JP2010148501A - がんマーカー、及び、がんの治療剤 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】BMCC1遺伝子の発現量を指標とする、がんの検出方法であって、上記がんが、前立腺がん、肺がん、胃がん、膀胱がん及び子宮がんからなる群より選ばれる、方法を提供する。
【選択図】なし
Description
(a)配列番号11に記載の配列からなるオリゴヌクレオチド、及び、配列番号12に記載の配列からなるオリゴヌクレオチド;
(b)配列番号13に記載の配列からなるオリゴヌクレオチド、及び、配列番号14に記載の配列からなるオリゴヌクレオチド;
(c)配列番号15に記載の配列からなるオリゴヌクレオチド、及び、配列番号16に記載の配列からなるオリゴヌクレオチド;
(d)配列番号30に記載の配列からなるオリゴヌクレオチド、及び、配列番号31に記載の配列からなるオリゴヌクレオチド
BMCC1遺伝子(BCH motif−containing molecule at the carboxyl terminal region 1)は、神経芽腫の予後決定に関与する遺伝子として本願発明者らが同定した遺伝子であり(特許文献1及び非特許文献1)、そのGenBank Accession No.は、AB050197である。BMCC1タンパク質は、340kDaであり、Bcl2/Adenovirus E1B 19kDa interacting protein 2(BNIP2)及びCdc42GAPホモロジードメイン(BCHドメイン)をC末端側に有している。図1は、ヒトのBMCC1遺伝子、PRUNE2遺伝子及びDD3遺伝子の染色体位置を模式的に示す図である。図1に示すとおり、BMCC1遺伝子は、ヒト9番染色体のq21.13に位置する。また、同じ染色体領域に、PRUNE2(GenBank Accession No. NM138818)が存在する。また、BMCC1遺伝子の第6イントロンに逆向きにDD3遺伝子が挿入されていることを見いだした。すなわち、DD3遺伝子の配列は、BMCC1遺伝子の第6イントロンの一部に対して、完全に相補的であった。DD3遺伝子によりコードされるDD3(GenBank Accession No.AF103907)は、前立腺がん抗原(PCA)とも呼ばれるnon−coding RNA(ncRNA)であり、前立腺がんのマーカーとして知られている。しかしながら、DD3の腫瘍発生メカニズムへの関与は明らかとなっていない。
本実施形態である、がんの検出方法について説明する。本実施形態のがんの検出方法は、BMCC1遺伝子の発現量を指標とする。BMCC1遺伝子をがんマーカーとして用いるものであり、BMCC1遺伝子の発現量が低いこととがんとの相関があるという本発明の知見に基づき、がん細胞又はがん組織を検出する。また、本実施形態のがんの検出方法は、がんが疑われる検体におけるBMCC1遺伝子の発現量を測定する工程と、BMCC1遺伝子の発現量を、正常検体、及び、がん検体におけるBMCC1遺伝子の発現量と比較する工程と、がんが疑われる検体におけるBMCC1遺伝子の発現量が、(i)正常検体におけるBMCC1遺伝子の発現量よりも低い、(ii)がん検体におけるBMCC1遺伝子の発現量と同じレベル、又は、(i)及び(ii)の両方に該当する場合に、当該がんが疑われる検体をがんと判定する工程と、を備える。
本実施形態である、DD3を標的とするsiRNAは、下記(a)〜(d)のいずれかのオリゴヌクレオチド対からなる二本鎖siRNAである。
(a)配列番号11に記載の配列からなるオリゴヌクレオチド、及び、配列番号12に記載の配列からなるオリゴヌクレオチド;
(b)配列番号13に記載の配列からなるオリゴヌクレオチド、及び、配列番号14に記載の配列からなるオリゴヌクレオチド;
(c)配列番号15に記載の配列からなるオリゴヌクレオチド、及び、配列番号16に記載の配列からなるオリゴヌクレオチド;
(d)配列番号30に記載の配列からなるオリゴヌクレオチド、及び、配列番号31に記載の配列からなるオリゴヌクレオチド
ヒト正常組織から抽出したtotalRNA(Clontech社)を用いて、以下の実験手順で半定量的RT−PCRを行い、BMCC1遺伝子、PRUNE2遺伝子及びDD3遺伝子のmRNA発現を調べた。
SuperScript First−Strand Synthesis System for RT−PCR(invitrogen社)を使用し、製品のプロトコールに沿ってcDNA合成を行った。行った。なお、cDNA合成には、2μgのtotal RNA、及び、ランダムプライマー(Random Hexamers、invitrogen社)を用いた。
以下の条件でPCR反応を行った。
<プライマー>
BMCC1;
BNF2:5’−ctgaacgatgaagggaaactgtcgataacgc−3’ (配列番号1)及び
BNR2:5’−cactgcctgccacggcttctgttg−3’ (配列番号2)
PRUNE2;
BNF2(配列番号1)及び
PRUNE2R1:5’−cacagcagatgttgaactccaggtgttc−3’ (配列番号3)
DD3;
DD3F3:5’−ggtgggaaggacctgatgatac−3’ (配列番号4)及び
DD3R3:5’−gcacagggcgaggctcatcgatg−3’ (配列番号5)
GAPDH1;
GAPDH1F:5’−accacagtccatgccatcac−3’ (配列番号6)
GAPDH1R:5’−tccaccaccctgttgctgta−3’ (配列番号7)
<反応液組成>
cDNA 1μl
10×rTaq Buffer 1μl
2.5mM dNTPs 1μl
フォワードプライマー(10μM) 0.5μl
リバースプライマー(10μM) 0.5μl
滅菌水 6μl
rTaq 0.1μl
総量 10μl
<反応条件>
上記組成の反応液が入ったチューブをサーマルサイクラー(Gene Amp(R)PCR System 9700、Applied Biosystem社)にセットし、BMCC1(BNF2/BNR2)プライマーセット(配列番号1及び2)の場合は、95℃(2分間)に加熱した後、95℃(15秒間)→59℃(15秒間)→72℃(20秒間)のサイクルを38回行い、さらに72℃で6分間保持した。PRUNE2(BNF2/PRUNE2R1)プライマーセット(配列番号1及び3)の場合は、95℃(2分間)に加熱した後、95℃(15秒間)→59℃(15秒間)→72℃(20秒間)のサイクルを38回行い、さらに72℃で7分間保持した。DD3(F3/R3)プライマーセット(配列番号4及び5)の場合は、95℃(2分間)に加熱した後、95℃(15秒間)→63℃(15秒間)→72℃(20秒間)のサイクルを38回行い、さらに72℃で6分間保持した。GAPDH1(F1/R1)プライマーセット(配列番号6及び7)の場合は、95℃(2分間)に加熱した後、95℃(15秒間)→58℃(15秒間)→72℃(20秒間)のサイクルを28回行い、さらに72℃で6分間保持した。得られたPCR産物は、2%アガロースゲルにて電気泳動し、エチジウムブロマイド(SIGMA社)を用いて検出した。
そこで、種々のがんにおけるBMCC1の発現について、肺がん(2例)、胃がん(2例)、膀胱がん(4例)、子宮がん(1例)、前立腺がん(2例)患者由来の正常組織とがん組織のマッチペアを用いてRT−PCR法によって検討した。
BMCC1;
kiaa0367F:5’−gaagcctctggtccagtcag−3’ (配列番号8)及び
kiaa0367R:5’−cttcggccgtatattctgga−3’ (配列番号9)
BMCC1(kiaa0367F/R)プライマーセットを用いたPCR反応は、95℃(2分間)に加熱した後、95℃(15秒間)→61℃(15秒間)→72℃(20秒間)のサイクルを35回行い、さらに72℃で6分間保持することにより行った。
DD3がBMCC1の遺伝子発現を抑制的に制御する可能性を検証するために、まず、前立腺がんより樹立した細胞株におけるBMCC1遺伝子、PRUNE2遺伝子及びDD3遺伝子の発現を、以下の方法により確認した。
前立腺がんより樹立した細胞株であるLNCaP細胞株、PC3細胞株、及び、Du145細胞株を植田先生(千葉がん泌尿器科部長)より供与頂き、これらを使用した。LNCaP細胞はアンドロゲン依存的な細胞株で、PC3細胞とDu145細胞はアンドロゲン非依存的な細胞株である。これらの細胞株の性質を表1に示す。また、コントロールとして、神経芽腫細胞株であるSK−N−BE細胞株を用いた。
DD3;
F3(配列番号4)及び
DD3R:5’−tcctgcccatcctttaagg−3’ (配列番号10)
DD3(F3/R)プライマーセットを用いたPCR反応では、96℃(5分間)に加熱した後、96℃(30秒間)→62℃(60秒間)のサイクルを35回行った。
次に、DD3に対するsiRNAによるDD3発現抑制がBMCC1遺伝子発現に与える影響を調べるために、siRNAを導入した前立腺がん細胞株(LNCaP細胞株及びPC3細胞株)から抽出したtotal RNAを用いて半定量的RT−PCTを行った。
DD3 siRNA1:5’−ggaaccaagauacaaagaacucuga−3’ (配列番号11)及び5’−ucagaguucuuuguaucuugguuccuu−3’ (配列番号12)
DD3 siRNA2:5’−ucacuagaaacagcaagaugacaat−3’ (配列番号13)及び5’−auugucaucuugcuguuucuagugaug−3’ (配列番号14)
DD3 siRNA3:5’−ggcauacuauaucaacuuugauuct−3’ (配列番号15)及び5’−agaaucaaaguugauauaguaugccaa−3’ (配列番号16)
コントロールsiRNA:センス鎖5’−cuuccucucuuucucucccuuguga−3’ (配列番号17)及びアンチセンス鎖5’−ucacaagggagagaaagagaggaagga−3’ (配列番号18)
DD3;
taqF4:5’−cacagagatccctgggagaaat−3’ (配列番号21)及び
taqR2:5’−ctgcccatcctttaaggaacac−3’ (配列番号22)
<反応液組成>
cDNA 1μl
10×LA−Taq Buffer 1μl
2.5mM dNTPs 1μl
2.5mM MgCl2 1μl
フォワードプライマー(10μM) 0.5μl
リバースプライマー(10μM) 0.5μl
滅菌水 5μl
LA−Taq 0.1μl
総量 10μl
DD3(taqF4/taqR2)プライマーセットを用いたPCR反応は、LA−Taq(タカラバイオ株式会社)を含む上記組成の反応液入ったチューブをサーマルサイクラー(Gene Amp(R)PCR System 9700、Applied Biosystem社)にセットし、95℃(2分間)に加熱した後、95℃(15秒間)→60℃(15秒間)→72℃(20秒間)のサイクルを35回行い、さらに72℃で7分間保持することにより行った。
BMCC1タンパク質の2074−2093番目の残基(アミノ酸配列:AKKPFSLKADGENPDILTHC、アミノ酸一文字表記;配列番号23;MBL社製合成ペプチド)を抗原ペプチドとして用い、以下の手順により抗BMCC1抗体を作製した。
実施例5と同様の手法により、siRNAをリポフェクション法(HiPerfect、キアゲン社)にて導入した後、48時間培養を行ったヒト前立腺がん細胞株LNCaPより抽出した全RNAを用いてcDNA合成し、半定量的RT−PCRを行った(図8)。
BMCC1に対するsiRNAとして、以下の配列を有するsiRNAを設計及び購入した(INTEGRATED DNA TECHNOLOGIES社)。
siBMCC1−1:5’−ggagaaggauauugacuugaagctg−3’ (配列番号24)及び5’−cagcuucaagucaauauccuuucuccau−3’ (配列番号25)
siBMCC1−2:5’−ggaguaucaggaagcaaaucaggta−3’ (配列番号26)及び5’−uaccugauuugcuuccugauacuccaa−3’ (配列番号27)
siBMCC1−3:5’−cccagugagauaaacaaugaagcag−3’ (配列番号28)及び5’−cugcuucauuguuuaucucacugggug−3’ (配列番号29)
また、DD3に対するsiRNAとして、DD3 siRNA1(配列番号11及び12)、DD3 siRNA3(配列番号15及び16)及びDD3 siRNA4(配列番号30及び31)を用いた。
DD3 siRNA4:5’−ggaguuagauuuaugcauauugugguu−3’ (配列番号30)及び5’−ccacaauaugcauaaaucuaacucc−3’ (配列番号31)
<PSA(F/R)プライマー及びADR(F/R)プライマー>
PSA;
F:5’−gcctctcgtggcagggcagt−3’ (配列番号32)及び
R:5’−gggtgaacttgcgcacacac−3’ (配列番号33)
ADR;
F:5’−tcaaaagagccgctgaagggaaaca−3’ (配列番号34)及び
R:5’−acaccatgagccccatccaggagta−3’ (配列番号35)
シスプラチン存在下におけるDD3発現抑制が前立腺がん細胞に与える影響を以下の手法により調べた。DD3に対するsiRNAを導入したLNCaP細胞をDMSO(ナカライテスク社)又はシスプラチン(cisplatin、CDDP;SIGMA社)で48時間処理した後、顕微鏡(ライカ社)観察を行った(図12)。また、siRNA導入から48時間後の細胞の増殖(Viability)をWST−8 kitを用いて測定した(図13)。アポトーシス細胞の検出は、TUNELアッセイkit(Roche社)を用いてマニュアルに従って行い、共焦点レーザー顕微鏡(ライカ社)観察にて定量を行った。図14に、siRNA導入から48時間後のLNCaP細胞におけるアポトーシス細胞の検出結果(核:青色、アポトーシス細胞:赤色)を示す。なお、条件毎に、それぞれ約400個の細胞についてアポトーシス細胞/核の割合を測定し、割合(%)を各パネルの下部に記載した。
初期段階の前立腺がんは大部分がアンドロゲン依存的であるためアンドロゲンブロック療法が有効であることが知られている。また、LNCaP細胞の増殖はアンドロゲン非存在下で抑制される。そこで、アンドロゲン非存在下におけるDD3発現抑制及びシスプラチン処理が前立腺がん細胞に与える影響を以下の方法により調べた。まず、LNCaP細胞を5%の低アンドロゲン含有FBS(invitrogen社)添加RPMI培地中で、DMSO又はCDDP処理を48、72時間行った後、細胞の増殖についてWST−8 kitを用いて測定した(図15)。次に、siRNAを導入したLNCaP細胞について5%の低アンドロゲン含有FBS添加RPMI培地中で、DMSO又はCDDP(SIGMA社)処理を48時間行った後、細胞の増殖をWST−8 kitを用いて測定した(図16)。
Claims (11)
- BMCC1遺伝子の発現量を指標とする、がんの検出方法であって、
前記がんが、前立腺がん、肺がん、胃がん、膀胱がん及び子宮がんからなる群より選ばれる、方法。 - がんが疑われる検体におけるBMCC1遺伝子の発現量を測定する工程と、
前記BMCC1遺伝子の発現量を、正常検体、及び、がん検体におけるBMCC1遺伝子の発現量と比較する工程と、
がんが疑われる検体におけるBMCC1遺伝子の発現量が、
(i)正常検体におけるBMCC1遺伝子の発現量よりも低い、
(ii)がん検体におけるBMCC1遺伝子の発現量と同じレベル、又は、
(i)及び(ii)の両方
に該当する場合に、当該がんが疑われる検体をがんと判定する工程と、
を備える、請求項1に記載の方法。 - 前記検体が、細胞又は組織片である、請求項2に記載の方法。
- 前記がんが、前立腺がんである、請求項1〜3いずれか一項に記載の方法。
- DD3を標的とするsiRNAであって、
前記siRNAが、下記(a)〜(d)のいずれかのオリゴヌクレオチド対からなる二本鎖siRNA。
(a)配列番号11に記載の配列からなるオリゴヌクレオチド、及び、配列番号12に記載の配列からなるオリゴヌクレオチド;
(b)配列番号13に記載の配列からなるオリゴヌクレオチド、及び、配列番号14に記載の配列からなるオリゴヌクレオチド;
(c)配列番号15に記載の配列からなるオリゴヌクレオチド、及び、配列番号16に記載の配列からなるオリゴヌクレオチド;
(d)配列番号30に記載の配列からなるオリゴヌクレオチド、及び、配列番号31に記載の配列からなるオリゴヌクレオチド - 請求項5に記載のsiRNAを有効成分とする、がん治療剤。
- 前記がんが、前立腺がん、肺がん、胃がん、膀胱がん及び子宮がんからなる群より選ばれる、請求項6に記載のがん治療剤。
- 前記がんが、前立腺がんである、請求項6に記載のがん治療剤。
- 抗がん剤をさらに含む、請求項8に記載のがん治療剤。
- 前記抗がん剤が、シスプラチンである、請求項9に記載のがん治療剤。
- 抗アンドロゲン剤をさらに含む、請求項8〜10いずれか一項に記載のがん治療剤。
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| JPN6014034845; 臨床と研究, (2004), 81, [4], p.553-556 * |
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| EP2204177A1 (en) | 2010-07-07 |
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