RU2007134371A - Лентивирусные векторы и их применение - Google Patents
Лентивирусные векторы и их применение Download PDFInfo
- Publication number
- RU2007134371A RU2007134371A RU2007134371/13A RU2007134371A RU2007134371A RU 2007134371 A RU2007134371 A RU 2007134371A RU 2007134371/13 A RU2007134371/13 A RU 2007134371/13A RU 2007134371 A RU2007134371 A RU 2007134371A RU 2007134371 A RU2007134371 A RU 2007134371A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- lentiviral
- heterologous
- sequence
- vector
- ltr
- Prior art date
Links
- 239000013598 vector Substances 0.000 title claims 27
- 241000713666 Lentivirus Species 0.000 title claims 3
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims 22
- 238000000034 method Methods 0.000 claims 19
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims 19
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims 19
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims 19
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims 16
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims 16
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims 16
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 claims 15
- 230000002463 transducing effect Effects 0.000 claims 12
- 238000012546 transfer Methods 0.000 claims 9
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 claims 8
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 claims 6
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims 6
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 claims 4
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 claims 4
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 claims 4
- 238000013518 transcription Methods 0.000 claims 4
- 230000035897 transcription Effects 0.000 claims 4
- 108700026226 TATA Box Proteins 0.000 claims 3
- 210000000234 capsid Anatomy 0.000 claims 3
- 108010027225 gag-pol Fusion Proteins Proteins 0.000 claims 3
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 claims 3
- 230000026683 transduction Effects 0.000 claims 3
- 238000010361 transduction Methods 0.000 claims 3
- 238000013519 translation Methods 0.000 claims 3
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 claims 3
- 208000031886 HIV Infections Diseases 0.000 claims 2
- 101710154606 Hemagglutinin Proteins 0.000 claims 2
- 241000713772 Human immunodeficiency virus 1 Species 0.000 claims 2
- 241000713340 Human immunodeficiency virus 2 Species 0.000 claims 2
- 102000005348 Neuraminidase Human genes 0.000 claims 2
- 108010006232 Neuraminidase Proteins 0.000 claims 2
- 101710093908 Outer capsid protein VP4 Proteins 0.000 claims 2
- 101710135467 Outer capsid protein sigma-1 Proteins 0.000 claims 2
- 101710176177 Protein A56 Proteins 0.000 claims 2
- 108091030071 RNAI Proteins 0.000 claims 2
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 claims 2
- 230000009368 gene silencing by RNA Effects 0.000 claims 2
- 239000000185 hemagglutinin Substances 0.000 claims 2
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 claims 2
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 claims 2
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims 2
- 210000000130 stem cell Anatomy 0.000 claims 2
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 claims 1
- 241000711950 Filoviridae Species 0.000 claims 1
- 108010037155 HIV-1 reverse transcriptase (395-404) Proteins 0.000 claims 1
- XQFRJNBWHJMXHO-RRKCRQDMSA-N IDUR Chemical compound C1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C(I)=C1 XQFRJNBWHJMXHO-RRKCRQDMSA-N 0.000 claims 1
- 108020004684 Internal Ribosome Entry Sites Proteins 0.000 claims 1
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims 1
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 claims 1
- 108091008874 T cell receptors Proteins 0.000 claims 1
- 102000016266 T-Cell Antigen Receptors Human genes 0.000 claims 1
- 108020005038 Terminator Codon Proteins 0.000 claims 1
- 102000006601 Thymidine Kinase Human genes 0.000 claims 1
- 108020004440 Thymidine kinase Proteins 0.000 claims 1
- 229960004150 aciclovir Drugs 0.000 claims 1
- MKUXAQIIEYXACX-UHFFFAOYSA-N aciclovir Chemical compound N1C(N)=NC(=O)C2=C1N(COCCO)C=N2 MKUXAQIIEYXACX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 claims 1
- 239000013043 chemical agent Substances 0.000 claims 1
- 230000004186 co-expression Effects 0.000 claims 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims 1
- 239000000824 cytostatic agent Substances 0.000 claims 1
- 230000001085 cytostatic effect Effects 0.000 claims 1
- 210000002889 endothelial cell Anatomy 0.000 claims 1
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims 1
- 230000005714 functional activity Effects 0.000 claims 1
- 229960002963 ganciclovir Drugs 0.000 claims 1
- IRSCQMHQWWYFCW-UHFFFAOYSA-N ganciclovir Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2COC(CO)CO IRSCQMHQWWYFCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 208000024908 graft versus host disease Diseases 0.000 claims 1
- 238000001802 infusion Methods 0.000 claims 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 claims 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims 1
- 210000005105 peripheral blood lymphocyte Anatomy 0.000 claims 1
- 230000000861 pro-apoptotic effect Effects 0.000 claims 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 claims 1
- 241000894007 species Species 0.000 claims 1
- 230000008685 targeting Effects 0.000 claims 1
- 241000712461 unidentified influenza virus Species 0.000 claims 1
Landscapes
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Claims (44)
1. Лентивирусная хелперная плазмида, включающая в себя
а) лентивирусную 5'LTR, содержащую функциональный нативный промотор, функционально присоединенный к полинуклеотидной последовательности, кодирующей лентивирусные gag и pol, и гетерологичному полиА-сигналу, который является эффективным для терминации транскрипции, управляемой указанным нативным промотором;
b) гетерологичный промотор, функционально присоединенный к последовательности, кодирующей оболочку, и гетерологичному полиА-сигналу, который является эффективным для терминации транскрипции, управляемой указанным гетерологичным промотором,
в которой указанные нативный и гетерологичный промоторы присутствуют в указанной плазмиде в противоположных транскрипционных ориентациях, и указанная плазмида не имеет функциональной упаковочной последовательности.
2. Лентивирусная хелперная плазмида по п.1, которая включает в себя TAR-элемент, который получен от других, в отличие от 5'LTR, видов лентивируса, и включает в себя RRE-элемент, который получен от других, в отличие от 5'LTR, видов лентивируса.
3. Лентивирусная хелперная плазмида по п.1, в которой указанная 5'LTR является нативной.
4. Лентивирусная хелперная плазмида по п.1, которая дополнительно включает в себя экспрессируемую полинуклеотидную последовательность, кодирующую Tat-полипептид или Rev-полипептид, который функционально присоединен к промотору.
5. Лентивирусная хелперная плазмида по п.1, в которой указанная 5'LTR представляет собой ВИЧ-1 или ВИЧ-2.
6. Лентивирусная хелперная плазмида по п.1, в которой указанная полинуклеотидная последовательность, кодирующая лентивирусные gag и pol, представляет собой gag и pol ВИЧ-1 или gag и pol ВИЧ-2.
7. Лентивирусная хелперная плазмида по п.1, в которой полинуклеотидная последовательность, кодирующая gag и pol, включает в себя по меньшей мере один не встречающийся в природе кодон для улучшения трансляции указанной кодирующей последовательности при экспрессии в совместимом хозяине.
8. Лентивирусная хелперная плазмида по п.1, в которой полинуклеотидная последовательность находится между последовательностью pol и кодирующей оболочку последовательностью, которая представляет собой терминирующий кодон или р7 KETWETWWTE кодирующую последовательность.
9. Лентивирусная хелперная плазмида по п.1, в которой указанная кодирующая оболочку последовательность кодирует оболочку VSV-G или оболочку филовируса.
10. Лентивирусная хелперная плазмида по п.1, которая дополнительно включает в себя антисмысловой полинуклеотид, который является эффективным для ингибирования трансляции указанной кодирующей оболочку последовательности.
11. Лентивирусный вектор переноса, включающий в себя
а) лентивирусную 5'LTR;
b) лентивирусную упаковочную последовательность, расположенную на расстоянии от указанной 5'LTR;
с) модифицированную лентивирусную 3'LTR, которая включает в себя бокс-последовательность ТАТА, но не содержит 3' U3 последовательностей 5' для указанных бокс-последовательностей ТАТА, в которой указанная 3'LTR обладает сниженной транскрипционной активностью.
12. Лентивирусный вектор переноса по п.11, дополнительно включающий в себя d) гетерологичный промотор, функционально присоединенный к гетерологичной полинуклеотидной последовательности.
13. Лентивирусный вектор переноса по п.11, в котором отсутствующие 3' U3 последовательности являются 5' с точностью до 20 нуклеотидов в бокс-последовательностях ТАТА.
14. Лентивирусный вектор переноса по п.11, в котором 3'LTR дополнительно включает в себя второй гетерологичный промотор, функционально присоединенный ко второй гетерологичной полинуклеотидной последовательности, где указанный промотор и гетерологичная полинуклеотидная последовательность инсерцированы в 3'LTR в положении, которое является эффективным для снижения транскрипционной активности указанной 3'LTR.
15. Лентивирусный вектор переноса по п.11, дополнительно включающий в себя второй гетерологичный промотор, функционально присоединенный к гетерологичной последовательности, кодирующей второй интересующий ген.
16. Лентивирусный вектор переноса по п.15, в котором указанные первая и вторая гетерологичные кодирующие последовательности разделены внутренним сайтом входа рибосом.
17. Лентивирусный вектор переноса по п.15, в котором каждая из указанных гетерологичных кодирующих последовательностей дополнительно включает в себя гетерологичный полиА-сигнал, который является эффективным для терминации транскрипции, управляемой указанными промоторами.
18. Лентивирусная упаковочная система для получения лентивирусного трансдуцирующего вектора, включающая в себя
а) лентивирусную хелперную плазмиду по п.1,
b) лентивирусный вектор переноса по п.11, и
с) плазмиду, включающую в себя кодирующую rev-полипептид последовательность, функционально присоединенную к гетерологичному промотору, и кодирующую tat-полипептид последовательность, функционально присоединенную к гетерологичному промотору.
19. Изолированная клетка, содержащая хелперный вектор по п.1.
20. Изолированная клетка, содержащая вектор переноса по п.11.
21. Изолированная клетка, содержащая лентивирусную упаковочную систему по п.18.
22. Способ получения лентивирусного трансдуцирующего вектора, включающий в себя
совместную экспрессию плазмид, включающих в себя упаковочную систему по п.18, в клетке-хозяине в условиях, эффективных для продукции трансдуцирующего вектора.
23. Способ производства представляющего интерес полипептида в клетке-хозяине, включающий в себя трансдукцию клетки-хозяина лентивирусным трансдуцирующим вектором с получением трансдуцированной клетки-хозяина, где указанный вектор включает в себя экспрессируемый гетерологичный полинуклеотид, кодирующий секретируемый гетерологичный полипептид, представляющий интерес.
24. Способ по п.23, в котором указанная клетка-хозяин представляет собой клетку СНО или 293.
25. Способ по п.23, дополнительно включающий в себя культивирование указанной трансдуцированной клетки-хозяина в условиях, эффективных для продукции указанного представляющего интерес полипептида.
26. Способ по п.23, в котором указанную клетку-хозяина трансдуцируют множеством лентивирусных трансдуцирующих векторов, в котором каждый вектор включает в себя отличающийся от других гетерологичный полинуклеотид, кодирующий отличающийся от других полипептид.
27. Способ по п.26, в котором каждый из указанных гетерологичных полинуклеотидов кодирует по меньшей мере один капсидный полипептид вирусного капсида, который при экспрессии в указанной клетке-хозяине осуществляет самосборку в указанный вирусный капсид.
28. Способ по п.27, в котором по меньшей мере один полинуклеотид кодирует полипептид гемагглютинина или нейраминидазы вируса гриппа.
29. Способ по п.23, в котором указанную клетку-хозяина трансдуцируют полинуклеотидами, кодирующими полипептиды гемагглютинина, нейраминидазы и матрикса (М1).
30. Способ по п.29, в котором каждый полинуклеотид присутствует в отдельном вирусном трансдуцирующем векторе.
31. Продукт, полученный способом по п.29.
32. Способ идентификации полипептидов или генов, которые улучшают производство полипептидов в клетках-хозяевах, включающий в себя получение множества трансдуцированных клеток-хозяев, каждая из которых трансдуцирована по меньшей мере двумя различными лентивирусными трансдуцирующими векторами, включающими в себя экспрессируемые полинуклеотиды, которые отличаются друг от друга своей последовательностью, и скрининг указанных клеток-хозяев на предмет функциональной активности, связанной с гетерологичной последовательностью.
33. Способ по п.32, в котором указанная гетерологичная последовательность представляет собой РНКи-последовательность, кодирующую полипептид последовательность или антисмысловую последовательность для представляющего интерес гена.
34. Способ лечения реакции «трансплантат против хозяина» (GVHD), связанной с трансплантацией донорских лимфоцитов хозяину, включающий в себя трансдукцию донорских лимфоцитов лентивирусным трансдуцирующим вектором, включающим в себя экспрессируемую или селективно экспрессируемую полинуклеотидную последовательность, которая кодирует цитостатический или цитотоксический элемент, необязательно, трансдукцию клеток в присутствии полипептидов или клеток реципиента, и инфузию указанных трансдуцированных лимфоцитов указанному хозяину.
35. Способ по п.34, в котором указанный селективно экспрессируемый ген функционкально присоединен к индуцибельному промотору или промотору, который активируется в присутствии экзогенно вводимого химического агента.
36. Способ по п.34, в котором указанный селективно экспрессируемый ген кодирует РНКи или проапоптотический полипептид.
37. Способ по п.34, в котором указанный цитотоксический элемент представляет собой последовательность, кодирующую тимидин-киназу герпеса или ген мультисубстратной киназы.
38. Способ по п.37, дополнительно включающий в себя введение эффективного количества ганцикловира, AZT, flurada® или ацикловира, в котором указанное количество является эффективным для того, чтобы привести указанную трансдуцированную клетку-хозяина к гибели.
39. Способ по п.34, дополнительно включающий в себя контактирование указанных донорских клеток с эффективным количеством аутоантигена хозяина одновременно с трансдукцией или до трансдукции указанных донорских клеток.
40. Экспрессирующий вектор, включающий в себя
а) лентивирусную 5'LTR, содержащую функциональный нативный промотор, функционально присоединенный к полинуклеотидной последовательности, кодирующей нативные лентивирусные gag и pol, и гетерологичному полиА-сигналу, который является эффективным для терминации транскрипции, управляемой указанным нативным промотором, где сигнал терминации трансляции находится ниже по отношению к началу gag-pol-последовательности, b) акцепторный сайт сплайсинга, расположенный ниже по отношению к gag-pol-последовательностям, и с) гетерологичную полинуклеотидную последовательность, расположенную ниже по отношению к gag-pol-последовательности, которая функционально присоединена к промотору 5'LTR.
41. Лентивирусный трансдуцирующий вектор, включающий в себя рецептор Т-клеток и цитотоксический элемент.
42. Упаковывающая лентивирусный вектор или продуцирующая клеточная линия, которая экспрессирует ингибирующую индуцибельный ген или молчащую последовательность, имеющую своей мишенью VSV-G.
43. Способ трансдукции популяции лимфоцитов периферической крови лентивирусным вектором, в котором популяция лимфоцитов не очищена до субпопуляций перед трансдукцией лентивирусным вектором.
44. Способ лечения рака с использованием лентивирусных векторов, в котором стволовые клетки обрабатывают лентивирусным вектором, экспрессирующим цитотоксический элемент, который функционально присоединен к промотору, специфичному для эндотелиальных клеток, и в котором производят инфузию стволовых клеток пациенту.
Applications Claiming Priority (7)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US65338605P | 2005-02-16 | 2005-02-16 | |
| US60/653,386 | 2005-02-16 | ||
| US66031005P | 2005-03-10 | 2005-03-10 | |
| US60/660,310 | 2005-03-10 | ||
| US60/682,059 | 2005-05-18 | ||
| US72376805P | 2005-10-05 | 2005-10-05 | |
| US60/723,768 | 2005-10-05 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2007134371A true RU2007134371A (ru) | 2009-03-27 |
Family
ID=40542248
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2007134371/13A RU2007134371A (ru) | 2005-02-16 | 2006-02-16 | Лентивирусные векторы и их применение |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| RU (1) | RU2007134371A (ru) |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EA032403B1 (ru) * | 2009-07-24 | 2019-05-31 | Иммьюн Дизайн Корп. | Лентивирусные векторы, псевдотипированные гликопротеином оболочки вируса синдбис |
-
2006
- 2006-02-16 RU RU2007134371/13A patent/RU2007134371A/ru unknown
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EA032403B1 (ru) * | 2009-07-24 | 2019-05-31 | Иммьюн Дизайн Корп. | Лентивирусные векторы, псевдотипированные гликопротеином оболочки вируса синдбис |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP2008538174A5 (ru) | ||
| AU757284B2 (en) | Anti-viral vectors | |
| ES2618508T3 (es) | Células que comprenden partículas lentivíricas con codones optimizados | |
| JP2022091989A (ja) | ウイルスベクター産生系 | |
| Ciminale et al. | Expression and characterization of proteins produced by mRNAs spliced into the X region of the human T-cell leukemia/lymphotropic virus type II | |
| CA2456169A1 (en) | Methods and compositions relating to improved lentiviral vector production systems | |
| Brinzevich et al. | HIV-1 interacts with human endogenous retrovirus K (HML-2) envelopes derived from human primary lymphocytes | |
| AU2018336042A1 (en) | Retroviral vectors | |
| WO1993011230A1 (en) | Modified mammalian stem cell blocking viral replication | |
| Langley et al. | Nucleotide sequence analysis of puma lentivirus (PLV-14): genomic organization and relationship to other lentiviruses | |
| Negre et al. | Lentiviral vectors derived from simian immunodeficiency virus | |
| Vahlenkamp et al. | A single amino acid substitution in the transmembrane envelope glycoprotein of feline immunodeficiency virus alters cellular tropism | |
| Pérot et al. | From viruses to genes: syncytins | |
| US7803582B2 (en) | Recombinant vector and use in gene therapy | |
| Mautino et al. | Inhibition of HIV-1 replication by novel lentiviral vectors expressing transdominant Rev and HIV-1 env antisense | |
| Bibollet-Ruche et al. | Genetic diversity of simian immunodeficiency viruses from West African green monkeys: evidence of multiple genotypes within populations from the same geographical locale | |
| RU2007134371A (ru) | Лентивирусные векторы и их применение | |
| US20240401077A1 (en) | Koala retrovirus envelope gylcoproteins and uses thereof | |
| Spirin et al. | Lentiviral vectors | |
| Gilbert et al. | HIV-2 and SIV vector systems | |
| CN102329776A (zh) | 一种表达Nectin-1基因胞外区片段的PK-15细胞系及其构建方法 | |
| EP1880006B1 (en) | Primate t-lymphotropic viruses | |
| Derse et al. | Transcriptional regulation of equine infectious anemia virus | |
| US11965173B2 (en) | Plasmid system | |
| WO2015053398A1 (ja) | 高力価レトロウイルスベクター |