RU2006134341A - Комплексы нуклеиновых кислот - Google Patents
Комплексы нуклеиновых кислот Download PDFInfo
- Publication number
- RU2006134341A RU2006134341A RU2006134341/13A RU2006134341A RU2006134341A RU 2006134341 A RU2006134341 A RU 2006134341A RU 2006134341/13 A RU2006134341/13 A RU 2006134341/13A RU 2006134341 A RU2006134341 A RU 2006134341A RU 2006134341 A RU2006134341 A RU 2006134341A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- nucleic acid
- molecules
- molecule
- nucleotides
- length
- Prior art date
Links
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 title claims abstract 133
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 title claims abstract 133
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 title claims abstract 133
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims abstract 26
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims abstract 21
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims abstract 21
- 230000005855 radiation Effects 0.000 claims abstract 4
- ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N ethidium bromide Chemical compound [Br-].C12=CC(N)=CC=C2C2=CC=C(N)C=C2[N+](CC)=C1C1=CC=CC=C1 ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 3
- 229960005542 ethidium bromide Drugs 0.000 claims abstract 3
- 238000010186 staining Methods 0.000 claims abstract 3
- 238000000034 method Methods 0.000 claims 32
- 239000003125 aqueous solvent Substances 0.000 claims 20
- 230000003196 chaotropic effect Effects 0.000 claims 17
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 claims 14
- LRHPLDYGYMQRHN-UHFFFAOYSA-N N-Butanol Chemical group CCCCO LRHPLDYGYMQRHN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 12
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 claims 12
- PAYRUJLWNCNPSJ-UHFFFAOYSA-N Aniline Chemical compound NC1=CC=CC=C1 PAYRUJLWNCNPSJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 11
- KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 7H-purine Chemical compound N1=CNC2=NC=NC2=C1 KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 8
- JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N Pyridine Chemical compound C1=CC=NC=C1 JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 8
- UMGDCJDMYOKAJW-UHFFFAOYSA-N thiourea Chemical compound NC(N)=S UMGDCJDMYOKAJW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 8
- MSXVEPNJUHWQHW-UHFFFAOYSA-N 2-methylbutan-2-ol Chemical compound CCC(C)(C)O MSXVEPNJUHWQHW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 6
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 claims 6
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 claims 6
- 230000004807 localization Effects 0.000 claims 6
- KLSJWNVTNUYHDU-UHFFFAOYSA-N Amitrole Chemical compound NC1=NC=NN1 KLSJWNVTNUYHDU-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- JOYRKODLDBILNP-UHFFFAOYSA-N Ethyl urethane Chemical compound CCOC(N)=O JOYRKODLDBILNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- PDQAZBWRQCGBEV-UHFFFAOYSA-N Ethylenethiourea Chemical compound S=C1NCCN1 PDQAZBWRQCGBEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Natural products NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- HTKFORQRBXIQHD-UHFFFAOYSA-N allylthiourea Chemical compound NC(=S)NCC=C HTKFORQRBXIQHD-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- 229960001748 allylthiourea Drugs 0.000 claims 4
- DNSISZSEWVHGLH-UHFFFAOYSA-N butanamide Chemical compound CCCC(N)=O DNSISZSEWVHGLH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- HPXRVTGHNJAIIH-UHFFFAOYSA-N cyclohexanol Chemical compound OC1CCCCC1 HPXRVTGHNJAIIH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- QGBSISYHAICWAH-UHFFFAOYSA-N dicyandiamide Chemical compound NC(N)=NC#N QGBSISYHAICWAH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- GTOKAWYXANYGFG-UHFFFAOYSA-N ethyl n-propylcarbamate Chemical compound CCCNC(=O)OCC GTOKAWYXANYGFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- ALBYIUDWACNRRB-UHFFFAOYSA-N hexanamide Chemical compound CCCCCC(N)=O ALBYIUDWACNRRB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- SURZCVYFPAXNGN-UHFFFAOYSA-N methyl-carbamic acid ethyl ester Chemical compound CCOC(=O)NC SURZCVYFPAXNGN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- WVDDGKGOMKODPV-ZQBYOMGUSA-N phenyl(114C)methanol Chemical compound O[14CH2]C1=CC=CC=C1 WVDDGKGOMKODPV-ZQBYOMGUSA-N 0.000 claims 4
- UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N pyridine Natural products COC1=CC=CN=C1 UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- JLEHSYHLHLHPAL-UHFFFAOYSA-N tert-butylurea Chemical compound CC(C)(C)NC(N)=O JLEHSYHLHLHPAL-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- YUKQRDCYNOVPGJ-UHFFFAOYSA-N thioacetamide Chemical compound CC(N)=S YUKQRDCYNOVPGJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- DLFVBJFMPXGRIB-UHFFFAOYSA-N thioacetamide Natural products CC(N)=O DLFVBJFMPXGRIB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N toluene-4-sulfonic acid Chemical compound CC1=CC=C(S(O)(=O)=O)C=C1 JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- -1 δ-valarolactam Chemical compound 0.000 claims 4
- 125000002490 anilino group Chemical group [H]N(*)C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 claims 3
- 239000002904 solvent Substances 0.000 claims 3
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims 2
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 claims 2
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 claims 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims 1
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 claims 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6816—Hybridisation assays characterised by the detection means
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6839—Triple helix formation or other higher order conformations in hybridisation assays
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
- C12Q1/701—Specific hybridization probes
- C12Q1/706—Specific hybridization probes for hepatitis
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Immunology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Virology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
1. Комплекс нуклеиновых кислот, содержащий определенное количество первой нуклеиновой кислоты, определенное количество второй нуклеиновой кислоты и определенное количество третьей нуклеиновой кислоты, где каждая молекула первой нуклеиновой кислоты, комплементарная каждой молекуле второй нуклеиновой кислоты, содержит последовательность, комплементарную участку каждой молекулы третьей нуклеиновой кислоты, число молекул первой нуклеиновой кислоты и число молекул второй нуклеиновой кислоты в 1-10раз превышает число молекул третьей нуклеиновой кислоты, первая нуклеиновая кислота, вторая нуклеиновая кислота и третья нуклеиновая кислота подвергаются поперечной сшивке с образованием комплекса нуклеиновых кислот, который при возбуждении длиной волны 518 нм после окрашивания бромидом этидия испускает флуоресцентное излучение при 605 нм с интенсивностью, превышающей, по меньшей мере, в 10 раз интенсивность излучения, испускаемого первой, второй и третьей нуклеиновыми кислотами, не подвергавшимися поперечной сшивке.2. Комплекс нуклеиновых кислот по п.1, где число молекул первой нуклеиновой кислоты и число молекул второй нуклеиновой кислоты в 10-10раз превышает число молекул третьей нуклеиновой кислоты.3. Комплекс нуклеиновых кислот по п.2, где длина молекул первой и второй нуклеиновых кислот составляет от 100 до 20000 нуклеотидов.4. Комплекс нуклеиновых кислот по п.3, где длина молекул первой и второй нуклеиновых кислот составляет от 200 до 8000 нуклеотидов.5. Комплекс нуклеиновых кислот по п.4, где длина комплементарной последовательности составляет от 10 до 20000 нуклеотидов.6. Комплекс нуклеиновых кислот по п.5, где длина комп
Claims (53)
1. Комплекс нуклеиновых кислот, содержащий определенное количество первой нуклеиновой кислоты, определенное количество второй нуклеиновой кислоты и определенное количество третьей нуклеиновой кислоты, где каждая молекула первой нуклеиновой кислоты, комплементарная каждой молекуле второй нуклеиновой кислоты, содержит последовательность, комплементарную участку каждой молекулы третьей нуклеиновой кислоты, число молекул первой нуклеиновой кислоты и число молекул второй нуклеиновой кислоты в 1-1012 раз превышает число молекул третьей нуклеиновой кислоты, первая нуклеиновая кислота, вторая нуклеиновая кислота и третья нуклеиновая кислота подвергаются поперечной сшивке с образованием комплекса нуклеиновых кислот, который при возбуждении длиной волны 518 нм после окрашивания бромидом этидия испускает флуоресцентное излучение при 605 нм с интенсивностью, превышающей, по меньшей мере, в 10 раз интенсивность излучения, испускаемого первой, второй и третьей нуклеиновыми кислотами, не подвергавшимися поперечной сшивке.
2. Комплекс нуклеиновых кислот по п.1, где число молекул первой нуклеиновой кислоты и число молекул второй нуклеиновой кислоты в 103-108 раз превышает число молекул третьей нуклеиновой кислоты.
3. Комплекс нуклеиновых кислот по п.2, где длина молекул первой и второй нуклеиновых кислот составляет от 100 до 20000 нуклеотидов.
4. Комплекс нуклеиновых кислот по п.3, где длина молекул первой и второй нуклеиновых кислот составляет от 200 до 8000 нуклеотидов.
5. Комплекс нуклеиновых кислот по п.4, где длина комплементарной последовательности составляет от 10 до 20000 нуклеотидов.
6. Комплекс нуклеиновых кислот по п.5, где длина комплементарной последовательности составляет от 20 до 8000 нуклеотидов.
7. Комплекс нуклеиновых кислот по п.2, где длина комплементарной последовательности составляет от 10 до 20000 нуклеотидов.
8. Комплекс нуклеиновых кислот по п.7, где длина комплементарной последовательности составляет от 20 до 8000 нуклеотидов.
9. Комплекс нуклеиновых кислот по п.3, где длина комплементарной последовательности составляет от 10 до 20000 нуклеотидов.
10. Комплекс нуклеиновых кислот по п.9, где длина комплементарной последовательности составляет от 20 до 8000 нуклеотидов.
11. Способ детекции целевого участка нуклеиновой кислоты, предусматривающий
предоставление определенного количества первой нуклеиновой кислоты, определенного количества второй нуклеиновой кислоты и незначительного количества третьей нуклеиновой кислоты, предположительно содержащей целевой участок, где каждая молекула первой нуклеиновой кислоты, комплементарная каждой молекуле второй нуклеиновой кислоты, содержит последовательность, комплементарную целевому участку каждой молекулы третьей нуклеиновой кислоты, число молекул первой нуклеиновой кислоты и число молекул второй нуклеиновой кислоты в 1-1016 раз превышает число молекул третьей нуклеиновой кислоты; денатурацию и локализацию на плоской поверхности первой, второй и третьей нуклеиновых кислот и посредством этого обеспечение образования поперечно сшитого комплекса нуклеиновых кислот, если каждая молекула третьей нуклеиновой кислоты содержит целевой участок; и определение присутствия или отсутствия поперечно сшитого комплекса нуклеиновых кислот.
12. Способ по п.11, где число молекул первой нуклеиновой кислоты и число молекул второй нуклеиновой кислоты в 103-1013 раз превышает число молекул третьей нуклеиновой кислоты.
13. Способ по п.12, где длина молекул первой и второй нуклеиновых кислот составляет от 100 до 20000 нуклеотидов.
14. Способ по п.13, где длина молекул первой и второй нуклеиновых кислот составляет от 200 до 8000 нуклеотидов.
15. Способ по п.14, где длина комплементарной последовательности составляет от 10 до 20000 нуклеотидов.
16. Способ по п.15, где длина комплементарной последовательности составляет от 20 до 8000 нуклеотидов.
17. Способ по п.16, где денатурацию проводят путем смешивания первой, второй и третьей нуклеиновых кислот в хаотропном водном растворителе.
18. Способ по п.17, где локализацию проводят путем добавления гидрофобного органического растворителя к хаотропному водному растворителю, и граница раздела двух растворителей образует плоскую поверхность.
19. Способ по п.18, где гидрофобный органический растворитель представляет собой н-бутиловый спирт, третамиловый спирт, циклогексиловый спирт, фенол, n-метоксифенол, бензиловый спирт, анилин, пиридин, пурин, 3-аминотриазол, бутирамид, гексамид, тиоацетамид, δ-валаролактам, третбутилмочевину, этилентиомочевину, аллилтиомочевину, тиомочевину, уретан, N-пропилуретан, N-метилуретан, цианогуанидин, или их сочетание.
20. Способ по п.19, где гидрофобный органический растворитель представляет собой анилин.
21. Способ по п.18, где хаотропный водный растворитель содержит Mg2+, Ca2+, Na+, K+, NH4 +, Cs+, Li+, (CH3)4N+ или их сочетание.
22. Способ по п.18, где хаотропный водный растворитель содержит тозилат-, Cl3CCOO-, SCN-, Cl04 -, I-, Br-, Cl-, BrO3 -, CH3COO-, HSO3 -, F-, SO4 2-, (CH3)3CCOO-, HPO4 - или их сочетание.
23. Способ по п.22, где хаотропный водный растворитель содержит SCN-.
24. Способ по п.12, где денатурация производится путем смешивания первой, второй и третей нуклеиновых кислот в хаотропном водном растворителе.
25. Способ по п.24, где локализация производится путем добавления гидрофобного органического растворителя к хаотропному водному растворителю, при этом граница раздела двух растворителей образует плоскую поверхность.
26. Способ по п.25, где обнаружение производится путем определения интенсивности флюоресценции, испускаемой поперечно сшитым комплексом нуклеиновых кислот после того, как его окрашивают флюоресцентным красителем, интеркалирующим двухцепочечную ДНК.
27. Комплекс нуклеиновых кислот, полученный способом, предусматривающим предоставление определенного количества молекул первой нуклеиновой кислоты, определенного количества молекул второй нуклеиновой кислоты и незначительного количества молекул третьей нуклеиновой кислоты, где каждая молекула первой нуклеиновой кислоты, комплементарная каждой молекуле второй нуклеиновой кислоты, содержит последовательность, комплементарную участку каждой молекулы третьей нуклеиновой кислоты, число молекул первой нуклеиновой кислоты и число молекул второй нуклеиновой кислоты превышает число молекул третьей нуклеиновой кислоты в 1-1016 раз; денатурацию и локализацию на плоской поверхности молекул первой, второй и третьей нуклеиновых кислот, таким образом способствуя образованию поперечно сшитого комплекса нуклеиновых кислот, который при возбуждении при 518 нм после окрашивания бромидом этидия испускает флуоресцентное излучение при 605 нм с интенсивностью, превышающей, по меньшей мере, в 10 раз интенсивность излучения, испускаемого первой, второй и третьей нуклеиновыми кислотами, не подвергшимися поперечной сшивке.
28. Комплекс нуклеиновых кислот, полученный способом по п.27, где число молекул первой нуклеиновой кислоты и число молекул второй нуклеиновой кислоты превышает число молекул третьей нуклеиновой кислоты в 103-1013 раз.
29. Комплекс нуклеиновых кислот, полученный способом по п.28, где денатурация производится путем помещения молекул первой, второй и третьей нуклеиновых кислот в хаотропный водный растворитель.
30. Комплекс нуклеиновых кислот, полученный способом по п.29, где локализация производится путем добавления гидрофобного органического растворителя к хаотропному водному растворителю, при этом граница раздела двух растворителей образует плоскую поверхность.
31. Комплекс нуклеиновых кислот, полученный способом по п.30, дополнительно предусматривающий выделение поперечно сшитого комплекса нуклеиновых кислот из смеси водного растворителя и гидрофобного органического растворителя.
32. Комплекс нуклеиновых кислот, полученный способом по п.30, где гидрофобный органический растворитель представляет собой н-бутиловый спирт, третамиловый спирт, циклогексиловый спирт, фенол, n-метоксифенол, бензиловый спирт, анилин, пиридин, пурин, 3-аминотриазол, бутирамид, гексамид, тиоацетамид, δ-валаролактам, третбутилмочевину, этилентиомочевину, аллилтиомочевину, тиомочевину, уретан, N-пропилуретан, N-метилуретан, цианогуанидин или их сочетание.
33. Комплекс нуклеиновых кислот, полученный способом по п.32, где гидрофобный органический растворитель представляет собой анилин.
34. Комплекс нуклеиновых кислот, полученный способом по п.30, где хаотропный водный растворитель содержит Mg2+, Ca2+, Na+, K+, NH4 +, Cs+, Li+, (CH3)4N+ или их сочетание.
35. Комплекс нуклеиновых кислот, полученный способом по п.30, где хаотропный водный растворитель содержит тозилат-, Cl3CCOO-, SCN-, Cl04 -, I-, Br-, Cl-, BrO3 -,CH3COO-, HSO 3 -, F-, SO4 2-, (CH3)3CCOO-, HPO4 - или их сочетание.
36. Комплекс нуклеиновых кислот, полученный способом по п.35, где хаотропный водный растворитель содержит SCN-.
37. Комплекс нуклеиновых кислот, полученный способом по п.30, где длина молекул первой и второй нуклеиновых кислот составляет от 100 до 20000 нуклеотидов.
38. Комплекс нуклеиновых кислот, полученный способом по п.37, где длина молекул первой и второй нуклеиновых кислот составляет от 200 до 8000 нуклеотидов..
39. Комплекс нуклеиновых кислот, полученный способом по п.38, где длина комплементарной последовательности составляет от 10 до 20000 нуклеотидов.
40. Комплекс нуклеиновых кислот, полученный способом по п.39, где длина комплементарной последовательности составляет от 20 до 8000 нуклеотидов.
41. Комплекс нуклеиновых кислот, полученный способом по п.37, где длина комплементарной последовательности составляет от 10 до 20000 нуклеотидов.
42. Комплекс нуклеиновых кислот, полученный способом по п.41, где длина комплементарной последовательности составляет от 20 до 8000 нуклеотидов.
43. Многофазная система, содержащая гидрофобный органический растворитель и хаотропный водный растворитель, разделенные на две фазы, определенное количество молекул нуклеиновых кислот на поверхности раздела между органическим и водным растворителем, где органический и водный растворители способствуют денатурации и локализации молекул нуклеиновых кислот.
44. Многофазная система по п.43, где гидрофобный органический растворитель представляет собой н-бутиловый спирт, третамиловый спирт, циклогексиловый спирт, фенол, n-метоксифенол, бензиловый спирт, анилин, пиридин, пурин, 3-аминотриазол, бутирамид, гексамид, тиоацетамид, δ-валаролактам, третбутилмочевину, этилентиомочевину, аллилтиомочевину, тиомочевину, уретан, N-пропилуретан, N-метилуретан, цианогуанидин или их сочетание
45. Многофазная система по п.44, где гидрофобный органический растворитель представляет собой анилин.
46. Многофазная система по п.43, где хаотропный водный растворитель содержит Mg2+, Ca2+, Na+, K+, NH4 +, Cs+, Li+, (CH3)4N+ или их сочетание.
47. Многофазная система по п.43, где хаотропный водный растворитель содержит тозилат-, Cl3CCOO-, SCN-, Cl04 -, I-, Br-, Cl-, BrO3 -, CH3COO-, HSO3 -, F-, SO4 2-, (CH3)3CCOO-, HPO4 - или их сочетание.
48. Многофазная система по п.47, где хаотропный водный растворитель содержит SCN-.
49. Многофазная система по п.43, где гидрофобный органический растворитель представляет собой н-бутиловый спирт, третамиловый спирт, циклогексиловый спирт, фенол, n-метоксифенол, бензиловый спирт, анилин, пиридин, пурин, 3-аминотриазол, бутирамид, гексамид, тиоацетамид, δ-валаролактам, третбутилмочевину, этилентиомочевину, аллилтиомочевину, тиомочевину, уретан, N-пропилуретан, N-метилуретан, цианогуанидин или их сочетание.; и хаотропный водный растворитель содержит тозилат-, Cl3CCOO-, SCN-, Cl04 -, I-, Br-, Cl-, BrO3 -,CH3COO-, HSO3 -, F-, SO4 2-, (CH3)3CCOO-, HPO4 - или их сочетание.
50. Многофазная система по п.43, где нуклеиновые кислоты включают определенное количество молекул первой нуклеиновой кислоты и определенное количество молекул второй нуклеиновой кислоты, где каждая молекула первой нуклеиновой кислоты комплементарна каждой молекуле второй нуклеиновой кислоты.
51. Многофазная система по п.43, где нуклеиновые кислоты включают определенное количество молекул третьей нуклеиновой кислоты из образца, и каждая молекула третьей нуклеиновой кислоты содержит участок, комплементарный последовательности каждой молекулы первой нуклеиновой кислоты.
52. Многофазная система по п.50, дополнительно содержащая определенное количество молекул третьей нуклеиновой кислоты из образца, каждая молекула третьей нуклеиновой кислоты содержит участок, комплементарный последовательности каждой молекулы первой нуклеиновой кислоты.
53. Многофазная система по п.49, где нуклеиновые кислоты включают определенное количество молекул первой нуклеиновой кислоты, определенное количество молекул второй нуклеиновой кислоты, определенное количество молекул третьей нуклеиновой кислоты из образца, где каждая молекула первой нуклеиновой кислоты комплементарна каждой молекуле второй нуклеиновой кислоты и содержит последовательность, комплементарную участку каждой молекулы третьей нуклеиновой кислоты.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US54896304P | 2004-02-28 | 2004-02-28 | |
| US60/548,963 | 2004-02-28 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2006134341A true RU2006134341A (ru) | 2008-04-10 |
Family
ID=34919422
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2006134341/13A RU2006134341A (ru) | 2004-02-28 | 2005-02-28 | Комплексы нуклеиновых кислот |
Country Status (11)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US20050260624A1 (ru) |
| EP (1) | EP1730305A2 (ru) |
| JP (1) | JP2007525224A (ru) |
| CN (1) | CN1965090A (ru) |
| AU (1) | AU2005218507A1 (ru) |
| BR (1) | BRPI0508100A (ru) |
| CA (1) | CA2557661A1 (ru) |
| RU (1) | RU2006134341A (ru) |
| TW (1) | TW200533751A (ru) |
| WO (1) | WO2005084272A2 (ru) |
| ZA (1) | ZA200607117B (ru) |
Families Citing this family (14)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US7078224B1 (en) * | 1999-05-14 | 2006-07-18 | Promega Corporation | Cell concentration and lysate clearance using paramagnetic particles |
| WO2007070381A2 (en) | 2005-12-09 | 2007-06-21 | Promega Corporation | Nucleic acid purification with a binding matrix |
| WO2007103485A2 (en) * | 2006-03-08 | 2007-09-13 | Promega Corporation | Small rna purification |
| US8039613B2 (en) | 2009-08-28 | 2011-10-18 | Promega Corporation | Methods of purifying a nucleic acid and formulation and kit for use in performing such methods |
| US8222397B2 (en) | 2009-08-28 | 2012-07-17 | Promega Corporation | Methods of optimal purification of nucleic acids and kit for use in performing such methods |
| EP2976425B1 (en) * | 2013-03-18 | 2019-11-06 | Qiagen GmbH | Stabilization and isolation of extracellular nucleic acids |
| AU2014362322B2 (en) | 2013-12-11 | 2021-05-27 | The Regents For Of The University Of California | Methods for labeling DNA fragments to recontruct physical linkage and phase |
| EP3174980A4 (en) | 2014-08-01 | 2018-01-17 | Dovetail Genomics, LLC | Tagging nucleic acids for sequence assembly |
| CN107533590B (zh) | 2015-02-17 | 2021-10-26 | 多弗泰尔基因组学有限责任公司 | 核酸序列装配 |
| US11807896B2 (en) | 2015-03-26 | 2023-11-07 | Dovetail Genomics, Llc | Physical linkage preservation in DNA storage |
| SG11201803289VA (en) | 2015-10-19 | 2018-05-30 | Dovetail Genomics Llc | Methods for genome assembly, haplotype phasing, and target independent nucleic acid detection |
| AU2017223600B2 (en) | 2016-02-23 | 2023-08-03 | Dovetail Genomics Llc | Generation of phased read-sets for genome assembly and haplotype phasing |
| JP7497976B2 (ja) | 2016-05-13 | 2024-06-11 | ダブテイル ゲノミクス エルエルシー | 保存されたサンプルからの長距離連鎖情報の回復 |
| CN107058297B (zh) * | 2017-06-05 | 2018-01-16 | 陈礼平 | 一种离液剂以及使用该离液剂提取基因组dna的方法 |
Family Cites Families (12)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5118605A (en) * | 1984-10-16 | 1992-06-02 | Chiron Corporation | Polynucleotide determination with selectable cleavage sites |
| US5763162A (en) * | 1990-03-14 | 1998-06-09 | The Regents Of University Of California | Multichromophore fluorescent DNA intercalation complexes |
| US5223414A (en) * | 1990-05-07 | 1993-06-29 | Sri International | Process for nucleic acid hybridization and amplification |
| US5455166A (en) * | 1991-01-31 | 1995-10-03 | Becton, Dickinson And Company | Strand displacement amplification |
| DE69535240T2 (de) * | 1994-10-28 | 2007-06-06 | Gen-Probe Inc., San Diego | Zusammensetzungen und Verfahren für die gleichzeitige Detektion und Quantifizierung von einer Mehrheit spezifischer Nuklein Säure Sequenzen |
| ATE272720T1 (de) * | 1996-08-29 | 2004-08-15 | Napro Biotherapeutics Inc | Verfahren zum auffinden, nachweisen, anreichern und/oder isolieren von ziel-nucleinsäuresequenzen unter verwendung von von reca ähnlicher rekombinase |
| JP2001506124A (ja) * | 1996-12-26 | 2001-05-15 | ダイキン工業株式会社 | ＲｅｃＡ様組換え酵素を用いる標的核酸配列のターゲティング、濃縮、検出、および／または単離の方法 |
| US6255469B1 (en) * | 1998-05-06 | 2001-07-03 | New York University | Periodic two and three dimensional nucleic acid structures |
| US6900300B1 (en) * | 2000-09-19 | 2005-05-31 | Ingeneus Corporation | Quadruplex DNA and duplex probe systems |
| AU4507201A (en) * | 1999-11-24 | 2001-06-18 | Incyte Genomics, Inc. | Normalization controls and duplex probes for hybridization reactions |
| US6927027B2 (en) * | 1999-12-21 | 2005-08-09 | Ingeneus Corporation | Nucleic acid multiplex formation |
| CN1348096A (zh) * | 2000-10-10 | 2002-05-08 | 栾国彦 | 一种均相特异性检测核酸的探针及应用方法 |
-
2005
- 2005-02-28 JP JP2007500805A patent/JP2007525224A/ja active Pending
- 2005-02-28 WO PCT/US2005/006420 patent/WO2005084272A2/en not_active Ceased
- 2005-02-28 CA CA002557661A patent/CA2557661A1/en not_active Abandoned
- 2005-02-28 US US11/069,370 patent/US20050260624A1/en not_active Abandoned
- 2005-02-28 EP EP05724047A patent/EP1730305A2/en not_active Withdrawn
- 2005-02-28 RU RU2006134341/13A patent/RU2006134341A/ru not_active Application Discontinuation
- 2005-02-28 US US11/069,631 patent/US20050260625A1/en not_active Abandoned
- 2005-02-28 BR BRPI0508100-9A patent/BRPI0508100A/pt not_active Application Discontinuation
- 2005-02-28 CN CNA2005800062172A patent/CN1965090A/zh active Pending
- 2005-02-28 AU AU2005218507A patent/AU2005218507A1/en not_active Abandoned
- 2005-03-01 TW TW094106141A patent/TW200533751A/zh unknown
-
2006
- 2006-08-25 ZA ZA200607117A patent/ZA200607117B/xx unknown
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| TW200533751A (en) | 2005-10-16 |
| WO2005084272B1 (en) | 2007-01-25 |
| US20050260624A1 (en) | 2005-11-24 |
| CN1965090A (zh) | 2007-05-16 |
| BRPI0508100A (pt) | 2007-07-17 |
| WO2005084272A2 (en) | 2005-09-15 |
| EP1730305A2 (en) | 2006-12-13 |
| US20050260625A1 (en) | 2005-11-24 |
| CA2557661A1 (en) | 2005-09-15 |
| AU2005218507A1 (en) | 2005-09-15 |
| WO2005084272A3 (en) | 2006-12-14 |
| ZA200607117B (en) | 2008-07-30 |
| JP2007525224A (ja) | 2007-09-06 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2006134341A (ru) | Комплексы нуклеиновых кислот | |
| US6716394B2 (en) | DNA sequencing using multiple fluorescent labels being distinguishable by their decay times | |
| KR102088381B1 (ko) | 압타머-기반 다중 검정법 | |
| US11384391B2 (en) | Flourescene energy transfer-based single molecule/ensemble DNA sequencing by synthesis | |
| WO2016131030A4 (en) | Methods for highly parallel and accurate measurement of nucleic acids | |
| US9598726B2 (en) | Method for enhancing efficiency and sensitivity in nucleic acid amplification from biological materials using ionic liquids | |
| JP6120449B2 (ja) | リンカーを介して結合した標識を含むオリゴヌクレオチド | |
| CN110029151B (zh) | 用于环介导等温扩增反应的添加剂组成物 | |
| US20220195518A1 (en) | Methods and compositions for nucleic acid sequencing | |
| Yu et al. | Facile preparation of non-self-quenching fluorescent DNA strands with the degree of labeling up to the theoretic limit | |
| RU2014133184A (ru) | Секвенирование днк с повторным использованием реагентов на проволочной сетке | |
| JP3970816B2 (ja) | バックグラウンドを下げる蛍光ハイブリダイゼーションプローブ | |
| EP2635553A1 (en) | Stabilization of ozone-labile fluorescent dyes by thiourea | |
| JP5647936B2 (ja) | 修飾ヌクレオチド及びこれを用いたリアルタイムポリメラーゼ反応 | |
| CN106471131B (zh) | 荧光性标记单链核酸及其用途 | |
| Narayanan et al. | Differential fluorescence quenching of fluorescent nucleic acid base analogues by native nucleic acid monophosphates | |
| WO2018089230A1 (en) | Antioxidant compounds for cleave formulations that support long reads in sequencing-by-synthesis | |
| AU2023246851A1 (en) | Compositions and methods for improving sequencing signals | |
| JP2009044967A (ja) | 二本鎖核酸の形成に係る情報を得る方法 | |
| US10519498B2 (en) | Additives to improve sequencing by synthesis performance | |
| Sang et al. | Quantum dots induce hot-start effects for Taq-based polymerase chain reaction | |
| JP6146742B2 (ja) | タンパク質のチオール基の酸化還元状態を検出する方法、並びにそれに用いられる試薬及びキット | |
| US9932633B2 (en) | Methods for assessing RNA quality | |
| JPWO2018008435A1 (ja) | 核酸分析方法 | |
| EP4089098A1 (en) | Fret dye labeled reversible nucleotide terminators and their use in sequencing of dna |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20091001 |
|
| FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20091001 |
|
| FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20091001 |