[go: up one dir, main page]

RU2019103691A - Искусственно сконструированная система регуляции ангиогенеза - Google Patents

Искусственно сконструированная система регуляции ангиогенеза Download PDF

Info

Publication number
RU2019103691A
RU2019103691A RU2019103691A RU2019103691A RU2019103691A RU 2019103691 A RU2019103691 A RU 2019103691A RU 2019103691 A RU2019103691 A RU 2019103691A RU 2019103691 A RU2019103691 A RU 2019103691A RU 2019103691 A RU2019103691 A RU 2019103691A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
gene
nucleic acid
neovascularization
factor associated
modification
Prior art date
Application number
RU2019103691A
Other languages
English (en)
Inventor
Дзеонг Хун КИМ
Сунг Воок ПАРК
Сеокдзоонг КИМ
Донг Воо СОНГ
Original Assignee
Тулджен Инкорпорейтед
СЕУЛ НЭШНЛ ЮНИВЕРСИТИ Ар энд ДиБи ФАУНДЕЙШН
Сеул Нэшнл Юниверсити Хоспитал
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Тулджен Инкорпорейтед, СЕУЛ НЭШНЛ ЮНИВЕРСИТИ Ар энд ДиБи ФАУНДЕЙШН, Сеул Нэшнл Юниверсити Хоспитал filed Critical Тулджен Инкорпорейтед
Publication of RU2019103691A publication Critical patent/RU2019103691A/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C12N15/86—Viral vectors
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/43—Enzymes; Proenzymes; Derivatives thereof
    • A61K38/46—Hydrolases (3)
    • A61K38/465—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1), e.g. lipases, ribonucleases
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • A61K48/005—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy characterised by an aspect of the 'active' part of the composition delivered, i.e. the nucleic acid delivered
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
    • A61K9/0012—Galenical forms characterised by the site of application
    • A61K9/0048—Eye, e.g. artificial tears
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P27/00—Drugs for disorders of the senses
    • A61P27/02—Ophthalmic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00—Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • C07K14/4701—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
    • C07K14/4702—Regulators; Modulating activity
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/475—Growth factors; Growth regulators
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/475—Growth factors; Growth regulators
    • C07K14/515—Angiogenesic factors; Angiogenin
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/52—Cytokines; Lymphokines; Interferons
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/102—Mutagenizing nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C12N15/1136—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against growth factors, growth regulators, cytokines, lymphokines or hormones
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/87—Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
    • C12N15/90—Stable introduction of foreign DNA into chromosome
    • C12N15/902—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination
    • C12N15/907—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination in mammalian cells
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
    • C12N9/22—Ribonucleases [RNase]; Deoxyribonucleases [DNase]
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01K—ANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2227/00—Animals characterised by species
    • A01K2227/10—Mammal
    • A01K2227/105—Murine
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01K—ANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2267/00—Animals characterised by purpose
    • A01K2267/03—Animal model, e.g. for test or diseases
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C12N2310/20—Type of nucleic acid involving clustered regularly interspaced short palindromic repeats [CRISPR]
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2750/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
    • C12N2750/00011—Details
    • C12N2750/14011—Parvoviridae
    • C12N2750/14111—Dependovirus, e.g. adenoassociated viruses
    • C12N2750/14141—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
    • C12N2750/14143—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30—Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Vascular Medicine (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Ophthalmology & Optometry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Endocrinology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Cardiology (AREA)

Claims (54)

1. Искусственно модифицированный фактор, ассоциированный с неоваскуляризацией и выбранный из группы, состоящей из гена VEGFA, гена HIF1A, гена ANGPT2, гена EPAS1 и гена ANGPTL4, которые имеют модификацию в последовательности нуклеиновой кислоты.
2. Искусственно модифицированный фактор, ассоциированный с неоваскуляризацией по п. 1, где модификацию последовательности нуклеиновой кислоты искусственно создают с использованием комплекса «гидовая нуклеиновая кислота - белок-редактор».
3. Искусственно модифицированный фактор, ассоциированный с неоваскуляризацией по п. 1, где фактором, ассоциированным с неоваскуляризацией, является один или более факторов, выбранных из группы, состоящей из гена VEGFA, гена HIF1A, гена ANGPT2, гена EPAS1 и гена ANGPTL4.
4. Искусственно модифицированный фактор, ассоциированный с неоваскуляризацией по п. 1, где ген представляет собой фактор, ассоциированный с неоваскуляризацией и искусственно модифицированный посредством комплекса «гидовая нуклеиновая кислота - белок-редактор»,
где: искусственно модифицированный фактор, ассоциированный с неоваскуляризацией, включает одну или более модификаций нуклеиновых кислот, которые представляют собой:
по меньшей мере одну делецию или инсерцию одного или более нуклеотидов; замену одним или более нуклеотидами, отличающимися от гена дикого типа; и инсерцию одного или более чужеродных нуклеотидов в последовательности мотива, смежного с протоспейсером (PAM), в последовательности нуклеиновой кислоты, входящей в состав фактора, ассоциированного с неоваскуляризацией, или в непрерывной последовательности из 1-50 п.о., где указанная область последовательности оснований является смежной с 5'-концом и/или 3'-концом этой последовательности, или
химическую модификацию одного или более нуклеотидов в последовательности нуклеиновой кислоты, входящей в состав фактора, ассоциированного с неоваскуляризацией.
5. Искусственно модифицированный фактор, ассоциированный с неоваскуляризацией по п. 1, где модификация нуклеиновых кислот присутствует в промоторной области гена.
6. Искусственно модифицированный фактор, ассоциированный с неоваскуляризацией по п. 1, где модификация нуклеиновых кислот присутствует в экзонной области гена.
7. Искусственно модифицированный фактор, ассоциированный с неоваскуляризацией по п. 1, где модификация нуклеиновых кислот присутствует в интронной области гена.
8. Искусственно модифицированный фактор, ассоциированный с неоваскуляризацией по п. 1, где модификация нуклеиновых кислот присутствует в энхансерной области гена.
9. Искусственно модифицированный фактор, ассоциированный с неоваскуляризацией по п. 4, где последовательность PAM представляет собой, например, одну или более из нижеследующих последовательностей (расположенных в направлении от 5' к 3'):
NGG (N представляет собой A, T, C или G);
NNNNRYAC (каждый N независимо представляет собой A, T, C или G, R представляет собой A или G, а Y представляет собой C или T);
NNAGAAW (каждый N независимо представляет собой A, T, C или G, а W представляет собой A или T);
NNNNGATT (каждый N независимо представляет собой A, T, C или G);
NNGRR(T) (каждый N независимо представляет собой A, T, C или G, R представляет собой A или G, а Y представляет собой С или Т); и
TTN (N представляет собой A, T, C или G).
10. Искусственно модифицированный фактор, ассоциированный с неоваскуляризацией по п. 2, где белок-редактор включает один или более белков, выбранных из группы, состоящей из белка Cas9, происходящего от Streptococcus pyogenes, белка Cas9, происходящего от Campylobacter jejuni, белка Cas9, происходящего от Streptococcus thermophilus, белка Cas9, происходящего от Streptococcus aureus, белка Cas9, происходящего от Neisseria meningitidis, и белка Cpf1.
11. Гидовая нуклеиновая кислота, способная образовывать комплементарную связь с последовательностями-мишенями SEQ ID NO: 1-79 в последовательностях нуклеиновой кислоты одного или более генов, выбранных из группы, состоящей из гена VEGFA, гена HIF1A, гена ANGPT2, гена EPAS1 и гена ANGPTL4, соответственно.
12. Гидовая нуклеиновая кислота по п. 11, которая включает одну или более гидовых нуклеиновых кислот, выбранных из группы, состоящей из:
гидовых нуклеиновых кислот, способных образовывать комплементарную связь с последовательностями-мишенями SEQ ID NO: 3, 4, 7, 9, 10 и 11 в последовательности нуклеиновой кислоты гена VEGFA, соответственно;
гидовых нуклеиновых кислот, способных образовывать комплементарную связь с последовательностями-мишенями SEQ ID NO: 14, 18, 19, 20, 26, 29 и 31 в последовательности нуклеиновой кислоты гена HIF1A, соответственно;
гидовых нуклеиновых кислот, способных образовывать комплементарную связь с последовательностями-мишенями SEQ ID NO: 33, 34, 37, 38, 39 и 43 в последовательности нуклеиновой кислоты гена ANGPT2, соответственно;
гидовых нуклеиновых кислот, способных образовывать комплементарную связь с последовательностями-мишенями SEQ ID NO: 47, 48, 49, 50, 53, 54 и 55 в последовательности нуклеиновой кислоты гена EPAS1, соответственно; и
гидовых нуклеиновых кислот, способных образовывать комплементарную связь с последовательностями-мишенями SEQ ID NO: 64, 66, 67, 73, 76 и 79 в последовательности нуклеиновой кислоты гена ANGPTL4, соответственно.
13. Молекула рРНК по п. 11, где гидовой нуклеиновой кислотой является нуклеотидная последовательность из 18-23 п.о.
14. Композиция для модификации гена, включающая:
гидовую нуклеиновую кислоту, способную образовывать комплементарную связь с последовательностями-мишенями SEQ ID NO: 1-79 в последовательностях нуклеиновой кислоты одного или более генов, выбранных из группы, состоящей из гена VEGFA, гена HIF1A, гена ANGPT2, гена EPAS1 и гена ANGPTL4, соответственно, или в последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей гидовую нуклеиновую кислоту; и
белок-редактор или последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую этот белок.
15. Композиция для модификации гена по п. 14, где белок-редактор включает один или более белков, выбранных из группы, состоящей из белка Cas9, происходящего от Streptococcus pyogenes, белка Cas9, происходящего от Campylobacter jejuni, белка Cas9, происходящего от Streptococcus thermophilus, белка Cas9, происходящего от Streptococcus aureus, белка Cas9, происходящего от Neisseria meningitidis, и белка Cpf1.
16. Композиция для модификации гена по п. 14, где модификация гена включает одну или более модификаций нуклеиновых кислот, которые представляют собой:
по меньшей мере одну делецию или инсерцию одного или более нуклеотидов; замену одним или более нуклеотидами, отличающимися от гена дикого типа; и инсерцию одного или более чужеродных нуклеотидов в последовательности мотива, смежного с протоспейсером (PAM), в последовательности нуклеиновой кислоты, входящей в состав фактора, ассоциированного с неоваскуляризацией, или в непрерывной последовательности из 1-50 п.о., где указанная область последовательности оснований является смежной с 5'-концом и/или 3'-концом этой последовательности, или
химическую модификацию одного или более нуклеотидов в последовательности нуклеиновой кислоты, входящей в состав фактора, ассоциированного с неоваскуляризацией.
17. Композиция для модификации гена по п. 16, где последовательность PAM включает одну или более из нижеследующих последовательностей (расположенных в направлении от 5' к 3'):
NGG (N представляет собой A, T, C или G);
NNNNRYAC (каждый N независимо представляет собой A, T, C или G, R представляет собой A или G, а Y представляет собой C или T);
NNAGAAW (каждый N независимо представляет собой A, T, C или G, а W представляет собой A или T);
NNNNGATT (каждый N независимо представляет собой A, T, C или G);
NNGRR(T) (каждый N независимо представляет собой A, T, C или G, R представляет собой A или G, а Y представляет собой С или Т); и
TTN (N представляет собой A, T, C или G).
18. Композиция для модификации гена по п. 14, где указанная композиция для модификации гена образуется в системе вирусного вектора.
19. Композиция для модификации гена по п. 18, где вирусный вектор включает один или более вирусов, выбранных из группы, состоящей из ретровируса, лентивируса, аденовируса, аденоассоциированного вируса (AAV), вируса коровьей оспы, поксвируса и вируса простого герпеса.
20. Способ получения информации о последовательностях сайтов-мишеней, которые были искусственно модифицированы у индивидуума, путем анализа последовательностей одного или более генов, выбранных из группы, состоящей из гена VEGFA, гена HIF1A, гена ANGPT2, гена EPAS1 и гена ANGPTL4.
21. Способ конструирования библиотеки на основе информации, полученной способом по п. 20.
22. Набор для модификации гена, включающий:
(a) гидовую нуклеиновую кислоту, способную образовывать комплементарные связи с последовательностями-мишенями SEQ ID NO: 1-79 в последовательностях нуклеиновой кислоты одного или более генов, выбранных из группы, состоящей из гена VEGFA, гена HIF1A, гена ANGPT2, гена EPAS1 и гена ANGPTL4, соответственно, или в последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей эти гены; и
(b) белок-редактор, включающий один или более белков, выбранных из группы, состоящей из белка Cas9, происходящего от Streptococcus pyogenes, белка Cas9, происходящего от Campylobacter jejuni, белка Cas9, происходящего от Streptococcus thermophilus, белка Cas9, происходящего от Streptococcus aureus, белка Cas9, происходящего от Neisseria meningitidis, и белка Cpf1, соответственно, или последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующую эти белки.
23. Композиция для лечения ангиоваскулярного расстройства, включающая:
гидовую нуклеиновую кислоту, способную образовывать комплементарные связи с одной или более последовательностями-мишенями в последовательностях нуклеиновой кислоты одного или более генов, выбранных из группы, состоящей из гена VEGFA, гена HIF1A, гена ANGPT2, гена EPAS1 и гена ANGPTL4, соответственно, или в последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей эти гены; и
белок-редактор или последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую этот белок.
24. Композиция для лечения по п. 23, где последовательность-мишень включает одну или более последовательностей-мишеней SEQ ID NO: 1-79.
25. Композиция для лечения по п. 23, где белком-редактором является белок Cas9, происходящий от Campylobacter jejuni.
26. Композиция для лечения по п. 23, где ангиоваскулярным расстройством является ишемическая ретинопатия или ретинопатия недоношенных.
RU2019103691A 2016-08-19 2017-08-21 Искусственно сконструированная система регуляции ангиогенеза RU2019103691A (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201662376998P 2016-08-19 2016-08-19
US62/376,998 2016-08-19
PCT/KR2017/009078 WO2018034554A1 (ko) 2016-08-19 2017-08-21 인위적으로 조작된 신생혈관형성 조절 시스템

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2019103691A true RU2019103691A (ru) 2020-09-22

Family

ID=61196886

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2019103691A RU2019103691A (ru) 2016-08-19 2017-08-21 Искусственно сконструированная система регуляции ангиогенеза

Country Status (11)

Country Link
US (2) US20180237771A1 (ru)
EP (2) EP3502261B1 (ru)
JP (2) JP7050215B2 (ru)
KR (2) KR102145092B1 (ru)
CN (1) CN109844123A (ru)
AU (2) AU2017313616B2 (ru)
BR (1) BR112019003124A2 (ru)
CA (1) CA3033939A1 (ru)
RU (1) RU2019103691A (ru)
SG (1) SG11201901306XA (ru)
WO (1) WO2018034554A1 (ru)

Families Citing this family (19)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US9828582B2 (en) 2013-03-19 2017-11-28 Duke University Compositions and methods for the induction and tuning of gene expression
US10676726B2 (en) 2015-02-09 2020-06-09 Duke University Compositions and methods for epigenome editing
EA201891317A3 (ru) 2015-11-30 2019-04-30 Дьюк Юниверсити Терапевтические мишени для коррекции гена дистрофина человека с помощью редактирования генов и способы их применения
US20190127713A1 (en) 2016-04-13 2019-05-02 Duke University Crispr/cas9-based repressors for silencing gene targets in vivo and methods of use
JP7490211B2 (ja) 2016-07-19 2024-05-27 デューク ユニバーシティ Ｃｐｆ１に基づくゲノム編集の治療適用
CN111094561B (zh) * 2017-07-07 2024-03-12 株式会社图尔金 靶特异性crispr变体
EP3740580A4 (en) 2018-01-19 2021-10-20 Duke University GENOME ENGINEERING WITH CRISPR-CAS SYSTEMS IN EUKARYONTS
CA3104989A1 (en) 2018-03-27 2019-10-03 G+Flas Life Sciences Sequence-specific in vivo cell targeting
WO2019190198A1 (ko) * 2018-03-27 2019-10-03 (주)지플러스 생명과학 가이드 rna 및 엔도뉴클레아제를 유효성분으로 포함하는 암 치료용 약학적 조성물
CN113195746B (zh) 2018-12-17 2023-10-20 日本制铁株式会社 炉内残留熔渣量的估计方法和估计装置
US11845989B2 (en) 2019-01-23 2023-12-19 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Treatment of ophthalmic conditions with angiopoietin-like 7 (ANGPTL7) inhibitors
KR20210132045A (ko) 2019-01-23 2021-11-03 리제너론 파마슈티칼스 인코포레이티드 안지오포이에틴-유사 7(angtl7) 억제제를 사용하는 안구 질환의 트리트먼트
CN112143701A (zh) * 2019-06-26 2020-12-29 中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心 基于rna定点编辑的抑制脉络膜新生血管形成的方法及试剂
WO2021243105A1 (en) * 2020-05-28 2021-12-02 University Of Southern California Composition and method for treating retinal vascular disease with vegf gene disruption
CN112662674B (zh) * 2021-01-12 2023-04-11 广州瑞风生物科技有限公司 靶向编辑VEGFA基因外显子区域的gRNA及其应用
MX2023009987A (es) 2021-02-26 2023-09-06 Regeneron Pharma Tratamiento de la inflamacion con glucocorticoides e inhibidores de angiopoyetina tipo 7 (angptl7).
CN114540325B (zh) * 2022-01-17 2022-12-09 广州医科大学 靶向dna去甲基化的方法、融合蛋白及其应用
CN119662652B (zh) * 2024-12-24 2025-09-02 中国人民解放军总医院 一种启动子及其应用
CN119876268B (zh) * 2025-03-28 2025-08-29 吉林大学 一种提高家兔生长速度的方法

Family Cites Families (22)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7795422B2 (en) * 2002-02-20 2010-09-14 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of hypoxia inducible factor 1 (HIF1) gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
EP2636739B1 (en) 2004-03-12 2014-12-10 Alnylam Pharmaceuticals Inc. iRNA agents targeting VEGF
EP2126081A2 (en) * 2007-03-02 2009-12-02 MDRNA, Inc. Nucleic acid compounds for inhibiting hif1a gene expression and uses thereof
WO2008154482A2 (en) * 2007-06-08 2008-12-18 Sirnaomics, Inc. Sirna compositions and methods of use in treatment of ocular diseases
WO2010078517A2 (en) * 2008-12-31 2010-07-08 Sirnaomics, Inc. Compositions and methods using sirna molecules and sirna cocktails for the treatment of breast cancer
WO2012100172A2 (en) * 2011-01-22 2012-07-26 Dicerna Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for the specific inhibition of hif-1a by double stranded rna
KR20150105634A (ko) * 2012-12-12 2015-09-17 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 서열 조작을 위한 개선된 시스템, 방법 및 효소 조성물의 유전자 조작 및 최적화
US8697359B1 (en) * 2012-12-12 2014-04-15 The Broad Institute, Inc. CRISPR-Cas systems and methods for altering expression of gene products
EP3744842A1 (en) * 2013-03-15 2020-12-02 The General Hospital Corporation Using truncated guide rnas (tru-grnas) to increase specificity for rna-guided genome editing
ES2987399T3 (es) * 2013-06-05 2024-11-14 Univ Duke Edición génica guiada por ARN y regulación génica
AU2014281031B2 (en) * 2013-06-17 2020-05-21 Massachusetts Institute Of Technology Delivery, use and therapeutic applications of the CRISPR-Cas systems and compositions for targeting disorders and diseases using viral components
PT3019619T (pt) * 2013-07-11 2021-11-11 Modernatx Inc Composições que compreendem polinucleótidos sintéticos que codificam proteínas relacionadas com crispr e sgarn sintéticos e métodos de utilização
WO2015048577A2 (en) * 2013-09-27 2015-04-02 Editas Medicine, Inc. Crispr-related methods and compositions
WO2015070083A1 (en) * 2013-11-07 2015-05-14 Editas Medicine,Inc. CRISPR-RELATED METHODS AND COMPOSITIONS WITH GOVERNING gRNAS
MX374529B (es) * 2013-12-12 2025-03-06 Broad Inst Inc Suministro, uso y aplicaciones terapeuticas de sistemas y composiciones crispr-cas para edicion del genoma.
CN113789317B (zh) * 2014-08-06 2024-02-23 基因工具股份有限公司 使用空肠弯曲杆菌crispr/cas系统衍生的rna引导的工程化核酸酶的基因编辑
PL3250691T3 (pl) * 2015-01-28 2023-11-27 Caribou Biosciences, Inc. Hybrydowe polinukleotydy dna/rna crispr i przydatne sposoby
CN108472314A (zh) * 2015-07-31 2018-08-31 明尼苏达大学董事会 修饰的细胞和治疗方法
TW201737944A (zh) 2015-11-12 2017-11-01 輝瑞大藥廠 使用crispr-cas9之組織特異性基因組工程
WO2017099494A1 (ko) * 2015-12-08 2017-06-15 기초과학연구원 Cpf1을 포함하는 유전체 교정용 조성물 및 그 용도
CN109789185A (zh) * 2016-07-28 2019-05-21 基础科学研究院 用于治疗眼部疾病的含cas9蛋白和向导rna的药物组合物
US12350368B2 (en) * 2017-04-14 2025-07-08 The Broad Institute, Inc. Delivery of large payloads

Also Published As

Publication number Publication date
EP4012032A1 (en) 2022-06-15
CA3033939A1 (en) 2018-02-22
US20210254054A1 (en) 2021-08-19
EP3502261A4 (en) 2020-07-15
KR102145092B1 (ko) 2020-08-14
EP3502261C0 (en) 2025-01-15
CN109844123A (zh) 2019-06-04
SG11201901306XA (en) 2019-03-28
AU2022204172B2 (en) 2024-08-15
WO2018034554A1 (ko) 2018-02-22
AU2022204172A1 (en) 2022-07-07
US20180237771A1 (en) 2018-08-23
KR102259006B1 (ko) 2021-05-31
KR20200098441A (ko) 2020-08-20
EP3502261A1 (en) 2019-06-26
US11999952B2 (en) 2024-06-04
BR112019003124A2 (pt) 2019-10-01
KR20180020929A (ko) 2018-02-28
JP2022058425A (ja) 2022-04-12
JP7050215B2 (ja) 2022-04-08
AU2017313616A1 (en) 2019-02-07
JP2019524847A (ja) 2019-09-05
JP7276422B2 (ja) 2023-05-18
EP3502261B1 (en) 2025-01-15
AU2017313616B2 (en) 2022-12-08

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2019103691A (ru) Искусственно сконструированная система регуляции ангиогенеза
RU2019118283A (ru) Искусственно созданная система управления функцией шк
RU2019106669A (ru) Модифицированный иммунорегуляторный элемент и изменение иммунитета посредством этого элемента
JPWO2021050571A5 (ru)
RU2014138491A (ru) Композиции и способы лечения гемоглобинопатии
Decker et al. The expression of the Ig H chain repertoire in developing bone marrow B lineage cells
US20200370039A1 (en) Adeno-associated virus library
HRP20241180T1 (hr) Modificirani faktor ix, te pripravci, postupci i upotreba za prijenos gena u stanice, organe i tkiva
JP2018534950A5 (ru)
US20190256868A1 (en) Compositions and methods for the treatment of myotonic dystrophy
RU96118426A (ru) Мутагенез днк за счет неупорядоченной фрагментации и вторичной сборки
JP2019517781A5 (ru)
JP2019524140A5 (ru)
JP2019537446A5 (ru)
US20110003705A1 (en) Novel method for generating and screening an antibody library
WO2020047498A1 (en) Directed modification of rna
KR20220119703A (ko) 조절 핵산 서열
JPWO2019183150A5 (ru)
JPWO2022256440A5 (ru)
JPWO2021041885A5 (ru)
JPWO2019200122A5 (ru)
Singh et al. Genetic polymorphism and sequence evolution of an alternatively spliced exon of the glial fibrillary acidic protein gene, GFAP☆
FI3615674T3 (fi) Menetelmiä reumatoidin artriitin hoitoon HLA-geenin RNA-ohjattua genomin muokkausta käyttämällä
CN115247162B (zh) 一种腺嘌呤碱基编辑用融合蛋白及其应用
CA3254576A1 (en) METHODS FOR EVALUATING MODIFIED RETRONIC ACTIVITY AND THEIR USES

Legal Events

Date Code Title Description
FA93 Acknowledgement of application withdrawn (no request for examination)

Effective date: 20200824