JP7181091B2 - ポリペプチドの組み換え産生中にトリスルフィド結合を減少させる方法 - Google Patents
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Description
本出願は、2016年5月10日出願の米国仮出願第62/334,433号の優先権の利益を主張するものであり、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
ASCIIテキストファイルでの以下の提出物の内容の全体が、参照により本明細書に組み込まれる:コンピュータ可読形態(CRF)の配列表(ファイル名:146392036540SEQLIST.txt、記録日:2017年5月8日、サイズ:34.1KB)。
本明細書に記載または参照される技術及び手順は一般に、当業者によって十分に理解され、例えば、Sambrook et al.,Molecular Cloning:A Laboratory Manual 3d edition(2001)Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,N.Y.、Current Protocols in Molecular Biology(F.M.Ausubel,et al.eds.,(2003))、the series Methods in Enzymology(Academic Press,Inc.)、Antibodies,A Laboratory Manual,and Animal Cell Culture(R.I.Freshney,ed.(1987))、Methods in Molecular Biology,Humana Press、Cell Biology:Introduction to Cell and Tissue Culture(J.P.Mather and P.E.Roberts,1998)Plenum Press、Cell and Tissue Culture:Laboratory Procedures(A.Doyle,J.B.Griffiths,and D.G.Newell,eds.,1993-8)J.Wiley and Sons、Handbook of Experimental Immunology(D.M.Weir and C.C.Blackwell,eds.)、Current Protocols in Immunology(J.E.Coligan et al.,eds.,1991)、Short Protocols in Molecular Biology(Wiley and Sons,1999)、Immunobiology(C.A.Janeway and P.Travers,1997)、Antibodies(P.Finch,1997)、Antibodies:A Practical Approach(D.Catty.,ed.,IRL Press,1988-1989)、Monoclonal Antibodies:A Practical Approach(P.Shepherd and C.Dean,eds.,Oxford University Press,2000)、Using Antibodies:A Laboratory Manual(E.Harlow and D.Lane(Cold Spring Harbor Laboratory Press,1999)、及びThe Antibodies(M.Zanetti and J.D.Capra,eds.,Harwood Academic Publishers,1995)などに記載されている、広く利用される手法などの従来の手法を使用して一般的に用いられている。
本明細書及び添付の特許請求の範囲で使用される場合、単数形「1つの(a)」、「1つの(an)」、及び「その」は、別段内容が明確に指示しない限り、複数の参照対象を含む。したがって、例えば、「1つの分子」への言及は、2つ以上のそのような分子の組み合わせを任意で含むといった具合である。
ポリペプチド中のトリスルフィド結合のレベルを減少させる方法
トリスルフィド結合は、追加の硫黄原子のジスルフィド結合への挿入によって生成され、それにより3つの連続した硫黄原子の共有結合がもたらされる。トリスルフィド結合は、ポリペプチド中のシステイン残基間に形成され得、分子内(すなわち、同じポリペプチド中の2つのシステイン間)または分子間(すなわち、別個のポリペプチド中の2つのシステイン間)に形成され得る。細胞培養中にポリペプチド中のトリスルフィド結合のレベルを減少させるための方法が本明細書に提供される。細胞培養後のプロセシング中にポリペプチド中のトリスルフィド結合のレベルを減少させるための方法もまた本明細書に提供される。本明細書の方法は、ジスルフィド結合含有ポリペプチド(例えば、抗体)の大規模産生(製造規模など)で有利に使用され得る。
i)約2μM~約35μMの鉄、
ii)約0.11μM~約2μMのリボフラビン(ビタミンB2)、
iii)約4.5μM~約80μMのピリドキシンまたはピリドキサール(ビタミンB6)、
iv)約3.4μM~約23μMの葉酸塩/葉酸(ビタミンB9)、
v)約0.2μM~約2.5μMのシアノコバラミン(ビタミンB12)、
vi)約9mM~約10mMのヒポタウリン、及び
vii)約0~約1.58mMのメチオニンのうちの1つ以上を含む、接触させることと、
宿主細胞を培養して、ポリペプチドを産生することと、宿主細胞によって産生されるポリペプチドを収集することとを含み、それによりポリペプチド中のトリスルフィド結合のレベルを減少させる、方法が提供される。ある特定の実施形態において、収集されたポリペプチドは、1つ以上の構成成分の濃度が上に明記される濃度(複数可)と異なることを除いて同一の条件下で産生されるポリペプチドのトリスルフィド結合レベルよりも、少ないトリスルフィド結合レベルを有する。ある特定の実施形態において、収集されたポリペプチド中の平均トリスルフィド結合%は、約20%、19%、18%、17%、16%、15%、14%、13%、12%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%、0.5%、または0.1%(トリスルフィドのモル/ポリペプチドのモル)のいずれか1つ未満である。ある特定の実施形態において、収集されたポリペプチド中の平均トリスルフィドは、1つ以上の構成成分の濃度が上に明記される濃度(複数可)と異なることを除いて同一の条件下で産生されるポリペプチドのトリスルフィド結合レベルと比較して、約10%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または99%超のいずれか1つだけ低下する。
i)約2μM~約35μMの鉄、
ii)約0.11μM~約2μMのリボフラビン(ビタミンB2)、
iii)約4.5μM~約80μMのピリドキシンまたはピリドキサール(ビタミンB6)、
iv)約3.4μM~約23μMの葉酸塩/葉酸(ビタミンB9)、
v)約0.2μM~約2.5μMのシアノコバラミン(ビタミンB12)、
vi)約9mM~約10mMのヒポタウリン、及び
vii)約0~約1.58mMのメチオニンのうちの1つ以上を含む、接触させることと、
宿主細胞を培養して、ポリペプチドを産生することと、宿主細胞によって産生されるポリペプチドを収集することとを含み、それによりポリペプチド中のトリスルフィド結合のレベルを減少させる、方法が提供される。ある特定の実施形態において、収集されたポリペプチドは、1つ以上の構成成分の濃度が上に明記される濃度(複数可)と異なることを除いて同一の条件下で産生されるポリペプチドのトリスルフィド結合レベルよりも、少ないトリスルフィド結合レベルを有する。ある特定の実施形態において、収集されたポリペプチド中の平均トリスルフィド%は、約20%、19%、18%、17%、16%、15%、14%、13%、12%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%、0.5%、または0.1%(トリスルフィドのモル/ポリペプチドのモル)のいずれか1つ未満である。ある特定の実施形態において、収集されたポリペプチド中の平均トリスルフィドは、1つ以上の構成成分の濃度が上に明記される濃度(複数可)と異なることを除いて同一の条件下で産生されるポリペプチドのトリスルフィド結合レベルと比較して、約10%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または99%超のいずれか1つだけ低下する。
i)約2μM~約35μMの鉄、
ii)約0.11μM~約2μMのリボフラビン(ビタミンB2)、
iii)約4.5μM~約80μMのピリドキシンまたはピリドキサール(ビタミンB6)、
iv)約3.4μM~約23μMの葉酸塩/葉酸(ビタミンB9)、
v)約0.2μM~約2.5μMのシアノコバラミン(ビタミンB12)、
vi)約9mM~約10mMのヒポタウリン、及び
vii)約0~約4.5mMのメチオニンのうちの1つ以上を含む、培養することと、
ポリペプチドを産生することと、宿主細胞によって産生されるポリペプチドを収集することとを含む、方法が提供される。ある特定の実施形態において、細胞培養培地中の構成成分のうちの1つ以上の濃度は、植え付け後の1つ以上の添加の累積濃度である。
i)約2μM~約35μMの鉄、
ii)約0.11μM~約2μMのリボフラビン(ビタミンB2)、
iii)約4.5μM~約80μMのピリドキシンまたはピリドキサール(ビタミンB6)、
iv)約3.4μM~約23μMの葉酸塩/葉酸(ビタミンB9)、
v)約0.2μM~約2.5μMのシアノコバラミン(ビタミンB12)、
vi)約9mM~約10mMのヒポタウリン、及び
vii)約0~約4.5mMのメチオニンのうちの1つ以上を含む、培養することと、
ポリペプチドを産生することと、宿主細胞によって産生されるポリペプチドを収集することとを含み、それによりポリペプチド中のトリスルフィド結合のレベルを減少させる、方法が提供される。ある特定の実施形態において、CEA-IL2v免疫サイトカインは、RG7813である。ある特定の実施形態において、FAP-IL2v免疫サイトカインは、RG7461である。ある特定の実施形態において、抗CEA/抗CD3二重特異性抗体は、RG7802である。ある特定の実施形態において、抗VEGF/抗アンジオポエチン二重特異性抗体は、RG7716である。ある特定の実施形態において、抗Ang2/抗VEGF二重特異性抗体は、RG7221である。ある特定の実施形態において、抗Ang2/抗VEGF二重特異性抗体は、CAS番号1448221-05-3である。ある特定の実施形態において、抗CD40抗体は、RG7876である。ある特定の実施形態において、細胞培養培地は、初期細胞培養培地である。ある特定の実施形態において、収集されたポリペプチドは、1つ以上の構成成分の濃度が上に明記される濃度(複数可)と異なることを除いて同一の条件下で産生されるポリペプチドのトリスルフィド結合レベルよりも、少ないトリスルフィド結合レベルを有する。ある特定の実施形態において、収集されたポリペプチド中の平均トリスルフィド%は、約20%、19%、18%、17%、16%、15%、14%、13%、12%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%、0.5%、または0.1%(トリスルフィドのモル/ポリペプチドのモル)のいずれか1つ未満である。ある特定の実施形態において、収集されたポリペプチド中の平均トリスルフィドは、1つ以上の構成成分の濃度が上に明記される濃度(複数可)と異なることを除いて同一の条件下で産生されるポリペプチドのトリスルフィド結合レベルと比較して、約10%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または99%超のいずれか1つだけ低下する。
i)約2μM~約35μMの鉄、及び
ii)約0~約4.5mMのメチオニンのうちの1つ以上を含む、培養することと、
ポリペプチドを産生することと、宿主細胞によって産生されるポリペプチドを収集することとを含み、それによりポリペプチド中のトリスルフィド結合のレベルを減少させる、方法が提供される。ある特定の実施形態において、CEA-IL2v免疫サイトカインは、RG7813である。ある特定の実施形態において、FAP-IL2v免疫サイトカインは、RG7461である。ある特定の実施形態において、抗CEA/抗CD3二重特異性抗体は、RG7802である。ある特定の実施形態において、抗VEGF/抗アンジオポエチン二重特異性抗体は、RG7716である。ある特定の実施形態において、抗Ang2/抗VEGF二重特異性抗体は、RG7221である。ある特定の実施形態において、抗Ang2/抗VEGF二重特異性抗体は、CAS番号1448221-05-3である。ある特定の実施形態において、抗CD40抗体は、RG7876である。ある特定の実施形態において、細胞培養培地は、初期細胞培養培地である。ある特定の実施形態において、収集されたポリペプチドは、1つ以上の構成成分の濃度が上に明記される濃度(複数可)と異なることを除いて同一の条件下で産生されるポリペプチドのトリスルフィド結合レベルよりも、少ないトリスルフィド結合レベルを有する。ある特定の実施形態において、収集されたポリペプチド中の平均トリスルフィド%は、約20%、19%、18%、17%、16%、15%、14%、13%、12%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%、0.5%、または0.1%(トリスルフィドのモル/ポリペプチドのモル)のいずれか1つ未満である。ある特定の実施形態において、収集されたポリペプチド中の平均トリスルフィドは、1つ以上の構成成分の濃度が上に明記される濃度(複数可)と異なることを除いて同一の条件下で産生されるポリペプチドのトリスルフィド結合レベルと比較して、約10%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または99%超のいずれか1つだけ低下する。
本明細書に提供される方法は、任意の種類の動物細胞(組み換え動物細胞など)中で、ポリペプチド(例えば、抗体及び二重特異性抗体を含む)を産生するために使用され得る。「動物細胞」という用語は、無脊椎動物細胞、非哺乳類脊椎動物(例えば、鳥類、爬虫類、及び両生類)細胞、ならびに哺乳動物細胞を包含する。無脊椎動物細胞の例としては、以下、Spodoptera frugiperda(イモムシ)、Aedes aegypti(蚊)、Aedes albopictus(蚊)、Drosophila melanogaster(ショウジョウバエ)、及びBombyx mori(例えば、Luckow et al.,Bio/Technology,6:47-55(1988)、Miller et al.,in Genetic Engineering,Setlow,J.K.et al.,eds.,Vol.8(Plenum Publishing,1986),pp.277-279、及びMaeda et al.,Nature,315:592-594(1985)を参照されたい)の昆虫細胞が挙げられる。
本明細書に提供される方法に従って、様々なポリペプチドが産生され得る。例としては、例えば、成長ホルモン(ヒト成長ホルモン及びウシ成長ホルモンを含む)、成長ホルモン放出因子、副甲状腺ホルモン、甲状腺刺激ホルモン、リポタンパク質、アルファ-1-アンチトリプシン、インスリンA鎖、インスリンB鎖、プロインスリン、卵胞刺激ホルモン、カルシトニン、黄体形成ホルモン、グルカゴン、凝固因子(因子VIIIC、因子IX、組織因子、及びフォンウィルブランド因子など)、抗凝固因子(タンパク質Cなど)、心房性ナトリウム利尿因子、肺表面活性剤、プラスミノーゲン活性化因子(ウロキナーゼまたはヒト尿もしくは組織型プラスミノーゲン活性化因子(t-PA)など)、ボンベシン、トロンビン、造血成長因子、腫瘍壊死因子-アルファ及び-ベータ、エンケファリナーゼ、RANTES(活性化時に制御され、通常T細胞が発現及び分泌している)、ヒトマクロファージ炎症性タンパク質(MIP-1-アルファ)、血清アルブミン(ヒト血清アルブミンなど)、ミュラー管抑制因子、リラキシンA鎖、リラキシンB鎖、プロリラキシン、マウス性腺刺激ホルモン関連ペプチド、微生物タンパク質(ベータ-ラクタマーゼなど)、デオキシリボヌクレアーゼ、IgE、細胞傷害性Tリンパ球関連抗原(CTLA)(CTLA-4など)、インヒビン、アクチビン、血管内皮成長因子(VEGF)、ホルモンまたは成長因子の受容体、タンパク質AまたはD、リウマトイド因子、神経栄養因子(骨由来神経栄養因子(BDNF)、ニューロトロフィン-3、-4、-5、もしくは-6(NT-3、NT-4、NT-5、もしくはNT-6)、または神経成長因子(NGF-~など)など)、血小板由来成長因子(PDGF)、線維芽細胞成長因子(aFGF及びbFGFなど)、上皮成長因子(EGF)、形質転換成長因子(TGF)(TGF-ベータ1、TGF-ベータ2、TGF-ベータ3、TGF-ベータ4、またはTGF-ベータ5を含む、TGF-アルファ及びTGF-ベータなど)、インスリン様成長因子-I及び-II(IGF-I及びIGF-II)、des(l-3)-IGF-1(脳IGF-1)、インスリン様成長因子結合タンパク質、CDタンパク質(CD3、CD4、CD8、CD19、CD20、CD34、及びCD40など)、エリスロポエチン、骨誘導因子、免疫毒素、骨形成タンパク質(BMP)、インターフェロン(インターフェロン-アルファ、-ベータ、及び-ガンマなど)、コロニー刺激因子(CSF)(例えば、M-CSF、GM-CSF、及びG-CSF)、インターロイキン(IL)(例えば、IL-1~IL-17)、スーパーオキシドジスムターゼ、T細胞受容体、表面膜タンパク質、崩壊促進因子、ウイルス抗原(例えば、AIDS外被の一部分など)、輸送タンパク質、ホーミング受容体、アドレシン、制御タンパク質、インテグリン(CD11a、CD11b、CD11c、CD18、ICAM、VLA-4、及びVCAMなど)、腫瘍関連抗原(HER2、HER3、もしくはHERA受容体など)、ならびに上に列挙されるポリペプチドのいずれかの断片が挙げられるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態において、本明細書に提供される方法に従って産生されるポリペプチドは、抗体またはその断片である。いくつかの実施形態において、本明細書に記載されるによって産生される抗体は、ヒト化抗体、キメラ抗体、ヒト抗体、ライブラリ由来抗体、または多重特異性抗体(二重特異性抗体など)である。ある特定の実施形態において、本明細書に提供される方法によって産生される抗体断片は、Fab、Fab’、F(ab’)2、scFv、(scFv)2、dAb、相補性決定領域(CDR)断片、線状抗体、一本鎖抗体分子、ミニボディ、ダイアボディ、及び抗体断片から形成される多重特異性抗体である。
本明細書に提供される方法に従って産生される抗体(または二重特異性抗体などの多重特異性抗体)によって標的とされ得る分子の例としては、可溶性血清タンパク質及びそれらの受容体、ならびに他の膜結合タンパク質(例えば、アドヘシン)が挙げられるが、これらに限定されない。別の実施形態において、本明細書に提供される多重特異性抗原結合タンパク質は、8MPI、8MP2、8MP38(GDFIO)、8MP4、8MP6、8MP8、CSFI(M-CSF)、CSF2(GM-CSF)、CSF3(G-CSF)、EPO、FGF1(αFGF)、FGF2(βFGF)、FGF3(int-2)、FGF4(HST)、FGF5、FGF6(HST-2)、FGF7(KGF)、FGF9、FGF10、FGF11、FGF12、FGF12B、FGF14、FGF16、FGF17、FGF19、FGF20、FGF21、FGF23、IGF1、IGF2、IFNA1、IFNA2、IFNA4、IFNA5、IFNA6、IFNA7、IFN81、IFNG、IFNWI、FEL1、FEL1(EPSELON)、FEL1(ZETA)、IL1A、IL1B、IL2、IL3、IL4、IL5、IL6、IL7、IL8、IL9、IL10、IL11、IL12A、IL12B、IL13、IL14、IL15、IL16、IL17、IL17B、IL18、IL19、IL20、IL22、IL23、IL24、IL25、IL26、IL27、IL28A、IL28B、IL29、IL30、PDGFA、PDGFB、TGFA、TGFB1、TGFB2、TGFBb3、LTA(TNF-β)、LTB、TNF(TNF-α)、TNFSF4(OX40リガンド)、TNFSF5(CD40リガンド)、TNFSF6(FasL)、TNFSF7(CD27リガンド)、TNFSF8(CD30リガンド)、TNFSF9(4-1BBリガンド)、TNFSF10(TRAIL)、TNFSF11(TRANCE)、TNFSF12(APO3L)、TNFSF13(April)、TNFSF13B、TNFSF14(HVEM-L)、TNFSF15(VEGI)、TNFSF18、HGF(VEGFD)、VEGF、VEGFB、VEGFC、IL1R1、IL1R2、IL1RL1、IL1RL2、IL2RA、IL2RB、IL2RG、IL3RA、IL4R、IL5RA、IL6R、IL7R、IL8RA、IL8RB、IL9R、IL10RA、IL10RB、IL11RA、IL12RB1、IL12RB2、IL13RA1、IL13RA2、IL15RA、IL17R、IL18R1、IL20RA、IL21R、IL22R、IL1HY1、IL1RAP、IL1RAPL1、IL1RAPL2、IL1RN、IL6ST、IL18BP、IL18RAP、IL22RA2、AIF1、HGF、LEP(レプチン)、PTN、及びTHPOからなる群から選択される、1つ、2つ、またはそれ以上のサイトカイン、サイトカイン関連タンパク質、及びサイトカイン受容体に結合することができる。
FGF13;FGF14;FGF16;FGF17;FGF18;FGF19;FGF2(bFGF);FGF20;FGF21;FGF22;FGF23;FGF3(int-2);FGF4(HST);FGF5;FGF6(HST-2);FGF7(KGF);FGF8;FGF9;FGFR;FGFR3;FIGF(VEGFD);FELl(EPSILON);FILl(ZETA);FLJ12584;FLJ25530;FLRTI(フィブロネクチン);FLT1;FOS;FOSL1(FRA-1);FY(DARC);GABRP(GABAa);GAGEB1;GAGEC1;GALNAC4S-6ST;GATA3;GDF5;GDNF-Ra1(GDNFファミリー受容体アルファ1;GFRA1;GDNFR;GDNFRA;RETL1;TRNR1;RET1L;GDNFR-アルファ1;GFR-アルファ-1);GEDA;GFI1;GGT1;GM-CSF;GNASI;GNRHI;GPR2(CCR10);GPR19(Gタンパク質共役受容体19;mM.4787);GPR31;GPR44;GPR54(KISS1受容体;KISS1R;GPR54;HOT7T175;AXOR12);GPR81(FKSG80);GPR172A(Gタンパク質共役受容体172A;GPCR41;FLJ11856;D15Ertd747e);GRCCIO(C10);GRP;GSN(ゲルゾリン);GSTP1;HAVCR2;HDAC4;HDAC5;HDAC7A;HDAC9;HGF;HIF1A;HOP1;ヒスタミン及びヒスタミン受容体;HLA-A;HLA-DOB(MHCクラスII分子(Ia抗原)のベータサブユニット);HLA-DRA;HM74;HMOXI;HUMCYT2A;ICEBERG;ICOSL;1D2;IFN-a;IFNA1;IFNA2;IFNA4;IFNA5;IFNA6;IFNA7;IFNB1;IFNガンマ;DFNW1;IGBP1;IGF1;IGF1R;IGF2;IGFBP2;IGFBP3;IGFBP6;IL-l;IL10;IL10RA;IL10RB;IL11;IL11RA;IL-12;IL12A;IL12B;IL12RB1;IL12RB2;IL13;IL13RA1;IL13RA2;IL14;IL15;IL15RA;IL16;IL17;IL17B;IL17C;IL17R;IL18;IL18BP;IL18R1;IL18RAP;IL19;IL1A;IL1B;ILIF10;IL1F5;IL1F6;IL1F7;IL1F8;IL1F9;IL1HY1;IL1R1;IL1R2;IL1RAP;IL1RAPL1;IL1RAPL2;IL1RL1;IL1RL2、ILIRN;IL2;IL20;IL20Rα;IL21R;IL22;IL-22c;IL22R;IL22RA2;IL23;IL24;IL25;IL26;IL27;IL28A;IL28B;IL29;IL2RA;IL2RB;IL2RG;IL3;IL30;IL3RA;IL4;IL4R;IL5;IL5RA;IL6;IL6R;IL6ST(糖タンパク質130);インフルエンザA;インフルエンザB;EL7;EL7R;EL8;IL8RA;DL8RB;IL8RB;DL9;DL9R;DLK;INHA;INHBA;INSL3;INSL4;IRAK1;IRTA2(免疫グロブリンスーパーファミリー受容体転座関連2);ERAK2;ITGA1;ITGA2;ITGA3;ITGA6(a6インテグリン);ITGAV;ITGB3;ITGB4(b4インテグリン);α4β7及びαEβ7インテグリンヘテロ二量体;JAG1;JAK1;JAK3;JUN;K6HF;KAI1;KDR;KITLG;KLF5(GC Box BP);KLF6;KLKIO;KLK12;KLK13;KLK14;KLK15;KLK3;KLK4;KLK5;KLK6;KLK9;KRT1;KRT19(ケラチン19);KRT2A;KHTHB6(毛髪特異的H型ケラチン);LAMAS;LEP(レプチン);LGR5(ロイシンリッチリピート含有Gタンパク質共役受容体5;GPR49、GPR67);Lingo-p75;Lingo-Troy;LPS;LTA(TNF-b);LTB;LTB4R(GPR16);LTB4R2;LTBR;LY64(リンパ球抗原64(RP105)、ロイシンリッチリピート(LRR)ファミリーのI型膜タンパク質);Ly6E(リンパ球抗原6複合体、遺伝子座E;Ly67,RIG-E,SCA-2,TSA-1);Ly6G6D(リンパ球抗原6複合体、遺伝子座G6D;Ly6-D、MEGT1);LY6K(リンパ球抗原6複合体、遺伝子座K;LY6K;HSJ001348;FLJ35226);MACMARCKS;MAGまたはOMgp;MAP2K7(c-Jun);MDK;MDP;MIB1;ミッドカイン;MEF;MIP-2;MKI67;(Ki-67);mMP2;mMP9;MPF(MPF、MSLN、SMR、巨核球増強因子、メソテリン);MS4A1;MSG783(RNF124、仮定上のタンパク質FLJ20315);MSMB;MT3(メタロチオネクチン-111);MTSS1;MUC1(ムチン);MYC;MY088;Napi3b(NaPi2bとしても知られる)(NAPI-3B、NPTIIb、SLC34A2、溶質輸送体ファミリー34(リン酸ナトリウム)、メンバー2、II型ナトリウム依存性リン酸輸送体3b);NCA;NCK2;ニューロカン;NFKB1;NFKB2;NGFB(NGF);NGFR;NgR-Lingo;NgR-Nogo66(Nogo);NgR-p75;NgR-Troy;NME1(NM23A);NOX5;NPPB;NR0B1;NR0B2;NR1D1;NR1D2;NR1H2;NR1H3;NR1H4;NR112;NR113;NR2C1;NR2C2;NR2E1;NR2E3;NR2F1;NR2F2;NR2F6;NR3C1;NR3C2;NR4A1;NR4A2;NR4A3;NR5A1;NR5A2;NR6A1;NRP1;NRP2;NT5E;NTN4;ODZI;OPRD1;OX40;P2RX7;P2X5(プリン受容体P2Xリガンド開口型イオンチャネル5);PAP;PART1;PATE;PAWR;PCA3;PCNA;PD-L1;PD-L2;PD-1;POGFA;POGFB;PECAM1;PF4(CXCL4);PGF;PGR;ホスファカン;PIAS2;PIK3CG;PLAU(uPA);PLG;PLXDC1;PMEL17(シルバーホモログ;SILV;D12S53E;PMEL17;SI;SIL);PPBP(CXCL7);PPID;PRI;PRKCQ;PRKDI;PRL;PROC;PROK2;PSAP;PSCA hlg(2700050C12Rik、C530008O16Rik、RIKEN cDNA 2700050C12、RIKEN cDNA 2700050C12遺伝子);PTAFR;PTEN;PTGS2(COX-2);PTN;RAC2(p21 Rac2);RARB;RET(ret癌原遺伝子;MEN2A;HSCR1;MEN2B;MTC1;PTC;CDHF12;Hs.168114;RET51;RET-ELE1);RGSI;RGS13;RGS3;RNF110(ZNF144);ROBO2;S100A2;SCGB1D2(リポフィリンB);SCGB2A1(マンマグロビン2);SCGB2A2(マンマグロビン1);SCYEI(内皮単球活性化サイトカイン);SDF2;Sema 5b(FLJ10372、KIAA1445、Mm.42015、SEMA5B、SEMAG、Semaphorin 5b Hlog、semaドメイン7回トロンボスポンジン反復配列(1型及び1型様)、膜貫通ドメイン(TM)及び短い細胞質ドメイン、(セマフォリン)5B);SERPINA1;SERPINA3;SERP1NB5(マスピン);SERPINE1(PAI-1);SERPDMF1;SHBG;SLA2;SLC2A2;SLC33A1;SLC43A1;SLIT2;SPPI;SPRR1B(Sprl);ST6GAL1;STABI;STAT6;STEAP(6回膜貫通前立腺上皮抗原);STEAP2(HGNC_8639、IPCA-1、PCANAP1、STAMP1、STEAP2、STMP、前立腺癌関連遺伝子1、前立腺癌関連タンパク質1、6回膜貫通前立腺上皮抗原2、6回膜貫通前立腺タンパク質);TB4R2;TBX21;TCPIO;TOGFI;TEK;TENB2(推定膜貫通プロテオグリカン);TGFA;TGFBI;TGFB1II;TGFB2;TGFB3;TGFBI;TGFBRI;TGFBR2;TGFBR3;THIL;THBSI(トロンボスポンジン-1);THBS2;THBS4;THPO;TIE(Tie-1);TMP3;組織因子;TLR1;TLR2;TLR3;TLR4;TLR5;TLR6;TLR7;TLR8;TLR9;TLR10;TMEFF1(EGF様及び2つのフォリスタチン様ドメインを有する膜貫通タンパク質1;
トモレグリン-1);TMEM46(shisaホモログ2);TNF;TNF-a;TNFAEP2(B94);TNFAIP3;TNFRSFIIA;TNFRSF1A;TNFRSF1B;TNFRSF21;TNFRSF5;TNFRSF6(Fas);TNFRSF7;TNFRSF8;TNFRSF9;TNFSF10(TRAIL);TNFSF11(TRANCE);TNFSF12(AP03L);TNFSF13(April);TNFSF13B;TNFSF14(HVEM-L);TNFSF15(VEGI);TNFSF18;TNFSF4(OX40リガンド);TNFSF5(CD40リガンド);TNFSF6(FasL);TNFSF7(CD27リガンド);TNFSFS(CD30リガンド);TNFSF9(4-1BBリガンド);TOLLIP;Toll様受容体;TOP2A(トポイソメラーゼEa);TP53;TPM1;TPM2;TRADD;TMEM118(リングフィンガータンパク質、膜貫通2;RNFT2;FLJ14627);TRAF1;TRAF2;TRAF3;TRAF4;TRAF5;TRAF6;TREM1;TREM2;TrpM4(BR22450、FLJ20041、TRPM4、TRPM4B、一過性受容体電位カチオンチャネル、サブファミリーM、メンバー4);TRPC6;TSLP;TWEAK;チロシナーゼ(TYR;OCAIA;OCA1A;チロシナーゼ;SHEP3);VEGF;VEGFB;VEGFC;バーシカン;VHL C5;VLA-4;XCL1(リンホタクチン);XCL2(SCM-1b);XCRI(GPR5/CCXCRI);YY1;ならびにZFPM2から選択される、1つ以上の標的に結合することができる。
QVQLVESGGG LVQPGRSLRL SCAASGFTVH SSYYMAWVRQ APGKGLEWVG AIFTGSGAEY KAEWAKGRVT ISKDTSKNQV VLTMTNMDPV DTATYYCASD AGYDYPTHAM HYWGQGTLVT VSS(配列番号31)
及び
DIQMTQSPSS LSASVGDRVT ITCRASQGIS SSLAWYQQKP GKAPKLLIYG ASETESGVPS RFSGSGSGTD FTLTISSLQP EDFATYYCQN TKVGSSYGNT FGGGTKVEIK(配列番号32)におけるVH及びVL配列(それらの配列の翻訳後修飾を含む)を含む。上記のVH及びVL配列はそれぞれ、配列番号106及び配列番号111としてUS2016/0176954に開示されている。(US2016/0176954の表7及び8を参照されたい。)いくつかの実施形態において、抗C5抗体は、305L015である(US2016/0176954を参照されたい)。
EVQLVQSGAE VKKPGASVKV SCKASGYTFT DSYMSWVRQA PGQGLEWIGD MYPDNGDSSY NQKFRERVTI TRDTSTSTAY LELSSLRSED TAVYYCVLAP RWYFSVWGQG TLVTVSS(配列番号8)
及び
DIQMTQSPSS LSASVGDRVT ITCRASQDIS NYLNWYQQKP GKAPKLLIYY TSRLRSGVPS RFSGSGSGTD FTLTISSLQP EDFATYYCQQ GHTLPPTFGQ GTKVEIK(配列番号9)におけるVH及びVL配列(それらの配列の翻訳後修飾を含む)を含む。
EVQLVQSGAE VKKPGASVKV SCKASGYAFT NYLIEWVRQA PGQGLEWIGV INPGSGDTYY SEKFKGRVTI TRDTSTSTAY LELSSLRSED TAVYYCARDR LDYWGQGTLV TVSS(配列番号16)
及び
DIQMTQSPSS LSASVGDRVT ITCHASQDIS SYIVWYQQKP GKAPKLLIYH GTNLEDGVPS RFSGSGSGTD FTLTISSLQP EDFATYYCVH YAQFPYTFGQ GTKVEIK(配列番号17)
におけるVH及びVL配列(それらの配列の翻訳後修飾を含む)を含む。
DIQMTQSPSS LSASVGDRVT ITCKASAAVG TYVAWYQQKP GKAPKLLIYS ASYRKRGVPS
RFSGSGSGTD FTLTISSLQP EDFATYYCHQ YYTYPLFTFG QGTKLEIKRT VAAPSVFIFP
PSDEQLKSGT ASVVCLLNNF YPREAKVQWK VDNALQSGNS QESVTEQDSK DSTYSLSSTL
TLSKADYEKH KVYACEVTHQ GLSSPVTKSF NRGEC(配列番号18)
QAVVTQEPSL TVSPGGTVTL TCGSSTGAVT TSNYANWVQE KPGQAFRGLI GGTNKRAPGT
PARFSGSLLG GKAALTLSGA QPEDEAEYYC ALWYSNLWVF GGGTKLTVLS SASTKGPSVF
PLAPSSKSTS GGTAALGCLV KDYFPEPVTV SWNSGALTSG VHTFPAVLQS SGLYSLSSVV
TVPSSSLGTQ TYICNVNHKP SNTKVDKKVE PKSC(配列番号19)
QVQLVQSGAE VKKPGASVKV SCKASGYTFT EFGMNWVRQA PGQGLEWMGW INTKTGEATY
VEEFKGRVTF TTDTSTSTAY MELRSLRSDD TAVYYCARWD FAYYVEAMDY WGQGTTVTVS
SASTKGPSVF PLAPSSKSTS GGTAALGCLV KDYFPEPVTV SWNSGALTSG VHTFPAVLQS
SGLYSLSSVV TVPSSSLGTQ TYICNVNHKP SNTKVDKKVE PKSCDGGGGS GGGGSEVQLL
ESGGGLVQPG GSLRLSCAAS GFTFSTYAMN WVRQAPGKGL EWVSRIRSKY NNYATYYADS
VKGRFTISRD DSKNTLYLQM NSLRAEDTAV YYCVRHGNFG NSYVSWFAYW GQGTLVTVSS
ASVAAPSVFI FPPSDEQLKS GTASVVCLLN NFYPREAKVQ WKVDNALQSG NSQESVTEQD
SKDSTYSLSS TLTLSKADYE KHKVYACEVT HQGLSSPVTK SFNRGECDKT HTCPPCPAPE
AAGGPSVFLF PPKPKDTLMI SRTPEVTCVV VDVSHEDPEV KFNWYVDGVE VHNAKTKPRE
EQYNSTYRVV SVLTVLHQDW LNGKEYKCKV SNKALGAPIE KTISKAKGQP REPQVYTLPP
CRDELTKNQV SLWCLVKGFY PSDIAVEWES NGQPENNYKT TPPVLDSDGS FFLYSKLTVD
KSRWQQGNVF SCSVMHEALH NHYTQKSLSL SPGK(配列番号20)
QVQLVQSGAE VKKPGASVKV SCKASGYTFT EFGMNWVRQA PGQGLEWMG WINTKTGEATY
VEEFKGRVTF TTDTSTSTAY MELRSLRSDD TAVYYCARWD FAYYVEAMD YWGQGTTVTVS
SASTKGPSVF PLAPSSKSTS GGTAALGCLV KDYFPEPVTV SWNSGALTS GVHTFPAVLQS
SGLYSLSSVV TVPSSSLGTQ TYICNVNHKP SNTKVDKKVE PKSCDKTHT CPPCPAPEAAG
GPSVFLFPPK PKDTLMISRT PEVTCVVVDV SHEDPEVKFN WYVDGVEVH NAKTKPREEQY
NSTYRVVSVL TVLHQDWLNG KEYKCKVSNK ALGAPIEKTI SKAKGQPRE PQVCTLPPSRD
ELTKNQVSLS CAVKGFYPSD IAVEWESNGQ PENNYKTTPP VLDSDGSFF LVSKLTVDKSR
WQQGNVFSCS VMHEALHNHY TQKSLSLSPG K(配列番号21)
EVQLVESGGG LVQPGGSLRL SCAASGYDFT HYGMNWVRQA PGKGLEWVGW INTYTGEPTY
AADFKRRFTF SLDTSKSTAY LQMNSLRAED TAVYYCAKYP YYYGTSHWYF DVWGQGTLVT
VSSASTKGPS VFPLAPSSKS TSGGTAALGC LVKDYFPEPV TVSWNSGALT SGVHTFPAVL
QSSGLYSLSS VVTVPSSSLG TQTYICNVNH KPSNTKVDKK VEPKSCDKTH TCPPCPAPEA
AGGPSVFLFP PKPKDTLMAS RTPEVTCVVV DVSHEDPEVK FNWYVDGVEV HNAKTKPREE
QYNSTYRVVS VLTVLAQDWL NGKEYKCKVS NKALGAPIEK TISKAKGQPR EPQVYTLPPC
RDELTKNQVS LWCLVKGFYP SDIAVEWESN GQPENNYKTT PPVLDSDGSF FLYSKLTVDK
SRWQQGNVFS CSVMHEALHN AYTQKSLSLS PGK(配列番号22)
QVQLVQSGAE VKKPGASVKV SCKASGYTFT GYYMHWVRQA PGQGLEWMGW INPNSGGTNY
AQKFQGRVTM TRDTSISTAY MELSRLRSDD TAVYYCARSP NPYYYDSSGY YYPGAFDIWG
QGTMVTVSSA SVAAPSVFIF PPSDEQLKSG TASVVCLLNN FYPREAKVQW KVDNALQSGN
SQESVTEQDS KDSTYSLSST LTLSKADYEK HKVYACEVTH QGLSSPVTKS FNRGECDKTH
TCPPCPAPEA AGGPSVFLFP PKPKDTLMAS RTPEVTCVVV DVSHEDPEVK FNWYVDGVEV
HNAKTKPREE QYNSTYRVVS VLTVLAQDWL NGKEYKCKVS NKALGAPIEK TISKAKGQPR
EPQVCTLPPS RDELTKNQVS LSCAVKGFYP SDIAVEWESN GQPENNYKTT PPVLDSDGSF
FLVSKLTVDK SRWQQGNVFS CSVMHEALHN AYTQKSLSLS PGK(配列番号23)
DIQLTQSPSS LSASVGDRVT ITCSASQDIS NYLNWYQQKP GKAPKVLIYF TSSLHSGVPS
RFSGSGSGTD FTLTISSLQP EDFATYYCQQ YSTVPWTFGQ GTKVEIKRTV AAPSVFIFPP
SDEQLKSGTA SVVCLLNNFY PREAKVQWKV DNALQSGNSQ ESVTEQDSKD STYSLSSTLT
LSKADYEKHK VYACEVTHQG LSSPVTKSFN RGEC(配列番号24)
SYVLTQPPSV SVAPGQTARI TCGGNNIGSK SVHWYQQKPG QAPVLVVYDD SDRPSGIPER
FSGSNSGNTA TLTISRVEAG DEADYYCQVW DSSSDHWVFG GGTKLTVLSS ASTKGPSVFP
LAPSSKSTSG GTAALGCLVK DYFPEPVTVS WNSGALTSGV HTFPAVLQSS GLYSLSSVVT
VPSSSLGTQT YICNVNHKPS NTKVDKKVEP KSC(配列番号25)
本明細書に提供される方法に従って産生されるポリペプチド(例えば、抗体または二重特異性抗体)は、それらの投与が好適となるように、好適な担体または賦形剤とともに製剤化され得る。本明細書に提供される方法に従って産生されるポリペプチド(例えば、抗体または二重特異性抗体)の好適な製剤は、所望される程度の純度を有するポリペプチド(例えば、抗体または二重特異性抗体)を、凍結乾燥製剤または水溶液の形態で、1つ以上の薬学的に許容される担体、賦形剤、または安定剤(Remington’s Pharmaceutical Sciences 16th edition,Osol,A.Ed.(1980))と混合することによって得られる。許容される担体、賦形剤、または安定剤は、レシピエントに対し、用いられる投薬量及び濃度で無毒であり、緩衝剤(リン酸、クエン酸、及び他の有機酸など)、アスコルビン酸及びメチオニンを含む酸化防止剤、保存剤(オクタデシルジメチルベンジル塩化アンモニウム、塩化ヘキサメトニウム、塩化ベンザルコニウム、塩化ベンゼトニウム、フェノール、ブチル、もしくはベンジルアルコール、アルキルパラベン(メチルもしくはプロピルパラベンなど)、カテコール、レゾルシノール、シクロヘキサノール、3-ペンタノール、及びm-クレゾールなど)、低分子量(約10残基未満)ポリペプチド、タンパク質(血清アルブミン、ゼラチン、もしくは免疫グロブリンなど)、親水性ポリマー(ポリビニルピロリドンなど)、アミノ酸(グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン、もしくはリジンなど)、単糖類、二糖類、及び他の炭水化物(グルコース、マンノース、もしくはデキストリンを含む)、キレート剤(EDTAなど)、糖類(スクロース、マンニトール、トレハロース、もしくはソルビトールなど)、塩形成対イオン(ナトリウムなど)、金属錯体(例えば、Zn-タンパク質錯体)、ならびに/または非イオン性界面活性剤(TWEEN(商標)、PLURONICS(商標)、もしくはポリエチレングリコール(PEG)など)を含む。例示的な抗体製剤は、参照により本明細書に明示的に組み込まれる、W098/56418に記載されている。皮下投与に適合した凍結乾燥製剤は、W097/04801に記載されている。そのような凍結乾燥製剤は、好適な希釈剤により高タンパク質濃度に再構成され得、この再構成された製剤は、本明細書において治療される哺乳動物に皮下投与され得る。
本明細書に提供される方法に従って産生される1つ以上のポリペプチド(例えば、抗体または二重特異性抗体)と、障害(例えば、自己免疫疾患またはがん)の治療または診断に有用な物質とを含有する製造品もまた提供される。ある特定の実施形態において、製造品は、容器と、容器上のもしくは容器に付随するラベルまたは添付文書とを含む。好適な容器には、例えば、ボトル、バイアル、シリンジなどが含まれる。容器は、ガラスまたはプラスチックなどの多様な材料から形成され得る。容器は、病態の治療に有効である組成物を保持し、滅菌アクセスポートを有し得る(例えば、容器は、皮下注射針によって穿刺可能な栓を有する静注溶液バッグまたはバイアルであり得る)。組成物中の少なくとも1つの活性薬剤は、本明細書に提供される方法に従って産生されるポリペプチド(例えば、抗体または二重特異性抗体)である。ラベルまたは添付文書は、組成物が特定の病態の治療に使用されることを示す。ラベルまたは添付文書は、本明細書に提供される方法に従って産生されるポリペプチド(例えば、抗体または二重特異性抗体)を含む組成物を対象に投与するための説明書を更に含むだろう。本明細書に記載される併用治療薬を含む製造品及びキットもまた企図される。
一連の第1の実験を無細胞系で実行して、細胞外に分泌される組み換えポリペプチド中のトリスルフィド形成に寄与する細胞培養培地中の構成成分を特定した。特に、実験は、そのようなポリペプチド中のトリスルフィド結合レベルに対するシステイン、シスチン、微量元素(鉄など)、及びBビタミンの効果を調査した。
簡潔には、11%のトリスルフィドを含有する例示的なポリペプチドである抗FluBを、(a)6mMのL-システイン(Cys)、(b)3mMのシスチン(Cys-Cys)、(c)6mMのL-システイン(Cys)及び35μMのFe(鉄)、または(d)3mMのシスチン(Cys-Cys)及び35μMのFe(鉄)を補充した培地1中でインキュベートした。上述のように補充したインキュベーションを培地2(すなわち、培地1とは異なる組成物を有する培地)中で反復した。抗FluBに関する更なる詳細は、WO2015/148806に記載されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
更なる一連の実験において、以下、(a)3mMのシスチン(Cys-Cys)、(b)35μMのFe、及び(c)Bビタミン(1.84μMのリボフラビン(ビタミンB2)、24.9μMのピリドキシン(ビタミンB6)、22.5μMの葉酸(ビタミンB9)、及び2.25μMのシアノコバラミン(ビタミンB12))の構成成分のうちの1つ以上を補充した培地1中で抗FluBを72時間インキュベートした。図2Aに示されるように、Cys-CysまたはCys-Cys+Bビタミンを補充した培地1中で抗FluBをインキュベートしたとき、トリスルフィド結合レベルは、著しい影響はなかった。Fe+Cys-CysまたはFe+Cys-Cys+Bビタミンを補充した培地1中で抗FluBをインキュベートしたとき、トリスルフィド結合レベルは著しく(すなわち、11%から約40%へと)増加したものの、トリスルフィド結合レベルは、無細胞系におけるB-ビタミンの存在下または不在下でおよそ同じであった。
配列番号8:
EVQLVQSGAE VKKPGASVKV SCKASGYTFT DSYMSWVRQA PGQGLEWIGD MYPDNGDSSY NQKFRERVTI TRDTSTSTAY LELSSLRSED TAVYYCVLAP RWYFSVWGQG TLVTVSS
配列番号9:
DIQMTQSPSS LSASVGDRVT ITCRASQDIS NYLNWYQQKP GKAPKLLIYY TSRLRSGVPS RFSGSGSGTD FTLTISSLQP EDFATYYCQQ GHTLPPTFGQ GTKVEIK
別の一連の実験を実行して、トリスルフィド結合レベルに対するシステイン(Cys)、シスチン(Cys-Cys)、鉄、及びBビタミンの効果を評価したが、今回は、これらの化合物が細胞培養環境においてどのような効果を有するかについて対処するするために、無細胞プロセスにおいてではなく、細胞培養プロセスにおいて実行した。
一組の細胞培養実験を実行して、培養中のトリスルフィド形成に対する、添加システイン(Cys)または添加シスチン(Cys-Cys)の効果を評価した。簡潔には、抗OX40 Abを産生するCHO細胞を、以下の表1に示される4つのプロトコルうちの1つに従って、2リットルの生物反応器内で14日間の実行にわたって培養した。
*細胞消費及び生成は計算には考慮しない。
追加の実験を実行して、産生細胞培養実行の基本培地中にのみ供給したときの、トリスルフィド形成に対するシステイン濃度の影響を評価した。抗OX40 Abを産生するCHO細胞を、14日間の産生細胞培養実行にわたって、2リットルの生物反応器内で培養した。基本培地に、(a)6mMのシステイン、(b)4.5mMのシステイン、または(c)3mMのシステインを補充した。これらの実験において、細胞培養物には、システインを欠くバッチ供給物培地を供給した。7、10、12、及び14日目に各培養物から試料を取得し、上述のHILIC-CADを介して各時点での抗OX40 Ab中のトリスルフィド%を決定した。図4Aは、抗OX40 Ab中のトリスルフィド結合レベルが、産生培養の開始時のシステインの初期濃度に相関したことを実証する。3mMのシステインを含有する基本培地中で培養した細胞によって産生される抗OX40 Ab中のトリスルフィド%は、7日目~14日目まで着実に減少し、14日目には0%のトリスルフィドが収集された。図4Aを参照されたい。各培養物からの抗OX40 Ab収率は、同等であった。図4Bを参照されたい。まとめると、図4A及び4Bの結果は、基本培地中のシステイン濃度を最適化して、収集時点で、ポリペプチド収率に影響を与えずに、ポリペプチド中のトリスルフィド%が著しく低下する(または排除すらされる)条件を達成することができることを示す。1つの特定の理論によって拘束されることを意図するものではないが、そのような結果は、より低い濃度で細胞培養実行の初期に提供されると、システインは細胞によって消費され、故に分泌ポリペプチド中でのトリスルフィド結合形成をもたらす細胞外シスチンの形成を防止することを示唆する。
更なる実験を実行して、培養中のポリペプチド中のトリスルフィド形成に対する、Fe濃度及び/またはBビタミン(例えば、リボフラビン、ピリドキシン、葉酸、及びシアノコバラミン)濃度の効果を評価した。抗OX40 Abを産生するCHO細胞を、以下の表2に示される4つのプロトコルうちの1つに従って、2リットルの生物反応器内で14日間の産生細胞培養実行にわたって培養した。
*基本培地中のBビタミン=1.84μMのビタミンB2、24.9μMのビタミンB6、22.5μMのビタミンB9、及び2.25μMのビタミンB12
**バッチ供給物培地中のBビタミン=12.5μMのビタミンB2、250μMのビタミンB6、150μMのビタミンB9、及び10μMのビタミンB12
トリスルフィド形成に対するBビタミン及びFeの相対的寄与を決定するために、抗OX40 Abを産生するCHO細胞を、上述の条件下、1リットルの基本培地を含有する2リットルの生物反応器内で14日間の産生細胞培養にわたって培養し、以下の表3に示される4つのプロトコルのうちの1つに従って実行した。
*基本培地中のBビタミン=1.84μMのビタミンB2、24.9μMのビタミンB6、22.5μMのビタミンB9、及び2.25μMのビタミンB12
**バッチ供給物培地中のBビタミン=12.5μMのビタミンB2、250μMのビタミンB6、150μMのビタミンB9、及び10μMのビタミンB12
***基本培地中またはバッチ供給物中にはシスチン(Cys-Cys)は提供されなかった
更なる実験を実行して、収集されたポリペプチド中のトリスルフィド結合形成を緩和する戦略を特定した。抗OX40 Abの収集された細胞培養流体(HCCF)を、以下の表4に概説される条件のうちの1つの下でインキュベートした。各条件を、温度、pH、及び溶解酸素(DO)について制御した。条件2及び3下では、システイン(すなわち、例示的な還元剤)を添加する30分前に、HCCFをEDTA(すなわち、例示的な金属キレート剤)とともにインキュベートした。混合物を各々4.5時間保持して、典型的な細胞培養物収集の期間をシミュレーションした。試料を15℃の水浴に移動させ、最大4日間(96時間)保持して、下流精製前の冷却保持時間をシミュレーションした。
産生中の組み換えポリペプチド中でのトリスルフィド形成に対するヒポタウリンの効果を試験するために、抗体産物を産生するCHO細胞培養物を、高いトリスルフィド結合レベル(すなわち、25%~45%のトリスルフィド)を有するポリペプチドを生成することが知られるプロセスで実行した。細胞は、単一の接種材料系列から供給され、4つの同型産生培養物を植え付けるのに使用した。3つの培養を、ヒポタウリンを有さない対照条件下で実行した。残りの培養物は、基本培地中に1g/Lのヒポタウリンを含んだ。全ての他の培地/溶液添加及びプロセスパラメータは、4つ全ての培養物について同じであった。細胞成長は、著しく影響されないようであったが、生存率は、ヒポタウリンを含む条件について、培養の終了時により良好に維持された(データ示さず)。最終収集された産物中のトリスルフィド結合レベルは、対照条件の39.9±2.7%に対して、ヒポタウリンを含む培養物(2.2%)について著しくより低かった。図9を参照されたい。
産生中の組み換えポリペプチド中のトリスルフィド形成に対するメチオニン及びシステインの効果を評価するために、以下の表6に示されるプロトコルのうちの1つに従う14日間の産生細胞培養実行にわたって、37℃及び7%のCO2の振盪24ウェルの深プレート中、自動化ロボット細胞培養システムによって、BsAb1を産生するCHO細胞を培養した(接種材料=6×106個の生細胞/ml)(RTE=微量元素溶液、Cys量は1つ目が培地であり、2つ目が供給物である)。3、6、及び9日目、10%の培養体積で培養物に10mMのメチオニンを供給した。合計36の条件を試験した。
●「-1」として与えられるSerの濃度=1:7.64mMであり、「1」として与えられるSerの濃度=4.5mMである。
●「-1」として与えられるMetの濃度=1.58mMであり、「1」として与えられるMetの濃度=2.25mMである。
●Cys濃度は(培地、供給物)として与えられ、培地濃度は3mMまたは7.5mMであり、供給物濃度は15mMまたは0mMである。
●RTE=微量元素溶液である。
*プロトコルJ及びKにおいて細胞を成長させた培地は、プロトコルH及びIにおいて使用した培地とは異なった。
第2の哺乳動物細胞株によって産生されるポリペプチドへのトリスルフィド形成に対するBビタミンの相対的寄与を評価するために、以下の表9に示される2つのプロトコルのうちの1つに従って、抗体を産生するCHO細胞を、1.2リットルの基本培地を含有する2リットルの生物反応器内で14日間の産生細胞培養実行にわたって培養した。
Claims (47)
- ポリペプチド中のトリスルフィド結合レベルを減少させるための方法であって、
(a)前記ポリペプチドをコードする核酸を含むチャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞を基本培地と接触させることであって、
前記基本培地が、
i)2μM~35μMの鉄、
ii)0.11μM~2μMのリボフラビン(ビタミンB2)、
iii)4.5μM~80μMのピリドキシンまたはピリドキサール(ビタミンB6)、
iv)3.4μM~23μMの葉酸(ビタミンB9)、及び
v)0.2μM~2.5μMのシアノコバラミン(ビタミンB12)を含む、または
前記基本培地が、
A)9mM~10mMのヒポタウリンを含む、または
前記基本培地が、
1)0~1.58mMのメチオニンを含む、前記接触させることと、
(b)前記CHO細胞を培養して、前記ポリペプチドを産生することと、
(c)前記CHO細胞によって産生される前記ポリペプチドを収集することと、を含む、前記方法。 - ポリペプチドを産生するための方法であって、
(a)前記ポリペプチドをコードする核酸を含むチャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞を基本培地と接触させることであって、
前記基本培地が、
i)2μM~35μMの鉄、
ii)0.11μM~2μMのリボフラビン(ビタミンB2)、
iii)4.5μM~80μMのピリドキシンまたはピリドキサール(ビタミンB6)、
iv)3.4μM~23μMの葉酸(ビタミンB9)、及び
v)0.2μM~2.5μMのシアノコバラミン(ビタミンB12)を含む、または
前記基本培地が、
A)9mM~10mMのヒポタウリンを含む、または
前記基本培地が、
1)0~1.58mMのメチオニンを含む、前記接触させることと、
(b)前記CHO細胞を培養して、前記ポリペプチドを産生することと、
(c)前記CHO細胞によって産生される前記ポリペプチドを収集することと、を含む、前記方法。 - 前記収集されたポリペプチドが、i)~v)の濃度、A)の濃度、または1)の濃度が(a)に明記されるi)~v)の濃度、A)の濃度、または1)の濃度と異なることを除いて同一の条件下で産生されるポリペプチドよりも、少ないトリスルフィド結合レベルを有する、請求項1または請求項2に記載の方法。
- 前記基本培地が、シスチンを欠く、請求項1~3のいずれか1項に記載の方法。
- 前記基本培地が、1.4mM~3mMのシステインまたはシスチンを含む、請求項1~3のいずれか1項に記載の方法。
- 前記基本培地が、0mM~1.58mMのメチオニン及び0mM~3mMのシステインを含む、請求項1~4のいずれか1項に記載の方法。
- 前記基本培地が、6mMのシステインを含む、請求項1~3のいずれか1項に記載の方法。
- ポリペプチド中のトリスルフィド結合レベルを減少させるための方法であって、
(a)細胞培養培地中で、前記ポリペプチドをコードする核酸を含むチャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞を培養することであって、
前記細胞培養培地が、
i)2μM~35μMの鉄、
ii)0.11μM~2μMのリボフラビン(ビタミンB2)、
iii)4.5μM~80μMのピリドキシンまたはピリドキサール(ビタミンB6)、
iv)3.4μM~23μMの葉酸塩/葉酸(ビタミンB9)、及び
v)0.2μM~2.5μMのシアノコバラミン(ビタミンB12)を含む、または
前記細胞培養培地が、
A)9mM~10mMのヒポタウリンを含む、または
前記細胞培養培地が、
1)0~2.25mMのメチオニンを含む、培養することと、
(b)前記ポリペプチドを産生することと、
(c)前記CHO細胞によって産生される前記ポリペプチドを収集することと、を含む、前記方法。 - 前記細胞培養培地中のi)~v)の濃度、A)の濃度、または1)の濃度が、植え付け後の1つ以上の添加の累積濃度である、請求項8に記載の方法。
- CEA-IL2v免疫サイトカイン、FAP-IL2v免疫サイトカイン、抗CEA/抗CD3二重特異性抗体、抗VEGF/抗アンジオポエチン二重特異性抗体、抗Ang2/抗VEGF二重特異性抗体、抗C5抗体、及び抗CD40抗体からなる群から選択されるポリペプチド中のトリスルフィド結合レベルを減少させるための方法であって、
(a)細胞培養培地中で、前記ポリペプチドをコードする核酸を含むチャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞を培養することであって、
前記細胞培養培地が、
i)2μM~35μMの鉄、
ii)0.11μM~2μMのリボフラビン(ビタミンB2)、
iii)4.5μM~80μMのピリドキシンまたはピリドキサール(ビタミンB6)、
iv)3.4μM~23μMの葉酸塩/葉酸(ビタミンB9)、及び
v)0.2μM~2.5μMのシアノコバラミン(ビタミンB12)を含む、または
前記細胞培養培地が、
A)9mM~10mMのヒポタウリンを含む、または
前記細胞培養培地が、
(1)0~2.25mMのメチオニンを含む、前記培養することと、
(b)前記ポリペプチドを産生することと、
(c)前記CHO細胞によって産生される前記ポリペプチドを収集することと、を含む、前記方法。 - CEA-IL2v免疫サイトカイン、FAP-IL2v免疫サイトカイン、抗CEA/抗CD3二重特異性抗体、抗VEGF/抗アンジオポエチン二重特異性抗体、抗Ang2/抗VEGF二重特異性抗体、抗C5抗体、及び抗CD40抗体からなる群から選択されるポリペプチド中のトリスルフィド結合レベルを減少させるための方法であって、
(a)細胞培養培地中で、前記ポリペプチドをコードする核酸を含むチャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞を培養することであって、前記細胞培養培地が、以下の構成成分、
i)2μM~35μMの鉄、及び
ii)0~2.25mMのメチオニンのうちの1つ以上を含む、前記培養することと、
(b)前記ポリペプチドを産生することと、
(c)前記CHO細胞によって産生される前記ポリペプチドを収集することと、を含む、前記方法。 - 前記方法が、少なくとも1つの供給物を更に含み、供給物培地が、以下、鉄、リボフラビン、ピリドキシン、ピリドキサール、葉酸、及びシアノコバラミンのうちの1つ以上を欠く、請求項1~11のいずれか1項に記載の方法。
- 前記供給物が、バッチ供給物である、請求項12に記載の方法。
- 前記バッチ供給物培地が、シスチンを欠く、請求項13に記載の方法。
- 前記バッチ供給物培地が、システインを欠く、請求項13または14に記載の方法。
- 前記バッチ供給物培地が、メチオニンを欠く、請求項13~15のいずれか1項に記載の方法。
- 前記鉄が、三価鉄(Fe3+)または二価鉄(Fe2+)である、請求項1~16のいずれか1項に記載の方法。
- (I)収集前に、前記CHO細胞の前記培養物にキレート剤及び還元剤を補充すること、
(II)前記CHO細胞の収集前細胞培養流体(PHCCF)にキレート剤及び還元剤を補充すること、または
(III)収集後に、前記CHO細胞の収集された細胞培養流体(HCCF)にキレート剤及び還元剤を補充することを更に含む、請求項1~17のいずれか1項に記載の方法。 - 前記還元剤が補充される前に、前記CHO細胞の前記培養物、前記PHCCF、または前記HCCFに前記キレート剤が補充される、請求項18に記載の方法。
- 前記還元剤が補充される60分~30分前に、前記CHO細胞の前記培養物、前記PHCCF、または前記HCCFに前記キレート剤が補充される、請求項19に記載の方法。
- 前記キレート剤及び前記還元剤が、前記CHO細胞の前記培養物、前記PHCCF、または前記HCCF中で30分間~4日間維持される、請求項18~20のいずれか1項に記載の方法。
- 前記CHO細胞の前記培養物、前記PHCCF、または前記HCCFが、15℃~37℃の温度で維持される、請求項18~21のいずれか1項に記載の方法。
- 前記CHO細胞の前記培養物、前記PHCCF、または前記HCCFが、6.5~7.5のpHで維持される、請求項18~22のいずれか1項に記載の方法。
- 前記CHO細胞の前記培養物、前記PHCCF、または前記HCCF中の溶解酸素(DO)の量が、少なくとも15%である、請求項18~23のいずれか1項に記載の方法。
- 前記CHO細胞の前記培養物、前記PHCCF、または前記HCCFが、15℃~37℃の温度及び6.5~7.5のpHで維持され、前記CHO細胞の前記培養物またはHCCF中の溶解酸素(DO)の量が、少なくとも15%である、請求項18~21のいずれか1項に記載の方法。
- 前記還元剤が、グルタチオン(GSH)、L-グルタチオン(L-GSH)、システイン、L-システイン、トリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩(TCEP)、2,3-tert-ブチル-4-ヒドロキシアニソール、2,6-ジ-tert-ブチル-4-メチルフェノール、3-アミノプロパン-1-スルホン酸、アデノシルホモシステイン、アンセリン、B-アラニン、B-カロチン、ブチル化ヒドロキシアニソール、ブチル化ヒドロキシトルエン、カルノシン、カルベジロール、クルクミン、システアミン、システアミン塩酸塩、デキサメタゾン、ジアリルジスルフィド、DL-ランチオニン、DL-チオルファン、エトキシキン、没食子酸、ゲンチジン酸ナトリウム塩水和物、グルタチオンジスルフィド、グルタチオン還元エチルエステル、グリシン、ヒドロコルチゾン、ヒポタウリン、イセチオン酸アンモニウム塩、L-システイン-グルタチオンジスルフィド、L-システインスルフィン酸一水和物、リポ酸、還元リポ酸、メルカプトプロピオニルグリシン、メチオニン、メチレンビス(3-チオプロピオン酸)、シュウ酸、クエルシトリン水和物、レスベラトロール、レチノイン酸、S-カルボキシメチル-L-システイン、セレン、セレノメチオニン、ジエチルジチオカルバミン酸銀、タウリン、チオ乳酸、トリシン、ビタミンC、ビタミンE、ビタミンB1、ビタミンB2、ビタミンB3、ビタミンB4、ビタミンB5、ビタミンB6、及びビタミンB11からなる群から選択される、請求項18~25のいずれか1項に記載の方法。
- 前記還元剤が、システイン及びL-システインからなる群から選択される、請求項26に記載の方法。
- 前記還元剤が、L-システインであり、前記L-システインが、前記CHO細胞の前記培養物またはHCCFに添加されて、3mM~6mMの最終濃度が達成される、請求項27に記載の方法。
- 前記キレート剤が、エチレンジアミン四酢酸(EDTA)、ニトリロ三酢酸(NTA)、エチレンジアミン-N,N’-ジコハク酸(EDDS)、クエン酸塩、シュウ酸塩、酒石酸塩、エチレン-ビス(オキシエチレンニトリロ)四酢酸(EGTA)、ジエチレントリアミン五酢酸(DTPA)、5-スルホサリチル酸、N,N-ジメチルドデシルアミンN-オキシド、ジチオオキサミド、エチレンジアミン、サリチルアルドキシム、N-(2’-ヒドロキシエチル)イミノ二酢酸(HIMDA)、オキシンキノリノール、及びスルホキシンからなる群から選択される、請求項18~28のいずれか1項に記載の方法。
- 前記キレート剤が、エチレンジアミン四酢酸(EDTA)、ニトリロ三酢酸(NTA)、エチレンジアミン-N,N’-ジコハク酸(EDDS)、及びクエン酸塩からなる群から選択される、請求項29に記載の方法。
- 前記キレート剤が、前記CHO細胞の前記培養物または前記HCCFに添加されて、20mMの最終濃度が達成される、請求項30に記載の方法。
- 前記ポリペプチドが、前記細胞培養培地へと分泌される、請求項1~31のいずれか1項に記載の方法。
- 前記収集されたポリペプチドを精製するステップを更に含む、請求項1~32のいずれか1項に記載の方法。
- 前記CHO細胞が、組み換えCHO細胞である、請求項1~33のいずれか1項に記載の方法。
- 前記方法が、ポリペプチド中のトリスルフィド結合のレベルを測定することを更に含む、請求項1~34のいずれか1項に記載の方法。
- 前記ポリペプチド中の平均トリスルフィド結合%が、20%未満、10%未満、5%未満、1%未満、0.5%未満、または0.1%未満である、請求項1~35のいずれか1項に記載の方法。
- 前記ポリペプチドが、抗体またはその断片である、請求項1~9及び12~36のいずれか1項に記載の方法。
- 前記ポリペプチドが、抗体断片であり、前記抗体断片が、Fab、Fab’、F(ab’)2、scFv、(scFv)2、dAb、相補性決定領域(CDR)断片、線状抗体、一本鎖抗体分子、ミニボディ、ダイアボディ、及び抗体断片から形成される多重特異性抗体からなる群から選択される、請求項37に記載の方法。
- 前記抗体またはその断片が、BMPR1B、E16、STEAP1、0772P、MPF、Napi3b、Sema 5b、PSCA hlg、ETBR、MSG783、STEAP2、TrpM4、CRIPTO、CD21、CD79b、FcRH2、HER2、NCA、MDP、IL20Rα、ブレビカン、EphB2R、ASLG659、PSCA、GEDA、BAFF-R、CD22、CD79a、CXCR5、HLA-DOB、P2X5、CD72、LY64、FcRH1、IRTA2、TENB2、PMEL17、TMEFF1、GDNF-Ra1、Ly6E、TMEM46、Ly6G6D、LGR5、RET、LY6K、GPR19、GPR54、ASPHD1、チロシナーゼ、TMEM118、GPR172A、CD33、CLL-1、C5、OX40、α4β7及びαEβ7インテグリンヘテロ二量体、IL-13、CD-20、FGFR、インフルエンザA、インフルエンザB、アミロイドベータ、HER3、補体因子D、IL-22c、PD-L1、PD-L2、PD-1、VEGF、アンジオポエチン2、CD3、FAP、CEA、ならびにIL-6からなる群から選択される抗原に結合する、請求項37に記載の方法。
- 前記ポリペプチドが、抗体であり、前記抗体が、二重特異性抗体である、請求項37に記載の方法。
- 前記二重特異性抗体が、抗VEGF/抗アンジオポエチン二重特異性抗体、抗CEA/抗CD3二重特異性抗体、または抗Ang2/抗VEGF二重特異性抗体である、請求項40に記載の方法。
- 前記ポリペプチドが、免疫サイトカインである、請求項1~9及び12~36のいずれか1項に記載の方法。
- 前記免疫サイトカインが、CEA-IL2vまたはFAP-IL2vである、請求項42に記載の方法。
- 細胞培養培地中で培養されたCHO細胞によって産生されるポリペプチド中のトリスルフィド結合レベルを減少させるための、細胞培養培地中の0~2.25mMのメチオニンの使用であって、ポリペプチドが、CEA-IL2v免疫サイトカイン、FAP-IL2v免疫サイトカイン、抗CEA/抗CD3二重特異性抗体、抗VEGF/抗アンジオポエチン二重特異性抗体、抗Ang2/抗VEGF二重特異性抗体、抗C5抗体、及び抗CD40抗体からなる群から選択される、使用。
- ポリペプチドを産生するために使用される、請求項1~44のいずれか1項に記載の方法又は使用。
- 前記ポリペプチド中の平均トリスルフィド%が、20%未満、10%未満、5%未満、1%未満、0.5%未満、または0.1%未満である、請求項45に記載の方法。
- 請求項45または46に記載の方法を含む、医薬の製造方法。
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