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JP2016101161A - Gene marker, method, reporter vector, primer set and assay kit for examining cellular property of test cells, and apparatus for examining cellular property - Google Patents

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Abstract

【課題】悪性腫瘍の治療法をより適切に選択する為に、被検細胞の細胞特性を評価する手段の提供。
【解決手段】被検細胞の細胞特性を評価するための遺伝子マーカーを提供する。ニコチンアミドホスホリボシル基転移酵素(NAMPT)遺伝子のmRNA、ペプチド若しくは蛋白質、またはNAMPT遺伝子プロモーター配列を含むポリヌクレオチドである遺伝子マーカー。NAMPT遺伝子は転移性の高い腫瘍において高発現することより、腫瘍細胞の転性と高い相関性を示す指標遺伝子であり、被検者の腫瘍細胞の転移性に関する細胞特性を評価するのに用いることのできる遺伝子マーカー。
【選択図】図1
To provide a means for evaluating cell characteristics of a test cell in order to more appropriately select a treatment method for a malignant tumor.
A genetic marker for evaluating cell characteristics of a test cell is provided. Genetic marker, which is a polynucleotide comprising mRNA, peptide or protein of a nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT) gene, or a NAMPT gene promoter sequence. The NAMPT gene is an indicator gene that is highly expressed in tumors with high metastasis and is highly correlated with tumor cell metastasis, and is used to evaluate the cell characteristics of the subject's tumor cells. Genetic markers that can be used.
[Selection] Figure 1

Description

本発明の実施形態は、被検細胞の細胞特性を評価するための遺伝子マーカー、方法、レポーターベクター、プライマーセットおよびアッセイキット、並びに細胞特性評価装置に関する。   Embodiments described herein relate generally to a genetic marker, a method, a reporter vector, a primer set and an assay kit, and a cell property evaluation apparatus for evaluating the cell property of a test cell.

我が国における死因の1位は癌である。癌は、悪性腫瘍の形成という共通点を持つ疾患群であり、今日までに200を超える様々な腫瘍が同定されている。悪性腫瘍の共通点は、細胞の無制御の増殖、近隣組織への浸潤能力、および全身組織への転移形成能力である。   Cancer is the number one cause of death in Japan. Cancer is a group of diseases having a common malignant tumor formation, and more than 200 various tumors have been identified to date. A common feature of malignant tumors is the uncontrolled proliferation of cells, the ability to invade nearby tissues, and the ability to form metastases to systemic tissues.

癌(悪性腫瘍)の治療では、腫瘍の性質(腫瘍細胞の特性)に応じた適切な治療法の選択が重要である。適切に治療法を選択するためには、できる限り早期に、腫瘍細胞の特性、すなわち腫瘍の良性悪性を評価することが望ましい。悪性腫瘍の場合は、その攻撃性、即ち、浸潤性や転移性などについても評価できることが望ましい。しかしながら現状では、原発巣、即ち、最初に腫瘍が発生した病変から得た腫瘍細胞からその転移性を評価することは困難である。   In the treatment of cancer (malignant tumor), it is important to select an appropriate treatment method according to the nature of the tumor (characteristics of the tumor cells). In order to select an appropriate treatment, it is desirable to evaluate the characteristics of tumor cells, that is, the benign malignancy of the tumor, as early as possible. In the case of a malignant tumor, it is desirable to be able to evaluate its aggressiveness, that is, invasiveness and metastasis. However, at present, it is difficult to evaluate the metastasis from the primary tumor, that is, the tumor cell obtained from the lesion where the tumor first occurred.

腫瘍の診断は、MRIやCTなどの画像診断装置を用いた診断、腫瘍から採取した細胞を観察して行う診断などがある。細胞の特性には、形態学的な特徴、すなわち細胞の大きさや形、接着性など、その外見から判別できる特性がある。細胞の形態的特徴を観察する方法としては、パパニコロウ染色法やギムザ染色法などが知られている。このような染色法では、細胞の核や細胞質などを染め分けて、その形態的な特徴から腫瘍細胞の特性を評価する。   Tumor diagnosis includes diagnosis using an image diagnostic apparatus such as MRI and CT, and diagnosis performed by observing cells collected from the tumor. The cell characteristics include morphological characteristics, that is, characteristics that can be distinguished from the appearance such as the size and shape of the cells and adhesiveness. Known methods for observing the morphological characteristics of cells include Papanicolaou staining and Giemsa staining. In such a staining method, cell nuclei and cytoplasm are dyed separately, and the characteristics of tumor cells are evaluated from their morphological characteristics.

一方、形態からは判別できない細胞特性もある。そのような細胞特性は、例えば、遺伝子発現の変化を伴う。遺伝子発現では、遺伝子の5’上流プロモーター配列に特定蛋白質が結合してプロモーターを活性化させる。活性化したプロモーターは、遺伝子の転写を促してmRNAが合成され、mRNAが翻訳されて蛋白質が合成される。遺伝子発現の変化は、当該遺伝子のプロモーター活性、あるいはmRNA量や蛋白質量を調べることによって検出される。   On the other hand, there are also cell characteristics that cannot be distinguished from the morphology. Such cellular properties are accompanied by, for example, changes in gene expression. In gene expression, a specific protein binds to a 5 'upstream promoter sequence of a gene to activate the promoter. The activated promoter promotes gene transcription to synthesize mRNA, and the mRNA is translated to synthesize proteins. Changes in gene expression are detected by examining the promoter activity of the gene, the amount of mRNA, and the amount of protein.

例えば、特定遺伝子の発現変化が腫瘍細胞の特性と高い相関を示す場合、その遺伝子は腫瘍マーカーとして利用できる。腫瘍マーカーを検出することにより、遺伝子発現に関連する細胞特性を判別することが可能となる。例えば、血液中や別の体液中、あるいは採取した腫瘍細胞において、特定の腫瘍マーカーが検出されれば、そのマーカーと高い相関をもつ腫瘍細胞の存在が示唆される。   For example, when a change in expression of a specific gene is highly correlated with the characteristics of tumor cells, the gene can be used as a tumor marker. By detecting a tumor marker, it is possible to discriminate cell characteristics related to gene expression. For example, if a specific tumor marker is detected in blood, another body fluid, or collected tumor cells, the presence of tumor cells highly correlated with the marker is suggested.

公知の腫瘍マーカーには、腫瘍細胞の増殖性を評価するKi−67遺伝子などがある。この腫瘍マーカーは、腫瘍細胞の増殖性評価に用いられている。また、腫瘍細胞の浸潤性や転移性の評価のためには、Arf−6やGlut1などが腫瘍マーカーの候補として報告されている。しかしながら、その評価精度は十分とはいえない。   Known tumor markers include the Ki-67 gene that evaluates the proliferation of tumor cells. This tumor marker is used for evaluating the proliferation of tumor cells. In addition, Arf-6, Glut1 and the like have been reported as tumor marker candidates for evaluating tumor cell invasion and metastatic properties. However, the accuracy of the evaluation is not sufficient.

このような状況において、悪性腫瘍の治療法をより適切に選択できるようにするために、細胞特性を評価するための更なる技術の開発が望まれている。   In such a situation, in order to be able to select a malignant tumor treatment more appropriately, development of a further technique for evaluating cell characteristics is desired.

特表2011−508609号公報Special table 2011-508609 gazette 特表2012−533530号公報Special table 2012-533530 gazette 国際公開第2004/058990号International Publication No. 2004/058990

Cancer Biology & Therapy、2008年5月、第7巻、第5号、p663−670Cancer Biology & Therapy, May 2008, Vol. 7, No. 5, p663-670 Endocrinology,2012年2月、第153巻、第2号、p554−563Endocrinology, February 2012, Volume 153, No. 2, p554-563

実施形態は、被検細胞の細胞特性を評価するための手段を提供することを目的とする。   Embodiment aims at providing the means for evaluating the cell characteristic of a test cell.

実施形態によれば、被検細胞の細胞特性を評価するための遺伝子マーカーが提供される。当該遺伝子マーカーは、NAMPT遺伝子のmRNA、ペプチド若しくは蛋白質、またはNAMPT遺伝子プロモーター配列を含むポリヌクレオチドである。   According to the embodiment, a genetic marker for evaluating the cell characteristics of a test cell is provided. The gene marker is a polynucleotide containing the mRNA, peptide or protein of the NAMPT gene, or the NAMPT gene promoter sequence.

実施形態の1例を示す模式図。The schematic diagram which shows one example of embodiment. 実施形態の1例を示す模式図。The schematic diagram which shows one example of embodiment. 実施形態の1例を示すブロック図。The block diagram which shows an example of embodiment. 実施形態の1例を示すブロック図。The block diagram which shows an example of embodiment. 実施形態の1例を示すフローチャート。The flowchart which shows an example of embodiment. 実験結果を示す図。The figure which shows an experimental result. 実験結果を示す図。The figure which shows an experimental result. 実験結果を示す図。The figure which shows an experimental result. 実験に使用した実施形態の1例であるベクターの構成を示す模式図。The schematic diagram which shows the structure of the vector which is an example of embodiment used for experiment. 実験結果を示す図。The figure which shows an experimental result. 実験結果を示す図。The figure which shows an experimental result. 実験結果を示す図。The figure which shows an experimental result.

以下、実施の形態について、図面を参照して説明する。   Hereinafter, embodiments will be described with reference to the drawings.

実施形態は、NAMPT遺伝子が、転移性の高い腫瘍細胞株において高発現されることを発見し、腫瘍細胞の転移性と高い相関を示す指標遺伝子であることを明らかにし、被検細胞の細胞特性を評価するための遺伝子マーカーとして使用できることを見出したことに基づく。   The embodiment has discovered that the NAMPT gene is highly expressed in highly metastatic tumor cell lines, revealed that it is an indicator gene highly correlated with the metastasis of tumor cells, and the cell characteristics of test cells Based on the finding that it can be used as a genetic marker for evaluating

NAMPT遺伝子は、ニコチンアミドホスホリボシル基転移酵素をコードする遺伝子であり、哺乳類のNAD生合成における律速酵素である。NAMPT遺伝子は、転移性の高い腫瘍細胞株において高発現される。   The NAMPT gene is a gene encoding nicotinamide phosphoribosyltransferase, and is a rate-limiting enzyme in mammalian NAD biosynthesis. The NAMPT gene is highly expressed in highly metastatic tumor cell lines.

一方、細胞の転移性は、被検細胞の細胞特性を評価する上で重要な指標の1つである。従って、NAMPT遺伝子の発現量を測定することにより、被検細胞の細胞特性、例えば、転移性若しくは浸潤性の有無または程度、その細胞が正常であるのか異常であるのかなどを評価することが可能である。そして被検細胞が異常である、または異常である可能性がある場合には、その異常性または悪性度の程度などを評価することが可能である。従って。NAMPT遺伝子に基づく遺伝子マーカーによって、従来よりもより正確に腫瘍細胞の細胞特性を評価することが可能となる。   On the other hand, the metastasis of cells is one of the important indexes for evaluating the cell characteristics of test cells. Therefore, by measuring the expression level of the NAMPT gene, it is possible to evaluate the cell characteristics of the test cell, for example, the presence or absence of metastatic or invasiveness, whether the cell is normal or abnormal It is. If the test cell is abnormal or possibly abnormal, the degree of abnormality or malignancy can be evaluated. Therefore. The genetic marker based on the NAMPT gene makes it possible to evaluate the cell characteristics of tumor cells more accurately than before.

被検細胞の細胞特性の評価とは、被検細胞の細胞特性、例えば、転移性若しくは浸潤性の有無または程度、その細胞が正常であるのか異常であるのかを評価すること、並びに被検細胞が異常である若しくはその可能性がある場合には、その異常性の程度または悪性度の程度などを評価することを含む。このような細胞特性の評価は、例えば、被検細胞が腫瘍細胞である場合には、腫瘍細胞の細胞特性の評価とは、例えば、腫瘍細胞の転移性若しくは浸潤性の有無、腫瘍細胞の転移性の程度、腫瘍細胞の良性度若しくは悪性度、腫瘍細胞の正常性若しくは異常性の程度を評価することであり得る。   The evaluation of the cell characteristics of the test cell is to evaluate the cell characteristics of the test cell, for example, the presence or absence of metastasis or invasiveness, whether the cell is normal or abnormal, and the test cell Is abnormal or possibly, includes evaluating the degree of abnormality or the degree of malignancy. For example, when the test cell is a tumor cell, the evaluation of the cell characteristic is, for example, the evaluation of the cell characteristic of the tumor cell, for example, whether the tumor cell is metastatic or invasive, the tumor cell metastasis It may be to evaluate the degree of sex, the degree of benign or malignant tumor cells, the degree of normality or abnormality of tumor cells.

ここで「腫瘍細胞」と記載するとき、「癌細胞」またはそれらを総括して「がん細胞」と解され得る。   Here, when describing as “tumor cells”, they may be understood as “cancer cells” or collectively “cancer cells”.

検査されるべき被検細胞は、細胞特性が評価されるべき細胞であればよい。   The test cell to be examined may be a cell whose cell characteristics are to be evaluated.

このような被検細胞の細胞特性を評価する方法は、被検細胞におけるNAMPT遺伝子の発現レベルを指標とすることを特徴とすればよい。例えば、この方法において、NAMPT遺伝子の発現レベルを指標とすることは、被検細胞におけるNAMPT遺伝子の発現量を測定すること、測定された被検細胞の発現量と閾値とを比較すること、その比較の結果に基づいて、およびその判定に基づいて被検細胞の細胞特性を評価することを含んでよい。   Such a method for evaluating the cell characteristics of the test cell may be characterized by using the expression level of the NAMPT gene in the test cell as an index. For example, in this method, using the expression level of the NAMPT gene as an indicator includes measuring the expression level of the NAMPT gene in the test cell, comparing the measured expression level of the test cell with a threshold, Evaluation of the cell characteristics of the test cell based on the result of the comparison and based on the determination may be included.

この評価は、基準となる細胞のNAMPT遺伝子の発現量若しくは発現の程度と比較して行われてもよい。或いはこの評価は、基準となる細胞のNAMPT遺伝子の発現量に加えて、基準となる細胞の細胞特性とを考慮して行われ得る。   This evaluation may be performed in comparison with the expression level or degree of expression of the NAMPT gene in the reference cell. Alternatively, this evaluation can be performed in consideration of the cell characteristic of the reference cell in addition to the expression level of the NAMPT gene in the reference cell.

基準となる細胞の例は、健常細胞若しくは正常細胞、転移性の有無および/または転移性の程度などの細胞特性が明らかにされている腫瘍細胞などであってもよい。基準細胞のNAMPT遺伝子の発現量若しくは細胞特性、例えば、転移性の程度などは、予め測定されていてもよく、実施形態の遺伝子マーカーを使用する試験を行う際に同時に測定および評価されてもよい。また、基準細胞から得られた基準となる当該遺伝子の発現量若しくは転移性レベルを閾値としてもよく、このような閾値は、予め定められた閾値であってもよく、被検細胞の細胞特性を評価する際に同時に測定されてもよく、被検細胞の細胞特性を評価する前後に定められてもよい。   Examples of the reference cell may be a healthy cell or a normal cell, a tumor cell whose cell characteristics such as the presence or absence of metastasis and / or the degree of metastasis have been clarified. The expression level or cell characteristics of the NAMPT gene in the reference cell, for example, the degree of metastasis, may be measured in advance, and may be measured and evaluated simultaneously when performing a test using the gene marker of the embodiment. . In addition, the expression level or metastatic level of the reference gene obtained from the reference cell may be set as a threshold value. Such a threshold value may be a predetermined threshold value, and the cell characteristics of the test cell may be determined. It may be measured at the same time as the evaluation, or may be determined before and after evaluating the cell characteristics of the test cell.

被検細胞の細胞特性を評価するための遺伝子マーカーは、NAMPT遺伝子の発現の有無および/または発現量を測定するために利用できる物質であればよい。例えば、遺伝子マーカーは、NAMPT遺伝子のmRNA、ペプチド若しくは蛋白質、またはNAMPT遺伝子プロモーター配列を含むポリヌクレオチドであってよい。   The gene marker for evaluating the cell characteristics of the test cell may be any substance that can be used for measuring the presence and / or expression level of the NAMPT gene. For example, the genetic marker may be a NAMPT gene mRNA, peptide or protein, or a polynucleotide comprising a NAMPT gene promoter sequence.

NAMPT遺伝子プロモーター配列の例を表1−1および表1−2に示す。

Figure 2016101161
Examples of NAMPT gene promoter sequences are shown in Table 1-1 and Table 1-2.
Figure 2016101161

Figure 2016101161
Figure 2016101161

これは配列番号1で示される配列であり、ヒト由来のNAMPT遺伝子プロモーター配列の1例である。しかしながら、NAMPT遺伝子プロモーター配列はこの配列に限定されるものではなく、NAMPT遺伝子プロモーター配列活性を示す限りにおいて1〜数個の置換、欠失、付加などの変異を含んでもよい。   This is the sequence represented by SEQ ID NO: 1, and is an example of a human-derived NAMPT gene promoter sequence. However, the NAMPT gene promoter sequence is not limited to this sequence, and may contain one to several mutations such as substitution, deletion, and addition as long as the NAMPT gene promoter sequence activity is exhibited.

更なる実施形態は、このような遺伝子マーカーを利用して、被検細胞の細胞特性を評価する方法である。この方法は、例えば、NAMPT遺伝子のmRNAの発現量、ペプチド若しくは蛋白質の発現量、またはNAMPT遺伝子プロモーターの活性(NAMPTプロモーター活性)を指標として、被検細胞の細胞特性を評価すればよい。実施形態の方法によれば、より早期に、より正確に被検細胞の細胞特性を評価することが可能である。従来の方法では、原発巣、即ち、最初に腫瘍が発生した病変の腫瘍細胞からその転移性を評価することは困難であるが、実施形態によれば、例えば、原発巣からの腫瘍細胞についても、細胞特性を評価することが可能となる。   A further embodiment is a method for evaluating cell characteristics of test cells using such genetic markers. In this method, for example, the cellular characteristics of the test cell may be evaluated using the expression level of the NAMPT gene mRNA, the expression level of the peptide or protein, or the activity of the NAMPT gene promoter (NAMPT promoter activity) as an index. According to the method of the embodiment, it is possible to evaluate the cell characteristics of the test cell more accurately at an earlier stage. In the conventional method, it is difficult to evaluate the metastasis from the primary tumor, that is, the tumor cell of the lesion in which the tumor first occurred. However, according to the embodiment, for example, the tumor cell from the primary tumor is also evaluated. It becomes possible to evaluate cell characteristics.

更なる実施形態は、NAMPT遺伝子の発現を指標として腫瘍の細胞特性を評価する方法を提供する。具体的には、被験者の腫瘍から採取した被検細胞におけるNAMPT遺伝子の発現を定量的に検出し、当該遺伝子の発現を対照となる健常細胞におけるNAMPT遺伝子の発現と比較すればよい。被検細胞のNAMPT遺伝子の発現量が、健常細胞のNAMPT遺伝子よりも高い場合に、被検細胞の転移性が高い、または異常性が高いと判定され得る。被検細胞のNAMPT遺伝子の発現量が、健常細胞のNAMPT遺伝子よりも低いまたは同等である場合に、被検細胞の転移性が低い、または異常性が低いと判定され得る。   A further embodiment provides a method for evaluating tumor cell characteristics using NAMPT gene expression as an indicator. Specifically, the expression of the NAMPT gene in the test cells collected from the tumor of the subject may be quantitatively detected, and the expression of the gene may be compared with the expression of the NAMPT gene in healthy cells as controls. When the expression level of the NAMPT gene in the test cell is higher than the NAMPT gene in the healthy cell, it can be determined that the test cell is highly metastatic or abnormal. When the expression level of the NAMPT gene in the test cell is lower or equivalent to the NAMPT gene in the healthy cell, it can be determined that the test cell has low metastasis or low abnormality.

被検細胞は、細胞群であってもよいし、単一細胞であってもよい。被検細胞は、被験者の腫瘍からそれ自身公知の採取方法によって採取すればよい。本発明では、上皮性腫瘍から採取した腫瘍細胞が好ましい。また、上皮性腫瘍の中でも、乳腺腫瘍や肺腫瘍から採取した腫瘍細胞が被検細胞としてより好ましい。しかしながら、これらに限定されるものではない。例えば、血液、尿、便、唾液、バイオプシーで得られた組織、口腔内粘膜、体腔液や喀痰などに含まれる細胞、あるいは培養した細胞を被検細胞としてもよい。   The test cell may be a cell group or a single cell. The test cells may be collected from the subject's tumor by a known collection method. In the present invention, tumor cells collected from epithelial tumors are preferred. Among epithelial tumors, tumor cells collected from breast tumors and lung tumors are more preferred as test cells. However, it is not limited to these. For example, blood, urine, feces, saliva, tissue obtained by biopsy, oral mucosa, cells contained in body cavity fluid or sputum, or cultured cells may be used as test cells.

実施形態に従う被検細胞の細胞特性評価では、被検細胞におけるNAMPT遺伝子の発現量と健常細胞におけるNAMPT遺伝子の発現を比較してもよい。健常細胞の平均的なNAMPT遺伝子の発現量を予め検出しておき、この数値から細胞特性評価における閾値を設定して、この閾値と被検細胞のNAMPT発現量とを比較してもよい。従って、必ずしも健常細胞におけるNAMPT遺伝子の発現量を検出する必要はない。   In the cell characteristic evaluation of the test cell according to the embodiment, the expression level of the NAMPT gene in the test cell may be compared with the expression of the NAMPT gene in a healthy cell. An average expression level of the NAMPT gene in healthy cells may be detected in advance, a threshold value in cell characteristic evaluation may be set from this value, and this threshold value may be compared with the NAMPT expression level in the test cell. Therefore, it is not always necessary to detect the expression level of the NAMPT gene in healthy cells.

NAMPT遺伝子の発現は、NAMPT蛋白質、或いはNAMPTmRNA、或いはNAMPT遺伝子プロモーターの活性を検出することにより行ってよい。これらを当該遺伝子発現または当該遺伝子の発現量の指標としてよい。   The expression of the NAMPT gene may be performed by detecting the activity of the NAMPT protein, NAMPT mRNA, or NAMPT gene promoter. These may be used as an index of the gene expression or the expression level of the gene.

NAMPT蛋白質を検出する場合は、酵素免疫法(EIA)や蛍光免疫法(FIA)により定量的に検出すればよい。あるいは免疫細胞染色法(ICC)や免疫組織染色法(IHC)、あるいは自動細胞解析分離装置(FACS)を用いて検出してもよい。   When NAMPT protein is detected, it may be detected quantitatively by enzyme immunization (EIA) or fluorescence immunization (FIA). Alternatively, detection may be performed using an immune cell staining method (ICC), an immunohistochemical staining method (IHC), or an automatic cell analysis / separation apparatus (FACS).

NAMPT遺伝子の発現は、例えば、NAMPTmRNAを検出してもよい。その場合、何れかの方法によりNAMPTmRNAを検出すればよい。例えば、プライマーセットを使用し、PCR増幅法、LAMP増幅法、SMAP増幅法およびICAN増幅法などを利用してサンプルを増幅し、増幅産物について解析を行ってもよい。この場合、好ましくは、mRNAを直接に増幅する逆転写PCR法、逆転写LAMP増幅法、逆転写SMAP増幅法および逆転写ICAN増幅法などが使用されてよい。増幅産物の解析は、プローブ核酸との結合を検出することにより行ってもよく、直接に増幅産物の塩基配列を特定してもよい。また、増幅せずに被検細胞のNAMPT遺伝子発現産物である核酸の塩基配列を決定することにより検出を行ってもよい。   For the expression of the NAMPT gene, for example, NAMPT mRNA may be detected. In that case, NAMPT mRNA may be detected by any method. For example, using a primer set, a sample may be amplified using a PCR amplification method, a LAMP amplification method, a SMAP amplification method, an ICAN amplification method, etc., and the amplification product may be analyzed. In this case, a reverse transcription PCR method, a reverse transcription LAMP amplification method, a reverse transcription SMAP amplification method, a reverse transcription ICAN amplification method, or the like that directly amplifies mRNA may be preferably used. Analysis of the amplification product may be performed by detecting the binding with the probe nucleic acid, or the base sequence of the amplification product may be directly specified. Alternatively, detection may be performed by determining the base sequence of a nucleic acid that is a NAMPT gene expression product of a test cell without amplification.

好ましいプライマーセットの例を表2に示す。

Figure 2016101161
Examples of preferred primer sets are shown in Table 2.
Figure 2016101161

表2に示すプライマーセットは逆転写PCR増幅のためのプライマーセットである。配列番号2と配列番号3とを組み合わせて使用される。配列番号2のプライマーは、フォワードプライマーであり、配列番号3のプライマーはリバースプライマーである。これらのプライマーセットは、好ましくNAMPTmRNAを増幅し、検出するために使用されるが、NAMPTmRNAを増幅、検出するためのプライマーセットは、これらに限定するものではない。   The primer sets shown in Table 2 are primer sets for reverse transcription PCR amplification. SEQ ID NO: 2 and SEQ ID NO: 3 are used in combination. The primer of SEQ ID NO: 2 is a forward primer, and the primer of SEQ ID NO: 3 is a reverse primer. These primer sets are preferably used for amplifying and detecting NAMPT mRNA, but the primer set for amplifying and detecting NAMPT mRNA is not limited thereto.

NAMPT遺伝子プロモーターの活性を検出する場合は、NAMPT遺伝子のプロモーターを組込んだレポーターベクターを用いた方法により検出すればよい。レポーターベクターは、通常のレポーターベクター、すなわち哺乳類細胞内で非複製(即ち、非増幅)のレポーターベクターを用いてもよいし、自己増幅型レポーターベクター、すなわち哺乳類細胞内で自立的に複製(即ち、増幅)するレポーターベクターを用いてもよい。   When detecting the activity of the NAMPT gene promoter, it may be detected by a method using a reporter vector incorporating the promoter of the NAMPT gene. The reporter vector may be a normal reporter vector, that is, a non-replicating (i.e., non-amplifying) reporter vector in a mammalian cell, or a self-amplifying reporter vector, i.e., autonomously replicating in a mammalian cell (i.e., A reporter vector that amplifies) may be used.

以下に被検細胞の細胞特性を評価する方法について、更に詳細に説明する。   Hereinafter, a method for evaluating the cell characteristics of the test cells will be described in more detail.

1.NAMPT蛋白質の検出による被検細胞の細胞特性評価
1−1.検出方法および細胞特性の評価方法
NAMPT蛋白質の検出は、NAMPT蛋白質に特異的な抗体(即ち、抗NAMPT抗体)を用いて検出すればよい。このような抗体は、NAMPT蛋白質の全長もしくは一部を抗原に用いて新たに作製してもよく、市販の抗体を用いてもよい。
1. 1. Cell characterization of test cells by detection of NAMPT protein 1-1. Detection Method and Cell Characteristic Evaluation Method The NAMPT protein may be detected using an antibody specific to the NAMPT protein (ie, an anti-NAMPT antibody). Such an antibody may be newly prepared by using the full length or a part of the NAMPT protein as an antigen, or a commercially available antibody may be used.

市販の抗体の例としては、例えば、ウサギ抗NAMPTポリクローナル抗体(ab45890、Abcam)などがあげられるが、これに限定するものではない。新たに抗体を作製する場合には、公知の抗体作製法に従って作製すればよい。   Examples of commercially available antibodies include, but are not limited to, rabbit anti-NAMPT polyclonal antibodies (ab45890, Abcam). What is necessary is just to produce in accordance with the well-known antibody production method, when producing a new antibody.

抗NAMPT抗体を用いたNAMPT蛋白質の検出は、公知の蛋白質検出法で行えばよい。このような蛋白質検出法としては、例えば、酵素免疫法(EIA)、蛍光免疫法(FIA)、免疫細胞染色法(ICC)、免疫組織染色法(IHC)または自動細胞解析分離装置(FACS)があるが、これらに限定するものではない。   The detection of the NAMPT protein using the anti-NAMPT antibody may be performed by a known protein detection method. Such protein detection methods include, for example, enzyme immunization (EIA), fluorescence immunization (FIA), immune cell staining (ICC), immunohistochemical staining (IHC), or automatic cell analysis separation device (FACS). However, it is not limited to these.

EIAやFIAでは、まず、例えば、腫瘍から採取した被検細胞から抽出された蛋白質と、対照となる健常細胞から抽出された蛋白質とをそれぞれマイクロタイタープレートのウェルに固定化する。その後、抗NAMPT抗体を添加してNAMPT蛋白質と特異的に反応させてから、余剰な抗体をリン酸緩衝液などで洗浄して取り除く。その後、抗NAMPT抗体を認識する標識抗体を用いて検出する。   In EIA or FIA, for example, a protein extracted from a test cell collected from a tumor and a protein extracted from a healthy cell as a control are each immobilized in a well of a microtiter plate. Thereafter, an anti-NAMPT antibody is added and reacted specifically with the NAMPT protein, and then excess antibody is removed by washing with a phosphate buffer or the like. Thereafter, detection is performed using a labeled antibody that recognizes the anti-NAMPT antibody.

標識抗体には、酵素標識した抗体や蛍光色素で標識した抗体などを用いてよい。酵素標識抗体を用いた場合は、抗NAMPT抗体と標識抗体を反応させた後、余剰な標識抗体をリン酸緩衝液などで洗浄して取り除く。その後、酵素の基質を添加して酵素反応を行った後、酵素反応の反応産物を検出すればよい。例えば、標識抗体の酵素が基質から発光物質が生成する場合は、ルミノメーターでウェルの発光強度を測定すればよい。これにより、発光物質量を定量的に検出することが可能である。適切な条件下において、発光強度は、標識抗体量と相関し、標識抗体量は抗NAMPT抗体量と相関し、抗NAMPT抗体量はNAMPT蛋白質量と相関する。これにより、発光物質の量を定量的に測定することによって、細胞から抽出した蛋白質中のNAMPT蛋白質量の定量化が可能である。同様に、標識抗体の酵素が基質から蛍光物質が生成する場合は、フルオロメーターでウェルの蛍光強度を測定することにより、NAMPT蛋白質量の定量化が可能である。蛍光強度による検出では、標識抗体を蛍光物質で直接標識してもよい。標識抗体の酵素が基質から発色物質が生成する場合は、吸光度計でウェルの吸光度を測定することにより、NAMPT蛋白質量の定量化が可能である。EIAやFIAで、被検細胞と健常細胞におけるNAMPT蛋白質量を検出して両者で蛋白質量の比較を行い、被検細胞のNAMPT遺伝子の発現量が、健常細胞のNAMPT遺伝子の発現量よりも高い場合に、被検細胞の異常性が高い、例えば、被検細胞の転移性が高いと判定すればよい。しかしながら、健常細胞におけるNAMPT蛋白質の発現量の測定は、被検細胞のNAMPT遺伝子の発現量の測定と共に必ずしも行う必要はない。例えば、健常細胞の平均的なNAMPT蛋白質量を予め測定しておき、この数値を細胞特性評価における閾値に設定してもよい。この閾値と被検細胞のNAMPT蛋白質量とを比較することによって細胞特性の評価が行われてもよい。   As the labeled antibody, an enzyme-labeled antibody or an antibody labeled with a fluorescent dye may be used. When an enzyme-labeled antibody is used, after reacting the anti-NAMPT antibody with the labeled antibody, the excess labeled antibody is removed by washing with a phosphate buffer or the like. Then, after adding an enzyme substrate and carrying out an enzyme reaction, the reaction product of the enzyme reaction may be detected. For example, when the enzyme of the labeled antibody produces a luminescent substance from the substrate, the luminescence intensity of the well may be measured with a luminometer. Thereby, it is possible to detect the amount of luminescent substance quantitatively. Under appropriate conditions, the luminescence intensity correlates with the amount of labeled antibody, the amount of labeled antibody correlates with the amount of anti-NAMPT antibody, and the amount of anti-NAMPT antibody correlates with the amount of NAMPT protein. Thereby, the amount of NAMPT protein in the protein extracted from the cells can be quantified by quantitatively measuring the amount of the luminescent substance. Similarly, when a fluorescent substance is produced from the substrate of the labeled antibody enzyme, the amount of NAMPT protein can be quantified by measuring the fluorescence intensity of the well with a fluorometer. In detection by fluorescence intensity, the labeled antibody may be directly labeled with a fluorescent substance. When the enzyme of the labeled antibody produces a chromogenic substance from the substrate, the amount of NAMPT protein can be quantified by measuring the absorbance of the well with an absorptiometer. EIA or FIA detects the amount of NAMPT protein in test cells and healthy cells and compares the amount of protein in both cells, and the expression level of NAMPT gene in the test cells is higher than the expression level of NAMPT gene in healthy cells In this case, it may be determined that the abnormality of the test cell is high, for example, the metastasis of the test cell is high. However, the measurement of the expression level of the NAMPT protein in healthy cells is not necessarily performed together with the measurement of the expression level of the NAMPT gene in the test cell. For example, an average NAMPT protein amount of healthy cells may be measured in advance, and this value may be set as a threshold value in cell characteristic evaluation. Cell characteristics may be evaluated by comparing this threshold with the amount of NAMPT protein in the test cell.

例えば、ICCやIHCでは、腫瘍から採取した被検細胞としての腫瘍細胞(組織)と、対照となる健常細胞(組織)を固定化液で固定化した後、リン酸緩衝液などで未反応の固定化液を取り除いてブロッキング処理を行い得る。抗NAMPT抗体を添加してNAMPT蛋白質と特異的に反応させてから、余剰な抗体をリン酸緩衝液などで洗浄して取り除き、抗NAMPT抗体を認識する標識抗体を用いて検出し得る。ICCやIHCに用いる試薬は、公知の試薬から適切に選択され使用されればよい。標識抗体には、酵素標識した抗体や蛍光色素で標識した抗体などを用いることができる。ICCやIHCでは、NAMPT蛋白質の発現を光学顕微鏡で検出し得る。例えば、標識抗体の酵素が基質から発光物質が生成する場合は、発光顕微鏡により細胞の発光が検出され得る。標識抗体の酵素が基質から蛍光物質が生成する場合は、蛍光顕微鏡により細胞の蛍光が検出され得る。標識抗体の酵素が基質から発色物質を生成する場合は、光学顕微鏡で細胞の発色が検出され得る。蛍光で検出を行う場合は、標識抗体を蛍光物質で直接標識してもよい。ICCやIHCでは、被検細胞と健常細胞のNAMPT蛋白質の発現量として、染色強度、すなわち発光、蛍光または発色の強度を顕微鏡で観察または比較すればよい。それにより、例えば、被検細胞のNAMPT遺伝子の発現量(染色強度)が、健常細胞のNAMPT遺伝子の発現量(染色強度)よりも高い場合に、例えば、被検細胞の異常性がある、異常性がある可能性がある、異常性が高い、または被検細胞の転移性が高いなどと判定され得る。   For example, in ICC and IHC, tumor cells (tissue) as test cells collected from a tumor and healthy cells (tissue) as a control are immobilized with an immobilization solution, and then unreacted with a phosphate buffer or the like. The immobilizing solution can be removed to perform a blocking treatment. After adding an anti-NAMPT antibody to react specifically with the NAMPT protein, excess antibody can be removed by washing with a phosphate buffer or the like, and detection can be performed using a labeled antibody that recognizes the anti-NAMPT antibody. Reagents used for ICC and IHC may be appropriately selected from known reagents and used. As the labeled antibody, an enzyme-labeled antibody or an antibody labeled with a fluorescent dye can be used. In ICC and IHC, the expression of NAMPT protein can be detected with a light microscope. For example, when a luminescent substance is produced from the substrate by the enzyme of the labeled antibody, the luminescence of the cell can be detected by a luminescence microscope. When the fluorescent substance is generated from the substrate of the enzyme of the labeled antibody, the fluorescence of the cell can be detected by a fluorescence microscope. When the enzyme of the labeled antibody produces a color developing substance from the substrate, the color development of the cells can be detected with an optical microscope. When detecting by fluorescence, the labeled antibody may be directly labeled with a fluorescent substance. In ICC or IHC, the intensity of staining, that is, the intensity of luminescence, fluorescence or color development, may be observed or compared with a microscope as the expression level of NAMPT protein in test cells and healthy cells. Thereby, for example, when the expression level (staining intensity) of the NAMPT gene in the test cell is higher than the expression level (staining intensity) of the NAMPT gene in the healthy cell, for example, there is an abnormality in the test cell. It can be determined that there is a possibility that the test cell is highly abnormal, or that the test cell is highly metastatic.

FACSでは、腫瘍から採取した被検細胞としての腫瘍細胞と、対照となる健常細胞を固定化液で固定化した後、リン酸緩衝液などで未反応の固定化液を取り除いてブロッキング処理が行われ得る。抗NAMPT抗体を添加してNAMPT蛋白質と特異的に反応させてから、余剰な抗体をリン酸緩衝液などで洗浄して取り除き、抗NAMPT抗体を認識する標識抗体を用いて、当該タンパク質が検出され得る。FACSでは、標識抗体は、蛍光物質で標識した抗体を用いることが好ましい。このように調整した細胞がFACSで検出され得る。FACSは、BD社(Becton、Dickinson and Company)の販売するFACSVerseなどの市販の装置が使用され得る。FACSでは、被検細胞と健常細胞のNAMPT蛋白質の発現量として、細胞の蛍光強度を検出および比較して、被検細胞のNAMPT遺伝子の発現量(蛍光強度)が、健常細胞のNAMPT遺伝子の発現量(蛍光強度)よりも高い場合に、例えば、異常性がある、または被検細胞の転移性が高い、などと判定され得る。   In FACS, after immobilizing tumor cells as test cells collected from a tumor and healthy control cells with an immobilization solution, the unreacted immobilization solution is removed with a phosphate buffer or the like to perform blocking treatment. Can be broken. After adding an anti-NAMPT antibody and reacting specifically with the NAMPT protein, the excess antibody is washed away with a phosphate buffer or the like, and the protein is detected using a labeled antibody that recognizes the anti-NAMPT antibody. obtain. In FACS, the labeled antibody is preferably an antibody labeled with a fluorescent substance. Cells prepared in this way can be detected by FACS. A commercially available apparatus such as FACS Verse sold by BD (Becton, Dickinson and Company) can be used for FACS. In FACS, as the expression level of NAMPT protein in test cells and healthy cells, the fluorescence intensity of the cells is detected and compared, and the expression level (fluorescence intensity) of NAMPT gene in the test cells is the expression level of NAMPT gene in healthy cells. When the amount is higher than the amount (fluorescence intensity), for example, it can be determined that there is an abnormality or the metastatic property of the test cell is high.

1−2.NAMPT蛋白質検出による被検細胞の細胞特性評価キット
本発明では、更なる実施の形態として、NAMPT蛋白質検出による被検細胞の細胞特定評価キットが提供される。それは、例えば、NAMPT蛋白質検出による腫瘍細胞の転移性評価キットであり得る。当該細胞特性評価キットは、少なくとも1種類の抗NAMPT抗体および緩衝液を含む。当該細胞特性評価キットは、抗NAMPT抗体を担持する公知のキャリアおよび/またはレポーターベクターを収容する容器を含んでもよい。更に、被検細胞の細胞特性を評価する方法をおこなうために必要な何れかの試薬を含んでもよい。例えば、抗NAMPT抗体を認識する標識抗体、当該標識抗体を検出するための基質、賦形剤、安定剤および/または他の所望の効果を有する成分などを更に含んでもよい。当該キットの組成物は、容器に含まれて提供されてもよい。
1-2. Kit for evaluating cell characteristics of test cells by detection of NAMPT protein In the present invention, a kit for cell specific evaluation of test cells by detection of NAMPT protein is provided as a further embodiment. For example, it may be a kit for evaluating metastasis of tumor cells by detecting NAMPT protein. The cell characterization kit includes at least one anti-NAMPT antibody and a buffer. The cell characterization kit may include a container that contains a known carrier carrying an anti-NAMPT antibody and / or a reporter vector. Furthermore, any reagent necessary for performing the method for evaluating the cell characteristics of the test cells may be included. For example, it may further contain a labeled antibody that recognizes the anti-NAMPT antibody, a substrate for detecting the labeled antibody, an excipient, a stabilizer, and / or a component having other desired effects. The kit composition may be provided in a container.

2.NAMPTmRNAの検出による被検細胞の細胞特性評価
2−1.検出方法および細胞特性の評価方法
NAMPTmRNAの検出は、NAMPTmRNAに特異的なプライマーセットを用いて逆転写PCR法によって検出すればよい。しかしながら、この方法に限定されるものではなく、当該mRNAの検出が可能であれば、それ自身公知のmRNA検出法を用いてもよい。このような検出法には、例えば、NAMPTmRNAを特異的に検出するプローブを用いたノーザンブロット法やDNA/RNAチップ法などが挙げられる。
2. 2. Cell characteristic evaluation of test cells by detection of NAMPT mRNA 2-1. Detection Method and Cell Characteristic Evaluation Method NAMPT mRNA may be detected by reverse transcription PCR using a primer set specific for NAMPT mRNA. However, the method is not limited to this method, and a known mRNA detection method may be used as long as the mRNA can be detected. Examples of such a detection method include Northern blotting using a probe that specifically detects NAMPT mRNA, DNA / RNA chip method, and the like.

逆転写PCR法では、例えば、腫瘍から採取した被検細胞と、対照となる健常細胞から抽出したRNAを鋳型に用いて逆転写反応でcDNAを合成し、これを鋳型に特異的なプライマーセットを用いたPCRでNAMPTmRNAの一部、もしくは全長を増幅して検出し得る。   In the reverse transcription PCR method, for example, cDNA is synthesized by reverse transcription reaction using RNA extracted from test cells collected from a tumor and healthy control cells as a template, and a primer set specific to the template is used. A part or the full length of NAMPT mRNA can be amplified and detected by the PCR used.

逆転写PCR法とは、上記の逆転写反応とPCRを組み合わせたmRNAの検出法をいう。逆転写反応および/またはPCRに用いる、酵素や基質や緩衝液などの試薬は市販のものを用い得る。あるいは、上記試薬が予めパッケージングされたキットを用いてもよい。   The reverse transcription PCR method is a method for detecting mRNA that combines the above reverse transcription reaction and PCR. Commercially available reagents such as enzymes, substrates and buffers used for reverse transcription and / or PCR can be used. Alternatively, a kit in which the reagent is packaged in advance may be used.

逆転写PCRに用いるプライマーセットは、NAMPT蛋白質をコーディングするセンス鎖とアンチセンス鎖に対して、それぞれ相補的な塩基配列を持つプライマーの組み合わせを含み得る。プライマーセットは、RNAに混入したゲノムDNAを増幅しないよう、2つ以上のエキソンに跨るプライマーの組み合わせでなることが好ましい。このようなプライマーセットの例は、配列番号2と配列番号3に記載のプライマーセットであり得る。しなしながら、これに限定されるものではなく、プライマーセットは、NAMPTmRNAの一部、または全長を特異的に増幅できればよい。NAMPTmRNAの一部、もしくは全長を、適切な反応条件下、上記プライマーセットを用いた逆転写PCRで増幅することにより、細胞から抽出したRNAに含まれるNAMPTmRNAの量を定量化してもよい。   The primer set used for reverse transcription PCR can include a combination of primers each having a complementary nucleotide sequence to the sense strand and the antisense strand encoding the NAMPT protein. The primer set is preferably a combination of primers spanning two or more exons so as not to amplify genomic DNA mixed in RNA. Examples of such primer sets can be the primer sets set forth in SEQ ID NO: 2 and SEQ ID NO: 3. However, the present invention is not limited to this, and the primer set only needs to specifically amplify a part or the entire length of NAMPT mRNA. The amount of NAMPT mRNA contained in RNA extracted from cells may be quantified by amplifying a part or full length of NAMPT mRNA by reverse transcription PCR using the above primer set under appropriate reaction conditions.

例えば、逆転写PCR法で、被検細胞と健常細胞におけるNAMPTmRNA量を検出して両者でmRNA量の比較を行い、被検細胞のNAMPTmRNA量が、健常細胞のNAMPTmRNAの発現量よりも高い場合に、被検細胞に異常性がある、例えば、被検細胞の転移性が高いと判定すればよい。このとき、健常細胞におけるNAMPTmRNA量の測定は、被検細胞のNAMPTmRNA量の測定と同時に必ずしも行う必要はない。健常細胞の平均的なNAMPTmRNA量を予め測定しておき、この数値を細胞特性評価における閾値に設定してもよい。このような閾値と被検細胞のNAMPTmRNA量とを比較することにより細胞特性の評価を行い得る。   For example, when the amount of NAMPT mRNA in a test cell and a healthy cell is detected by reverse transcription PCR and the amount of mRNA in both cells is compared, and the amount of NAMPT mRNA in the test cell is higher than the expression level of NAMPT mRNA in the healthy cell The test cell may be abnormal, for example, it may be determined that the test cell is highly metastatic. At this time, the measurement of the amount of NAMPT mRNA in healthy cells is not necessarily performed simultaneously with the measurement of the amount of NAMPT mRNA in test cells. The average amount of NAMPT mRNA in healthy cells may be measured in advance, and this value may be set as a threshold value for cell characteristic evaluation. Cell characteristics can be evaluated by comparing such a threshold value with the amount of NAMPT mRNA in the test cell.

2−2.NAMPTmRNA検出による被検細胞の細胞特性評価キット
更なる実施の形態として、NAMPTmRNA検出による被検細胞の細胞特性評価キットが提供される。それは、例えば、NAMPTmRNA検出による腫瘍細胞の細胞特性評価キットであり得る。当該細胞特性評価キットは、上記1−1に記載のプライマーセットおよび緩衝液を含んでもよい。細胞特性評価キットは、プライマーセット担持する公知のキャリアおよび/またはプライマーセットを収容する容器を含んでもよい。更に、当該細胞特性評価定キットは、被検細胞の細胞特性を評価する方法を行うために必要な何れかの試薬を含んでもよい。例えば、逆転写PCRを行うための酵素や基質、緩衝液、賦形剤、安定剤および/または他の所望の効果を有する成分などを含んでもよい。当該キットの組成物は、容器に含まれて提供されてもよい。
2-2. Kit for evaluating cell characteristics of test cells by detecting NAMPT mRNA As a further embodiment, a kit for evaluating cell characteristics of test cells by detecting NAMPT mRNA is provided. It can be, for example, a cell characterization kit for tumor cells by NAMPT mRNA detection. The cell property evaluation kit may include the primer set and the buffer described in 1-1. The cell characterization kit may include a known carrier carrying a primer set and / or a container containing the primer set. Further, the cell property evaluation kit may include any reagent necessary for performing a method for evaluating the cell property of a test cell. For example, an enzyme, a substrate, a buffer solution, an excipient, a stabilizer, and / or a component having other desired effects for performing reverse transcription PCR may be included. The kit composition may be provided in a container.

3.レポーターベクターを用いたNAMPT遺伝子プロモーター活性の検出
3−1.レポーターベクター
NAMPT遺伝子プロモーター活性の検出で用いることができるレポーターベクターの一例を図1により説明する。図1に示すレポーターベクターは、哺乳類細胞内で自律的に複製(即ち、増幅)しないレポーターベクターの例である。レポーターベクター1は、検出可能な信号を生ずるレポーター遺伝子発現ユニット2を含む。レポーター遺伝子発現ユニット2は、NAMPTプロモーター配列4と、その下流に機能的に連結されたレポーター遺伝子5と、その下流に機能的に連結された転写終結シグナル配列6とを含む。
3. 3. Detection of NAMPT gene promoter activity using reporter vector 3-1. Reporter Vector An example of a reporter vector that can be used for detection of NAMPT gene promoter activity is described with reference to FIG. The reporter vector shown in FIG. 1 is an example of a reporter vector that does not autonomously replicate (ie, amplify) in mammalian cells. The reporter vector 1 includes a reporter gene expression unit 2 that produces a detectable signal. The reporter gene expression unit 2 includes a NAMPT promoter sequence 4, a reporter gene 5 operably linked downstream thereof, and a transcription termination signal sequence 6 operably linked downstream thereof.

ここで、「機能的に連結された」とは、各遺伝子が目的とする機能を発揮することが可能な状態で連結している状態をいう。例えば、蛋白質をコードする配列の場合、それぞれの塩基配列がコードするアミノ酸配列が正しく連結されていることをいう。言い換えれば、それは、アミノ酸コドンのフレームにずれがなく、当該塩基配列が導入された細胞において、目的とする活性が機能するペプチドが合成されることをいう。またここで、「機能的に連結」の語は、「作動可能に連結」の語と交換可能に使用されてもよい。   Here, “functionally linked” refers to a state in which each gene is linked in a state where it can exert its intended function. For example, in the case of a sequence encoding a protein, it means that the amino acid sequences encoded by the respective base sequences are correctly linked. In other words, it means that there is no shift in the frame of the amino acid codon and a peptide that functions in the target activity is synthesized in the cell into which the base sequence is introduced. Also, herein, the term “functionally coupled” may be used interchangeably with the term “operably coupled”.

NAMPT遺伝子のプロモーター配列4は、当該遺伝子のプロモーター活性として、NAMPT遺伝子からmRNAへの転写活性を制御する情報が得られるべき核酸配列である。NAMPT遺伝子のプロモーター配列4は、細胞のゲノムにおいて、NAMPT遺伝子、即ち、NAMPT蛋白質のアミノ酸配列情報をコードする核酸配列の5’上流領域に位置する配列である。NAMPT遺伝子のプロモーター配列4は、NAMPT遺伝子からmRNAへの転写活性を制御する情報が得るに十分な長さの核酸配列であればよい。例えば、NAMPT遺伝子のプロモーター配列4の一例を配列番号1に記載した。しかしながら、当該遺伝子のプロモーター配列は、NAMPT遺伝子からmRNAへの転写活性を制御する情報が得られるのであれば、その塩基配列は配列番号1に記載の塩基配列と完全に一致する必要はなく、即ち、相同性を持つ配列であってもよく、また塩基配列も配列番号1よりも短い塩基配列、即ち、配列番号1に記載の配列の一部のみであってもよい。また、配列番号1に記載の核酸配列の一部と他の遺伝子プロモーターの核酸配列を連結した融合核酸配列であってもよい。例えば、NAMPT遺伝子のプロモーター配列は、表2に示す配列番号4および配列番号5をそれぞれ含むフォワードプライマーとリバースプライマーとを含むプライマーセットを用いてヒトゲノムから取得してもよい。   The promoter sequence 4 of the NAMPT gene is a nucleic acid sequence from which information for controlling the transcription activity from the NAMPT gene to mRNA should be obtained as the promoter activity of the gene. The promoter sequence 4 of the NAMPT gene is a sequence located in the 5 'upstream region of the nucleic acid sequence encoding the amino acid sequence information of the NAMPT gene, that is, the NAMPT protein, in the cell genome. The promoter sequence 4 of the NAMPT gene may be a nucleic acid sequence having a length sufficient to obtain information for controlling transcription activity from the NAMPT gene to mRNA. For example, an example of promoter sequence 4 of NAMPT gene is described in SEQ ID NO: 1. However, the promoter sequence of the gene need not completely match the nucleotide sequence described in SEQ ID NO: 1 as long as information for controlling the transcription activity from the NAMPT gene to mRNA can be obtained. The base sequence may be a base sequence shorter than SEQ ID NO: 1, that is, only a part of the sequence described in SEQ ID NO: 1. Further, it may be a fusion nucleic acid sequence obtained by linking a part of the nucleic acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 and the nucleic acid sequence of another gene promoter. For example, the promoter sequence of the NAMPT gene may be obtained from the human genome using a primer set including a forward primer and a reverse primer respectively including SEQ ID NO: 4 and SEQ ID NO: 5 shown in Table 2.

上記の記載に関して「相同性をもつ配列」とは、ゲノム上の特定の配列と同一な配列であるか、またはゲノム上の特定の配列と同一な配列の一部、例えば、1若しくは数個の塩基が置換、欠失または付与された配列であり、且つプロモーター活性を有する配列をいう。例えば、「相同性をもつ」、「相同な」および「相同の」とは、ゲノム配列に対して90%以上で相同である配列であればよい。また「融合核酸配列」とは、異なるゲノム上または同一ゲノム上の連続しない2つ以上の特定の配列を一体化してなる配列をいう。即ち、NAMPT遺伝子のプロモーター配列4は、NAMPT遺伝子プロモーター配列の一部と、他の遺伝子プロモーター配列からなる2つ以上のユニットで構成されてもよい。NAMPT遺伝子のプロモーター配列4は、被検細胞のゲノム上の配列に相同性を有する配列に加えて、任意の更なる配列を含んでもよい。任意の更なる配列を含む場合、NAMPT遺伝子のプロモーター配列4がプロモーター活性を有する限り、リンカー配列などと呼ばれる任意の更なる配列を含んでもよい。   In the above description, “sequence having homology” means a sequence that is identical to a specific sequence on the genome, or a part of the same sequence as the specific sequence on the genome, for example, one or several sequences. A sequence in which a base is substituted, deleted or added, and has a promoter activity. For example, “having homology”, “homologous”, and “homologous” may be sequences that are 90% or more homologous to the genome sequence. The “fusion nucleic acid sequence” refers to a sequence obtained by integrating two or more specific sequences on different genomes or on the same genome. That is, the promoter sequence 4 of the NAMPT gene may be composed of a part of the NAMPT gene promoter sequence and two or more units composed of other gene promoter sequences. The promoter sequence 4 of the NAMPT gene may include any further sequence in addition to the sequence having homology to the sequence on the genome of the test cell. When any additional sequence is included, any additional sequence called a linker sequence or the like may be included as long as the promoter sequence 4 of the NAMPT gene has promoter activity.

レポーター遺伝子5は、検出可能な信号を生ずる蛋白質をコードする何れかの遺伝子であればよい。検出可能な信号は、レポーター蛋白質自身、レポーター蛋白質と何れかの物質との反応、レポーター蛋白質と何れかの物質との結合などから生じる何れかの検出可能な信号であればよい。   Reporter gene 5 may be any gene that encodes a protein that produces a detectable signal. The detectable signal may be any detectable signal generated from the reporter protein itself, the reaction between the reporter protein and any substance, the binding between the reporter protein and any substance, or the like.

レポーター蛋白質をコードするレポーター遺伝子5は、検出可能な信号を生ずるレポーター蛋白質であればよい。レポーター遺伝子5は、例えば、ルシフェラーゼ遺伝子、β−ガラクトシダーゼ遺伝子、一酸化窒素合成酵素遺伝子、キサンチンオキシダーゼ遺伝子、青色蛍光蛋白質遺伝子、緑色蛍光蛋白質遺伝子、赤色蛍光蛋白質遺伝子および重金属結合蛋白質遺伝子であってもよい。これらの遺伝子はそれぞれ、ルシフェラーゼ、β−ガラクトシダーゼ、一酸化窒素合成酵素、キサンチンオキシダーゼ、青色蛍光蛋白質、緑色蛍光蛋白質、赤色蛍光蛋白質および重金属結合蛋白質をコードし、レポーターベクターの活性化によりこれらの蛋白質を発現する。1つの実施形態において好ましい例は、発光酵素蛋白質をコードする遺伝子であり、例えば、ルシフェラーゼ遺伝子およびβ−ガラクトシダーゼ遺伝子などを含む。   The reporter gene 5 encoding the reporter protein may be any reporter protein that produces a detectable signal. The reporter gene 5 may be, for example, a luciferase gene, β-galactosidase gene, nitric oxide synthase gene, xanthine oxidase gene, blue fluorescent protein gene, green fluorescent protein gene, red fluorescent protein gene, and heavy metal binding protein gene. . Each of these genes encodes luciferase, β-galactosidase, nitric oxide synthase, xanthine oxidase, blue fluorescent protein, green fluorescent protein, red fluorescent protein and heavy metal binding protein, and these proteins are activated by activation of the reporter vector. To express. A preferable example in one embodiment is a gene encoding a luminescent enzyme protein, and includes, for example, a luciferase gene and a β-galactosidase gene.

重金属結合蛋白質を検出可能な信号として発現するレポーターベクターの1例は、特開2012−200245に開示されている。   An example of a reporter vector that expresses a heavy metal binding protein as a detectable signal is disclosed in Japanese Patent Application Laid-Open No. 2012-200245.

レポーター遺伝子から得られる信号は、何れかの装置により検出可能な信号であればよい。またそのような信号の検出は、信号の種類に応じて選択された何れかの装置を用いて行えばよい。装置の例は、発光測定装置、蛍光測定装置、X線測定装置、電子スピン共鳴装置、核医学診断装置、磁気共鳴イメージング装置などであってもよい。また、信号の検出により得られた結果は、信号の有無を示しても、信号の大きさを示しても、或いはその両方を示してもよい。   The signal obtained from the reporter gene may be any signal that can be detected by any device. Further, such signal detection may be performed using any device selected according to the type of signal. Examples of the apparatus may be a luminescence measuring apparatus, a fluorescence measuring apparatus, an X-ray measuring apparatus, an electron spin resonance apparatus, a nuclear medicine diagnostic apparatus, a magnetic resonance imaging apparatus, and the like. Further, the result obtained by detecting the signal may indicate the presence or absence of the signal, the magnitude of the signal, or both.

検出可能な信号の好ましい例は、発光、蛍光および発色などの光学信号である。ここで用いる「発光」とは、化学発光、生物発光または生物化学発光を指す。信号が光学信号である場合、光学検出装置により信号を検出すればよい。例えば、検出可能な信号が発光である場合、発光を検出可能な発光測定装置、例えば、発光顕微鏡などで信号を検出すればよい。   Preferred examples of detectable signals are optical signals such as luminescence, fluorescence and color development. As used herein, “luminescence” refers to chemiluminescence, bioluminescence or biochemiluminescence. When the signal is an optical signal, the signal may be detected by an optical detection device. For example, when the detectable signal is light emission, the signal may be detected by a light emission measuring device capable of detecting light emission, for example, a light emission microscope.

転写終結シグナル配列6は、その上流の遺伝子の転写を終結する配列であればよく、例えば、ポリ(A)付加シグナルであってよい。ポリ(A)付加シグナルは、哺乳動物の遺伝子の転写終結に機能するものであればよい。例としては、SV40ウイルスの後期ポリ(A)付加シグナル(配列番号6)や、牛成長ホルモン遺伝子のポリ(A)付加シグナル(配列番号7)などが挙げられる。転写終結シグナル配列の例を表3に示す。   The transcription termination signal sequence 6 may be a sequence that terminates transcription of a gene upstream thereof, and may be, for example, a poly (A) addition signal. The poly (A) addition signal may be any signal that functions to terminate transcription of mammalian genes. Examples include the late poly (A) addition signal (SEQ ID NO: 6) of the SV40 virus and the poly (A) addition signal (SEQ ID NO: 7) of the bovine growth hormone gene. Examples of transcription termination signal sequences are shown in Table 3.

表3に記載の転写終結シグナルは、NAMPT遺伝子のプロモーター配列4の上流に連結してもよい。転写終結シグナル6をプロモーター配列4の上流に連結することにより、レポーターベクターの任意の配列からの不適切な転写によるレポーター遺伝子5の発現(リーク)を防止することができる。これにより、不適切な転写(発現リーク)によるバックグラウンド(ノイズ)を減少させ、レポーター遺伝子5の発現により生成する信号の検出感度、および検出精度を高めることが可能である。

Figure 2016101161
The transcription termination signal shown in Table 3 may be linked upstream of the promoter sequence 4 of the NAMPT gene. By linking the transcription termination signal 6 upstream of the promoter sequence 4, expression (leakage) of the reporter gene 5 due to inappropriate transcription from any sequence of the reporter vector can be prevented. Thereby, the background (noise) due to inappropriate transcription (expression leak) can be reduced, and the detection sensitivity and detection accuracy of the signal generated by the expression of the reporter gene 5 can be increased.
Figure 2016101161

ただし、本態様の実施において使用可能なポリ(A)付加シグナルは、これに限定されるものではなく、ポリ(A)付加シグナルとしての機能を損なわない限りにおいては、遺伝子配列を改変したものを用いてもよい。   However, the poly (A) addition signal that can be used in the practice of this embodiment is not limited to this, and the modified poly (A) addition signal may be used as long as the function as the poly (A) addition signal is not impaired. It may be used.

図2を用いて自己増幅型レポーターベクターの例を説明する。図2(a)および図2(b)に自己複製ベクターの2つの例を示す。   An example of a self-amplifying reporter vector will be described with reference to FIG. 2A and 2B show two examples of self-replicating vectors.

図2(a)に示す自己複製ベクター21は、複製開始配列を含むこと以外は、図1に示したレポーターベクターと同じ構成を含む。   The self-replicating vector 21 shown in FIG. 2 (a) has the same configuration as the reporter vector shown in FIG. 1 except that it contains a replication initiation sequence.

自己複製ベクター21は、レポーター遺伝子発現ユニット2と、その下流に連結された複製開始ユニットを含む。図2に示した例は、複製開始ユニットが複製開始配列3を含む例である。複製開始配列3は、対応する複製開始蛋白質の結合により自己複製ベクター21が導入された細胞内において自己複製を開始する。   The self-replicating vector 21 includes a reporter gene expression unit 2 and a replication initiation unit linked downstream thereof. The example illustrated in FIG. 2 is an example in which the replication start unit includes a replication start sequence 3. The replication initiation sequence 3 initiates self-replication in cells into which the self-replication vector 21 has been introduced by binding of the corresponding replication initiation protein.

自己複製ベクターは、被検細胞で複製開始蛋白質が発現している条件下において、被検細胞核内で自己複製を行う。複製開始配列3は、例えば、哺乳類細胞で、複製開始蛋白質の結合によって活性化されて自己複製を開始する配列であればよく、それ自身公知の複製開始配列であればよい。複製開始配列3は、例えば、シミアン・ウイルス40(配列番号8)、エプスタイン・バー・ウイルスまたはマウス・ポリオーマ・ウイルスに由来する複製開始配列であってもよい。複製開始配列3の例を表4に示す。

Figure 2016101161
The self-replicating vector performs self-replication in the test cell nucleus under the condition that the replication initiation protein is expressed in the test cell. The replication initiation sequence 3 may be a sequence that is activated by binding of a replication initiation protein and initiates self-replication in mammalian cells, for example, and may be a replication initiation sequence known per se. The replication initiation sequence 3 may be, for example, a replication initiation sequence derived from simian virus 40 (SEQ ID NO: 8), Epstein-Barr virus, or mouse polyoma virus. An example of the replication start sequence 3 is shown in Table 4.
Figure 2016101161

自己複製ベクターは、例えば、それ自身公知のプラスミドベクターを利用してもよい。例えば、この自己複製ベクターのプラスミドベクターの例は、特開2013−42721に開示されている。   As the self-replicating vector, for example, a plasmid vector known per se may be used. For example, an example of a plasmid vector of this self-replicating vector is disclosed in JP2013-42721.

自己複製ベクターの自己複製は、複製開始配列3に対して複製開始蛋白質が結合することにより開始される。複製開始蛋白質は、複製開始配列3に結合できるように被検細胞核内に自己複製ベクターと共に存在すればよい。例えば、複製開始蛋白質は、レポーターベクターとして使用される自己複製ベクターから発現されてもよく、更なるベクターから発現されてもよく、被検細胞により発現されてもよい。   Self-replication of the self-replicating vector is initiated by binding of a replication initiator protein to the replication initiator sequence 3. The replication initiator protein may be present together with the self-replicating vector in the test cell nucleus so that it can bind to the replication initiator sequence 3. For example, the replication initiator protein may be expressed from a self-replicating vector used as a reporter vector, may be expressed from a further vector, or may be expressed by a test cell.

例えば、複製開始蛋白質を被検細胞核内に供給するために、複製開始蛋白質ユニットが存在してもよい。複製開始蛋白質ユニットは、例えば、プロモーターと、その下流に機能的に連結された複製開始蛋白質をコードする複製開始蛋白質遺伝子と、その下流に機能的に連結された転写終結シグナル配列を含んでもよい。或いは、複製開始蛋白質ユニットは、これらの配列からなってもよい。   For example, a replication initiator protein unit may be present in order to supply a replication initiator protein into the test cell nucleus. The replication initiation protein unit may include, for example, a promoter, a replication initiation protein gene encoding a replication initiation protein operably linked downstream thereof, and a transcription termination signal sequence operably linked downstream thereof. Alternatively, the replication initiator protein unit may consist of these sequences.

複製開始蛋白質ユニットは、自己複製ベクター21の核酸上に存在してもよく、自己複製ベクター21の核酸とは異なる核酸上に存在してもよい。自己複製ベクターとは異なる核酸上に複製開始蛋白質ユニットが存在する場合、複製開始蛋白質ユニットは、被検細胞の染色体上に存在してもよく、被検細胞に含まれる他の核酸上に存在してもよい。   The replication initiating protein unit may be present on the nucleic acid of the self-replicating vector 21 or may be present on a nucleic acid different from the nucleic acid of the self-replicating vector 21. When the replication initiator protein unit is present on a nucleic acid different from that of the self-replicating vector, the replication initiator protein unit may be present on the chromosome of the test cell or may be present on another nucleic acid contained in the test cell. May be.

複製開始蛋白質ユニットが、レポーターベクターとしての自己複製ベクターに含まれる場合、そこに含まれるレポーター遺伝子発現ユニット2と、複製開始蛋白質ユニットとが、1つのプロモーター配列4によってそれらの発現が共に制御されていてもよく、独立した2つのプロモーター配列によってそれらの発現がそれぞれ制御されていてもよい。2つのプロモーター配列によってそれらの発現がそれぞれ制御される場合、例えば、複製開始蛋白質ユニットは、自己複製ベクター21の核酸上に、レポーター遺伝子発現ユニット2とは独立して存在してよい。その場合、複製開始蛋白質遺伝子の発現を制御するプロモーターは、構成的に発現するプロモーターであることが好ましい。   When the replication initiating protein unit is contained in a self-replicating vector as a reporter vector, the expression of the reporter gene expression unit 2 and the replication initiating protein unit contained therein are both controlled by one promoter sequence 4. Alternatively, their expression may be controlled by two independent promoter sequences. When their expression is controlled by the two promoter sequences, for example, the replication initiator protein unit may be present on the nucleic acid of the self-replicating vector 21 independently of the reporter gene expression unit 2. In that case, the promoter controlling the expression of the replication initiator protein gene is preferably a constitutively expressed promoter.

複製開始蛋白質遺伝子は、例えば、シミアン・ウイルス40のラージT抗原遺伝子、エプスタイン・バー・ウイルスのEBNA−1遺伝子、マウス・ポリオーマ・ウイルスのラージT抗原遺伝子などであってもよい。好ましいラージT抗原遺伝子の例は、配列番号9、配列番号10若しくは配列番号11で示される核酸、または配列番号9、配列番号10若しくは配列番号11の配列中の1若しくは数個の塩基が欠失、置換若しくは付加された配列により示された、DNA複製開始機能を有する核酸であってよい。ここで、DNA複製開始機能とは、複製を開始できる蛋白質をコードしていることをいう。上記複製開始蛋白質遺伝子の例を表5−1、表5−2、表6−1、表6−2、表7−1および表7−2に示す。

Figure 2016101161
The replication initiation protein gene may be, for example, the large T antigen gene of Simian virus 40, the EBNA-1 gene of Epstein-Barr virus, the large T antigen gene of mouse polyoma virus, and the like. Examples of preferred large T antigen genes include a nucleic acid represented by SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10 or SEQ ID NO: 11, or a deletion of one or several bases in the sequence of SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10 or SEQ ID NO: 11 Or a nucleic acid having a DNA replication initiation function, which is indicated by the substituted or added sequence. Here, the DNA replication initiation function refers to encoding a protein capable of initiating replication. Examples of the replication initiation protein gene are shown in Table 5-1, Table 5-2, Table 6-1, Table 6-2, Table 7-1 and Table 7-2.
Figure 2016101161

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複製開始蛋白質遺伝子と、複製開始配列との組み合わせは、複製を開始することが可能な組み合わせであればよい。そのような組み合わせの例は次の通りである:
複製開始蛋白質をコードする遺伝子が、シミアン・ウイルス40のラージT抗原遺伝子であり、前記複製開始配列が、シミアン・ウイルス40からの複製開始配列である組み合わせ;
複製開始蛋白質遺伝子が、エプスタイン・バー・ウイルスのEBNA−1遺伝子であり、複製開始配列が、エプスタイン・バー・ウイルスからの複製開始配列である組み合わせ;
複製開始蛋白質遺伝子が、マウス・ポリオーマ・ウイルスのラージT抗原遺伝子であり、複製開始配列が、マウス・ポリオーマ・ウイルスからの複製開始配列である組み合わせ。これらのような組み合わせは好ましいが、これらに限定するものではない。
The combination of the replication initiation protein gene and the replication initiation sequence may be any combination that can initiate replication. Examples of such combinations are:
A combination wherein the gene encoding the replication initiator protein is a large T antigen gene of simian virus 40 and the replication initiator sequence is a replication initiator sequence from simian virus 40;
A combination in which the replication initiator protein gene is the Epstein-Barr virus EBNA-1 gene and the replication initiator sequence is the replication initiator sequence from Epstein-Barr virus;
A combination wherein the replication initiator protein gene is a large T antigen gene of mouse polyoma virus and the replication initiator sequence is a replication initiator sequence from mouse polyoma virus. Combinations such as these are preferred, but are not limited thereto.

自己複製ベクターは、バイシストロニック発現ベクターであってもよい。バイシストロニック発現ベクターでは、バイシストロニック発現用配列を用いることにより、NAMPTプロモーター配列4により、その下流に含まれる2つの遺伝子、即ち、レポーター遺伝子の発現と複製開始蛋白質の発現とが同時に制御される。即ち、このような自己複製ベクターでは、レポーター遺伝子発現ユニット2と複製開始蛋白質ユニットとが、同じプロモーターによって制御されて発現される。そのようなバイシストロニック発現自己複製ベクターの例について図2(b)を参照しながら説明する。自己複製ベクター31は、NAMPTプロモーター配列4と、レポーター遺伝子5と、IRES7と、複製開始蛋白質遺伝子8と、転写終結シグナル配列6と、複製開始配列3とを含む。NAMPTプロモーター配列4と、レポーター遺伝子5と、IRES7と、複製開始蛋白質遺伝子8と、転写終結シグナル配列6とは、上流から下流に向けてこの順番で機能的に連結されている。IRES7は、内部リボソーム進入部位(internal ribosomal entry site)であり、バイシストロニック発現用配列の1例である。バイシストロニック発現配列の例は、例えば、脳心筋ウイルスの内部リボゾーム進入配列(配列番号12)などである。IRES7は、哺乳類細胞において、mRNAの5’末端キャップ構造に依存せずに、mRNAの内部にリボゾームを結合させて蛋白質の翻訳を開始させる塩基配列である。IRES7が2つの遺伝子の間に配置されることにより、バイシストロニックなmRNAが合成される。すなわち、IRES7が2つの遺伝子の間に組み込まれることで、この2つの遺伝子がコードする2種類の蛋白質を1つのmRNAで翻訳させることができる。この例を表8に示す。

Figure 2016101161
The self-replicating vector may be a bicistronic expression vector. In the bicistronic expression vector, by using the bicistronic expression sequence, the NAMPT promoter sequence 4 simultaneously controls the expression of two genes included downstream thereof, that is, the reporter gene and the replication initiation protein. The That is, in such a self-replicating vector, the reporter gene expression unit 2 and the replication initiating protein unit are expressed by being controlled by the same promoter. An example of such a bicistronic expression self-replicating vector will be described with reference to FIG. The self-replicating vector 31 includes a NAMPT promoter sequence 4, a reporter gene 5, an IRES 7, a replication initiation protein gene 8, a transcription termination signal sequence 6, and a replication initiation sequence 3. The NAMPT promoter sequence 4, the reporter gene 5, the IRES 7, the replication initiation protein gene 8, and the transcription termination signal sequence 6 are functionally linked in this order from upstream to downstream. IRES7 is an internal ribosomal entry site and is an example of a bicistronic expression sequence. An example of a bicistronic expression sequence is, for example, a brain myocardial virus internal ribosome entry sequence (SEQ ID NO: 12). IRES7 is a base sequence that initiates protein translation by binding a ribosome to the interior of mRNA without depending on the 5 ′ end cap structure of mRNA in mammalian cells. By placing IRES7 between the two genes, bicistronic mRNA is synthesized. That is, by incorporating IRES7 between two genes, two types of proteins encoded by these two genes can be translated into one mRNA. This example is shown in Table 8.
Figure 2016101161

IRES7の存在により、NAMPTプロモーター配列4により、レポーター遺伝子5の配列が転写され、それに続いて複製開始蛋白質遺伝子8が転写される。複製開始蛋白質遺伝子8の配列が読まれた後、転写終結シグナル配列6の存在により、転写は停止する。複製開始蛋白質遺伝子8から転写、翻訳されて産生する複製開始蛋白質は、複製開始配列3に結合し、自己複製ベクター31の複製が開始される。   Due to the presence of IRES7, the sequence of the reporter gene 5 is transcribed by the NAMPT promoter sequence 4, and subsequently, the replication initiation protein gene 8 is transcribed. After the sequence of the replication initiation protein gene 8 is read, the transcription is stopped by the presence of the transcription termination signal sequence 6. The replication initiator protein transcribed and translated from the replication initiator protein gene 8 is bound to the replication initiator sequence 3, and the replication of the self-replicating vector 31 is started.

このようなレポーターベクターから生じた検出可能な信号を検出することにより、NAMPTプロモーター配列の活性化を評価することが可能であり、それによりNAMP遺伝子の発現量を評価することが可能である。その結果に基づき、被検細胞の細胞特性を判定することが可能となる。   By detecting a detectable signal generated from such a reporter vector, it is possible to evaluate the activation of the NAMPT promoter sequence, and thereby the expression level of the NAMP gene can be evaluated. Based on the result, the cell characteristics of the test cell can be determined.

上記レポーターベクターにおいて、プロモーター活性とは、プロモーター配列の下流に機能的に接続された遺伝子の転写を誘導することを意味する。NAMPT遺伝子のプロモーター配列4がプロモーター活性を有する場合、そのプロモーター活性は、NAMPT遺伝子のプロモーター配列4の配列全体により由来するものであっても、NAMPT遺伝子のプロモーター配列4の一部分の配列に由来するものであってもよい。また例えば、NAMPT遺伝子のプロモーター配列4が最小プロモーターを含んでもよい。NAMPT遺伝子のプロモーター配列4のプロモーター活性化は、NAMPT遺伝子のプロモーター配列4上の一部分の配列に対する転写因子の結合の有無や被修飾塩基の修飾の状態によって制御される。   In the above reporter vector, promoter activity means inducing transcription of a gene functionally connected downstream of the promoter sequence. When the promoter sequence 4 of the NAMPT gene has promoter activity, the promoter activity is derived from the partial sequence of the promoter sequence 4 of the NAMPT gene, even if it is derived from the entire sequence of the promoter sequence 4 of the NAMPT gene It may be. For example, the promoter sequence 4 of the NAMPT gene may contain a minimal promoter. Promoter activation of the promoter sequence 4 of the NAMPT gene is controlled by the presence or absence of binding of a transcription factor to a partial sequence on the promoter sequence 4 of the NAMPT gene and the modification state of the base to be modified.

NAMPT遺伝子のプロモーター配列4は、被検細胞のゲノム上の一部分と同一性を有する配列である標的核酸配列を含む。従って、自己増幅するレポーターベクターの場合、自己増幅の間に、被検細胞が含む標的核酸配列中の官能基の置換の状況をエピジェニックな特性として、当該自己複製ベクターが、標的核酸配列中の塩基上に写し取る(即ち、コピーする)ことができる。即ち、NAMPTプロモーター配列の活性化は、標的核酸配列中の修飾可能な塩基における官能基、例えば、メチル基またはアセチル基の置換の有無または程度に依存して活性化されたり、不活性化されたりしてもよい。   The promoter sequence 4 of the NAMPT gene includes a target nucleic acid sequence that is a sequence having identity with a portion on the genome of the test cell. Therefore, in the case of a reporter vector that self-amplifies, the self-replicating vector contains the target nucleic acid sequence in the target nucleic acid sequence with the state of substitution of the functional group in the target nucleic acid sequence contained in the test cell as an epigenic characteristic during self-amplification. It can be copied (ie, copied) onto the base. That is, the activation of the NAMPT promoter sequence may be activated or deactivated depending on the presence or absence or degree of substitution of a functional group in a modifiable base in the target nucleic acid sequence, for example, a methyl group or an acetyl group. May be.

自己複製レポーターベクター31は、NAMPT遺伝子プロモーター4が活性化する条件下で、被検細胞内で自己複製を行うことが可能である。すなわち、NAMPTプロモーター4が活性化すると、IRES7の働きにより、レポーター遺伝子5と複製開始蛋白質遺伝子8は、バイシストロニックなmRNAとして転写され、当該mRNAの翻訳産物であるレポーター蛋白質と複製開始蛋白質が産生される。複製開始蛋白質は、自己複製型レポーターベクターの複製開始配列3に結合し、DNA複製に必要な蛋白質と結合することにより、当該レポーターベクターは自己複製する。   The self-replicating reporter vector 31 can self-replicate in the test cell under the condition that the NAMPT gene promoter 4 is activated. That is, when the NAMPT promoter 4 is activated, the reporter gene 5 and the replication initiation protein gene 8 are transcribed as bicistronic mRNA by the action of IRES7, and the reporter protein and the replication initiation protein which are translation products of the mRNA are produced. Is done. The replication initiator protein binds to the replication initiation sequence 3 of the self-replicating reporter vector, and binds to a protein necessary for DNA replication, so that the reporter vector self-replicates.

自己複製レポーターベクターは、自己複製が可能なベクターであればよく、例えば、プラスミドベクターであってもよい。このような自己複製型プラスミドベクターの例は、特開2013−42721などに開示されている。   The self-replicating reporter vector may be a vector capable of self-replication, and may be, for example, a plasmid vector. Examples of such self-replicating plasmid vectors are disclosed in JP2013-42721.

3−2.NAMPTプロモーター活性の検出
3−1に記載のレポーターベクターを用いて、被検細胞あるいは健常細胞におけるNAMPR遺伝子のプロモーター活性(即ち、NAMPTプロモーター活性)を検出する方法の1例を説明する。ここで、プロモーター活性の検出とは、プロモーター活性の有無の検出またはプロモーター活性化の量的測定であってもよい。
3-2. Detection of NAMPT Promoter Activity An example of a method for detecting the promoter activity of the NAMPR gene (ie, NAMPT promoter activity) in test cells or healthy cells using the reporter vector described in 3-1. Here, the detection of promoter activity may be detection of the presence or absence of promoter activity or quantitative measurement of promoter activation.

NAMPT遺伝子のプロモーター領域(配列番号1)を有するレポーターベクター1または自己増幅レポーターベクター21若しくは31を用意する(a)。次に、レポーターベクター1、21または31を、生きたままの被検細胞および健常細胞に導入する(b)。その後、細胞中でレポーターベクター1、21または31のレポーター遺伝子が発現する状態を維持する。レポーターベクター21または31を用いる場合は、細胞が分裂して増殖し得る培養条件、すなわちレポーターベクターの自己複製可能な状態に維持する(c)。このような状態において、細胞ゲノムのNAMPT遺伝子のプロモーター活性が、レポーターベクターのNAMPTプロモーター(配列番号1)の活性に反映される(d)。次に、NAMPTプロモーター活性の指標として、レポーター遺伝子から発現するレポーター蛋白質の量を測定する(e)。最後に、被検細胞と健常細胞とにおけるレポーター蛋白質の量を比較して、被検細胞におけるレポーター蛋白質の量が多い場合に、被検細胞が異常性を有する細胞、例えば、腫瘍細胞であると判定する(f)。このとき、健常細胞におけるNAMPTプロモーター活性、すなわち健常細胞へのレポーターベクターの導入、およびレポーター蛋白質発現量の測定は必ずしも必要ではない。例えば、健常細胞の平均的なNAMPTプロモーター活性を予め測定しておき、この数値を細胞特性評価における閾値に設定して、この閾値と被検細胞のNAMPTプロモーター活性とを比較することにより評価を行ってもよい。   A reporter vector 1 having a promoter region of the NAMPT gene (SEQ ID NO: 1) or a self-amplifying reporter vector 21 or 31 is prepared (a). Next, the reporter vector 1, 21, or 31 is introduced into living test cells and healthy cells (b). Thereafter, the state in which the reporter gene of the reporter vector 1, 21, or 31 is expressed in the cell is maintained. When the reporter vector 21 or 31 is used, it is maintained in a culture condition in which the cells can divide and grow, that is, in a state where the reporter vector can self-replicate (c). In such a state, the promoter activity of the NAMPT gene of the cell genome is reflected in the activity of the NAMPT promoter (SEQ ID NO: 1) of the reporter vector (d). Next, the amount of reporter protein expressed from the reporter gene is measured as an index of NAMPT promoter activity (e). Finally, when the amount of the reporter protein in the test cell and the healthy cell is compared, and the amount of the reporter protein in the test cell is large, the test cell is an abnormal cell, for example, a tumor cell Determine (f). At this time, NAMPT promoter activity in healthy cells, that is, introduction of a reporter vector into healthy cells and measurement of reporter protein expression level are not necessarily required. For example, the average NAMPT promoter activity of healthy cells is measured in advance, this value is set as a threshold value for cell characteristic evaluation, and the evaluation is performed by comparing this threshold value with the NAMPT promoter activity of the test cell. May be.

上述のNAMPTプロモーター活性の検出は、レポーター蛋白質の発現を検出または定量することにより可能である。レポーター蛋白質は、例えば、ルシフェラーゼ、β−ガラクトシダーゼ、一酸化窒素合成酵素、キサンチンオキシダーゼ、青色蛍光蛋白質、緑色蛍光蛋白質、赤色蛍光蛋白質および重金属結合蛋白質であってよい。選択されたレポーター蛋白質の種類に応じて、適切な検出および/または測定方法を選択することが可能である。   The NAMPT promoter activity described above can be detected by detecting or quantifying the expression of the reporter protein. The reporter protein may be, for example, luciferase, β-galactosidase, nitric oxide synthase, xanthine oxidase, blue fluorescent protein, green fluorescent protein, red fluorescent protein, and heavy metal binding protein. An appropriate detection and / or measurement method can be selected according to the type of the selected reporter protein.

以下に、レポーター蛋白質の検出例を挙げる。レポーター遺伝子が発光遺伝子、例えば、ルシフェラーゼ遺伝子の場合、被検細胞からルシフェラーゼ蛋白質を抽出して基質を加えた後に、ルミノメーターを用いて溶液の発光強度が測定され得る。レポーター遺伝子が蛍光蛋白質遺伝子の場合、例えば、被検細胞に特定波長の光を照射し、被検細胞内において蛍光蛋白質から発生される蛍光の強度が蛍光測定装置により測定され得る。あるいは、被検細胞から抽出した蛍光蛋白質を含む抽出液に特定波長の光を照射し、抽出液中の蛍光蛋白質から発生される蛍光の強度が蛍光測定装置により測定され得る。   Examples of reporter protein detection are given below. When the reporter gene is a luminescent gene, for example, a luciferase gene, the luminescence intensity of the solution can be measured using a luminometer after extracting the luciferase protein from the test cell and adding the substrate. When the reporter gene is a fluorescent protein gene, for example, the test cell can be irradiated with light of a specific wavelength, and the intensity of the fluorescence generated from the fluorescent protein in the test cell can be measured by a fluorometer. Alternatively, the extract containing the fluorescent protein extracted from the test cells can be irradiated with light of a specific wavelength, and the intensity of the fluorescence generated from the fluorescent protein in the extract can be measured by a fluorescence measuring device.

レポーター遺伝子がβ−ガラクトシダーゼ遺伝子の場合、β−ガラクトシダーゼ蛋白質を抽出して基質を加えた後に、吸光度測定装置を用いて溶液の吸光度が測定され得る。   When the reporter gene is a β-galactosidase gene, the absorbance of the solution can be measured using an absorbance measurement device after extracting the β-galactosidase protein and adding a substrate.

レポーター遺伝子として、活性酸素生成酵素遺伝子を使用してもよい。活性酸素生成酵素遺伝子は、活性酸素を生成する酵素をコードする遺伝子である。活性酸素生成酵素遺伝子としては、例えば、一酸化窒素合成酵素遺伝子やキサンチンオキシダーゼ遺伝子などが挙げられる。一酸化窒素合成酵素遺伝子の翻訳産物である一酸化窒素合成酵素、およびキサンチンオキシダーゼ遺伝子の翻訳産物であるキサンチンオキシダーゼは、活性酸素を生成する。活性酸素は、電子スピン共鳴装置(ESR装置)などで検出され得る。ESR装置による方法では、活性酸素の発生量が直接的に測定されてもよく、特異的なスピントラップ剤を利用して、それが測定されてもよい。スピントラップ剤を利用する場合、まず、活性酸素生成酵素をスピントラップ剤でトラップしてから、トラップされた活性酸素生成酵素から発生される活性酸素の発生量を測定する。   As the reporter gene, an active oxygen generating enzyme gene may be used. The active oxygen generating enzyme gene is a gene encoding an enzyme that generates active oxygen. Examples of the active oxygen generating enzyme gene include a nitric oxide synthase gene and a xanthine oxidase gene. Nitric oxide synthase, which is a translation product of the nitric oxide synthase gene, and xanthine oxidase, which is a translation product of the xanthine oxidase gene, generate active oxygen. Active oxygen can be detected by an electron spin resonance apparatus (ESR apparatus) or the like. In the method using the ESR apparatus, the amount of active oxygen generated may be measured directly, or it may be measured using a specific spin trap agent. When a spin trap agent is used, first, the active oxygen generating enzyme is trapped by the spin trap agent, and then the amount of active oxygen generated from the trapped active oxygen generating enzyme is measured.

レポーター遺伝子として、重金属結合蛋白質遺伝子を用いてもよい。重金属結合蛋白質遺伝子は、重金属に特異的に結合する蛋白質をコードする遺伝子である。重金属に結合された蛋白質の生成量は、磁気共鳴イメージング装置、核医学診断装置またはX線コンピュータ断層撮影装置により行われればよい。重金属結合蛋白質の発生量は、例えば、以下のように行われる。まず、測定可能な重金属を予め被検細胞の培養液に加える。次に、必要に応じて被検細胞を洗浄した後に、被検細胞から重金属結合蛋白質を抽出する。次に、抽出された重金属結合蛋白質を、培養液に加えた重金属に対応した画像診断装置で撮像し、重金属結合蛋白質の量を測定する。なお、重金属結合蛋白質は、被検細胞の内部で発現させてもよいし、被検細胞の外表面で発現させてもよい。重金属結合蛋白質遺伝子の例は、金属化合物結合ペプチドをコードする塩基配列であればよい。例えば、金属化合物結合蛋白質は、特定の金属化合物に対して特異的に結合するペプチド、オリゴペプチド、ポリペプチドおよび/または蛋白質であればよい。例えば、金属化合物を結合するペプチドをコードする配列は、所望の金属化合物と結合することが知られる抗体遺伝子や一本鎖抗体遺伝子の塩基配列を利用してもよく、そのような塩基配列に基づいてデザインすればよい。そのような塩基配列について、例えば、金属化合物との結合を維持する範囲での1つまたは幾つかの塩基の置換、欠失および付加などの修飾および/または改変、適用する対象に応じた修飾および/または改変することによりデザインしてもよい。一本鎖抗体ペプチドをコードする遺伝子は、金属化合物を結合する抗体のアミノ酸配列からデザインすることができる。例えば、MRI撮像では、造影効果が高いためにガドリニウム化合物が好ましく使用される。ガドリニウム化合物は、例えば、ガドリニウム、ガドリニウムイオン、ガドリニウム錯体、それらの塩およびそれらの誘導体、これらの何れかを含む誘導体、またはガドリニウム化合物の類似物などからなる金属化合物であればよい。また、細胞外に金属化合物結合能を提示するレポーター遺伝子であってもよい。そのようなレポーター遺伝子は、細胞外に提示される金属化合物結合ペプチドをコードする塩基配列であってよい。そのような塩基配列は、例えば、細胞において転写され、翻訳され、金属化合物結合ペプチドを産生し、産生された金属化合物結合ペプチドは、細胞膜に移動して、細胞外に金属化合物結合能を提示するように構成されていればよい。このようなレポーター遺伝子の例は、例えば、特開2012−200245に開示されている。   A heavy metal binding protein gene may be used as a reporter gene. The heavy metal binding protein gene is a gene encoding a protein that specifically binds to a heavy metal. The amount of protein bound to the heavy metal may be determined by a magnetic resonance imaging apparatus, a nuclear medicine diagnostic apparatus, or an X-ray computed tomography apparatus. The amount of heavy metal binding protein generated is, for example, as follows. First, a measurable heavy metal is added in advance to a culture solution of a test cell. Next, after washing the test cells as necessary, a heavy metal binding protein is extracted from the test cells. Next, the extracted heavy metal binding protein is imaged with an image diagnostic apparatus corresponding to the heavy metal added to the culture solution, and the amount of heavy metal binding protein is measured. The heavy metal binding protein may be expressed inside the test cell or may be expressed on the outer surface of the test cell. An example of the heavy metal binding protein gene may be a base sequence encoding a metal compound binding peptide. For example, the metal compound binding protein may be a peptide, oligopeptide, polypeptide and / or protein that specifically binds to a specific metal compound. For example, the sequence encoding a peptide that binds to a metal compound may utilize the base sequence of an antibody gene or single chain antibody gene known to bind to the desired metal compound, and based on such base sequence Design. For such base sequences, for example, modifications and / or alterations such as substitution, deletion and addition of one or several bases within the range that maintains the binding with the metal compound, modifications according to the target to be applied, and You may design by modifying. A gene encoding a single-chain antibody peptide can be designed from the amino acid sequence of an antibody that binds a metal compound. For example, in MRI imaging, a gadolinium compound is preferably used because of its high contrast effect. The gadolinium compound may be a metal compound including, for example, gadolinium, gadolinium ions, gadolinium complexes, salts and derivatives thereof, derivatives containing any of these, or analogs of gadolinium compounds. It may also be a reporter gene that presents a metal compound binding ability outside the cell. Such a reporter gene may be a base sequence encoding a metal compound-binding peptide that is presented extracellularly. Such a base sequence is, for example, transcribed and translated in a cell to produce a metal compound-binding peptide, and the produced metal compound-binding peptide moves to the cell membrane and presents a metal compound-binding ability outside the cell. What is necessary is just to be comprised. Examples of such a reporter gene are disclosed in, for example, Japanese Patent Application Laid-Open No. 2012-200245.

例えば、自己複製するレポーターベクターを用いて被検細胞の転移性を評価する方法は、レポーターベクターを準備することと、レポーターベクターを当該被検細胞に導入することと、複製開始蛋白質が発現されている条件下で、被検細胞を培養することと、被検細胞において発現されたレポーター蛋白質を検出することとを含めばよい。   For example, a method for evaluating the metastatic property of a test cell using a self-replicating reporter vector includes preparing a reporter vector, introducing a reporter vector into the test cell, and expressing a replication initiator protein. Culturing the test cell under a certain condition and detecting the reporter protein expressed in the test cell may be included.

3−3.レポーターベクターを用いた被検細胞の細胞特性評価キット
更なる実施の形態として、レポーターベクターを用いた被検細胞の細胞特性評価キットが提供されてもよい。それは、腫瘍細胞の細胞特性評価キットであってもよい。細胞特性評価キットは、上記3−1に記載のレポーターベクターのうち、少なくとも1種類のレポーターベクターおよび緩衝液を含んでもよい。また、細胞特性評価キットは、更に、レポーターベクターを担持する公知のキャリアおよび/またはレポーターベクターを収容する容器を含んでもよい。更に、細胞特性評価キットは、被検細胞、例えば、腫瘍細胞の細胞特性を評価する方法を行うために必要な何れかの試薬を含んでもよい。そのような試薬は、例えば、レポーター遺伝子から産生されるレポーター蛋白質の基質、賦形剤、安定剤および/または他の所望の効果を有する成分などを含んでもよい。これらの細胞特性評価キットは、容器に含まれて提供されてもよい。
3-3. Kit for evaluating cell characteristics of test cells using reporter vector As a further embodiment, a kit for evaluating cell characteristics of test cells using a reporter vector may be provided. It may be a cell characterization kit for tumor cells. The cell property evaluation kit may include at least one reporter vector and a buffer among the reporter vectors described in 3-1. The cell property evaluation kit may further include a known carrier carrying a reporter vector and / or a container containing the reporter vector. Furthermore, the cell property evaluation kit may include any reagent necessary for performing a method for evaluating the cell property of a test cell, for example, a tumor cell. Such reagents may include, for example, reporter protein substrates produced from the reporter gene, excipients, stabilizers and / or other components having the desired effect. These cell property evaluation kits may be provided in a container.

4.薬物のスクリーニング方法
NAMPT蛋白質の検出による被検細胞の細胞特性評価方法を利用して、被検細胞の転移などの異常を抑制する薬物をスクリーニングしてもよい。NAMPT蛋白質の検出による腫瘍細胞の異常、例えば、腫瘍細胞の転移などを抑制する薬物をスクリーニングしてもよい。例えば、スクリーニングされるべき薬物で処理した薬物処理細胞群と、薬物を処理しない病態細胞群とを用意し、これらの2つの細胞群についてそれぞれ細胞特性を評価し、得られた結果を比較すればよい。病態細胞群は、スクリーニングされるべき薬物によって治療されるべき異常性を有すればよい。このような病態細胞特性が、薬物処理により治療されたか否かを指標に薬物のスクリーニングを行えばよい。また、薬物処理細胞群および病態細胞群に加えて、正常細胞群を用意し、正常な細胞の細胞特性を評価してもよい。正常な細胞の細胞特性は、薬物のスクリーニングを行う際にコントロールとして使用してもよい。正常な細胞の細胞特性は、薬物のスクリーニングに並行して判定されてもよく、予め判定しておいてもよい。
4). Drug Screening Method A drug that suppresses abnormalities such as metastasis of a test cell may be screened using a method for evaluating cell characteristics of the test cell by detecting a NAMPT protein. Drugs that suppress tumor cell abnormalities, such as tumor cell metastasis, by detecting NAMPT protein may be screened. For example, if a drug-treated cell group treated with the drug to be screened and a pathological cell group not treated with the drug are prepared, cell characteristics are evaluated for each of these two cell groups, and the obtained results are compared. Good. The pathological cell group only needs to have an abnormality to be treated by the drug to be screened. Drug screening may be performed by using as an index whether such pathological cell characteristics have been treated by drug treatment. In addition to the drug-treated cell group and the pathological cell group, a normal cell group may be prepared and the cell characteristics of normal cells may be evaluated. The cellular properties of normal cells may be used as a control when performing drug screening. The cell characteristics of normal cells may be determined in parallel with drug screening, or may be determined in advance.

5.被検細胞の細胞特性評価装置
細胞特性評価装置は、遺伝子導入部、培養部、撮像部および判定部を備える。遺伝子導入部は、NAMPT遺伝子プロモーター配列を含むレポーターベクターを被検細胞の核内に導入するユニットである。培養部は、遺伝子導入部で処理され、即ち、遺伝子導入された被検細胞を培養するユニットである。撮像部は、培養部で培養された被検細胞について、明視野画像を撮像し、更に、その同じ視野について当該レポーター遺伝子の発現に由来して細胞毎に生じた発光信号からなる発光画像を撮像するユニットである。判定部は、明視野画像と発光画像とに基づいて被検細胞の細胞毎の細胞特性を判定するユニットである。
5. Cell characteristic evaluation apparatus for test cells The cell characteristic evaluation apparatus includes a gene introduction unit, a culture unit, an imaging unit, and a determination unit. The gene introduction unit is a unit that introduces a reporter vector containing a NAMPT gene promoter sequence into the nucleus of a test cell. The culture part is a unit that is processed by the gene introduction part, that is, a unit for culturing the test cell into which the gene has been introduced. The imaging unit captures a bright field image of the test cell cultured in the culture unit, and further captures a luminescence image composed of a luminescence signal generated for each cell derived from the expression of the reporter gene for the same field of view. Unit. The determination unit is a unit that determines cell characteristics of each cell of the test cell based on the bright field image and the light emission image.

更なる例においては、遺伝子導入部は、NAMPT遺伝子プロモーター配列を含むレポーターベクターを被検細胞の核内に導入するユニットである。培養部は、遺伝子導入部で処理され、即ち、遺伝子導入された被検細胞を培養するユニットである。撮像部は、培養部で培養された被検細胞について、レポーター遺伝子の発現に由来して細胞毎に生じた発光信号からなる発光画像を撮像するユニットである。判定部は、発光画像とに基づいて被検細胞の細胞毎の細胞特性を判定するユニットである。   In a further example, the gene introduction part is a unit for introducing a reporter vector containing a NAMPT gene promoter sequence into the nucleus of a test cell. The culture part is a unit that is processed by the gene introduction part, that is, a unit for culturing the test cell into which the gene has been introduced. The imaging unit is a unit that captures a luminescence image composed of a luminescence signal generated for each cell derived from the expression of the reporter gene for the test cells cultured in the culture unit. A determination part is a unit which determines the cell characteristic for every cell of a test cell based on a luminescence picture.

実施形態に従う被検細胞の細胞特性を判定する装置の1例について図3を用いて説明する。図3は、装置70の概略を示すブロック図である。装置70は、被検細胞の異常活性を検出し、それに基づいて被検細胞の細胞特性を評価する装置の1例である。   An example of an apparatus for determining cell characteristics of a test cell according to the embodiment will be described with reference to FIG. FIG. 3 is a block diagram showing an outline of the device 70. The apparatus 70 is an example of an apparatus that detects abnormal activity of a test cell and evaluates cell characteristics of the test cell based on the abnormal activity.

装置70は、細胞分離ユニット71と、DNA導入ユニット72と、測定ユニット73と、これらの下方に連続して配置されたステージ74とを含む。細胞分離ユニット71、DNA導入ユニット72および測定ユニット73は、1つのステージ74を共有し、このステージ74によって、この順番で連絡している。言い換えれば、ステージ74の上方に細胞分離ユニット71と、DNA導入ユニット72と、測定ユニット73とが上流から下流に向けてこの順番で配置される。   The apparatus 70 includes a cell separation unit 71, a DNA introduction unit 72, a measurement unit 73, and a stage 74 arranged continuously below these. The cell separation unit 71, the DNA introduction unit 72, and the measurement unit 73 share one stage 74, and communicate with each other in this order by this stage 74. In other words, the cell separation unit 71, the DNA introduction unit 72, and the measurement unit 73 are arranged above the stage 74 in this order from upstream to downstream.

細胞分離ユニット71は、対象から得た検体から、試験されるべき細胞、即ち、被検細胞を分離するための分離器75を含む。分離器75は、対象から得た検体を受ける受容器76aと、受容器76aで受け取った検体について消化などを行う処理器76bと、処理器76bで処理された処理済み検体から被検細胞を分離するための分離部77とを備える。受容器76aと処理器76bと分離部77は、互いに内径の異なる3つの中空の筒状体が上から下へと向けてこの順番で積み重なり、互いに液密に一体化されてなる。受容器76aと処理器76bと分離部77との各境界部は、弁により開閉可能に液絡されている。受容器76aは上部が開口したテーパのある筒状体であり、開閉可能な蓋を備える。受容器76aと処理器76bとの境界は、弁が液密に閉じる。この弁が閉じたときには、これは受容器76aの底となる。処理器76bは、受容器76aの下端と連続する筒状体である。受容器76aとの境界部の弁が液密に閉じたときには、処理器76bは有蓋となる。分離部77との境界部の弁が閉じたときには、処理器76bは有底となる。分離部77は、その内壁が処理器76bの内壁から液密に連続している筒状体であり、その下端には弁が設けられている。この弁が液密に閉じて、分離部77は有底となる。分離部77内部には、分離材が固定されている。装置70の使用時には、分離部77底の下方のステージ74上に、容器78が載置される。容器78は、分離された被検細胞79を含む試料を分離部77から受け取り、収容する容器78である。ここで、処理器76bは、その内部に含む検体に対して消化および生化学反応などの所望の処理を行う加熱および/または恒温機構を備えてもよい。また、分離材は、処理器76bからの下りてきた検体から、被検細胞を含む試料を分離、採取する部材であってもよく、または処理器76bからの下りてきた検体から、夾雑物を取り除く部材であってもよい。分離材は、分離部77の中心軸に交差する面に沿って広がり分離部77の内壁の円周に亘って固定されていてよい。分離材は、例えば、フィルター、メンブランおよび/または磁石などであってもよい。   The cell separation unit 71 includes a separator 75 for separating cells to be tested, that is, test cells, from a specimen obtained from a subject. The separator 75 separates a test cell from a receptor 76a that receives a sample obtained from a target, a processor 76b that digests the sample received by the receptor 76a, and a processed sample that has been processed by the processor 76b. And a separation unit 77. The receiving device 76a, the processing device 76b, and the separating portion 77 are formed in such a manner that three hollow cylindrical bodies having different inner diameters are stacked in this order from top to bottom, and are liquid-tightly integrated with each other. Each boundary portion between the receiving device 76a, the processing device 76b, and the separating portion 77 is liquid-tightly opened and closed by a valve. The receptacle 76a is a tapered cylindrical body having an open top and includes a lid that can be opened and closed. The valve is liquid tightly closed at the boundary between the receiver 76a and the processor 76b. When this valve is closed, it becomes the bottom of the receiver 76a. The processor 76b is a cylindrical body continuous with the lower end of the receiver 76a. When the valve at the boundary with the receiver 76a is liquid-tightly closed, the processor 76b is covered. When the valve at the boundary with the separation unit 77 is closed, the processor 76b is bottomed. The separation part 77 is a cylindrical body whose inner wall is liquid-tightly continuous from the inner wall of the processor 76b, and a valve is provided at the lower end thereof. The valve closes in a liquid-tight manner, and the separating portion 77 has a bottom. A separating material is fixed inside the separating portion 77. When the apparatus 70 is used, the container 78 is placed on the stage 74 below the bottom of the separation unit 77. The container 78 is a container 78 that receives and stores a sample including the separated test cell 79 from the separation unit 77. Here, the processor 76b may include a heating and / or thermostatic mechanism for performing a desired process such as digestion and biochemical reaction on the specimen contained therein. Further, the separation material may be a member that separates and collects a sample including the test cell from the sample that has fallen from the processing device 76b, or a contaminant from the sample that has fallen from the processing device 76b. It may be a member to be removed. The separating material may extend along a plane intersecting the central axis of the separating portion 77 and may be fixed over the circumference of the inner wall of the separating portion 77. The separating material may be, for example, a filter, a membrane, and / or a magnet.

分離器75で分離された被検細胞79を含む試料は、ステージ74上に載置された容器78に収容される。被検細胞を収容する容器78は、DNA導入ユニット72に送られる。   The sample including the test cell 79 separated by the separator 75 is accommodated in a container 78 placed on the stage 74. The container 78 that contains the test cells is sent to the DNA introduction unit 72.

DNA導入ユニット72は、容器78に収容された被検細胞に対してレポーターベクターを導入する制御部80と導入プローブ81とを備える。被検細胞へのレポーターベクターの導入はそれ自身公知の方法により行われてよい。制御部80と導入プローブ81は、選択された導入方法を達成するための何れかの導入機構を利用した装置であればよい。例えば、DNA導入ユニット72はエレクトロポレーションを行う装置であってもよい。その場合、制御部80はDNA導入器であり、導入プローブ81は電極プローブであり、これらによってエレクトロポレーターが構成されていてもよい。更に、DNA導入ユニット72は、レポーターベクターを含む試薬を容器78に供給するためのノズルを備えてもよい(図示せず)。更にDNA導入ユニット72は、ノズルに試薬を送るための送液システム、送液システムに試薬を供給するための試薬収納容器を備えてもよい(図示せず)。   The DNA introduction unit 72 includes a control unit 80 and an introduction probe 81 for introducing a reporter vector into a test cell accommodated in a container 78. Introduction of a reporter vector into a test cell may be performed by a method known per se. The controller 80 and the introduction probe 81 may be any device that uses any introduction mechanism for achieving the selected introduction method. For example, the DNA introduction unit 72 may be a device that performs electroporation. In that case, the controller 80 is a DNA introducer, the introduction probe 81 is an electrode probe, and an electroporator may be constituted by these. Further, the DNA introduction unit 72 may include a nozzle for supplying a reagent containing a reporter vector to the container 78 (not shown). Further, the DNA introduction unit 72 may include a liquid feeding system for sending the reagent to the nozzle and a reagent storage container for supplying the reagent to the liquid feeding system (not shown).

また、DNA導入ユニット72は、所定の時間に亘り、所定の培養条件下で容器78内の被検細胞79を培養する培養器として機能してもよい。DNA導入ユニット72の培養は、制御部80により制御されればよい。   Further, the DNA introduction unit 72 may function as an incubator for culturing the test cell 79 in the container 78 under a predetermined culture condition for a predetermined time. The culture of the DNA introduction unit 72 may be controlled by the control unit 80.

DNA導入ユニット72において、レポーターベクターが導入された被検細胞を含む容器78は、次に測定ユニット73に送られる。   In the DNA introduction unit 72, the container 78 containing the test cells into which the reporter vector has been introduced is then sent to the measurement unit 73.

測定ユニット73は、ステージ74の一部分を上部と下部とから覆う暗箱82と、暗箱82内部に配置された光源83と、光源83の下方のステージ面に開口する窓と、窓の下方に設置された対物レンズ87を取り付けられた撮像部88と、光源83および撮像部88に連絡している制御部85と、制御部85にそれぞれ連絡した表示部84および記憶部86とを備える。例えば、測定ユニット73の光源83、対物レンズ87および撮像部88は、CCDカメラまたはCMOSカメラなどを搭載した顕微鏡に含まれて設置されてもよい。また、制御部85、表示部84および記憶部86は、これらを備えたコンピュータであってもよい。   The measurement unit 73 is installed in a dark box 82 that covers a part of the stage 74 from above and below, a light source 83 disposed in the dark box 82, a window that opens on a stage surface below the light source 83, and a window below the window. The imaging unit 88 to which the objective lens 87 is attached, a control unit 85 communicating with the light source 83 and the imaging unit 88, and a display unit 84 and a storage unit 86 communicating with the control unit 85, respectively. For example, the light source 83, the objective lens 87, and the imaging unit 88 of the measurement unit 73 may be included in a microscope equipped with a CCD camera or a CMOS camera. Moreover, the control part 85, the display part 84, and the memory | storage part 86 may be a computer provided with these.

実施形態に従う被検細胞の細胞特性を評価する装置について図4を用いて説明する。図4は、図3に示した装置70のうち、ステージについての構成のみが異なる装置の例である。この装置70では、細胞分離ユニット71と、DNA導入ユニット72と、測定ユニット73と、これらのユニットのそれぞれの下方にそれぞれ配置されたステージ74a、74b、74cとを含む。このように図3の装置70は、ステージがそれぞれのユニットに対して設けられる。ユニット間、即ち、ステージ間の移動は、手動により行ってもよく、それぞれの移動をロボットアームなどによって自動で行ってもよい。   An apparatus for evaluating cell characteristics of test cells according to the embodiment will be described with reference to FIG. FIG. 4 is an example of an apparatus that differs from the apparatus 70 shown in FIG. 3 only in the configuration of the stage. The apparatus 70 includes a cell separation unit 71, a DNA introduction unit 72, a measurement unit 73, and stages 74a, 74b, and 74c disposed below the units. 3 is provided with a stage for each unit. Movement between the units, that is, between the stages may be performed manually, or each movement may be automatically performed by a robot arm or the like.

このような図3および4に示す装置70による細胞特性の評価の1例について図5を用いて説明する。まず、細胞分離ユニット71の分離部77下方のステージ74上に容器78を載置する。次に、上部開口から受容器76a内に、所望により予めミンスやホモジナイズなどの前処理がなされた検体を持ち込む。これと共に、処理器76bでの処理に必要な試薬が添加される。試薬の添加は、処理器76bに開閉可能に設けられた試薬添加口から行われてよい(S20)。受容器76aの蓋を閉め、処理器76bとの境界の弁を開く。予め設定された条件に従って処理器76b内で消化処理が行われる。処理器76bは予め設定された条件を満たす環境を作り出すための温度調節器を備えてよい(S21)。次に、処理器76bと分離部77との境界の弁か解放され、処理器76b内で処理された検体が分離部77内部に送られる。分離部77の分離材を通過することにより、検体に含まれる夾雑物が除去される(S22)。分離された被検細胞を含む試料は容器78に送られて収容される。ここで、分離材を通過するのに先駆けて処理器76b内で進められた反応を止めるための反応停止試薬が検体に対して添加されてもよい。この添加は、予め分離部77内に反応停止試薬を収容されていてもよく、そのような試薬を添加するための開閉可能な試薬添加口が分離器75の何れかの位置の壁面に設けられていてもよい(S23)。   One example of the evaluation of cell characteristics by the apparatus 70 shown in FIGS. 3 and 4 will be described with reference to FIG. First, the container 78 is placed on the stage 74 below the separation unit 77 of the cell separation unit 71. Next, a sample that has been pretreated with mince, homogenization, or the like as needed is brought into the receiver 76a from the upper opening. Along with this, reagents necessary for processing in the processor 76b are added. The addition of the reagent may be performed from a reagent addition port provided in the processor 76b so as to be opened and closed (S20). The lid of the receiver 76a is closed and the valve at the boundary with the processor 76b is opened. Digestion processing is performed in the processor 76b in accordance with preset conditions. The processor 76b may include a temperature controller for creating an environment that satisfies a preset condition (S21). Next, the valve at the boundary between the processor 76 b and the separation unit 77 is released, and the specimen processed in the processor 76 b is sent into the separation unit 77. By passing through the separation material of the separation unit 77, impurities contained in the specimen are removed (S22). The sample containing the separated test cells is sent to the container 78 and stored therein. Here, prior to passing through the separation material, a reaction stopping reagent for stopping the reaction advanced in the processor 76b may be added to the specimen. In this addition, a reaction stopping reagent may be stored in the separation unit 77 in advance, and an openable and closable reagent addition port for adding such a reagent is provided on the wall surface at any position of the separator 75. (S23).

被検細胞79を含む試料を収容したままで、容器78は、DNA導入ユニット72に送られる(S24)。DNA導入ユニット72のノズルからレポーターベクターを含む試薬が容器78に添加される。導入プローブ81を容器78内の試料に接触させ、制御部80からの制御によりレポーターベクターが被検細胞79に導入される(S25)。制御部80の制御下で被検細胞79は、所定の時間に亘り、所定の培養条件下で培養される(S26)。   The container 78 is sent to the DNA introduction unit 72 while containing the sample including the test cell 79 (S24). A reagent containing a reporter vector is added to the container 78 from the nozzle of the DNA introduction unit 72. The introduction probe 81 is brought into contact with the sample in the container 78, and the reporter vector is introduced into the test cell 79 under the control of the control unit 80 (S25). Under the control of the control unit 80, the test cell 79 is cultured under a predetermined culture condition for a predetermined time (S26).

その後、容器78は測定ユニット73に送られる。測定ユニット73では、容器78に収容された被検細胞79におけるレポーター蛋白質量を測定する。測定ユニット73における全ての手続きは、予め記憶部86に格納されたプログラムおよび複数の情報が纏められたテーブルに従って制御部85が制御する。例えば、光源83からの光照射、照射時間および照射間隔などの照射条件の制御、撮像部88による撮像および撮像条件の制御、撮像された画像についての画像処理および画像処理などが測定ユニット73により制御される。また、細胞特性の判定についても、予め記憶部86に格納されたプログラムに沿って、画像と細胞特性とを対応付けした情報を含むテーブルを参照して、制御部85が行う。   Thereafter, the container 78 is sent to the measurement unit 73. In the measurement unit 73, the amount of reporter protein in the test cell 79 accommodated in the container 78 is measured. All procedures in the measurement unit 73 are controlled by the control unit 85 in accordance with a table preliminarily stored in the storage unit 86 and a table in which a plurality of pieces of information are collected. For example, the measurement unit 73 controls irradiation conditions such as light irradiation from the light source 83, irradiation time and irradiation interval, imaging and imaging condition control by the imaging unit 88, image processing and image processing for the captured image, and the like. Is done. The determination of cell characteristics is also performed by the control unit 85 with reference to a table including information in which images and cell characteristics are associated with each other in accordance with a program stored in the storage unit 86 in advance.

DNA導入ユニット72における被検細胞の培養の後、容器78は測定ユニット73に送られる。その後、光源83からの光が容器78内に照射される。容器78を通過した光は、対物レンズ87で集められ、その光から撮像部88は任意に明視野画像を得る。その後、暗箱82内において、被検細胞に導入されたレポーター蛋白質からの光学的な信号(ここでは、1例としての発光)を、対物レンズ87を通して、撮像部88によって撮像する。光源83の光照射を止め、被検細胞からの発光が対物レンズ87で集められ、その光から撮像部88が発光画像を得る(S27)。撮像部88により得られた任意の明視野画像および発光画像は、制御部85により画像処理されて任意に重ね合わされて(マージされて)表示部84に表示される。制御部85では、画像の表示部84への表示と同時または表示と前後して、明視野画像および発光画像と、記憶部86に格納されたテーブルとに基づいて、被検細胞の細胞特性を判定する。この判定の結果は、マージされた画像と共に表示部84に示される(S28)。   After culturing the test cells in the DNA introduction unit 72, the container 78 is sent to the measurement unit 73. Thereafter, the light from the light source 83 is irradiated into the container 78. The light that has passed through the container 78 is collected by the objective lens 87, and the imaging unit 88 arbitrarily obtains a bright field image from the light. Thereafter, in the dark box 82, an optical signal (here, light emission as an example) from the reporter protein introduced into the test cell is imaged by the imaging unit 88 through the objective lens 87. Light emission from the light source 83 is stopped, light emission from the subject cell is collected by the objective lens 87, and the imaging unit 88 obtains a light emission image from the light (S27). Arbitrary bright field images and light emission images obtained by the imaging unit 88 are subjected to image processing by the control unit 85 and arbitrarily superimposed (merged) and displayed on the display unit 84. In the control unit 85, the cell characteristics of the test cell are determined based on the bright field image and the luminescent image and the table stored in the storage unit 86 at the same time as or before and after the display of the image on the display unit 84. judge. The result of this determination is displayed on the display unit 84 together with the merged image (S28).

ここでは、レポーター蛋白質からの光学的な信号として発光が生じる例を示したが、発光とは異なるレポーター蛋白質が生じる検出な可能な信号についても、撮像部88を構成する検出装置を交換することにより同様に測定することが可能である。   Here, an example in which light emission occurs as an optical signal from the reporter protein is shown, but for a detectable signal in which a reporter protein different from the light emission is generated, the detection device that constitutes the imaging unit 88 is replaced. It is possible to measure similarly.

またここで、図には示さないが、測定ユニット73は、電算的処理および画像処理などを行う処理部あるいは特性判定を行う解析部を更に備えてもよい。これらの処理部および解析部が、上述では制御部85が行っている電算的処理および画像処理、並びに特性判定を行ってもよい。   Here, although not shown in the figure, the measurement unit 73 may further include a processing unit that performs a computer process and an image process or an analysis unit that performs characteristic determination. These processing units and analysis units may perform the computer processing, image processing, and characteristic determination performed by the control unit 85 in the above description.

上記実施形態では、被検細胞の培養をDNA導入ユニット72が行う例を示したが、被検細胞の培養は、測定ユニット73において行ってもよい。その場合、装置70が更に細胞培養を可能にする部材を備えればよい。或いは、DNA導入ユニット72と測定ユニット73と両方において、被検細胞が培養されてもよい。   In the above embodiment, the DNA introduction unit 72 performs the culture of the test cell. However, the test cell may be cultured in the measurement unit 73. In that case, the apparatus 70 may further include a member that enables cell culture. Alternatively, the test cells may be cultured in both the DNA introduction unit 72 and the measurement unit 73.

装置70の各ユニットの動きを制御するために各ユニットがそれぞれに制御部を備えてもよく、装置70に含まれる全てのユニットが1つの制御部、例えば、制御部85により行われてもよい。また、ステージ74上に載置された容器78のユニット間の移動は、ステージ74に搭載された容器移動機構により行ってもよい。そのような機構は、例えば、装置70に備えられ、装置70に備えられた制御部により動きを制御されたロボットアームによって行われてもよい。或いは、ステージ74にベルトコンベアが取り付けられていてもよい。   In order to control the movement of each unit of the device 70, each unit may be provided with a control unit, and all the units included in the device 70 may be performed by one control unit, for example, the control unit 85. . Further, the movement between the units of the container 78 placed on the stage 74 may be performed by a container moving mechanism mounted on the stage 74. Such a mechanism may be performed by, for example, a robot arm that is provided in the device 70 and whose movement is controlled by a control unit provided in the device 70. Alternatively, a belt conveyor may be attached to the stage 74.

また、容器78へのレポーターベクターの添加は、容器78がDNA導入ユニット72の所定の位置に送られる以前の何れかの時期に行われてもよい。その場合、装置70は、レポーターベクター添加機構をDNA導入ユニット72よりも上流の所望の位置に更に備えればよい。   The reporter vector may be added to the container 78 at any time before the container 78 is sent to a predetermined position of the DNA introduction unit 72. In that case, the apparatus 70 may further include a reporter vector addition mechanism at a desired position upstream from the DNA introduction unit 72.

このような装置によって、被検細胞の細胞特性が評価される。この装置によれば、より高い精度で被検細胞の細胞特性を評価することが可能である。また、検査をスループットで行うことが可能であるので、簡便に検査を行うことが可能であり、試料の取り違えやコンタミネーションを防ぐことが可能である。   With such an apparatus, the cell characteristics of the test cells are evaluated. According to this apparatus, it is possible to evaluate the cell characteristics of the test cell with higher accuracy. In addition, since inspection can be performed with a throughput, it is possible to easily perform inspection, and it is possible to prevent sample mix-up and contamination.

また、明視野画像に基づいて、被検細胞の形態学的特徴を得て、レポーターベクターからの情報と共に被検細胞の細胞特性が評価されてもよい。形態学的特徴は、例えば、被検細胞の面積、被検細胞の面積に対する核の面積の比率、被検細胞の長径に対する短径の比率、被検細胞における核の数または被検細胞の辺縁部の特徴、例えば、辺縁部のコントラスト比などであってもよい。これらは、非侵襲性光学的撮像方法によって得られる。例えば、ハイパースペクトルイメージング法、位相差顕微法または微分干渉法などによってこれらの情報を得てもよい。   Further, morphological characteristics of the test cell may be obtained based on the bright field image, and the cell characteristics of the test cell may be evaluated together with information from the reporter vector. Morphological characteristics include, for example, the area of the test cell, the ratio of the area of the nucleus to the area of the test cell, the ratio of the short diameter to the long diameter of the test cell, the number of nuclei in the test cell or the side of the test cell It may be a feature of the edge, for example, a contrast ratio of the edge. These are obtained by non-invasive optical imaging methods. For example, these pieces of information may be obtained by hyperspectral imaging, phase contrast microscopy, differential interference, or the like.

例えば、明視野で形態学的観察を行う場合、近赤外領域の波長を有する光を照射して行うことが好ましい。例えば、近赤外領域の波長を有する光は、700nm〜750nmの波長を有する近赤外光または350nm〜1050nmのマルチスペクトル光が好ましい。例えば、被検細胞に対して近赤外領域の波長の光を照射し、その光の反射または吸収、例えば、反射率または吸収率を指標に被検細胞の形態学的情報を得ればよい。   For example, when morphological observation is performed in a bright field, it is preferable to perform irradiation with light having a wavelength in the near infrared region. For example, the light having a wavelength in the near infrared region is preferably near infrared light having a wavelength of 700 nm to 750 nm or multispectral light of 350 nm to 1050 nm. For example, the test cell may be irradiated with light having a wavelength in the near-infrared region, and the reflection or absorption of the light, for example, the morphological information of the test cell may be obtained using the reflectance or absorption rate as an index .

例えば、被検細胞の転移性が高い場合には、細胞形態が紡錘形などのアスペクト比が高い細胞形態をしている傾向がある。例えば、そのような被検細胞の形態学的情報についても、測定ユニット73において取得すればよい。その場合についても、測定ユニット73は、予め記憶部86に格納されたプログラムおよび複数の情報が纏められたテーブルに従う制御部85により制御されればよい。テーブルには、レポーターベクターからの検出可能な信号と細胞特性との関係についての情報が含まれる他、更に、被検細胞の形態学的特徴と細胞特性との関係、検出可能な信号と細胞特性と形態学的特徴との関係を示す情報が含まれればよい。また、例えば、光源83からの光照射、照射時間および照射間隔などの照射条件の制御、撮像部88による撮像および撮像条件の制御、撮像された画像についての画像処理および画像処理などが測定ユニット73により制御される。また、細胞特性の評価は、予め記憶部86に格納されたプログラムに沿って、形態学的特徴とレポーターベクターからの情報と細胞特性とを対応付けした情報を含むテーブルを参照して、制御部85が行えばよい。このようにプロモーター活性と形態的特徴との複数の側面から被検細胞の細胞特性を評価することにより、より正確な結果を出すことが可能である。   For example, when the test cell has a high metastatic property, the cell shape tends to be a cell shape having a high aspect ratio such as a spindle shape. For example, such morphological information of the test cell may be acquired in the measurement unit 73. Also in that case, the measurement unit 73 may be controlled by the control unit 85 according to a table in which a program stored in the storage unit 86 and a plurality of pieces of information are collected. The table contains information about the relationship between the detectable signal from the reporter vector and the cell characteristics, as well as the relationship between the morphological characteristics and cell characteristics of the test cell, the detectable signal and the cell characteristics. It is only necessary to include information indicating the relationship between and the morphological features. In addition, for example, the measurement unit 73 controls irradiation conditions such as light irradiation from the light source 83, irradiation time and irradiation interval, imaging and imaging condition control by the imaging unit 88, image processing and image processing on the captured image, and the like. Controlled by In addition, the evaluation of the cell characteristics is performed by referring to a table including information in which morphological characteristics, information from the reporter vector, and cell characteristics are associated with each other in accordance with a program stored in the storage unit 86 in advance. 85 may be performed. Thus, it is possible to obtain a more accurate result by evaluating the cell characteristics of the test cell from a plurality of aspects of promoter activity and morphological characteristics.

[例]
被検細胞の細胞特性を評価する方法の1つの例として、腫瘍細胞株の転移性を評価した。即ち、被検細胞の1例として腫瘍細胞株を用いた。細胞特性の1例として転移性を観察した。
[Example]
As one example of a method for evaluating the cell characteristics of the test cells, the metastasis of tumor cell lines was evaluated. That is, a tumor cell line was used as an example of the test cell. Metastatic property was observed as an example of cell characteristics.

例1.免疫染色(NAMPT蛋白質の検出)による腫瘍細胞株の転移性評価
転移性の評価には、ヒト乳腺腫瘍由来の細胞株として、高転移性細胞株であるBT−549およびMDA−MB−231、並びに低転移性細胞株であるMCF−7およびT47−Dを用いた。これらの細胞株を8ウェルチャンバースライド(Thermo Scientific)に播種し、37℃、5%CO雰囲気下で培養した。8ウェルチャンバースライドから培地を取り除き、細胞をリン酸生理緩衝液(PBS)で洗浄した。その後、4%パラホルムアルデヒド溶液を加えて室温に20分間インキュベートして細胞を固定化した。パラホルムアルデヒド溶液を取り除き、PBSで洗浄後、0.2%のTritonX−100含有PBSを加え、室温に10分間インキュベートして膜透過処理を行った。TritonX−100含有PBSを取り除き、PBSで洗浄後、Image−IT FX signal enhancer(Life Technologies)を加えて室温に30分間インキュベートしてブロッキング処理を行った。Image−IT FX signal enhancerを取り除き、PBSで洗浄した。その後、500倍希釈したウサギ抗NAMPTポリクローナル抗体(ab45890、Abcam)を含むCan Get Signal(TOYOBO)を加えて4℃に一晩インキュベートした。抗体溶液を取り除き、PBSで洗浄後、2000倍希釈したAlexa546標識ヤギ抗ウサギ抗体を加えて室温に30分間インキュベートした。抗体溶液を取り除き、PBSで洗浄後、DAPI溶液を加えて室温に1分間インキュベートして細胞核を染色した。PBSで洗浄後、Prolonged Gold Antifade Reagent(Life Technologies)により染色細胞をスライドグラスに封入した。染色細胞の蛍光像は、顕微鏡Axio Imager 2(Carl Zeiss)で観察して写真を撮影した。Alexa546の蛍光は、励起波長:550nm、蛍光波長:605nmのフィルターセットで観察した。DAPIの蛍光は、励起波長:320nm、蛍光波長:490nmのフィルターセットで観察した。染色細胞の蛍光画像を図6に示した。
Example 1. Evaluation of metastasis of tumor cell lines by immunostaining (detection of NAMPT protein) For evaluation of metastasis, cell lines derived from human mammary tumors, BT-549 and MDA-MB-231, which are highly metastatic cell lines, and Low metastatic cell lines MCF-7 and T47-D were used. These cell lines were seeded on 8-well chamber slides (Thermo Scientific) and cultured at 37 ° C. in a 5% CO 2 atmosphere. The medium was removed from the 8-well chamber slide, and the cells were washed with phosphate physiological buffer (PBS). Thereafter, 4% paraformaldehyde solution was added and incubated at room temperature for 20 minutes to immobilize the cells. After removing the paraformaldehyde solution and washing with PBS, 0.2% Triton X-100-containing PBS was added and incubated at room temperature for 10 minutes for membrane permeabilization. TritonX-100-containing PBS was removed, and after washing with PBS, Image-IT FX signal enhancer (Life Technologies) was added and incubated at room temperature for 30 minutes for blocking treatment. The Image-IT FX signal enhancer was removed and washed with PBS. Thereafter, Can Get Signal (TOYOBO) containing a rabbit anti-NAMPT polyclonal antibody (ab45890, Abcam) diluted 500 times was added and incubated overnight at 4 ° C. The antibody solution was removed, washed with PBS, Alexa546-labeled goat anti-rabbit antibody diluted 2000 times was added, and incubated at room temperature for 30 minutes. After removing the antibody solution and washing with PBS, the DAPI solution was added and incubated at room temperature for 1 minute to stain cell nuclei. After washing with PBS, the stained cells were encapsulated in a slide glass with Prolonged Gold Anti-Reagent (Life Technologies). The fluorescent image of the stained cells was observed with a microscope Axio Imager 2 (Carl Zeiss) and photographed. The fluorescence of Alexa 546 was observed with a filter set having an excitation wavelength of 550 nm and a fluorescence wavelength of 605 nm. The fluorescence of DAPI was observed with a filter set having an excitation wavelength of 320 nm and a fluorescence wavelength of 490 nm. The fluorescence image of the stained cells is shown in FIG.

試験に供した乳腺腫瘍由来細胞株の全てが、抗Nampt蛋白質で蛍光染色された。高転移性細胞株:BT−549およびMDA−MB−231では、低転移性細胞株:MCF−7およびT47−Dよりも強い染色シグナルが検出された。即ち、高転移性細胞株は、Nampt蛋白質を高発現していた。この結果から、同蛋白質量を指標とした腫瘍細胞の細胞特性の1例としての転移性の評価が可能であることが示された。   All breast tumor-derived cell lines subjected to the test were fluorescently stained with anti-Nampt protein. In the highly metastatic cell lines: BT-549 and MDA-MB-231, a stronger staining signal was detected than in the low metastatic cell lines: MCF-7 and T47-D. That is, the highly metastatic cell line highly expressed Nampt protein. From this result, it was shown that the metastatic property as an example of the cell characteristics of tumor cells can be evaluated using the same protein amount as an index.

例2.逆転写PCR(NAMPTmRNAの検出)による腫瘍細胞株の転移特性評価
(1)乳腺腫瘍細胞株
実験には、ヒト乳腺腫瘍由来の細胞株として、高転移性細胞株であるMDA−MB−231およびBT−549、低転移性細胞株であるMCF−7およびT47−D、並びに良性腫瘍細胞株であるMCF−10Aを用いた。これらの細胞株を24ウェルプレートに播種し、37℃、5%CO雰囲気下で培養した。細胞株からRNeasy Mini Kit(Qiagen)により全RNAを抽出し、RT−PCR(逆転写PCR)によりNampt mRNA(Nampt遺伝子から転写されたmRNA)を検出した。
Example 2. Evaluation of Metastasis Characteristics of Tumor Cell Lines by Reverse Transcription PCR (Detection of NAMPT mRNA) (1) Breast Tumor Cell Lines For cell lines derived from human mammary tumors, MDA-MB-231 and BT, which are highly metastatic cell lines, were used. -549, low metastatic cell lines MCF-7 and T47-D, and benign tumor cell line MCF-10A. These cell lines were seeded in 24-well plates and cultured at 37 ° C. in a 5% CO 2 atmosphere. Total RNA was extracted from the cell line by RNeasy Mini Kit (Qiagen), and Nampt mRNA (mRNA transcribed from Nampt gene) was detected by RT-PCR (reverse transcription PCR).

上述の全RNAから、SuperScript VILO cDNA Synthesisi Kit(Life Technologies)を用いた逆転写反応によりcDNAを合成した。その後、下記プライマーセットを用いたPCRでNampt mRNAを増幅した。   From the above-mentioned total RNA, cDNA was synthesized by a reverse transcription reaction using SuperScript VILO cDNA Synthesis Kit (Life Technologies). Thereafter, Nampt mRNA was amplified by PCR using the following primer set.

Forward primer;5’−ACCTTACAAGAGATTGTAG−3’ (配列番号2)
Reverse primer;5’−TATGGAGAAGATCCTGACC−3’ (配列番号3)
PCR終了後、増幅産物を0.8%アガロースゲルで電気泳動し、エチジウムブロマイドでゲルを染色した。UV照射下でゲル中のPCR増幅産物を可視化して写真を撮影した(図7)。ここで、上記撮影により得られた写真は、何れもバックが黒であり、バンドが白く抜けたものである。その画像をそのまま図面に示すとバンドが見えにくい。バンドをより見やすくするために、上記撮影により得られた写真をコンピュータに取り込み、画像加工ソフトを用いて、バンド強度および他のデータとの相対性を損なわないように白黒色を反転したイメージを示した。NAMPTmRNAは、試験に供した乳腺腫瘍由来細胞株の全てで検出された。高転移性細胞株であるMDA−MB−231およびBT−549では、低転移性細胞株であるMCF−7およびT47−D並びに良性腫瘍細胞株であるMCF−10Aよりも強いNAMPTmRNAの増幅シグナルが検出された。即ち、高転移性細胞株はNAMPTmRNAを高発現していた。この結果から、NAMPTのmRNA量を指標として、被検細胞の1例である腫瘍細胞について、その細胞特性の1例である転移性を評価することが可能であることが示された。
Forward primer; 5′-ACCCTTACAAGAGATTGTAG-3 ′ (SEQ ID NO: 2)
Reverse primer; 5′-TATGGAGAAGATCCTGACC-3 ′ (SEQ ID NO: 3)
After completion of PCR, the amplified product was electrophoresed on a 0.8% agarose gel, and the gel was stained with ethidium bromide. A photo was taken by visualizing the PCR amplification product in the gel under UV irradiation (FIG. 7). Here, all the photographs obtained by the above photographing have black backgrounds and white bands. If the image is shown in the drawing as it is, the band is difficult to see. In order to make the band easier to see, the image obtained by the above shooting is taken into a computer, and the image processing software is used to show an image with black and white colors reversed so as not to impair the band intensity and relativeness with other data. It was. NAMPT mRNA was detected in all breast tumor-derived cell lines subjected to the test. The highly metastatic cell lines MDA-MB-231 and BT-549 have a stronger amplification signal of NAMPT mRNA than the low metastatic cell lines MCF-7 and T47-D and the benign tumor cell line MCF-10A. was detected. That is, the highly metastatic cell line highly expressed NAMPT mRNA. From this result, it was shown that metastasis, which is an example of the cell characteristics, of a tumor cell, which is an example of a test cell, can be evaluated using the amount of NAMPT mRNA as an index.

(2)肺腫瘍細胞株
実験には、肺腫瘍由来の細胞株として、基底上皮腺肺癌細胞株であるA−549、および扁平上皮肺癌細胞株であるLUDLU−1を用いた。これらの細胞株から、上記例(1)と同様の方法で、全RNAを抽出してRT−PCRでNAMPTmRNAを検出した。PCRのプライマーには、配列番号2と3に記載のプライマーセットを用いた。
(2) Lung tumor cell line In the experiment, A-549, which is a basal epithelial lung cancer cell line, and LUDLU-1, which is a squamous lung cancer cell line, were used as a lung tumor-derived cell line. Total RNA was extracted from these cell lines in the same manner as in Example (1) above, and NAMPT mRNA was detected by RT-PCR. The primer sets described in SEQ ID NOs: 2 and 3 were used as PCR primers.

PCR終了後、増幅産物を0.8%アガロースゲルで電気泳動し、エチジウムブロマイドでゲルを染色した。UV照射下でゲル中のPCR増幅産物を可視化して写真を撮影した(図8)。ここで、上記撮影により得られた写真は、何れもバックが黒であり、バンドが白く抜けたものである。その画像をそのまま図面に示すとバンドが見えにくい。バンドをより見やすくするために、上記撮影により得られた写真をコンピュータに取り込み、画像加工ソフトを用いて、バンド強度および他のデータとの相対性を損なわないように白黒色を反転したイメージを示した。NAMPTmRNAは、基底上皮腺肺癌細胞株であるA−549、扁平上皮肺癌細胞株であるLUCLU−1の何れの細胞株においても検出された。また、低転移性細胞株であるA−549ではNAMPTmRNA量が少ないことが明らかになった。   After completion of PCR, the amplified product was electrophoresed on a 0.8% agarose gel, and the gel was stained with ethidium bromide. A photo was taken by visualizing the PCR amplification product in the gel under UV irradiation (FIG. 8). Here, all the photographs obtained by the above photographing have black backgrounds and white bands. If the image is shown in the drawing as it is, the band is difficult to see. In order to make the band easier to see, the image obtained by the above shooting is taken into a computer, and the image processing software is used to show an image with black and white colors reversed so as not to impair the band intensity and relativeness with other data. It was. NAMPT mRNA was detected in any cell line of A-549, a basal epithelial lung cancer cell line, and LUCLU-1, a squamous lung cancer cell line. Further, it was revealed that A-549, which is a low metastatic cell line, has a small amount of NAMPT mRNA.

例3.レポータージーンアッセイ(NAMPTプロモーター活性の検出)による腫瘍細胞の転移性評価
(1)乳癌細胞株
(a)レポーターベクターの構築
ニコチンアミドホスホリボシル転移酵素(Nampt)遺伝子のプロモーター領域(−2426〜+276bp、配列番号1)を組込んだレポーターベクターを作製した。Nampt遺伝子のプロモーター領域は、ヒトのゲノムを鋳型にPCRで増幅した。PCRは、PrimeStar GLX DNA polymerase(TaKaRa BIO)を用いておこなった。PCRに用いたプライマー配列を以下に示す。
Example 3 Evaluation of tumor cell metastasis by reporter gene assay (detection of NAMPT promoter activity) (1) Breast cancer cell line (a) Construction of reporter vector Promoter region of nicotinamide phosphoribosyltransferase (Nampt) gene (−2426 to +276 bp, SEQ ID NO: A reporter vector incorporating 1) was prepared. The promoter region of the Nampt gene was amplified by PCR using a human genome as a template. PCR was performed using PrimeStar GLX DNA polymerase (TaKaRa BIO). The primer sequences used for PCR are shown below.

Forward primer;5’−GGGACGCGTCCATGTTGCCCAGGCTGGTCTCA−3’(配列番号4)
Reverse primer;5’−CGGCTCGAGAGCTCCCTGGCGCGGCTGCGAGGAA−3’(配列番号5)
PCRで得たプロモーター配列を、PGV−B2(TOYO B−Net)に組込んでレポーターベクター:pNampt−Lを作製した。PGV−B2は、ルシフェラーゼ遺伝子(レポーター遺伝子)と転写終結シグナル配列とを上流から下流に向けてこの順番で備えるベクターである。具体的には、PGV−B2のルシフェラーゼ遺伝子の上流に、PCRで増幅したプロモーター配列であるCK19プロモーター領域を組込み、レポーターベクター:pNampt−Lを作製した(図9)。
Forward primer; 5′-GGGACGCGTCCATGTTGCCCAGCTGGTCTCA-3 ′ (SEQ ID NO: 4)
Reverse primer; 5′-CGGCTCGAGAGCTCCCTGGCGCGCGCTGCAGGAA-3 ′ (SEQ ID NO: 5)
The promoter sequence obtained by PCR was incorporated into PGV-B2 (TOYO B-Net) to prepare a reporter vector: pNampt-L. PGV-B2 is a vector comprising a luciferase gene (reporter gene) and a transcription termination signal sequence in this order from upstream to downstream. Specifically, a CK19 promoter region, which is a promoter sequence amplified by PCR, was incorporated upstream of the PGV-B2 luciferase gene to prepare a reporter vector: pNampt-L (FIG. 9).

細胞株ごとのレポーターベクターの導入効率の補正用ベクターには、pNLuc−tkを使用した。pNLuc−tkは、pRL−tk(Promega)のヒト・ヘルペスウイルスのチミジンキナーゼ(tk)遺伝子プロモーターを、pNL1.1(Promega)のNanoLuc遺伝子の上流に組込むことにより作製した。   PNLuc-tk was used as a vector for correcting the introduction efficiency of the reporter vector for each cell line. pNLuc-tk was prepared by incorporating the human herpesvirus thymidine kinase (tk) gene promoter of pRL-tk (Promega) upstream of the NanoLuc gene of pNL1.1 (Promega).

(b)リポフェクション(細胞へのレポーターDNA導入)
40μlのOpti−MEM(Life Technologies)に、0.15μgのレポーターベクター:pNampt−Lと0.05μgの導入効率補正用ベクター:pNLuc−tkを加えた。その後、0.2μgのエンハンサー試薬(Plus reagent、Life Technologies)を加えて室温に5分間インキュベートした。この溶液に、0.7μlのLipofectamine LTX(Life Technologies)を加えてよく縣濁し、室温に25分間インキュベートした。溶液を48ウェルプレートに移し、2.0mlのヒト乳腺腫瘍に由来する5種類の細胞縣濁液(MDA−MB−231、BT−549、MCF−7、T−47DおよびMCF−10A)を加えて穏やかに混合した。その後、37℃、5%CO雰囲気のインキュベータ内で細胞を培養した。
(B) Lipofection (introduction of reporter DNA into cells)
To 40 μl of Opti-MEM (Life Technologies), 0.15 μg of a reporter vector: pNampt-L and 0.05 μg of a vector for correcting introduction efficiency: pNLuc-tk were added. Thereafter, 0.2 μg of enhancer reagent (Plus reagent, Life Technologies) was added and incubated at room temperature for 5 minutes. To this solution, 0.7 μl of Lipofectamine LTX (Life Technologies) was added and well suspended, and incubated at room temperature for 25 minutes. Transfer the solution to a 48-well plate and add 2.0 ml of 5 cell suspensions derived from human mammary tumors (MDA-MB-231, BT-549, MCF-7, T-47D and MCF-10A) And gently mixed. Thereafter, the cells were cultured in an incubator at 37 ° C. and 5% CO 2 atmosphere.

(c)レポータージーンアッセイ
上記例3(b)のリポフェクションから72時間後、48ウェルプレートから培養液を取り除き、PBSで洗浄した。その後、150μlの細胞溶解液(Glo−Lysis Buffer)(Promega)を加えて−80℃に30分以上静置して凍結した。使用時には、細胞溶解液を室温で解凍した後、溶解液を遠心チューブに回収し、遠心により細胞残渣を沈殿させた。上清を新しいサンプルチューブに回収し、上清25μlを96ウェル・プレート(Nunc)に分注した。ウェルに等量のLuciferase基質溶液(One−Glo Luciferase Assay System、Promega)、またはNanoLuc基質溶液(Nano−Glo Luciferase Assay System)(Promega)を加えた後、ルミノメーター(Mithras LB940、Berthold)で発光強度を測定した。それにより、pNampt−Lの活性、および導入効率補正用レポーターDNA:pNLuc−tkの活性を測定した。pNampt−Lの相対発光強度は、同レポーターDNAの活性値(発光強度:RLU)をpNLuc−tkの活性値(発光強度)で除算した値とした。結果を図10に示した。高転移性細胞株であるBT−549は、低転移性細胞株であるMCF−7およびT47−D、並びに良性腫瘍細胞株であるMCF−10Aよりも強い発光強度(RLU)を示した。すなわち、高転移性細胞株はNAMPTプロモーター活性が高いことが明らかになった。これにより、NAMPTプロモーター活性を指標として、被検細胞の1例である腫瘍細胞について、細胞特性の1例である転移性を評価することが可能であることが示された。
(C) Reporter gene assay 72 hours after the lipofection in Example 3 (b) above, the culture solution was removed from the 48-well plate and washed with PBS. Thereafter, 150 μl of cell lysate (Glo-Lysis Buffer) (Promega) was added, and the mixture was allowed to stand at −80 ° C. for 30 minutes or more and frozen. At the time of use, after thawing the cell lysate at room temperature, the lysate was collected in a centrifuge tube, and cell debris was precipitated by centrifugation. The supernatant was collected in a new sample tube, and 25 μl of the supernatant was dispensed into a 96-well plate (Nunc). After adding an equal amount of Luciferase substrate solution (One-Glo Luciferase Assay System, Promega) or NanoLuc substrate solution (Nano-Glo Luciferase Assay System) (Promega) to L, 40 μm, L Was measured. Thereby, the activity of pNampt-L and the activity of reporter DNA for correcting the introduction efficiency: pNLuc-tk were measured. The relative luminescence intensity of pNampt-L was a value obtained by dividing the activity value (luminescence intensity: RLU) of the reporter DNA by the activity value (luminescence intensity) of pNLuc-tk. The results are shown in FIG. BT-549, a highly metastatic cell line, showed stronger luminescence intensity (RLU) than MCF-7 and T47-D, which are low metastatic cell lines, and MCF-10A, which is a benign tumor cell line. That is, it was revealed that the highly metastatic cell line has high NAMPT promoter activity. Thus, it was shown that metastasis, which is an example of cell characteristics, can be evaluated for tumor cells, which are examples of test cells, using NAMPT promoter activity as an index.

(2)肺癌細胞株
(a)レポーターベクター
上記例3(1)(a)に記載のpNampt−Lを用いて以下の実験を行った。
(2) Lung cancer cell line (a) Reporter vector The following experiment was conducted using pNampt-L described in Example 3 (1) (a) above.

(b)リポフェクション(細胞へのレポーターDNA導入)
ヒト肺癌に由来する2種類の細胞株であるA−549およびLUDLU−1に、上記例3(1)(b)と同様のリポフェクション法により、細胞内にpNampt−Lを導入した。
(B) Lipofection (introduction of reporter DNA into cells)
Into two types of cell lines derived from human lung cancer, A-549 and LUDLU-1, pNampt-L was introduced into the cells by the same lipofection method as in Example 3 (1) (b) above.

(c)レポータージーンアッセイ
上記例3(1)(c)と同様に、細胞溶解液を調整した。その後、遠心で細胞残渣を沈殿させて上清25μlを96ウェル・プレート(Nunc)に分注し、等量のLuciferase基質溶液(One−Glo Luciferase Assay System, Promega)、またはNanoLuc基質溶液(Nano−Glo Luciferase Assay System)(Promega)を加えて、ルミノメーター(Mithras LB940,Berthold)で発光強度を測定した。pNampt−Lの相対発光強度は、同レポーターDNAの活性値(発光強度)をpNLuc−tkの活性値(発光強度)で除算した値とした。結果を図11に示した。基底上皮腺肺癌細胞株であるA−549、扁平上皮肺癌細胞株であるLUCLU−1の何れの細胞株も発光を示された。即ち、両細胞株からNAMPTプロモーター活性が検出された。また、低転移性細胞株であるA−549ではNAMPTプロモーター活性が低いことが明らかになった。
(C) Reporter gene assay A cell lysate was prepared in the same manner as in Example 3 (1) (c) above. Thereafter, cell debris is precipitated by centrifugation, and 25 μl of the supernatant is dispensed into a 96-well plate (Nunc), and an equal amount of Luciferase substrate solution (One-Glo Luciferase Assay System, Promega) or NanoLuc substrate solution (Nano- Glo Luciferase Assay System (Promega) was added, and the luminescence intensity was measured with a luminometer (Mithras LB940, Berthold). The relative luminescence intensity of pNampt-L was obtained by dividing the activity value (luminescence intensity) of the reporter DNA by the activity value (luminescence intensity) of pNLuc-tk. The results are shown in FIG. Both A-549, a basal epithelial lung cancer cell line, and LUCLU-1, a squamous lung cancer cell line, showed luminescence. That is, NAMPT promoter activity was detected from both cell lines. Further, it was revealed that A-549, which is a low metastatic cell line, has low NAMPT promoter activity.

例4.細胞発光イメージングによる転移性乳癌細胞株の検出
(1)レポーターベクター
上記例3(1)で作製したレポーターベクター:pNampt−Lを実験に使用した。
Example 4 Detection of metastatic breast cancer cell line by cell luminescence imaging (1) Reporter vector The reporter vector prepared in Example 3 (1): pNampt-L was used in the experiment.

(2)リポフェクション(細胞へのレポーターDNA導入)
500μlのOpti−MEM(Life Technologies)に、2.5μgのレポーターベクター:pNampt−Lと2.5μgのエンハンサー試薬(Plus reagent、Life Technologies)を加えた。これを室温に5分間インキュベートした。この溶液に、6.25μlのLipofectamine LTX(Life Technologies)を加えてよく縣濁した。その後、室温に25分間インキュベートした。溶液を35mm培養ディッシュに移し、ヒト乳腺腫瘍由来の高転移性悪性腫瘍細胞株であるBT−549、低転移性悪性腫瘍細胞株であるMCF−7およびヒト乳腺腫瘍由来の良性腫瘍細胞株であるMCF−10Aの縣濁液2.0mlをそれぞれ加えて穏やかに混合した。その後、37℃、5%CO雰囲気のインキュベータ内で細胞をそれぞれ培養した。
(2) Lipofection (introduction of reporter DNA into cells)
To 500 μl of Opti-MEM (Life Technologies), 2.5 μg of reporter vector: pNampt-L and 2.5 μg of enhancer reagent (Plus reagent, Life Technologies) were added. This was incubated at room temperature for 5 minutes. To this solution, 6.25 μl of Lipofectamine LTX (Life Technologies) was added and well suspended. Thereafter, it was incubated at room temperature for 25 minutes. The solution was transferred to a 35 mm culture dish, and BT-549, a high metastatic malignant tumor cell line derived from human breast tumor, MCF-7, a low metastatic malignant tumor cell line, and a benign tumor cell line derived from human mammary tumor Each 2.0 ml of MCF-10A suspension was added and gently mixed. Thereafter, the cells were cultured in an incubator at 37 ° C. and 5% CO 2 atmosphere.

(3)発光イメージング
レポーターベクター導入細胞株の発光イメージングは、LUMINOVIEW発光イメージングシステム(LV200、Olympus)で行った。リポフェクションから24時間後、pNampt−Lを導入したBT−549、MCF−7、およびMCF−10Aの培地に発光基質VivoGlo luciferin(Promega)を添加した(最終濃度200μM)。培養ディッシュをLUMINOVIEWの所定の位置にセットし、明視野と暗視野(発光)で細胞の顕微鏡画像(×20倍)を撮影した。暗視野での撮影は、露光時間(発光検出時間)20分間でおこなった。発光イメージングの結果を図12に示した。図12には、明視野画像と暗視野画像(発光画像)を重ね合わせ画像を示した。画像の重ね合わせは、画像処理ソフトウェアMETAMORPHでおこなった。高転移性悪性腫瘍細胞BT−549では、強く発光する細胞が観察された(図12(a)、BT−549)。低転移性腫瘍細胞MCF−7では発光細胞が観察されたが(図12(b)、MCF−7)、その発光は弱かった。また、良性腫瘍細胞MCF−10Aでは、発光細胞は観察されなかった(図12(c)、MCF−10A)。
(3) Luminescence Imaging Luminescence imaging of a reporter vector-introduced cell line was performed with a LUMINOWEW luminescence imaging system (LV200, Olympus). 24 hours after lipofection, the luminescent substrate VivoGloluciferin (Promega) was added to the medium of BT-549, MCF-7, and MCF-10A into which pNampt-L was introduced (final concentration 200 μM). The culture dish was set at a predetermined position of LUMINOWEW, and microscopic images (× 20 times) of the cells were taken in bright field and dark field (luminescence). The shooting in the dark field was performed with an exposure time (light emission detection time) of 20 minutes. The results of luminescence imaging are shown in FIG. FIG. 12 shows a superimposed image of a bright field image and a dark field image (light emission image). Image superposition was performed with image processing software METAMORPH. Strongly luminescent cells were observed in the highly metastatic malignant tumor cell BT-549 (FIG. 12 (a), BT-549). Luminescent cells were observed in the low-metastatic tumor cell MCF-7 (FIG. 12 (b), MCF-7), but the luminescence was weak. In addition, no luminescent cells were observed in the benign tumor cell MCF-10A (FIG. 12 (c), MCF-10A).

これらの実施形態または実施例によれば、細胞特性を評価するための新たな技術を提供することができる。   According to these embodiments or examples, a new technique for evaluating cell characteristics can be provided.

本発明のいくつかの実施形態を説明したが、これらの実施形態は、例として提示したものであり、発明の範囲を限定することは意図していない。これら新規な実施形態は、その他の様々な形態で実施されることが可能であり、発明の要旨を逸脱しない範囲で、種々の省略、置き換え、変更を行うことができる。これら実施形態やその変形は、発明の範囲や要旨に含まれるとともに、特許請求の範囲に記載された発明とその均等の範囲に含まれる。   Although several embodiments of the present invention have been described, these embodiments are presented by way of example and are not intended to limit the scope of the invention. These novel embodiments can be implemented in various other forms, and various omissions, replacements, and changes can be made without departing from the scope of the invention. These embodiments and modifications thereof are included in the scope and gist of the invention, and are included in the invention described in the claims and the equivalents thereof.

Claims (27)

被検細胞の細胞特性を評価するための遺伝子マーカーであって、前記遺伝子マーカーが、NAMPT遺伝子のmRNA、ペプチド若しくは蛋白質、またはNAMPT遺伝子プロモーター配列を含むポリヌクレオチドであることを特徴とする遺伝子マーカー。   A gene marker for evaluating cell characteristics of a test cell, wherein the gene marker is a mRNA containing a NAMPT gene mRNA, peptide or protein, or a NAMPT gene promoter sequence. 前記被検細胞が上皮性腫瘍であることを特徴とする請求項1に記載の遺伝子マーカー。   The genetic marker according to claim 1, wherein the test cell is an epithelial tumor. 前記被検細胞が、乳腺組織由来または肺組織由来の腫瘍細胞であることを特徴とする請求項1に記載の遺伝子マーカー。   The genetic marker according to claim 1, wherein the test cell is a tumor cell derived from a mammary gland tissue or a lung tissue. 被検細胞におけるNAMPT遺伝子の発現レベルを指標とすることを特徴とする被検細胞の細胞特性を評価する方法。   A method for evaluating cell characteristics of a test cell, characterized by using the expression level of the NAMPT gene in the test cell as an index. 前記被検細胞が上皮性腫瘍であることを特徴とする請求項4に記載の方法。   The method according to claim 4, wherein the test cell is an epithelial tumor. 前記被検細胞が、乳腺組織由来または肺組織由来の腫瘍細胞であることを特徴とする請求項4に記載の方法。   The method according to claim 4, wherein the test cells are tumor cells derived from mammary gland tissue or lung tissue. 前記NAMPT遺伝子の発現レベルを指標とすることが、
前記被検細胞におけるNAMPT遺伝子の発現量を測定すること、
測定された前記被検細胞の発現量と閾値とを比較すること、
前記比較の結果に基づいて、前記被検細胞におけるNAMPT遺伝子の発現の程度を判定すること、および
前記判定に基づいて前記被検細胞の細胞特性を評価すること
を含むことを特徴とする請求項4〜6の何れか1項に記載の方法。
Using the expression level of the NAMPT gene as an index,
Measuring the expression level of the NAMPT gene in the test cell;
Comparing the measured expression level of the test cells with a threshold value;
The method includes: determining a degree of expression of a NAMPT gene in the test cell based on the comparison result; and evaluating cell characteristics of the test cell based on the determination. The method according to any one of 4 to 6.
前記閾値は、健常細胞からのNAMPT遺伝子の発現量に基づいて定められることを特徴とする請求項7に記載の方法。   The method according to claim 7, wherein the threshold is determined based on an expression level of a NAMPT gene from healthy cells. 前記健常細胞からのNAMPT遺伝子の発現量は、
当該被検細胞の発現量の測定に先駆けて、当該健常細胞においてNAMPT遺伝子の発現量を測定することにより得られる、
当該被検細胞の発現量の測定の後に、当該健常細胞においてNAMPT遺伝子の発現量を測定することにより得られる、または
当該被検細胞の発現量の測定に並行して、当該健常細胞においてNAMPT遺伝子の発現量を測定することにより得られることを特徴とする請求項8に記載の方法。
The expression level of the NAMPT gene from the healthy cells is
Obtained by measuring the expression level of the NAMPT gene in the healthy cells prior to the measurement of the expression level of the test cells,
Obtained by measuring the expression level of the NAMPT gene in the healthy cells after the measurement of the expression level of the test cells, or in parallel with the measurement of the expression level of the test cells, The method according to claim 8, wherein the method is obtained by measuring the expression level of.
前記NAMPT遺伝子の発現量の測定が、NAMPT蛋白質量、NAMPTmRNA量またはNAMPT遺伝子プロモーター活性量を測定することにより行われることを特徴とする請求項7〜9の何れか1項に記載の方法。   The method according to any one of claims 7 to 9, wherein the expression level of the NAMPT gene is measured by measuring a NAMPT protein mass, a NAMPT mRNA level, or a NAMPT gene promoter activity level. 前記NAMPT蛋白質量の測定が、抗NAMPT抗体を用いた免疫学的測定法により行われることを特徴とする請求項10に記載の方法。   The method according to claim 10, wherein the measurement of the amount of NAMPT protein is performed by an immunological assay using an anti-NAMPT antibody. 前記免疫学的測定法が、酵素免疫法(EIA)、蛍光免疫法(FIA)、細胞自動解析分離装置(FACS)、免疫細胞染色法(ICC)または免疫組織染色法(IHC)であることを特徴とする請求項11に記載の方法。   The immunological measurement method is enzyme immunization (EIA), fluorescence immunization (FIA), automatic cell analysis / separation device (FACS), immune cell staining (ICC) or immunohistochemical staining (IHC) The method of claim 11, wherein the method is characterized in that: 前記NAMPTmRNA量の測定が、逆転写PCR法により行われることを特徴とする請求項10に記載の方法。   The method according to claim 10, wherein the measurement of the amount of NAMPT mRNA is performed by a reverse transcription PCR method. 前記逆転写PCR法において、配列番号2またはその相補配列で示される第1のプライマーと、配列番号3またはその相補配列で示される第2のプライマーとを含むプライマーセットを用いて増幅反応を行うことを特徴とする請求項13に記載の方法。   In the reverse transcription PCR method, an amplification reaction is carried out using a primer set comprising a first primer represented by SEQ ID NO: 2 or a complementary sequence thereof and a second primer represented by SEQ ID NO: 3 or a complementary sequence thereof The method according to claim 13. 前記NAMPT遺伝子プロモーター活性量の測定が、NAMPT遺伝子プロモーター配列を含むレポーターベクターを用いて行われることを特徴とする請求項10に記載の方法。   The method according to claim 10, wherein the measurement of the NAMPT gene promoter activity is performed using a reporter vector containing a NAMPT gene promoter sequence. 前記レポーターベクターがレポーター遺伝子発現ユニットを含み、
前記レポーター遺伝子発現ユニットは、
(A−a)NAMPT遺伝子の5’上流プロモーター配列;
(A−b)前記プロモーター配列の下流に機能的に連結された検出可能なレポーター蛋白質をコードするレポーター遺伝子;および
(A−c)前記レポーター遺伝子の下流に機能的に連結された転写終結シグナル配列;
を含むことを特徴とする請求項15に記載の方法。
The reporter vector comprises a reporter gene expression unit;
The reporter gene expression unit is
(Aa) the 5 ′ upstream promoter sequence of the NAMPT gene;
(Ab) a reporter gene encoding a detectable reporter protein operably linked downstream of the promoter sequence; and (Ac) a transcription termination signal sequence operably linked downstream of the reporter gene. ;
The method according to claim 15, comprising:
前記レポーターベクターが、更に、前記レポーター遺伝子発現ユニットと同一核酸上に連結された複製開始ユニットを含み、前記複製開始ユニットは、
(B)複製開始蛋白質の結合によって当該レポーターベクターの自己複製を開始する複製開始配列;
を含み、前記NAMPT遺伝子の発現量の測定が、
(1)前記レポーターベクターを準備することと;
(2)前記レポーターベクターを当該被検細胞に導入することと:
(3)当該複製開始蛋白質が発現されている条件下で、前記被検細胞を培養することと:
(4)前記被検細胞において発現された前記レポーター蛋白質を検出することと:
を含む請求項16に記載の方法。
The reporter vector further comprises a replication initiation unit linked on the same nucleic acid as the reporter gene expression unit, the replication initiation unit comprising:
(B) a replication initiation sequence that initiates self-replication of the reporter vector upon binding of a replication initiator protein;
Measuring the expression level of the NAMPT gene,
(1) preparing the reporter vector;
(2) introducing the reporter vector into the test cell;
(3) culturing the test cell under conditions where the replication initiation protein is expressed:
(4) detecting the reporter protein expressed in the test cell;
The method of claim 16 comprising:
被検細胞の細胞特性を評価するためのレポーターベクターであって、前記レポーターベクターは、レポーター遺伝子発現ユニットを含み、前記レポーター遺伝子発現ユニットは、
(A−a)NAMPT遺伝子の5’上流プロモーター配列;
(A−b)前記プロモーター配列の下流に機能的に連結された検出可能なレポーター蛋白質をコードするレポーター遺伝子;および
(A−c)前記レポーター遺伝子の下流に機能的に連結された転写終結シグナル配列;
を含むことを特徴とするレポーターベクター。
A reporter vector for evaluating cell characteristics of a test cell, wherein the reporter vector includes a reporter gene expression unit, and the reporter gene expression unit comprises:
(Aa) the 5 ′ upstream promoter sequence of the NAMPT gene;
(Ab) a reporter gene encoding a detectable reporter protein operably linked downstream of the promoter sequence; and (Ac) a transcription termination signal sequence operably linked downstream of the reporter gene. ;
A reporter vector comprising:
前記レポーターベクターが、更に、前記レポーター遺伝子発現ユニットと同一核酸上に連結された複製開始ユニットと複製開始蛋白質ユニットとを含み、前記複製開始ユニットは、
(B)複製開始蛋白質の結合によって当該レポーターベクターの自己複製を開始する複製開始配列;
を含み、前記複製開始蛋白質ユニットは、
(C−a)前記レポーター遺伝子の下流に機能的に連結されたIRES配列;および
(C−b)前記IRES配列の下流に機能的に連結された複製開始蛋白質をコードする複製開始蛋白質遺伝子;
を含み、
前記転写終結シグナル配列(A−c)が、前記複製開始蛋白質遺伝子(C−b)の下流に機能的に連結されていることを特徴とする請求項18に記載のレポーターベクター。
The reporter vector further comprises a replication initiation unit and a replication initiation protein unit linked on the same nucleic acid as the reporter gene expression unit, and the replication initiation unit comprises:
(B) a replication initiation sequence that initiates self-replication of the reporter vector upon binding of a replication initiator protein;
The replication initiator protein unit comprises:
(Ca) an IRES sequence operably linked downstream of the reporter gene; and (Cb) a replication initiator protein gene encoding a replication initiator protein operably linked downstream of the IRES sequence;
Including
19. The reporter vector according to claim 18, wherein the transcription termination signal sequence (Ac) is operably linked downstream of the replication initiation protein gene (CB).
前記IRES配列が、脳心筋炎ウイルスのIRES配列であることを特徴とする請求項18に記載のレポーターベクター。   The reporter vector according to claim 18, wherein the IRES sequence is an encephalomyocarditis virus IRES sequence. 前記レポーターベクターが、更に、前記レポーター遺伝子発現ユニットと同一核酸上に連結された複製開始ユニットと複製開始蛋白質ユニットとを含み、前記複製開始ユニットは、
(B)複製開始蛋白質の結合によって当該レポーターベクターの自己複製を開始する複製開始配列;
を含み、前記複製開始蛋白質ユニットは、
(D−a)構成的に発現する構成的プロモーター;
(D−b)前記構成的プロモーターの下流に機能的に連結された前記複製開始蛋白質をコードする複製開始蛋白質遺伝子;および
(D−c)前記複製開始蛋白質遺伝子の下流に機能的に連結された更なる転写終結シグナル配列;
を含むことを特徴とする請求項18に記載のレポーターベクター。
The reporter vector further comprises a replication initiation unit and a replication initiation protein unit linked on the same nucleic acid as the reporter gene expression unit, and the replication initiation unit comprises:
(B) a replication initiation sequence that initiates self-replication of the reporter vector upon binding of a replication initiator protein;
The replication initiator protein unit comprises:
(Da) a constitutive promoter that is constitutively expressed;
(Db) a replication initiator protein gene encoding the replication initiator protein operably linked downstream of the constitutive promoter; and (Dc) operably linked downstream of the replication initiator protein gene. A further transcription termination signal sequence;
The reporter vector according to claim 18, comprising:
前記複製開始蛋白質遺伝子がシミアン・ウイルス40のラージT抗原遺伝子であり、前記複製開始配列がシミアン・ウイルス40の複製開始配列であることを特徴とする請求項19または21の何れか1項に記載のレポーターベクター。   The replication origin protein gene is a large T antigen gene of simian virus 40, and the replication initiation sequence is a replication initiation sequence of simian virus 40. Reporter vector. 前記NAMPT遺伝子の5’上流プロモーター配列が、配列番号1で示される配列を含む請求項18〜22の何れか1項に記載のレポーターベクター。   The reporter vector according to any one of claims 18 to 22, wherein the 5 'upstream promoter sequence of the NAMPT gene comprises a sequence represented by SEQ ID NO: 1. 前記レポーター遺伝子が、発光遺伝子、蛍光遺伝子、発色遺伝子、重金属結合遺伝子または一酸化窒素合成遺伝子である請求項18〜23の何れか1項に記載のレポーターベクター。   The reporter vector according to any one of claims 18 to 23, wherein the reporter gene is a luminescent gene, a fluorescent gene, a chromogenic gene, a heavy metal binding gene, or a nitric oxide synthesis gene. 被検細胞の細胞特性を評価するためのプライマーセットであって、配列番号2またはその相補配列で示される第1のプライマーと、配列番号3またはその相補配列で示される第2のプライマーとを含むプライマーセット。   A primer set for evaluating the cell characteristics of a test cell, comprising a first primer represented by SEQ ID NO: 2 or a complementary sequence thereof, and a second primer represented by SEQ ID NO: 3 or a complementary sequence thereof Primer set. 被検細胞の細胞特性を評価するためのアッセイキットであって、
(1)請求項18〜24の何れか1項に記載のレポーターベクターおよび緩衝液;または
(2)請求項25に記載のプライマーセットおよび緩衝液;
を含むことを特徴とするアッセイキット。
An assay kit for evaluating cell characteristics of a test cell,
(1) The reporter vector and buffer according to any one of claims 18 to 24; or (2) the primer set and buffer according to claim 25;
An assay kit comprising:
(1)NAMPT遺伝子プロモーター配列を含むレポーターベクターを、被検細胞の核内に導入する遺伝子導入部と、
(2)前記遺伝子導入部で処理された前記被検細胞を培養する培養部と、
(3)前記培養部で培養された前記被検細胞について明視野画像を撮像し、更に、その同じ視野について当該レポーター遺伝子の発現に由来して細胞毎に生じた発光信号からなる発光画像を撮像する撮像部と、
(4)前記明視野画像と前記発光画像とに基づいて当該被検細胞の細胞毎の細胞特性を判定する判定部と
を具備する細胞特性評価装置。
(1) a gene introduction part for introducing a reporter vector containing a NAMPT gene promoter sequence into the nucleus of a test cell;
(2) a culture unit for culturing the test cells treated in the gene introduction unit;
(3) Taking a bright field image of the test cell cultured in the culture section, and further taking a luminescence image consisting of a luminescence signal generated for each cell from the expression of the reporter gene in the same field An imaging unit to
(4) A cell characteristic evaluation apparatus comprising: a determination unit that determines cell characteristics of each cell of the subject cell based on the bright field image and the light emission image.
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