JP5004083B2 - Recombinant diacylglycerol acyltransferase with high enzymatic activity - Google Patents
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Description
本発明は、貯蔵脂質の主要成分であるトリアシルグリセロールの合成酵素であるジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼを高活性の組換え体で製造する方法、及び得られた高活性の組換えジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ自体に関するものである。 The present invention relates to a method for producing a diacylglycerol acyltransferase, which is a synthase of triacylglycerol, which is a major component of storage lipids, with a highly active recombinant, and the resulting highly active recombinant diacylglycerol acyltransferase itself. Is.
ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼは、貯蔵脂質の主要成分であるトリアシルグリセロールの合成酵素であり、貯蔵脂質の合成に重要な役割をもつ酵素である。このため、油糧微生物、植物による脂質生産を改変するためのターゲットであり(非特許文献1)、反対に、肥満、高脂血症、糖尿病などのメタボリックシンドロームに関係する脂質蓄積を改善するためのターゲットでもある(非特許文献2)。
ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ(以下、DGATともいう。)は、その遺伝子配列より、コレステロールアシルトランスフェラーゼと相同性を有するDGAT1(非特許文献3)とモルティエレラ・ラマニアナ・バー・アングリスポラより精製したDGATの遺伝子配列と相同性を有するDGAT2(非特許文献4)に分類される。両者間では、相同性は有していない。両者ともに、微生物、植物、動物で相同性を有する遺伝子(オルトログ)が存在するが、トリアシルグリセロール合成における役割は、異なっていると考えられる。
マウスでは、DGAT1の破壊はトリアシルグリセロールの低下はそれほどでもなく、食餌による肥満に対して耐性を示したのに対し(非特許文献5)、DGAT2の破壊ではトリアシルグリセロールの顕著な低下を示し、誕生後直ちに死亡した(非特許文献6)。また、出芽酵母でもDGAT1タイプであるARE1, ARE2遺伝子の破壊よりも、DGAT2タイプであるDGA1遺伝子の破壊がトリアシルグリセロール合成の顕著な低下をもたらした(非特許文献7)。以上の結果より、DGAT2タイプの酵素がトリアシルグリセロール合成の主要な反応を担っていると考えられている。以下、本発明において、単にジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ、又はDGATなどというとき、DGAT2タイプの酵素を指す。
A diacylglycerol acyltransferase is a synthase of triacylglycerol, which is a major component of storage lipids, and an enzyme having an important role in the synthesis of storage lipids. Therefore, it is a target for modifying lipid production by oily microorganisms and plants (Non-Patent Document 1), and on the contrary, to improve lipid accumulation related to metabolic syndrome such as obesity, hyperlipidemia, diabetes, etc. (Non-Patent Document 2).
The diacylglycerol acyltransferase (hereinafter also referred to as DGAT) is a gene sequence of DGAT1 (Non-patent Document 3) having homology to cholesterol acyltransferase and DGAT purified from Mortierella lamaniana bar angerspora based on the gene sequence. And DGAT2 (Non-patent Document 4). There is no homology between the two. Both have a homologous gene (ortholog) in microorganisms, plants and animals, but their roles in triacylglycerol synthesis are thought to be different.
In mice, the destruction of DGAT1 did not significantly reduce triacylglycerol and was resistant to diet-induced obesity (Non-Patent Document 5), whereas the destruction of DGAT2 showed a marked reduction in triacylglycerol. Died immediately after birth (Non-patent Document 6). In addition, even in budding yeast, the disruption of the DGAT2 type DGA1 gene resulted in a significant reduction in triacylglycerol synthesis than the disruption of the DGAT1 type ARE1, ARE2 gene (Non-patent Document 7). From the above results, it is considered that the DGAT2 type enzyme is responsible for the main reaction of triacylglycerol synthesis. Hereinafter, in the present invention, when simply referred to as diacylglycerol acyltransferase or DGAT, it refers to a DGAT2 type enzyme.
DGATは、既に述べたように脂質生産あるいは脂質蓄積における重要な酵素であり、その酵素活性を活性化あるいは阻害する物質の探索は、脂質生産の向上及び脂質蓄積に伴なう疾病の改善に重要である。しかしながら、DGATは膜結合性の不安定な酵素であり、天然での安定な酵素の供給源は知られていない。一方、DGAT遺伝子を取得して(非特許文献4、非特許文献8、特許文献1、特許文献2)、昆虫細胞、サッカロミセス・セレビジアなどで発現させて、酵素活性のある遺伝子産物を取得することは行われているが、報告によって得られた酵素活性にはばらつきがある。カスター種子やキリ種子のDGAT2を酵母に発現させた時は、そのミクロソーム膜でのDGAT活性は、20-50 pmol/min/mg proteinであった(非特許文献9、非特許文献10)。一方、モルティエレラ・ラマニアナ・バー・アングリスポラのDGAT2やサッカロミセス・セレビシェのDGA1遺伝子などを昆虫細胞に発現させた時のミクロソーム膜での活性は、30-200 nmol/min/mg protein というきわめて高い値を示している(非特許文献4、図5)が、同報告の別の実験では同じ条件で酵素活性が約100 pmol/min/mg proteinという低いピコモル単位の数値(非特許文献4、図7)であることから見て、上記高い活性値は単位の表記間違いの可能性もあり、少なくとも安定して高い活性が呈せられていないことが考えられる。他の報告でマウスのDGAT2を昆虫細胞に発現させた場合でも、そのミクロソーム膜の酵素活性は、約600 pmol/min/mg protein(発現していない場合の酵素活性は約200 pmol/min/mg protein)であって(非特許文献8)、やはり、ピコモルのオーダーを超えるものではない。そして、いずれの場合も、膜表面での酵素活性によりDGATの発現を確認したにとどまるものであって、これらの発現DGATが安定的に使用されたという報告も、さらに単離されて高い比活性をもつDGATが得られたという報告もない。
本発明の課題は、DGAT遺伝子を、高い酵素活性を有する状態で大量に発現させる方法、及び高い酵素活性を有する組換えDGATを提供することであり、また当該DGAT又は高濃度で高活性の組換えDGATを含む形質転換宿主(生存状態、破砕物もしくは培養液)を用いた、DGAT活性を活性化あるいは阻害する物質の探索を行うシステムを確立できるようにする点にある。 An object of the present invention is to provide a method for expressing a DGAT gene in a large amount in a state having a high enzyme activity, and a recombinant DGAT having a high enzyme activity, and also a DGAT or a group having a high activity at a high concentration. This is to establish a system for searching for a substance that activates or inhibits DGAT activity using a transformed host (survival state, crushed material or culture solution) containing a modified DGAT.
本発明者らは、前記課題を解決すべく種々検討を重ねた結果、SNF2遺伝子を破壊した変異微生物を、DGAT遺伝子を発現させる宿主として用いることによって、発現させるDGAT遺伝子産物として、酵素活性が極めて高いDGATを大量に発現させることに成功した。
本発明者等は、先に、脂質合成を抑制する遺伝子として、トランスポゾン挿入変異により、サッカロミセス・セレビシェのSNF2遺伝子を同定し、この遺伝子を破壊することにより、この変異株の脂質生産性が向上することを見い出しており(特許文献2)、このSNF2遺伝子破壊株にサッカロミセス・セレビシェのDGAT遺伝子であるDGA1遺伝子を過剰発現させることで、脂質含量を30%程度まで増加させることができるという知見を得ていた(特願2006-31705)。これらの知見から、SNF2遺伝子破壊株においてDGAT活性が増加していることは予測されたものの、コントロールで用いたサッカロミセス・セレビシェの通常の野生株でDGA1遺伝子を過剰発現させた場合でも、すでに17%程度も脂質含量が増加していることからみて、SNF2遺伝子破壊株でDGAT活性が増加しているといっても、そのDGAT活性の増加程度は、野生株の場合に比べてたかだか数倍から10倍程度であると予想された。
しかしながら、実際にSNF2遺伝子破壊株におけるDGAT活性を測定したところ、数百倍程度という驚くべき酵素活性の増加が見られた。本発明は、SNF2遺伝子破壊株におけるDGAT活性が予想をはるかに越えて高いという知見に基づいてなされたものである。
また、DGAT蛋白質にタグペプチドをつけても、発現するDGAT遺伝子産物の高い酵素活性が失われないことを確認し、必要に応じて組換えDGATを容易に精製できることを見い出した。さらに、上記形質転換微生物中のDGATの酵素活性は、極めて高く安定しているので、酵素蛋白質をさらに濃縮、精製することなく破砕液のままでクリアな酵素活性が検出できることを見出し、組換えDGAT及びそれを含有する破砕液を用いたDGATの活性化物質又は阻害物質のスクリーニング系を確立して、本発明を完成するに至った。
As a result of various studies to solve the above problems, the present inventors have used a mutant microorganism in which the SNF2 gene is disrupted as a host for expressing the DGAT gene, so that the enzyme activity is extremely high as a DGAT gene product to be expressed. We succeeded in expressing high DGAT in large quantities.
The present inventors previously identified the SNF2 gene of Saccharomyces cerevisiae by transposon insertion mutation as a gene that suppresses lipid synthesis, and by destroying this gene, the lipid productivity of this mutant strain is improved. (Patent Document 2), and obtained the knowledge that the lipid content can be increased to about 30% by overexpressing the DGA1 gene, which is a DGAT gene of Saccharomyces cerevisiae, in this SNF2 gene disrupted strain (Japanese Patent Application 2006-31705). From these findings, although it was predicted that DGAT activity was increased in the SNF2 gene-disrupted strain, even when the DGA1 gene was overexpressed in a normal wild strain of Saccharomyces cerevisiae used as a control, it was already 17% Although the DGAT activity is increased in the SNF2 gene-disrupted strain in view of the increase in the lipid content, the increase in the DGAT activity is several times to 10 times that in the wild strain. It was expected to be about double.
However, when the DGAT activity in the SNF2 gene disrupted strain was actually measured, a surprising increase in enzyme activity of several hundred times was observed. The present invention has been made based on the finding that the DGAT activity in the SNF2 gene-disrupted strain is much higher than expected.
Moreover, it was confirmed that even when a tag peptide was attached to the DGAT protein, the high enzymatic activity of the expressed DGAT gene product was not lost, and it was found that the recombinant DGAT could be easily purified as needed. Furthermore, since the enzyme activity of DGAT in the above-mentioned transformed microorganism is extremely high and stable, it has been found that a clear enzyme activity can be detected in a crushed solution without further concentration and purification of the enzyme protein. And the screening system of the activator or inhibitor of DGAT using the crushing liquid containing the same was established, and it came to complete this invention.
すなわち、本発明は以下の(1)〜(7)に示す通りである。
[1] SNF2遺伝子あるいはそのオルトログ遺伝子が破壊または機能低下している宿主細胞に、ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ遺伝子が導入され、取得された当該形質転換体を培養して得られる組換えジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ。
[2] 前記宿主細胞が、SNF2遺伝子が破壊又は機能低下しているサッカロミセス・セレビシェであることを特徴とする、前記[1]に記載の組換えジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ。
[3] 前記ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ遺伝子が、サッカロミセス・セレビシェのDGA1遺伝子であることを特徴とする、前記[1]又は[2]に記載の組換えジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ。
[4] SNF2遺伝子が破壊又は機能低下しているサッカロミセス・セレビシェに、DGA1遺伝子が導入された形質転換体が、さらに、LEU2遺伝子も導入されていることを特徴とする、前記[3]に記載の組換えジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ。
[5] 前記ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ遺伝子の産物がタグペプチドをもつように改変されており、形質転換体を培養して得られた発現産物から、導入されたタグペプチドの性質によって均一に精製されたものであることを特徴とする、前記[1]〜[4]のいずれかに記載の組換えジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ。
[6] SNF2遺伝子あるいはそのオルトログ遺伝子が破壊または機能低下している宿主細胞に、ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ遺伝子を導入して形質転換し、当該形質転換体を培養して、得られた発現産物から組換えジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼを取得することを特徴とする、組換えジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼの製造方法。
[7] SNF2遺伝子が破壊又は機能低下しているサッカロミセス・セレビシェに、サッカロミセス・セレビシェ由来のDGA1遺伝子を導入して形質転換することを特徴とする、前記[6]に記載の組換えジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼの製造方法。
[8] 前記DGA1遺伝子を導入して形質転換する際に、さらにLEU2遺伝子も導入することを特徴とする、前記[7]に記載の組換えジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼの製造方法。
[9] 前記ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ遺伝子の産物がタグペプチドをもつように改変されたものであり、形質転換体を培養して得られた発現産物から、導入されたタグペプチドの性質によって均一に精製する工程を含むことを特徴とする、前記[6]〜[8]のいずれかに記載の組換えジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼの製造方法。
[10] 前記形質転換体を培養する際に、窒素源欠乏培地で培養することを特徴とする、前記[6]〜[9]のいずれかに記載の組換えジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼの製造方法。
[11] 前記[1]〜[5]のいずれかに記載の組換えジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼを用いることを特徴とする、ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼの酵素活性を活性化する物質、又は阻害する物質のスクリーニング方法。
That is, the present invention is as shown in the following (1) to (7).
[1] A recombinant diacylglycerol acyltransferase obtained by culturing the obtained transformant by introducing a diacylglycerol acyltransferase gene into a host cell in which the SNF2 gene or its ortholog gene has been disrupted or reduced in function.
[2] The recombinant diacylglycerol acyltransferase according to [1], wherein the host cell is Saccharomyces cerevisiae in which the SNF2 gene is disrupted or has a reduced function.
[3] The recombinant diacylglycerol acyltransferase according to [1] or [2] above, wherein the diacylglycerol acyltransferase gene is a DGA1 gene of Saccharomyces cerevisiae.
[4] The above-mentioned [3], wherein the transformant in which the DGA1 gene is introduced into Saccharomyces cerevisiae in which the SNF2 gene is disrupted or reduced in function further has the LEU2 gene introduced therein. Recombinant diacylglycerol acyltransferase.
[5] The product of the diacylglycerol acyltransferase gene has been modified to have a tag peptide, and has been uniformly purified from the expression product obtained by culturing the transformant according to the properties of the introduced tag peptide. The recombinant diacylglycerol acyltransferase according to any one of [1] to [4] above, wherein
[6] A diacylglycerol acyltransferase gene is introduced into a host cell in which the SNF2 gene or its orthologue gene has been disrupted or reduced in function, the transformant is cultured, and the resulting expression product is combined. A method for producing a recombinant diacylglycerol acyltransferase, comprising obtaining a substituted diacylglycerol acyltransferase.
[7] The recombinant diacylglycerol acyl according to [6] above, wherein the SGA2 gene is transformed or introduced into a Saccharomyces cerevisiae in which the SNF2 gene is disrupted or reduced in function. A method for producing a transferase.
[8] The method for producing a recombinant diacylglycerol acyltransferase according to [7], wherein a LEU2 gene is also introduced when the DGA1 gene is introduced for transformation.
[9] The product of the diacylglycerol acyltransferase gene is modified so as to have a tag peptide, and is uniformly purified from the expression product obtained by culturing the transformant according to the properties of the introduced tag peptide. The method for producing a recombinant diacylglycerol acyltransferase according to any one of the above [6] to [8], comprising the step of:
[10] The method for producing a recombinant diacylglycerol acyltransferase according to any one of [6] to [9], wherein the transformant is cultured in a nitrogen source-deficient medium.
[11] Screening of a substance that activates or inhibits the enzyme activity of diacylglycerol acyltransferase, wherein the recombinant diacylglycerol acyltransferase according to any one of [1] to [5] is used. Method.
本発明により、DGAT遺伝子を大量に、かつ高い酵素活性を有する状態で発現させる方法が提供でき、同時に、高い酵素活性を有する組換えDGATを提供することができた。また、精製前の形質転換宿主が高活性の組換えDGATを含んでいるので、組換えDGATと同様に、形質転換宿主またはその破砕液のまま用いても、DGAT酵素の活性化物質又は阻害物質を迅速にスクリーニングすることができ、簡便なスクリーニング法が提供できた。特に、DGAT阻害物質は、肥満や糖尿病などの疾患に対する創薬のターゲットとなることから、本発明は、肥満や糖尿病などの疾患用創薬の提供に繋がる。 According to the present invention, a method of expressing a DGAT gene in a large amount and in a state having high enzyme activity can be provided, and at the same time, a recombinant DGAT having high enzyme activity can be provided. In addition, since the transformed host before purification contains highly active recombinant DGAT, the activator or inhibitor of DGAT enzyme can be used as it is in the transformed host or its disrupted solution as in the case of recombinant DGAT. Thus, a simple screening method could be provided. In particular, since DGAT inhibitors are targets for drug discovery for diseases such as obesity and diabetes, the present invention leads to the provision of drug discovery for diseases such as obesity and diabetes.
本発明は、主要な貯蔵脂質であるトリアシルグリセロールを合成する酵素であるDGAT遺伝子を、SNF2遺伝子あるいはそのオルトログを破壊あるいは機能低下させた宿主細胞で発現させて、酵素活性の高いDGAT蛋白質を取得するものである。
サッカロミセス・セレビシェのSNF2遺伝子は、原核生物、真核生物に広くオルトログが存在し、遺伝子DNAを包んでいるクロマチンを再構築させるという普遍的な機能をもっている。従って、SNF2遺伝子のオルトログを破壊したサッカロミセス・セレビシェ以外の微生物、又は動植物細胞を宿主とすることができる。これらの宿主細胞に対してDGAT遺伝子を導入して発現させた場合には、同様に、高い酵素活性の組換えDGATを得ることができる。
本発明において、SNF2遺伝子が破壊された変異体を取得する方法は、既に記載された方法(非特許文献11、特許文献3)等によって行うことができる。
例えば、マーカー遺伝子の両端に、破壊しようとする対象遺伝子の上流域、下流域の配列を付加したDNAを作成し、該DNAを用いて宿主を形質転換することにより、導入したDNAが、破壊しようとする遺伝子の上流と下流域部分で、相同的組み替えを起こし、対象遺伝子を破壊することができる。対象遺伝子が破壊された変異体は、マーカー遺伝子の発現による形質変化により識別できる。
本発明においては、その他の手法でも、遺伝子の機能を欠失あるいは低下させることができるものであれば使用可能である。これらには、上記破壊対象遺伝子を単離した後、適当な制限酵素で切断し、該切断部位にマーカー遺伝子を挿入して得た断片を用いて形質転換する方法、マーカー遺伝子を、破壊対象遺伝子の一部含むプラーマーを用いてPCRにより増幅し、形質転換する方法、あるいは突然変異剤などにより、ランダム変異を生じさせて、対象遺伝子が変異したものをスクリーニングする方法等がある。
In the present invention, a DGAT gene, which is an enzyme that synthesizes triacylglycerol, which is a major storage lipid, is expressed in a host cell in which the SNF2 gene or its ortholog is disrupted or reduced in function, thereby obtaining a DGAT protein having high enzyme activity. To do.
The SNF2 gene of Saccharomyces cerevisiae has a wide range of orthologs in prokaryotes and eukaryotes, and has the universal function of reconstructing chromatin that wraps gene DNA. Therefore, microorganisms other than Saccharomyces cerevisiae that have disrupted the ortholog of the SNF2 gene, or animal and plant cells can be used as hosts. Similarly, when a DGAT gene is introduced and expressed in these host cells, recombinant DGAT with high enzyme activity can be obtained.
In the present invention, the method for obtaining a mutant in which the SNF2 gene is disrupted can be performed by the methods already described (Non-patent Document 11, Patent Document 3) and the like.
For example, by creating a DNA in which the upstream and downstream sequences of the target gene to be disrupted are added to both ends of the marker gene, and transforming the host using the DNA, the introduced DNA will be disrupted. It is possible to cause homologous recombination in the upstream and downstream regions of the gene to destroy the target gene. Mutants in which the gene of interest is disrupted can be identified by phenotypic changes due to the expression of marker genes.
In the present invention, other techniques can be used as long as they can delete or reduce the function of the gene. These include a method of transforming using a fragment obtained by isolating the gene to be disrupted, cleaving with an appropriate restriction enzyme, and inserting the marker gene into the cleavage site, There are a method of amplifying and transforming by using a plumer containing a part of the above, a method of transforming, or a method of screening for a mutant of a target gene by causing a random mutation using a mutagen or the like.
本発明で発現させるDGAT遺伝子は、サッカロミセス・セレビシェのDGA1遺伝子と相同性を有するDGAT2ファミリーに属する遺伝子であって、宿主である生物で発現可能なものであれば、どのような生物由来のものであっても利用可能である。発現させるDGAT遺伝子の由来となる生物は、発現する宿主細胞の由来生物と同一でもよいし、他の生物でもよい。発現のしやすさや、酵素活性の強さ、酵素の基質特異性などを検討して、至適のDGAT遺伝子を選択して使用すればよい。また、本発明のDGAT遺伝子とは、天然のDGAT遺伝子のみならず、そのフラグメント、塩基配列の1部を改変した核酸、または天然DGAT遺伝子の配列に由来するプライマー、プローブを用いて通常のハイブリダイズ条件で取得できる核酸であって、かつ、その発現産物が、天然DGATと同様のDGAT活性を有する蛋白質である場合は包含される。 The DGAT gene to be expressed in the present invention is a gene belonging to the DGAT2 family having homology with the DGA1 gene of Saccharomyces cerevisiae, and can be derived from any organism as long as it can be expressed in the host organism. Even if it is available. The organism from which the DGAT gene to be expressed is derived may be the same as the organism from which the host cell is to be expressed, or may be another organism. The optimal DGAT gene may be selected and used by considering the ease of expression, the strength of the enzyme activity, the substrate specificity of the enzyme, and the like. The DGAT gene of the present invention is not only a natural DGAT gene but also a fragment, a nucleic acid obtained by modifying a part of the base sequence, or a primer or probe derived from the sequence of the natural DGAT gene. It is included when the nucleic acid can be obtained under conditions and the expression product is a protein having DGAT activity similar to that of natural DGAT.
本発明におけるDGAT遺伝子の発現手法は、染色体外で複製するプラスミド等のベクター中に組み込んで行っても、染色体内に組み込まれるベクター中に組み込んで行ってもよい。リポソーム法などのDGAT遺伝子を直接導入する方法を用いることもできる。
また、DGA1遺伝子が挿入されたベクターを用いて、サッカロミセス・セレビシェを形質転換してDGA1遺伝子を発現させる場合、同時にLEU2遺伝子を発現していた方が脂質含量が高いことが知られているので(特願2006-31705)、LEU2遺伝子も同時に加えて形質転換を行うことが好ましい。
The expression method of the DGAT gene in the present invention may be incorporated into a vector such as a plasmid that replicates extrachromosomally or may be incorporated into a vector that is incorporated into the chromosome. A method of directly introducing a DGAT gene such as a liposome method can also be used.
In addition, when a DGA1 gene is expressed by transforming Saccharomyces cerevisiae using a vector into which the DGA1 gene is inserted, it is known that the lipid content is higher when the LEU2 gene is expressed at the same time ( Japanese Patent Application No. 2006-31705) and LEU2 gene are preferably added at the same time for transformation.
本発明において発現される高い酵素活性をもったDGATは、発現された生物の破砕液そのもの(または、細胞培養液)でも容易に検出できるために、活性測定のためにさらに細胞分画を行って膜画分を調製したり、さらに界面活性剤による可溶化や精製を行わなくてもよい。そのため、さまざまな生物由来のDGATの酵素活性に対する影響を検討するような化合物のスクリーニングにおいては、手間をかけずにスクリーニングを確立できる。
本発明において発現される高い酵素活性をもった組換えDGATは、タグペプチドを付けて容易に精製できるようにしても、高い酵素活性を保持している。タグペプチドは、6xHis、GST(グルタチオンSトランスフェラーゼ)、FLAG、マルトース結合蛋白質などがあり、酵素活性に影響を与える位置に付与しないかぎりいずれも用いてもよい。タグペプチドの付いた組換えDGATは、界面活性剤による可溶化後、それぞれのタグペプチドを特異的に認識するアフィニティーカラムによって容易に均一に精製できる。したがって、得られた形質転換体を大量培養することで、容易に酵素活性の高い組換えDGATを、大量に精製された状態で得ることができる。このようなDGATの標品は、通常用いられる放射性同位元素を用いた感度の高い測定法でなく、分光学的な方法でも測定が可能であり、かつ夾雑物が少ないため非特異的な影響を最小限に排除できるため、DGAT活性を活性化あるいは阻害する物質のハイスループットスクリーニングにも使用可能である。
Since the DGAT having high enzyme activity expressed in the present invention can be easily detected in the lysate itself (or cell culture solution) of the expressed organism, further cell fractionation is performed for activity measurement. It is not necessary to prepare a membrane fraction or to perform solubilization or purification with a surfactant. Therefore, in the screening of compounds that examine the influence of DGAT derived from various organisms on the enzyme activity, it is possible to establish the screening without trouble.
Recombinant DGAT with high enzyme activity expressed in the present invention retains high enzyme activity even though it can be easily purified with a tag peptide attached. Tag peptides include 6xHis, GST (glutathione S transferase), FLAG, maltose binding protein, and the like, and any of them may be used as long as it is not provided at a position that affects enzyme activity. Recombinant DGAT with a tag peptide can be easily and uniformly purified by an affinity column that specifically recognizes each tag peptide after solubilization with a surfactant. Therefore, by culturing the obtained transformant in large quantities, recombinant DGAT with high enzyme activity can be easily obtained in a state of being purified in large quantities. Such a DGAT sample is not a highly sensitive measurement method using a commonly used radioisotope, but can also be measured by a spectroscopic method, and since there are few impurities, it has a nonspecific effect. Since it can be eliminated to the minimum, it can be used for high-throughput screening of substances that activate or inhibit DGAT activity.
そして、本発明において得られた組換えDGATは、公知のDGA1遺伝子の発現産物であることからアミノ酸配列レベルでは,天然の酵母DGATと同一であると考えられるが、従来DGAT活性として認識されていた活性値から予測できないほどのきわめて高い活性を呈していることからみて、発現後修飾を受けた新規な蛋白質である蓋然性が高い。すなわち、SNF2遺伝子破壊酵母という宿主細胞内での環境により、糖鎖付加、又はリン酸基付加などの何らかの修飾を受けあるいは修飾が解除され、新規で優れた酵素蛋白質を提供できたものであると考えられる。後述のように、少なくとも天然DGATとして認識されていた蛋白質とは区別される、新規な組換えDGATを提供したものであるか、または少なくとも、新規な組換えDGAT組成物を提供したものであるといえる。SNF2遺伝子のオルトログ遺伝子が破壊された他の微生物又は動植物細胞においても、同様の環境を提供できるといえるから、当該微生物又は動植物細胞の形質転換体で発現されたDGAT蛋白質も同様に酵素活性の高い改変体が得られる。 The recombinant DGAT obtained in the present invention is known to be the same as natural yeast DGAT at the amino acid sequence level because it is a known expression product of the DGA1 gene, but has been conventionally recognized as DGAT activity. In view of the extremely high activity that cannot be predicted from the activity value, there is a high probability that it is a novel protein that has undergone post-expression modification. In other words, depending on the environment in the host cell called SNF2 gene disrupted yeast, it was subjected to some modification such as glycosylation or phosphate group addition or the modification was released, and a new and excellent enzyme protein could be provided. Conceivable. As described later, at least a novel recombinant DGAT that is distinguished from a protein recognized as a natural DGAT is provided, or at least a novel recombinant DGAT composition is provided. I can say that. Since it can be said that other microorganisms or animal and plant cells in which the ortholog gene of the SNF2 gene is disrupted can also provide a similar environment, the DGAT protein expressed in the transformant of the microorganism or animal and plant cells also has a high enzymatic activity. A variant is obtained.
本発明において、DGAT遺伝子を発現させた形質転換体を培養するためには通常の形質転換細胞用培養液又培地を用いることができる。たとえば、形質転換酵母の場合であれば、後述の実施例に挙げたようなSD培地(グルコースを炭素源とし、イーストナイトロジェンベースを窒素源とし、要求栄養素を加えた培地)を用いることができるが、培地の炭素源、窒素源の種類、培養温度、培養時間などについては、酵素活性が高い組換えDGATを大量に得るのに最適な条件を適宜選択することができる。これらの条件としては、培地の窒素源の量が重要で、微生物の生育可能な範囲で窒素源欠乏培地を使用すれば、微生物の脂質含量の増加とともに酵素活性の高い組換えDGATの発現量も大幅に増加させることができる。
以下に、本発明を実施例により詳しく説明するが、本発明は実施例のみに限定されるものではない。
In the present invention, a normal culture solution or medium for transformed cells can be used for culturing a transformant expressing the DGAT gene. For example, in the case of transformed yeast, an SD medium (medium in which glucose is used as a carbon source, yeast nitrogen base is used as a nitrogen source, and required nutrients are added) as described in Examples below can be used. However, with respect to the type of carbon source, nitrogen source, culture temperature, culture time, and the like of the medium, optimum conditions for obtaining a large amount of recombinant DGAT having high enzyme activity can be appropriately selected. As these conditions, the amount of nitrogen source in the medium is important. If a nitrogen source-deficient medium is used in the range where microorganisms can grow, the expression level of recombinant DGAT with high enzyme activity can be increased along with the increase in lipid content of microorganisms. Can be significantly increased.
Hereinafter, the present invention will be described in detail with reference to examples, but the present invention is not limited to the examples.
[実施例1]
DGAT遺伝子を出芽酵母サッカロミセス・セレビシェSNF2遺伝子破壊株に発現させることによる酵素活性の高い組換えDGATの取得
出芽酵母サッカロミセス・セレビシェSNF2遺伝子の変異株(BY4741Δsnf2株)(Mat a leu2Δ0 his3Δ1 ura3Δ0 met15Δ0 SNF2::kanMX)(インビトロジェン社製)あるいは野生株(BY4741株)(Mat a leu2Δ0 his3Δ1 ura3Δ0 met15Δ0) (インビトロジェン社製)を宿主として用いた。発現させるDGAT遺伝子は、サッカロミセス・セレビシェ自身のDGAT遺伝子であるDGA1を用いた。DGA1は、サッカロミセス・セレビシェのゲノムDNAを鋳型とし、表1のDGA1用のプライマーを用いたPCRによって増幅して取得した。このプライマーは、既に決定されているゲノムDNA配列にもとづいて、遺伝子全長を増幅できるように設計され、その末端に制限酵素SacI認識部位とXbaI認識部位を含んでいる。この時のPCR増幅条件は、0.4 units KOD plus polymerase (Toyobo社製)、0.2 mM dNTP mixture、0.5 μM プライマー、10 ng サッカロミセス・セレビシェのゲノムDNAを、1 mM MgCl2を含む添付の緩衝液中で反応させた(全反応液 20 μl)。増幅条件は、94℃で2分間反応させた後、94℃(15秒間)/55℃(30秒間)/68℃(90秒間)を1サイクルとして25回くり返すことで行った。反応液は、0.7%アガロースゲル電気泳動にかけ、エチジウムブロマイド染色後、紫外線照射して、予期したサイズの単一バンドが得られたことを確認した。増幅したDGA1は、PCR purification kit (キアゲン社製)により、プライマーなどを除いて、精製した。FAA3についても同様にPCRによって増幅して取得した。ただし、1.2 mM MgCl2を用い、増幅サイクルは、94℃(15秒間)/60℃(30秒間)/68℃(120秒間)を用いた。
Obtaining recombinant DGAT with high enzymatic activity by expressing DGAT gene in Saccharomyces cerevisiae SNF2 gene disruption strain Saccharomyces cerevisiae SNF2 gene mutant strain (BY4741Δsnf2 strain) (Mat a leu2Δ0 his3Δ1 ura3Δ0 met15Δ0 SNF2: kanMX) (manufactured by Invitrogen) or wild strain (BY4741 strain) (Mat a leu2Δ0 his3Δ1 ura3Δ0 met15Δ0) (manufactured by Invitrogen) was used as a host. As the DGAT gene to be expressed, DGA1, which is Saccharomyces cerevisiae's own DGAT gene, was used. DGA1 was obtained by amplification by PCR using Saccharomyces cerevisiae genomic DNA as a template and primers for DGA1 in Table 1. This primer is designed to amplify the full length of the gene based on the already determined genomic DNA sequence, and contains a restriction enzyme SacI recognition site and an XbaI recognition site at its ends. PCR amplification conditions were as follows: 0.4 units KOD plus polymerase (Toyobo), 0.2 mM dNTP mixture, 0.5 μM primer, 10 ng Saccharomyces cerevisiae genomic DNA in the attached buffer containing 1 mM MgCl2. (20 μl of total reaction solution). Amplification was performed by reacting at 94 ° C. for 2 minutes and then repeating 25 times with 94 ° C. (15 seconds) / 55 ° C. (30 seconds) / 68 ° C. (90 seconds) as one cycle. The reaction solution was subjected to 0.7% agarose gel electrophoresis, and after ethidium bromide staining, it was irradiated with ultraviolet rays to confirm that a single band of the expected size was obtained. The amplified DGA1 was purified by PCR purification kit (Qiagen), excluding primers. FAA3 was similarly amplified by PCR and obtained. However, 1.2 mM MgCl 2 was used, and the amplification cycle was 94 ° C. (15 seconds) / 60 ° C. (30 seconds) / 68 ° C. (120 seconds).
得られたDGA1遺伝子は、SacI、XbaI(ニッポンジーン社製)により制限酵素処理を行って、両端がSacI切断による粘着性末端及びXbaI切断による粘着性末端を作成する。ベクターとして、pL1091-5 (2μmを複製開始部位とするマルチコピーベクターで、インサート遺伝子の発現にグルコース培地で高発現のADH1プロモーターをもち、酵母での選択マーカーとしてURA3遺伝子を持ち、大腸菌での選択マーカーとしてアンピシリン耐性遺伝子をもつベクター)を用い、これらも同様にSacI、XbaIで切断した。
インサート、ベクターともにPCR purification kitにより、制限酵素で切断された低分子のオリゴヌクレオチドを除いた後、ライゲーションによりインサート遺伝子をベクターに組み込んだ。ライゲーションは、ベクター:インサート比が1/1〜1/10程度になるように混合し、Ligation high (Toyobo社製)を用いて16℃で1時間-3時間反応させて行った。
ライゲーションしたベクターの大腸菌への形質転換は、大腸菌JM109株コンピテントセル(ECOS、ニッポンジーン社製)を用いて行った。ライゲーション反応液をコンピテントセルに加え、氷中で5分間インキュベートした後、42℃45秒の熱ショックを加え、アンピシリンを含むLB寒天培地にまいて、37℃で1晩培養後のアンピシリン耐性のコロニーの有無を確認した。アンピシリンを含む培地で生育したコロニーは、アンピシリン耐性遺伝子のあるベクターで形質転換した大腸菌と考えられる。
得られたコロニーのうち、インサート遺伝子のはいったベクターを検出するために、コロニーPCRを行った。このPCRのプライマー(pVT100L-5’及びpVT100L-3’)は、ADH1プロモーターとターミネーターの配列から設計し(表1)、ADH1プロモーターとターミネーターの間のマルチクローニングサイトへのインサート遺伝子の挿入を、そのサイズに相当するバンドの増幅によって確認できる。この時のPCR溶液は、1 unit Ex Taq (Takara社製)、0.2 mM dNTP mixture、0.5μM プライマーを添付の緩衝液に懸濁したものに、コロニーを突き刺した竹串の先端をすすいで調製した(全反応液20μl)。増幅は、95℃で1分間反応させた後、95℃(30秒間)/48℃(30秒間)/72℃(2分間)を1サイクルとして25回くり返すことで行った。
インサート遺伝子のはいったベクターで形質転換されていた大腸菌は、シングルコロニーにした後、アンピシリンを添加したLB培地中で37℃で一晩培養した。得られた大腸菌に含まれるベクターを、プラスミド抽出キット(QIAprep Spin Miniprep Kit, キアゲン社製)を用いて精製した。精製したベクターは、各種の制限酵素によって処理を行い、目的のインサート遺伝子が正しい方向に挿入されていることを確認した。また、得られたプラスミドにDGA1遺伝子配列が正しく組み込まれてことは、インサート領域のDNA配列を決定して確認した。配列決定には、Thermo Sequenase Cy5.5 dye terminator cycle sequencing kit(ベリタス社製)を用いて蛍光ラベルを行い、Long-Read Tower DNAシークエンサー(ベリタス社製)を使用して塩基配列を決定した。
The obtained DGA1 gene is subjected to restriction enzyme treatment with SacI and XbaI (manufactured by Nippon Gene Co., Ltd.) to create a sticky end by SacI cleavage and a sticky end by XbaI cleavage at both ends. As a vector, pL1091-5 (multi-copy vector with 2 μm as the replication initiation site, which has an ADH1 promoter highly expressed in glucose medium for expression of the insert gene, has the URA3 gene as a selection marker in yeast, and is selected in E. coli. These vectors were similarly cleaved with SacI and XbaI.
Both the insert and vector were removed by PCR purification kit to remove low-molecular oligonucleotides cleaved with restriction enzymes, and the insert gene was incorporated into the vector by ligation. Ligation was carried out by mixing at a vector: insert ratio of about 1/1 to 1/10 and reacting at 16 ° C. for 1 hour to 3 hours using Ligation high (manufactured by Toyobo).
Transformation of the ligated vector into E. coli was performed using E. coli JM109 strain competent cells (ECOS, Nippon Gene). Ligation reaction solution was added to competent cells, incubated for 5 minutes in ice, then heat shocked at 42 ° C for 45 seconds, spread on LB agar medium containing ampicillin and cultured at 37 ° C overnight for resistance to ampicillin resistance. The presence or absence of colonies was confirmed. A colony grown in a medium containing ampicillin is considered to be Escherichia coli transformed with a vector having an ampicillin resistance gene.
Among the obtained colonies, colony PCR was performed in order to detect a vector containing the insert gene. Primers for this PCR (pVT100L-5 ′ and pVT100L-3 ′) were designed from the sequences of the ADH1 promoter and terminator (Table 1), and the insertion of the insert gene into the multicloning site between the ADH1 promoter and terminator was performed. This can be confirmed by amplification of the band corresponding to the size. The PCR solution at this time was prepared by rinsing the tip of a bamboo skewer with a colony pierced in 1 unit Ex Taq (Takara), 0.2 mM dNTP mixture, and 0.5 μM primer suspended in the attached buffer. (20 μl of total reaction solution). Amplification was performed by reacting at 95 ° C. for 1 minute, and then repeating 25 times with 95 ° C. (30 seconds) / 48 ° C. (30 seconds) / 72 ° C. (2 minutes) as one cycle.
E. coli transformed with the vector containing the insert gene was transformed into a single colony and then cultured overnight at 37 ° C. in LB medium supplemented with ampicillin. The vector contained in the obtained Escherichia coli was purified using a plasmid extraction kit (QIAprep Spin Miniprep Kit, manufactured by Qiagen). The purified vector was treated with various restriction enzymes to confirm that the target insert gene was inserted in the correct direction. In addition, the correct integration of the DGA1 gene sequence into the obtained plasmid was confirmed by determining the DNA sequence of the insert region. For sequencing, fluorescent labeling was performed using a Thermo Sequenase Cy5.5 dye terminator cycle sequencing kit (manufactured by Veritas), and a nucleotide sequence was determined using a Long-Read Tower DNA sequencer (manufactured by Veritas).
DGA1遺伝子が挿入されたベクター(pL1091-5/DGA1)を用いて、サッカロミセス・セレビシェBY4741野生株及びΔsnf2株を形質転換した。その際、同時に脂質含量を高める作用のあるLEU2遺伝子(特願2006-31705)も加えて形質転換を行った。具体的には、pL1091-5の選択マーカーのURA3遺伝子をLEU2遺伝子に変化させたベクターであるpL1177-2を用いた。また、同様に、脂質含量を高める作用が見出されているFAA3遺伝子(アシルCoA合成酵素遺伝子の1種)(特願2006-31705)を挿入したベクター(pL1177-2/FAA3)もpL1177-2の代わりに形質転換に用いた。コントロールとして、DGA1遺伝子を含まないpL1091-5を用いた組み合わせも用いた。形質転換は、酵母形質転換キット(S.c. EasyComp Transformation Kit, インビトロジェン社製)を用いて行った。マーカー遺伝子により合成が可能になる栄養素(ウラシル及びロイシン)を含まないSD寒天培地(20 g/l グルコース、6.7 g/l yeast nitrogen base w/o amino acids、20 mg/lヒスチジン、20 mg/lメチオニン、20 g/l 寒天を加えた培地)で増殖してくるコロニーを取得し、シングルコロニーを形質転換株として用いた。
得られた形質転換株は、液体培地中で30℃、120rpmのロータリーシェーカーで培養した。培地は、SD窒素源欠乏培地(NLSD)(20 g/l グルコース、1.7 g/l yeast nitrogen base w/o amino acids and ammonium sulfate、1 g/l ammonium sulfate、20 mg/lヒスチジン、20 mg/lメチオニンを含む培地)を用いた。培養は、4日間、7日間行った。
培養後、菌体を遠心分離(3000rpm, 5分)によって沈降させ、4℃で菌体破砕用緩衝液(10 mM Tris-HCl (pH 7.4), 0.25M ショ糖, 0.15 M KCl, 1 mM EDTA)にて洗浄して遠心分離を行った後、菌体を破砕した。菌体の破砕は、ブラウン社製のMSKホモジナイザーを用い、ガラスビーズ(直径0.45-0.5 mm)を加えて炭酸ガスで冷却しながら30秒間運転して行った。菌体破砕後の溶液を遠心分離(3000rpm, 5分)し、その上清をホモジネート液として取得した。
The Saccharomyces cerevisiae BY4741 wild strain and Δsnf2 strain were transformed with the vector into which the DGA1 gene was inserted (pL1091-5 / DGA1). At that time, the LEU2 gene (Japanese Patent Application No. 2006-31705) having an action of increasing the lipid content was also added for transformation. Specifically, pL1177-2, a vector in which the URA3 gene, which is a selection marker for pL1091-5, was changed to the LEU2 gene was used. Similarly, the vector (pL1177-2 / FAA3) into which the FAA3 gene (one of the acyl CoA synthase genes) (Japanese Patent Application No. 2006-31705), which has been found to increase lipid content, has been inserted is also pL1177-2 Used for transformation instead of. As a control, a combination using pL1091-5 not containing the DGA1 gene was also used. Transformation was performed using a yeast transformation kit (Sc EasyComp Transformation Kit, manufactured by Invitrogen). SD agar medium (20 g / l glucose, 6.7 g / l yeast nitrogen base w / o amino acids, 20 mg / l histidine, 20 mg / l) without nutrients (uracil and leucine) that can be synthesized by the marker gene Colonies growing on a medium supplemented with methionine and 20 g / l agar) were obtained, and single colonies were used as transformants.
The obtained transformant was cultured in a liquid medium on a rotary shaker at 30 ° C. and 120 rpm. Medium is SD nitrogen source deficient medium (NLSD) (20 g / l glucose, 1.7 g / l yeast nitrogen base w / o amino acids and ammonium sulfate, 1 g / l ammonium sulfate, 20 mg / l histidine, 20 mg / l l Medium containing methionine) was used. The culture was performed for 4 days and 7 days.
After incubation, the cells are sedimented by centrifugation (3000 rpm, 5 minutes), and the cells are disrupted at 4 ° C. (10 mM Tris-HCl (pH 7.4), 0.25 M sucrose, 0.15 M KCl, 1 mM EDTA). ) And centrifugation, and then the cells were crushed. The cells were crushed by using an MSK homogenizer manufactured by Brown Co., Ltd., adding glass beads (diameter 0.45-0.5 mm) and cooling with carbon dioxide gas for 30 seconds. The solution after disrupting the cells was centrifuged (3000 rpm, 5 minutes), and the supernatant was obtained as a homogenate solution.
ホモジネート中のDGAT活性は、既に報告された方法に基づいて行った(Kamisaka, Y. et al. Lipids, 28, 583-587 (1993))。反応液として、10 mM リン酸緩衝液(pH 7.0), 0.15 M KCl, 3.4 μM (0.2 μCi/ml) [1-14C]oleoyl-CoA, 1 mM 1,2-diolein, 0.1% Triton X-100に適当量のホモジネートを加えて、液量を100 μlとし、30℃で5分間反応させた。反応後は、3 mlクロロホルム/メタノール(1:2)を加え、室温で1時間程度放置して脂質を抽出させた。その後、1 ml クロロホルムと1 ml 水を加えて、二相分配を行わせ、下層のクロロホルム層を分取して窒素ガスで濃縮した。この脂質抽出液をシリカゲル60TLCプレート(メルク社製)にアプライし、ヘキサン/ジエチルエーテル/酢酸(80:40:1)を展開溶媒として脂質の分離を行った。DGAT活性によって[1-14C]oleoyl-CoAが1,2-dioleoinに転移して合成される14C-trioleinのスポットをかきとって、シンチレーションカクテルを加え、シンチレーションカウンター(アロカ社製)にて放射活性を測定し、酵素活性を算出した。
その結果、表2のようにΔsnf2株にDGA1遺伝子を過剰発現することによって、野生株にDGA1遺伝子を過剰発現する場合の500〜700倍程度のDGAT活性の増加が見られた。この増加は、Δsnf2株にDGA1遺伝子を過剰発現することによる脂質含量の増加から予想されるよりもはるかに顕著なものであった。このDGAT活性の増加は、培養4日目、7日目のホモジネートでも大きな相違はなく、また形質転換に用いるベクターをpL1177-2の代わりにpL1177-2/FAA3にしても大きな相違はなかった。また、Δsnf2株をDGA1遺伝子を含まないコントロールベクターのみで形質転換した場合にも、形質転換しない場合に比べて若干のDGAT活性の増加はみられたが、この時の活性と比較しても、DGA1遺伝子の過剰発現によって200倍以上の活性の増加が見られた。また、検出されたDGAT活性は、ホモジネートを-80℃に保存しておくことによって、少なくとも6ヶ月間は大きな活性の低下がなく、また少なくとも3−4回の凍結融解によっては大きな活性の低下がないことから、非常に安定なものと考えられた。
以上の結果より、Δsnf2株にDGA1遺伝子を過剰発現することによって、その遺伝子産物であるDGAT活性が顕著に増加した菌株破砕液(ホモジネート)を得ることができた。
As a result, as shown in Table 2, by overexpressing the DGA1 gene in the Δsnf2 strain, an increase in the DGAT activity of about 500 to 700 times when the DGA1 gene was overexpressed in the wild strain was observed. This increase was much more pronounced than expected from the increase in lipid content by overexpressing the DGA1 gene in the Δsnf2 strain. This increase in DGAT activity was not significantly different between the homogenates on the 4th and 7th days of culture, and there was no significant difference when the vector used for transformation was pL1177-2 / FAA3 instead of pL1177-2. In addition, even when the Δsnf2 strain was transformed only with the control vector not containing the DGA1 gene, a slight increase in DGAT activity was observed compared to the case where no transformation was performed. An over 200-fold increase in activity was observed due to overexpression of the DGA1 gene. In addition, the detected DGAT activity does not significantly decrease the activity for at least 6 months by storing the homogenate at −80 ° C., and does not significantly decrease the activity by at least 3-4 freeze-thaw cycles. Because it was not, it was considered very stable.
From the above results, it was possible to obtain a strain disruption solution (homogenate) in which the DGAT activity as the gene product was remarkably increased by overexpressing the DGA1 gene in the Δsnf2 strain.
[実施例2]
タグペプチド付きで発現された酵素活性の高い組換えDGATの取得
DGA1遺伝子産物にタグペプチドを付与して、出芽酵母サッカロミセス・セレビシェのSNF2遺伝子破壊株に発現させた時に、高いDGAT活性を保持しているかどうかを検討した。蛋白質にタグペプチドが付与されていれば、タグペプチドを特異的に認識するカラムなどを用いて、容易にタグペプチド付与蛋白質を精製することができる。
本実験では、タグペプチドとして一般的なヒスチジンタグ(6xHis)を付与することとし、6xHisを有するベクターであるpYES2/NTC(インビトロジェン社製)に、DGA1遺伝子を組み込んでN末端側に6xHisが存在するような蛋白質を発現するDNAコンストラクトをクローニングした。この場合のDGA1遺伝子も出芽酵母のゲノムDNAよりPCRにより増幅して取得したが、実施例1の場合と異なり、DGA1p ORFの最初のメチオニンから始まるようなコンストラクトを作成する必要から(DGA1遺伝子の開始コドンのすぐ前にストップコドンがあり、実施例1のプライマーを用いたPCR産物では6xHisに続いてDGA1pが翻訳されない。)、別の組み合わせのプライマー(DGA1-3, DGA1-2)を用いた(表1)。これらのプライマーは、それぞれEcoRI認識部位とXbaI認識部位を有しており、このプライマーで増幅されたコンストラクトのDGA1遺伝子より3’末端側にEcoRI認識部位を含むため、このコンストラクトをEcoRIで処理すると両端にEcoRI切断による粘着性末端が作成された。
ベクターであるpYES2/NTCもEcoRIで処理して、両端にEcoRI切断による粘着性末端が作成し、アルカリフォスファターゼ(TSAP、プロメガ社製)で脱リン酸し、PCR purification kitにより、制限酵素で切断された低分子のオリゴヌクレオチドを除いた後、ライゲーションによりインサート遺伝子をベクターに組み込んだ。ライゲーションは、ベクター:インサート比が1/1〜1/10程度になるように混合し、Ligation high (Toyobo社製)を用いて16℃で1時間-3時間反応させて行った。ライゲーション後、実施例1で述べたような方法で大腸菌を形質転換し、6xHis付き DGA1を含むベクターをクローニングした。この場合には、DGA1の挿入の仕方は2通りあるが、6xHisにDGA1の5’領域が続くように挿入したベクターを制限酵素処理によって確認して取得した。また、この領域は塩基配列を決定して蛋白質への翻訳の読み枠が予定通りであることは確認した。
取得した6xHis付き DGA1を含むベクターは、HindIIIとNotIで酵素処理し、6xHis付き
DGA1の領域を切り出し、HindIIIとNotIで酵素処理したpL1091-5とライゲーションを行い、大腸菌を形質転換して、pL1091-5に6xHis付き DGA1が挿入されたベクターをクローニングした。精製したベクターは、各種の制限酵素によって処理を行い、6xHis付き DGA1が正しく挿入されていることを確認した。
6xHis付き DGA1が挿入されたベクター(pL1091-5/DGA1(6xHis))を用いた、サッカロミセス・セレビシェBY4741野生株及びΔsnf2株の形質転換は、実施例1でのpL1091-5/DGA1による形質転換と同様に行った。得られた形質転換株の培養、菌体の破砕、ホモジネートのDGAT活性の測定も実施例1と同様に行った。その結果、6xHis付き DGA1の過剰発現でも、6xHisがないDGA1の過剰発現の場合と同様に、野生株でのDGAT活性は低く、Δsnf2株でのDGAT活性は顕著に高いことが見い出された(表3)。ただし、培養4日目のホモジネートの活性は、6xHisがない場合より30-40%程度増加しているのに対し、培養7日目のホモジネートの活性は、6xHisがない場合の50-60%程度に減少した。6xHisが付与されたことによって、細胞内での代謝速度などが若干変化したものと思われるが、詳細は不明である。しかし、若干の活性の変動はあるが、6xHisの付与に関わらず、Δsnf2株にDGA1遺伝子を発現すれば、顕著に高いDGAT活性が検出されることが確認できた。
Obtaining recombinant DGAT with high enzymatic activity expressed with tag peptide
It was examined whether or not a high DGAT activity was retained when a tag peptide was added to the DGA1 gene product and expressed in the SNF2 gene disrupted strain of Saccharomyces cerevisiae. If a tag peptide is attached to the protein, the tag peptide-attached protein can be easily purified using a column that specifically recognizes the tag peptide.
In this experiment, a general histidine tag (6xHis) is added as a tag peptide, and the 6xHis vector pYES2 / NTC (manufactured by Invitrogen) incorporates the DGA1 gene and 6xHis is present on the N-terminal side. A DNA construct expressing such a protein was cloned. The DGA1 gene in this case was also obtained by amplification from the genomic DNA of Saccharomyces cerevisiae by PCR. However, unlike the case of Example 1, it is necessary to construct a construct starting from the first methionine of the DGA1p ORF (start of DGA1 gene There is a stop codon immediately before the codon, and in the PCR product using the primer of Example 1, DGA1p is not translated following 6xHis.), Another combination of primers (DGA1-3, DGA1-2) was used ( Table 1). Each of these primers has an EcoRI recognition site and an XbaI recognition site, and since the construct amplified with this primer contains an EcoRI recognition site at the 3 ′ end from the DGA1 gene, both ends are treated with EcoRI. A sticky end was created by EcoRI cutting.
The vector pYES2 / NTC is also treated with EcoRI to create sticky ends by EcoRI cleavage at both ends, dephosphorylated with alkaline phosphatase (TSAP, Promega), and cleaved with restriction enzymes using PCR purification kit After removing the small oligonucleotide, the insert gene was incorporated into the vector by ligation. Ligation was carried out by mixing at a vector: insert ratio of about 1/1 to 1/10 and reacting at 16 ° C. for 1 hour to 3 hours using Ligation high (manufactured by Toyobo). After ligation, E. coli was transformed by the method described in Example 1, and a vector containing 6xHis-attached DGA1 was cloned. In this case, there are two ways of inserting DGA1, but the vector inserted so that the 5 ′ region of DGA1 follows 6 × His was confirmed by restriction enzyme treatment and obtained. In addition, the nucleotide sequence of this region was determined, and it was confirmed that the reading frame for translation into protein was as planned.
The obtained vector containing DGA1 with 6xHis is enzyme-treated with HindIII and NotI and with 6xHis.
The region of DGA1 was excised, ligated with pL1091-5 enzyme-treated with HindIII and NotI, E. coli was transformed, and a vector in which DGA1 with 6xHis was inserted into pL1091-5 was cloned. The purified vector was treated with various restriction enzymes to confirm that DGA1 with 6xHis was correctly inserted.
Transformation of Saccharomyces cerevisiae BY4741 wild strain and Δsnf2 strain using a vector in which DGA1 with 6xHis was inserted (pL1091-5 / DGA1 (6xHis)) The same was done. The obtained transformed strain was cultured, the cells were disrupted, and the DGAT activity of the homogenate was measured in the same manner as in Example 1. As a result, it was found that even in the case of overexpression of DGA1 with 6xHis, the DGAT activity in the wild strain was low and the DGAT activity in the Δsnf2 strain was remarkably high as in the case of overexpression of DGA1 without 6xHis (Table). 3). However, the homogenate activity on the 4th day of culture is about 30-40% higher than that without 6xHis, whereas the homogenate activity on the 7th day of culture is about 50-60% without 6xHis. Decreased. The addition of 6xHis seems to have slightly changed the metabolic rate in cells, but the details are unknown. However, although there was a slight change in activity, it was confirmed that a significantly high DGAT activity was detected when the DGA1 gene was expressed in the Δsnf2 strain, regardless of the application of 6xHis.
次に、6xHis付き DGA1を過剰発現した時の蛋白質としての発現量を、6xHisに対する抗体を用いて検討した。6xHis付き DGA1を過剰発現した野生株、Δsnf2株のホモジネートを、12.5% SDSポリアクリルアミドゲル電気泳動(PAGE)にアプライし、200Vで40分程度泳動した。泳動後、ゲルをPVDF膜(Hybond-P, GEヘルスケア社製)にブロッティングし、10%スキンミルクで膜をブロッキングした後、マウス抗6xHis抗体(GEヘルスケア社製、1:2000希釈)を加えて1時間インキュベーションした。インキュベーション後、膜を3回洗浄し、ぺルオキシダーゼ標識ヒツジ抗マウス抗体(GEヘルスケア社製、1:2000希釈)で1時間インキュベーションした。インキュベーション後、膜を3回洗浄し、化学発光検出試薬(ECL、GEヘルスケア社製)を加えて、6xHis付与DGA1pに相当するバンドで生じた化学発光をイメージアナライザー(LAS1000plus、富士フィルム社製)で検出した。
その結果、野生株に発現した場合とΔsnf2株に発現した場合とで、細胞の全蛋白質あたりに発現されるDGA1蛋白質の量(50kDa付近のバンド)は基本的には同程度であることが見い出された(図1)。実際に、各バンドを定量してみると、Δsnf2株をpL1091-5/DGA1(6xHis) pL1177-2で形質転換した株の4日目のホモジネートが他の50%程度の量であるのと、Δsnf2株をpL1091-5/DGA1(6xHis) pL1177-2/FAA3で形質転換した株の7日目のホモジネートが他の2倍程度の量であるのを除けば、ほぼ同じであった。すなわち、野生株とΔsnf2株でのDGAT活性の100倍以上の相違は、蛋白質の発現量の2倍前後の相違では説明できない。明らかに得られた組換えDGAT自体の性質に基づくものであり、きわめて高い酵素活性を有する新規な組換えDGATが提供された可能性が高いものである。なお、細胞の全蛋白質あたりのDGA1蛋白質の量は野生株とΔsnf2株で上記のように同程度であるが、Δsnf2株では野生株に比べて増殖も高く、含まれる全蛋白質量も多いことから、同じ培養液あたりでのDGA1蛋白質の量は、DGA1を発現したΔsnf2株のほうが、DGA1を発現した野生株よりも数倍程度高かった。
Next, the expression level as a protein when DGA1 with 6xHis was overexpressed was examined using an antibody against 6xHis. A homogenate of wild strain and Δsnf2 strain overexpressing DGA1 with 6xHis was applied to 12.5% SDS polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) and electrophoresed at 200 V for about 40 minutes. After electrophoresis, the gel was blotted on PVDF membrane (Hybond-P, manufactured by GE Healthcare). After blocking the membrane with 10% skin milk, mouse anti-6xHis antibody (GE Healthcare, diluted 1: 2000) was used. In addition, it was incubated for 1 hour. After incubation, the membrane was washed three times and incubated with peroxidase-labeled sheep anti-mouse antibody (GE Healthcare, 1: 2000 dilution) for 1 hour. After incubation, the membrane was washed 3 times, chemiluminescence detection reagent (ECL, manufactured by GE Healthcare) was added, and chemiluminescence generated in the band corresponding to 6xHis-added DGA1p was image analyzer (LAS1000plus, manufactured by Fuji Film). Detected with.
As a result, it was found that the amount of DGA1 protein expressed per cell total protein (band near 50 kDa) was basically the same when expressed in the wild strain and when expressed in the Δsnf2 strain. (FIG. 1). Actually, when each band was quantified, the amount of the homogenate on the 4th day of the strain obtained by transforming the Δsnf2 strain with pL1091-5 / DGA1 (6xHis) pL1177-2 was about 50%. Except that the Δsnf2 strain was transformed with pL1091-5 / DGA1 (6xHis) pL1177-2 / FAA3, the amount of homogenate on the 7th day was almost the same as that of the other, except that it was about twice the amount. That is, a difference of 100 times or more of the DGAT activity between the wild strain and the Δsnf2 strain cannot be explained by a difference of about twice the protein expression level. It is apparently based on the properties of the recombinant DGAT itself obtained, and it is highly likely that a novel recombinant DGAT having extremely high enzyme activity was provided. The amount of DGA1 protein per total protein in the cells is similar to that in the wild strain and Δsnf2 strain as described above, but the Δsnf2 strain has higher growth than the wild strain, and the amount of total protein contained is also large. The amount of DGA1 protein per culture medium was several times higher in the Δsnf2 strain expressing DGA1 than in the wild strain expressing DGA1.
一方、分子量から予想される50kDa以外にもいくつかマイナーなバンドが認められたが、それらの出現パターンは野生株とΔsnf2株で異なっていた。例えば、野生株では20kDa付近のバンドが共通して検出されたが、Δsnf2株では認められなかった。逆に、Δsnf2株の4日目のホモジネートでは、25kDa付近に複数のバンドが検出されたが、野生株では認められなかった。このようなマイナーなバンドの存在が、酵素活性の顕著な相違に影響を与えている可能性も否定できないので、以下、以上の結果をもとに本願のきわめて高いDGAT活性の原因について考察する。
まず、最も高い可能性は、上述のごとくΔsnf2株で発現されたDGAT蛋白質の翻訳後修飾の程度が変化した可能性である。リン酸化、糖鎖付加、脂肪酸付加などの修飾によって、酵素活性が変化することもよく知られているので、このような特定の翻訳後修飾をうけた(あるいは修飾が解除された)蛋白質分子種であり、そのことで酵素活性が顕著に高まったと考えられる。その場合は、得られた発現産物は、天然のDGAT蛋白質とはアミノ酸配列は同一であっても当該アミノ酸配列の鎖を修飾する基が異なっているので、化学物質としては従来のものとは別異の物質であり、きわめて高い酵素活性を有する新規蛋白質を提供したことになる。
他の可能性としては、発現される蛋白質については修飾も含めて野生株とΔsnf2株で変化はなく蛋白質としては同一であるが、SNF2遺伝子を破壊したΔsnf2株内の環境下では、活性化因子が増加した、あるいは阻害因子が減少したという可能性が考えられる。上記図1によると、野生株で発現させた場合と、SNF2破壊株で発現させた場合とでは、マイナーバンドの位置が若干異なっているので、これらバンドが活性化作用または阻害作用を有するDGAT遺伝子産物の分解物やその再結合物に相当する可能性が考えられる。後者の場合は、上記図1で野生型には存在し、本願のDGAT蛋白質から消失したバンドが強力な阻害因子であり、従来当該阻害因子も含めてDGAT蛋白質と認識されていたのに対し、本発明ではその阻害因子の産生が抑えられた結果、本来のDGAT蛋白質の活性を示したという可能性である。しかし、従来膜表面などで確認された天然DGATの酵素活性が概ね低レベルであったこと、または安定して高活性を呈した例がないことからみて、天然DGATの発現環境でも同様なもしくは別異の阻害因子が存在していたことになるので、本発明でこれら阻害因子の産生が抑えられた結果、高活性組換えDGATが得られたのであれば、結局、従来阻害因子も含めて「DGAT」として認識されていた低活性の蛋白質とは、別異の「DGAT」蛋白質を提供できたことになり、新規蛋白質を提供したということができる。
なお、最後の可能性として、上記図1でΔsnf2株で新たに出現した25kDaのバンドが、組換えDGATの強力な活性化因子であったという可能性を考えることができる。しかしながら、図1によれば、この25kDaのバンドは、4日培養株で強く発現しており、7日培養株ではほとんど存在していない。そうであるにもかかわらず、4日培養株であっても7日培養株であっても、その組換えDGATの酵素活性の高さはほとんど変わらない。そうしてみると、当該25kDaのバンドが強力な活性化因子であるという可能性はないといえる。
したがって、いずれにしても、本願発明は、高い酵素活性を有する新規な組換えDGATを提供したものであり、同時に、発現産物として組換えDGATを含む培養液、微生物菌体ホモジネート,などのきわめて高い酵素活性を有する新規な蛋白質組成物を提供したものでもある。そして、精製したDGAT蛋白質組成物はもちろんのこと、微生物菌体ホモジネート又は培養液の状態であっても、安定して高い活性を有していることから、直接DGAT活性の阻害物質もしくは活性化物質のスクリーニング方法に用いることができる。
On the other hand, some minor bands other than 50 kDa predicted from the molecular weight were observed, but their appearance patterns were different between the wild strain and the Δsnf2 strain. For example, a band around 20 kDa was commonly detected in the wild strain, but not in the Δsnf2 strain. Conversely, in the homogenate on day 4 of the Δsnf2 strain, multiple bands were detected around 25 kDa, but not in the wild strain. Since it is impossible to deny the possibility that the presence of such a minor band affects a remarkable difference in enzyme activity, the cause of the extremely high DGAT activity of the present application will be discussed below based on the above results.
First, the highest possibility is that the degree of post-translational modification of the DGAT protein expressed in the Δsnf2 strain as described above may have changed. It is also well known that enzyme activity changes due to modifications such as phosphorylation, sugar chain addition, and fatty acid addition, so protein molecular species that have undergone such specific post-translational modification (or the modification has been released) Therefore, it is considered that the enzyme activity was remarkably increased. In that case, the obtained expression product is different from the conventional DGAT protein as a chemical substance because it has the same amino acid sequence but a different group that modifies the chain of the amino acid sequence. This is a new substance that is a different substance and has extremely high enzyme activity.
Another possibility is that the expressed protein, including modifications, is the same in the wild strain and the Δsnf2 strain and is the same as the protein, but in the environment within the Δsnf2 strain in which the SNF2 gene is disrupted, the activator It is possible that the increase in the number of inhibitors or the decrease in inhibitory factors. According to FIG. 1 above, since the position of the minor band is slightly different between the case where it is expressed in the wild strain and the case where it is expressed in the SNF2-disrupted strain, these DGAT genes have an activation or inhibitory action. There is a possibility that it corresponds to a decomposition product of the product and its recombination product. In the latter case, the band that is present in the wild type in FIG. 1 and disappears from the DGAT protein of the present application is a strong inhibitor, whereas it was conventionally recognized as a DGAT protein including the inhibitor. In the present invention, as a result of suppressing the production of the inhibitor, it is possible that the activity of the original DGAT protein was exhibited. However, in view of the fact that the enzyme activity of natural DGAT, which has been confirmed on the membrane surface in the past, has been generally at a low level, or there is no example of stable and high activity, the same or different in the expression environment of natural DGAT. Since different inhibitory factors were present, if high-activity recombinant DGAT was obtained as a result of suppressing the production of these inhibitory factors in the present invention, eventually, including the conventional inhibitory factors, This means that a protein “DGAT” different from the low activity protein recognized as “DGAT” could be provided, and a new protein was provided.
As a final possibility, the possibility that the 25 kDa band newly appeared in the Δsnf2 strain in FIG. 1 was a strong activator of recombinant DGAT can be considered. However, according to FIG. 1, this 25 kDa band is strongly expressed in the 4-day culture and hardly exists in the 7-day culture. Nevertheless, the level of the enzyme activity of the recombinant DGAT is almost the same regardless of whether it is a 4-day culture strain or a 7-day culture strain. Then, it can be said that there is no possibility that the 25 kDa band is a strong activator.
Therefore, in any case, the present invention provides a novel recombinant DGAT having high enzyme activity, and at the same time, a culture solution containing recombinant DGAT as an expression product, a microbial cell homogenate, etc. are extremely high. The present invention also provides a novel protein composition having enzyme activity. And since it has stable and high activity even in the state of microbial cell homogenate or culture solution as well as the purified DGAT protein composition, it is an inhibitor or activator of direct DGAT activity. The screening method can be used.
[実施例3]
酵素活性の高い組換えDGATを用いたDGAT活性を阻害する化合物のスクリーニング
実施例1で取得した酵素活性の高い組換えDGATを含むホモジネートを用いて、活性を阻害する化合物のスクリーニング系を構築した。ホモジネートとしては、Δsnf2株をpL1091-5/DGA1と pL1177-2で形質転換した株を7日間培養した時のものを用い、実施例1で示したような[1-14C]oleoyl-CoAを用いた測定法でDGATの活性を測定した。化合物としては、スパイスに含まれるもので脂質蓄積性のリポミセス酵母の脂質蓄積とリピッドボディ形成を阻害することが見い出されたオイゲノールとピペリン(Kimura et al J. Agric. Food Chem. 54, 3529 (2006))を用いた。その結果、オイゲノールとピペリンともにホモジネートのDGAT活性を阻害することが見い出され(表4)、本発明で調製された酵素活性の高い組換えDGATを用いてDGAT活性を阻害する化合物がスクリーニングできることが確認された。
Screening of compounds that inhibit DGAT activity using recombinant DGAT with high enzyme activity Using the homogenate containing recombinant DGAT with high enzyme activity obtained in Example 1, a screening system for compounds that inhibit activity was constructed. The homogenate using those when cultured strains were transformed Δsnf2 shares pL1091-5 / DGA1 and PL1177-2 7 days, the [1- 14 C] oleoyl-CoA as described in Example 1 The activity of DGAT was measured by the measurement method used. As compounds, eugenol and piperine (Kimura et al J. Agric. Food Chem. 54, 3529 (2006), which were found in spices and found to inhibit lipid accumulation and lipid body formation in lipid-accumulating lipomyces yeasts. )) Was used. As a result, both eugenol and piperine were found to inhibit DGAT activity of homogenate (Table 4), and it was confirmed that a compound that inhibits DGAT activity can be screened using recombinant DGAT having high enzyme activity prepared in the present invention. It was done.
DGATは、主要な貯蔵脂質であるトリアシルグリセロールの主要な合成酵素であり、貯蔵脂質の蓄積が肥満や糖尿病などの疾患の病因の1つであることを勘案すると、DGATの阻害剤は、これらの疾患に対する創薬のためのターゲットとして有望である。本発明により使用可能になった高い酵素活性のDGAT蛋白質を用いることによって、これらの疾患の創薬となりうるDGATの阻害剤を、さまざまな生物由来のDGATを用いて迅速にスクリーニングできるようになった。 DGAT is a major synthase of triacylglycerol, which is a major storage lipid, and considering that accumulation of storage lipid is one of the etiology of diseases such as obesity and diabetes, inhibitors of DGAT are It is promising as a target for drug discovery for various diseases. By using the DGAT protein with high enzyme activity that can be used according to the present invention, it has become possible to rapidly screen for inhibitors of DGAT that can be used for the discovery of these diseases using DGAT derived from various organisms. .
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