RU2018110079A - Способ и устройство для распознавания тканей - Google Patents
Способ и устройство для распознавания тканей Download PDFInfo
- Publication number
- RU2018110079A RU2018110079A RU2018110079A RU2018110079A RU2018110079A RU 2018110079 A RU2018110079 A RU 2018110079A RU 2018110079 A RU2018110079 A RU 2018110079A RU 2018110079 A RU2018110079 A RU 2018110079A RU 2018110079 A RU2018110079 A RU 2018110079A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- image
- data
- roi
- discrete
- comparator
- Prior art date
Links
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING OR CALCULATING; COUNTING
- G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
- G06T7/00—Image analysis
- G06T7/0002—Inspection of images, e.g. flaw detection
- G06T7/0012—Biomedical image inspection
-
- G—PHYSICS
- G02—OPTICS
- G02B—OPTICAL ELEMENTS, SYSTEMS OR APPARATUS
- G02B21/00—Microscopes
- G02B21/36—Microscopes arranged for photographic purposes or projection purposes or digital imaging or video purposes including associated control and data processing arrangements
- G02B21/365—Control or image processing arrangements for digital or video microscopes
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING OR CALCULATING; COUNTING
- G06V—IMAGE OR VIDEO RECOGNITION OR UNDERSTANDING
- G06V20/00—Scenes; Scene-specific elements
- G06V20/60—Type of objects
- G06V20/69—Microscopic objects, e.g. biological cells or cellular parts
- G06V20/695—Preprocessing, e.g. image segmentation
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING OR CALCULATING; COUNTING
- G06V—IMAGE OR VIDEO RECOGNITION OR UNDERSTANDING
- G06V20/00—Scenes; Scene-specific elements
- G06V20/60—Type of objects
- G06V20/69—Microscopic objects, e.g. biological cells or cellular parts
- G06V20/698—Matching; Classification
-
- H—ELECTRICITY
- H04—ELECTRIC COMMUNICATION TECHNIQUE
- H04N—PICTORIAL COMMUNICATION, e.g. TELEVISION
- H04N7/00—Television systems
- H04N7/18—Closed-circuit television [CCTV] systems, i.e. systems in which the video signal is not broadcast
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING OR CALCULATING; COUNTING
- G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
- G06T2207/00—Indexing scheme for image analysis or image enhancement
- G06T2207/10—Image acquisition modality
- G06T2207/10056—Microscopic image
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING OR CALCULATING; COUNTING
- G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
- G06T2207/00—Indexing scheme for image analysis or image enhancement
- G06T2207/20—Special algorithmic details
- G06T2207/20112—Image segmentation details
- G06T2207/20161—Level set
Landscapes
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Theoretical Computer Science (AREA)
- Multimedia (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Computer Vision & Pattern Recognition (AREA)
- Radiology & Medical Imaging (AREA)
- Quality & Reliability (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Medical Informatics (AREA)
- Signal Processing (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Optics & Photonics (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Image Analysis (AREA)
- Image Processing (AREA)
- Investigating Or Analysing Materials By Optical Means (AREA)
Claims (38)
1. Компьютерно-реализуемый способ обработки изображений, включающий в себя
получение данных изображения с микроскопа, определяющих изображение предметного стекла микроскопа для окрашенного гематоксилином и эозином образца ткани, при этом данные изображения предметного стекла микроскопа содержат множество пикселей изображения;
получение данных дескриптора, указывающих тип ткани, из которого происходит образец ткани;
выбор, на основании данных дескриптора, операции с изображением, сконфигурированной для преобразования данных изображения;
применение выбранной операции с изображением к данным изображения для идентификации ряда дискретных областей пространства на изображении;
выбор из хранилища данных множества количественных метрик изображения, при этом количественные метрики изображения выбирают на основании данных дескриптора,
определение, для каждой дискретной области пространства, значения данных области изображения для каждой из множества количественных метрик изображения на основании подмножества данных изображения, ассоциированных с конкретной или каждой дискретной областью пространства,
использование данных дескриптора для выбора из хранилища данных по меньшей мере одного компараторного набора значений данных модели ткани, при этом каждый компараторный набор ассоциирован с отдельной соответствующей компараторной структурой ткани, и каждый компараторный набор содержит значения данных для множества количественных метрик изображения для соответствующей компараторной структуры ткани;
сравнение значений данных области изображения для каждой дискретной области по меньшей мере с одним компараторным набором;
в случае, когда значение данных области изображения для конкретной или каждой дискретной области пространства соответствует компараторному набору, предоставление карты данных изображения, показывающей, что конкретная дискретная область пространства содержит соответствующую компараторную структуру ткани;
в случае, когда дискретная область пространства (ROI) не соответствует данным компаратора, ее классифицируют как неразрешенную ROI, и дополнительную операцию с изображением применяют к неразрешенной ROI с получением модифицированной ROI; и
вычисление для модифицированной ROI по меньшей мере одной количественной метрики изображения для сравнения с данными компаратора с целью классификации модифицированной ROI.
2. Способ по п. 1, в котором операция с изображением включает операцию сравнения с порогом, сконфигурированную для предоставления карты изображения с двумя состояниями, например,
в котором дискретные области пространства содержат смежные группы пикселей, принадлежащие к первому из двух состояний карты с двумя состояниями, например, в котором смежные группы пикселей содержат превышающие порог пиксели.
3. Способ по любому из предшествующих пунктов, в котором количественные метрики изображения включают в себя по меньшей мере одну из: размера дискретной области пространства (ROI), формы дискретной области пространства (ROI), оптической плотности дискретной области пространства (ROI), границы дискретной области пространства (ROI), и содержит ли дискретная область пространства (ROI) идентифицируемые подкомпоненты ROI.
4. Способ по любому из предшествующих пунктов, в котором дополнительная операция с изображением включает по меньшей мере одно из размывания, расширения и открытия.
5. Способ по любому из предшествующих пунктов, включающий в себя сравнение значения по меньшей мере одной количественной метрики изображения для модифицированной ROI с данными компаратора с целью идентификации модифицированной ROI.
6. Способ по п. 5, в котором, в случае, когда одно или более значений по меньшей мере одной количественной метрики изображения для модифицированной ROI не соответствуют данным компаратора для идентификации модифицированной ROI, способ включает в себя получение второй модифицированной ROI путем применения второй дополнительной операции с изображением по меньшей мере к одной из: (a) неразрешенной ROI и (b) модифицированной ROI.
7. Способ по п. 6, включающий в себя вычисление для второй модифицированной ROI по меньшей мере одной количественной метрики изображения, выбранной из списка, включающего в себя: размер ROI, форму ROI, оптическую плотность ROI, границу ROI, и содержит ли ROI идентифицируемые подкомпоненты ROI, и
сравнение значений по меньшей мере одной количественной метрики изображения для второй модифицированной ROI с данными компаратора для идентификации второй модифицированной ROI, например,
в случае, когда вторая модифицированная ROI не соответствует данным компаратора для идентификации второй модифицированной ROI, способ включает в себя циклическое повторение:
(i) применение еще одного оператора изображения с получением дополнительно модифицированной ROI;
(ii) вычисление по меньшей мере одной количественной метрики изображения; и
(iii) сравнение значений по меньшей мере одной количественной метрики изображения для этой дополнительно модифицированной ROI с данными компаратора для идентификации этой дополнительно модифицированной ROI.
8. Способ по любому из предшествующих пунктов, в котором операция с изображением включает пространственный фильтр, сконфигурированный для идентификации структурированных данных изображения, которые описывают структуры, имеющие шкалу пространственной длины в выбранном диапазоне, например,
в котором пространственный фильтр включает морфологический фильтр, имеющий структурирующий элемент, выбранный на основании данных дескриптора, при этом
по меньшей мере одно из размера и формы структурирующего элемента выбирают на основании данных дескриптора.
9. Способ по любому из предшествующих пунктов, в котором множество количественных метрик изображения включает в себя метрику, основанную на оптической плотности в конкретной или каждой дискретной области.
10. Способ по любому из предшествующих пунктов, в котором множество количественных метрик изображения включает в себя:
(a) метрику, основанную на пространственных частотных данных в выбранном диапазоне пространственных частот в конкретной или каждой дискретной области;
(b) метрику, основанную на данных текстуры в конкретной или каждой дискретной области; и
(c) по меньшей мере одну метрику морфологии ткани по шкале длины, выбранной на основании данных дескриптора.
11. Способ по любому из предшествующих пунктов, включающий в себя определение на основании идентичности соответствующей компараторной структуры ткани, следует ли дополнительно анализировать конкретную или каждую дискретную область, при этом в случае, когда конкретную или каждую дискретную область не будут дополнительно анализировать, конкретную или каждую дискретную область исключают из последующего анализа данных изображения.
12. Способ по любому из предшествующих пунктов, включающий в себя применение первого морфологического фильтра к данным изображения в конкретной или каждой дискретной области в случае, когда конкретную или каждую дискретную область следует проанализировать дополнительно, при этом морфологический фильтр имеет структурирующий элемент, выбранный для предоставления данных по клеточным ядрам, идентифицирующих клеточные ядра.
13. Способ по любому из предшествующих пунктов, включающий в себя получение значений данных для указанного множества количественных метрик изображения из множества изображений предметного стекла микроскопа, выбор последовательности из множества изображений предметного стекла микроскопа на основании значений данных для по меньшей мере одной из указанного множества количественных метрик изображения, например, дополнительно включающий в себя представление множества изображений предметного стекла микроскопа человеку-оператору в выбранной последовательности.
14. Способ по любому из предшествующих пунктов, в котором данные изображения включают в себя данные оптической плотности.
15. Диагностическое устройство, сконфигурированное для выполнения способа по любому из предшествующих пунктов, например, при этом устройство сконфигурировано для предоставления по меньшей мере одного из (a) дополненного изображения, содержащего указание результата по меньшей мере одного из указанных этапов сравнения, и (b) диагностического указания наличия раковых клеток в ткани на основании результата по меньшей мере одного из указанных этапов сравнения.
16. Компьютерный программный продукт, включающий в себя инструкции программ, сконфигурированные для программирования процессора для выполнения способа по любому из пп. 1-13.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| GB1516869.3 | 2015-09-23 | ||
| GB1516869.3A GB2542765A (en) | 2015-09-23 | 2015-09-23 | Method and apparatus for tissue recognition |
| PCT/GB2016/052974 WO2017051191A2 (en) | 2015-09-23 | 2016-09-23 | Method and apparatus for tissue recognition |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2018110079A true RU2018110079A (ru) | 2019-10-23 |
| RU2018110079A3 RU2018110079A3 (ru) | 2020-03-13 |
Family
ID=54544702
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2018110079A RU2018110079A (ru) | 2015-09-23 | 2016-09-23 | Способ и устройство для распознавания тканей |
Country Status (7)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US10671832B2 (ru) |
| EP (1) | EP3353743A2 (ru) |
| JP (1) | JP2018529103A (ru) |
| CN (1) | CN108140239A (ru) |
| GB (1) | GB2542765A (ru) |
| RU (1) | RU2018110079A (ru) |
| WO (1) | WO2017051191A2 (ru) |
Families Citing this family (11)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US10684199B2 (en) | 2017-07-27 | 2020-06-16 | Agilent Technologies, Inc. | Preparation of tissue sections using fluorescence-based detection |
| CA3081643A1 (en) * | 2017-11-06 | 2019-05-09 | University Health Network | Platform, device and process for annotation and classification of tissue specimens using convolutional neural network |
| US11080324B2 (en) * | 2018-12-03 | 2021-08-03 | Accenture Global Solutions Limited | Text domain image retrieval |
| JP7270058B2 (ja) * | 2019-03-12 | 2023-05-09 | エフ・ホフマン-ラ・ロシュ・アクチェンゲゼルシャフト | 予測的組織パターン特定のためのマルチプルインスタンスラーナ |
| EP3709262A1 (en) * | 2019-03-13 | 2020-09-16 | Koninklijke Philips N.V. | Correlated image analysis for 3d biopsy |
| CN111144244B (zh) * | 2019-12-13 | 2023-07-11 | 唐美(北京)文化科技发展有限公司 | 家具木材类别识别方法及装置 |
| KR20230144555A (ko) * | 2021-02-08 | 2023-10-16 | 씨디엑스 메디칼 아이피 인크. | 진단적 중요도의 순서대로 세포 및 조직을 동적으로 우선순위를 매기고 조직화하며 표시하는 시스템 및 방법 |
| CN113066080B (zh) * | 2021-04-19 | 2024-07-26 | 广州信瑞医疗技术有限公司 | 切片组织识别方法、装置,细胞识别模型及组织分割模型 |
| US12475564B2 (en) | 2022-02-16 | 2025-11-18 | Proscia Inc. | Digital pathology artificial intelligence quality check |
| EP4552079A1 (en) * | 2022-07-06 | 2025-05-14 | Memorial Sloan Kettering Cancer Center | Determining predicted outcomes of subjects with cancer based on segmentations of biomedical images |
| CN117853932B (zh) * | 2024-03-05 | 2024-05-14 | 华中科技大学 | 一种基于光电吊舱的海面目标检测方法、检测平台及系统 |
Family Cites Families (28)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6466687B1 (en) * | 1997-02-12 | 2002-10-15 | The University Of Iowa Research Foundation | Method and apparatus for analyzing CT images to determine the presence of pulmonary tissue pathology |
| US8406498B2 (en) * | 1999-01-25 | 2013-03-26 | Amnis Corporation | Blood and cell analysis using an imaging flow cytometer |
| US6993169B2 (en) * | 2001-01-11 | 2006-01-31 | Trestle Corporation | System and method for finding regions of interest for microscopic digital montage imaging |
| US7864380B2 (en) * | 2001-03-19 | 2011-01-04 | Dmetrix, Inc. | Slide-borne imaging instructions |
| WO2003105675A2 (en) | 2002-06-18 | 2003-12-24 | Lifespan Biosciences, Inc. | Computerized image capture of structures of interest within a tissue sample |
| GB2398379A (en) * | 2003-02-11 | 2004-08-18 | Qinetiq Ltd | Automated digital image analysis |
| US7689023B2 (en) * | 2003-05-30 | 2010-03-30 | Rabinovich Andrew M | Color unmixing and region of interest detection in tissue samples |
| RU2295297C2 (ru) | 2003-12-02 | 2007-03-20 | Александр Васильевич Жукоцкий | Способ исследования и диагностики состояния биологического объекта или его части |
| CN1296699C (zh) * | 2003-12-19 | 2007-01-24 | 武汉大学 | 显微多光谱骨髓及外周血细胞自动分析仪和分析骨髓及外周血细胞的方法 |
| US20060127880A1 (en) * | 2004-12-15 | 2006-06-15 | Walter Harris | Computerized image capture of structures of interest within a tissue sample |
| US20070135999A1 (en) * | 2005-12-13 | 2007-06-14 | Applied Spectral Imaging Ltd. | Method, apparatus and system for characterizing pathological specimen |
| WO2008005426A2 (en) * | 2006-06-30 | 2008-01-10 | University Of South Florida | Computer-aided pathological diagnosis system |
| EP2143043A4 (en) | 2007-05-07 | 2011-01-12 | Ge Healthcare Bio Sciences | SYSTEM AND METHOD FOR THE AUTOMATED ANALYSIS OF CELLULAR ASSAYS AND TISSUE |
| RU2353295C2 (ru) | 2007-05-08 | 2009-04-27 | Государственное учреждение Научный центр клинической и экспериментальной медицины Сибирского отделения Российской академии медицинских наук (ГУ НЦКЭМ СО РАМН) | Способ дифференциальной диагностики фолликулярной аденомы и фолликулярного рака щитовидной железы |
| WO2009003198A1 (en) | 2007-06-28 | 2008-12-31 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | System and method for automatically detecting change in a series of medical images of a subject over time |
| US8600135B2 (en) | 2007-06-28 | 2013-12-03 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | System and method for automatically generating sample points from a series of medical images and identifying a significant region |
| EP2227774B1 (en) * | 2007-12-04 | 2014-07-09 | University College Dublin, National University of Ireland Dublin | Method and system for image analysis |
| JP2011022131A (ja) | 2009-06-18 | 2011-02-03 | Olympus Corp | 医療診断支援装置、画像処理方法、画像処理プログラム、およびバーチャル顕微鏡システム |
| US20100329535A1 (en) * | 2009-06-26 | 2010-12-30 | Marc Macenko | Methods, Systems and Computer Program Products for Analyzing Histology Slide Images |
| RU2014102672A (ru) | 2011-07-28 | 2015-09-10 | Медетект Аб | Способ получения изображений среза ткани |
| WO2013022688A1 (en) * | 2011-08-05 | 2013-02-14 | Siemens Healthcare Diagnostics Inc. | Automated detection of diagnostically relevant regions in pathology images |
| WO2013049153A2 (en) * | 2011-09-27 | 2013-04-04 | Board Of Regents, University Of Texas System | Systems and methods for automated screening and prognosis of cancer from whole-slide biopsy images |
| EP2904373B1 (en) * | 2012-10-03 | 2022-12-14 | Koninklijke Philips N.V. | Combined sample examinations |
| US9946953B2 (en) * | 2013-05-10 | 2018-04-17 | Koninklijke Philips N.V. | Apparatus and method for processing images of tissue samples |
| US10776606B2 (en) * | 2013-09-22 | 2020-09-15 | The Regents Of The University Of California | Methods for delineating cellular regions and classifying regions of histopathology and microanatomy |
| WO2015113895A1 (en) * | 2014-01-28 | 2015-08-06 | Ventana Medical Systems, Inc. | Adaptive classification for whole slide tissue segmentation |
| US9092691B1 (en) * | 2014-07-18 | 2015-07-28 | Median Technologies | System for computing quantitative biomarkers of texture features in tomographic images |
| CN104745670A (zh) * | 2015-04-16 | 2015-07-01 | 黄小军 | 一种细胞芯片的制备方法及其在肿瘤筛查领域的应用 |
-
2015
- 2015-09-23 GB GB1516869.3A patent/GB2542765A/en not_active Withdrawn
-
2016
- 2016-09-23 US US15/761,940 patent/US10671832B2/en active Active
- 2016-09-23 CN CN201680055803.4A patent/CN108140239A/zh active Pending
- 2016-09-23 EP EP16805169.6A patent/EP3353743A2/en not_active Withdrawn
- 2016-09-23 JP JP2018514780A patent/JP2018529103A/ja not_active Ceased
- 2016-09-23 RU RU2018110079A patent/RU2018110079A/ru not_active Application Discontinuation
- 2016-09-23 WO PCT/GB2016/052974 patent/WO2017051191A2/en not_active Ceased
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| US10671832B2 (en) | 2020-06-02 |
| US20190073511A1 (en) | 2019-03-07 |
| JP2018529103A (ja) | 2018-10-04 |
| GB2542765A (en) | 2017-04-05 |
| WO2017051191A3 (en) | 2017-04-27 |
| WO2017051191A2 (en) | 2017-03-30 |
| GB201516869D0 (en) | 2015-11-04 |
| EP3353743A2 (en) | 2018-08-01 |
| CN108140239A (zh) | 2018-06-08 |
| RU2018110079A3 (ru) | 2020-03-13 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2018110079A (ru) | Способ и устройство для распознавания тканей | |
| JP2022164718A (ja) | 顕微鏡スライド画像のための焦点重み付き機械学習分類器誤り予測 | |
| JP6547386B2 (ja) | 画像処理装置及び方法 | |
| US9842391B2 (en) | Method and apparatus for processing an image of a tissue sample | |
| Zhang et al. | Cell detection and segmentation using correlation clustering | |
| US20200242759A1 (en) | Bone marrow cell labeling methods and systems | |
| WO2014133756A2 (en) | Method and apparatus for learning-enhanced altas-based auto-segmentation | |
| US20150186755A1 (en) | Systems and Methods for Object Identification | |
| RU2015111423A (ru) | Способ и устройство для идентификации целевого объекта на изображении | |
| US9070203B2 (en) | Identification and quantification of microtextured regions in materials with ordered crystal structure | |
| RU2014110361A (ru) | Процессор изображений, сконфигурированный для эффективной оценки и устранения информации переднего плана на изображениях | |
| JP2018535470A5 (ru) | ||
| US10565706B2 (en) | Method and apparatus for tissue recognition | |
| CN107315989B (zh) | 针对医学资料图片的文本识别方法和装置 | |
| CN106408578A (zh) | 一种单木分割方法及装置 | |
| RU2015136525A (ru) | Процесс обработки медицинских изображений | |
| WO2017051195A1 (en) | Pattern driven image processing method & apparatus for tissue recognition | |
| JP5755810B2 (ja) | 特徴抽出のための技法 | |
| Fabijanska | Normalized cuts and watersheds for image segmentation | |
| Schimke et al. | Quickshear Defacing for Neuroimages. | |
| JP6405603B2 (ja) | 情報処理装置、情報処理システム及びプログラム | |
| Su et al. | Learning based automatic detection of myonuclei in isolated single skeletal muscle fibers using multi-focus image fusion | |
| Fabijańska et al. | New accelerated graph‐based method of image segmentation applying minimum spanning tree | |
| US9390313B2 (en) | Image measurement apparatus and image measurment method measuring the cell neclei count | |
| CN117173696A (zh) | 显示指定类型的细胞识别方法、装置、电子设备及介质 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20210416 |