JP2015519058A - 亜科eサルアデノウイルスa1302、a1320、a1331及びa1337ならびにそれらの使用 - Google Patents
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Abstract
Description
本明細書とともに電子形態で出願される配列表資料は、引用することによりその内容が本明細書の内容となる。このファイルは“UPN_Y6334PCT_ST25.txt”と標識され、2013年5月17日に作成され、3,085,687バイト(2.94MB)である。
アデノウイルスは、約36キロベース(kb)のゲノムサイズの二本鎖DNAウイルスであり、多様な標的組織において高度に有効な遺伝子導入を達成するその能力及び大きな導入遺伝子容量の故に、遺伝子導入用途のために広く用いられてきた。通常、アデノウイルスのE1遺伝子を欠失させ、選ばれるプロモーター、問題の遺伝子のcDNA配列及びポリAシグナルから成る導入遺伝子カセットで置き換え、複製欠損組換えウイルスを得る。
6つの新規な亜科Eサルアデノウイルスの単離された核酸配列及びアミノ酸配列ならびにこれらの配列を含有するベクターを本明細書で提供する。本発明のベクター及び細胞を使用するための複数の方法も提供する。これらのアデノウイルスはSAdV−A1302、SAdV−A1320、SAdV−A1331及びSAdV−A1337を含む。
すべてチンパンジーの排泄物から単離されたサルアデノウイルス、SAdV−A1302、SAdV−A1320、SAdV−A1331及びSAdV−A1337からの新規な核酸及びアミノ酸配列を提供する。
、組換えアデノ−関連ウイルス(AAV)ベクターの作製に必要な必須(essential)ヘルパー機能を与えることにおいて有用である。かくしてそのような作製方法においてこれらの配列を使用するヘルパー構築物、方法及び細胞系を提供する。
クレオチド配列を比較することができる。Fastaは、クエリー及びサーチ配列(query and search sequences)の間の最大の重なりの領域の整列及びパーセント配列同一性を与える。例えば引用することによりその記載事項が本明細書の内容となるGCG Version 6.1に与えられるようなそのデフォルトパラメーター(6のワードサイズ(word size)及びスコアリングマトリックスに関するNOPAM因子)を有するFastaを用いて、核酸配列の間のパーセント配列同一性を決定することができる。類似して、アミノ酸整列を行うためのプログラムが入手可能である。一般にこれらのプログラムはデフォルト設定で用いられるが、当該技術分野における熟練者はこれらの設定を必要通りに変えることができる。あるいはまた、当該技術分野における熟練者は、少なくとも言及されたアルゴリズム及びプログラムにより与えられるレベルのような同一性又は整列のレベルを与える別のアルゴリズム及びコンピュータープログラムを用いることができる。
」という用語は、他の成分、要素、整数、段階などを排除する。
本発明は、サルアデノウイルスSAdV−A1302、SAdV−A1320、SAdV−A1331及びSAdV−A1337の核酸配列及びアミノ酸配列を提供し、それらはそれらが自然において関連している他の材料から単離される。
本明細書で提供されるSAdV−A1302核酸配列は、配列番号:1のヌクレオチド1−36430を含む。本明細書のSAdV−A1320核酸配列は、配列番号:25のヌクレオチド1−36603を含む。本明細書で提供されるSAdV−A1331核酸配列は、配列番号:50のヌクレオチド1−36647を含む。本明細書で提供されるSAdV−A1337核酸配列は、配列番号:77の1−36639を含む。引用することによりその記載事項が本明細書の内容となる配列表を参照されたい。
ブリッドチンパンジーAd/AAVが含まれ得る。当該技術分野における熟練者は、さらに別のサルアデノウイルスベクター及び/又はSAdV−A1302、SAdV−A1320、SAdV−A1331又はSAdV−A1337遺伝子配列がrAAV及びアデノウイルスヘルパーに依存性の他のウイルスの作製に有用であろうことを認識するであろう。
本明細書に記載されるアデノウイルス核酸によりコードされるタンパク質、酵素及びそれらのフラグメントのようなSAdV−A1302、SAdV−A1320、SAdV−A1331又はSAdV−A1337アデノウイルスの遺伝子産物を提供する。他の方法により作製される、これらの核酸配列によりコードされるアミノ酸配列を有するSAdV−A1302、SAdV−A1320、SAdV−A1331又はSAdV−A1337タンパク質、酵素及びそれらのフラグメントがさらに包含される。そのようなタンパク質には、上記の表中で同定されたオープンリーディングフレームによりコードされるもの、配列表中で与えられる配列番号に関連して(with reference to)下記の表中で同定されるタンパク質ならびにそれに実質的な相同性を有する配列が含まれる。本明細書で同定されるタンパク質及びポリペプチドのフラグメントも、それに実質的な相同性を有するフラグメントとともに示す。
パク質性タンパク質を含まない独特のサルアデノウイルスタンパク質を提供する。好ましくは、これらのタンパク質は少なくとも10%均一(homogeneous)であり、より好ましくは60%均一であり、そして最も好ましくは95%均一である。
したフラグメントには、もっと短い内部、C−末端又はN−末端フラグメントが含まれる。例えば1つの適したフラグメントは、DE1及びFG1と称されるヘキソンタンパク質のループ領域(ドメイン)又はその超可変領域である。そのようなフラグメントには、配列番号:9、34、59又は86を参照して、サルヘキソンタンパク質のアミノ酸残基の大体(about)125−443;大体138−441に及ぶ領域あるいはもっと小さいフラグメント、例えば大体残基138−残基163;大体170−大体176;大体195−大体203;大体233−大体246;大体253−大体374;大体287−大体297;及び大体404−大体430に及ぶフラグメントが含まれる。当該技術分野における熟練者は、他の適したフラグメントを容易に同定することができる。さらに、当該技術分野における熟練者に既知の多様な目的のためにヘキソンタンパク質を改変することができる。ヘキソンタンパク質はアデノウイルスの血清型に関する決定因子であるので、そのような人工のヘキソンタンパク質は人工の血清型を有するアデノウイルスを生ずる。本発明のチンパンジーAdペントン配列及び/又は繊維配列及び/又はそれらのフラグメントを用いて、他の人工のキャプシドタンパク質を構築することもできる。
knob)である。他の適したフラグメントの例には、配列番号:19、44、69又は96中に与えられるアミノ酸番号付けに基づく約50個、100個、150個又は200個のアミノ酸のN−末端及び/又はC−末端切断を有する繊維が含まれる。さらに別の適したフラグメントには内部フラグメントが含まれる。さらに、当該技術分野における熟練者に既知の多様な方法を用いて、繊維タンパク質を改変することができる。
−A1337遺伝子産物の収率及び/又は発現を強化するために導入され得るような改変、例えばSAdV−A1302、SAdV−A1320、SAdV−A1331又はSAdV−A1337遺伝子産物のすべて又はフラグメントを強化のための融合パートナーと融合させる(直接又はリンカーを介して)融合分子の構築を本明細書で提供する。他の適した改変には、通常切断されるプレ−又はプロ−タンパク質を除去するため及び成熟タンパク質又は酵素を与えるためのコード領域(例えばタンパク質又は酵素)の切断ならびに/あるいは分泌性遺伝子産物を与えるためのコード領域の突然変異が含まれるが、制限ではない。さらに別の改変は、当該技術分野における熟練者に容易に明らかになるであろう。本明細書で提供されるSAdV−A1302、SAdV−A1320、SAdV−A1331又はSAdV−A1337タンパク質に少なくとも約98%、約99%、約99.5%又は約99.9%の同一性を有するタンパク質がさらに包含される。
et al.,1986 Science,233:747−753;Queen et al.,1989 Proc,Nat’l.Acad.Sci.USA,86:10029−10033;PCT特許出願番号PCT/WO9007861;及びRiechmann et al.,Nature,332:323−327(1988);Huse et al.,1988a Science,246:1275−1281を参照されたい]。あるいはまた、本発明の抗原への動物又はヒト抗体の相補性決定領域を操作することにより、抗体を作製することができる。例えばE.Mark andPadlin,“Humanization of Monoclonal Antibodies”,Chapter 4,The Handbook of Experimental Pharmocology,Vol.113,The Pharmacology of
Monoclonal Antibodies,Springer−Verlag(June,1994);Harlow et al.,1999,Using Antibodies:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory Press,NY;Harlow et al.1989,Antibodies:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor,New York;Houston et al.,198
8,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:5879−5883;及びBird et al.,1988,Science 242:423−437を参照されたい。本発明はさらに、抗イディオタイプ抗体(Ab2)及び抗−抗−イディオタイプ抗体(Ab3)を提供する。例えばM.Wettendorff et al.,”Modulation of anti−tumor immunity by anti−idiotypic antibodies.”In Idiotypic Network and Diseases,ed.by J.Cerny及びJ.Hiernaux,1990 J.Am.Soc.Microbiol.,Washington DC:pp.203−229を参照されたい。これらの抗−イディオタイプ及び抗−抗−イディオタイプ抗体は、当該技術分野における熟練者に周知の方法を用いて作製される。これらの抗体を、診断及び臨床法ならびにキットを含む多様な目的のために用いることができる。
dV−A1302、SAdV−A1320、SAdV−A1331又はSAdV−A1337の配列、タンパク質及びフラグメントを作製することができる。適した作製法は当該技術分野における熟練者に周知である。例えばSambrook et al,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Press(Cold Spring Harbor,NY)を参照されたい。あるいはまた、周知の固相ペプチド合成法によりペプチドを合成することもできる(Merrifield,J.Am.Chem.Soc.,85:2149(1962);Stewart and Young,Solid Phase Peptide Synthesis(Freeman,San Francisco,1969)pp.27−62)。これらの及び他の適した作製法は、当該技術分野における熟練者の知識の範囲内であり、本発明の制限ではない。
本明細書に記載される組成物は、治療目的又はワクチン目的のいずれかのために異種分子を細胞に送達するベクターを含む。本明細書で用いられる場合、ベクターには裸のDNA、ファージ、トランスポゾン、コスミド、エピソーム、プラスミド又はウイルスを含むが制限ではない遺伝子要素が含まれ得る。そのようなベクターは、SAdV−A1302、SAdV−A1320、SAdV−A1331又はSAdV−A1337のサルアデノウイルスDNA及びミニ遺伝子を含有する。「ミニ遺伝子」又は「発現カセット」により
、選ばれた異種遺伝子ならびに翻訳、転写及び/又は宿主細胞における遺伝子産物の発現の駆動に必要な他の調節要素の組み合わせを意味する。
ら入手可能であるか、あるいは多様な商業的及び研究的供給源から依頼により入手可能である。さらに、多くのそのような株の配列は、例えばPubMed及びGenBankを含む多様なデータベースから入手可能である。他のサル又はヒトアデノウイルスから調製される相同性アデノウイルスベクターは、公開文献中に記載されている[例えば米国特許第5,240,846号明細書を参照されたい]。Ad5型[GeneBank Accession No.M73370]を含む複数のアデノウイルス型のDNA配列がGenBankから入手可能である。血清型2、3、4、7、12及び40のような、及びさらに現在同定されているヒト型を含むいずれの既知のアデノウイルス型からもアデノウイルス配列を得ることができる。類似して、ヒト以下の動物(例えばサル)に感染することが知られているアデノウイルスを本発明のベクター構築物において用いることもできる。例えば米国特許第6,083,716号明細書を参照されたい。
導入遺伝子の選択、クローニング及び「ミニ遺伝子」の構築及びそのウイルスベクター中への挿入にために用いられる方法は、本明細書に与えられる説明を得て、当該技術分野における熟練の範囲内である。
導入遺伝子は、導入遺伝子にフランキングするベクター配列にとって異種の核酸配列であり、それは問題のポリペプチド、タンパク質又は他の産物をコードする。核酸コード配列は、宿主細胞における導入遺伝子の転写、翻訳及び/又は発現を可能にするやり方で調節要素に操作可能に連結している。
ミニ遺伝子に関して上記で同定した主要な要素の他に、ベクターは必要な通常の調節要素も含み、それはプラスミドベクターがトランスフェクションされたか、又は本発明により作製されるウイルスに感染した細胞におけるその転写、翻訳及び/又は発現を可能にするやり方で導入遺伝子に操作可能に連結している。本明細書で用いられる場合、「操作可能に連結した」配列は、問題の遺伝子と隣接している発現調節配列及びトランスで(in
trans)又はある距離で作用して問題の遺伝子を調節する発現調節配列の両方を含む。
翻訳有効性を強化する配列(例えばコザック共通配列);タンパク質安定性を強化する配列;ならびに望ましい場合はコードされる産物の分泌を強化する配列を含む。他の配列の中で、キメライントロンを用いることができる。
al.,Nat.Biotech.,17:241−245(1999))。組織−特異的であるプロモーターの例は、中でも肝臓(アルブミン、Miyatake et al.,J.Virol.,71:5124−32(1997);B型肝炎ウイルスコアプロモーター、Sandig et al.,Gene Ther.,3:1002−9(1996);アルファ−フェトタンパク質(AFP)、Arbuthnot et al.,Hum.Gene Ther.,7:1503−14(1996))、骨オステオカルシン(Stein et al.,Mol.Biol.Rep.,24:185−96(1997));骨シアロタンパク質(Chen et al.,J.Bone Miner.Res.,11:654−64(1996))、リンパ球(CD2、Hansal
et al.,J.Immunol.,161:1063−8(1988);免疫グロブリン重鎖;T細胞レセプター鎖)、ニューロン−特異的エノラーゼ(NSE)プロモーター(Anderson et al.,Cell Mol.Neurobiol.,13:503−15(1993))、ニューロフィラメント軽鎖遺伝子(Piccioli
et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,88:5611−5(1991))及びニューロン−特異的vgf遺伝子(Piccioli et al.,Neuron,15:373−84(1995))のようなニューロン性に関して既知である。
Spring Harbor,NY]中に記載されているもののような通常のcDNAのクローニング法、アデノウイルスゲノムの重複オリゴヌクレオチド配列の使用、ポリメラーゼ連鎖反応及び所望のヌクレオチド配列を与える適した方法が含まれる。
1つの態様において、サルアデノウイルスプラスミド(又は他のベクター)を用いてアデノウイルスベクターを作製する。1つの態様において、アデノウイルスベクターは、複製−欠損であるアデノウイルス粒子である。1つの態様において、アデノウイルス粒子はE1a及び/又はE1b遺伝子における欠失により複製−欠損とされる。あるいはまた、アデノウイルスは、場合によりE1a及び/又はE1b遺伝子を保持しながら他の手段によって複製−欠損とされる。類似して、いくつかの態様において、E2b及び/又はDN
Aポリメラーゼ遺伝子における欠失により、ベクターへの免疫反応を低下させることができる。アデノウイルスベクターは、アデノウイルスゲノムへの他の突然変異、例えば温度−感受性突然変異又は他の遺伝子における欠失を含有することもできる。他の態様において、アデノウイルスベクター中に無損傷のE1a及び/又はE1b領域を保持するのが望ましい。そのような無損傷のE1領域はアデノウイルスゲノム中のその天然の位置に位置するか、又は天然のアデノウイルスゲノム中の欠失の部位(例えばE3領域中)に置かれることができる。
かくしてミニ遺伝子の保有のために用いられるウイルスベクターのサルアデノウイルス遺伝子の内容に依存して、ミニ遺伝子を含有する感染性組換えウイルス粒子の作製に必要な十分なサルアデノウイルス遺伝子配列を与えるために、ヘルパーアデノウイルス又は非−複製性ウイルスフラグメントが必要であり得る。有用なヘルパーウイルスは、アデノウイルスベクター構築物中に存在しない、及び/又はベクターがトランスフェクションされるパッケージング細胞系により発現されない選ばれたアデノウイルス遺伝子配列を含有する。1つの態様において、ヘルパーウイルスは複製−欠損であり、上記の配列に加えて多様なアデノウイルス遺伝子を含有する。そのようなヘルパーウイルスは、望ましくはE1−発現細胞系と組み合わされて用いられる。
上記の遺伝子のいずれかにおいて欠失した組換えサルアデノウイルス(Ad)を作製するために、欠失した遺伝子領域の機能を、もしウイルスの複製及び感染性に必須であったら、ヘルパーウイルス又は細胞系、すなわち補完もしくはパッケージング細胞系により組換えウイルスに供給しなければならない。多くの状況において、チンパンジーAdベクターをトランス補完する(transcomplement)ために、ヒトE1を発現する細胞系を用いることができる。本発明のチンパンジーAd配列と現在入手可能なパッケージング細胞中に見出されるヒトAdE1配列の間の多様性の故に、現在のヒトE1−含有細胞の使用は複製及び生成過程の間に複製−能力を有するアデノウイルスの生成を妨げるので、これは特に有利である。しかしながらある状況において、E1−欠失サルアデノウイルスの作製に用いられ得るE1遺伝子産物を発現する細胞系を用いることは望ましいであろう。そのような細胞系は記載されている。例えば米国特許第6,083,716号明細書を参照されたい。
17]、Detroit[例えばDetroit 510,CCL 72]及びWI−38[CCL 75]細胞であることができるが、制限ではない。これらの細胞系はすべてAmerican Type Culture Collection,10801 University Boulevard,Manassas,Virginia 20110−2209から入手可能である。他の供給源から他の適した親細胞系を得ることができる。
法を含む。通常の方法を用いてこの集成を行うことができる。そのような方法には、周知であり且つ上記で挙げたSambrook et al.に記載されているcDNA及びゲノムクローニング、ポリメラーゼ連鎖反応と組み合わされたアデノウイルスゲノムの重複オリゴヌクレオチド配列の使用、合成的方法ならびに所望のヌクレオチド配列を与える他の適した方法が含まれる。
一般に、ミニ遺伝子を含んでなるベクターをトランスフェクションにより送達する場合、約1x104個の細胞〜約1x1013個の細胞、そして好ましくは約105個の細胞に約5μg〜約100μgのDNA、そして好ましくは約10〜約50μgのDNAの量でベクターを送達する。しかしながら、選ばれるベクター、送達法及び選ばれる宿主細胞のような因子を考慮して、宿主細胞に対するベクターDNAの相対的な量を調整することができる。
通常のcDNAのクローニング法、アデノウイルスゲノムの重複オリゴヌクレオチド配列の使用、ポリメラーゼ連鎖反応及び所望のヌクレオチド配列を与える適した方法が含まれる。標準的なトランスフェクション法及びコ−トランスフェクション法、例えばCaPO4沈降法が用いられる。用いられる他の通常の方法は、ウイルスゲノムの相同的組換え、寒天重層(agar overlay)におけるウイルスのプラーク形成、シグナル発生の測定の方法などを含む。
組換えサルアデノウイルスA1302(SAdV−A1302)、SAdV−A1320、SAdV−A1331又はSAdV−A1337に基づくベクターは、ヒト患者又は非−サルの獣医学的患者への試験管内、生体外及び生体内における遺伝子導入のために有用である。
続的な投与のそれぞれに関して、あるいは特定の血清型のキャプシドのあらかじめ選ばれた回数(1回、2回、3回、4回又はもっと多く)の投与の後に、ウイルスキャプシドを変更することができる。かくして療法は、第1のサルキャプシドを有するrAdの送達、第2のサルキャプシドを有するrAdを用いる送達及び第3のサルキャプシドを用いる送達を含むことができる。単独で、互いに組み合わせて、あるは他のアデノウイルス(好ましくは免疫学的に交差反応性でない)と組み合わせて本発明のAdキャプシドを使用する多様な他の療法が、当該技術分野における熟練者に明らかであろう。場合により、そのような療法は他のヒト以下の霊長類のアデノウイルス、ヒトアデノウイルス又は本明細書に記載されるような人工の配列のキャプシドを有するrAdの投与を含むことができる。療法の各段階(phase)は、単一のAdキャプシドを用いる一系列の注入(又は他の送達経路)及びそれに続く異なるAd源からの別のキャプシドを用いる一系列の投与を含むことができる。あるいはまた、SAdV−A1302、SAdV−A1320、SAdV−A1331又はSAdV−A1337ベクターを、他のウイルス系、非−ウイルス送達系、タンパク質、ペプチド及び他の生物学的に活性な分子を含む他の非−アデノウイルス−媒介送達系を含む療法において用いることができる。
1つの態様において、上記の組換えベクターを、公開されている遺伝子治療のための方法に従ってヒトに投与する。選ばれた導入遺伝子を保有するサルアデノウイルスベクターを、好ましくは生物学的に適合性の溶液又は製薬学的に許容され得る送達ビヒクル中に懸濁させて、患者に投与することができる。適したビヒクルには無菌食塩水が含まれる。製薬学的に許容され得る担体であることが既知であり、且つ当該技術分野における熟練者に周知の他の水性及び非−水性等張無菌注入溶液ならびに水性及び非−水性無菌懸濁液をこの目的のために用いることができる。
りに約1x109〜約5x1012個の粒子の範囲内である。場合により、複数の投与部位を送達することができる。別の例において、経口用調製物のために適したヒトの又は獣医学的投与量は、約1x1011〜約1x1015個の粒子の範囲内であることができる。当該技術分野における熟練者は、投与経路及び組換えベクターが用いられる治療的又はワクチン的用途に依存してこれらの用量を調整することができる。導入遺伝子の発現のレベルあるいは免疫原の場合には循環する抗体のレベルを監視して、投与量の投与の頻度を決定することができる。投与のタイミング又は頻度の決定のためのさらに別の方法は、当該技術分野における熟練者に容易に明らかになるであろう。
導入遺伝子によりコードされる有用な治療用産物には、インスリン、グルカゴン、成長ホルモン(GH)、副甲状腺ホルモン(PTH)、成長ホルモン放出因子(GRF)、卵胞刺激ホルモン(FSH)、黄体化ホルモン(LH)、ヒト絨毛性ゴナドトロピン(hCG)、血管内皮成長因子(VEGF)、アンジオポエチン、アンジオスタチン、顆粒球コロニー刺激因子(GCSF)、エリスロポエチン(EPO)、結合組織成長因子(CTGF)、塩基性線維芽細胞成長因子(bFGF)、酸性線維芽細胞成長因子(aFGF)、上皮成長因子(EGF)、トランスフォーミング増殖因子(transforming growth factor)(TGF)、血小板由来成長因子(PDGF)、インスリン成長因子I及びII(IGF−I及びIGF−II)、TGF、アクチビン、インヒビンを含むトランスフォーミング増殖因子スーパーファミリー(superfamily)のいずれか1つ、あるいは骨形態形成タンパク質(BMP)BMPs1−15のいずれか、成長因子のヘレグルイン(heregluin)/ニューレグリン(neuregulin)/ARIA/neu分化因子(NDF)ファミリーのいずれか1つ、神経成長因子(NGF)、脳由来神経栄養因子(BDNF)、ニューロトロフィンNT−3及びNT−4/5、毛様体神経栄養因子(CNTF)、グリア細胞系由来神経栄養因子(GDNF)、ニューツリン、アグリン、セマフォリン/コラプシンのファミリーのいずれか1つ、ネトリン−1及びネトリン−2、肝細胞成長因子(HGF)、エフリン、ノギン、ソニックヘッジホグ(sonic hedgehog)ならびにチロシンヒドロキシラーゼを含むがこれらに限られないホルモンならびに成長及び分化因子が含まれる。
も本発明において有用である。これらには、免疫グロブリンIgG、IgM、IgA、IgD及びIgE、キメラ免疫グロブリン、ヒト化抗体、一本鎖抗体、T細胞レセプター、キメラT細胞レセプター、一本鎖T細胞レセプター、クラスI及びクラスII MHC分子ならびに操作された免疫グロブリン及びMHC分子が含まれるが、制限ではない。有用な遺伝子産物には、補体調節タンパク質、膜補因子タンパク質(membrane cofactor protein)(MCP)、崩壊促進因子(DAF)、CR1、CF2及びCD59のような補体調節タンパク質も含まれる。
及び防御的療法の標的ポリペプチドには、いくつかの態様において自己免疫疾患のための標的抗原としても使用されるB細胞リンパ腫により作られる抗体の可変領域及びT細胞リンパ腫のT細胞レセプターの可変領域が含まれる。モノクローナル抗体17−1A及び葉酸結合ポリペプチドにより認識されるポリペプチドを含む、腫瘍細胞中でより高レベルで見出されるポリペプチドのような他の腫瘍−関連ポリペプチドを、標的ポリペプチドとして用いることができる。
組換えSAdV−A1302、SAdV−A1320、SAdV−A1331又はSAdV−A1337ベクターを、免疫原性組成物として用いることもできる。本明細書で用いられる場合、免疫原性組成物は、哺乳類、そして好ましくは霊長類への送達の後に免疫原性組成物により送達される導入遺伝子産物に対し、体液性(例えば抗体)もしくは細胞性(例えば細胞傷害性T細胞)反応が高まる(mounted)組成物である。組換えサルAdは所望の免疫原をコードする遺伝子を、そのアデノウイルス配列欠失のいずれか中に含有することができる。サルアデノウイルスは、ヒト起源のアデノウイルスと比較して、種々の動物種における生の組換えウイルスワクチンとしての使用により良好に適しているようであるが、しかしそのような使用に制限されない。組換えアデノウイルスを、免疫反応の誘導に非常に重要であり、且つ病原体の拡散を制限することが可能な抗原が同定されており、且つcDNAが利用可能であるいずれの病原体に対する予防的もしくは治療的ワクチンとしても用いることができる。
る。別のウイルス科には、流行性胃腸炎の重要な原因病原体(causative agent)であるノーウォーク群のウイルスを包含するカルシウイルス科が含まれる。ヒト及びヒト以下の動物において免疫反応を誘導するための抗原の標的化における使用に望ましいさらに別のウイルス科は、シンドビスウイルス、ロスリバーウイルス、ならびにベネズエラ、東部及び西部ウマ脳炎を含むアルファウイルス属ならびに風疹ウイルスを包含するルビウイルスを包含するトガウイルス科である。フラビウイルス科には、デング熱、黄熱病、日本脳炎、セントルイス脳炎及びダニ媒介脳炎ウイルスが含まれる。他の標的抗原は、C型肝炎、あるいは感染性気管支炎ウイルス(家禽)、ブタ伝染性胃腸炎ウイルス(ブタ)、ブタ血球凝集性脳脊髄炎ウイルス(ブタ)、ネコ感染性腹膜炎ウイルス(ネコ)、ネコ腸内コロナウイルス(ネコ)、イヌコロナウイルス(イヌ)のような複数のヒト以下ウイルス及び感冒を引き起こしうるヒト呼吸器コロナウイルスを包含するコロナウイルス科ならびに/あるいは非A、非Bもしくは非C型肝炎から生じ得る。コロナウイルス科内で、標的抗原には、E1(Mもしくはマトリックスタンパク質とも呼ばれる)、E2(Sもしくはスパイクタンパク質とも呼ばれる)、E3(HEもしくはヘマグルチン−エルテロース(hemagglutin−elterose)とも呼ばれる)糖タンパク質(すべてのコロナウイルスに存在するわけではない)又はN(ヌクレオキャプシド)が含まれる。さらに別の抗原を、ベシクロウイルス属(例えば水疱性口内炎ウイルス)及び一般的リッサウイルス(例えば狂犬病)を含むラブドウイルス科に対し標的化することができる。
rch 2001)及びR.R.Amara et al,Science,292:69−74(6 April 2001)に記載されているHIV及びSIVタンパク質も参照されたい。別の例において、HIV及び/又はSIV免疫原性タンパク質又はペプチドを用いて、融合タンパク質又は他の免疫原性分子を形成することができる。例えば、2001年8月2日に公開された国際公開第01/54719号パンフレット及び1999年4月8日に公開された国際公開第99/16884号パンフレットに記載されているHIV−1 Tat及び/又はNef融合タンパク質ならびに免疫化療法を参照されたい。本発明は、本明細書に記述されるHIV及び/又はSIV免疫原性タンパク質もしくはペプチドに制限されない。さらに、これらのタンパク質への多様な改変が記載されているか、あるいは当該技術分野における熟練者が容易にそれを成すことができる。例えば米国特許第5,972,596号明細書に記述されている改変gagタンパク質を参照されたい。さらに、いかなる所望のHIV及び/又はSIV免疫原も単独で、又は組合せて送達することができる。そのような組合せは単一のベクターから、又は複数のベクターからの発現を含むことができる。場合により、別の組合せは、タンパク質の形態における1種もしくはそれより多い免疫原の送達を用いる1種もしくはそれより多い発現された免疫原の送達を含むことができる。そのような組合せを下記においてより詳細に議論する。
ス・モニリフォルミス(streptobacillus moniliformis)及びスピリルム(spirillum)が含まれ;グラム−陽性桿菌には、リステリア・モノシトゲネス(listeria monocytogenes);エリジペロスリクス・ルシオパチエ(erysipelothrix rhusiopathiae);ジフテリア菌(Corynebacterium diphtheria)(ジフテリア);コレラ;炭疽菌(B.anthracis)(炭疽);ドノヴァン症(そ径部肉芽腫);及びバルトネラ症が含まれる。病原性嫌気性バクテリアにより引き起こされる疾患には、破傷風;ボツリヌス中毒;他のクロストリジウム;結核;らい;及び他のマイコバクテリアが含まれる。病原性スピロヘータ疾患には、梅毒;トレポネーマ症;イチゴ腫、ピンタ及び風土病性梅毒;ならびにレプトスピラ症が含まれる。より病原性の高いバクテリア及び病原性菌・カビにより引き起こされる他の感染には、放線菌症;ノカルジア症;クリプトコックス症、ブラストミセス症、ヒストプラスマ症及びコクシジオイデス真菌症;カンジダ症、アスペルギルス症及びムコール菌症;スポロトリクス症;パラコクシジオイデス真菌症、ペトリエリジオーシス(petriellidiosis)、トルロプシス症、菌腫及びクロモマイコーシス;ならびに皮膚糸状菌症が含まれる。リケッチア感染には、発疹チフス、ロッキー山熱、Q熱及びリケッチア痘が含まれる。マイコプラスマ及びクラミジア感染の例には:マイコプラスマ肺炎;性病性リンパ肉芽腫;オウム病;及び周産期クラミジア感染が含まれる。病原性真核生物には、病原性原生動物及び蠕虫が含まれ、それらにより起こされる感染には:アメーバ症;マラリア;リーシュマニア;トリパノソーマ症;トキソプラスマ症;ニューモシスチス・カリニ(Pneumocystis carinii);トリカンス(Trichans);トキソプラスマ・ゴンジイ(Toxoplasma gondii);バベシア症;ジアルジア症;旋毛虫症;フィラリア症;住血吸虫症;線虫;吸虫(trematodes)もしくは吸虫(flukes);及び条虫(cestode)(条虫(tapeworm))感染が含まれる。
タウイルス(hantavirus)が含まれる。さらに、そのように分類されるか又は異なって分類される他の生物を、将来そのような目的のために同定及び/又は使用することができる。本明細書に記載されるウイルスベクター及び他の構築物が、これらの生物、ウイルス、それらの毒素又は他の副生成物からの抗原を送達するのに有用であり、その抗原はこれらの生物学的薬剤への感染又はそれらとの他の有害な反応を予防及び/又は処置するであろうことが容易に理解されるであろう。
選ばれる遺伝子の治療レベル又は免疫性のレベルを監視して、追加免疫(booster)の必要性(あれば)を決定することができる。血清中のCD8+ T細胞反応又は場合により抗体力価の評価に続き、場合による追加免疫免疫化が望ましいかもしれない。場合により、組換えSAdV−A1302、SAdV−A1320、SAdV−A1331又はSAdV−A1337ベクターを、一回の投与で、あるいは種々の組合せ療法において、例えば他の活性成分を含む処置の療法もしくは経路と組合せて、あるいはプライム−ブースト療法(prime−boost regimen)において送達しうる。多様なそのような療法が当該技術分野で記載されており、且つ容易に選択され得る。
ク質サブユニットの発現のためのマルチタンパク質療法を記述するR.R.Amara,Science,292:69−74(6 April 2001)を参照されたい。例えば、DNAプライミング(DNA prime)は、1つの転写物からのGag、Pol、Vif、VPX及びVprならびにEnv、Tat及びRevを送達することができる。あるいはまた、SIV Gag、Pol及びHIV−1 Envは、組換えSAdV−A1302、SAdV−A1320、SAdV−A1331又はSAdV−A1337アデノウイルス構築物中で送達される。さらに別の療法は国際公開第99/16884号パンフレット及び国際公開第01/54719号パンフレットに記載されている。
応性抗原であることである。
response)を誘導するため、あるいは他の活性薬剤への細胞障害性T細胞反応を強化するか又は助けるための、これらのウイルスのキャプシドの使用(場合により無損傷の又は組換えウイルス粒子あるいは中空キャプシドが用いられる)を提供する。SAdV−A1302、SAdV−A1320、SAdV−A1331又はSAdV−A1337キャプシドを単独で、あるいは活性薬剤への免疫反応を強化するためのそれとの組み合わせ療法において、送達することができる。有利なことに、宿主を亜群Eアデノウイルスに感染させることなく、所望の効果を達成することができる。他の側面において、SAdV−A1302、SAdV−A1320、SAdV−A1331又はSAdV−A1337キャプシドを患者に送達することを含んでなる、インターフェロンアルファの生成が必要な患者においてそれを誘導する方法を提供する。さらに別の側面において、培養物において1種もしくはそれより多いサイトカイン(例えばIFN−α)/ケモカインを生成させる方法を提供する。この方法は、樹状細胞及び本明細書に記載されるSAdV−A1302、SAdV−A1320、SAdV−A1331又はSAdV−A1337キャプシドを含有する培養物を、中でもアルファインターフェロンを含むサイトカイン/ケモカインの生成に適した条件下でインキュベーションすることを含む。
イルス亜群E粒子の量で、SAdV−A1302、SAdV−A1320、SAdV−A1331又はSAdV−A1337キャプシドを培養物に加える。次いで混合物を、例えば約28℃〜約40℃の範囲内、約35℃〜約37℃の範囲内あるいは約37℃においてインキュベーションする。典型的には、約12〜96時間又は約48時間後に、細胞を遠心沈殿させ、上澄み液を集める。適切には、細胞ライシスを避ける条件下でこれを行い、それにより上澄み液中の細胞破片の存在を減らすか又は排除する。遠心分離は、細胞からのサイトカインの分離を可能にし、それにより雑に単離されたサイトカインを与える。アデノウイルス及びアデノウイルスキャプシドなどからのサイトカインのさらなる精製のために、サイジングカラム(sizing columns)ならびに他の既知のカラム及び方法が利用可能である。そのように精製されるこれらのサイトカインは、多様な用途における調製及び使用のために利用可能である。
University of Louisiana New Iberia Research Center,4401 W.Admiral Doyle Drive,New Iberia,Louisiana,USAにおいて、チンパンジーコロニーから糞便試料を得た。糞便懸濁液から濾過された上澄み液をヒト細胞系A549の培養物中に接種した。培養物中で約1〜2週間の後、いくつかの接種材料を有する細胞培養物において、可視の細胞変性効果(CPE)が明らかであった。この方法によって単離されたウイルスを、塩化セシウム勾配バンディング(cesium chloride gradient banding)の標準的なアデノウイルス精製法を用い、A549細胞を用いて大規模調製に拡大した。精製されたアデノウイルスからのDNAを単離し、Qiagen Genomics services,Hilden,Germanyにより完全に配列決定した。完全なゲノム配列の分析は、単離されたウイルスが以前に報告されたことがない新規な配列を有することを示した。
一般的に記載されている通りに、SAdV−A1302、SAdV−A1320、SAdV−A1331又はSAdV−A1337(亜群E)を用いるE1欠失ベクターを作製することができる。
A.野生型SAdV−A1302、SAdV−A1320、SAdV−A1331及びSAdV−A1337を、直接免疫蛍光法により監視される感染阻害中和抗体アッセイ(infection inhibition neutralizing antibody assay)を用いて、ヒトアデノウイルス5(亜種C)及びチンパンジーアデノウイルス7(SAdV−24)ならびにヒトプールIgG(human pooled IgG)と比較して交差−中和活性に関して評価する。ヒトプールIgG[HuプールIgG]は商業的に購入され、普遍的ヒト集団がさらされている複数の抗原に対する抗体をそれが含有しているので、免疫無防備状態の患者における投与に関して承認されている。ヒトプールIgGに関するサルアデノウイルスに対する中和抗体の存在又は不在は、普遍的集団におけるこれらのアデノウイルスへの抗体の普及の反映である。
lls)を有するウェル中のスライドに加える。1時間後、各ウェル中の細胞に100μlの20%胎児ウシ血清(FBS)−DMEMを補完し、5%CO2中で37℃において22時間培養する。次に、PBSを用いて細胞を2回濯ぎ、パラホルムアルデヒド中における固定(4%,30分間)及び0.2% Triton中における浸透性化(permeabilization)(4℃,20分間)の後に、DAPIならびにHAdV−5に対して産生された(raised)、FITC標識され、広く交差反応性のヒツジ抗体(Virostat)を用いて染色する。顕微鏡下でFITC陽性細胞の数を数えることにより、感染のレベルを決定する。天然の(naive)血清標準と比較してアデノウイルス感染を50%かもしくはそれより多く阻害する最高血清希釈としてNAB力価を報告する。<1/20の力価値が示される場合、中和抗体濃度は検出限界、すなわち1/20より低い。
A.SAdV−A1302
SnaBI+Ndeを用いてpSR7プラスミド(配列番号:202)を消化することにより、E1欠失SAdV−A1302クローンを作製し、末端をCIPで処理し、野生型SAdV−A1302配列(配列番号:1)をNdeIで消化して、プラスミド中への導入のための〜3021bpの左末端(Start−NdeI)フラグメントを作製する。得られるプラスミド(pS240−1302)をSnaBI+Ndeで消化し、末端にクレノウを満たし、CIPで処理する。pBleuSK I−PIプラスミド(配列番号:203−I−CeuI及びPI−SceIのための部位を宿している)をSmaI及びポリメラーゼIを有するHindIIIで消化し、プラスミドpS241−A1302を作製する。pS241−A1302を、次いでPac/exonuc−inact/Nde/CIPで処理し、野生型SAdV−A1302配列(配列番号:1)の〜7071bpの右末端(Nde−末端)フラグメントをその中にクローニングして、pS242_A1302プラスミドを生ずる。pS242_A1302プラスミドを、次いでNdeIで消化し、CIPで末端を処理し、野生型SAdV−A1302配列(配列番号:1)の〜
26kbpのフラグメントをその中にクローニングして、pS243−A1302プラスミドを生ずる。
E1欠失SAdV−A1320クローン(配列番号:206)、p2870を以下の通りに作製し、すべての段階は標準的な分子生物学的方法を用いて行われた。野生型A1320配列(配列番号:25)の5’(左末端)、5’ITRからNheI部位までをシャトルプラスミドpSR7(配列番号:202)中にSma/NheI部位において挿入した。配列番号:25のNdeI/EcoRVフラグメント(E1a、E1b 19k及びE1bの〜75%に関するコード配列)をメガヌクレアーゼクローニングカセット(EcoRV/EcoRV制限部位)で置き換えた。次いで野生型A1320配列(配列番号:25)の3’(右末端)、NheI部位から3’ITRまでをシャトルプラスミド中に挿入した(NheI/EcoRVフラグメントの置き換え)。アデノウイルスゲノム(配列番号:25)の残る中間部分(NheI/NheI)を、次いでNheI部位を介してシャトルプラスミドに加えた。
pSR5プラスミド(配列番号:201)をSmaI+SpeIで消化することによりE1欠失SAdV−A1331クローンを作製し、末端をCIPで処理し、野生型SAdV−A1331配列(配列番号:50)をSpeIで消化していくつかのフラグメントを作製する。〜10,629bpのフラグメントをプラスミド中に導入する。得られるプラスミド(pS230−1331)をBsiWI+NdeI又はSnaBI+NdeIで消化し、SnaIB(BsiWI)+NdeI部位を介して、ICeuPISceIメガヌクレアーゼカセット(配列番号:205)をその中にクローニングする。得られるプラスミド(pS231−1331)を次いでEcoRV+SpeIで消化し、SpeIで消化された野生型SAdV−A1331配列(配列番号:50)の〜1301bpのフラグメントをその中にクローニングし、pS232−A1331プラスミドを生ずる。pS232−A1331を次いでSpeIで消化し、CIPで処理し、SpeIで消化された野生型SAdV−A1331配列(配列番号:50)の〜24,718bpのフラグメントをその中にクローニングし、pS233−A1331プラスミドを生ずる。
E1欠失SAdV−A1337クローン(配列番号:287)、p2875を以下の通りに作製し、すべての段階は標準的な分子生物学的方法を用いて行われた。野生型A1337配列(配列番号:77)の5’(左末端)、5’ITRからNheI部位までをシャトルプラスミドpSR7(配列番号:202)中にSnaBI/NdeI部位において挿入した。配列番号:77のSnaBI/SmaIフラグメント(E1a、E1b 19k及びE1bの〜50%に関するコード配列)をメガヌクレアーゼクローニングカセット(EcoRV/EcoRV制限部位)で置き換え、PI−SceI/NdeIフラグメントをPI−SceI/NdeIリンカーで置き換えて、さらにE1bから400bpを欠失させた。次いで野生型A1337配列(配列番号:77)の3’(右末端)、NdeI部位から3’ITRまでをシャトルプラスミド中に挿入した(NdeI/EcoRVフラグメントの置き換え)。アデノウイルスゲノム(配列番号:77)の残る中間部分(NdeI/NdeI)を、次いでNdeI部位を介してシャトルプラスミドに加えた。
HIV gag(short)配列を有するE1欠失SAdV−A1320クローン(配列番号246;p2876)及びHIV gag(short)配列を有するE1欠失SAdV−A1337クローン(配列番号:336;p2878)を、実施例4,B及びDに記載した通りに作製した。通常の方法に従ってクローンをレスキューし、ベクターを増殖した(expanded)。保護時の特性化は、両方のベクターが細胞変性効果(CPE)を示すことを明らかにした。A1320及びA1337ベクターに関し、それぞれmL当たりに5.26x1012個及び5.55x1012個の粒子の力価が得られた。両方のベクターは、内毒素の生成なく作製された。
A.方法
Taqman TCID50TMアッセイを用い、各ベクターに関して感染力価比を決定する。感度、再現性及び一巡時間を向上させるために、アデノウイルスベクターに関する感染力アッセイを開発し、プラークアッセイのような標準的な方法の代わりとして用いた
。Taqman TCID50TMアッセイは、ベクターの限界希釈及び陽性ウェルの感受性で定量的な合図(calling)のためにリアルタイムPCR(real−time
PCR)を用いるウイルスDNA複製の50%終点決定に基づく。要するに、ベクターを連続希釈し(10−倍希釈)、96−ウェルプレートフォーマットにおいて293細胞に感染させるのに用いる(希釈当たりに8個の複製ウェル)。3日間のインキュベーション期間の後、複製されたDNAを抽出し、導入遺伝子発現カセットに特異的なリアルタイムPCRプライマー−プローブセット(例えばpolyA)を用いて定量する。Karbers式に基づく基本的なコンピュータープログラムにより、50%終点決定を行う。アッセイの有効性確認(validation)は、力価(IU/ml)及び粒子対感染力(P:I)比の優れた再現性を示した(データは示されていない)。P:I比を試料(preparation)の感染力の尺度として用い、低いP:I比はより感染性のベクター試料を示す。アッセイは一貫してP:I比を繰り返し(returns)、それらはプラークアッセイを用いて、あるいは細胞変性効果(CPE)の観察に基づくTCID50アッセイを用いて達成されるものよりずっと低い。Taqman TCID50由来のP:I比は、ベクターサブタイプ内のロット間の一貫性の尺度として最も有用である。
上記Aの方法に従って、HIV gag(short)配列を有するE1欠失SAdV−A1320クローン(配列番号246;p2876)を調べた。8617の感染力価比が見出された。
HIV gag(short)配列を有するE1欠失SAdV−A1320クローン(配列番号246;p2876)及びHIV gag(short)配列を有するE1欠失SAdV−A1337クローン(配列番号:336;p2878)を、実施例4,B及びDに記載した通りに作製した。通常の方法に従ってクローンを保護し、ベクターを拡大した。引用することによりその記載事項が本明細書の内容となるRoy, et al.[“Partial protection against H5N1 influenza in mice with a single dose of a chimpanzee adenovirus vector expressing nucleoprotein”,Vaccine 25:6845−6851(August 6,2007)]に含有される案を用い、得られる組換えアデノウイルスウイルスによるT細胞誘導を評価することができる。
酵素結合イムノソルベントアッセイ、インターフェロン−γ 酵素結合イムノスポットアッセイ(enzyme−linked immunospot assay)及び細胞内サイトカイン染色(ICCS)を含むLin et al.,J Virol.200
7 November;81(21):11840−11849(Vaccines Based on Novel Adeno−Associated Virus Vectors Elicit Aberrant CD8+ T−cell Responses in Mice)及びLin et al.,Hum.Gene Ther.2008 July;19(7):663−669(Impact of Preexisting Vector Immunity on the Efficacy of Adeno−Associated Virus−Based HIV−1 Gag Vaccines)の方法に従って、本明細書に記載されるアデノウイルスベクターへのサイトカイン反応の特性化を行う。
Claims (23)
- (a)SAdV−A1302のヘキソンタンパク質、配列番号:9のアミノ酸1〜950;SAdV−A1320のヘキソンタンパク質、配列番号:34のアミノ酸1〜943;SAdV−A1331のヘキソンタンパク質、配列番号:59のアミノ酸1〜944;SAdV−A1337のヘキソンタンパク質、配列番号:86のアミノ酸1〜931;
(b)SAdV−A1302のペントンタンパク質、配列番号:5のアミノ酸1〜528;SAdV−A1320のペントンタンパク質、配列番号:29のアミノ酸1〜542;SAdV−A1331のペントンタンパク質、配列番号:54のアミノ酸1〜539;SAdV−A1337のペントンタンパク質、配列番号:81のアミノ酸1〜532;ならびに
(c)SAdV−A1302の繊維タンパク質、配列番号:19のアミノ酸1〜440;SAdV−A1320の繊維タンパク質、配列番号:44のアミノ酸1〜445;SAdV−A1331の繊維タンパク質、配列番号:69のアミノ酸1〜445;SAdV−A1337の繊維タンパク質、配列番号:96のアミノ酸1〜490;
より成る群から選ばれるキャプシドタンパク質を含んでなるキャプシドを有するアデノウイルスであって、該キャプシドは宿主細胞中における遺伝子の転写、翻訳及び/又は発現を指示する発現調節配列に操作可能に連結された遺伝子を保有する異種分子を包膜しているアデノウイルス。 - 複製及び包膜に必要な5’及び3’アデノウイルスシス−要素をさらに含んでなる請求項1に従うアデノウイルス。
- 該アデノウイルスがE1遺伝子の全部又は一部を欠いている請求項1に従うアデノウイルス。
- 該アデノウイルスが複製−欠損である請求項3に従うアデノウイルス。
- 該ウイルスがハイブリッドキャプシドを有する請求項1に従うアデノウイルス。
- 該ベクターがSAdV−A1302、SAdV−A1320、SAdV−A1331及びSAdV−1337から選ばれる1種より多いキャプシドタンパク質を含む請求項5に従うアデノウイルス。
- サルアデノウイルスヘキソンタンパク質のフラグメントを含有するヘキソンを含んでなるキャプシド及びSAdVに異種である核酸配列を有する組換えアデノウイルスであって、SAdVヘキソンタンパク質のフラグメントは長さが約50個のアミノ酸のN−末端もしくはC−末端切断を有する配列番号:9、34、59又は86のSAdVヘキソンタンパク質であるか、あるいは
配列番号:9、34、59又は86のアミノ酸残基125〜443;
配列番号:9、34、59又は86のアミノ酸残基138〜441;
配列番号:9、34、59又は86のアミノ酸残基138〜163;
配列番号:9、34、59又は86のアミノ酸残基170〜176;及び
配列番号:9、34、59又は86のアミノ酸残基404〜430
より成る群から選ばれる組換えアデノウイルス。 - キャプシドがさらにSAdV−A1302、SAdV−A1320、SAdV−A1331又はSAdV−1337繊維タンパク質を含む請求項7に従う組換えアデノウイルス。
- キャプシドがさらにSAdV−A1302、SAdV−A1320、SAdV−A133
1又はSAdV−1337ペントンタンパク質を含む請求項7に従う組換えアデノウイルス。 - 該アデノウイルスが、複製及び包膜に必要な5’及び3’アデノウイルスシス−要素を含んでなるシュードタイプ(pseudotyped)アデノウイルスであり、該シス−要素はアデノウイルス5’逆方向末端反復及びアデノウイルス3’逆方向末端反復を含んでなる請求項7に従う組換えアデノウイルス。
- アデノウイルスが、宿主細胞中における産物の発現を指示する配列に操作可能に連結された、該産物をコードする核酸配列を含む請求項7に従う組換えアデノウイルス。
- 組換えアデノウイルスが1個もしくはそれより多いアデノウイルス遺伝子を含む請求項7に従う組換えアデノウイルス。
- 組換えアデノウイルスが複製−欠損である請求項7に従う組換えアデノウイルス。
- 組換えアデノウイルスがアデノウイルスE1において欠失している請求項13に従え組換えアデノウイルス。
- 製薬学的に許容され得る担体中に請求項1〜14のいずれかに従うウイルスを含んでなる組成物。
- 請求項1〜14のいずれかに従うウイルスを患者に送達することを含んでなる、アデノウイルスレセプターを有する細胞を標的化するための方法。
- 配列番号:1のサルアデノウイルスA1302核酸1〜36430及びその相補体(complement);
配列番号:25のサルアデノウイルスA1320核酸1〜36603及びその相補体;
配列番号:50のサルアデノウイルスA1331核酸1〜36647及びその相補体;ならびに
配列番号:77のサルアデノウイルスA1337核酸1〜36639及びその相補体
より成る群から選ばれる単離されたサルアデノウイルス核酸。 - (a)SAdV−A1331(配列番号:50)及びSAdV−A1337(配列番号:77)の5’逆方向末端反復(ITR)配列;
(b)SAdV−A1331(配列番号:50)及びSAdV−A1337(配列番号:77)のアデノウイルスE1a領域;
(c)SAdV−A1302(配列番号:1)、SAdV−A1320(配列番号:25)、SAdV−A1331(配列番号:50)及びSAdV−A1337(配列番号:77)のアデノウイルスE1b領域又はスモールT及びラージT領域に関するオープンリーディングフレームより成る群から選ばれるそのフラグメント;
(d)SAdV−A1302(配列番号:1)、SAdV−A1320(配列番号:25)、SAdV−A1331(配列番号:50)及びSAdV−A1337(配列番号:77)の、pTP、ポリメラーゼ及びIVa領域に関するオープンリーディングフレームを含むE2b領域;
(e)SAdV−A1302(配列番号:1)、SAdV−A1320(配列番号:25)、SAdV−A1331(配列番号:50)及びSAdV−A1337(配列番号:77)のL1領域又は52/55kD及びIIIa領域に関するオープンリーディングフレームより成る群から選ばれるそのフラグメント;
(f)SAdV−A1302(配列番号:1)、SAdV−A1320(配列番号:25
)、SAdV−A1331(配列番号:50)及びSAdV−A1337(配列番号:77)のL2領域又はペントン、VII、V及びX領域に関するオープンリーディングフレームより成る群から選ばれるそのフラグメント;
(g)SAdV−A1302(配列番号:1)、SAdV−A1320(配列番号:25)、SAdV−A1331(配列番号:50)及びSAdV−A1337(配列番号:77)のL3領域又はVI、ヘキソン及びエンドプロテアーゼ領域に関するオープンリーディングフレームより成る群から選ばれるそのフラグメント;
(h)SAdV−A1302(配列番号:1)、SAdV−A1320(配列番号:25)、SAdV−A1331(配列番号:50)及びSAdV−A1337(配列番号:77)の、DNA−結合タンパク質(DBP)領域に関するオープンリーディングフレームを含むE2aタンパク質;
(i)SAdV−A1302(配列番号:1)、SAdV−A1320(配列番号:25)、SAdV−A1331(配列番号:50)及びSAdV−A1337(配列番号:77)のL4領域又は100kD、22kD及びVIII領域に関するオープンリーディングフレームより成る群から選ばれるそのフラグメント;
(j)SAdV−A1302(配列番号:1)、SAdV−A1320(配列番号:25)、SAdV−A1331(配列番号:50)及びSAdV−A1337(配列番号:77)のE3領域又は12.5K、CR1−アルファ、gp19K、CR1−ベータ、CR1−ガンマ、CR1−デルタ、RID−ベータ及び14.7K領域に関するオープンリーディングフレームより成る群から選ばれるそのフラグメント;
(k)SAdV−A1302(配列番号:1)、SAdV−A1320(配列番号:25)、SAdV−A1331(配列番号:50)及びSAdV−A1337(配列番号:77)のL5領域又は繊維タンパク質に関するオープンリーディングフレームから選ばれるそのフラグメント;
(l)SAdV−A1331(配列番号:50)及びSAdV−A1337(配列番号:77)のE4領域又はE4 ORF6/7、E4 ORF6、E4 ORF4、E4 ORF3、E4 ORF2及びE4 ORF1領域に関するオープンリーディングフレームより成る群から選ばれるそのフラグメント;
(m)SAdV−A1302(配列番号:1)のE4領域又はE4 ORF6/7、E4
ORF6、E4 ORF4、E4 ORF3及びE4 ORF2領域に関するオープンリーディングフレームより成る群から選ばれるそのフラグメント;
(n)SAdV−A1320(配列番号:25)のE4領域又はE4 ORF6/7、E4 ORF6及びE4 ORF4領域に関するオープンリーディングフレームより成る群から選ばれるそのフラグメント;ならびに
(o)SAdV−A1331(配列番号:50)及びSAdV−A1337(配列番号:77)の3’ITR
より成る群から選ばれる1つもしくはそれ多いサルアデノウイルス核酸配列を含んでなるベクター。 - 請求項18に従う核酸配列によりコードされるサルアデノウイルスタンパク質。
- E1a、配列番号:76,103;
E1b、スモールT/19K、配列番号:2,26,51,78;
E1b、ラージT/55K、配列番号:21,46,71,98;
52/55D、配列番号:3,27,52,79;
IIIa、配列番号:4,28,53,80;
ペントン、配列番号:5,29,54,81;
VII、配列番号:30,55,82;
V、配列番号:6,31,56,83;
pX、配列番号:7,32,57,84;
VI、配列番号:8,33,58,85;
ヘキソン、配列番号:9,34,59,86;
エンドプロテアーゼ、配列番号:10,35,60,87;
100kD、配列番号:11,36,61,88;
22kD、配列番号:22,47,72,99;
VIII、配列番号:12,37,62,89;
E3/12.5K、配列番号:13,38,63,90;
CRI−アルファ、配列番号:23,48,73,100;
gp19K、配列番号:14,39,64,91;
CR1−ベータ、配列番号:15,40,65,92;
CR1−ガンマ、配列番号:16,41,66,93;
CR1−デルタ、配列番号:17,42,69,94;
RID−ベータ、配列番号:18,43,68,95;
E3/14.7K、配列番号:24,49,74,101;及び
繊維、配列番号:19,44,69,96
より成る群から選ばれる1種もしくはそれより多いサルアデノウイルスタンパク質を含んでなる組成物。 - 請求項20に従う組成物を患者に送達することを含んでなるアデノウイルスレセプターを有する細胞を標的化するための方法であって、該組成物はヘキソン、ペントン及び繊維から選ばれる1種もしくはそれより多いサルアデノウイルスSAdV−A1302、SAdV−A1320、SAdV−A1331又はSAdV−1337タンパク質を含む方法。
- 標的細胞への分子の送達における使用のための請求項1〜6のいずれか1つに従うアデノウイルス又は請求項7〜14のいずれか1つに従う組換えアデノウイルス。
- 標的細胞への分子の送達に有用な薬剤の製造における請求項1〜6のいずれか1つに従うアデノウイルス又は請求項7〜14のいずれか1つに従う組換えアデノウイルスの使用。
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