JP2008125378A - 昆虫由来のベシクルフュージングatpアーゼ活性に関わる有害生物の生理状態に変化を与える薬剤 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】有害生物の生理状態に変化を与える薬剤であり、ベシクルフュージングATPアーゼ(以下、本酵素と記す。)の活性を変化させる能力を有することを特徴とする薬剤、並びに、被験物質が有する有害生物防除能力の検定方法であって、(1)例えば、配列番号1で示されるアミノ酸配列からなる蛋白質等を含む群Aから選択される本酵素と被験物質との接触系内における前記本酵素の活性を測定する第一工程、及び(2)第一工程により測定された活性と対照における活性とを比較することにより得られる差異に基づき前記物質の有害生物防除能力を評価する第二工程、を有することを特徴とする方法等。
【選択図】なし
Description
1.有害生物の生理状態に変化を与える薬剤であり、昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼの活性を変化させる能力を有することを特徴とする薬剤;
2.昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼが、ワタアブラムシ由来のベシクルフュージングATPアーゼであることを特徴とする前項1記載の薬剤;
3.有害生物の生理状態に変化を与える薬剤が、有害生物防除剤であることを特徴とする前項1記載の薬剤;
4.昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼの活性を変化させる能力が、昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼとATPとの反応を阻害する能力であることを特徴とする前項1記載の薬剤;
5.有効成分として、昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼの活性を変化させる能力を有する化学物質又はその農学的に許容される塩を含有することを特徴とする有害生物防除剤;
6.前記化学物質が、昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼとATPとの反応を阻害する能力を有する化学物質であることを特徴とする前項5記載の有害生物防除剤;
7.前記化学物質が、昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼとATPとの無細胞反応系において、前記化学物質の存在濃度が10μM以上の場合に、当該化学物質が存在しない場合よりもベシクルフュージングATPアーゼの活性が低くなるように阻害する能力を有する化学物質であることを特徴とする前項6記載の有害生物防除剤;
8.前記化学物質が、昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼとATPとの反応の無細胞反応系において、100μM以下のIC50となるように阻害する能力を有する化学物質であることを特徴とする前項6記載の有害生物防除剤;
9.被験物質が有する有害生物防除能力の検定方法であって、
(1)下記の群Aから選択されるベシクルフュージングATPアーゼと被験物質との接触系内における前記ベシクルフュージングATPアーゼの活性を測定する第一工程、及び
(2)第一工程により測定された活性と対照における活性とを比較することにより得られる差異に基づき前記物質の有害生物防除能力を評価する第二工程、
を有することを特徴とする方法
<群A>
(a)配列番号1で示されるアミノ酸配列からなる蛋白質
(b)配列番号1で示されるアミノ酸配列において、1若しくは複数のアミノ酸が欠失、付加若しくは置換されたアミノ酸配列からなり、かつベシクルフュージングATPアーゼ活性を有する蛋白質
(c)配列番号1で示されるアミノ酸配列と75%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつベシクルフュージングATPアーゼ活性を有する蛋白質
(d)配列番号2で示される塩基配列によりコードされるアミノ酸配列からなる蛋白質
(e)配列番号2で示される塩基配列と75%以上の配列同一性を有する塩基配列によりコードされるアミノ酸配列からなり、かつベシクルフュージングATPアーゼ活性を有する蛋白質
(f)配列番号2で示される塩基配列を有するポリヌクレオチドに対し相補性を有するポリヌクレオチドと、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるアミノ酸配列からなり、かつベシクルフュージングATPアーゼ活性を有する蛋白質
(g)昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼのアミノ酸配列からなる蛋白質
(h)ワタアブラムシ由来のベシクルフュージングATPアーゼのアミノ酸配列からなる蛋白質;
10.前項9記載の検定方法により評価された有害生物防除能力を有する物質を選抜することを特徴とする有害生物防除能力を有する物質の探索方法;
11.前項10記載の探索方法により選抜された物質又はその農学的に許容される塩を有効成分として含有することを特徴とする有害生物防除剤;
12.前項5、6、7、8又は11記載の有害生物防除剤の有効量を、保護すべき作物、有害生物又は有害生物の生息場所に施用することを特徴とする有害生物防除方法;
13.前項9記載の検定方法により評価された有害生物防除能力を有する物質を特定し、特定された有害生物防除能力を有する物質と有害生物とを接触させることを特徴とする有害生物防除方法;
14.下記の群Bのいずれかのアミノ酸配列を有することを特徴とする昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼ;
<群B>
(a)配列番号1で示されるアミノ酸配列
(b)配列番号1で示されるアミノ酸配列において、1若しくは複数のアミノ酸が欠失、付加若しくは置換されたアミノ酸配列からなり、かつベシクルフュージングATPアーゼ活性を有するアミノ酸配列
(c)配列番号1で示されるアミノ酸配列と75%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつベシクルフュージングATPアーゼ活性を有するアミノ酸配列
(d)配列番号2で示される塩基配列を有するアミノ酸配列
(e)配列番号2で示される塩基配列と75%以上の配列同一性を有する塩基配列によりコードされるアミノ酸配列からなり、かつベシクルフュージングATPアーゼ活性を有するアミノ酸配列
(f)配列番号2で示される塩基配列に対し相補性を有するポリヌクレオチドと、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるアミノ酸配列からなり、かつベシクルフュージングATPアーゼ活性を有するアミノ酸配列
(g)ワタアブラムシ由来のベシクルフュージングATPアーゼが有するアミノ酸配列
15.有害生物防除能力を評価するための指標を提供する試薬としての、昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼの使用;
16.有害生物防除能力を評価するための指標を提供する試薬としての、前項14記載の昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼの使用;
17.前項14記載のベシクルフュージングATPアーゼのアミノ酸配列をコードする塩基配列を有することを特徴とするポリヌクレオチド;
18.配列番号2で示される塩基配列からなることを特徴とする前項17記載のポリヌクレオチド;
19.前項17又は18記載のポリヌクレオチドが有する塩基配列に対し相補性を有する塩基配列を有することを特徴とするポリヌクレオチド;
20.前項17又は18記載のポリヌクレオチドの部分塩基配列又はその部分塩基配列に対して相補性を有する塩基配列を有することを特徴とするポリヌクレオチド;
21.配列番号3又は4で示される塩基配列からなることを特徴とする前項20記載のポリヌクレオチド;
22.ベシクルフュージングATPアーゼのアミノ酸配列をコードする塩基配列を有するポリヌクレオチドの取得方法であって、前項20又は21記載のポリヌクレオチドをプライマーとして用いたPCRにより所望のポリヌクレオチドを増幅する工程、増幅された所望のポリヌクレオチドを特定する工程、及び、特定された所望のポリヌクレオチドを回収する工程、を有することを特徴とする方法;
23.ベシクルフュージングATPアーゼのアミノ酸配列をコードする塩基配列を有するポリヌクレオチドの取得方法であって、前項19、20又は21記載のポリヌクレオチドをプローブとして用いたハイブリダイゼーションにより所望のポリヌクレオチドを検出する工程、検出された所望のポリヌクレオチドを特定する工程、及び、特定された所望のポリヌクレオチドを回収する工程、を有することを特徴とする方法;
24.前項17又は18記載のポリヌクレオチドを、バクテリオファージ由来のプロモーターに機能可能な形で連結してなることを特徴とする環状ポリヌクレオチド;
25.バクテリオファージ由来のプロモーターが、T7RNAポリメラーゼ遺伝子のプロモーターであることを特徴とする前項24記載の環状ポリヌクレオチド;
26.前項24又は25記載の環状ポリヌクレオチドであって、宿主細胞内で自己複製の為の複製開始点を有することを特徴とする環状ポリヌクレオチド;
27.前項17又は18記載のポリヌクレオチドをベクターに連結することを特徴とする環状ポリヌクレオチドの製造方法;
28.前項17又は18記載のポリヌクレオチドが導入されてなることを特徴とする形質転換体;
29.形質転換体が形質転換大腸菌であることを特徴とする前項28記載の形質転換体;
30.前項17又は18記載のポリヌクレオチドが宿主細胞に導入されてなることを特徴とする形質転換体の製造方法;
31.前項28又は29記載の形質転換体を培養し、産生された昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼを回収する工程を有することを特徴とするベシクルフュージングATPアーゼの製造方法;
32.研究ツールとしての、前項14記載の昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼ或いは前項17乃至21のいずれかの前項記載のポリヌクレオチドの使用;
33.研究ツールが有害生物防除剤をスクリーニングするための実験ツールであることを特徴とする前項32記載の「使用」;
34.被験物質について、当該被験物質が有する昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼの活性を変化させる能力に係るデータ情報を入力・蓄積・管理する手段、前記データ情報を所望の条件に基づき照会・検索する手段、及び、照会・検索された結果を表示・出力する手段を具備することを特徴とするシステム;
等を提供するものである。
鱗翅目害虫:ニカメイガ(Chilo suppressalis)、コブノメイガ(Cnaphalocrocis medinalis)、ヨーロピアンコーンボーラー(Ostrinia nubilalis)、シバツトガ(Parapediasia teterrella)等のメイガ類、ハスモンヨトウ(Spodoptera litura)、シロイチモジヨトウ(Spodoptera exigua)、アワヨトウ(Pseudaletia separata)、ヨトウガ(Mamestra brassicae)、タマナヤガ(Agrotis ipsilon)、トリコプルシア属(Trichoplusia spp.)、ヘリオティス属(Heliothis spp.)、ヘリコベルパ属(Helicoverpa spp.)、エアリアス属(Earias spp.)等のヤガ類、モンシロチョウ(Pieris rapae crucivora)等のシロチョウ類、リンゴコカクモンハマキ(Adoxophyes orana fasciata)、ナシヒメシンクイ(Grapholita molesta)、コドリングモス(Cydia pomonella)等のハマキガ類、モモシンクイガ(Carposina niponensis)等のシンクイガ類、モモハモグリガ(Lyonetia clerkella)等のチビガ類、キンモンホソガ(Phyllonorycter ringoniella)等のホソガ類、ミカンハモグリガ(Phyllocnistis citrella)等のコハモグリガ類、コナガ(Plutela xylostella)等のスガ類、ピンクボールワーム(Pectinophora gossypiella)等のキバガ類、ヒトリガ類、ヒロズコガ類等;
双翅目害虫:アカイエカ(Culex pipiens pallens)、コガタアカイエカ(Culex tritaeniorhynchus)、ネッタイイエカ(Culex quinquefasciatus)等のイエカ類、(Aedes aegypti)、(Aedes albopictus)等のエーデス属、(Anopheles sinensis)等のアノフェレス属、ユスリカ類、イエバエ(Musca domestica)、オオイエバエ(Muscina stabulans)等のイエバエ類、クロバエ類、ニクバエ類、ヒメイエバエ類、タネバエ(Delia platura)、タマネギバエ(Delia antiqua)等のハナバエ類、ミバエ類、ショウジョウバエ類、チョウバエ類、ブユ類、アブ類、サシバエ類、ハモグリバエ類等;
鞘翅目害虫:ウエスタンコーンルートワーム(Diabrotica virgifera virgifera)、サザンコーンルートワーム(Diabrotica undecimpunctata howardi)等のコーンルートワーム類、ドウガネブイブイ(Anomala cuprea)、ヒメコガネ(Anomala rufocuprea)等のコガネムシ類、メイズウィービル(Sitophilus zeamais)、イネミズゾウムシ(Lissorhoptrus oryzophilus)、アズキゾウムシ(Callosobruchuys chienensis)等のゾウムシ類、チャイロコメノゴミムシダマシ(Tenebrio molitor)、コクヌストモドキ(Tribolium castaneum)等のゴミムシダマシ類、イネドロオイムシ(Oulema oryzae)、ウリハムシ(Aulacophora femoralis)、キスジノミハムシ(Phyllotreta striolata)、コロラドハムシ(Leptinotarsa decemlineata)等のハムシ類、シバンムシ類、ニジュウヤホシテントウ(Epilachna vigintioctopunctata)等のエピラクナ類、ヒラタキクイムシ類、ナガシンクイムシ類、カミキリムシ類、アオバアリガタハネカクシ(Paederus fuscipes)等;
アザミウマ目害虫:ミナミキイロアザミウマ(Thrips palmi)等のスリップス属、ミカンキイロアザミウマ(Frankliniella occidentalis)等のフランクリニエラ属、チャノキイロアザミウマ(Sciltothrips dorsalis)等のシルトスリップス属等のアザミウマ類、クダアザミウマ類等;
膜翅目害虫:ハバチ類、アリ類、スズメバチ類等;
網翅目害虫:ゴキブリ類、チャバネゴキブリ類等;
直翅目害虫:バッタ類、ケラ類等;
隠翅目害虫:ヒトノミ等;
シラミ目害虫:ヒトジラミ等;
シロアリ目害虫:シロアリ類等;
ダニ目害虫:ナミハダニ(Tetranychus urticae)、カンザワハダニ(Tetranychus kanzawai)、ミカンハダニ(Panonychus citri)、リンゴハダニ(Panonychus ulmi)、オリゴニカス属等のハダニ類、ミカンサビダニ(Aculops pelekassi)、リンゴサビダニ(Aculus schlechtendali)等のフシダニ類、チャノホコリダニ(Polyphagotarsonemus latus)等のホコリダニ類、ヒメハダニ類、ケナガハダニ類、フタトゲチマダニ(Haemaphysalis longicornis)、ヤマトチマダニ(Haemaphysalis flava)、タイワンカクマダニ(Dermacentor taiwanicus)、ヤマトマダニ(Ixodes ovatus)、シュルツマダニ(Ixodes persulcatus) 、オウシマダニ(Boophilus microplus)等のマダニ類、ケナガコナダニ(Tyrophagus putrescentiae)等のコナダニ類、コナヒョウヒダニ(Dermatophagoides farinae)、ヤケヒョウヒダニ(Dermatophagoides ptrenyssnus)等のヒョウヒダニ類、ホソツメダニ(Cheyletus eruditus)、クワガタツメダニ(Cheyletus malaccensis)、ミナミツメダニ(Cheyletus moorei)等のツメダニ類、ワクモ類等;
線虫類:ミナミネグサレセンチュウ(Pratylenchus coffeae)、キタネグサレセンチュウ(Pratylenchus fallax)、ダイズシストセンチュウ(Heterodera glycines)、ジャガイモシストセンチュウ(Globodera rostochiensis)、キタネコブセンチュウ(Meloidogyne hapla)、サツマイモネコブセンチュウ(Meloidogyne incognita)等。
その他に、例えばATPアーゼ活性を測定する生物学的手法(in vivo測定法)のような定法により、ベシクルフュージングATPアーゼ活性を検出することも可能である。
ここで「公共のデータベース」としては、例えば、GenBnak、、DDBL及びEMBLの各デー−タバンクが公開しているデータベース等を挙げることができ、当該データベースに登録されているデータを誰でも制限なしで利用できる。Genbankに登録されている塩基配列に関する情報は、例えば、National Center for Biotechnology Information のWEBペー−ジ(URL;http://www.ncbi.nlm.nih.gov)から、Genbankによって各遺伝子に付与されている上記の登録番号 (Accession No.)をもとに検索を行うことによって入手することができる。因みに、INSDに登録されたデータは科学資料として永久に保存され公開されることが、上記3データバンクで構成される国際塩基配列データベース(international Nucleotide Sequence Databases, INSD)の諮問機関である国際諮問委員会により作成された「DDBL/EMBL/GenBnakの登録データの取り扱い」(2002年5月23-24日)で明文化されており、GenBnak、、DDBL及びEMBLの各データバンクが公開しているデータ全てを如何なる当業者であっても登録番号 (Accession No.)に基づきデー−タの照合、検索、入手等は可能である。
Cb:無処理区の処理前の虫の生存数
Cai:無処理区の観察時の虫の生存数
Tb:処理区の処理前の虫の生存数
Tai:処理区の観察時の虫の生存数
有意に高い防除価を示す供試薬剤については、有害生物防除活性があると言える。また、より好ましくは、当該防除価が30%以上の供試薬剤は実質的な殺虫活性があると判断でき、当該防除価が30%未満の供試化合物は実質的な殺虫活性が無いと判断できる。
(a)配列番号1で示されるアミノ酸配列からなる蛋白質
(b)配列番号1で示されるアミノ酸配列において、1若しくは複数のアミノ酸が欠失、付加若しくは置換されたアミノ酸配列からなり、かつベシクルフュージングATPアーゼ活性を有する蛋白質
(c)配列番号1で示されるアミノ酸配列と75%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつベシクルフュージングATPアーゼ活性を有する蛋白質
(d)配列番号2で示される塩基配列によりコードされるアミノ酸配列からなる蛋白質
(e)配列番号2で示される塩基配列と75%以上の配列同一性を有する塩基配列によりコードされるアミノ酸配列からなり、かつベシクルフュージングATPアーゼ活性を有する蛋白質
(f)配列番号2で示される塩基配列を有するポリヌクレオチドに対し相補性を有するポリヌクレオチドと、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるアミノ酸配列からなり、かつベシクルフュージングATPアーゼ活性を有する蛋白質
(g)昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼのアミノ酸配列からなる蛋白質
(h)ワタアブラムシ由来のベシクルフュージングATPアーゼのアミノ酸配列からなる蛋白質
を示す(以下、群Aと記す。)。
(f)に記載される「ストリンジェントな条件」としては、Sambrook J., Frisch E. F., Maniatis T.著、モレキュラークローニング第2版(Molecular Cloning 2nd edition)、コールド スプリング ハーバー ラボラトリー発行(Cold Spring Harbor Laboratory press)等に記載される通常の方法に準じて行われるハイブリダイゼーションにおいて、例えば、6×SSC(1.5M NaCl、0.15M クエン酸三ナトリウムを含む溶液を10×SSCとする)を含む溶液中で45℃にてハイブリッドを形成させた後、2×SSCで50℃にて洗浄するような条件(Molecular Biology, John Wiley & Sons, N. Y. (1989), 6.3.1-6.3.6)等を挙げることができる。洗浄ステップにおける塩濃度は、例えば、2×SSC(低ストリンジェンシーな条件)から0.2×SSC(高ストリンジェンシーな条件)までの条件から選択することができる。洗浄ステップにおける温度は、例えば、室温(低ストリンジェンシーな条件)から65℃(高ストリンジェンシーな条件)までの条件から選択することができる。また、塩濃度と温度の両方を変えることもできる。
(h)記載の蛋白質は、昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼの中で、ワタアブラムシに存在するベシクルフュージングATPアーゼを示し、(a)記載のアミノ酸配列からなる蛋白質も含まれる。
(a)配列番号1で示されるアミノ酸配列
(b)配列番号1で示されるアミノ酸配列において、1若しくは複数のアミノ酸が欠失、付加若しくは置換されたアミノ酸配列からなり、かつベシクルフュージングATPアーゼ活性を有するアミノ酸配列
(c)配列番号1で示されるアミノ酸配列と75%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつベシクルフュージングATPアーゼ活性を有するアミノ酸配列
(d)配列番号2で示される塩基配列を有するアミノ酸配列
(e)配列番号2で示される塩基配列と75%以上の配列同一性を有する塩基配列によりコードされるアミノ酸配列からなり、かつベシクルフュージングATPアーゼ活性を有するアミノ酸配列
(f)配列番号2で示される塩基配列に対し相補性を有するポリヌクレオチドと、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるアミノ酸配列からなり、かつベシクルフュージングATPアーゼ活性を有するアミノ酸配列
(g)ワタアブラムシ由来のベシクルフュージングATPアーゼが有するアミノ酸配列
上記の群Bのに示されるアミノ酸配列のうち、(b)、(c)、(d)、(e)、(f)、(g)に示される蛋白質のアミノ酸配列において、(a)に示されるアミノ酸配列との間に認められることのある相違は、一部のアミノ酸の欠失、置換、付加等である。これらには、例えば、上記の(a)で示されるアミノ酸配列を有する蛋白質が細胞内で受けるプロセシングによる欠失が含まれる。また、当該蛋白質が由来する生物の種差や個体差等により天然に生じる遺伝子変異や、部位特異的変異導入法、ランダム変異導入法、突然変異処理等によって人為的に導入される遺伝子変異等により生じるアミノ酸の欠失、置換、付加等が含まれる。
(f)に記載される「ストリンジェントな条件」としては、Sambrook J., Frisch E. F., Maniatis T.著、モレキュラークローニング第2版(Molecular Cloning 2nd edition)、コールド スプリング ハーバー ラボラトリー発行(Cold Spring Harbor Laboratory press)等に記載される通常の方法に準じて行われるハイブリダイゼーションにおいて、例えば、6×SSC(1.5M NaCl、0.15M クエン酸三ナトリウムを含む溶液を10×SSCとする)を含む溶液中で45℃にてハイブリッドを形成させた後、2×SSCで50℃にて洗浄するような条件(Molecular Biology, John Wiley & Sons, N. Y. (1989), 6.3.1-6.3.6)等を挙げることができる。洗浄ステップにおける塩濃度は、例えば、2×SSC(低ストリンジェンシーな条件)から0.2×SSC(高ストリンジェンシーな条件)までの条件から選択することができる。洗浄ステップにおける温度は、例えば、室温(低ストリンジェンシーな条件)から65℃(高ストリンジェンシーな条件)までの条件から選択することができる。また、塩濃度と温度の両方を変えることもできる。
(h)記載の蛋白質は、昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼの中で、ワタアブラムシに存在するベシクルフュージングATPアーゼを示し、(a)記載のアミノ酸配列からなる蛋白質も含まれる。
<第1の取得方法>
例えば、ポリヌクレオチド群Bに含まれる配列番号2で示される塩基配列からなるポリヌクレオチドの取得方法を以下に示す。工程としては、ワタアブラムシから全RNAを取得し、cDNAライブラリーを合成して、PCR増幅を行うことによって目的のポリヌクレオチドを取得できる。
以上のようにして配列番号2で示される塩基配列からなるポリヌクレオチドを取得することが可能である。
<第2の取得方法>
また、ポリヌクレオチド群Bに示されるポリヌクレオチドは、配列番号2に示される塩基配列からなるポリヌクレオチドを基にして、前記の部位特異的変異導入法であるアンバー変異を利用する方法、変異導入用プライマーを用いたPCRによる方法等によって変異が導入されたポリヌクレオチドを作製することによっても得ることが可能である。
<第3の取得方法>
また、ポリヌクレオチド群Bに示されるポリヌクレオチドは、配列番号2に示される塩基配列からなるポリヌクレオチド等をプローブとしたハイブリダイゼーション法によっても取得可能である。より具体的には、前記のSambrook J., Frisch E. F., Maniatis T.著、モレキュラークローニング第2版(Molecular Cloning 2nd edition)、コールド スプリング ハーバー ラボラトリー発行(Cold Spring Harbor Laboratory press)等に記載される通常の方法に準じて行われるハイブリダイゼーション法に従い実施可能である。
<第4の取得方法>
また、ポリヌクレオチド群Bに示されるポリヌクレオチドは、既知の昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼのアミノ酸配列配列を基にプライマーを作製しPCRによって取得することも可能である。具体的には、チャバネゴキブリ(Blatella germanica)等の他の昆虫種におけるベシクルフュージングATPアーゼ相同遺伝子を得るために、Codehop program(Fred Hutchinson Cancer Research Center が運営するBlocks Protein Analysis Server のウェブサイトから公的に利用可能 http://blocks.fhcrc.org/blocks/codehop.html)を利用してディジェネレートプライマーを設計する。この時、前述のワタアブラムシ由来のベシクルフュージングATPアーゼ遺伝子配列及び既に公知であるキイロショウジョウバエ(NCBI accession number NM_080138)、タバコスズメガ(AF118384)、コットンボールワーム(AY220909)、ガンビエハマダラカ(XM_307148)の配列を参考にする。選択した昆虫種におけるベシクルフュージングATPアーゼ相同遺伝子の部分配列は、当該昆虫種由来のcDNA第1鎖を鋳型とした一連のPCRにより増幅する。ここで、鋳型とするcDNA第1鎖は前述のSuperscript IIIを用いた方法により調製する。PCRには、フォワード及びリバースプライマーとしてそれぞれのディジェネレートプライマーと、Amplitaq Gold (Applied Biosystems社製)とを用いて、当該試薬に付属される説明書に従って行う。PCRの条件は後述のようなタッチダウンPCRとする。すなわち、最初に94℃、10分間、続いて94℃、30秒間、60℃から1サイクルにつき1℃の減少を伴い10サイクルで50℃まで変化させて、1分間、72℃、1分30秒間を10サイクルとし、さらに94℃、30秒間、50℃、1分間、72℃、1分30秒間を25サイクルとし、最後に72℃、7分間とする。PCR産物はアガロースゲル電気泳動により分析・精製することにより、目的のDNA断片を取得する。さらにこのようにして取得されたDNA断片をpCR4-TOPO vector (Invitrogen社製)にクローニングした後、塩基配列を決定する。
前記群Bに示されるアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドが導入された形質転換体とは、例えば、バクテリオファージのT7RNAポリメラーゼプロモーターに機能可能な形で連結されたワタアブラムシのベシクルフュージングATPアーゼ遺伝子を含むDNA断片が導入された形質転換大腸菌、が挙げられる。具体的には、以下の方法に従って作製することが可能である。
また、ベシクルフュージングATPアーゼは、組換えバキュロウィルス/昆虫培養細胞Sf9発現系を用いることによっても製造することができる。この発現系は最も強力で用途の広い真核生物細胞を用いた蛋白質発現系の一つであり、かび、植物、細菌、ウイルス等多くの生物材料由来の外来遺伝子発現系である。
(1)ワタアブラムシからの全RNAの抽出
ポット植えのキュウリ葉上で飼育されたワタアブラムシ(Aphis gossypii)の成虫及び幼虫の混合した集団630mgを葉上から細筆又は小さなハケでかきとり、これを液体窒素中で乳鉢及び乳棒を用いて粉末状になるまで破砕した。凍結された破砕粉体からRNA抽出試薬ISOGEN(ニッポンジーン社製)を用いてRNAを単離した。
人工飼育されたチャバネゴキブリ(Blattella germanica)を成虫、幼虫、卵鞘の3種類の試料として準備した。成虫としては雄10頭及び雌(卵鞘を取り除いた個体)10頭で1.1g、幼虫としては雄10頭及び雌10頭で1.0g、卵鞘としては26個で1.0gを用いた。3種類の試料を別々の乳鉢及び乳棒を用いて、液体窒素中で粉末状になるまで破砕した。凍結された破砕粉体からRNA抽出試薬ISOGEN(ニッポンジーン社製)を用いてRNAを単離した。乳鉢中の凍結された破砕粉体に10mlのISOGENを加えた後、前記破砕粉体を10分間磨砕した。この時、乳鉢は氷上に置いた状態で操作した。磨砕後、液体状の試料をピペットにて15mlチューブに移し、さらに2mlのクロロホルム(和光純薬工業社製)を加えた。直ちに当該混合物を15秒間激しく混和した後、これを室温で3分間静置した。次いで静置された混和物を4℃、15分間、12,000×gで遠心分離した後、上層の水相を5mlずつ2本の新しいチューブに移した。ぞれぞれのチューブにISOGENを5ml加え、直ちに当該混合物を15秒間激しく混和した後、これを室温で3分間静置した。次いで静置された混和物を4℃、15分間、12,000×gで再度遠心分離した後、上層の水相10mlをそれぞれ新しい50mlチューブに移した。続いて、ぞれぞれのチューブにイソプロパノール(和光純薬工業社製)を10ml加えた後、当該混合物を氷上で30分間静置した。静置された混合物を4℃、10分間、12,000×gで遠心分離することにより、RNAを沈殿させた。上清を除去した後、残渣に20mlの70%エタノールを加えた。得られた混合物を4℃、5分間、10,000×gで遠心分離した。上清を除去した後、チューブの口を下にして3分間静置し、沈殿した全RNAを軽く乾燥させてから、当該沈殿を市販のRNase-free water(ナカライテスク社製)1mlに溶解させた。このようにして調製された全RNAの濃度(260 nmの吸光度から算出)は、成虫由来の全RNAの場合には1.1mg/ml、幼虫由来の全RNAの場合には2.5mg/ml、卵鞘由来の全RNAの場合には1.4mg/mlであった。
ワタアブラムシ全RNAからのcDNA第1鎖は、RT-PCR用のRandom Primers (Invitrogen社製)及びSuperscript III (Invitrogen社製)を用いて、当該試薬に付属される説明書に従って合成された。
チャバネゴキブリ(Blatella germanica)等の他の昆虫種におけるベシクルフュージングATPアーゼ相同遺伝子を得るために、Codehop program(Fred Hutchinson Cancer Research Center が運営するBlocks Protein Analysis Server のウェブサイトから公的に利用可能 http://blocks.fhcrc.org/blocks/codehop.html)を利用してディジェネレートプライマーを設計する。この時、前述のワタアブラムシ由来のベシクルフュージングATPアーゼ遺伝子配列及び既に公知であるキイロショウジョウバエ(NCBI accession number NM_080138)、タバコスズメガ(NCBI accession number AF118384)、コットンボールワーム(NCBI accession number AY220909)、ガンビエハマダラカ(NCBI accession number XM_307148)等の塩基配列を参考にする。
大腸菌発現用ベクターにクローニングするベシクルフュージングATPアーゼ遺伝子断片は、実施例2で取得されたワタアブラムシのベシクルフュージングATPアーゼcDNA全長を鋳型として、当該遺伝子配列に特異的なプライマーである配列番号5に示される塩基配列からなるオリゴヌクレオチド及び当該遺伝子配列に特異的なプライマーでありXhoI制限酵素サイトを付加した配列番号6に示される塩基配列からなるオリゴヌクレオチドとPfuUltra High Fidelity polymerase (Stratagene社製)を用いて、当該試薬に付属される説明書に従ってPCR増幅された。PCRの条件は、最初に94℃、5分間、続いて94℃、20秒間、60℃、20秒間、72℃、2分間を40サイクルとし、最後に72℃、7分間とした。
得られたPCR産物を、Qiaquick PCR Purification Kit(Qiagen社製)を用いて当該キットに付属される説明書に従って精製し、精製後のDNA断片をXhoIで切断した。
ワタアブラムシのベシクルフュージングATPアーゼのBlunt/XhoI DNA断片をアガロースゲル電気泳動により分析し、単離・精製後、大腸菌発現用ベクターpET41b(+)(Novagen社製)のEcoRV/XhoIクローニングサイトにライゲーションした。以下、得られたベクターをpGAY008と名付けた。
組み換えベシクルフュージングATPアーゼタンパク質は2つのHisタグと1つのGSTタグが付加された形で翻訳されるため、769アミノ酸からなる組み換えタンパク質が得られることとなった。
Qiafilter Plasmid Maxiprepを用いて、Qiagen Plasmid Purification Handbookに記載される方法に従って、pGAY008を調製した。
1ng/ulの濃度のpGAY008を1ul用いて、大腸菌BL21(DE3)のコンピテントセル(Invitrogen社製)を添付の説明書に従って形質転換した。50mg/Lのカナマイシン(Sigma社製)を含むLB寒天培地上で、37℃、一晩培養することにより、形質転換された大腸菌のコロニーを得た。
pGAY008により形質転換された大腸菌BL21(DE3)を、50mg/Lのカナマイシン(Sigma社製)を含むLB培地()にて、37℃、250rpmで一晩旋回培養した。翌朝、培養液を50mg/Lのカナマイシンを含むLB培地で1/25に希釈し、37℃、250rpmで培養を続け、OD600が0.8になったところで、終濃度が10μMになるようにIPTGを添加した。さらに、25℃、60rpmで4日間培養し、大腸菌内で組み換えベシクルフュージングATPアーゼタンパク質を生産させた。誘導および発現後、培養液を7000rpmで10分間遠心分離することにより、大腸菌を回収した。上清は廃棄し、回収した大腸菌は液体窒素により瞬間凍結後、使用時まで-80℃に保存した。
ワタアブラムシのベシクルフュージングATPアーゼを、N末端にGST(グルタチオンSトランスフェラーゼ)タグとHisタグを、C末端にもHisタグを付加した状態で、pET41(b+)中にクローニングした。ベシクルフュージングATPアーゼ組み換えタンパク質は、Hisタグを利用した1段階目の精製手順と、GSTタグを利用した2段階目の精製手順とにより精製した。
凍結保存しておいた誘導後の大腸菌BL21(DE3)を、30 ml のbreaking buffer(100mM Hepes/KOH pH 7.5, 500mM KCl, 5mM MgCl2, 2mM 2-メルカプトエタノール, 5mM ATP, 0.5mM, Pefablock, 10μg/μl Leupeptin, 1μM Pepstatin A)に再懸濁した後、当該細胞再懸濁液を試料として、フレンチプレス(Thermo Spectronic社製)を用いてbreaking buffer中で破砕した。大腸菌破砕のための圧力は1300-1500 psiであった。フレンチプレス処理後の大腸菌破砕液を14,000rpm、2℃、60分間遠心分離することにより、上清を回収し、次いで回収された上清に対して0.45μmフィルター処理を施した後、これを氷上で保存した。
HiTrap Chelating HP (Amersham biosciences社製)又はHisTrap HP (Amersham biosciences社製)カラムを用いて、当該カラムに付属される説明書に従って、金属アフィニティクロマトグラフィーにより1段階目の精製に組み換えタンパク質を供試した。大容量の精製には、Chelating Fast Flow Sepharose(Amersham biosciences社製)を充填したXK-16/20 column(Amersham biosciences社製)を用いた。尚、精製の各ステップではAEKTA-FPLC (Amersham biosciences社製)を使用した。
(ii)カラムの体積(CV)の5倍量の85%バッファーA/15%バッファーBによる非結合サンプルの溶出
(iii)CVの15倍量の40%バッファーB(200mMイミダゾール)による洗浄
(iv)CV15倍量の70 %バッファーB(350mMイミダゾール)による精製タンパク質の溶出
(v)CVの5倍量の100 %バッファーB(500 mMイミダゾール)によるカラムの洗浄
GSTrap FF(Amersham biosciences社製)カラムを用いて、当該カラムに付属される説明書に従って、2段階目の精製に1段階目の精製で集めた溶出画分を供試した。精製の各ステップではAEKTA-FPLC (Amersham biosciences社製)を使用した。
結合バッファーであるバッファーAの組成は、20mM Hepes pH 7.0, 200mM KCl, 1mM MgCl2, 2mM 2-メルカプトエタノール, 10%グリセロールとした。溶出バッファーであるバッファーBの組成は、50mM Tris-HCl, 10mM 還元型グルタチオン, 2mM 2-メルカプトエタノール, 10%グリセロールとした。グルタチオンを添加後、KOHにてpH7.5に調整した。ワタアブラムシのベシクルフュージングATPアーゼのGSTタグによる精製は以下の手順で行った。
(ii)CVの20倍量の100%バッファーAによる非結合サンプルの溶出
(iii)CVの30倍量の100%バッファーBによる精製タンパク質の溶出
ポリアクリルアミドゲルのクマシー染色には、次の染色液と脱色液を用いた。染色液の組成は、1g/L クマシーブリリアントブルーR、50%(v/v)メタノール、12%(v/v)酢酸、38%(v/v)蒸留水とし、十分に混和後、ろ過により溶け残ったクマシーブリリアントブルーRを取り除いた。脱色液の組成は、25%(v/v)メタノール、10%(v/v)酢酸、65%(v/v)蒸留水とした。
ウエスタンブロット解析には、一次抗体としてanti - His(H15) sc-803 rabbit polyclonal IgG antibody (tebubio社製)を1/500に希釈して使用した。二次抗体としては、goat anti-rabbit-HRP (Pierce社製)を1/10000希釈して用いた。
ベシクルフュージングATPアーゼ活性を変化させる化合物の選抜は、実施例7で調製されたアブラムシのベシクルフュージングATPアーゼを用いた試験管内反応系に、試験化合物を添加することによって変化するベシクルフュージングATPアーゼの活性を測定し、評価する系で実施した。
下記の組成(表3)からなる滅菌済み人工飼料を調製した。次いで、最終濃度が50ppmとなるようにDMSOに溶解された試験化合物を当該人工飼料の0.5%容量添加・混合すること以外は、Handbook of Insect Rearing Vol.1 (Elsevier Science Publisers 1985) 35頁〜36頁に記載される方法と同様にしてワタアブラムシを飼育した。飼育6日後にワタアブラムシの生存数を調査し、次の式により防除価を求めることにより、有意な防除価(例えば、防除価が30%以上)を示したものを殺虫活性有りとして判定した。
Cb:無処理区の処理前の虫の生存数
Cai:無処理区の観察時の虫の生存数
Tb:処理区の処理前の虫の生存数
Tai:処理区の観察時の虫の生存数
その結果を、実施例8の結果と合わせて、実施例9における表4に示した。
実施例9と同様にして殺虫活性試験を実施した結果を、実施例8の結果と合わせて、実施例10における表5に示した。
PCRのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号4
PCRのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号5
PCRのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号6
PCRのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
Claims (34)
- 有害生物の生理状態に変化を与える薬剤であり、昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼ(Vesicle-fusing ATPase:EC.3.6.4.6)の活性を変化させる能力を有することを特徴とする薬剤。
- 昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼが、ワタアブラムシ由来のベシクルフュージングATPアーゼであることを特徴とする請求項1記載の薬剤。
- 有害生物の生理状態に変化を与える薬剤が、有害生物防除剤であることを特徴とする請求項1記載の薬剤。
- 昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼの活性を変化させる能力が、昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼとATPとの反応を阻害する能力であることを特徴とする請求項1記載の薬剤。
- 有効成分として、昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼの活性を変化させる能力を有する化学物質又はその農学的に許容される塩を含有することを特徴とする有害生物防除剤。
- 前記化学物質が、昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼとATPの反応を阻害する能力を有する化学物質であることを特徴とする請求項5記載の有害生物防除剤。
- 前記化学物質が、昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼとATPとの無細胞反応系において、前記化学物質の存在濃度が10μM以上の場合に、当該化学物質が存在しない場合よりもベシクルフュージングATPアーゼの活性が低くなるように阻害する能力を有する化学物質であることを特徴とする請求項6記載の有害生物防除剤。
- 前記化学物質が、昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼとATPとの反応の無細胞反応系において、100μM以下のIC50となるように阻害する能力を有する化学物質であることを特徴とする請求項6記載の有害生物防除剤。
- 被験物質が有する有害生物防除能力の検定方法であって、
(1)下記の群Aから選択されるベシクルフュージングATPアーゼと被験物質との接触系内における前記ベシクルフュージングATPアーゼの活性を測定する第一工程、及び
(2)第一工程により測定された活性と対照における活性とを比較することにより得られる差異に基づき前記物質の有害生物防除能力を評価する第二工程、
を有することを特徴とする方法。
<群A>
(a)配列番号1で示されるアミノ酸配列からなる蛋白質
(b)配列番号1で示されるアミノ酸配列において、1もしくは複数のアミノ酸が欠失、付加もしくは置換されたアミノ酸配列からなり、かつベシクルフュージングATPアーゼ活性を有する蛋白質
(c)配列番号1で示されるアミノ酸配列と75%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつベシクルフュージングATPアーゼ活性を有する蛋白質
(d)配列番号2で示される塩基配列によりコードされるアミノ酸配列からなる蛋白質
(e)配列番号2で示される塩基配列と75%以上の配列同一性を有する塩基配列によりコードされるアミノ酸配列からなり、かつベシクルフュージングATPアーゼ活性を有する蛋白質
(f)配列番号2で示される塩基配列を有するポリヌクレオチドに対し相補性を有するポリヌクレオチドと、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるアミノ酸配列からなり、かつベシクルフュージングATPアーゼ活性を有する蛋白質
(g)昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼのアミノ酸配列からなる蛋白質
(h)ワタアブラムシ由来のベシクルフュージングATPアーゼのアミノ酸配列からなる蛋白質 - 請求項9記載の検定方法により評価された有害生物防除能力を有する物質を選抜することを特徴とする有害生物防除能力を有する物質の探索方法。
- 請求項10記載の探索方法により選抜された物質又はその農学的に許容される塩を有効成分として含有することを特徴とする有害生物防除剤。
- 請求項5、6、7、8又は11記載の有害生物防除剤の有効量を、保護すべき作物、有害生物又は有害生物の生息場所に施用することを特徴とする有害生物防除方法。
- 請求項9記載の検定方法により評価された有害生物防除能力を有する物質を特定し、特定された有害生物防除能力を有する物質と有害生物とを接触させることを特徴とする有害生物防除方法。
- 下記の群Bのいずれかのアミノ酸配列を有することを特徴とする昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼ。
<群B>
(a)配列番号1で示されるアミノ酸配列
(b)配列番号1で示されるアミノ酸配列において、1もしくは複数のアミノ酸が欠失、付加もしくは置換されたアミノ酸配列からなり、かつベシクルフュージングATPアーゼ活性を有するアミノ酸配列
(c)配列番号1で示されるアミノ酸配列と75%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつベシクルフュージングATPアーゼ活性を有するアミノ酸配列
(d)配列番号2で示される塩基配列を有するアミノ酸配列
(e)配列番号2で示される塩基配列と75%以上の配列同一性を有する塩基配列によりコードされるアミノ酸配列からなり、かつベシクルフュージングATPアーゼ活性を有するアミノ酸配列
(f)配列番号2で示される塩基配列に対し相補性を有するポリヌクレオチドと、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるアミノ酸配列からなり、かつベシクルフュージングATPアーゼ活性を有するアミノ酸配列
(g)ワタアブラムシ由来のベシクルフュージングATPアーゼが有するアミノ酸配列 - 有害生物防除能力を評価するための指標を提供する試薬としての、昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼの使用。
- 有害生物防除能力を評価するための指標を提供する試薬としての、請求項14記載の昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼの使用。
- 請求項14記載のベシクルフュージングATPアーゼのアミノ酸配列をコードする塩基配列を有することを特徴とするポリヌクレオチド。
- 配列番号2で示される塩基配列からなることを特徴とする請求項17記載のポリヌクレオチド。
- 請求項17又は18記載のポリヌクレオチドが有する塩基配列に対し相補性を有する塩基配列を有することを特徴とするポリヌクレオチド。
- 請求項17又は18記載のポリヌクレオチドの部分塩基配列又はその部分塩基配列に対して相補性を有する塩基配列を有することを特徴とするポリヌクレオチド。
- 配列番号3又は4で示される塩基配列からなることを特徴とする請求項20記載のポリヌクレオチド。
- ベシクルフュージングATPアーゼのアミノ酸配列をコードする塩基配列を有するポリヌクレオチドの取得方法であって、請求項20又は21記載のポリヌクレオチドをプライマーとして用いたPCRにより所望のポリヌクレオチドを増幅する工程、増幅された所望のポリヌクレオチドを特定する工程、及び、特定された所望のポリヌクレオチドを回収する工程、を有することを特徴とする方法。
- ベシクルフュージングアーゼのアミノ酸配列をコードする塩基配列を有するポリヌクレオチドの取得方法であって、請求項19、20又は21記載のポリヌクレオチドをプローブとして用いたハイブリダイゼーションにより所望のポリヌクレオチドを検出する工程、検出された所望のポリヌクレオチドを特定する工程、及び、特定された所望のポリヌクレオチドを回収する工程、を有することを特徴とする方法。
- 請求項17又は18記載のポリヌクレオチドを、バクテリオファージ由来のプロモーターに機能可能な形で連結してなることを特徴とする環状ポリヌクレオチド。
- バクテリオファージ由来のプロモーターが、T7RNAポリメラーゼ遺伝子のプロモーターであることを特徴とする請求項24記載の環状ポリヌクレオチド。
- 請求項24又は25記載の環状ポリヌクレオチドであって、宿主細胞内で自己複製の為の複製開始点を有することを特徴とする環状ポリヌクレオチド。
- 請求項17又は18記載のポリヌクレオチドをベクターに連結することを特徴とする環状ポリヌクレオチドの製造方法。
- 請求項17又は18記載のポリヌクレオチドが導入されてなることを特徴とする形質転換体。
- 形質転換体が形質転換大腸菌であることを特徴とする請求項28記載の形質転換体。
- 請求項17又は18記載のポリヌクレオチドが宿主細胞に導入されてなることを特徴とする形質転換体の製造方法。
- 請求項28又は29記載の形質転換体を培養し、産生された昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼを回収する工程を有することを特徴とするベシクルフュージングATPアーゼの製造方法。
- 研究ツールとしての、請求項14記載の昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼ或いは請求項17乃至21のいずれかの請求項記載のポリヌクレオチドの使用。
- 研究ツールが有害生物防除剤をスクリーニングするための実験ツールであることを特徴とする請求項32記載の「使用」。
- 被験物質について、当該被験物質が有する昆虫由来のベシクルフュージングATPアーゼの活性を変化させる能力に係るデータ情報を入力・蓄積・管理する手段、前記データ情報を所望の条件に基づき照会・検索する手段、及び、照会・検索された結果を表示・出力する手段を具備することを特徴とするシステム。
Priority Applications (7)
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|---|---|---|---|
| JP2006311241A JP2008125378A (ja) | 2006-11-17 | 2006-11-17 | 昆虫由来のベシクルフュージングatpアーゼ活性に関わる有害生物の生理状態に変化を与える薬剤 |
| US12/515,071 US20110207775A1 (en) | 2006-11-17 | 2007-11-19 | Agent that modulates physiological condition of pests, involved in insect vesicle-fusing atpase activity |
| EP10180541A EP2336154A3 (en) | 2006-11-17 | 2007-11-19 | Agent that modulates physiological condition of pests, involved in insect vesicle-fusing atpase activity |
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