JPH11511336A - 真核細胞に搬入された外来dnaの改良組込み - Google Patents
真核細胞に搬入された外来dnaの改良組込みInfo
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Abstract
(57)【要約】
本発明は、真核細胞、特に植物細胞、のゲノム内に無傷形態で外来DNAフラグメントを安定に組込むための改良法を提供する。この方法は、形質転換の標的となる真核細胞への外来DNAの組込みを促進する1またはそれ以上のタンパク質と共に外来DNAを提供することを含んでなり、そのタンパク質は、真核細胞中で発現する能力のあるキメラ遺伝子または形質転換可能RNAの形態で提供される。この方法は、アグロバクテリウムから得られた組込み促進タンパク質を用いて、無傷形態でT−DNA境界と結合させた外来DNAフラグメントの安定な組込みを達成するために、特に、植物細胞に適用される。トランスジェニック培養物、組織、および生物体全体、特にトランスジェニック植物は、本発明の方法により形質転換させた細胞から再生させることができる。
Description
【発明の詳細な説明】
真核細胞に搬入された外来DNAの改良組込み
本発明は、一般に、外来DNAによる真核細胞、特に、植物細胞の形質転換お
よびかかる細胞からのトランスジェニック生物、組織または培養物の産出に関す
る。
トランスジェニック植物の産生に組換えDNA技術を適用することから生じる
広範囲の利益を利用するために、外来DNA分子を植物細胞へ導入する幾つかの
方法が開発されている。これらの方法は、植物細胞へのアグロバクテリウム介在
T−DNA導入などの修飾生物学的システムおよび電気穿孔法、マイクロインジ
ェクション、リン酸カルシウムまたはポリエチレングリコール(PEG)介在D
NA摂取または細胞融合およびマイクロプロジェクタイル衝撃(microprojectile
bombardment)(総括的およびある程度の概説については、“Plant Genetic Tran
sformation and Gene Expression,A Laboratory Manual”、Draper,J.等編、Bla
ckwell Scientific Publications(1988)出版、参照;Potrykus等、“Direct Gen
e Transfer:State of the Art and Future Potential”、Plant Mol.Biol.Rep.3
:117-128(1985)も参照)などの物理的非生物学的システムがある。
開発された方法は、外来DNAによる広範囲の植物種の安定な形質転換を可能
にした。特に、物理的技術の発展は、生物学的システムに課せられた明らかな宿
主範囲制限を克服してきた。しかしながら、これらの物理的方法に共通の不足点
は、それらはいずれも搬入(delivered)DNAを植物細胞ゲノムへ規則正しく
組込む手段を備えていないということである。そのため、これらの方法は、あま
り理解されていないメカニズムによる搬入DNAの非制御組込みに左右されなけ
ればならず、外来DNAが普通、植物細胞ゲノムのシングル部位でランダムフラ
グメントの複数コピーとして組み込まれるということが起こる。外来DNAの植
物細胞への物理的導入の結果起こる安定な形質転換事象の予測性を改良すること
により、導入遺伝子の安定な発現を示す遺伝子的に安定な形質転換植物を産生す
るこれらのプロセスの有用性および全効率が顕著に向上することになる。この目
的を達成するために取られた1つの手法は、生物学的システムにおける形質転換
および/または組込みを促進するタンパク質を非生物学的搬入技術と組み合わせ
ることであった。所望の効果を達成するためには、形質転換標的細胞への搬入の
前にタンパク質自身を外来DNA分子と結合させて、そのタンパク質が搬入され
る生物学的システムをできるだけまねる必要があると考えられてきた(WO95/054
71およびWO95/34647)。
真核細胞外で産生され、外来DNAと組み合わせて搬入される場合に、外来D
NAによる真核細胞の安定な組込み型形質転換を促進する多くのタンパク質が知
られている。本発明は、かかるタンパク質は自然に安定な組込み型形質転換を促
進するので、それらを真核細胞外で産生させたり、外来DNAと結合させる必要
はないという発見に基づくものである。更に、かかるタンパク質をコードする翻
訳可能RNAまたはキメラ遺伝子の真核形質転換標的細胞への搬入もまた、同時
搬入外来DNAの安定な組込み型形質転換を効果的に促進できる。
本発明の主たる目的の1つは、外来DNAで真核細胞を形質転換させることに
より対象のDNAを安定に組込む改良法を提供することである。この改良法は、
一般に、形質転換の標的となる真核細胞に、組込みを促進する1またはそれ以上
のタンパク質を産生する能力のある少なくとも1つのキメラ遺伝子またはRNA
を組込みたい外来DNAと組み合わせて提供することを含む。
本発明の方法によれば、真核細胞を
(a)T−DNA境界配列と結合させた(bounded)対象のDNAからなるDN
Aフラグメント;および、
(b)T−DNA境界配列と結合させたDNAの組込みを促進する1またはそれ
以上のタンパク質を該真核細胞中で発現する能力のある少なくとも1つのキメラ
DNAまたはRNA分子、
で形質転換させる。
本発明に従う組込みの標的となる対象の外来DNAフラグメントは、当業者が
無傷形態で真核細胞ゲノムへ組込むことを望むあらゆるDNAフラグメント、例
えば、植物細胞または得られた植物体または植物細胞培養物において対象となる
特定の生物学的活性RNA(例えば、アンチセンスRNAまたはリボザイム)ま
たはタンパク質を発現するように設計したキメラ遺伝子であり得る。
該外来DNAの組込みを促進する能力のあるタンパク質は、特に、T−DNA
境界配列と結合させた対象のDNAの真核細胞ゲノムへの組込みを目的として使
用されるアグロバクテリウムTiまたはRiプラスミドのビルレンス(virulence
、vir)領域によりコードされるタンパク質である。
特に、本発明は、非生物学的搬入法によるアグロバクテリウム・ツメファシエ
ンス介在T−DNA導入および組込みの陽性特性を兼ね備えた外来DNAにより
植物細胞を安定に形質転換する改良法を提供する。この改良法は、T−DNA境
界配列と結合させた、植物細胞ゲノムへ組込みたい外来DNAフラグメントを、
植物細胞中で外来DNAの組込みを促進するアグロバクテリウム由来のタンパク
質を発現する能力のある少なくとも1つのキメラ遺伝子またはRNAと共に、植
物細胞に提供することを含む。本発明により提供されるアグロバクテリウム由来
のタンパク質は、特に、VirD1、VirD2、VirC1、VirC2またはVirE
2に相当する。好ましくは、VirD2とVirD1、VirC1、VirC2、VirE
2のいずれかの組み合わせ、またはそれらの副組み合わせを使用する。最も好ま
しくは、VirD2単独、VirD1とVirD2の組み合わせ、またはVirD1、V
irD2およびVirE2の組み合わせの使用である。アグロバクテリウム由来のタ
ンパク質が植物細胞中で発現することにより、予測可能な終点を有する無傷フラ
グメントとして外来DNAが組込まれることになる。
本発明によれば、T−DNA境界配列と結合させた外来DNAフラグメントを
、電気穿孔法、マイクロインジェクション、誘導摂取およびマイクロプロジェク
タイル衝撃などの非生物学的手段により植物細胞へ搬入できる。
本発明によれば、アグロバクテリウム由来のタンパク質もまた、DNA(植物
細胞中で発現可能なキメラ遺伝子)またはRNA(植物細胞中で翻訳可能なRN
A)の形態で非生物学的手段により植物細胞へ搬入できる。
外来DNAフラグメントおよびDNAまたはRNA形態のアグロバクテリウム
由来のタンパク質は、外来DNAを搬入した後および外来DNAを組込む前に、
アグロバクテリウム由来のタンパク質が植物細胞中に存在するように、一時的に
搬入する。これは、好ましくは、これらの成分の一段階での同時搬入により達成
できる。あるいは、形質転換の標的となる植物細胞は、アグロバクテリウム由来
のタンパク質を発現する能力のあるキメラ遺伝子で予め安定に形質転換させてお
いた植物または細胞培養物から得ることもできる。
本発明のその他の態様では、別のDNAフラグメントで安定に形質転換させた
植物細胞を再生させて、所望の導入遺伝子を安定に発現し、かつその導入遺伝子
の安定な発現をメンデル特性として受け継ぐ後代へと継代する稔性トランスジェ
ニック植物を生産する。
下記の定義は本発明の理解を助けることを意図する:
組込み:本明細書で使用する“組込み”は、真核細胞に搬入される外来DNA
分子が真核細胞のゲノムDNAへ安定に取り込まれるプロセスを総括的に表すた
めに使用する。
マイクロプロジェクタイル衝撃:本明細書で使用する“マイクロプロジェクタ
イル衝撃”は、マイクロプロジェクタイル上の核酸をコーティングし、コーティ
ング化マイクロプロジェクタイルを生細胞内へと打ち込むことにより、DNAお
よびRNAを含む核酸を生細胞へ搬入する一般的方法を表すために使用する(例
えば、実施例1−4、米国特許第5,036,006号;WO91/02071(植物およびその細
胞の形質転換へのこのアプローチの応用を記載している)参照;また、米国特許
第5,302,523号;Koziel等、Biotechnology 11:194-200(1993)(粒子衝撃によるト
ウモロコシのElite近交系の形質転換を記載している);Vasil等、Biotechnology
11:1553-1558(1993);Weeks等、Plant Physiol.102:1077-1084(1993);Tanaka,
T.等、“Successful expression in pollen of various plant species of in v
itro synthesized mRNA introduced mRNA introduced by particle bombardment
”,Plant Mol.Biol.28:337-341(1995);Vasil等、Biotechnology 10:667-674(19
92);R.Walker.L.等、“GUS Messenger RNA Delivery and Expression in Plant
Cells via Particle Bombardment”,In Vitro Cell Dev.Biol.26:70A-#218(19
90);Iida,A.等、Appl.Microbiol.Biotechnol.33:560-563(1990);Gordon-Kamm
等、Plant Cell 2:603-618(1990);Fromm等、Biotechnology 8:833-839(1990);
Mori
kawa,H.等、Appl.Microbiol.Biotechnol.31:320-322(1989)参照)。
エアゾールビームインジェクション:本明細書で使用する“エアゾールビーム
インジェクション”は、核酸を生細胞へエアゾールビームの形態で物理的に搬入
する方法を表すために使用する(例えば、米国特許第5,240,842号参照)。
電気穿孔法:本明細書で使用する“電気穿孔法”は、細胞を生体分子の存在下
で電気的衝撃または放電に付すことにより、生体分子、特にDNAおよびRNA
などの核酸を生細胞へ搬入する方法を表すために使用する(例えば、米国特許第
5,231,019号;“Plant Genetic Transformation and Gene Expression,A Labora
tory Manual”Draper,J.等編、Blackwell Scientific Publications(1988)出版
の第3.3章;Saul,M.W.等、“Direct DNA Transfer to Protoplasts With and
Without Electroporation”,Plant Molecular Biology Manual A1:1-16(1988)
;Okada,K.等、“Introduction of Functional RNA into Plant Protoplasts by
Electroporation”,Plant Cell Physiol.27(4):619-626(1986);Shillito,R.D
.等、“High Efficiency Direct Gene Transfer to Plants”,Biotechnology 3
:1099-1103(1985);EP-292 435(チバ−ガイギー)、EP-392 225(チバ−ガイギー
)およびWO93/07278(チバ−ガイギー)参照)。
マイクロインジェクション:本明細書で使用する“マイクロインジェクション
”は、生体物質、特に、DNAまたはRNAを直接、生細胞へと機械的に注入す
る方法を表すために使用する(例えば、“Plant Genetic Transformation and Ge
ne Expression,A Laboratory Manual”、前掲の3.4章;Graessmann,M.等、“M
icroinjection of Tissue Culture Cells”、Methods in Enzymology 101:482-4
92(1983)参照)。
誘導摂取:本明細書で使用する“誘導摂取”は、生体物質、特に核酸の生細胞
による摂取を誘導する方法を総括的に表すために使用する(例えば、米国特許第
5,036,006号の背景の章参照)。このような方法には、特に、ポリエチレングリ
コール(PEG)介在摂取(例えば、“Plant Genetic Transformation and Gen
e Expression,A Laboratory Manual”Draper,J.等編、Blackwell Scientific Pu
blications(1988)出版の第3.2章;Saul,M.W.等、“Direct DNA Transfer to P
ro
toplasts With and Without Electroporation”,前掲;Negrutiu等、Plant Mol
. Biol 8:363-373(1987))および熱ショック処理(米国特許第5,231,019号参照
)がある。
VirD:本明細書で使用した“VirD”は、T−DNA導入に必要な機能を与
えるTiまたはRiプラスミドのビルレンス(Vir)D オペロンに由来する遺伝子
またはタンパク質を表すために使用する(概説は、Zambryski P.C.,“Chronicles
from the Agrobacterium-plant cell DNA transfer story”,Ann.Rev.Plant P
hysiol.Plant Mol.Biol.43:465-490(1992)参照)。この領域由来の特定の遺伝子
および対応するタンパク質は、VirDオペロン上のそれらが生じるところの番号
により示す。例えば、ビルレンス Dオペロンの第1遺伝子は、“VirD1”と
表し、第2遺伝子は、“VirD2”と表す。
ビルレンス領域DNAは、アグロバクテリウム介在T−DNA導入の際、通常
、植物細胞へ導入されることも植物ゲノム内へ組込まれることもない。更に、vi
r遺伝子産物は、細菌TiまたはRiプラスミド由来のT−DNAエレメントを植
物ゲノムへ移動させるようにトランスで自然に作用する。T−領域とvir領域は
、機能を損なうことなく、異なるプラスミド上で分離することができる(De Fram
ond,A.J.等、Bio/Technology 1:262-269(1983);Hoekema等、Nature 303:179-18
0(1983);Bevan,M.Nucleic Acids Res.12:8711-8721(1984))。
VirD遺伝子座の5'半分によりコードされる2つのポリペプチドは、アグロ
バクテリウムから植物細胞:VirD1およびVirD2へのT−DNA導入に対す
るDNAプロセッシングの開始において重要な役割を果す。VirD1およびVir
D2タンパク質は、VirDオペロンの第1遺伝子および第2遺伝子によりそれぞ
れコードされいる(Stachel S.E.& Nester E.W.“The genetic and transcriptio
nal organization of the vir region of the A6 Ti plasmid of Agrobacterium
tumefaciens.EMBO J.5:1445-1454(1986))。遺伝子研究により、T−鎖形成がV
irDオペロン産物により媒介されることが示された(Yanofsky等、Cell 47:471-4
77(1986);Stachel等、EMBO J.6:857-863(1987))。特に、VirDオペロンの第1
および第2遺伝子は、T−DNA境界切断に必要なポリペプチドをコードする
ことが示されている(De Vos & Zambryski,Mol.Plant Microbe Inter.2:43-52(19
89);Filichkin & Gelvin,Mol Microbiol 8:915-926(1993);Jayaswal等、J.Bac
teriol.169;5035-5045(1987);Porter等、Nucleic Acids Res.15:7503-7515(19
87);Stachel等、EMBO J.6:857-863(1987))。この活性は、T−DNA境界配列
による一本鎖切れ目(ニック)の生成をもたらす(Stachel S.E.等、“Generatio
n of single-stranded T-DNA molecules during the initial stage of T-DNA t
ransfer from Agrobacterium tumefaciens to plant cells”Nature(London)322
:706-712(198);Yanofsky等、Cell 47:471-477(1986);Wang等、Science 235:58
7-591(1987);Albright等、J.Bacteriol.169:1046-1055(1987))。VirD1/Vi
rD2は、T−DNA境界配列を第3および第4塩基間で切断する。一旦これら
のニック化分子が作られれば、T−DNAのボトム鎖(T−鎖)の遊離の鎖状ss
DNAコピーが観測される(Stachel等、Nature(London)322:706-712(1986);Sta
chel等、EMBO J.6:857-863(1987))。VirD2は、T−DNAの5'末端に共有結
合した状態にある(概説は、Zupan J.R.& Zambryski,P.“Transfer of T-DNA fr
om Agrobacterium to the plant cell”.Plant Physiol.107:1041-1047(1995)
参照)。
VirD2のC−末端50%を失ったvirD2変異体の研究により、T−DNA
境界をニックするために必要なのはVirD2のN−末端50%のみであることが
示された。しかしながら、この変異体は感染植物上の腫瘍を誘引することができ
ない。よって、このC−末端は、植物細胞におけるT−DNAの導入にある役割
を持つようである(Zambryski P.C.,“Chronicles from the Agrobacterium-plan
t cell DNA transfer story”Ann.Rev.Plant Physiol.Plant Mol.Biol.43:465-
490(1992))。このドメインは、二裂(bipartite)核局在化シグナル(NLS)を
含有する(Howard等、Cell 68:109-118(1992))。NLS配列の生物学的能力は、
二裂NLSの2つの基本的構造がVirD2から欠失した場合にアグロバクテリウ
ムが発癌性を劇的に低減するという観測により確認された(Shurvinton,Proc.Nat
l.Acad.Sci.(USA)89.11837-11841(1992))。
VirD2単独はインビトロで一本鎖DNA上の部位特異的DNA切断−連結反
応を行使し、これはこのタンパク質がDNA切断に必要な触媒活性を有すること
を示すものである(Pansegrau等、Proc.Natl.Acad.Sci.90:11538-11542(1993))。
pTiC58のVirD1およびVirD2は、インビトロでのT−境界特異的切断を
触媒するのに十分であることが、Scheiffle等、J.Biol.Chemistry 270:1269-127
6(1995)に報告されている(それ以外にJasper等、Proc.Natl.Acad.Sci.91:694-69
8(1994)参照)。
I型のトポイソメラーゼ活性は、VirD1−含有抽出物について報告された(Gh
ai & Das,Proc.Natl.Acad.Sci.86:319-3113(1989))。この活性は、VirD1の特
徴であり、VirD2による切断に備えて、DNAを弛緩するのに必要であると提
案された。しかしながら、より高度に精製されたVirD1タンパク質はトポイソ
メラーゼ活性を示さなかった(Scheiffle等、J.Biol.Chemistry 270:1269-1276(1
995))。
VirD2の配列分析により、オクトピン、ノパリンまたはリゾゲン型プラスミ
ドのいずれかを持つアグロバクテリウムの各株間でN末端が85%保存されるこ
とが明らかとなった(Hirayama等、Mol.Gen.Genet.213:229-237(1988);Wang等、
J.Bacteriol.172:4432-4440(1990);Yanofsky等、Cell 47:471-477(1986))。C
−末端は25%だけ保存されるが、最大の類似性は、NLSシグナルを持つ最後
30アミノ酸にある(Zambryski,1992に概説)。
VirE:本明細書で使用する“VirE”は、T−DNA導入に必要な機能を与
えるTiおよびRiプラスミドのビルレンス(Vir)Eオペロンに由来する遺伝子ま
たは対応するタンパク質を表すために使用する。用語“VirE2”は、本明細書
では、VirEオペロン上のVirE2遺伝子の産物として同定された一本鎖DNA
(ssDNA)結合タンパク質を表すために使用する(Gielt,C.等、Proc.Natl.Acad.
Sci.84:9006-9010(1987);Citovsky等、Science 240:501-504(1988))。VirE2
は、T−鎖をその長さに沿ってコーティングすると考えられる。このタンパク質
と一本鎖DNAとの相互作用は非特異的である。ノパリンVirE2タンパク質(H
irooka等、J.Bacteriol.169:1529-1536(1987))およびオクトピンVirE2タンパ
ク質(Winans等、Nucleic Acids Rex.15:825-837(1987))は、核局在化シグナル
を含有する。VirE2タンパク質は、T−複合体の主要部分であると考えられて
おり、核への輸送を援助し得る(概説は、Zupan & Zambryski,Plant Physiol.107
:1041-1047(1995))。virE2遺伝子を発現するトランスジェニック植物は、アグ
ロバクテリウムのVirE変異体を補足でき、VirE2タンパク質が植物細胞にお
いて重要な役割を果たすことを証明している(概説は、Zupan & Zambryski,Plant
Physiol.107:1041-1047(1995)参照)。
VirC:本明細書で使用する“VirC”は、2つのポリペプチド、VirC1お
よびVirC2をコードするTiおよびRiプラスミドのVirC遺伝子座を表すため
に使用する(Yanofsky M.F.& Nester E.W.“Molecular characterization of a h
ost-range-determining locus from Agrobacterium tumefaciens”,J.Bacterio
l.168:237-243(1986))。この遺伝子座は、アグロバクテリウムにおけるT−DN
A境界ニック形成を増強することが示されている(Toro N.等、“Role of the ov
erdrive sequence in T-DNA border cleavage in Agrobacterium”,Proc.Natl.
Acad.Sci.(USA)85(22):8558-8562(1988))。VirCもまた、VirD1およびVir
D2遺伝子の産物が制限されている場合に異種E.coli系にてT−鎖産生を増強
することが示されている(De Vos G.& Zambryski P.“Expression of Agrobacte
rium nopaline specfic VirD1,VirD2 and VirC1 and their requirement for T-
strand production in E.coli.”Molec.Plant.Microbe Inter.2:42-52(1989))。
VirC1は、DNAアフィニティー・クロマトグラフィーによりオクトピン・オ
ーバードライブ配列(overdrive sequences)と相互作用することが示されている
が、VirC1の正確な機能は不明である。それは、VirD1およびVirD2と、
または境界反復配列(リピート)および/またはオーバードライブ配列と結合し
て、ニック形成およびT−鎖産生を促進することもある(Toro N等、“The Agrob
acterium tumefaciens virC1 gene product binds to overdrive,a T-DNA trans
fer enhancer”J.Bacteriol.171:6845-6849(1989))。
T−DNA境界:本明細書で使用する“T−DNA境界”は、約25bpの不完
全直列反復DNA配列を表すことを意図し、DNAフラグメントの両端にそれが
存在することにより、そのフラグメントがT−DNAとして認識され、アグロバ
クテリウムタンパク質による作用を受ける。T−DNAのいずれかの末端に生じ
るT−DNA境界は、慣用的に“左”および“右”と表される。右境界のコンセ
ンサス配列は、5'−GNNTGNCAGGATATATNNNNNNGTNA
N−3'(配列番号1)であり、左境界のコンセンサス配列は、5'−GGTGG
CAGGATATATNNNNNNTGTAAA−3'(配列番号2)である(Jo
uanin等、Plant Mol.Biol.12:75-85(1989))。これらの境界間のいずれのDNA
もアグロバクテリウムから植物細胞へと移行する(概説は、Zambryski P.C.,“Ch
ronicles from the Agrobacterium-plant cell DNA transfer story”,Ann.Rev.
Plant Physiol.Plant Mol.Biol.43:465-490(1992))。
様々な形質転換植物系列のT−DNA含量の研究により、T−DNAの植物ゲ
ノムへの組込みは、しばしば(右境界の場合)これらの境界反復配列の位置で、
または(左境界の場合)その近くで起こることが明らかとなった(Slightom等、E
MBO J.4:3069-3077(1985);Gheysen等、Genes & Dev.5:287-297(1991);Mayerho
fer等、EMBO J.10:697-704(1991);Ohta等、Plant J.7:157-164(1995);Koncz等
、Proc.Natl.Acad.Sci.86:8467-8471(1989))。
左境界と右境界との構造的類似性にもかかわらず、境界機能の研究は、T−D
NA境界は別々に利用されることを示している。右境界配列の欠失または逆位は
、T−DNA導入の殆ど完全な損失をもたらすのに対し、左境界反復配列の欠失
は、殆ど全く影響がない(Shaw C.H.等、“The right hand copy of the nopalin
e Ti plasmid 25 bp repeat is required for tumor formation”Nucleic Acids
Res.12:6031-6041(1984);Jen G.C.& Chilton M-D,“The right border region
of pTiT37 T-DNA is intrinsically more active than the left border in pr
omoting T-DNA transformation”Proc.Natl.Acad.Sci(USA)83:3895-3899(1986))
。遺伝子分析は、T−DNA導入が極性であり、境界反復配列の配向により決定
される極性をもつことを示している(Wang等、Cell 38:455-462(1984);Peralta
and Ream,Proc.Natl.Acad.Sci.82:5112-5116(1985))。これは、恐らく、T−鎖
が右から左方向に産生されるという事実に起因する(Albright等、“Processing
of the T-DNA of Agrobacterium tumefaciens generates border nicks and lin
ear,si
ngle-stranded T-DNA”J.Bacteriol.16,1046-1055(1987))。
T−DNA境界の配列情況は、その活性に大きく影響を与える。右境界周囲の
配列は極性DNA導入を増強し、左境界周囲の配列は極性DNA導入を減弱する
(Wang K.等、“Sequence context of the T-DNA border repeat element determ
ins its relative activity during T-DNA transfer to plant cells”Mol.Gen.
Genet.210:338-346(1987))。“オーバードライブ”と呼ばれる24bpのシス活
性配列は、オクトピンプラスミドの右境界の隣に存在する(Peralta等、EMBO J.5
:1137-1142(1986);Shurviton & Ream,J.Bacteriol.173:5558-5563(1991))。オ
ーバードライブは、境界から数千塩基対離れた位置にある場合でさえT−DNA
導入を刺激する(Van Haaren M.J.J.等、“Overdrive is a T-region transfer e
nhancer which stimulates T-strand production in A.tumefaciens”Nucleic A
cids Res.15:8983-8997(1987))。しかしながら、それは、独自にT−DNA導入
を媒介することはできない(Peralta,E.G.等、“overdrive”,a T-DNA transmi
ssion enhancer on the Agrobacterium tumefaciens tumor-inducing plasmid”
EMBO J.5:1137-1142(1986);Van Haaren M.J.J.等、“Functional analysis of
the Agrobacterium tumefaciens octopine Ti-plasmid left and right T-regi
on border fragment”Plant Mol.Biol.8:95-104(1987))。このオーバードライ
ブ配列は、元々オクトピンTiプラスミドTL−DNA右境界反復配列の右側の
領域に位置していた。同様の配列がオクトピンpTi TR−領域の、およびアグ
ロピンpRi TL−およびTR−領域の右境界反復配列の隣に存在する(Slightom
等、“Nucleotide sequence analysis of TL-DNA Agrobacterium thizogenes ty
pe plasmid.Identification of open reading frames”J.Biol.Dhem.261:108-1
21(1986);Jouanin等、“Analysis of TR-DNA/plant junctions in the genome
of a Convolvulus arvensis clone transformed with Agrobacterium rhizogene
s strain A4”Plant Mol.Biol.12:75-85(1989))。右境界近くの配列の比較によ
り、各右境界反復配列の右とは異なる間隔で現れるコア配列(5'−TGTTT
GTT−3')と呼ばれる8bpの領域が明らかとなった。マンノピン型 pRi81
96T−DNA右境界は、オーバードライブ配列に関連するどの配列も含有しな
いが、
異なる8bp配列(5'−ATTAGTTC−3')を6回繰り返して含有する(Han
sen G.等、“Agrobacterium rhizogenes pRi8196 T-DNA:Mapping and DNA sequ
ence of functions involved in manopine synthesis and hairy root differen
tiation”Proc.Natl.Acad.Sci(USA)88:7763-7767(1991))。この配列は、オーバ
ードライブとまさしく機能的に等価である(Hansen G.等“A T-DNA transfer enh
ancer sequence in the vicinity of the right border of Agrobacterium rhiz
ogenes pRi8196”Plant Mol.Biol.20:113-122(1992))。ノパリンT−DNA境界
近くにはオーバードライブ配列と密接に類似する配列はない(Wnag K.等、“Seq
uence context of the T-DNA border repeat element determinnes its relativ
e activity during T-DNA transfer to plant cells”Mol.Gen.Genet.210:338-3
46(1987))が、そのことは、この領域に存在するある配列が類似の役割を果たす
ことを排除するものではない。
実施例で使用した25bp右境界配列は、pTiAch5に由来する(Van Haaren,M.
J.J.,Plant Mol.Biol.13:523-531(1989))。プラスミドpNeoPBluc上に存在す
る右境界は、pTiT37に由来する(Bevan,Nucleic Acids Res.12:8711-8721(1
984))。
右境界に近接した配列はDNAの植物細胞への導入を増強できるが、実施例に
記載の実験では、ルシフェラーゼ遺伝子の発現の混乱が起こる可能性を最少に抑
えるため、最少の長さの右境界配列を選択した。しかしながら、オーバードライ
ブなどのエンハンサー様配列を含有するより長い右境界配列を使用してもよい。
真核細胞において、対象のDNAの組込みを促進するタンパク質を産生する能
力のあるキメラ遺伝子は、実施例にて例示するように標準遺伝子工学技術を用い
て構築できる。かかるキメラ遺伝子は、真核細胞において作動可能に連結したコ
ード配列の発現を支配する適切な調節シグナル(例えば、プロモーター、リーダ
ー配列、転写ターミネーター、ポリアデニル化部位)に作動可能に連結させたタ
ンパク質をコードするDNA配列からなる。このようなコード配列および調節シ
グナルは、当分野では十分に報告されている。組込み促進タンパク質の発現を向
上するためには、標的真核細胞における発現に最適なコード配列の合成物を使用
してもよい。
真核細胞において、組込みを促進するタンパク質を産生する能力のあるmRN
Aは、実施例にて例示するように、所望のタンパク質をコードする翻訳可能なキ
ャップ形成ポリ−A mRNA転写物を調製するための標準システムを用いて調製
できる。
当分野で利用できる標準技術を用いて、外来DNAの安定な組込みを促進する
タンパク質をコードする外来DNAおよびキメラ遺伝子またはRNAを様々な方
法で植物細胞に与えることは、当業者には容易に明らかであろう。これらの成分
を真核細胞へと搬入する正確な方法は、外来DNAの安定な組込みを促進するタ
ンパク質が外来DNAフラグメントをもつ同一の細胞にて下記の適切な期間中に
産生される限り、重要ではない。
外来DNAの無傷形態での安定な組込みを促進する有益な作用を達成するため
には、外来DNAフラグメントが真核細胞へ提供される前、または外来DNAが
真核細胞に組込まれた後に、この作用を備えたタンパク質が真核細胞中で産生さ
れる必要はない。その代わりに、これらのタンパク質は、外来DNAフラグメン
トが真核細胞へ提供された後および外来DNAが組込まれる前の一時的な期間そ
れらが十分な量で存在するように、植物細胞中で産生される必要があるだけであ
る。コード化タンパク質がこの適当な期間中に産生されるようにキメラ遺伝子ま
たは翻訳可能なRNAを真核細胞に与えるためのあらゆる手法が使用できる。
本明細書に与えた実施例にて例示するように、これらのタンパク質を適当な時
間枠中に十分な量で産生させる方法の1つは、そのタンパク質をコードするキメ
ラ遺伝子または翻訳可能なRNAを外来DNAフラグメントと共に真核細胞へ導
入することである(即ち、各成分の同時搬入)。この手法は、核酸分子(DNAま
たはDNAおよびRNA)の単回搬入に関連するため、好まれる。この手法につ
いて考えられるその他の有益な態様は、真核細胞の正常な成長および発生に逆効
果を与え得る組込み促進タンパク質の安定な産生ではなく。むしろ適当な期間中
の組込み促進タンパク質の一時的な産生を達成するのに使用できることである。
一実施態様では、本発明を用いて、アグロバクテリウム介在T−DNA形質転
換をまねるために、T−DNA境界と結合させた無傷の外来DNAフラグメント
による植物細胞の安定な形質転換を達成する。本発明のこの態様によれば、次の
成分を形質転換の標的となる植物細胞へ与える:
(a)植物細胞ゲノムへ組込むことが望まれる対象の外来DNAフラグメント、
該フラグメントは、1またはそれ以上のT−DNA境界と結合させている(一本
鎖T−DNA境界は、T−DNA導入、特に、1境界が左右両方の境界機能を果
たすことができる環状T−DNAの導入を遂行するのに十分であり得る);およ
び、
(b)少なくとも1つのキメラ遺伝子またはRNA、かかるキメラ遺伝子または
RNAはそれぞれ、外来DNAフラグメントの無傷形態での安定な組込みを単独
でまたは他のアグロバクテリウム由来のタンパク質と共に促進するアグロバクテ
リウム由来のタンパク質を植物細胞中で産生する能力がある。
本発明のこの態様に従い、植物細胞にて産生されるアグロバクテリウム由来の
タンパク質には、アグロバクテリウムのTiまたはRiプラスミドのビルレンス領
域に由来するタンパク質があるが、これらに限定されない。特に、この中には、
VirC1、VirC2、VirD1、VirD2およびVirE2がある。好ましくは、
産生されたタンパク質は、VirD2タンパク質、またはVirD2とVirD1、V
irE2のいずれか、またはVirD1およびVirE2の両方との組み合わせである
。植物細胞中のアグロバクテリウム由来のタンパク質は、予測可能な終点をもつ
無傷フラグメントとして外来DNAの組込みを引き起こす。得られた形質転換植
物細胞は、そのゲノムに組込まれたアグロバクテリウムのT−DNAに類似する
外来DNAフラグメントを有する。
植物細胞中で本発明のアグロバクテリウム由来のタンパク質を産生する能力の
あるキメラ遺伝子は、実施例にて例示のように、標準遺伝子工学技術を用いて構
築できる。このようなキメラ遺伝子は、植物細胞中で作動可能に連結したコード
配列の発現を支配する適切な調節シグナル(例えば、プロモーター、リーダー、
転写ターミネーター、ポリアデニル化部位)に作動可能に連結させたアグロバク
テリウム由来のタンパク質をコードするDNA配列から構成される。このような
コード配列および調節シグナルは、当分野では容易に入手可能である。実施例に
て使用したVirD1およびVirD2コード配列は、ジーンバンク(GenBank)
から受託番号M14762として提供される。
植物細胞において本発明のアグロバクテリウム由来のタンパク質を産生する能
力のあるRNAは、実施例にて例示のように、所望のタンパク質をコードする翻
訳可能なキャップ形成ポリ−A mRNA転写物を調製するための標準システムを
用いて調製できる。
本発明のこの態様による組込みの標的とされる外来DNAフラグメントは、植
物細胞または得られた植物体または植物細胞培養物中の、特定の生物活性RNA
(例えば、アンチセンスRNAまたはリボザイム)を発現するように設計したキ
メラ遺伝子または対象となるタンパク質など、当業者が無傷形態で植物細胞ゲノ
ムへ組み込みたいと望むものであればどのようなDNAフラグメントであっても
よい。唯一の要件は、そのフラグメントがVirD1およびVirD2タンパク
質により認識および作用され得るような1またはそれ以上のT−DNA境界に結
合していることである。このようなT−DNA境界の外来DNAフラグメントへ
の結合は、実施例1に記載する。
当分野で利用可能な様々なメカニズムの1つまたはそれ以上による核酸の搬入
を受け易いあらゆる真核細胞が、本発明に従う形質転換のための標的として使用
できる。これには、カビ、酵母、動物細胞および特に植物細胞がある。酵母つい
ては、T−DNAの導入が示されている。Piers等、Proc.Natl.Acad.Sci.93:161
3-1618(1996)参照。動物細胞については、VirD2およびVirE2(その局在シ
グナルの修飾後)の細胞核への局在化が示されている。Guralnick等、Plant Cel
l 8:363-373(1996)参照。様々な動物細胞へ核酸を搬入する方法は、当分野では
よく知られている(例えば、“Current Protocols in Molecular Biology”,vol
s.1-3,ed.by Ausubel,F.M.等、pub.by John Wily & Sons,Inc.(1995)参照;特に
、第9章“Introduction of DNA into Mammalian Cells”参照)。
記載の形質転換法により、通常、マーカー遺伝子の発現により同定される形質
転換細胞の完全体(complete set)または集合体(collection)が得られる。次
いで、細胞の植物体への再生により形質転換植物の完全体または集合体が提供さ
れる。形質転換植物細胞並びに再生させた形質転換植物体の両方の完全体はその
組込み事象の性質により特徴づけることができる。本発明に従う1体の細胞また
は植物体は、それらがアグロ感染を用いて形質転換されたかのように、個々の植
物細胞または植物体の5%以上がアグロバクテリウム右境界T−DNA配列によ
りゲノムDNAへつなげた対象のDNAを含むことを特徴とする。好ましくは、
その割合は10%以上である。一般に、5〜70%の割合およびより好ましくは
10〜50%の割合で観測される。1体の形質転換植物細胞または植物体は、通
常、10またはそれ以上の独立した形質転換事象に基づく。好ましくは、1回の
物理的形質転換実験により、20、30、40または50以上の独立した形質転
換事象が起こる。形質転換植物細胞および植物体、並びにそれらの個々の植物細
胞または植物体の後代は、本発明の更なる主題の構成要素である。
植物標的として可能性のあるものには、単子葉植物および双子葉植物またはそ
れぞれの植物細胞、特に、農業経済的に重要な作物植物、例えば、トウモロコシ
およびその他の穀物類、例えば、小麦、エンバク、ライ麦、モロコシ類、コメ、
大麦、キビ、芝生および飼草など、並びに、綿、サトウキビ、テンサイ、ナタネ
、バナナ、ポプラ、クルミ、タバコおよび大豆がある。
当分野で利用できる様々な生物学的および非生物学的搬入メカニズムの1つま
たはそれ以上による形質転換のための標的として役立ち得るあらゆる植物細胞タ
イプまたは植物細胞源は、本発明に従う形質転換のための標的としても働くこと
ができる。これには、未熟および成熟胚、花粉、プトロプラスト、懸濁培養細胞
、カルス細胞、子葉またはその他の種子および苗部分、および葉または葉片があ
るが、これらに限定されない。
本発明の方法により得られる形質転換植物細胞は、対象となる組込まれた無傷
外来DNAを含有する。この組込まれた外来DNAは、T−DNA挿入事象に続
いて組込まれたDNA上に典型的に保持される部分的T−DNA境界配列を含む
こともある。本発明の方法により得られた形質転換植物細胞は、当分野でよく知
られている標準操作法に従い、トランスジェニック植物細胞培養物および稔性ト
ランスジェニック植物を産生するのに使用できる。
よって、本発明の更なる態様は、無傷形態でそのゲノムへ安定に組込まれたT
−DNA境界配列と結合させた外来DNAフラグメントを有する稔性トランスジ
ェニック植物を産生する方法であって:
a)本発明の方法に従い、該外来DNAを植物細胞ゲノム内へ形質転換させるか
、または組込み;そして、
b)工程(a)の植物細胞を産生させて該稔性トランスジェニック植物を再生す
る、
ことを含む。
好ましくは、該稔性トランスジェニック植物は、タバコ、綿、ナタネ、大豆、
トウモロコシ、小麦およびコメからなる群から選択される。
該トランスジェニック植物およびそれから得られた種子内に設計された遺伝的
特性は、有性生殖または栄養生長(vegetative growth)により継代されて、後
代植物に維持され繁殖され得る。一般に、該維持および繁殖は、既知の農業的方
法の用途を発展させて、耕作、種まきまたは収穫などの特定の目的に適合させる
ものである。水栽培または温室技術などの特定の方法にも適用できる。生長中の
作物は昆虫または感染により引き起こされる攻撃および損害、並びに雑草による
競合に無防備であるので、雑草、植物病、昆虫、線虫、およびその他の不利な条
件を制御して、収量を向上するための処置が取られる。それらには、土壌の耕耘
または雑草および感染植物の除去などの機械的処置、並びに、除草剤、殺菌剤、
殺生殖体剤(gametocides)、殺線虫剤、生長調節剤、成熟剤および殺虫剤など
の農業化学の適用がある。
本発明によるトランスジェニック植物および種子の有利な遺伝的特性は、更に
、害虫、除草剤またはストレスに対する耐性、栄養価の向上、収率の増加または
倒伏または飛散による損失の低下を導く構造の改良などの改善された特性を有す
る植物の開発を目指す植物品種改良において使用できる。様々な品種改良段階は
、交雑させる系列の選択、親系列の授粉の支配または適切な後代植物の選択など
の十分に定義されたヒトの介入を特徴とする。望まれる特性によって、様々な品
種改良処置が取られる。当面の技術は、当分野でよく知られており、ハイブリダ
イゼーション、同系交配、戻し交配、多系交配、変種混合、種間ハイブリダイゼ
ーション、異数体技術等があるが、これらに限定されない。ハイブリダイゼーシ
ョン技術は、機械的、化学的または生化学的手法により雄性または雌性不稔植物
を得るための植物の不稔化も含む。異種系列の花粉を用いて雄性不稔植物を交差
授粉すれば、雄性不稔であるが雌性稔性である植物のゲノムは確実に両方の親系
列の特性を均一に獲得する。そのため、本発明のトランスジェニック種子および
植物体は、例えば、除草剤または農薬処置などの常法の効率を高めたり、その修
飾した遺伝的特性により該方法の手間を省かせるように改良された植物系列の品
種改良に使用できる。または、改良されたストレス耐性を有する新規作物を得る
こともでき、その最適化された遺伝的“素質”により、比較的不利な発育条件に
耐えることのできなかった生産物よりも良好な品質の収穫生産物が得られる。
種子生産において、種子の生殖特質と均一性は必須の生産物特性であるのに対
し、農家に収穫され販売される種子の生殖特質と均一性は重要視されていない。
作物を他の作物や雑草種子のない状態に維持すること、種子由来の疾病を制御す
ること、および良好に生殖する種子を産生することは困難であるので、純粋な種
子の生育、調整およびマーケティングの分野に携わる種子生産者は、かなり大規
模の十分に特性化された種子生産手段を開発してきた。そのため、農家が自家作
物から集めた種子を用いずに、特定の品質基準に合致する保証された種子を購入
するのは普通のことである。種子として使用される繁殖材料は、習慣的に、除草
剤、殺虫剤、殺真菌剤、殺菌剤、殺線虫剤、軟体動物駆除剤またはそれらの混合
剤を含む保護剤コーティングで処理される。習慣的に使用される保護剤コーティ
ングには、カプタン、カルボキシン、チラム(TMTD(登録商標))、メタラキシ
ル(Apron(登録商標))、およびピリミホス−メチル(Actellic(登録商標))などの
化合物がある。所望ならば、これらの化合物を、処方の分野で習慣的に採用され
る更なる担体、界面活性剤または適用促進アジュバントと共に処方して、細菌、
真菌または動物害虫により引き起こされる損傷から保護する。保護剤コーティン
グは、繁殖物質を液体製剤に浸すか、または、複合湿潤または乾燥製剤でコーテ
ィングすることにより適用できる。芽または果実への処置などのその他の適用法
もまた可能である。
本発明の更なる態様は、本発明のトランスジェニック植物、トランスジェニッ
ク植物材料、またはトランスジェニック種子の使用を特徴とする上記例示の方法
などの新規農法を提供することである。
本方法の成分(即ち、外来DNAおよびその外来DNAの組込みを促進するタ
ンパク質をコードするキメラ遺伝子またはRNA)が当分野で利用可能な標準技
術を用いる様々な方法で植物細胞に提供され得ることは、当業者には容易に理解
される。これらの成分を植物細胞に提供する正確な手段は、外来DNAの安定な
組込みを促進するタンパク質が上記の適当な期間で産生される限り、重要ではな
い。
植物細胞に提供する各成分の正確な量も同様に重要ではなく、成分が搬入され
る手段および形態によって変わり得る。所望ならば、当業者は、特定の搬入シス
テムを用いてそれぞれの最適レベルを測定するために提供する各成分の量を定型
的に変えてもよい。成功した組合わせの1つを実施例1に記載しており、これを
更なる最適化のための出発点として役立てることができる。
本方法の成分の植物細胞への搬入は、核酸を植物細胞へ搬入するために当分野
で利用できる様々な技術によって達成でき、それらの技術には、アグロバクテリ
ウム介在T−DNA形質転換(例えば、“Plant Genetic Transformation Metho
ds and Transgenic Plants”と題するWO95/35388参照)などの生物学
的メカニズムおよびマイクロプロジェクタイル衝撃、電気穿孔法、マイクロイン
ジェクション、誘導摂取およびエアゾールビームインジェクションなどの非生物
学的メカニズムを含むが、必ずしもこれらに限定されない。好ましい手法では、
一回の操作で本方法の全ての成分(即ち、外来DNAおよびその外来DNAの組
込みを促進するタンパク質をコードするキメラ遺伝子またはRNA)をレシピエ
ント植物細胞へ搬入する。
本発明により搬入される、組込み促進タンパク質をコードするmRNAは、そ
れが分解される前の限られた期間に植物細胞においてコード化タンパク質を産生
すると予想される。このmRNAから産生されたタンパク質は、同じくそれが正
常な細胞プロセスにより分解される前の限られた期間に植物細胞中に残っている
ことが予想される。従って、これらのタンパク質は、本方法に従い、RNAの形
態で植物細胞へ一過的に搬入できる。これらのタンパク質の一過的搬入は、かか
るタンパク質が連続して存在すると不要な作用を与え得るような場合に好まれる
こともある。これと同じ効果は、容易に組込むことができない形態の組込み促進
タンパク質をコードするキメラ遺伝子を機能的な形態で植物細胞ゲノムへ搬入す
ることにより、達成できる。
組込み促進タンパク質をキメラ遺伝子により細胞へ提供する場合、様々な成分
が結合したり、一本鎖DNA分子として搬入されることもあるが、好ましくは、
それぞれのキメラ遺伝子を別のDNA分子としての外来DNAフラグメントと共
に同時搬入する。別個のDNA分子としての搬入は、外来DNAフラグメントに
対するキメラ遺伝子の比率を変化させ、かつ最適化させるものである。これらの
構築物を別個の分子上に設計することもまた同じく一層便利である。無作為組込
みによるかかるキメラ遺伝子のゲノムへの安定な取り込みは、T−DNA境界と
結合させた外来DNAの直接組込みに比べ測定可能な頻度で起こることが期待で
きる。外来DNAの直接組込みとこのような無作為組込み事象の分離を容易にす
るために、組込み促進タンパク質をコードするキメラ遺伝子は好ましくは、外来
DNAとは別の一本鎖DNA分子として搬入できる。この手法を用いると、キメ
ラ遺伝子のコピーはT−DNA境界と結合させた外来DNAの直接組込みとは異
なる遺伝子座に組込まれるようである。その結果、外来DNAを含む直接組込み
事象と形質転換植物細胞から得られた植物の連続的な品種改良により無作為に組
込まれたVirD1およびVirD2遺伝子の分離は、容易に達成され。
好ましい実施態様では、組込み促進タンパク質をコードするキメラDNA遺伝
子またはRNAを植物細胞へ搬入するための媒体として植物ウイルスベクターを
用いる。
このようなベクターは、所望のDNAまたはRNAの植物細胞における取り込
みおよび発現のために、ジェミニウイルスレプリコン(Ugaki,M.,Nucleic Acids
Research 19:371-377(1994))などの植物DNAウイルスレプリコンおよびRNA
ウイルスベクター(Sablowski,R.W.,Proc.Natl.Acad.Sci.92:6901-6907(1995))
から誘導できる。これらのベクターは典型的には標的植物細胞中で複製するので
、かかるベクターへ組込んだキメラ遺伝子またはRNAは増幅し、そこから産生
されるタンパク質が増大する。また、このタイプのウイルスベクターは植物細胞
ゲノム内に組込まれることはなく、何故ならば、その元となるウイルスレプリコ
ンが通常組み込まれないからである。よって、本方法は、かかるタンパク質をコ
ードするキメラ遺伝子の組込みという危険を低減しながら、大量の組込み促進タ
ンパク質を一過的に産生するという利点を有する。このようなウイルスベクター
を使用して、予め形質転換の標的となる植物細胞に全体的に感染させることも有
利であり得る。この手法は、組込み促進タンパク質またはタンパク質群をコード
するDNAまたはRNAを同時搬入する必要性を回避することにより、多量に組
込むことが望まれる外来DNAの搬入を可能にするものである。
植物ウイルスベクターもまた、植物細胞への組込みの標的となる外来DNAフ
ラグメントを搬入するための媒体として使用できる。これらのベクターは典型的
に標的植物細胞中で複製するため、この手段にこれらを使用すれば、組込みに利
用できる多数の外来DNAフラグメント鋳型を増幅する。
植物ウイルスベクターを使用して、組込みの標的となる外来DNAフラグメン
トおよび組込み促進タンパク質をコードするキメラ遺伝子の両方を植物細胞へ搬
入する場合、同一のウイルスベクターを使用して両方の成分を搬入することもで
き、または2つの別個のウイルスベクターを使用してもよい。アグロバクテリウ
ム介在形質転換がウイルスベクターを植物細胞へ搬入するために使用される技術
である場合、その手法は、“アグロ感染”として知られている(Grimsley等、Nat
ure 325:177-179(1987)参照)。
組込み促進タンパク質をコードするキメラ遺伝子と外来DNAとの同時搬入に
代わるものとして、既にそのゲノムへ安定に取り込まれたこれらのキメラ遺伝子
を含有するトランスジェニック植物細胞へ外来DNAを搬入してもよい。標準技
術を用いた、組込み促進タンパク質をコードするキメラ遺伝子を含むDNA分子
での形質転換により産生したトランスジェニック植物体またはトランスジェニッ
ク植物細胞培養物は、かかるトランスジェニック植物細胞の供給源として使用で
きる。この手法を用いると、外来DNAを必要とする直接組込み事象を、形質転
換植物細胞から得られた植物の連続的品種改良により安定に組込まれたキメラ遺
伝子から分離できる(例えば、Peerbolte,R.等、“Transformation of plant pr
otoplasts with DNA:cotransformation of non-selected calf thymus carrier
DNA and meiotic segregation of transforming DNA sequences”,Plant.Mol.B
iol.5(4):235-246(1985)参照)。
本明細書では本発明を1つの植物細胞の形質転換に関して記載しているが、当
業者ならば、本発明を基礎とする(マイクロインジェクションを除く)搬入法は
典型的には、細胞培養物、カルスまたは植物体全体から摘出した組織形態の植物
細胞集団に適用されることを理解するであろう。結果として、安定に形質転換し
た植物細胞を形質転換植物細胞と非形質転換植物細胞の混合集団から同定および
/または選択するこれらの搬入法と共に使用するための様々な技術が開発されて
きた(例えば、Dekeyser,R.等、“Evaluation of selectable markers for rice
transformation”,Plant Physiol.90(1):217-223(1989)参照)。これらの技術は
、同様にして本発明と併せて使用することもできる。外来DNA成分に関して、
非生物学的搬入法を用いる本発明の方法に従う植物細胞の形質転換は、2つの基
本的なタイプの組込み事象:(1)かかる組込み事象を促進するタンパク質の存
在により支配されるT−DNA境界と結合させた無傷外来DNAフラグメントの
単純な挿入、および(2)使用した非生物学的搬入法に特有の外来DNAの様々
な部分および置換物(permutations)の無作為挿入、に帰着することが意図され
る。
これら2つのタイプの組込み事象は、外来DNAフラグメントまたはそのサブフ
ラグメントをプローブとして用いる制限処理したゲノムDNAのサザン・ブロッ
ト・ハイブリダイゼーション、無傷形態の外来DNAフラグメントの存在を検出
するように設計したポリメラーゼ連鎖反応(PCR)ベースの技術などの標準分子
分析手段を形質転換植物細胞のゲノムDNAに応用することにより、容易に識別
できる。両方のタイプの挿入事象を含有する植物細胞の場合、かかる事象は、そ
れから得られたトランスジェニック植物において典型的な品種改良手法により分
離できる。これらの手段を用いると、本発明の適用により生じるT−DNAと結
合させた無傷外来DNAフラグメントの簡単な挿入を有するトランスジェニック
植物細胞または植物体を同定でき、これらを使用して、トランスジェニック植物
細胞培養物および/またはトランスジェニック植物体および後代を産生できる。
本発明は、アグロバクテリウムT−DNA導入システムに基づく改良組込みシ
ステムに限定されるものではないと理解されるべきである。Virタンパク質およ
びT−DNA境界に類似する組込み促進タンパク質および認識配列を利用する更
なるシステムは、本発明に従い修飾して、形質転換の標的となる真核細胞におけ
る単純な組込み事象の頻度を改善することができる。例えば、蓄積データは、ア
グロバクテリウムから植物へのT−DNA導入とプラスミド介在細菌コンジュゲ
ーションとの間に密接な関係が存在することを示唆している。配列の関連が、(
i)T−境界のニック領域とincP導入起点;(ii)virDオペロンの遺伝子クラス
ターとリラキサーゼオペロン(TraI/TraJ)、との間に見いだされている。
TraIとVirD2並びにそれらの標的−RP4 oriTニック領域およびT−境界
反復配列は、それぞれ、顕著な類似性を共有している(“Plant Transformation
”と題するWO88/03564参照)。インビトロでは、TraIおよびVirD
2はそれぞれ、各自のコグネイトニック部位を支える一本鎖オリゴヌクレオチド
においてニックを生成するのに十分である(Pansegrau等、Proc.Natl.Acad.Sci.
(USA)90:11538-11542(1993)参照)。過剰の切断産物の存在下で、TraIおよび
VirD2の両方はまた、2片の一本鎖DNAをつなげる反対の反応を触媒できる
。VirD2もまた、oriTの切断を触媒できる。ジェミニウイルスRepタンパク
質
または細菌ファージおよびプラスミドのローリングサークル型複製に関係するタ
ンパク質と、もう一方の、細菌接合性DNA導入、またはアグロバクテリウムか
ら植物ゲノムへのT−DNAの導入および組込みに携わるタンパク質との間に機
能的類似体性が見いだされている(Heyraud-Nitschke F,等、Nucl.Acids Res.910
-916(1995))。図面の簡単な説明 第1図(A-B)
:実施例1記載の実験に用いるプラスミド構造を示す。これら
プラスミドの組成を実施例1の“材料と方法”の項に記載する。RBは25−bp
の右境界配列に対応する。制限部位は次のように表す:E=EcoRI;P=Pst
I.第2図
:pNeoRBLucプラスミドの概要図式を示す。LB:左境界;RB:右
境界。図式の上段箱型囲いは形質転換体のサザンブロット分析に用いるプローブ
を示す。制限部位は次のように表す:E=EcoRI;P=Pst;X=XbaI;H
=HindIII。“NPTII”はネオマイシン・ホスフォトランスフェラーゼII・オ
ープンリーディングフレームを表す。“NOS T”はノパリン・シンターゼタ
ーミネーターを表す。“CaMV35S”はカリフラワー・モザイクウイルス(
CaMV)からの35Sプロモーターを表す。“LUC”はルシフェラーゼのオ
ープンリーディングフレームを表す。“35S T”はCaMV 35S転写物の
ターミネーターを表す。第3図
:pNeoRBLuc、p35SD1およびp35SD2プラスミドでの形質転
換後の植物DNA標的部位の配列分析を示す。数値は標的クローン呼称番号を表
す。pNeoRBLucが有する右境界配列は小文字で表す(Rb列結合)。フラグ
メント1、2a、3および5は、タバコPSII(X62426;nt908)と10
0%の相同性、タバコNtpII10(X70088;nt573)と100%の相同
性、タバコのリブロース・1,5−ビスホスフェートカルボキシラーゼ(X02
353;nt2174)と100%の相同性、およびペチュニアのクロロフィル結
合タンパク質(M21317;nt1013)と80%の相同性をそれぞれ示す。第4図(A-F)
:実施例3および4で使用するプラスミド地図を示す。使用す
る略号は実施例3の“材料および方法”の項に記載する。第5図(A-B)
:実施例5で使用するプラスミドpwAdhD1、pwAdhD2、pw
BarRBLuc、およびpBARRBLucの図解描写。第6図
:プラスミドpClB1711の図解描写(実施例1参照)第7図
:プラスミドpClB1711deltaBの図解描写(実施例7参照)第8図
:プラスミドpClB1711deltaB-H,Nの図解描写(実施例7参照)第9図
:プラスミドpClB1711deltaB-H,N-Bの図解描写(実施例7参
照)第10図
:プラスミドpClB1711-H,Nの図解描写(実施例7参照)第11図
:プラスミドpBS-NCの図解描写(実施例7参照)第12図
:プラスミドpBS-NC-RBの図解描写(実施例7参照)第13図
:プラスミドUbiPATdlの図解描写(実施例7参照)第14図
:プラスミドLB.UbiPATdlの図解描写(実施例7参照)第15図
:プラスミドpAVM1の図解描写(実施例7参照)第16図
:プラスミドp35SD2の図解描写(実施例8参照)第17図(A-B)
:virD2オープンリーディングフレーム含有プラスミドp3
5SD2のEcoRIフラグメントからフラグメントA-Cを調製する工程の図解
描写(実施例8参照)第18図
:プラスミドpTC182の図解描写(実施例8参照)第19図
:プラスミドpTC182-Aの図解描写(実施例8参照)第20図
:プラスミドpTC182-A-Bの図解描写(実施例8参照)第21図
:プラスミドpUC21の図解描写(実施例8参照)第22図
:プラスミドpC21-Xの図解描写(実施例8参照)第23図
:プラスミドppUC21-Cの図解描写(実施例8参照)第24図
:プラスミドpUC21-virD2の図解描写(実施例8参照)第25図
:プラスミドT7polyAの図解描写(実施例8参照)第26図
:プラスミドT7virD2polyAの図解描写(実施例8参照)実施例
ここで用いる標準の組換えDNAおよび分子クローニング技術は周知の技術であ
り、次の文献に記載されている:ジェイ・サムブルーク(J.Sambrook)、イ
ー・エフ・フリッシュ(E.F.Fritsch)およびティ・マニアティス(T.M
aniatis)、分子クローニング:実験室マニュアル、コールド・スプリング・ハ
ーバー・ラボラトリー、コールド・スプリング・ハーバー(Cold Spring Har
bor)、ニューヨーク(1989);ティー・ジェイ・シルハヴィ(T.J.Si
lhavy)、エム・エル・バーマン(M.L.Berman)およびエル・ダブリュ・エ
ンクイスト(L.W.Enquist)、遺伝子融合の実験、コールド・スプリング・
ハーバー・ラボラトリー、コールド・スプリング・ハーバー、ニューヨーク(1
984)。
実施例1:植物細胞の“アグロリスティック(agrolistic)”形質転換:VirD1
とVirD2遺伝子およびT-DNA-境界選択マーカー遺伝子のバイオリスティッ
ク(biolistic)搬入後ら植物中で産生されたT-鎖の組込み
A.要約
ビルレンス遺伝子VirD1およびVirD2は、T-DNAを植物核DNAに挿
入する際に、宿主植物細胞へ搬入するに先立って、アグロバクテリウム・ツメフ
ァシエンス(Agrobacterium tumefaciens)中のTiプラスミドからT−鎖を摘
出するために必要である。我々はプラスミドDNAのバイオリスティック搬入法
を採用し、植物中のVirD1およびVirD2によってT-DNA境界配列の結合
および/または部位特異的ニック形成を試験した。金マイクロプロジェクタイル
を3種のプラスミド混合物で被覆した;3種のプラスミドはそれぞれ、CaMV
35Sプロモーター制御下のVirD1およびVirD2コード領域およびCaMV
35Sとルシフェラーゼコード領域との間に挿入した右境界配列を含むテスト遺
伝子を含む。我々はルシフェラーゼの一過性発現を測定し、テスト遺伝子の完全
度および転写利用率を試験した。タバコおよびトウモロコシの両細胞で、ルシフ
ェラーゼの一過性発現はVirD1およびVirD2プラスミドを同時に搬入したこ
とにより強く阻害された。阻害はテスト遺伝子プラスミドに対するVirDプラス
ミドの比が増大するとより大きくなった。有意な阻害は境界配列の一方向でのみ
、すなわち、ルシフェラーゼmRNAの鋳型であるDNA鎖のVirD2ニック形
成を導く方向にのみ起こった。VirD1のみあるいはVirD2のみでは効果が少
なかった。選択マーカーおよびルシフェラーゼテスト遺伝子、さらにVirDプラ
スミドの混合物を有する形質転換ベクターをバイオリスティックに搬入すると適
度の頻度で“アグロリスティック”挿入物が生成し、その植物DNAをもつ右結
合
部は、T-DNA挿入事象について期待される配列を正確に保持していた。我々
は幾つかの形質転換体系列にバイオリスティックと“アグロリスティック”事象
の両方が起こっていることを見出した。
B.序論
粒子衝撃による遺伝子搬入法は、植物の形質転換に広く応用されるようになっ
たことで、広範囲に受け入れられる技術となっている(総説、アール・ゴイ(A
hl Goy)およびデュウジング(Duesing)、1995)。例えば、ヨーロッパ
・アワノメイガ幼虫耐性トウモロコシがこの技術により開発されている(コジー
ル(Koziel)ら、1993)。製品開発の過程では、導入遺伝子の構造とコピー
数ならびにその安定性を確立しなければならない。最も望ましい製品は単一の単
純な挿入物をもつものであって、外来プラスミドベクターDNAを含まないもの
である。しかし、粒子衝撃による植物の形質転換では、導入遺伝子がプラスミド
ベクターを含む複数のコピーを組込んでしまう傾向がある(クライン(Klein)
ら、1988、クラインら、1989;ゴードン−カム・ダブリュ・ジェイ(G
ordon-Kamm W.J.)ら、1990;バジル(Vasil)ら、1992;ワン・ワ
イ(Wan Y.)およびルモー・ピー(Lemaux P.)、1994)。この手法は、
組込み前もしくは組込み中にプラスミド・コンカテマーの形成を促進すると思わ
れる。バイオリスティック形質転換により挿入された複数のコピーは、一般には
遺伝子連鎖しており、引き続く繁殖中に分離することはできない。
導入遺伝子の複数のコピーは幾つかの機構により、その発現を不安定なものと
する(総説、マツケ・エム(Matzke M)およびマツケ・エイ(Matzke A)、1
995):導入遺伝子の複数のコピーは相互作用して互いに不活化し合い、かつ
、“共抑制”または“遺伝子沈黙”などと様々に呼ばれる発生機構的メカニズム
によって関係する宿主遺伝子をも不活化してしまう。さらに、相同組換えが複数
のコピーの遺伝的不安定性を招く可能性もある。このような理由で、挿入した導
入遺伝子のコピー数を減らすのが、導入した遺伝子の信頼性を維持するのに有益
であることを証明する必要がある。
アグロバクテリウム介在形質転換により導入した外来遺伝子の組込みパターン
は、一般に植物細胞の粒子衝撃より得られるものと著しく異なっている(総説、
チルトン(Chilton)、1993)。バイオリスティック搬入により作製した無
傷でかつ再編成した導入遺伝子のコピー数は、アグロバクテリウム系で植物に導
入した導入遺伝子のコピー数を大幅に上回ることがしばしばである。アグロバク
テリウムは、移入された遺伝子を腫瘍誘発プラスミド(Ti)または根誘発プラ
スミド(Ri)と呼ばれるプラスミドに組込むメカニズムを発達させている(総
説、カド、1993)。TiのT-DNA(導入DNA)またはRiプラスミドD
NAと呼ばれる特定の部分は、Ti/Riプラスミド上の25−bpの直列反復境
界配列にフランクしており、この部分が細菌から植物細胞核へ移動して植物染色
体DNAに組込まれることになる。DNA導入の精巧な機構が一連のビルレンス
(vir)遺伝子によりコード化されている(総説、ザンブリスキー(Zambryski)
、1992)。vir遺伝子を活性化するとT-DNA境界反復配列内に部位特異的
ニックを生成させ、T-DNAの下部鎖に相当する直鎖状一本鎖DNA分子(T-
鎖)を生じる。ニック形成はVirDオペロン、VirD1およびVirD2によりコ
ードされた二種類のポリペプチドを必要とする(スタッチェル(Stachel)およ
びネスター(Nester)、1986;スタッチェルら、1987;ヘレーラ−エ
ストレーラ(Herrera-estrella)ら、1988;デボス(DeVos)およびザン
ブリスキー(Zambryski)、1989;ダレンバーガー(Durrenberger)ら、19
89;ハワード(Howard)ら、1989;コウコリコバ−ニコラ(Koukolikov
a-Nicola)ら、1993)。VirD1はDNA−弛緩活性を示し(ガイ(Ghai)
およびダス(Das)、1990;フィリックキン(Filichkin)およびゲルビン(
Gelvin)、1993)、一方、VirD2は境界配列の低位鎖を切断するエンドヌ
クレアーゼ活性を有する(スタッチェル(Stachel)ら、1986;ヤノフスキ
ー(Yanofsky)ら、1986;ワング(Wang)ら、1987;オルブライト(
Albright)ら、1987)。イン・ビトロの実験は、精製したVirD2は一本
鎖DNAを特異的に切断することを証明している(パンセグロウ(Pansegrau)
ら、1993;ヤスパー(Jasper)ら、1994)。スーパーコイル状または
弛緩状二本鎖DNAはイン・ビトロでVirD2のみでは切断の基質として作用し
ない(ヤ
スパーら、1994)。
VirD2はチロシン残基29(ダーレンバーガー(Durrenberger)ら、19
89;ボーゲル(Vogel)およびダス(Das)、1992;パンセグロウ(Pansegra
u)ら、1993)を介してニック化DNAの5'末端(ワード(Ward)およびバー
ンズ(Barnes)、1988;ヤング(Young)およびネスター(Nester)、1988
;ハワード(Howard)ら、1989)に共有結合する。左境界配列の二番目の切
断はT-鎖を遊離する。このT-鎖はさらに一本鎖結合タンパク質VirE2により
、その長方向に沿って被覆される。VirD2およびVirE2は、T-鎖を植物細
胞核に導くと信じられている核局在化シグナル(NLS)を含有している(ヘレ
ーラ−エストレーラ(Herrera-Estrella)、1990;ハワード(Howard)
ら、1992;シャービントン(Shurvinton)ら、1992;チンランド(Ti
nland)ら、1992;ロッシ(Rossi)ら、1993)。VirD2およびVir
E2のNLSはタバコ中およびトウモロコシ中に認められている(チトウスキー
(Citovsky)ら、1994)が、その効力は組織の成長段階に依存している。
最近のデータは、VirD2がT-鎖の5'末端を植物DNAに連結させるのに介在
している可能性があるという見解を支持している(チンランド(Tinland)ら、
1995)。
本研究で我々は新規な植物形質転換技法を開発した;それはアグロバクテリウ
ム系の幾つかの利点と、広範な作物植物用のバイオリスティックならびに他の搬
入システムにおいて確立された高い効力とを結び付けたものである。企図したこ
とは、T-DNA挿入物でのような、ベクター配列をもたない対象遺伝子を組込
み、コピー数を制御することである。我々の方法は選択マーカーを側面にフラン
クしているT-DNA境界配列含有形質転換プラスミドと共に同時搬入されたVi
rD1およびVirD2遺伝子の植物発現カセットを用いることである。我々は、
一過性発現したVirD1およびVirD2遺伝子産物が、実際に、イン・プランタ
でのT-DNA境界配列を切断することができるし、さらに、バイオリスティッ
ク搬入の後にさらにT-DNA型の挿入事象(“アグロリスティック”事象)を
提示することができることを見出した。
C.材料と方法
1.プラスミド
本研究に用いるプラスミド挿入物総ての構造を第1図に示す。
pClB1711は、カリフラワー・モザイクウイルス35S(CaMV35S
)プロモーターにより駆動するホタル・ルシフェラーゼ遺伝子含有pUC誘導体
である。pClB1711の構築
pClB1711は35S発現シグナルに結合したルシフェラーゼ遺伝子を含
んでいる。親ベクターpClB710(ロスシュタイン(Rothstein)ら、19
87)は、ルシフェラーゼ遺伝子挿入に先立って、非反復制限部位PstIおよび
NarIを除去することによって改変した。CaMVプロモーターの上流に位置す
るPstI部位は、隣接のSaIIおよびSphI制限部位で切断し、合成リンカー
[5'−TCGACATG−3']を連結させてSaII部位を創製し、SphIお
よびPstI部位を除くことにより除去した。CaMVポリアデニル化配列の3'側
に位置するNarI部位は、NarIおよびNdeIで切断し、52bpフラグメントを
切除し、次いで、クレノウ消化および平滑末端連結により除去した。プラスミド
pJD204(オウ(Ow)ら、サイエンス234:856−859(1986
))およびpDO0432(デュ・ウエット(De Wet)ら、モル・セル・ビオ
ル(Mol.Cell.Biol.)7(2):725727(1987))はそれぞれ
、ドナルド・ヘリンスキー博士(Dr.Donald Helinski)およびスチーブ・ハ
ウエル博士(Dr.Steve Howell)より入手した。ルシフェラーゼ遺伝子、2
2bpのルシフェラーゼ5'UTLおよび約130bpの3'末端を含むpJD204
からの1826bp HindIII−bamHIフラグメントは、35Sプロモーター
とポリアデニル化シグナルとの間に来るように、pClB710のBamHI部位
中に、オリゴ体5'−GATCCCTGCAGA−3'(配列番号3)および5'
−AGCTTCTGCAGG−3'(配列番号4)から製造した合成リンカーで
連結した。
pClB1701はルシフェラーゼ遺伝子フラグメントを、修飾したpClB7
10ベクターに挿入することにより製造した。pClB1711は、pClB17
01をPstIおよびNarIで消化し、生成したプラスミドを遺伝子のリーダーと
5'末端を含むリンカーR5B1で連結することにより構築した。
リンカーR5B1は下記の相補的オリゴマーから製造したフラグメントからな
る。
T-DNA境界を導入するために、LBA5269(バン・ハーレン(Van H
aaren)ら、1989)の右境界配列に対応する二種類の合成オリゴヌクレオチ
ドをアニールして二本鎖:5'−ATCCGGCAGGATATATACCGT
TGTAATTCTGCA−3'(配列番号7)とした。BamHI-PstIにフラ
ンクしたこの二本鎖を、pClB1711のプロモーターとルシフェラーゼをコ
ードする配列との間の対応する部位に挿入し、pRB(+)Lucとした。pRB(-)
Lucでは、右境界配列はプロモーターに関し逆方向に導入した。pNeoRBLuc
はタバコ懸濁細胞の安定な形質転換用に設計され、左境界配列、ネオマイシン・
ホスフォトランスフェラーゼ遺伝子(nptII)およびルシフェラーゼ遺伝子を
プロモーターとpRB(+)Luc由来のルシフェラーゼコード領域との間に挿入し
た右境界と共に含んでいる(第2図)。Nos(nopaline syntase; ノパリン・シ
ンターゼ)プロモーターにより駆動するnptII遺伝子はプラスミドpBin19か
ら2.2 kb SacII-HindIIIフラグメントとして切り出した(ビーバン(
Bevan)、1984)。左境界配列はpBin19からBgIII-EcorIフラグ
メントとして切り出した。これら両方のフラグメントはpRB(+)LucのXbaI-
HindII部位に挿入した。pNeoLucは、CaMV35Sプロモーターとルシフ
ェ
ラーゼコード領域の間に挿入した右境界配列をもたないpNeoRBlucの等価物
である。
pTiA6からのVirD1およびVirD2遺伝子は発現ベクターpMF6(カ
リス(Callis)ら、1987)にサブクローンしたものであり、CaMV35S
プロモーター(0.5 kb)、Adh1第1イントロン(0.5 kb)およびノパリ
ン・シンターゼ(nos)ポリアデニル化領域(0.25 kb)からなる(第1図)
。VirD1コード配列に対応するpAD1187(ガイ(Ghai)およびダス(
Das)、1989)からの0.6 kb EcoRI-PstIをpMF6にクローン化し
てp35SAdhD1とした。VirD2コード配列はpAD1190(ガイおよび
ダス、1989)から1.8 kb EcoRIフラグメントとして切り出し、pMF
6にクローン化した。得られるプラスミド、p35SAdhD2およびp35SAdh
D2(rev)は、VirD2コード領域をセンスまたはアンチセンス方向のいずれか
に有していた。Adh1イントロン配列をp35SAdhD1,p35SAdhD2およ
びp35SAdhD2(rev)から除去して、それぞれ、p35SD1、p35SD2お
よびp35SD2(rev)とし、タバコ組織用にデザインした実験に使用した。
pGUSは、CaMV35Sプロモーターの制御下β−グルクロニダーゼ(G
US)をコードする配列GUS遺伝子とヒマの実カタラーゼ遺伝子イントロンを
含有するpUC誘導体である(オオタら、1990)。
2.植物材料トウモロコシ懸濁細胞
:トウモロコシ(ジー・メイズ・エル;Zea mays L.)の
懸濁培養は、B73に関係する選択株の未成熟胚から選択した凍結保存胚形成I
I型カルスから起こした。凍結保存カルス(ディマイオ(DiMaio)およびシリ
トオ(Shillito)、1992)約1gをスクロース30g/lおよび2,4−ジクロ
ロフェノキシ酢酸(2,4−D)(2N63S)2mg/lを添加したN6液体培地
(チュウ(Chu)ら、1975)に加えた。培養物は暗所にて150rpmのオービ
タル・シェーカーにより25℃で培養した。懸濁培養物は7日ごとに、充填細胞
量1mlを新鮮な2N63S液体培地に移すことで継代培養した。衝撃実験に使用
するトウモロコシ細胞懸濁液は3日令の急速生育培養物から取り出した。衝撃処
理前に、約0.5ml充填量の細胞を減圧下、7−cmフィルター(ワットマン、
No.4)によりろ過した。ろ過物をスクロース120g/lを含有するゲルライト
固化N6培地に移した。塗布した細胞を衝撃処理前に25℃に4時間保持した。
衝撃処理後、塗布物を25℃24時間培養した。タバコ懸濁細胞
:ニコチアナ・タバクム(Nicotiana tabacum)細胞株NT-1(
アン(An)、1985)を、2,4−D 2 mg/lおよびスクロース(30g/l)を
添加したムラシゲースクーグ培地(MurashigeおよびSkoog)(MS3S)で育
成した。細胞は週に一度、500mlフラスコ中で5mlの接種物として新鮮培地1
00mlに加えることで継代培養した。フラスコをロータリーシェーカー上125
rpm、27℃で培養した。4日後、培養物の一部0.5 mlを滅菌フィルター(ワ
ットマンNo.4)に展開し、それを次いで12%スクロース添加MS培地に移し
、衝撃処理前に4時間室温保持した。
3.植物細胞の衝撃処理
組織を金マイクロプロジェクタイルで衝撃処理し、プラスミド混合物を沈殿さ
せた。全実験において、トウモロコシおよびタバコ用内部対照としてpGUSプ
ラスミドDNAを使用した。同時形質転換実験では、金粒子は同一質量の全プラ
スミドDNA(標的プレート当たり0.5μg各プラスミドDNA)または基質プ
ラスミドに対して2:1のモル比でVirD1およびVirD2遺伝子を担持するプ
ラスミドを担持していた。安定な形質転換実験では、同時形質転換混合物はnpt
II選択プラスミドに対して5:1の分子量比でVirD1およびVirD2遺伝子
を担持するプラスミドを含有していた。標的プレート当たり衝撃に要するプラス
ミド混合物の各アリコートは選択マーカー0.1μgおよびp35SD1およびp3
5SD2プラスミドDNA各0.5μgからなっていた。各DNAの適切な量を総
量10μlに混合し、1.0μm金ミクロ担体(60mg/ml)50μl上に沈積する
ように2.5M CaCl2 50μlおよび0.1Mスペルミジン遊離塩基20μlで
沈殿させた。ミクロ投射物による衝撃処理はPDS−1000Heバイオリステ
ィック装置(デュポン)で実施したが、その際、遮断スクリーン棚の下8cmの位
置にサンプルを載せた1500 psi破砕ディスクを使用した。
4.タバコ懸濁細胞の安定な形質転換
衝撃処理の24時間後、タバコ細胞をカナマイシン300μg/ml含有MS3S
プレート上に移植した。衝撃処理から約3週間後に生成した個々の微小カルスを
カナマイシン300μg/ml添加新鮮プレート上に移植した。同じ培地上2度の継
代培養の後、タバコ細胞約100mgをカナマイシン300μg/ml添加液体培地2
5mlに接種し、懸濁培養を開始した。
5.一過性発現アッセイ
供給者の推奨に従って、組織抽出物中のルシフェラーゼを測定した(ルシフェ
ラーゼ・アッセイ・システム、プロメガ(Promega))。β−グルクロニダーゼ
活性はGUS-ライト・キット(トロピックス(Tropix))を用い、化学発光ア
ッセイ法により定量した。ルシフェラーゼおよびβ−グルクロニダーゼ活性は、
アナリティカル・ルミネッセンス・モデル2001ルミノメーターにより測定し
、25℃10秒間積算して光単位で表す。
6.DNA抽出およびサザン・ブロット・ハイブリダイゼーション
細胞培養物は培養10日後にろ過、回収し、液体窒素中凍結した。DNAは記
載のように単離した(ホール(Hall)ら、1991)。
ゲノムDNA約5μgをEcoRIでの消化に用いた。0.7%アガロースゲル上
分離した後、DNAを遺伝子スクリーン/メンブレンに移し、製造業者記載の条
件に従いハイブリダイゼーションを実施した(NENリサーチ・プロダクト、デ
ュポン)。DNAプローブはファルマシア社のオリゴ標識キットを用い、[a-32
P]dCTPで標識した。この新しいプローブはnptII遺伝子の2−kb PstI
フラグメントに相当する(第2図)。該 lucプローブはルシフェラーゼ遺伝子の
0.7 kb XbaI-EcoRIフラグメントに相当する(第2図)。プローブを除去す
るために、メンブレンを0.1%SDS溶液で100℃5分間処理し剥ぎ取った
。
7.T-DNA/植物DNA結合物のクローニング
形質転換したタバコカルスからのDNA(30μg)をEcoRIで消化し、1
% シー・プラーク(sea-plaque)アガロースゲル(FMC)上分離用電気泳動に
付した。クローン化すべきフラグメントのサイズに合わせてアガロース薄片をゲ
ルから切り出し、DNAをQIAクイック・ゲル・抽出キット(キアゲン(Qia
gen))でアガロースから抽出した。次いで、フラグメントをpUC19の脱ホ
スフォリル化EcoRI部位にクローン化した。連結反応混合物はエレクトロポレ
ーション(電気穿孔法)によりE.coli HB101に形質転換するのに用いた。
適正な挿入物を有するプラスミド含有コロニーを、0.5 kb CaMV35Sプロ
モーターフラグメントをプローブとして用いるコロニーフィルター・ハイブリダ
イゼーションにより同定した。ドナープラスミドDNAと植物DNAとの結合物
の配列は、プライマー5'−CCACTATCCTTCGCAAGACC−3'(
配列番号8)を用い分析した;該配列はCaMV35S中の右境界配列から10
6−bpの距離に位置している。
D.結果
1.実験設計
VirD1およびVirD2遺伝子産物が植物細胞中で発現したときに、T-DN
A境界配列をニックするか否かを探求するために、我々は試験プラスミドpBR(
+)Lucを構築した;該プラスミドはプロモーターとルシフェラーゼ遺伝子のコ
ード領域との間に基質T-DNA境界配列を含有している。CaMV35Sプロモ
ーターとルシフェラーゼコード領域との間に右境界配列を挿入しても、植物組織
内でのルシフェラーゼ遺伝子の発現を阻害はしない(データ非開示)。境界配列
は、VirD1およびVirD2遺伝子産物により導入された部位特異的切れ目(ニ
ック)がルシフェラーゼmRNAの鋳型であるDNA鎖に切れ目(ニック)を入
れるようにし、その結果、ルシフェラーゼ転写と酵素の生成が減少するような方
法で配置した。pRB(+)LucおよびvirD遺伝子を担持するプラスミドで植物細
胞を同時衝撃処理後、境界配列でのニック形成のいずれもがルシフラーゼ活性を
アッセイすることで定量的に測定し得るようにする。しかし、ルシフェラーゼ活
性の低下は、VirD1およびVirD2遺伝子産物がプロモーターとコード配列と
の間に位置する境界配列に結合するためということでも説明し得る;その結合が
ルシフェラーゼ遺伝子の転写を阻害するからである。それ故、これら二つの可能
性を区別するためにプロモーターに関して逆方向に境界配列を有するプラスミド
pRB(-)
Lucを試験した。もしルシフェラーゼ活性の低下が,VirD遺伝子産物が境界配
列に結合した結果であるならば、その時は境界配列が逆方向でもその低下が観察
されるはずである。
VirD1およびVirD2タンパク質が、境界配列に切れ目(ニック)を生じる
前に衝撃処理植物細胞に一過性に生じる以上、そのような切れ目(ニック)の形
成は多分、ルシフェラーゼ遺伝子の転写が既に始まってから後に起こるだろう。
それ故、ルシフェラーゼ活性の測定は植物細胞中のVirD1およびVirD2活性
よりも、多分下回った値となるはずである。
植物細胞中でVirD1およびVirD2遺伝子を発現させるために、それぞれの
オープン・リーディング・フレーム(ORF)をCaMV35Sプロモーターの
制御下に置いた。VirD2 ORFを、コントロールとして作動するプロモータ
ーに関し、アンチセンスの方向に導入した。トウモロコシ・アルコール・デヒド
ロゲナーゼ1・イントロン1の存在がトウモロコシ中の遺伝子の発現を増大させ
るということが判明していたので(カリス(Callis)ら、1987)、我々もま
たトウモロコシの一過性発現実験に用いるp35SAdhD1およびp35SAdhD
2(プロモーターとVirD1およびVirD2 ORF遺伝子をそれぞれコードす
る領域との間に挿入したイントロンを含む)を構築した。β−グルクロニダーゼ
(GUS)遺伝子を発現するプラスミドpGUSを、DNA導入の効率を制御す
るための内部基準として各衝撃処理ごとに包含させた。全ての場合に、DNA搬
入効率の多様性を補正するために、レポーターの活性をGUS活性に対するルシ
フェラーゼ活性の比として表わす。
2.イン・プランタでのVirD1およびVirD2遺伝子産物による境界配列の切
断を試験するための一過性発現アッセイ
トウモロコシおよびタバコ細胞がT-DNA境界配列を介して転写に影響する
その能力を個々に試験するために、まず一時的にVirD1およびVirD2遺伝子
で同時搬入した我々のテストプラスミドで該細胞を別々に形質転換した。p35
SD1 DNAまたはp35SAdhD1 DNAをpRB(+)LUC DNAと共に
同時搬入した後、GUS活性に対するルシフェラーゼの80%制御レベルをタバ
コおよびトウモロコシ組織で観察した(表1および表2;下表参照)。p35S
D2 DNA(タバコ)またはp35SAdhD2 DNA(トウモロコシ)をpR
B(+)LUC DNAと共に同時搬入すると、GUS活性に対するルシフェラーゼ
の制御レベルが50%および80%となる(第1表および第2表;下記参照)。
表1.タバコ細胞中のVirD1およびVirD2の活性。プラスミド構成物を第1
図に描出し、バイオリスティック装置によりタバコ細胞に搬入した。括弧内の数
字はプラスミドのモル比を示す。培養24時間後、組織を均一化し、酵素活性を
定量した。活性をルシフェラーゼ(Luc)対β−グルクロニダーゼ(Glu)の比
で表わす。衝撃処理ごとに分析し、データを繰返し6回の平均値プラス・マイナ
ス標準偏差として表わす。%コントロール値は、対照プラスミドで観察される活
性に対するルシフェラーゼ対β−グルクロニダーゼ活性の比から定量した。
表2.トウモロコシ細胞中のVirD1およびVirD2の活性。活性は第1表の脚
注記載と同様に表わす。
二つのvir遺伝子は一緒になると相乗効果を示すように思われた。等量のpR
B(+)LUC DNAをVirD1およびVirD2担持プラスミドと共に(1:1:
1の比)バイオリスティック装置により同時搬入すると、ルシフェラーゼ活性が
タバコの場合は対照の約20%に(第1表)、またトウモロコシ細胞の場合には
10%にまで(第2表)低下する。VirD1およびVirD2プラスミドの比がテ
ストプラスミドに対して高い(2:2:1)場合には、ルシフェラーゼ活性が更
に低下して、タバコ細胞では約10%(第1表)に、トウモロコシ細胞では1%
(第2表)となる。同様の実験を、対照プラスミドp35SD2(rev)(タバコ)ま
たはp35SAdhD2(rev)(トウモロコシ)をアンチセンス方向のVirD2コード
配列共に用いて実施すると、予想どおりにVirD1単独で実施した実験と同様の
結果を与えた(第1表および第2表)。この事実は、我々の内部標準GUS遺伝
子が、搬入した総DNA濃度を変化させる効果に対し効果的に制御したことを証
明している。
テストプラスミドのT-DNA境界を方向逆転させると、ルシフェラーゼ遺伝
子の一過性発現に対するVirD1および/またはVirD2遺伝子の影響が消失す
るか大幅に減少した。pBR(-)Lucをp35SD1およびp35SD2プラスミド
でタバコ細胞に衝撃処理しても、ルシフェラーゼ活性の有意な低下は認めなかっ
た。同様に、pBR(-)Lucをp35SD1またはp35SD2と共にそれぞれ別
個に同時搬入しても、ルシフェラーゼ活性の有意な低下を示さなかった(第1表
)。これらの観察が強く示したことは、pBR(+)LucテストプラスミドとVir
D1およびVirD2遺伝子で見られたルシフェラーゼ活性の低下は、アグロバク
テリウムで観察されたと同様のvir遺伝子産物により生じた右境界配列での鎖特
異的切れ目(ニック)の結果ということである(総説として、ザンブリスキー(
Zambryski)、1992)。
3.安定な形質転換体の分析
VirD1およびVirD2遺伝子産物の活性を評価するために、タバコ懸濁細胞
の安定な形質転換を次いで実施した;その評価はこれらの遺伝子をその基質DN
Aと共にバイオリスティック装置により同時搬入した後のDNA組込みパターン
に基づいた。これらの実験にはpNeoRBLucを用いた;このものは左境界T-
DNA、選択可能マーカーとしてのnptII、および35SRB(+)Luc遺伝子を
、プロモーターとルシフェラーゼコード領域の間に挿入した右境界T-DNAと
共に含有している。下記、結果と考察に示すように、我々は、境界配列上のVir
D1およびVirD2活性の結果として、T-鎖を生じることになったタバコ・ゲ
ノムへのこれらDNA挿入を“アグロリスティック事象”と命名した。これに対
し、我々は、バイオリスティック装置により遺伝子を植物細胞中に搬入した結果
通常起こる過程を表わすDNA挿入断片を“バイオリスティック事象”と命名し
た。バイオリスティック事象と推定上のアグロリスティック事象を区別する当初
の基
準は、T-DNAの切除によりpNeoRBLucからLucコード領域が排除されて
しまったために形質転換したクローンにルシフェラーゼ活性が欠如しているとい
うことであった。分子のレベルでは、アグロリスティック事象を表わす導入遺伝
子は、neoプローブとはハイブリダイズするが、lucプローブとはしないはずであ
る。更に、アグロリスティック事象では、導入したDNAと植物DNAとの間の
結合部配列はT-鎖の右境界末端に厳密に対応するはずである。両型の事象は同
一の植物細胞内で起こることもあるが、そのようなクローンはルシフェラーゼ活
性が存在するということで、遺伝子的にはバイオリスティック事象として記録す
る。バイオリスティック事象と推定上のアグロリスティック事象の双方をサザン
・ハイブリダイゼーションにより探求し、各挿入タイプの頻度を測定した。タバ
コ懸濁細胞はpNeoRBLucプラスミドDNAをp35SD1およびp35SD2
DNAと共に1:5:5の比率で被覆したマイクロプロジェクタイルで衝撃処理
した。対照として、pNeoRBLucプラスミドを単独で衝撃処理し、また、境界
欠損対照プラスミドpNeoLucもp35SD1およびp35SD2 DNAと共に共
衝撃処理した。安定な形質転換体は、カナマイシン含有培地上に生育させて選択
した。単一衝撃フィルター当たり平均40のカナマイシン耐性クローンが出現し
たが、一つまたは二つだけのカルスにつき更にプレートごとに分析した。同数の
カナマイシン抵抗カルスを、対照プラスミドpNeoRBLuc DNA単独またはp
NeoLuc DNAプラスp35SD1 DNAおよびp35SD2 DNAでの衝撃
処理後に回収した。
アグロリスティック事象の頻度を大まかに推定するには、総カナマイシンカル
スに対し、ルシフェラーゼを発現しないと分析されたカナマイシン耐性カルスの
総数比を算出することで実施できた。この基準によると、アグロリスティック事
象の頻度は約10%であった;分析した32カルス株の内、3株はルシフェラー
ゼ活性を発現しなかった。上に議論したように、アグロリスティック事象とバイ
オリスティック事象が同一の植物細胞に起こり得るという理由で、この数値は多
分アグロリスティック事象の頻度としては低い評価である。
4.対照“バイオリスティック”事象のサザン・ブロット分析
(i)pNeoRBLuc単独、および(ii)p35SD1およびp35SD2 DNAで
衝撃処理したpNeoLucプラスミドでそれぞれ衝撃処理した後、得られた対照カ
ナマイシン耐性カルス株からのDNAにつきサザン・ブロット・ハイブリダイゼ
ーションを実施した。ゲノムDNAをEcoRIで消化した;これはneoプローブ
およびlucプローブの双方に類似したpNeoRNLucプラスミドから3.9 kbの
フラグメントを生じる(第2図)。ゲノムDNA消化物をneoプローブとハイブ
リダイズさせると、全てのレーンに予測したサイズ(3.9 kb)のハイブリッド
・バンドを示した;未反応のフラグメントコピー数は、ハイブリダイゼーション
強度をコピー対照レーンと比較して、核当たり1から10以上と変化した。プロ
ーブとして使用した境界欠損対照プラスミドpNeoLucと共にp35SD1および
p35SD2 DNAで同時衝撃処理した形質転換株をサザン・ブロット分析する
と、これらの株にはnptII遺伝子の無傷の再編成コピー双方が存在することが
明らかとなった。このような再編成はバイオリスティック装置によって得られた
形質転換体にはしばしば見られることである。
5.アグロリスティック事象候補のサザンブロット分析
サザンブロット分析を、pNeoRBLucの同時衝撃により得た16種のカナマ
イシン耐性カルスのDNAにつき、ハイブリダイゼーション・プローブとしてp
35SD1およびp35SD2 DNAを使用し実施した。サザン・ブロット分析
では、ルシフェラーゼ活性が陽性と判定された32種およびルシフェラーゼを発
現しないと判定した3種から13種のカルス株を無作為に選定した。ルシフェラ
ーゼ陽性カルス株からのDNAはneoプローブとハイブリッド形成する予測サイ
ズ(3.9 kb)のバンドを含んでいた。無傷のnptII遺伝子コピー数は、ハイ
ブリダイゼーション強度をコピー対照レーンと比較して、核当たり1から10の
範囲であった。観察されたコピー数はpNeoLuc DNAならびにp35SD1お
よびp35SD2 DNAで形質転換したカルスでは非常に少なかった。
pNeoRBLucと共にp35SD1およびp35SD2 DNAで衝撃処理した形
質転換カルス全てについてそのDNAには3.4 kbのバンドを観察した。このサ
イズのフラグメントはこれらの株においてVirD2プローブとハイブリッド形成
することが判明した。Neoプローブ用フラグメントは、p35SD1およびp35
SD2構築物にも存在するターミネーター配列の断片を含んでいた;それは標識
プローブの僅か1.2%を表わすに過ぎないが、VirD遺伝子挿入物のコピーは
多数あるはずで、目視し得る大きさのシグナルを生じはずである。
ブロットをlucプローブとハイブリッド形成させると、3群の形質転換カルス
株が識別し得た:(i)neoプローブおよびlucプローブとハイブリッド形成する挿
入物をもつカルス株;(ii)その一部の挿入物がneoプローブのみとハイブリッド
形成し、一部がneoおよびlucプローブの双方とハイブリッド形成するカルス株;
(iii)neoプローブとのみハイブリッド形成する挿入物をもつカルス株。このカル
スの第1の群は、多分、アグロリスティック事象を含んでいなかったのだ。カル
スの第2の群は多分2種の事象を含んでいた:その一つはアグロリスティック事
象で、neoプローブとハイブリッド形成する4.8 kb、4.6 kbおよび5kbフラ
グメントの存在により証明されるもの、およびもう一つはバイオリスティック事
象で、lucプローブとハイブリッド形成する3.9 kbフラグメントの存在により
証明されるものである。カルスの第3の群は、neoプローブとのみハイブリッド
形成するという能力に基づき、推定上のアグロリスティック事象のみを示した。
三種のカルスはこの群に入る;一番目は3.2 kbのハイブリッド・バンドを含む
もの、二番目は3.8kbと5kbという二つのハイブリッド・バンドを含むもの、
そして三番目は5.5 kbの一本のバンドを含むものである。これら三つのハイブ
リダイゼーションパターンは特異であり、明らかに独立した単一細胞形質転換事
象を表わしている。
サザンハイブリダイゼーションにより分析した16種の形質転換タバコ株の内
で、10種がバイオリスティック事象を示し、3種が推定上のアグロリスティッ
ク事象を示し、3種が両方を示した。
6.推定上のアグロリスティック事象の分子分析
推定上のアグロリスティック挿入事象の性質は、組込んだDNAとそのような
推定上の事象と一致するハイブリダイゼーションパターンを示すカルス株中の植
物DNAとの間の結合部の配列を決定することにより最終的に証明した。これら
の結合をもつカルス株からのDNAフラグメントをクローン化し、T-DNA境
界の内側から外側へ向けて配列を決定した(方法参照)。ヌクレオチド配列は、
それぞれのフラグメントが右境界/植物DNA結合部を示す配列を含んでいるこ
とを明らかにした。T-DNAの右側末端は、T-DNAの右境界配列のニック形
成部位と一致した。
5例の内4例の植物ヌクレオチド配列は、cDNAについてすでに他所で報告
されているタバコ結合配列と完全に一致した。興味深いことに4例全てにおいて
、T-DNAの右境界は、遺伝子の5'−非翻訳領域のポリアデニル化部位に近い
高AT領域で植物遺伝子に関してアンチセンス方向に向いたCaMV35Sプロ
モーターと共に挿入されている。付加的ヌクレオチドおよび反復配列は、右側結
合部位には見られなかった。標的部位の欠如が起きたのか否かは、挿入フラグメ
ントの左境界が決まっていないので結論し得ない。
対照として、右境界配列とその両側に隣接領域を含むDNAフラグメントを、
バイオリスティック事象DNAフラグメントと一致するハイブリダイゼーション
パターンを示すカルス株からクローン化した。これらの事象からのヌクレオチド
配列は右境界配列−植物DNA結合を示さず、むしろ右境界配列全長および期待
したルシフェラーゼコード配列は範囲外にあることを示していた。
E.結論
Tiプラスミドがコードするビルレンスタンパク質VirD1およびVirD2は
アグロバクテリウムにとってT−鎖形成のために必要である。ここで我々は、C
aMV35Sプロモーターの制御下で境界配列を巻き込んでいるプラスミドと共
に、二種類のビルレンス遺伝子VirD1およびVirD2をバイオリスティック装
置によって導入した後に、インプランタ中でT-DNAが形成されたことの証明
と植物細胞中への組込みを紹介する。形質転換したタバコカルスの約10%がア
グロリスティック挿入物、すなわち、VirD1およびVirD2遺伝子産物が作用
した後に組込まれたDNAのみを有していた。形質転換したカルスの同様のフラ
クションは、アグロリスティック事象とバイオリスティック事象の両方を含んで
いた。アグロリスティック事象中の導入遺伝子::植物DNA結合部には、右境界
配列内に部位特異的切断があることを証明した;この事実は25−bpの反復配列
をもつ最初の3ヌクレオチドに続く右境界T-DNA末端につき開示する集積デ
ータと一致している(ゲイセン(Gheysen)ら、1991;メイエルホッファー
(Mayerhofer)、1991;オオバ、1995)。組込み事象の正確さは、植
物細胞核の組換え工程にはVirD2が直接関与しているものとして判断されてい
る(チンランド(Tinland)ら、1995)。
アグロリスティック事象の組込み部位は、ここでは、転写された領域で同定す
る;これは、異種植物(コンツ(Koncz)ら、1989;ハーマン(Herman)ら
、1990;カートバンディット(Kertbundit)ら、1991)中T-DNAは潜
在的に転写可能性のあるゲノムの位置に、植物染色体(チャイら、1986;ウ
ォールロート(Wallroth)ら、1986)に無作為分布したT-DNA挿入物と共
に優先的に組込まれるというデータを支持する。T-DNA組込みは通常、植物
DNA中での大きな再配列とは関係ないが、標的植物DNA配列の欠失、逆位お
よび複製がT-DNA形質転換の間に起こる。ここで実験したアグロリスティッ
ク事象にとって、植物の標的部位では注目すべき主要な再編成はなかった。
オープンリーディングフレームに対しアンチセンスの方向を向いた右境界にC
aMV35Sプロモーターをもつ既知タバコ光誘導および/または光合成遺伝子を
、ポリアデニル化シグナル近傍にアグロリスティックに組込むと、一致したパタ
ーンとなるのは興味がそそられる。この方向でT-DNA構造を挿入することは
アンチセンス転写を生じることになり、相当するタバコ遺伝子の発現を不活化す
ることになる。しかしながら、これらの非光合成培養NT1細胞はこのような光
合成遺伝子を必要としない。
右境界配列での切断が頻繁に起こると思われる一過性発現実験に基づいて、基
質分子を見かけ上高率で切断した。驚くべきことに、この比率は安定な形質転換
には維持されなかった。このことはVirD2で切断した後の右境界配列連結反応
により説明することができた;と言うのは、イン・ビトロ・アッセイがVirD2
はT-DNA境界配列を含む一本鎖オリゴヌクレオチドの範囲内で部位−特異的
切断−結合反応を触媒することを示しているからである(パンセグロー(Panse
grau)ら、1993)。もう一つの解釈は、効率的なアグロバクテリウム介在形
質転換に必要な一本鎖結合VirE2が欠如しているからというものである。T-
鎖に結合し、防御することのできる植物細胞中の非特異的一本鎖結合タンパク質
VirE2に等価なものがある、と仮定することはできるが、virE2遺伝子をVi
rD1およびVirD2と共に付加すると、アグロリスティック事象の回収効率が
改善するはずである。我々がまた知り得た欠点は、VirD1およびVirD2遺伝
子を一緒にして形質転換プラスミドと共に同時搬入すると、多分、バイオリステ
イックに高頻度で同じ形質転換株に組込まれてしまうことである;同時形質転換
はバイオリスティック装置によると非常に効率的である。これら不要の遺伝子は
異なった種類の外来DNAの代表である。しかし、我々はそれらが独特の挿入メ
カニズムをもつという理由で、それらが“アグロリスティック”挿入フラグメン
トに結合せず、トランスジェニック植物の引き続く育種により除去することがで
きると仮定する。この仮説は再生しないこれらのトランスジェニックNT1細胞
では試験することができない。
このアグロリスティック形質転換システムは幾つかの他と異なる利点をもつ:
(i)このシステムはバイオリスティック形質転換法に影響を受け易い植物標的組
織に直ちに適用することができる;(ii)挿入されたDNAは外来のベクターDN
Aをもたない;(iii)VirD1およびVirD2遺伝子なしで搬入したDNAの場
合より関心のある遺伝子コピーの挿入が少ない。この場合、不安定性に関係する
可能性のある相同性領域が最小となる。
このように、アグロバクテリウムT-DNA挿入メカニズムの簡潔で精度の高
いアグロリスティック手法をバイオリスティック搬入の最良の形態と組み合わせ
ると、農業的に価値の高いトランスジェニック作物植物の生産に広く適用可能な
新しい技術を提供することができる。
実施例2:植物発現カセットの構築
トランスジェニック植物体または植物細胞中での発現を企図した遺伝子配列を
発現カセット中の適当なプロモーターの後と適当な転写ターミネーターの上流に
集め、キメラ遺伝子を創製する。これらの発現カセットは、実施例3に記載した
植物形質転換ベクターに容易に移すことができる。プロモーターの選択
発現カセットまたはキメラ遺伝子に用いるプロモーターの選択は、トランスジ
ェニック植物体中の導入遺伝子の空間的一時的発現パターンを決めることになる
。選択したプロモーターが特定の細胞型(葉部表皮細胞、葉肉細胞、根部表層細
胞など)において、あるいは特定の組織もしくは器官(例えば、根部、葉部また
は花部)において導入遺伝子を発現することになり、この選択が導入遺伝子にお
いて望ましい位置での発現に反映することになる。一方で、選択したプロモータ
ーは光誘発または他の一時的な制御プロモーターの下で遺伝子の発現を駆動させ
ることも可能である。別の変法では、選択したプロモーターを化学的に制御する
。この場合には、必要とするときのみ、化学誘発物質で誘発処理し、導入遺伝子
の発現を誘発することができる。転写ターミネーター
種々の転写ターミネーターが発現カセット用として入手可能である。これらの
ものは導入遺伝子とその適正なポリアデニル化部分を超える転写を終了させる。
適当な転写ターミネーターおよび植物中で作用することが知られているものは、
CaMV 35Sターミネーター、tmlターミネーター、ノパリン・シンターゼ・
ターミネーター、エンドウrbcS E9ターミネーターである。これらは単子葉お
よび双子葉植物の両方で使用することができる。発現を増強または制御する配列
多くの配列がその転写単位内で遺伝子発現を増強することが判明しているが、
これらの配列はトランスジェニック植物での発現を増加させるために、本発明の
遺伝子と結合させて用いることができる。
種々のイントロン配列は、特に単子葉植物細胞での発現を高めることが示され
ている。例えば、トウモロコシのAdh1遺伝子のイントロンは、トウモロコシ細
胞に導入すると、その同族プロモーターの下で野生型遺伝子の発現を有意に高め
ることが判明している。イントロン1がとりわけ効果的であることが分かり、ク
ロラムフェニコール・アセチルトランスフェラーゼとの融合構築物中で高い発現
を示した(カリス(Callis)ら、ジーン・デベロープ(Genes Develop.)1
:1183−1200(1987))。同じ実験系において、トウモロコシ・ブ
ロンズ1(bronze 1)遺伝子からのイントロンは発現増大において同様の効果
を示した(カリスら、上記)。イントロン配列は植物形質転換ベクター中に、典
型的には非翻訳リーダー内に常套的に包含されている。
ウイルスから誘導した多数の非翻訳リーダー配列もまた発現を高めることが知
られている。特に、タバコ・モザイク・ウイルス(TMV、“オメガ−配列”)
、トウモロコシ・クロロティック・モットル・ウイルス(MCMV)、およびア
ルファルファ・モザイク・ウイルス(AIMV)からのリーダー配列は発現増大
に効果的であることが示されている(例えば、ガリー(Gallie)ら、ヌクレイ
ック・アシド・リサーチ(Nucl.Acids Res.)15:8693−8711(
1987);スクゼスキー(Skuzeski)ら、プラント・モレキュラー・バイオ
ロジー(Plant Molec.Biol.)15:65−79(1990))。
実施例3:バイオリスティックに搬入したDNA中の部位特異的組換えを実施す
るための“ヒット・エンド・ラン”法:リコンビナーゼmRMAの同時搬入
A.要約
我々はバイオリスティック装置を用いてDNAおよびmRNAを植物細胞に共
搬入する方法を記載する。我々は種々の条件でマイクロプロジェクタイル上に沈
着したDNAおよびRNAの安定性と回収率をゲル電気泳動法により証明した。
活性mRNAの搬入にはCaCl2単独またはCaCl2+スペルミジン+トリスバッ
ファーによる沈着が有効であったが、非緩衝スペルミジンはRNAをフラグメン
ト化した。
効率的な沈着法とトウモロコシおよびタバコ細胞へのバイオリスティック搬入
法を用いて、我々はホタル・ルシフェラーゼをコードするイン・ビトロ合成のキ
ャップ・ポリアデニル化mRNAの発現を証明した。速度論的研究が証明すると
ころによると、ルシフェラーゼmRNAの発現は同時に搬入された35S/ルシ
フェラーゼDNAの一過性発現よりも早い段階でピークに達した。
バイオリスティックに搬入したR、すなわち、ザイゴサッカロマイセス・ルー
クシー(Zygosaccharomyces rouxii)の部位特異的リコンビナーゼをコードす
るmRNAの活性を証明するために、我々はトウモロコシ細胞に向け、RSの逆
方向コピーが両側に隣接した逆転35Sプロモーター、それに続く35Sリーダ
ー、ルシフェラーゼ遺伝子および35Sターミネーター領域を含む基質プラスミ
ドを共搬入した。基質プラスミド単独では有意なルシフェラーゼ発現が起こらな
かったが、R mRNAを同時搬入すると、その35Sプロモーターがリコンビ
ナーゼによりはじかれて、ルシフェラーゼ酵素が産生された。
導入遺伝子の挿入と発現を制御する部位特異的組換え酵素システムの有効な使
用について、mRNAとして一時的にリコンビナーゼ活性を導入する利点と共に
考察する。
B.序論
植物細胞へ遺伝子搬入するのに粒子衝撃を用いるときは、導入遺伝子DNAが
無作為にゲノム中に、一般には多くのコピーを含む単位部位に入り込む(クライ
ン(Klein)ら、1988;クラインら、1989;ゴードン−カム・ダブリュ
・ジェイ(Gordon-Kamm W.J.)ら、1990;バジル(Vasil)ら、199
2;ワン・ワイ(Wan Y.)およびルモー・ピー(Lemaux P.)、1994)。導
入遺伝子の編成、挿入位置、時に認められる高コピー数などが幾つものメカニズ
ムによる発現を不安定なものとする:例えば、導入遺伝子の複数コピーが相互作
用して、アンチセンスまたはメチル化あるいはまだよく解明されていない他の“
沈黙”のメカニズムにより互いに不活性化する(総説:マツケ・エム(Matzke
M)およびマツケ・エイ(Matzke A.)、1995)。導入遺伝子の複数コピー
は単一挿入部位に連結するので、減数分裂を経て引き続き植物の生成に至る過程
でコピー数を減少させることはできない。導入遺伝子発現の基礎研究のために、
また農業的応用において導入遺伝子作物植物の商業生産にとって、導入した遺伝
子の編成と発現における改良は優先順位が高い。部位特異的組換えシステムは、
導入遺伝子の挿入パターンを単純化すること、および植物ゲノム中であらかじめ
定められた部位にそれらを振り向けることの有用な手段となり得る(アルバート
(Al
bert)ら、1995)。
数種の部位特異的リコンビナーゼが植物細胞中で活性であることが示されてい
る(総説参照:オーデル(Odell)およびラッセル(Russell)、1994):バク
テリオファージP1のCre/loxシステム、サッカロマイセス・セレビシエ(Sac
charomyces cerevisiae)の2μプラスミドからのFLP/FRT組換えシステム
、およびザイゴサッカロマイセス・ルークシー(マツザキら、1988)のpS
R1プラスミドからのR/RSシステム。これらのシステムは簡単な故に利用度
の高いものである;完全に操作する場合であっても、それらが必要とするのは単
一のリコンビナーゼタンパク質(Cre,FLP,R)およびその対応する標的、
すなわち、短い所定の組換え部位(それぞれ、lox,FLP,RS)である。更
に、これらの組換え頻度は著しく高い。リコンビナーゼはその組換え反応により
、認識部位の位置と方向に依存して三種のDNA再編成を媒介する。もしDNA
フラグメントが互いに逆方向の関係にある二つの部位に結合したならば、介在し
たDNAの反転が起こる。もし二つの認識部位が同一方向にあるとすれば、介在
DNAの切除と環状化が起こる。認識部位が別のDNA分子上にあるときは、遺
伝子の交換が起こり、もし一方が環状であれば、その分子は他の分子に直鎖状に
組込まれることになる。
部位特異的リコンビナーゼ活性は簡易化するのに用いることができる;また標
的導入遺伝子を植物に導入することができる。しかし、もしこの活性が持続する
ものであれば、組換え構造が不安定なものになりかねない。それ故に、リコンビ
ナーゼ活性を一過性のものとして発現させることが望ましい。これは最近の研究
で達成されたことであるが、そこではlox-含有導入遺伝子を、Creを発現するト
ランスジェニック植物(アルバート(Albert)ら、1995)中のlox部位に標
的として組込んだことを証明している。lox部位はプロモーターとcre遺伝子のコ
ード領域とのあいだに位置しているので、部位特異的組換えの結果はCre発現を
不活性化し、生成物を安定化した。実験した全ての組込み結果は、サザン・ハイ
ブリダイゼーション分析に基づくと単一コピーであった。本研究で我々はバイオ
リスティック遺伝子搬入法を使用するためにR/RS部位特異リコンビナーゼシ
ステムを適応した。R/RSシステムはタバコで効果的に作用することが示され
ている:R遺伝子を一過性に原形質体に形質転換すると、その遺伝子産物は、D
NAの部位特異的反転または切除により潜在性グルクロニダーゼ遺伝子となった
(オノウチら、1992)。我々がここに証明するのは、バイオリスティック処
理によりトウモロコシおよびタバコ細胞に搬入したR-リコンビナーゼは、効率
は低いが(効率はパラメーターを最適化することで増加させ得た)同様に作用し
、そのプロモーターを刺激して潜在ルシフェラーゼ遺伝子を始動させるというこ
とである。更に、リコンビナーゼを産生するにはNAよりもむしろmRNAを使
用すると、DNA基質を細胞中に導入した後、迅速にそれを産生するようになる
が保証される。標的RS-部位は3bpの不斉コアにより隔てられた一対の14bp
逆方向反復配列からなる31bpのパリンドローム・ヌクレオチド配列を含んでい
る(マツザキら、1988)。トランスジェニック植物の生産のためには、R−
遺伝子が植物ゲノムに挿入されるのを避けるために、そして形質転換の初期段階
においてリコンビナーゼの発現が一過性でのみ起こるように、DNAよりもむし
ろリコンビナーゼmRNAを利用するのが望ましい。我々が以下に記載するのは
、R−リコンビナーゼをコードするmRNAを標的RS−含有潜在ルシフェラー
ゼDNA構築物と共に同時導入する方法であって、それによってルシフェラーゼ
遺伝子発現を活性化する一過性リコンビナーゼ活性を得た。
C.材料と方法
1.植物材料トウモロコシ細胞
トウモロコシ(ジー・メイズ・エル;Zea mays L.)の懸濁培養はB73関
連選択株の未成熟胚から選択した凍結保存胚芽タイプIIカルスから開始した。凍
結保存カルス(ディマイオ(DiMaio)およびシリート(Shillito)、1992)
を急速融解し、その約1gをスクロース30g/lおよび2,4−ジクロロフェノキ
シ酢酸(2,4−D)(2N63S)添加N6液体培地(チュウ(Chu)ら、19
75)50mlに加えた。培養物を暗所25℃、オービタル・シェーカー150rp
mの条件で培養した。懸濁培養物は、7日ごとに充填細胞量2mlを2N63S液
体培地に移すことによって継代培養した。
細胞200mgを含む培養物を滅菌デュラポアー・フィルター上に拡散し、浸透
圧調整剤として12%スクロース添加培地2N6上に置いた。平板化した細胞を
衝撃処理に先立ち、4時間室温に保持し、衝撃後には24時間まで保持した。タバコ細胞
ニコチアナ・タバクム(Nicotiana tabacum)細胞株NT−1(アン(An)
、1985)を、2,4−D2mg/lおよびスクロース30g/l添加ムラシゲ−スク
ーグ(Murashige & Skoog,1962)培地上で生育した。細胞は、500ml
フラスコ中接種材料5mlを新鮮な培地100mlに加えることにより週に一度継代
培養した。フラスコをロータリー・シェーカー上125rpm、27℃で培養した
。継代培養の4日後、細胞の一部0.5mlを無菌フィルター(ワットマンNo.4
)上に拡散した。次いで、フィルターを12%スクロース添加MS培地に移し、
衝撃処理前には4時間室温に保持し、衝撃処理後は24時間まで保持した。
2.プラスミド
T7LUCA50鋳型(第4図)を構築した:これはホタル・ルシフェラーゼ
mRNAのイン・ビトロ転写のためのものである:まず、lucをT7プロモータ
ーに結合させ、次いで、T7/lucフラグメントをポリA挿入断片を含むpUC1
8に挿入した。T7プロモーターをlucコード領域に結合させるために、該T7
プロモーターをBgIIIとしてpET3(ローゼンバーグ(Rosenberg)ら、19
87)から切り出し、pUC19のBamHI部位にクローン化してpAT26を
形成させた。配列+9ないし+26をPCR介在欠失によりBamHI部位で置換
し、pAT27を形成させた。pCIB1711(第4C図、下記参照)からBam
HI/Asp718フラグメントとして切り出した35S−リーダー−ルシフェラ
ーゼをpAT27に導入して、T7Lucを形成させた。このプラスミドからのT
7/luc挿入断片をXbaI/Asp718フラグメントとしてpUC18A50Xに移
動した。pUC18A50Xはオリゴヌクレオチド対を、Asp718(5')およ
びHindIII(3')突出末端にフランクした50A−残基と共に含むpUC18誘導
体である;そのEcoRI部位を合成オリゴヌクレオチドでXbaI部位に変換し
た。
pT7RecA50(第4B図)はpUC18A50X誘導体であり、このもの
はT7プロモーター、35Sリーダー、およびそのポリA−コード領域に加えて
リコンビナーゼコード領域を含む。35Sリーダー/リコンビナーゼ・フラグメ
ントをpRec(下記参照)から切り出してBamHI/Asp 718とし、pAT2
7に連結してpT7Recを形成させる。pT7RecからのXbaI/KpnIフラグ
メントを次にpUC18A50Xに挿入してpT7RecA50を形成させた。
pClB1711(第4C図)はpClB710(ロススタイン(Rothstein)
ら、1987)の誘導体であって、pJD204(ド・ウエット(de Wet)ら、
1987)からのホタル・ルシフェラーゼ・コード領域をHindIII-BamHIと
して、5'端BamHI/PstI/HindIIIオリゴアダプターをもつpCIB710
ベクターのBamHI部位に導入し、pClB1701を形成させたものである。
得られるプラスミドの35Sプロモーター/リーダーはBamHI部位が転写開始
点に確実に位置するように、そのEcoRV-BamHIフラグメントをpDO435
(オウ(Ow)ら、1986)のものと置換することにより調製し、pClB170
0とした。pClB1700からのハイブリッド35Sリーダー(50bp)/ルシ
フェラーゼ・リーダー(22bp)をPstI部位でNarI経由luc遺伝子に移し、
58bpの35Sリーダーに相当する合成オリゴヌクレオチドおよびluc ORFの
開始点と置き換えた(参照:カロッジー(Carozzi)ら、この構築の詳細につい
ては発表準備中)。
pRec(第4D図)はpClB1711の誘導体であるが、これは35Sプロ
モーター、リーダーおよびターミネーター配列を保持し、リコンビナーゼ・コー
ド領域と置き換えたルシフェラーゼ・コード領域を有する。これを達成するため
に、pGAHR(オノウチら、1991)からのリコンビナーゼ遺伝子5'末端
をBamHI/BgIIIフラグメントとしてpSP72(プロメガ(Promega))の
対応する部位にクローン化し、ベクターXholおよび挿入フラグメントPvull部
位間のDNAをオリゴヌクレオチド:5'-TCGAGTTGCATGCAG-3'
(配列番号9)と置き換えた;その結果、リコンビナーゼの開始コドン(下線)
がSphI部位に変わった。ベクターpClB1711を同様に修飾し、35S−
リーダーの末端を以下のようにSphIと置き換えた:35Sプロモーター/リー
ダーを含むPstI/FcoRIフラグメントをpSGpoly11ベクターにサブクロ
ーン化し、BamHI部位ユニークとした。BamHI/XbaIで消化後、SphI部
位を含むリンカーを導入した:5'-GATCGCAGCATGC(CTAG)-3'
(配列番号10;括弧内はオリゴヌクレオチドの相補鎖配列を示す)。得られた
修飾PstI/EcoRIフラグメントは3−経路連結反応によりpClB1711バ
ックボーンに復元した。続いて、内部SphI部位であるという理由で、二つの連
続した連結反応において、リコンビナーゼ遺伝子を導入し、luc遺伝子に置き換
えた。
p1RSLuc(第4E図)はpClB1711の誘導体であって、31−bp R
S部位をルシフェラーゼ遺伝子の35S−プロモーターと35Sリーダーの間に
挿入したものである。HindIIとPstI部位間のプロモーターを先ずpSGpoly7
にサブクローン化してpSG35Sを形成させ、次いで、ユニークBamHI部位
に、RS(太字)およびHindIII(下線)をもつ下記の配列に相当するオリゴ対を
連結させた:
5'-GATCAAGCTTTTGATGAAAGAATACGTTATTCTT
TCATCAA(GATC)-3'(配列番号11)
挿入したオリゴ体を上に示したように時計回りであるように配列して決めたクロ
ーンを選択し、そのRS-含有XbaI/PstIサブフラグメントを3経路連結反応
によりpClB1711バックボーンに復元し、p1RSLucとした。
p2RSLuc(第4F図)はpClB1711の誘導体であって、反対方向35
Sプロモーターの両側に合成RS部位を導入してあり、かつ、luc遺伝子の残余
部分に関して35Sプロモーター全体が逆になっているものである。上記の35
S−プロモーター・サブクローンpSG35S をHindII/XbaIで消化し、R
S(太字)およびPstI部位(下線)をもつ下記配列に相当するオリゴ対を導入
した:
5'-AGCTACTGCAGTTGATGAAAGAATACGTTATTCT
TTCATCAA(CTAG)-3'(配列番号12)
得られるクローンをBamHIで消化し、RSの二番目のコピーを前段に記載した
オリゴ対に連結反応により導入した。クローンは、第二RS部位の方向が第一の
ものと反対のものを選択した(すなわち、5'-GATCAAGCTTTTGAT
GAAAG-AATACGTTATTCTTTCATCAA(GATC)-3'(配
列番号13)は時計回りと反対方向だった)。パリンドロームRS配列の方向は
下線の中心不斉トリヌクレオチドCGT(または他鎖のACG)により明確にし
た。得られた2RSプロモータークローンから、HindII/PstIフラグメントを
切り出し、2経路連結反応によりpClB1711に復元し、35S−プロモータ
ー・フラグメントの方向を逆転してp2RSLucを形成した。
3.mRNAの合成
T7LucA50およびT7RecA50プラスミド(第4Aおよび4B図)を、
ポリ(A)伸長部の直下流で切断するHindIIIにより直鎖状化した。直鎖状化した
DNAをフェノール/クロロホルムで抽出し、次いで、エタノール沈殿した。直
鎖状化したDNAをイン・ビトロ転写するに当たり、[m7G(5')ppp(5')]を
含むT7キャップ−スクライブ(Cap-Scribe)キット(ベーリンガー)からの
T7ポリメラーゼを使用した。幾つかの実験では、転写産物を直ちにRNA分解
酵素(RNase)不含デオキシリボヌクレアーゼ(DNase)(0.03u/ml、ウ
オーシントン・バイオケミカル(Worthington Biochemical)でrRNアシン(r
RNasin;プロメガ(Promega))(1u/ml)の存在下37°5分処理した;最後
に、フェノール/クロロホルムで抽出し、次いで、エタノール沈殿した。mRN
Aの完全度および濃度をアガロースゲル電気泳動法により定量した。
4.バイオリスティック供給体の滅菌
金粒子(1.0μm−バイオラッド(Biorad)、0.3μm−ヒレウス(Herae
us))を滅菌するに当たり、粒子60mgを100%エタノールと0.1%DEP
C中に入れた。粒子をRNA分解酵素不含水で3度すすぎ、RNA分解酵素不含
水1mlまたはRNA分解酵素不含50%グリセリン溶液1mlに再懸濁した。調製
した粒子50μl部を6回のショットに用いた。マクロキャリアーを100%エ
タノールと0.1%DEPCに浸漬し、100%エタノールにより3回すすぎ、
風乾した。ストップスクリーンはオートクレーブ処理した。
5.核酸沈着
バイオラッド(BioRad)の指示書に従い、DNAを金粒子(60mg/ml)懸
濁液50μlに沈着させた。mRNAをテキストに示された種々の条件下で金粒
子懸濁液50μlに沈殿させた。全ての沈殿剤はRNA分解酵素不含であり、連
続的に攪拌しながら4℃で金粒子懸濁液に加えた。全試薬を添加したのち、3分
間攪拌を続け、次いで、簡単なミクロ遠心分離(1分)により沈積した。上清を
除き、粒子を冷却100%エタノールで1度洗浄し、100%エタノール60μ
lに懸濁した。この混合物を攪拌し、10μl部をピペットでマクロキャリアーデ
ィスク上に移し、層流フード中風乾した。
6.植物細胞へのマイクロプロジェクタイル搬入
マイクロプロジェクタイルを粒子加速器(PDS−1000/He装置)により
、発射装置から5.5cmの位置に据えた1100−1550psi破砕サンプルディ
スクを用いて植物細胞に搬入した。100μmメッシュのステンレス・スクリー
ンを停止板と組織の中間位置に置いた。標的プレートを1回(タバコ細胞)また
は2回(トウモロコシ細胞)投射処理した。
7.ルシフェラーゼ・アッセイ
ルシフェラーゼをプロメガ(Promega)のルシフェラーゼ・アッセイ・システム
により供給業者の推奨に従い、組織抽出物としてアッセイした。ルシフェラーゼ
活性をアナリティカル・ルミネッセンス・モデル2001ルミノメーターにより
検出し、25℃で10秒間集積した光単位で表した。比活性を算出するために、
タンパク質濃度をバイオラッド・タンパク質・アッセイ・キットにより定量した
。
D.結果
1.金粒子上未処理mRNAの沈着
mRNA搬入および続く発現を最適化するために、mRNAを金粒子に沈着さ
せる幾つかの方法を検討し、沈着物および上清中のmRNAの状態および回収率
をアガロースゲル電気泳動法により分析した。各フラクションを“上清”(最初
の沈殿反応から直接ピペット分離した)、“金”(mRNA沈積後水中に懸濁し
た金)および“水溶出物”(mRNA被覆金粒子を水に懸濁し、遠沈した後の上
清)と名付けた。水溶出物は、植物細胞に搬入後、沈着したmRNAがどの程度
直ぐに再溶解したかを定量するために試験した。
デュポンのDNA沈殿法を1.0M CaCl2および16mMスペルミジンの条件
で実施したが、mRNAは酷く分解した(データ非開示)。スペルミジン遊離塩
基がRNAをアルカリ水解してしまうらしい。そこで、スペルミジンを用いず、
CaCl2を種々の濃度とし(1.0M,0.3Mおよび0.07M)、mRNAを金
粒子に沈着させてみた。1.0M CaCl2が優れた結果を与え、RNA付着金粒
子を1.0M CaCl2中−20℃で一夜培養すると、効率が90−100%に改
善されることが分かった。2度エタノール洗浄した粒子は、1度のみのものより
もより容易にmRNAを水溶出物中に溶出した;これは多分CaCl2が除去され
たためである。
2.バイオリスティック搬入後のルシフェラーゼmRNAの一過性発現
この方法で金粒子に沈着させたmRNAがバイオリスティック搬入過程を無事
通り抜け、植物細胞中で一過性に機能し得るかどうかを調べるために、イン・ビ
トロ合成したルシフェラーゼmRNAを植物細胞に搬入した。CaMV35Sリ
ーダー配列および50アデニレート残基を有するポリ(A)末端部を、植物細胞中
でルシフェラーゼ発現が増強されるようにT7LucA50鋳型構築物に包含させ
た。キャップ形成ルシフェラーゼmRNAを金粒子上に1.0M CaCl2で沈着
させ、−20℃で一夜培養した;この粒子をトウモロコシおよびタバコ懸濁細胞
中で衝撃処理した。ルシフェラーゼ・アッセイは搬入後、2、6および24時間
目に実施した。結果を下記第3表に示す。2時間目まで、有意なルシフェラーゼ
活性が検出された。活性は6時間目まで増加したが、24時間目までには減少し
た。これに対して、バイオラッドDNA処方により金粒子に沈着した35S−ル
シフェラーゼ遺伝子(pCIB1711)を含むDNAプラスミドの一過性発現
は、24時間目で最大であった。
3.R/RSリコンビナーゼ・システムがトウモロコシ中で機能していること;
逆方向プロモーターーがルシフェラーゼ一過性発現を始動させることの証明
部位特異的リコンビナーゼシステムR/RS(ザイゴサッカロマイセス・ルク
シー(Z.rouxii)から)が、タバコで機能すると報告されている(オノウチら
、1991)ようにトウモロコシ中でも機能するか否かを試すために、二重の一
過性発現アッセイを用いた;そこでは、トウモロコシ細胞中一過性発現するR−
リコンビナーゼは、同時搬入した潜在性ルシフェラーゼ遺伝子を一過性発現させ
るために、プロモーターのフリップを必要とする。陽性の対照として、二重アッ
セイをタバコ細胞で試験した。マイクロプロジェクタイル衝撃処理により、35
S
−リコンビナーゼ遺伝子含有pRecプラスミド(第4D図)を潜在性ルシフェラ
ーゼプラスミドp2RSLuc(第4F図)と共にトウモロコシ細胞に同時搬入し
た。p2RSのプロモーターをフリップすると、プロモーターとluc発現の効果
が未知のluc遺伝子との間に起こるRS(31bp)のコピーを止めてしまう。そこ
で我々は陽性対照プラスミドを構築した;それ故、p1RSLucを構築し(第4
E図)、リコンビナーゼにより反転したp2RSLucの産生を予想どおり促進し
た。p1RSLucはCaMV35Sプロモーターを、正しい向きではあるが、リ
ーダーとルシフェラーゼ・コード配列からRS部位一個分隔てて含んでいる。p
1RSLucはタバコおよびトウモロコシの両方でpClB1711と同様のレベル
で発現することが判明した(データ未開示);該遺伝子のRS“フットプリント
”はluc発現への影響がほんの僅かである。
p2RSLucおよびpRecの混合物、ならびに対照プラスミドp2RSLuc単独
、p1RSLucおよびp1RSLucプラスpRecを、バイオラッド(BioRad)プ
ロトコールにより金粒子上に沈着させ、タバコおよびトウモロコシ細胞に向け衝
撃処理した(第4表)。R-リコンビナーゼはタバコにおいてluc遺伝子を少なく
とも4%の効率で24時間まで刺激したが(26,000 vs 597,000光単
位/μgタンパク質)、その過程はトウモロコシでは効果の発現が非常に低く、効
率は高々0.27%であった(53 vs 20,000光単位/μgタンパク質)。ト
ウモロコシで検出された非常に低い活性は実際には有意であり、再現性もあるこ
とが判明した。この実験でトウモロコシ中のリコンビナーゼ活性を制限する特徴
は、核内の事象(遅い転写、偽スプライス部位、mRNAが核外へ出ることがで
きない)または細胞質の事象(翻訳停止、希コドンの使用、mRNAの不安定、
など)である。もし問題が核にあるとすれば、それはリコンビナーゼmRNAの
バイオリスティック搬入により回避できると期待した;それは多分転写物を直接
細胞質に導入するはずである。
ザイゴサッカロマイセス・ルークシー(Z.rouxii)リコンビナーゼの標的部位
は、ここに採用した31bpのパリンドローム配列を含む58bp領域(マツザキら
、モレキュラー・アンド・セルラー・バイオロジ(Molecular and Cellular
Biology)8、955−962(1988))にあらかじめ狭んでおく。我々の結
果は、我々の潜在ルシフェラーゼ構築物のプロモーターをR−遺伝子介在フリッ
ピングに付せば、31bpパリンドロームで十分であるということを示している。
このように、この短縮したRS配列は、タバコおよびトウモロコシの両方で部位
特異的組換えを行うのに十分である。
4.リコンビナーゼmRNA活性を経るルシフェラーゼDNAの一過性発現
リコンビナーゼmRNAはRNA回収に好適な条件、1.0M CaCl2および
−20℃一夜培養で、p2RSLuc DNAと共に金粒子上に共沈殿させた。粒子
をトウモロコシ細胞に衝撃処理し、ルシフェラーゼ活性を2時間および24時間
後に測定した。結果を下記第5表に示す。ルシフェラーゼ発現は衝撃処理後2時
間では無視し得るものであった。24時間では、ルシフェラーゼ発現がmRNA
リコンビナーゼ処理および2RS潜在性ルシフェラーゼプラスミドに作用する3
5S−リコンビナーゼDNAの双方において明白であった。反転反応が平衡に近
付くに従って、プロモーターの配向が50%オンおよび50%オフの安定した状
態になる。予測し得るルシフェラーゼ発現の最高レベルは、p1RSLuc活性レ
ベルの50%となるはずである。mRNA−駆動フリッピングは理論上最高値の
67%という驚く程高い効率で達し得た。DNA−駆動反転の効率もまた有意に
改善されたが、p1RSLuc発現の極端に低いレベルが示すのは、mRNA用に
開発した沈殿法がDNAにとって非常に効果があったということであった。それ
故に、DNAおよびRNAの両方にとって効果のある最適妥協点を求めるために
更に沈殿条件を検討した。
5.mRNAおよびDNAを金粒子上へ効率的に共沈着
DNAとmRNAとを同時搬入する効率を改善する努力過程で、我々は沈殿混
合物中にスペルミジンを用い再試験した;しかし、そこではpHを下げ、RNA
の分解をできるだけ避けるためにトリス・バッファーを添加した。50mMトリ
ス・バッファーpH7.5の存在下で、1.0MCaCl2および2、4、10また
は16mMスペルミジンを用いるとき、DNAおよびmRNAは粒子上に共沈着
した。核酸の沈着効率を上記のようにアガロースゲル電気泳動法により試験した
。未処理DNAおよびmRNAが全てのスペルミジン濃度において効率的に粒子
上に沈着した(データ非開示)。最低濃度ではより多くのDNAおよびmRNA
が
粒子から離れて水中に再溶解した;これが一過性発現および安定な形質転換のた
めに利点となる可能性がある。
最終の精製において、我々はトリス・バッファーの濃度を変え、生物活性の基
準により効能をテストした:2mMスペルミジンを5mM(処理A)または50
mM(処理B)トリス・バッファーpH7.5と共に用い、Luc mRNAを沈着
させ、トウモロコシ細胞中に衝撃処理した。衝撃処理後5時間目で、処理Aおよ
び処理Bで一過性発現レベルがそれぞれ1,091および8,000光単位/μgタ
ンパク質であった。50mMトリスを用いて達成したより高いmRNA活性は、
以前の沈殿条件、1.0M CaCl2、−20℃一夜培養(第1表)におけるより
も3〜4倍の改善が見られる。
処理AおよびBは、トウモロコシおよびタバコ細胞に衝撃処理したp2RSLu
c DNAと共にリコンビナーゼmRNAを沈着させるのに用いた。ルシフェラー
ゼ活性を24時間目に測定し、その結果を下記第6表に示した。DNA発現が5
mMおよび50mMトリスにより改善された;しかし、そのレベルはバイオラッ
ドの沈殿手法を用いて達成したレベルには達しなかった(第4表)。mRNA発
現に好適な条件、50mMトリスは最高の効率を与え、そのリコンビナーゼ活性
はトウモロコシおよびタバコで、それぞれ18.9%および9.4%であった。リ
コンビナーゼ効率は第5表に示したものよりも低いが、DNA発現のより高いレ
ベルは安定な形質転換を達成するのに重要である。我々の結論は、スペルミジン
濃度を低くし、トリスで緩衝化することがRNAで使用可能であり、DNAの発
現を改善し得るということである。
E.考察
我々はここに粒子衝撃処理によりmRNAとDNAを同時搬入する方法を発表
する;この方法はDNA分子上のmRNAをコードするタンパク質を一過性に作
用させることができる。mRNAおよびDNAを同時搬入することは、安定な形
質転換から生じる永続的発現の可能性なしにトランス作用機能を細胞内に導入す
ることを可能とする。mRNAをコードするリコンビナーゼは搬入時間という短
期間に、一過性に活性なだけである。このやり方は供与体DNAを、得られる植
物中でリコンビナーゼ発現というやっかいな問題を起こさずに、植物ゲノム中の
RS部位に部位特異的に導入するのに用いることができる。アガロースゲルおよ
びルシフェラーゼ発現の研究は、両方ともに、DNA搬入に好適な条件はmRN
Aにとっても最適というものではなく、その逆もそうであるということを示して
いる。異なる沈着条件を選ぶことによって、標的植物細胞中の再編成DNAの最
適レベルを達成するために、二つの内のいずれかを有利とすることができる。沈
着後の金粒子上核酸を電気泳動により分析する方法は、異なる沈着条件の効率を
定性的もしくは定量的に評価する簡潔な手段であると証明した。この手法は粒子
衝撃による核酸の搬入条件を更に磨き上げる探索研究に用いることができる。し
かし、電気泳動法は全体的な損傷を検出するだけなので、最終的診断は生物活性
によらなければならない。
この研究において外から導入したmRNA分子は、効率的な転写発現の役割を
果たすことが分かっている3つの特徴もつように設計した。翻訳において初期の
本質的段階である真核細胞開始因子を結合するための認識部位として作用するよ
うに、5'末端にキャップを加えた。非アデニル化mRNAは電気穿孔したタバ
コ、ニンジン、トウモロコシおよびコメのプロトプラストにおいて、そのアデニ
ル化した対照物よりも約100ないし200倍翻訳効率が低いので、イン・ビト
ロ転写に際し50個のアデニル化残基ポリ(A)端末を3'末端側に合成導入した
(ガリー(Gallie)ら、1989、植物細胞)。ポリアデニル化mRNAの効
率もまた、5'キャップの存在下大きさの順に増大することが示されている(ガ
リー、1991)。CaMV35Sの非翻訳リーダー配列はタバコとトウモロコ
シの両方に関与し、その発現を増大させることが示されている(ガリーら、19
89、植物細胞;ドウソン・デイ(Dowson Day)ら、1993)。
mRNAを植物細胞に直接搬入するのは細胞機能の研究に利益を与える。mR
NAの安定性と翻訳効率を、転写因子、処理工程および細胞質への移送とは別に
イン・ビボで実験することができる。エレクトロポレーション(電気穿孔法)(
ヒッグス(Higgs)およびコルバート(Colbert)、1993)およびポリエチレン
グリコール(ガリー、1993、植物細胞レポート)はmRNAを植物プロトプ
ラストに導入する有用な効率的方法であることが証明されている。しかし、これ
らの搬入方法はプロトプラストに限られるが、バイオリスティック搬入法は多く
の種類の植物細胞および器官に広く適用し得る。形質転換した植物中で安定的に
発現したときに不利益となるかあるいは非常に有害であるようなタンパク質は、
バイオリスティック手段により搬入したmRNAから一過性発現させることがで
きる。例えば、R/RS植物でのリコンビナーゼ発現は、丁度、リコンビナーゼ
遺伝子含有植物と標的部位含有植物との間に起こる遺伝的交差がキメラ組換え活
性とF1植物でのモザイク発現に至るように、切り出しのモザイク・パターンと
することができた(ラッセル(Russell)ら、1992;オノウチら、1995)。
作物植物で成功裏に改良したトランスジェニック構築物を生産するために、こ
のR/RSシステムを用いて、もとの植物の確実な位置に一種または複数種の新
しい遺伝子を置換することができる。このように、第一のトランスジェニックカ
セットおよびその選択マーカー(RS部位の両側に配置)は、異なる選択マーカ
ーと共に第二のものと置換することができる。第二のものは、順々に、もう一度
第一の選択可能マーカーを用いて第三のものと置き換え得る。この手法は必要と
する選択マーカーの数を減らすことになるし、トランスジェニックカセットにも
とづく位置効果変動を避けることにもなる。
部位特異的組換えシステムを植物中で使用すると、導入遺伝子の挿入および発
現の制御が容易になる可能性が高い。リコンビナーゼ・システムはゲノムのあら
かじめ定めた場所に挿入するのを可能とし、いわゆる“位置効果”を回避できる
(フクシゲおよびサオアー(Sauer)、1992;ラクソ(Lakso)ら、1992
;オーゴーマン(O'Gorman)ら、1991)。リコンビナーゼ介在の導入遺伝子
欠失および逆位事象は、遺伝子発現の制御および選択マーカー遺伝子の除去を可
能にする(総説として参照:オーデル(Odell)およびラッセル(Russell)、19
94)。リコンビナーゼ活性をmRNAの形で導入すれば、形質転換過程の初期
に組換え事象を発生させ、モザイク化の危険を減少させることによってその利用
範囲を拡大することができる。更に、mRNA搬入は、リコンビナーゼ遺伝子情
報がゲノムに導入されるのを避ける部位特異的組込みの図式を設計するのに非常
に大きな自由度を与えるようになる。
実施例4:組込み促進タンパク質VirD1およびVirD2をコードするmRNA
とDNAとをタバコおよびトウモロコシ細胞に共衝撃処理
発明の詳細な説明で述べたように、翻訳可能なRNAを経由する形質転換の標
的とされる真核細胞に搬入した組込み促進タンパク質は、翻訳可能RNAが分解
するまでの一定時間、産生されることが期待される。このRNAが産生するタン
パク質は、それが通常の細胞内過程を経て分解されるまでの一定時間、植物細胞
中に留まることが期待される。このように、組込み促進タンパク質を翻訳可能な
RNAの形で搬入することは、そのようなタンパク質を一時的に搬入する方法の
代表である。このようなタンパク質の一過性搬入は、そのタンパク質が継続して
存在すると望ましくない効果を示す可能性のある場合に好ましい。以下の実施例
では、VirD1およびVirD2タンパク質をT−DNA境界に結合させたDNA
フラグメントと共に植物細胞に搬入する手法について記載する。報告された結果
では、これらのVirタンパク質が産生されて、関連する組込み促進活性を該DN
Aフラグメントに与えたとしている。
使用した植物材料:
トウモロコシ細胞:
B73に関連する選択株(2717)の未成熟胚から選択した凍結保存胚発生型
IIカルスからトウモロコシ(Zea mays L.)を起こし、その懸濁培養物をスク
ロース30g/lおよび2,4−ジクロロフェノキシ酢酸(2,4−D)(2N63
S)添加N6液体培地(チュー(Chu)ら、1975)で生育させた。培養物を暗
所、25℃オービタル・シェーカー150rpmで培養した。懸濁培養物を7日ご
とに、充填細胞量1mlを新鮮な2N63S液体培地に移すことにより継代培養し
た。衝撃実験に使用するトウモロコシ細胞懸濁液は3日齢の急速生育培養物から
採取した。衝撃処理する前に、約0.5mlの充填細胞量を7−cmのフィルター(
ワットマンNo.4)上に減圧濾取した。
タバコ細胞:
ニコチアナ・タバクム(Nicotiana tabacum)細胞株NT−1を2,4−D 2
mg/lおよびスクロース(30g/l)添加ムラシゲ−スクーグ(Skoog)培地中で生
育させた。細胞を、500mlフラスコ中接種材料5mlを新鮮な培地100mlに加
えることにより週に一度継代培養した。フラスコをロータリー・シェーカー12
5rpm、27℃で培養した。継代培養の4日後、細胞の一部0.5mlを無菌フィル
ター(ワットマンNo.4)上に拡散した。次いで、フィルターをMS培地に移し
た。
プラスミド構築:
1− T7プロモーターおよびポリA末端含有ベクターの構築:
ポリリンカー(SphI-EcoRI-NheI-ClaI-BgIII-Asp718-HindIII
-Xhol-Hind*III;HindIII部位を不活性化する)をpT7RecA50(実施例3
参照)のSphI-HindIII部位に挿入した。次いで、オリゴAsp718-A(50)
-DraI-HindIIIをpT7-A50を起こす対応部位に挿入した。
2− pT7D1A50の構築:
以前にpSG5(p35Sadh1D1のEcoRI−BamHIフラグメントから)
のEcoRI-BamHIにクローン化したvirD1コード領域を含むEcoRI-BgII
Iフラグメントを、EcoRIおよびBgIIIで消化したpT7-A50に挿入した。
3− pT7D2A50の構築:
virD2コード領域の二つのフラグメント、EcoRI-BamH1(5'−末端)お
よびBamI-ClaI(3'−末端)をpT7-A50のEcoRI-ClaIにクローン化
した。3'−末端をBamHI-ClaIフラグメントに変換するために、まず3'−
末端をpブルースクリプト・プラスミドpSKのBamHI-EcoRVにBamHI-
HaeIIIフラグメントとしてクローン化した。
mRNAの合成:
T7D1A50およびT7D2A50プラスミドを、ポリ(A)伸長部の直下流
で切断するXhoIにより直鎖状化した。直鎖状化したDNAをフェノール/クロ
ロホルムで抽出し、次いで、エタノール沈殿した。直鎖状化したDNAをイン・
ビトロ転写するに当たり、[m7G(5')ppp(5')]を含むT7キャップ−スクラ
イブ(Cap-Scribe)キット(ベーリンガー)からのT7ポリメラーゼを使用し
た。VirDaおよびVirD2をコードするmRNAの完全度および濃度をアガロ
ースゲル電気泳動法により決定した。
バイオリスティック供給体の滅菌:
金粒子(0.3μm−ヒレウス(Heraeus))を滅菌するに当たり、粒子60m
gを100%エタノールと0.1%DEPC中に入れた。粒子をRNA分解酵素不
含水で3度すすぎ、RNA分解酵素不含50%グリセリン溶液1mlに再懸濁した
。調製した粒子50μl部を6回のショットに用いた。マクロキャリアーを10
0%エタノールと0.1%DEPCに浸漬し、100%エタノールにより3回す
すぎ、風乾した。ストップスクリーンはオートクレーブ処理した。
核酸沈着:
DNA(1μg)およびmRNA(約8μg;4μg virD1および4μg virD
2または対照として8μg非特異性mRNA)を金粒子(60mg/ml;0.3um)
懸濁液50μl中に、トリス・バッファー(1M)0.5μl、CaCl2(2.5M)
50μlお
よび0.1Mスペルミジン2.5μlを連続して加えることにより沈着させた。全
試薬を添加したのち、3分間攪拌を続け、次いで、簡単なミクロ遠心分離(1分
)により沈積した。上清を除き、粒子を冷却100%エタノールで1度洗浄し、
100%エタノール60μlに懸濁した。この混合物を攪拌し、10μl部をピペ
ットでマクロキャリアーディスク上に移し、層流フード中風乾した。
植物細胞へのマイクロプロジェクタイル搬入
マイクロプロジェクタイルを粒子加速器(PDS−He 1000;デュポン)
により、発射装置から5.5cmの位置に据えた1100psi破砕サンプルディスク
を用いて植物細胞に搬入した。100μmメッシュのステンレス・スクリーンを
停止板と組織の中間位置に置いた。標的プレートを2回投射処理した。
ルシフェラーゼ・アッセイ
ルシフェラーゼをプロメガ(Promega)のルシフェラーゼ・アッセイ・システ
ムにより供給業者の推奨に従い、組織抽出物としてアッセイした。ルシフェラー
ゼ活性をアナリティカル・ルミネッセンス・モデル2001ルミノメーターによ
り検出し、25℃で10秒間集積した光単位で表した。比活性を算出するために
、タンパク質濃度をバイオラッド・タンパク質・アッセイ・キットにより定量し
た。
結果:
ルシフェラーゼのアッセイを衝撃処理24時間後に実施した。virD1およびv
irD2のmRNAを、35Sプロモーターとルシフェラーゼ・コード配列との間
に挿入した右境界配列を含むp35SRBLucと共に同時衝撃処理した。対照実
験においては、p35SRBLucを非特異的mRNAと共に衝撃処理した。最初
の実験結果を下記第7表に開示する。続く実験結果は実施例8に記載し、第14
表に開示する。
結論:virD1 mRNAおよびvirD2 mRNAをpRB(+)Luc DNAと共に
同時搬入した後、この実験ではルシフェラーゼ活性が50%低下するのを観察し
た(第7表)。mRNAとして植物細胞に搬入した二種のvir遺伝子は相乗作用
を示すように思われた。これらの観察は、ルシフェラーゼ活性に低下が見られた
のは、virD1およびvirD2タンパク質が右境界配列に鎖特異的ニックを入れた
結果であることを強く示している。
実施例5:インプランタ(in planta)で産生したトウモロコシゲノムにおけるT
鎖組込み
要約
この明細書で「アグロリスティック(agrolistic)」と称する新規植物形質転換
技術が開発されたことにより、T−DNA挿入体の場合と同様、ベクター配列を
伴わない、対象となる遺伝子のみの組込みおよびコピー数の制御が可能となった
。この方法では、選択マーカーにフランクしているT−DNA境界配列を含むベ
クターと共にバイオリスティック(biolistic)装置により同時搬入(codelivered
)されるビルレンス遺伝子の植物発現カセットを使用する。この試験では、小麦
萎縮ウイルス(WDF)が、植物発現可能なビルレンス遺伝子(virD1、virD
2およびvirE2)および左右境界配列にフランクさせた選択マーカーをトウモ
ロコシ細胞へ導入するための複製ベクターとして選択された。virD1およびvir
D2遺伝子産物は、実際にインプランタでT−DNA境界配列を切断し、バイオ
リスティック搬入後にT−DNA型挿入事象(「アグロリスティック」事象)を
誘発し得ることが見いだされた。
序論
アグロバクテリウムは、形質転換による植物細胞の遺伝子操作または遺伝子工
学用の手段として広く使用されている。その病原性プラスミドの特定領域T−D
NAを転移させ、植物ゲノムへ安定した状態で組込む。T−DNAは、境界配列
と呼ばれる25塩基対の直列反復配列により範囲が定められている(再検討のた
め、ズパンおよびザンブリスキ、1995参照)。T−境界間に位置するDNA
配列があればそれらは全て、アグロバクテリウムから植物細胞へ有効に移行され
得る。しかしながら、T−DNA導入および組込みは、細菌の宿主範囲によって
制限されており、ほとんどの双子葉植物については有効に形質転換し得るが、単
子葉植物については僅かに過ぎない(再検討のため、チルトン、1994)。
アグロバクテリウムの限られた宿主範囲から生じるギャップを埋めるため、単
子葉植物の遺伝子形質転換の有効な方法を見いだすことが望ましい。可能な一方
法は、複合体の再構築に必要な手段を全て植物細胞に供給することによりインプ
ランタでT−複合体を産生させることから成る。それらの手段は、1)境界配列
にフランクさせた対象の遺伝子、および2)植物発現カセットの制御下にあるビ
ルレンス遺伝子である。virD1およびvirD2遺伝子産物は、T−DNAプロセ
ッシングの重要段階に不可欠である(再検討のため、ズパンおよびザンブリスキ
、1995参照)。virD2は鎖特異的エンドヌクレアーゼであり、virD1に補
助されると境界配列を特異認識する。切断下において、virD2は、一本鎖DN
AまたはT−鎖の5'末端に共有結合したままである。T−鎖は、一本鎖結合性
タンパク質virE2により保護される。産生した核タンパク質複合体は、植物細
胞へ移出される。virD2は、T鎖を植物細胞核中へ導く核局在化シグナルを含
む。virD2は、植物ゲノムへのT鎖の5'末端のライゲーションに関与し得る(
ティンランドら、1995)。この試験では、小麦萎縮ウイルス(WDV、ウガ
キら、1987)を植物における複製ベクターとして選択することにより、イン
プランタでのT鎖の形成および植物ゲノムへのその組込みを試験した。上記のベ
クターを使用する目的は、ジェミニウイルスを高コピー数で植物細胞核において
増殖させ、高レベル発現させることである。
原材料および方法
プラスミド(概略図については図5参照)
pClB1711は、カリフラワーモザイクウイルス35S(CaMV35S)
プロモーターにより推進される蛍ルシフェラーゼ遺伝子を含むpUC誘導体であ
る。それは実施例3に記載されている。pwiBarRBLucは、トウモロコシ浮遊
細胞の安定した形質転換用に設計されたもので、左境界配列、CaMV35Sプ
ロモーターにより駆動されるBar遺伝子(トンプソンら、1987)および右境
界配列がプロモーターおよびルシフェラーゼコード領域間に挿入されたルシフェ
ラーゼ遺伝子を含む。bar遺伝子をpClB3064(コジエルら、1993)か
らHindIII-EcoRIフラグメントとして切除した。左境界をBgIII-EcoRIフ
ラグメントとしてpBin19から切除した(ベヴァン、1984)。
pTiA6からのvirD1およびvirD2遺伝子を、まずCaMV35Sプロモー
ター(0.5kb)、Adh1第1イントロン(0.5kb)およびノパリンシンターゼ
(nos)ポリアデニル化領域(0.25kb)から成る発現ベクターpMF6(カリ
スら、1987)へサブクローニングした。pAD1187(フォーゲルおよび
ダス、1992)からの0.6kb EcoRI-PstIフラグメントおよびpAD11
90からの1.8kbフラグメントをpMF6へクローニングすることにより、そ
れぞれp35SAdhD1およびp35SAdhD2を生成した。35Sプロモータ
ー制御下でvirD1遺伝子を含むp35SAdhD1からのXbaI-NotIフラグメ
ントを、修飾pwi-11のNheI-Not部位へサブクローニングした。ポリリンカ
ー(NheI−NotI−SpeI−KnpI−BgIII)を、pwi-11(ウガキら、1
987)の唯一のBamHI-Sall部位へ導入した。35Sプロモーター制御下v
irD2コード配列を含むp35SAdhD2からのNotIフラグメントを、pwi−
11の唯一のNotI部位へサブクローニングした。virE2コード領域を、アグロ
バクテリウムTi−プラスミドpTiA6(受託番号X04784)(ウィナン
ズら、1987)の3kb XhoIフラグメントを含むpw108から切除した。pw
108の687bpのSacI-SmaIフラグメントを、まずpBluescript KS-(
ストラタジーン、インコーポレイテッド)の対応する部位へクローニングすると
、pKS3'E2が生成した。pw108からの924bp HaeIII-SacIを、pK
S3'E2からのSacI-PstI断片およびEcoRI-付着および平滑末端(5'-
AATTCATGGATCTTTCTGGCAATGAGAAATCCAGG-
3'、配列番号14)にフランクさせた1対のアニール化DNAオリゴヌクレオ
チドと合わせ、pBluescriptKS-のEcoRI-PstI部位へクローニングして
、pKSE2を製造した。次いで、全virE2コード領域を包含するXhoI-Pst
Iフラグメントを、pMF6のXhoI-PstIフラグメントへサブクローニング
することにより、p35SAdhE2を製造した。35Sプロモーター、Adh1イ
ントロン、virE2コード領域およびNosターミネーターを含むNotI-XbaIフ
ラグメントを、pwi-11のNotI-NheI部位へクローニングした。pGUSは
、CaMV35Sプロモーター制御下のβ−グルクロニダーゼ(GUS)コード
配列およびトウゴマカタラーゼ(catalse)遺伝子イントロンを含むpUC誘導体
である(オータら、1990)。
トウモロコシ浮遊細胞
ゼア・マイス品種ブラック・メキシカン・スウィート(BMS)の懸濁培養を
、30g/lのショ糖および2mg/lの2,4−ジクロロフェノキシ酢酸(2,4−
D)を補ったN6培地(チューら、1975)(2N63S)で維持した。衝撃
処理実験に使用されるトウモロコシ細胞懸濁液を、3日齢の急生長培養物から採
取した。衝撃処理前、約0.5mlの充填細胞量を、7cmフィルター(ホワットマ
ン、N°4)により真空濾過した。120g/lのショ糖を含むフィトアガー凝固
2N6培地における衝撃処理前、平板培養細胞を25℃で4時間保った。安定し
た形質転換を行うため、衝撃処理の24時間後フィルターを2N63S凝固培地
に移した。それに続いて、培養中の細胞の大多数が生長を止めるまで、増加濃度
のバスタを含む新鮮培地上でフィルターを8日間隔で移した。これは一般に8〜
10mg/lのバスタを含む平板培養における選別の4〜6週間後に行われた。次
いで、フィルター上に発生した独立カルスを、バスタ(10mg/l)を補ったフ
ィトアガー凝固培地に移した。同培地で2継代培養後、DNA単離用にバスタ(
10mg/l)を補った25ml液体培地中に約100mgのトウモロコシ細胞を接種
することにより、懸濁培養を開始した。
植物細胞の衝撃処理:
組織に金マイクロプロジェクタイルを衝撃処理すると、プラスミド混合物が沈
澱した。pGUSプラスミドDNAを一過性実験における内部対照として使用し
た。同時形質転換実験の場合、金粒子は、等質量の全プラスミドDNA(1標的
プレート当たり各プラスミドDNA0.5μg)のいずれかを担持していた。安定
した形質転換実験の場合、同時形質転換混合物は、ビルレンス遺伝子をもつプラ
スミドとbar選択プラスミドを1:1または2:1のモル比で含んでいた。1標
的プレートにつき衝撃処理されたプラスミド混合物の各アリコートは、0.4μg
の選択マーカーおよびpwi35SAdhD1およびpwiAdh35SD2および/ま
たはpwiAdh35SE2プラスミドDNAの各々0.4μgまたは0.8μgにより
構成された。適量の各DNAを、総体積10μl中で混合し、50μlの2.5モ
ルCaCl2および0.1モルのスペルミジン不含有塩基20μlにより沈澱を誘
発すると、
0.3μmの金微小担体50μl(60mg/ml)に対して沈澱が生じた。マイクロ
プロジェクタイル衝撃処理は、サンプルを停止スクリーン棚の8cm下方に配置し
た1100psi破裂ディスクを用いるPDS−1000Heバイオリスティック装
置(デュポン)により行われた。
一過性発現検定
供給業者(ルシフェラーゼ検定システム、プロメガ)の勧告に従い、ルシフェ
ラーゼを組織抽出物において検定した。GUS−光キット(トロピックス)を用
いる化学発光検定法により、β−グルクロニダーゼ活性を測定した。ルシフェラ
ーゼおよびβ−グルクロニダーゼ活性は、25℃で10秒にわたって集積された
分析用ルミネセンスモデル2001ルミノメーターにより検出される光単位とし
て表されている。
DNA抽出およびサザンブロットハイブリダイゼーション
接種10日後濾過により細胞培養物を採取し、液体窒素中で凍結させた。DN
Aを記載された要領で単離した(ホールら、1991)。
約10μgのゲノムDNAを、EcoRI消化用に使用した。0.7%アガロース
ゲルでの分離後、DNAをアマーシャム・ハイボンドプラス膜に移し、製造業者
(アマーシャム)により記載された条件に従いハイブリダイゼーションを行った
。ファルマシアのオリゴ標識キットを用いて[a−32P]dCTPによりDNA
プローブを標識した。Barプローブは、Bar遺伝子の0.5kb BgIIIフラグメン
トに相当する。lucプローブは、ルシフェラーゼ遺伝子の0.7kb XbaI−Eco
RIフラグメントに対応する。プローブを除去するため、100℃で5分間0.
1%SDS溶液により膜を剥した。
T−DNA/植物DNA結合部のクローニング
トランスジェニックトウモロコシカルスからのDNA(30μg)を、EcoR
Iにより消化し、0.8%アガロースゲルにおける分取電気泳動にかけた。クロ
ーン化するフラグメントの大きさに対応するアガロースの薄片をゲルから切り取
り、遺伝子クリーンキットでDNAをアガロースから抽出した。次いで、フラグ
メントをpUC18の脱リン酸化EcoRI部位にクローン化した。ライゲーショ
ン混
合物を用いて、電気穿孔によりE.coli HB101細胞を形質転換した。正確な
挿入片を伴うプラスミドを含むコロニーを、プローブとして0.5kb Barフラグ
メントを用いるコロニーフィルターハイブリダイゼーションにより同定した。次
いで、陽性クローン由来のDNAをBamHI-EcoRIで消化した。BamHIは
、右境界配列から3bpの距離に位置する部位を有する。このフラグメントを、p
UC18の対応する部位に再クローン化した。植物DNAとドナープラスミドD
NAとの結合部の配列を、普遍プライマーを用いて分析した。
結果
インプランタでのvirD1およびvirD2遺伝子産物による境界配列の切断に関
して試験する一過性発現検定法
植物細胞での発現時にvirD1およびvirD2遺伝子産物がT−DNA境界配列
をニックし得るか否かを調べるため、試験プラスミドpwiRBLucおよびpRB
Lucを検定した。それらは、プロモーターおよびルシフェラーゼ遺伝子のコード
領域間に基質T−DNA境界配列を含んでいた。pRBLucはpUC誘導体であ
り、pwiは、トウモロコシ細胞で複製し得る小麦萎縮ウイルス(WDV)由来の
ベクターであり、2つの相補的センスORF、ウイルス複製に必要とされるC1
およびC2およびE.coli由来のp15A複製起点により構成される。このベク
ターは、ウイルス拡散および徴候発現に関与するORF V1およびORF V2
を含まない(ウガキら、1991)。virD1およびvirD2遺伝子産物により導
入された部位特異的ニックにより、ルシフェラーゼmRNAの鋳型であるDNA
鎖が破壊されるため、ルシフェラーゼ転写物および酵素の産生は減らすべきであ
る。pRBLucまたはpwiRBLucおよびCaMV35Sプロモーター制御下vir
D遺伝子をもつプラスミドによる植物細胞の同時衝撃処理後、境界配列における
ニック形成は全て、ルシフェラーゼ活性を検定することにより当然定量的に測定
可能である。
ルシフェラーゼ遺伝子の高レベル発現は、pRBLuc DNAまたはpwiRB
Luc DNAで衝撃処理されたトウモロコシ細胞において達成された。pRBLu
c DNAまたはpwiRBLuc DNAとpwiD1 DNAおよびpwiD2 DNA
をトウモロコシ細胞へ同時搬入することにより、GUSに対するルシフェラーゼ
活性の10倍減少がもたらされた(表8)。またpwiD2 DNAとpwiRBLu
c DNAの搬入によっても、GUSに対するルシフェラーゼ活性の10倍減少が
もたらされた。この結果は、WDVが1個の環状一本鎖DNAから成るゲノムを
有するという事実により説明され得る。それらは二本鎖中間体を介して感染細胞
の核で増え、それに続いてウイルス鎖DNAのローリングサークル型複製用鋳型
として使用される(サウンダーズら、1991、ステンガーら、1991)。vi
rD2は、インビトロで一本鎖オリゴヌクレオチドを切断することが示された(
パンセグラウら、1993、ジャスパーら、1994)。即ち、virD1は、ジ
ェミニウイルスのssDNA形態の切断に必要とされない。
安定な形質転換体の分析
トウモロコシ浮遊細胞の安定した形質転換に対し、バイオリスティック装置に
よるこれらの遺伝子とそれらの基質DNAの同時搬入後のDNA組込みパターン
に関するvirD1およびvirD2遺伝子産物の活性の評価を行った。これらの実験
の場合、我々は、左T−DNA境界、選択マーカーとしてBar、および右T−D
NA境界がプロモーターとルシフェラーゼコード領域の間に挿入された35SR
BLuc遺伝子を含むpwiBarRBLucおよびpBarRBLucを使用した。virD
介在組込み事象に関するスクリーンは、pBarRBLucまたはpwiBarLucから
T−DNAを切除することによるLucコード領域の排除から生じる、形質転換ク
ローンにおけるルシフェラーゼ活性の欠如を示した。境界配列でvir遺伝子産物
の活性の後にT鎖が産生される上記事象を、「アグロリスティック事象」と命名
した。対照的に、「バイオリスティック事象」とは、トウモロコシゲノムにおけ
る挿入体であり、バイオリスティック装置により植物細胞への遺伝子搬入後に通
常生じるプロセスを示すものであった。
トウモロコシ浮遊細胞を、1:1:1または1:2:2の割合でpBarRBL
ucまたはpwiBarRBLucプラスミドDNAと一緒にpwiD1およびpwiD2D
NAでコーティングしたマイクロプロジェクタイルにより衝撃処理した。対照と
して、pwiBarRBLucおよびpBarRBLucプラスミドについても単独で衝
撃処理した。バスタ含有培地での生長具合によって安定な形質転換体を選択した
。衝撃処理の3−4週間後、1フィルター当たり平均8〜10のバスタ耐性コロ
ニーが現れたが、サブセットのみさらに各プレートから分析した。p35AdhE
2プラスミドDNAを他のビルレンス遺伝子と同時搬入すると、1フィルター当
たり僅かに多い数(12−15)のカルスが回収された。総バスタカルスに対す
るルシフェラーゼを発現しないものと分析されたバスタ耐性カルスの総数の割合
により、アグロリスティック事象の頻度を概略的に見積もることができた。この
基準によると、pBarRBLucをpwi35SAdhD1およびpwi35SAdhD2
プラスミドDNAと同時搬入した場合、アグロリスティック事象の頻度は約20
%であった。使用される標的プラスミドがpwiBarRBLucである場合、頻度は
約40%に増加した。またpwi35SAdhE2を上記プラスミドと同時搬入する
と、この頻度は約50%に増加した。
サザン分析
分子レベルにおいて、アグロリスティック事象を示す挿入断片は、当然lucプ
ローブではなくBarプローブとハイブリダイズする。さらに、アグロリスティッ
ク事象において、導入されたDNAと植物DNAとの結合部の配列は、当然T鎖
の右境界末端に正確に対応する。両タイプの事象とも同じ植物細胞で起こり得る
が、上記クローンは、遺伝子的にはルシフェラーゼ活性の存在に基づいたバイオ
リスティック事象として評価される。バイオリスティックおよび推定的アグロリ
スティックの両事象についてサザンハイブリダイゼーションにより調査して挿入
断片の各タイプの頻度を測定した。
(i)pwiBarRBLuc DNA、(ii)pwiBarRBLuc、pwiD1および
pwiD2 DNA、(iii)pwiBarRBLuc、pwiD1、pwiD2およびpwiE
2 DNA、(iv)pBarRBLuc DNAおよび(v)pBarRBLuc、pwiD
1、pwiD2 DNAによる衝撃処理後に得られたバスタ耐性カルスラインから
のDNAにおいてサザンブロットハイブリダイゼーションを遂行した。
ブロット分析により、第9表に要約した3群のトランスジェニックカルスライ
ンが示された。即ち、(i)barおよびneoプローブ両方とハイブリダイズするカ
ルスライン、(ii)barプローブのみとハイブリダイズする挿入断片もあれば、
両プローブとハイブリダイズする挿入断片もあるカルスライン、(iii)barプロ
ーブのみとハイブリダイズする挿入断片を伴うカルスライン。第1群のカルスは
アグロリスティック事象を含まないと思われた。第2群のカルスは2タイプの事
象、すなわちアグロリスティック事象およびバイオリスティック事象を含むと思
われた。第3群のカルスは推定的アグロリスティック事象のみを呈した。例えば
、pwiBarRBLuc、pwiD1およびpwiD2形質転換実験から分析された10
トランスジェニックトウモロコシラインのうち、3つがバイオリスティック事象
を含み、6つが推定的アグロリスティック事象を含み、1つが両方を有していた
。個別ラインのハイブリダイゼーションパターンは特有であり、カルスラインが
独立した形質転換事象であることを示していた。
推定的アグロリスティック事象の分子分析
推定的アグロリスティック事象の性質を、組込みDNAと植物DNA間の結合
部の配列を決定することにより証明した。ヌクレオチド配列は、これらのフラグ
メントの各々が右境界/植物DNA結合部を含むことを示した。挿入片の右端点
は、アグロリスティック事象に関して予測されたとおり、T−DNAの右境界配
列のニック形成部位と同一であった。
DNAをバイオリスティック装置によりトウモロコシ細胞に搬入した。括弧内
の数はプラスミドの割合を示す。24時間インキュベーション後、組織をホモジ
ネートし、酵素活性を測定した。β−グルクロニダーゼ(GUS)を発現するプ
ラスミド、pGUSは、DNA導入効率に関する対照として各衝撃処理に含まれ
ており、レポーター遺伝子の活性はルシフェラーゼ対GUS活性の割合として表
されている。独立した衝撃処理を分析し、データは3回+または−標準偏差の平
均値として示されている。
括弧内の数は形質転換実験に使用されたDNAの濃度を示す。
B=バイオリスティック事象、A=推定的アグロリスティック事象、サザン=
サザン分析したカルスの数、カルス=ルシフェラーゼ活性について分析したカル
スの数
実施例6:トウモロコシおよびタバコ細胞における単一プロモーターによるvir
D1およびvirD2の発現。
植物細胞における細菌遺伝子の発現を達成するためには、原核生物プロモータ
ーでは植物細胞中で転写できないため、細菌遺伝子の個々のコード領域を別々の
植物プロモーターに融合させなければならない。各遺伝子を別々のプロモーター
に融合することは実行可能であるが、その場合いくつかの問題点を呈し得る。例
えば、同じプロモーターが異なる遺伝子に対して使用される場合のサイレンシン
グである。この実施例で立証された戦略は、唯一の植物プロモーターに2個の遺
伝子を縦に連結することである。このポリジーンメッセージはアグロバクテリウ
ムのvirDオペロンに属するvirD1およびvirD2の2種のコード配列を含む。
virDオペロンの5'半分によりコードされるこれら2つのポリペプチドは、ア
グロバクテリウムから植物細胞へのT−DNA導入に関するDNAプロセッシン
グの開始において主要な役割を演じる。virD2は、virD1により補助されて第
3および第4塩基間のT−DNA境界配列を切断する鎖特異的エンドヌクレアー
ゼである。virD2は、T−DNAの5'末端に共有結合したままであり、植物細
胞へT−DNAを導き、植物ゲノムへのT−DNAの5'末端のライゲーション
に関与すると考えられている。これら2種のタンパク質は、植物プロモーターに
フックされたとき植物細胞中で機能的であることが示された。
この実施例では、単一植物プロモーターにより駆動されるvirD1およびvirD
2遺伝子から成る発現単位に遺伝子操作を加え、インプランタでの機能的発現を
立証した。個々の遺伝子を転写融合体または翻訳融合体としてつなげ、後者の場
合には植物細胞においてそれらの酵素活性を保持していることが示された。
材料および方法
D1−D2またはD2−D1融合体の構築
2タイプの融合体を構築した。
1)転写融合体:
virD1およびvirD2コード領域間に小空間(33nt)が存在するvirD1お
よびvirD2コード領域の配列を使用した。p35SD1の1.1kbのNotI-Ps
tIフラグメントおよびp35D2の1.5kbのPstI-XbaIフラグメントをp
SK+のNotI-SpeI部位へクローン化して、p35StpD1D2を産生した
。
2)翻訳融合体:
ビルレンス遺伝子virD1およびvirD2についても、投入された介在配列を介
して融合させることにより、両タンパク質の自由な動きが可能となり、翻訳後切
断が行われやすくなっている。p35SD1D2の場合、virD1コード領域は
融合体の5'末端にあり、p35SD2D1はプロモーターの直後にvirD2領域
を含んでいた。修飾は全てDNA配列決定により確認された。
p35SD1D2の構築:
virD1とvirD2をコードする融合体virD1−virD2を作製するため、vir
D1の停止コドンとvirD2の開始コドンを除去した。これは、p35SD1の
0.48kbのEcoRI-BanIおよびp35SD2の0.25kbのPvuI-HindIII
断片に対しBanI-付着およびPvuI-付着末端にフランクさせた、一対のアニー
ル化DNAオリゴヌクレオチドをpUC21のEcoRI-HindIIIへクローニン
グすることにより行われた。アニール化した対は、次のオリゴヌクレオチドによ
り構成されていた:
次いで、virD1コード領域、リンカーおよびvirD2コード領域の5'末端を
含むこの構築物のEcoRI-PstIフラグメントをp35SD2のEcoRI-Pst
I部位へ挿入して、p35SD1D2を生成した。
p35SD2D1の構築:
同様に、プラスミドpD2D1は、同じ介在配列を通じてvirD1コード領域
にフレーム内結合したpD2D1の5'末端にvirD2コード領域を含む。まずvi
rD1のN−末端コード配列を重複オリゴヌクレオチドから再構築することによ
り、5'末端にEcoRI部位を与え、virD1の第1コドンを欠失する(;配列番
号17)。アニールしたこれらのオリゴヌクレオチドをpBluescriptKS+(
ストラタジーン、インコーポレイテッド)へクローン化すると、pKS
5'D1が得られた。次いで、p35SD2からの1.3kbのSacII-BfaIフラ
グメントおよびSacII-EcoRI-切断pKS5'D1プラスミドDNAを、virD
2の天然停止コドンを欠く形になるように、5'末端にBfaI部位の改変を含む
リンカーと結合させた(5′-TATCCTTCTACTCCCCCAACTCCCTCTCCTAGCACGCCTCCGACAC-
CTAGC-3′(配列番号18)および5′-AATTGGCTAGGTGTCGGAGGCGTGCTAGGAGAG-GGAGT
TGGGGGAGTAGAAGGA-3′(配列番号19))。次いで、virD2コード領域、リンカー
およびvirD1コード領域の5'末端を包含するEcoRI-ClaIフラグメントを
、p35SD1のEcoRI-ClaI部位へクローン化してp35SD2D1を製
造した。
試験プラスミドの構築:
pwBarRBLuc、pRBLucの構築は、実施例5に記載されている。
植物材料:
バイオリスティック装置による衝撃処理用のトウモロコシ(B37−誘導体)
およびタバコ(NT−1)浮遊細胞の製造は、先の実施例に記載されている。
植物細胞の衝撃処理:
組織を金マイクロプロジェクタイルにより衝撃処理すると、そこにプラスミド
の混合物が沈澱した。同時形質転換実験の場合、金粒子は、0.5μgまたは1μ
gの試験プラスミドと共にタバコおよびトウモロコシ細胞のそれぞれについてヘ
ルパープラスミド合計2μgまたは4μgを担持していた。pUC18プラスミド
のDNAの適量を混合することにより、混合物中に等質量のプラスミドDNAを
維持した(表10および表11参照)。2.5モルのCaCl2および0.1モルの
スペルミジン不含有塩基により、50μlの3μm金微小担体(60mg/ml)にD
NAが沈澱した。微小発射体衝撃処理は、停止スクリーンシェルフの8cm下方に
サンプルを配置させた1550psi破壊ディスクを用いるPDS−1000Heバ
イオリスティック装置(デュポン)により遂行された。
一過性発現検定:
供給会社(ルシフェラーゼ検定システム、プロメガ)の薦めるとおり、組織抽
出物においてルシフェラーゼを検定にかけた。ルシフェラーゼ活性は、25℃で
10秒間にわたり集積されたアナリティカル・ルミネセンス・モデル2001ル
ミノメーターにより検出される光単位として表されている。比活性を計算するた
め、バイオ-ラッドタンパク質検定キットを用いてタンパク質濃度を測定した。
結果および検討:
融合体設計戦略:
virD1およびvirD2遺伝子は、アグロバクテリウム・ツメファシエンスのオ
クトピンpTiA6プラスミドから得られた。p35StpD1D2が運ぶ転写融
合体は、天然介在配列がvirDオペロンに存在するvirD1およびvirD2のコー
ド領域を含む。
p35SD1D2およびp35SD2D1が運ぶ翻訳融合体は、介在配列を介
して融合されたvirD1およびvirD2コード領域を含むことにより、両タンパク
質の動きが自由となり、翻訳後切断が行われやすくなる。
インプランタでのポリジーンの機能的発現
転写および翻訳融合体の機能的発現を検定するため、p35StpD1D2、
p35SD1D2およびp35SD2D1を、バイオリスティック装置により試
験プラスミドと共に植物細胞へ同時搬入した。試験プラスミドには、プロモータ
ーとルシフェラーゼ遺伝子のコード領域間に挿入された右境界配列が含まれてお
り、この配列内での鎖特異的切断によりルシフェラーゼ発現が低減化されるよう
に設計した。2タイプの試験プラスミド、すなわちpUC−誘導プラスミド(p
RBLuc)および小麦萎縮ジェミニウイルス由来のプラスミド(pwBarRBLu
c)をトウモロコシ細胞において検定した。
トウモロコシおよびタバコ細胞を、別々のプロモーターにより各々駆動される
virD1およびvirD2遺伝子と同時搬入された試験プラスミドで一時的に形質転
換することにより、それらがT−DNA境界配列を通して転写に影響を与える能
力を試験した。p35SD1 DNAおよびp35SD2 DNAをpRBLucま
たはpwBarRBLuc DNAと同時搬入後、0.3%および1%の対照レベルの
ルシフェラーゼ活性をタバコおよびトウモロコシ組織において観察した(第10
表、第11表および第12表)。
転写融合体中で一緒の2種のvir遺伝子は、活性が軽微であると思われた。等
量のpRBLucおよびp35StpD1D2 DNA(1:1の割合)をバイオリ
スティック装置により同時搬入すると、ルシフェラーゼ活性はタバコでは対照の
約57%(第12表)およびトウモロコシ細胞では60−80%(第10表およ
び第11表)に低下した。p35StpD1D2プラスミド対試験プラスミドの比
が高いとき(2:1)、ルシフェラーゼ活性はそれ以上はあまり低下しなかった。
翻訳融合体を運ぶp35SD1D2プラスミドを用いる類似実験は、タバコで
は対照の約12%(第12表12)およびトウモロコシ細胞では22−47%(
第10表および第11表)のルシフェラーゼ活性の低下を示した。p35SD1
D2プラスミド対試験プラスミドの比が高いとき(2:1)、ルシフェラーゼ活
性はどの場合においてもさらに約2−5%に低下した。翻訳融合体p35SD2
D1におけるビルレンス遺伝子の天然配向が逆転しても、p35SD1D2の場
合と同様であった(第10、11および12表)。
これらの観察結果は、翻訳融合体がインプランタでも機能的であったことを強
く示している。
第10表:DNAをバイオリスティック装置によりトウモロコシ細胞に搬入した
。括弧内の数は、プラスミドの割合を示す。24時間インキュベーション後、組
織をホモジネートし、ルシフェラーゼ活性を測定し、光単位/μg(タンパク質
)として表した。独立した衝撃処理を分析し、データは3回反復値+または−標
準偏差の平均値として与えられている。
第11表:第10表に関する脚注参照。
第12表:表10に関する脚注参照。
実施例7:形質転換効率におけるvirE2の役割
トウモロコシ細胞において、「ヒーリング」ベクターがアグロリスティック事
象の頻度を高める能力について試験した。使用されたこのベクターは、右境界の
左にあるT−DNA構造の内側にポリアデニル化シグナルを含んでいた。
実験の第2部において、virE2をvirD1およびvirD2遺伝子と同時搬入し
た。このタンパク質は、T−DNAの製造ではなくT−DNAの効果的な導入に
必要とされることが示されている(スタッヒェルら、1986)。virE2は、
協同的および非特異的にインビトロで一本鎖DNAに結合する。virE2は、T
鎖の保護に関与し得る。virE2タンパク質は、ビルレンス遺伝子の誘導後にア
グロバクテリウム・ツメファシエンスで製造される最も豊富なタンパク質である
(スタッヒェルら、1986)。virE2は核局在化シグナルを有し、それらは
植物で認識されるため(再検討のため、ズパンおよびザンブリスキ、1995参
照)、この遺伝子がインプランタで導入される場合さらに高率の形質転換が予測
される。
材料および方法:
pAVM1の構築:右境界にポリアデニル化シグナルを含むベクター(図6−
15参照)
A部。pClB1711−HNの構築
pClB1711を、BamHIにより消化し、再ライゲーションすると、17
11デルタBが形成され、そこでEcoRI部位(現時点では唯一(ユニーク))を
切断し、オリゴヌクレオチドの挿入により破壊し、HindIIIおよびNotI部位が
同時に作製される。配列分析により、我々は、これらの部位が(SacI部位の後
)KpnI、次いでHindIIIの配向にあるクローンを同定した。もとのプラスミド
の失われた部分を回復するため、まず正しい配向でLucコード領域を運ぶ大型B
amHIフラグメントを挿入して、1711−HN−Bを形成させた。次いで、そ
のXbaI挿入片を、もとのpClB1711の対応する部分により置き換え、失
われたリーダー配列を再導入した。
B部。Lucコード領域末端のEcoRIとBamHI部位の間に合成オリゴヌクレ
オチド境界配列を導入し、NotI/ClaIフラグメントをpBluescriptにサブ
クローニングすると、挿入片中のEcoRIおよびBamHI部位は唯一になった。
境界オリゴヌクレオチドを挿入することによりpBS−NC−RBを形成後、そ
の修飾NotI/ClaI挿入片をpClB1711−HNバックボーンに戻してp
ClB1711−HN−RBを形成した。
C部。pUbiPATデルタlへの左T−DNA境界の挿入
pUCIACのイントロンにおける望ましくないEcoRI部位を排除するため
に、プラスミド(dam−マイナス株SCS110で成長)をClaIで消化してEc
oRI部位を含む小さな2断片を除去した。次いで、オリゴヌクレオチドを導入
してClaI部位を除去し、SphI部位を作製して、プラスミドpUbiPATデ
ルタlを形成させた。キメラPAT遺伝子の末端にある現時点で唯一のEcoRI
部位へ、一端から68塩基対の位置にあるT−DNAの左境界を運ぶノパリン型
Tiプラスミドである(ヤダヴ、N.S.、ヴァンダーレイデン、J.、ベネット
、D.バーンズ、W.M.、およびチルトン、M.D.1982)、pTiT37の
EcoRI断片29をクローン化した。短い直列反復配列がノパリンTiプラスミ
ド上のT−DNAにフランクして(プロシーディング・オブ・ナショナル・アカ
デミー・オブ・サイエンシーズ・オブ・ザ・ユナイテッド・ステーツ・オブ・ア
メリカ79、6322−6326)、LB−UbiPATデルタ1を形成する。
D部。pAVM1の組立
pClB1711−HN−RBのHindIII挿入フラグメントを切断し、LB−
UbiPATデルタlのHindIII部位へライゲーションした。マッピングにより
左および右境界が正しい導入配向でPAT遺伝子にフランクしている構築物が同
定された。生成したプラスミドは、Luc遺伝子プロモーターおよびT−DNAの
外側のコード領域を有するが、そのターミネーターは右境界のちょうど内側にあ
る。
トウモロコシ浮遊細胞:
ゼア・マイス(トウモロコシ)品種ブラック・メキシカン・スウィート(BM
S)の懸濁培養を、30g/lのショ糖および2mg/lの2,4−ジクロロフェノキ
シ酢酸(2,4−D)を補ったN6培地(2N63S)(チューら、1975)
で維持した。衝撃処理実験に使用したトウモロコシ細胞懸濁液は、3日齢の急成
長培養物から採取した。衝撃処理前、約0.5mlの充填細胞量を7cmフィルター
(ホワットマン、N°4)により真空濾過した。120g/lショ糖含有フィトア
ガー凝固2N6培地での衝撃処理前に、平板培養細胞を25℃で4時間保った。
安定した形質転換にするため、衝撃処理の24時間後フィルターを2N63S凝
固培地へ移した。それに続いて、培養中の細胞の大多数が生長を止めるまで、8
日間隔で増加濃度のバスタを含む新鮮な培地においてフィルターを移した。これ
は一般に8〜10mg/lのバスタを含むプレートでの4〜6週間の選別後に行わ
れた。次いで、フィルターで生じた独立カルスを、バスタ(10mg/l)を補っ
たフィトアガー凝固培地へ移した。同培地で2継代後、DNA単離用にバスタ(
10mg/l)を補った25ml液体培地中へ約100mgのトウモロコシ細胞を接種
することにより懸濁培養を開始させた。
植物細胞の衝撃処理:
金マイクロプロジェクタイルにより組織を衝撃処理すると、プラスミドの混合
物が沈澱した。同時形質転換混合物は、ビルレンス遺伝子を運ぶプラスミドとba
r選択プラスミドを1:1.3の割合で含んでいた。1標的プレート当たり衝撃処
理したプラスミド混合物の各アリコートは、選択マーカー0.6μg並びにp35
SAdhD1およびp35SAdhD2および/またはp35SAdhE2プラスミド
DNA各々0.8μgにより構成されていた。各DNAの適量を総容量10μl中
で混合し、50μlの2.5モルCaCl2および20μlの0.1モルのスペルミジ
ン不含有塩基により沈澱させると、0.3μm金微小担体(60mg/ml)50μl
への沈澱が起こった。マイクロプロジェクタイル衝撃処理は、停止スクリーンシ
ェルフの8cm下方にサンプルを配置させた1100psi破壊ディスクを用いるP
DS−1000Heバイオリスティック装置(デュポン)により行われた。
DNA抽出およびサザンブロットハイブリダイゼーション
接種の10日後濾過により細胞培養物を採取し、液体窒素中で凍結させた。記
載された要領でDNAを単離した(ホールら、1991)。
約10μgのゲノムDNAを、EcoRIでの消化用に使用した。0.7%アガロ
ースゲルでの分離後、DNAをアマーシャム・ハイボンド・プラス膜に移し、製
造業者(アマーシャム)により記載された条件に従いハイブリダイゼーションを
行った。ファルマシアのオリゴ標識キットを用いて[a−32P]dCTPにより
DNAプローブを標識した。PATプローブは、pat遺伝子の0.7kbのPstフラ
グメントに対応する。lucプローブは、ルシフェラーゼ遺伝子の0.7kbのXbaI
−EcoRIフラグメントに対応する。プローブを除去するため、100℃で5分
間0.1%SDSの溶液により膜を剥した。
結果
安定した形質転換体の分析
トウモロコシ浮遊細胞の安定した形質転換を誘発し、形質転換効率に対するp
AVM1ベクターの効果について、バイオリスティック装置によりビルレンス遺
伝子と上記ベクターを同時搬入後に評価した。前者のベクターは、T鎖が挿入さ
れた遺伝子のアンチセンスを発現する手段を容易に提供し得る配向で右境界内側
に35S−プロモーターを有していた。この新規タイプのベクターでは、35S
−プロモーターが、右境界内側の35S−ターミネーターにより置き換えられて
おり、3'末端に挿入されている場合に標的遺伝子を「回復させる(heal)」よう
な配向であった。
この実験の場合、使用されたpAVM1は、左T−DNA境界、選択マーカー
としてのPAT、35S−ターミネーター、右T−DNA境界およびT−DNA
−様構造外側にルシフェラーゼ遺伝子を含んでいる。我々は、境界配列に対する
vir遺伝子産物の活性の後に生じ、T鎖が形成されるトウモロコシゲノムへのそ
れらのDNA挿入を「アグロリスティック事象」と命名した。対照的に、バイオ
リスティック装置による植物細胞への遺伝子搬入後に通常生じるプロセスを示す
DNA挿入を「バイオリスティック事象」と命名した。バイオリスティック事象
および推定的アグロリスティック事象を区別する最初の基準は、pAVM1から
のT−DNA切除によるLucコード領域の排除から起こる、形質転換クローンに
おけるルシフェラーゼ活性の欠如であった。
トウモロコシ浮遊細胞を、p35SAdhD1、p35SAdhD2および/また
はp35SAdhE2 DNAと一緒にpAVM1プラスミドDNAでコーティン
グしたマイクロプロジェクタイルにより衝撃処理した。対照として、pAVM1
についても単独で衝撃処理した。バスタ含有培地での生長により、安定した形質
転換体を選択した。pAVM1単独による衝撃処理後1フィルター当たり約5−
8カルスが回収され得た。pAVM1、p35SAdhD1、p35SAdhD2お
よびp35SAdhE2 DNAによるトウモロコシ細胞の衝撃処理の4−5週間
後、1フィルター当たり平均10のバスタ耐性クローンが回収され得た。1プレ
ート当たり若干のものについてのみ更に分析した。約2−3のカルスが、pAV
M1、p35SAdhD1およびp35SAdhD2 DNAにより衝撃処理された
フィルターに出現した。この差異は、T鎖の保護に関与する一本鎖DNA結合性
タンパク質をコード化するvirE2遺伝子の存在に起因し得る。このタンパク質
は、T−DNA製造ではなくT−DNAの効果的に導入に必要であることが示さ
れた(スタッヒェルら、1986)。
アグロリスティック事象の頻度は、全バスタ耐性カルスに対する、ルシフェラ
ーゼを発現しなかった分析済みバスタ耐性カルス総数の割合により評価され得る
。この基準によると、pAVM1をp35SAdhD1およびp35SAdhD2
DNAと同時搬入した場合、アグロリスティック事象の頻度は約25%であった
。pwiE2についても上記プラスミドと同時搬入された場合、この頻度は約50
%に微増した。
サザン分析
分子レベルでは、アグロリスティック事象を示す導入遺伝子は、当然lucプロ
ーブではなくBarプローブとハイブリダイズする。両タイプの事象とも同じ植物
細胞で起こり得るが、上記クローンは、遺伝子的にルシフェラーゼ活性の存在に
基づくバイオリスティック事象として評価される。バイオリスティックおよび推
定的アグロリスティックの両事象をサザンハイブリダイゼーションにより調べ、
各タイプの挿入の頻度について測定した。サザン・ブロット・ハイブリダイゼー
ションは、(i)pAVM1 DNAおよび(ii)pAVM1、p35SAdhD
1、p35SAdhD2およびp35SAdhE2 DNAによる衝撃処理後に得ら
れたバスタ耐性カルスラインからのDNAについて遂行された。結果は下記第1
3表にまとめる。
結論:
a)バイオリスティック事象に対するアグロリスティック事象の割合はpAV
M1の場合約35%であり、20−40%の通常見いだされるパーセンテージの
範囲内に含まれる。
b)virE2の存在により、形質転換効率は改善され得る。
virE2は核局在化シグナルを有し、それらは植物中で認識されるため(再検
討のため、ズパンおよびザンブリスキー、「プラント・フィジオロジー」107
:1041−1047(1995)参照)、この遺伝子がインプランタで導入さ
れると、さらに高率の形質転換が予測された。virE2遺伝子を発現するトラン
スジェニック植物は、アグロバクテリウムのvirE突然変異体を補足し得ること
から、virE2タンパク質が植物細胞において重要な役割を演じているという証
拠を提供する。
実施例8:トウモロコシ細胞へのvirD1およびvirD2mRNAの衝撃処理
この実施例では、virD1およびvirD2遺伝子のmRNAとしての植物細胞へ
の搬入およびT−DNA境界配列に対するそれらの活性について記載する。
材料および方法:
トウモロコシ細胞:
B73に関連したエリートラインの未分化胚から選択された低温保存胚形成II
型カルスから開始されたトウモロコシ(ゼア・マイス品種)の懸濁培養を、30
g/lのショ糖および2mg/lの2,4−ジクロロフェノキシ酢酸(2,4−D)を
補ったN6液体培地(2N63S)(チューら、1975)中で生長させた。培
養物を暗所中150rpmでのオービタル振盪機において25℃でインキュベーシ
ョンした。1mlの充填細胞量を50mlの新鮮な2N63S液体培地中へ移すこと
により、懸濁培養物を7日毎に継代培養した。衝撃処理実験に使用したトウモロ
コシ細胞懸濁液は、3日齢の急成長培養物から採取された。衝撃処理前、約0.
5mlの充填細胞量を7cmフィルター(ホワットマン、N°4)により真空濾過し
た。
タバコ細胞:
ニコチアナ・タバクムのセルラインNT−1を、2mg/lの2,4−Dおよびシ
ョ
糖(30g/l)を補ったムラチゲおよびスクーグ培地で生長させた。500mlフ
ラスコ中100mlの新鮮培地へ5mlの接種材料を加えることにより、細胞を週1
回継代培養した。フラスコを125rpmでの回転振盪機において27℃でインキ
ュベーションした。継代培養4日後の細胞からの0.5mlのアリコートを、滅菌
フィルター(ホワットマン・ナンバー4)へ拡散させた。次いで、フィルターを
MS培地へ移した。
プラスミド構築:
T7プロモーターおよびポリAテイルを含むベクターの構築:
次の制限部位(Sphl-EcoRI-Nhel-Clal-BgIII-Asp718-HindIII-Xhol-Hind*III
、キリング(killing)部位として最後のHindIIIを伴う)を含むポリリンカー
を、pT7RecA50のSphI−HindIII部位へ挿入した。次いで、Asp718
−A(50)−DraI−HindIIIと命名されたオリゴマーを対応する部位へ挿入す
ると、pT7−A50が形成された。このオリゴマーの相補鎖は下記配列を有す
る:
pT7D1A50の構築:
pSG5のEcoRI−BamHIへ先にクローン化したD1コード領域のEcoR
I−BgIIIフラグメント(p35SAdh1D1のEcoRI−BamHIフラグメン
トから)。
pT7D2ポリAの構築:(図16−26参照)
A.調製されたフラグメントの単離
virD2コード領域をp35SD2から切除し、分取ゲル電気泳動およびアガ
ロースからのDNA抽出により単離した。内部部位は、virD2の5'および3'
末端の調製をサブフラグメントで行うことを必要とした。5'末端から単離した
HindIII/EcoRIフラグメントをPvuIでトリミングしてフラグメントAを製
造した。3'末端から単離したBamHI/EcoRIフラグメントをHaeIIIでトリ
ミングしてフラグメントCを製造した。中央フラグメントBは、HindIII/Bam
HI消化により得られた。
B.フラグメントAおよびBのクローニング
ベクターpTC182をHindIIIおよびSphIで消化し、SphI末端に対する
フラグメントA+アダプターオリゴ(開始コドンを復元)を適所へライゲーショ
ンすると、pTC182−Aが形成された。このプラスミドをHindIIIおよびB
amHIで消化し、フラグメントBをAの3'末端にライゲーションした。合わせ
たフラグメントABを切除し、生成したプラスミドpTC182−A−BのBam
HI/SphI消化後にゲル精製した。
C.修飾pUC21ベクターにおけるフラグメントABおよびCのクローニン
グ
BamHIおよびXbaI部位間のpUC21ポリリンカー部分を除去し、ほとん
どの部位を復元したオリゴヌクレオチド対により置き換え、この構築で必要とさ
れるBgIII部位を付加した。生成したプラスミドpUC21−Xを、BamHIお
よびEcoRVで消化し、フラグメントCをベクターへライゲーションして、pU
C21−Cを形成した。次に、この生成物をBamHIおよびSphIで消化し、上
記からの単離フラグメントABをライゲーションして、virD2を再構築した。
生成したプラスミドpUC21−virD2をSphIおよびBgIIIで消化後、調製
したvirD2 ORFを含むフラグメントABCをゲル精製した。
D.T7転写ベクターへのvirD2のクローニング
上記転写ベクター、T7ポリAを、SphIおよびBgIIIで消化し、フラグメン
トABC(=virD2)をT7プロモーター下方および42A残基のブロック上
方の位置へライゲーションした。
mRNA合成:
T7D1A50およびT7D2A50プラスミドを、XhoIにより直鎖状化し
、ポリ(A)伸長部のすぐ下流を切断した。直鎖状化したDNAをフェノール/
クロロホルム抽出し、次いでエタノール沈澱した。[m7G(5')ppp(5')]を含
む
T7キャップ-スクライブキット(ベーリンガー)のT7ポリメラーゼを用いて
、直鎖状化DNAのインビトロ転写を行った。mRNAの正確さおよび濃度をア
ガロースゲル電気泳動により測定した。
バイオリスティック供給材料の滅菌:
金粒子(03μm−ヘラエウス)を、100%エタノールおよび0.1%DEP
C中に60mgの粒子を入れることにより滅菌した。粒子をリボヌクレアーゼ不含
有水により3回リンスし、次いで1mlのリボヌクレアーゼ不含有50%グリセリ
ン溶液に再懸濁した。製造された粒子50μlずつを6ショットに使用した。巨
大担体を100%エタノールおよび0.1%DEPC中に沈め、次いで100%
エタノール中で3回リンスし、風乾した。停止スクリーンをオートクレーブにか
けた。
核酸沈澱:
0.5μlのトリス緩衝液(1モル)、50μlのCaCl2および0.1モルのス
ペルミジン2.5μlを連続して加えることにより、DNA(1μg)およびmR
NA(約8μg:4μgのD1および4μgのD2または8μgの非特異的mRNA
)が金粒子(60mg/ml、0.3μm)の50μl懸濁液へ沈澱した。全薬剤を加
えた後、旋回混合を3分間続行した後、短い超遠心分離(1分)により粒子が沈
降した。上清を除去し、粒子を冷100%エタノールで1回洗浄し、100%エ
タノール60μlに再懸濁した。この混合物を旋回混合し、10μlずつを微小
担体ディスクへピペットで移し、層流フードで風乾した。
植物細胞へのマイクロプロジェクタイル搬入
サンプルを発射アセンブリーから5.5cmのところに配した1550psi破壊デ
ィスクを用いて、粒子加速装置(PDS−He1000、デュポン)によりマイ
クロプロジェクタイルを植物細胞へ搬入した。100μmメッシュステンレスス
チール製スクリーンを、ストッピングプレートおよび組織間の中間に置いた。標
的プレートを2度衝撃処理した。
ルシフェラーゼ検定:
ルシフェラーゼおよびGusを、供給業者の薦めるとおりプロメガのルシフェラ
ーゼ検定システムで組織抽出物において検定した。ルシフェラーゼおよびβ−グ
ルクロニダーゼ活性は、25℃で10秒間アナリティカル・ルミネセンスモデル
2001ルミノメーターにより検出される光単位として表される。
結果:
衝撃処理の24時間後にルシフェラーゼ検定を行った。D1およびD2のmR
NAを、右境界配列が35Sプロモーターとルシフェラーゼコード配列の間に挿
入されているp35SRBLucと同時衝撃処理した。対照実験では、p35SR
BLucを非特異mRNAで衝撃処理するか、またはD1およびD2 mRNAを
、境界配列を全く含まないpLUC DNAと同時搬入した。結果は下記第14
表に示す。
24時間インキュベーション後、組織をホモジネートし、酵素活性を測定した
。β−グルクロニダーゼ(GUS)を発現するプラスミド、pGUSを、DNA
導入効率の対照として各衝撃処理に含ませ、レポーター活性をルシフェラーゼ対
GUS活性の割合として表す。独立衝撃処理を分析し、データを3回反復値+ま
たは−標準偏差の平均値として示す。%対照値は、β−グルクロニダーゼに対す
るルシフェラーゼ活性対対照プラスミドにより観察される活性の割合から測定さ
れる。
結論:
pRB(+)Luc DNAとD1 mRNAおよびD2 mRNAの同時搬入後、
ルシフェラーゼ活性が10倍減少した。mRNAとして植物細胞へ搬入される2
種のvir遺伝子は、相乗効果を有すると思われた。これらの観測結果は、観測さ
れたルシフェラーゼ活性の減少がvir遺伝子産物による右境界配列での鎖特異的
ニックの結果であることを強く示していた。
mRNA搬入の利点は、その効果が必ず一過性である点である。ヘルパープラ
スミドの外来DNAは全く存在しない。
実施例9:プロトプラストにおける「アグロリスティック」
形質転換技術は、遺伝子操作および作物品種の改良のための重要な手段である
(ラスキン、1996)。様々な形質転換システムにより、稔性植物を生じ得る
細胞へ外来遺伝物質を直接導入することができる。これらのシステムには、電気
穿孔または直接DNA摂取によるプロトプラストへのDNA搬入、細胞へのマイ
クロインジェクション、およびDNAコーティングしたマイクロプロジェクタイ
ルでの衝撃処理による遺伝子導入がある(再検討のため、モリッシュおよびフロ
ム、1992参照)。既存の搬入システムでは、外来遺伝子の複数コピーを組込
む傾向がある。ベクター配列を伴わない外来遺伝子の単純な組込みパターンをも
たらす方法が要望されている。
ここに記載されている「アグロリスティック」と称される形質転換方法は、外
来遺伝子の挿入およびベクター配列の排除という単純なパターンでトランスジェ
ニック物質を生じさせる可能性を有する。この方法では、選択マーカーにフラン
クしているT−DNA境界配列を含むプラスミドと同時搬入される、T−DNA
の形成および保護において重要な役割を演じるビルレンス遺伝子(virD1、vir
D2およびvirE2)に対する植物発現カセットを使用する。先の実施例におい
て、これらの成分全てをバイオリスティック装置により植物細胞へ搬入するとき
、この技術的方法は有用であることが示されている。
この実施例では、我々は、これらの成分全てを搬入するためのプロトプラスト
への直接DNA搬入方法を使用する。我々は、この方法で搬入されたvirD1お
よびvirD2遺伝子産物が実際にT−DNA型挿入事象を誘発し得ること、およ
びvirE2遺伝子産物を含ませると、形質転換頻度が高められ得ることを見いだ
した。
材料および方法
プラスミド
pClB1711は、カリフラワーモザイクウイルス35S(CaMV35S
)プロモーターにより駆動される蛍ルシフェラーゼ遺伝子を含むpUC誘導体で
あり、実施例3に記載されている。T−DNA境界を導入するため、LBA52
69(ファン・ハーレンら、1989)の右境界配列に対応する2種の合成オリ
ゴヌクレオチドをアニーリングすることにより、二本鎖:5'-ATCCGGCA
GGATATATACCGTTGTAATTCTGCA−3'(配列番号22)
を生成した。BamHI−PstI部位にフランクさせたこの二本鎖を、プロモータ
ーおよびルシフェラーゼコード配列間においてpClB1711での対応する部
位へ挿入すると、pRBLucが得られた(図2参照)。pNeoRBLucは、左境
界配列、ネオマイシンホスホトランスフェラーゼ遺伝子(nptII)およびルシフ
ェラーゼ遺伝子を含み、右境界はプロモーターおよびpRB(+)Lucからのルシ
フェラーゼコード領域間に挿入されている。nos(ノパリンシンターゼ)プロモ
ーターにより駆動されるnptII遺伝子を、2.2kbのSacII−HindIII断片として
プラスミドpBin19から切除した。左境界配列をBgIII−EcoRIフラグメン
トとしてpBin19から切除した。これら両断片をpRB(+)LucのXbaI−H
indIII部位へ挿入した。pNeoLucはpNeoRBlucの均等物であり、CaMV3
5Sプロモーターおよびルシフェラーゼコード領域間に右境界配列は挿入されて
いない。
pTiA6からのvirD1およびvirD2遺伝子を、CaMV35Sプロモーター
(0.5kb)、Adh1第1イントロン(0.5kb)およびノパリンシンターゼ(no
s)ポリアデニル化領域(0.25kb)から成る発現ベクターpMF6(カリスら
、1987)へサブクローニングした(図1)。virD1コード配列に対応する
pAD1187由来の0.6kbのEcoRI−PstIフラグメントを、pMF6へ
ク
ローン化すると、p35SAdhD1が生成された。virD2コード配列をpAD
1190(ガイおよびダス、1989)由来の1.8kbのEcoRIフラグメント
として切除し、pMF6でクローン化すると、p35SAdhD2が生成された。
virE2コード領域を、アグロバクテリウムTiプラスミドpTiA6(受託番
号X04784)(ウィナンズら、1987)の3kbのXhoI断片を含むpw10
8からクローン化した。まずpw108の687bpのSacI−SmaIフラグメント
をpKS(−)の対応する部位へクローン化してpKS3'E2を生成した。pw1
08由来の924bpのHaeIII−SacIを、pKS3'E2由来のSacI−Pst
I断片およびEcoRI−付着および平滑末端にフランクさせた一対のアニール化
DNAオリゴヌクレオチド(5'−AATTCATGGATCTTTCTGGC
AATGAGAAATCCAGG−3'、配列番号23)と合わせ、pBluescri
pt KS−(ストラタジーン、インコーポレイテッド)のEcoRI−PstI部位
へクローン化してpKSE2を生成した。次いで、全virE2コード領域を包含
するXhoI−PstI断片をpMF6のXhoI−PstIへサブクローン化して、p
35SAdhE2を生成した。
植物材料
トウモロコシ浮遊細胞:
ゼア・マイス品種ブラック・メキシカン・スウィート(BMS)の懸濁培養物
を、30g/lのショ糖および2mg/lの2,4−ジクロロフェノキシ酢酸(2,4
−D)を補ったN6培地(2N63S)(チューら、1975)で維持した。実
験に使用されるトウモロコシ細胞懸濁液は、3日齢の急生長培養物から採取され
た。
プロトプラストは、『ブラック・メキシカン・スウィートコーン:組織培養物
に関するその用途。生物学的研究用トウモロコシ』、W.F.シェリダン、シャー
ロッテスヴィル編、Va.プラント・モレキュラー・バイオロジー・アソーシエ
ーション(1982)(385−388頁)に記載された要領で、トウモロコシ
同系交配BMS(ブラック・メキシカン・スウィート)の細胞懸濁培養物から単
離された。形質転換の2日後パロモマイシン(200mg/l)を培地に含ませた
。
形質転換の4週間後に現れた独立微小カルスを、200μg/mlパロモマイシン
を補った新鮮なプレートへ移した。同培地での2回の継代培養後、200μg/m
lのパロモマイシンを補った25mlの液体培地中へ約100mgのトウモロコシ細
胞を接種することにより、懸濁培養を開始させた。第15表に記載された要領で
p35SAdhD1、p35SAdhD2および/またはp35SAdhE2の存在ま
たは非存在下異なる濃度のpNeoRBLuc DNAによりプロトプラストを形質
転換した。
DNA抽出およびサザンブロットハイブリダイゼーション
接種の10日後濾過により細胞培養物を採取し、液体窒素中で冷凍した。DN
Aを記載された要領(ホールら、1991)で単離した。
約10μgのゲノムDNAを、EcoRIでの消化に使用した。0.7%アガロー
スゲルでの分離後、製造会社(アマーシャム)により記載された条件に従い、D
NAをハイボンド+膜へ移し、ハイブリダイゼーションを行った。ファルマシア
のオリゴ標識キットを用いて、DNAプローブを[a−32P]dCTPにより標
識した。neoプローブは、nptII遺伝子の0.3kbのPstI−SphIフラグメント
に対応する。lucプローブは、ルシフェラーゼ遺伝子の0.7kbのXbaI−EcoR
Iフラグメントに対応する。プローブを除去するため、100℃で5分間0.5
%SDSの溶液により膜を剥した。
結果:
実験的設計
遺伝子試験によるVirD1−および−VirD2介在挿入事象に関するスクリー
ニングを行えるベクターを設計した。ベクターpNeoRBLucは、Tiプラスミ
ドからの天然左境界、nos−NPTII−nos(ノパリンシンターゼプロモーターお
よびターミネーター配列を伴うキメラネオマイシンホスホトランスフェラーゼII
遺伝子)、35Sプロモーター、合成右境界配列およびルシフェラーゼコード領
域を含む。通常の機構により形質転換されるパロモマイシン耐性トウモロコシカ
ルスは、ほぼ不変的にルシフェラーゼ遺伝子を含み、ルシフェラーゼを発現する
。反対に、ルシフェラーゼを発現できないクローンは、VirD1およびVirD2
介
在切除およびT−鎖組込みの候補産物であった。植物細胞においてvirD1、vir
D2およびvirE2遺伝子を発現させるため、それらの各オープン・リーディン
グ・フレーム(ORF)をCaMV35Sプロモーターの制御下に置いた。
安定な形質転換体の分析:
様々な比率のp35SAdhD1およびp35SAdhD2および/またはp35
SAdhE2 DNAと共にpNeoRBLucプラスミドDNAを用いて、プロトプ
ラストを形質転換した。対照として、pNeoRBLucプラスミドについても単独
で搬入した。パロマイシン含有培地での生長により、安定な形質転換体を選択し
た。pNeoRBlucをvirD1およびvirD2遺伝子により同時形質転換すると、
1プレート当たり平均120のパロモマイシン耐性クローンが現れたが、30の
カルスについてのみさらに分析した。virE2をビルレンス遺伝子のプールに加
えると、パロモマイシン耐性カルスの数は250に達し得る。
一連の各実験から30のパロモマイシン耐性クローンを分析すると、約10−
40%はルシフェラーゼを発現しないことが分かり、これはvirD1−virD2介
在組込み事象の約10−40%頻度を示していた。両挿入片を含むクローンは9
0%ルシフェラーゼ陽性群に含まれるため、これは「アグロリスティック」事象
の頻度を過少評価したと思われる。virE2遺伝子の存在または非存在下での実
験から回収されたルシフェラーゼを発現しないカルスの頻度に顕著な差異はなか
った。
形質転換体クローンのサザンブロット分析:
サザンブロットハイブリダイゼーションは、(i)pNeoRBLuc単独、(ii
)p35SAdhD1およびp35SAdhD2 DNAと同時形質転換されたpNe
oRBLucプラスミドおよび(iii)p35SAdhD1、p35SAdhD2および
p35SAdhE2 DNAと同時形質転換されたpNeoRBLucプラスミドによ
る衝撃処理後に得られた対照パロモマイシン耐性カルスラインからのDNAで行
われた。
ゲノムDNAをEcoRIで消化した結果、neoおよびlucの両プローブと相同で
あるpNeoRBLucプラスミド由来の3.9kbのフラグメントが生成する。Eco
RIは、pNeoRBLucのT−DNA構造部分内側に一部位およびルシフェラー
ゼコード領域にもう一つの部位を有する。
pNeoRBLuc単独によるプロトプラストの形質転換から回収された対照形質
転換体は、予想通りlucおよびneoの両プローブとハイブリダイズする3.9kbの
EcoRIフラグメントを呈した。このフラグメントのコピー数は5より大きく、
さらに再編成および/またはフラグメント化DNAの複数コピーが見られた。
pNeoRBLucとp35SAdhD1、p35SAdhD2および/またはp35
SAdhE2プラスミド DNAの同時搬入後に得られたパロモマイシン耐性カル
スラインからのDNAのサザンブロット分析は、第15表に示されている。サザ
ンブロット分析の場合、ルシフェラーゼ活性について陰性試験したカルスライン
が選択された。例えば、実験#8で回収し、サザンハイブリダイゼーションによ
り分析した8種のトランスジェニックトウモロコシラインのうち、4種はバイオ
リスティック事象を呈し、4種は推定的アグロリスティック事象を呈した。同じ
ハイブリダイゼーションフィルターに含まれるコピー数標準値との比較により判
断したところによると、NPTII遺伝子コピーの推定数は一般に1形質転換体ゲ
ノムについて1または2であった。neoプローブおよびlucプローブとハイブリダ
イズするゲノムDNAを含むカルスラインは、pNeoLuc DNA単独での形質
転換から回収したカルスラインよりも少ないコピー数を呈した。
第15表:形質転換の4週間後に個々のカルスの数を評価した。
結論:
これらの結果は、この技術方法がプロトプラストへ搬入された外来遺伝子の組
込みのパターンを単純化し得ることを明白に示している。VirD1−VirD2−
介在組込みの頻度は約20−30%であった。さらに、virE2を加えることに
より、形質転換効率が改善された。この技術方法により、外来DNAを伴わず、
対象の遺伝子組込みの単純なパターンをもつ形質転換植物の回収が促進されるは
ずである。
実施例10:未分化接合子胚の直接衝撃処理によるトウモロコシのCG0052
6遺伝子型の形質転換および選択剤としてのホスフィノトリシンの使用による形
質転換カルスの単離。
バイオリスティック(商標)装置を用いる衝撃処理用DNAの製造。
トウモロコシの未分化胚またはI型カルスは、コジエルら、「バイオテクノロ
ジー」11:194−200(1993)(これらの関連部分を引用して説明の
一部とする)に記載された要領で形質転換され得る。
本質的には公開された方法に従い、マイクロメートルサイズの金(一般的には
直径1.0mmまたは0.3mm)の存在下での化学沈降によるマイクロプロジェクタ
イル衝撃処理用にDNAを製造する。金に加えて、マイクロメートルサイズの他
の高密度粒子、例えばタングステンまたは白金が使用され得る。この方法の一修
飾法では、まず粒子を水に懸濁し、音波処理することにより粒子自体を製造する
。次いで、音波処理された粒子が遠心分離により沈澱し、これを50%グリセリ
ン水溶液に再懸濁する。次に、この方法で製造される粒子を、体積50μl中1
管当たり約3mgの金粒子を含む個々の管に等分する。使用されるプラスミドの数
、それらのサイズおよび所望のDNAの最終濃度により異なる量でDNAを各管
に加える。
次に、約3分間旋回混合しながら、2.5モルのCaCl2約50μlおよび0.1
モルのスペルミジン約20μlをその順序で各管に加える。次いで、DNA/金
複合体を静かに遠心分離にかける。上清を除去する。粒子を250μlの無水エ
タノールで1回洗浄し、再沈澱させ、次いで、約75μlの新鮮な無水エタノー
ルに再懸濁する。こうして準備された各管は、PDS−1000/Heによる6
「ショット」に対して十分なDNA/金複合体を含む。十分に懸濁したDNA/
金複合体10μlを、無振動環境において各巨大担体シートへピペットで移す。
PDS−1000/He装置では、異なる与圧グレードでも利用可能なプラス
チックディスクの破裂によりヘリウムのバーストが放出される。例えば、ヘリウ
ム1平方インチ当たり200、450、650、900、1100、1350、
1550、1800、2000および2200ポンドで破裂する単一ディスクま
たはディスクの組み合わせが得られる。このガスのバーストが巨大担体シートを
推進し、これはステンレススチールスクリーンより停止される。スクリーンは、
異なるメッシュサイズ、例えば10×10、16×16、24×24などを有し
得る。他の設定項目は、巨大担体飛行距離、ギャップ距離および粒子飛行距離で
ある。これらの設定項目は、製造業者の使用者用マニュアルに詳記されている。
典型的には、ギャップ距離約5.5mm、巨大担体飛行距離約10mmおよび粒子飛
行距離約6〜9cmが使用される。さらに、スクリーンまたはバッフルは、停止ス
クリーンおよび標的プレート間の粒子飛行距離内に挿入され得る。上記のスクリ
ーンまたはバッフルが膨張する気体からの衝撃波を妨害することにより、標的へ
の損害が低減化される。一例では、開口部約100μmのステンレススチールス
クリーンを使用する。他の開口部サイズおよび材料組成も使用され得る。
未分化胚またはI型胚形成カルスは、異なるパターンで標的プレートに配置さ
れ得る。一連の実験を通して、未分化胚に関する最適化パターンが展開される。
一最適化パターンにおいて、未分化胚は円形パターンで配置され、この円形は直
径約2cmである。未分化胚は円形の周縁部に配置される。約25の未分化胚を各
標的プレートに置く。さらに、標的プレートは、巨大担体発射アセンブリーに対
してある角度に方向転換され得る。この結果、粒子拡散による未分化胚の求基的
部分の最大飽和が確実になる。胚形成応答を生じさせるのは、未分化胚の求基的
部分である。
I型胚形成カルスの衝撃処理の一例では、カルスを、栄養培地上の直径約1cm
の円の周縁に置く。衝撃処理装置の機械的設定項目は、未分化胚の衝撃処理に関
して上記で列挙した設定項目と同様または類似した位置に配置され得る。
標的パターンおよびガン設定項目は相互関係を有することに注目すべきである
。言い替えれば、微小発射体衝撃処理装置における他の機械的設定項目の使用に
より、標的プレートでの受容組織の他の最適配置がもたらされ得る。機械的設定
項目および標的パターンの他の組み合わせもこの発明の範囲内に含まれる。
形質転換
未分化胚は、自家受粉の約14日後に得られる。未分化接合子胚を、1プレー
ト当たり未分化胚25で胚発生カルス形成を誘導および促進し得る培地を含む相
異なる標的プレート間に分割する。未分化接合子胚を、バイオ・ラッドからのP
DS1000/He装置を用いてプラスミドp35SAdhD1、p35SAdhD
2およびT−DNA標的プラスミド(pbarRBlucまたはpAVM1)の混合物
により衝撃処理する。virE2遺伝子に関する発現可能なDNAも含まれ得る。
本質的に上記の公開された方法に従い、0.3または1μm金粒子に対しプラスミ
ドを沈澱形成させる。各標的プレートは、1100−1300psiのバースト圧
力を用いてプラスミドおよび金製品により2回発射される。
プラスミドpbarRBlucは、ホスフィノトリシン耐性をコードするキメラ遺伝
子を含むため、この物質を用いて、インビトロで形質転換細胞を選択する。この
選択は衝撃処理の1日後3mg/Lで適用され、全部で8−12週間維持される。
こうして得られた胚形成カルスは、1mg/1ホスフィノトリシンの存在下で再生
される。
1991年9月13日付けアメリカ合衆国特許出願07/759243(この
関連部分を引用して説明の一部とする)に記載された要領で、PPTに対する耐
性についてクロロフェノールレッド(CR)試験により全カルスを試験する。こ
の検定法では、どの細胞がPPTの存在下で生長しているかを示すpH高感度指
示薬染料を使用する。生長する細胞は、培地においてpH変化をもたらし、指示
薬のクロロフェノールレッドを(赤から)黄色に変える。PPTに対する耐性遺
伝子を発現する植物は、この試験で容易に同定される。CR試験による陽性の植
物を、bar遺伝子の存在に関するPCRにより検定する。
選択マーカー遺伝子を含む植物を、ルシフェラーゼ遺伝子の発現について検定
する。ルシフェラーゼ活性の欠如は、カルスがアグロリスティック事象であり得
ることの指標である。アグロリスティック事象は、T−DNAの挿入と類似した
方法でDNAがトウモロコシDNAへ組み込まれているものであるが、アグロバ
クテリウムは介在しない。ルシフェラーゼ遺伝子発現について陰性の植物を、サ
ザーンブロットにより検定する。サザンブロット分析により観察されるバンドパ
ターンは、どの形質転換体が実際にアグロリスティックであるかを示していた。
実施例11:未分化接合子胚の直接衝撃処理によるトウモロコシのA188遺伝
子型の形質転換および選択剤としてのホスフィノトリシンの使用による形質転換
植物の単離。
遺伝子型A188の雌穂を自家受粉すると、約12−14日後に未分化接合子
胚が得られる。未分化接合子胚を、2JMS+5DcプラスAgNO3培地に置く
。16−20時間後、未分化接合子胚を同培地(ただし、12%ショ糖含有)へ
移す。3−5時間後、未分化接合子胚を、PDS1000/He装置を用いてプ
ラスミドp35SAdhD1、p35SAdhD2およびT−DNA標的プラスミド
(pbarRBlucまたはpAVM1)の混合物により衝撃処理する。virE2遺伝
子について発現可能なDNAも含まれ得る。上記要領で、本質的にはバイオ・ラ
ッドから公表された方法に従い、プラスミドを0.3または1μm金粒子へ沈澱さ
せる。バースト圧力1100−1300psiのヘリウムを用いて粒子を搬入する
。各標的プレートをプラスミドおよび金粒子製品により2回発射する。一夜イン
キュベーション後、2%ショ糖および5−10mg/Lのホスフィノトリシンを含
む新鮮な維持培地へ未分化胚を移し、ほぼ2週間毎に同培地へ継代培養する。こ
うして得られた胚形成カルスは、1mg/Lホスフィノトリシンの存在下で再生さ
れる。
再生する全植物を、PPT耐性についてクロラムフェニコールレッド(CR)
試験により試験する。この検定では、どの細胞がPPTの存在下で生長している
かを示すpH高感度指示薬染料を使用する。PPT耐性を示す葉片は、培地にお
いてpH変化をもたらし、指示薬を(赤から)黄色に変える。PPTに対する耐
性遺伝子を発現する植物は、この試験で容易に同定される。CR試験による陽性
の植物を、bar遺伝子の存在に関するPCRにより検定する。
選択マーカー遺伝子を含む植物を、ルシフェラーゼ遺伝子の発現について検定
する。ルシフェラーゼ活性の欠如は、カルスがアグロリスティック事象であり得
ることの指標である。アグロリスティック事象は、T−DNAの挿入と類似した
方法でDNAがトウモロコシDNAへ組み込まれているものであるが、アグロバ
クテリウムは介在しない。ルシフェラーゼ遺伝子発現について陰性の植物を、サ
ザンブロットにより分析する。サザンブロットにおけるバンドパターンは、どの
形質転換体が実際にアグロリスティックであるかを示している。
実施例12:未分化接合子胚から誘導されたI型カルスの衝撃処理によるトウモ
ロコシのCG00526遺伝子型の形質転換および選択剤としてのホスフィノト
リシンの使用による形質転換カルスの単離。
I型カルスは、標準培養技術を用いて未分化接合子胚から得られる。遺伝子を
搬入するため、約300mgのI型カルスを、外科用メスで切り刻み、18%ショ
糖含有標準培養培地で3回リンスすることにより調製し、即座に再び18%ショ
糖含有半固体培養培地上へ置く。約4時間後、バイオ・ラッドからのPDS10
00/Heバイオリスティック装置を用いて組織を衝撃処理する。バイオ・ラド
からの標準プロトコールを用いて、プラスミドを0.3または1μm金粒子へ沈澱
させる。遺伝子搬入の約16−20時間後、カルスを2%ショ糖およびバスタと
して10mg/Lホスフィノトリシン含有標準培養培地へ移す。カルスを8週間選
択培地で継代培養した後、植物産生のために残存生長しているカルスを標準再生
培地へ移す。
再生する全植物を、PPT耐性についてクロラムフェニコールレッド(CR)
試験により試験する。この検定では、どの細胞がPPTの存在下で生長している
かを示すpH高感度指示薬染料を使用する。生長する細胞は、培地においてpH
変化をもたらし、指示薬を(赤から)黄色に変える。PPTに対する耐性遺伝子
を発現する植物は、この試験で容易に同定される。CR試験による陽性の植物を
、bar遺伝子の存在に関するPCRにより検定する。
選択マーカー遺伝子を含む植物を、ルシフェラーゼ遺伝子の発現について検定
する。ルシフェラーゼ活性の欠如は、カルスがアグロリスティック事象であり得
ることの指標である。アグロリスティック事象は、T−DNAの挿入と類似した
方法でDNAがトウモロコシDNAへ組み込まれているものであるが、アグロバ
クテリウムは介在しない。ルシフェラーゼ遺伝子発現について陰性の植物を、サ
ザンブロットにより分析する。サザンブロットにおけるバンドパターンは、どの
形質転換体が実際にアグロリスティックであるかを示している。
実施例13:未分化接合子胚から誘導された破砕性懸濁培養細胞を衝撃処理する
ことによるB73から誘導されたトウモロコシの遺伝子型のカルスの形質転換お
よび選択剤としてのホスフィノトリシンの使用による形質転換カルスの単離。
破砕性カルスは、アメリカ合衆国特許第5350689号(これを引用して説
明の一部とする)に記載されたB73から誘導された遺伝子型の平板培養未分化
胚から誘導された。
懸濁培養物をN6培地で毎週継代培養した。継代培養の3−5日後に取られた
細胞は、それらを710μmステンレススチールフィルターで濾過し、次いでそ
れらをデュラポア(CGC1280/81参照)膜表面へ分布させることにより
採取された。約0.4gの細胞を、各々直径47mm膜の表面に分布させた。PDS
1000/He装置を用いて、vir遺伝子(35SAdhD1、p35SAdhD2)
を運ぶプラスミドおよびT−DNA標的プラスミド(pbarRBlucまたはpAV
M1)の混合物による衝撃処理前の3−5時間、12%ショ糖含有N6培地に膜
を置いた。等量(1:1:1)のVirD1、virD2および35S−bar 標的T
−DNA(2ショットとして各々合計1.3μg)または過剰のvir遺伝子(2シ
ョットとして2:2:1μg)のいずれかを細胞に搬入した。virE2遺伝子につ
いて発現可能なDNAも上記実験に含まれ得る。
上記要領で、本質的にはバイオ・ラッドから公表された方法に従い、プラスミ
ドを0.3または1μm金粒子へ沈澱させた。バースト圧力1100−1300ps
iのヘリウムを用いて粒子を搬入した。各標的プレートは2ショットを受けた。
一夜インキュベーション後、2%ショ糖および3mg/Lのホスフィノトリシンを
含む新鮮な維持培地へカルスを伴う膜を移した。3週間後、各フィルターからの
細胞を、3プレートの10mg/Lバスタ含有2N6培地の表面へ拡散させた。4
週間後、生長しているコロニーを、3mg/lバスタを含む新鮮な2N6へ移し、
1週間後こうして得られたカルスをPPT耐性に関するクロロフェノールレッド
(CR)試験により試験した。この検定では、どの細胞がPPTの存在下で生長
しているかを示すpH高感度指示薬染料を使用する。生長する細胞は、培地にお
いてpH変化をもたらすため、指示薬を(赤から)黄色に変える。PPTに対す
る耐性遺伝子を発現するカルスは、この試験で容易に同定された。陽性片が培地
を黄
色またはオレンジ色に変えたことから、少なくともある程度のPPT耐性を示し
ており、それらを5mg/lバスタ含有2N6培地に置いた。
CR試験による陽性のカルスを、barまたはPAT遺伝子の存在に関するPC
Rにより検定した。
第16表:‡(1)および(2)は2回反復処理であった。
*このコロニーはルシフェラーゼについて陽性であった。
§これらの1つは推定的アグロリスティック事象であった。
選択マーカー遺伝子を含むカルスラインに対し、ルシフェラーゼ遺伝子の発現
について検定を行った。ルシフェラーゼ活性の欠如は、カルスがアグロリスティ
ック事象であり得ることの指標であった。アグロリスティック事象は、T−DN
Aの挿入と類似した方法でDNAがトウモロコシDNAへ組み込まれているもの
であるが、アグロバクテリウムは介在しない。ルシフェラーゼ遺伝子発現につい
て陰性のカルスラインを、サザンブロットにより分析した。サザンブロットにお
けるバンドパターン(図)は、どの形質転換体が実際にアグロリスティックであ
るかを示していた。
この表は、この実験で分析された23セルラインのうち、11はルシフェラー
ゼ活性を欠き、そしてサザンブロットにより分析されたもののうち9セルライン
中4セルラインはT−DNA様挿入片のみを含み、2セルラインはT−DNA様
挿入片および非生物学的(この場合バイオリスティック)DNA搬入方法を用い
た後に見いだされる典型的挿入片の両方を含んでいたことを示している。
実施例14:未分化接合子胚から誘導されたI型カルス細胞の衝撃処理によるト
ウモロコシのCG00526遺伝子型のカルスの形質転換および選択剤としての
ホスフィノトリシンの使用による形質転換カルスの単離。
カルスは、コジエルら、「バイオテクノロジー」11:194−200(19
93)に記載された遺伝子型CG00526の平板培養未分化胚から誘導される
。
維持培地(2DG4+0.5mg/12,4−D)において培養物を週1回継代培
養し、継代培養物を3−5時間12%ショ糖含有2DG4培地に置いた2−3日
後に細胞塊を採取する。1プレート当たり16標的カルス片を直径8−10mmの
環状に配置させる。PDS1000/He装置を用いて、vir遺伝子(35SAd
hD1、p35SAdhD2)を運ぶプラスミドおよびT−DNA標的プラスミド
(pbarRBlucまたはpAVM1)の混合物によりカルスを衝撃処理する。等量
(1:1:1)のVirD1、virD2および35S−bar 標的T−DNA(2シ
ョットとして各々合計1.3μg)または過剰のvir遺伝子(2ショットとして2
:2:1μg)のいずれかを細胞に搬入する。virE2遺伝子について発現可能な
DNAも含まれ得る。
上記要領で、本質的にはバイオ・ラッドから公表された方法に従い、プラスミ
ドを0.3または1μm金粒子へ沈澱させた。バースト圧力650psiのヘリウム
を用いて粒子を搬入する。各標的プレートは2ショットを受ける。一夜インキュ
ベーション後、2%ショ糖を含む新鮮な維持培地へカルスを移す。さらに2週間
後、望ましいカルス(典型的なI型形態を示す)を、120mg/Lバスタ(PP
T)含有維持培地へ継代培養する。4週間後、生長しているカルスを、30mg/
lのバスタを含む新鮮な維持培地へ移す。
カルスを全部で8週間選択培地で継代培養した後、残存し、生長しているカル
スを植物製造用の標準再生培地へ移す。再生する植物を全てPPT耐性に関する
クロロフェノールレッド(CR)試験により試験する。この検定では、どの細胞
がPPTの存在下で生長しているかを示すpH高感度指示薬染料を使用する。生
長する細胞は、培地においてpH変化をもたらすため、指示薬を(赤から)黄色
に変える。PPTに対する耐性遺伝子を発現する植物は、この試験で容易に同定
される。CR試験による陽性の植物を、bar遺伝子の存在に関するPCRにより
検定する。
選択マーカー遺伝子を含む植物に対し、ルシフェラーゼ遺伝子の発現について
検定を行う。ルシフェラーゼ活性の欠如は、カルスがアグロリスティック事象で
あり得ることの指標である。アグロリスティック事象は、T−DNAの挿入と類
似した方法でDNAがトウモロコシDNAへ組み込まれているものであるが、ア
グロバクテリウムは介在しない。ルシフェラーゼ遺伝子発現について陰性の植物
を、サザンブロットにより分析する。サザンブロットにおけるバンドパターンは
、どの形質転換体が実際にアグロリスティックであるかを示している。
実施例15:vir遺伝子およびT−DNA標的配列によるトウモロコシプロトプ
ラストの形質転換
ゼア・マイスの懸濁培養物からのプロトプラストの製造およびDNAによる形
質転換方法は、アメリカ合衆国特許5350689に記載されている。
プロトプラストの形質転換に使用されるDNAは、例えばプラスミドp35S
AdhD1、p35SAdhD2およびT−DNA標的プラスミド(pbarRBlucま
たはpAVM1)の混合物により構成される。virE2遺伝子について発現可能
なDNAもまた含まれ得る(実施例7参照)。カルスはプロトプラストから回収
され、植物は選択剤としてホスフィノトリシンを用いて記載された要領で再生さ
れる。形質転換プロトプラスト誘導細胞は、DNA処理の10日後から開始して
3−5mg/L PPTを含む選択培地の適用により選択される。
再生する植物を全てPPT耐性に関するクロロフェノールレッド(CR)試験
により試験する。この検定では、どの細胞がPPTの存在下で生長しているかを
示すpH高感度指示薬染料を使用する。生長する細胞は、培地においてpH変化
をもたらすため、指示薬を(赤から)黄色に変える。PPTに対する耐性遺伝子
を発現する植物は、この試験で容易に同定される。CR試験による陽性の植物を
、bar遺伝子の存在に関するPCRにより検定する。
選択マーカー遺伝子を含む植物に対し、ルシフェラーゼ遺伝子の発現について
検定を行う。ルシフェラーゼ活性の欠如は、カルスがアグロリスティック事象で
あり得ることの指標である。アグロリスティック事象は、T−DNAの挿入と類
似した方法でDNAがトウモロコシDNAへ組み込まれているものであるが、ア
グロバクテリウムは介在しない。ルシフェラーゼ遺伝子発現について陰性の植物
を、サザンブロットにより分析する。サザンブロットにおけるバンドパターンは
、どの形質転換体がT−DNA様挿入片を有するかを示している。境界配列のク
ローニングおよび配列決定を行うことにより、挿入片の性質が確認され得る。
この発明の具体的な実施態様は限られた数しか上記では詳記していないが、当
技術分野に精通していれば、この発明の新たな教示内容および利点から実質的に
逸脱することなく、多くの修飾が具体的な実例において可能であることは容易に
理解できるはずである。従って、上記修飾は全て、この発明の範囲内に含まれる
ものとする。
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T,LV,MG,MK,MN,MX,NO,NZ,PL
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UZ,VN
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1.真核細胞を (a)T−DNA境界配列と結合させた対象のDNAからなるDNAフラグメン トで;および、 (b)T−DNA境界配列と結合させたDNAの組込みを促進する1またはそれ 以上のタンパク質を該真核細胞中で発現する能力のある少なくとも1つのキメラ DNAまたはRNA分子で、 形質転換させることを含んでなる、該細胞のゲノムへ対象となるDNAを組込む 方法。 2.処理工程a)およびb)が同時に実施される、請求の範囲第1項に記載の 方法。 3.該真核細胞が植物細胞である、請求の範囲第1項に記載の方法。 4.該キメラDNAまたはRNA分子がアグロバクテリウムTiまたはRiプス ラミドのビルレンス領域によりコードされた1またはそれ以上のタンパク質をコ ードするキメラ核酸分子からなる、請求の範囲第1項に記載の方法。 5.該キメラDNAまたはRNA分子がVirD2、VirD1、VirC1、Vir C2またはVirE2をコードする、請求の範囲第4項に記載の方法。 6.該キメラDNAまたはRNA分子がVirD2単独;またはVirD1および VirD2の組み合わせ;VirD1、VirD2およびVirE2の組み合わせ、をコ ードする、請求の範囲第5項に記載の方法。 7.該キメラDNAまたはRNA分子がVirD2をコードする、請求の範囲第 5項に記載の方法。 8.T−DNA境界配列と結合させた対象のDNAが植物ウイルスベクターの 一部である、請求の範囲第3項に記載の方法。 9.該DNA遺伝子が植物ウイルスベクターの一部である、請求の範囲第3項 に記載の方法。 10.T−DNA境界配列に結合させた対象のDNAおよび該DNA遺伝子が植 物ウイルスベクターの一部である、請求の範囲第3項に記載の方法。 11.該植物細胞が双子葉植物の細胞である、請求の範囲第3項に記載の方法。 12.該双子葉植物が、タバコ、綿、アブラナおよび大豆からなる群から選択さ れる、請求の範囲第11項に記載の方法。 13.該植物細胞が単子葉植物の細胞である、請求の範囲第3項に記載の方法。 14.該単子葉植物が、トウモロコシ、コムギおよびコメからなる群から選択さ れる、請求の範囲第13項に記載の方法。 15.該対象のDNAがキメラ遺伝子を含んでなる、請求の範囲第1項に記載の 方法。 16.該キメラ遺伝子が該真核細胞中でタンパク質を発現する能力のある、請求 の範囲第15項に記載の方法。 17.T−DNA境界配列に結合させた該対象のDNAおよび該DNA遺伝子が 一本鎖DNA分子の成分である、請求の範囲第1項に記載の方法。 18.ゲノム内に組込まれたT−DNA境界配列と結合させたDNAを有する稔 性トランスジェニック植物を産生する方法であって、 a)該DNAを請求の範囲第3項の方法に従って植物細胞のゲノムへ形質転換 させ;そして、 b)その形質転換植物細胞を稔性トランスジェニック植物へと再生させること 、を含んでなる、方法。 19.該稔性トランスジェニック植物が、タバコ、綿、ナタネ、大豆、トウモロ コシ、小麦およびコメからなる群から選択される、請求の範囲第18項に記載の 方法。 20.T−DNA境界配列と結合させた対象のDNAの真核細胞ゲノムへの組込 みを目的とする形質転換法における、アグロバクテリウムのビルレンスタンパク 質をコードする遺伝子の使用。 21.該遺伝子がVirD2、VirD1、VirC1、VirC2またはVirE2をコ ードするキメラ遺伝子である、請求の範囲第20項に記載の使用。 22.物理的形質転換実験にて得られたトランスジェニック植物細胞または植物 体の完全体であって、該植物細胞または植物体の5%またはそれ以上が、アグロ バクテリウム右境界T−DNA配列によりゲノムDNAにつなげた対象のDNA を含んでなる、完全体。 23.マイクロプロジェクタイル衝撃により得られた、請求の範囲第22項に記 載の植物細胞または植物体の完全体。 24.該植物細胞または植物体の10%から70%が、アグロバクテリウム右境 界T−DNA配列により植物ゲノムDNAにつなげた対象のDNAを含んでなる 、請求の範囲第22項に記載の植物細胞または植物体の完全体。 25.20またはそれ以上の独立した形質転換事象から得られた、請求の範囲第 22項に記載の植物細胞または植物体の完全体。 26.10またはそれ以上の独立した形質転換事象から得られた、請求の範囲第 24項に記載の植物細胞または植物体の完全体。 27.請求の範囲第22項に記載の植物細胞または植物体の後代。
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