JP7558391B2 - バフィーコート試料に使用するための膵臓癌診断用組成物 - Google Patents
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Description
本明細書で、“膵臓癌”は、膵臓にできる腫瘍を総称するものであって、漿液性嚢胞腫瘍、粘液性嚢胞腫瘍、膵管内乳頭粘液性腫瘍、固形乳頭状腫瘍、リンパ上皮性嚢腫、嚢腫性奇形腫などの嚢胞腫瘍のような陽性腫瘍、および膵管腺癌腫、腺房細胞癌腫、神経内分泌腫瘍などの悪性腫瘍などを例示することができる。本明細書で提供されるバイオマーカーによって診断可能な膵臓癌は前記膵臓癌から選択でき、例えば、悪性腫瘍から選択できるが、これに制限されるわけではない。
本明細書で、膵臓癌診断のためのバイオマーカーとして、インターロイキン28(Interleukin 28;IL-28)、インターロイキン29(Interleukin 29;IL-29)、またはこれらの組み合わせが提供される。本明細書に記載されたバイオマーカーは、蛋白質および/またはこれを暗号化する遺伝子を意味することができる。
本明細書で、バイオマーカーの検出は、試料でのバイオマーカーの存在有無および/またはバイオマーカーの水準(濃度)を測定するのを意味することができる。
本明細書で提供される膵臓癌診断用組成物は、前述のバイオマーカーの検出可能な製剤を含むものであってもよい。
本明細書で提供される膵臓癌診断用組成物および診断方法(または診断に情報を提供する方法)は、対象から分離された血液試料でインターロイキン28、インターロイキン29、およびこれらの暗号化遺伝子からなる群より選択された1種以上のバイオマーカーを検出する段階を含むことができる。
(a)対象から分離された血液試料でインターロイキン28、インターロイキン29、およびこれらの暗号化遺伝子からなる群より選択された1種以上のバイオマーカーを検出する段階、および
(b)前記血液試料内に前記バイオマーカーが存在するか、比較対象試料(正常試料)より高い水準で存在する場合、前記試料または前記試料が由来した対象を膵臓癌患者と診断(または確認または決定)する段階
を含むことができる。
(a)対象から分離された血液試料でインターロイキン28、インターロイキン29、およびこれらの暗号化遺伝子からなる群より選択された1種以上のバイオマーカーの水準を測定する段階、および
(b)(i)前記血液試料で測定されたバイオマーカー水準を比較対象試料内のバイオマーカーの水準と比較する段階、
(ii)試料で測定されたバイオマーカーの水準が比較対象試料より高い場合、前記試料または前記試料が由来した対象を膵臓癌患者と診断(または確認または決定)する段階、または
(iii)前記段階(i)および(ii)の全て
を含むことができる。任意に、前記方法は、前記段階(b)(段階(i)および/または(ii))以前に、比較対象試料内のバイオマーカーの水準を測定する段階を追加的に含むことができる。
(c)膵臓癌患者と診断された対象に膵臓癌治療を行う段階
を追加的に含むことができる。
本明細書で提供される膵臓癌診断用組成物、キット、および方法の適用可能な診断対象試料または血液試料は診断対象から得られた(または分離されたまたは由来した)液体生検(liquid biopsy)、例えば、血液、血清、血漿、および/またはこれらから分離された細胞を含むものであってもよく、一例で、前記試料は診断対象から分離されたバフィーコートを含むものであってもよい。
(1)温度:2~30℃、2~28℃、2~25℃、2~23℃、2~20℃、2~18℃、2~15℃、2~13℃、2~10℃、2~8℃、2~6℃、2~5℃、2~4℃、3~30℃、3~28℃、3~25℃、3~23℃、3~20℃、3~18℃、3~15℃、3~13℃、3~10℃、3~8℃、3~6℃、3~5℃、3~4℃、4~30℃、4~28℃、4~25℃、4~23℃、4~20℃、4~18℃、4~15℃、4~13℃、4~10℃、4~8℃、4~6℃、4~5℃、5~30℃、5~28℃、5~25℃、5~23℃、5~20℃、5~18℃、5~15℃、5~13℃、5~10℃、5~8℃、5~6℃、10~30℃、10~28℃、10~25℃、10~23℃、10~20℃、10~18℃、10~15℃、10~13℃、15~30℃、15~28℃、15~25℃、15~23℃、15~20℃、15~18℃、20~30℃、20~28℃、20~25℃、または20~23℃;
(2)速度:300g~2000g、300g~1800g、300g~1500g、300g~1300g、300g~1000g、500g~2000g、500g~1800g、500g~1500g、500g~1300g、500g~1000g、600g~1000g、700g~1000g、800g~1000g、500g~900g、600g~900g、700g~900g、800g~900g、500g~800g、600g~800g、または700g~800g;および
(3)時間:5~20分、7~20分、9~20分、5~15分、7~15分、9~15分、5~12分、7~12分、または9~12分間。
他の例で、候補化合物処理時の前記バイオマーカーの水準を測定して膵臓癌治療薬物の候補物質をスクリーニングする方法を提供する。
生物試料に候補化合物を接触させる段階;
前記生物試料でのインターロイキン28、インターロイキン29、およびこれらの暗号化遺伝子からなる群より選択された1種以上のバイオマーカーの水準を測定する段階;および
前記候補化合物を接触させた生物試料でのバイオマーカーの水準を候補物質を接触させない生物試料でのユビキチン分解酵素および/またはこれを暗号化する遺伝子の水準と比較する段階
を含むことができる。
本発明はまた、以下に関する。
[項目1]
インターロイキン28、インターロイキン29、およびこれらの暗号化遺伝子からなる群より選択された1種以上を検出可能な製剤を含み、
血液由来バフィーコート(buffy coat)に使用するためのものである、
膵臓癌診断用組成物。
[項目2]
前記バフィーコートは、血液の遠心分離時、上部の血漿層と下部の赤血球層の間に形成された全体白血球層であって、血液を次の条件(1)~(3)から選択された一つ以上の条件で遠心分離して上から順次に得られた血漿層(上)、バフィーコート層(中間)、および赤血球層(下)のうちの中間のバフィーコート層から得られるものである、項目1に記載の膵臓癌診断用組成物:
(1)温度:2~30℃;
(2)速度:300g~2000g;および
(3)時間:5~20分間。
[項目3]
前記バフィーコートは、血液を次の条件(1)~(3)から選択された一つ以上の条件で遠心分離して上から順次に得られた血漿層(上)、バフィーコート層(中間)、および赤血球層(下)のうちの中間のバフィーコート層から得られるものである、項目1に記載の膵臓癌診断用組成物:
(1)温度:4~25℃;
(2)速度:500g~1800g;および
(3)時間:7~20分間。
[項目4]
前記検出可能な製剤は、インターロイキン28、インターロイキン29、およびこれらの暗号化遺伝子からなる群より選択された1種以上と結合する小分子化合物、蛋白質、ペプチド、および核酸分子からなる群より選択された1種以上である、項目1~3のうちのいずれか一項に記載の膵臓癌診断用組成物。
[項目5]
項目1~3のうちのいずれか一項の膵臓癌診断用組成物を含む、膵臓癌診断用キット。
[項目6]
血液由来バフィーコート(buffy coat)に使用するためのものである、項目5に記載の膵臓癌診断用キット。
[項目7]
対象から分離された血液試料からインターロイキン28、インターロイキン29、およびこれらの暗号化遺伝子からなる群より選択された1種以上を検出する段階を含み、
前記血液試料は血液由来バフィーコート(buffy coat)である、
膵臓癌診断に情報を提供する方法。
[項目8]
前記検出する段階以後に、
前記血液試料内に前記バイオマーカーが存在するか、正常試料より高い水準で存在する場合、前記試料または前記試料が由来した対象を膵臓癌患者と確認する段階
を追加的に含む、項目7に記載の膵臓癌診断に情報を提供する方法。
[項目9]
前記バフィーコートは、血液の遠心分離時、上部の血漿層と下部の赤血球層の間に形成された全体白血球層であって、血液を次の条件(1)~(3)から選択された一つ以上の条件で遠心分離して上から順次に得られた血漿層(上)、バフィーコート層(中間)、および赤血球層(下)のうちの中間のバフィーコート層から得られるものである、項目7に記載の膵臓癌診断に情報を提供する方法:
(1)温度:2~30℃;
(2)速度:300g~2000g;および
(3)時間:5~20分間。
[項目10]
前記バフィーコートは、血液を次の条件(1)~(3)から選択された一つ以上の条件で遠心分離して上から順次に得られた血漿層(上)、バフィーコート層(中間)、および赤血球層(下)のうちの中間のバフィーコート層から得られるものである、項目7に記載の膵臓癌診断に情報を提供する方法:
(1)温度:4~25℃;
(2)速度:500g~1800g;および
(3)時間:7~20分間。
1.1.バフィーコート(buffy coat)試料の準備
膵臓癌で膵臓癌バイオマーカーの発現変化を確認するために、膵臓癌患者の血液由来バフィーコート(buffy coat)でIL-29、およびIL-28のmRNA発現を確認した。また、比較のために、膵臓癌を病まない一般人(以下、正常人と称する)血液由来のバフィーコートに対しても同一な試験を行った。
膵臓癌で膵臓癌バイオマーカーの発現変化を確認するために、膵臓癌患者の血液由来末梢血液単核球でIL-29、およびIL-28(IL-28A)のmRNA発現を確認した。また、比較のために、膵臓癌を病まない一般人(以下、正常人と称する)血液由来の末梢血液単核球に対しても同一な試験を行った。
前記実施例1で準備された試料での遺伝子発現はReal-time qPCRで測定し、前記Real-time qPCRはprobe-based multiplex PCRで行った。Multiplex PCRのために、マーカーであるIL-29(GenBank Accession No.NM_172140.2)、およびIL-28A(GenBank Accession No.NM_172138.2;以下、IL-28と称する)それぞれのプローブはFAM dyeで標識し、内部対照遺伝子(Reference gene)として使用するためのGAPDHはHEX dyeで標識した。プライマーとプローブは、IDT(Integrated DNA Technologies, Inc.)で購入して使用した。
同一人(膵臓癌患者(P.C);3人)から、実施例1.1を参照してバフィーコート試料を準備し、実施例1.2を参照してPBMC試料を準備した。前記準備されたバフィーコート試料とPBMC試料に対して、実施例2を参照してIL-29およびIL-28のmRNA発現水準(ΔCt)を測定した。
Claims (8)
- インターロイキン28、インターロイキン29、およびこれらをコードする遺伝子からなる群より選択された1種以上を検出可能な製剤を含み、
血液由来バフィーコート(buffy coat)に使用するためのものである、
膵臓癌診断用組成物であって、
前記製剤は、インターロイキン28もしくはインターロイキン29に結合することができる、抗体、その抗原結合断片、抗原結合断片を含む抗体類似体、もしくは受容体、またはインターロイキン28もしくはインターロイキン29をコードする遺伝子にハイブリダイズすることができる核酸分子であり、かつ
前記バフィーコートは、血液の遠心分離後に上部の血漿層と下部の赤血球層の間に形成される、単核球、顆粒球、およびリンパ球を含む全体白血球層であり、密度勾配媒体を使用しない血液の遠心分離で血漿層(上)、バフィーコート層(中間)、および赤血球層(下)を形成させることによって得られるものである、前記膵臓癌診断用組成物。 - 前記バフィーコートは、血液を次の条件(1)~(3)から選択された一つ以上の条件で遠心分離して血漿層(上)、バフィーコート層(中間)、および赤血球層(下)を形成させること、およびバフィーコート層(中間)を分離することによって得られるものである、請求項1に記載の膵臓癌診断用組成物:
(1)温度:2~30℃;
(2)速度:300g~2000g;および
(3)時間:5~20分間。 - 前記バフィーコートは、血液を次の条件(1)~(3)から選択された一つ以上の条件で遠心分離して血漿層(上)、バフィーコート層(中間)、および赤血球層(下)を形成させること、およびバフィーコート層(中間)を分離することによって得られるものである、請求項1に記載の膵臓癌診断用組成物:
(1)温度:4~25℃;
(2)速度:500g~1800g;および
(3)時間:7~20分間。 - 請求項1~3のうちのいずれか一項の膵臓癌診断用組成物を含み、血液由来バフィーコート(buffy coat)に使用するためのものである、膵臓癌診断用キットであって、
前記バフィーコートは、血液の遠心分離後に上部の血漿層と下部の赤血球層の間に形成される、単核球、顆粒球、およびリンパ球を含む全体白血球層であり、密度勾配媒体を使用しない血液の遠心分離で血漿層(上)、バフィーコート層(中間)、および赤血球層(下)を形成させることによって得られるものである、膵臓癌診断用キット。 - 前記バフィーコートは、血液を次の条件(1)~(3)から選択された一つ以上の条件で遠心分離して血漿層(上)、バフィーコート層(中間)、および赤血球層(下)を形成させること、およびバフィーコート層(中間)を分離することによって得られるものである、請求項4に記載の膵臓癌診断用キット:
(1)温度:2~30℃;
(2)速度:300g~2000g;および
(3)時間:5~20分間。 - インターロイキン28もしくはインターロイキン29に結合することができる、抗体、その抗原結合断片、抗原結合断片を含む抗体類似体、もしくは受容体、またはインターロイキン28もしくはインターロイキン29をコードする遺伝子にハイブリダイズすることができる核酸分子を用いて、対象から分離された血液試料からインターロイキン28、インターロイキン29、およびこれらをコードする遺伝子からなる群より選択された1種以上のバイオマーカーを検出する段階
を含み、
前記血液試料は血液由来バフィーコート(buffy coat)である、
膵臓癌診断のために情報を提供する方法であって、
前記バフィーコートは、血液の遠心分離後に上部の血漿層と下部の赤血球層の間に形成される、単核球、顆粒球、およびリンパ球を含む全体白血球層であり、密度勾配媒体を使用しない血液の遠心分離で血漿層(上)、バフィーコート層(中間)、および赤血球層(下)を形成させることによって得られるものであり、
前記血液試料内に前記バイオマーカーが存在するか、または正常試料より高い水準で存在する場合、前記対象が膵臓癌患者であるという情報が提供される、前記方法。 - 前記バフィーコートは、血液の遠心分離後に上部の血漿層と下部の赤血球層の間に形成された全体白血球層であって、血液を次の条件(1)~(3)から選択された一つ以上の条件で遠心分離して血漿層(上)、バフィーコート層(中間)、および赤血球層(下)を形成させること、およびバフィーコート層(中間)を分離することによって得られるものである、請求項6に記載の膵臓癌診断のために情報を提供する方法:
(1)温度:2~30℃;
(2)速度:300g~2000g;および
(3)時間:5~20分間。 - 前記バフィーコートは、血液を次の条件(1)~(3)から選択された一つ以上の条件で遠心分離して血漿層(上)、バフィーコート層(中間)、および赤血球層(下)を形成させること、およびバフィーコート層(中間)を分離することによって得られるものである、請求項6に記載の膵臓癌診断のために情報を提供する方法:
(1)温度:4~25℃;
(2)速度:500g~1800g;および
(3)時間:7~20分間。
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