JP2014510518A - Hsa関連組成物および使用方法 - Google Patents
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Abstract
【選択図】図17
Description
本出願は、その内容全体を参照によって援用する、2011年2月15日に出願された、PCT出願第PCT/US2011/24855号明細書の優先権を主張する。
本出願は、2011年8月7日に作成され、45,056バイトのサイズを有する、「MED0554_PCT2_ST25」と題されたテキストファイルとして、EFS−Webを介して本出願と共に提出された配列表を参照によって組み込む。
新生児のFc受容体(FcRn)は、pH依存性機序によって、特にエンドソームの酸性pHで双方の分子を結合し、それらを再循環して細胞表面に戻し、したがって双方の分子をデフォルトのリソソーム分解経路からそらすことによって、IgGおよびヒト血清アルブミン(HSA)の双方の寿命を延長する。FcRn結合能力は、アルブミンのドメインIIIに内在性であることが示されている。
本開示は、HSA関連組成物および使用方法を提供する。本開示は、新生児FcRn結合断片および異種ポリペプチドまたはその生物活性断片を含んでなる、ヒト血清アルブミン(HSA)部分を含んでなるキメラポリペプチド、ならびに薬学的担体と組み合わされた、キメラポリペプチドを含んでなる組成物を提供する。このようなキメラポリペプチドを生成するのに有用な構築物もまた、開示される。さらに本開示は、キメラポリペプチドと、それらをコードする構築物を生成する方法を教示する。本開示は、ヒト血清アルブミン(HSA)部分を含んでなるポリペプチドをさらに提供し、そのHSA部分は、HSAドメインIII、またはその新生児Fc受容体(FcRn)結合断片を含んでなり、HSAドメインIIIは、1〜18個のアミノ酸置換を含んでなって、HSA部分が前記アミノ酸置換を含まない対照ポリペプチドと比較して、ポリペプチドのFcRn親和性および血清半減期の片方または双方を増大させる。本開示はまた、ヒト血清アルブミン(HSA)部分を含んでなるキメラポリペプチドも提供し、そのHSA部分は、HSAドメインIII、またはその新生児Fc受容体(FcRn)結合断片、および異種タンパク質を含んでなり、キメラポリペプチドは異種タンパク質の機能活性を保持してFcRnに結合することができ、HSAドメインIIIは、少なくとも1つのアミノ酸置換を含むことで、HSA部分が前記アミノ酸置換を含まない対照キメラポリペプチドと比較して、キメラポリペプチドのFcRn親和性および血清半減期の片方または双方を増大させる。さらに本明細書では、キメラポリペプチドを使用して、例えばタンパク質の血清半減期を増大させる方法が開示される。ポリペプチドの多様な大集団のスクリーニングに有用な、アデノウイルスライブラリーの生成に有用な、方法およびベクターもまた開示される。このような方法は、FcRn親和性および血清半減期の片方または双方を増大させる、HSAドメインIIIアミノ酸置換のスクリーニングと同定のために有用である。
本発明を例証する目的で、本発明の特定の実施形態が図面に描写される。しかし本発明は、図面に描写される実施形態の正確な配置、および手段に限定されない。
6.1 緒言
新生児のFc受容体(FcRn)は、pH依存性機序によって、特にエンドソームの酸性pHで双方の分子を結合し、それらを再循環して細胞表面に戻し、したがって双方の分子をデフォルトのリソソーム分解経路からそらすことによって、IgGおよびヒト血清アルブミン(HSA)の双方の寿命を延長する。FcRn結合能力は、アルブミンのドメインIIIに内在性であることが示されている。本明細書で実証されるように、HSAのFcRn結合断片の付加を使用して、タンパク質の血清半減期を増大させ、および/または抗体、抗体代替物、タンパク質、タンパク質スキャフォールド、およびペプチドなどの治療薬のFcRn結合親和性を増大させ得る。特に本明細書で実証されるように、酸性pH(例えばおよそ5.5のpH)ではFcRn結合親和性が増大するのに対し、中性pH(例えばおよそ7.4のpH)では親和性は実質的に変化しない。本開示のFcRn結合領域変種を含んでなるキメラポリペプチドは、野生型FcRn結合領域よりもなおさらに、タンパク質の血清半減期またはFcRn結合親和性を増大させてもよい。本発明のHSA変種ポリペプチドは、治療標的に結合するスキャフォールドの役割を果たしてもよく、または治療薬と共役してもよい。
本発明のさらに詳細な記述を継続する前に、特定の組成物または工程段階は変動することもあるため、本発明はそれらに限定されないものと理解される。本明細書および添付の特許請求範囲の用法では、文脈上例外が明記されていない限り、単数形「a」、「an」、および「the」は、複数指示対象を含むことに留意すべきである。
特定の態様では、本開示は、HSAドメインIIIを含んでなる、ヒト血清アルブミン(HSA)変種ポリペプチドまたはその新生児Fc受容体(FcRn)結合断片を提供し、前記変種ポリペプチドはFcRnに結合し得て、前記HSAドメインIIIは、1〜18個のアミノ酸置換を含んでなり、前記アミノ酸置換を欠く対照HSAポリペプチドと比較して、前記変種ポリペプチドの血清半減期を増大させ、またはFcRn親和性を増大させる。
本発明は、ドメインIIIを含んでなるHSA部分のコンビナトリアル変異体セット、ならびにトランケーション変異体を作り出すことをさらに想定し、生物活性変種配列を同定するのに特に有用である。天然HSAポリペプチドと比較して選択的効力を有する、コンビナトリアルケミストリー由来変種を生成し得る。同様に、変異誘発は、対応する野生型HSAポリペプチドと劇的に異なる、細胞内半減期を有する変種を生成し得る。例えは変性タンパク質は、対象タンパク質の破壊か、そうでなければ不活性化をもたらす、タンパク質分解またはその他の細胞プロセスに対して、より安定またはより不安定のいずれかにし得る。このような変異を利用してそれらの半減期を調節することで、HSAポリペプチドレベルを変化させ得る。例えば縮重オリゴヌクレオチド配列から、可能なHSA変種配列のライブラリーを作成し得る、多数の様式がある。自動DNA合成機内で縮重遺伝子配列の化学合成を実施し、次に発現のために、合成遺伝子を適切な遺伝子にライゲートし得る。遺伝子の縮重セットの目的は、可能なポリペプチド配列の所望のセットをコードする配列を全て、1つの混合物中に提供することである。縮重オリゴヌクレオチドの合成については、当該技術分野で周知である(例えばNarang,SA(1983)Tetrahedron 39:3;Itakura et al.,(1981)Recombinant DNA,Proc.3rd Cleveland Sympos.Macromolecules,ed.AG Walton,Amsterdam:Elsevier pp273−289;Itakura et al.,(1984)Annu.Rev.Biochem.53:323;Itakura et al.,(1984)Science 198:1056;Ike et al.,(1983)Nucleic Acid Res.11:477を参照されたい)。このような技術は、その他のタンパク質の指向性進化において用いられている(例えばScott et al.,(1990)Science 249:386−390;Roberts et al.,(1992)PNAS USA 89:2429−2433;Devlin et al.,(1990)Science 249:404−406;Cwirla et al.,(1990)PNAS USA87:6378−6382;ならびに米国特許第5,223,409号明細書、米国特許第5,198,346号明細書、および米国特許第5,096,815号明細書を参照されたい)。
本開示のHSA変種ポリペプチドをはじめとするHSA部分を含んでなるポリペプチドは、任意の異種タンパク質と結合してもよい。特定の実施形態では、異種タンパク質は治療薬である。特定の実施形態では、治療薬は抗体またはペプチドである。特定の実施形態では、キメラポリペプチドの異種タンパク質部分は、抗体またはその抗原結合性断片を含んでなる。特定の実施形態では、キメラポリペプチドは、IgG免疫グロブリンの定常領域をさらに含んでなる。特定の実施形態では、異種タンパク質は、非抗体治療用タンパク質を含んでなる。特定の実施形態では、キメラポリペプチドの異種タンパク質部分は、増殖因子またはサイトカインを含んでなる。特定の実施形態では、キメラポリペプチドは、エピトープをさらに含んでなる。例えば検出および/または精製に有用なエピトープ(例えばHisタグ、FLAGタグなど)。
特定の態様では、本開示は、本開示のポリペプチド(例えばHSA変種、HSA部分のあるキメラポリペプチド)のいずれかをコードするヌクレオチド配列を含んでなる、核酸構築物を提供する。さらに本発明は、キメラポリペプチドまたはHSA変種ポリペプチド(例えばそれらの生物活性断片、変種、および融合物をはじめとするHSA部分)を生成するために、このような核酸を利用する。ある特定の実施形態では、本発明の組換えキメラタンパク質を生成するために、核酸は、異種タンパク質(例えば抗体または治療用ペプチド)をコードするDNAをさらに含んでなってもよい。これらの核酸は全て、集合的にHSA核酸と称される。
特定の実施形態では、本開示は、本開示のキメラ融合物の異種タンパク質を使用して、処置可能な病的状態を処置する方法を提供する。特定の実施形態では、本開示は、前記タンパク質をHSA部分に結合させるステップを含んでなり、そのHSA部分が、ドメインIII、またはその新生児Fc受容体(FcRn)結合断片を含んでなる、対象中のタンパク質の血清半減期を増大させ、および/またはFcRn結合親和性を増大させる方法を提供する。特定の実施形態では、HSAドメインIIIは、1〜18個のアミノ酸置換を含んでなり、得られる対照ポリペプチドと比較して、相対的キメラポリペプチドのFcRn親和性、および血清半減期の片方または双方を増大させる。これらの方法は、上述したようなキメラまたはHSA変種ポリペプチドの治療有効量をそれを必要とする個体に投与するステップを伴う。特定の実施形態では、方法は、(a)HSA部分またはその生物活性断片と、(b)異種タンパク質とを含んでなる、キメラポリペプチドを投与するステップを含んでなる。これらの方法は、特に動物、およびより具体的にはヒトの治療的および予防的処置を目的としている。
特定の実施形態では、前記対象への投与は、HSA変種またはキメラポリペプチドを全身投与するステップを含んでなる。特定の実施形態では、前記対象への投与は、HSA変種またはキメラポリペプチドを経口的に投与するステップを含んでなる。特定の実施形態では、前記対象への投与は、前記HSA変種またはキメラポリペプチドを静脈内投与するステップを含んでなる。
本開示のキメラポリペプチドは、(i)異種タンパク質の機能を実質的に保持して、(ii)非修飾HSA部分に結合したキメラポリペプチドと比較して、または別の適切な対照と比較して、FcRn親和性が増大し、および/または血清半減期が増大することに基づいて特徴付けられる。本開示のHSA変種ポリペプチドは、天然HSA部分と比較して、または別の適切な対照と比較して、FcRn親和性が増大し、および/または血清半減期増大することに基づいて特徴付けられる。キメラポリペプチドまたはHSA変種ポリペプチドの特性は、生体外(in vitro)または生体内(in vivo)の任意の1つまたは複数の適切なアッセイで評価してもよい。
特定の実施形態では、本開示の対象キメラまたはHSA変種ポリペプチドは、薬学的に許容可能な担体と配合される。1つまたは複数のキメラまたはHSA変種ポリペプチドは、単独でまたは製剤処方(組成物)の成分として投与し得る。キメラまたはHSA変種ポリペプチドは、医学または獣医学で使用するために、任意の都合良い投与方法のために配合されてもよい。ラウリル硫酸ナトリウムやステアリン酸マグネシウムなどの湿潤剤、乳化剤、および潤滑剤;ならびに着色剤、剥離剤、コート剤、甘味剤、着香料および芳香剤、保存料および抗酸化剤もまた、組成物中に存在し得る。
特定の実施形態では、本開示は、本開示の少なくとも1つのキメラまたはHSA変種ポリペプチドで充填された、1つまたは複数の容器を含んでなる医薬品包装またはキットもまた提供する。特定の実施形態では、本開示の製剤は、異種タンパク質、異種ポリペプチド、異種ペプチド、大分子、小分子、マーカー配列、診断用薬または検出可能作用物質、治療成分、薬剤成分、放射性金属イオン、第2の抗体、および固体担体をはじめとするが、これに限定されるものではない別の部分と、組換え的に融合または化学的に結合する、キメラまたはHSA変種ポリペプチドを含んでなる。特定の実施形態では、本開示の製剤は、無菌液体として単回投与バイアルに調合される。本開示の製剤は、目標体積1.2mLの3cc USP I型ホウケイ酸褐色バイアル(West Pharmaceutical Serices;パーツ番号6800−0675)で提供されてもよい。例示的な容器としては、バイアル、ボトル、充填済みシリンジ、IVバッグ、ブリスター包装(1つまたは複数の丸薬を含んでなる)が挙げられるが、これに限定されるものではない。医薬品または生物学的製剤の製造、使用または販売を規制する行政機関によって規定される形式の注意書きは、このような容器に任意選択的に付随してもよく、その注意書きは、行政機関によるヒトの診断および/または投与のための製造、使用または販売認可を反映する。
宿主細胞からの組換えアデノウイルス粒子の生成に有用なDNAベクターは、当該技術分野で周知であり、市販の試薬が容易に入手できる(例えばInvitrogenからのカタログ番号V493−20およびV494−20を参照されたい)。本開示は、アデノウイルス粒子の生成に有用なDNAベクター中にOriP配列を組み込むことで、組換えアデノウイルス(本明細書中でアデノウイルスベクターとも称される)の生成を促進する方法を提供する。OriP含有アデノウイルスベクターは、EBNA−1タンパク質の発現のための配列をさらに含んでなってもよく、または代案としては、EBNA−1タンパク質を発現する宿主細胞が、組換えアデノウイルス粒子を生成するために使用される。OriP含有アデノウイルスベクターは、対象DNA配列(例えばHSAドメインIII変種をコードするDNA配列)の多様な/複合体ライブラリーを含んでなる、組換えアデノウイルスの集団を生成するのに特に有用である。
(i)別のベクターによる組換えクローニングのための組換え部位(例えばattR1およびattR2)、このような部位は、当該ベクターから作成された組換えアデノウイルス中における発現のために、対象DNA配列のクローニングをもたらすのに有用である;
(ii)選択および/または対抗選択に有用な抗生物質/薬剤(例えばクロラムフェニコール)耐性遺伝子および/または毒素発現遺伝子(例えばccdB遺伝子);
(iii)対象DNA配列のサブクローニングに有用なクローニング部位(マルチクローニング部位であってもよい);
(iv)1つまたは複数の対象タンパク質をコードする、1つまたは複数の対象遺伝子を含んでなってもよい対象DNA;
(v)幅広い哺乳類細胞(例えばヒトサイトメガロウイルス(CMV)即時初期プロモーター)中における対象遺伝子発現のためのプロモーター、プロモーターは、構成的であってもまたは誘導性であってもよい;
(vi)対象タンパク質の検出および/または精製のためのエピトープタグ(例えばHis6Xエピトープ)。エピトープタグは、対象組換えタンパク質の5’または3’末端のいずれに存在してもよい;
(vii)mRNAの効率的な転写終結、およびポリアデニル化のためのポリアデニル化(ポリA)配列(例えばシミアンウイルス40ポリA配列);
(viii)大腸菌(E.coli)中のプラスミドの高コピー数複製と維持のための複製起点;
(ix)大腸菌(E.coli)中における選択のための抗生物質耐性遺伝子;
(x)ベクターの線形化のための制限酵素部位(例えばPacI)、制限酵素部位は要素(viii)および(ix)の側面に位置してもよい;および
(xi)EBNA−1タンパク質をコードするDNA配列。
1.(a)ヒト血清アルブミン(HSA)部分と、(b)異種タンパク質とを含んでなるキメラポリペプチドであって、そのHSA部分が、HSAドメインIII、またはその新生児Fc受容体(FcRn)結合断片を含んでなり、キメラポリペプチドが異種タンパク質の機能活性を保持してFcRnに結合し得て、前記HSAドメインIIIが1〜18個のアミノ酸置換を含んでなって、HSA部分が前記アミノ酸置換を含まない対照キメラポリペプチドと比較して、キメラポリペプチドのFcRn親和性および血清半減期の片方または双方を増大させる、キメラポリペプチド。
ここで本発明を一般的に記述し、それは、本発明の特定の態様および実施形態の単なる例証のみを目的とし、本発明の限定を意図しない、以下の実施例を参照してより容易に理解されるであろう。例えば本明細書で開示される特定の構築物および実験デザインは、適切な機能を検証するための例示的なツールと方法に相当する。したがって開示される特定の構築物および実験計画のいずれかを本開示の範囲内で置換し得ることは、容易に分かるであろう。さらに使用される特定の装置と試薬、サイズ、製造会社などの特定の一覧または説明は、特にそうである旨の断りのない限り、本発明の限定と見なされないことが理解されるであろう。同様に機能するその他の装置および試薬で容易に置換してもよいことが、さらに理解されるであろう。
本実施例は、表面プラズモン共鳴(SPR)を使用して、ヒトFcRnに対するHSAのドメインIIIの結合、解離、および平衡親和定数を測定する。ドメインIII(「DIII」とも略記される)は、アミノ酸残基381〜585に及ぶ、ヒト血清アルブミンタンパク質断片である。ドメインIIIのアミノ酸配列は、配列番号1で記載される。完全長成熟HSAのアミノ酸配列は、配列番号2で記載される。これらの実験で使用するために、ピキア・パストリス(Pichia pastoris)(Pichia Patoris)からドメインIIIを発現させて精製した。
ドメインIII遺伝子をコードする組換えプラスミドは、Geneart AG,Regensburg,Germanyから得られた。制限酵素EcoRIおよびNotIを使用して、供給業者が提供するベクターからドメインIII遺伝子を摘出し、pPICZ−α−Aピキア属(Pichia)発現ベクター(Invitrogen;カタログ番号V195−20)にクローニングした。組換えドメインIIIタンパク質は、製造会社の使用説明書に概説される様式で発現させた。組換えドメインIIIタンパク質は培地中に分泌され、GE Healthcare(カタログ番号17519701)からのHiTrapブチルセファロース・ファストフロー・カラム上の疎水性相互作用クロマトグラフィーによって精製された。簡単に述べると、培養液の塩分およびpHは、1.5M硫酸アンモニウムおよび50mMリン酸ナトリウム、pH7.0に、最初に調節した。培養液を濾過してブチルセファロースカラムに通過させ、低塩pH7.0ナトリウムリン酸緩衝液を使用して、結合ドメインIIIを溶出した。50℃に保たれる循環水ジャケット付きヒドロキシアルコキシプロピル デキストラン(Hydroxyaloxypsopyl Dextran)(Sigma−Aldrich;カタログ番号H6258)カラムに、精製タンパク質の画分を通過させて脱脂した。クマシーブルー染色による4〜12%SDS PAGEによる視覚化で、脱脂および非脱脂形態双方の純度は99%であった(図1A)。タンパク質濃度は、A280で測定した。これまで公表された測定と密な相関性がある、近紫外線CDおよび遠紫外線CDの測定によって、精製ドメインIIIの適切な折り畳みが確認された。(例えばGiancola et al.International Journal of Biological Macromolecules 20(1997)193−204を参照されたい)。
BIAcore T100装置(Uppsala,Sweden)上で、25℃で平衡、結合、および解離速度定数を測定し、BIAcore T100評価ソフトウェアv.1.1(BIAcore,Inc,Uppsala,Sweden)を使用してデータを分析した。標準アミン共役(BIAcore Handbook、2002)によって、CM4(カタログ番号BR−1005−39)またはCM5チップ(カタログ番号BR−1000−14)上に、ドメインIIIの非脱脂および脱脂の双方の形態をそれぞれ1016および1184 RUの共役密度で、共有結合的に固定化した。フローセルの1つは、同一固定化プロトコルを使用して、タンパク質なしで模擬共役させて空試験とした。全ての注入は、pH5.5、50mMリン酸および150mMNaCl緩衝液中で作成し、チップ表面をpH7.4のリン酸緩衝食塩水(PBS)で、注入と注入の間に再生した。結合定数(kon)、解離定数(koff)、および平衡解離定数(KD)を単一実験で測定するために、固定化ドメインIIIタンパク質上に、増大する濃度のヒトFcRn(39nM〜40μM)を50μL/分で注入した(図1B、左パネル)。結合を平衡に至らせて、運動定数konおよびkoffは、曲線の結合相(4分間)および解離相(1分間)の双方を1:1ラングミュアモデルに同時に適合させることで誘導した。KDは、非線形回帰分析を使用して、検体濃度と対比される平衡結合応答(Req)プロットを定常状態親和性モデルに適合させることで誘導した(図1B、右パネル)。ドメインIIIの脱脂および非脱脂双方の形態は、同様の結合センサーグラム、およびReq対リガンド濃度プロットを示した。
この実験は、HSAのドメインIIIと治療用タンパク質または抗体、またはその変種との融合が、相互作用のpH依存性に影響を及ぼすことなく、酸性pHにおける、治療用タンパク質/抗体のFcRnに対する親和性を改善することを実証した。これはpH5.5におけるFcRnの親和性を増大させ、血清半減期増大につながると思われる(例えば生体内または適切なモデル系中の寿命改善)。例えば、ヒトFcRn遺伝子の単一コピーを発現する(が、マウスFcRnを欠く)遺伝子組換えマウス中において、治療用タンパク質に融合したドメインIIIを含んでなるHSA部分の薬物動態学的半減期測定を実施して、野生型または変種ドメインIIIを含んでなる部分との融合の半減期に対する影響を評価してもよい。
代表的タンパク質としてヒトIgG1を使用し、IgG単独と、HSAまたはドメインIIIに融合したIgGとの間で、FcRn親和性を比較した。HSAまたはドメインIIIは、Gly−Gly−Gly−Gly−Serの4つの反復単位を含んでなるリンカーを介して、ヒトIgG1重鎖のC末端に融合させた(図2A)。FcRn上のIgG結合部位とHSA結合部位の間の距離に基づいて、リンカーの長さをデザインし、双方のリガンドをそれぞれの結合部位に同時に結合させた。天然IgGと比較して、10倍改善されたFcRn親和性を示す、以前記載されているIgGの高親和性変種(IgG−YTE、Dall’Acqua, et al.,2002,J Immunol.,169:5171−5180を参照されたい)のHSAおよびドメインIII融合バージョンもまた、同様にして生成した。したがって以下の構築物が生成されて、使用された:
IgG
IgG(YTE)
IgG−(G4S)4−HSA
IgG−(G4S)4−ドメインIII
IgG(YTE)−(G4S)4−HSA
IgG(YTE)−(G4S)4−ドメインIII
簡単に述べると、全ての6つの構築物を発現ベクターにクローンして、293F細胞(GIBCOカタログ番号R79007)中における一過性発現によってタンパク質を精製した。GE HealthcareからのHiTrap(商標)プロテインAアフィニティカラム(カタログ番号17−0403−03)を使用して、培養液中に分泌されたIgG1および融合タンパク質を精製した。還元および非還元の双方の条件下で、SDS PAGEによって精製タンパク質を分離し、クーマシー染色で視覚化して99%の純度を観察した(図2B)。
融合タンパク質のヒトFcRnの親和性(KD)をBIAcore T100装置(Uppsala,Sweden)上で測定した。簡単に述べると、ヒトIgG、IgG−(G4S)4−ドメインIII、IgG−(G4S)4−HSA、IgG−YTE、IgG−YTE−(G4S)4−ドメインIII、およびIgG−YTE−(G4S)4−HSAは、装置製造会社により概説されるようにして、標準アミノ共役化学を使用して、2つのSeries 5センサーチップ(GE Healthcare)上の別個のフローセルに高密度で固定化した。最終表面IgG密度は、それぞれ5116、5258、6097、5256、5561、および5531RUであった。参照フローセルもまた、いかなるタンパク質もなしに同一固定化プロトコルを使用して、各センサーチップ上で調製した。タンパク質共役セルと参照セル双方の表面に、50mMのP04、150mMのNaCl緩衝液、pH5.5中の5.86nM〜3000nMの範囲にわたるヒトFcRnの2倍連続希釈液を5μL/分の流速で注入した。50分間にわたり結合データを収集し、0.05%のTween20を含有するpH7.4リン酸緩衝食塩水の複数回の60秒間の注入による再生がそれに続いた。BIAcore T100評価ソフトウェアv.1.1(BIAcore,Inc,Uppsala,Sweden)を使用して、各注入の平衡結合応答(Req)を濃度に対してプロットし、定常状態親和性モデル(図3)に適合させて、平衡結合定数KDを得た。挿入図は、固定化リガンドに対する、一連の濃度のFcRnの結合を表す。IgG−YTE変種と、対応する融合タンパク質のKDもまた、同一様式で誘導された(データ示さず)。
この実験は、HSAと抗体の融合が、抗体の血清半減期を増大させることを実証した。図7に示されるように、実施例1に記載されるIgG−HSA融合体の血清持続は、IgG単独と比較して増大した。血清半減期増大は、IgG−YTE変種で見られたのと同等であった。しかしこの研究では、IgG−YTE変種へのHSAの付加は、YTE単独を上回る著しい増強をもたらさないようであった。
ヒトFcRnは、抗β−2ミクログロブリン抗体を用いた免疫ブロット法によって視覚化されるように、濃度依存様式で、天然HSAウェルに結合することが観察された。しかし同様の実験条件下で試験された変性HSAを使用して、同様の結果は観察されなかった。
本実施例は、HSAおよびドメインIIIが成功裏に、酵母細胞表面に発現され得て、また酸性pHで実施された修正フローサイトメトリーで評価されるように、これらの提示タンパク質がpH依存様式でFcRnに結合もし得ることを実証する。したがって酵母細胞上の発現は、ドメインIIIにバリエーションを含有する構築物(例えばドメインIIIのみ、完全長HSA、トランケート型HSA、または少なくともドメインIIIを含んでなるキメラポリペプチド)をスクリーニングして、このような構築物が、例えば(i)FcRnに結合する能力、および(ii)非変種構築物と比較して増大した親和性でFcRnに結合する能力を評価する1つの方法を提供する。
HSA、ドメインIIIまたは一本鎖Fv断片(scfv)をpYD1酵母ディスプレイベクター(Invitrogen;カタログ番号V835−01)にクローンして、酵母細胞表面における提示のために、S.セレヴィシエ(S.cerevisiae)に形質転換した。pYD1は、ガラクトース誘導性プロモーターの制御下にある、S.セレヴィシエ(S.cerevisiae)タンパク質Aga2pとのC末端融合として、対象タンパク質を提示する。全ての実験的手順は、供給業者のマニュアルに記載されるようにして実施した。形質転換細胞は、栄養要求性選択マーカーであるウラシルおよびトリプトファンを使用して選択し、適切な選択培地中で培養した(Teknova Inc.;カタログ番号C8140)。培養物をガラクトースで最高48時間誘導し、Aga2p融合タンパク質を発現させた。細胞を0、24、および48時間目に試料採取した。0.1%アイシングラスを含有するpH7.2のPBSで、細胞サンプルを洗浄してブロックし、FITC結合ウサギポリクローナル抗HSA抗体(AbcamInc.;カタログ番号AB34669)で染色して、フローサイトメトリーにより分析した。
HSA、ドメインIIIまたはscfvを発現し、ガラクトースで48時間誘導された酵母細胞を、0.1%アイシングラスを含有するpH5.5、50mMのリン酸ナトリウム、150mMのNaCl緩衝液(FACS緩衝液とも称される)で、1時間ブロックした。次にpH5.5リン酸緩衝液中のビオチン化FcRn(70μM)と共に細胞をインキュベートし、ストレプトアビジンフィコエリトリン(PE)(Invitrogen Inc.)を使用して、結合FcRnを視覚化した。このように染色された細胞を、慣例的に使用されるPBSの代わりに、pH5.5、50mMのリン酸ナトリウム、150mMのNaCl緩衝液を用いて、フローサイトメトリーによって分析した。
遺伝子操作されてpENDisplayと称されるscFv−Fc発現カセット(図8Aを参照されたい)を含有するGateway(登録商標)エントリーベクター中で、scFv−Fcタンパク質の表面ディスプレイのために、グリコシルホスファチジルイノシトール(GPI)アンカーを使用する哺乳類表面ディスプレイライブラリーを構築した。異なるscFv配列のライブラリーが、Sfi/NotI部位に容易に挿入される。pENDisplayベクター中のライブラリーは、製造会社に従って、pAd/PL−DEST(商標)ベクター(Invitrogen;カタログ番号V494−20)ベクターと組み合わされて、アデノウイルス発現ライブラリーが作成され、合計約5×106個のコロニー形成単位(cfu)が得られた。アデノウイルスを生成するために、トランスに組換えアデノウイルスを生成するのに必要なE1タンパク質(E1aおよびE1b)を提供する、安定して組み込まれたE1遺伝子のコピーを含有する293A細胞(Invitrogen;カタログ番号R70507)に、直線化されて左右逆方向末端反復(ITR)が露出されるアデノウイルス発現ライブラリーを形質移入した。FACS分析によって、直線化アデノウイルスライブラリーで直接形質移入された293A細胞の少なくとも50%が、それらの表面に抗体を提示することが分かった。しかしアデノウイルス生成のために、直線化アデノウイルスライブラリーを293A細胞に形質移入すると、110mm(径)のシャーレあたり50個を下回るプラークが得られた。アデノウイルスを10日目に収穫してウイルスDNAを単離し、PCRを使用してscFvコード領域を増幅し、それをpENDisplayベクターに再度クローンして戻し、96個のコロニーを拾って配列決定した。14個のみの特有のVH配列が、96個のクローン分析から同定された。プラーク回収の低効率は、直線化アデノウイルスベクターの分解に起因することもあり、アデノウイルスライブラリー複雑度の著しい低下をもたらす。
ファージディスプレイおよび哺乳類細胞表面提示技術もまた、HSAおよびドメインIIIの可能なディスプレイプラットフォームとして評価された。ファージディスプレイプラットフォームは、恐らくこれらの分子中の多数のジスルフィド結合のために、細菌細胞表面にHSAおよびドメインIIIのどちらも発現しなかった(データ示さず)。しかし293−F細胞中の一過性の表面発現を使用する、哺乳類細胞ディスプレイシステムは、崩壊促進因子からのグリコシルホスファチジルイノシトール(Glycosylphosphatidylinisotol)(GPI)アンカーシグナルによって媒介され(例えば米国特許出願公開第2007/0111260号明細書に記載される変異DAF)、HSAおよびドメインIIIを成功裏に提示した。提示されるタンパク質は、FcRn結合能力を保持した(データ示さず)。
本実施例は、HSAへのFcRn結合仲介における、ドメインIII上の表面露出ループの役割を描写する。
ループ1:残基398〜400=3個のアミノ酸
ループ2:残基415〜419=5個のアミノ酸
ループ3:残基439〜443=5個のアミノ酸
ループ4:残基468〜470=3個のアミノ酸
ループ5:残基480〜482=3個のアミノ酸
ループ6:残基492〜509=18個のアミノ酸
ループ7:残基516〜517=2個のアミノ酸
ループ8:残基537〜541=5個のアミノ酸
ループ9:残基561〜564=4個のアミノ酸
アミノ酸配列アラインメントによって、13の異なる動物種間において、ドメインIII中で保存された表面接近可能なアミノ酸残基が同定された。このような保存された残基をアラニンに単独に変異させて、FcRn結合中におけるそれらの役割を判定する。
システインおよびプロリンを除く、ドメインIII中の全てのアミノ酸を全ての20個のアミノ酸に変異させ(すなわち野生型アミノ酸および全ての19個の非野生型アミノ酸)、個々の変異体が単一変異を1つの位置にのみ有するように、変異体ライブラリーを作成する。205個のアミノ酸の全長が、ライブラリー構築によってカバーされ;したがって184個の残基は個々に変異して、3496種の全ライブラリー多様性がもたらされる。ドメインIII単独、全長HSAタンパク質、トランケート型HSA、または少なくともドメインIIIを含んでなるキメラタンパク質の1つまたは複数の文脈で、ドメインIII変異が導入されてスクリーニングされる。標準変異誘発法を利用して、ドメインIII変異体ライブラリーを作成し得る。任意選択的にまたは代案としては、Geneart AG,Germanyなどの商業施設によって、ドメインIII変異体のライブラリーが、作成される。組換えアデノウイルスの生成改善のためにOriP配列を含んでなる(OriPを含んでなる汎用エントリーベクターの概略図については図10を参照されたい)、上述される、pYD1酵母ディスプレイベクターまたは哺乳類ディスプレイベクターpEN−HSA−GPIなどのディスプレイベクターに、変異体ライブラリーをクローンして、本出願に記載されるに標準生体外アッセイ(例えばフローサイトメトリー)を使用して、FcRn結合能力についてスクリーニングする。FcRnに対する改善された親和性を提示する変種が、同定される。各変種はまた、スクリーニングされて、FcRn親和性改善が酸性pHのみで起きて、中性pHで起きないかどうかが判定されてもよい。酸性pHでは改善されるが、中性pHでは改善されないFcRn親和性は、(i)変種ドメインIII構築物のみ;(ii)完全長HSAの文脈で提示される変異ドメインIII構築物;または(iii)キメラポリペプチドの文脈で試験されてもよい。前述の事項は、野生型ドメインIII、野生型完全長HSA、または変異なしのキメラポリペプチドと比較される。実験デザインは、FcRn親和性を改善する変異がある結合エピトープを同定できるようにする。
実施例10(上記)で同定される最も頻度の高い変異の組み合わせを調べるために、残基407;415;463;495;508;509;511;512;515;516;517;521;523;524;526;527;および557が、表7に示される残基に変異されるように、合成ドメインIIIライブラリーを作成して、個々の変異体が2〜4個の変異を有するように、変異体ライブラリーを作成する。代案としては、列挙される各残基が、全ての20個のアミノ酸(すなわち野生型アミノ酸と全ての19個の非野生型アミノ酸)に変異されるようにライブラリーを作成して、より大規模な組み合わせのセットを調べてもよい。
18個の単一アミノ酸がドメインIII中の保存アミノ酸から選択され、本出願に記載される標準法を使用して、各変種が単一変異を1つの位置のみに有するように、単独にアラニンに変異させる。18個の変種を導入して、全長HSAタンパク質の文脈で、または代案としてはトランケート型HSA、または少なくともドメインIIIを含んでなるキメラタンパク質中でスクリーニングする。本出願に記載されるi標準生体外アッセイを使用して、FcRn結合能力について18個の変種をスクリーニングする。FcRnに対する親和性改善を提示する変種が、同定される。各変種はまた、スクリーニングされて、FcRn親和性改善が酸性pHのみで起きて、中性pHで起きないどうかが判定される。酸性pHでは改善されるが、中性pHでは改善されないFcRn親和性は、(i)変種ドメインIII構築物のみ;(ii)完全長HSAの文脈で提示される変異ドメインIII構築物;または(iii)キメラポリペプチドの文脈で試験されてもよい。前述の事項は、野生型ドメインIII、野生型完全長HSA、または変異なしのキメラポリペプチドと比較される。
位置463、508、523、および524を全ての19個の非野生型アミノ酸に別々に変異させ、本質的に上述したように、76個の個々の点変異のセットをクローンして発現させた(「HSA−DIII変異体の生成および発現」と題された上の節を参照されたい)。チップと共役している抗HSA(非ドメインIIIバインダー)を使用して、BIAcore分析を実施し、細胞上清からHSA変種を捕捉した。次にヒトFcRnをチップ上に通過させてpH5.5で結合させ、pH5.5における結合と解離を測定した。この構成では、解離定数(kd(1/s))が、結合定数よりもさらに正確である。野生型HSAよりも少なくとも2.5倍遅いオフ速度を有する単一変異体の結合定数が、表8に提供される。表8を見ても分かるように、これらの位置における多数の置換が、野生型HSAと比較して、より緩慢なオフ速度と、FcRn結合改善をもたらす。
改善されたFcRn結合HSA変異体が、長期の半減期を有するという概念実証を試験するために、目下利用できる唯一のマウスモデルは、huFcRn tgnマウスである(マウス遺伝子の同型接合KO、およびヒト遺伝子の異型接合KI)(PetkovaS.B et al,(2006)International Immunology,Vol.18,No.12,pp.1759−1769)。このモデルは、HSA半減期測定の観点から、Wt HSAよりも10倍高い親和性で、ヒトFcRnと結合する、マウス血清アルブミン(600μM)の非常に高い循環濃度という、重大な限界を有する。しかしこのモデルは、試験されたHSA変種が、マウス血清アルブミン(MSA)と成功裏に競合できれば使用し得る。
Claims (32)
- ヒト血清アルブミン(HSA)部分を含んでなるポリペプチドであって、そのHSA部分がHSAドメインIII、またはその新生児Fc受容体(FcRn)結合断片を含んでなり、前記HSAドメインIII、またはその新生児Fc受容体(FcRn)結合断片が、完全長成熟HSA中の位置に対応して番号付けされた、
(a)残基463および508;
(b)残基463および523;
(c)残基463および524;
(d)残基508および523;
(e)残基508および524;
(f)残基523および524;
(g)残基463、508、および523;
(h)残基463、508、および524;
(i)残基463、523、および524;
(j)残基508、523、および524;および
(k)残基463、508、523、および524
からなる群から選択される位置におけるアミノ酸置換を含んでなり、前記置換が、HSA部分が前記アミノ酸置換を含まない対照ポリペプチドと比較して、前記ポリペプチドのFcRn親和性および血清半減期の片方または双方を増大させる、ポリペプチド。 - X1がロイシンでなく、および/またはX2がスレオニンでなく、および/またはX3がイソロイシンでなく、および/またはX4がリジンでない、配列番号18を含んでなるポリペプチドであって、X1がロイシンであり、X2がスレオニンであり、X3がイソロイシンであり、X4がリジンである対照ポリペプチドと比較して、FcRn親和性増大および血清半減期増大の片方または双方を有するポリペプチド。
- X1が、システイン、フェニルアラニン、グリシン、ヒスチジン、イソロイシン、アスパラギン、セリン、またはグルタミンであり;X2がシステイン、グルタミン酸、イソロイシン、リジン、アルギニン、またはセリンであり;X3が、アラニン、システイン、アスパラギン酸、グルタミン酸、フェニルアラニン、グリシン、ヒスチジン、イソロイシン、リジン、ロイシン、メチオニン、アスパラギン、プロリン、グルタミン、アルギニン、セリン、スレオニン、バリン、トリプトファン、またはチロシンであり;およびX4が、アラニン、フェニルアラニン、グリシン、ヒスチジン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、グルタミン、スレオニン、またはバリンである、請求項2に記載のポリペプチド。
- X1がアスパラギンであり、および/またはX2がアルギニンであり、またはX3がグリシンであり、および/またはX4がロイシンである、請求項2に記載のポリペプチド。
- 前記ポリペプチドが、前記対照ポリペプチドよりも高い親和性でFcRnに結合する、請求項1〜4のいずれか一項に記載のポリペプチド。
- 前記ポリペプチドが、前記対照ポリペプチドよりも高い親和性でFcRnに結合し、前記親和性が酸性pHで測定される、請求項1〜5のいずれか一項に記載のポリペプチド。
- 残基463における置換が、L463C、L463F、L463G、L463H、L463I、L463N、L463S、L463Qから選択され;残基508における置換が、T508C、T508E、T508I、T508K、T508R、T508Sから選択され;残基523における置換が、I523A、I523C、I523D、I523E、I523F、I523G、I523H、I523I、I523K、I523L、I523M、I523N、I523P、I523Q、I523R、I523S、I523T、I523V、I523W、I523Yから選択され;および残基524における置換が、K524A、K524F、K524G、K524H、K524I、K524L、K524M、K524Q、K524T、K524Vから選択される、請求項1、または請求項5〜6のいずれか一項に記載のポリペプチド。
- 残基463における置換が、L463F、L463Nから選択され;残基508における置換が、T508R、T508Sから選択され;残基523における置換が、I523D、I523E、I523F、I523G、I523K、I523Rから選択され;残基524における置換がK524Lである、請求項7に記載のポリペプチド。
- HSAドメインIII中の前記アミノ酸置換が、
(a)L463N/T508R;
(b)L463N//I523G;
(c)L463N/K524L;
(d)T508R/I523G;
(e)T508R/K524L;
(f)I523G/K524L;
(g)L463N/T508R/I523G;
(h)L463N/T508R/K524L;
(i)L463N//I523G/K524L;
(j)T508R/I523G/K524L;および
(k)L463N/T508R/I523G/K524L
からなる群から選択される、請求項7または8に記載のポリペプチド。 - HSAドメインIII中の前記アミノ酸置換がL463N/T508Rである、請求項9に記載のポリペプチド。
- HSAドメインIII中の前記アミノ酸置換がL463N//I523Gである、請求項9に記載のポリペプチド。
- HSAドメインIII中の前記アミノ酸置換がL463N/K524Lである、請求項9に記載のポリペプチド。
- HSAドメインIII中の前記アミノ酸置換がT508R/I523Gである、請求項9に記載のポリペプチド。
- HSAドメインIII中の前記アミノ酸置換がT508R/K524Lである、請求項9に記載のポリペプチド。
- HSAドメインIII中の前記アミノ酸置換がL463N/T508R/I523Gである、請求項9に記載のポリペプチド。
- HSAドメインIII中の前記アミノ酸置換がL463N/T508R/K524Lである、請求項9に記載のポリペプチド。
- HSAドメインIII中の前記アミノ酸置換がL463N//I523G/K524Lである、請求項9に記載のポリペプチド。
- HSAドメインIII中の前記アミノ酸置換がT508R/I523G/K524Lである、請求項9に記載のポリペプチド。
- HSAドメインIII中の前記アミノ酸置換がL463N/T508R/I523G/K524Lである、請求項9に記載のポリペプチド。
- 配列番号のアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド。
- 前記ポリペプチドが、異種タンパク質の機能活性を保持してFcRnに結合でき、異種タンパク質を含んでなる請求項1〜15のいずれか一項に記載のポリペプチド。
- 前記異種タンパク質が、抗体またはその抗原結合性断片を含んでなる、請求項21に記載のポリペプチド。
- 前記異種タンパク質が、治療用タンパク質を含む、請求項21または22に記載のポリペプチド。
- 前記異種タンパク質が、前記HSA部分と化学的にまたは組換え的に結合している、請求項21〜23のいずれか一項に記載のポリペプチド。
- 前記ポリペプチドが、異種非タンパク質作用物質の機能活性を保持しFcRnに結合できる、非タンパク質作用物質に結合する請求項1〜15のいずれか一項に記載のポリペプチド。
- 前記異種タンパク質または前記非タンパク質作用物質が、前記HSA部分のN末端アミノ酸に、前記HSA部分のC末端アミノ酸に、または前記HSA部分の内部アミノ酸に結合している、請求項21〜25のいずれか一項に記載のポリペプチド。
- HSA部分がHSAドメインIの少なくとも一部;またはHSAドメインIIの少なくとも一部;またはHSAドメインIの少なくとも一部と、HSAドメインIIの少なくとも一部をさらに含んでなる、請求項1〜26のいずれか一項に記載のポリペプチド。
- 請求項1〜27のいずれか一項に記載のポリペプチドと、薬学的に許容可能な担体とを含んでなる組成物。
- 請求項1〜22のいずれか一項に記載のポリペプチド、または請求項28に記載の組成物を前記対象に投与するステップを含んでなる、それを必要とする対象を治療する方法。
- 請求項1〜27のいずれか一項に記載のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含んでなる、核酸構築物。
- タンパク質を請求項1〜15または27のいずれか一項に記載のポリペプチドに結合させるステップを含んでなる、タンパク質のFcRn親和性および血清半減期の片方または双方を増大させる方法。
- 非タンパク質作用物質を請求項1〜15または27のいずれか一項に記載のポリペプチドに結合させるステップを含んでなる、非タンパク質作用物質のFcRn親和性および血清半減期の片方または双方を増大させる方法。
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