[go: up one dir, main page]

RU2006125964A - Способ получения l-аминокислот с использованием бактерии семейства enterobacteriaceae - Google Patents

Способ получения l-аминокислот с использованием бактерии семейства enterobacteriaceae Download PDF

Info

Publication number
RU2006125964A
RU2006125964A RU2006125964/13A RU2006125964A RU2006125964A RU 2006125964 A RU2006125964 A RU 2006125964A RU 2006125964/13 A RU2006125964/13 A RU 2006125964/13A RU 2006125964 A RU2006125964 A RU 2006125964A RU 2006125964 A RU2006125964 A RU 2006125964A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
residue
bacterium
alcohol dehydrogenase
seq
amino acid
Prior art date
Application number
RU2006125964/13A
Other languages
English (en)
Inventor
Леонид Романович Птицын (RU)
Леонид Романович Птицын
Ирина Борисовна Альтман (RU)
Ирина Борисовна Альтман
рова Вероника Александровна Котл (RU)
Вероника Александровна КОТЛЯРОВА
Ольга Николаевна Мохова (RU)
Ольга Николаевна Мохова
Тать на Абрамовна Ямпольска (RU)
Татьяна Абрамовна Ямпольская
Юрий Иванович Козлов (RU)
Юрий Иванович Козлов
Original Assignee
Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ) (RU)
Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ)
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ) (RU), Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ) filed Critical Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ) (RU)
Priority to RU2006125964/13A priority Critical patent/RU2006125964A/ru
Priority to BRPI0715584A priority patent/BRPI0715584B8/pt
Priority to CN200780027157.1A priority patent/CN101490251B/zh
Priority to PCT/JP2007/064304 priority patent/WO2008010565A2/en
Priority to CN2012105573975A priority patent/CN103215319A/zh
Priority to EP07768453.8A priority patent/EP2046949B1/en
Priority to JP2009503341A priority patent/JP5407858B2/ja
Publication of RU2006125964A publication Critical patent/RU2006125964A/ru
Priority to US12/354,042 priority patent/US20090203090A1/en
Priority to US14/668,080 priority patent/US20150203881A1/en

Links

Landscapes

  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Claims (48)

1. Мутантная алкогольдегидрогеназа, устойчивая к аэробной инактивации, выбранная из группы, состоящей из
А) белка, включающего аминокислотную последовательность SEQ ID NO:2, исключая белок, содержащий мутацию в позиции 568 в SEQ ID NO:2, и содержащего, по крайней мере, одну дополнительную мутацию, улучшающую рост бактерии в жидкой среде, содержащей этанол в качестве единственного источника углерода, отличающийся тем, что указанная дополнительная мутация находится в позиции, отличной от позиции 267 в SEQ ID NO:2; и
Б) варианта белка А, обладающего активностью алкогольдегидрогеназы.
2. Мутантная алкогольдегидрогеназа по п.1 отличающаяся тем, что указанная дополнительная мутация выбрана из группы, состоящей из
A) замены остатка глутаминовой кислоты в позиции 560 в SEQ ID NO:2 на остаток другой аминокислоты;
Б) замены остатка фенилаланина в позиции 566 в SEQ ID NO:2 на остаток другой аминокислоты;
B) замены остатка глутаминовой кислоты, остатка метионина, остатка изолейцина и остатка аланина в позиции 22, 236, 554 и 786, соответственно, в SEQ ID NO:2 на остатки другой аминокислоты; и
Г) комбинации этих замен.
3. Мутантная алкогольдегидрогеназа по п.1 отличающаяся тем, что указанная дополнительная мутация выбрана из группы, состоящей из
A) замены остатка глутаминовой кислоты в позиции 560 в SEQ ID NO:2 на остаток L-лизина;
Б) замены остатка фенилаланина в позиции 566 в SEQ ID NO:2 на остаток L-валина;
B) замены остатка глутаминовой кислоты, остатка метионина, остатка изолейцина и остатка аланина в позициях 22, 236, 554 и 786 в SEQ ID NO:2 на остаток глицина, валина, серина и валина, соответственно; и
Г) комбинации этих замен.
4. Фрагмент ДНК, кодирующий мутантную алкогольдегидрогеназу по любому из пп.1-3.
5. Бактерия-продуцент L-аминокислоты семейства Enterobacteriaceae, содержащая мутантную алкогольдегидрогеназу по любому из пп.1-3.
6. Бактерия-продуцент L-аминокислоты семейства Enterobacteriaceae, отличающаяся тем, что указанная бактерия модифицирована таким образом, что активность мутантной алкогольдегидрогеназы по любому из пп.1-3 в этой бактерии увеличена.
7. Бактерия по п.6, отличающаяся тем, что активность мутантной алкогольдегидрогеназы увеличена путем усиления экспрессии гена, кодирующего указанную мутантную алкогольдегидрогеназу.
8. Бактерия по п.6, отличающаяся тем, что активность указанной мутантной алкогольдегидрогеназы увеличена путем модификации последовательности, контролирующей экспрессию гена, кодирующего указанную алкогольдегидрогеназу, или путем увеличения количества копий гена, кодирующего указанную алкогольдегидрогеназу.
9. Бактерия по п.5 или 6, отличающаяся тем, что указанная бактерия выбрана из группы, состоящей из Escherichia, Enterobacter, Erwinia, Klebsiella, Pantoea, Providencia, Salmonella, Serratia, Shigella, and Morganella.
10. Бактерия по п.5 или 6, отличающаяся тем, что указанная бактерия является продуцентом L-треонина.
11. Бактерия по п.10, отличающаяся тем, что указанная бактерия дополнительно модифицирована таким образом, что у этой бактерии усилена экспрессия гена, выбранного из группы, состоящей из
мутантного гена thrA, который кодирует аспартокиназа-гомосериндегидрогеназу I, устойчивую к ингибированию треонином по типу обратной связи;
гена thrB, который кодирует гомосеринкиназу;
гена thrC, который кодирует треонинсинтазу;
гена rhtA, который кодирует предпологаемый трансмембранный белок;
гена asd, который кодирует аспартат-β-семиальдегиддегидрогеназу;
гена aspC, который кодирует аспартатаминотрансферазу (аспартаттрансаминазу); и
комбинации этих генов.
12. Бактерия по п.11 отличающаяся тем, что указанная бактерия модифицирована таким образом, что экспрессия указанного мутантного гена thrA, указанного гена thrB, указанного гена thrC и указанного гена rhtA у этой бактерии усилена.
13. Бактерия по п.5 или 6, отличающаяся тем, что указанная бактерия является продуцентом L-лизина.
14. Бактерия по п.5 или 6, отличающаяся тем, что указанная бактерия является продуцентом L-гистидина.
15. Бактерия по п.5 или 6, отличающаяся тем, что указанная бактерия является продуцентом L-фенилаланина.
16. Бактерия по п.5 или 6, отличающаяся тем, что указанная бактерия является продуцентом L-аргинина.
17. Бактерия по п.5 или 6, отличающаяся тем, что указанная бактерия является продуцентом L-триптофана.
18. Бактерия по п.5 или 6, отличающаяся тем, что указанная бактерия является продуцентом L-глутаминовой кислоты.
19. Способ получения L-аминокислоты, включающий
А) выращивание бактерии семейства Enterobacteriaceae-продуцента L-аминокислоты, обладающей повышенной способностью усваивать этанол, в питательной среде, и
Б) выделение L-аминокислоты из культуральной жидкости.
20. Способ по п.19, отличающийся тем, что способность бактерии семейства Enterobacteriaceae усваивать этанол усилена путем введения мутации, придающей алкогольдегидрогеназе устойчивость к аэробной инактивации.
21. Способ по п.20, отличающийся тем, что указанная мутантная алкогольдегидрогеназа содержит мутацию в позиции 568 в SEQ ID NO:2 и, по крайней мере, одну дополнительную мутацию, улучшающую рост бактерии в жидкой среде, содержащей этанол в качестве единственного источника углерода.
22. Способ по п.21, отличающийся тем, что указанная дополнительная мутация выбрана из группы, состоящей из
А) замены остатка глутаминовой кислоты в позиции 560 в SEQ ID NO:2 на остаток другой аминокислоты;
Б) замены остатка фенилаланина в позиции 566 в SEQ ID NO:2 на остаток другой аминокислоты;
В) замены остатка глутаминовой кислоты, остатка метионина, остатка изолейцина и остатка аланина в позициях 22, 236, 554 и 786, соответственно, в SEQ ID NO:2 на остаток другой аминокислоты.
23. Способ по п.21, отличающийся тем, что указанная дополнительная мутация выбрана из группы, состоящей из
A) замены остатка глутаминовой кислоты в позиции 560 в SEQ ID NO:2 на остаток L-лизина;
Б) замены остатка фенилаланина в позиции 566 в SEQ ID NO:2 на остаток L-валина;
B) замены остатка глутаминовой кислоты, остатка метионина, остатка изолейцина и остатка аланина в позициях 22, 236, 554 и 786 в SEQ ID NO:2 на остатки глицина, валина, серина и валина, соответственно.
24. Способ по п.19, отличающийся тем, что указанная бактерия модифицирована таким образом, что активность мутантной алкогольдегидрогеназы в этой бактерии увеличена.
25. Способ по п.24, отличающийся тем, что указанная активность увеличена путем усиления экспрессии гена, кодирующего указанную мутантную алкогольдегидрогеназу.
26. Способ по п.24, отличающийся тем, что указанная активность увеличена путем модификации последовательности, контролирующей экспрессию гена, кодирующего указанную алкогольдегидрогеназу, или путем увеличения количества копий гена, кодирующего указанную алкогольдегидрогеназу.
27. Способ по п.19, отличающийся тем, что указанная бактерия выбрана из группы, состоящей из Escherichia, Enterobacter, Erwinia, Klebsiella, Pantoea, Providencia, Salmonella, Serratia, Shigella, and Morganella.
28. Способ по п.20, отличающийся тем, что аминокислотная последовательность указанной мутантной алкогольдегидрогеназы, по крайней мере, на 90% идентична последовательности SEQ ID NO:2.
29. Способ по п.20, отличающийся тем, что аминокислотная последовательность указанной мутантной алкогольдегидрогеназы, по крайней мере, на 95% идентична последовательности SEQ ID NO:2.
30. Способ по п.20, отличающийся тем, что аминокислотная последовательность указанной мутантной алкогольдегидрогеназы, по крайней мере, на 98% идентична последовательности SEQ ID NO:2.
31. Способ по п.19, отличающийся тем, что указанной L-аминокислотой является L-треонин.
32. Способ по п.19, отличающийся тем, что указанной L-аминокислотой является L-лизин.
33. Способ по п.19, отличающийся тем, что указанной L-аминокислотой является L-гистидин.
34. Способ по п.19, отличающийся тем, что указанной L-аминокислотой является L-фенилаланин.
35. Способ по п.19, отличающийся тем, что указанной L-аминокислотой является L-аргинин.
36. Способ по п.19, отличающийся тем, что указанной L-аминокислотой является L-триптофан.
37. Способ по п.19, отличающийся тем, что указанной L-аминокислотой является L-глутаминовая кислота.
38. Способ получения L-аминокислоты, включающий
А) выращивание бактерии-продуцента L-аминокислоты семейства Enterobacteriaceae, содержащей алкогольдегидрогеназу, в питательной среде, содержащей этанол; и
Б) выделение L-аминокислоты из культуральной жидкости, отличающийся тем, что указанная алкогольдегидрогеназа экспрессируется под контролем промотора, функционирующего в условиях аэробного культивирования.
39. Способ по п.38, отличающийся тем, что указанный промотор, функционирующий в условиях аэробного культивирования, выбран из группы, состоящей из промоторов Ptac, lac, trp, trc, PR, и PL.
40. Способ по п.38, отличающийся тем, что указанная алкогольдегидрогеназа является мутантной алкогольдегидрогеназой, устойчивой к аэробной инактивации.
41. Способ по п.38, отличающийся тем, что указанная алкогольдегидрогеназа получена из штамма бактерии, выбранной из группы, состоящей из Escherichia coli, Erwinia carotovora, Salmonella typhimurium, Shigella flexneri, Yersinia pestis, Pantoea ananatis, Lactobacillus plantarum, Lactococcus lactis.
42. Способ по п.38, отличающийся тем, что указанная алкогольдегидрогеназа включает аминокислотную последовательность SEQ ID NO:2, исключая алкогольдегидрогеназу, в которой остаток глутаминовой кислоты в позиции 568 заменен на остаток другой аминокислоты, иной, чем остаток аспарагиновой кислоты.
43. Способ по п.38, отличающийся тем, что указанная алкогольдегидрогеназа включает аминокислотную последовательность SEQ ID NO:2, исключая алькогольдегидрогеназу, в которой остаток глутаминовой кислоты в позиции 568 заменен на остаток лизина.
44. Способ по п.42, отличающийся тем, что указанная алкогольдегидрогеназа содержит, по крайней мере, одну дополнительную мутацию, улучшающую рост указанной бактерии в жидкой среде, содержащей этанол в качестве единственного источника углерода.
45. Способ по п.44, отличающийся тем, что указанная дополнительная мутация выбрана из группы, состоящей из
A) замены остатка глутаминовой кислоты в позиции 560 в SEQ ID NO:2 на остаток другой аминокислоты;
Б) замены остатка фенилаланина в позиции 566 в SEQ ID NO:2 на остаток другой аминокислоты;
B) замены остатка глутаминовой кислоты, остатка метионина, остатка изолейцина и остатка аланина в позициях 22, 236, 554 и 786, соответственно, в SEQ ID NO:2 на остатки другой аминокислоты; и
Г) комбинации этих замен.
46. Способ по п.44, отличающийся тем, что указанная дополнительная мутация выбрана из группы, состоящей из:
А) замены остатка глутаминовой кислоты в позиции 560 в SEQ ID NO:2 на остаток лизина;
Б) замены остатка фенилаланина в позиции 566 в SEQ ID NO:2 на остаток валина;
В) замены остатка глутаминовой кислоты, остатка метионина, остатка изолейцина и остатка аланина в позициях 22, 236, 554 и 786 в SEQ ID NO:2 на остатки глицина, валина, серина и валина, соответственно; и
Г) комбинации этих замен.
47. Способ по п.38, отличающийся тем, что указанная бактерия-продуцент L-аминокислоты выбрана из группы, состоящей из Escherichia, Enterobacter, Erwinia, Klebsiella, Pantoea, Providencia, Salmonella, Serratia, Shigella, and Morganella.
48. Способ по п.38, отличающийся тем, что указанная L-аминокислота выбрана из группы, состоящей из L-треонина, L-лизина, L-гистидина, L-фенилаланина, L-аргинина, L-триптофана и L-глутаминовой кислоты.
RU2006125964/13A 2006-07-19 2006-07-19 Способ получения l-аминокислот с использованием бактерии семейства enterobacteriaceae RU2006125964A (ru)

Priority Applications (9)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2006125964/13A RU2006125964A (ru) 2006-07-19 2006-07-19 Способ получения l-аминокислот с использованием бактерии семейства enterobacteriaceae
BRPI0715584A BRPI0715584B8 (pt) 2006-07-19 2007-07-12 método para produzir um l-aminoácido
CN200780027157.1A CN101490251B (zh) 2006-07-19 2007-07-12 使用肠杆菌科细菌产生l-氨基酸的方法
PCT/JP2007/064304 WO2008010565A2 (en) 2006-07-19 2007-07-12 A method for producing an l-amino acid using a bacterium of the enterobacteriaceae family
CN2012105573975A CN103215319A (zh) 2006-07-19 2007-07-12 使用肠杆菌科细菌产生l-氨基酸的方法
EP07768453.8A EP2046949B1 (en) 2006-07-19 2007-07-12 A method for producing an l-amino acid using a bacterium of the enterobacteriaceae family
JP2009503341A JP5407858B2 (ja) 2006-07-19 2007-07-12 腸内細菌科の細菌を用いたl−アミノ酸の製造方法
US12/354,042 US20090203090A1 (en) 2006-07-19 2009-01-15 Method for producing an l-amino acid using a bacterium of the enterobacteriaceae family
US14/668,080 US20150203881A1 (en) 2006-07-19 2015-03-25 Method for Producing an L-Amino Acid Using a Bacterium of the Enterobacteriaceae Family

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2006125964/13A RU2006125964A (ru) 2006-07-19 2006-07-19 Способ получения l-аминокислот с использованием бактерии семейства enterobacteriaceae

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2007127466/13A Substitution RU2364628C2 (ru) 2007-07-18 2007-07-18 Способ получения l-аминокислот с использованием бактерии семейства enterobacteriaceae

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2006125964A true RU2006125964A (ru) 2008-01-27

Family

ID=39109503

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2006125964/13A RU2006125964A (ru) 2006-07-19 2006-07-19 Способ получения l-аминокислот с использованием бактерии семейства enterobacteriaceae

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2006125964A (ru)

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN102227504B (zh) 产生l-氨基酸的方法
CN103146593B (zh) 生产l-氨基酸的微生物和生产l-氨基酸的方法
US8367371B2 (en) Method for production of L-amino acid
CN1330763C (zh) 使用属于埃希氏菌属的细菌生产l-苏氨酸的方法
RU2004137719A (ru) Способ получения l-аминокислот с использованием бактерий семейства enterobacteriaceae
CN101273054A (zh) 产生l-氨基酸的细菌和用于产生l-氨基酸的方法
CN1914328A (zh) 属于埃希氏菌属的产l-苏氨酸细菌以及生产l-苏氨酸的方法
CN104302765B (zh) 反馈抗性α-异丙基苹果酸合酶
JP2015525576A (ja) 腸内細菌科の改善された菌株の使用下でのl−アミノ酸の発酵による製造方法
RU2008142988A (ru) Способ производства l-аминокислот
JPWO2008126784A1 (ja) グルタチオンおよびγ−グルタミルシステインの製造法
RU2006130318A (ru) Способ получения l-аминокислот с использованием штаммов семейства enterobacteriaceae
CN101365797A (zh) 用于改良生产天冬氨酸衍生的氨基酸及化学品的改变的乙醛酸支路
KR101059380B1 (ko) L-트레오닌의 생산 방법
RU2007127466A (ru) Способ получения l-аминокислот с использованием бактерии семейства enterobacteriaceae
RU2006125964A (ru) Способ получения l-аминокислот с использованием бактерии семейства enterobacteriaceae
JP2007513601A (ja) エシェリヒア属に属するl−スレオニン生産菌及びl−スレオニンの製造法
RU2133772C1 (ru) Модифицированная фосфоенолпируваткарбоксилаза, фрагмент днк, штамм escherichia coli, рекомбинантная днк, способ получения аминокислоты (варианты), способ селекции клеток escherichia coli, способ получения модифицированной фосфоенолпируваткарбоксилазы, способ получения фрагмента днк и способ получения микроорганизма
JP2010183841A (ja) L−アミノ酸の製造法
RU2006100893A (ru) Способ получения l-аминокислот с использованием бактерий семейства enterobacteriaceae
RU2005101111A (ru) Способ получения l-аминокислот с использованием бактерий семейства enterobacteriaceae
JP2022550349A (ja) 細菌の発酵による2-メチル酪酸の製造方法
RU2006117420A (ru) Бактерия семейства enterobacteriaceae-продуцент l-аминокислоты и способ получения l-аминокислоты
RU2006109061A (ru) Способ получения l-аминокислот с использованием бактерий семейства enterobacteriaceae
RU2005138193A (ru) Способ получения l-аминокислот с использованием бактерий семейства enterobacteriaceae

Legal Events

Date Code Title Description
FA95 Acknowledgement of application withdrawn due to the later filing of the same application (junior application)

Effective date: 20080117