JP2018184399A - 低減されたエフェクター機能及び延長された半減期を有する分子、組成物、並びにそれらの使用 - Google Patents
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Abstract
【課題】親ポリペプチドと比較して、低減又は排除されたエフェクター機能、並びに増加した安定性及び血漿半減期を示す、変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドの提供。【解決手段】特定のアミノ酸配列に変異を有する、野生型Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、低減したFc媒介エフェクター機能を有する、変異型IgG Fcドメインを含む単離されたポリペプチド、ポリペプチドと治療部分とを含むコンジュゲート、及びポリペプチドを含む医薬組成物。【選択図】図1
Description
本開示は、望ましい安定性を維持しながら、低減されたエフェクター機能及び延長された半減期をもたらす突然変異を含む変異型IgG Fcを含む分子、特に、限定するものではないが、免疫グロブリン(例えば、抗体)などのポリペプチドに関する。本開示はまた、このようなポリペプチド、発現ベクター、宿主ベクター、宿主細胞をコードする核酸、並びに、治療及び診断組成物、製剤及びキットなど、これらを作製及び使用する方法にも関する。
抗体は、可変(Fv)領域及び定常(Fc)領域と呼ばれる2つの異なる領域から構成される。抗体のFc領域は、Fc受容体及びC1qなどのいくつかのリガンドと相互作用して、エフェクター機能と呼ばれる一連の機能的能力を付与する。Fc受容体は、抗体と免疫系の細胞アーム(cellular arm)との間の連絡を媒介する(Raghavan et al.,Annu.Rev.Cell.Dev.Biol.12:181−220(1996);Ravetch et al.,Annu.Rev.Immunol.19:275−290,(2001))。
Fc/FcγR複合体の形成は、典型的に、これらの細胞内にシグナル伝達イベント、並びにこれに続く免疫応答、例えば、炎症メディエータの放出、B細胞活性化、エンドサイトーシス、食作用、及び細胞傷害性攻撃を引き起こす。FcγRsを発現する非特異的細胞傷害性細胞が、標的細胞に結合した抗体を認識した後、標的細胞の溶解を引き起こす細胞媒介反応は、抗体依存性細胞傷害(ADCC)と呼ばれる(Ghetie et al.,Annu.Rev.Immunol.18:739−766(2000);Ravetch et al.,Annu.Rev.Immunol.19:275−290(2001))。
ヒトFcγRは、3つの異なるクラス:FcγRI(CD64)、FcγRII(CD32)及びFcγRIII(CD16)に分けられる。IgG分子は、FcγRに対する差異的アイソタイプ特異性を呈示する。IgG3分子は、全てのFcγRアイソフォームに強力に結合する。血液において最も一般的なアイソフォームであるIgG1は、FcγRIIA/βアイソフォームに対する親和性は低いものの、全てのFcγRに結合する。IgG4は、FcγRIに対する中程度の結合物質であり、FcγRIIBに対する弱い結合物質である。最後に、IgG2は、FcγRIIAの1つの対立遺伝子形態(FcγRIIA−H131に弱く結合するにすぎない(Siberil et al.,J.Immunol.Lett.106:111−118(2006))。全てのFcγRへの結合に直接関与しているものとして、CH2領域のN末端部分のアミノ酸残基(234〜238)の短い連続区間。また、残基268、297、327及び329も、FcγRのサブセットとの結合に影響を与えることができ、CH2及びCH3領域に位置する複数の残基も、FcγR結合に寄与している(Canfield et al.,J.Exp.Med.173:1483−91(1991),Chappel et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 888:9036−40(1991),Gergely et al.FASEB J.4:3275−83(1990))。
分子のFc領域の重なり部位は、補体により媒介される細胞非依存性細胞傷害性機能の活性化を制御する。従って、補体タンパク質C1qとのFc結合は、補体依存性細胞傷害(CDC)と呼ばれるプロセスを媒介する(Ward et al.,Ther.Immunol.2:77−94(1995))。
場合によっては、エフェクター機能を低減又は排除することが有利である。こうした場合、補体又はエフェクター細胞をわずかしかリクルートしない抗体又はFcドメイン含有フラグメントの使用が有益である(例えば、以下の文献を参照のこと:Wu et al.,Cell Immunol.200:16−26(2000);Shields et al.,J.Biol.Chem.276:6591−6604(2001);米国特許第6,194,551号明細書;米国特許第5,885,573号明細書;PCT公開国際公開第04/029207号パンフレット;及び米国特許第2011/0059078号明細書)。
特定のサブクラスのヒト免疫グロブリンは、補体又はエフェクター細胞、例えば、IgG2及びIgG4をわずかにしかリクルートしないが、全てのエフェクター機能が欠如した天然の免疫グロブリンは知られていない。従って、別の手法は、エフェクター機能を担うFc領域の残基を改変するか、又は突然変異させることである。例えば、以下の文献を参照されたい:PCT公開:国際公開第2006076594号パンフレット;国際公開第199958572号パンフレット;国際公開第2006047350号パンフレット、及び国際公開第2006053301号パンフレット;米国特許第2006−0134709号明細書;米国特許第5,624、821号明細書;米国特許第6,194,551号明細書;及び第5,885,573号明細書;Armour et al.,Eur.J.Immunol.29:2613−2624(1999);Reddy et al.,J.Immunol.164:1925−1933(2000);Xu et al.,Cell Immunol.200:16−26(2000);Shields et al.,J.Biol.Chem.276:6591−6604(2001)。
エフェクター機能の低減又は排除について考慮すべきことは、他の重要な抗体特性が攪乱されないことである。従って、Fc変異体の改変は、抗体の安定性、溶解性、及び構造的統合性、並びにFcRnやタンパク質A及びGなどの他の重要なFcリガンドと相互作用する能力を維持しながら、FcγR及び/又はC1qとの結合のみを除去するように実施すべきである。
Raghavan et al.,Annu.Rev.Cell.Dev.Biol.12:181−220(1996)
Ravetch et al.,Annu.Rev.Immunol.19:275−290,(2001))
Ghetie et al.,Annu.Rev.Immunol.18:739−766(2000);
Siberil et al.,J.Immunol.Lett.106:111−118(2006)
Canfield et al.,J.Exp.Med.173:1483−91(1991),
Chappel et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 888:9036−40(1991),
Gergely et al.FASEB J.4:3275−83(1990))
Ward et al.,Ther.Immunol.2:77−94(1995))。
Wu et al.,Cell Immunol.200:16−26(2000)
Shields et al.,J.Biol.Chem.276:6591−6604(2001)
Armour et al.,Eur.J.Immunol.29:2613−2624(1999)
Reddy et al.,J.Immunol.164:1925−1933(2000)
Xu et al.,Cell Immunol.200:16−26(2000)
本開示は、安定性、例えば、熱安定性を維持しながら、要望される特性、例えば、低減したエフェクター機能、及び向上した血漿半減期をもたらすアミノ酸置換を有する変異型Fcドメインを含む組換えポリペプチドに関する。ある態様において、本開示のポリペプチドは、変異型IgG Fcドメインを含み、この変異型IgG Fcドメインは、(a)234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;(b)235位にアラニン(A)、アスパラギン(N)、フェニルアラニン(F)、グルタミン(Q)、若しくはバリン(V)アミノ酸;(c)322位にアラニン(A)、アスパラギン酸(D)、グルタミン酸(E)、ヒスチジン(H)、アスパラギン(N)、若しくはグルタミン(Q)アミノ酸;又は331位にアラニン(A)若しくはグリシン(G)アミノ酸を含み(有し)、ここで、アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う。
別の態様において、ポリペプチドは、234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;235位にグルタミン(Q)アミノ酸;及び322位にグルタミン(Q)アミノ酸を含み、ここで、アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う。ある態様では、ポリペプチドは、234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;235位にグルタミン(Q)アミノ酸;及び331位にグリシン(G)アミノ酸を含み、ここで、アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う。ある態様では、ポリペプチドは、234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;235位にアラニン(A)アミノ酸;及び322位にグルタミン(Q)アミノ酸を含み、ここで、アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う。
ある態様において、ポリペプチドはさらに、(a)252位にチロシン(Y)アミノ酸、若しくは252位にセリン(S)アミノ酸、若しくは252位にトリプトファン(W)アミノ酸、若しくは252位にトレオニン(T)アミノ酸;及び/又は(b)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び/又は(c)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸、若しくは256位にセリン(S)アミノ酸、若しくは256位にアルギニン(R)アミノ酸、若しくは256位にグルタミン(Q)アミノ酸、若しくは256位にアスパラギン酸(D)アミノ酸を含み、ここで、アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う。
別の態様において、ポリペプチドはさらに、(a)252位にチロシン(Y)アミノ酸;及び/又は(b)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び/又は(c)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸を含み、ここで、アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う。別の態様では、ポリペプチドは、(a)252位にチロシン(Y)アミノ酸、若しくは252位にセリン(S)アミノ酸、若しくは252位にトリプトファン(W)アミノ酸、若しくは252位にトレオニン(T)アミノ酸;及び(b)254位にトレオニン(T)アミノ酸を含み、ここで、アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う。ある態様では、ポリペプチドは、(a)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び(b)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸、若しくは256位にセリン(S)アミノ酸、若しくは256位にアルギニン(R)アミノ酸、若しくは256位にグルタミン(Q)アミノ酸、若しくは256位にアスパラギン酸(D)アミノ酸を含み、ここで、アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う。
ある態様において、ポリペプチドはさらに(a)252位にチロシン(Y)アミノ酸、若しくは252位にセリン(S)アミノ酸、若しくは252位にトリプトファン(W)アミノ酸、若しくは252位にトレオニン(T)アミノ酸;並びに(b)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸、若しくは256位にセリン(S)アミノ酸、若しくは256位にアルギニン(R)アミノ酸、若しくは256位にグルタミン(Q)アミノ酸、若しくは256位にアスパラギン酸(D)アミノ酸を含み、ここで、アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う。
ある態様において、ポリペプチドはさらに(a)252位にチロシン(Y)アミノ酸、及び254位にトレオニン(T)アミノ酸;又は、(b)254位にトレオニン(T)アミノ酸及び256位にグルタミン酸(E)アミノ酸;(c)252位にチロシン(Y)アミノ酸及び256位にグルタミン酸(E)アミノ酸を含み、ここで、アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う。ある態様では、ポリペプチドは、252位にチロシン(Y)アミノ酸、254位にトレオニン(T)アミノ酸、及び256位にグルタミン酸(E)アミノ酸を含み、ここで、アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う。
一態様において、ポリペプチドは、(a)234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;(b)235位にグルタミン(Q)アミノ酸;(c)322位にグルタミン(Q)アミノ酸;(d)252位にチロシン(Y)アミノ酸;(e)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び(f)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸を含み、ここで、アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う。一態様において、ポリペプチドは、(a)234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;(b)235位にグルタミン(Q)アミノ酸;(c)331位にグリシン(G)アミノ酸;(d)252位にチロシン(Y)アミノ酸;(e)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び(f)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸を含み、ここで、アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う。別の態様では、ポリペプチドは、(a)234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;(b)235位にアラニン(A)アミノ酸;(c)322位にグルタミン(Q)アミノ酸;(d)252位にチロシン(Y)アミノ酸;(e)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び(f)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸を含み、ここで、アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う。
ある態様において、ポリペプチドは、野生型Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、向上した薬物動態(PK)特性を有する。ある態様では、PK特性は半減期である。特定の態様では、ポリペプチドは、野生型Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、向上したFcRn結合を有する。ある態様では、IgG Fcドメインは非ヒト由来である。別の態様では、IgG Fcドメインはヒト由来である。具体的態様では、非ヒトIgG Fcドメインは、げっ歯類、ロバ、ヒツジ、ウサギ、ヤギ、モルモット、ラクダ、ウマ又はニワトリに由来する。
ある態様において、IgG Fcドメインは、ヒト免疫グロブリンGクラス1(IgG1)Fcドメイン、ヒト免疫グロブリンGクラス2(IgG2)Fcドメイン、ヒト免疫グロブリンGクラス3(IgG3)Fcドメイン、及びヒト免疫グロブリンGクラス4(IgG4)Fcドメインからなる群から選択される。ある態様では、ポリペプチドは、さらに抗原結合ドメインを含む。ある態様では、抗原結合ドメインは、モノクローナル抗体又はその抗原結合フラグメントに由来する。ある態様では、抗原結合ドメインは、ヒト抗体、ヒト化抗体、又はキメラ抗体に由来する。ある態様では、抗原結合ドメインは、(a)一本鎖抗体;(b)ダイアボディ;(c)抗体のポリペプチド鎖;(d)F(ab’)2フラグメント;又は(e)F(ab)フラグメントを含む。
ある態様において、ポリペプチドは、野生型Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、低減したFc媒介エフェクター機能を有する。ある態様では、エフェクター機能は、抗体依存性細胞媒介細胞傷害(ADCC)である。他の態様では、エフェクター機能は、補体依存性細胞傷害(CDC)である。ある態様では、ポリペプチドは、野生型Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、Fcγ受容体(FcγR)に対し低い親和性を有する。ある態様では、FcγRは、ヒトFcγRである。ある態様では、FcγRは、FcγRI、FcγRII、及びFcγRIIIからなる群から選択される。ある態様では、FcγRIは、FcγRIαである。別の態様では、FcγRIIは、FcγRIIa又はFcγRIIbである。また別の態様では、FcγRIIIは、FcγRIII(158V)又はFcγRIII(158F)である。
ある態様において、ポリペプチドは、野生型Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して向上した親和性で、FcRnと結合する。ある態様では、ポリペプチドは、pH7.4よりpH6.0で、FcRnに対する高い親和性を有する。ある態様では、ポリペプチドは、野生型Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して低減した親和性で、C1qと結合する。
ある態様において、ポリペプチドは、FES−YTE IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、熱安定性の増加を呈示する。ある態様では、熱安定性の増加は、示差走査熱量測定(DSC)により測定される。特定の態様では、熱安定性の増加は、少なくとも4℃である。ある態様では、熱安定性は、示差走査型蛍光定量法(DSF)により測定する。具体的態様では、DSF蛍光プローブは、Sypro Orangeである。ある態様では、熱安定性の増加は少なくとも5℃である。
ある態様において、ポリペプチドは、FES−YTE IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、ポリエチレングリコール(PEG)沈殿アッセイを用いて測定される見かけ溶解度の増加を呈示する。ある態様では、ポリペプチドは、FES−YTE IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、加速安定性アッセイを用いて測定される安定性の増加を呈示する。ある態様では、加速安定性アッセイは、(i)長期間にわたるポリペプチドのインキュベーション、及び(ii)高温でのインキュベーションを含む。ある態様では、加速安定性アッセイは、高濃度でのインキュベーションを含む。ある態様では、長期間は少なくとも1ヵ月である。特定の態様では、高濃度は少なくとも25mg/mlである。特定の態様では、高温は少なくとも40℃である。ある態様では、加速安定性アッセイは、高機能サイズ排除クロマトグラフィー(HPSEC)又は動的光散乱法(DLS)を用いて実施される。
本開示は、本開示のポリペプチドをコードする配列を含む、単離された核酸も提供する。また、本開示のポリペプチドをコードする配列を含む核酸を含有する組成物、発現ベクター、及び宿主細胞も提供される。宿主細胞は、本開示のポリペプチドをコードする配列を含む単離された核酸、本開示のポリペプチドをコードする配列を含む核酸を含有する組成物、又は本開示のポリペプチドをコードする配列を含む核酸を含有する発現ベクターを含むことができる。
本開示は、(a)本開示のポリペプチドをコードする配列を含む核酸を含有する宿主細胞を培養するステップ;及び(b)ポリペプチドを単離するステップを含む、本開示のポリペプチドを作製する方法も提供する。本開示はまた、本開示のポリペプチドと担体を含む組成物も提供する。
本開示は、本開示のポリペプチドを含む診断薬も提供する。ある態様では、ポリペプチドを標識する。本開示はまた、本開示のポリペプチド及び治療部分を含むコンジュゲートも提供する。また本開示は、(a)本開示のポリペプチド、(b)本開示のポリペプチドをコードする配列を含む、単離された核酸、(c)本開示のポリペプチドをコードする配列を有する核酸を含む組成物、発現ベクター、若しくは宿主細胞、(d)本開示のポリペプチドと担体を含む組成物、(e)ある態様では、標識することができる、本開示のポリペプチドを含む診断薬、又は(f)本開示のポリペプチド及び治療部分を含むコンジュゲートを含むキットも提供する。
本開示は、哺乳動物を治療する方法も提供し、この方法は、有効量の(a)本開示のポリペプチド、(b)本開示のポリペプチドをコードする配列を含む、単離された核酸、(c)本開示のポリペプチドをコードする配列を有する核酸を含む組成物、発現ベクター、若しくは宿主細胞、(d)本開示のポリペプチドと担体を含む組成物、(e)ある態様では、標識することができる本開示のポリペプチドを含む診断薬、又は(f)本開示のポリペプチド及び治療部分を含むコンジュゲートを、治療が必要な哺乳動物に投与することを含む。
本開示は、Fcドメインを含む親ポリペプチドのFc誘導性エフェクター機能を低減する方法も提供し、この方法は、(a)Fcドメインにおける234位のアミノ酸をフェニルアラニン(F)で置換するステップ;(b)Fcドメインにおける235位のアミノ酸をアラニン(A)、アスパラギン(N)、フェニルアラニン(F)、グルタミン(Q)、若しくはバリン(V)で置換するステップ;(c)Fcドメインの322位のアミノ酸をアラニン(A)、アスパラギン酸(D)、グルタミン酸(E)、ヒスチジン(H)、アスパラギン(N)、若しくはグルタミン(Q)で置換するステップ;又はFcドメインの331位のアミノ酸をアラニン(A)若しくはグリシン(G)で置換するステップを含み、ここで、アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う。上記方法のある態様において、親ポリペプチドのFcドメインは、(a)252位にチロシン(Y)アミノ酸、若しくは252位にセリン(S)アミノ酸、若しくは252位にトリプトファン(W)アミノ酸、若しくは252位にトレオニン(T)アミノ酸;及び/又は(b)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び/又は(c)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸、若しくは256位にセリン(S)アミノ酸、若しくは256位にアルギニン(R)アミノ酸、若しくは256位にグルタミン(Q)アミノ酸、若しくは256位にアスパラギン酸(D)アミノ酸を含み、ここで、アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う。上記方法の別の態様では、親ポリペプチドのFcドメインは、(a)252位にチロシン(Y);及び/又は(b)254位にトレオニン(T);及び/又は(c)256位にグルタミン酸(E)を含み;ここで、アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う。
また、Fcドメインを含む親ポリペプチドのFc誘導性エフェクター機能を低減すると共に、その半減期を増加させる方法も提供され、この方法は、(a)Fcドメインにおける234位のアミノ酸をフェニルアラニン(F)で置換するステップ;(b)Fcドメインにおける235位のアミノ酸をアラニン(A)、アスパラギン(N)、フェニルアラニン(F)、グルタミン(Q)、若しくはバリン(V)で置換するステップ;並びに(c)Fcドメインの322位のアミノ酸をアラニン(A)、アスパラギン酸(D)、グルタミン酸(E)、ヒスチジン(H)、アスパラギン(N)、若しくはグルタミン(Q)で置換するステップ;又はFcドメインの331位のアミノ酸をアラニン(A)若しくはグリシン(G)で置換するステップ;並びに(d)252位のアミノ酸をチロシン(Y)若しくはセリン(S)若しくはトリプトファン(W)若しくはトレオニン(T)で置換するステップを含み;ここで、Fcドメインのアミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う。上記方法のある態様において、252位のアミノ酸をチロシン(Y)で置換するが、ここで、アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う。上記方法のある態様において、(a)254位のアミノ酸をトレオニン(T)で置換することができ;及び(b)256位のアミノ酸をグルタミン酸(E)若しくはセリン(S)、若しくはアルギニン(R)、若しくはグルタミン(Q)で置換することができ、ここで、Fcドメインのアミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う。上記方法の別の態様では、256位のアミノ酸をグルタミン酸(E)で置換するが、ここで、アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う。上記方法のある態様において、234位のアミノ酸をフェニルアラニン(F)で置換し;235位のアミノ酸をグルタミン(Q)で置換し;322位のアミノ酸をグルタミン(Q)で置換するが、ここで、アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う。ある態様では、234位のアミノ酸をフェニルアラニン(F)で置換し;235位のアミノ酸をグルタミン(Q)で置換し;331位のアミノ酸をグリシン(G)で置換するが、ここで、アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う。上記方法のある態様では、234位のアミノ酸をフェニルアラニン(F)で置換し;235位のアミノ酸をアラニン(A)で置換し;322位のアミノ酸をグルタミン(Q)で置換するが、ここで、アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う。上記方法の別の態様では、エフェクター機能は、抗体依存性細胞媒介細胞傷害(ADCC)である。上記方法のある態様では、エフェクター機能は、補体依存性細胞傷害(CDC)である。上記方法の別の態様では、ポリペプチドは、FES−YTE IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、熱安定性の増加を呈示する。上記方法のある態様において、熱安定性は、示差走査熱量測定(DSC)により測定する。上記方法のある態様において、熱安定性の増加は、少なくとも4℃である。上記方法の特定の態様において、熱安定性は、DSF蛍光プローブを用いた示差走査蛍光定量法(DSF)により測定する。上記方法のある態様では、DSF蛍光プローブは、Sypro Orangeである。上記方法のある態様では、熱安定性の増加は少なくとも5℃である。上記方法のある態様において、ポリペプチドは、FES−YTE IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、ポリエチレングリコール(PEG)沈殿アッセイを用いて測定される見かけ溶解度の増加を呈示する。上記方法の別の態様では、ポリペプチドは、FES−YTE IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、加速安定性アッセイを用いて測定される安定性の増加を呈示する。上記方法のある態様では、加速安定性アッセイは、(i)長期間にわたるポリペプチドのインキュベーション、及び(ii)高温でのインキュベーションを含む。上記方法のある態様では、加速安定性アッセイは、高濃度でのインキュベーションを含む。上記方法のある態様では、長期間は、少なくとも1ヵ月である。上記方法のある態様では、高濃度は、少なくとも25mg/mlである。上記方法の特定の態様では、高温は、少なくとも40℃である。
本開示は、安定性、例えば、熱安定性を維持しながら、所望の特性、例えば、低減したエフェクター機能、及び向上した血漿半減期をもたらすアミノ酸置換を有する変異型Fcドメインを含む組換えポリペプチドに関する。本開示は、特に、野生型IgGに対して、1つ又は複数のアミノ酸修飾を含む、IgG Fcドメイン(例えば、ヒトIgG Fcドメイン)、又はFcRn(好ましくは、Fc若しくはヒンジ−Fcドメイン)に結合するそのフラグメントを含むポリペプチド、より具体的には免疫グロブリンに関し、ここで、このような修飾は、エフェクター機能を低減又は除去する。
ある態様では、本開示は、特に、ヒト又はヒト化IgG、並びにヒトIgG FcドメインのFcRn結合部分を含む他の生体活性分子の修飾に関し、これは、治療、予防及び診断に特定の用途を有する。ある態様では、ポリペプチドは、エフェクター機能を除去する修飾、並びにポリペプチドの血漿半減期を増大する修飾を含む、IgG Fcドメイン、又はFcRn(好ましくは、Fc若しくはヒンジ−Fcドメイン)に結合するそのフラグメントを含む。
定義
「1つの(a)」又は「1つの(an)」の実体という用語は、1つ又は複数の実体を指し;例えば、「1つのポリペプチド配列」は、1つ又は複数のポリペプチド配列を表すと理解される。このように、「1つの(a)(又は1つの(an))」、「1つ又は複数の」、及び「少なくとも1つの」という用語は、本明細書において置換え可能に用いることができる。さらに、本明細書で用いる「及び/又は」は、2つの明示した特徴又は構成要素の各々のいずれか若しくは両方の具体的開示として理解すべきである。従って、本明細書において「A及び/又はB」というフレーズで用いられる場合、用語「及び/又は」は、「A及びB」、「A又はB」、「A」(単独)、及び「B」(単独)を含むことが意図される。同様に、「A、B、及び/又はC」のようなフレーズで用いられる場合、用語「及び/又は」は、以下のケースの各々を包含することが意図される:A、B、及びC;A、B、又はC;A又はB;B又はC;A及びC;A及びB;B及びC;A(単独);B(単独);及びC(単独)。
定義
「1つの(a)」又は「1つの(an)」の実体という用語は、1つ又は複数の実体を指し;例えば、「1つのポリペプチド配列」は、1つ又は複数のポリペプチド配列を表すと理解される。このように、「1つの(a)(又は1つの(an))」、「1つ又は複数の」、及び「少なくとも1つの」という用語は、本明細書において置換え可能に用いることができる。さらに、本明細書で用いる「及び/又は」は、2つの明示した特徴又は構成要素の各々のいずれか若しくは両方の具体的開示として理解すべきである。従って、本明細書において「A及び/又はB」というフレーズで用いられる場合、用語「及び/又は」は、「A及びB」、「A又はB」、「A」(単独)、及び「B」(単独)を含むことが意図される。同様に、「A、B、及び/又はC」のようなフレーズで用いられる場合、用語「及び/又は」は、以下のケースの各々を包含することが意図される:A、B、及びC;A、B、又はC;A又はB;B又はC;A及びC;A及びB;B及びC;A(単独);B(単独);及びC(単独)。
特に定義しない限り、本明細書で用いる全ての技術及び科学用語は、本開示が関連する分野の当業者により一般に理解されるものと同じ意味を有する。例えば、Concise Dictionary of Biomedicine and Molecular Biology,Juo,Pei−Show,2nd ed.,2002,CRC Press;The Dictionary of Cell and Molecular Biology,3rd ed.,1999,Academic Press;及びOxford Dictionary Of Biochemistry And Molecular Biology,Revised,2000,Oxford University Pressは、当業者に、本開示に用いられる用語の多くについての一般的辞書を提供する。
単位、接頭辞、及び符号は、Systeme International de Unites(SI)で認められる形態で表示する。数値範囲は、範囲を示す数値も含まれる。特に記載のない限り、アミノ酸配列は、アミノからカルボキシ配向で、左から右へと表記する。本明細書に記載する見出しは、様々な態様を限定するものではなく、これらの態様は、本明細書全体を参照することにより、表現され得る。従って、すぐ下に定義する用語は、本明細書全体を参照することにより、さらに詳細に定義される。
本明細書において「含む」という表現で態様が記載される場合には、「〜からなる」及び/又は「ほぼ〜からなる」という用語で記載される他の類似した態様も提供されることは理解されよう。
アミノ酸は、その一般に公知の3文字記号か、又はIUPAC−IUB Biochemical Nomenclature Commissionにより推奨される1文字記号のいずれかにより、本明細書中で記述される。ヌクレオチドも同様に、一般に受け入れられた1文字コードにより記述される。
本明細書で用いる「ポリペプチド」という用語は、アミド結合(ペプチド結合としても知られる)により線状に連結したモノマー(アミノ酸)から構成される分子を指す。用語「ポリペプチド」は、2つ以上のアミノ酸のいずれかの鎖又は複数の鎖を指し、特定の長さの産物を指すわけではない。本明細書で用いる「タンパク質」は、1つ又は複数のポリペプチドからなる分子を含むことが意図され、ある態様では、アミド結合以外の結合により結合することができる。他方で、タンパク質は、単一のポリペプチド鎖であってもよい。後者の場合、単一ポリペプチド鎖は、ある態様では、互いに融合してタンパク質を形成する2つ以上のポリペプチドサブユニットを含んでもよい。「ポリペプチド」及び「タンパク質」という用語はまた、限定するわけではないが、グリコシル化、アセチル化、リン酸化、アミド化、公知の保護/遮断基による誘導体化、タンパク質分解切断、又は非天然アミノ酸による修飾などの発現後修飾の産物も指す。ポリペプチド又はタンパク質は、天然の生物学的供給源から誘導するか、又は組換え技術により生成することもできるが、必ずしも指定された核酸配列から翻訳されるわけではない。これは、化学的合成など、あらゆる方法で作製することができる。
「単離された」ポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、ベクター、細胞、又は組成物は、天然に見出されない形態のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、ベクター、細胞、又は組成物である。単離されたポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、ベクター、細胞又は組成物は、それらがもはや天然にみいだされる形態ではない程度まで精製されたものを含む。ある態様では、単離された抗体、ポリヌクレオチド、ベクター、細胞、又は組成物は、実質的に純粋である。
「組換え」ポリペプチド又はタンパク質は、組換えDNA技術により生成されたポリペプチド又はタンパク質を指す。宿主細胞において発現した、組換え生成のポリペプチド又はタンパク質は、任意の好適な技術により分離、分画、又は部分的若しくは実質的に精製された天然若しくは組換えポリペプチドと同様に、本開示の目的のために単離されたものとみなされる。
また、ポリペプチドの断片、変異体、又は誘導体、及びこれらの任意の組合せも本開示に含まれる。本開示のポリペプチド及びタンパク質について述べるとき、「断片」という用語は、参照ポリペプチド又はタンパク質の特性の少なくとも一部を保持する任意のポリペプチド又はタンパク質を包含する。ポリペプチドの断片は、タンパク質分解断片、及び欠失断片を含む。
本明細書で用いる「変異体(バリアント)」と言う用語は、少なくとも1つのアミノ酸修飾によって親ポリペプチド配列のものとは異なるポリペプチド配列を指す。親ポリペプチドは、天然のポリペプチド、すなわち「野生型」(WT)ポリペプチドであってもよいし、又は野生型ポリペプチドの修飾された形態であってもよい。変異型ポリペプチドという用語は、ポリペプチド自体、ポリペプチドを含む組成物、又はこれをコードするアミノ配列を指す場合もある。好ましくは、変異型ポリペプチド(例えば、変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチド)は、親ポリペプチドと比較して少なくとも1つのアミノ酸修飾、例えば、親ポリペプチドと比較して約1〜約10のアミノ酸修飾、好ましくは、約1〜約6のアミノ酸修飾を有する。本明細書において変異型ポリペプチド配列は、一般に、親ポリペプチド配列と少なくとも90%の配列同一性、極めて一般的には、少なくとも約95%の配列同一性を有する。
本開示のポリペプチド又はタンパク質の変異体は、前述のような断片、さらには、アミノ酸置換、欠失、若しくは挿入により改変されたアミノ酸配列を含むポリペプチド又はタンパク質を包含する。変異体は、天然又は非天然のものであってよい。非天然の変異体は、当分野では公知の突然変異誘発技術を用いて生成することができる。変異型ポリペプチドは、保存的又は非保存的アミノ酸置換、欠失若しくは付加を含み得る。
ポリペプチド又はタンパク質に用いられる場合、「誘導体」という用語は、天然のポリペプチド又はタンパク質に見出されない別の特徴を呈するように改変されたポリペプチド又はタンパク質を指す。変異型Fcドメインの「誘導体」の一例は、第2のポリペプチド若しくは別の分子(例えば、PEG、発色団、若しくは蛍光団)又は原子(例えば、放射性同位元素)との融合物若しくはコンジュゲートである。
本明細書で用いる「ポリヌクレオチド」又は「ヌクレオチド」という用語は、単一の核酸及び複数の核酸を包含することを意図し、単離された核酸分子又は構築物、例えば、メッセンジャーRNA(mRNA)若しくはプラスミドDNA(pDNA)を指す。特定の態様では、ポリヌクレオチドは、従来のリン酸ジエステル結合又は特殊な結合(例えば、ペプチド核酸(PNA)に存在するようなアミド結合)を含む。
「核酸」という用語は、ポリヌクレオチドに存在するいずれか1つ又は複数の核酸セグメント、例えばDNA若しくはRNAを指す。核酸又はポリヌクレオチドに用いられる場合、「単離された」という用語は、その天然の環境から取り出された核酸分子、DNA若しくはRNAを指し、例えば、ベクターに含まれる変異型Fcドメインを含むポリペプチドをコードする組換えポリヌクレオチドは、本開示の目的のために単離されたとみなされる。単離されたポリヌクレオチドの別の例としては、異種宿主細胞に維持されているか、又は溶液中の他のポリヌクレオチドから(部分的若しくは実質的に)精製された組換えポリヌクレオチドが挙げられる。単離されたRNA分子としては、本開示のポリヌクレオチドのin vivo又はin vitro RNA転写物がある。本開示の単離されたポリヌクレオチド又は核酸は、合成により生成されたこのような分子をさらに含む。さらに、ポリヌクレオチド又は核酸は、プロモータ、エンハンサー、リボソーム結合部位、又は転写終結シグナルなどの調節エレメントを含み得る。
本明細書で用いる「宿主細胞」という用語は、組換え核酸を保有するか、又は保有することができる細胞若しくは細胞の集団を指す。宿主細胞は、原核細胞(例えば、大腸菌(E.coli))であってよく、あるいは、宿主細胞は、真核細胞、例えば、真菌細胞(例:サッカロミセス・セレビシエ(Saccharomyces cerivisiae)、ピキア・パストリス(Pichia pastoris)、若しくはシゾサッカロミセス・ポンベ(Schizosaccharomyces pombe)などの酵母細胞)、及び昆虫細胞(例:Sf−9)又は哺乳動物細胞(例:HEK293F、CHO、COS−7、NIH−3T3)であってよい。
本開示はまた、1つ又は複数の保存的アミノ酸置換を含む変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドも包含する。「保存的アミノ酸置換」は、アミノ酸残基を、類似の側鎖を有するアミノ酸残基で置換したものである。類似の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、当分野において定義されており、そのようなものとして、塩基性側鎖(例えば、リシン、アルギニン、ヒスチジン)、酸性側鎖(例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸)、非荷電性極性側鎖(例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、トレオニン、チロシン、システイン)、非極性側鎖(例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン)、β分岐側鎖(例えば、トレオニン、バリン、イソロイシン)及び芳香族側鎖(例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン)が挙げられる。従って、ポリペプチド中のアミノ酸を同じ側鎖ファミリー由来の別のアミノ酸で置換する場合、この置換は、保存的であるとみなされる。別の態様では、アミノ酸の鎖は、側鎖ファミリーメンバーの順序及び/又は組成が異なる、構造的に類似した鎖で保存的に置換することもできる。
2つのポリヌクレオチド又はポリペプチド配列同士の「配列同一性(%)」という用語は、2つの配列の最適なアラインメントに導入しなければならない付加又は欠失(すなわちギャップ)を考慮に入れて、比較ウィンドウにわたって配列が共有する同一の一致した位置の数を指す。一致した位置は、同じヌクレオチド又はアミノ酸が、対象及び参照配列の両方に提示される任意の位置である。ギャップはヌクレオチド又はアミノ酸ではないため、対象配列に提示されるギャップは計数しない。同様に、対象配列のヌクレオチド又はアミノ酸は計数し、参照配列からのヌクレオチド又はアミノ酸は計数しないため、参照配列に提示されるギャップは計数しない。
配列同一性の割合(%)は、次のようにして算出する:2つの鎖に同一のアミノ酸残基又は核酸塩基が存在する位置の数を決定して、一致した位置の数を取得し、一致した位置の数を比較ウィンドウ内の位置の総数で割り、その商に100を掛けることにより、配列同一性の割合を得る。2つの配列同士の配列の比較及び配列同一性(%)の決定は、オンライン使用及びダウンロードの両方で容易に入手可能なソフトウエアを用いて達成することができる。好適なソフトウエアプログラムは、様々な供給源から、タンパク質及びヌクレオチド配列の両方のアラインメント用の好適なソフトウエアプログラムを入手することができる。配列同一性(%)を決定する1つの好適なプログラムは、bl2seqであり、これは、米国政府の国立生物工学情報センター(National Center for Biotechnology Information)BLASTウェブサイト(blast.ncbi.nlm.nih.gov)から入手可能なプログラムのBLASTスイートの一部である。Bl2seqは、BLASTN又はBLASTPアルゴリズムのいずれかを用いて、2つの配列の比較を実施する。BLASTNは、核酸配列を比較するのに用いられるのに対し、BLASTPは、アミノ酸配列を比較するのに用いられる。他の好適なプログラムは、例えば、Needle、Stretcher、Water、又はMatcherであり、これらは、バイオインフォマティクスプログラムのEMBOSSスイートの一部であり、European Bioinformatics Institute(EBI)(www.ebi.ac.uk/Tools/psa)から入手することも可能である。
ポリヌクレオチド又はポリペプチド参照配列とアラインメントする単一のポリヌクレオチド又はポリヌクレオチド対象配列内の様々な領域は、各々固有の配列同一性(%)を有しうる。配列同一性の割合の値は、少数第2位で四捨五入することに留意する。例えば、80.11、80.12、80.13、及び80.14は、80.1に丸め、また80.15、80.16、80.17、80.18、及び80.19は、80.2に丸める。また、長さの値は常に整数であることに留意する。
当業者であれば、配列同一性(%)の計算のための配列アラインメントの生成は、一次配列データによってのみ駆動されるバイナリ配列−配列比較に限定されない。配列アラインメントは、多重配列アラインメントから得ることができる。多重配列アラインメントを生成するのに好適な1プログラムは、ClustalW2であり、www.clustal.orgから入手することができる。別の好適なプログラムは、MUSCLEであり、www.drive5.com/muscle/から入手することができる。あるいは、ClustalW2及びMUSCLEは、例えば、EBIからも入手可能である。
また、配列アラインメントは、配列データを、構造データ(例えば、結晶学的タンパク質構造)、機能データ(例えば、突然変異の位置)、又は系統発生学的データなどの異種情報源からのデータと統合することにより、生成することができることも理解されよう。多重配列アラインメントを生成するために異種データを統合する好適なプログラムは、T−Coffeeであり、これは、www.tcoffee.orgから入手することができ、それ以外にも、例えば、EBIからも入手可能である。また、配列同一性(%)を計算するのに用いられる最終アラインメントは、自動又は手動のいずれで管理してもよいことは理解されよう。
「抗体」という用語は、免疫グロブリン分子の可変領域内での少なくとも1つの抗原認識部位を介して、タンパク質、ポリペプチド、ペプチド、炭水化物、ポリヌクレオチド、脂質、又はこれらの組合せなどの標的を認識して、標的に特異的に結合する免疫グロブリン分子を意味する。本明細書で用いる場合、「抗体」という用語は、以下のものを包含する:インタクトなポリクローナル抗体、インタクトなモノクローナル抗体、抗体フラグメント(Fab、Fab’、F(ab’)2、及びFvフラグメント)、一本鎖Fv(scFv)突然変異体、少なくとも2つのインタクトな抗体から作製された二重特異性抗体などの多重特異性抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、ある抗体の抗原決定部分を含む融合タンパク質、並びに抗体が所望の生体活性を呈示する限りにおいて、抗原認識部位を含むいずれか他の修飾免疫グロブリン分子。抗体は、それぞれα、δ、ε、γ、及びμと呼ばれるその重鎖定常ドメインの同一性に基づき、免疫グロブリンの5つの主要クラス:IgA、IgD、IgE、IgG及びIgM、又はそのサブクラス(アイソタイプ)のいずれのものであってもよい。免疫グロブリンの様々なクラスは、それぞれ異なる公知のサブユニット構造及び3次元配置を有する。抗体は、裸であってもよいし、又は毒素、放射性同位元素などの他の分子に結合させてもよい。本明細書で置換え可能に用いられる「抗体」又は「免疫グロブリン」は、一般に置換え可能に用いられ、全抗体及び任意の抗原結合フラグメント又は一本鎖を含む。
本明細書で用いる場合、「IgG」という用語は、認識された免疫グロブリンγ遺伝子によって実質的にコードされる抗体のクラスに属するポリペプチドを指す。ヒトにおいて、このクラスは、IgG1、IgG2、IgG3、及びIgG4を含む。マウスでは、このクラスは、IgG1、IgG2a、IgG2b及びIgG3を含む。
「抗体結合フラグメント」という用語は、インタクトな抗体の一部を指し、また、インタクトな抗体の抗原決定可変領域を指す。当分野では、抗体の抗原結合機能は、完全長抗体のフラグメントによって実施され得る。抗体フラグメントの例として、限定するわけではないが、Fab、Fab’、F(ab’)2及びFvフラグメント、直鎖状抗体、一本鎖抗体、並びに抗体フラグメントから形成される多重特異性抗体が挙げられる。
「モノクローナル抗体」という用語は、単一の抗原決定基、又はエピトープの高度に特異的認識及び結合に関与する均質抗体集団を指す。これは、典型的に様々な抗原決定基に向かう様々な抗体を含むポリクローナル抗体とは対照的である。用語「モノクローナル抗体」は、インタクトな完全長のモノクローナル抗体と、抗体フラグメント(Fab、Fab’、F(ab’)2、及びFvなど)、一本鎖(scFv)突然変異体、抗体部分を含む融合タンパク質、及び抗原認識部位を含むいずれか他の修飾免疫グロブリン分子の両方を包含する。さらに、「モノクローナル抗体」は、限定するわけではないが、ハイブリドーマ、ファージ選択、組換え発現、及びトランスジェニック動物によるものなど、任意の数の方法で作製した抗体を指す。
「ヒト抗体」という用語は、ヒトにより産生される抗体、又は当分野では公知の任意の技術を用いて作製される、人により産生される抗体と一致するアミノ酸配列を有する抗体を指す。ヒト抗体の定義は、インタクトな抗体若しくは完全長抗体、そのフラグメント、並びに/又は少なくとも1つのヒト重鎖及び/若しくは軽鎖ポリペプチドを含む抗体、例えば、マウス軽鎖及びヒト重鎖ポリペプチドを含む抗体を含む。「ヒト化抗体」という用語は、非ヒト(例えば、マウス)免疫グロブリンに由来する抗体を指し、これは、最小限の非ヒト(例えば、マウス)配列を含むように改変されている。
「キメラ抗体」という用語は、免疫グロブリン分子のアミノ酸配列が、2つ以上の種に由来する抗体を指す。典型的に、軽鎖及び重鎖両方の可変領域は、要望される特異性、親和性、及び能力を有する哺乳動物(例えば、マウス、ラット、ウサギなど)の1つの種に由来する抗体の可変領域に相当するのに対し、定常領域は、その種における免疫応答の誘発を回避するために、別の種(通常、ヒト)に由来する抗体の配列と相同的である。
「Kabatに記載のEUインデックス」という用語は、Kabat et al.,Sequences of Immunological Interest,5th Ed.Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,Md.(1991)に記載のヒトIgG1 EU抗体の番号付けシステムを指す。本願で言及する全てのアミノ酸位置は、EUインデックス位置を指す。例えば、「L234」及び「EU L234」はいずれも、Kabatに記載されるEUインデックスに従い、234位のアミノ酸ロイシンを指す。
本明細書で用いる「Fcドメイン」及び「IgG Fcドメイン」という用語は、IgG分子のパパイン消化により得られる結晶性フラグメントと相関する、免疫グロブリンの一部、例えば、IgG分子を指す。Fc領域は、ジスルフィド結合により連結されたIgG分子の2つの重鎖のC末端半分を含む。これには、抗原結合活性はないが、炭水化物部分と、補体及びFcRn受容体(以下を参照)などのFc受容体に対する結合部位を有する。例えば、Fcドメインは、第2定常ドメインCH2全体(IgG1のEU位置231〜340の残基、例えば、表2を参照)及び第3定常ドメインCH3(ヒトIgG1のEU位置341〜447の残基、例えば、表3を参照)を含有する。
Fcは、分離した上記領域、又は抗体、抗体フラグメント、又はFc融合タンパク質に関連する上記領域を指す。限定するものではないが、EU位置270、272、312、315、356、及び358などのFcドメインにおけるいくつかの位置で多形性が認められているため、本出願に提示した配列と当分野で公知の配列との間に若干の差が存在し得る。従って、「野生型IgG Fcドメイン」又は「WT IgG Fcドメイン」は、天然に存在する任意のIgG Fcドメイン(すなわち、任意の対立遺伝子)を指す。Myriad Fc突然変異体、Fcフラグメント、Fc変異体、及びFc誘導体は、以下の文献に記載されている:米国特許第5,624,821号明細書;米国特許第5,885,573号明細書;米国特許第5,677,425号明細書;米国特許第6,165,745号明細書;米国特許第6,277,375号明細書;米国特許第5,869,046号明細書;米国特許第6,121,022号明細書;米国特許第5,624,821号明細書;米国特許第5,648,260号明細書;米国特許第6,528,624号明細書;米国特許第6,194,551号明細書;米国特許第6,737,056号明細書;米国特許第7,122,637号明細書;米国特許第7,183,387号明細書;米国特許第7,332,581号明細書;米国特許第7,335,742号明細書;米国特許第7,371,826号明細書;米国特許第6,821,505号明細書;米国特許第6,180,377号明細書;米国特許第7,317,091号明細書;米国特許第7,355,008号明細書;米国特許第2004/0002587号明細書;並びにPCT公開番号:国際公開第99/058572号パンフレット、国際公開第2011/069164号パンフレット及び国際公開第2012/006635号パンフレット。
ヒトIgG1、IgG2、IgG3及びIgG4の重鎖の配列は、いくつかの配列データベース、例えば、それぞれ受諾番号P01857(IGHG1_HUMAN)、P01859(IGHG2_HUMAN)、P01860(IGHG3_HUMAN)、及びP01861(IGHG1_HUMAN)でUniprotデータベース(www.uniprot.org)に見出すことができる。表1〜3は、Kabatに記載のEUインデックスに従い、ヒトIgG1(配列番号1)、IgG2(配列番号2)、IgG3(配列番号3)及びIgG4(配列番号4)からのIgG重鎖のアミノ酸配列及び番号付けを表示する。IgGサブクラス間で異なる残基には陰影を付け、既知の対立遺伝子変異体の部位は、星印(*)で示す。
本明細書で用いる「変異型IgG Fcドメイン」及び「IgG Fc変異型ドメイン」は、Fcドメイン内のいずれかの位置に導入された1つ又は複数のアミノ酸置換、欠失、挿入又は修飾を含むIgG Fcドメインを指す。特定の態様において、変異型IgG Fcドメインは、1つ又は複数のアミノ酸置換を含まない野生型Fcドメインと比較して、FcγR及び/又はClqに対する結合親和性の低減又は除去をもたらす1つ又は複数のアミノ酸置換を含む。Fc結合相互作用は、様々なエフェクター機能及び下流のシグナル伝達イベント、例えば、限定するわけではないが、抗体依存性細胞媒介細胞傷害(ADCC)及び補体依存性細胞傷害(CDC)にとって不可欠である。従って、特定の態様において、変異型IgG Fcドメイン(例えば、抗体、融合タンパク質又はコンジュゲート)は、同じアミノ酸配列を有するが、1つ又は複数のアミノ酸置換、欠失、挿入又は修飾を含まない対応ポリペプチド、例えば、Fc領域の対応位置に天然のアミノ酸残基を含む非修飾Fc領域と比較して、少なくとも1つ又は複数のFcリガンド(例えば、FcγR)に対する改変された結合親和性を呈示することができる。
「YTE」又は「YTE突然変異体」という用語は、ヒトFcRnとの結合の増大をもたらすと共に、突然変異を有する抗体の血清半減期を向上させる、IgG1 Fcドメインにおける突然変異のセットを指す。YTE突然変異体は、IgGの重鎖に導入された3つの「YTE突然変異」:M252Y、S254T、及びT256E(番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う)の組合せを含む。米国特許第7,658,921号明細書(参照として本明細書に組み込む)を参照されたい。YTE突然変異体は、同じ抗体の野生型形態と比して、抗体の血清半減期を増大することが判明している。例えば、Dall’Acqua et al.,J.Biol.Chem.281:23514−24(2006)及び米国特許第7,083,784号明細書を参照されたい。尚、これらの文献は、その全体を参照として本明細書に組み込むものとする。「Y」突然変異体は、M256Y突然変異だけを含み、同様に、「YT」突然変異は、M252YとS254Tだけを含み、また「YE」突然変異は、M252YとT256Eだけを含む。特に、他の突然変異が、EU位置252及び/又は256に存在し得ることが考慮される。特定の態様において、EU位置252の突然変異は、M252F、M252S、M252W若しくはM252Tであってよく、及び/又はEU位置256の突然変異は、T256S、T256Q、T256R若しくはT256Dであってよい。
「FES」又は「FES突然変異体」という用語は、エフェクター機能の除外、すなわち抗体依存性細胞媒介細胞傷害及び補体媒介細胞傷害を媒介するFcドメインの能力の排除をもたらすIgG Fcドメインにおける突然変異のセットを指す。特定の態様において、FES突然変異体は、3つの「FES突然変異」:L234F、L235E、及びP331S(番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う)の組合せを含み得る。これらの突然変異は、FcγRI(CD64)、FcγRIIA(CD32A)、FcγRIII(CD16)及びC1qとのFcドメインの結合に大幅な低減を引き起こす。例えば、米国特許第2011/0059078号明細書及びOganesyan et al.Acta Crystallographica D 64:700−704(2008)を参照されたい。尚、これらの文献は、その全体を参照として本明細書に組み込むものとする。「FE」突然変異体は、L234F突然変異とL235E突然変異だけを含む。
「FES−YTE IgG Fcドメイン」という用語は、3つの「FES」突然変異(L234F/L235E/P331S)と3つの「YTE」突然変異(M252Y/S254T/T256E)を含む野生型IgG Fcドメインを指し、ここで、全ての番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う。本明細書に示すように、FES突然変異とYTE突然変異を組み合わせると(例えば、「FES−YTE」Fcドメインの場合)、このような突然変異の組合せを含まない対応ポリペプチドと比較して、タンパク質安定性にかなりの低下がみられる(例えば、以下の実施例1を参照)。
本明細書で用いる「Fc融合物」という用語は、1つ又は複数のポリペプチド若しくは小分子をFcドメイン又はその変異体若しくは誘導体と作動可能に連結させたタンパク質を指す。Fc融合物は、免疫グロブリンのFc領域と、融合相手(一般に任意のタンパク質又は小分子であってよい)を結合させる。Fc融合物の非Fc部分、すなわち融合相手の役割は、標的との結合を媒介することであってよく、従って、これは、抗体の可変領域に対して機能的に類似するものであってよい。
本明細書で用いる「親」ポリペプチドという用語は、変異体(例えば、変異型Fcドメイン、又は変異型抗体若しくは変異型Fc融合物など、Fcドメインを含む変異型ポリペプチド)を作製するために、後に修飾されるポリペプチド(例えば、親Fcドメイン、又は抗体若しくはFc融合物など、Fcドメインを含むポリペプチド)である。親ポリペプチドは、天然に存在するポリペプチド(例えば、野生型Fcドメイン)、又は天然に存在するポリペプチドの変異体若しくは改変された形態(例えば、YTE Fcドメイン及び/又はFES−YTE Fcドメイン)であってよい。親ポリペプチドという用語は、ポリペプチド自体、親ポリペプチドを含む組成物、又はそれをコードするアミノ酸を指すこともある。従って、本明細書で用いる「親Fcドメイン」とは、変異体を作製するために修飾されるFcドメインを意味し、また、本明細書で用いる「親抗体」とは、IgG変異型Fcドメインを含む変異型抗体を作製するために、修飾される抗体を意味する。
本明細書で用いる「IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド」という用語は、上に定義した変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドを指す。
「Fc変異体」は、Fcドメインを含み、単独で存在することもできるし、あるいは、抗体、Fc融合物、単離されたFc、Fcフラグメント、又はその他のポリペプチドに関連して存在することもできる。Fc変異体は、Fcポリペプチド自体、Fc変異型ポリペプチドを含む組成物、又はそれをコードするアミノ酸配列を指すこともある。本明細書に記載する変異型IgG Fcドメインは、これらを構成するアミノ酸修飾に応じて定義される。本明細書で述べる全てのアミノ酸位置について、番号付けは、常にKabatに記載されるEUインデックスに従う。従って、例えば、M252Yは、親Fcドメインに対して、EU位置252のメチオニン(M)がチロシン(Y)で置換されたFc変異体である。同様に、例えば、M252Y/S254T/T256Eは、親Fcドメインに対して、EU位置252(MからY)、254(SからT)、及び256(TからE)にそれぞれ置換を有する変異型Fc変異体を定義する。また、変異体は、突然変異したEUアミノ酸位置におけるその最終アミノ酸組成に応じた名称で呼ぶこともできる。例えば、M252Y/S254T/T256E突然変異体は、YTEと称することができる。置換が記載される順序は任意である。すなわち、例えば、M252Y/S254T/T256Eは、T256E/S254T/M252Yと同じFcであることに留意する。
本明細書で用いる「Fcγ受容体」又は「FcγR」という用語は、IgG抗体Fc領域に結合して、FcγR遺伝子によりコードされるタンパク質のファミリーの任意のメンバーを指す。ヒトの場合、このファミリーは、限定するわけではないが、以下のものを含む:アイソフォームFcγRIa、FcγRIb、及びFcγRIcなどのFcγRI(CD64);アイソフォームFcγRIIa(アロタイプH131及びR131など)、FcγRIIb(FcγRIIb−1及びFcγRIIb−2など)、及びFcγRIIcを含むFcγRII(CD32);並びにアイソフォームFcγRIIIa(アロタイプV158及びF158など)及びFcγRIIIb(アロタイプFcγRIIIb−NA1及びFcγRIIIb−NA2など)を含むFcγRIII(CD16)、さらにはいずれか未発見のヒトFcγR若しくはFcγRイソフォーム又はアロタイプ。FcγRは、限定するわけではないが、ヒト、マウス、ラット、ウサギ、及びサルなどのあらゆる生物に由来するものであってよい。マウスFcγRとしては、限定するわけではないが、FcγRI(CD64)、FcγRII(CD32)、FcγRIII(CD16)、及びFcγRIII−2(CD16−2)、並びにいずれか未発見のマウスFcγR若しくはFcγRイソフォーム又はアロタイプが挙げられる。
本明細書で用いる「FcRn」又は「FcRn受容体」という用語は、ヒト又は霊長類胎盤、又は卵黄嚢(ウサギ)を介した胎児への、並びに初乳から小腸を介した新生児への母親のIgGの輸送に関与することがわかっているFc受容体(「n」は、新生児を表す)を指す。また、FcRnは、IgG分子と結合し、これらを血清中に再循環させることにより、一定血清IgGレベルの維持に関与することも知られている。FcRnとIgG分子の結合は、pH依存性であり、pH6.0で最適の結合が、またpH>7.0で弱い結合が起こる。IgGとFcγRの結合によって、エフェクター機能(例えば、ADCC)をトリガーすることができるのに対し、pH依存的様式でのFcRnとの結合により、IgG抗体の血清半減期を延長することができる。エフェクター機能は、長い血清半減期を有する分子には望ましくないと考えられる。
本明細書で用いる「エフェクター機能」という用語は、FcドメインとFc受容体又はリガンドの相互作用から起こる生化学的イベントを指す。エフェクター機能としては、限定するわけではないが、ADCC、ADCP、及びCDCが挙げられる。本明細書で用いる「エフェクター細胞」とは、1つ又は複数のFc受容体を発現して、1つ又は複数のエフェクター機能を媒介する免疫系の細胞を意味する。エフェクター細胞としては、限定するわけではないが、単球、マクロファージ、好中球、樹状細胞、好酸球、肥満細胞、血小板、B細胞、大顆粒リンパ球、ランゲルハンス細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、及びγδT細胞が挙げられ、これらは、限定するわけではないが、ヒト、マウス、ラット、ウサギ、及びサルなどのあらゆる生物に由来するものであってよい。
「抗体依存性細胞媒介細胞傷害」又は「ADCC」という用語は、特定の細胞傷害性細胞(例えば、主としてNK細胞、好中球、及びマクロファージ)上に存在するFc受容体(FcR)に結合したFcドメインを含むポリペプチド(例えば、抗体)が、上記の細胞傷害性エフェクター細胞を抗原提示「標的細胞」に特異的に結合させた後、細胞毒で標的細胞を死滅させることを可能にする、細胞傷害の形態を指す。(Hogarth et al.,Nature review Drug Discovery 2012,11:313)。抗体及びそのフラグメント以外に、抗原発現標的細胞に特異的に結合する能力を有するFcドメイン、例えば、Fc融合物及びFcコンジュゲートタンパク質は、細胞媒介細胞傷害を実施する能力があることが考慮される。
簡略化のために、本明細書では、Fcドメインを含むポリペプチドの活性から生じた細胞媒介細胞傷害もADCC活性と呼ぶ。本開示の特定のポリペプチドが、ADCCにより標的細胞の溶解を媒介する能力を検定することができる。ADCC活性を評価するために、目的のポリペプチド(例えば、抗体)を、免疫エフェクター細胞と組み合わせた標的細胞に添加して、標的細胞の細胞溶解を引き起こす。細胞溶解は、一般に、溶解した細胞からの標識(例えば、放射性基質、蛍光染料又は天然の細胞内タンパク質)により検出される。このようなアッセイに有用なエフェクター細胞としては、末梢血液単核細胞(PBMC)及びナチュラルキラー(NK)細胞が挙げられる。in vitroADCCアッセイの具体例が、Bruggemann et al.,J.Exp.Med.166:1351(1987);Wilkinson et al.,J.Immunol.Methods 258:183(2001);Patel et al.,J.Immunol. Methods 184:29(1995)に記載されている。これに代わり、又はこれに加えて、目的の抗体のADCC活性は、in vivoで、例えば、Clynes et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 95:652(1998)に開示されているような動物モデルにおいて、評価することもできる。
本明細書で用いる「CDC」という用語は、補体依存性細胞傷害、すなわち、補体系により媒介される標的細胞破壊の生化学的イベントを指す。
本明細書で用いる「半減期」又は「in vivo半減期」という用語は、所与の動物の循環における本開示の特定タイプのポリペプチドの生物学的半減期を指し、動物に投与した量の半分が、動物における循環及び/又は他の組織から排出されるのに必要な時間で表される。
本明細書で用いる「被験者(被験体)」という用語は、特定の治療の受容体となる任意の動物(例えば、哺乳動物)を指し、限定するわけではないが、ヒト、非ヒト霊長類、げっ歯類などが挙げられる。「被験者」及び「患者」という用語は、ヒト被験者を指す場合、本明細書では置換え可能に用いられる。
本明細書で用いる「医薬組成物」という用語は、活性成分の生物学的活性が有効となるような形態をしており、しかも、組成物が投与される被験者に対して許容不可能なほど毒性である別の成分を含まない製剤を指す。このような組成物は無菌であってよい。
本明細書に開示するポリペプチド(例えば、抗体)の「有効量」は、具体的に記載された目的を実施するのに十分な量である。「治療に有効な量」は、明示された目的に関して、経験に基づき、また常用の方法で決定することができる。本明細書で用いる「治療に有効な量」は、被験者又は哺乳動物の疾患若しくは障害を「治療する」のに有効なポリペプチド(例えば、抗体)、又はその他の薬剤の量を指す。
本明細書で用いる場合、「標識」という用語は、「標識された」ポリペプチドを作製するために、ポリペプチド(例えば、抗体)に直接若しくは間接的に結合させる検出可能な化合物又は組成物を指す。標識は、それ自体(例えば、放射性同位元素標識若しくは蛍光標識)で検出可能であるか、又は、酵素標識の場合には、検出可能な異質化合物若しくは組成物の化学的変質を触媒することができる。
「治療する」又は「治療」又は「治療すること」又は「緩和する」又は「緩和すること」という用語は、以下の両方を指す:(1)診断された病状又は障害の症状を治癒、減速、軽減する、及び/又はその進行を止める治療的措置、並びに(2)対象とする病状又は障害の発症を予防する、及び/又は遅らせる予防的措置。従って、治療が必要な者は、すでに障害を有する者;障害に罹患しやすい者;及び障害を予防しようとする者を含む。
「ベクター」という用語は、宿主細胞に、目的の1つ又は複数の遺伝子を送達する、またある態様では、発現することができる構築物を意味する。ベクターの例として、限定するわけではないが、ウイルス性ベクター、裸のDNA若しくはRNA発現ベクター、プラスミド、コスミド又はファージベクター、カチオン縮合剤と結合したDNA若しくはRNA発現ベクター、リポソームに被包されたDNA若しくはRNA発現ベクター、並びにプロデューサ細胞などの特定の真核細胞が挙げられる。
変異型IgG Fcドメイン
いくつかの態様では、延長された血清半減期を賦与し、エフェクター機能を大幅に低減するか、又は完全に排除する変異型IgG Fcドメインが提供される。これらの変異型IgG Fcドメインは、例えば、望ましくない有害なADCC及びCDC活性を低減しながら、薬物動態的パラメータを好都合に改変する(同時に、投与回数の減少を可能にする)ために、例えば、既存の治療用抗体に導入することができる。
変異型IgG Fcドメイン
いくつかの態様では、延長された血清半減期を賦与し、エフェクター機能を大幅に低減するか、又は完全に排除する変異型IgG Fcドメインが提供される。これらの変異型IgG Fcドメインは、例えば、望ましくない有害なADCC及びCDC活性を低減しながら、薬物動態的パラメータを好都合に改変する(同時に、投与回数の減少を可能にする)ために、例えば、既存の治療用抗体に導入することができる。
FcドメインのCH2領域に位置する突然変異(EU M252Y、EU S254T、及びEU T256E置換に対応する)のYTEセット(Dall’Acqua et al.,J.Immunol.169:5171−80 2002;Dall’Acqua et al.,J.Biol.Chem.281:23514−24(2006))は、pH6で循環受容体FcRnとの結合を改善することにより、カニクイザルの抗体血清半減期を増加させることが判明している。やはりFcドメインのCH2領域に位置するFES三重突然変異(EU L234F、EU L235E、及びEU P331Sの置換セットに相当する)は、FCγRとC1qの結合を無効にすることによって、ADCC又はCDCを誘発することができない抗体をもたらす(Oganesyan et al.,Acta Crystallogr.D 64:700−704(2008))。本明細書で明らかにするように、変異型Fcドメイン、例えば、ある抗体の変異型Fcドメインにおいて。これらの突然変異を組み合わせることにより、野生型親分子、例えば、野生型IgG1 Fcと比較して、低減した熱安定性を有するFcドメインが得られる。
本明細書で明らかにするように、EU位置234、235、及び322又は331(例えば、L234F/L235Q/K322Q又はL234F/L235Q/P331G)での特定のIgG Fcドメインアミノ酸置換は、ADCC及びCDCを大幅に低減するか、又は排除する。EU位置234、235、及び322又は331でのこれらの特定のIgG Fcドメインアミノ酸置換をYTE突然変異と組み合わせると、得られる変異型Ig Fcドメインは、FES−YTE突然変異体と同等のADCC及びCDC特性を示すが、同時に大幅に向上した熱安定性も呈示する。
従って、ある態様では、変異型IgG Fcドメイン(例えば、ヒトIgG Fcドメインの変異体又はそのFcRn結合フラグメント)を含むポリペプチドが提供され、これは、以下:
(i)EU位置234にフェニルアラニン(F)アミノ酸、
(ii)EU位置235にアラニン(A)、アスパラギン(N)、フェニルアラニン(F)、グルタミン(Q)若しくはバリン(V)アミノ酸、並びに
(iii)EU位置322にアラニン(A)、アスパラギン酸(D)、グルタミン酸(E)、ヒスチジン(H)、アスパラギン(N)、若しくはグルタミン(Q)アミノ酸、又は(上記に代わり)331位にアラニン(A)若しくはグリシン(G)アミノ酸
を含む。
(i)EU位置234にフェニルアラニン(F)アミノ酸、
(ii)EU位置235にアラニン(A)、アスパラギン(N)、フェニルアラニン(F)、グルタミン(Q)若しくはバリン(V)アミノ酸、並びに
(iii)EU位置322にアラニン(A)、アスパラギン酸(D)、グルタミン酸(E)、ヒスチジン(H)、アスパラギン(N)、若しくはグルタミン(Q)アミノ酸、又は(上記に代わり)331位にアラニン(A)若しくはグリシン(G)アミノ酸
を含む。
一態様では、EU位置234にフェニルアラニン(F)アミノ酸、EU位置235にグルタミン(Q)アミノ酸、並びにEU位置322にグルタミン(Q)アミノ酸を含む変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供される。以後、この変異型IgG Fcドメイン及びアミノ酸置換のセットを「FQQ」と呼ぶ。
別の態様では、EU位置234にフェニルアラニン(F)アミノ酸、EU位置235にグルタミン(Q)アミノ酸、並びにEU位置331にグリシン(G)アミノ酸を含む、変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供される。以後、この変異型IgG Fcドメイン及びアミノ酸置換のセットを「FQG」と呼ぶ。
さらに別の態様では、EU位置234にフェニルアラニン(F)アミノ酸、EU位置235にアラニン(A)アミノ酸、並びにEU位置322にグルタミン(Q)アミノ酸を含む、変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供される。以後、この変異型IgG Fcドメイン及びアミノ酸置換のセットを「FAQ」と呼ぶ。
特定の態様において、EU位置234、235、及び322又は331に、上に開示したアミノ酸置換の3つを含み、しかもEU位置252、254、又は256のいずれか1つに、1つ又は複数のアミノ酸置換をさらに含む、変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供される。従って、一態様では、EU位置252にチロシン(Y)アミノ酸、若しくはEU位置252にフェニルアラニン(F)アミノ酸、若しくはEU位置252にセリン(S)アミノ酸、若しくはEU位置252にトリプトファン(W)アミノ酸、若しくはEU位置252にトレオニン(T)アミノ酸をさらに含む変異型IgG Fcドメイン(例えば、FQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメイン)を含むポリペプチドが提供される。具体的態様では、EU位置252にチロシン(Y)アミノ酸をさらに含む変異型IgG Fcドメイン(例えば、FQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメイン)を含むポリペプチドが提供される。
別の態様において、EU位置254にトレオニン(T)アミノ酸をさらに含む変異型IgG Fcドメイン(例えば、FQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメイン)を含むポリペプチドが提供される。別の態様では、EU位置256にグルタミン酸(E)アミノ酸、又はEU位置256にセリン(S)アミノ酸、又はEU位置256にアルギニン(R)アミノ酸、又はEU位置256位にグルタミン(Q)アミノ酸、又はEU位置256にアスパラギン酸(D)アミノ酸をさらに含む変異型IgG Fcドメイン(例えば、FQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメイン)を含むポリペプチドが提供される。具体的態様では、EU位置256位にグルタミン酸(E)アミノ酸をさらに含む変異型IgG Fcドメイン(例えば、FQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメイン)を含むポリペプチドが提供される。
特定の態様において、EU位置234、235、及び322又は311に、上に開示したアミノ酸置換の3つを含み、しかもEU位置252、254、又は256からなる群から選択される2つの位置に置換をさらに含む、ポリペプチドが提供される。従って、一態様では、EU位置252にチロシン(Y)アミノ酸、及びEU位置254にトレオニン(T)アミノ酸をさらに含む変異型IgG Fcドメイン(例えば、FQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメイン)を含むポリペプチドが提供される。
別の態様において、EU位置254にトレオニン(T)アミノ酸及びEU位置256にグルタミン酸(E)アミノ酸をさらに含むIgG Fcドメイン(例えば、FQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメイン)を含むポリペプチドが提供される。さらに別の態様では、EU位置252にチロシン(Y)アミノ酸及びEU位置256にグルタミン酸(E)アミノ酸をさらに含む変異型IgG Fcドメイン(例えば、FQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメイン)を含むポリペプチドが提供される。
特定の態様において、EU位置234、235、及び322又は331に、上に開示したアミノ酸の3つを含む変異型IgG Fcドメイン(例えば、FQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメイン)を含むポリペプチドが提供され、ここで、変異型IgG Fcドメインは、EU位置252にチロシン(Y)アミノ酸、EU位置254にトレオニン(T)アミノ酸、及びEU位置256にグルタミン酸(E)アミノ酸をさらに含む。
ある態様において、EU位置234にフェニルアラニン(F)アミノ酸、EU位置235にグルタミン(Q)アミノ酸、EU位置322にグルタミン(Q)アミノ酸、EU位置252にチロシン(Y)アミノ酸、EU位置254にトレオニン(T)アミノ酸、及びEU位置256にグルタミン酸(E)アミノ酸を含む変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供される。
別の態様において、EU位置234にフェニルアラニン(F)、EU位置235にグルタミン(Q)アミノ酸、EU位置331にグリシン(G)アミノ酸、EU位置252にチロシン(Y)アミノ酸、EU位置254にトレオニン(T)アミノ酸、及びEU位置256にグルタミン酸(E)アミノ酸を含む変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供される。さらに別の態様では、EU位置234にフェニルアラニン(F)、EU位置235にアラニン(A)アミノ酸、EU位置322にグルタミン(Q)アミノ酸、EU位置252にチロシン(Y)アミノ酸、EU位置254にトレオニン(T)アミノ酸、及びEU位置256にグルタミン酸(E)アミノ酸を含む変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供される。従って、本開示は、限定するわけではないが、FQQ突然変異とYTE突然変異を含む変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチド、及びFAQ突然変異とYTE突然変異を含む変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドを包含する。
ある態様において、変異型IgG Fcドメインの親ポリペプチドは、前述した置換に対応するアミノ酸の1つ又は複数をすでに含んでいる。例えば、親Fcポリペプチドは、IgG4に見出されるように、EU位置234にフェニルアラニン(F)を含んでいてもよい。このような態様では、開示された置換の1つ又は複数を既に含む1つ又は複数のアミノ酸の修飾は必要ない。
ある態様において、変異型IgG Fcドメインはヒト由来である。ある別の態様では、変異型IgG Fcドメインは非ヒト由来である。非ヒトIgG Fcドメインは、例えば、げっ歯類(例えば、ラット若しくはマウス)、ロバ、ヒツジ、ウサギ、ヤギ、モルモット、ラクダ、ウマ、又はニワトリ由来のものであってよい。ヒト変異型IgG Fcドメインは、例えば、サブクラスIgG1、IgG2、IgG3又はIgG4 Fcドメインであってよい。変異型IgG FcドメインがマウスIgG Fcドメインである場合、ドメインは、例えば、サブクラスIgG1、IgG2a、IgG2b、又はIgG3ドメインであってよい。
ある態様において、配列番号9〜配列番号32からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供される。別の態様では、配列番号9〜配列番号32からなる群から選択されるアミノ酸配列から構成される変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供される。本明細書に記載する教示に基づき、配列番号9〜配列番号32に記載される変異型IgG Fcドメインが、1つの特定の対立遺伝子変異を呈示することは、当業者に理解されよう。従って、ある態様では、配列番号9〜配列番号32に記載の変異型IgG Fcドメインの様々な対立遺伝子変異を含むポリペプチドが提供される。既知の対立遺伝子変異の部位を表1〜3に記載する。
ある態様において、表4に開示したアミノ酸配列(配列番号37〜配列番号40)の1つを含む変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供される。別の態様では、表4に開示したアミノ酸配列(配列番号37〜配列番号40)の1つからなる変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供される。本明細書に記載の教示に基づき、配列番号37〜配列番号40に記載される変異型IgG Fcドメインが1つの具体的対立遺伝子変異を呈示することは、当業者に理解されよう。従って、ある態様では、配列番号37〜配列番号40に記載の変異型IgG Fcドメインの異なる対立遺伝子変異を含むポリペプチドが提供される。既知の対立遺伝子変異の部位を表1〜3に記載する。
半減期の増加
ある態様において、上に開示した変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドは、野生型IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、向上した薬物動態(PK)特性を有する。ある態様では、向上したPK特性の例は、例えば、向上したFcRn受容体との結合、又は半減期の増加である。本明細書に記載される変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドは、哺乳動物(例えば、ヒト)において5日超、10日超、15日超、20日超、25日超、30日超、35日超、40日超、45日超、2ヵ月超、3ヵ月超、4ヵ月超、又は5ヵ月超の半減期(例えば、血清半減期)を有し得る。
ある態様において、上に開示した変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドは、野生型IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、向上した薬物動態(PK)特性を有する。ある態様では、向上したPK特性の例は、例えば、向上したFcRn受容体との結合、又は半減期の増加である。本明細書に記載される変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドは、哺乳動物(例えば、ヒト)において5日超、10日超、15日超、20日超、25日超、30日超、35日超、40日超、45日超、2ヵ月超、3ヵ月超、4ヵ月超、又は5ヵ月超の半減期(例えば、血清半減期)を有し得る。
哺乳動物における、本明細書に記載のポリペプチドを含むIgG Fc変異型ドメインの半減期増加によって、ポリペプチド(例えば、抗体又は抗体フラグメント)のより高い血清力価が得られるため、ポリペプチドの投与回数を減少する、及び/又は投与しようとするポリペプチドの濃度を低減することができる。
具体的態様において、EU位置252、254、及び256からなる群から選択される1つ又は複数の位置に置換(例えば、Y、YT、YE、YTE突然変異)を含むポリペプチドを含有するIgG Fc変異型ドメインは、野生型Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して半減期の増加を呈示する。他の具体的態様では、EU位置252、254、及び256からなる群から選択される1つ又は複数の位置に置換(例えば、Y、YT、YE、YTE突然変異)を含むポリペプチドを含有するIgG Fc変異型ドメインは、FQQ、FQG又はFAQ突然変異をさらに含み、野生型Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、半減期の増加、並びに低減したFcエフェクター機能を呈示し得る。
具体的態様において、EU位置252、254、及び256からなる群から選択される1つ又は複数の位置に置換(例えば、Y、YT、YE、YTE突然変異)を含むポリペプチドを含有するIgG Fc変異型ドメインは、野生型Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、pH7.4よりpH6.0でFcRnに対する高い親和性を有する。他の具体的態様では、EU位置252、254、及び256からなる群から選択される1つ又は複数の位置に置換(例えば、Y、YT、YE、YTE突然変異)を含むIgG Fc変異型ドメインは、FQQ、FQG又はFAQをさらに含み、野生型Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、pH7.4よりpH6.0でFcRnに対する高い親和性を示すと共に、低減したFcエフェクター機能を呈示し得る。
Fc受容体との結合
本明細書に記載のポリペプチドを含むIgG Fc変異型ドメイン(例えば、変異型IgG Fcドメインを含む抗体又はそのフラグメント)は、Fc領域に位置する少なくとも1つのアミノ酸残基の置換をさらに含んでもよく、ここで、このような置換により、少なくとも1つのFcリガンドに対する親和性の低減又は除去が起こる。前述したように、野生型Fcドメインは、限定するわけではないが、FcγR受容体(例えば、FcγRIIb、FcγRIIIa)及び補体タンパク質C1qなどのいくつかのリガンドと相互作用し、これらの相互作用は、様々なエフェクター機能及び下流のシグナル伝達イベント、例えば、限定するわけではないが、抗体依存性細胞媒介細胞傷害(ADCC)及び補体依存性細胞傷害(CDC)にとって不可欠である。従って、特定の態様において、開示した分子と同じアミノ酸配列を有するが、Fc領域に少なくとも1つのアミノ酸残基の置換を含まない分子と比較して、エフェクター機能を促進することを担うFcリガンドに対する親和性が低減又は除去されたIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。
本明細書に記載のポリペプチドを含むIgG Fc変異型ドメイン(例えば、変異型IgG Fcドメインを含む抗体又はそのフラグメント)は、Fc領域に位置する少なくとも1つのアミノ酸残基の置換をさらに含んでもよく、ここで、このような置換により、少なくとも1つのFcリガンドに対する親和性の低減又は除去が起こる。前述したように、野生型Fcドメインは、限定するわけではないが、FcγR受容体(例えば、FcγRIIb、FcγRIIIa)及び補体タンパク質C1qなどのいくつかのリガンドと相互作用し、これらの相互作用は、様々なエフェクター機能及び下流のシグナル伝達イベント、例えば、限定するわけではないが、抗体依存性細胞媒介細胞傷害(ADCC)及び補体依存性細胞傷害(CDC)にとって不可欠である。従って、特定の態様において、開示した分子と同じアミノ酸配列を有するが、Fc領域に少なくとも1つのアミノ酸残基の置換を含まない分子と比較して、エフェクター機能を促進することを担うFcリガンドに対する親和性が低減又は除去されたIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。
ある態様において、以下の特性の1つ又は複数を含む、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される:エフェクター機能(ADCC及び/又はCDC)の低減又は除去、Fc受容体との結合の低減又は除去、又は細胞傷害性の低減又は除去。特定の態様では、FcγR受容体(例えば、FcγRIIb、FcγRIIIa)及び/又は補体タンパク質C1qに対する低減した親和性を呈示する、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。いくつかの態様では、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドは、FcRn受容体との増大した結合を有する。
当業者であれば、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが、改変されたFcγR及び/又はC1q結合特性を有し得ることは理解されよう。結合特性の例として、限定するわけではないが、結合特異性、平衡解離定数(KD)、解離及び会合定数(それぞれkoff及びkon)、結合親和性及び/又は結合活性が挙げられる。当分野では、平衡解離定数(KD)は、koff/konとして定義される。
当業者であれば、所与の治療又は診断用途にとってどの動態パラメータが最も重要であるかを決定することができる。例えば、1つ又は複数の正の調節因子(例えば、FcγRIIIA)との結合を低減する修飾及び/又は阻害性Fc受容体(例えば、FcγRIIB)との結合の増大は、ADCC活性を低減する上で好適である。従って、結合親和性の比(例えば、KD)は、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドのADCC活性が増大したか、又は低減したかを示すことができる。さらに、C1qとの結合を低減する修飾は、CDC活性を低減又は排除する上で好適となる。
変異型IgG Fcドメイン含有ポリペプチドのそのリガンドに対する親和性及び結合特性は、Fc−FcγR相互作用、すなわちFc領域と特異的結合を決定するための当分野で公知の様々なin vitroアッセイ方法(生化学又は免疫学的アッセイ)により決定することができる。このような方法として、平衡方法(例えば、酵素結合免疫吸着法(ELISA)若しくは放射免疫測定法(RIA))、又は動力学(例えば、BIACORE(登録商標)分析などの表面プラズマ共鳴)、並びに間接結合アッセイ、競合阻害アッセイ、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)、ゲル電気泳動及びクロマトグラフィー(例えば、ゲル濾過)などのその他の方法が挙げられる。
上記及びその他の方法は、検査しようとする1つ又は複数の成分への標識を用いてもよいし、及び/又は、限定するものではないが、色素原、蛍光、ルミネセンス、又は同位体標識などの各種検出方法を使用してもよい。結合親和性及び動力学の詳細な説明は、Paul,W.E.,ed.,Fundamental Immunology,4th Ed.,Lippincott−Raven,Philadelphia(1999)に見出すことができる。
一態様において、野生型Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、1つ又は複数のFc受容体、例えば、限定するわけではないが、FcγRI(FcγRIa、FcγRIb、及びFcγRIcアイソフォームなど);FcγRII(FcγRIIa、FcγRIIb、及びFcγRIIcアイソフォームなど);並びにFcγRIII(FcγRIIIa及びFcγRIIIbアイソフォームなど)などに対する低減した結合親和性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。別の態様では、前述した1つ又は複数のFc受容体に対する、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドの結合は完全に除去される。
一態様において、野生型Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、FcγRIに対する低減した親和性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。別の態様では、野生型Fcドメインを含む親ポリペプチドより、少なくとも2倍、又は少なくとも3倍、又は少なくとも5倍、又は少なくとも7倍、又は少なくとも10倍、又は少なくとも20倍、又は少なくとも30倍、又は少なくとも40倍、又は少なくとも50倍、又は少なくとも60倍、又は少なくとも70倍、又は少なくとも80倍、又は少なくとも90倍、又は少なくとも100倍、又は少なくとも200倍低いか、又は検出不可能なレベルまで低減したFcγRI受容体に対する親和性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。
別の態様において、野生型Fcドメインを含む親ポリペプチドより、少なくとも90%、少なくとも80%、少なくとも70%、少なくとも60%、少なくとも50%、少なくとも40%、少なくとも30%、少なくとも20%、少なくとも10%、又は少なくとも5%低い、FcγRI受容体に対する親和性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。ある態様では、FcγRIは、アイソフォームFcγRIaである。別の態様では、FcγRIは、アイソフォームFcγRIbである。さらに別の態様では、FcγRIは、アイソフォームFcγRIcである。
一態様において、野生型Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、FcγRIIに対する低減した親和性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。別の態様では、野生型Fcドメインを含む親ポリペプチドより、少なくとも2倍、又は少なくとも3倍、又は少なくとも5倍、又は少なくとも7倍、又は少なくとも10倍、又は少なくとも20倍、又は少なくとも30倍、又は少なくとも40倍、又は少なくとも50倍、又は少なくとも60倍、又は少なくとも70倍、又は少なくとも80倍、又は少なくとも90倍、又は少なくとも100倍、又は少なくとも200倍低い、FcγRII受容体に対する親和性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。
別の態様において、野生型Fcドメインを含む親ポリペプチドより、少なくとも90%、少なくとも80%、少なくとも70%、少なくとも60%、少なくとも50%、少なくとも40%、少なくとも30%、少なくとも20%、少なくとも10%、又は少なくとも5%低い、FcγRII受容体に対する親和性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。ある態様では、FcγRIIは、アイソフォームFcγRIIaである。別の態様では、FcγRIIaアイソフォームは、アロタイプH131である。さらに別の態様では、FcγRIIaアイソフォームは、アロタイプR131である。別の態様では、FcγRIIは、アイソフォームFcγRIIbである。ある態様では、FcγRIIbアイソフォームは、FcγRIIb−1である。別の態様では、FcγRIIbアイソフォームは、FcγRIIb−2である。さらに別の態様では、FcγRIIは、アイソフォームFcγRIIcである。
一態様において、野生型Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、FcγRIIIに対する低減した親和性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。別の態様では、野生型Fcドメインを含む親ポリペプチドより、少なくとも2倍、又は少なくとも3倍、又は少なくとも5倍、又は少なくとも7倍、又は少なくとも10倍、又は少なくとも20倍、又は少なくとも30倍、又は少なくとも40倍、又は少なくとも50倍、又は少なくとも60倍、又は少なくとも70倍、又は少なくとも80倍、又は少なくとも90倍、又は少なくとも100倍、又は少なくとも200倍低い、FcγRIII受容体に対する親和性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。
別の態様において、野生型Fcドメインを含む親ポリペプチドより、少なくとも90%、少なくとも80%、少なくとも70%、少なくとも60%、少なくとも50%、少なくとも40%、少なくとも30%、少なくとも20%、少なくとも10%、又は少なくとも5%低い、FcγRIII受容体に対する親和性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。ある態様では、FcγRIIIは、アイソフォームFcγRIIIaである。別の態様では、FcγRIIIaは、アロタイプ158V(F158V対立遺伝子変異体)である。別の態様では、FcγRIIIaは、アロタイプ158Fである。別の態様では、FcγRIIIは、アイソフォームFcγRIIIbである。別の態様では、FcγRIIIbは、アロタイプNA1である。別の態様では、FcγRIIIbは、アロタイプNA2である。
本明細書に記載するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド(例えば、変異体IgG Fcドメインを含む抗体又はそのフラグメント)は、Fc領域に位置する少なくとも1つのアミノ酸残基の置換をさらに含んでもよく、このような置換により、FcRnに対する増大した親和性が得られる。前述したように、野生型FcドメインとFcRnのpH依存性相互作用は、半減期を延長する。一態様において、野生型Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、FcRnに対する増大した親和性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。別の態様では、野生型Fcドメインを含む親ポリペプチドより、少なくとも2倍、又は少なくとも3倍、又は少なくとも5倍、又は少なくとも7倍、又は少なくとも10倍、又は少なくとも20倍、又は少なくとも30倍、又は少なくとも40倍、又は少なくとも50倍、又は少なくとも60倍、又は少なくとも70倍、又は少なくとも80倍、又は少なくとも90倍、又は少なくとも100倍、又は少なくとも200倍高い、FcRn受容体に対する親和性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。別の態様では、野生型Fcドメインを含む親ポリペプチドより、少なくとも90%、少なくとも80%、少なくとも70%、少なくとも60%、少なくとも50%、少なくとも40%、少なくとも30%、少なくとも20%、少なくとも10%、又は少なくとも5%高い、FcRn受容体に対する親和性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。特定の態様では、pH7.4よりpH6.0でFcRnに対する高い親和性を示す、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。
一態様において、約100nM〜約100μM、又は約100nM〜約10μM、又は約100nM〜約1μM、又は約1nM〜約100μM、又は約10nM〜約100μM、又は約1μM〜約100μM、又は約10μM〜約100μMであるFcγR受容体に対する親和性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。特定の態様では、1μM超、5μM超、10μM超、25μM超、50μM超、100μM超であるFcγR受容体に対する親和性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。別の態様では、100μM未満、50μM未満、10μM未満、5μM未満、2.5μM未満、1μM未満、又は100nM未満、又は10nM未満であるFcγR受容体に対する親和性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。
具体的態様では、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、FcγRに対する低減した親和性を呈示するFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供される。別の具体的態様では、EU位置252、254、及び256からなる群から選択される1つ又は複数の位置に置換(例えば、Y、YT、YE、YTE突然変異)をさらに含むFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供され、これは、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、FcγRに対する低減した親和性を呈示する。
具体的態様では、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、FcγRとの結合が完全に除去されたFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供される。別の具体的態様では、EU位置252、254、及び256からなる群から選択される1つ又は複数の位置に置換(例えば、Y、YT、YE、YTE突然変異)をさらに含むFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供され、これは、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、FcγRとの結合が完全に除去されている。
具体的態様では、野生型Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、FcRnに対する増大した親和性を呈示するFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供される。別の具体的態様では、EU位置252、254、及び256からなる群から選択される1つ又は複数の位置に置換(例えば、Y、YT、YE、YTE突然変異)をさらに含むFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供され、これは、野生型Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、FcRnに対する増大した親和性を呈示する。
C1qとの結合
補体活性化経路は、補体系の第1成分(C1q)と、コグネート抗原と複合体化した1分子、例えば、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドとの結合によって開始される。補体活性化を評価するためには、例えば、Gazzano−Santoro et al.,J.Immunol.Methods,202:163(1996)に記載のようなCDCアッセイを実施することができる。
補体活性化経路は、補体系の第1成分(C1q)と、コグネート抗原と複合体化した1分子、例えば、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドとの結合によって開始される。補体活性化を評価するためには、例えば、Gazzano−Santoro et al.,J.Immunol.Methods,202:163(1996)に記載のようなCDCアッセイを実施することができる。
一態様において、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、C1qに対する低減した親和性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。別の態様では、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドより、少なくとも2倍、又は少なくとも3倍、又は少なくとも5倍、又は少なくとも7倍、又は少なくとも10倍、又は少なくとも20倍、又は少なくとも30倍、又は少なくとも40倍、又は少なくとも50倍、又は少なくとも60倍、又は少なくとも70倍、又は少なくとも80倍、又は少なくとも90倍、又は少なくとも100倍、又は少なくとも200倍低い、C1q受容体に対する親和性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。
別の態様では、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドより、少なくとも90%、少なくとも80%、少なくとも70%、少なくとも60%、少なくとも50%、少なくとも40%、少なくとも30%、少なくとも20%、少なくとも10%、又は少なくとも5%低い、C1qに対する親和性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。
別の態様において、約100nM〜約100μM、又は約100nM〜約10μM、又は約100nM〜約1μM、又は約1nM〜約100μM、又は約10nM〜約100μM、又は約1μM〜約100μM、又は約10μM〜約100μMであるC1qに対する親和性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。特定の態様では、1μM超、5μM超、10μM超、25μM超、50μM超、100μM超であるC1qに対する親和性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。
具体的態様では、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、C1qに対する低減した親和性を呈示するFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供される。別の具体的態様では、EU位置252、254、及び256からなる群から選択される1つ又は複数の位置に置換(例えば、Y、YT、YE、YTE突然変異)をさらに含むFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供され、これは、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、C1qに対する低減した親和性を呈示する。
特定の具体的態様では、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、C1qとの結合が完全に除去されたFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供される。別の具体的態様では、EU位置252、254、及び256からなる群から選択される1つ又は複数の位置に置換(例えば、Y、YT、YE、YTE突然変異)をさらに含むFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供され、これは、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、C1qとの結合が完全に除去されている。
低減したADCC活性
一態様において、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、低減したADCC活性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。別の態様では、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドより、少なくとも2倍、又は少なくとも3倍、又は少なくとも5倍、又は少なくとも10倍、又は少なくとも50倍、又は少なくとも100倍低いADCC活性を呈示するか、又は300μg/mlの濃度で検出不可能なADCC活性を有するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。さらに別の態様では、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドに対して、少なくとも10%、又は少なくとも20%、又は少なくとも30%、又は少なくとも40%、又は少なくとも50%、又は少なくとも60%、又は少なくとも70%、又は少なくとも80%、又は少なくとも90%、又は少なくとも100%、又は少なくとも200%、又は少なくとも300%、又は少なくとも400%、又は少なくとも500%低減したADCC活性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。特定の態様では、検出不可能なADCC活性を有するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。
一態様において、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、低減したADCC活性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。別の態様では、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドより、少なくとも2倍、又は少なくとも3倍、又は少なくとも5倍、又は少なくとも10倍、又は少なくとも50倍、又は少なくとも100倍低いADCC活性を呈示するか、又は300μg/mlの濃度で検出不可能なADCC活性を有するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。さらに別の態様では、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドに対して、少なくとも10%、又は少なくとも20%、又は少なくとも30%、又は少なくとも40%、又は少なくとも50%、又は少なくとも60%、又は少なくとも70%、又は少なくとも80%、又は少なくとも90%、又は少なくとも100%、又は少なくとも200%、又は少なくとも300%、又は少なくとも400%、又は少なくとも500%低減したADCC活性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。特定の態様では、検出不可能なADCC活性を有するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。
具体的態様では、ADCC活性の低減又は除去は、本明細書に記載のIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが、Fcリガンド及び/又は受容体に対して呈示する親和性の低減に起因すると考えられる。
具体的態様において、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、ADCC活性の低減又は除去を呈示するFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供される。別の具体的態様では、EU位置252、254、及び256からなる群から選択される1つ又は複数の位置に置換(例えば、Y、YT、YE、YTE突然変異)をさらに含むFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供され、これは、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、ADCC活性の低減又は除去を呈示する。
本明細書に記載のIgG変異型ドメイン含有ポリペプチドは、1つ又は複数のFcγR媒介エフェクター細胞機能を決定するためのin vitro機能アッセイによって特性決定することができる。特定の態様では、in vitroアッセイのものと同様の結合特性及びエフェクター細胞機能をin vivoモデルにおいて有するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。しかし、本開示は、in vitroアッセイで要望される表現型を呈示しないが、in vivoで要望される表現型を呈示する、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドを排除しない。
低減したCDC活性
一態様において、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、低減したCDC活性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。別の態様では、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドより、少なくとも2倍、又は少なくとも3倍、又は少なくとも5倍、又は少なくとも10倍、又は少なくとも50倍、又は少なくとも100倍低いCDC活性を呈示する、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。さらに別の態様では、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドに対して、少なくとも10%、又は少なくとも20%、又は少なくとも30%、又は少なくとも40%、又は少なくとも50%、又は少なくとも60%、又は少なくとも70%、又は少なくとも80%、又は少なくとも90%、又は少なくとも100%、又は少なくとも200%、又は少なくとも300%、又は少なくとも400%、又は少なくとも500%低減したCDC活性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。特定の態様では、検出可能なCDC活性を一切呈示しないIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。具体的態様では、CDC活性の低減及び/又は除去は、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが、Fcリガンド及び/又は受容体に対して呈示する親和性の低減に起因すると考えられる。
一態様において、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、低減したCDC活性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。別の態様では、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドより、少なくとも2倍、又は少なくとも3倍、又は少なくとも5倍、又は少なくとも10倍、又は少なくとも50倍、又は少なくとも100倍低いCDC活性を呈示する、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。さらに別の態様では、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドに対して、少なくとも10%、又は少なくとも20%、又は少なくとも30%、又は少なくとも40%、又は少なくとも50%、又は少なくとも60%、又は少なくとも70%、又は少なくとも80%、又は少なくとも90%、又は少なくとも100%、又は少なくとも200%、又は少なくとも300%、又は少なくとも400%、又は少なくとも500%低減したCDC活性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。特定の態様では、検出可能なCDC活性を一切呈示しないIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。具体的態様では、CDC活性の低減及び/又は除去は、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが、Fcリガンド及び/又は受容体に対して呈示する親和性の低減に起因すると考えられる。
具体的態様において、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、CDC活性の低減又は完全な除去を呈示するFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供される。別の具体的態様では、EU位置252、254、及び256からなる群から選択される1つ又は複数の位置に置換(例えば、Y、YT、YE、YTE突然変異)をさらに含むFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供され、これは、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、CDC活性の低減又は完全な除去を呈示する。
低減した毒性
エフェクター機能(例えば、ADCC及びCDC)は、臨床効果に寄与する重要な機序となり得るが、生物学的療法は、不要な細胞及び/又は標的を認識して攻撃するよう免疫系に指令する複雑な性質に関連する有害な毒性の課題を呈し得ることが当分野において理解されている。さらに、攻撃のための認識及び/又はターゲティングが、治療が必要な部位で実施されない場合、有害な毒性などの結果が起こり得る。従って、所望する作用の機序に応じて、関連する毒性を低減するように所与の治療分子のエフェクター機能を調節することができる。
エフェクター機能(例えば、ADCC及びCDC)は、臨床効果に寄与する重要な機序となり得るが、生物学的療法は、不要な細胞及び/又は標的を認識して攻撃するよう免疫系に指令する複雑な性質に関連する有害な毒性の課題を呈し得ることが当分野において理解されている。さらに、攻撃のための認識及び/又はターゲティングが、治療が必要な部位で実施されない場合、有害な毒性などの結果が起こり得る。従って、所望する作用の機序に応じて、関連する毒性を低減するように所与の治療分子のエフェクター機能を調節することができる。
一態様において、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、低減した毒性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。別の態様では、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドより、少なくとも2倍、又は少なくとも3倍、又は少なくとも5倍、又は少なくとも7倍、又は少なくとも10倍、又は少なくとも20倍、又は少なくとも30倍、又は少なくとも40倍、又は少なくとも50倍、又は少なくとも60倍、又は少なくとも70倍、又は少なくとも80倍、又は少なくとも90倍、又は少なくとも100倍、又は少なくとも200倍低い毒性を呈示する、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。別の態様では、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドに対して、少なくとも10%、又は少なくとも20%、又は少なくとも30%、又は少なくとも40%、又は少なくとも50%、又は少なくとも60%、又は少なくとも70%、又は少なくとも80%、又は少なくとも90%、又は少なくとも100%、又は少なくとも200%、又は少なくとも300%、又は少なくとも400%、又は少なくとも500%低減した毒性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。
具体的態様において、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、低減した毒性を呈示するFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供される。別の具体的態様では、EU位置252、254、及び256からなる群から選択される1つ又は複数の位置に置換(例えば、Y、YT、YE、YTE突然変異)をさらに含むFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供され、これは、野生型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、低減した毒性を呈示する。
増大した安定性
別の態様において、FES−YTE変異型IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、増大した安定性、例えば、熱安定性を有するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。ある態様では、EU位置252、254、及び256からなる群から選択される1つ又は複数の位置に置換(例えば、Y、YT、YE、YTE突然変異)をさらに含むFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供され、これは、FES−YTE変異型IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、増大した安定性、例えば、熱安定性を有する。具体的態様では、YTE突然変異をさらに含むFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供され、これは、FES−YTE変異型IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、増大した安定性、例えば、熱安定性を有する。
別の態様において、FES−YTE変異型IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、増大した安定性、例えば、熱安定性を有するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。ある態様では、EU位置252、254、及び256からなる群から選択される1つ又は複数の位置に置換(例えば、Y、YT、YE、YTE突然変異)をさらに含むFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供され、これは、FES−YTE変異型IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、増大した安定性、例えば、熱安定性を有する。具体的態様では、YTE突然変異をさらに含むFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供され、これは、FES−YTE変異型IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、増大した安定性、例えば、熱安定性を有する。
本明細書で用いる「安定性」という用語は、環境条件(例えば、高温又は低温)に応じたポリペプチドの1つ又は複数の物理的性質の維持の当分野で認定された尺度を指す。特定の態様では、物理的性質は、ポリペプチドの共有結合構造の維持(例えば、タンパク質分解切断、不要な酸化又は脱アミノの非存在)であってよい。別の態様では、物理的性質はまた、適正に折りたたまれた状態のポリペプチドの存在(例えば、可溶性若しくは不溶性凝集体又は沈殿物の非存在)であってもよい。一態様において、ポリペプチドの安定性は、ポリペプチドの生物物理学的特性、例えば、熱不安定性、pHアンフォールディングプロフィール、グリコシル化の安定な除去、生化学的機能(例えば、別のタンパク質に結合する能力)、フラグメント化率(%)、純度損失など、及び/又はこれらの組合せをアッセイすることにより測定する。別の態様では、生化学的機能は、相互作用の結合親和性によって証明される。
一態様において、タンパク質安定性の尺度は、熱安定性、すなわち、熱攻撃に対する耐性である。安定性は、当分野では公知の方法、例えば、HPLC(高性能液体クロマトグラフィー)、SEC(サイズ排除クロマトグラフィー)、DLS(動的光散乱法)などを用いて、測定することができる。熱安定性を測定する方法としては、限定するものではないが、示差走査熱量測定(DSC)、示差走査蛍光定量法(DSF)、円偏光二色性(CD)、及び熱攻撃アッセイが挙げられる。
ある態様において、FES−YTE変異型IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、増大した熱安定性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。ある態様では、FES−YTE変異型IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、DSCにより測定される熱安定性に、少なくとも1℃、少なくとも2℃、少なくとも3℃、少なくとも4℃、少なくとも5℃、少なくとも6℃、少なくとも7℃、少なくとも8℃、少なくとも9℃若しくは少なくとも10℃の増大を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。別の態様では、FES−YTE変異型IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、DSCにより測定される熱安定性に、約1℃、約2℃、約3℃、約4℃、約5℃、約6℃、約7℃、約8℃、約9℃若しくは約10℃の増大を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。
ある態様では、EU位置252、254、及び256からなる群から選択される1つ又は複数の位置に置換(例えば、Y、YT、YE、YTE突然変異)をさらに含むFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供され、これは、FES−YTE変異型IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、DSCにより測定される熱安定性に増大を呈示する。具体的態様では、YTE突然変異をさらに含むFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供され、これは、FES−YTE変異型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、DSCにより測定される熱安定性に増大を呈示する。
ある態様では、FES−YTE変異型IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、増大した熱安定性を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。ある態様では、熱安定性は、DSF及びSYPRO(登録商標)Orange DSF蛍光プローブを用いて測定される。当業者であれば、DSFによりタンパク質安定性を測定するために、SYPRO(登録商標)Orange以外の蛍光プローブ、例えば、中でもNile Red、SYPRO(登録商標)Red、ダポキシルスルホン酸、ビス−アニリノナフタレンスルホン酸(ビス−ANS)、1−アニリノナフタレン−8−スルホン酸(1,8−ANS)、又はCPMなど(例えば、Niesen et al.,Nature Protocols 2:2212−21(2007)を参照)を使用できることは理解されよう。
ある態様では、FES−YTE変異型IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、SYPRO(登録商標)Orangeを用いたDSFにより測定される熱安定性に、少なくとも1℃、少なくとも2℃、少なくとも3℃、少なくとも4℃、少なくとも5℃、少なくとも6℃、少なくとも7℃、少なくとも8℃、少なくとも9℃若しくは少なくとも10℃の増大を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。別の態様では、FES−YTE変異型IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、SYPRO(登録商標)Orangeを用いたDSFにより測定される熱安定性に、約1℃、約2℃、約3℃、約4℃、約5℃、約6℃、約7℃、約8℃、約9℃若しくは約10℃の増大を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。
ある態様において、EU位置252、254、及び256からなる群から選択される1つ又は複数の位置に置換(例えば、Y、YT、YE、YTE突然変異)をさらに含むFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供され、これは、FES−YTE変異型IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、SYPRO(登録商標)Orangeを用いたDSFにより測定される熱安定性に増大を呈示する。具体的態様では、YTE突然変異をさらに含むFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供され、これは、FES−YTE変異型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、SYPRO(登録商標)Orangeを用いたDSFにより測定される熱安定性に増大を呈示する。
ある態様において、FES−YTE IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、ポリエチレングリコール(PEG)沈殿アッセイを用いて測定される増大した見かけ溶解度を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。例えば、Middaugh et al.,J.Biol.Chem.254:367−370(1979);Shire et al.,eds.,2010,Current Trends in Monoclonal Antibody Development and Manufacturing,Springer;Gibson et al.,J.Pharm.Sci.100:1009−21(2011)を参照されたい。ある態様では、EU位置252、254、及び256からなる群から選択される1つ又は複数の位置に置換(例えば、Y、YT、YE、YTE突然変異)をさらに含むFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供され、これは、FES−YTE変異型IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、ポリエチレングリコール(PEG)沈殿アッセイを用いて測定される増大した見かけ溶解度を呈示する。具体的態様では、YTE突然変異をさらに含むFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供され、これは、FES−YTE変異型IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドと比較して、ポリエチレングリコール(PEG)沈殿アッセイを用いて測定される増大した見かけ溶解度を呈示する。
貯蔵中のバイオ医薬品は、時間の経過と共に変化するが、その特性が製造業者の規格の範囲内に維持されている限り、安定しているとみなされる。製剤が、推奨される貯蔵条件で安定した状態を維持する日数は、貯蔵寿命と呼ばれる。製剤の貯蔵寿命を推定する基準として役立つデータ収集に一般に用いられる実験プロトコルは、安定性アッセイと呼ばれる。貯蔵寿命は、一般に、安定性試験の種類:リアルタイム安定性アッセイ及び加速安定性アッセイに従って推定する。加速安定性アッセイでは、製剤を増大したストレス条件:例えば、温度、湿度及びpH下で貯蔵する。例えば、Tydeman及びKirkwood,J.Biol.Stand.12:195−206(1984);Some et al.,J.Pharm.Sci.90:1759−66(2001);FDA.Guidelines for submitting documentations for the stability of human drugs and biologics.Rockville(MD),1987を参照されたい。
ある態様において、FES−YTE変異型IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、加速安定性アッセイを用いて測定される安定性の増大を呈示するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドが提供される。ある態様では、EU位置252、254、及び256からなる群から選択される1つ又は複数の位置に置換(例えば、Y、YT、YE、YTE突然変異)をさらに含むFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供され、これは、FES−YTE変異型IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、加速安定性アッセイを用いて測定される安定性の増大を呈示する。具体的態様では、YTE突然変異をさらに含むFQQ、FQG又はFAQ変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドが提供され、これは、FES−YTE変異型IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、加速安定性アッセイを用いて測定される安定性の増大を呈示する。
ある態様において、加速安定性アッセイは、長期間にわたるIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドのインキュベーション及び/又は高温でのインキュベーションを含む。別の態様では、加速安定性アッセイは、高濃度でのIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドのインキュベーションにより実施する。ある態様では、加速安定性アッセイによる測定は、高性能サイズ排除クロマトグラフィー(HPSEC)を用いて実施する。他の態様では、加速安定性アッセイによる測定は、動的光散乱法(DSL)を用いて実施する。当業者であれば、当分野で公知の各種方法によりポリペプチド凝集を測定できることを理解されよう。
ある態様において、加速安定性アッセイの長期の時間は、少なくとも1週間、少なくとも2週間、少なくとも3週間、少なくとも4週間、少なくとも1ヵ月、少なくとも2ヶ月、少なくとも3ヵ月、又は少なくとも4ヶ月である。別の態様では、加速安定性アッセイの長期の時間は、約1週間、約2週間、約3週間、約4週間、約1ヵ月、約2ヶ月、約3ヵ月、又は約4ヶ月である。
ある態様において、加速安定性アッセイで用いるIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドの濃度は、少なくとも10mg/ml、少なくとも15mg/ml、少なくとも20mg/ml、少なくとも25mg/ml、少なくとも30mg/ml、少なくとも35mg/ml、少なくとも40mg/ml、少なくとも45mg/ml、又は少なくとも50mg/mlである。ある態様では、加速安定性アッセイで用いるIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドの濃度は、約10mg/ml、約15mg/ml、約20mg/ml、約25mg/ml、約30mg/ml、約35mg/ml、約40mg/ml、約45mg/ml、又は約50mg/mlである。
ある態様において、加速安定性アッセイで用いる温度は、少なくとも30℃、少なくとも35℃、少なくとも40℃、少なくとも45℃、少なくとも50℃、少なくとも55℃、又は少なくとも60℃である。ある態様において、加速安定性アッセイで用いる高温は、約30℃、約35℃、約40℃、約45℃、約50℃、約55℃、又は約60℃である。
方法
ある態様において、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドのFc誘導性エフェクター機能(例えば、ADCC及び/又はCDC)を低減する方法が提供され、この方法は、以下:(a)FcドメインにおけるEU位置234のアミノ酸をフェニルアラニン(F)で置換するステップ;(b)FcドメインにおけるEU位置235のアミノ酸をアラニン(A)、アスパラギン(N)、フェニルアラニン(F)、グルタミン(Q)、若しくはバリン(V)で置換するステップ;(c)FcドメインのEU位置322のアミノ酸をアラニン(A)、アスパラギン酸(D)、グルタミン酸(E)、ヒスチジン(H)、アスパラギン(N)、若しくはグルタミン(Q)で置換するステップ;又はFcドメインのEU位置331のアミノ酸をアラニン(A)若しくはグリシン(G)で置換するステップを含む。ある態様において、親ポリペプチドのFcドメインは、EU位置252にチロシン(Y);及び/又はEU位置254にトレオニン(T);及び/又はEU位置256にグルタミン酸(E)を含む。ある具体的態様では、親ポリペプチドのFcドメインは、EU位置252にチロシン(Y)、EU位置254にトレオニン(T)、及びEU位置256にグルタミン酸(E)を含む。すなわち、親ポリペプチドのFcドメインは、YTE変異型IgG Fcドメインである。
ある態様において、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドのFc誘導性エフェクター機能(例えば、ADCC及び/又はCDC)を低減する方法が提供され、この方法は、以下:(a)FcドメインにおけるEU位置234のアミノ酸をフェニルアラニン(F)で置換するステップ;(b)FcドメインにおけるEU位置235のアミノ酸をアラニン(A)、アスパラギン(N)、フェニルアラニン(F)、グルタミン(Q)、若しくはバリン(V)で置換するステップ;(c)FcドメインのEU位置322のアミノ酸をアラニン(A)、アスパラギン酸(D)、グルタミン酸(E)、ヒスチジン(H)、アスパラギン(N)、若しくはグルタミン(Q)で置換するステップ;又はFcドメインのEU位置331のアミノ酸をアラニン(A)若しくはグリシン(G)で置換するステップを含む。ある態様において、親ポリペプチドのFcドメインは、EU位置252にチロシン(Y);及び/又はEU位置254にトレオニン(T);及び/又はEU位置256にグルタミン酸(E)を含む。ある具体的態様では、親ポリペプチドのFcドメインは、EU位置252にチロシン(Y)、EU位置254にトレオニン(T)、及びEU位置256にグルタミン酸(E)を含む。すなわち、親ポリペプチドのFcドメインは、YTE変異型IgG Fcドメインである。
ある態様において、IgG Fcドメインを含む親ポリペプチドのFc誘導性エフェクター機能(例えば、ADCC及び/又はCDC)を低減すると共に、その半減期を増大する方法も提供され、この方法は、以下:(a)FcドメインにおけるEU位置234のアミノ酸をフェニルアラニン(F)で置換するステップ;(b)FcドメインにおけるEU位置235のアミノ酸をアラニン(A)、アスパラギン(N)、フェニルアラニン(F)、グルタミン(Q)、若しくはバリン(V)で置換するステップ;並びに(c)FcドメインのEU位置322のアミノ酸をアラニン(A)、アスパラギン酸(D)、グルタミン酸(E)、ヒスチジン(H)、アスパラギン(N)、若しくはグルタミン(Q)で置換するステップ;又はFcドメインのEU位置331のアミノ酸をアラニン(A)若しくはグリシン(G)で置換するステップ;並びに(d)EU位置252のアミノ酸をチロシン(Y)で置換するステップを含む。ある態様では、この方法は、EU位置254のアミノ酸をトレオニン(T)で置換するステップ;及びEU位置256のアミノ酸をグルタミン酸(E)で置換するステップをさらに含む。
ある態様において、Fc誘導性エフェクター機能(例えば、ADCC及び/又はCDC)を低減する方法、並びにFc誘導性エフェクター機能(例えば、ADCC及び/又はCDC)を低減すると共に、前述した半減期を増大する方法は、FcドメインにおけるEU位置234のアミノ酸のフェニルアラニン(F)による置換;FcドメインにおけるEU位置235のアミノ酸のグルタミン(Q)による置換;FcドメインにおけるEU位置322のアミノ酸のグルタミン(Q)による置換を含む。
ある態様において、Fc誘導性エフェクター機能(例えば、ADCC及び/又はCDC)を低減する方法、並びにFc誘導性エフェクター機能(例えば、ADCC及び/又はCDC)を低減すると共に、前述した半減期を増大する方法は、FcドメインのEU位置234のアミノ酸のフェニルアラニン(F)による置換;FcドメインのEU位置235のアミノ酸のグルタミン(Q)による置換;FcドメインのEU位置331のアミノ酸のグリシン(G)による置換を含む。
ある態様において、Fc誘導性エフェクター機能(例えば、ADCC及び/又はCDC)を低減する方法、並びにFc誘導性エフェクター機能(例えば、ADCC及び/又はCDC)を低減すると共に、前述した半減期を増大する方法は、FcドメインにおけるEU位置234のアミノ酸のフェニルアラニン(F)による置換;FcドメインにおけるEU位置235のアミノ酸のアラニン(A)による置換;FcドメインにおけるEU位置322のアミノ酸のグルタミン(Q)による置換を含む。
抗体及びそのフラグメント
ある態様において、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドは、抗原結合ドメインを含む。ある具体的態様では、抗原結合ドメインは、抗体、例えば、モノクローナル抗体、又はその抗原結合ドメインであってよい。抗原結合ドメインは、完全長抗体、例えば、ヒト抗体、ヒト化抗体、又はキメラ抗体、又はそのフラグメントであってよい。ある態様では、抗原結合ドメインは、例えば、一本鎖抗体;ダイアボディ;抗体のポリペプチド鎖;F(ab’)2フラグメント;又はF(ab)フラグメントを含む。
ある態様において、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドは、抗原結合ドメインを含む。ある具体的態様では、抗原結合ドメインは、抗体、例えば、モノクローナル抗体、又はその抗原結合ドメインであってよい。抗原結合ドメインは、完全長抗体、例えば、ヒト抗体、ヒト化抗体、又はキメラ抗体、又はそのフラグメントであってよい。ある態様では、抗原結合ドメインは、例えば、一本鎖抗体;ダイアボディ;抗体のポリペプチド鎖;F(ab’)2フラグメント;又はF(ab)フラグメントを含む。
「抗体変異体(抗体バリアント)」という用語は、本明細書に記載の変異型IgG Fcドメイン含有ポリペプチドを指し、ここで、このポリペプチドは抗体である。抗体変異体としては、モノクローナル抗体、多重特異性抗体、ヒト抗体、ヒト化抗体、ラクダ化(camelized)抗体、キメラ抗体、抗イディオタイプ(抗−Id)抗体、及びこれらのいずれかのFcドメイン含有フラグメントが挙げられる。ある態様では、抗体変異体は、免疫グロブリン分子及び免疫グロブリン分子の免疫学的に活性のフラグメント、すなわち、抗原結合ドメインを含有する分子を包含し、ここで、これらのフラグメントは、本明細書に記載する変異型IgG Fcドメインを含む別の免疫グロブリンドメインに融合又は結合させることができる。一態様では、抗体変異体は、ヒトIgG1、IgG2、IgG3又はIgG4アイソタイプのものである。
本明細書に記載の変異型IgG Fcドメインを含む抗体変異体及びそのフラグメントは、鳥類及び哺乳動物(例えば、ヒト、マウス若しくはラットなどのげっ歯類、ロバ、ヒツジ、ウサギ、ヤギ、モルモット、ラクダ、ウマ、又はニワトリ)を含むあらゆる動物に由来するものでよい。具体的態様では、抗体変異体は、ヒト又はヒト化モノクローナル抗体である抗体変異体が提供される。本明細書で用いる場合、「ヒト」抗体は、ヒト免疫グロブリンのアミノ酸配列を有する抗体を含み、また、ヒト免疫グロブリン、又はヒト遺伝子由来の抗体を発現するマウスから単離された抗体を含む。
抗体変異体は、単一特異性、二重特異性、三重特異性であってもよいし、又はより大きな特異性を有することもできる(多重特異性抗体)。多重特異性抗体変異体は、要望される標的分子の様々なエピトープに特異的に結合することができるか、又は標的分子と、異種ポリペプチド若しくは固体支持体材料などの異種エピトープの両方に特異的に結合することができる。例えば、以下の文献を参照されたい:国際公開番号:国際公開第94/04690号パンフレット;国際公開第93/17715号パンフレット;国際公開第92/08802号パンフレット;国際公開第91/00360号パンフレット;及び国際公開第92/05793号パンフレット;Tutt et al.,J.Immunol.147:60−69(1991);米国特許第4,474,893号明細書、米国特許第4,714,681号明細書、米国特許第4,925,648号明細書、米国特許第5,573,920号明細書、及び米国特許第5,601,819号明細書;並びにKostelny et al.,J.Immunol.148:1547(1992)。二重特異性又は多重特異性抗体を作製するための方法は当分野では公知である。
変異型IgG Fcドメインを含む抗体を生成する方法
抗体変異体又はそのフラグメントは、特に、化学的合成又は組換え発現技術により、抗体の合成のために当分野では公知のいずれかの方法により生成することができる。
抗体変異体又はそのフラグメントは、特に、化学的合成又は組換え発現技術により、抗体の合成のために当分野では公知のいずれかの方法により生成することができる。
モノクローナル抗体変異体は、ハイブリドーマ、組換え、及びファージ展示技術の使用、又はこれらの組合せなど、当分野では公知の多様な技術を用いて作製することができる。例えば、モノクローナル抗体変異体は、ハイブリドーマ技術を用いて生成することができ、そのようなものとして、当分野では公知であり、例えば、以下の文献に教示されているものがある:Harlow et al.,Antibodies:A Laboratory Manual,(Cold Spring Harbor Laboratory Press,2nd ed.1988);Hammerling,et al.,in:Monoclonal Antibodies and T−Cell Hybridomas 563−681(Elsevier,N.Y.,1981)。ハイブリドーマ技術を用いて、特定の抗体を生成及びスクリーニングする方法は常用であり、当分野では公知である。
抗体変異体は、当分野では公知の様々な方法により作製することができる。非制限的例は、抗体コード領域を(例えば、ハイブリドーマから)単離するステップと、1つ又は複数のFcドメインアミノ酸置換を単離された抗体コード領域に導入するステップとを含む。あるいは、本明細書に記載の変異型IgG Fcドメインをコードするベクターに可変領域をサブクローン化することも可能である。
特定のエピトープを認識する抗体変異体フラグメントは、当分野では公知の任意の技術により作製することができる。ヒトにおける抗体変異体のin vivo使用及びin vitro検出アッセイなどのいくつかの用途の場合、ヒト又はキメラ抗体変異体を使用することが有利となり得る。完全にヒトの抗体は、ヒト被験者の治療的処理の場合、特に望ましい。本明細書に記載の変異型IgG Fcドメインを含むヒト抗体又はそのフラグメントは、当分野では公知の様々な方法によって作製することができる。例えば、以下の文献を参照されたい:米国特許第4,444,887号明細書、米国特許第4,716,111号明細書;並びに国際公開番号:国際公開第98/46645号パンフレット、国際公開第98/50433号パンフレット、国際公開第98/24893号パンフレット、国際公開第98/16654号パンフレット、国際公開第96/34096号パンフレット、国際公開第96/33735号パンフレット、及び国際公開第91/10741号パンフレット。
本明細書に記載の変異型IgG Fcドメインを含むキメラ抗体変異体又はそのフラグメントは、当分野では公知の様々な方法によって作製することができる。例えば、以下の文献を参照されたい:Morrison,Science 229:1202(1985);Oi et al.,BioTechniques 4:214(1986);Gillies et al.,J.Immunol.Methods 125:191−202(1989);米国特許第5,807,715号明細書、米国特許第4,816,567号明細書、米国特許第4,816,397号明細書、及び米国特許第6,311,415号明細書。特定の態様では、ヒト化抗体変異体又はそのフラグメントは、本明細書に記載の変異型IgG Fcドメインを含む。ヒト化抗体変異体は、当分野では公知の様々な技術を用いて生成することができ、そのような技術として、限定するわけではないが、以下のものが挙げられる:CDRグラフティング(欧州特許第239,400号明細書;国際公開第91/09967号パンフレット;及び米国特許第5,225,539号明細書、米国特許第5,530,101号明細書、及び米国特許第5,585,089号明細書)、ベニア化若しくは再表面化(欧州特許第592,106号明細書及び欧州特許第519,596号明細書;Padlan,Molecular Immunology 28:489−498(1991);Studnicka et al.,Protein Engineering 7:805−814(1994);及びRoguska et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 91:969−973(1994))、チェーンシャッフリング(米国特許第5,565,332号明細書)、並びに例えば、下記の文献に開示されている技術:米国特許第6,407,213号明細書及び米国特許第5,766,886号明細書、国際公開第9317105号パンフレット、Tan et al.,J.Immunol.169:1119−25(2002)、Caldas et al.,Protein Eng.13:353−60(2000)、Morea et al.,Methods 20:267−79(2000),Baca et al.,J.Biol.Chem.272:10678−84(1997)、Roguska et al.,Protein Eng.9:895−904(1996)、Couto et al.,Cancer Res.55(23 Supp):5973s−5977s(1995)、Couto et al.,Cancer Res.55:1717−22(1995),Sandhu,Gene 150:409−10(1994)、及びPedersen et al.,J.Mol.Biol.235:959−73(1994)。
ヒト抗体変異体はまた、機能性内在性免疫グロブリン遺伝子を発現することができないが、ヒト免疫グロブリンを発現することができるトランスジェニックマウスを用いて生成することもできる。例えば、ヒト重鎖及び軽鎖免疫グロブリン遺伝子複合体をランダムに、又は相同的組換えにより、マウス胚性幹細胞に導入することができる。あるいは、ヒト重鎖及び軽鎖遺伝子に加えて、ヒト可変領域、定常領域、及び多様性領域もマウス胚性幹細胞に導入することができる。マウス重鎖及び軽鎖免疫グロブリン遺伝子は、相同性組換えによりヒト免疫グロブリン遺伝子座の導入とは別に、又は導入と同時に非機能性にすることができる。特に、JH領域の同型接合性欠失は、内在性抗体生成を妨げる。修飾された胚性幹細胞を増殖して、マイクロインジェクションで芽細胞に導入することにより、キメラマウスを作製する。次に、キメラマウスを繁殖させて、ヒト抗体を発現する同型接合性子孫を生産する。トランスジェニックマウスを通常の方法で、選択した抗原又はその免疫原性フラグメントで免疫する。
抗原に対するモノクローナル抗体は、従来のハイブリドーマ技術を用いて免疫したトランスジェニックマウスから得ることができる。トランスジェニックマウスが保有するヒト免疫グロブリントランスジーンは、B細胞分化の間に再配列し、続いて、クラススイッチ及び体細胞突然変異を被る。従って、このような技術を用いて、治療に有用な抗体を生成することが可能である。ヒト抗体を生成する上記の技術の概要については、Lonberg及びHuszar,Int.Res.Immunol.13:65−93(1995)を参照されたい。ヒト抗体及びヒトモノクローナル抗体を生成する上記の技術並びにこのような抗体を生成するためのプロトコルの詳細については、例えば、以下の文献を参照されたい:国際公開第98/24893号パンフレット、国際公開第96/34096号パンフレット、及び国際公開第96/33735号パンフレット;並びに米国特許第5,413,923号明細書、米国特許第5,625,126号明細書、米国特許第5,633,425号明細書、米国特許第5,569,825号明細書、米国特許第5,661,016号明細書、米国特許第5,545,806号明細書、米国特許第5,814,318号明細書、及び米国特許第5,939,598号明細書。
ポリヌクレオチド
IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドが提供される。また、高度ストリンジェンシー、中度又は低度ストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件下で、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドとハイブリダイズするポリヌクレオチドも提供される。
IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドが提供される。また、高度ストリンジェンシー、中度又は低度ストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件下で、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドとハイブリダイズするポリヌクレオチドも提供される。
ある態様では、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列は、好適な供給源から得られる親ポリヌクレオチド配列から生成することができる。ポリヌクレオチド配列を取得したら、ヌクレオチド配列の操作のための当分野では公知の方法、例えば、組換えDNA技術、部位指定突然変異、PCRなど(例えば、下記の文献に記載されている技術を参照:Sambrook et al.,1990,Molecular Cloning,A Laboratory Manual,2d Ed.,Cold Spring Harbor Laboratory,Cold Spring Harbor,N.Y.及びAusubel et al., eds.1998,Current Protocols in Molecular Biology,John Wiley & Sons NY;尚、いずれの文献も参照としてその全体を本明細書に組み込む)を用いて、ポリヌクレオチド配列を操作することにより、異なるアミノ酸配列を有するIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドを作製する、例えば、アミノ酸置換、欠失、及び/又は挿入を形成することができる。
別の態様では、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列は、化学的に合成されたオリゴヌクレオチドからアセンブリングすることができる(例えば、Kutmejer et al.BioTechniques 17:242(1994)に記載のように)が、これは、手短には、コード配列の一部を含む重複オリゴヌクレオチドの合成、これらオリゴヌクレオチドのアニーリング及び連結、続いてPCRによる連結オリゴヌクレオチドの増幅を含む。
特定の抗原及び融合相手
変異体IgG Fcドメインを含む結合分子、例えば、抗体、融合タンパク質、又はコンジュゲートを用いて、ほぼ全ての分子をターゲティングすることができる。さらに、ほぼ全ての分子を、本明細書に記載の変異体IgG Fcドメインを含む融合タンパク質又はコンジュゲートに組み込むこともできる。
変異体IgG Fcドメインを含む結合分子、例えば、抗体、融合タンパク質、又はコンジュゲートを用いて、ほぼ全ての分子をターゲティングすることができる。さらに、ほぼ全ての分子を、本明細書に記載の変異体IgG Fcドメインを含む融合タンパク質又はコンジュゲートに組み込むこともできる。
これらの具体的標的分子及び/又は融合相手として、限定するわけではないが、以下のタンパク質のリストに属するタンパク質、並びにサブユニット、ドメイン、部分及びエピトープが挙げられる:レニン;ヒト成長ホルモン及びウシ成長ホルモンなどの成長ホルモン;成長ホルモン放出因子;副甲状腺ホルモン;甲状腺刺激ホルモン;リポタンパク質;α−1−抗トリプシン;インスリンA鎖;インスリンB鎖;プロインスリン;卵胞刺激ホルモン;カルシトニン;黄体形成ホルモン;グルカゴン;第VII因子、第VIIIC因子、第IX因子、組織因子(TF)、及びフォン・ヴィレブランド因子などの凝固因子;プロテインCなどの抗凝固因子;心房ナトリウム利尿因子;肺サーファクタント;ウロキナーゼ又はヒト尿又は組織プラスミノーゲン活性化因子などのプラスミノーゲン活性化因子(t−PA);ボンベシン;トロンビン;造血成長因子;腫瘍壊死因子−α及び−β;エンケファリナーゼ;RANTES(regulated on activation normally T−cell expressed and secreted);ヒトマクロファージ炎症性タンパク質(MIP−1−α);ヒト血清アルブミンなどの血清アルブミン;ミュラー管抑制物質;リラキシンA鎖;リラキシンB鎖;プロレラキシン;マウスゴナドトロピン関連ペプチド;β−ラクタマーゼなどの微生物タンパク質;DNase;IgE;CTLA−4などの細胞傷害性Tリンパ球関連抗原(CTLA);インヒビン;アクチビン;血管内皮細胞成長因子(VEGF);例えば、EGFR、VEGFRなどのホルモン又は成長因子に対する受容体;αインターフェロン(α−IFN)、βインターフェロン(β−IFN)及びγインターフェロン(γ−IFN)などのインターフェロン;プロテインA又はD;リウマチ因子;骨由来神経栄養因子(BDNF)、ニュートロフィン−3、−4、−5若しくは−6(NT−3、NT−4、NT−5若しくはNT−6)、又は神経成長因子などの神経栄養因子;血小板由来成長因子(PDGF);AFGF及びPFGFなどの線維芽成長因子;上皮成長因子(EGF);TGF−α及びTGF−β(TGF−1、TGF−2、TGF−3、TGF−4、若しくはTGF−5など)のようなトランスフォーミング増殖因子;インスリン様成長因子I及びII(IGF−I及びIGF−II);des(1−3)−IGF−I(脳IGF−I)、インスリン様成長因子結合タンパク質;CD2、CD3、CD4、CD8、CD11a、CD14、CD18、CD19、CD20、CD22、CD23、CD25、CD33、CD34、CD40、CD40L、CD52、CD63、CD64、CD80及びCD147などのCDタンパク質;エリスロポエチン;骨誘導因子;免疫毒素;骨形成タンパク質(BMP);インターフェロン−α、−β及び−γなどのインターフェロン;M−CSF、GM−CSF、及びG−CSFなどのコロニー刺激因子(CSF);インターロイキン、例えば、IL−1〜IL−13;TNFα、スーパーオキシドジスムターゼ;T細胞受容体;表面膜タンパク質;崩壊促進因子;例えば、AIDSエンベロープの一部(例:gp120)などのウイルス抗原;輸送タンパク質;ホーミング受容体;アドレシン;調節タンパク質;細胞接着分子、例えば、LFA−1、Mac 1、p150.95、VLA−4、ICAM−1、ICAM−3及びVCAM、a4/p7インテグリン、並びに(Xv/p3インテグリン(1つ又は複数のいずれかのそのサブユニットを含む)、CD49a、CD49b、CD49c、CD49d、CD49e、CD49f、α7、α8、α9、αD、CD11a、CD11b、CD51、CD11c、CD41、αIIb、αIELbなどのインテグリンαサブユニット;CD29、CD18、CD61、CD104、β5、β6、β7及びβ8などのインテグリンβサブユニット;限定するわけではないが、αVβ3、αVβ5及びα4β7などのインテグリンサブユニットの組合せ;アポトーシス経路のメンバー;IgE;血液型抗原;flk2/flt3受容体;肥満(OB)受容体;mp1受容体;CTLA−4;タンパク質C;EphA2、EphA4、EphB2などのEph受容体;HLA−DRなどのヒト白血球抗原(HLA);補体受容体CR1、C1Rqなどの補体タンパク質及びC3及びC5などのその他の補体因子;GpIbα、GpIIb/IIIa及びCD200などの糖タンパク質受容体;並びに上に挙げたポリペプチドのいずれかの断片。
ある態様では、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド(例えば、抗体変異体、融合タンパク質、又はコンジュゲート)は、限定するわけではないが、以下に挙げる癌抗原に特異的に結合することができる:ALK受容体(プレイトロフィン受容体)、プレイトロフィン、KS1/4全身性癌抗原;卵巣癌抗原(CA125);前立腺酸性ホスフェート;前立腺特異的抗原(PSA);メラノーマ関連抗原p97;メラノーマ抗原gp75;高分子量メラノーマ抗原(HMW−MAA);前立腺特異的膜抗原;癌胎児性抗原(CEA);多形性上皮ムチン抗原;ヒト乳脂肪球抗原;CEA、TAG−72、CO17−1A、GICA19−9、CTA−1及びLEAなどの結腸直腸腫瘍関連抗原;バーキットリンパ腫抗原−38.13;CD19;ヒトB細胞リンパ腫抗原−CD20;CD33;ガングリオシドGD2、ガングリオシドGD3、ガングリオシドGM2及びガングリオシドGM3などのメラノーマ特異的抗原;腫瘍特異的移植型細胞表面抗原(TSTA);T抗原、DNA腫瘍ウイルス及びRNA腫瘍ウイルスのエンベロープ抗原などのウイルス誘導性腫瘍抗原;結腸のCEA、5T4癌胎児栄養膜糖タンパク質及び膀胱癌腫瘍癌胎児抗原などの癌胎児抗原−α−フェトプロテイン;ヒト肺癌抗原L6及びL20などの分化抗原;線維肉腫の抗原;ヒト白血病T細胞抗原−Gp37;ネオ糖タンパク質;スフィンゴ脂質;EGFR(表皮成長因子受容体)などの乳癌抗原;NY−BR−16;NY−BR−16及びHER2抗原(p185HER2);多形性上皮ムチン(PEM);悪性ヒトリンパ球抗原−APO−1;胎児赤血球に見出されるI抗原などの分化抗原;成体赤血球に見出される初期内胚葉I抗原;着床前胚;胃腺癌に認められるI(Ma);乳房上皮に認められるM18、M39;骨髄細胞に認められるSSEA−1;VEP8;VEP9;My1;Va4−D5;結腸直腸癌に認められるD156−22;TRA−1−85(血液型H);精巣及び卵巣癌に認められるSCP−1;結腸腺癌に認められるC14;肺腺癌に認められるF3;胃癌に認められるAH6;Yハプテン;胚性癌細胞に認められるLey;TL5(血液型A);A431細胞に認められるEGF受容体;膵臓癌に認められるE1シリーズ(血液型B);胚性癌細胞に認められるFc10.2;胃腺癌抗原;腺癌に認められるCO−514(血液型Lea);腺癌に認められるNS−10;CO−43(血液型Leb);A431細胞のEGF受容体に認められるG49;結腸腺癌に認められるMH2(血液型ALeb/Ley);結腸癌に認められる19.9;胃癌ムチン;骨髄細胞に認められるT5A7;メラノーマに認められるR24;胚性癌に認められる4.2、GD3、D1.1、OFA−1、GM2、OFA−2、GD2、及びM1:22:25:8並びに4〜8細胞期胚に認められるSSEA−3及びSSEA−4;皮膚T細胞リンパ腫抗原;MART−1抗原;シアリル(Sialy)Tn(STn)抗原;結腸癌NY−CO−45;肺癌抗原NY−LU−12変異型A;腺癌抗原ART1;腫瘍随伴性関連脳−精巣癌抗原(腫瘍と神経組織の共通抗原(onconeuronal antigen)MA2;腫瘍随伴性神経抗原);神経−腫瘍学的腹側抗原(neuro−oncological ventral antigen)2(NOVA2);肝細胞癌抗原遺伝子520;腫瘍関連抗原CO−029;腫瘍関連抗原MAGE−C1(癌/精巣抗原CT7)、MAGE−B1(MAGE−XP抗原)、MAGE−B2(DAM6)、MAGE−2、MAGE−4−a、MAGE−4−b及びMAGE−X2;癌/精巣抗原(NY−EOS−1)並びに上に挙げたポリペプチドのいずれかのフラグメント。
さらに別の態様において、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド(例えば、抗体変異体、融合タンパク質、又はコンジュゲート)は、感染因子(例えば、細菌、ウイルス)に特異的に結合することができる。感染性細菌としては、限定するものではないが、グラム陰性菌及びグラム陽性菌が挙げられる。グラム陽性菌としては、限定するわけではないが、パスツレラ属(Pasteurella)種、ブドウ球菌属(Staphylococci)種、及び連鎖球菌属(Streptococcus)種が挙げられる。グラム陰性菌としては、限定するものではないが、大腸菌属(Escherichia coli)、シュードモナス属(Pseudomonas)種、及びサルモネラ属(Salmonella)種が挙げられる。感染性細菌の具体的例を以下に挙げるが、これらに限定されるわけではない:ヘリコバクター・ピロリ(Helicobacter pylori)、ボレリア菌(Borrelia burgdorferi)、レジオネラ・ニューモフィラ(Legionella pneumophilia)、マイコバクテリウム属(Mycobacteria)種(例えば、結核菌(M.tuberculosis)、マイコバクテリウム・アビウム(M.avium)、マイコバクテリウム・イントラセルラレ(M.intracellulare)、カンサシ菌(M.kansasii)、マイコバクテリウム・ゴルドナエ(M.gordonae))、黄色ブドウ球菌(Staphylococcus aureus)、緑濃菌(Pseudomonas aeruginosa)、淋菌(Neisseria gonorrhoeae)、髄膜炎菌(Neisseria meningitidis)、リステリア菌(Listeria monocytogenes)、化膿性連鎖球菌(Streptococcus pyogenes)(A群ストレプトコッカス属)、ストレプトコッカス・アガラクチエ(Streptococcus agalactiae)(B群ストレプトコッカス属)、ストレプトコッカス属(ビリダンス群)、フェカリス菌(Streptococcus faecalis)、ストレプトコッカス・ボビス(Streptococcus bovis)、ストレプトコッカス属(嫌気性種)、肺炎球菌(Streptococcus pneumoniae)、病原性カンピロバクター属(Campylobacter)種、エンテロコッカス属(Enterococcus)種、インフルエンザ菌(Haemophilus influenzae)、炭疽菌(Bacillus anthracis)、ジフテリア菌(Corynebacterium diptheriae)、コリネバクテリウム属(Corynebacterium)種、ブタ丹毒菌(Erysipelothrix rhusiopathae)、ウェルシュ菌(Clostridium perfringens)、破傷風菌(Clostridium tetani)、エンテロバクター・エロゲネス(Enterobacter aerogenes)、肺炎桿菌(Klebsiella pneumoniae)、パスツレラ・ムルトシダ(Pasteurella multocida)、バクテロイデス属(Bacteroides)種、フソバクテリウム・ヌクレアツム(Fusobacterium nucleatum)、ストレプトバチルス・モニリフォルミス(Streptobacillus moniliformis)、梅毒トレポネーマ(Treponema pallidum)、トレポネーマ・ペルテヌエ(Treponema pertenue)、レプトスピラ属(Leptospira)、リケッチア属(Rickettsia)、及びアクチノミセス・イスラエリ(Actinomyces israelii)。ウイルスとしては、限定するものではないが、エンテロウイルス、ロタウイルス、アデノウイルス、肝炎ウイルスがある。ヒトにおいて認められているウイルスの具体的例を以下に挙げるが、これらに限定されるわけではない:レトロウイルス科(Retroviridae)(例えば、ヒト免疫不全ウイルス(HIV);ピコルナウイルス科(Picornaviridae)(例えば、ポリオウイルス、A型肝炎ウイルス;エンテロウイルス、ヒトコクサッキー(Coxsackie)ウイルス、ライノウイルス、エコーウイルス);カリシウイルス科(Calciviridae)(例えば、胃腸炎を引き起こす株);トガウイルス科(Togaviridae)(例えば、ウマ脳炎ウイルス、風疹ウイルス);フラビウイルス科(Flaviviridae)(例えば、デングウイルス、脳炎ウイルス、黄熱病ウイルス);コロナウイルス科(Coronaviridae)(例えば、コロナウイルス);ラブドウイルス科(Rhabdoviridae)(例えば、水疱性口内炎ウイルス、狂犬病ウイルス);フィロウイルス科(Filoviridae)(例えば、エボラウイルス);パラミクソウイルス科(Paramyxoviridae)(例えば、パラインフルエンザウイルス、ムンプスウイルス、麻疹ウイルス、呼吸器合胞体ウイルス);オルトミクソウイルス科(Orthomyxoviridae)(例えば、インフルエンザウイルス)、ブンガウイルス科(Bungaviridae)(例えば、ハンタン(Hantaan)ウイルス、ブンガウイルス、フレボウイルス(phleobovirus)及びナイロ(Nairo)ウイルス);アレナウイルス科(Arena viridae)(出血熱ウイルス);レオウイルス科(Reoviridae)(例えば、レオウイルス、オルビウイルス、及びロタウイルス);ビルナウイルス科(Birnaviridae);ヘパドナウイルス科(Hepadnaviridae)(B型肝炎ウイルス);パルボウイルス科(Parvoviridae)(パルボウイルス);パポバウイルス科(Papovaviridae)(パピローマウイルス、ポリオーマウイルス);アデノウイルス科(Adenoviridae)(大部分のアデノウイルス);ヘルペスウイルス科(Herpesviridae)(例えば単純ヘルペスウイルス(HSV)I及びII、帯状疱疹ウイルス、サイトメガロウイルス(CMV));ポックスウイルス科(痘瘡ウイルス、ワクシニアウイルス、ポックスウイルス);イリドウイルス科(Iridoviridae)(例えば、アフリカブタ熱ウイルス);並びに未分類ウイルス(例えば、海綿状脳疾患の病原体、デルタ肝炎の病原体、非A型、非B型肝炎の病原体;ノーウォーク(Norwalk)及び関連ウイルス及びアストロウイルス)。
コンジュゲート及び誘導体
ある態様において、本明細書に記載の変異型IgG Fcドメインは、限定するわけではないが、ペプチド、ポリペプチド、タンパク質、融合タンパク質、核酸分子、小分子、模倣剤、合成薬、無機分子、及び有機分子などの1つ又は複数の部分と結合又は融合させることができる。
ある態様において、本明細書に記載の変異型IgG Fcドメインは、限定するわけではないが、ペプチド、ポリペプチド、タンパク質、融合タンパク質、核酸分子、小分子、模倣剤、合成薬、無機分子、及び有機分子などの1つ又は複数の部分と結合又は融合させることができる。
ある態様において、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドは、例えば、ポリペプチドへのあらゆるタイプの分子の共有結合、又は化学若しくは酵素修飾により修飾された誘導体を含む。例えば、誘導体は、例えば、グリコシル化、アセチル化、ペギル化、リン酸化、アミド化、公知の保護/遮断基による誘導体化、タンパク質分解切断、細胞リガンド若しくはその他のタンパク質との連結により修飾されたポリペプチドを含む。様々な化学修飾のいずれかを公知の技術により実施することができ、このような技術として、限定するわけではないが、特異的化学分解、アセチル化、ホルミル化などがある。さらに、誘導体は、1つ又は複数の非古典的アミノ酸を含有することもできる。
IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドを、高分子ポリエチレングリコール(PEG)などのポリマー分子に結合させることができる。PEGは、ポリペプチドのN−若しくはC−末端とのPEGの部位特異的結合、又はリシン残基に存在するエプシロン−アミノ基のいずれかにより、多機能リンカーを用いて、又は用いずに、ポリペプチドに結合させることができる。生物活性の損失を最小限にする直鎖状又は分岐状ポリマー誘導体化を用いることができる。
異種タンパク質若しくはポリペプチド(又はそれらの断片、少なくとも10、少なくとも20、少なくとも30、少なくとも40、少なくとも50、少なくとも60、少なくとも70、少なくとも80、少なくとも90若しくは少なくとも100アミノ酸)に化学的に結合させた(共有及び非共有結合の両方を含む)IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドを含むコンジュゲートが提供される。結合は、必ずしも直接である必要はなく、リンカーを介して実施することもできる。このようなリンカー分子は、当分野では公知であり、以下の文献に記載されている:Denardo et al.Clin Cancer Res 4:2483(1998);Peterson et al.Bioconjug.Chem.10:553(1999);Zimmerman et al.Nucl.Med.Biol.26:943(1999);Garnett,Adv.Drug Deliv.Rev.53:171(2002)。
さらに、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドに結合させた異種タンパク質、ペプチド若しくはポリペプチドを含む組成物も提供される。ポリペプチドを抗体部分と融合又は結合させる方法は当分野において公知である。例えば、以下の文献を参照されたい:米国特許第5,336,603号明細書、米国特許第5,622,929号明細書、第5,359,046号明細書、第5,349,053号明細書、第5,447,851号明細書、及び第5,112,946号明細書;欧州特許第307,434号明細書、欧州特許第367,166号明細書;国際公開第96/04388号パンフレット及び国際公開第91/06570号パンフレット;Ashkenazi et al.Proc.Natl.Acad.Sci.USA 88:10535−39(1991,);Zheng et al.J.Immunol.154:5590−5600(1995);Vil et al.Proc.Natl.Acad.Sci.USA89:11337−41(1992)。
ある態様において、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドを診断又は検出可能な薬剤と結合させる。このようなコンジュゲートは、特定の治療法の効果の決定などの臨床試験手順の一環として炎症性疾患の発症又は進行をモニター又は予測する上で有用となり得る。このような診断及び検出は、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドを検出可能な物質と結合させることにより達成することができる。
ある態様において、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドを治療剤と結合させる。IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドは、細胞毒素、例えば、静細胞若しくは細胞致死物質、治療剤又は放射性金属イオン、例えば、α放射体などの治療部分と結合させることができる。細胞毒素若しくは細胞致死物質は、細胞に対して有害な任意の物質を含む。
ある態様において、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドは、所与の生体応答を改変する治療剤又は薬物部分と結合させることができる。治療剤又は薬物部分が古典的化学治療剤に限定されると解釈すべきではない。例えば、薬物部分は、要望される生体活性を有するタンパク質又はポリペプチドであってよい。このようなタンパク質として、例えば、毒素、シトシン、又は成長因子などを挙げることができる。
さらには、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドは、放射性金属イオン(放射性金属の例については上記を参照)を結合させるのに有用な放射性物質又は大環状キレート剤などの治療部分と結合させることができる。
本明細書に記載の変異型IgG Fcドメインを含む抗体、すなわち、抗体変異体を治療部分に結合させることができる。治療部分を抗体に結合させる技術は公知であり、例えば、以下の文献を参照されたい:Arnon et al.,“Monoclonal Antibodies For Immunotargeting Of Drugs in Cancer Therapy”,in Monoclonal Antibodies And Cancer Therapy,Reisfeld et al.(eds.),pp.243−56.(Alan R.Liss,Inc.1985);Hellstrom et al.,“Antibodies For Drug Delivery”,in Controlled Drug Delivery (2nd Ed.),Robinson et al.(eds.),pp.623−53(Marcel Dekker,Inc.1987);Thorpe,“Antibody Carriers Of Cytotoxic Agents in Cancer Therapy:A Review”,in Monoclonal Antibodies 84:Biological And Clinical Applications,Pinchera et al.(eds.),pp.475−506(1985);“Analysis,Results,And Future Prospective Of The Therapeutic Use Of Radiolabeled Antibody in Cancer Therapy”,in Monoclonal Antibodies For Cancer Detection And Therapy,Baldwin et al.(eds.),pp.303−16(Academic Press 1985)、並びにThorpe et al.Immunol.Rev.62:119−58(1982)。あるいは、Segalにより米国特許第4,676,980号明細書に記載されているように、抗体変異体を第2抗体と結合させることにより、抗体ヘテロコンジュゲートを形成することもできる。
ある態様において、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドは、1つ又は複数の改変糖型、すなわち、このポリペプチドに共有結合している炭水化物組成物を含む。改変糖型は、限定するわけではないが、エフェクター機能の低減などの様々な目的に有用となり得る。改変糖型は、当業者には公知の任意の方法、例えば、改変又は変異型発現株の使用、1種又は複数種の酵素(例えば、DI N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIII(GnTI11))との共発現、様々な生物若しくは様々な生物由来の細胞株におけるIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドの発現、又はIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドを発現させた後の炭水化物の修飾により作製することができる。改変糖型を作製する方法は当分野では公知であり、限定するわけではないが、以下の文献に記載のものを含む:Umana et al.,Nat.Biotechnol.17:176−180(1999);Davies et al.,Biotechnol.Bioeng.74:288−294(2001);Shields et al.,J.Biol.Chem.277:26733−26740(2002);Shinkawa et al.,J.Biol.Chem.278:3466−3473(2003);Okazaki et al.,J.Mol.Biol.336:1239−49(2004);米国特許第6,602,684号明細書;米国特許第2009/0004179号明細書;国際公開第00/61739号パンフレット、国際公開第01/292246号パンフレット、国際公開第02/311140号パンフレット、国際公開第02/30954号パンフレット、国際公開第07/005786号パンフレット。
融合タンパク質
Fc融合タンパク質は、免疫グロブリン又はその断片のFcドメインと融合相手(一般に、任意のタンパク質、ポリペプチド、ペプチド、又は小分子であってよい)を結合させる。Fc融合タンパク質の非Fc部分、すなわち融合相手の役割は、必ずというわけではないが、多くの場合、標的との結合を媒介することであるため、抗体の可変領域と機能的に類似している。従って、融合タンパク質、すなわち、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドと、ある分子(例えば、細胞表面受容体、ケモカインなど)に特異的に結合する融合相手が提供される。
Fc融合タンパク質は、免疫グロブリン又はその断片のFcドメインと融合相手(一般に、任意のタンパク質、ポリペプチド、ペプチド、又は小分子であってよい)を結合させる。Fc融合タンパク質の非Fc部分、すなわち融合相手の役割は、必ずというわけではないが、多くの場合、標的との結合を媒介することであるため、抗体の可変領域と機能的に類似している。従って、融合タンパク質、すなわち、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドと、ある分子(例えば、細胞表面受容体、ケモカインなど)に特異的に結合する融合相手が提供される。
ある態様において、融合タンパク質は、ペプチド、ポリペプチド、タンパク質スカホールド、scFv、dsFv、ダイアボディ、Tandab(タンデムダイアボディ)、又はIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドに融合する抗体模倣物を含んでもよい。ある態様では、融合タンパク質は、ペプチド、ポリペプチド、タンパク質スカホールド、scFv、dsFv、ダイアボディ、Tandab、又は抗体模倣物とIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをつなげるリンカー領域を含んでもよい。ポリペプチドをつなげて新規の連結された融合ポリペプチドにするための天然及び人工のペプチドリンカーの使用は、文献からよく知られている(Hallewell et al.,J.Biol.Chem.264,5260−5268(1989);Alfthan et al.,Protein Eng.8,725−731(1995);Robinson & Sauer,Biochemistry 35,109−116(1996);Khandekar et al.,J.Biol.Chem.272,32190−32197(1997);Fares et al.(1998),Endocrinology 139,2459−2464;Smallshaw et al.(1999),Protein Eng.12,623−630;米国特許第5,856,456号明細書)。
ある態様において、融合タンパク質は、変異型IgG Fcドメインを融合相手と結合させるものでよく、融合相手は、一般に、タンパク質であってよく、このようなタンパク質として、限定するわけではないが、リガンド、酵素、受容体のリガンド部分、接着タンパク質、又はいずれか他のタンパク質若しくはドメインなどが挙げられる。例えば、Chamow et al.,Trends Biotechnol.14:52−60(1996);Ashkenazi et al.,Curr.Opin.Immunol.9:195−200(1997);Heidaran et al.,FASEB J.9:140−5(1995)を参照されたい。
一態様において、融合タンパク質は、標的分子に特異的に結合する部分と融合した変異型IgG Fcドメインを含んでもよく、ここで、標的分子は、例えば、リガンド、受容体又はその断片である。融合タンパク質は、前述したアミノ酸置換、例えば、FQQ、FAQ、若しくはFQG Fcドメイン突然変異を含む変異型IgG Fcドメインを含んでもよく、EU位置252、254、及び256からなる群から選択される1つ又は複数の位置に置換、例えば、Y、YT、YE、YTE Fcドメイン突然変異をさらに含んでもよい。
具体的態様において、融合タンパク質は、EU位置234にフェニルアラニン(F)、EU位置235にグルタミン(Q)、及びEU位置322にグルタミン(Q)を含む変異型IgG Fcドメインを含む。ある態様では、FQQ変異型IgG Fcドメインを含む融合タンパク質は、EU位置252にチロシン(Y)、EU位置254にトレオニン(T)、及びEU位置256にグルタミン酸(E)をさらに含む。
別の態様において、融合タンパク質は、EU位置234にフェニルアラニン(F)、EU位置235にグルタミン(Q)、及びEU位置331にグリシン(G)を含む変異型IgG Fcドメインを含む。ある態様では、FQG変異型IgG Fcドメインを含む融合タンパク質は、EU位置252にチロシン(Y)、EU位置254にトレオニン(T)、及びEU位置256にグルタミン酸(E)をさらに含む。
さらに別の態様では、融合タンパク質は、EU位置234にフェニルアラニン(F)、EU位置235にアラニン(A)、及びEU位置322のグルタミン(Q)を含む変異型IgG Fcドメインを含む。ある態様では、FAQ変異型IgG Fcドメインを含む融合タンパク質は、EU位置252にチロシン(Y)、EU位置254位にトレオニン(T)、及びEU位置256にグルタミン酸(E)をさらに含む。
別の態様において、融合タンパク質は、本明細書に記載の変異型IgG Fcドメインと融合した生体活性分子を含む。本明細書に記載の変異型IgG Fcドメインと融合させることができる生体活性分子としては、限定するわけではないが、ペプチド、ポリペプチド、タンパク質、小分子、模倣剤、合成薬、無機分子、及び有機分子が挙げられる。一態様では、生体活性分子は、少なくとも5個、少なくとも10個、少なくとも20個、少なくとも30個、少なくとも40個、少なくとも50個、少なくとも60個、少なくとも70個、少なくとも80個、少なくとも90個又は少なくとも100個の連続したアミノ酸残基を含むポリペプチドであり、これは、本明細書に記載の変異型IgG Fcドメインのアミノ酸配列に対して異種である。
本明細書に記載の変異型IgG Fcドメインを含む融合タンパク質は、精製を容易にするために、限定するわけではないが、ペプチドなどのマーカ配列と融合させることができる。ある態様では、マーカアミノ酸配列は、His6タグ、「フラグ」タグ、血球凝集素「HA」タグ、又は他の市販の様々なタグの1つである。
様々なリンカーを用いて、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドを融合相手に共有結合させることにより、融合タンパク質を作製することができる。あるいは、ポリペプチド、タンパク質及び融合タンパク質は、標準的組換えDNA技術、又はタンパク質合成技術、例えば、ペプチド合成装置により生成することができる。
組換えポリペプチド発現
IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド、誘導体、類似体又はその断片、例えば、本明細書に記載の変異型IgG Fcドメインを含む抗体変異体又は融合タンパク質の組換え発現は、ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクターの構築により達成することができる。IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド(例えば、抗体変異体又は融合タンパク質)をコードするポリヌクレオチドを取得したら、当分野では公知の組換えDNA技術により、ポリペプチド生成のためのベクターを作製することができる。
IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド、誘導体、類似体又はその断片、例えば、本明細書に記載の変異型IgG Fcドメインを含む抗体変異体又は融合タンパク質の組換え発現は、ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクターの構築により達成することができる。IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド(例えば、抗体変異体又は融合タンパク質)をコードするポリヌクレオチドを取得したら、当分野では公知の組換えDNA技術により、ポリペプチド生成のためのベクターを作製することができる。
従って、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド(例えば、抗体変異体又は融合タンパク質)をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを発現させることによりタンパク質を作製する方法が、本明細書に記載される。当業者には公知の方法を用いて、コード配列と適切な転写及び翻訳制御シグナルを含有する発現ベクターを構築することができる。これらの方法には、例えば、in vitro組換えDNA技術、合成技術、及びin vivo遺伝子組換えが含まれる。従って、プロモータに作動可能に連結した、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む複製可能なベクターが提供される。
従来の技術により、発現ベクターを宿主細胞に転移させた後、トランスフェクトした細胞を従来の技術により培養することにより、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドを生成することができる。従って、異種プロモータに作動可能に連結した、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む宿主細胞が提供される。
様々な宿主発現ベクター系を使用して、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドを発現することができる(例えば、米国特許第5,807,715号明細書を参照)。このような宿主発現系は、目的のコード配列を生成し、その後にこれを精製するのに用いられるビヒクルを表すが、適切なヌクレオチドコート配列で形質転換又はトランスフェクトすると、変異型IgG Fcドメインを含むポリペプチドをin situで発現することができる細胞も表す。このような宿主発現系として、限定するわけではないが、以下のものが挙げられる:IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードする1つ又は複数の配列を含む組換えバクテリオファージDNA、プラスミドDNA若しくはコスミドDNAで形質転換させた細菌(例えば、大腸菌(E.coli)及び枯草菌(B.subtilis))などの微生物;IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードする1つ又は複数の配列を含む組換え酵母発現ベクターで形質転換させた酵母(例えば、サッカロミセス・ピキア(Saccharomyces Pichia));IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードする1つ又は複数の配列を含む組換えウイルス発現ベクター(例えば、バキュロウイルス)で感染させた昆虫細胞系;IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードする1つ又は複数の配列を含む組換えウイルス発現ベクター(例えば、カリフラワーモザイクウイルス、CaMV;タバコモザイクウイルス、TMV)で感染させるか、又はIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードする1つ又は複数の配列を含む組換えプラスミド発現ベクター(例えば、Tiプラスミド)で形質転換させた植物細胞系;あるいは、哺乳動物細胞又は哺乳動物ウイルスのゲノム由来のプロモータを含む組換え発現構築物を保有する哺乳動物細胞系(例えば、COS、CHO、BHK、293、NS0、3T3細胞)。
挿入した配列の発現を調節するか、又は要望される特定の様式で遺伝子産物を修飾及びプロセシングする宿主細胞株を選択することができる。タンパク質産物のこのような修飾(例えば、グリコシル化)及びプロセシング(例えば、切断)は、タンパク質の機能に重要となり得る。様々な宿主細胞は、タンパク質及び遺伝子産物の翻訳後プロセシング及び修飾のための特有かつ独特の機構を有する。一次転写物の適正なプロセシング、遺伝子産物のグリコシル化、及びリン酸化のための細胞機構を有する真核宿主細胞を用いることができる。このような哺乳動物宿主細胞としては、限定するわけではないが、CHO、VERY、BHK、HeLa、COS、MDCK、293、3T3、W138、BT483、Hs578T、HTB2、BT20及びT47D、NS0、CRL7O3O及びHsS78Bst細胞が挙げられる。
組換えタンパク質の長期にわたる高収率生成のためには、多くの場合、安定した発現が好ましい。例えば、当分野では公知の方法を用いて、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドを安定して発現する細胞株を作製することができる。
組換え発現により、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド(例えば、抗体変異体又は融合タンパク質)を生成したら、当分野では公知のタンパク質の精製方法、例えば、クロマトグラフィー(例:イオン交換クロマトグラフィー、特にプロテインAの後の特定の抗原に対する親和性によるアフィニティークロマトグラフィー、及びサイジングカラムクロマトグラフィー)、遠心分離、溶解度差、又はその他いずれかの標準的タンパク質精製方法により精製することができる。
特性決定及び機能性アッセイ
IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドは、様々な方法で特性決定することができる。特に、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドは、リガンド、例えば、FcγRIIA、FcγRIIIA(158V)、Clqに特異的に結合する能力についてアッセイすることができる。このようなアッセイは、溶液中で(例えば、Houghten、Bio/Techniques13:412−421(1992)を参照)、ビーズを用いて(例えば、Lam,Nature 354:82−84を参照)、チップを用いて(例えば、Fodor,Nature 364:555−556(1993)を参照)、細菌を用いて(例えば、米国特許第5,223,409号明細書を参照)、プラスミドを用いて(例えば、Cull et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89:1865−1869(1992)を参照)、又はファージを用いて(例えば、Scott及びSmith,Science 249:386−390(1990);Devlin,Science 249:404−406(1990);Cwirla et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 87:6378−6382(1990);及びFelici,J.Mol.Biol.222:301−310(1991)を参照)実施することができる。リガンド、例えば、FcγRIIA、FcγRIIIA(158V)、Clqに特異的に結合することが判明した分子は、続いて、リガンドに対するその親和性についてアッセイすることができる。
IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドは、様々な方法で特性決定することができる。特に、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドは、リガンド、例えば、FcγRIIA、FcγRIIIA(158V)、Clqに特異的に結合する能力についてアッセイすることができる。このようなアッセイは、溶液中で(例えば、Houghten、Bio/Techniques13:412−421(1992)を参照)、ビーズを用いて(例えば、Lam,Nature 354:82−84を参照)、チップを用いて(例えば、Fodor,Nature 364:555−556(1993)を参照)、細菌を用いて(例えば、米国特許第5,223,409号明細書を参照)、プラスミドを用いて(例えば、Cull et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89:1865−1869(1992)を参照)、又はファージを用いて(例えば、Scott及びSmith,Science 249:386−390(1990);Devlin,Science 249:404−406(1990);Cwirla et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 87:6378−6382(1990);及びFelici,J.Mol.Biol.222:301−310(1991)を参照)実施することができる。リガンド、例えば、FcγRIIA、FcγRIIIA(158V)、Clqに特異的に結合することが判明した分子は、続いて、リガンドに対するその親和性についてアッセイすることができる。
IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドは、当分野では公知の任意の方法により、抗原(例えば、癌抗原及び他の抗原との交差反応性)又はリガンド(例えば、FcγR)などの分子に対する特異的結合についてアッセイすることができる。特異的結合及び交差反応性を分析するのに用いることができる免疫アッセイとして、限定するわけではないが、ウエスタンブロットなどの技術を用いた競合及び非競合アッセイ系、放射性免疫検定、ELISA(酵素結合イムノソルベントアッセイ)、「サンドイッチ」免疫検定、免疫沈降検定、沈降素反応、凝集アッセイ、補体固定アッセイ、蛍光免疫検定、プロテインA免疫アッセイなどが挙げられる。このようなアッセイは常用であり、当分野では公知である。例えば、Ausubel et al.,eds,1994,Current Protocols in Molecular Biology,Vol.1,John Wiley & Sons,Inc.,New Yorkを参照されたい。
IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドの、抗原又はリガンド(例えば、FcγR)などの分子に対する結合親和性、及び相互作用の解離速度は、競合結合アッセイで決定することができる。IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドの動態パラメータも、当分野では公知の任意の表面プラズモン共鳴(SPR)に基づくアッセイを用いて決定することができる(例えば、BIAcore又はProteOn動態分析)。例えば、Mullet et al.Methods 22:77−91(2000);Dong et al.Rev.Mol.Biotech.82:303−23(2002);Fivash et al.Curr.Opin.Biotechnol.9:97−101(1998);Rich et al.Curr.Opin.Biotechnol.11:54−61(2000)を参照されたい。さらに、米国特許第6,373,577号明細書;米国特許第6,289,286号明細書;米国特許第5,322,798号明細書;米国特許第5,341,215号明細書;米国特許第6,268,125号明細書に記載のタンパク質−タンパク質相互作用を測定するための、SPR計器及びSPRに基づく方法のいずれかが、本開示の方法で考慮される。
IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドと細胞表面に発現された分子(例えば、FcγR)との結合を特性決定するために、当業者には公知の技術のいずれかを用いて、蛍光活性化細胞選別法(FACS)を使用することができる。
IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドは、FcγR媒介エフェクター細胞機能を媒介するその能力についてアッセイすることができる。アッセイすることができるエフェクター細胞機能の例としては、限定するわけではないが、抗体依存性細胞媒介細胞傷害性(ADCC)、C1q結合、及び補体依存性細胞媒介細胞傷害性(CDC)がある。エフェクター細胞機能活性を決定するために、当業者には公知の任意の細胞ベースアッセイ又は無細胞アッセイを用いることができる(例えば、Perussia et al.Methods Mol.Biol.121:179−92(2000);Baggiolini et al.Experientia 44:841−8(1998);Lehmann et al.J.Immunol.Methods 243:229−42(2000);Brown,Methods Cell Biol.45:147−64(1994);Munn et al.J.Exp.Med.172:231−237(1990);Abdul−Majid et al.Scand.J.Immunol.55:70−81(2002);Ding et al.Immunity 8:403−411(1998)を参照)。特に、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドは、当業者には公知の標準的方法のいずれかを用いて、ナチュラルキラー細胞などのエフェクター細胞におけるFcγR媒介ADCC活性についてアッセイすることができる(例えば、Perussia et al.Methods Mol.Biol.121:179−92(2000)を参照)。
IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドがC1qに結合して、補体依存性細胞傷害(CDC)を媒介する能力を特性決定する方法は、当分野では公知である。例えば、C1q結合を決定するためには、C1q結合ELISAを実施することができる。補体活性化をアッセイするためには、例えば、Gazzano−Santoro et al.J.Immunol.Methods 202:163(1996)に記載されているように、補体依存性細胞(CDC)アッセイを実施することができる。
医薬組成物及び投与方法
別の態様において、担体と一緒に製剤化されたIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードする核酸、又はこれらの組合せを含む組成物が提供される。このような組成物は、1つの抗体若しくは(例えば、2つ以上の異なる)抗体の組合せ、融合タンパク質、又はコンジュゲートを含むことができる。ある態様では、このような組成物は、生理学的に耐容性であり、従って、被験者への治療、予防、又は診断用の投与に好適である。
別の態様において、担体と一緒に製剤化されたIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードする核酸、又はこれらの組合せを含む組成物が提供される。このような組成物は、1つの抗体若しくは(例えば、2つ以上の異なる)抗体の組合せ、融合タンパク質、又はコンジュゲートを含むことができる。ある態様では、このような組成物は、生理学的に耐容性であり、従って、被験者への治療、予防、又は診断用の投与に好適である。
別の態様において、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド(例えば、抗体変異体、融合タンパク質、若しくはコンジュゲート)又はIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードする核酸を含む組成物は、1種又は複数種の薬学的に許容される塩を含んでもよい。
考慮される組成物に用いることができる好適な水性及び非水性担体の例としては、水、エタノール、ポリオール(例えば、グリセロール、プロピレングリコール、ポリエチレングリコールなど)、及びこれらの好適な混合物、オリーブ油などの植物油、オレイン酸エチルなどの注入用有機エステルが挙げられる。例えば、レシチンなどのコーティング材料の使用、分散液の場合には要求される粒度の維持、並びに界面活性剤の使用により、適正な流動性を維持することができる。
別の態様において、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド(例えば、抗体変異体、融合タンパク質、若しくはコンジュゲート)又はIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードする核酸を含む組成物は、さらに、防腐剤、湿潤剤、乳化剤及び分散剤などの薬剤を含んでもよい。微生物の存在の防止は、滅菌方法、並びに各種の抗菌剤及び抗真菌剤、例えば、パラベン、クロロブタノール、フェノールソルビン酸などの含有の両方によって確実にすることができる。また、糖、塩化ナトリウムなどの等張剤を組成物に含有させることが望ましい場合もある。さらに、注射用薬剤形態の長期間の吸収は、モノステアリン酸アルミニウム及びゼラチンなど、吸収を遅らせる薬剤の含有によりもたらすことができる。
薬学的に許容される担体としては、滅菌注射液又は分散液の即時調剤のための滅菌水溶液又は分散液及び滅菌粉末がある。薬学的に活性の物質のためのこのような媒質及び薬剤の使用は当分野では公知である。従来の媒質又は薬剤が活性化合物と不適合ではない限り、医薬組成物へのそれらの使用が考慮される。また、追加の活性化合物を組成物に組み込むこともできる。ある態様では、許容される担体は、ヒト及び動物への投与に承認されているか、又はそのような投与に安全とみなされる賦形剤、すなわち、GRAS物質(一般に安全とみなされる)を含む。GRAS物質は、米国食品医薬品局(Food and Drug administration)により、米国連邦規則(Code of Federal Regulations(CFR))の21 CFR 182及び22 CFR 182に記載されており、これらは、参照として本明細書に組み込むものとする。
IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド(例えば、抗体変異体、融合タンパク質、若しくはコンジュゲート)又はIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードする核酸を含む医薬組成物への活性成分の実際の使用量は、具体的患者、組成物、及び投与方法について要望される治療応答を、患者に有毒となることなく達成するのに有効な活性成分の量を得るために変動し得る。選択される使用量は、使用する具体的組成物、又はそのエステル、塩若しくはアミド、投与経路、投与時間、使用される具体的化合物の排出速度、治療期間、使用する具体的組成物と併用される他の薬物、化合物及び/又は物質、治療しようとする患者の年齢、性別、体重、病状、全身の健康状態及び以前の病歴、並びに医療分野で公知の同様の要因など、様々な薬物動態学的要因に応じて異なる。
治療に有効な用量のIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードする核酸、又はその医薬組成物によって、疾患の症状の重症度の低減、無症状期間の頻度及び長さの増加、又は罹患による機能障害又は能力障害の予防がもたらされる。また、治療に有効な用量は、疾患発症を阻止又は遅らせることができる。従って、臨床又は生化学的モニタリングアッセイを用いて、特定の治療が、治療に有効な用量であるか否かを決定することができる。当業者であれば、被験者の大きさ、被験者の症状の重症度、及び選択した具体的組成物若しくは投与経路などの要因に基づき、そのような量を決定することができる。
IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド(例えば、抗体変異体、融合タンパク質、若しくはコンジュゲート)又はIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードする核酸を含む組成物は、当分野では公知の様々な方法の1つ又は複数を用いて、1つ又は複数の投与経路により投与することができる。当業者には理解されるように、投与の経路及び/又は方法は、要望される結果に応じて異なる。IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードする核酸を含む組成物、及びその医薬組成物について選択される投与経路としては、例えば、注射又は注入による静脈内、筋内、皮内、腹腔内、皮下、脊髄又はその他の非経口投与経路がある。非経口投与は、経腸又は局所投与以外の投与方法であり、通常、注射により行われ、限定するわけではないが、静脈内、筋内、動脈内、鞘内、嚢内、眼窩内、心臓内、皮内、腹腔内、気管内、皮下、表皮下、関節内、被膜下、クモ膜下、せき髄内、硬膜外及び胸骨内注射及び注入が挙げられる。あるいは、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードする核酸を含む組成物、及びその医薬組成物は、局所、表皮又は粘膜への投与経路などの非腸管外経路により投与することもでき、例えば、鼻内、経口、膣、直腸、舌下又は局所投与がある。
治療方法
IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド(例えば、抗体変異体、融合タンパク質、若しくはコンジュゲート)又はIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードする核酸は、疾患、障害、又は感染に関連する1つ又は複数の症状を予防、治療、若しくは改善するために、動物、とくに哺乳動物、具体的には、ヒトに投与することができる。
IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド(例えば、抗体変異体、融合タンパク質、若しくはコンジュゲート)又はIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードする核酸は、疾患、障害、又は感染に関連する1つ又は複数の症状を予防、治療、若しくは改善するために、動物、とくに哺乳動物、具体的には、ヒトに投与することができる。
IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド又はIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードする核酸は、エフェクター細胞機能(例えば、ADCC及び/又はCDC)の効果の改変が要望される疾患若しくは障害の治療又は予防に特に有用となり得る。
IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド又はIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードする核酸、及びその組成物は、原発性又は転移性腫瘍疾患(すなわち、癌)、自己免疫疾患、及び感染症の治療又は予防に特に有用であり得る。IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド又はIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードする核酸は、当分野では公知の、又は本明細書に記載の薬学的に許容される組成物として提供することができる。以下に詳述するように、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド又はIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードする核酸は、癌(特に、受動免疫療法において)、自己免疫疾患、炎症性疾患若しくは感染症を治療又は予防する方法に用いることができる。
さらに、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド又はIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードする核酸、及びその組成物は、癌、自己免疫疾患、炎症性疾患若しくは感染症の治療又は予防のための当分野では公知の他の治療薬と併用して、有利に用いることもできる。IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド又はIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードする核酸、及びその組成物はまた、疾患、障害、若しくは感染を治療するのに用いられる1種又は複数種の薬物、例えば、抗癌薬、抗炎症薬又は抗ウイルス薬などと併用して、有利に用いることもできる。
ある態様において、IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド又はIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードする核酸を投与することにより、癌及び関連病状に関連する1つ又は複数の症状を予防、治療、又は改善するための方法が提供される。
IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド又はIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドをコードする核酸は、被験者の炎症性疾患に関連する1つ又は複数の症状を予防、治療、又は管理するために用いることができる。
本開示は、治療又は予防に有効な量のIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドを投与することを含む、被験者の感染症を治療又は予防する方法も包含する。IgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチドにより治療又は予防することができる感染症は、限定するわけではないが、ウイルス、細菌、真菌、原生動物、及びウイルスなどの感染因子によって引き起こされる。
キット
さらに、本明細書に開示する1種又は複数種の医薬組成物を充填した1つ又は複数の容器を含む医薬パック又はキットも提供される。任意選択で、このような容器に、医薬又は生物製剤の製造、使用若しくは販売を規制する政府機関が規定した書式での通知を備えることができ、この通知は、ヒトへの投与のための製造、使用又は販売機関による承認を表すものである。本開示は、治療及び投与方法に用いることができるキットを提供する。一態様では、キットは、1つ又は複数の容器中に、好ましくは精製形態のIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド(例えば、抗体変異体、融合タンパク質、若しくはコンジュゲート)を含む。
さらに、本明細書に開示する1種又は複数種の医薬組成物を充填した1つ又は複数の容器を含む医薬パック又はキットも提供される。任意選択で、このような容器に、医薬又は生物製剤の製造、使用若しくは販売を規制する政府機関が規定した書式での通知を備えることができ、この通知は、ヒトへの投与のための製造、使用又は販売機関による承認を表すものである。本開示は、治療及び投与方法に用いることができるキットを提供する。一態様では、キットは、1つ又は複数の容器中に、好ましくは精製形態のIgG Fc変異型ドメイン含有ポリペプチド(例えば、抗体変異体、融合タンパク質、若しくはコンジュゲート)を含む。
これらの実施例は、あくまで例示を目的として記載され、特許請求の範囲を限定するものとして決して解釈すべきではなく、むしろ本明細書に記載する教示の結果として明らかになるあらゆる変更を包含するものと解釈すべきである。
実施例1
変異型IgG Fcドメインの作製と抗体の生成及び精製
抗RSV糖タンパク質Fヒト化モノクローナル抗体モタビズマブ(MEDI 532,Numax(商標);Wu et al.,J.Mol.Biol.350:126−144(2005);Wu et al.,J.Mol.Biol.368:652−65(2007)を参照)(以後「Ab1」と呼ぶ)、抗IL−4R抗体(例えば、米国特許第8,092,804号明細書を参照)(以後、「Ab2」と呼ぶ)、抗CDR20抗体HB20.3(例えば、米国特許第2009/0136516号明細書:米国特許第2009/0155275号明細書を参照)(以後、「Ab3」と呼ぶ)、又は抗C5a抗体1B8(以後、「Ab4」と呼ぶ)の重鎖のFc領域に突然変異を導入した。突然変異は、オーバーラップエクステンションによるPCRを用いた部位指定突然変異誘発(例えば、Ho et al.,Gene 77:51−59(1989)を参照)により導入した。要望される突然変異を含むプライマーを用いて、重鎖遺伝子の領域を増幅した。次に、これらの断片を合わせて(必要に応じ)、要望される突然変異を含む完全長ヒトIgG1 Fc遺伝子断片を作製した。次いで、最終PCR断片を個別に重鎖コード哺乳動物発現ベクター中にクローン化した。この処理により、上記抗体の野生型重鎖定常部分の、異なるFc修飾対応部分による置換が実施された。構築物を確認するために用いるDNA配列決定をGenewiz(South Plainfield,NJ)により実施した。
変異型IgG Fcドメインの作製と抗体の生成及び精製
抗RSV糖タンパク質Fヒト化モノクローナル抗体モタビズマブ(MEDI 532,Numax(商標);Wu et al.,J.Mol.Biol.350:126−144(2005);Wu et al.,J.Mol.Biol.368:652−65(2007)を参照)(以後「Ab1」と呼ぶ)、抗IL−4R抗体(例えば、米国特許第8,092,804号明細書を参照)(以後、「Ab2」と呼ぶ)、抗CDR20抗体HB20.3(例えば、米国特許第2009/0136516号明細書:米国特許第2009/0155275号明細書を参照)(以後、「Ab3」と呼ぶ)、又は抗C5a抗体1B8(以後、「Ab4」と呼ぶ)の重鎖のFc領域に突然変異を導入した。突然変異は、オーバーラップエクステンションによるPCRを用いた部位指定突然変異誘発(例えば、Ho et al.,Gene 77:51−59(1989)を参照)により導入した。要望される突然変異を含むプライマーを用いて、重鎖遺伝子の領域を増幅した。次に、これらの断片を合わせて(必要に応じ)、要望される突然変異を含む完全長ヒトIgG1 Fc遺伝子断片を作製した。次いで、最終PCR断片を個別に重鎖コード哺乳動物発現ベクター中にクローン化した。この処理により、上記抗体の野生型重鎖定常部分の、異なるFc修飾対応部分による置換が実施された。構築物を確認するために用いるDNA配列決定をGenewiz(South Plainfield,NJ)により実施した。
293fectin(商標)(Invitrogen)をトランスフェクション試薬として用いて、全ての構築物をHEK293F細胞に一時的に発現させ、Invitrogenの無血清Freestyle(商標)培地中で増殖させた。トランスフェクションから10日後に培地を収集し、製造者のプロトコル(GE Healthcare,Piscataway,NJ)に従って標準的プロテインAアフィニティークロマトグラフィーにより全ての抗体フォーマットを精製した。続いて、抗体を25mMヒスチジン−HCl(pH6.0)でバッファー交換し、還元及び非還元条件下のSDS−PAGEを用いて、さらには分析サイズ排除クロマトグラフィーにより構築物の純度を分析した。分取サイズ排除クロマトグラフィーを用いて、99〜100%純粋なIgGサンプルを取得した。
実施例2
示差走査熱量測定(DSC)、及びSYPRO(登録商標)Orange示差走査蛍光定量法(DSF)熱安定性測定
IgGドメインの不安定性は、好ましくない化学、製造、及び制御(CMC)特性と相関すると考えられ、このような特性には、熱安定性及び溶解度の低下、凝集又はフラグメント化の増加があり、これらは最終的に純度損失の増大、製剤化/送達選択肢の限定、並びにその他の開発性の課題を招くことになる。
示差走査熱量測定(DSC)、及びSYPRO(登録商標)Orange示差走査蛍光定量法(DSF)熱安定性測定
IgGドメインの不安定性は、好ましくない化学、製造、及び制御(CMC)特性と相関すると考えられ、このような特性には、熱安定性及び溶解度の低下、凝集又はフラグメント化の増加があり、これらは最終的に純度損失の増大、製剤化/送達選択肢の限定、並びにその他の開発性の課題を招くことになる。
Microcal VP−DSC示差走査マイクロ熱量計(Microcal,Northampton,MA)を用いて、DSC実験を実施した。DSCに用いた全ての溶液及びサンプルは、0.22μmフィルターを用いて濾過し、熱量計にロードする前にガス抜きした。DSC試験に用いた抗体は、分析ゲル濾過クロマトグラフィーにより判断して、>95%モノマーであった。DSC分析の前に、全サンプルを25mMヒスチジン−HCl(pH6)で入念に(少なくとも3回のバッファー交換)透析した。この透析からのバッファーを後のDSC実験の基準バッファーとして用いた。サンプル測定前に、ベースライン測定値(バッファー対バッファー)を取得し、サンプル測定値から差し引いた。透析したサンプル(濃度1mg/ml)をサンプルウェルに添加し、DSC測定を走査速度1℃/分で実施した。Microcalにより提供されたOrigin(商標)DSCソフトウエアを用いて、データ解析及びデコンボリューションを実施した。
DSF実験のために、SYPRO(登録商標)Orangeを、25mMヒスチジン−HCl(pH6)中、濃度0.5mg/mlで、抗体に添加した(Goldberg et al.,J.Pharm.Sci.100:1306−1315(2011))。25マイクロリットルの調製サンプルを、白色のPCRプレートに2回繰り返して添加した。Chromo4 Real Time PCR Detector(Bio−Rad,Hercules,California)をサーマルサイクラーとして使用し、ソフトウエアのカスタム色素較正ルーチンを用いて、蛍光放射を検出した。試験サンプルを含むPCRプレートを、0.2℃の増分で、温度増分毎に10秒の間隔を置き、20℃〜90℃までの昇温に付した。曲線の変曲点を計算するための数学的二次関数法を用いたソフトウエアによりTmを計算した。記録したTmは、3つの測定値の平均値である。
Ab1又はAb2のFc領域に突然変異を導入した。FES及びYTE突然変異をAb1及びAb2のFcドメインに導入し(表4のIgG1−FES−YTEに対応するデータを参照)、熱安定性の低下及び純度損失の増大を観察した。Ab1及びAb2は、熱安定性においてそれぞれ14℃及び13℃の損失を示した(DSCにより測定)。FES−YTE抗体変異体(表5のIgG1−FES−YTE)もまた、野生型又はYTE対応物のいずれに対しても有意に増大した純度損失を示した(加速安定性アッセイを用いて、1ヵ月にわたり40℃で測定した場合)。
YTEセットの突然変異又はFES−YTEの付加の際の熱安定性は、CH2ドメインだけに影響を与えた(図1)。Ab4のDSCトレースから、CH2ドメインTmは、YTE及びFES−YTE突然変異の付加により低下するが、Fab及びCH3ドメインの熱安定性は影響を受けないまま維持されることが判明した。YTEの付加により熱安定性は低下した(表4及び図1を参照)が、純度損失の有意な増大は、FES突然変異をYTE突然変異と組み合わせて導入したときに初めて開始した。
FES−YTE突然変異を含む変異型Fcドメインと同じ生物学的特性を備える、より高い熱安定性の変異型Fcドメインの構築に役立てるために、本発明者らは、離断突然変異誘発による各FES突然変異の熱安定性への寄与を決定したが、結果は、EU L234F突然変異が熱安定性に何の作用も及ぼさなかったのに対し、EU L235E突然変異及びEU P331S突然変異は、Ab3−YTEバックグラウンドに対し、DSCにより定量して、それぞれ約−2.5℃及び−3.5℃の熱安定性の低下を示した(すなわち、FcドメインがすでにYTE突然変異を含むAb3抗体に、EU L234F、EU L235E、及びEU P331S突然変異を導入した)。
FcドメインのL235及びP331EU位置に別の突然変異を形成し、熱安定性の増加について評価した(表6)。C1q結合を低減する目的で、EU P331S置換がFES突然変異体に最初に含まれているため、本発明者らは、同様に突然変異誘発するために、別の部位、EU位置K322(やはりC1q結合を低減することがわかっている)を選択した(Idusogie et al.,J.Immunol.164:4178−4184(2000))。
EU位置L235での選択した突然変異(I、A、N、F、Q及びV)を有する変異型Fcドメインを含む抗体は全て、EU L235E突然変異を有する変異型Fcドメインを含む対応抗体と比較して、L234F YTE Ab3バックグラウンドにおいて約2℃増加した熱安定性を呈示した。
EU位置P331で、アラニン及びグリシン突然変異は、FES−YTE突然変異を有するFcドメインを含む抗体と比較して、ごくわずかに(1℃)熱安定性を向上させた(突然変異は、EU L234F L235E YTE Ab3バックグラウンドに導入した)。EU位置K322(EU位置P331の代わりの部位)で、A、E、N、H及びQへの突然変異を形成し、熱安定性の増加について分析した。EU K322E、K322N及びK322H置換は、実際に、FES−YTEと比較して熱安定性の低下をもたらした。これらの突然変異をEU L234F L235E YTE Ab3バックグラウンドに導入したところ、CH2 Tmは、それぞれ0.3、7、及び2.6℃低下した。EU L234F L235E YTE Ab3バックグラウンドへのEU K322A及びK322Q突然変異は、FES−YTEと比較して、それぞれ1.2℃及び2.8℃の熱安定性の向上をもたらした。
次に、熱安定性の向上、純度損失及び生物物理学的安定性の向上、並びに要望される生物学的特性(FcRn結合の増大及びADCC及びCDC誘導の欠如など)を評価するために、EU位置L235及びP331又はK322での最も高い熱安定性の突然変異を組み合わせた構築物を作製した。
FQG−YTE、FQQ−YTE、及びFAQ−YTE変異型FcドメインをAb3及びAb4バックグラウンドに形成した。FQG−YTE、FQQ−YTE、及びFAQ−YTE変異型Fcドメインを含むAb3及びAb4変異体は、FES−YTE突然変異を含むAb3及びAb4変異体(図1)と比較して、有意な熱安定性の向上を示した(図2)。
Ab3バックグラウンドにおいて、FES−YTE突然変異体は55.6℃のCH2 Tmを有した。対照的に、FAQ−YTE、FQG−YTE、及びFQQ−YTE突然変異を含むAb3変異体は、それぞれ60.6℃、60.2℃、及び61.6℃のCH2 Tmを有し(表7)、これは、Fcドメイン突然変異のこれらの組合せが、実際に、CH2ドメインに向上した熱安定性を賦与したことを示している。
実施例3
表面プラズモン共鳴結合分析
3つの突然変異体FQQ、FQF、及びFAQの組合せ、並びにYTE突然変異を有する変異型IgG Fcドメインを含む抗体を、これらが、FES−YTE突然変異を有する変異型IgG Fcドメインを含む抗体と同じ結合プロフィールを有することを確認するために、FcγR受容体、C1q及びFcRnとの結合について試験した。
表面プラズモン共鳴結合分析
3つの突然変異体FQQ、FQF、及びFAQの組合せ、並びにYTE突然変異を有する変異型IgG Fcドメインを含む抗体を、これらが、FES−YTE突然変異を有する変異型IgG Fcドメインを含む抗体と同じ結合プロフィールを有することを確認するために、FcγR受容体、C1q及びFcRnとの結合について試験した。
ProteOn XPR36表面プラズモン共鳴装置(Bio Rad)を用いて、実験を実施した。0.005%Tween 20(PBS/Tween)、pH7.4を含むリン酸緩衝食塩水を、ヒトFcRn(細胞外ドメイン)結合を除くほとんどの実験の泳動用バッファーとして用いた。ヒトFcRn結合には、0.005%Tween 20(PBS/Tween)、pH6.0を含むリン酸緩衝食塩水を用いた。実験は全て25℃で実施した。EDAC(1−エチル−3−[3−ジメチルアミノプロピル]カルボジイミド)及びスルホ−NHS(N−ヒドロキシスルホスクシンイミド)を用いて、ProteoOn(商標)GLC Sensor Chip(#176−5011)上に、4000〜6000のR.U.(応答単位)レベルまで抗体を固定化した。次に、C1q、FcγRI、FcγRIIa、FcγRIIb、FcγRIII(158V)、FcγRIII(158F)、及びFcRnをIgG固定化表面上に様々な濃度にて、25μl/分の流量で、定常状態、又はほぼ定常状態を達成するのに十分な時間にわたり流した。ProteOnソフトウエアを用いて、定常状態平衡結合分析により、結合(わずかでも決定することができる場合)を定量した。ヒトFcγRI、FcγRIIa、FcγRIIb、FcγRIII(158V)、FcγRIII(158F)、及びFcRn細胞外ドメインを所内で哺乳動物発現ベクターにより作製した。ヒトC1qをQuidel(CA)から取得した。
FES−YTE、FAQ−YTE、FQG−YTE、又はFQQ−YTE突然変異を有する変異型IgG Fcドメインを含む抗体は、FcγRIa、FcγRIIa、FcγRIIb、FcγRIIIa(158V)、FcγRIIIa(158F)、又はC1qと、SPR(ProteOn)により定量可能な結合を示さなかった(表8及び9)。FQQ−YTE又はFQG−YTE突然変異を有する変異型IgG Fcドメインを含む抗体に対するFcRn結合は、FES−YTE又はYTE突然変異を有する変異型IgG Fcドメインを含む抗体について得られた値と同様であったが、これは、pH6.0で、向上したFcRn結合が維持されていることを示している(表8及び9)。
このように、SPR結合実験から、FAQ−YTE、FQG−YTE、又はFQQ−YTE突然変異を有する変異型IgG Fcドメインを含む抗体には、ADCCに不可欠であることがわかっている細胞受容体への結合、及びCDCを開始することができる可溶性受容体C1qが欠如していることが判明した。
実施例4
抗体依存性細胞傷害(ADCC)アッセイ
抗体依存性細胞傷害(ADCC)アッセイを、Ab3(HB20.3抗CD20;配列番号5及び6)バックグラウンドに組み込んだ変異型IgG Fcドメインを用いて実施した。CD16を発現するナチュラルキラー細胞株をエフェクター細胞として、またDaudi細胞を標的として用いた。Daudi細胞及びエフェクター細胞をPBSで洗浄し、800,000c/mlの密度まで希釈した。Daudi細胞及びエフェクター細胞を白色のV字状ウェル底96ウェルプレート(各々50μl)に添加した。様々な濃度のAb3抗体変異体をウェルに添加した。細胞と抗体を37℃で4時間インキュベートした。また、製造業者の指示に従い、CytoTox 96非放射性細胞傷害アッセイ(Promega)を用いたLDH放出の分析により、Daudi細胞死もモニターした。
抗体依存性細胞傷害(ADCC)アッセイ
抗体依存性細胞傷害(ADCC)アッセイを、Ab3(HB20.3抗CD20;配列番号5及び6)バックグラウンドに組み込んだ変異型IgG Fcドメインを用いて実施した。CD16を発現するナチュラルキラー細胞株をエフェクター細胞として、またDaudi細胞を標的として用いた。Daudi細胞及びエフェクター細胞をPBSで洗浄し、800,000c/mlの密度まで希釈した。Daudi細胞及びエフェクター細胞を白色のV字状ウェル底96ウェルプレート(各々50μl)に添加した。様々な濃度のAb3抗体変異体をウェルに添加した。細胞と抗体を37℃で4時間インキュベートした。また、製造業者の指示に従い、CytoTox 96非放射性細胞傷害アッセイ(Promega)を用いたLDH放出の分析により、Daudi細胞死もモニターした。
ナチュラルキラー(NK)細胞由来の細胞株をエフェクター細胞として、Daudi細胞を標的として用いた実験において、WT Ab3抗体と、YTE突然変異を有する変異型IgG Fcドメインを含むAb3抗体が、滴定可能なADCC応答を示した。逆に、FAQ−YTE、FQQ−YTE、又はFES−YTE突然変異を有する変異型IgG Fcドメインを含むAb3抗体は、300μg/mlまでの濃度でも有意な細胞傷害性を誘導しなかった(図3)。
実施例5
補体依存性細胞傷害(CDC)アッセイ
補体依存性細胞傷害(CDC)アッセイを、Ab3(HB20.3抗CD20;配列番号5及び6)に組み込んだ変異型IgG Fcドメインを用いて実施した。健康なドナーからのヒト血清を補体供給源として、またDaudi細胞をエフェクター細胞として用いた。Daudi細胞をPBSで洗浄し、800,000c/mlの密度まで希釈した。次いで、細胞を白色のV字底プレート(各々50μl)に添加した。次に、希釈した血清(50μl)を所望の濃度で、様々な希釈度の抗体と一緒に添加した。細胞を37℃で4時間インキュベートした。続いて、アラマーブルー(alamar blue)試薬(Life Technologies)を添加し、12時間後にDaudi細胞死を定量した(製造業者の指示に従い)。
補体依存性細胞傷害(CDC)アッセイ
補体依存性細胞傷害(CDC)アッセイを、Ab3(HB20.3抗CD20;配列番号5及び6)に組み込んだ変異型IgG Fcドメインを用いて実施した。健康なドナーからのヒト血清を補体供給源として、またDaudi細胞をエフェクター細胞として用いた。Daudi細胞をPBSで洗浄し、800,000c/mlの密度まで希釈した。次いで、細胞を白色のV字底プレート(各々50μl)に添加した。次に、希釈した血清(50μl)を所望の濃度で、様々な希釈度の抗体と一緒に添加した。細胞を37℃で4時間インキュベートした。続いて、アラマーブルー(alamar blue)試薬(Life Technologies)を添加し、12時間後にDaudi細胞死を定量した(製造業者の指示に従い)。
WT Ab3抗体又はYTE突然変異を有するFcドメインを含むAb3抗体のみが、頑健な補体依存性細胞傷害を誘導することが判明した。逆に、FAQ−YTE、FQG−YTE、FQQ−YTE、FES−YTE突然変異を有する変異型IgG Fcドメインを含むAb3抗体は、補体依存性細胞傷害を誘導しないで終わった(図4)。
実施例6
加速安定性試験
Ab4抗体(1B8抗C5a抗体;配列番号7及び8)バックグラウンドにおける抗体変異体を25mMヒスチジンpH6.0中で100mg/mlまで濃縮した。抗体をガラスバイアルに入れ、(40℃、75%相対湿度)制御室内で6週間にわたり貯蔵した。サンプルを凝集体割合(%)について高性能サイズ排除クロマトグラフィー(HPSEC)により1週間毎に試験した。HPSEC分析は、TSK−Gel G3000カラムを備えたAgilent HPLC装置(Agilent Technologies)で実施した。溶出したタンパク質を280nmでの紫外線吸光度を用いて検出し、結果を生成物モノマーピークの面積割合(%)として記録した。モノマーより早期に溶出したピークを凝集体割合(%)として記録し、モノマーの後に溶出したピークをフラグメント/その他の割合(%)として記録した。一定時間にわたる凝集率を線形回帰により決定した。
加速安定性試験
Ab4抗体(1B8抗C5a抗体;配列番号7及び8)バックグラウンドにおける抗体変異体を25mMヒスチジンpH6.0中で100mg/mlまで濃縮した。抗体をガラスバイアルに入れ、(40℃、75%相対湿度)制御室内で6週間にわたり貯蔵した。サンプルを凝集体割合(%)について高性能サイズ排除クロマトグラフィー(HPSEC)により1週間毎に試験した。HPSEC分析は、TSK−Gel G3000カラムを備えたAgilent HPLC装置(Agilent Technologies)で実施した。溶出したタンパク質を280nmでの紫外線吸光度を用いて検出し、結果を生成物モノマーピークの面積割合(%)として記録した。モノマーより早期に溶出したピークを凝集体割合(%)として記録し、モノマーの後に溶出したピークをフラグメント/その他の割合(%)として記録した。一定時間にわたる凝集率を線形回帰により決定した。
加速安定性試験を実施して、FES−YTE突然変異を有する変異型IgG Fcドメインを含む抗体に対する、FAQ−YTE、FQG−YTE、FQQ−YTE突然変異を有する変異型IgG Fcドメインを含む抗体の凝集/フラグメント化速度に認められる向上を評価した(表10)。FES−YTE抗体変異体(Ab4バックグラウンド中の)は、1ヵ月にわたり40℃で1.93%凝集率を有したのに対し、FQG−YTE及びFQQ−YTE突然変異を有するAb4抗体は、それぞれ1.01%〜1.1%までの向上を示した。
FES−YTE突然変異を有するAb4抗体は、1ヵ月当たり3.82%の全体モノマー損失率を有したのに対し、WT Ab4抗体及びYTE突然変異を有するAb4抗体は、それぞれ1ヵ月当たり2.71%及び2.75%の全体モノマー損失率を有した。FQQ−YTE及びFQG−YTE突然変異を有するAb4抗体は、3.28%及び3.36%と、FES−YTE突然変異を有するAb4抗体と比較して、40℃での向上した全体モノマー損失率を有した。FAQ−YTE突然変異を有するAb4抗体は、より高いフラグメント化率(5.74%)のために、予想より高いモノマー損失/月を有した。
実施例7
等電点電気泳動(IEF)ゲル
プレキャストアムホリン(ampholine)ゲル(Amersham Biosciences,Uppsala Sweden;pI範囲3.5〜9.5)にIgGをロードした。広範囲pIマーカ標準(Amersham Biosciences,pI範囲3〜10)を用いて、様々な抗体又は抗体フラグメントについて相対pIを決定した。1500V、50mAで電気泳動を105分間実施した。Sigma固定液(Sigma,Saint Louis,MO)を用いて、ゲルを45分固定した。Simply Blue染料(Invitrogen)を用いて、室温で一晩染色を実施した。25%エタノール、8%酢酸及び67%精製水からなる溶液を用いて、脱染を実施した。
等電点電気泳動(IEF)ゲル
プレキャストアムホリン(ampholine)ゲル(Amersham Biosciences,Uppsala Sweden;pI範囲3.5〜9.5)にIgGをロードした。広範囲pIマーカ標準(Amersham Biosciences,pI範囲3〜10)を用いて、様々な抗体又は抗体フラグメントについて相対pIを決定した。1500V、50mAで電気泳動を105分間実施した。Sigma固定液(Sigma,Saint Louis,MO)を用いて、ゲルを45分固定した。Simply Blue染料(Invitrogen)を用いて、室温で一晩染色を実施した。25%エタノール、8%酢酸及び67%精製水からなる溶液を用いて、脱染を実施した。
IEFゲルによる分析から、Ab4抗体(1B8抗C5a抗体;配列番号7及び8)のFcドメインへのFAQ−YTE、FQG−YTE、及びFQQ−YTE突然変異の導入が、pIに対して最小限の影響しか及ぼさず、構築物は全て近似のpI>8.3であることが判明した(図5)。
実施例8
ポリエチレングリコール(PEG)沈殿による見かけ溶解度
PEG沈殿アッセイは、Gibson et al.,J.Pharm.Sci.100:1009−1021(2011)と同様に実施した。PEG 6000の量を増加しながら添加することにより、抗体を沈殿させた。50mMリン酸ナトリウムバッファーpH7.2中0%〜40%[w/v]PEGの範囲のPEG6000溶液を調製した。これらの溶液を96ウェル白色ポリスチレンフィルタープレートのウェルに添加した。次いで、様々なレベルのPEGを含むウェルに抗体を最終濃度1mg/mLまで添加した。96ウェルプレートを室温で一晩インキュベートした。次に、プレートを遠心分離して、濾過液を透明のポリスチレン96ウェルコレクションプレートに回収した。続いて、各サンプル濾過液を等量ずつ新しい透明ポリスチレン96ウェルプレートに移した後、ナノドロップ(nanodrop)を用い、280nmでの吸光度を測定することにより、濾過液をタンパク質濃度について分析した。凝集トランジッションの傾きを用いて、見かけ溶解度を算出する。
ポリエチレングリコール(PEG)沈殿による見かけ溶解度
PEG沈殿アッセイは、Gibson et al.,J.Pharm.Sci.100:1009−1021(2011)と同様に実施した。PEG 6000の量を増加しながら添加することにより、抗体を沈殿させた。50mMリン酸ナトリウムバッファーpH7.2中0%〜40%[w/v]PEGの範囲のPEG6000溶液を調製した。これらの溶液を96ウェル白色ポリスチレンフィルタープレートのウェルに添加した。次いで、様々なレベルのPEGを含むウェルに抗体を最終濃度1mg/mLまで添加した。96ウェルプレートを室温で一晩インキュベートした。次に、プレートを遠心分離して、濾過液を透明のポリスチレン96ウェルコレクションプレートに回収した。続いて、各サンプル濾過液を等量ずつ新しい透明ポリスチレン96ウェルプレートに移した後、ナノドロップ(nanodrop)を用い、280nmでの吸光度を測定することにより、濾過液をタンパク質濃度について分析した。凝集トランジッションの傾きを用いて、見かけ溶解度を算出する。
FAQ−YTE、FQG−YTE、及びFQQ−YTE突然変異を有する変異型Fcドメインを含むAb4抗体(1B8抗C5a抗体;配列番号7及び8)を見かけ溶解度の向上について評価したが、これは、PEG沈殿により評価した(表11)。凝集トランジッションの外挿法によって、「見かけ溶解度」の尺度を得ることができる。この値は、絶対値が実際の溶解限度を示さない(例えば、高度に可溶性のタンパク質の値は過大評価される)ため、抗体変異体を等級付けするのに限り有用である。
FES−YTE突然変異を有する変異型Fcドメインを含むAb4抗体は、<10mg/mlで、試験した全抗体の中で最も低い見かけ溶解度を示した。FAQ−YTE、FQG−YTE、FQQ−YTEを有する変異型Fcドメインを含むAb4抗体は全て、高い見かけ溶解度スコア>100mg/mlを有し、FES−YTEに対して向上した溶解性を示した。
実施例9
動的光散乱(DLS)
タンパク質粒度分布及び分子サイズをZetasizer Nano ZS(Malvern Instruments,Malvern,PA)を用いて、動的光散乱(DLS)によりモニターした。633nmレーザーを用いて、サンプル(25mMヒスチジン−HClpH6中1mg/ml)を照射し、散乱光の強度を173°の角度で測定した。室温で分析したサンプルを実験用ベンチトップ上で約90分インキュベートした後、サンプリングした。各サンプル分析の前に、粘度、屈折率及び吸光度などのパラメータについて補正率を導入した。
動的光散乱(DLS)
タンパク質粒度分布及び分子サイズをZetasizer Nano ZS(Malvern Instruments,Malvern,PA)を用いて、動的光散乱(DLS)によりモニターした。633nmレーザーを用いて、サンプル(25mMヒスチジン−HClpH6中1mg/ml)を照射し、散乱光の強度を173°の角度で測定した。室温で分析したサンプルを実験用ベンチトップ上で約90分インキュベートした後、サンプリングした。各サンプル分析の前に、粘度、屈折率及び吸光度などのパラメータについて補正率を導入した。
それぞれのFcドメインにFAQ−YTE、FQG−YTE、FQQ−YTE突然変異を含むAb4抗体(1B8抗C5a抗体;配列番号7及び8)の変異体、並びに野生型Ab4及びそれぞれのFcドメインにFES−YTE及びYTE突然変異を含む変異体は全て、動的光散乱(DLS)により、単分散であることが認められた(表12)。従って、Ab4抗体のFcドメインにFAQ−YTE、FQG−YTE、FQQ−YTE突然変異の各組合せを導入しても、多分散性の増大は起こらなかった。
具体的態様についての以上の説明から、他の者が、当分野の基礎知識を適用することにより、記載した全体的概念を逸脱することなく、過度の実験なしに、上記の具体的態様を容易に変更及び/又は多様な応用のために改変できるという、本開示の全体的性質が十分に明らかになるであろう。従って、このような改変及び変更は、本明細書に提示した教示及び指針に基づき、開示された態様の同等物の意味及び範囲に含まれるものとする。本明細書の用語及び表現は、本教示及び指針に照らして、本明細書の用語及び表現が当業者に解釈されるように、説明を目的とするものであり、限定を目的とするものではないことを理解すべきである。
本開示の広さ及び範囲は、前述した例示的態様のいずれによっても限定すべきではなく、以下の特許請求の範囲及びそれらの同等物に従ってのみ定めるべきである。
本出願に引用した全ての刊行物、特許、特許出願、又はその他の文献は、あたかも各々個別の刊行物、特許、特許出願、又はその他の文献が、あらゆる目的のために参照として組み込まれることが個別に示されているのと同じ範囲まで、あらゆる目的のためにそれらの全体が参照として本明細書に組み込まれる。さらに、2012年4月30日に提出された米国仮特許出願第61/640,327号明細書は、あらゆる目的のためにその全体が参照として本明細書に組み込まれる。
本発明は以下の実施形態を包含する:
[1] 変異型IgG Fcドメインを含む単離されたポリペプチドであって、前記変異型IgG Fcドメインが、
(a)234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;
(b)235位にアラニン(A)、アスパラギン(N)、フェニルアラニン(F)、グルタミン(Q)、若しくはバリン(V)アミノ酸;及び
(c)322位にアラニン(A)、アスパラギン酸(D)、グルタミン酸(E)、ヒスチジン(H)、アスパラギン(N)、若しくはグルタミン(Q)アミノ酸;又は331位にアラニン(A)若しくはグリシン(G)アミノ酸
を有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、単離されたポリペプチド。
[2] 234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;235位にグルタミン(Q)アミノ酸;及び322位にグルタミン(Q)アミノ酸を有し、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1に記載のポリペプチド。
[3] 234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;235位にグルタミン(Q)アミノ酸;及び331位にグリシン(G)アミノ酸を有し、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1に記載のポリペプチド。
[4] 234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;235位にアラニン(A)アミノ酸;及び322位にグルタミン(Q)アミノ酸を有し、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1に記載のポリペプチド。
[5] (a)252位にチロシン(Y)アミノ酸、若しくは252位にセリン(S)アミノ酸、若しくは252位にトリプトファン(W)アミノ酸、若しくは252位にトレオニン(T)アミノ酸;及び/又は
(b)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び/又は
(c)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸、若しくは256位にセリン(S)アミノ酸、若しくは256位にアルギニン(R)アミノ酸、若しくは256位にグルタミン(Q)アミノ酸、若しくは256位にアスパラギン酸(D)アミノ酸
をさらに有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1〜4のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[6] (a)252位にチロシン(Y)アミノ酸;及び/又は
(b)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び/又は
(c)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸
をさらに有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1〜4のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[7] (a)252位にチロシン(Y)アミノ酸、若しくは252位にセリン(S)アミノ酸、若しくは252位にトリプトファン(W)アミノ酸、若しくは252位にトレオニン(T)アミノ酸;及び
(b)254位にトレオニン(T)アミノ酸
をさらに有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1〜4のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[8] (a)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び
(b)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸、若しくは256位にセリン(S)アミノ酸、若しくは256位にアルギニン(R)アミノ酸、若しくは256位にグルタミン(Q)アミノ酸、若しくは256位にアスパラギン酸(D)アミノ酸
をさらに有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1〜4のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[9] (a)252位にチロシン(Y)アミノ酸、若しくは252位にセリン(S)アミノ酸、若しくは252位にトリプトファン(W)アミノ酸、若しくは252位にトレオニン(T)アミノ酸;並びに
(b)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸、若しくは256位にセリン(S)アミノ酸、若しくは256位にアルギニン(R)アミノ酸、若しくは256位にグルタミン(Q)アミノ酸、若しくは256位にアスパラギン酸(D)アミノ酸
をさらに有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1〜4のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[10] (a)252位にチロシン(Y)アミノ酸、及び254位にトレオニン(T)アミノ酸;又は、
(b)254位にトレオニン(T)アミノ酸及び256位にグルタミン酸(E)アミノ酸;又は、
(c)252位にチロシン(Y)アミノ酸及び256位にグルタミン酸(E)アミノ酸をさらに有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1〜4のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[11] 252位にチロシン(Y)アミノ酸、254位にトレオニン(T)アミノ酸、及び256位にグルタミン酸(E)アミノ酸をさらに有し、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1〜4のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[12] (a)234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;
(b)235位にグルタミン(Q)アミノ酸;
(c)322位にグルタミン(Q)アミノ酸;
(d)252位にチロシン(Y)アミノ酸;
(e)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び、
(f)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸
を有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1に記載のポリペプチド。
[13] (a)234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;
(b)235位にグルタミン(Q)アミノ酸;
(c)331位にグリシン(Q)アミノ酸;
(d)252位にチロシン(Y)アミノ酸;
(e)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び、
(f)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸
を有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1に記載のポリペプチド。
[14] (a)234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;
(b)235位にアラニン(A)アミノ酸;
(c)322位にグルタミン(Q)アミノ酸;
(d)252位にチロシン(Y)アミノ酸;
(e)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び、
(f)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸
を有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1に記載のポリペプチド。
[15] 前記ポリペプチドが、野生型Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、向上した薬物動態(PK)特性を有する、1〜14のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[16] 前記PK特性が、半減期である、15に記載のポリペプチド。
[17] 前記ポリペプチドが、野生型Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、向上したFcRn結合を有する、1〜16のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[18] 前記IgG Fcドメインが、非ヒト由来である、1〜17のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[19] 前記IgG Fcドメインが、ヒト由来である、1〜17のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[20] 前記非ヒトIgG Fcドメインが、げっ歯類、ロバ、ヒツジ、ウサギ、ヤギ、モルモット、ラクダ、ウマ又はニワトリに由来する、18に記載のポリペプチド。
[21] 前記IgG Fcドメインが、ヒト免疫グロブリンGクラス1(IgG 1 )Fcドメイン、ヒト免疫グロブリンGクラス2(IgG 2 )Fcドメイン、ヒト免疫グロブリンGクラス3(IgG 3 )Fcドメイン、及びヒト免疫グロブリンGクラス4(IgG 4 )Fcドメインからなる群から選択される、19に記載のポリペプチド。
[22] 前記ポリペプチドが、さらに抗原結合ドメインを含む、1〜21のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[23] 前記抗原結合ドメインが、モノクローナル抗体又はその抗原結合フラグメントに由来する、22に記載のポリペプチド。
[24] 前記抗原結合ドメインが、ヒト抗体、ヒト化抗体、又はキメラ抗体に由来する、22に記載のポリペプチド。
[25] 前記抗原結合ドメインが、以下:
(a)一本鎖抗体;
(b)ダイアボディ;
(c)抗体のポリペプチド鎖;
(d)F(ab’) 2 フラグメント;又は、
(e)F(ab)フラグメント
を含む、22に記載のポリペプチド。
[26] 前記ポリペプチドが、野生型Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、低減したFc媒介エフェクター機能を有する、1〜21のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[27] 前記エフェクター機能が、抗体依存性細胞媒介細胞傷害(ADCC)である、26に記載のポリペプチド。
[28] 前記エフェクター機能が、補体依存性細胞傷害(CDC)である、26に記載のポリペプチド。
[29] 前記ポリペプチドが、野生型Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、Fcγ受容体(FcγR)に対し低い親和性を有する、1〜28のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[30] 前記FcγRが、ヒトFcγRである、29に記載のポリペプチド。
[31] 前記FcγRが、FcγRI、FcγRII、及びFcγRIIIからなる群から選択される、29に記載のポリペプチド。
[32] 前記FcγRIが、FcγRIαである、31に記載のポリペプチド。
[33] 前記FcγRIIが、FcγRIIa又はFcγRIIbである、31に記載のポリペプチド。
[34] 前記FcγRIIIが、FcγRIII(158V)又はFcγRIII(158F)である、31に記載のポリペプチド。
[35] 前記ポリペプチドが、野生型Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、向上した親和性でFcRnと結合する、1〜34のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[36] 前記ポリペプチドが、pH7.4におけるよりもpH6.0において、FcRnに対する高い親和性を有する、35に記載のポリペプチド。
[37] 前記ポリペプチドが、野生型Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、低減した親和性でC1qと結合する、1〜36のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[38] 前記ポリペプチドが、FES−YTE IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、熱安定性の増加を呈示する、1〜37のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[39] 前記熱安定性が、示差走査熱量測定(DSC)により測定される、38に記載のポリペプチド。
[40] 前記熱安定性の増加が、少なくとも4℃である、39に記載のポリペプチド。
[41] 前記熱安定性が、示差走査型蛍光定量法(DSF)により測定される、38に記載のポリペプチド。
[42] 前記DSF蛍光プローブが、Sypro Orangeである、41に記載のポリペプチド。
[43] 前記熱安定性の増加が、少なくとも5℃である、42に記載のポリペプチド。
[44] 前記ポリペプチドが、FES−YTE IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、ポリエチレングリコール(PEG)沈殿アッセイを用いて測定される見かけ溶解度の増加を呈示する、1〜43のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[45] 前記ポリペプチドが、FES−YTE IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、加速安定性アッセイを用いて測定される安定性の増加を呈示する、1〜44のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[46] 前記加速安定性アッセイが、(i)長期間にわたるポリペプチドのインキュベーション、及び(ii)高温でのインキュベーションを含む、45に記載のポリペプチド。
[47] 前記加速安定性アッセイが、高濃度でのインキュベーションにより実施される、46に記載のポリペプチド。
[48] 前記長期間が、少なくとも1ヵ月である、46に記載のポリペプチド。
[49] 前記高濃度が、少なくとも25mg/mlである、47に記載のポリペプチド。
[50] 前記高温が、少なくとも40℃である、46に記載のポリペプチド。
[51] 前記加速安定性アッセイが、高機能サイズ排除クロマトグラフィー(HPSEC)又は動的光散乱法(DLS)を用いて実施される、45〜50のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[52] 1〜51のいずれか1項に記載のポリペプチドをコードする配列を含む、単離された核酸。
[53] 52に記載の核酸を含む組成物。
[54] 52に記載の核酸を含む発現ベクター。
[55] 52に記載の核酸、53に記載の組成物、又は54に記載のベクターを含む宿主細胞。
[56] (a)55に記載の細胞を培養するステップ;及び(b)前記ポリペプチドを単離するステップを含む、1〜51のいずれか1項に記載のポリペプチドを作製する方法。
[57] 1〜51のいずれか1項に記載のポリペプチドと、担体とを含む組成物。
[58] 1〜51のいずれか1項に記載のポリペプチドを含む診断薬。
[59] 前記ポリペプチドが標識されている、58に記載の診断薬。
[60] 1〜51のいずれか1項に記載のポリペプチドと、治療部分とを含むコンジュゲート。
[61] 1〜51のいずれか1項に記載のポリペプチド、又は52〜55若しくは57〜60のいずれか1項に記載の組成物を含むキット。
[62] 哺乳動物を治療する方法であって、1〜51のいずれか1項に記載のポリペプチド、又は52〜55若しくは57〜60のいずれか1項に記載の組成物を有効量で、治療が必要な哺乳動物に投与することを含む方法。
[63] Fcドメインを含む親ポリペプチドのFc誘導性エフェクター機能を低減する方法であって、以下:
(a)Fcドメインにおける234位の前記アミノ酸をフェニルアラニン(F)で置換するステップ;
(b)Fcドメインにおける235位の前記アミノ酸をアラニン(A)、アスパラギン(N)、フェニルアラニン(F)、グルタミン(Q)、若しくはバリン(V)で置換するステップ;及び
(c)Fcドメインの322位の前記アミノ酸をアラニン(A)、アスパラギン酸(D)、グルタミン酸(E)、ヒスチジン(H)、アスパラギン(N)、若しくはグルタミン(Q)で置換するステップ;又はFcドメインの331位のアミノ酸をアラニン(A)若しくはグリシン(G)で置換するステップ
を含み、
ここで、前記Fcドメインの前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う方法。
[64] 前記親ポリペプチドの前記Fcドメインが、
(a)252位にチロシン(Y)アミノ酸、若しくは252位にセリン(S)アミノ酸、若しくは252位にトリプトファン(W)アミノ酸、若しくは252位にトレオニン(T)アミノ酸;及び/又は
(b)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び/又は
(c)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸、若しくは256位にセリン(S)アミノ酸、若しくは256位にアルギニン(R)アミノ酸、若しくは256位にグルタミン(Q)アミノ酸、若しくは256位にアスパラギン酸(D)アミノ酸
を有し、
ここで、前記Fcドメインの前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う方法。
[65] 前記親ポリペプチドの前記Fcドメインが、
(a)252位にチロシン(Y);及び/又は
(b)254位にトレオニン(T);及び/又は
(c)256位にグルタミン酸(E)
を有し、
ここで、前記Fcドメインの前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う方法。
[66] Fcドメインを含む親ポリペプチドのFc誘導性エフェクター機能を低減すると共に、その半減期を増加させる方法であって、以下:
(a)前記Fcドメインにおける234位の前記アミノ酸をフェニルアラニン(F)で置換するステップ;
(b)前記Fcドメインにおける235位の前記アミノ酸をアラニン(A)、アスパラギン(N)、フェニルアラニン(F)、グルタミン(Q)、若しくはバリン(V)で置換するステップ;及び
(c)前記Fcドメインの322位の前記アミノ酸をアラニン(A)、アスパラギン酸(D)、グルタミン酸(E)、ヒスチジン(H)、アスパラギン(N)、若しくはグルタミン(Q)で置換するステップ;又は前記Fcドメインの331位のアミノ酸をアラニン(A)若しくはグリシン(G)で置換するステップ;並びに
(d)252位の前記アミノ酸をチロシン(Y)若しくはセリン(S)若しくはトリプトファン(W)若しくはトレオニン(T)で置換するステップ
を含み;
ここで、前記Fcドメインの前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う方法。
[67] 252位の前記アミノ酸がチロシン(Y)で置換され、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、66に記載の方法。
[68] (a)254位の前記アミノ酸をトレオニン(T)で置換するステップ;及び、
(b)256位の前記アミノ酸をグルタミン酸(E)若しくはセリン(S)、若しくはアルギニン(R)、若しくはグルタミン(Q)で置換するステップ
をさらに含み、
ここで、前記Fcドメインの前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、66又は67に記載の方法。
[69] 256位の前記アミノ酸がグルタミン酸(E)で置換され、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、68に記載の方法。
[70] 234位の前記アミノ酸がフェニルアラニン(F)で置換され;235位の前記アミノ酸がグルタミン(Q)で置換され;322位の前記アミノ酸がグルタミン(Q)で置換され、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、63〜69のいずれか1項に記載の方法。
[71] 234位の前記アミノ酸がフェニルアラニン(F)で置換され;235位の前記アミノ酸がグルタミン(Q)で置換され;331位の前記アミノ酸がグリシン(G)で置換され、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、63〜70のいずれか1項に記載の方法。
[72] 234位の前記アミノ酸がフェニルアラニン(F)で置換され;235位の前記アミノ酸がアラニン(A)で置換され;322位の前記アミノ酸がグルタミン(Q)で置換され、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、63〜70のいずれか1項に記載の方法。
[73] 前記エフェクター機能が、抗体依存性細胞媒介細胞傷害(ADCC)である、63〜72のいずれか1項に記載の方法。
[74] 前記エフェクター機能が、補体依存性細胞傷害(CDC)である、63〜72のいずれか1項に記載の方法。
[75] 前記ポリペプチドが、FES−YTE IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、熱安定性の増加を呈示する、63〜72のいずれか1項に記載の方法。
[76] 前記熱安定性が、示差走査熱量測定(DSC)により測定される、75に記載の方法。
[77] 前記熱安定性の増加が、少なくとも4℃である、75に記載の方法。
[78] 前記熱安定性が、DSF蛍光プローブを用いた示差走査蛍光定量法(DSF)により測定される、75に記載の方法。
[79] 前記DSF蛍光プローブが、Sypro Orangeである、78に記載の方法。
[80] 前記熱安定性の増加が、少なくとも5℃である、78に記載の方法。
[81] 前記ポリペプチドが、FES−YTE IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、ポリエチレングリコール(PEG)沈殿アッセイを用いて測定される見かけ溶解度の増加を呈示する、63〜72のいずれか1項に記載の方法。
[82] 前記ポリペプチドが、FES−YTE IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、加速安定性アッセイを用いて測定される安定性の増加を呈示する、63〜72のいずれか1項に記載の方法。
[83] 前記加速安定性アッセイが、(i)長期間にわたるポリペプチドのインキュベーション、及び(ii)高温でのインキュベーションを含む、82に記載の方法。
[84] 前記加速安定性アッセイが、高濃度でのインキュベーションにより実施される、83に記載の方法。
[85] 前記長期間が、少なくとも1ヵ月である、83に記載の方法。
[86] 前記高濃度が、少なくとも25mg/mlである、84に記載の方法。
[87] 前記高温が、少なくとも40℃である、83に記載の方法。
本発明は以下の実施形態を包含する:
[1] 変異型IgG Fcドメインを含む単離されたポリペプチドであって、前記変異型IgG Fcドメインが、
(a)234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;
(b)235位にアラニン(A)、アスパラギン(N)、フェニルアラニン(F)、グルタミン(Q)、若しくはバリン(V)アミノ酸;及び
(c)322位にアラニン(A)、アスパラギン酸(D)、グルタミン酸(E)、ヒスチジン(H)、アスパラギン(N)、若しくはグルタミン(Q)アミノ酸;又は331位にアラニン(A)若しくはグリシン(G)アミノ酸
を有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、単離されたポリペプチド。
[2] 234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;235位にグルタミン(Q)アミノ酸;及び322位にグルタミン(Q)アミノ酸を有し、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1に記載のポリペプチド。
[3] 234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;235位にグルタミン(Q)アミノ酸;及び331位にグリシン(G)アミノ酸を有し、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1に記載のポリペプチド。
[4] 234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;235位にアラニン(A)アミノ酸;及び322位にグルタミン(Q)アミノ酸を有し、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1に記載のポリペプチド。
[5] (a)252位にチロシン(Y)アミノ酸、若しくは252位にセリン(S)アミノ酸、若しくは252位にトリプトファン(W)アミノ酸、若しくは252位にトレオニン(T)アミノ酸;及び/又は
(b)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び/又は
(c)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸、若しくは256位にセリン(S)アミノ酸、若しくは256位にアルギニン(R)アミノ酸、若しくは256位にグルタミン(Q)アミノ酸、若しくは256位にアスパラギン酸(D)アミノ酸
をさらに有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1〜4のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[6] (a)252位にチロシン(Y)アミノ酸;及び/又は
(b)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び/又は
(c)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸
をさらに有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1〜4のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[7] (a)252位にチロシン(Y)アミノ酸、若しくは252位にセリン(S)アミノ酸、若しくは252位にトリプトファン(W)アミノ酸、若しくは252位にトレオニン(T)アミノ酸;及び
(b)254位にトレオニン(T)アミノ酸
をさらに有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1〜4のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[8] (a)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び
(b)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸、若しくは256位にセリン(S)アミノ酸、若しくは256位にアルギニン(R)アミノ酸、若しくは256位にグルタミン(Q)アミノ酸、若しくは256位にアスパラギン酸(D)アミノ酸
をさらに有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1〜4のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[9] (a)252位にチロシン(Y)アミノ酸、若しくは252位にセリン(S)アミノ酸、若しくは252位にトリプトファン(W)アミノ酸、若しくは252位にトレオニン(T)アミノ酸;並びに
(b)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸、若しくは256位にセリン(S)アミノ酸、若しくは256位にアルギニン(R)アミノ酸、若しくは256位にグルタミン(Q)アミノ酸、若しくは256位にアスパラギン酸(D)アミノ酸
をさらに有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1〜4のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[10] (a)252位にチロシン(Y)アミノ酸、及び254位にトレオニン(T)アミノ酸;又は、
(b)254位にトレオニン(T)アミノ酸及び256位にグルタミン酸(E)アミノ酸;又は、
(c)252位にチロシン(Y)アミノ酸及び256位にグルタミン酸(E)アミノ酸をさらに有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1〜4のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[11] 252位にチロシン(Y)アミノ酸、254位にトレオニン(T)アミノ酸、及び256位にグルタミン酸(E)アミノ酸をさらに有し、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1〜4のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[12] (a)234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;
(b)235位にグルタミン(Q)アミノ酸;
(c)322位にグルタミン(Q)アミノ酸;
(d)252位にチロシン(Y)アミノ酸;
(e)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び、
(f)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸
を有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1に記載のポリペプチド。
[13] (a)234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;
(b)235位にグルタミン(Q)アミノ酸;
(c)331位にグリシン(Q)アミノ酸;
(d)252位にチロシン(Y)アミノ酸;
(e)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び、
(f)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸
を有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1に記載のポリペプチド。
[14] (a)234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;
(b)235位にアラニン(A)アミノ酸;
(c)322位にグルタミン(Q)アミノ酸;
(d)252位にチロシン(Y)アミノ酸;
(e)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び、
(f)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸
を有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、1に記載のポリペプチド。
[15] 前記ポリペプチドが、野生型Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、向上した薬物動態(PK)特性を有する、1〜14のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[16] 前記PK特性が、半減期である、15に記載のポリペプチド。
[17] 前記ポリペプチドが、野生型Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、向上したFcRn結合を有する、1〜16のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[18] 前記IgG Fcドメインが、非ヒト由来である、1〜17のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[19] 前記IgG Fcドメインが、ヒト由来である、1〜17のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[20] 前記非ヒトIgG Fcドメインが、げっ歯類、ロバ、ヒツジ、ウサギ、ヤギ、モルモット、ラクダ、ウマ又はニワトリに由来する、18に記載のポリペプチド。
[21] 前記IgG Fcドメインが、ヒト免疫グロブリンGクラス1(IgG 1 )Fcドメイン、ヒト免疫グロブリンGクラス2(IgG 2 )Fcドメイン、ヒト免疫グロブリンGクラス3(IgG 3 )Fcドメイン、及びヒト免疫グロブリンGクラス4(IgG 4 )Fcドメインからなる群から選択される、19に記載のポリペプチド。
[22] 前記ポリペプチドが、さらに抗原結合ドメインを含む、1〜21のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[23] 前記抗原結合ドメインが、モノクローナル抗体又はその抗原結合フラグメントに由来する、22に記載のポリペプチド。
[24] 前記抗原結合ドメインが、ヒト抗体、ヒト化抗体、又はキメラ抗体に由来する、22に記載のポリペプチド。
[25] 前記抗原結合ドメインが、以下:
(a)一本鎖抗体;
(b)ダイアボディ;
(c)抗体のポリペプチド鎖;
(d)F(ab’) 2 フラグメント;又は、
(e)F(ab)フラグメント
を含む、22に記載のポリペプチド。
[26] 前記ポリペプチドが、野生型Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、低減したFc媒介エフェクター機能を有する、1〜21のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[27] 前記エフェクター機能が、抗体依存性細胞媒介細胞傷害(ADCC)である、26に記載のポリペプチド。
[28] 前記エフェクター機能が、補体依存性細胞傷害(CDC)である、26に記載のポリペプチド。
[29] 前記ポリペプチドが、野生型Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、Fcγ受容体(FcγR)に対し低い親和性を有する、1〜28のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[30] 前記FcγRが、ヒトFcγRである、29に記載のポリペプチド。
[31] 前記FcγRが、FcγRI、FcγRII、及びFcγRIIIからなる群から選択される、29に記載のポリペプチド。
[32] 前記FcγRIが、FcγRIαである、31に記載のポリペプチド。
[33] 前記FcγRIIが、FcγRIIa又はFcγRIIbである、31に記載のポリペプチド。
[34] 前記FcγRIIIが、FcγRIII(158V)又はFcγRIII(158F)である、31に記載のポリペプチド。
[35] 前記ポリペプチドが、野生型Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、向上した親和性でFcRnと結合する、1〜34のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[36] 前記ポリペプチドが、pH7.4におけるよりもpH6.0において、FcRnに対する高い親和性を有する、35に記載のポリペプチド。
[37] 前記ポリペプチドが、野生型Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、低減した親和性でC1qと結合する、1〜36のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[38] 前記ポリペプチドが、FES−YTE IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、熱安定性の増加を呈示する、1〜37のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[39] 前記熱安定性が、示差走査熱量測定(DSC)により測定される、38に記載のポリペプチド。
[40] 前記熱安定性の増加が、少なくとも4℃である、39に記載のポリペプチド。
[41] 前記熱安定性が、示差走査型蛍光定量法(DSF)により測定される、38に記載のポリペプチド。
[42] 前記DSF蛍光プローブが、Sypro Orangeである、41に記載のポリペプチド。
[43] 前記熱安定性の増加が、少なくとも5℃である、42に記載のポリペプチド。
[44] 前記ポリペプチドが、FES−YTE IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、ポリエチレングリコール(PEG)沈殿アッセイを用いて測定される見かけ溶解度の増加を呈示する、1〜43のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[45] 前記ポリペプチドが、FES−YTE IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、加速安定性アッセイを用いて測定される安定性の増加を呈示する、1〜44のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[46] 前記加速安定性アッセイが、(i)長期間にわたるポリペプチドのインキュベーション、及び(ii)高温でのインキュベーションを含む、45に記載のポリペプチド。
[47] 前記加速安定性アッセイが、高濃度でのインキュベーションにより実施される、46に記載のポリペプチド。
[48] 前記長期間が、少なくとも1ヵ月である、46に記載のポリペプチド。
[49] 前記高濃度が、少なくとも25mg/mlである、47に記載のポリペプチド。
[50] 前記高温が、少なくとも40℃である、46に記載のポリペプチド。
[51] 前記加速安定性アッセイが、高機能サイズ排除クロマトグラフィー(HPSEC)又は動的光散乱法(DLS)を用いて実施される、45〜50のいずれか1項に記載のポリペプチド。
[52] 1〜51のいずれか1項に記載のポリペプチドをコードする配列を含む、単離された核酸。
[53] 52に記載の核酸を含む組成物。
[54] 52に記載の核酸を含む発現ベクター。
[55] 52に記載の核酸、53に記載の組成物、又は54に記載のベクターを含む宿主細胞。
[56] (a)55に記載の細胞を培養するステップ;及び(b)前記ポリペプチドを単離するステップを含む、1〜51のいずれか1項に記載のポリペプチドを作製する方法。
[57] 1〜51のいずれか1項に記載のポリペプチドと、担体とを含む組成物。
[58] 1〜51のいずれか1項に記載のポリペプチドを含む診断薬。
[59] 前記ポリペプチドが標識されている、58に記載の診断薬。
[60] 1〜51のいずれか1項に記載のポリペプチドと、治療部分とを含むコンジュゲート。
[61] 1〜51のいずれか1項に記載のポリペプチド、又は52〜55若しくは57〜60のいずれか1項に記載の組成物を含むキット。
[62] 哺乳動物を治療する方法であって、1〜51のいずれか1項に記載のポリペプチド、又は52〜55若しくは57〜60のいずれか1項に記載の組成物を有効量で、治療が必要な哺乳動物に投与することを含む方法。
[63] Fcドメインを含む親ポリペプチドのFc誘導性エフェクター機能を低減する方法であって、以下:
(a)Fcドメインにおける234位の前記アミノ酸をフェニルアラニン(F)で置換するステップ;
(b)Fcドメインにおける235位の前記アミノ酸をアラニン(A)、アスパラギン(N)、フェニルアラニン(F)、グルタミン(Q)、若しくはバリン(V)で置換するステップ;及び
(c)Fcドメインの322位の前記アミノ酸をアラニン(A)、アスパラギン酸(D)、グルタミン酸(E)、ヒスチジン(H)、アスパラギン(N)、若しくはグルタミン(Q)で置換するステップ;又はFcドメインの331位のアミノ酸をアラニン(A)若しくはグリシン(G)で置換するステップ
を含み、
ここで、前記Fcドメインの前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う方法。
[64] 前記親ポリペプチドの前記Fcドメインが、
(a)252位にチロシン(Y)アミノ酸、若しくは252位にセリン(S)アミノ酸、若しくは252位にトリプトファン(W)アミノ酸、若しくは252位にトレオニン(T)アミノ酸;及び/又は
(b)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び/又は
(c)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸、若しくは256位にセリン(S)アミノ酸、若しくは256位にアルギニン(R)アミノ酸、若しくは256位にグルタミン(Q)アミノ酸、若しくは256位にアスパラギン酸(D)アミノ酸
を有し、
ここで、前記Fcドメインの前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う方法。
[65] 前記親ポリペプチドの前記Fcドメインが、
(a)252位にチロシン(Y);及び/又は
(b)254位にトレオニン(T);及び/又は
(c)256位にグルタミン酸(E)
を有し、
ここで、前記Fcドメインの前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う方法。
[66] Fcドメインを含む親ポリペプチドのFc誘導性エフェクター機能を低減すると共に、その半減期を増加させる方法であって、以下:
(a)前記Fcドメインにおける234位の前記アミノ酸をフェニルアラニン(F)で置換するステップ;
(b)前記Fcドメインにおける235位の前記アミノ酸をアラニン(A)、アスパラギン(N)、フェニルアラニン(F)、グルタミン(Q)、若しくはバリン(V)で置換するステップ;及び
(c)前記Fcドメインの322位の前記アミノ酸をアラニン(A)、アスパラギン酸(D)、グルタミン酸(E)、ヒスチジン(H)、アスパラギン(N)、若しくはグルタミン(Q)で置換するステップ;又は前記Fcドメインの331位のアミノ酸をアラニン(A)若しくはグリシン(G)で置換するステップ;並びに
(d)252位の前記アミノ酸をチロシン(Y)若しくはセリン(S)若しくはトリプトファン(W)若しくはトレオニン(T)で置換するステップ
を含み;
ここで、前記Fcドメインの前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う方法。
[67] 252位の前記アミノ酸がチロシン(Y)で置換され、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、66に記載の方法。
[68] (a)254位の前記アミノ酸をトレオニン(T)で置換するステップ;及び、
(b)256位の前記アミノ酸をグルタミン酸(E)若しくはセリン(S)、若しくはアルギニン(R)、若しくはグルタミン(Q)で置換するステップ
をさらに含み、
ここで、前記Fcドメインの前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、66又は67に記載の方法。
[69] 256位の前記アミノ酸がグルタミン酸(E)で置換され、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、68に記載の方法。
[70] 234位の前記アミノ酸がフェニルアラニン(F)で置換され;235位の前記アミノ酸がグルタミン(Q)で置換され;322位の前記アミノ酸がグルタミン(Q)で置換され、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、63〜69のいずれか1項に記載の方法。
[71] 234位の前記アミノ酸がフェニルアラニン(F)で置換され;235位の前記アミノ酸がグルタミン(Q)で置換され;331位の前記アミノ酸がグリシン(G)で置換され、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、63〜70のいずれか1項に記載の方法。
[72] 234位の前記アミノ酸がフェニルアラニン(F)で置換され;235位の前記アミノ酸がアラニン(A)で置換され;322位の前記アミノ酸がグルタミン(Q)で置換され、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、63〜70のいずれか1項に記載の方法。
[73] 前記エフェクター機能が、抗体依存性細胞媒介細胞傷害(ADCC)である、63〜72のいずれか1項に記載の方法。
[74] 前記エフェクター機能が、補体依存性細胞傷害(CDC)である、63〜72のいずれか1項に記載の方法。
[75] 前記ポリペプチドが、FES−YTE IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、熱安定性の増加を呈示する、63〜72のいずれか1項に記載の方法。
[76] 前記熱安定性が、示差走査熱量測定(DSC)により測定される、75に記載の方法。
[77] 前記熱安定性の増加が、少なくとも4℃である、75に記載の方法。
[78] 前記熱安定性が、DSF蛍光プローブを用いた示差走査蛍光定量法(DSF)により測定される、75に記載の方法。
[79] 前記DSF蛍光プローブが、Sypro Orangeである、78に記載の方法。
[80] 前記熱安定性の増加が、少なくとも5℃である、78に記載の方法。
[81] 前記ポリペプチドが、FES−YTE IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、ポリエチレングリコール(PEG)沈殿アッセイを用いて測定される見かけ溶解度の増加を呈示する、63〜72のいずれか1項に記載の方法。
[82] 前記ポリペプチドが、FES−YTE IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、加速安定性アッセイを用いて測定される安定性の増加を呈示する、63〜72のいずれか1項に記載の方法。
[83] 前記加速安定性アッセイが、(i)長期間にわたるポリペプチドのインキュベーション、及び(ii)高温でのインキュベーションを含む、82に記載の方法。
[84] 前記加速安定性アッセイが、高濃度でのインキュベーションにより実施される、83に記載の方法。
[85] 前記長期間が、少なくとも1ヵ月である、83に記載の方法。
[86] 前記高濃度が、少なくとも25mg/mlである、84に記載の方法。
[87] 前記高温が、少なくとも40℃である、83に記載の方法。
Claims (87)
- 変異型IgG Fcドメインを含む単離されたポリペプチドであって、前記変異型IgG Fcドメインが、
(a)234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;
(b)235位にアラニン(A)、アスパラギン(N)、フェニルアラニン(F)、グルタミン(Q)、若しくはバリン(V)アミノ酸;及び
(c)322位にアラニン(A)、アスパラギン酸(D)、グルタミン酸(E)、ヒスチジン(H)、アスパラギン(N)、若しくはグルタミン(Q)アミノ酸;又は331位にアラニン(A)若しくはグリシン(G)アミノ酸
を有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、単離されたポリペプチド。 - 234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;235位にグルタミン(Q)アミノ酸;及び322位にグルタミン(Q)アミノ酸を有し、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、請求項1に記載のポリペプチド。
- 234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;235位にグルタミン(Q)アミノ酸;及び331位にグリシン(G)アミノ酸を有し、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、請求項1に記載のポリペプチド。
- 234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;235位にアラニン(A)アミノ酸;及び322位にグルタミン(Q)アミノ酸を有し、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、請求項1に記載のポリペプチド。
- (a)252位にチロシン(Y)アミノ酸、若しくは252位にセリン(S)アミノ酸、若しくは252位にトリプトファン(W)アミノ酸、若しくは252位にトレオニン(T)アミノ酸;及び/又は
(b)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び/又は
(c)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸、若しくは256位にセリン(S)アミノ酸、若しくは256位にアルギニン(R)アミノ酸、若しくは256位にグルタミン(Q)アミノ酸、若しくは256位にアスパラギン酸(D)アミノ酸
をさらに有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、請求項1〜4のいずれか1項に記載のポリペプチド。 - (a)252位にチロシン(Y)アミノ酸;及び/又は
(b)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び/又は
(c)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸
をさらに有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、請求項1〜4のいずれか1項に記載のポリペプチド。 - (a)252位にチロシン(Y)アミノ酸、若しくは252位にセリン(S)アミノ酸、若しくは252位にトリプトファン(W)アミノ酸、若しくは252位にトレオニン(T)アミノ酸;及び
(b)254位にトレオニン(T)アミノ酸
をさらに有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、請求項1〜4のいずれか1項に記載のポリペプチド。 - (a)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び
(b)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸、若しくは256位にセリン(S)アミノ酸、若しくは256位にアルギニン(R)アミノ酸、若しくは256位にグルタミン(Q)アミノ酸、若しくは256位にアスパラギン酸(D)アミノ酸
をさらに有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、請求項1〜4のいずれか1項に記載のポリペプチド。 - (a)252位にチロシン(Y)アミノ酸、若しくは252位にセリン(S)アミノ酸、若しくは252位にトリプトファン(W)アミノ酸、若しくは252位にトレオニン(T)アミノ酸;並びに
(b)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸、若しくは256位にセリン(S)アミノ酸、若しくは256位にアルギニン(R)アミノ酸、若しくは256位にグルタミン(Q)アミノ酸、若しくは256位にアスパラギン酸(D)アミノ酸
をさらに有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、請求項1〜4のいずれか1項に記載のポリペプチド。 - (a)252位にチロシン(Y)アミノ酸、及び254位にトレオニン(T)アミノ酸;又は、
(b)254位にトレオニン(T)アミノ酸及び256位にグルタミン酸(E)アミノ酸;又は、
(c)252位にチロシン(Y)アミノ酸及び256位にグルタミン酸(E)アミノ酸をさらに有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、請求項1〜4のいずれか1項に記載のポリペプチド。 - 252位にチロシン(Y)アミノ酸、254位にトレオニン(T)アミノ酸、及び256位にグルタミン酸(E)アミノ酸をさらに有し、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、請求項1〜4のいずれか1項に記載のポリペプチド。
- (a)234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;
(b)235位にグルタミン(Q)アミノ酸;
(c)322位にグルタミン(Q)アミノ酸;
(d)252位にチロシン(Y)アミノ酸;
(e)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び、
(f)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸
を有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、請求項1に記載のポリペプチド。 - (a)234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;
(b)235位にグルタミン(Q)アミノ酸;
(c)331位にグリシン(G)アミノ酸;
(d)252位にチロシン(Y)アミノ酸;
(e)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び、
(f)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸
を有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、請求項1に記載のポリペプチド。 - (a)234位にフェニルアラニン(F)アミノ酸;
(b)235位にアラニン(A)アミノ酸;
(c)322位にグルタミン(Q)アミノ酸;
(d)252位にチロシン(Y)アミノ酸;
(e)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び、
(f)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸
を有し、
ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、請求項1に記載のポリペプチド。 - 前記ポリペプチドが、野生型Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、向上した薬物動態(PK)特性を有する、請求項1〜14のいずれか1項に記載のポリペプチド。
- 前記PK特性が、半減期である、請求項15に記載のポリペプチド。
- 前記ポリペプチドが、野生型Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、向上したFcRn結合を有する、請求項1〜16のいずれか1項に記載のポリペプチド。
- 前記IgG Fcドメインが、非ヒト由来である、請求項1〜17のいずれか1項に記載のポリペプチド。
- 前記IgG Fcドメインが、ヒト由来である、請求項1〜17のいずれか1項に記載のポリペプチド。
- 前記非ヒトIgG Fcドメインが、げっ歯類、ロバ、ヒツジ、ウサギ、ヤギ、モルモット、ラクダ、ウマ又はニワトリに由来する、請求項18に記載のポリペプチド。
- 前記IgG Fcドメインが、ヒト免疫グロブリンGクラス1(IgG1)Fcドメイン、ヒト免疫グロブリンGクラス2(IgG2)Fcドメイン、ヒト免疫グロブリンGクラス3(IgG3)Fcドメイン、及びヒト免疫グロブリンGクラス4(IgG4)Fcドメインからなる群から選択される、請求項19に記載のポリペプチド。
- 前記ポリペプチドが、さらに抗原結合ドメインを含む、請求項1〜21のいずれか1項に記載のポリペプチド。
- 前記抗原結合ドメインが、モノクローナル抗体又はその抗原結合フラグメントに由来する、請求項22に記載のポリペプチド。
- 前記抗原結合ドメインが、ヒト抗体、ヒト化抗体、又はキメラ抗体に由来する、請求項22に記載のポリペプチド。
- 前記抗原結合ドメインが、以下:
(a)一本鎖抗体;
(b)ダイアボディ;
(c)抗体のポリペプチド鎖;
(d)F(ab’)2フラグメント;又は、
(e)F(ab)フラグメント
を含む、請求項22に記載のポリペプチド。 - 前記ポリペプチドが、野生型Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、低減したFc媒介エフェクター機能を有する、請求項1〜21のいずれか1項に記載のポリペプチド。
- 前記エフェクター機能が、抗体依存性細胞媒介細胞傷害(ADCC)である、請求項26に記載のポリペプチド。
- 前記エフェクター機能が、補体依存性細胞傷害(CDC)である、請求項26に記載のポリペプチド。
- 前記ポリペプチドが、野生型Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、Fcγ受容体(FcγR)に対し低い親和性を有する、請求項1〜28のいずれか1項に記載のポリペプチド。
- 前記FcγRが、ヒトFcγRである、請求項29に記載のポリペプチド。
- 前記FcγRが、FcγRI、FcγRII、及びFcγRIIIからなる群から選択される、請求項29に記載のポリペプチド。
- 前記FcγRIが、FcγRIαである、請求項31に記載のポリペプチド。
- 前記FcγRIIが、FcγRIIa又はFcγRIIbである、請求項31に記載のポリペプチド。
- 前記FcγRIIIが、FcγRIII(158V)又はFcγRIII(158F)である、請求項31に記載のポリペプチド。
- 前記ポリペプチドが、野生型Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、向上した親和性でFcRnと結合する、請求項1〜34のいずれか1項に記載のポリペプチド。
- 前記ポリペプチドが、pH7.4におけるよりもpH6.0において、FcRnに対する高い親和性を有する、請求項35に記載のポリペプチド。
- 前記ポリペプチドが、野生型Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、低減した親和性でC1qと結合する、請求項1〜36のいずれか1項に記載のポリペプチド。
- 前記ポリペプチドが、FES−YTE IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、熱安定性の増加を呈示する、請求項1〜37のいずれか1項に記載のポリペプチド。
- 前記熱安定性が、示差走査熱量測定(DSC)により測定される、請求項38に記載のポリペプチド。
- 前記熱安定性の増加が、少なくとも4℃である、請求項39に記載のポリペプチド。
- 前記熱安定性が、示差走査型蛍光定量法(DSF)により測定される、請求項38に記載のポリペプチド。
- 前記DSF蛍光プローブが、Sypro Orangeである、請求項41に記載のポリペプチド。
- 前記熱安定性の増加が、少なくとも5℃である、請求項42に記載のポリペプチド。
- 前記ポリペプチドが、FES−YTE IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、ポリエチレングリコール(PEG)沈殿アッセイを用いて測定される見かけ溶解度の増加を呈示する、請求項1〜43のいずれか1項に記載のポリペプチド。
- 前記ポリペプチドが、FES−YTE IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、加速安定性アッセイを用いて測定される安定性の増加を呈示する、請求項1〜44のいずれか1項に記載のポリペプチド。
- 前記加速安定性アッセイが、(i)長期間にわたるポリペプチドのインキュベーション、及び(ii)高温でのインキュベーションを含む、請求項45に記載のポリペプチド。
- 前記加速安定性アッセイが、高濃度でのインキュベーションにより実施される、請求項46に記載のポリペプチド。
- 前記長期間が、少なくとも1ヵ月である、請求項46に記載のポリペプチド。
- 前記高濃度が、少なくとも25mg/mlである、請求項47に記載のポリペプチド。
- 前記高温が、少なくとも40℃である、請求項46に記載のポリペプチド。
- 前記加速安定性アッセイが、高機能サイズ排除クロマトグラフィー(HPSEC)又は動的光散乱法(DLS)を用いて実施される、請求項45〜50のいずれか1項に記載のポリペプチド。
- 請求項1〜51のいずれか1項に記載のポリペプチドをコードする配列を含む、単離された核酸。
- 請求項52に記載の核酸を含む組成物。
- 請求項52に記載の核酸を含む発現ベクター。
- 請求項52に記載の核酸、請求項53に記載の組成物、又は請求項54に記載のベクターを含む宿主細胞。
- (a)請求項55に記載の細胞を培養するステップ;及び(b)前記ポリペプチドを単離するステップを含む、請求項1〜51のいずれか1項に記載のポリペプチドを作製する方法。
- 請求項1〜51のいずれか1項に記載のポリペプチドと、担体とを含む組成物。
- 請求項1〜51のいずれか1項に記載のポリペプチドを含む診断薬。
- 前記ポリペプチドが標識されている、請求項58に記載の診断薬。
- 請求項1〜51のいずれか1項に記載のポリペプチドと、治療部分とを含むコンジュゲート。
- 請求項1〜51のいずれか1項に記載のポリペプチド、又は請求項52〜55若しくは57〜60のいずれか1項に記載の組成物を含むキット。
- 哺乳動物を治療する方法であって、請求項1〜51のいずれか1項に記載のポリペプチド、又は請求項52〜55若しくは57〜60のいずれか1項に記載の組成物を有効量で、治療が必要な哺乳動物に投与することを含む方法。
- Fcドメインを含む親ポリペプチドのFc誘導性エフェクター機能を低減する方法であって、以下:
(a)Fcドメインにおける234位の前記アミノ酸をフェニルアラニン(F)で置換するステップ;
(b)Fcドメインにおける235位の前記アミノ酸をアラニン(A)、アスパラギン(N)、フェニルアラニン(F)、グルタミン(Q)、若しくはバリン(V)で置換するステップ;及び
(c)Fcドメインの322位の前記アミノ酸をアラニン(A)、アスパラギン酸(D)、グルタミン酸(E)、ヒスチジン(H)、アスパラギン(N)、若しくはグルタミン(Q)で置換するステップ;又はFcドメインの331位のアミノ酸をアラニン(A)若しくはグリシン(G)で置換するステップ
を含み、
ここで、前記Fcドメインの前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う方法。 - 前記親ポリペプチドの前記Fcドメインが、
(a)252位にチロシン(Y)アミノ酸、若しくは252位にセリン(S)アミノ酸、若しくは252位にトリプトファン(W)アミノ酸、若しくは252位にトレオニン(T)アミノ酸;及び/又は
(b)254位にトレオニン(T)アミノ酸;及び/又は
(c)256位にグルタミン酸(E)アミノ酸、若しくは256位にセリン(S)アミノ酸、若しくは256位にアルギニン(R)アミノ酸、若しくは256位にグルタミン(Q)アミノ酸、若しくは256位にアスパラギン酸(D)アミノ酸
を有し、
ここで、前記Fcドメインの前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う方法。 - 前記親ポリペプチドの前記Fcドメインが、
(a)252位にチロシン(Y);及び/又は
(b)254位にトレオニン(T);及び/又は
(c)256位にグルタミン酸(E)
を有し、
ここで、前記Fcドメインの前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う方法。 - Fcドメインを含む親ポリペプチドのFc誘導性エフェクター機能を低減すると共に、その半減期を増加させる方法であって、以下:
(a)前記Fcドメインにおける234位の前記アミノ酸をフェニルアラニン(F)で置換するステップ;
(b)前記Fcドメインにおける235位の前記アミノ酸をアラニン(A)、アスパラギン(N)、フェニルアラニン(F)、グルタミン(Q)、若しくはバリン(V)で置換するステップ;及び
(c)前記Fcドメインの322位の前記アミノ酸をアラニン(A)、アスパラギン酸(D)、グルタミン酸(E)、ヒスチジン(H)、アスパラギン(N)、若しくはグルタミン(Q)で置換するステップ;又は前記Fcドメインの331位のアミノ酸をアラニン(A)若しくはグリシン(G)で置換するステップ;並びに
(d)252位の前記アミノ酸をチロシン(Y)若しくはセリン(S)若しくはトリプトファン(W)若しくはトレオニン(T)で置換するステップ
を含み;
ここで、前記Fcドメインの前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う方法。 - 252位の前記アミノ酸がチロシン(Y)で置換され、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、請求項66に記載の方法。
- (a)254位の前記アミノ酸をトレオニン(T)で置換するステップ;及び、
(b)256位の前記アミノ酸をグルタミン酸(E)若しくはセリン(S)、若しくはアルギニン(R)、若しくはグルタミン(Q)で置換するステップ
をさらに含み、
ここで、前記Fcドメインの前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、請求項66又は67に記載の方法。 - 256位の前記アミノ酸がグルタミン酸(E)で置換され、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、請求項68に記載の方法。
- 234位の前記アミノ酸がフェニルアラニン(F)で置換され;235位の前記アミノ酸がグルタミン(Q)で置換され;322位の前記アミノ酸がグルタミン(Q)で置換され、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、請求項63〜69のいずれか1項に記載の方法。
- 234位の前記アミノ酸がフェニルアラニン(F)で置換され;235位の前記アミノ酸がグルタミン(Q)で置換され;331位の前記アミノ酸がグリシン(G)で置換され、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、請求項63〜70のいずれか1項に記載の方法。
- 234位の前記アミノ酸がフェニルアラニン(F)で置換され;235位の前記アミノ酸がアラニン(A)で置換され;322位の前記アミノ酸がグルタミン(Q)で置換され、ここで、前記アミノ酸番号付けは、Kabatに記載のEUインデックスに従う、請求項63〜70のいずれか1項に記載の方法。
- 前記エフェクター機能が、抗体依存性細胞媒介細胞傷害(ADCC)である、請求項63〜72のいずれか1項に記載の方法。
- 前記エフェクター機能が、補体依存性細胞傷害(CDC)である、請求項63〜72のいずれか1項に記載の方法。
- 前記ポリペプチドが、FES−YTE IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、熱安定性の増加を呈示する、請求項63〜72のいずれか1項に記載の方法。
- 前記熱安定性が、示差走査熱量測定(DSC)により測定される、請求項75に記載の方法。
- 前記熱安定性の増加が、少なくとも4℃である、請求項75に記載の方法。
- 前記熱安定性が、DSF蛍光プローブを用いた示差走査蛍光定量法(DSF)により測定される、請求項75に記載の方法。
- 前記DSF蛍光プローブが、Sypro Orangeである、請求項78に記載の方法。
- 前記熱安定性の増加が、少なくとも5℃である、請求項78に記載の方法。
- 前記ポリペプチドが、FES−YTE IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、ポリエチレングリコール(PEG)沈殿アッセイを用いて測定される見かけ溶解度の増加を呈示する、請求項63〜72のいずれか1項に記載の方法。
- 前記ポリペプチドが、FES−YTE IgG Fcドメインを含む同じポリペプチドと比較して、加速安定性アッセイを用いて測定される安定性の増加を呈示する、請求項63〜72のいずれか1項に記載の方法。
- 前記加速安定性アッセイが、(i)長期間にわたるポリペプチドのインキュベーション、及び(ii)高温でのインキュベーションを含む、請求項82に記載の方法。
- 前記加速安定性アッセイが、高濃度でのインキュベーションにより実施される、請求項83に記載の方法。
- 前記長期間が、少なくとも1ヵ月である、請求項83に記載の方法。
- 前記高濃度が、少なくとも25mg/mlである、請求項84に記載の方法。
- 前記高温が、少なくとも40℃である、請求項83に記載の方法。
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| WO2025232879A1 (en) | 2024-05-10 | 2025-11-13 | Cytocares (Shanghai) Inc. | Anti-lilrb2 monospecific and bispecific antibody constructs and uses thereof |
Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2010502232A (ja) * | 2006-09-08 | 2010-01-28 | メディミューン,エルエルシー | ヒト化抗cd19抗体ならびに癌、移植および自己免疫疾患の治療におけるその使用 |
| JP2010535032A (ja) * | 2007-07-31 | 2010-11-18 | メディミューン,エルエルシー | 多重特異性エピトープ結合性タンパク質およびその用途 |
| WO2011005481A1 (en) * | 2009-06-22 | 2011-01-13 | Medimmune, Llc | ENGINEERED Fc REGIONS FOR SITE-SPECIFIC CONJUGATION |
| WO2013118858A1 (ja) * | 2012-02-09 | 2013-08-15 | 中外製薬株式会社 | 抗体のFc領域改変体 |
Family Cites Families (8)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP0307434B2 (en) | 1987-03-18 | 1998-07-29 | Scotgen Biopharmaceuticals, Inc. | Altered antibodies |
| US6410008B1 (en) * | 1994-12-12 | 2002-06-25 | Beth Israel Hospital Association | Chimeric IL-10 proteins and uses thereof |
| US7183387B1 (en) * | 1999-01-15 | 2007-02-27 | Genentech, Inc. | Polypeptide variants with altered effector function |
| US6737056B1 (en) * | 1999-01-15 | 2004-05-18 | Genentech, Inc. | Polypeptide variants with altered effector function |
| PT1355919E (pt) | 2000-12-12 | 2011-03-02 | Medimmune Llc | Moléculas com semivida longa, composições que as contêm e suas utilizações |
| US20090042291A1 (en) * | 2002-03-01 | 2009-02-12 | Xencor, Inc. | Optimized Fc variants |
| KR20100049568A (ko) | 2007-06-26 | 2010-05-12 | 메디뮨 엘엘씨 | Rsv 감염 및 관련 병증의 치료 방법 |
| PL2486141T3 (pl) * | 2009-10-07 | 2018-07-31 | Macrogenics, Inc. | Polipeptydy zawierające regiony fc i mające w wyniku zmian w zakresie fukozylacji ulepszoną funkcję efektorową, i sposoby zastosowania tych polipeptydów |
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Patent Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2010502232A (ja) * | 2006-09-08 | 2010-01-28 | メディミューン,エルエルシー | ヒト化抗cd19抗体ならびに癌、移植および自己免疫疾患の治療におけるその使用 |
| JP2010535032A (ja) * | 2007-07-31 | 2010-11-18 | メディミューン,エルエルシー | 多重特異性エピトープ結合性タンパク質およびその用途 |
| WO2011005481A1 (en) * | 2009-06-22 | 2011-01-13 | Medimmune, Llc | ENGINEERED Fc REGIONS FOR SITE-SPECIFIC CONJUGATION |
| WO2013118858A1 (ja) * | 2012-02-09 | 2013-08-15 | 中外製薬株式会社 | 抗体のFc領域改変体 |
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