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JP2528721B2 - セルロ―ス結合融合タンパク質 - Google Patents

セルロ―ス結合融合タンパク質

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JP2528721B2
JP2528721B2 JP1507496A JP50749689A JP2528721B2 JP 2528721 B2 JP2528721 B2 JP 2528721B2 JP 1507496 A JP1507496 A JP 1507496A JP 50749689 A JP50749689 A JP 50749689A JP 2528721 B2 JP2528721 B2 JP 2528721B2
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Description

【発明の詳細な説明】 本発明の技術分野 本発明は、ポリサッカロイドマトリックスに結合可能
なキメラポリペプチドを含むポリペプチド組成物(セル
ロース結合融合タンパク質)および組換えDNA技術を用
いた該組成物の製造方法に関するものである。
本発明の技術的背景 微生物系における遺伝子発現よる外来タンパク質の生
産は、大量に同一のタンパク質を得るうえで重要であ
る。遺伝子組換えによって生産されるタンパク質(組換
えタンパク質;recombinant protein)の精製およびその
再生は発酵工程をデザインする際に考慮すべきものの中
で重要課題である。組換えタンパク質を単離する手段と
して伝統的なタンパク質精製手段のみならず、融合タン
パク質(fusion protein)を用いる方法がある。この融
合タンパク質はアフィニテイクロマトグラフィによって
精製することが可能で、目的とする融合タンパク質の構
成成分はアフニテイマトリックスへのポリペプチドの共
有結合にもとづく結合によって精製される。例えば、β
−ガラクトシダーゼと融合した目的とするタンパク質か
らなる融合タンパク質はp−アミノ−フェニル−β−D
−チオ−ガラクトシド−セファロースカラムによって精
製することができる。このような方法はウイルス抗原の
ような免疫原性ポリペプチドを精製するのに用いられて
きた。また、免疫グロブリンのFc領域に対して特異的に
結合するスタフイロコッカス(ブドウ球菌)プロテイン
Aも、その特異的性質を利用してアフィニテイ精製に用
いることができる。
精製に加えて、融合したものから元の構成成分を回収
することはしばしば必要とされることである。そこで、
化学的および生物学的方法によって融合タンパク質を分
割し、その構成成分または断片に分けることが行なわれ
てきた。例えば、低pH環境によって酸に不安定なアスパ
ラチルプロリンによって連結された2つの断片からなる
融合タンパク質を分割することができる。この方法を用
いることができるのは主に目的とする断片が酸に対して
不安定なものではない場合である。また、インシュリン
やソマトスタチンのようなホルモンから構成される融合
タンパク質の場合は臭化シアンによって分割することが
可能である。この臭化シアンはメチオニン残基のカルボ
キシル側に特異的に作用し、融合タンパク質を分割して
目的とするホルモンを離す。しかし、この方法は目的と
するタンパク質がメチオニン残基を含む場合には適当で
ない。
部位特異的なタンパク質加水分解による融合タンパク
質の分割についても研究されてきた。例えば、ニワトリ
α−2コラーゲン前駆体リンカー(chicken pro α−2
collagen linker)を挿入した融合タンパク質は微生物
由来の精製コラーゲナーゼによって特異的に分解され、
その分解にともなって構成成分が放出される。
組換えタンパク質の精製および回収のための他の方法
として、タンパク質のカルボキシル末端にポリアルギニ
ン鎖を設ける方法もある。
アルギニン残基はタンパク質の全体的な塩基性(base
icity)を増大させてイオン交換クロマトグラフィによ
る目的とするタンパク質の精製を可能にさせるものであ
る。カルボキシルペプチダーゼBによるポリアルギニン
末端の連続的な切断によって目的とするタンパク質の回
収が可能となり、また目的とするタンパク質のpI値を減
少させることによって塩基性コンタミからの精製を可能
とする。
目的とするタンパク質の精製または固定のための安価
で、かつ簡易な方法を開発することは大変興味の持たれ
ることである。セルロースのような炭水化物ポリマー
は、大量入手可能で安価なものであり、さらに特異的に
結合する酵素が豊富に存在することが知られていること
から、融合タンパク質の精製および(または)固定化の
ための材料として好適である。そこで、酵素のようなも
のが結合する炭水化物ポリマーからなる部位を少なくと
も部分的に有する融合タンパク質を調製することが注目
されている。
関連文献 セルロースの精製に用いられるセルラーゼの親和性に
関する文献: Boyer et al.,Biotechnol.Bioeng.(1987)29:176-179 Halliwell et al.,Biochem J.(1978)169:713-735 Mar'yanov et al.,Biokhimiya(1984)19:405-104 Nummi et al.,Anal.Biochem.(1981)116:137-141 van Tilbeurgh et al.,FEBS letters(1986)204:223-227 Cellulomonas fimiから得たいくつかのセルロース遺
伝子をE. coliにクローン化することに関する文献: Whittle et al.,Gene(1982)17:139-145 Gilkes et al..,J.Gen.Microbiol.(1984)130:1377-1384 アビセル(Avicel;微結晶セルロース)をネイテイブ
な酵素を精製するのに用いることに関する文献: Gilkes et al.,J.Biol.Chem.(1984)259:10455-10459 アビセル(Avicel;微結晶セルロース)を組換え酵素
を精製するのに用いることに関する文献: Owolabi et al.,Appl.Environ.Microbiol.(1988)54:518
-523 マルトースに結合する二価性(bifunctional)ハイブ
リッドタンバク質について記載した文献: Bedouelle et al.,Eur.J.Biochem.(1988)171:541-549 C. fimiの2種類のセルラーゼ、すなわちエクソグル
カンアーゼ(Cex)およびエンドグルカンアーゼ(Cen
A)についての特長が記載され、かつそれらの遺伝子cex
およびcenAの配列決定がされたことに関する文献: Wong et al.,Gene(1986)44:315-324 O'Neill et al.,Gene(1986)44:325-330 推測されたアミノ酸配列がそれらの酵素のドメイン構
造を明らかにすることに関する文献: Warren et al.,PROTEINS:Structure,Function,and Gene
tics(1986)1:335-341 他のセルラーゼにおいてもドメイン構造が調べられた
ことに関する文献: Teeri et al.,Publications(1987)38:Technical center
of Finland Teeri et al.,Gene(1987)51:43-52 加水分解による分割によって分離したドメインによっ
てドメイン構造についてのいくつかの知見が得られたこ
とを報告する文献: Langsford et al.,FEBS Letters(1986)204:223-227 Tomme et al.,Eur.J.Biolchem.(1988)170:575-581 van Tilbeurgh et al.,Eur.J.Biochem.(1988)170:575-5
81 van Tilbeurgh et al.,FEBS letters(1986)204:223-227 C. fimi培養液上清中に見いだされたセリンプロテア
ーゼに関する文献: Langsford et al.,J.Gen.Microbiol.(1984)130:1367-13
76 前記セリンプロテアーゼが基質結合した組換え体cenA
およびCexを分割し、セルロースに対する親和性の著し
い減少を伴って触媒的に活性な断片(catalytically-ac
tive fragments)を放出することに関する文献: Langsford et al.,ERBS letters(1987)225:163-167 残りの断片は両酵素の低電荷密度の変化領域(irregu
lar regions of low charge density)に該当し、かつ
それらの酵素のセルロース結合ドメインをなすと考えら
れている。
本発明の要約 本発明の目的はポリサッカライドマトリックスに結合
可能な融合タンパク質(セルロース結合融合タンパク
質;cellulose binding fusion protein)とそのための
調製方法とを提供することである。本発明にもとづくセ
ルロース結合融合タンパク質(以下、融合タンパク質と
呼ぶ)はポリサッカロイドの基質結合領域から少なくと
もなるものである。融合タンパク質は、目的とするポリ
ペプチドをコードする遺伝子に連結(ligated)し、か
つポリサッカロイダーゼの基質結合領域をコードするDN
A断片から少なくともなるDNAを宿主細胞に導入して形質
転換させて調製される。これによって得られた融合タン
パク質はポリサカロイダーゼの基質からなる固形支持体
(solid support)に容易に結合する。その組成物は種
々の興味あるポリペプチドのどれかを含むポリサッカロ
イドマトリックスを調製するために用いられるか、ある
いは融合タンパク質または興味あるポリペプチドの精製
方法に用いられる。
図の詳細な説明 第1図はCex発現プラスミドpeC-1.1およびpUC12-1.1c
exの構成を示すものである。β−ラクタマーゼ(Apr)、C
ex(クロスハッチスクエア)およびlac遺伝子のプロモ
ーターをコードする遺伝子の機能的位置関係は矢印で示
してある。制限酵素による切断部位はそれぞれB=BamH
I、E=EcoRI、H3=Hind III、S=Sal Iの略号で示
す。
第2図はRBS、翻訳開始部位、さらにβGal-exg発現プ
ラスミドpUC12-1.1 cex、pUC12-1.1(737)およびpUC12
-1.1(PTIS)の融合結合部のアミノ末端に関するDNA配
列を示すものである。
第3図はpUCEC2の構成を示すものである。
第4図は(A)pcEC2および(B)pUCEC2におけるlac
ZとcenAとの融合部分の核酸およびアミノ酸配列を示す
ものである。
第5図はpEO1の構成を示すものである。
Sp=SphI、Ss=ハイブリッドSmaI、Sa=SalI、PS=Ps
tI、ABG=β−ガラクトシダーゼ遺伝子Cexエクソグルコ
ナーゼ遺伝子、SED=基質結合ドメイン、PT=プロリン
−スレオニンボックスハッチドボックスマルチプルクロ
ーニング部位。
第6図はpUC12-1.1cex(PTIS)を直線状にして制限酵
素による切断部位を表した概略説明図である。
第7図は(A)融合酵素のフェド−バッチ生産(fed-
batch production)、精製および固定についての概略説
明図、(B)セルロース様物質をグルコースに加水分解
するための再利用可能なファーメンター・固定カラム
(fermentor-immobilization column)の概略説明図で
ある。
実施態様の説明 融合タンパク質は幅広い分野に利用でき、例えばタン
パク質の精製や固定化、さらに固形診断剤(solid phas
e diagnostics)の調製方法において融合タンパク質の
利用が求められている。また、目的とする化合物をポリ
サッカロイドに結合させるための手段として融合タンパ
ク質を利用することも求められている。そこで、本発明
にもとづく実施態様においてはセルラーゼの基質結合部
分が少なくとも目的とするタンパク質に融合した融合タ
ンパク質からなる新規な組成物およびその調製方法を提
供する。
少なくとも、目的とするポリペプチドをコードする遺
伝子を含むDNA断片と連結(ligated)させたポリサッカ
ロイダーゼの基質結合領域をコードする遺伝子を含むDN
A断片とからなるDNAを宿主細胞に導入する。そしてそれ
らの遺伝子を導入された宿主細胞を増殖させ、かつそれ
らの遺伝子を発現させることによって、それの遺伝子に
もとづく組成物、すなわち融合タンパク質の調製をおこ
なう。このような系に用いることが可能な宿主細胞は大
腸菌などの原核細胞のみならず酵母などの真核細胞でも
よい。このようにして調製される融合タンパク質はその
大部分が以下の式によって表すことが可能である。
SBR-MR-X この式で、SBRは、ポリペプチドのN末端叉はC末端領
域であり、少なくともポリサッカロイダーゼの基質結合
領域を含む108から134のアミノ酸からなるアミノ酸配列
である。
MRは中間に位置する領域で、炭素数が2ないし30また
はアミノ酸が2ないし20からなるSBRとXとを結合する
部位である。この領域は融合タンパク質が特異的に切断
されるためのアミノ酸配列を含む部分で、そのアミノ配
列はイムノグロブリンA1プロテアーゼのような高特異性
タンパク質分解酵素によって認識される部位と一致す
る。
XはN−末端またはC−末端領域にあたる部分で、目
的とするポリペプチド全体あるいはその断片を含む。目
的とするポリペプチドとしては、酵素、ホルモン、イム
ノグロブリン、色素等が考えられる。
融合タンパク質の調製 セルロース遺伝子の単離方法は従来技術、すなわちゲ
ノムDNAあるいはcDNAにもとづく方法、またはそれらの
組み合わせを含む方法等によって行なった。また、多く
の遺伝子操作技術が知られており、それらの方法として
例えば消化、連結、制限、in vitroにおける突然変異誘
発、プライマー修復、リンカーおよびアダプターの利用
などがある(Maniatis et al.,Molecular Clonig,Cold S
pring Harbor Laboratory,Cold Spring Harbor,New Yor
k,1982)。
ゲノムDNAを利用する方法は、本発明の実施に好適な
セルラーゼ遺伝子を有する生物からゲノムDNAライブラ
リーを調製して行なう。例えば、そのようなセルラーゼ
遺伝子はCellulomonas fimiTrichoderma resei等の菌
株から得ることができる。そのような菌株からゲノムDN
Aを単離し、適当な制限酵素、例えばBam HIによって切
断する。得られた断片はベクターに組み込む。好ましい
ベクターとしてはプラスミドpBR332があり、制限エンド
ヌクレアーゼBam HIによって切断して前記断片が挿入で
きるようにする。セルラーゼのアミノ酸配列をもとにし
て、前記断片を組み込まれたベクターを導入された宿主
細胞が生産するセルラーゼ遺伝子に関係したmRNAまたは
DNAから調製されたcDNAまたはゲノムライブラリーをス
クリーニングするためのプローブをデザインすることが
できる。
セルラーゼcDNAまたはその断片をハイブリダイゼーシ
ョンのためのプローブとして用いることによって、他の
微生物に存在する構造的に類似した遺伝子をクローン化
することができる。例えば、Cellulomonas fimiのセル
ラーゼ遺伝子に関するヌクレオチド配列をもとにしてオ
リゴヌクレオチドプローブを調製し、このプローブによ
ってセルラーゼ活性を有する生物から、その活性に関係
する遺伝子を単離することが可能である。そのようなプ
ローブは実際の配列よりも短いものだが、少なくとも10
塩基、好ましくは、14塩基からなるヌクレオチド配列を
有するものが考えられる。実際の遺伝子と同じくらいま
で、あるいはそれより長いヌクレオチド配列も利用可能
であり、好ましくは500塩基、寄り好ましくは250塩基の
ヌクレオチド配列の長さのものを利用することが可能で
ある。もちろん、プローブはRNAまたはDNAのどちらでも
よい。
プローブとして利用するに当たっては、プローブを標
識(例えば32P、3H、ビオチンまたはアビジンによる標
識)し、目的とする遺伝子を有する生物から得た一重鎖
DNAまたはRNAとともにインキュベートしてハイブリダイ
ズさせる。ハイブリダイゼーションは一重鎖DNAと二重
鎖(ハイブリッド)DNA(またはRNA/DNA)とを分離(普
通はニトロセルロース紙による)したのち、プローブに
付けられた標識によって検知することができる。なお、
このようなハイブリダイゼーション方法は当業者にとっ
ては既知のことである。
一般的にはプローブは同定を容易ならしめる検知可能
な標識を付けて用いられるのだが、未標識のオリゴヌク
レオチドも利用可能で、二重鎖DNA(またはDNA/RNA)を
直接的に検知する方法に利用できる。したがって、「オ
リゴヌクレオチドプローブ」という言葉の中には標識さ
れたものと標識されないものとが含まれる。
セルラーゼのセルロース結合ドメインを単離するため
に、いくつかの遺伝学的アプローチを試みた。
ひとつの方法は制限方法を用いるもので、制限酵素に
よって遺伝子の一部分を切り取り、そして遺伝子の一部
分を欠失した遺伝子をベクターに挿入することによって
特定遺伝子由来の欠損タンパク質を得ることである。他
の方法はエクソヌクレアーゼを用いるもので、例えばBa
l31のようなエクソヌクレアーゼを用いて遺伝子中に生
じた制限酵素による切断欠失部分の内側から、あるいは
3′末端および5′末端の外側からヌクレオチドを取り
除いて遺伝子の特定部分を欠失させる。このような遺伝
子の欠失による方法によって得られた変異遺伝子由来の
欠損タンパク質の基質結合能を調べることによって元の
タンパク質の基質結合部位等を推測することができる。
基質結合能、結合活性等を調べるための好適な基質と
してはアビセル(Avicel)、コットンファイバー、フイ
ルターペーパー、クラフトまたはグラウンドウッドパル
プなどがある。
基質結合領域をコードするヌクレオチド配列をcDNAま
たは染色体DNAとして同定することができたら、このヌ
クレオチド配列を含種々の方法を用いて目的とするポリ
ペプチドをコードする遺伝子を含むDNA配列に融合させ
る。つぎに、ポリサッカロイド結合をコードする断片と
目的とするポリペプチドをコードするDNAとを連結させ
る。そして、種々の方法を用いて連結されたDNAに含ま
れる遺伝子をベクターを介して宿主細胞に導入し、この
宿主細胞の翻訳系を利用して発現させる。宿主細胞とし
ては、例えばE.coliなどの原核生物や、例えばSaccharo
myces cerevisiaeがなどの真核生物を用いることができ
る。
用いる制限酵素に合わせてそのアミノ酸配列を変えた
複数のポリペプチド断片のアミノ酸配列を持つ融合タン
パク質を発現することのできるプラスミドの調製は実施
例のところで詳細に説明する。
細菌に含まれる転写調節領域またはプロモーターは、
lacプロモーター、TACプロモーター、ラムダレフトおよ
びライトプロモーター、trpおよびlacプロモーター、ta
cプロモーターなどを含む。転写調節領域は融合タンパ
ク質の生産に関係した遺伝子発現を調節する配列を含む
もので、この遺伝子発現は成長培地中における温度条
件、栄養条件あるいは遺伝子産物の存在によって制御さ
れる。例えば、融合タンパク質の生産に関連した遺伝子
の発現はラムダファージのPLプロモーター、OLオペレー
ターおよび温度感受性リプレッサー含む調節領域を利用
することによって、温度条件を変えることによって制御
することができる。プロモーターの調節はレセプターと
オペレーターとの相互作用によって達成される。
発現カセット(expression cassette)は宿主細胞に
おいてプラスミドとして維持されるための複製系のなか
に含まれるかあるいは含まれないで、宿主ゲノムに挿入
(integrate)される。宿主細胞に外来DNAを導入する方
法として、例えばリン酸カルシウム共沈殿法、ウイルス
とその宿主となる細胞との接触による感染、細胞へのマ
イクロインジェクションによるDNA導入などが知られて
いる。融合遺伝子を適当な宿主細胞に導入すると、宿主
細胞は融合遺伝子を発現するために成長する。このこと
は、例えば、構造遺伝子をリーデイングフレーム中に挿
入し、このリーデイングフレームから上流にはシグナル
配列(セクレタリリーダー)を置く必要がある。実例と
して挙げられるセクレタリリーダーはペニシリナーゼ、
イムノグロブリン、T細胞レセプター、外被タンパク質
などのセクレタリリーダーがある。適当なリーデイング
フレーム内での融合によって、キメラペプチドを培地中
に分泌させることが可能となる。
目的とする遺伝子産物が細胞外に分泌されずに宿主細
胞中に残されている場合は、細胞を飢餓状態にして溶菌
して細胞外に出す。そして遺伝子産物をポリサカロイド
基質に結合させることによって単離および精製を行な
う。
前記遺伝子産物が活性タンパク質である場合、その活
性タンパク質の活性機能が野生型のものと同等となるよ
うにするためには野生型と同等の立体構造をとるような
形で生産、分泌される必要があろう。
前記の組換えによって得られた遺伝子産物はグリコシ
ル化または非グリコシル化されたものである。グリコシ
ル化の度合は、部分的には遺伝子産物であるポリペプチ
ドのアミノ酸配列にもとづき、さらに宿主細胞の種類に
よって決まる。例えば、E.coli細胞においてはグリコシ
ル化されることなく非グリコシル化遺伝子産物が得ら
れ、昆虫細胞においては哺乳類細胞における場合よりも
グリコシル化の度合いが少ない。叉、酵母の場合はグリ
コシレーション過剰となる。
さらに、融合遺伝子から融合タンパク質を生産するこ
とに加えて、融合タンパク質を化学合成することも可能
である。すなわち、基質結合領域またはその集まったも
のを精製し、当業者において既知の方法によって目的と
するポリペプチドに化学的に結合させることができる。
融合タンパク質の利用 本発明にもとづく組成物の適用範囲は広範囲にわた
る。例えば、インターロイキン2、第VIII因子、リグニ
ナーゼ、TPAなどの生物学的試料を精製する際に、該試
料を含む組換えタンパク質を既知のタンパク質精製方法
にもとづいてセルロースのポリサッカロイド結合領域に
結合させたのち、組換えタンパク質のセルロース結合領
域に存在するアミノ酸配列に特異的に作用するプロテア
ーゼを用いてポリサッカロイド結合領域から離すして単
離および精製することが可能である。
本発明にもとづく組成物はセルロース性支持体上に目
的とするポリペプチドを固定する手段として用いること
ができる。なぜなら、基質結合領域はセルロースに強固
にかつ特異的に吸着するからで、以下のような種々の利
用法がある。
臨床検査のための固体状剤、例えば、酵素、抗体フラ
グメント、ペプチドホルモンなどの調製に利用すること
ができる。
クリアランス値を減少させるために薬物を結合させる
ために利用することもでき、そのような薬物としてイン
ターロイキン2のようなポリペプチド、またセルロース
は溶解可能なもの(例えば、カルボキシルメチルセルロ
ース)または固体状支持体(例えば、微結晶セルロース
(アビセル))が考えられる。
薬物を運ぶために、その薬物を単独であるいは免疫原
性を高めるためにアジュバントとともにカルボキシメチ
ルセルロースに結合させることもできる。
色素の結合にも利用できる。すなわち、紙とか生地
(綿)などのようなセルロース性表面に印刷あるいは塗
装することに利用できる。
加水分解や相乗効果を与えるために利用することが可
能で、例えば木材の加工のためにリグニナーゼのような
酵素を結合させたり、木材パルプを漂白するためにポル
フィリンを結合させたりすることができる。
農業上の利用方法としては、例えば、BTトキシンや他
の抗微生物剤を植物表面に結合させることができる。ま
た、窒素固定のために、根表面に窒素固定細菌を結合さ
せるの利用できる。さらに、肥料の放出や、抗菌剤の放
出を維持するのに利用できる。海水のような高塩濃度条
件下で表面が汚れるのを防ぐことにも利用可能で、この
ような場合には淡水に移すことによって融合タンパク質
を取り除くことができよう。
セルロース支持体に結合させるポリペプチドはその使
用方法や目的に合わせて標識したり、あるいは未標識の
まま使用することができる。標識物質としては、例え
ば、放射性同位元素、酵素、蛍光物質、発色物質、粒
子、酵素基質または補酵素、酵素阻害剤、磁性粒子など
がある。また、これらの標識物質をポリペプチドに結合
させる方法も色々あり、例えば他のアミノ酸を保護した
状態で、末端にあるアミノ酸にピロレゾンを形成させ
て。このピロレゾンに種々の標識物質を結合させること
ができる。
以下の実施例は本発明の限界を示すものではなく、具
体的な説明を行なうためのものである。
実験 略語について pNPC=p−ニトロフェニル−β−D−セロビオシド、 HPA=アズール粉末、 gCenAおよびgCex=C.fimiから得たCenAおよびCexのグ
リコシル化したもの、 ngCenAおよびngCex=組換えE.coliから得たCenAおよ
びCexのグリコシル化したもの、 RPC=逆相クロマトグラフィ、 SDS-PAGE=ドデシル硫酸ナトリウム−ポリアクリルア
ミドゲル電気泳動、 α−Pro/Thr=合成Pro/Thrボックスに対するウサギ抗
血清、PMSF=フェニルメチルサルホニルフルオライド。
提供を受けた生物学的系統 以下のものをアメリカンタイプカルチャーコレクショ
ン(ATCC、所在地:米国 20852メリーランド州ロック
ビル、パークローンドライブ12301番地)から提供して
いただいた。
プラスミドpEC-1含有大腸菌(Escherichia coli C60
0):1986年3月27日供託、ATCC承認番号第67120号、 クローン化したCex遺伝子を挿入したプラスミドpCEC-
2含有大腸菌(Escherichia coli C600)の継代培養株:
1986年4月23日供託、ATCC承認番号第67101号、 クローン化したCex遺伝子を挿入したプラスミドpEC-1
(pUC12-1.1cex)含有大腸菌(Escherichia coli JM8
3)の継代培養株:1986年4月23日供託、ATCC承認番号第
67102号。
実施例1 Cex遺伝子発現プラスミドの構成 A.細菌の株およびプラスミド 宿主細胞として用いる大腸菌株C600(thr-1,leu-6,th
i-1,supE44,lacyY1およびtonA21)およびプラスミドpcI
857およびpCP3はエリックレモー(Erik Remaut)から入
手した。また、これらの細菌およびプラスミドについて
は「遺伝子(Gene)」(1983年発行、第22巻、第103-11
3頁)に記載されている。
B.組換えDNA技術 DNAの調製および酵素反応に関してはコールドスプリ
ングハーバー研究所が出版したマニュアル(Maniatis e
t al.,Molecular Cloning:A laboratory Manual,Cold
Spring Harbor labo.,Cold Spring Harbor,MY.)にもと
づいた。
制限エンドヌクレアーゼ、DNAポリメラーゼI(クレ
ノーフラグメント)、T4DNAリガーゼおよび簡易翻訳開
始部位(PTIS;portable translation initiation sit
e)はファルマシア(Pharmasia Inc.)製品を購入し
た。
ラムダファージの左方向プロモーター(PL)を持つプ
ラスミドをラムダファージのcI857遺伝子を持つ株へ導
入して遺伝子発現(細菌性形質転換;bacterial transfo
rmation)させる方法は以下の点を除いて前記マニュア
ルに記載された方法にもとづいた。すなわち、本実施例
では細菌細胞に34℃、2分の熱刺激(ヒートショック)
を与え、LB培地で1時間インキュベートしたのち選択培
地上に移した。
C.細菌の増殖と誘導 細菌はLB培地(前記マニュアル参照のこと)に0.4%
グルコース、50μm/mlカナマイシンおよび75μm/mlアン
ピシリンを加えてオートクレーヴした後、該培地におい
て細菌を増殖させる。この増殖は30℃で行ない、吸光度
が600nmにおいて0.3の値になるまで増殖させる。増殖
後、培地上の増殖した菌株を二分して一方は30℃(非誘
導)で増殖を行ない、他方は41℃(誘導)で増殖させ
た。
D.cex遺伝子の単離 Cfimiからcex遺伝子を単離する方法は米国特許出願
第859,042号(1986年5月2日出願)にもとづいて行な
った。詳細は該特許出願を参照するとよい。
E.プラスミドの構成 1.pUC12-1.1cex 、Cfimi由来DNA断片(6.6kbp.の長さ)上にクロー
ン化されたcex遺伝子を、BamHIによって切り取り、かつ
プラスミドpBR322のBamHI部位に挿入してpEC-1プラスミ
ドを形成する。
cex遺伝子の位置はpEC-1.1プラスミドとなる2.56kbp
からなるBam HI-Sal I DNA断片に対する欠失地図作成に
よって決定することができる(第1図)。
pUC12-1.1cexプラスミドは第1図に示すように、pEC-
1.1から単離した2.56kbp断片をpUC12プラスミド上のE
coliラクトースオペロン(lacZp/o)のプロモーター・
オペレーター領域から反対側下流に位置するところに挿
入して得られた(Gene(1982)19:259-268)。pEC-1プ
ラスミドについてはホワイトルらの論文(Whittle et
al.,Gene(1982)130:139-145)およびギルケスらの論
文(Gilkes et al.,J.Gen.Microbiol.(1984)130:137
7-1384)を参照するとよい。
RBS、転写開始部位およびβGal-Exg発現プラスミドpU
C12-1.1cexの融合結合部アミノ末端のDNA塩基配列は第
2図に示した。
2.pUC12-1.1(737) pUC12-1.1(737)を構成するために、5′末端側塩基
配列の未翻訳部分、リボゾーム結合部位(RBS)およびc
ex遺伝子の翻訳開始コドンを除去し、プロモーター・オ
ペレーター領域およびEcoliラクトースオペロンのア
ミノ酸末端(βGal)を挿入し、つづいてPTISのRBS-ATG
と置き換えた。
第一段階は、プラスミドpUC12-1.1cexSty IおよびB
am HIによって切断して生じた付着端(stagered ends)
をDNAポリメラーゼI(クレノー酵素)によって修復し
た。そしてプラスミドDNAを希釈条件下で連結してpUC12
-1.1(737)を得た。この操作によって、 (i)Cexリーダー配列のコドン2とpUC12によってコー
ドされたβGalαフラグメントのコドン11との間におけ
るフレーム内融合(in-frame fusion); (ii)Sty I切断部位の再生;および (iii)Bam HI切断部位とcex遺伝子翻訳開始コドンとの
置換が行なわれた。pUC12-1.1(737)のβGal-Cex融合
領域の塩基配列およびその配列から考えられるアミノ酸
配列を第2図に示した。
3.pUC12-1.1(PTIS) pUC12-1.1(PTIS)を得るためにpUC12-1.1(737)をE
coRIおよびBam HIによって切断し、EcoRI付着端およびB
am HI付着端を有する17bpのPTISを挿入した。これによ
って、PTISのイニシエターATGに対するcexリーダー配列
第2コドンのフレーム内融合が行なわれた(第2図参
照)。PTS AATTTGGAAAAATTAG ACCTTTTTAATACCTAG RBS、転写開始部位、βGal-Exg発現プラスミドの融合
結合部アミノ末端のDNA塩基配列。プラスミドpUC12-1.1
cexは未融合のcex遺伝子産物をコードする。プラスミド
pUC12-1.1cexにおける天然cex遺伝子産物のコドンはリ
ーダー配列の開始部位ATGを−41とし、成熟したExgの第
1コドンを+1として番号が付けられた。βGal ‐Exg
融合遺伝子における第1cexコドンはもとの位置番号で
ある。想定されるアミノ酸配列はDNA塩基配列の上に一
文字で表した。βGal由来のヌクレオチドおよびアミノ
酸には下線を引いた。まれに現われるアミノ酸はlac
伝子由来ではなく、pUC12の結合領域から由来するもの
である。
cex遺伝子のアミノ末端におけるSty I、Ava IIおよび
EcoRIIの制限部位をpUC12におけるβGalのアミノ末端に
対するcex遺伝子の融合に用いた。
Exg活性は細胞タンパク質全体の重さ(mg)に対する
単位時間(分)当たりのp−ニトロフェニルの放出量
(ng)によって表した。
実施例2 CenA発現プラスミドの構成 A.細菌および培地 CenA発現実験においてEcoli JM101を使用した。培
養はすべてLB培養液によって行い、必要に応じて1.5%
(w/V)寒天によって培養液を固化させた。さらにこの
培養液にアンピシリンを終濃度が100μg/mlとなるよう
に添加した。CexA活性は1.0%(W/V)寒天および1.0%
(W/V)カルボキシメチルセルロース(CMC)含有LB培地
上のコロニー増殖後、コンゴ赤によって染色することに
よって検知した。液体培養は容量が50または250mlのエ
ーレンマイヤーフラスコに10または50mlの培養液を加え
て、振とう式ウオーターバス(New Brunswick Gyrotory
water bath)により200rpmで振とうさせておこなっ
た。
B.DNA技術 プラスミドはEcoliをアルカリ処理によって溶菌さ
せ、さらにCsCl−エチジウムブロマイド勾配下における
遠心によって収集した。制限エンドヌクレアーゼによる
消化、断片の連結(リゲーション)およびEcoliの形
質転換(transformation)は記載通りに行なった。
C.他の方法 フレンチプレスによって細胞を破壊することによって
抽出物を調製した。細胞の表層を被う内膜と外膜との間
(ペリプラズム)に存在する酵素を浸透圧ショックによ
って放出させた。培養液上清は遠心によって得た。すべ
ての酵素は30℃でアッセイした。Ecoli JM101/pUC18-
1.6CenAからのエンドグルカナーゼは陰イオン交換クロ
マトグラフィー(モノQレシン(MonoQ resin)上で、2
0mMピペラジン中に0-0.1M NaClの勾配、pH9.8の条件下
で行なった)によって分離した後、免疫吸着クロマトグ
ラフィーによって精製した。アミノ酸配列は気相アミノ
酸配列分析装置(Applied Biosysems社製、470A gaspha
se sequenator)によるエドマン分解にもとづく方法に
よって自動測定した。
D.CeA遺伝子の単離 CfimiからCenA遺伝子を単離する方法は米国特許出
願第895,352号(1986年8月11日出願)にもとづいた。
E.プラスミドの構成 第3図はpUCEC2の構成の概略説明図である。pcEC2に
ある6.0kbからなるCfimiDNA挿入断片から1.6kbからな
SstI断片を精製し、pUC18のSstI部位に挿入してpUC
EC2を形成した。第4図はその概略説明図で、(A)はp
cUC2を示し、(B)はpUCEC2のlacZとCenAとの融合部
分の塩基配列およびそれにもとづくアミノ酸配列を表し
たものである。第4図(A)において、細線の部分はpB
R322由来DNAを示し、箱状部分はCfimi由来DNAを示
す。斜線の部分はCenAをコードする配列を有する部分
で、横方向に延びた矢印は転写方向を示す。矢印Sが指
し示す部分はSstI部位である。
実施例3 cex SBD遺伝子断片とアグロバクテリアのβ−ガラクト
シダーゼ遺伝子(abg)とを含む発現カセットの構成な
らびに融合タンパク質の特性 A.発現カセットの構成 第5図はpEO1の構成を示す概略説明図である。プラス
ミドpUC12-1.1cex(PTIS)をPstIで切断した。これに
よって、2つの大きさの異なる断片が得られ、それぞれ
の断片はPstI制限部位を有した。そして、この断片の
うちの小さいほう(およそ1071bp)を単離した。このDN
A断片は1515bpにある挿入断片のPstI部位からベクター
PstI部位の部分に一致する。そこで、このPstI-Pst
I断片をSphIによる完全消化によって3つの断片(55b
p、72bpおよび944bp)にした。このうちもっとも大きい
SphI-PstI断片を単離した。
つぎに、大きいabg遺伝子断片(PstI-SphI)および
小さいcexSBD断片(SphI-PstI)(第5図参照)を同一
フレーム上で連結して、目的とするプラスミド構成(約
4954bp)、すなわちpEO1にした。pEO1プラスミドは2254
bpからなるベクターで、このベクターに挿入されている
cexSBD-abg挿入断片は2254bpである。pEO1プラスミドは
Ecoli JM101に導入した。
B.酵素およびPAGEによる融合タンパク質の特性分析 pEO1にコードされた融合タンパク質はアビセルに対す
る結合能および元のAbgと比較した触媒活性によって特
徴づけられる。触媒活性による融合タンパク質の特性分
析はカイネテイックス(例えばKm値やVmax値)を調べる
ことや融合タンパク質の基質特異性を調べることによっ
て行なった。酵素活性は、時間、温度、pH、イオン強度
および緩衝液に関する標準的な測定条件下において一定
濃度のセロビオースから生産できるグルコース量によっ
て決定した。このグルコース濃度はグルコースアナライ
ザー(ベックマン社製)による測定結果をもとにした。
この装置による分析は、グルコースからグルコン酸に変
換される際の酸素消費量を酸素電極によって測定するこ
とにもとづいて行なわれるもので、この酸素消費量は既
知の濃度のグルコースを含む標準液の酸素消費量と正比
例の関係にあるので、この関係を利用してグルコース濃
度を決定することができる。
また、SDS-PAGEによって融合タンパク質の分子量を調
べた。すなわち、精製された融合タンパク質をCfimi
から得たプロテアーゼによって2ないしそれ以上のタン
パク質断片にしたあとSDS-PAGEに流し、MUG(4-methylu
mbelliferyl-8-D-glucoside)あるいはX-glu(5-bromo-
4-chloro-3-indolyl−λ−D-glucopyranoside)のよう
な螢光グルコシド誘導体を用いてザイモグラム(量比の
検討)を行なうことによって調べた。なお、これによっ
て他の小さな活性酵素断片の形成およびその分子量を決
定することも可能である。
C.融合タンパク質の吸着性 セルラーゼのセルロースに対する吸着は不溶性セルロ
ーズ基質の加水分解に必要とされる第1段階と考えられ
る。酵素の種類、濃度、組み合わせおよびその比、温
度、pH、緩衝液のイオン強度などの因子がどのようにセ
ルラーゼの吸着カイネテイックスおよびセルロースの分
解速度に対して影響を及ぼすかについて知るために、い
くつかの微生物のセルラーゼについて、その酵素のセル
ロースへの結合が調べられてきた(Chose&Bisaria,197
9;Moloney&Coughlan,1983;Ooshima et al.,1983;Ryu
et al.,1984;Andrease et al.,1987;Williamson&Stut
zenberge,1987)。
セルロース基質に対する融合酵素の結合能は吸着平衡
定数(Ka)を求めることによって調べた。すでにセルロ
ースへのセルラーゼの吸着はラングミュアの吸着等温式
(Langumuir,1916)に従うことが知られている。
Cb=(Cmax・Ka・Cf)/(1+Ka・Cf)(1) Cbは反
応が平衡状態に達した際のセルロース単位重量当たりの
結合酵素量を示し、Cfは結合していない酵素量、Cmaxは
酵素の最大吸着量、そしてKaは吸着平衡定数を示す。等
式(1)からより利用価値の高い等式(2)が導きだせ
る。この等式(2)はプロットしやすいことから等式
(1)に比べてkaやCmaxを容易に求めることができる。
(Cf/Cb)=(Cf/Cmax)+(1/(Ka・Cmax)) (2) 等式(2)は等式y=mx+bによって与えられる直線
を得るためにCfに対してCf/Cbをプロットするのに用い
られる。傾き(m)は1/(Ka・Cmax)によって与えられ
る。KaおよびCmaxとして求められた値は重要なもので、
それらの値によって基質に対する酵素の吸着親和性や吸
着剤単位表面当たりの吸着部位数がそれぞれわかる。特
にKa値が必要で、それによってセルラーゼに対する融合
酵素の吸着に関する化学的および物理的パラメーターを
比較検討することができる。
アビセルに対する酵素の結合能は、実験系に加えられ
た酵素の活性濃度に対する結合にあずかった酵素、上清
中に含まれる結合にあずからなった酵素および蒸留水中
に洗い流された結合酵素のそれぞれの百分率によって表
した。種々の酵素濃度で行なわれるセルロース基質に対
する酵素の吸着プロセスにおけるケイネテイックスに関
する調査は異なるpH、濃度および緩衝液のイオン強度条
件下におけるKa値の決定を含むものである。固定化融合
タンパク質の安定性(操作時および貯蔵時)はバッチま
たはカラムに存在するアビセルに対する酵素の結合と時
間経過にともなって起こる酵素反応とによって決定し
た。単位時間当たりの回収グルコース量、融合タンパク
質の活性濃度および洗い流されたタンパク質量を固定化
方法の安定性を示す指標とした。
実施例4 基質結合に関与するDNA断片の単離 基質との結合に関与する特異的SBDペプチドを同定す
るのに、いくつかの遺伝学的アプローチを試みることは
可能である。その一つの方法として、遺伝子のある部分
を制限酵素によって取り除き、残された部分を繋ぎ合わ
せて特定の遺伝子断片に関連した欠陥を持つタンパク質
をコードする変異遺伝子を得る方法がある。他の方法と
しては、エクソヌクレアーゼ(例えばBal31)によってD
NAの5′および3′の両末端外側からあるいは遺伝子の
制限酵素によって切断されて生じたギャップ内側から計
画的にヌクレオチドを取り除く方法がある。これらの遺
伝子欠失方法は、野生型タンパク質よりも短く、かつ野
生型が持つ本来の機能とは異なる機能を有すると思われ
る欠損タンパク質をコードする変異遺伝子を作り出すこ
とが最終目的である。欠損タンパク質の機能は、特定の
ペプチド断片それ自体の除去あるいはあるアミノ酸の欠
失の結果によって生じた修飾タンパク質の形態変化にも
とづくものと考えられる。
A.XmaIII制限酵素を用いた欠失 第6図に示したpUC12-1.1cex(PTIS)プラスミドは関
連した制限部位および大きさを有する。SalI(S)に
よってプラスミドを部分消化し、1962ヌクレオチドと25
80ヌクレオチドとの間にある遺伝子部分を除去すると、
得られた欠損タンパク質はアビセルに結合できなかっ
た。この結果はSalI部位(1962ヌクレオチド)から終
止コドン(2189ヌクレオチドの所にあるTGA)に到るま
での配列によってコードされるペプチドが酵素の結合に
重要な領域であることを証明するものではない。欠失開
始の部分よりも直前にある領域がセルラーゼの結合に重
要な部分であろう。SalIによる欠失突然変異体による
セルロースへの非結合にとって他の重要な要因はベクタ
ーの欠失Cexとβ−ガラクトシダーゼとによって形成さ
れる融合タンパク質である。
アミノ酸の平均分子量を110と仮定すると、SalIによ
る欠失突然変異体において欠失されたペプチドは約8kD
(キロダルトン)の大きさとなる。この予想される大き
さは、タンパク質加水分解的に切断したエクソグルカナ
ーゼからなる試料によってFPLC(ファルマシア社製)に
より精製され、かつアビセルに強固に結合することがで
きるペプチドの大きさに大変よく一致していた。このこ
とは、特異的SBDペプチドが明らかにこの8kDに含まれる
ことを強く示唆している。プロテナーゼ切断部位かどう
かを正確に未極めるためにFPLCによって精製された約8k
DからなるペプチドのN−末端の配列を調べた。その結
果、アミノ酸切断部位はPTボックスの端(最後のスレオ
ニンとセリンとの間)から始まることがわかった。この
アミノ酸配列をもとにして、計算によって求めらたSBD
ペプチドの大きさは11.3kDであった。FPLC精製SBDペプ
チドの大きさとアミノ酸切断部位から予想される計算上
の大きさとの不一致はポリアクリルアミドゲルにおいて
ペプチドの移動が正常に行なわれないことが原因として
考えられる。
さらに、基質結合部に含まれるアミノ酸配列を調べる
ために、XmaIIIにおって部分消化下(第6図)。大きさ
が5107bpに一致する線状の断片を単離し、その断片の両
端を連結してEcoli JM101に導入した。なお、この断
片には1873ヌクレオチドと2074ヌクレオチドとの間の遺
伝子部分が欠失しており、その結果、欠損タンパク質が
生産された。そこで、この欠損タンパク質のアビセルに
対する結合親和性について調べ、かつ野生型のcexタン
パク質と比較した。
B.Bal31を用いた欠失 Bal31は二重鎖DNAの3′および5′末端の両方を、内
側の一重鎖切断をすることなしに、ほぼ同時に分解して
いく高特異性のヌクレアーゼである。この酵素はCaイオ
ンの存在を必要とするので、この酵素による欠失の程度
を反応溶液に二価イオンのキレート剤であるEGTAを加え
ることによってコントロールすることができ、またモニ
ターすることも可能である(Maniatis et al.,1982)。
cex遺伝子をBal31による消化処理にかけるまえに、以
下の領域を含むループアウト断片を合成した。すなわ
ち、その領域とは (1)欠失が開始される制限部位(ベクターのみにあ
り、かつCfami遺伝子挿入断片の数ヌクレオチドほど
下流にあるXbaI認識切断部位)、 (2)ベクターおよび挿入断片のどちらにも存在しない
第2制限部位(NcoI)、および (3)すべての3つのリーデイングフレームにある終止
コドンを含むヌクレオチド配列である。
まずはじめに、ループアウト断片は挿入断片を含むM1
3ssDNAテンプレートとアニーリングさせた。この断片は
d(A,T,G,C)三リン酸、クレノーポリメラーゼ、リガ
ーゼを加えて延長した。その後、この断片をEcoli JM
101に導入し、プラークハイブリダイゼーションによっ
て標識ループアウトプライマーと雑種形成するものをス
クリーニングした。DNAの複製型をEcoli形質転換株か
ら単離した。まず、二重鎖DNAをXbaIで切断して線状の
DNAにし、それをNcoIで切断した。一端がNcoI部位に
よって切断されたCfimiDNA含有スタッファーDNA断片
を線状のDNAに連結してNcoI部位を再生させた。このよ
うに構成されたものを両端(スタッファーDNA内およびc
ex遺伝子挿入断片内で)からほぼ同じ速度で消化するこ
とが可能なBal 31によって消化した。この消化によって
反応試料の部分を取り除き、EGTAを含むDNA緩衝液に入
れてBal31による消化を停止させた。スタッッファーDNA
は不活性化されたBal 31消化DNA混合物にNcoIを加える
ことによって取り除いた。このDNAはクレノーポリメラ
ーゼ処理し、アガロースゲルによって分画し、さらにpU
C12に連結して二重鎖閉環状DNAとした。この二重鎖閉環
状DNAを含む溶液を数μmほど取って、挿入断片の長さ
におけるわずかな違いがBal 31による欠失の結果である
ことを確かめるために、2種類の制限酵素によて処理し
た。前記二重鎖閉環状DNAはEcoli JM101に導入した。
cex遺伝子の3′末端に欠失のある突然変異体ファミリ
ーをスクリーニングするために、8kd SBDに対する抗体
を用いて欠失の認められるクローンを同定した。
異なる欠失突然変異体によって産生される欠損タンパ
ク質の前記アビセルへの結合能および触媒活性について
検討した。
実施例5 アビセルに固定されたβ−グリコシダーゼ融合タンパク
質を用いたセロビオースからのグルコースの生産 第7図はβ−グルコシダーゼ融合タンパク質を利用す
る概略説明図をである。
ここでは得られたセロビオース混合物をエンドグルカ
ナーゼ−エクソグルカナーゼ混合溶液とともにβ−グル
コシダーゼを固定したアビセルカラムに連続して流す方
法を用いた。
分解されるべきセルロース原料を含む溶液にエンドグ
ルカナーゼとエクソグルカナーゼとを適当な比率で発酵
槽に加えた。
つぎに一定時間酵素反応させて、溶液中にセルビオー
スを産生させた。その後、この溶液をアビセルカラムに
流し、エンドグルカナーゼとエクソグルカナーゼとを吸
着させ、かつ濃縮した。セロビオースを含む流出液をβ
−グルコシダーゼ融合タンパク質を固定した第2のカラ
ムに流し、該融合タンパク質によってセルビオースをグ
ルコース単位にまで加水分解した。エンドグルカナーゼ
とエクソグルカナーゼとを最初のカラムにおいて蒸留水
を流すことによって流出させて再生した。両方のカラム
は精製および酵素による変換に数回再利用することが可
能である。
実施例6 cenA-アルカリホスファターゼ融合タンパク質発現カセ
ットの調製 Tn phoAはEcoliのシグナル配列欠損アルカリホス
ファターゼ遺伝子(′phoA)を含むトランスポゾンTn5
の誘導体である。リーデイングフレーム内にある発現遺
伝子への転移による挿入はphoA融合タンパク質を作りだ
すことができる。もし、標的遺伝子がタンパク質エクス
ポートシグナルを含む場合、標的遺伝子は融合タンパク
質の分泌に関与することができる。この融合タンパク質
の分泌はアルカリホスファターゼによって検知すること
がき、この酵素の活性は、酵素がペリプラズムに位置す
るときだけ認められた。TnphoAはマルチプルクローニ
ング部位を有するプラスミドにおいてCfimi cenAと
融合したphoA遺伝子を作るのに用いられる。目的とす
るタンパク質をコードする遺伝子はマルチプルクローニ
ング部位にクローンすることが可能で、かつ融合タンパ
ク質として発現させることができた。この遺伝子産物は
アビセルのようなセルロースカラムへの結合によって精
製することができ、CfimiプロテアーゼによってcenA
融合パートナーを切断することができた。
A.遺伝子融合の調製とその解析 TnphoAの転位よる突然変異誘発はcenAとの遺伝子融
合を行なう際に利用される。cenAを含むプラスミドはp
UCEC2、pTZ18Uにクローン化された1.6kb Sst I cenA断
片、pUC18の多機能性誘導体である(Yanisch-Perron et
al.,Gene(1985)33:103-119)。pTZ18UはU.S.バイオ
ケミカルズ社から入手可能である。
オリゴヌクレオチドに直接突然変異誘発を行なう方法
(Zoller et al.,Nucleic Acids Res.(1982)10:6487
-6500およびZoller et al.,Methods Enzymol.(1983)
100:468-500)はcenA遺伝子のカルボキシル末端部分を
欠失させることおよびpTZ18UのPro-Thrボックスとマル
チプルクローニング部位とを並べて置くことに利用され
る。スクリーニング方法として、プローブとして変異オ
リゴヌクレオチドを用いたドットブロットハイブリダイ
ゼーションや制限酵素による分析がある。鎖伸張停止方
法によるDNAの塩基配列決定を、欠失領域の配列を確か
めるために行なった(Yanisch-Perron、前掲)。
転位はトランスポゾン、λTnphoA-1、を含む欠損ラム
ダファージをEcoli CC118(pUCEC2)に感染させて行
なった(Gutierrez et al.,J.Mol.Bio.(1987)195:28
9-297)。EcoliCC118はphoA遺伝子に欠失部分が存在
する。cenAと同一フレーム上へのcenA遺伝子の転位に
よる挿入はCenA-PhoA融合タンパク質を作る。このCenA
-PhoA融合タンパク質はペリプラズムに運ばれ、cen
シグナルペプチドによってその分泌が促進される。カナ
マイシン(トランスポゾン由来)およびアンピシリン抵
抗性によって選択されたコロニーをインジコ系基質であ
る5−ブロモ−4−クロロ−3−ヨードイルホスフェー
ト(XP)に対するアルカリホスファターゼ活性によって
スクリーニングした。phoA+コロニーから得たプラスミ
ドDNAは再びEcoliに導入され、上記のように選択およ
びスクリニーングされる。phoA+コロニーはカルボキ
シメチルセルロース(CMC)プレート上におけるエンド
グルカナーゼ活性をコンゴレッドによる染色により調べ
ることによってスクリーニングする(Gilkes et al.,Bi
o/Technology(1984)2:259-263)。表現型としてpho
A+ 、Eng -、そしてアンピシリンおよびカナマイシン耐性
であることが要求される。
プラスミドDNAをphoA+ 、Eng -コロニーから単離し、制
限酵素によって消化してからアガロースゲル電気泳動に
かけた。55個のコロニーをスクリーニングした結果、34
個のコロニーにおいて正しい方向にあるcenAに挿入さ
れたTnphoA挿入断片を有することがわかった。挿入はc
enA遺伝子全体にわたって行なわれていた。それらのク
ローンのうちのいくつかはずれてた位置に挿入が起こっ
ており、その可能性は融合のタンパク質産物をみれば明
らかである。CenA-PhoA融合タンパク質のセルロースに
対する結合を調べてみると、融合タンパク質は50mMリン
酸緩衝液(pH7.0)および0.5M NaClによる洗浄にもかか
わらず、濾紙に結合していた。
引き続いて行なわれる実験のために、セルロースに結
合した融合タンパク質を選択した。TnphoAの正確な挿
入位置を知るために鎖伸張停止方法によるDNA塩基配列
の決定を行なった。アビセルへの結合を促進させ、かつ
アビセルからの流出を起こさせる緩衝液の状態は実施例
3において述べたのでそれを参照されたい。
アビセル結合融合タンパク質をCfimiプロテアーゼ
とともにインキュベートし、このプロテアーゼによる分
解によって生じた断片をSDS-PAGEおよびphoAザイモグ
ラムまたはウエスタンイムノブロット、またはゲル濾過
クロマトグラフィーによって分析した。基質結合断片を
SDSに溶解し、プローブとしてPro-Thrボックスに対する
抗血清を用いてSDS-PAGEおよびウエスタンイムノブロッ
トによって分析した(Langsford et al.,FEBS letters
(1987)225:163-167)。
B.融合タンパク質の精製 融合タンパク質を含むEcoli抽出物をアビセルマト
リックスへの融合タンパク質の結合を促進させる緩衝液
とともにアビィセルカラムにのせる。非特異的な結合タ
ンパク質を緩衝液で洗い流したのち、Cfimiプロテア
ーゼをカラムにのせ、緩衝液で洗った。集められた分画
についてアルカリホスホターゼ活性を調べ、酵素活性が
ピークに達した分画をイオン交換またはゲル濾過クロマ
トグラフィによって精製した。プロテアーゼ濃度および
流速のような精製条件はアルカリホスホターゼ活性が最
も良く再現されるように色々と変えた。
実施例7 薬物誘導に対するCellulomoas fimiセルロース結合ドメ
インの利用 A.溶解性/持続性 インターロイキン2 Cfimiのセルロース結合領域に連結したインターロ
イキン2(IL-2)を含む融合タンパク質は、少なくとも
cexAまたはcexセルロース結合領域をコードするDNA塩基
配列と、IL-2またはその機能性部分をコードする遺伝子
とからなる融合遺伝子の調製とその融合遺伝子をEcol
iのような発現宿主へ導入することとによって上記方法
により調製した。融合タンパク質はセルロース(アビセ
ルまたはコットン)によるアフィニテイクロマトグラフ
ィによって精製した。蒸留水を流すことによって融合タ
ンパク質を流出させた後、この融合タンパク質を可溶性
(カルボキシルメチル)または不溶性(アビセル)セル
ロースに結合させた。それらの結合物をマウス(i.p.)
に注射し、腹腔内液を採取してIL-2のクリアランスカイ
ネテイックスを決定した。その結果、結合物は循環によ
ってIL-2のクリアランス速度を減少させることがわかっ
た。
B.免疫原性/アジュバント活性 前記のようにして調製され、かつCfimiセルラーゼ
のセルローズ結合領域に結合しているIL-2およびアルカ
リホスファターゼを含む2つの融合タンパク質は、それ
ぞれの融合タンパク質のセルロース結合領域によって同
じセルローズ結合領域に結合にした。ここでは、可溶性
(例えば、カルボキシルメチル)および不溶性(アビセ
ル)セルロースマトリックスを用いて、混合マトリック
ス(IL-2-CBR+セルロース+CBR−アルカリホスファタ
ーゼ)を作製し、それをマウスに注射した。1〜2週間
後に免疫応答(T細胞増殖およびアルカリホスファター
ゼ抗体濃度)について調べた。そして、同量のアルカリ
ホスファターゼ−CBRを注射した際の同免疫応答と比較
した。さらに、HIVgp120-CBRおよびPseudomonas porin
CBRをアルカリホスファターゼと置き換えて同様の系で
実験した。その結果、抗原に非常に近接したIL-2の組み
合わせは抗原に対する免疫応答増幅に利用できることが
わかった。
以上説明したように、本発明の組成物は目的とするペ
プチドに結合するポリサカロイドのポリサカロイド結合
ドメインを含むものである。また、本発明の組成物は可
溶性または不溶性のポリサッカロイドマトリックスに対
する種々のリガンドとして利用できる。このようなマト
リックスへの結合は薬輸送システム、発酵槽などに利用
することができ、またリガンドの精製または単離手段と
しても利用でき、リガンドとマトリックスとの結合は特
異的なプロテアーゼ処理によって切断することができる
のでリガンドを回収することができる。
この明細書に示したすべての出版物および特許出願は
本発明の内容に対する従来技術のレベルを示したもので
ある。すべての出版物および特許出願はあたかも個々の
出版物または特許出願が特別に、かつ個々に引用されて
いるかのようにして本願明細書に引用された。以上、添
付した請求の範囲に開示された本発明の目的から外れる
ことなく実施態様にもとづいて本発明の新規性および進
歩性を開示した。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (73)特許権者 999999999 ミラー,ロバート シー カナダ国 V7R 4N9 ブリティッ シュ コロンビア ノース バンクーバ ー ハックルベリー レーン 5535 (73)特許権者 999999999 ウォレン,リチャード エイ ジェイ カナダ国 V5Z 1Z1 ブリティッ シュ コロンビア バンクーバー ダブ リュ 21スト アヴェニュ 942 (73)特許権者 999999999 ジルクス,ネイル アール カナダ国 V6R 3B1 ブリティッ シュ コロンビア バンクーバー ダブ リュ 15ス アヴェニュ 4423 (72)発明者 キルバーン,ダグラス ジー カナダ国 V6S 1T4 ブリティッ シュ コロンビア バンクーバー ダブ リュ 29ス アベニュ 3728 (72)発明者 ミラー,ロバート シー カナダ国 V7R 4N9 ブリティッ シュ コロンビア ノース バンクーバ ー ハックルベリー レーン 5535 (72)発明者 ウォレン,リチャード エイ ジェイ カナダ国 V5Z 1Z1 ブリティッ シュ コロンビア バンクーバー ダブ リュ 21スト アヴェニュ 942 (72)発明者 ジルクス,ネイル アール カナダ国 V6R 3B1 ブリティッ シュ コロンビア バンクーバー ダブ リュ 15ス アヴェニュ 4423 (56)参考文献 特開 昭62−259596(JP,A) Gene,Vol.61,No.3, P.421−427(1987)

Claims (21)

    (57)【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】融合タンパク質を含むポリサッカロイドマ
    トリックスを調製する方法において、 セルラーゼの基質結合領域と所望のポリペプチドとを含
    み、前記ポリサッカロイドマトリックスを加水分解しな
    い融合タンパク質を調製し、 前記セルラーゼに対する基質を含む前記ポリサッカロイ
    ドマトリックスに、前記融合タンパク質を、前記基質結
    合領域が該ポリサッカロイドマトリックスに結合する条
    件下で接触させることを特徴とする方法。
  2. 【請求項2】前記融合タンパク質の調製において、5′
    末端から3′末端への転写方向で、転写開始調節部位、
    翻訳開始部位、融合タンパク質をコードするDNA配列、
    および翻訳と転写の終止部位を含み、前記開始及び終止
    部位は前記融合タンパク質の発現を制御する、DNA構造
    物を有する宿主細胞を増殖し、前記融合タンパク質を単
    離する、請求の範囲第1項に記載の方法。
  3. 【請求項3】前記単離において、前記融合タンパク質
    と、前記セルラーゼの基質を含むマトリックスを接触さ
    せる請求の範囲第2項に記載の方法。
  4. 【請求項4】前記セルラーゼがCellulomonas fimiから
    得られるものである請求の範囲第1ないし3項の何れか
    1項に記載の方法。
  5. 【請求項5】前記セルラーゼがエンドグルカナーゼ(E.
    C.3.2.1.4)またはセロビオハイドロラーゼ(E.C.3.2.
    1.91)である請求の範囲第1ないし3項の何れか1項に
    記載の方法。
  6. 【請求項6】前記ポリサッカロイドマトリックスが不溶
    性セルロースである請求の範囲第1ないし5項の何れか
    1項に記載の方法。
  7. 【請求項7】前記不溶性セルロースが微結晶性セルロー
    ス、リグノセルロース性物質、または綿である請求の範
    囲第6項記載の方法。
  8. 【請求項8】前記リグノセルロース性物質が、木材、木
    材パルプ、または植物組織を含む請求の範囲第7項記載
    の方法。
  9. 【請求項9】前記ポリサッカロイドマトリックスが可溶
    性ポリサッカロイドである請求の範囲第1ないし5項の
    何れか1項に記載の方法。
  10. 【請求項10】前記可溶性ポリサッカロイドがカルボキ
    シルメチルセルロースである請求の範囲第9項記載の方
    法。
  11. 【請求項11】アフィニティーマトリックスを用いて所
    望のポリペプチドを固定化する方法において、 セルラーゼの基質結合領域のアミノ酸配列と前記所望の
    ポリペプチドとを含み、前記アフィニティーマトリック
    スを加水分解しない融合タンパク質を調製し、 前記セルラーゼに対する基質を含むアフィニティーマト
    リックスに、前記融合タンパク質を、前記基質結合領域
    が該アフィニティーマトリックスに結合する条件下で接
    触させることを特徴とする方法。
  12. 【請求項12】前記所望のポリペプチドがβ−グルコシ
    ダーゼまたはインターロイキン−2である請求の範囲第
    11項記載の方法。
  13. 【請求項13】アフィニティーマトリックスを用いて所
    望のポリペプチドを精製する方法において、 セルラーゼの基質結合領域のアミノ酸配列と前記所望の
    ポリペプチドとを含み、前記アフィニティーマトリック
    スを加水分解しない融合タンパク質を調製し、 前記セルラーゼに対する基質を含むアフィニティーマト
    リックスに、前記融合タンパク質を、前記基質結合領域
    が該アフィニティーマトリックスに結合する条件下で接
    触させて前記融合タンパク質を前記アフィニティーマト
    リックスに結合させ、 前記アフィニティーマトリックスから前記融合タンパク
    質または所望のポリペプチドを分離させることを特徴と
    する方法。
  14. 【請求項14】前記基質結合領域がCellulomonas fimi
    から得られるセルラーゼに含まれるものである請求の範
    囲第13項記載の方法。
  15. 【請求項15】前記セルラーゼがエンドグルカナーゼ
    (E.C.3.2.1.4)またはセロビオハイドラーゼ(E.C.3.
    2.1.91)である請求の範囲第14項記載の方法。
  16. 【請求項16】前記アフィニティーマトリックスが微結
    晶性セルロースである請求の範囲第13ないし15項の何れ
    か1項に記載の方法。
  17. 【請求項17】前記所望のポリペプチドがアルカリホス
    ファターゼである請求の範囲第13ないし16項の何れか1
    項に記載の方法。
  18. 【請求項18】ハイブリッドタンパク質を含むポリサッ
    カロイドマトリックスにおいて、前記ハイブリッドタン
    パク質が、セルラーゼの基質結合領域と、該基質結合領
    域と通常結合するポリペプチドとは異なるものである所
    望のポリペプチドとを含み、ポリサッカロイドマトリッ
    クスを加水分解しないハイブリッドタンパク質であり、
    前記基質結合領域が該ポリサッカロイドマトリックスに
    結合しているポリサッカロイドマトリックス。
  19. 【請求項19】前記ポリサッカロイドがセルロースであ
    る請求の範囲第18項に記載のポリサッカロイドマトリッ
    クス。
  20. 【請求項20】セルロースマトリックスと少なくとも2
    つの異なるハイブリッドタンパク質とを含み、各ハイブ
    リッドタンパク質は、セルラーゼの基質結合領域と、イ
    ンターロイキン−2またはアルカリホスファターゼの活
    性を有するポリペプチドとを含み、各ハイブリッドタン
    パク質の前記基質結合領域が前記セルロースマトリック
    スに結合するとともに、前記ハイブリッドタンパク質が
    前記セルロースマトリックスを加水分解しないものであ
    ることを特徴とする組成物。
  21. 【請求項21】セルロースマトリックスとハイブリッド
    タンパク質を含み、該ハイブリッドタンパク質が、セル
    ラーゼの基質結合領域と、アルカリホスファターゼまた
    はβ−ガラクトシダーゼの活性を有するポリペプチドと
    を含み、前記基質結合領域がセルロースマトリックスに
    結合するとともに、前記ハイブリッドタンパク質が前記
    セルロースマトリックスを加水分解しないものであるこ
    とを特徴とする組成物。
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