JPH02163088A - 緑膿菌のリポタンパク質i - Google Patents
緑膿菌のリポタンパク質iInfo
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- JPH02163088A JPH02163088A JP1227304A JP22730489A JPH02163088A JP H02163088 A JPH02163088 A JP H02163088A JP 1227304 A JP1227304 A JP 1227304A JP 22730489 A JP22730489 A JP 22730489A JP H02163088 A JPH02163088 A JP H02163088A
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- Japan
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- pseudomonas aeruginosa
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- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
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- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/569—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for microorganisms, e.g. protozoa, bacteria, viruses
- G01N33/56911—Bacteria
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- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/04—Antibacterial agents
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- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
- C07K14/21—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Pseudomonadaceae (F)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
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- C12Q1/689—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for bacteria
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
緑Rffr (Pseudomonas aeru3i
nosa)は、広く分布しており、ヒトの医学分野で「
厄介な微生物」とみなされている。その主な標的は、衰
弱した患者で、抗生物質療法が頻繁に用いられるが、辛
うじてコントロールされるのみである。特に、集中治療
室の患者、対麻痺(paraplegia)の患者、火
傷を負ったヒト、または消防夫または製鋼職工のような
火傷の危険性の高い人々で、特に危険である。これら全
ての場合において、能動免疫による感染防御が期待され
る。リボタンパク質(OMPI)(l 1poprot
ein I)は、ボリンF (porin F(OMP
F))のように、緑膿菌の外膜の主要成分であり、この
ために、同様にワクチンの成分として適している可能性
がある。
nosa)は、広く分布しており、ヒトの医学分野で「
厄介な微生物」とみなされている。その主な標的は、衰
弱した患者で、抗生物質療法が頻繁に用いられるが、辛
うじてコントロールされるのみである。特に、集中治療
室の患者、対麻痺(paraplegia)の患者、火
傷を負ったヒト、または消防夫または製鋼職工のような
火傷の危険性の高い人々で、特に危険である。これら全
ての場合において、能動免疫による感染防御が期待され
る。リボタンパク質(OMPI)(l 1poprot
ein I)は、ボリンF (porin F(OMP
F))のように、緑膿菌の外膜の主要成分であり、この
ために、同様にワクチンの成分として適している可能性
がある。
本発明は、血清型6、A T CC33354の緑膿菌
からの外膜タンパク質I(OMPT)の遺伝子の完全な
特徴付けに基づいている。それから得られたDNA配列
およびアミノ酸配列は表1に示された通りである。表中
、アミノ酸の3文字コードを対応する塩基トリブレット
の下に示し、シグナルペプチドをイタリック体で強調し
ている。
からの外膜タンパク質I(OMPT)の遺伝子の完全な
特徴付けに基づいている。それから得られたDNA配列
およびアミノ酸配列は表1に示された通りである。表中
、アミノ酸の3文字コードを対応する塩基トリブレット
の下に示し、シグナルペプチドをイタリック体で強調し
ている。
この目的のために、外膜のタンパク質を緑li@菌から
得て、これから古典的な方法にてモノクローナル抗体を
得た。
得て、これから古典的な方法にてモノクローナル抗体を
得た。
ゲノムDNAを菌株から単離精製して、ラムダEMBL
3遺伝子バンクを既述(A、−屯Fr1SChaUfら
: J、 Mo1. Biol、 170 (1983
) 827−842、M、 Ducheneら: J、
Bacteriol、 170 (1988)155
−162)のようにして作出した。この遺伝子バンクを
ブレーティングして、得られたプラークからの材料をニ
トロセルロース膜に移した。緑膿菌のリボタンパク質■
に特異的なモノクローナル抗体を少量のリボタンパク質
Iを発現したプラークを検出するために用いた。すなわ
ち、抗体−抗原反応をアルカリホスファターゼとカップ
リングした第二抗体と適当な呈色反応とを用いることに
よって可視化した。リボタンパク質Iをコードする遺伝
子は、15kbの大きさで陽性の入ファージに含まれて
いるDNA断片上に位置させて、次いで、626bpの
大きさのTaq I断片に配置させた。
3遺伝子バンクを既述(A、−屯Fr1SChaUfら
: J、 Mo1. Biol、 170 (1983
) 827−842、M、 Ducheneら: J、
Bacteriol、 170 (1988)155
−162)のようにして作出した。この遺伝子バンクを
ブレーティングして、得られたプラークからの材料をニ
トロセルロース膜に移した。緑膿菌のリボタンパク質■
に特異的なモノクローナル抗体を少量のリボタンパク質
Iを発現したプラークを検出するために用いた。すなわ
ち、抗体−抗原反応をアルカリホスファターゼとカップ
リングした第二抗体と適当な呈色反応とを用いることに
よって可視化した。リボタンパク質Iをコードする遺伝
子は、15kbの大きさで陽性の入ファージに含まれて
いるDNA断片上に位置させて、次いで、626bpの
大きさのTaq I断片に配置させた。
DNAの画鋲をSanger (Sangerら: P
roc、 Natl。
roc、 Natl。
Acad、 Sci、 USA 74 (1977)
5463−5467)の方法によって完全に配列決定し
た。対応するアミノ酸配列をこのようにして得たDNA
配列から推知した。
5463−5467)の方法によって完全に配列決定し
た。対応するアミノ酸配列をこのようにして得たDNA
配列から推知した。
成熟タンパク質のN末端を、成熟タンパク質が同様にシ
スティン残基で始まる、対応する大腸菌タンパク質と比
較して推知した。このシスティン残基は、緑膿菌におけ
るように同じ配列集合c+y−Cys−5er−5er
(K、 NakamuraおよびM、 Inouye
:Ce1l 18 (1979) 1109−1117
)に位置している。
スティン残基で始まる、対応する大腸菌タンパク質と比
較して推知した。このシスティン残基は、緑膿菌におけ
るように同じ配列集合c+y−Cys−5er−5er
(K、 NakamuraおよびM、 Inouye
:Ce1l 18 (1979) 1109−1117
)に位置している。
遺伝子の単離によりて、ここで、リボタンパク質Iおよ
びこのタンパク質の免疫原性を有する部分配列をワクチ
ンの調製に用いるに必要な量および純度で得ることが可
能になる。
びこのタンパク質の免疫原性を有する部分配列をワクチ
ンの調製に用いるに必要な量および純度で得ることが可
能になる。
このように、本発明は、表1に示されたアミノ酸配列を
有するリボタンパク質r(OMPI)、それをコードす
るDNA(そのタンパク質コード鎖は表に示されている
)、リボタンパク質■の免疫原性部分配列、リボタンパ
ク質■およびこのタンパク質の免疫原性部分配列を用い
て得られたポリクローナルおよびモノクローナル抗体な
らびに対応する血清、さらにはそのような抗体または対
応するヌクレオチド配列を含む診断補助物およびそれら
の診断補助物を用いる診断方法、さらに、リボタンパク
質■または免疫原性部分タンパク質の調製のための遺伝
子操作法、に関する。
有するリボタンパク質r(OMPI)、それをコードす
るDNA(そのタンパク質コード鎖は表に示されている
)、リボタンパク質■の免疫原性部分配列、リボタンパ
ク質■およびこのタンパク質の免疫原性部分配列を用い
て得られたポリクローナルおよびモノクローナル抗体な
らびに対応する血清、さらにはそのような抗体または対
応するヌクレオチド配列を含む診断補助物およびそれら
の診断補助物を用いる診断方法、さらに、リボタンパク
質■または免疫原性部分タンパク質の調製のための遺伝
子操作法、に関する。
さらに、本発明は、ヒトモノクローナル抗体を用いる受
動免疫の道を開く。本発明は、したがって、本発明によ
って得られる抗原の、対応するモノクローナル抗体を生
産するリンパ細胞の誘導およびそのような抗体の産生に
ついてのリンパ細胞の試験のための、使用にも間する。
動免疫の道を開く。本発明は、したがって、本発明によ
って得られる抗原の、対応するモノクローナル抗体を生
産するリンパ細胞の誘導およびそのような抗体の産生に
ついてのリンパ細胞の試験のための、使用にも間する。
調製操作、精製、免疫および血清および抗体の獲得は、
公知の方法で行うことができる。例えば、門−E、 G
11lelandら: Infection and
Immunity44 (1984) 49−54、R
,E、讐、 Hancockら:J。
公知の方法で行うことができる。例えば、門−E、 G
11lelandら: Infection and
Immunity44 (1984) 49−54、R
,E、讐、 Hancockら:J。
Infectious Diseases 149 (
1984) 220−226.5゜5awadaら:
J、 Infectious Diseases 15
0 (1984)570−576)を参照されたい。
1984) 220−226.5゜5awadaら:
J、 Infectious Diseases 15
0 (1984)570−576)を参照されたい。
本発明は、以下に詳述される通りである。特に記載がな
い限り、パーセントは重量パーセントを表す。
い限り、パーセントは重量パーセントを表す。
例」−
リボタンパク質Iの調製
リボタンパク質IをInouyeら(J、ofBact
eriology 127 (1976) 555−5
63)の方法に従って得る。
eriology 127 (1976) 555−5
63)の方法に従って得る。
肚2
リボタンパク質Iに対するモノクローナル抗体の調製
精製したリボタンパク質■をフロイントのアジュバント
またはAI (OH)3とともにBa1b/Cマウスに
腹腔内注射する。溶解した抗原を6週間後のブースター
に用いる。抗体価をELISAによって1週間後に決定
する。免疫応答が適当でない場合には、さらなる注射を
行う。10μ8の溶解抗原を、細胞融合の3日前にマウ
スの静注ブースターに用いる。標準法(に、 [oeh
lerおよびC0M1lstein: Nature
256 (1975) 495−497)を用いて肺臓
細胞をNSI細胞と融合させる。HAT培地における選
択の後、単一コロニーをマイクロウェルで増殖させて、
それらの培養上清を、リボタンパク質Iに対する抗体に
ついて順次ELrSAで試験する。陽性のコロニーをサ
ブクローニングする。抗体を培養上清からおよびBa1
b/cマウスの誘導した腹水から得て、従来の生化学的
方法によって精製して特徴付けを行った。
またはAI (OH)3とともにBa1b/Cマウスに
腹腔内注射する。溶解した抗原を6週間後のブースター
に用いる。抗体価をELISAによって1週間後に決定
する。免疫応答が適当でない場合には、さらなる注射を
行う。10μ8の溶解抗原を、細胞融合の3日前にマウ
スの静注ブースターに用いる。標準法(に、 [oeh
lerおよびC0M1lstein: Nature
256 (1975) 495−497)を用いて肺臓
細胞をNSI細胞と融合させる。HAT培地における選
択の後、単一コロニーをマイクロウェルで増殖させて、
それらの培養上清を、リボタンパク質Iに対する抗体に
ついて順次ELrSAで試験する。陽性のコロニーをサ
ブクローニングする。抗体を培養上清からおよびBa1
b/cマウスの誘導した腹水から得て、従来の生化学的
方法によって精製して特徴付けを行った。
肚旦
リボタンパク質I DNAの調製および特徴付は緑膿
菌からの遺伝子バンクの作出: 遺伝子バンクの作出については報告(M。
菌からの遺伝子バンクの作出: 遺伝子バンクの作出については報告(M。
[)ucheneら: J、 Bacteriol、
170 (198B) 155−162)があり、これ
に従って行フた。
170 (198B) 155−162)があり、これ
に従って行フた。
リボタンパク質I配列のための遺伝子バンクのスクリー
ニング: 組換えファージを500 pfu (plaque f
ormingunits、プラーク形成巣位)の密度て
NM539m菌ローンにブレーティングして一晩培養し
た。ファージブラークーをさらに37℃で6時間培養し
て、それからニトロセルロース膜に移す。陽性のプラー
クをそれらのリボタンパク質Iの含有量によって同定す
る。すなわち、フィルターをまずモノクローナル抗体6
A4とともにインキュベートして、次いで、陽性の抗体
−抗原反応を第二の抗体およびアルカリホスファターゼ
による酵素呈色反応を用いて同定する。
ニング: 組換えファージを500 pfu (plaque f
ormingunits、プラーク形成巣位)の密度て
NM539m菌ローンにブレーティングして一晩培養し
た。ファージブラークーをさらに37℃で6時間培養し
て、それからニトロセルロース膜に移す。陽性のプラー
クをそれらのリボタンパク質Iの含有量によって同定す
る。すなわち、フィルターをまずモノクローナル抗体6
A4とともにインキュベートして、次いで、陽性の抗体
−抗原反応を第二の抗体およびアルカリホスファターゼ
による酵素呈色反応を用いて同定する。
リボタンパク質I遺伝子およびそれに隣接する領域の配
列分析: 単離したファージの一つを大量培養(1リツトル)して
、DNAをそれから調製した(Maniatisら:M
o1ecular Cloning、Co1d spr
ing 1larborPublications、
1982)。後者を制限酵素5allで切断して、得ら
れる制限断片をショットガン法にてp B R322(
Bolivarら: Gene 2 (1977)95
−113)に、次いでp U C19(Yanisch
−Perronら: Gene 33 (1985)
103−119)にサブクローニングする。この場合、
形質転換された大腸菌細胞中で、陽性の形質転換体が抗
体反応によって認識されるほど充分な量のリボタンパク
質I (OMP I)が同様に発現される。タンパク質
を発現する最小のサブクローンは、クローンpITaq
である。
列分析: 単離したファージの一つを大量培養(1リツトル)して
、DNAをそれから調製した(Maniatisら:M
o1ecular Cloning、Co1d spr
ing 1larborPublications、
1982)。後者を制限酵素5allで切断して、得ら
れる制限断片をショットガン法にてp B R322(
Bolivarら: Gene 2 (1977)95
−113)に、次いでp U C19(Yanisch
−Perronら: Gene 33 (1985)
103−119)にサブクローニングする。この場合、
形質転換された大腸菌細胞中で、陽性の形質転換体が抗
体反応によって認識されるほど充分な量のリボタンパク
質I (OMP I)が同様に発現される。タンパク質
を発現する最小のサブクローンは、クローンpITaq
である。
プラスミドDNAをこのクローンから単離して、Exo
IIIおよびExo■で消化(Yanisch−Per
ronら二上記を参照されたい)の後、Chenおよび
Seeburg(DNA 4 (1985) 165
−170)の方法で配列決定する。クローンは626b
pの大きさでリボタンパク質1(OMPI)をコードす
る完全な配列を含むTaq I挿入物を有している。こ
の配列は、表1に示される通りである。
IIIおよびExo■で消化(Yanisch−Per
ronら二上記を参照されたい)の後、Chenおよび
Seeburg(DNA 4 (1985) 165
−170)の方法で配列決定する。クローンは626b
pの大きさでリボタンパク質1(OMPI)をコードす
る完全な配列を含むTaq I挿入物を有している。こ
の配列は、表1に示される通りである。
阻ユ
リボタンパク質■の発現:
リボタンパク質■遺伝子の緑膿菌における転写を導くプ
ロモーターは大腸菌のコンセンサスプロモーターときわ
めて似ていることから、タンパク質は、今日までに研究
されたリボタンパク質1転写単位の完全な配列を含む全
てのプラスミドで発現される。
ロモーターは大腸菌のコンセンサスプロモーターときわ
めて似ていることから、タンパク質は、今日までに研究
されたリボタンパク質1転写単位の完全な配列を含む全
てのプラスミドで発現される。
リボタンパク質Iは、プラスミドpITaqで形質転換
された大腸菌の培養から上記したInouyeらの方法
によってそれを単離して得られる。
された大腸菌の培養から上記したInouyeらの方法
によってそれを単離して得られる。
敢旦
抗血清の調製:
アレルギー 糖尿病、免疫不全症、貧血または皮膚病の
病歴を持たない健康成人を、異質W織で(hetero
logously)発現させたリボタンパク質■、また
はその部分配列物、で免疫する。接種は、第1日日、8
日目および155日目行う。最後の接種から3週間の後
に、ボランティア被験者から採血して、B型肝炎表面抗
原およびHIV抗原について試験した。陰性反応を示す
供与血づ1のみをプールして、管理された無歯条件下で
分画して包装する。
病歴を持たない健康成人を、異質W織で(hetero
logously)発現させたリボタンパク質■、また
はその部分配列物、で免疫する。接種は、第1日日、8
日目および155日目行う。最後の接種から3週間の後
に、ボランティア被験者から採血して、B型肝炎表面抗
原およびHIV抗原について試験した。陰性反応を示す
供与血づ1のみをプールして、管理された無歯条件下で
分画して包装する。
表1:緑膜面からのリボタンパク質Iの配列コード領域
は3文字コードでアミノ酸残基が示されている。シグナ
ルペプチドはイタリック体で書かれている。
は3文字コードでアミノ酸残基が示されている。シグナ
ルペプチドはイタリック体で書かれている。
ATG AACAACGTT CTG AAA τT
CTCτGCT CTG GCT CTG GCT G
CT GTTMat Asn ksn Val X、a
u Lys Pha Ear Aha Lauえ−Le
uλ―)、ia Va1CTG GCCACCGGT
TGC入CCACCCAG TCCAAA GA
A ACCCAA GCT C0TZsu hla
Tbr Gユy Cys Sar Sur
l1is Sar Lys Glu Th
r Glu Ala 入:qloo
120CτG ACC
GCT ACCGAA GACGCA GCT GCT
CGT GCT CAG GCT CGCGCTLa
u Thr Jua Thr Glu AJp Jua
JLLa Ala 社q AIJL Gin Aia
Arg ALa140
160
”80GACCAA GCCTAT CGCA
AG GCT GAC(−AA GCT CTG GG
CGCT GCT CAGλsp Glu Ala
Tyr 入rg I、ys Jua λs
p Glu 入ユa Leu Gユy Ala
λユaGユnλA入 GCT CAG CAG
ACCGCT (、λCGAG GCT AAC
CAG CGT GCCC″TG C’=CLys
入−Gin 〕1 Tbr Jua JLsp Glu
Jua ksxs にluλ=g Ala Leu
);qATG CTG (、入A AAA G
CCAGCCGCAAG 丁λ入 τλGMat
Lau Glu Lys Jux S@r
JLrg Lys 會 舎弟1頁の続き ■Int、 C1’ 識別記号 庁内整理番号 し U/ に 99: 00
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Jua ksxs にluλ=g Ala Leu
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Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1、表1に示されたアミノ酸配列を有する、緑膿菌の外
膜タンパク質であるリボタンパク質 I 。 2、請求項1に記載のリボタンパク質 I をコードする
、DNA。 3、請求項1に記載のリボタンパク質 I の、免疫原性
部分配列物。 4、表1に示されたリボタンパク質 I または免疫原性
部分配列物をコードするDNAを、原核または真核細胞
中で発現させることからなる、表1に示されたリボタン
パク質 I または免疫原性部分配列物の製造法。 5、請求項1に記載のリボタンパク質 I または請求項
3に記載のこのタンパク質の免疫原性部分配列物を抗原
として用いることによって得られる、ポリクローナル抗
体またはモノクローナル抗体。 6、請求項5に記載の抗体を含んでなる、診断補助物。 7、請求項2に記載のヌクレオチド配列物の全部または
部分、またはそれから派生するヌクレオチド配列物、を
含んでなる、診断補助物。 8、請求項6または7に記載の診断補助物を用いること
からなる、診断法。 9、抗体を産生するためにリンパ細胞を誘導するための
、請求項1または3に記載のタンパク質の使用。 10、請求項1または3に記載のタンパク質に対する抗
体の産生についてリンパ細胞を試験するための、請求項
1または3に記載のタンパク質の使用。
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| DE3829616A DE3829616C2 (de) | 1988-09-01 | 1988-09-01 | Lipoprotein I (OMPI) von Pseudomonas aeruginosa |
| DE3829616.0 | 1988-09-01 |
Related Child Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP11206921A Division JP2000152794A (ja) | 1988-09-01 | 1999-07-21 | 緑膿菌のリポタンパク質i |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
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