JP2011024580A - 癌細胞浸潤の診断及び予防 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】AXL、GAS6、MMP14、ADAM12、ADAM17、MT3MMP、FGF2、FGF5、FYN、LYN、DDR2、TIMP1、HB−EGF、SGK、RPS6RB1、MAP4K4、SIRPα及びAnnexin A2から成る群から選択した少なくとも1種の遺伝子の発現を測定し、並びにAXL遺伝子、AXLリガンド遺伝子又はタンパク質又はそのリガンドを抑制することから成る悪性疾患の浸潤度を減少させる。
【選択図】なし
Description
遺伝子発現を"材料及び方法"で記載したように、各々指示した細胞系からのRNAのcDNAアレイハイブリダイゼーション(2部の標本)により測定した。22種の選択した遺伝子は少なくとも75%の弱浸潤性BC細胞系、高浸潤性BC細胞系(赤及び緑バー)又は両方とも2倍より大きい中央倍率変化で、識別性に発現した。MCF10Aに関する遺伝子発現のレベルを、クラスターの下部キー中に示した色及びシャドウで表す。各色調は、尺度の下の数により挟まれた範囲の全ての値を包含する。GenBank accession number(第3表参照)及び各遺伝子の説明並びに自作アレイ膜上のスポット場所も得られる(遺伝子の別の第2及び3表参照)。確認試験は、アレイと同じRNA標本を用いて、ノーザン(AXL及びGAS6)又はRT−PCR分析(HER2発現及び増幅に関してはRoche system、未記載)により行った。他に記載のない限り、アレイとその他の方法間の一致は、大多数の試料に相関して、2倍以内であった:少なくとも10倍の、その他の方法論による倍率変化を過小評価するアレイの定性的一致。浸潤性及び弱浸潤性細胞系の位置はカラーバーにより示した。
遺伝子発現を"材料及び方法"で記載したように、指示した各細胞系及び原発性腫瘍からのRNAのcDNAアレイハイブリダイゼーション(二部の標本)により測定した。26種の選択遺伝子は少なくとも75%の弱浸潤性BC細胞系、高浸潤性BC細胞系(赤及び緑バー)又は両方とも2倍より大きい中央倍率変化で、特異的に発現した。正常な乳房組織(2つの混合)に関する遺伝子発現レベルは、クラスターの下部キー中に示した色及びシャドウで表す。各色調は、尺度の下の数により挟まれた範囲の全ての値を包含する。GenBank accession number(第3表参照)及び各遺伝子の説明並びに自作アレイ膜上のスポット位置も得られる。確認試験は、アレイで使用したと同じRNA標本を用いて、ノーザン(AXL及びGAS6、原発性腫瘍に関しては未記載)又はRT−PCR分析(HER2発現及び増幅に関してのみRoche system、未記載)により行った。他に記載のない限り、アレイとその他の方法間の一致は、大多数の試料に相関して、2倍以内であった;少なくとも10倍の、その他の方法論による倍率変化を過小評価するアレイの定性的一致。
指示した各細胞系から単離したmRNA(15μg/レーン)をcDNAアレイ上にデポジットしたフラグメントに相応するプローブを用いるハイブリダイゼーションによって指名遺伝子の発現に関して分析した。Ac745(正常乳房上皮細胞)に相応する各mRNAに関する発現レベルを各帯の下に記録する。主特異的帯に相応する大きさ(右)は各mRNAに関して文献で報告されたものと一致する。同じフィルターを用いてプローブし、これらの分析用にプローブした。パネル:A−発現AXL、B−GAS及びC−β−アクチンmRNA。β−アクチンのレベルを代表的フィルター用の試料荷重用の対照として表す。mRNAは2種の別々に増殖した細胞培養基から調製し、指示遺伝子の発現レベルに関して試験した。
細胞はマトリゲル層上で7〜14日間培養した。
A.3つの基本的形態学を表す写真は指示したBC細胞系を表す。B.傷アッセイ(Wound assay)は、MDA−MB−435Smock及びdnAXL突然変異体クローン2に関して表す。位置及び処理は図に記載する。倍率は×100であった。
A.細胞はマトリゲル層上で7〜14日間培養した(第1図の説明参照)。処理しなかったか又は指示したように抗体によって処理した。
A.AXL wt感染及び強制過剰発現の形態学的作用。MCF7細胞におけるAXL wtの過剰発現は、緊密な丸石形細胞から多数の突出拡張部を有する不規則形細胞への変化を生じる。
A.対照ベクターを発現するSF126神経膠腫細胞クローン(SF126−mock)、UFO/AXLの野生型(SF126−Ufo−WT)及びUFO/AXLの切端優性阻害型突然変異体形(SF126−Ufo−DN)のウェスタンブロット分析。血清−減少細胞を処理しないまま(−)か又は200μg/mlGas6で処理した(+)。溶解物を抗ホスホチロシン血清(上部パネル)又はヒトUFO/AXLの細胞外ドメインに対する抗体(下の列)でブロットした。SF126−moc細胞と比較して、分析により、各々SF126−UFO−WT及びSF126−UFO−DN細胞で増加(約30%)及び全廃のGas6/UFO/AXL媒介シグナリングが実証された。B〜D。SF126細胞(B)におけるUFO/AXLの切端優性阻害型突然変異体形の発現は、SF126−moc及びSF125−UFO−WT細胞(B及びC)に比べた場合に、それらの形態学を変化させた。
A.SF126細胞クローンに関する腫瘍容量の分析。腫瘍細胞をヌードマウス(n=4群当たりの動物)中に皮下に移植し、14日間追跡した。平均±SEM値を表す。*p<0.05対SF126−moc細胞。B.生体内多蛍光ビデオ顕微鏡法により評価した、SF126細胞クローンをヌードマウスのdorsal skinfold chamber中に移植後の腫瘍面積の定量的分析(左パネル)及び機能性血管密度(右パネル)(n=4、群当たりの動物)。平均±SD値を表す。統計分析をANOVA、次いで適切な事後検定(post hoc test)により群間の個別比較を実施した;*p<0.05対SF126−Ufo−DN細胞。C及びD.腫瘍容量の差異を示すSF126−UFO−WT腫瘍(C)及びSF126−UFO−DN腫瘍(D)の代表的組織形態学像。バーは1mmを表す。H&E染色。E及びF.腫瘍浸潤の差異を示すSF126−UFO−WT腫瘍(E)及びSF126−UFO−DN腫瘍(F)の代表的組織形態学像。SF126−UFO−WT腫瘍は、隣接皮膚筋肉及び皮下組織を広範囲に浸潤した(E)(矢印は破壊された筋肉層の残遺物を示す)が、SF126−UFO−DN腫瘍細胞浸潤はほぼ完全に抑制された(F)。(F)中で筋肉層の構造は保持された。バーは100μmを表す。H&E染色。H及びI.蛍光顕微鏡を単独(G)及び位相差と組み合わせて(H)、隣接組織層中へのSF126−UFO−DN腫瘍細胞の浸潤の不在を確認。腫瘍細胞は移植の前にDilで標識付けした。バーは100μmを表す。全試料は、ヌードマウスのdorsal skinfold chamber中へ移植後21日目に摘出した。t、腫瘍塊;m、皮膚筋肉層;sc、皮下組織。SF126−moc、対照;SF126−Ufo−WT、UFO/AXLの野生型を発現する細胞;SF126−Ufo−DN、UFO/AXLの切端優性阻害型突然変異体形を発現する細胞。
A.SF126細胞クローンのMTT増殖アッセイ。Gas6(200μg/ml)の不在及び存在下。細胞は左未処理(−Gas6)又は200μg/mlのGas6で処理した(+Gas6)。分析は培養48時間後に実施した。増殖率は刺激しなかったSF126−moc細胞に関して表す。平均値を表す。B及びC.UFO/AXL機能の抑制に付随する変化のない凝集能を実証するSF126−Ufo−WT及びSF126−Ufo−DN細胞クローンによる多細胞凝集体形成。D.7日間の観察期間中のSF126細胞クローンの遊走性。遊走面積を画像分析システムを用いて面積測定法により分析した。平均±SD値を表す。統計分析は、ANOVA、次いで対応のないスチューデントt検定を使用して行った。*p<0,05対SF126−moc。E及びF。胎児ラット脳凝集体を用いるSF126−UFO−WT腫瘍細胞スフェロイド(E)又はSF126−UFO−DN腫瘍細胞スフェロイド(F)の48時間対比による腫瘍細胞浸潤の分析。SF126−UFO−DN腫瘍細胞スフェロイドと脳細胞凝集体の間の輪郭の鮮明な境界は、UFO/AXL機能の抑制による浸潤性の欠如を示す。B,脳細胞凝集体;S、腫瘍スフェロイド、SF126−mock、対照;SF−126−Ufo−WT、UFO/AXLの野生型を発現する細胞;SF126−Ufo−DN、UFO/AXLの切端優性阻害型突然変異形を発現する細胞。
A.脳中にSF126−Ufo−WT細胞及びSF126−Ufo−DN細胞の定位移植後の成長したヌードマウスの生存曲線(n=4、群当たりの動物)。神経欠損を発現するか又は最初の体重の>30%減少したら直ちに動物を殺した。B〜E.隣接脳組織中への瀰漫性腫瘍細胞浸潤を示す、脳中への移植後のSF126−Ufo−WT腫瘍の組織形態学(B)。腫瘍細胞は、血管周囲間隙(C)、白質路に添って(D)及び心室系の壁に添って(E)浸潤した。H&E染色、バーは100μmを表す。
1.材料及び方法
1.1.腫瘍試料及び細胞系
乳癌(BC)及びその他の腫瘍の種類及び大きさに関する選択の偏向を排除するために、試験すべきRNAは任意抽出試料から調製した。原発性浸潤性乳癌の試料は手術を受ける患者72人から集めた。外科切除後、腫瘍をマクロ解剖し:切片を病理学的診断用に取り出し、隣接片をmRNA抽出用の液体窒素中で素早く凍結させた。診断時の患者の平均年齢は55才(29〜81才の範囲)であり、大多数は閉経後であった。腫瘍は、乳癌のWHO組織学的分類法により分類した:管癌、小葉癌、管小葉混合癌及び髄様癌。正常乳房mRNAから得てプールした"正常"cDNAを対照及び標準化用に使用した。前記"正常"cDNA中のプロテインキナーゼ(PK)及びホスファターゼ(PP)の発現プロファイルを別々に評価した。本試験に21種のBC及び3種の正常乳房上皮細胞系を含めた。乳癌細胞系の供給源は下記の通りであった:BT−20,BT−474、BT−483、BT−459、Du−4475、MDA−MB−134、−157、−175、−361、−436、−453、−468、SK−BR−3及びZR−75−1、T−47D、MDA−MB−231、ZR−75−30はAmerican Type Culture Collection(ATCC、Rockville、MD)から入手した。MCF−7、クローン及びBC細胞系DALはSUGEN(Redwood City、CA)から入手した。HBL−100細胞系はATCCからのものであった。この細胞系は正常組織からのものであったが、縦列統合SV−40配列を有する(9)。培養はグルタミン6mM、ヒトインシュリン10μg/ml及び10%の胎児子ウシ血清(FCS)を補充したRPMI1640培地(CSL、Parkville、オーストラリア)中で対数増殖で維持した。正常乳房上皮細胞株MCF10A、MCF10T−24及びMCF10neoはDr.M.Gilles(Arizona Cancer center)から得た。Ac745はDr.B.Stampferから入手し、Hs578Bst、インシュリン、ヒドロコルチゾン、EGF、コレラ毒素、ビタミン及び抗生物質のコンディション培地を補充したDMEM F12培地で増殖させた。
全RNA及びゲノムDNAをグアニジニウムイソチオシアネート溶液(GTS緩衝剤:4Mグアニジニウムイソチオシアネート、25mMクエン酸ナトリウムpH7.0、0.5%サルコシル及び0.1Mβ−メルカプトエタノール)中で溶解、次いでフェノール−クロロホルム抽出により同じ細胞ペレットから単離した。全RNAを修正を加えた標準法(Sambrookその他[1989])を用いて単離した。DNAを集め、同じ容量のフェノール:クロロホルム:イソアミルアルコール(25:24:1)で2回抽出した。RNA及びDNAを各細胞系から最小3つの別々の場合で単離した。
PK及びPP遺伝子発現をナイロンフィルターアレイ上で放射性標的を用いてハイブリダイゼーションにより分析した(cDNA)。アレイはキナーゼ、ホスファターゼ及びその他のシグナリングプロテインをコードする645種の遺伝子:リガンド、アダプター、転写因子、メタロプロテイナーゼ/ADAM、アポトーシス関与遺伝子及び11種のハウスキーピング遺伝子を含有した(リストはhttp://www.biochem.mpg.de 又は ullrich@biochem.mpg.deで得られる)。これらのアイデンティティーをプラスミドDNAのシークエンス法により実証し、GenBank配列情報と比較した。PK及びPPのアイデンティティーはナイロンフィルター上に、1個又は2部、スポットされた全クローンに関して合致した。標準化目的用に、GFP遺伝をゲノム及びベクターDNAと同様に2回スポットした。プラスミドの精製はプラスミド精製キッット(Qiagen、ドイツ)を用いて行った。
フィルターを先ず0.5%SDS中で攪拌しながら5分間予備洗浄した。プレハイブリダイゼーション溶液10ml中には、酵母tRNAが含まれていた。ヒトCot−1DNA(BRL/Life法)をハイブリダイゼーション工程で使用したが、これはRoller bottle(Hybaid Inc.)中で16時間回転炉中で65℃で行った。標識付けしたプローブを100℃で10分間変性し、次いで直ちにハイブリダイゼーション混合物中に入れ、これを更に18時間65℃で培養した。18時間後、ハイブリダイゼーション混合物を捨て、アレイを2塩化ナトリウム:クエン酸ナトリウム(SSC)緩衝剤、0.2%SDS中で42℃で20分間連続的に回転させながらインキュベーター中で2回洗浄した。3回めの洗浄をプラスチック箱中で0.2xSSC、0.1%SDS中で15〜60分間65℃で水平に振りながら行った。3回目の洗浄後、フィルターを湿らせた1枚のWhatman paper上に載せ、サランラップで覆った。次いでアレイをPhotosphorimager storage screenを有するimager cassette(Fuji、日本)に入れ、2日間露光した。
露光した蛍光画像記憶スクリーンをPhosphoimager Scanner(Fuji)で解像度50ミクロンでスキャンし、MacBAS2000(Fuji)を用いて視覚化した。画像をソフトウェアプロトコルにより分析するためにArrayVision V(カナダ)に送った。個々のエレメントの内部参照データベースへのマッピングは、全ゲノム対照DNA、GFP及びベクターを表す合計4つの対照要素を用いてソフトウェアベースの基板上に画像を整列させることによって行った。標準化は、各データ要素の未処理強度を100(この値は、アレイ開発で我々が実施した多数の異なるハイブリダイゼーションから導き出した、全要素の平均未処理強度である)に分けた全ベクター要素の平均未処理強度と等しい標準化率を掛けることによって行った。標準化した画像のソフトウェアによる対比較を、前記したように正常乳房RNA、不死(新生物発生前の)乳房上皮細胞系から得てプールした"正常"cDNAから取った標識付けcDNAのハイブリダイゼーションから得た画像に対して行った。発現レベルの変化を標準化した強度を用いて計算し、比(プラスの比は転写レベルの増加を示し、マイナスの比は転写レベルの減少を示した)として表し、Scatter−blotグラフィック及びTreeView programにより視覚化した(13〜16)。
結果を分析する前に、重複スポット又は2つの別々のアレイ上の同じcDNAを用いた1つのハイブリダイゼーション又は同じRNAから調製したcDNAを用いて2つの別々のハイブリダイゼーションを比較することによって、実験の再現性を実証した。各場合に、結果は各々相関係数0.96、0.98及び0.98での良好な再現性を示した(データは未記載)。再現性は2倍発現差を有意な差異とみなすのに十分であった。二次分析はエクセル及び統計ソフトウェアを用いて行った。腫瘍パラメーターと相関させた発現レベルを有する遺伝子の探査を数回の連続工程で行った。先ず、遺伝子を重要な要因により相違する腫瘍の2つのサブグループにおけるそれらの中央発現レベルを比較することによって検出した。我々は平均値よりも中央値を用いた。それは、多くの遺伝子で発現レベルの可変性が高く、その結果、標準偏差で発現レベルが平均値と同じか又は上位となり平均との比較が不可能となるからである。第2に、これらの検出した遺伝子を図面で視覚により調べ、最後に、相関を確認すると確証されるものに対して適正な統計分析を行った。ER−陽性腫瘍及びER−陰性腫瘍間のHER2発現の比較を、Mann−Witney試験を用いて検証した。相関係数を使用して遺伝子発現レベルを含まれた腋窩リンパ節の数と比較した。
この試験からのデータを記載したように分析し、表示した(13〜16)。簡単には、階層的クラスタリングアルゴリズムにより結果の表を作成するが、その際要因/アレイのcDNA(特異的遺伝子を表す)を遺伝子発現のパターンの類似性に基づいて一緒に分類する。同じアルゴリズムを適用して、実験試料(即ち細胞系及び腫瘍)をそれらの遺伝子発現の全般的パターンの類似性に従ってクラスターする。こうして整理したデータ表を着色画像として図示する。垂直軸に添って、分析された遺伝子はクラスタリングアルゴリズムによる順序付けて配列されるので、最も類似した発現パターンを有する遺伝子は相互に隣接している。水平軸に添って、実験試料は、全遺伝子中で最も類似した発現パターンを有するようなものが相互に隣接しているように配列される。この表の画像の各細胞/区画の色は、該当する各遺伝子の測定した発現比を表す。色彩度は測定した遺伝子発現比の強度に正比例し、最も明るい赤区画は最高T/N比(即ち>8倍の差異)を有し、最も明るい緑区画は最低のT/N比、黒区画は約1の比を有し、灰色の区画は不十分なデータ品質を示す。
我々は幾つかの乳癌標本及び全乳癌細胞系における発現AXL及びGAS6遺伝子の検出用にノーザンブロット分析の標準プロトコルを使用した。負荷RNA試料をヒトβ−アクチンプローブを用いるフィルターの再ハイブリダイゼーションにより実証した。
化学浸潤分析は、Albiniその他の方法を修正して使用して行った(10)。トリプシン化後、細胞(20000)をBoyden chamber中のマトリゲル塗布(4.0mg/mlの150μl)8μmポリプロピレンフィルターインサートに載せた(Biocoat Matrigel Invasion Chamber、Becton Dickinson、Bedford、MA or Nunc 10mm tissue culture inserts、Naperville、IL)。下部チェンバーは、Albiniその他により記載されているようにして製造した0.55mlのNIH3T3−調整培地又は幾つかの細胞系に関しては通常増殖培地を含有した。
マトリゲル上で増殖した細胞の形態学の測定は前記したようにして行った(10)。簡単には、培地50μl中に再懸濁させた細胞(細胞5000個/96ウェルプレートのウェル)を−RPMA基礎培地塩中6.0mg/mlに希釈したマトリゲル(Becton Dickinson)70μlから成る前もって調製したマトリゲルコーチング上で培養した。これらの上で重合後、希釈したマトリゲル(1.0mg/ml)50μlを加えた。コロニー伸展を実験の間中モニターし、OpenLab(UK)デジタルカメラを装備したZeiss AxioVert35顕微鏡を用いて7〜14日目に撮影した。
一夜断餌後、融合細胞単分子膜上にプラスチックチップで傷を付けた。写真撮影(位相差)する前に、MDA−MB−345S−mock及びMDA−MB−435−dnAXL、クローン2細胞を培地(10%FCS)及びGAS6(200ng/ml)を含有する培地で12、24及び48時間処理した。細胞遊走を定量するために、傷の3個の無作為選択部分(長さ1mm)を倍率40Xで写真撮影した;平均傷幅を20μm毎に測定し、傷閉合平均%を計算した。試料当たり3つの別個の傷を調べ、傷閉合平均%を計算した。
乳癌細胞(3D増殖アッセイ用に5000個及びBoyden chamber中での浸潤アッセイ用に20000個)を抗体50μl及び細胞懸濁液500μlを使用してEx−AXLポリクローナル抗体(200μg/ml)により処理した。細胞を抗体と一緒に室温で60分間培養し、次いで室温でPBS中で洗浄した。細胞のプレート及び次の24時間処理間隔は同じ濃度のEx−AXL抗体を用いて行った。
ウィルスのAXLwt及びdn−AXL突然変異形を修正を加えた標準プロトコル(31)に従って得た。簡単には、pLXSN−AXLwt及びpLXSN−dnAXLをEcoRI/BamHI及びNotl/Xbal位置経由でクローン化した。
AXL/UFO特異性抗体は、ウサギをアミノ酸残基1−410(AXL−Ex)を含有する組換えGST−AXL細胞外ドメイン融合タンパク質で免疫処理することによって産生した。組換えGST−AXL−Exタンパク質は感染したHEK293細胞(ベクターpcDNA3−GST)により安定的に分泌された。培地を集め、GST−AXL−Exタンパク質を標準GST−tagプロトコル(Pharmacia、Sweden)を用いて精製した。AXL−Exポリクローナル抗体をGAT−Sepharoseアフィニティーカラムで部分的に精製した。
本試験の目的は、乳癌攻撃性用の新しいマーカーを確認する目的で乳癌細胞中のプロテインキナ−ゼ、ホスファターゼ及びシグナリング遺伝子の発現プロフファイルを確立することであった。cDNAハイブリダイゼーションアッセイを使用して、14の弱浸潤性、7の高浸潤性乳癌細胞系及び3つの正常乳房上皮細胞系の遺伝子発現プロファイルを分析した(第1表、図1、浸潤性BC細胞系及び対照の3D増殖)。
第1表:浸潤性のコンセンサスを発生させるために使用した乳癌細胞系の特徴
a)試料起源及び病理学的評価情報はATCCカタログから得た。PT、原発性腫瘍;PE、胸膜滲出液;Ca、癌。
b)腫瘍データはATCCカタログ又は参照17に報告されていた。
+、無胸腺ヌードマウス又はSCIDマウスの異種移植片として産出された触診できる腫瘍;
−、非腫瘍形成性;met、対照18及び19により報告されたような転移性細胞系。
c)マトリゲル中で培養した細胞の形態学の記載及びBoyden chamber浸潤性アッセイにおけるそれらの活性は対照10から得た。
1.材料及び方法
1.1 ヒト神経膠腫
下記ヒト神経膠腫細胞をこの試験で使用した:U−118、U−1242、SF126、A−172、U−373、U−1240、T−98G、SF763及びSF767。細胞は全て5%CO2加湿インキュベーター中で10%胎児ウシ血清(PAA GmbH、Linz、オーストリア)中で37℃で増殖させ、Hoechst33258染料を用いてマイコプラズマ汚染に関して定期的に試験した。下記のように増殖培地(全てGibco、カースルスーエ、ドイツ)を使用した:U−118、T−98G及びSF763用にDMEM;U−1242用にMEM、非必須アミノ酸(原料の1:100希釈;Gibco)、1mM Na−Pyruvate;SF−126、A−172及びU373用にグルコース4.5g/Lを有するDMEM及びU−1240及びSF767用にMEM。dorsal skinfold chamber標本中への腫瘍移植の前に、前記したように細胞をDilで染色した(参照35)。
cDNAアレイ並びにそのハイブリダイゼーション法は前記で詳説した(参照31)。アレイは84のRTK及び30のプロテインチロシンホスファターゼに相応する125のcDNAフラグメント+対照cDNAから成っていた。全RNA、Poly(A)+RNA及びcDNAプローブは前記したようにして産生した(対照31)。cDNA3〜5μlの標識付けは[32−P]dATPの50μCiの存在でMegaprime kit(Amersham)を用いて行った。プレハイブリダイゼーション溶液を5×SSC、0.5%(v/v)SDS、パン酵母tRNA(Roche)100μg/ml及び標識付けしたcDNAプローブ(2〜5×106cpm/ml)を含有するハイブリダイゼーション溶液と取り換え、68℃で16時間培養した。膜を厳しい条件下で洗浄した。phosphorimager system(Fuji BAS1000;Fuji)を使用してハイブリダイゼーションシグナルを定量した。各スロットの平均値を式:A=(AB−B)×100/Bを用いて計算した[A、最終容量;AB、各スロットシグナルの強度(ピクセル/mm2);B、背景(ピクセル/mm2)]。cDNAアレイの結果は、前記したようにRT−PCR分析により確認すべきであった(参照31)。
AXL用コード2.7kbpのcDNAシークエンスをレトロウィルスベクターpLXSNのEcoRI/BamHI制限部位中にクローンした。優性阻害型変異体を1.5kbpのEcoRI/Fsplフラグメントを同じベクター中にサブクローンすることによって産生した。発現プラスミド及び空ベクターを燐酸カルシウム共沈殿法を用いてPhoenix−Ampho細胞中にトランスインフェクションした。組換えレトロウィルスを含有する上澄みをトランスインフェクション後28時間ハーベストし、最終濃度8μg/mlでポリブレンと混合し、サブコンフルエントSF126細胞に3時間適用した。感染を同じプロデューサー細胞の新しい上澄みを用いて2回繰り返した。感染した細胞を1日後に通過させ、1mg/mlのG418を用いて2週間選別した。モノクローナル細胞系をウェスタンブロット分析によりモニターしたようにAXLの高発現用に選択した。
細胞は、50mM Hepes pH7.5、150mM NaCl、1mM EDTA、10%グリセロール、1% Triton X−100、Aprotinin10μg/mlを補充した10mM Na4P2O7、1mM PMSF、2mM Na3VO4、10mM NaF中で溶解した。タンパク質濃度はマイクロBCAプロテインアッセイ(PIERCE、Rockford、Illinois)により測定した。AXLを全細胞タンパク質1.8mgから、プロテインAセファローズ懸濁液(CL−4B、Amersham Biosciences、Freiburg、ドイツ)30μl及び抗−AXLポリクローナルウサギ血清(対照36)3μlを用いて一夜4℃で沈殿させた。沈殿をHNTG緩衝剤(20mM Hepes pH7.5、150mM NaCl、10%グリセロール、0.1% Triton X−100)で3回洗浄した。免疫沈殿又は全細胞タンパク質200μg/レーンを還元試料緩衝剤と混合し、7.5%SDS−PAGEによって分離し、ニトロセルロース膜(Protran;Schleicher&Schuell、Dassel,ドイツ)に移した。膜を150mM NaCl、50mM Tris−HClpH7.5、5mM EDTA、0.05% Triton X−100中で0.25%ゼラチンでブロックし、同じ緩衝剤中で1:5000に希釈した抗ホスホチロシンモノクローナル抗体4G10と一緒に一夜−4℃で培養した。二次抗体ヤギ抗マウスHRP(1:10000、BioRad)を室温で60分間適応した。抗−AXL(ポリクローナルウサギ血清。1:1000)及びプロテインA−HRP(BioRad、1:40000)で再プローブする前に、膜を55℃で90分間ストリッピングした。検出はWestern Lightning試薬(Perkin Elmer Life Sciences、ボストン)を用いて行った。
無胸腺ヌードマウス(nu/nu;雄/雌)を特異的病原菌不含環境内部で飼育、維持し、6〜10週の年齢で使用した。実験はInstitutional Animal Care and Use Committeeの認証研究プロトコル及びガイドラインに従って行った。外科処理用にマウスをケタミン/キシラジンの皮下注射により麻酔した。
神経膠腫異種移植片は1×106個のC6細胞(対照44)のヌードマウス左腋腹中への注射により皮下で増殖させた。腫瘍増殖は移植後14日までノギスを用いて評価した。腫瘍容量を(長さ×幅×高さ)/2として計算した。大脳内腫瘍細胞移植用に、ヌードマウスの頭を定位ネズミ頭ホルダー(stereotactic rodent head holder)に固定した。移植は、細胞5×105個を右線条体に定位に注射することによって行った。一つの実験群の動物が神経学的欠損を発現するか又は動物の体重が>30%減少したら直ちに、腫瘍増殖を比較するために、動物を殺した。
2枚の対照的チタン枠を動物の背面皮膚の襞に置き、皮膚の伸ばした二重層を挟み、1層の黄紋筋層、皮下組織及び表皮から成るdorsal skinfold chamberを作った。ガラスカバーガラスで覆った観察窓により、チェンバー内で増殖する腫瘍の微小血管系の生体内顕微鏡観察を繰り返し行うことができた。チェンバー製造2日後に、腫瘍細胞移植用にdorsal skinfold chamberのカバーガラスを一時的に取り除いた。動物はskinfold chamberによく耐え、睡眠及び食餌挙動において不快又は変化の徴候を示さなかった。
生体内エピ蛍光ビデオ顕微鏡法を移植後21日間に渡って実施した(対照37、38、39)。神経膠腫細胞のDil標識付けにより、隣接宿主組織からの腫瘍の詳細な描写並びに緑色光エピイルミネーション(520〜570nm)適用により個々の腫瘍細胞の確認が可能となった。FITC結合デキストラン(MW=150000;0.1ml静脈内)でコントラスト増強及び青色光エピイルミネーション(450〜490nm)の使用を適用して個々の血管を可視性にした。腫瘍増殖を、蛍光により標識付けした腫瘍塊により覆われた組織面積の測定により評価した。宿主及び腫瘍微小血管系の分析は、血管密度及び血管直径が含んだ(対照37)。
実験終了時に、神経膠腫含有dorsal skinfold chamber標本及び脳を切開し、組織形態学分析用に液体窒素中で凍結した。切片をスタブに載せ、Tissue−Tek(Miles Laboratories Inc.、Naperville、IL)中に包埋し、液体N2で冷却した2−メチルブタン(E.Merck、Darmstadt、ドイツ)中で凍結した。連続軸切片(5μm)を切断し、ゼラチンを前塗布したスライド上に載せた(Sigma)。切片を標準工程に従ってハリス・ヘマトキシリン及びエオシンG(Merck)で染色した。
神経膠腫細胞系の増殖を、3−(4,5−ジメチルチアゾール−2−イル)−2,5−ジフェニルテトラゾリウムブロミド(MTT)アッセイ(Boeringer Mannheim、Mannheim、ドイツ)で評価した。細胞を96ウェル組織培養プレート中で細胞3000個/ウェルの濃度で播き、Gas6(200μg/ml)の不在又は存在で48時間培養した。次いで細胞を、MTT染料の着色ホルマザン生成物へのそれらの還元力を細胞増殖指数として検定した。
神経膠腫スフェロイドを細胞5×106個を培地中で1.0%Noble寒天(DIFCO、Detroit、MI)を前もって下塗した75cm2フラスコ中へ播くことにより産生した。培養中で7〜10日後、300μmより小さい直径を有するスフェロイドを遊走性及び浸潤性試験用に選択した。神経膠腫スフェロイドを24ウェルプレートの中央に置いた。スフェロイド外植片から遊走する腫瘍細胞により覆われた面積を細胞遊走性指数として使用した。各外植片の2つの直交直径を7日間に渡って位相差顕微鏡を用いて毎日測定し、腫瘍細胞により覆われた平均面積を計算した。遊走性アッセイは4回実施した。
胎児ラット脳細胞凝集体を前記した標準化方法により産生した(対照40)。簡単には、18日の年齢のBD IXラット胎児を帝王切開により取り出した。脳を注意深く切開し、ミンチし、連続的にトリプシン化した。遠心分離後、細胞1×107個(培地に再懸濁)を24ウェルプレートの寒天塗布ウェル中に播いた。再凝集2日後、スフェロイドを新しいウェルに移し(凝集体5〜7個/ウェル)、そこで18〜21日間成熟させた。その時間までに成熟脳凝集体は生成した。胎児ラット脳凝集体及び神経膠腫スフェロイドは、in situで脳及び神経膠腫細胞に似ている標準化された原発性無血管脳及び腫瘍塊を表し、従って試験管内での神経膠腫細胞遊走及び血管に無関係な浸潤を調べるための好適なモデルとなる。浸潤性アッセイ用に、単一成熟脳凝集体(直径=250〜300μm)を寒天塗布96ウェルプレート中に入れた。同じ大きさの単一神経膠腫スフェロイドを同じくウェル中へ移し、脳凝集体と接触させた。対比を各々24時間及び48時間培養し、その後ハーベストし、パラホルムアルデヒド中に固定し、準薄(semithin)切片(2μm)の製造用にプラスチック樹脂中に包埋した。切片をトルイジンブルーで染色した。神経膠腫細胞浸潤工程を無傷のままのラット脳凝集体の量に関して評価した。浸潤性アッセイは4回行った。
群間の差異を分析するために、群間の個々の比較用に、一元配置分析(ANOVA)、次いで適切な事後試験(post hoc test)を実施した。p<0.05の結果は有意であるとみなした。
2.1
神経膠腫細胞生物学におけるUFO/AXLの関連性を調べるために、細胞内RTKドメインを欠くヒトUFO/AXLの切端ドメインネガティブ突然変異体をレトロウィルス発現系を用いてSF126神経膠腫細胞(SF126−Ufo−DN)中に導入した。空ベクターで感染させた細胞(SF126−mock)又はUFO/AXLのヒト野生型形(SF126−Ufo−WT)を対照として使用した。ヒトUFO/AXLの細胞外ドメインに対する抗体を用いるウェスタンブロット法により、SF126−Ufo−DN細胞クローン中の野生型及び切端受容体の高発現レベルを確認した(図8A低いパネル)。切端受容体の発現がUFO/AXLシグナル伝達を遮断するか否かを確認するために、そのリガンドGas6で刺激に次ぐUFO/AXL受容体燐酸化を測定した(図8Aトップレーン)。SF126−moc細胞中で、中程度のベースラインシグナルが観察され、これはGas6刺激で増加した。SF126−Ufo−WT中でGas6−誘発シグナルが増加した。反対に、SF126−Ufo−DN細胞中でベースライン及びGas6−誘発燐酸化はほぼ完全に抑制された。
腫瘍増殖に関するUFO/AXLの相関を調べるために、各クローンの細胞1×106個を大人のヌードマウスの腋腹中に皮下移植した。SF126−moc細胞に比較すると、SF126−Ufo−DN細胞の腫瘍形成性は劇的に損なわれ、腫瘍増殖は97%減少した(図9A)。反対にSF126−Ufo−WT細胞では腫瘍増殖は僅かに促進された(図9A)。生体内における神経膠腫細胞生物学におけるUFO/AXLの役割を更に詳細に検証するために、SF126−Ufo−WT細胞及びSF126−Ufo−DN細胞を大人のヌードマウスのdorsal skinfoldの透明なチェンバー中へ移植した。腫瘍細胞の蛍光標識付け及び蛍光血漿マーカーの全身投与により、このモデルは腫瘍増殖、腫瘍細胞挙動、腫瘍の腫瘍起因性血管形成及び腫瘍灌流を生体内多蛍光ビデオ顕微鏡により繰り返しかつ非観血的に評価することができる。この方法を用いて腫瘍増殖に関するUFO/AXLシグナリングの有意性を確認することができた。
UFO/AXL機能の遮断による腫瘍増殖の抑制の下にある機序を更に解明するために、試験管内の神経膠腫細胞挙動を分析した。MTTアッセイはSF126−Ufo−DN細胞の増殖が標準培養条件下で、各々SF126−moc及びSF126−Ufo−Wt細胞に比較して50%及び35%減少したことを実証した(図10A)。注目に値することには、この結果はUFO/AXLリガンドGas6を用いる刺激と無関係であったことであり、これはGas6/UFO/AXLシグナリングが細胞分裂促進性作用を発揮しないという前記仮説を確認する。UFO/AXLは細胞間接着を媒介すると指摘された(参照43)ので、細胞の多細胞凝集体形成力を調べた。SF126−moc及びSF126−Ufo−WT細胞は迅速にスフェロイドを形成した(図10B)。それらの凝集力はSF126−Ufo−DN細胞中で減弱せず(図10C)、これは細胞凝集がUFO/AXLの細胞外ドメインによってのみ媒介されることを確認する。次ぎに、神経膠腫細胞遊走を腫瘍スフェロイドを培養し、遊走する腫瘍細胞と最初のスフェロイドからの距離を測定することによってアドレスした。SF126−moc及びSF126−Ufo−WT細胞が相当距離遊走したが、腫瘍細胞遊走性はSF126−Ufo−DN細胞で非常に減少していた(図10D)。細胞遊走性は腫瘍浸潤に必要不可欠であるので、SF126細胞クローンの浸潤性を腫瘍スフェロイドを胎児のラット脳細胞凝集体と対比させることによってアドレスした。共培養48時間後、SF126−moc及びSF126−Ufo−Wt細胞の両方が能凝集体を瀰漫性に浸潤した(図10E)。対照的に、同じ時間後にSF126−Ufo−DN腫瘍スフェロイドと脳細胞凝集体との間の明確な境界を観察することができ、これらの細胞が正常な脳組織中へ浸潤できなかったことを示す(図10F)。
総合して、本分析の結果は、悪性脳腫瘍の生物学におけるRTK UFO/AXLの新しい基本的役割を示す。所見は、UFO/AXLが、EGFR又はPDGFR−αと比較可能な程度まで、有意数のヒト神経膠腫細胞系によって過剰発現されかつ神経膠腫増殖並びに神経膠腫浸潤を媒介することを示す。UFO/AXLは神経膠腫浸潤に関与すると報告された最初のRTKであり、従ってこれらの高攻撃性であり、しかも難治性の腫瘍を抑制するための新しい治療標的である。これはUFO/AXLシグナリングの抑制が神経膠腫増殖を抑制し、正位移植による生存を伸ばすことを実証する本発明の結果により支持される。
単一遺伝子としてのRTK AXLが実験系で腫瘍転移を誘発するのに十分であるという事実は、転移表現型の取得が数種の遺伝及びエピ遺伝現象を含む多段工程であるという現行の見解と対比するので、意外である。
1.BC細胞系、原発性腫瘍及び神経膠芽腫細胞のcDNAアレイ分析を使用して、"浸潤性のコンセンサス"(クラスターAXL)を確認した。この32種の遺伝子から成る浸潤性のコンセンサスを使用して癌細胞及び原発性腫瘍の攻撃性を予言することができる。
Claims (34)
- AXL、GAS、MMP14、ADAM12、ADAM17、MT3MMP、FGF2、FGF5、FYN、LYN、DDR2、TIMP1、HB−EGF、SGF、S6KII、MAP4K4、SIRPα、Annexin 2、Stat 5b及びEDG2から成る群から選択した少なくとも1種の遺伝子の発現を測定することから成り、その際、高発現が高浸潤と相関している、悪性疾患の浸潤性の判定法。
- 前記群から選択した少なくとも2種の遺伝子の発現を測定することから成る、請求項1に記載の方法。
- 少なくともAXL遺伝子の発現を測定することから成る、請求項1又は2に記載の方法。
- 悪性疾患が癌、特に乳癌、前立腺癌、腎臓癌、肺癌、結腸癌、神経膠芽腫及びその他の癌から選択した癌である、請求項1から3までのいずれか1項に記載の方法。
- 癌が神経膠芽腫である、請求項4に記載の方法。
- 発現をmRNAレベルで測定する、請求項1から5までのいずれか1項に記載の方法。
- 発現を核酸アレイで測定する、請求項6に記載の方法。
- 発現をタンパク質レベルで測定する、請求項1から5までのいずれか1項に記載の方法。
- 発現を免疫学的検定法で測定する、請求項8に記載の方法。
- AXL遺伝子発現及び/又はAXLリガンド遺伝子発現及び/又はタンパク質機能及び/又はタンパク質リガンド機能を抑制することから成る、悪性疾患の浸潤性を減少させる方法。
- AXLタンパク質リガンドがGAS6である、請求項10に記載の方法。
- AXLタンパク質の受容体チロシンキナーゼ活性を抑制することから成る、請求項10に記載の方法。
- AXL遺伝子の発現を抑制することから成る、請求項10に記載の方法。
- AXLタンパク質及びそのリガンド間の相互作用を抑制することから成る、請求項10に記載の方法。
- AXL遺伝子、AXLリガンド遺伝子、AXLタンパク質及び/又はAXLタンパク質リガンドの阻害剤を、悪性疾患の浸潤性を減少させるのに効果的な量でそれを必要としている被験者に投与することから成る、請求項10から14のいずれか1項に記載の方法。
- 悪性疾患が癌、特に乳癌、前立腺癌、腎臓癌、肺癌、結腸癌、神経膠芽腫及びその他の癌から選択した癌である、請求項15に記載の方法。
- 癌が神経膠芽腫である、請求項16に記載の方法。
- 被験者が哺乳類、特にヒトである、請求項15から17に記載の方法。
- 阻害剤がAXLタンパク質に対する抗体である、請求項15から18のいずれか1項に記載の方法。
- 阻害剤が、AXL遺伝子に対するアンチセンス核酸、リボザイム又はRNA干渉分子又はその転写物である、請求項15から18のいずれか1項に記載の方法。
- 阻害剤がAXL遺伝子の優性阻害型突然変異体である、請求項15から18のいずれか1項に記載の方法。
- 薬理学的活性希釈剤、キャリア及び/又はアジュバントと一緒に、活性剤としてAXL遺伝子、AXLリガンド遺伝子、AXLタンパク質及び/又はAXLタンパク質リガンドの阻害剤から成る医薬組成物。
- 阻害剤がAXLタンパク質に対する抗体である、請求項22に記載の組成物。
- 阻害剤が、AXL遺伝子に対するアンチセンス核酸、リボザイム又はRNA干渉分子又はその転写物である、請求項22に記載の組成物。
- 阻害剤がAXL遺伝子の優性阻害型突然変異体である、請求項22に記載の組成物。
- 悪性疾患の浸潤性を減少させるための請求項22から25のいずれか1項に記載の組成物。
- 悪性疾患で転移形成を減少させるための請求項22から26のいずれか1項に記載の組成物。
- 悪性疾患が神経膠芽腫である、請求項26から27のいずれか1項に記載の組成物。
- 少なくとも1種のその他の活性剤から成る、請求項22から26のいずれか1項に記載の組成物。
- その他の活性剤が細胞毒性又は細胞増殖抑制剤である、請求項29に記載の組成物。
- 試験化合物がAXL遺伝子、AXLリガンド遺伝子、AXLタンパク質及び/又はAXLタンパク質リガンドを抑制することができるかどうかを測定することから成る悪性疾患の浸潤性の阻害剤の同定及び/又はキャラクタリゼーション法。
- 試験化合物がAXLタンパク質と結合できる及び/又はAXL遺伝子発現を減少させることができるかどうかを測定することから成る請求項31に記載の方法。
- 細胞ベースのアッセイ系を使用する、請求項31又は32に記載の方法。
- 細胞不含アッセイ系を使用する、請求項31又は32に記載の方法。
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