TARIFNAME HIYAR SARI DAMAR VIRÜSÜNE (CVYV) DIRENÇLI KARPUZ BITKILERI Açiklama BULU UN ALANI Bu bulus bitki yetistirme ve bitki islahi alanina iliskindir. Hiyar Sari Damar Virüsüne (CVYV) dirençli karpuz bitkileri ve CVYV direnç lokusuna siki sikiya bagli SNP (Tek Nükleotit Polimorfizmi) markörleri sunulmaktadir. Bu markörler, CVYV direnç lokusunu içeren ve direnç lokusu bir diploid bitkide homozigot formda veya bir triploid veya tetraploid bitkide sirasiyla üç veya dört kopya halinde oldugunda CVYV'ye dirençli olan karpuz bitkilerini veya bitki bölümlerini seçmek için kullanilabilir. Markörler CVYV direnç lokusunu içeren bitkileri (veya bu bitkilerden bitki bölümlerini) CVYV direnç lokusu olmayan bitkilerden (veya bitki bölümlerinden) ayirt etmek için de kullanilabilir. CVYV direnç lokusu tek bir resesif (çekinik) lokustur. Lokus karpuz genomu kromozom 3 üzerinde bulunur. Ayni kromozom üzerinde Ling ve digerleri (Cucurbitaceae 2008, IX. Eucarpia Toplanti Tutanaklari, 21-24 Mayis), eIF4E genindeki bir markörün zym olarak adlandirilan bir resesif genin verdigi ZYMV (Kabak Sari Mozaik Virüsü) direncine bagli oldugunu bildirdiler. CVYV direnci veren yabani karpuzdan bir homozigot geri melezleme (introgresyon) içeren bulusun kültive edilmis karpuz bitkileri ZYMV direnci içermiyordu ve Ling ve digerleri (2008, yukarida) tarafindan bildirilen eIF4E genindeki markörü içermiyordu. Dolayisiyla bulusun CVYV direnç lokusu tek basina kullanilabilir veya istege bagli olarak çift dirençli bitkiler üretmek için ZYMV direnciyle (resesifzym geni) kombine edilebilir. Kromozom 3 üzerinde bir geri melezleme fragmani içeren bulusun karpuz satilabilir meyveler üreten kültive edilmis C. lanatus ssp. vulgaris bitkileridir. Dolayisiyla bitkiler veya bitki bölümleri, kromozom 3 (C. lanatus ssp. lanatus türü bir bitkiden veya C. lanatus ssp. muCOSOSpermus türü bir bitkiden) bir yabani karpuzun bir geri melezleme fragmanini içeren kültive edilmis karpuzun (C. lanatus ssp. vulgari's) bir genomunu içerir, burada sözü edilen geri inelezleme fragmani CVYV direnç lokusunu içerir. CVYV lokusu ve/Veya geri melezleme fragmani hücrelerde, bitkilerde, bitki bölümlerinde veya bunlarin DNAasinda siki sikiya bagli markörlerle, yani burada sunulan SNP markörlerinin birinin veya daha fazlasinin SNP genotipiyle (veya SNP haplotipi) tanimlanabilir. BULUSA DAIR BILINEN HUSUSLAR CVYV hiyar, kavun, karpuz ve kabak gibi kabakgillerde ciddi zararlara neden olan bir potyvirus"tür (Potyviridae familyasi). Virüs mekanik olarak ve beyaz sinek Bemisi'a tabaci olan CVYV,nin dogal vektörü tarafindan bulastirilabilir. Beyaz sinek vektörü B. tabaci' dünyanin baslica karpuz yetistirme alanlarinin birçogunda endemiktir. CVYV hem tarlalardaki hem de plastik tünellerdeki ürünlere bulasir. CVYV,ye karsi direnç kavunda ve hiyarda tespit edilmistir, ama henüz karpuzda tespit CVYVaye karsi bir direnç QTL (niceliksel özellik lokusu) açiklanmaktadir. Karpuzda CVYV semptomlari bazen hafif yaprak klorozudur, ama çogunlukla dissal semptomlar kolayca farkedilemez veya belli olmaz. Bu durumda CVYV enfeksiyonu ancak, meyvelerde disaridan görülmeyen, aina meyveleri tüketilebilir olmaktan çikaran içsel nekroz olusumu saptandiginda görülür. CVYV ters transkriptaz PCT (RT-PC R) ile ve nükleik asit hibridizasyonuyla, örnegin 2007 OEPP/EPPO Bulletin 37, sayfa 554-5597da, "Cucumber vein yellowing virus (Ipomovirus)" basligi altinda açiklandigi gibi saptanabilir. Bu belgede ayrica CVYV`yi saptamak için test bitkilerine mekanik ve beyaz sinekle bulastirma yaklasimlari açiklanmaktadir. Bulusun bir amaci, bir diploid bitkide homozigot formdayken veya bir triploid veya tetraploid bitkide sirasiyla üç veya dört kopya halindeyken, CVYV7ye karsi direnç veren, kromozom 3 üzerinde bir direnç lokusu içeren, kültive edilmis karpuz bitkileri, C. lanatus ssp. vulgaris ve bu bitkilerin bölümlerini sunmaktir. Bu lokus tadi aci olan ve briks derecesi çok düsük (örnegin 3.0 veya daha düsük bir briks) olan beyaz etli veya sari etli meyvelere sahip iki farkli yabani tip Citrullus lanatus ssp. lanatus ve Citrullus lariatus ssp. mucosospermufta saptanan bir Niceliksel Özellik Lokusudur (QTL) ve bu lokus satilabilir yüksek olan kaliteli meyveleri olan kültive edilmis karpuza (Citrullus lariatus ssp. vulgari's) geri melezlendi. CVYV direnci veren bu QTL burada cyv_3.1 olarak geçmektedir. Bir, iki, üç veya dört kopya halined cyv_3. 1 içeren kültive edilmis karpuz bitkileri arasinda diploid bitkiler veya ikili-haploid bitkiler, tetraploid bitkiler ve triploid bitkilerin (örnegin çekirdeksiz meyveler üreten triploid hibrid bitkiler) yani sira, bu bitkilerin yetistirilebildigi tohumlar ve bitkilerin cyvý3.1"i içeren bölümleri (meyveler, meyve bölümleri, köksaplar, filizler, hücreler, polen, basçiklar, tohumcuklar, saplar, yapraklar, çenekler, hipokotiller, çiçekler, in vitro hücre veya doku kültürleri, in vitro propagasyonlar ve benzeri) yer alir. CVYV direnci veren QTL cyv_3. l "e siki sikiya bagli moleküler markörleri ve bu tür moleküler markörlerin birinin veya daha fazlasinin a) bir (örnegin bir diploidde heterozigot), iki (örnegin diploid ve ikili-haploid bitkilerde homozigot), üç (bir triploidde) veya dört kopyada (bir tetraploidde) cyv_3.1 içeren kültive edilmis karpuz bitkilerinin yetistirilmesinde ve/veya b) bitkilerin, bitki bölümlerinin, hücrelerin veya genomik DNA°nin, bu moleküler markörlerin birinin veya daha fazlasinin varligi açisindan ve dolayisiyla cyv_3. 1 ,in varligi açisindan taranmasinda kullanimini sunmak da bulusun bir amacidir. Bu yetistirme usulleri ve tarama usulleri burada kapsanmaktadir. GENEL TANIM sözü edilmeyen kalemlerin dislanmadigini belirtmek için sinirlandirici olmayan bir sekilde kullanilmaktadir. Ayrica, bir ögeye "bir" belgisiz sifatiyla referansta bulunulmasi, baglam açikça ögelerin birinin ve sadece birinin olmasini gerektirmedikçe, birden fazla ögenin bulunma olasiligini dislamamaktadir. Dolayisiyla "bir" belgisiz sifati genellikle "en az bir" anlamindadir, örnegin "bir bitki" ayni zamanda birkaç bitkiyi belirtmektedir vs. Benzer bir sekilde, "bir meyve" veya "bir bitki" birçok meyveyi ve bitkiyi de belirtir. Burada "bitki" terimi bütün olarak bitkiyi veya bunun tercihen elde edildigi bitkiyle ayni genetik yapiya sahip bölümleri veya türevleri, örnegin bitki organlari (örnegin hasat edilmis veya edilmemis meyveler, yapraklar, çiçekler, basçiklar vs.), bitki hücreleri, bitki protoplastlari, bütün olarak bitkilerin rejenere edilebildigi bitki hücresi doku kültürleri, bitki kalluslari, bitki hücresi yiginlari, bitki transplantlari, tîdeler, bitkilerdeki bütün haldeki bitki hücreleri, bitki klonlari veya mikropropagasyonlar veya bitki bölümleri, Örnegin bitki çelikleri, ogulcuklar, polen, basçiklar, tohumcuklar, meyveler (örnegin hasat edilmis dokular veya organlar), çiçekler, yapraklar, tohumlar, klonal olarak çogalmis bitkiler, kökler, saplar, kök uçlari, asilar (filizler ve/veya köksaplar) ve benzerini içerecek sekilde kullanilmaktadir. Fideler, kök salmadan önceki veya sonraki çelikler gibi herhangi bir gelisim asamasi da dâhildir. "Bir bitkinin tohumlari"ndan söz edildiginde, bunlar bitkinin yetistirilebilecegi tohumlari veya özdöllenme veya çapraz döllenmeden sonra bitkide üretilmis tohumlari belirtmektedir. Burada "varyete" veya "kültivar" terimi, belirli bir genotipten veya genotipler kombinasyonundan kaynaklanan özellikler ifade edilerek tanimlanabilen, bilinen en alt sinifin tek bir botanik taksonu içindeki bir bitki grubunu belirtmek için kullanilmaktadir. belirtir, bu alellerin hepsi spesifik bir lokustaki bir özellige veya nitelige iliskindir. Bir organizmanin bir diploid hücresinde, belirli bir genin alelleri bir kromozom üzerinde spesifik bir yerde veya lokusta bulunur. Hoinolog kroinozomlar çiftinin her kromozoinu üzerinde bir alel bulunur. Bir diploid bitki türü belirli bir lokusta çok sayida farkli alel içerebilir. Bunlar genin özdes alelleri (homozigot) veya iki farkli alel (heterozigot) olabilir. ardisik iliskili jenerasyonlari belirtmektedir. Iki bitki veya hattin melezlenmesiyle üretilen tohumlardan yetistirilen bitkiler F1 jenerasyonu olarak adlandirilir. F1 bitkilerinin özdöllenmesi F2 jenerasyonuyla sonuçlanir ve böyle devam eder. elde edilenjenerasyondur. Dolayisiyla, F1 hibrid tohumlari, F1 hibrid bitkilerinin yetistigi tohumlardir. F 1 hibridleri heteroz (melez gücü) nedeniyle daha kuvvetli ve daha yüksek verimlidir. Essoylu hatlar genomdaki lokuslarin çogunda esas olarak homozigottur. Bir "bitki hatti" veya "yetistirme hatti" bir bitkiyi veya silsilesini belirtir. Burada "essoylu hat" terimi, tekrar tekrar özdöllenmis ve hemen hemen homozigot olan bir bitki hattini belirtmek için kullanilmaktadir. Dolayisiyla bir "essoylu hat" veya "ebeveyn hatti", yüksek bir tek düzelige sahip bir bitki hattiyla sonuçlanan, birçok jenerasyon (örnegin en az 5, 6, 7 veya daha fazla) soy içi üretilen bir bitkiyi belirtmektedir. bir bölge (transkripsiyonu yapilmis bölge) ve islevsel olarak bagli bir regülatör bölge (örnegin bir promotör) içeren bir (genomik) DNA dizisini belirtir. Dolayisiyla bir genin farkli alelleri, kodlanmis proteinin genomik DNA dizisi (örnegin promotör dizisi, ekson dizileri, intron dizileri vs.), mRNA ve/veya amino asit dizisinin bir veya daha fazla nükleotidindeki farkliliklar formunda olabilen, genin farkli alternatif formlaridir. kromozom üzerindeki spesifik bir yeri veya yerleri veya konumu belirtmektedir. Dolayisiyla CVYV lokusu (veya CVYV direnci veren lokus), karpuz genomunda, cyv_3.1 adi verilen QTL9nin bulundugu yerdir. cyvý3.] lokusu kültive edilmis karpuz kromozomu 3 içine geri melezlenir (http://www.icugi.org/cgi-bin/ICuGI/index.cgi°de "Watennelonz Genome", "Watermelon genome (97103) - version I " altinda bulunan yayimlanmis karpuz genomunun kromozom tahsisi kullanilarak ve Guo S, Zhang J, Sun H, Salse J, Lucas W, Zhang H, Zheng Y, Mao L, Ren Y, Wang Z (2013) "The draft genome of watermelon (Citrullus lanatus) and resequencing of 20 diverse accessions"da (Nature Genetics 45:51- 58) açiklandigi gibi), yani cyv_3.1 yabani bir karpuzdan kültive edilmis karpuz genomu içine (yani kromozom 3 üzerine) geri melezlenir. Bir "niceliksel özellik lokusu" veya "QTL", sürekli olarak dagitilan (niceliksel) bir fenotipin ekspresivitesini etkileyen bir veya daha fazla aleli kodlayan kromozomal bir lokustur. CVYV direnci veren niceliksel özellik lokusu (veya "CVYV QTL") burada cyv_3. 1 olarak adlandirilmaktadir. vejetatif bitki bölümünü/bölümlerini veya bir diploid bitkinin yetistirilebildigi tohumu belirtmektedir. Bir "DH bitki" veya "ikili-haploid bitki", diploid bitkinin haploid genomu örnegin in vitro teknikler kullanilarak ikiye katlanmak suretiyle üretilen bir diploid bitkidir. Dolayisiyla bir DH bitki bütün lokuslarda homozigottur. vejetatif bitki bölümünü/bölümlerini veya bir triploid bitkinin yetistirilebildigi tohumu belirtmektedir. vejetatif bitki bölümünü/bölümlerini veya bir tetraploid bitkinin yetistirilebildigi tohumu belirtmektedir. için polen tasiyici olarak uygun olan (essoylu veya hibrid) diploid bitkiyi veya bunun bölümlerini (örnegin poleni veya filizini) belirtmektedir. Dolayisiyla polen tasiyici bir bitki, uygun gündüz zainaninda ve uygun bir süreyle uygun bir polen miktarini üreterek, triploid bitkilerin iyi meyve tutumunu (ve iyi triploid meyve verimini) saglayabilir. ebeveynin bir disi tetraploid ebeveynle çapraz döllenmesiyle elde edilen hibrid, triploid tohumdan yetistirilen triploid bir bitkidir. Erkek ebeveyn (polen tasiyici bitki) bir tetraploid disi ebeveynde meyve tutumuna ve tohum üretimine yol açmak için kullanilarak, Fl hibrid triploid tohumlari içeren meyveler elde edilir. F1 triploid tohumlari üretmek için kullanilan erkek ebeveyn de disi ebeveyn de essoyludur, dolayisiyla her ebeveyn hatti hemen hemen homozigot ve stabildir. triploid bitkide üretilen triploid meyvelerdir, bu meyveler hiç olgun çekirdek içermez. Meyve bir veya daha fazla küçük, yenebilir, beyaz tohumcuk içerebilir. transplantin kombinasyonunu, özellikle polen tasiyicilarin triploid hibrid bitkilerle ayni tarlaya ekilmesini ve/veya dikilmesini (triploid bitkiler üzerinde çekirdeksiz meyve üretimi ve polen tasiyici bitkilerde diploid meyve üretimi için) belirtmektedir. Örnegin polen tasiyici triploid bitkilerle ayri siralara dikilebilir veya ayni siraya (ömegin her sira içindeki tepelere) birlikte dikilebilir. Polen tasiyicilar triploid siralari arasina da dikilebilir. Ayrica tohumlamadan önce polen tasiyicilarin ve triploid hibridlerin tohumlari karistirilarak, rastgele tohumlama uygulanabilir. Triploid hibrid bitkilerin ve/veya polen tasiyici bitkilerin transplantlari farkli bir bitkinin bir köksapini da içerebilir. Uygun köksaplar bu alanda bilinmektedir. Farkli bir köksapi olan karpuz bitkileri "asili" olarak geçer. veya fidelerin (genç bitkiler) dikilmesini belirtir. in vitro propagasyon veya asilama usulleriyle (Iilizler kullanilarak) propaasyonunu belirtir. In vitro propagasyon, in vitro hücre veya doku kültürünü ve in vitro kültürden bütün olarak bir bitkinin rejenerasyonunu içerir. Asilama, bir köksap üzerine asilamayla orijinal bir bitkinin propagasyonunu içerir. Böylece orijinal bitkinin klonlari (yani genetik olarak özdes vejetatif propagasyonlar) in vitro kültür veya asilamayla üretilebilir. "Hücre kültürü" veya "doku kültürü" bir bitkinin hücrelerinin veya dokularinin in vitro kültürünü belirtir. bitkinin olusturulmasini belirtir. "Çogalmayan hücre" tam bir bitki olarak rej enere edilemeyen bir hücreyi belirtir. direnci) eksprese eden bir aleli belirtir. Bulusa göre cyv_3. 1, bir diploid bitkide iki kopya, bir tetraploid bitkide dört kopya veya bir triploid bitkide üç kopya halinde bulundugunda CVYV dirençli bir bitkiyle sonuçlanir, dolayisiyla bu bitkilerde baskin bir alel yoktur. Baskin alel burada cyv_3.1 geri melezlemesinin olmadigi bitkilerde bulunan yabani tip (WT) alel olarak geçmektedir. agronomik özelliklere sahiptir, özellikle iyi meyve kalitesine ve meyve tekdüzeligine sahip satilabilir meyveler üretir. ssp. lanalus ve Citrullus lanatus ssp. mucosospermufu belirtmektedir. Polimorfizmini belirtir ve burada sunulan SNP markörleri CVYV°ye dirençli yabani karpuz tiplerinde bulunan cyv_3.] 'e siki sikiya baglidir. SNP_02 kromozom 3, nükleotit nükleotit 7.693.225,te bir "T" (Timin) yerine bir "C" (Sitozin) içerir. "SNP genotipi" terimi spesifik SNP,de bulunan nükleotidi belirtir. "Direnç genotipi" veya "CVYV genotipi" veya ""cyv_3.1 genotipi"nden söz edildiginde, CVYVsye dirençli yabani tipin nükleotidine referansta bulunulur. Dolayisiyla SNP_02 için "direnç genotipi" kromozom 3, 7.693.225°te "C"dir (Sitozin). Diger bir (alternatif) nükleotit, geri melezlemenin olmadigi kültive edilmis karpuzda bulunan nükleotidi belirtir ve WT genotip veya duyarli genotip olarak adlandirilabilir. haplotipi", "direnç haplotipi" veya "cyv_3.1 haplotipi"nden söz edildiginde, cyv_3.1 'e bagli çesitli SNP markörlerinin SNP genotipine referansta bulunur. Örnegin haplotip-A SNP_01, SNP_02 ve SNP_03 için sirasiyla G-G-C nükleotitlerini içerir. Haplotip-B Ha SNP_01, SNP_02 ve SNP_03 için sirasiyla A-G-C nükleotitlerini içerir. pozisyon" ve "kromozom 3", kültive edilmis karpuzun fiziksel genomunu (dünya çapinda ag http://WWW.icugi.org/egi-bin/ICuGI/index.cgi"de "Watermelonz Genome", üzerindeki fiziksel pozisyonu belirtir. Dolayisiyla, örnegin SNP_01 fiziksel olarak kromozom 3, nükleotit 7.586.752"de konumlanmis nükleotitte (veya "baz"da) bulunur, konumlanmis nükleotitte (veya "baz"da) bulunur. Kromozom 3"ün fiziksel büyüklügü 0 ila 28.9 Mbidir. bölgesi", melezlemeyle veya geleneksel yetistirme teknikleriyle, örnegin geriye melezlemeyle (ebeveyn ile melez üretme, backcrossing) ayni türden veya iliskili türlerden baska bir bitkiye dâhil edilen bir kromozom fragmanini (veya kromozom bölümünü veya bölgesini) belirtir, yani geri melezlenmis fragman, "geri melezlemek" fiiliyle belirtilen yetistirme usullerinin (geriye melezleme gibi) sonucudur. Karpuzda, yabani karpuz tipleri, yabani genomun fragmanlarini kültive edilmis karpuz genomu içine geri melezlemek için kullanilabilir. Dolayisiyla böyle bir kültive edilmis karpuz bitkisi bir "kültive edilmis Citrullus lanatus SSp. vulgari's genomuna" sahiptir, ama genomda yabani bir karpuzun bir fragmanini, örnegin Citrullus lanatus ssp. lanatus veya Citrullus lanatus ssp. mucasospermiiftan bir geri melezleme fragmanini içerir. Dolayisiyla örnegin burada bir kültive edilmis karpuz genoinunu ve bu genomda kromozom 3 üzerinde burada cyv_3. 1 adi verilen CVYV direnci veren QTL"yi içeren yabani karpuzdan bir geri melezleme fragmanini haiz kültive edilmis bir karpuz sunulmaktadir. "Geri melezleme fragmani" teriminin hiçbir zaman tam bir kroinozomu içerinedigi, sadece bir kromozomun bir bölümünü içerdigi takdir edilecektir. Geri melezleme fragmani büyük olabilir, örnegin bir kromozomun dörtte üçü veya yarisi olabilir, ama tercihen daha küçüktür, örnegin yaklasik Mb veya daha küçük, örnegin yaklasik 10 Mb veya daha küçük, yaklasik 9 Mb veya daha küçük, yaklasik 8 Mb veya daha küçük, yaklasik 7 Mb veya daha küçük, yaklasik 6 Mb veya daha küçük, yaklasik 5 Mb veya daha küçük, yaklasik 4 Mb veya daha küçük, yaklasik 3 Mb veya daha küçük, yaklasik 2.5 Mb veya 2 Mb veya daha küçük, yaklasik 1 esit) veya daha küçük, örnegin yaklasik 200,000 bp (200 kilo baz çiftine esit) veya daha daha küçük, yaklasik 30,000 bp (30 kb) veya daha küçüktür. CVYV direnci veren QTL cyv_3. l 'i içeren bir geri melezleme fragmanini haiz kültive edilmis karpuzun bir kromozom 3`ü burada bir "rekombinant kromozom 3" olarak da geçmektedir. semptomlarinin olmadigini veya duyarli varyete Sugar Baby gibi duyarli kontrol bitkilerindekinden istatistiksel olarak anlamli ölçüde daha az semptom oldugunu belirtir. CVYV direnci örnegin bir CVYV direnç tahlili kullanilarak veya alternatif olarak dogal CVYV enfeksiyonunun oldugu yetistirme alanlarinda tarlada veya tünelde degerlendirilebilir. Örnegin Ömeklerde açiklandigi gibi çesitli CVYV direnç tahlilleri müinkündür, ama genel olarak bir CVYV direnç tahlili örnegin birçok fidenin ilk açilmis gerçek yapraginin yapay inokülasyonunu, istege bagli olarak ardindan örnegin dört veya bes gün sonra yapragin ikinci bir kez inokülasyonunu, fidelerin ve kontrol bitkilerinin uygun bir süreyle ve uygun kosullar altinda inkübasyonunu ve inokülasyondan sonra bir sonra) degerlendirilmesini içerebilir. Testin basarili olmasi için duyarli kontrolün çok veya daha fazla bitki dâhil edilir ve tercihen birkaç esdeney yapilir. Bir yöne göre, direnç test edilirken, duyarli kontrol hattinin veya varyetesinin bitkilerinin en az %50, %60, %70, en az %70, %80, %90 veya %100"ü hiç semptom göstermezse hat veya varyete dirençli kabul edilir. meyve üzerinde ölçülen ortalama toplam çözünür kati içerigini belirtir. Tercihen her biri kesilip açilmis meyvenin merkezi ile kabugu arasinda ölçülen en az üç meyvenin ortalamasi hesaplanir. Meyve kalitesine iliskin olarak "satilabilir", karpuz meyvelerinin taze tüketime yönelik olarak satilmak için uygun oldugu, lezzetinin iyi oldugu (hiç istenmeyen tada sahip olmadigi), briks derecesinin en az 9.0, tercihen en az 10.0 veya en az 1 1.0 oldugu ve tercihen ayni zamanda tekdüze bir meyve eti rengine sahip oldugu, örnegin beyaz (örnegin Cream of Saskatchewan varyetesi), sari (örnegin Yamato Cream l varyetesi), turuncu (örnegin Tendersweet varyetesi), pembe (örnegin Sadul varyetesi), pembemsi kirmizi (örnegin Crimson Sweet varyetesi), kirmizi (örnegin Sugar Baby varyetesi) veya koyu kirmizi (örnegin Dixie Lee varyetesi) oldugu anlamina gelir. rengin meyve etinin her yerinde esit bir sekilde dagildigi, yani yamali olmadigi anlamina gelir. Dolayisiyla, kirmizi bir meyve, meyve etinin her yerinde kirmizidir ve beyaz yamalar içermez. Tekdüze kirmizi renkli bir meyvenin bir örnegi diploid varyete Premium F1 "dir (Nunhems). Ayni kromozom üzerinde lokuslar arasindaki (örnegin moleküler markörler arasindaki ve/Veya fenotipik markörler arasindaki) "fiziksel mesafe" bazlar veya baz çiftleri (bp), kilo bazlar veya kilo baz çiftleri (kb) veya megabazlar veya mega baz çiftleri (Mb) olarak ifade edilen gerçek mesafedir. Ayni kromozomlar üzerinde lokuslar arasindaki (örnegin moleküler markörler arasindaki ve/veya fenotipik markörler arasindaki) "genetik mesafe" çaprazlanma sikligi veya rekombinasyon sikligiyla (RF) ölçülür ve santimorgan (CM) olarak ifade edilir. Bir CM yaklasik %1 rekombinasyon sikligina karsilik gelir. Hiç rekombinasyon bulunamazsa, RF sifirdir ve lokuslar ya fiziksel olarak son derece yakindir veya özdestir. Iki lokus birbirinden ne kadar uzaksa, RF o kadar yüksektir. özelliklerine iliskindir. Essoylu hatlar, birkaç soy içi üretim jenerasyonuyla üretildikleri için genetik olarak son derece tekdüzedirler. Benzer bir sekilde bu essoylu hatlardan üretilen F 1 hibridleri ve triploid hibridler, genotipik ve fenotipik özellikleri ve performanslari açisindan son derece tek düzedir. karpuza (kültive edilmis C. lanazus ssp. vulgaris kromozom 3 üzerine) geri melezlenmis lokus cyv_3. 1 'de bulunan bir aleli belirtir. Dolayisiyla "CVYV aleli" terimi ayni zamanda farkli yabani karpuzlardan elde edilebilen CVYV alellerini de kapser. Genomdaki lokusta hiç baskin duyarli (yabani tip, WT) alel yoksa (yani diploid karpuzda iki CVYV aleli kopyasi, triploid karpuzda 3 kopya ve tetraploid karpuzda 4 kopya varsa), bitki hatti veya varyetesi CVYV,ye dirençli olacaktir. Geri melezleme fragmaninin olmadigi kültive edilmis karpuz bitkilerinde kromozom 3 üzerinde ayni lokusta bulunan alel burada "yabani tip" alel (WT) olarak geçinektedir. cyv_3.1 resesif oldugu için, CVYV direnç fenotipini eksprese etmek için hiçbir yabani tip alelin bulunmasi gerekmez. Dolayisiyla, CVYV direnç fenotipini eksprese etmek için iki rekombinant kromozom 3 (diploid karpuz hatlari veya varyetelerinde), üç rekombinant kromozom 3 (triploid karpuz hatlari veya varyetelerinde) veya dört rekombinant kromozom 3`ün (tetraploid karpuz hatlari veya varyetelerinde) bulunmasi gerekir. Burada sunulan SNP genotipleri ve SNP haplotipleri cyv_3.] ,i içeren geri melezleme fragmaninin varligini gösterir. Bir özellik (CVYV direnci gibi) veren bir genetik öge, bir geri melezleme fragmani veya bir gen veya alel, bulundugu bitkiden veya tohumdan bulunmadigi baska bir bitkiye veya tohuma (örnegin CVYV'ye duyarli bir hatta veya varyeteye), genetik öge, lokus, geri melezleme fragmani, gen veya alel tarafindan verilen özelligin ilave edilmesi disinda alici bitkide fenotipik bir degisiklige yol açmadan geleneksel yetistirme teknikleri kullanilarak aktarilabiliyorsa, bitki veya tohum veya doku veya hücreden "elde edilebilir" oldugu söylenebilir veya "elde edilebilir" veya "türetilebilir" oldugu söylenebilir veya veya ""bulunabilir". Terimler alternatifli olarak kullanilmaktadir ve genetik öge, lokus, geri melezleine fragmani, gen veya alel bu sekilde, Özelligi içermeyen herhangi bir baska genetik zemine aktarilabilir. Sadece tevdi edilen ve genetik öge, lokus, geri melezleme fragmani, gen veya aleli içeren tohumlar degil, ayni zamanda tevdi edilen tohumlardan veya bunlarin altsoylarindan veya atalarindan gelistirilen ticari varyeteler gibi, genetik öge, lokus, geri melezleme, gen veya aleli korumak üzere seçilmis bu tür tohumlarin silsilesi/altsoylari da kullanilabilir ve burada kapsanmaktadir. Benzer bir sekilde, genetik Öge, lokus, geri melezleme fragmani, gen veya aleli (örnegin cyv_3.1 veya bunun bir varyantini) içeren baska yabani kaynaklar belirlenebilir ve kültive edilmis karpuza aktarim için kullanilabilir. Bir bitkinin (veya bir bitkinin genomik DNA°si, hücresi veya dokusu) tevdi edilen tohumlardan elde edilebilenle ayni (veya varyant) genetik öge, lokus, geri melezleine fragmani, gen veya aleli içerip içermedigi, bu alanda uzman olanlar tarafindan, fenotipik tahliller, tam genom dizileme, moleküler markör analizi, özellik esleme, kromozom boyama, alelizm testleri ve bunun gibi bu alanda bilinen bir veya daha fazla teknik veya teknikler kombinasyonu kullanilarak belirlenebilir. Bir "Varyant" veya "ortolog" dizi veya bir "varyant cyv_3.1", NCIMB42449°da veya bitkisinden elde edilen CVYV direnci veren bir QTL (cyv_3.1) veya QTL,yi içeren bir geri inelezleine fragmanini belirtir, ama bu varyant cyv_3.1 ,e bagli, SNP markörünün/ markörlerinin veya SNP haplotiplerinin bir veya daha fazla direnç genotipini içerir ve burada varyant genomik dizi SNP7yi içeren DIZI ID NO'ya (DIZI ID NO: 1, DIZI ID NO:2 veya DIZI ID NO: 39ün herhangi biri) öneinli dizi özdesligi, yani en az %85, %90, dizideki SNP orijinal DIZI ID NO,daki SNP"nin pozisyonuna "karsilik gelen bir nükleotitte" veya "karsilik gelen bir nükleotit pozisyonunda" oldugu söylenir. Dolayisiyla, orijinal dizi ve varyant dizi bütün uzunluk boyunca ikili olarak hizalandiginda, örnegin orijinal dizide 76. pozisyondaki bir SNP, varyantta, orijinal dizideki 76. nükleotide karsilik gelen nükleotitte bulunacaktir. Dolayisiyla, burada spesifik bir genomik dizide (DIZI ID NO: 1 ila DIZI ID NO: 3°ten seçilmis) belirli bir SNP direnç genotipinden söz edildiginde, bu, genomik dizinin varyantlarindaki SNP direnç genotipini, yani sözü edilen diziye (DIZI özdesligi içeren bir genoinik dizideki SNP direnç genotipini de kapsamaktadir. Dolayisiyla bir yöne göre burada DIZI 1D NO: 1 ila ?Yün herhangi birine yapilan herhangi bir referans DIZI ID NO: 1 ila 3°ün herhangi birinin bir varyantini da kapsar, varyant sözü edilen genotipini, örnegin SNP_02 ve SNP_031ten seçilen bir veya daha fazla SNP markörünün karpuz genomuna spesifik markörün genotipini belirleyerek, kültive edilmis karpuz kromozomu 3 üzerinde yabani bir karpuzdan bir geri melezlemenin olup olmadigini, hangi geri melezleme fragmaninin CVYV direnci QTUyi (cyv_3.1 veya varyanti) içerdigini (veya bir yabani karpuz tipinin genomunda cyv_3.1 'i veya bunun bir varyantini içerip içermedigini) test etmek için kullanilabilen bir moleküler markör tahlilini belirtir. bir mesafe içindeki herhangi bir yabani karpuz genomuna spesifik markörün genotiplenmesini de içerebilir. ölçümün aritmetik ortalamasini belirtir. Bu alanda uzman olanlar, bir bitki hattinin veya varyetesinin fenotipinin bir dereceye kadar yetistirme kosullarina bagli oldugunu ve dolayisiyla tercihen çesitli esdeneylerle ve ayni deneyde ayni kosullar altinda yetistirilen uygun kontrol bitkileriyle (örnegin Sugar Baby varyetesinden veya herhangi bir baska CVYV,ye duyarli varyete veya hattan bitkiler) randomize deneysel dizaynlarda en az 10, edeceklerdir. "Istatistiksel olarak anlamli" veya "istatistiksel olarak anlamli bir sekilde" farkli veya "anlamli bir sekilde" farkli, uygun bir kontrolle karsilastirildiginda kontrole (kontrolün ortalamasina) göre bir özellik açisindan istatistiksel olarak anlamli bir fark (örnegin ANOVA kullanilarak p degeri 0.05"in altinda, p < 0.05) gösteren bir bitki hattinin veya varyetesinin o özelligini belirtir. edilmesini, taniinlaninasini ve/veya aktarilmasini saglayan, hepsi yetistirici tarafindan bilinen melezleme, geriye melezleme, özdöllenme, seçim, ikili haploid üretimi, kroinozomu ikiye katlama, ogulcuk kurtarma, protoplast füzyonu, markör destekli seçim, mutasyonla islah ve benzerini (yani genetik modifikasyon / transformasyon /transgenik usuller disindaki usuller) kapsamaktadir. genetik zeminden (örnegin bir yabani karpuz; "verici" olarak da geçer) baska bir (çogunlukla bir üst) genetik zemine ("yinelenen ebeveyn" olarak da geçer) örnegin kültive edilmis karpuza aktarilabildigi bir islah usulünü belirtmektedir. Bir melezin (örnegin bir yabani karpuz kültive edilmis bir karpuzla melezlenerek elde edilen bir F1 bitkisi veya F1 ,in özdöllenmesinden elde edilen bir F2 bitkisi veya F3 bitkisi ve benzeri) bir yavrusu, üst genetik zemine sahip ebeveyne, örnegin kültive edilmis ebeveyne "geri çaprazlanir". Tekrarlanan geriye melezlemenin ardindan, bir (çogunlukla alt) genetik zeminin özelligi diger (çogunlukla) üst genetik zemine dâhil edilecektir. geri inelezleine fragmani) varligina göre seçmek için, spesifik bir lokusa veya spesifik bir kromozom bölgesine (örnegin geri melezleme fragmani) genetik olarak bagli olan moleküler markörlerin (SNP markörleri gibi) varliginin kullanildigi bir islemdir. Örnegin genetik olarak CVYV direnci QTL"ye bagli bir moleküler markör, kromozom 3 üzerinde QTL içeren karpuz bitkilerini veya bitki bölümlerini saptamak ve/veya seçmek için kullanilabilir. Moleküler markörün genetik baglantisi lokusa ne kadar yakinsa, markörün mayotik rekombinasyonla lokustan ayrilmasi o kadar düsük ihtimaldir. Benzer bir sekilde, iki inarkör birbirine ne kadar yakindan bagliysa, iki markörün birbirinden ayrilmasi 0 kadar düsük ihtimaldir (ve bir birim olarak birlikte ayrilmalari o kadar büyük ihtimaldir). bir moleküler markör, fiziksel olarak markörün yanindaki (yani her bir yanindaki) genomik Mb, 74kb, 50kb, 20kb, 10kb, Skb, 2kb, lkbssi veya daha azi içinde olan bir markörü belirtir. Örnegin, cyv_3. 1 'i içeren yabani karpuzdan geri melezlenen bir bölgeyi gösteren Sekil liin diyagramina bakiniz, burada diyagramda büyütülmüs bölgenin 5Mb,si içinde olan markörler gösterilmektedir. baglanti analizi için siklikla kullanilan istatistiksel bir testtir. LOD skoru, iki lokus (moleküler markör lokuslari ve/Veya bir fenotipik özellik lokusu) gerçekten baglantili ise test verilerini elde etme ihtimalini, tamamen sans eseri ayni verileri gözlemleme ihtimaliyle karsilastirir. Pozitif LOD skorlari baglantinin varligini destekler ve 3.0,in üzerindeki bir LOD skoru baglantinin kaniti olarak kabul edilir. +3 olan bir LOD skoru, 1000°e l ihtimalle gözlemlenen baglantinin sans eseri olusinadigini gösterir. transformasyonla bir bitkinin genomu içine dâhil edilmis bir rekombinant gen gibi bir DNA dizisi içeren bir genetik lokusu belirtmektedir. Genomu içine kalici bir sekilde entegre olmus bir transgen içeren bir bitki "transgenik bitki" olarak adlandirilir. Bir "izole edilmis nükleik asit dizisi" veya "izole edilmis DNA", artik izole edildigi dogal ortamda olmayan bir nükleik asit dizisini, örnegin bir bakteriyel konakçi hücre içindeki veya bitki nükleer veya plastid genomu içindeki bir nükleik asit dizisini belirtir. Burada bir Bir "konakçi hücre" veya bir "rekombinant konakçi hücre" veya "transforme edilmis hücre", terimleri sözü edilen hücre içine dahil edilmis, en az bir nükleik asit molekülünün bir sonucu olarak ortaya çikan yeni bir münferit hücreyi (veya organizmayi) belirtmektedir. Konakçi hücre tercihen bir bitki hücresi veya bakteriyel bir hücredir. Konakçi hücre nükleik asidi kromozom disi (epizomal) replike olan bir molekül olarak içerebilir veya konakçi hücrenin nükleer veya plastid genomuna entegre edilmis veya dâhil edilmis kromozom, örnegin minikromozom olarak içerir. iki peptit veya iki nükleotit dizisinin hizalanmasiyla belirlenebilir. Diziler örnegin GAP veya BESTF IT programlariyla veya Emboss programi "Needle" (varsayilan parametreler kullanilarak, asagiya bakiniz) ile optimal olarak hizalandiklarinda en azindan belirli bir minimal dizi özdesligi yüzdesini (asagida tanimlandigi gibi) paylastiklari zaman "esas itibariyla özdes", veya "esas itibariyla benzer" olarak adlandirilabilir. Bu programlar, uygun çiftlerin sayisi en yüksege çikarilarak ve uyusmazliklarin sayisi en aza indirilerek, bütün uzunluk boyunca iki diziyi hizalamak için Needleman ve Wunsch global hizalama algoritmasini kullanilir. Genellikle, varsayilan parametreler kullanilir; açiklik yaratim cezasi = 10 ve açiklik uzatina cezasi = 0.5 (hem nükleotit hem protein hizalamalari için). Nükleotitler için, kullanilan varsayilan puanlama matrisi DNAFULL"dur ve proteinler için 10919). Dizi hizalamalari ve dizi özdesligi yüzdesi için puanlar örnegin dünya çapinda agda, ebi.ac.uk/Tools/psa/emboss_needle/ altinda bulunan EMBOSS gibi bilgisayar programlari kullanilarak belirlenebilir. Alternatif olarak dizi benzerligi veya özdesligi FASTA, BLAST ve bunun gibi veri tabanlari aranarak belirlenebilir, ama dizi özdesligini karsilastirinak için isabetlerin alinmasi ve ikili olarak hizalaninasi gerekir. Dizi özdesligi varsayilan parametreler, yani açiklik yaratim cezasi : 10, açiklik uzatma cezasi : 0.5 kullanilarak, nükleik asitler için DNAFULL ve proteinler için Blosum62 puanlama matrisi kullanilarak belirlendigi üzere) iki protein veya iki protein sahasi veya iki nükleik asit dizisi "önemli dizi özdesligi ne sahiptir. Bir referans diziye "önemli dizi özdesligi"ne sahip veya bir referans diziye en az %80, özdesligine sahip bir nükleik asit dizisinden (örnegin DNA veya genomik DNA) söz edildiginde, bir düzenlemede sözü edilen nükleotit dizisi verilen nükleotit dizisine esas itibariyla özdes kabul edilir ve zorlayici hibridizasyon kosullari kullanilarak tanimlanabilir. Baska bir düzenlemede, nükleik asit dizisi verilen nükleotit dizisiyle karsilastirildiginda bir veya daha fazla mutasyon içerir, ama yine de zorlayici hibridizasyon kosullari kullanilarak tanimlanabilir. nükleotit dizilerini belirlemek için kullanilabilir. Zorlayici kosullar diziye baglidir ve farkli durumlarda farkli olacaktir. Genel olarak zorlayici kosullar, tanimli bir iyon gücü ve pH,de spesifik diziler için termal erime noktasinin (Tm) yaklasik 5°C asagisi olacak sekilde seçilir. Tm, hedef dizinin %507sinin tamamen uyumlu bir proba hibridize oldugu sicakliktir (tanimli iyon gücü ve pH°de). Tipik olarak zorlayici kosullar tuz konsantrasyonunun pH 7"de yaklasik 0.02 molar oldugu ve sicakligin en az 60°C oldugu kosullardir. Tuz konsantrasyonunun düsürülmesi ve/veya sicakligin arttirilmasi zorlayiciligi arttirir. RNA-DNA hibridizasyonlari (örnegin 100 nt bir probun kullanildigi Northern blot°lar) için zorlayici kosullar, örnegin 20 dakika 63°C°de 0.2X SSClde en az bir yikamayi içerenler veya esdeger kosullardir. DNA-DNA hibridizasyonu (100 nt bir probun kullanildigi Southern blot"1ar) için zorlayici kosullar, örnegin 20 dakika en az 50°C, genellikle yaklasik 55°C bir sicaklikta yikamayi içerenler veya esdeger kosullardir. Örnegin bakiniz: Sambrook ve digerleri (1989) ve Sambrook ve Russell (2001). direncinin ayni gen veya lokus tarafindan mi yoksa farkli genler veya lokuslar tarafindan m1 belirlendiginin test edilebilmesini saglayan bir genetik testi belirtmektedir. Örnegin test edilecek bitkiler birbiriyle inelezlenir (tercihen homozigot olinalarini garantilemek için özdöllenmeden sonra), F1 veya sonraki özdöllenme veya geriye melezleme silsilesi arasindan fenotiplerin ayrilmasi belirlenir. Ayrilma oranlari, genlerin veya lokuslarin alelik mi yoksa farkli oldugunu belirtir. Dolayisiyla örnegin aleller ayni gendense, F1 bitkilerinin (iki homozigot bitkinin melezlenmesiyle üretilmis) hepsi (%100) ayni fenotipe sahip olacaktir, ama aleller farkli genlerdense bu olmayabilir. Benzer bir sekilde, F2 bitkilerinde fenotipik ayrilma ayni genlerin mi farkli genlerin mi söz konusu oldugunu gösterecektir. belirlenebildigi usulleri belirtmektedir. Örnegin özellik açisindan ayrilan büyük bir popülasyon, kromozom 3 üzerinde özelligin (örnegin CVYV) ve DNA markörlerinin ayrilmasi açisindan analiz edilebilir ve QTL'nin hangi SNP markörleri çifti arasinda bulundugunu belirlemek için, CVYV direnç lokusunu (Sekil l°de çizgili alana bakiniz) içeren kromozom 3 bölgesinde rekombinasyon olaylari içeren bitkiler seçilebilir. QTLlnin bulundugu araligi daraltmak için en bagli markör çifti arasinda ek markörler için de arama yapilabilir. Sekil 1 sol taraftaki diyagramda, SNP markörlerinin her bir yaninda 5 Mb"1ik bir bölgeyi kapsayan yabani karpuzdan bir geri melezleme fragmanini (çizgili bölge) içeren bir rekombinant kromozom 3 gösterilmektedir. Kültive edilmis karpuz bölgeleri çizgili degildir (beyaz). Iki genislemede (orta ve sag diyagram), SNP genotipleri ve konumlari (kromozom konumu Mb ile belirtilir, örnegin SNP_01 için 7.5 Mb ve SNP_04 için 7.7 Mb) dâhil olmak üzere CYCV°ye dirençli ve ZYMV"ye duyarli bir bitki (orta diyagram) için ve CVYV"ye dirençli ve ZYMV,ye dirençli bir bitki (sag diyagram) için SNP markörleri SNP_01 ila SNP_04 gösterilmektedir: SNP_0.1 halotipe bagli olarak AA veya GG olabilir; SNP_02 direnç genotipi GG°ye sahiptir; SNP_03 direnç genotipi CC"ye sahiptir; ve SNPý04 TT genotipine (ZYMV duyarliligini gösterir) veya GG genotipine (ZYMV direncini, yani homozigot formda zym lokusunu içeren bir bölgenin (çizgili bölge) varligini gösterir) sahiptir. AYRINTILI ACIKLAMA Bulus sahipleri, yabani karpuz tiplerinin kromozom 31ü üzerinde, CVYV direnci veren bir lokus içeren, bir resesif QTL tespit ettiler. Direnç veren QTUye bagli iki farkli haplotip saptadilar: haplotip A SNP_01, SNP_02 ve SNP_037te sirasiyla G-G-C nükleotitlerini içeriyordu ve haplotip B SNP_01, SNP_02 and SNP_033te sirasiyla A-G-C nükleotitlerini içeriyordu. Ayrica, SNP_02 ve SNP_03 (her iki direnç haplotipinin iki yaygin SNP`si) cyv_3.1 lokusuna sikica bagliydi ve QTL cyv_3.1 ,i, iki farkli yabani karpuz tipinden CVYVaye duyarli kültive edilmis karpuza geriye melezlemek, böylece satilabilir meyveler üreten kültive edilmis karpuza CVYV direnci vermek için kullanildi. Homozigot formda cyv_3. I içeren iki diploid essoylu hattin tohumlari, Nunhems B.V. Bu iki hat, homozigot formda SN P_02 ve SN P_O3 içerir ve SNP haplotipi Biye sahiptir. Meyveler briks degeri 11.0 olan çekirdekli, kirmizi etli meyvelerdir ve satilabilir meyvelerdir. Bitkiler CVYV,ye dirençli ve ZYMV,ye duyarlidir (ve ayrica Ling ve digerlerinin (2008, yukarida) eIF4E markörünü içetmez). Hatlarin biri Crimson Sweet tipi bir kabuga sahiptir (NCIMB bir Jubilee kabuguna (Premium F1 "deki gibi) sahiptir. Ortalama meyve agirligi sirasiyla 7 kg ve 8 kg"dir. Ayrica ortalama meyve agirliklari yaklasik 2 kg ila yaklasik 12 kg olan, cyv_3.1 lokusunu içeren bir dizi kültive edilmis essoylu hat üretildi. Homozigot formda cyv_3. I içeren baska bir diploid elit essoylu hattin tohumlari Nunhems B.V. tarafindan NClMB 42666 erisim numarasiyla NClMB,ye tevdi edildi. Bu hat homozigot formda SNP_02 ve SNP_03 içerir ve SNP haplotipi Aiya sahiptir. Meyveler çekirdekli, kirmizi etli, satilabilir meyvelerdir. Tablo 1 - Dünya çapinda ag icugi.org/cgi-bin/ICuGI/index.Cgi"de "Watermelonz Genome", genomunun kromozom 3,ü üzerindeki ayi/_31,6 bagli SNP markörleri ve SNP konumu SNP C. lanatus ssp. C. [anatus ssp. cyv_3.] Dizinin 76. nükleotidinde SNP markör mucasospermus, lanatus 'tan içermeyen içeren genomik dizi (5* - 37 yönü) ve adi tan cyv_3.1 cyv_3. 1/ karpuz kültive edilmis karpuz kromozomu 3 melezleme melezleme (WT/ WT) *Nükleotit 7.586.7529de bulunur *Nükleotit 7.664.093,te bulunur *Nükleotit 7.693.225°te bulunur Fenotip CVYV dirençli CVYV dirençli CVYV duyarli SNP Direnç Haplotipi Direnç haplotip A: SNP_01, Haplotipi B: SNP_03 için SNP_02 ve G-G-C SNP_03 için Cyvý3. I içeren diploid kültive edilmis karpuz bitkileri, tohumlari ve bitki bölümleri Bulus bir yönüyle Citrullus lanatus ssp. vulgaris türü diploid kültive edilmis bir karpuz bitkisi(nin tohumu) suninakta olup, burada sözü edilen bitki kromozom 3 üzerinde bir yabani karpuz bitkisinden bir geri melezleme fragmani içerir, burada sözü edilen geri melezleme fragmani CVYV direnci veren bir lokus içerir ve istege bagli olarak asagidakilerden olusan gruptan seçilen bir markörle saptanabilir (veya böyle bir markör a) DIZI ID NO: 2'nin (SNP_02) 76. nükleotidinde veya DIZI ID NO: 23ye en az %90, 76. nükleotidinde bir Guanin (G); ve/veya b) DIZI ID NO: 3"ün (SNPIO3) 76. nükleotidinde veya DIZI ID NO: 3"e en az %90, 76. nükleotidinde bir Sitozin (C); ve/Veya (istege bagli olarak) kb, 20kb, 10kb, 5kb, 2kb, lkb'si veya daha azi içinde yabani karpuz genomuna spesifik bir moleküler markör. Dolayisiyla yukaridaki karpuz bitkisi kromozom 3 (cyv_3.] içeren) üzerinde, SNP_02 ve/veya SNP_03 direnç genotipiyle ve/veya istege bagli olarak SNP_02 veya SNP-03'ün 5Mb`si içinde yabani karpuz genomuna spesifik baska bir markörle saptanabilen bir geri melezleme fragmani içerir. SNP_02 ve SNP_03 QTL°ye siki sikiya bagli oldugu halde, SNP_02"yi ve/veya SNP_"de sözü edildigi gibi cyv_3.1 'e siki sikiya bagli yabani karpuz genomuna spesifik bir veya daha fazla farkli markörü koruyan geri melezleme fragmanlari üretmek mümkündür. Bu alana yapilan önemli katki, geri inelezleme fragmanin burada cyv_3.1 olarak geçen CVYV direnç lokusunu içermesidir. CVYV direnç lokusu heterozigot formda olabildigi (sadece bir rekombinant kromozom 3 bulunabildigi) için bitkinin fenotipik olarak CVYV'ye dirençli olmasi gerekmez. Dolayisiyla SNP_02 için diploid genotip heterozigot GA (Guanin/Adenin) veya homozigot GG (Guanin/Guanin) olabilir ve SNP-03 için diploid genotip heterozigot CT (Sitozin/Timin) veya homozigot CC (Sitozin/Sitozin) olabilir. Baska bir deyisle, bir bitki DIZI ID NO: 2°nin (SNP-02) 76. nükleotidinde veya bir varyant veya %99 dizi özdesligini haiz bir dizide DIZI ID NO: 2'nin 76. nükleotidine karsilik gelen bir nükleotitte sadece bir Guanine (G) ve DIZI ID NO: 3 ,ün (SNP_03) 76. nükleotidine karsilik gelen bir nükleotitte sadece bir Sitozine sahip olarak geri melezleme fragmani (ve QTL) için heterozigot olabilir; veya DIZI ID NO: 2Snin (SNP-02) 76. nükleotidinde veya bir varyant dizide, yani DIZI ID NO: 2"ye en az %90, %91, %92, %93, 76. nükleotidine karsilik gelen bir nükleotitte iki Guanine sahip olarak ve DIZI ID NO: 3 "ün (SNP_03) 76. nükleotidinde veya bir varyant dizide, yani DIZI ID NO:3 "e en az %90, DIZI ID NO:3,ün 76. nükleotidine karsilik gelen bir nükleotitte iki Sitozine (C) sahip olarak geri melezleme fragmani (ve QTL) için homozigot olabilir. Ayni sey yukarida c)°de cyv_3.1 e bagli yabani karpuz genomuna spesifik markörler için de geçerlidir, yani bu markör heterozigot veya homozigot olabilir. c)"deki markörler örnegin bölge dizilenerek belirlenebilir. Bu markörler cyv-3.] 'e bagli olan ve yabani karpuz genoinik DNA°si ve kültive edilmis karpuz genomik DNA7s1 arasinda polimorIik olan markörler, örnegin SNP markörleri, bir veya daha fazla nükleotiteklentileri veya silintileri (örnegin INDEL markörleri), AFLP markörleri ve benzeri olabilir. Bir yöne göre, geri melezleme fragmani homozigot formdadir ve CVYV lokusu cyv_3. ] 'i içeren geri melezleme fragmani homozigot formdadir, böylece bitki bir CVYV direnç tahlilinde ve/Veya bir moleküler inarkör tahlilinde belirlenebildigi gibi CVYV"ye dirençlidir, Dolayisiyla bir yöne göre SNP_O2, SNP_O3 ve/veya yabani karpuz genomuna spesifik markör homozigottur, yani SNP_OZ ve SNP_O3 sirasiyla direnç genotipi GG ve CC,ye sahiptir ve bitki bir CVYV direnç tahlilinde test edildigi ve tercihen ayni zamanda dogal CVYV basinci altinda tarlada veya tünelde yetistirildigi zaman CVYV,ye dirençlidir. Sözü edildigi gibi, yabani karpuz genomuna spesifik markörler, cyv_3.] 'i içeren geri melezleme fragmani üzerinde bulunan ve geri melezleme fragmanini kültive edilmis karpuz kromozom 3 bölgesinden (cyv_3.1 'i içermeyen WT genotipi) ayirt eden herhangi bir tipte moleküler markör, örnegin bir veya daha fazla SNP markörü, CAPS markörü, RFLP markörü, AFLP markörü, mikrouydu markörü, miniuydu markörü, bir veya daha fazla nükleotit eklentisi veya silintisi (örnegin INDEL°ler) olabilir. Dolayisiyla, "yabani10 karpuz genomuna spesifik bir moleküler markör", cyvý3.] içeren yabani karpuz genomu geri melezleine fragmani ile geri inelezleine fragmanini içerineyen kültive edilmis karpuz genoinu arasinda polimorfik veya ayirt edici olan bir markördür. Polimorfik SNP markörleri burada sunulmustur, ancak bu alanda uzman olanlar tarafindan, örnegin geri melezleme fragmanini içeren kromozom 3 üzerindeki bölgenin eslenmesi veya ince eslenmesi veya dizilenmesiyle kolayca baska markörler gelistirilebilir. Örnegin homozigot formda geri melezleme fragmanini içeren, tevdi edilmis bitkilerin kromozom 3 bölgesi kb, 50 kb, 20 kb, 10 kb, 2 kb, 1 kb"si veya daha azi içindeki baska yabani karpuz genomuna Spesifik moleküler markörleri, yani SNP_2 ve/veya SNP_03°e bagli ve dolayisiyla cyvý3. 1"i içeren geri melezleine fragmanini gösteren baska yabani karpuz genomuna spesifik markörleri tanimlamak için kültive edilmis karpuz kromozomu 3aün ayni bölgesiyle karsilastirilabilir. Dolayisiyla, bir yöne göre sözü edilen geri melezleme fraginani asagidakilerden olusan gruptan seçilen bir markörle saptanabilir (veya böyle bir markörü içerir): bir diploid genotip GG (Guanin/Guanin); ve/veya bir bir diploid genotip CC (Sitozin/Sitozin); ve/veya kb, 20kb, 10kb, 5kb, 2kb, 1kb`si veya daha azi içinde yabani karpuz genomuna spesifik bir moleküler markör, bu markör homozigot formdadir. Burada spesifik bir pozisyonda, örnegin DIZI ID NO: 2,nin veya "DIZI ID NO: 29ye en az dizinin" 76. nükleotinde bir SNP genotipinden söz edildiginde, bu, SNP genotipinin bir (örnegin DIZI ID NO: 2,nin 76. nükleotidine karsilik gelen) bir nükleotitte bulundugu anlamina gelir. Örnegin, varyant dizi bir veya daha fazla nükleotit kisa olabilir, ama sözü edilen DIZI 1D NO"yu haiz varyant dizi ikili olarak hizalandiginda, varyant dizinin hangi10 nükleotidinin ayni nükleotide karsilik geldigi görülebilir. Varyant dizide bu örnegin, sözü edilen dizinin 76. nükleotidine karsilik gelen varyant dizinin 75 veya 77 numarali nükleotidi olabilir. Dolayisiyla yukaridaki bitki Örneklerde açiklandigi gibi bir CVYV direnç tahlilinde veya CVYVinin dogal olarak olustugu bölgelerde tarlada veya tünelde belirlenebildigi gibi, fenotipinde CVYV" ye dirençlidir. Bir CVYV direnç tahlilinde hat veya varyetenin birçok (örnegin 2, 3, 4 veya daha fazla) ve istege bagli olarak birkaç yerde ve ayni tahlile duyarli bir kontrol varyetesinin birçok bitkisi dâhil edilerek test edildigi takdir edilecektir. Tevdi edilen hatlarin tohumlari pozitif bir kontrol olarak dâhil edilebilir. Bütün mevcut karpuz varyeteleri CVYV7ye duyarlidir, dolayisiyla duyarli kontrol olarak herhangi bir varyete veya herhangi bir varyetenin ebeveyn hatti, örnegin eski diploid varyete Sugar Baby kullanilabilir veya Dumara (Nunhems) kullanilabilir. Bulusun spesifik bir düzenlemesinde, Citrullus lanatus ssp. vulgari's türü bir diploid kültive edilmis karpuz bitkisi(nin tohumu) sunulmakta olup, burada sözü edilen bitki kromozom 3 üzerinde bir yabani karpuz bitkisinden bir geri melezleme fragmani içerir, burada sözü edilen geri melezleme fragmani CVYV direnci veren bir lokus içerir ve asagidakilerle saptanabilir (veya asagidakileri içerir): bir Guanin (G); ve/veya bir Sitozin (C). Bitki homozigot veya heterozigot formda CVYV direnç lokusu içerir. Bir yöne göre, bitki homozigot formda geri melezleme fragmanini içerir, yani geri melezleme fraginani asagidakilerle saptanabilir (veya asagidakileri içerir): bir diploid genotip GG (Guanin/Guanin); ve/veya bir diploid genotip CC (Sitozin/Sitozin). Yukarrdaki diploid bitkiler bir düzenlemede SNP haplotip A veya SNP haplotip B`ye sahiptir. Dolayisiyla, bir yöne göre bitkiler SNP_01 - SNP_02 ve SNP_03 için sirasiyla G- G-Ciye sahip SNP haplotip A`yi içerir (örnegin diploid formda, SNP haplotip A ya homozigot forinda GG-GG-CCldir veya heterozigot formda GG-GA-CTdIr). baska bir yönde, bitki SNP_01, SNP_02 ve SNP_03 için sirasiyla A-G-C° ye sahip SNP haplotip B"yi içerir (örnegin diploid formda SNP haplotip A homozigot formda AA-GG-CCdir veya heterozigot forma AG-GA-CT°dir). Dolayisiyla DIZI ID NO: 1*in (SNP_Ol) veya DIZI ID özdesligini haiz bir dizinin 76. nükleotidinde, SNP genotipi bir Guanin veya bir Adenin olabilir. SNP_01 iki farkli direnç haplotipini ayirt edebilir. Yukarida açiklanan diploid karpuz bitkilerinin herhangi biri herhangi bir tipte olabilir, yani cyv_3. I direnç lokusu CVYV lokusunu içeren hatlar veya varyeteler üretmek için herhangi bir kültive edilmis karpuza dâhil edilebilir. Kültive edilmis karpuzlar farkli meyve altinda, hatta 0.65 kgiye esit veya daha az; yaklasik 1.4 ila 3.2 kg (yaklasik 3-7 libre) bir kisilik büyüklükler; yaklasik 2.7 ila 5.5 kg (yaklasik 6-12 libre) buzdolabi büyüklükleri; ve yaklasik 15.9 kg"ye (35 libre) kadar daha fazla büyüklükler), meyve eti renkleri ve meyve sekilleri ve farkli kabuk renkleri üretir. Dolayisiyla cyv_3.1 lokusu islahla, kültive edilmis karpuza dâhil edilerek, herhangi bir meyve sekli (örnegin uzun, oval uzun, bloklu, bloklu uzun, küresel veya yuvarlak), meyve yüzeyi (örnegin kirisik, düz), meyve eti rengi (örnegin kirmizi, koyu kirmizi, açik parlak kirmizi, mercan kirmizisi, turuncu, somon rengi veya pembe, sari, kanarya sarisi veya beyaz), kabuk rengi (örnegin açik yesil; koyu yesil; dar, orta genislikte veya genis çizgili yesil; gri çesitleri; noktali veya noktasiz; Golden sarisi; Crimson tipi kabuk, Jubilee tipi kabuk; Allsweet tipi kabuk; siyah/koyu yesil), kabuk kalinligi, kabuk sertligi, kabuk deseni (örnegin çizgili, çizgisiz, ag gibi), meyve eti yapisi/meyve eti sertligi, likopen ve/veya vitamin içerigi, farkli seker:asit oranlari, çok iyi meyve tadi ve benzeri üretilebilir. Örnegin meyve özellikleri için genleri açiklayan Guner Genel olarak önemli islah amaçlari erken olgunluk, yüksek meyve verimi, yüksek iç meyve kalitesidir (iyi tek düze renk, yüksek seker, uygun seker:asit orani, iyi tat, yüksek vitamin10 ve likopen içerigi, siki meyve eti yapisi, lifsiz meyve eti dokusu, içte bosluk, kabuk nekrozu, çiçek burnu çürügü veya çapraz dikis gibi kusurlarin olmamasi ve iyi kabuk özellikleri ve çatlama direnci). Diploid hat veya varyete tarafindan üretilen meyveler tercihen satilabilir meyvelerdir. tercihen en az 11.0 veya daha fazladir. Meyve rengi kirmizi, koyu kirmizi, açik parlak kirmizi, mercan kirmizisi, turuncu, somon rengi, pembe, pembemsi kirmizi, sari, kanarya sarisi veya beyaz gibi herhangi bir renk olabilir. Tercihen meyve eti rengi tek düzedir. Diploid bir essoylu hat veya iki essoylu hat melezlenerek üretilen bir diploid hibrid olabilir. Bir yöne göre her iki essoylu ebeveyn hatti, hibridin de homozigot olmasi için cyv_3.1 için homozigottur. Diploid bitki bir essoylu hat, bir varyete, bir diploid F1 hibrid, açiklandigi gibi satilabilir meyveler üreten özel bir polen tasiyici) veya klonal olarak çogaltilmis herhangi bir bitki de dâhil olmak üzere herhangi bir baska kültive edilmis diploid olabilir. CVYV direnci fenotipi tercihen fenotipik olarak eksprese edildigi için, cyv_3.] 'e bagli markörlerin biri veya daha fazlasi gibi, geri melezleme fragmani da bir yönde diploidde homozigottur. Cyv_3.1 içeren yabani karpuz geri melezleme fragmani çesitli büyüklüklerde, örnegin yaklasik 15Mb veya daha az, yaklasik 10 Mb veya daha az, yaklasik 9 Mb veya daha az, yaklasik 8 Mb veya daha az, yaklasik 7 Mb veya daha az, yaklasik 6 Mb veya daha az, yaklasik 5 Mb veya daha az, yaklasik 4 Mb veya daha az, yaklasik 3 Mb veya daha az, daha az veya yaklasik 0.5 Mb (500,000 baz çiftine esit) veya daha az, örnegin yaklasik olabilir. Daha küçük geri melezleme fragmanlari, negatif Özellikler ayni fragman üzerinde olabildigi için genellikle tercih edilir. Bir geri melezleme fragmaninin büyüklügü, mayotik rekombinasyonla (örnegin bitkinin özdölleninesiyle) ve örnegin burada açiklandigi gibi bir fenotipik tahlil ve/veya bir moleküler markör tahlili kullanilarak daha küçük bir geri melezleme fragmanina sahip, ama cyv_3.1 'i koruyan rekombinant silsile bitkileri seçilerek azaltilabilir. Rekombinasyonla SNP_01 ve/veya SNP_02 ve/veya SNP_03 kaybedilir, ama10 bitki cyvý3. 1 lokusunu korursa, cyvý3.] 'i koruyan bir bitkiyi seçmek için fenotipik seçim kullanilabilir ve/Veya geri melezleine fragmani baska bir usul kullanilarak, örnegin QTL"nin bulundugu kromozom 3 bölgesi (örnegin kromozom 3lün yaklasik 2.50 Mb ile yaklasik 12.8 Mb,si arasindaki bölge) veya cyv_3.1 'e bagli baska yabani karpuz genoinuna spesifik markörler dizilenerek saptanabilir. Bu baska yabani karpuz genomuna spesifik markörler ince esleme, dizileme ve bunun gibi bu alanda uzman olanlarin bildigi usuller kullanilarak gelistirilebilir. Bir yönüne göre bulusun geri melezleme fragmani (cyv_3.] veya bunun bir varyantini içerir ve geri melezleme fragmani bir yabani karpuz bitkisinden geri melezlenmistir) kromozom 3°ün 2.50 Mb"sinde baslayan ve 12.80 Mb"sinde sona eren bölgeyi içeren (veya kapsayan) ve cyvý3.] lokusunu veya bunun bir varyantini içeren bir fragmandir. Baska bir yöne göre, bulusun geri melezleme fraginani (cyv_3.1 veya bunun bir varyantini içerir ve geri melezleme fraginani bir yabani karpuz bitkisinden geri melezlenmistir) kromozom 3°ün 2.50 Mb,sinde baslayan ve 12.80 Mblsinde sona eren bölgenin daha daha küçük bir fragmanini (bölüm) içeren ve cyv_3.1 lokusunu veya bunun bir varyantini içeren bir fragmandir. Bir yöne göre bölümün büyüklügü en az 5kb, 10kb, 20kb veya daha fazladir. Yine baska bir yöne göre, bulusun geri melezleme fragmani (cyv_3.1 veya bunun bir varyantini içerir ve geri melezleme fragmani bir yabani karpuz bitkisinden geri melezlenmistir) kromozom 3"ün 2.50 Mb'sinde baslayan ve 12.80 Mb,sinde sona eren, 50kb, 35kb, 30kb, 20kb veya daha az olan (yukarida açiklandigi gibi) bölgenin daha küçük bir fragmanindan (alt fragmanindan) olusur ve cyv_3.l lokusunu veya bunun bir varyantini içerir. Bir yöne göre bölümün büyüklügü en az 5kb, 10kb, 20kb veya daha fazladir. Yine baska bir yöne göre bulusun geri melezleme fragmani (cyv_3.1 veya bunun bir varyantini içerir ve geri melezleme fragmani bir yabani karpuz bitkisinden geri melezlenmistir) kromozom 3,ün 7.50 Mb,sinde baslayan ve 7.75 Mb,sinde sona eren bölgeyi veya 7.60 Mb9sinde baslayan ve 7.70 Mb°sinde sona eren bölgeyi içerir, burada fragman cyv_3.1 lokusunu veya bunun bir varyantini içerir. Bir yöne göre bölümün büyüklügü en az 5kb, lOkb, 20kb veya daha fazladir. Burada bulusun bitkilerinin yetistirilebildigi tohumlar da sunulmaktadir. Benzer bir sekilde bulusun bitkilerinin bitki bölümleri, örnegin hücreler, kökler, yapraklar, meyveler, meyve bölümleri, polen, tohumcuklar, çiçekler, köksaplar, filizler, çelikler, saplar, bu bölümler veya hücrelerden ekstrakte edilen DNA ve benzeri de burada kapsanmaktadir. Bu bitki bölümleri genomlarinda, açiklandigi gibi bir veya daha fazla markörle saptanabilen, geri melezleme fragmanini içeren en az bir rekombinant kromozom 3 ,i ihtiva eder. Benzer bir sekilde bu hücrelerden veya bitki bölümlerinden ekstrakte edilen genomik DNA genomunda, açiklandigi gibi bir veya daha fazla markörle saptanabilen, geri inelezleme fragmanini içeren en az bir rekombinant kromozom 3"i ihtiva eder. C. lanatus ssp. mucosospermus CVYV direnç kaynagi, US GRIN koleksiyonundan elde edilen bir yabani tipti. Yaklasik 3.0 bir briksle küçük (yaklasik 13 cm X 13 cm) beyaz etli meyvelere sahiptir. C. lanatus ssp. lanatus tipi de US GRIN koleksiyondan elde edilen bir yabani tipti. 3.0,in altindaki bir briksle, yaklasik 16 cm x 24 cm büyüklügünde sari aci meyveleri vardi. Direnç cyv_3.1 bu iki diploid yabani tipten CVYV"ye duyarli karpuz elit hatlarina geri çaprazlanarak, cyv_3.] )i içeren ve CVYV, ye karsi dirençli olan diploid kültive edilmis karpuz üretildi, burada geri melezleme fragmani homozi got formda bulunuyordu. Yukarida sözü edildigi gibi, homozigot formda cyv_3.1 ,i içeren iki diploid essoylu kültive numuralariyla tevdi edilmistir. Bu iki hat SNP_02 ve SNP_03 "ü homozigot formda içerir ve bir SNP haplotip B7ye sahiptir. Meyveler briks degeri 11.0 olan, çekirdekli, kirmizi etli meyvelerdir ve dolayisiyla satilabilir meyvelerdir. Bitkiler CVYViye dirençli, ama ZYMV"ye duyarlidir (ve Ling ve digerlerinin (2008, yukarida) eIF4E markörünü de içermez). Hatlarin birinin bir Crimson Sweet kabuguna sahip meyveleri vardir, digerinin bir Jubilee kabuguna sahip meyveleri vardir. cyv_3.l bu iti hattan, fenotipik seçim veya markör seçimi veya her ikisi kullanilarak, geleneksel islahla herhangi bir baska kültive edilmis karpuz hattina veya varyetesine aktarilabilir. Homozigot formda cyv_3.1 içeren baska bir diploid elit essoylu hattin tohumlari da Nunhems B.V. tarafindan NCIMB'ye NCIMB 42666 erisim numarasiyla tevdi edilmistir. Bu hat SNP_02 ve SNP_03 'ü homozigot formda içerir ve SNP haplotip A'ya sahiptir. Meyveler çekirdekli, kirmizi etli olup, satilabilir meyvelerdir. Bitkiler CVYV°ye dirençlidir.10 numarasiyla tevdi edilen tohumlardan, örnegin bu tohumlardan yetistirilen bitkiler (veya bunlarin silsilesi) baska bir karpuz bitkisiyle melezlenerek ve geri melezleme fragmanini içeren silsile seçilerek elde edilir (elde edilebilir/ içinde bulundugu gibidir). Bir yöne göre diger karpuz bitkisi cyv_3.1 içermeyen kültive edilmis bir karpuzdur. Alternatif olarak diger C. lanatus ssp. mucosospermus veya C. lanatus ssp. lanatus yabani tipleri cyv_3.1 (veya bunun bir varyantini) içerebilir ve cyv_3.] "i (veya bunun bir varyantini) kültive edilmis karpuza geri melezlemek için kullanilabilir. Bu yabani tipleri belirlemek için istege bagli olarak CVYV direnç tahlilleriyle kombinasyon halinde burada sunulan bir veya daha fazla markör kullanilabilir. Örnegin, burada sunulan SNP markörleri kullanilarak US GRIN koleksiyonunun yabani karpuz tiplerinin silsilesi taranirken, Örnek 6'da gösterildigi gibi, yabani tip PI1893I8,in tohumlarinin cyv_3.1 içerdigi tespit edildi. Pll89318 sert beyaz etli, aci ve briks derecesi çok düsük (yaklasik 3.0) olan meyveler üretir. Cyv_3.1 lokusu bundan veya baska yabani karpuz tiplerinden, istege bagli olarak burada sunulan SNP markörlerinin biri veya daha fazlasi kullanilarak burada açiklandigi gibi kültive edilmis karpuza geri melezlenebilir. Dolayisiyla, bir yöne göre bulusun kültive edilmis karpuz bitkisi örnegin PIl89318 veya bunun silsilesinden veya baska yabani karpuzlardan bir geri melezleme fragmani içerir, dolayisiyla geri melezleme fragmani cyv_3.1 direnç lokusunu içerir ve burada açiklandigi gibi cvy_3.1 e bagli bir veya daha fazla markörle saptanabilir. Yabani karpuzlar SNP haplotip A veya B olabilir. Örnegin PIl89318 homozigot formda SNP haplotip A'ya sahiptir. Bulusun bir düzenleinesinde Citrullus lanatus ssp. vulgaris türü diploid kültive edilmis bir karpuz bitkisi(nin tohumu) sunulmakta olup, burada sözü edilen bitki kromozom 3 üzerinde bir yabani karpuz bitkisinden bir geri melezleme fragmani içerir, sözü edilen geri melezleme fragmani CVYV direnci veren bir lokus içerir, burada sözü edilen geri melezleme fragmani asagidakileri içerir: bir Guanin (G); ve/veya bir Sitozin (C); ve/veya istege bagli olarak kb, 20kb, lOkb, 5kb, 2kb, lkb'si veya daha azi içinde yabani karpuz genomuna spesifik bir moleküler markör. Bulusun baska bir düzenlemesinde Citrullus lanatus ssp. vulgari's türü diploid kültive edilmis bir karpuz bitkisi(nin tohumu) sunulmakta olup, burada sözü edilen bitki kromozom 3 üzerinde bir yabani karpuz bitkisinden bir geri melezleme fragmani içerir, sözü edilen geri melezleme fragmani CVYV direnci veren bir lokus içerir ve sözü edilen geri melezleme fragmani asagidakilerden olusan gruptan seçilen bir markörle saptanabilir (veya bu markörü içerir): a) DIZI ID NO: 2'nin (SNP_02) veya zorlayici kosullar altinda DIZI ID NO: Z'ye hibridize olan bir nükleik asit molekülünün 76. nükleotidinde bir Guanin (G); ve/Veya b) DIZI ID NO: 3,ün (SNP_03) veya zorlayici kosullar altinda DIZI ID NO: 3 ,e hibridize olan bir nükleik asit molekülünün 76. nükleotidinde bir Sitozin (C); ve/Veya kb, 20kb, 10kb, 5kb, 2kb, lkb'si veya daha azi içinde yabani karpuz genomuna spesifik bir moleküler markör. Bulusun farkli bir düzenlemesinde Citrullus lariatus ssp. vulgari's türü diploid kültive edilmis bir karpuz bitkisi(nin tohumu) sunulmakta olup, burada sözü edilen bitki kromozom 3 üzerinde bir yabani karpuz bitkisinden bir geri melezleme fragmani içerir, burada sözü edilen geri melezleme fragmani CVYV direnci veren bir lokus içerir ve sözü edilen geri melezleme fragmani asagidakilerden olusan gruptan seçilen bir markörle saptanabilir (veya bu markörü içerir): bir Guanin (G); ve/veya bir Sitozin (C); ve/veya istege bagli olarak kb, 20kb, 10kb, 5kb, 2kb, 1kb°si veya daha azi içinde yabani karpuz genomuna Spesifik bir moleküler markör.10 Bir yöne göre geri melezleme fragmani ve inarkörler homozigottur. Bir yöne göre, bulusun bitkileri kromozom 3 üzerinde ZYMV direnci veren bir lokustan yoksundur. Ancak, CVYV direnci asagida açiklandigi gibi kromozom 3 üzerinde ZYMV Ayrica yukaridaki bitkilerin meyveleri veya bölümleri, hücreleri, yapraklari, çiçekleri ve bunun gibi bitki bölümleri de burada kapsanmaktadir. Daha önce sözü edildigi gibi, meyveler satilabilir diploid meyvelerdir. Bir düzenlemede, kültive edilmis karpuz bitkisi veya bitki bölümü, NCIMB 42449 veya bulundugu gibi veya yabani karpuz P1189318ide veya baska yabani karpuzlarda bulundugu gibi CVYV direnci veren lokusu içerir. Dolayisiyla bir yöne göre, tohumlari NCIMB42449 veya bu bitkilerin herhangi birinin silsilesi (örnegin özdöllenmeyle ve/veya melezlemeyle elde edilen ve cyv_3.1 'i koruyan) baska bir karpuz bitkisiyle, örnegin kültive edilmis bir karpuz elit hatti veya varyetesiyle melezlenerek elde edilebilir (elde edilmesi mümkündür). Baska bir yöne göre cyv_3.1 geni, P1189318 gibi yabani karpuzlardan veya baska yabani karpuzlardan kültive edilmis karpuza direncin geri melezlenmesiyle elde edilebilir. 42666 erisim numaralariyla tevdi edilmis tohumlarda bulundugu gibi CVYV direnci veren geri melezleme fragmanini veya bunun daha kisa bir bölümünü içeren kültive edilmis karpuz bitkisi veya bitki bölümü sunulmaktadir. Dolayisiyla bir yöne göre, cyv_3.1 'i içeren 42666 erisim numarasiyla tedvi edilmis bir karpuz bitkisi veya bu bitkilerin herhangi birinin silsilesi (örnegin özdöllenmeyle ve/veya melezlemeyle elde edilir ve bu silsile cyv_3. I i korur) baska bir karpuz bitkisiyle melezlenerek elde edilebilir. Dolayisiyla, kromozom 3 üzerindeki CVYV direnç geni bir yöne göre NCIMB 42449 veya bunlarin silsilesinde bulunan gendir, ama baska bir yabani karpuzun, özellikle cyv_3.1 'e bagli bir veya daha fazla SNP markörünü, yani SNP markörlerinin direnç genotipini içeren yabani bir karpuzun direnç geni de olabilir. Örnekler P1189318 veya digerleri gibi yabani tiplerdir. Markör analizine ek olarak veya alternatif olarak, böyle bir CVYV direncinin gerçekten ayni direnç geni, yani cyv_3. 1 tarafindan verilip verilmedigini belirlemek için bu10 alanda uzman olanlar kolayca bir alelizm testi yapabilirler. Benzer bir sekilde, ayni genin, yani cyv_3.1 'in CVYV direnç fenotipinden sorumlu oldugunu teyit etmek için esleme, ince esleme, dizileme, genetik kalitim ve bunun gibi baska usuller veya usullerin kombinasyonlari kullanilabilir. C VYV direnci vere/1 cyv 3.] ,in ZYM V direnciyle kombine edilmesi Bulus sahipleri, cyv_3.1 ,in ZYMV'ye karsi direnç veren resesifzym geniyle ayni kromozom üzerindi bulundugunu tespit ettiler. Dolayisiyla cyv_3.] kromozom 3 üzerinde zym ile kombine edilerek, baglama fazinda CVYV ve ZYMV direnci veren lokuslar içeren bir kromozom elde etmek mümkündür. ZYMV yaprak bitleri tarafindan bulastirilan bir virüstür ve hafif ila siddetli meyve deformasyonu ve renk bonulmasina neden olabilir. Zym direnci için kaynaklar örnegin Ling ve digerleri (2008, yukarida) tarafindan açiklanan CAPS makrörünü SNP_04 olarak adlandirilan bir SNP markörüne dönüstürdüler, Tablo 2" ye bakiniz. Tablo 2 - ZYMV direncine bagli eIF4E geninde SNP markörü ve dünya çapinda ag icugi.org/Cgi-bin/lCuGl/index.Cgi,de "Watermelonz Genome", "Watermelon genome (97103) - version 1 " altinda yayimlanan kültive edilmis karpuz genomu kromozom 3 üzerinde SNP konumu Ör. P1595203'ten zym/zym geri melezleme içeren karpuz zym/zym olmadan karpuz varyetesi Dizinin 70. nükleotidinde SNP içeren genomik dizi (5, - 3, yönü) ve kültive edilmis karpuz kromozom 3 üzerinde fiziksel SNP konumu (*) *Nükleotit 7.767.975*te bulunur F enotip ZYMV,ye dirençli ZYMV3ye duyarli Dolayisiyla yukarida açiklanan bulusun diploid karpuz bitkileri kromozom 3 üzerinde ayrica zym genini içerebilir. Dolayisiyla bulusun bir yönüne göre Citrullus lanatus ssp. vulgari's türü diploid kültive edilmis bir karpuz bitkisi(nin tohumu) sunulmakta olup, burada sözü edilen bitki kromozom 3 üzerinde CVYV direnci veren bir lokusu haiz bir yabani karpuz bitkisinden bir geri melezleme fragmani içerir, burada sözü edilen geri melezleme fragmani asagidakilerden olusan gruptan seçilen bir markörle saptanabilir (veya bu markörü içerir): bir Guanin (G); ve/veya bir Sitozin (C), ve/veya kb, 20kb, lOkb, 5kb, 2kb, lkb`si veya daha azi içinde yabani karpuz genomuna spesifik bir moleküler markör. d) burada bitki ayrica kromozom 3 üzerinde zym genini içerir. Istege bagli olarak zym geninin (bu geni içeren bir geri melezleme fragmaninin) varligi Guanin (G) ile saptanir. Ancak, SNP_O4 muhtemelen zym Je çok yakindan bagli degildir, dolayisiyla zym ,in var olmasini saglamak için daha yakindan bagli bir markörün fenotipik seçimi veya gelistirilmesi tercih edilebilir. Dolayisiyla rekombinant kromozom 3, CVYV direnç lokusu ayi/_3.1 'i içeren geri melezleme fragmanini içerir ve ayrica ayni kromozom üstünde zym genini (bu geni içeren bir geri melezleme fragmanini) içerebilir. Bitkinin fenotipik olarak CVYV°ye dirençli ve ZYMV'ye dirençli olmasi gerekmez, çünkü CVYV direnç lokusu ve zym geni heterozi got formda olabilir (sadece bir rekombinant kromozom 3 bulunabilir). Bir yöne göre, bitki rekombinant kromozom için homozigottur ve dolayisiyla hem CVYVye hem ZYMV,ye karsi dirençlidir. Dolayisiyla, bir yöne göre, CVYV direnç lokusu cyv_3.1 'i içeren geri melezleme fragmani homozigot formdadir ve zym geni (bu geni içeren geri melezleme fragmani) homozigot formdadir, dolayisiyla bitki CVYV"ye ve ZYMV7ye dirençlidir. Bir yöne göre, SNP_02 ve/Veya SNPIO3 ve/Veya cyvý3. 1 'e bagli yabani karpuz genomuna spesifik markör(ler) homozigottur ve zym homozigottur (zym/zym) ve istege bagli olarak SNP_O4 (varsa) homozigot GG,dir (Guanin/Guanin). Bulusun spesifik bir düzenlemesinde, Citrullus lanatus ssp. vulgari's türü diploid kültive edilmis bir karpuz bitkisi(nin tohumu) sunulinakta olup, burada sözü edilen bitki kromozom 3 üzerinde, cyv_3.1 adi verilen CVYV direnci veren bir lokusu haiz, bir yabani karpuz bitkisinden bir geri melezleme fragmani içerir, burada sözü edilen geri melezleme fragmani asagidakilerle saptanabilir (veya asagidakileri içerir): bir Guanin (G), ve bir Sitozin (C); ve c) burada kromozom 3 ayrica zym genini içerir. Bir yöne göre, bitki homozigot formda kromozom 3 üzerinde geri melezleme fragmanini içerir, yani geri melezleme fragmani asagidakilerle saptanabilir (veya asagidakileri içerir): bir diploid genotip GG (Guanin/Guanin); ve bir diploid genotip CC (Sitozin/Sitozin), ve c) burada kromozom 3 ayrica homozigot formda zym genini (zym/zym) içerir; ve d) burada bitki CVYV°ye ve ZYMV°ye dirençlidir. Yukaridaki diploid bitkiler bir düzenlemede zym geniyle kombine edilmis CVYV SNP haplotip A veya SNP haplotip B,ye sahip olabilir. Dolayisiyla, bir yöne göre, bitkiler SNP_01 ve SNP_02 ve SNP_03 için sirasiyla G-G-C"ye sahip SNP haplotip A'yi (örnegin diploid formda SNP haplotip A homozigot formda GG-GG-CC veya heterozigot formda GG-GA-CTdir) ve cyv_3.1 ile ayni kromozom üzerinde bagli zym genini içerir (ve istege bagli olarak SNPIO4 diploid genotip heterozigot GT veya homozigota GG,ye sahiptir). Baska bir yöne göre, bitki SNP_01 ve SNP_02 ve SNP_03 için sirasiyla A-G-C"ye sahip SNP haplotip B,yi (örnegin diploid formda SNP haplotipi A homozigot formda AA-GG- CC veya heterozigot formda AG-GA-CTdir) ve cyv_3.1 ile ayni kromozom üzerine bagli zym genini içerir (ve istege bagli olarak SNP_O4 diploid genotip heterozigot GT veya homozigot GGîye sahiptir). Dolayisiyla DIZI ID NO: l`in (SNP_01) veya DIZI ID NO: haiz bir dizinin 76. nükleotidinde, SNP genotipi bir Guanin veya bir Adenin olabilir. SNP_01 iki farkli CVYV direnç haplotipini ayirt edebilir, ama her bir halotip ayni kromozom 3 üzerinde zym geniyle kombine edilebilir. Dolayisiyla bir diploid CVYV"ye ve ZYMViye dirençli bitki asagidaki iki genotipin birini Kromozom 3 üzerindeki SNP Diploid SNP genotipi Diploid SNP genotipi markörü ve gen gen zym/zym zym/zym Istege bagli olarak SNP_04 GG GG CVYV direnç lokusu cyv_3.1 )i zym geniyle kombine etmek için, bu alanda uzman olanlar bulusun cyv_3.1 içeren bir bitkisini zym genini içeren bir bitkiyle melezleyecek ve bir rekombinant kromozom 3 üzerinde hem CVYV lokusu cyv_3.1 'i hem zym genini içeren bir rekombinant silsile bitkisini seçeceklerdir. numaralariyla tevdi edilen tohumlarda oldugu gibi CVYV direnci veren lokus cyv_3.1 'i içeren ve ayrica zym genini içeren kültive edilmis karpuz bitkisi veya bitki bölümü sunulmaktadir. numaralariyla tevdi edilen tohumlarda oldugu gibi geri melezleme fragmanini (cyv_3.1 i içerir) veya bunun daha küçük bir fragmanini (lokus cyvý3. 1 'i koruyan) ve ayrica zym genini içeren kültive edilmis karpuz bitkisi veya bitki bölümü sunulmaktadir. Bir yöne göre, bulusa uygun diploid karpuz bitkileri (ve bitkilerin yetistirilebildigi tohumlar) birkaç kez özdöllenmeyle üretilen essoylu hatlardir. Baska bir yöne göre, bulusa uygun diploid karpuz bitkileri (ve bitkilerin yetistirilebildigi tohumlar) bulusa göre iki diploid essoylu hat melezlenerek ve melezden tohumlar toplanarak üretilir. Tevdi edilen tohumlardan yetistirilen bitkiler CGMMV (Hiyar Yesil Benek Virüsü) açisindan da test edildi, ama cyv_3.] 'in CGMMV direnci vermedigini gösterecek sekilde duyarliydilar. Cyvý3. 1 (veya bir varyantini) iceren tetraploid kültive edilmis karpuz bitkileri ve bitki bölümleri Tohumsuz triploid karpuz üretimi diploid erkek ebeveyn bitkilerden alinan polenin tetraploid (2n = 4x = 44) anaç ebeveyn bitkileri dölleinek için kullanilmasini içerir. Tetraploid çiçeklerin diploid polenle polenlenmesi triploid olan Fl tohumlarina yol açar Eigsti 1971, Hort Science 6: 1-2). Bu F1 tohumlarindan yetistirilen triploid hibrid bitkiler, kromozom dengesizligi nedeniyle steril polen ürettikleri için kendi kendilerine kisirdirlar (Fehr, 1987). Dolayisiyla triploid hibridlerin karpuz meyvesini üretmek için bir diploid polen tasiyiciyla polenlenmesi gerekir. Bu nedenle triploid bitkiler meyve üretimi için polen tasiyici bitkilerle birlikte dikilir. Triploid hibrid bitki üzerinde polenlemeden sonra üretilen "çekirdeksiz" meyveler çogunlukla gerçekten çekirdeksiz degildir, yenebilir olan gelismemis, küçük, soluk çekirdekler içerebilir. Dolayisiyla bu çekirdeksiz triploid varyeteleri üretmek için, bir tetraploid disi ebeveyn hatti (tercihen essoylu bir hat) ve bir diploid erkek ebeveyn hatti (tercihen essoylu bir hat) melezlenir. Çapraz polenlemeyle tetraploid ebeveynin meyvelerinde üretilen çekirdekler, tetraploid anneden iki kromozom takimi ve diploid babadan bir kromozom takimina sahip olarak triploiddir. Bu çekirdekler toplanir ve triploid varyeteler olarak satilir. Bu tohumlardan yetistirilen triploid bitkiler (bir polen tasiyici tarafindan saglanan) meyve tutumunu uyarmak için yine de polene ihtiyaç duyar, ama üretilen meyveler çekirdeksiz karpuz meyveleridir. Bir yöne göre, her biri cyvý3.] içeren bir yabani karpuzdan geri melezleme fragmani içeren dört rekombinant kromozom 3"ü haiz bir tetraploid karpuz bitkisi sunulmaktadir. Dolayisiyla tetraploid bitki cyv_3.1 'in dört kopyasini içerir. Cyv_3.1 ,in iki kopyasini içeren bir diploid erkek ebeveyn hattiyla melezlendiginde, elde edilen triploid tohumlar cyv_3. 1 "in üç kopyasini içerir. Böyle bir tetraploid bitkiyi yapmak için, geri melezleme fragmani için homozigot olan, yukarida açiklanan CVYV`ye dirençli diploid bitkilerin herhangi biri, tetraploid bitkiler olusturmak için baslangiç malzemesi olarak kullanilabilir. Bu diploid bitkilerden bir tetraploid bitki olusturmak için bu alanda uzman olanlarin bildigi kromozom ikiye katlama teknikleri kullanilabilir. Örnegin Noh ve digerleri (2012) Hort. Environ. Bioteehnol. usullerde kromozomun ikiye katlanmasini saglamak için kolsisin, dinitoalanin veya orizalin gibi bir antimitotik madde kullanilir. Istege bagli olarak, bitki bölümlerinden tetraploid bitkiler üretmek için doku kültürü kullanilabilir. Bitkilerin tetraploid oldugunu dogrulamak için kromozom sayisi teyit edilebilir. Kromozom sayisi (ploidy) kromozom sayimiyla veya akis sitometrisiyle veya bilinen baska usullerle kolayca belirlenebilir (burada referans olarak zikredilen Sari ve digerleri, Scientia Horticulturae 82: 265 7 277, ineorporated herein by reference). Dolayisiyla bulusun bir yönüne göre Citrullus lanatus ssp. vulgaris türü CVYVsye dirençli bir tetraploid kültive edilmis karpuz bitkisi(nin tohumu) sunulmakta olup, burada bitki kromozom 3 üzerinde bir yabani karpuz bitkisinden bir geri melezleme fragmani içerir, burada sözü edilen geri inelezleine fragmani, ayi/_3.1 lokusunun varligi nedeniyle CVYV direnci verir ve rekombinant kromozom 3 dört kopya halinde bulunur. Geri melezleme fragmani asagidakilerden olusan gruptan seçilen bir markörle saptanabilir (veya böyle bir markör içerebilir): bir Guanin (G); ve/veya bir Sitozin (C); ve/veya kb, 20kb, lOkb, 5kb, 2kb, lkb'si veya daha azi içinde yabani karpuz genomuna spesifik bir moleküler markör. Sözü edildigi gibi, tetraploid bitki sözü edilen rekombinant kromozom 39ün dört kopyasini Dolayisiyla, bir düzenlemede, yukaridaki tetraploid karpuz bitkisi asagidakileri içerir: bir tetraploid genotip GGGG (Guanin/Guanin/Guanin/Guanin); ve/veya bir tetraploid genotip CCCC (Sitozin/Sitozin/Sitozin/Sitozin); ve/Veya kb, 20kb, lOkb, 5kb, 2kb, lkblsi veya daha azi içinde yabani karpuz genomuna spesifik bir moleküler markör için bir tetraploid genotip. Tetraploid bitkilerin veya bitki bölümlerinin (hücreler, yapraklar, DNA ve benzeri) genotiplenmesi, SNP genotiplerini ayirt etmek için bir KASP tahlili kullanilarak, diploidler için olanla ayni sekilde yapilabilir, örnegin SNP_02 için GGGG içeren bitkiler veya bölümler, genomlarinda SNP_02 için GGGA, GGAA, GAAA veya AAAA içeren bitkilerden veya bölümlerden ayirt edilebilir. Tatraploid yukarida ayrintili olarak açiklanan CVYVlye dirençli bir diploidin kromozomlari ikiye katlanarak yapilabildigi için, yukarida diploid için açiklanan yönler tetraploid için de geçerlidir. Örnegin tetraploid ayrica rekombinant kromozom 3 üzerinde baglama fazinda zym genini de içerebilir ve dolayisiyla cyv_3.1 'in (veya bunun bir varyantinin) dört kopyasini ve zym ,nin dört kopyasini içerebilir. Benzer bir sekilde, dört kopyada haplotip A veya haplotip B bulunabilir. Dolayisiyla, yukaridaki diploidlerden asagidaki tetraploidler elde edilebilir: Kromozom 3 üzerindeki SNP Diploid SNP genotipi 9 Diploid SNP genotypeê markörü ve geni tetraploid SNP genotipi tetraploid SNP genotipi Istege bagli olarak zym geni zym/zym 9 zym/zym 9 Istege bagli olarak SNP_04 GG 9 GGGG GG 9 GGGG CVYV,ye dirençli tetraploid tercihen birkaç kez özdöllenmeye tabi tutularak, triploid tohumlarin üretiminde disi ebeveyn olarak kullanilabilen bir essoylu tetraploid üretilir. edilen diploid, CVYV'ye dirençli bitkiler veya bunlarin silsilesi (örnegin daha küçük bir geri melezleme fragmani içeren), tetraploidleri yapmak için kullanilir. Bu bitkiler zym geni Bir yöne göre tohumlari NCIMB 42666 erisim nuinaralariyla tevdi edilen diploid, CVYVsye dirençli bitkiler veya bunlarin silsilesi (örnegin daha küçük bir geri inelezleme fragmani içeren), tetraploidleri yapmak için kullanilir. Baska bir yöne göre, farkli bir yabani karpuzdan, örnegin P11893187den veya digerlerinden bir cyv_3.1 geni içeren kültive edilmis karpuz bitkileri, tetraploid, CVYV'ye dirençli bir bitki yapmak için kullanilir. Ayrica tetraploidler yapmak için hem cyv_3.1 (veya bunun bir varyanti) hem zym genini içeren bitkiler kullanilabilir. Cyv_3.1 (veya bunun bir varyanti), geleneksel islah teknikleriyle ve rekombinantlar seçilerek, istege bagli olarak kromozom 3 üzerinde hem cyv_3.1 hem zym içeren burada açiklanan markörlerin yardimiyla, PIS952037te oldugu gibi zym gemiyle kolayca kombine edilebilir. P1595203 USDA, ARS, National Genetic Resources Program, Germplasm Resources Information Network - (GRIN)"de bulunabilir. veya P11893183de veya baska yabani karpuzlarda oldugu gibi CVYV°ye direnç veren lokusu ve istege bagli olarak zym genini içeren bir tetraploid karpuz bitkisi (ve bitkinin yetistirilebildigi tohum) sunulmaktadir. Bir yöne göre, bulusa uygun tetraploid karpuz bitkileri (ve bitkilerin yetistirilebildigi tohumlar) birkaç kez özdöllenmeyle üretilen essoylu hatlardir. Bir yöne göre bitkiler asagida açiklanan triploid tohum üretimi için ebeveyn hatlar olarak uygundur. Bu tetraploid bitkilerin yetistirilebildigi tohumlar burada kapsanmaktadir. Hücreler, polen, çiçekler, meyveler, yapraklar, saplar ve bunun gibi bulusa uygun tetraploid bitkilerin bitki bölümleri de burada kapsanmaktadir. Meyveler tercihen satilabilir meyvelerdir. Briks veya daha yüksektir. Meyve rengi herhangi bir renk, örnegin kirmizi, koyu kirmizi, açik parlak kirinizi, mercan kirmizisi, turuncu, somon rengi, pembe, pembemsi kirmizi, sari, kanarya sarisi veya beyaz olabilir. Tercihen meyve eti rengi tek düzedir. Bir yöne göre bulusun tetraploid bitkisi bir vejetatif propagasyondur. Tetraploid bitkiler bir veya daha fazla kez özdöllenme yapabilir, ama baska bir tetraploid karpuz bitkisiyle melezlenmeleri de mümkündür. Diger tetraploid karpuz bitkisi cyv_3.] içeriniyorsa, melez tarafindan üretilen F1 cyv_3.1 Jin sadece iki kopyasini içerir. Böyle bir bitki yeniden cyv_3.] içermeyen bir tetraploid bitkiyle melezlenirse, cyv_3.] ,in sadece bir kopyasini haiz silsile üretilebilir. Benzer bir sekilde böyle bir bitki özdöllenme yaparsa, cyv_3.] ,in bir veya üç kopyasini haiz silsile üretilebilir. Dolayisiyla, cyv_3.1 ,in 3, 2 veya sadece 1 kopyasini içeren bir tetraploid karpuz da burada kapsanmaktadir. Cyv 3. 1 (veya bunun bir varvantini) iceren triploid kültive edilmis karpuz bitkileri ve bitki Bir yöne göre yukarida açiklanan CVYV, ye dirençli tetraploid bitki disi ebeveyn olarak kullanilir ve CVYV"yi dirençli bir erkek ebeveynin (yine yukarida açiklanmaktadir) poleniyle polenlenir ve melezden tohumlar toplanir. Bu tohumlar triploiddir, yani bulusun cyv_3.1 lokusunun üç kopyasini içerirler. Bu tohumlardan yetistirilen bitkiler CVYVdirençlidir ve çekirdeksiz karpuz meyveleri (triploid meyveler) üretir. Istege bagli olarak bitkiler ayni zamanda ZYMViye de dirençlidir, yani zym geni içerirler. Dolayisiyla, yukarida bulusun diploid ve tetraploid bitkileri için açiklanan bütün yönler triploid tohumlar ve bu tohumlardan yetistirilen bitkiler için geçerlidir. Dolayisiyla, bir tevdi edilen tohumlarda bulunan cyvý3. I lokusudur. Ama P1189318 veya digerleri gibi yabani karpuzlarda bulundugu gibi cyv_3.1 geni de olabilir. Baska bir yöne göre, NCIMB gibi geri melezleme fragmani (ayi/_3. 1 lokusunu içerir) veya bunun daha küçük bir fragmani burada kapsanmaktadir, daha küçük fragman cyv_3. 1 lokusunu korur. Cyv_3. 1 in baska varyantlari, örnegin baska yabani karpuz tiplerinden olanlar da burada kapsanmaktadir. Triploid CVYVye dirençli bitkilerin yetistirilebildigi tohumlarin yani sira, bu tohumlardan yetistirilen bitki bölüinleri ve bu bitkiler tarafindan üretilen çekirdeksiz karpuz meyveleri de buradaki bir düzenlemedir. Triploid, çekirdeksiz meyveler tercihen satilabilir meyvelerdir. Tercihen ortalama briks en Meyveler herhangi bir büyüklük, sekil, renk ve kabuk desenine sahip olabilir. Tercihen meyve eti rengi olgunlukta tek düzedir. Bir yöne göre meyve eti kirmizi veya koyu kirmizidir. Üç kopya halinde cyv_3.1 (veya bunun bir varyantini) içeren bir triploid hibridin ortalama olabilir. Baska bir düzenlemede, üç kopya halinde cyv_3.] (veya bunun bir varyantini) içeren bir triploid hibridin ortalama meyve agirligi 5 kg°ye esit veya daha az, örnegin 4, 3, 2, 1, 1.5 veya 1 kg, hatta daha az olabilir. Çekirdeksiz meyveler herhangi bir sekil (örnegin uzun, oval, bloklu, küresel veya yuvarlak), meyve yüzeyi (kirisik, düz), meyve eti rengi (kirmizi, koyu kirmizi, açik parlak kirmizi, mercan kirmizisi, turuncu, somon rengi, pembe, pembemsi kirmizi, sari, kanarya sarisi veya beyaz), kabuk rengi (açik yesil; koyu yesil; dar, orta genislikte veya genis çizgili yesil; gri çesitleri; noktali veya noktasiz; Golden sarisi), kabuk kalinligi, kabuk sertligi, kabuk deseni (örnegin çizgili, çizgisiz, ag gibi), meyve eti yapisi/meyve eti sertligi, likopen ve/veya vitamin içerigi, farkli sekerzasit oranlari, çok iyi meyve tadi ve benzerine sahip olabilir. Dolayisiyla, CVYV direnci veren cyv_3.1 lokusu (veya varyanti), örnegin geleneksel islahla farkli sekillere ve büyüklüklere ve benzerine sahip meyveler üreten çesitli çekirdeksiz varyeteler yetistirinek için kullanilabilir. Guner ve Wehner 2004, Hort Science Genel olarak önemli islah amaçlari erken olgunlasma, yüksek meyve verimi, yüksek iç meyve kalitesidir (iyi tek düze renk, yüksek seker, dogru sekerzasit orani, iyi tat, yüksek vitamin ve likopen içerigi, siki et dokusu, lifsiz et dokusu, iç bosluk, kabuk nekrozu, çiçek burnu çürügü veya çapraz dikis gibi kusurlarin olmamasi ve iyi kabuk özellikleri ve çatlama direnci). Bir yöne göre, bulusun triploid bitkisi bir vejetatif propagasyondur. Vejetatifpropagasyonlar ve hücre veya doku kültürleri Yukaridaki diploid bitkiler, tetraploid bitkiler veya triploid bitkiler, vejetatif olarak (klonal olarak) da çogaltilabilir ve vejetatif olarak çogaltilmis bu bitkiler veya "vejetatif propagasyonlar" bulusun bir düzenlemesidir. Bunlar cyvý3.] ,e (veya bunun bir varyantina) bagli markörlerin biriyle veya daha fazlasiyla (veya tümüyle) ve/veya fenotipik olarak baska karpuz bitkilerinden kolayca ayirt edilebilir. Vejetatif propagasyonlar farkli usullerle yapilabilir. Örnegin bulusun bir bitkisinin bir veya daha fazla filizi farkli bir köksap, örnegin biyotik veya abiyotik strese toleransli bir köksap üzerine asilanabilir. Diger usuller arasinda in vitro hücre veya doku kültürü usulleri ve bu kültürlerden vejetatif propagasyonlarin rejenerasyonu yer alir. Bu hücre veya doku kültürleri çesitli hücreler veya dokular içerir veya bunlardan olusur. Bir yöne göre, böyle bir hücre veya doku kültürü vejetatif hücreler veya vejetatif dokular içerir veya bunlardan olusur. Baska bir yöne göre, bir hücre veya doku kültürü basçiklar veya tohumcuklar gibi üreme hücreleri veya dokularini içerir veya bunlardan olusur. Bu kültürler, örnegin ikili haploid bitkiler yapmak için kromozomu ikiye katlama maddeleriyle islemden geçirilebilir veya alternatif olarak haploid bitkiler yapmak (örnegin bir tetraploidden diploidler yapmak veya bir diploidden haploidler yapmak) için kullanilabilir. Dolayisiyla, bir in vitro hücre veya doku kültürü meyve, ogulcuk, meristem, çenek, polen, tohumcuk, yaprak, basçik, kök, kök ucu, pistil, çiçek, tohum, saptan olusan gruptan seçilen bir bitki bölümünden hücreler veya protoplastlar ve bitki dokusu içerir veya bundan olusur. Bunlarin herhangi birinin bölümleri, örnegin sadece tohum zarfi (matemal doku) dâhil Dolayisiyla bulusun bir yönüne göre, hepsi yukarida açiklandigi gibi cyvý3.] 'in (veya bir varyantinin) bir, iki, üç veya dört kopyasini içeren bir bitkinin hücrelerinin bir hücre kültürü veya doku kültürü sunulmaktadir. Sözü edildigi gibi, cyv_3. 1 içeren bir bitkinin bir bitki bölümünden hücreler veya protoplastlar veya bitki dokusu içeren bir hücre kültürü veya bir doku kültürü ogulcuk, meristem, çenek, polen, yaprak, basçik, kök, kök ucu, pistil, çiçek, tohum, saptan olusan gruptan; veya bunlarin herhangi birinin bölümlerinden seçilen hücreleri veya dokulari içerebilir veya bunlardan olusabilir. Ayrica böyle bir hücre kültürü veya doku kültüründen rejenere edilen bir karpuz bitkisi sunulmakta olup, burada rejenere edilmis bitki (veya bunun, örnegin rejenere edilmis bitkinin özdöllenmesinden sonra elde edilen silsilesi) cyv_3.1 lokusunu (veya bunun bir varyantini) içerir. Dolayisiyla, bir yöne göre, bir veya daha fazla kopya halinde cyvý3.] (veya bunun bir varyantini) içeren kaipuz bitkisi vejetatif olarak çogaltilmis bir karpuz bitkisidir. Farkli bir yöne göre, bir veya daha fazla kopya halinde cyv_3.1 (veya bunun bir varyantini) içeren bulusun hücreleri ve dokulari çogalmayan hücreler veya dokulardir. QTL cyv_3.1 (veya bunun bir varyantinin) ve/veya cyv_3.1 'e (veya bunun bir varyantina) bagli markörlerin usulleri ve kullanimlari Bulusun resesif cyv_3.1 lokusu (veya bunun bir varyanti), yani lokusu içeren geri melezleme fragmani, örnegin bulusun bitkileriyle, örnegin tevdi edilen tohumlardan yetistirilen bitkilerle veya bulusun vejetatif olarak çogaltilmis bitkileriyle melezlemeler yapilarak veya cyv_3.] 'i (veya bunun bir varyantini) içeren yabani karpuz bitkileri belirlenerek ve böyle bir yabani tipten cyv_3. 1 (veya bunun bir varyanti) burada açiklandigi gibi kültive edilmis karpuza geri melezlenerek, herhangi bir baska kültive edilmis karpuz bitkisine aktarilabilir veya dâhil edilebilir. Örnegin, karpuzun yabani tipleri, cyv_3.l *i veya bunun bir varyantini içeren varsayiinsal yabani tipleri belirlemek için, cyv_3.1 lokusuna bagli bir veya daha fazla markörle (örnegin SNP_02 ve/Veya SNP_03 ve/veya cyv_3.1 'e bagli bir veya daha fazla baska markör) taranabilir. Bu tipler istege bagli veya alternatif olarak bir CVYV direnç tahlilinde fenotipik olarak da taranabilir ve/veya kültive edilmis karpuz bitkileriyle melezleneblir ve melezin altsoylari CVYV direnç markörü genotipi ve/veya CVYV direnç fenotipi açisindan taranabilir. Dolayisiyla bu alanda uzman olanlar, baska yabani karpuz tiplerinde QTL cvy_3.1,i veya bir varyantini saptayabilir, bulusun diploid karpuz bitkilerini üretmek10 için kültive edilmis karpuz hatlarina 4, 5, 6, 7 veya daha fazla kez geri çaprazlayarak onu kültive edilmis karpuza kromozom 3 üzerine aktarabilirler. Daha sonra bunlar, burada açiklandigi gibi tetraploidler ve triploidler üretmek için kullanilabilir. Dolayisiyla, cvy_3.1 veya bunun bir varyanti tarafindan verilen CVYV direnci, örnegin burada baska yerlerde açiklandigi gibi bir cyv_3.] kaynagi olarak burada tevdi edilen tohum kullanilarak veya yabani karpuz tiplerinde cyv_3.1 (veya bunun bir varyanti) belirlenerek ve kültive edilmis karpuza (geri) melezlenerek, kültive edilmis karpuzun farkli genetik zeminlerine melezlenebilir. Cyv_3.1 (veya bunun bir varyanti) bilinen islah usulleri kullanilarak cyv_3.1 (veya bunun bir varyantini) içermeyen baska karpuz bitkilerine dâhil edilebilir. Sinirlandirici olmamak kosuluyla tekrarlanan seçim, soy islahi, geriye melezleine islahi, essoylu gelistirme, hibrid testleri, markör destekli islah ve bunun gibi bilinen islah usulleri tek baslarina veya kombinasyon halinde kullanilabilir. Daha sonra burada sunulan bir veya daha fazla markör ve/veya CVYV direnci (baskin WT aleli bulunmadiginda) kullanilarak ayi/_3.1 'i (veya bunun bir varyantini) koruyan silsile seçilir. Dolayisiyla, cyv_3.1 (veya bunun bir varyantina) sahip silsile bitkilerinin seçimi bir veya daha fazla kez özdöllenmis bitkilerde fenotipik CVYV direnci seçimiyle ve CVYV`ye duyarli bitkiler atilarak yapilabilir. Örnegin, CVYV direnci için ayrilan silsile CVYV istilasinin oldugu bir alana asilanir veya dikilirse, CVYV,ye dirençli bitkiler kolayca saptanabilir. Dolayisiyla, bir yöne göre Citrullus lanatus ssp. vulgari's türü bir diploid kültive edilmis karpuz bitkisi üretmenin bir usulü sunulmakta olup, burada sözü edilen bitki kromozom 3 üzerinde bir yabani karpuz bitkisinden bir geri inelezleine fragmani içerir, burada sözü edilen geri melezleme fragmani CVYV direnci veren bir lokus içerir, usul asagidaki asamalari içerir: Kromozom 3 üzerinde CVYV direnci veren bir lokus içeren bir yabani karpuz bitkisini bir diploid kültive edilmis karpuz bitkisiyle melezlemek ve bir kültive edilmis karpuz genomu ve kromozom 3 üzerinde yabani karpuz bitkisinden bir geri melezleme fragmani içeren sözü edilen melezin silsilesini seçmek, sözü edilen geri melezleme fragmani CVYV direnci veren lokusu içerir. Yabani karpuz bitkisinde ve/veya silsilede CVYV direnci veren lokusun varligi bir CVYV direnç tahlili kullanilarak fenotipik olarak ve/veya moleküler bir düzeyde, cyv_3. 1 'e (veya bir varyantina) bagli bir veya daha fazla markörün varligi, örnegin asagidakilerden olusan gruptan seçilen bir veya daha fazla markörün varligi saptanarak belirlenebilir: bir Guanin (G); ve/veya bir Sitozin (C); ve/veya kb, 20kb, 10kb, 5kb, 2kb, 1kb°si veya daha azi içinde yabani karpuz genomuna Spesifik bir moleküler markör. Geri melezleine fragmani, örnegin CVYV direncini baska özelliklerle kombine etmek için diger diploid kültive edilmis karpuz bitkilerine de aktarilabilir. Dolayisiyla, baska bir yöne göre burada Citri'llus lanatus ssp. vulgari's türü bir diploid kültive edilmis karpuz üretmenin bir usulü sunulmakta olup, burada sözü edilen bitki kromozom 3 üzerinde bir yabani karpuz bitkisinden bir geri melezleme fragmani içerir, sözü edilen geri melezleme fragmani CVYV direnci veren bir lokus içerir; usul asagidaki asamalari içerir: Kromozom 3 üzerinde CVYV direnci veren bir lokus içeren bir diploid kültive edilmis karpuz bitkisinin (yukarida açiklandigi gibi) baska bir diploid kültive edilmis karpuz bitkisiyle, özellikle kromozom 3 üzerinde CVYV direnci veren bir lokus içermeyen bir bitkiyle melezlenmesi ve bir kültive edilmis karpuz genomu ve kromozom 3 üzerinde yabani karpuz bitkisinden bir geri melezleme fragmani içeren sözü edilen melezin silsilesinin (örnegin F1, F2, F3 veya baska özdöllenme silsilesi veya geriye melezleme silsilesi) seçilmesi, burada sözü edilen geri melezleine fragmani CVYV direnci veren lokusu içerir. Silsile istege bagli olarak bir veya daha fazla özdöllenmeyle kombine edilmis bir veya daha fazla geriye melezlemenin bir sonucu, örnegin BCl, BCl Sl, BC1S2, BC2, BCZSl, BC3 ve benzeri olabilir. Yine, silsilede geri melezleme fragmaninin varligi açiklanan markörlerin bir veya daha fazlasi ve/veya CVYV direnç tahlilleri kullanilarak belirlenebilir. Ayrica genomlarinda CVYV direnci veren bir lokus içeren bir geri melezleme fragmani ihtiva kromozom 3 üzerinde eden karpuz tohumlari, bitkileri veya bitki bölümleri veya bu tohumlardan, bitkilerden veya bitki bölümlerinden DNA"yi seçmek veya tanimlamak için bir tarama usulü sunulinakta olup, usul asagidakileri içerir: Karpuz tohumlarini, bitkilerini veya bitki bölümlerini (örnegin hücreleri) veya bu tohulardan, bitkilerden veya bitki bölümlerinden DNAsyi cyv_3.1 'e (veya bir varyantina) bagli burada açiklandigi gibi bir veya daha fazla markörün, örnegin asagidakilerden olusan bir veya daha fazla markörün varligi açisindan taramak: bir Guanin (G); ve/Veya bir Sitozin (C), ve/veya kb, 20kb, 10kb, 5kb, 2kb, lkblsi veya daha azi içinde yabani karpuz genomuna spesifik bir moleküler markör. Karpuz tohumlari, bitkileri veya bitki bölümleri haploid, ikili haploid, diploid, triploid veya tetraploid olabilir. Açiktir ki, bir veya daha fazla markörün varligina iliskin tarama, markörün birkaç kopyasinin, örnegin bir tetraploidde SNP_02,nin dört Guanin (G) kopyasinin taranmasini (saptanmasini) içerebilir. Benzer bir sekilde, alternatif veya ek olarak, WT (duyarli) SNP genotipinin yokluguna iliskin tarama burada kapsanmaktadir. nükleotidinde bir Guanin (G) içeren bir diploid bitkiye, bitki bölümüne veya DNAlya referansta bulunuldugunda, markör tahlili alternatif veya ek olarak DIZI 1D NO: 21nin veya yoklugunu saptayabilir. Istege bagli olarak, usul ayrica bir kopya (örnegin haploidler veya diploidler için), iki kopya (örnegin diploidler veya ikili haploidler için), üç kopya (örnegin triploidler için) veya dört kopya (örnegin tetraploidler için) halinde geri melezleme fragmani içeren bir veya daha fazla tohum, bitki veya bitki bölümünün seçilmesini içerir. Burada açiklanan moleküler markörler standart usule göre saptanabilir. Örnegin SNP markörleri, bir KASP tahlili (WWW.kpbioscience.co.uk,ye bakiniz) veya baska SNP genotipleme tahlilleri kullanilarak kolayca saptanabilir. Bir KASP tahlili gelistirmek için, SNP,nin 70 baz çifti akis yukarisi ve 70 baz çifti akis asagisi seçilebilir ve alele spesifik iki düz primer ve alele spesifik bir ters primer dizayn edilebilir. KASP tahlili usulü için Dolayisiyla bir yöne göre, SNP markörleri ve cyv_3.1 ile iliskili markörün varligi/yoklugu bir KASP tahlili kullanilarak belirlenir, ama ayni sekilde baska SNP genotipleme tahlilleri kullanilabilir. Keza örnegin bir TaqMan SNP genotipleme tahlili, Yüksek Çözünürlüklü Erime (HRM) tahlili, SNP genotipleme dizileri (örnegin Fluidigm, Illumina ve benzeri) veya DNA dizilemesi kullanilabilir. Farkli bir yöne göre, Citrullus lanatus ssp. vui'garis türü bir tetraploid kültive edilmis karpuz üretmenin bir usulü sunulmakta olup, burada sözü edilen bitki kromozom 3 üzerinde bir yabani karpuz bitkisinden bir geri melezleme fragmani içerir, burada sözü edilen geri melezleme fragmani CVYV direnci veran bir lokus içerir, usul asagidaki asamalari içerir: Bir diploid kültive edilmis karpuzun veya bunun bir bölümünün kromozomlarinin ikiye katlanmasi ve bir tetraploid bitkinin veya bitki bölümünün tanimlanmasi (veya seçilmesi) ve istege bagli olarak bundan bütün halde bir bitkinin rejenere edilmesi, burada sözü edilen diploid baska yerde açiklandigi gibi kromozom 3 üzerinde homozigot formda CVYV direnci veren bir lokus içeren bir geri melezleme fragmaninin varligina bagli olarak CVYV"ye duyarlidir, Tetraploid bitkinin istege bagli olarak bir veya daha fazla özdöllenmesiyle cyv_3.1 'in veya bir varyantinin dört kopyasini içeren bir essoylu tetraploid hat üretir. Kolsisin tedavisi ve tetraploid saptamasiyla kromozomun ikiye katlanmasi için örnegin bakiniz: http://cuke.h0rt.ncsu.edu/cucurbit/wmelon/seedless.htm1. Yine, cyv_3.1 ,in veya bunun varyantinin varligi, bagli markörlerin biri veya daha fazlasi veya tümü saptanarak belirlenebilir. CVYV direncine sahip bir tetraploid essoylu bitki üretmek için asagidaki asamalari içeren bir usul sunulmaktadir: a) kromozom 3 üzerinde bir yabani karpuz bitkisinden bir geri melezleine fragmani içeren bir diploid essoylu hat temin etmek, sözü edilen geri melezleme fragmani homozigot formda CVYV direnci veren bir lokus içerir ve b) sözü edilen essoylu hattin veya hattin bitki bölümünün kromozomlarini ikiye katlayarak, bir tetraploid hat veya tetraploid bitki bölümü üretmek ve hattin bir tetraploid bitkisini rejenere etmek ve c) tetraploid hatti birkaç jenerasyon özdölllenmeye tabi tutmak. Asama a)"da diploid bitki yukarida açiklandigi gbi bulusun herhangi bir diploid bitkisi tevdi edilen tohumdan elde edilen bir bitki veya bunlarin herhangi biririr silsilesi olabilir tohumdan cyv_3.1 ,in melezlemeyle aktarildigi bir diploid bitki olabilir. Diploid, bir yabani, CVYV,ye dirençli karpuzdan cyv_3.1 'in veya bir varyantinin kültive edilmis karpuza geri melezlenmesiyle üretilen yeni bir diploid bitki de olabilir. Geri melezleine örnegin PIl893 18 veya baska yabani karpuz tiplerinden olabilir. Yine baska bir yöne göre, Citrullus lanatus ssp. vulgaris türü triploid hibrid karpuz bitkilerini üretmek için asagidakiler içeren bir usul sunulmaktadir: Cyv_3.1 Jin (veya bunun bir varyantirir) dört kopyasini içeren bir tetraploid disi ebeveyn hattinin, cyv_3.1°in (veya bunun bir varyantinin) iki kopyasini içeren bir diploid erkek ebeveyn hattiyla melezlenmesi ve disi ebeveyn hattinda üretilen tohumlarin toplanmasi. Istege bagli olarak toplanan tohumlar kurutulabilir. Tetraploid disi hattin polenlenmesi izolasyon bloklarinda elle veya böceklerle (örnegin arilar) olabilir. Tetraploid disi çiçeklerin erkek diploidden polenle polenlenmesini saglamak için, erkek çiçeklerin elle toplanmasini ve disi çiçeklerin elle polenlenmesi, ardindan polenleninis çiçegin öitülmesi gibi farkli usuller kullanilabilir. Alternatif olarak, tetraploid bitkiler üzerindeki pistilli çiçeklerin diploid polenle polenlenmesini saglamak için teraploid bitkilerde gelisen bütün erkek (ercikli) çiçekler uzaklastirilabilir. Tetraploid bitkilerdeki meyveler olgunlastiginda toplanir ve triploid F1 hibrid tohumlari (çapraz polenlenmeden kaynaklanan) toplanir. Bunlar daha sonra sinitlandirilabilir (örnegin büyüklüge göre), kurutulur, istege bagli olarak islemden geçirilir ve satis için paketlenir. Dolayisiyla yukaridaki usulle elde edilen tohumlari içeren veya bu tohumlardan olusan ambalajlar veya kaplar buradaki bir düzenlemedir. Bir düzenlemede, çekirdeksiz triploid meyveler üretmek için asagidakileri içiren bir usul sunulmaktadir: a) cyv_3.1 )in veya bunun bir varyantinin üç kopyasini içeren triploid hibrid karpuz bitkileri ile diploid polen tasiyici bitkileri birlikte dikmek, b) triploid hibrid bitkilerdeki disi çiçeklerin polenlenmesine izin vermek ve istege bagli olarak o) triploid hibrid bitkilerden meyveleri toplamak. Dolayisiyla, çekirdeksiz meyve üretimi için, bulusa uygun triploid CVYV"ye dirençli hibrid, örnegin Jenny veya Polimax gibi uygun bir diploid polen tasiyiciyla veya Süper polen tasiyicilar (SP-1, SP-Z, SP-3, SP-4, SP-5), Sidekick, Escort-4, Companion veya açiklandigi gibi çift amaçli bir polen tasiyici olabilir. Diploid polen tasiyicinin, triploid hibridlerde meyve tutumunu saglamak için günün dogru zamaninda ve uygun bir süreyle yeterli polen üretmesi gerekir. Polen tasiyici bitkiler hibrid diploidler (F1 diploidler) veya açik polenlenmis (OP) polen tasiyicilar olabilir. Daha sonra bulusun triploid bitkilerinden meyveler toplanir. Triploid bitkiler farkli köksaplar üzerine asilanabilir. Usul tercihen açik alanda uygulanir. Bir tarlaya birlikte dikim polen tasiyici ve triploidlerin ekilmesi veya dikilmesiyle yapilabilir. Bu alanda bilindigi gibi çesitli birlikte dikim usulleri ve çesitli polen tasiyici: triploid hibrid oranlari kullanilabilir. Örnegin en azindan her 2, en azindan her 3 veya en azindan her 4 triploid sirasi için bir polen tasiyici bitki sirasi bulunabilir, ama baska birlikte dikim usulleri de kullanilabilir. Polenleme genellikle arilar tarafindan yapilir ve dogal olarak yeterli yabani ari yoksa tarlalarda ari kovanlari temin edilebilir. Polenleme elle veya mekanik yollarla da yapilabilir. Olgunlukta hasat elle veya makineyle yapilabilir. Üç kopya cycý3.] (veya bunun bir varyantini) içeren triploid meyveler çekirdeksizdir. Meyveler taze tüketilmek veya islenmek üzere hasat edilebilir. Birçok bu tür meyveyi veya meyve bölümünü içeren kaplar da bulusun baska bir düzenlemesidir. Hasat edien meyveler sinitlandirilabilir, kaplar vs. içinde ambalajlanabilir. Triploid meyveler içeren veya bunlardan olusan kaplar tercihen genomlarinda cyv_3.1 ,in (veya bir varyantinin) üç kopyasini içeren satilabilir meyveleri içerir veya bunlardan olusur. Meyve bölümleri ve meyve bölümlerini içeren gida veya yem ürünleri içeren kaplar da burada kapsanmaktadir. Bulusa uygun kullanimlar Cyv_3.1 Jin (veya bunun bir varyantinin) satilabilir meyveler üreten, CVYVsye dirençli kültive edilmis karpuz bitkileri üretmek için kullanilmasi bulusun bir yönüdür. Benzer bir sekilde cyv_3.1 ,e (veya bunun bir varyantina) bagli markörlerin herhangi birinin cyv_3.1 ,i (veya bunun bir varyantini) içeren veya koruyan bitkilerin veya bitki bölümlerinin veya silsilenin tanimlanmasinda ve/veya seçilmesinde kullanimi da burada kapsanmaktadir. Bir yöne göre bulusa uygun bir diploid veya ikili haploid bitkinin bir erkek veya disi ebeveyn olarak kullanimi sunulmakta olup, burada bitki baska bir karpuz bitkisiyle melezlenerek veya özdöllenmesine izin verilerek silsile üretilir. Bir yöne göre, bulusa uygun bir tetraploid bitkinin bir erkek veya disi ebeveyn olarak kullanimi sunulmakta olup, burada bitki baska bir karpuz bitkisiyle (örnegin bir diploid erkek ebeveynle) melezlenerek veya özdöllenmesine izin verilerek silsile üretilir. Özellikle bir tetraploidin hibrid triploid karpuz tohumu üretiminde (yani F1 tohumu üretimi) bir disi ebeveyn olarak kullanimi burada kapsanmaktadir. Baska bir yöne göre, bulusa uygun triploid bitkinin triploid çekirdeksiz meyve üretiminde kullanimi sunulmaktadir. T ohumlar ve bitki bölümleri ve silsile Burada açiklanan diploid, triploid veya tetraploid bitkilerin yetisirilebildigi tohumlari sunmanin da bulusun bir amaci oldugu takdir edilecektir. Ayrica bulusun diploid, ikili haploid, triploid veya tetraploid bitkilerinin hücrelerinin ve dokularinin yani sira fideleri, filizleri ve köksaplari da burada kapsanmaktadir. Bu bitki bölümleri bulusa uygun cyv_3. 1 i (veya bir varyantini) içerir. Bitkinin bir bitki bölümü örnegin filiz, meyve, polen, tohumcuk, sap, çenek, yaprak, hücre, ogulcuk, meristem, basçik, kök, kök ucu, pistil, çiçek ve/veya tohum arasindan seçilebilir. F 1 tohumlarini ve sonraki jenerasyon silsileyi (F2, F3 vs.) üretmek için burada açiklanan cyv_3.1 'i (veya bir varyantini) içeren bir bitki baska bir karpuz bitkisiyle inelezlenerek ve/veya bulusa uygun bir bitki özdöllenerek elde edilebilen tohumlar gibi bulusa uygun bitkilerin herhangi birinin silsilesi de burada sunulmaktadir. Silsilede cyv_3. 1 ,in (veya bir varyantinin) varligi CVYV direnç tahlilleriyle ve/veya markör analiziyle belirlenebilir.10 Bulusa uygun bitkilerden (örnegin cyvýî 1 veya bunun bir varyantini içeren bitkilerden) elde edilen (türetilen) veya elde edilebilir (türetilebilir) karpuz bitkileri arasinda, özdöllenme, melezleme, geriye melezleme, yinelenen seçim, çift haploid üretiini, inarkör destekli seçim, klonal propagasyonlar, transformantlar ve bunun gibi islah usulleriyle elde edilen bitkiler yer alir, burada elde edilen bitkiler bulusa uygun cyv_3.1 Ji (veya bir varyantini) içeren en az bir rekombinant kromozom 3 içerir. NCIMB 42666 erisim numarasiyla tevdi edilmis bir karpuz bitkisi veya bu bitkilerin herhangi birinin örnegin melezleine ve/veya özdöllemeyle elde edilen silsilesi sunulmaktadir. Bir yöne göre, temsil edici sayida tohumu NCIMB 42449 veya NCIMB sunulmaktadir. Ayrica bu bitkilerden veya bunlarin silsilesinden elde edilen polen, bir tohumcuk, hücreler, dokular, vejetatif propagasyonlar sunulmaktadir. Bir yöne göre silsile, tevdi edilmis bitkilerin cyv_3.] lokusunu korur. Bir yöne göre, silsile, tohumlari NCIMB kromozom 3'ü üzerindeki (cyv_3.1 'i içeren) geri melezleme fragmanini veya geri melezleme fragmaninin daha küçük bir fragmanini korur, burada daha küçük fragman CVYV direnci veren lokusu (cyv_3.]) korur. Ince esleme. dizileme ve alelizm testleri, Cyv_3.1 lokusu kromozom 3 "ün yaklasik 2.50 Mbssi ile yaklasik 12.8 Mblsi arasindaki bölgede bulunur, Sekil 1. Ince esleme, lokusun tam konumunu belirlemek için bu alanda bilinen usuller kullanilarak yapilabilir. Örnegin geri melezlenmis bölgenin daha küçük bölümlerini içeren rekombinant hatlar üretilebilir ve daha sonra hangi fraginanin hâlâ CVYVsye karsi direnci verdigini (ve dolayisiyla lokusu korudugunu) belirlemek için CVYV tahlilleri kullanilabilir. Alternatif olarak, bölge aday direnç genlerini belirlemek için dizilenebilir. Bu usuller veya benzer usuller kullanilarak cyv_3.1 lokusuna (veya varyantina) daha yakindan bagli markörler belirlenebilir, örnegin SNP_02" ye veya lkb veya daha az bir fiziksel mesafe içinde olan, cyv_3.] ,e (veya bir varyantina) bagli yabani karpuz genomuna spesifik moleküler markör belirlenebilir. Benzer bir sekilde, CVYViye dirençli herhangi yabani karpuz tipleri, örnegin Pll 893 l 8 veya digerleri kültive edilmis CVYVSye duyarli karpuzla melezlenerek yeni bir esleme popülasyonu üretilebilir ve cyv_3.1 veya bunun bir varyanti tarafindan CVYV direncinin verilip verilmedigi belirlenir, yani bir CVYV direnci QTL kromozom 3"le ayni bölgeye eslenirse, yabani tip açik bir sekilde cyv_3.1 ,i veya bunun bir varyantini içeriyor demektir. Iki karpuz bitkisinin ikisi de CVYV direncine sahipse ve dirence ayni QTL"nin neden oldugu açik degilse, ayni lokusun (yani cyv_3.] veya bir varyanti) söz konusu olup olmadigini belirlemek için farkli usuller kullanilabilir. Sözü edildigi gibi, kromozom 3 bölgesinde bir yabani karpuzdan direnç veren bir geri melezleine fragmaninin bulunup bulunmadigini belirlemek için markör testleri ve/veya dizileme ve/veya QTL esleme veya ince esleine kullanilabilir. Alternatif veya ek olarak bir alelizm testi yapilabilir, yani iki bitki melezlenebilir ve silsile bitkilerinde fenotipin (CVYV direnci) ayrilmasi analiz edilebilir. Asagidaki sinirlandirici olmayan Örneklerde, bulusa uygun cyv_3.1 içeren bitkiler açiklanmaktadir. Örneklerde aksi belirtilmedikçe, örnegin Maynard 2001, Watermelons - Characteristics, Production and Marketing, ASHS Press; Mohr H.C. Waterrnelon Breeding, Mark J. Bassett (editör) 1986 Breeding Vegetable Crops, AVI Publishing Company"de açiklandigi gibi geleneksel karpuz islah usulleri kullanilmaktadir. Tevdiat Bilgisi Nunhems B.V. homozigot formda cyv_3.] içeren ve Crimson Sweet tipi bir kabugu olan meyveler üreten bir diploid kültive edilmis karpuz hattinin tohumlarini NCIMB 42449 erisim numarasiyla ve homozi got formda cyv_3.1 içeren ve Jubile tipi bir kabugu olan meyveler üreten bir diploid kültive edilmis karpuz hattinin tohumlarini NCIMB 42450 erisim numarasiyla tevdi etti. Tohumlar Nunhems B.V. tarafindan 18 Agustos 2015ite NCIMB Ltd., Ferguson Building, Craibstone Estate, Bucksburn, Aberdeen AB21 9YA, BK°de tevdi edildi. Bu basvuru askida oldugu sürece Patent ve Marka Daire Baskani tarafindan belirlenen kisilerin tevdiatlara erisim yetkisi olacaktir. Nunhems B.V. homozigot formda cyv_3.] içeren ve kirmizi etli meyveler üreten bir diploid kültive edilmis karpuz hattinin tohumlarini NCIMB 42666 erisim numarasiyla tevdi etti. Tohumlar Nunhems B.V. tarafindan 26 Eylül 2016°da NCIMB Ltd., Ferguson Building, Craibstone Estate, Bucksburn, Aberdeen AB21 9YA, BK'de tevdi edildi. Bütün tohum tevdiatlari Budapeste Anlasmasi çerçevesinde ve Uzman çözümü kullanilarak yapildi. 37 C.F.R. g 1.808(b)°ye tabi olarak, tevdiatçinin bir veya daha fazla tevdiatin kamuya açik olmasina yönelik olarak getirdigi bütün kisitlamalar tevdiatlara erisim saglanarak patentin verilmesi üzerine kesin olarak kaldirilacaktir. Tevdiatlar, hangisi daha uzunsa 30 yil süreyle veya en son talepten sonra 5 yil veya patentin uygulanabilir oldugu süreyle korunacak ve bu süre içinde uygulanamaz hale gelirse degistirilecektir. Basvuru sahibi bu basvuru üzerine bu patent kapsaminda veya Bitki Varyetesi Koruma Kanunu (7 USC 2321 ve devami) kapsaminda verilen haklarindan feragat etmez. Örnekler Örnek 1: CVYV direnci - QTL esleme Yabani karpuz tipi ve CVYV,ye duyarli bir essoylu tescilli hat arasindaki inelezleinelerle iki F2 esleme popülasyonu olusturuldu. Popülasyonlar 3000 SNP ile genotiplendi. F3 hatlarinin fenotiplenmesi Italyasda iklim hücrelerinde bir CVYV tahlili kullanilarak yapildi. Ilk gerçek açilmis yaprak (ekimden 15 ila 20 gün sonra) elle inoküle edildi, ilkinden 4-5 gün sonra ikinci bir inokülasyon yapildi. Kontrol bitkileri sadece tamponla inoküle edildi. Iki replika halinde ve duyarli kontrol olarak Sugar Baby dâhil olmak üzere, CVYV (Almeria tipi sus) içeren inokulumla genotip basina toplam 14 bitki inoküle edildi. Bir randomize blok dizayni kullanildi. CVYV dondurulmus enfekte olmus yaprak dokusunda korundu. Inokulumu hazirlamak için duyarli hiyar varyetesi Sheila üzerinde virüs önceden çogaltildi. Daha sonra inokulumu hazirlamak için taze, genç, semptomatik Sheila varyetesi yapraklari kullanildi (5 ml 0.03M fosfat tampon için 1 gram taze yaprak, aktif karbon ve diyatomlu toprakla birlikte bir havan ve tokmakla bir buz yatagi üzerinde ezildi). inoküle edilmis bitkiler 12-14 saat aydinlik, 25 derece Celsius gündüz sicakligi ve 18 derece Celsius gece sicakligiyla inkübe edildi. Yapraklara düzenli araliklarla (örnegin inokülasyondan 20 gün sonra (dpi), 35 dpi, 50 dpi, 65 dpi) CVYV semptomlari açisindan puan verildi. Duyarli kontrol Sugar Babylnin 30 dpi sonra siddetle semptomatik olmasi gerekir. Tek tek bitkilere üç sinifta puan verildi. a) duyarli - yapraklar üzerinde semptomlar var, b) dirençli - yapraklar üzerinde hiç semptom yok, 0) kuskulu. Bir hattin direrençli kabul edilmesi için 0 hattin bitkilerinin, en az %90,inin "dirençli" olarak degerlendirilmesi gerekiyordu. QTL eslemesi, her iki esleme popülasyonunda kromozom 3 üzerinde cyv_3.1 adi verilen CVYV direnci için öneinli bir QTL3yi ortaya çikardi. QTL,nin yerini daha iyi belirlemek için, güven araligi içinde daha fazla SNP markörü tanimlandi. QTLlye yakindan bagli SNP_01, SNP_02 ve SNP_03 adi verilen üç markör belirlendi, Tablo 17e bakiniz (yukarida). SNP Kromozom Kromozom 3 üzerinde baz pozisyonu Örnek 2: cyv 3. 1 ,in elit hatlara geri çaprazlanmasi Markör destekli geriye melezleme kullanilarak, cyv_3.1 birkaç elit hatta geri çaprazlandi (4 numaralariyla tevdi edildi. açiklananla ayni sekilde, Murciaida iklim hücrelerinde art arda iki yil CVYV°ye direnç açisindan degerlendirildi (fenotiplendi). Sonuçlar asagida Tablo 4,te gösterilmektedir: 2014 fenotiplemesi: Bitki hatti Tekrar Bitki Ilk Ikinci sayisi degerlendirme degerlendirme (dirençli (dirençli bitkiler %,si) bitkiler %"si) Duyarli hat 1 10 O 0 Duyarli hat 2 10 30 20 Duyarli hat 1 10 40 0 Duyarli hat 2 10 50 20 Duyarli hat 3 10 40 10 Sugar Baby (kontrol) Çok 50 22 O 2015 fenotiplemesi: Sugar Baby (kontrol) Çok 35 27 O Ornek 3: Markör teyidi Farkli karpuz malzemelerinin bir derlemesinde bu markörlerin teyidi, CVYV direnci için iki haplotipin kesfine yol açti, SNP_01 haplotipleri ayirt edebildi. Test edilen bütün ticari hibridler Sugar Baby ile ayni genotipe sahipti ve hepsi CVYV*ye duyarliydi. SNP_01 SNP_02 SNP_03 CVYV direnci SUGAR BABY GG AA TT Duyarli Örnek 4: ZYMV direnci kromozom 3 üzerinde bagimsiz bir lokustur Literatürden ZYMV direncinin de kromozom 3 üzerinde bulundugu bilindigi için, bulus sahipleri CVYV°ye dirençli bitkilerin ayni zamanda ZYMV°ye dirençli olup olmadigini susuyla inoküle ettiler. SNP markör verilerini, burada SNP_04 olarak geçen zym genine bagli olarak yayimlanan SNP için yeniden analiz ettiler. direnci direnci Essoylu hat - GG GG CC GG Dirençli Dirençli tevdi edilmemis Essoylu hat - AA GG CC TT Dirençli Duyarli Essoylu hat- AA GG CC TT Dirençli Duyarli SUGAR BABY GG AA TT TT Duyarli Duyarli Sonuçlar cyvý3. 1 ve zym ,in kromozom 3 üzerindeki bagimsiz lokuslar oldugunu ve SNP_043ün ZYMVSye dirençli ve duyarli bitkileri ayirt etmek için kullanilabildigini gösterdi. Örnek 5: Tetraploid hatlar dirençli tetraploid hatlari üretmek için kullanildi. NCIMB 42449 için bes vasayimsal tetraploid hat yapildi, NCIMB 42450 için ise on varsayimsal tetraploid hat yapildi. Örnek 6: Yabani karpuz tiplerinin taranmasi Örnegin US GRIN derlemesinden kaynaklanan yabani, diploid, karpuz tipleri silsilesi CVYV direnci açisindan ve SNP_01, SNP_02 ve SNP_03 için SNP genotipleri açisindan tarandi. PII89318,den kaynaklanan bir hattin asagidaki SNP genotipine ve asagidaki direnç fenotipine sahip oldugu tespit edildi:. SNP_01 SNP_02 SNP_03 CVYV direnci P1189318 GG GG CC Dirençli Dolayisiyla bu yabani karpuz, ayi/_3.1 ,i kültive edilmis karpuza, örnegin geriye melezlemeyle geri melezlemek için kullanilabilir. burada tevdi edilen tohumlardan yetistirilmis bitkilerle melezlenerek bir alelizm testi uygulanabilir. TR TR TR TR TR TR TR TR TR