合,或者,一或多個影響結合之殘基可以變構方式結合,而不與抗體直接接觸。
與包含一或多個MCAM之殘基39、62、133、141、145、159、167、175、206、207、212、216、220、221、223、225、227、238、241和392之抗原決定部位結合,尤其是與包含一或多個殘基141和145之抗原決定部位結合的抗體很可能與m2120共享有用之抑制性質。因此,其特定結合受一或多個MCAM之殘基141和145,尤其是殘基141之誘變作用抑制的抗體可能與m2120共享類似性質。一些該等抗體與包含或由MCAM之殘基141及/或145所組成之抗原決定部位結合。該抗原決定部位可為線性的,諸如包含一或二個該具體指定之胺基酸(141和145)的抗原決定部位(例如2-5、3-5、3-10、3-15、3-20、5-10、5-15、5-20、5-30、5-40、5-50、5-60或5-70個連續胺基酸)或者該抗原決定部位可為構象的,此種抗原決定部位包含或由一或二個該具體指定之胺基酸所組成。
2. 與特定MCAM抗原決定部位結合之抗體的產製方法
一些抗體係與m2120抗體結合相同或重疊之抗原決定部位。其他針對人MCAM之非人單株抗體(例如小鼠、天竺鼠、靈長類、兔子或大鼠)之製造可藉由,例如使用人MCAM,或包含所需之抗原決定部位(以下簡稱 “免疫原”)之肽片段的人MCAM,或顯示人MCAM之細胞株,或人MCAM cDNA(由逆轉錄病毒編碼或使用基因槍免疫化)免疫動物,並篩選所產生之用於與MCAM結合,選擇性地,與m2120競爭之抗體(參見Harlow & Lane,Antibodies,A Laboratory Manual(CSHP NY,1988),此篇以引用方式被併入本文以用於所有目的)。選擇性地,該免疫原係與載體分子共軛結合。選擇性地,該免疫原係與佐劑一起投予。可依下述使用數種類型之佐劑。較佳地,先使用弗氏完全佐劑,再使用不完全佐劑以免疫實驗動物。通常使用兔子或天竺鼠來製造多株抗體。通常使用小鼠來製造單株抗體。篩選特異結合MCAM內之理想抗原決定部位的抗體。
本發明提供用於創建針對上述抗原決定部位之抗體的MCAM之肽片段。該等肽之實例包括長度介於2-5、3-5、3-10、3-15、3-20、5-10、5-15、5-20、5-30、5-40、5-50、5-60或5-70個連續胺基酸之間的肽且包括至少一個MCAM之胺基酸殘基141和145。於這些肽的某些肽中,該肽同時包含胺基酸殘基141和145。
免疫原可與載體分子共軛結合,通常為載體多肽,從而協助引發針對與該載體共軛結合之片段的免疫反應。單一作用劑可連接單一載體,一種作用劑之數個複本可與一種載體之數個複本連接,該載體之複本又彼此連接,一種作用劑之數個複本可連接一種載體之單一複本,或者一種作用劑之單一複本可連接一種載體或不同載體之 數個複本。合適之載體包括血清白蛋白、匙孔血藍蛋白、免疫球蛋白分子、甲狀腺球蛋白、卵白蛋白、破傷風類毒素或來自其他致病細菌之類毒素,諸如白喉(例如CRM197)、大腸桿菌、霍亂或幽門螺桿菌或減毒之毒素衍生物。
免疫原通常係與醫藥上可接受之佐劑一起投予。相對於若單獨使用肽之情況,該佐劑增加所誘導之抗體的效價及/或所誘導之抗體的結合親和力。各種佐劑均可與MCAM之免疫原性片段組合使用以引發免疫反應。較佳之佐劑可增強對免疫原之固有反應,但不引起會影響該反應之定性形式的免疫原中的構象變化。示例性佐劑包括氫氧化鋁和磷酸鋁、3脫-O-醯化單磷醯脂質A(MPLTM)(參見GB 2220211(RIBI ImmunoChem Research Inc.,Hamilton,Montana,現為Corixa之一部分)。StimulonTM QS-21為從南美洲發現之皂皮莫利納樹(Quillaja Saponaria Molina tree)的樹皮中分離出之三萜糖苷或皂甙(參見Kensil et al.,Vaccine Design:The Subunit and Adjuvant Approach(eds.Powell & Newman,Plenum Press,NY,1995);US 5,057,540)(Aquila BioPharmaceuticals,Framingham,MA;現為Antigenics Inc.,New York,NY)。其他佐劑為水包油乳劑(諸如角鯊烯或花生油),其可選擇性地與免疫刺激劑,諸如單磷醯脂質A(參見Stoute et al.,N.Engl.J.Med.336,86-91(1997))、普朗尼克(pluronic)聚合物及經滅殺之分枝桿菌組合。另一佐劑為CpG(WO 98/40100)。佐劑可以治療組成物之組分形式與活性劑一起投予或可在投予治療劑之前、同時或之後投予分別。
3. 抗體類型
抗體可為單株或多株的。抗體可為非人的,諸如小鼠或大鼠、非人之靈長類動物或可為人。抗體可為嵌合的、經表面修飾的、人化的、靈長化的,等。
單株抗體係使用上述方法人化且該方法描述於Queen,US 5,530,101和5,585,089;Winter,US 5,225,539、Carter,US 6,407,213、Adair,US 5,859,205、Foote,US 6,881,557中。該受體抗體序列可為,例如成熟人抗體可變區序列、該等序列之複合物、人抗體可變區之共有序列(Kabat之輕和重鏈可變區共有序列,1991,如上述),或種系可變區序列。因此,人化抗體為其有些或全部CDR係完全或實質上來自供體抗體且其可變區框構序列及恆定區(若存在時)係完全或實質上來自人抗體序列的抗體。類似地,人化重鏈具有至少一個、二個,且通常是全部三個完全或實質上來自供體抗體重鏈之CDR及實質上來自人重鏈可變區框構和恆定區序列之重鏈可變區框構序列和重鏈恆定區(若存在時)。類似地,人化輕鏈具有至少一個、二個,通常是全部三個完全或實質上來自供體抗體輕鏈之CDR及實質上來自人輕鏈可變區框構和恆定區序列之輕鏈可變區框構序列和輕鏈恆定區(若存在時)。除了奈米抗體及dAb外,人化抗體包含 人化重鏈和人化輕鏈。當在各別CDR之間的對應殘基(如Kabat所定義者)具有至少85%、90%、95%或100%之同一性時,人化抗體中之CDR實質上係來自非人抗體之對應CDR。當Kabat所定義之對應殘基具有至少85%、90%、95%或100%之同一性時,抗體鏈之可變區框構序列或抗體鏈之恆定區實質上係分別來自人可變區框構序列或人恆定區。
雖然人化抗體通常納入所有六個來自小鼠抗體之CDR(較佳為如Kabat所定義者),其亦可使用較全部數量更少(例如至少3、4或5個CDR)之來自小鼠抗體的CDR製造(例如Pascalis et al.,J.Immunol.169:3076,2002;Vajdos et al.,Journal of Molecular Biology,320:415-428,2002;Iwahashi et al.,Mol.Immunol.36:1079-1091,1999;Tamura et al,Journal of Immunology,164:1432-1441,2000)。
於一些抗體中僅需要部分之CDR(即,結合所需之CDR殘基的子集(稱為SDR))來保留人化抗體中之結合。不接觸抗原且不在SDR中之CDR殘基可根據之前的研究(例如CDR H2中之殘基H60至H65通常不需要),藉由分子建模及/或憑經驗,或依Gonzales et al.,Mol.Immunol.41:863,2004中之描述從位在Chothia高度可變環(Chothia,J.Mol.Biol.196:901,1987)外之Kabat CDR區鑑定出。於該等人化抗體中,在其中不存有一或多個供體CDR殘基或其中整個供體CDR被省略的位置處,佔據 該位置之胺基酸可為佔據受體抗體序列中之對應位置(藉由Kabat編號)的胺基酸。CDR中所包含之該等以供體胺基酸取代受體胺基酸的數目反映了平衡競爭考慮。該等取代在減少人化抗體中之小鼠胺基酸數目且因此降低可能之致免疫性上可能是有利的。然而,取代亦可能引起親和力之變化且最好避免親和力顯著降低。亦可憑經驗選擇CDR中用於替代之位置和欲取代之胺基酸。
該人受體抗體的序列可選擇性地選自許多已知之人抗體序列中以在人受體序列可變區框構和供體抗體鏈之對應的可變區框構之間提供高度之序列同一性(例如65至85%之同一性)。
某些來自人可變區框構殘基之胺基酸可基於彼等對CDR構象及/或對抗原之結合的可能影響而被選來用於取代。該等可能影響之調查係藉由建模、檢查在特殊位置處之胺基酸的特性或憑經驗觀察特殊胺基酸之取代或致突變的影響來進行。
例如,當小鼠可變區框構殘基與所選定之人可變區框構殘基之間有一個胺基酸不同時,當該胺基酸被合理地預期下列情況時該人框構胺基酸可被來自小鼠抗體之同等框構胺基酸取代:(1)直接與抗原非共價結合,(2)與CDR區相鄰,(3)或與CDR區交互作用(例如在CDR區之約6Å內)。
其他用於取代之候選胺基酸為對人免疫球蛋白該位置處而言不尋常之受體人框構胺基酸。這些胺基酸可被來自小鼠供體抗體之同等位置的胺基酸或來自較典型之人免疫球蛋白的同等位置的胺基酸所取代。其他用於取代之候選胺基酸為對人免疫球蛋白該位置處而言不尋常之受體人框構胺基酸。
本發明進一步提供特異結合上述MCAM抗原決定部位之嵌合型和經表面修飾型非人抗體。
嵌合抗體為其中該非人抗體(例如小鼠)之輕和重鏈的成熟可變區與人輕和重鏈恆定區合併之抗體。該等抗體實質上或完全保留該小鼠抗體之結合特異性,且為人序列之約三分之二。
經表面修飾之抗體為一種人化抗體類型,其保留一些且通常為全部CDR及一些非人抗體之非人可變區框構殘基,但以來自人抗體序列之對應位置的殘基取代其他可能有助於B-T細胞抗原決定部位之可變區框構殘基,例如暴露之殘基(Padlan,Mol.Immunol.28:489,1991)。其結果為其中該CDR完全或實質上來自非人抗體之抗體且該非人抗體之可變區框構藉由取代變得更類似於人類。
針對MCAM之人抗體可藉由如下述之各種技術提供。一些人抗體係藉由競爭性結合實驗、上述Winter之噬菌體展示方法或以其他方式選出以具有與特定小鼠抗體(諸如實施例中所描述之小鼠單株抗體的其中之一)相同 之抗原決定部位特異性。人抗體亦可藉由僅使用MCAM之片段作為標靶抗原及/或藉由篩選針對MCAM之缺失突變體集合庫之抗體來篩選特定之抗原決定部位特異性。
用於製造人抗體之方法包括Oestberg等人,Hybridoma 2:361-367(1983)之三源雜交瘤方法;Oestberg,美國專利第4,634,664號;及Engleman等人,美國專利第4,634,666號,其使用包含人免疫球蛋白基因之轉基因小鼠,參見,例如Lonberg等人,WO93/12227(1993);US 5,877,397、US 5,874,299、US 5,814,318、US 5,789,650、US 5,770,429、US 5,661,016、US 5,633,425、US 5,625,126、US 5,569,825、US 5,545,806、Nature 148,1547-1553(1994)、Nature Biotechnology 14,826(1996)、Kucherlapati,WO 91/10741(1991))及噬菌體展示方法,參見,例如Dower,等人,WO 91/17271及McCafferty,等人,WO 92/01047、US 5,877,218、US 5,871,907、US 5,858,657、US 5,837,242、US 5,733,743及US 5,565,332。
嵌合型、人化(包括經表面修飾者)及人抗體通常係藉由如上述之重組表現製備。
本發明進一步提供非抗體結合分子。非抗體結合分子包括,例如以脂質運載蛋白(lipocalin)骨架為基礎之抗運載蛋白(anticalin),該脂質運載蛋白骨架為一種蛋白質結構,其特點為可支撐形成配體結合位點之四個高可變環的剛硬β-桶。新穎之結合特異性係藉由環區中針 對性隨機突變加功能展示和經引導之選擇來進行遺傳工程處理(Skerra(2008)FEBS J.275:2677-2683)。其他合適之骨架可包括,例如以人纖連蛋白第III型的第10個胞外結構域為基礎之阿德奈汀(adnectin)或單體(monobody)(Koide and Koide(2007)Methods Mol.Biol.352:95-109);以葡萄球菌蛋白A之Z結構域為基礎的親和體(affibody)(Nygren et al.(2008)FEBS J.275:2668-2676);以錨蛋白(ankyrin)重複蛋白為基礎之DARPin(Stumpp et al.(2008)Drug.Discov.Today 13:695701);以人Fyn蛋白激酶之SH3結構域為基礎的fynomer(Grabulovski et al.(2007)J.Biol.Chem.282:3196-3204);以來自硫化裂片菌(Sulfolobus acidolarius)之Sac7d為基礎的阿非廷(affitin)(Krehenbrink et al.(2008)J.Mol.Biol.383:1058-1068);以人y-B-晶體蛋白(crystallin)為基礎之阿非林(affilin)(Ebersbach et al.(2007)J.Mol.Biol.372:172-185);以膜受體蛋白之A結構域為基礎的avimer(Silverman et al.(2005)Biotechnol.23:1556-1561);富含半胱胺酸之半胱胺酸結(knottin)肽(Kolmar(2008)FEBS J.275:2684-2690);及經遺傳工程處理之Kunitz型抑制劑(Nixon and Wood(2006)Curr.Opin.Drug.Discov.Dev.9:261-268)。綜述參見Gebauer and Skerra(2009)Curr.Opin.Chem.Biol.13:245-255。
於這些抗體之某些抗體中,該抗體並非包含完全或實質上來自下列抗體之CDR(如Kabat、Chothia所 定義者,或彼等之複合物)的這些抗體中之任一種抗體或這些抗體:WO/2012/170071及PCT/US2013/058773中所描述的抗體,尤其是WO/2012/170071中命名為選殖株15(由SEQ ID NO:12-21所定義者)及選殖株17(由SEQ ID NO:1-10所定義者)之抗體及PCT/US2013/058773中所描述之命名為1174.1.3、1414.1.2、1415.1.1和1749.1.3之小鼠抗人MCAM單株選殖株和命名為2120.4.19和2107.4.10之大鼠抗人MCAM單株抗體選殖株。
4. 篩選抗體活性之方法
本文中所描述之MCAM抗體之抑制活性可藉由各種方法分析,包括與結合相同或實質上類似之抗原決定部位的抗體(例如m2120)進行之競爭性結合分析及以MCAM之配體,層黏連蛋白411之層黏連蛋白α 4鏈阻斷MCAM結合。
例如,MCAM抗體抑制MCAM與層黏連蛋白411之層黏連蛋白α 4鏈之間的相互作用之活性可依下述篩選。將表現MCAM之細胞(a)在存有或不存有候選抗體下與包含層黏連蛋白α 4鏈,例如層黏連蛋白411之α 4鏈的重組多肽一起培育;(b)監測層黏連蛋白α 4與細胞的結合水準,例如藉由螢光顯微鏡或流式細胞儀;和(c)若存有候選抗體時該層黏連蛋白α 4之結合量較不存有該候選抗體時之結合量少,則該候選抗體被鑑定為MCAM/層黏連蛋白α 4相互作用之抑制劑。替換之篩選方案涉及使用 表現層黏連蛋白α 4鏈之細胞群,其可在存有及不存有候選抗體下與MCAM一起培育,並監測MCAM與細胞群之結合量。若存有候選抗體時,MCAM與細胞群之結合量少於無候選抗體存在時的結合量,則該候選抗體為MCAM拮抗劑。
其他監測方法包括螢光活化細胞分選(FACS)及酶聯免疫吸附試驗(ELISA)。
該根據其抑制MCAM與其配體(例如層黏連蛋白α 4鏈)結合之能力所鑑定出之MCAM拮抗劑為用於治療特徵為具有表現MCAM之細胞浸潤的發炎病況之候選藥劑。
亦可在體內評估MCAM抗體之抑制活性。用於評估MCAM抗體之抑制活性的方法實例係以實驗性自體免疫性腦脊髓炎(EAE)模型進行。EAE係在實驗室動物中產生以製造類似於人體中多發性硬化症(MS)所具之症狀的疾病。參見,例如Bauer et al.,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA 106:1920-1925(2009)。EAE通常係經由為動物注射來自其他動物之中樞神經系統的不同蛋白質(例如髓鞘鹼性蛋白及整個脊柱或腦組織之萃取物)或注射與髓鞘特異反應之T細胞來產生。EAE常用於追蹤復發或進展形式之MS的進程。EAE一直作為研發用於MS之治療劑和研究MS之具體疾病過程的合適動物模型。參見,例如Gold et al.,Brain 129:1953-1971(2006);亦見Steinman et al.,Ann.Neurol.60:12-21(2006)。
MCAM阻斷疾病進展之效果可在EAE之治療模型(其中TH 17極化係在體內發生)中檢查。以PLP 139-151肽將小鼠免疫化以誘導EAE。在疾病發作後,以候選抗MCAM抗體或同種型對照組經由腹膜內途徑治療小鼠,之後每一天進行治療。每天監測小鼠並以盲眼方式評分,且每2-3天取得體重。在以候選MCAM抗體治療之小鼠中復發延遲及症狀嚴重性顯著降低表示此為成功之候選抗體。
F. 共軛結合抗體
特異結合MCAM之共軛結合抗體可用於瞄準癌症或腫瘤細胞以破壞或瞄準涉及自體免疫性疾病或神經發炎性疾病之細胞。該等抗體亦可用於瞄準至少部分係藉由表現MCAM來介導的任何疾病。例如,該等抗體亦可與其他治療劑、其他蛋白質、其他抗體及/或可檢測之標記共軛結合。參見WO 03/057838;US 8,455,622。該等治療劑可為任何可用於治療、對抗、改良、預防或改善患者體內不欲有之病況或疾病(諸如自體免疫疾病、神經炎症疾病或癌症)的作用劑。治療劑可包括細胞毒性劑、細胞生長抑制劑、放射治療劑、免疫調節劑或任何促進或增強抗體活性之生物活性劑。細胞毒性劑可為任何對細胞有毒的作用劑。細胞生長抑制劑可為任何抑制細胞增殖之作用劑。免疫調節劑可為任何刺激或抑制免疫反應之發展或保持的作用劑。放射治療劑可為任何發射輻射之分子或化合 物。若該等治療劑與MCAM特異性抗體(諸如本文所描述之抗體)偶聯,該偶聯之治療劑將對表現MCAM之細胞(例如免疫細胞,諸如TH17表現細胞或癌細胞,諸如惡性黑色素細胞)具有超越其他細胞之特定親和力。因此,投予直接瞄準表現MCAM之細胞的共軛結合抗體對其他周圍細胞和組織的影響最小。這對於那些在獨立投服時毒性太大之治療劑特別有用。此外,可以使用更小量之治療劑。
抗體可經修飾以作為免疫毒素。參見,例如美國專利案第5,194,594號。例如蓖麻毒素(ricin)(一種源自植物之細胞毒素)可經由使用用於該抗體之雙官能試劑S-乙醯巰基琥珀酸酐及用於蓖麻毒素之琥珀醯亞胺基3-(2-吡啶基二硫基)丙酸酯與抗體偶聯。見Pietersz et al.,Cancer Res.48(16):4469-4476(1998)。偶聯造成蓖麻毒素之B鏈結合活性喪失,然而既不損害蓖麻毒素A鏈之毒性潛力,亦不損害抗體之活性。同樣地,皂草素(saporin)(核糖體組裝之抑制劑)可經由在化學方式插入之氫硫基之間的二硫鍵來偶聯至抗體。見Polito et al.,Leukemia 18:1215-1222(2004)。
放射性同位素亦可連接抗體,諸如,例如釔90(90Y)、銦111(111In)、131I、99mTc、放射銀-111、放射銀-199及鉍213。藉由習知之雙官能螯合物可將放射性同位素與抗體連接。在連接放射銀-111和放射銀-199方面,可使用以硫為底之交聯劑。見Hazra et al.,Cell Biophys.24-25:1-7(1994)。銀放射性同位素之連接可能涉 及以抗壞血酸還原該免疫球蛋白。在放射性同位素(諸如111In和90Y)方面,可使用替伊莫單抗(ibritumomab tiuxetan)且此抗體將與該等同位素反應以分別形成111In-替伊莫單抗及90Y-替伊莫單抗。參見Witzig,Cancer Chemother.Pharmacol.,48 Suppl 1:S91-S95(2001)。
其他治療劑亦可連接至抗體。治療劑通常為細胞毒性的或抑制細胞生長的。例如,抗體可與有毒化學治療藥物共軛結合,諸如美登素(maytansine)、格爾德黴素(geldanamycin),微管蛋白(tubulin)抑制劑,諸如奧里斯他汀(auristatin)或小溝(minor groove)結合劑,諸如加利車黴素(calicheamicin)。其他代表性治療劑包括已知可用於治療、控制或改善自體免疫疾病、神經炎性疾病或癌症,或自體免疫疾病、神經炎症疾病或癌症之症狀的試劑。該等治療劑之實例揭示於本文他處。
抗體亦可與其他蛋白質偶聯。例如,抗體可與Fynomer偶聯。Fynomer為源自人Fyn SH3結構域之小結合蛋白(例如7kDa)。其可為穩定且可溶的,且其可缺少半胱胺酸殘基及二硫鍵。Fynomer可經遺傳工程改造以能與抗體相同之親和力和特異性結合標靶分子。其適合用於創建以抗體為基礎之多特異性融合蛋白。例如,Fynomer可融合至抗體之N端及/或C端以創建具有不同架構之雙特異性和三特異性FynomAb。Fynomer之選擇可使用FACS、Biacore透過篩選技術及以細胞為基礎之可允許有效選擇具有最佳性能之Fynomer的分析法從Fynomer 庫選出。Fynomer之實例揭示於Grabulovski et al.,J.Biol.Chem.282:3196-3204(2007);Bertschinger et al.,Protein Eng.Des.Sel.20:57-68(2007);Schlatter et al.,MAbs.4:497-508(2011);Banner et al.,Acta.Crystallogr.D.Biol.Crystallogr.69(Pt6):1124-1137(2013);及Brack et al.,Mol.Cancer Ther.13:2030-2039(2014)中。
本文所揭示之抗體亦可偶聯或與一或多種其他抗體共軛結合(例如,以形成抗體雜共軛結合物)。該等其他抗體可與MCAM內之不同的抗原決定部位結合或可結合不同的標靶抗原。
抗體亦可與可檢測標記偶聯。該等抗體可用於,例如診斷自體免疫性疾病、神經炎性疾病或癌症、用於監測自體免疫性疾病、神經炎性疾病或癌症之進展及/或用於評估治療效力。該等抗體可用於在具有或容易罹患自體免疫疾病、神經炎性疾病或癌症之個體中,或在從該等個體取得之適當的生物樣本中執行該等測定。可偶聯或連接抗體之代表性的可檢測標記包括各種酶,諸如辣根過氧化物酶、鹼性磷酸酶、β-半乳糖苷酶或乙醯膽鹼酯酶;輔基,諸如鏈黴素/生物素和抗生物素蛋白/生物素;螢光物質,諸如繖形酮(umbelliferone)、螢光素(fluorescein)、異硫氰酸螢光素(fluorescein isothiocyanate)、若丹明(rhodamine)、二氯三嗪胺螢光素(dichlorotriazinylamine fluorescein)、丹磺醯氯(dansyl chloride)或藻紅蛋白(phycoerythrin);發光物質,諸如發 光胺(luminol);生物發光物質,諸如螢光素酶、螢光素和水母發光蛋白;放射活性物質,諸如放射銀-111、放射銀-199、鉍213、碘(131I、125I、123I、121I)、碳(14C)、硫(5S)、氚(3H)、銦(115In、113In、112In、111In)、鍀(99Tc)、鉈(201Ti)、鎵(68Ga、67Ga)、鈀(103Pd)、鉬(99Mo)、氙(133Xe)、氟(18F)、153Sm、177Lu、159Gd、149Pm、140La、175Yb、166Ho、90Y、47Sc、186Re、188Re,142Pr、105Rh、97Ru、68Ge、57Co、65Zn、85Sr、32P、153Gd、169Yb、51Cr、54Mn、75Se、113Sn和117Tin;使用各種正電子發射X線斷層照相術之正電子發射金屬;非放射活性順磁性金屬離子;及經放射標記或與特定放射性同位素共軛結合之分子。
治療劑、其他蛋白質、其他抗體及/或可檢測標記可使用本技藝中已知之技術,直接或間接透過中間體(例如連接子)偶聯或與鼠、嵌合型、經表面修飾型或人化抗體共軛結合。參見,例如Arnon et al.,"Monoclonal Antibodies For Immunotargeting Of Drugs In Cancer Therapy"在Monoclonal Antibodies And Cancer Therapy,Reisfeld et al.(eds.),pp.243-56(Alan R.Liss,Inc.1985)中;Hellstrom et al.,"Antibodies For Drug Delivery"在Controlled Drug Delivery(2nd Ed.),Robinson et al.(eds.),pp.623-53(Marcel Dekker,Inc.1987)中;Thorpe,"Antibody Carriers Of Cytotoxic Agents In Cancer Therapy:A Review"在Monoclonal Antibodies 84: Biological And Clinical Applications,Pinchera et al.(eds.),pp.475-506(1985)中;"Analysis,Results,And Future Prospective Of The Therapeutic Use Of Radiolabeled Antibody In Cancer Therapy"在Monoclonal Antibodies For Cancer Detection And Therapy,Baldwin et al.(eds.),pp.303-16(Academic Press 1985)中;及Thorpe et al.,Immunol.Rev.,62:119-58(1982)。合適之連接子包括,例如可裂解及不可裂解之連接子。可使用在酸性或還原條件下或在暴露於特定蛋白酶時釋出藥物的不同連接子。同樣地,可使用在酸性或還原條件下、在暴露於特定蛋白酶時或在其他定義之條件下釋出偶聯之治療劑、蛋白質、抗體及/或可檢測之標記的不同連接子。
IV. 治療方法
本文所揭示之抗體或其他拮抗劑可用於具有(例如符合本技藝所公認之標準,諸如DSM-IV-TR或DSM-V之標準)或相對於自體免疫性疾病、神經炎性疾病和癌症之一般族群而言處於升高之風險下的個體的治療或有效預防中。升高之風險可從存有一或多個與疾病相關之遺傳或生化標記或一或多種與該疾病一致,但不足以允許明確診斷的症狀評估。上述類別或疾病並不一定彼此相互排斥;例如,多發性硬化症可被歸類為神經炎症或自體免疫。可藉由本方法治療之一些具體的示例性疾病包括多發性硬化症、帕金森氏病、過敏性接觸性皮膚炎、牛皮癬、 牛皮癬關節炎,類風濕關節炎、結節病、炎性腸病、克隆氏病和癌症,尤其是實體腫瘤,諸如黑色素瘤。雖然該方法之實施不依賴於理解機制,咸信,於一些方法中,抗體或其他拮抗劑至少是部分藉由抑制表現在T細胞(例如TH 17細胞)上之MCAM和層黏連蛋白α 4鏈(例如表現在內皮細胞之表面上的層黏連蛋白411之α 4鏈)之交互作用來運作。抗體-藥物共軛物可具有額外之作用機制,包括該經連接之作用劑的細胞毒性或抑制細胞生長效果,通常係在標靶細胞內攝取之後。抗體-藥物共軛物亦可誘導與腫瘤相關之巨噬細胞毒性。
神經炎性病況之特徵為CNS炎症及/或細胞/組織損傷。該指標可包括增加之神經膠質活化、增加之促炎細胞因子/趨化因子水準(例如TNF α、INF γ、IL-1 β)、增加之血-腦屏障滲透性及/或增加之免疫細胞(例如白細胞)募集/入侵CNS。該神經炎症常與免疫系統細胞長期活化相關(即,自體免疫相關之神經炎症),但可能輪替或另外具有急性發作。
多發性硬化症之至少四種亞型中的任一種為容易治療的疾病。復發-緩解型MS(RR-MS)為MS最常見的形式,其特徵為在明確定義之病情加重/復發(急性發作)之後部分或完全恢復。復發期之間無疾病進展。最初(在診斷時),RR-MS代表約85%之新診斷的個體。復發之確定需要新症狀或徵兆出現至少24小時以不與發燒或併發疾病(諸如“流感”或尿路感染)關聯,因為升高之體溫可 將無徵狀疾病或舊病灶揭露出。
原發進行性(PP-MS)係從開始延續而來,沒有明確的復發。可以有高原(穩定期)。所有MS個體中有10至15%屬於此組,且傾向發生在老年個體。此組中之女性與男性比例相等,不像其他形式,其中女性主要佔約2:1。PP-MS亦傾向表現較少之腦MRI變化及較多之脊髓病理性/脊髓相關變化。
第二種進行性形式(SP-MS)係以RR-MS開始,稍後之穩定發展可能有或無復發。約50%之復發-緩解型個體進展成續發性進展型。
發生在約5%個體中之進行性復發形式(PR-MS)為從發病開始具有重疊復發(有或沒有恢復)之進行性形式。
MS之診斷通常係基於病史、神經學檢查和各種測試,包括核磁共振成像(MRI)、誘發電位檢查(EP)和脊髓液分析。MS的確定診斷需要中樞神經系統(CNS)中至少二個分開之區域(其包括腦、脊髓和視神經)中受損的證據及該損害之發生相距至少一個月的證據且排除所有其他可能的診斷。除了治療性處理藉由本技藝公認之標準被診斷患有MS之個體外,本方法亦可預防性地用於治療具有至少一種MS之徵兆或症狀的個體,與一般健康人群相比較,該至少一種MS之徵兆或症狀使個人處於增加之進展成MS的風險中。例如,該方法可用於治療曾有一次MS樣症狀一稱為臨床單一症候群(CIS)之攻擊(亦稱為復發或 惡化)的個體,該個體可能或可能不繼續發展出MS。除了其他方法外,處於發展出MS之風險中的個體亦可藉由其血清中是否存有針對蛋白KIR4.1之抗體被鑑別出。
神經炎性疾病亦包括帕金森氏病。帕金森氏病之症狀包括震顫(例如手、胳膊、腿、下巴和臉部顫抖);四肢及軀幹強直或僵硬;運動徐緩(bradykinesia)或運動遲緩;姿勢不穩或平衡和協調受損;抑鬱及其他情緒變化;吞嚥、咀嚼和說話困難;泌尿問題或便秘;皮膚問題;睡眠中斷。帕金森氏病可從這類症狀及/或大腦掃描及/或其他試驗診斷出以排除其他疾病。
本發明方法可用於抑制癌症生長或轉移。癌症可為造血系統惡性腫瘤或實體腫瘤,即,由細胞過度生長或增殖導致之細胞團塊,無論是良性或惡性的,包括癌前期病變。癌症可為良性、惡性或轉移的。轉移性癌症係指已從其最先開始處擴散至體內另一處的癌症。由轉移性癌症細胞形成的腫瘤稱為轉移性腫瘤或轉移,此術語亦用於指稱癌細胞擴散至身體其他部分之過程。一般而言,轉移癌與原始癌症或原發癌具有相同名稱及相同類型之癌細胞。癌症之實例包括實體腫瘤,諸如黑色素瘤、癌、母細胞瘤及肉瘤。癌症亦包括血液惡性腫瘤、諸如白血病或淋巴樣惡性腫瘤,諸如淋巴瘤。該等癌症之更特別的實例包括鱗狀細胞癌、肺癌、腹膜癌、肝細胞癌、胃部或胃癌,包括胃腸道癌、胰臟癌、神經膠質瘤、神經膠質母細胞瘤、子宮頸癌、卵巢癌、肝癌(liver cancer)、膀胱癌、肝 細胞瘤、乳癌、結腸癌、直腸癌、結腸直腸癌、子宮內膜癌或子宮癌、唾液腺癌、腎癌或腎臟癌、前列腺癌、外陰癌、甲狀腺癌、肝癌(hepatic carcinoma)、肛門癌、陰莖癌及頭頸癌。
自體免疫疾病包括全身性自體免疫疾病、器官或組織特異性自體免疫疾病及展現自體免疫型表現之疾病。在這些疾病中,身體發展出對抗一種自身抗原之細胞性及/或體液免疫反應,導致該抗原受破壞及可能之局部失穩破壞及/或致命後果。若存在時,細胞性反應可為B細胞或T細胞或此兩者。據報導,TH 17細胞(其特徵為製造介白素(IL)-17和IL-22之T輔助細胞譜系)進入組織以促進致病性自體免疫反應,包括人類之多發性硬化和小鼠之實驗性自體免疫性腦脊髓炎(EAE)。參見,例如Cua et al.,Nature 421:744-748(2003);Ivonov et al.,Cell 126:1121-1133(2006)。TH 17細胞可藉由其特定招募至組織和浸潤組織來起始或擴散炎症反應。
自體免疫性疾病之實例包括格雷夫斯病(Graves’disease)、橋本氏甲狀腺炎(Hashimoto’s thyroiditis)、自體免疫性多腺體症候群、胰島素依賴型糖尿病(第1型糖尿病)、胰島素抵抗型糖尿病(第2型糖尿病)、免疫介導之不孕症、自體免疫性愛迪生氏病(autoimmune Addison’s disease)、天皰瘡(pemphigus vulgaris)、尋常天皰瘡(pemphigus foliaceus)、皰疹樣皮炎(dermatitis herpetiformis)、自體免疫性脫髮(autoimmune alopecia)、白斑病(vitiligo)、自體免疫性溶血性貧血(autoimmune hemolytic anemia)、特發性血小板減少性紫瘢(idiopathic thrombocytopenic purpura)、自體免疫性血小板減少性紫瘢(autoimmune thrombocytopenic purpura)、惡性貧血(pernicious anemia)、重症肌無力(myasthenia gravis)、吉蘭巴雷症候群(Guillain-Barre syndrome)、僵人症候群(stiff man syndrome)、急性風濕熱(acute rheumatic fever)、交感性眼炎(sympathetic ophthalmia)、古德帕斯徹氏症候群(Goodpasture’s syndrome)、自體免疫性葡萄膜炎(autoimmune uveitis)、顳動脈炎(temporal artertis)、白塞氏病(Bechet’s disease)、炎性腸病、克隆氏病、潰瘍性結腸炎(ulcerative colitis)、原發性膽汁性肝硬化(primary bilary cirrhosis)、自體免疫性肝炎(autoimmune hepatitis)、自體免疫性卵巢炎(autoimmune oophoritis)、纖維肌痛(fibromyalgia)、多肌炎(polymyositis)、皮肌炎(dermatomyostis)、強直性脊柱炎(ankylosing spondylitis)、高安氏動脈炎(Takayashu arteritis)、脂膜炎(panniculitis)、類天皰瘡(pemphigoid)、不明來源之血管炎、抗嗜中性球細胞質抗體(anca)陰性血管炎、anca陽性血管炎、系統性紅斑狼瘡(systemic lupus erythematosus)、牛皮癬性關節炎(psoriatic arthritis)、類風濕關節炎(rheumatoid arthritis)、硬皮病(scleroderma)、系統性壞死性血管炎(systemic necrotizing vasculitis)、韋格納肉芽腫病(Wegener’s granulomatosis)、CREST症候群、抗磷脂症 候群、修格連氏症候群(Sjogren’s syndrome)、嗜酸細胞性胃腸炎(eosinophilic gastroenteritis)、非典型局部皮炎(atypical topical dermatitis)、心肌病(cardiomyopathy)、感染後症候群、感染後心內膜心肌炎(postinfectious endomyocarditis)、腹腔疾病(celiac disease)、多發性硬化(multiple sclerosis)、結節病(sarcoidosis)、克隆氏病和牛皮癬。
抗體或其他拮抗劑係在有效之攝生法中投予,意指延遲接受治療之疾病(例如癌症)發作、降低嚴重程度、抑制進一步惡化及/或改善至少一種徵兆或症狀的劑量、投予途徑及投予頻率。若患者已罹患病症,該攝生法可稱為治療有效之攝生法。若患者處於相對於一般群體而言升高之發病風險,但尚未經歷症狀時,該攝生法可稱為預防有效之攝生法。於一些情況中,在個別患者中可觀察到相對於相同患者之病史對照或過往經驗之治療效力或預防效力。於其他情況中,治療性或預防性效力可在經治療之患者群體的臨床前或臨床試驗中相對於對照之未經治療的患者群而獲得證實。
抗體之示例性劑量為0.1至20,或0.5至5mg/kg體重(例如0.5、1、2、3、4或5mg/kg)或為固定劑量之10至1500mg。在眾多因素中,該劑量取決於患者之病況及對先前治療之反應(若有的話),無論該治療是預防性或治療性且無論該病症是急性或慢性。
投予可經由腸胃道外、靜脈內、口服、皮 下、動脈內、顱內、鞘內、腹膜內、局部、鼻內或肌肉內途徑。在一些抗體方面及一些情況下,藉由靜脈內或皮下途徑投予入系統性循環為較佳者。靜脈內投予可,例如在30至90分鐘之期間藉由輸注投予。
在眾多因素中,投予頻率取決於抗體在循環中之半衰期、患者狀況及給藥途徑。投予頻率可為每天、每週、每月、每季或不定期地回應患者之病況變化或接受治療之疾病的進展。用於靜脈內投予之示例性頻率為在治療之連續過程中以每週至每季之頻率投藥,儘管亦可能更頻繁或更不頻繁的投予。在皮下投予方面,示例性投予頻率為每天至每月,儘管亦可能更頻繁或更不頻繁的投予。
投予之劑量數目取決於該病症為急性或慢性及欲治療之病症的反應。在急性病症或慢性病症之急性惡化方面,1至10個劑量通常是足夠的。有時單一大丸藥劑量(可選擇地為分割形式)對急性病症或慢性病症之急性惡化是足夠的。急性病症或急性惡化復發時可重複治療。在慢性病症方面,可在規律之時間間隔下投予抗體,例如每週、隔週、每月、每季、每6個月投予至少1、5年或10年或患者終生。
以本文所揭示之抗體或其他拮抗劑進行之治療可與其他有效對抗正接受治療之病症的治療組合。組合治療可配製成用於分別投予。其他用於治療多發性硬化症之治療劑包括一或多種下列治療劑:特立氟胺(teriflunomide)、干擾素β-1a、干擾素β-1b、醋酸格拉默 (glatiramer acetate)、芬戈莫德(fingolimod)和米托蒽醌(mitoxantrone)或皮質類固醇,諸如潑尼松(prednisone)、甲潑尼龍(methylprednisolone)或地塞米松(dexamethasone)。
用於癌症之另外的治療劑包括烷基化劑,諸如卡莫司汀(carmustine)、苯丁酸氮芥(chlorambucil)、順鉑(cisplatin)、卡鉑(carboplatin)、奧沙利鉑(oxaliplatin)、丙卡巴肼(procarbazine)和環磷醯胺(cyclophosphamide);抗代謝物,諸如氟尿嘧啶(fluorouracil)、氟尿苷(floxuridine)、氟達拉濱(fludarabine)、吉西他濱(gemcitabine)、甲胺蝶呤(methotrexate)和羥基脲;天然產物,包括植物生物鹼和抗生素,諸如博來黴素(bleomycin)、多柔比星(doxorubicin)、柔紅黴素(daunorubicin)、伊達比星(idarubicin)、依托泊苷(etoposide)、絲裂黴素(mitomycin)、米托蒽醌(mitoxantrone)、長春鹼(vinblastine)、長春新鹼(vincristine)和紫杉醇(Taxol)(太平洋紫杉醇(paclitaxel))或相關化合物,諸如泰索帝®(Taxotere®);拓撲異構酶(topoisomerase)1抑制劑伊立替康(irinotecan);替莫唑胺(temozolomide)和格立得®(Gliadel®)、卡莫司汀(carmustine);和酪胺酸激酶抑制劑,諸如格列衛舒尼®(Gleevec®)、舒癌特®(Sutent®)(蘋果酸舒尼替尼(sunitinib malate))、多吉美®(Nexavar®)(索拉非尼(sorafenib))和特羅凱®(Tarceva®)(厄洛替尼(erlotinib))或 易瑞沙®(Iressa®)(吉非替尼(gefitinib));血管生成抑制劑;和單株抗體,包括針對HER2抗原之赫賽汀®(Herceptin®);針對VEGF之阿瓦斯丁®(Avastin®);或針對表皮生長因子(EGF)受體之抗體,諸如愛必妥®(Erbitux®)(西妥昔單抗(cetuximab))及維克替比®(Vectibix®)(帕尼單抗(panitumumab))。
用於治療帕金森氏症之另外的試劑包括左旋多巴(levodopa)、苯思萊德(benzaseride)、卡比多巴(carbidopa)、多巴胺激動劑(dopamine agonists)、非麥角多巴胺激動劑(non-ergot dopamine agonists)、兒茶酚-O-甲基(catechol-O-methyl)(“COMT”)抑制劑,諸如,例如恩他卡朋(entacopone)或托卡朋(tolcopone)、單胺氧化酶(“MAO”)抑制劑,諸如,例如雷沙吉蘭(rasagaline)、金剛烷胺(amantadine)或抗膽鹼能劑(anticholinergic agent)。
V. 調製劑
較佳地,用於經胃腸外投可之醫藥組成物為無菌的且實質上為等張並在GMP條件下製造。醫藥組成物可以單位劑量形式提供(即,用於單次投予之劑量)。醫藥組成物可使用一或多種生理上及醫藥上可接受之載體、稀釋劑、賦形劑或估劑配製。該調製劑取決於所選擇之投予途徑。用於注射方面,抗體可在水溶液中配製,較佳地,在生理相容之緩衝劑,諸如Hank氏液、林格氏液或生理鹽水或醋酸鹽緩衝劑中配製(以減少注射部位之不 適)。該溶液可含有調製劑,諸如懸浮劑、穩定劑及/或分散劑。或者,抗體可為用於在使用前以合適之載劑,例如無菌無熱原水構成之凍乾形式。
本發明提供之調製劑包含本文所描述之抗體或其他拮抗劑、緩衝液、一或多種糖及/或多元醇和表面活性劑,且pH值係介於約5.5至約7。該調製劑可製備成用於以液體形式或凍乾形式儲存。當以凍乾形式儲存時,該調製劑可以液體(例如無菌水)重構成本文所描述之濃度和性質。當凍乾之組成物被說成是可經由加入水進行重構成以產生具體指定之組分濃度及pH的調製劑時,其意指該凍乾之調製劑可單純地經由加水(即,不供給額外量之組分,或添加酸或鹼以改變pH值)來進行重構成。若該凍乾調製劑係被重構成與該調製劑預凍乾製品相同之體積,該預凍乾之液體調製劑的濃度和性質亦可根據下文中之描述。若體積不同,則調製劑之濃度應按比例地調整。例如,若該重構成之體積為預凍乾體積之一半,則在預凍乾調製劑中之組分的濃度應為重構成調製劑中的一半濃度。
可選擇地,依下述將該抗體再懸浮於調製劑中,暫時冷凍以用於儲存預凍乾法、凍乾、以水重構成為與預凍乾時相同之濃度。較佳地,該等調製劑應在整個冷凍、凍乾、儲存和重構成過程中穩定抗體且為適合用於腸胃道外投予的。於一示例性工作流程中,將該純化之抗體以約40mg/mL重新懸浮在調製劑中並在-40℃下冷凍保存 於袋子中。將袋子在室溫下解凍3小時並將內容物匯集。將調製劑通過0.2微米無菌過濾器進行無菌過濾。在小瓶中填滿5.4mL之調製劑並凍乾之。將凍乾之小瓶貯存於2-8℃下。經由加入無菌水來將凍乾之小瓶進行重構成(例如根據該調製劑加入約5.0至5.4mL之無菌水)。然後,將5mL經重構成之產物加入含有20至100mL用於靜脈輸注入患者之生理鹽水、乳酸林格氏液或5%右旋糖溶液或類似物之IV袋的接口中。
一些調製劑包括填充劑,其可或可不與糖/多元醇組分相同。通常,該調製劑為無菌的,例如經由使用0.2μm或0.22μm過濾器進行無菌過濾來實現。該調製劑在冷凍和解凍時通常是穩定的,具有低水準至檢測不到之碎裂及/或聚集(如下文中之進一步定義)。還有其他調製劑在該凍乾餅被重構成後可在約40℃下至少維持穩定三個月。於一些調製劑中,少於約5%之抗體係以聚集體之形式存在於調製劑中。
於一些調製劑中,該抗體之存在濃度係介於約5mg/mL至約100mg/mL。於一些調製劑中,該抗體之存在濃度係介於約5mg/mL至約50mg/mL。於一些調製劑中,該抗體之存在濃度係介於約25mg/mL至約50mg/mL。例如,該抗體之存在濃度可為約35至45mg/mL或約40mg/mL。該抗體可以約50mg/小瓶至約500mg/小瓶,或更高之含量存在於無菌液態劑型中。該抗體可以約40mg/小瓶至約500mg/小瓶之含量存在於凍乾劑型中。例 如,該抗體可以約250mg至350mg/小瓶或約200mg/小瓶之含量存在於無菌液態或凍乾劑型中。
該調製劑可包含本文所描述之任何抗體。於一些調製劑中,該經配製之抗體為包含下列者之抗體:(i)包含SEQ ID NO:161之3個Kabat CDR的成熟重鏈可變區,唯其中位置32(Kabat編號)可為N、S或Q,且位置33(Kabat編號)可為G或A,其中該成熟重鏈可變區與SEQ ID NO:161具有至少90%之同一性,及(ii)包含SEQ ID NO:123之3個Kabat CDR的成熟輕鏈可變區,其與SEQ ID NO:123具有至少90%之同一性。在該等調製劑中,成熟重鏈可變區之位置1(Kabat編號)可被E佔據。於一些調製劑中,該成熟重鏈可變區具有SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:160或SEQ ID NO:161之胺基酸序列,且該成熟輕鏈可變區具有SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:122或SEQ ID NO:123之胺基酸序列。例如,於一些調製劑中,該成熟重鏈可變區具有SEQ ID NO:161之胺基酸序列而該成熟輕鏈可變區具有SEQ ID NO:123之胺基酸序列。
於其他調製劑中,該配製之抗體為本文中所描述之經分離之抗MCAM抗體。於該等調製劑中,該經分離之抗MCAM抗體與人MCAM(SEQ ID NO:11)之包括胺基酸殘基141之抗原決定部位結合。
在所揭示之調製劑中使用緩衝液以取得適合該抗體之pH值,諸如,例如組胺酸、琥珀酸鹽及檸檬酸緩 衝液。一些調製劑之pH值係介於約5.5至約7,例如pH值為5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9或7.0。一些調製劑之pH值係介於約5.5至約6.5。一些調製劑之pH值為約6.0,而其他調製劑的pH值為約6.5。於一些調製劑中,組胺酸緩衝液之存在濃度係介於約10mM至約30mM,例如濃度為約15至25mM或約20mM。
用於調製劑之合適的糖及/或多元醇包括海藻糖和蔗糖,或彼等之組合。糖/多元醇係作為填充劑、凍乾保護劑及/或張力調節劑。例如,某些調製劑包含存在濃度介於約200mM至約260mM之海藻糖,或存在濃度介於約200mM至約260mM之蔗糖。某些調製劑包含存在濃度為約220mM之海藻糖。其他調製劑包含存在濃度為約220mM之蔗糖。某些該等調製劑之特徵為滲透壓介於約250-400、300-400或300-350mOsm/kg,例如287或29mOsm/kg。
調製劑可含有表面活性劑以減少抗體聚集及吸附至表面。合適之表面活性劑包括濃度介於約0.005重量%至約0.05重量%之聚山梨醇酯20。聚山梨酯20防止抗體之調製劑中可能發生之聚集或濁度明顯增加。該聚山梨醇酯20之存在濃度可介於約0.01%至約0.05%。例如,該濃度可為0.005%、0.01%、0.015%、0.02%、0.025%、0.03%、0.035%、0.04%、0.045%或0.05%。或者,於一些調製劑中,聚山梨醇酯20之存在濃度可介於約0.05g/L、 0.1g/L、0.15g/L、0.2g/L、0.25g/L、0.3g/L、0.35g/L、0.4g/L、0.45g/L或0.5g/L。一些調製劑包含濃度為0.2g/L之聚山梨醇酯20。
一種示例性調製劑(液態、預凍乾或凍乾後重構成)之特徵為pH值介於約5.5至約7,且包括:(a)本文所描述之抗體,其濃度介於約10mg/mL至約50mg/mL;(b)組胺酸緩衝液,其存在濃度介於約10mM至約30mM;(c)一或多種選自下列群組之糖和多元醇(“糖/多元醇”):存在濃度介於約200mM至約260mM之海藻糖,及存在濃度介於約200mM至約260mM之蔗糖;及(d)存在濃度介於約0.005重量%至約0.05重量%之聚山梨醇酯20。於一實例中,該調製劑可包括:(a)本文所描述之任何抗體;(b)濃度為約20mM之組胺酸緩衝液;(c)濃度為約220mM之蔗糖;(d)濃度為約0.02%之聚山梨醇酯20;及約6.0之pH值。於另一實例中,該調製劑可包括:(a)本文所描述之任何抗體;(b)濃度為約20mM之組胺酸緩衝液;(c)濃度為約220mM之海藻糖;(d)濃度為約0.02%之聚山梨醇酯20;及約6.5之pH值。
一些凍乾調製劑包含:(a)本文所描述之抗體;(b)組胺酸緩衝液;(c)海藻糖或蔗糖;及(d)聚山梨醇酯20。該凍乾調製劑可包括約200mg之抗體。一些凍乾調製劑能夠以無菌水重構成。一些凍乾調製劑包含100至300或150至250mg之抗體、10至20或14至16mg之組胺酸、300至450或350至400mg之蔗糖及0.5至1.5mg 或0.75至1.25mg之聚山梨醇酯20。其他凍乾調製劑包含100至300或150至250mg之抗體、10至20或14至16mg之組胺酸、360至500或400至450mg之海藻糖脫水合物,及0.5至1.5mg或0.75至1.25mg之聚山梨醇酯20。
一種示例性凍乾調製劑包含200mg之抗體、15.5mg之組胺酸、376mg之蔗糖和1mg之聚山梨醇酯20。另一示例性凍乾調製劑包含200mg之抗體、15.5mg之組胺酸、416mg之海藻糖二水合物及1mg之聚山梨酯20。一些這類調製劑可被重構至體積約5mL。其他凍乾調製劑包含與本段中所揭示之任一者比例相同,但量不同之相同組分(例如400mg之抗體、31mg之組胺酸、752mg之蔗糖及2mg之聚山梨醇酯20)。
凍乾調製劑可被重構至具有(a)濃度約30至50或35至45mg/mL,例如約40mg/mL之抗體;(b)存在濃度約10至30或15至25mM,例如約20mM之組胺酸緩衝液;(c)存在濃度約160至330或200至260mM,例如約220mM之蔗糖或海藻糖;(d)存在濃度約0.1至0.3或0.15至0.25g/L,例如約0.2g/L之聚山梨醇酯20;和(e)pH為約5.5至6.5,例如約6.0(若存有蔗糖)或6.5(若存有海藻糖)。
較佳地,液態或重構成之凍乾調製劑實質上為等張的,意味滲透壓為約250至350mOsm/kg水。一些調製劑之滲透壓為270至300mOsm/kg。一些調製劑之滲 透壓為約287或約295mOsm/kg。液態或重構成之凍乾調製劑亦可為高張性>350mOsm/kg水或低張性(<250mOsm/kg水)。
除了本文中所描述之作為組分者外,所描述之任何調製劑可不使用醫藥賦形劑、載體或類似物來製造。該等調製劑可被描述為由所列舉之組分所組成,或者若存有不影響該調製劑之性質的微不足道之量的其他組分時。實質上由所列舉之組分所組成。較佳地,調製劑係在由FDA核准或可被FDA核准之用於製備用於投予人之藥物的良好生產規範(GMP)下製造。
本發明包含在38℃至42℃下可穩定(例如藉由高性能尺寸排阻色層分析(HPSEC)評估)至少約30天、至少約3個月或更久之抗體調製劑。該等調製劑亦可以在20℃至24℃下穩定至少約1年,及/或在2℃至4℃下穩定至少約3年。評估凍乾調製劑之穩定性以在冷凍乾燥狀態儲存。若將該調製劑在一或多種這些具體指定之時間和溫度之組合下培育後其符合下列低至不可檢測之破碎及/或低至不可檢測之聚集的定義時,則該調製劑被認為是穩定的。更具體地,所揭示之調製劑表現出低至不可檢測之抗體聚集及/或破碎水準,或其聚集及/或破碎水準較初始水準的增加程度為低至不可檢測(例如少於約5%之聚集)。具有低至不可檢測之破碎水準的調製劑含有至少約65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、98%或99%之總蛋白,例如藉由疏水性交互作用色層分析法測定時為單峰, 或當藉由簡化的毛細管凝膠電泳法(rCGE)測定時為二個波峰(各對應於抗體重鏈和抗體輕鏈),其代表非降解抗體,且不含有其他各自具有超過5%、超過4%、超過3%、超過2%、超過1%或超過0.5%之總蛋白的單峰。當藉由高效尺寸排阻色層分析法(HPSEC)測量時,具有低至不可檢測之聚集水準的調製劑含有不超過約15重量%、不超過約10重量%、不多超過約5重量%、不超過約4重量%、不超過約3重量%、不超過約2重量%、不超過約1重量%或不超過約0.5重量%之蛋白質聚集。例如,於一些調製劑中,少於約5%之抗體係以聚集體之形式存在。穩定調製劑亦顯示出生物學活性之損失很少或沒有損失,例如藉由ELISA及/或另外之功能分析測量時,其結合親和力為初始可測量值之至少約50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、98%或99%。
VI. 套組
本發明進一步提供包含MCAM抗體或本文所揭示之其他拮抗劑和相關材料,諸如使用說明書(例如仿單)的套組(例如容器)。該使用說明可含有,例如用於投予MCAM拮抗劑及選擇性地,一或多種另外之試劑的指示。MCAM拮抗劑之容器可為單位劑量、散裝包裝(例如多劑量包裝)或次單位劑量。
仿單係指通常包括在治療產品之商業包裝中,含有關於適應症、用途、劑量、給藥、關於使用該等 治療產品之禁忌症及/或警告的說明書。
套組亦可包括第二容器,其包含醫藥上可接受之緩衝液,諸如注射用抑菌水(BWFI)、磷酸鹽緩衝之生理鹽水、林格氏液和右旋糖溶液。其亦可包括其他從商業和用戶立場來看需要的材料,包括其他緩衝液、稀釋劑、過濾器、針頭和注射器。
上文或下文中所列舉之所有專利歸檔、網站、其他出版物、登錄編號等之全部內容以引用方式被納入本文以用於所有目的,其程度如同各單獨項目被具體且個別地指明以引用方式納入本文。若序列之不同版本與不同時間之登錄編號有關,該與本申請案之有效歸檔日期的登錄編號相關之版本是有意義的。有效歸檔日期係指早於實際歸檔日期或者,若適用時,優先權申請之歸檔日期稱為登錄編號。同樣地,除非另外指明,如果不同版本之出版物、網站或類似物係在不同時間發佈,該申請案之有效歸檔日期最新出版的版本是有意義的。除非具體指明,本發明之任何特性、步驟、要素、實施態樣或態樣可與任何其他特性、步驟、要素、實施態樣或態樣組合使用。雖然本發明已藉由說明和舉例較詳細地描述以用於澄清和理解,顯然地,某些變化和修改可在所附之申請專利的範圍內實施。
材料和方法 抗體生成/表徵
為了生成能夠與老鼠MCAM結合之抗體,MCAM-Fc係經由將老鼠MCAM之胞外結構域融合至人IgG並使用標準技術在CHO細胞中製造來生成。以100μg在CFA中之MCAM-Fc蛋白(1:1體積)將Lou/M大鼠免疫化。以在不完全弗氏佐劑(Freund’s adjuvant)(IFA)中之MCAM-Fc蛋白(1:1體積)在2週之時間間隔為大鼠加強免疫兩次。使用標準實驗計畫從免疫化之大鼠中生成雜交瘤並藉由Clonepix選擇選殖株。以全長之老鼠MCAM基因轉染CHO細胞並使用新黴素和標準技術選擇穩定表現者。使用標準技術,以羧基螢光素琥珀醯亞胺酯(CFSE)將母CHO細胞(MCAM陰性)進行螢光標記,並與未經標記之經MCAM轉染的CHO細胞以1:1之比例混合。將雜交瘤上清液與此細胞混合物一起培育30分鐘,以經螢光標記之抗大鼠二級抗體(Jackson Immuno)藉由流式細胞術檢測可能之MCAM特異性抗體的結合。
將來自經篩選之MCAM特異性抗體陽性的雜交瘤之上清液與經螢光標記之老鼠MCAM-Fc蛋白(5μg/mL)預培育30分鐘,再加入表現層黏連蛋白α 4之細胞株WM2664中並藉由流式細胞術測定對MCAM-Fc蛋白結合細胞株的中和作用。
為了生成能夠結合人MCAM之大鼠抗體,經由將人MCAM之胞外結構域融合至人IgG並使用標準技術在CHO細胞中製造來生成hMCAM-Fc。以在CFA中之250μg hMCAM-Fc蛋白(1:1體積)將Lou/M大鼠免疫 化。在二週之時間間隔中以在不完全弗氏佐劑(IFA)中之hMCAM-Fc蛋白(1:1體積)為大鼠加強免疫兩次。使用標準實驗計畫從免疫化之大鼠中生成雜交瘤並藉由Clonepix選擇選殖株。以全長人MCAM基因轉染CHO細胞並使用新黴素和標準技術選擇穩定表現者。使用標準技術以羧基螢光素琥珀醯亞胺酯(CFSE)將母CHO細胞(MCAM陰性)進行螢光標記,並與未標記之經人MCAM轉染的CHO細胞以1:1之比例混合。將雜交瘤上清液與此細胞混合物一起培育30分鐘並以經螢光標記之抗大鼠二級抗體(Jackson Immuno),藉由流式細胞術檢測可能之人MCAM特異性抗體的結合。
為了生成能夠結合人MCAM之老鼠抗體,經由將人MCAM之胞外結構域融合至人IgG來生成hMCAM-Fc並使用標準技術在CHO細胞中製造。以50μg在CFA中之hMCAM-Fc蛋白(1:1體積)將Balb/c小鼠免疫化。在二週之時間間隔中以在不完全弗氏佐劑(IFA)中之hMCAM-Fc蛋白(1:1體積)為小鼠加強免疫兩次。使用標準實驗計畫從免疫化之小鼠中生成雜交瘤並藉由Clonepix選擇選殖株。以全長人MCAM基因轉染CHO細胞並使用新黴素和標準技術選擇穩定表現者。使用標準技術以羧基螢光素琥珀醯亞胺酯(CFSE)將母CHO細胞(MCAM陰性)進行螢光標記,並與未標記之經人MCAM轉染的CHO細胞以1:1之比例混合。將雜交瘤上清液與此細胞混合物一起培育30分鐘並以經螢光標記之抗小鼠 第二抗體(Jackson Immuno),藉由流式細胞術檢測可能之人MCAM特異性抗體的結合。
將來自經篩選之人MCAM特異性抗體陽性的雜交瘤的上清液與經螢光標記之hMCAM-Fc蛋白(5μg/mL)預培育30分鐘,再加入表現層黏連蛋白α 4之細胞株WM2664中並藉由流式細胞術測定對hMCAM-Fc蛋白結合細胞株的中和作用。
核酸和蛋白質操作
為了測定CDR,使用RNAquous-4PCR套組(Ambion)自雜交瘤細胞分離出總RNA並用於cDNA合成中。使用從Marathon cDNA擴增(Clontech)修改之方法合成第一和第二股cDNA,將該cDNA銜接子連接至所獲得之dscDNA的5’端。根據該特異性抗體同種型恆定區序列設計重鏈和輕鏈二者之反向特異性引物,並連同銜接子引物一起用於該使用Pfu Ultra DNA聚合酶(Stratagene)進行之VL和VH片段的PCR擴增反應中。將擴增之PCR產物選殖入pCR-Blunt-TOPO(Invitrogen)中並測定該核苷酸序列。比較所鑑定之選殖株的序列以決定VL和VH序列內之同一性百分比。
為了測定上清液中之IL-17濃度,使用商業套組(R & D系統)進行ELISA。
實施例1. 抗MCAM單株抗體之生成
依上文中材料和方法之描述生成針對人MCAM蛋白之小鼠和大鼠單株抗體。藉由評估該單株抗體結合經人MCAM轉染之細胞的能力來確認該單株抗體與人MCAM之間的特異性結合。為此,以羧基螢光素琥珀醯亞胺酯(CFSE)標記未經轉染之細胞並與未標記之經人MCAM轉染的細胞混合。因此,可以區別未經轉染之細胞。
使用這些技術分離出823個獨立的小鼠融合選殖株並證實可表現能夠結合人MCAM的抗體。此外,分離出152個獨立的大鼠融合選殖株並證實可表現能夠結合人MCAM的抗體。
接著,使用抗人MCAM單株抗體來測試其阻斷人MCAM結合其配體之能力。將人MCAM-Fc蛋白(5μg/mL)與同種型對照抗體或10μg/mL之測試單株抗體在PBS中預溫育30分鐘。將該混合物加入健康之脊髓組織切片中,隨後依上文材料和方法中之描述藉由螢光顯微鏡表徵。此外,將以人MCAM基因轉染之母CHO細胞(CHOK1)或CHO細胞與CHO培養基(DMEM)、重組層黏連蛋白411(10μg/ml)或重組層黏連蛋白511(即,層黏連蛋白10(α 5 β 1 γ 1))(10μg/ml)在37℃下預培育45分鐘。清洗細胞並以泛層黏連蛋白抗體,藉由流式細胞術檢測層黏連蛋白411特異結合MCAM,但層黏連蛋白511則不。將經人MCAM轉染之CHO細胞與抗MCAM抗體(在20μg/ml之濃度下)預培育,再與層黏連蛋白一起培育可 停止人MCAM結合層黏連蛋白411。
利用此技術,證實上述823個獨立之小鼠融合選殖株中有87個選殖株且152個獨立之大鼠融合選殖株中有26個選殖株可表現能阻斷人MCAM蛋白與其配體,層黏連蛋白之α-4鏈之間的交互作用之抗體。
實施例2. 抗MCAM單株抗體之進一步表徵
將上述實施例1中所描述之具有下列能力的87個獨立小鼠融合選殖株及26個獨立大鼠融合選殖株進一步依下述表徵:(i)與人MCAM結合,及(ii)阻斷人MCAM與層黏連蛋白之α-4鏈之間的交互作用。首先,依下述定量該單株抗體阻斷人MCAM與層黏連蛋白之α-4鏈結合之能力的IC50。將表現人MCAM之CHO細胞與抗人MCAM抗體(在各種濃度下)在攝氏4度下一起培育30分鐘。然後,清洗掉未經結合之抗體並將細胞與20μg/ml之重組人層黏連蛋白411在攝氏37度下一起培育45分鐘。然後,清洗掉未經結合之層黏連蛋白,以經螢光標記之抗層黏連蛋白抗體檢測結合至該細胞表面之層黏連蛋白。清洗後,藉由流式細胞術檢測結合至表面之層黏連蛋白的量並根據該平均螢光強度來計算IC50。
使用上述分析,鑑定出六個獨立抗人MCAM單株抗體選殖株可結合人MCAM且具有阻斷表現在細胞表面上之人MCAM與其結合配體(人層黏連蛋白411)之間的交互作用之最大能力。此六個MCAM單株抗體選殖株在本文 中稱為(i)小鼠抗人MCAM單株選殖株1174.1.3、1414.1.2、1415.1.1和1749.1.3,及(ii)大鼠抗人MCAM單株抗體選殖株2120.4.19和2107.4.10。這些抗體之重鏈和輕鏈的胺基酸和核酸序列及彼等之高度可變區提供在SEQ ID NO:29至92中。更具體地說,在上述分析中,單株抗體選殖株1174.1.3、1414.1.2、1415.1.1、1749.1.3、2120.4.19和2107.4.10之IC50經測定分別為0.469μg/ml、0.431μg/ml、0.307μg/ml、0.545μg/ml、0.888μg/ml和0.290μg/ml。此外,為了測定各單株抗體之特異性結合親和力所執行之實驗證明各單株抗體均能以高親和力(數據未顯示)結合人MCAM蛋白。因此,這些特異性單株抗體每一個均非常能結合人MCAM並抑制表現人MCAM之細胞與其α-4層黏連蛋白結合配體之間的交互作用。相反地,二種對照抗體,非特異性人IgG1抗體及先前描述之稱為ABX-MA1的全長之人抗MCAM抗體(例如,參見Mills et al.,Cancer Res.62:5106(2002)及美國專利案第6,924,360、7,067,131和7,090,844號)均無法阻斷人MCAM與其層黏連蛋白411對應部分之間的結合交互作用。因此,上述鑑定之六種特異性單株抗體擁有新穎能力可同時(i)以高親和力結合活細胞表面上之人MCAM,和(ii)阻斷表現人MCAM之細胞與包含α-4多肽鏈之層黏連蛋白的交互作用。
實施例3. 抗MCAM單株抗體之結構域結合分析
採用ForteBio分析來測定人MCAM蛋白上單 株抗體選殖株1174.1.3、1414.1.2、1415.1.1、1749.1.3、2120.4.19及2107.4.10所識別並與之結合的抗原決定部位之位置。使用下列實驗計劃:使用ForteBio抗人IgG Fc生物傳感器(biosensor)將各種MCAMhFc結構域(包括全長MCAMhFc蛋白)固定在生物傳感器表面。將這些傳感器浸入MCAM特異性1174.1.3、1414.1.2、1415.1.1、1749.1.3、2120.4.19或2107.4.10抗體中以用於檢測對這些結構域或全長蛋白之結合。將這些樣本裝載入黑色96孔板後,Octet Red程式之編排如下:基線# 1,60秒;裝載各結構域,180秒;基線# 2,60秒;抗體與結構域聯結,180秒;及抗體與結構域離解,240秒。
使用之試劑和耗材:
1. MCAMhFc最終濃度@ 5μg/ml
2. 抗體選殖株1174.1.3、1414.1.2、1415.1.1、1749.1.3、2120.4.19及2107.4.10株@ 5μg/ml
3. 用於動力學實驗之ForteBio抗人IgG Fc Capture(AHC)生物傳感器,目錄編號18-5060
4. 來自Greiner Bio-one之黑色96孔盤,目錄編號655209
5. ForteBio Octet Red機器
6. 使用帶有20% FCS之新鮮組織培養基DMEM作為緩衝液以用於稀釋
來自這些分析的結果如下。
單株抗體選殖株1174.1.3、1414.1.2、1415.1.1和1749.1.3均顯示出與人MCAM蛋白之結構域3(由人MCAM蛋白之胺基酸244-321(SEQ ID NO:24)具體界定)上所發現之抗原性抗原決定部位結合。這些單株抗體無法結合人MCAM之結構域1(即,胺基酸19至129,SEQ ID NO:22)、結構域2(即,胺基酸139至242,SEQ ID NO:23)或結構域1和2之組合(即,胺基酸19至242)。因此,單株抗體選殖株1174.1.3、1414.1.2、1415.1.1和1749.1.3可界定位於人MCAM蛋白之結構域3內的新穎抗原性抗原決定部位。
單株抗體選殖株2120.4.19和2107.4.10各自顯示出結合由人MCAM結構域1(即,胺基酸19至129,SEQ ID NO:22)和結構域2(即,胺基酸139至242,SEQ ID NO:23)之組合所界定的抗原性抗原決定部位。此兩種單株抗體本身無一單獨結合人MCAM結構域1。因此,單株抗體選殖株2120.4.19和2107.4.10界定一個新穎之抗原性抗原決定部位,此係藉由同時存有人MCAM蛋白結構域1和2來確定。
與上述相反的,先前描述之全長人抗MCAM抗體ABX-MA1係結合至與上述不同之抗原性抗原決定部位,即,完全僅由人MCAM結構域1界定且包含在人MCAM結構域1內之抗原性抗原決定部位。
鑑於這些結果,由於單株抗體選殖株1174.1.3、1414.1.2、1415.1.1、1749.1.3、2120.4.19和 2107.4.10中的每一株均能夠同時(i)結合人MCAM,及(ii)阻斷人MCAM與含有α-4層黏連蛋白之蛋白質之間的交互作用,而ABX-MA1抗體僅能夠結合人MCAM,但不能阻斷人MCAM與包含α-4層黏連蛋白之蛋白質之間的交互作用,這些結果證明人MCAM結構域2、人MCAM結構域3及其組合在與α-4層黏連蛋白鏈之結合交互作用中具有作用。鑑於此,顯然地,結合人MCAM之結構域2、人MCAM結構域3及/或彼等之組合的抗體可作為能夠阻斷人MCAM與α-4層黏連蛋白之間的交互作用之作用劑、可用於抑制本文所描述之由該交互作用造成的各種後果。相反地,結合僅由人MCAM結構域1所界定之抗原性抗原決定部位的抗體(諸如本文所描述之ABX-MA1抗體)不能用來阻斷MCAM/α-4層黏連蛋白之交互作用及其各種下游生物學結果。
實施例4. 霰彈槍誘變抗原決定部位圖譜繪製
使用霰彈槍誘變及能表現和分析在真核細胞內之大突變標靶蛋白庫之高通量細胞技術鑑定用於與抗MCAM抗體結合之各種所欲胺基酸殘基。將人MCAM蛋白中之每一殘基個別突變成丙胺酸或其他具體指定之殘基以分析功能中的變化。在標準哺乳動物細胞株中表現蛋白質。
表1顯示用於產生霰彈槍誘變庫之試劑和方法的概述。
成功地優化全長人類MCAM之密碼子、合成並分殖入哺乳動物高度表現載體。然後,查證此母構建體之序列並藉由免疫檢測法驗證在哺乳動物細胞中之表現。
將藉由免疫螢光來檢測結合MCAM之2120.4.19抗體及小鼠血清之方法的高通量霰彈槍誘變格式成功地優化。以在384孔格式中之二級抗體的單一稀釋液測試各初級抗體之系列稀釋液。測試抗體以供檢測表現人MCAM之293T和BHK細胞。選擇用於篩選完整突變庫之最佳分析條件。
創建MCAM突變庫並查證序列,其係由545個選殖株(528/536丙胺酸突變體及17/17定點突變體)所組成,各帶有取代丙胺酸之單一殘基(丙胺酸殘基被取代成絲胺酸)或指定殘基。集合庫中未出寬殘基35、66、161、261、342、380、414和435。藉由免疫檢測以一式三份篩選突變庫中結合小鼠血清之突變體。此驗證各突變體選殖株之細胞表面表現。
進行多輪優化以決定適合用於繪製圖譜之條件。評估下列變量:多種層黏連蛋白濃度及抗層黏連蛋白二級抗體濃度、各種阻斷緩衝液以減少非特異性結合、多 種細胞類型及多個清洗步驟。
藉由免疫檢測以一式三份篩選突變庫中結合2120.4.19抗體之突變體。量化各突變體之反應性以鑑定表現出結合損失之點突變體。
量化各突變體選殖株之單株抗體及血清反應性以鑑定表現出結合損失但不影響表面表現之點突變。經由比較該單株抗體結合略圖與各突變體選殖株之血清結合略圖來鑑定各抗體之關鍵殘基。
在384孔格式中以野生型(WT)MCAM或單獨之載體轉染BHK細胞,再進行免疫檢測。測試各抗體之系列稀釋液(從4μg/ml開始)對WT或單獨載體之免疫反應性抗(表2)。各個點代表重複四份之平均值。
決定用於2120.4.19及Ms血清之免疫檢測及 繪製抗原決定部位之圖譜的最佳篩選條件。使用這些條件,各抗體表現出強大信號、高信號對背景值及重複操作之間的低變異性。這些數據指出這些條件適合成功繪製高通量抗原決定部位圖譜。使用最終篩選濃度為025μg/mL之2120.4.19及Ms血清之1:800稀釋液。使用稀釋400倍之來自Jackson ImmunoResearch的二級抗體以用於2120.4.19和血清檢測。表3顯示出經優化之用於高通量免疫檢測的實驗參數。
以一式三份分析突變庫之表面表現(小鼠血清結合)及單株抗體結合。將背景值從每個原始數據點扣除並對野生型MCAM反應值標準化。結果顯示於第1圖中。繪製2120.4.19之平均單株抗體結合值作為其平均表面表現值之函數(第1圖,灰色菱形)。應用<30%單株抗體反應性及>50%小鼠血清結合的閾值來鑑定單株抗體結合為陰性,但表面表現為陽性之選殖株(第1圖,黑色菱形)。
經由評估各選殖株之平均單株抗體反應性與其總體表面表現(平均血清反應性)之比較來鑑定2120.4.19之關鍵殘基(表4)。鑑定出之參與抗體結合的殘基為那些在單株抗體結合方面為陰性(<30% WT),但在表面表現方面為陽性(>50%WT)者。表中顯示各關鍵殘基之平均反應性(和標準差)。
藉由霰彈槍誘變圖譜繪製所鑑定之關鍵胺基酸表明2120.4.19抗體之結合位點。數據指出2120.4.19結合構象複雜之抗原決定部位,而主要為第二Ig結構域。
關鍵殘基似乎很大程度地倚賴由第二及/或第三Ig結構域之二硫鍵促成的結構穩定。2120.4.19之結合 係由包含一或二個該經二硫化物鍵結之第二Ig結構域的半胱胺酸161和223的關鍵殘基簇支援。
實施例5. 用於抗體和層黏連蛋白結合之確認性MCAM抗原決定部位圖譜繪製
為了鑑定2120.4.19在人MCAM上之結合位點,使用Schrodinger Maestro在人BCAM Ig1和Ig2模型上建立人MCAM Ig1和Ig2之同源模型(第2A圖)。根據該結構信息和霰彈槍誘變信息設計並產生二十個點突變體。在哺乳動物細胞上顯示這些突變體並使用FACS測試2120.4.19及層黏連蛋白α-4對該MCAM突變體之結合。三個MCAM單一突變體,1141A、D216A及Y318A,顯示出完全喪失與α-4層黏連蛋白之結合。I141A顯示完全喪失與2120.4.19之結合,而P145V顯示出明顯喪失與2120.4.19之結合。
為了進一步確認該數據,產生分別表現I141A、P145V、D216A及Y318A之穩定細胞株。以上述之純化蛋白質進行ForteBio分析。對照組ABX-MAI抗體結合野生型MCAM及MCAM突變體。2120.4.19未顯示出明顯結合MCAM I141A突變體。此外,2120.4.19顯示出分別大幅減少結合MCAM P145V和D216A突變體。再者,2120.4.19對MCAM突變體P145V之結合顯示出快速之K下降。
實施例6. 人化抗MCAM 2120抗體之生成
根據下列實驗計劃生成各種人化抗MCAM抗體。首先,使用JN Biosciences之專有算法構建可變區之三維分子模型。接著,使用該分子模型鑑定那些對形成CDR結構而言很重要或對結合至抗原而言是必要的框構胺基酸殘基。同時,選擇分別與該VH和VL胺基酸序列具有高度同源性之cDNA衍生的人VH和VL胺基酸序列。最後,將對CDR結構或對抗原結合而言很重要之CDR序列連同框構胺基酸殘基一起從VH和VL移植入該對應之選定的人框構序列。
第3圖描述各種2120重鏈和輕鏈序列之比對。殘基編號係根據Kabat編號。涉及形成CDR及抗原結合的框構(FR)胺基酸殘基之不同突變係根據抗體版本來鑑定。
2120抗體之示例性突變描寫於第3A圖中(在CDR-H1中(S30T)、介於CDR-H1和CDR-H2之間(I37V和L481)及介於CDR-H2和CDR-H3之間(K71R)用方格框起來之殘基影響CDR接觸;而在CDR-H2(T68S)後面與額外之突變組合之S30T、I37V、L48I和K71R突變影響CDR接觸);及第3B圖中(介於CDR-L1和CDR-L2之間(L46V和Y49F)和介於CDR-L2和CDR-L3之間(V581)用方格框起來的殘基影響CDR接觸;介於CDR-L1和CDR-L2之間(L46V和Y49F)用方格框起來的殘基影響CDR接觸;而在CDR-L1(T22N)之前與額外之突變組合之L4 6V、Y49F和V58I突變影響抗體/抗原交互作用)。
設計每個鏈的數個版本(標準相對於激進或保守)。在那些包含N-脫醯胺化基序(motif)的抗體(NG)方面,將對天冬醯胺或甘胺酸之突變引入標準版本中。合成具有異源信號序列之各種人化V區並選殖入含有人CK(VL)或人IgG1(VH)的表現載體中。
根據製造商之實驗計劃,以FreeStyleTM MAX轉染試劑(Invitrogen)將重和輕鏈質粒共同轉染入293F細胞中。以蛋白A PhyTip柱(Phynexus)將表現之抗體純化並經由OD280定量。
根據下列實驗計劃在競爭性ELISA中比較人化抗體與母囓齒動物或嵌合抗體之表觀親和力。
以重組hMCAM-His將ELISA盤塗層並以酪蛋白緩衝液阻斷之以防止非特異性結合。在有或無增加3×濃度之未標記的競爭劑(人化抗體,囓齒動物的或嵌合型的)的存在下將亞飽和濃度之生物素化的囓齒動物或嵌合抗體加入其中。之後進行清洗以去除未結合之抗體,加入鏈親和素(streptavidin)HRP以允許檢測該生物素化之抗體。以TMB受質發展ELISA並測量OD450。使用GraphPad Prism5軟體測定該未經標記之競爭劑的IC50值。
表5概述人化序列之設計。
根據製造商之實驗計劃,以FreeStyleTM MAX轉染試劑(Invitrogen)將重和輕鏈質粒共同轉染入293F細胞中。以蛋白A PhyTip柱(Phynexus)將表現之抗體純化並經由OD280定量。
根據下列實驗計劃在競爭性ELISA中比較人化抗體與母囓齒動物或嵌合抗體之表觀親和力。
以重組hMCAM-His將ELISA盤塗層並以酪蛋白緩衝液阻斷之以防止非特異性結合。在有或無增加3×濃度之未標記的競爭劑(人化抗體,囓齒動物的或嵌合的)的存在下將亞飽和濃度之生物素化的囓齒動物或嵌合抗體加入其中。之後進行清洗以去除未結合之抗體,加入鏈親和素HRP以允許檢測生物素化之抗體。以TMB受質發展ELISA並測量OD450。使用GraphPad Prism5軟體測定該未經標記之競爭劑的IC50值。
使用ForteBioOctet Red測量親和力。使用抗 人Fc傳感器捕捉該人化抗體並使用數種濃度之hMCAMHis分析物,利用1:1擬合模型來測定親和力。
根據以下實驗計劃在層黏連蛋白/FACS分析中測量抗體之效力:在有或無各種濃度之人化的、囓齒動物的或嵌合抗體之存在下,將重組層黏連蛋白411(Biolaminate)加入表現hMCAM之CHO細胞中。培育30-45分鐘後,清洗細胞並加入與AF650(NovusBio)共軛結合之抗層黏連蛋白以檢測該結合之層黏連蛋白。將該細胞在流式細胞儀上運行以測量該層黏連蛋白之結合信號。
表6提供用於轉染之構建體。
表7描述特定之轉染實驗。
表8顯示藉由ForteBio和競爭性ELISA測量與母囓齒動物抗體相較下之人化抗體的相對親和力及第一輪轉染之表現水準。
表9顯示藉由ForteBio、競爭性ELISA及功 能阻斷數據(層黏連蛋白/FACS分析)測量與母囓齒動物相較下,來自第二輪轉染之抗體的親和力及表現水準。
總體而言,這些數據證明藉由ForteBio測量時,各種2120人化抗體之親和力降低>5x,且藉由競爭性ELISA和層黏連蛋白阻斷分析測量時大部分之表觀親和力下降>2-3x,但VH5VL3(G-A N-脫醯胺化突變體VH/保守性VL)除外,其親和力和效力降低<2X。
重新表現某些候選抗體並藉由ForteBio測試彼等之親和力及彼等之IC50。結果提供於下列表10中。
實施例7. 人化2120抗體之修飾
利用上述DNA操作方法並根據Liu et al.JBC.286:11211-7,2011來構建2120.4.19抗體成熟重鏈可變區之大鼠和人化版本之變異體。構建在位置H 1(Kabat編號)處之麩胺酸被麩胺醯胺所取代的2120.4.19、h2120VH1、h2120VH2、h2120VH3、h2120VH4和h2120VH5之變異體(第4A圖)。這些變異體被稱為2120.4.19.Q1E、h2120VH1.Q1E、h2120VH2.Q1E、h2120VH3.Q1E、h2120VH4.Q1E及h2120VH5.Q1E並顯示於SEQ ID NO:156至161中。由SEQ ID NO:157至161鑑別之人化版本描述於第4A圖之比對中。使用該經修飾之可變重鏈可構建各種大鼠和人化抗體,包括:h2120VH1.Q1E+h2120VL1;h2120VH1.Q1E+h2120VL2;h2120VH1.Q1E+h2120VL3;h2120VH2.Q1E+h2120VL1;h2120VH2.Q1E+h2120VL2;h2120VH2.Q1E+h2120VL3;h2120VH3.Q1E+h2120VL1;h2120VH3.Q1E+h2120VL2;h2120VH3.Q1E+h2120VL3;h2120VH4.Q1E+h2120VL1;h2120VH4.Q1E+h2120VL2;h2120VH4.Q1E+h2120VL3;h2120VH5.Q1E+h2120VL1;h2120VH5.Q1E+h2120VL2;及h2120VH5.Q1E+h2120VL3。
<110> 普羅帝納生物科學公司(Prothena Biosciences Limited)
<120>抗黑色素瘤細胞黏著分子(MCAM)抗體類及使用彼等之相關方法 (ANTI-MCAM ANTIBODIES AND ASSOCIATED METHODS OF USE)
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<170> 用於Windows 4.0版之FastSEQ
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<213> 人工序列
<220>
<223> 合成的
<400> 176
<210> 177
<211> 448
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成的
<400> 177
<210> 178
<211> 116
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽
<400> 178
<210> 179
<211> 116
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽
<400> 179

Claims (65)

  1. 一種抗體,其包含:(a)成熟重鏈可變區,其包含SEQ ID NO:161之3個Kabat CDR,唯其中位置32(Kabat編號)可為N、S或Q,且位置33(Kabat編號)可為G或A,且其中位置1(Kabat編號)被E佔用;及(b)成熟輕鏈可變區,其包含SEQ ID NO:123之3個Kabat CDR。
  2. 如申請專利範圍第1項之抗體,其中該成熟重鏈可變區與SEQ ID NO:161具有至少90%之同一性,且該成熟輕鏈可變區與SEQ ID NO:123具有至少90%之同一性。
  3. 如申請專利範圍第1項之抗體,其中該成熟重鏈可變區與SEQ ID NO:161具有至少95%之同一性,且該成熟輕鏈可變區與SEQ ID NO:123具有至少95%之同一性。
  4. 如申請專利範圍第1項之抗體,其中該成熟重鏈可變區與SEQ ID NO:161具有至少98%之同一性,且該成熟輕鏈可變區與SEQ ID NO:123具有至少95%之同一性。
  5. 如申請專利範圍第1項之抗體,其中該成熟重鏈可變區與SEQ ID NO:161具有至少99%之同一性,且該成熟輕鏈可變區與SEQ ID NO:123具有至少95%之同一性。
  6. 如申請專利範圍第1項之抗體,其中該成熟重鏈可變區具有SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:160或SEQ ID NO:161之胺基酸序列,且其中該成熟輕鏈可變區與SEQ ID NO:123具有至少95%之同一性。
  7. 如申請專利範圍第1項之抗體,其中該成熟重鏈可變區與SEQ ID NO:161具有至少95%之同一性,且該成熟輕鏈可變區與SEQ ID NO:123具有至少98%之同一性。
  8. 如申請專利範圍第1項之抗體,其中該成熟重鏈可變區與SEQ ID NO:161具有至少95%之同一性,且該成熟輕鏈可變區與SEQ ID NO:123具有至少99%之同一性。
  9. 如申請專利範圍第1項之抗體,其中該成熟重鏈可變區與SEQ ID NO:161具有至少95%之同一性,且該成熟輕鏈可變區具有SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:122或SEQ ID NO:123之胺基酸序列。
  10. 如申請專利範圍第1項之抗體,其中該成熟重鏈可變區與SEQ ID NO:161具有至少98%之同一性,且該成熟輕鏈可變區與SEQ ID NO:123具有至少98%之同一性。
  11. 如申請專利範圍第1項之抗體,其中該成熟重鏈可變區與SEQ ID NO:161具有至少99%之同一性,且該成熟輕鏈可變區與SEQ ID NO:123具有至少99%之同一 性。
  12. 如申請專利範圍第1項之抗體,其中該成熟重鏈可變區具有SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:160或SEQ ID NO:161之胺基酸序列,且其中該成熟輕鏈可變區具有SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:122或SEQ ID NO:123之胺基酸序列。
  13. 如申請專利範圍第1項之抗體,其中該成熟重鏈可變區具有SEQ ID NO:161之胺基酸序列,且其中該成熟輕鏈可變區具有SEQ ID NO:123之胺基酸序列。
  14. 如申請專利範圍第1至13項中任一項之抗體,其為人化抗體。
  15. 一種經分離之抗黑色素瘤細胞黏著分子(MCAM)抗體,其與人MCAM(SEQ ID NO:11)之包括胺基酸殘基141的抗原決定部位結合。
  16. 如申請專利範圍第15項之經分離之抗MCAM抗體,其中該抗原決定部位包含胺基酸殘基145。
  17. 如申請專利範圍第15或16項之經分離之抗MCAM抗體,其中該抗原決定部位包含該包括胺基酸殘基141之人MCAM的至少五個連續胺基酸殘基。
  18. 如申請專利範圍第15至17項中任一項之經分離之抗MCAM抗體,其中該抗體不是單株抗體2120.4.19或包含實質上來自單株抗體2120.4.19之CDR的抗體。
  19. 如申請專利範圍第15至18項中任一項之經分離 之抗MCAM抗體,其中該抗體為單株抗體。
  20. 如申請專利範圍第15至19項中任一項之經分離之抗MCAM抗體,其中該抗體為嵌合抗體、人化抗體、經表面修飾之抗體或人抗體。
  21. 如申請專利範圍第1至20、74及75項中任一項之抗體或經分離之抗MCAM抗體,其為抗原結合片段。
  22. 一種醫藥組成物,其包含如申請專利範圍第1至21、62及63項中任一項之抗體或經分離之抗MCAM抗體。
  23. 一種醫藥調製劑,其包含:(a)一種抗體,其包含:(i)成熟重鏈可變區,其包含SEQ ID NO:161之3個Kabat CDR,唯其中位置32(Kabat編號)可為N、S或Q,且位置33(Kabat編號)可為G或A;及(ii)成熟輕鏈可變區,其包含SEQ ID NO:123之3個Kabat CDR;(b)存在濃度介於約10mM至約30mM之組胺酸緩衝液;(c)一或多種選自下列群組之糖和多元醇(“糖/多元醇”):(i)存在濃度介於約200mM至約260mM之蔗糖;及(ii)存在濃度介於約200mM至約260mM之海藻糖;及 (d)存在濃度介於約0.005重量%至約0.05重量%之聚山梨醇酯20;其中該醫藥調製劑之特徵為pH值介於約5.5至約7。
  24. 如申請專利範圍第23項之醫藥調製劑,其中該成熟重鏈可變區與SEQ ID NO:161具有至少90%之同一性,且該成熟輕鏈可變區與SEQ ID NO:123具有至少90%之同一性。
  25. 如申請專利範圍第23或24項之醫藥調製劑,其中該成熟重鏈可變區之位置1(Kabat編號)被E佔用。
  26. 如申請專利範圍第23至25項中任一項之醫藥調製劑,其中該成熟重鏈可變區具有SEQ ID NO:157、SEQ ID NO:158、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:160或SEQ ID NO:161之胺基酸序列,且其中該成熟輕鏈可變區具有SEQ ID NO:121、SEQ ID NO:122或SEQ ID NO:123之胺基酸序列。
  27. 如申請專利範圍第23至26項中任一項之醫藥調製劑,其中該成熟重鏈可變區具有SEQ ID NO:161之胺基酸序列且該成熟輕鏈可變區具有SEQ ID NO:123之胺基酸序列。
  28. 一種醫藥調製劑,其包含:(a)如申請專利範圍第15至21項中任一項之經分離之抗MCAM抗體;(b)存在濃度介於約10mM至約30mM之組胺酸緩衝 液;(c)一或多種選自下列群組之糖及多元醇(“糖/多元醇”):(i)存在濃度介於約200mM至約260mM之蔗糖;及(ii)存在濃度介於約200mM至約260mM之海藻糖;及(d)存在濃度介於約0.005重量%至約0.05重量%之聚山梨醇酯20;其中該醫藥調製劑之特徵為pH值介於約5.5至約7。
  29. 如申請專利範圍第28項之醫藥調製劑,其中該經分離之抗MCAM抗體與人MCAM(SEQ ID NO:11)之包括胺基酸殘基141之抗原決定部位結合。
  30. 如申請專利範圍第23至29、64及65項中任一項之醫藥調製劑,其中該抗體或經分離之抗MCAM抗體的存在濃度為約40mg/mL。
  31. 如申請專利範圍第23至30、64及65項中任一項之醫藥調製劑,其中該組胺酸緩衝液之存在濃度為約20mM。
  32. 如申請專利範圍第23至31、64及65項中任一項之醫藥調製劑,其中該糖/多元醇為存在濃度為約220mM之蔗糖。
  33. 如申請專利範圍第32項之醫藥調製劑,其中該 pH為約6.0。
  34. 如申請專利範圍第33項之醫藥調製劑,其特徵為滲透壓為約295mOsm/kg。
  35. 如申請專利範圍第23至31、64及65項中任一項之醫藥調製劑,其中該糖/多元醇為存在濃度為約220mM之海藻糖。
  36. 如申請專利範圍第35項之醫藥調製劑,其中該pH值為約6.5。
  37. 如申請專利範圍第36項之醫藥調製劑,其特徵為滲透壓為約287mOsm/kg。
  38. 如申請專利範圍第23至37、64及65項中任一項之醫藥調製劑,其中少於約5%之該抗體或該經分離之抗MCAM抗體係以聚集體形式存在於該調製劑中。
  39. 如申請專利範圍第23至38、64及65項中任一項之醫藥調製劑,其進一步包含增容劑(bulking agent)。
  40. 如申請專利範圍第23至39、64及65項中任一項之醫藥調製劑,其為無菌的。
  41. 如申請專利範圍第23至40、64及65項中任一項之醫藥調製劑,其係在冷凍和解凍時呈安定。
  42. 如申請專利範圍第23至41、64及65項中任一項之醫藥調製劑,其中在38至42℃下儲存至少30天後及/或在38至42℃下儲存至少3個月後,至少65%之蛋白質係以單峰出現在疏水性交互作用色層分析上。
  43. 如申請專利範圍第23至41、64及65項中任一項 之醫藥調製劑,其在38至42℃下儲存至少30天後及/或在38至42℃下儲存至少3個月後,在高性能尺寸排阻色層分析上具有不超過5重量%之聚集蛋白質。
  44. 一種凍乾之調製劑,其包含:(a)如申請專利範圍第15至21、23至27、62及63項中任一項之抗體或經分離之抗MCAM抗體;(b)組胺酸緩衝液;(c)蔗糖或海藻糖;及(d)聚山梨醇酯20。
  45. 如申請專利範圍第44項之凍乾之調製劑,其在添加水時重構成為pH值介於約5.5至約6.5之調製劑。
  46. 如申請專利範圍第44或45項之凍乾之調製劑,其包含約10mg至約40mg之該抗體或該經分離之抗MCAM抗體。
  47. 如申請專利範圍第44至46項中任一項之凍乾之調製劑,其中該調製劑當被重構成時包含存在量為約20mM之組胺酸緩衝液。
  48. 如申請專利範圍第44至47項中任一項之凍乾之調製劑,其中該調製劑當被重構成時包含存在量為約220mM之蔗糖。
  49. 如申請專利範圍第48項之凍乾之調製劑,其中該調製劑當被重構成時之pH值為約6.0。
  50. 如申請專利範圍第44至47項中任一項之凍乾之調製劑,其中該調製劑當被重構成時包含存在量約 220mM之海藻糖。
  51. 如申請專利範圍第50項之凍乾之調製劑,其中該調製劑當被重構成時之pH值為約6.5。
  52. 如申請專利範圍第44至51項中任一項之凍乾之調製劑,其中該聚山梨醇酯20之存在量係介於約0.01重量%至約0.05重量%。
  53. 如申請專利範圍第44項之凍乾之調製劑,其可藉由對包含下列群組之水溶液添加水進行重構成:(a)存在濃度為約40mg/mL之該抗體或該經分離之抗MCAM抗體;(b)存在濃度為約20mM之組胺酸緩衝液;(c)存在濃度為約220mM之蔗糖;(d)存在濃度為約0.02%之聚山梨醇酯20;及(e)pH值為約6.0。
  54. 如申請專利範圍第53項之凍乾之調製劑,其包含:(a)200mg之該抗體或該經分離之抗MCAM抗體;(b)15.5mg之組胺酸;(c)376mg之蔗糖;(d)1mg之聚山梨醇酯20;及(e)pH值為約6.0。
  55. 如申請專利範圍第44項之凍乾之調製劑,其可藉由對包含下列群組之水溶液添加水進行重構成:(a)存在濃度為約40mg/mL之該抗體或該經分離之 抗MCAM抗體;(b)存在濃度為約20mM之組胺酸緩衝液;(c)存在濃度為約220mM之海藻糖;(d)存在濃度為約0.02%之聚山梨醇酯20;及(e)pH值為約6.5。
  56. 如申請專利範圍第55項之凍乾之調製劑,其包含:(a)200mg之該抗體或該經分離之抗MCAM抗體;(b)15.5mg之組胺酸;(c)416mg之海藻糖二水合物;(d)1mg之聚山梨醇酯20;及(e)pH值為約6.5。
  57. 一種經分離之肽,其包含與抗MCAM單株抗體結合之抗原決定部位,其中該肽包含人MCAM(SEQ ID NO:11)的5至50個連續胺基酸殘基,該等連續胺基酸殘基包括胺基酸殘基141。
  58. 如申請專利範圍第57項之經分離之肽,其中該肽與載體多肽連接。
  59. 如申請專利範圍第57或58項之經分離之肽,其中該肽係與佐劑組合。
  60. 一種產生抑制人MCAM結合層黏連蛋白(laminin)α-4鏈之抗體的方法,其包含:(a)使用如申請專利範圍第57至59項中任一項所定義之肽免疫個體; (b)從該個體分離出B細胞,其中該B細胞分泌抗體;及(c)篩選該抗體以鑑別能抑制人MCAM結合層黏連蛋白α-4鏈之抗體。
  61. 如申請專利範圍第60項之方法,其進一步包含:(d)將該B細胞與培養之永生化的細胞融合以形成製造單株抗體之雜交瘤細胞;(e)培養該雜交瘤細胞;及,(f)從培養物分離出單株抗體。
  62. 如申請專利範圍第1項之抗體,其中該成熟重鏈可變區具有SEQ ID NO:161之胺基酸序列且該成熟輕鏈可變區具有SEQ ID NO:123之胺基酸序列,且其中該抗體包含具有SEQ ID NO:171之胺基酸序列的重鏈恆定區及具有SEQ ID NO:168之胺基酸序列的輕鏈恆定區。
  63. 如申請專利範圍第1項之抗體,其中該成熟重鏈可變區具有SEQ ID NO:161之胺基酸序列且該成熟輕鏈可變區具有SEQ ID NO:123之胺基酸序列,且其中該抗體包含具有SEQ ID NO:172之胺基酸序列的重鏈恆定區及具有SEQ ID NO:168之胺基酸序列的輕鏈恆定區。
  64. 如申請專利範圍第23至27項中任一項之醫藥調製劑,其中該成熟重鏈可變區具有SEQ ID NO:161之胺基酸序列且該成熟輕鏈可變區具有SEQ ID NO:123之胺基酸序列,且其中該抗體包含具有SEQ ID NO:171之胺基酸序列的重鏈恆定區及具有SEQ ID NO:168之胺基酸 序列的輕鏈恆定區。
  65. 如申請專利範圍第23至27項中任一項之醫藥調製劑,其中該成熟重鏈可變區具有SEQ ID NO:161之胺基酸序列且該成熟輕鏈可變區具有SEQ ID NO:123之胺基酸序列,且其中該抗體包含具有SEQ ID NO:172之胺基酸序列的重鏈恆定區及具有SEQ ID NO:168之胺基酸序列的輕鏈恆定區。
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