JP2019522468A - プロバイオティック活性を示すバチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)菌株 - Google Patents
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Abstract
本発明は、クロストリジウム・パーフリンジェンス(C.perfringens)を強力に阻害する新規なバチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株およびプロバイオティクスとしてのその使用に関する。
Description
本発明は、クロストリジウム・パーフリンジェンス(C.perfringens)を強力に阻害する新規なバチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株およびプロバイオティクスとしてのその使用に関する。
飼料産業におけるプロバイオティック成分としてのバチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株の使用は、従来技術において周知である。プロバイオティクス(「直接給与生菌剤」または「DFM」とも呼ばれる)の機能は、有益な細菌の増殖の補助および/または病原性細菌の増殖の抑制によって腸内細菌叢に好影響を与えることにある。理想的には、プロバイオティクスを用いることによって、成長促進抗生物質(APG)を使用しなくても済むようになる。しかしそれに加えて、プロバイオティクスが、特定の飼料成分の消化を助けるなどのさらなる機能を果たすことが望ましい。
したがって、技術水準に鑑み、腸内細菌叢に好影響を及ぼすだけでなく、望ましくは少なくとも1つのさらなる機能を果たすプロバイオティクスが求められている。
驚くべきことに、本発明による細菌は、有利な特性を数多く示すことが見出された。本発明による細菌は、商業的に重大な影響を及ぼす主要な家禽類の病原菌であるクロストリジウム・パーフリンジェンス(C.perfringens)の増殖を阻害するその能力に加えて、特に胆汁の存在下で非常に高い増殖速度を示すとともに、セルロースの消化を非常に効果的に支援する。
バチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)DSM 32314は、天然に存在する単離物のスクリーニングによって同定されている。これは、特許手続上の微生物の寄託の国際承認に関するブダペスト条約の規定に基づき、Evonik Degussa GmbHの名義にて前述の受託番号で2016年5月12日付でドイツ微生物細胞培養コレクション(DSMZ)に寄託されている。その系統発生的および表現型の特性に基づき、バチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株DSM 32314はバチルス・パラリケニフォルミス(B.paralicheniformis)として分類される場合もある(Dunlap et al.(2015), Int J Syst Evol Microbiol 65, 3487−3492参照)。
したがって、本発明の第1の対象は、以下の群から選択されるバチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)菌株および/または前記バチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)菌株の調製物である:
a) DSMZにDSM 32314で寄託されたバチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)菌株;
b) DSM 32314で寄託されたバチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)菌株の変異体であって、DSM 32314菌株のすべての同定特性を示し、好ましくは、前記菌株DSM 32314に対して少なくとも95%、好ましくは少なくとも96%、少なくとも97%または少なくとも98%、より好ましくは少なくとも99%または少なくとも99.5%のDNA配列同一性を有する変異体;
c) (a)または(b)の調製物;
d) (a)、(b)または(c)に含まれる代謝産物の有効な混合物を含有する調製物。
a) DSMZにDSM 32314で寄託されたバチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)菌株;
b) DSM 32314で寄託されたバチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)菌株の変異体であって、DSM 32314菌株のすべての同定特性を示し、好ましくは、前記菌株DSM 32314に対して少なくとも95%、好ましくは少なくとも96%、少なくとも97%または少なくとも98%、より好ましくは少なくとも99%または少なくとも99.5%のDNA配列同一性を有する変異体;
c) (a)または(b)の調製物;
d) (a)、(b)または(c)に含まれる代謝産物の有効な混合物を含有する調製物。
DSMZにDSM 32314で寄託されたバチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)菌株は、以下の特徴的配列を示す:
a) 配列番号1のポリヌクレオチド配列に対して少なくとも99.5%、特に100%の配列同一性を有する16S rDNA配列;
b) 配列番号2のポリヌクレオチド配列に対して少なくとも99.5%、特に100%の配列同一性を有するyqfD配列;
c) 配列番号3のポリヌクレオチド配列に対して少なくとも99.5%、特に100%の配列同一性を有するgyrB配列;
d) 配列番号4のポリヌクレオチド配列に対して少なくとも99.5%、特に100%の配列同一性を有するrpoB配列;
e) 配列番号5のポリヌクレオチド配列に対して少なくとも99.5%、特に100%の配列同一性を有するgroEL配列。
a) 配列番号1のポリヌクレオチド配列に対して少なくとも99.5%、特に100%の配列同一性を有する16S rDNA配列;
b) 配列番号2のポリヌクレオチド配列に対して少なくとも99.5%、特に100%の配列同一性を有するyqfD配列;
c) 配列番号3のポリヌクレオチド配列に対して少なくとも99.5%、特に100%の配列同一性を有するgyrB配列;
d) 配列番号4のポリヌクレオチド配列に対して少なくとも99.5%、特に100%の配列同一性を有するrpoB配列;
e) 配列番号5のポリヌクレオチド配列に対して少なくとも99.5%、特に100%の配列同一性を有するgroEL配列。
したがって、本発明のさらなる対象は、バチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)菌株またはその調製物、特に前述の特性を示すバチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株であって、以下の特性のうちの少なくとも1つを示し、好ましくは以下の特性のすべてを示すものである:
a) 配列番号1のポリヌクレオチド配列に対して少なくとも99%、好ましくは少なくとも99.5%、より好ましくは少なくとも99.8%または少なくとも99.9%、特に100%の配列同一性を有する16S rDNA配列;
b) 配列番号2のポリヌクレオチド配列に対して少なくとも99%、好ましくは少なくとも99.5%、より好ましくは少なくとも99.8%または少なくとも99.9%、特に100%の配列同一性を有するyqfD配列;
c) 配列番号3のポリヌクレオチド配列に対して少なくとも99%、好ましくは少なくとも99.5%、より好ましくは少なくとも99.8%または少なくとも99.9%、特に100%の配列同一性を有するgyrB配列。
a) 配列番号1のポリヌクレオチド配列に対して少なくとも99%、好ましくは少なくとも99.5%、より好ましくは少なくとも99.8%または少なくとも99.9%、特に100%の配列同一性を有する16S rDNA配列;
b) 配列番号2のポリヌクレオチド配列に対して少なくとも99%、好ましくは少なくとも99.5%、より好ましくは少なくとも99.8%または少なくとも99.9%、特に100%の配列同一性を有するyqfD配列;
c) 配列番号3のポリヌクレオチド配列に対して少なくとも99%、好ましくは少なくとも99.5%、より好ましくは少なくとも99.8%または少なくとも99.9%、特に100%の配列同一性を有するgyrB配列。
好ましくは、このバチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株は、以下のさらなる特性のうちの少なくとも1つを示し、より好ましくは以下のさらなる特性のすべてを示す:
d) 配列番号4のポリヌクレオチド配列に対して少なくとも99%、好ましくは少なくとも99.5%、より好ましくは少なくとも99.8%または少なくとも99.9%、特に100%の配列同一性を有するrpoB配列;
e) 配列番号5のポリヌクレオチド配列に対して少なくとも99%、好ましくは少なくとも99.5%、より好ましくは少なくとも99.8%または少なくとも99.9%、特に100%の配列同一性を有するgroEL配列。
d) 配列番号4のポリヌクレオチド配列に対して少なくとも99%、好ましくは少なくとも99.5%、より好ましくは少なくとも99.8%または少なくとも99.9%、特に100%の配列同一性を有するrpoB配列;
e) 配列番号5のポリヌクレオチド配列に対して少なくとも99%、好ましくは少なくとも99.5%、より好ましくは少なくとも99.8%または少なくとも99.9%、特に100%の配列同一性を有するgroEL配列。
したがって、本発明の特定の対象はまた、以下の特性を示すバチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)菌株である:
a) 配列番号1の16S rDNA配列;
b) 配列番号2のyqfD配列;
c) 配列番号3のgyrB配列。
a) 配列番号1の16S rDNA配列;
b) 配列番号2のyqfD配列;
c) 配列番号3のgyrB配列。
好ましくは、このバチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株は、以下のさらなる特性を示す:
d) 配列番号4のrpoB配列;
e) 配列番号5のgroEL配列。
d) 配列番号4のrpoB配列;
e) 配列番号5のgroEL配列。
本発明の菌株は、好ましくは、以下のさらなる特性のうちの少なくとも1つを特徴とし、より好ましくは以下のさらなる特性のすべてを特徴とする:
本発明の菌株は、好ましくは、嫌気性条件下で増殖することができる。さらに、本発明の菌株は、好ましくは、このような嫌気性条件下で非水溶性セルロースを分解することができる。
本発明の菌株は、好ましくは、嫌気性条件下で増殖することができる。さらに、本発明の菌株は、好ましくは、このような嫌気性条件下で非水溶性セルロースを分解することができる。
本発明の菌株は、好ましくは、感染性細菌、特にクロストリジウム・パーフリンジェンス(C.perfringens)を非常に効果的に阻害する。特に本発明の菌株は、好ましくは、クロストリジウム・パーフリンジェンス(C.perfringens)のATCC 13124型菌株に関してLBKelly寒天プレート上でのウェル拡散拮抗アッセイにおける病原菌クリアランスが少なくとも10mmであり、より好ましくは少なくとも13mmであることを特徴とする。
胞子は、好ましくは低pHで生存可能であり、好ましくは、わずか4.0、特にわずか3.0、好ましくはわずか2.0のpHに曝された状態で少なくとも1時間生存する。
本発明による菌株は、好ましくは、0.05重量%の酢酸、0.05重量%のプロピオン酸および/または0.2重量%の乳酸の存在下で増殖し得ることをさらに特徴とする。
本発明による菌株は、好ましくは、セルラーゼ活性が少なくとも200mU/mL、より好ましくは少なくとも230mU/mL、特に少なくとも約250mU/mLであり、キシラナーゼ活性が少なくとも10mU/mL、より好ましくは少なくとも15mU/mL、特に少なくとも約20mU/mLであり、かつ/またはプロテアーゼ活性が少なくとも6mU/mL、より好ましくは少なくとも8mU/mL、特に少なくとも約10mU/mLであることをさらに特徴とする。
本発明によるバチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株は、好ましくは、2mMの胆汁の存在下で、より好ましくは4mMの胆汁の存在下で増殖し得ることをさらに特徴とする。特に本発明によるバチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株は、好ましくは、それぞれ2mMの胆汁の存在下で、AUC5性能値が少なくとも0.3、好ましくは少なくとも0.4、特に少なくとも0.5、殊に約0.54であり、かつAUC10性能値が少なくとも1.5、好ましくは少なくとも1.75、特に少なくとも2.0、殊に約2.1であることを特徴とする。
さらに、本発明によるバチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株は、好ましくは、高濃度塩の条件下で、特に10重量%のNaClの存在下で、少なくとも1日間増殖することができる。
さらに、本発明の菌株は、好ましくは、動物飼料のペレット化に必要な高温で生存し、特に好ましくは、80℃の温度で少なくとも20分間生存する。
本発明による菌株は、バチルス・パラリケニフォルミス(B.paralicheniformis)と分類される場合もあるため、前述の特性を示すバチルス・パラリケニフォルミス(B.paralicheniformis)菌株およびその調製物も、本発明のさらなる対象である。
いかなる理論にも束縛されることを望むものではないが、本発明によるバチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)菌株は、選択的有効性を示す代謝産物の産生や、利用可能な栄養素をより良好に消費することによる病原性細菌との競合を含む多面的な作用様式によって動物の健康を増進し、これによって腸内の病原性細菌の効果的な抑制が確立されるものと考えられる。
抗生物質に対するプロバイオティクスの大きな利点の1つに、プロバイオティクスは、無秩序に細菌を破壊することも、病原性細菌の抗生物質耐性菌株を生じさせることもない、という点が挙げられる。通常、プロバイオティクスは、特定の有効性を示す抗菌性物質の産生によって病原性細菌と選択的に競合することができるとともに、理想的には、これと同時に、有益な腸内細菌叢の増殖および生存を増強することができる。さらに、プロバイオティクスは、好ましくは、処置動物における全身免疫応答を刺激することができる。
本発明のDSM 32314の変異菌株は、好ましくは偶発的変異体である。「偶発的変異体」なる用語は、変異誘発物質を意図的に使用することなくDSM 32314から生じる変異体を指す。こうした偶発的変異体は、UV光の存在下または親が感受性を示す特定の抗生物質の存在下でバチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)菌株を増殖させて、耐性変異体を生物学的活性の向上や動物の健康の1つまたは複数の徴候を増強させる能力の向上について試験するなどの古典的な方法によって得ることができる。偶発的変異体を同定するための他の方法は、当業者に知られている。しかし、本発明には、これらの好ましい偶発的変異体の他に、遺伝子工学によって得られる変異体などの、DSM 32314の他のあらゆる種類の変異体が包含される。
本発明の特定の一実施形態は、前述の特性を特徴とするDSM 32314菌株の、天然に存在しない変異体である。
本発明の好ましい一実施形態において、本発明の菌株および調製物は、好ましくは、動物またはヒトに経口投与される。
したがって、本発明のさらなる対象は、本発明のバチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株および/または調製物を含有する、組成物、例えば飼料原料、食料品、飲用水および飼育用水ならびに治療用組成物である。
本発明のさらなる対象はまた、飼料または食品中のプロバイオティック成分(DFM)としての、本発明のバチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株および/または調製物の使用である。
本発明のさらなる対象はまた、飼料または食品中のプロバイオティック成分(DFM)としての、バチルス・パラリケニフォルミス(B.paralicheniformis)菌株および/またはその調製物の使用である。
本発明による好ましい食料品は、乳製品、特にヨーグルト、チーズ、ミルク、バターおよびクワルクである。
本発明の菌株の細胞は、特に本発明の組成物中で、胞子(休眠状態である)として存在することも、栄養細胞(増殖中である)として存在することも、移行状態細胞(増殖期から胞子形成期へと移行中である)として存在することも、これらの細胞の少なくとも2種類の組合せ物として存在することも、特にこれらの細胞のすべての種類の組合せ物として存在することも可能である。好ましい一実施形態において、本発明の組成物は、主に胞子を含むか、または胞子のみを含む。
本発明のバチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)菌株およびそれを含有する組成物は、動物への投与に際し、好ましくは、当該動物の健康を増進し、かつ/または当該動物の全身状態を改善し、かつ/または当該動物の飼料要求率を改善し、かつ/または当該動物の死亡率を低下させ、かつ/または当該動物の生存率を増加させ、かつ/または当該動物の体重増加を向上させ、かつ/または当該動物の生産性を向上させ、かつ/または当該動物の疾患抵抗性を向上させ、かつ/または当該動物の免疫応答を増大させ、かつ/または当該動物において健康な腸内細菌叢を確立もしくは維持し、かつ/または当該動物の糞便を通じた病原菌の放出を減少させる。特に本発明の菌株および組成物を使用することにより、治療目的での抗生物質の投与後に腸内細菌叢の健全なバランスが再度確立されるよう支援することができる。
したがって、本発明のさらなる対象は、動物の健康を増進し、かつ/または動物の全身状態を改善し、かつ/または動物の飼料要求率を改善し、かつ/または動物の死亡率を低下させ、かつ/または動物の生存率を増加させ、かつ/または動物の体重増加を向上させ、かつ/または動物の生産性を向上させ、かつ/または動物の疾患抵抗性を向上させ、かつ/または動物の免疫応答を増大させ、かつ/または動物において健康な腸内細菌叢を確立もしくは維持し、かつ/または動物の糞便を通じた病原菌の放出を減少させる方法であって、本発明の菌株および/もしくは調製物または当該菌株を含有する本発明の組成物を動物に投与する方法である。
したがって、本発明のさらなる対象はまた、動物の健康を増進し、かつ/または動物の全身状態を改善し、かつ/または動物の飼料要求率を改善し、かつ/または動物の死亡率を低下させ、かつ/または動物の生存率を増加させ、かつ/または動物の体重増加を向上させ、かつ/または動物の生産性を向上させ、かつ/または動物の疾患抵抗性を向上させ、かつ/または動物の免疫応答を増大させ、かつ/または動物において健康な腸内細菌叢を確立もしくは維持し、かつ/または動物の糞便を通じた病原菌の放出を減少させるための、本発明の菌株および/または調製物および/または組成物の使用であって、本発明の菌株および/もしくは調製物または当該菌株を含有する本発明の組成物を動物に投与する使用である。
したがって、本発明のさらなる対象はまた、動物の健康を増進し、かつ/または動物の全身状態を改善し、かつ/または動物の飼料要求率を改善し、かつ/または動物の死亡率を低下させ、かつ/または動物の生存率を増加させ、かつ/または動物の体重増加を向上させ、かつ/または動物の生産性を向上させ、かつ/または動物の疾患抵抗性を向上させ、かつ/または動物の免疫応答を増大させ、かつ/または動物において健康な腸内細菌叢を確立もしくは維持し、かつ/または動物の糞便を通じた病原菌の放出を減少させるための、前述の本発明の菌株および調製物ならびに当該菌株を含有する本発明の組成物である。
「動物の生産性の向上」とは、特に以下のいずれかを指す:卵、乳もしくは肉をより多くまたは高品質に生産すること、または離乳した子の生産量を増加させること。
本発明の菌株、調製物および組成物の方法および使用は、治療的なものであってもよいし、治療的でないものであってもよい。本発明の特に好ましい一実施形態において、前記方法および使用は、治療用途のものではなく、特に栄養補給用途のものである。
動物の未処置の肥料は、病原性細菌および他の成分ゆえに、特に当該動物自体および/または当該肥料と接触するヒトにとって有害な環境作用を示すことがあるが、当該動物に本発明の菌株、組成物もしくは調製物を給与するか、または当該動物の肥料もしくは敷料を本発明の菌株、組成物もしくは調製物で直接処置することのいずれによっても、前述の作用を回避することができる。したがって、本発明のさらなる対象は、肥料または汚染液体の有害な環境作用を制御および/または回避する方法であって、本発明による少なくとも1種の菌株、少なくとも1種の調製物および/または少なくとも1種の組成物を、肥料、汚染液体、敷料、ピットまたは肥料溜めに施与する工程を含む方法である。好ましくは、組成物は、液体の形態で例えば噴霧により、または粉末として例えば散布により施与される。
有害な細菌は敷料のコンシステンシーに悪影響を及ぼすことがあり、これによって特に敷料が若干ないし高度に液状となることがあり、これが家禽類の趾蹠の病変を招くことがあるが、本発明の菌株、組成物または調製物を動物に給与することで、これを回避することができる。したがって、本発明のさらなる対象は、敷料のコンシステンシーを制御および/もしくは改善する方法、特に敷料の固形のコンシステンシーを確保する方法、ならびに/または趾蹠の病変を回避する方法であって、本発明による少なくとも1種の菌株、少なくとも1種の調製物および/または少なくとも1種の組成物を、動物、特に家禽類に給与する工程を含む方法である。
本発明による菌株および調製物はまた、水質の改善にも使用することができる。したがって、本発明のさらなる対象はまた、水または水溶液、特に飲用水および/または飼育用水の品質を制御および/または向上させる方法であって、本発明による少なくとも1種の菌株および/または少なくとも1種の調製物および/または少なくとも1種の組成物を、水または水溶液に施与する工程を含む方法である。
さらに、本発明による菌株および調製物は、植物の微生物病の治療にも使用することができる。したがって、本発明のさらなる対象はまた、植物、特に栽培植物の微生物病を治療および/または予防する方法であって、本発明による少なくとも1種の菌株および/または少なくとも1種の調製物および/または少なくとも1種の組成物を、植物に施与する工程を含む方法である。この施与は、液体の形態で例えば噴霧により行うことも可能であるし、固体の形態で特に粉末として行うことも可能である。
本発明の菌株、調製物および組成物を使用することによって、好ましくは、前述の特性のうちの少なくとも1つの改善が実現され、ここで、特性の実現とは、好ましくは、適切な陰性対照と比較した場合の少なくとも1%、より好ましくは少なくとも3%または少なくとも5%の改善を意味する。陰性対照としては、畜産分野で知られている平均的なものを用いることができるが、好ましくは、陰性対照動物として、試験動物と同一の処置を施すが本発明の菌株および/または調製物を投与しないものを用いることができる。
特に本発明の菌株、調製物および組成物は、動物の腸内での病原性細菌の増殖を阻害および/または減少させるのに有効な量で動物に投与または給与することができる。こうした病原性細菌としては、クロストリジウム綱菌(Clostridia)、リステリア属菌(Listeria)、サルモネラ属菌(Salmonella)、エンテロコッカス属菌(Enterococci)、スタフィロコッカス属菌(Staphylococci)、エロモナス属菌(Aeromonas)、ストレプトコッカス属菌(Streptococci)、カンピロバクター属菌(Campylobacter)、エスケリキア・コリ(Escherichia coli)およびビブリオ属菌(Vibrio)が挙げられる。これに関連して、本発明の方法を用いることにより、動物の糞便中に放出される病原性細菌の量を減少させることができる。本発明の方法を用いることにより、動物の腸内での乳酸菌などの有益な細菌の増殖を維持または増加させることもできる。病原性細菌の減少および/または有益な細菌の増加もしくは維持により、本発明の組成物は、全体として健康な腸内細菌叢を維持することができる。
したがって、本発明のさらなる対象は、有害なもしくは病原性の細菌の増殖を阻害および/もしくは減少させ、かつ/または動物の腸内の有益な細菌の増殖を維持および/もしくは増加させる方法であって、本発明の菌株および/または調製物および/または組成物を動物に投与し、前記病原性細菌は、好ましくは、クロストリジウム綱菌(Clostridia)、特にクロストリジウム・パーフリンジェンス(C.perfringens)およびクロストリジウム・ディフィシレ(C.difficile)、リステリア属菌(Listeria)、特にリステリア・モノサイトゲネス(L.monocytogenes)、リステリア・ゼーリゲリ(L.seeligeri)およびリステリア・ウェルシメリ(L.welshimeri)、サルモネラ属菌(Salmonella)、特にサルモネラ・エンテリカ(S.enterica)、サルモネラ・ガリナルム(S.gallinarum)、サルモネラ・プローラム(S.pullorum)、サルモネラ・アリゾナエ(S.arizonae)、サルモネラ・ティフィムリウム(S.typhimurium)、サルモネラ・エンテリティディス(S.enteritidis)およびサルモネラ・ボンゴリ(S.bongori)、エンテロコッカス属菌(Enterococci)、特にエンテロコッカス・フェカリス(E.faecalis)、エンテロコッカス・フェシウム(E.faecium)およびエンテロコッカス・セコルム(E.cecorum)、スタフィロコッカス属菌(Staphylococci)、特にスタフィロコッカス・アウレウス(S.aureus)、エロモナス属菌(Aeromonas)、ストレプトコッカス属菌(Streptococci)、特にストレプトコッカス・スイス(S.suis)およびストレプトコッカス・ガリナセウス(S.gallinaceus)、カンピロバクター属菌(Campylobacter)、特にカンピロバクター・ジェジュニ(C.jejuni)およびカンピロバクター・コリ(C.coli)、エスケリキア・コリ(Escherichia coli)およびビブリオ属菌(Vibrio)、特にビブリオ・パラヘモリティカス(V.parahemolyticus)およびビブリオ・ハルベイ(V.harveyi)から選択され、前記有益な細菌は、好ましくは、乳酸菌、特にラクトバチルス属菌(Lactobacilli)およびビフィズス菌(Bifidobacteria)から選択される方法である。
本発明の好ましい一実施形態において、少なくとも1種の病原性細菌の量、特にクロストリジウム・パーフリンジェンス(C.perfringens)の量は、少なくとも0.5 logだけ減少し、より好ましくは少なくとも1 log、少なくとも2 logまたは少なくとも3 logだけ減少する。
したがって、本発明のさらなる対象はまた、病原性細菌の増殖を阻害および/もしくは減少させ、かつ/または動物の腸内の有益な細菌の増殖を維持および/もしくは増加させるための本発明の菌株、調製物および組成物であって、前記病原性細菌は、好ましくは、クロストリジウム綱菌(Clostridia)、特にクロストリジウム・パーフリンジェンス(C.perfringens)およびクロストリジウム・ディフィシレ(C.difficile)、リステリア属菌(Listeria)、特にリステリア・モノサイトゲネス(L.monocytogenes)、リステリア・ゼーリゲリ(L.seeligeri)およびリステリア・ウェルシメリ(L.welshimeri)、サルモネラ属菌(Salmonella)、特にサルモネラ・エンテリカ(S.enterica)、サルモネラ・ガリナルム(S.gallinarum)、サルモネラ・プローラム(S.pullorum)、サルモネラ・アリゾナエ(S.arizonae)、サルモネラ・ティフィムリウム(S.typhimurium)、サルモネラ・エンテリティディス(S.enteritidis)およびサルモネラ・ボンゴリ(S.bongori)、エンテロコッカス属菌(Enterococci)、特にエンテロコッカス・フェカリス(E.faecalis)、エンテロコッカス・フェシウム(E.faecium)およびエンテロコッカス・セコルム(E.cecorum)、スタフィロコッカス属菌(Staphylococci)、特にスタフィロコッカス・アウレウス(S.aureus)、エロモナス属菌(Aeromonas)、ストレプトコッカス属菌(Streptococci)、特にストレプトコッカス・スイス(S.suis)およびストレプトコッカス・ガリナセウス(S.gallinaceus)、カンピロバクター属菌(Campylobacter)、特にカンピロバクター・ジェジュニ(C.jejuni)およびカンピロバクター・コリ(C.coli)、エスケリキア・コリ(Escherichia coli)およびビブリオ属菌(Vibrio)、特にビブリオ・パラヘモリティカス(V.parahemolyticus)およびビブリオ・ハルベイ(V.harveyi)から選択され、前記有益な細菌は、好ましくは、乳酸菌、特にラクトバチルス属菌(Lactobacilli)およびビフィズス菌(Bifidobacteria)から選択される、菌株、調製物および組成物である。
病原性細菌の発生および/または増殖の増大によって、特定の疾患が生じるかまたは生じる可能性がある。例えば、クロストリジウム・パーフリンジェンス(Clostridium perfringens)の発生および/または増殖の増大は、腸疾患の発症、特に家禽類の壊死性腸炎の発症を招くことがある。クロストリジウム・パーフリンジェンス(Clostridium perfringens)の発生および/または増殖の増大は、細菌性腸炎、壊疽性皮膚炎および胆管肝炎のようなさらなる疾患の発症も招く可能性がある。クロストリジウム・パーフリンジェンス(C.perfringens)による感染症の最も軽い形態でさえ、すでに下痢を伴うことがあり、その結果、敷料が濡れてしまい、趾蹠皮膚炎のような二次的な病気を引き起こす可能性がある。
したがって、本発明のさらなる対象はまた、前述の本発明の菌株および/または組成物を含有する治療用組成物である。
したがって、本文脈における好ましい対象は、動物、好ましくは家禽類における壊死性腸炎、特に亜臨床的壊死性腸炎を治療および/または予防するための、前述の本発明の菌株および/または組成物を含有する治療用組成物である。したがって、本文脈におけるさらなる好ましい対象は、動物、好ましくは家禽類における、細菌性腸炎、壊疽性皮膚炎、胆管肝炎、クロストリジウム症、下痢および/または趾蹠皮膚炎を治療および/または予防するための、前述の本発明の菌株および/または組成物を含有する治療用組成物である。
したがって、本発明のさらなる対象はまた、家禽類における疾患、特に腸疾患、好ましくは壊死性腸炎、特に亜臨床的壊死性腸炎の治療および/または予防であって、本発明の菌株および/または組成物および/または調製物を、それを必要とする動物に投与する治療および/または予防である。したがって、本発明のさらなる対象はまた、細菌性腸炎、壊疽性皮膚炎、胆管肝炎、クロストリジウム症、下痢および/または趾蹠皮膚炎から選択される疾患、好ましくは家禽類の疾患の治療および/または予防であって、本発明の菌株および/または組成物および/または調製物を、それを必要とする動物に投与する治療および/または予防である。
本発明の菌株および/または調製物および/または組成物は、動物の生涯にわたって、または動物の生涯の特定の段階もしくは部分の間に、複数日にわたって飼料および/または飲用水において動物に投与することができる。例えば、本発明の菌株および/または組成物を、スターター期用食餌でのみ投与することも可能であるし、家畜の仕上げ期用食餌でのみ投与することも可能である。
本発明の特定の対象はまた、ヒトの健康を増進し、かつ/またはヒトの全身状態を改善し、かつ/またはヒトの疾患抵抗性を向上させ、かつ/またはヒトの免疫応答を増大させ、かつ/またはヒトにおいて健康な腸内細菌叢を確立もしくは維持する方法であって、本発明の菌株および/もしくは調製物または当該菌株を含有する本発明の組成物をヒトに投与する方法である。
したがって、本発明のさらなる対象は、ヒトの健康を増進し、かつ/またはヒトの全身状態を改善し、かつ/またはヒトの疾患抵抗性を向上させ、かつ/またはヒトの免疫応答を増大させ、かつ/またはヒトにおいて健康な腸内細菌叢を確立もしくは維持するための、本発明の菌株および/または調製物および/または組成物の使用であって、本発明の菌株および/もしくは調製物または当該菌株を含有する本発明の組成物をヒトに投与する使用である。
本発明の組成物、特に飼料、食品および医薬組成物ならびに飲用水または飼育用水は、好ましくは、本発明の菌株を含むとともに、約1×103〜約2×1012 CFU/g 飼料またはml 水の比率で動物に投与され、特に約1×103または約1×104または約1×105または約1×106または約1×107または約1×108または約1×109または約1×1010または約1×1011または約1×1012 CFU/g 飼料またはml 水の比率で動物に投与され、好ましくは約1×104〜約1×1010 CFU/g 飼料またはml 水の量で動物に投与され、より好ましくは1×104〜1×107 CFU/g 飼料またはml 水の量で動物に投与される。
これに相応して、本発明の飼料、食品および水性組成物中の本発明の菌株および/または調製物の好ましい量は、好ましくは0.1重量%〜10重量%、より好ましくは0.2重量%〜5重量%、特に0.3重量%〜3重量%である。
本発明の方法を、あらゆる種類の動物に用いることができ、特にあらゆる種類の非ヒト動物および非昆虫動物に用いることができ、より好ましくは、哺乳類や水生動物や鳥類といったあらゆる種類の脊椎動物に使用することができる。
本発明の恩恵を受け得る動物としては、これらに限定されるものではないが例えば、家畜、ペット、外来動物、動物園の動物、水生動物、スポーツ、レクリエーションまたは作業に用いられる動物が挙げられる。
ペットは、好ましくは、イヌ類、ネコ類、家庭で飼育している鳥類および家庭で飼育している外来動物から選択される。水生動物は、好ましくは魚類および甲殻類であって、好ましくはヒトの栄養を意図したものから選択される。これらには、特にコイ、ティラピア、ナマズ、マグロ、サケ、マス、バラムンディ、鯛、パーチ、タラ、小エビ、ロブスター、カニ、大型のエビおよびクレイフィッシュが挙げられる。これに関連して好ましいサケの種類は、タイセイヨウサケ、ベニザケ、サクラマス、キングサーモン、ケタサーモン、ギンザケ、ドナウイトウ、タイヘイヨウサケおよびカラフトマスである。
さらに好ましい水生動物は、養殖魚であって、続いて処理されて魚粉または魚油が得られるものである。これに関連して、これらの魚は、好ましくは、ニシン、ポラック、メンヘーデン、アンチョビ、カペリンまたはタラである。
さらに好ましい一実施形態において、動物は、消費のために飼育される、または食料生産体としての家畜であり、例えば家禽類、ブタおよび反芻動物である。家禽類は、生産的家禽類または家庭で飼育している家禽類から選択することができるが、嗜好的な家禽類または猟鳥類からも選択することができる。
本文脈における好ましい生産的家禽類は、ニワトリ、シチメンチョウ、アヒルおよびガチョウである。本文脈における生産的家畜は、好ましくは、若齢畜の生産に向けて最適化された家禽類または肉を有するように最適化された家禽類である。
好ましい嗜好的な家禽類または猟鳥類は、クジャク、キジ、ヤマウズラ、イワシャコ、ホロホロチョウ、ウズラ、キバシオオライチョウ、ライチョウ、ハトおよび白鳥であり、特にウズラが好ましい。
さらに好ましい家禽類は、平胸類の鳥類、特にダチョウおよびエミューならびにオウムである。
本発明による反芻動物は、好ましくはウシ、ヤギおよびヒツジから選択される。一実施形態において、本発明の組成物を離乳前の動物に給与することにより、当該動物の健康を増進させ、特に当該動物における下痢の発症率を減少させることができる。離乳前の動物とは、子牛を含む、出生時から約12週齢までの範囲の反芻動物である。
本発明の組成物は、少なくとも1種の担体もしくは典型的な飼料成分またはそれらの組合せ物を含むことができる。
適切な担体は、回収性、効率もしくは物理的特性を改善するために、および/または包装および投与を補助するために添加される不活性配合成分である。このような担体を、個々に添加してもよいし組み合わせて添加してもよい。これらの担体は、固結防止剤、抗酸化剤、増量剤および/または保護剤から選択することができる。有用な担体の例には、多糖類(特にデンプン、マルトデキストリン、メチルセルロース、ガム、キトサンおよび/またはイヌリン)、タンパク質源(特に脱脂粉乳および/またはスイートホエー粉末)、ペプチド類、糖類(特にラクトース、トレハロース、スクロースおよび/またはデキストロース)、脂質類(特にレシチン、植物油および/または鉱油)、塩類(特に塩化ナトリウム、炭酸ナトリウム、炭酸カルシウム、チョーク、石灰石、炭酸マグネシウム、リン酸ナトリウム、リン酸カルシウム、リン酸マグネシウムおよび/またはクエン酸ナトリウム)およびシリケート(特にクレー、特にベオライトクレー、非晶質シリカ、ヒュームド/沈降シリカ、ゼオライト、フラー土、ベイリス、クリントポライト、モンモリロナイト、珪藻土、タルク、ベントナイトおよび/またはケイ酸塩、例えばケイ酸アルミニウム、ケイ酸マグネシウムおよび/またはケイ酸カルシウム)が挙げられる。動物用飼料の添加物に適した担体は、毎年発行されるAmerican Feed Control Officials, Inc.’s Official Publicationに記載されている。例えば、Official Publication of American Feed Control Officials, Sharon Krebs編集, 2006年版, ISBN 1−878341−18−9参照。担体は、発酵ブロスを濃縮した後および/または乾燥中および/または乾燥後に添加することができる。本発明による好ましい担体は、炭酸カルシウム、珪藻土および植物油から選択される。
本発明の好ましい一実施形態は、濃縮組成物、特に飼料添加組成物、すなわち、本発明の少なくとも1種の菌株と前述の少なくとも1種の担体とを含有する飼料組成物の調製に適した組成物であり、ここで、少なくとも1種の菌株は、好ましくは0.1〜10重量%の量で含まれ、より好ましくは0.2〜5重量%の量で含まれ、特に0.3〜3重量%の量で含まれ、とりわけ0.4〜2.2重量%の量で含まれ、少なくとも1種の担体は、好ましくは少なくとも90重量%の量で含まれ、好ましくは90〜99.9重量%の量で含まれ、より好ましくは95〜99.8重量%の量で含まれ、特に97〜99.7重量%の量で含まれ、とりわけ97.8〜99.6重量%の量で含まれ、担体は、好ましくは、実質的に石灰石からなり、特に少量の珪藻土および/または植物油を含有する石灰石からなる。
安定化された菌株を含有する本発明のこれらの好ましい組成物を用いることにより、好ましくは本発明による菌株を本明細書で上述した量で含有する飼料および医薬組成物ならびに飲用水および飼育用水を調製することができる。好ましい一実施形態において、飼料、飲用水または飼育用水1トンあたり、こうした濃縮組成物を200〜1000g、特にこうした濃縮組成物を250g、500gまたは1000g使用することによって、動物への給与に使用することができる組成物が提供される。これらの濃縮組成物は、好ましくは、該濃縮組成物1gあたり、本発明の少なくとも1種の菌株を1×109〜2×1011 CFU、特に2×109〜1×1011 CFUの量で含有する。
これらの濃縮組成物から出発して、濃縮組成物を典型的な飼料成分または食品成分と混合することによってそれぞれ飼料組成物および食品組成物を調製することができる。
本発明による組成物に含有させることができ、かつ/または本発明による濃縮組成物から出発する飼料組成物の調製に使用することができる適切かつ典型的な動物飼料成分には、以下のもののうち1つまたは複数が挙げられる:タンパク質類、炭水化物類、脂肪類、さらなるプロバイオティクス、プレバイオティクス、酵素類、ビタミン類、免疫調節剤、乳代替物、ミネラル類、アミノ酸類、抗コクシジウム剤、酸ベースの生成物および/または抗生物質などの医薬品。
本発明により使用することができる成分を含有する炭水化物類は、例えば、飼草、粗飼料、小麦全粒粉、ヒマワリ全粒粉または大豆粕およびそれらの混合物である。
本発明により使用することができる成分を含有するタンパク質類は、例えば、大豆タンパク質、エンドウタンパク、小麦グルテンまたはコーングルテンおよびそれらの混合物である。
本発明により使用することができる成分を含有する脂肪類は、特に動物性および植物性の双方の油であり、例えば、大豆油、菜種油、ヒマワリ油、アマニ油またはヤシ油といった植物油、魚油およびそれらの混合物である。
本発明により使用することができる、タンパク質類を含有しつつさらに脂肪類をも含有する成分は、例えば、魚粉、オキアミ粉末、二枚貝類粉末、イカ類粉末またはエビ殻およびそれらの組合せ物である。
本発明の菌株および調製物と組み合わせて本発明により使用することができるさらなるプロバイオティクス(DFM)は、好ましくは、バチルス・サブティリス(Bacillus subtilis)、バチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)、バチルス・レンタス(Bacillus lentus)、バチルス・プミルス(Bacillus pumilus)、バチルス・ラテロスポーラス(Bacillus laterosporus)、バチルス・コアギュランス(Bacillus coagulans)、バチルス・アレヴィ(Bacillus alevi)、バチルス・セレウス(Bacillus cereus)、バチルス・バディウス(Bacillus badius)、バチルス・チューリンゲンシス(Bacillus thurigiensis)、エンテロコッカス・フェシウム(Enterococcus faecium)およびペジオコッカス・アシジラクティシー(Pediococcus acidilactici)の種から選択される細菌である。好ましい例は、バチルス・サブティリス(Bacillus subtilis)DSM 32315(特許手続上の微生物の寄託の国際承認に関するブダペスト条約の規定に基づき2016年5月12日付でDSMZに寄託)およびその誘導体、Keminより商標CLOSTAT(登録商標)として市販されているバチルス・サブティリス(Bacillus subtilis)PB6(米国特許第7,247,299号明細書(US 7,247,299)に記載、ATCC受託番号PTA−6737にて寄託)、CalpisよりCALSPORIN(登録商標)として市販されているバチルス・サブティリス(Bacillus subtilis)C−3102(米国特許第4,919,936号明細書(US 4,919,936)に記載、発酵研究所(Fermentation Research Institute)、産業技術総合研究所(Agency of Industrial Science and Technology)(日本)にFERM BP−1096として寄託)、Chr.Hansenより商標GalliPro(登録商標)として市販されているバチルス・サブティリス(Bacillus subtilis)DSM 17299、Chr.Hansenより商標GalliProTect(登録商標)として市販されている、バチルス・サブティリス(Bacillus subtilis)DSM 17299とバチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)DSM 17236との混合物、Chr.Hansenより商標BIOPLUS2B(登録商標)として市販されている、バチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)とバチルス・サブティリス(Bacillus subtilis)胞子との混合物、または米国特許第6,849,256号明細書(US 6,849,256)に記載のバチルス・コアギュランス(Bacillus coagulans)菌株である。サッカロマイセス・セレビシエ(Saccharomyces cerevisiae)、ピキア・パストリス(Pichia pastoris)、アスペルギルス・ニガー(Aspergillus niger)、アスペルギルス・オリゼー(Aspergillus oryzae)またはハンセヌラ属菌(Hansenula)などの、バチルス属菌(Bacillus)以外のプロバイオティクスも、本発明の組成物に使用することができる。特に食品組成物においては、ヒトの健康に有用であることが知られているさらなるプロバイオティクス、例えば乳酸生成細菌、特に乳酸菌またはビフィズス菌を使用することができる。こうしたさらなるプロバイオティクスを本発明の組成物の一部として配合しない場合には、こうしたプロバイオティクスを、本発明の組成物と一緒に(同時にまたは異なる時点のいずれでも)投与することができる。
本発明により使用することができるプレバイオティクスは、好ましくはオリゴ糖類であり、特にガラクトオリゴ糖類、シリアルオリゴ糖類、ラクツロース、ラクトスクロース、フラクトオリゴ糖類、パラチノースまたはイソマルトースオリゴ糖、グリコシルスクロース、マルトオリゴ糖類、イソマルトオリゴ糖類、シクロデキストリン類、ゲンチオオリゴ糖類、大豆オリゴ糖類、キシロオリゴ糖類、デキストラン類、ペクチン類、ポリガラクツロナン、ラムノガラクツロナン、マンナン、ヘミセルロース、アラビノガラクタン、アラビナン、アラビノキシラン、難消化性デンプン、メビオース、キトサン、アガロース、イヌリン、タガトース、ポリデキストロースおよびアルギン酸塩から選択されるものである。
本発明による飼料組成物中で使用することができ、飼料の消化を助けることができる酵素は、好ましくは、フィターゼ(EC 3.1.3.8またはEC 3.1.3.26)、キシラナーゼ(EC 3.2.1.8)、ガラクタナーゼ(EC 3.2.1.89)、ガラクトシダーゼ、特にα−ガラクトシダーゼ(EC 3.2.1.22)、プロテアーゼ(EC 3.4)、ホスホリパーゼ、特にホスホリパーゼA1(EC 3.1.1.32)、ホスホリパーゼA2(EC 3.1.1.4)、ホスホリパーゼC(EC 3.1.4.3)およびホスホリパーゼD(EC 3.1.4.4)、リゾホスホリパーゼ(EC 3.1.1.5)、アミラーゼ、特にα−アミラーゼ(EC 3.2.1.1);リゾチーム(EC 3.2.1.17)、グルカナーゼ、特にβ−グルカナーゼ(EC 3.2.1.4またはEC 3.2.1.6)、グルコアミラーゼ、セルラーゼ、ペクチナーゼまたはそれらの任意の混合物から選択される。
市販のフィターゼの例には、Bio−Feed(登録商標)Phytase(Novozymes)、Ronozyme(登録商標)PおよびHiPhos(登録商標)(DSM Nutritional Products)、Natuphos(登録商標)(BASF)、Finase(登録商標)およびQuantum(登録商標)Blue(AB Enzymes)、Phyzyme(登録商標)XP(Verenium/DuPont)およびAxtra(登録商標)PHY(DuPont)が挙げられる。他の好ましいフィターゼには、例えば国際公開第98/28408号(WO 98/28408)、国際公開第00/43503号(WO 00/43503)および国際公開第03/066847号(WO 03/066847)に記載されているものが挙げられる。
市販のキシラナーゼの例には、Ronozyme(登録商標)WXおよびG2(DSM Nutritional Products)、Econase(登録商標)XTおよびBarley(AB Vista)、Xylathin(登録商標)(Verenium)およびAxtra(登録商標)XB(キシラナーゼ/β−グルカナーゼ、DuPont)が挙げられる。市販のプロテアーゼの例には、Ronozyme(登録商標)ProAct(DSM Nutritional Products)が挙げられる。
本発明により使用することができるビタミン類は、例えば、ビタミンA、ビタミンD3、ビタミンE、ビタミンK、例えばビタミンK3、ビタミンB12、ビオチン、コリン、ビタミンB1、ビタミンB2、ビタミンB6、ナイアシン、葉酸およびパントテン酸塩、例えばD−パントテン酸カルシウムまたはそれらの組合せ物である。
使用することができる免疫調節剤は、例えば、抗体、サイトカイン、噴霧乾燥血漿、インターロイキンもしくはインターフェロンまたはそれらの組合せ物である。
本発明により使用することができるミネラル類は、例えば、ホウ素、コバルト、塩化物、クロム、銅、フッ化物、ヨウ素、鉄、マンガン、モリブデン、セレン、亜鉛、カルシウム、マグネシウム、カリウムもしくはナトリウムまたはそれらの組合せ物である。
本発明により使用することができるアミノ酸類は、例えば、リジン、アラニン、スレオニン、メチオニンもしくはトリプトファンまたはそれらの組合せ物である。
したがって、本発明のさらなる一実施形態は、動物飼料組成物の製造方法であって、本発明の少なくとも1種の菌株および/または少なくとも1種の調製物および/または少なくとも1種の濃縮組成物を、特に動物の健康増進に有効な量で、飼料成分、例えばタンパク質類、脂質類および/または炭水化物類、ならびに必要に応じてさらなる有益な物質、好ましくは前述の有益な物質と混合して飼料組成物を生成することを含む方法である。この方法は、例えばペレット化工程も含むことができる。
当業者に知られている標準的なペレット化法を用いることができ、これには例えば、乾燥飼料または半湿性飼料の押出加工が挙げられる。好ましいペレット化温度は、約65℃〜約120℃である。
本発明の菌株および組成物は、当技術分野で周知の方法にしたがって本発明の菌株を培養することによって得ることができ、これには、例えば米国特許第6,060,051号明細書(US 6,060,051)、欧州特許出願公開第0287699号明細書(EP 0287699)または米国特許出願公開第2014/0010792号明細書(US 2014/0010792)に記載の培地や他の方法を用いることが含まれる。従来の大規模な微生物培養プロセスには、液中発酵、固体発酵または液面培養が挙げられる。発酵の終了に向かって栄養素が枯渇するにつれて、菌株の細胞は増殖期から胞子形成期への移行を開始し、それによって、発酵の最終生成物の大部分が、胞子、代謝産物および残留発酵培地となる。胞子形成はこれらの菌株の自然の生活環の一部であり、一般には栄養素の制限に応じて細胞によって開始される。発酵は、バチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)細胞の高レベルのコロニー形成単位が獲得できかつ胞子形成が促進されるように構成される。発酵により生じる培養培地内の細菌の細胞、胞子および代謝産物は、直接使用することも可能であるし、遠心分離法、接線流ろ過法、深層ろ過法および蒸発法などの従来の工業的方法によって濃縮させることも可能である。濃縮発酵ブロスを例えばダイアフィルトレーション法により洗浄することにより、残留発酵ブロスおよび代謝産物を除去することができる。
発酵ブロスまたはブロス濃縮物は、担体の添加の有無にかかわらず、噴霧乾燥法、凍結乾燥法、トレイ乾燥法、流動層乾燥法、ドラム乾燥法または蒸発法などの従来の乾燥プロセスまたは方法を用いて乾燥することができる。得られた乾燥生成物を、粉砕法や造粒法などによりさらに加工して、特定の粒子サイズまたは物理的形態を得ることができる。上記の担体は、乾燥後に添加することもできる。
本発明の菌株の調製物は、無細胞調製物であってもよいし、細胞破片を含有する調製物であってもよいし、無傷細胞と細胞破片との混合物を含有する調製物であってもよい。本発明の菌株の無細胞調製物は、例えば発酵ブロスの遠心分離および/またはろ過によって得ることができる。用いる技術に応じて、これらの無細胞調製物は、細胞を全く有していないわけではなく、少量の細胞を含んでいてもよい。細胞は、代謝産物、酵素および/またはペプチドのような化合物を周囲の培地に分泌するため、細胞の上清は、該細胞によって分泌された化合物、特に代謝産物、酵素および/またはペプチドの混合物を含有する。したがって、本発明の好ましい一実施形態において、菌株の調製物は、発酵ブロスの上清である。
菌株の細胞破片を含有する組成物は、当業者に知られている技術、例えば機械的手段または高圧の印加による細胞の破砕によって得ることができる。印加する力の程度に応じて、破砕された細胞のみを含有する組成物か、または細胞破片と無傷細胞との混合物を含有する組成物が得られる。細胞の均質化は、例えば、細胞フレンチプレス、ソニケーター、ホモジナイザー、マイクロフルイダイザー、ボールミル、ロッドミル、ペブルミル、ビーズミル、高圧粉砕ロール、垂直軸インパクター、工業用ブレンダー、高せん断ミキサー、パドルミキサーおよび/またはポリトロンホモジナイザーの利用によって実現可能である。好適な代替物は、細胞の酵素的および/または化学的処理である。
本発明の無細胞調製物には、まず前述の技術を適用して細胞を破砕し、続いて細胞破片および残りの無傷細胞を除去することによって得られる調製物も含まれる。細胞破片および残りの無傷細胞の除去は、特に遠心分離および/またはろ過によって行うことができる。
本発明の菌株の調製物は、活性化合物として、以下にさらに記載される少なくとも1種の代謝産物、好ましくは代謝産物の混合物、および/もしくは少なくとも1種の酵素であって、プロテアーゼ、特にリケニシン、キシラナーゼおよび/もしくはセルラーゼから選択される酵素、および/もしくは少なくとも1種のペプチド、ならびに/またはそれらの組合せ物を含有することができる。
本発明の菌株に含まれかつ/または前述の細胞調製物に含まれる代謝産物の有効な混合物を含有する調製物は、例えば米国特許第6,060,051号明細書(US 6,060,051)に記載の方法にしたがって得ることができる。特に、こうした調製物は、酢酸エチルのような有機溶媒を使用して前述の調製物に含まれる代謝産物を沈殿させ、次いでこの沈殿した代謝産物を適切な溶媒に再度溶解させることによって得ることができる。続いて、この代謝産物を、サイズ排除ろ過にて分子量カットオフに基づいて代謝産物を異なる画分に分類することによって精製することができる。
本発明の代謝産物の有効な混合物を含有する調製物は、好ましくは、本発明の菌株の代謝産物を少なくとも5種、より好ましくは少なくとも6種、少なくとも7種、少なくとも8種または少なくとも9種含み、特に本発明の菌株の代謝産物をすべて含む。DSM 32314菌株の代謝産物の含量を、表5.1に示す。これらの代謝産物は、好ましくは400〜3000ダルトン、より好ましくは450〜2500ダルトンの分子量を有する。
好ましくは、本発明によれば、本発明の各実施形態において常に、本発明の菌株および/または調製物および/または組成物を有効量で使用する。「有効量」なる用語は、本発明の菌株および/または調製物および/または組成物を投与せずに同一の食餌(飼料および他の化合物を含む)を投与した動物と比較した場合に、特にすでに前述した特性に関して、動物および/または環境に対して有益な効果を少なくとも1つ奏する量を指す。
治療用途の場合には、好ましくは治療量の本発明の菌株および/または調製物および/または組成物が使用される。「治療量」なる用語は、動物の疾患状態を改善させ、一変させ、または予防するのに十分な量を指す。特に、組成物が(i)様々な用量で腸内の病原性細菌を阻害または減少させ、(ii)有益な細菌のレベルを増加または維持し、かつ/または(iii)様々な用量で動物の健康を増進する能力を評価することにより、当業者は様々な動物について最適な投与量レベルを容易に決定することができる。
実施例
例1.胃腸管における生存に関連する菌株特性
動物の直接給与生菌剤(DFM)/プロバイオティクスとして優れた菌株を得るために、様々な環境サンプルからバチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)菌株をスクリーニングした。この菌株は、標的動物の腸においてその完全な能力を発揮することを目的としているため、様々な環境や腸に関連する条件に耐えるものとなるように、この菌株について予めスクリーニングを行った。菌株の胞子を生成させ(Nicholson and Setlow 1990)、これを洗浄し、80℃で20分間インキュベートし(低温殺菌処理)、次いでビールインフュージョンブロス寒天(VI、Difco(登録商標)、No.234420、Becton Dickinson GmbH、独国ハイデルベルク)を用いて滴定により対数で1ずつ減少させて10個の希釈物を得た。増殖前に濃度が2番目に高い希釈物を−80℃で保存し、これを、胞子状態以降のすべての評価の標準化出発点として用いた。胃の通過をシミュレートするために(Argenzio 2004a; Trampel and Duke 2004)、Larsenら(2014)に基づいて酸曝露の生存について評価した。栄養細胞の増殖について、さらに、低pHで(これは、胃/前胃および砂嚢の条件下での増殖を示す)評価し、また、胃または砂嚢の通過直後での小腸の近位部での菌株の増殖を確認する(Argenzio 2004b; Trampel and Duke 2004)目的で、pH7で4mMまでの胆汁(B8631、CAS 8008−63−8、Sigma−Aldrich)の存在下で評価した。2.5mMのKNO3(Glaser et al.1995)を補充したVI培地内で嫌気性条件(AnaeroPak(登録商標)、Thermo Fisher Scientific)下で標準化した胞子溶液を接種することにより、嫌気性腸内(Argenzio 2004b; Trampel and Duke 2004)での菌株の適性を評価した。さらに、1%スキムミルク粉末(70166、Sigma−Aldrich)または0.1%非水溶性AZCL−HEセルロース(I−AZCEL、Megazyme International、アイルランド国ブレイ)を補充したVI寒天プレートで、菌株の嫌気的なタンパク質分解性および細胞溶解活性を評価した。5%NaClを添加したVI寒天上での増殖を測定することにより、腸内でも見られる浸透圧ストレス(Argenzio 2004b; Trampel and Duke 2004)を評価した(den Besten et al.2009)。最後に、胞子を99℃に20分間曝露し(Palop et al.1996)、続いてVI寒天上に接種して胞子の熱安定性を評価することにより、ペレット化の安定性を測定した。
例1.胃腸管における生存に関連する菌株特性
動物の直接給与生菌剤(DFM)/プロバイオティクスとして優れた菌株を得るために、様々な環境サンプルからバチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)菌株をスクリーニングした。この菌株は、標的動物の腸においてその完全な能力を発揮することを目的としているため、様々な環境や腸に関連する条件に耐えるものとなるように、この菌株について予めスクリーニングを行った。菌株の胞子を生成させ(Nicholson and Setlow 1990)、これを洗浄し、80℃で20分間インキュベートし(低温殺菌処理)、次いでビールインフュージョンブロス寒天(VI、Difco(登録商標)、No.234420、Becton Dickinson GmbH、独国ハイデルベルク)を用いて滴定により対数で1ずつ減少させて10個の希釈物を得た。増殖前に濃度が2番目に高い希釈物を−80℃で保存し、これを、胞子状態以降のすべての評価の標準化出発点として用いた。胃の通過をシミュレートするために(Argenzio 2004a; Trampel and Duke 2004)、Larsenら(2014)に基づいて酸曝露の生存について評価した。栄養細胞の増殖について、さらに、低pHで(これは、胃/前胃および砂嚢の条件下での増殖を示す)評価し、また、胃または砂嚢の通過直後での小腸の近位部での菌株の増殖を確認する(Argenzio 2004b; Trampel and Duke 2004)目的で、pH7で4mMまでの胆汁(B8631、CAS 8008−63−8、Sigma−Aldrich)の存在下で評価した。2.5mMのKNO3(Glaser et al.1995)を補充したVI培地内で嫌気性条件(AnaeroPak(登録商標)、Thermo Fisher Scientific)下で標準化した胞子溶液を接種することにより、嫌気性腸内(Argenzio 2004b; Trampel and Duke 2004)での菌株の適性を評価した。さらに、1%スキムミルク粉末(70166、Sigma−Aldrich)または0.1%非水溶性AZCL−HEセルロース(I−AZCEL、Megazyme International、アイルランド国ブレイ)を補充したVI寒天プレートで、菌株の嫌気的なタンパク質分解性および細胞溶解活性を評価した。5%NaClを添加したVI寒天上での増殖を測定することにより、腸内でも見られる浸透圧ストレス(Argenzio 2004b; Trampel and Duke 2004)を評価した(den Besten et al.2009)。最後に、胞子を99℃に20分間曝露し(Palop et al.1996)、続いてVI寒天上に接種して胞子の熱安定性を評価することにより、ペレット化の安定性を測定した。
バチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)菌株DSM 32314は、模擬的な胃を通過して生存した。DSM 32314菌株の増殖は、pH6から出発して観察された。DSM 32314菌株は嫌気的に増殖し、嫌気性条件下で非水溶性セルロースを分解することができた。DSM 32314菌株は、2mMおよび4mMの胆汁の存在下でも、10%NaClの存在下でも増殖することができた。DSM 32314菌株は、4.35×109 CFU/mLの平均胞子数に達し、DSM 32314菌株の胞子は、99℃に20分間曝露した後も生存可能であった。さらに、バチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)の野生型菌株WT1およびWT2は、嫌気的に増殖し、pH6に耐えると評価されたが、嫌気的にセルロースを分解することができず、したがってDFM/プロバイオティクス候補としては不適格であった。しかし、バチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)の野生型菌株WT1およびWT2を、以下の例で野生型対照として使用した。
例2.野生型バチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)に対する菌株性能の比較 − 胆汁耐性の定量的評価
例1から選択されたバチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)菌株DSM 32314の競合性を評価するため、代表的なバチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)野生型1(WT1)および野生型2(WT2)と比較して解析を行い、胃を通過した直後の近位小腸において中性pHでの胆汁の存在下で菌株が機能しうるか否かを(Argenzio 2004b; Trampel and Duke 2004)、2mMの胆汁を添加したVIB培地での菌株増殖によって調べた。100mLの三角フラスコ内の50uLの候補菌株細胞懸濁液および10mLのVIBを含む一晩培養物を37℃および200rpmでインキュベートし、次いで、一晩培養物約50uLを、2mLの胆汁を含むpH7の1mLのVIBを入れた100ウェルハニカムプレート(Oy Growth Curves Ab Ltd、旧Thermo Labsystems、フィンランド国ヘルシンキ)に移して、1mLにつきOD 0.2を得た。BioLinkソフトウェアパッケージを搭載したBioscreeen C MBR(Oy Growth Curves Ab Ltd)を用いて15分ごとにODを測定しながら、37℃および200rpmでの菌株の特定の増殖を48時間観察した。曲線下面積(AUC)を計算する前の各時点で、各培養物につき、胆汁のみを有するブロス(ブランク)の3つのブランクOD読取値の平均値分を減じた。各菌株の定量的評価を、0〜5時間の曲線下面積(AUC5:OD×時間(h))、0〜10時間の曲線下面積(AUC10:OD×時間(h))および菌株がその最大光学濃度に達するまでの時間(Tmax(h))として比較して行った。MiniTab(登録商標)16 Statistical Softwareの一方向ANOVA手法(Minitab Inc.,米国ペンシルベニア州ステートカレッジ)を用いて統計的解析を行った。結果を、表2.1.に示す。
例1から選択されたバチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)菌株DSM 32314の競合性を評価するため、代表的なバチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)野生型1(WT1)および野生型2(WT2)と比較して解析を行い、胃を通過した直後の近位小腸において中性pHでの胆汁の存在下で菌株が機能しうるか否かを(Argenzio 2004b; Trampel and Duke 2004)、2mMの胆汁を添加したVIB培地での菌株増殖によって調べた。100mLの三角フラスコ内の50uLの候補菌株細胞懸濁液および10mLのVIBを含む一晩培養物を37℃および200rpmでインキュベートし、次いで、一晩培養物約50uLを、2mLの胆汁を含むpH7の1mLのVIBを入れた100ウェルハニカムプレート(Oy Growth Curves Ab Ltd、旧Thermo Labsystems、フィンランド国ヘルシンキ)に移して、1mLにつきOD 0.2を得た。BioLinkソフトウェアパッケージを搭載したBioscreeen C MBR(Oy Growth Curves Ab Ltd)を用いて15分ごとにODを測定しながら、37℃および200rpmでの菌株の特定の増殖を48時間観察した。曲線下面積(AUC)を計算する前の各時点で、各培養物につき、胆汁のみを有するブロス(ブランク)の3つのブランクOD読取値の平均値分を減じた。各菌株の定量的評価を、0〜5時間の曲線下面積(AUC5:OD×時間(h))、0〜10時間の曲線下面積(AUC10:OD×時間(h))および菌株がその最大光学濃度に達するまでの時間(Tmax(h))として比較して行った。MiniTab(登録商標)16 Statistical Softwareの一方向ANOVA手法(Minitab Inc.,米国ペンシルベニア州ステートカレッジ)を用いて統計的解析を行った。結果を、表2.1.に示す。
AUC5とは、0時間の時点〜5時間の時点の曲線下面積(光学濃度×h)であり;AUC10とは、0時間の時点〜10時間の時点の曲線下面積(光学濃度×h)であり;Tmaxとは、最大光学濃度に達するまでの時間(h)であり;SEMとは、プールした平均値の標準誤差であり;A、Bは、文字が一緒でないものは著しく相違することを意味する。
直接比較したところ、2mMの胆汁の存在下で、DSM 32314菌株は、野生型バチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)菌株WT1およびWT2よりも10時間早くその最大ODに達した。さらに、DSM 32314菌株は、野生型バチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株の増殖と比較して、この試験の最初の5時間で1.4倍〜2.0倍、そしてこの試験の最初の10時間で1.8倍〜3.0倍、それぞれ速く増殖した。
例3.動物の栄養摂取のための従来の直接給与生菌剤(DFM)/プロバイオティクスに対する菌株性能の比較 − 短鎖脂肪酸(SCFA)の存在下での増殖
DSM 32314菌株の増殖とWT1菌株の増殖との比較を、短鎖脂肪酸の存在下で評価した。短鎖脂肪酸は腸内で観察され、大腸に向かって重大性を増す(Argenzio 2004b; Trampel and Duke 2004)。例1に記載の標準化した胞子溶液を用いて試験を開始し、37℃およびpH6でVI培地内での好気菌の増殖を試験し、読取パラメーターは、増殖対増殖なしであった。この試験のために、McIlvaineバッファー(Palop et al.1996)を用いてVI培地をpH6に調整し、次いで0.05%酢酸(HA、537020、CAS 64−19−7、Sigma−Aldrich)、0.05%プロピオン酸(HP、P1386、CAS 79−09−4、Sigma−Aldrich)または0.2%乳酸(HL、W261106、CAS 50−21−5、Sigma−Aldrich)を補充した。結果を、表3.1.に示す。
DSM 32314菌株の増殖とWT1菌株の増殖との比較を、短鎖脂肪酸の存在下で評価した。短鎖脂肪酸は腸内で観察され、大腸に向かって重大性を増す(Argenzio 2004b; Trampel and Duke 2004)。例1に記載の標準化した胞子溶液を用いて試験を開始し、37℃およびpH6でVI培地内での好気菌の増殖を試験し、読取パラメーターは、増殖対増殖なしであった。この試験のために、McIlvaineバッファー(Palop et al.1996)を用いてVI培地をpH6に調整し、次いで0.05%酢酸(HA、537020、CAS 64−19−7、Sigma−Aldrich)、0.05%プロピオン酸(HP、P1386、CAS 79−09−4、Sigma−Aldrich)または0.2%乳酸(HL、W261106、CAS 50−21−5、Sigma−Aldrich)を補充した。結果を、表3.1.に示す。
バチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)菌株DSM 32314は、酢酸、プロピオン酸および乳酸の存在下でpH6で増殖することができたが、WT1菌株はこれらの条件下で胞子期から増殖することができなかった。
例4.動物の栄養摂取のための従来の直接給与生菌剤(DFM)/プロバイオティクスに対する菌株性能の比較 − 酵素活性の定量的評価
例2で行った試験と同様に、菌株DSM 32314、WT1およびWT2を比較して、それぞれの好気条件下でのセルロース分解活性、キシラン分解活性およびタンパク質分解活性を評価した。セルラーゼ活性およびキシラナーゼ活性を、Larsen et al.(2014)に記載のとおりに測定した。タンパク質分解活性分析のために、先に記載したように、37℃でVIB内で菌株のスターター培養物および主培養物を増殖させた。20mMリン酸ナトリウム(二塩基性、無水)および150mM塩化ナトリウムからなるバッファー(いずれの成分もSigma−Aldrich製)20uLを含む0.5%フルオレセインイソチオシアネートカゼイン(FITC;C3777、Sigma−Aldrich)溶液20uLに、主培養物から10uLを加え、次いで37℃で1時間インキュベートした。10%(v/v)トリクロロ酢酸(Sigma−Aldrich)150uLを加え、37℃でさらに30分間インキュベートした後、サンプルを19,000rpmで15分間遠心分離し、次いで2uLの上清を200uLの500mMトリスHCl溶液(Trizma BaseTRIS、Sigma−Aldrich)に移した。励起494nm、発光518nmで、タンパク質分解性の遊離による可溶性ペプチドの蛍光を測定した(TECAN GENios Microplate Reader, Tecan Group Ltd.,スイス国メンネドルフ)。分析を、3回の独立した実験で行い、次いで溶液1マイクロリットルあたりのmU数として平均をとり、MiniTab(登録商標)16 Statistical Softwareの一方向ANOVA手法(Minitab Inc.,米国ペンシルベニア州ステートカレッジ)を用いて統計的解析を行った。結果を、表4.1.に示す。
例2で行った試験と同様に、菌株DSM 32314、WT1およびWT2を比較して、それぞれの好気条件下でのセルロース分解活性、キシラン分解活性およびタンパク質分解活性を評価した。セルラーゼ活性およびキシラナーゼ活性を、Larsen et al.(2014)に記載のとおりに測定した。タンパク質分解活性分析のために、先に記載したように、37℃でVIB内で菌株のスターター培養物および主培養物を増殖させた。20mMリン酸ナトリウム(二塩基性、無水)および150mM塩化ナトリウムからなるバッファー(いずれの成分もSigma−Aldrich製)20uLを含む0.5%フルオレセインイソチオシアネートカゼイン(FITC;C3777、Sigma−Aldrich)溶液20uLに、主培養物から10uLを加え、次いで37℃で1時間インキュベートした。10%(v/v)トリクロロ酢酸(Sigma−Aldrich)150uLを加え、37℃でさらに30分間インキュベートした後、サンプルを19,000rpmで15分間遠心分離し、次いで2uLの上清を200uLの500mMトリスHCl溶液(Trizma BaseTRIS、Sigma−Aldrich)に移した。励起494nm、発光518nmで、タンパク質分解性の遊離による可溶性ペプチドの蛍光を測定した(TECAN GENios Microplate Reader, Tecan Group Ltd.,スイス国メンネドルフ)。分析を、3回の独立した実験で行い、次いで溶液1マイクロリットルあたりのmU数として平均をとり、MiniTab(登録商標)16 Statistical Softwareの一方向ANOVA手法(Minitab Inc.,米国ペンシルベニア州ステートカレッジ)を用いて統計的解析を行った。結果を、表4.1.に示す。
表4.1.野生型菌株WT1およびWT2と比較したバチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)菌株DSM 32314のセルラーゼ活性、プロテアーゼ活性およびキシラナーゼ活性
SEMとは、プールした平均値の標準誤差であり;A、Bは、文字が一緒でないものは著しく相違することを意味する。
直接比較したところ、菌株DSM 32314は、WT2と比較して4.4倍の著しいセルラーゼ活性の増加を示した。さらに、DSM 32314は、WT1と比較して3.0倍の著しいプロテアーゼ活性の増加を示し、WT2と比較して3.6倍の著しいプロテアーゼ活性の増加を示した。さらに、DSM 32314は、WT1およびWT2と比較して1.4倍の著しいキシラナーゼ活性の増加を示した。
例5.動物の栄養摂取のための従来の直接給与生菌剤(DFM)/プロバイオティクスに対する菌株性能の比較 − 代謝産物の発現および病原菌の阻害
例2で行った試験と同様に、バチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株DSM 32314、WT1およびWT2を比較して、各培地における発現された代謝産物および阻害された病原菌のそれぞれの数を評価した。代謝産物発現分析のために、スターター培養物を増殖させ、Scholz et al.(2011)により記載されたとおりに試験を行った。100mLフラスコ内で37℃、160rpmで24時間増殖させた10mLのLuria Bertamiブロス(LB,Thermo Fisher Scientific)培養物から、100uLを主培養物に移した。主培養物を、0.2mL/L KellyT微量金属溶液(LBKelly, Scholz et al.2011)を含有する10mLのLB内で、または10mLのトリプチカーゼ大豆ブロス(Oxoid,Thermo Fisher Scientific)に0.6%酵母抽出物を加えたもの(Y1625、CAS 8013−1−2、Sigma−Aldrich;得られたブロスをTSBYEと略記する)の中で、いずれも100mLフラスコ内で37℃で160rpmで24時間増殖させた。この主培養物のうち4mLを、15mLの試験管内で2mLのn−ブタノールと合し、3分間ボルテックス処理し、次いで15分間超音波処理した。5000rpmで1分間遠心分離を行った後、有機相を移し、真空乾燥させ、これを、高速液体クロマトグラフィー − エレクトロスプレーイオン化質量分析法(HPLC−ESI−MS;Chen et al.2006)を用いて分析した。各サンプルを負モードと正モードの2つの異なるモードで測定し、質量スペクトルを得た。TeoおよびTan(2005)に同様に報告されたとおりに得られたピークを、分子量(Da)に換算した。比較の結果を、表5.1.に示す。
例2で行った試験と同様に、バチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株DSM 32314、WT1およびWT2を比較して、各培地における発現された代謝産物および阻害された病原菌のそれぞれの数を評価した。代謝産物発現分析のために、スターター培養物を増殖させ、Scholz et al.(2011)により記載されたとおりに試験を行った。100mLフラスコ内で37℃、160rpmで24時間増殖させた10mLのLuria Bertamiブロス(LB,Thermo Fisher Scientific)培養物から、100uLを主培養物に移した。主培養物を、0.2mL/L KellyT微量金属溶液(LBKelly, Scholz et al.2011)を含有する10mLのLB内で、または10mLのトリプチカーゼ大豆ブロス(Oxoid,Thermo Fisher Scientific)に0.6%酵母抽出物を加えたもの(Y1625、CAS 8013−1−2、Sigma−Aldrich;得られたブロスをTSBYEと略記する)の中で、いずれも100mLフラスコ内で37℃で160rpmで24時間増殖させた。この主培養物のうち4mLを、15mLの試験管内で2mLのn−ブタノールと合し、3分間ボルテックス処理し、次いで15分間超音波処理した。5000rpmで1分間遠心分離を行った後、有機相を移し、真空乾燥させ、これを、高速液体クロマトグラフィー − エレクトロスプレーイオン化質量分析法(HPLC−ESI−MS;Chen et al.2006)を用いて分析した。各サンプルを負モードと正モードの2つの異なるモードで測定し、質量スペクトルを得た。TeoおよびTan(2005)に同様に報告されたとおりに得られたピークを、分子量(Da)に換算した。比較の結果を、表5.1.に示す。
さらに、表5.1.の代謝産物の一部ではあるが詳細には調査されていないバチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)によるバクテリオシンの産生によるクロストリジウム・パーフリンジェンス(Clostridium perfringens)の阻害について、ウェル拡散拮抗試験(Parente et al.1995)により評価した。病原性クロストリジウム・パーフリンジェンス(C.perfringens)の4種の候補について試験した。これらの候補は、TeoおよびTan(2005)によるクロストリジウム・パーフリンジェンス(C.perfringens)のATCC 13124型菌株、ならびに家禽類およびブタ由来の3種の病原性クロストリジウム・パーフリンジェンス(C.perfringens)野生分離株(ライプチヒ大学獣医学部バクテリオロジー・ミクロロジー学科教授Christoph Baums博士、独国ポツダムにより取得)であった。ライプチヒより取得したクロストリジウム・パーフリンジェンス(C.perfringens)のA型菌株には、次のように記載されている:菌株2300−1−17および2300−1−18は、壊死性腸炎陽性ニワトリの消化管から単離したものである。どちらの菌株もα毒素を産生し、菌株2300−1−17はさらにNetB毒素も発現する(Savva et al.2013;Uzal et al.2014)のに対して、試験した2300−1−18菌株はβ2毒素について陽性であった(Allaart et al.2012)。2300−1−19菌株を、クロストリジウムA型腸炎の症状を示す下痢をした子ブタの消化管から単離した(Songer and Uzal 2005)。増殖条件および培地は、TeoおよびTan(2005)によって記載されている。簡潔に述べると、バチルス属(Bacillus)菌株を、5%CO2雰囲気中で100mLフラスコ内で37℃および160rpmで、10mLのTSBYEおよびLBKellyスターター培養物中でそれぞれ24時間増殖させた。クロストリジウム・パーフリンジェンス(Clostridium perfringens)スターター培養物を、100mLフラスコ内で37℃および160rpmで、液状のチオグリコレートブロス(FTB、Becton Dickenson)内で嫌気的に(AnaeroPak(登録商標), Thermo Fischer Scientific)24時間培養し、次いで滅菌綿棒を用いて寒天プレート(1%寒天を含有するTSBYE、略してTSAYE)上に広げた。接種したTSAYEプレートを、次いで37℃で嫌気的に一晩インキュベートして、クロストリジウム・パーフリンジェンス(C.perfringens)の菌叢を得た。一晩増殖させた後、直径9mmの3つのウェルを菌叢入りの寒天に切断し、ここで、1番目のウェルを、培養物を含まない非接種対照として使用し、2番目のウェルに、クロストリジウム・パーフリンジェンス(C.perfringens)を阻害しないバチルス属(Bacillus)菌株(バチルス・セレウス変種トヨイ(B.cereus var.toyoi、NCIMB 40112))100uLを接種し、3番目のウェルに、バチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)DSM 32314またはDSM 17299スターター培養物100uLを接種した。37℃で24時間インキュベーションした後、切断したウェルの縁部からクリアランスされた菌叢の境界部までを測定してクリアランスゾーンをmmで求め、各コロニーを2回(水平方向、垂直方向で)測定し、次いで平均をとった。各バチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)の拮抗試験および培地について、2回のプレート操作で分析を行った。平均分離のためにFisher LSDを用いて、MiniTab(登録商標)16 Statistical Softwareの一方向ANOVA手法(Minitab Inc.,米国ペンシルベニア州ステートカレッジ)を用いて統計的解析を行った。病原菌阻害(LBKellyで増殖させた菌株)についての結果を表5.2.に示し、病原菌阻害(TSBYEで増殖させた菌株)についての結果を表5.3.に示す。
表5.2.バチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)DSM 32314およびDSM 17299による病原性クロストリジウム・パーフリンジェンス(C.perfringens)の阻害能力を比較したウェル拡散アッセイ(LBKellyで増殖させた菌株)。値は、病原菌のクリアランス(mm)である。
SEMとは、プールした平均値の標準誤差であり;A、Bは、文字が一緒でないものは著しく相違することを意味する。
表5.3.バチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)DSM 32314およびDSM 17299による病原性クロストリジウム・パーフリンジェンス(C.perfringens)の阻害能力を比較したウェル拡散拮抗(TSBYEで増殖させた菌株)。値は、病原菌のクリアランス(mm)である。
SEMとは、プールした平均値の標準誤差であり;A、Bは、文字が一緒でないものは著しく相違することを意味する。
例6.インドで飼育し、新規なバチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)または成長促進抗生物質を給与したブロイラーの性能の比較
使用済みの敷料を敷いたフロアペンに入れた1日齢の雄のVencobb 400(Venkateshwara Hatcheries Pvt.Ltd,インド)の雛を用いて、ブロイラーの生育性能試験を行った。3種の食餌処置物を無作為に割り当て、ペン1つあたり25羽を入れた状態で1つの処置物につき反復的な18個のペンを用いた。鳥に、スターター期(1日目〜14日目)、育成期(15日目〜28日目)および仕上げ期(29日目〜42日目)からなる3つの時期に、これらの食餌処置物のうちの1つを給与した。基礎食餌は主に、コクシジウム症を抑制する目的でジノトルミド500g/MTを含有するトウモロコシ・大豆粕(表6.1.)をベースとしていた。この基礎食餌はさらに、追加の試みとして4%の肉骨粉(MBM)を含有していた。なぜならば、MBMは、ブロイラーのニワトリにおいてクロストリジウム・パーフリンジェンス(Clostridium perfringens)により引き起こされる壊死性腸炎の発症の素因となるためである(M’Sadeqa et al.2015)。これら3種の食餌処置物は主にトウモロコシ・大豆粕をベースとしており(表6.1.)、次のものを含有していた:1.基礎対照(対照)、2.対照+バシトラシンメチレンジサリチレート50g/MT 飼料(BMD)、3.対照+バチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)DSM 32314菌株250g/MTで、2.0×109 cfu/gを含むもの(DSM 32314)。実験用処置物を、1〜42日齢でマッシュ形態で自由に給与した。一方向ANOVA手法およびSAS対9.4を用いたLSD事後試験解析により統計的解析を行った(SAS Institute Inc.,米国)。体重、飼料要求率および死亡率に対するこれら各処置物の結果を、表6.2.に報告する。
使用済みの敷料を敷いたフロアペンに入れた1日齢の雄のVencobb 400(Venkateshwara Hatcheries Pvt.Ltd,インド)の雛を用いて、ブロイラーの生育性能試験を行った。3種の食餌処置物を無作為に割り当て、ペン1つあたり25羽を入れた状態で1つの処置物につき反復的な18個のペンを用いた。鳥に、スターター期(1日目〜14日目)、育成期(15日目〜28日目)および仕上げ期(29日目〜42日目)からなる3つの時期に、これらの食餌処置物のうちの1つを給与した。基礎食餌は主に、コクシジウム症を抑制する目的でジノトルミド500g/MTを含有するトウモロコシ・大豆粕(表6.1.)をベースとしていた。この基礎食餌はさらに、追加の試みとして4%の肉骨粉(MBM)を含有していた。なぜならば、MBMは、ブロイラーのニワトリにおいてクロストリジウム・パーフリンジェンス(Clostridium perfringens)により引き起こされる壊死性腸炎の発症の素因となるためである(M’Sadeqa et al.2015)。これら3種の食餌処置物は主にトウモロコシ・大豆粕をベースとしており(表6.1.)、次のものを含有していた:1.基礎対照(対照)、2.対照+バシトラシンメチレンジサリチレート50g/MT 飼料(BMD)、3.対照+バチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)DSM 32314菌株250g/MTで、2.0×109 cfu/gを含むもの(DSM 32314)。実験用処置物を、1〜42日齢でマッシュ形態で自由に給与した。一方向ANOVA手法およびSAS対9.4を用いたLSD事後試験解析により統計的解析を行った(SAS Institute Inc.,米国)。体重、飼料要求率および死亡率に対するこれら各処置物の結果を、表6.2.に報告する。
BWとは、指定された期間における鳥の平均体重であり;FCRとは、指定された期間内に体重を増加させるための飼料として算出した飼料要求率であり;対照とは、基礎食餌中に添加物を含まないものを指し;BMDとは、基礎食餌にバシトラシンメチレンジサリチレートを添加した処置物であり;DSM 32314とは、基礎食餌にDSM 32314菌株を添加した処置物であり;差とは、DSM 32314を対照と比較した場合の数値差であり;相対%とは、DSM 32314と対照との差を、対照からの変化分として%で示したものである。
このブロイラーから得られたデータは、BMDおよびDSM 32314の両生成物ともに、対照と比較して体重が改善されたことを示している。しかし、予備生成物群Dで処置した群は、21日目および42日目の双方で最高の平均体重を有し、対照に比べてそれぞれ24.5gおよび66.8gの増加が見られた。同様に、FCRは、21日目および42日目で、BMDで処置した群とDSM 32314で処置した群の双方で減少した。この実験によって、これらの条件でDSM 32314が、対照と比較して、ブロイラーのFCRを、強力な成長促進抗生物質であるBMDと少なくとも同様に改善することができるとともに、さらには、すべての群のうちの最高の平均重量を達成する要因となったことが判明した。
例7:様々な病原菌株に対するウェル拡散拮抗試験
3種の異なる病原菌であるエンテロコッカス・セコルム(Enterococcus cecorum)DSM 20683、ストレプトコッカス・ガリナセウス(Streptococcus gallinaceus)DSM 15349およびストレプトコッカス・スイス(Streptococcus suis)ATCC 43765を用いて、ウェル拡散拮抗試験を行った。
3種の異なる病原菌であるエンテロコッカス・セコルム(Enterococcus cecorum)DSM 20683、ストレプトコッカス・ガリナセウス(Streptococcus gallinaceus)DSM 15349およびストレプトコッカス・スイス(Streptococcus suis)ATCC 43765を用いて、ウェル拡散拮抗試験を行った。
エンテロコッカス・セコルム(E.cecorum)は、ブロイラーにおいて跛行、関節炎および骨髄炎を引き起こすことが知られており、これらは、通常、関節および/または骨組織の炎症によって引き起こされる。さらにエンテロコッカス・セコルム(E.cecorum)は、心膜の炎症を引き起こす可能性がある[Kense et al.2011]。DSM 20683を、ニワトリの盲腸から単離した。
ストレプトコッカス・ガリナセウス(S.gallinaceus)は、家禽類において敗血症を引き起こす可能性がある。肉眼的病変には、脾腫、肝腫、腎肥大症および鬱血が含まれていた。弁膜心内膜炎を招く肝臓および脾臓の壊死および/または梗塞の複数の領域も観察された[Collins et al.2002]。
ストレプトコッカス・スイス(S.suis)は、ブタにおける重大な病原菌であり、離乳後の子ブタにおける細菌性致死の最も重大な要因の1つであり、敗血症、髄膜炎およびその他の多くの感染症を引き起こす[Goyette−Desjardins et al.2014]。ATCC 43765は、血清学的群R;血清型2に属し、ブタから単離されたものである。
バチルス属(Bacillus)菌株を、100mLの振とうフラスコ内で、37℃、200rpmで16時間にわたり、TSBYE(30g/l TSB+6g/l 酵母抽出物)またはLB−Kelly(DSMZ培地1032の微量元素溶液を補充したLB培地)内で増殖させた。これらの病原性菌株を、595nmの光学濃度が少なくとも1となるまで適切な条件下で液体培養物として増殖させ、次いで100μlを滅菌スパチュラで寒天プレートの表面上に広げた。ストレプトコッカス・ガリナセウス(S.gallinaceus)についてはBHI寒天プレートを使用し、エンテロコッカス・セコルム(E.cecorum)およびストレプトコッカス・スイス(S.suis)についてはTSBYE寒天プレートを使用する。直径9mmの3つのウェルを、乾燥したプレートに切断した。1番目のウェルを、培養しない非接種培地対照として使用し、2番目のウェルに、非阻害性バチルス属(Bacillus)菌株(バチルス・セレウス変種トヨイ(B.cereus var.toyoi、NCIMB 40112)100uLを接種し、3番目のウェルに、バチルス・サブティリス(Bacillus subtilis)DSM 32315またはDSM 17299の培養物100uLを接種した。適切な条件下で37℃で24時間インキュベーションした後、切断したウェルの縁部からクリアランスされた菌叢の境界部までを測定してクリアランスゾーンをmmで求めた。各コロニーを2回(水平方向、垂直方向で)測定し、次いで平均をとった。結果を表7.1に示す。
表7.1:ウェル拡散拮抗アッセイにおける、病原性菌株に対するバチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)DSM 32314の阻害能力と、病原性菌株に対するバチルス・サブティリス(Bacillus subtilis)DSM 17299の阻害能力との比較。値は、病原菌のクリアランス(mm)である。
このデータは、DSM 32314が、特にDSM 17299と比較して、エンテロコッカス・セコルム(E.cecorum)、ストレプトコッカス・ガリナセウス(S.gallinaceus)、ストレプトコッカス・スイス(S.suis)を非常に効果的に阻害できることを示す。
Claims (19)
- 以下の群から選択されるバチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)菌株またはその調製物:
a) DSMZにDSM 32314で寄託されたバチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株;
b) DSM 32314で寄託されたバチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株の変異体であって、DSM 32314菌株のすべての同定特性を示す変異体;
c) (a)または(b)の調製物;
d) (a)、(b)または(c)に含まれる化合物の有効な混合物を含有する調製物。 - 前記DSM 32314菌株に対して少なくとも95%のDNA配列同一性を有する、請求項1の(b)記載のDSM 32314のバチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)の変異体。
- バチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)菌株またはその調製物であって、前記バチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株は、以下の特性:
a) 配列番号1のポリヌクレオチド配列に対して少なくとも99%、好ましくは少なくとも99.5%、特に100%の配列同一性を有する16S rDNA配列;および/または
b) 配列番号2のポリヌクレオチド配列に対して少なくとも99%、好ましくは少なくとも99.5%、特に100%の配列同一性を有するyqfD配列;および/または
c) 配列番号3のポリヌクレオチド配列に対して少なくとも99%、好ましくは少なくとも99.5%、特に100%の配列同一性を有するgyrB配列
を示す、バチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)菌株またはその調製物。 - 前記バチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株は、以下のさらなる特性:
d) 配列番号4のポリヌクレオチド配列に対して少なくとも99%、好ましくは少なくとも99.5%、特に100%の配列同一性を有するrpoB配列;および/または
e) 配列番号5のポリヌクレオチド配列に対して少なくとも99%、好ましくは少なくとも99.5%、特に100%の配列同一性を有するgroEL配列
を示す、請求項1から3までのいずれか1項記載のバチルス・リケニフォルミス(Bacillus licheniformis)菌株または調製物。 - 嫌気的に増殖することができ、特に嫌気性条件下で非水溶性セルロースを分解できることを特徴とする、請求項1から4までのいずれか1項記載のバチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株。
- クロストリジウム・パーフリンジェンス(C.perfringens)を阻害できることを特徴とし、特に、クロストリジウム・パーフリンジェンス(C.perfringens)のATCC 13124型菌株に関してLBKelly寒天プレート上でのウェル拡散拮抗アッセイにおける病原菌クリアランスが少なくとも10mmであり、より好ましくは少なくとも13mmであることを特徴とする、請求項1から5までのいずれか1項記載のバチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株。
- 0.05重量%の酢酸、0.05重量%のプロピオン酸および/または0.2重量%の乳酸の存在下で増殖し得ることを特徴とする、請求項1から6までのいずれか1項記載のバチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株。
- セルラーゼ活性が少なくとも200mU/mL、好ましくは少なくとも230mU/mL、特に少なくとも250mU/mLであり、かつ/またはキシラナーゼ活性が少なくとも10mU/mL、好ましくは少なくとも15mU/mLであり、かつ/またはプロテアーゼ活性が少なくとも6mU/mL、好ましくは少なくとも8mU/mLであることを特徴とする、請求項1から7までのいずれか1項記載のバチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株。
- 2mMの胆汁の存在下で、好ましくは4mMの胆汁の存在下で増殖し得ることを特徴とし、特に、2mMの胆汁の存在下で、AUC5性能値が少なくとも0.3、好ましくは少なくとも0.4、特に少なくとも0.5であり、かつAUC10性能値が少なくとも1.5、好ましくは少なくとも1.75、特に少なくとも2.0であることを特徴とする、請求項1から8までのいずれか1項記載のバチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株。
- 飼料または食品中のプロバイオティック成分(DFM)としての、請求項1から9までのいずれか1項記載のバチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株またはその調製物の使用。
- 飼料原料または食料品の組成物であって、
請求項1から9までのいずれか1項記載のバチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株またはその調製物と、
少なくとも1種のさらなる飼料または食品成分であって、好ましくは、タンパク質類、炭水化物類、脂肪類、さらなるプロバイオティクス、プレバイオティクス、酵素類、ビタミン類、免疫調節剤、乳代替物、ミネラル類、アミノ酸類、抗コクシジウム剤、酸ベースの生成物、医薬品およびそれらの組合せ物から選択される成分と
を含有する、飼料原料または食料品の組成物。 - 請求項1から9までのいずれか1項記載のバチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株またはその調製物と、製薬学的に許容可能な担体とを含有する、医薬組成物。
- 動物またはヒトの健康状態を改善するための、特に動物またはヒトの腸の健康状態を改善するための、請求項11または12記載の組成物。
- 動物、特に鳥類、より好ましくはニワトリへの給餌方法であって、前記動物に、請求項1から9までのいずれか1項記載のバチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株もしくは調製物および/または請求項11記載の飼料原料組成物および/または請求項12記載の医薬組成物を施与することを特徴とする方法。
- 動物またはヒトの健康状態、特に動物またはヒトの腸の健康状態を改善する方法であって、前記動物またはヒトに、請求項1から9までのいずれか1項記載のバチルス・リケニフォルミス(B.licheniformis)菌株もしくは調製物または請求項11から13までのいずれか1項記載の組成物を投与することを含む方法。
- 動物の健康を増進し、かつ/または動物の全身状態を改善し、かつ/または動物の飼料要求率を改善し、かつ/または動物の死亡率を低下させ、かつ/または動物の生存率を増加させ、かつ/または動物の体重増加を向上させ、かつ/または動物の疾患抵抗性を向上させ、かつ/または動物の免疫応答を増大させ、かつ/または動物において健康な腸内細菌叢を確立もしくは維持し、かつ/または動物の糞便を通じた病原菌の放出を減少させる方法であって、請求項1から9までのいずれか1項記載の少なくとも1種の菌株および/もしくは少なくとも1種の調製物または請求項11から13までのいずれか1項記載の少なくとも1種の組成物を動物に投与する方法。
- 肥料または汚染液体の有害な環境作用を制御および/または回避する方法であって、請求項1から9までのいずれか1項記載の少なくとも1種の菌株および/もしくは少なくとも1種の調製物ならびに/または請求項11から13までのいずれか1項記載の少なくとも1種の組成物を、肥料、汚染液体、敷料、ピットまたは肥料溜めに施与する工程を含む方法。
- 水または水溶液、特に飲用水または飼育用水の品質を制御および/または向上させる方法であって、請求項1から9までのいずれか1項記載の少なくとも1種の菌株および/もしくは少なくとも1種の調製物ならびに/または請求項11から13までのいずれか1項記載の少なくとも1種の組成物を、水または水溶液に施与する工程を含む方法。
- 栽培植物の微生物病を治療および/または予防する方法であって、請求項1から9までのいずれか1項記載の少なくとも1種の菌株および/もしくは少なくとも1種の調製物ならびに/または請求項11から13までのいずれか1項記載の少なくとも1種の組成物を、栽培植物に施与する工程を含む方法。
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