JP7046401B1 - 敏感肌の遺伝的素因の判定方法 - Google Patents
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Abstract
Description
[1] 被験者から採取したDNA含有試料について、以下の(a1)又は(a2)の1種又は2種以上の一塩基多型(SNP)のアレルを検出する工程と、検出されるアレルの塩基の少なくとも一つがリスクアレルである場合に、該被験者が化粧品に対する敏感肌になり易いと判定する工程を含む、化粧品に対する敏感肌の遺伝的素因を判定する方法。
(a1) 配列番号1に示される塩基配列の101番目の塩基におけるSNP(SNP:ID rs77016918で特定されるSNP)
(a2) 配列番号1に示される塩基配列の101番目の塩基におけるSNP(SNP:ID rs77016918で特定されるSNP)と連鎖不平衡係数r2≧0.8の関係にあるSNP
[2] 前記(a2)の配列番号1に示される塩基配列の101番目の塩基におけるSNP(SNP:ID rs77016918で特定されるSNP)と連鎖不平衡係数r2≧0.8の関係にあるSNPが、配列番号2に示される塩基配列の101番目の塩基におけるSNP(SNP:ID rs60969883で特定されるSNP)、又は配列番号3に示される塩基配列の101番目の塩基におけるSNP(SNP:ID rs9799057で特定されるSNP)である、[1]に記載の方法。
[3] [1]又は[2]に記載の方法により判定された結果に基づいて、被験者の化粧品に対する敏感肌の遺伝的素因の程度に応じた化粧品に対する敏感肌の予防及び/又は改善作用を有する化粧料及び/又は飲食品を該被験者に提供する、化粧料及び/又は飲食品の提供方法。
[4] 配列番号1に示される塩基配列の101番目の塩基におけるSNP(SNP:ID rs77016918で特定されるSNP)、若しくは該SNPと連鎖不平衡係数r2≧0.8の関係にあるSNPを含む10塩基以上の配列、又はその相補配列を有するプローブ、及び/又は、配列番号1に示される塩基配列の101番目の塩基におけるSNP(SNP:ID rs77016918で特定されるSNP)、若しくは該SNPと連鎖不平衡係数r2≧0.8の関係にあるSNPを含む領域を増幅することのできるプライマーを含む、化粧品に対する敏感肌の遺伝的素因を判定するためのキット。
本発明の化粧品に対する敏感肌の遺伝的素因の判定方法は、個人の化粧品に対する敏感肌の遺伝的素因と関連する特定の一塩基多型(SNP)又は当該SNPと連鎖不平衡にあるSNPを用いて、化粧品に対する敏感肌になり易いかを予測するものである。本発明において、「化粧品に対する敏感肌」とは、慢性的又は一時的に、外用剤の特定成分(例えば、界面活性剤、防腐剤、香料等)に対して過敏に反応し、容易に肌トラブルが起こる肌をいう。肌トラブルには、限定はされないが、チクチクする、ヒリヒリする、つっぱる、かゆくなる、かぶれる、カサカサする等の症状をいう。
(a1) 配列番号1に示される塩基配列の101番目の塩基におけるSNP(SNP:ID rs77016918で特定されるSNP)
(a2) 配列番号1に示される塩基配列の101番目の塩基におけるSNP(SNP:ID rs77016918で特定されるSNP)と連鎖不平衡係数r2≧0.8の関係にあるSNP
上記のSNPの検出及びタイピング方法では、各方法に応じたプローブやプライマーが使用される。このようなプローブやプライマーもまた本発明の範囲に包含され、キットとして提供できる。
本試験を実施するにあたり、同意書、遺伝型判定等について、自社における倫理審査委員会によって承認を受けた。同意書のサインにて同意を受けたサンプル提供者よりサンプル採取を行い、遺伝型判定及び関連解析を行った。
日本人女性被験者1108人(平均年齢49.1歳)から唾液を採取し、Maxwell RSC Stabilized Saliva DNA Kit(プロメガ社製)を使用してゲノムDNAを抽出し、DNAサンプルを得た。
SNPデータベース(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/)に登録されたSNPの内、rs77016918を解析の対象とした。さらに、Ensembl Genome Browser(https://asia.ensembl.org/index.html)を参考に、日本人における、rs77016918と連鎖不平衡の関係にあるSNP(連鎖不平衡係数r2≧0.8)であるrs60969883、rs9799057についても解析の対象とした(下記表3)。また、比較例として、乾燥による敏感肌を評価できることが報告されているSPINK5に関連するSNPであるrs2303067についても解析を行った。
(1)で得られたDNAサンプルについて、TaqMan SNP Genotyping Assays(Applied Biosystems社製)及びSsoAdvanced Universal Probes Supermix(Bio Rad社製)を用い、CFX384 Touch Real-Time PCR Detection System(Bio Rad社製)にて遺伝型の決定を行った。
化粧品に対する敏感肌に関するアンケート項目は、「敏感肌だと思いますか?」という質問に対して「1.思わない」、「2.やや思う」、「3.思う」の中から1つ、「1年間で化粧品が合わないと感じたことがありますか?」という質問に対して、「1.ない」、「2.時々ある」、「3.よくある」の中から1つ回答するものとした。
表現型データに基づいて、「敏感肌だと思いますか?」の回答が「1.思わない」であり、かつ「1年間で化粧品が合わないと感じたことがありますか?」の回答が「1.ない」であった被験者609人をコントロール群(正常肌群)、「敏感肌だと思いますか?」の回答が「2.やや思う」又は「3.思う」であり、かつ「1年間で化粧品が合わないと感じたことがありますか?」の回答が「2.時々ある」又は「3.よくある」であった被験者102人をケース群(敏感肌群)とした。遺伝型データと敏感肌との関連性について、正常肌群若しくは敏感肌群のいずれであるかを目的変数、遺伝型データのマイナーアレルの本数を説明変数としたロジスティック回帰分析を行い、各SNPに対するp値を評価した。4種類のSNPを解析したため、第一種の過誤の増大を回避するためにボンフェローニ法により有意水準を補正し(0.05/4)、p値が0.0125(1.25E-02)未満の場合に有意な関連性があるものと判断した。
解析を行った各SNPが存在する染色体番号、物理位置、アレル、マイナーアレル及びリスクアレルの塩基、オッズ比、p値を表4に示す。p値の欄において、それぞれのp値は10を底とする指数形式で表示され、符号Eの前後に記載された数値はそれぞれp値を指数形式で表示した際の仮数部と指数部を示す。
Claims (4)
- 被験者から採取したDNA含有試料について、以下の(a1)又は(a2)の1種又は2種以上の一塩基多型(SNP)のアレルを検出する工程と、検出されるアレルの塩基の少なくとも一つがリスクアレルである場合に、該被験者が化粧品に対する敏感肌になり易いと判定する工程を含む、化粧品に対する敏感肌の遺伝的素因を判定する方法。
(a1) 配列番号1に示される塩基配列の101番目の塩基におけるSNP(SNP:ID rs77016918で特定されるSNP、リスクアレルはC)
(a2) 配列番号1に示される塩基配列の101番目の塩基におけるSNP(SNP:ID rs77016918で特定されるSNP、リスクアレルはC)と連鎖不平衡係数r2≧0.8の関係にあるSNP - 前記(a2)の配列番号1に示される塩基配列の101番目の塩基におけるSNP(SNP:ID rs77016918で特定されるSNP、リスクアレルはC)と連鎖不平衡係数r2≧0.8の関係にあるSNPが、配列番号2に示される塩基配列の101番目の塩基におけるSNP(SNP:ID rs60969883で特定されるSNP、リスクアレルはT)、又は配列番号3に示される塩基配列の101番目の塩基におけるSNP(SNP:ID rs9799057で特定されるSNP、リスクアレルはC)である、請求項1に記載の方法。
- 請求項1又は2に記載の方法により判定された結果に基づいて、被験者の化粧品に対する敏感肌の遺伝的素因の程度に応じた化粧品に対する敏感肌の予防及び/又は改善作用を有する化粧料及び/又は飲食品を該被験者に提供する、化粧料及び/又は飲食品の提供方法。
- 配列番号1に示される塩基配列の101番目の塩基におけるSNP(SNP:ID rs77016918で特定されるSNP)、若しくは該SNPと連鎖不平衡係数r2≧0.8の関係にあるSNPを含む10塩基以上の配列、又はその相補配列を有するプローブ、及び/又は、配列番号1に示される塩基配列の101番目の塩基におけるSNP(SNP:ID rs77016918で特定されるSNP)、若しくは該SNPと連鎖不平衡係数r2≧0.8の関係にあるSNPを含む領域を増幅することのできるプライマーを含む、化粧品に対する敏感肌の遺伝的素因を判定するためのキット。
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