본 발명은 한 그룹의 신규 글리코실트랜스퍼라제 및 이를 이용하여 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물 글리코실화 반응에 촉매 작용하는 방법을 제공하였다.
본 발명은 한 그룹의 신규 글리코실트랜스퍼라제 및 이를 이용하여 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물 글리코실화 반응에 촉매 작용하는 방법을 제공하였다.
본 발명의 제1 양태에 있어서, 체외 글리코실화 방법을 제공하였고,
글리코실트랜스퍼라제 존재 하에서, 글리코실기 공여체의 글리코실기를 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물의 C20 부위 및/또는 C3 부위의 첫 번째 글리코실기에 전이시켜, 글리코실기화된 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물을 형성하는 단계를 포함하며,
여기서, 상기 글리코실트랜스퍼라제는 SEQ ID NO.: 4, 6, 8, 8, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 98, 또는 100으로 표시된느 글리코실트랜스퍼라제 또는 이의 유도 폴리펩티드로부터 선택된다.
다른 하나의 바람직한 예에서, C20 부위에서 글리코실기화된 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물로 진세노사이드Rd, CK, F1 및 F2를 포함한다.
본 발명의 제2 양태에 있어서, 체외 글리코실화 방법을 제공하였고,
글리코실트랜스퍼라제 존재 하에서, 글리코실기 공여체의 글리코실기를 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물의 C6 부위의 첫 번째 글리코실기에 전이시켜, 글리코실기화된 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물을 얻는 단계를 포함하며;
여거서, 상기 글리코실트랜스퍼라제는 SEQ ID NO.:12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28 및 30으로 표시되는 글리코실트랜스퍼라제 또는 이의 유도 폴리펩티드로부터 선택된다.
다른 하나의 바람직한 예에서, C6 부위에서 글리코실기화된 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물로 Rg1 또는 Rh1을 포함한다.
본 발명은 체외 글리코실화 하는 방법을 제공하였고,
글리코실트랜스퍼라제 존재 하에서, 글리코실기 공여체의 글리코실기를 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물의 C3 부위의 첫 번째 글리코실기에 전이시켜, 글리코실기화된 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물을 형성하는 단계를 포함하며;
여기서, 상기 글리코실트랜스퍼라제는 SEQ ID NO.: 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124로 표시되는 글리코실트랜스퍼라제 또는 이의 유도 폴리펩티드로부터 선택된다.
다른 하나의 바람직한 예에서, C3 부위에서 글리코실기화된 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물로 F2, 또는 Rh2를 포함한다. 또 다른 하나의 바람직한 예에서, 상기 유도 폴리펩티드는 각각,
(a) SEQ ID NOs.: 4, 6, 8, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124 중 하나 또는 여러개로 표시되는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드;
(b) SEQ ID NOs: 4, 6, 8, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124에 태그 서열, 신호 서열 또는 분비 신호 서열을 부가하여 형성된, 글리코실트랜스퍼라제 활성을 갖는 유도 폴리펩티드;
(c) 아미노산 서열과 SEQ ID NOs: 4, 6, 8, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124 중 하나 또는 여러개로 표시되는 아미노산 서열의 상동성이 ≥ 95 %이며, 글리코실트랜스퍼라제 활성을 갖는 유도 폴리펩티드로부터 선택된다.
다른 하나의 바람직한 예에서, (c)는 SEQ ID NOs.: 4, 6, 8, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124 중 하나 또는 여러개로 표시되는 아미노산 서열의 폴리펩티드를 하나 또는 여러 개의 아미노산 잔기로 치환, 결실 또는 부가하여 형성된, 글리코실트랜스퍼라제 활성을 갖는 유도 폴리펩티드를 더 포함한다.
본 발명의 제3 양태에 있어서, 분리된 폴리펩티드를 제공하였고, 상기 분리된 폴리펩티드는,
SEQ ID NOs.: 4, 6, 8, 28, 30, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124 중 하나 또는 여러 개로 표시되는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드 또는 이의 유도 폴리펩티드이며; 여기서, 상기 유도 폴리펩티드는,
(a) SEQ ID NOs.: 4, 6, 8, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124 중 하나 또는 여러 개로 표시되는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드;
(b) SEQ ID NOs: 4, 6, 8, 28, 30, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124에 태그 서열, 신호 서열 또는 분비 신호 서열을 부가하여 형성된, 글리코실트랜스퍼라제 활성을 갖는 유도 폴리펩티드;
(c) 아미노산 서열과 SEQ ID NOs: 4, 6, 8, 28, 30, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124 중 하나 또는 여러 개로 표시되는 아미노산 서열의 상동성이 ≥ 95 %이고, 글리코실트랜스퍼라제 활성을 갖는 유도 폴리펩티드로부터 선택된다.
다른 하나의 바람직한 예에서, (c)는 SEQ ID NOs.: 4, 6, 8, 28, 30, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124 중 하나로 표시되는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드를 하나 또는 여러 개의 아미노산 잔기로 치환, 결실, 또는 부가하여 형성된, 글리코실트랜스퍼라제 활성을 갖는 유도 폴리펩티드를 더 포함한다.
또 다른 하나의 바람직한 예에서, 상기 분리된 폴리펩티드는 체외 글리코실화에 사용된다.
본 발명의 제4 양태에 있어서, 분리된 폴리뉴클레오티드를 제공하였고, 상기 폴리뉴클레오티드는,
(A) 제4 양태에 따른 폴리펩티드를 코딩하는 뉴클레오티드 서열;
(B) SEQ ID NOs: 4, 6, 8, 28, 30, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124로 표시되는 폴리펩티드를 코딩하는 뉴클레오티드 서열;
(C) SEQ ID NO.: 3, 5, 7, 27, 29, 38, 40, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 89, 91, 93, 95, 97, 99, 115, 117, 119, 121, 또는 123으로 표시되는 뉴클레오티드 서열;
(D) SEQ ID NO.: 3, 5, 7, 27, 29, 38, 40, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 89, 91, 93, 95, 97, 99, 115, 117, 119, 121, 또는 123으로 표시되는 뉴클레오티드 서열로 표시되는 서열과의 상동성이 ≥ 95 %(바람직하게는 ≥ 98 %)인 뉴클레오티드 서열;
(E) (A) ~ (D) 중 어느 하나에 따른 뉴클레오티드 서열과 상보적(바람직하게는 완전 상보적)인 뉴클레오티드 서열로부터 선택된다.
또 다른 하나의 바람직한 예에서, 상기 (D)는 SEQ ID NO.: 3, 5, 7, 27, 29, 38, 40, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 89, 91, 93, 95, 97, 99, 115, 117, 119, 121, 또는 123으로 표시되는 뉴클레오티드 서열의 5’말단 및/또는 3’ 말단에서 1 ~ 60개(바람직하게는 1 ~ 30개, 더욱 바람직하게는 1 ~ 10개)의 뉴클레오티드를 절단 또는 부가함으로써 형성된 뉴클레오티드 서열을 더 포함한다.
또 다른 하나의 바람직한 예에서, 서열 SEQ ID NO.: 3, 5, 7, 27, 29, 38, 40, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 89, 91, 93, 95, 97, 99, 115, 117, 119, 121, 또는 123으로 표시되는 뉴클레오티드 서열은 각각 SEQ ID NOs: 4, 6, 8, 28, 30, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124로 표시되는 폴리펩티드를 코딩한다.
본 발명의 제5 양태에 있어서, 전달체를 제공하였고, 상기 전달체는 본 발명의 제4 양태에 따른 폴리뉴클레오티드를 포함하거나, 또는 본 발명의 제3 양태에 따른 분리된 폴리펩티드를 발현한다.
본 발명의 제3 양태에 따른 분리된 폴리펩티드의 용도에 있어서, 글리코실기 공여체로부터의 글리코실기를 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물의 (i) C-6 부위의 첫 번째 글리코실기; 또는 (ii) C-20 부위의 첫 번째 글리코실기; 및/또는 (iii)C3 부위의 첫 번째 글리코실기에 전이시켜 당사슬을 연장하는 반응과 같은 하나 또는 다양한 반응에 촉매 작용을 하거나, 또는 상기와 같은 하나 또는 다양한 반응에 촉매 작용을 하는 촉매제의 제조에 사용된다.
다른 하나의 바람직한 예에서, 상기 글리코실기 전이는 특정 부위의 라디칼에서 글리코실기의 부가 또는 치환을 포함한다.
또 다른 바람직한 예에서, 폴리펩티드 또는 이의 유도 폴리펩티드의 용도를 더 제공하였고,
글리코실트랜스퍼라제 존재 하에서, 글리코실기 공여체의 글리코실기를 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물의 C-6 부위의 첫 번째 글리코실기; 또는 C-20 부위의 첫 번째 글리코실기; 및/또는 C-3 부위의 첫 번째 글리코실기에 전이시켜, 글리코실기화된 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물을 형성하는 반응에 촉매 작용을 하거나, 또는 상기 반응에 촉매 작요을 하는 촉매제의 제조에 사용되며;
여기서, 상기 글리코실트랜스퍼라제는 SEQ ID NO.: 4, 6, 8, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124로 표시되는 글리코실트랜스퍼라제 또는 이의 유도 폴리펩티드로부터 선택되는 것을 특징으로 한다.
또 다른 바람직한 예에서, 폴리펩티드 또는 이의 유도 폴리펩티드의 용도를 더 제공하였고,
글리코실트랜스퍼라제 존재 하에서, 글리코실기 공여체의 글리코실기를 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물의 C20 부위 및/또는 C3 부위의 첫 번째 글리코실기에 전이시켜, 글리코실기화된 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물을 형성하는 반응에 촉매 작용을 하거나, 또는 상기 반응에 촉매 작용을 하는 촉매제의 제조에 사용되며;
여기서, 상기 글리코실트랜스퍼라제는 SEQ ID NO.: 4, 6, 8, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 98, 또는 100으로 표시되는 글리코실트랜스퍼라제 또는 이의 유도 폴리펩티드로부터 선택되는 것을 특징으로 한다.
또 다른 바람직한 예에서, 폴리펩티드 또는 이의 유도 폴리펩티드의 용도를 더 제공하였고,
글리코실트랜스퍼라제 존재 하에서, 글리코실기 공여체의 글리코실기를 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물의 C6 부위의 첫 번째 글리코실기에 전이시켜, 글리코실기화된 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물을 형성하는 반응에 촉매 작용을 하거나, 또는 상기 반응에 촉매 작용을 하는 촉매제의 제조에 사용되며;
여기서, 상기 글리코실트랜스퍼라제는 SEQ ID NO.: 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 또는 30으로 표시되는 글리코실트랜스퍼라제 또는 이의 유도 폴리펩티드로부터 선택되는 것을 특징으로 한다.
또 다른 바람직한 예에서, 폴리펩티드 또는 이의 유도 폴리펩티드의 용도를 더 제공하였고,
글리코실트랜스퍼라제 존재 하에서, 글리코실기 공여체의 글리코실기를 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물의 C-3 부위의 첫 번째 글리코실기에 전이시켜, 글리코실기화된 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물을 형성하는 반응에 촉매 작용을 하거나, 또는 상기 반응에 촉매 작용을 하는 촉매제의 제조에 사용되며;
여기서, 상기 글리코실트랜스퍼라제는 SEQ ID NO.: 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124로 표시되는 글리코실트랜스퍼라제 또는 이의 유도 폴리펩티드로부터 선택되는 것을 특징으로 한다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 유도 폴리펩티드는 각각,
(a) SEQ ID NOs.: 4, 6, 8, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124 중 하나로 표시되는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드;
(b) SEQ ID NOs: 4, 6, 8, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124에 태그 서열, 신호 서열 또는 분비 신호 서열을 부가하여 형성된, 글리코실트랜스퍼라제 활성을 갖는 유도 폴리펩티드;
(c) 아미노산 서열과 SEQ ID NOs: 4, 6, 8, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124 중 하나로 표시되는 아미노산 서열의 상동성이 ≥ 95 %이고, 글리코실트랜스퍼라제 활성을 갖는 유도 폴리펩티드로부터 선택된다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 글리코실기 공여체는 UDP-글루코스, ADP-글루코스, TDP-글루코스, CDP-글루코스, GDP-글루코스, UDP-아세틸글루코스, ADP-아세틸글루코스, TDP-아세틸글루코스, CDP-아세틸글루코스, GDP-아세틸글루코스, UDP-자일로스, ADP-자일로스, TDP-자일로스, CDP-자일로스, GDP-자일로스, UDP-갈락투론산, ADP-갈락투론산, TDP-갈락투론산, CDP-갈락투론산, GDP-갈락투론산, UDP-갈락토스, ADP-갈락토스, TDP-갈락토스, CDP-갈락토스, GDP-갈락토스, UDP-아라비노스, ADP-아라비노스, TDP-아라비노스, CDP-아라비노스, GDP-아라비노스, UDP-람노스, ADP-람노스, TDP-람노스, CDP-람노스, GDP-람노스, UDP-자일로스, ADP-자일로스, TDP-자일로스, CDP-자일로스, GDP-자일로스, 또는 기타 뉴클레오시드디포스페이트헥소스(Nucleoside diphosphate hexose) 또는 뉴클레오시드디포스페이트펜토스(Nucleoside diphosphate pentose), 또는 이들의 조합으로부터 선택되는 뉴클레오시드디포스페이트당을 포함한다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 글리코실기 공여체는 UDP-글루코스, UDP-갈락투론산, UDP-갈락토스, UDP-아라비노스, UDP-람노스, UDP-자일로스, 또는 其他우리딘디포스페이트헥소스(uridine diphosphate hexose) 또는 우리딘디포스페이트펜토스(uridine diphosphate pentose), 또는 이들의 조합으로부터 선택되는 우리딘디포스페이트(UDP)당을 포함한다. 또 다른 바람직한 예에서, 상기 분리된 폴리펩티드 하기 하나 또는 여러 개의 반응에 촉매 작용을 하거나, 또는 하기 하나 또는 여러 개의 반응에 촉매 작용을 하는 촉매제의 제조에 사용되고,
(A)
식(I) 화합물 식(Ⅱ) 화합물
여기서, R1은 H, 단당 글리코실기 또는 다당 글리코실기이며; R2는 H 또는 OH이고; R3은 단당 글리코실기이며; R4는 단당 글리코실기이고, 상기 폴리펩티드는 SEQ ID NO: 4, 6, 8, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124 또는 이의 유도 폴리펩티드로부터 선택된다. 또 다른 바람직한 예에서, 상기 단당은 글루코스(Glc), 람노스(Rha), 아세틸글루코스(Glc(6)Ac), 아라비노푸라노스(Araf), 아라비노피라노스(Arap), 또는 자일로스(Xyl) 등을 포함한다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 다당은 Glc(2-1)Glc, Glc(6-1)Glc, Glc(6)Ac, Glc(2-1)Rha, Glc(6-1)Arap, Glc(6-1)Xyl, Glc(6-1)Araf, Glc(3-1)Glc(3-1), Glc(2-1) Glu(6)Ac, Glc(6-1)Arap(4-1)Xyl, Glc(6-1)Arap(2-1)Xyl, 또는 Glc(6-1)Arap(3-1)Xyl 등 2 ~ 4개의 단당으로 이루어진 다당을 포함한다.
또 다른 바람직한 예에서, R1-R4가 치환된 후의 화합물은 하기 표에 나타낸 바와 같다.
즉, 상기 R1이 H이고, R2가 OH이며, R3이 글루코실기일 경우, 상기 식(I) 화합물은 진세노사이드CK (CK)이고;상기 R1이 H이며, R2가 OH이고, R3 및 R4가 글루코실기일 경우, 상기 식(Ⅱ) 화합물은 지페노사이드LXXV이며;
상기 R1이 H이고, R2가 OH이며, R3이 글루코실기이고, R4가 자일로실기일 경우, 상기 식(Ⅱ) 화합물은 지페노사이드XIII이며;
R1 및 R2가 모두 H이고, R3이 글루코실기일 경우, 상기 식(I) 화합물은 진세노사이드DMG이며;
R1 및 R2가 모두 H이고, R3 및 R4가 글루코실기일 경우, 상기 식(Ⅱ) 화합물은 사포닌DMGG (20-O-β-(D-글루코피라노실)-β-(D-글루코피라노실)-다마렌디올) (20-O-β-(D-glucopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)- dammarenediol)이며;
R1 및 R2가 모두 H이고, R3이 글루코실기이며, R4가 자일로실기일 경우, 상기 식(Ⅱ) 화합물은 사포닌DMGX (20-O-β-(D-자일로피라노실)-β-(D-글루코피라노실)-다마렌디올) (20-O-β-(D-xylopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)- dammarenediol)이고;
R1이 글루코실기이며, R2가 OH이고, R3이 글루코실기일 경우, 상기 식(I) 화합물은 진세노사이드F2(F2)이며;
R1이 글루코실기이고, R2가 OH이며, R3 및 R4가 글루코실기일 경우, 상기 식(Ⅱ) 화합물은 지페노사이드XVII이고;
R1이 글루코실기이고, R2가 OH이며, R3이 글루코실기이고, R4가 자일로실기일 경우, 상기 식(Ⅱ) 화합물은 지페노사이드IX이며;
R1이 2개의 글루코실기(Glc(2-1)Glc)이고, R2가 OH이며, R3이 글루코실기일 경우, 상기 식(I) 화합물은 진세노사이드Rd이고;
R1이 2개의 글루코실기(Glc(2-1)Glc)이며, R2가 OH이고, R3 및 R4가 글루코실기일 경우, 상기 식(Ⅱ) 화합물은 진세노사이드Rb1이거나; 또는
R1이 2개의 글루코실기(Glc(2-1)Glc)이며, R2가 OH이고, R3이 글루코실기이며, R4가 자일로실기일 경우, 상기 식(Ⅱ) 화합물은 진세노사이드Rb3이고;
상기 R1이 H이며, R2가 OH이고, R3이 글루코실기이며, R4가 아라비노실기(Arabinosyl group)일 경우, 상기 식(Ⅱ) 화합물은 진세노사이드F3이;
(B)
식(Ⅲ) 화합물 식(Ⅳ) 화합물
여기서, R1이 H, 글리코실기 또는 다당 글리코실기이고, R2가 글리코실기이며, R3이 글리코실기이고, 상기 폴리펩티드는 SEQ ID NOs.: 4 또는 이의 유도 폴리펩티드로부터 선택된다.
또 다른 바람직한 예에서, R1-R3이 치환된 후의 화합물은 하기 표에 나타낸 바와 같다:
즉, R1이 H이고, R2가 글루코실기일 경우, 상기 식(Ⅲ) 화합물은 진세노사이드F1 (F1)이며;R1이 H이고, R2 및 R3이 글루코실기일 경우, 상기 식(Ⅳ) 화합물은 노토진세노사이드U이며; R1 및 R2가 글루코실기일 경우, 상기 식(Ⅲ) 화합물은 진세노사이드Rg1 (Rg1)이거나; 또는
R1, R2 및 R3이 글루코실기일 경우, 상기 식(Ⅳ) 화합물은 노토진세노사이드R3(R3)이고;
(C)
식(V) 화합물 식(VI) 화합물;
여기서, R1 및 R2는 H 또는 글리코실기이고, R3 및 R4는 글리코실기이며; 상기 폴리펩티드는 SEQ ID NOs.: 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30 또는 이의 유도 폴리펩티드로부터 선택된다.
또 다른 바람직한 예에서, R1-R4가 치환된 후의 화합물은 하기 표에 나타낸 바와 같다:
즉, R1이 H이고, R2 및 R3이 글루코실기일 경우, 상기 식(V) 화합물은 진세노사이드Rg1이며;R1이 H이고, R2 및 R3이 글루코실기이며, R4가 자일로실기일 경우, 상기 식(VI) 화합물은 노토진세노사이드R1이고;
R1이 H이며, R2 및 R3이 글루코실기이고, R4가 글루코실기일 경우, 상기 식(VI) 화합물은 사포닌20-O-Glucosylginsenoside Rf이며;
R1 및 R2가 H이고, R3이 글루코실기일 경우, 상기 식(V) 화합물은 진세노사이드Rh1이고;
R1 및 R2가 H이며, R3이 글루코실기이고, R4가 자일로실기일 경우, 상기 식(VI) 화합물은 노토진세노사이드R2이며; R1 및 R2가 H이고, R3 및 R4가 글루코실기일 경우, 상기 식(VI) 화합물은 진세노사이드Rf이다.
(D)
식(Ⅶ) 화합물 식(Ⅷ) 화합물
여기서, R1은 글리코실기이고; R2 및 R3은 OH 또는 H이며; R4는 글리코실기 또는 H이고; R5는 글리코실기이며, R5-R1-O는 C3첫 번째 글리코실기로부터 유도된 글리코실기이고; 상기 폴리펩티드는 SEQ ID NOs.: 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124 또는 이의 유도 폴리펩티드로부터 선택되며;
R1-R4가 치환된 후의 화합물은 하기 표에 나타낸 바와 같다:
즉, R1이 글루코실기이고; R2가 H이며, R3이 OH이고, R4가 H일 경우, 식(Ⅶ) 화합물은 Rh2이며;R1이 글루코실기이고; R2가 H이며, R3이 OH이고, R4가 글루코실기일 경우, 식(Ⅶ) 화합물은 F2이며;
R1이 글루코실기이고; R2가 H이며, R3이 OH이고, R4가 2개의 글루코실기일 경우, 식(Ⅶ) 화합물은 지페노사이드(Gypenoside) XVII이며;
R1이 글루코실기이고; R2가 H이며, R3이 OH이고, R4가 하나의 글루코실기로부터 연장된 하나의 자일로실기일 경우, 식(Ⅶ) 화합물은 지페노사이드 IX이며;
기질 (Ⅶ) 화합물이 Rh2이면, 산물 식(Ⅷ) 화합물은 Rg3이고; 기질 (Ⅶ) 화합물이 F2이면, 산물 식(Ⅷ) 화합물은 Rd이며; 기질 (Ⅶ) 화합물이 Gypenoside XVII이면, 산물 식(Ⅷ) 화합물은 Rb1이고; 기질 (Ⅶ) 화합물이 Gypenoside IX이면, 산물 식(Ⅷ) 화합물은 Rb3이다.
(E)
식(IX) 화합물 식(X) 화합물
식(IX) 화합물 식(X) 화합물
여기서, R1은 글리코실기이고; R2 및 R3은 OH 또는 H이며; R4는 글리코실기 또는 H이고; R5는 글리코실기이며, R6-R1-O는 C3첫 번째 글리코실기로부터 유도된 글리코실기이고; R6은 글리코실기이며, R6-R1-O는 C3 첫 번째 글리코실기로부터 유도된 글리코실기이고, 상기 폴리펩티드는 SEQ ID NOs.: 41, 45, 90, 92, 94 또는 96 또는 이의 유도 폴리펩티드로부터 선택되며;
R1가 2개의 글루코실기이고, R2가 H이며, R3이 OH이고, R4가 H일 경우, 식(IX) 화합물은 Rg3이다.
R1이 2개의 글루코실기이고, R2가 H이며, R3이 OH이고, R4가 글루코실기일 경우, 식(IX) 화합물은 Rd이다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 글리코실기는 글루코실기, 자일로스, 갈락투론산기, 갈락토실기(galactosyl group), 아라비노실기, 람노실기(Rhamnosyl group), 및 기타 헥소실기(Hexosyl group) 또는 펜토실기(Pentosyl group)로부터 선택된다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 식에서 (I), (Ⅲ), (V), (Ⅶ), (IX) 화합물은 S배열 또는 R배열의 다마렌형 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물, 라노스테인(Lanostane)형 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물, apotirucallane형 테트라시클릭트리터페노이드, 티루칼라네스(Tirucallanes)형 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물, 시클로아탄(시클로알탄)(cycloartane)형 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물, 쿠커비탄(Cucurbitane)형 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물, 또는 멜리아칸(Decane)형 테트라시클릭트리터페노이드계 화합물을 포함한다(하지만 이에 한정되지 않음).
또 다른 바람직한 예에서, 상기 반응식에서 (Ⅱ), (Ⅳ), (VI), (Ⅷ), 또는 (X) 화합물은 진세노사이드Rg3, 진세노사이드Rd, 진세노사이드Rb1, 진세노사이드Rb3, 사포닌DMGG, 사포닌DMGX, 지페노사이드LXXV, 지페노사이드XVII, 지페노사이드XIII, 지페노사이드IX, 노토진세노사이드U, 노토진세노사이드R1, 노토진세노사이드R2, 노토진세노사이드R3, 3-O-β-(D-xylopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)-PPD; 3-O-β-(D-xylopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)-CK, 20-O-Glucosylginsenoside Rf및Ginsenoside F3을 포함한다.
본 발명의 제6 양태에 있어서, 글리코실기 전이 촉매반응을 수행하는 방법을 제공하였고, 본 발명의 제3 양태에 따른 폴리펩티드 또는 이의 유도 폴리펩티드 존재 하에서, 글리코실기 전이 촉매 반응을 수행하는 단계를 포함한다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 방법은,
글리코실기 공여체 및 본 발명의 제3 양태에 따른 폴리펩티드 및 이의 유도 폴리펩티드 존재 하에서, 상기 식(I) 화합물을 상기 식(Ⅱ) 화합물로 전이시키거나, 또는 식(Ⅲ) 화합물을 상기 식(Ⅳ) 화합물로 전이시키거나, 또는 식(V) 화합물을 상기 식(VI) 화합물로 전이시키거나; 또는 상기 식(Ⅶ) 화합물을 상기 식(Ⅷ) 화합물로 전이시키거나, 또는 식(IX) 화합물을 상기 식(IX) 화합물로 전이시키는 단계를 더 포함한다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 방법은 상기 폴리펩티드 및 이의 유도 폴리펩티드를 촉매 반응에 각각 넣는 단계; 및/또는
상기 폴리펩티드 및 이의 유도 폴리펩티드를 촉매 반응에 동시에 넣는 단계를 더 포함한다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 방법은 글리코실트랜스퍼라제를 코딩하는 뉴클레오티드 서열이 다마렌디올 및/또는 프로토파낙사디올 및/또는 프로토파낙사트리올 합성 대사 경로에서의 관건적인 유전자와 숙주 세포에서 공동 발현되어, 상기 식(Ⅱ), (Ⅳ), (VI), (Ⅷ), 또는 (X) 화합물을 얻는 단계를 더 포함한다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 숙주 세포는 효모균 또는 대장균이다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 폴리펩티드는 SEQ ID NOs.: 4, 6, 8, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124로 표시되는아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드 및 이의 유도 폴리펩티드이다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 폴리펩티드를 코딩하는 뉴클레오티드 서열은 SEQ ID NOs.: 3, 5, 7, 13, 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 38, 40, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 89, 91, 93, 95, 97, 99, 115, 117, 119, 121, 또는 123으로 표시된다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 방법은 반응 체계에 효소 활성 조절용 첨가물을 제공하는 단계를 더 포함한다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 효소 활성 조절용 첨가물은 효소 활성을 향상시키거나 효소 활성을 억제시키는 첨가물이다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 효소 활성 조절용 첨가물은 Ca2 +, Co2 +, Mn2 +, Ba2+, Al3+, Ni2+, Zn2+ 또는 Fe2+로부터 선택된다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 효소 활성 조절용 첨가물은 Ca2 +, Co2 +, Mn2 +, Ba2+, Al3+, Ni2+, Zn2+ 또는 Fe2+를 생성할 수 있는 물질이다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 글리코실기 공여체는 뉴클레오시드디포스페이트당이고, UDP-글루코스, ADP-글루코스, TDP-글루코스, CDP-글루코스, GDP-글루코스, UDP-자일로스, ADP-자일로스, TDP-자일로스, CDP-자일로스, GDP-자일로스, UDP-갈락투론산, UDP-아세틸글루코스, ADP-아세틸글루코스, TDP-아세틸글루코스, CDP-아세틸글루코스, GDP-아세틸글루코스, ADP-갈락투론산, TDP-갈락투론산, CDP-갈락투론산, GDP-갈락투론산, UDP-갈락토스, ADP-갈락토스, TDP-갈락토스, CDP-갈락토스, GDP-갈락토스, UDP-아라비노스, ADP-아라비노스, TDP-아라비노스, CDP-아라비노스, GDP-아라비노스, UDP-람노스, ADP-람노스, TDP-람노스, CDP-람노스, GDP-람노스, 또는 기타 뉴클레오시드디포스페이트헥소스 또는 뉴클레오시드디포스페이트펜토스, 또는 이들의 조합으로부터 선택된다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 글리코실기 공여체는 우리딘디포스페이트당이고, UDP-글루코스, UDP-자일로스, UDP-갈락투론산, UDP-갈락토스, UDP-아라비노스, UDP-람노스, 또는 기타 우리딘디포스페이트헥소스 또는 우리딘디포스페이트펜토스, 또는 이들의 조합으로부터 선택된다.
또 다른 바람직한 예에서, 반응체계의 pH는 pH4.0 ~ 10.0이고, 바람직하게 pH는 5.5 ~ 9.0이다.
또 다른 바람직한 예에서, 반응 체계의 온도는 10 ~ 105 ℃이고, 바람직하게 온도는 20 ~ 50 ℃이다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 다마렌디올 합성 대사 경로에서의 관건적인 유전자는 다마렌디올 합성 효소 유전자를 포함한다(하지만 이에 한정되지 않음).
또 다른 바람직한 예에서, 상기 진세노사이드CK 합성 대사 경로에서의 관건적인 유전자는 다마렌디올 합성 효소 유전자, 시토크롬P450 CYP716A47 유전자 및 P450 CYP716A47의 환원 효소 유전자 및 테트라시클릭트리터페노이드C20 부위의 글리코실트랜스퍼라제UGTPg1(Genbank accession number KF377585.1), 또는 이들의 조합을 포함한다(하지만 이에 한정되지 않음).
또 다른 바람직한 예에서, 상기 진세노사이드진세노사이드F1 합성 대사 경로에서의 관건적인 유전자는 다마렌디올 합성 효소 유전자, 시토크롬P450 CYP716A47 유전자, P450 CYP716A47의 환원 효소 유전자, 시토크롬P450 CYP716A53V2 유전자 및 이의 환원 효소 유전자와 테트라시클릭트리터페노이드C20 부위의 글리코실트랜스퍼라제UGTPg1, 또는 이들의 조합을 포함한다(하지만 이에 한정되지 않음).
또 다른 바람직한 예에서, 상기 진세노사이드Rg1 합성 대사 경로에서의 관건적인 유전자는 다마렌디올 합성 효소 유전자, 시토크롬P450 CYP716A47 유전자와 P450 CYP716A47의 환원 효소 유전자 및 테트라시클릭트리터페노이드C20 부위 및 C6의 글리코실트랜스퍼라제UGTPg1와 UGTPg100(Genbank accession number AKQ76388.1), 또는 이들의 조합을 포함한다(하지만 이에 한정되지 않음).
또 다른 바람직한 예에서, 상기 글리코실기 촉매 반응의 기질은 식(I), (Ⅲ), (V), (Ⅶ), (IX) 화합물이고, 상기 산물은 각각 (Ⅱ), (Ⅳ), (VI), (Ⅷ), (X) 화합물이며;
또 다른 바람직한 예에서, 상기 식(I) 화합물은 진세노사이드CK이고, 식(Ⅱ) 화합물은 지페노사이드LXXV (20-O-β-(D-글루코피라노실)-β-(D-글루코피라노실)-프로토파낙사디올) (20-O-β-(D-glucopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)-protopanaxadiol)이며;
또는, 상기 식(I) 화합물은 진세노사이드DMG이고, 식(Ⅱ) 화합물은 신규 진세노사이드DMGG (20-O-β-(D-글루코피라노실)-β-(D-글루코피라노실)-다마렌디올) (20-O-β-(D-glucopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)- dammarenediol)이며;
상기 식(I) 화합물은 진세노사이드F2이고, 식(Ⅱ) 화합물은 지페노사이드XVII(3-O-β-(D-글루코피라노실)-20-O-β-(D-글루코피라노실)-β-(D-글루코피라노실)-프로토파낙사디올)(3-O-β-(D-glucopyranosyl)-20-O-β-(D-glucopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl) -protopanaxadiol)이며;
또는, 상기 식(I) 화합물은 진세노사이드Rd이고, 식(Ⅱ) 화합물은 진세노사이드Rb1(3-O-β-(D-글루코피라노실)-β-(D-글루코피라노실)-20-O-β-(D-글루코피라노실)-β-(D-글루코피라노실)-프로토파낙사디올)(3-O-β-(D-glucopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)-20-O-β-(D-glucopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)-protopanaxadiol)이며;
또는, 상기 식(I) 화합물은 진세노사이드Rd이고, 식(Ⅱ) 화합물은 진세노사이드Rb3(3-O-β-(D-글루코피라노실)-β-(D-글루코피라노실)-20-O-β- (D-자일로피라노실)-β-(D-글루코피라노실)-프로토파낙사디올)(3-O-β-(D-glucopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)-20-O-β-(D-xylopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)-protopanaxadiol)이며;
상기 식(I) 화합물은 진세노사이드CK이고, 식(Ⅱ) 화합물은 지페노사이드XIII이며;
상기 식(I) 화합물은 진세노사이드DMG이고, 식(Ⅱ) 화합물은 진세노사이드DMGX (20-O-β-(D-자일로피라노실)-β-(D-글루코피라노실)-다마렌디올) (20-O-β-(D-glucopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)- dammarenediol)이며;
상기 식(I) 화합물은 진세노사이드F2이고, 식(Ⅱ) 화합물은 지페노사이드IX이며;
상기 식(I) 화합물은 진세노사이드CK이고, 식(Ⅱ) 화합물은 진세노사이드F3이며; 또 다른 바람직한 예에서, 상기 식(Ⅲ) 화합물은 진세노사이드F1이고, 식(Ⅳ) 화합물은 노토진세노사이드U(20-O-β-(D-글루코피라노실)-β-(D-글루코피라노실)-프로토파낙사트리올) (20-O-β-(D-glucopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)-protopanaxatriol)이며;
또 다른 바람직한 예에서, 상기 식(Ⅲ) 화합물은 진세노사이드Rg1이고, 식(Ⅳ) 화합물은 노토진세노사이드R3이며;
또 다른 바람직한 예에서, 상기 식(V) 화합물은 진세노사이드Rg1이고, 식(VI) 화합물은 노토진세노사이드R1(6-O-β-(D-자일로피라노실)-β-(D-글루코피라노실)-20-O-β-(D-글루코피라노실)-프로토파낙사트리올)(6-O-β-(D-xylopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)-20-O-β-(D-glucopyranosyl) -protopanaxatriol)이며;
상기 식(V) 화합물은 진세노사이드Rg1이고, 식(VI) 화합물은 20-O-Glucosylginsenoside Rf이며;
상기 식(V) 화합물은 진세노사이드Rh1이고, 식(VI) 화합물은 노토진세노사이드R2(6-O-β-(D-자일로피라노실)-β-(D-글루코피라노실)-프로토파낙사트리올)(6-O-β-(D-xylopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)-protopanaxatriol)이다.
또는, 상기 식(V) 화합물은 진세노사이드Rh1이고, 식(VI) 화합물은 진세노사이드Rf이다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 식(III) 화합물은 진세노사이드Rg1이고, 식(Ⅳ) 화합물은 노토진세노사이드R3이며;
또 다른 바람직한 예에서, 상기 식(Ⅶ) 화합물이 Rh2이면, 산물 식(Ⅷ) 화합물은 Rg3이고;
상기 식(Ⅶ) 화합물이 F2이면, 산물 식(Ⅷ) 화합물은 Rd이며;
상기 식(Ⅶ) 화합물이 Gypenoside XVII이면, 산물 (Ⅷ) 화합물은 Rb1이고;
상기 식 (Ⅶ) 화합물이 Gypenoside IX이면, 산물(Ⅷ) 화합물은 Rb3이다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 식 (IX) 화합물이 Rg3이면, 산물 식(X) 화합물은 3-O-β-(D-xylopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)-PPD이고;
상기 식(IX) 화합물이 Rd이면, 산물 식(X) 화합물은 3-O-β-(D-xylopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)-CK이다.
본 발명의 제7 양태에 있어서, 유전자 조작된 숙주 세포를 제공하였고, 상기 숙주 세포는 본 발명의 제5 양태에 따른 전달체를 포함하거나, 또는 유전자를 본 발명의 제4 양태에 따른 폴리뉴클레오티드에 통합시켰다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 세포는 원핵 세포 또는 진핵 세포이다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 숙주 세포는 효모 세포 또는 식물 세포와 같은 진핵 세포이다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 숙주 세포는 출아형 효모 세포이다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 숙주 세포는 대장균과 같은 원핵 세포이다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 숙주 세포는 인삼 세포이다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 숙주 세포는 (II), (Ⅳ), (VI), (Ⅶ), (X) 화합물을 자연적으로 생성하는 세포가 아니다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 숙주 세포는 진세노사이드Rg3, 진세노사이드Rd, 진세노사이드Rb1, 진세노사이드Rb3, 사포닌DMGG, 사포닌DMGX, 지페노사이드LXXV, 지페노사이드XVII, 지페노사이드XIII, 지페노사이드IX, 노토진세노사이드U, 노토진세노사이드R1, 노토진세노사이드R2, 노토진세노사이드R3, 3-O-β-(D-xylopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)-PPD; 3-O-β-(D-xylopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)-CK, 20-O-Glucosylginsenoside Rf 및 Ginsenoside F3을 자연적으로 생성하는 세포가 아니다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 다마렌디올 합성 대사 경로에서의 관건적인 유전자는 다마렌디올 합성 효소 유전자를 포함한다(하지만 이에 한정되지 않음).
또 다른 바람직한 예에서, 상기 숙주 세포는 다마렌디올 합성 효소 유전자, 시토크롬P450 CYP716A47 유전자, P450 CYP716A47의 환원 효소 유전자 및 테트라시클릭트리터페노이드C20 부위의 글리코실트랜스퍼라제UGTPg1, 또는 이들의 조합을 포함하는(하지만 이에 한정되지 않음) 진세노사이드CK 합성 대사 경로에서의 관건적인 유전자를 함유한다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 숙주 세포는 다마렌디올 합성 효소 유전자, 시토크롬P450 CYP716A47 유전자, P450 CYP716A47의 환원 효소 유전자, 시토크롬P450 CYP716A53V2 유전자 및 테트라시클릭트리터페노이드C20 부위의 글리코실트랜스퍼라제UGTPg1, 또는 이들의 조합을 포함하는(하지만 이에 한정되지 않음) 진세노사이드F1 합성 대사 경로에서의 관건적인 유전자를 함유한다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 진세노사이드Rg1 합성 대사 경로에서의 관건적인 유전자는 다마렌디올 합성 효소 유전자, 시토크롬P450 CYP716A47 유전자 및 P450 CYP716A47의 환원 효소 유전자 및 테트라시클릭트리터페노이드C20 부위 및 C6의 글리코실트랜스퍼라제UGTPg1 및 UGTPg100(Genbank accession number AKQ76388.1), 또는 이들의 조합을 포함한다(하지만 이에 한정되지 않음).
본 발명의 제8 양태에 있어서, 본 발명의 제7 양태에 따른 숙주 세포의 용도를 제공하였고, 효소 효소 촉매 작용 시약을 제조하거나, 글리코실트랜스퍼라제를 생성하거나, 촉매 작용 세포로 사용되거나, 또는 식(Ⅱ), (Ⅳ), (VI), (Ⅷ) 또는 (X) 화합물의 생성에 사용된다.
본 발명의 제9 양태에 있어서, 유전자 변형 식물을 생성하는 방법을 제공하였고, 제8양태에 따른 유전자 조작된 숙주 세포를 식물로 재생시키는 단계를 포함하고, 상기 유전자 조작된 숙주 세포는 식물 세포이다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 유전자 조작된 숙주 세포는 인삼 세포이다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 유전자 조작된 숙주 세포는 삼칠 세포이다.
본 발명의 범위 내에서, 본 발명이 상기 각 기술적 특징 및 이하(예를 들어 실시예)에서 구체적으로 기술되는 각 기술적 특징은 서로 조합되어 새롭거나 바람직한 기술적 해결 수단을 구성할 수 있음을 이해하여야 한다. 편폭의 제한으로 인해 여기서 일일이 설명하지 않을 것이다.
(1) 본 발명의 글리코실트랜스퍼라제는 테트라시클릭트리터페노이드 화합물 기질의 C-20 부위의 첫 번째 글리코실기/또는 C-6 또는 C-3 부위의 첫 번째 글리코실기에 글리코실기를 특이적 및 효율적으로 전입시키거나 글리코실기를 치환하여 당사슬을 연장할 수 있고;
(2) 본 발명의 글리코실트랜스퍼라제는 특히 CK, DMG, F2, Rd, F1, Rh1 및 Rg1을 활성을 갖는 진세노사이드Rg3, 진세노사이드Rd, 진세노사이드Rb1, 진세노사이드Rb3, 사포닌DMGG, 사포닌DMGX, 지페노사이드LXXV, 지페노사이드XVII, 지페노사이드XIII, 지페노사이드IX, 노토진세노사이드U, 노토진세노사이드R1, 노토진세노사이드R2, 노토진세노사이드R3, 3-O-β-(D-xylopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)-PPD; 3-O-β-(D-xylopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)-CK, 20-O-Glucosylginsenoside Rf 및 Ginsenoside F3으로 각각 전환시킬 수 있으며;
(3) 진세노사이드Rb1은 신경 세포 및 항염증 및 항산화 효능이 있고; 진세노사이드Rb3은 심근 허혈을 완화시키며 항우울 효능이 있다. 노토진세노사이드R1은 노토진세노사이드의 주요 성분으로, 항염증 효능이 있다. 노토진세노사이드R2는 신경 보호 효능이 있다.
본 발명자는 광범위하고 심층적인 연구를 걸쳐, 처음으로 글리코실트랜스퍼라제, 이의 대응되는 글리코실 전이 촉매 부위를 제공하였다. 구체적으로, 본 발명의 글리코실트랜스퍼라제 GT29-32 (SEQ ID NO.: 4), GT29-33 (SEQ ID NO.: 6), GT29-34 (SEQ ID NO.: 8), GT29-4(SEQ ID NO.: 12), GT29-5(SEQ ID NO.: 14), GT29-7(SEQ ID NO.: 16), GT29-9(SEQ ID NO.: 18), GT29-11(SEQ ID NO.: 20), GT29-13(SEQ ID NO.:22), GT29-17(SEQ ID NO.: 24), GT29-18(SEQ ID NO.: 26), GT29-19(SEQ ID NO.:116), GT29-20(SEQ ID NO.:118), GT29-21(SEQ ID NO.:120), GT29-22(SEQ ID NO.:122), GT29-23(SEQ ID NO.:124), GT29-24(SEQ ID NO.: 28), GT29-25(SEQ ID NO.: 30), GT29-36(SEQ ID NO.: 90), GT29-37(SEQ ID NO.: 92), GT29-42(SEQ ID NO.: 94), GT29-43(SEQ ID NO.: 96), GT29-45(SEQ ID NO.: 98), GT29-46(SEQ ID NO.: 100), PNUGT29-1(SEQ ID NO.: 39), PNUGT29-2(SEQ ID NO.: 41), PNUGT29-3(SEQ ID NO.: 43), PNUGT29-4(SEQ ID NO.: 45), PNUGT29-5(SEQ ID NO.: 47), PNUGT29-6(SEQ ID NO.: 49), PNUGT29-7(SEQ ID NO.: 51), PNUGT29-8(SEQ ID NO.: 53), PNUGT29-9(SEQ ID NO.: 55), PNUGT29-14(SEQ ID NO.: 57), PNUGT29-15(SEQ ID NO.: 59)는 테트라시클릭트리터페노이드 화합물 기질의 C-20 부위, C-6 부위 또는 C3 부위의 첫 번째 글리코실기의 히드록실글리코실화에 특이적이 효율적으로 촉매 작용하거나 원래의 글리코실기를 글리코실 치환하여, 당사슬을 연장할 수 있다.
본 발명의 글리코실트랜스퍼라제 특히 진세노사이드CK, DMG, F2, Rd, F1, Rh1 및 Rg1을 다른 활성이 있는 진세노사이드Rg3, 진세노사이드Rd, 진세노사이드Rb1, 진세노사이드Rb3, 사포닌DMGG, 사포닌DMGX, 지페노사이드LXXV, 지페노사이드XVII, 지페노사이드XIII, 지페노사이드IX, 노토진세노사이드U, 노토진세노사이드R1, 노토진세노사이드R2, 노토진세노사이드R3, 3-O-β-(D-xylopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)-PPD; 3-O-β-(D-xylopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)-CK, 20-O-Glucosylginsenoside Rf 및 Ginsenoside F3으로 각각 전이시킬 수 있다.
정의
본 명세서에 사용된 바오 같이, 용어 “활성 폴리펩티드”, “본 발명의 폴리펩티드 및 이의 유도 폴리펩티드”, “본 발명의 효소”, “글리코실트랜스퍼라제”는 호환 사용이 가능하고, 모두 GT29-32 (SEQ ID NO.: 4), GT29-33 (SEQ ID NO.: 6), GT29-34 (SEQ ID NO.: 8), GT29-4(SEQ ID NO.: 12), GT29-5(SEQ ID NO.: 14), GT29-7(SEQ ID NO.: 16), GT29-9(SEQ ID NO.: 18), GT29-11(SEQ ID NO.: 20), GT29-13(SEQ ID NO.:22), GT29-17(SEQ ID NO.: 24), GT29-18(SEQ ID NO.: 26), GT29-19(SEQ ID NO.:116), GT29-20(SEQ ID NO.:118), GT29-21(SEQ ID NO.:120), GT29-22(SEQ ID NO.:122), GT29-23(SEQ ID NO.:124), GT29-24(SEQ ID NO.: 28), GT29-25(SEQ ID NO.: 30), GT29-36(SEQ ID NO.: 90), GT29-37(SEQ ID NO.: 92), GT29-42(SEQ ID NO.:94), GT29-43(SEQ ID NO.: 96), GT29-45(SEQ ID NO.: 98), GT29-46(SEQ ID NO.: 100), PNUGT29-1(SEQ ID NO.: 39), PNUGT29-2(SEQ ID NO.: 41), PNUGT29-3(SEQ ID NO.: 43), PNUGT29-4(SEQ ID NO.: 45), PNUGT29-5(SEQ ID NO.: 47), PNUGT29-6(SEQ ID NO.: 49), PNUGT29-7(SEQ ID NO.: 51), PNUGT29-8(SEQ ID NO.: 53), PNUGT29-9(SEQ ID NO.: 55), PNUGT29-14(SEQ ID NO.: 57), PNUGT29-15(SEQ ID NO.: 59)폴리펩티드 및 이의 유도 폴리펩티드를 의미한다.
본 명세서에 사용된 바와 같이, “분리된 폴리펩티드” 또는 “활성 폴리펩티드”는 상기 폴리펩티드에 자연적으로 과련된 다른 단백질, 지질류 또는 다른 물질이 실질적으로 함유되지 않은 것을 의미한다. 당업자는 표준 단백질 정제 기술을 사용하여 상기 폴리펩티드를 정제할 수 있다. 실질적으로 순수한 폴리펩티드는 비 환원성 폴리 아크릴 아미드 겔에 단일 주 밴드를 생성할 수 있다. 상기 폴리펩티드의 순도는 아미노산 서열에 의해 추가로 분석될 수 있다.
본 발명의 활성 폴리펩티드는 재조합 폴리펩티드, 천연 폴리펩티드, 합성 폴리펩티드일 수 있다. 본 발명의 폴리펩티드는 자연적으로 정제된 산물, 또는 화학 합성된 산물, 또는 재조합 기술을 사용하여 원핵 또는 진핵 숙주(예를 들어, 박테리아, 효모, 식물)에 생성된 것일 수 있다. 재조합 생산 수단에 사용된 숙주에 따라, 본 발명의 폴리펩티드는 글리코실화거나, 또는 비글리코실화된 것일 수 있다. 본 발명의 폴리펩티드는 출발 메오닌 잔기를 포함하거나 포함하지 않을 수도 있다.
본 발명은 상기 폴리펩티드의 단편, 유도체 및 유사체를 더 포함한다. 본 명세서에 사용된 바와 같이, 용어 “단편”, “유도체” 및 “유사체”는 상기 폴리펩티드와 동일한 생물학적 기능 또는 활성을 대체로 부유하는 폴리펩티드를 지칭한다.
본 발명의 폴리펩티드단편, 유도체 또는 유사체는 (i) 하나 또는 복수 개의 보존적 또는 비보존적인 아미노산 잔기(바람직하게는 보존적인 아미노산 잔기)가 치환된 폴리펩티드가 있고, 이렇게 치환된 아미노산 잔기는 윤전자 코드에 의해 코딩된 것일 수있거나 아닐 수도 있으며, 또는 (ii) 하나 또는 복수 개의 아미노산 잔기에 치환기가 있는 폴리펩티드, 또는 (iii) 성숙된 폴리펩티드가 다른 하나의 화합물(폴리에틸렌 글리콜과 같은 예를 들어 폴리펩티드의 반감기를 연장시키는 화합물)과 융합시켜 형성된 폴리펩티드, 또는 (iv) 추가 아미노산 서열을 이 폴리펩티드 서열에 융합하여 형성된 폴리펩티드(예를 들어, 리더 서열 또는 분비 서열 또는 이 폴리펩티드를 정제하기 위한 서열, 또는 단백질원 서열, 또는 항원 IgG 단편과 형성된 융합 단백질)일 수 있다. 본 명세서의 교시에 따르면, 이러한 단편, 유도체 및 유사체는 당업자에게 공지된 범위 내에 속한다.
본 발명의 활성 폴리펩티드는 글리코실트랜스퍼라제 활성을 가지며 하기와 같은 하나 또는 복수의 반응을 촉진할 수 있다.
(A)
식(I) 화합물 식(Ⅱ) 화합물
여기서, R1은 H, 단당 글리코실기 또는 다당 글리코실기이고; R2는 H 또는 OH이며; R3은 단당 글리코실기이고; R4는 단당 글리코실기이며, 상기 폴리펩티드는 SEQ ID NO: 4, 6, 8, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124 또는 이의 유도 폴리펩티드로부터 선택된다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 단당은 글루코스(Glc), 람노스(Rha), 아세틸글루코스(Glc(6)Ac), 아라비노푸라노스(Araf), 아라비노피라노스(Arap), 또는 자일로스(Xyl) 등을 포함한다.
또 다른 바람직한 예에서, 상기 다당은 Glc(2-1)Glc, Glc(6-1)Glc, Glc(6)Ac, Glc(2-1)Rha, Glc(6-1)Arap, Glc(6-1)Xyl, Glc(6-1)Araf, Glc(3-1)Glc(3-1), Glc(2-1) Glu(6)Ac, Glc(6-1)Arap(4-1)Xyl, Glc(6-1)Arap(2-1)Xyl, 또는 Glc(6-1)Arap(3-1)Xyl 등 2 ~ 4개의 단당으로 이루어진 다당을 포함한다.
R1-R4가 치환된 후의 화합물은 하기 표에 나타낸 바와 같다:
즉, 상기 R1이 H이고, R2가 OH이며, R3이 글루코실기일 경우, 상기 식(I) 화합물은 진세노사이드CK (CK)이고;
R1 및 R2가 모두 H이며, R3이 글루코실기일 경우, 상기 식(I) 화합물은 진세노사이드DMG이고;
R1이 글루코실기이며, R2가 OH이고, R3이 글루코실기일 경우, 상기 식(I) 화합물은 진세노사이드F2 (F2)이거나; 또는
R1이 2개의 글루코실기(Glc(2-1)Glc)이며, R2가 OH이고, R3이 글루코실기일 경우, 상기 식(I) 화합물은 진세노사이드Rd이고;
(B)
식(Ⅲ) 화합물 식(Ⅳ) 화합물
여기서, R1은 H, 글리코실기 또는 다당 글리코실기이며, R2는 글리코실기이고, R3은 글리코실기이며, 상기 폴리펩티드는 SEQ ID NOs.: 4 또는 이의 유도 폴리펩티드로부터 선택되고;
R1-R3이 치환된 후의 화합물은 하기 표에 나타낸 바와 같다:
즉, R1이 H이고, R2가 글루코실기일 경우, 상기 식(Ⅲ) 화합물은 진세노사이드F1 (F1)이거나; 또는 R1 및 R2가 글루코실기일 경우, 상기 식(Ⅲ) 화합물은 진세노사이드Rg1 (Rg1)이며;
(C)
식(V) 화합물 식(VI) 화합물;
여기서, R1 및 R2는 H 또는 글리코실기이고, R3 및 R4는 글리코실기이다. 상기 폴리펩티드는 SEQ ID NOs.: 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30 또는 이의 유도 폴리펩티드로부터 선택되고;
R1-R4가 치환된 후의 화합물은 하기 표에 나타낸 바와 같다:
즉, R1이 H이고, R2 및 R3이 글루코실기일 경우, 상기 식(V) 화합물은 진세노사이드Rg1이고;
R1 및 R2가 H이며, R3이 글루코실기일 경우, 상기 식(V) 화합물은 진세노사이드Rh1이다.
(D)
식(Ⅶ) 화합물 식(Ⅷ) 화합물
여기서, R1은 글리코실기이고; R2 및 R3은 OH 또는 H이며; R4는 글리코실기 또는 H이고; R5는 글리코실기이며, R5-R1-O는 C3의 첫 번째 글리코실기로부터 유도된 글리코실기이고; 상기 폴리펩티드는 SEQ ID NOs.: 26, 28, 30, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124 또는 이의 유도 폴리펩티드로부터 선택되며;
즉, R1이 글루코실기이고; R2가 H이며, R3이 OH이고, R4가 H일 경우, 식(Ⅶ) 화합물은 Rh2이며; R1이 글루코실기이고; R2가 H이며, R3이 OH이고, R4가 글루코실기일 경우, 식(Ⅶ) 화합물은 F2이며;
R1이 글루코실기이고; R2가 H이며, R3이 OH이고, R4가 2개의 글루코실기일 경우, 식(Ⅶ) 화합물은 지페노사이드 XVII이며;
R1이 글루코실기이고; R2가 H이며, R3이 OH이고, R4가 하나의 글루코실기로부터 연장된 하나의 자일로실기일 경우, 식(Ⅶ) 화합물은 지페노사이드 IX이며;
(E)
식(IX) 화합물 식(X) 화합물
여기서, R1은 글리코실기이고; R2 및 R3은 OH 또는 H이며; R4는 글리코실기 또는 H이고; R5는 글리코실기이며, R5-R1-O는 C3의 첫 번째 글리코실기로부터 유도된 글리코실기이고; R6은 글리코실기이며, R6-R1-O은 C3의 첫 번째 글리코실기로부터 유도된 글리코실기이고, 상기 폴리펩티드는 SEQ ID NOs.: 41, 45, 90, 92, 94 또는 96 또는 이의 유도 폴리펩티드로부터 선택되며;
R1이 2개의 글루코실기이고, R2가 H이며, R3이 OH이고, R4가 H일 경우, 식(IX) 화합물은 Rg3이다.
R1이 2개의 글루코실기이고, R2가 H이며, R3이 OH이고, R4가 글루코실기일 경우, 식(IX) 화합물은 Rd이다.
상기 폴리펩티드의 바람직한 서열은 SEQ ID NO.: 4, 6, 8, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124로 표시되는 폴리펩티드이고, 상기 용어는 상기 폴리펩티드와 동일한 기능을 갖는, SEQ ID NO.: 4, 6, 8, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124 서열의 돌연변이 형태 및 유도 폴리펩티드를 더 포함한다. 이러한 돌연변이 형태는 하나 또는 복수 개(통상적으로 1 ~ 50개, 바람직하게는 1 ~ 30개, 더욱 바람직하게는 1 ~ 20개, 가장 바람직하게는 1 ~ 10개)의 아미노산의 결실, 삽입 및/또는 치환, 및 C 말단 및/또는 N 말단에 하나 또는 복수 개(통상적으로 20개 이내, 바람직하게는 10개 이내, 더욱 바람직하게는 5개 이내)의 아미노산을 첨가하는 것을 포함한다(하지만 이에 한정되지 않음). 예를 들어, 당 업계에서, 성능이 비슷하거나 유사한 아미노산에 의해 치환될 때, 단백질의 기능은 일반적으로 변하지 않는다. 또한 예를 들어, C 말단 및/또는 N 말단에 하나 또는 복수 개의 아미노산의 첨가는 일반적으로 단백질의 기능을 변화시키지 않는다. 상기 용어 본 발명의 단백질의 활성 단편 및 활성 유도체를 더 포함한다. 본 발명은 상기 폴리펩티드의 유사체를 더 제공하였다. 이러한 유사체와 천연 폴리펩티드의 차이는 아미노산 서열의 차이일 수 있고, 서열에 영향을 미치지 않는 돌연변이 형태의 차이일 수도 있거나, 또는 둘 다일 수 있다. 이러한 폴리펩티드는 천연 또는 유도된 유전자 변이체를 포함한다. 유도된 변이체는 다양한 기술에 의해 얻을 수 있으며, 예를 들어, 복사 또는 유도제에 노출되어 생성된 무작위 돌연변이를 통해 얻을 수 있고, 부위 특이적 돌연변이법 또는 기타 분자 생물학에 공지된 기술에 의해 얻을 수도 있다. 유사체는 천연 L-아미노산의 잔기(예를 들어 D-아미노산)를 갖는 유사체, 및 비천연적으로 존재하거나 합성된 아미노산(예를 들어 β, γ-아미노산)을 갖는 유사체를 더 포함한다. 본 발명의 폴리펩티드는 상기에서 예를 든 대표적인 폴리펩티드에 제한되지 않는 것을 이해해야 한다.
변형(통상적으로 1차 구조를 변경하지 않음) 형태로 체내 또는 체외의 폴리펩티드의 아세틸화 또는 카르복실화와 같은 화학적으로 유도된 형태를 포함한다. 변형은 글리코실화를 더 포함하고, 예를 들어, 폴리펩티드는 그러한 폴리펩티드의 합성 및 가공 또는 추가 가공 단계에서 글리코실화 변형에 의해 생성된다. 이러한 변형은 폴리펩티드를 글리코실화를 수행하는 효소(예를 들어, 포유 동물의 글리코실라제 또는 탈글리코실라제)에 노출시킴으로써 완성된다. 변형 형태는 인산화 아미노산 잔기(예를 들어, 포스포티로신, 포스포세린, 포스포레오닌)를 갖는 서열을 더 포함한다. 단백질 분해 효소 가수 분해에 대한 내성을 향상 시키거나 용해성을 최적화하도록 변형된 폴리펩티드를 더 포함한다.
본 발명의 GT29-32, GT29-33, GT29-34, GT29-4, GT29-5, GT29-7, GT29-9, GT29-11, GT29-13, GT29-17, GT29-18, GT29-19, GT29-20, GT29-21, GT29-22, GT29-23, GT29-24, GT29-25, GT29-32, GT29-33, GT29-34, GT29-36, GT29-37, GT29-42, GT29-43, GT29-45, GT29-46, PNUGT29-1, PNUGT29-2, PNUGT29-3, PNUGT29-4, PNUGT29-5, PNUGT29-6, PNUGT29-7, PNUGT29-8, PNUGT29-9, PNUGT29-14 또는 PNUGT29-15 단백질의 아미노기 말단 또는 카르복실기 말단은 단백질 태그로서 하나 또는 복수 개의 폴리펩티드 단편을 더 포함할 수 있다. 임의의 적합한 태그는 제한없이 본 발명에 사용될 수 있다. 예를 들어, 상기 태그는 FLAG, HA, HA1, c-Myc, Poly -His, Poly-Arg, Strep-TagII, AU1, EE, T7, 4A6, ε, B, gE 및 Ty1일 수 있다. 이러한 태그는 단백질의 정제에 사용될 수 있다. 표에 이 중의 일부 시판되는 태그를 열거하였다.
번역된 단백질이 분비되어 발현하도록 하기 위해(예를 들어 세포 외에 분비됨), 상기 GT29-32, GT29-33, GT29-34, GT29-4, GT29-5, GT29-7, GT29-9, GT29-11, GT29-13, GT29-17, GT29-18, GT29-19, GT29-20, GT29-21, GT29-22, GT29-23, GT29-24, GT29-25, GT29-32, GT29-33, GT29-34, GT29-36, GT29-37, GT29-42, GT29-43, GT29-45, GT29-46, PNUGT29-1, PNUGT29-2, PNUGT29-3, PNUGT29-4, PNUGT29-9, PNUGT29-14 또는 PNUGT29-15의 아미노산 아미노기 말단에 pelB 신호 펩티드 등과 같은 신호 펩티드 서열을 추가할 수도 있다. 신호 펩티드는 폴리펩티드에서 세포 내로부터 분비되어 나오는 과정에서 절단될 수 있다.본 발명의 폴리뉴클레오티드는 DNA 형태 또는 RNA 형태일 수 있다. DNA 형태는 cDNA, 게놈 DNA 또는 인공 합성된 DNA를 포함한다. DNA는 단일 가닥 또는 이중 가닥일 수 있다. DNA는 코딩 가닥 또는 비코딩 가닥일 수 있다. 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 코딩 영역 서열은 SEQ ID NO.: 3, 5, 7, 11, 13, 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 38, 40, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 89, 91, 93, 95, 97, 99, 115, 117, 119, 121, 또는 123으로 표시되는 코딩 영역 서열과 동일하거나 축퇴 변이체일 수 있다. 본 명세서에 사용된 바와 같이, “축퇴 변이체”는 본 발명에서 SEQ ID NO.: 4, 6, 8, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124로 표시되는 서열을 갖는 단백질을 지칭하나, SEQ ID NO.: 3, 5, 7, 11, 13, 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 38, 40, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 89, 91, 93, 95, 97, 99, 115, 117, 119, 121, 또는 123로 각각 표시되는 코딩 영역 서열과 차별되는 핵산 서열이다.
SEQ ID NO.: 4, 6, 8, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124를 갖는 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드는 성숙 폴리펩티드만을 코딩하는 코딩 서열; 성숙 폴리펩티드의 코딩 서열 및 다양한 추가 코딩 서열; 성숙 폴리펩티드의 코딩 서열(및 임의의 추가 코딩 서열) 및 비코딩 서열을 포함한다.
용어 “폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드”는 폴리펩티드를 코딩하는 것을 포함하는 폴리 뉴클레오티드일 수 있고, 추가적인 코딩 및/또는 비코딩 서열을 더 포함하는 폴리뉴클레오티드일 수도 있다.
또한 본 발명은 상기 폴리 뉴클레오티드의 변이체, 본 발명과 동일한 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드 또는 폴리펩티드를 코딩하는 이의 단편, 유사체 및 유도체에 관한 것이다. 이 폴리 뉴클레오티드의 변이체는 천연적으로 발생되는 대립 변이체 또는 비천연적으로 발생되는 변이체일 수 있다. 이러한 뉴클레오티드 변이체는 치환 변이체, 결실 변이체 및 삽입 변이체를 포함한다. 당 업계에 공지된 바와 같이, 대립 변이체는 하나의 폴리 뉴클레오티드의 대체 형태이고, 이는 하나 또는 복수 개의 뉴클레오티드의 치환, 결실 또는 삽입일 수 있지만, 실질적으로 이의 코딩된 폴리펩티드의 기능을 변화시키지 않는다.
또한 본 발명은 상기의 서열 혼성화되고 2개의 서열 사이에 적어도 50 %, 바람직하게는 적어도 70 %, 더욱 바람직하게 적어도 80 %, 85 %, 90 %, 95 %의 동일성을 갖는 폴리 뉴클레오티드에 관한 것이다. 본 발명은 특히 엄격한 조건(또는 엄한 조건) 하에서 본 발명에 따른 폴리 뉴클레오티드와 혼성화될 수 있는 폴리 뉴클레오티드에 관한 것이다. 본 발명에서, “엄격한 조건”은, (1) 비교적 낮은 이온 강도와 비교적 높은 온도 하에서의 혼성화 및 용리, 예를 들어 0.2 × SSC, 0.1 %의 SDS, 60 ℃; 또는 (2) 혼성화시 변성제 첨가, 예를 들어, 50 %(v/v)의 포름아미드, 0.1 %의 소태아 혈청/0.1 %의 Ficoll, 42 ℃ 등; 또는 (3) 두 가닥의 서열 사이의 동일성이 적어도 90 % 이상이고, 바람직하게는 95 % 이상일 때만 혼성화된다. 또한, 혼성화 가능한 폴리 뉴클레오티드에 의해 코딩된 폴리펩티드는 SEQ ID NO.: 4, 6, 8, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 116, 118, 120, 122, 또는 124로 표시되는 성숙 폴리펩티드와 동일한 생물학적 기능과 활성을 갖는다.
또한 본 발명은 상기의 서열과 혼성화된 핵산 단편에 관한 것이다. 본 명세서에 사용된 바와 같이, “핵산 단편”의 길이는 적어도 15개의 뉴클레오티드, 바람직하게는 적어도 30개의 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 50개의 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 100개의 뉴클레오티드를 포함한다. 핵산 단편은 GT29-32, GT29-33, GT29-34, GT29-4, GT29-5, GT29-7, GT29-9, GT29-11, GT29-13, GT29-17, GT29-18, GT29-19, GT29-20, GT29-21, GT29-22, GT29-23, GT29-24, GT29-25, GT29-32, GT29-33, GT29-34, GT29-36, GT29-37, GT29-42, GT29-43, GT29-45, GT29-46, PNUGT29-1, PNUGT29-2, PNUGT29-3, PNUGT29-4, PNUGT29-5, PNUGT29-6, PNUGT29-7, PNUGT29-8, PNUGT29-9, PNUGT29-14 또는 PNUGT29-15 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 결정 및/또는 분리하기 위한 핵산 증폭 기술(예를 들어 PCR)에 적용될 수 있다.
본 발명에서의 폴리펩티드와 폴리 뉴클레오티드는 바람직하게 분리된 형식으로 제공되고, 더욱 바람직하게는 정제 또는 균질화 형식으로 제공된다.
본 발명의 GT29-32, GT29-33, GT29-34, GT29-4, GT29-5, GT29-7, GT29-9, GT29-11, GT29-13, GT29-17, GT29-18, GT29-19, GT29-20, GT29-21, GT29-22, GT29-23, GT29-24, GT29-25, GT29-32, GT29-33, GT29-34, GT29-36, GT29-37, GT29-42, GT29-43, GT29-45, GT29-46, PNUGT29-1, PNUGT29-2, PNUGT29-3, PNUGT29-4, PNUGT29-5, PNUGT29-6, PNUGT29-7, PNUGT29-8, PNUGT29-9, PNUGT29-14 또는 PNUGT29-15뉴클레오티드 전장 서열 또는 이의 단편은 통상적으로 PCR 증폭법, 재조합법 또는 인공 합성의 방법에 의해 얻는다. PCR 증폭법에 관하여, 본 발명에 개시된 관련 뉴클레오티드 서열, 특히 개방 판독 프레임 서열에 따라 프라이머를 설계할 수 있고, 시판되는 cDNA 라이브러리 또는 당업자에게 공지된 통상적인 방법에 의해 제조된 cDNA 라이브러리를 주형으로 증폭하여 관련 서열을 얻을 수 있다. 서열이 비교적 길 경우, 2회 또는 여러 회 PCR 증폭을 수행할 필요가 있고, 다음 각각의 증폭된 단편을 정확한 순서에 따라 함께 스플라이싱한다.
관련 서열을 얻으면, 재조합법에 따라 관련 서열을 대량으로 얻을 수 있다. 이는 일반적으로 전달체에 클로닝되고 다시 세포로 전달된 후, 통상적인 방법에 의해 증식된 숙주 세포로부터 분리하여 얻은 관련 서열이다.
이 외에, 특히 단편 길이가 짧을 경우 인공 합성 방법 관련 서열을 합성할 수도 있다. 통상적으로, 먼저 복수 개의 작은 단편을 합성한 후, 다시 연결하여 긴 단편을 얻을 수 있다.
현재, 본 발명의 단백질(또는 이의 단편, 또는 이의 유도체)을 코딩하는 DNA 서열은 화학적 합성에 의해 완전히 얻을 수 있다. 이후, 이 DNA 서열은 당 업계에 공지된 다양한 기존 DNA 분자 (또는 예를 들어 전달체) 및 세포에 도입될 수 있다. 이 외에, 화학 합성에 의해 돌연변이를 본 발명의 단백질 서열에 도입할 수도 있다.
PCR 기술에 의해 DNA/RNA를 증폭시키는 방법은 바람직하게는 본 발명의 유전자를 얻기 위해 사용된다. 특히, 라이브러리로부터 전장의 cDNA를 얻는 것이 어려운 경우, 바람직하게 RACE법(RACE-cDNA 말단 고속 증폭법)을 사용할 수 있고, PCR에 사용된 프라이머는 본 명세서에 개시된 본 발명의 서열 정보에 따라 적절히 선택될 수 있으며, 통상적인 방법에 따라 합성될 수도 있다. 증폭된 DNA/RNA는 전기 영동과 같은 통상적인 방법에 의해 분리 및 정제될 수 있다.
또한 본 발명은 본 발명의 폴리 뉴클레오티드를 포함하는 전달체, 본 발명의 전달체 또는 GT29-32, GT29-33, GT29-34, GT29-4, GT29-5, GT29-7, GT29-9, GT29-11, GT29-13, GT29-17, GT29-18, GT29-19, GT29-20, GT29-21, GT29-22, GT29-23, GT29-24, GT29-25, GT29-32, GT29-33, GT29-34, GT29-36, GT29-37, GT29-42, GT29-43, GT29-45, GT29-46, PNUGT29-1, PNUGT29-2, PNUGT29-3, PNUGT29-4, PNUGT29-5, PNUGT29-6, PNUGT29-7, PNUGT29-8, PNUGT29-9, PNUGT29-14 또는 PNUGT29-15 단백질 코딩 서열로 유전자 조작에 의해 생성된 숙주 세포, 및 재조합 기술에 의해 본 발명에 따른 폴리펩티드를 생성하는 방법에 관한 것이다.
통상적인 재조합 DNA 기술에 의해, 본 발명의 폴리뉴클레오티드 서열을 이용하여 재조합된 GT29-32, GT29-33, GT29-34, GT29-4, GT29-5, GT29-7, GT29-9, GT29-11, GT29-13, GT29-17, GT29-18, GT29-19, GT29-20, GT29-21, GT29-22, GT29-23, GT29-24, GT29-25, GT29-32, GT29-33, GT29-34, GT29-36, GT29-37, GT29-42, GT29-43, GT29-45, GT29-46, PNUGT29-1, PNUGT29-2, PNUGT29-3, PNUGT29-4, PNUGT29-5, PNUGT29-6, PNUGT29-7, PNUGT29-8, PNUGT29-9, PNUGT29-14 또는 PNUGT29-15폴리펩티드를 발현하거나 생산할 수 있다. 일반적으로,
(1). 본 발명의 GT29-32, GT29-33, GT29-34, GT29-4, GT29-5, GT29-7, GT29-9, GT29-11, GT29-13, GT29-17, GT29-18, GT29-19, GT29-20, GT29-21, GT29-22, GT29-23, GT29-24, GT29-25, GT29-32, GT29-33, GT29-34, GT29-36, GT29-37, GT29-42, GT29-43, GT29-45, GT29-46, PNUGT29-1, PNUGT29-2, PNUGT29-3, PNUGT29-4, PNUGT29-5, PNUGT29-6, PNUGT29-7, PNUGT29-8, PNUGT29-9, PNUGT29-14 또는 PNUGT29-15 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드(또는 변이체), 또는 상기 폴리뉴클레오티드를 함유한 재조합 발현 전달체를 적합한 숙주 세포에 형질 전화시키거나 형질도입시키는 단계;
(2). 적합한 배지에서 숙주 세포를 배양하는 단계;
(3). 배지 또는 세포에서 단백질을 분리, 정제하는 단계를 포함한다.
본 발명에서, GT29-32, GT29-33, GT29-34, GT29-4, GT29-5, GT29-7, GT29-9, GT29-11, GT29-13, GT29-17, GT29-18, GT29-19, GT29-20, GT29-21, GT29-22, GT29-23, GT29-24, GT29-25, GT29-32, GT29-33, GT29-34, GT29-36, GT29-37, GT29-42, GT29-43, GT29-45, GT29-46, PNUGT29-1, PNUGT29-2, PNUGT29-3, PNUGT29-4, PNUGT29-9, PNUGT29-14 또는 PNUGT29-15 폴리뉴클레오티드 서열은 재조합 발현 전달체에 삽입될 수 있다. 용어 “재조합 발현 전달체”는 당 업계에 공지된 박테리아 플라스미드, 파지, 효모 플라스미드, 식물 세포 바이러스, 아데노바이러스와 같은 포유 동물 세포 바이러스, 레트로바이러스 또는 기타 전달체를 지칭한다. 숙주 체내에서 복제 및 안정화될 수 있는 플라스미드 및 전달체라면 임의의 것을 사용할 수 있다. 발현 전달체의 하나의 중요한 특징은 통상적으로 복제 기점, 프로모터, 마커 유전자 및 번역 제어 요소를 함유한다는 것이다.
당업자에게 공지된 방법은 GT29-32, GT29-33, GT29-34, GT29-4, GT29-5, GT29-7, GT29-9, GT29-11, GT29-13, GT29-17, GT29-18, GT29-19, GT29-20, GT29-21, GT29-22, GT29-23, GT29-24, GT29-25, GT29-32, GT29-33, GT29-34, GT29-36, GT29-37, GT29-42, GT29-43, GT29-45, GT29-46, PNUGT29-1, PNUGT29-2, PNUGT29-3, PNUGT29-4, PNUGT29-9, PNUGT29-14 또는 PNUGT29-15코딩 DNA 서열 및 적합한 전사/번역 제어 신호를 함유하는 발현 전달체를 구축하는데 사용된다. 이러한 방법은 체외 재조합 DNA 기술, DNA 합성 기술, 체내 재조합 기술 등을 포함한다. 상기 DNA 서열은 발현 전달체 중의 적합한 프로모터에 효과적으로 연결되어 mRNA 합성을 지시할 수 있다. 이러한 프로모터의 대표적인 예로, 대장균의 lac 또는 trp 프로모터; λ파지 PL 프로모터; CMV 즉시 초기 프로모터, HSV 티미딘키나제 프로모터, 초기 및 말기 SV40프로모터, 역전사 바이러스의 LTRs 및 기타 일부 공지된 제어 가능한 유전자가 원핵 또는 진핵 세포 또는 이의 바이러스에서 발현되는 프로모터를 비롯한 진핵 프로모터가 있다. 발현 전달체는 번역 개시용의 리보솜 결합 부위 및 전사 종결자를 더 포함한다.
이 외에, 바람직하게 발현 전달체는 진핵 세포 배양을 위한 디히드로폴레이트리덕타제(dihydrofolate reductase), 네오마이신(neomycin) 내성 및 녹색 형광 단백질(GFP)과 같은 형질 전환 된 숙주 세포 선택하기 위한 표현형 특성을 제공하거나, 대장균의 테트라사이클린(tetracycline) 또는 암피실린 내성을 제공하기 위한 하나 또는 복수 개의 선별 마커 유전자를 포함한다.
상기의 적합한 DNA 서열 및 적합한 프로모터 또는 제어 서열을 전달체를 단백질의 발현을 가능하게 하는 적절한 숙주 세포에 형질 전환시킬 수 있다.
숙주 세포는 박테리아 세포와 같은 원핵 세포; 또는 효모 세포와 같은 하등 진핵 세포; 또는 포유 동물 세포와 같은 고등 진핵 세포일 수 있다. 대표적인 예로 대장균, 스트렙토마이세스 속; 살모넬라티피무리움의 박테리아 세포; 효모와 같은 진균 세포; 식물 세포; 초파리 S2 또는 Sf9의 곤충 세포; CHO, COS, 293세포, 또는 Bowes 흑색종 세포의 동물 세포 등이 있다.
본 발명의 폴리 뉴클레오티드가 고등 진핵 세포에서 발현될 때, 인핸서 서열이 전달체에 삽입되면 전사가 향상된다. 인핸서는 DNA의 시스 작용 인자로, 통상적으로 약 10개 내지 300개의 염기쌍이 있으며, 프로모터에 작용하여 유전자의 전사를 증가시킨다. 복제 개시점 말기 일측의 100개 내지 270개의 염시쌍의 SV40인핸서, 복제 개시점 말기 일측의 폴리마 인핸서 및 아데노 바이러스 인핸서 등을 포함하는 것을 예로 들 수 있다.
적절한 전달체, 프로모터, 인핸서 및 숙주 세포를 선택하는 방법은 당업자에게 명백할 것이다.
재조합 DNA에 의한 숙주 세포의 형질 전환은 당업자에게 공지된 통상적인 기술을 사용하여 수행될 수 있다. 숙주가 대장균과 같은 원핵 생물일 때, DNA를 흡수할 수 있는 컴피턴트 세포는 지수 생장기 이후에 획득할 수 있고, CaCl2법에 의해 처리되며, 사용된 단계는 당 업계에 잘 알려져 있다. 다른 방법은 MgCl2를 사용하는 것이다. 필요하면, 형질 전환은 전기 천공에 의해 수행될 수도 있다. 숙주가 진핵 생물일 경우, 인산칼슘 공침법, 미세 주사법, 전기 천공법, 리포좀 패키징 등과 같은 통상적인 기계적 방법과 같은 DNA 형질 감염 방법을 선택하여 사용할 수 있다.
얻은 형질 전환체는 통상의 방법에 따라 배양하여 본 발명의 유전자에 의해 코딩된 폴리펩티드를 발현시킬 수 있다. 사용된 숙주 세포에 따라, 배양에 사용된 배지는 다양한 통상적인 배지로부터 선택될 수 있다. 숙주 세포 성장에 적합한 조건 하에서 배양하였다. 숙주 세포가 적절한 세포 밀도까지 성장한 후, 선택된 프로모터는 적합한 방법(예를 들어 온조 전환 또는 화학적 유도)에 의해 유도되고, 세포를 일정 시간 동안 더 배양하였다.
상기 방법에서의 재조합 폴리펩티드는 세포 내 또는 세포 막 상에서 발현되거나 세포 외로 분비될 수 있다. 필요하면, 재조합 단백질은 이의 물리적, 화학적 및 기타 특성을 이용하여 다양한 분리 방법에 의해 분리 및 정제할 수 있다. 이러한 방법은 당업자에게 잘 알려져 있다. 이러한 방법의 예로 통상적인 재생 처리, 단백질 침전제 처리(염석 방법), 원심 분리, 침투 파균, 울트라 처리, 울트라 원심 분리, 분자체 크로마토그래피(겔 여과), 흡착 크로마토그래피, 이온 교환 크로마토그래피, 고성능 액체 크로마토그래피 (HPLC) 및 기타 다양한 액상 크로마토그래피 기술 및 이러한 방법의 조합을 포함하지만 이에 한정되지 않는다.
응용
본 발명에 관한 활성 폴리펩티드 또는 글리코실트랜스퍼라제는 공지된 진세노사이드 및 신규 진세노사이드 및 이의 유도체의 인공 합성에 사용될 수 있고, CK, DMG, F2, Rd, F1, Rh1 및 Rg1 등을 각각 진세노사이드Rg3, 진세노사이드Rd, 진세노사이드Rb1, 진세노사이드Rb3, 사포닌DMGG, 사포닌DMGX, 지페노사이드LXXV, 지페노사이드XVII, 지페노사이드XIII, 지페노사이드IX, 노토진세노사이드U和, 노토진세노사이드R1, 和노토진세노사이드R2, 노토진세노사이드R3, 3-O-β-(D-xylopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)-PPD; 3-O-β-(D-xylopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)-CK, 20-O-Glucosylginsenoside Rf 및 Ginsenoside F3으로 전환할 수 있다.
본 발명의 장점:
(1) 본 발명의 글리코실트랜스퍼라제는 테트라시클릭트리터페노이드 화합물 기질의 C-20 부위의 첫 번째 글리코실기/또는 C-6 또는 C-3 부위의 첫 번째 글리코실기에 글리코실기를 특이적 및 효율적으로 전입시키거나 글리코실기를 치환하여 당사슬을 연장할 수 있고;
(2) 본 발명의 글리코실트랜스퍼라제는 특히 CK, DMG, F2, Rd, F1, Rh1 및 Rg1을 활성을 갖는 진세노사이드Rg3, 진세노사이드Rd, 진세노사이드Rb1, 진세노사이드Rb3, 사포닌DMGG, 사포닌DMGX, 지페노사이드LXXV, 지페노사이드XVII, 지페노사이드XIII, 지페노사이드IX, 노토진세노사이드U, 노토진세노사이드R1, 노토진세노사이드R2, 노토진세노사이드R3, 3-O-β-(D-xylopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)-PPD; 3-O-β-(D-xylopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl)-CK, 20-O-Glucosylginsenoside Rf 및 Ginsenoside F3으로 각각 전환시킬 수 있으며;
(3) 진세노사이드Rb1은 신경 세포 및 항염증 및 항산화 효능이 있고; 진세노사이드Rb3은 심근 허혈을 완화시키며 항우울 효능이 있다. 노토진세노사이드R1은 노토진세노사이드의 주요 성분으로, 항염증 효능이 있다. 노토진세노사이드R2는 신경 보호 효능이 있다.
실시예 1. 인삼글리코실트랜스퍼라제 및 코딩 유전자의 분리
인삼 RNA를 추출하고 연전사하여 인삼의 cDNA를 얻었다. 상기 cDNA를 주형으로 프라이머 쌍 1(SEQ ID NO.: 1 및 SEQ ID NO.: 2) 또는 프라이머 쌍 2(SEQ ID NO.: 9 및 SEQ ID NO.: 10) 또는 프라이머 쌍 3(SEQ ID NO.: 113 및 SEQ ID NO.: 114)에 의해 PCR 증폭을 수행하여, 1.4 ~ 1.5 kb인 증폭 산물을 얻었다. DNA 폴리머라제는 TaKaRa Bio Group 유한 회사의 고충실도 KOD DNA폴리머라제를 선택하여 사용하였다. PCR 산물은 아가로스 겔 전기 영동에 의해 검출되었다.
자외선 조사 하에서, 표적 DNA 밴드를 절단하였다. 다음 Axygen Gel Extraction Kit(AEYGEN회사)를 사용하여 아가로스 겔로부터 DNA, 즉 증폭된 DNA단편을 회수하였다. 이 DNA단편에 TaKaRa Bio Group 유한 회사의 rTaq DNA 폴리머라제를 사용하여 말단에 A를 첨거한 후 시판되는 클로닝 전달체 pMD18-T Vector와 연결되었다. 연결 산물을 시판되는 대장균 EPI300 적격 세포에 형질 전환시킨 후, 형질 전환된 대장균 박테리아 용액을 50ug/mL의 AMP, 0.5mM의 IPTG, 25 μg/mL의 X-Gal을 함유한 LB 플레이트에 도포하고, PCR 및 효소 절단에 의해 재조합 클론을 추가로 확인하였다. 몇 개의 클로을 취하여 재조합 플라스미드를 추출한 후 시퀀싱하여, 29개의 상이한 핵산 서열을 얻었으며, 각각 GT29-32 (SEQ ID NO.: 3), GT29-33 (SEQ ID NO.: 5), GT29-34 (SEQ ID NO.: 7), GT29-4(SEQ ID NO.: 11), GT29-5(SEQ ID NO.: 13), GT29-7(SEQ ID NO.: 15), GT29-9(SEQ ID NO.: 17),GT29-11(SEQ ID NO.: 19), GT29-13(SEQ ID NO.:21), GT29-17(SEQ ID NO.: 23), GT29-18(SEQ ID NO.: 25), GT29-19(SEQ ID NO.: 116), GT29-20(SEQ ID NO.: 118), GT29-21(SEQ ID NO.: 120), GT29-22(SEQ ID NO.: 122), GT29-23(SEQ ID NO.: 124), GT29-24(SEQ ID NO.: 27), GT29-25(SEQ ID NO.: 29), GT29-36(SEQ ID NO.:89), GT29-37(SEQ ID NO.: 91), GT29-42(SEQ ID NO.: 93), GT29-42(SEQ ID NO.: 95), GT29-45(SEQ ID NO.: 97)和GT29-46(SEQ ID NO.: 99)으로 명명하였다. BESTORF 소프트웨어로 ORF를 찾았다. 서열 대비에 의해, 확장된 산물이 모두 글리코실트랜스퍼라제 제1 패밀리 보존적 기능 도메인을 가지며, 이는 글리코실트랜스퍼라제 유전자인 것을 나타낸다.
GT29-32: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-32는 442개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 GT29-32를 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 4로 포시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.2 kDa이고, 등전점 pI는 6.09인 것으로 예측되었다. 상기 글리코실트랜스퍼라제는 기능적으로 검증된 글리코실트랜스퍼라제 UGTPg29(Genbank accession AKA44579.1)의 아미노산 서열과의 동일성은 92 %로 나타났다.
GT29-33: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-33는 448개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 GT29-33을 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 6으로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 50.0 kDa이고, 등전점 pI는 6.77인 것으로 예측되었다. 상기 글리코실트랜스퍼라제는 기능적으로 검증된 글리코실트랜스퍼라제 UGTPg29의 아미노산 서열과의 동일성은 90 %로 나타났다.
GT29-34: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-34는 446개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 GT29-34를 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 8로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.7 kDa이고, 등전점 pI는 6.23으로 나타났다. 상기 글리코실트랜스퍼라제는 기능적으로 검증된 글리코실트랜스퍼라제 UGTPg29의 아미노산 서열과의 동일성은 90 %로 나타났다.
GT29-4: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-4는 446개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 GT29-4를 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 12로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.8 kDa인 것으로 예측되었고, 등전점은 5.63으로 나타났다. 상기 글리코실트랜스퍼라제는 기능적으로 검증된 글리코실트랜스퍼라제 UGTPg29의 아미노산 서열과의 동일성은 92 %로 나타났다.
GT29-5: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-5는 446개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 GT29-5를 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 14로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.7 kDa이고, 등전점 pI는 5.93인 것으로 예측되었다. 상기 글리코실트랜스퍼라제는 기능적으로 검증된 글리코실트랜스퍼라제 UGTPg29의 아미노산 서열과의 동일성은 93 %로 나타났다.
GT29-7: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-7은 446개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 GT29-7을 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 16으로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.8 kDa이고, 등전점 pI는 5.8인 것으로 예측되었다. 상기 글리코실트랜스퍼라제는 기능적으로 검증된 글리코실트랜스퍼라제 UGTPg29의 아미노산 서열과의 동일성은 92 %로 나타났다.
GT29-9: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-9는 446개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 GT29-9를 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 18로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.8 kDa이고, 등전점 pI는 5.93인 것으로 예측되었다. 상기 글리코실트랜스퍼라제는 기능적으로 검증된 글리코실트랜스퍼라제 UGTPg29의 아미노산 서열과의 동일성은 92 %로 나타났다.
GT29-11: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-11은 446개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 GT29-11을 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 20으로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.9 kDa이고, 등전점 pI는 5.90인 것으로 예측되었다. 상기 글리코실트랜스퍼라제는 기능적으로 검증된 글리코실트랜스퍼라제 UGTPg29의 아미노산 서열과의 동일성은 91 %로 나타났다.
GT29-13: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-13은 446개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 GT29-13을 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 22로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.9 kDa이고, 등전점 pI는 5.93인 것으로 예측되었다. 상기 글리코실트랜스퍼라제는 기능적으로 검증된 글리코실트랜스퍼라제 UGTPg29의 아미노산 서열과의 동일성은 91 %로 나타났다.
GT29-17: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-17은 442개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 GT29-17을 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 24로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.3 kDa이고, 등전점 pI는 5.35인 것으로 예측되었다. 상기 글리코실트랜스퍼라제는 기능적으로 검증된 글리코실트랜스퍼라제 UGTPg29의 아미노산 서열과의 동일성은 93 %로 나타났다.
GT29-18: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-18은 446개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 GT29-18을 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 26으로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.9 kDa이고, 등전점 pI는 5.93인 것으로 예측되었다. 상기 글리코실트랜스퍼라제는 기능적으로 검증된 글리코실트랜스퍼라제 UGTPg29의 아미노산 서열과의 동일성은 91 %로 나타났다.
GT29-24: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-24는 446개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 GT29-24를 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 28로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.9 kDa이고, 등전점 pI는 5.93인 것으로 예측되었다. 상기 글리코실트랜스퍼라제는 기능적으로 검증된 글리코실트랜스퍼라제 UGTPg29의 아미노산 서열과의 동일성은 91 %로 나타났다.
GT29-25: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-25는 446개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 GT29-25를 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 30으로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.9 kDa이고, 등전점 pI는 5.93인 것으로 예측되었다. 상기 글리코실트랜스퍼라제는 기능적으로 검증된 글리코실트랜스퍼라제 UGTPg29의 아미노산 서열과의 동일성은 91 %로 나타났다.
GT29-19: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-19는 442개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 GT29-19를 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 116으로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.1 kDa이고, 등전점 pI는 5.47인 것으로 예측되었다.
GT29-20: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-20은 442개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 GT29-20을 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 118로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.1 kDa이고, 등전점 pI는 5.93인 것으로 예측되었다.
GT29-21: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-21은 442개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 GT29-21을 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 120으로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.1 kDa이고, 등전점 pI는 5.80인 것으로 예측되었다.
GT29-22: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-22는 442개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 GT29-22를 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 122로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.1 kDa이고, 등전점 pI는 5.93인 것으로 예측되었다.
GT29-23: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-23은 442개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 GT29-23을 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 124로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.0 kDa이고, 등전점 pI는 5.61인 것으로 예측되었다.
GT29-36: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-36은 442개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 GT29-36을 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO:102로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.1 kDa이고, 등전점 pI는 5.93인 것으로 예측되었다.
GT29-37:글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-37은 442개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 GT29-37을 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO:104로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.1 kDa이고, 등전점 pI는 5.62인 것으로 예측되었다.
GT29-42:글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-42는 444개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 GT29-42를 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO:106으로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.4 kDa이고, 등전점 pI는 6.16인 것으로 예측되었다.
GT29-43: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-43은 442개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 GT29-43을 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO:108로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.1 kDa이고, 등전점 pI는 5.78인 것으로 예측되었다.
GT29-45: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-45는 448개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 GT29-45를 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 110으로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 50.0 kDa이고, 등전점 pI는 7.25인 것으로 예측되었다.
GT29-46: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-46은 442개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 GT29-46을 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 112로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.1 kDa이고, 등전점 pI는 5.48인 것으로 예측되었다.
실시예 2. 대장균에서 글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-32, GT29-33 및 GT29-34의 발현
실시예 1에 따라 구축된 GT29-32, GT29-33 및 GT29-34 유전자를 함유하는 플라스미드 GT29-32-pMD18T, GT29-33-pMD18T 및 GT29-34-pMD18T를 주형으로, 표 1에 나타낸 프라이머로 목표 유전자 GT29-32, GT29-33 및 GT29-34를 증폭하였다.
발현 전달체 pET28a(Merck 회사에서 구입)를 NcoI/SalI 효소로 절단한 후, GT29-32, GT29-33 및 GT29-34를 pET28a(Vazyme서 구입 한 1 단계 클로닝 키트)에 클로닝하여, 대장균 발현 전달체 GT29-32-pET28a, GT29-33-pET28a 및 GT29-34-pET28a를 구축하였다. 재조합 단백질 GT29-32, GT29-33 및 GT29-34의 C말단이 6×His tag 태그를 갖도록 pET28a의 6×His tag 서열을 사용하였다. 플라스미드를 시판되는 E. coli BL21에 각각 형질 전화시켜, 재조합 균주 BL21-GT29-32, BL21-GT29-33 및 BL21-GT29-34를 구축하였다. 하나의 재조합체를 LB 배지에 접종하고, 37 ℃의 온도 하에서 200 rpm으로 OD60이 약 0.6 ~ 0.8이 될 때까지 배양하며, 박테리아 용액을 4 ℃로 냉각시키고, 최종 농도가 100 μM인 IPTG를 넣어, 18 ℃의 온도 하에서 120 rpm으로 16시간 동안 발현을 유도하였다. 4 ℃의 온도 하에서 원심 분리하여 균체를 수집하고, 초음파에 의해 세포를 파쇠한 후, 4 ℃의 온도 하에서 12000 g으로 10분 동안 원심 분리하여 세포 용해물 상청액을 수집하며, 샘플을 취하여 SDS-PAGE 전기 영동 및 웨스턴 블롯을 수행하였다. SDS-PAGE에 따르면 GT29-32-pET28a, GT29-33-pET28a 및 GT29-34-pET28a의 재조합 형질 전환체는 빈 전달체 pET28a 재조합 형질 전환체 세포 용해물과 명확한 차이가 없었으며, 가용성 발현량이 유의하지 않았다(도 1A). 항 6×His tag 웨스턴 블롯(도 1의 (B))에 따르면, 45 ~ 55 kD 사이에는 명확한 밴드가 있으며, 글리코실트랜스퍼라제 GT29-32, GT29-33 및 GT29-34는 대장균에서 소량의 가용성 발현을 갖는다.
| 유전자 |
프라이머 |
SEQ ID NO. |
| UGT29-4 |
UGT29-4-F |
31 |
| UGT29-4-R |
34 |
| UGT29-5 |
UGT29-5-F |
33 |
| UGT29-5-R |
32 |
| UGT29-7 |
UGT29-7-F |
35 |
| UGT29-7-R |
32 |
| UGT29-9 |
UGT29-9-F |
33 |
| UGT29-9-R |
32 |
| UGT29-11 |
UGT29-11-F |
33 |
| UGT29-11-R |
32 |
| UGT29-13 |
UGT29-13-F |
33 |
| UGT29-13-R |
32 |
| UGT29-17 |
UGT29-17-F |
31 |
| UGT29-17-R |
32 |
| UGT29-18 |
UGT29-18-F |
33 |
| UGT29-18-R |
34 |
| UGT29-24 |
UGT29-24-F |
33 |
| UGT29-24-R |
34 |
| UGT29-25 |
UGT29-25-F |
33 |
| UGT29-25-R |
32 |
| UGT29-32 |
UGT29-32-F |
31 |
| UGT29-32-R |
32 |
| UGT29-33 |
UGT29-33-F |
36 |
| UGT29-33-R |
37 |
| UGT29-34 |
UGT29-34-F |
36 |
| UGT29-34-R |
34 |
| UGT29-19 |
UGT29-19-F |
125 |
| UGT29-19-R |
126 |
| UGT29-20 |
UGT29-20-F |
127 |
| UGT29-20-R |
128 |
| UGT29-21 |
UGT29-21-F |
129 |
| UGT29-21-R |
130 |
| UGT29-22 |
UGT29-22-F |
131 |
| UGT29-22-R |
132 |
| UGT29-23 |
UGT29-23-F |
133 |
| UGT29-23-R |
134 |
| UGT29-36 |
UGT29-36-F |
101 |
| UGT29-36-R |
102 |
| UGT29-37 |
UGT29-37-F |
103 |
| UGT29-37-R |
104 |
| UGT29-42 |
UGT29-42-F |
105 |
| UGT29-42-R |
106 |
| UGT29-43 |
UGT29-43-F |
107 |
| UGT29-43-R |
108 |
| UGT29-45 |
UGT29-36-F |
109 |
| UGT29-36-R |
110 |
| UGT29-46 |
UGT29-36-F |
111 |
| UGT29-36-R |
112 |
표 1. 유전자 즉폭에 사용된 프라이머
실시예 3. GT29-32, GT29-33 및 GT29-34의 체외 글리코실 전이 활성 및 산물 검증
실시예 2에서 재조합 대장균 BL21-GT29-32, BL21-GT29-33 및 BL21-GT29-34의 세포 용해물 상청액을 조효소 용액으로 글리코실 전이 반응을 수행하고, 빈 전달체 pET28a재조합 대장균을 전이하는 세포 용해물을 대조로 하였다.
도 2에 도시된 바와 같이, GT29-32 및 GT29-34는 프로토파낙사디올형 진세노사이드CK를 글리코실기 수용체로, UDP-글루코스(UDP-glucose)를 글리코실기 공여체로 하여, 이에 촉매 작용하여 새로운 산물을 생성할 수 있고;
도 3에 도시된 바와 같이:GT29-32, GT29-33 및 GT29-34는 진세노사이드Rd를 글리코실기 수용체로, UDP-글루코스를 글리코실기 공여체로 하여, 이에 촉매 작용하여 Rb1을 생성할 수 있다. HPLC의 결과는 TLC의 결과와 일치하였다.
따라서, GT29-32 및 GT29-34는 CK의 C20-O-Glc에 촉매 작용하여 일 분자의 글루코스를 연장하여 진세노사이드Gypenoside LXXV를 생성할 수 있다. UDP-자일로스(UDP-xylose)가 글리코실기 공여체일 경우, GT29-32는 Rd에 촉매 작용하여 3가지 산물을 생성할 수 있다. 여기서, 하나의 산물의 TLC에서의 이동율이 Rb3와 일치하였고, 즉 GT29-32는 C20-O-Glc에 일 분자의 자일로스를 연장하여 Rb3을 생성할 수 있다(도 2). HPLC의 결과는 TLC와 일치하였고, GT29-32는 Rd 및 UDP-자일로스에 촉매 작용하여 3가지 산물을 생성할 수 있다(도 4).
GT29-32는 프로토파낙사트리올형 진세노사이드F1을 글리코실기 수용체로, UDP-글루코스를 글리코실기 공여체로 하여, 촉매 작용하여 새로운 산물을 생성할 수 있고, F1의 C20-O-Glc에서 일 분자의 글루코스가 연장된 것으로 예측되며, 산물은 노토진세노사이드R3(Notoginsenoside R3)이다(도 5 및 도 6).
GT29-32, GT29-33 및 GT29-34는 프로토파낙사디올형 진세노사이드CK를 글리코실기 수용체로, UDP-아라비노스를 글리코실기 공여체로 하여, CK의 C-20 첫번재 글리코실기에 연장된 하나의 아라비노실기에 촉매 작용하여 진세노사이드F3(Ginsenoside F3)을 생성할 수 있고, 여기서 GT29-32의 활성이 가장 강하다(도 17).
실시예 4. 대장균에서 글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-4, GT29-5, GT29-7, GT29-9, GT29-11, GT29-13, GT29-17, GT29-18, GT29-24 및 GT29-25의 발현
실시예 1에서 구축된 GT29-4, GT29-5, GT29-7, GT29-9, GT29-11, GT29-13, GT29-17, GT29-18, GT29-24 및 GT29-25 유전자를 함유한 플라스미드GT29-4-pMD18T, GT29-5-pMD18T, GT29-7-pMD18T, GT29-9-pMD18T, GT29-11-pMD18T, GT29-13-pMD18T, GT29-17-pMD18T, GT29-18-pMD18T, GT29-24-pMD18T 및 GT29-25-pMD18T를 주형으로, 표 1에 나타낸 프라이머로 목표 유전자 GT29-4, GT29-5, GT29-7, GT29-9, GT29-11, GT29-13, GT29-17, GT29-18, GT29-24 및 GT29-25를 증폭하였다. 발현 전달체pET28a Merck에서 구입)를 NcoI/SalI 효소로 절단한 후, GT29-11, GT29-13, GT29-17, GT29-18, GT29-24 및 GT29-25를 pET28a(Vazyme서 구입 한 1 단계 클로닝 키트)에 클로닝하여, 대장균 발현 전달체GT29-4-pET28a, GT29-5-pET28a, GT29-7-pET28a, GT29-9-pET28a, GT29-11-pET28a, GT29-13-pET28a, GT29-17-pET28a, GT29-18-pET28a, GT29-24-pET28a 및 GT29-25-pET28a를 구축하였다.
재조합 단백질 GT29-4-pET28a, GT29-5-pET28a, GT29-7-pET28a, GT29-9-pET28a, GT29-11-pET28a, GT29-13-pET28a, GT29-17-pET28a, GT29-18-pET28a, GT29-24 및 GT29-25의 C이 6×His tag 태그를 갖도록 pET28a의 6×His tag 서열을 사용하였다. 플라스미드를 시판되는 E. coli BL211에 각각 형질 전화시켜, 재조합 균주 BL21-GT29-4, BL21-GT29-5, BL21-GT29-7, BL21-GT29-9, BL21-GT29-11, BL21-GT29-13, BL21-GT29-17, BL21-GT29-18, BL21-GT29-24 및 BL21-GT29-25를 구축하였다. 하나의 재조합체를 LB 배지에 접종하고, 37 ℃의 온도 하에서 200 rpm으로 OD60이 약 0.6 ~ 0.8이 될 때까지 배양하며, 박테리아 용액을 4 ℃로 냉각시키고, 최종 농도가 100 μM인 IPTG를 넣어, 18 ℃의 온도 하에서 120 rpm으로 16시간 동안 발현을 유도하였다. 4 ℃의 온도 하에서 원심 분리하여 균체를 수집하고, 초음파에 의해 세포를 파쇠한 후, 4 ℃의 온도 하에서 12000 g으로 10분 동안 원심 분리하여 세포 용해물 상청액을 수집하며, 샘플을 취하여 SDS-PAGE 전기 영동 및 웨스턴 블롯을 수행하였다.
SDS-PAGE에 따르면 GT29-4-pET28a, GT29-5-pET28a, GT29-7-pET28a, GT29-9-pET28a, GT29-11-pET28a, GT29-13-pET28a, GT29-17-pET28a, GT29-18-pET28a, GT29-24-pET28a 및 GT29-25-pET28a 재조합 형질 전환체는 빈 전달체 pET28a 재조합 형질 전환체 세포 용해물과 명확한 차이가 없었으며, 가용성 발현량이 유의하지 않았다. 항 6×His tag 웨스턴 블롯에 따르면, 45 ~ 55 kD 사이에는 명확한 밴드가 있으며, 글리코실트랜스퍼라제 GT29-4, GT29-5, GT29-7, GT29-9, GT29-11, GT29-13, GT29-17, GT29-18, GT29-24 및 GT29-25는 대장균에서 소량의 가용성 발현을 갖는다.
실시예 5. GT29-4, GT29-5, GT29-7, GT29-9, GT29-11, GT29-13, GT29-17, GT29-18, GT29-24 및 GT29-25의 체외 글리코실 전이 활성 및 산물 검증
실시예 2에서 재조합 대장균 BL21-GT29-4, BL21-GT29-5, BL21-GT29-7, BL21-GT29-9, BL21-GT29-11, BL21-GT29-13, BL21-GT29-17, BL21-GT29-18, BL21-GT29-24 및 BL21-GT29-25의 세포 용해물 상청액을 조효소 용액으로 글리코실 전이 반응을 수행하고, 빈 전달체 pET28a재조합 대장균을 전이하는 세포 용해물을 대조로 하였다.
도 7에 도시된 바와 같이, GT29-4, GT29-5, GT29-7, GT29-9, GT29-11, GT29-13, GT29-17, GT29-18, GT29-24 및 GT29-25는 프로토파낙사디올형 진세노사이드Rg1을 글리코실기 수용체로, UDP-자일로스를 글리코실기 공여체로 하여, 이에 촉매 작용하여 노토진세노사이드R1을 생성할 수 있다. HPLC의 결과는 TLC의 결과와 일치하였다(도 8 및 도 9). 따라서, GT29-4, GT29-5, GT29-7, GT29-9, GT29-11, GT29-13, GT29-17, GT29-18, GT29-24 및 GT29-25는 Rg1의 C6-O-Glc에 촉매 작용하여 일 분자 자일로스를 연장시켜 노토진세노사이드R1을 생성할 수 있다.
도 10에 도시된 바와 같이, GT29-24 및 GT29-25는 프로토파낙사디올형 진세노사이드Rh2를 글리코실기 수용체로, UDP-글루코스를 글리코실기 공여체로 하여, Rh2의 C-3 부위글리코실기에 촉매 작용하여 하나의 글루코실기를 연장시켜 진세노사이드Rg3을 생성할 수 있다. 기질을 F2로 대체할 경우, GT29-24 및 GT29-25는 F2의 C-3 부위글리코실기에 추가로 촉매 작용하여 하나의 글루코실기를 연장시켜 진세노사이드Rd를 생성할 수 있다.
실시예 6. 삼칠글리코실트랜스퍼라제 및 이의 코딩 유전자의 분리
삼칠 RNA을 추출하고 역전사하여, 삼칠의 cDNA를 얻었다. 상기 cDNA를 주형으로 프라이머 쌍 1 (SEQ ID NO.: 82 및 SEQ ID NO.: 83),프라이머 쌍 2 (SEQ ID NO.:84 및 SEQ ID NO.: 85)프라이머 쌍 3(SEQ ID NO.:84 및 SEQ ID NO.:86)프라이머 쌍 4(SEQ ID NO.:87和SEQ ID NO.: 88, )에 의해 PCR을 수행하여, 1.4 ~ 1.5 kb인 증폭 산물을 얻었다. DNA 폴리머라제는 TaKaRa Bio Group 유한 회사의 고충실도 KOD DNA폴리머라제를 선택하여 사용하였다. PCR 산물은 아가로스 겔 전기 영동에 의해 검출되었다.
실시예 1을 참조하여 몇 개의 클로을 취하여 재조합 플라스미드를 추출한 후 시퀀싱하여, 14개의 상이한 핵산 서열을 얻었으며, 각각 PNUGT29-1 (SEQ ID NO.: 38), PNUGT29-2 (SEQ ID NO.:40), PNUGT29-3 (SEQ ID NO.: 42), PNUGT29-4(SEQ ID NO.: 44), PNUGT29-5(SEQ ID NO.: 46), PNUGT29-6(SEQ ID NO.: 48), PNUGT29-7(SEQ ID NO.: 50), PNUGT29-8(SEQ ID NO.: 52), PNUGT29-9(SEQ ID NO.:54)PNUGT29-14(SEQ ID NO.: 56) 및 PNUGT29-15(SEQ ID NO.: 58)로 명명하였다. 소프트웨어로 ORF를 찾았다. 서열 대비에 의해, 확장된 산물이 모두 글리코실트랜스퍼라제 제1 패밀리 보존적 기능 도메인을 가지며, 이는 글리코실트랜스퍼라제 유전자인 것을 나타낸다.
PNUGT29-1: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 PNUGT29-1은 447개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 PNUGT29-1을 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 39로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.688 kDa이고, 등전점 pI는 6.58인 것으로 예측되었다.
PNUGT29-2: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 PNUGT29-2는 442개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 PNUGT29-2를 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 41로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.118 kDa이고, 등전점 pI는 6.20인 것으로 예측되었다.
PNUGT29-3: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 PNUGT29-3은 447개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 PNUGT29-3을 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 43으로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.729 kDa이고, 등전점 pI는 6.58인 것으로 예측되었다.
PNUGT29-4: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 PNUGT29-4는 447개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 PNUGT29-4를 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 45로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.715 kDa이고, 등전점 pI는 6.58인 것으로 예측되었다.
PNUGT29-5: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 PNUGT29-5는 447개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 PNUGT29-5를 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 47로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.718 kDa이고, 등전점 pI는 6.45인 것으로 예측되었다.
PNUGT29-6: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 PNUGT29-6은 447개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 PNUGT29-6을 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 49로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.657 kDa이고, 등전점 pI는 6.70인 것으로 예측되었다.
PNUGT29-7: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 PNUGT29-7은 447개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 PNUGT29-7을 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 51로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.749 kDa이고, 등전점 pI는 6.58인 것으로 예측되었다.
PNUGT29-8: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 PNUGT29-8은 447개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 PNUGT29-8을 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 53으로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.657 kDa이고, 등전점 pI는 6.70인 것으로 예측되었다.
PNUGT29-9: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 PNUGT29-9는 447개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 PNUGT29-9를 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 55로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.695kDa이고, 등전점 pI는 6.58인 것으로 예측되었다.
PNUGT29-14: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 PNUGT29-14는 447개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 PNUGT29-14를 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 57로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.778 kDa이고, 등전점 pI는 6.70인 것으로 예측되었다.
PNUGT29-15: 글리코실트랜스퍼라제 유전자 PNUGT29-15는 447개의 아미노산을 함유하는 하나의 단백질 PNUGT29-15를 코딩하고, 서열 표 중 SEQ ID NO: 59로 표시되는 아미노산 서열을 갖는다. 소프트웨어에 의해 상기 단백질의 이론적 분자량은 49.755 kDa이고, 등전점 pI는 6.63인 것으로 예측되었다.
실시예 7. 대장균에서 삼칠글리코실트랜스퍼라제 유전자 PNUGT29-1, PNUGT29-2, PNUGT29-3, PNUGT29-4, PNUGT29-5, PNUGT29-6, PNUGT29-7, PNUGT29-8, PNUGT29-9, PNUGT29-14 및 PNUGT29-15의 발현
실시예 6에 따라 구축된PNUGT29-1, PNUGT29-2, PNUGT29-3, PNUGT29-4, PNUGT29-5, PNUGT29-6, PNUGT29-7, PNUGT29-8, PNUGT29-9, PNUGT29-14 및 PNUGT29-15 유전자를 함유하는 플라스미드 PNUGT29-1-pMD18T, PNUGT29-2-pMD18T, PNUGT29-3-pMD18T, PNUGT29-4-pMD18T, PNUGT29-5-pMD18T, PNUGT29-6-pMD18T, PNUGT29-7-pMD18T, PNUGT29-8-pMD18T, PNUGT29-9-pMD18T, PNUGT29-14-pMD18T和PNUGT29-15-pMD18T를 주형으로, 표 1에 나타낸 프라이머로 목표 유전자 PNUGT29-1, PNUGT29-2, PNUGT29-3, PNUGT29-4, PNUGT29-5, PNUGT29-6, PNUGT29-7, PNUGT29-8, PNUGT29-9, PNUGT29-14 및 PNUGT29-15를 증폭하였다. 실시예 2의 방법을 참조하여, 재조합 균주 BL21- PNUGT29-1, BL21- PNUGT29-2, BL21- PNUGT29-3, BL21- PNUGT29-4, BL21- PNUGT29-5, BL21- PNUGT29-6, BL21- PNUGT29-7, BL21- PNUGT29-8, BL21- PNUGT29-9, BL21- PNUGT29-14 및 BL21- PNUGT29-15를 구축하고 샘플을 취하여 SDS-PAGE 전기 영동 및 웨스턴 블롯을 수행하였다. 항 6×His tag 웨스턴 블롯(도 10)에 따르면, 45 ~ 65 kD사이에는 명확한 밴드가 있으며, 글리코실트랜스퍼라제 PNUGT29-1, PNUGT29-2, PNUGT29-3, PNUGT29-4, PNUGT29-5, PNUGT29-6, PNUGT29-7, PNUGT29-8, PNUGT29-9, PNUGT29-14 및 PNUGT29-15는 대장균에서 소량의 가용성 발현을 갖는다.
| 유전자 |
프라이머 |
SEQ ID NO. |
| PNUGT29-1 |
PNUGT29-1-F |
60 |
| PNUGT29-1-R |
61 |
| PNUGT29-2 |
PNUGT29-2-F |
62 |
| PNUGT29-2-R |
63 |
| PNUGT29-3 |
PNUGT29-3-F |
64 |
| PNUGT29-3-R |
65 |
| PNUGT29-4 |
PNUGT29-4-F |
66 |
| PNUGT29-4-R |
67 |
| PNUGT29-5 |
PNUGT29-5-F |
68 |
| PNUGT29-5-R |
69 |
| PNUGT29-6 |
PNUGT29-6-F |
70 |
| PNUGT29-6-R |
71 |
| PNUGT29-7 |
PNUGT29-7-F |
72 |
| PNUGT29-7-R |
73 |
| PNUGT29-8 |
PNUGT29-8-F |
74 |
| PNUGT29-8-R |
75 |
| PNUGT29-9 |
PNUGT29-9-F |
76 |
| PNUGT29-9-R |
77 |
| PNUGT29-14 |
PNUGT29-14-F |
78 |
| PNUGT29-14-R |
79 |
| PNUGT29-15 |
PNUGT29-15-F |
80 |
| PNUGT29-15-R |
81 |
표 2. 유전자 증폭에 사용된 프라이머
실시예 8. 삼칠 글리코실트랜스퍼라제 PNUGT29-1, PNUGT29-2, PNUGT29-3, PNUGT29-4, PNUGT29-5, PNUGT29-6, PNUGT29-7, PNUGT29-8, PNUGT29-9, PNUGT29-14 및 PNUGT29-15의 체외 글리코실 전이 활성 및 산물 검증
실시예 7에서 재조합 대장균 BL21- PNUGT29-1, BL21- PNUGT29-2, BL21- PNUGT29-3, BL21- PNUGT29-4, BL21- PNUGT29-5, BL21- PNUGT29-6, BL21- PNUGT29-7, BL21- PNUGT29-8, BL21- PNUGT29-9, BL21- PNUGT29-14 및 BL21- PNUGT29-15의 세포 용해물 상청액을 조효소 용액으로 글리코실 전이 반응을 수행하고, 빈 전달체 pET28a재조합 대장균을 전이하는 세포 용해물을 대조로 하였다.
도 11에 도시된 바와 같이: PNUGT29-1, PNUGT29-2, PNUGT29-3, PNUGT29-4, PNUGT29-5, PNUGT29-6, PNUGT29-7, PNUGT29-8, PNUGT29-9, PNUGT29-14, PNUGT29-15는 프로토파낙사디올형 진세노사이드Rd를 글리코실기 수용체로, UDP-글루코스를 글리코실기 공여체로 하여, Rd의 C-20 부위의 글리코실기에 촉매 작용하여 하나의 글루코실기를 연장시켜 Rb1을 생성할 수 있다.
도 12에 도시된 바와 같이: PNUGT29-1, PNUGT29-2, PNUGT29-3, PNUGT29-4, PNUGT29-5, PNUGT29-6, PNUGT29-7, PNUGT29-8, PNUGT29-9, PNUGT29-14, PNUGT29-15는 프로토파낙사디올형 진세노사이드CK를 글리코실기 수용체로, UDP-글루코스를 글리코실기 공여체로 하여, C-20 부위의 글리코실기에 촉매 작용하여 하나의 글루코실기를 연장시켜 지페노사이드 LXXV를 생성할 수 있다.
도 13에 도시된 바와 같이: PNUGT29-1, PNUGT29-2, PNUGT29-3, PNUGT29-4, PNUGT29-5, PNUGT29-6, PNUGT29-7, PNUGT29-8, PNUGT29-9, PNUGT29-14, PNUGT29-15는 프로토파낙사디올형 진세노사이드Rh2를 글리코실기 수용체로, UDP-글루코스를 글리코실기 공여체로 하여, Rh2의 C-3 부위의 글리코실기에 촉매 작용하여 하나의 글루코실기를 연장시켜 Rg3을 생성할 수 있다.
실시예 9. 대장균에서 글리코실트랜스퍼라제 유전자 GT29-19, GT29-20, GT29-21, GT29-22, GT29-23, GT29-36, GT29-37, GT29-42, GT29-43, GT29-45 및 GT29-46의 발현
실시예 1에 따라 구축된 GT29-19, GT29-20, GT29-21, GT29-22, GT29-23, GT29-36, GT29-37, GT29-42, GT29-43, GT29-45 및 GT29-46 유전자을 함유하는 플라스미드GT29-19-pMD18T, GT29-20-pMD18T, GT29-21-pMD18T, GT29-22-pMD18T, GT29-23-pMD18T, GT29-36-pMD18T, GT29-37-pMD18T, GT29-42-pMD18T, GT29-43-pMD18T, GT29-45-pMD18T 및 GT29-46-pMD18T를 주형으로, 표 1에 나타낸 프라이머에 의해 목표 유전자 GT29-36, GT29-37, GT29-42, GT29-43, GT29-45 및 GT29-46을 증폭하였다.
실시예 2를 참조하여, 재조합 균주 BL21-GT29-19, BL21-GT29-20, BL21-GT29-21, BL21-GT29-22, BL21-GT29-23, BL21-GT29-36, BL21-GT29-37, BL21-GT29-42, BL21-GT29-43, BL21-GT29-45 및 BL21-GT29-46을 구축하고, 샘플을 취하여 SDS-PAGE 전기 영동 및 웨스턴 블롯을 수행하였다.
상기 글리코실트랜스퍼라제 GT29-19, GT29-20, GT29-21, GT29-22, GT29-23, GT29-36, GT29-37, GT29-42, GT29-43, GT29-45 및 GT29-46은 프로토파낙사디올형 진세노사이드Rh2를 글리코실기 수용체로, UDP-글루코스를 글리코실기 공여체로 하여, Rh2의 C-3 부위의 글리코실기에 모두 촉매 작용하여 하나의 글루코실기를 연장시켜 진세노사이드Rg3을 생성할 수 있고, 도 15는 GT29-45 및 GT29-46는 Rh2에 촉매 작용하여 Rg3을 생성할 수 있는 것을 나타낸다.
상기 글리코실트랜스퍼라제 GT29-19, GT29-20, GT29-21, GT29-22, GT29-23, GT29-36, GT29-37, GT29-42, GT29-43은 프로토파낙사디올형 진세노사이드Rd를 글리코실기 수용체로, UDP-자일로스를 글리코실기 공여체로 하여, Rd C-3 부위의 두 번째 글루코스를 자일로스로 치환하여 새로운 트리테르페노이드사포닌 (3-O-β-(D-xylopyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl), 20-O-β- (D-glucopyranosyl)-PPD)을 생성할 수 있고, 여기서 GT29-36, GT29-37, GT29-42 및 GT29-43의 활성이 가장 강하다(도 14).
도 16에 도시된 바와 같이, GT29-45 및 GT29-46은 프로토파낙사디올형 진세노사이드CK를 글리코실기 수용체로, UDP-글루코스를 글리코실기 공여체로 하여, CK의 C-20 부위의 글리코실기에 추가로 촉매 작용하여 하나의 글루코실기를 연장시켜 지페노사이드 LXXV를 생성할 수 있고, 여기서 GT29-45의 활성이 비교적 강하다.
실시예 10. 글리코실트랜스퍼라제 활성의 추가적 확인
상기 실시예 3, 실시예 5, 실시예 8를 반복 수행하되, 차이점은 다른 글리코실기 공여체와 기질로 대체되는 것이며, 실험 결과 표 3 내지 표 5에 나타낸 바와 같다.
| |
|
C-3 |
| |
|
UDP-자일로스 |
UDP-G |
| SEQ ID NO.: |
|
Rd |
F2 |
Rh2 |
| 116 |
GT29-19 |
++ |
++ |
+++ |
| 118 |
GT29-20 |
++ |
++ |
+++ |
| 120 |
GT29-21 |
+ |
++ |
+++ |
| 122 |
GT29-22 |
+ |
++ |
++ |
| 124 |
GT29-23 |
+ |
++ |
++ |
| 90 |
GT29-36 |
+++ |
++ |
++ |
| 92 |
GT29-37 |
+++ |
++ |
++ |
| 94 |
GT29-42 |
+++ |
++ |
++ |
| 96 |
GT29-43 |
+++ |
++ |
++ |
| 98 |
GT29-45 |
NS |
++ |
++ |
| 100 |
GT29-46 |
NS |
++ |
++ |
| 39 |
PNUGT29-1 |
NS |
++ |
+++ |
| 41 |
PNUGT29-2 |
NS |
+++ |
+++ |
| 43 |
PNUGT29-3 |
NS |
+++ |
+++ |
| 45 |
PNUGT29-4 |
NS |
+++ |
+++ |
| 47 |
PNUGT29-5 |
NS |
++ |
++ |
| 49 |
PNUGT29-6 |
NS |
++ |
++ |
| 51 |
PNUGT29-7 |
NS |
++ |
++ |
| 53 |
PNUGT29-8 |
NS |
++ |
++ |
| 55 |
PNUGT29-9 |
NS |
+++ |
+++ |
| 57 |
PNUGT29-14 |
NS |
++ |
++ |
| 59 |
PNUGT29-15 |
NS |
++ |
++ |
| |
|
C-6 |
| |
|
UDP-자일로스 |
UDP-G |
| SEQ ID NO.: |
명칭 |
Rg1 |
Rh1 |
Rg1 |
Rh1 |
| 12 |
GT29-4 |
++ |
++ |
+ |
+ |
| 14 |
GT29-5 |
++ |
++ |
+ |
+ |
| 16 |
GT29-7 |
+++ |
++ |
++ |
++ |
| 18 |
GT29-9 |
++ |
++ |
+ |
+ |
| 20 |
GT29-11 |
+++ |
+++ |
++ |
++ |
| 22 |
GT29-13 |
++ |
++ |
++ |
++ |
| 24 |
GT29-17 |
++ |
++ |
+ |
+ |
| 26 |
GT29-18 |
+++ |
+++ |
++ |
++ |
| 28 |
GT29-24 |
+++ |
+++ |
++ |
++ |
| 30 |
GT29-25 |
+++ |
+++ |
+ |
+ |
| |
|
C-20 |
| |
|
UDP-자일로스 |
UDP-G |
UDP-아라비노스 |
| SEQ ID NO.: |
명칭 |
Rd |
CK |
F1 |
Rd |
CK |
| 4 |
GT29-32 |
+++ |
+++ |
++ |
+ |
++ |
| 6 |
GT29-33 |
+ |
++ |
+ |
++ |
++ |
| 8 |
GT29-34 |
+ |
++ |
+ |
++ |
++ |
| 98 |
GT29-45 |
+ |
++ |
+ |
+ |
NS |
| 100 |
GT29-46 |
+ |
+ |
+ |
+ |
NS |
| 39 |
PNUGT29-1 |
+ |
+++ |
+ |
+ |
NS |
| 41 |
PNUGT29-2 |
+ |
+ |
+ |
+ |
NS |
| 43 |
PNUGT29-3 |
+ |
+++ |
++ |
+ |
NS |
| 45 |
PNUGT29-4 |
+ |
+++ |
++ |
++ |
NS |
| 47 |
PNUGT29-5 |
+ |
+++ |
+ |
++ |
NS |
| 49 |
PNUGT29-6 |
+ |
+++ |
++ |
++ |
NS |
| 51 |
PNUGT29-7 |
+ |
+++ |
+ |
+ |
NS |
| 53 |
PNUGT29-8 |
+ |
+++ |
+ |
+ |
NS |
| 55 |
PNUGT29-9 |
+ |
+++ |
+ |
+ |
NS |
| 57 |
PNUGT29-14 |
+ |
+++ |
+ |
+ |
NS |
| 59 |
PNUGT29-15 |
+ |
+++ |
+ |
+ |
NS |
*NS는 표시되지 않음을 나타낸다.
표 3 내지 표 5로부터, 본 발명의 글리코실트랜스퍼라제는 통상적인 글리코실기 공여체 및 기질을 사용할 수 있고, 테트라시클릭트리터페노이드계 물질의 상이한 부위에서 글리코실기를 연장시키거나 글리코실기를 치환하는 활성을 갖는 것을 알 수 있다.
본 발명에서 언급되는 모든 문헌은 본원 발명에서 각각의 문헌이 단독으로 참조로 인용되는 것처럼 참조로 인용된다. 이 외에 본 발명의 상기 내용을 열독한 후, 당업자는 본 발명에 대하여 다양한 변경 또는 수정을 할 수 있으며, 이런한 등가 형식도 본원에 첨부된 특허청구범위에 의해 한정된 범위에 속하는 것을 이해하여야 한다.