JP2018102351A - Fibrous tissue extraction device, fibrous tissue extraction method, and fibrous tissue extraction program - Google Patents
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Abstract
Description
本発明は、磁気共鳴画像撮影装置(以下、MRI装置)にて撮像された拡散強調画像(以下、DWI画像)を用いて、線維状組織を抽出する方法、線維状組織を抽出し表示する装置並びに線維状組織を抽出するプログラムに関する。 The present invention relates to a method for extracting a fibrous tissue using a diffusion weighted image (hereinafter referred to as a DWI image) captured by a magnetic resonance imaging apparatus (hereinafter referred to as an MRI apparatus), an apparatus for extracting and displaying the fibrous tissue. The present invention also relates to a program for extracting fibrous tissue.
被検体を傾斜磁場内に載置し水素原子核の磁気モーメントの励起エネルギーに相当するラジオ波を照射したのち水素原子核の磁気モーメントが基底状態に戻る時に発生するエコー信号を検出し被検体の形態画像や被検体内の生体分子の移動情報を得るMRI装置がある。被検体内の水分子は傾斜磁場が作用することで、被検体内の構造に従って異方性をもった拡散を示す。 The specimen is placed in a gradient magnetic field, irradiated with radio waves corresponding to the excitation energy of the magnetic moment of the hydrogen nucleus, and then the echo signal generated when the magnetic moment of the hydrogen nucleus returns to the ground state is detected, and the morphological image of the subject And an MRI apparatus that obtains movement information of biomolecules in a subject. The water molecules in the subject exhibit diffusion with anisotropy according to the structure in the subject by the action of a gradient magnetic field.
特に、線維状組織の走行方向に沿って大きな異方性をもって拡散することが知られている。線維状組織を抽出する方法として、異なる印加方向をもつ複数の傾斜磁場を印加して得られるDWI画像から計算される拡散テンソルを用いて、線維状組織の経路を追跡し、抽出する方法がある。従来は、設定した追跡開始点から、拡散テンソルの最大固有ベクトルの方向に次の開始点を設定し、これを繰り返すことによって線維状組織の抽出を行っていた。 In particular, it is known to diffuse with great anisotropy along the traveling direction of the fibrous tissue. As a method of extracting fibrous tissue, there is a method of tracking and extracting the path of fibrous tissue using a diffusion tensor calculated from DWI images obtained by applying multiple gradient magnetic fields with different application directions. . Conventionally, the next start point is set in the direction of the maximum eigenvector of the diffusion tensor from the set tracking start point, and the fibrous tissue is extracted by repeating this.
特許文献1に記載の追跡方法は、開始点の最大固有ベクトルの方向のみに基づいて次の開始点を設定する処理を繰り返し、線維状組織の抽出を行っていた。この処理を繰り返すと誤差が累積する事になり、線維状組織の抽出精度が低下したり、誤抽出により順方向の追跡と逆方向の追跡の抽出結果が一致しなかったりするおそれがあった。
In the tracking method described in
本発明は、1つの開始点に対して追跡先の候補点を複数設定し、開始点の最大固有ベクトルと候補点の最大固有ベクトルの両方を用いて開始点と候補点を結ぶ曲線を生成し、生成した曲線の指標に基づき、複数の候補点の中から、1つの候補点を決定する線維状組織の抽出方法を提供する。したがって、本発明により提供される線維状組織抽出装置、線維状組織抽出方法並びに線維状組織抽出プログラムは、順方向による抽出結果と逆方向による抽出結果が原理的に一致する追跡方法であり、誤抽出の可能性を低減しつつ線維状組織の抽出精度を向上することを可能にする。 The present invention sets a plurality of candidate points to be tracked for one start point, generates a curve connecting the start point and the candidate point using both the maximum eigenvector of the start point and the maximum eigenvector of the candidate point, and generates Provided is a fibrous tissue extraction method for determining one candidate point out of a plurality of candidate points based on the index of the curve. Therefore, the fibrous tissue extraction device, the fibrous tissue extraction method, and the fibrous tissue extraction program provided by the present invention are tracking methods in which the extraction result in the forward direction and the extraction result in the reverse direction are in principle identical, It is possible to improve the extraction accuracy of the fibrous tissue while reducing the possibility of extraction.
上記課題を解決するために、本発明は、MRI装置にて撮像されたDWI画像を用いて線維状組織を抽出する線維状組織抽出装置であって、前記DWI画像上の点において算出される拡散テンソルを対角化し、固有値と、絶対値が最大の固有値に対応する最大固有ベクトルを算出する対角化演算部と、前記DWI画像上の点を開始点に設定する開始点設定部と、前記開始点を起点に設定する起点設定部と、前記起点からの方向が前記起点における最大固有ベクトルの方向となす角と所定角以下であり、前記起点からの距離が所定の範囲内にある、複数の点を候補点として設定する候補点設定部と、複数の前記候補点の中から拡散異方性が閾値以上となる候補点を選別する候補点選別部と、前記起点と前記候補点における接線ベクトルが各々の最大固有ベクトルの方向となるように前記起点と前記候補点を結ぶ曲線を複数の前記候補点について各々生成する曲線生成部と、生成された前記曲線の指標に基づき、複数の前記候補点の中から、1つの候補点と、前記起点と該1つの候補点を結ぶ1つの曲線と、を決定する候補点決定部と、前記候補点決定部により決定された前記1つの候補点を次の起点に設定する起点更新部と、前記候補点選別部により選別される候補点が無くなるまで、前記候補点設定部と、前記候補点選別部と、前記曲線生成部と、前記候補点決定部と、起点更新部の処理を繰り返し、前記候補点決定部により決定された全ての曲線をつなげ、線維状組織として抽出する制御部と、を備えることを特徴とする。 In order to solve the above-mentioned problem, the present invention is a fibrous tissue extraction apparatus that extracts a fibrous tissue using a DWI image captured by an MRI apparatus, and is a diffusion calculated at a point on the DWI image Diagonalizing the tensor and calculating the eigenvalue and the maximum eigenvector corresponding to the eigenvalue with the maximum absolute value, the starting point setting unit for setting the point on the DWI image as the starting point, and the start A starting point setting unit for setting a point as a starting point, and a plurality of points whose direction from the starting point is equal to or less than a predetermined angle with an angle formed with the direction of the maximum eigenvector at the starting point, and the distance from the starting point is within a predetermined range A candidate point setting unit that sets a candidate point having a diffusion anisotropy equal to or greater than a threshold value from among the plurality of candidate points, and a tangent vector at the starting point and the candidate point. Each maximum eigenvector A curve generating unit that generates a curve connecting the starting point and the candidate point for each of the plurality of candidate points so as to be in a direction, and one of the plurality of candidate points based on the generated index of the curve A candidate point, a candidate point determining unit for determining the starting point and one curve connecting the one candidate point, and a starting point for setting the one candidate point determined by the candidate point determining unit as a next starting point The candidate point setting unit, the candidate point selecting unit, the curve generating unit, the candidate point determining unit, and the starting point updating unit until there is no candidate point selected by the update unit and the candidate point selecting unit. A control unit that repeats the process and connects all the curves determined by the candidate point determination unit and extracts them as a fibrous tissue.
また、本発明に係る線維状組織抽出方法は、MRI装置にて撮像されたDWI画像を用いて線維状組織を抽出する線維状組織抽出方法であって、前記DWI画像上の点において算出される拡散テンソルを対角化し、固有値と、絶対値が最大の固有値に対応する最大固有ベクトルを算出する対角化演算ステップと、前記拡散強調画像上の点を開始点に設定する開始点設定ステップと、設定した前記開始点を起点に設定する起点設定ステップと、設定した前記起点からの方向が前記起点における最大固有ベクトルの方向となす角と所定角以下であり、前記起点からの距離が所定の範囲内にある、複数の点を候補点として設定する候補点設定ステップと、複数の前記候補点の中から拡散異方性が閾値以上となる候補点を選別する候補点選別ステップと、前記起点と前記候補点における接線ベクトルが各々の最大固有ベクトルの方向となるように前記起点と前記候補点を結ぶ曲線を複数の前記候補点について各々生成する曲線生成ステップと、生成された前記曲線の指標に基づき、複数の前記候補点の中から、1つの候補点と、前記起点と該候補点を結ぶ1つの曲線と、を決定する候補点決定ステップと、決定された前記1つの候補点を次の起点に設定する起点更新ステップと、前記候補点選別ステップにより選別される候補点が無くなるまで、前記候補点設定ステップと、前記候補点選別ステップと、前記曲線生成ステップと、前記候補点決定ステップと、前記起点更新ステップと、を繰り返し、候補点決定ステップにより決定された全ての曲線をつなげ、線維状組織として抽出する制御ステップと、を備えることを特徴とする。 The fibrous tissue extraction method according to the present invention is a fibrous tissue extraction method that extracts a fibrous tissue using a DWI image captured by an MRI apparatus, and is calculated at points on the DWI image. Diagonalization of the diffusion tensor, eigenvalue, diagonalization calculation step for calculating the maximum eigenvector corresponding to the eigenvalue having the maximum absolute value, a start point setting step for setting a point on the diffusion weighted image as a start point, A starting point setting step for setting the set starting point as a starting point, a direction from the set starting point being equal to or less than a predetermined angle with an angle formed by the direction of the maximum eigenvector at the starting point, and a distance from the starting point being within a predetermined range A candidate point setting step for setting a plurality of points as candidate points, a candidate point selecting step for selecting a candidate point having a diffusion anisotropy equal to or greater than a threshold value from the plurality of candidate points, and the starting point Based on a curve generation step for generating a curve connecting the starting point and the candidate point for each of the plurality of candidate points such that a tangent vector at the candidate point is in the direction of each maximum eigenvector, and the generated index of the curve A candidate point determining step for determining one candidate point and one curve connecting the starting point and the candidate point from among the plurality of candidate points; and determining the determined one candidate point as the next starting point The candidate point setting step, the candidate point selection step, the curve generation step, and the candidate point determination step until there is no candidate point selected by the candidate point selection step, And a control step of repeating all the starting point updating steps, connecting all the curves determined by the candidate point determining step, and extracting them as a fibrous tissue. And wherein the Rukoto.
本発明によれば、各点の最大固有ベクトルに接する曲線で接続することで、節点における線が連続となり、線維状組織を誤抽出する可能性を低減した線維状組織抽出装置、線維状組織抽出方法、並びに線維状組織抽出プログラムを提供することができる。 According to the present invention, a fibrous tissue extraction device and a fibrous tissue extraction method that are connected by a curve that touches the maximum eigenvector of each point so that the lines at the nodes are continuous and the possibility of erroneous extraction of the fibrous tissue is reduced. As well as a fibrous tissue extraction program.
以下、添付図面を用い本発明に係る線維状組織抽出装置の好ましい実施形態について説明する。なお、以下の説明及び添付図面において、同一機能を有するものは同一符号を付け、その繰り返しの説明は省略する。 Hereinafter, preferred embodiments of a fibrous tissue extraction device according to the present invention will be described with reference to the accompanying drawings. In the following description and the accompanying drawings, components having the same function are denoted by the same reference numerals, and repeated description thereof is omitted.
図1に、本発明に係る線維状組織抽出装置1のハードウェア構成を示す。線維状組織抽出装置1は、CPU(Central Processing Unit)2、主メモリ3、記憶装置4、表示メモリ5、表示装置6、マウス8に接続されたコントローラ7、キーボード9、ネットワークアダプタ10が、システムバス11によって信号送受可能に接続されて構成される。
FIG. 1 shows a hardware configuration of a fibrous
線維状組織抽出装置1は、ネットワーク12を介して磁気共鳴画像撮影装置(MRI装置)13や医用画像データベース14と信号送受可能に接続される。ここで、「信号送受可能に」とは、電気的、光学的に有線、無線を問わずに、相互にあるいは一方から他方へ信号送受可能な状態を示す。
The fibrous
CPU2は、各構成要素の動作を制御する装置である。CPU2は、記憶装置4に格納されるプログラムやプログラムの実行に必要な医用画像情報等のデータを主メモリ3にロードし実行する。記憶装置4は、例えばハードディスクである。記憶装置4は、また、データの受け渡しをする装置であれば良く、フレシキブルディスク、光(磁気)ディスク、ZIPメモリ、USBメモリ等の可搬性記録媒体であっても良い。
The
医用画像情報は、LAN(Local Area Network)等のネットワーク12を介し、医用画像データベース14や、MRI装置13から取得される。
The medical image information is acquired from the
表示メモリ5は、液晶ディスプレイやCRT(Cathode Ray Tube)等の表示装置6に表示するための表示データを一時格納するものである。
The
マウス8やキーボード9は、操作者が線維状組織抽出装置1に対して操作指示を行う操作デバイスである。マウス8はトラックパッドやトラックボールなどの他のポインティングデバイスであっても良い。コントローラ7は、マウス8の状態を検出して、表示装置6上のマウスポインタの位置を取得し、取得した位置情報等をCPU2へ出力するものである。
The mouse 8 and the
ネットワークアダプタ10は、線維状組織抽出装置1をLAN、電話回線、インターネット等のネットワーク12に接続するためのものである。
The
MRI装置13は、線維状組織を抽出するために必要なDWI画像を撮像する装置である。医用画像データベース14は、MRI装置13によって撮像された医用画像情報を記憶するデータベースシステムである。
The
CPU2が後述する方法を実行することにより、線維状組織が抽出される。抽出された線維状組織は表示装置6に表示される。
When the
図2に、本発明に係る表示装置6の表示画面200を示す。表示画面200は、画像表示部210、開始点領域設定部220、画像操作部230、追跡開始指示部240を有する。開始点領域設定部220を用い、画像表示部210に表示されるMPR画像または3D画像211上に、開始点領域212を設定する。MPR画像または3D画像211上に重畳表示された213及び214は、後述する追跡方法を実行することにより抽出される線維状組織であり、それぞれ順方向の追跡により抽出された線維状組織213、逆方向の追跡により抽出された線維状組織214を示す。
FIG. 2 shows a
以下、図3を用い、本実施例1の処理の流れを説明する。
Hereinafter, the processing flow of the first embodiment will be described with reference to FIG.
(ステップS301)
記憶装置4は、MRI装置13または医用画像データベース14からDWI画像を読み込む。
(Step S301)
The storage device 4 reads the DWI image from the
(ステップS302)
CPU2はステップS301で読み込んだDWI画像上の各点における拡散テンソルを算出する。傾斜磁場を印加して得られるDWI画像の画素値Sは以下の(式1)で与えられる。
(Step S302)
ここで、S0は傾斜磁場を印加しないときの画素値であり、bは傾斜磁場強度及びパルスシーケンスによる傾斜磁場印加時間等により決まるスカラー量でありb値(b factor)と呼ばれる。Gは傾斜磁場の印加方向を示す単位ベクトルであり、Dは拡散テンソルである。拡散テンソルDは3行3列の対称行列を用いて、(式2)のように表される。
Here, S 0 is a pixel value when no gradient magnetic field is applied, and b is a scalar amount determined by the gradient magnetic field strength, the gradient magnetic field application time by a pulse sequence, and the like, and is called a b value (b factor). G is a unit vector indicating the application direction of the gradient magnetic field, and D is a diffusion tensor. The diffusion tensor D is expressed as (Equation 2) using a 3 × 3 symmetric matrix.
拡散テンソルDの未知数は6つであり、6つ以上の異なる印加方向をもつ傾斜磁場Gを印加して得られるDWI画像を用いて求めることができる。 There are six unknowns of the diffusion tensor D, which can be obtained using a DWI image obtained by applying a gradient magnetic field G having six or more different application directions.
(ステップS303)
CPU2はS302で算出した拡散テンソルDを対角化し、3つの固有値と固有ベクトルを算出する。算出した固有ベクトルのうち、絶対値が最大の固有値に対応する固有ベクトルを最大固有ベクトルとして保存する。
(Step S303)
The
(ステップS304)
操作者は、表示画面200を参照しながら、マウス8及びキーボード9、あるいは表示装置6がタッチパネルモニタである場合はタッチパネルモニタを用いて、開始点領域設定部220を操作し、画像表示部210に表示されるMPR画像または3D画像211上に、開始点領域212を設定する。開始点領域212は、例えば、抽出したい線維状組織が通過する可能性が高い領域に設定する。開始点領域212を設定後、操作者は、追跡開始指示部240を操作し、CPU2は線維状組織の抽出処理を開始する。
(Step S304)
While referring to the
なお、上記の開始点領域の設定は、線維状組織を抽出する開始点を設定するための方法の一例である。開始点領域を設定する代わりに、画像表示部210に表示されるMPR画像または3D画像211上の1点を開始点としてポイントし、ポイントした1点について線維状組織の抽出を行ってもよい。
Note that the above setting of the start point region is an example of a method for setting a start point for extracting a fibrous tissue. Instead of setting the start point region, a point on the MPR image or
(ステップS305)
CPU2はS304で設定した開始点領域に含まれる複数の点を開始点に設定し、最大固有ベクトルに基づいて、順方向に線維状組織を抽出する。ステップS305の詳細については、以下、図4を用い説明する。
(Step S305)
The
(ステップS306)
CPU2は、最大固有ベクトルを-1倍し、S305と同様の処理で、逆方向に線維状組織を抽出する。
(Step S306)
The
(ステップS307)
CPU2は、S305とS306で抽出した線維状組織をMPR画像または3D画像211上に重畳し、画像表示部210に表示する。213はS305の順方向の追跡により抽出された線維状組織であり、214はS306の逆方向の追跡により抽出された線維状組織である。
(Step S307)
The
なお、図2には、順方向の追跡により抽出された線維状組織213と、逆方向の追跡により抽出された線維状組織214の両方を表示しているが、上記のステップS305又はS306いずれか一方の処理を省略し、順方向又は逆方向いずれか一方の方向のみ線維状組織の追跡を行ってもよい。
FIG. 2 shows both the
以下、図4と図5を用い、S305の処理の詳細を説明する。図4はS305の処理の中身を説明するためのフローチャートである。 Hereinafter, the details of the processing of S305 will be described with reference to FIGS. FIG. 4 is a flowchart for explaining the contents of the process of S305.
(ステップS401)
CPU2は、開始点領域212に含まれる1つの点を開始点に設定し、設定した1つの開始点について線維状組織の抽出を開始する。
(Step S401)
The
(ステップS402)
CPU2は、開始点を起点に設定する。
(Step S402)
CPU2 sets the starting point as the starting point.
(ステップS403)
CPU2は、起点からの方向が起点における最大固有ベクトルの方向となす角と所定角以下であり、起点からの距離が所定の範囲内にある、複数の点を候補点として設定する。
(Step S403)
The
図5に、起点と候補点の関係を示す。CPU2は、起点501における最大固有ベクトル502を中心として所定角以下の方向でかつ、起点501からの距離が所定の範囲内にある候補点設定領域506内に含まれる複数の点を候補点503(503-1、503-2、503-3、503-4)として設定する。
FIG. 5 shows the relationship between the starting point and the candidate points. The
(ステップS404)
CPU2は、設定した候補点の中から、線維状の異方性拡散を示している候補点を選別する。
(Step S404)
The
異方性拡散の度合いは、拡散異方性(Fractional Anisotropy)を用いて評価される。拡散異方性は拡散の偏りの程度を示す値であり、拡散異方性が大きいほど線維状の異方性拡散が大きいことを示す。拡散異方性は、3つの拡散テンソルの固有値λ1、λ2、λ3を用いて、以下の(式3)で与えられる。
The degree of anisotropic diffusion is evaluated using diffusion anisotropy. The diffusion anisotropy is a value indicating the degree of bias of diffusion, and the greater the diffusion anisotropy, the greater the fibrous anisotropic diffusion. The diffusion anisotropy is given by the following (formula 3) using eigenvalues λ 1 , λ 2 , and λ 3 of the three diffusion tensors.
ここで、Davは見かけの拡散度合い(Apparent Diffusion Coefficient)であり、以下の(式4)で与えられる。
Here, Dav is an apparent diffusion coefficient (Apparent Diffusion Coefficient), and is given by (Equation 4) below.
CPU2は、上記(式3)の拡散異方性を計算し、拡散異方性が閾値以上となる候補点を選別する。
The
(ステップS405)
CPU2は、選別した候補点503の中から、更に、起点501と候補点503を結ぶ方向ベクトルを含む平面を決定し、起点501の最大固有ベクトルと前記平面を挟んで反対方向に伸びる最大固有ベクトルを有する候補点503を選別する。
(Step S405)
The
より詳しくは、CPU2は、で選別した候補点の中から、更に、各候補点の拡散テンソルの最大固有ベクトルが、前記各候補点と起点501を結んだ直線より外側に向いている候補点を選別する。図6に、各候補点の拡散テンソルの最大固有ベクトルが、前記各候補点と起点501を結んだ直線より外側に向いている候補点を選別することを説明するための図を示す。本ステップによる選別処理を行う理由は、図6に示すように候補点設定領域506内の候補点503の拡散テンソルの最大固有ベクトル504のように、候補点503と起点501を結んだ直線603より外側を向いている場合、曲線505のように滑らかな接続となるが、最大固有ベクトル604のように内側を向いている場合、S字状の曲線605で結ばれることとなり自然な接続とならないためである。
More specifically,
本ステップの理想的な実施方法を以下に示す。 The ideal implementation method for this step is shown below.
直線603と最大固有ベクトル502が張る平面の法線を決定し、前記法線と直線603が張る平面を境界平面とし、最大固有ベクトル502との内積が正となる前記境界平面の単位法線ベクトルを決定する。更に、前記単位法線ベクトルとの内積が負となる最大固有ベクトルを有する候補点を選別する。
Determines the normal of the plane extending from the
なお、本ステップS405の処理は、省略可能な処理であり、必要に応じて実施する形態であってもよい。 Note that the process of step S405 is an optional process and may be implemented as necessary.
(ステップS406)
CPU2は、選別した候補点の中から、更に、起点501の最大固有ベクトル502と候補点の最大固有ベクトル504のなす角が所定値以下となる候補点503を選別する。
(Step S406)
From the selected candidate points, the
なお、本ステップS406の処理は、省略可能な処理であり、必要に応じて実施する形態であってもよい。 Note that the process of step S406 is an optional process and may be implemented as necessary.
(ステップS407)
CPU2は、候補点が残っているか確認する。候補点が残っている場合(Yesの場合)、ステップS408に進み、複数の候補点の中から1つの候補点を決定する。候補点が残っていない場合(Noの場合)、ステップS411に進む。
(Step S407)
CPU2 checks whether candidate points remain. If candidate points remain (Yes), the process proceeds to step S408, and one candidate point is determined from among a plurality of candidate points. If no candidate points remain (No), the process proceeds to step S411.
(ステップS408)
CPU2は、選別した各候補点について、起点と候補点における接線ベクトルが各々の最大固有ベクトルの方向となるように、起点と候補点を結ぶ曲線505を生成する。図7に、起点と候補点を曲線接続方法の概念図を示す。曲線505は、好適には、3次のスプライン曲線を用いる。起点501の3次元座標を(x0,y0,z0)とすると、起点501を通る3次のスプライン曲線は媒介変数sを用いて以下の(式5),(式6)のように表される。
(Step S408)
For each selected candidate point, the
ここで、{an、bn、cn|n=x、y、z}は未知の定数である。起点501における拡散テンソルの最大固有ベクトル502と候補点503における拡散テンソルの最大固有ベクトル504に接する3次のスプライン曲線505を決定するためには、9つの条件式が必要となる。起点501における最大固有ベクトル502に接する条件から3つ、候補点503における最大固有ベクトル504に接する条件から3つ、候補点503の座標(x1,y1,z1)を通る条件から3つの条件式がそれぞれ得られる。これらの条件式を解くことにより、9つの未知数{an、bn、cn|n=x、y、z}が定まり、曲線505が決定される。
Here, {a n , b n , c n | n = x, y, z} are unknown constants. In order to determine the
(ステップS409)
CPU2は、S408で生成した各候補点503と起点501を結ぶ各曲線505の曲率を計算する。図8に、曲率を計算する方法を説明するための図を示す。平面802は、r(s)で表される曲線上の点801における接触平面である。ベクトルe1(s)は、曲線r(s)上の点801における接線ベクトルである。ベクトルe2(s)は、曲線r(s)上の点801における法線ベクトルである。平面802上にある法線ベクトルを主法線ベクトルと呼ぶ。また、曲線r(s)上の点801を通り平面802に垂直なベクトルe3(s)を陪法線ベクトルと呼ぶ。点801がΔsだけ変化したとき、e1(s)とe1(s+Δs)のなす角をΔθとおくと、主曲率k(s)は以下の(式7)で表される。
(Step S409)
The
また、点801がΔsだけ変化したとき、e3(s)とe3(s+Δs)のなす角をΔφとおくと、捩率と呼ばれる第二曲率τ(s)が以下の(式8)のように定義される。
Further, when the
CPU2は、各候補点503と起点501を結ぶ各曲線505の曲率を計算し、比較する。比較する曲率は、主曲率k(s)であってもよいし、主曲率k(s)と第二曲率τ(s)から生成される評価関数f(k(s),τ(s))であってもよい。評価関数f(k(s),τ(s))の例として、例えば、f(k(s),τ(s))= w1*k(s)+w2*τ(s)が用いられる。ここで、w1,w2は経験的に決定されるパラメータである。f(k(s),τ(s))の起点501から候補点503までの経路における平均値は、以下の(式9)のように表される。
ここで、l(si)は分割した曲線の曲線長であり、
Where l (s i ) is the curve length of the divided curve,
である。 It is.
(ステップS410)
CPU2は、S409で計算した起点501と各候補点503とを結ぶ、複数の曲線505の曲率の平均値<f>の中から、曲率が最小となる候補点と、その候補点と起点とを結ぶ1つの曲線を決定する。決定した1つの曲線を抽出し、決定した候補点を次の起点に設定する。ステップS403に戻り、設定した次の起点について線維状組織の抽出処理を継続する。
(Step S410)
The
なお、上記において、曲率の平均値<f>を、候補点を選定するための指標としたが、曲率の平均値<f>の代わりに、開始点から候補点までの曲線を複数の曲線に分割し、分割した曲線ごとに曲率f(si)を計算し、f(si)の最大値fmax = max{f(si)}が最小となる候補点を次の起点とし、その候補点と起点とを結ぶ1つの曲線を決定してもよい。 In the above, the average value <f> of curvature is used as an index for selecting candidate points, but instead of the average value <f> of curvature, the curve from the start point to the candidate points is changed into a plurality of curves. divided, calculate the curvature f (s i) for each divided curve, the candidate point maximum value f max = max {f (s i)} is a minimum of f (s i) as the next starting point, the One curve connecting the candidate point and the starting point may be determined.
以後、ステップS406において候補点が無くなるまで、ステップS403〜ステップS410までの処理を繰り返し、線維状組織の抽出処理を継続する。 Thereafter, the process from step S403 to step S410 is repeated until the candidate point is eliminated in step S406, and the fibrous tissue extraction process is continued.
(ステップS411)
CPU2は、現在の起点を線維状組織の終点とし、現在の開始点についての線維状組織の抽出処理を完了する。S410でこれまで決定した全ての曲線をつなげ、現在の開始点についての線維状組織の抽出結果とする。
(Step S411)
The
(ステップS412)
CPU2は、開始点領域212内の全ての開始点について線維状組織の抽出処理を完了したか確認する。全ての開始点について線維状組織の抽出処理を完了した場合(Yesの場合)、ステップS306に進み、逆方向の線維状組織の抽出を行う。全ての開始点について線維状組織の抽出処理を完了していない場合(Noの場合)、ステップS413に進む。
(Step S412)
The
(ステップS413)
CPU2は、開始点領域212に含まれる別の点を次の開始点に設定する。ステップS402に進み、次の開始点について線維状組織の抽出処理を行う。
(Step S413)
The
本実施例1では、空間的に幅を持った領域で候補点を選別することができるため、次の起点として最適な候補点を決定し、線維状組織の抽出精度を向上することができる。 In the first embodiment, candidate points can be selected in a spatially wide region, so that an optimal candidate point can be determined as the next starting point, and the fibrous tissue extraction accuracy can be improved.
図9に、実施例2における処理の流れを示す。図10は、実施例2における起点と候補点の関係を示す図である。 FIG. 9 shows a processing flow in the second embodiment. FIG. 10 is a diagram illustrating a relationship between a starting point and candidate points in the second embodiment.
実施例1は、起点と候補点を結ぶ曲線の曲率を候補点を選定するための指標としたが、実施例2では、起点と候補点を結ぶ曲線の長さを候補点を選定するための指標とする。そのため、ステップS903において、起点から等距離となる球面上の点を候補点として設定する。実施例1と異なる処理は、ステップS903、S909及びS910の処理である。ステップS901〜S902、S904〜S908、S911〜S913の処理は、実施例1のステップS401〜S402、S404〜S408、S411〜S413の処理と同一であるので、その説明を省略する。 In Example 1, the curvature of the curve connecting the starting point and the candidate point is used as an index for selecting the candidate point. In Example 2, the length of the curve connecting the starting point and the candidate point is used for selecting the candidate point. Use as an indicator. Therefore, in step S903, a point on the sphere that is equidistant from the starting point is set as a candidate point. The processing different from the first embodiment is the processing in steps S903, S909, and S910. Since the processes in steps S901 to S902, S904 to S908, and S911 to S913 are the same as the processes in steps S401 to S402, S404 to S408, and S411 to S413 in the first embodiment, description thereof is omitted.
(ステップS903)
CPU2は、起点501からの方向が起点501における最大固有ベクトルの方向となす角と所定角以下であり、起点501から等距離となる球面1006上の点503(503-1、503-2、503-3、503-4)を候補点として設定する。
(Step S903)
The
(ステップS909)
CPU2は、S908で生成した起点501と各候補点503を結ぶ各曲線r(s)の長さを計算する。曲線の長さLは、以下の(式11)を用いて計算される。
(Step S909)
The
(ステップS910)
CPU2は、S909で計算した起点501と各候補点503を結ぶ、複数の曲線505の中から、長さが最小となる候補点と、その候補点と開始点とを結ぶ1つの曲線を決定し、決定した候補点を次の起点に設定する。ステップS903に戻り、次の起点についての線維状組織の抽出処理を行う。
(Step S910)
CPU2 determines a candidate point having the shortest length and a single curve connecting the candidate point and the starting point from among a plurality of
本実施例2では、実施例1よりも低い計算コストで線維状組織を抽出することができる。 In the second embodiment, a fibrous tissue can be extracted at a calculation cost lower than that in the first embodiment.
なお、本発明の線維状組織抽出装置は上記実施形態に限定されるものではなく、発明の要旨を逸脱しない範囲で構成要素を変形して具体化できる。例えば、上記S408のステップにおいて、起点と候補点を結ぶ曲線の例として3次のスプライン曲線を挙げ、本発明の実施形態を具体的に説明したが、スプライン曲線の代わりにベジェ曲線を用いて起点と候補点を接続し、接続した曲線の指標から候補点を決定してもよい。また、上記実施形態に開示されている複数の構成要素を適宜組み合わせても良い。さらに、上記実施形態に示される全構成要素からいくつかの構成要素を削除しても良い。 The fibrous tissue extraction apparatus of the present invention is not limited to the above embodiment, and can be embodied by modifying the constituent elements without departing from the gist of the invention. For example, in the step of S408, a cubic spline curve is given as an example of a curve connecting a starting point and a candidate point, and the embodiment of the present invention has been specifically described. However, a starting point using a Bezier curve instead of a spline curve is described. And the candidate points may be connected, and the candidate points may be determined from the indices of the connected curves. Moreover, you may combine suitably the some component currently disclosed by the said embodiment. Furthermore, some components may be deleted from all the components shown in the above embodiment.
1 線維状組織抽出装置、2 CPU、3 主メモリ、4 記憶装置、5 表示メモリ、6 表示装置、7 コントローラ、8 マウス、9 キーボード、10 ネットワークアダプタ、11 システムバス、12 ネットワーク、13 磁気共鳴画像撮影装置(MRI装置)、14 医用画像データベース、200 表示画面、210 画像表示部、211 MPR画像または3D画像、212 開始点領域、213 順方向の追跡により抽出された線維状組織、214 逆方向の追跡により抽出された線維状組織、220 開始点領域設定部、230 画像操作部、240 追跡開始指示部、501 起点、502 最大固有ベクトル、503、503-1、503-2、503-3、503-4 候補点、504 最大固有ベクトル、505 曲線、506 候補点設定領域、603 直線、604 最大固有ベクトル、605 曲線、801 点、802 平面、1006 球面 1 Fibrous tissue extractor, 2 CPU, 3 main memory, 4 storage device, 5 display memory, 6 display device, 7 controller, 8 mouse, 9 keyboard, 10 network adapter, 11 system bus, 12 network, 13 magnetic resonance image Imaging device (MRI device), 14 medical image database, 200 display screen, 210 image display unit, 211 MPR image or 3D image, 212 starting point region, 213 fibrous tissue extracted by forward tracking, 214 reverse direction Fibrous tissue extracted by tracking, 220 start point area setting unit, 230 image operation unit, 240 tracking start instruction unit, 501 starting point, 502 maximum eigenvector, 503, 503-1, 502-2, 503-3, 503- 4 Candidate points, 504 maximum eigenvectors, 505 curves, 506 candidate point setting area, 603 straight lines, 604 maximum eigenvectors, 605 curves, 801 points, 802 plane, 1006 sphere
Claims (15)
前記拡散強調画像上の点において算出される拡散テンソルを対角化し、固有値と、絶対値が最大の固有値に対応する最大固有ベクトルを算出する対角化演算部と、
前記拡散強調画像上の点を開始点に設定する開始点設定部と、
前記開始点を起点に設定する起点設定部と、
前記起点からの方向が前記起点における最大固有ベクトルの方向となす角と所定角以下であり、前記起点からの距離が所定の範囲内にある、複数の点を候補点として設定する候補点設定部と、
複数の前記候補点の中から拡散異方性が閾値以上となる候補点を選別する候補点選別部と、
前記起点と前記候補点における接線ベクトルが各々の最大固有ベクトルの方向となるように前記起点と前記候補点を結ぶ曲線を複数の前記候補点について各々生成する曲線生成部と、
前記曲線の指標に基づき、複数の前記候補点の中から、1つの候補点と、前記起点と該1つの候補点を結ぶ1つの曲線と、を決定する候補点決定部と、
前記候補点決定部により決定された前記1つの候補点を次の起点に設定する起点更新部と、
前記候補点選別部により選別される候補点が無くなるまで、前記候補点設定部と、前記候補点選別部と、前記曲線生成部と、前記候補点決定部と、起点更新部の処理を繰り返し、前記候補点決定部により決定された全ての曲線をつなげ、線維状組織として抽出する制御部と、
を備えることを特徴とする線維状組織抽出装置。 A fibrous tissue extraction device that extracts a fibrous tissue using a diffusion weighted image captured by a magnetic resonance imaging apparatus,
Diagonalizing a diffusion tensor calculated at a point on the diffusion-weighted image, and calculating a eigenvalue and a maximum eigenvector corresponding to the eigenvalue having the maximum absolute value,
A starting point setting unit for setting a point on the diffusion weighted image as a starting point;
A starting point setting unit for setting the starting point as a starting point;
A candidate point setting unit configured to set a plurality of points as candidate points, wherein a direction from the starting point is equal to or less than a predetermined angle with an angle formed with the direction of the maximum eigenvector at the starting point, and a distance from the starting point is within a predetermined range; ,
A candidate point selection unit for selecting a candidate point having a diffusion anisotropy equal to or greater than a threshold value from the plurality of candidate points;
A curve generator for generating a curve connecting the starting point and the candidate point for each of the plurality of candidate points such that a tangent vector at the starting point and the candidate point is in the direction of each maximum eigenvector;
A candidate point determination unit for determining one candidate point and one curve connecting the starting point and the one candidate point from among the plurality of candidate points based on the index of the curve;
A starting point updating unit for setting the one candidate point determined by the candidate point determining unit as a next starting point;
Until there are no candidate points to be selected by the candidate point selection unit, the candidate point setting unit, the candidate point selection unit, the curve generation unit, the candidate point determination unit, and the starting point update unit are repeated, A control unit that connects all the curves determined by the candidate point determination unit and extracts as a fibrous tissue,
A fibrous tissue extraction apparatus comprising:
前記開始点設定部は、前記開始点領域に含まれる複数の点から1つずつ開始点を設定し、
前記制御部は、前記開始点領域に含まれる複数の点すべてについて、前記線維状組織を抽出するように制御する、
ことを特徴とする請求項1又は2に記載の線維状組織抽出装置。 A start point region setting unit for setting a predetermined region on the diffusion weighted image as a start point region;
The start point setting unit sets a start point one by one from a plurality of points included in the start point region,
The control unit controls to extract the fibrous tissue for all of a plurality of points included in the start point region;
The fibrous tissue extraction device according to claim 1 or 2, wherein the device is a fibrous tissue extraction device.
ことを特徴とする請求項1乃至3のいずれか一項に記載の線維状組織抽出装置。 The candidate point selection unit determines a plane including a direction vector connecting the starting point and the candidate point, and further selects the candidate point having the maximum eigenvector of the starting point and the maximum eigenvector extending in the opposite direction across the plane. ,
The fibrous tissue extraction device according to any one of claims 1 to 3, wherein
ことを特徴とする請求項1乃至4のいずれか一項に記載の線維状組織抽出装置。 The candidate point selection unit further selects a candidate point having an angle between a maximum eigenvector of the starting point and a maximum eigenvector of the candidate point that is equal to or less than a predetermined value from the plurality of candidate points.
The fibrous tissue extraction device according to any one of claims 1 to 4, wherein
前記候補点決定部は、複数の前記候補点の中から、前記曲線の指標が最小となる1つの候補点と、前記起点と該1つの候補点を結ぶ1つの曲線と、を決定すること、
を特徴とする請求項1乃至5のいずれか一項に記載の線維状組織抽出装置。 The indicator of the curve is an average principal curvature in the path of the curve,
The candidate point determination unit determines, from among the plurality of candidate points, one candidate point with the smallest index of the curve, and one curve connecting the starting point and the one candidate point;
The fibrous tissue extraction device according to any one of claims 1 to 5, wherein
前記候補点決定部は、複数の前記候補点の中から、前記曲線の指標が最小となる1つの候補点と、前記起点と該1つの候補点を結ぶ1つの曲線と、を決定すること、
を特徴とする請求項1乃至5のいずれか一項に記載の線維状組織抽出装置。 The index of the curve is an average value in the path of the curve of the value obtained by the evaluation function relating to the main curvature and the second curvature of the curve,
The candidate point determination unit determines, from among the plurality of candidate points, one candidate point with the smallest index of the curve, and one curve connecting the starting point and the one candidate point;
The fibrous tissue extraction device according to any one of claims 1 to 5, wherein
前記候補点決定部は、複数の前記候補点の中から、前記曲線の指標が最小となる1つの候補点と、前記起点と該1つの候補点を結ぶ1つの曲線と、を決定すること、
を特徴とする請求項1乃至5のいずれか一項に記載の線維状組織抽出装置。 The index of the curve is a maximum value of the main curvature calculated for each of the divided curves by dividing the curve into a plurality of curves.
The candidate point determination unit determines, from among the plurality of candidate points, one candidate point with the smallest index of the curve, and one curve connecting the starting point and the one candidate point;
The fibrous tissue extraction device according to any one of claims 1 to 5, wherein
前記候補点決定部は、複数の前記候補点の中から、前記曲線の指標が最小となる1つの候補点と、前記起点と該1つの候補点を結ぶ1つの曲線と、を決定すること、
を特徴とする請求項1乃至5のいずれか一項に記載の線維状組織抽出装置。 The index of the curve is a maximum value obtained by dividing the curve into a plurality of curves and obtained by an evaluation function relating to the main curvature and the second curvature calculated for each of the divided curves,
The candidate point determination unit determines, from among the plurality of candidate points, one candidate point with the smallest index of the curve, and one curve connecting the starting point and the one candidate point;
The fibrous tissue extraction device according to any one of claims 1 to 5, wherein
前記候補点決定部は、複数の前記候補点の中から、前記曲線の指標が最小となる1つの候補点と、前記起点と該1つの候補点を結ぶ1つの曲線と、を決定すること、
を特徴とする請求項1乃至5のいずれか一項に記載の線維状組織抽出装置。 The index of the curve is a length of a curve connecting the starting point and the candidate point,
The candidate point determination unit determines, from among the plurality of candidate points, one candidate point with the smallest index of the curve, and one curve connecting the starting point and the one candidate point;
The fibrous tissue extraction device according to any one of claims 1 to 5, wherein
ことを特徴とする請求項1乃至10のいずれか一項に記載の線維状組織抽出装置。 The curve connecting the starting point and the candidate point is a cubic spline curve.
The fibrous tissue extraction device according to any one of claims 1 to 10, wherein
前記拡散強調画像上の点において算出される拡散テンソルを対角化し、固有値と、絶対値が最大の固有値に対応する最大固有ベクトルを算出する対角化演算ステップと、
前記拡散強調画像上の点を開始点に設定する開始点設定ステップと、
設定した前記開始点を起点に設定する起点設定ステップと、
設定した前記起点からの方向が前記起点における最大固有ベクトルの方向となす角と所定角以下であり、前記起点からの距離が所定の範囲内にある、複数の点を候補点として設定する候補点設定ステップと、
複数の前記候補点の中から拡散異方性が閾値以上となる候補点を選別する候補点選別ステップと、
前記起点と前記候補点における接線ベクトルが各々の最大固有ベクトルの方向となるように前記起点と前記候補点を結ぶ曲線を複数の前記候補点について各々生成する曲線生成ステップと、
生成された前記曲線の指標に基づき、複数の前記候補点の中から、1つの候補点と、前記起点と該候補点を結ぶ1つの曲線と、を決定する候補点決定ステップと、
決定された前記1つの候補点を次の起点に設定する起点更新ステップと、
前記候補点選別ステップにより選別される候補点が無くなるまで、前記候補点設定ステップと、前記候補点選別ステップと、前記曲線生成ステップと、前記候補点決定ステップと、前記起点更新ステップと、を繰り返し、候補点決定ステップにより決定された全ての曲線をつなげ、線維状組織として抽出する制御ステップと、
を備えることを特徴とする線維状組織抽出方法。 A fibrous tissue extraction method for extracting a fibrous tissue using a diffusion weighted image captured by a magnetic resonance imaging apparatus,
Diagonalizing a diffusion tensor calculated at a point on the diffusion-weighted image to calculate a eigenvalue and a maximum eigenvector corresponding to the eigenvalue having the maximum absolute value;
A starting point setting step of setting a point on the diffusion weighted image as a starting point;
A starting point setting step for setting the set starting point as a starting point;
Candidate point setting for setting a plurality of points as candidate points, the direction from the set starting point being equal to or less than a predetermined angle with the angle formed by the direction of the maximum eigenvector at the starting point, and the distance from the starting point being within a predetermined range Steps,
A candidate point selection step of selecting candidate points having a diffusion anisotropy equal to or greater than a threshold value from the plurality of candidate points;
A curve generating step for generating a curve connecting the starting point and the candidate point for each of the plurality of candidate points such that a tangent vector at the starting point and the candidate point is in the direction of each maximum eigenvector;
A candidate point determining step for determining one candidate point and one curve connecting the starting point and the candidate point from among the plurality of candidate points based on the generated index of the curve;
A starting point update step of setting the determined one candidate point as a next starting point;
The candidate point setting step, the candidate point selection step, the curve generation step, the candidate point determination step, and the starting point update step are repeated until there are no candidate points to be selected by the candidate point selection step. A control step of connecting all the curves determined by the candidate point determination step and extracting as a fibrous tissue;
A fibrous tissue extraction method comprising:
前記開始点設定ステップは、前記開始点領域に含まれる複数の点から1つずつ開始点を設定し、
前記制御ステップは、前記開始点領域に含まれる複数の点すべてについて、前記線維状組織を抽出するように制御する、
ことを特徴とする請求項12に記載の線維状組織抽出方法。 A start point region setting step of setting a predetermined region on the diffusion weighted image as a start point region;
The start point setting step sets a start point one by one from a plurality of points included in the start point region,
The control step controls to extract the fibrous tissue for all of a plurality of points included in the start point region.
The fibrous tissue extraction method according to claim 12, wherein:
前記拡散強調画像上の点において算出される拡散テンソルを対角化し、固有値と、絶対値が最大の固有値に対応する最大固有ベクトルを算出する対角化演算ステップと、
前記拡散強調画像上の点を開始点に設定する開始点設定ステップと、
設定した前記開始点を起点に設定する起点設定ステップと、
設定した前記起点からの方向が前記起点における最大固有ベクトルの方向となす角と所定角以下であり、前記起点からの距離が所定の範囲内にある、複数の点を候補点として設定する候補点設定ステップと、
複数の前記候補点の中から拡散異方性が閾値以上となる候補点を選別する候補点選別ステップと、
前記起点と前記候補点における接線ベクトルが各々の最大固有ベクトルの方向となるように前記起点と前記候補点を結ぶ曲線を複数の前記候補点について各々生成する曲線生成ステップと、
生成された前記曲線の指標に基づき、複数の前記候補点の中から、1つの候補点と、前記起点と該候補点を結ぶ1つの曲線と、を決定する候補点決定ステップと、
決定された前記1つの候補点を次の起点に設定する起点更新ステップと、
前記候補点選別ステップにより選別される候補点が無くなるまで、前記候補点設定ステップと、前記候補点選別ステップと、前記曲線生成ステップと、前記候補点決定ステップと、前記起点更新ステップと、を繰り返し、候補点決定ステップにより決定された全ての曲線をつなげ、線維状組織として抽出する制御ステップと、
を備えることを特徴とする線維状組織抽出プログラム。 A fibrous tissue extraction program for extracting fibrous tissue using a diffusion weighted image captured by a magnetic resonance imaging apparatus,
Diagonalizing a diffusion tensor calculated at a point on the diffusion-weighted image to calculate a eigenvalue and a maximum eigenvector corresponding to the eigenvalue having the maximum absolute value;
A starting point setting step of setting a point on the diffusion weighted image as a starting point;
A starting point setting step for setting the set starting point as a starting point;
Candidate point setting for setting a plurality of points as candidate points, the direction from the set starting point being equal to or less than a predetermined angle with the angle formed by the direction of the maximum eigenvector at the starting point, and the distance from the starting point being within a predetermined range Steps,
A candidate point selection step of selecting candidate points having a diffusion anisotropy equal to or greater than a threshold value from the plurality of candidate points;
A curve generating step for generating a curve connecting the starting point and the candidate point for each of the plurality of candidate points such that a tangent vector at the starting point and the candidate point is in the direction of each maximum eigenvector;
A candidate point determining step for determining one candidate point and one curve connecting the starting point and the candidate point from among the plurality of candidate points based on the generated index of the curve;
A starting point update step of setting the determined one candidate point as a next starting point;
The candidate point setting step, the candidate point selection step, the curve generation step, the candidate point determination step, and the starting point update step are repeated until there are no candidate points to be selected by the candidate point selection step. A control step of connecting all the curves determined by the candidate point determination step and extracting as a fibrous tissue;
A fibrous tissue extraction program comprising:
前記開始点設定ステップは、前記開始点領域に含まれる複数の点から1つずつ開始点を設定し、
前記制御ステップは、前記開始点領域に含まれる複数の点すべてについて、前記線維状組織を抽出するように制御する、
ことを特徴とする請求項14に記載の線維状組織抽出プログラム。 A start point region setting step of setting a predetermined region on the diffusion weighted image as a start point region;
The start point setting step sets a start point one by one from a plurality of points included in the start point region,
The control step controls to extract the fibrous tissue for all of a plurality of points included in the start point region.
The fibrous tissue extraction program according to claim 14, wherein:
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