JP2018161152A - 血小板標的化治療 - Google Patents
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Abstract
Description
本願は、2012年10月24日に出願された米国仮特許出願第61/717,951号の優先権を主張するものであり、上述出願はその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
血友病は一般的な出血性障害(男性の約10,000人に1人にみられる)であり、患者の血液が正常に凝固しないため重度の内出血を来たし、死に至る場合が多い。血友病は通常、遺伝性であり、患者は出生時に始まり生涯を通じて再発する制御不可能な重度の出血事象を示す。血小板とともに作用して血液凝固を助ける凝固因子にはいくつかあるが、血友病患者では通常、凝固第VIII因子(血友病A)または第IX因子(血友病B)をコードするタンパク質の量または性質に欠陥がみられ、これが正常な止血を妨げる。
本開示は、外来遺伝子の発現を血小板に標的化するための組成物および方法に関する。本開示は特に、外来性作用物質(例えば、凝固因子)の発現を血小板に標的化することによる、血友病および他の疾患ならびに症状の治療に関する。いくつかの実施形態では、本開示は、造血幹細胞遺伝子治療のための組成物および臨床的に意義のある方法に関し、骨髄巨核球内での外来遺伝子の発現を標的化とすることにより、ヒト血小板内での組換え治療用タンパク質の発現および/または貯蔵をもたらす。
図1は、血小板標的化レンチウイルスベクターの設計を示す図である。(A)ITGA2B遺伝子プロモーターフラグメントが巨核球の特異的な発現をルシフェラーゼに導く。(B)−889ITGA2B−BDDFVIII−WPTSレンチウイルスベクターの略図。(C)−673ITGA2B−VWFSPD2−BDDFVIII−WPTSレンチウイルスベクターの略図。
定義
本発明の理解を容易にするため、多数の用語および語句を以下に定義する。
本開示は、外来遺伝子の発現を血小板に標的化するための組成物および方法に関する。本開示は特に、外来性作用物質(例えば、凝固因子)の発現を血小板に標的化することによる、血友病および他の病気ならび症状の治療に関する。
本発明は特定の標的化ベクターまたは発現カセットに限定されるものではない。いくつかの実施形態では、発現カセットは、細胞(例えば、血小板)特異性のプロモーターと作動可能に連結した目的外来遺伝子を含む。いくつかの実施形態では、発現カセットは、遺伝子発現標的化分子または遺伝子発現シグナル分子および発現エンハンサーをさらに含む。図7、8および10に本発明の実施形態に有用な発現カセットおよびベクターを例示する。例示的なベクター構成要素を以下に記載する。
いくつかの実施形態では、ベクターは、特定の細胞型に遺伝子発現を指示するプロモーターを含む。例えば、いくつかの実施形態では、プロモーターは血小板特異的プロモーターである。本発明は、特定の血小板特異的プロモーターに限定されない。いくつかの実施形態では、短縮されたインテグリンαIIb遺伝子(ITGA2B)プロモーターを用いる。例示的なプロモーターとしては、特に限定されないが、巨核球において高レベルの遺伝子転写のための「ETS」および「GATA」エレメントをコードする−1218、−889および−673ITGA2Bプロモーターならびに他の造血細胞系列において遺伝子転写を抑制するリプレッサー領域を含む(配列番号21、22、23および25;図8および10)。
Marguerie博士を筆頭とするフランスのグループによって初めて明らかにされた(Prandini MH,Denarier E,Frachet P,Uzan G,Marguerie G.Isolation of the human platelet glycoprotein IIb gene and characterization of the 5’ flanking region.Biochem Biophys Res Commun 1988,156(1):595−601)。図7は、ITGA2Bプロモーターの構造領域を示す。いくつかの実施形態では、このプロモーターのフラグメント(例えば、1218,−889および−673)を用いる。いくつかの実施形態では、−673は血小板に特異的な導入遺伝子の発現を駆動するために不可欠な全ての調節エレメントを含む。1993年に、研究者らは遺伝子プロモーターに関する研究を行い、転写因子GATA−1が、ITGA2Bに確認されるGATA−1結合部位として機能する少なくとも3つの領域、おそらくは第四の領域を有する巨核球における高レベルの遺伝子発現に重要であることを明らかにした(Martin F,Prandini MH,Thevenon D,Marguerie G,Uzan G.The transcription factor GATA−1 regulates the promoter activity of the platelet glycoprotein IIb gene.J Biol Chem 1993,268(29):21606−21612)。次いで、高レベルの導入遺伝子発現を生じさせるために協働すると信じられるITGA2Bに結合する別の転写因子Etsの3個のコンセンサス配列が発見された(Lemarchandel V,Ghysdael J,Mignotte V,Rahuel C,Romeo PH.GATA and Ets cis−acting sequences mediate megakaryocyte−specific expression.Mol Cell Biol
1993,13(1):668−676)。マウスITGA2Bプロモーターがクローン化され、ヒトITGA2Bプロモーター、特に転写因子コンセンサス結合配列が同定された領域において、ヌクレオチド配列相同性が極めて高いことが明らかにされた(Denarier E,Martin F,Martineau S,Marguerie G.PCR cloning and sequence of the murine GPIIb gene promoter.Biochem Biophys Res Commun 1993,195(3):1360−1364)。さらに、遺伝子プロモーターを解析することにより、遺伝子プロ−モーターが他の造血系列で導入遺伝子転写を駆動することを妨げるために、ITGA2Bの−139〜−63の領域が保持されていなければならず、この領域がリプレッサーを標識することが明らかになった(Prandini MH,Martin F,Thevenon D,Uzan G.The tissue−specific transcriptional regulation of the megakaryocytic glycoprotein IIb gene is controlled by interactions between a repressor and positive cis−acting elements.Blood 1996,88(6):2062−2070)。最後に、プロモーターが最適な血小板特異的遺伝子の転写に不可欠な三次元構造を形成する際に他のエレメントとともにEtsと協働するのに重要であると考えられている、Sp1の結合部位がITGA2Bにおいて同定された(Block KL,Shou Y,Poncz M.An Ets/Sp1 interaction in the 5’−flanking region of the megakaryocyte−specific
alpha IIb gene appears to stabilize Sp1
binding and is essential for expression
of this TATA−less gene.Blood 1996,88(6):2071−2080)。
本発明は特定の外来遺伝子に限定されない。血友病を治療する実施形態では、外来遺伝子は一般に凝固因子(例えば、第VIII因子および/または第IX因子)である。ヒト第VIII因子はアクセッション番号NM_000132.3であり、ヒト第IX因子はアクセッション番号NM_000133.3である。
いくつかの実施形態では、発現カセットは、血小板の特定の部分構造内の発現を標的化する標的化因子をさらに含む。いくつかの実施形態では、発現カセットは、VWFに加えて、細胞顆粒区画、特に、ともに細胞が活性化されると分泌される内皮細胞の天然の貯蔵部分構造「バイベル・パラーデ小体」および血小板α顆粒にタンパク質を貯蔵する証明された能力を有するペプチドと融合した組換えタンパク質を輸送することができることが見いだされているシグナル配列ペプチドの最小限のアミノ酸配列をさらに含む。例えば、いくつかの実施形態では、Rosenberg JBら,Intracellular Trafficking of FVIII to von Willebrand Factor storage Granules,J.Clin.Invest.101,613−624(1998);Haberichter SL,Jacobi P,Montgomery RR.Critical independent regions
in the VWF propeptide and mature VWF that enable normal VWF storage.Blood 2003,101(4):1384−1391およびHaberichterら,The Von Willlebrand Factor Propeptide(VWFpp)Traffics an Unrelated Protein to Storage,Arterioscler Thromb Vas Biol.22,921 926(2002)に記載されるように、発現構築物は、α顆粒区画への分子の直接輸送を促進するフォン・ヴィルブランド因子プロペプチドシグナルペプチドおよびD2ドメイン(SPD2)をコードする核酸を含む。
本発明は特定の発現ベクターに限定されない。いくつかの実施形態では、ベクターは自己不活性化である。いくつかの実施形態では、ベクターはレトロウイルスベクター(例えば、レンチウイルスベクター)である。表2に例示的な適切なベクターをまとめて記載する。
いくつかの実施形態では、本発明は幹細胞(例えば、造血幹細胞または癌幹細胞)の遺伝子操作ためのシステムおよび方法を提供する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載される組成物および方法を血小板機能に関連する様々な障害(例えば、血友病および下の表3に記載される障害)の治療への使用を見いだす。
実験
以下の実施例は、本発明の特定の好ましい実施形態および態様を詳細に説明するために記載するものであり、本発明の範囲を限定するものとして解釈されない。
材料および方法
細胞系
American Type Culture Collection(Rockville、MD)からヒト形質転換細胞系を入手し、前巨核球(HEL巨核球形質転換細胞系)(Bray,P.F.ら,J Clin Invest 80,1812−1817.(1987);Greenberg,S.M.ら、T細胞リンパ腫(KT1)(Okamoto,T.ら,J Biol Chem 261,4615−4619(1986))、B細胞リンパ腫(Raji)(Choi,J.H.ら,International
immunopharmacology 8,852−858,2008.01.037(2008))、赤白血病(K562)(Gauwerky,C.およびGolde,D.W.Blood 56,886−891(1980))および上皮(HeLa)(Goldstein,M.N.ら,Annals of the New York Academy of Sciences 89,474−483(1960))の細胞系に関して記載されている条件下で増殖させた。
ITGA2B遺伝子プロモーター構築物:ヒト全巨核球細胞系Dami,49からゲノムDNAを単離し、ITGA2Bのセンスプライマー「−1218」
Sci U S A 1999,96(17):9654−9659)。
細胞系(2×107個)にITGA2B遺伝子プロモーター構築物(−1218、−889、−673)(図1A)またはホタルルシフェラーゼをコードする陽性(CMV)もしくは陰性(Basic)対照のいずれか(20μg)と、β−ガラクトシダーゼ.49をコードするpCMVnlac(20μg)とを共トランスフェクトした。簡単にいうと、共トランスフェクションの48時間後、細胞を洗浄して回収し、溶解液を調製し、ルシフェラーゼアッセイシステム(Promega)を用いて、−80℃で凍結した。Turner Designs Model20ルミノメーターによりルシフェラーゼ活性を測定した。β−ガラクトシダーゼの基質である、クロロフェノールレッド−β−D−ガラクトフラノシド(galactophranoside)(CPRG)による発色変化を測定する高感度ELISA酵素アッセイにより各細胞系の一過性の導入遺伝子発現を正規化するために、β−ガラクトシダーゼ活性を検出した(Eustice DCら,Biotechniques 1991,11(6):739−740,742−733)。各々の細胞系のトランスフェクション効率を明らかにするために、各構築物についてルシフェラーゼ/CPRG Vmax値の相対光量単位(RLU)の平均値を比較してルシフェラーゼ活性の百分率を求めた。図1Aに示されるように、pCMVLucのRLUに100%の値を任意に割り当て、その値に基づいて各ベクターについて全ての他の結果を計算した。
ITGA2B−(M)WPTS遺伝子導入ベクターはHIV1型レンチウイルスベクター(D.Trono、University of Geneva、Switzerland)に由来する。51 p−889ITGA2B−BDDFVIII−WPTSレンチウイルスベクター(図1B)はヒトITGA2Bプロモーターの−889〜+30ヌクレオチドフラグメントおよびヒトBDDFVIII分子をコードする。16 p−673ITGA2B−VWFSPD2−BDDFVIII−WPTSレンチウイルスベクター(図1C)はヒトITGA2B遺伝子プロモーターのヌクレオチド−673〜+30のフラグメントと、これに続くヒトフォン・ヴィルブランド因子プロペプチドのフラグメント(D2ドメイン(1,199bp)と連結した540アミノ酸のVWFシグナルペプチド(SP;66bp)をコードするVWFpp)と、SPD2ペプチドを用いてヒトBDDFVIIIを血小板α顆粒まで輸送するハイブリッド分子の巨核球特異的転写を可能にするヒトBDDFVIIIをコードするcDNAとをコードする。SPをコードする22個のcDNAは、順方向プライマー(P)1(5’GTTAATCGATATCTCCTTGCCACCTAGA3’)(配列番号5)および逆方向P2(5’AATCTGGCAGGAATCATGGTCCTTCTTCCACAACCT3’)(配列番号6)を用いてPCRにより増幅され、順方向P3(5’AGGTTGTGGAAGAAGGACCATGATTCCTGCCAGATTTGC3’)(配列番号7)および逆方向P4(5’CGTCTCGGCCCTTTTGCTGCCATGAGACAG3’)(配列番号8)を用いてPCRにより増幅したD2と連結した。ネステッドPCRにより、ITGA2BプロモーターおよびVWFSPD2を、P5(5’ATCGATATCTCCTTGCCACCTA3’)(配列番号9)およびP4と連結した。p−889ITGA2−BDDFVIII−WPTSは、VWFD2に直接連結するcDNAを合成するために、順方向P7(5’CGTCTCAGGGCCACCAGAAGATACTACCT3’)(配列番号10)および逆方向P8(5’ACGCGTCTTCTCTACATACTAGTA3’)(配列番号11)を用いて、BDDFVIIIのフラグメントをコードするcDNAのPCRの鋳型として機能した。5’hBDDFVIII(BsmB1およびMluI)と連結した固有の制限部位−673ITGA2B−SPD2(ClaIおよびBsmBI)を3’BDDFVIII(MluIおよびSpel)とともに用いて、全PCR産物をpCR−Blunt II−TOPO(Life Technologies、Grand
Island、NY)中でクローン化した。全フラグメントをpWPTSレンチウイルスベクター中でクローン化し、ヌクレオチド配列分析により正確な同一性を確認した。3プラスミド一過性共トランスフェクションにより組換えビリオンが生じた後、上清を収集し、遠心分離により500倍に濃縮し、使用するまで−80oCで保管した(Fang Jら,Proc Natl Acad Sci USA 2011,108(23):9583−9588)。RT−PCRによりビリオンの力価を決定した(Lizee Gら,Hum Gene Ther 2003,14(6):497−507)。ストック内に複製能のあるビリオンが存在しないことをマーカーレスキューアッセイで確認した(Wilcoxら,Blood 2000,95(12):3645−3652)。
ともに米国実験動物飼育公認協会(American Association for Accreditation of Laboratory Animal Care)の公認施設であるノースカロライナ大学およびウィスコンシン医科大学の動物管理使用委員会(Institutional Animal Care and Use Committee)により承認された、血友病Aに罹患したFVIII欠損イヌを用いたサイトカイン動員CD34+G−PBCの遺伝子導入および自家移植に関する研究(ノースカロライナ大学、Chapel Hill、NC)(Lozier JNら,Proc
Natl Acad Sci USA 2002,99(20):12991−12996)を実施した。
19匹のFVIII欠損成体雄イヌ(1.25歳、4.25歳および6.5歳)にイヌ組換え顆粒球コロニー刺激因子(crG−CSF;10μg/(kg・日)および幹細胞因子(crSCF;5μg/(kg・日))(Amgen、Thousand Oaks、CA)を連日注射した。3日目に、COBE Spectra Blood Cell
Separatorを用いてG−PBCを収集した。Fico−Paque Plus(GE Healthcare、Uppsala、Sweden)により単核G−PBCを単離した。Automacs磁気細胞分離器(Miltenyi Biotec Inc.、Auburn、CA)によりビオチンコンジュゲート1H6Ab(1mg/ml)(Richard Nash、フレッド・ハッチンソン研究所、Seattle、WA)および抗ビオチン免疫磁気ビーズ(1:5希釈)を用いてCD34+G−PBCを選別した。CD34+G−PBCを−889ITGA2B−BDDFVIII−WPTSまたは−673ITGA2B−VWFSPD2−BDDFVIII−WPTSレンチウイルスベクターで形質導入した。簡単に言うと、20μg/cm2のRetroNectin(Takara Shuzo、Otsu、Shiga、Japan)でコートした6ウェルプレート(Falcon−Becton Dickinson、Franklin Lakes、NJ)に1ウェル当たり4×106個の細胞を播き、10%FCS、rhIL−3、rcaIL−6、rcaSCF、rhTPOおよびrhflk2/flt3リガンドを含有するX−Vivo 10中、1細胞当たり1.0×104個のITGA2B−FVIIIレンチビリオンとインキュベートした。骨髄非破壊的用量5〜10mg/kgのBusulfex(登録商標)で前処置した各自家移植レシピエントの橈側皮静脈内に1kg当たり約3×106個のFVIII形質導入CD34+G−PBCと、2×108個のCD34(−)G−PBCとを注入した。移植後約90日間、シクロスポリン(Gengraf(登録商標)、Abbott Laboratories、North Chicago、IL)10mg/(kg・日)およびMMF 8mg/(kg・日)により一時的に免疫を抑制した(表1)(Fangら,Proc Natl Acad Sci USA 2011,108(23):9583−9588)。
事前に選択した時間に血液を、7.5%EDTA抗凝固剤を含むバキュチューブ(vacutube)内に採取した(Fangら,上記)。Vet ABC血液分析器(scil animal care company、Gurnee、IL)で血液細胞を計数した。Fico/Lite(商標)(Atlanta Biologicals、Norcross、GA)により血小板を単離してPBSで洗浄し、免疫蛍光フローサイトメトリーまたはFVIII:C活性分析に直接使用した。Ficoll−Paque Plus(登録商標)(GE Healthcare)により製造業者の仕様書に従って白血球を単離した。
イヌCD34「1H6」(1mg/ml)に対するマウスモノクローナル一次抗体をフレッド・ハッチンソン癌研究センター(Seattle、WA)から入手した。イヌフィブリノーゲンを認識する27 A ヒツジ抗ウサギフィブリノーゲンポリクローナル一次抗体(5μg/ml)をEnzyme Research社から購入した。モノクローナル一次抗体(5〜10μg/ml)、ヒトBDDFVIII 53二次抗体上のエピトープを認識するMBC103.3および301.3(R.R.Montgomery、BloodCenter of WI、Milwaukee、WI)を用い、ロバ抗ヒツジIgGのフラグメント(H+L)とコンジュゲートしたAlexa Fluor(登録商標)488 F(ab’)2(1:1,000希釈)とヤギ抗マウスIgGのAlexa Fluor(登録商標)568 F(ab’)2フラグメント(H+L)(1:500希釈)とをLife Technologies社(Grand Island、NY)から入手した。
イヌ血小板を3.7%(vol/vol)緩衝ホルマリンで固定し、0.5%Triton X−100(20mmol/L Hepes、300mmol/Lスクロース、50mmol/L NaClおよび3mmol/L MgCl2、pH7.0中)で透過処理し、HBSS中2.5%の正常ヤギ血清でブロッキングした。血小板をイヌフィブリノーゲンに対するヒツジポリクローナル一次抗体およびヒトFVIIIに対するモノクローナル一次抗体(MBC103.3および301.3)(5μg/ml)と4℃で一晩インキュベートした。ロバ抗ヒツジIgGの53 Alexa Fluor(登録商標)488コンジュゲートF(ab’)2フラグメント(H+L)を、フィブリノーゲンを検出する二次抗体(1:1,000希釈)として使用し、25℃で30分間、ヤギ抗マウスIgGのAlexa Fluor(登録商標)568コンジュゲートF(ab’)2フラグメント(H+L)とコンジュゲートした二次抗体(1:500希釈)を用いてFVIIIの存在を検出した。血小板をVectashield(Vector Labs、Burlingame、CA)でマウントした。Zeiss LSM510多光子共焦点顕微鏡(Carl Zeiss,Inc.、Oberkochen、Germany)で免疫蛍光を検出した(Wilcox DAら,Journal of thrombosis and haemostasis:JTH 2003,1(11):2300−2311)。FVIII欠損イヌから単離血小板を陰性対照として用いた。非特異的アイソタイプ対照抗体を陰性対照とした。血小板を各視野で撮影したZ切片により画像化し、全Zシリーズ(12〜25枚の画像)を1つの積み重なった投影像にまとめた。Confocal Assistantソフトウェアプログラム(Bio−Rad)を用いてこの投影像を統合した。コンピュータが割り当てる色はビットマップの重なりの強度に基づくものであり、Alexa488−蛍光色素は緑色の画素で表され、Alexa568−蛍光色素は赤色の画素で表され、2つの蛍光色素コンジュゲート抗体の共局在は黄色の画素で表された。
イヌ血小板を血液から単離し、BDDFVIIIの細胞内検出用にCytofix(商標)およびPERM/WASH(商標)試薬(BD Biosciences)で処理した。血小板をヒトFVIIIに対するモノクローナル一次抗体(MBC103.3および301.3)(5μg/ml)と4℃で30分間インキュベートした後、ヤギ抗マウスIgG(H+L)のAlexa Fluor(登録商標)568コンジュゲートF(ab’)2 フラグメントとコンジュゲートした二次抗体(1:500希釈)と4℃で30分間インキュベートした。FVIII欠損イヌから単離した血小板を陰性対照として用いた。非特異的アイソタイプ対照抗体を陰性対照とした。細胞を収集し、Accuri分析ソフトウェアを用いて、Accuri(登録商標)C6フローサイトメータ(Accuri Cytometers,Inc.、Ann Arbor MI)で分析した。
血小板を1.25%グルタルアルデヒド(Fluka AG、Buchs、Switzerland)で固定し、2.3Mスクロース(Fluka)を注ぎ、Reichert
KF80凍結システム(Leica、Vienna、Austria)で凍結させた。FC 4Eクライオキットアタッチメントを装着したUltracut Eウルトラミクロトームで約80nmの切片を作製し、コロジオンでコートしたニッケルグリッドに載せた。1%BSAを含むPBSでグリッドを10分間インキュベートした後、FVIII(301.3)に対する一次抗体の小滴(10μg/ml)上に25℃で1時間置いた。切片を10nm金粒子(1/100希釈のAuroProbe EM G10)に吸着させたヤギ抗マウス二次抗体と1時間インキュベートした。対照には同じ種の無関係なIgGを同じ濃度で使用した。
グリッドを酢酸ウラニルおよびオスミウムで染色し、次いでメチルセルロースに包埋した後、Jeol JEM−1010透過型電子顕微鏡(Jeol、Croissy−sur−seine、France)により80KVで観察した。
循環末梢血から血小板を単離して洗浄し、血小板活性化の生理学的アゴニストで活性化した。活性化を誘導するため、既に記載されている通り、1mM CaCl2、1mM MgCl2、それぞれ25μMのアデノシン二リン酸(ADP)(Sigma)、エピネフリン(Bio/Data Corporation、Horsham、PA)ならびにイヌトロンビン受容体活性化ペプチド:PAR1(SFFLKN−NH2)、PAR3(TRFGAP−NH2)およびPAR4(SFPGQP−NH2)を含有するタイロード緩衝液(2.5×106/ml)に血小板を37℃で30分間懸濁させた(Fangら,上記)。陰性対照として、アゴニストを加えないタイロード緩衝液で別々のアリコートをインキュベートした。遠心分離により血小板をペレット化し、アゴニスト処理試料および陰性対照試料から上清を吸引し廃棄した。coatestアッセイを用いたFVIII:C活性の試験まで血小板ペレットを直ちに−80℃で凍結した。
Ficoll−Paque(商標)Plus(Amersham Pharmacia
Biotech AB、Uppsala、Sweden)で精製したイヌ白血球から、QIAamp(登録商標)DNA Blood Mini Kit(Qiagen、Maryland、USA)を用いてDNAを単離した。p−889ITGA2−BDDFVIII−WPTSを陽性対照とした。順方向プライマーP1(5’−ACGCTATGTGGATACGCTG−3’)および逆方向プライマーP2(5’−AACACCACGGAATTGTCAG−3’)(配列番号12)を用いてPTC200機器(MJ Research、Watertown、MA)でTaqポリメラーゼ(Invitrogen、Carlsbad、CA)によるPCR分析を実施して、WPREをコードする318ヌクレオチドの一次産物を合成した(図1B、C)。WPREの302bp産物をコードするネスト化した順方向プライマーP3(5’−TGGATACGCTGCTTTAATGC−3’)(配列番号13)および逆方向プライマーP4(5’−AATTGTCAGTGCCCAACAG−3’)(配列番号14)により二次PCR反応を実施した(図5A)。
BIO−RAD CFX96 Real−Time Systemを用いたRT−qPCRによりレンチウイルス遺伝子標識の百分率を測定した。52 簡単に言うと、TaqMan Universal PCR Master Mix(Life technologies)12.5μl、濃度900nMの各プライマーおよび200nMのプローブを水20μl中で混合した。次いでイヌゲノムDNA 5μlを加え、PCRを500Cで2分間、950Cで10分間、次いで950Cで15秒間を40サイクル、600Cで1分間にて用いた。各RT−qPCRには、陰性対照として鋳型を使用しない対照を含めた。Primer Expressソフトウェア(バージョン1.0;Applied
Biosystems)を用いて各試料の遺伝子コピー数を三重反復で分析し、導入遺伝子コピー数/ゲノムの平均値をレンチウイルスベクター陽性の末梢血細胞の百分率(形質導入効率としても知られる)に変換し、表1の表1の8列目に報告した。使用したレンチウイルスLTRのプライマーおよびプローブは:順方向:5’−AGCTTGCCTTGAGTGCTTCA−3’(配列番号15);逆方向:5’−TGACTAAAAGGGTCTGAGGGA−3’(配列番号16);プローブ:6FAM−TGCCCGTCTGTTGTGTGACTCTG−MGBNFQ(配列番号17)であった。遺伝子コピー数の内在性対照として、イヌITGB3遺伝子を順方向:5’−ATGCATCCCACTTGCTGGTAT−3’(配列番号18);逆方向:5’−TGCCCATCGTTAGGTTGG−3’(配列番号19);プローブ:6FAM−TGCCTGCCAGCCTTCCATCCAG−MGBNFG(配列番号20)とともに使用した。コピー数はTaqManの原理に基づくものとした。関連する配列(レンチウイルスベクターLTRおよびイヌITGB3)を含む既知濃度のプラスミド構築物の10段階希釈を用いて、試料定量化のための標準曲線を作成した。
末梢血白血球から単離したゲノムDNA内のレンチウイルスベクター挿入部位の位置を特定するために、LAM−PCRを実施した。簡単に言うと、ベクター特異的5’−ビオチン化プライマー[5’−/ビオチン/−GAACCCACTGCTTAAGCCTCA−3’(配列番号26)]を用いた2回の線形PCR[95℃で5分間;(95℃で1分間、60℃で45秒間、72℃で90秒間)×50;72℃で10m]により、組み込まれたプロウイルスLTRと宿主ゲノムとの間の接合点を選別し、ストレプトアビジンでコートした磁気ビーズ[Dynal M−280]を用いて精製した。クレノウポリメラーゼおよびランダムな6塩基プライマーを用いて産物を二本鎖にし、65℃で2時間、Tsp509Iで消化した。非LTR末端に方向性二本鎖リンカーオリゴを連結し、得られた産物を、LTR特異的順方向プライマー[F1:5’−/ビオチン/−AGCTTGCCTTGAGTGCTTCA−3’(配列番号27);F2:5’−AGTAGTGTGTGCCCGTCTGT−3’(配列番号28)]およびリンカーカセット特異的逆方向プライマー[R1:5’−GACCCGGGAGATCTGAATTC−3’(配列番号29);R2:5’−AGTGGCACAGCAGTTAGG−3’(配列番号30)]を用いたネステッドPCR[95℃で5分間;(95℃で1m、60℃で45秒間、72℃で90秒間)×35;72℃で10m]により増幅した。ネステッドPCRの巡回の間で、ストレプトアビジンでコートした磁気ビーズを用いて産物を精製した。2%TAEアガロースゲル上で産物を可視化した。配列決定には、産物をゲル精製してpCR2.1−TOPO中にクローン化し、大腸菌Top10内に形質転換し、LB−Amp−Xgalプレート上で選択し、M13F/Rを用いたコロニーPCRにより増幅した。
プロウイルスLTR配列を含むことが確認されたLAM−PCRの配列産物は、既知のゲノム反復およびプロウイルス的特徴をマスクした。UCSCのBlat(BLASTのような配列比較ツール)サーバを用いて、得られた配列をイヌゲノム(CanFam 2.0、2005年5月組立て)と比較した。95%の類似度のゲノム内の固有の位置への配列マッピングを選択し、プロウイルスLTR配列と隣接するゲノム配列比較の基準として組込み部位を決定した。各部位について、最も近接するRefSeq遺伝子を決定し、ヒト癌オルソログのリストと比較した。
Chromogenix Coatest(登録商標)SP4 FVIIIキット(DiaPharma、Franklin、OH)を用いて、1ml当たり1×108個の血小板を含むライセートをFVIII:Cについて試験した。12個の上清試料の反復標本を96ウェルマイクロタイタープレートのコートしていないウェルに入れ(25μl/ウェル)、アッセイ成分(リン脂質、第IXa因子、第X因子および塩化カルシウム)を加え、37oCで10分間インキュベートした。発色因子Xa基質のS−675を加え、予め37oCに設定したWallac Victor2マイクロプレートリーダーにプレートを移した。S−2675のXa因子に依存する転換は各ウェル中のFVIII:Cの量と直接相関する。405nmのVmaxを用いて血小板溶出液緩衝液で希釈した既知量の組換えヒトFVIII(Kogenate;Bayer Healthcare Pharmaceuticals、Berkeley、CA)を、プロットすることにより標準曲線を作成した。速度論的ソフトウェアプログラム、SOFTmax、v.2.34(Molecular Devices)を用いて、各反応のVmaxをFVIII:C活性の単位に変換した。405nmにおける終点の読取り値によってFVIII活性を測定し、490nmにおけるバックグラウンドの読取り値を405nmから減じた。表1および図6に記録されている測定値を用いて、平均FVIII:C U/(ml・1×108血小板)×92ml血液/kg×イヌの体重(kg)×(2×108血小板)/1ml血液の掛け算を実行することより、FVIII:C/イヌの合計最大値を算出した。
WBCTは、28℃で2本のシリコン塗布ガラス管(Becton−Dickinson、Rutherford、NJ)を用いる、リー・ホワイト凝固時間の変法である(Nichols TCら,J Thromb Haemost 2012,10(3):474−476)。全血1mlを採取し、各管に血液0.5mlずつを分配した。タイマーを作動させた。1分後、一方の管を30秒毎に傾け、他方の管をそのまま静置した。傾けた管に血餅が形成されたとき、第2の管を血餅が形成されるまで30秒毎に傾けた。第2の管に完全にゲル化した血餅が形成されるまでの時間をWBCTとして記録した。G−PBC移植の前と後に、血漿による治療を少なくとも1か月間実施していない、正常な止血性のイヌ(WBCTが7.5〜12.5分)1例および被験イヌ3例(F20、I42、M64)から、血液を採取した。
既に記載されている通りに、凝固因子VIIIまたはIXのいずれかに対する阻害抗体を検出する活性部分的トロンボプラスチン時間(aPTT)混合アッセイにより、インヒビターについてイヌ血漿(F20、I42およびM64)をスクリーニングした(Langdell RDら,J Lab Clin Med 1953,41(4):637−647;Sahud MA.Semin Thromb Hemost 2000,26(2):195−203;Matrai Jら,Hepatology 2011,53(5):1696−1707)。簡単に言うと、被験血漿を正常血漿と1:1で混合し37℃で2時間インキュベートした後、標準的なaPTT試薬を用いて、このインキュベートした混合物を分析する。ヒトFVIIIと交差反応してヒトFVIIIを阻害する既知のベセスダインヒビター(BIU)力価を有する血友病Aイヌの血漿(陽性対照)と、インヒビターがみられないイヌの血漿(陰性対照)とを同時にアッセイし比較した。
血小板標的化レンチウイルスベクターの設計および戦略
ルシフェラーゼレポーターアッセイは、完全長ヒトITGA2B遺伝子プロモーターのフラグメントにより同程度の血小板特異的な遺伝子転写を許容することを明らかにした(図1A)。3種類の異なるITGA2Bプロモーターフラグメント(−1218、−889および−673)は前−巨核球細胞系内でほぼ同じレベルのルシフェラーゼ活性を導いた。これに対して、他の血液細胞系列および上皮細胞系ではITGA2Bプロモーターによって駆動されるルシフェラーゼ活性は検出不可能であった。各ITGA2Bプロモーターは、高レベルの巨核球遺伝子転写を可能にするEtsおよびGATA因子ならびに他の細胞系列内での発現を抑制するリプレッサー領域をコードする(Prandini MHら,Blood 1996,88(6):2062−2070)。20 結果として、ヒトの遺伝子治療の戦略を開発するために、最適な造血幹細胞形質導入効率および血友病Aイヌの血小板由来BDDFVIIIによる止血機能を改善する能力について2種類のレンチウイルス遺伝子導入ベクターを試験した。ヒトITGA2Bプロモーターの−889ヌクレオチドから始まるフラグメントをコードするレンチウイルスベクターで形質導入したG−PBCを注入した2匹のイヌは、BDDFVIIIの巨核球特異的転写を導くことが可能であることが示された(図1B)。21 通常条件下では血小板にはFVIIIが存在しないが、この方法により、組織培養したヒトCD34+G−PBC、12およびレンチウイルスベクターで形質導入し血友病Aマウスに、移植した骨髄に由来する血小板の子孫に利用可能なBDDFVIIIを貯蔵させることに成功したことがわかった(Shiら,Journal of Thrombosis and Haemostasis 2007,5(2):352−361)。BDDFVIIIのα顆粒区画内への輸送を促進するために、フォン・ヴィルブランド因子(VWF)プロペプチドシグナルペプチドおよびD2ドメイン(SPD2)と融合したBDDFVIIIのハイブリッド分子の巨核球特異的発現を誘導するようにして設計した最も短いITGA2Bプロモーターのフラグメント(−673)をコードする新規レンチウイルスベクターで形質導入したG−PBCを1匹のイヌに注入した(図1C)(Haberichter SLら,Arterioscler Thromb Vasc Biol 2002,22(6):921−926;Haberichter SLら,Blood 2003,101(4):1384−1391)。VWFはヒト血小板の正常なα顆粒の成分であり(ただし、イヌ血小板には存在しない)(Nichols TCら,Blood 1993,81(10):2644−2651)、ヒトおよびイヌ血漿中でFVIIIのキャリアタンパク質としての役割を果たす(Kaufman RJら,Molecular & Cellular Biology 1989,9(3):1233−1242)。
臨床的に意義のあるプロトコルを設計するため、イヌサイトカイン(cG−CSFおよびcSCF)によりイヌ造血幹細胞を骨髄から末梢血中に動員し、GTイヌを用いたこれまでの研究と同一の有害事象を生じさせずにG−PBCアフェレーシスを実施した(Fangら,上記)。Ficoll−Paque Plusを用いてアフェレーシス産物から単核リンパ球を単離し、次いで、免疫磁気選択によりイヌCD34抗原陽性(CD34+)細胞を精製した(McSweeney PAら,Blood 1998,91(6):1977−1986)。各標的細胞は、形質導入細胞のためのエクスビトロ選択もインビトロ選択も用いずに、CD34+G−PBC1個当たり約1x104個の全ウイルス粒子を形質導入し、3匹の血友病AイヌにFVIII形質導入CD34+G−PBCを体重1kg当たり約3×106個注入した自家移植の条件を表1にまとめる(4列目、5列目)。新たに移植された細胞が生着するためのニッチを骨髄内に設けるために、骨髄非破壊的な移植前処置レジメンを用いた(表1、2列目)。前処置レジメンの強度は、用量が臓器に毒性となるレベルによって決定した。正常イヌモデルを用いた以前の研究では、移植前条件で致死量以下のブスルファン(造血幹細胞に対して優先的に毒性を示す薬物)を投与することによって、安定な造血キメラの同種混合ドナー/宿主を安全に確立することができることが示されている。最近の報告では、イヌ白血球接着不全症を修正するために、造血幹細胞遺伝子を導入するために10mg/kgのブスルファンを使用し(Bauer TR,Jr.ら,Nat Med 2008,14(1):93−97)、次いで主要組織適合複合体が一致する骨髄移植後にミコフェノール酸モフェチル(MMF)およびシクロスポリン(CSP)により一時的に免疫を抑制したこと(Enssle Jら,Hum
Gene Ther 2010,21(4):397−403)に成功したことが示されている。しかし、本研究で移植を実施した1匹目のイヌ(F20)は、G−PBC移植から3か月間、イヌ血漿製剤の形態のイヌ(c)FVIIIおよび組換えcFVIIIの連日補給を必要としたことから、このレベルの移植前処置レジメンは血友病Aの動物には不適切であることがわかった。G−PBC移植後、血小板中のヒトBDDFVIIIが有意水準に達するまでイプシロン−アミノカプロン酸(EACA)も注入した。EACAはプラスミン−プラスミノーゲン系に有効な合成阻害剤であり、くも膜下出血、多数の原因による尿生殖器出血および血友病患者の口腔外科手術をコントロールする(Griffin JDら,Semin Thromb Hemost 1978,5(1):27−40)。比較のため、G−PBC移植の1年前および2.5年後の、cFVIII補給による治療を必要とした重篤な出血の発症の数を各イヌについて記録した(表1、10列目、11列目)(Niemeyer GPら,Experimental Hematology 2003,31(12):1357−1362)。F20に高頻度の出血事象が観察されたことから、次の2例の移植レシピエントには低用量のブスルファンからなるより穏やかな前処置レジメン(I42、5mg/kg;M64、7mg/kg)を実施した。結局、3匹のイヌ全ては、血小板に容易に検出可能なヒトBDDFVIIIレベルが観察され、hemocult検査によりGI出血がないことが示されるまで、G−PBC移植から3か月間、一時的な免疫抑制(Fangら,上記)およびcFVIIIおよびEACAの連日補給を標準的な移植レジメンとして実施した(Fangら,上記)。最終的には、I42およびM64では、移植後2.5年にわたって重度の出血の発症が認められず、FVIII補給をそれ以上必要としないことが観察された(表1、11列目)。
G−PBC移植後にBDDFVIIIが血小板で合成され貯蔵されるかどうか決定するために、免疫共焦点顕微鏡法を実施した。図2Aに示されているのは、レンチウイルスベクターで形質導入したG−PBCの自家移植したイヌ1例(I42)から単離した血小板の顕微鏡分析の結果の画像であり、図2Aは全3例のイヌ(F20、I42、M64)の分析結果を表している。血小板α顆粒の特異的マーカー、フィブリノーゲン(Fg)に点状の染色パターンがみられた(左パネル)。このほか、血小板内にヒトBDDFVIIIが点状のパターンで検出された(中央パネル)。左パネル(Fg)と中央パネル(BDDFVIII)とを重ね合わせたときに見られる黄色い染色から明らかなように、Fg内にBDDFVIII染色が高頻度で共局在しているのがわかるが、このことは両タンパク質が血小板α顆粒内に一緒に貯蔵されている可能性を示すものである(右パネル)(Wilcoxら,J Thromb Haemost 2003,1(12):2477−2489)。
移植後少なくとも2.5年間にわたって、F20、I42およびM64から収集した白血球から単離されたゲノムDNAのPCRによりレンチウイルスベクターのWPREエレメントを検出した(図5A)。末梢血白血球から単離されたゲノムDNAのリアルタイム定量的PCR(RT−qPCR)分析により、各レンチウイルスベクターの形質導入効率は1%(F20)、4%(I42)および2%(M64)であることがわかった(表1、8列目)。挿入による発癌が出現していない場合には、ゲノム解析によるレンチウイルスベクターの検出は、末梢血計数および末梢血塗抹による評価を頻繁に実施して循環造血細胞の形態および数が正常であることが確認されたイヌが全例とも、全般的に良好な健康状態にあることと一致する。このほか、被験イヌゲノム内へのレンチウイルスベクターの組込みパターンを決定するために線形増幅による(LAM)−PCRを実施した。図5Bは、FVIII欠損症対照のゲノム内にはレンチウイルスベクターが存在しなかったのに対して、移植を実施したイヌ(F20、I42およびM64)のゲノムDNAには複数のバンドが存在するように思われることを示す。明確な挿入部位がF20では第4染色体に、M64では第35染色体に特異的に検出された。この結果は、I42のゲノムDNA内にレンチウイルスベクターの挿入を検出することはできたが、このイヌのゲノム地図の正確な領域に挿入部位の位置を特定することはできなかったことを示す(Sutter NB,Ostrander EA.Dog star rising:the dog genetic system.Nat Rev Genet 2004,5(12):900−910)。要するに、以上の結果は、この研究を含めても(移植の約2.5年後)、挿入による変異誘発が起こらなかったことを示唆する。このことは、通常動物およびヒトゲノムの良性の領域にレンチウイルスベクターを挿入することを見いだした別の報告と一致する(Biffi Aら,Blood 2011,117(20):5332−5339)。
これまで、ヒト造血細胞が、組織培養されたヒト巨核球内でヒトBDDFVIII(FVIII:C)の機能的な形態を合成させるための主要な組織源として機能することが、BDDFVIII形質導入ヒトG−PBC、12を異種移植したマウスから単離された末梢血血小板およびBDDFVIII形質導入骨髄の移植を実施した血友病Aのマウスモデル(Shi Qら,Journal of Thrombosis and Haemostasis 2007,5(2):352−361)で観察されている(Shi Qら,Molecular Genetics and Metabolism 2003,79(1):25−33.)。本研究(図6)は、各イヌの自家G−PBC移植から少なくとも2.5年間にわたる発色分析により、FVIII:C活性(約5〜15mU/(ml・108血小板)は、移植の約1年後に最高値が出現し、通常、約5〜10mU/(ml・108血小板)になることが検出されることを示す¥(F20、I42、M6)。FVIII欠損症イヌの試料を各時点の陰性対照とした(黒線)。
Haemost 2012,10(3):474−476)。止血が正常なイヌでは平均WBCTが10.5分±標準偏差1.4分である。G−PBC移植前では、FVIII欠損症イヌのベースラインWBCTは44.5分(F20)、40.5分(I42)および60分超(M64)であった。G−PBC移植後では、平均WBCTは39.5分(F20、n=5)、38.4分(I42、n=5)および41.9分(M64、n=4)に減少した。この結果は、WBCTが極めて緩やかに減少することを示し、FVIII欠損症イヌのWBCTが正常変動内に十分に収まっていると考えられる。興味深いことに、この結果は、実験イヌの血漿内にFVIII:Cを検出すること(WBCTの成功に不可欠な要素である)ができないことを支持する。したがって、この結果は、エクスビボのWBCT測定が、インビボの止血を改善するための血小板FVIIIの効果を予測するのに適さない検査法であることを示唆するが、それは(血漿中FVIIIとは異なり)この結果が、血管損傷部位において、図4および図6に示されるように生理学的血小板アゴニストによる刺激後に活性化血小板から血小板由来FVIIIが分泌されて、FVIII欠損症イヌの止血が改善しなければならないことを示唆されるからである。
Claims (27)
- a)インテグリンαIIb遺伝子(ITGA2B)プロモーターのフラグメントを含む発現カセットと、前記発現カセットと作動可能に連結された外来目的遺伝子とを含む発現ベクターとを含む、組成物。
- 前記発現ベクターが、さらに前記目的遺伝子の発現を細胞の特定の位置に標的化する標的化因子を含む、請求項1に記載の組成物。
- 前記標的化因子が、前記目的遺伝子の発現を、血小板を産生する特定の造血細胞系列内に標的化する、請求項3に記載の組成物。
- 前記標的化因子が、D2ドメインと作動可能に連結されたヒトフォン・ヴィルブランド因子プロペプチド(VWFpp)のフラグメントである、請求項3に記載の組成物。
- 前記発現カセットが、配列番号24の配列を含む核酸配列を有する、請求項4に記載の組成物。
- 前記発現カセットが、配列番号24の核酸配列を有する、請求項5に記載の組成物。
- 前記発現カセットが、配列番号21、22、23および25からなる群より選択される配列を含む核酸配列を有する、請求項1に記載の組成物。
- 前記発現カセットが、配列番号21、22、23および25からなる群より選択される核酸配列を有する、請求項7に記載の組成物。
- 前記外来遺伝子がヒトFVIII遺伝子である、請求項1〜8のいずれか1項に記載の組成物。
- 前記ベクターが自己不活性化ベクターである、請求項1〜8のいずれか1項に記載の組成物。
- 前記ベクターがレトロウイルスベクターである、請求項10に記載の組成物。
- 前記レトロウイルスベクターがレンチウイルスベクターである、請求項11に記載の組成物。
- 請求項1〜12のいずれか1項に記載の組成物を含む、造血幹細胞。
- 前記幹細胞がエクスビボである、請求項13に記載の幹細胞。
- 動物の血友病を治療するための、請求項13または14に記載の幹細胞の使用。
- 前記動物がヒトである、請求項15に記載の使用。
- 前記第VIII因子遺伝子が改変幹細胞内で発現する条件下で、前記改変幹細胞を作製するために造血幹細胞と請求項1〜8のいずれか1項に記載の組成物とを接触させることを含む、方法。
- さらに前記改変幹細胞を動物に移植する段階を含む、請求項17に記載の方法。
- 前記動物が、血友病があると診断されている、請求項18に記載の方法。
- 前記移植により前記動物の大量出血が治療または予防される、請求項18に記載の方法。
- 前記動物がヒトである、請求項17に記載の方法。
- 前記接触をエクスビボで実施する、請求項17に記載の方法。
- 前記動物から前記幹細胞を動員する、請求項18に記載の方法。
- 前記動員が、前記動物へのサイトカインの投与を含む、請求項23に記載の方法。
- 前記動物が、血小板内で前記第VIII因子を発現する、請求項18に記載の方法。
- 前記方法を繰り返す、請求項17〜25のいずれか1項に記載の方法。
- 前記方法を定期的に繰り返す、請求項26に記載の方法。
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