Claims (17)
1. Изолированный полинуклеотид, содержащий последовательность, выбранную из группы, состоящей из a) последовательностей, представленных в SEQ ID NO: 1, 3-86, 142-298, 301-303, 307, 313, 314, 316, 317, 325 и 327-330, b) последовательностей, комплементарных последовательностям, представленным в SEQ ID NO: 1, 3-86, 142-298, 301-303, 307, 313, 314, 316, 317, 325 и 327-330, с) последовательностей, состоящих, по меньшей мере, из 20 непрерывно следующих друг за другом остатков последовательности, представленной в SEQ ID NO: 1, 3-86, 142-298, 301-303, 307, 313, 314, 316, 317, 325 и 327-330, d) последовательностей, которые в условиях умеренной жесткости гибридизуются с последовательностью, представленной в SEQ ID NO: 1, 3-86, 142-298, 301-303, 307, 313, 314, 316, 317, 325 и 327-330, e) последовательностей, обладающих, по меньшей мере, 75% идентичностью с последовательностью SEQ ID NO: 1, 3-86, 142-298, 301-303, 307, 313, 314, 316, 317, 325 и 327-330, f) последовательностей, обладающих, по меньшей мере, 90% идентичностью с последовательностью SEQ ID NO: 1, 3-86, 142-298, 301-303, 307, 313, 314, 316, 317, 325 и 327-330, и g) вырожденных вариантов последовательности, представленной в SEQ ID NO: 1, 3-86, 142-298, 301-303, 307, 313, 314, 316, 317, 325 и 327-330.1. An isolated polynucleotide containing a sequence selected from the group consisting of a) of the sequences shown in SEQ ID NO: 1, 3-86, 142-298, 301-303, 307, 313, 314, 316, 317, 325 and 327-330, b) sequences complementary to the sequences presented in SEQ ID NO: 1, 3-86, 142-298, 301-303, 307, 313, 314, 316, 317, 325 and 327-330, c) sequences consisting of at least 20 continuously following each other residues of the sequence shown in SEQ ID NO: 1, 3-86, 142-298, 301-303, 307, 313, 314, 316, 317, 325 and 327 -330, d) sequences that are moderately hard the awes hybridize with the sequence shown in SEQ ID NO: 1, 3-86, 142-298, 301-303, 307, 313, 314, 316, 317, 325 and 327-330, e) sequences having at least , 75% identity with the sequence of SEQ ID NO: 1, 3-86, 142-298, 301-303, 307, 313, 314, 316, 317, 325 and 327-330, f) sequences having at least 90% identity with the sequence of SEQ ID NO: 1, 3-86, 142-298, 301-303, 307, 313, 314, 316, 317, 325 and 327-330, and g) degenerate variants of the sequence shown in SEQ ID NO: 1, 3-86, 142-298, 301-303, 307, 313, 314, 316, 317, 325 and 327-330.
2. Изолированный полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из (а) SEQ ID NO: 299, 300, 304-306, 308-312, 314, 326 и 331-334, (b) последовательностей, кодируемых полинуклеотидом по п.1, (с) последовательностей, обладающих, по меньшей мере, 70% идентичностью с последовательностью, кодируемой полинуклеотидом по п.1, и (d) последовательностей, обладающих, по меньшей мере, 90% идентичностью с последовательностью, кодируемой полинуклеотидом по п.1.2. An isolated polypeptide containing an amino acid sequence selected from the group consisting of (a) SEQ ID NO: 299, 300, 304-306, 308-312, 314, 326 and 331-334, (b) sequences encoded by the polynucleotide according to claim 1, (c) sequences having at least 70% identity with the sequence encoded by the polynucleotide according to claim 1, and (d) sequences having at least 90% identity with the sequence encoded by the polynucleotide according to claim .1.
3. Экспрессирующий вектор, содержащий полинуклеотид по п.1, оперативно связанный с последовательностью регуляции экспрессии.3. An expression vector containing the polynucleotide according to claim 1, operably linked to an expression regulation sequence.
4. Клетка-хозяин, трансформированная или трансфицированная экспрессирующим вектором по п.3.4. A host cell transformed or transfected with an expression vector according to claim 3.
5. Изолированное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, который специфично связывается с полипептидом по п.2.5. An isolated antibody or antigen binding fragment thereof that specifically binds to the polypeptide of claim 2.
6. Способ определения наличия злокачественной опухоли у пациента, включающий в себя следующие стадии: (а) получение биологического образца от пациента, (b) контактирование биологического образца со связывающим агентом, который связывается с полипептидом по п.2, (с) определение в образце количества полипептида, который связывается со связывающим агентом, и (d) сравнение количества полипептида с предварительно определенным отсекающим (″cut-off″) значением, и на основе этого определение наличия злокачественной опухоли у пациента.6. A method for determining the presence of a malignant tumor in a patient, comprising the following steps: (a) obtaining a biological sample from the patient, (b) contacting the biological sample with a binding agent that binds to the polypeptide according to claim 2, (c) determining the sample the amount of the polypeptide that binds to the binding agent; and (d) comparing the amount of the polypeptide with a predetermined cut-off value, and based on this, determining the presence of a malignant tumor in the patient.
7. Гибридый белок, содержащий, по меньшей мере, один полипептид по п.2.7. A hybrid protein containing at least one polypeptide according to claim 2.
8. Олигонуклеотид, который в условиях умеренной жесткости гибридизуется с последовательностью, указанной в SEQ ID NO: 1, 3-86, 142-298, 301-303, 307, 313, 314, 316, 317, 325 и 327-330.8. The oligonucleotide, which under conditions of moderate stringency hybridizes with the sequence specified in SEQ ID NO: 1, 3-86, 142-298, 301-303, 307, 313, 314, 316, 317, 325 and 327-330.
9. Способ стимулирования и/или экспансии Т-клеток, специфичных для белка опухоли, включающий в себя осуществление контакта Т-клеток, по меньшей мере, с одним компонентом, выбранным из группы, состоящей из (a) полипептидов по п.2, (b) полинуклеотидов по п.1, и (c) антиген-презентирующих клеток, которые экспрессируют полипептид по п.2, в условиях и в течение времени, достаточных для того, чтобы обеспечить возможность для стимуляции и/или экспансии Т-клеток.9. A method of stimulating and / or expanding T cells specific for a tumor protein, comprising contacting the T cells with at least one component selected from the group consisting of (a) polypeptides according to claim 2, ( b) polynucleotides according to claim 1, and (c) antigen-presenting cells that express the polypeptide according to claim 2, under conditions and for a time sufficient to allow stimulation and / or expansion of T cells.
10. Изолированная популяция Т-клеток, содержащая Т-клетки, полученные согласно способу по п.9.10. An isolated population of T cells containing T cells obtained according to the method of claim 9.
11. Композиция, содержащая первый компонент, выбранный из группы, состоящей из физиологически приемлемых носителей и иммуностимуляторов, и второй компонент, выбранный из группы, состоящей из (a) полипептидов по п.2, (b) полинуклеотидов по п.1, (c) антител по п.5, (d) гибридных белков по п.7, (e) популяций Т-клеток по п. 10, и (f) антиген-презентирующих клеток, которые экспрессируют полипептид по п.2.11. A composition comprising a first component selected from the group consisting of physiologically acceptable carriers and immunostimulants, and a second component selected from the group consisting of (a) polypeptides according to claim 2, (b) polynucleotides according to claim 1, (c ) antibodies according to claim 5, (d) hybrid proteins according to claim 7, (e) T-cell populations according to claim 10, and (f) antigen-presenting cells that express the polypeptide according to claim 2.
12. Способ стимулирования иммунного ответа у пациента, включающий в себя введение пациенту композиции по п.11.12. A method of stimulating an immune response in a patient, comprising administering to the patient a composition according to claim 11.
13. Способ лечения злокачественной опухоли у пациента, включающий в себя введение пациенту композиции по п.11.13. A method of treating a malignant tumor in a patient, comprising administering to the patient a composition according to claim 11.
14. Способ определения наличия злокачественной опухоли у пациента, включающий в себя следующие стадии (а) получение биологического образца от пациента, (b) контактирование биологического образца с олигонуклеотидом по п.8, (с) определение в образце количества полинуклеотида, который гибридизуется с олигонуклеотидом, и (d) сравнение количества полинуклеотида, который гибридизуется с олигонуклеотидом, с предварительно определенным отсекающим значением и на основе этого определение наличия злокачественной опухоли у пациента.14. A method for determining the presence of a malignant tumor in a patient, comprising the following steps (a) obtaining a biological sample from a patient, (b) contacting the biological sample with the oligonucleotide of claim 8, (c) determining in the sample the amount of polynucleotide that hybridizes with the oligonucleotide and (d) comparing the amount of polynucleotide that hybridizes with the oligonucleotide with a predetermined cutoff value and based on this, determining the presence of a malignant tumor in the patient.
15. Диагностический набор, содержащий, по меньшей мере, один олигонуклеотид по п.8.15. A diagnostic kit containing at least one oligonucleotide according to claim 8.
16. Диагностический набор, содержащий, по меньшей мере, одно антитело по п.5 и реагент для детекции, при этом реагент для детекции содержит репортерную группу.16. A diagnostic kit containing at least one antibody according to claim 5 and a detection reagent, wherein the detection reagent contains a reporter group.
17. Способ подавления развития злокачественной опухоли у пациента, включающий в себя следующие стадии: (a) инкубирование CD4+ и/или CD8+ T-клеток, выделенных из организма пациента, по меньшей мере, с одним компонентом, выбранным из группы, состоящей из (i) полипептидов по п.2, (ii) полинуклеотидов по п.1, и (iii) антиген-презентирующих клеток, которые экспрессируют полипептид по п.2 так, чтобы Т-клетки пролиферировали, (b) введение пациенту эффективного количества пролиферирующих Т-клеток, и таким образом, подавление развития злокачественной опухоли у пациента.17. A method of inhibiting the development of a malignant tumor in a patient, comprising the following steps: (a) incubating CD4 + and / or CD8 + T cells isolated from the patient’s body with at least one component selected from the group consisting of (i ) polypeptides according to claim 2, (ii) polynucleotides according to claim 1, and (iii) antigen-presenting cells that express the polypeptide according to claim 2 so that T cells proliferate, (b) administering to the patient an effective amount of proliferating T- cells, and thus suppressing the development of a malignant tumor in a patient NTA.