JP2010530960A - アルボウイルス感染の診断又はスクリーニング方法、該方法に有用な試剤及びそれらの用途 - Google Patents
アルボウイルス感染の診断又はスクリーニング方法、該方法に有用な試剤及びそれらの用途 Download PDFInfo
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Abstract
上記の方法は、
(i) 対象者又は動物からの試料を、考慮される対象者又は動物の種のIg分子の特定のクラスに対して指向されたIg結合タンパク質で感作された固体担体と接触させ、
(ii) (i)で形成された免疫複合体を、アルボウイルスED3ドメインとアルカリホスファターゼ(PhoA)とを少なくとも含むハイブリッドタンパク質からなる検知分子とインキュベートする
ことを含み、
該免疫複合体の検出が上記の試料中のアルボウイルスの存在の指標である。
【選択図】なし
Description
フラビウイルス感染は、現在のところ、ウイルス単離、RT-PCRによるウイルスRNAの検出及びウイルスタンパク質又は抗ウイルス免疫グロブリン分子を標的にした免疫化学的アッセイを含むいくつかの方法により検出されている。ウイルスRNA、ウイルスタンパク質、ビリオン及び異なるクラスの抗体(IgM、IgA及びIgG)の出現及び消滅の動態は、1次感染又はその後の感染の間に、いくつかのフラビウイルスについて、よく文書化されている。
フラビウイルス感染の診断は、いくつかの因子により複雑である。あるフラビウイルスに対する抗体を測定するために現在最も用いられる血清学的試験は、このファミリーの他のメンバーと交差反応する(Kuno, 2003)。これらの交差反応は、いくつかのフラビウイルスが同時に循環している地域では問題であろう。例えば、WNVに対して指向された多くの抗体が、JEV (日本脳炎ウイルス)、SLEV (セントルイス脳炎ウイルス)及びDENVとさえも交差反応する(Granwehrら, 2004)。DENVに対して指向された多くの抗体が、YFV及びJEVと交差反応する(Vorndam及びKuno, 1997)。
患者の血清中のウイルス抗体の検出のための免疫吸着アッセイ(ISA)は、主に2つのタイプに属する:間接的ISA及び抗体特異的捕捉ISA。
担体-virAg :: 血清 :: @Ig-レポーター (1)
ここで、「-」は共有結合又は固定化のことであり、「::」は非共有相互作用のことである。Ig結合タンパク質は、Igの特定のクラス(@IgX、ここでX = M、A又はG)に特異的であり得る。この場合、IgX特異的間接的ISAという。間接的ISAのいくつかのバリエーション、特に抗原捕捉ISA、エピトープブロッキングISA及びアビディティーISAが記載されている(Blitvichら, 2003; Johnsonら, 2000; Matheusら, 2005)。
担体-@IgX :: 血清 :: virAg :: @virAg-レポーター (2)
Ig結合タンパク質(@IgX)により、IgM、IgG又はIgA抗体捕捉免疫吸着アッセイ(MAC-ELISA、GAC-ELISA又はAAC-ELISA)ということができる。
担体-@GST :: GST-(3D6エピトープ) :: scFv3D6-PhoA
ここで、@GSTは、グルタチオン-S-トランスフェラーゼ(GST)に対して指向された抗体を表し、GST-(3D6エピトープ)は、GSTと抗体3D6のエピトープとのハイブリッドタンパク質を表し、scFv3D6-PhoAは、抗体3D6の単鎖可変フラグメント(scFv)とアルカリホスファターゼとのハイブリッドタンパク質を表す。
サンドイッチELISAアッセイは、患者の血清中の抗原の存在を検出するために用いられるが、本発明のように感染性因子に対して指向された抗体の存在を検出するために用いられない。さらに、このような方法は、アッセイにおいて用いられる少なくとも2つの非競合抗体の単離と特徴決定とを必要とする。
担体-RF :: 血清 :: rED3-HRP
ここで、リウマチ因子(RF)は、IgG免疫グロブリンのFcフラグメントを認識する自己免疫抗体であり、rED3-HRPは、セイヨウワサビペルオキシダーゼ(HRP)と西ナイルウイルスからのエンベロープタンパク質Eの組換えドメイン3 (rED3)との化学的コンジュゲートである。HRPは単量体タンパク質であるが、アルカリホスファターゼは二量体であり、rED3-HRPハイブリッドタンパク質は、2つのパートナーであるrED3とHRPとを化学的にカップリングさせることにより得られた。
この研究における著者らは、彼らの「リバースELISA」がいずれの特異的IgM抗体も検出しないことを明確に述べている(第472頁、左欄、第31行以降)。彼らは、彼らのリバースELISAが、世界における西ナイルウイルス感染の流行に関する知識を向上できたと結論付けている。よって、このような方法論は、ウイルス感染の流行についての長期的な疫学的研究に最も適する。
担体-rED3 :: 血清 :: @IgG-HRP
ここで、@IgG-HRPは、セイヨウワサビペルオキシダーゼとヒトIgGに対して指向された抗体との化学的コンジュゲートである。
著者らは、組換えドメインrED3は、マイクロタイタープレートのウェルを被覆する抗体にほとんど結合せず(第2764頁、第34〜39行)、よって抗体捕捉ELISAに適しないことを明確に記載している。
* SMB由来又は細胞培養由来のウイルス抗原
GAC-又はMAC-ELISAの特異性は、SMB由来又は細胞培養由来のウイルス抗原を用いる場合に、著しくは異ならない(Cardosaら, 1992)。抗原のこのような調製物を用いて行われるMAC-ELISAは、ウイルス血清型群に通常は特異的であるが、感染しているウイルスを血清型群内で区別することはほとんどできない。例えば、この方法は、DENVによる感染と、JEV又はWNVのいずれかによる感染とを区別できる(Innisら, 1989; Martinら, 2002)。しかし、この方法は、感染している血清型がほとんどの場合に最高のシグナルを有するにもかかわらず、4つのDENV血清型による感染同士を区別することは困難である(Nawaら, 2000)。この方法は、WNV感染とSLEV又はJEV感染とを、JEV血清型群のこれらのフラビウイルスについての試験を同時に、そして精密で特異的な診断アルゴリズムを用いて行うならば、区別できる(Martinら, 2002; 2004)。しかし、このような特異的診断は、1次感染においてのみ可能である。なぜなら、交差反応性は、2次及びさらなる感染を経験した患者においてより重要であるからである(Kaoら, 2005; Telesら, 2005)。
いくつかのフラビウイルスからのprM/gpE VLPは、測定の感受性、特異性、正確性及びその他の統計的試験のいくつかの基準の点で、MAC-ELISAにおけるSMB由来抗原と同等又はよりよく作動する(Holmesら, 2005; Martinら, 2002; Martinら, 2000; Muerhoffら, 2002)。DENVについて、VLPは、1次感染における感染している血清型を検出することに成功している(Shuら, 2002; Shu及びHuang, 2004)。SLEVについて、VLPは、SMB由来抗原とは異なって、WNV又はポワッサンウイルスに対して指向されたIgM抗体と交差反応しない(Purdyら, 2004)。TBEV (ダニ媒介性脳炎ウイルス;Tick-Borne Encephalitis Virus)について、VLPは、市販の抗原とは異なって、JEVに対して指向されたIgM抗体と交差反応しない(Yoshiiら, 2003)。WNVについては、しかし、VLPは、その他のフラビウイルス(JEV、SLEV、DENV、YFV)に感染したか又はそれに対してワクチン接種された患者からの血清と高い割合で交差反応する(Hogrefeら, 2004)。ショウジョウバエ細胞で組換えタンパク質として発現されるgpEの細胞外ドメインsEは、MAC-及びGAC-ELISAのクロマトグラフィーフォーマットで用いられる。DENVの4つの血清型からの組換えsEドメインを用いるこの免疫クロマトグラフィーアッセイは、抗原としてSMB抽出物を用いて行われる通常のMAC-及びGAC-ELISAのものに匹敵する特異性及び感度を有する(Cuzzubboら, 2001)。
免疫アッセイにおける抗原としてのED3ドメインの使用には、いくつかの因子が関連する。これは、高度に抗原性で免疫原性である。最も強く中和する抗体は、このドメインに対して指向される(Crill及びRoehrig, 2001; Sanchezら, 2005)。ED3ドメイン同士の配列は、gpEの他のドメイン同士よりもより離れている(Gritsunら, 1995)。異なるフラビウイルスと交差反応する抗体は、ED3に対するよりもgpEのED1及びED2ドメインに対して指向される(Crill及びChang, 2004; Kanaiら, 2006; Modisら, 2005; Roehrig, 2003; Sanchezら, 2005)。DENVについて、大腸菌(E. coli)からのTrpEタンパク質とED3ドメインの4つの血清型との間のハイブリッドTrpE-ED3は、細胞培養由来ウイルス抗原と比較されている。2種の抗原は、回復期血清中のDENVに対して指向されたIgM又はIgG抗体を検出するための感度が等しい。しかし、TrpE-ED3抗原は、DENV感染とYFV又はJEVのワクチン接種との間の区別について、細胞培養由来抗原よりもより特異的である(Simmonsら, 1998)。DENVについて、組換え単離ED3ドメイン(rED3)は、免疫ブロットストリップアッセイにおいて感染している血清型の検出に成功している(Ludolfsら, 2002)。WNVについて、rED3は、サル、ヒト及びウマの血清のパネルについて、IgG特異的間接的ELISAにおいてSMB由来抗原よりもより感度が高く特異的な応答を与える。これは、WNVに対するIgG応答を、その他の関連するフラビウイルス(JEV、SLEV、MVEV)に対するものから明確に区別できる(Beasleyら, 2004)。TBEVについて、rED3もIgG特異的間接的ELISAにおいてSMB由来抗原よりもより感度が高く特異的な応答を与える。これは、ダニ媒介(TBEV)フラビウイルスと蚊媒介(YFV、DENV)フラビウイルスとを区別できるが、フラビウイルスのTBEV血清型群のメンバー同士を区別できない(Holbrookら, 2004)。
組換え抗原を用いる捕捉ELISA法を用いる場合、結合価(valence)及び折り畳みの問題が生じ、検出の問題も生じ得る。
実際に、予備実験は、WNVからのrED3ドメインが、マイクロタイタープレートのウェルを被覆する抗体にほとんど結合しないか、又は捕捉され得るが立体障害のために検出抗体が結合しないことを示唆している。よって、rED3は、捕捉アッセイフォーマットに直ちに適しないであろうと結論付けられた(Beasleyら, 2004)。しかし、他の説明は、等しく可能性がある。フラビウイルスは、その表面にて180個の単量体(90個の二量体)のgpEを示すので、gpE及びそのED3ドメインは、複数の近接したコピーで存在する(Kuhnら, 2002; Mukhopadhyayら, 2003)。IgG、IgA又はIgMの同じ分子は、そのエピトープの2〜5コピーに同時に結合でき、この結合の多価形式は、強い見かけの親和性(アビディティー)をもたらす。抗原の結合価は、prM/gpE VLPにおいても高い(Ferlenghiら, 2001)。これは、可溶性gpE (sE)のような二量体の組換え抗原について2である(Kanaiら, 2006; Modisら, 2003; Modisら, 2005; Reyら, 1995)が、単離されたED3ドメインについて1だけである。よって、単量体rED3ドメインと、IgMの1つの結合部位との間の親和性は、MAC-ELISAのために不充分であろう。同様の問題が、特に1次感染についてIgG-又はIgA-捕捉ELISAに生じ得る。単量体rED3ドメインのこの制限を克服するために、そのオリゴマー形成を工学的に操作する(engineer)ことが必要であろう。
いくつかの異なる抗原に対する血清の応答を量的に比較し(例えば異なるウイルス血清型に対して)、よってその特異性を推定するために、アッセイの検出系は、全ての試験される抗原について同じでなければならない。このことは、ポリクローナル抗体を用いる場合についてはそうでないだろう。異なるウイルス又はウイルス血清型の共通エピトープに対して指向されたモノクローナル抗体の使用は、以下の問題を導くであろう。(i)ヒト血清への抗原の結合は、トレーサーモノクローナル抗体のエピトープをマスクし得る。(ii)トレーサー抗体と異なる抗原との間の親和性は、エピトープの構造の関係に依存し得る。結果として、アッセイの出力シグナルと捕捉された抗原の量との関係は、異なる抗原について変動し得る。
(i) 対象者又は動物からの試料を、考慮される対象者又は動物の種のIg分子の特定のクラスに対して指向されたIg結合タンパク質、最も一般的には異種抗体からなるIg結合タンパク質(抗IgX抗体)で感作された固体担体と接触させ、
(ii) (i)で形成された免疫複合体を、アルボウイルスED3ドメイン、好ましくはフラビウイルスED3ドメインとアルカリホスファターゼ(PhoA)とを少なくとも含むハイブリッドタンパク質からなる検知分子とインキュベートする
ことを含み、
該免疫複合体の検出が上記の試料中のアルボウイルスの存在の指標である、
ことを特徴とする、対象者又は動物宿主におけるアルボウイルスの診断又はスクリーニングのための方法に関する。
上記の方法を行う別の有利な形態によると、上記のアルボウイルスは好ましくはフラビウイルスである。
上記の方法を行う別の有利な実施形態によると、上記のアルカリホスファターゼは、ラット、マウス、ニワトリ、ウシ、酵母及び細菌のアルカリホスファターゼからなる群より選択され、好ましくは大腸菌のアルカリホスファターゼである。
よって、上記の方法を行うさらに有利な形態によると、上記のハイブリッドタンパク質は、好ましくは、ヘキサヒスチジンと、適切なフラビウイルスED3ドメインと、大腸菌のアルカリホスファターゼとを含み、配列番号25を含む。
好ましくは、アルカリホスファターゼは配列番号25からなる。
好ましくは、アルカリホスファターゼは配列番号24からなる。
アルカリホスファターゼへのその他の改変は可能であり、本発明に包含される。
(i) いくつかのアッセイで用いられる反応物(抗原又は検出系)の粗調製物が、規定された(defined)均質な分子種で置き換えられる;
(ii) アッセイに必要な反応物及び工程の数が低減される;
(iii) 感染性ウイルス、動物又は細胞培養物の安全な実験室におけるそれらの調製のための操作を伴うアッセイの全ての要素を、細菌で生成でき、容易に精製できる組換え要素で置き換えられる。
本発明は、組換え抗原を二量体化し、同時に、その遺伝子配列とアルカリホスファターゼ遺伝子とのハイブリッドを構築することにより組換え抗原を酵素トレーサーと融合させる可能性に依拠する。このようにして、低い親和性の抗体、例えば、五量体でありかつアルボウイルスによる感染において初期に出現するIgM免疫グロブリンを検出できる反応物が得られる。この初期の検出は、流行病の管理におけるツールとして用いることができる。よって、これは、IgGの検出に基づき、かつ後向き調査においてのみ用いられる種々のサンドイッチ、リバース及び間接的ELISAのようなアッセイとは明らかに異なる。
担体-@IgX :: 血清 :: (H6-ED3-PhoA)2 (3)
(ここで、X = M、A又はG)。
より好ましくは、ED3ドメインは、特にWNV (ED3.WNと記載される)から、黄熱病ウイルス(ED3-YF)から、又はデングウイルス(血清型1、2、3又は4)からであり、好ましくはDENVの血清型1からである(ED3.DEN1と記載される)。
フラビウイルスのED3ポリペプチドは、例えば、国際PCT出願WO 2004/016586に記載される。
特に、本発明は、本発明による方法に用いることができるハイブリッドタンパク質に関する。
上記のハイブリッドタンパク質の有利な実施形態によると、これは、ヘキサヒスチジンと、適切なフラビウイルスED3ドメインと、大腸菌のアルカリホスファターゼとを含む。
上記のハイブリッドタンパク質は、好ましくは多量体の形態であり、より好ましくは例えば(H6-ED3-PhoA)2のような二量体の形態である。
- ED3ドメインがDEN1ウイルスからである場合、該ハイブリッドタンパク質(H6-ED3.DEN1-PhoA)は、(配列番号2)の配列を示す。
- ED3ドメインがDEN2ウイルスからである場合、該ハイブリッドタンパク質(H6-ED3.DEN2-PhoA)は、(配列番号4)を示す。
- ED3ドメインがDEN3ウイルスからである場合、該ハイブリッドタンパク質(H6-ED3.DEN3-PhoA)は、(配列番号6)の配列を示す。
- ED3ドメインがDEN4ウイルスからである場合、該ハイブリッドタンパク質(H6-ED3.DEN4-PhoA)は、(配列番号8)の配列を示す。
- ED3ドメインが西ナイルウイルスからである場合、該ハイブリッドタンパク質(H6-ED3.WN-PhoA)は、(配列番号10)の配列を示す。
- ED3ドメインが黄熱病ウイルスからである場合、該ハイブリッドタンパク質(H6-ED3.YF-PhoA)は、(配列番号12)の配列を示す。
好ましくは、上記の核酸は、H6-ED3.DEN1-PhoAハイブリッドタンパク質をコードする配列番号1、H6-ED3.DEN2-PhoAハイブリッドタンパク質をコードする配列番号3、H6-ED3.DEN3-PhoAハイブリッドタンパク質をコードする配列番号5、H6-ED3.DEN4-PhoAハイブリッドタンパク質をコードする配列番号7、H6-ED3.WN-PhoAハイブリッドタンパク質をコードする配列番号9、及びH6-ED3.YF-PhoAハイブリッドタンパク質をコードする配列番号11からなる群より選択される。
好ましくは、これらは、正しいED3を、2つの変異(D153G及びD330N) (Le Duら, 2002の番号付けによる)を含む改変アルカリホスファターゼ(配列番号24)を含む発現ベクターpEBL1 (配列番号13)に挿入することにより得られる。
上記の発現ベクターは、CNCM (Collection Nationale de Culture de Microorganismes、75015 パリ、リュ デュ ドクトール ル 28 (28 rue du Docteur Roux, 75015 PARIS))に、2007年4月23日に、アクセッション番号I-3747で寄託されている。
(a) 上記で定義されるハイブリッドタンパク質をコードする配列を含む発現ベクターを、適切なアルボウイルスED3ポリペプチド、好ましくはフラビウイルスED3ポリペプチドをコードする配列をベクターpEBL1 (配列番号13)に挿入することにより得て、
(b) 適切な大腸菌株、好ましくはXL1-blue株(Bullockら, 1997により記載される)を、(a)で得られた発現ベクターで形質転換し、
(c) 上記の改変された株を、適切な培地中で培養し、
(d) タグ-ED3-PhoAハイブリッドタンパク質を、ペリプラスム抽出物から精製する
ことを含むことを特徴とする。
(i) 対象者又は動物からの試料を、考慮される対象者又は動物の種のIg分子の特定のクラスに対して指向されたIg結合タンパク質で感作された固体担体と接触させ、
(ii) (i)で形成された免疫複合体を、アルボウイルスED3ドメインとアルカリホスファターゼとを少なくとも含むハイブリッドタンパク質からなる検知分子とインキュベートし、
(iii) 上記のアルボウイルス抗体の存在を検出する
ことを含む。
上記の検出は、pNPPを加え、パラニトロフェノールの形成を測定することにより行われるのが好ましい。
- 考慮される動物種のIg分子の特定のクラスに対して指向されたIg結合タンパク質、最も一般的には異種抗体からなるIg結合タンパク質(抗IgX抗体)で感作された固体担体と、
- 少なくとも、アルボウイルスED3ドメインとアルカリホスファターゼとを少なくとも含むハイブリッドタンパク質と、
- 少なくとも1つの陽性対照、好ましくは感染した個体からの参照血清と、
- 少なくとも1つの陰性対照、好ましくは感染していない個体からの参照血清と
を含む、対象者におけるアルボウイルス抗体、好ましくはフラビウイルス抗体を診断及び/又はスクリーニングするためのキットにも関する。
好ましくは、アルカリホスファターゼは配列番号24を含む。
(i) 対象者又は動物からの試料を、考慮される動物の種のIg分子の特定のクラスに対して指向されたIg結合タンパク質で感作された固体担体と接触させ、
(ii) (i)で形成された免疫複合体を、病原体の適切な抗原とアルカリホスファターゼとを含むハイブリッドタンパク質からなる検知分子とインキュベートする
ことを含み、
該免疫複合体の存在が感染の指標である
ことを特徴とする、病原体による感染を診断するか、病原体又はその免疫原によるワクチン接種を確認するか、又は病原体の疫学を研究する方法にも関する。
(i) 分子、タンパク質又は細胞を、PhoAと融合したタンパク質又はそのフラグメントを含むハイブリッドタンパク質と接触させ、
(ii) PhoAと融合したタンパク質又はそのフラグメントと上記の分子、タンパク質又は細胞との間で結局は形成された複合体を検出する
ことを含むことを特徴とする、PhoAと融合したタンパク質又はそのフラグメントと、分子、タンパク質又は細胞との相互作用を研究する方法にも関する。
(i)固体担体と結局は結合させた抗アルボウイルス抗体又はアルボウイルスの表面分子の受容体を、PhoAと融合したアルボウイルスのエピトープを含むハイブリッドタンパク質と接触させ、
(ii)上記の抗アルボウイルス抗体又は上記の受容体と上記のエピトープとの間で形成された複合体を、適切なシグナル、例えばパラニトロフェノールの形成を測定することにより検出し、
(iii)試験する化合物を加え、
(iv)上記の抗アルボウイルス抗体又は上記の受容体と上記のエピトープとの間で形成された複合体の量が、工程(ii)で検出された複合体の量に関して低減したかを、適切なシグナルを測定し、(ii)で得られたシグナルと得られたシグナルとを比較することにより検出する
ことを含む。
図1. プラスミドpLB11、pVP5、pLIP5GN-H6及びpEBL1の構造。bla及びaph遺伝子は、それぞれアンピシリン及びカナマイシンに対する耐性をコードする。Ssはシグナル配列についてであり、H6はヘキサヒスチジンについてである。下の部分:pLIP5GN-H6及びpEBL1におけるphoAシグナル配列の5'末端とphoA 遺伝子の主要部分との間の配列の詳細。垂直の矢印は、シグナルペプチドの切断部位を示す。phoA遺伝子に属さない残基又はその生成物は、斜体である。
図3. H6-ED3.WN-PhoAハイブリッドを用いて行った、マウス血清の単純化MAC-ELISA。塗りつぶした印、gpE.WNを感染させたマウスからの血清;白抜きの印、非感染マウスの対照血清。四角、25℃にて3時間の顕示;丸、4℃にて一晩の顕示;菱形、ブランクの平均値。
図5. 抗原に対する単純化MAC-ELISAの特異性。アッセイを、H6-ED3.DEN1-PhoA及びH6-ED3.WN-PhoAハイブリッドを並行して用いて行った。塗りつぶした印、WNVに感染させたマウスからの血清;白抜きの印、非感染マウスの対照血清。丸、同族H6-ED3.WN-PhoA抗原;四角、非同族H6-ED3.DEN1-PhoA抗原;菱形、ブランクの平均値。顕示は、4℃にて一晩行った。
図7. H6-ED3.DEN1-PhoAハイブリッドを用いて行った、4つの血清型のDENVでの感染を経験した患者からの血清の単純化MAC-及びGAC-ELISA。血清を400倍に希釈し、アッセイの顕示を、25℃にて3時間行った。(A) 単純化MAC-ELISA。(B) 単純化GAC-ELISA。(C) MAC-及びGAC-ELISAにおけるシグナルの比r。試料1.1、DENV1による1次感染の血清;試料1.2、DENV1による2次感染の血清;試料2、3及び4、DENV-2、-3及び-4による感染の血清;試料C、健康な個体の血清;試料N及びB、血清又は抗ヒトIgをそれぞれ省略したアッセイでのシグナル。
実施例1:材料及び方法
- 培地、バッファー及びキット
培養培地LB (Sambrook及びRussell, 2001)及びSB (Pluckthun, 1996)は、記載されている。アンピシリンは200μg/mLで、カナマイシンは50μg/mLで用いた。アンピシリンを含むLB培地は、全ての遺伝子構築物について用いた。プラスミドDNAの調製は、Qiaprep Spin Miniprepキットを用い、アガロースゲルからのDNA抽出はGel Extractionキット(ともにQiagenから)を用い、DNAのライゲーションはQuick Ligationキット(Roche)を用い、ポリアクリルアミドゲル電気泳動はNuPAGE Novexシステム(Invitrogen)を用いて行った。酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)は、96ウェルマイクロタイトレーションプレート(Maxisorb, Nunc)で行った。PBSバッファー(リン酸緩衝塩水)は、Invitrogen又はSigma-Aldrichから購入し、ウシ血清アルブミン(BSA)はRocheから;低脂肪ドライミルクはRegilaitから;Tween 20、4-ニトロフェニルホスフェート(pNPP)及び5-ブロモ-4-クロロ-3-インドリルホスフェート(Xp)はSigma-Aldrichから購入した。バッファーAは、50 mM Tris-HCl、pH 8.0、500 mM NaClを含有し;バッファーBは、PBS中の0.05% Tweenを含有し;バッファーCは、PBS中の0.1% Tweenを含有し;バッファーDは、10%エタノールアミン、pH 9.8、0.01 M MgSO4を含有し;バッファーEは、バッファーD中の20μM ZnCl2を含有した。
大腸菌のXL1-Blue株(Bullockら, 1987)、並びにプラスミドpET20b+ (www.novagen.com)、pUC-4K (Genbankアクセッション番号X06404) (Vieira及びMessing, 1982)、pCR-Blunt (Bernardら, 1994), pQUANTAbody (Boulain及びDucancel, 2004)、pLB11 (Lisovaら, 2007)及びpVP5 (Lisovaら, 2007)は、記載されている。XL1-Blueのハイパーコンピテント細胞(Stratagene)、pCR-Blunt (Invitrogen)、pET20b+ (Novagen)及びpUC-4K (Amersham Biosciences)は、供給業者から購入した。プラスミドpLIP5GN-H6は、pQUANTAbodyの誘導体である(図1)。デングウイルスの血清型1のFGA/89株(DENV1;Genbankアクセッション番号AF226687) (Duarte dos Santosら, 2000)、西ナイルウイルスのIS-98-ST1株(WNV;Genbank AF481864;(Malkinsonら, 2002))、麻疹ウイルスのSchwarz株の組換え形MVSchw及びその誘導体MVSchw-sEWNV (Despresら, 2005)は、記載されている。pUC-4Kは、カナマイシン耐性を与えるaph遺伝子を、容易に可動化できるDNAカセットの形で有する。pQUANTAbodyは、大腸菌からのphoA遺伝子の変異対立遺伝子を、プロモーターptacの制御下に有する。この対立遺伝子は、その活性部位にD153G及びD330Nの2つの変異を有し、かつ触媒特性が向上されたアルカリホスファターゼ(PhoA)をコードする(Boulain及びDucancel, 2004; Le Duら, 2002; Mullerら, 2001)。pLIP5GN-H6は、pQUANTAbodyとは、ヒスチジンの6コドン(H6)及びマルチクローニング部位領域の存在が異なり、これらはともに、シグナル配列の下流のphoAのコドン27とコドン28の間に位置する(図1)。pLB11及びpVP5は、ED3.DEN1及びED3.WNをそれぞれコードする遺伝子セグメントを、pET20b+のNcoI及びXhoI制限部位の間に有する(図1)。MVSchw-sEWNVは、WNVからのgpEの可溶形を発現する。
ヤギ抗ヒトIgM及びIgG (Sigma-Aldrich)は、供給業者から購入した。ヒト血清は、フランス領ギアナのインスティティ・パスツール、国立アルボウイルス参照センター(the National Center of Reference for Arboviruses, Institut Pasteur of French Guiana)のコレクションからであった。これらは、発疹及び軽い出血の症状発現を伴うか又は伴わないデングの基本的な臨床症状(発熱、頭痛、筋肉痛、関節痛)を示す患者から回収された。血清は、標準的な診断法、特に抗原としてマウス脳抽出物を用いるGAC-及びMAC-ELISAを用いて特徴決定した。
プラスミドpLIP5GN-H6のクローニング領域に位置する制限部位は非常に近く、この領域での二重制限切断はモニターするのが困難である。よって、カナマイシンに対する耐性のカセットを、この領域のSalI部位に挿入した。プラスミドpUC-4Kを、SalI酵素で消化し、aph遺伝子を含有するDNAフラグメントをアガロースゲル電気泳動で精製した。pLIP5GN-H6もSalIで消化した。精製したフラグメントと線状ベクターとを、ライゲーションにより再び結合させた。組換えプラスミドpEBL1 (配列番号13)を、ライゲーション混合物でXL1-Blueのコンピテント細胞を形質転換し、形質転換細胞を、アンピシリン及びカナマイシンの両方を含有するLB培地上で選択することにより回収した。
* XL1-Blue(pEBL1)
XL1-Blue(pEBL1)は、pEBL1プラスミドを含有する大腸菌株である。pEBL1は、ヘキサヒスチジンと、所望のパッセンジャータンパク質(フラビウイルスのED3)と、触媒特性が向上された大腸菌からのアルカリホスファターゼとの融合タンパク質の構築を単純化するために工学的に作製された。pEBL1において、カナマイシンに対する耐性を与えるDNAカセットは、パッセンジャー遺伝子の位置にて挿入されている。よって、Hermannら,1990により以前に記載されたクローニングストラテジーに従って、パッセンジャー遺伝子の挿入を行ってモニターするのがより容易である。
実施例1を参照されたい。
生物は、アンピシリン及びカナマイシンに対して耐性である。この表現型は、LB寒天培地、100μg/ml アンピシリン及び50μg/mlカナマイシンを含有するペトリ皿上で生物を培養することにより調べることができる。
方法
フラビウイルスのED3ドメインとPhoAとのハイブリッドタンパク質をコードするED3-phoAハイブリッド遺伝子を、次のようにして構築した。プラスミドpEBL1 (実施例2を参照)を、まず、制限酵素SmaIで消化し、消化の完了を電気泳動により確認し、消化したDNAを、Microspin G25カラム(Amersham-Biosciences)上でのサイズ排除クロマトグラフィーにより脱塩した。pEBL1の線状の形態を、次いで、SalI酵素で消化し、制限切断を電気泳動によりモニターし、カナマイシン耐性のカセット(1252 bp)に相当するDNAフラグメントが出現した。ED3遺伝子を、2つのオリゴヌクレオチドプライマーと高忠実度のポリメラーゼPfu-Turbo (Stratagene)を用いるPCRにより増幅した。ED3遺伝子の5'末端とハイブリッド形成するプライマーはSalI部位を有し、3'末端にハイブリッド形成するプライマーはScaI及びSpeI部位を有した。ScaI部位(AGT-ACT)は、SmaI部位(CCC-GGG)よりも好ましい。なぜなら、後者は希なコドンCCCを導入するからである。ScaI、SpeI及びSalI部位は、ED3.DEN1遺伝子にもED3.WN遺伝子にも存在しなかった。PCR生成物をSalI及びScaIで消化した。消化生成物を、アガロースゲルによる電気泳動及び抽出により精製し、次いで、ライゲーションにより再結合させた。組換えプラスミドを形質転換によりXL1-Blue株に導入し、組換え細菌を、Xp指示薬培地上での青色コロニーの形成及びカナマイシンに対する感受性についてスクリーニングした。
5'-GCCGGCGGTCGACAAAGGGATGTCATATGTGATGTGCAC-3' (配列番号14);
5'-G TTTAGTACTAGTTTTCCCTATGCTGCT TCCCTT C-3' (配列番号15)。
同様に、ED3.WNを増幅するために用いたプライマーは、以下の配列を有した:
5'-GCCGGCGGTCGACAAAGGAACAACCTATGGCGTCTG-3' (配列番号16);
5'GGTGAGTACTAGTTTTGCCAATGCTGCT ACCAGAC-3' (配列番号17)。
5'-GCACTGGCACTCTTACCGTTAC-3' (配列番号18);
5'-CAGTCTGATCACCCGTTAAAC-3' (配列番号19)。
生成及び精製
H6-ED3-PhoAハイブリッドは、XL1-Blue株中のプラスミドpEBL11及びpEBL15から生成した。生成株の前培養を、SBブロス(1/10容量)に単離したコロニーを植菌し、37℃にて一晩インキュベーションすることにより行った。生成は、前培養物を同じ培地の1容量で希釈して最初の吸光度A600nm = 0.25〜0.30を得て、30℃にてA600nm = 1.5〜2.0まで成長させ、プロモーターptacを0.2 mM IPTGを用いて誘導し、同じ温度にてさらに2時間インキュベーションすることにより行った。全てのその後の工程は4℃にて行った。培養物は、5000 rpmにて10分間遠心分離した。細菌ペレットをバッファーA中の5 mMイミダゾール、1 mg/ml硫酸ポリミキシンB (Sigma-Aldrich)に再懸濁し(1/40容量)、細菌懸濁物を、磁気撹拌器で1時間穏やかに撹拌した。ペリプラスム抽出物は、懸濁物を13000 rpmにて10分間遠心分離し、-20℃にて凍結させることにより回収した。ED3-PhoAハイブリッドを、NiNTA樹脂(0.6ml/L-培養物、Qiagen)のカラム上での親和性クロマトグラフィーにより、ペリプラスム抽出物から精製した。カラムにペリプラスム抽出物を載せ、バッファーA中の20 mMイミダゾール(樹脂の10容量)で洗浄した。結合したタンパク質は、バッファーA中のイミダゾールの40〜100 mMのステップ勾配を用いて溶出した。精製物のフラクションを、還元条件下のSDS-PAGE (12%アクリルアミド)により分析した。H6-ED3-PhoAを含有し、>90%の純度のものをプールし、P10カラム(Amersham biosciences)上でのサイズ排除クロマトグラフィーによりPBSバッファーに移した。これらを、PBSへの移行の前又は後のいずれかで(このことは機能的特性の点で重要でない) (結果を参照)、-80℃にて直ちに凍結させた。精製H6-ED3-PhoAハイブリッドの濃度は、A280nmと、ソフトウェアスイートEMBOSSのサブルーチンPepstatsを用いてそれらのアミノ酸配列から算出した(Riceら, 2000)単量体についての吸光係数ε280nm = 40 680 M-1cm-1とを用いて決定した。
間接的ELISAは、200μL/ウェルの容量のマイクロタイトレーションプレートで行った。抗体mAb4E11を、PBSで10000倍に希釈した。プレートのウェル1〜11に抗体溶液を装填し、ウェル12にPBS単独を装填し、吸着反応のために4℃にて一晩インキュベートした。ウェルをバッファーBで洗浄し(3回)、バッファーB中の3% BSAで25℃にて3時間ブロッキングし、バッファーBで再び洗浄した(4回)。H6-ED3.DEN1-PhoAハイブリッド(0.2μMの最初の濃度)を、バッファーB中の1% BSAを用いて2倍に系列希釈した。ウェル1〜10に、ハイブリッドの最初の希釈10個を装填し、ウェル11に希釈バッファー単独を、ウェル12にハイブリッドの最低希釈を装填した。プレートを、捕捉反応のために25℃にて1時間インキュベートした。ウェルを上記のようにして洗浄し、捕捉されたハイブリッドを、バッファーD中の5 mM (2 mg/ml)のpNPPの添加により顕示した。パラニトロフェノールの形成を、A405nmを用いて4℃にて一晩の後に測定した。
pNPPからのp-ニトロフェノレート(pNP)の形成を、25℃にて、バッファーD又はE中でA405nmによりモニターした。pNPPの最初の濃度(5 mM)は飽和していた(Le Duら, 2002)ので、動力学的パラメータkcatは、以下の等式により算出できた:
dA405nm/dt = kcatE0ε405nm(pNP) (4)
式中、dA405nm/dtは、pNPの形成の初速度であり;E0は、(H6-ED3-PhoA)2二量体の合計濃度であり;ε405nm(pNP) = 1.78×104 M-1cm-1である(Mullerら, 2001)。kcatの値は、いくつかの値のE0について測定し、平均した。
H6-ED3-PhoAハイブリッドの機能を評価するために、それらのホスファターゼ活性を測定し、モノクローナル抗体mAb4E11によるそれらの認識をアッセイした。H6-ED3.DEN1-PhoA及びH6-ED3.WN-PhoAハイブリッドは、pNPPのpNPへの脱リン酸化について活性であり、バッファーD中、25℃での二量体1分子についてのkcat値がそれぞれ190±18 s-1及び154±6 s-1に等しい。H6-ED3.DEN1-PhoAは、固定化されたmAb4E11に、間接的ELISAにおいて特異的に結合し、このことはその固有のホスファターゼ活性により顕示された。これらの結果は、ハイブリッドのPhoA部分が正しく折り畳まれて二量体であったことを示した。なぜなら、PhoAの二量体の形態は、その単量体の形態よりも100倍活性が高いからである(Boulanger及びKantrowitz, 2003)。これらの結果は、ハイブリッドのED3.DEN1部分が正しく折り畳まれて抗原として機能的であることを示した。なぜなら、mAb4E11のエピトープは不連続で高次構造であり、ED3.DEN1ドメイン中に含まれるからである(Lisovaら, 2007)。各ハイブリッド分子の抗原特性はその固有の酵素活性を用いて明らかにされたので、結果は、H6-ED3.DEN1-PhoA分子の著しい割合が全ての所望される特性を同時に有し、すなわち、それらのPhoA部分が二量体でかつ活性であり、それらのED3.DEN1部分が抗原性でかつ二価(bivalent)状態であることを示した。PhoAポリペプチド鎖の7位の2つの残基は、PhoA二量体の構造中の同じ側に位置する(Le Duら, 2002)。よって、H6-ED3-PhoA二量体中のED3部分の2つのコピーも、分子の同じ側にあるはずであり、アビディティーの形態により免疫グロブリンと相互作用できるはずである。上記の結果は、H6-ED3-PhoAハイブリッドをGAC-ELISA及びMAC-ELISAで用い得ることを示すのに充分であった。
H6-ED3.DEN1-PhoA及びH6-ED3.WN-PhoAについての触媒定数kcatの値により、これらのハイブリッド分子のPhoA部分の高い活性、よってそれらの二量体状態が確かめられた。PhoAによる組換えED3ドメインの人工的な二量体形成は、ウイルス全体の表面でのそれらの多量体での提示を、よって、抗体又はその他の受容体とのそれらの多価性の形態の相互作用を部分的に模倣した。
方法
捕捉ELISAは、100μL/ウェルの容量のマイクロタイトレーションプレートを用いて行った。抗IgG及び抗IgM抗体をPBSで希釈した(最終濃度1μg/mL)。プレートのウェル1〜11に抗体の溶液を装填し、ウェル12にPBS単独を装填した。プレートを、吸着反応のために4℃にて一晩インキュベートした。次の朝に、ウェルをバッファーCで洗浄し(3回)、バッファーC中の3% (w/v)ドライミルクで37℃にて1時間ブロッキングし、次いでバッファーCで洗浄した(3回)。分析される血清及び対照血清を、100倍に、バッファーC中の1%粉ミルクで希釈し、次いで系列希釈した。H6-ED3-PhoAハイブリッドを、同じバッファーで希釈した(0.5μMの単量体の最終濃度)。ウェル1〜10に血清の最初の希釈10個を装填し、ウェル11に希釈バッファー単独を、ウェル12に血清の最低希釈を装填した。プレートを抗体捕捉反応のために37℃にて1時間インキュベートした。ウェルをバッファーCで洗浄し(3回)、次いで、H6-ED3-PhoAの溶液を装填した。プレートを、結合反応のために37℃にて1時間インキュベートした。ウェルを上記のようにして洗浄し、結合したH6-ED3-PhoA分子を、バッファーE中の5 mM pNPPの添加により顕示した。A405nmを、25℃にて数時間又は4℃にて一晩の後に測定した。血清のシグナルは、その値がブランク対照の少なくとも2倍であった場合に、著しいとみなした。血清の力価は、シグナルが著しかったものについての最大希釈係数に等しかった。いくつかの洗浄を延長し、抗IgM抗体を2.4μg/mLの最終濃度で用い、H6-ED3.DEN1-PhoAを0.2μMの単量体の最終濃度で用い、pNPPがバッファーD中にあった以外は、ヒト血清と同様にしてマウス血清について捕捉ELISAを行った。
抗フラビウイルスIgGの定量のための単純化GAC-ELISA
H6-ED3-PhoAハイブリッドが、同族フラビウイルスに対して指向されたIgGを、免疫化されたマウスの血清中で検出でき、よって、このような血清学に通常用いられるGAC-ELISAのプロトコルを単純化できるかについて試験した。よって、マウスIgGに対して指向された抗体を、マイクロタイトレーションプレートのウェルに、プラスチックの受動吸着により固定化した。この固定化抗体は、マウス血清中に存在するIgGを捕捉するために用いた。ED3ドメインに対して指向されたIgGを、H6-ED3-PhoAハイブリッドを用いて、その抗原性部分の結合とそのPhoA部分の触媒活性とにより顕示した(等式3)。
同様にして、H6-ED3-PhoAハイブリッドが、フラビウイルスに対して指向されたIgMを、免疫化したマウスの血清中で検出でき、よって、通常用いられるMAC-ELISAのプロトコルを単純化できるかについて試験した。マウスIgMに対して指向された抗体を固定化した。固定化抗体を用いて、マウス血清中に存在するIgMを捕捉した。ED3ドメインに対して指向されたIgMを、二価のH6-ED3-PhoAハイブリッドを用いて顕示した(等式3)。
本発明による単純化GAC-及びMAC-ELISAの特異性を、交差反応を行うことにより試験した。DENV1ウイルスで免疫にしたマウスの血清を、2つの並行するGAC-ELISAに供し、これらはH6-ED3.DEN1-PhoAハイブリッド又はH6-ED3.WN-PhoAを用いて顕示した(図4)。逆に、MVSchw-sEWNVキメラウイルスで免疫にしたマウスの血清を、2つの並行するMAC-ELISAに供し、これらはH6-ED3.DEN1-PhoAハイブリッド又はH6-ED3.WN-PhoAを用いて顕示した(図5)。一晩の顕示の後に、同族のシグナルは、GAC-ELISAにおける非同族のシグナルよりも5.4倍まで高く、MAC-ELISAにおいて3.9倍まで高かった。もちろん、これらの数字は、特異的シグナル(血清のシグナルからブランクのシグナルを減じる)を考慮すると、より高かった。これらの結果は、本明細書に記載されるようなGAC-及びMAC-ELISAは特異的であり、これらが、感染又は免疫化に関与したフラビウイルスを同定することを可能にしたことを示した。
H6-ED3.DEN1-PhoAハイブリッドを用いて、デングウイルスの4つの血清型DENV1〜DENV4の1つに感染したヒト患者からの血清を試験した。DENV1について、症状の開始から第9日と第28日の間に採取された3つの血清試料は、デングウイルスでの1次感染に相当した。第13及び18日に採取された2つの血清試料は、2次感染に相当した。DENV2、-3及び-4について、試料を第8日〜第32日の間に採取し、感染の1次又は2次の状態はわからなかった。これらの血清は、予め、乳飲みマウスの脳抽出物を抗原として用いるGAC-及びMAC-ELISAの標準的な方法によりアッセイされた。以下の対照を用いた:ヒトIgG又はIgMに対して指向された固定化抗体を省略したアッセイ;血清を省略したアッセイ;デングウイルスにより感染していない患者の血清を用いる2つのアッセイ。
実験のさらなる系列において、デングウイルスの4つの血清型DEN1〜DEN4の1つ又は黄熱病ウイルス(YFV)に感染した患者の血清を回収し、MAC-ELISA (Talarminら, 1998)及びPCR (Lanciottiら, 1992)の標準的な方法により特徴決定した。標準的なMAC-ELISAは、感染した乳飲みマウスの脳の抽出物を抗原として用い、PCRは、それぞれのウイルス血清型に特異的なプライマーを用いた(表I)。プライマー配列と増幅条件は、記載されたとおりであった(Lanciottiら, 1992)。特に、プライマー配列は、次のとおりであった:
プライマーD1: 5'- TCAATATGCTGAAACGCGCGAGAAACCG -3' (配列番号26)。
プライマーD2: 5'- TTGCACCAACAGTCAATGTCTTCAGGTTC -3' (配列番号27)。
プライマーTS1: 5'- CGTCTCAGTGATCCGGGGG -3' (配列番号28)。
プライマーTS2: 5'- CGCCACAAGGGGCATGAACAG -3' (配列番号29)。
プライマーTS3: 5'- TAACATCATCATGAGACAGAGC -3' (配列番号30)。
プライマーTS4: 5'- CTC TGT TGT CTT AAA CAA GAG A -3' (配列番号31)。
担体-@huIgM :: 血清 :: (H6-ED3-PhoA)2
ここで、@huIgMは、ヒトIgMに対して指向された抗体である。本発明者らは、血清アッセイのシグナルAが、対照のシグナルAcの2倍を超える場合、すなわちA>2Acの場合に陽性であるとみなした。対照は、n重(n≧3)で行い、ヒトIgMに対して指向された抗体が省略されたアッセイであった。
単純化MAC-ELISAの感度を、血清及び同族ハイブリッドのそれぞれのタイプについて表IVの第1行に示す。この感度は、DEN1及びDEN2血清について高く、DEN3及びYF血清について中程度であり、DEN4血清について低かった。カイエンヌのインスティティ・パスツールから受け取り、ワクチン接種された患者に相当する4つのYF血清に限定するならば、感度はより高かった(4つの陽性シグナル)。YFVのワクチン株17Dに相当する配列を有するED3.YF-PhoAハイブリッドは、野生型株に対して指向されたものよりも、ワクチンウイルスに対して指向されたIgMをよりよく検出できるだろう。
ED3-PhoAハイブリッドのモジュール性構造は、単純化MAC-ELISAでのシグナル強度が、そのED3部分と血清の抗体との間の認識の特性にのみ依存するようなものである。この特性は、異なるED3ドメインを有するED3-PhoAハイブリッドを用いて所定の血清について得られたシグナルを定量的に比較することを可能にする。よって、本発明者らは、同族ED3-PhoAハイブリッドを用いて陽性シグナルを与える血清と、非同族ハイブリッドよりも同族ハイブリッドを用いてより高いシグナルを与える血清の割合を算出した。本発明者らは、これらの割合を、4つのED3.DENハイブリッドについて、次いで5つのED3-PhoAハイブリッドについて算出した。このようにして4つのDENハイブリッドについて算出された血清型特異性は、DEN1、DEN2及びDEN3ハイブリッドについて≧89%であり、DEN4ハイブリッドについてゼロであった(表IV、第3行)。5つのハイブリッドについて算出したウイルス特異性も、DEN4ハイブリッドを除いて≧89%であった(表IV、第5行)。
デングウイルスの3つの血清型DEN1、DEN2及びDEN3のうちの1つに感染した患者の血清を回収し、IgG特異的間接的ELISA及びPCRの標準的な方法により特徴決定した。間接的ELISAは、感染した乳飲みマウスの脳の抽出物を抗原として用い、PCRは、それぞれのウイルス血清型に特異的なプライマーを用いた(表I)。回収した血清を、本発明による単純化GAC-ELISAにより、以前に記載したような3つの対応するH6-ED3-PhoAハイブリッドを用いてアッセイした(実施例5を参照)。単純化GAC-ELISAの一般的なフォーマットは、次のとおりである:
担体-@huIgG :: 血清 :: (H6-ED3-PhoA)2
ここで、@huIgGは、ヒトIgGに対して指向された抗体である。本発明者らは、血清アッセイのシグナルが、対照のシグナルの2倍より高い場合に、陽性であるとみなした。対照は、n重(n≧3)で行われた、ヒトIgGに対して指向された抗体を省略したアッセイであった。同族ハイブリッドを用いて行った単純化GAC-ELISAにおける陽性血清の割合は低く、最大でも29%であった(表V)。
実施例8〜11において特徴決定したH6-ED3-PhoAハイブリッドにより、本発明者らは、単純化MAC-ELISAにより、早期のデングウイルス又は黄熱病ウイルスによる最近の感染を認識できた。感度は、DEN1>DEN2>DEN3 = YF >> DEN4の順に、DEN4ウイルスを除いて高い〜より高いになった。
CNCM I−3748
CNCM I−3749
Claims (34)
- (i) 対象者又は動物からの試料を、考慮される対象者又は動物の種のIg分子の特定のクラスに対して指向されたIg結合タンパク質で感作された固体担体と接触させ、
(ii) (i)で形成された免疫複合体を、アルボウイルスED3ドメインとアルカリホスファターゼ(PhoA)とを少なくとも含むハイブリッドタンパク質からなる検知分子とインキュベートする
ことを含み、
該免疫複合体の検出が、前記試料中のアルボウイルスの存在の指標である、
ことを特徴とする、対象者又は動物宿主におけるアルボウイルスの診断又はスクリーニングのための方法。 - 前記Ig結合タンパク質が、抗IgM、抗IgG及び抗IgA抗体からなる群より選択されることを特徴とする請求項1に記載の方法。
- 前記アルボウイルスが、フラビウイルスであることを特徴とする請求項1又は2に記載の方法。
- 前記アルカリホスファターゼが、ラット、マウス、ニワトリ、ウシ、酵母及び細菌のアルカリホスファターゼからなる群より選択されることを特徴とする請求項1〜3のいずれか1項に記載の方法。
- 前記アルカリホスファターゼが大腸菌のアルカリホスファターゼであり、配列番号25を含むことを特徴とする請求項4に記載の方法。
- 前記ハイブリッドタンパク質が、ポリペプチドタグをさらに含むことを特徴とする請求項1〜5のいずれか1項に記載の方法。
- 前記ポリペプチドタグが、HIS (ヘキサヒスチジン)、c-MYC、HA、VSV-G、HSV、V5及びFLAGからなる群より選択されることを特徴とする請求項6に記載の方法。
- 前記ハイブリッドタンパク質が好ましくはヘキサヒスチジンと、フラビウイルスED3ドメインと、大腸菌のアルカリホスファターゼとを含むことを特徴とする請求項1〜7のいずれか1項に記載の方法。
- 前記大腸菌のアルカリホスファターゼが改変されていることを特徴とする請求項5又は8に記載の方法。
- 前記大腸菌のアルカリホスファターゼが、その活性部位に2つの変異D153G及びD330Nを含み、配列番号24を含む請求項9に記載の方法。
- 前記ED3ドメインのポリペプチドが、黄熱病ウイルスED3ドメインポリペプチド、西ナイルウイルスED3ドメインポリペプチド、デングウイルスED3ドメインポリペプチド、セントルイス脳炎ウイルスED3ドメインポリペプチド、マリーバレー脳炎ウイルスED3ドメインポリペプチド、及び日本脳炎ウイルスED3ドメインポリペプチドからなる群より選択されることを特徴とする請求項1〜10のいずれか1項に記載の方法。
- ポリペプチドタグと、アルボウイルスED3ドメインと、アルカリホスファターゼとを含むことを特徴とするハイブリッドタンパク質。
- ヘキサヒスチジンと、
黄熱病ウイルスED3ドメインポリペプチド、西ナイルウイルスED3ドメインポリペプチド、デングウイルスED3ドメインポリペプチド、セントルイス脳炎ウイルスED3ドメインポリペプチド、マリーバレー脳炎ウイルスED3ドメインポリペプチド、及び日本脳炎ウイルスED3ドメインポリペプチドを含む群より選択されるフラビウイルスED3ドメインと、
大腸菌のアルカリホスファターゼと
を含むことを特徴とする請求項12に記載のハイブリッドタンパク質。 - 好ましくは多量体の形態にあり、より好ましくは二量体の形態にあることを特徴とする請求項12又は13に記載のハイブリッドタンパク質。
- 配列番号2の配列からなる(H6-ED3.DEN1-PhoA)2、配列番号4の配列からなる(H6-ED3.DEN2-PhoA)2、配列番号6の配列からなる(H6-ED3.DEN3-PhoA)2、配列番号8の配列からなる(H6-ED3.DEN4-PhoA)2、配列番号10の配列からなる(H6-ED3.WN-PhoA)2、及び配列番号12の配列からなる(H6-ED3.YF-PhoA)2からなる群より選択されることを特徴とする請求項12〜14のいずれか1項に記載のハイブリッドタンパク質。
- 請求項12〜15のいずれか1項に記載のハイブリッドタンパク質をコードする核酸。
- H6-ED3.DEN1-PhoAハイブリッドタンパク質をコードする配列番号1、H6-ED3.DEN2-PhoAハイブリッドタンパク質をコードする配列番号3、H6-ED3.DEN3-PhoAハイブリッドタンパク質をコードする配列番号5、H6-ED3.DEN4-PhoAハイブリッドタンパク質をコードする配列番号7、H6-ED3.WN-PhoAハイブリッドタンパク質をコードする配列番号9、及びH6-ED3.YF-PhoAハイブリッドタンパク質をコードする配列番号11からなる群より選択されることを特徴とする請求項16に記載の核酸。
- (a) 請求項12〜15のいずれか1項に記載のハイブリッドタンパク質をコードする配列を含む発現ベクターを、アルボウイルスED3ポリペプチド、好ましくはフラビウイルスED3ポリペプチドをコードする配列をベクターpEBL1 (配列番号13)に挿入することにより得て、
(b) 適切な大腸菌株、好ましくはXL1-blue株を、(a)で得られた発現ベクターで形質転換し、
(c) 改変された前記株を、適切な培地中で培養し、
(d) タグ-ED3-PhoAハイブリッドタンパク質を、ペリプラスム抽出物から精製する
ことを含むことを特徴とする、請求項12〜15のいずれか1項に記載のハイブリッドタンパク質を作製する方法。 - 工程(a)の発現ベクターが、請求項12〜15のいずれか1項で定義されるハイブリッドタンパク質の発現ベクターからなる群より選択されることを特徴とする請求項18に記載の方法。
- 前記発現ベクターが、ハイブリッドタンパク質H6-ED3.DEN1-PhoAをコードする配列を含む(pEBL11、CNCM (Collection Nationale de Culture de Microorganismes、75015 パリ、リュ デュ ドクトール ル 28)に、2007年4月23日に、アクセッション番号I-3748で寄託された)ことを特徴とする請求項19に記載の方法。
- 前記発現ベクターが、ハイブリッドタンパク質H6-ED3.WN-PhoAをコードする配列を含む(pEBL15、CNCM (Collection Nationale de Culture de Microorganismes、75015 パリ、リュ デュ ドクトール ル 28)に、2007年4月23日に、アクセッション番号I-3749で寄託された)ことを特徴とする請求項19に記載の方法。
- CNCM (Collection Nationale de Culture de Microorganismes、75015 パリ、リュ デュ ドクトール ル 28)に、2007年4月23日に、アクセッション番号I-3747で寄託された発現ベクターpEBL1。
- CNCM (Collection Nationale de Culture de Microorganismes、75015 パリ、リュ デュ ドクトール ル 28)に、2007年4月23日に、アクセッション番号I-3748で寄託された発現ベクターpEBL11。
- CNCM (Collection Nationale de Culture de Microorganismes、75015 パリ、リュ デュ ドクトール ル 28)に、2007年4月23日に、アクセッション番号I-3749で寄託された発現ベクターpEBL15。
- (i) 対象者又は動物からの試料を、考慮される対象者又は動物の種のIg分子の特定のクラスに対して指向されたIg結合タンパク質で感作された固体担体と接触させ、
(ii) (i)で形成された免疫複合体を、アルボウイルスED3ドメインとアルカリホスファターゼとを少なくとも含むハイブリッドタンパク質からなる検知分子とインキュベートし、
(iii) 前記アルボウイルス抗体の存在を検出する
ことを含む、対象者又は動物におけるアルボウイルス抗体、好ましくはフラビウイルス抗体をスクリーニングする方法。 - - 考慮される動物種のIg分子の特定のクラスに対して指向されたIg結合タンパク質で感作された固体担体と、
- 少なくとも、請求項12〜15のいずれか1項で定義されるアルボウイルスED3ドメインとアルカリホスファターゼとを少なくとも含むハイブリッドタンパク質と、
- 少なくとも1つの陽性対照、好ましくは感染した個体からの参照血清と、
- 少なくとも1つの陰性対照、好ましくは感染していない個体からの参照血清と
を含む、対象者におけるアルボウイルス抗体、好ましくはフラビウイルス抗体について診断及び/又はスクリーニングするためのキット。 - 前記Ig結合タンパク質が、抗IgM、抗IgG及び抗IgAからなる群より選択され、前記ハイブリッドタンパク質が、ヘキサヒスチジンと、適切なフラビウイルスのウイルスED3ドメインと、大腸菌のアルカリホスファターゼとを含むことを特徴とする請求項26に記載のキット。
- 前記アルカリホスファターゼが、その活性部位に2つの変異D153G及びD330Nを含む改変アルカリホスファターゼであり、配列番号24を含むことを特徴とする請求項27に記載のキット。
- 病原体の適切な抗原とアルカリホスファターゼとを含むハイブリッドタンパク質の、前記病原体による感染のインビトロ診断又は前記病原体の疫学の研究のための使用。
- 病原体の適切な抗原とアルカリホスファターゼとを含むハイブリッドタンパク質の、前記病原体又はその免疫原に対するワクチン接種のインビトロでの確認のための使用。
- タンパク質又はそのフラグメントとアルカリホスファターゼとを含むハイブリッドタンパク質の、PhoAと融合した前記タンパク質又はそのフラグメントと分子、タンパク質又は細胞との相互作用を研究するための使用。
- (i) 対象者又は動物からの試料を、考慮される動物の種のIg分子の特定のクラスに対して指向されたIg結合タンパク質で感作された固体担体と接触させ、
(ii) (i)で形成された免疫複合体を、病原体の適切な抗原とアルカリホスファターゼとを含むハイブリッドタンパク質からなる検知分子とインキュベートする
ことを含み、
該免疫複合体の存在が感染の指標である
ことを特徴とする、病原体による感染を診断するか、病原体又はその免疫原によるワクチン接種を確認するか、又は病原体の疫学を研究するための方法。 - (i) 分子、タンパク質又は細胞を、PhoAと融合したタンパク質又はそのフラグメントを含むハイブリッドタンパク質と接触させ、
(ii) PhoAと融合したタンパク質又はそのフラグメントと前記分子、タンパク質又は細胞との間で結局は形成された複合体を検出する
ことを含むことを特徴とする、PhoAと融合したタンパク質又はそのフラグメントと、分子、タンパク質又は細胞との相互作用を研究する方法。 - (i)固体担体と結局は結合させた抗アルボウイルス抗体又はアルボウイルスの表面分子の受容体を、PhoAと融合したアルボウイルスのエピトープを含むハイブリッドタンパク質と接触させ、
(ii)前記抗アルボウイルス抗体又は前記受容体と前記エピトープとの間で形成された複合体を、適切なシグナル、例えばパラニトロフェノールの形成を測定することにより検出し、
(iii)試験する化合物を加え、
(iv)前記抗アルボウイルス抗体又は前記受容体と前記エピトープとの間で形成された複合体の量が、工程(ii)で検出された複合体の量に関して低減したかを、適切なシグナルを測定し、(ii)で得られたシグナルと得られたシグナルとを比較することにより検出する
ことを含む、抗アルボウイルス化合物をスクリーニングする方法。
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