RU2837517C1 - System for visualising and analysing biological samples in culture medium - Google Patents
System for visualising and analysing biological samples in culture medium Download PDFInfo
- Publication number
- RU2837517C1 RU2837517C1 RU2024108605A RU2024108605A RU2837517C1 RU 2837517 C1 RU2837517 C1 RU 2837517C1 RU 2024108605 A RU2024108605 A RU 2024108605A RU 2024108605 A RU2024108605 A RU 2024108605A RU 2837517 C1 RU2837517 C1 RU 2837517C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- culture medium
- substrate
- unit
- image
- detection unit
- Prior art date
Links
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 title claims abstract description 93
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 title claims abstract description 30
- 239000000758 substrate Substances 0.000 claims abstract description 94
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 claims abstract description 37
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims abstract description 25
- 238000005286 illumination Methods 0.000 claims abstract description 22
- 238000010191 image analysis Methods 0.000 claims abstract description 15
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims abstract description 13
- 238000004891 communication Methods 0.000 claims abstract description 8
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 6
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims description 5
- 238000012800 visualization Methods 0.000 claims description 5
- 230000005855 radiation Effects 0.000 claims description 3
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 abstract description 5
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract description 2
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract 1
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 22
- 239000004599 antimicrobial Substances 0.000 description 7
- 238000000034 method Methods 0.000 description 7
- 238000003491 array Methods 0.000 description 6
- 230000002906 microbiologic effect Effects 0.000 description 5
- 239000002131 composite material Substances 0.000 description 4
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 4
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 4
- 238000013461 design Methods 0.000 description 3
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 3
- 230000033001 locomotion Effects 0.000 description 3
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 3
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 3
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 2
- 230000000845 anti-microbial effect Effects 0.000 description 2
- 239000003086 colorant Substances 0.000 description 2
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 2
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 2
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 description 2
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- 230000004075 alteration Effects 0.000 description 1
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 1
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 238000013473 artificial intelligence Methods 0.000 description 1
- 238000013528 artificial neural network Methods 0.000 description 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 1
- 239000003124 biologic agent Substances 0.000 description 1
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 1
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 1
- 238000009792 diffusion process Methods 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 1
- 239000006101 laboratory sample Substances 0.000 description 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 238000012543 microbiological analysis Methods 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000000704 physical effect Effects 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 1
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 1
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 1
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 1
Abstract
Description
Изобретение относится к области микробиологии, а более конкретно к системам визуализации и анализа биологических образцов, и может найти применение в автоматизированном тестировании штаммов микроорганизмов, присутствующих в биологических образцах, на чувствительность к антимикробным веществам. The invention relates to the field of microbiology, and more specifically to systems for visualizing and analyzing biological samples, and can find application in automated testing of microorganism strains present in biological samples for sensitivity to antimicrobial substances.
Определение чувствительности/устойчивости штаммов в популяции микроорганизмов к антимикробным веществам является одним из важнейших элементов медицинской практики. Качественное тестирование на чувствительность микроорганизмов к различным терапевтическим средствам позволяет определить, является ли микроорганизм устойчивым или чувствительным к определенному антибиотику, но не дает указания на степень чувствительности или резистентности микроорганизма. Количественное тестирование на чувствительность обеспечивает индикацию концентрации противомикробного агента, необходимого для ингибирования роста микроорганизма. Термин минимальная ингибирующая концентрация (MIC) используется для обозначения минимальной концентрации противомикробного агента, которая требуется для ингибирования роста микроорганизма. Использование автоматизированных систем позволяет минимизировать время работы персонала, а также свести к минимуму возможность человеческой ошибки при определении MIC. В общем виде, процесс определения чувствительности/устойчивости штаммов в популяции микроорганизмов к антибиотикам сводится к следующему.Determining the susceptibility/resistance of strains in a population of microorganisms to antimicrobial agents is one of the most important elements of medical practice. Qualitative testing for the susceptibility of microorganisms to various therapeutic agents allows one to determine whether a microorganism is resistant or susceptible to a particular antibiotic, but does not indicate the degree of susceptibility or resistance of the microorganism. Quantitative susceptibility testing provides an indication of the concentration of the antimicrobial agent required to inhibit the growth of the microorganism. The term minimum inhibitory concentration (MIC) is used to denote the minimum concentration of the antimicrobial agent required to inhibit the growth of the microorganism. The use of automated systems allows one to minimize the time of personnel work, as well as to minimize the possibility of human error in determining MIC. In general, the process of determining the susceptibility/resistance of strains in a population of microorganisms to antibiotics is as follows.
Лабораторный образец помещается на подложку в среду для биологического роста, а затем подложка перемещается в инкубационную камеру. При реализации современных подходов анализа после инкубации культуральная подложка с биологическим образцом устанавливается в биологический сканер для обнаружения, подсчета и оценки роста бактерий. После установки подложки сканер генерирует изображение подложки с культуральной средой. Затем количество колоний микроорганизмов может быть подсчитано или иным образом определено с использованием процедур обработки изображений и анализа, выполняемых либо в сканирующем устройстве, либо с помощью внешнего вычислительного устройства.The laboratory sample is placed on a substrate in a biological growth medium, and then the substrate is moved to an incubation chamber. In modern assay approaches, after incubation, the culture substrate with the biological sample is installed in a biological scanner to detect, count and assess bacterial growth. After the substrate is installed, the scanner generates an image of the substrate with the culture medium. The number of microbial colonies can then be counted or otherwise determined using image processing and analysis procedures performed either in the scanner or using an external computing device.
Известные биологические сканеры автоматизируют обнаружение и подсчет бактерий или других биологических агентов в биологической культуральной среде и тем самым улучшают процесс биологического тестирования за счет уменьшения количества человеческих ошибок и времени проведения анализа.Well-known biological scanners automate the detection and enumeration of bacteria or other biological agents in biological culture media, thereby improving the biological testing process by reducing human error and analysis time.
В патенте США US6696269B2 описана сканирующая система для проведения микробиологического анализа образцов в чашке Петри, которая имеет опору для удерживания чашки Петри, камеру и множество диодов, расположенных по кругу над камерой и излучающих рассеянный белый свет. Камера оптически обнаруживает зоны подавления роста микроорганизмов, возникающие вокруг диффузионных дисков.US Patent US6696269B2 describes a scanning system for carrying out microbiological analysis of samples in a Petri dish, which has a support for holding the Petri dish, a camera and a plurality of diodes arranged in a circle above the camera and emitting diffuse white light. The camera optically detects zones of inhibition of microorganism growth that arise around diffusion disks.
В патенте США US6372485B1 описано устройство, включающее в себя источник света, способный генерировать составной световой сигнал, имеющий световые элементы переменной интенсивности, и контроллер, адаптированный для управления источником света с использованием заданного профиля освещения.US Patent US6372485B1 describes a device including a light source capable of generating a composite light signal having light elements of variable intensity, and a controller adapted to control the light source using a predetermined lighting profile.
В патенте РФ RU2398233C2 чашка Петри устанавливается на основании, снабженном светопоглощающим покрытием, при этом диаметр чашки Петри не может превышать внутренний диаметр осветителя, а расстояние D от горизонтальной плоскости симметрии осветителя до верхней поверхности чашки Петри определяется из соотношенияIn the Russian patent RU2398233C2, the Petri dish is mounted on a base equipped with a light-absorbing coating, while the diameter of the Petri dish cannot exceed the internal diameter of the illuminator, and the distance D from the horizontal plane of symmetry of the illuminator to the upper surface of the Petri dish is determined from the ratio
где: t - радиус поперечного сечения осветителя, r - расстояние между центром поперечного сечения осветителя и вертикальной осью симметрии осветителя.where: t is the radius of the illuminator cross-section, r is the distance between the center of the illuminator cross-section and the vertical axis of symmetry of the illuminator.
В патентах США US7298885B2 и US6215894B1 биологический сканер обеспечивает автоматический выбор профилей обработки изображений для сканирования различных типов чашек Петри. Сканер может идентифицировать тип чашки Петри по различным машиночитаемым индикаторам, таким как оптически или магнитносчитываемые метки. In US patents US7298885B2 and US6215894B1, a biological scanner provides automatic selection of image processing profiles for scanning different types of Petri dishes. The scanner can identify the type of Petri dish by various machine-readable indicators, such as optical or magnetically readable marks.
Патент РФ RU2791813C1 относится к системам и способам обнаружения и классификации колоний микроорганизмов на изображениях на основе технологий искусственного интеллекта и компьютерного зрения, и может быть использован для автоматизированного обнаружения и классификации колоний патогенных и условно патогенных микроорганизмов у больных или из объектов внешней среды на изображениях колоний микроорганизмов в чашках Петри.Russian patent RU2791813C1 relates to systems and methods for detecting and classifying colonies of microorganisms in images based on artificial intelligence and computer vision technologies, and can be used for automated detection and classification of colonies of pathogenic and opportunistic microorganisms in patients or from environmental objects in images of colonies of microorganisms in Petri dishes.
В соответствии с патентом США US11341648B2 система и способ обеспечивают последовательное получение контрастных изображений колоний на чашке Петри и преобразование цветового пространства с использованием входных данных с изображений с течением времени, для оценки того, произошел ли рост микроорганизмов в данном образце.According to US Patent US11341648B2, a system and method provide for sequential acquisition of contrast images of colonies on a Petri dish and color space transformation using input data from the images over time, to assess whether microorganism growth has occurred in a given sample.
Описанные патенты не позволяют создать универсальную систему анализа изображений для проведения анализа и на чашках Петри, и в микробиологических планшетах, так как для этого необходимо изменять направления освещения и/или детектирования относительно подложек с культуральной средой.The described patents do not allow the creation of a universal image analysis system for conducting analysis both on Petri dishes and in microbiological plates, since this requires changing the directions of illumination and/or detection relative to the substrates with the culture medium.
В патенте США US9809836B2 представлен способ идентификации микробных колоний в подложках с культуральной средой, который включает использование устройства формирования изображения для получения первого изображения подложки с культуральной средой при обеспечении освещения передней стороны устройства и для получения второго изображения подложки с культуральной средой при обеспечении освещения задней стороны устройства. Способ дополнительно содержит анализ первого и второго изображений для идентификации колоний микроорганизмов на каждом изображении, анализ значений параметра размера для колонии в конкретном месте подложки с культуральной средой на первом и втором изображениях и сравнение значений. US Patent US9809836B2 presents a method for identifying microbial colonies in substrates with a culture medium, which includes using an imaging device to obtain a first image of a substrate with a culture medium while providing illumination of the front side of the device and to obtain a second image of the substrate with a culture medium while providing illumination of the back side of the device. The method further comprises analyzing the first and second images to identify colonies of microorganisms in each image, analyzing the size parameter values for a colony at a specific location of the substrate with a culture medium in the first and second images, and comparing the values.
В патенте США US8094916B2 описан сканер подложек с культуральной средой, который включает в себя многоцветную систему освещения, позволяющую освещать подложки с культуральной средой разными цветами. Монохроматическая камера захватывает изображения подложки с культуральной средой во время освещения подложки с культуральной средой каждым из цветов освещения. Процессор объединяет изображения для формирования составного многоцветного изображения и/или отдельных компонентов составного изображения и анализирует составное изображение для получения аналитического результата, такого как подсчет колоний или результат присутствия/отсутствия. Сканер может включать компоненты передней и задней подсветки, что позволяет анализировать различные виды подложек с культуральной средой.US Patent US8094916B2 describes a culture medium substrate scanner that includes a multi-color illumination system that allows for illuminating culture medium substrates with different colors. A monochromatic camera captures images of the culture medium substrate while illuminating the culture medium substrate with each of the illumination colors. A processor combines the images to form a composite multi-color image and/or individual components of the composite image and analyzes the composite image to obtain an analytical result, such as a colony count or a presence/absence result. The scanner may include front and back illumination components, which allows for the analysis of different types of culture medium substrates.
В патенте США US7496225B2 подложка с культуральной средой загружается в биологический сканер с помощью моторизованных роликов, и исполнительный механизм прижимает подложку с культуральной средой к валику, как только подложка с культуральной средой перемещается в положение сканирования внутри биологического сканера. Изобретение позволяет загружать подложки с культуральной средой вертикально и освещать их со стороны камеры или на просвет.In US Patent US7496225B2, a substrate with a culture medium is loaded into a biological scanner using motorized rollers, and an actuator presses the substrate with the culture medium against the roller as soon as the substrate with the culture medium moves to the scanning position inside the biological scanner. The invention allows substrates with a culture medium to be loaded vertically and illuminated from the camera side or by transmission.
Системы и устройства, описанные в приведенных патентах, имеют сложные подвижные механизмы в своем составе, что значительно усложняет конструкцию систем и уменьшает их надежность, а также предполагают передвижение подложки с культуральной средой, что может привести к изменению фокусного расстояния от камеры до анализируемых образцов и понизить достоверность результатов анализа.The systems and devices described in the cited patents have complex moving mechanisms in their composition, which significantly complicates the design of the systems and reduces their reliability, and also involve the movement of the substrate with the culture medium, which can lead to a change in the focal distance from the camera to the analyzed samples and reduce the reliability of the analysis results.
Целью предлагаемого изобретения является увеличение надежности системы за счет уменьшения количества подвижных элементов и увеличение функциональности системы путем обеспечения возможности формирования изображений подложки с культуральной средой с различных сторон при обеспечении подложки с культуральной средой, установленной неподвижно на платформе, и неподвижного блока освещения. Также целью предлагаемого изобретения является увеличение длины оптического пути при формировании изображений подложки с культуральной средой для улучшения качества этих изображений и повышения достоверности результатов анализа.The objective of the proposed invention is to increase the reliability of the system by reducing the number of moving elements and to increase the functionality of the system by providing the ability to form images of the substrate with the culture medium from different sides, while providing the substrate with the culture medium fixedly installed on the platform, and a fixed lighting unit. The objective of the proposed invention is also to increase the length of the optical path when forming images of the substrate with the culture medium to improve the quality of these images and increase the reliability of the analysis results.
Указанная цель достигается за счет создания системы визуализации и анализа биологических образцов, которая содержит устройство регистрации, состоящее из платформы для установки подложек с культуральной средой, системы формирования изображения, включающей блок освещения, который расположен в прямом оптическом доступе с по меньшей мере одной из поверхностей подложки с культуральной средой, блок детектирования и оптическую систему, содержащую два набора стационарно закрепленных зеркал, которые формируют два оптических пути, передающих изображение от разных поверхностей подложки с культуральной средой к блоку детектирования, и блока управления, соединенного двухсторонней связью с платформой, блоком освещения и блоком детектирования, и содержащего блок переключения, который позволяет системе формирования изображения формировать изображения разных поверхностей подложки с культуральной средой, и устройство анализа изображений.The said objective is achieved by creating a system for visualising and analysing biological samples, which comprises a recording device consisting of a platform for installing substrates with a culture medium, an image formation system including a lighting unit which is located in direct optical access with at least one of the surfaces of the substrate with the culture medium, a detection unit and an optical system containing two sets of fixedly mounted mirrors which form two optical paths transmitting an image from different surfaces of the substrate with the culture medium to the detection unit, and a control unit connected by two-way communication with the platform, the lighting unit and the detection unit, and containing a switching unit which allows the image formation system to form images of different surfaces of the substrate with the culture medium, and an image analysis device.
В одном из вариантов системы визуализации и анализа биологических образцов согласно настоящему изобретению блок детектирования имеет в своем составе одну камеру, поворотное зеркало для переключения между двумя оптическими путями и электрический привод, соединенный с зеркалом и блоком переключения, обеспечивающий поворот зеркала для передачи изображений от разных поверхностей подложки с культуральной средой двумя разными оптическими путями на указанную камеру.In one embodiment of the system for visualizing and analyzing biological samples according to the present invention, the detection unit includes one camera, a rotating mirror for switching between two optical paths, and an electric drive connected to the mirror and the switching unit, ensuring rotation of the mirror for transmitting images from different surfaces of the substrate with the culture medium via two different optical paths to the said camera.
В ещё одном из вариантов системы визуализации и анализа биологических образцов согласно настоящему изобретению блок детектирования имеет в своем составе две камеры, при этом одна камера получает изображение от одной поверхности подложки с культуральной средой, а другая – от другой, разными оптическими путями, а блок переключения позволяет переключать блок детектирования на изображения разных поверхностей подложки с культуральной средой путем выбора камеры.In another embodiment of the system for visualizing and analyzing biological samples according to the present invention, the detection unit has two cameras, wherein one camera receives an image from one surface of the substrate with the culture medium, and the other from the other, by different optical paths, and the switching unit allows switching the detection unit to images of different surfaces of the substrate with the culture medium by selecting the camera.
В ещё одном из вариантов системы визуализации и анализа биологических образцов согласно настоящему изобретению указанная оптическая система имеет два дополнительных стационарно закрепленных зеркала.In another embodiment of the system for visualizing and analyzing biological samples according to the present invention, said optical system has two additional fixed mirrors.
В ещё одном из вариантов системы визуализации и анализа биологических образцов согласно настоящему изобретению система визуализации и анализа биологических образцов имеет в своем составе источник ультрафиолетового излучения.In another embodiment of the system for visualizing and analyzing biological samples according to the present invention, the system for visualizing and analyzing biological samples includes a source of ultraviolet radiation.
В ещё одном из вариантов системы визуализации и анализа биологических образцов согласно настоящему изобретению система визуализации и анализа биологических образцов имеет в своем составе блок идентификации для распознавания машиночитаемых меток на подложке с культуральной средой.In another embodiment of the system for visualizing and analyzing biological samples according to the present invention, the system for visualizing and analyzing biological samples includes an identification unit for recognizing machine-readable marks on a substrate with a culture medium.
В ещё одном из вариантов системы визуализации и анализа биологических образцов согласно настоящему изобретению платформа для установки подложек с культуральной средой выполнена подвижной.In another embodiment of the system for visualizing and analyzing biological samples according to the present invention, the platform for installing substrates with a culture medium is made movable.
В ещё одном из вариантов системы визуализации и анализа биологических образцов согласно настоящему изобретению отдельные источники света блока освещения расположены планарно и на равном расстоянии от оси, перпендикулярной геометрическому центру подложки с культуральной средой, тем самым обеспечивая равномерное освещение анализируемых образцов.In another embodiment of the system for visualizing and analyzing biological samples according to the present invention, individual light sources of the illumination unit are arranged planarly and at an equal distance from the axis perpendicular to the geometric center of the substrate with the culture medium, thereby ensuring uniform illumination of the analyzed samples.
В ещё одном из вариантов системы визуализации и анализа биологических образцов согласно настоящему изобретению отдельные источники света блока освещения расположены с двух сторон подложки с культуральной средой, тем самым обеспечивая освещение двух противоположных поверхностей подложки с культуральной средой.In another embodiment of the system for visualizing and analyzing biological samples according to the present invention, separate light sources of the illumination unit are located on both sides of the substrate with the culture medium, thereby providing illumination of two opposite surfaces of the substrate with the culture medium.
В ещё одном из вариантов системы визуализации и анализа биологических образцов согласно настоящему изобретению устройство анализа изображений включает базу данных, выход которой соединен с блоком преобразования изображения, выход которого соединен со входом блока классификации, выход которого соединен со входом базы данных, которая соединена двусторонней связью с блоком управления.In another embodiment of the system for visualizing and analyzing biological samples according to the present invention, the image analysis device includes a database, the output of which is connected to an image conversion unit, the output of which is connected to the input of a classification unit, the output of which is connected to the input of a database, which is connected by two-way communication to a control unit.
В ещё одном из вариантов системы визуализации и анализа биологических образцов согласно настоящему изобретению устройство анализа изображений реализовано в виде компьютера, соединенного двухсторонней связью с устройством регистрации.In another embodiment of the system for visualizing and analyzing biological samples according to the present invention, the image analysis device is implemented in the form of a computer connected by two-way communication to the recording device.
В ещё одном из вариантов системы визуализации и анализа биологических образцов согласно настоящему изобретению устройство анализа изображений включает в себя базу данных, блок преобразования изображений и блок классификации.In another embodiment of the system for visualizing and analyzing biological samples according to the present invention, the image analysis device includes a database, an image conversion unit and a classification unit.
Более полное представление о раскрываемом изобретении может быть получено из нижеследующего раздела “Осуществление изобретения” совместно с прилагаемыми чертежами, из которых: A more complete understanding of the disclosed invention can be obtained from the following section “Implementation of the invention” together with the attached drawings, of which:
ФИГ. 1 - блок-схема, отражающая функциональный состав и соединения систем и блоков предлагаемой системы визуализации и анализа биологических образцов, согласно раскрываемому изобретению;FIG. 1 is a block diagram reflecting the functional composition and connections of the systems and blocks of the proposed system for visualization and analysis of biological samples, according to the disclosed invention;
ФИГ. 2 - вид сбоку системы визуализации и анализа биологических образцов с одной камерой и поворотным зеркалом согласно одному из вариантов раскрываемого изобретения; FIG. 2 is a side view of a biological sample imaging and analysis system with a single camera and a rotating mirror according to one embodiment of the disclosed invention;
ФИГ. 3 - аксонометрический вид системы визуализации и анализа биологических образцов с одной камерой и поворотным зеркалом согласно одному из вариантов раскрываемого изобретения;FIG. 3 is an axonometric view of a system for visualizing and analyzing biological samples with a single camera and a rotating mirror according to one embodiment of the disclosed invention;
ФИГ. 4 - аксонометрический вид системы визуализации и анализа биологических образцов с одной камерой, поворотным зеркалом и с выдвинутой платформой для загрузки подложек с культуральной средой согласно одному из вариантов раскрываемого изобретения;FIG. 4 is an axonometric view of a system for visualizing and analyzing biological samples with one camera, a rotating mirror, and an extended platform for loading substrates with a culture medium according to one embodiment of the disclosed invention;
ФИГ. 5 - вид сбоку системы визуализации и анализа биологических образцов с двумя камерами и двумя дополнительными стационарно закрепленными зеркалами согласно другому варианту раскрываемого изобретения; FIG. 5 is a side view of a system for visualizing and analyzing biological samples with two cameras and two additional fixed mirrors according to another embodiment of the disclosed invention;
ФИГ. 6 - аксонометрический вид системы визуализации и анализа биологических образцов с двумя камерами и двумя дополнительными стационарно закрепленными зеркалами согласно другому варианту раскрываемого изобретения;FIG. 6 is an axonometric view of a system for visualizing and analyzing biological samples with two cameras and two additional fixed mirrors according to another embodiment of the disclosed invention;
ФИГ. 7 - аксонометрический вид системы визуализации и анализа биологических образцов с двумя камерами и двумя дополнительными стационарно закрепленными зеркалами согласно другому варианту раскрываемого изобретения;FIG. 7 is an axonometric view of a system for visualizing and analyzing biological samples with two cameras and two additional fixed mirrors according to another embodiment of the disclosed invention;
ФИГ. 8 - блок-схема, отражающая функциональный состав и соединения систем и блоков предлагаемой системы визуализации и анализа биологических образцов, согласно одному из вариантов раскрываемого изобретения;FIG. 8 is a block diagram reflecting the functional composition and connections of the systems and blocks of the proposed system for visualization and analysis of biological samples, according to one of the embodiments of the disclosed invention;
ФИГ. 9 - пример изображения подложки с культуральной средой, представляющей собой чашку Петри, полученного системой согласно раскрываемому изобретению;FIG. 9 is an example of an image of a substrate with a culture medium, which is a Petri dish, obtained by the system according to the disclosed invention;
ФИГ. 10 - пример изображения подложки с культуральной средой, представляющей собой чашку Петри, с колониями микроорганизмов и дисков с антимикробным препаратом, полученного системой, согласно раскрываемому изобретению;FIG. 10 is an example of an image of a substrate with a culture medium, which is a Petri dish with colonies of microorganisms and disks with an antimicrobial preparation obtained by the system according to the disclosed invention;
ФИГ. 11 - пример массивов определенных координат детектированных объектов на поверхности подложки с культуральной средой, представляющей собой чашку Петри, их класс и вероятности принадлежности к указанному классу;FIG. 11 - an example of arrays of certain coordinates of detected objects on the surface of a substrate with a culture medium, which is a Petri dish, their class and the probabilities of belonging to the specified class;
ФИГ. 12 - пример изображения подложки с культуральной средой, представляющей собой 96-луночный планшет, полученного системой согласно раскрываемому изобретению;FIG. 12 is an example of an image of a substrate with a culture medium, which is a 96-well plate, obtained by the system according to the disclosed invention;
ФИГ. 13 - пример изображения подложки с культуральной средой, представляющей собой 96-луночный планшет, с колониями микроорганизмов, полученного системой согласно раскрываемому изобретения;FIG. 13 is an example of an image of a substrate with a culture medium, which is a 96-well plate, with colonies of microorganisms, obtained by the system according to the disclosed invention;
ФИГ. 14 - пример фрагмента массивов определенных координат детектированных объектов на поверхности подложки с культуральной средой, представляющей собой 96-луночный планшет, их класс и вероятности принадлежности к указанному классу согласно раскрываемому изобретению.FIG. 14 is an example of a fragment of arrays of certain coordinates of detected objects on the surface of a substrate with a culture medium, which is a 96-well plate, their class and the probabilities of belonging to the specified class according to the disclosed invention.
Осуществление изобретенияImplementation of the invention
Далее будут раскрыты некоторые примеры для формирования общего представления о принципах конструкции, функционирования, изготовления и применения систем и устройств, раскрытых в настоящем описании. Несколько примеров проиллюстрированы на прилагаемых чертежах. Специалистам в данной области техники будет понятно, что конкретные системы и устройства, раскрытые в настоящем описании и проиллюстрированные на прилагаемых чертежах, не являются ограничивающими примерами, а также то, что объем настоящего раскрытия определен исключительно формулой изобретения. Отличительные признаки, проиллюстрированные или раскрытые на одном примере, могут быть скомбинированы с отличительными признаками других примеров. Предполагается, что подобные модификации или варианты входят в объем настоящего раскрытия.Some examples will now be disclosed to form a general idea of the principles of design, operation, manufacture and use of the systems and devices disclosed in the present description. Several examples are illustrated in the accompanying drawings. It will be understood by those skilled in the art that the specific systems and devices disclosed in the present description and illustrated in the accompanying drawings are not limiting examples, and that the scope of the present disclosure is defined solely by the claims. Distinctive features illustrated or disclosed in one example may be combined with distinctive features of other examples. It is assumed that such modifications or variations are included in the scope of the present disclosure.
В предлагаемой системе визуализации и анализа биологических образцов использованы технические решения, приведенные на блок-схеме, изображенной на ФИГ. 1.The proposed system for visualization and analysis of biological samples uses the technical solutions shown in the block diagram depicted in FIG. 1.
Система визуализации и анализа биологических образцов, находящихся в культуральной среде, имеет в своем составе устройство регистрации 100 и устройство анализа изображений 200. The system for visualizing and analyzing biological samples located in a culture medium includes a recording device 100 and an image analysis device 200.
К устройству регистрации 100 относится платформа 110, в которую загружается подложка с культуральной средой 111. Платформа 110 может быть выполнена подвижной, в этом случае после установки в нее подложки с культуральной средой 111 она перемещает подложку с культуральной средой 111 в устройство регистрации 100. Платформа 110 может приводиться в движение ручным, полуавтоматическим или автоматическим способом путем получения управляющих команд от блока управления 140. Положение платформы может определяться датчиками, такие как оптопары, при этом сигнал о положении платформы отправляется на блок управления 140.The registration device 100 includes a platform 110, into which a substrate with a culture medium 111 is loaded. The platform 110 can be made movable, in which case after the substrate with the culture medium 111 is installed in it, it moves the substrate with the culture medium 111 into the registration device 100. The platform 110 can be set in motion manually, semi-automatically or automatically by receiving control commands from the control unit 140. The position of the platform can be determined by sensors, such as optocouplers, and a signal about the position of the platform is sent to the control unit 140.
Согласно одному из вариантов изобретения, изображенному на ФИГ. 2, платформа 110 может быть выполнена подвижной и приводиться в движение ручным способом путем физического воздействие оператора устройства на рукоятку 150. При этом для установки подложки с культуральной средой 111, платформа 110 перемещается из положения, указанного на ФИГ. 4, в положение, указанное на ФИГ. 3. According to one embodiment of the invention, shown in FIG. 2, the platform 110 can be made movable and set in motion manually by physical action of the device operator on the handle 150. In this case, to install the substrate with the culture medium 111, the platform 110 moves from the position indicated in FIG. 4 to the position indicated in FIG. 3.
Подложка с культуральной средой 111 может представлять собой чашку Петри, например, круглую чашку Петри диаметром 60, 90, 100 и 150 мм или квадратную чашку Петри 120×120 мм, или микробиологический планшет, например, круглодонный или плоскодонный 96-луночных планшет стандарта ANSI/SBS 1-2004. Конструкция платформы 110 позволяет установить на нее подложку с культуральной средой 111 таким образом, чтобы обеспечить ее устойчивость и неподвижность относительно платформы 110 при загрузке в устройство и во время визуализации и анализа подложки с культуральной средой 111. The substrate with the culture medium 111 can be a Petri dish, for example, a round Petri dish with a diameter of 60, 90, 100 and 150 mm or a square Petri dish 120x120 mm, or a microbiological plate, for example, a round-bottomed or flat-bottomed 96-well plate of the ANSI/SBS 1-2004 standard. The design of the platform 110 allows the substrate with the culture medium 111 to be installed on it in such a way as to ensure its stability and immobility relative to the platform 110 when loaded into the device and during visualization and analysis of the substrate with the culture medium 111.
Подложка с культуральной средой 111 может иметь машиночитаемые индикаторы, такие как оптические или магнитные индикаторы, нанесенные на подложку. Блок идентификации 120, позволяющий сканировать машиночитаемые индикаторы, может находиться как снаружи устройства, так и внутри него. Блок идентификации 120 функционирует посредством получения управляющих команд от блока управления 140. The substrate with the culture medium 111 may have machine-readable indicators, such as optical or magnetic indicators, applied to the substrate. The identification unit 120, allowing the machine-readable indicators to be scanned, may be located both outside and inside the device. The identification unit 120 functions by receiving control commands from the control unit 140.
Согласно одному из вариантов изобретения, изображенному на ФИГ. 2, блок идентификации 120 состоит из двух идентификаторов 135а и 135б. Идентификатор 135а расположен рядом с платформой 110 и используется для сканирования машиночитаемых индикаторов, нанесенных на подложку с культуральной средой 111 (не изображена на ФИГ. 2). Оператор устройства сканирует машиночитаемые индикаторы вручную путем позиционирования машиночитаемого индикатора на подложку с культуральной средой 111 в непосредственной близости с идентификатором 135а.According to one embodiment of the invention, shown in FIG. 2, the identification unit 120 consists of two identifiers 135a and 135b. The identifier 135a is located near the platform 110 and is used to scan machine-readable indicators applied to the substrate with the culture medium 111 (not shown in FIG. 2). The operator of the device scans the machine-readable indicators manually by positioning the machine-readable indicator on the substrate with the culture medium 111 in close proximity to the identifier 135a.
Идентификатор 135б расположен внутри прибора и предназначен для сканирования машиночитаемых индикаторов, нанесенных на подложку с культуральной средой 111. Сканирование выполняется автоматически при загрузке подложки с культуральной средой 111 внутрь устройства регистрации 100.Identifier 135b is located inside the device and is intended for scanning machine-readable indicators applied to the substrate with culture medium 111. Scanning is performed automatically when loading the substrate with culture medium 111 inside the registration device 100.
Система формирования изображения 130 предназначена для сканирования поверхности подложки с культуральной средой 111 и генерации ее изображения. The imaging system 130 is designed to scan the surface of the substrate with the culture medium 111 and generate an image thereof.
Система формирования изображения 130 имеет в своем составе блок освещения 131, представляющий собой множество диодов, которые расположены на горизонтальной кольцевой поверхности над платформой 110. Блок освещения 131 функционирует посредством получения управляющих команд от блока управления 140 и обеспечивает равномерное освещение подложки с культуральной средой 111. The image formation system 130 includes a lighting unit 131, which is a plurality of diodes that are located on a horizontal annular surface above the platform 110. The lighting unit 131 functions by receiving control commands from the control unit 140 and provides uniform illumination of the substrate with the culture medium 111.
Блок детектирования 133 представляет собой одну или несколько камер, например, CCD или CMOS камеру. Блок детектирования 133 обеспечивает получение изображения поверхностей (верхней или нижней) подложки с культуральной средой 111 при их освещении блоком освещения 131 и передачу изображений на блок управления 140. The detection unit 133 is one or more cameras, for example, a CCD or CMOS camera. The detection unit 133 ensures obtaining an image of the surfaces (upper or lower) of the substrate with the culture medium 111 when illuminated by the illumination unit 131 and transmitting the images to the control unit 140.
Оптический путь от подложки с культуральной средой 111, освещенной блоком освещения 131, до блока детектирования 133 формируется оптической системой 132, а поверхность подложки с культуральной средой 111, с которой формируется изображение, выбирается посредством блока переключения 141. Длина оптического пути от подложки с культуральной средой 111 до блока детектирования 133 значительно превышает длину оптического пути в аналогичных системах, что улучшает качество изображений, формируемых блоком детектирования 133, за счет уменьшения аберраций. Оптический путь не является прямолинейным, что позволяет уменьшить фоновую засветку при формировании изображений блоком детектирования 133 от блока освещения 131.The optical path from the substrate with the culture medium 111, illuminated by the illumination unit 131, to the detection unit 133 is formed by the optical system 132, and the surface of the substrate with the culture medium 111, with which the image is formed, is selected by means of the switching unit 141. The length of the optical path from the substrate with the culture medium 111 to the detection unit 133 significantly exceeds the length of the optical path in similar systems, which improves the quality of the images formed by the detection unit 133, due to a reduction in aberrations. The optical path is not rectilinear, which makes it possible to reduce background illumination when forming images by the detection unit 133 from the illumination unit 131.
Согласно одному из вариантов изобретения, изображенному на ФИГ. 2 и 3, оптическая система представляет собой зеркала 160а, 160б, 161а и 161б, стационарно установленные под углом 45 градусов относительно центральной линии оптического пути, а также поворотное зеркало 136, принимающее два положения также под углом 45 градусов относительно центральной линии оптического пути. Размер зеркал 160а, 160б, 161а и 161б соответствует размеру поля зрения на соответствующем участке оптического пути или превышает его. According to one embodiment of the invention, shown in FIG. 2 and 3, the optical system is mirrors 160a, 160b, 161a and 161b, stationary installed at an angle of 45 degrees relative to the central line of the optical path, as well as a rotating mirror 136, which takes two positions also at an angle of 45 degrees relative to the central line of the optical path. The size of the mirrors 160a, 160b, 161a and 161b corresponds to the size of the field of view on the corresponding section of the optical path or exceeds it.
Поворотное зеркало 136 приводится в движение электрическим приводом 162 посредством получения управляющего сигнала от блока управления 140. Два возможных положения поворотного зеркала 136 определяют один из двух возможных оптических и путей и, соответственно, две области зрения блока детектирования 133, соответствующие нижней и верхней поверхности подложки с культуральной средой 111. The rotating mirror 136 is driven by an electric drive 162 by receiving a control signal from the control unit 140. Two possible positions of the rotating mirror 136 determine one of two possible optical paths and, accordingly, two fields of view of the detection unit 133, corresponding to the lower and upper surfaces of the substrate with the culture medium 111.
При положении поворотного зеркала 136, изображенного на ФИГ. 2, оптический путь формируется последовательно через зеркала 160а и 160б. При этом, камера 137 формирует изображение верхней поверхности подложки с культуральной средой 111. In the position of the rotating mirror 136 shown in FIG. 2, the optical path is formed sequentially through the mirrors 160a and 160b. In this case, the camera 137 forms an image of the upper surface of the substrate with the culture medium 111.
При изменении положения поворотного зеркала 136 электрическим приводом 162 оптический путь формируется последовательно через зеркала 161а и 161б. При этом камера 137 формирует изображение нижней поверхности подложки с культуральной средой 111. When the position of the rotating mirror 136 is changed by the electric drive 162, the optical path is formed sequentially through the mirrors 161a and 161b. In this case, the camera 137 forms an image of the lower surface of the substrate with the culture medium 111.
На ФИГ. 4 представлен аксонометрический вид устройства согласно варианту настоящего изобретения, описанному выше. FIG. 4 is an axonometric view of the device according to the embodiment of the present invention described above.
Согласно одному из вариантов изобретения, изображенному на ФИГ. 5-7, блок детектирования 133 включает в себя камеру 181 и камеру 182. Оптический путь от верхней поверхности подложки с культуральной средой 111, освещенной блоком освещения 131, до камеры 181 формируется последовательно через зеркала 160а, 160б и 171. Оптический путь от нижней поверхности подложки с культуральной средой 111, освещенной блоком освещения 131, до камеры 182 формируется последовательно через зеркала 161а, 161б и 172. При этом поверхность подложки с культуральной средой 111, с которой формируется изображение, выбирается посредством блока переключения 141, включающую соответствующую камеру из камер 181 и 182. Соответствующая камера формирует изображение поверхности подложки с культуральной средой 111 и передает изображение на блок управления 140. According to one embodiment of the invention shown in FIGS. 5-7, the detection unit 133 includes a camera 181 and a camera 182. The optical path from the upper surface of the substrate with the culture medium 111, illuminated by the illumination unit 131, to the camera 181 is formed sequentially through the mirrors 160a, 160b and 171. The optical path from the lower surface of the substrate with the culture medium 111, illuminated by the illumination unit 131, to the camera 182 is formed sequentially through the mirrors 161a, 161b and 172. In this case, the surface of the substrate with the culture medium 111, from which the image is formed, is selected by means of the switching unit 141, which includes the corresponding camera from the cameras 181 and 182. The corresponding camera forms an image of the surface of the substrate with the culture medium 111 and transmits the image to the control unit 140.
Согласно одному из вариантов изобретения камеры 181 и 182 могут быть установлены вместо зеркал 170 и 171 соответственно, при этом, они направлены в противоположные стороны и параллельно центральным линиям оптического пути. Оптический путь до камеры 181 от верхней поверхности подложки с культуральной средой 111 формируется последовательно через зеркала 160а, 160б. Оптический путь до камеры 182 от нижней поверхности подложки с культуральной средой 111 формируется последовательно через зеркала 161а, 161б.According to one embodiment of the invention, chambers 181 and 182 can be installed instead of mirrors 170 and 171, respectively, while they are directed in opposite directions and parallel to the central lines of the optical path. The optical path to chamber 181 from the upper surface of the substrate with the culture medium 111 is formed sequentially through mirrors 160a, 160b. The optical path to chamber 182 from the lower surface of the substrate with the culture medium 111 is formed sequentially through mirrors 161a, 161b.
Камеры 181 и 182 могут формировать изображения верхней и нижней поверхностей подложки с культуральной средой 111 одновременно, в таком случае, поверхность подложки с культуральной средой 111, с которой формируется изображение, выбирается посредством блока переключения 141 путем выбора соответствующего одной из камер 181 и 182 сигнала. Cameras 181 and 182 can form images of the upper and lower surfaces of the substrate with the culture medium 111 simultaneously, in which case the surface of the substrate with the culture medium 111 from which the image is formed is selected by means of the switching unit 141 by selecting the signal corresponding to one of the cameras 181 and 182.
Изображение с блока управления 140 поступают в устройство анализа изображений 200, которое обеспечивает анализ изображений. Согласно одному из вариантов изобретения, изображенному на ФИГ. 8, изображение с блока управления 140 поступает в устройство анализа изображений 200, содержащее базу данных 210, блок преобразования изображения 211 и блок классификации 213.The image from the control unit 140 is fed to the image analysis device 200, which provides image analysis. According to one embodiment of the invention, shown in FIG. 8, the image from the control unit 140 is fed to the image analysis device 200, which contains a database 210, an image conversion unit 211 and a classification unit 213.
Изображение сохраняется в базу данных 210 и передается на блок преобразования изображений 211, который преобразует его в нужную размерность, выполняет фильтрацию и передает на блок классификации 212. Обученная нейронная сеть блока классификации 212 определяет координаты детектированных объектов на поверхности подложки с культуральной средой 111, их класс и массив с вероятностями принадлежности к указанному классу. Блок классификации 212 передает в базу данных 210 три массива чисел: координаты детектированных объектов, их класс и массив с вероятностями принадлежности к указанному классу. Выбор класса зависит от значения вероятности, пороговое значение может составлять, например, 55 % вероятности. The image is saved in the database 210 and transmitted to the image conversion unit 211, which converts it into the required dimension, filters it and transmits it to the classification unit 212. The trained neural network of the classification unit 212 determines the coordinates of the detected objects on the surface of the substrate with the culture medium 111, their class and an array with the probabilities of belonging to the specified class. The classification unit 212 transmits three arrays of numbers to the database 210: the coordinates of the detected objects, their class and an array with the probabilities of belonging to the specified class. The choice of class depends on the probability value, the threshold value can be, for example, 55% of the probability.
В базе данных 210 хранится множество изображений подложки с культуральной средой 111, представляющие собой изображения поверхностей подложки с культуральной средой 111, а также результаты обработки изображений блоком классификации 212.The database 210 stores a plurality of images of the substrate with the culture medium 111, which represent images of the surfaces of the substrate with the culture medium 111, as well as the results of image processing by the classification unit 212.
Пример изображения подложки с культуральной средой 111, представляющей собой чашку Петри, представлен на ФИГ. 9. На ФИГ. 10 представлены обнаруженные блоком классификации объекты на поверхности подложки с культуральной средой 111. Зеленым цветом выделены диски с антимикробным препаратом и колонии микроорганизмов, которые выросли вокруг дисков. На ФИГ. 11 представлен пример массивов определенных координат детектированных объектов на поверхности подложки с культуральной средой, представляющей собой чашку Петри, их класс и вероятности принадлежности к указанному классу. Под ключом 'disks' содержится массив размерности [N, 3], где N - количество найденных дисков с антимикробным препаратом, 3 - это целые числа, означающие x-координату, y-координату и радиус дисков с антимикробным препаратов соответственно. Под ключом 'sensitivity' содержится массив размерности [N, 3], где N - количество найденных зон чувствительности микроорганизмов, 3 - это целые числа, означающие x-координату, y-координату и радиус зоны чувствительности микроорганизма.An example of an image of a substrate with a culture medium 111, which is a Petri dish, is shown in FIG. 9. FIG. 10 shows the objects detected by the classification unit on the surface of the substrate with the culture medium 111. The disks with the antimicrobial drug and the colonies of microorganisms that have grown around the disks are highlighted in green. FIG. 11 shows an example of arrays of certain coordinates of the detected objects on the surface of the substrate with the culture medium, which is a Petri dish, their class and the probabilities of belonging to the specified class. The 'disks' key contains an array of dimension [N, 3], where N is the number of disks with the antimicrobial drug found, 3 are integers denoting the x-coordinate, y-coordinate and radius of the disks with the antimicrobial drug, respectively. The 'sensitivity' key contains an array of dimension [N, 3], where N is the number of microorganism sensitivity zones found, 3 is an integer representing the x-coordinate, y-coordinate and radius of the microorganism sensitivity zone.
Пример изображения подложки с культуральной средой 111, представляющей собой 96-луночных планшет, представлен на ФИГ. 12. На ФИГ. 13 представлены обнаруженные блоком классификации объекты на поверхности подложки с культуральной средой 111. Зеленым цветом выделены найденные лунки с колониями микроорганизмов. На ФИГ. 14 представлен пример фрагментов массивов определенных координат детектированных объектов в лунках 96-луночного планшета, их класс и вероятности принадлежности к указанному классу, который представляет собой список из трех массивов.An example of an image of a substrate with a culture medium 111, which is a 96-well plate, is shown in FIG. 12. FIG. 13 shows the objects detected by the classification unit on the surface of the substrate with the culture medium 111. The detected wells with colonies of microorganisms are highlighted in green. FIG. 14 shows an example of fragments of arrays of certain coordinates of detected objects in the wells of a 96-well plate, their class and the probabilities of belonging to the specified class, which is a list of three arrays.
Первый массив имеет размерность [N, 4], где N - количество лунок на микробиологическом планшете, а 4 - количество координат лунки, т.е. x-координата верхнего левого угла, y-координата верхнего левого угла, x-координата нижнего правого угла, y-координата нижнего правого угла.The first array has the dimension [N, 4], where N is the number of wells on the microbiological plate, and 4 is the number of well coordinates, i.e. x-coordinate of the upper left corner, y-coordinate of the upper left corner, x-coordinate of the lower right corner, y-coordinate of the lower right corner.
Второй массив имеет размерность [N], где N - количество лунок на микробиологическом планшете. Каждое число представлено либо 1 - класс отсутствия роста микроорганизма, либо 2 - класс наличия роста микроорганизма.The second array has the dimension [N], where N is the number of wells on the microbiological plate. Each number is represented either by 1 - the class of absence of microorganism growth, or by 2 - the class of presence of microorganism growth.
Третий массив имеет размерность [N], где N - количество лунок на микробиологическом планшете. Каждое число в массиве - это число от 0 до 1, обозначающее вероятность принадлежности лунки с соответствующим индексом к классу 2.The third array has the dimension [N], where N is the number of wells on the microbiological plate. Each number in the array is a number from 0 to 1, indicating the probability of the well with the corresponding index belonging to class 2.
Согласно одному из вариантов изобретения устройство регистрации 100 может иметь в своем составе один или несколько источников ультрафиолетового излучения, предназначенных для инактивации вирусов и уничтожения бактерий и плесени внутри устройства для регистрации 100.According to one embodiment of the invention, the recording device 100 may include one or more ultraviolet radiation sources designed to inactivate viruses and destroy bacteria and mold inside the recording device 100.
Согласно одному из вариантов изобретения устройство анализа изображений 200 может быть реализовано с использованием любой подходящей аппаратной платформы, включая, без ограничений: настольный компьютер; мобильное устройство (например, планшетный компьютер, ноутбук или нетбук); смартфон; или подобное. При этом, устройство анализа изображений 200 соединено двухсторонней связью с устройством регистрации 100.According to one embodiment of the invention, the image analysis device 200 can be implemented using any suitable hardware platform, including, without limitation: a desktop computer; a mobile device (for example, a tablet computer, laptop or netbook); a smartphone; or the like. In this case, the image analysis device 200 is connected by two-way communication with the recording device 100.
Claims (21)
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2837517C1 true RU2837517C1 (en) | 2025-03-31 |
Family
ID=
Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2016127128A1 (en) * | 2015-02-06 | 2016-08-11 | Life Technologies Corporation | Systems and methods for assessing biological samples |
| US9576181B2 (en) * | 2012-11-07 | 2017-02-21 | Biomerieux | Bio-imaging method |
| US9578220B2 (en) * | 2010-08-30 | 2017-02-21 | Panasonic Healthcare Holdings Co., Ltd. | Observation device, observation program, and observation system |
| US9612199B2 (en) * | 2013-03-13 | 2017-04-04 | Denovo Sciences, Inc. | System for imaging captured cells |
Patent Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US9578220B2 (en) * | 2010-08-30 | 2017-02-21 | Panasonic Healthcare Holdings Co., Ltd. | Observation device, observation program, and observation system |
| US9576181B2 (en) * | 2012-11-07 | 2017-02-21 | Biomerieux | Bio-imaging method |
| US9612199B2 (en) * | 2013-03-13 | 2017-04-04 | Denovo Sciences, Inc. | System for imaging captured cells |
| WO2016127128A1 (en) * | 2015-02-06 | 2016-08-11 | Life Technologies Corporation | Systems and methods for assessing biological samples |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2126962C1 (en) | Method detecting microorganisms in sample, procedures determining sensitivity of microorganisms to antibiotics and system for realization of such methods and procedures | |
| US6107054A (en) | Microbiological testing apparatus and method | |
| Kirschner et al. | Classification and identification of enterococci: a comparative phenotypic, genotypic, and vibrational spectroscopic study | |
| CN100457888C (en) | Biological growth plate scanner with automated intake | |
| US9109194B2 (en) | Device for harvesting bacterial colony and method therefor | |
| JP6366604B2 (en) | Method for detecting colonies of gas-producing microorganisms | |
| JP6266017B2 (en) | Method for distinguishing microbial colonies in images | |
| Fredborg et al. | Rapid antimicrobial susceptibility testing of clinical isolates by digital time-lapse microscopy | |
| JP6178340B2 (en) | Devices for early detection of microorganisms | |
| CA2728478C (en) | System and method for analyzing antibiotic susceptibility of biological samples | |
| KR102811379B1 (en) | Method and system for identifying gram types of bacteria | |
| KR102811424B1 (en) | How to identify yeast or bacteria | |
| CN106462730B (en) | Method and sterility test device for detecting a micro-colony grown on an agarose medium or membrane of a sample | |
| US20230360415A1 (en) | Application development environment for biological sample assessment processing | |
| Zhu et al. | High-accuracy rapid identification and classification of mixed bacteria using hyperspectral transmission microscopic imaging and machine learning. | |
| Bae et al. | Portable bacterial identification system based on elastic light scatter patterns | |
| US20240344106A1 (en) | Rapid antimicrobial susceptibility testing by video-based object scattering intensity detection | |
| Law et al. | Low cost automated whole smear microscopy screening system for detection of acid fast bacilli | |
| Song et al. | Mini-review: Recent advances in imaging-based rapid antibiotic susceptibility testing | |
| RU2837517C1 (en) | System for visualising and analysing biological samples in culture medium | |
| JP2003135095A (en) | Microorganism testing method and microorganism testing device | |
| WO2023245122A2 (en) | Instrumentation for rapid antimicrobial susceptibility testing from bodily fluids and cultures | |
| US20230230249A1 (en) | Digital antimicrobial susceptibility testing | |
| CN120738322A (en) | Agar method bacterial drug sensitivity automatic reading equipment and data analysis method | |
| WO2024054455A1 (en) | Platform for antimicrobial susceptibility testing and bacterial identification |