JP7778571B2 - 免疫細胞機能をモジュレートするための変異体インターロイキン-2ポリペプチドと抗原結合分子の融合体 - Google Patents
免疫細胞機能をモジュレートするための変異体インターロイキン-2ポリペプチドと抗原結合分子の融合体Info
- Publication number
- JP7778571B2 JP7778571B2 JP2021572298A JP2021572298A JP7778571B2 JP 7778571 B2 JP7778571 B2 JP 7778571B2 JP 2021572298 A JP2021572298 A JP 2021572298A JP 2021572298 A JP2021572298 A JP 2021572298A JP 7778571 B2 JP7778571 B2 JP 7778571B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- cells
- polypeptide
- amino acid
- mutant
- fusion protein
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
- A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
- A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
- A61K47/68—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
- A61K47/6801—Drug-antibody or immunoglobulin conjugates defined by the pharmacologically or therapeutically active agent
- A61K47/6803—Drugs conjugated to an antibody or immunoglobulin, e.g. cisplatin-antibody conjugates
- A61K47/6811—Drugs conjugated to an antibody or immunoglobulin, e.g. cisplatin-antibody conjugates the drug being a protein or peptide, e.g. transferrin or bleomycin
- A61K47/6813—Drugs conjugated to an antibody or immunoglobulin, e.g. cisplatin-antibody conjugates the drug being a protein or peptide, e.g. transferrin or bleomycin the drug being a peptidic cytokine, e.g. an interleukin or interferon
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
- A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
- A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
- A61K47/68—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
- A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
- A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
- A61K47/68—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
- A61K47/6835—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment the modifying agent being an antibody or an immunoglobulin bearing at least one antigen-binding site
- A61K47/6849—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment the modifying agent being an antibody or an immunoglobulin bearing at least one antigen-binding site the antibody targeting a receptor, a cell surface antigen or a cell surface determinant
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/52—Cytokines; Lymphokines; Interferons
- C07K14/54—Interleukins [IL]
- C07K14/55—IL-2
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
- C07K16/2803—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily
- C07K16/2815—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily against CD8
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
- C07K16/2803—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily
- C07K16/2818—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily against CD28 or CD152
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/505—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising antibodies
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/505—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising antibodies
- A61K2039/507—Comprising a combination of two or more separate antibodies
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
- C07K2317/51—Complete heavy chain or Fd fragment, i.e. VH + CH1
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
- C07K2317/515—Complete light chain, i.e. VL + CL
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
- C07K2317/52—Constant or Fc region; Isotype
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
- C07K2317/56—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
- C07K2317/56—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
- C07K2317/569—Single domain, e.g. dAb, sdAb, VHH, VNAR or nanobody®
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/60—Immunoglobulins specific features characterized by non-natural combinations of immunoglobulin fragments
- C07K2317/62—Immunoglobulins specific features characterized by non-natural combinations of immunoglobulin fragments comprising only variable region components
- C07K2317/622—Single chain antibody (scFv)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/70—Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
- C07K2317/73—Inducing cell death, e.g. apoptosis, necrosis or inhibition of cell proliferation
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/90—Immunoglobulins specific features characterized by (pharmaco)kinetic aspects or by stability of the immunoglobulin
- C07K2317/92—Affinity (KD), association rate (Ka), dissociation rate (Kd) or EC50 value
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/30—Non-immunoglobulin-derived peptide or protein having an immunoglobulin constant or Fc region, or a fragment thereof, attached thereto
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/70—Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction
- C07K2319/74—Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction containing a fusion for binding to a cell surface receptor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/70—Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction
- C07K2319/74—Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction containing a fusion for binding to a cell surface receptor
- C07K2319/75—Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction containing a fusion for binding to a cell surface receptor containing a fusion for activation of a cell surface receptor, e.g. thrombopoeitin, NPY and other peptide hormones
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Zoology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicinal Preparation (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Description
本願は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる、2019年6月5日に出願した米国仮出願第62/857,726号の優先権を主張するものである。
ASCIIテキストファイルでの以下の提出内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる:コンピュータ読み取り可能な形式(CRF)の配列表(ファイル名:182842000140SEQLIST.TXT、記録日:2020年6月5日、サイズ:105KB)。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
(項目1)
2つの部分を含む融合タンパク質であって、
i)第1の部分が、抗体重鎖VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3単量体であって、ここで、VHは、可変重鎖であり、CH2-CH3は、Fcドメインである、抗体重鎖VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3単量体、抗体軽鎖VL-CLであって、ここで、VLは、可変軽鎖であり、CLは、定常軽鎖である、抗体軽鎖VL-CL、および変異体IL-2ポリペプチドを含み、前記変異体IL-2ポリペプチドのN末端が、前記FcドメインのC末端にリンカーを介して融合されており;
ii)第2の部分が、抗体重鎖VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3単量体および抗体軽鎖VL-CLを含み;
前記第1の部分と前記第2の部分の両方が、次の群:ヒトCD8α、ヒトCD8βおよびヒトPD1から選択される1つの抗原上のエピトープに結合する、
融合タンパク質。
(項目2)
2つの部分を含む融合タンパク質であって、
i)第1の部分が、抗体ヒンジ-CH2-CH3単量体であって、ここで、CH2-CH3は、Fcドメインである、抗体ヒンジ-CH2-CH3単量体と変異体IL-2ポリペプチドとを含むポリペプチドであって、前記変異体IL-2ポリペプチドのN末端が、前記FcドメインのC末端にリンカーを介して融合されているポリペプチドであり;
ii)第2の部分が、抗体重鎖VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3単量体と抗体軽鎖VL-CLとを含むポリペプチドであり;
前記第2の部分が、次の群:ヒトCD8α、ヒトCD8βおよびヒトPD1から選択される1つの抗原上のエピトープに結合する、
融合タンパク質。
(項目3)
2つの部分を含む融合タンパク質であって、
i)第1の部分が、抗体ヒンジ-CH2-CH3単量体であって、ここで、CH2-CH3は、Fcドメインである、抗体ヒンジ-CH2-CH3単量体と変異体IL-2ポリペプチドとを含むポリペプチドであって、前記変異体IL-2ポリペプチドのC末端が、前記FcドメインのN末端にリンカーを介して融合されているポリペプチドであり;
ii)第2の部分が、抗体重鎖VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3単量体と抗体軽鎖VL-CLとを含むポリペプチドであり;
前記第2の部分が、次の群:ヒトCD8α、ヒトCD8βおよびヒトPD1から選択される1つの抗原上のエピトープに結合する、
融合タンパク質。
(項目4)
2つの部分を含む融合タンパク質であって、
i)第1の部分が、ヒトCD8αまたはヒトCD8βに結合する抗原結合ドメインを含み;
ii)第2の部分が、変異体IL-2ポリペプチドを含み;
前記第2の部分が、前記第1の部分にリンカーを介して連結されている、
融合タンパク質。
(項目5)
前記第1の部分が、(a)1つもしくは2つの重鎖ポリペプチドと1つもしくは2つの軽鎖ポリペプチドとを含む抗体もしくはその抗原結合性断片;(b)単鎖抗体もしくは単鎖可変断片(scFv);または(c)VHH抗体を含む、項目4に記載の融合タンパク質。
(項目6)
NK細胞の活性化と比較して、10倍またはそれより大きい効力でCD8+T細胞を活性化する、項目1から5のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
(項目7)
NK細胞の活性化と比較して、50倍またはそれより大きい効力でCD8+T細胞を活性化する、項目6に記載の融合タンパク質。
(項目8)
前記変異体IL-2ポリペプチドが、配列番号1のアミノ酸配列を有する野生型IL-2ポリペプチドの結合親和性と比較して、配列番号2のアミノ酸配列を有するIL-2Rαポリペプチドに対する結合親和性の50%またはそれを超える低減を示す、項目1から7のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
(項目9)
前記変異体IL-2ポリペプチドが、配列番号1のアミノ酸配列を有する野生型IL-2ポリペプチドの結合親和性と比較して、配列番号3のアミノ酸配列を有するIL-2Rβポリペプチドに対する結合親和性の50%またはそれを超える低減を示す、項目8に記載の融合タンパク質。
(項目10)
前記変異体IL-2ポリペプチドが、配列番号1のアミノ酸配列を有する野生型IL-2ポリペプチドの結合親和性と比較して、配列番号4のアミノ酸配列を有するIL-2Rγポリペプチドに対する結合親和性の50%またはそれを超える低減を示す、項目8または項目9に記載の融合タンパク質。
(項目11)
前記変異体IL-2ポリペプチドが、配列番号1に対する1つもしくは複数または2つもしくはそれより多くのアミノ酸置換を有する、配列番号1の配列を含み、前記1つもしくは複数または2つもしくはそれより多くの置換が、Q11、H16、L18、L19、D20、Q22、R38、F42、K43、Y45、E62、P65、E68、V69、L72、D84、S87、N88、V91、I92、T123、Q126、S127、I129およびS130からなる群より選択される配列番号1の位置における置換を含む、項目1から10のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
(項目12)
前記1つもしくは複数または2つもしくはそれより多くの置換が、配列番号1に対するF42AまたはF42Kアミノ酸置換を含む、項目11に記載の融合タンパク質。
(項目13)
前記1つもしくは複数または2つもしくはそれより多くの置換が、配列番号1に対するR38A、R38D、R38E、E62Q、E68A、E68Q、E68KまたはE68Rアミノ酸置換をさらに含む、項目11または項目12に記載の融合タンパク質。
(項目14)
前記1つもしくは複数または2つもしくはそれより多くの置換が、配列番号1に対するH16E、H16D、D20N、M23A、M23R、M23K、S87K、S87A、D84L、D84N、D84V、D84H、D84Y、D84R、D84K、N88A、N88S、N88T、N88R、N88I、V91A、V91T、V91E、I92A、E95S、E95A、E95R、T123A、T123E、T123K、T123Q、Q126A、Q126S、Q126T、Q126E、S127A、S127E、S127KまたはS127Qアミノ酸置換をさらに含む、項目11から13のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
(項目15)
前記1つもしくは複数または2つもしくはそれより多くの置換が、配列番号1と比較してアミノ酸変異C125Aをさらに含む、項目11から14のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
(項目16)
前記変異体IL-2ポリペプチドが、配列番号18~88からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、項目1から10のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
(項目17)
前記変異体IL-2ポリペプチドが、以下のセットのアミノ酸置換(配列番号1の配列に対する):R38EおよびF42A;R38DおよびF42A;F42AおよびE62Q;R38AおよびF42K;R38E、F42AおよびN88S;R38E、F42AおよびN88A;R38E、F42AおよびV91E;R38E、F42AおよびD84H;H16D、R38EおよびF42A;H16E、R38EおよびF42A;R38E、F42AおよびQ126S;R38D、F42AおよびN88S;R38D、F42AおよびN88A;R38D、F42AおよびV91E;R38D、F42AおよびD84H;H16D、R38DおよびF42A;H16E、R38DおよびF42A;R38D、F42AおよびQ126S;R38A、F42KおよびN88S;R38A、F42KおよびN88A;R38A、F42KおよびV91E;R38A、F42KおよびD84H;H16D、R38AおよびF42K;H16E、R38AおよびF42K;R38A、F42KおよびQ126S;F42A、E62QおよびN88S;F42A、E62QおよびN88A;F42A、E62QおよびV91E;F42A、E62QおよびD84H;H16D、F42AおよびE62Q;H16E、F42AおよびE62Q;F42A、E62QおよびQ126S;R38E、F42AおよびC125A;R38D、F42A、およびC125A;F42A、E62QおよびC125A;R38A、F42KおよびC125A;R38E、F42A、N88SおよびC125A;R38E、F42A、N88AおよびC125A;R38E、F42A、V91EおよびC125A;R38E、F42A、D84HおよびC125A;H16D、R38E、F42AおよびC125A;H16E、R38E、F42AおよびC125A;R38E、F42A、C125AおよびQ126S;R38D、F42A、N88SおよびC125A;R38D、F42A、N88AおよびC125A;R38D、F42A、V91EおよびC125A;R38D、F42A、D84HおよびC125A;H16D、R38D、F42AおよびC125A;H16E、R38D、F42AおよびC125A;R38D、F42A、C125AおよびQ126S;R38A、F42K、N88SおよびC125A;R38A、F42K、N88AおよびC125A;R38A、F42K、V91EおよびC125A;R38A、F42K、D84HおよびC125A;H16D、R38A、F42KおよびC125A;H16E、R38A、F42KおよびC125A;R38A、F42K、C125AおよびQ126S;F42A、E62Q、N88SおよびC125A;F42A、E62Q、N88AおよびC125A;F42A、E62Q、V91EおよびC125A;F42A、E62QおよびD84HおよびC125A;H16D、F42AおよびE62QおよびC125A;H16E、F42A、E62QおよびC125A;F42A、E62Q、C125AおよびQ126S;F42A、N88SおよびC125A;F42A、N88AおよびC125A;F42A、V91EおよびC125A;F42A、D84HおよびC125A;H16D、F42AおよびC125A;H16E、F42AおよびC125A;ならびにF42A、C125AおよびQ126Sのうちの1つを有する、配列番号1のアミノ酸配列を含む、項目1から10のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
(項目18)
前記融合タンパク質が、ヒトCD8に結合し、前記融合タンパク質のCD8への結合が、CD8とMHCクラスIの相互作用を遮断しない、項目1から17のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
(項目19)
第1および第2のFcドメインが、EU番号付けに従って、次のFc変異:L234A、L235A、G237AおよびK322Aを含む、項目1から18のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
(項目20)
(a)EU番号付けに従って、前記第1のFcドメインが、次のアミノ酸置換:Y349CおよびT366Wを含み、前記第2のFcドメインが、次のアミノ酸置換:S354C、T366S、L368AおよびY407Vを含むか;または
(b)EU番号付けに従って、前記第2のFcドメインが、次のアミノ酸置換:Y349CおよびT366Wを含み、前記第1のFcドメインが、次のアミノ酸置換:S354C、T366S、L368AおよびY407Vを含む、
項目1から19のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
(項目21)
(a)前記融合タンパク質が、ヒトCD8に結合し、前記融合タンパク質のCD8への結合が、CD8とMHCクラスIの相互作用を遮断しない特性;および
(b)NK細胞の活性化と比較して、10倍またはそれより大きい効力でCD8+T細胞を活性化する特性、
のうちの1つまたは複数を有する、項目1から20のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
(項目22)
CD8+T細胞およびNK細胞の活性化の効力が、細胞増殖により評価される細胞活性化のEC50により測定される、項目6、7および21のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
(項目23)
項目1から22のいずれか一項に記載の変異体IL-2ポリペプチドまたは融合タンパク質をコードする1つまたは複数の単離されたポリヌクレオチド。
(項目24)
項目23に記載のポリヌクレオチドを含む1つまたは複数のベクター、特に発現ベクター。
(項目25)
項目23に記載のポリヌクレオチドを含む宿主細胞。
(項目26)
項目1から22のいずれか一項に記載の融合タンパク質と薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物。
(項目27)
医薬としての使用のための、項目1から22のいずれか一項に記載の融合タンパク質または項目26に記載の組成物。
(項目28)
がんまたは慢性感染症を処置する方法であって、有効量の項目1から22のいずれか一項に記載の融合タンパク質または項目26に記載の組成物を患者に投与するステップを含む方法。
(項目29)
がんを処置する方法であって、有効量の項目1から22のいずれか一項に記載の融合タンパク質または項目26に記載の組成物をT細胞療法、がんワクチン、化学療法剤、または免疫チェックポイント阻害剤(ICI)と組み合わせて患者に投与するステップを含む方法。
(項目30)
前記ICIが、PD-1、PD-L1またはCTLA-4の阻害剤である、項目29に記載の方法。
「免疫細胞」は、本明細書で使用される場合、宿主の免疫系にとって異質とみなされる生物または他の実体に対して反応する、免疫系の細胞である。それらは、外来病原体、生物および疾患から宿主を保護する。免疫細胞は、白血球とも呼ばれ、病原体と闘うための生得免疫応答と適応免疫応答の両方に関与する。生得免疫応答は、病原体への曝露時にさらなる抗原刺激または学習過程なしに直ちに起こる。適応免疫応答は、最初の抗原刺激を必要とし、その後、記憶形成を行ない、その結果として、同じ病原体とのその後の遭遇中の応答性の強化をもたらす。生得免疫細胞は、単球、マクロファージ、樹状細胞、生得リンパ系細胞(ILC)、例えばナチュラルキラー(NK)細胞など、好中球、巨核球、好酸球および好塩基球を含むが、これらに限定されない。適応免疫細胞は、BおよびTリンパ球/細胞を含む。T細胞サブセットは、アルファベータCD4+T(ナイーブCD4+、メモリーCD4+、エフェクターメモリーCD4+、エフェクターCD4+、調節性CD4+)、およびアルファベータCD8+T(ナイーブCD8+、メモリーCD8+、エフェクターメモリーCD8+、エフェクターCD8+)を含むが、これらに限定されない。B細胞サブセットは、ナイーブB、メモリーB、および形質細胞を含むが、これらに限定されない。NK TおよびTガンマデルタ(Tγδ)細胞は、生得リンパ球と適応リンパ球の両方の特性を示す。
本開示は、とりわけ、IL-2Rα(例えば、配列番号2のまたは図1Bに示されているようなアミノ酸配列を含む)に対して50%未満の結合親和性を示す、変異体IL-2ポリペプチドを提供する。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドはまた、IL-2Rβ(例えば、配列番号3のまたは図1Cに示されているようなアミノ酸配列を含む)に対して50%未満の結合親和性を示す。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、野生型IL-2ポリペプチド(例えば、配列番号1のまたは図1Aに示されているようなアミノ酸配列を含む)と比較して、IL-2Rαに対して50%未満の結合親和性、およびIL-2Rβ(例えば、配列番号3のまたは図1Cに示されているようなアミノ酸配列を含む)に対して50%未満の結合親和性を示す。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、野生型IL-2ポリペプチド(例えば、配列番号1のまたは図1Aに示されているようなアミノ酸配列を含む)と比較して、IL-2Rαに対して50%未満の結合親和性、およびIL-2Rγ(例えば、配列番号4のまたは図1Dに示されているようなアミノ酸配列を含む)に対して50%未満の結合親和性を示す。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、野生型IL-2ポリペプチドと比較して、IL-2Rαに対して50%未満の結合親和性、IL-2Rβに対して50%未満の結合親和性およびIL-2Rγに対して50%未満の結合親和性を示す。IL-2RαおよびIL-2Rβに対する野生型および本開示の変異体ポリペプチドの結合親和性の差異は、例えば、当業者によく知られているタンパク質間相互作用の親和性を測定する標準的な表面プラズモン共鳴(SPR)アッセイで、測定することができる。IL-2Rγに対する野生型および本開示の変異体ポリペプチドの結合親和性の差異は、IL-2Rγに対する野生型IL-2ポリペプチドの親和性が非常に低いので、SPRアッセイによって信頼性をもって測定することができない。その代わりに、IL-2Rγに対するそれらの低減した親和性を、pSTAT5を測定し、IL-2Rγに対する親和性を低減させる置換があるまたはないIL-2ポリペプチドのIL-2R発現細胞に対する活性を比較する、in vitroアッセイを行なうことにより、推定することができる。
KPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号27)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCSSIISTLT(配列番号28)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISSINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号29)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISAINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号30)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINEIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号31)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRHLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号32)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEDLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号33)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEELLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号34)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCSSIISTLT(配列番号35)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISSINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号36)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISAINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号37)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINEIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号38)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRHLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号39)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEDLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号40)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEELLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号41)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCSSIISTLT(配列番号42)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISSINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号43)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISAINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号44)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINEIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号45)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRHLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号46)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEDLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号47)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEELLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号48)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCSSIISTLT(配列番号49)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号50)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号51)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号52)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号53)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISSINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号54)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISAINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号55)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKAT
ELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINEIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号56)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRHLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号57)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEDLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号58)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEELLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号59)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFASSIISTLT(配列番号60)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISSINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号61)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISAINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号62)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINEIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号63)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRHLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号64)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEDLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号65)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEELLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号66)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFASSIISTLT(配列番号67)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISSINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号68)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISAINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号69)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINEIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号70)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRHLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号71)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEDLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号72)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEELLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号73)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFASSIISTLT(配列番号74)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISSINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号75)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISAINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号76)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINEIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号77)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRHLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号78)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEDLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号79)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEELLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号80)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFASSIISTLT(配列番号81)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISSINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号82)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISAINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号83)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINEIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号84)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRM
LTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRHLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号85)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEDLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号86)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEELLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号87)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、変異体IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFASSIISTLT(配列番号88)のアミノ酸配列を含む。
本開示は、本開示の変異体IL-2ポリペプチドと、次の抗原:CD8α、CD8βおよびPD1のうちの1つに結合する抗原結合分子とを含む融合タンパク質であって、融合体の抗原結合分子に対する抗原を発現する免疫細胞を、前記抗原を発現しない免疫細胞よりも優先的に活性化する、融合タンパク質を提供する。
前記融合タンパク質は、図4に描示されているような異なるフォーマットを有する。一部の実施形態では、融合タンパク質は、図4Aに描示されているような2つの部分を含む:i)第1の部分が、抗体重鎖VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3単量体(ここで、VHは、可変重鎖であり、CH2-CH3は、Fcドメインである)と、抗体軽鎖VL-CL(ここで、VLは、可変軽鎖であり、CLは、定常軽鎖である)と、変異体IL-2ポリペプチドとを含むポリペプチドであって、変異体IL-2ポリペプチドのN末端が、FcドメインのC末端にリンカーを介して融合されているポリペプチドであり;ii)第2の部分が、抗体重鎖VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3単量体と抗体軽鎖VL-CLとを含むポリペプチドであり;第1の部分と第2の部分との両方が、次の群:ヒトCD8α、ヒトCD8βおよびヒトPD1から選択される1つの抗原上のエピトープに結合する。
一部の実施形態では、融合タンパク質は、ヒトCD8に結合し、融合タンパク質のCD8への結合は、CD8とMHCクラスIの相互作用を遮断しない。一部の実施形態では、本開示の抗原結合分子は、CD8α上のエピトープに結合し、この抗原結合分子のCD8αへの結合は、CD8ααまたはCD8αβと標的細胞または抗原提示細胞上のMHCクラスI分子との相互作用を遮断しない。一部の実施形態では、本開示の抗原結合分子は、CD8β上のエピトープに結合し、この抗原結合分子のCD8βへの結合は、CD8αβと標的細胞または抗原提示細胞上のMHCクラスI分子との相互作用を遮断しない。一部の実施形態では、本開示の抗CD8抗体または融合タンパク質が、CD8とMHCクラスIの相互作用を遮断するかどうかを、例えば、抗CD8抗体または融合タンパク質の存在または非存在下でCD8+T細胞の(例えば、抗原刺激による)活性化ステータスをアッセイすることにより、アッセイすることができる。例示的なアッセイおよび条件については、例えば、実施例3を参照されたい。
以下の列挙された実施形態は、本発明の一部の態様の代表である。
1.2つの部分を含む融合タンパク質であって、
i)第1の部分が、抗体重鎖VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3単量体(ここで、VHは、可変重鎖であり、CH2-CH3は、Fcドメインである)と、抗体軽鎖VL-CL(ここで、VLは、可変軽鎖であり、CLは、定常軽鎖である)と、変異体IL-2ポリペプチドとを含むポリペプチドであって、変異体IL-2ポリペプチドのN末端が、FcドメインのC末端にリンカーを介して融合されているポリペプチドであり;
ii)第2の部分が、抗体重鎖VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3単量体と抗体軽鎖VL-CLとを含むポリペプチドであり;
第1の部分と第2の部分の両方が、次の群:ヒトCD8α、ヒトCD8βおよびヒトPD1から選択される1つの抗原上のエピトープに結合する融合タンパク質。
2.2つの部分を含む融合タンパク質であって、
i)第1の部分が、抗体ヒンジ-CH2-CH3単量体(ここで、CH2-CH3は、Fcドメインである)と変異体IL-2ポリペプチドとを含むポリペプチドであって、変異体IL-2ポリペプチドのN末端が、前記FcドメインのC末端にリンカーを介して融合されているポリペプチドであり;
ii)第2の部分が、抗体重鎖VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3単量体と抗体軽鎖VL-CLとを含むポリペプチドであり;
第2の部分が、次の群:ヒトCD8α、ヒトCD8βおよびヒトPD1から選択される1つの抗原上のエピトープに結合する
融合タンパク質。
3.2つの部分を含む融合タンパク質であって、
i)第1の部分が、抗体ヒンジ-CH2-CH3単量体(ここで、CH2-CH3は、Fcドメインである)と変異体IL-2ポリペプチドとを含むポリペプチドであって、変異体IL-2ポリペプチドのC末端が、FcドメインのN末端にリンカーを介して融合されているポリペプチドであり;
ii)第2の部分が、抗体重鎖VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3単量体と抗体軽鎖VL-CLとを含むポリペプチドであり;
第2の部分が、次の群:ヒトCD8α、ヒトCD8βおよびヒトPD1から選択される1つの抗原上のエピトープに結合する
融合タンパク質。
4.前記変異体IL-2ポリペプチドが、図1Aに描示されているアミノ酸配列を有する野生型IL-2ポリペプチドの結合親和性と比較して、図1Bに描示されているアミノ酸配列を有するIL-2Rαポリペプチドに対する結合親和性の50%またはそれを超える低減、および図1Aに描示されているアミノ酸配列を有する野生型IL-2ポリペプチドの結合親和性と比較して、図1Cに描示されているアミノ酸配列を有するIL-2Rαポリペプチドに対する結合親和性の50%またはそれを超える低減を示す、実施形態1~3のいずれか1つの融合タンパク質。
5.前記変異体IL-2ポリペプチドが、図1Aに描示されているアミノ酸配列を有する野生型IL-2ポリペプチドの結合親和性と比較して、図1Dに描示されているアミノ酸配列を有するIL-2Rγポリペプチドに対する結合親和性の50%またはそれを超える低減をさらに示す、実施形態4の融合タンパク質。
6.前記変異体IL-2ポリペプチドが、図2に描示されているような、かつQ11、E15、H16、L18、L19、D20、Q22、R38、F42、K43、Y45、E62、P65、E68、V69、L72、N88、V91、I92、T123、Q126、S127、I129、S130の群から選択される、野生型IL-2アミノ酸配列に対する2つまたはそれより多くのアミノ酸置換を有する、実施形態4または5の融合タンパク質。
7.前記変異体IL-2ポリペプチドが、野生型IL-2と比較してその生物物理学的特性を向上させるためのアミノ酸変異C125Aをさらに含む、実施形態6の融合タンパク質。
8.前記第1および第2のFcドメインが、エフェクター機能を低下させるために、EU番号付けに従って、次のFc変異:L234A、L235A、G237AおよびK322Aを含有する、実施形態6または7の融合タンパク質。
9.前記第1および第2のFcドメインが、ヘテロ二量体の形成を促進するために、次のアミノ酸置換:Y349C/T366W(ノブ)ならびにS354C、T366S、L368AおよびY407V(ホール)を含有する、実施形態6または7の融合タンパク質。
10.実施形態1~9のいずれか1つの変異体IL-2ポリペプチドまたは融合タンパク質をコードする1つまたは複数の単離されたポリヌクレオチド。
11.実施形態10のポリヌクレオチドを含む1つまたは複数のベクター、特に発現ベクター。
12.実施形態10のポリヌクレオチドを含む宿主細胞。
13.実施形態1~9のいずれか1つによる融合タンパク質と薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物。
14.医薬としての使用のための実施形態1~9のいずれか1つの融合タンパク質。
15.がんまたは慢性感染症を処置する方法であって、実施形態1~9および13のいずれかによる組成物を患者に投与するステップを含む方法。
16.がんを処置する方法であって、実施形態1~9および13のいずれかによる組成物を、T細胞療法またはがんワクチンと組み合わせて患者に投与するステップを含む方法。
組換えDNA技法
組換えDNA操作を伴う技法は、以前に、Sambrook et al., Molecular cloning: A laboratory manual; Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y., 1989に記載された。すべての試薬は、製造業者の指示に従って使用した。DNA配列は、二本鎖シークエンシングにより決定した。
所望の遺伝子セグメントは、適切な鋳型を使用してPCRにより生成したか、または合成オリゴヌクレオチドからThermo Scientific(Pleasanton、CA)、ATUM(Newark、CA)、Genewiz(South Plainfield、NJ)、もしくはGeneScript(Piscataway、NJ)で合成されたものであった。設計した制限エンドヌクレアーゼ切断部位と隣接している遺伝子セグメントを消化し、その後、それらのそれぞれの発現ベクターにクローニングした。DNAを形質転換された細菌から精製し、濃度をUV可視分光法により決定した。DNAシークエンシングを使用して、サブクローニングされた遺伝子断片のDNA配列を確認した。
CD8またはPD1抗原に結合する抗体を、in vitroディスプレイ系またはin vivo免疫化のどちらかを使用して生成した。in vitroディスプレイ法のために、非免疫ヒト抗体ファージライブラリーを、5~6ラウンド、パニングして、標的抗原に対する抗体を単離した。パニング後、ELISAで標的抗原への、非特異的抗原より特異的な結合を示した個々のファージクローンを同定した。その後、特異的バインダーの重鎖および軽鎖VドメインのDNA断片をクローニングし、シークエンシングした。その一方で、組換え形態の抗原でのマウスおよびラマの免疫化から抗体も生成した。マウス免疫化からは、ハイブリドーマ法を使用して抗体を単離した。手短に述べると、免疫化後、脾臓および/またはリンパ節からのB細胞を骨髄腫細胞系と融合してハイブリドーマ細胞を生成した。次いで、ハイブリドーマクローンを、ELISAを使用して個々にスクリーニングして、抗原に特異的な抗体を発現するクローンを同定した。最後に、抗体の重鎖および軽鎖VドメインのDNA断片を特異的ハイブリドーマからクローニングし、その後、シークエンシングした。ラマ免疫化については、抗体遺伝子を末梢B細胞からクローニングし、ファージミドベクターにライゲーションしてファージディスプレイ抗体ライブラリーを生成した。次いで、ファージライブラリーを目的の抗原に対してパニングすることによって抗体を単離した。パニング後、標的抗原への非特異的抗原より特異的な結合を示した個々のファージクローンを、ELISAを使用して同定した。その後、特異的バインダーの重鎖および軽鎖VドメインのDNA断片をクローニングし、シークエンシングした。次いで、非ヒト(マウスおよびラマ)由来の抗体をヒト化して、非ヒトフレームワークおよび相補性決定領域変異を除去した。
ヒト免疫グロブリン軽鎖および重鎖のヌクレオチド配列に関する一般情報は、Lefranc et al. IMGT(登録商標), the international ImMunoGeneTics information system(登録商標) 25 years on. Nucleic Acids Res. 2015 Jan;43からのIMGT(登録商標)(international ImMunoGeneTics information system(登録商標))で得られる。重鎖および軽鎖Vドメインの増幅DNA断片を、ヒトIgG1含有哺乳動物発現ベクターにインフレームで挿入した。構築物のIL-2部分を、IgG重鎖のC末端とIL-2のN末端との間に、(G4S)3 15-merリンカーを使用して重鎖とインフレームでクローニングした。IL-2部分を融合した後、IgG重鎖のC末端リシン残基を除去した。単一IL-2遺伝子が完全IgGに融合された構築物を生成するには、IgG CH3ドメインにおけるノブ-イントゥ-ホール改変により促進されるヘテロ二量体化のために2つの重鎖プラスミドを構築してトランスフェクトする必要があった。IL-2部分に接続された「ホール」重鎖は、CH3ドメインにY349C、T366S、L368AおよびY407V変異を保有した一方で、融合されていない「ノブ」重鎖は、CH3ドメインにS354CおよびT366W変異を保有した(EU番号付け)。FcγR結合/エフェクター機能を消失させ、FcR共活性化を防止するために、IgG重鎖の各々のCH2ドメインに次の変異を導入した:L234A/L235A/G237A(EU番号付け)。抗体-IL-2融合構築物の発現をCMVプロモーターにより駆動し、コード配列の下流に位置する合成ポリAシグナル配列により転写を終結させた。
実施例で使用する場合のIL-2ポリペプチドを有する融合タンパク質をコードする構築物は、ポリエチレンイミン(PEI)を使用する指数増殖しているExpi293細胞と哺乳動物発現ベクターの共トランスフェクションにより産生した。手短に述べると、IL-2融合構築物を、先ず、プロテインAマトリックスを使用してアフィニティークロマトグラフィーにより精製した。プロテインAカラムをリン酸緩衝食塩水(PBS)中で平衡させ、洗浄した。融合構築物を、20mMクエン酸ナトリウム、50mM塩化ナトリウム、pH3.6で溶出した。溶出画分をプールし、10mM MES、25mM塩化ナトリウム pH6に透析した。ホモ二量体よりもヘテロ二量体を精製するためにイオン交換クロマトグラフィー(Mono-S、GE Healthcare)を使用してタンパク質をさらに精製した。タンパク質をロードした後、カラムを10mM MES、25mM塩化ナトリウム pH6で洗浄する。次いで、タンパク質を10mM MES pH6緩衝液中25mMから500mMまでの漸増勾配の塩化ナトリウムで溶出した。ヘテロ二量体に相当する主溶離液ピークを回収し、濃縮した。次いで、精製タンパク質をPBS中でのサイズ排除クロマトグラフィー(Superdex 200、GE Healthcare)により洗練した。
IL-2融合タンパク質の活性を、STAT5のリン酸化を測定するヒト末梢血単核細胞(PBMC)でのアッセイで決定した。Ficoll-Paque Plus(GE Healthcare)を使用して健康なドナーの血液からPBMCを単離し、ACK溶解緩衝液(Gibco)を製造業者の指示に従って使用して赤血球を溶解した。典型的には、PBMCを無血清RPMI1640培地に2×106個の細胞/mlで再懸濁させ、96ウェルU底プレートに分取した(ウェル当り50μl)。IL-2融合タンパク質および対照タンパク質、例えば、組換えヒトIL-2および対照(HAに標的化される)融合タンパク質を希釈して所望の濃度にし、ウェルに添加した(2×刺激として50μlを添加した)。インキュベーションを典型的には30分、37℃で行ない、その後、100μlの予温しておいた4%PFA(最終2%)を用いて10分間、37℃でそれを停止させた。次いで、細胞を次の表面マーカーに対する抗体で染色した:CD45(クローンHI30)、CD3(UCHT1、BD Biosciences)、CD8α(SK1、Biolegend;RPA-T8、Biolegend)、CD4(RPA-T4、Biolegend)、およびCD25(M-A251、Biolegend)。細胞を洗浄緩衝液(PBS中の2%FBS)で2回洗浄し、4%PFAで10分間、室温で固定した。固定後、予冷しておいたPhosflow Perm buffer III(BD Biosciences)を製造業者のプロトコールに従って用いて、細胞を透過処理した。透過処理後、細胞を、細胞内マーカー(pSTAT5[pY694]、クローン47、BD Biosciences、および/またはパーフォリン、クローンδG9、BD Biosciences)に対する抗体で染色し、フローサイトメトリーで分析した。データを、pSTAT5陽性パーセントとして、一部の場合にはpSTAT5平均蛍光強度(MFI)として表し、GraphPad Prismにインポートして各構築物についてのEC50値を決定した。
脾臓を70mMストレーナー上に配置し、プランジャーを使用してストレーナーを通してPBSで細胞を洗浄することにより、B6マウスの脾臓から脾細胞を単離した。赤血球をACK溶解緩衝液で溶解し、細胞をRPMI培地1ml当り20×106個で再懸濁させた。細胞をU底プレートに1ウェル当り50mlで播種した。IL-2融合タンパク質および対照タンパク質を細胞に添加した(2×刺激として50μl)。CD49b抗体(5ml、DX5クローン)を各ウェルに添加した後、37℃で30分間、細胞をインキュベートした。細胞を8%PFA(最終4%)で固定した。細胞をPBS-2%FBSで2回洗浄し、75mlのPhosflow Perm buffer III緩衝液に再懸濁させ、1時間、4℃でインキュベートした。細胞をPBS-2%FBSで3回洗浄し、CD3(17A2)、CD4(GK1.5)、CD8a(53-6.7)、CD8b(YTS156.7.7)、CD25(7D4)、およびpSTAT5(クローン47)に対する抗体を含有する50μlのFACS緩衝液中で染色した。試料を2回洗浄し、フローサイトメトリーで分析した。Ki67アッセイのために、1×105個の脾細胞を、96ウェルU底プレート内10%FBSを補充したRPMI培地に播種し、37℃で5日間培養した後、Ki-67について染色した。手短に述べると、CD3(145-2C11)、CD4(GK1.4)、CD8(53-6.7)、CD25(PC61)およびNK1.1(PK136)に対する抗体で細胞の表面を染色し、次いで、固定し、Foxp3/Transcription Factor Staining Buffer Set(Thermo Fisher Scientific)を製造業者のプロトコールに従って使用して透過処理した。Ki67抗体(クローン16A8)を45分間、4℃で添加し、その後、細胞を洗浄し、フローサイトメトリーで分析した。
ヒトとカニクイザルCD8α、CD8βおよびPD1抗原に対する、ならびにヒトIL-2RαおよびIL-2Rβに対するIL-2融合タンパク質の動態速度定数(kinetic rate constant)(konおよびkoff)および親和性(KD)を、BIAcore(GE Healthcare)(10mMホスフェート、150mM塩化ナトリウム pH7.4、0.005% Tween 20)を使用して37℃で表面プラズモン共鳴(SPR)により測定した。手短に述べると、親和性を決定するために、IL-2融合タンパク質をそれらのFcを介してCM4センサーチップ上に、共有結合で固定化された抗ヒトFc捕捉抗体によって0.75μg/mLでおよび10μL/分の流量で30秒間、捕捉した。参照表面として役立つようにフローセル1上には抗体を捕捉しなかった。様々な濃度の抗原(1mMから1.4nMまで3倍希釈)またはIL-2受容体(3mMから12nMまで3倍希釈)を、捕捉されたIL-2融合タンパク質上に被検物質として注入した。結合相を120秒間記録し、解離相を600秒間記録した。Biacore Evaluation Softwareを使用して、センサーグラムを二重参照し、物質移動モデルで1:1ラングミュアにグローバルフィッティングして会合速度(kon)、解離速度(koff)および平衡解離定数(KD=koff/kon)を決定した。
本実施例は、IL-2融合体化合物のマウスNK細胞におけるSTAT5の活性化能およびマウスにおけるNK媒介毒性の誘導能を試験するための実験を説明する。
本実施例は、抗マウスCD8抗体の特徴付けを記載する。
抗マウスCD8抗体の結合親和性をフローサイトメトリー分析によって決定した。新鮮な脾細胞を、xCD8ab1(クローン2.43)、xCD8ab2(クローンYTS156.7.7)またはxCD8ab2.1のいずれかとともに2時間、4℃でインキュベートした。xCD8ab1(クローン2.43)およびxCD8ab2(クローンYTS156.7.7)配列は、以前に公開されている。xCD8ab2.1クローンは、変異N95A(VH)およびD92A(VK)の導入によりxCD8ab2から誘導した。抗マウスCD8抗体とのインキュベーション後に、細胞をCD3、CD4、CD8に対する抗体および抗hFc(HP6017、Biolegend)で染色し、これらのうちの最後の抗hFcは、hFcを含有するCD8-IL2融合体の結合を測定するために使用した。染色された細胞を洗浄し、フローサイトメトリーにより分析し、抗hFcでの染色の平均蛍光強度(MFI)を使用して結合を表示した。図7に示されているように、xCD8ab2は、CD8+T細胞に対してxCD8ab1より高い親和性を有した。xCD8ab2.1は、xCD8ab2に2つの変異(N95A(VH)およびD92A(VK))を導入することにより生成した、xCD8ab2のより親和性の低いバリアントである。
本実施例は、CD8抗体に融合したIL-2変異タンパク質の特徴付けを記載する。
B16マウス腫瘍モデル
8~10週齢のC57BL6雌マウス(Jackson Labs)を.動物飼養施設で飼育し、環境に順化させた。培養B16.F10細胞(ATCC、CRL-6475)を採取し、移植のために無血清培地(1×DMEM、Sigma D6429)に5×106個の細胞/mLで再懸濁させた。マウスを剪毛し、5×105個の細胞(100μL)を後肢の後部上方に皮下移植した。移植後おおよそ8日目に60~120mm3の腫瘍体積に達するまで腫瘍を測定した(TV=幅×幅×長さ×0.5)。次いで、腫瘍体積によりマウスを群に無作為に割り当てた。各マウスを秤量し、首筋の下に皮下投与した。腫瘍体積および体重を、研究の終了(初回投与の30~40日後)まで、または最大腫瘍体積(2000mm3)に達するまで、3~4日ごとに測定した。研究の終了時にCO2と適切な二次安楽死薬によりマウスを安楽死させた。
BALB/c雌マウスを剪毛し、培養CT26 wt細胞(ATCC、CRL-2638)の2×105個の細胞(100μL)を後肢の後部上方に皮下移植した。腫瘍体積が、移植後おおよそ8日目に60~120mm3に達するまで、腫瘍体積を測定した(TV=幅×幅×長さ×0.5)。次いで、各マウスを秤量し、示した化合物を皮下投与した(1群当りマウス9匹)。
B6マウスにB16腫瘍細胞を注射し、腫瘍を200~250mm3に成長させた後、1mg/kgで示したIL-2融合体をマウスに投与した。腫瘍を投与後5日目に除去し、単一細胞に消化し、フローサイトメトリーによりプロファイリングしてCD8+T細胞およびNK細胞(NK1.1+CD3-)を検出した。手短に述べると、Miltenyi Gentle MACS Cチューブの中でMouse Tumor Dissociation Kit(Miltenyi Biotec、130-096-730)を製造業者のプロトコールに従って使用して、腫瘍を消化した。単離された細胞を計数し、10×106個の細胞をCD45、CD3、CD4、CD8、CD25およびCD49bに対する抗体で染色した。血液もマウスから採取し(50μl)、ACK溶解緩衝液で溶解し、洗浄緩衝液(PBS/0.5% BSA/2mM EDTA)で洗浄し、系統マーカーで染色してCD8+T細胞およびNK細胞を同定した。細胞をフローサイトメーターで分析した。
CD8抗体に融合したIL-2変異タンパク質バリアントを、IL-2Rを発現する他の免疫細胞と比較してCD8+T細胞の選択的標的化について試験した。IL-2変異タンパク質を、フォーマットBで、以前に公開された抗マウスCD8抗体であるxmCD8ab1(2.43クローン)に融合した。マウス脾細胞を、実施例1に記載したように、IL-2変異タンパク質融合体で処理してSTAT5アッセイを行なった。表1および図9は、この実験の結果をまとめる。
本実施例は、IL-2Rβ/γへの結合が減少したxmCD8-IL-2変異タンパク質の特徴付けを記載する。
STAT5アッセイ
B16腫瘍を担持しているB6マウスからの脾細胞を、示したタンパク質とともに、抗CD49b染色抗体と一緒にRPMI培地中で30分間、インキュベートし、その後、細胞を、細胞表面マーカー(CD3、CD4、CD8、CD25)についておよび細胞内STAT5について、実施例1におけるプロトコールに従って染色した。示した細胞サブセットにおけるSTAT5についてのデータを平均蛍光強度(MFI)として表す。
B16腫瘍を担持しているB6マウスからの脾細胞を、示したタンパク質とともに5日間、完全RPMI培地中でインキュベートし、その後、細胞を、細胞表面マーカー(CD3、CD4、CD8、CD25、NK1.1)について、ならびに増殖の細胞内マーカー、Ki67、IL-2Rβ/γおよびSTAT5からの下流シグナル伝達事象について、実施例1におけるプロトコールに従って染色した。
xmCD8ab2-IL2m4の活性用量が、検出可能なNK細胞拡大増殖を誘導したことを考慮すると、NK細胞を含む、IL2R+細胞に対するその活性をさらに減少させるためにIL2m4に追加の変異を導入した。IL-2Rβ/γのIL-2との相互作用表面における(IL-2Rbgへの結合を低減させると予測された)変異を選択した。IL-2Rへの結合を妨げる、選択した変異を有するIL-2変異タンパク質を、フォーマットCでxmCD8ab2抗体に融合し、マウス脾細胞を用いてSTAT5アッセイで試験した。表2ならびに図15Aおよび15Bは、これらの実験の結果を示す。表2は、変異のリストを示す。
結果
NK細胞と比較して、CD8 T細胞に対する様々な程度の選択性を有する4つの代表的なCD8-IL2融合体を、B16腫瘍モデルにおいて実施例4に記載したように試験した。すべてのマウスに、1mg/kgの示した融合体を5mg/kgの抗PD1と一緒に投与した。図20に示されているように、CD8-IL-2は、TAg-IL-2vよりも良好な性能(図10を参照されたい)をより低い用量で示した。CD8 T細胞に対して最も低い選択性を有するCD8-IL2融合体は、B16モデルにおいて、TAg-IL-2vについて観察されたもの(図10)に迫る、最も小さい有効性を有した。最も高い有効性および>40%無腫瘍マウスには、>10倍の選択性が必要であった。
本実施例は、hPBMCにおけるCD8-IL-2融合体の活性および選択性に対するIL-2変異の影響を記載する。
hPBMCにおけるCD8-IL-2融合体の活性に対するIL-2変異の影響を特徴付けるために、示したIL-2変異タンパク質をxmCD8ab1抗体に融合し、hPBMCを用いてSTAT5アッセイで試験した。xmCD8ab1抗体は、ヒトCD8を認識しなかった。得られたデータを使用して、各々の変異をSTAT5活性に対するその効果に従ってランク付けした。表6、7および8は、この実験の結果をまとめる。Tregを、IL-2Rβγを発現する細胞の代表例として示す。
Claims (23)
- 2つの部分を含む融合タンパク質であって、
i)第1の部分が、抗体重鎖VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3単量体であって、ここで、VHは、可変重鎖であり、CH2-CH3は、Fcドメインである、抗体重鎖VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3単量体、抗体軽鎖VL-CLであって、ここで、VLは、可変軽鎖であり、CLは、定常軽鎖である、抗体軽鎖VL-CL、および変異体IL-2ポリペプチドを含み、前記変異体IL-2ポリペプチドのN末端が、前記FcドメインのC末端にリンカーを介して融合されており;
ii)第2の部分が、抗体重鎖VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3単量体および抗体軽鎖VL-CLを含み;
前記第1の部分と前記第2の部分の両方が、次の群:ヒトCD8α、およびヒトCD8βから選択される1つの抗原上のエピトープに結合し;
前記変異体IL-2ポリペプチドが、以下のセットのアミノ酸置換(配列番号1の配列に対する):R38EおよびF42A;R38DおよびF42A;F42AおよびE62Q;R38AおよびF42K;R38E、F42AおよびN88S;R38E、F42AおよびN88A;R38E、F42AおよびV91E;R38E、F42AおよびD84H;H16D、R38EおよびF42A;H16E、R38EおよびF42A;R38E、F42AおよびQ126S;R38D、F42AおよびN88S;R38D、F42AおよびN88A;R38D、F42AおよびV91E;R38D、F42AおよびD84H;H16D、R38DおよびF42A;H16E、R38DおよびF42A;R38D、F42AおよびQ126S;R38A、F42KおよびN88S;R38A、F42KおよびN88A;R38A、F42KおよびV91E;R38A、F42KおよびD84H;H16D、R38AおよびF42K;H16E、R38AおよびF42K;R38A、F42KおよびQ126S;F42A、E62QおよびN88S;F42A、E62QおよびN88A;F42A、E62QおよびV91E;F42A、E62QおよびD84H;H16D、F42AおよびE62Q;H16E、F42AおよびE62Q;F42A、E62QおよびQ126S;R38E、F42AおよびC125A;R38D、F42AおよびC125A;F42A、E62QおよびC125A;R38A、F42KおよびC125A;R38E、F42A、N88SおよびC125A;R38E、F42A、N88AおよびC125A;R38E、F42A、V91EおよびC125A;R38E、F42A、D84HおよびC125A;H16D、R38E、F42AおよびC125A;H16E、R38E、F42AおよびC125A;R38E、F42A、C125AおよびQ126S;R38D、F42A、N88SおよびC125A;R38D、F42A、N88AおよびC125A;R38D、F42A、V91EおよびC125A;R38D、F42A、D84HおよびC125A;H16D、R38D、F42AおよびC125A;H16E、R38D、F42AおよびC125A;R38D、F42A、C125AおよびQ126S;R38A、F42K、N88SおよびC125A;R38A、F42K、N88AおよびC125A;R38A、F42K、V91EおよびC125A;R38A、F42K、D84HおよびC125A;H16D、R38A、F42KおよびC125A;H16E、R38A、F42KおよびC125A;R38A、F42K、C125AおよびQ126S;F42A、E62Q、N88SおよびC125A;F42A、E62Q、N88AおよびC125A;F42A、E62Q、V91EおよびC125A;F42A、E62QおよびD84HおよびC125A;H16D、F42AおよびE62QおよびC125A;H16E、F42A、E62QおよびC125A;F42A、E62Q、C125AおよびQ126S;F42A、N88SおよびC125A;F42A、N88AおよびC125A;F42A、V91EおよびC125A;F42A、D84HおよびC125A;H16D、F42AおよびC125A;H16E、F42AおよびC125A;ならびにF42A、C125AおよびQ126Sのうちの1つを有する、配列番号1のアミノ酸配列を含む、
融合タンパク質。 - 2つの部分を含む融合タンパク質であって、
i)第1の部分が、抗体ヒンジ-CH2-CH3単量体であって、ここで、CH2-CH3は、Fcドメインである、抗体ヒンジ-CH2-CH3単量体と変異体IL-2ポリペプチドとを含むポリペプチドであって、前記変異体IL-2ポリペプチドのN末端が、前記FcドメインのC末端にリンカーを介して融合されているポリペプチドであり;
ii)第2の部分が、抗体重鎖VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3単量体と抗体軽鎖VL-CLとを含むポリペプチドであり;
前記第2の部分が、次の群:ヒトCD8α、およびヒトCD8βから選択される1つの抗原上のエピトープに結合し;
前記変異体IL-2ポリペプチドが、以下のセットのアミノ酸置換(配列番号1の配列に対する):R38EおよびF42A;R38DおよびF42A;F42AおよびE62Q;R38AおよびF42K;R38E、F42AおよびN88S;R38E、F42AおよびN88A;R38E、F42AおよびV91E;R38E、F42AおよびD84H;H16D、R38EおよびF42A;H16E、R38EおよびF42A;R38E、F42AおよびQ126S;R38D、F42AおよびN88S;R38D、F42AおよびN88A;R38D、F42AおよびV91E;R38D、F42AおよびD84H;H16D、R38DおよびF42A;H16E、R38DおよびF42A;R38D、F42AおよびQ126S;R38A、F42KおよびN88S;R38A、F42KおよびN88A;R38A、F42KおよびV91E;R38A、F42KおよびD84H;H16D、R38AおよびF42K;H16E、R38AおよびF42K;R38A、F42KおよびQ126S;F42A、E62QおよびN88S;F42A、E62QおよびN88A;F42A、E62QおよびV91E;F42A、E62QおよびD84H;H16D、F42AおよびE62Q;H16E、F42AおよびE62Q;F42A、E62QおよびQ126S;R38E、F42AおよびC125A;R38D、F42AおよびC125A;F42A、E62QおよびC125A;R38A、F42KおよびC125A;R38E、F42A、N88SおよびC125A;R38E、F42A、N88AおよびC125A;R38E、F42A、V91EおよびC125A;R38E、F42A、D84HおよびC125A;H16D、R38E、F42AおよびC125A;H16E、R38E、F42AおよびC125A;R38E、F42A、C125AおよびQ126S;R38D、F42A、N88SおよびC125A;R38D、F42A、N88AおよびC125A;R38D、F42A、V91EおよびC125A;R38D、F42A、D84HおよびC125A;H16D、R38D、F42AおよびC125A;H16E、R38D、F42AおよびC125A;R38D、F42A、C125AおよびQ126S;R38A、F42K、N88SおよびC125A;R38A、F42K、N88AおよびC125A;R38A、F42K、V91EおよびC125A;R38A、F42K、D84HおよびC125A;H16D、R38A、F42KおよびC125A;H16E、R38A、F42KおよびC125A;R38A、F42K、C125AおよびQ126S;F42A、E62Q、N88SおよびC125A;F42A、E62Q、N88AおよびC125A;F42A、E62Q、V91EおよびC125A;F42A、E62QおよびD84HおよびC125A;H16D、F42AおよびE62QおよびC125A;H16E、F42A、E62QおよびC125A;F42A、E62Q、C125AおよびQ126S;F42A、N88SおよびC125A;F42A、N88AおよびC125A;F42A、V91EおよびC125A;F42A、D84HおよびC125A;H16D、F42AおよびC125A;H16E、F42AおよびC125A;ならびにF42A、C125AおよびQ126Sのうちの1つを有する、配列番号1のアミノ酸配列を含む、
融合タンパク質。 - 2つの部分を含む融合タンパク質であって、
i)第1の部分が、抗体ヒンジ-CH2-CH3単量体であって、ここで、CH2-CH3は、Fcドメインである、抗体ヒンジ-CH2-CH3単量体と変異体IL-2ポリペプチドとを含むポリペプチドであって、前記変異体IL-2ポリペプチドのC末端が、前記FcドメインのN末端にリンカーを介して融合されているポリペプチドであり;
ii)第2の部分が、抗体重鎖VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3単量体と抗体軽鎖VL-CLとを含むポリペプチドであり;
前記第2の部分が、次の群:ヒトCD8α、およびヒトCD8βから選択される1つの抗原上のエピトープに結合し;
前記変異体IL-2ポリペプチドが、以下のセットのアミノ酸置換(配列番号1の配列に対する):R38EおよびF42A;R38DおよびF42A;F42AおよびE62Q;R38AおよびF42K;R38E、F42AおよびN88S;R38E、F42AおよびN88A;R38E、F42AおよびV91E;R38E、F42AおよびD84H;H16D、R38EおよびF42A;H16E、R38EおよびF42A;R38E、F42AおよびQ126S;R38D、F42AおよびN88S;R38D、F42AおよびN88A;R38D、F42AおよびV91E;R38D、F42AおよびD84H;H16D、R38DおよびF42A;H16E、R38DおよびF42A;R38D、F42AおよびQ126S;R38A、F42KおよびN88S;R38A、F42KおよびN88A;R38A、F42KおよびV91E;R38A、F42KおよびD84H;H16D、R38AおよびF42K;H16E、R38AおよびF42K;R38A、F42KおよびQ126S;F42A、E62QおよびN88S;F42A、E62QおよびN88A;F42A、E62QおよびV91E;F42A、E62QおよびD84H;H16D、F42AおよびE62Q;H16E、F42AおよびE62Q;F42A、E62QおよびQ126S;R38E、F42AおよびC125A;R38D、F42AおよびC125A;F42A、E62QおよびC125A;R38A、F42KおよびC125A;R38E、F42A、N88SおよびC125A;R38E、F42A、N88AおよびC125A;R38E、F42A、V91EおよびC125A;R38E、F42A、D84HおよびC125A;H16D、R38E、F42AおよびC125A;H16E、R38E、F42AおよびC125A;R38E、F42A、C125AおよびQ126S;R38D、F42A、N88SおよびC125A;R38D、F42A、N88AおよびC125A;R38D、F42A、V91EおよびC125A;R38D、F42A、D84HおよびC125A;H16D、R38D、F42AおよびC125A;H16E、R38D、F42AおよびC125A;R38D、F42A、C125AおよびQ126S;R38A、F42K、N88SおよびC125A;R38A、F42K、N88AおよびC125A;R38A、F42K、V91EおよびC125A;R38A、F42K、D84HおよびC125A;H16D、R38A、F42KおよびC125A;H16E、R38A、F42KおよびC125A;R38A、F42K、C125AおよびQ126S;F42A、E62Q、N88SおよびC125A;F42A、E62Q、N88AおよびC125A;F42A、E62Q、V91EおよびC125A;F42A、E62QおよびD84HおよびC125A;H16D、F42AおよびE62QおよびC125A;H16E、F42A、E62QおよびC125A;F42A、E62Q、C125AおよびQ126S;F42A、N88SおよびC125A;F42A、N88AおよびC125A;F42A、V91EおよびC125A;F42A、D84HおよびC125A;H16D、F42AおよびC125A;H16E、F42AおよびC125A;ならびにF42A、C125AおよびQ126Sのうちの1つを有する、配列番号1のアミノ酸配列を含む、
融合タンパク質。 - 2つの部分を含む融合タンパク質であって、
i)第1の部分が、ヒトCD8αまたはヒトCD8βに結合する抗原結合ドメインを含み;
ii)第2の部分が、変異体IL-2ポリペプチドを含み;
前記第2の部分が、前記第1の部分にリンカーを介して連結され、
前記変異体IL-2ポリペプチドが、以下のセットのアミノ酸置換(配列番号1の配列に対する):R38EおよびF42A;R38DおよびF42A;F42AおよびE62Q;R38AおよびF42K;R38E、F42AおよびN88S;R38E、F42AおよびN88A;R38E、F42AおよびV91E;R38E、F42AおよびD84H;H16D、R38EおよびF42A;H16E、R38EおよびF42A;R38E、F42AおよびQ126S;R38D、F42AおよびN88S;R38D、F42AおよびN88A;R38D、F42AおよびV91E;R38D、F42AおよびD84H;H16D、R38DおよびF42A;H16E、R38DおよびF42A;R38D、F42AおよびQ126S;R38A、F42KおよびN88S;R38A、F42KおよびN88A;R38A、F42KおよびV91E;R38A、F42KおよびD84H;H16D、R38AおよびF42K;H16E、R38AおよびF42K;R38A、F42KおよびQ126S;F42A、E62QおよびN88S;F42A、E62QおよびN88A;F42A、E62QおよびV91E;F42A、E62QおよびD84H;H16D、F42AおよびE62Q;H16E、F42AおよびE62Q;F42A、E62QおよびQ126S;R38E、F42AおよびC125A;R38D、F42AおよびC125A;F42A、E62QおよびC125A;R38A、F42KおよびC125A;R38E、F42A、N88SおよびC125A;R38E、F42A、N88AおよびC125A;R38E、F42A、V91EおよびC125A;R38E、F42A、D84HおよびC125A;H16D、R38E、F42AおよびC125A;H16E、R38E、F42AおよびC125A;R38E、F42A、C125AおよびQ126S;R38D、F42A、N88SおよびC125A;R38D、F42A、N88AおよびC125A;R38D、F42A、V91EおよびC125A;R38D、F42A、D84HおよびC125A;H16D、R38D、F42AおよびC125A;H16E、R38D、F42AおよびC125A;R38D、F42A、C125AおよびQ126S;R38A、F42K、N88SおよびC125A;R38A、F42K、N88AおよびC125A;R38A、F42K、V91EおよびC125A;R38A、F42K、D84HおよびC125A;H16D、R38A、F42KおよびC125A;H16E、R38A、F42KおよびC125A;R38A、F42K、C125AおよびQ126S;F42A、E62Q、N88SおよびC125A;F42A、E62Q、N88AおよびC125A;F42A、E62Q、V91EおよびC125A;F42A、E62QおよびD84HおよびC125A;H16D、F42AおよびE62QおよびC125A;H16E、F42A、E62QおよびC125A;F42A、E62Q、C125AおよびQ126S;F42A、N88SおよびC125A;F42A、N88AおよびC125A;F42A、V91EおよびC125A;F42A、D84HおよびC125A;H16D、F42AおよびC125A;H16E、F42AおよびC125A;ならびにF42A、C125AおよびQ126Sのうちの1つを有する、配列番号1のアミノ酸配列を含む、
融合タンパク質。 - 前記第1の部分が、(a)1つもしくは2つの重鎖ポリペプチドと1つもしくは2つの軽鎖ポリペプチドとを含む抗体もしくはその抗原結合性断片;(b)単鎖抗体もしくは単鎖可変断片(scFv);または(c)VHH抗体を含む、請求項4に記載の融合タンパク質。
- NK細胞の活性化と比較して、10倍またはそれより大きい効力でCD8+T細胞を活性化する、請求項1から5のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
- NK細胞の活性化と比較して、50倍またはそれより大きい効力でCD8+T細胞を活性化する、請求項6に記載の融合タンパク質。
- 前記変異体IL-2ポリペプチドが、配列番号1のアミノ酸配列を有する野生型IL-2ポリペプチドの結合親和性と比較して、配列番号2のアミノ酸配列を有するIL-2Rαポリペプチドに対する結合親和性の50%またはそれを超える低減を示す、請求項1から7のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
- 前記変異体IL-2ポリペプチドが、配列番号1のアミノ酸配列を有する野生型IL-2ポリペプチドの結合親和性と比較して、配列番号3のアミノ酸配列を有するIL-2Rβポリペプチドに対する結合親和性の50%またはそれを超える低減を示す、請求項8に記載の融合タンパク質。
- 前記変異体IL-2ポリペプチドが、配列番号1のアミノ酸配列を有する野生型IL-2ポリペプチドの結合親和性と比較して、配列番号4のアミノ酸配列を有するIL-2Rγポリペプチドに対する結合親和性の50%またはそれを超える低減を示す、請求項8または請求項9に記載の融合タンパク質。
- 前記融合タンパク質が、ヒトCD8に結合し、前記融合タンパク質のCD8への結合が、CD8とMHCクラスIの相互作用を遮断しない、請求項1から10のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
- 前記第1の部分のCH2-CH3のFcドメインおよび前記第2の部分のCH2-CH3のFcドメインが、EU番号付けに従って、次のFc変異:L234A、L235A、G237AおよびK322Aを含む、請求項1から11のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
- (a)EU番号付けに従って、前記第1の部分のCH2-CH3のFcドメインが、次のアミノ酸置換:Y349CおよびT366Wを含み、前記第2の部分のCH2-CH3のFcドメインが、次のアミノ酸置換:S354C、T366S、L368AおよびY407Vを含むか;または
(b)EU番号付けに従って、前記第2の部分のCH2-CH3のFcドメインが、次のアミノ酸置換:Y349CおよびT366Wを含み、前記第1の部分のCH2-CH3のFcドメインが、次のアミノ酸置換:S354C、T366S、L368AおよびY407Vを含む、
請求項1から12のいずれか一項に記載の融合タンパク質。 - (a)前記融合タンパク質が、ヒトCD8に結合し、前記融合タンパク質のCD8への結合が、CD8とMHCクラスIの相互作用を遮断しない特性;および
(b)NK細胞の活性化と比較して、10倍またはそれより大きい効力でCD8+T細胞を活性化する特性、
のうちの1つまたは複数を有する、請求項1から13のいずれか一項に記載の融合タンパク質。 - CD8+T細胞およびNK細胞の活性化の効力が、細胞増殖により評価される細胞活性化のEC50により測定される、請求項6、7および14のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
- 請求項1から15のいずれか一項に記載の融合タンパク質をコードする1つまたは複数の単離されたポリヌクレオチド。
- 請求項16に記載のポリヌクレオチドを含む1つまたは複数のベクター、特に発現ベクター。
- 請求項16に記載のポリヌクレオチドを含む宿主細胞。
- 請求項1から15のいずれか一項に記載の融合タンパク質と薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物。
- 医薬としての使用のための、請求項1から15のいずれか一項に記載の融合タンパク質を含む組成物または請求項19に記載の医薬組成物。
- がんまたは慢性感染症を処置するための、請求項1から15のいずれか一項に記載の融合タンパク質を含む組成物または請求項19に記載の医薬組成物。
- がんを処置するための、請求項1から15のいずれか一項に記載の融合タンパク質を含む組成物または請求項19に記載の医薬組成物であって、前記組成物が、T細胞療法、がんワクチン、化学療法剤、または免疫チェックポイント阻害剤(ICI)と組み合わせて患者に投与されることを特徴とする、組成物または医薬組成物。
- 前記ICIが、PD-1、PD-L1またはCTLA-4の阻害剤である、請求項22に記載の組成物または医薬組成物。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2025000023A JP2025060983A (ja) | 2019-06-05 | 2025-01-05 | 免疫細胞機能をモジュレートするための変異体インターロイキン-2ポリペプチドと抗原結合分子の融合体 |
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US201962857726P | 2019-06-05 | 2019-06-05 | |
| US62/857,726 | 2019-06-05 | ||
| PCT/US2020/036454 WO2020247843A2 (en) | 2019-06-05 | 2020-06-05 | Fusions of mutant interleukin-2 polypeptides with antigen binding molecules for modulating immune cell function |
Related Child Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2025000023A Division JP2025060983A (ja) | 2019-06-05 | 2025-01-05 | 免疫細胞機能をモジュレートするための変異体インターロイキン-2ポリペプチドと抗原結合分子の融合体 |
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JP2022535130A JP2022535130A (ja) | 2022-08-04 |
| JPWO2020247843A5 JPWO2020247843A5 (ja) | 2023-06-13 |
| JP7778571B2 true JP7778571B2 (ja) | 2025-12-02 |
Family
ID=73652315
Family Applications (2)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2021572298A Active JP7778571B2 (ja) | 2019-06-05 | 2020-06-05 | 免疫細胞機能をモジュレートするための変異体インターロイキン-2ポリペプチドと抗原結合分子の融合体 |
| JP2025000023A Pending JP2025060983A (ja) | 2019-06-05 | 2025-01-05 | 免疫細胞機能をモジュレートするための変異体インターロイキン-2ポリペプチドと抗原結合分子の融合体 |
Family Applications After (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2025000023A Pending JP2025060983A (ja) | 2019-06-05 | 2025-01-05 | 免疫細胞機能をモジュレートするための変異体インターロイキン-2ポリペプチドと抗原結合分子の融合体 |
Country Status (7)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US20220251202A1 (ja) |
| EP (1) | EP3980051A4 (ja) |
| JP (2) | JP7778571B2 (ja) |
| KR (1) | KR20220083660A (ja) |
| CN (1) | CN114786708A (ja) |
| CA (1) | CA3142738A1 (ja) |
| WO (1) | WO2020247843A2 (ja) |
Families Citing this family (34)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN116970059A (zh) | 2016-12-22 | 2023-10-31 | 库尔生物制药有限公司 | T细胞调节性多聚体多肽及其使用方法 |
| US11851471B2 (en) | 2017-01-09 | 2023-12-26 | Cue Biopharma, Inc. | T-cell modulatory multimeric polypeptides and methods of use thereof |
| IL309479A (en) | 2017-03-15 | 2024-02-01 | Cue Biopharma Inc | Methods for modulating an immune response |
| EP3675892A4 (en) | 2017-07-03 | 2021-10-06 | Torque Therapeutics, Inc. | IMMUNOSTIMULATORY FUSION MOLECULES AND THEIR USES |
| EP3737689A4 (en) | 2018-01-09 | 2021-12-01 | Cue Biopharma, Inc. | MULTIMERIC T CELL-MODULATING POLYPEPTIDES AND METHOD OF USING THEREOF |
| WO2020023702A1 (en) | 2018-07-25 | 2020-01-30 | AskGene Pharma, Inc. | Novel il-21 prodrugs and methods of use thereof |
| JP7512210B2 (ja) | 2018-09-21 | 2024-07-08 | イノベント バイオロジックス (スウツォウ) カンパニー,リミテッド | 新規インターロイキン2およびその使用 |
| WO2020252264A1 (en) | 2019-06-12 | 2020-12-17 | AskGene Pharma, Inc. | Novel il-15 prodrugs and methods of use thereof |
| AU2020292421B2 (en) * | 2019-06-14 | 2026-01-08 | Cugene, Inc. | Novel interleukin-2 variants and bifunctional fusion molecules thereof |
| TW202208395A (zh) | 2020-05-12 | 2022-03-01 | 美商信號生物製藥公司 | 多聚體t細胞調節多肽及其使用方法 |
| CN116323647A (zh) | 2020-05-13 | 2023-06-23 | 博纳姆治疗公司 | 蛋白质复合物的组合物及其使用方法 |
| JP2023532904A (ja) * | 2020-07-02 | 2023-08-01 | インヒブルクス インコーポレイテッド | 修飾il-2ポリペプチドを含むポリペプチド及びその使用 |
| EP4211149A4 (en) | 2020-09-09 | 2024-10-09 | Cue Biopharma, Inc. | MULTIMERIC POLYPEPTIDES MODULATING MHC CLASS II T CELLS FOR THE TREATMENT OF TYPE 1 DIABETES MELLITUS (T1D) AND METHODS OF USE THEREOF |
| TW202406932A (zh) | 2020-10-22 | 2024-02-16 | 美商基利科學股份有限公司 | 介白素2-Fc融合蛋白及使用方法 |
| WO2022087458A1 (en) | 2020-10-23 | 2022-04-28 | Asher Biotherapeutics, Inc. | Fusions with cd8 antigen binding molecules for modulating immune cell function |
| CN117321087A (zh) | 2021-03-26 | 2023-12-29 | 先天制药公司 | 包含与细胞因子融合用于nk细胞衔接的nkp46结合位点、癌抗原结合位点的多特异性蛋白质 |
| US20240199714A1 (en) * | 2021-04-16 | 2024-06-20 | Orionis Biosciences, Inc. | Il-2 based constructs |
| JP2024522069A (ja) | 2021-05-19 | 2024-06-11 | アシャ バイオセラピューティクス,インク. | Il-21ポリペプチド及び標的化コンストラクト |
| WO2022258691A1 (en) | 2021-06-09 | 2022-12-15 | Innate Pharma | Multispecific proteins binding to nkg2d, a cytokine receptor, a tumour antigen and cd16a |
| US20240392008A1 (en) | 2021-06-09 | 2024-11-28 | Innate Pharma | Multispecific proteins binding to nkp46, a cytokine receptor, a tumour antigen and cd16a |
| WO2022258678A1 (en) | 2021-06-09 | 2022-12-15 | Innate Pharma | Multispecific proteins binding to nkp30, a cytokine receptor, a tumour antigen and cd16a |
| EP4351733A1 (en) | 2021-06-09 | 2024-04-17 | Innate Pharma | Multispecific antibodies binding to cd20, nkp46, cd16 and conjugated to il-2 |
| EP4373854A1 (en) * | 2021-07-20 | 2024-05-29 | Inhibrx, Inc. | Cd8-binding polypeptides and uses thereof |
| WO2023004305A1 (en) * | 2021-07-20 | 2023-01-26 | Inhibrx, Inc. | Cd8-targeted modified il-2 polypeptides and uses thereof |
| WO2023010032A1 (en) * | 2021-07-28 | 2023-02-02 | Anwita Biosciences, Inc. | Interleukin-2 muteins, fusion proteins, pharmaceutical compositions, and therapeutic applications |
| EP4433097A1 (en) * | 2021-11-17 | 2024-09-25 | F. Hoffmann-La Roche AG | Compositions of protein complexes and methods of use thereof |
| KR20250039519A (ko) | 2022-06-16 | 2025-03-20 | 세파론 엘엘씨 | 항-pd-1 항체-약화된 il-2 면역접합체 및 그의 용도 |
| EP4556493A1 (en) * | 2022-07-11 | 2025-05-21 | Genuv Inc. | Cytokine fusion protein |
| EP4605422A2 (en) * | 2022-10-20 | 2025-08-27 | Repertoire Immune Medicines, Inc. | Cd8 t cell targeted il2 |
| CN116041539B (zh) * | 2022-10-31 | 2023-07-21 | 山东博安生物技术股份有限公司 | Il-2突变体免疫缀合物 |
| AU2024241026A1 (en) * | 2023-03-21 | 2025-10-09 | Fortvita Biologics (Singapore) Pte. Ltd. | Preparation containing anti-pd-1/mutant il-2 immunoconjugate |
| US20250195677A1 (en) * | 2023-12-19 | 2025-06-19 | Cephalon Llc | Uses for attenuated il-2 immunoconjugates |
| WO2025163581A1 (en) * | 2024-02-01 | 2025-08-07 | Astrazeneca Ab | Cd8-binding cytokine engagers and methods of use thereof |
| CN118373896B (zh) * | 2024-04-19 | 2025-07-29 | 上海科棋药业科技有限公司 | 抗pd-1抗体与il-2突变体的双功能融合蛋白 |
Citations (8)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20170313753A1 (en) | 2009-01-21 | 2017-11-02 | Amgen Inc. | Methods of treating graft versus host disease using il-2 muteins |
| JP2018102312A (ja) | 2014-02-06 | 2018-07-05 | エフ.ホフマン−ラ ロシュ アーゲーF. Hoffmann−La Roche Aktiengesellschaft | インターロイキン−2融合タンパク質及びその使用 |
| WO2018170168A1 (en) | 2017-03-15 | 2018-09-20 | Cue Biopharma, Inc. | Methods for modulating an immune response |
| WO2018184964A1 (en) | 2017-04-03 | 2018-10-11 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Immunoconjugates of an anti-pd-1 antibody with a mutant il-2 or with il-15 |
| WO2018234862A1 (en) | 2017-06-19 | 2018-12-27 | Medicenna Therapeutics Inc. | Uses and methods for il-2 superagonists, agonists, and fusions thereof |
| WO2019032661A1 (en) | 2017-08-09 | 2019-02-14 | Orionis Biosciences Inc. | CD8 LIAISON AGENTS |
| JP2019058182A (ja) | 2013-03-14 | 2019-04-18 | アムジエン・インコーポレーテツド | 制御性t細胞の増殖のためのインターロイキン−2ムテイン |
| WO2019104092A1 (en) | 2017-11-21 | 2019-05-31 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Partial agonists of interleukin-2 |
Family Cites Families (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| KR20120053042A (ko) * | 2009-08-17 | 2012-05-24 | 로슈 글리카트 아게 | 표적화된 면역접합체 |
| EA201892619A1 (ru) * | 2011-04-29 | 2019-04-30 | Роше Гликарт Аг | Иммуноконъюгаты, содержащие мутантные полипептиды интерлейкина-2 |
| EP3421495A3 (en) * | 2013-03-15 | 2019-05-15 | Xencor, Inc. | Modulation of t cells with bispecific antibodies and fc fusions |
| MY185014A (en) * | 2015-08-07 | 2021-04-30 | Alx Oncology Inc | Contructs having a sirp-alpha domain or variant thereof |
| BR112019021411A2 (pt) * | 2017-04-13 | 2020-05-05 | Hoffmann La Roche | métodos para tratar ou retardar a progressão do câncer e para melhorar a função, usos de um imunoconjugado, de um agonista, de um antagonista, composições, kit e invenção |
| KR20200010354A (ko) * | 2017-05-24 | 2020-01-30 | 팬디온 테라퓨틱스, 인코포레이티드 | 표적화된 면역관용 |
| WO2022087458A1 (en) * | 2020-10-23 | 2022-04-28 | Asher Biotherapeutics, Inc. | Fusions with cd8 antigen binding molecules for modulating immune cell function |
-
2020
- 2020-06-05 JP JP2021572298A patent/JP7778571B2/ja active Active
- 2020-06-05 KR KR1020227000163A patent/KR20220083660A/ko active Pending
- 2020-06-05 US US17/616,157 patent/US20220251202A1/en active Pending
- 2020-06-05 CA CA3142738A patent/CA3142738A1/en active Pending
- 2020-06-05 CN CN202080051337.9A patent/CN114786708A/zh active Pending
- 2020-06-05 EP EP20819187.4A patent/EP3980051A4/en active Pending
- 2020-06-05 WO PCT/US2020/036454 patent/WO2020247843A2/en not_active Ceased
-
2025
- 2025-01-05 JP JP2025000023A patent/JP2025060983A/ja active Pending
Patent Citations (8)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20170313753A1 (en) | 2009-01-21 | 2017-11-02 | Amgen Inc. | Methods of treating graft versus host disease using il-2 muteins |
| JP2019058182A (ja) | 2013-03-14 | 2019-04-18 | アムジエン・インコーポレーテツド | 制御性t細胞の増殖のためのインターロイキン−2ムテイン |
| JP2018102312A (ja) | 2014-02-06 | 2018-07-05 | エフ.ホフマン−ラ ロシュ アーゲーF. Hoffmann−La Roche Aktiengesellschaft | インターロイキン−2融合タンパク質及びその使用 |
| WO2018170168A1 (en) | 2017-03-15 | 2018-09-20 | Cue Biopharma, Inc. | Methods for modulating an immune response |
| WO2018184964A1 (en) | 2017-04-03 | 2018-10-11 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Immunoconjugates of an anti-pd-1 antibody with a mutant il-2 or with il-15 |
| WO2018234862A1 (en) | 2017-06-19 | 2018-12-27 | Medicenna Therapeutics Inc. | Uses and methods for il-2 superagonists, agonists, and fusions thereof |
| WO2019032661A1 (en) | 2017-08-09 | 2019-02-14 | Orionis Biosciences Inc. | CD8 LIAISON AGENTS |
| WO2019104092A1 (en) | 2017-11-21 | 2019-05-31 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Partial agonists of interleukin-2 |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| US20220251202A1 (en) | 2022-08-11 |
| WO2020247843A8 (en) | 2021-04-22 |
| EP3980051A4 (en) | 2023-09-13 |
| CN114786708A (zh) | 2022-07-22 |
| WO2020247843A3 (en) | 2021-03-04 |
| EP3980051A2 (en) | 2022-04-13 |
| KR20220083660A (ko) | 2022-06-20 |
| JP2025060983A (ja) | 2025-04-10 |
| AU2020287373A1 (en) | 2022-01-06 |
| CA3142738A1 (en) | 2020-12-10 |
| JP2022535130A (ja) | 2022-08-04 |
| WO2020247843A2 (en) | 2020-12-10 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP7778571B2 (ja) | 免疫細胞機能をモジュレートするための変異体インターロイキン-2ポリペプチドと抗原結合分子の融合体 | |
| US12139525B2 (en) | Targeted heterodimeric Fc fusion proteins containing IL-15 IL-15alpha and antigen binding domains | |
| US20230055445A1 (en) | Pd-1 targeted il-15/il-15ralpha fc fusion proteins and uses in combination therapies thereof | |
| US11584794B2 (en) | Bispecific heterodimeric fusion proteins containing IL-15-IL-15Ralpha Fc-fusion proteins and immune checkpoint antibody fragments | |
| JP7148539B2 (ja) | 免疫抱合体 | |
| KR20230112632A (ko) | 면역 세포 기능을 조절하기 위한 cd8 항원 결합 분자와의 융합 | |
| WO2022125694A1 (en) | Fusions of interleukin polypeptides with bispecific antigen binding molecules for modulating immune cell function | |
| JP2023521238A (ja) | 免疫複合体 | |
| TW202237630A (zh) | 用於調節免疫細胞功能之突變介白素-10多肽與抗原結合分子之融合體 | |
| US20250339519A1 (en) | Combination of cytokine fusion proteins with cd8 antigen binding molecules | |
| JP2025532960A (ja) | 慢性ウイルス感染症を治療するためのcd8抗原結合分子との融合物 | |
| AU2020287373B2 (en) | Fusions of mutant interleukin-2 polypeptides with antigen binding molecules for modulating immune cell function | |
| CN116829577A (zh) | 用于调节免疫细胞功能的突变型白介素-10多肽与抗原结合分子的融合物 | |
| CN116997362A (zh) | 含调节免疫细胞功能的cd8抗原结合分子的融合物 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20230605 |
|
| A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20230605 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20240801 |
|
| A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20241031 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20250105 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20250501 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20250731 |
|
| TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
| A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20251027 |
|
| A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20251119 |
|
| R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 7778571 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |