JP4641695B2 - 新規なhev抗原性ペプチド及び方法 - Google Patents
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Description
発明の分野
本発明は、肝炎E型ウィルス(HEV)の中国菌種のゲノムからクローンを合成された免疫反応性の高いウイルスのペプチド、pE2及びヒトにおけるHEVの防御のためのワクチン構成物の使用と同様に、HEVの検出および診断用の信頼できる診断の方法の開発での利用に関する。
【0002】
発明の背景
肝炎E型ウィルス(HEV)は、腸内的に感染された肝炎(Balayan et al.,1983)の原因として1983年に最初に発見された。ウィルスゲノムの完全長は、1991年に最初にクローンされて、シークエンスの解析がなされ、一本鎖のポジティブセンスの包含されていないRNAであると判明した(Tam et al., 1991)。形態論であるが、カリチウィルス科(Bradlley et al., 1988; Huang et al., 1992; Panda et al., 1989)のメンバーに似て、それははっきりしたゲノムの構成(Berke, et al., 1997)を持っている。シークエンス分析に基づくと、7.2Kbのウィルスゲノムが三つのオープンリーディングフレーム(ORF)を含むことが予測される(図1)(Tam et al., 1991; Aye et al., 1992; Aye et al., 1993; Huang et al., 1992; reyes et al., 1993)。非構造的なウィルス性タンパク質は、ウィルスゲノムの5´末端に位置するORF1によるポリタンパク質としてエンコードされている。ORF2は、ゲノムの3´末端に位置しており、主な構造的タンパク質をエンコードしている。ORF3の5´末端は、ORF1の3´末端を伴って重複する1塩基を有し、3´末端はORF2の5´末端を伴い重複する339塩基を有する。ORF3は、その機能は未だ解明されていない別の構造的タンパク質のためにコードすると信じられている。線形の抗原エピトープは、エピトープマッピング及び組み合わせペプチド研究によってORF2及びORF3に位置している(Coursaget et al., 1993; Khudyakov et al., 1993; Khudyakov et al., 1994)。
【0003】
最近の研究は、ORF2領域の主要なHEV構造タンパク質のアミノ及びカルボキシ末端から派生する切り詰められた組み合わせペプチドが、粒子状のウィルス内でセルフアセンブルできることが示している(Li et al., 1997)。大きさがより小さければ、かかるウィルス状の粒子は、感染ウィルスのカプシドタンパク質に構造的に及び抗原的に同様である(Li et al., 1997;Xing et al., 1999)。かかる発見に基づくと、粒子状のウィルスへの組み合わせペプチドのアセンブリは、感染性ウィルス粒子の大きなカプシドへの完全長HEV構造的タンパク質のアセンブリとして同様な要求を有するかもしれない。特に、かかる発見は、構造タンパク質のみをエンコードするORF2がウィルスカプシドへのセルフアセンブルに十分であろうことを示唆している。さらに、カプシドタンパク質自身の形態において含まれる相互作用は、アミノ酸残基112内皮細胞い障害608からの完全長ORF2タンパク質のドメイン内で起こることが現れるであろう(Xing et al., 1999)。高いイソエレクトリックポイント12.35で、主要な構造的タンパク質のアミノ末端ドメインで位置する111アミノ酸シークエンスは、ウィルスゲノムのパッケージングを含んでいると信じられている(Briton and heinz, 1990)。しかしながら、かかるドメインは、ウィルスカプシド自身のアセンブリに直接的に明白に参加しない。主要な構造的タンパク質のカルボキシ末端ドメインはまた、ウィルスカプシドのアセンブリに直接的に参加しない。しかしながら、Li et al., (1997)は、かかるドメインの適切なタンパク質分解を生ずる分解がウィルス状の粒子のアセンブリに必要であることを示している。
【0004】
肝炎Eは、基本的に発展途上国で流行病及び散発的な形式で発生する。肝炎Eの数多の大きな発生は、下水に汚染された飲料水によって1950から1980年代にかけて発生した(Visvanathan, 1957; Wong et al., 1980; Myint et al., 1985; Belabbles et al., 1985; hau et al., 1999)。伝染は通常自己制限している。しかし、伝染が妊娠中に存在する場合、重大な複雑に関する報告がある(Tsega et al., 1992; Dilawari et al., 1994; Hussaini et al., 1997)。ウィルス感染に対する格闘で使用された重要な予防の1つの戦略は、公衆衛生安全性および環境保護を保証する環境上の検体でのHEVのモニタリングおよび検出である。しかしながら、ウィルス粒子を集める及び濃縮するために現在利用される従来の方法は、HEVの潜在的な源の調査及び発見を限定する、いくつかの周知の損失を持っている。現在、最も一般的な活用されている方法の二つは、吸着と遠心分離である。
【0005】
吸着方法において、ウィルスは微孔フィルターへの吸着によって最初にテストサンプルから遠心分離され、次いで、大量の溶出液によって溶出される。しかしながら、この技術は、さらに有機物の酸及びタンパク質(それらはウイルスの検出に邪魔をしてもよい)のような様々な他の溶質を有効に濃縮する。特に、多くの自然発生の無機酸及び有機的な溶質が標的ゲノムの増幅において有用な核酸ポリメラーゼを阻害する(例えば、逆転写酵素及びTaqポリメラーゼ)(Tsai et al., 1992;1993)。それらを増幅することができ、したがって、曖昧な結果の一因となる前に、テスト・サンプルの中にあるヌクレアーゼ及びプロテアーゼの可能性は、ウイルス・ゲノムを退化させるかもしれない。加えて、他の溶質が結局これらのポリメラーゼを破損することができる毒性の結果を示しているかもしれない一方、様々なタンパク質、炭水化物及び他の有機化合物は、核酸ポリメラーゼの適切な機能に必要なマグネシウム・イオンおよびヌクレオチドを拘束するかもしれない(Demeke and Adams, 1992; Imai et al., 1992; Kolk et al., 1992)。
【0006】
遠心分離方法において、テストサンプルは均一化され、次いで繰り返して遠心分離される。処理の期間、ポリエチレングルコース(PEG)が上清に添加され、次いで再度遠心分離される。最終的なペレットをバッファーにて再度懸濁される。しかしながら、最終濃縮物はまだ、細胞培養、逆転写反応、及びポリメラーゼチェーンリアクションなどの続く診断方法に影響を与える毒性物質を含有している(Beril et al., 1996)。結果として、ゲル濾過若しくはセファッデクスカラムによって解毒化作用を受けたテストサンプルから派生する濃縮物が必要である。
【0007】
ウィルス感染との格闘に使用する別の重要な戦略は、公衆衛生安全性及び保護を保証するHEVに対する免疫処置用のワクチンの利用である。しかしながら、培養細胞中のウイルスを繁殖させる際の困難さのために、実際の減じられたウィルス粒子あるいは殺されたウィルス粒子を使用して、ワクチンHEV伝染病を開発することは従来可能ではなかった。代替となる解決法として、特に、ウィルスゲノムの構造的な遺伝子から派生する、数多の組換えHEVペプチドは、HEVの収縮からの保護の提供においてより有望である(Tsarev et al., 1994a; Tsarev et al., 1997)。弱毒化ウィルスと比較して、ワクチンの形態での組換えペプチドの使用の利点は、ペプチドがより効率的に合成でき、利便的に精製できることである。さらに、結果となるワクチンがどのような生きた不活ウィルス粒子を含むことなく、そこで感染の危険性の可能性が避けられる。
【0008】
上記の見解において、以前に記述された損失を回避するだろうだけでなく生物学と環境上の検体のHEVを発見するためにより敏感な分析的なテストを提供するHEVを決定し、及びおよび分析する信頼できる方法の必要性が残る。本発明によると、HEVによる現在及び過去に伝染された患者からの血清で反応性が高いことが分かっている、肝炎Eウィルス(HEV)ゲノムのORF2のカルボキシ末端領域から派生する高い免疫反応性の組換えウィルスペプチド、pE2を採用する診断方法が提供される。さらに、そのアミノ酸シークエンスの一部が他のHEV分離株の中に高度に保存されるので、pE2ペプチドは、抗原的に肝炎Eウイルスと関係がある。ここでさらに記載され、例証されるように、pE2ペプチドの抗原的特性は、HEV感染の免疫的処置及び予防におけるワクチンとして良好な候補である。したがって、HEV感染の検出に活用する診断方法及び斬新なpE2ペプチドが利用される肝炎Eウイルス伝染を防ぐのに有効なワクチン構成がここに提供される。
【0009】
発明の概要
本発明の目的は、ホモダイマーを成形するpE2モノマーの単に露出された続く二量化である、整合の抗原決定基群の存在により肝炎Eウイルスで汚染された個体からの血清で免疫反応性が高い、肝炎Eウィルス(HEV)ペプチドを提供することである。
【0010】
本発明の別の目的は、臨床生物学のテスト・サンプル中の免疫グロブリンMおよびIgG抗体の検出によるHEVの決定する現在と過去の伝染用の方法であり、それはHEV抗体に結合するその高い特異性及び感度により免疫試薬としてpE2ダイマーを組込んでいる、改善されてより信頼性のある診断方法の提供である。
【0011】
本発明のまた別の目的は、テスト・サンプル中のHEV粒子を有効に捕らえて、分離し、濃縮することができ、従来の方法の使用と提携して欠点を回避する、pE2ダイマーに対して特に上げられる抗体の使用して、公衆衛生及び環境上の研究中のHEVをモニターし、及び検出検知するための、改善されてより信頼性のある診断方法の提供である。
【0012】
本発明のまだ別の目的は、HEV感染の免疫処置及び予防のための、pE2ダイマーからなるワクチン構成物及びその使用の提供である。
【0013】
表1に示されているように、ヌクレオチド配列相同性のパーセンテージは異なるHEV分離株の中に77%乃至100%と異なるかもしれないが、アミノ酸配列の相同性の高い率によって示されるように、これらの変更は自然界において一般に保守的である。HEVの異なる分離株の中に明らかにされるようなHEVゲノム内の保存は、(1)pE2ペプチドは、HEVの構造的タンパク質の重要な機能的ドメインであるかもしれない、(2)pE2ペプチドを組込む診断のテストは、異なる分離株のHEVの検出において有利だろう、(3)pE2ペプチドから調製されるワクチンは、異なるHEV分離株からの保護を産出するだろう、ことを意味する。
【0014】
【表1】
本発明によると、肝炎Eウィルス(HEV)ゲノムのORF2のカルボキシ末端領域から派生し、SEQ.I.D.NO:2によって識別されるアミノ酸配列からなる、免疫反応性の高いウィルスペプチド、pE2が提供される。pE2ペプチドの特別な特質は、当然ホモダイマーを成形するためにペプチドのモノマー間の共有結合でない相互作用の結果露出されるだけの、整合の抗原決定基群を所有する。さらに、高い免疫反応性の構造pE2ペプチドのクローニング及び発現は、精製及び特性付けと同様に、ここに記載される。
【0015】
本発明のHEVペプチドのpE2は、直接的にウィルスカプシドのアセンブリに参加する事前に記載されたHEVの主要な構造的タンパク質のドメインから派生される。pE2ペプチドのORF2ヌクレオチド配列のカルボキシドメインからの翻訳は、完全長タンパク質のカルボキシドメインに対応する長さの267アミノ酸残基になると予測される。同様なペプチドマッピング研究(khudyakov et al., 1993; khudyakov et al., 1994)に基づくと、ペプチドは、アミノ及びカルボキシ末端の両者において、線形エピトープを含むことがまた、予測される。しかしながら、クローンされたシークエンスにおけるフレームシフト突然変異は、213のアミノ酸残基だけのより小さなペプチドの代わりに与えるオリジナルのcDNA配列から上流に位置した新しい終止コドンで翻訳を時期尚早に終了させた(図2)。
【0016】
効果的に除去されたカルボキシドメインを有するカルボキシ末端にて切断されて示されているpE2ペプチドの特性付けは、ウィルス状の粒子のセルフアセンブリを阻害する。結果として、pE2ペプチドは、二量化によるモノマーとしてお互いに相互作用し、ホモダイマーとして自然発生する。さらに、pE2ペプチドは、、HEVの反応的な人間の血清によって、ホモダイマーがHEVカプシドタンパク質のある構造の特徴を模倣することを提案する、その二量体の形式で強く認識される。したがって、他の調査者によって報告された、他の細菌で表現されたHEVペプチドとそれを識別する役目をするpE2ペプチドの二量化によって引き起こされた整合の抗原決定基群である(Yarbough et al., 1991; Purdy et al., 1992; Li et al., 1994; Li et al., 1997)。以前に報告されたHEVペプチドの抗原活性が、第1にそれぞれの主要な構造内に含まれていた線形のエピトープの存在に起因していた一方、本発明のpE2ペプチドの抗原活性は、大部分はホモダイマーの4次構造と関係がある。このようにして、他の同様の整合の抗原決定基群ではないことが、以前にペプチドマッピングによって記述されたか若しくは予言された理由により、pE2ペプチドの抗原領域は、ORF2のアミノ末端基領域内に確定された、事前に識別された線形のエピトープとは明確に異なる。
【0017】
ここに実証され、記載されるように、抗原活性の二つの異なるタイプが、新規なpE2ペプチドによって表現される。抗原活性の第一のタイプは、現在まで記述された、他の細菌で表現されたHEVの抗原ペプチドに関連した同様の型の活性であるpE2ペプチドのモノマーの形式に関係している(Yarbough et al., 1991; Purdy et al., 1992; Liet al., 1994)。活性は、水溶液中のそれぞれのペプチドによって仮定された様々な形状に対応する二次及び三次構造によって影響を受けるかもしれないが、この種の抗原活性は、主にそれぞれのペプチドの一次構造に位置した線形のエピトープに起因する(Li et al., 1997)。しかしながら、pE2ペプチドによって示された、第二及びより顕著な抗原活性は、ペプチドの二量体の形式に関係している、そしてそれはより高度にそのモノマーの形式より免疫反応性であると発見された。実験の研究は、pE2モノマーに対して反応的な抗体のためによりもはるかに高いレベルに、HEVの反応的なヒトの血清の中にあるpE2二量体に対して反応的な抗体のレベルが頻繁に観察されたことを示す。この新型の抗原活性(それは従来記述されていない)は、大部分は、pE2ホモダイマーに固有の新しい整合の抗原決定基群に起因する。さらに、抗原活性は二量体の解離で改廃され、また、一旦モノマーがダイマーを成形するために再び連合したならば、活性が再構成される。この行動は、整合の抗原決定基群に関連した抗原活性は、ホモダイマーを成形するためにpE2モノマー間の共有結合でない相互作用によって引き起こされたpE2ペプチドの二量体の形式(すなわち四次元構造)と関係があることを例証する。
【0018】
E2DNA配列
本発明の一つの態様によると、整合のペプチドpE2をエンコードし、SEQI.D.NO:1として識別されるcDNA配列からなり、任意の相同な配列若しくはそのフラグメントである、精製された核酸分子、E2が提供される。
【0019】
核酸配列、E2は、HEVの中国菌種D11092の肝炎Eウィルス(HEV)ゲノムのORF2領域のカルボキシ末端から、元来抽出される(図2)。長さで811の塩基対を含み、位置7127乃至7129にある停止コードンを位置6326乃至7136にかける、オリジナルのクローンの配列は、PCR増幅誤差により位置6957で不注意に推測上単一の塩基対欠失を含んでいる(図2)。生じるフレームシフト突然変異は、ヌクレオチド配列の翻訳に新しい停止コードンで時期尚早に終了させた(位置6966から6968)。核酸シーケンスの後の翻訳は642の塩基対を含んで、そこからコード化された斬新なpE2ペプチドおよび斬新なE2ヌクレオチド配列(例えば、SEQ ID NO:1)の生成および発見に結びついた。したがって、図2に言及すると、斬新なE2ヌクレオチド配列スパン位置6326乃至6968であって、そこで位置6968が除去され、及び単一の塩基対欠損が、位置6957で存在する後新しい停止コドンに下流に配列のフラグメントが位置する。
【0020】
遺伝子コードの退化により、1つ以上のコドンは、SEQ ID NO:2(例えば、pE2)によって表わされる配列の所定のアミノ酸残基のためにコード化するかもしれないし、それによって、生成されるかもしれないし、さらにpE2ペプチドをコード化するSEQ ID NO:1(例えば、E2)に加えて種々様々の核酸シーケンスに帰着する。したがって、発明は、全ての、SEQ ID NO:1のための補足的な核酸シーケンスを含む可能なコドン選択に基づいた組み合わせの選択により生成することができたヌクレオチド配列の可能な変化を熟考する。これらの組み合わせは、pE2ペプチドの核酸配列に適用されるような標準の三つ組遺伝子コードに従って作られ、また、そのような変化はすべて特に示されることと見なされることになっている。
【0021】
さらに、pE2ペプチド派生物の多様性若しくは抗原等価物は例えば様々な代用、挿入、欠失若しくは拡張、を含んで、合成されるかもしれない、その最終結果は、pE2ペプチドの免疫化学の反応性を変更しない。したがって、pE2ペプチドの免疫学的に活発な派生物のためにコード化する核酸配列も、本発明の一部であることとして熟考される。かかる派生物を合成する方法は、当業者によって容易に遂行されるかもしれない(Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd ED., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Plainview, NY, 1989)。本発明と一致して、pE2ペプチド(すなわち抗原の等価物)のアミノ酸配列をコード化するどんな核酸シーケンスはpE2を表現する組換分子を生成するために使用することができる。
【0022】
pE2アミノ酸配列
本発明の別の態様によると、SEQI.D.NO:2若しくは相同配列、フラグメント若しくは上記の類似体によって表わされるアミノ酸配列を含む、整合のHEVペプチド抗原、pE2が提供される。
【0023】
完全にそのアミノ酸配列内にポリペプチドの三長さ構造を決定するための情報が伝えられることは相当に確証される。さらに、特定の整合のエピトープを確定するアミノ酸を含む配列部分は、広く、分子の長さに沿った介在配列で分散することができる。ポリペプチドの予言された三次(四次)構造に基づいて、整合のエピトープの三次元の座標は、ポリペプチドの一次構造の三次元の折畳によりそれらの正確な形状へ結局もたらされる。したがって、アミノ酸配列が、エピトープの整合の構造及び免疫化学の反応を実質上変更しないポリペプチドの構造の構成のより高いレベルに基づいたある程度の修正に従うことが期待される。したがって、様々なエピトープを確定する残基のポリペプチドを位置した群間のセグメントは、重要ではなく、これらの介在配列内の残基の拡張、欠失、挿入あるいは代用に続くエピトープの表現を変更しないかもしれない。
【0024】
さらに、特別のエピトープを確定する配列内に含まれていたアミノ酸残基の化学的性質によって、同様の官能基がある残基を備えた代用は、エピトープの免疫化学の反応を変更しないかもしれない。この点では、それが抗pE2抗体によって認識可能なままであるように、pE2ペプチドの免疫化学の反応が保存されている限り、他のアミノ酸残基によってアミノ酸配列中の様々なアミノ酸残基が派生物を生成するために削除されるかもしれないし、挿入されるかもしれないし、代用されるかもしれないことが期待される。もちろん、これは、合併した特別の変更には異なる分離株のHEVの中の緊張させる負荷変化に対処する際にのようにその使用での長所があると規定している(表1)。さらに、発明の範囲内で熟考されるアミノ酸置換は代用品残基の化学性質が、オリジナルのアミノ酸の化学性質に類似している。アミノ酸は、一般的に、Gly/Ala; Asp/Glu; Asn/Glu; Val/lle/Leu; Ser/Thr; Lys/Arg;及びPhe/Tyrのような組み合わせを含んでいる官能基に基づいて、同様の化学特性を有していると考えられる。pE2ペプチドのこれらの派生物は、したがって、もしHEV抗体へのそれらの免疫化学の反応が保存されていることがSEQI.D.NO:2によって確定されたアミノ酸配列順序の拡張、代用、挿入および欠失を含むかもしれない。pE2ペプチドに対して起こされた同じ抗体によって認識することができる場合、本発明の範囲内に2つのペプチドが等価な免疫化学の反応を持っていると言われている。
【0025】
pE2ペプチド合成
本発明のpE2ペプチドは、化学の合成方法及び組換DNA技術を含む興味のある整合のエピトープを提供する既知の方法によって合成できる。pE2ペプチドを調製する好ましい方法は、ペプチドの隔離及び精製が後続する宿主細胞中の組換えDNA発現による。本発明と一致して、ペプチドのフラグメント、融合タンパク質若しくは機能的な等価物である、pE2ペプチドをエンコードする核酸配列は、適切な宿主細胞でpE2の発現を直接行なう組換えDNA分子に使用されるであろう。pE2ペプチドの免疫反応を発現するために、pE2ペプチドをエンコードする核酸配列(例えば、SEQI.D.NO:1)若しくは上記の機能的な等価物は、転写に必要な要素及び挿入されたコード配列の翻訳を含む適切な発現ベクターに挿入される。選択された宿主細胞に依存して、発現ベクターは通常、DNA配列の発現に影響する、プロモーター、リボソーム結合部位、翻訳の開始及び停止部位、及び転写停止部位を含有するDNAの制御を含むであろう。
【0026】
したがって、本発明の別の態様によると、HEVゲノムからのcDNA配列の分離、適切な宿主細胞内で発現可能な発現ベクターへのcDNA配列の挿入、発現ベクターを伴う宿主細胞への形質転換、形質転換された宿主細胞の培養、及びpE2ペプチドの分離と精製からなる本発明のpE2ペプチドを調製する方法が提供される。
【0027】
当業者に既知である方法は、pE2をコード化している配列及び適切な転写及び翻訳制御を含んでいる発現ベクターの合成に使用できる。上述のように得られた所望のcDNA配列は、既知の標準的な技術を用いて、発現ベクターに挿入される(Sambrook et al., 1989 and Ausubel et al., 1989)。発現ベクターは、通常は、制限酵素で切断され、cDNA配列は平滑末端若しくはスタッガー末端ライゲーションを用いて挿入される。切断は、通常、発現ベクターの便利な位置における制限部位でなされ、一旦挿入されると、cDNA配列は、発現に影響するcDNAの機能的要素の制御を受ける。宿主細胞の形質転換及び培養並びに要求されるようなペプチドの分離はまた、標準的な技術を用いて実行される。
【0028】
細胞系において、発現されるペプチド若しくはタンパク質のために意図される使用に依存して多くの発現ベクターが選択されるかもしれない。例えば、大量のペプチド若しくはタンパク質が、容易に精製される融合タンパク質の高レベルの発現を導く抗体やベクターの合成に必要とされる場合は所望でありえる。本発明に関連する別の態様によると、pE2ペプチドをコード化するSEQI.D.NO:1によって識別される、核酸配列E2を含んで、核酸配列E2の発現が可能な発現ベクターが提供される。発現ベクターは、細胞系の発現において適切であり、しかし多機能のE.coliクローニング及びに制限されていないが、好ましくは、E.coli、及び発現ベクターpGEX(プロメガ社、マジソン、ウィスコンシン州)を含んでいる。この特異的なベクターにおいて、pE2をコード化する配列は5´末端で、3´末端でのグルタチオンS−トランスフェラーゼ(GST)のためのへテロな配列を伴うフレームにおけるベクターにライゲートされ、結果となるハイブリッドのポリヌクレオチド配列は、融合タンパク質として表現される。一般的には、かかる融合タンパク質は可溶性で、グルタチオン−アガロースビーズへの吸着に続いて、フリーのグルタチオンの存在下における溶出によって容易に溶解された細胞から精製できる。かかるシステムで合成されるタンパク質は、切断部位を含むように設計され、トロンビンのような適切なプロテアーゼを加えることにより、関心のあるクローンされたペプチドはGST部位から放出される。
【0029】
したがって、本発明の好ましい実施態様によると、融合タンパク質、GE2を発現し、グルタチオン−S−トランスフェラーゼ(GST)ポリペプチドに融合するSEQI.D.NO:2として識別されるHEVペプチドからなるプラスミドが提供される。SEQI.D.NO:1によって表現されるE2核酸配列は、E2核酸配列のオープンリーディングフレームが、GSTオープンリーディングフレームのフレーム内にある、pGEX20発現ベクターに挿入される。本発明のプラスミドは、811塩基対の配列を停止コドンを7127乃至7129に位置する6326乃至7136に含んでなる。しかしながら、PCR増幅のエラーによって起こる、フレームシフト突然変異である6957部位の単一塩基対の欠損は、核酸配列の翻訳を新しい停止コドン(6966乃至6968)で早々に停止し、結果として、新規なpE2ペプチドの産出となる。したがって、新規なE2配列は、6957部位の単一塩基対の欠損を伴う6326乃至6968部位まで拡張し、フラグメントは、部位6968除去後の新しい停止コドンの下流に位置する(図2)。新規なpE2ペプチドをエンコードする、クローンされたE2配列は642塩基対を有し、SEQI.D.NO:1として識別される。
【0030】
GE2タンパク質
完全なGSTポリペプチドに融合された完全なpE2ペプチドを含む分離された融合タンパク質GE2は、約92kDである。しかしながら、本発明のGE2融合タンパク質は、免疫原であり、したがって92kDよりも小さいと予測される、pE2ペプチドの小部分を含むことができる。ここに記載の融合タンパク質GE2は、pE2アミノ酸配列及びGST若しくはヘテロなタンパク質配列間に位置する切断部位を含んで合成され、トロンビンを用いるグルタチオンセファロース4Bカラムに結合して、pE2ペプチドはヘテロな部位から切断され、精製される。さらに、精製及び特性付けの目的に加えて、GE2ポリペプチドはまた、適切な宿主細胞でのpE2ペプチドの発現を導き、確認するため及びpE2ペプチドのエピトープに特異的なポリモノクローナル抗血清若しくはモノクローナル抗体の発達のために利用性がある。代わって、分離されたGE2ポリペプチドを伴う哺乳類の免疫反応によって産出されたポリモノクローナル抗血清若しくはモノクローナル抗体は、ここに記載されるように、生物学的テストサンプルでのHEV粒子の存在をアッセイするために、有用である。
【0031】
診断試薬としてのpE2
ここに提供される整合のpE2ペプチドは、診断アッセイにおいてHEV抗体の存在における生物学的テスト・サンプルをスクリーニングするために使用される免疫試薬として使用されるかもしれない、したがって、HEV伝染の検出および診断での従業者か臨床医を援助する。したがって、本発明は、pE2ペプチドを用いて生物学的テストサンプルでの抗HEV抗体を検出する免疫化学的な方法を提供する。本質的に、抗HEV抗体を検出するための捕獲抗原としてpE2を活用するように設計される任意の免疫アッセイ形態が採用される。免疫アッセイを実行する方法は当業者にとって既知であり、本発明は、任意の特定の免疫アッセイに制限するようには意図されていない。相同性及びヘテロな両者の免疫アッセイが使用される。
【0032】
一般的に、生物学的テストサンプルは、HEV抗体が接触されて、反応が起こるような状況下及び時間においてpE2ペプチドが培養されていることを含むと疑われる。好ましくは、pE2ペプチドは適切な固体支持に付されている。HEV抗体がテストサンプルに存在する場合、pE2ペプチドを伴って免疫学的複合体(抗原―抗体複合体)を形成し、固体支持に付されるであろう。意見として、ある実例において、固体支持体は、非結合物質を除去するためにバッファー溶液で洗浄され、アッセイの感度を改善するために援助するであろう。洗浄後、免疫学的複合体は指示試薬と反応し、第二の複合体が形成される時間及び状況における培養が可能となる。免疫学的複合体は、アッセイの形態に依存する、多くの既知の技術によって検出される。例えば、標識若しくはシグナルを産出する物質(例えば、酵素)を伴う抗−哺乳類免疫グロブリン複合体の接合体が、指示試薬として一般的に使用される。免疫学的複合体の存在は、テストサンプルにおけるHEVに対する抗体の存在を確認し、シグナル産出の測定によって決定される。多くの指示試薬を伴うように、抗体の存在量は、通常は、シグナルの産出に比例する。テストサンプル中の免疫複合体の存在は、可視で検出されるか、若しくは、自動化走査及び解析装置を用いて機械的に検出される。
【0033】
適切な固形支持体は、実行する免疫アッセイ形態の種類に依存するが、しかしながら、選択された支持体の種類は適切な強度を有し、免疫学的複合体の免疫反応性を干渉しないか、シグナル産出物質からの検出可能なシグナルの合成を干渉しない。固形支持体の実施例は、反応トレイのマイクロウェルの壁、テストチューブ、シート、プレート、スライド、ビーズ(例えば、ポリスチレン若しくはガラス)、ニトロセルロースストリップ、メンブラン、ラテックス粒子、ガラスのチップ、プラスチック及びその他のような微細粒子を含んでいる。
【0034】
免疫学的複合体の形態を検出するための手段として使用される標識若しくはシグナル産出物質は、沈澱物の可視検出、若しくは色の変化、顕微鏡による可視検出、若しくは分光光度計、放射線測定若しくはその他同様による自動化検出を可能にする。シグナル産出物質の実施例は、コロイド状の金、蛍光物質、発光物質、クロマゲン、放射活性要素、酵素(例えば、アルカリフォスファターゼ、ホースラディッシュペルオキシターゼ、及びベータ−ガラクトシダーゼ)及び増幅物質(例えば、ビオチン、抗−ビオチン及びアビジン)を含んでいる。
【0035】
したがって、本発明の別の態様によると、下記の段階からなる生物学的テストサンプルに存在するHEV抗体の診断及び検出のための方法が提供される:
−SEQI.D.NO:2若しくは相同性配列、フラグメント、または上記に列記のアナログによって確定されるアミノ酸配列からなるpE2ペプチドの提供であって、pE2ペプチドは好ましくは、固形支持体上に固定されることを特徴とする;
−pE2ペプチド及び抗HEV抗体間の免疫学的(抗原−抗体)複合体の形態を可能にする状況下の生物学的テストサンプルを伴うpE2ペプチドの接触及び培養;
−結果となる混合物からの非結合物質の可能な除去;
−指示試薬を伴う結果となる混合物の培養;及び
−免疫学的複合体の存在のための混合物の検査であって、免疫学的複合体の形態がテストサンプルでの肝炎Eウィルス(HEV)に対する抗体の存在を示す。
【0036】
抗−pE2抗体の産出
pE2ペプチドによって表示される高い免疫化学反応により、pE2ペプチドに対する特異的な反応性の抗体が、当業者によって周知の技術によって産出できることがここに記載の方法及び実施例によってさらに実証された。本発明のpE2ペプチドの整合の抗原決定基群が、HEVカプシド・タンパク質の同様の構造の特徴を模倣するので、pE2ペプチドは、ポリクローナル及びモノクローナル抗体の両方の生産に役立つ。さらに、pE2ペプチドに対して検出されたかかる抗体、若しくは抗体のフラグメントは、分離によるHEV感染を決定するための価値のある及びウィルス粒子及び/若しくは抗原のスクリーニングのための免疫試薬として診断テストの発展において特に有用である。このようにして、抗−pE2抗体は、生物学的サンプルでのHEV抗原の存在を検出するための従来の免疫アッセイ形態及びHEVウィルス粒子の小サンプルが分離及び濃縮できる免疫捕獲形態を含有する多くの臨床診断手順において使用できる(Harlow and Lane, Antibodies: A laboratory Manual, 1988, Cold Springs Harbor Laboratory Press)。
【0037】
本発明のpE2ペプチドに対するポリクローナル抗体が所望であれば、選択された非ヒトの哺乳類宿主(例えば、マウス、ラット、羊、ウサギ、ヤギ等)は、キャリアーと任意に接合されて、ペプチドを伴って免疫反応を促進するために注入され、このようにして抗体の生産は引き続き回復されて、精製される。本発明の好ましい実施態様によると、哺乳類の宿主は、上記に記載のHEV整合エピ糖尿病―プ産出するようなGE2ポリペプチドによって免疫反応される。GE2ポリペプチドは、注入可能な形態で投与され、GE2ポリペプチドは、生理学的に受理可能な希釈で混合される。フロインドの完全若しくは不完全アジュバントのようなアジュバントが、形態に含まれるかもしれない。かかる形態は、適切な時間をかけて、宿主に注入され、HEVウィルス抗体のためのアッセイのために適切な間隔で血清サンプルは取られる。適切なレベルの反応が獲得される場合、宿主は出血する。次いで、例えば、免疫アフィニティクロマトグラフィーによって、抗体が標準的な手順を用いて血液血清から回復されて、精製される。
【0038】
本発明のポリクローナル抗体が好ましいが、ポリクローナルシステムとして機能する様々なモノクローナル抗体を含むシステムがまた、本発明の範囲内である。HEV整合エピトープに対して導かれるモノクローナル抗体はまた、当業者によって、本発明のGE2ポリペプチドを用いて容易に合成できる。ハイブリドーマとして一般に名高い永久の抗体産生細胞ラインを使用して、モノクローナル抗体を生産するための一般的な方法論は有名である。ハイブリドーマは、抗−pE2抗体及びハイブリッド細胞に長期的な組織培養安定を与える、不朽にする細胞を合成する細胞の融合によって合成できる。ハイブリッド細胞株の形態において、第一の融合相手である、抗体合成細胞は、GE2ポリペプチドで接種される、例えば、マウス若しくはラットのような非−ヒト哺乳類宿主の脾臓細胞でありえる。ホストが抗体反応をマウントするための十分な時間が経過した後、抗体合成細胞は除去される。マウスまたはネズミの髄腫細胞株のような不朽にする細胞株の細胞は、ハイブリドーマ(それは所望のモノクローナル抗体を分泌する)のような細胞株を識別するためにスクリーニングされた抗体産生細胞及び生じる融合で融合される。不朽にする細胞を伴う抗体合成細胞の融合は、標準的な手法によって達成される(Kohler and Milstein, (1975) Nature (London) 256, 495−497; Kennet, R., (1980) in Monoclonal Antibodies (Kennet et al., Eds. Pp. 365−367, Pienum Press, NY))。融合された細胞株は培養されて、モノクローナル抗体がスクリーニングされて、ポリクローナル抗体を回復するための同様な方法での培養培地からの抗−pE2抗体の合成のために精製される。
【0039】
したがって、本発明のさらなる態様によると、HEV抗原に対する精製された抗体を産出するための方法が提供され、ここにおいて、SEQI.D.NO:2若しくは相同な配列、フラグメント又は上記に列記のアナログによって表現されるアミノ酸配列を有する整合HEVペプチドpE2の効果的な量が非−ヒト哺乳類ホストに注入され、合成された抗体が収集される。本発明の好ましい実施態様において、SEQI.D.NO:2によって表現されるアミノ酸配列を含む組換え融合タンパク質、GE2が、所望の抗体を産出するために、非−ヒト哺乳類ホストに注入される。
【0040】
捕獲試薬としての抗−pE2抗体の活用
本発明のpE2ペプチドを使用して起こされ若しくは発達されたモノクローナル若しくはポリクローナル抗体は、生物学的テストサンプルでのHEVカプシドタンパク質若しくはウィルス粒子の存在を検出する捕獲試薬として免疫アッセイに使用される。本質的に、捕獲試薬として抗−pE2抗体を活用するために設計された免疫アッセイ形態が、採用される。免疫アッセイを実行するための方法は、当業者において既知であり、本発明は、任意の特異的な免疫アッセイに対して限定するようには意図されていない。
【0041】
一般的に、本発明のpE2ペプチドの整合の抗原決定基群が、HEVカプシドタンパク質の同様の構造の特徴を模倣するので、抗−pE2抗体は、ウィルスRNAの抽出及び逆転写酵素チェーン反応(RT−PCR)によって引き続いて検出できる、HEVウィルス粒子を分離し、濃縮する免疫捕獲方法に採用されるかもしれない。本発明の好ましい実施態様によると、免疫捕獲方法がHEVウィルス粒子を分離し、濃縮する目的のために提供され、ここにおいて、ポリスチレンパドル若しくは別の適切な固形の吸着物質が、pE2ペプチドに対して起こされた抗血清で覆われる。かかる方法は、ウィルスRNAの抽出及び好ましくは、入れ子ポリメラーゼチェーン反応である、RT−PCRの適用によって決定されるテストサンプルでのウィルスの少量を検出するために効率が高い。
【0042】
適切な固形支持体若しくは吸着物質は、実行される免疫形態の種類に依存するだろうが、しかしながら、選択された支持体の種類が適切な強度を有し、免疫学的複合体の免疫活性を干渉しないことが望ましい。固形支持体の実施例は、反応トレイのマイクロウェルの壁、テストチューブ、シート、プレート、スライド、ビーズ(例えば、ポリスチレン若しくはガラス)、ニトロセルロースストリップ、メンブラン、ラテックス粒子、ガラスのチップ、プラスチック及びその他のような微細粒子を含んでいる。
【0043】
したがって、本発明の別の態様によると、下記の段階からなる生物学的テストサンプルに存在するHEVウィルス粒子(例えば、分析物)の検出のための方法が提供される:
−SEQI.D.NO:2若しくは相同性配列、フラグメント、または上記に列記のアナログによって確定されるアミノ酸配列を有するpE2ペプチドに対して起こされた精製された抗体の提供であって、抗−pE2抗体は好ましくは、固形支持体上に固定されることを特徴とする;
−抗−pE2抗体及びテストサンプルに存在するであろう任意のHEV分析物間の複合体の形態を可能にする状況下の生物学的テストサンプルを伴う抗−pE2抗体の接触及び培養;
−結果となる混合物からの非結合物質の可能な除去;及び
−HEV分析物の存在のための混合物の検査。
【0044】
診断テストキット
ここに記載されている新規なHEVペプチド、pE2若しくは抗−pE2抗体は、一般的には、HEV感染の検出及び診断に使用する診断テストキットの形体に包含されている。通常、キットは、分離された容器内に、免疫試薬としてのpE2ペプチド若しくは抗−pE2抗体が含まれている。さらに、採用される免疫試薬及び検出されるHEV分析物の種類に依存して、キットは追加的に、ポジティブ及びネガティブコントロールサンプル、ラベルが直接シグナルを産出しない場合には、標識された抗ヒト抗体及びシグナル産出試薬(例えば、酵素標識の場合の酵素基質)のような指示試薬が含まれているであろう。ここで記載されているように、用語としての“分離された容器”は、診断テストキットに提供される他の物質と同様に、本発明のpE2ペプチド若しくは抗−pE2抗体を限定的に固定して保持できる任意の物質を意味する。アッセイを実行する手引きは、通常、キット内に含有されている。かかる手引きは、一般的に、免疫試薬の濃度若しくは少なくとも一つのアッセイ方法のパラメーター、例えば、混合されている免疫試薬の相対量及びサンプル、免疫試薬/サンプル混合の時間、温度、バッファー状態、等を記載している。
【0045】
所望であれば、本発明のpE2ペプチド若しくは抗−pE2抗体は、一般的には、受動的な吸着若しくは当業者において周知である多くの技術の共有結合を介して固形の支持物質に固定される。本発明のpE2ペプチド若しくは抗−pE2抗体固定するための固形の支持体の有用性は当業者において周知である。適切な支持は、実行される免疫アッセイ形体の種類に依存するが、しかしながら、選択された支持体の種類は適切な強度を有し、免疫学的複合体の免疫反応性を干渉しないか、シグナル産出物質からの検出可能なシグナルの合成を干渉しないことが望ましい。固形支持体の実施例は、反応トレイのマイクロウェルの壁、テストチューブ、シート、プレート、スライド、ビーズ(例えば、ポリスチレン若しくはガラス)、ニトロセルロースストリップ、メンブラン、ラテックス粒子、ガラスのチップ、プラスチック及びその他のような微細粒子を含んでいる。
【0046】
指示試薬は、本発明の免疫試薬による免疫学的複合体の形態の指示が可能な標識若しくはシグナル産出物質及び捕獲されたHEV分析物を含むべきである。診断用テストキットの指示試薬は、例えば、凍結乾燥された形体の液体の分散として、若しくは実質的には乾燥パウダーとして、溶液にて提供可能である。指示試薬がシグナル産出物質としての酵素を活用する場合、酵素の基質もまた、診断用テストキットの分離された容器に提供できる。抗原−抗体結合による免疫学的複合体の形態を検出するための手段として使用される標識若しくはシグナル産出物質は、沈澱物の可視検出、若しくは色の変化、顕微鏡による可視検出、若しくは分光光度計、放射線測定若しくはその他同様による自動化検出を可能にする。シグナル産出物質の実施例は、コロイド状の金、蛍光物質(例えば、フルオレセイン、及びローダミン)、発光物質、クロマゲン、放射活性要素、酵素(例えば、アルカリフォスファターゼ、ホースラディッシュペルオキシターゼ、及びベータ−ガラクトシダーゼ)及び増幅物質(例えば、ビオチン、抗−ビオチン及びアビジン)を含んでいる。
【0047】
HEV抗体を検出するためのキットの実施例として、本発明のpE2の所定量は、入ってくるHEV抗体と免疫学的に結合することができるように、反応トレイのマイクロウェルに固定されている。指示試薬は、テストサンプルに存在するであろう任意のHEV抗体を認識して結合する、標識された哺乳類抗−ヒト抗体でありえる。標識された哺乳類抗−ヒト抗体は、シグナル産出物質としての酵素として活用が可能であり、酵素が直接シグナルを産出しない場合は、酵素の基質が追加的に提供される。
【0048】
ワクチン
今日、文化的にワクチンの拡大が成功しないため、弱毒化されたワクチンの合成はまだ可能ではない。現在発展している候補となるワクチンは、真核生物で発現される主要な構造的タンパク質の組換えペプチドである(Tsarev et al., 1993a; Tsarev et al., 1994a)。弱毒化されたワクチンと比較して、ワクチンの形態の組換えペプチドを使用する利点は、ペプチドがより効率的に合成され、簡単に精製されることである。さらに、結果となるワクチンが任意の生きた完全なウィルス粒子を含む可能性はなく、したがって感染の危険性を避けられる。
【0049】
pE2ペプチドは、そのモノマーの形式よりそのダイマーの形式でより免疫原であることが分かった。pE2ペプチドに対して起こされた抗血清の実験研究において、ダイマーに対する抗体活性のレベルが、モノマーの形式に対する活性よりも実質的に高い。さらに、HEV抗体の特異性の広いスペクトルを表現するHEV活性ヒト血清とは違って、pE2抗血清は、HEV抗体の特異性の制限されたスペクトルを有する。特に、しかしながら、pE2抗血清は、ウィルスの十分な免疫捕獲を効果的にする能力によって証明されるようなHEV粒子の認識及び結合が可能である。したがって、抗原関係がpE2ペプチドのダイマーの形式とウイルスの間で確立された、pE2ダイマーがHEVカプシド・タンパク質に形態学的に抗原的にに関連づけられて、それを作るウイルス・カプシドのある構造の特徴を模倣するということである。したがって、肝炎Eウィルスカプシド及びpE2ペプチドがある共通の抗原決定基群をシェアして、より詳細には、新しい整合の抗原決定基群は、pE2ペプチドのダイマーの形式と関連することが、確立が高い。この主張は、ペプチドのダイマーの形式がHEVの反応的なヒトの血清によって強く一般に認識されたという発見と一致している。
【0050】
pE2ホモダイマーがHEVカプシドタンパク質と構造上及び抗原的に関係のあるように見えるという事実の概観では、これが、HEV伝染に対するワクチンに対する潜在的な候補としてアピールする、細菌で表現されたペプチドを作る。さらに、異なるHEV分離株(表1)のHEVゲノム内の保存は、pE2ペプチドが中国の分離株に由来している一方さらに、それがメキシコおよび米国から最近分離された最も遺伝学的に分岐する菌株を含む他のHEV型からの保護を産出するだろうとさらに示唆する。
【0051】
したがって、本発明のさらなる別の実施態様によると、SEQI.D.NO:2若しくは相同性配列、フラグメント、または上記に列記のアナログ、及び免疫処置に続く肝炎Eウイルスを備えた抗原投与から哺乳動物を保護する、薬学的に受容可能なキャリアによって識別され、pE2ペプチドからなるワクチン構成物が提供される。
【0052】
さらに、肝炎Eウィルスに対する感染に抵抗する個々の免疫処理のためのワクチンの使用が提供され、ここでワクチンは、薬学的に受容可能なキャリアーとの組み合わせにおいて、pE2ペプチドの免疫学的な有効量からなる。薬学的に受容可能なキャリアーは、当業者にとって既知である(Amon, R. (Ed.) Synthetic Vaccines I: 83−92, CRC Press, Inc., Boca Raton, Fl., 1987)。キャリアーは、ペプチドを患者に導入するための入れ物(vehicles)の使用において適切な液体状の媒体を含んでいるが、しかし薬剤を受け取る個体に有害な抗体の生産を引き起こしてはならない。かかる液体媒体の実例は、食塩水である。さらに、ワクチンの形態はまた、免疫反応を刺激するためのアジュバントを含んでおり、そこにおいて、ワクチンの効果を増幅する。
【0053】
“免疫学的に効果的な量”は、上記に定義されたように、処理のために有効である被験者への、一回量中の、あるいは一連の一部としてのその量の投与を意味する。かかる量は、処置される被験者、処置される被験体種(例えば、非−ヒト哺乳類、霊長類等)の健康状態、抗体を合成するための被験者の免疫システムの可能性、望まれる保護の程度、ワクチンの形態、感染しているHEVの菌株、及び他の重要要素に依存する。量は、比較的型通りの試みを経て決定することができる広範囲に落ちるだろうことが予期される。
【0054】
本発明のワクチンは、経口及び非経口(例えば、静脈内、皮下、若しくは筋肉内)注入を含むワクチンの投与のための任意の簡素な方法によって投与される。処置は、ワクチンの単一の投与若しくは一定期間における複数の投与から構成される。
【0055】
上記、及び発明を特徴づける斬新さの他の利点及び特徴は、ここに付加され、一部分をこれについて形成した請求項での特殊性で指摘される。本発明をより理解するにあたり、本発明の利点、及び本発明の使用による目的、参照は添付の図面及び記述的な問題(発明の好ましい実施例がその中で例証され記述される)になされるかもしれない。
【0056】
任意の方法及び同様の物質若しくは等価である任意の方法及び物質もここに記述したが、本発明の実行若しくは試験において使用することができ、好ましい方法及び物質がここで今、記述される。
【0057】
次の記載では、発明が、本発明の好ましい実施例を例証する、添付の図の援助によって詳細に説明されるだろう。
【0058】
本発明の詳細な記載
もし他の方法で確定されなかったならば、ここに使用される技術的及び科学的な用語はすべて、この発明が属する技術における通常の当技術のうちの1つによって一般に理解されるのと同じ意味を持っている。一般的に、命名法はここに使用した。また、細胞培養、分子遺伝学、および下に記述された核酸化学における研究室での手順は、既知であり、当技術において採用される。標準的な技術が、組換え核酸方法、細胞培養、及び形質転換に使用される。一般的に、酵素反応及び精製段階は、製造者の手引きにしたがって実行される。技術及び手順は、一般的には、当業の従来の方法及び様々な一般的な参照(Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd Ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Plainview, NY, 1989)にしたがって実行される。開示の全体にわたって使用される、次の用語が、もし他の方法で示されなかったならば、次の意味を持っていると理解される:
生物学的テストサンプルは、関心ある分析物の供給源である、個々の体の構成物を意味する。テストサンプルの実施例は、限定されないが、ヒト及び動物の体液、例えば全血、血清、血漿、脳脊髄液、白血球、腸管の分泌物、小水、及びリンパ液である。
【0059】
E2は、図2に例証された中国HEV菌株(DDBJ 承認番号 No.D11092)のゲノムの6326乃至6968位置に拡張しているクローンcDNAフラグメントで、6957部位(例えば、SEQIDNO:1)に単一塩基対の欠損を含んでいる。
【0060】
pE2は、E2(例えば、SEQIDNO:2)によってエンコードされたペプチドである。
【0061】
E3は、図3に例証された中国HEV菌株(DDBJ 承認番号 No.D11092)のゲノムの5364乃至5477位置に対応するクローンcDNAフラグメントである。
【0062】
pE3は、図4にて例証されるE3によってエンコードされたペプチドである。
【0063】
GE2は、融合タンパク質であり、pE2のアミノ末端がグルタチオンS−トランスフェラーゼのカルボキシ末端と結合している。
【0064】
GE3は、融合タンパク質であり、pE3のアミノ末端がグルタチオンS−トランスフェラーゼのカルボキシ末端と結合している。
【0065】
肝炎Eウィルス(HEV)は、カルシウィルス()の仲間と同様な形態の一本鎖ポジティブRNAウィルスである。それは、肝炎の散発的な症例か固有の発生を引き起こすことができ、肝炎Aウィルス(HAV)、肝炎Bウィルス(HBV)、肝炎Cウィルス(HCV)及び肝炎Dウィルス(HDV)とは血清学的見地から異なる。
【0066】
ホモダイマーは、二つの同一のモノマーの結合により形成された分子である。
【0067】
相同配列は、SEQIDNO:1若しくは2のそれぞれにより識別される、E2核酸配列若しくはpE2アミノ酸配列と同一な配列を少なくとも80%、より好ましくは90%を有する核酸若しくはアミノ酸配列である。
【0068】
I HEVゲノム配列
HEVゲノム配列は、図2A乃至2D及び図3にそれぞれのORF2及びORF3と対応して例証されている。同様に、ORF2及びORF3領域のそれぞれから派生する遺伝子の生成物と対応して図4及び5にペプチド配列が示されている。したがって、ゲノム配列は、下記にリスト化して示される:
SEQIDNO:1は、ORF2から派生したクローンDNAフラグメントE2の核酸配列である。
【0069】
SEQIDNO:2は、ペプチドpE2のアミノ酸配列である。
【0070】
SEQIDNO:3は、ORF2Rb(表9を参照)プライマー下流の核酸配列である。
【0071】
II HEVペプチドpE2及びpE3
HEVゲノムからのpE2及びpE3の発現
HEVの中国菌株D11092のゲノム内に位置するORF3配列の3´末端からの114領域及びORF2配列の3´末端からの811が、逆転写ポリメラーゼチェーン反応(RT−PCR)によって、複製されて、増幅された。続いて、かかる配列は、pGEXベクターのBamHI及びEcoRIクローニング部位でライゲートされた。複製されたウィルスの遺伝子は、EcoRI及びBamHI(図6のレーン2及び3)を伴うプラスミドの消化によって回復され、シークエンス解析された。解析は、ウィルスゲノム内の5364乃至5477位置の114bpに位置した。3.9kDの分子量の37のアミノ酸のpE3であると予測された。811bpの配列が、6326乃至7136に位置するが、しかしながら、解析はまた、PCR増幅のエラーによると思われる、6957部位(図2D)の単一の塩基対欠損を明らかにした。結果となるフレームシフトは、核酸配列の翻訳が6968部位の新しい停止コドンで早々に停止し、このようにして、当初予期していたような267アミノ酸残基に代わって、期待していたよりも小さい、23kDの分子量である213アミノ酸残基の長さのpE2が得られる。pE2のカルボキシ末端の3つのアミノ酸残基は、非−HEV配列(SEQIDNO:2)であるフレームシフトによって合成された。
【0072】
核酸配列は、HEVの中国菌株(DDBJ 承認番号 No. D11092)のORF2及びORF3領域にそれぞれ対応して図2A乃至2D及び3にて示されている。
【0073】
アミノ酸配列は、HEVの中国菌株(DDBJ 承認番号 No. D11092)のORF2及びORF3領域のそれぞれから派生したpE2及びpE3ペプチドに対応して図4及び5に示されている。
【0074】
HEV ORF2及びORF3特異的タンパク質の特性
HEVゲノムの両ORF2及びORF3から複製された配列は、グルタチオンS−トランスフェラーゼ(GST)融合ペプチド、GE2及びGE3のそれぞれに発現される。発現システムは、ウィルスペプチドの高い産出率を与え、グルタチオンセファロース−4Bシステムを用いた場合に効果的な精製を可能にする。かかる方法は、約2mgの精製されたGE2及び1リットルの細菌培養から7mgのGE3を産出する。あるいは、セファロース−4BへのGE2の結合は、GSTのカルボキシ末端で融合タンパク質を切断し、ウィルスペプチドpE2を放出する、トロンンビンを用いて溶出される。かかる方法は、1リットルの細菌培養から約1mgの精製されたpE2ペプチドを産出する。
【0075】
GE2及びpE2の精製された調製は、SDSPAGE及びウェスタンブロッティング(図7)によって特徴付けられる。精製されたpE2融合タンパク質、GE2(レーン1及び2)、pE2ペプチド(レーン3及び4)及びグルタチオンS−トランスフェラーゼ(GST)融合タンパク質(レーン5)は、(A)SDSPAGE及びGST特異的抗血清及び(C)プールされたヒトHEV活性ヒト血清を用いて(B)ウェスタンブロッティングによって解析される。加えて、GE2及びpE2ペプチドのサンプルは、続くSDSPAGE(A)及びウェスタンブロッティング(B及びC)による解析(レーン2及び4)のために、100℃で3分間加熱される。精製されたGE2は92kDの分子量のダイマー状形態の主用なバンドに分解され(図7A、レーン1)、しかし、サンプルが100℃の三分間の熱処理後に、49kDに分離された(図7A、レーン2)。GE2の両ダイマー状及びモノマー状形態は、対応するウェスタンブロッティングでの抗GST血清によって認識される(図7B、レーン1及び2)。かかる調製でのマイナーな生成物の一つである、49kDのGE2モノマーは、抗GSTとだけ反応して、ヒトHEV活性血清とは反応しない(図7C、レーン2)ことは注意すべきである。したがって、GE2が100℃で3分間加熱された場合、49kDのモノマーは主要なバンドになるが、しかし、そのヒトHEV血清に対する抗原性は著しく縮減された(図7C、レーン2)。トロンビンを伴う融合タンパク質結合の消化により精製されたpE2ペプチドは、42kDのダイマーを自然に形成し、100℃で3分間の過熱後に23kDのモノマーに分離する(図7A、レーン3及び4のそれぞれ)。pE2のダイマー若しくはモノマー形態の何れも、抗GST血清にて認識されない(図7B、レーン3及び4)。さらに、pE2のダイマー形態のみが、ヒトHEV血清と反応した(図7C,レーン1及び3)。
【0076】
ORF3から発現された精製されたGST融合タンパク質(GE3)はまた、SDSPAGE及びウェスタンブロッティングによって特徴付けられた(図8)。GE3タンパク質は、予期された30kDの分子量のバンドとして泳動したモノマーとして発生した。ウェスタンブロッティングは、GE3が抗GST抗血清及びプールされたHEVヒト血清の両者と反応性があることを示した。しかしながら、pE2及びGE2と対照的に、GE3の反応性は、GE3の抗原性活性が熱によって影響されないため、モノマー形態とのみ関連している。したがって、完全長のタンパク質に特異的なORF3のカルボキシ末端への従来のペプチドマッピング研究によって位置したエピトープに、かかる活性が少なくとも部分的に起因することはありそうである。
【0077】
III pE2及びpE2の抗原活性
pE2ペプチドはホモダイマーとして自然に発生する
従来からの研究は、HEV活性ヒト血清によって認識されるHEVゲノムのORF2によりエンコードされたHEVの構造的タンパク質の組み合わせペプチドを記載している(Yarbough et al., 1991; Liet al, 1994)。構造タンパク質の長さを測る短いペプチドのオーバーラップを用いるペプチドマッピングの技術によって、かかる抗原性ペプチドの反応は、ポリペプチドの長さに沿った異なる領域へ位置する抗体結合部位の数及び性質に起因した。線形エピトープに言及すると、かかる抗体結合部位は、アミノ酸配列によって決定されるようなタンパク質の1次構造に関連している。2次及び3次構造によって決定される溶液内の組換えペプチドによる仮定された形状は、抗体に対するエピトープの接近性に影響し、したがって、抗原性活性を縮減する。
【0078】
本発明の組換えpE2ペプチドは、HEV反応性ヒト血清により認識できる抗原性活性の二つの種類を表現する。抗原活性の一つの種類は、pE2ペプチドの1次構造に関連して、一方で活性の第二種類はダイマー形態におけるペプチドの4次構造に関連している。第一抗原性活性は、pE2ペプチドのアミノ酸配列内に含まれる線形エピトープに起因しており、ウェスタンブロッティング及び下記の記載によって識別されるように、モノマー形態と関連している。しかしながら、抗原性活性の第二種類は、自然状態において厳密に整合であり、pE2ペプチドのモノマーがホモダイマーを形成するためにお互いに関連する場合のみの結果である。したがって、他のHEV組換えペプチドとは区別されるpE2ペプチドの著しい特質は、自然状態で主に生理学的条件の下のホモダイマー(例えば、大きいオリゴマー)を成形し、かかるペプチドの抗原性活性は、そのダイマーの形式によって単独で達成されたpE2ペプチドの4次構造から推測上発生する整合の抗原決定基群に起因する。さらに、抗原活性はダイマーの解離で改廃されるが、モノマーの形式からのダイマーの再構成で活性を回復することができる。したがって、抗原活性のこの種類は、HEVゲノムのORF2領域から派生した組換えペプチドにおいて、報告されるその種類の第一番目である。
【0079】
図7は、プールされたヒトHEV活性血清のpE2及び精製されたpE2のグルタチオンS−トランスフェラーゼ(GST)融合タンパク質(例えば、GE2)のダイマー形態に対する強い反応性を示している。精製されたGE2(レーン1及び2)及び精製されたpE2(レーン3及び4)は、ここに記載のように合成されて、GSTに対して起こされた抗血清及び(C)プールされたHEV活性ヒト血清を用いる(A)SDSPAGE及び(B)ウェスタンブロッティングによって解析された。レーン2及び4にて使用しているサンプルは、解析の直前に100℃で3分間加熱された。GSTの精製サンプル及び分子量マーカーの混合物は、レーン5及び6にそれぞれロードされた。非加熱サンプル(7A、レーン1及び3)において、融合タンパク質GE2は、約92kDの分子量のダイマーとして泳動(7A、レーン1)し、pE2は、約42kDの分子量のダイマーとして泳動した(7A、レーン3)。しかしながら、図7Aのレーン2及び4に例証されているように、加熱は、49kDaのモノマー状GE2融合タンパク質及び23kDaのモノマー状pE2ペプチドのそれぞれに分離するように両タンパク質のダイマー形態を引き起こす。ダイマー若しくはモノマー形態の何れかの融合たんぱく質GE2は、予期されたように(7B、レーン5)、GSTと同様に、GST(7B、レーン1及び2)に対して起こされた抗血清によって認識されることが下記のウェスタンブロッティングによって明らかにされた。HEV活性ヒト血清は、GE2融合タンパク質(7C,レーン1)及びpE2ペプチド(7C,レーン3)のダイマー状の形態を強く認識した。100℃で3分間のサンプルの加熱は、GE2融合タンパク質及びpE2ペプチドの両者のダイマー状の形態を対応するモノマー状の形態に分離する結果となった。しかしながら、かかる分離は、GE2タンパク質及びpE2ペプチド(7C、レーン2及び4のそれぞれ)のモノマー状の形態を認識し及び結合するHEV活性ヒト血清の不可能によって示されているように、抗原性活性の付随する欠損と関連している。
【0080】
pE2モノマーの抗原性は評価され、ウェスタンブロッティング(図9)によるpE2ダイマーの抗原性と比較された。精製されたpE2ペプチドの非加熱及び加熱サンプルの等量が混合された。混合物は、連続的に4倍に希釈され、レーン1乃至6にロードされた。電気泳動後、pE2の両形態の抗原性は、図7の200倍希釈で使用されたプールされたHEV活性ヒト血清にて決定された。図9は、プールされたヒト血清がポジティブ反応を与えるpE2モノマーの最低量は1360ngで、同じ状態でテストした場合のpE2ダイマーで決定された最低量の86ngよりも16倍高いことを示している。さらに、pE2ダイマーに対して反応の強度は、pE2モノマーに対する反応の強度よりも約5倍高いと予測された。したがって、組み合わされた結果は、pE2ダイマーと関連する抗原性活性はモノマーよりも明らかに大きく、pE2ダイマーの全体の活性は、pE2モノマーの全体の活性よりも約80倍大きいことを実証する。pE2モノマーの抗原活性は、pE2アミノ酸配列の1次構造内に含まれる数多の線形エピトープに起因している。
【0081】
加えて、市販のHEV ELISAキット(Genelabs Diagnostics Pte Ltd., Singapore)における18の個々のヒト血清のポジティブが、モノマーの形態へpE2ダイマーを分離するために、pE2ペプチドのダイマー形態を保存するのに未処理にしておかれたか、若しくは100℃で3分間加熱されて、事前に解析する精製されたpE2のサンプルの等量の混合物(反応につきpE2の各形態が1360g)に対してウェスタンブロッティング(図10)によって50倍希釈でテストされた。図10に示されている結果によると、18血清のうちの8血清のみがpE2ダイマー及びモノマーの両者に対して活性である一方、残りの10の血清はpE2ダイマーに対してのみ活性であった。モノマー形態と比較されたpE2ダイマーに対する抗体反応性のより高い普及は、ダイマーがモノマーより抗原性的に反応的であるという一層の徴候である。
【0082】
図11は、pE2ダイマーに固有の抗原性活性の第二種類が、ダイマーの4次構造、若しくはオリゴマー、pE2ペプチドの形態に関連していることを示している。整合の抗原決定基群と呼ばれて、pE2以外に再結合のペプチドに関連したこの種の抗原反応性(それは、HEVゲノムのORF2領域に由来する)は、従来未知である。SDSPAGE(A)及びウェスタンブロッティング解析(B)に先立ち、精製されたpE2の分離サンプルは4つの異なる温度:4℃(レーン1);20℃(レーン2);37℃(レーン3);及び45℃(レーン4)で1時間8Mで処理された。さらに、45℃で処理されたサンプルの一部分は、SDSPAGE及びウェスタンブロッティング解析に先立ち、尿素を除去するため(レーン5)に、続いてオーバーナイトで透析された。ウェスタンブロッティングは、250倍希釈されたプールされたHEV活性ヒト血清を用いて実行された。SDSPAGEによって得られた結果(図11A)は、pE2の完全な解離が45℃で完全に達成されるまで、pE2ダイマーがそのモノマー形態へ分離した範囲は加熱過程の間に温度の増加につれて増加したことを示している(レーン4)。これらの結果と一致して、ウェスタンブロッティング解析(図11B)は、pE2ダイマーが存在している(例えば、レーン1乃至3及びレーン5)サンプルにおいてのみ、HEV活性血清が反応性の任意の度合いを表すこと例証している。あるいは、HEV活性ヒト血清は、pE2ペプチドのモノマーの形式だけを含んでいる、加熱したサンプルの方へ向かう反応が少しもないことを示している。
【0083】
かかる結果は、生理学的状況において、pE2モノマーは自然状態でホモダイマーを形成するためにお互いに関連して、HEV活性ヒト血清によって認識される整合抗原性決定は、pE2のモノマー形態に対する抗体が検出できないために、かかるダイマー状の相互作用の発生によることを提案する。したがって、pE2ダイマーの4次構造により決定された抗原性活性のかかる第二種類は、pE2ペプチドがダイマー形態である場合に、自然状態において厳密に整合に見えて、単に機能的である。結果として、pE2ペプチドのダイマー形態の分離は、整合抗原性活性の損失と関連して示されてた(例えば、図11B、レーン4)。しかしながら、整合抗原性活性は、PBSに対する尿素で扱われたサンプルのオーバーナイトの透析に続くダイマーを成形するためにpE2モノマーの再会合において回復することができるかもしれない(図11B、レーン5)。
【0084】
HEV感染におけるpE2重要な整合の抗原決定基群
上記に示して記載したように、HEV活性ヒト血清によって認識可能な二つの種類のpE2抗原性活性のダイマー形態の整合の抗原決定基群は、モノマー形態の線形エピトープよりも自然状態のHEV感染において重要な役割を表す。これは、ウェスタンブロッティング解析(図10)の結果が、全体の内の18HEV活性ヒト血清において、すべての18の血清がpE2ペプチドのダイマー形態に対して活性であり、一方で、血清の内の8血清がpE2ペプチドのモノマー形態に対して追加的に活性であることを示す場合に結論とされる。さらに、図9に示された結果に基づくと、pE2の整合の抗原決定基群の全体の活性は、モノマー内に含まれる線形エピトープの活性よりも約80倍高いことが予測される。
【0085】
自然状態のHEV感染におけるpE2の整合の抗原決定基群の役割は、21の健康なドナーの血液からの血清及び肝炎の発症後の異なる時間で採取された非A,B及びC急性肝炎を有する96人の患者からの血清テストによってさらに評価された(表2)。試験に使用された血清は、香港に存在するプリンスマーガレット病院に登録されている、現在若しくは過去において非A,B及びC急性肝炎の患者から得られた。結果は、pE2に特異的なIgG抗体は、健康なドナーよりも非A,B及びC急性肝炎の患者において著しく存在していることを示している。違いは、HEVが非A,B及びC肝炎の共通の原因であることを示すエピデミオロジカル(epidemiological)な研究と一致している。IgG抗体の検出は、数名のかかる患者は現在感染しており、他の患者は過去においてウィルスによって感染していたことを提示している。健康なドナーの約10%は、過去においてウィルスに感染しており、これは、かかる血液サンプルが得られたコミュニティーの中のHEV伝染のレベルに合意している。
【0086】
【表2】
IV pE2及びGE3のHEV特異性の決定
pE2ダイマー及びpE3の抗遺伝活性がHEV特異的であると確認するために、急性若しくは非A,B及びC急性肝炎の患者から得られた96血清検体のうち、74を市販のHEV特異的ELISAによってさらに試験された(表3)。市販のテストとpE2若しくはGE3テスト間の高い一致率は、pE2及びpE3のHEV抗原性特異性を実証している。
【0087】
【表3】
V IgG及びIgM抗HEVを検出するためのELISAの確立
二つの分離したELISAは、pE2若しくはグルタチオンS−トランステップフェラーゼ融合タンパク質GE3の何れかの精製された調製を伴う分離されたマイクロプレートのコーティングによって導かれた。かかるHEVペプチドの生成及び精製は、すでに記載済みである。かかる調製の純度は、42kDpE2ダイマー及びそれぞれの調製における総タンパク質の89%及び95%を構成するような、30.4kDGE3融合タンパク質の相対強度によって決定される(図12、左のレーン)。ウェスタンブロッティングは、かかるペプチドはHEVポジティブなヒト血清(図12、固形及びハッチドな円)の反応によって示されるようなかかる調製における主要な抗原であるが、しかしコントロールのネガティブなヒト血清(図12、開いている円)によって示されるような抗原ではないことを示している。精製されたHEVペプチド調製で生産されたアッセイによるこれらの血清の滴定は、ウェスタンブロッティングにより決定されるような対応するペプチドに対するこれらの血清の反応性と関連した、典型的な結果を産出した。
【0088】
追加試験において、HEVIgG抗体のレベルは、pE2及びGE3に特異的なアッセイを用いて90の健康なドナー及び現在及び過去において非A,B及びC急性肝炎に感染した96名の患者から得られた血清検体で決定された。個々の患者血清の抗体レベルは、一般に、以前にウェスタンブロッティングにより決定されるような対応するウイルスのペプチドに対するそれらの反応性と関連した(図13)。ウェスタンブロッティングにより決定された活性血清(図13、固形棒)において得られたOD値は、弱い活性(図13、ハッチド棒)若しくは非活性(図13、開いている棒)よりも高い。
【0089】
ウェスタンブロッティングによって証拠づけられた非活性の血清の平均OD値より高い5SDにおける遮断値をセットすることにより、pE2活性の85.7%若しくは弱い活性血清は、pE2特異的アッセイによってポジティブな結果が得られ、GE3活性血清の66.6%は、GE3特異的アッセイによってポジティブな結果が得られた。ウェスタンブロッティングとpE2及びGE3特異的アッセイ間の全体の一致は、それぞれ91.7%及び88.5%であった。ウェスタンブロッティングの結果に基づくと、両者のELISAテストは100%の特性を有し、かかるアッセイ及びウェスタンブロッティングによって得られた異なる結果は、弱い反応的な血清に制限された。pE2アッセイは42kDpE2ダイマーに特異的であり、GE3アッセイは30.4kDpE3ペプチドに特異的であることがこの結果で確認された。ELISAによって決定されるようなIgGpE2抗体の漿普及(seroprevalence)は、HEV患者で50%で、ドナーで5.5%で、IgG GE3の漿普及は、HEV患者で22.9%で、ドナーの1.15%であった。テスト被験者の何れのグループのpE2特異的抗体の漿普及は、GE3特異的抗体の漿普及よりも高かった。これは、pE2が2つの抗原の優先種で、これらの抗体の何れかのより高い存在が急性肝炎に関係していた、と示唆した。
【0090】
HEVカプシドタンパク質の明瞭な抗原領域への抗体の反応
さらなる比較において、96血清のうちの74血清のIgG抗体が、市販のテストキット(Genelabs Diagnostics Pte Ltd., Singapore)によってさらにテストされた。市販のテストキットは、HEVのブメセ(Bumese)及びメキシコ菌株(yarbough etal., 1991)のそれぞれのORF2及びORF3の3´末端からエンコードされた42アミノ酸ペプチド及び33アミノ酸ペプチドを含有する混合物から構成された。市販のテストで使用されたORF3の33アミノ酸ペプチドは、なぜならば、すでに記載したように、pE3は、ORF3の3´末端から発現された38アミノ酸ペプチドであるために、pE3(例えば、GE3)の一部分内であることが分かった。したがって、市販テストでのORF3特異的ペプチドの抗原性特異性は、GE3の抗原性特異性に近接して関連するであろうことが予期される。一方で、市販テストに使用されたORF2特異的ペプチドは、213アミノ酸pE2ペプチドのカルボキシ末端からのさらなる下流に位置している。したがって、キット内に含まれているORF2ペプチドによって部分的に決定された市販テストキットの抗原性特異性は、本発明のpE2ペプチドとは異なることが予期される。ORF2領域から派生した過去に報告されたHEVペプチドとは異なって、pE2の抗原性活性は独特であり、主として、pE2モノマーがホモダイマーを成形するために互いに関連させる場合、露出されるだけの整合の抗原決定基群に起因する。
【0091】
ウェスタンブロッティングによって証明されたように、30の血清はpE2IgG及びGE3IgGの両者において活性があるように過去にテスト(pE2+/GE3+、図15A及び15D)され、14の血清はpE2IgGのみに活性(pE2+/GE3−、図15B及び15E)で、30の血清は、何れのペプチドに対しても活性がない(pE2−/GE3−、図15C及び15F)。結果として、pE2及びGE3の活性血清における市販のアッセイによって決定された抗体のレベルは、GE3抗体のレベルに応じて同等に変化する(図15A)が、しかし、pE2特異的抗体のレベルと独立している(図15D)。11のかかる血清はGE3にとって弱い活性で、GE3特異的ELISAの遮断値を下回る低いOD値を与える(図15A)。pE2に対してのみ活性である14血清のうちの10の血清は、対応する抗体の異なるレベルを含んでいることが分かった。14血清のうちの7の血清は、市販のアッセイによって活性である(図15E)。しかしながら、それらのすべては、GE3特異的ELISAによってネガティブな結果が与えられた(図15B)。残りの血清は、何れのペプチドに対しても非活性である。それらのすべては、pE2及びGE3特異的ELISAの両者によってネガティブな結果が与えられ、しかし1つ以外のすべては市販のアッセイによってネガティブな結果が与えられた。
【0092】
3つのアッセイによって検出されたHEV抗体のスペクトルが、表4に概要されている。それらの明瞭な抗原性特異性にも関わらず、33の血清は、pE2特異的アッセイ及び市販のアッセイによってポジティブであり、33の血清は両者のアッセイによってネガティブであり、二つのアッセイ間の全体の一致は87.8%が与えられた。同様にして、GE3特異的アッセイと市販のアッセイ間の全体の一致は74.3%であった。3つのアッセイを組み合わせた全体の一致は、66.2%であった。市販のアッセイ(47%)によってHEV抗体の検出頻度は、pE2特異的アッセイよりもわずかに低く(50%)、GE3特異的アッセイよりも高かった(29%)。個々の血清によって表現された抗体のスペクトルに基づくと、40血清のうちの15血清において市販のアッセイによって検出された抗体は、GE3特異的アッセイによるテストの場合に血清が非活性であるため、この分析を生産するために使用される、ORF2に特異的なペプチドに特異性であるものに起因することができる。残りの23の血清は市販のアッセイ及びGE3特異的アッセイの両者によってポジティブな結果が与えられるが、しかしながら、これらの血清がさらに市販のアッセイを生産するために使用される、ORF2に特異的なペプチドに対する抗体を含んでいる場合、上記の結果は確認されなかった。
【0093】
【表4】
VI 現在及び過去のHEV感染における抗体反応
HEV患者及び健康なドナーからの血清のpE2及びGE3特異的IgM抗体のレベルもまた、決定された。予備的研究において、抗ヒトIgGの存在及び不在において得られた結果が本質的に同一であるように、アッセイは、IgG抗体の存在によって影響されないことが示された。後の決定は、したがって抗ヒトIgGがない状態で行われた。また、遮断値は90人のドナーからの血清の平均OD値を上回る3SDでセットされた。図14は、肝炎Eの発症の時間を伴う患者からの血清内のpE2及びGE3抗体の発生を比較している。pE2及びGE3特異的IgM抗体及びGE3特異的IgG抗体は、主に肝炎Eの発症後の早い期間に得られたサンプルの血清に存在する一方で、pE2特異的IgG抗体の発生は疾病の発症とは関連していない。
【0094】
図14のようなpE2及びGE3特異的アッセイによって決定されるHEV抗体レベルに基づくと、テストされた個人の血清検体は9つの明らかなHEVの血清学的なプロファイルを表現する。53名の患者の血清のすべてが、かかる抗体(表5)の一つ以上において様々な活性があることが判明した。18の血清は、現在の感染と一致する5つの血清学的プロファイルを表現した(表5、プロファイル1乃至5)。それらは、pE2IgMのみに活性である3つの血清(表5、プロファイル1)、pE2及びGE3特異的IgG抗体に追加的に活性である11の血清(表5、プロファイル2)、及びpE2IgM3、pE2及びGE3特異的IgG抗体に活性で、またGE3特異的IgM抗体に活性である3つの血清(表5、プロファイル4)を含んでいる。他の血清は、pE2特異的IgMに活性で、また様々な他の抗体である。かかるサンプルの16サンプルは、肝炎Eの発症後から30日以内に採取されたことは注意すべきことである。他の2名の患者の血清は、発症後60日以上で採取された。ドナーからのそれら及び他の血清は、、推測上肝炎Eの過去の出来事と無関係な無症候性のHEV伝染に依存した。別の35名の患者の血清は、IgG抗体にポジティブで、IgM抗体にポジティブでない過去のHEV感染と一致する、血清学的なプロファイルを表現した(表5、プロファイル6乃至8)。かかる血清の27の血清は、pE2特異的IgGと活性があり(表5、プロファイル6)、及び7つの血清はGE3特異的IgGに活性があり(表5、プロファイル7)が、しかし何れの血清もIgM抗体には活性がなかった(表5、プロファイル6乃至8)。一つのプロファイルは、上記の何れかの抗体とも活性がない血清を示している(表5、プロファイル9)。しかしながら、かかる血清学的プロファイルの発生は肝炎Eの発症時間とは関係していない。現在の感染プロファイルを示している殆どの検体は、肝炎Eの発症から27日以内に採取され(平均は13日)、他の検体は括弧内に表示された日にちにおいて採取された。過去の感染のプロファイルは、疾病の発症とは関係しておらず、かかる検体は、非活性血清のように疾病の発症後の同じ率においてまとめられた(平均は50及び40日)。
【0095】
【表5】
低い結合活性IgG抗pE2抗体の決定のためのELISA
ELISA方法の更なる適用は、pE2ダイマーを用いて血清での低い結合活性IgG抗体の決定のためである。これは、4M尿素の存在及び不在での血清検体の滴定により達成される。低い結合活性IgG抗体の存在は、尿素処理が明らかな抗体レベルを4倍以上著しく縮減する場合に示唆される。表6は、低い結合活性抗体が、肝炎Eの発症後2週間以内に採取した患者の血清で占有的に検出され、次いでかかる抗体は徐々に結合活性なIgG抗体と取り替えられるたことを示している。このようにして、低い結合活性IgG抗体の一時的な発生は、急性の肝炎Eの診断に潜在的に役立つようにする。
【0096】
【表6】
VII HEVRNAを検出するための免疫捕獲RT−PCRの確立
ヒト血清の上記に記載の反応性は、もしpE2ダイマーがHEVカプシドの模倣のある構造的な特質である場合に説明される。この可能性をテストするために、pE2に対して起こされた抗血清がHEV粒子の免疫捕獲に影響することを決定する実験が実行された。
【0097】
RT−PCRプライマーの特異性
この研究において、二つのプライマーである、A5R/A3F及びB5R/B3F(表9)がRT−PCRのために選択された。かかるプライマーの特異性は、HEV,HAV,腸内ウィルス及びカリシウィルスを分離して含んでいる検体で直接RT−PCRを行なって評価された。図16は、HEVを含んでいる検体のみがRT−PCR増幅に続く203bpHEV配列の予期される大きさの特異的なバンドを表した。
【0098】
HEVのpE2ダイマーの模倣な構造的特質
pE2だいまーとHEVウィルス粒子間の抗原的関係は、pE2ペプチドに対して起こされた抗血清でコーティングされたポリスチレンパドルを用いた免疫捕獲実験によって研究された。使用された抗血清は、pE2ダイマーに対して優先的に活性がある、100μgの精製されたpE2の4回の投与で免疫処理されたサルから得られた。抗血清は、pE2モノマーに対して弱い活性で、他のHEV抗原に対しては活性がない。抗血清によってコーティングされたパドルは、HEV粒子の特異的な免疫捕獲に影響することが判明し、拘束されたウイルスは続いて、下記に記載の“原料及び方法”の副題の章で記載されているような逆転写ポリメラーゼチェーン反応(RT−PCR)によって検出される。パドルは、カルシウィルス(レーン4及びレーン5)及び腸内ウィルス(レーン6)との反応を同様に許容するが、しかし、HAVの捕獲の影響には失敗した(図16)。
【0099】
かかる結果は、pE2ダイマーが、ダイマーに対して優先的に活性である抗血清を可能にし、したがってHEV粒子の免疫捕獲に十分に影響し特異的である、HEV粒子のある構造的特質を模倣しているという主張をさらに支持している。離床、食品及び環境的なサンプルでのHEVの検出のために免疫捕獲アッセイを開発するためのかかる発見の適用が、下記に議論されている。
【0100】
免疫捕獲RT−PCR
ウサギのpE2に対して起こされた抗血清は、免疫捕獲HEVに対する可能性をテストされた。抗血清及び事前に免疫処理された血清で分離してコーティングされたポリスチレンのパドルは、ウィルスの捕獲のために使用された。捕獲された粒子にてRT−PCRが実行された。抗血清が、保存しているウィルスの55までの希釈のHEV粒子を捕獲する(図17A)一方で、事前に免疫処理された血清は、希釈していない保存している溶液でのウィルスの捕獲において失敗した(図17B)。
【0101】
IC−RT−PCRに対する市販のウィルスRNA検出キットの比較
上記に記載の免疫捕獲RT−PCR(IC−RT−PCR)方法は、HEV特異的タンパク質pE2の発現から派生した抗血清の安定した供給源の可能性のため、公衆衛生及び環境モニタリングにおけるHEVの検出のために日常的に使用できる。
【0102】
下記に記載の方法において、HEV粒子の免疫捕獲は、分子生物学者にとって親しまれて使用されている市販のキット(QIAamp Viral RNA Kit, QIAGEN)によるHEVのRNAの抽出によって続かれる。市販のキットを用いたRNA抽出の効率が干渉なしで100%だと仮定すると、市販のキットがサンプルの体積よりも32回分提供できるので、理論的には、IC−RT−PCRは、直接のRT−PCRよりも感度が32倍高くなるであろう。この研究において、植え付けられたウィルスは、連続した5倍希釈されるので、予期される結果は、IC−RT−PCRはRT−PCRよりも25倍感度が高くなる。
【0103】
かかる研究において、HEVが植え付けられた検体の3つのタイプは、淡水、人間の糞検体の上澄み液、及び均質化された甲殻類検体の上澄み液を含んで調製された。水のサンプル、甲殻類(例えば、カキ)のサンプル、及び糞便のサンプルは、等量のHEVでスパイク(spiked)された。スパイクされたサンプルは、連続的に5倍希釈され、希釈されたサンプルの分割は、市販(従来)の方法及び免疫捕獲方法によってHEVの存在をテストされた。かかる検体からのHEV捕獲の比較的な効率は試験されて、結果は表7に提供された。かかる結果によると、免疫捕獲方法は、HEVの検出において従来のRT−PCR方法よりも感度が水のサンプルにおいて25倍、糞のサンプルにおいて125倍、甲殻類のサンプルにおいて125倍高いことが実証している。したがって、結果は、IC−RT−PCRは、市販のウィルスRNAキットよりも感度が少なくとも25倍高いことが示された。水のサンプルにおいて観察された増大した感度の理由は、従来のRT−PCR方法によってテストされたサンプル体積よりも32倍多い体積によって免疫捕獲方法でテストしたためである。さらに、結果は、続くcDNA合成のためのRNAの抽出を阻害する、糞及び甲殻類の上澄み液において未知の要因が存在することを示唆している。したがって、水のサンプルが検出を阻害する物質を含んでいないと思われるため、この理由が、水のサンプルが甲殻類や糞のサンプルの上澄み液よりも著しく高い結果となっている。しかしながら、糞及び甲殻類のサンプルで観察された干渉物は、従来のRT−PCRにIC−RT−PCRを用いることで最小限に縮減される。従来のRT−PCRに25倍高いIC−RT−PCRの感度が上昇した方法は、免疫捕獲方法による阻害物質の除去に起因する。
【0104】
【表7】
結果として、市販のRT−PCR方法及びIC−RT−PCR方法の両者は、水のサンプルよりも糞及び甲殻類のサンプルにおいてより低い感度を有する。しかしながら、この減少は、ウィルスの衰退を加速することが可能な糞及び甲殻類のサンプルにおける数多の未知の要因によって引き起こされる。一方で、IC−RT−PCRの結果は、直接のRT−PCRを用いるよりも125倍より感度が高く、これは、免疫捕獲方法が、糞及び甲殻類サンプル内の未知のものからの干渉を克服したことを意味し、Ic−RT−PCRが臨床及び環境的モニターにおいて実用することを例証する。
【0105】
VII HEVタンパク質でのpE2の役割
非A,B及びC肝炎患者の研究の過去の結果は、組換えペプチドpE2のダイマー形態は、ペプチドのモノマー形態の二量化によって産出される、整合の抗原決定基群の暴露によって自然のHEV感染において重要な役割をしていると推測されることが示唆された。
【0106】
非A乃至C急性肝炎患者の研究ですでに示されているように、pE2のダイマー形態は、自然のHEV感染においてより顕著な役割であることが仮定として分かっている。一般的に、pE2特異的IgM抗体は、急性HEV感染の期間に合成される。対応するIgG抗体がまた合成され、結合活性を増加させることを伴う、延長された期間の間固執した。さらに、それらは、以前にウイルスに感染された個体からの回復期の血清及び血清の中にある最も普及しているHEV抗体だった。それらの結果は、pE2がHEVに対する保護を与えることを示唆し、さらにマカクサルの実験感染での保護研究によって支持される。さらに、結果は、保護的影響は、主に、線形エピトープの表現に反対するようにpE2ペプチドの二量化によって表現される整合の抗原決定基群に起因し、ワクチン開発のための合理的な基礎を提供することが示唆される。
【0107】
マカクサルのモデルを用いる実験感染での保護研究は、pE2ペプチドの精製された調製を用いる免疫処理がHEV抗原投与に対する動物の保護を与え、したがって主要なワクチンの候補となることを示している。伝染性の服用量は、ゲノムの服用量に接近することが分かった。また、実験的な伝染に関連した病理学は、人間における自然感染に関連した病理学に匹敵した(Tsarev et al., 1993; Tsarev et al., 1994b)。細菌的に表現されたペプチドがHEVに対する保護を与えるかどうかを明らかに示すことを得るために、本試験で使用された動物は、HEVウィルスの相同的な菌株と同等な少なくとも105のゲノムを含む比較的大量の投与で抗原投与された。糞の中のウイルス排出物、及びコントロール動物で見られたビラエミラ(viraemia)は、免疫になった動物の中で本質的に廃棄された。それらの動物のうちの何れも、抗原投与以前にすでに存在する抗pE2抗体から分離する追加的なHEV抗体を発展しなかった。事前の抗原投与の血清中に存在する抗pE2抗体がpE2のモノマー形態よりもpE2のダイマー形態を特異的に認識することにより優勢であるため、保護的影響が、ウィルスペプチドの二量化から起こされる整合抗原決定基群に大いに起因すると結論された。この確信と一致して、pE2ペプチドの研究及び特徴付けは、おそらくHEV(それはHEVカプシドを形成するために相互に作用する)の主な構造タンパク質中の領域を包含することを示唆している。したがって、ウィルスカプシドは、pE2二量化により産出されるウィルスカプシドと比較して、同一若しくは同様な整合抗原決定基群から産出される。結果として、pE2ダイマーに特異的な抗体は、自然のHEV感染の反応において優勢な抗体である。
【0108】
210のアミノ酸のHEVペプチドのpE2に特異的なヌクレオチド配列は、報告されたヌクレオチド配列と比較された、プロトタイプのHEV菌株の対応する領域のアミノ酸配列を予測する。210のアミノ酸のペプチドは、HEVゲノム(表1)のORF2の保存性の高い領域でエンコードされている。免疫処理のために使用されたウィルスペプチドの純度は、SDSPAGE(図7A、レーン3)及び上記ペプチドの抗原性、ヒトHEV活性(図7C、レーン3)を用いた免疫ブロッティングによって評価された。タンパク質の90%以上を構成するPE2は、免疫処理のために使用されて精製された調製に存在する。ダイマー状の形態は、HEV活性ヒト血清(図7C、レーン3)によって特異的に認識されるが、しかし23kDのモノマー状の形態(図7C、レーン4)では認識されない。かかる結果は、ヒトの血清に存在している抗HEV抗体は、ウィルスペプチドの二量化から起こされる整合の抗原決定基群に対して主に導かれることを示唆している。
【0109】
免疫化
3匹のテストサル(M1、M2、M3)が、精製されたpE2ダイマーの100μgの調製の投与を4週間ごとに筋肉内投与されて免疫処理された。他の3匹のサル(M5、M7、M8)は、コントロールとして、プラシーボを与えられた。動物は、4回の免疫処理投与後2週間採血され、血清は精製されたpE2、GE3に対するウェスタンブロッティング及び市販のELISAテストによってテストされた。続いて、動物は最終の免疫処理投与に続く2週間にHEVの相同性菌株と等価の105ゲノムで抗原投与された。
【0110】
免疫処理に反応する抗体は、精製されたpE2ペプチドで合成されたELISAを用いてモニターされた(図18)。結果は、免疫処理は、すべての3匹の動物(M1乃至M3)のウィルスペプチドに対する活発な抗体反応を誘発したことを示している。抗体は、第一免疫処理後の一週で最初に検出され、三回目の投与を受けた後の約一週で最高レベルに到達した。コントロール動物は、検出可能なpE2特異的抗体を示していない。すべての3匹の動物に見られた活発な反応は、pE2が強い抗原性であることを示している。
【0111】
ウィルスの抗原投与の直前に採取されたHEV特異的血清は、在来(例えば、pE2ダイマー)と同じサンプル、熱変性されて精製されたpE2(例えば、pE2モノマー)(図19A、レーン1乃至4)、精製されたGE3融合タンパク質(図19B)に対するウェスタンブロッティング及びHEV(図19C)を検出するための市販のELISAアッセイによって解析された。後者のアッセイは、ORF2及びORF3特異的なタンパク質のカルボキシ末端領域のアミノ酸配列に対応する二つの合成HEVペプチドの混合物によって生成されたELISAである。製造者のインストラクションによると、アッセイは二つのHEVペプチドを活用し、一つはpE3(例えば、GE3)と同様で、もう一つはpE2と重ならないが、隣接して位置している、HEVの主な構造的タンパク質のカルボキシ末端領域に対応する。
【0112】
図19Aは、連続的に4倍まで希釈された血清の分割量を用いてウェスタンブロッティングによってpE2ダイマー及びモノマーに対する抗体レベルの決定を示す。M1からの血清は、4000倍の希釈(レーン1)と256000倍の希釈(レーン4)間でテストされ、M2からの血清は、100倍希釈(レーン1)と6400倍希釈(レーン4)間でテストされ、M3からの血清は、250倍希釈(レーン1)と16000倍希釈(レーン4)間でテストされた。ブロットは、精製されたpE2ペプチドのダイマー状及びモノマー状形態の等価な調製で生成された。何れかの形態に対する抗体のレベルは、ペプチドのそれぞれの形態に対する活性である、血清の最大希釈(希釈の上限)として定義された。結果は、M1から採取された血清におけるダイマーに対する抗体のレベルは、制限希釈が4000倍である、モノマーに対する抗体レベルよりも16倍高い、64000倍希釈であることを示している。M2及びM3から採取された血清でのダイマーに対する抗体のレベルは、それぞれ1600倍希釈及び4000倍希釈で、同一の血清でのモノマーに対する対応する抗体のレベルよりも、それぞれ16倍及び4倍以上高い。免疫処理以前にそれらの動物から採取された血清の何れも、100倍希釈の血清(図19A、レーン5)において検出可能な活性を示さなかった。
【0113】
図19Bは、100倍希釈において、血清の何れも精製されたGE3に対して活性がないことを示している。同一の血清は、主要なHEV構造タンパク質のカルボキシ末端に対応する合成ペプチド及びHEVゲノムのORF3により特異的なタンパク質で製造された、市販のELISAによって同一の希釈率でテストされた。図19Cは、血清の何れもかかるHEVペプチドに対して検出可能な抗体を含んでいないことを示している。コントロール動物からの血清はまた、上記に記載の方法によって同様にテストされ、血清の何れも、同様の上記の何れの方法による検出可能なHEV抗体を示さなかった。
【0114】
したがって、それらの結果は、pE2ペプチドは高い抗原性を有し、例えば、マウス、ラット、羊若しくはウサギのような他の哺乳類のホストにおける免疫反応を活性化することができるように、サルにおける活発な抗体反応の誘発が可能であることを示している。免疫処理に反応して生成された抗体は、pE2ダイマーに対して優先的に活性である。上限希釈によって決定されている、それらの抗体のレベルは、モノマーに対する抗体の対応するレベルよりも4乃至16倍高い。これは、pE2がモノマー形態よりも高いレベルの抗体生成を引き起こすために、pE2ダイマーが優性な抗原であることを示している。さらに、精製されたpE2を用いる免疫処理は、他の市販の可能な方法による検出可能な他のHEV抗体の生成を誘発しない。したがって、精製されたpE2に対して起こされたこのような抗血清は、pE2に対して特異的であり、より詳細には、ペプチドのダイマー形態に対して特異的であることが、これらの結果から結論とされる。さらに、モノマーにおける上限希釈を越えて希釈された抗血清は、モノマーに対してではなく、ダイマーに対してのみ活性を与えられた。免疫学の通常の実行と一致して、ここに記述のように適切な希釈によるダイマーにおいて“単一特異的(monospecific)”を与えられた抗血清は、抗血清に含まれているモノマー及び線形のエピトープからのダイマーによって表現されたダイマー、及び整合の抗原決定基群を識別するために使用することができる。
【0115】
HEV抗原投与
3匹のテスト動物(M1、M2、M3)及び3匹のコントロール動物(M5、M7、M8)が、HEVの相同な菌株の腹膜内注射による免疫処理に続き2週間抗原投与された。抗原投与するウィルスは、1986年に中華人民共和国での発生(表1、菌株D11092)から元来抽出されて、ウィルスの注入量は、1回の投与が105HEVゲノム等価であるようにPCRによって測定された(図20)。注入された抗原投与するウィルスの霊長類の感染投与は、決定されなかった。他の調査による最近の研究は、HEVの霊長類の感染性滴定は、ゲノムの滴定と同一の度合いであることが示された。
【0116】
実験的な感染が続き、動物の肝炎Eウィルスの発達を毎日観察された。ウィルスの排出物が、感染の前と後の2日置きに採取された糞のサンプルにてモニターされた。末梢血サンプルは、血漿及び末梢血単球細胞(PBMC)でのウィルス負荷の決定をするために、1週間に2回採取された。血清の検体は、ALTレベルの決定をするために採取された。動物の両グループは、正常なALTレベルを有し、肝炎Eの兆候の発展は観察されなかった。これは、ウィルスが霊長類での過去の系によって弱毒化されたものと推測される(Zhuang et al., 1992)。それにもかかわらず、表8は、一つのコントロールサンプルのM5が、感染後5日目と17日目間から採取されたすべての糞のサンプルからウィルスの排出物を確認したことを示している。ウィルスの排泄物は、他のコントロール動物のM7及びM8にて7日目から17日目までの10日間持続した。HEVゲノムはまた、感染後の9日目のM7及び13日目のM8から採取したPBMC検体にて検出された。HEVゲノムは、それらの動物から採取された何れの血漿サンプルからも検出されなかった。pE2ペプチドで免疫処理された二つのテスト動物のM1及びM2でのウィルスの排出物は完全に除去され、それは3番目のテスト動物のM3での1日のウィルス排出物を縮減し、ウィルスのゲノムは、それらの動物から採取された何れの血漿若しくはPBLサンプルでは検出されなかった。
【0117】
【表8】
ウィルス抗原投与後のHEVセロコンバージョン(seroconversion)
ウィルス抗原投与前及び後の4週間までに採取された血清サンプルに存在するHEV抗体のスペクトルは、図19に記載の実験的な方法及び状況にしたがって解析された。図21は、ウィルス抗原投与の前にすべてのコントロール動物(M5、M7、M8)から採取された血清が、初期のすべての3つのHEV抗体アッセイによってネガティブが与えられた。HEVセロコンバージョンは、一つのコントロール動物のM5において、感染に続いて7日で発生した。これは、この日に採取された血清のpE2ホモダイマー特異的抗体の検出及びすべての続く出来事によって立証された(図21)。すべての血清サンプルはまた、市販のELISAテストによるHEV抗体のための可能なテスト結果を与え、7日目及び14日目に採取された一連のサンプルは、同様に精製されたGE3に対して活性であった。感染に対する抗体反応の幅広い特異性のスペクトルは、初期に記載したpE2ペプチドでの免疫処理に対する抗体反応の制限された特異的なスペクトルとは対照的である(図21)。感染後の14日目及び21日目の別のコントロール動物M7から採取した血清検体は、pE2ダイマーに対して若干活性で、市販のアッセイによってポジティブな結果が得られ、検体の何れもORF3特異的ペプチドGE3に対して活性ではない。残りのコントロール動物のM8は、感染に対する検出可能な抗体反応を上昇しなかった。対照的に、pE2抗体を除外すると、免疫処理された動物は、感染後に他の抗体を得られなかった(図21)。
【0118】
免疫処理された動物(M1、M2、M3)から採取された血清は、ウィルス抗原投与以前の日にちにおいてpE2ダイマーに対してすでに活性であり、抗体は、ウィルス兆銭後の7、14及び28日後のそれらの動物から採取された続くサンプルに持続していた。しかしながら、コントロール動物とは対照的に、免疫処理された動物の何れもがウィルス抗原投与後に追加的なHEV抗体を得られなかった。
【0119】
考察
過去の研究では、アカゲザルがHEVにおける適切な動物モデルであった。伝染性の投与量は、ゲノムの投与量にほぼ同等なことが分かった(Tsarev et al., 1994b)。また、実験の伝染に関連した病理学は、人間の自然感染に関連した病理学に匹敵する(Tsarev et al., 1993b)。細菌的に発現されたペプチドがHEVに対する保護を供給するかどうかの明らかな示唆を得るために、当研究において使用された動物は、HEVウィルスの相同的な菌株と等価の少なくとも105のゲノムを含んでいる比較的大きな投与量で抗原投与された。我々は、すべての三つのコントロール動物によって少なくとも10日間排泄物のサンプル中の延長されたウイルス排出物に伝染が起因していることを示した。また、2匹の動物における一時的なビラエミアは、PBMC検体でのウイルス・ゲノムの検出によって証拠づけた。さらに、感染は、2匹の動物でのHEVセロコンバージョンによって伴われた。抗原投与するウィルスは霊長類における過去の感染系によって弱毒化されているためと仮定されるが、しかしながら、すべてのコントロール動物は通常のALTレベルで健康を維持している。
【0120】
精製されたpE2での免疫処理は、モノマー及びダイマー形態の両者におけるペプチドに対する活発な抗体反応を誘発することが分かった。ダイマーの活性な抗対のレベルは、モノマーに特異的な抗体の対応するレベルよりも実質的に高い。それらの抗体とは関係なく、血清は他のHEV活性を表現しない。pE2活性抗体は、免疫処理された動物での実験的な感染を防ぐために明白に提供された。排泄物でのウィルスの排出物は、二つの免疫処理された動物で廃棄され、第三の動物では、コントロール動物では1日で観察された、排出物の持続期間は10日以上から縮減されたことが示された。免疫処理された動物の何れもPBMC若しくは血漿検体にて検出可能なウィルス負荷が隠されて、pE2特異的抗体とは関係なく、それらの動物の何れもウィルス抗原投与後に追加的なHEV抗体を得られなかった。
【0121】
組換えて発現されたpE2ペプチドがHEVの相同的な菌株を伴う霊長類の実験的な感染を防ぎ、その防御がpE2ペプチドのダイマー形態に対する抗体に大いに起因することが結果から示された。pE2は、メキシコ(Huang et al., 1992)及び米国(Schlauder et al., 1998)から最も遺伝的に分岐した分離株を含む異なるHEV分離株において保存性が高いため、pE2ペプチドがHEVの他の菌株による感染に対して同様に防御するであろう。
【0122】
次の実施例は、創造性のある概念の実例の目的のために供給され、追加された請求項によって確定されるような発明の範囲を限定するようには意図されない。
【0123】
実施例
ウィルス菌株−DDBJ 承認番号 No.D11092の中国HEV菌株は、H.Zhuang教授、Beijing Medical University, P.R. China (Aye et al., 1992)からの寛大な提供による。Zhuang(Zhuang et al., 1992)により記載された方法にしたがって実験的に感染されたマカクサルの胆汁が採取され、糞検体が肝炎E患者から採取された。
【0124】
血清−ここに記載されて使用された96の血清は、現在若しくは過去において非A、B、及びC急性肝炎の香港のプリンスマーガレット病院に登録されている患者から採取された。検体は、入院中若しくは病院から解放された後の異なる期間において、患者から集められた。
【0125】
実施例1−HEVカプシド遺伝子のクローニング
HEV RNAの抽出
ウィルスのRNAは、製造者の手引書に従い、QIAamp Virus RNA Kit(QIAGEN, GbmH, Hilden, Germany)を用いて実験的にHEV感染したマカクサル(Zhuang et al., 1992)の胆汁から抽出された。精製されたRNAは、2倍量のイソプロパノール(BDH Laboratory Supplies, England)及び1/10量の3M NaAc(pH6.4)(Sigma, USA)で混合され、1時間マイナス20℃で放置された。その後、混合物は15000prmで15分間遠心分離された。ペレットは、70%エタノール(BDH Laboratory Supplies, England)で一度洗浄され、次いで逆転写バッファーにて再懸濁された。
【0126】
標的配列のRT−PCR
逆転写において、RNAのペレットは20μlのRTマスターミックス(4μlの5xRTバッファー(ベーリンガーマンハイム);1.6μlの2.5mM dNTP;0.2μlの鳥類の骨髄芽球症ウィルス(AMV)(ベーリンガーマンハイム);0.625μlのRNAsin(ベーリンガーマンハイム);1μlのリバースプライマーE5R又はER3(150μg/μl);12.6μlのRNAseフリーの水)に添加され、42℃で1時間インキュベートされた。
【0127】
使用されたプライマーは、表9にリスト化してある。E5R及びER3は、ウィルスのcDNAフラグメントを構成するために設計された。ORF2及びORF3の3´末端領域に対応するcDNA配列が、それぞれのプライマーのペアORF2F/ORF2Rb及びORF3F/ORF3Rを用いて増幅された。上記のプライマーは、増幅されたcDNAフラグメントのクローニングを容易にするために、BamHI及びEcoRI制限部位を含むように修正された。すべてのプライマーは、Life Technologies,USAによって合成された。
【0128】
6957の位置に単一の塩基対の欠損を含有している6326乃至7136位置までにわたっている、オリジナルのcDNAは、ORF2F/ORF2Raのプライマーのペアを用いてORF2領域からクローニングされた。しかしながら、新規なE2cDNA配列(SEQ ID NO:1)は、ORF2Fの同一の上流のプライマーを用い、同じ領域からクローニングされ、新規な下流のプライマーであるORF2Rbは、配列位置6932乃至6956に位置してクローニングされた。新規なクローニングされた配列は、pE2ペプチド(SEQ ID NO:2)と同一な配列をエンコードしたが、新しい停止コドンの下流に位置する配列だけが除去された。
【0129】
【表9】
標的配列cDNAのPCR増幅は、5μlのcDNAを45μlのPCRマスターミックス(5μlの10xTaqバッファー(ベーリンガーマンハイム);4μlの2.5mM dNTP混合物;1.0μlの各プライマー(150ng/μl);1μlのTaq DNAポリメラーゼ(1U/μl)(ベーリンガーマンハイム))及び33μlの超純水に添加することによって実行された。PCRの混合物は、50μlのミネラルオイルによって覆われた。温度サイクルの条件は、変性が94℃で40秒、アニーリングが57℃で40秒、伸長が72℃で1分間である。結果となるPCR生成物は、ORF2及びORF3のそれぞれから設計されたE2及びE3である。
【0130】
pGEXプラスミドへのクローニング
PCR産物はフェノール−クロロフォルムで抽出され、次いでエタノールで沈澱された。PCR産物E2とE3及びベクターpGEX20は、BamHI及びEcoRI(ベーリンガーマンハイム)を用いて切断された。ベクターpGEX20は、香港大学の微生物学部のDr.Cao Liangからの提供である。ベクターpGEX20は、BamHI、EcoRI、XhoI及びClaIの制限部位の認識配列を含有する複数のクローニング部位5´―CCGCGTGGATCCGAAATTCCTCGAGATCGATTAG―3´を伴うpGEX発現ベクター(Smith et al., 1988)の派生物である。切断されたフラグメントは、アガロースゲルにて分離され、電気分解したゲルからバンドを切り出して回収し、次いでエタノールによって沈澱された。次ぎに、E2及びE3は、T4ライゲース(ベーリンガーマンハイム)を用いてpGEX20にライゲートされた。組換えプラスミドpGEX20−E2及びpGEX20−E3は、gene pulser(バイオ−ラッド)によってE.Coli DH5αに電気的な形質転換によって形質転換され、アンピシリン(100μg/ml)を伴うLB寒天平板(Sambrook et al., 1989)に植え付けられた。形質転換した20のコロニーをプラスミド調製のために採取した。BamHI及びEcoRIの切断が続いて行なわれ、予期される挿入の大きさの組み替え体が選択された(図6)。本研究にて使用されたすべてのプラスミドは、QIAgen mini−plasmid kit(QIAgen, Hiden, Germany)を用いて調製された。
【0131】
シークエンシング
DNAシークエンスは、ABI PRISM Dye Terminator Cycle Sequencing Kit(パーキンエルマー)を用いて実行された。結果は、811bpのE2配列が6326乃至7136部位に位置し、おそらくPCR増幅のエラーによると仮定される、6957位置における単一の塩基対の欠損が明らかになって示された。結果となるフレームシフトは、当初に期待したような267のアミノ酸の代わりに、23kDの分子量を備えた213のアミノ酸の期待したより小さなペプチドを与える位置6968で新しい停止コドンで翻訳を時期尚早に終了を引き起こすことを予期された。E2の位置及び相対するフラグメントは、図1に示されている。
【0132】
実施例2−HEVペプチドの生成及び精製
GST融合タンパク質の発現
組み合わせプラスミドはE.coli BL21に形質転換された。単一のコロニーが採取されて、2xYAT培地(トリプトン 16g/l;イースト抽出物 10g/l;塩化ナトリウム 5g/l;アンピシリン 100μg/l)で培養された。オーバーナイトの培養(4ml)は400mlの2xYAT培地に植え付けられ、28℃にてOD600が0.5以上になるまでインキュベートされた。イソプロピルβ−D−チオガラクトシド(IPTG)(ファルマシアバイオテク、米国)(400μlの100mM溶液)が添加され、培養は5乃至6時間かけて成長された。細胞は、ベックマンJ2−MCのローターJA−14にて7000rpmで10分間遠心回転されてペレットにされた。
【0133】
精製
ペレットは、リン酸食塩水バッファー(PBS:0.8%塩酸;0.02%塩化カリウム;0.144%Na2HPO4;0.024%KH2PO4,pH7.0)で一度洗浄され、20mlのPBSで再懸濁され、SONIPREP 150 (MSE)(30秒間可動;30秒間停止;35回;18乃至22パワー)にて超音波処理された。超音波処理後、Triton−X100(シグマ、米国)が、1%の終濃度になるように添加され、混合物は30分間穏やかに攪拌された。細菌の溶菌液は4℃で遠心分離されて、上澄み液が集められた。融合タンパク質のバッチ精製が、グルタチオンセファロース−4B(ファルマシアバイオテク、米国)を用いた“GST融合タンパク質システムマニュアル”にしたがって実行された。結合融合タンパク質は、溶出バッファー(50mMのトリス−塩酸、pH8.0の10mMの還元されたグルタチオン)にて2回溶出され、それぞれのORF2及びORF3のcDNAフラグメントに対応するGE2及びGE3として回収される。
【0134】
バルクマトリックスに結合の融合タンパク質のトロンビン切断
トロンビン(ファルマシアバイオテク、米国)(5μlの1U/μl溶液)及び95μlのPBSが100μlのベッド体積のGE2が結合しているグルタチオンセファロース−4Bに添加され、22℃で16時間インキュベートされた。上澄み液が遠心分離によって集められ、マトリックスの第二洗浄の上澄み液を伴ってプールされた。このトロンビンが切断されたタンパク質は、計画的なpE2であった。
【0135】
実施例3−HEVペプチドの識別
SDSポリアクリルアミドゲル電気泳動(SDS−PAGE)の解析
標準的な方法(Sambrook et al., 1989)にしたがって、10%のSDS−ポリアクリルアミドゲルがセットされた。ペプチドの検体(4μg)がゲルにロードされて、Minigel Twin G42(バイオメトラ、ドイツ国)を用いて100ボルトで3時間電気泳動された。ゲルは、45mlメタノール、45ml水及び10ml氷酢酸の混合物のクマシーブリリアントブルーR250で染色された。
【0136】
ウェスタンブロッティング
SDS−PAGEの後、ゲル内のタンパク質は、Mini−PROTEAN II Cell(バイオラッド)を用いて100ボルトで1時間の条件で0.45μmのニトロセルロースメンブラン(バイオラッド、米国)に転写された。ブロットされたものを5%のスキムミルク(Carnation, Nestle)で1xPBSで4℃にてオーバーナイト浸透した後、メンブランは、肝炎E患者から集められてプールされた血清(500倍希釈)若しくはギニアピッグから採取された抗GST血清(1000倍希釈)と室温で1.5時間反応された。PBSでの0.05%Tween20(登録商標)で毎回5分間の洗浄を3回繰り返し洗浄した後、メンブランはプロテイン−A(バイオラッド、米国)が結合しているホースラディッシュペルオキシダーゼ(HRP)と室温にてさらに1.5時間反応させた。再度3回洗浄した後、ポジティブバンドが、3−アミノ−9−エチルカルバゾール(AEC Single Solution, ZYMED, USA)によってメンブランを室温にて5乃至10分間のインキュベーションによって現像される。発色反応は、メンブランを水に浸けることによって停止される。血清及び上記に記載の結合物は、ブロッキングバッファー(1xPBS内の5%のスキムミルク(Carnation、ネスレ))にて希釈された。
【0137】
実施例4−抗HEVIgG及びIgMを検出するELISAの確立
血清の供給源
香港のプリンセスマーガレット病院で集められた非A、B及びC肝炎の96名の患者からの血清が研究された。それらの血清のうち、96のうちの74サンプルは、市販のHEVキット(Genelabs, Singapore)によってさらにテストされた。90名の健康なドナーからの血清は、クィーンメリー病院にて採取された。
【0138】
HEVペプチド抗原を用いるELISA
何れかのpE2若しくはpE3に特異的なアッセイが、0.063μg/mlの精製されたpE2ペプチド(0.05M炭酸ナトリウム、pH9.5の6.3ng/100μl)若しくは0.23μg/mlのGE3(0.05M炭酸ナトリウム、pH9.5の23ng/100μl)を伴うポリスチレンのマイクロタイタープレート(Nunc、デンマーク王国)を各ウェルへのコーティングによって合成された。使用されるペプチドの濃度は、適切になるように事前に決定される。4℃でのオーバーナイトのインキューベーション後に、ウェルは350μlの洗浄バッファー(PBS内の0.05%Tween20(登録商標))で洗浄され、次いで2%のウシ血清アルブミン(BSA)(シグマ、米国)をPBSで24時間4℃にでブロックされる。プレートは、洗浄バッファーで再度2回洗浄された。HEV抗体のレベルは、0.1mlの血清検体を100希釈で同一に複製されたウェルに添加することによって決定された(希釈液:1%BSA、PBS中の0.2%Bronidox)。37℃で30分間のインキューベーション後、ウェルはPBS内の0.05%Tween20で5回洗浄された。IgM抗体は、25000倍に希釈されたホースラディッシュペルオキシターゼ(HRP)が結合したヒト抗体IgM特異的な抗血清(BIOSOUC)及び16000倍に希釈されたHRPが結合されたプロテインAを伴うIgG抗体(バイオラッド)(希釈液:1%BSA、0.2%Bronidox、PBS中の10%スクロース)によって決定された。37℃で30分間のインキューベーション後、ウェルは5回洗浄されて、100μlのTMB基質(3、3´、5、5´−テトラメチルベンジジン)(Diesse,イタリア)を添加された。37℃で15分間のインキュベーション後、0.3MH2SO4によって反応は停止された。プレートは、Anthos2001マイクロプレートリーダー(ANTHOS LAB)によって450nmで読まれた。分離したテストの実行で獲得された結果を比較するために、各実行されたテスト血清から獲得されたOD値は、同時に得られた標準血清に対して標準化される。抗pE2IgG遮断値は、ウェスタンブロッティングにより事前にテストされた非活性血清の平均OD値を上回って3SDにセットされた。抗pE2IgG遮断値は、健康な血液のドナーの血清の平均OD値を上回って3SDにセットされた。
【0139】
pE2IgG結合活性テスト
血清は連続的に希釈され、複製されたウェルのpE2でコーティングされたマイクロプレートによって反応された。37℃で30分間のインキューベーション後、ウェルは洗浄され、次いでPBS(コントロール)若しくは4M尿素を含有するPBSにて室温で10分間処理された。プレートが洗浄され、次いで先のようにHPR−プロテインAで反応された。
【0140】
実施例5−ウェスタンブロッティングによるIgG抗pE2の検出
血清の供給源
実施例4で使用されたすべての血清を、ウェスタンブロッティング技術を用いて再テストされた。
【0141】
ウェスタンブロッティング
34μgの精製されたpE2が、SDSポリアクリルアミドゲルの70mm幅の単一レーンにロードされ、100ボルトで3時間電気泳動された。電気泳動後、ペプチドは0.45μmの100%のニトロセルロースメンブラン(バイオラッド)にMINI−PROTEAN II Cell(バイオラッド)を用いて100ボルトで1時間転写された。ブロッキングバッファーを4℃でオーバーナイトで攪拌した後、メンブランは2mmのストリップに切断された。ストリップは、250倍に希釈された各血清にそれぞれ1.5時間インキュベートされた。それらは洗浄バッファーで5分間の洗浄され、ついで30000倍に希釈されたアルカリフォスファターゼが結合されたヤギ抗ヒト抗体(シグマ、米国)で室温で1.5時間インキュベートされた。3回の洗浄後、BCIP/NBT混合液(Gibico BRL、米国)が発色反応のために添加され、反応はストリップを水に浸けることによって停止した。結果は、殆どの抗体が、pE2のモノマー形状ではなく、ダイマー形状の結合に起因するELISAによって決定されたことが、確認された。
【0142】
実施例6−免疫捕獲RT−PCR(IC−RT−PCR)
特異的なウサギポリクローナル抗体の生成
HEVに対する抗体の生成のために使用される抗原は、グルタチオンS−トランスフェラーゼ融合たんぱく質、GE2のように開発されたpE2ペプチドである。体重が2.5乃至3.0kgのメスの白うさぎが、100μgの抗原によって免疫処理された。第一投与は、完全なフロイントアジュバントと等量を含んでいる。不完全はフロイントアジュバントは、10乃至14日のインターバルスケジュールでの続く投与にて使用された。ウサギ抗体の10000倍に希釈されたELISAによろ検出可能なレベルまで特異的な抗体が上昇した場合、ウサギは、PBS中の100μgの抗原を静脈に追加投与された。追加投与後の4日目に、血液は心臓に穴をあけて採取された。特異的な抗体は、ウェスタンブロッティング及びELISAによって評価された。
【0143】
糞便の懸濁の調製
13人の急性肝炎E患者の糞便が、First People’s Hospital of Guangzhouにて採取された。3匹の実験的に感染されたサルの糞便は、HEVを植え付けた後の0乃至30日にて採取された。
【0144】
糞便検体(5g)は、20mlの1xPBSで混合され、4℃で1時間インキュベートされた。混合物は1500rpmで10分間遠心分離されて、上澄み液は免疫捕獲のために回収された。
【0145】
甲殻類の均一化された懸濁液の調製
64の甲殻類検体は、香港周辺の市場から収集され、17の検体は、環境保護局(Department of Environmental protection)から収集された。
【0146】
甲殻類の肉の20gは、穏やかに混和されて、均一化された物は100mlの0.2Mグリシン−0.15M塩化ナトリウムバッファー(pH9.5)及びCat−Floc(1%w/v)の2mlの保存溶液で混合された。結果となる混合は、攪拌され、4℃で10分間インキュベートされた。混合液は、ついで5分間1000rpmにて遠心分離された。上澄み液は、免疫捕獲のために収集された。
【0147】
HEV粒子の種付け
HEV粒子を含む胆汁は、Zhuang Hui教授(Beijing Medical University)によって親切にも提供された確認された実験的に感染されたマカクサルから収集された。胆汁は、PBSで1%のBSA200倍に希釈され、これを保存液と呼ぶ。保存溶液は、50乃至56まで5倍連続して希釈され、これを反応溶液と呼ぶ。反応溶液の10μlの各分注量は、IC−RT−PCR及び直接的なRT−PCRの比較のために、HEVの植付け検体を合成するために、5mlの何れかの水、糞便の上澄み液、若しくは甲殻類の上澄み液と混合された。
【0148】
免疫捕獲
50mM炭酸ナトリウム/炭酸水素ナトリウムバッファー(pH9.6)で200倍に希釈された抗血清は、コーティング溶液として使用された。Nunc−Immuno paddle(Nunc、デンマーク王国)は、1mlのコーティング溶液によってチューブ内で37℃で4時間インキューベーションされた。抗血清は除去され、パドルを37℃で1時間インキュベートすることによって、PBS中の1mlの2%ウシ血清アルブミン(BSA)で置きかえられた。次いで、パドルはPBSの0.05%Tween20(登録商標)で洗浄され、免疫捕獲のために試験管に移された。甲殻類の上澄み液若しくは20%の糞便の上澄み液(4.5ml)が試験管に添加され、試験管は4℃でオーバーナイとで穏やかに攪拌された。次いで、免疫パドルと呼ばれるパドルは、PBSの0.05%Tween20(登録商標)で3回洗浄され、HEVのRNAの検出のためのRNA抽出及び入れ子RT−PCRのために、マイクロ遠心試験管に移された。
【0149】
ウィルスRNAの抽出
RNAseフリー水(140μl)及びAVLバッファー(560μl)が、免疫パドルを含む試験管に添加された。次いで、ウィルスのRNAは、“QIAgen Viral RNA Handbook”の手引きにしたがって抽出された。その後、1/10量の2M酢酸ナトリウム(pH 4.6)及び1体積量のイソポロパノ−ルが、精製されたRNAに添加された。混合物は攪拌され、マイナス20℃で1時間放置され、次いで14000rpmで4℃で15分間遠心分離された。ペレットは、事前に冷却した70%エタノールで一度洗浄された。遠心分離後、エタノールは注意深く除去され、特定のcDNAに逆転写する前に、ペレットは室温で15分間風乾された。
【0150】
逆転写(RT)及び入れ子PCR
RT及びPCRに使用されたプライマーは、表9にリスト化されている。外側のプライマーのペアは、AR5及びA3Rで、内側のプライマーはB5F及びB3Rである。
【0151】
RT−PCR:各RNAペレットは、20μlのマスターミックス(4μlの5xRTバッファー(ベーリンガーマンハイム)、1.6μlの2.5mMdNTP,0.2μlの25U/μlの鳥類の骨髄芽球症ウィルス(AMV)(ベーリンガーマンハイム)、0.625μlの40U/μlのRNAsin(ベーリンガーマンハイム)、1μlの150ng/μlのリバースプライマー(A3)及び12.6μlのRNAseフリーの水)と混合された。42℃で1時間のインキューベーション後、cDNA(5μl)が、45μlのPCRマスターミックス(5μlの10xTaqバッファー(ベーリンガーマンハイム)、4μlの2.5mM dNTP混合物、1.0μlのフォワード及びリバースプライマー(150ng/μl)(A3及びA5)、1μlの1U/μl TaqDNAポリメラーゼ(ベーリンガーマンハイム)及び33μlの超純粋水)に添加された。PCR混合液は、50μlのミネラルオイルによって覆われた。増幅は、DNA Thermal cycler 480(Perkin−Elmer Cetus)によって、下記の条件で実行された:94℃で40秒間の変性;57℃で40秒間のアニーリング;72℃で1分20秒間の伸長反応。処理は、72℃の最終の自動伸長に続き、全体で35サイクル行なわれた。
【0152】
入れ子PCR及びアンプリコン検出:2μlの第一のPCR産物が、プライマーB3及びB5のみが含まれていない第一のPCRと同一の状態の48μlのPCRマスターミックスに添加された。5μlのPCR産物及び50bpのDNAラダー(GibcoGRL)は、2%アガロースゲルにTBEバッファーでロードされ、100ボルトで30分間電気泳動された。ゲルは、0.5μg/mlのエチジウムブロマイドで15分間染色され、次いで、UV光にて可視化された。
【0153】
実施例7−HEVほごにおけるpE2の役割
動物
野性型サルのアカゲザルマカクは、1ヵ月間隔離されて、ALT及びHEV抗体のテストのために採血された。60以上のALT/AST若しくはIgG抗HEVポジティブのサルは、試験から除外された。サルは、3つのグループ、1つのテストグループ、及び1つのコントロールグループに分けられた。各グループは、3匹の動物から構成された。
【0154】
免疫処理
テストグループは、100μgの精製されたpE2を各々含有する筋肉内投与を4週間にわたって免疫処理された。第一の投与は、等量のフロイントアジュバントを含有する。不完全なフロイントアジュバントは、続く投与に使用された。精子の検体は、HEV抗体の決定のために毎週採取された。特異的な抗体が十分なレベルまで誘発される場合、動物はI/V追加免疫が与えられた。動物の両グループは、HEVの相同性菌株の105ゲノムと等価の投与の静脈内注射によって最後に免疫処理されてから、二週間抗原投与された。糞便の検体は2日置きに採取され、末梢血液サンプルは感染後5週間にわたって毎週採血された。血漿及び末梢単球血液細胞(PMBC)は、フィコール−ハイパーク(Ficall−hypaque)勾配遠心分離(Knof et al., 1998)によって分離された。アラニンアミノトランスフェラーゼ(ALT)レベルは、自動解析機(Model7170、日立製作所、日本国)によって新鮮に回収された血清サンプルで決定された。血漿サンプルは、HEV抗体及びHEVゲノムを決定するために保存された。
【0155】
HEVペプチドの抗原投与
動物の両グループは、HEVの相同性菌株の105ゲノムと等価の投与の静脈注射によって最後に免疫処理されてから、二週間抗原投与された。
【0156】
霊長類のモニタリング
糞便の検体は、2日置きに採取され、末梢血液サンプルは感染後5週間続けて毎週採取された。血漿及び末梢単球血液細胞(PMBC)は、フィコール−ハイパーク(Ficall−hypaque)勾配遠心分離(Knof et al., 1998)によって分離された。アラニンアミノトランスフェラーゼ(ALT)レベルは、自動解析機(Model7170、日立製作所、日本国)によって新鮮に回収された血清サンプルで決定された。血漿サンプルは、HEV抗体及びHEVゲノムを決定するために保存された。
【0157】
HEV抗体のレベルは、Bijing Medical Universityによって製造された市販のHEV ELISAキットによって決定されまた、精製されたpE2ペプチドでコーティングされたマイクロタイタープレートによって生成されたアッセイによって決定された。精製されたウィルスペプチドに対する抗体は、約0.5μgのpE2若しくは100μgのGE3を10%のSDS−ポリアクリルアミドゲルの70mm幅スラブにロードする、ウェスタンブロッティングによって決定された。電気泳動後、ウィルスペプチドは電気泳動的にニトロセルロースメンブランに転移してブロットされた。かかるメンブランは、5%のスキムミルクを用いて4℃でオーバーナイト攪拌され、使用するために2mmのストリップに切断された。ホースラディッシュぺルオキシターゼ結合のプロテインA(バイオラッド、米国)は、第二抗体として2000倍希釈で使用された。
【0158】
PMBCのウィルスRNA及び血漿は、製造者の手引きにしたがって、QIAmp RNA Blood mini−kit及びQIAgen Viral RNA Kit(キアゲン、ドイツ国)を用いて抽出された。精製されたウィルスRNAは、逆転写され、次いで入れ子PCRで増幅された。逆転写に使用されるプライマーは、A3Rである。外側のプライマーのペアはA5F及びA3Rで、内側のプライマーのペアはB5F及びB3R(表9)である。
【0159】
免疫捕獲方法は、糞便検体におけるHEVの検出のために使用される。ポリスチレンオアドル(Nunc−Immuno paddle, Nunc, デンマーク王国)は、1mlの100倍希釈した高度免疫ウサギ抗pE2血清で37℃で4時間コーティングされた。コーティングされたパドルは、1mlのブロッキングバッファー(PBS中の2%ウシ血清アルブミン)で37℃、1時間処理することによってブロックされた。PBS溶解の0.05%Tween20での洗浄後に、パドルは4.5mlの20%の糞便の懸濁を含有する試験管に移された。試験管は、穏やかに4℃でオーバーナイトで攪拌された。次いで、パドルはPBS溶解の0.05%Tween20で3回洗浄され、QIAgen Viral RNA Kit(QIAGEN、ドイツ国)を用いるRNAの抽出のためにきれいな試験管に配置された。精製されたウィルスRNAは、すでに記載のように、逆転写され、増幅された。
【0160】
産業適用可能性
肝炎Eウィルス(HEV)の中国菌株のゲノムからクローンされた免疫活性が高いウィルスペプチドpE2は、ヒトにおけるHEVを防御するためのワクチンの構成及びワクチンの方法の発展と同様に、HEVの検出のための信頼の置ける診断方法及び診断アッセイの発展において占有的に使用される。
【0161】
【図面の簡単な説明】
【図1】 HEVゲノム内のオープンリーディングフレームORF1、ORF2、及びORF3のゲノム構造及びpE2及びpE3ペプチドのためのコード領域のおよその位置を例証する。
【図2A】 中国HEV菌株(DDBJ 承認番号 NO.D11092)のORF2のヌクレオチド配列及び上記配列から派生するE2フラグメントを提供し、単一の塩基対欠損がボックスによって示されている。
【図2B】 中国HEV菌株(DDBJ 承認番号 NO.D11092)のORF2のヌクレオチド配列及び上記配列から派生するE2フラグメントを提供し、単一の塩基対欠損がボックスによって示されている。
【図2C】 中国HEV菌株(DDBJ 承認番号 NO.D11092)のORF2のヌクレオチド配列及び上記配列から派生するE2フラグメントを提供し、単一の塩基対欠損がボックスによって示されている。
【図2D】 中国HEV菌株(DDBJ 承認番号 NO.D11092)のORF2のヌクレオチド配列及び上記配列から派生するE2フラグメントを提供し、単一の塩基対欠損がボックスによって示されている。
【図3】 中国HEV菌株(DDBJ 承認番号 NO.D11092)のORF3のヌクレオチド配列及び上記配列から派生するE3フラグメントを提供する。
【図4】 E2によってエンコードされているpE2ペプチドのアミノ酸配列を提供する。
【図5】 E3によってエンコードされているpE3ペプチドのアミノ酸配列を提供する。
【図6】 HEV遺伝子配列を運ぶ組換えプラスミドの特質を示している。HEV遺伝子のORF2の810bp配列を含む821挿入(レーン2)及びORF3の114bp配列を含む124挿入(レーン2)が、BamHI及びEcoRIによって組換えpGEX20プラスミドを切断することにより獲得された。かかる生成物の分子量は、マーカーと比較された(レーン1)。
【図7】 ORF2から発現された精製されたHEV組換えペプチドの特性を示す。精製されたpE2融合タンパク質、GE2(レーン1及び2)、pE2ペプチド(レーン3及び4)及びグルタチオンS−トランスフェラーゼ(GST)融合タンパク質(レーン5)が、GST−特異的抗血清及び(C)プールされたヒトHEV活性ヒト血清を使用して(A)SDSPAGE及び(B)ウェスタンブロッティングによって解析された。加えて、GE2及びpE2ペプチドのサンプルは、SDSPAGE(A)及びウェスタンブロッティング(B及びC)による後の解析(レーン2及び4)のために、100℃で3分間加熱された。かかる生成物の分子量は、マーカーと比較される(レーン6)。
【図8】 HEVゲノムのORF3から発現されたGST融合ペプチド、GE3の特質を示している。GE3ペプチド(レーン1)、100℃で3分間加熱されたGE3ペプチド(レーン2)及びGST(レーン3)は、GST−特異的抗血清及び(C)プールされたヒトHEV活性ヒト血清を使用して(A)SDSPAGE及び(B)ウェスタンブロッティングによって解析された。かかる生成物の分子量は、マーカーと比較される(レーン4)。
【図9】 pE2モノマーの抗原活性よりも約80倍強いpE2ダイマーの抗原活性を示している。図10において示されるような精製されたpE2の加熱及び非加熱の等価のサンプルを1.3乃至1360ナノグラム量を計り、200倍に希釈したプールされたHEV活性ヒト血清を使用してウェスタンブロッティングされた。プールされた血清によって検出されたpE2の最低量は、1360ngで、これは同一状況下で86ngを検出したpE2ダイマーの最低量よりも約16倍高い。制限している濃度でのダイマーに対する活性は、モノマーの制限している濃度に対して観察された反応よりも少なくとも5倍ほど強度が高いと予測された。したがって、pE2ダイマーの抗原活性は、pE2モノマーの抗原活性よりも約80倍強いと予測された。
【図10】 ダイマー及びモノマー形状の組み合わせpE2ペプチドの異なる抗原性を示している。精製されたpE2の1300ngを含む等価のサンプルが、ペプチドのダイマー形状をペプチドのモノマー形状に分離するために、100℃で3分間加熱された。加熱されたサンプルは、加熱されていない精製されたpE2サンプルと等しい割合で混合された。ペプチドの23kDモノマー形体及び42kDダイマー形体は、SDSPAGEによって分離され、メンブラン上にブロットされた。メンブランは、ウェスタンブロット解析のためにストリップ状に切断された。50倍に希釈された8の血清の試験は、pE2モノマー及びpE2ダイマーの両者に対して活性であった一方で、別の10の血清はpE2ダイマーに対してのみ活性であった。
【図11】 8M尿素で1時間かけて4℃(レーン1)、20℃(レーン2)、37℃(レーン3)及び45℃(レーン4)加熱された精製されたpE2ペプチドの処置を示している。8M尿素で1時間かけて45℃加熱された処理した精製されたpE2ペプチドと等価のサンプルはまた、1xPBSでオーバーナイトで透析された(レーン5)。5つのサンプルは、プールされたヒトHEV活性ヒト血清を使用して(A)SDSPAGE及び(B)ウェスタンブロッティングをされた。
【図12】 ELISAによって決定されるように、精製されたpE2若しくはGE3と反応されたヒトの3種類の血清に存在するIgG抗体のレベルを比較している。かかる血清に含まれているIgG抗体のレベルは、精製されたpE2若しくはGE3の調製の所定の最適な濃度によってコーティングされたマイクロプレートを用いる滴下によって決定された。ペプチドの調製は、SDSPAGE(左のレーン)によって解析され、100倍に希釈された血清を使用してウェスタンブロッティングによって試験された。ヒトの血清は、対応する組換えペプチドに対して、強い活性(個体の円)、弱い活性(ハッチドサークル)、若しくは非活性(開かれた円)の何れかである。抗体のレベルは、0.37の遮断OD値を越える、OD値を与える、血清希釈の逆数として定義される。
【図13】 精製されたpE2若しくはGE3に対して強い活性(個体の棒)、弱い活性(ハッチド棒)、若しくは非活性(開かれた棒)である、ELISAによって決定されるような非A,B,及びC肝炎を有する96名の患者から得られる血清に含まれるIgG抗体の分配レベルを示している。各血清検体は、ウェスタンブロッティングによって100倍の血清の希釈で試験され、精製されたpE2でコーティングされたマイクロプレートを用いたELISAによって解析された。抗体のレベルは、OD値によって確認され、ペプチドに対する血清の活性は、反応の強度によって評価された。
【図14】 疾病の発症に続くHEV抗体の時間分配を例証している。非A,B,及びC肝炎を有する96名の患者から得られる血清に含まれるpE2特異的(A)IgG抗体及び(B)IgM並びにpE3特異的(C)IgG及び(D)IgM抗体が、それぞれのHEVペプチドで合成されるELISAによって決定された。結果は、かかる血清が取られた場合に疾病発症後の時間の長さと比較された。遮断OD値(点線)は、pE2IgGで0.52、pE2IgMで0.57、GE3IgGで1.05及びGE3IgMで0.74であった。
【図15】 個別のHEV特異性の三つのELISAによる抗体の決定を例証している。非A,B,及びC肝炎を有する96名の患者のうちの74名の肝炎患者から得られる血清に含まれるHEV特異的抗体は、市販されているアッセイ(GeneLabs Diagnostics Pte Ltd., Singapore)によってさらに試験された。結果は、GE3に特異的(A、B及びC)若しくはpE2に特異的(D、E及びF)なアッセイによって得られた結果と比較された。事前に実行されたウェスタンブロッティングは、32の血清がpE2及びGE3(A及びD)に対して活性であり、14の血清がpE2のみに対して活性であり(B及びE)、40の血清はかかるペプチドの何れに対しても非活性(C及びF)であることを示した。遮断OD値(点線)は、市販のアッセイに対して0.6であり、pE2特異的IgGで0.52、及びGE3特異的IgGで1.05であった。
【図16】 精製されたpE2に対して起こされた抗血清でコーティングされたポリスチレンパドルによるHEVの特異的な免疫捕獲を示している。図19で記載される動物M1から取得された抗血清は、100倍に希釈され、ポリスチレンパドルをコーティングするために使用される。パドルは、別々に、HEV(レーン2)、HAV(レーン3)、カリシウィルス(レーン4及び5)、若しくは腸内ウィルス(レーン6)を含む溶液にオーバーナイトで浸透された。パドルは、溶液から除去され、バッファー溶液を4回変えて、洗浄された。パドルに結合したRNAは抽出されて、逆転写及びcDNAは、対応するウィルスのプライマーを用いて、PCR複製された。かかる生成物の分子量は、マーカーと比較される(レーン1)。
【図17】 図18にて記載されている動物M1から取得された(A)pE2特異的抗血清若しくは(B)事前免疫血清の何れかでコーティングされたポリスチレンパドルを用いてHEVの免疫捕獲を例証し、HEVを含んでいる連続的に希釈された胆汁の4.5mlサンプルで反応された。洗浄後、パドルに結合していたHEV粒子は、RT−PCRにより検出された。かかる生成物の分子量は、マーカーと比較される(左のレーン)。
【図18】 精製されたpE2で免疫処理に反応するマカクサルによるpE2抗体の合成を示している。3匹のサル(M1,M2及びM3)は、100ugの精製されたpE2を4週間注入されて各々免疫処理された。3匹のコントロールサル(M5,M7及びM8)には、プラシーボが与えられた。免疫処理が終了した2週間後に、動物の両グループは、HEVの105ゲノムと等価な投与を静脈注射によって感染され、動物はさらに7週間観察された。血清サンプルは、週ごとに採取され、ELISAテストを用いる抗−pE2抗体の存在のために解析された。
【図19】 精製されたpE2ペプチドの調製での免疫処理に続くHEVの抗原投与の前にマカクサルから採取された血清に存在するHEV抗体のスペクトルを例証する。3匹の大人のサル(M1,M2及びM3)は、100ugの精製されたpE2を含む調製によって週間隔で4回注入された。最終注入から2週間後に取得された血清は、連続的に4段階に希釈され、精製されたpE2のモノマー(100℃にて三分間加熱)及びダイマー(未処理)の形体の混合物に等しいものに対するウェスタンブロッティングによって試験された。M1からの免疫血清は、4倍に連続的に希釈された4000倍乃至256000倍(レーン1乃至4)で試験され、M2からのサンプルは、100倍から6400倍に希釈されて試験され、M3からのサンプルは、250乃至16000倍に希釈されて試験された。事前に免疫処理された血清は、ネガティブコントロールとして、100倍に希釈されて試験された(レーン5)(A)。かかる動物からの事前免疫処理及び免疫処理血清、及びポジティブコントロール血清Pは、GE3(B)、pE3ペプチドを含む30kDGST融合タンパク質に対してウェスタンブロッティングにより、100倍希釈で試験され、及びに市販のアッセイ(Beijing Medical University, Beijing)を用いてELISA(C)によって試験された。製造者によって推奨されるELISAの遮断OD値は、点線によって示されている。
【図20】 抗原投与する肝炎Eウィルスのゲノム投与を例証している。動物は、ストックされたHEVの100倍希釈の1mlで接種された。接種するウィルスのゲノム投与は、“原料及び方法”という副題でここより下記に記載のようにウィルス調製の連続的に希釈されたアリコートでRT−PCRにて決定された。
【図21】 HEV抗原投与に反応する抗体を例証している。血漿サンプルは、免疫処理された(M1、M2、M3)及び非免疫処理のコントロール動物(M5、M7、M8)から、HEV抗原投与に続く示された時間の前に直ちに採取された。ポジティブP、及びネガティブN、コントロールヒト血清サンプルと同様に、血清サンプルは、精製されたpE2及びGE3に対してウェスタンブロッティングによって試験され、市販のアッセイ(Genelabs Diagnostics Pte Ltd., Singapore)を用いてELISAによって試験された。
Claims (32)
- SEQ ID NO:2に記載のアミノ酸配列を含む、精製された且つ単離されたペプチド,pE2。
- 請求項1に定義された、前記ペプチドに融合した非相同のアミノ酸配列を含む組み換え融合タンパク質。
- 前記非相同のアミノ酸配列は、グルタチオンS−トランスフェラーゼをコードすることを特徴とする、請求項2に記載の組み換え融合タンパク質。
- 化学的な合成又は組み換えDNAの発現のいずれかによって、請求項1に定義された、前記pE2ペプチドを発生させる方法。
- SEQ ID NO:1に記載のDNA配列を含む、精製された且つ単離された核酸分子,E2。
- 請求項1に定義された、前記pE2ペプチドをエンコードするDNA配列を含む、精製された且つ単離された核酸分子。
- SEQ ID NO:3に記載の、配列を含む、精製された且つ単離された核酸分子。
- 請求項5又は6に記載の前記核酸分子を含有するベクターにおいて、
前記ベクターは、適切な宿主細胞又は微生物への導入の際に前記核酸分子を発現させることが可能なものであることを特徴とする、ベクター。 - 前記ベクターは、プラスミドであることを特徴とする、請求項8に記載のベクター。
- 前記宿主細胞は、真核細胞であることを特徴とする、請求項8に記載のベクター。
- 前記宿主細胞は、E.Coliであることを特徴とする、請求項8に記載のベクター。
- 請求項8乃至11のうちいずれか一項に定義された前記ベクターで形質転換された宿主細胞又は微生物。
- 請求項1乃至3のうちいずれか一項に定義された、前記ペプチド又はタンパク質を発生させる方法であって、
適切な宿主細胞又は微生物において発現させられることが可能なものであるようにベクター構築物へと前記ペプチド又はタンパク質をエンコードする核酸分子を挿入すること、前記ベクター構築物で宿主細胞又は微生物を形質転換すること、前記形質転換された宿主細胞又は微生物を培養すること、及び結果として生じるペプチド又はタンパク質の生産物を単離すると共に精製することを含む、方法。 - 請求項1に定義された、前記pE2ペプチドに対する精製された抗体を生産するための方法であって、
非ヒト哺乳類の宿主へと、免疫学的に有効な量の前記pE2ペプチドを注入すること、及び、前記生産された抗体を単離すると共に精製することを含む、方法。 - 請求項1に定義された、前記pE2ペプチドのホモダイマーに対して特異的に反応性のものである、精製された抗体又は抗体のフラグメント。
- 請求項1乃至3のうちいずれか一項に定義された、前記pE2ペプチド又はタンパク質、及び薬理学的に受容可能な担体を含む、肝炎Eウィルス(HEV)からの感染に対して個体を免疫化するためのワクチン組成物。
- 肝炎Eウィルスからの感染に対して個体を免疫化するための医薬の調製のための請求項16に定義されたワクチン組成物の使用。
- 生物学的なテストサンプルにおけるHEV抗体の存在又は不在を決定するための方法であって、
−SEQ ID NO:2によって表されたアミノ酸配列を含む、精製された且つ単離されたペプチド,pE2を提供すること;
−前記pE2ペプチドと、HEV抗体を含有することが疑われた前記生物学的なテストサンプルを接触させること;
−免疫学的な(抗体−抗原)複合体の形成を可能にするために十分な条件下で前記結果として生じる混合物をインキュベートすること;及び
−そのような免疫学的な複合体の存在について前記混合物を検査すること、それによって前記複合体の形成が、前記テストサンプルにおけるHEV抗体の存在を示唆すること
:を含む、方法。 - 前記生物学的なテストサンプルは、ヒトの血液、血清又は血漿であることを特徴とする、請求項18に記載の方法。
- 前記免疫学的な複合体の存在は、反応が起こることを許容する条件下で指示試薬を伴ったインキュベーションを後に続けることによって決定されることを特徴とする、請求項18又は19に記載の方法。
- 前記指示試薬は、着色された生産物を形成するために基質と反応する酵素に付けられた哺乳類の抗ヒト免疫グロブリンであることを特徴とする請求項20に記載の方法。
- 肝炎Eウィルス(HEV)に対する抗体の検出のための診断のテストキットであって、
−SEQ ID NO:2に記載のアミノ酸配列を含む、精製された且つ単離されたペプチド,pE2;及び
−前記pE2ペプチドを含有する免疫学的な(抗原−抗体)複合体を検出することが可能な指示試薬
:を含む、診断のテストキット。 - −対照標準;及び
−検体の希釈剤及び/又は洗浄緩衝剤
:をさらに含む、請求項22に記載の診断のテストキット。 - 前記ペプチド,pE2は、固体の支持体に不動にさせられることを特徴とする、請求項22又は23に記載の診断のテストキット。
- 前記固体の支持体は、滴定マイクロプレートのウェルであることを特徴とする、請求項24に記載の診断のテストキット。
- 生物学的なテストサンプルにおいて、肝炎Eウィルス(HEV)のウィルス粒子を検出するための方法であって、
−請求項15に定義された、前記精製された抗pE2抗体を提供すること;
−前記抗E2抗体及びHEVウィルス粒子を含有する複合体の形成を可能にする条件下で前記生物学的なテストサンプルと前記抗pE2抗体を接触させると共にインキュベーションすること;並びに
−そのような複合体の存在について前記混合物を検査すること、それによって前記複合体の形成が、前記テストサンプルにおけるHEVウィルス粒子の存在を示唆すること
:を含む、方法。 - 前記抗pE2抗体によって捕獲された前記HEVウィルス粒子の存在は、ウィルスのRNAを抽出すること及びそれに逆転写酵素ポリメラーゼ連鎖反応(RT−PCR)を適用することによって決定されることを特徴とする、請求項26に記載の方法。
- 請求項15に定義された、前記精製された抗pE2抗体を含む生物学的なテストサンプルにおける肝炎Eウィルス(HEV)分析物を検出するための診断の試薬。
- 生物学的なテストサンプルにおける肝炎Eウィルス(HEV)分析物の検出のための診断の試薬としての、請求項15に定義された、精製された抗pE2抗体の使用。
- 請求項28に定義された診断の試薬を含む、生物学的なテストサンプルにおける肝炎Eウィルス(HEV)分析物を検出するための診断のテストキット。
- 前記精製された抗pE2抗体は、固体の支持体に不動にさせられることを特徴とする、請求項30に記載の診断のテストキット。
- 生物学的なテストサンプルにおける、肝炎Eウィルス(HEV)抗体の存在又は不在を決定するための診断の試薬において、
前記診断の試薬は、請求項1に定義された、前記pE2ペプチドと共通して、前記pE2ペプチドに対して生じさせられた抗体によって認識されることが可能な一つの又はより多くの抗原決定基を有するタンパク質、ポリペプチド、又はペプチドを含むことを特徴とする、診断の試薬。
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