JP5768319B2 - 微生物検出方法 - Google Patents
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Description
本実施形態に係る微生物検出方法は、FISH法を用いて微生物を検出する方法であり、図1に示すように第1〜第8の工程からなる。また、これら第1〜第8の工程のうち、第7の工程は、本実施形態における夾雑物蛍光色変異工程である。
第1の工程では、レジオネラ菌の固定標本を作製する(ステップS1)。すなわち、レジオネラ菌(標的微生物)を含む水を主成分とする液体試料に、終濃度が4質量%になるようにパラホルムアルデヒド溶液を添加すると共に液体試料を4℃の温度の下で一晩保存することにより、レジオネラ菌を液体試料中に化学固定した固定標本を作製する。
第2の工程では、上記レジオネラ菌の固定標本を液体試料から分離する(ステップS2)。すなわち、上記第1の工程で得られたレジオネラ菌の固定標本を含む液体試料を、ろ過装置10(図2参照)によってろ過することで、レジオネラ菌の固定標本を液体試料から分離する。
第3の工程では、レジオネラ菌の固定標本を乾燥させる(ステップS3)。すなわち、レジオネラ菌の固定標本が付着したメンブレンフィルタ2aをろ過器2から取り外し、さらにメンブレンフィルタ2aを常温の空気中で乾燥させた後に99.5質量%のエタノールで脱水し、再度、常温の空気中で乾燥させる。
第4の工程では、レジオネラ菌の固定標本にプローブを結合させる(ステップS4)。すなわち、FITC(fluorescein isothiocyanate)によって標識したプローブ(レジオネラ菌用DNAプローブ)と、ハイブリダイゼーションバッファとを「1:9」の割合で混合したプローブ溶液をシャーレ内に作製し、レジオネラ菌が付着したメンブレンフィルタ2aから切り取った扇形のフィルタ部分(菌サンプル2b)をピンセットによってプローブ溶液に浸し、46℃の温度下で約2時間保存することで、レジオネラ菌の固定標本にプローブを結合させる。
なお、上記ハイブリダイゼーションバッファの成分構成は、NaClが0.9質量%、Tris‐Clが20mM、formamideが35質量%、Blocking reagentが2質量%、SDS(Sodium Dodecyl sulphate:界面活性剤)が0.02質量%である。
第5の工程では、上記菌サンプル2bから未反応のプローブを除去する(ステップS5)。すなわち、ウォッシングバッファを50mlの遠沈管に入れ、当該ウォッシングバッファに上記菌サンプル2bを48℃の環境下で15分浸すことで、菌サンプル2b上の未反応のプローブを除去する。ウォッシングバッファ内では、未反応のプローブが自然拡散によって菌サンプル2bから剥がれ落ちる。
なお、上記ウォッシングバッファの成分構成は、Tris−Clが20mM、NaClが80mM、EDTA(ethylenediaminetetraacetic acid)が5mM、SDSが0.01質量%である。
第6の工程では、菌サンプル2bを乾燥させる(ステップS6)。すなわち、ウォッシングバッファによって未反応のプローブが除去された菌サンプル2bを99.5質量%のエタノールに1分間入れることで脱水し、その後に常温の空気中で乾燥させる。
第7の工程(夾雑物蛍光色変異工程)では、菌サンプル2bに含まれる夾雑物の蛍光色を変異させる(ステップS7)。この第7の工程は、最初に夾雑物蛍光色変異液Cを作製する前工程と、夾雑物蛍光色変異液Cを用いて菌サンプル2bに含まれる夾雑物の蛍光色を変異させる後工程とからなる。前工程では、親油性スリチル色素であるN-(3-triethylammoniumpropyl)-4-(6-(4-(diethylamino)phenyl)hexatrienyl)pyridinium dibromide(親油性蛍光色素)の原液をベクターシールドによって50〜500ng/mlに希釈した夾雑物蛍光色変異液C(溶液)を作製する。この夾雑物蛍光色変異液Cとしては、N-(3-triethylammoniumpropyl)-4-(6-(4-(diethylamino)phenyl)hexatrienyl)pyridinium dibromideを100〜400ng/mlの範囲で希釈したものが好ましい。また、N-(3-triethylammoniumpropyl)-4-(6-(4-(diethylamino)phenyl)hexatrienyl)pyridinium dibromideを200〜300ng/mlに希釈したものがより好ましい。
第8の工程では、蛍光顕微鏡を用いて試料中のレジオネラ菌を検出する(ステップS8)。すなわち、上記後工程で処理されたスライドガラス11を蛍光顕微鏡に装着し、波長495nmの青色の励起光をスライドガラス11上の試料に照射することにより、プローブが結合したレジオネラ菌を波長520nmの緑色光として蛍光させる。そして、蛍光顕微鏡で得られる試料の画像を所定の画像処理アルゴリズムで画像処理することによって試料中に含まれるレジオネラ菌のみを検出する。
(1)上記実施形態では、FISH法によってレジオネラ菌を染色したが、本発明はこれに限定されない。例えば、核酸染色法及び抗体染色法等、FISH法以外の蛍光染色法によってレジオネラ菌を染色するようにしてもよい。
例えば、夾雑物蛍光色変異液として、親油性カルボシアニン色素である3,3'-dioctadecyl-5,5'-di(4-sulfophenyl)oxacarbocyanine,sodium salt、または親油性ナイルレッドである9-(Diethylamino)-5H-benzo[a]phenoxazin-5-oneを希釈した溶液を用いてもよい。
Claims (7)
- 試料から標的微生物を検出する微生物検出方法であって、
前記試料中の夾雑物の蛍光色を前記標的微生物の蛍光と異なる色に変異させるために、親油性蛍光色素を希釈した溶液である夾雑物蛍光色変異液を試料中に添加する夾雑物蛍光色変異工程を具備することを特徴とする微生物検出方法。
- 前記夾雑物蛍光色変異液は、前記親油性蛍光色素として親油性スリチル色素、親油性カルボシアニン色素または親油性ナイルレッドを希釈した溶液であることを特徴とする請求項1に記載の微生物検出方法。
- 前記夾雑物蛍光色変異液は、前記親油性スリチル色素であるN-(3-triethylammoniumpropyl)-4-(6-(4-(diethylamino)phenyl)hexatrienyl)pyridinium dibromide、前記親油性カルボシアニン色素である3,3'-dioctadecyl-5,5'-di(4-sulfophenyl)oxacarbocyanine,sodium salt、または前記親油性ナイルレッドである9-(Diethylamino)-5H-benzo[a]phenoxazin-5-oneを希釈した溶液であることを特徴とする請求項2に記載の微生物検出方法。
- 前記夾雑物蛍光色変異液は、前記親油性スリチル色素であるN-(3-triethylammoniumpropyl)-4-(6-(4-(diethylamino)phenyl)hexatrienyl)pyridinium dibromide、前記親油性カルボシアニン色素である3,3'-dioctadecyl-5,5'-di(4-sulfophenyl)oxacarbocyanine,sodium salt、または前記親油性ナイルレッドである9-(Diethylamino)-5H-benzo[a]phenoxazin-5-oneを50〜500ng/mlの濃度で使用することを特徴とする請求項3に記載の微生物検出方法。
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- FISH(fluorescence in situ hybridization)法を使用することを特徴とする請求項1〜6のいずれか一項に記載の微生物検出方法。
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