JP2008161179A - 抗真菌性タンパク質及びその利用 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】Monascus種から得られる単離・精製された抗真菌性タンパク質又はその生物学的に機能性の同等物。
【選択図】図1
Description
本発明によれば、抗真菌性タンパク質MAFP1をコード化するヌクレオチド配列を含む単離・精製されたポリヌクレオチドを提供することができる。
本発明によれば、本発明の組み換えベクターを含む組み換え宿主細胞を提供することができる。
本発明によれば、抗真菌性タンパク質、及び好適なキャリアを含む抗真菌性組成物であって、該タンパク質が、真菌性疾病に対する保護を提供するのに十分な量で提供されることを特徴とする抗真菌性組成物を提供することができる。
本発明によれば、本発明の抗真菌性タンパク質をコード化するトランス遺伝子がそのゲノム中に組み込まれたトランスジェニック生物を提供することができる。
本発明によれば、本発明のプライマー対を含むPCRアッセイキットを提供することができる。
本明細書において特に断らない限り、本発明に関連して用いられている科学技術的用語は、当業者が普通に理解する意味を有するものとする。用語の意味及び範囲は明確であるべきであるが、何らかの潜在的なあいまいさが生じた場合には、本明細書に与えられた定義が、如何なる辞書の定義又は付帯的な定義に優先する。
本発明の一つの目的は、Monascus種由来の単離・精製された抗真菌性タンパク質を提供することである。本発明の他の目的は、抗真菌性タンパク質をコード化するヌクレオチド配列を含む単離・精製されたポリヌクレオチドを提供することである。Monascus抗真菌性タンパク質及びその抗真菌性タンパク質をコード化する遺伝子は、Monascus全ゲノムデータベースからの抽出(mining)及び比較分析によって発見された。
(1)酸性アミノ酸
(2)塩基性アミノ酸
(3)中性極性アミノ酸
(4)中性非極性アミノ酸
これら各種のグループ内の代表的なアミノ酸としては、これらに限定されないが、(1)アスパラギン酸及びグルタミン酸等の酸性(マイナスの電気を帯びた)アミノ酸;(2)アルギニン、ヒスチジン及びリジン等の塩基性(プラスの電気を帯びた)アミノ酸;(3)グリシン、セリン、スレオニン、システイン、チロシン、アスパラギン及びグルタミン等の中性極性アミノ酸;及び(4)アラニン、ロイシン、イソロイシン、バリン、プロリン、フェニルアラニン、トリプトファン及びメチオニン等の中性非極性(疎水性)アミノ酸が挙げられる。
本発明の他の目的は、配列番号:1又は4に示される核酸配列を含有するベクターを提供することである。生物学的に活性なMAFP1を発現させるために、MAFP1又は生物学的に機能性の同等物をコード化する核酸配列は、適切な発現ベクター、即ち、挿入されたコード配列の転写及び翻訳に必要な要素を含んでいるベクター中に挿入され得る。本発明によれば、当業者に周知の方法を用いて、MAFP1をコード化する配列及び適切な転写及び翻訳制御要素を含有する発現ベクターを構築することができる。これらの方法は、in vitro組み換えDNA技術、合成技術及びin vitro遺伝子組み換えを含む。ベクターは通常、用いる特定の宿主細胞中で機能性となるように選択される(即ち、遺伝子の増幅及び/又は遺伝子の発現が起こり得るように、ベクターは宿主細胞装置(host cell machinery)と適合している)。
本発明によれば、驚くべきことに、MAFP1タンパク質が分泌性のタンパク質であり、病原性真菌の増殖を効果的に阻害できることを見出した。従って、本発明のMAFP1タンパク質は、動物、植物又は微生物の真菌性疾病の治療、抑制及び/又は予防に用いることができる。抗真菌性タンパク質を被験者に投与することによって、又は抗真菌性タンパク質をコード化するDNA分子を含むベクターによって被験者を形質転換することによって、被験者中のコード化された抗真菌性タンパク質を発現させる抗真菌性タンパク質を直接使用して、真菌性疾病に対する保護を提供することができる。
本発明はまた、特に、真菌性疾病を治療、抑制及び/又は予防のために、本発明の抗真菌性タンパク質を含む抗真菌性組成物を提供する。この組成物は、好適なキャリア、希釈剤、溶媒、不活性物質又は他の添加剤を含んでいてもよく、任意に、他の抗真菌活性物質、賦形剤、補助剤(auxiliaries)、肥料又は成長調節剤を含んでいてもよい。
このようにして単離されたcDNAは、宿主細胞中に導入するための適切な形質転換/発現ベクターに移送することができる。さらに別の態様では、本発明の抗真菌性遺伝子は、本発明の新規な抗真菌性タンパク質をコード化する核酸セグメントを発現するトランスジェニック生物を製造するために用いることができる。トランスジェニック生物の製造方法は、マイクロインジェクション又は遺伝子組換えベクターによる感染等、当業界で周知である。一般に、この方法は、MAFP1抗真菌性タンパク質をコード化するコード領域に作動可能に連結されたプロモーターを含有するDNAセグメントによる好適な宿主細胞の形質転換を含む。このようなコード領域は、一般に、転写終結領域に作動可能に連結されており、それによってプロモーターは細胞内のコード領域の転写を駆動することができ、従って、in vitroで組換えタンパク質を製造する能力を与えることができる。
ある実施形態では、オリゴヌクレオチドプライマーを用いることが有利である。そのようなプライマーの配列は、PCR法に用いるための抗真菌性タンパク質遺伝子の特定された(defined)セグメントを検出、増幅又は突然変異させるために設計される。PCR用のプライマー及びハイブリダイゼーション・スクリーニング用のプローブは、配列番号:1又は4に示されるDNAのヌクレオチド配列に基づいて設計することができる。プライマーは、二量体形成を防止するために、自己相補的な配列も、それらの3’末端の相補的配列も有しないことが好ましい。プライマーは、制限部位を含んでいてもよい。プライマーは、DNAにアニーリングされ、十分な回数のPCRを実施することにより、ゲル電気泳動及び染色によって容易に可視化される生成物を得る。プライマーは、一般に少なくとも14個、通常少なくとも20個、好ましくは少なくとも24個、より好ましくは少なくとも28個のヌクレオチド長を有する。そのようなプライマーは、配列番号:2と同じ若しくは類似の抗真菌活性を有する抗真菌性ポリペプチド又はタンパク質をコード化する遺伝子を特異的にプライミング(priming)することができるであろう。他の種由来の関連する抗真菌性タンパク質遺伝子のセグメントも、このようなプライマーを用いたPCRによって増幅することができる。増幅された断片は、精製され、適切なベクター中に挿入され、当業界で公知の常套手段によって増殖され得る。
以下の実施例で用いるMonascus株は、台湾のBioresource Collection and Research Center(BCRC)に保存されているMonascus株である:M.pilosus(BCRC 38072、BCRC 38093及びBCRC31502)、M.barkeri(BCRC 33309)、M.floridanus(BCRC 33310)、M.lunisporas(BCRC 33640)、M.ruber(BCRC 31534、BCRC 31523、BCRC 31535、BCRC 33314、BCRC 33323及びBCRC 31533)、M.kaoliang(BCRC 31605=CBS 302.78)、M.purpureus(BCRC 31541=ATCC 16379、BCRC 33325=IFO 30873、BCRC 31615=DSM 1379、BCRC 31499=ATCC 16360=ATCC 26311及びBCRC 31542=ATCC 16365=ATCC 16426)、及びM.sanguineus(BCRC 33446=ATCC 200613から選択する。
Monascus種中のmafp1遺伝子の分布
種々のMonascus種にmafp1遺伝子(配列番号:1)が存在するか否かを明らかにするために、mafp1遺伝子を増幅するためのプライマーを、プライマー設計ソフトウエア(Vector NTI(InforMax)Primer Design)を用いて設計した。プライマーは、次の3つのグループに組み合わされた:(1)プライマーH160−5F(配列番号:6)とプライマーH160−3R(配列番号:7)、これらはmafp1遺伝子の全長配列の増幅に用いることができる;(2)プライマーH160−5S(配列番号:8)とプライマーH160−3R、これらはプロペプチド及び成熟MAFP1領域を含む配列をコード化するヌクレオチド配列の増幅に用いることができる;及び(3)プライマーH160−5P(配列番号:9)とプライマーH160−3R、これらは成熟MAFP1領域を含む配列をコード化するヌクレオチド配列の増幅に用いることができる。
mafp1遺伝子と各種のMonascus種中のmafp1遺伝子のcDNAとの配列比較
mafp1遺伝子のクローニング及び配列決定
Monascus株をYM培地(グリセロール7%、グルコース3%、MSG(L−グルタミン酸1ナトリウム)3%、ポリペプトン1.2%、NaNO3 0.2%及びMgSO4−7H2O 0.1%、pH6.0)中、25℃で9日間培養した。3Mフィルター膜による真空濾過によって、真菌体と培養液を分離した。好適量の真菌体を用いる従来のフェノール抽出法によって真菌の染色体DNAを得た。プライマーH160−5F及びH160−3Rを用いてPCR増幅を実施した。Monascus株から得られた染色体DNA 100ngを、PCRテンプレートとして用いた。PCR反応溶液は、10nM dNTP 0.2μL、10×PCR緩衝液2.5μL、前方プライマー及び後方プライマー5ピコモル及びTaq酵素5単位を含む。mafp1遺伝子を増幅するためのPCR条件は、(1)94℃、5分間;(2)94℃、40秒間を30サイクル、55℃、40秒間及び70℃30秒間;(3)72℃3分間;及び(4)4℃に保持である。mafp1遺伝子の全長配列のうちのPCR増幅されたヌクレオチド断片を精製し、pGEM−Tベクター(Promega)中にクローニングした。プラスミドDNAを配列決定のために抽出した。
Monascus株を、YM培地(グリセロール7%、グルコース3%、MSG(L−グルタミン酸1ナトリウム)3%、ポリペプトン1.2%、NaNO3 0.2%及びMgSO4−7H2O 0.1%、pH6.0)中、25℃で9日間培養した。3Mフィルター膜による真空濾過によって真菌体と培養液を分離した。好適量の真菌体を用いるRiboPure(登録商標)−酵母キット(Ambion)によって真菌の全RNAを得た。Improm−II(登録商標)逆転写系(Reverse Transcription system)キット(Promega)を用いて最初のcDNA鎖を製造した。mafp1遺伝子の特定のプライマー対(H160−5F及びH160−3R)をPCRに用いて、全長のmafp1のcDNA断片を増幅した。好適量の最初のcDNA鎖をPCRテンプレートとして用いた。PCR反応溶液は、10nM dNTP 0.2μL、10×PCR緩衝液2.5μL、H160−5F及びH160−3R 5ピコモル及びTaq酵素5単位を含む。mafp1 cDNAを増幅するためのPCR条件は、(1)94℃、5分間;(2)94℃、40秒間、55℃、40秒間を30サイクル及び72℃、1分間;(3)72℃、3分間;及び(4)4℃で保持である。増幅されたPCR産物を精製し、pGEM−Tベクター(Promega)中にクローニングした。プラスミドDNAを配列決定のために抽出した。
病原体対峙培養アッセイ
Monascus真菌の抗真菌活性を確認するために、2種類のMonascus種(M.pilosus BCRC 38072及びBCRC 38093)の円形真菌ブロック(直径0.5cm)と、病原性真菌(H.panici BCRC 35004)とをPDA皿の両側に置き、28℃で培養した。病原性真菌の増殖阻害を観察した。この予備的な結果は、両方の株が、H.panici BCRC 35004の増殖を阻害できることを示した。
Monascus抗真菌性タンパク質(MAFP1)の精製、N−末端配列決定、及び抗真菌活性アッセイ
MAFP1の精製
M.pilosus BCRC 38093の、25℃、9日間培養後の培養液(culture broth)400mLを、0.22μmのフィルター膜を用いて、4,500rpmで遠心分離して、不純物を除去した。30kDaのフィルター膜を用いて遠心分離された培養液を処理し(process)、30kDaより小さい分子を含む溶液を回収し、pH6.6に調整した。CM Sepharose Fast Flow(Amersham Biosciences)樹脂10mLとタンパク質溶液40mLとを、室温で16時間混合した。この混合物を空のクロマトグラフィーカラムに充填した。結合していないタンパク質を洗い出した。このカラムを、溶液A(10mM ナトリウム−リン酸緩衝液中25mM NaCl、pH6.6)100mLで溶出し、溶液A及び溶液B(10mM ナトリウム−リン酸緩衝液中1M NaCl、pH6.6)の異なる割合からなる溶液を用いてタンパク質を溶出した。溶液Aの濃度勾配は、95%から、80%、75%、50%、0%までであった。それぞれの濃度勾配に対して溶液100mLを使用し、溶出画分を15mLの試験管に別々に分けた。
精製されたMAFP1溶液をTCAで沈殿させ、15%アクリルアミドSDS−PAGEを用いて分析した。異なる濃度のリゾチームをタンパク質の定量基準として用いた。電気泳動後、タンパク質をゲルからPVDF膜に移し、0.1%クマシーブリリアントブルーR250(Coomassie Brilliant Blue R250)で染色した(図3参照)。MAFP1タンパク質のバンドを切り出し、メタノールで脱色した。ddH2Oで膜を何回も洗浄し、暗所で乾燥させた。Applied Biosystems Procise Sequencer 494を用いて、処理されたMAFP1タンパク質のN−末端配列を決定した。
病原体拮抗投与量アッセイを実施し、精製したMAFP1タンパク質の抗真菌活性を確認した。病原性真菌(P.variotii BCRC 33174及びH.panici BCRC 35004)の真菌区画(block)をPDA皿の中央に置いた。各濃度のMAFP1溶液(精製したMAFP1タンパク質を0μg〜0.8μg含有する)の6mmのペーパーディスクを、病原性真菌の真菌区画の周りに置いた。皿を28℃で培養し、病原性真菌の増殖阻害を観察した。結果を図4に示した。結果は、MAFP1タンパク質0.2μgで、P.variotiiの増殖を有意に抑制できることを示した。また、結果は、MAFP1タンパク質0.4μgで、H.paniciの増殖を有意に阻害できることを示した。MAFP1の濃度が高ければ高いほど、病原性真菌の増殖を阻害する活性が強いことが観察された。Monascus種由来のMAFP1タンパク質は、抗真菌活性を有するタンパク質であり、P.variotii等のヒトの病原体及びH.panici等の植物の病原体の増殖を阻害できることが証明された。
本発明によれば、本発明の抗真菌性タンパク質を用いる植物の真菌性疾病を抑制する方法が提供される。
本発明によれば、本発明の抗真菌性タンパク質をコード化するトランス遺伝子がそのゲノム中に組み込まれたトランスジェニック生物が提供される。
Claims (19)
- Monascus種から得られる単離・精製された抗真菌性タンパク質又は生物学的に機能性のその同等物。
- 前記Monascus種が、Monascus barkeris、Monascus floridanus、Monascus lunisporas、Monascus pilosus及びMonascus ruberからなる群から選択される、請求項1に記載の抗真菌性タンパク質。
- 前記Monascus barkeris株がMonascus barkeris BCRC 33309であり、
前記Monascus floridanus株がMonascus floridanus BCRC 33310であり、前記Monascus lunisporas株がMonascus lunisporas BCRC 33640であり、前記Monascus pilosus株がMonascus pilosus BCRC 38072、 BCRC 38093又はBCRC 31502であり、及び前記Monascus ruber株がMonascus ruber BCRC 31523、BCRC 31533、BCRC 31534、BCRC 31535、BCRC 33314又はBCRC 33323である請求項2に記載の抗真菌性タンパク質。 - 配列番号:2、配列番号:3若しくは配列番号:5のアミノ酸配列を含む抗真菌性タンパク質、又は生物学的に機能性のその同等物。
- 請求項1又は4に記載の抗真菌性タンパク質をコード化するヌクレオチド配列を含む単離・精製されたポリヌクレオチド。
- 前記ヌクレオチド配列が、
a)配列番号:1又は配列番号:4のヌクレオチド配列;
b)a)の縮退配列;
c)a)又はb)の相補配列;及び
d)高緊縮条件下でa)〜c)のいずれかにハイブリダイズするヌクレオチド配列
からなる群から選択される請求項5に記載のポリヌクレオチド。 - 請求項5に記載の単離・精製されたヌクレオチド配列を含む遺伝子組み換えベクター。
- 請求項7に記載のベクター又は請求項5に記載の単離・精製されたヌクレオチド配列を含む遺伝子組み換え宿主細胞。
- 請求項1又は4に記載の抗真菌性タンパク質、及び好適なキャリアを含む抗真菌性組成物であって、該タンパク質が、真菌性疾病に対する保護を提供するのに十分な量で提供されることを特徴とする抗真菌性組成物。
- 追加的な抗真菌剤を含む請求項9に記載の抗真菌性組成物。
- 請求項1又は4に記載の抗真菌性タンパク質を、真菌性疾病に対する保護を提供するのに十分な量で、植物に適用することを含む植物真菌の抑制方法。
- 前記抗真菌性タンパク質が請求項9に記載の組成物によって提供される請求項11に記載の方法。
- 請求項1又は4に記載の抗真菌性タンパク質をコード化するDNA分子を含むベクターによって植物細胞を形質転換し、コード化された抗真菌性タンパク質を、真菌性疾病に対する保護を提供するのに十分な量で発現させることによって前記抗真菌性タンパク質が提供される請求項11に記載の方法。
- 真菌性疾病を治療するための医薬品の製造のための、請求項1又は4に記載の抗真菌性タンパク質の使用。
- 前記抗真菌性タンパク質が、請求項9に記載の組成物によって提供される請求項14に記載の使用。
- 請求項1又は4に記載の抗真菌性タンパク質をコード化するトランス遺伝子が、そのゲノム中に組み込まれたトランスジェニック生物。
- 前記生物が植物若しくはその子孫又はその植物由来の種子である請求項16に記載のトランスジェニック生物。
- 請求項1又は4に記載の抗真菌性タンパク質をコード化するヌクレオチドを増幅することができる単離・精製されたプライマー対であって、該プライマーの配列が配列番号:6、配列番号:7、配列番号:8及び配列番号:9からなる群から選択される配列のうちの少なくとも8個のヌクレオチドを含むことを特徴とする単離・精製されたプライマー対。
- 請求項18に記載のプライマー対を含むPCRアッセイキット。
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