JP2018186828A - 抗原特異的t細胞の製造方法 - Google Patents
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Abstract
Description
(1)抗原特異性を有するヒトシングルポジティブT細胞の製造方法であって、
ヒトT細胞から誘導されたiPS細胞を、CD4/CD8ダブルネガティブ細胞に分化させる工程と、
前記CD4/CD8ダブルネガティブ細胞のT細胞受容体に刺激を与える工程と、
T細胞受容体に刺激を与えた前記CD4/CD8ダブルネガティブ細胞をシングルポジティブT細胞に分化させる工程とを含む、方法。
(2)シングルポジティブT細胞が、CD8シングルポジティブ細胞である、上記(1)に記載の方法。
(3)ヒトT細胞が、抗原特異性を有する、上記(1)または(2)に記載の方法。
(4)上記(1)〜(3)のいずれかに記載の方法により製造された、抗原特異性を有するヒトシングルポジティブT細胞。
(5)上記(4)に記載のヒトシングルポジティブT細胞を含んでなる医薬組成物。
本発明は、ヒトT細胞から誘導されたiPS細胞(以下、「T−iPS細胞」ともいう)を、CD4/CD8ダブルネガティブ(DN)細胞に分化させる工程と、前記CD4/CD8DN細胞のT細胞受容体に刺激を与える工程と、T細胞受容体に刺激を与えた前記CD4/CD8DN細胞をシングルポジティブT細胞、具体的には、CD8SP細胞及び/又はCD4SP細胞に分化させる工程とを含む、抗原特異性を有するヒトCD8SP細胞及び/又はCD4SP細胞の製造方法を提供する。
ヒトT細胞から誘導されたiPS細胞(すなわち、T−iPS細胞)をCD4/CD8DN細胞に分化させるためには、中胚葉系への分化を誘導し易くするという観点から、先ずはT−iPS細胞をフィーダー細胞(好ましくはストローマ細胞、より好ましくはヒトストローマ細胞)上にて、必ずしもサイトカインを含有しなくてもよいが、サイトカイン、血清(例えば、ウシ胎児血清(FBS))、インスリン、トランスフェリン、亜セレン酸ナトリウム、L−グルタミン、α−モノチオグリセロール、アスコルビン酸等を含有する培地中にて培養することが好ましい。用いるストローマ細胞としては、造血系への分化を誘導し易くするという観点から、放射線照射等の処理を施したOP9細胞、10T1/2細胞(C3H10T1/2細胞)であることが好ましい。T−iPS細胞を効率良くCD34造血前駆細胞に誘導させる観点では、培地に添加されるサイトカインは、VEGF、SCF、TPO、SCF及びFLT3L群から選択される少なくとも1のサイトカインであることが好ましく、VEGF、SCF及びTPO、又は、VEGF、SCF及びFLT3Lであることがより好ましい。また、培地としては、例えば、X−VIVO培地、イスコフ改変ダルベッコ培地(IMDM培地)、α−MEM、DMEMが挙げられるが、造血前駆細胞等を含有する袋状の構造物(「T−iPSサック」又は「ESサック」とも称する)の形成効率が高いという観点から、IMDM培地が好ましい。このT−iPS細胞の培養期間としては、T−iPSサックを形成するまでの期間であることが好ましく、T−iPS細胞の培養を開始してから好ましくは8〜14日間、より好ましくは10〜14日間である。培養環境としては、特に制限はないが、好ましくは、5%CO2、35〜38℃、より好ましくは37℃の条件である。また、T−iPSサックの形成効率が高く、T−iPSサックに含まれる血球細胞の数が多いという観点から、低酸素濃度条件(酸素濃度:例えば、5〜20%)下にて培養することがより好ましい。
後述の比較例1において示す通り、T−iPS細胞から再分化したT細胞において、RAG1及びRAG2の発現は、CD4/CD8DN段階よりもCD4/CD8DP段階の方がより強いことが、本発明者らによって初めて明らかとなった。さらに、T−iPS細胞を再分化させたT細胞のTCRA mRNAにおいて、DN段階よりもDP段階の方が、元のヒトT細胞とは異なるTCR遺伝子の再構成パターンを有する頻度が高いことが、本発明者らによって初めて明らかとなり、T−iPS細胞をT細胞に再分化させる過程、特にCD4/CD8DN段階からCD4/CD8DP段階に至る過程において、RAG1及びRAG2により、TCRA遺伝子の更なるアセンブル(受容体修正)が生じていることが強く示唆された。
後述の実施例において示す通り、前記工程にて、T−iPS細胞由来のCD4/CD8DN細胞を、該細胞表面上に発現しているTCRを介して刺激することにより、T−iPS細胞が、DN段階からDP段階、さらにはSP段階(例えば、CD8SP段階又はCD4SP段階)へと分化するにつれ生じ得るTCRA遺伝子の更なる再構成(受容体修正)を抑制できることが明らかになった。
本発明の方法によって製造されるヒトCD8SP細胞又はCD4SP細胞は、後述の実施例において示す通り、抗原特異的な免疫機能を有する。さらに、特にCD8SP細胞は、疲弊したT細胞(すなわち、長期生存能、自己複製能及び/又はエフェクター機能が著しく弱まったT細胞)のマーカーの一つであるPD−1は発現していないのに対し、セントラルメモリーT細胞の表現型を代表するCD27及びCD28と共にCCR7が発現しており、またテロメアも元となったT細胞と比べ長くなっており、高い自己複製能を有している。このことは、CD4SP細胞においても同様であると考えられる。従って、本発明の方法によって製造したヒトT細胞は、例えば、腫瘍、感染症(例えば、慢性感染症)、自己免疫不全等の疾患の治療又は予防において有用である。
HLAはA24型であるHIV−1感染患者のPBMCsからNef138−8(wt)特異的CTL株を、「Kawana−Tachikawa,A.ら、J Virol、2002年、76巻、11982〜11988ページ」の記載に沿って樹立した。
「Takayama,N.ら、J Exp Med、2010年、207巻、2817〜2830ページ」に記載の通り、最適化されたT細胞の培養条件によって、末梢血T細胞又はCTLクローンからヒトiPS細胞を樹立した。
10% ヒトAB血清、2mM L−グルタミン、100U/ml ペニシリン及び100ng/ml ストレプトマイシンを添加したRPMI−1640。
ヒトiPS培地の組成は下記の通りである。
20% KSR、2mM L−グルタミン、1%非必須アミノ酸、10μM 2−メルカプトエタノール及び5ng/ml b−FGFを添加したDMEM/F12FAM。
<アルカリフォスファターゼ染色及び免疫細胞化学>
アルカリフォスファターゼ活性は、アルカリフォスファターゼ基質キットII(Vector Laboratories社製)を用いて、その使用説明書に従って評価した。
SSEA−4(1:50,FAB1435P,R&D Systems社製)
Tra−1−60(1:100,MAB4360,Millipore社製)
Tra−1−81(1:100,MAB4381,Millipore社製)
HLA−A24(1:100,BIH0964,Veritas社製)
顕微鏡写真は、AxioオブザーバーZ1蛍光顕微鏡(Carl Zeiss社製)を用いて行った。
NOD−Scidマウスを用いた系におけるテラトーマ形成を通して、「Masaki,H.ら、Stem Cell Res、2007年、1巻、105〜115ページ」の記載に沿って、ヒトiPS細胞の多能性を評価した。
ゲノムDNAを、メチルイージーエクシード急速DNAバイサルファイト変換キット(MethylEasy Xceed Rapid DNA Bisulphite Modification Kit、Human Genetic Signatures社製)を用い、その使用説明書に従って処理した。
ES細胞、iPS細胞及びT細胞から、RNイージーマイクロキット(RNeasy micro kit、Qiagen社製)を用いて、トータルRNAを抽出した。次いで、トータルRNAを鋳型として、大容量cDNA逆転写キット(High Capacity cDNA Reverse Transcription Kit、Applied Biosystems社製)とランダム6塩基プライマーとを用いて、逆転写反応を行った。RT−PCRは「Takayama,N.ら、J Exp Med、2010年、207巻、2817〜2830ページ」に記載の通りに行った。分析に用いた、標的遺伝子及びPCRプライマーの配列(配列番号:9〜43)を表2に示す。
ゲノムDNAは、QIAamp DNAキット(Qiagen社製)を用いて、その使用説明書に従って、約5x106細胞から抽出した。
逆転写産物5’末端における乗り換え機構(switch mechanism at the 5’−end of the reverse transcript)に基づく方法(SMART法、「Du,G.ら、J Immunol Methods、2006年、308巻、19〜35ページ(2006)」 参照)にて、スーパースマートcDNA合成キット(Super SMART(TM)cDNA synthesis kit、Clontech Laboratories社製)を用いて、その使用説明書に従って、二重鎖cDNAを合成した。合成した二重鎖cDNAはアドバンテージ2PCRキット(BD Clontech社製)を用いて増幅し、増幅したcDNAから表5に示すプライマー(配列番号:128〜130)を用いてTCRA特異的増幅又はTCRB特異的増幅を行った。得られたPCR産物は、pGEM−T−Easyベクター(Promega社製)に挿入し、クローニングして、シークエンシングに供した。
細胞内のグランザイムBに染色するため、T細胞をα−CD3/28ビーズ及び10μg/ml ブレフェルジンA(BFA、Invitrogen社製)と共にインキュベートした。
ヒトES細胞、T−iPS細胞、再分化T細胞、末梢血T細胞及び末梢血NK細胞から、全RNA(Total RNA)をRNeasyマイクロキット(Qiagen社製)を用いて抽出した。
「Neuber,K.ら、Immunology、2003年、109巻、24〜31ページ」に記載の通り、DAKOテロメアPNAキット/FITC(DAKO社製)を用いて、テロメアの長さを測定した。
抗原発現細胞として、HLA−A24発現自己B−LCLsを用いて、「Kawana−Tachikawa,A.ら、J Virol、2002年、76巻、11982〜11988ページ」及び「Tsunetsugu−Yokota,Y.ら、J Virol、2003年、77巻、10250〜10259ページ」の記載に沿って、IFN−γを対象とするELISPOTアッセイ及び標準的な51Cr放出アッセイを行うことにより、T細胞の抗原特異的応答性を測定した。
本実施例における全てのデータは、平均値±標準偏差(mean±S.D.)にて表わされる。本実施例における全ての統計解析においては、エクセル(Microsoft社製)及びPrism(Graphpad Software社製)を用い、不対2テール(two−tailed)スチューデントのt検定を行い、P<0.05の値を有意とした。
<抗原特異的細胞傷害性T細胞クローンから多能性細胞への再プログラミング>
T細胞由来iPS細胞を樹立するため、本発明者らは健常被験者から提供された末梢血単核球細胞(PBMCs)からCD3+T細胞を磁気的に単離した。次いで、単離したCD3+T細胞を、10ng/ml IL−2存在下、前記CD3+T細胞量の3倍量の抗ヒトCD3抗体及び抗ヒトCD28抗体でコートしたマイクロビーズ(α−CD3/CD28ビーズ)にて刺激した。そして、このように活性化したCD3+T細胞に、OCT4、SOX2、KLF4及びc−MYCを各々コードするレトロウィルスを導入した(図2 参照)。
TCRαβ遺伝子の再構成は、胸腺における正常なαβT細胞の発達過程に関与していることが知られている。そこで次に、前記にて樹立したT−iPS細胞はαβT細胞に由来しているかどうかを、かかる再構成に基づき遡及的に確認した。すなわち、TCRB遺伝子アセンブルを解析するための多重PCRプライマーを、BIOMED−2コンソーシアム(「van Dongen,J.J.ら、Leukemia、2003年、17巻、2257〜2317ページ」 参照)により設計した。また、TCRA遺伝子アセンブルを検出するためのプライマーは独自に設計した(図1 参照)。そして、かかるプライマーを用いて、PCRを行うことにより、前記T−iPS細胞におけるTCRαβ遺伝子の再構成を検出した。得られた結果を図14〜17に示す。
<T−iPS細胞からT細胞への再分化>
次に、前記T−iPS細胞の造血分化能を調べるため、特異的なインビトロ分化プロトコールに従って、前記T−iPS細胞を中胚葉に由来する種類の細胞、特に造血幹/前駆細胞へと再分化させた(国際公開第2011/096482号、「Vodyanik,M.A.ら、Blood、2005年、105巻、617〜626ページ」及び「Takayama,N.ら、Blood、2008年、111巻、5298〜5306ページ」 参照)。
15%ウシ胎児血清(FBS)と、10μg/mL ヒトインスリン、5.5μg/mLヒトトランスフェリン及び5ng/mL亜セレン酸ナトリウムからなるカクテルと、2mM L−グルタミンと、0.45mM α−モノチオグリセロールと、50μg/mLアスコルビン酸とを添加したIMDM。
15% FBS、2mM L−グルタミン、100U/ml ペニシリン及び100ng/ml ストレプトマイシンを添加したαMEM。
<本発明の方法による、T−iPS細胞からCD8シングルポジティブ細胞への再分化>
比較例1において示した通り、T−iPS細胞を再分化させたT細胞のTCRAmRNAにおいて、DN段階よりもDP段階の方が、元のヒトT細胞とは異なるTCR遺伝子の再構成パターンを有する頻度が高いことが明らかになった。また、T−iPS細胞を再分化させたT細胞において、RAG1及びRAG2の発現は、DN段階よりもDP段階の方がより強いことが明らかになった。
<本発明のCD8SP細胞の抗原特異性>
実施例1において得られた再分化CD8SP細胞は、元となったH25−4のTCR遺伝子と同じ再構成パターンを有することにより、H25−4が特異性を示す抗原ペプチドを認識できるかどうかを調べた。すなわち、実施例1において得られた再分化T細胞全部と、A24/Nef−138−8(wt)テトラマーとを混合し、「Kawana−Tachikawa,A.ら、J Virol、2002年、76巻、11982〜11988ページ」の記載に沿って、フローサイトメトリー分析を行った。なお、「A24/Nef−138−8(wt)テトラマー」は、H25−4が認識する抗原(Nef−138−8(wt))及びHLA(A24)を4量体化させたものである。得られた結果を図26に示す。
図31及び32に示した結果から明らかな通り、再分化CD8SP細胞の遺伝子発現プロファイルは、H25−4オリジナルT細胞クローンのそれとは類似していることが明らかになった。しかし、相関係数並びにクラスター解析によって、再分化CD8SP細胞とNK細胞との相関は見出せなかった。従って、T−iPS細胞は、元になったT細胞と同じ抗原特異性を示すCD8+T細胞に再分化できることが明らかになった。
<本発明のCD8SP細胞の高い増殖性>
実施例1において、6cmディッシュ上でのT−iPS細胞とOP9−DL1との共培養から得られたT系譜細胞の数は、105個より少なかった。しかし、図には示さないが、第一の刺激によって108個以上の細胞数まで増幅させることができた。そこで、本発明の方法によって得られたCD8SP細胞の増殖性を調べるため、reT−1、reT−2.2及びreT−3を、5μg/ml PHA、10ng/mL IL−7及び10ng/mL IL−15にて刺激し、その後2週間における各細胞の増加率(増幅率)を測定した。得られた結果を図33に示す。
<本発明のCD8SP細胞の抗原特異的な機能>
CTLsの細胞傷害の主な機構の一つに、TCRシグナルと共に生じる細胞溶解性分子の分泌がある。そこで、本発明の方法によって得られたCD8SP細胞(reT−2.2)においても、前記CD8SP細胞量の3倍量のα−CD3/CD28ビーズによってTCRを刺激することにより、細胞溶解性分子が分泌されるかどうかを細胞内染色により調べた。得られた結果を図36に示す。
<本発明の方法による、T−iPS細胞からCD4シングルポジティブ細胞への再分化>
本実施例では、DN段階からDP段階への移行が完全に終了する前に、再分化T系譜細胞のTCRを刺激する手法を用いて、T−iPS細胞由来のT系譜細胞から成熟CD4SP細胞を製造することを試みた。
<223> Nef−138−8(野生型)
配列番号2
<223> HIV−1エンベロープ由来ペプチド
配列番号3
<223> Gag−28−9(野生型)
配列番号4
<223> 人工的に合成されたポリペプチドの配列(Nef−138−8(2F))
配列番号5〜130
<223> 人工的に合成されたプライマーの配列
配列番号131
<223> TRAV8−3*01 TRAJ10*01
配列番号132
<223> TRAV13−1*01 TRAJ29*01
配列番号133
<223> TRAV38−2/DV8*01 TRAJ31*01
配列番号134
<223> TRAV12−1*01 TRAJ7*01
配列番号135
<223> TRAV21*02 TRAJ16*01
配列番号136
<223> TRAV1−2*01 TRAJ6*01
配列番号137
<223> TRAV1−2*01 TRAJ7*01
配列番号138
<223> TRAV1−2*01 TRAJ10*01
配列番号139
<223> TRAV1−2*01 TRAJ16*01
配列番号140
<223> TRAV8−1*01 TRAJ6*01
配列番号141
<223> TRAV12−1*01 TRAJ6*01
配列番号142
<223> TRAV12−1*01 TRAJ9*01
配列番号143
<223> TRAV6*01 TRAJ13*01
配列番号144
<223> TRAV12−1*01 TRAJ27*01
配列番号145
<223> TRBV7−9*01 TRBD1*01 TRBJ2−5*01
配列番号146
<223> 生殖系 TRBD1*01 TRBJ2−7*01
配列番号147
<223> TRBV29−1*02 TRBD1*01 TRBJ2−2*01
配列番号148
<223> 生殖系 TRBD2*01/*02 TRBJ2−7*01/*02
配列番号149
<223> TRBV29−1*01 TRBD1*01 TRBJ2−2*01
Claims (5)
- 抗原特異性を有するヒトシングルポジティブT細胞の製造方法であって、
ヒトT細胞から誘導されたiPS細胞を、CD4/CD8ダブルネガティブ細胞に分化させる工程と、
前記CD4/CD8ダブルネガティブ細胞のT細胞受容体に刺激を与える工程と、
T細胞受容体に刺激を与えた前記CD4/CD8ダブルネガティブ細胞をシングルポジティブT細胞に分化させる工程とを含む、方法。 - シングルポジティブT細胞が、CD8シングルポジティブ細胞である、請求項1に記載の方法。
- ヒトT細胞が、抗原特異性を有する、請求項1または2に記載の方法。
- 請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法により製造された、抗原特異性を有するヒトシングルポジティブT細胞。
- 請求項4に記載のヒトシングルポジティブT細胞を含んでなる医薬組成物。
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