KR20130081394A - A novel cytochrome p450 hydroxylase and process for preparing hydroxylated cyclosporin a employing the same - Google Patents
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Abstract
본 발명은 세베키아 베니하나로부터 유래된 신규한 사이토크롬 P450 수산화효소(Cytochrome P450 hydroxylase, CYP), 상기 CYP를 코딩하는 폴리뉴클레오티드, 상기 폴리뉴클레오티드를 포함하는 발현벡터, 상기 발현벡터가 도입된 형질전환체, 상기 형질전환체를 이용하여 상기 CYP를 생산하는 방법, 상기 CYP 및 전자전이 효소를 코딩하는 각각의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 발현벡터, 상기 CYP 및 전자전이 효소를 코딩하는 각각의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 발현벡터가 도입된 형질전환체 및 상기 CYP 및 전자전이 효소를 코딩하는 각각의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 발현벡터가 도입된 형질전환체를 이용하여 4-(γ-hydroxy)-CyA를 생산하는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 수산화된 사이클로스포린 A의 생산방법을 이용하면, 종래의 방법보다 4-(γ-hydroxy)-CyA를 높은 효율로 생산할 수 있으므로, 다양한 발모제의 개발 및 생산에 널리 활용될 수 있을 것이다.The present invention is a novel cytochrome P450 hydroxylase (CYP) derived from Severkia Benihana, polynucleotide encoding the CYP, expression vector comprising the polynucleotide, transformation expression into which the expression vector is introduced Sieve, a method for producing the CYP using the transformant, an expression vector comprising respective polynucleotides encoding the CYP and an electron transfer enzyme, and each polynucleotide encoding the CYP and an electron transfer enzyme A method of producing 4- (γ-hydroxy) -CyA using a transformant having an expression vector introduced therein and a transformant having an expression vector containing the polynucleotide encoding the CYP and the electron transfer enzyme. It is about. By using the production method of the hydroxylated cyclosporin A of the present invention, since it can produce 4- (γ-hydroxy) -CyA with higher efficiency than the conventional method, it will be widely used in the development and production of various hair regrowth.
Description
본 발명은 신규한 사이토크롬 P450 수산화효소 및 이를 이용한 수산화된 사이클로스포린 A의 생산방법에 관한 것으로, 보다 구체적으로 본 발명은 세베키아 베니하나로부터 유래된 신규한 사이토크롬 P450 수산화효소(Cytochrome P450 hydroxylase, CYP), 상기 CYP를 코딩하는 폴리뉴클레오티드, 상기 폴리뉴클레오티드를 포함하는 발현벡터, 상기 발현벡터가 도입된 형질전환체, 상기 형질전환체를 이용하여 상기 CYP를 생산하는 방법, 상기 CYP 및 전자전이 효소를 코딩하는 각각의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 발현벡터, 상기 CYP 및 전자전이 효소를 코딩하는 각각의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 발현벡터가 도입된 형질전환체 및 상기 CYP 및 전자전이 효소를 코딩하는 각각의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 발현벡터가 도입된 형질전환체를 이용하여 4-(γ-hydroxy)-CyA를 생산하는 방법에 관한 것이다.
The present invention relates to a novel cytochrome P450 hydroxylase and a method for producing hydroxylated cyclosporin A using the same. More specifically, the present invention relates to a novel cytochrome P450 hydroxylase (Cytochrome P450 hydroxylase, CYP) derived from Severia benihana. ), A polynucleotide encoding the CYP, an expression vector comprising the polynucleotide, a transformant into which the expression vector is introduced, a method of producing the CYP using the transformant, the CYP and an electron transfer enzyme An expression vector comprising each polynucleotide encoding, a transformant into which an expression vector comprising each polynucleotide encoding the CYP and electron transfer enzyme is introduced, and each polynucleotide encoding the CYP and electron transfer enzyme 4- (γ-hydroxy) -Cy using a transformant having an expression vector including A method for producing A.
인체의 모발은 약 10 만 내지 15 만 개 정도이며, 각각의 모발은 서로 다른 주기를 가지며 성장기(anagen), 퇴행기(catagen), 휴지기(telogen)를 거쳐 성장, 탈락한다. 이러한 주기는 3∼6 년에 걸쳐 반복되는데 그 결과 일일 평균 50내지 100 개의 모발이 정상적으로 탈락하게 된다. 일반적으로 탈모증이라 함은 이러한 주기 중에서 성장기의 모발 비율이 짧아지고 퇴행기 또는 휴지기의 모발이 많아져 비정상 적으로 모발이 탈락하는 숫자가 많아지는 것을 일컫는다.The human hair is about 100,000 to 150,000 pieces, and each hair has a different cycle and grows and drops out through the anagen, the catagen, and the telogen. This cycle is repeated over three to six years, with the result that on
탈모의 원인으로는 혈액순환 불량설, 남성호르몬 작용 과잉설, 피지 분비 과잉설, 과산화물, 세균 등에 의한 두피 기능 저하설, 유전적 요인, 노화, 스트레스 등이 논의되어 왔었다. 그러나 현재까지 탈모에 관한 명확한 원인은 밝혀져 있지 않으며, 최근 들어 식생활의 변화, 사회환경 등에 의한 스트레스의 증가 등으로 탈모로 고민하는 인구가 늘어나고 있는 추세이고 그 연령 또한 낮아지고 있으며, 여성의 탈모 인구도 늘어나고 있는 실정이다.The causes of alopecia have been discussed, such as poor blood circulation, excessive male hormone action, excessive sebum secretion, peroxide, bacteria, hypodermic function, genetic factors, aging, stress. However, to date, no clear cause of hair loss is known, and in recent years, a growing number of people are suffering from hair loss due to changes in diet and stress caused by social conditions. It is increasing.
이러한 탈모증의 치료나 예방에 있어서 현재까지 가장 널리 사용되는 제제는 미녹시딜 함유 제제로서, 현재까지 미국 FDA의 승인을 받은 두 가지 발모제 성분 중의 하나이다. 미녹시딜은 혈압강하의 목적으로 개발된 고혈압 치료제이었지만 사용상의 부작용으로 발모 현상이 나타나면서 현재에는 발모제로 더 유명한 약물이 되었다. 미녹시딜의 발모 작용기전에 대해서는 정확히 밝혀져 있지는 않지만, 혈관 확장 효과를 통한 혈류량 증가로 모근에 영양을 공급하여 모발 성장을 촉진하는 것으로 생각되고 있다.The most widely used formulations for the treatment or prevention of such alopecia to date are minoxidil-containing formulations, and are currently one of two hair repellent components approved by the US FDA. Minoxidil was a drug for hypertension that was developed for the purpose of lowering blood pressure, but with the side effect of use, hair growth phenomenon has now become a more famous drug for hair growth. Although the mechanism of minoxidil's hair growth is not known, it is thought to promote hair growth by nourishing hair roots by increasing blood flow through vasodilation effect.
이밖에 최근에 발매가 시작된 머크(Merck)사의 프로페시아(Propecia) 주성분인 피나스테라이드(finasteride)는 남성호르몬 테스토스테론이 더 강력한 형태의 남성호르몬인 디히드로테스토스테론으로 전환되는 것을 억제한다. 1997년 12월 남성형 탈모증의 치료제로 1 ㎎ 타블렛이 FDA로부터 사용 승인을 받아 현재 시판 중으로, 임상결과 유의할 만한 효과를 나타내는 것으로 판명되었으나 일부 남성 기능 억제 부작용도 보고되고 있다(J. Am. Acad. Dermatol., 1998; 39; 578∼589). 그러나 이 약물 또한 미녹시딜과 같이 임상효과가 그다지 탁월하지 못하고 부작용에 대한 우려 때문에 좀 더 우수한 발모제 탐색연구가 활발히 진행되고 있다.In addition, Merck's recently launched propecia, finasteride, inhibits the conversion of androgen testosterone to the more potent form of dihydrotestosterone. In December 1997, a 1 mg tablet was approved by the FDA for the treatment of androgenetic alopecia and is currently on the market. It has been shown to have a significant clinical effect, but some male side effects are reported (J. Am. Acad. Dermatol). , 1998; 39; 578-589). However, this drug, like minoxidil, is not very effective in clinical research, and researches for more excellent hair repellents are being actively conducted due to concerns about side effects.
한편, 사이클로스포린 류는 대표적인 면역 억제제인 동시에 바이러스, 진균, 원생동물을 억제하는 효과 및 부작용으로 신장독성, 간독성, 고혈압, 치주조직 비대, 발모효과 등 다양한 생리효과를 갖고 있다(Advances in Pharmacol., 1996; 35; 114∼246 및 Drug Safety, 1994; 10; 310∼317). 그 중 대표적인 사이클로스포린 A(Cyclosporin A, CyA)는 11개의 아미노산이 환상으로 결합된 올리고 펩타이드로서 장기이식 환자들의 거부반응을 치료하기 위한 강력한 면역억제제이며, 부작용으로 신장독성, 간 독성, 고혈압, 치주조직 비대, 발모효과 등의 다양한 생리효과를 가지고 있다. CyA는 불완전 균류인 토포클라디움 인플라툼 (Toypocladium inflatum)을 호기성 상태에서 액체배양 할 경우에 생성되는 24가지의 구조적으로 유사한 대사물질들 (사이클로스포린 A에서 Z까지) 가운데 가장 많이 생성되는 물질이다. CyA와 그 유사물들은 사이클로스포린 신데테이즈 (Cyclosporin Synthetase)라는 다기능 단일 효소에 의해서 11개의 아미노산이 순서대로 활성화되고, N-메틸레이션(N-methylation)되고, 펩티드결합을 형성하는 Non-ribosomal 기작으로 생합성된다.Cyclosporins, on the other hand, have various physiological effects such as renal toxicity, hepatotoxicity, hypertension, periodontal tissue enlargement, and hair growth effect as a representative immunosuppressive agent, and inhibiting viruses, fungi and protozoa (Advances in Pharmacol., 1996 35; 114-246 and Drug Safety, 1994; 10; 310-317). Cyclosporin A (CyA) is an oligopeptide with a ring of 11 amino acids and is a powerful immunosuppressant to treat rejection of organ transplant patients. It has various physiological effects such as hypertrophy and hair growth effect. CyA is the most abundant of the 24 structurally similar metabolites (cyclosporine A to Z) produced when incomplete fungi, Topopodium inflatum, are cultured in aerobic liquid culture. CyA and its analogs are biosynthesized by non-ribosomal mechanisms in which 11 amino acids are activated sequentially, N-methylated and formed peptide bonds by a multifunctional single enzyme called Cyclosporin Synthetase. do.
CyA의 여러 부작용 중에서 체모의 과대성장 부작용을 이용한 발모제로서의 개발 가능성이 그동안 여러 연구에 의해 수행되어 왔다. 그 중에는 동물 발모실험, 인간원형 탈모증, 인간 남성형 탈모증, 화학요법에 의한 탈모 동물에서 탈모억제 효과 등에 대한 광범위한 연구가 수행되었고, 마우스 등판 실험 결과로 비교한다면 시판되고 있는 미녹시딜보다 약 100 배 정도 우수한 효과를 보여주고 있다.Among the various side effects of CyA, the possibility of development as a hair regrowth agent using the overgrowth side effects of the hair has been conducted by various studies. Among them, extensive researches on animal hair growth test, human alopecia areata, human androgenetic alopecia, and chemotherapy for hair loss control were performed, and the results of mouse backing experiments were about 100 times better than commercial minoxidil. Is showing.
CyA는 다양한 세균과 진균류 등에 의한 생물전환을 통해 다양한 유도체로 전환된다. 희귀 방선균인 세베키아 베니하나(Sebekia benihana)에 의해 4번 위치에 수산기가 부가된 형태의 유도체(4-(γ-hydroxy)-CyA, 4-(γ-hydroxy)-4-N-demethyl-CyA, Di-4,6-(γ-hydroxy)-CyA 등)로 전환됨이 확인되었는데(한국공개특허 제2004-88593호), 이 중 상기 4-(γ-hydroxy)-CyA는 CyA가 가지고 있는 면역억제 활성이 감소되고, 발모효과는 그대로 유지된다고 알려져 있다(한국등록특허 제316604호). 이러한 반응은 상기 균주에서 발현되는 사이토크롬 P450 수산화효소(Cytochrome P450 hydroxylase, CYP)와 전자전이효소에 의하여 수행되는 것으로 알려져 있는데, 상기 CYP는 식물, 박테리아, 동물, 고세균 등의 자연계의 모든 생물 종에서 발현되는 헴(heme)을 포함한 헤모프로테인(hemoprotein)의 일종으로서, 상기 헴에 포함된 철 이온이 일산화탄소(CO)와 결합 시 450㎚에서 특징적인 흡광을 나타내고, 생체내의 다양한 산화 반응을 촉매 하는 효소로 알려져 있다. 현재까지 연구된 바에 의하면, 세베키아 베니하나에서 발현되는 CYP는 5종(CYP501, CYP502, CYP503, CYP504 및 CYP506)이 존재하는 것으로 알려져 있고, 이들 효소의 활성을 이용하여 세베키아 베니하나에서 4-(γ-hydroxy)-CyA로 전환되는 것으로 얼려져 있으나, 상기 전환수율이 낮아서 산업적으로 이용하기가 어렵다는 문제점이 있었다.
CyA is converted to various derivatives through bioconversion by various bacteria and fungi. Derivatives having a hydroxyl group at
이러한 배경하에서, 본 발명자들은 미생물에 의한 CyA의 생물전환시 수산화 효율을 향상시키는 방법을 개발하기 위하여 예의 연구노력한 결과, CyA의 수산화를 매개하는 신규한 효소단백질을 발굴하고, 상기 효소단백질을 전자전이 효소와 함께 발현시키도록 변이된 형질전환체를 사용할 경우, CyA의 수산화 효율을 향상시킬 수 있음을 확인하고, 본 발명을 완성하였다.
Under these circumstances, the present inventors have made diligent efforts to develop a method for improving the hydroxylation efficiency during the bioconversion of CyA by microorganisms. As a result, the present inventors have discovered a novel enzyme protein that mediates the hydroxylation of CyA and electron transfer the enzyme protein. When using a transformant transformed to be expressed with the enzyme, it was confirmed that the hydroxylation efficiency of CyA can be improved, the present invention was completed.
본 발명의 하나의 목적은 CyA의 수산화를 매개하는 신규한 사이토크롬 P450 수산화효소(Cytochrome P450 hydroxylase, CYP)를 제공하는 것이다.One object of the present invention is to provide a novel cytochrome P450 hydroxylase (CYP) that mediates the hydroxylation of CyA.
본 발명의 다른 목적은 상기 CYP를 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 제공하는 것이다.Another object of the present invention is to provide a polynucleotide encoding the CYP.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 폴리뉴클레오티드를 포함하는 발현벡터를 제공하는 것이다.Still another object of the present invention is to provide an expression vector comprising the polynucleotide.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 발현벡터가 도입된 형질전환체를 제공하는 것이다.It is still another object of the present invention to provide a transformant into which the above expression vector has been introduced.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 형질전환체를 이용하여 상기 CYP를 생산하는 방법을 제공하는 것이다.Still another object of the present invention is to provide a method for producing the CYP using the transformant.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 CYP 및 전자전이 효소를 코딩하는 각각의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 발현벡터를 제공하는 것이다.Still another object of the present invention is to provide an expression vector comprising each polynucleotide encoding the CYP and the electron transfer enzyme.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 CYP 및 전자전이 효소를 코딩하는 각각의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 발현벡터가 도입된 형질전환체를 제공하는 것이다.Still another object of the present invention is to provide a transformant into which an expression vector containing each polynucleotide encoding the CYP and the electron transfer enzyme is introduced.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 CYP 및 전자전이 효소를 코딩하는 각각의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 발현벡터가 도입된 형질전환체를 이용하여 4-(γ-hydroxy)-CyA를 생산하는 방법을 제공하는 것이다.
Still another object of the present invention is to provide a method for producing 4- (γ-hydroxy) -CyA using a transformant into which an expression vector containing each polynucleotide encoding the CYP and an electron transfer enzyme is introduced. will be.
상기 본 발명의 목적을 달성하기 위한 일 실시양태로서, 본 발명은 사이클로스포린 A(Cyclosporin A, CyA)의 수산화를 매개하는 신규한 사이토크롬 P450 수산화효소(Cytochrome P450 hydroxylase, CYP)를 제공한다.
As one embodiment for achieving the object of the present invention, the present invention provides a novel cytochrome P450 hydroxylase (CYP) that mediates the hydroxylation of cyclosporin A (CyA).
본 발명자들은 CyA를 수산화시켜서 면역억제활성이 감소된 유도체(4-(γ-hydroxy)-CyA)를 생산할 수 있는 방선균의 일종인 세베키아 베니하나(Sebekia benihana)로 부터 상기 CyA를 수산화시킬 수 있는 신규한 효소단백질을 규명하고자 하였다. 이를 위하여, 상기 균주의 게놈 DNA를 분석하여 공지된 5종 이외의 신규한 CYP를 코딩하는 유전자를 스크리닝하고자 하였다. 그 결과, 총 16종의 신규한 CYP(CYP001 내지 CYP016)를 코딩하는 것으로 예상되는 유전자를 발굴하고, 이들 중에서 4-(γ-hydroxy)-CyA의 생산에 관여하는 CYP를 코딩하는 유전자를 스크리닝한 결과, CYP008이 결실된 S. benihana 균주에서는 4-(γ-hydroxy)-CyA의 발현량이 야생형 균주의 것보다도 감소됨을 확인하였으므로, 상기 CYP008이 CyA를 수산화시킬 수 있는 활성을 나타냄을 알 수 있었다(실시예 1).
The inventors of the present invention can hydroxylate CyA from Sebekia benihana , a type of actinomycetes capable of hydroxylating CyA to produce derivatives having reduced immunosuppressive activity (4- (γ-hydroxy) -CyA). We attempted to identify novel enzyme proteins. To this end, the genomic DNA of the strain was analyzed to screen for genes encoding novel CYP other than the five known species. As a result, genes expected to encode a total of 16 new CYPs (CYP001 to CYP016) were discovered, and among them, the genes encoding CYPs involved in the production of 4- (γ-hydroxy) -CyA were screened. As a result, it was confirmed that the expression level of 4- (γ-hydroxy) -CyA was reduced in the S. benihana strains in which CYP008 was deleted, compared to that of the wild type strain, and thus, the CYP008 exhibited an activity capable of hydroxylating CyA. Example 1).
본 발명의 용어 "사이클로스포린 A(Cyclosporin A, CyA)"란, 1개의 아미노산으로 구성된 사이클릭 펩타이드로서 아미노산의 구조에 따라 다양한 형태로 존재할 수 있으며, 하기의 화학식 1의 구조를 갖을 수 있는 화합물을 의미한다. 상기 CyA는 장기이식 후에 따르는 조직이식 거부반응을 억제하기 위한 면역억제제로서 사용되고, 부작용으로서 모발성장을 촉진시키는 활성을 나타낸다. 본 발명의 목적상 상기 CyA는 4-(γ-hydroxy)-CyA를 생산하기 위한 전구체로서 사용되나, 특별히 이에 제한되지는 않는다.
As used herein, the term "cyclosporin A (Cyclosporin A, CyA)" is a cyclic peptide composed of one amino acid, which may exist in various forms depending on the structure of the amino acid, and means a compound having the structure of
본 발명의 용어 "사이토크롬 P450 수산화효소(Cytochrome P450 hydroxylase, CYP)"란, 자연계의 모든 생물 종에서 발현되고, 다양한 산화반응을 촉매하며, 헴(heme)을 포함한 헤모프로테인의 일종을 의미하는데, 상기 헴에 포함된 철 이온이 일산화탄소(CO)와 결합할 경우에 450㎚의 특징적인 흡광을 나타내고, 폴리케타이드, 지방산, 비타민, 스테로이드 계열의 항생제 등을 비롯한 여러 종류의 화합물을 기질로 사용하는 것으로 알려져 있다. 본 발명의 목적상 상기 CYP는 CyA를 수산화시키는 반응을 수행하기 위하여 사용되며, 특별히 이에 제한되지 않으나, 바람직하게는 방선균 유래의 CYP가 될 수 있고, 보다 바람직하게는 세베키아 베니하나로부터 유래된 CYP501, CYP502, CYP503, CYP504, CYP506, 또는 본 발명에서 새로이 선별된 CYP001 내지 CYP016 중 어느 하나가 될 수 있으며, 가장 바람직하게는 세베키아 베니하나로부터 유래된 신규한 CYP008이 될 수 있다. 특히, 상기 신규한 CYP008은 특별히 이에 제한되지 않으나, 서열번호 1의 아미노산 서열 또는 이와 70% 이상, 보다 바람직하게는 80% 이상, 보다 바람직하게는 90% 이상의 상동성을 가지는 아미노산 서열을 가지는 단백질일 수 있다. The term "cytochrome P450 hydroxylase (CYP)" of the present invention is expressed in all species of nature, catalyzes various oxidation reactions, and refers to a kind of hemoprotein including heme, When iron ions contained in the heme are combined with carbon monoxide (CO), they exhibit a characteristic absorption of 450 nm and use various kinds of compounds including polyketides, fatty acids, vitamins, and steroid-based antibiotics as substrates. It is known. For the purposes of the present invention, the CYP is used to carry out a reaction for hydroxylating CyA, and is not particularly limited thereto. Preferably, the CYP may be CYP derived from actinomycetes, and more preferably, CYP501 derived from Severkia bennihana. , CYP502, CYP503, CYP504, CYP506, or any of the newly selected CYP001 to CYP016 in the present invention, most preferably a novel CYP008 derived from Severkia Benihana. In particular, the novel CYP008 is not particularly limited, but may be a protein having an amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or an amino acid sequence having at least 70%, more preferably 80%, more preferably 90% or more homology thereof. Can be.
본 발명의 용어 "상동성"이란, 단백질을 코딩하는 유전자의 염기 서열이나 아미노산 서열의 유사한 정도를 의미하는데, 상동성이 충분히 높은 경우 해당 유전자의 발현 산물은 동일하거나 유사한 활성을 가질 수 있다.
As used herein, the term "homology" refers to a similar degree of a nucleotide sequence or an amino acid sequence of a gene encoding a protein. When homology is sufficiently high, expression products of the gene may have the same or similar activity.
상기 목적을 달성하기 위한 다른 실시양태로서, 본 발명은 상기 CYP008을 코딩하는 폴리뉴클레오티드, 상기 폴리뉴클레오티드를 포함하는 발현벡터, 상기 발현벡터가 도입되어 CYP008을 발현할 수 있는 형질전환체 및 상기 형질전환체를 이용하여 CYP008을 생산하는 방법을 제공한다.
As another embodiment for achieving the above object, the present invention is a polynucleotide encoding the CYP008, an expression vector comprising the polynucleotide, a transformant capable of expressing CYP008 by introducing the expression vector and the transformation It provides a method for producing CYP008 using a sieve.
본 발명에서 제공하는 상기 신규한 CYP를 코딩하는 폴리뉴클레오티드는 특별히 이에 제한되지 않으나, 세베키아 베니하나 균주에서 유래된 폴리뉴클레오티드가 될 수 있는데, 바람직하게는 서열번호 2의 폴리뉴클레오티드 서열 또는 이와 70% 이상, 보다 바람직하게는 80% 이상, 보다 바람직하게는 90% 이상의 상동성을 가지는 염기 서열을 가지는 폴리뉴클레오티드일 수 있으나, 특별히 이에 제한되지는 않는다.The polynucleotide encoding the novel CYP provided by the present invention is not particularly limited, but may be a polynucleotide derived from a Severkibenihana strain, preferably the polynucleotide sequence of SEQ ID NO: 2 or 70% thereof. As described above, the polynucleotide having a base sequence having more than 80% homology, more preferably at least 80%, more preferably at least 90% may be, but is not particularly limited thereto.
본 발명의 용어 "발현벡터"란, 적합한 숙주 내에서 목적 유전자를 발현시킬 수 있도록 적합한 조절 서열에 작동 가능하게 연결된 유전자의 염기서열을 함유하는 DNA 제조물을 의미한다. 상기 조절 서열은 전사를 개시할 수 있는 프로모터, 그러한 전사를 조절하기 위한 임의의 오퍼레이터 서열, 적합한 mRNA 리보좀 결합 부위를 코딩하는 서열, 및 전사 및 해독의 종결을 조절하는 서열을 포함하고, 그 외에 시그널 펩타이드를 코드하는 DNA, 인핸서 서열, 원하는 유전자의 5'측 및 3'측의 비번역 영역, 선택마커 영역, 또는 복제가능단위 등을 적절하게 포함할 수도 있다. 상기 발현 벡터는 표준적인 재조합 DNA 기술을 이용하여 제조 및 정제될 수 있다. 상기 발현 벡터의 종류는 원핵세포 및 진핵세포의 각종 숙주 세포에서 원하는 유전자를 발현하고, 원하는 단백질을 생산하는 기능을 하는 한 특별히 한정되지 않지만, 강력한 활성을 나타내는 프로모터와 강한 발현력을 보유하면서 자연 상태와 유사한 형태의 외래 단백질을 대량으로 생산할 수 있는 벡터가 바람직하다. 통상 사용되는 벡터의 예로는 천연 상태이거나 재조합된 상태의 플라스미드, 코스미드, 바이러스 및 박테리오파지를 들 수 있다. 예를 들어, 파지 벡터 또는 코스미드 벡터로서 pWE15, M13, λEMBL3, λEMBL4, λFIXII, λDASHII, λZAPII, λgt10, λgt11, Charon4A, 및 Charon21A 등을 사용할 수 있으며, 플라스미드 벡터로서 pDZ 벡터, pBR계, pUC계, pBluescriptII계, pGEM계, pTZ계, pCL계 및 pET계 등을 사용할 수 있다. 사용 가능한 벡터는 특별히 제한되는 것이 아니며 공지된 발현 벡터를 사용할 수 있다. 바람직하게는 pDZ 벡터 등을 사용할 수 있다. 본 발명의 목적상 상기 발현벡터는 CYP008을 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 포함하여, CyA의 수산화를 매개하는 CYP008을 발현시키기 위하여 사용될 수 있으나, 특별히 이에 제한되지는 않는다.
As used herein, the term “expression vector” refers to a DNA preparation containing a nucleotide sequence of a gene operably linked to a suitable regulatory sequence so as to express a gene of interest in a suitable host. The regulatory sequence includes a promoter capable of initiating transcription, any operator sequence for regulating such transcription, a sequence encoding a suitable mRNA ribosomal binding site, and a sequence regulating termination of transcription and translation, and other signals DNAs encoding peptides, enhancer sequences, untranslated regions on 5 'and 3' sides of the gene of interest, selection marker regions, or replicable units, etc. may be appropriately included. The expression vector can be prepared and purified using standard recombinant DNA techniques. The expression vector is not particularly limited as long as it expresses a desired gene in various host cells of prokaryotic and eukaryotic cells and produces a desired protein. However, the expression vector has a promoter that exhibits strong activity, A vector capable of producing a large amount of exogenous protein in a form similar to that of the wild type. Examples of commonly used vectors include natural or recombinant plasmids, cosmids, viruses and bacteriophages. For example, pWE15, M13, [lambda] EMBL3, [lambda] EMBL4, [lambda] FIXII, [lambda] DASHII, [lambda] ZAPII, [lambda] gt10, [lambda] gt11, Charon4A, and Charon21A can be used as the phage vector or cosmid vector. , pBluescriptII system, pGEM system, pTZ system, pCL system and pET system can be used. The vector which can be used is not specifically limited, A well-known expression vector can be used. Preferably, a pDZ vector or the like can be used. For the purpose of the present invention, the expression vector may be used to express CYP008, which mediates the hydroxylation of CyA, including polynucleotides encoding CYP008, but is not particularly limited thereto.
본 발명에서 용어, "형질전환체"는 하나 이상의 목적 단백질을 암호화하는 유전자를 갖는 벡터가 숙주세포에 도입되어 목적 단백질을 발현시키도록 형질이 감염된 세포를 의미하며, 진핵세포, 원핵세포 등의 모든 세포가 될 수 있는데, 특별히 이에 제한되지 않으나, 대장균, 스트렙토미세스, 살모넬라 티피뮤리움 등의 박테리아 세포; 효모 세포; 피치아 파스토리스 등의 균류 세포; 드로조필라, 스포도프테라 Sf9 세포 등의 곤충 세포; CHO, COS, NSO, 293, 보우 멜라노마 세포 등의 동물 세포; 또는 식물 세포가 될 수 있다.
As used herein, the term "transformer" refers to a cell that has been transfected so that a vector having a gene encoding one or more target proteins is introduced into the host cell to express the target protein, and all eukaryotic cells, prokaryotic cells, and the like. Cells, but are not particularly limited to bacterial cells such as E. coli, Streptomyces, Salmonella typhimurium; Yeast cells; Fungal cells such as Pichia pastoris; Insect cells such as Drosophila and Spodoptera Sf9 cells; Animal cells such as CHO, COS, NSO, 293, Bowmanella cells; Or plant cells.
본 발명에서 제공하는 CYP008을 생산하는 방법은 (ⅰ) 상기 형질전환체를 배양하여 배양물을 수득하는 단계; 및 (ⅱ) 상기 배양물로부터 CYP008을 회수하는 단계를 포함한다.
Method for producing a CYP008 provided by the present invention comprises the steps of (iii) culturing the transformant to obtain a culture; And (ii) recovering CYP008 from the culture.
상기 본 발명의 목적을 달성하기 위한 또 다른 실시양태로서, 본 발명은 CYP 및 전자전이 효소를 코딩하는 각각의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 발현벡터, 상기 발현벡터가 도입된 형질전환체 및 상기 형질전환체를 이용하여 4-(γ-hydroxy)-CyA를 생산하는 방법을 제공하는 것이다.
As another embodiment for achieving the object of the present invention, the present invention is an expression vector comprising each polynucleotide encoding the CYP and electron transfer enzyme, the transformant is introduced with the expression vector and the transformant To provide a method for producing 4- (γ-hydroxy) -CyA.
본 발명자들은 세베키아 베니하나로부터 유래된 신규한 CYP인 CYP008이 CyA의 수산화를 매개할 수 있는지를 확인하기 위하여, 두개의 수산화 효소(CTY506 및 CYP008)를 코딩하는 유전자와 3세트의 전자전이 효소를 코딩하는 유전자를 조합하여 포함하는 발현벡터(pYJ1621, pYJ1623, pYJ1625)를 제작하고(실시예 2), 상기 제작된 각 발현벡터를 세베키아 베니하나에 도입하여 형질전환체(YJ405, YJ407, YJ409)를 제작하였으며(실시예 3), 이들 형질전환체에 목적하는 수산화 효소를 코딩하는 유전자와 전자전이 효소를 코딩하는 유전자가 정상적으로 도입되었는지의 여부를 확인하고(실시예 4, 5, 6), 이들 제작된 각각의 형질전환체를 액체배지 또는 고체배지에서 배양한 결과, 야생형 세베키아 베니하나보다 4-(γ-hydroxy)-CyA을 1.1 내지 1.8배의 높은 함량으로 생산할 수 있음을 확인하였다(실시예 7, 8).
In order to determine whether CYP008, a novel CYP derived from Severkia Benihana, can mediate the hydroxylation of CyA, we used a gene encoding two hydroxylases (CTY506 and CYP008) and three sets of electron transfer enzymes. An expression vector (pYJ1621, pYJ1623, pYJ1625) comprising a combination of coding genes was prepared (Example 2), and each of the prepared expression vectors was introduced into Severia benihana and transformants (YJ405, YJ407, YJ409). (Example 3), and confirmed whether the gene encoding the desired hydroxyl enzyme and the gene encoding the electron transfer enzyme to these transformants was normally introduced (Example 4, 5, 6), these As a result of culturing each transformant in a liquid medium or a solid medium, it was confirmed that 4- (γ-hydroxy) -CyA can be produced at a content of 1.1 to 1.8 times higher than that of wild-type Severkia Benihana. It was (Examples 7,8).
본 발명의 용어 "전자전이 효소"란, 생체내 산화 또는 환원반응에 관여하는 효소에 보조인자인 NAD, NADP 등을 통하여 추진력(driving force)으로 사용되는 전자 또는 수소이온 등을 제공하는 효소를 의미한다. 통상적으로, 퓨티다레독신(putidaredoxin)과 퓨티다레독신 환원효소(putidaredoxin reductase), 페레독신(ferredoxin)과 페레독신 환원효소(ferredoxin reductase), 플라보독신(flavodoxin)과 플라보독신 환원효소(flavodoxin reductase) 등과 같이 두개의 단백질이 쌍을 이루어 형성된다. 본 발명의 목적상 상기 전자전이 효소는 CYP에 수소이온을 공급하여 CYP에 의하여 CyA를 수산화시키기 위한 추진력을 제공하는 데 사용된다.
As used herein, the term "electron transfer enzyme" refers to an enzyme that provides electrons or hydrogen ions, etc., which are used as a driving force through NAD, NADP, etc., which are cofactors, to enzymes involved in the oxidation or reduction reaction in vivo. . Typically, putidaredoxin and putidaredoxin reductase, ferredoxin and perredoxin reductase, flavodoxin and flavodoxin reductase And two proteins are formed in pairs. For the purposes of the present invention, the electron transfer enzyme is used to supply hydrogen ions to CYP to provide a driving force for hydroxylating CyA by CYP.
상기 CYP 및 전자전이 효소를 코딩하는 각각의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 발현벡터는 상기 CYP를 코딩하는 폴리뉴클레오티드와 전자전이 효소를 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 포함하도록 구성되는데, 특별히 이에 제한되지는 않으나, 상기 CYP를 코딩하는 폴리뉴클레오티드는 바람직하게는 1종 또는 2종 이상의 CYP를 코딩하는 폴리뉴클레오티가 연속적으로 연결되도록 구성될 수도 있고, 보다 바람직하게는 숙주세포로 사용되는 세베키아 베니하나로부터 유래된 다양한 CYP를 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 조합하여 연속적으로 연결되도록 구성될 수도 있으며, 가장 바람직하게는 CYP506을 코딩하는 폴리뉴클레오티드와 CYP008을 코딩하는 폴리뉴클레오티드가 연속적으로 연결되도록 구성된 발현벡터를 사용함이 바람직하다. 아울러, 상기 전자전이 효소를 코딩하는 폴리뉴클레오티드는 상기 효소를 구성하는 두 개의 단백질(퓨티다레독신과 퓨티다레독신 환원효소, 페레독신과 페레독신 환원효소, 플라보독신과 플라보독신 환원효소 등)을 코딩하는 폴리뉴클레오티드가 연속적으로 연결되도록 구성될 수도 있고, 상기 전자전이 효소는 1종 또는 2종이상을 포함할 수도 있으나, 특별히 이에 제한되지는 않는다.
The expression vector comprising each of the polynucleotides encoding the CYP and the electron transfer enzyme is constructed to include the polynucleotide encoding the CYP and the polynucleotide encoding the electron transfer enzyme, May be constructed such that polynucleotides encoding one or more CYPs are continuously connected, and more preferably, a polynucleotide encoding a variety of polynucleotides derived from Sebecia vanilan, which is used as a host cell It is preferable to use an expression vector constructed such that a polynucleotide encoding CYP506 and a polynucleotide encoding CYP008 are continuously connected to each other, and most preferably, a polynucleotide encoding CYP008 and a polynucleotide encoding CYP008 are continuously connected. In addition, the polynucleotide encoding the electron transfer enzyme is composed of two proteins constituting the enzyme (putidaredoxin and putidaredoxin reductase, perredoxin and perredoxin reductase, flavodoxin and flavodoxin reductase, etc.) The polynucleotide encoding the may be configured to be connected continuously, the electron transfer enzyme may include one or two or more, but is not particularly limited thereto.
상기 CYP 및 전자전이 효소를 코딩하는 각각의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 발현벡터가 도입된 형질전환체는 특별히 이에 제한되지 않으나, 적어도 CyA를 수산화시킬 수 있는 숙주세포에 상기 발현벡터가 도입되어, 4-(γ-hydroxy)-CyA의 생산량을 증가시키도록 변이된 세포가 될 수 있고, 상기 CyA를 수산화시킬 수 있는 숙주세포는 특별히 이에 제한되지 않으나, 바람직하게는 CyA를 수산화시킬 수 있는 방선균류의 미생물이 될 수 있고, 보다 바람직하게는 CyA를 수산화시킬 수 있는 세베키아 속 미생물이 될 수 있으며, 가장 바람직하게는 CyA를 수산화시킬 수 있는 세베키아 베니하나가 될 수 있다.
The transformant into which the expression vector containing each polynucleotide encoding the CYP and the electron transfer enzyme is introduced is not particularly limited thereto, and the expression vector is introduced into a host cell capable of hydroxylating at least CyA. Host cells capable of becoming mutated cells to increase the production of (γ-hydroxy) -CyA, and which can hydroxylate the CyA are not particularly limited thereto, but preferably microorganisms of actinomycetes capable of hydroxylating CyA. It may be, and more preferably may be a Severkier microorganism capable of hydroxylating CyA, and most preferably it may be a Severkia benihana capable of hydroxylating CyA.
본 발명에서 제공하는 4-(γ-hydroxy)-CyA를 생산하는 방법은 (ⅰ) 사이토크롬 P450 수산화효소(CYP) 및 전자전이 효소를 코딩하는 각각의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 발현벡터를 제작하는 단계; (ⅱ) 상기 제작된 발현벡터를 CyA를 수산화시킬 수 있는 숙주세포에 도입하여 형질전환체를 제작하는 단계; (ⅲ) 상기 형질전환체를 배양하여 배양물을 수득하는 단계; 및, (ⅳ) 상기 배양물로부터 4-(γ-hydroxy)-CyA를 회수하는 단계를 포함한다. The method for producing 4- (γ-hydroxy) -CyA provided by the present invention comprises the steps of: (i) preparing an expression vector comprising each polynucleotide encoding a cytochrome P450 hydroxylase (CYP) and an electron transfer enzyme; ; (Ii) preparing a transformant by introducing the prepared expression vector into a host cell capable of hydroxylating CyA; (Iii) culturing the transformant to obtain a culture; And (iii) recovering 4- (γ-hydroxy) -CyA from the culture.
이때, 상기 CYP는 특별히 이에 제한되지 않으나, 바람직하게는 세베키아 속 미생물 유래의 CYP가 될 수 있고, 보다 바람직하게는 세베키아 베니하나 유래의 CYP가 될 수 있으며, 가장 바람직하게는 세베키아 베니하나 유래의 CYP501, CYP502, CYP503, CYP504, CYP506, CYP008 및 이들의 조합이 될 수 있다. At this time, the CYP is not particularly limited thereto, but may preferably be a CYP derived from the genus Severkia, more preferably may be a CYP derived from Severkia benihana, and most preferably, Severkia benihana. Derived from CYP501, CYP502, CYP503, CYP504, CYP506, CYP008 and combinations thereof.
또한, 전자전이 효소는 특별히 이에 제한되지 않으나, P. putida 유래의 퓨티다레독신(putidaredoxin)과 퓨티다레독신 환원효소(putidaredoxin reductase), S. benihana 유래의 페레독신(ferredoxin)과 S. coelicolor A3(2) 유래의 페레독신 환원효소(ferredoxin reductase), E. coli 유래의 플라보독신(flavodoxin)과 플라보독신 환원효소(flavodoxin reductas) 등이 될 수 있다. In addition, the electron transfer enzyme is not particularly limited, but putidaredoxin (putidaredoxin) and putidaredoxin reductase derived from P. putida , ferredoxin ( S. benihana ) and S. coelicolor A3 ( 2) can be derived from ferredoxin reductase (ferredoxin reductase), flavodoxin (flavodoxin) and flavodoxin reductase (flavodoxin reductas) derived from E. coli .
바람직하게는, CYP로서 CYP506 및 CYP008을 포함하고 전자전이 효소로서 퓨티다레독신과 퓨티다레독신 환원효소를 포함하는 조합, CYP로서 CYP506 및 CYP008을 포함하고 전자전이 효소로서 페레독신과 페레독신 환원효소를 포함하는 조합, CYP로서 CYP506 및 CYP008을 포함하고 전자전이 효소로서 플라보독신과 플라보독신 환원효소를 포함하는 조합 등을 사용할 수 있으나, 특별히 이에 제한되지는 않는다.
Preferably, a combination comprising CYP506 and CYP008 as CYP and containing putidaredoxin and putidaredoxin reductase as electron transfer enzyme, and CYP506 and CYP008 as CYP and peredoxin and peredoxin reductase as electron transfer enzyme Combinations including CYP506 and CYP008 as CYP, and combinations including flavodoxin and flavodoxin reductase as electron transfer enzymes, but are not particularly limited thereto.
아울러, 상기 숙주세포는 특별히 이에 제한되지 않으나, CyA를 수산화시킬 수 있는 방선균류의 미생물이 될 수 있고, 보다 바람직하게는 CyA를 수산화시킬 수 있는 세베키아 속 미생물이 될 수 있으며, 가장 바람직하게는 CyA를 수산화시킬 수 있는 세베키아 베니하나가 될 수 있다. In addition, the host cell is not particularly limited thereto, but may be a microorganism of actinomycetes capable of hydroxylating CyA, and more preferably, may be a microorganism of the genus Sebekia, which is capable of hydroxylating CyA, most preferably. It can be Severkia Benihana which can hydroxylate CyA.
상기 형질전환체의 배양은 특별히 이에 제한되지 않으나, 배지의 종류에 따라 액체배양, 고체배양 등의 방법으로 수행될 수 있고, 배지성분의 공급방법에 따라 회분식 배양방법, 연속식 배양방법, 유가식 배양방법 등에 의해 수행됨이 바람직하고, 배양조건은 특별히 이에 제한되지 않으나, 염기성 화합물(예: 수산화나트륨, 수산화칼륨 또는 암모니아) 또는 산성 화합물(예: 인산 또는 황산)을 사용하여 적정 pH(pH 5 내지 9, 바람직하게는 pH 6 내지 8, 가장 바람직하게는 pH 6.8)를 조절할 수 있고, 산소 또는 산소-함유 가스 혼합물을 배양물에 도입시켜 호기성 조건을 유지할 수 있으며, 배양온도는 20 내지 45℃, 바람직하게는 25 내지 40℃를 유지할 수 있고, 약 10 내지 160시간 동안 배양함이 바람직하다. 상기 배양에 의하여 생산된 오르니틴은 배지중으로 분비되거나 세포내에 잔류할 수 있다.The culturing of the transformant is not particularly limited thereto, but may be performed by liquid culture, solid culture, or the like according to the type of medium, and may be batch culture method, continuous culture method, or fed-batch type according to the medium component supply method. It is preferably carried out by a culturing method, and the culturing conditions are not particularly limited thereto, but using a basic compound (eg sodium hydroxide, potassium hydroxide or ammonia) or an acidic compound (eg phosphoric acid or sulfuric acid) at an appropriate pH (pH 5 to 9, preferably pH 6 to 8, most preferably pH 6.8), can be introduced to the culture to maintain aerobic conditions by introducing an oxygen or oxygen-containing gas mixture, the culture temperature is 20 to 45 ℃, Preferably 25 to 40 ℃ can be maintained, it is preferable to incubate for about 10 to 160 hours. Ornithine produced by the culture may be secreted into the medium or remain in the cells.
아울러, 사용되는 배양용 배지는 탄소 공급원으로는 당 및 탄수화물(예: 글루코오스, 슈크로오스, 락토오스, 프럭토오스, 말토오스, 몰라세, 전분 및 셀룰로오스), 유지 및 지방(예: 대두유, 해바라기씨유, 땅콩유 및 코코넛유), 지방산(예: 팔미트산, 스테아르산 및 리놀레산), 알콜(예: 글리세롤 및 에탄올) 및 유기산(예: 아세트산) 등을 개별적으로 사용하거나 또는 혼합하여 사용할 수 있고; 질소 공급원으로는 질소-함유 유기 화합물(예: 펩톤, 효모 추출액, 육즙, 맥아 추출액, 옥수수 침지액, 대두 박분 및 우레아), 또는 무기 화합물(예: 황산암모늄, 염화암모늄, 인산암모늄, 탄산암모늄 및 질산암모늄) 등을 개별적으로 사용하거나 또는 혼합하여 사용할 수 있으며; 인 공급원으로서 인산 이수소칼륨, 인산수소이칼륨, 이에 상응하는 나트륨 함유 염 등을 개별적으로 사용하거나 또는 혼합하여 사용할 수 있고; 기타 금속염(예: 황산마그네슘 또는 황산철), 아미노산 및 비타민과 같은 필수성장-촉진 물질을 포함할 수 있다.
In addition, the culture medium used may include sugars and carbohydrates (e.g. glucose, sucrose, lactose, fructose, maltose, molasses, starch and cellulose), fats and fats (e.g. soybean oil, sunflower seeds) as carbon sources. Oils, peanut oils and coconut oils), fatty acids (e.g. palmitic acid, stearic acid and linoleic acid), alcohols (e.g. glycerol and ethanol) and organic acids (e.g. acetic acid), etc. may be used individually or in combination ; Nitrogen sources include nitrogen-containing organic compounds such as peptone, yeast extract, gravy, malt extract, corn steep liquor, soybean meal and urea, or inorganic compounds such as ammonium sulfate, ammonium chloride, ammonium phosphate, ammonium carbonate and Ammonium nitrate) and the like can be used individually or in combination; As a source of phosphorus, potassium dihydrogen phosphate, dipotassium hydrogen phosphate, a corresponding sodium-containing salt, and the like can be used individually or in combination; Other metal salts such as magnesium sulfate or iron sulfate, and essential growth-promoting substances such as amino acids and vitamins.
본 발명의 수산화된 사이클로스포린 A의 생산방법을 이용하면, 종래의 방법보다 4-(γ-hydroxy)-CyA를 높은 효율로 생산할 수 있으므로, 다양한 발모제의 개발 및 생산에 널리 활용될 수 있을 것이다.
By using the production method of the hydroxylated cyclosporin A of the present invention, since it can produce 4- (γ-hydroxy) -CyA with higher efficiency than the conventional method, it will be widely used in the development and production of various hair regrowth.
도 1은 4-(γ-hydroxy)-CyA를 생산하기 위한 발현벡터의 구성을 나타내는 개략도이다.
도 2는 S. benihana의 conjugation을 통한 형질 전환 방법을 나타내는 개략도이다.
도 3a는 발현벡터 pYJ1621에 포함된 목적하는 유전자(CYP506, CYP008, camA 및 camB)를 나타내는 개략도이고,
도 3b는 YJ405의 genomic DNA를 PCR 증폭시킨 결과를 나타내는 전기영동사진이다.
도 3c는 YJ405의 genomic DNA를 southern blot hybridization 방법으로 분석한 결과를 나타내는 전기영동사진이다.
도 4a는 발현벡터 pYJ1623에 포함된 목적하는 유전자(CYP506, CYP008, FD506 및 SCO0681)를 나타내는 개략도이다.
도 4b는 YJ407의 genomic DNA를 PCR 증폭시킨 결과를 나타내는 전기영동사진이다.
도 4c는 YJ407의 genomic DNA를 southern blot hybridization 방법으로 분석한 결과를 나타내는 전기영동사진이다.
도 5a는 발현벡터 pYJ1625에 포함된 목적하는 유전자(CYP506, CYP008, fldA 및 fpr)를 나타내는 개략도이다.
도 5b는 YJ409의 genomic DNA를 PCR 증폭시킨 결과를 나타내는 전기영동사진이다.
도 5c는 YJ409의 genomic DNA를 southern blot hybridization 방법으로 분석한 결과를 나타내는 전기영동사진이다.
도 6은 대조군의 균주에서 생산된 4-(γ-hydroxy)-CyA를 HPLC-ESI-MS로 분석한 결과이다.
도 7은 액체배양 방법으로 생산된 4-(γ-hydroxy)-CyA의 수산화율을 분석한 결과이다.
도 8은 고체배양 방법으로 생산된 4-(γ-hydroxy)-CyA의 수산화율을 분석한 결과이다.1 is a schematic diagram showing the configuration of an expression vector for producing 4- (γ-hydroxy) -CyA.
Figure 2 is a schematic diagram showing a transformation method through conjugation of S. benihana .
Figure 3a is a schematic diagram showing the genes of interest (CYP506, CYP008, camA and camB ) contained in the expression vector pYJ1621,
Figure 3b is an electrophoresis picture showing the result of PCR amplification of genomic DNA of YJ405.
Figure 3c is an electrophoresis picture showing the results of analyzing the genomic DNA of YJ405 by southern blot hybridization method.
4A is a schematic diagram showing the genes of interest (CYP506, CYP008, FD506, and SCO0681) included in the expression vector pYJ1623.
Figure 4b is an electrophoresis picture showing the result of PCR amplification of genomic DNA of YJ407.
4C is an electrophoresis image showing the result of analysis of the genomic DNA of YJ407 by Southern blot hybridization.
Figure 5a is a schematic diagram showing the genes of interest (CYP506, CYP008, fldA and fpr ) contained in the expression vector pYJ1625.
Figure 5b is an electrophoresis picture showing the result of PCR amplification of genomic DNA of YJ409.
Figure 5c is an electrophoresis picture showing the results of analyzing the genomic DNA of YJ409 by southern blot hybridization method.
Figure 6 is the result of analyzing the 4- (γ-hydroxy) -CyA produced in the strain of the control by HPLC-ESI-MS.
7 shows the results of analyzing the hydroxylation rate of 4- (γ-hydroxy) -CyA produced by the liquid culture method.
8 is a result of analyzing the hydroxylation rate of 4- (γ-hydroxy) -CyA produced by the solid culture method.
이하 본 발명을 실시예를 통하여 보다 상세하게 설명한다. 그러나 이들 실시예는 본 발명을 예시적으로 설명하기 위한 것으로 본 발명의 범위가 이들 실시예에 한정되는 것은 아니다.
Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to examples. However, these examples are for illustrative purposes only, and the scope of the present invention is not limited to these examples.
실시예Example
1: 사이클로스포린 A의 수산화를 매개하는 1: mediating the hydroxylation of cyclosporin A
신규한New
CYPCYP
유전자의 선발 Selection of genes
사이클로스포린 A의 수산화율을 향상시키기 위하여, S. benihana(KTTC 9610)의 genome 분석을 통해 공지된 5종의 CYP 유전자 이외에 신규한 16종의 CYP 유전자를 선발하였다(표 1).
In order to improve the hydroxylation rate of cyclosporin A, 16 new CYP genes were selected in addition to the five known CYP genes through genome analysis of S. benihana (KTTC 9610) (Table 1).
2
3
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CYP502
CYP503
CYP504
CYP506
CYP001
CYP002
CYP003
CYP004
CYP005
CYP006
CYP007
CYP008
CYP009
CYP010
CYP011
CYP012
CYP013
CYP014
CYP015
CYP016CYP501
CYP502
CYP503
CYP504
CYP506
CYP001
CYP002
CYP003
CYP004
CYP005
CYP006
CYP007
CYP008
CYP009
CYP010
CYP011
CYP012
CYP013
CYP014
CYP015
CYP016
Accession no. DI131915.1
Accession no. DI126285.1
Accession no. DI129591.1
Accession no. DI139785.1Accession no. DI130758.1
Accession no. DI131915.1
Accession no. DI126285.1
Accession no. DI129591.1
Accession no. DI139785.1
상기 표 1에서 보듯이, 6번 내지 21번의 16종의 CYP 유전자를 선발하였고, 상기 선발된 유전자 중에서 사이클로스포린 A의 수산화를 매개할 수 있는 활성을 나타내는 단백질을 코딩하는 유전자를 선별하기 위하여, 상기 각 유전자를 결실시킨 변이주를 각각 제작하고, 이들 각각의 변이주로부터 발현되는 수산화된 사이클로스포린 A(4-(γ-hydroxy)-CyA)의 발현량을 측정한 다음, 상기 4-(γ-hydroxy)-CyA의 발현량이 야생형 균주의 것보다도 감소된 균주를 선발한 결과, CYP008 유전자만이 사이클로스포린 A의 수산화를 매개할 수 있는 활성을 나타내는 단백질을 발현시킬 수 있음을 확인하였다.
As shown in Table 1, 16 to 21 CYP genes were selected, and in order to select a gene encoding a protein expressing an activity capable of mediating the hydroxylation of cyclosporin A from the selected genes, Mutant strains each having a gene deleted were prepared, and the expression level of hydroxylated cyclosporin A (4- (γ-hydroxy) -CyA) expressed from each of these strains was measured, and then the 4- (γ-hydroxy) -CyA was measured. As a result of selecting a strain whose expression level was reduced compared to that of the wild type strain, it was confirmed that only the CYP008 gene can express a protein exhibiting an activity capable of mediating the hydroxylation of cyclosporin A.
실시예Example
2: 4-(γ- 2: 4- (γ-
hydroxyhydroxy
)-) -
CyACyA
를 생산하기 위한 발현벡터의 제작Construction of Expression Vector to Produce
상기 사이클로스포린 A에 대한 수산화 활성을 나타내는 단백질을 코딩하는 것으로 확인된 CYP008 유전자와 이미 수산화 활성이 입증된 CYP506 유전자(NCBI accession No.: DI139785.1)를 포함하고, 전자전이 활성을 나타내는 단백질을 코딩하는 유전자를 포함하는 발현벡터를 제작하였다. 이때, 사용된 전자전이 활성을 나타내는 단백질을 코딩하는 유전자로는 3개의 그룹을 사용하였는데, 1번 그룹은 P. putida 유래의 putidaredoxin 유전자인 camB와 putidaredoxin reductase인 camA 유전자를 사용하였고, 2번 그룹은 S. benihana의 CYP506 유전자의 3'-downstream에 존재하는 ferredoxin 유전자인 FD506과 S. coelicolor A3(2) 유래의 ferredoxin reductase 유전자인 SCO0681을 사용하였으며, 3번 그룹은 E. coli 유래의 flavodoxin인 fldA 유전자와 ferredoxin (flavodoxin) reductase인 fpr 유전자를 사용하였다.A CYP008 gene confirmed to encode a protein exhibiting hydroxyl activity against cyclosporin A and a CYP506 gene (NCBI accession No .: DI139785.1), which have already been demonstrated to exhibit hydroxyl activity, encode a protein exhibiting electron transfer activity. An expression vector containing a gene was prepared. At this time, the electron transfer to the gene encoding a protein showing the activity were used for the three groups, 1 group was used camA gene, putidaredoxin gene camB and putidaredoxin reductase of P. putida origin, is one
상기 유전자들은 RBS(ribosome binding site)와 start codon 부터 stop codon까지의 염기서열이 포함되도록 PCR(polymerase chain reaction)을 수행함으로써 확보하였다. PCR에는 Tag 중합효소 (Genotech)를 사용 하였고, 사용한 프라이머는 CYP008 유전자를 증폭시키기 위한 서열번호 3 및 4의 프라이머, CYP506 유전자를 증폭시키기 위한 서열번호 5 및 6의 프라이머, camA 유전자를 증폭시키기 위한 서열번호 7 및 8의 프라이머, camB 유전자를 증폭시키기 위한 서열번호 9 및 10의 프라이머, FD506 유전자를 증폭시키기 위한 서열번호 11 및 12의 프라이머, SCO0681 유전자를 증폭시키기 위한 서열번호 13 및 14의 프라이머, fldA 유전자를 증폭시키기 위한 서열번호 15 및 16의 프라이머, 및 fpr 유전자를 증폭시키기 위한 서열번호 17 및 18의 프라이머를 사용하였고, 상기 각 프라이머의 염기서열은 표 2와 같다. PCR 증폭을 통해 얻은 각각의 유전자 단편은 EcoRI (또는 PacI)과 XbaI의 제한효소를 처리하여 pLitmus28 벡터에 클로닝을 하였다.
The genes were obtained by performing a polymerase chain reaction (RPC) to include a ribosome binding site (RBS) and nucleotide sequences from start codon to stop codon. Tag polymerase (Genotech) was used for PCR, and primers used were primers of SEQ ID NOs: 3 and 4 for amplifying the CYP008 gene, primers of SEQ ID NOs: 5 and 6 for amplifying the CYP506 gene, and sequences for amplifying the camA gene. No. 7 and 8 of the primer, SEQ ID NO: for amplifying
상기 2개의 수산화 활성을 나타내는 단백질을 코딩하는 유전자와 3그룹의 전자전이 활성을 나타내는 단백질을 코딩하는 유전자를 조합하여 포함하는 각각의 발현벡터를 제작하였다(도 1). 도 1은 4-(γ-hydroxy)-CyA를 생산하기 위한 발현벡터의 구성을 나타내는 개략도이다. 도 1에서 보듯이, 각각 3개의 발현벡터에서 프로모터로서는 ermE를 사용하고, 수산화 활성을 나타내는 단백질을 코딩하는 유전자로는 CYP008 유전자와 CYP506 유전자를 순차적으로 연결한 것을 공통적으로 사용하였으며, 전자전이 활성을 나타내는 단백질을 코딩하는 각 그룹의 유전자와 함께 pLitmus28 벡터에서 조합한 뒤 이를 integration 벡터인 pSET152로 클로닝하여 사이클로스포린 A의 수산화를 위한 발현벡터를 제작하였다. 이때, 1번 그룹을 포함하는 발현벡터를 "pYJ1621"라 명명하고, 2번 그룹을 포함하는 발현벡터를 "pYJ1623"라 명명하였으며, 3번 그룹을 포함하는 발현벡터를 "pYJ1625"라 명명하였다. Each expression vector was prepared comprising a combination of the genes encoding the two hydroxyl activity proteins and the gene encoding the three groups of electron transfer activity (FIG. 1). 1 is a schematic diagram showing the configuration of an expression vector for producing 4- (γ-hydroxy) -CyA. As shown in FIG. 1, ermE is used as a promoter in each of three expression vectors, and a gene connecting the CYP008 gene and the CYP506 gene is commonly used as a gene encoding a protein showing hydroxyl activity. The expression vector for cyclosporin A was prepared by combining the genes represented by the genes of each group in the pLitmus28 vector and cloning them into the integration vector pSET152. At this time, the expression
아울러, 음성대조군으로서 상기 2개의 수산화 활성을 나타내는 단백질을 코딩하는 유전자만을 포함하고 전자전이 활성을 나타내는 단백질을 코딩하는 유전자를 포함하지 않는 발현벡터를 제작하고, 이를 "pYJ1627"이라 명명하였다.
In addition, as a negative control group, an expression vector containing only the gene encoding the protein showing two hydroxyl activities and the gene encoding the protein showing the electron transfer activity was prepared and named "pYJ1627".
실시예Example
3: 4-(γ- 3: 4- (γ-
hydroxyhydroxy
)-) -
CyACyA
를 생산하기 위한 형질전환체의 제작Preparation of a transformant to produce
먼저, 상기 실시예 2에서 제작된 각각의 발현벡터를 E. coli ET12567/pUZ8002에 도입하여 각각의 형질전환체를 수득하고, 이들 형질전환체를 LB 액체배지에 아프라마이신 25㎍/㎖을 넣고 37℃에서 12시간 배양한 후, 1㎖의 배양액을 50㎖의 LB 액체배지에 옮기고, 37℃에서 광학 밀도 (optical density, OD600)가 0.4-0.5가 될 때까지 배양하였다. 배양액을 원심분리한 후, 항생제가 없는 LB 액체배지로 두 번 세척을 하고 500㎕의 LB로 농축을 하였다. First, each of the expression vectors prepared in Example 2 was introduced into E. coli ET12567 / pUZ8002 to obtain respective transformants, and 25 µg / ml of apramycin was added to the LB liquid medium. After 12 hours of incubation at 37 ° C., 1 ml of the culture was transferred to 50 ml of LB liquid medium and incubated at 37 ° C. until the optical density (OD600) was 0.4-0.5. The culture was centrifuged, washed twice with LB broth without antibiotics, and concentrated to 500 μl of LB.
한편, S. benihana spore 80㎕에 2xTY (trptone 0.16%, yeast extract 0.1%, NaCl 0.05%) 500㎕를 혼합한 뒤 원심분리하고 재현탁 한 후 50℃에서 10분 동안 열충격 (heat-shock)을 가하여, 균사액을 수득하였다.Meanwhile, 500 µl of 2xTY (trptone 0.16%, yeast extract 0.1%, NaCl 0.05%) was mixed with 80 µl of S. benihana spore, followed by centrifugation and resuspension, followed by heat-shock for 10 minutes at 50 ° C. In addition, mycelia were obtained.
상기 각각의 E. coli 농축액 500㎕와 균사액 500㎕를 혼합하고, 이들 각각의 혼합물을 mISP4 고체배지(Difco ISP4 medium 3.7%, yeast extract 0.05% and tryptone 0.15%)에 도포한 다음, 30℃에서 18-20시간 동안 배양하였다. 상기 배양된 고체배지에 30㎕/㎖의 날리딕신산(nalidixic acid)과 30㎕/㎖의 아프라마이신을 도말하고, 15-20일 동안 추가로 배양한 다음, 항생제 저항성을 나타내는 각각의 colony를 선별하였다(도 2). 도 2는 S. benihana의 conjugation을 통한 형질 전환 방법을 나타내는 개략도이다.500 μl of each E. coli concentrate and 500 μl of mycelia were mixed, and each of these mixtures was applied to a mISP4 solid medium (Difco ISP4 medium 3.7%, yeast extract 0.05% and tryptone 0.15%), and then at 30 ° C. Incubate for 18-20 hours. The cultured solid medium was plated with 30 μl / ml nalidixic acid and 30 μl / ml apramycin, further incubated for 15-20 days, and then each colony showing antibiotic resistance. Selected (FIG. 2). Figure 2 is a schematic diagram showing a transformation method through conjugation of S. benihana .
상기 발현벡터 pYJ1621가 도입된 형질전환체는 "YJ405"라 명명하고, 상기 발현벡터 pYJ1623이 도입된 형질전환체는 "YJ407"이라 명명하였으며, 상기 발현벡터 pYJ1625가 도입된 형질전환체는 "YJ409"라 명명하고, 음성대조군인 상기 발현벡터 pYJ1627이 도입된 형질전환체는 "YJ410"이라 명명하였다.
The transformant into which the expression vector pYJ1621 was introduced was named "YJ405", and the transformant into which the expression vector pYJ1623 was introduced was named "YJ407", and the transformant into which the expression vector pYJ1625 was introduced was "YJ409". The transformant into which the expression vector pYJ1627, which is a negative control group, was introduced was named "YJ410".
실시예Example
4: 1번 그룹이 도입된 형질전환체의 검정 4: Assay of transformants in which
상기 방법으로 제작된 각각의 형질전환체 중에서, 1번 그룹을 포함하는 발현벡터 pYJ1621가 도입된 형질전환체 YJ405에 목적하는 유전자(CYP506, CYP008, camA 및 camB)가 정상적으로 도입되었는지의 여부를 PCR 방법과 southern blot hybridization 방법으로 각각 검정하였다.
Among the transformants produced by the above method, PCR method was used to determine whether the target genes (CYP506, CYP008, camA and camB ) were normally introduced into the transformant YJ405 into which the expression vector pYJ1621 containing the first group was introduced. And southern blot hybridization methods, respectively.
먼저, PCR 방법의 경우, YJ405의 genomic DNA를 주형으로 하고 상기 표 5에 개시된 각각의 프라이머를 이용하여 PCR을 수행하여 PCR 절편을 수득하고, 상기 수득한 PCR 절편을 전기영동하였다(도 3a 및 3b). 도 3a는 발현벡터 pYJ1621에 포함된 목적하는 유전자(CYP506, CYP008, camA 및 camB)를 나타내는 개략도이고, 도 3b는 YJ405의 genomic DNA를 PCR 증폭시킨 결과를 나타내는 전기영동사진이다. 도 3b에서 보듯이, 상기 YJ405의 genomic DNA에는 1.3kb의 CYP8 유전자, 1.3kb의 CYP506 유전자, 1.3kb의 camA 유전자 및 0.3kb의 camB 유전자가 포함되어 있음을 확인하였다.
First, in the case of the PCR method, genomic DNA of YJ405 was used as a template, and PCR was performed using each primer described in Table 5 above to obtain PCR fragments, and the obtained PCR fragments were electrophoresed (FIGS. 3A and 3B). ). Figure 3a is a schematic diagram showing the desired genes (CYP506, CYP008, camA and camB ) contained in the expression vector pYJ1621, Figure 3b is an electrophoresis picture showing the results of PCR amplification of genomic DNA of YJ405. As shown in Figure 3b, it was confirmed that the genomic DNA of YJ405 contained 1.3kb CYP8 gene, 1.3kb CYP506 gene, 1.3kb camA gene and 0.3kb camB gene.
다음으로, southern blot hybridization 방법의 경우, YJ405의 genomic DNA를 대상으로 CYP008의 유전자 및 CYP506 유전자인 약 2.8kb의 유전자 영역을 검출할 수 있는 프로브 1(서열번호 19)과 키트(DIG labeling과 detection kit, Roche)를 사용한 southern blot hybridization 방법을 수행하였다(도 3c). 도 3c는 YJ405의 genomic DNA를 southern blot hybridization 방법으로 분석한 결과를 나타내는 전기영동사진이다. 도 3c에서 보듯이, probe로 사용한 DNA 단편의 크기인 2.8kb의 band가 확인되어 재조합 균주 YJ405 내에 수산화 유전자 및 전자전이 유전자가 삽입되었음을 확인할 수 있었다.
Next, in the southern blot hybridization method, probe 1 (SEQ ID NO: 19) and a kit (DIG labeling and detection kit) capable of detecting a gene region of about 2.8kb, which is the CYP008 gene and the CYP506 gene, were detected on genomic DNA of YJ405. Southern blot hybridization method using (Roche) (Fig. 3c). Figure 3c is an electrophoresis picture showing the results of analyzing the genomic DNA of YJ405 by southern blot hybridization method. As shown in FIG. 3c, a band of 2.8 kb, which is the size of the DNA fragment used as a probe, was confirmed to confirm that the hydroxyl gene and the electron transfer gene were inserted into the recombinant strain YJ405.
실시예Example
5: 2번 그룹이 도입된 형질전환체의 검정 5: Assay of transformants in which
상기 방법으로 제작된 각각의 형질전환체 중에서, 2번 그룹을 포함하는 발현벡터 pYJ1623이 도입된 형질전환체 YJ407에 목적하는 유전자(CYP506, CYP008, FD506 및 SCO0681)가 정상적으로 도입되었는지의 여부를 PCR 방법과 southern blot hybridization 방법으로 각각 검정하였다.
Whether or not the desired genes (CYP506, CYP008, FD506 and SCO0681 ) were normally introduced into the transformant YJ407 into which the expression vector pYJ1623 containing the second group among the transformants prepared by the above method was introduced was determined by the PCR method And southern blot hybridization, respectively.
먼저, PCR 방법의 경우, YJ407의 genomic DNA를 주형으로 하고 상기 표 5에 개시된 각각의 프라이머를 이용하여 PCR을 수행하여 PCR 절편을 수득하고, 상기 수득한 PCR 절편을 전기영동하였다(도 4a 및 4b). 도 4a는 발현벡터 pYJ1623에 포함된 목적하는 유전자(CYP506, CYP008, FD506 및 SCO0681)를 나타내는 개략도이고, 도 4b는 YJ407의 genomic DNA를 PCR 증폭시킨 결과를 나타내는 전기영동사진이다. 도 4b에서 보듯이, 상기 YJ407의 genomic DNA에는 1.3kb의 CYP8 유전자, 1.3kb의 CYP506 유전자, 0.2kb의 FD506 유전자 및 1.4kb의 SCO0681 유전자가 포함되어 있음을 확인하였다.
First, in the case of the PCR method, genomic DNA of YJ407 was used as a template, and PCR was performed using each of the primers described in Table 5 above to obtain PCR fragments, and the obtained PCR fragments were electrophoresed (FIGS. 4A and 4B). ). Figure 4a is a schematic diagram showing the desired genes (CYP506, CYP008, FD506 and SCO0681 ) contained in the expression vector pYJ1623, Figure 4b is an electrophoresis picture showing the result of PCR amplification of genomic DNA of YJ407. As shown in Figure 4b, it was confirmed that the genomic DNA of YJ407 contained 1.3kb CYP8 gene, 1.3kb CYP506 gene, 0.2kb FD506 gene and 1.4kb SCO0681 gene.
다음으로, southern blot hybridization 방법의 경우, YJ407의 genomic DNA를 대상으로 CYP008 유전자의 일부(제한효소 AscI 절단부위 이후), CYP506 유전자 및 FD506 유전자의 일부(제한효소 AscI 절단부위 이전)인 약 2.5kb의 유전자 영역을 검출할 수 있는 프로브 2(서열번호 20)와 키트(DIG labeling과 detection kit, Roche)를 사용한 southern blot hybridization 방법을 수행하였다(도 4c). 도 4c는 YJ407의 genomic DNA를 southern blot hybridization 방법으로 분석한 결과를 나타내는 전기영동사진이다. 도 4c에서 보듯이, probe로 사용한 DNA 단편의 크기인 2.5kb의 band가 확인되어 재조합 균주 YJ407 내에 수산화 유전자 및 전자전이 유전자가 삽입되었음을 확인할 수 있었다.
In the southern blot hybridization method, approximately 2.5 kb of genomic DNA of YJ407 (after restriction AscI cleavage site), CYP506 gene and FD506 gene (before restriction AscI cleavage site) were obtained. Southern blot hybridization was performed using probe 2 (SEQ ID NO: 20) and a kit (DIG labeling and detection kit, Roche) capable of detecting a gene region (FIG. 4C). 4C is an electrophoresis image showing the result of analysis of the genomic DNA of YJ407 by Southern blot hybridization. As shown in FIG. 4c, a band of 2.5 kb, which is the size of the DNA fragment used as the probe, was confirmed to confirm that the hydroxyl gene and the electron transfer gene were inserted into the recombinant strain YJ407.
실시예Example
6: 3번 그룹이 도입된 형질전환체의 검정 6: Assay of transformants in which
상기 방법으로 제작된 각각의 형질전환체 중에서, 3번 그룹을 포함하는 발현벡터 pYJ1625가 도입된 형질전환체 YJ409에 목적하는 유전자(CYP506, CYP008, fldA 및 fpr)가 정상적으로 도입되었는지의 여부를 PCR 방법과 southern blot hybridization 방법으로 각각 검정하였다.
Among the transformants produced by the above method, PCR method was used to determine whether the target genes (CYP506, CYP008, fldA, and fpr ) were normally introduced into transformant YJ409 into which the expression vector
먼저, PCR 방법의 경우, YJ409의 genomic DNA를 주형으로 하고 상기 표 5에 개시된 각각의 프라이머를 이용하여 PCR을 수행하여 PCR 절편을 수득하고, 상기 수득한 PCR 절편을 전기영동하였다(도 5a 및 5b). 도 5a는 발현벡터 pYJ1625에 포함된 목적하는 유전자(CYP506, CYP008, fldA 및 fpr)를 나타내는 개략도이고, 도 5b는 YJ409의 genomic DNA를 PCR 증폭시킨 결과를 나타내는 전기영동사진이다. 도 5b에서 보듯이, 상기 YJ409의 genomic DNA에는 1.3kb의 CYP8 유전자, 1.3kb의 CYP506 유전자, 0.5kb의 fldA 유전자 및 0.7kb의 fpr 유전자가 포함되어 있음을 확인하였다.
First, in the case of the PCR method, using genomic DNA of YJ409 as a template and performing PCR using each primer described in Table 5 above, PCR fragments were obtained, and the obtained PCR fragments were electrophoresed (FIGS. 5A and 5B). ). Figure 5a is a schematic diagram showing the desired genes (CYP506, CYP008, fldA and fpr ) contained in the expression vector pYJ1625, Figure 5b is an electrophoresis picture showing the result of PCR amplification of genomic DNA of YJ409. As shown in Figure 5b, it was confirmed that the genomic DNA of YJ409 contains 1.3kb CYP8 gene, 1.3kb CYP506 gene, 0.5kb fldA gene and 0.7kb fpr gene.
다음으로, southern blot hybridization 방법의 경우, YJ409의 genomic DNA를 대상으로 CYP506 유전자의 일부(제한효소 NruI 절단부위 이후) 및 fldA 유전자의 일부(제한효소 SspI 절단부위 이전)인 약 1.9kb의 유전자 영역을 검출할 수 있는 프로브 3(서열번호 21)과 키트(DIG labeling과 detection kit, Roche)를 사용한 southern blot hybridization 방법을 수행하였다(도 5c). 도 5c는 YJ409의 genomic DNA를 southern blot hybridization 방법으로 분석한 결과를 나타내는 전기영동사진이다. 도 5c에서 보듯이, probe로 사용한 DNA 단편의 크기인 1.9kb의 band가 확인되어 재조합 균주 YJ409 내에 수산화 유전자 및 전자전이 유전자가 삽입되었음을 확인할 수 있었다.
Next, in the southern blot hybridization method, a gene region of about 1.9 kb, which is a part of the CYP506 gene (after the restriction enzyme NruI cleavage site) and a part of the fldA gene (before the restriction enzyme SspI cleavage site), was selected for genomic DNA of YJ409. Southern blot hybridization using a probe 3 (SEQ ID NO: 21) and a kit (DIG labeling and detection kit, Roche) was performed (FIG. 5C). Figure 5c is an electrophoresis picture showing the results of analyzing the genomic DNA of YJ409 by southern blot hybridization method. As shown in Figure 5c, the band of 1.9kb, the size of the DNA fragment used as a probe was confirmed that the hydroxyl gene and the electron transfer gene was inserted into the recombinant strain YJ409.
실시예Example
7: 액체배양 방법을 이용한 4-(γ- 7: Production of 4- (γ-
hydroxyhydroxy
)-) -
CyACyA
의 생산Production of
상기 제작된 각 형질전환체를 액체배양 방법으로 배양하여 4-(γ-hydroxy)-CyA를 생산하고, 생산된 4-(γ-hydroxy)-CyA의 함량을 측정하였다.
Each of the transformants prepared above was cultured in a liquid culture method to produce 4- (γ-hydroxy) -CyA, and the content of 4- (γ-hydroxy) -CyA produced was measured.
구체적으로, 상기 제작된 각 형질전환체를 아프라마이신 25㎍/㎖이 포함된 5㎖의 GSMY 액체배지(glucose 0.7%, soluble starch 0.75%, yeast extract 0.45%, malt extract 0.5%, calcium carbonate 0.005%)에 접종하고, 30℃에서 230rpm으로 진탕시키면서 3일동안 배양하였으며, 상기 각 배양물을 원심분리하여 각각의 균체를 수득하였다. 상기 수득한 각각의 균체 50㎎을 아프라마이신 25㎍/㎖이 포함된 50㎖의 GSMY 액체배지에 접종하고, 30℃에서 230rpm으로 진탕시키면서 2일동안 배양하였으며, 상기 각각의 배양물에 사이클로스포린 A 1.25㎎을 첨가한 다음, 동일한 조건하에서 3일동안 추가로 배양하였다. 배양이 종료되면, 배양물을 원심분리하여 각각의 균체를 수득하고, 이에 배양물 부피의 2배 부피의 에틸아세테이트를 가하여 12시간 동안 방치시켰으며, 이로부터 각각의 에틸아세테이트 층을 수득하였다. 상기 수득한 에틸아세테이트 층으로부터 용매를 제거하여 각각의 시료를 수득하고, 이를 200㎕의 메탄올에 용해시킨 것을 HPLC 및 HPLC-ESI-MS 분석용 시료로서 사용하였다. 이때, 대조군으로는 야생형 균주를 사용하였다.
Specifically, each of the prepared transformants was a 5 ml GSMY liquid medium (glucose 0.7%, soluble starch 0.75%, yeast extract 0.45%, malt extract 0.5%, calcium carbonate 0.005 containing
HPLC(high performance liquid chromatography) 분석은, 기기(waters (Milford, MA) model 2690 separation module), 컬럼(Phenomenex 사의 Gemini 5u C18 110A, 250x4.60㎜, 5micron), 흡수 파장(210㎚), 펌프유속(1.00㎖/min), 펌프압력(50.0psi), 컬럼의 온도(50℃), 용매 A(25%의 메탄올), 용매 B(100%의 아세토나이트릴) 및 분석조건(0~4분 동안은 용매 B 40%, 5~20분 동안은 용매 B 61%, 21~40분 동안은 용매 B 100%, 45~60분 까지는 용매 B 40%)을 사용하여 수행하였다.
High performance liquid chromatography (HPLC) analysis was performed on instruments (waters (Milford, MA) model 2690 separation module), columns (Gemini 5u C18 110A from Phenomenex, 250 x 4.60 mm, 5 micron), absorption wavelength (210 nm), pump flow rate (1.00 mL / min), pump pressure (50.0 psi), column temperature (50 ° C.), solvent A (25% methanol), solvent B (100% acetonitrile) and analytical conditions (0-4 minutes)
HPLC-ESI-MS(HPLC-Electro Spray Ionization-mass spectrometry) 분석은, 기기(waters (Milford, MA) model 2690 separation module), 컬럼(XTetra? MS C18 3.5㎛, 2.1x50㎜), 용매 A(5mM 암모늄아세테이트 및 0.05% 아세트산 수용액), 용매 B(5mM 암모늄아세테이트 및 0.05% 아세트산이 용해된 80% 아세토나이트릴), 유속(0.22㎖/min), 분석 조건(0~40분 동안 용매 A 40%, 41~47분 동안 용매 A 5%, 48~60분까지는 용매 A 40%)을 사용하여 수행하였다. 상기 컬럼을 통과한 시료를 micromass((Baverly, MA) Quattro LC triple-tandem quadrupole mass spectrometer)를 통과시키고, 양이온 모드의 검출기에 적용하였다(도 6). 도 6은 대조군의 균주에서 생산된 4-(γ-hydroxy)-CyA를 HPLC-ESI-MS로 분석한 결과를 나타내는데, A는 HPLC-ESI-MS 크로마토그램을 나타내고, B는 ESI-MS 스펙트라를 나타낸다. 도 6에서 보듯이, 대조군인 S. benihana 야생형 균주에 의해 4-(γ-hydroxy)-CyA)가 생산될 뿐만 아니라, 수산화된 유도체 4번 methyl leucine 과 6번 methyl leucine 이 함께 수산화된 유도체(Di-4,6-(γ-hydroxy)-CyA)도 매우 소량으로 함께 생산됨을 확인하였다.
HPLC-ESI-MS (HPLC-Electro Spray Ionization-mass spectrometry) analysis was performed on the instrument (waters (Milford, MA) model 2690 separation module), column (XTetra® MS C18 3.5 μm, 2.1 × 50 mm), solvent A (5 mM) Ammonium acetate and 0.05% acetic acid aqueous solution), solvent B (80% acetonitrile with 5 mM ammonium acetate and 0.05% acetic acid), flow rate (0.22 mL / min), analytical conditions (40% solvent A for 0-40 minutes, 5% solvent A for 41-47 minutes, 40% solvent A for 48-60 minutes). Samples passed through the column were passed through a micromass ((Baverly, MA) Quattro LC triple-tandem quadrupole mass spectrometer) and applied to a detector in cationic mode (FIG. 6). Figure 6 shows the results of the analysis of 4- (γ-hydroxy) -CyA produced in the strain of the control by HPLC-ESI-MS, A shows the HPLC-ESI-MS chromatogram, B is the ESI-MS spectra Indicates. As shown in FIG. 6, not only 4- (γ-hydroxy) -CyA) is produced by the control S. benihana wild type strain, but also the
상술한 바와 같이, HPLC 및 HPLC-ESI-MS 분석을 수행한 결과는 도 7에 나타내었다. 도 7은 액체배양 방법으로 생산된 4-(γ-hydroxy)-CyA의 수산화율을 분석한 결과로서, A는 4-(γ-hydroxy)-CyA의 HPLC 크로마토그램을 나타내고, B는 4-(γ-hydroxy)-CyA의 생산량과 수산화율을 각 형질전환체별로 비교한 결과를 나타내는 그래프이며, a는 4-(γ-hydroxy)-CyA를 나타내고, b는 CyA를 나타낸다.As described above, the results of HPLC and HPLC-ESI-MS analysis are shown in FIG. 7. 7 is a result of analyzing the hydroxylation rate of 4- (γ-hydroxy) -CyA produced by the liquid culture method, A shows the HPLC chromatogram of 4- (γ-hydroxy) -CyA, B is 4- ( γ-hydroxy) -CyA is a graph showing the result of comparing the production rate and the hydroxyl ratio of each transformant, a represents 4- (γ-hydroxy) -CyA, b represents CyA.
상기 도 7에서 보듯이, 4-(γ-hydroxy)-CyA의 생산량을 비교하면, 대조군에서는 0.55㎎(생전환률 44%)이 생산되었고, 음성대조군인 형질전환체 YJ410에서는 0.56㎎(생전환률 45%)이 생산되었으며, 형질전환체 YJ405에서는 0.63㎎(생전환률 50%)이 생산되었으며, 형질전환체 YJ407에서는 0.61㎎(생전환률 49%)이 생산되었고, 형질전환체 YJ409에서는 0.84㎎(생전환률 67%)이 생산됨을 확인하였다. As shown in FIG. 7, when the production amount of 4- (γ-hydroxy) -CyA is compared, 0.55 mg (44% of bioconversion rate) was produced in the control group, and 0.56 mg (45% of bioconversion rate) in the transformant YJ410, a negative control group. %) Was produced, 0.63 mg (50% live conversion rate) was produced in transformant YJ405, 0.61 mg (49% live conversion rate) was produced in transformant YJ407, and 0.84 mg (birth conversion rate) in transformant YJ409. 67%) was produced.
이처럼, 대조군과 수산화 효소만이 과발현되는 음성대조군(YJ410)을 비교하면 4-(γ-hydroxy)-CyA의 생산량에 별다른 차이를 나타내지 않음에 반하여, 전자전이 효소가 추가로 과발현되는 각 형질전환체(YJ405, YJ407 및 YJ409)는 1.1 내지 1.5배로 향상된 생산량으로 4-(γ-hydroxy)-CyA를 생산함을 확인하였다.As such, when comparing the control group and the negative control group (YJ410) overexpressed only the hydroxyl enzyme, there was no difference in the production of 4- (γ-hydroxy) -CyA, whereas each transformant was further overexpressed by the electron transfer enzyme. (YJ405, YJ407 and YJ409) was confirmed to produce 4- (γ-hydroxy) -CyA with 1.1 to 1.5-fold improved production.
따라서, 4-(γ-hydroxy)-CyA의 생산량을 증대시키기 위하여는 전자전이 효소를 단독으로 또는 수산화 효소와 함께 과발현시켜야 함을 알 수 있었다.
Therefore, in order to increase the production of 4- (γ-hydroxy) -CyA it was found that the electron transfer enzyme must be overexpressed alone or in combination with the hydroxylase.
실시예Example
8: 고체배양 방법을 이용한 4-(γ- 8: 4- (γ- using solid culture method
hydroxyhydroxy
)-) -
CyACyA
의 생산Production of
상기 제작된 각 형질전환체를 고체배양 방법으로 배양하여 4-(γ-hydroxy)-CyA를 생산하고, 생산된 4-(γ-hydroxy)-CyA의 함량을 측정하였다.
Each transformant prepared above was cultured by a solid culture method to produce 4- (γ-hydroxy) -CyA, and the content of 4- (γ-hydroxy) -CyA produced was measured.
구체적으로, 상기 제작된 각 형질전환체를 아프라마이신 25㎍/㎖이 포함된 5㎖의 GSMY 액체배지에 접종하고, 30℃에서 230rpm으로 진탕시키면서 3일동안 배양하였으며, 상기 각 배양물 20㎕을 1.25㎎의 사이클로스포린 A가 첨가된 GSMY 고체배지 50㎖에 도말하여 30℃에서 5일간 배양하였다. 배양이 종료되면, 상기 고체배지를 0.5-0.8㎜의 크기로 절단하고, 이에 메탄올을 가하여 추출한 다음, 진공건조기에 적용하여 농축하였다. 상기 메탄올 농축물에 혼합용매(물:에틸아세테이트=1:3, v/v)를 가하여 12시간 동안 방치시켰으며, 이로부터 각각의 에틸아세테이트 층을 수득하였다. 상기 수득한 에틸아세테이트 층으로부터 용매를 제거하여 각각의 시료를 수득하고, 이를 200㎕의 메탄올에 용해시킨 것을 HPLC 및 HPLC-ESI-MS 분석용 시료로서 사용하였다. 이때, 대조군으로는 야생형 균주를 사용하였다.
Specifically, the prepared transformants were inoculated in 5 ml GSMY liquid medium containing 25 µg / ml of apramycin, and cultured for 3 days while shaking at 230 rpm at 30 ° C., and 20 µl of each culture. Was smeared in 50 ml of GSMY solid medium to which 1.25 mg of cyclosporine A was added and incubated at 30 ° C. for 5 days. When the incubation was completed, the solid medium was cut into a size of 0.5-0.8 mm, methanol was added thereto, extracted, and then concentrated in a vacuum dryer. A mixed solvent (water: ethyl acetate = 1: 3, v / v) was added to the methanol concentrate and left to stand for 12 hours, thereby obtaining respective ethyl acetate layers. The solvent was removed from the obtained ethyl acetate layer to obtain each sample, which was dissolved in 200 µl of methanol and used as a sample for HPLC and HPLC-ESI-MS analysis. At this time, a wild type strain was used as a control group.
상기 시료를 사용한 HPLC 및 HPLC-ESI-MS 분석을 상기 실시예 7과 동일한 방법으로 수행하고, 그 결과는 도 8에 나타내었다. HPLC and HPLC-ESI-MS analysis using the sample were performed in the same manner as in Example 7, and the results are shown in FIG. 8.
도 8은 고체배양 방법으로 생산된 4-(γ-hydroxy)-CyA의 수산화율을 분석한 결과로서, A는 4-(γ-hydroxy)-CyA의 HPLC 크로마토그램을 나타내고, B는 4-(γ-hydroxy)-CyA의 생산량과 수산화율을 각 형질전환체별로 비교한 결과를 나타내는 그래프이며, a는 4-(γ-hydroxy)-CyA를 나타내고, b는 CyA를 나타낸다.8 is a result of analyzing the hydroxylation rate of 4- (γ-hydroxy) -CyA produced by the solid culture method, A shows the HPLC chromatogram of 4- (γ-hydroxy) -CyA, B is 4- ( γ-hydroxy) -CyA is a graph showing the result of comparing the production rate and the hydroxyl ratio of each transformant, a represents 4- (γ-hydroxy) -CyA, b represents CyA.
상기 도 8에서 보듯이, 4-(γ-hydroxy)-CyA의 생산량을 비교하면, 대조군에서는 0.55㎎(생전환률 44%)이 생산되었고, 음성대조군인 형질전환체 YJ410에서는 0.56㎎(생전환률 45%)이 생산되었으며, 형질전환체 YJ405에서는 0.69㎎(생전환률 55%)이 생산되었으며, 형질전환체 YJ407에서는 0.68㎎(생전환률 54%)이 생산되었고, 형질전환체 YJ409에서는 1.01㎎(생전환률 81%)이 생산됨을 확인하였다. As shown in FIG. 8, when the production amount of 4- (γ-hydroxy) -CyA is compared, 0.55 mg (44% of bioconversion rate) was produced in the control group, and 0.56 mg (conversion rate of 45) in the transformant YJ410, a negative control group. %) Was produced, 0.69 mg (55% live conversion rate) was produced in transformant YJ405, 0.68 mg (54% conversion rate) was produced in transformant YJ407, and 1.01 mg (birth conversion rate) in transformant YJ409. 81%) was produced.
상기 실시예 7의 결과와 동일하게, 대조군과 수산화 효소만이 과발현되는 음성대조군(YJ410)을 비교하면 4-(γ-hydroxy)-CyA의 생산량에 별다른 차이를 나타내지 않음에 반하여, 전자전이 효소가 추가로 과발현되는 각 형질전환체(YJ405, YJ407 및 YJ409)는 1.2 내지 1.8배로 향상된 생산량으로 4-(γ-hydroxy)-CyA를 생산함을 확인하였다.As in the result of Example 7, the negative control group (YJ410) overexpressing only the control and the hydroxyl enzyme showed no difference in the production of 4- (γ-hydroxy) -CyA, whereas the electron transfer enzyme In addition, it was confirmed that each of the transformants overexpressed (YJ405, YJ407 and YJ409) produced 4- (γ-hydroxy) -CyA with an improved yield of 1.2 to 1.8 times.
따라서, 4-(γ-hydroxy)-CyA의 생산량을 증대시키기 위하여는 전자전이 효소를 단독으로 또는 수산화 효소와 함께 과발현시켜야 함을 다시한번 알 수 있었다.
Therefore, in order to increase the production of 4- (γ-hydroxy) -CyA, it can be seen that the electron transfer enzyme must be overexpressed alone or together with the hydroxylase.
<110> Ewha University-Industry Collaboration Foundation SNU R&DB FOUNDATION <120> A novel Cytochrome P450 hydroxylase and process for preparing hydroxylated Cyclosporin A employing the same <130> PA111000/KR <160> 21 <170> KopatentIn 2.0 <210> 1 <211> 394 <212> PRT <213> CYP008 <400> 1 Val Asn Ile Asp Leu Val Asp Gln Asp His Tyr Ala Thr Phe Gly Pro 1 5 10 15 Pro His Glu Gln Met Arg Trp Leu Arg Glu His Ala Pro Val Tyr Trp 20 25 30 His Glu Gly Glu Pro Gly Phe Trp Ala Val Thr Arg His Glu Asp Val 35 40 45 Val His Val Ser Arg His Ser Asp Leu Phe Ser Ser Ala Arg Arg Leu 50 55 60 Ala Leu Phe Asn Glu Met Pro Glu Glu Gln Arg Glu Leu Gln Arg Met 65 70 75 80 Met Met Leu Asn Gln Asp Pro Pro Glu His Thr Arg Arg Arg Ser Leu 85 90 95 Val Asn Arg Gly Phe Thr Pro Arg Thr Ile Arg Ala Leu Glu Gln His 100 105 110 Ile Arg Asp Ile Cys Asp Asp Leu Leu Asp Gln Cys Ser Gly Glu Gly 115 120 125 Asp Phe Val Thr Asp Leu Ala Ala Pro Leu Pro Leu Tyr Val Ile Cys 130 135 140 Glu Leu Leu Gly Ala Pro Val Ala Asp Arg Asp Lys Ile Phe Ala Trp 145 150 155 160 Ser Asn Arg Met Ile Gly Ala Gln Asp Pro Asp Tyr Ala Ala Ser Pro 165 170 175 Glu Glu Gly Gly Ala Ala Ala Met Glu Val Tyr Ala Tyr Ala Ser Glu 180 185 190 Leu Ala Ala Gln Arg Arg Ala Ala Pro Arg Asp Asp Ile Val Thr Lys 195 200 205 Leu Leu Gln Ser Asp Glu Asn Gly Glu Ser Leu Thr Glu Asn Glu Phe 210 215 220 Glu Leu Phe Val Leu Leu Leu Val Val Ala Gly Asn Glu Thr Thr Arg 225 230 235 240 Asn Ala Ala Ser Gly Gly Met Leu Thr Leu Phe Glu His Pro Asp Gln 245 250 255 Trp Asp Arg Leu Val Ala Asp Pro Ser Leu Ala Ala Thr Ala Ala Asp 260 265 270 Glu Ile Val Arg Trp Val Ser Pro Val Asn Leu Phe Arg Arg Thr Ala 275 280 285 Thr Ala Asp Leu Thr Leu Gly Gly Gln Gln Val Lys Ala Asp Asp Lys 290 295 300 Val Val Val Phe Tyr Ser Ser Ala Asn Arg Asp Ala Ser Val Phe Ser 305 310 315 320 Asp Pro Glu Val Phe Asp Ile Gly Arg Ser Pro Asn Pro His Ile Gly 325 330 335 Phe Gly Gly Gly Gly Ala His Phe Cys Leu Gly Asn His Leu Ala Lys 340 345 350 Leu Glu Leu Arg Val Leu Phe Glu Gln Leu Ala Arg Arg Phe Pro Arg 355 360 365 Met Arg Gln Thr Gly Glu Ala Arg Arg Leu Arg Ser Asn Phe Ile Asn 370 375 380 Gly Ile Lys Thr Leu Pro Val Thr Leu Gly 385 390 <210> 2 <211> 1185 <212> DNA <213> CYP008 <400> 2 gtgaacatcg acctcgtcga tcaggaccac tacgcgacct tcggcccccc gcacgagcag 60 atgcgctggc tgagagagca cgctcccgtc tactggcacg agggcgagcc gggattctgg 120 gccgtcaccc gccacgagga cgtcgtccac gtctcccgcc actccgacct gttctcctcc 180 gcgcgcaggc tcgccctgtt caacgagatg ccggaggagc agcgggagct gcagcggatg 240 atgatgctca accaggaccc gcccgagcac accagaaggc gctccctggt caaccgcggt 300 ttcaccccgc gcaccatccg cgcgctggag cagcacatcc gcgacatctg cgacgacctg 360 ctcgaccagt gctcaggcga aggagacttc gtcaccgacc tcgccgcgcc cctcccgctc 420 tacgtgatct gtgagctgct cggcgcgccc gtcgccgacc gcgacaagat cttcgcctgg 480 tccaaccgca tgatcggcgc ccaggacccc gactacgccg cctcaccgga ggagggcggc 540 gccgcggcca tggaggtcta cgcctacgcc tccgaactgg ccgcccagcg tcgcgccgcc 600 ccgcgcgacg acatcgtcac caagctcctc cagtccgacg agaacggcga gagcctgacg 660 gagaacgagt tcgagctctt cgtgctgctc ctcgtggtcg cgggcaacga gaccacccgt 720 aacgccgcct ccggcggcat gctcaccctc ttcgagcatc cggaccagtg ggacaggctg 780 gtcgccgacc cctccctcgc cgccacggcc gccgacgaga tcgtccgctg ggtctcgccg 840 gtgaacctct tccgccgtac ggcgacagcc gacctcaccc tgggcggaca gcaggtcaag 900 gccgacgaca aggtcgtggt cttctactcc tctgccaaca gggacgcgtc ggtcttctcc 960 gatccggagg tcttcgacat cggacggtct cccaacccgc acatcgggtt cggaggcgga 1020 ggcgcgcact tctgcctggg caaccatctg gccaagctcg agctgcgcgt actcttcgag 1080 cagctggcca ggaggttccc gcggatgcgg cagaccggcg aggcccgccg gttgcgctcg 1140 aacttcatca acggcatcaa gaccctcccc gtcaccctcg gctga 1185 <210> 3 <211> 36 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 3 tacgtagaat tcactagtcc tcgcgctggt ttcata 36 <210> 4 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 4 tctagaggtt cagccgaggg tgac 24 <210> 5 <211> 36 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 5 tacgtagaat tcactagtag cggaacgcgt aatatc 36 <210> 6 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 6 tctagaatcc acttcgagtt ccat 24 <210> 7 <211> 44 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 7 ttaattaaac tagtatcgat acacatggga gtgcgtgcta agtg 44 <210> 8 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 8 tctagattca ggcactactc agttcagctt 30 <210> 9 <211> 38 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 9 ttaattaaac tagtcatagc gtgtgaggat aaacagat 38 <210> 10 <211> 29 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 10 tctagattta ccattgccta tcgggaaca 29 <210> 11 <211> 36 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 11 gaattctacg taactagtat ggaactcgaa gtggat 36 <210> 12 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 12 tctagatcat gaagggtccg caggcga 27 <210> 13 <211> 36 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 13 gaattctacg taactagtga tctgtcaccg ctcgaa 36 <210> 14 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 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Sequence <220> <223> probe 2 <400> 20 ggcgcgcccg tcgccgaccg cgacaagatc ttcgcctggt ccaaccgcat gatcggcgcc 60 caggaccccg actacgccgc ctcaccggag gagggcggcg ccgcggccat ggaggtctac 120 gcctacgcct ccgaactggc cgcccagcgt cgcgccgccc cgcgcgacga catcgtcacc 180 aagctcctcc agtccgacga gaacggcgag agcctgacgg agaacgagtt cgagctcttc 240 gtgctgctcc tcgtggtcgc gggcaacgag accacccgta acgccgcctc cggcggcatg 300 ctcaccctct tcgagcatcc ggaccagtgg gacaggctgg tcgccgaccc ctccctcgcc 360 gccacggccg ccgacgagat cgtccgctgg gtctcgccgg tgaacctctt ccgccgtacg 420 gcgacagccg acctcaccct gggcggacag caggtcaagg ccgacgacaa ggtcgtggtc 480 ttctactcct ctgccaacag ggacgcgtcg gtcttctccg atccggaggt cttcgacatc 540 ggacggtctc ccaacccgca catcgggttc ggaggcggag gcgcgcactt ctgcctgggc 600 aaccatctgg ccaagctcga gctgcgcgta ctcttcgagc agctggccag gaggttcccg 660 cggatgcggc agaccggcga ggcccgccgg ttgcgctcga acttcatcaa cggcatcaag 720 accctccccg tcaccctcgg ctgaacctct agtagcggaa cgcgtaatat cgcgactaag 780 gagctgacgt gacggagccc ccgtacaccg tgaccgcgct 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tggtaaagac gttgccgatg tccatgacat 1680 tgcaaaaagc agcaaagaag atctggaagc ttatgacatt ctgctgctgg gcatcccaac 1740 ctggtattac ggcgaagcgc agtgtgactg ggatgacttc ttcccgactc tcgaagagat 1800 tgatttcaac ggcaaactgg ttgcgctgtt tggttgtggt gaccaggaag attacgccga 1860 atatt 1865 <110> Ewha University-Industry Collaboration Foundation SNU R & DB FOUNDATION <120> A novel Cytochrome P450 hydroxylase and process for preparing hydroxylated Cyclosporin A employing the same <130> PA111000 / KR <160> 21 <170> Kopatentin 2.0 <210> 1 <211> 394 <212> PRT <213> CYP008 <400> 1 Val Asn Ile Asp Leu Val Asp Gln Asp His Tyr Ala Thr Phe Gly Pro 1 5 10 15 Pro His Glu Gln Met Arg Trp Leu Arg Glu His Ala Pro Val Tyr Trp 20 25 30 His Glu Gly Glu Pro Gly Phe Trp Ala Val Thr Arg His Glu Asp Val 35 40 45 Val His Val Ser Arg His Ser Asp Leu Phe Ser Ser Ala Arg Arg Leu 50 55 60 Ala Leu Phe Asn Glu Met Pro Glu Glu Gln Arg Glu Leu Gln Arg Met 65 70 75 80 Met Met Leu Asn Gln Asp Pro Pro Glu His Thr Arg Arg Arg Ser Leu 85 90 95 Val 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ccgacaggga gttcttccag cgtcacgcgc tggcgctgaa caacttcgac gccgtccccg 1860 aggagcagta cgccgcctac gtcgcgctgc aggagtacct gcacgcgctg gtcctggcca 1920 aacgcgccac ccccaccgac gacctgctcg gcgatctcgc gcgcgaggag ctcaccgacg 1980 aggagctcac caacatcggg gttctgctgc tgggcgccgg gctcgacacc accgccaaca 2040 tgctcgcgct gggcaccttc gccctgctga gccaccccgg ccagctcgcc gccctgcgcg 2100 ccgacccggg cctcgccgac caggccgtcg aggagctgct gcgctacctg agcatcaccc 2160 acaccgggat acgggccgca ctggaggatg tcgagctgaa cggtcacgtg atcaaagcgg 2220 gggagagcgt cgccctctcg gcgcaggcgg ccaaccgcga ccctgagcgc ttcgccgacc 2280 ccgacactct cgacctgcac cgtcaggcca ccggacatct gagcttcggt cacggcgtcc 2340 accagtgcct cggccagcag ctggcccgcg tggagatgcg cgtcgccctt cccgcgctgg 2400 tcacccgttt cccgacgctg cggctggcca tatcctcagc agaggtgccg ctgcgcacca 2460 attccgacat ctacggcgtg caccggctcc cggtcgcgtg ggacaaggag tagccgatgg 2520 aactcgaagt ggattctagt gagctcggta ccagcccgac ccgagcacgc gccggcacgc 2580 ctggtcgatg tcggaccgga gttcgaggta cgcggcttgc aggtccagga aggggacgtc 2640 catgcgagtg tccgttcgag tggcggcttg cgcccgatgc tagtcgcggt tgatcggcga 2700 tcgcaggtgc acgcggtcga tcttgacggc tggcgagagg tgcggggagg atctgaccga 2760 cgcggtccac acgtggcacc gcgatgctgt tgtgggcaca atcgtgccgg ttggtaggat 2820 cc 2822 <210> 20 <211> 2460 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> probe 2 <400> 20 ggcgcgcccg tcgccgaccg cgacaagatc ttcgcctggt ccaaccgcat gatcggcgcc 60 caggaccccg actacgccgc ctcaccggag gagggcggcg ccgcggccat ggaggtctac 120 gcctacgcct ccgaactggc cgcccagcgt cgcgccgccc cgcgcgacga catcgtcacc 180 aagctcctcc agtccgacga gaacggcgag agcctgacgg agaacgagtt cgagctcttc 240 gtgctgctcc tcgtggtcgc gggcaacgag accacccgta acgccgcctc cggcggcatg 300 ctcaccctct tcgagcatcc ggaccagtgg gacaggctgg tcgccgaccc ctccctcgcc 360 gccacggccg ccgacgagat cgtccgctgg gtctcgccgg tgaacctctt ccgccgtacg 420 gcgacagccg acctcaccct gggcggacag caggtcaagg ccgacgacaa ggtcgtggtc 480 ttctactcct ctgccaacag ggacgcgtcg gtcttctccg atccggaggt cttcgacatc 540 ggacggtctc ccaacccgca catcgggttc ggaggcggag gcgcgcactt ctgcctgggc 600 aaccatctgg ccaagctcga gctgcgcgta ctcttcgagc agctggccag gaggttcccg 660 cggatgcggc agaccggcga ggcccgccgg ttgcgctcga acttcatcaa cggcatcaag 720 accctccccg tcaccctcgg ctgaacctct agtagcggaa cgcgtaatat cgcgactaag 780 gagctgacgt gacggagccc ccgtacaccg tgaccgcgct gcccaccatg cgccctcccg 840 gctgcccgtt cgacccgccc gaggagttgg cgcagctgcg cgagcagcac ccactcagca 900 ggatggtctt ccccgacggg cacgtcggct ggctggtgac cagtcacgcc ctggctcgcg 960 cggtcgtggc cgacccccgc ttcagctcgc ggcacgagct catgcactcg ccgttccctg 1020 gggccatctc ggcggagagg ccgccgccgg ccgcgcccgg catgttcatc ggcgtcgatc 1080 cgcccgagca cacccgctac cgcaagctgc tcacggggaa gttcaccgtc cgcaggatgc 1140 gcagtctcgc cgcccgcgtc gaggagatca ccgccgagca cctggacgcc atggagcggc 1200 agggcccgcc tgtggacctg gtgcaggcct acgcccagcc cgtccccgcg ctgatgatct 1260 gcgagctgct cggcgttccc tacgccgaca gggagttctt ccagcgtcac gcgctggcgc 1320 tgaacaactt cgacgccgtc cccgaggagc agtacgccgc ctacgtcgcg ctgcaggagt 1380 acctgcacgc gctggtcctg gccaaacgcg ccacccccac cgacgacctg ctcggcgatc 1440 tcgcgcgcga ggagctcacc gacgaggagc tcaccaacat cggggttctg ctgctgggcg 1500 ccgggctcga caccaccgcc aacatgctcg cgctgggcac cttcgccctg ctgagccacc 1560 ccggccagct cgccgccctg cgcgccgacc cgggcctcgc cgaccaggcc gtcgaggagc 1620 tgctgcgcta cctgagcatc acccacaccg ggatacgggc cgcactggag gatgtcgagc 1680 tgaacggtca cgtgatcaaa gcgggggaga gcgtcgccct ctcggcgcag gcggccaacc 1740 gcgaccctga gcgcttcgcc gaccccgaca ctctcgacct gcaccgtcag gccaccggac 1800 atctgagctt cggtcacggc gtccaccagt gcctcggcca gcagctggcc cgcgtggaga 1860 tgcgcgtcgc ccttcccgcg ctggtcaccc gtttcccgac gctgcggctg gccatatcct 1920 cagcagaggt gccgctgcgc accaattccg acatctacgg cgtgcaccgg ctcccggtcg 1980 cgtgggacaa ggagtagccg atggaactcg aagtggattc tagtgagctc ggtaccagcc 2040 cgacccgagc acgcgccggc acgcctggtc gatgtcggac cggagttcga ggtacgcggc 2100 ttgcaggtcc aggaagggga cgtccatgcg agtgtccgtt cgagtggcgg cttgcgcccg 2160 atgctagtcg cggttgatcg gcgatcgcag gtgcacgcgg tcgatcttga cggctggcga 2220 gaggtgcggg gaggatctga ccgacgcggt ccacacgtgg caccgcgatg ctgttgtggg 2280 cacaatcgtg ccggttggta ggatcctcta gtatggaact cgaagtggat cgcgagcgct 2340 gcatcggggc gggcatgtgc gcgctgaccg cccccgaggt cttcgaccag gacctcgacg 2400 acggcagggt gatgctgctg gattcgtcgc cgccccccgg gcaccaggcg aaggcgcgcc 2460 2460 <210> 21 <211> 1865 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> probe 3 <400> 21 tcgcgactaa ggagctgacg tgacggagcc cccgtacacc gtgaccgcgc tgcccaccat 60 gcgccctccc ggctgcccgt tcgacccgcc cgaggagttg gcgcagctgc gcgagcagca 120 cccactcagc aggatggtct tccccgacgg gcacgtcggc tggctggtga ccagtcacgc 180 cctggctcgc gcggtcgtgg ccgacccccg cttcagctcg cggcacgagc tcatgcactc 240 gccgttccct ggggccatct cggcggagag gccgccgccg gccgcgcccg gcatgttcat 300 cggcgtcgat ccgcccgagc acacccgcta ccgcaagctg ctcacgggga agttcaccgt 360 ccgcaggatg cgcagtctcg ccgcccgcgt cgaggagatc accgccgagc acctggacgc 420 catggagcgg cagggcccgc ctgtggacct ggtgcaggcc tacgcccagc ccgtccccgc 480 gctgatgatc tgcgagctgc tcggcgttcc ctacgccgac agggagttct tccagcgtca 540 cgcgctggcg ctgaacaact tcgacgccgt ccccgaggag cagtacgccg cctacgtcgc 600 gctgcaggag tacctgcacg cgctggtcct ggccaaacgc gccaccccca ccgacgacct 660 gctcggcgat ctcgcgcgcg aggagctcac cgacgaggag ctcaccaaca tcggggttct 720 gctgctgggc gccgggctcg acaccaccgc caacatgctc gcgctgggca ccttcgccct 780 gctgagccac cccggccagc tcgccgccct gcgcgccgac ccgggcctcg ccgaccaggc 840 cgtcgaggag ctgctgcgct acctgagcat cacccacacc gggatacggg ccgcactgga 900 ggatgtcgag ctgaacggtc acgtgatcaa agcgggggag agcgtcgccc tctcggcgca 960 ggcggccaac cgcgaccctg agcgcttcgc cgaccccgac actctcgacc tgcaccgtca 1020 ggccaccgga catctgagct tcggtcacgg cgtccaccag tgcctcggcc agcagctggc 1080 ccgcgtggag atgcgcgtcg cccttcccgc gctggtcacc cgtttcccga cgctgcggct 1140 ggccatatcc tcagcagagg tgccgctgcg caccaattcc gacatctacg gcgtgcaccg 1200 gctcccggtc gcgtgggaca aggagtagcc gatggaactc gaagtggatt ctagtgagct 1260 cggtaccagc ccgacccgag cacgcgccgg cacgcctggt cgatgtcgga ccggagttcg 1320 aggtacgcgg cttgcaggtc caggaagggg acgtccatgc gagtgtccgt tcgagtggcg 1380 gcttgcgccc gatgctagtc gcggttgatc ggcgatcgca ggtgcacgcg gtcgatcttg 1440 acggctggcg agaggtgcgg ggaggatctg accgacgcgg tccacacgtg gcaccgcgat 1500 gctgttgtgg gcacaatcgt gccggttggt aggatcctct agtttcaata agtttcaaga 1560 ggttatttca ctcatggcta tcactggcat ctttttcggc agcgacaccg gtaataccga 1620 aaatatcgca aaaatgattc aaaaacagct tggtaaagac gttgccgatg tccatgacat 1680 tgcaaaaagc agcaaagaag atctggaagc ttatgacatt ctgctgctgg gcatcccaac 1740 ctggtattac ggcgaagcgc agtgtgactg ggatgacttc ttcccgactc tcgaagagat 1800 tgatttcaac ggcaaactgg ttgcgctgtt tggttgtggt gaccaggaag attacgccga 1860 atatt 1865
Claims (17)
Cytochrome P450 hydroxylase (CYP), comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 and mediating the hydroxylation of Cyclosporin A (CyA).
세베키아 베니하나(Sebekia benihana)로부터 유래된 것인 사이토크롬 P450 수산화효소.
The method of claim 1,
Cytochrome P450 hydroxylase derived from Sebekia benihana .
A polynucleotide encoding the cytochrome P450 hydroxylase of claim 1.
서열번호 2의 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드.
The method of claim 3,
Polynucleotide comprising the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2.
An expression vector comprising the polynucleotide of claim 3.
A transformant expressing cytochrome P450 hydroxylase having an amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 introduced by the expression vector of claim 5.
(ⅱ) 상기 배양물로부터 사이토크롬 P450 수산화효소(CYP)를 회수하는 단계를 포함하는, 사이토크롬 P450 수산화효소의 생산방법.
(Iii) culturing the transformant of claim 6 to obtain a culture; And
(Ii) recovering cytochrome P450 hydroxylase (CYP) from the culture.
A polynucleotide encoding at least one cytochrome P450 hydroxylase (CYP) selected from the group consisting of CYP, CYP501, CYP502, CYP503, CYP504, CYP506, and combinations thereof of SEQ ID NO: 1, and putidaredoxin (putidaredoxin and putidaredoxin reductase set, ferredoxin and ferredoxin reductase set, and flavodoxin and flavodoxin reductase set) An expression vector comprising a polynucleotide encoding at least one electron transfer enzyme selected from the group.
CYP로서 서열번호 1의 CYP 및 CYP506을 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 포함하고, 전자전이 효소로서 퓨티다레독신과 퓨티다레독신 환원효소를 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 것인 발현벡터.
10. The method of claim 9,
An expression vector comprising polynucleotides encoding CYP and CYP506 of SEQ ID NO: 1 as CYP, and polynucleotides encoding putidaredoxin and putidaredoxin reductase as electron transfer enzymes.
CYP로서 서열번호 1의 CYP 및 CYP506을 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 포함하고, 전자전이 효소로서 페레독신과 페레독신 환원효소를 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 것인 발현벡터.
10. The method of claim 9,
An expression vector comprising a polynucleotide encoding CYP and CYP506 of SEQ ID NO: 1 as CYP, and a polynucleotide encoding peredoxin and peredoxin reductase as an electron transfer enzyme.
CYP로서 서열번호 1의 CYP 및 CYP506을 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 포함하고, 전자전이 효소로서 플라보독신과 플라보독신 환원효소를 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 것인 발현벡터.
10. The method of claim 9,
An expression vector comprising a polynucleotide encoding CYP and CYP506 of SEQ ID NO: 1 as CYP, and a polynucleotide encoding flavodoxin and flavodoxin reductase as an electron transfer enzyme.
The transformant of claim 9, wherein the expression vector is introduced into a host cell to produce 4- (γ-hydroxy) -CyA.
상기 숙주세포는 내재적으로 사이클로스포린 A(CyA)를 수산화시킬 수 있는 것인 형질전환체.
The method of claim 12,
The host cell is a transformant capable of intrinsically hydroxylating cyclosporin A (CyA).
상기 미생물은 세베키아 베니하나(Sebekia benihana)인 것인 형질전환체.
The method of claim 13,
The microorganism is Sebekia benihana ( Sebekia benihana ) transformants.
(ⅱ) 상기 제작된 발현벡터를 숙주세포에 도입하여 형질전환체를 제작하는 단계;
(ⅲ) 상기 형질전환체를 배양하여 배양물을 수득하는 단계; 및,
(ⅳ) 상기 배양물로부터 4-(γ-hydroxy)-CyA를 회수하는 단계를 포함하는, 4-(γ-hydroxy)-CyA의 생산방법.
(Iii) preparing an expression vector comprising cytochrome P450 hydroxylase (CYP) and each polynucleotide encoding an electron transfer enzyme;
(Ii) preparing a transformant by introducing the prepared expression vector into a host cell;
(Iii) culturing the transformant to obtain a culture; And
(Iii) recovering 4- (γ-hydroxy) -CyA from the culture, method of producing 4- (γ-hydroxy) -CyA.
상기 숙주세포는 내재적으로 사이클로스포린 A(CyA)를 수산화시킬 수 있는 것인 형질전환체.
16. The method of claim 15,
The host cell is a transformant capable of intrinsically hydroxylating cyclosporin A (CyA).
상기 배양은 고체배양 또는 액체배양에 의하여 수행되는 것인 방법.
16. The method of claim 15,
Wherein the culturing is carried out by solid culture or liquid culture.
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