JP2008249465A - Probe array and its manufacturing method - Google Patents
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Abstract
Description
本発明はプローブアレイおよびその製造方法に関する。 The present invention relates to a probe array and a manufacturing method thereof.
近年、標的物質と反応できるプローブ(例えば、DNA、タンパク質等の生体物質)をガラス、シリコン等のプレート状担体に固定化し、標的物質の検出を行うDNAチップ、プロテインチップ等のプローブアレイが開発されている。 In recent years, probe arrays such as a DNA chip and a protein chip have been developed that can detect a target substance by immobilizing a probe capable of reacting with a target substance (for example, a biological substance such as DNA or protein) on a plate-like carrier such as glass or silicon. ing.
プローブアレイによる標的物質の検出は、標的物質を含む液体試料をプレート状担体上に添加し、乾燥を防ぐためにカバーグラス等を被せ、プローブと標的物質とを反応させた後、洗浄してプローブと反応した標的物質以外の物質を除去し、予め標的物質に結合させておいた標識物質(例えば、蛍光物質、酵素等)を検出することにより行われる。 Detection of the target substance by the probe array is performed by adding a liquid sample containing the target substance onto a plate-like carrier, covering with a cover glass to prevent drying, reacting the probe with the target substance, washing, and A substance other than the reacted target substance is removed, and a labeling substance (for example, a fluorescent substance, an enzyme, etc.) previously bound to the target substance is detected.
しかしながら、従来のプローブアレイでは、液体試料をマイクロピペットで吸い取り、均一にプレート状担体に添加し、カバーグラスを被せ、反応後にカバーグラスを外して均一にプレート状担体を洗浄するという操作を手作業で行わなければならなかったため、作業性が悪く、また比較的多量の液体試料を必要としていた。 However, in the conventional probe array, the liquid sample is sucked with a micropipette, added uniformly to the plate carrier, covered with a cover glass, and after the reaction, the cover glass is removed and the plate carrier is washed uniformly. Therefore, workability was poor and a relatively large amount of liquid sample was required.
このような状況の下、光透過性の円筒状キャピラリーの内壁に複数種類のプローブが縞状に固定されたプローブアレイが開発された(特許文献1参照)。
上記プローブアレイによれば、円筒状キャピラリーの中空部に対する液体試料、洗浄液等の流入および流出という簡便な操作により、標的物質を検出することができる。しかしながら、必要な液体試料の量は依然として多く、またプローブアレイ自体の製造方法も容易ではない。 According to the probe array, the target substance can be detected by a simple operation of inflow and outflow of a liquid sample, a cleaning liquid, and the like with respect to the hollow portion of the cylindrical capillary. However, the amount of liquid sample required is still large, and the manufacturing method of the probe array itself is not easy.
本発明は、このような実状に鑑みてなされたものであり、液体試料の使用量を減らすことができ、また簡便に製造することのできるプローブアレイおよびその製造方法を提供することを目的とする。 The present invention has been made in view of such a situation, and an object of the present invention is to provide a probe array that can reduce the amount of liquid sample used and can be easily manufactured, and a method for manufacturing the same. .
上記目的を達成するために、第1に本発明は、片面にプローブ固定化層を有する平面状のプローブ固定シートと、前記プローブ固定シートのプローブ固定化層側に位置する、熱融着可能な透明性を有する平面状の第1のカバーシートと、前記プローブ固定シートのプローブ固定化層の反対側に位置する、熱融着可能な平面状の第2のカバーシートとを備え、前記第1のカバーシートおよび前記第2のカバーシートの少なくとも両縁部は熱融着されており、前記プローブ固定シートのプローブ固定化層と前記第1のカバーシートとの間には、液導入スペースを構成する空隙が存在することを特徴とするプローブアレイを提供する(請求項1)。 In order to achieve the above object, first, the present invention is a flat probe fixing sheet having a probe fixing layer on one side, and is heat-sealable located on the probe fixing layer side of the probe fixing sheet. A first planar cover sheet having transparency; and a second planar cover sheet that is located on the opposite side of the probe immobilization layer of the probe immobilization sheet and that can be heat-sealed. At least both edges of the cover sheet and the second cover sheet are heat-sealed, and a liquid introduction space is formed between the probe fixing layer of the probe fixing sheet and the first cover sheet. There is provided a probe array characterized in that there is a void to be formed (claim 1).
第2に本発明は、両面にプローブ固定化層を有する平面状のプローブ固定シートと、前記プローブ固定シートの一方の面側に位置する、熱融着可能な透明性を有する平面状の第1のカバーシートと、前記プローブ固定シートの他方の面側に位置する、熱融着可能な透明性を有する平面状の第2のカバーシートとを備え、前記第1のカバーシートおよび前記第2のカバーシートの少なくとも両縁部は熱融着されており、前記プローブ固定シートのプローブ固定化層と前記第1のカバーシートとの間、および前記プローブ固定シートのプローブ固定化層と前記第2のカバーシートとの間には、それぞれ液導入スペースを構成する空隙が存在することを特徴とするプローブアレイを提供する(請求項2)。 Secondly, the present invention provides a planar probe fixing sheet having a probe fixing layer on both sides, and a planar first sheet which is located on one side of the probe fixing sheet and has heat-sealable transparency. And a flat second cover sheet that is located on the other surface side of the probe fixing sheet and has heat-transmissible transparency, the first cover sheet and the second cover sheet At least both edges of the cover sheet are heat-sealed, between the probe fixing layer of the probe fixing sheet and the first cover sheet, and between the probe fixing layer of the probe fixing sheet and the second There is provided a probe array characterized in that there are air gaps constituting liquid introduction spaces between the cover sheets (claim 2).
上記発明(請求項1,2)において、前記第1のカバーシートと前記第2のカバーシートとは、一箇所以外、全周縁部において熱融着されており、前記熱融着されていない箇所は、液注入部となっていてもよいし(請求項3)、二箇所以外、全周縁部において熱融着されており、前記熱融着されていない箇所は、液注入部および排出部となっていてもよい(請求項4)。 In the above inventions (Inventions 1 and 2), the first cover sheet and the second cover sheet are heat-sealed at all peripheral edges except for one place, and are not heat-sealed. May be a liquid injection part (Claim 3), and other than the two places, it is heat-sealed at the entire periphery, and the non-heat-fused parts are the liquid injection part and the discharge part. (Claim 4).
第3に本発明は、片面または両面にプローブ固定化層を有する平面状のプローブ固定シートと、前記プローブ固定シートのプローブ固定化層側に位置する、熱融着可能な透明性を有する平面状のカバーシート(1枚または2枚)とを備え、前記プローブ固定シートおよび前記カバーシートの少なくとも両縁部は熱融着されており、前記プローブ固定シートのプローブ固定化層と前記カバーシートとの間には、液導入スペースを構成する空隙が存在することを特徴とするプローブアレイを提供する(請求項5)。 Thirdly, the present invention relates to a planar probe fixing sheet having a probe fixing layer on one side or both sides, and a planar shape having heat-transparent transparency located on the probe fixing layer side of the probe fixing sheet. Cover sheet (one or two sheets), at least both edges of the probe fixing sheet and the cover sheet are heat-sealed, and the probe fixing layer of the probe fixing sheet and the cover sheet There is provided a probe array characterized in that there is an air gap constituting a liquid introduction space between them (claim 5).
第4に本発明は、片面にプローブ固定化層を有する平面状のプローブ固定シートのプローブ固定化層側に、熱融着可能な透明性を有する平面状の第1のカバーシートを重ね、前記プローブ固定シートのプローブ固定化層の反対側に、熱融着可能な平面状の第2のカバーシートを重ね、前記第1のカバーシートおよび前記第2のカバーシートの少なくとも両縁部を熱融着し、もって前記プローブ固定シートのプローブ固定化層と前記第1のカバーシートとの間に、液導入スペースを構成する空隙を形成することを特徴とするプローブアレイの製造方法を提供する(請求項6)。 Fourthly, in the present invention, a planar first cover sheet having transparency that can be heat-sealed is stacked on the probe-immobilized layer side of a planar probe-immobilized sheet having a probe-immobilized layer on one side, On the opposite side of the probe fixing layer of the probe fixing sheet, a flat second cover sheet that can be heat-sealed is overlaid, and at least both edges of the first cover sheet and the second cover sheet are heat-fused. A probe array manufacturing method is provided, characterized in that a gap forming a liquid introduction space is formed between the probe fixing layer of the probe fixing sheet and the first cover sheet. Item 6).
第5に本発明は、両面にプローブ固定化層を有する平面状のプローブ固定シートの一方の面側に、熱融着可能な透明性を有する平面状の第1のカバーシートを重ね、前記プローブ固定シートの他方の面側に、熱融着可能な透明性を有する平面状の第2のカバーシートを重ね、前記第1のカバーシートおよび前記第2のカバーシートの少なくとも両縁部を熱融着し、もって前記プローブ固定シートのプローブ固定化層と前記第1のカバーシートとの間、および前記プローブ固定シートのプローブ固定化層と前記第2のカバーシートとの間に、液導入スペースを構成する空隙を形成することを特徴とするプローブアレイの製造方法を提供する(請求項7)。 Fifthly, in the present invention, a planar first cover sheet having transparency that can be heat-sealed is superimposed on one surface side of a planar probe fixing sheet having probe fixing layers on both sides, and the probe A flat second cover sheet having transparency that can be heat-sealed is stacked on the other surface side of the fixing sheet, and at least both edges of the first cover sheet and the second cover sheet are heat-fused. A liquid introduction space between the probe fixing layer of the probe fixing sheet and the first cover sheet and between the probe fixing layer of the probe fixing sheet and the second cover sheet. Provided is a method for manufacturing a probe array, characterized in that a gap is formed (claim 7).
第6に本発明は、片面または両面にプローブ固定化層を有する平面状のプローブ固定シートのプローブ固定化層側に、熱融着可能な透明性を有する平面状のカバーシート(1枚または2枚)を重ね、前記プローブ固定シートおよび前記カバーシートの少なくとも両縁部を熱融着し、もって前記プローブ固定シートのプローブ固定化層と前記カバーシートとの間に、液導入スペースを構成する空隙を形成することを特徴とするプローブアレイの製造方法を提供する(請求項8)。 Sixth, the present invention provides a flat cover sheet (1 or 2) having transparency that can be heat-sealed on the probe-fixing layer side of a flat probe-fixing sheet having a probe-fixing layer on one or both sides. And at least both edges of the probe fixing sheet and the cover sheet are heat-sealed, so that a gap constituting a liquid introduction space is formed between the probe fixing layer of the probe fixing sheet and the cover sheet. A method for manufacturing a probe array is provided.
上記発明(請求項6〜8)によれば、熱融着によって簡便にプローブアレイを製造することができる。また、シート状の部材を重ねて熱融着するため、得られるプローブアレイにおける液導入スペースの容積は極めて小さくなる。かかるプローブアレイによれば、少ない試料溶液量で効率的に検出作業を行うことができる。 According to the said invention (inventions 6-8), a probe array can be simply manufactured by heat sealing | fusion. Further, since the sheet-like members are stacked and heat-sealed, the volume of the liquid introduction space in the obtained probe array becomes extremely small. According to such a probe array, the detection operation can be efficiently performed with a small amount of sample solution.
本発明によれば、熱融着によって簡便にプローブアレイを製造することができる。また、得られるプローブアレイにおける液導入スペースの容積は極めて小さいため、少ない試料溶液量で効率的に検出作業を行うことができる。 According to the present invention, a probe array can be easily manufactured by thermal fusion. Moreover, since the volume of the liquid introduction space in the obtained probe array is extremely small, the detection operation can be performed efficiently with a small amount of sample solution.
以下、本発明の実施形態について説明する。
〔第1の実施形態〕
図1(a)は、本発明の第1の実施形態に係るプローブアレイ1Aの断面図((b)のX−X断面図)、図1(b)は、同実施形態に係るプローブアレイ1Aの平面図である。図1に示すように、本実施形態に係るプローブアレイ1Aは、平面状のプローブ固定シート2Aと、平面状の第1のカバーシート3Aと、平面状の第2のカバーシート4Aとを備えている。
Hereinafter, embodiments of the present invention will be described.
[First Embodiment]
1A is a cross-sectional view of the
プローブ固定シート2Aは、基材21Aと、基材21Aに積層されたプローブ固定化層22Aとから構成される。本実施形態における基材21Aは、プローブ固定化層22Aを形成することができ、かつ、液体試料、洗浄液等に不溶性である限り特に限定されるものではない。
The
かかる基材21Aの材料としては、例えば、ポリエチレン、ポリプロピレン等のポリオレフィン、ポリエチレンテレフタレート、ポリブチレンテレフタレート等のポリエステル、ポリ塩化ビニル、ポリスチレン、ポリウレタン、ポリカーボネート、ポリメタクリル酸メチル、エチレン酢酸ビニル共重合体、エチレン(メタ)アクリル酸共重合体、エチレン(メタ)アクリル酸エステル共重合体、アイオノマー樹脂などの樹脂からなるシート、またはそれらの積層シート;アルミニウム、ステンレススチール等の金属または合金からなるシートまたは板;ガラス板;セラミックス板;それらの複合材料等が挙げられる。
Examples of the material of the
基材21Aの色は、プローブ固定化層22Aのプローブに結合した標的物質に結合している標識物質(例えば、蛍光物質等)を認識し易い色であることが好ましく、例えば白色であることが好ましい。
The color of the
基材21Aの厚さは、後述する液導入スペース6Aが形成される厚さである限り特に限定されるものではないが、通常5〜200μm、好ましくは10〜50μmである。
The thickness of the
プローブ固定化層22Aは、プローブを固定化するための材料(プローブ固定化材料)からなる層にプローブが固定化されたものである。プローブは、例えば、静電結合、共有結合、タンパク質−タンパク質相互作用、タンパク質−低分子相互作用等による化学的吸着または化学反応を利用して固定することができる。また、細孔を有する粒子の物理的吸着作用を利用して固定することができる。
The
例えば、静電結合を利用する場合には、プローブ固定化材料として、ポリカチオン性物質を選択することが好ましい。ポリカチオン性物質としては、例えば、カチオン性基を有する高分子;ポリリジン、ポリアルギニン、リジンとアルギニンの共重合体等の塩基性アミノ酸の単独重合体若しくは共重合体又はこれらの誘導体;ポリエチレンイミン等のポリカチオン性ポリマー等が挙げられる。これらの中でも、ポリL−リジン、ポリエチレンイミン等が好ましく用いられる。 For example, when electrostatic coupling is used, it is preferable to select a polycationic substance as the probe immobilization material. Examples of polycationic substances include polymers having cationic groups; homopolymers or copolymers of basic amino acids such as polylysine, polyarginine, a copolymer of lysine and arginine, or derivatives thereof; polyethyleneimine, etc. And a polycationic polymer. Among these, poly L-lysine, polyethyleneimine and the like are preferably used.
また、例えば、物理的吸着作用を利用する場合には、プローブ固定化材料として、無機粒子、特に多孔質の無機粒子を選択することが好ましい。かかる無機粒子としては、例えば、シリカ粒子、炭化ケイ素、窒化ケイ素、炭化ホウ素、アルミナ等が挙げられる。無機粒子の平均二次粒径は、0.1〜20μmであることが好ましく、特に0.5〜10μmであることが好ましい。 Further, for example, when utilizing a physical adsorption action, it is preferable to select inorganic particles, particularly porous inorganic particles, as the probe immobilization material. Examples of such inorganic particles include silica particles, silicon carbide, silicon nitride, boron carbide, and alumina. The average secondary particle size of the inorganic particles is preferably 0.1 to 20 μm, and particularly preferably 0.5 to 10 μm.
無機粒子が多孔質の場合、BET比表面積は、100〜1000m2/gであることが好ましく、特に200〜600m2/gであることが好ましい。また、細孔容積は、0.5〜5ml/gであることが好ましく、特に1〜3ml/gであることが好ましい。さらに、平均細孔直径は、30〜500Åであることが好ましく、特に50〜300Åであることが好ましい。 When the inorganic particles are porous, BET specific surface area is preferably 100~1000m 2 / g, it is particularly preferably 200~600m 2 / g. The pore volume is preferably 0.5 to 5 ml / g, particularly preferably 1 to 3 ml / g. Furthermore, the average pore diameter is preferably 30 to 500 mm, and particularly preferably 50 to 300 mm.
プローブ固定化材料として無機粒子を使用する場合、熱可塑性樹脂、熱硬化性樹脂、活性エネルギー線硬化性樹脂等のバインダーに、無機粒子と所望により溶媒を分散させたものを塗工することにより、プローブ固定化層22Aを形成することができる。
When using inorganic particles as a probe immobilization material, by coating inorganic particles and a solvent, if desired, in a binder such as a thermoplastic resin, a thermosetting resin, an active energy ray curable resin, The
プローブ固定化材料からなる層の厚さは、プローブが確実に固定される厚さである限り特に限定されるものではないが、通常0.5〜500μm、好ましくは5〜300μmである。 The thickness of the layer made of the probe-immobilizing material is not particularly limited as long as the thickness is such that the probe is reliably fixed, but is usually 0.5 to 500 μm, preferably 5 to 300 μm.
プローブは、プローブ群として複数スポット状に固定されることが好ましい。各プローブ群に含まれるプローブの種類は、通常、各プローブ群の固定位置に基づいて識別できるようになっている。各プローブ群は、プローブの種類と位置とが対応付けられる限りいかなる形態で固定されていてもよく、各プローブ群は、例えば筋状に固定されていてもよい。また、固定されるプローブ群の数は特に限定されるものではなく、適宜変更が可能である。また、各プローブ群の配置、スポットの大きさ等は適宜変更が可能である。 The probes are preferably fixed in a plurality of spots as a probe group. The type of probe included in each probe group is usually identified based on the fixed position of each probe group. Each probe group may be fixed in any form as long as the type and position of the probe are associated with each other, and each probe group may be fixed in a streak shape, for example. The number of probe groups to be fixed is not particularly limited, and can be changed as appropriate. Further, the arrangement of each probe group, the size of the spot, and the like can be changed as appropriate.
1つのプローブ群には、通常、同一種類の複数のプローブが含まれている。各プローブ群に含まれるプローブは、例えば、核酸、タンパク質、抗原、抗体、酵素、糖鎖等の生体物質である。異なるプローブ群に含まれるプローブの種類は同一種類であってもよいし異なる種類であってもよいが、プローブ群全体で複数種類のプローブが含まれることが好ましい。複数種類のプローブが固定されていることにより、複数種類の標的物質を同時に並列して検出することができる。 One probe group usually includes a plurality of probes of the same type. The probes included in each probe group are biological materials such as nucleic acids, proteins, antigens, antibodies, enzymes, sugar chains, and the like. The types of probes included in different probe groups may be the same or different types, but it is preferable that a plurality of types of probes are included in the entire probe group. By fixing a plurality of types of probes, a plurality of types of target substances can be detected simultaneously in parallel.
第1のカバーシート3Aは、熱や超音波によって融着可能で、かつ、透明性を有する材料から構成される。第1のカバーシート3Aが透明性を有することにより、プローブ固定シート2Aのプローブに結合した標的物質に結合している標識物質(例えば、蛍光物質等)を第1のカバーシート3Aの外側から認識することができる。すなわち、第1のカバーシート3Aの透明度は、標識物質を認識できる程度であれば、特に限定されない。
The
第1のカバーシート3Aを構成する材料としては、例えば、ポリエチレン、ポリプロピレン等のポリオレフィン、ポリアクリロニトリル、エチレン−メタクリル酸共重合体、ポリスチレン、ポリ塩化ビニル、ポリ塩化ビニリデン、ポリアミド等の熱融着性を有する樹脂からなるシート、あるいはポリエチレンテレフタレート、ポリブチレンテレフタレート、ポリエチレンナフタレートなどのポリエステル、ナイロン、セロハン、エチレン−酢酸ビニル共重合体、ポリ塩化ビニル、ポリプロピレン、ポリスチレン、ポリカーボネート、ポリスルホン、ポリエーテルエーテルケトン、ポリエーテルスルホン、ポリフェニレンスルフィド、ポリエーテルイミド、ポリイミド、フッ素樹脂、ポリアミド、アクリル樹脂、ノルボルネン系樹脂等の樹脂からなる基材シートに、上記熱融着性を有する樹脂からなるシートを積層または上記熱融着性を有する樹脂をコートした積層シート等が挙げられる。
As a material constituting the
第1のカバーシート3Aの厚さは、後述する液導入スペース6Aが形成される厚さである限り特に限定されるものではないが、通常1〜1000μm、好ましくは10〜500μmである。
The thickness of the
第2のカバーシート4Aは、熱や超音波によって融着可能な材料から構成される。第2のカバーシート4Aとしては、第1のカバーシート3Aと同様のものを使用することができる。ただし、第2のカバーシート4Aは、透明性を有する必要はない。
The
本実施形態に係るプローブアレイ1Aにおいては、プローブ固定シート2Aを内部に収納するようにして(プローブ固定シート2Aを挟み込まないようにして)、第1のカバーシート3Aと第2のカバーシート4Aとが、全周縁部において熱融着されている。すなわち、プローブアレイ1Aの全周縁部には、熱融着部5Aが形成されている。熱融着部5Aの幅は、第1のカバーシート3Aと第2のカバーシート4Aとが確実に接合される限り特に限定されないが、通常0.2〜10mm、好ましくは2〜5mmである。
In the
図1(a)に示すように、プローブ固定シート2Aのプローブ固定化層22Aと第1のカバーシート3Aとの間には空隙が存在し、この空隙は液導入スペース6Aを構成する。この空隙は、プローブアレイ1Aの製造に伴って自然に形成されるものである。
As shown in FIG. 1A, a gap exists between the
プローブアレイ1Aを製造するには、プローブ固定シート2Aのプローブ固定化層22A側に第1のカバーシート3Aを重ね、プローブ固定シート2Aの基材21A側に第2のカバーシートを重ねた状態で、第1のカバーシート3Aおよび第2のカバーシート4Aの周縁部を熱融着する。第1のカバーシート3Aおよび第2のカバーシート4Aは、いずれも平面状であるが、熱融着するためにそれらの周縁部を加圧する結果、周縁部以外の部分(中央部)が僅かに持ち上がる。これにより、プローブ固定シート2Aのプローブ固定化層22Aと第1のカバーシート3Aとの間に、非常に薄い空隙、すなわち小さい容積の液導入スペース6Aが形成される。
In order to manufacture the
液導入スペース6Aの容積は、プローブアレイ1Aの大きさにもよるが、1〜50μlであることが好ましく、特に3〜10μlであることが好ましい。液導入スペース6Aの容積がかかる範囲にあることで、必要十分な液体試料をプローブ固定化層22Aのプローブに接触させることができ、従来と比較して液体試料の使用量を減らすことができる。
Although the volume of the
また、本実施形態に係るプローブアレイ1Aは、上記のように第1のカバーシート3Aとプローブ固定シート2Aと第2のカバーシートとを重ねて熱融着するだけで、簡便に製造することができる。
In addition, the
なお、プローブ固定シート2Aは常法によって製造することができる。例えば、基材21Aの表面に対して、アプリケーター、ブレードコーター、ロールコーター、バーコーター、ダイコーター、スクリーン印刷機、スプレー等によってプローブ固定化材料をコートし、乾燥させた後、得られた層に対して、所望のプローブをプローブ群としてスポッティングし、固定化すればよい。
The
なお、図1(b)に示すように、本実施形態に係るプローブアレイ1Aの平面形状は矩形であるが、標的物質の検出を行うことができる限り、これに限定されるものではない。
As shown in FIG. 1B, the planar shape of the
プローブアレイ1Aを利用した標的物質の検出は、例えば次のようにして行うことができる。
Detection of the target substance using the
第1工程として、標識物質が結合した標的物質を含有する液体試料をシリンジに入れ、シリンジの針を第1のカバーシート3Aに穿刺し、液導入スペース6Aに液体試料を流入させ、標的物質とプローブとを接触させる。この間、シリンジの針の穿刺によって形成された孔は、粘着テープ等によって塞いでもよい。
As a first step, a liquid sample containing a target substance bound with a labeling substance is put into a syringe, the needle of the syringe is punctured into the
標的物質の種類は特に限定されるものではないが、例えば、核酸、タンパク質、抗原、抗体、酵素、糖鎖等の生体物質が挙げられ、プローブ及び標的物質の組み合わせとしては、例えば、核酸/相補的核酸、受容体タンパク質/リガンド、酵素/基質、抗体/抗原等が挙げられる。なお、核酸には、DNA、RNA及びこれらの類似体又は誘導体(例えば、ペプチド核酸(PNA)、ホスホロチオエートDNA等)が含まれる。 The type of the target substance is not particularly limited, and examples thereof include biological substances such as nucleic acids, proteins, antigens, antibodies, enzymes, sugar chains, etc. Examples of combinations of probes and target substances include, for example, nucleic acid / complementary Nucleic acid, receptor protein / ligand, enzyme / substrate, antibody / antigen and the like. The nucleic acid includes DNA, RNA, and analogs or derivatives thereof (for example, peptide nucleic acid (PNA), phosphorothioate DNA, etc.).
標識物質としては、例えば、フルオレセイン、ローダミン、フィコエリトリン等の蛍光物質;アルカリホスファターゼ、ホースラディッシュペルオキシダーゼ等の酵素;ルミノール、ルシゲニン、アクリジウムエステルの化学発光物質;ルシフェラーゼ、ルシフェリン等の生物発光物質等が挙げられる。液体試料の溶媒は、例えば、水、緩衝液、有機溶媒であり、標的物質の種類に応じて適宜選択することができる。 Examples of the labeling substance include fluorescent substances such as fluorescein, rhodamine and phycoerythrin; enzymes such as alkaline phosphatase and horseradish peroxidase; chemiluminescent substances such as luminol, lucigenin and acridium ester; and bioluminescent substances such as luciferase and luciferin. It is done. The solvent of the liquid sample is, for example, water, a buffer solution, or an organic solvent, and can be appropriately selected according to the type of the target substance.
第2工程として、上記シリンジの針の穿刺によって形成された孔、または別途シリンジの針の穿刺によって形成した孔を介して液導入スペース6Aから液体試料を流出させた後、シリンジを使用して液導入スペース6Aに対し洗浄液を流入及び流出させ、プローブを洗浄する。これにより、プローブと反応した標的物質以外の物質を除去することができる。
As a second step, after the liquid sample is caused to flow out of the
第3工程として、標的物質に結合している標識物質を検出する。標識物質が蛍光物質である場合、プローブ固定化層22Aに励起光を照射し、プローブ固定化層22Aから発せられる蛍光を蛍光検出器で検出することによって、標的物質を検出することができる。標識物質が酵素である場合には酵素呈色反応により標的物質を検出することができる。ここで、第1のカバーシート3Aは透明性を有するため、プローブ固定シート2Aを取り出すことなく、上記構成を有するプローブアレイ1Aのままで、検出を行うことが可能である。
As a third step, a labeling substance that is bound to the target substance is detected. When the labeling substance is a fluorescent substance, the target substance can be detected by irradiating the
上記実施形態において、第1のカバーシート3Aと第2のカバーシート4Aとは、全周縁部において熱融着されているが、本発明はこれに限定されるものではない。例えば、図2に示すプローブアレイ1A’のように、第1のカバーシート3Aと第2のカバーシート4Aとは、一箇所を除いて全周縁部において熱融着されていてもよい。この場合、熱融着されていない箇所は、液注入部7Aを構成する。かかるプローブアレイ1A’においては、使用時に、シリンジの針で第1のカバーシート3Aに孔を空ける必要がなく、液注入部7Aに針を差し込んで、液導入スペース6Aに液を流入させることができる。
In the above embodiment, the
また、例えば、図3に示すプローブアレイ1A''のように、第1のカバーシート3Aと第2のカバーシート4Aとは、二箇所を除いて全周縁部において熱融着されていてもよい。本実施形態では、プローブアレイ1A''の相対向する位置に、熱融着されていない箇所が形成されている。この場合、熱融着されていない箇所は、液注入部7Aおよび排出部8Aを構成する。
Further, for example, like the
かかるプローブアレイ1A''においては、使用時に、シリンジの針で第1のカバーシート3Aに孔を空ける必要がなく、液注入部7Aに針を差し込んで、液導入スペース6Aに液体試料を流入させる。このとき、液導入スペース6A内のエアは、排出部8Aから排出されるため、スムーズに液体試料を流入させることができる。また、プローブを洗浄するときも、液導入スペース6A内の液体を排出部8Aから排出することができるため、スムーズに洗浄液を流入させることができる。
In such a
なお、熱融着部5Aの平面形状は、図1(b)および図2に示すように、略同じ幅を有する帯状であってもよいし、図3に示すように、液注入部7Aまたは排出部8Aに向かって漸次幅が狭くなっていてもよい。
The planar shape of the heat-sealing
〔第2の実施形態〕
図4(a)は、本発明の第2の実施形態に係るプローブアレイ1Bの断面図((b)のX−X断面図)、図4(b)は、同実施形態に係るプローブアレイ1Bの平面図である。図4に示すように、本実施形態に係るプローブアレイ1Bは、平面状のプローブ固定シート2Bと、平面状の第1のカバーシート3Bと、平面状の第2のカバーシート4Bとを備えている。
[Second Embodiment]
4A is a cross-sectional view of the
プローブ固定シート2Bは、基材21Bと、基材21Bの一方の面に積層されたプローブ固定化層22Bと、基材21Bの他方の面に積層されたプローブ固定化層22B’とから構成される。
The
基材21Bの材料およびプローブ固定化層22B,22B’の材料は、上記第1の実施形態における基材21Aおよびプローブ固定化層22Aと同様である。本実施形態では、基材21Bの両面にプローブ固定化層22B,22B’が形成されているため、プローブ固定化層が基材の片面に形成されている場合と比較して、2倍の種類のプローブを固定化すること、あるいはプローブ固定シート、ひいてはプローブアレイを小型化することが可能である。
The material of the
第1のカバーシート3Bの材料は、上記第1の実施形態における第1のカバーシート3Aと同様である。また、第2のカバーシート4Bは、第1のカバーシート3Bと同じく透明性を有する必要があるため、第2のカバーシート4Bの材料は、上記第1の実施形態における第1のカバーシート3Aと同様である。
The material of the
本実施形態に係るプローブアレイ1Bは、上記第1の実施形態に係るプローブアレイ1Aと同様の方法によって製造することができる。その結果、プローブ固定シート2Bの一方のプローブ固定化層22Bと第1のカバーシート3Bとの間には、液導入スペース6Bを構成する空隙が形成され、プローブ固定シート2Bの他方のプローブ固定化層22B’と第2のカバーシート4Bとの間には、液導入スペース6B’を構成する空隙が形成される。
The
なお、プローブ固定シート2Bは、基材21Bの両面にプローブ固定化層22B,22B’を形成する以外、上記第1の実施形態におけるプローブ固定シート2Aと同様の方法によって製造することができる。
The
プローブアレイ1Bを利用した標的物質の検出は、上記第1の実施形態に係るプローブアレイ1Aにおける方法と同様にして行うことができるが、液の流入および流出を2つの液導入スペース6B,6B’に対して行う必要がある。
The detection of the target substance using the
本実施形態に係るプローブアレイ1Bにおいても、上記第1の実施形態に係るプローブアレイ1Aと同様に、熱融着されていない部分が一箇所または二箇所あり、液注入部、または液注入部および排出部が形成されてもよい。
Also in the
〔第3の実施形態〕
図5(a)は、本発明の第3の実施形態に係るプローブアレイ1Cの断面図((b)のX−X断面図)、図5(b)は、同実施形態に係るプローブアレイ1Cの平面図である。図5に示すように、本実施形態に係るプローブアレイ1Cは、平面状のプローブ固定シート2Cと、平面状の第1のカバーシート3Cと、平面状の第2のカバーシート4Cとを備えている。
[Third Embodiment]
FIG. 5A is a cross-sectional view of the
プローブ固定シート2Cは、基材21Cと、基材21Cに積層されたプローブ固定化層22Cとから構成される。基材21Cの材料およびプローブ固定化層22Cの材料は、上記第1の実施形態における基材21Aおよびプローブ固定化層22Aと同様である。
The
また、第1のカバーシート3Cの材料は、上記第1の実施形態における第1のカバーシート3Aと同様であり、第2のカバーシート4Cの材料は、上記第1の実施形態における第2のカバーシート4Aと同様である。
The material of the
本実施形態に係るプローブアレイ1Cにおいては、プローブ固定シート2Cの縁部を挟み込むようにして、第1のカバーシート3Cと第2のカバーシート4Cとが、全周縁部において熱融着されている。それ以外は、上記第1の実施形態に係るプローブアレイ1Aと同様にして、プローブアレイ1Cを製造することができる。
In the
プローブアレイ1Cを利用した標的物質の検出は、上記第1の実施形態に係るプローブアレイ1Aにおける方法と同様にして行うことができる。
Detection of a target substance using the
本実施形態に係るプローブアレイ1Cにおいても、上記第1の実施形態に係るプローブアレイ1Aと同様に、熱融着されていない部分が一箇所または二箇所あり、液注入部、または液注入部および排出部が形成されてもよい。また、上記第2の実施形態に係るプローブアレイ1Bと同様に、基材21Cの両面にプローブ固定化層22Cが形成され、プローブ固定シート2Cのそれぞれのプローブ固定化層22Cと、第1のカバーシート3Cおよび第2のカバーシート4Cとの間に、液導入スペース6Cを構成する空隙が形成されてもよい。
Also in the
〔第4の実施形態〕
図6(a)は、本発明の第4の実施形態に係るプローブアレイ1Dの断面図((b)のX−X断面図)、図6(b)は、同実施形態に係るプローブアレイ1Dの平面図である。図6に示すように、本実施形態に係るプローブアレイ1Dは、平面状のプローブ固定シート2Dと、平面状のカバーシート3Dとを備えている。
[Fourth Embodiment]
FIG. 6A is a cross-sectional view of the
プローブ固定シート2Dは、基材21Dと、基材21Dに積層されたプローブ固定化層22Dとから構成される。基材21Dの材料は、上記第1の実施形態における基材21Aと同様である。
The
一方、プローブ固定化層22Dのプローブ固定化材料は、プローブを固定化することができ、かつ、熱融着性を有するものである必要がある。かかるプローブ固定化材料としては、例えば、ポリエチレン、ポリプロピレン等のポリオレフィン、ポリアクリロニトリル、エチレン−メタクリル酸共重合体、ポリスチレン、ポリ塩化ビニル、ポリ塩化ビニリデン、ポリアミド等が挙げられる。
On the other hand, the probe immobilization material of the
カバーシート3Dの材料は、上記第1の実施形態における第1のカバーシート3Aと同様である。
The material of the
本実施形態に係るプローブアレイ1Dにおいては、カバーシート3Dとプローブ固定シート2Dのプローブ固定化層22Dとが、全周縁部において熱融着されている。そして、プローブ固定化層22Dとカバーシート3Dとの間には、液導入スペース6Dを構成する空隙が形成されている。
In the
プローブアレイ1Dを製造するには、プローブ固定シート2Dのプローブ固定化層22D側にカバーシート3Dを重ね、その状態で、カバーシート3Dおよびプローブ固定化層22Dの周縁部を熱融着する。この製造方法により、上記液導入スペース6Dが自然に形成される。
In order to manufacture the
プローブアレイ1Dを利用した標的物質の検出は、上記第1の実施形態に係るプローブアレイ1Aにおける方法と同様にして行うことができる。
Detection of a target substance using the
本実施形態に係るプローブアレイ1Dにおいても、上記第1の実施形態に係るプローブアレイ1Aと同様に、熱融着されていない部分が一箇所または二箇所あり、液注入部、または液注入部および排出部が形成されてもよい。また、上記第2の実施形態に係るプローブアレイ1Bと同様に、基材21Dの両面にプローブ固定化層22Dが形成され、各プローブ固定化層22Dをカバーするようにカバーシート3Dが設けられ、プローブ固定シート2Dのそれぞれのプローブ固定化層22Dと、カバーシート3Dとの間に、液導入スペース6Dを構成する空隙が形成されてもよい。
Also in the
〔第5の実施形態〕
図7(a)は、本発明の第5の実施形態に係るプローブアレイ1Eの断面図((b)のX−X断面図)、図7(b)は、同実施形態に係るプローブアレイ1Eの平面図である。図7に示すように、本実施形態に係るプローブアレイ1Eは、平面状のプローブ固定シート2Eと、平面状のカバーシート3Eとを備えている。
[Fifth Embodiment]
FIG. 7A is a sectional view of a
プローブ固定シート2Eは、基材21Eと、基材21Eに積層されたプローブ固定化層22Eとから構成される。ただし、プローブ固定化層22Eは、基材21Eの相対向する二箇所の縁部(本実施形態では長手方向に延在する縁部)には形成されていない。プローブ固定化層22Eの材料は、上記第1の実施形態におけるプローブ固定化層22Aと同様である。
The
一方、基材21Eの材料は、熱融着性を有するものである必要がある。かかる基材21Eを構成する材料としては、上記第1の実施形態における第1のカバーシート3Aと同様のものを使用することができる。ただし、基材21Eの色は透明である必要はなく、白色であることが好ましい。
On the other hand, the material of the
カバーシート3Eの材料は、上記第1の実施形態における第1のカバーシート3Aと同様である。
The material of the
本実施形態に係るプローブアレイ1Eにおいては、カバーシート3Eとプローブ固定シート2Eの基材21Eとが、相対向する二箇所の縁部において熱融着されている。熱融着されていない相対向する二箇所の縁部は開口部となっており、それぞれ液注入部および排出部を構成する。そして、プローブ固定化層22Eとカバーシート3Eとの間には、液導入スペース6Eを構成する空隙が形成されている。
In the
プローブアレイ1Eを製造するには、プローブ固定シート2Eのプローブ固定化層22E側にカバーシート3Eを重ね、その状態で、カバーシート3Eおよび基材21Eの両縁部を熱融着する。この製造方法により、上記液導入スペース6Eが自然に形成される。
In order to manufacture the
プローブアレイ1Eを利用した標的物質の検出は、前述したプローブアレイ1A''(図3参照)における方法と同様にして行うことができる。
Detection of a target substance using the
本実施形態に係るプローブアレイ1Eにおいても、上記第4の実施形態に係るプローブアレイ1Dと同様に、カバーシート3Eとプローブ固定シート2Eとが、全周縁部において熱融着されていてもよい。また、上記第2の実施形態に係るプローブアレイ1Bと同様に、基材21Eの両面にプローブ固定化層22Eが形成され、各プローブ固定化層22Eをカバーするようにカバーシート3Eが設けられ、プローブ固定シート2Eのそれぞれのプローブ固定化層22Eと、カバーシート3Eとの間に、液導入スペース6Eを構成する空隙が形成されてもよい。
Also in the
〔第6の実施形態〕
図8(a)は、本発明の第6の実施形態に係るプローブアレイ1Fの断面図((c)のX−X断面図)、図8(b)は、同実施形態に係るプローブアレイ1Fの断面図((c)のY−Y断面図)、図8(c)は、同実施形態に係るプローブアレイ1Fの平面図である。図8に示すように、本実施形態に係るプローブアレイ1Fは、平面状のプローブ固定シート2Fと、平面状のカバーシート3Fとを備えている。
[Sixth Embodiment]
8A is a cross-sectional view of the
プローブ固定シート2Fは、基材21Fと、基材21Fに積層されたプローブ固定化層22Fとから構成される。ただし、プローブ固定化層22Fは、基材21Eの相対向する二箇所の縁部(本実施形態では長手方向に延在する縁部)と、基材21Eの中心線の部分には形成されていない。すなわち、プローブ固定化層22Fは、間にスリット9Fが形成されるように二分割して形成されている。
The
スリット9Fの幅は、0.05〜1mmであることが好ましく、特に0.1〜0.5mmであることが特に好ましい。
The width of the
基材21Fの材料は、上記第5の実施形態における基材Eと同様であり、プローブ固定化層22Fの材料は、上記第1の実施形態におけるプローブ固定化層22Aと同様である。また、カバーシート3Fの材料は、上記第1の実施形態における第1のカバーシート3Aと同様である。
The material of the
本実施形態に係るプローブアレイ1Fにおいては、カバーシート3Fとプローブ固定シート2Fの基材21Fとが、全周縁部において熱融着されている。ただし、二分割されているプローブ固定化層22Fの間のスリット9Fの部分は、熱融着されずに開放されており、液注入部7Fおよび排出部8Fを構成している。一方、プローブ固定化層22Fとカバーシート3Fとの間には、液導入スペース6Fを構成する空隙が形成されている。
In the
プローブアレイ1Fを製造するには、プローブ固定シート2Fのプローブ固定化層22F側にカバーシート3Fを重ね、その状態で、スリット9Fが潰れない程度の圧力をもって、カバーシート3Fおよび基材21Fの全周縁部を熱融着する。この製造方法により、上記液注入部7Fおよび排出部8Fと、上記液導入スペース6Fが形成される。
In order to manufacture the
プローブアレイ1Fを利用した標的物質の検出は、前述したプローブアレイ1A''(図3参照)における方法と同様にして行うことができる。
Detection of a target substance using the
本実施形態に係るプローブアレイ1Fにおいても、上記第2の実施形態に係るプローブアレイ1Bと同様に、基材21Fの両面にプローブ固定化層22Fが形成され、各プローブ固定化層22Fをカバーするようにカバーシート3Fが設けられ、プローブ固定シート2Fのそれぞれのプローブ固定化層22Fと、カバーシート3Fとの間に、液導入スペース6Fを構成する空隙が形成されてもよい。
Also in the
〔第7の実施形態〕
図9(a)は、本発明の第7の実施形態に係るプローブアレイ1Gの断面図((b)のX−X断面図)、図9(b)は、同実施形態に係るプローブアレイ1Gの平面図である。図9に示すように、本実施形態に係るプローブアレイ1Gは、平面状のプローブ固定シート2Gと、平面状のカバーシート3Gとを備えている。
[Seventh Embodiment]
9A is a cross-sectional view of the
プローブ固定シート2Gは、基材21Gと、基材21Gに積層されたプローブ固定化層22Gとから構成される。ただし、プローブ固定化層22Gは、基材21Gの周縁部には形成されていない。プローブ固定化層22Gの材料は、上記第1の実施形態におけるプローブ固定化層22Aと同様である。
The
一方、基材21Gの材料は、熱融着性を有するものである必要がある。かかる基材21Gを構成する材料としては、上記第1の実施形態における第1のカバーシート3Aと同様のものを使用することができる。ただし、基材21Gの色は透明である必要はなく、白色であることが好ましい。
On the other hand, the material of the
本実施形態おけるカバーシート3Gは、周縁部以外の部分が凹部となっている。凹部の深さは、プローブ固定化層22Gの厚さよりも大きく、かつ、熱融着後にカバーシート3Gとプローブ固定化層22Gとが接触しないような深さである必要がある。具体的には、凹部の深さは、5〜100μmであることが好ましく、特に10〜50μmであることが好ましい。本発明では、上記のような凹部を有するシートも平面状の範疇に含むものとする。カバーシート3Gの材料は、上記第1の実施形態における第1のカバーシート3Aと同様である。
The
本実施形態に係るプローブアレイ1Gにおいては、カバーシート3Gとプローブ固定シート2Gの基材21Gとが、全周縁部(カバーシート3Gの凹部以外の部分)において熱融着されている。そして、カバーシート3Gの凹部(プローブ固定化層22Gとカバーシート3Gとの間の空隙)は、液導入スペース6Gを構成している。
In the
プローブアレイ1Gを製造するには、プローブ固定シート2Gのプローブ固定化層22G側に、凹部がプローブ固定シート2G側となるようにカバーシート3Gを重ね、その状態で、カバーシート3Gおよび基材21Gの全周縁部を熱融着する。この製造方法により、上記液導入スペース6Gが形成される。
In order to manufacture the
プローブアレイ1Gを利用した標的物質の検出は、上記第1の実施形態に係るプローブアレイ1Aにおける方法と同様にして行うことができる。
Detection of a target substance using the
本実施形態に係るプローブアレイ1Gにおいても、上記第1の実施形態に係るプローブアレイ1Aと同様に、熱融着されていない部分が一箇所または二箇所あり、液注入部、または液注入部および排出部が形成されてもよい。また、上記第2の実施形態に係るプローブアレイ1Bと同様に、基材21Gの両面にプローブ固定化層22Gが形成され、各プローブ固定化層22Gをカバーするようにカバーシート3Gが設けられ、プローブ固定シート2Gのそれぞれのプローブ固定化層22Gと、カバーシート3Gとの間に、液導入スペース6Gが形成されてもよい。
Also in the
以上説明した実施形態は、本発明の理解を容易にするために記載されたものであって、本発明を限定するために記載されたものではない。したがって、上記実施形態に開示された各要素は、本発明の技術的範囲に属する全ての設計変更や均等物をも含む趣旨である。 The embodiment described above is described for facilitating understanding of the present invention, and is not described for limiting the present invention. Therefore, each element disclosed in the above embodiment is intended to include all design changes and equivalents belonging to the technical scope of the present invention.
例えば、上記実施形態に係るプローブアレイ1A〜1Dは、全周縁部において熱融着されているのではなく、両縁部のみにおいて熱融着されていてもよい。 For example, the probe arrays 1 </ b> A to 1 </ b> D according to the above-described embodiment may be heat-sealed only at both edges instead of being heat-sealed at the entire peripheral edge.
以下、実施例等により本発明をさらに具体的に説明するが、本発明の範囲はこれらの実施例等に限定されるものではない。 EXAMPLES Hereinafter, although an Example etc. demonstrate this invention further more concretely, the scope of the present invention is not limited to these Examples etc.
〔実施例1〕
(1)プローブ固定シートの作製
基材である厚さ50μmの白色ポリエチレンテレフタレートフィルム(以下「PETフィルム」という。)を30mm×10mmの大きさに切断し、プローブ固定化材料としてのポリL−リジン溶液(濃度:0.01%,溶媒:0.1×PBS)に浸漬して、1時間振盪した。次いで、超純水中で4回激しく洗浄し、余分なポリL−リジンを洗い流した。そして、ポリL−リジンを付着させたPETフィルムをバキュームオーブンにより60℃で4時間乾燥させ、ポリL−リジン(厚さ5μm)をPETフィルムに密着させた。
[Example 1]
(1) Production of probe fixing sheet A white polyethylene terephthalate film (hereinafter referred to as “PET film”) having a thickness of 50 μm, which is a base material, is cut into a size of 30 mm × 10 mm, and poly L-lysine as a probe fixing material It was immersed in a solution (concentration: 0.01%, solvent: 0.1 × PBS) and shaken for 1 hour. Subsequently, it was washed vigorously 4 times in ultrapure water to wash away excess poly L-lysine. Then, the PET film to which poly-L-lysine was adhered was dried at 60 ° C. for 4 hours in a vacuum oven, and poly-L-lysine (thickness 5 μm) was adhered to the PET film.
上記のようにしてプローブ固定化材料であるポリL−リジンをコートしたPETフィルムを30mm×3mmの大きさにカットし、コート面上にポジティブコントロール用プローブDNAおよびネガティブコントロール用プローブDNA(濃度:100pmol/μL,溶媒:0.2×SSC)を各1μLずつスポッティングした。なお、ポジティブコントロール用プローブDNAとしては200〜500merのポリ(dA)を使用し、ネガティブコントロール用プローブDNAとしては200〜500merのポリ(dT)を使用した。 The PET film coated with poly-L-lysine, which is a probe-immobilizing material as described above, was cut into a size of 30 mm × 3 mm, and positive control probe DNA and negative control probe DNA (concentration: 100 pmol) on the coated surface. / ΜL, solvent: 0.2 × SSC) was spotted 1 μL each. In addition, 200-500 mer poly (dA) was used as the positive control probe DNA, and 200-500 mer poly (dT) was used as the negative control probe DNA.
次いで、スポッティング液を乾燥させ、UVクロスリンカー(UV照射装置)により紫外線を600mJ照射して、プローブDNAが固定化されたプローブ固定化層を有するプローブ固定シートを得た。 Next, the spotting solution was dried and irradiated with 600 mJ of ultraviolet rays using a UV crosslinker (UV irradiation device) to obtain a probe fixing sheet having a probe fixing layer on which the probe DNA was fixed.
(2)プローブアレイの作製
カバーシートとして、片面にポリプロピレンからなる熱融着層を有する透明な3層フィルム(PET:12μm/シリカ蒸着PET:12μm/キャストポリプロピレン(CPP):50μm,40mm×15mm)を2枚用意した。
(2) Preparation of probe array As a cover sheet, a transparent three-layer film (PET: 12 μm / silica vapor deposited PET: 12 μm / cast polypropylene (CPP): 50 μm, 40 mm × 15 mm) having a heat fusion layer made of polypropylene on one side Two sheets were prepared.
上記(1)で作製したプローブ固定シートを、上記2枚のカバーシートにより、それらの熱融着層を内側にしてサンドイッチした。このとき、プローブ固定シートは、カバーシートの中央に配置した。この状態で、2枚のカバーシートの全周縁部を5mm幅で熱融着し、そして熱融着部の端部3mmをカットした。このようにして、図1に示すようなプローブアレイを得た。 The probe fixing sheet prepared in the above (1) was sandwiched between the two cover sheets with their heat-fusible layers inside. At this time, the probe fixing sheet was arranged at the center of the cover sheet. In this state, the entire peripheral edge of the two cover sheets was heat-sealed with a width of 5 mm, and the end 3 mm of the heat-sealed part was cut. In this way, a probe array as shown in FIG. 1 was obtained.
(3)ハイブリダイゼーション
マイクロシリンジに、標的オリゴヌクレオチドを含むハイブリダイゼーション溶液(標的オリゴヌクレオチド濃度:1pmol/μL,イーストtRNA濃度:1μg/μL,溶媒:0.2%SDS含有3×SSC)を充填した。なお、標的オリゴヌクレオチドとしては5’末端にビオチンを結合させた22merのポリ(dT)を使用した。
(3) Hybridization A microsyringe was filled with a hybridization solution containing the target oligonucleotide (target oligonucleotide concentration: 1 pmol / μL, yeast tRNA concentration: 1 μg / μL, solvent: 3 × SSC containing 0.2% SDS). . As the target oligonucleotide, 22-mer poly (dT) in which biotin was bound to the 5 ′ end was used.
上記(2)で作製したプローブアレイのプローブ固定化層側のカバーシートの端部に、上記マイクロシリンジの針を穿刺し、当該プローブアレイの液導入スペースに上記液体試料を注入した。針の穿刺によってカバーシートに形成された孔を粘着テープで塞ぎ、40℃の恒温槽内で一晩加温した。 The needle of the microsyringe was punctured at the end of the cover sheet on the probe immobilization layer side of the probe array produced in (2), and the liquid sample was injected into the liquid introduction space of the probe array. The hole formed in the cover sheet by needle puncture was closed with an adhesive tape and heated overnight in a constant temperature bath at 40 ° C.
(4)ポストハイブリダイゼーション洗浄
恒温槽からプローブアレイを取り出し、ハイブリダイゼーション溶液の排出と、非特異的に吸着した標的オリゴヌクレオチドの洗い流しのために、上記粘着テープを剥がし、プローブ固定化層側のカバーシートにおける上記孔と相対向する端部にシリンジの針を穿刺し、液導入スペースに洗浄バッファー1(2×SSC,0.1%SDS)をゆっくり注入し、次いで洗浄バッファー2(1×SSC)をゆっくり注入し、さらに洗浄バッファー3(0.2×SSC)をゆっくり注入し、最後に超純水をゆっくり注入して、洗浄作業を終了した。
(4) Post-hybridization washing Take out the probe array from the thermostat, remove the hybridization solution, and wash off the non-specifically adsorbed target oligonucleotide. Remove the adhesive tape and cover the probe-immobilized layer side. A needle of a syringe is punctured at the end of the sheet facing the hole, and washing buffer 1 (2 × SSC, 0.1% SDS) is slowly injected into the liquid introduction space, and then washing buffer 2 (1 × SSC) Was slowly injected, and further washing buffer 3 (0.2 × SSC) was slowly injected, and finally ultrapure water was slowly injected to finish the cleaning operation.
(5)ブロッキング及び標的オリゴヌクレオチドの検出
洗浄後のプローブアレイの液導入スペースに、シリンジでブロッキング溶液(1%カゼイン,3×SSC)を注入し、室温で30分間ブロッキングを行った。ブロッキング溶液を超純水により排出した後、ストレプトアビジン/アルカリフォスファターゼ複合体溶液(原液を0.2M NaCl,0.1M Tris−HCl(pH7.4),0.05% Triton−X,1% カゼイン溶液で2000倍に希釈したもの)を満たし、室温で30分間反応させた。
(5) Blocking and detection of target oligonucleotide A blocking solution (1% casein, 3 × SSC) was injected into the solution introduction space of the probe array after washing with a syringe, and blocking was performed at room temperature for 30 minutes. After draining the blocking solution with ultrapure water, a streptavidin / alkaline phosphatase complex solution (stock solution was 0.2 M NaCl, 0.1 M Tris-HCl (pH 7.4), 0.05% Triton-X, 1% casein). The solution was diluted 2000 times with a solution) and reacted at room temperature for 30 minutes.
ストレプトアビジン/アルカリフォスファターゼ複合体溶液を液導入スペースから排出した後、標的オリゴヌクレオチドに結合しているビオチンに結合しなかったストレプトアビジン/アルカリフォスファターゼ複合体を除去するために、液導入スペースにシリンジで緩衝液A(0.2M NaCl,0.1M Tris−HCl(pH7.4),0.05% Triton−X)を注入して洗浄を行い、次いで、液導入スペースに緩衝液B(0.2M NaCl、0.1M Tris−HCl(pH7.4))を注入して洗浄を行った。 After discharging the streptavidin / alkaline phosphatase complex solution from the solution introduction space, a syringe is used in the solution introduction space to remove the streptavidin / alkaline phosphatase complex that did not bind to biotin bound to the target oligonucleotide. Buffer A (0.2M NaCl, 0.1M Tris-HCl (pH 7.4), 0.05% Triton-X) was injected to perform washing, and then Buffer B (0.2M Washing was performed by injecting NaCl, 0.1 M Tris-HCl (pH 7.4)).
その後、液導入スペースを基質溶液(緩衝液B 10mL,BCIP(5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリルフォスフェート)溶液9μLおよびNBT(ニトロブルーテトラゾリウム)溶液18μL)で満たし、室温で3時間放置し、発色反応を行った。 Thereafter, the solution introduction space was filled with a substrate solution (10 mL of buffer B, 9 μL of BCIP (5-bromo-4-chloro-3-indolyl phosphate) solution and 18 μL of NBT (nitroblue tetrazolium) solution), and 3 hours at room temperature. The color reaction was allowed to stand.
その結果、標的オリゴヌクレオチドと相補的であるポジティブコントロール用プローブDNAを固定化した部分には明瞭なシグナルが現れたが、標的オリゴヌクレオチドと相補的でないネガティブコントロール用プローブDNAを固定化した部分にはシグナルが全く現れなかった。 As a result, a clear signal appeared in the portion where the positive control probe DNA that was complementary to the target oligonucleotide was immobilized, but in the portion where the negative control probe DNA that was not complementary to the target oligonucleotide was immobilized. No signal appeared.
〔実施例2〕
アクリル系樹脂(日本カーバイド工業社製,KP−1374,固形分(アクリル系樹脂含有量)33.0質量%)100質量部に、シリカ粒子(日本シリカ工業社製,ニップジェルBY−600,固形分100質量%)および酢酸エチル57質量部を分散して、塗工液を調製した。なお、上記シリカ粒子の平均二次粒径(測定方法:コールターカウンター法)は6μmであり、BET比表面積(測定方法:窒素吸着法)は450m2/gであり、細孔容積(測定方法:窒素吸着法)は1.3ml/gであり、平均細孔直径(測定方法:窒素吸着法)は10Åであった。
[Example 2]
To 100 parts by mass of acrylic resin (manufactured by Nippon Carbide Industries, KP-1374, solid content (acrylic resin content) 33.0% by mass), silica particles (manufactured by Nippon Silica Industry, Nipgel BY-600, solid content) 100% by mass) and 57 parts by mass of ethyl acetate were dispersed to prepare a coating solution. The silica particles have an average secondary particle size (measurement method: Coulter counter method) of 6 μm, a BET specific surface area (measurement method: nitrogen adsorption method) of 450 m 2 / g, and a pore volume (measurement method: measurement method: The nitrogen adsorption method) was 1.3 ml / g, and the average pore diameter (measurement method: nitrogen adsorption method) was 10 mm.
基材である厚さ50μmの白色の易接着性ポリエステルフィルム(東洋紡績社製,コスモシャインA4300)上に、上記塗工液をアプリケーターによって塗布し、100℃で5分間乾燥させ、厚さ20μmのプローブ固定化材料からなる層を形成した。 The above coating solution was applied with an applicator on a white 50 μm thick easy-adhesive polyester film (Toyobo Co., Ltd., Cosmo Shine A4300) as a base material, dried at 100 ° C. for 5 minutes, and a thickness of 20 μm. A layer made of a probe-immobilizing material was formed.
上記のようにしてプローブ固定化材料からなる層を形成した易接着性ポリエステルフィルムを30mm×3mmの大きさにカットした後、実施例1と同様にしてプローブDNAを固定化し、プローブ固定シートを得た。 After cutting the easy-adhesive polyester film having the layer made of the probe-immobilized material as described above into a size of 30 mm × 3 mm, the probe DNA is immobilized in the same manner as in Example 1 to obtain a probe-immobilized sheet. It was.
得られたプローブ固定シートを使用して、実施例1と同様にしてプローブアレイを作製し、実施例1と同様にして標的オリゴヌクレオチドの検出を行った。その結果、標的オリゴヌクレオチドと相補的であるポジティブコントロール用プローブDNAを固定化した部分には明瞭なシグナルが現れたが、標的オリゴヌクレオチドと相補的でないネガティブコントロール用プローブDNAを固定化した部分にはシグナルが全く現れなかった。 Using the obtained probe fixing sheet, a probe array was prepared in the same manner as in Example 1, and the target oligonucleotide was detected in the same manner as in Example 1. As a result, a clear signal appeared in the portion where the positive control probe DNA that was complementary to the target oligonucleotide was immobilized, but in the portion where the negative control probe DNA that was not complementary to the target oligonucleotide was immobilized. No signal appeared.
〔実施例3〕
プローブ固定シートの基材として、片面にポリプロピレンからなる熱融着層を有する白色の3層フィルム(PET:12μm/シリカ蒸着PET:12μm/キャストポリプロピレン(CPP):50μm)を用意した。
Example 3
A white three-layer film (PET: 12 μm / silica vapor-deposited PET: 12 μm / cast polypropylene (CPP): 50 μm) having a heat fusion layer made of polypropylene on one side was prepared as a substrate for the probe fixing sheet.
上記基材の熱融着層面上に、プローブ固定化材料としてのポリL−リジン溶液(濃度:0.01%,溶媒:0.1×PBS)をアプリケーターによって図10に示すようにパターンコーティングし、バキュームオーブンにより60℃で4時間乾燥させ、ポリL−リジン(厚さ5μm)を基材21の熱融着層に密着させた(図10中の符号22はプローブ固定化材料からなる層を示す)。 As shown in FIG. 10, a poly L-lysine solution (concentration: 0.01%, solvent: 0.1 × PBS) as a probe-immobilizing material is pattern-coated on the surface of the heat-sealing layer of the substrate as shown in FIG. Then, it was dried in a vacuum oven at 60 ° C. for 4 hours, and poly L-lysine (thickness 5 μm) was adhered to the heat-sealing layer of the base material 21 (reference numeral 22 in FIG. 10 represents a layer made of a probe-immobilized material). Show).
上記のようにしてプローブ固定化材料であるポリL−リジンをコートした3層フィルムを、図11に示すように、30mm×13mmの大きさにカットした後、実施例1と同様にしてプローブDNAを固定化し、プローブ固定シート2を得た。
The three-layer film coated with poly-L-lysine, which is a probe-immobilizing material as described above, is cut into a size of 30 mm × 13 mm as shown in FIG. Was fixed to obtain a
カバーシートとして、片面にポリプロピレンからなる熱融着層を有する透明な3層フィルム(PET:12μm/シリカ蒸着PET:12μm/キャストポリプロピレン(CPP):50μm,30mm×13mm)を用意した。上記プローブ固定シートのプローブ固定化層側の面に、上記カバーシートの熱融着層側の面を合わせ、両シートの長手方向に延在する両縁部を5mm幅で熱融着し、そして熱融着部の端部3mmをカットした。このようにして、図7に示すようなプローブアレイを得た。 As a cover sheet, a transparent three-layer film (PET: 12 μm / silica vapor-deposited PET: 12 μm / cast polypropylene (CPP): 50 μm, 30 mm × 13 mm) having a heat fusion layer made of polypropylene on one side was prepared. The surface of the probe fixing sheet on the probe fixing layer side is aligned with the surface of the cover sheet on the heat sealing layer side, and both edges extending in the longitudinal direction of both sheets are heat-sealed with a width of 5 mm, and The end part 3 mm of the heat fusion part was cut. In this way, a probe array as shown in FIG. 7 was obtained.
得られたプローブアレイを使用して、実施例1と同様にして標的オリゴヌクレオチドの検出を行った。ただし、液体の流入および流出は、プローブアレイの熱融着されていない開口部から行った。その結果、標的オリゴヌクレオチドと相補的であるポジティブコントロール用プローブDNAを固定化した部分には明瞭なシグナルが現れたが、標的オリゴヌクレオチドと相補的でないネガティブコントロール用プローブDNAを固定化した部分にはシグナルが全く現れなかった。 Using the obtained probe array, the target oligonucleotide was detected in the same manner as in Example 1. However, the inflow and outflow of liquid were performed from the opening part of the probe array which is not heat-sealed. As a result, a clear signal appeared in the portion where the positive control probe DNA that was complementary to the target oligonucleotide was immobilized, but in the portion where the negative control probe DNA that was not complementary to the target oligonucleotide was immobilized. No signal appeared.
〔実施例4〕
プローブ固定シートの基材として、片面にポリプロピレンからなる熱融着層を有する白色の3層フィルム(PET:12μm/シリカ蒸着PET:12μm/キャストポリプロピレン(CPP):50μm)を用意した。
Example 4
A white three-layer film (PET: 12 μm / silica vapor-deposited PET: 12 μm / cast polypropylene (CPP): 50 μm) having a heat fusion layer made of polypropylene on one side was prepared as a substrate for the probe fixing sheet.
上記基材の熱融着層面上に、実施例2と同様にして調製した塗工液をアプリケーターによって図10に示すようにパターンコーティングし、100℃で5分間乾燥させ、厚さ20μmのプローブ固定化材料からなる層22を形成した。 The coating solution prepared in the same manner as in Example 2 was pattern-coated on the surface of the heat-fusible layer of the substrate as shown in FIG. 10, dried at 100 ° C. for 5 minutes, and fixed to a probe having a thickness of 20 μm. A layer 22 made of a chemical material was formed.
上記のようにしてプローブ固定化材料からなる層を形成した3層フィルムを、図11に示すように、30mm×13mmの大きさにカットした後、実施例1と同様にしてプローブDNAを固定化し、プローブ固定シート2を得た。
As shown in FIG. 11, the three-layer film formed with the probe-immobilizing material layer was cut into a size of 30 mm × 13 mm as described above, and then the probe DNA was immobilized in the same manner as in Example 1. A
得られたプローブ固定シートを使用して、実施例3と同様にしてプローブアレイを作製し、実施例1と同様にして標的オリゴヌクレオチドの検出を行った。その結果、標的オリゴヌクレオチドと相補的であるポジティブコントロール用プローブDNAを固定化した部分には明瞭なシグナルが現れたが、標的オリゴヌクレオチドと相補的でないネガティブコントロール用プローブDNAを固定化した部分にはシグナルが全く現れなかった。 Using the obtained probe fixing sheet, a probe array was prepared in the same manner as in Example 3, and the target oligonucleotide was detected in the same manner as in Example 1. As a result, a clear signal appeared in the portion where the positive control probe DNA that was complementary to the target oligonucleotide was immobilized, but in the portion where the negative control probe DNA that was not complementary to the target oligonucleotide was immobilized. No signal appeared.
本発明は、プローブアレイの簡便な製造および液体試料の使用量の低減に有用である。 The present invention is useful for simple production of a probe array and reduction of the amount of liquid sample used.
1A,1A’,1A'',1B,1C,1D,1E,1F,1G…プローブアレイ
2,2A,2B,2C,2D,2E,2F,2G…プローブ固定シート
21,21A,21B,21C,21D,21E,21F,21G…基材
22A,22B,22B’,22C,22D,22E,22F,22G…プローブ固定化層
22…プローブ固定化材料からなる層
3A,3B,3C…第1のカバーシート
3D,3E,3F,3G…カバーシート
4A,4B,4C…第2のカバーシート
5A,5B,5C,5D,5E,5F,5G…熱融着部
6A,6B,6B’,6C,6D,6E,6F,6G…液導入スペース
7A,7F…液注入部
8A,8F…排出部
9F…スリット
1A, 1A ′, 1A ″, 1B, 1C, 1D, 1E, 1F, 1G... Probe
Claims (8)
前記プローブ固定シートのプローブ固定化層側に位置する、熱融着可能な透明性を有する平面状の第1のカバーシートと、
前記プローブ固定シートのプローブ固定化層の反対側に位置する、熱融着可能な平面状の第2のカバーシートと
を備え、
前記第1のカバーシートおよび前記第2のカバーシートの少なくとも両縁部は熱融着されており、
前記プローブ固定シートのプローブ固定化層と前記第1のカバーシートとの間には、液導入スペースを構成する空隙が存在することを特徴とするプローブアレイ。 A planar probe fixing sheet having a probe fixing layer on one side;
A flat first cover sheet having transparency that can be heat-sealed, located on the probe-fixing layer side of the probe-fixing sheet;
A second cover sheet, which is located on the opposite side of the probe-immobilized layer of the probe-immobilized sheet, and which can be heat-sealed, and
At least both edges of the first cover sheet and the second cover sheet are heat-sealed,
A probe array, wherein a gap constituting a liquid introduction space exists between the probe fixing layer of the probe fixing sheet and the first cover sheet.
前記プローブ固定シートの一方の面側に位置する、熱融着可能な透明性を有する平面状の第1のカバーシートと、
前記プローブ固定シートの他方の面側に位置する、熱融着可能な透明性を有する平面状の第2のカバーシートと
を備え、
前記第1のカバーシートおよび前記第2のカバーシートの少なくとも両縁部は熱融着されており、
前記プローブ固定シートのプローブ固定化層と前記第1のカバーシートとの間、および前記プローブ固定シートのプローブ固定化層と前記第2のカバーシートとの間には、それぞれ液導入スペースを構成する空隙が存在することを特徴とするプローブアレイ。 A planar probe fixing sheet having probe fixing layers on both sides; and
A planar first cover sheet having transparency that can be heat-sealed, located on one surface side of the probe fixing sheet;
A second cover sheet having a transparent shape that can be heat-sealed, located on the other surface side of the probe fixing sheet;
At least both edges of the first cover sheet and the second cover sheet are heat-sealed,
Liquid introduction spaces are formed between the probe fixing layer of the probe fixing sheet and the first cover sheet and between the probe fixing layer of the probe fixing sheet and the second cover sheet, respectively. A probe array characterized by the presence of voids.
前記プローブ固定シートのプローブ固定化層側に位置する、熱融着可能な透明性を有する平面状のカバーシートと
を備え、
前記プローブ固定シートおよび前記カバーシートの少なくとも両縁部は熱融着されており、
前記プローブ固定シートのプローブ固定化層と前記カバーシートとの間には、液導入スペースを構成する空隙が存在することを特徴とするプローブアレイ。 A planar probe fixing sheet having a probe fixing layer on one side or both sides; and
A flat cover sheet that is located on the probe fixing layer side of the probe fixing sheet and has heat-transparent transparency, and
At least both edges of the probe fixing sheet and the cover sheet are heat-sealed,
A probe array, wherein a gap constituting a liquid introduction space exists between the probe fixing layer of the probe fixing sheet and the cover sheet.
前記第1のカバーシートおよび前記第2のカバーシートの少なくとも両縁部を熱融着し、もって前記プローブ固定シートのプローブ固定化層と前記第1のカバーシートとの間に、液導入スペースを構成する空隙を形成する
ことを特徴とするプローブアレイの製造方法。 A flat first cover sheet having transparency that can be heat-sealed is superimposed on the probe fixing layer side of a flat probe fixing sheet having a probe fixing layer on one side, and the probe fixing sheet is fixed to the probe. On the opposite side of the layer, a flat second cover sheet that can be heat-sealed is overlaid,
At least both edges of the first cover sheet and the second cover sheet are heat-sealed, so that a liquid introduction space is provided between the probe fixing layer of the probe fixing sheet and the first cover sheet. A method of manufacturing a probe array, comprising forming a gap.
前記第1のカバーシートおよび前記第2のカバーシートの少なくとも両縁部を熱融着し、もって前記プローブ固定シートのプローブ固定化層と前記第1のカバーシートとの間、および前記プローブ固定シートのプローブ固定化層と前記第2のカバーシートとの間に、液導入スペースを構成する空隙を形成する
ことを特徴とするプローブアレイの製造方法。 A planar first cover sheet having transparency that can be heat-sealed is superposed on one surface side of a planar probe fixing sheet having probe fixing layers on both sides, and the other surface side of the probe fixing sheet In addition, a flat second cover sheet having transparency that can be heat-sealed is overlaid,
At least both edge portions of the first cover sheet and the second cover sheet are heat-sealed, so that the probe fixing layer of the probe fixing sheet and the first cover sheet, and the probe fixing sheet A method for producing a probe array, comprising: forming a void that constitutes a liquid introduction space between the probe-immobilized layer and the second cover sheet.
前記プローブ固定シートおよび前記カバーシートの少なくとも両縁部を熱融着し、もって前記プローブ固定シートのプローブ固定化層と前記カバーシートとの間に、液導入スペースを構成する空隙を形成する
ことを特徴とするプローブアレイの製造方法。 On the probe fixing layer side of the flat probe fixing sheet having the probe fixing layer on one side or both sides, a planar cover sheet having transparency that can be heat-sealed is overlaid,
Heat-sealing at least both edges of the probe fixing sheet and the cover sheet, thereby forming a gap that constitutes a liquid introduction space between the probe fixing layer of the probe fixing sheet and the cover sheet. A method for producing a probe array.
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-
2007
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