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JPH06501614A - 組換えpcr法を用いるキメラ抗体の調製 - Google Patents

組換えpcr法を用いるキメラ抗体の調製

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JPH06501614A
JPH06501614A JP3516456A JP51645691A JPH06501614A JP H06501614 A JPH06501614 A JP H06501614A JP 3516456 A JP3516456 A JP 3516456A JP 51645691 A JP51645691 A JP 51645691A JP H06501614 A JPH06501614 A JP H06501614A
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 この発明はキメラ抗体の調製に関する。この発明は、典型的には、ヒト化抗体( humaoised a+uibodie+)の産生に適用可能である。
抗体は、典型的には、ジスルフィド結合によって互いに連結する2つのH鎖およ び2つのL鎖を含む。各り鎖はジスルフィド結合によって各々のH鎖に連結して いる。各H鎖は、その一端に、可変部ドメイン、それに続く多数の定常部ドメイ ンを有する。各り鎖は、その一端に可変部ドメイン、および他端に定常部ドメイ ンを有してる。このL鎖可変部ドメインは、H鎖の定常部ドメインに並列してい る。L鎮定常部ドメインは、H鎖の第1定常部ドメインに並列している。L鎖お よびH鎖の定常部ドメインは、抗体の抗原への結合には直接は影響しない。
L鎖およびH鎖の多対の可変部ドメインは、抗原結合部位を形成する。L鎖およ びH鎖のこれらドメインは同じ一般構造を有し、各ドメインは、その配列が比較 的保全され、3つの相補性決定領域(CDRs)によって結合された、4つの領 域からなるフレームワークを含む。4つのフレームワーク領域は主としてβ−シ ート構造をとり、CDR5はこのβ−シート構造に結合し、時にはその一部を形 成するループを形成する。CDR5はフレームワーク領域により非常に接近して 保持され、他方のドメインからのCDR5と一緒に、抗原結合部位の形成に寄与 する。抗体のCDR5およびフレームワーク領域は、にab[ら(“5equs oces of proteins ofimmunologieml 1nt ensf” LIS Dep+、of Health and HumanSs tv:ct+、 υS Government Pr1nfiB 0flics 、1987 )を参照することにより決定することができる。
CDR5が可変部ドメインフレームワーク領域とは異なる種に由来する改変抗体 (xlfs+sd ufibod7)の調製がEP−A−0239400に開示 されている。CDR5はラットもしくはマウスのモノクローナル抗体であっても よい。改変抗体の可変部ドメイン、および定常部ドメイン、のフレームワークは 、ヒト抗体由来であってもよい。そのようなヒト化抗体は、ヒトに投与された場 合に、ラットもしくはマウス抗体に対するヒトの免疫応答と比較して、無視し得 る免疫応答しか誘発しない。ヒト化CA M P A T H−1抗体がEP− A−0328404に開示されている。
「オーパーラ’7ブ伸長(overlip !xtensioa ) Jの技法 には、テンプレート・ヌクレオチド配列に相補的なオリゴヌクレオチドブライマ ーの使用および重複末端を有するDNA断片を生成するポリメラーゼ・チェイン ・リアクション(PCR)が含まれる。これらの断片は、各鎖の3′重複を相補 鎖の3′伸長のプライマーとして機能させることを可能にする重複のヌクレオチ ド変更の組み込みによるヌクレオチド配列への特定の改変の導入にこの技法を用 いることを記述している。
部位指向(tife−diucted )変異生成であるこの技法を使用して、 マウス主要組織適合遺伝子複合体クラス−!遺伝子のそれらの変異を生成させ、 クローニングし、分析する。
Borfonら(Grne、 77.61−68 (1989))は、重複伸張 による遺伝子スプライシング(SOE)の技法を記述している。この技法は、プ ライマーA、BSCおよびDを用いるPCRによって生成される2つのDNA片 、ABおよびCD、を結合させることによる、ハイブリッド長さのDNA、AD 、の生成を可能にする。プライマーBおよびCの少なくとも一部は、互いに相補 的である。PCRによって生成した断片ABおよびCDは、ポジ鎖(posi+ ivt 5jrxnd )であるABがネガ鎖(nBalive tfrand  )であるCDのアニールを可能ならしめるよう混合される。BC間の重複は2 本の鎖が互いの伸長を開始させることを可能にする。プライマーAおよびDは、 伸長した鎖のPCR反応の開始に用いられる。
マウスH−2K の一部(CD)の、H−2L’遺伝子の対応する上流および下 流部分である上流および下流領域(それぞれABおよびEF)間への結合に、上 記技法が用いられた。これら全ての断片、AB、、CDおよびEFは、プライマ ーAないしFを用いるPCHにより生成された。3種の断片は、最初に断片AD (すなわち、AB−CD) 、次いで生成物AF(すなわち、AB−CD−EF )を生成するSOEを2回行なうことにより、結合させた。
この発明によると、第1抗体のCDRが第2抗体のフレームワーク領域間に結合 されるキメラ抗体の製造方法が創案されている。
一般に、この発明の技法は、2種のフレームワーク領域、ABおよびCD、およ びそれらの間にドナーCDRによって置き換えられるCDRを含むテンプレート を用いて行なわれる。プライマーAおよびBはフレームワーク領域ABの増幅に 用いられ、プライマーCおよびDはフレームワーク領域CDの増幅に用いられる 。しかしながら、プライマーBおよびCもまたそれらの5′末端に、ドナーCD R配列の全てもしくは少なくとも一部に対応するさらなる配列を有している。プ ライマーBおよびCは、ポリメラーゼ・チェインφリアクション(PCR)を実 施し、それにより全てのドナーCDR配列を組み込むことを可能にする条件下に おいて、互いにそれらの5′末端のアニーリングを可能にするに十分な長さて重 複する。増幅された領域ABおよびCDは、単一反応においてSOEを行ない、 キメラ生成物を生成させることもできる。
この発明の1つの面によると、抗体鎖もしくはそれらの断片をフードし、この抗 体鎖の可変部領域の相補性決定領域(CDRs)の少なくとも1つが第1の哺乳 動物抗体に由来し、かつ可変領域のフレームワークが第2の異なる哺乳動物抗体 に由来するものである、下記式で表わされる二本鎖もしくは一本鎖DNAの製造 方法であって、5−Fl−M−F2 1’ ここで、Mは第2の抗体のCDRをコードするDNAを含み、かつFlおよびF 2はMの側方に位置する配列をコードし、(1) 下記式で表わされる一本鎖も しくは二本鎖DNAテンプレートを調製し、 5−fl−H−fl 3− ここで、HはMとは異なる特異性のCDRをコードするDNAを含み、かっfl およびflは各々F1およびF2に実質的に相同であり、 (i i) D N AオリゴヌクレオチドプライマーA%BSCおよびDを得 、ここで、 Aは、Flの5′末端に対応する5′末端を有し、かつ配列Flの対応長さに等 しい配列alを含み、 Hに向かって5′から3′の方向に指向し;Bは、配列 blはMの対応長さに相補的であり、かっMの5′末端に相補的な3′末端を有 する配列を含み、b2はFlにおける対応長さの配列に相補的であり、かつFl の3′末端に相補的なヌクレオチドから始まる5′末端を有し; Cは、配列 5−c’ −C23− からなり、ここで、 C1は、Mの対応長さに等しく、かつMの3′末端に対応する3′末端を有する 配列を含み、 C2は、F2における対応長さの配列に等しく、かっF2の5′末端に対応する ヌクレオチドから始まる5′末端を有し; Dは、F2の3′末端に相補的な5′末端を有し、かつF2の対応長さに相補的 である配列d1を含み、およびHに向かって5′から3′の方向に指向し;並び に、blおよびclは、PCRを実施可能な条件下において、それらの5′末端 を互いにアニールし得るに十分な長さで重複しており、 (1目)所望の順番で、プライマ一対A、BおよびC,Dを用いて、上記(1) において調製されるテンプレートに対するPCR反応を行ない、および (1v) 上記(目1)において得られる生成物を混合し、プライマーAおよび Dを用いてPCR反応を行なう、ことを包含する方法が提供される。
オリゴヌクレオチドは都合のよい大きさであればよい。
好ましくは、FlおよびF2は、各々少なくとも1種のヒト抗体フレームワーク 領域をコードし、さらに、任意に、CDR5をコードする。好ましくは、Hは前 記第1抗体のCDRをコードする。好ましくは、Mは、非非とCDR領域をコー ドし、最も好ましくは、ネズミ科動物もしくは鰯歯類動物CDRをコードする。
プライマーAおよびDは、通常少なくとも12、例えば少なくとも15ヌクレオ チド、より一般的には20ないし30ヌクレオチドの長さである。所望であれば 、プライマーAおよびDは、それらの5′末端ヌクレオチド内に少なくとも1つ の制限エンドヌクレアーゼ認識部位を含むことができる。プライマーBおよびC は、通常少なくとも20、例えば少なくとも30ヌクレオチドの長さである。よ り一般的には、これらのプライマーは40をこえ、例えば45ないし60ヌクレ オチドの長さである。
一般に、200ヌクレオチド長さまでのオリゴヌクレオチドを合成することが可 能である。したがって、一般にプライマーA、B、CおよびDは、各々15ない し200ヌクレオチド長さである。
■ b およびC1の間の重複の長さは、BおよびCの全長並びに重複領域の特定の 塩基組成を含む多数の因子に依存し得る。しかしながら、重複は通常少なくとも 12、例えば少なくとも15ヌクレオチドである。実施!B様の1つによると、 プライマーBおよびC内の配列b およびclは、同じ数のヌクレオチド長さで ある。この発明の好ましい態様によると、b およびclは両者ともにMの長さ であり、そのため、重複ちまたこの長さである。
通常、プライマーAの3′末端とHの5′末端との距離は少なくともI5ヌクレ オチドである。より一般的には、この距離は、flの長さからAそれ自身の長さ を減じたものである。同様に、Dの3′末端と領域Hとの距離も少なくとも15 ヌクレオチドであり、より一般的には、flの長さからDそれ自身の長さを減じ たものである。実施態様の1つによると、プライマーA、B、CおよびDの各々 の配列al、b2、C2およびdlは、それぞれ15ないし30ヌクレオチドの 長さである。
M、並びにFlおよびF2の5′および3′領域の全配列が、プライマーA、B 、CおよびDの配列によって決定されることは認識されるであろう。
したがって、この状況において、これらのプライマーと配列Fl 、MまたはF 2のどの一部とでもあっても、その間の「相同性」に言及することは適当ではな いと考えられる。その代わり、ここで用いられるように、「対応長さくcorr esp。
nding length) Jという用語が、ヌクレオチド数が等しく、かつ 同一の(または相補的な)配列を有する配列を意味する。
上記(i)に関して、配列f1およびR2はFlおよびF2の各々に実質的に相 同であり、ここでは、プライマーAないしDは、これらのプライマー配列の領域 内でのflおよびR2への小変更の導入に用いることができる。
領域FlおよびF2は、CDRMのいずれかの側方のフレームワーク領域の少な くとも一部をコードするDNAを含む。FlおよびF2はこれらの配列の側方に 位置する領域、例えば、さらなるCDR5をコードするDNAの内部もしくはそ れをこえた領域をコードしてもよい。
他の面によると、この発明は、下記配列からなる、長さが30ないし+10ヌク レオチドのオリゴヌクレオチドを提供する。
5−ol−R23− (ここで、Olは非ヒト起源のCDR領域の少なくとも15ヌクレオチドの配列 を含み、かつ02はヒト起源のフレームワーク領域の少なくとも15ヌクレオチ ドを含む)このオリゴヌクレオチドは、上述の方法におけるプライマーとしての 使用に適している。
さらなる面によると、この発明は、抗体鎖もしくはそれらの断片をコードし、こ の抗体鎖の可変部領域の3つの相補性決定領域(CDRs)が第1の哺乳動物抗 体に由来し、かつ可変部ドメインの4つのフレームワーク領域が第2の異なる哺 乳動物抗体に由来するものである、下記式で表わされる二本鎖もしくは一本鎖D NAの製造方法であって、511−Ml−F2−R2−R3−R3−R43−こ こで、MI SR2およびR3は第2の抗体のCDRをコードす;5DNAを含 み、かっFl、F2、R3およびR4はcDRs Ml、R2およびR3の側方 に位置するフレームワーク配列を含み、 (1) 下記式で表わされる一本鎖もしくは二本gDNAテンプレートを調製し 、 5−fl−Hl−R2−R2−R3−R3−R43−ここで、Hl 、R2およ びR3はMl 、R2およびR3とは異なる特異性のCDR5をコードするDN Aを含み、がっfl、R2、R3およびR4は各々Fl、F2、R3およびR4 と実質的に相同であり、 (ii) DNAオリゴヌクレオチドブライ?−A、B、C,D。
E、FlGおよびHを得、ここで、 Aは、Flの5′末端に対応する5′末端を有し、かつ配列F1の対応長さに等 しい配列a1を含み、 f(1に向かって5′から3′の方向に指向し;Bは、配列 5−b’−bl 3− からなり、ここで、 blはMlの対応長さに相補的であり、かっMlの5′末端に相補的な3′末端 を有する配列を含み、blはFlにおける対応長さの配列に相補的であり、かつ Flの3′末端に相補的なヌクレオチドから始まる5′末端を有し; Cは、配列 clは、Mlの対応長さに等しく、かつMlの3′末端に対応する3′末端を有 する配列を含み、C−は、F2における対応長さの配列に等しく、かつF2の5 ′末端に対応するヌクレオチドから始まる5′末端を育し; Dは、配列 5−d’−dl 3− からなり、こ二で、 dIは、R2の対応長さに相補的であり、かつ〜12の5′末端に相補的な3′ 末端を存する配列を含み、dlは、F2における対応長さの配列に相補的であり 、かつF2の3′末端に相補的なヌクレオチドから始まる5′末端を有し; Eは、配列 elは、R2の対応長さに等しく、かつR2の3′末端に対応する3′末端を有 する配列を含み、R2は、R3における対応長さの配列に等しく、かっR3の5 ′末端に対応するヌクレオチドから始まる5′末端を有し; Fは、配列 flは、R3の対応長さに相補的であり、かっR3の5′末端に相補的な3′末 端を有する配列を含み、R2は、R3における対応長さの配列に相補的であり、 かつR3の3′末端に相補的なヌクレオチドから始まる5′末端を有し; Gは、配列 glは、R3の対応長さに等しく、かっR3の3′末端に対応する3′末端を有 する配列を含み、glは、R4における対応長さの配列に等しく、かっR4の5 ′末端に対応するヌクレオチドから始まる5′末端を有し; Hは、R4の3′末端に相補的な5″末端を有し、かっR4の対応長さに相補的 である配列hlを含み、およびR3に向かって5′から3′の方向に指向し;並 びに、対b1およびcl、dlおよびel、およびflおよびglは、PCRを 実施可能な条件下において、それらの5′末端を互いにアニールし得るに十分な 長さで重複しており、(1目)所望の順番で、プライマー対A%B、C%D、E 、FおよびG、Hを用いて、上記(i)において調製されるテンプレートに対す るPCR反応を行ない、DNA断片AB%CD。
EFおよびGHを得、 (1v) 上記(iii)において得られる断片を結合させ、所望のDNAを得 る、 ことを包含する方法が提供される。
実施態様の1つによると、F4はCDRM3の側方に位置するフレームワーク配 列および抗体鎖の定常部領域の全てもしくは一部をコードするDNAを含む。
工程(1v)は、 (iva) 断片ABおよびCDをプライマーAおよびDと混合し、PCRを行 なってDNA断片ADを得;(ivb) 上記工程(ival の前、その間ま たはそれに続いて、断片EFおよびGHをプライマーEおよびHと混合し、PC Rを行なってDNA断片EHを得、並びに(ivc) 断片ADおよびEHをプ ライマーAおよびHと混合し、所望のDNAを得る、 ことにより行なうこともできる。
変わりに、工程(1v)は、 (ivx) 断片CDおよびEFをプライマー〇およびFと混合し、PCRを行 なってDNA断片CFを得、並びに(ivlrl)断片ABおよびCFをプライ マーAおよびFと混合し、PCRを行なってDNA断片AFを得、かつ(ivc −11断片AFおよびGHをプライマーAおよびHと混合し、所望のDNAを得 るか、あるいは (ivb−21断片CFおよびGHをプライマー〇およびHと混合し、PCRを 行なってDNA断片CHを得、かつ(ivc−2)断片ABおよびCHをプライ マーAおよびHと混合し、所望のDNAを得る、 ことにより行なうこともできる。
図面の簡単な説明 図1は、この発明による方法を説明する。黒塗りのボックスは、CAMFATI !抗体のフレームワーク領域の間に挿入され、本来のCDR(白抜きのボックス )に置き換わる、ネズミ科動物のCDR領域からのDNA配列を示す。A、、B 、CおよびDは、用いられたPCRプライマーを、それらの5′から3′への方 向を示す半矢印(hxlf−urov)と共に示す。
図2は、図1に示される方法に関わるキー配列を詳細に示す。
図3は、この発明の方法が、抗体の3つのCDR領域の全ての置き換えにどのよ うに用いられ得るのかを模式的に示す図。
図4は、二の発明に用いることができるプライマーの1つの取合わせをさらに詳 細に説明する。
FlおよびF2 DNA領域における可能な変異は、図1および3に説明される この発明の態様を対比することにより明らかである。
図1において、車−のCDRDNAの置換を示すこの発の5′末端から始まり、 “D”の5′末端の補足物までである。
この領域は、全体で、3つのフレームワーク領域、2つのCDR5およびプライ マーD内の停止コドンを組み込んでいる全H鎖定常部領域をコードする。対称的 に、5′からCDRまでが置換されたFlのDNAは、単一のフレームワークを 含み、CDR5は有していない。
図3において、プライマー′C#および“D”の間のDNAは、単一のフレーム ワーク領域をコードする。これは、図示される方法が、抗体の可変部類域をコー ドするDNAの3つのCDR5の全ての置換を示すためである。この取合わせに 関して、プライマー゛D”はdlの配列だけではなく、第2のCDR領域の一部 をコードするさらなる5′配列をも含むことに注意すべきである。
抗体鎖の3つのCDR5の全てをコードするDNAが置換される場合には、図3 の取合わせを用いることができる。
したがって、4種のプライマー“A”、B″、“C″および“D” (A、B、 、CおよびDに対して上で定義した通り)からなる第1セツトが、全ての第1C DR(CDRI )および第2CDR(CDR2)の少な(とも一部の置き換え に用いられる。プライマー”E”、′F”、′G”およびH”(各々A、B、C およびDと同様の定義)からなる第2セツトが、第3CDR(CDR3)および CDR2の少なくとも一部の置き換えに用いられる。CDR2の置換を確実にす るために、プライマー′D1および“E”はPCHの実施を可能にする条件下に おいてそれらの5′末端を互いにアニールし得るに十分な長さで重複しなければ ならない。本質的に、CDR2の置き換えは、各々ASB、CおよびDと同様に 定義されている4種のプライマー″C”、“D”、“E”および“F’のセット により達成される。
図3に図示されるこの発明の態様において、断片ABおよびCDがアニールされ て断片ADが得られ、断片EFおよびGHが結合して断片EHが得られる。最後 に、ADがEHと結合して、3つのCDR5全てが置き換えられた可変部類域を コードする断片AHが得られる。
それにより、可変部類域をコードするDNAにおいて、図3に図示されるような プライマー“Aoないし“H“を用いて、3つのCDRDNAの全てを置き換え 得る他の取合わせには、図3(1)に示されるようにプライマー対“A”十′B ”、“C”+“Do、“E”十゛F″および“G”+“H”を用いて反応を行な い、断片CDおよびEFを一緒に結合させて断片CFを生成させ、およびこの断 片を第1断片AB、次にGH,またはその逆のいずれかで結合させることが含ま れる。
その代わりに、3つのCDR5をコードするDNAは連続的に置き換えることも できる。プライマー“A”、“B”、“C”および“H”を用いる第1反応(図 3に示す通りであり、プライマーAないしDと同様の定義)を、この発明に従っ てCDRIの置き換えに用いることができる。プライマー“A”、“E“、“D ゛および′H”を用いる反応からなる第2セツト(図3に示す通りであり、プラ イマーAないしDと同様の定義)はCDR2を置き換える。プライマー“A”、 “F”、“Goおよび“H”を用いる反応からなる最後のセットはCDR3を置 き換える。
プライマーAおよびDは、それらの5′末端に、例えばflまたはF2には表現 されない制限エンドヌクレアーゼ認識配列を表わすさらなる配列を有していても よい。
AおよびDの配列、5′からalおよびdlは、flとFlおよびF2とF2と の間の相同性の程度を考慮する場合、無視される。同様に、Flおよび/または F2がそれぞれflおよび/またはF2よりも短かければ、相同性の程度を測定 する際に、Fl /F2に対になる相手が存在しないfl/f2のさらなる配列 も無視される。
全てのプライマーには、fl/f2配列および対応する、もしくは相補的なプラ イマー配列との間に、2ないし5のヌクレオチド不適合のような数、例えばlな いしlOが含まれていてもよい。これらの不適合は、flおよびF2と比較した ときに、FlおよびF2の配列における所望のコーディング変更の設計に用いる ことかできる。
この発明の方法は、CDR領域のいずれか1つが置き換えられているキメラ抗体 またはそれらの断片の製造に用いることができる。また、これは、抗原結合領域 のCDR領域のいずれか2つ、もしくは3つ全ての置き換えにも用いることもで きる。
この発明の方法は、完全抗体りもしくはH鎖の1以上のCDR5をコードするD NAの置き換えに用いることができる。
少なくとも1つのCDR領域をコードするDNA断片を用いてもよい。例えば、 LもしくはH鎖の一方もしくは両方をコードするDNAがこの発明の方法により 処理されている、FabSF (ab)2またはFv断片のような抗体断片を製 造することが可能である。
抗体のフレームワーク領域およびCDR5をコードするDNAはしばしばベクタ ー、例えば発現ベクター内に存在する。
幾つかのケースでは、プライマーAおよびD(または少なくともそれらの領域a  およびd、)の一方もしくは両方が、置き換えられているCDHの側方に位置 するフレームワーク領域の1つの配列よりも、むしろベクター配列に対応するこ とが必要であるか、もしくは望ましい。
この発明によって製造されたDNAは、適切な複製もしくは発現ベクターにクロ ーンし、バクテリア、イースト、昆虫または哺乳動物細胞に導入してキメラ抗体 を製造することができる。適切な発現系の例を以下に記載する。
抗体鎖は相補的抗体鎖と共に共発現(co−expresssd) シ得る。少 なくとも、相補釣鐘の可変部領域および/または各定常部領域のフレームワーク は、一般に、前記第2の種に由来するものである。L鎖およびH鎖は共発現し得 る。いずれか、もしくは両方の鎖は、この発明の方法により調製されている。
好ましくは、両鏡のCDR5は選択された同一の抗体に由来する。両発現鎖を含 む抗体を回収することができる。
抗体は、天然抗体またはそれらの断片の構造を有していることが好ましい。した がって、抗体には、完全抗体、(Fib’) 2断片、Fab断片、L鎖二量体 またはH鎖を含みf尋る。抗体は、I gGl 、I gG2.1gG3もしく は1gG4のようなIgG、IgM、IgA、IgEまたはIgDてあってもよ い。その代わりに、抗体は、WO36101533に記載されている型のキメラ 抗体であってもよい。
WO36101533によるキメラ抗体には、抗原結合領域および非免疫グロブ リン領域が含まれる。この抗原結合領域は、抗体り鎖可変部領域またはH鎖可変 部領域である。典型的には、キメラ抗体は、LおよびH鎖可変部領域の両者を含 む。
非免疫グロブリン領域は、そのC末端で抗原結合領域に融合している。非免疫グ ロブリン領域は、典型的には、非免疫グロブリンタンパク質であり、酵素領域、 公知の結合特異性を有するタンパク質由来の領域、タンパク毒由来の領域、また は実に遺伝子によって発現したいかなるタンパク質に由来する領域であってもよ い。キメラ抗体の2つの領域は、切断可能なリンカ−配列によって接続されてい てもよい。
この発明は、抗体、典型的にはモノクローナル抗体、例えばラットまたはマウス 抗体のヒト化に好ましく用いられる。
したがって、得られた抗体のフレームワークおよび定常領域は、抗体のLおよび /またはH鎖のCDR5がラットもしくはマウスCDR5であるにもかかわらず 、ヒトフレームワークおよび定常領域である。好ましくは、全てのCDR5はラ ットまたはマウスCDR5である。この発明に従って製造される抗体は、ラット またはマウスCDR5をのせたIgG1゜1gG2.1gG3.1gG4のよう なヒトIgG、IgM。
IgA、IgEまたはIgDであり得る。
この発明の方法は、得られるキメラ抗体が、CDR領域(複数)の起源である非 ヒト抗体の抗原結合能力を保持するような方法で行なわれる。
出発抗体は、典型的には、選択された特異性を有する抗体である。この特異性の 保持を確実にするために、この抗体の可変部領域フレームワークは、最も近い他 の種の抗体の可変部領域フレームワークであることが好ましい。「概ね最も近い 」とは、アミノ酸配列に関して概ね最も相同性が高いことを意味する。2つの可 変部領域の間で、少なくとも50%の相同性があることが好ましい。
この発明による方法によってヒト化抗体を製造するための4つの一般的な工程が ある。
(1)出発抗体りおよびH鎖可変部領域のヌクレオチドおよび予想されるアミノ 酸配列の決定; (2)キメラ抗体の設計、すなわち、どの抗体フレームワーク領域をこの方法で 用いるかの決定; (3)オリゴヌクレオチドA、BSCおよびDの同定、およびヒト化抗体をコー ドするDNAを製造するための一連のPCR反応におけるこれらのプライマーの 使用;並びに(4)このDNAの適切な宿主細胞系への形質導入およびヒト化抗 体の発現。
これら4つの工程を、抗体のヒト化に関連して以下に説明する。しかしながら、 それらは、非ヒト種の抗体に改変する場合にも等しく良好に適用可能である。
1望1:抗体りおよびH鎖可変部領域のヌクレオチドおよび予想されるアミノ酸 配列の決定 キメラ抗体を作製するために、抗体のHおよびL鎖可変部領域のアミノ酸配列の みを知る必要がある。定常部領域の配列は、これらがヒト化策に寄与しないので 、無関係である。
抗体の可変部領域アミノ酸配列を決定する最も簡単な方法は、HおよびL鎖可変 部領域をコードするクローン化cDNAからのものである。
与えられた抗体のHおよびL鎖可変部領域cDNAをクローニングする2つの一 般法:(1)通常のeDNAライブラリーから、または(2)PCRによる方法 が存在する。これら両者の方法は広く知られている。CDNAのヌクレオチド配 列が与えられれば、この情報を抗体可変部領域の予想されるアミノ酸配列に翻訳 することは簡単なことである。
工程2:キメラ抗体の設計 ヒト化の工程でどのヒト抗体配列を用いるかを決定するにあたり、考慮すべき幾 つかの因子がある。LおよびH鎖のヒト化は互いに独立に考慮されるが、その議 論の道筋は基本的には互いに似ている。
この選択工程は、以下の根拠に基づいている:与えられた抗体の抗原特異性およ び親和性は、主として、可変部領域CDR5のアミノ酸配列によって決定される 。可変部領域フレームワーク残基はほとんど、もしくは直接は寄与しない。フレ ームワーク領域の主な機能は、CDR5を、抗原を認工するための正しい空間方 位に保持することである。このため、ヒト可変部領域フレームワークへの鰯歯類 動物のCDR5の置換は、ヒト可変部領域がそれらの起源である鰯歯類動物の可 変部領域と高い相同性を有している場合に、それらの正確な空間方位が最も保持 される結果となるようである。したがって、好ましくは、ヒト可変部領域は奮歯 類動物の可変領域(複数)と高い相同性を有するものが選ばれるべきである。
適切なヒト抗体可変領域配列は以下のようにして選択することができる: 1、コンピュータ・プログラムを用い、全ての利用可能なタンパク質(およびD NA)データベースを、鰯歯類動物の抗体可変部領域と最も相同のヒト抗体可変 領域配列について検索する。適切なプログラムの出力は、鰯歯類動物の抗体と最 も相同な配列、各配列の相同性のパーセント、および鰯歯類動物の配列に対する 各配列のアラインメントのリストである。これは、HおよびL鎖可変部領域の両 方について独立に行なわれる。上記分析は、ヒト免疫グロブリン配列のみが含ま れている場合には、より簡単に遂行される。
2、ヒト抗体可変部領域配列を挙げ、相同性の比較を行なう。
最初に、非常に変わりやすいH鎖のCDR3を除いて、CDR5の長さについて 比較を行なう。ヒトH鎖並びににおよびλL鎖はサブグループに分けることがで きる:H鎖3サブグループ、に鎖4サブグループ、λ鎖すブグループ6サブグル ープ。各サブグループ内のCDRの大きさは似ているか、サブグループ間で変化 する。通常、相同性の第1の近似値として、諺歯類動物Ab CDRをヒト−サ ブグループと合わせることができる。その後、同じ長さのCDR5を有する抗体 のアミノ酸配列相同性について、特にCDR5内、しかしそれだけではなく周囲 のフレームワーク領域においても、比較を行なう。最も相同のCDR5を有する ヒト可変部領域をヒト化のためのフレームワークとして選択する。
例えば、R,X、5aiki (’The Design and Oplim isa+ion ofthe PCR″ in ”PCRTechnolog7 ” 、 Ed H,A、Er1ich。
5lock+on Presl、(1989) )によって記載されているよう に、PCR用のプライマーを設計する一般的な原理はよく知られている。加えて 、各CDR置換に対して、特別な要素を考慮することができる。必要または所望 であるならば、Aおよび/またはDの5′末端は、第2および/または第3CD Hの一部または全てをコードする。このプライマー、AおよびDは、それらの5 ′末端に、制限酵素部位を含むこともできる。これらの部位は、最終PCR反応 からのヒト化抗体のクローニングに用いられるベクターに従って設計することが できる。プライマーBおよびCは、PCRを実施可能にする条件下でそれらの5 ′末端を互いにアニールし得るに十分な長さで少なくとも重複することを満足さ せる長さでなければならない。これには、通常、少なくとも12、好ましくは少 なくとも15ヌクレオチドの重複が必要とされる。4種のプライマーのうちの1 種以上が、それらのテンプレート配列とヌクレオチド1個以上が異なっていても よい。これらの相違は、抗体のフレームワーク領域への所望のコーディング変更 の導入に利用することができる。
これらのプライマーは、その後、ヒト化抗体をコードするDNAを生成するため に、適当なテンプレートを用いる一連のPCR反応に用いられる。PCR反応は 、5xiki ら、5cienu 、239.487−491 (1988)の 記載の通りに行なうことができる。各段階で、PCR反応の所望の生成物を、例 えば選択濾過を用いて、必要に応じて精製することができ、必要であれば、生成 物の同一性を、例えばゲル電気泳動により、確立することができる。
工程4:改変抗体の形質導入および発現キメラ抗体をコードするDNAを製造す る反応に続いて、このDNAを、LまたはH鎖定常部領域をコードする適当なり NAに結合させ、発現ベクターにクローニングし、適当な宿主細胞系、好ましく は哺乳動物細胞系に形質導入する。これらの工程は、ルーチン方式で行なうこと ができる。したがって、キメラ抗体は、 a)少なくともIg HまたはL鎖の可変部領域をコードするDNA配列に動作 可能に結合する、適当なプロモータを含む第1の増殖可能な発現ベクターであっ て、前記可変部領域が第1の抗体からのフレームワーク領域および異なる特異性 を有する第2の抗体からのCDR5を含むベクターを調製し、 b)必要であれば、少なくとも相補的1g LまたはH鎖各々の可変部領域をコ ードするDNA配列に動作可能に結合する、適当なプロモータを含む第2の複製 可能な発現ベクターを調製し、 C)前記第1ベクターまたは調製されたベクターの両方を用いて細胞系を形質転 換し、 d)前記形質転換細胞系を培養して前記改変抗体を製造する、 ことを包含する方法によって調製することができる。
好ましくは、工程a)におけるDNA配列は、抗体鎖の可変部領域および、また は各定常部領域の両方をコードする。
抗体は回収し、精製することができる。改変抗体を製造するために形質転換され た細胞系は、チャイニーズl\ムスター卵巣(CHO)細胞系またはミエローマ 、11イブリドーマ、トリオーマまたはクアドローマのような、有利にリンパ系 起源の不死化哺乳動物細胞系であってもよい。この細胞系は、エプスタイン・バ ールウィルスのようなウィルスを用いた形質転換により不死化されている、B細 胞のような正常9279球であってもよい。最も好ましくは、不死化細胞系はミ エローマ細胞系またはそれらの誘導細胞系である。
キメラ抗体の製造に用いられる細胞系は好ましくは哺乳動物細胞系ではあるが、 バクテリア細胞系またはイースト細胞系のような他の適当な細胞系を代わりに用 いることができる。
ミエローマ細胞系のような不死化細胞系の幾つかが、それらの正常状態において 、単離されたIg LまたはH鎖を分泌することが知られている。そのような細 胞系が工程a)で調製されたベクターで形質転換された場合には、通常分泌され る鎖が、工程a)において調製されるベクターによってコードされるIg鎖の可 変部領域に相補的である限りにおいて、方法の工程b)を行なう必要はない。
しかしながら、不死化細胞系が分泌を行なわないか、もしくは相補釣鐘を分泌し ない場合には、工程b)を行なう必要がある。この工程は、工程a)において製 造されたベクターを、キメラ抗体のLまたはH鎖の可変部領域だけではなく、相 補的な可変部領域をコードするようにさらに操作することにより行なうことがで きる。
代わりに、工程b)は、不死化細胞系の形質転換に用いられる第2のベクターを 調製することにより行なわれる。この代替法は調製品のより簡便な構築をもたら すが、抗体製造の効率に劣り、第1の代替法はど好ましいものではない。
不死化細胞系が相補的りまたはH鎖を分泌する場合には、例えば、適当なバクテ リア細胞をベクターで形質転換し、次いでバクテリア細胞をスフ二ロプラスト融 合により不死化細胞系と融合させることにより、形質転換細胞系を製造すること ができる。代わりに、エレクトロポレーシヨンもしくは他の適切な方法により、 DNAを不死化細胞系内に直接導入することもできる。
その結果、抗体鎖の可変部領域のCDR5が第1の哺乳動物種の抗体の対応する CDR5と相同であり、かつ抗体の可変部領域のフレームワークおよび定常部領 域が第2の異なる哺乳動物種の抗体の対応するフレームワークおよび定常部領域 と相同である抗体か製造される。典型的には、LもしくはH鎖の可変部領域の3 つのCDR5全てが第1の種に由来する。
抗体は、IgG1.1gG2.1gG3もしくは1gG4のようなIgG、Ig M、IgA、IgEまたはIgDであってもよい。代わりに、抗体はW Oa6 101533に記載される型のキメラ抗体であってもよい。
この発明の組換えPCR技法は、3回のPCR反応を用いてわずか2日で完全に ヒト化されたMAb DNA配列の生成を可能にする。従来、部位指向変異誘発 (Jooei 凶、合成(Quetn 旦、匣1回具 Acad、 Sti、U 、S、A、、 86゛10029−10033 (1989) )が抗体のヒト 化に用いられている。
上記方法は、多数のヒトIgGサブグループmH鎖(Cbar7ら、Ce1l、 44.97−106 (1986) )に存在する19アミノ酸CDRH2のよ うな大きなCDR5を移相するにも拘らず、手順の中でより少ないオリゴヌクレ オチドしか必要としないという、これらの技法を凌駕する利点を有する。例えば 、図4に示されるように、第1のPCR生成物がCDRの中央部で15bp重復 するように設計されている場合には、FR標的配列に対応する15bpの相同性 を推測すると、57bpのCDRの適当なFR上への移送には最大51bpのオ リゴヌクレオチドが必要となる(Higuchi、 υsing PCRto  engineer DNA、in″PCRT!chnolog7@Ed、 11 .A、 Er1ich、 5tockfon Press(+989) )。
また、この発明の技法は、全ての操作を、dsおよびssベクター間のサブクロ ーニングを必要とすることなくdsDNAで行ない、その結果、ヒト化生成物の 生成に要する時間および労力を減少させることができるという、部位指向変異誘 発を凌駕する利点を有する。
以下の例によりこの発明を説明する。
例 1 (a)ヒト・バックグランドへのDNA8 CDRIIIの組換えPCRグラフ ティング この目的は、ラット抗ジゴキシンmAb (DNA8)からのH鎖CDRI ( CDRHI )をヒト1g主鎖にグラフトすることであった。
組換えPCHに使用されるテンプレートは、予めヒト化される(配列番号1)。
これは、ゲノムの形態からcDNAの形態に再操作(re−engineers d ) L、続いて、R13において、CAMPATトIB CDR112オヨ ヒCDR113配列をDI48 CDRB2 オヨヒCDRB3に置き換えてH UIJDXCB、23 uテンプレートを生成させるために、部位変異誘発を行 なったものである。
PCR反応(Siiki ら、5cience 、 239.487−491  (1988))は、Sgttrbrookら、Mol!cular CloIl ing : A Lsbora+arIManual、 2nd Edn、、  Co1d Sp「ing Harbor Libora+o+7 (19891 の方法によって調製したti HUMDXCB、 23テンプレートを用いて行 なった。反応は、温度サイクル(94℃!分間、50℃2分間および72℃3分 間)25回とそれに続<72℃での最後の10分間の工程を用いて、プログラム 可能な加熱ブロック(Hマbxid)内で行なった。製造者が推すように、各プ ライマー18g1テンプレート50ngおよびnLポリメラーゼ(1’erki n HaberCetus ) 2.5ユニツトを反応緩衝液で最終容積100 μlとして用いた。合成オリゴヌクレオチドは、7500DNAシンセサイザー (Milligu)で作製した。
用いた方法を図1にまとめる。使用したプライマーは:A:配列番号2 B:配列番号3 C:配列番号4 D:配列番号5 プライマー対AとB1およびCとDそれぞれを用いて2つのPCR反応を行なっ た。プライマーAおよびDは、HIIMDXCIIl、 23インサー ト(D  5’ オヨび3″末端1:Bind I11部位を取り込んだポジおよびネガ 鎖オリゴヌクレオチドに対応する。
図2は、!IIIMDXcH,23インサートの3つの領域のヌクレオチド配列 を示し、このインサートは、CAMPATII−1!Iリーダー配列の開始コド ンを含むインサートの5′末端の最初の42bp ;CAMPATH−Illか らのFRBIの3’ 27bp 、 CDRIllの全長およびFlllI2の 5’ 27bll ;およびCAMPATH−111定常部領域(C84>末端 の停止コドンを含むインサートの3′末端の最後の27bpを取り込んでいる。
これらの配列は、それぞれ117bPおよび+206bpに分離している。プラ イマーBは、DNA8のCDRHI配列と共に、CAMPATH−111CりR 1l+の代わりにCCAMPACAMPATHhe 27およびThr 30を NEW FRHIに存在するSer残基に変換し戻す点変異を有する’I CA MPATII−11t FR旧領領域3′末端からのネガ鎖配列を有している( 図2)。プライマーCは、プライマーBのCDRIII領域に相補的であり、C AMPATII−IHFR112の5′末端に入り込むDNA8 CDRIII のポジ鎖配列から構成されている(図2)。第1回のABおよびCD PCR反 応において、プライマーBおよびDそれぞれからBUMDXCIl、 23ネガ 鎖が合成される(図1)。次のサイクルにおいて、断片ABおよびCD(各々配 列番号6および7)が増幅される(図1および2)。このように、この2つの反 応の生成物はHUMDICH,23インサートの全長を構成するが、これは上述 の点変異およびDNA8のCDRII11配列で置換されたCoop[h−1n  CDRHIを有する。断片ABおよびCDは両者とも、変性および再アニーリ ング(reinn!xliB )の際に重複配列がアニールできるように、DN A8 CDR旧配列配列している。
過剰のプライマーは、C<++j+1con 100で選択濾過することにより ABおよびCD PCR反応から除去した(Higuchi各反応液50μlを TE (10mM)リス−HCN%pH8,0、ImM EDTA)2mlに入 れ、Cenjricon 100の上部貯蔵槽において混合した。製造者のプロ トコルでは、続いて固定角ローター内における100OXGでの25分間の遠心 が用いられ、PCR生成物を40μl濃縮物として回収した。
Csn1ricon 100濃縮物10μmに対し、上述の第1PCR反応で行 なった条件と同じ条件を用い、プライマーAおよびD(図1)を用いる組換えP CR反応を行なった。断片ABのポジ鎖およびCDのネガ鎖はそれらの3′末端 に相補的DX48CDRHI配列を含んでおり、第1PCRサイクルにおいて、 アニールし、互いのプライマーとして作用する。重複の伸長は、移植DX48  CDRBIを含有する組換え生成物断片ADを生成し、これはPCHの次の回で プライマーAおよびDにより増幅される(図1および2)。断片ABおよびCD の残りの鎖(それらの5″末端で相補的)は互いに開始させることはできないが 、プライマーAおよびDのテンプレートの役割を果たすことができる。これらは 、反応中にプライマーBおよびCが欠けているために指数的な様式で増殖するこ とはないが、より多くの第1PCR生成物を生成する。
ゲル精製PCR生成物を、89mM)リス−ホウ酸塩72m〜I EDTA中の 0.8%タイプ■:メデイウムEEOアガロース(Sigma )を含有し、エ チジウムブロマイドで染色することにより可視化されたアガロースゲルで分析し た。断片の予想されたサイズは以下の通りであった:AB、207bp:CD、  1285bp ; AD、 +471bp0反応ADにおいて他の小さなバン ドもみられたものの、各々の場合に観察された顕著なバンドは予想されたサイズ であった。
(b)組換えPCR生成物のクローニングおよび配列決定断片AD(配列番号8 )をゲル溶出させ、Hindln (BRL)で消化してpUC−18(BRL )のBindI[I部位にクローニングした。組換え分子を含有するクローンの ヌクレオチド配列を、5equsnass Kit (U S B)のプロトコ ルに従って、プラスミド争ブライミング(plasmid priming )  、続くジデオキシ連鎖停止法(dideox7 chain−terminz tion method :Saagtrら、Proc、Ng目、Acad、S ci、υ、S、A、、74.5463−5467 (1977) )によって決 定した。全1463 n+インサートは適正な配列であり、2組のPCR反応に 起因する取り込みの誤りはないことが見出された。
例2 この目的は、YFC51,1,1ラット抗ヒト−CD18 HおよびL鎖のヒト 化であった。両鏡の可変部領域のDNA配列が決定され、以下に示されている。
配列番号9および10 − H鎖、および配列番号11および12− L組 上述の工程(2)に記載される選択手順を用い、NEWM H鎖およびREI  L鎖のヒト可変部ドメインeフレームワーク(Kabij 亘、’5equen ces of pjoleins of im+*unologicxlint erest’ U、S、Dept、of l1exljh xnd llu+u ++ 5ervices、U、S。
Govsrnmsn! Priling 01!ies (1987) )をヒ ト化方法のために選択した。
ヒト化HおよびL鎖を以下の通りに構築した。
(i) L鎖 L!1!オリゴヌクレオチド・プライマーAL ;配列番号13 BL :配列番号14 CL :配列番号15 D、:配列番号l6 EL :配列番号17 F、:配列番号18 GL:配列番号19 Ho:配列番号20 PCR反応は、温度サイクル(94℃1分間、50℃2分間、および72℃3分 間)20回とそれに続<72℃での最後の10分間の工程を用いて、プログラム 可能な加熱ブロック(Hybaid)内で行なった。製造者よって勧められる通 り、各プライマー1μg1特定の量のテンプレート、およびTiqポリメラーゼ (Perkin Elmu Ce1us) 2.5ユニツトを反応緩衝液で最終 容積100μlとして用いた。
PCRの最初のテンプレートは、CAMI’ATH−IHL鎖(REI上のヒト 化CA+1PATH−1; Pageand S7dsnhxm、Biotec hnology9、64−68. (19911)であった。4通りの初期PC R反応を、各反応力たりテンプレート10ngを用い、各々プライマー対A と BCとDE とF およびGLとH4を用L L’L L’L L いて行なった。これらのPCR反応の生成物、断片A B t −CDLSEF LおよびGHLを、製造者によって勧められるプロトコルに従って、Prep− A−Gene (Bio−Rid )を用いて精製した。断片AB とCD、お よびEF、とGH,を各精製り 生成物の1/4を用いて結合させ、それぞれプライマーAL1とDLおよびEL とHLを用いて組換えPCR反応を行なった。これらの反応の生成物、断片AD LおよびEHL、を上述の通り精製し、プライマーALおよびH4を用いる組換 えPCR反応において、各々の1/4を結合させた。ヒト化り鎖組換えPCR最 終生成物、AHLを、Crove 亘(1991)の方法に従い、プライマーA LおよびHL中のHindn1部位を利用してpUC−18(BRL)のHin dDI部位にクローニングした。
単離プラスミドをジデオキシ連鎖停止法によって配列決定し、適正な配列のクロ ーンを選択した。
(ii) H鎖 H鎖オリゴヌクレオチド・プライマー A、A=配列番号21 BH:配列番号22 CH:配列番号23 DE:配列番号24 Eヨ:配列番号25 FH:配列番号26 GH:配列番号27 HH:配列番号28 PCRの最初のテンプレートはCAMPATト11 H鎖であった。
段落(i)に記載の組換えPCR法ではあるがオリゴヌクレオチドブライマーA  ないしHHを用いる方法を利用して、■ 鰯歯類動物のCDR5をテンプレート上にグラフトした。最終PCR,すなわち 断片AD およびEHHとプライマー■ A およびHl、では高い収率で生成物を得ることかできな■ いので、(断片AD およびEF、から)断片AFHを生成させ、断片EHと共 に、プライマーA およびH,を用いII H るPCRに用いた。オリゴヌクレオチドA およびHHは、それぞれ1Iind nIおよびEcoRIを用いて、ヒト化可変部領域の初期クローニングが容易に なるように設計し、かつ、次の可変部領域のクローニングを容易にするために、 選択された適切な定常部領域と共にSpt 1部位をオリゴヌクレオチドGHの N EWMフレームワーク4 (FH4)に導入した。Spe I部位は、ヒト 化H鎖テンプレートの位置109(前出のKxbaj 旦によるナンバリング) のロイシン残基を変えないように選択した。6つのヒトH鎖J−ミニジーン(■ −ロinigens)のうちの4つはこの位置にロイシンを有している(前出の Kabat 9)。
ヒト化H鎖可変部領域組換えPCR生成物を、Bindm/」二R1切断pUC −18(BRL )にクローニングし、適性配列を有する単離プラスミドを選択 した。CAMPATト11I H鎖のFH4およびγ11定部領域を、オリゴヌ クレオチド・プライマーXll (配列番号29)およびYll (配列番号3 0)を用いてp U C−18にPCRクローニングした。プライマーXBはS pe Iおよび肛odIII部位を有し、YBはEcoR1部位を有する。
ローニングに用い、適性配列を有する単離プラスミドを選択した。続いて、加工 FR4Slυ■部位を用いて、ヒト化可変部領域およびγ11定部領域クローン から完全H鎖を再構築した。
配列表 1.配列番号1の情報 i)配列の特色: (A)配列の長さ ・ 1457 (B)配列の型 : 核酸 (C)鎖の数 二 一本鎖 (D)トポロジー : 直鎖状 ii)配列の種類 : cDNA it)配列の特徴 (A)特徴を表わす記号:CDS[?コーディング配列](B)存在位置 +  1.、.1457(D)他の情報 : /生成物−“可変部類域H鎖”標準名糟 “HUMDXCH,23” it)配列の特徴 (A)特徴を表わす記号: MitCf*xjur!(B)存在位置 + 15 6.、.182(D)他の情報 : /機能−CAMPATII IHFRHI it)配列の特徴 (A)特徴を表わす記号: Mice jtx+ure(B)存在位置 : + 83.、.197(D)他の情報 : /機能−CAMPATII III C DR旧1り配列の特徴 (A)特徴を表わす記号: Wise [ex+ure(B)存在位置 : 1 98.、.224(D)他の情報 : /機能−CAMPATHill FRB 2xi)配列の記載 : 配列番号1 AAG″′″ACA CTTAC丁GAGC入CλCλGGACCTCi%CC ATCコ8M!!t TにCACCGTG TC’T GSCTTCACCTTCAcCGA’l’  TT口τACλTG MC197Cys Thr Val Ser Gly P ha Thr Phtτ:; シp P11!! Tl/τ*at xsnTO CGTG AGλ CAG CCA CCT GGA CにA GGT 224 T=p Vll Arg Gより pr□ p;□ GIY Arg GIY1 4コO CCに GGT AAA TC;AGTGCGACGGAAGCTT 1547 pro Gユl/ L”i’S 2、配列番号2の情報 i)配列の特色: (A)配列の長さ :24塩基対 (B)配列の型 : 核酸 (C)鎖の数 : 一本鎖 (D)トポロジー : 直鎖状 ii)配列の種類 : 5sDNA iii )ハイポセティヵル配列 :NOiマ)アンチセンス 二N。
xi)配列の記載 : 配列番号2 GATCAAGCTTτλCAGTTACT GAGC243、配列番号3の情 報 i)配列の特色: (A)配列の長さ =45塩基対 (B)配列の型 : 核酸 (C)鎖の数 : 一本鎖 (D)トポロジー : 直鎖状 ii)配列の種類 : 5sDNA !11)ハイボセティカル配列 :N0iv)アンチセンス : Yes xi)配列の記載 : 配列番号3 TCGCACAGACCGTCGTGGλA にTCtl;TC;AATA C ごλTACCCλC入CCC5454、配列番号4の情報 i)配列の特色: (A)配列の長さ :45塩基対 (B)配列の型 : 核酸 (C)鎖の数 二 一本鎖 (D)トポロジー : 直鎖状 ii)配列の種類 : 5sDNA 111)ハイポセティカル配列 :N0iv)アンチセンス ;N0 xi)配列の記載 : 配列番号4 ACTTλTGGTA TCGGTcTGGC−CTGGGTGAGA CAG CCACCTG GACGA 455、配列番号5の情報 i)配列の特色: (A)配列の長さ :27塩基対 (B)配列の型 : 核酸 (C)鎖の数 二 一本鎖 (D)トポロジー : 直鎖状 ii)配列の種類 : 5sDNA iii )ハイポセティヵル配列 :N。
iv)アンチセンス : Yes xi)配列の記載 : 配列番号5 CλTTTACTCA CC;CTGCCTTCGAACTAG 276、配列 番号6の情報 i)配列の特色: (A)配列の長さ :207塩基対 (B)配列の型 : 核酸 (C)鎖の数 : 二本鎖 (D)トポロジー : 直鎖状 五【)配列の種類 : dsDNA xi)配列の記載 : 配列番号6 GATCλ入CCτT TACAGTTACT GAGCACkCλG GAC CTCλCCλ TG 421.−−0100.、、、、、、、、、−、、、、 、、、、、、、、、、、、、、、、、−、、、、、 159TccxcccTc ’r CTGGCAGCACCTTCAGCACT TATGGTATにG G T(1;TGGGC2077、配列番号7の情報 i)配列の特色: (A)配列の長さ : 1285塩基対(B)配列の型 : 核酸 (C)鎖の数 : 二本鎖 (D)トポロジー : 直鎖状 ■)配列の種類 : dsDNA xi)配列の記載 : 配列番号7 人CTTATGGTA TGGC;TGTGCI;G CTGGC;TGAGA  C入GCC入ccTc cλCにAGGT 43、、、、、、、、、、、、、 、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、 、 ’254CCGGGTλλAT GAGTGCGACCGAAGCTTGA T CL2ε58、配列番号8の情報 i)配列の特色: (A)配列の長さ : 1471 (B)配列の型 : 核酸 (C)鎖の数 : 二本鎖 (D)トポロジー : 直鎖状 ii)配列の種類 ・ d s DNA目)配列の特徴 (A)特徴を表わす記号: CD5 (B)存在位置 + 1.、.1471(D)他の情報 : /生成物−“可変 部類域H鎖″皇工)配列の特徴 (A)特徴を表わす記号+ MiB 1eatun(B)存在位置 : 160 .、.186(D)他の情報 : 7機能 CAMPATH11FR旧ix)配 列の特徴 (A)特徴を表わす記号: Wise fexturt(B)存在位置 : 1 75.、.17?(D)他の情報 二 点変異 ix)配列の特徴 (A)特徴を表わす記号: Misc fei++ue(B)存在位置 : 1 84.、.186(D)他の情報 二 点変異 ix)配列の特徴 (A)特徴を表わす記号: Misc lcs!u+e(B)存在位置 : 1 87.、.207(D)他の情報 : /機能−DK48 CDR旧ix)配列 の特徴 (A)特徴を表わす記号: Misc fesjott(B)存在位置 : 2 08.、.234(D)他の情報 : 7機能 CAMPATII 1!! F R1]2xi)配列の記載 : 配列番号8 GATCAAGcT″: τACλGTTλCT GAG(入CλCλGGλC CTCACCATG 42t 、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、、 、、、、、、+、、 159T(1;CAce GTG TC’!’ GGCA にCAcCTTCAGCACτ T入T GGT ATG :L98cys T hr Val Saw Gly (Sar) Thr Ph@(Sar) Ta r Tyr Gly MatGGT GTG c、;こ TGG GTG AG A CAG CGA CCτ GGA CGA GGT 2コ4Gly Val  GLy Trp Valλrg Gin ?ro pro Gly Arg  GlyCCに GGT 入λλ TGλGTGCGACGGA入GCTTGλT C1471Pro GIY Ala (9)配列番号9の情報 (i)配列の特色: (A)配列の長さ :417塩基対 (B)配列の型 : 核酸 (C)鎖の数 二 二本鎖 (D)トポロジー : 直鎖状 (目)配列の種類 : cDNA (マi)起源: (A)生物名 :R1口us rxNus(1x)配列の特徴 (A)特徴を表わす記号: CD5 (B)存在位置 : 1.、.417 (D)他の情報 : /生成物−“シグナル配列を有する可変部類域H鎖” /標準名−’ YFC51゜1.1’ (ix)配列の特徴 (A)特徴を表わす記号: Mise signxl(B)存在位置 :1.、 .57 (D)他の情報 : /機能−“シグナル配列”(1x)配列の特徴 (A)特徴を表わす記号: Mi+c I!1tur!(B)存在位置 : 1 48.、.162(D)他の情報 : /機能−“CDRI”(lり配列の特徴 (A)特徴を表わす記号: Mise texture(B)存在位置 : 2 05.、.255(ix)配列の特徴 (A)特徴を表わす記号: Mise l5xlur!(B)存在位置 : 3 52..184(xi)配列の記載 : 配列番号9 フご==?Tにコにλ=にり久フご烏フ、1: A1%C=コニ=:丁=フr’ −+ Z S ’+(10)配列番号10の情報 (i)配列の特色: (A)配列の長さ :139アミノ酸 (B)配列の型 : アミノ酸 (D)トポロジー : 直鎖状 (ロ)配列の種類 : 蛋白質 (!1)配列の記載 : 配列番号10(11)配列番号11の情報 (i)配列の特色: (A)配列の長さ =375塩基対 (B)配列の型 : 核酸 (C)鎖の数 : 二本鎖 (D)トポロジー : 直鎖状 (ii)配列の種類 : cDNA (vi)起源: (A)生物名 : RxHus rxftus(ir)配列の特徴 (A)特徴を表わす記号: CD5 (B)存在位置 : 1.、j75 (D)他の情報 : /生成物−“可変部領域り鎖”/標準名−“YFC51, 1,1” (ix)配列の特徴 (A)特徴を表わす記号: Muse 5Hntl(B)存在位置 :1.、. 60 (D)他の情報 : /機能−“シグナル配列”(ix)配列の特徴 (A)特徴を表わす記号: Misc texture(B)存在位置 : 1 30.、.162(D)他の情報 : /機能−“CDR1”(ix)配列の特 徴 (A)特徴を表わす記号: Muse fexture(B)存在位置 : 2 08.、.228(D)他の情報 : /機能−“CDI 2″(1x)配列の 特徴 (A)特徴を表わす記号: Misc texture(B)存在位置 + 3 25..151(D)他の情報 : /機能−“CDR3”(工1)配列の記載  : 配列番号11(12)配列番号12の情報 (i)配列の特色: (A)配列の長さ :125アミノ酸 (B)配列の型 : アミノ酸 (D)トポロジー : 直鎖状 (ii)配列の種類 : 蛋白質 (xl)配列の記載 : 配列番号12(」1)配列の種類 : cDNA (■1)ハイポセティカル配列 二N0(lマ)アンチセンス :No (yi)起源: (A)生物名 コR1目us rx目++5(xi)配列の記載 : 配列番号 17λ=;;:ミλ c6にに3ズセ (13)配列番号13の情報 (i)配列の特色: (A)配列の長さ ;30塩基対 (B)配列の型 : 核酸 (C)鎖の数 二 −重鎖 (D)トポロジー ・ 直鎖状 (11)配列の種類 : 5sDNA (1目)ハイポセティカル配列 二N。
(1v)アンチセンス :NO (工1)配列の記載 : 配列番号13αシ罠λλス:Tσ工:Vλコズルコ℃ ^GフCλ(14)配列番号14の情報 (i)配列の特色: (A)配列の長さ :43塩基対 (B)配列の型 : 核酸 (C)鎖の数 二 −重鎖 (D)トポロジー : 直鎖状 :o (++)配列の種類 : 5sDNA(目I)ハイポセティカル配列 二 N。
(1v)アンチセンス : Yes (工1)配列の記載 : 配列番号14α:λ品=vJiχ=υαα:゛C:λ 二iXフτフ(λ;=℃八π=へ15)配列番号15の情報 (i)配列の特色: (A)配列の長さ =43塩基対 (B)配列の型 : 核酸 (C)鎖の数 二 −重鎖 (D)トポロジー : 直鎖状 コ0 (目)配列の種類 : 5sDNA(目1)ハイボセティカル配列 =N 。
(it)アンチセンス :N。
(xl)配列の記載 : 配列番号15入り5;ご=5σユコフ2−スαI=α =1=にに入り人ズ=に石(20)配列番号20の情報 (i)配列の特色: (A)配列の長さ :30塩基対 (B)配列の型 : 核酸 (C)鎖の数 二 −重鎖 (D)トポロジー : 直鎖状 (2)配列の種類 : 5sDNA (口1)ハイポセティカル配列 二N。
(1マ)アンチセンス : Yes (xi)配列の記載 : 配列番号20Gにに3λズ=TCフ請C〜コff1e 工=ロ=工λ(21)配列番号2Nの情報 (i)配列の特色: (A)配列の長さ :31塩基対 (B)配列の型 : 核酸 (C)鎖の数 二 −重鎖 CD)トポロジー : 直鎖状 (11)配列の種類 : 5sDNA (1目)ハイポセティカル配列 =NO(1v)アンチセンス =N。
(xl)配列の記載 : 配列番号21=−に;a―=コC,5コ=にC (22)配列番号22の情報 (i)配列の特色: (A)配列の長さ =36塩基対 (B)配列の型 : 核酸 (C)鎖の数 二 −重鎖 (D)トポロジー : 直鎖状 (ii)配列の種類 : 5sDNA (iii)ハイポセティカル配列 :N。
(エマ)アンチセンス : Yes (xl)配列の記載 2 配列番号223o GTGc^ニλ^G;:λλゴc り;TQ入AG5Tαλ^G;;λSλC八C(へ3)配列番号23の情報 (i)配列の特色: (A)配列の長さ =36塩基対 (B)配列の型 : 核酸 (C)鎖の数 二 −重鎖 (D)トポロジー : 直鎖状 (百)配列の種類 : 5sDNA (iii)ハイポセティカル配列 =NO(1v)アンチセンス =NO (ti)配列の記載 : 配列番号23つ、 ズフごコニ=ど二;蝉χα;:− (28)配列番号28の情報 (i)配列の特色: (A)配列の長さ =36塩基対 (B)配列の型 : 核酸 (C)鎖の数 : 一本鎖 (D)トポロジー : 直鎖状 (目)配列の種類 : 5sDNA (百I)ハイポセティカル配列 =N。
(1v)アンチセンス : Yes (xi)配列の記載 : 配列番号28゛フロχ:口=℃λχ石入に口てGGA Cχχ7にG工℃(29)配列番号29の情報 (i)配列の特色: (A)配列の長さ =48塩基対 (B)配列の型 : 核酸 (C)鎖の数 : 一本鎖 (D)トポロジー : 直鎖状 (11)配列の種類 : 5sDNA (目りハイポセティカル配列 :NO (iv)アンチセンス =N。
(xi)配列の記載 : 配列番号29にズー=:Wzコバ;=λ;πに;=に ;=:(30)配列番号30の情報 (i)配列の特色: (A)配列の長さ =33塩基対 (B)配列の型 、 核酸 (C)鎖の数 二 一本鎖 (D)トポロジー : 直鎖状 (ロ)配列の種類 : 5sDNA (iii)ハイボセテイカル配列 =NO(iv)アンチセンス : Yes (xi)配列の記載 ・ 配列番号3036 詰=:==コにコごコ=コ品α a 図1 0CAMPATH−IN CDFIHI−DX48 CDFIN+ 図3 PCRAS PCj’lCD PCREF PCRGWPCRAD PCREH 図4 補正書の翻訳文提出書(特許法第184条の8)週平成5年4月12日

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.抗体鎖もしくはそれらの断片をコードし、この抗体鎖の断片の可変部領域の 相補性決定領域(CDRs)の少なくとも1つが第1の哺乳動物抗体に由来し、 かつ可変領域のフレームワークが第2の異なる哺乳動物抗体に由来するものであ る、下記式で表わされる二本鎖もしくは一本鎖DNAの製造方法であって、 5′F1−M−F23′ ここで、Mは第2の抗体のCDRをコードするDNAを含み、かつF1およびF 2はそれぞれMの側方に位置する5′および3′配列をコードし、 (i)下記式で表わされる一本鎖もしくは二本鎖DNAテンプレートを調製し、 5′f1−H−f23′ ここで、HはMとは異なる特異性のCDRをコードするDNAを含み、かつf1 およびf2は各々F1およびF2に実質的に相同であり、 (iii)DNAオリゴヌクレオチドプライマ−A、B、CおよびDを得、ここ で、 Aは、F1の5′末端に対応する5′末端を有し、かつ配列F1の対応長さに等 しい配列a1を含み、 Hに向かって5′から3′の方向に指向し;Bは、配列 5′b1−b23′ からなり、ここで、 b1はMの対応長さに相補的であり、かつMの5′末端に相補的な3′末端を有 する配列を含み、b2はF1における対応長さの配列に相補的であり、かつF1 の3′末端に相補的なヌクレオチドから始まる5′末端を有し; Cは、配列 5′c1−c23′ からなり、ここで、 c1は、Mの対応長さに等しく、かつMの3′末端に対応する3′末端を有する 配列を含み、 c2は、F2における対応長さの配列に等しく、かつF2の5′末端に対応する ヌクレオチドから始まる5′末端を有し; Dは、F2の3′末端に相補的な5′末端を有し、かつF2の対応長さに相補的 である配列d1を含み、およびHに向かって5′から3′の方向に指向し;並び に、b1およびc1は、ポリメラーゼ・チェイン・リアクション(PCR)を実 施可能な条件下において、それらの5′末端を互いにアニールし得るに十分な長 さで重複しており、(iii)所望の順番で、プライマー対A、BおよびC、D を用いて、上記(i)において調製されるテンプレートに対するPCR反応を行 ない、および (iv)上記(iii)において得られる生成物を混合し、プライマ−Aおよび Dを用いてPCR反応を行なう、ことを包含する方法。 2.F1およびF2が、各々少なくとも1種のヒト抗体フレームワーク領域、お よび任意に、さらにCDRsをコードする請求の範囲第1項記載の方法。 3.Hが、前記第1抗体のCDRをコードする請求の範囲第1項または第2項記 載の方法。 4.Mが、非非とCDR領域をコードする請求の範囲第1項ないし第3項のいず れか1項に記載の方法。 5.Mが、ネズミ科動物または■歯類動物のCDRをコードする請求の範囲第4 項記載の方法。 6.プライマ−AおよびBが、それらの5′末端の10ヌクレオチド内に少なく とも1種の制限エンドヌクレアーゼ認識部位を含む請求の範囲第1項ないし第5 項のいずれか1項に記載の方法。 7.プライマ−BおよびCにおいて、b1およびc1が、その長さにおいて、ヌ クレオチドの数が同じである請求の範囲第1項ないし第6項のいずれか1項に記 載の方法。 8.プライマーA、B、CおよびDが、それぞれ15ないし30ヌクレオチドの 長さである請求の範囲第1項ないし第7項のいずれか1項に記載の方法。 9.プライマ−A、B、CおよびD各々のa1、b1、c1およびd1が、それ ぞれ15ないし30ヌクレオチドの長さである請求の範囲第8項記載の方法。 10.ヒト抗体LまたはH鎖のCDR領域の少なくとも1つが請求の範囲第1項 ないし第9項に記載の方法によって置き換えられるヒト化抗体の製造方法。 11.3つ全てのCDR領域が置き換えられる請求の範囲第10項記載の方法。 12.得られたDNAの発現ベクターへの導入をさらに含む請求の範囲第1項な いし第11項記載の方法。 13.前記発現ベクターの宿主細胞への導入をさらに含む請求の範囲第12項記 載の方法。 14.前記宿主細胞がチャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞またはミエロ ーマ細胞である請求の範囲第13項記載の方法。 15.得られたDNAの発現および発現した生成物の回収をさらに含む請求の範 囲第13項または第14項記載の方法。 16.下記配列からなる、長さが30ないし110ヌクレオチドのオリゴヌクレ オチド。 5′o1−o23′ (ここで、o1は非ヒト起源のCDR領域の少なくとも15ヌクレオチドの配列 を含み、かつo2はヒト起源のフレームワーク領域の少なくとも15ヌクレオチ ドを含む)17.抗体鎖もしくはそれらの断片をコードし、この抗体鎖の可変部 領域の3つの相補性決定領域(CDRs)が第1の哺乳動物抗体に由来し、かつ 可変部ドメインの4つのフレームワーク領域が第2の異なる哺乳動物抗体に由来 するものである、下記式で表わされる二本鎖もしくは一本鎖DNAの製造方法で あって、 5′F1−M1−F2−M2−F3−M3−F43′ここで、M1、M2および M3は第2の抗体のCDRをコードするDNAを含み、かつF1、F2、F3お よびF4はCDRsM1、M2およびM3の側方に位置するフレームワーク配列 を含み、 (i)下記式で表わされる一本鎖もしくは二本鎖DNAテンプレートを調製し、 5′f1−H1−f2−H2−f3−H3−f43′ここで、H1、H2および H3はM1、M2およびM3とは異なる特異性のCDRsをコードするDNAを 含み、かつf1、f2、f3およびf4は各々F1、F2、F3およびF4と実 質的に相同であり、 (ii)DNAオリゴヌクレオチドプライマ−A、B、C、D、E、F、Gおよ びHを得、ここで、 Aは、F1の5′末端に対応する5′末端を有し、かつ配列F1の対応長さに等 しい配列a1を含み、 H1に向かって5′から3′の方向に指向し;Bは、配列 5′b1−b23′ からなり、ここで、 b1はM1の対応長さに相補的であり、かつM1の5′末端に相補的な3′末端 を有する配列を含み、b2はF1における対応長さの配列に相補的であり、かつ F1の3′末端に相補的なヌクレオチドから始まる5′末端を有し; Cは、配列 5′c1−c23′ からなり、ここで、 c1は、M1の対応長さに等しく、かつM1の3′末端に対応する3′末端を有 する配列を含み、c2は、F2における対応長さの配列に等しく、かつF2の5 ′末端に対応するヌクレオチドから始まる5′末端を有し; Dは、配列 5′d1−d23′ からなり、ここで、 d1は、M2の対応長さに相補的であり、かつM2の5′末端に相補的な3′末 端を有する配列を含み、d2は、F2における対応長さの配列的相補的であり、 かつF2の3′末端に相補的なヌクレオチドから始まる5′末端を有し; Eは、配列 5′e1−e23′ からなり、ここで、 e1は、M2の対応長さに等しく、かつM2の3′末端に対応する3′末端を有 する配列を含み、e2は、F3における対応長さの配列に等しく、かつF3の5 ′末端に対応するヌクレオチドから始まる5′末端を有し; Fは、配列 5′f1−f23′ からなり、ここで、 f1は、M3の対応長さに相補的であり、かつM3の5′末端に相補的な3′末 端を有する配列を含み、f2は、F3における対応長さの配列に相補的であり、 かつF3の3′末端に相補的なヌクレオチドから始まる5′末端を有し; Gは、配列 5′g1−g23′ からなり、ここで、 g1は、M3の対応長さに等しく、かつM3の3′末端に対応する3′末端を有 する配列を含み、g2は、F4における対応長さの配列に等しく、かつF4の5 ′末端に対応するヌクレオチドから始まる5′末端を有し; Hは、F4の3′末端に相補的な5′末端を有し、かつF4の対応長さに相補的 である配列h1を含み、およびH3に向かって5′から3′の方向に指向し;並 びに、対b1およびc1、d1およびe1、およびf1およびg1は、PCRを 実施可能な条件下において、それらの5′末端を互いにアニールし得るに十分な 長さで重複しており、(iii)所望の順番で、プライマー対A、B;C、D; E、FおよびG、Hを用いて、上記(i)において調製されるテンプレートに対 するPCR反応を行ない、DNA断片AB、CD、EFおよびGHを得、 (iv)上記(iii)において得られる断片を結合させ、所望のDNAを得る 、 ことを包含する方法。 18.F4が、CDRM3の側方に位置するフレームワーク配列および抗体鎖の 接触領域の全てもしくは一部をコードするDNAを含む請求の範囲第17項記載 の方法。 19.前記工程(iv)が、 (iva)断片ABおよびCDをプライマ−AおよびDと混合し、PCRを行な ってDNA断片ADを得;(ivb)上記工程(iva)の前、その間またはそ れに続いて、断片EFおよびGHをプライマ−EおよびHと混合し、PCRを行 なってDNA断片EHを得、並びに(ivc)断片ADおよびEHをプライマ− AおよびHと混合し、所望のDNAを得る、 ことにより行なわれる請求の範囲第17項または第18項記載の方法。 21.工程(iv)が (iva)断片CDおよびEFをプライマ−CおよびFと混合し、PCRを行な ってDNA断片CFを得、並びに(ivb−1)断片ABおよびCFをプライマ −AおよびFと混合し、PCRを行なってDNA断片AFを得、かつ(ivc− 1)断片AFおよびGHをプライマ−AおよびHと混合し、所望のDNAを得る か、あるいは (ivb−2)断片CFおよびGHをプライマ−CおよびHと混合し、PCRを 行なってDNA断片CHを得、かつ(ivc−2)断片ABおよびCHをプライ マ−AおよびHと混合し、所望のDNAを得る、 ことにより行なわれる請求の範囲第17項または第18項記載の方法。
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