JP6169101B2 - 炎症性疾患の予防及び/又は治療において有用な化合物を同定するスクリーニング法 - Google Patents
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Description
本発明は、GPR84アゴニストが好中球走化性を誘導し、かつGPR84アンタゴニストがGPR84アゴニスト刺激性走化性を遮断することができる証拠を提供する。これらの結果は、GPR84が好中球動員プロセスにおける必須プレーヤーであることを示す。したがって、本発明は、炎症性疾患に関与するプロセスであるGPR84アゴニスト刺激性走化性を阻害する化合物の同定のための新規のアッセイに関する。特に、炎症性疾患は、炎症性腸疾患(IBD)、関節リウマチ、慢性閉塞性肺疾患(COPD)、及び特発性肺線維症(IPF)から選択される。
GPR84は、発現配列タグデータマイニング戦略の結果として、及びさらに、好中球で発現される新規ケモカイン受容体を同定することを目的とした縮重プライマー逆転写酵素-ポリメラーゼ連鎖反応(RT-PCR)法を用いて(Yousefiの文献、2001)、ヒトB細胞から最近単離され、特徴付けられた(Wittenbergerらの文献、2001, J Mol Biol, 307, 799-813)。
本発明は、GPR84の活性を阻害する化合物が、免疫細胞、例えば、好中球、マクロファージ、及び樹状細胞、特に、好中球の走化性を阻害することができるという発見に基づいている。該化合物は、種々のさらなる細胞及びインビボモデルにおける該化合物の活性によって示され得るように、炎症性疾患、神経炎症性疾患、感染性疾患、自己免疫疾患、及び/又は免疫細胞機能の障害が関与する疾患の治療において有用である。特定の実施態様において、炎症性疾患は、炎症性腸疾患(IBD)、関節リウマチ、慢性閉塞性肺疾患(COPD)、及び特発性肺線維症(IPF)から選択される。
以下の用語は、それとともに以下に提示された意味を有することが意図され、本発明の説明及び意図される範囲を理解する際に有用である。
本発明は、GPR84アゴニスト(例えば、中鎖脂肪酸)が好中球走化性を誘導すること、及びGPR84アンタゴニストがこの走化性を特異的に遮断することができることを示し、Gタンパク質共役受容体84(GPR84)が好中球動員プロセスにおける必須プレーヤーであることを示している。好中球の遊走は、通常、いくつかの一般的な走化性物質、例えば、細菌産物ホルミル-Met-Leu-Phe(fMLP)、並びにインターロイキン8(IL-8)及びロイコトリエンB4(LTB4)のような宿主由来産物によって導かれる(Foxmanの文献、1997; Foxmannの文献、1999; Baggioliniの文献、1998)。好中球は、様々なGタンパク質共役受容体の使用を通して走化性物質の存在を感知する。主要なクラスの走化性受容体は、ホルミルペプチド-ホルミルペプチド受容体(FPR)、ケモカイン-ケモカイン受容体(CCR又はCXCR)、及びロイコトリエン-ロイコトリエン受容体(BLT)によって誘発される。IL8、好中球活性化因子-78、ホルミル-Met-Leu-Phe(fMLP)のような典型的な走化性物質を用いた実験により、これらがGPR84のリガンドではないことが明らかにされた(Yosefiの文献、2001)。GPR84は、他のクラスのアゴニストによって活性化され、例示的なGPR84アゴニストとしては、ナトリウムデカノエート、3,3'ジインドリルメタン、及び2,5-ジヒドロキシ-3-ウンデシル-2,5-シクロヘキサジエン-1,4-ジオン(エンベリン)が挙げられる。特に、本発明は、GPR84アンタゴニストが、IL8によって刺激される走化性を含む、古典的走化性物質によって刺激される走化性を遮断しないことを示している。これは、GPR84が、別々のかつ異なる走化性経路を介して作用するということ、及びGPR84のアゴニストが、好中球動員において果たす個々の役割を有するということを示している。
a.細胞集団を、試験化合物に、GPR84アゴニストの存在下、走化性を測定するのに好適な系で暴露すること;及び
b.該系における該細胞の走化性の阻害に関連する特性を測定すること
を含む、方法を提供する。
a.試験化合物を、配列番号1のアミノ酸配列並びに/又は配列番号2、6、10、12、及び14からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むその断片を含むGPR84ポリペプチドと接触させる工程;並びに
b.GPR84ポリペプチドの活性及び/又は発現に関連する特性を測定する工程
を含む。
a.該化合物を、配列番号1のアミノ酸配列を含むGPR84ポリペプチド並びに配列番号2、6、10、12、及び14からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むその断片と接触させる工程;
b.該化合物の該GPR84ポリペプチド又はその断片に対する結合親和性を測定する工程;並びに
c.該ポリペプチドに対する所望のレベルの結合親和性を有する化合物を選択する工程
を含む。
(ヒト単球由来マクロファージ及び樹状細胞におけるGPR84発現)
PBMC画分を、密度勾配技術により、バフィーコートから単離した。単球を、MACS技術による陽性選択(CD14+細胞選択)を用いて、PBMC画分から単離した。
ヘパリン添加チューブに新たに回収した血液を等容量の氷冷DPBSで希釈する。20mLの希釈した血液を4mLのACDバッファー(140mMクエン酸、200mMクエン酸ナトリウム、及び220mMデキストロース)と穏やかに混合する。その後、12mLのデキストラン/NaCl(6%デキストラン/0.9%NaCl)溶液を混合物に添加し、試料を最大20回穏やかに反転させる。全容量を新しい受容器(recipient)に移し、二相の完全な分離が生じるように、室温で1時間インキュベートする。その後、黄色がかった上清を、清潔な遠心分離チューブに移し、1300rpm及び4℃で12分間遠心分離する。遠心分離後、上清を廃棄し、赤血球溶解が生じるように、残存する細胞ペレットを12mLの氷冷H2Oに速やかに再懸濁させる。20秒後、4mLの氷冷した0.6M KClを添加する。試料を慎重に混合し、1300rpm、4℃で6分間遠心分離する。上清を廃棄し、赤血球溶解手順をもう1回繰り返す。その後、細胞ペレットを4mLのDPBSに再懸濁させ、15mL遠心分離チューブ中の5mLのLymphoprep(商標)上に重層する。1500rpm、4℃で30分間遠心分離した後、上清を除去し、好中球を含む細胞ペレットを細胞培養培地(RPMI+1%Glutamax+10mM Hepes+10%HI FBS)に再懸濁させる。5,000,000/mLの200μLの細胞を、100ng/mL LPSを含むウェル(96ウェルプレート)に播種する。37℃、5%CO2、98%湿度で4又は24時間インキュベートした後、試料をマイクロチューブに移し、遠心分離する。ペレットをRLTバッファー(Qiagen)に再懸濁させ、解析するまで-80℃で保存する。
脾臓を雌マウスBALB/cJから回収し、ピストンを用いて脾臓を破砕することにより、脾細胞の細胞懸濁液を単離する。遠心分離(300×g、10分間)後、CD4+CD62L+ T細胞を、供給元のプロトコル(Miltenyi Biotec)に従って、MACS技術で単離する。
20mLのグリコーゲン(0.1%、w/v)を腹腔内注射してから24時間後、好中球を25mLのPBSバッファーによる腹腔洗浄により回収する。滲出液を、1150rpmで10分間、4℃で遠心分離する(低速ブレーキ)。上清を除去し、細胞を、50mL Falconチューブ中の12mLの氷冷した蒸留水に懸濁させる。10〜20秒後、4mLの0.6M KClを添加し、数回混合する。Falconチューブを50mLまでPBSで満たす。チューブを、1300rpmで6分間、4℃で遠心分離する(高速ブレーキ)。上清を除去し、ペレットを、Falconチューブ当たり4mLのPBSに再懸濁させる。4mLの細胞懸濁液を、15mL Falconチューブ中の5mLのLymphoprep(商標)上に重層し、低速ブレーキを用いて、1500rpmで30分間、4℃で遠心分離する。回転させた後、上清を、滅菌先端による穏やかな吸引を用いて取り除き、細胞を細胞培養培地(RPMI+1%Glutamax+10mM Hepes+10%HI FBSに再懸濁させる。5,000,000/mLの200μLの細胞をウェルに播種し、5μLのRPMI又は100ng/mL LPSを添加する。37℃、5%CO2、98%湿度で4又は24時間インキュベートした後、試料をマイクロチューブに移し、遠心分離する。ペレットをRLTバッファーに再懸濁させ、解析するまで-80℃で保存した。
RNeasy Miniキット(Qiagen)を製造業者の指示に従って用いて、全RNAを抽出する。cDNAを、cDNA逆転写キット(Applied Biosystems)を用いて調製し、Q-PCRを、GPR84、及びハウスキーピング遺伝子としてのGAPDH用のSYBRGreenプライマーを用いて実施する。データ解析のために、GPR84対ハウスキーピング遺伝子GAPDHのΔCt値を計算する(ΔCt=Ct GPR84−Ct GAPDH)。
本発明者らは、GPR84アゴニスト(MCFA、例えば、ナトリウムデカノエート、3,3'ジインドリルメタン、及びエンベリン)が好中球走化性を誘導すること、並びにGPR84アンタゴニストが、GPR84アゴニスト刺激性走化性を遮断することができるが、IL8刺激性走化性を遮断することがないことを示し、これにより、Gタンパク質共役受容体84(GPR84)が好中球動員プロセスにおける必須プレーヤーであることが示された。したがって、GPR84のアゴニスト又はアンタゴニストの作用は、好中球遊走試験でアッセイすることができる。好中球遊走アッセイでは、ヒト志願者由来のバフィーコートから新たに単離された好中球を化合物で30分間処理する。その後、好中球を、Corning HTSトランスウェル96透過性サポートシステムの上のウェルに移す。該サポートシステムの下のウェルには、エンベリン溶液が満たされている。1時間インキュベートした後、下の区画中のエンベリンへと向かう好中球の遊走を、ATPliteルミネセンスATP検出アッセイシステム(Perkin Elmer, カタログ番号:436110)を用いて、下のウェルのATP含量を測定することにより定量することができる。
ヒトのバフィーコートを等容量の氷冷DPBSで希釈する。20mLの希釈したバフィーコートを、4mLのACDバッファー(140mMクエン酸、200mMクエン酸ナトリウム、及び220mMデキストロース)と穏やかに混合した。その後、12mLの6%デキストラン/0.9%NaCl溶液(250mL H2Oに溶解させた15gデキストランT2000及び2.25g NaCl)をこの混合物に添加し、試料を最大20回穏やかに反転させる。全容量を新しい受容器(recipient)に移し、二相の完全な分離が生じるように、室温で1時間インキュベートする。その後、黄色がかった上清を、清潔な遠心分離チューブに移し、1300rpm及び4℃で12分間遠心分離する。遠心分離後、上清を廃棄し、赤血球溶解が生じるように、残存する細胞ペレットを12mLの氷冷H2Oに速やかに再懸濁させる。20秒後、4mLの氷冷した0.6M KClを添加する。試料を慎重に混合し、1300rpm、4℃で6分間遠心分離する。上清を廃棄し、赤血球溶解手順をもう1回繰り返す。その後、細胞ペレットを4mLのDPBSに再懸濁させ、15mL遠心分離チューブ中の5mLのLymphoprep(Nycomed Pharma, カタログ番号:1114545)上に重層する。1300rpm、4℃で12分間遠心分離した後、上清を除去し、好中球を含む細胞ペレットを、25mLの走化性バッファー(10mM HEPESを補充したRPMI 1640培地;各実験用に新たに作製されたもの)に再懸濁させる。
1ミリリットル当たり8.9×106細胞の細胞懸濁液を調製する。走化性バッファー中の20μLの化合物溶液を180μLの細胞懸濁液に添加する。混合物を、15分後の細胞の再懸濁を間に挟んで、37℃で30分間インキュベートする。この後、70μLの細胞懸濁液を、5.0μmの細孔径のポリカーボネートメンブレンを備えたCorning HTSトランスウェル96透過性サポートシステム(Corning, カタログ番号:3387)の上の区画に移す。その後、該トランスウェルシステムのレシーバーウェルを、化合物及び走化性物質(エンベリン)を含む200μLの走化性バッファーで満たす。5%CO2中、37℃で1時間インキュベートした後、トランスウェルシステムの上のプレートを取り外し、レシーバープレート中の細胞懸濁液を、96ウェルV底プレートに移す。50μLのDPBSをレシーバープレートに添加して、残存する細胞の乾燥を防ぐ。該V底プレートを1500rpmで6分間遠心分離する。上清を除去し、細胞を50μLのDPBSに再懸濁させる。その後、細胞をトランスウェルシステムのレシーバープレートに戻す。この後、100μLのATPlite溶液(Perkin Elmer, カタログ番号:436110)を細胞に添加する。プレートを、振盪させながら、暗所で10分間インキュベートする。その後、170μLの細胞溶解液を白色96ウェルプレートに移し、発光を測定する。検出された発光シグナルは、上のウェルからレシーバーウェルに遊走した細胞の数に線形相関するものとみなされる。
表3.
GPR84のアゴニスト又はアンタゴニストの作用は、ラット由来の好中球を用いて、好中球遊走試験でアッセイすることができる。ラット好中球遊走アッセイでは、グリコーゲン(0.1%、w/v)の腹腔内注射後のラットから新たに単離された好中球を化合物で30分間処理する。その後、好中球を、Corning HTSトランスウェル96透過性サポートシステムの上のウェルに移す。該サポートシステムの下のウェルには、EC80(GPR84の活性の80%を生じさせる濃度)のエンベリン溶液が満たされている。1時間インキュベートした後、下の区画中のエンベリンへと向かう好中球の遊走を、Cell Titer Glow Substrateアッセイシステム(Promega, カタログ番号:G755B)を用いて、下のウェルのATP含量を測定することにより定量することができる。
グリコーゲン(0.1%、w/v)を腹腔内注射してから24時間後、細胞を25mL HBSSによる腹腔洗浄により回収し、その後、1300rpm及び4℃で12分間遠心分離する。遠心分離後、上清を廃棄し、赤血球溶解が生じるように、残存する細胞ペレットを12mLの氷冷H2Oに速やかに再懸濁させる。20秒後、4mLの氷冷した0.6M KClを添加する。試料を慎重に混合し、1300rpm、4℃で6分間遠心分離する。上清を廃棄し、細胞ペレットを4mLのDPBSに再懸濁させ、15mL遠心分離チューブ中の5mLのLymphoprep(Axis Shield, カタログ番号:1114544)上に重層する。1500rpm、4℃で30分間遠心分離した後、上清を除去し、好中球を含む細胞ペレットを、5mLの走化性バッファー(10mM HEPESを補充したRPMI 1640培地;各実験用に新たに作製されたもの)に再懸濁させる。
1ミリリットル当たり8.9×106細胞の細胞懸濁液を調製する。走化性バッファー中の10μLの化合物溶液を90μLの細胞懸濁液に添加する。混合物を、15分後の細胞の再懸濁を間に挟んで、37℃で30分間インキュベートする。この後、75μLの細胞懸濁液を、5.0μmの細孔径のポリカーボネートメンブレンを備えたCorning HTSトランスウェル96透過性サポートシステム(Corning, カタログ番号:3387)の上の区画に移す。その後、該トランスウェルシステムのレシーバーウェルを、化合物及び走化性物質(エンベリン)を含む200μLの走化性バッファーで満たす。5%CO2中、37℃で1時間インキュベートした後、トランスウェルシステムの上のプレートを取り外し、70μLのCell Titer Glow Substrate(Promega, カタログ番号:G755B)をレシーバープレートに添加する。レシーバープレートを、振盪させながら、暗所で10分間インキュベートする。その後、180μLの細胞溶解液を白色96ウェルプレートに移し、発光を測定する。検出された発光シグナルは、上のウェルからレシーバーウェルに遊走した細胞の数に線形相関するものとみなされる。
以下のアッセイをGPR84活性化の決定に使用することができる。[35S]GTPγS結合アッセイは、GPCRのアゴニスト占有後のGタンパク質活性化のレベルを、非加水分解性類似体[35S]GTPγSのGαサブユニットへの結合を決定することにより測定するものである。
表5.GPR84 GTP-γS結合アッセイで測定されたEC50値
実施例2に記載のアッセイ法、又は本明細書中の他の方法を用いて同定された化合物を、既知の疾患モデルを用いてインビボでさらに検証することができる。マウス慢性DSS誘導性炎症性腸疾患モデル(IBD)は、炎症性腸疾患の十分に検証された疾患モデルである(Wirtz S.らの文献、2007 Nature Protocols 2, 541-546; Sina C.らの文献、2009 J. Immunol. 183 7514-7522)。
無傷群(水;ビヒクルのみ、n=10)、
罹患群(DSS;ビヒクルのみ、n=10)、
参照として使用されるスルファサラジン群(DSS;スルファサラジン、p.o.、n=10)、及び
試験化合物群(DSS;試験化合物、p.o.、n=10)。
C57BL/6Jマウス系統にタバコの煙(TS)を連続4日間毎日暴露すると、肺の炎症が引き起こされ、これは、最後の暴露から24時間後、同様に処置された空気に暴露された群と比較したとき、気管支肺胞洗浄液(BAL)中に回収される全細胞数の増加により示された。
(参考文献)
Claims (20)
- GPR84アゴニスト刺激性走化性を阻害する化合物を同定する方法であって:
a.配列番号1のアミノ酸配列を含むGPR84ポリペプチドを発現する細胞集団を、試験化合物に、GPR84アゴニストの存在下、走化性を測定するのに好適な系で暴露すること;
b.該系における該細胞の走化性の阻害を測定することであって、遊走した細胞の数を測定すること
を含む、前記方法。 - 以下の工程:
c.前記化合物を、配列番号1のアミノ酸配列を含むGPR84ポリペプチド、及び/又は配列番号2、6、10、12、又は14からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むその断片と接触させる工程;並びに
d.GPR84ポリペプチドの活性又は発現を測定する工程であって、該GPR84ポリペプチドの活性又は発現が、
i. 試験化合物で処理された細胞によって放出されるGPR84活性の下流バイオマーカー又はメッセンジャー分子の量によって、又は
ii. ポリペプチド結合剤を用いてGPR84の量を測定することによって、又は
iii. 細胞内のGPR84の発現レベルを測定することによって
決定される、前記工程
をさらに含む、請求項1記載の方法。 - 前記試験されるべき化合物を対照と比較する工程をさらに含む、請求項1又は2のいずれか一項記載の方法。
- 前記対照が、IL8(ヒト)、KC/CXCL1(ラット)、N-ホルミルメチオニル-ロイシル-フェニルアラニン(fMLP)、LTB4、又はC5aからなる群から選択される走化性物質の存在下の細胞である、請求項3記載の方法。
- 前記対照が、走化性物質の存在下、GPR84ポリペプチドの既知のアンタゴニストに暴露された免疫細胞である、請求項3記載の方法。
- 前記対照が、走化性物質のみに暴露された、GPR84ポリペプチドを発現する免疫細胞である、請求項3記載の方法。
- 前記化合物が、さらに、IL8刺激性走化性も、LTB4刺激性走化性も阻害しない、請求項1記載の方法。
- 前記細胞が、樹状細胞、マクロファージ、及び好中球からなる群から選択される免疫細胞である、請求項1記載の方法。
- 前記細胞が好中球である、請求項6記載の方法。
- 前記メッセンジャー分子が、環状AMP(cAMP)である、請求項2記載の方法。
- 前記GPR84アゴニストが、カプリン酸、ウンデカン酸、ラウリン酸、2,5-ジヒドロキシ-3-ウンデシル-2,5-シクロヘキサジエン-1,4-ジオン(エンベリン)、イコサ-5,8,11,14-テトライン酸、5S,6R-ジヒドロキシ-イコサ-7,9,11,14-テトライン酸、ジインドリルメタン、及びインドール-3-カルビノールを含む群から選択される、請求項1記載の方法。
- 前記GPR84アゴニストが、2,5-ジヒドロキシ-3-ウンデシル-2,5-シクロヘキサジエン-1,4-ジオン(エンベリン)又はカプリン酸である、請求項11記載の方法。
- 遊走した細胞の数が、改良型ボイデンチャンバーを用いて同定され、かつ前記測定が、495nmにおけるクリスタルバイオレットの光学密度の測定、カルセインとともにプレインキュベートされた細胞の場合の485/535nmにおける吸光度の測定、ATPの測定、直接的な細胞計数、濁度測定、好中球エラスターゼ、CD11 好中球のペルオキシダーゼなどの細胞特異的マーカーの測定、及び放射性同位体計数からなる群から選択される、請求項1記載の方法。
- 前記測定が、前記チャンバーにおけるATPレベルの変化である、請求項13記載の方法。
- 遊走した細胞の数が、ジグモンドチャンバーを用いて同定され、かつ前記測定が、低速度撮影ビデオ顕微鏡法を用いた観察である、請求項1記載の方法。
- 遊走した細胞の数が、ダン走化性チャンバーを用いて同定され、かつ前記測定が顕微鏡の読出しである、請求項1記載の方法。
- 前記測定が細胞計数である、請求項13、15、又は16記載の方法。
- 前記化合物が、スクリーニングライブラリーの化合物及び配列番号1によるGPR84ポリペプチドに対する結合親和性を有する化合物からなる群から選択される、請求項1〜5のいずれか一項記載の方法。
- 以下の工程:
a.前記化合物を、配列番号1のアミノ酸配列を含むGPR84ポリペプチド、並びに/又は配列番号2、6、10、12、及び14からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むその断片と接触させる工程;
b.前記GPR84ポリペプチド又はその断片に対する前記化合物の結合親和性を測定する工程;並びに
c.前記ポリペプチドに対する所望のレベルの結合親和性を有する化合物を選択する工程
をさらに含む、請求項1〜18のいずれか一項記載の方法。 - 少なくとも10μMの結合親和性を有する化合物が選択される、請求項19記載の方法。
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