[go: up one dir, main page]

SK286106B6 - Spôsob vykonávania imunodiagnostickej skúšky na detekciu protilátky proti vírusu hepatitídy C - Google Patents

Spôsob vykonávania imunodiagnostickej skúšky na detekciu protilátky proti vírusu hepatitídy C Download PDF

Info

Publication number
SK286106B6
SK286106B6 SK40-2005A SK402005A SK286106B6 SK 286106 B6 SK286106 B6 SK 286106B6 SK 402005 A SK402005 A SK 402005A SK 286106 B6 SK286106 B6 SK 286106B6
Authority
SK
Slovakia
Prior art keywords
hcv
region
protein
glycoprotein
virus
Prior art date
Application number
SK40-2005A
Other languages
English (en)
Inventor
Robert O. Ralston
Frank Marcus
Kent B. Thudium
Barbara A. Cervase
Original Assignee
Novartis Vaccines & Diagnostics, Inc.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=27417050&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=SK286106(B6) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Novartis Vaccines & Diagnostics, Inc. filed Critical Novartis Vaccines & Diagnostics, Inc.
Publication of SK286106B6 publication Critical patent/SK286106B6/sk

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/005Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A61P1/16Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system for liver or gallbladder disorders, e.g. hepatoprotective agents, cholagogues, litholytics
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • A61P31/14Antivirals for RNA viruses
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • A61P31/20Antivirals for DNA viruses
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02Immunomodulators
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02Immunomodulators
    • A61P37/04Immunostimulants
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2770/00MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses positive-sense
    • C12N2770/00011Details
    • C12N2770/24011Flaviviridae
    • C12N2770/24211Hepacivirus, e.g. hepatitis C virus, hepatitis G virus
    • C12N2770/24222New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
  • Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Spôsob vykonávania imunodiagnostickej skúšky na detekciu protilátky proti vírusu hepatitídy C (HCV,anti-HCV protilátky) spočíva v tom, že sa (a) poskytne HCV skrátený glykoproteín, ktorý je vybraný zo súboru zahrnujúceho glykoproteín exprimovaný z E1 oblasti HCV, ktorá zahrnuje deléciu časti sekvencie, nachádzajúcej sa v oblasti aminokyselín 330 až 380 E1 oblasti, číslovanej od začiatku HCV polyproteínu, a glykoproteín exprimovaný z E2 oblasti HCV, ktorá zahrnuje deléciu časti sekvencie, nachádzajúcej sa v oblasti aminokyselín 660 až 830 E2 oblasti, číslovanej od začiatku HCV polyproteínu, nasleduje inkubácia biologickej vzorky s uvedeným HCV skráteným glykoproteínom za podmienok, ktoré umožňujú tvorbu komplexu protilátka-antigén, a (b) stanoví sa, či sa vytvoril komplex protilátka-antigén, obsahujúci tento skrátený glykoproteín.

Description

Tento vynález je zameraný na spôsob vykonávania imunodiagnostickej skúšky na detekciu protilátky proti vírusu hepatitídy C.
Doterajší stav techniky
Hepatitída typu non-A non-B (NANBH) je nákazlivá choroba (alebo skupina chorôb), o ktorej sa usudzuje, že je spôsobená vírusom a je odlíšiteľná od iných foriem s vírusom asociovaných pečeňových chorôb, ako sú choroby spôsobené vírusom hepatitídy A (HAV), vírusom hepatitídy B (HBV), delta hepatitis vírusom (HDV), cytomegalovírusom (CMV) alebo vírusom Epstein-Barrovej. Epidemiologické štúdie napovedajú, že môžu byť tri typy NANBH: vodou prenosný typ alebo ihlami prenosný typ a sporadicky sa vyskytujúci spoločne získaný typ. Počet príčinných agens je neznámy. Ale nový vírusový druh, vírus hepatitídy C (HCV) bol nedávno identifikovaný ako primárny (ak nie jediný) pôvodca krvou prenosnej NANBH (BB-NANBH). Hepatitída typu C sa javí byť hlavnou formou hepatitíd spojených s transfúziou v mnohých krajinách alebo oblastiach, vrátane Spojených štátov, Európy, Japonska. Je tu tiež evidentné prispenie HCV v indukcii hepatocelulámeho karcinómu. Existuje tak potreba účinnej metódy na prevenciu a liečenie HCV infekcie. Potreba citlivých, špecifických metód na skríning a identifikáciu nosičov HCV a HCV-kontaminovanej krvi alebo krvných produktov je zrejmá. Post-transfúzna hepatitída (PTH) sa vyskytuje približne u 10 % pacientov s transfúziou a HCV sa pripisuje 90 % týchto prípadov. Hlavným problémom pri tejto chorobe je častá progresia do chronického pečeňového ochorenia nastupujúca v 25 až 55 %.
Starostlivosť o pacienta, ako i prevencia prenosu vírusu hepatitídy C krvou a krvnými produktmi alebo tesným osobným kontaktom, potrebuje spoľahlivý diagnostický a prognostický nástroj na detekciu nukleových kyselín, antigénov a protilátok, týkajúcich sa HCV. Navyše je tu tiež potreba účinnej vakcinácie a imunoterapeutických liečebných agens na prevenciu a/alebo liečenie choroby.
HCV sa objavuje v krvi infikovaných jedincov vo veľmi nízkom stupni v porovnaní s inými infekčnými vírusmi, čo robí vírus veľmi ťažko detekovateľným. Nízke vírusové zaťaženie je pravdepodobne primárnym dôvodom, že kauzálny agens NANB hepatitídy nebol tak dlho detegovaný. I keď bol teraz klonovaný, je stále ťažké HCV kultivovať a množiť. V súlade s tým je tu silná potreba rekombinantných prostriedkov na produkciu diagnostických, terapeutických, profylaktických HCV proteínov.
Navyše je i veľká potreba HCV vakcíny. Je však problematické kultivovať HCV v bunkových líniách. Nie je tak možné produkovať atenuované vírusové kmene sériovou pasážou v tkanivovej/bunkovej kultúre.
Podstata vynálezu
Predmetom tohto vynálezu je spôsob vykonávania imunodiagnostickej skúšky na detekciu protilátky proti vírusu hepatitídy C alebo HCV čiže anti-HCV protilátky, ktorého podstata spočíva v tom, že zahrnuje kroky: poskytnutie HCV skráteného glykoproteínu, kde glykoproteínje vybraný zo súboru zahrnujúceho glykoproteín exprimovaný z EI oblasti HCV, ktorá zahrnuje deléciu časti sekvencie, nachádzajúcej sa v oblasti aminokyselín 330 až 380 EI oblasti, číslovanej od začiatku HCV polyproteínu, a glykoproteín exprimovaný z E2 oblasti HCV, ktorá zahrnuje deléciu časti sekvencie nachádzajúcej sa v oblasti aminokyselín 660 až 830 E2 oblasti, číslovanej od začiatku HCV polyproteínu, inkubácia biologickej vzorky s uvedeným HCV skráteným glykoproteínom za podmienok, ktoré umožňujú tvorbu komplexu protilátka-antigén a stanovenie, či sa vytvoril komplex protilátka-antigén, obsahujúci tento skrátený glykoproteín.
Ďalej sa opisuje predmetný vynález detailne a v širších súvislostiach.
Zistilo sa, že dva HCV proteíny, EI a E2 sa javia byť s membránou asociované asialoglykoproteíny, ak sú exprimované v rekombinantných systémoch. Toto je prekvapujúce, pretože asialoglykoproteíny u cicavcov zvyčajne nezostávajú vo forme zakončenej manózou, ale sú modifikované cukrami. Manózou zakončená forma je obvykle iba prechodná. V prípade EI a E2 (ako boli exprimované v predmetnom systéme) sa javí byť asialoglykoprotein konečnou formou. EI (obalový proteín 1) je asialoglykoproteín, majúci molekulovú hmotnosť 35 000, ktorý je prepisovaný z danej oblasti HCV genómu. E2 (obalový proteín 2) je asialoglykoproteín, majúci molekulovú hmotnosť okolo 72 000, ktorý je prepisovaný z danej NS1 (neštruktúrny proteín 1) oblasti HCV genómu, na základe flavivírusového modelu HCV. Pretože vírusové asialoglykoproteíny sú často vysoko imunogénne, sú EI a E2 prvými kandidátmi pri použití v imunodiagnostických skúškach a terapeutických/profylaktických vakcínach.
Objav, že EI a E2 nie sú sialylované, je významný. Jednotlivá forma proteínu často určuje, ktoré bunky môžu slúžiť ako vhodný hostiteľ pre rekombinantnú expresiu. Prokaryoty ako E. coli neglykozylujú proteíny a sú všeobecne nevhodné na produkciu asialoglykoproteínov použitých ako antigén, pretože glykozylácia je často dôležitá pre plnú antigénnosť, solubilitu a stabilitu proteínu. Nižšie eukaryoty ako kvasinky a huby glykozylujú proteíny, ale všeobecne sú neschopné pridávať koncový zvyšok sialovej kyseliny ku komplexu cukru. Tak z kvasiniek odvodené proteíny môžu byť antigénovo odlišné od ich prirodzených (nerekombinantných) proťajškov. Expresia v cicavčích bunkách je preferovaná pre aplikáciu, v ktorej je dôležitá antigenicita produktu, pričom glykozylácia rekombinantných proteínov by sa mala veľmi podobať takej, ktorá je pri prirodzených vírusových proteínoch.
Nové informácie ukazujú, že HCV vírus môže preniknúť do hostiteľských buniek počas infekcie buď vďaka asialoglykoproteínovému receptoru, nachádzajúcemu sa na hepatocytoch, alebo manózovému receptoru nachádzajúcemu sa na hepatických endoteliálnych bunkách a makrofágoch (hlavne Kupfferových bunkách). S prekvapením sa zistilo, že väčšina prirodzených E1 a E2 neobsahuje terminálny zvyšok kyseliny sialovej, aleje iba glykozylovaná na jadre. Malá frakcia navyše obsahuje koncový N-acetylglukozamín.
Hepatitis C vírusový, skrátený asialoglykoproteín je bez všetkých alebo podstatných koncových zvyškov kyseliny sialovej. Hepatitis C vírusový alebo HCV, skrátený asialoglykoproteín, je vybraný zo skupiny zahrnujúcej asialoglykoproteín exprimovaný z E1 oblasti HCV, ktorá zahrnuje deléciu časti sekvencie, nachádzajúcej sa v oblasti aminokyselín 330 až 380 E1 oblasti, číslovanej od začiatku HCV polyproteínov a asialoglykoproteín exprimovaný z E2 oblasti HCV, ktorá zahrnuje deléciu časti sekvencie, nachádzajúcej sa v oblasti aminokyselín 660 až 830 E2 oblasti, číslovanej od začiatku HCV polyproteínu.
Uskutočnenie vynálezu
A. Definície
Výraz „asialoglykoproteín“ označuje glykozylovaný protein, ktorý je bez zlúčeniny kyseliny sialovej. Asialoglykoproteín môže byť pripravený rekombinantne alebo purifikáciou z bunkovej kultúry alebo z prirodzeného zdroja. V súčasnosti preferované asialoglykoproteíny sú odvodené od HCV, výhodne ide o asialoglykoproteíny E1 a E2, najvýhodnejšie rekombinantne E1 a E2 (rEl a rE2). Protein „v podstate bez“ sialovej kyseliny sa získa v medziach možností tejto definície, ak množstvo zvyšku sialovej kyseliny významne neinterferuje s väzbou asialoglykoproteínu na manózu viažuce proteíny, ako je GNA. Tento stupeň sialylácie sa zvyčajne získa tam, kde je menej ako 40 % celkovo N-viazaných cukrov na sialovej kyseline, výhodnejšie menej ako 30 %, ešte výhodnejšie menej ako 20 %, obzvlášť výhodne menej ako 10 %, obzvlášť výhodne menej ako 5 % a najvýhodnejšie menej ako 2 %.
Výraz „El“ ako sa tu používa, označuje protein alebo polypeptid exprimovaný v rozmedzí prvých 400 aminokyselín HCV polyproteínu, označovaného ako E alebo S protein. Vo svojej prirodzenej forme ide o asialoglykoproteín s molekulovou hmotnosťou 35 000, ktorý je silne asociovaný s membránou. Vo väčšine HCV kmeňov je El protein kódovaný vo vírusovom polyproteíne, nasledujúci C (jadrový) protein. El proteín sa rozkladá od asi aminokyseliny 192 k asi aminokyseline 383 celkovej dĺžky polyproteínu. Výraz „El“ ako je tu použitý, tiež zahrnuje analóg a upravené mutanty, ktoré sú imunologický krížovo reaktívne s prirodzeným El.
Výraz „E2“, ako je tu použitý, označuje protein alebo polypeptid exprimovaný v rozmedzí prvých 900 aminokyselín NCV polyproteínu, niekedy označovaného ako NS1 protein. Vo svojej prirodzenej forme je to glykoproteín s molekulovou hmotnosťou 72 000, ktorý je silne asociovaný s membránou. Vo väčšine prirodzených kmeňov E2 protein nasleduje El protein. E2 protein sa rozkladá približne od aminokyseliny 384 k aminokyseline 820. Výraz „E2“, ako je tu použitý, označuje tiež analógy a spracované mutanty, ktoré sú imunologický skrížené reaktívne s prirodzeným E2.
Výraz „purifikovaný“ (čistený) ako je tu použitý, označuje kompozíciu, kde požadovaný protein tvorí aspoň 35 % celkového proteínového komponentu v kompozícii. Požadovaný protein účelne tvorí aspoň 40 %, lepšie aspoň 50 %, ešte lepšie aspoň 60 % a výhodne 70 %, výhodnejšie 80 %, ešte výhodnejšie 90 % a najvýhodnejšie aspoň 95 % celkového proteínového komponentu. Kompozícia môže obsahovať iné zlúčeniny ako cukry, soli, lipidy, rozpúšťadlá a tak podobne, bez ohrozenia uvedenej čistoty. „Izolovaným“ HCV glykoproteínom sa myslí HCV asialoglykoproteínová kompozícia, ktorá má čistotu aspoň 35 %.
„Manózu viažuci protein“ znamená lektín alebo iný protein, ktorý špecificky viaže proteíny, majúce manéžou zakončenú glykozyláciu (t. j. asialoglykoproteín), napríklad manózu viažuce lektíny, protilátky špecifické pre manózou zakončené glykozylácie, receptorový protein pre manózu (R. A. B. Ezekowitz a spol., J. Exp. Med. 176, 1785 až 1794 (1990)), receptorový protein pre asialoglykoproteín (H. Kurate a spol., J. Biol. Chem. 265. 11295 až 11298 (1990)), sérový manózu viažuci protein (I. Schuffenecker a spol., Cytogenet. Celí Genet. 56, 99 až 102 (1991), K. Sastry a spol., J. Immunol. 147. 692 až 697) (1991)), sérový asialoglykoproteín viažuci protein a podobne. Manózu viažuce lektíny zahrnujú napríklad GNA, konkavalín (ConA) a ďalšie lektíny s podobnými väzbovými vlastnosťami.
Výraz „GNA lektín“ označuje aglutinín Galanthus nivalus, komerčne dostupný lektín, ktorý viaže manózou zakončené glykoproteíny.
„Rekombinantný“ glykoproteín, ako je tu označený, je glykoproteín exprimovaný z rekombinantného polynukleotidu, v ktorom štruktúrny gén kódujúci glykoproteín je exprimovaný pod kontrolou regulačných sekvencií, nie prirodzene pripojených k štruktúrnemu génu, alebo kde štruktúrny gén je modifikovaný. Napríklad sa môže získať vektor, v ktorom je štruktúrny gén E1 umiestnený pod kontrolou funkčných fragmentov promótora kvasinkovej glyceraldehyd-3-fosfátdehydrogenázy (GAPDH). Súčasne preferovaným promótorom na použitie v kvasinkách je hybridný ADH2 (GAP promótor, opísaný US patentom č. 4 880 734, ktorý využíva fragment GAPDH promótora v kombinácii s protismemou aktivačnou sekvenciou, odvodenou od alkoholdehydrogenázy 2). Modifikácia štruktúrneho génu môže zahrnúť substitúciu rôznych kodónov a degeneráciu kodónov (t. j. utilizovať hostiteľom preferované kodóny, eliminovať alebo generovať miesto štiepenia reštrikčnými enzýmami, kontrolovať vlásenkové formácie atď.) a substitúciu, inzerciu alebo deléciu limitovaného množstva kodónov, kódujúcich odlišné aminokyseliny (výhodne nie viac ako 10 %, výhodnejšie menej ako 5 % z prirodzených aminokyselinových sekvencií by malo byť zmenené) a tak podobne. Podobne ako „rekombinantný“ receptor sa označuje receptorový proteín exprimovaný z rekombinantného polynukleotidu, v ktorom štruktúrny gén, kódujúci receptorový proteín, je exprimovaný pod kontrolou regulačnej sekvencie neprirodzene pripojenej k štruktúrnemu génu alebo v ktorom je štruktúrny gén modifikovaný.
Termín „izolovaný polypeptid“ označuje polypeptid, ktorý je v podstate zbavený iných HCV vírusových komponentov, hlavne polynukleotidov. Polypeptidová kompozícia je „v podstate bez“ iných komponentov, ak hmotnosť polypeptidu v kompozícii je aspoň 70 % hmotnosti polypeptidu a ďalších komponentov, výhodnejšie aspoň asi 80 %, ešte výhodnejšie asi 90 % a najvýhodnejšie 95 % alebo viac. Napríklad kompozícia, obsahujúca 100 pg/ml E1 a iba 3 pg/ml iných HCV komponentov (t. j. DNA, lipidov atď.) je v podstate „bez iných vírusových komponentov“, a tak je kompozícia izolovaného peptidu v medziach rozsahu tejto definície.
Termín „sekrečný leader“ označuje polypeptid, ktorý kóduje N-koniec proteínu a spôsobuje, že proteín je po translácii secemovaný do kultivačného média hostiteľských buniek. Sekrečný leader bude všeobecne odvodený od použitej hostiteľskej bunky. Napríklad vhodný sekrečný leader na použitie v kvasinkách je Saccharomyces cerevisae α-faktor leader (pozri US patent č. 4 870 008).
Výraz „nižšie eukaryoty“ označuje hostiteľské bunky, akými sú kvasinky, huby a podobne. Nižšie eukaryoty sú obyčajne (ale nie nevyhnutne) jednobunkové. Preferovanými nižšími eukaryotmi sú kvasinky, hlavne druhy Saccharomyces, Schizosaccharomyces, Klueromyces, Pichia, Hansenula a podobne. Najbežnejšie používanými kvasinkovými hostiteľmi sú Saccharomyces cerevisiae, S. carlsoergensis a K. lactis a sú to bežne používané hostiteľské bunky.
Termín „vyššie eukaryoty“ označuje hostiteľské bunky odvodené od vyšších živočíchov, ako sú cicavce, plazy, hmyz a podobne. Súčasne preferovanými vyššími eukaryotickými hostiteľskými bunkami sú tie, ktoré sú odvodené od čínskeho škrečka (napríklad CHO), opice (napríklad COS bunky), ľudské a hmyzie (napríklad Spodoptera frugiperda). Hostiteľské bunky môžu byť poskytnuté v suspenzii alebo v skúmavkovej kultúre, tkanivových kultúrach, orgánových kultúrach a podobne.
Výraz „kalciový modulátor“ označuje zlúčeninu schopnú sekvestrácie alebo väzby kalciových iónov vnútri endoplazmatického retikula alebo ovplyvňovať koncentráciu kalciových iónov vnútri ER svojím pôsobením na kalciové regulačné proteíny (napríklad proteíny kalciového kanálu, kalciovej pumpy atď.). Vhodné kalciové modulátory obsahujú napríklad tapsigargín, EGTA (etylénglykol-bis[3-aminoetyléter]N,N,N',N'-tetraoctová kyselina). Teraz preferovaným modulátorom je tapsigargín (pozri napr. O. Thastrup a spol., Proc. Nat. Acad. Sci. USA (1990), 87,2466 - 2470).
Termín „imunogénne“ označuje schopnosť substancie spôsobovať humorálnu a/alebo bunkovú imunitnú odpoveď, ak je sama naviazaná na nosič za prítomnosti alebo neprítomnosti prísad. „Neutralizácia“ označuje imunitnú odpoveď, ktorá blokuje infekčnosť buď čiastočne, alebo úplne, infekčného agens. „Vakcína“ je imunogénna kompozícia schopná vyvolať ochranu proti HCV úplnú alebo čiastočnú a je vhodná na liečenie indivídua.
Výraz „biologická tekutina“ označuje tekutinu získanú z organizmu, ako je sérum, plazma, sliny, žalúdočný sekrét, hlien a pod. Všeobecne je biologická tekutina skrínovaná na prítomnosť HCV častíc. Niektoré biologické tekutiny sú použité ako zdroj iných produktov, akými sú zrážacie faktory (napríklad faktor VIII:C), sérový albumín, rastový hormón a pod. V takýchto prípadoch je dôležité, že zdroj biologickej tekutiny je zbavený kontaminácie vírusom, akým je HCV.
B. Všeobecná metóda
E1 oblasť HCV genómuje opísaná v EP 388 323 ako oblasť „E“, zatiaľ čo E2 je opísaná ako „NS1“. E1 oblasť zahrnuje približne aminokyseliny 192 až 383 vo vírusovom polyproteíne plnej dĺžky. E2 oblasť zahrnuje približne oblasť aminokyselín 384 - 830. Kompletné sekvencie prototypov týchto proteínov (HCV-1 kmeň) sú v odbore dosiahnuteľné (pozri EP 388 232) a sú všeobecnými metódami na klonovanie a expresiu proteínov. Tak El, ako E2 môžu byť exprimované z polynukleotidu, kódujúceho prvých 850 až 900 aminokyselín HCV polyproteínu.' post-translačné spracovanie vo väčšine eukaryotických buniek štiepi počiatočný polyproteín na C, E1 a E2. Je možno upraviť 5' koniec kódujúcej oblasti na zníženie množstva produkovaného proteínu.
Expresia asialoglykoproteínov sa môže dosiahnuť mnohými metódami. Napríklad je možné dosiahnuť expresiu v nižších eukaryotoch (ako sú kvasinky), ktoré prirodzene nepridávajú zvyšky kyseliny sialovej ku glykozylovaným proteínom. V kvasinkovom expresnom systéme sa teraz preferuje využitie sekrečného leadera, ako je S. cerevisoae α-faktor leader, takže proteín je exprimovaný po translácii do kultivačného média. Je tiež v súčasnosti preferované využívanie glykozylácie bez mutantu, akým je pmrl, pretože tieto mutanty poskytujú iba jadrovú glykozyláciu a často secemujú heterológne proteíny s vysokou výťažnosťou (H. K. Rudolph a spol., Celí 58, 133 až 145 (1989)). Alternatívne je možné využiť iné druhy kvasiniek, ako je Pichia pastoris, ktorá exprímuje glykoproteíny, obsahujúce 8 až 9 manéžových zvyškov vo forme, o ktorej sa usudzuje, že sa podobá jadrovej glykozylácii formy pozorovanej u cicavcov a S. cerevisiae.
Alternatívne je možné uskutočniť expresiu v cicavčích bunkách a blokovať koncovú glykozyláciu (pridanie sialovej kyseliny). „Rekombinantné“ konštrukty budú výhodne zahrnovať expresný signál na zaistenie toho, že proteín je smerovaný do endoplazmatického retikula. Transport do Golgiho aparátu sa javí byť blokovaný E1 a E2 samotnými: vysoká hladina expresie E1 alebo E2 v cicavčích bunkách sa zdá byť ukončujúca sekréciu všetkých celulámych proteínov v endoplazmatickom retikule alebo cis Golgiho aparáte. Je navyše možné využiť glykozyláciu defektných mutantov. Pozri napríklad P. Stanley, Ann. Rev. Genet. 18, 525 až 552 (1984). V prípade glykozylácie alebo transportného mutantu exprimujúceho E1 alebo E2 so sialyláciou, môžu byť koncové zvyšky kyseliny sialovej oddelené pôsobením neuraminidázy.
Výťažok môže byť ďalej zvyšovaný pôsobením kalciového modulátora na získanie uvoľneného proteínu z vnútra endoplazmatického retikula. K vhodným modulátorom patria tapsigargín, EGTA a A23817 (pozri napr. O. Thastrup a spol., Proc. Nat. Acad. Sci. USA 87, 2466 až 2470 (1990)). Je napríklad možné exprimovať veľké množstvo E1 a E2 intraceluláme v cicavčích bunkách (napríklad CHO, COS, HeLa bunkách a pod.) transfekciou rekombinantným vektorom vírusu vakcínie. Po poskytnutí času na expresiu proteínov a akumuláciu v endoplazmatickom retikule sú bunky vystavené pôsobeniu kalciového modulátora v koncentrácii vysoko dostatočnej na to, aby spôsobila uvoľnenie obsahu ER. Proteín sa získa späť z kultivačného média, odkiaľ sa zoberie do ďalšieho cyklu.
Okrem toho môže byť výhodné exprimovať skrátenú formu obalového proteínu. Tak El, ako E2 receptor má silne hydrofóbnu doménu, ktorá výrazne kotví proteín v endoplazmatickom retikule a zabraňuje účinnému uvoľneniu. Tak šije možné želať deléciu oblasti sekvencie nájdenej v jednej alebo viacerých oblastiach aminokyselín 170 až 190, 260 až 290 alebo 330 až 380 El (počítané od začiatku polyproteínu) a aminokyselín 660 až 830 E2 (pozri napríklad obr. 20-1 EP 388 232). Je pravdepodobné, že aspoň jedna z týchto hydrofóbnych domén formuje transmembránovú oblasť, ktorá nie je nevyhnutná pre antigénnosť proteínu, a ktorá tak môže byť deletovaná bez nežiaduceho účinku. Najlepšia oblasť pre deléciu môže byť určená vykonaním malého množstva delečných experimentov skúseným odborníkom. Delécia hydrofóbneho 3' konca v E2 vedie k sekrécii exprimovanej časti E2 so sialyláciou secemovaného proteínu.
Je možné použiť akýkoľvek variant vektorov na získanie sekrécie. Nižšie eukaryoty, ako sú kvasinky, sú typicky transformované plazmidy s použitím metódy zrážania fosforečnanom vápenatým alebo transfekciou rekombinantným vírusom. Vektory sa môžu replikovať v hostiteľskej bunke nezávisle alebo sa môžu integrovať do genómu hostiteľskej bunky. Vyššie eukaryoty môžu byť transformované plazmidmi, ale sú zvyčajne infikované rekombinantným vírusom, napríklad rekombinantným vírusom vakcínie. Preferovaná je najmä vakcínia, pretože infekcia vakcíniou zastavuje expresiu proteínov hostiteľskej bunky. Teraz sú preferovanými hostiteľskými bunkami HeLa a plazmacytómové bunkové línie. V prítomnom systéme to znamená, že El a E2 sa akumulujú ako väčšinový glykozylovaný typ ER hostiteľa. Pretože rEl a rE2 budú prevažujúce glykoproteíny, ktoré sú zakončené manózou, môžu byť ľahko purifikované z buniek s použitím lektínov, ako je aglutinín Galanthus nivalus (GNA), ktorý viaže koncové manózové zvyšky.
Proteíny, ktoré sú prirodzene exprimované ako manózou zakončené glykoproteíny, sú relatívne vzácne v cicavčej fyziológii. Vo väčšine prípadov je cicavčí glykoproteín manózou zakončený iba ako prechodný intermediát v metabolickej ceste glykozylácie. Skutočnosť, že HCV proteíny, exprimované rekombinantne, obsahujú manózou ukončenú glykozyláciu alebo (v menšom stupni) N-acetylglukózamín, znamená, že HCV proteíny a všetky virióny môžu byť separované a čiastočne purifikované z endogénnych proteínov použitím lektínov špecifických pre koncovú manózu alebo N-acetylglukózamín. Rekombinantné proteíny sa javia byť autentické a zdajú sa byť v podstate identické s obalovými proteínmi zistenými v zrelom, voľnom virióne, alebo k vytvoreným s bunkou asociovaným obalovým proteínom. Je tak možné použiť lektíny, akým je GNA pre manózou zakončené proteíny a WGA (zárodočný aglutinín pšenice) a jeho ekvivalenty pre N-acetylglukózamínom zakončené proteíny. Môžu sa využiť lektíny, viazané na pevnú fázu (napríklad lektín - Sepharose® kolónu) na separáciu El a E2 zo supematantov bunkových kultúr a iných tekutín, napríklad na purifikáciu počas produkcie antigénov pre vakcínu alebo na použitie pri imunodiagnostickej skúške.
Alternatívne je možné poskytnúť vhodný lektín na izoláciu El, E2 alebo HCV viriónu z tekutiny alebo tkanivových vzoriek zo subjektu, o ktorom sa predpokladá, že je infikovaný HCV. Pretože manózou zakon čené glykoproteíny sú relatívne vzácne, môže takýto postup slúžiť na čistenie proteínov prítomných vo vzorke, významne redukujúcim pozadie. Po väzbe na lektín môže byť HCV proteín detegovaný použitím anti-HCV protilátok. Ak je prítomný celý virión, je možné alternatívne detegovať HCV nukleové kyseliny použitím PCR techník alebo iných metód amplifikácie nukleovej kyseliny, smerujúcich k zachovaniu oblasti HCV genómu (napríklad 5' nekódujúca oblasť). Táto metóda dovoľuje izoláciu a charakterizáciu odlišných kmeňov HCV s ohľadom na antigénny drift alebo variáciu, t. j. v prípadoch, kde nové kmene nie sú skrížené imunologický reaktívne s kmeňmi použitými na prípravu protilátok. Je tu mnoho ďalších ciest využitia výhodnosti unikátneho rozpoznania manózou zakončených glykoproteínov jednotlivými lektínmi. Napríklad je možné inkubovať vzorky, o ktorých sa predpokladá, že sú kontaminované HCV viriónmi alebo proteínmi s biotínom alebo avidínom označenými lektínmi a zrážať proteín-lektínový komplex s použitím avidínu alebo biotínu. Je možné tiež použiť afinitu lektínu k HCV proteínom na zameranie zlúčenín na virión na terapeutický účel, napríklad konjugáciou antivírusovej zlúčeniny s GNA. Alternatívne je možné použiť vhodné lektíny na vylúčenie manózou zakončených glykoproteínov zo séra alebo frakcie plazmy, a tak redukovať alebo eliminovať riziko HCV kontaminácie.
V súčasnosti je preferované izolovať E1 a/alebo E2 asialoglykoproteíny zo surového bunkového lyzátu inkubáciou s imobilizovaným manózu viažucim proteínom, hlavne lektínom, ako je ConA alebo GNA. Bunky sú lyzované, t. j. napr. mechanickou disrupciou v hypotonickom pufre nasledovanou odstredením na prípravu post-nukleámeho lyzátu a ďalším odstredením na získanie surovej frakcie mikrozomálnej membrány. Surová membránová frakcia je následne solubilizovaná v pufre, obsahujúcom povrchovo aktívnu látku akou je Triton X-100, NP-40 a podobne. Detergentový extrakt je ďalej vyčistený od nerozpustných častíc odstredením a výsledný vyčistený lyzát je inkubovaný v chromatografickej kolóne, obsahujúcej proteín viažuci imobilizovanú manózu, výhodne GNA viazaný na pevný nosič, akou je agaróza alebo SepharosaR v čase dostatočnom na väzbu, typicky 16 až 20 hodín. Suspenzia je potom aplikovaná do kolóny až do toho času, kým sa nezačne objavovať v eluente, potom je inkubovaná v kolóne v čase dostatočnom na viazanie, zvyčajne asi 12 až 24 hodín. Väzbový materiál je potom vymývaný ďalším pufor obsahujúcim detergentom (t. j. napr. Triton X-100, NP-40 a podobne) a eluovaný manózou na poskytnutie čisteného asialoglykoproteínu. Pri elúcii je preferované eluovať iba do toho času, kým sa proteíny objavia v eluáte, v tomto bode je elúcia zastavená a kolóna sa ekvilibruje 3 až 2 hodiny pred elúciou proteínov. O tom sa predpokladá, že je dostatočný čas na spomalenie stupňa očakávaných veľkých proteínových agregátov. V prípadoch, keď E1 a E2 sú exprimované spoločne v natívnej forme (t. j. bez skrátenia domény viažucej membránu) sa podstatná frakcia asialoglykoproteínu javí ako E1 : E2 agregáty. Ak sú skúmané elektrónovým mikroskopom, javí sa podstatný podiel týchto agregátov ako takmer sférické častice, majúce priemer asi 40 nm, čo je veľkosť očakávaná pre intaktný vírus. Tieto častice sa javia byť samozhromažďujúcimi s časticami subvírusovými. Pri týchto agregátoch sa očakáva, že budú mať kvartému štruktúru veľmi podobnú štruktúre autentických HCV viriónových častíc, a tak sa predpokladá ich využitie ako vysoko imunogénnej vakcíny.
E1/E2 komplexy môžu byť ďalej purifikované gólovou chromatografiou v základnom médiu, napríklad Fractogel-DEAE alebo DEAE-Sepharose®. Použitím Fractogel-DEAE gélovej chromatografie je možné získať E1/E2 komplexy približne so 60 až 80 % čistotou. Je možné ďalej purifikovať E1 pôsobením lyzínproteázy, pretože E1 má 0 až 1 lyzínový zvyšok. Pôsobením lyzínproteázy na komplex sa ničí E2 a umožňuje sa tak ľahká separácia El.
Tkanivová špecifickosť HCV v kombinácii s pozorovaním, že HCV obalové glykoproteíny sú manózou zakončené, napovedá, že vírus využíva manéžový receptor alebo asialoglykoproteínový receptor (ASGR), aby vstúpil do hostiteľskej bunky. Manózový receptor sa nachádza na makrofágoch a bunkách hepatálnych sínusov, zatiaľ čo ASGR sa nachádza na parenchymálnych hepatocytoch. Je tak možné kultivovať HCV využitím hostiteľských buniek, ktoré exprimujú jeden alebo obidva tieto receptory. Je možné využiť buď primárne bunkové kultúry, ktoré prirodzene exprimujú receptor, s použitím podmienok, pri ktorých je receptor udržiavaný, alebo môže byť transfekovaná iná bunková línia, ako je HeLa, CHO, COS a podobne, vektorom poskytujúcim expresiu receptora.
Klonovanie manózového receptora a jeho transfekcia a expresia vo fibroblastoch bola demonštrovaná M. E. Taylorom a spol., J. Biol. Chem. 265, 12156 až 12162 (1990). Klonovanie a sekvenovanie ASGR opísal K. Drickamer a spol., J. Biol. Chem. 259, 770 až 778 (1984), a M. Spiess a spol., Proc. Nat. Acad. Sci. USA 82, 6465 až 6469 (1985), transfekciu a expresiu funkčného ASGR v krysých HTC bunkách opísal M. McPhaul a P. Berg, Proc. Nat. Acad. Sci. USA 83, 8863 až 8867 (1986) a M. McPhaul a P. Berg, Mol. Celí. Biol. 7, 1841 až 1847 (1987). Je tak možné transfekovať jeden alebo obidva receptory do vhodných bunkových línií a použiť výsledné bunky ako hostiteľov na propagáciu HCV v kultúre. Sériová pasáž HCV v takej kultúre by mala priniesť vývoj atenuovaných kmeňov vhodných na použitie ako živé vakcíny. Je možné využiť buď primáme bunkové kultúry, ktoré prirodzene exprimujú receptor s použitím podmienok, v ktorých je receptor zachovaný, alebo je možné transfekovať inú bunkovú líniu ako HeLa, CHO, COS a podobne, vektorom, poskytujúcim expresiu receptora. Klonovanie manózového receptora a jeho transfekcia a expresia vo fibroblastoch bola demonštrovaná Taylorom a spol., pozri skôr, zatiaľ čo transfekcia a expresia funkčného
ASGR v krysích HTC bunkách bola opísaná McPhaulom a spol., pozri skôr. Teraz je preferované použitie imortalizovaných bunkových línií transfekovaných jedným alebo oboma rekombinantným receptormi.
Imunogénne kompozície môžu byť pripravené podľa metód známych v odbore. Prítomné kompozície obsahujú imunogénne množstvo polypeptidu, napríklad El, E2 alebo E1/E2 časticových kompozícií obvykle kombinované s farmaceutický prijateľným nosičom, pričom ďalej výhodne obsahujú prísadu. Ak je žiaduci „kokteil“, môže byť kombinácia HCV polypeptidu, ako napríklad El plus E2 antigénu, zmiešaná dohromady na zvýšenie účinnosti. Vírusu podobné častice E1/E2 agregátu sú považované za obzvlášť vhodný vakcínový antigén.
Príklady uskutočnenia vynálezu
Ďalej uvedené príklady predstavujú praktické uskutočnenie pre odborníkov v odbore a neznamenajú v žiadnom prípade obmedzenie tohto vynálezu.
Príklad 1 (Klonovanie a expresia) (A) Vektory boli konštruované z plazmidov, obsahujúcich 5' časť HCV genómu, ako je opísané v EP 318 216 a EP 388 232. Kazeta HCV(S/B) obsahuje Stul-Bglll DNA fragment, ktorý kóduje 5' zakončenie polyproteínu od Metl do Leu906, začínajúci pri nukleotide -63 vzhľadom na Met]. Zahrnuje jadrový proteín (C), El proteín (niekedy tiež označovaný ako S), E2 proteín (označovaný tiež ako NS1) a 5' časť NS2a oblasti. Po expresii konštruktu sa jednotlivé C, El a E2 proteíny produkujú proteolytickým spracovaním.
Kazeta HCV(A/B) obsahuje ApsLl-Bglll DNA fragment, kódujúci 5' koniec polyproteínu od Met] až do Leuw„ začínajúci pri nukleotide -6 vzhľadom na Metb Zahrnuje jadrový proteín (C), El proteín (niekedy tiež označovaný ako NS1) a 5' časť NS2a oblasti. Po expresii konštruktu sa jednotlivé C, El a E2 proteíny produkujú proteolytickým spracovaním.
Kazeta C-E1(S/B) (Stul-BamHI časť) obsahuje 5' koniec od Met! až do 11ε34ο (BamHI miesto v géne). Expresia tejto kazety vedie k expresii C a určitého skráteného El (Eľ). Časť skrátená od 3' konca je hydrofóbna oblasť, o ktorej sa predpokladá, že slúži ako translokačný signál.
Kazeta NSI(B/B) (BamHI-Bglll časť) obsahuje malú 3' časť od El (od Met364), celý E2 a časť NS2a (do Leu9o6). V tomto konštrukte slúži El fragment ako translokačný signál.
Kazeta TPA-NS1 využíva leader aktivátora ľudského tkanivového plazminogénu (tPa) ako translokačný signál namiesto 3' časti El. Kazeta obsahuje skrátenú formu E2 od Gly406 do Glu66l, v ktorej je hydrofóbny 3' koniec vypustený.
Každá kazeta bola inzertovaná do vektora pGME3Z (Promega) s a bez synteticky β-globín 5'-nekódujúcej sekvencie na transkripciu a transláciu s použitím T7 a expresiu in vitro v králičom retikulocyte. Rekombinantné vektory vírusu vaccinia (rVV) boli pripravené vsunutím kaziet do plazmidu pSCl 1 (získaný od Dr. B. Mosse, NIH) a nasledujúcou rekombináciou s vaccinia vírusom, ako opísal Charkrabarty a spol., Mol. Celí. Biol. 5,3403 až 3409(1985).
(B) Pozmenený expresný vektor bol skonštruovaný inzertom HCV(A/B) medzi Stul a Spel miesta pSCS9 (získaný od Dr. B. Mosse, NIH) a nasledujúcou rekombináciou s vaccinia vírusom, ako opísal Charkrabarty a spol., Mol. Celí. Biol. 5,3403 - 3409 (1985).
(C) HeLa S3 bunky boli zhromaždené odstreďovaním počas 7 minút pri frekvencii otáčok 2000 min'1 pri teplote miestnosti v sterilných 500 ml odstreďovacích nádobách (JA-10 rotor). Pelety boli resuspendované na konečnú koncentráciu 2 x 107 buniek/ml v ďalšom kultivačnom médiu (Joklik modifikované MEM Spinner médium + 5 % konského séra a gentamycín) („spinner médium“). Ultrazvukom spracovaný surový vv/SCS9-HCV zásobný vírus bol pridaný v násobku infekcie 8 pfu/bunka a zmes bola miešaná pri teplote 37 °C 30 minút. Infikované bunky boli potom prenesené do nádoby, obsahujúcej 8 1 spiner-média a inkubované 3 dni pri 37 °C.
Kultivované bunky potom boli zhromaždené odstredením a pelety boli resuspendované v pufre (10 mM Tris-HCl, pH 9,0, 152 ml). Bunky boli potom homogenizované s použitím 40 ml Dounce homogenizátora (50 rázov) a jadrá peletované odstredením (5 min., frekvencia otáčok 1600 min'1, 4 °C, JA-20 rotor). Jadrové pelety boli resuspendované v Tris pufre (24 ml), rehomogenizované a opäť peletované pri zhromaždení všetkých supematantov.
Zhromaždený lyzát bol rozdelený na 10 ml podiely a spracovaný ultrazvukom 3 x 30 minút v sonifikátore pri strednej sile. Sonifikovaný lyzát (15 ml) bol navrstvený na 17 ml sacharózové vankúšiky (36 %) v SW28 odstreďovacích skúmavkách a odstreďovaný pri frekvencii otáčok 13 500 min'1 počas 80 min. pri 4 °C na peletovanie vírusu. Peleta vírusu bola resuspendovaná v 1 ml Tris pufra (1 mM Tris HC1, pH 9,0) a zmrazená pri -80 °C.
Príklad 2 (Porovnanie produktov in vitro a in vivo) (A) E1 a E2 boli exprimované obidva in vitro a in vivo a 35S-Met označené s použitím vektorov opísaných v príklade 1. BSC-40 a HeLa bunky boli infikované rVV vektormi na in vivo expresiu. Médium a bunkové lyzáty boli skúšané na rekombinantné proteíny. Produkty boli imunoprecipitované s použitím ľudského HCV antiséra, zatiaľ čo in vitro proteiny boli analyzované priamo. Výsledné proteíny boli analyzované SDSPAGE.
Retikulocytový expresný systém (pGEM3Z s HCV(S/B) alebo HCV(A/B) produkuje C, E1 a E2 proteíny, majúce molekulové hmotnosti približne 18 000, 35 000 a 72 000. Lyzáty z BSC-40 a HeLa buniek transfekovaných rVV, obsahujúcim HCV(S/B), HCV(A/B) alebo C-E1(S/B) majú rovnaké proteíny. Pretože retikulocytový systém neposkytuje účinné golgi spracovanie, a preto neposkytuje sialovú kyselinu, skutočnosť, že obidva in vitro a in vivo produkty majú identické pohyblivosti, potvrdzuje, že proteíny nie sú in vivo sialylované. Iba rVV vektor, obsahujúci TPA-NS1 vedie v akejkoľvek extracelulámej sekrécii E2, ktorá má zmenenú pohyblivosť spojenú so sialyláciou.
(B) HCV(S/B) bol exprimovaný in vitro a inkubovaný s panelom biotinylovaných lektínov: GNA, SNA, PNA, WGA a ConA. Po inkubácii boli komplexy zhromaždené na avidín-akrylových guľôčkach, premyté, eluované Laemmli-vzorkovým pufrom a analyzované SDS-PAGE. Výsledky ukazujú, že E1 a E2 sa viaže na GNA a ConA, čo indikuje prítomnosť manózy. GNA sa viaže na koncové manózové skupiny, zatiaľ čo ConA sa viaže na akúkoľvek aa-napojenú manózu. Neprítomnosť väzby k SNA, PNA a WGA indikuje, že žiaden z proteínov neobsahuje sialovú kyselinu, galaktóza-N-acetylgalaktózamín alebo N-acetylglukózamín.
(C) Rádioaktívne značené E1 a E2 boli produkované v BSC-40 bunkách infekciou rVV, obsahujúcich HCV(SZB) (vv/SCll-HCV) a imunoprecipitované s ľudským HCV+ antisérom. Polovica imunoprecipitovaného materiálu bola ošetrená cez noc neuraminidázou na odstránenie akejkoľvek sialovej kyseliny. Po tomto spracovaní sa ošetrené a neošetrené proteíny analyzujú pomocou SDS-PAGE. Nebol pozorovaný žiaden významný rozdiel v mobilite, indikujúci neprítomnosť sialylácie in vivo.
(D) Rádioaktívne značené E1 a E2 boli produkované v BSC-40 bunkách infekciou rVV, obsahujúcich HCV(A/B) (vv/SCS9-HCV) a buď imunoprecipitované ľudským HCV+ sérom, alebo precipitované s použitím biotinylovaného GNA lektínu pripojeného k akrylovým guľôčkam s použitím w/SCl 1 bez HCV sekvencie ako kontroly. Precipitáty boli analyzované SDS-PAGE. Údaje demonštrujú, že E1 a E2 boli hlavnými druhmi manózou zakončených proteínov vo vv/SCS9-HCV infikovaných bunkách. CNA bol účinný ako ľudské antisérum v zrážaní E1 a E2 z bunkového kultivačného média. Bol pozorovaný komponent s molekulovou hmotnosťou 25 000, ale javí sa byť špecifický k vakcínia-infikovaným bunkám.
Príklad 3 (Purifikácia s použitím lektínu) (A) HeLa S3 bunky boli inokulované purifikovaným základným vírusom s vysokým titrom vv/SCSG-HCV pri násobnej infekcii 5 pfu/bunka a zmes bola miešaná pri 37 °C 30 minút. Infikované bunky boli potom prenesené do nádoby obsahujúcej 8 litrov spinner-média a inkubované 3 dni pri 37 °C. Bunky boli opäť zhromaždené odstredením a resuspendované v hypotonickom pufre (20 mM HEPES, 10 mM NaCl, 1 mM MgCl2, 120 ml) na ľade. Bunky potom boli homogenizované Dounce homogenizátorom (50 rázov) a jadrá peletované odstredením (5 minút, frekvencia otáčok 1600 min'1, 4 °C, JA-20 rotor). Pelety boli spojené, resuspendované v 48 ml hypotonického pufra, rehomogenizované, znova odstredené, opäť spojené a zmrazené na -80 °C.
Zmrazené supematanty potom boli roztavené a mikrozomálne membránové frakcie post-jadrového lyzátu izolované odstredením počas 20 min. v JA-20 rotore pri frekvencii otáčok 13 500 min'1 pri 4 °C. Supematant bol odstránený ašpiráciou.
Pelety boli vybraté do 96 ml detergentového pufra (20 mM Tris-HCl, 100 mM NaCl, 1 mM EDTA, 1 mM DDT, 0,5 % Triton X-100, pH 7,5) a homogenizované (50 rázov). Produkt bol vyčerený odstredením pri frekvencii 13 500 min'1 počas 20 minút pri teplote 4 °C a supematant bol zhromaždený.
GNA-agarózová kolóna (1 cm x 3 cm, 3 mg GNA/ml guľôčok, 6 ml objem lôžka, Vector Lebs, Burlingame, CA) bola vopred ekvilibrovaná s detergentovým pufrom. Vzorka supematantu bola aplikovaná na kolónu s recirkuláciou pri prietokovej rýchlosti 1 ml/min. počas 16 až 20 hodín pri 4 °C. Kolóna bola potom premytá detergentovým pufrom.
Purifikované E1/E2 asialoglykoproteíny boli eluované a-D-manozidom (0,9 M v detergentovom pufre) pri prietokovej rýchlosti 0,5 ml/min. Elúcia bola zastavená pri výskyte E1/E2 v eluente a kolóna sa nechala ekvilibrovať počas 2-3 hodín. Frakcie boli analyzované pomocou Westem blot a vyfarbením striebrom. Pikové frakcie boli spojené a ožiarené UV na inaktiváciu akéhokoľvek zvyškového vaccinia vírusu.
(B) GNA-agarózou purifikované E1 a E2 asialoglykoproteíny boli sedimentované 20 až 60 % glycerínovými gradientmi. Gradienty boli frakcionované a proteíny boli analyzované SDS-PAGE a Westemblottingom. Bloty boli skúšané s GNA na identifikáciu E1 a E2. Výsledky ukazujú prítomnosť E1 : E2 hete rodiméru, ktorý sedimentuje očakávanou rýchlosťou (t. j. poloha charakteristická pre protein s molekulovou hmotnosťou 110 000). Sú tiež prítomné väčšie agregáty HCV obalových proteínov. E2 : E2 homodiméry sú tiež evidentné. E2 sa prejavuje ako prevládajúci vo väčších druhoch vzhľadom na El, i keď tiež boli detegované diskrétne El : E2 druhy. Väčšie druhy sedimentujú výrazne rýchlejšie ako tyroglobulínový markér.
(C) GNA-agarózou punfikované El a E2 boli sedimentované v 20 až 60 % glycerínových gradientoch, obsahujúcich 1 mM EDTA. Frakcie boli analyzované SDS-PAGE s a bez β-merkaptoetanolu (βΜΕ). Nebol pozorovaný žiaden alebo len malý rozdiel v zjavnom zastúpení El a E2 za prítomnosti alebo neprítomnosti βΜΕ, indikujúci neprítomnosť disulfidových väzieb medzi heterodimérmi.
(D) E1/E2 komplexy (približne 40 % čistoty) boli analyzované na Coulter DM-4-sub-mikrónovom časticovom analyzátore. Materiál v rozmedzí 20 až 60 nm bol detegovaný.
(E) E1/E2 komplexy (približne 40 % čistoty) boli analyzované elektrónovou mikroskopiou s použitím negatívneho vyfarbenia fosforwolfrámovou kyselinou. Elektrónový mikrograf odhaľuje prítomnosť častíc, majúcich sférický zjav a priemer asi 40 nm. E1/E2 komplexy boli inkubované s HCV+ ľudským antisérom, potom analyzované EM s negatívnym vyfarbením. Boli pozorované komplexy protilátky, obsahujúce veľké agregáty a malé častice.
Príklad 4 (Chromatografické čistenie) (A) GNA lektínom purifikovaný materiál pripravený v príklade 3 (0,5 až 0,8 ml) bol zriedený 10-krát pufrom A (20 mM Tris-Cl pufor, pH 8,0, 1 mM EDTA) a aplikovaný na 1,8 x 1,5 cm kolónu Fractogelu EMD DEAE-650 (EM Separations, Gibbstown, New Jersey, kat. č. 16883) ekvilibrovanú v pufri A. Proteínová frakcia obsahujúca E1/E2 bola eluovaná rovnakým pufrom pri rýchlosti prietoku 0,2 ml/min. a boli odoberané 1 ml frakcie. Frakcie, obsahujúce El a E2 (stanovené SDS-PAGE) boli spojené a uložené pri -80 °C.
(B) Materiál purifikovaný v časti (A) mal čistotu 60 až 80 %, hodnotené pomocou SDS-PAGE. Identifikácia domnelých El a E2 pruhov bola potvrdená analýzou N-koncovej sekvencie s použitím transferovej techniky. Na tento účel bol Fractogel-DEAE purifikovaný E1/E2 materiál redukovaný prídavkom Laemli pufra (pH 6,8, 0,06 M Tris-Cl, 2,3 % SDS, 10 % glycerín, 0,72 M β-merkaptoetanol) a varený 3 minúty. Vzorka potom bola vložená na 10 % polyakrylamidový gél. Po SDS-PAGE bol protein prenesený na polyvinylidéndifluorid-(PVDF)-ovú 0,2 pm membránu (Bio-Rad Laboratories, Richmond, CA). Z blotu boli vyrezané pruhy domnelých El a E2 proteínov a podrobené analýze N-koncových aminokyselín, i keď nebola venovaná žiadna zvláštna starostlivosť ochrane amino-koncovej blokáde počas prípravy materiálu. Prvých 15 cyklov ukazuje, že El vzorka má sekvenciu
Tyr-Gln-Val-Arg-X-Ser-Thr-Gly-X-Tyr-His-Val-X-Asn-Asp, zatiaľ čo sekvencia E2 je
Thr-His-Val-Thr-Gly-X-X-Ala-Gly-His-X-Val-Gly-Phe.
Tieto údaje o aminokyselinových sekvenciách sú v súlade s údajmi predpokladanými zo zodpovedajúcich DNA sekvencií.
E1/E2 produkt purifikovaný Fractogel-DEAE chromatografiou je považovaný za agregovaný, ako je zrejmé zo skutočnosti, že veľké množstvo El a E2 koeluuje v oblasti prázdneho objemu kolóny pre gélovú chromatografiu Bio-Sil TSK-4000 SVV. Toto ukazuje, že za natívnych podmienok má významné množstvo E1/E2 komplexu molekulovú hmotnosť najmenej 800 000. E1/E2 materiál, majúci molekulovú hmotnosť asi 650 000, bol rovnako pozorovaný.

Claims (3)

  1. PATENTOVÉ NÁROKY
    1. Spôsob vykonávania imunodiagnostickej skúšky na detekciu protilátky proti vírusu hepatitídy C alebo HCV čiže anti-HCV protilátky, vyznačujúci sa tým, že zahrnuje kroky: poskytnutie HCV skráteného glykoproteínu, kde glykoproteín je vybraný zo súboru zahrnujúceho glykoproteín exprimovaný z El oblasti HCV, ktorá zahrnuje deléciu časti sekvencie, nachádzajúcej sa v oblasti aminokyselín 330 až 380 El oblasti, číslovanej od začiatku HCV polyproteínu a glykoproteín exprimovaný z E2 oblasti HCV, ktorá zahrnuje deléciu časti sekvencie, nachádzajúcej sa v oblasti aminokyselín 660 až 830 E2 oblasti, číslovanej od začiatku HCV polyproteínu; inkubácia biologickej vzorky s uvedeným HCV skráteným glykoproteinom za podmienok, ktoré umožňujú tvorbu komplexu protilátka-antigén a stanovenie, či sa vytvoril komplex protilátka-antigén, obsahujúci tento skrátený glykoproteín.
  2. 2. Spôsob podľa nároku 1, vyznačujúci sa tým, že skrátený glykoprotein sa exprimuje z E1 oblasti HCV, ktorá zahrnuje deléciu časti sekvencie, nachádzajúcej sa v oblasti aminokyselín 330 až 380 E1 oblasti, číslovanej od začiatku HCV polyproteínu.
  3. 3. Spôsob podľa nároku 1, vyznačujúci sa tým, že skrátený glykoprotein sa exprimuje z E2 5 oblasti HCV, ktorá zahrnuje deléciu časti sekvencie, nachádzajúcej sa v oblasti aminokyselín 660 až 830 E2
SK40-2005A 1990-11-08 1991-11-07 Spôsob vykonávania imunodiagnostickej skúšky na detekciu protilátky proti vírusu hepatitídy C SK286106B6 (sk)

Applications Claiming Priority (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US61141990A 1990-11-08 1990-11-08
US61196590A 1990-11-08 1990-11-08
US75888091A 1991-09-13 1991-09-13
PCT/US1991/008272 WO1992008734A1 (en) 1990-11-08 1991-11-07 Hepatitis c virus asialoglycoproteins

Publications (1)

Publication Number Publication Date
SK286106B6 true SK286106B6 (sk) 2008-03-05

Family

ID=27417050

Family Applications (3)

Application Number Title Priority Date Filing Date
SK40-2005A SK286106B6 (sk) 1990-11-08 1991-11-07 Spôsob vykonávania imunodiagnostickej skúšky na detekciu protilátky proti vírusu hepatitídy C
SK442-93A SK285623B6 (sk) 1990-11-08 1991-11-07 Spôsob produkcie asialoglykoproteínu hepatitis C vírusu
SK690-97A SK285624B6 (sk) 1990-11-08 1991-11-07 Hepatitis C vírusový (HCV) skrátený asialoglykoproteín, kompozícia s jeho obsahom a jeho použitie

Family Applications After (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
SK442-93A SK285623B6 (sk) 1990-11-08 1991-11-07 Spôsob produkcie asialoglykoproteínu hepatitis C vírusu
SK690-97A SK285624B6 (sk) 1990-11-08 1991-11-07 Hepatitis C vírusový (HCV) skrátený asialoglykoproteín, kompozícia s jeho obsahom a jeho použitie

Country Status (17)

Country Link
EP (2) EP0556292B2 (sk)
JP (8) JPH06504431A (sk)
AT (1) ATE188220T1 (sk)
AU (1) AU668078B2 (sk)
CA (2) CA2095521C (sk)
CZ (1) CZ289006B6 (sk)
DE (1) DE69131882T3 (sk)
DK (2) DK0842947T4 (sk)
ES (1) ES2139591T5 (sk)
FI (1) FI107803B (sk)
GR (1) GR3032771T3 (sk)
HU (2) HUT66063A (sk)
NO (2) NO304380B1 (sk)
PT (2) PT99466B (sk)
RO (1) RO115446B1 (sk)
SK (3) SK286106B6 (sk)
WO (1) WO1992008734A1 (sk)

Families Citing this family (32)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6274148B1 (en) 1990-11-08 2001-08-14 Chiron Corporation Hepatitis C virus asialoglycoproteins
JP3158177B2 (ja) * 1991-10-08 2001-04-23 国立感染症研究所長 C型肝炎診断薬
WO1993015193A1 (en) * 1992-01-31 1993-08-05 Abbott Laboratories Mammalian expression systems for hcv proteins
UA39944C2 (uk) * 1992-07-07 2001-07-16 Чірон Корпорейшн Спосіб визначення ранньої сероконверсії у ссавця-хазяїна до вірусу гепатиту с і набір для використання в способі
ATE249838T1 (de) 1993-05-12 2003-10-15 Chiron Corp Konserviertes motiv der hepatitis c virus e2/ns1 region
US5514539A (en) * 1993-06-29 1996-05-07 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Nucleotide and deduced amino acid sequences of the envelope 1 gene of 51 isolates of hepatitis C virus and the use of reagents derived from these sequences in diagnostic methods and vaccines
US5610009A (en) * 1994-01-28 1997-03-11 Abbott Laboratories Mammalian expression systems for hepatitis C virus envelope genes
EP1845108A3 (en) 1994-07-29 2007-10-24 Innogenetics N.V. Monoclonal antibodies to purified hepatitis c virus envelope proteins for diagnostic and therapeutic use
WO1996004301A2 (en) * 1994-07-29 1996-02-15 Chiron Corporation Novel hepatitis c e1 and e2 truncated polypeptides and methods of obtaining the same
DK1510580T3 (da) 1994-07-29 2009-02-16 Novartis Vaccines & Diagnostic Trunkeret hepatitis C E2-polypeptid og fremgangsmåder til opnåelse heraf
IT1271593B (it) * 1994-11-30 1997-06-04 Sanitaria Scaligera Spa Procedimento ed apparecchiatura per l'immunoadsorbimento specifico di virus hiv, di antigene gp120 e complesso cd4-gp120.
US6127116A (en) * 1995-08-29 2000-10-03 Washington University Functional DNA clone for hepatitis C virus (HCV) and uses thereof
FR2744725B1 (fr) * 1996-02-09 1998-04-30 Pasteur Institut Anticorps specifiques des complexes formes par les glycoproteines e1 et e2 du virus de l'hepatite c, procedes de determination de la presence, et d'isolement de ces complexes
US6514731B1 (en) 1996-05-24 2003-02-04 Chiron Corporation Methods for the preparation of hepatitis C virus multiple copy epitope fusion antigens
KR100209095B1 (ko) * 1996-06-28 1999-07-15 성재갑 C형 간염 바이러스의 프로테아제의 활성을 측정할 수 있는 c형 간염 대체 바이러스, 그 재조합 유전자 및 그 용도
JP4021493B2 (ja) 1996-11-08 2007-12-12 ザ ガヴァメント オブ ザ ユナイテッド ステイツ オブ アメリカ、レプリゼンテッド バイ ザ セクレタリー、 デパートメント オブ ヘルス アンド ヒューマン サーヴィスィズ C型肝炎ウイルス様粒子の合成および精製
US7338759B1 (en) 1997-03-04 2008-03-04 Washington University HCV variants
US7049428B1 (en) 1998-03-04 2006-05-23 Washington University HCV variants
ES2328536T3 (es) 1997-05-06 2009-11-13 Novartis Vaccines And Diagnostics, Inc. Produccion intracelular de polipeptido e2 truncado de la hepatitis c.
EP0947525A1 (en) 1998-03-27 1999-10-06 Innogenetics N.V. Epitopes in viral envelope proteins and specific antibodies directed against these epitopes: use for detection of HCV viral antigen in host tissue
US7108855B2 (en) 1998-06-24 2006-09-19 Innogenetics N.V. Purified hepatitis C virus envelope proteins for diagnostic and therapeutic use
JP5175417B2 (ja) 2000-08-17 2013-04-03 トリペップ アクチ ボラゲット リバビリンを含むワクチンおよびその使用方法
US7022830B2 (en) 2000-08-17 2006-04-04 Tripep Ab Hepatitis C virus codon optimized non-structural NS3/4A fusion gene
US6680059B2 (en) 2000-08-29 2004-01-20 Tripep Ab Vaccines containing ribavirin and methods of use thereof
US6858590B2 (en) 2000-08-17 2005-02-22 Tripep Ab Vaccines containing ribavirin and methods of use thereof
US7101561B2 (en) 2000-12-01 2006-09-05 Innogenetics N.V. Purified hepatitis C virus envelope proteins for diagnostic and therapeutic use
US7022323B2 (en) 2001-06-26 2006-04-04 Progenics Pharmaceuticals, Inc. Uses of DC-SIGN and DC-SIGNR for inhibiting hepatitis C virus infection
US20030232745A1 (en) * 2001-06-26 2003-12-18 Olson William C. Uses of DC-sign and DC-Signr for inhibiting hepatitis C virus infection
AU2003265454A1 (en) * 2002-08-16 2004-03-03 Ohio University Hepatitis c viral-like particle purification
CA2618429A1 (en) 2005-05-25 2007-03-22 Tripep Ab A hepatitis c virus non-structural ns3/4a fusion gene
WO2009022236A2 (en) 2007-08-16 2009-02-19 Tripep Ab Immunogen platform
WO2009130588A2 (en) 2008-04-22 2009-10-29 Tripep Ab Immunogen platform

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE3886363T3 (de) * 1987-11-18 2004-09-09 Chiron Corp. (N.D.Ges.D. Staates Delaware), Emeryville NANBV-Diagnostika
IL88599A0 (en) * 1987-12-10 1989-07-31 Cell Bio Group Ltd Glycoprotein cell growth modulating materials,their preparation and compositions containing them
UA50829C2 (uk) * 1989-03-17 2002-11-15 Чірон Корпорейшн Очищений поліпептид, що містить антиген вірусу гепатиту с, полінуклеотид, вектор, клітини, система експресії, моноклональне антитіло, препарат поліклональних антитіл, нуклеотидна проба, аналітичні набори, спосіб виявлення нуклеїнових кислот, способи імуноаналізу, вакцина, спосіб одержання антитіл
KR100206150B1 (ko) * 1990-04-04 1999-07-01 로버트 피. 블랙버언 항-에이치씨브이 항체에 대한 면역분석용 씨형 간염 바이러스(에이치디브이)항원의 조합체

Also Published As

Publication number Publication date
DK0556292T4 (da) 2006-12-27
NO304380B1 (no) 1998-12-07
JPH1171395A (ja) 1999-03-16
SK285623B6 (sk) 2007-05-03
EP0842947B1 (en) 2004-04-21
PT99466B (pt) 1999-04-30
DE69131882T3 (de) 2007-05-24
RO115446B1 (ro) 2000-02-28
EP0842947A2 (en) 1998-05-20
EP0556292A1 (en) 1993-08-25
FI932025A0 (fi) 1993-05-05
CZ82493A3 (en) 1994-04-13
EP0556292A4 (sk) 1995-01-18
FI932025L (fi) 1993-06-07
DK0556292T3 (da) 2000-04-17
CA2095521A1 (en) 1992-05-09
DE69131882D1 (en) 2000-02-03
ES2139591T5 (es) 2007-08-01
SK285624B6 (sk) 2007-05-03
EP0842947B2 (en) 2009-03-18
DK0842947T4 (da) 2009-06-08
DE69131882T2 (de) 2000-05-04
JP2008031181A (ja) 2008-02-14
HU9301336D0 (en) 1993-10-28
GR3032771T3 (en) 2000-06-30
FI107803B (fi) 2001-10-15
JP2006219503A (ja) 2006-08-24
NO972213L (no) 1997-05-14
PT102022B (pt) 2000-12-29
WO1992008734A1 (en) 1992-05-29
PT99466A (pt) 1992-10-30
ES2139591T3 (es) 2000-02-16
CA2203443C (en) 2001-08-28
NO972213D0 (no) 1997-05-14
DK0842947T3 (da) 2004-07-26
NO931680L (no) 1993-06-28
CZ289006B6 (cs) 2001-10-17
HU227498B1 (en) 2011-07-28
NO931680D0 (no) 1993-05-07
CA2095521C (en) 2009-06-30
JP2001286290A (ja) 2001-10-16
EP0842947A3 (en) 2001-12-12
JPH06504431A (ja) 1994-05-26
ATE188220T1 (de) 2000-01-15
PT102022A (pt) 1999-01-29
NO304381B1 (no) 1998-12-07
JP2003093081A (ja) 2003-04-02
JP3207155B2 (ja) 2001-09-10
EP0556292B1 (en) 1999-12-29
SK69097A3 (en) 1997-11-05
JP2005187479A (ja) 2005-07-14
JP2003174875A (ja) 2003-06-24
SK44293A3 (en) 1993-08-11
AU668078B2 (en) 1996-04-26
CA2203443A1 (en) 1992-05-09
HUT66063A (en) 1994-09-28
AU9026791A (en) 1992-06-11
EP0556292B2 (en) 2006-11-29
JP4056306B2 (ja) 2008-03-05

Similar Documents

Publication Publication Date Title
SK286106B6 (sk) Spôsob vykonávania imunodiagnostickej skúšky na detekciu protilátky proti vírusu hepatitídy C
US7105303B2 (en) Antibodies to hepatitis C virus asialoglycoproteins
RU2175657C2 (ru) Асиалогликопротеин вируса гепатита c (нсv), иммуногенная композиция, способ индукции иммунного ответа, способ иммуноанализа
JP2945759B2 (ja) C型肝炎ウイルスアシアロ糖タンパク質
EP1471073B1 (en) Hepatitis C virus asialoglycoproteins
FI107804B (fi) Immunomäärityksissä käytettäviä hepatiitti-C-viruksen asialoglykoproteiineja
CZ289923B6 (cs) Hepatitis C virový, zkrácený asialoglykoprotein, farmaceutická kompozice s jeho obsahem a jeho pouľití
IE84479B1 (en) Hepatitis C Virus Asialoglycoproteins