JP2018528945A - 多発性嚢胞腎の処置のための方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本明細書では、多発性嚢胞腎の処置のための方法及び組成物が提供される。
「多発性嚢胞腎」または「PKD」は、複数の嚢胞が少なくとも1つの腎臓に生じて、罹患した腎臓(複数可)の肥大及び腎機能の進行性喪失がもたらされる遺伝型の腎疾患である。
「血尿」は、尿中の赤血球の存在を意味する。
多発性嚢胞腎(PKD)は、流体で満たされた嚢胞が腎臓で発生し、腎臓肥大、腎不全、及び多くの場合末期腎疾患をもたらす、遺伝型の腎疾患である。嚢胞の過剰増殖は、PKDの顕著な病理学的特徴である。PKDの管理では、処置のための一次目標は、腎機能を維持し、かつ末期腎疾患(ESRD)の発症を予防することであり、それにより、PKDを有する対象の平均余命を向上させる。
本明細書では、多発性嚢胞腎(PKD)の処置のための方法が提供され、方法は、miR−17と相補的な修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を、PKDを有し、または有すると疑われる対象に投与することを含む。
多発性嚢胞腎または本明細書に列挙された状態のいずれかの処置は、複数の療法を含んでもよい。そのようなものであるから、本明細書で提供される特定の実施形態では、miR−17と相補的な核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することに加えて、少なくとも1つの療法を投与することを含む、多発性嚢胞腎を有し、または有すると疑われる対象を処置するための方法である。
本明細書に記載の修飾オリゴヌクレオチドは、miR−17(配列番号1)またはその前駆体(配列番号2)と相補的な核酸塩基配列を有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの各核酸塩基は、miR−17の核酸塩基配列またはその前駆体中の対応する位置のそれぞれの核酸塩基と塩基対合を受けることができる。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、miR−17の核酸塩基配列またはその前駆体配列に対する1つ以上のミスマッチ塩基対を有することがあり、依然として、その標的配列にハイブリダイズすることができる。
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、8〜25連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、8〜12連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、12〜25連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、15〜25連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、15〜19連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、15〜16連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、17〜23連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、19〜23連結ヌクレオシドからなる。
特定の実施形態では、本明細書で提供されるオリゴヌクレオチドは、核酸塩基、糖、及び/またはヌクレオシド間連結に対する1つ以上の修飾を含んでもよく、よって、修飾オリゴヌクレオチドである。修飾核酸塩基、糖、及び/またはヌクレオシド間連結は、例えば、細胞取り込みの増強、他のオリゴヌクレオチドまたは核酸標的に対する親和性の増強、及びヌクレアーゼの存在下での安定性の増加、などの望ましい特性のために、非修飾形態よりも選択され得る。
本明細書では、医薬組成物が提供される。特定の実施形態では、本明細書で提供される医薬組成物は、8〜25連結ヌクレオシドからなり、かつmiR−17と相補的な核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を含む。特定の実施形態では、本明細書で提供される医薬組成物は、8〜12連結ヌクレオシドからなり、かつmiR−17と相補的な核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドからなる化合物を含む。特定の実施形態では、本明細書で提供される医薬組成物は、15〜25連結ヌクレオシドからなり、かつmiR−17と相補的な核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を含む。特定の実施形態では、本明細書で提供される医薬組成物は、17〜23連結ヌクレオシドからなり、かつmiR−17と相補的な核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を含む。
本発明は、キットも提供する。一部の実施形態では、キットは、修飾オリゴヌクレオチドを含む本発明の1つ以上の化合物を含み、オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、miR−17の核酸塩基配列と相補的である。化合物は、本明細書に記載のヌクレオシドパターンのいずれかを有することができる。一部の実施形態では、化合物は、バイアル内に存在することができる。複数の、例えば、10のバイアルが、例えば、調剤パック中に存在することができる。一部の実施形態では、バイアルは、シリンジで利用可能にするために製造される。キットは、化合物を使用するための使用説明書も含有する可能性がある。
特定の実施形態では、本発明は、実験モデルにおいて本発明の修飾オリゴヌクレオチドを使用及び/または試験する方法を提供する。当業者らは、本発明の医薬品を評価するために、このような実験モデルのプロトコールを選択及び修正することができる。
特定の実施形態では、microRNAレベルは、インビトロまたはインビボで細胞または組織中で定量される。特定の実施形態では、microRNAレベルの変化は、マイクロアレイ分析により測定される。特定の実施形態では、microRNAレベルの変化は、TaqMan(登録商標)microRNAアッセイ(Applied Biosystems)などのいくつかの市販のPCRアッセイのうちの1つにより測定される。
Pkhd1/cre;Pkd2F/Fマウスは自然に、多発性嚢胞腎を発生し、これらをADPKDのモデルとして使用した。Patel et al.,PNAS,2013;110(26):10765−10770を参照のこと。
抗miR化合物を含むオリゴヌクレオチドは、腎臓内のいくつかの細胞型に分布することが知られている。Chau et al.,Sci Transl Med.,2012,121ra18により報告されるように、Cy3標識抗miRの正常マウスまたは腎障害に罹患しやすいマウス(片側性尿管閉塞、間質性線維化のモデル)のいずれかへの次の投与後、腎臓における最大蛍光強度は、近位尿細管上皮であった。内皮細胞、周皮細胞、筋線維芽細胞、及びマクロファージは全て、検出可能な量のCy3標識抗miRも含有していた。しかし、糸球体、特に、足場細胞は、化学的に修飾されたオリゴヌクレオチドの既知の分布と一致する有意な量の抗miRを受け入れないようであった(Masarjian et al.,Oligonucleotides,2004,14,299−310)。
多数のmicroRNAは、シード配列同一性を共有し、それにより、microRNAファミリーのメンバーである。microRNAのシード領域が、標的特異性の決定因子であるので、microRNAファミリーメンバーは多くの場合、同様のセットのメッセンジャーRNA標的を制御する。シード領域の外側では、microRNAファミリーメンバーは、様々な程度の配列同一性を共有する。
ヒトADPKD嚢胞由来の初代培養において、miR−17阻害の効果を研究した。凍結したヒト初代ADPKD細胞は、Kansas University Medical Center(KUMC)のResearch Biomaterials and Cellular Models Coreにより提供された。上述したように、5%のFBS、5ug/mlのインスリン、5ug/mlのトランスフェリン、及び5ng/mlの亜セレン酸ナトリウム(ITS)(Lonza)を補充したDMEM:F12培地(Gibco)中で、ヒト初代ADPKD細胞を成長させた(Yamaguchi et al.,Am J Physiol Renal Physiol,2010,299:F944−951)。
Ca+2及びMg+2不含PBS中のトリプシンの1:10希釈液を使用して、80%コンフルエントで、ヒトADPKD細胞をトリプシン処理した。細胞を、96ウェルプレート中、2500細胞/ウェルの密度で、製造者のプロトコールに従ってRNAiMAX(Life Technologies)でトランスフェクトした。処置は次の通りであった:
●抗miR−17(3nM、10nM、または30nMの用量で;各処置についてn=5)
●対照オリゴヌクレオチド(表3に示す用量で;各処置についてn=5)。対照処置を変えるために、2つの異なる対照群を使用した。ドナー1〜4、3、または5由来の培養物について、それぞれ30nMの単回用量で、対照オリゴヌクレオチドを試験した。ドナー5由来の細胞について、3つの異なる用量で、単一の対照オリゴヌクレオチドを試験した。
●RNAiMAX(n=5)を用いるモックトランスフェクション
●PBS(n=5)
ヒト初代ADPKD細胞を、80%コンフルエントまで成長させ、Ca+2及びMg+2不含PBS中のトリプシンの1:10希釈液を使用して、トリプシン処理をした。1日目に、6ウェルプレートフォーマット中で、RNAiMAXを使用して、細胞をトランスフェクトした。処置群は、次の通りである。
●1nM、5nM、または20nMの用量の抗miR−17(各用量についてn=3)
●5つの対照オリゴヌクレオチド、それぞれ20nMの用量(各対照オリゴヌクレオチドについてn=3)
●RNAiMAX(n=3)を用いるモックトランスフェクション
●PBS
Nphp3の変異を持つPcyマウスは自然に、Pkhd1/cre;Pkd2F/Fマウスで観察されたものよりも疾患の進行が遅い多発性嚢胞腎を発生する。PCYモデルは、ヒトPKDのモデル、ならびに髄質性嚢胞腎/髄質嚢胞腎(NPH/MCD)複合体のモデルとして使用される。Pcyマウスモデルにおいて、miR−17と相補的な修飾オリゴヌクレオチド(抗miR−17化合物)を試験した。野生型マウスを、対照マウスとして使用した。miR−17とは無関係のmiRNAと相補的なオリゴヌクレオチドを、特異性に対する処置対照(抗miR対照)として使用した。抗miR−17化合物は、DNA、2′−MOE、及びS−cEt糖部分を有する、19連結ヌクレオシド(5′−CTGCACTGTAAGCACTTTG−3′;配列番号15)長の完全にホスホロチオエート化されたオリゴヌクレオチドであった。
Claims (45)
- 多発性嚢胞腎の処置方法であって、8〜25連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を、それを必要とする対象に投与することを含み、前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、miR−17と相補的である、前記方法。
- 前記対象が、多発性嚢胞腎を有する、請求項1に記載の方法。
- 前記対象が、多発性嚢胞腎を有すると疑われる、請求項1に記載の方法。
- 前記対象が、前記修飾オリゴヌクレオチドを投与する前に、多発性嚢胞腎を有すると診断されている、請求項1に記載の方法。
- 前記対象が、前記修飾オリゴヌクレオチドの投与前に、前記対象の腎臓、尿、または血液中のmiR−17の増加したレベルを有すると判定された、請求項1に記載の方法。
- 前記多発性嚢胞腎が、常染色体劣性多発性嚢胞腎または常染色体優性多発性嚢胞腎である、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
- 前記多発性嚢胞腎が、常染色体優性多発性嚢胞腎である、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
- 前記対象が、PKD1遺伝子の変異またはPKD2遺伝子の変異から選択される変異を有する、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
- 前記対象が、増加した両腎容積を有する、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
- 前記対象が、高血圧を有する、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
- 前記対象が、損なわれた腎機能を有する、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
- 前記対象が、腎機能の改善を必要とする、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
- 前記投与が、
a)前記対象の腎機能を改善し、
b)前記対象の腎機能の悪化を遅延させ、
c)前記対象の両腎容積を低減させ、
d)前記対象の両腎容積の増加を減速させ、
e)前記対象の嚢胞成長を阻害し、
f)前記対象における嚢胞成長の増加を減速させ、
g)前記対象の腎臓痛を低減させ、
h)前記対象の腎臓痛の増加を減速させ、
i)前記対象の腎臓痛の発症を遅延させ、
j)前記対象の高血圧を低減し、
k)前記対象の高血圧の悪化を減速させ、
l)前記対象の高血圧の発症を遅延させ、
m)前記対象の腎臓の線維化を低減させ、
n)前記対象の前記腎臓における線維化の悪化を減速させ、
o)前記対象の末期腎疾患の発症を遅延させ、
p)前記対象の透析までの時間を遅延させ、
q)前記対象の腎移植までの時間を遅延させ、かつ/または
r)前記対象の平均余命を向上させる、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。 - 前記投与が、
a)前記対象のアルブミン尿を低減させ、
b)前記対象のアルブミン尿の悪化を減速させ、
c)前記対象のアルブミン尿の発症を遅延させ、
d)前記対象の血尿を低減させ、
e)前記対象の血尿の悪化を減速させ、
f)前記対象の血尿の発症を遅延させ、
g)前記対象の血中尿素窒素を低減させ、
h)前記対象の前記血液中のクレアチニンを低減させ、
i)前記対象のクレアチニンクリアランスを改善し、
j)前記対象のアルブミン:クレアチニン比を低減させ、
k)前記対象の糸球体濾過量を改善し、
l)前記対象の糸球体濾過量の悪化を減速させ、
m)前記対象の前記尿中の好中球ゼラチナーゼ結合性リポカリン(NGAL)タンパク質を低減させ、かつ/または
n)前記対象の前記尿中の腎障害分子−1(KIM−1)タンパク質を低減させる、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。 - a)前記対象の両腎容積を測定すること、
b)前記対象の高血圧を測定すること、
c)前記対象の腎臓痛を測定すること、
d)前記対象の前記腎臓の線維化を測定すること、
e)前記対象の前記血液中の血中尿素窒素を測定すること、
f)前記対象の前記血液中のクレアチニンを測定すること、
g)前記対象のクレアチニンクリアランスを測定すること、
h)前記対象のアルブミン尿を測定すること、
i)前記対象のアルブミン:クレアチニン比を測定すること、
j)前記対象の糸球体濾過量を測定すること、
k)前記対象の前記尿中の好中球ゼラチナーゼ結合性リポカリン(NGAL)タンパク質を測定すること、及び/または
l)前記対象の前記尿中の腎障害分子−1(KIM−1)タンパク質を測定することを含む、先行請求項の1項に記載の方法。 - 前記両腎容積が、身長補正腎容積である、請求項9、13、及び15のいずれか1項に記載の方法。
- 前記嚢胞が、前記対象の1つ以上の腎臓に存在する、請求項13に記載の方法。
- 前記嚢胞が、前記対象の前記肝臓に存在する、請求項13に記載の方法。
- 降圧薬である少なくとも1つの追加療法を投与することを含む、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
- アンギオテンシンII変換酵素(ACE)阻害薬、アンギオテンシンII受容体遮断薬(ARB)、利尿薬、カルシウムチャネル遮断薬、キナーゼ阻害薬、アドレナリン受容体アンタゴニスト、血管拡張薬、ベンゾジアゼピン、レニン阻害薬、アルドステロン受容体アンタゴニスト、エンドセリン受容体遮断薬、哺乳類ラパマイシン標的(mTOR)阻害薬、ホルモンアナログ、バソプレシン受容体2アンタゴニスト、アルドステロン受容体アンタゴニスト、透析、及び腎臓移植から選択される少なくとも1つの追加療法を投与することを含む、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
- 前記アンギオテンシンII変換酵素(ACE)阻害薬が、カプトプリル、エナラプリル、リシノプリル、ベナゼプリル、キナプリル、ホシノプリル、ラミプリル及びから選択される、請求項20に記載の方法。
- 前記アンギオテンシンII受容体遮断薬(ARB)が、カンデサルタン、イルベサルタン、オルメサルタン、ロサルタン、バルサルタン、テルミサルタン、及びエプロサルタンから選択される、請求項20に記載の方法。
- 前記バソプレシン受容体2アンタゴニストが、トルバプタンである、請求項20に記載の方法。
- 前記アルドステロン受容体アンタゴニストが、スピロノラクトンである、請求項20に記載の方法。
- 前記キナーゼ阻害薬が、ボスチニブ及びKD019から選択される、請求項20に記載の方法。
- 前記mTOR阻害薬が、エベロリムス、ラパマイシン、及びシロリムスから選択される、請求項20に記載の方法。
- 前記ホルモンアナログが、ソマトスタチン及び副腎皮質刺激ホルモンから選択される、請求項20に記載の方法。
- 前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が、miR−17の前記核酸塩基配列(配列番号1)と、少なくとも90%相補的であり、少なくとも95%相補的であり、または100%相補的である、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
- 前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が、前記核酸塩基配列5′−GCACTTTG−3′(配列番号3)を含み、前記核酸塩基配列中の各Tが独立して、T及びUから選択される、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
- 前記修飾オリゴヌクレオチドが、8〜12連結ヌクレオシドからなる、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
- 前記修飾オリゴヌクレオチドが、12〜25連結ヌクレオシドからなる、請求項1〜29のいずれか1項に記載の方法。
- 前記修飾オリゴヌクレオチドが、15〜25連結ヌクレオシドからなる、請求項1〜29のいずれか1項に記載の方法。
- 前記修飾オリゴヌクレオチドが、17〜23連結ヌクレオシドからなる、請求項1〜29のいずれか1項に記載の方法。
- 前記修飾オリゴヌクレオチドが、8、9、10、11、または12連結ヌクレオシドからなる、請求項1〜29のいずれか1項に記載の方法。
- 前記修飾オリゴヌクレオチドが、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、または25連結ヌクレオシドからなる、請求項1〜29のいずれか1項に記載の方法。
- 前記修飾オリゴヌクレオチドが、15、16、17、18、19、20、21、または22連結ヌクレオシドからなる、請求項1〜29のいずれか1項に記載の方法。
- 前記修飾オリゴヌクレオチドが、17、18、19、20、21、22、または23連結ヌクレオシドからなる、請求項1〜29のいずれか1項に記載の方法。
- 前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも1つの修飾ヌクレオシドを含む、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
- 前記修飾ヌクレオシドが、S−cEtヌクレオシド、2′−O−メトキシエチルヌクレオシド、及びLNAヌクレオシドから選択される、請求項38に記載の方法。
- 前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも1つの修飾ヌクレオシド間連結を含む、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
- 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間連結が、修飾ヌクレオシド間結合である、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
- 前記修飾ヌクレオシド間連結が、ホスホロチオエートヌクレオシド間連結である、請求項40または41に記載の方法。
- 前記化合物が、前記修飾オリゴヌクレオチドからなる、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
- 治療的有効量の前記化合物を投与することを含む、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
- 多発性嚢胞腎の処置のための、8〜25連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドの使用であって、前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が、miR−17と相補的である、前記使用。
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