JP2014530860A - C型肝炎の処置のための新規化合物 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、2011年10月20日に出願された米国仮特許出願第61/549,450号の利益を主張する。
化合物1の製造経路をスキーム1に示す。この経路は、ベイリス・ヒルマンおよびパラジウムクロスカップリングの化学的アプローチを利用する。ベイリス・ヒルマン反応により不飽和エステルを得る。DABCOまたは(4s)-キヌクリジン-3-オールを、最初の工程で塩基として用いることができる。該ヒドロキシをアセチル化してアセテートを得た。塩基性条件下におけるインドールの共役付加によって環化の前駆体を得た(それはパラジウムクロスカップリング反応の基質であり、該パラジウムクロスカップリング反応によりシクロヘプテンが得られる)。ジメチルスルホキソニウムイリドの使用によりラセミ体のシクロプロパンを得た。この化合物をSFCキラルクロマトグラフィーにより分割した。この分割は大スケール(例えば>100g)に適していた。tert-ブチルエステルをTFA/CH2Cl2で処理して酸を得て、それを、CH2Cl2およびTFAを除去した後で粗生成物として単離した。該クルードな酸を、HATUおよびヒューニッヒ塩基の存在下においてCH2Cl2中で(1R,5S)-3-メチル-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタンのビス-HCl塩とカップリングさせ、カラムクロマトグラフィーにより精製した後で、アミドを得た。MeOHおよびTHFの混合物中においてLiOHを用いて加水分解させ、CH2Cl2で抽出ワークアップおよびトリチュレートして、最後から2番目の化合物を得た。該酸と1-メチルシクロプロパン-1-スルホンアミドの最終カップリング(EDCおよびDMAPにより促進させた)により、化合物1を得た。カラムクロマトグラフィー精製により得られた物質には〜3%のCH2Cl2残留溶媒が含まれていた(それは高真空下で80℃にて除去することが難しい)。CH2Cl2を、API/MeOHを溶解させてエバポレートして最終的に60℃にて24時間高真空で乾燥させることを繰り返して、除去した。
スキーム1.
スキーム2
tert-ブチル 2-((2-ブロモ-5-フルオロフェニル)(ヒドロキシ)メチル)アクリレート
この方法は、(4s)-キヌクリジン-3-オールのより経済的な代替品としてDABCOを用いる。1 L フラスコに、2-ブロモ-5-フルオロベンズアルデヒド(13.4 g, 66.0 mmol)、DABCO(14.81 g, 132 mmol)、DMF(53.6 mL)および水(13.4 mL)を入れた。この反応混合液に、tert-ブチル アクリレート(12.68g, 99.0 mmol)を加えた。次いで、該混合液を室温で12時間撹拌した。その後、TLCにより出発物質の消費が示された。該反応混合液を25 mLの水で希釈した後、100 mLのMTBEで2回抽出した。有機相を合わせて、0.1N HCl、水および食塩水で洗浄した。次いで、それをMgSO4で乾燥させ、濾過し、濃縮して、25 g(>100%)の生成物を無色の油状物として得て、それをさらなる精製は行わずに用いた。
tert-ブチル 2-(アセトキシ(2-ブロモ-5-フルオロフェニル)メチル)アクリレート
DCM(500 mL)中のヒドロキシ出発物質(18 g, 54.4 mmol)の混合液に、無水酢酸(6.15 mL, 65.2 mmol)、ヒューニッヒ塩基(12.3 mL, 70.7 mmol)およびDMAP(0.066 g, 0.54 mmol)を加えた。この混合液を室温で2時間撹拌した後、減圧濃縮した。残渣をエーテル(500mL)で希釈し、0.1N HCl、水および食塩水で洗浄した。その後、有機相をMgSO4で乾燥させ、濾過し、減圧濃縮して19 g(94%)のアセテートを黄色の油状物として得た。 1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 7.57 (dd, J=8.8, 5.3 Hz, 1H), 7.09 (dd, J=9.3, 3.0 Hz, 1H), 6.96 (ddd, J=8.8, 7.8, 3.0 Hz, 1H), 6.92 (d, J=0.8 Hz, 1H), 6.45-6.41 (m, 1H), 5.54-5.49 (m, 1H), 2.18-2.15 (s, 3H), 1.47-1.43 (s, 9H). LCMS: (RT = 1.46分), カラム: PHENOMENEX-LUNA 2.0 x 30mm (3μm), 移動相: グラジエント 60-100%B, 溶媒A(90%水:10%メタノール:0.1%TFA), 溶媒B(10%水:90%メタノール:0.1%TFA), 流速: 1.0 mL/分; (M+H+23) = 397.08.
(E)-メチル 1-(3-(2-ブロモ-5-フルオロフェニル)-2-(tert-ブトキシカルボニル)アリル)-3-シクロヘキシル-1H-インドール-6-カルボキシレート
10-メチル 6-(2-メチル-2-プロパニル) 13-シクロヘキシル-3-フルオロ-7H-インドロ[2,1-a][2]ベンゾアゼピン-6,10-ジカルボキシレート
5-メチル 1a-(2-メチル-2-プロパニル)(1aR,12bS)-8-シクロヘキシル-11-フルオロ-1,12b-ジヒドロシクロプロパ[d]インドロ[2,1-a][2]ベンゾアゼピン-1a,5(2H)-ジカルボキシレート
5-メチル 1a-(2-メチル-2-プロパニル) (1aR,12bS)-8-シクロヘキシル-11-フルオロ-1,12b-ジヒドロシクロプロパ[d]インドロ[2,1-a][2]ベンゾアゼピン-1a,5(2H)-ジカルボキシレート
(1aS,12bR)-8-シクロヘキシル-11-フルオロ-5-(メトキシカルボニル)-1,12b-ジヒドロシクロプロパ[d]インドロ[2,1-a][2]ベンゾアゼピン-1a(2H)-カルボン酸
出発物質(700 mg, 1.39 mmol)およびTFA(5 mL, 64.9 mmol)の混合液を室温で3時間撹拌した。LCMSによってジエステルの完全な消費が示された。その後、該反応混合液を減圧濃縮して、630 mg(100%)の生成物をオフホワイト色の固形物として得た。 1H NMR (400 MHz, CDCl3)(回転異性体) δ 8.41 (d, J=1.0 Hz, 0.6H), 8.16 (s, 0.4H), 7.91 (d, J=8.8 Hz, 0.4H), 7.85 (d, J=8.5 Hz, 0.6H), 7.75 (dd, J=8.4, 1.4 Hz, 0.4H), 7.67 (dd, J=8.4, 1.4 Hz, 0.6H), 7.49-7.34 (m, 2H), 7.25-7.13 (m, 1H), 5.50 (d, J=15.6 Hz, 0.6H), 5.28 (d, J=15.1 Hz, 0.4H), 4.05 (d, J=15.1 Hz, 0.4H), 3.96 (s, 1.2H), 3.95 (s, 1.8H), 3.52-3.45 (m, 0.6H), 3.00-2.74 (m, 2H), 2.23-1.23 (m, 11.6H), 0.24 (t, J=6.0 Hz, 0.4H); LCMS: (RT = 2.60分), カラム: PHENOMENEX-LUNA 2.0 x 30mm (3μm), 移動相: グラジエント 0-100%B, 溶媒A(90%水:10%メタノール:0.1%TFA), 溶媒B(10%水:90%メタノール:0.1%TFA), 流速: 1.0 mL/分 (M+H) = 448.29.
メチル (1aR,12bS)-8-シクロヘキシル-11-フルオロ-1a-((3-メチル-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタ-8-イル)カルボニル)-1,1a,2,12b-テトラヒドロシクロプロパ[d]インドロ[2,1-a][2]ベンゾアゼピン-5-カルボキシレート
(1aR,12bS)-8-シクロヘキシル-11-フルオロ-1a-((3-メチル-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタ-8-イル)カルボニル)-1,1a,2,12b-テトラヒドロシクロプロパ[d]インドロ[2,1-a][2]ベンゾアゼピン-5-カルボン酸
(1aR,12bS)-8-シクロヘキシル-11-フルオロ-N-((1-メチルシクロプロピル)スルホニル)-1a-((3-メチル-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタ-8-イル)カルボニル)-1,1a,2,12b-テトラヒドロシクロプロパ[d]インドロ[2,1-a][2]ベンゾアゼピン-5-カルボキサミド
5-メチル 1a-(2-メチル-2-プロパニル) (1aR,12bS)-8-シクロヘキシル-11-フルオロ-1,12b-ジヒドロシクロプロパ[d]インドロ[2,1-a][2]ベンゾアゼピン-1a,5(2H)-ジカルボキシレート
メチル (1aR,12bS)-8-シクロヘキシル-11-フルオロ-1a-((3-メチル-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタ-8-イル)カルボニル)-1,1a,2,12b-テトラヒドロシクロプロパ[d]インドロ[2,1-a][2]ベンゾアゼピン-5-カルボキシレート
N-(tert-ブチル)-1-メチルシクロプロパン-1-スルホンアミド
1-メチルシクロプロパン-1-スルホンアミド
HCV NS5B RdRpクローニング、発現、および精製
HCVのNS5Bタンパク質、遺伝子型1bをコードするcDNAをpET21a発現ベクターにクローニングした。該タンパク質を18個のアミノ酸のC-末端切断で発現させ、溶解性を増強した。大腸菌コンピテント細胞株BL21(DE3)を、該タンパク質の発現に用いた。培養物が600 nmで吸光度2.0になるまで、37℃で〜4時間培養した。該培養物を20℃まで冷却し、1 mM IPTGで誘導した。新鮮なアンピシリンを最終濃度50 μg/mlまで添加し、該細胞を終夜20℃で増殖させた。
ビーズ上固相均一アッセイ(on-bead solid phase homogeneous assay)を、NS5B阻害剤を評価するために、384-ウェル型において用いた(WangY-K, Rigat K, Roberts S, and Gao M (2006) Anal Biochem, 359: 106-111)。ビオチン標識オリゴdT12プライマーを、プライマーおよびビーズを1Xバッファー中で混合して、室温で3時間インキュベートすることによって、ストレプトアビジンでコーティングしたビーズ(SPAビーズ(GE, RPNQ0007)もしくはimaging bead(GE, RPNQ0261)上に結合させた。未結合のプライマーを遠心分離して除去した。プライマー-結合ビーズを、3x反応混合物(20 mM Hepes バッファー, pH 7.5、dTプライマー結合ビーズ、ポリA鋳型、3H-UTP、およびRNAse阻害剤(Promega N2515))中に再懸濁させた。化合物をDMSO中で1:3に連続希釈し、アッセイプレート中に等分した。等量の(10 μL)の水、3X反応混合物、および3Xアッセイバッファー(60 mM Hepes バッファー, pH 7.5、7.5 mM MgCl2、7.5 mM KCl、3 mM DTT、0.03 mg/mL BSA、6%グリセロール)の酵素を、アッセイプレート上の希釈した化合物に加えた。384-ウェルアッセイにおける成分の最終濃度: 0.36 nM 鋳型、15 nM プライマー、0.29 mM 3H-UTP(0.3 μCi)、1.6 U/μL RNAse阻害剤、7 nM NS5B酵素、0.01 mg/mL BSA、1 mM DTT、および0.33 μg/μLビーズ、20 mM Hepesバッファー、pH 7.5, 2.5 mM MgCl2、2.5 mM KCl、および0.1%DMSO。
化合物を評価するために用いた細胞株は、ウミシイタケルシフェラーゼレポーター遺伝子を有する遺伝子型1bのHCVレプリコンを恒常的に発現するヒト肝細胞由来細胞株(Huh-7)から成る。これらの細胞を、10%FBS、100 U/mL ペニシリン/ストレプトマイシンおよび1.0 mg/mL G418を含有するダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)中で維持した。
化合物の有効性を評価するために、用量設定した化合物を無菌の384-ウェル組織培養プレート(tissue culture treated plate)に移し、該プレートにHCVレプリコン細胞(2.4 x 103細胞/ウェルの密度で50 μL)を、4%FCSを含有するDMEM中(最終DMSO濃度 0.5%)中に播種した。37℃で3日間インキュベートした後、細胞を、EnduRen基質(Promega cat #E6485)を用いて製造者の指示書に従って、ウミシイタケルシフェラーゼ活性について分析した。簡単に述べると、該EnduRen基質をDMEMに希釈し、次いでプレートに、7.5 μMの最終濃度まで添加した。該プレートを、37℃で少なくとも1時間インキュベートした後、Viewlux Imager (PerkinElmer)において、発光プログラム(luminescence program)を用いて、測定した。50%有効濃度(EC50)を、上記の4つのパラメーターロジスティック方程式を用いて算出した。
化合物Iについての酵素およびレプリコンデータを表2に報告する。
表2.
hERGフラックスアッセイは、hERG阻害を予測するための相対的なハイスループット機能分析(FLIPR-ベースである)であり、公知のIKr阻害剤に対して検証されており、パッチクランプ、結合およびin silicoのモデリングデータと比較されている。
安定してhERGチャネルを発現するHEK293細胞を、10%Sigmaウシ胎仔血清、非必須アミノ酸、2mM L-グルタミンおよび500 μg/mL G418を加えたダルベッコ改変イーグル培地において、37℃にて、5%CO2インキュベーター中で、増殖させた。細胞を、10%血清培地中に2 x 104 細胞/ウェル(20 μl)の密度で、384-ウェル Corning ポリ-D-リジンコーティング黒色/透明プレートに入れ、細胞のコンフルエントな単層が得られるまで、5%CO2インキュベーター中において37℃で15-24時間インキュベートした。
BTC-AM色素(Molecular Probes, Eugene, OR)の2 mMストックを、100%DMSO中に調製し、次いで、アッセイ当日に1:1で10%(w/v)プルロニック酸/DMSOを加える。その後、該色素をhERG外部EPバッファー(external EP buffer)中に希釈する。このBTC色素混合液(30 μl)を細胞に加え、最終添加濃度 2.5 μMを得る。細胞を21℃で45分間インキュベートする。hERG外部EPバッファーには、140 mM NaCl、4.0 mM KCl、1.8 mM CaCl2、1.0 mM MgCl2、10 mM HEPES, pH 7.3および10 mMグルコースが含まれる;これはパッチクランプ実験に用いたバッファーと同じである(全てのバッファー成分はSigma Chemicalから入手)。
試験サンプルを、10 mM DMSOまで希釈し、384-ウェルプレートにおいてDMSOに1:2の比で連続希釈する。2.5 μlの連続希釈した試験サンプルを75 μlのhERG外部電気生理学的(EP)バッファーに移した。色素添加およびバッファー交換後、10 μlの 水で希釈した化合物を2つの複製プレートの細胞に加える。化合物を細胞と共に30-45分間予めインキュベートした後、アッセイをFLIPRで読み取る。サンプル調製物およびアッセイ希釈物から、80 μM〜0.156 nMの範囲の10ポイントの最終濃度を得る。
色素を添加した細胞を、FLIPR384(Molecular Devices, Sunnyvale, CA)(488 nm 波長(line)のアルゴンレーザーを用いて色素を励起させる)で読み取る。発光を、540 ± 30 nmのバンドパスフィルターを用いて、フィルターにかけた。10 μl/ウェルのEPバッファー(33 mM K2SO4および0.66 mM Tl2SO4(Sigma/Aldrich)を含む)を加えることによりhERGチャネルを刺激して開口させる。各プレートについて、データを1秒毎に10秒間集め、その後、タリウム含有刺激バッファーを加える。データ収集を、1秒毎に50秒間行い、その後、3秒毎にさらに2分間行う。刺激バッファーを加えることによって、アッセイ読み取り時に50 μlの最終量となり、0.65%の最終DMSO含量を得る。
hERGフラックスアッセイの統計的ロバスト性を、ブランクおよび全量(totals)のウェルから決定する。ブランクウェル(カラム21および22)は各化合物試験プレート(試験化合物が存在しない)についての最大hERG活性化を定義し、全量ウェル(カラム23および24)(hERGチャネル阻害剤(ドフェチリドまたはE-4031)の飽和濃度を含む)は100%hERGチャネル阻害を定義する。FLIPRプレートリーダーから得られた生の蛍光単位データファイルは、自動的にエクスポートされ、インハウスデータ解析ツールにより処理される。各濃度の試験化合物についての換算パーセント阻害データを、MathIQフィッティングエンジン(ID Business Solutions Limited, Surrey, UK)を用いて適合させた。試験化合物の所定の条件におけるタリウム流束について、蛍光の変化の最大振幅を適合させることにより、データを解析した。化合物の効力(IC50値)を、2つの10ポイント濃度反応曲線の平均から算出した。
表3: FLIPRデータ
細胞株
ヒト遅延整流性カリウムイオンチャネル遺伝子(hERG)cDNAで安定にトランスフェクトされたヒト胎児由来腎臓(HEK293)細胞を、hERGアッセイにおいて用いた。HEK293細胞において発現させたリコンビナントhERGチャネルおよびヒト心臓細胞における野生型のIKrチャネルの生物物理学的および薬理学的特性は、ほぼ同一である。いくつかの公知のhERG遮断薬(ドフェチリド、テルフェナジン、シサプリドおよびE 4031を含む)は、同一の効力で、hERG安定発現株におけるリコンビナントhERG電流および単離心筋細胞におけるIKr電流を阻害する。
膜電流を、Multiclamp 700シリーズ積分パッチクランプ増幅器(Axon Instruments, Foster City, California)で、全細胞パッチクランプ法の変型を用いて記録した。hERGカリウムチャネルを発現する細胞を、プレキシグラス(plexiglass)浴容器に設置し、倒立顕微鏡のステージに載せ、浴溶液で継続的に灌流した。
表4: パッチクランプデータ
Claims (3)
- 治療上有効な量の(1aR,12bS)-8-シクロヘキシル-11-フルオロ-N-((1-メチルシクロプロピル)スルホニル)-1a-((3-メチル-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタ-8-イル)カルボニル)-1,1a,2,12b-テトラヒドロシクロプロパ[d]インドロ[2,1-a][2]ベンゾアゼピン-5-カルボキサミドまたはその医薬的に許容される塩を、医薬的に許容されるアジュバント、担体または希釈剤とともに含む医薬組成物。
- 治療上有効な量の請求項1に記載の化合物を患者に投与することを含む、C型肝炎感染症の処置方法。
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