RU2008117457A - Способ экстрагирования днк из образцов тканей организма - Google Patents
Способ экстрагирования днк из образцов тканей организма Download PDFInfo
- Publication number
- RU2008117457A RU2008117457A RU2008117457/15A RU2008117457A RU2008117457A RU 2008117457 A RU2008117457 A RU 2008117457A RU 2008117457/15 A RU2008117457/15 A RU 2008117457/15A RU 2008117457 A RU2008117457 A RU 2008117457A RU 2008117457 A RU2008117457 A RU 2008117457A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- sample
- dna
- procedure
- solution
- surfactant
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract 39
- 239000000243 solution Substances 0.000 claims abstract 14
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 claims abstract 13
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 11
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims abstract 11
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 claims abstract 10
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 claims abstract 10
- KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N Isopropanol Chemical compound CC(C)O KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 6
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 claims abstract 5
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 claims abstract 4
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 claims abstract 4
- 210000000988 bone and bone Anatomy 0.000 claims abstract 4
- 239000000872 buffer Substances 0.000 claims abstract 4
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N phenol group Chemical group C1(=CC=CC=C1)O ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 4
- 238000000746 purification Methods 0.000 claims abstract 4
- 239000007787 solid Substances 0.000 claims abstract 4
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 3
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 claims abstract 3
- 238000000605 extraction Methods 0.000 claims abstract 3
- 239000000843 powder Substances 0.000 claims abstract 3
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims abstract 3
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract 3
- 238000004090 dissolution Methods 0.000 claims abstract 2
- 239000008187 granular material Substances 0.000 claims abstract 2
- NALMPLUMOWIVJC-UHFFFAOYSA-N n,n,4-trimethylbenzeneamine oxide Chemical compound CC1=CC=C([N+](C)(C)[O-])C=C1 NALMPLUMOWIVJC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 2
- 235000015281 sodium iodate Nutrition 0.000 claims abstract 2
- 239000011697 sodium iodate Substances 0.000 claims abstract 2
- 229940032753 sodium iodate Drugs 0.000 claims abstract 2
- 239000002904 solvent Substances 0.000 claims abstract 2
- 238000007400 DNA extraction Methods 0.000 claims 9
- 238000002203 pretreatment Methods 0.000 claims 6
- FVAUCKIRQBBSSJ-UHFFFAOYSA-M sodium iodide Chemical compound [Na+].[I-] FVAUCKIRQBBSSJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims 6
- DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M Sodium laurylsulphate Chemical group [Na+].CCCCCCCCCCCCOS([O-])(=O)=O DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims 4
- 239000002563 ionic surfactant Substances 0.000 claims 3
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- XUIMIQQOPSSXEZ-UHFFFAOYSA-N Silicon Chemical compound [Si] XUIMIQQOPSSXEZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 229910052710 silicon Inorganic materials 0.000 claims 2
- 239000010703 silicon Substances 0.000 claims 2
- 238000002791 soaking Methods 0.000 claims 2
- 235000009518 sodium iodide Nutrition 0.000 claims 2
- 239000011324 bead Substances 0.000 claims 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 claims 1
- 230000003544 deproteinization Effects 0.000 claims 1
- 239000003599 detergent Substances 0.000 claims 1
- 238000011978 dissolution method Methods 0.000 claims 1
- 238000001035 drying Methods 0.000 claims 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 claims 1
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 claims 1
- 230000017854 proteolysis Effects 0.000 claims 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 claims 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 claims 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 claims 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 238000007781 pre-processing Methods 0.000 abstract 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6806—Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/1003—Extracting or separating nucleic acids from biological samples, e.g. pure separation or isolation methods; Conditions, buffers or apparatuses therefor
- C12N15/1006—Extracting or separating nucleic acids from biological samples, e.g. pure separation or isolation methods; Conditions, buffers or apparatuses therefor by means of a solid support carrier, e.g. particles, polymers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/1003—Extracting or separating nucleic acids from biological samples, e.g. pure separation or isolation methods; Conditions, buffers or apparatuses therefor
- C12N15/1017—Extracting or separating nucleic acids from biological samples, e.g. pure separation or isolation methods; Conditions, buffers or apparatuses therefor by filtration, e.g. using filters, frits, membranes
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Immunology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Sampling And Sample Adjustment (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
Abstract
1. Способ для экстрагирования ДНК, включающий: ! (1) способ предварительной обработки, предусматривающий: ! процедуру получения фрагментов использованием целого образца твердой ткани организма, нарезанием образца или дроблением образца, и ! последующую процедуру декальцинирования добавлением водного раствора этилендиаминтетрауксусной кислоты (EDTA) к образцу, и добавление поверхностно - активного вещества к полученному водному раствору, далее включающий: ! (2) способ растворения, предусматривающий: ! процедуру добавления буферного раствора растворителя, который растворяет комплекс ДНК-белок в образце ткани организма (1) к этому образцу и добавление протеолитического фермента к буферному раствору для применения образца (1) для получения раствора комплекса ДНК-белок, ! (3) способ экстрагирования, предусматривающий: ! процедуру добавления насыщенного фенольного буфера, включающего трис(гидроксиметил)аминометана гидрохлорид, или водного раствора, содержащего натрия иодат и изопропанол, к раствору комплекса (2) для удаления белков, и затем отделение экстракта ДНК, ! (4) способ очистки, предусматривающий: ! последующий способ очистки ДНК посредством пропускания экстракта ДНК (3) через колонку, ! где фрагменты не представляют собой порошок. ! 2. Способ для экстрагирования ДНК по п.1, в котором твердая ткань представляет собой зуб или кость. ! 3. Способ для экстрагирования ДНК по п.2, в котором процедура получения фрагментов включает: ! использование целого зуба, нарезание зуба или кости на куски толщиной от 0,1 до 0,5 см, или использование гранул, по меньшей мере размером приблизительно 5 мм, полученных дроблением, для получения фраг�
Claims (18)
1. Способ для экстрагирования ДНК, включающий:
(1) способ предварительной обработки, предусматривающий:
процедуру получения фрагментов использованием целого образца твердой ткани организма, нарезанием образца или дроблением образца, и
последующую процедуру декальцинирования добавлением водного раствора этилендиаминтетрауксусной кислоты (EDTA) к образцу, и добавление поверхностно - активного вещества к полученному водному раствору, далее включающий:
(2) способ растворения, предусматривающий:
процедуру добавления буферного раствора растворителя, который растворяет комплекс ДНК-белок в образце ткани организма (1) к этому образцу и добавление протеолитического фермента к буферному раствору для применения образца (1) для получения раствора комплекса ДНК-белок,
(3) способ экстрагирования, предусматривающий:
процедуру добавления насыщенного фенольного буфера, включающего трис(гидроксиметил)аминометана гидрохлорид, или водного раствора, содержащего натрия иодат и изопропанол, к раствору комплекса (2) для удаления белков, и затем отделение экстракта ДНК,
(4) способ очистки, предусматривающий:
последующий способ очистки ДНК посредством пропускания экстракта ДНК (3) через колонку,
где фрагменты не представляют собой порошок.
2. Способ для экстрагирования ДНК по п.1, в котором твердая ткань представляет собой зуб или кость.
3. Способ для экстрагирования ДНК по п.2, в котором процедура получения фрагментов включает:
использование целого зуба, нарезание зуба или кости на куски толщиной от 0,1 до 0,5 см, или использование гранул, по меньшей мере размером приблизительно 5 мм, полученных дроблением, для получения фрагментов, которые не содержат порошок.
4. Способ для экстрагирования ДНК по п.1, в котором водный раствор EDTA в процессе предварительной обработки содержит поверхностно-активное вещество.
5. Способ для экстрагирования ДНК по п.4, в котором поверхностно-активное вещество представляет собой ионное поверхностно-активное вещество.
6. Способ для экстрагирования ДНК по п.5, в котором ионное поверхностно-активное вещество представляет собой додецилсульфат натрия (SDS).
7. Способ для экстрагирования ДНК по п.4, в котором концентрация поверхностно-активного вещества в водном растворе EDTA составляет от 0,1 до 0,5 мас.%.
8. Способ для экстрагирования ДНК по п.1, в котором процедура декальцинации в способе предварительной обработки включает:
вымачивание образца в водном растворе EDTA при температуре от 20 до 60°С в течение от 2 ч до 2 сут.
9. Способ для экстрагирования ДНК по п.4, в котором процедура декальцинации в способе предварительной обработки включает:
вымачивание образца в водном растворе EDTA и поверхностно-активного вещества при температуре от 37 до 60°С в течение от 2 ч до 2 сут.
10. Способ для экстрагирования ДНК по п.1, в котором образец ткани организма в способе предварительной обработки предварительно очищен процедурой очистки.
11. Способ для экстрагирования ДНК по п.10, в котором процедура очистки в способе предварительной обработки включает:
промывание образца ткани организма водным раствором нейтрального детергента, водой и затем этанолом, и сушку образца.
12. Способ для экстрагирования ДНК по п.1, в котором раствор ДНК в способе для растворения получен добавлением протеолитического фермента к раствору комплекса и затем хранением раствора при температуре от 37 до 65°С в течение от 0,5 до 6 ч.
13. Способ для экстрагирования ДНК по п.1, в котором способ экстракции включает:
добавление насыщенного фенольного буфера и
отделение водной надосадочной жидкости.
14. Способ для экстрагирования ДНК по п.1, в котором колонка в способе очистки представляет собой кремниевую мембранную колонку, колонку, заполненную кремниевыми шариками или процедуру центрифугирования с использованием йодида натрия.
15. Растворы для экстрагирования ДНК, включающие:
(1-1) водный раствор, содержащий этилендиаминтетрауксусную
кислоту (EDTA) для декальцинации посредством добавления к фрагменту целого образца твердой ткани организма, фрагментам, полученным нарезанием образца или фрагментам, полученным дроблением образца,
(1-2) поверхностно-активное вещество для добавления в водный раствор для декальцинации,
(2-1) раствор буфера для растворения комплекса ДНК-белок в образце ткани организма,
(2-2) раствор протеолитического фермента для протеолиза белка и
(3) насыщенный фенольный буфер, содержащий трис(гидроксиметил)аминометана гидрохлорид, или водный раствор, включающий натрия йодид и изопропанол, для их депротеинизации.
16. Растворы по п.15, в которых поверхностно-активное вещество представляет собой ионизированное поверхностно-активное вещество.
17. Растворы по п.16, в которых ионное поверхностно-активное вещество представляет собой додецилсульфат натрия (SDS).
18. Растворы по п.15, в которых концентрация поверхностно-активного вещества в водном растворе EDTA составляет от 0,1 до 0,5 мас.%
Applications Claiming Priority (4)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2005-289698 | 2005-10-03 | ||
| JP2005289698 | 2005-10-03 | ||
| JP2006098286 | 2006-03-31 | ||
| JP2006-098286 | 2006-03-31 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2008117457A true RU2008117457A (ru) | 2009-11-10 |
Family
ID=37902339
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2008117457/15A RU2008117457A (ru) | 2005-10-03 | 2006-10-03 | Способ экстрагирования днк из образцов тканей организма |
Country Status (5)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US20070077573A1 (ru) |
| EP (1) | EP1950289A4 (ru) |
| JP (2) | JP4165899B2 (ru) |
| RU (1) | RU2008117457A (ru) |
| WO (1) | WO2007043494A1 (ru) |
Families Citing this family (9)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| ES2332757B1 (es) * | 2007-10-18 | 2010-10-14 | Universidade Da Coruña | Metodo de extraccion de adn de alta calidad en tejidos de moluscos bivalvos. |
| CN101302508B (zh) * | 2008-06-12 | 2010-09-15 | 上海交通大学 | 假单胞菌m18的rna快速提取方法 |
| CN102586231B (zh) * | 2012-03-07 | 2013-12-18 | 天根生化科技（北京）有限公司 | 一种快速的大片段基因组脱氧核糖核酸提取方法 |
| CN102721592A (zh) * | 2012-07-12 | 2012-10-10 | 吉林大学 | 一种适用于双向电泳的蚜虫蛋白样品制备方法 |
| CN106908402B (zh) * | 2017-03-17 | 2020-03-24 | 青海大学 | 蚕豆根系蛋白质组学分析的样品制备方法 |
| JP6962707B2 (ja) * | 2017-05-19 | 2021-11-05 | プリマハム株式会社 | 洗浄剤組成物 |
| CN107513528A (zh) * | 2017-10-16 | 2017-12-26 | 鲁东大学 | 一种江珧贝壳dna提取方法、鉴定引物及试剂盒 |
| CN108456676A (zh) * | 2018-03-30 | 2018-08-28 | 黄书琴 | 从骨骼或牙齿中提取dna的提取缓冲液和提取方法 |
| KR102603588B1 (ko) * | 2021-10-28 | 2023-11-20 | (주)한국첨단시험연구원 | Dna 추출을 위한 침전제 조성물 및 이것이 적용된 dna 추출방법 |
Family Cites Families (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6534095B1 (en) * | 1999-09-03 | 2003-03-18 | Lifenet | Pulsatile acidification wave demineralization process for producing osteoinductive bone; and osteoinductive bone produced thereby |
| US20040126796A1 (en) * | 2002-10-07 | 2004-07-01 | David Carlson | Extraction of DNA from biological samples |
| JP3789429B2 (ja) | 2002-12-24 | 2006-06-21 | 敏一 皆川 | 簡易ｄｎａ抽出法 |
-
2006
- 2006-05-30 US US11/442,304 patent/US20070077573A1/en not_active Abandoned
- 2006-10-03 RU RU2008117457/15A patent/RU2008117457A/ru not_active Application Discontinuation
- 2006-10-03 JP JP2007539932A patent/JP4165899B2/ja active Active
- 2006-10-03 WO PCT/JP2006/320155 patent/WO2007043494A1/ja not_active Ceased
- 2006-10-03 EP EP06798505A patent/EP1950289A4/en not_active Withdrawn
-
2008
- 2008-06-05 JP JP2008148291A patent/JP4427588B2/ja active Active
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| WO2007043494A9 (ja) | 2007-06-07 |
| WO2007043494A1 (ja) | 2007-04-19 |
| JP4427588B2 (ja) | 2010-03-10 |
| JP4165899B2 (ja) | 2008-10-15 |
| EP1950289A1 (en) | 2008-07-30 |
| US20070077573A1 (en) | 2007-04-05 |
| JP2008220386A (ja) | 2008-09-25 |
| JPWO2007043494A1 (ja) | 2009-04-16 |
| EP1950289A4 (en) | 2009-02-11 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Arivalagan et al. | Shell matrix proteins of the clam, Mya truncata: roles beyond shell formation through proteomic study | |
| RU2008117457A (ru) | Способ экстрагирования днк из образцов тканей организма | |
| CN102161988B (zh) | 一种提取单个鱼卵仔鱼微量总dna的简便快速方法 | |
| MX2010001425A (es) | Produccion de proteina canola 2s que implica intercambio ionico. | |
| CN105241720B (zh) | 一种适合双向电泳的红树植物秋茄叶片总蛋白提取方法 | |
| AR044159A1 (es) | Extraccion rapida de acido ribonucleico de celulas y tejidos | |
| CN102628039B (zh) | 一种通用植物总rna提取法 | |
| CN104560959A (zh) | 一种饱和氯化钠法快速批量提取血液dna的试剂盒和方法 | |
| CN105420229A (zh) | 一种提取古代生物骨骼dna的裂解液及方法 | |
| RU2002129603A (ru) | Способ извлечения рения | |
| CN106434633A (zh) | 骨组织rna快速提取试剂盒 | |
| CN110387369A (zh) | 一种能够满足微量核酸生物样本提取纯化要求的试剂盒及其使用方法 | |
| CN104596826A (zh) | 一种泌尿系结石内蛋白的提取方法 | |
| CN104164423B (zh) | 利用rna吸附柱快速提取植物rna的试剂盒及方法 | |
| CN101735297A (zh) | 一种植物低分子量rna的快速提取方法 | |
| KR20150049865A (ko) | 봉독으로부터 멜리틴의 분리방법 | |
| CN101985461A (zh) | 一种从甲醛固定组织或甲醛固定石蜡包埋组织中提取总蛋白质的方法 | |
| CN106434632A (zh) | 一种穿山甲甲片的dna提取方法 | |
| CN101705224A (zh) | 一种从“太岁”中提取基因组的方法 | |
| CN102690319B (zh) | 一种生物被膜状态下猪链球菌总蛋白的提取方法 | |
| CN103694309A (zh) | 一种提取和检测鱼类精子膜蛋白的方法 | |
| JP2006104461A (ja) | グリコサミノグリカン画分中の不純物の除去方法 | |
| KR20180064085A (ko) | Ｐｃｒ용 ｄｎａ의 간단하고 신속한 추출방법 | |
| CN105154433A (zh) | 一种大豆胞囊线虫胞囊寄生菌dna提取方法 | |
| CN115453021B (zh) | 一种sds脱细胞溶液及其在脱细胞处理或细胞外基质不可溶组分鉴定中的应用 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA93 | Acknowledgement of application withdrawn (no request for examination) |
Effective date: 20100113 |